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TW201938557A - 作為sos1抑制劑之新穎芐胺基取代吡啶并嘧啶酮及衍生物 - Google Patents

作為sos1抑制劑之新穎芐胺基取代吡啶并嘧啶酮及衍生物 Download PDF

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TW201938557A
TW201938557A TW107146126A TW107146126A TW201938557A TW 201938557 A TW201938557 A TW 201938557A TW 107146126 A TW107146126 A TW 107146126A TW 107146126 A TW107146126 A TW 107146126A TW 201938557 A TW201938557 A TW 201938557A
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Abstract

本發明涵蓋式(I)化合物,
Figure TW201938557A_A0001

其中基團R1 R4 Ap具有申請專利範圍及說明書中所給出之含義;其作為SOS1抑制劑之用途;含有此類化合物之醫藥組合物及其作為藥劑/醫學應用之用途、尤其作為用於治療及/或預防腫瘤學疾病之藥劑之用途。

Description

作為SOS1抑制劑之新穎芐胺基取代吡啶并嘧啶酮及衍生物
本發明係關於式(I)之新穎苄胺基取代吡啶并嘧啶酮及衍生物

其中基團R1 至R4 、A及p具有申請專利範圍及說明書中所給出之含義;其作為SOS1抑制劑之用途;含有此類化合物之醫藥組合物及其作為藥劑/醫學應用之用途、尤其作為用於治療及/或預防腫瘤學疾病之藥劑之用途。
包括KRAS (V-Ki-ras2克爾斯頓(Kirsten)大鼠肉瘤病毒性致癌基因同系物)、NRAS (神經胚細胞瘤RAS病毒性致癌基因同系物)及HRAS (哈維(Harvey)鼠類肉瘤病毒致癌基因)及其任何突變體之RAS家族蛋白質係以GTP結合或GDP結合狀態存在於細胞中之小GTP酶(McCormick等人,J. Mol. Med. (Berl)., 2016, 94(3):253-8;Nimnual等人,Sci. STKE., 2002, 2002(145):pe36)。該等RAS家族蛋白質具有較弱之固有GTP酶活性及較慢之核苷酸交換速率(Hunter等人,Mol. Cancer Res., 2015, 13(9):1325-35)。諸如NF1等GTP酶活化蛋白(GAP)之結合增加RAS家族蛋白質之GTP酶活性。諸如SOS1 (Son of Sevenless 1)等鳥嘌呤核苷酸交換因子(GEF)之結合促進自RAS家族蛋白質釋放GDP,從而實現GTP結合(Chardin等人,Science, 1993, 260(5112):1338-43)。當處於GTP結合狀態時,RAS家族蛋白質具有活性且接合效應蛋白(包括C-RAF及磷酸肌醇3-激酶(PI3K))以促進RAF/促分裂原或細胞外信號調控激酶(MEK/ERK)路徑、PI3K/AKT/雷帕黴素(rapamycin)之哺乳動物靶標(mTOR)路徑及RalGDS (Ral鳥嘌呤核苷酸解離刺激物)路徑(McCormick等人,J. Mol. Med. (Berl)., 2016, 94(3):253-8;Rodriguez-Viciana等人,Cancer Cell. 2005, 7(3):205-6)。該等路徑影響多種細胞過程,例如增殖、存活、代謝、運動性、血管生成、免疫性及生長(Young等人,Adv. Cancer Res., 2009, 102:1-17;Rodriguez-Viciana等人,Cancer Cell. 2005, 7(3):205-6)。
RAS家族蛋白質中之癌症相關突變抑制其固有及GAP誘導之GTP酶活性,從而導致GTP結合/活性RAS家族蛋白質之群體增加(McCormick等人,Expert Opin. Ther. Targets., 2015, 19(4):451-4;Hunter等人,Mol. Cancer Res., 2015, 13(9):1325-35)。此進而導致RAS家族蛋白質下游之效應物路徑(例如MEK/ERK、PI3K/AKT/mTOR、RalGDS路徑)之持續活化。在多種人類癌症(包括肺癌、結腸直腸癌及胰臟癌)中發現KRAS突變(例如胺基酸G12、G13、Q61、A146) (Cox等人,Nat. Rev. Drug Discov., 2014, 13(11):828-51)。在多種人類癌症類型中亦發現HRAS (例如胺基酸G12、G13、Q61)及NRAS (例如胺基酸G12、G13、Q61、A146)中之突變,然而與KRAS突變相比頻率通常較低(Cox等人,Nat. Rev. Drug Discov., 2014, 13(11):828-51)。RAS家族蛋白質之改變(例如突變、過表現、基因擴增)亦已描述為針對諸如以下等癌症藥物之抗性機制:EGFR抗體西妥昔單抗(cetuximab)及帕尼單抗(panitumumab)) (Leto等人,J. Mol. Med. (Berl). 2014年7月;92(7):709-22)及EGFR酪胺酸激酶抑制劑奧希替尼(osimertinib)/AZD9291 (Ortiz-Cuaran等人,Clin. Cancer Res., 2016, 22(19):4837-47;Eberlein等人,Cancer Res., 2015, 75(12):2489-500)。
無七之子1(Son of Sevenless 1;SOS1)係最初鑑別之果蠅(Drosophila)蛋白SOS之人類同系物(Pierre等人,Biochem. Pharmacol., 2011, 82(9):1049-56;Chardin等人,Cytogenet. Cell. Genet., 1994, 66(1):68-9)。該SOS1蛋白係由1333個胺基酸組成(150 kDa)。SOS1係具有以下之多結構域蛋白質:兩個串聯N-末端組織蛋白結構域(HD),之後為Dbl同源性結構域(DH)、普列克受質蛋白(Pleckstrin)同源性結構域(PH)、螺旋連接體(HL)、RAS交換體基序(REM)、CDC25同源性結構域及C-末端富含脯胺酸之結構域(PR)。SOS1具有兩個用於RAS家族蛋白質之結合位點;一個係結合GDP結合之RAS家族蛋白質以促進鳥嘌呤核苷酸交換之催化位點且一個係結合GTP結合之RAS家族蛋白質從而引起SOS1之催化性GEF功能進一步增加之別位位點(Freedman等人,Proc. Natl. Acad. Sci. U S A., 2006, 103(45):16692-7;Pierre等人,Biochem. Pharmacol., 2011, 82(9):1049-56)。已公開之數據指示SOS1在癌症中之突變KRAS活化及致癌信號傳導中之重要參與(Jeng等人,Nat. Commun., 2012, 3:1168)。耗乏SOS1含量降低攜帶KRAS突變之腫瘤細胞之增殖速率及存活,而在KRAS野生型細胞系中觀察不到效應。藉由引入催化位點突變之SOS1無法挽救SOS1損失之效應,此證明SOS1 GEF活性在KRAS突變癌細胞中之至關重要的作用。
SOS1經由除RAS家族蛋白質突變以外之機制在很大程度上參與癌症中RAS家族蛋白質信號傳導之活化。SOS1與轉接蛋白Grb2相互作用,且所得SOS1/Grb2複合物結合至經活化/磷酸化受體酪胺酸激酶(例如EGFR、ErbB2、ErbB3、ErbB4、PDGFR-A/B、FGFR1/2/3、IGF1R、INSR、ALK、ROS、TrkA、TrkB、TrkC、RET、c-MET、VEGFR1/2/3、AXL) (Pierre等人,Biochem. Pharmacol., 2011, 82(9):1049-56)。SOS1亦募集至其他磷酸化細胞表面受體,例如T細胞受體(TCR)、B細胞受體(BCR)及單核球群落刺激因子受體(Salojin等人,J. Biol. Chem. 2000, 275(8):5966-75)。SOS1至質膜鄰近RAS家族蛋白質之此定位使得SOS1能夠促進RAS家族蛋白質活化。RAS家族蛋白質之SOS1活化亦可藉由SOS1/Grb2與慢性骨髓性白血病中常見的BCR-ABL致癌蛋白之相互作用來介導(Kardinal等人,2001, Blood, 98:1773-81;Sini等人,Nat. Cell Biol., 2004, 6(3):268-74)。
