SOX 유전자 패밀리

SOX gene family
SOXB 서브패밀리, HMG 박스 옆에 있는 C 터미널
식별자
기호.SOXP
PF12336
인터프로IPR022097
SOXE, N 단자
식별자
기호.Sox_N
PF12444
인터프로IPR022151
SOXF, C 단자, 9aaTAD
식별자
기호.SOX_C
인터프로IPR021934
프로 사이트PS51516
SOXF, 센트럴
식별자
기호.Sox17_18_mid
PF12067
인터프로IPR033392

SOX 유전자(SRY 관련 HMG 상자 유전자)는 DNA작은 홈에 결합하는 전사인자 패밀리를 인코딩하고 HMG 상자라고 불리는 상동성 배열로 특징지어지는 유전자의 슈퍼 패밀리에 속합니다.이 HMG 박스는 진핵생물 종 전체에 걸쳐 고도로 보존된 DNA 결합 도메인입니다.호몰로그는 곤충, 선충, 양서류, 파충류, 조류 및 다양한 포유동물에서 확인되었다.하지만, HMG 상자는 자연에서 매우 다양할 수 있으며, 종들 사이에 보존되는 아미노산은 극히 적다.

삭스 유전자는 Y염색체에 존재하는 SRY라고 불리는 유전자의 HMG 박스를 포함하는 것으로 정의된다.인간과 쥐에는 20개의 SOX 유전자가 있고, 드로소필라에는 8개의 유전자가 있다.거의 모든 Sox 유전자는 Sry의 HMG 박스와 최소 50%의 아미노산 유사성을 보인다.패밀리는 기능적 평가에 [1]따라 HMG 영역 내의 호몰로지 및 기타 구조적 모티브에 따라 하위 그룹으로 나뉜다.

발달적으로 중요한 Sox 패밀리는 특별한 기능이 없으며, 많은 구성원들이 발전의 여러 다른 측면을 규제할 수 있는 능력을 가지고 있다.많은 삭스 유전자가 성별 결정에 관여하는 반면, 일부는 신경 발달과 같은 과정에서도 중요하다.예를 들어 Sox2와 Sox3는 소뇌 상피과립세포가 이동상태로 이행하는 데 관여한다.Sox 2는 또한 초기 배아와 배아줄기세포에서 [2]다능성을 유지하는 전사 인자이다.과립세포는 과립뉴런으로 분화하며 Sox11은 이 [3]과정에 관여한다.소뇌에서의 이러한 순차적 발현으로 인해 일부 Sox 유전자는 소아 뇌종양의 조기 진단에 유용할 것으로 생각되며, 중요한 연구의 표적이 된다.

Sox 단백질은 WWCAAW 배열과 유사한 배열(W=A 또는 T)에 결합한다.Sox 유전자는 DNA에 대한 결합특이성이 약하고 특이적으로 낮은 친화력을 가지고 있다. Sox 유전자는 배열 특이성이 높은 이동성 그룹을 포함하고 유사한 배열 특이성을 가진 Tcf/Lef1 유전자와 관련이 있다(대략 TWWCAAAG).[4]

무리

삭스 유전자는 그룹으로 분류된다.다른 그룹의 삭스 유전자는 DNA 결합 영역 밖에서 거의 유사성을 공유하지 않는다.마우스와 인간의 경우 그룹의 구성원은 다음과 같습니다.[5]

「 」를 참조해 주세요.

레퍼런스

  1. ^ Bowles, J; Schepers G; Koopman P. (November 2000). "Phylogeny of the SOX family of developmental transcription factors based on sequence and structural indicators". Dev. Biol. 227 (2): 239–55. doi:10.1006/dbio.2000.9883. PMID 11071752.
  2. ^ Takahashi, Kazutoshi; Yamanaka, Shinya (2006-08-25). "Induction of pluripotent stem cells from mouse embryonic and adult fibroblast cultures by defined factors". Cell. 126 (4): 663–676. doi:10.1016/j.cell.2006.07.024. ISSN 0092-8674. PMID 16904174.
  3. ^ Rex, M; Church, R; Tointon, K; Ichihashi, RM; Mokhtar, S; Uwanogho, D; Sharpe, PT; Scotting, PJ (March 1998). "Granule cell development in the cerebellum is punctuated by changes in Sox gene expression". Molecular Brain Research. 55 (1): 28–34. doi:10.1016/S0169-328X(97)00354-9. PMID 9645957.
  4. ^ Lefebvre V, Dumitriu B, Penzo-Méndez A, Han Y, Pallavi B (2007). "Control of cell fate and differentiation by Sry-related high-mobility-group box (Sox) transcription factors". Int. J. Biochem. Cell Biol. 39 (12): 2195–214. doi:10.1016/j.biocel.2007.05.019. PMC 2080623. PMID 17625949.
  5. ^ Guth SI, Wegner M (October 2008). "Having it both ways: Sox protein function between conservation and innovation". Cell. Mol. Life Sci. 65 (19): 3000–18. doi:10.1007/s00018-008-8138-7. PMID 18516494. S2CID 8943181.

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