PER3

PER3
PER3
식별자
에일리어스PER3, GIG13, FASPS3, 주기 1주기 클럭 3, 주기 1주기 조절기 3
외부 IDOMIM: 603427 MGI: 1277134 HomoloGene: 7886 GeneCard: PER3
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈

8863

18628

앙상블

ENSG000049246

ENSMUSG000028957

유니프로트

P5645

O70361

RefSeq(mRNA)

NM_011067
NM_001289877
NM_001289878

RefSeq(단백질)

NP_001276806
NP_001276807
NP_035197

장소(UCSC)Chr 1: 7.78 ~7.85 MbChr 4: 151 ~151.04 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

PER3 유전자는 인간의 [5]1주기 단백질 상동성 단백질 3을 암호화한다.PER3는 PER1 및 PER2 유전자에 대한 패럴로그이다.그것은 인간의 [6]지연 수면 단계 증후군과 관련된 일주기 유전자이다.

역사

Per3 유전자는 1998년 [7][8]6월 두 연구 그룹(코베 의과대학과 하버드 의과대학)에 의해 독립적으로 복제됐다.포유동물 Per3는 Per2에 대한 상동성 cDNA 서열을 검색하여 발견되었다.마우스 PERIUS3 단백질(mPER3)의 아미노산 배열은 다른 두 개의 PER [8][7]단백질과 37-56% 유사하다.

기능.

이 유전자는 Period 유전자의 일원이다.그것은 포유동물 뇌의 일차 일주기 페이스메이커인 상경질핵(SCN)에서 일주기 패턴으로 발현된다.이 과의 유전자는 운동 활동, 신진대사 및 행동의 일주기 리듬의 구성 요소를 인코딩합니다.는이라는의 일주기 생체 표현 계속되는 어둠 속에서, 그리고light/dark 주기의 변화 유전자 표현의 SCN.[9]PER1과 PER2에 비례하여 변화 분자 시계와이라는에 마스터 체내 시계.에서 가볍게 반응성을 위해, 하지만 데이터 PER3.PER3 이상 시멘트가 기능에 표시된다 필요하다 이후 계속되고 있다.s특정 조직에서 내인성 시간 유지에 중요한 것으로 판명되었으며, 내인성 기간의 조직 특이적 변화는 Per3 더블 녹아웃(--) [10]마우스에서 일주기 클럭의 내부 정렬 불량을 초래한다.PER3는 PER1 및 PER2에 안정화 효과를 가지며, PER3-P415A/H417R 다형성에서는 [11]이 안정화 효과를 감소시킬 수 있다.

시간생물학에서의 역할

mPer3의 RNA 수치는 SCN과 눈뿐만 아니라 간, 골격근 및 [8]고환을 포함한 말초 조직에서도 일주기 리듬에 따라 진동합니다.빛에 반응하여 mRNA가 유도되는 Per1, Per2와는 달리 SCN의 Per3 mRNA는 빛에 반응하지 않는다.이는 Per3가 Per1 또는 Per2와 [8]다르게 규제될 수 있음을 나타냅니다.

mPER3 단백질에는 mPER1 및 mPER2와 유사한 PAS 도메인이 포함되어 있습니다.mPER3는 이 도메인을 [8]사용하여 다른 단백질과 결합할 가능성이 높다.반면 PER1/2은 transcription-translation 피드백 루프는 세포 내 체내 시계.는데 관여되어 중요한 것으로 보여 왔다 하지만, PER3의 이 고리에 완전히 진입하지 못하다는 mPER3와 기능적 mPER2 mPER1에 중복 되지 않는 것으로 나타난 밝혀졌다.핵심 시계 고리[12]mPer3이 아니라 회원이다.전혀 그렇지 않아요.[12]

동물 연구

Per3 유전자는 PER1과 PER2 유전자에 대한 마비작용이 있지만, 동물에 대한 연구는 일반적으로 그것이 일주기 리듬에 크게 기여하지 않는다는 것을 보여준다.기능 Per3-/- 동물은 자유 주행 기간 [12]동안 작은 변화만 경험하며 광 펄스에 [13]대해 크게 다르게 반응하지 않습니다.Per1-/- 및 Per2-- 동물은 프리런 기간에 큰 변화를 경험하지만 Per1 또는 Per2에 더해 Per3를 녹아웃해도 프리런 [12]리듬에 거의 영향을 주지 않습니다.또한 Per1-/Per2-/- 마우스는 완전히 부정맥 상태이므로 이 두 유전자가 Per3보다 [12]생체시계에 훨씬 더 중요하다는 것을 알 수 있다.

per3 녹아웃 마우스는 운동 활동 기간이 약간 짧아지고(0.5시간[13]) 빛에 덜 민감하며 빛-어두운 주기의 변화에 더 느리게 들어갑니다.PER3는 빛에 반응하는 행동 활동을 억제하는 데 관여할 수 있지만, mPer3 표현은 일주기 [14][15]리듬에 필요하지 않다.

