GRIA3

GRIA3
GRIA3
사용 가능한 구조물
PDB직교 검색: PDBe RCSB
식별자
별칭GRIA3, GLUR-C, GLUR-K3, GLUR3, GLURC, GluA3, MRX94, 글루타이트 이온성 수용체 AMPA형 소단위 3, MRXSW
외부 IDOMIM: 305915 MGI: 95810 HomoloGene: 37353 GeneCard: GRIA3
직교체
종인간마우스
엔트레스

2892

53623

앙상블

ENSG00000125675

ENSMUSG00000001986

유니프로트

P42263

Q9Z2W9

RefSeq(mRNA)

NM_181894
NM_000828
NM_001256743
NM_007325

NM_001281929
NM_016886
NM_001290451
NM_001358361

RefSeq(단백질)

NP_000819
NP_001243672
NP_015564

NP_001268858
NP_001277380
NP_058582
NP_001345290

위치(UCSC)Cr X: 123.18 – 123.49MbChr X: 40.49 – 40.77Mb
PubMed 검색[3][4]
위키다타
인간 보기/편집마우스 보기/편집

글루탐산염 수용체 3은 인간에서 GRIA3 유전자에 의해 암호화된 단백질이다.[5][6][7]

함수

글루탐산염 수용체는 포유류 뇌에서 지배적인 흥분성 신경전달물질 수용체로서 다양한 정상 신경생리학적 과정에서 활성화된다.이들 수용체는 다중의 서브유닛을 가진 이단 단백질 복합체로서 각각 투과된 부위가 있으며, 모두 리간드 게이트 이온 채널을 형성하도록 배열되어 있다.글루탐산 수용체의 분류는 다른 약리 작용제에 의한 그 활성화에 기초한다.이 유전자는 알파아미노-3-히드록시-5-메틸-4-이소사졸 프로피온산염(AMPA) 수용체군에 속한다.이 위치에서의 대체 스플라이싱은 신호 전달 특성에 따라 달라질 수 있는 몇 가지 다른 이소 형태를 야기한다.[7]

게놈 연구는 결함이 있는 GRIA3 변종들과 정신분열증 위험의 고도로 높아진 사이의 잠정적인 연관성을 밝혀냈다.

상호작용

GRIA3는 GRIP1[8] 및 PICK1과 상호작용하는 것으로 나타났다.[8]

RNA 편집

여러 이온 채널과 신경전달물질 수용체는 ADAR의 기판으로서 mRNA 전 수용체들이다.[9]여기에는 글루탐산염 수용체 5개 서브유닛(이온성 AMPA 글루탐산염 수용체 서브유닛(Glur2, Glur3, Glurur4)과 카이네이트 수용체 서브유닛(Glur5, Glur6)이 포함된다.글루탐산염 게이트 이온 채널은 채널당 4개의 서브유닛으로 구성되며 각 서브유닛은 모공 루프 구조에 기여한다.모공 루프 구조는 K+ 채널(예: 인간 K1v.1 채널)에서 발견되는 구조와 관련이 있다.[10]인간 K1v.1 채널 프리 mRNA도 A to I RNA 편집의 대상이 된다.[11]글루탐산 수용체들의 기능은 뇌에 대한 빠른 신경전달의 조정에 있다.개별 서브유닛의 RNA 편집 이벤트에 의한 RNA 스플라이싱뿐만 아니라 서브유닛의 다양성도 결정된다.이것은 이들 수용체들의 필연적으로 높은 다양성을 낳는다.GluR3는 GRIA3 유전자의 유전자 산물로, 그 전 mRNA는 RNA 편집을 받는다.

유형

A to I RNA 편집은 RNA(ADAR)에 작용하는 아데노신 디아미나제 계열에 의해 촉매로 작용하여, 사전 mRNA의 이중 가닥 영역 내에서 아데노신을 구체적으로 인식하여 이노신에 디아민화한다.이노신은 세포의 변환 기계에 의해 구아노신(guanosine)으로 인식된다.ADAR 계열 ADARs 1-3의 멤버는 3명이며, ADAR1과 ADAR2는 효소 활성 멤버가 유일하다.ADAR3는 뇌에서 규제 역할을 하는 것으로 생각된다.ADAR1과 ADAR2는 조직으로 널리 표현되는 반면 ADAR3는 뇌로 제한된다.RNA의 이중 가닥 영역은 편집부지의 가까운 영역에 있는 잔여물 사이의 베이스 페어링에 의해 형성되지만, 일반적으로 인접 인트론 내에 잔류물이 있을 수 있다.편집 영역과 기본 쌍을 이루는 영역을 ECS(보완 시퀀스 편집)라고 함

위치

이 서브 유닛의 사전 mRNA는 한 위치에서 편집된다.R/G 편집 사이트는 M3와 M4 지역 사이의 exon 13에 위치한다.편집 결과, 코돈은 아르기닌(AGA)에서 글리신(GGA)으로 변경된다.편집 위치는 수용기의 초당적 리간드 상호작용 영역에 해당한다.R/G 부지는 대체 스플라이싱에 의해 도입된 38-아미노-아시드 길이 플립 및 플롭 모듈 바로 직전에 아미노산 769에서 발견된다.플립과 플롭 양식은 이 단백질의 편집된 버전과 편집되지 않은 버전 모두에 존재한다.[12]편집 보완 시퀀스(ECS)는 exon에 가까운 전자 시퀀스에서 찾을 수 있다.전자 시퀀스에는 5' 스플라이스 부지가 포함된다.이중 좌초 예상 지역은 30개의 염기쌍이다.아데노신 잔여물은 유전적으로 인코딩된 대본에서 일치하지 않지만, 편집 후에는 그렇지 않다.GluR-B의 Q/R 사이트와 유사한 시퀀스에도 불구하고 이 사이트의 편집은 GluR-3 사전 mRNA에서는 발생하지 않으며, 편집 시 이중 가닥 RNA 구조에서 편집 전 불일치하는 표적형 아데노신이 생성되어 편집 후 매칭된다.관련된 전자적 시퀀스에는 5'의 기증자 스플라이스 부위가 포함되어 있다.[12][13]