此外,SOS1之改變與癌症有關。SOS1突變在以下中發現:胚胎型橫紋肌肉瘤、賽特利細胞(sertoli cell)睪丸瘤、皮膚之顆粒細胞瘤(Denayer等人,Genes Chromosomes Cancer, 2010, 49(3):242-52)及肺腺癌(Cancer Genome Atlas Research Network., Nature. 2014, 511(7511):543-50)。同時,SOS1之過表現已闡述於膀胱癌(Watanabe等人,IUBMB Life., 2000, 49(4):317-20)及前列腺癌(Timofeeva等人,Int. J. Oncol., 2009, 35(4):751-60)中。除癌症以外,遺傳性SOS1突變與RAS病變之發病機理有關,該等RAS病變如(例如)努南氏症候群(Noonan syndrome,NS)、心-面-皮膚症候群(CFC)及1型遺傳性牙齦纖維瘤病(Pierre等人,Biochem. Pharmacol., 2011, 82(9):1049-56)。
SOS1亦係活化GTP酶RAC1 (Ras相關之C3肉毒桿菌毒素受質1)之GEF (Innocenti等人,J. Cell Biol., 2002, 156(1):125-36)。如同RAS家族蛋白質,RAC1與多種人類癌症及其他疾病之發病機理有關(Bid等人,Mol. Cancer Ther. 2013, 12(10):1925-34)。
無七之子2(Son of Sevenless 2;SOS2),即哺乳動物細胞中之SOS1同系物亦起活化RAS家族蛋白質之GEF的作用(Pierre等人,Biochem. Pharmacol., 2011, 82(9):1049-56;Buday等人,Biochim. Biophys. Acta., 2008, 1786(2):178-87)。來自小鼠剔除模型之已公開數據表明SOS1及SOS2在成年小鼠穩態中之作用冗餘。雖然小鼠中SOS1之種系剔除導致中期胚胎妊娠期間之致死性(Qian等人,EMBO J., 2000, 19(4):642-54),但全身條件性SOS1剔除成年小鼠係可存活(Baltanás等人,Mol. Cell. Biol., 2013, 33(22):4562-78)。SOS2基因靶向在小鼠中並未產生任何明顯之表型(Esteban等人,Mol. Cell. Biol., 2000, 20(17):6410-3)。相比之下,雙重SOS1及SOS2剔除導致成年小鼠之快速致死性(Baltanás等人,Mol. Cell. Biol., 2013, 33(22):4562-78)。該等已公開之數據表明,可充分耐受個別SOS同種型之選擇性靶向(例如選擇性SOS1靶向)以達成SOS1/RAS家族蛋白質驅動癌症(或其他SOS1/RAS家族蛋白質病理學)與正常細胞及組織之間的治療指標。
預期SOS1之催化位點與RAS家族蛋白質之結合的選擇性藥理學抑制防止SOS1介導之RAS家族蛋白質活化為GTP結合形式。預期此等SOS1抑制劑化合物因此抑制細胞中RAS家族蛋白質下游之信號傳導(例如ERK磷酸化)。在與RAS家族蛋白質依賴性相關之癌細胞(例如KRAS突變癌細胞系)中,預期SOS1抑制劑化合物遞送抗癌效能(例如抑制增殖、存活、轉移等)。針對SOS1:RAS家族蛋白質結合(奈莫耳級IC50 值)及細胞中ERK磷酸化(奈莫耳級IC50 值)之高抑制功效係SOS1抑制劑化合物之期望特性。此外,SOS1抑制劑化合物之期望特性將係相對於SOS2,對SOS1之選擇性抑制。此結論係基於如上文所闡述之SOS1剔除小鼠之活表型及SOS1/SOS2雙重剔除小鼠之致死率。
先前所闡述之SOS1抑制劑化合物中尚未完全達成該等特性。在近幾十年中,RAS家族蛋白質-SOS1蛋白相互作用已獲得愈來愈多之認識。迄今為止,已作出若干次努力以鑑別並最佳化靶向RAS之效應物結合位點或SOS1之催化性結合位點之結合物(關於所選綜述,參見:Lu等人,ChemMedChem. 2016, 11(8):814-21),而僅取得有限成功。
最近,已鑑別出小的活化分子,其結合至緊密靠近RAS結合位點之SOS1之親脂性口袋(Burns等人,Proc. Natl. Acad. Sci. 2014, 111(9):3401-6)。然而,該等分子之結合似乎導致核苷酸交換增加,且因此使RAS活化而非去活化。
為穩定RAS家族蛋白質與SOS1之蛋白質-蛋白質相互作用且防止RAS家族蛋白質重新加載GTP,隨後鑑別出若干不同片段(Winter等人,J. Med. Chem. 2015, 58(5):2265-74)。然而,該等片段與SOS1之可逆結合並未轉化成對核苷酸交換之可量測效應,且對於與RAS共價結合之片段僅觀察到較弱效應。
而且最近,已進行實驗以將合理設計及篩選平臺組合來鑑別SOS1之小分子抑制劑(Evelyn等人,Chem. Biol. 2014, 21(12):1618-28;Evelyn等人,J. Biol. Chem. 2015, 290(20):12879-98;Zheng等人,WO 2016/077793),即結合至SOS1且抑制與RAS家族蛋白質之蛋白質-蛋白質相互作用的化合物。儘管已鑑別出對SOS1具有輕微抑制性效應之化合物,但對鳥嘌呤核苷酸交換及細胞信號轉導調節(例如ERK磷酸化)之效應仍較弱。
WO 2018/115380及WO 2018/172250揭示基於喹唑啉之SOS抑制劑。
在本文中,吾人闡述新穎SOS1抑制劑化合物,其結合至SOS1催化位點(藉助結晶學確認)且同時防止與RAS家族蛋白質之相互作用及RAS家族蛋白質之活化。此對SOS1與RAS家族蛋白質、尤其KRAS (具有低單數位奈莫耳IC50 活性)之相互作用產生明顯抑制性效應,且因此顯著降低KRAS突變癌細胞系中之ERK磷酸化。
預期本文所闡述之選擇性SOS1抑制劑化合物向患有與RAS家族蛋白質信號傳導依賴性相關之癌症之患者遞送藥理學益處。預期由SOS1抑制劑化合物靶向之此等癌症包括在RAS家族蛋白質路徑(例如KRAS、NRAS、HRAS)、受體酪胺酸激酶(例如EGFR、ErbB2、ErbB3、ErbB4、PDGFR-A/B、FGFR1/2/3、IGF1R、INSR、ALK、ROS、TrkA、TrkB、TrkC、RET、c-MET、VEGFR1/2/3、AXL)、GAP (例如NF1)及SOS1中展現組分(蛋白質、基因)之改變(突變、基因擴增、過表現)之彼等。另外,鑒於SOS1在RAC1活化中之作用,預期展示RAC1依賴性之癌症由SOS1抑制劑化合物靶向。此外,在與RAS家族蛋白質路徑失調相關之其他疾病(例如神經纖維瘤病、努南氏症候群(NS)、心-面-皮膚症候群(CFC)及1型遺傳性牙齦纖維瘤病)中,亦將預期SOS1抑制劑化合物遞送藥理學益處。
除抑制性效應及功效以外,本文所揭示之化合物亦顯示良好溶解性、微調之DMPK性質及對人類激酶體(kinome)激酶之良好選擇性。此外,該等結構上及合成上新穎的基於吡啶并嘧啶酮之化合物顯示良好之代謝穩定性、降低之細胞色素之時間依賴性抑制風險及可能地降低之一般脫靶可能性。
化合物
現已發現,令人驚訝地,其中基團R1 R4 Ap 具有下文中所給出含義之式(I) 化合物用作SOS1之催化位點與RAS家族蛋白質之相互作用之抑制劑,該相互作用參與控制細胞增殖。因此,本發明之化合物可(例如)用於治療特徵在於過度或異常細胞增殖之疾病。
因此本發明係關於式(I) 化合物
,
其中
[A0]
R1 Ra1