임상적 의의

exon 18의 54-bp 반복 시퀀스의 PER3 "길이" 다형성(GenBank 가입 번호).AB047686)는 추정인산화 도메인을 코드하는 영역에 18개의 아미노산이 삽입 또는 결실되어 발생하는 구조적 다형성이다.다형성은 주간 선호와 지연 수면 단계 증후군과 관련이 있다.긴 대립 유전자의 다형은 "아침성"과 관련이 있고 짧은 대립 유전자는 "저녁성"과 관련이 있습니다.짧은 대립 유전자는 또한 지연 수면 단계 [6]증후군과 관련이 있다.길이 다형성은 또한 지방 형성을 억제하는 것으로 나타났으며, Per3 녹아웃 마우스는 야생형에 비해 지방 조직이 증가하고 근육 조직이 감소하는 것으로 나타났다.또한 길이 다형성의 존재는 비당뇨병 대조군 [16]환자에 비해 제2형 당뇨병(T2DM) 환자와도 관련이 있는 것으로 나타났다.PER3-P415A/H417R 다형성은 인간의 가족성 고도 수면기 증후군뿐만 아니라 계절성 정서 장애와 관련이 있지만, 쥐에게 주입되면 다형성은 수면기 [11]지연을 일으킨다.

진

맞춤법

다음은 다른 [17]종에서 PER3 유전자의 일부 맞춤법 목록입니다.

  • PER3(P. 트로글로이드)
  • PER3(M. mulata)
  • PER3(낭창)
  • PER3 (H. sapiens)
  • PER3 (B. 황소자리)
  • Per3 (M. musculus)
  • Per3 (R. norveicus)
  • PER3(G. gallus)
  • per3(X. tropicalis)
  • per3(D. rerio)

패럴로그

  • PER1
  • PER2

유전자 위치

인간 PER3 유전자는 염색체 1의 다음 [18]위치에 있습니다.

  • 시작: 7,784,320 bp
  • 종료: 7,845,181 bp
  • 길이: 60,862 베이스
  • Exons: 25

PER3에는 19개의 트랜스크립트(스플라이스 바리안트)가 있습니다.

단백질 구조

PER3 단백질은 다음과 같은 [19]특징을 가지고 있는 것으로 확인되었습니다.

  • 크기 : 1201 아미노산
  • 분자량: 131888Da
  • 4차 구조:호모디머

번역 변경 후

다음은 Per3 [19]유전자에 대한 알려진 전사 후 수정 사항입니다.

  • CSNK1E에 의한 인산화는 약하며 PER1과의 연관성과 핵으로의 전위가 필요한 것으로 보인다.
  • 유비쿼티드
  • 포스포사이트플러스 수정 사이트
  • neXtProt에서 수정 사이트

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG000049246 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000028957 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Shearman LP, Zylka MJ, Weaver DR, Kolakowski LF, Reppert SM (December 1997). "Two period homologs: circadian expression and photic regulation in the suprachiasmatic nuclei". Neuron. 19 (6): 1261–9. doi:10.1016/S0896-6273(00)80417-1. PMID 9427249. S2CID 10059149.
  6. ^ a b Archer SN, Robilliard DL, Skene DJ, Smits M, Williams A, Arendt J, von Schantz M (June 2003). "A length polymorphism in the circadian clock gene Per3 is linked to delayed sleep phase syndrome and extreme diurnal preference". Sleep. 26 (4): 413–5. doi:10.1093/sleep/26.4.413. PMID 12841365.
  7. ^ a b Takumi T, Taguchi K, Miyake S, Sakakida Y, Takashima N, Matsubara C, Maebayashi Y, Okumura K, Takekida S, Yamamoto S, Yagita K, Yan L, Young MW, Okamura H (August 1998). "A light-independent oscillatory gene mPer3 in mouse SCN and OVLT". The EMBO Journal. 17 (16): 4753–9. doi:10.1093/emboj/17.16.4753. PMC 1170804. PMID 9707434.
  8. ^ a b c d e Zylka MJ, Shearman LP, Weaver DR, Reppert SM (June 1998). "Three period homologs in mammals: differential light responses in the suprachiasmatic circadian clock and oscillating transcripts outside of brain". Neuron. 20 (6): 1103–10. doi:10.1016/S0896-6273(00)80492-4. PMID 9655499. S2CID 14797914.
  9. ^ "Entrez Gene: PER3 period homolog 3 (Human)".
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  13. ^ a b Shearman LP, Jin X, Lee C, Reppert SM, Weaver DR (September 2000). "Targeted disruption of the mPer3 gene: subtle effects on circadian clock function". Molecular and Cellular Biology. 20 (17): 6269–75. doi:10.1128/MCB.20.17.6269-6275.2000. PMC 86101. PMID 10938103.
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  15. ^ Pereira DS, van der Veen DR, Gonçalves BS, Tufik S, von Schantz M, Archer SN, Pedrazzoli M (2014). "The effect of different photoperiods in circadian rhythms of per3 knockout mice". BioMed Research International. 2014: 170795. doi:10.1155/2014/170795. PMC 4042019. PMID 24982860.
  16. ^ Karthikeyan R, Marimuthu G, Sooriyakumar M, BaHammam AS, Spence DW, Pandi-Perumal SR, Brown GM, Cardinali DP (June 2014). "Per3 length polymorphism in patients with type 2 diabetes mellitus". Hormone Molecular Biology and Clinical Investigation. 18 (3): 145–9. doi:10.1515/hmbci-2013-0049. hdl:11336/15739. PMID 25390010. S2CID 36626446.
  17. ^ "PER3". Homologene. NCBI. 2017. Retrieved 12 Apr 2017.
  18. ^ "PER3". Entrez Gene. NCBI. 2017. Retrieved 12 Apr 2017.
  19. ^ a b "Per3 Gene". GeneCards. Weizmann Institute of Science. Retrieved April 12, 2017.

외부 링크

이 기사에는 미국 국립 의학 도서관(미국 국립 의학 도서관)의 공공 도메인 텍스트가 포함되어 있습니다.