아페탈라 2

Apetala 2
AP2 어댑터와 혼동하지 마십시오.
AP2 도메인
PDB 3gcc EBI.jpg
DNA와 [1]복잡한 GCC 박스 결합 도메인의 구조.
식별자
기호.AP2
팜PF00847
빠맘 클랜CL0081
인터프로IPR001471
스마트SM00380
프로 사이트PS51032
SCOP23gcc/SCOPe/SUPFAM
아페탈라 2
식별자
기호.AP2
NCBI유전자829845
유니프로트P47927

Apetala 2(AP2)는 유전자로 많은 전사인자 패밀리인 AP2/EREBP 패밀리의 구성원입니다.아라비도프시스 탈리아나에서 AP2는 꽃 [2]발육의 ABC 모델에서 역할을 한다.원래 이 단백질 패밀리는 식물에 특유하다고 생각되었다; 그러나 최근 연구는 말라리아의 원인 물질인 Plasmodium falciparum을 포함한 아피콤플렉산이 ApiAP2 [3]패밀리로 불리는 관련된 전사인자 세트를 암호화한다는 것을 보여주었다.

A. 탈리아나 전사인 RAV1에서 N말단 AP2 도메인은 5'-CAACA-3' 시퀀스를 결합하고, C말단 고보존 B3 도메인은 5'-CACCTG-3'[4] 시퀀스를 결합한다.

AP2의 구조와 생물학적 함량

최근의 연구를 통해, 아페탈라 2는 호르몬 조절,[5] 특히 AGAMLIGH와 같은 꽃과 식물에 중요한 역할을 하는 것으로 밝혀졌다.오가와가 실시한 이 연구는 유전자 발현에 있어서 Apetala 2와 AtEBP의 관계를 명확히 하기 위해 작성되었다.그 결과 AtEBP의 과잉 발현으로 잎에서 AP2 발현 조절이 증가하여 N-말단 영역이 AP2 유사 [6]표현형을 생성할 필요가 없음을 시사했다.AP2는 또한 ANT라고 불리는 또 다른 화합물을 구성하는데, ANT는 에틸렌 반응 요소 결합 [7]단백질의 DNA 결합 도메인과 상동하는 두 개의 AP2 도메인으로 구성됩니다.Maes의 또 다른 연구인 Petunia AP2 유사 유전자와 꽃과 씨앗 발육에서의 역할에서는 Petunia에서 AP2 유사 단백질이 발견되었고, 위치 교배에서의 발현 패턴을 연구함으로써 다음과 같이 나타났다.PhAP2A, PhAP2B 및 PhAP2C.PhAP2A는 A. 탈리아나에서 AP2와 매우 유사한 기능을 가지고 있으며 거의 정확한 유전자 서열을 가지고 있는 것으로 밝혀졌다.PhAP2B 및 PhAP2C는 AP2 계열의 전사인자 중 다른 서브그룹에 속하며, 꽃발달 중에 PhAP2A와 [8]비교하여 매우 다른 발현 패턴을 보이는 AP2 유사 단백질을 부호화한다.

AP2와 화합물의 연관성

아페탈라2 돌연변이는 종자발달 중 수크로스에 대한 헥소스의 비율 변화를 일으켜 AP2가 당대사에 [9]미치는 영향을 통해 종자량을 조절할 수 있는 가능성을 열어준다.단백질로서, 그것은 시스템 내의 당의 양을 조절하고 운송, 형태 형성, 신호 전달에 관여합니다.또 다른 연구는 이 비생물적 스트레스 반응에서 DBF1의 기능을 분석한 결과 아라비도시스 식물이 DBF1을 과잉 발현하는 것은 대조군 [10]식물보다 삼투압 스트레스에 더 내성이 있다는 것을 발견했다.DBF1은 Apetala 2가 전사 팩터를 수행하는 데 도움이 되는 바인딩 팩터입니다.

질병.