보존

랫드에서도 편집이 일어난다.[12]

규정

GluR-3의 편집은 쥐의 뇌에서 배아기 저수준에서 출생시 편집수준의 큰 증가까지 조절된다.인간의 경우 GRIA3 대본의 80~90%가 편집된다.[12]이 글루탐산 수용체 하위 장치에 Q/R 사이트 편집이 없는 것은 이중 형성에 필요한 전자적 시퀀스가 없기 때문이다.[14]

결과들

구조

편집 결과 편집 사이트에서 코돈 변경(AGA)에서 (GGA)로, R에서 G로 변경된다.[12]

함수

R/G 사이트에서 편집하면 담수화로부터 더 빨리 회복할 수 있다.이 사이트의 편집되지 않은 Glu-R은 복구 속도가 느리다.그러므로 편집은 빠른 자극에 지속적인 반응을 허용한다.편집과 스플리싱의 교차점이 여기서 일어날 것 같다.편집은 스플라이싱 전에 이루어진다.모든 AMPA 수용체는 플립과 플립으로 대체적으로 분할된 변종에서 발생한다.플롭에서 발생하는 AMPA 수용체들은 플립 형태보다 더 빨리 탈진한다.[12]편집은 또한 이 현장의 스플라이싱에도 영향을 미치는 것으로 생각된다.

참고 항목

참조

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리스 89: ENSG00000125675 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리스 89: ENSMUSG00000001986 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ McNamara JO, Eubanks JH, McPherson JD, Wasmuth JJ, Evans GA, Heinemann SF (Jul 1992). "Chromosomal localization of human glutamate receptor genes". J Neurosci. 12 (7): 2555–62. doi:10.1523/JNEUROSCI.12-07-02555.1992. PMC 6575855. PMID 1319477.
  6. ^ Gecz J, Barnett S, Liu J, Hollway G, Donnelly A, Eyre H, Eshkevari HS, Baltazar R, Grunn A, Nagaraja R, Gilliam C, Peltonen L, Sutherland GR, Baron M, Mulley JC (Mar 2000). "Characterization of the human glutamate receptor subunit 3 gene (GRIA3), a candidate for bipolar disorder and nonspecific X-linked mental retardation". Genomics. 62 (3): 356–68. doi:10.1006/geno.1999.6032. PMID 10644433.
  7. ^ a b "Entrez Gene: GRIA3 glutamate receptor, ionotrophic, AMPA 3".
  8. ^ a b Hirbec, Hélène; Perestenko Olga; Nishimune Atsushi; Meyer Guido; Nakanishi Shigetada; Henley Jeremy M; Dev Kumlesh K (May 2002). "The PDZ proteins PICK1, GRIP, and syntenin bind multiple glutamate receptor subtypes. Analysis of PDZ binding motifs". J. Biol. Chem. 277 (18): 15221–4. doi:10.1074/jbc.C200112200. ISSN 0021-9258. PMID 11891216.
  9. ^ Bass BL (2002). "RNA editing by adenosine deaminases that act on RNA". Annu. Rev. Biochem. 71: 817–46. doi:10.1146/annurev.biochem.71.110601.135501. PMC 1823043. PMID 12045112.
  10. ^ Seeburg PH, Single F, Kuner T, Higuchi M, Sprengel R (July 2001). "Genetic manipulation of key determinants of ion flow in glutamate receptor channels in the mouse". Brain Res. 907 (1–2): 233–43. doi:10.1016/S0006-8993(01)02445-3. PMID 11430906. S2CID 11969068.
  11. ^ Bhalla T, Rosenthal JJ, Holmgren M, Reenan R (October 2004). "Control of human potassium channel inactivation by editing of a small mRNA hairpin". Nat. Struct. Mol. Biol. 11 (10): 950–6. doi:10.1038/nsmb825. PMID 15361858. S2CID 34081059.
  12. ^ a b c d e f Lomeli H, Mosbacher J, Melcher T, Höger T, Geiger JR, Kuner T, Monyer H, Higuchi M, Bach A, Seeburg PH (December 1994). "Control of kinetic properties of AMPA receptor channels by nuclear RNA editing". Science. 266 (5191): 1709–13. Bibcode:1994Sci...266.1709L. doi:10.1126/science.7992055. PMID 7992055.
  13. ^ Seeburg PH, Higuchi M, Sprengel R (May 1998). "RNA editing of brain glutamate receptor channels: mechanism and physiology". Brain Res. Brain Res. Rev. 26 (2–3): 217–29. doi:10.1016/S0165-0173(97)00062-3. PMID 9651532. S2CID 12147763.
  14. ^ Herb A, Higuchi M, Sprengel R, Seeburg PH (March 1996). "Q/R site editing in kainate receptor GluR5 and GluR6 pre-mRNAs requires distant intronic sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93 (5): 1875–80. Bibcode:1996PNAS...93.1875H. doi:10.1073/pnas.93.5.1875. PMC 39875. PMID 8700852.

추가 읽기

외부 링크

이 기사는 공공영역에 있는 미국 국립 의학 도서관의 텍스트를 통합하고 있다.