Ra1 係選自由以下組成之群:C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C2-6 烯基、C2-6 炔基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基,其中該C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C2-6 烯基、C2-6 炔基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基全部視情況經一或多個相同或不同的Rb1 及/或Rc1 取代;
每一Rb1 獨立地選自由以下組成之群:-ORc1 、-NRc1 Rc1 、鹵素、-CN、-C(O)Rc1 、-C(O)ORc1 、-C(O)NRc1 Rc1 、-S(O)2 Rc1 、-S(O)2 NRc1 Rc1 、-NHC(O)Rc1 、-N(C1-4 烷基)C(O)Rc1 、-NHC(O)ORc1 及-N(C1-4 烷基)C(O)ORc1
每一Rc1 獨立地選自由以下組成之群:氫、C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C2-6 烯基、C2-6 炔基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基,其中該C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C2-6 烯基、C2-6 炔基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基全部視情況經一或多個相同或不同的Rd1 及/或Re1 取代;
每一Rd1 獨立地選自由以下組成之群:-ORe1 、-NRe1 Re1 、鹵素、-CN、-C(O)Re1 、-C(O)ORe1 、-C(O)NRe1 Re1 、-S(O)2 Re1 、-S(O)2 NRe1 Re1 、-NHC(O)Re1 、-N(C1-4 烷基)C(O)Re1 、-NHC(O)ORe1 及-N(C1-4 烷基)C(O)ORe1
每一Re1 獨立地選自由以下組成之群:氫、C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C2-6 烯基、C2-6 炔基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基;
[B0]
R2 係選自由以下組成之群:氫、C1-4 烷基、C3-6 環烷基、3員至6員雜環基及鹵素;
[C0]
R3 係選自由以下組成之群:氫、C1-4 烷基及C1-4 鹵代烷基;
[D0]
環系統A 係選自由以下組成之群:C6-10 芳基、5員至10員雜芳基及9員至10員二環雜環基;
p 表示1、2或3;
每一R4 獨立地選自由以下組成之群:C1-4 烷基、C2-4 烯基、C2-4 炔基、C1-4 鹵代烷基、羥基-C1-4 烷基、羥基-C1-4 鹵代烷基、C3-6 環烷基、3員至6員雜環基、羥基-C3-6 環烷基、經3員至6員雜環基取代之C1-4 鹵代烷基、經羥基、鹵素、-NH2 、-SO2 -C1-4 烷基及二價取代基=O取代之3員至6員雜環基,而=O可僅係非芳香族環中之取代基;
或其鹽。
在一態樣[A1] 中,本發明係關於式(I) 化合物或其鹽,其中
R1 Ra1
Ra1 係選自由以下組成之群:C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基,其中該C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基全部視情況經一或多個相同或不同的Rb1 及/或Rc1 取代;
每一Rb1 獨立地選自由以下組成之群:-ORc1 、-NRc1 Rc1 、鹵素、-CN、-C(O)Rc1 、-C(O)ORc1 及-C(O)NRc1 Rc1
每一Rc1 獨立地選自由以下組成之群:氫、C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基,其中該C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基全部視情況經一或多個相同或不同的Rd1 及/或Re1 取代;
每一Rd1 獨立地選自由以下組成之群:-ORe1 、-NRe1 Re1 、鹵素、-CN、-C(O)Re1 、-C(O)ORe1 及-C(O)NRe1 Re1
每一Re1 獨立地選自由以下組成之群:氫、C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基。
在另一態樣[A2] 中,本發明係關於式(I) 化合物或其鹽,其中
R1 Ra1
Ra1 係選自由以下組成之群:C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基及5員至10員雜芳基,其中該C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基及5員至10員雜芳基全部視情況經一或多個相同或不同的Rb1 及/或Rc1 取代;
每一Rb1 獨立地選自由以下組成之群:-ORc1 、鹵素及-C(O)NRc1 Rc1
每一Rc1 獨立地選自由以下組成之群:氫、C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基,其中該C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基全部視情況經一或多個相同或不同的Rd1 及/或Re1 取代;
每一Rd1 獨立地選自由-ORe1 及鹵素組成之群;
每一Re1 獨立地選自由氫及C1-6 烷基組成之群。
在另一態樣[A3] 中,本發明係關於式(I) 化合物或其鹽,其中
R1 Ra1
Ra1 係選自由C3-10 環烷基及C4-10 環烯基組成之群,其中該C3-10 環烷基及C4-10 環烯基二者均視情況經一或多個相同或不同的Rb1 及/或Rc1 取代;
每一Rb1 獨立地選自由以下組成之群:-ORc1 、-NRc1 Rc1 、鹵素、-CN、-C(O)Rc1 、-C(O)ORc1 及-C(O)NRc1 Rc1
每一Rc1 獨立地選自由以下組成之群:氫、C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基,其中該C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基全部視情況經一或多個相同或不同的Rd1 及/或Re1 取代;
每一Rd1 獨立地選自由以下組成之群:-ORe1 、-NRe1 Re1 、鹵素、-CN、-C(O)Re1 、-C(O)ORe1 、-C(O)NRe1 Re1
每一Re1 獨立地選自由以下組成之群:氫、C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基。
在另一態樣[A4] 中,本發明係關於式(I) 化合物或其鹽,其中
R1 係C3-8 環烷基,其視情況經一或多個相同或不同的Rb1 及/或Rc1 取代;
每一Rb1 獨立地選自由以下組成之群:-ORc1 、鹵素及-C(O)NRc1 Rc1
每一Rc1 獨立地選自由以下組成之群:氫、C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、3員至8員雜環基、苯基及5員至6員雜芳基,其中該C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、3員至8員雜環基、苯基及5員至6員雜芳基全部視情況經一或多個相同或不同的Rd1 及/或Re1 取代;
每一Rd1 獨立地選自由-ORe1 及鹵素組成之群;
每一Re1 獨立地選自由氫及C1-6 烷基組成之群。
在另一態樣[A5] 中,本發明係關於式(I) 化合物或其鹽,其中
R1 係C3-8 環烷基,其視情況經一或多個選自由以下組成之群之相同或不同的取代基取代:C1-4 烷基、C1-4 鹵代烷基、C1-4 烷氧基-C1-4 烷基、5員至6員雜芳基、苯基、鹵代苯基、鹵素、3員至6員雜環基、-C(O)N(C1-4 烷基)2 及羥基。
在另一態樣[A6] 中,本發明係關於式(I) 化合物或其鹽,其中
R1 係選自