DNA는 끊임없이 돌연변이를 일으키는데, 이것은 기형 단백질로 인해 단백질의 기능이 완전히 변화하고 경우에 따라서는 질병을 일으킬 수 있다.예를 들어 AP2 연구에서 ERF/AP2형 전사 인자는 차분 디스플레이 역전사(PCR)에 의해 분리되었으며,[11] 이는 잎에서 과민 반응을 유발했다.Arabidopsis CBF 유전자 패밀리는 AP2domain 함유 단백질을 코드하는 3개의 유전자로 구성되며 모두 저온에서 유전자 발현을 할 수 있도록 조절되지만 압시스산이나 [12]탈수에는 해당되지 않는다.

레퍼런스

  1. ^ Allen MD, Yamasaki K, Ohme-Takagi M, Tateno M, Suzuki M (September 1998). "A novel mode of DNA recognition by a beta-sheet revealed by the solution structure of the GCC-box binding domain in complex with DNA". EMBO J. 17 (18): 5484–96. doi:10.1093/emboj/17.18.5484. PMC 1170874. PMID 9736626.
  2. ^ Riechmann JL, Meyerowitz EM (1998). "The AP2/EREBP family of plant transcription factors". Biol. Chem. 379 (6): 633–46. doi:10.1515/bchm.1998.379.6.633. PMID 9687012.
  3. ^ Balaji S, Babu MM, Iyer LM, Aravind L (2005). "Discovery of the principal specific transcription factors of Apicomplexa and their implication for the evolution of the AP2-integrase DNA binding domains". Nucleic Acids Research. 33 (13): 3994–4006. doi:10.1093/nar/gki709. PMC 1178005. PMID 16040597.
  4. ^ Kagaya Y, Ohmiya K, Hattori T (1999). "RAV1, a novel DNA-binding protein, binds to bipartite recognition sequence through two distinct DNA-binding domains uniquely found in higher plants". Nucleic Acids Res. 27 (2): 470–8. doi:10.1093/nar/27.2.470. PMC 148202. PMID 9862967.
  5. ^ 아라비도시스 탈리아나 에틸렌 반응성 요소 결합 단백질과 식물성 호메오틱 유전자, APETALA2의 상호 조절.오가와, T, 우치미야, H, 카와이야마다, M. Ann. Bot (2007)
  6. ^ 꽃 조절기 AGAMLY의 기능 영역: DNA 결합 영역의 특성화 및 지배적인 음성 돌연변이의 분석.미즈카미, Y, 황, H, 튜더, M, Hu, Y, Ma, H. 플랜트 셀(1996년)
  7. ^ AINTEGUMENTA 유전자는 배란과 여성 배우체 발달에 필요한 아라비도시스 유전자와 꽃의 동종 유전자 APETALA2와 관련이 있다.Klucher, K.M., Chow, H., Reiser, L., Fischer, R.L. Plant Cell(1996년)
  8. ^ Petunia Ap2와 유사한 유전자와 꽃과 씨앗의 발달에서 그들의 역할.Maes, T., Van de Steene, N., Zethof, J., Karimi, M., D'Hauw, M., Mares, G., Van Montagu, M., Gerats, T. 식물 세포(2001)
  9. ^ APETALA2에 의한 시드 질량 제어.오토, M.A., 피셔, R.L, 골드버그, R.B., 나카무라, K., 하라다, J. Proc. Natl. Acad. Sci.U.S.A. (2005)
  10. ^ R3H 도메인을 포함한 옥수수 DBF1-인터랙터 단백질 1은 스트레스 응답에서 DBF1 활성의 잠재적 조절제이다.Saleh, A., Lumbreras, V., Lopez, C., Kizis, E.D., Pagés, M. Plant J. (2006)
  11. ^ 후추전사인자 CaPF1은 아라비도시스의 병원체와 동결 내성을 부여한다.이, S.Y., Kim, J.H., 정, Y.H., Lee, S. Kim, W.T., Yu, S.H., Choi, D. Plant Physol.(2004)
  12. ^ Arabidopsis CBF 유전자 패밀리는 AP2 도메인 함유 단백질을 코드하는 3개의 유전자로 구성되며 발현은 저온에 의해 조절되지만 아브시스산이나 탈수에 의해 조절되지 않는다.Medina, J., Bargues, M., Terol, J., Pérez-Alonso, M., Salinas, J. Plant Physol.(1999)

외부 링크