콜리모바이러스과

Caulimoviridae
콜리모바이러스과
바이러스 분류 e
(순위 미지정): 바이러스
영역: 리보비리아
왕국: 파라나비래
문: 아르베르비리코타
클래스: 레브트라비케테스
주문: 오르테빌라스
패밀리: 콜리모바이러스과

콜리모바이러스과(Caulimoviridae)는 [1]식물을 감염시키는 바이러스 과이다.이 과에는 94종이 있으며 11속으로 [2][3]분류된다.Caulimoviridae과에 속하는 바이러스는 이중사슬 DNA(dsDNA) 역전사 바이러스(또는 파라레트로바이러스)로 불린다.즉, 복제 사이클에 역전사 단계를 포함한 바이러스이다.이 패밀리는 dsDNA 게놈을 가진 모든 식물 바이러스를 포함하고 있으며 라이프사이클에서 역전사 단계를 가집니다.

분류법

다음과 같은 속들이 [3]인식되고 있다.

바이러스 입자 구조

이 패밀리의 모든 바이러스는 포장이 되어 있지 않습니다.바이러스 입자는 세균 형태이거나 등각선이다.바이러스 구조에 포함된 핵캡시드의 유형은 바이러스 입자의 크기를 결정합니다.균상 입자는 직경이 약 35~50nm이고 길이는 최대 900nm입니다.등각 입자의 지름은 평균 45~50nm이며, 이십면체 대칭을 나타낸다.

게놈 구조와 레플리케이션

CaMV의 게놈 지도입니다. 잘 연구된 가족이죠.ORF : 1 : 이동단백질, 2 : 고도전달인자, 3 : 바이러스 관련단백질, 4 : gag-Capsid, 5 : pro/pol-A3단백질 및 RT/RNase H, 6 : 트랜스액티베이터/바이로플라스민.MP, CP, PRO, POL은 이 패밀리에서 흔히 볼 수 있습니다.배열은 다양합니다.

이 계열의 바이러스의 게놈은 7.2-9.3kbp의 비공유 폐쇄 원형 dsDNA를 포함하고 있으며, 두 게놈 가닥의 특정 위치에서 불연속성을 보인다.이러한 게놈은 페투바이러스에서 관찰된 바와 같이 콩무비러스와 같은 8개의 ORF에 대해 하나의 ORF(Open Reading Frame)를 포함합니다.바이러스 게놈에 의해 코드된 단백질은 역전사효소-리보핵산가수분해효소 H, 아스파라긴 단백질 효소, 핵캡시드 및 트랜스활성화제를 포함한다. - 아직 특정 기능이 할당되지 않은 복제에 필수적인 다른 단백질들이 있다.

복제는 숙주 세포의 세포질과 핵 모두에서 일어난다.우선, 바이러스 게놈은 세포질로 들어간다.바이러스 DNA는 숙주 핵에 들어갈 때 초코일 형태의 미니 염색체 구조를 형성하며, 그곳에서 말단 용장성 폴리아데닐화 RNA로 전사된다(DNA의 일부 부분에 대해 두 번 전사가 일어나기 때문에).새롭게 전사된 RNA는 세포질로 들어가 바이러스 단백질로 변환되거나 바이러스 역전사효소에 의해 dsDNA 바이러스 게놈의 새로운 복사본으로 역전사됩니다.새로운 dsDNA 게놈은 세포질에 캡슐화되어 방출된다.

복제 과정은 역전사 단계와 RNA 중간체를 포함하므로 Caulimoviridae 계열의 바이러스는 진정한 dsDNA 바이러스로 간주되지 않고 DNA 역전사 바이러스라고 불립니다.그들은 레트로바이러스와 이 특징을 공유한다.그러나 레트로바이러스와 달리 Caulimoviridae의 바이러스는 복제를 위해 숙주의 게놈에 바이러스 게놈을 통합할 필요가 없으며, 이러한 이유로 그들의 게놈은 효소 단백질 인테그레이스를 코드하지 않는다.