在另一態樣[A7] 中,本發明係關於式(I) 化合物或其鹽,其中
R1 係選自由C1-6 烷基及C1-6 鹵代烷基組成之群。
在另一態樣[A8] 中,本發明係關於式(I) 化合物或其鹽,其中
R1 係選自由C1-4 烷基及C1-4 鹵代烷基組成之群。
在另一態樣[A9] 中,本發明係關於式(I) 化合物或其鹽,其中
R1 係3員至10員雜環基,其視情況經一或多個相同或不同的Rb1 及/或Rc1 取代;
每一Rb1 獨立地選自由以下組成之群:-ORc1 、-NRc1 Rc1 、鹵素、-CN、-C(O)Rc1 、-C(O)ORc1 及-C(O)NRc1 Rc1
每一Rc1 獨立地選自由以下組成之群:氫、C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基,其中該C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基全部視情況經一或多個相同或不同的Rd1 及/或Re1 取代;
每一Rd1 獨立地選自由以下組成之群:-ORe1 、-NRe1 Re1 、鹵素、-CN、-C(O)Re1 、-C(O)ORe1 及-C(O)NRe1 Re1
每一Re1 獨立地選自由以下組成之群:氫、C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基。
在另一態樣[A10] 中,本發明係關於式(I) 化合物或其鹽,其中
R1 係3員至10員雜環基,其視情況經一或多個選自由以下組成之群之相同或不同的取代基取代:C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基及C6-10 芳基。
在另一態樣[A11] 中,本發明係關於式(I) 化合物或其鹽,其中
R1 係3員至8員雜環基,其視情況經一個選自由以下組成之群之取代基取代:C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基及C6-10 芳基。
在另一態樣[A12] 中,本發明係關於式(I) 化合物或其鹽,其中
R1 係選自

在另一態樣[A13] 中,本發明係關於式(I) 化合物或其鹽,其中
R1 係5員至6員雜芳基,其視情況經C1-4 烷基取代。
在另一態樣[B1] 中,本發明係關於式(I) 化合物或其鹽,其中
R2 係氫。
在另一態樣[B2] 中,本發明係關於式(I) 化合物或其鹽,其中
R2 係C1-4 烷基。
在另一態樣[B3] 中,本發明係關於式(I) 化合物或其鹽,其中
R2 係甲基。
在另一態樣[B4] 中,本發明係關於式(I) 化合物或其鹽,其中
R2 係鹵素。
在另一態樣[B5] 中,本發明係關於式(I) 化合物或其鹽,其中
R2 係選自由氟及溴組成之群;
在另一態樣[B6] 中,本發明係關於式(I) 化合物或其鹽,其中
R2 係氟。
在另一態樣[B7] 中,本發明係關於式(I) 化合物或其鹽,其中
R2 係C3-5 環烷基。
在另一態樣[B8] 中,本發明係關於式(I) 化合物或其鹽,其中
R2 係環丙基。
在另一態樣[C1] 中,本發明係關於式(I) 化合物或其鹽,其中
R3 係氫。
在另一態樣[C2] 中,本發明係關於式(I) 化合物或其鹽,其中
R3 係C1-4 烷基。
在另一態樣[C3] 中,本發明係關於式(I) 化合物或其鹽,其中
R3 係甲基。
在另一態樣[D1] 中,本發明係關於式(I) 化合物或其鹽,其中
環系統A 係選自由以下組成之群:C6-10 芳基、5員至10員雜芳基及9員至10員二環雜環基;
p 表示1或2;
每一R4 獨立地選自由以下組成之群:C1-4 烷基、C2-4 炔基、C1-4 鹵代烷基、羥基-C1-4 鹵代烷基、經3員至6員雜環基、鹵素及二價取代基=O取代之C1-4 鹵代烷基,而=O可僅係非芳香族環中之取代基。
在另一態樣[D2] 中,本發明係關於式(I) 化合物或其鹽,其中
環系統A 係選自由C6-10 芳基及9員至10員二環雜環基組成之群;
p 表示1或2;
每一R4 獨立地選自由以下組成之群:C1-4 烷基、C2-4 炔基、C1-4 鹵代烷基、羥基-C1-4 鹵代烷基、經3員至6員雜環基、鹵素及二價取代基=O取代之C1-4 鹵代烷基,而=O可僅係非芳香族環中之取代基。
在另一態樣[D3] 中,本發明係關於式(I) 化合物或其鹽,其中
Ap 個取代基R4 一起具有亞結構

RA 係選自由以下組成之群:C1-4 烷基、C1-4 鹵代烷基、羥基-C1-4 烷基、羥基-C1-4 鹵代烷基、經3員至6員雜環基取代之C1-4 鹵代烷基、C3-6 環烷基、羥基-C3-6 環烷基、3員至6員雜環基、3員至6員羥基-雜環基、鹵素及-SO2 -C1-4 烷基;
RB 係選自由氫及-NH2 組成之群;
RC 係選自由以下組成之群:氫、C1-4 烷基及鹵素;

RA RC 與其所連接之碳原子一起形成5員至6員非芳香族碳環、5員至6員非芳香族雜環或5員至6員雜芳基,其中該5員至6員非芳香族碳環、5員至6員非芳香族雜環及5員至6員雜芳基全部視情況經一或多個鹵素或經側氧基取代。
在另一態樣[D4] 中,本發明係關於式(I) 化合物或其鹽,其中
Ap 個取代基R4 一起具有亞結構

RA 係選自由以下組成之群:C1-4 烷基、C1-4 鹵代烷基、羥基-C1-4 烷基、羥基-C1-4 鹵代烷基、經3員至6員雜環基取代之C1-4 鹵代烷基、C3-6 環烷基、羥基-C3-6 環烷基、3員至6員雜環基、3員至6員羥基-雜環基、鹵素及-SO2 -C1-4 烷基;
RB 係選自由氫及-NH2 組成之群;
RC 係選自由以下組成之群:氫、C1-4 烷基及鹵素;

RA RC 與其所連接之碳原子一起形成5員至6員非芳香族碳環或5員至6員非芳香族雜環,其中該5員至6員非芳香族碳環及該5員至6員非芳香族雜環二者均視情況經一或多個鹵素或經側氧基取代。
在另一態樣[D5] 中,本發明係關於式(I) 化合物或其鹽,其中
Ap 個取代基R4 一起具有亞結構

RA 係選自由以下組成之群:C1-4 鹵代烷基、羥基-C1-4 鹵代烷基及經3員至6員雜環基取代之C1-4 鹵代烷基;
RB 係氫;
RC 係選自由以下組成之群:氫、C1-4 烷基及氟;