식물 게놈에 내인성 바이러스 요소(EVE)의 존재는 널리 [4][5][6]퍼져 있다.그리고 대부분의 알려진 식물 EVE는 Caulimoviridae의 DNA 게놈을 가진 바이러스에서 유래한다.통합은 DNA 복구 메커니즘 동안 비호몰로지 말단 결합(불법 사생아 재조합)을 통해 일어나는 것으로 생각된다.대부분의 식물 EVE는 감염되지 않습니다.그러나 페투니아(페투니아 정맥 청소 바이러스), 바나나(바나나 스트릭 OL 바이러스, 바나나 스트릭 GF 바이러스, 바나나 스트릭 IM 바이러스), 니코티아나 에드워드손(담배 스트릭 제거 바이러스)의 게놈에서는 감염성 콜리모바이러스과 EVE가 보고되고 있다.

레퍼런스

  1. ^ Teycheney, PY; Geering, ADW; Dasgupta, I; Hull, R; Kreuze, JF; Lockhart, B; Muller, E; Olszewski, N; Pappu, H; Pooggin, MM; Richert-Pöggeler, KR; Schoelz, JE; Seal, S; Stavolone, L; Umber, M; ICTV Report Consortium (October 2020). "ICTV Virus Taxonomy Profile: Caulimoviridae". The Journal of General Virology. 101 (10): 1025–1026. doi:10.1099/jgv.0.001497. PMC 7660458. PMID 32940596.
  2. ^ "ICTV Report Caulimoviridae".
  3. ^ a b "Virus Taxonomy: 2020 Release". International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). March 2021. Retrieved 21 May 2021.
  4. ^ Recent advances in plant virology. Caranta, Carole. Norfolk, UK: Caister Academic Press. 2011. ISBN 9781904455752. OCLC 644654169.{{cite book}}: CS1 유지보수: 기타 (링크)
  5. ^ Geering, Andrew D. W.; Maumus, Florian; Copetti, Dario; Choisne, Nathalie; Zwickl, Derrick J.; Zytnicki, Matthias; McTaggart, Alistair R.; Scalabrin, Simone; Vezzulli, Silvia (10 November 2014). "Endogenous florendoviruses are major components of plant genomes and hallmarks of virus evolution". Nature Communications. 5 (1): 5269. Bibcode:2014NatCo...5.5269G. doi:10.1038/ncomms6269. ISSN 2041-1723. PMC 4241990. PMID 25381880.
  6. ^ Diop, Seydina Issa; Geering, Andrew D. W.; Alfama-Depauw, Françoise; Loaec, Mikaël; Teycheney, Pierre-Yves; Maumus, Florian (12 January 2018). "Tracheophyte genomes keep track of the deep evolution of the Caulimoviridae". Scientific Reports. 8 (1): 572. Bibcode:2018NatSR...8..572D. doi:10.1038/s41598-017-16399-x. ISSN 2045-2322. PMC 5766536. PMID 29330451.
  7. ^ Richert‐Pöggeler, Katja R.; Noreen, Faiza; Schwarzacher, Trude; Harper, Glyn; Hohn, Thomas (15 September 2003). "Induction of infectious petunia vein clearing (pararetro) virus from endogenous provirus in petunia". The EMBO Journal. 22 (18): 4836–4845. doi:10.1093/emboj/cdg443. ISSN 0261-4189. PMC 212712. PMID 12970195.
  8. ^ Gayral, Philippe; Noa-Carrazana, Juan-Carlos; Lescot, Magali; Lheureux, Fabrice; Lockhart, Benham E. L.; Matsumoto, Takashi; Piffanelli, Pietro; Iskra-Caruana, Marie-Line (1 July 2008). "A Single Banana Streak Virus Integration Event in the Banana Genome as the Origin of Infectious Endogenous Pararetrovirus". Journal of Virology. 82 (13): 6697–6710. doi:10.1128/JVI.00212-08. ISSN 0022-538X. PMC 2447048. PMID 18417582.
  9. ^ Lockhart, B. E.; Menke, J.; Dahal, G.; Olszewski, N. E. (2000). "Characterization and genomic analysis of tobacco vein clearing virus, a plant pararetrovirus that is transmitted vertically and related to sequences integrated in the host genome". Journal of General Virology. 81 (6): 1579–1585. doi:10.1099/0022-1317-81-6-1579. PMID 10811941.

외부 링크