RA RC 與其所連接之碳原子一起形成5員至6員非芳香族碳環、5員至6員非芳香族雜環或5員至6員雜芳基,其中該5員至6員非芳香族碳環、5員至6員非芳香族雜環及5員至6員雜芳基全部均視情況經一或多個氟或經側氧基取代。
在另一態樣[D6] 中,本發明係關於式(I) 化合物或其鹽,其中
Ap 個取代基R4 一起具有亞結構

RA 係選自由以下組成之群:C1-4 鹵代烷基、羥基-C1-4 鹵代烷基及經3員至6員雜環基取代之C1-4 鹵代烷基;
RB 係氫;
RC 係選自由以下組成之群:氫、C1-4 烷基及氟;

RA RC 與其所連接之碳原子一起形成5員至6員非芳香族碳環或5員至6員非芳香族雜環,其中該5員至6員非芳香族碳環及該5員至6員非芳香族雜環二者均視情況經一或多個氟或經側氧基取代。
在另一態樣[D7] 中,本發明係關於式(I) 化合物或其鹽,其中
Ap 個取代基R4 一起係選自:

在另一態樣[D8] 中,本發明係關於式(I) 化合物或其鹽,其中
Ap 個取代基R4 一起係選自:

所有上文所提及之結構態樣[A1][A13][B1][B8] [C1][C3][D1][D8] 均分別係相應態樣[A0][B0][C0][D0] 之較佳實施例。與本發明之化合物(I) 之不同分子部分相關之結構態樣[A0][A13][B0][B8][C0][C3] 及[D0][D8] 可彼此視需要以組合[A][B][C][D] 進行組合以獲得較佳化合物(I) 。每一組合[A][B][C][D] 表示且界定本發明之化合物(I) 之個別實施例或通用子集。
本發明具有結構(I) 之較佳實施例係實例化合物I-1I-179 及其任一子集。
本文中一般定義以及明確揭示之所有合成中間體及其鹽亦係本發明之一部分。
本文中一般定義或明確揭示之所有個別合成反應步驟以及包含該等個別合成反應步驟之反應順序亦係本發明之一部分。
本發明進一步係關於式(I) 化合物之水合物、溶劑合物、多晶型、代謝物、衍生物、異構物及前藥(包括其全部實施例)。
本發明進一步係關於式(I) 化合物之水合物(包括其全部實施例)。
本發明進一步係關於式(I) 化合物之溶劑合物(包括其全部實施例)。
具有(例如)酯基之式(I) 化合物(包括其全部實施例)係潛在前藥,在生理條件下裂解之酯亦係本發明之一部分。
本發明進一步係關於式(I) 化合物之醫藥上可接受之鹽(包括其全部實施例)。
本發明進一步係關於式(I) 化合物(包括其全部實施例)與無機或有機酸或鹼之醫藥上可接受之鹽。
醫學應用 - 治療方法
本發明係關於SOS1抑制劑化合物、尤其式(I) 化合物(包括其全部實施例),其可用於治療及/或預防與SOS1相關或由SOS1調節、尤其其中抑制SOS1與RAS家族蛋白質及/或RAC1之相互作用具有治療益處之疾病及/或病狀,包括(但不限於)癌症之治療及/或預防。
在另一態樣中,本發明係關於式(I) 化合物或其醫藥上可接受之鹽,其用作藥劑。
在另一態樣中,本發明係關於式(I) 化合物或其醫藥上可接受之鹽,其用於治療人類或動物體之方法中。
在另一態樣中,本發明係關於SOS1抑制劑化合物、尤其式(I) 化合物,或其醫藥上可接受之鹽,其用於治療及/或預防其中抑制SOS1與RAS家族蛋白質及/或RAC1之相互作用具有治療益處之疾病及/或病狀,包括(但不限於)癌症之治療及/或預防。
在另一態樣中,本發明係關於SOS1抑制劑化合物、尤其式(I) 化合物,或其醫藥上可接受之鹽,其用於癌症之治療及/或預防。
在另一態樣中,本發明係關於SOS1抑制劑化合物、尤其式(I) 化合物,或其醫藥上可接受之鹽,其用於治療及/或預防人類或動物體癌症之方法中。
在另一態樣中,本發明係關於SOS1抑制劑化合物、尤其式(I) 化合物,或其醫藥上可接受之鹽,其用於治療及/或預防人類或動物體癌症之方法中。
在另一態樣中,本發明係關於如上文所定義使用之SOS1抑制劑化合物或其醫藥上可接受之鹽,其中該SOS1抑制劑化合物係在至少一種其他藥理學活性物質之前、之後或與其一起投與。
在另一態樣中,本發明係關於如上文所定義使用之式(I) 化合物或其醫藥上可接受之鹽,其中該化合物係在至少一種其他藥理學活性物質之前、之後或與其一起投與。
在另一態樣中,本發明係關於如上文所定義使用之SOS1抑制劑化合物或其醫藥上可接受之鹽,其中該SOS1抑制劑化合物係與至少一種其他藥理學活性物質組合投與。
在另一態樣中,本發明係關於如上文所定義使用之式(I) 化合物或其醫藥上可接受之鹽,其中該化合物係與至少一種其他藥理學活性物質組合投與。
在另一態樣中,本發明係關於經製備用於在SOS1抑制劑化合物之前、之後或與其一起投與之藥理學活性物質或其醫藥上可接受之鹽,其如上文針對式(I) 化合物之使用所定義來使用。
在另一態樣中,本發明係關於經製備用於在式(I) 化合物之前、之後或與其一起投與之藥理學活性物質或其醫藥上可接受之鹽,其如上文針對式(I) 化合物之使用所定義來使用。
在另一態樣中,本發明係關於SOS1抑制劑化合物、尤其式(I) 化合物,或其醫藥上可接受之鹽,其用於如上文所定義之治療或治療方法中。
在另一態樣中,本發明係關於SOS1抑制劑化合物、尤其式(I) 化合物,或其醫藥上可接受之鹽之用途,其用於製備用於治療及/或預防癌症之醫藥組合物。
在另一態樣中,本發明係關於如上文所定義之SOS1抑制劑化合物或其醫藥上可接受之鹽之用途,其中該SOS1抑制劑化合物係在至少一種其他藥理學活性物質之前、之後或與其一起投與。
在另一態樣中,本發明係關於如上文所定義之式(I) 化合物或其醫藥上可接受之鹽之用途,其中該化合物係在至少一種其他藥理學活性物質之前、之後或與其一起投與。
在另一態樣中,本發明係關於如上文所定義之SOS1抑制劑化合物、尤其式(I) 化合物,或其醫藥上可接受之鹽之用途,其用於治療。
在另一態樣中,本發明係關於用於治療及/或預防其中抑制SOS1與RAS家族蛋白質或RAC1之相互作用具有治療益處之疾病及/或病狀之方法,其包含向人類投與治療有效量之SOS1抑制劑化合物、尤其式(I) 化合物,或其醫藥上可接受之鹽。
在另一態樣中,本發明係關於用於治療及/或預防癌症之方法,其包含向人類投與治療有效量之SOS1抑制劑化合物、尤其式(I) 化合物,或其醫藥上可接受之鹽。
在另一態樣中,本發明係關於如上文所定義之方法,其中該SOS1抑制劑化合物或其醫藥上可接受之鹽係在至少一種其他藥理學活性物質之前、之後或與其一起投與。
在另一態樣中,本發明係關於如上文所定義之方法,其中該式(I) 化合物或其醫藥上可接受之鹽係在至少一種其他藥理學活性物質之前、之後或與其一起投與。
在另一態樣中,本發明係關於如上文所定義之方法,其中該SOS1抑制劑化合物或其醫藥上可接受之鹽係與治療有效量之至少一種其他藥理學活性物質組合投與。
在另一態樣中,本發明係關於如上文所定義之方法,其中該式(I) 化合物或其醫藥上可接受之鹽係與治療有效量之至少一種其他藥理學活性物質組合投與。
在另一態樣中,本發明係關於如上文所定義之治療方法。
在另一態樣中,本發明係關於套組,其包含
• 第一醫藥組合物或劑型,其包含SOS1抑制劑化合物及視情況一或多種醫藥上可接受之載劑、賦形劑及/或媒劑,及
• 至少第二醫藥組合物或劑型,其包含另一藥理學活性物質及視情況一或多種醫藥上可接受之載劑、賦形劑及/或媒劑。
在另一態樣中,本發明係關於套組,其包含
• 第一醫藥組合物或劑型,其包含式(I) 化合物及視情況一或多種醫藥上可接受之載劑、賦形劑及/或媒劑,及
• 至少第二醫藥組合物或劑型,其包含另一藥理學活性物質及視情況一或多種醫藥上可接受之載劑、賦形劑及/或媒劑。
在另一態樣中,本發明係關於醫藥組合物,其包含至少一種(較佳地一種)式(I) 化合物或其醫藥上可接受之鹽,及一或多種醫藥上可接受之賦形劑。
在另一態樣中,本發明係關於醫藥製劑,包含式(I) 化合物或其醫藥上可接受之鹽,及至少一種(較佳地一種)其他藥理學活性物質。
在另一態樣中,欲與SOS1抑制劑化合物、尤其式(I) 化合物(包括化合物(I) 之所有個別實施例或一般子集)一起/組合使用或在如本文(上文及下文)所定義之醫學應用、用途、治療及/或預防方法中使用之藥理學活性物質可選自以下中之任一或多者(較佳地在所有該等實施例中僅使用一種其他藥理學活性物質):
1. EGFR / 或其突變體之抑制劑
a. 例如阿法替尼(afatinib)、厄洛替尼(erlotinib)、吉非替尼(gefitinib)、拉帕替尼(lapatinib)、西妥昔單抗、帕尼單抗、奧希替尼、奧莫替尼(olmutinib)、EGF-816;
b. 較佳者係阿法替尼、奧希替尼及西妥昔單抗;
c. 最佳者係阿法替尼
2. ErbB2 (Her2) / 或其突變體之抑制劑
a. 例如阿法替尼、拉帕替尼、曲妥珠單抗(trastuzumab)、帕妥珠單抗(pertuzumab);
b. 較佳者係阿法替尼及曲妥珠單抗;
c. 最佳者係曲妥珠單抗;
3. ALK / 或其 突變體之抑制劑
a. 例如克唑替尼(crizotinib)、阿雷替尼(alectinib)、恩曲替尼(entrectinib)、布吉替尼(brigatinib);
b. 較佳者係克唑替尼及阿雷替尼;
c. 最佳者係克唑替尼;
4. MEK / 或其 突變體之抑制劑
a. 例如曲美替尼(trametinib)、考比替尼(cobimetinib)、貝美替尼(binimetinib)、司美替尼(selumetinib)、瑞法替尼(refametinib);
b. 較佳者係曲美替尼及考比替尼;
c. 最佳者係曲美替尼;
5. GDP 結合 KRAS / 或其 突變體之抑制劑
a. KRAS G12C之不可逆抑制劑
i. 例如ARS-853 (WO 2014/152588中之化合物V-64)、WO 2016/044772中之實例I-272;
b. GDP結合KRAS及/或其突變體之可逆抑制劑;
6. BCR-ABL / 或其 突變體之抑制劑
a. 例如伊馬替尼(imatinib)、達沙替尼(dasatinib)、尼羅替尼(nilotinib);
b. 較佳者係伊馬替尼及尼羅替尼;
c. 最佳者係伊馬替尼;
7. FGFR1 / FGFR2 / FGFR3 / 或其 突變體之抑制劑
a. 例如尼達尼布(nintedanib);
8. ROS1 / 或其 突變體之抑制劑
a. 例如克唑替尼、恩曲替尼、勞拉替尼(lorlatinib)、色瑞替尼(ceritinib)、美樂替尼(merestinib);
b. 較佳者係克唑替尼及恩曲替尼;
c. 最佳者係克唑替尼;
9. c-MET / 或其 突變體之抑制劑
10. AXL / 或其 突變體之抑制劑
11. NTRK1 / 或其 突變體之抑制劑
12. RET / 或其 突變體之抑制劑
13. 紫杉烷
a. 例如太平洋紫杉醇(paclitaxel)、nab-太平洋紫杉醇、多西他賽(docetaxel);
b. 較佳者係太平洋紫杉醇;
14. 含鉑 化合物
a. 例如順鉑(cisplatin)、卡鉑(carboplatin)、奧沙利鉑(oxaliplatin);
15. 抗代謝物
a. 例如5-氟尿嘧啶、卡培他濱(capecitabine)、氟尿苷、阿糖胞苷(cytarabine)、吉西他濱(gemcitabine)、曲氟尿苷(trifluridine)及替比嘧啶(tipiracil)之組合(= TAS102);
b. 較佳者係吉西他濱;
16. 有絲分裂激酶 抑制
a. 例如CDK4/6抑制劑
i. 例如帕博西尼(palbociclib)、瑞博西尼(ribociclib)、阿貝西尼(abemaciclib);
ii. 較佳者係帕博西尼及阿貝西尼;
iii. 最佳者係阿貝西尼;
17. 免疫治療
a. 例如免疫檢驗點抑制劑
i. 例如抗CTLA4 mAb、抗PD1 mAb、抗PD-L1 mAb、抗PD-L2 mAb、抗LAG3 mAb、抗TIM3 mAb;
ii. 較佳係抗PD1 mAb;
iii. 例如伊匹單抗(ipilimumab)、尼沃魯單抗(nivolumab)、派姆單抗(pembrolizumab)、阿替珠單抗(atezolizumab)、阿維魯單抗(avelumab)、德瓦魯單抗(durvalumab)、匹利珠單抗(pidilizumab)、PDR-001 (=斯帕珠單抗(spartalizumab));
iv. 較佳者係尼沃魯單抗、派姆單抗及PDR-001 (=斯帕珠單抗);
v. 最佳者係派姆單抗;
18. 血管生成 藥物
a. 例如貝伐珠單抗(bevacizumab)、尼達尼布;
b. 最佳者係貝伐珠單抗;
19. 拓撲異構酶 抑制
a. 例如伊立替康(irinotecan)、脂質體伊立替康、托泊替康(topotecan);
b. 最佳者係伊立替康;
20. A-Raf / B-Raf / C-Raf / 或其 突變體之抑制劑
a. 例如RAF-709 (= WO 2014/151616中之實例131)、LY-3009120 (= WO 2013/134243中之實例1);
21. ERK / 或其突變體之抑制劑
a. 例如烏利替尼(ulixertinib);
22. 細胞凋亡調控劑
a. 例如p53 (較佳地功能性p53、最佳地wt p53)與MDM2 (「MDM2抑制劑」)之間的相互作用之抑制劑;
i. 例如HDM-201、NVP-CGM097、RG-7112、MK-8242、RG-7388、SAR405838、AMG-232、DS-3032、RG-7775、APG-115;
ii. 較佳者係HDM-201、RG-7388及AMG-232
b. 例如PARP抑制劑;
c. 例如MCL-1抑制劑;
23.m TOR 之抑制劑
a. 例如雷帕黴素、替西羅莫司(temsirolimus)、依維莫司(everolimus)、利達莫司(ridaforolimus);
24. 後生調控劑
a. 例如BET抑制劑
i. 例如JQ-1、GSK 525762、OTX 015 (= MK8628)、CPI 0610、TEN-010 (= RO6870810);
b. 例如CDK9抑制劑;
25. IGF1/2 / IGF1-R 之抑制劑
a. 例如疝托珠單抗(xentuzumab)(WO 2010/066868中之抗體60833)、MEDI-573 (=杜昔妥單抗(dusigitumab));
26. RAS GEF / 或其突變體之抑制劑
a. 例如SOS2及/或其突變體之抑制劑
27. PI3K / 或其突變體之抑制劑
在本發明中,應理解,根據本發明使用之組合、組合物、套組、方法、用途或化合物可設想為活性成分或組分之同時、並行、依序、相繼、交替或單獨投與。應瞭解,SOS1抑制劑化合物(例如式(I) 化合物)及至少一種其他藥理學活性物質可依賴地或獨立地調配投與,例如SOS1抑制劑化合物(例如式(I) 化合物)及至少一種其他藥理學活性物質可作為同一醫藥組合物/劑型之一部分或較佳地以分開之醫藥組合物/劑型投與。
在此背景中,本發明意義內之「組合」或「經組合」包括(但不限於)自一種以上活性成分之混合或組合產生之產物,且包括固定及非固定(例如游離)組合二者(包括套組)及用途,例如同時、並行、依序、相繼、交替或單獨使用組分或成分。術語「固定組合」意指同時以單一實體或劑量之形式向患者投與兩種活性成分。術語「非固定組合」意指兩種活性成分作為分開的實體同時、並行或依序且無具體時間限制地投與患者,其中此投與在患者體內提供治療有效含量之兩種化合物。
SOS1抑制劑化合物(例如式(I) 化合物)及至少一種其他藥理學活性物質之投與可藉由共投與活性組分或成分來進行,例如藉由以一個單一調配物或劑型或以兩個或更多個分開的調配物或劑型同時或並行地向其投與。或者,SOS1抑制劑化合物(例如式(I) 化合物)及至少一種其他藥理學活性物質之投與可藉由依序或交替地投與活性組分或成分來進行,例如以兩個或更多個分開的調配物或劑型。
舉例而言,同時投與包括實質上同時投與。此投與形式亦可稱為「伴隨」投與。並行投與包括在相同一般時間段內投與活性劑,例如在同一天但不一定在同一時間。交替投與包括在一段時間期間(例如在幾天或一週過程內)投與一種藥劑,之後在隨後一段時間期間(例如在幾天或一週過程內)投與一或多種其他藥劑,且然後將此模式重複一或多個循環。依序或相繼投與包括在第一時間段期間(例如在幾天或一週過程內)使用一或多個劑量投與一種藥劑,之後在第二及/或另一時間段期間(例如在幾天或一週過程內)使用一或多個劑量投與一或多種其他藥劑。亦可採用重疊時間表,其包括在治療期內之不同日期投與活性劑,而不一定按照常規順序。亦可採用該等一般指南之變化形式,例如根據所使用之藥劑及個體之狀況。
本發明組合之要素可藉由熟習此項技術者所習知之方法來投與(無論依賴地或獨立地),例如藉由經口、經腸、非經腸(例如肌內、腹膜內、靜脈內、經皮或皮下注射或植入)、經鼻、經陰道、直腸或局部投與途徑,且可單獨或一起調配成含有適於每一投與途徑之習用無毒醫藥上可接受之載劑、賦形劑及/或媒劑之適宜劑量單元調配物。
因此,在本發明之一態樣中,本發明提供用於治療及/或預防癌症之方法,其包含向有需要之患者投與治療有效量之SOS1抑制劑化合物(例如式(I) 化合物)及治療有效量之至少一種其他藥理學活性物質,其中該SOS1抑制劑化合物(例如式(I) 化合物)係與該至少一種其他藥理學活性物質同時、並行、依序、相繼、交替或分開投與。
在另一態樣中,本發明提供用於治療及/或預防癌症之SOS1抑制劑化合物(例如式(I) 化合物),其中該SOS1抑制劑化合物(例如式(I) 化合物)係與該至少一種其他藥理學活性物質同時、並行、依序、相繼、交替或分開投與。
在另一態樣中,本發明提供套組,其包含
• 第一醫藥組合物或劑型,其包含SOS1抑制劑化合物(例如式(I) 化合物)及視情況一或多種醫藥上可接受之載劑、賦形劑及/或媒劑,及
• 至少第二醫藥組合物或劑型,其包含另一藥理學活性物質及視情況一或多種醫藥上可接受之載劑、賦形劑及/或媒劑,
其用於治療及/或預防癌症,其中該第一醫藥組合物係與該第二及/或另一醫藥組合物或劑型同時、並行、依序、相繼、交替或分開投與。
在本發明之另一實施例中,根據本發明使用之組合、套組、用途、方法及化合物(包括全部實施例)之組分(即組合夥伴)係同時投與。
在本發明之另一實施例中,根據本發明使用之組合、套組、用途、方法及化合物(包括全部實施例)之組分(即組合夥伴)係並行投與。
在本發明之另一實施例中,根據本發明使用之組合、套組、用途、方法及化合物(包括全部實施例)之組分(即組合夥伴)係依序投與。
在本發明之另一實施例中,根據本發明使用之組合、套組、用途、方法及化合物(包括全部實施例)之組分(即組合夥伴)係相繼投與。
在本發明之另一實施例中,根據本發明使用之組合、套組、用途、方法及化合物(包括全部實施例)之組分(即組合夥伴)係交替投與。
在本發明之另一實施例中,根據本發明使用之組合、套組、用途、方法及化合物(包括全部實施例)之組分(即組合夥伴)係分開投與。
欲投與之一或多種活性化合物之「治療有效量」係預防、改善或治療疾病或病症所需之最小量。
本發明之組合可以治療有效之單一或分開之日劑量投與。組合之活性組分可以在單一療法中治療有效之此等劑量投與,或以低於在單一療法中所使用之劑量但在組合時產生期望(聯合)治療有效量之此等劑量投與。
在另一態樣中,欲利用如本文(上文及下文)所定義之SOS1抑制劑化合物、使用SOS1抑制劑化合物、式(I) 化合物、使用式(I) 化合物、製備之用途及治療及/或預防之方法來治療/預防之疾病/病狀/癌症係選自由以下組成之群:胰臟癌、肺癌、結腸直腸癌、膽道癌、多發性骨髓瘤、黑色素瘤、子宮癌、子宮內膜癌、甲狀腺癌、急性髓性白血病、膀胱癌、尿路上皮癌、胃癌、子宮頸癌、頭頸部鱗狀細胞癌、瀰漫性大B細胞淋巴瘤、食道癌、慢性淋巴球性白血病、肝細胞癌、乳癌、卵巢癌、前列腺癌、神經膠母細胞瘤、腎癌及肉瘤。
在另一態樣中,欲利用如本文(上文及下文)所定義之SOS1抑制劑化合物、用於應用之SOS1抑制劑化合物、式(I) 化合物、用於應用之式(I) 化合物、用於製備之應用及治療及/或預防之方法治療/預防之疾病/病狀/癌症係選自由以下組成之群:胰臟癌、肺癌(較佳非小細胞肺癌(NSCLC))、膽道癌及結腸直腸癌。
在另一態樣中,欲利用如本文(上文及下文)所定義之SOS1抑制劑化合物、用於應用之SOS1抑制劑化合物、式(I) 化合物、用於應用之式(I) 化合物、用於製備之應用及治療及/或預防之方法治療/預防之疾病/病狀係RAS病變,較佳係選自由以下組成之群:1型神經纖維瘤病(NF1)、努南氏症候群(NS)、多發雀斑樣痣型努南氏症候群(Noonan Syndrome with Multiple Lentigines,NSML)(亦稱為LEOPARD症候群)、毛細血管畸形-動靜脈畸形症候群(CM-AVM)、克斯提洛氏症候群(Costello Syndrome,CS)、心-面-皮膚症候群(CFC)、雷吉士症候群(Legius Syndrome)(亦稱為NF1樣症候群)及遺傳性牙齦纖維瘤病。
在另一態樣中,欲利用如本文(上文及下文)所定義之SOS1抑制劑化合物、用於應用之SOS1抑制劑化合物、式(I) 化合物、用於應用之式(I) 化合物、用於製備之應用及治療及/或預防之方法治療/預防之疾病/病狀/癌症係定義為展現以下分子特徵中之一或多者之疾病/病狀/癌症:
1. KRAS 改變
a. KRAS擴增(wt 或突變體);
b. KRAS過表現(wt 或突變體);
c. 一或多種KRAS突變:
i. G12突變(例如G12C、G12V、G12S、G12A、G12V、G12R、G12F、G12D);
ii. G13突變(例如G13C、G13D、G13R、G13V、G13S、G13A)
iii. T35突變(例如T35I);
iv. I36突變(例如I36L、I36M);
v. E49突變(例如E49K);
vi. Q61突變(例如Q61H、Q61R、Q61P、Q61E、Q61K、Q61L、Q61K);
vii. K117突變(例如K117N);
viii. A146突變(例如A146T、A146V);
2. NRAS 改變:
a. NRAS擴增(wt 或突變體);
b. NRAS過表現(wt 或突變體);
c. 一或多種NRAS突變:
i. G12突變(例如G12A、G12V、G12D、G12C、G12S、G12R);
ii. G13突變(例如G13V、G13D、G13R、G13S、G13C、G13A);
iii. Q61突變(例如Q61K、Q61L、Q61H、Q61P、Q61R);
iv. A146突變(例如A146T、A146V);
3. HRAS 改變:
a. HRAS擴增(wt 或突變體);
b. HRAS過表現(wt 或突變體);
c. 一或多種HRAS突變;
i. G12突變(例如G12C、G12V、G12S、G12A、G12V、G12R、G12F、G12D);
ii. G13突變(例如G13C、G13D、G13R、G13V、G13S、G13A);
iii. Q61突變(例如Q61K、Q61L、Q61H、Q61P、Q61R);
4. EGFR 改變:
a. EGFR擴增(wt 或突變體);
b. EGFR過表現(wt 或突變體);
c. 一或多種EGFR突變
i. 例如外顯子20插入、外顯子19缺失(Del19)、G719X (例如G719A、G719C、G719S)、T790M、C797S、T854A、L858R、L861Q或其任一組合;
5. ErbB2 (Her2) 改變:
a. ErbB2擴增;
b. ErbB2過表現;
c. 一或多種ErbB2突變
i. 例如R678、G309、L755、D769、D769、V777、P780、V842、R896、c.2264_2278del (L755_T759del)、c.2339_2340ins (G778_P780dup)、S310;
6. c-MET 改變
a. c-MET擴增;
b. c-MET過表現;
c. 一或多種c-MET突變
i. 例如E168、N375、Q648、A887、E908、T1010、V1088、H1112、R1166、R1188、Y1248、Y1253、M1268、D1304、A1357、P1382;
7. AXL 改變:
a. AXL擴增;
b. AXL過表現;
8. BCR-ABL 改變:
a. 涉及ABL基因之染色體重排;
9. ALK 改變:
a. ALK擴增;
b. ALK過表現;
c. 一或多種ALK突變
i. 例如1151Tins、L1152R、C1156Y、F1174L、L1196M、L1198F、G1202R、S1206Y、G1269A;
d. 涉及ALK基因之染色體重排;
10. FGFR1 改變
a. FGFR1擴增;
b. FGFR1過表現;
11. FGFR2 改變
a. FGFR2擴增;
b. FGFR2過表現;
12. FGFR3 改變
a. FGFR3擴增;
b. FGFR3過表現;
c. 涉及FGFR3基因之染色體重排;
13. NTRK1 改變
a. 涉及NTRK1基因之染色體重排;
14. NF1 改變
a. 一或多種NF1突變;
15. RET 改變
a. RET擴增;
b. RET過表現;
c. 涉及RET基因之染色體重排
16. ROS1 改變
a. ROS1擴增;
b. ROS1過表現;
c. 一或多種ROS1突變
i. 例如G2032R、D2033N、L2155S;
d. 涉及ROS1基因之染色體重排;
17. SOS1 改變
a. SOS1擴增;
b. SOS1過表現;
c. 一或多種SOS1突變;
18. RAC1 改變
a. RAC1擴增;
b. RAC1過表現;
c. 一或多種RAC1突變;
19. MDM2 改變
a. MDM2擴增
b. MDM2過表現
c. MDM2擴增與功能性p53組合
d. MDM2擴增與野生型p53組合
20. RAS 野生型
a. KRAS野生型
b. HRAS野生型
c. NRAS野生型
21. V600E 以外之一或多種 B-Raf 突變
尤佳地,欲利用如本文(上文及下文)所定義之SOS1抑制劑化合物、用於應用之SOS1抑制劑化合物、式(I) 化合物、用於應用之式(I) 化合物、用於製備之應用及治療及/或預防之方法治療/預防之癌症係選自由以下組成之群:
• 具有選自由以下組成之群之KRAS突變之肺腺癌:G12C、G12V、G12D及G12R;
• 具有選自由以下組成之群之KRAS突變之結腸直腸腺癌:G12D、G12V、G12C、G12R及G13D;及
• 具有選自由以下組成之群之KRAS突變之胰臟腺癌:G12D、G12V、G12R、G12C及Q61H。
如本文所揭示或定義之任一疾病/病狀/癌症、醫學應用、用途、治療及/或預防之方法(包括分子/遺傳特徵)可利用如本文所揭示或定義之任一式(I) 化合物(包括化合物(I) 之所有個別實施例或一般子集)來治療/實施。
定義
本文中未明確定義之術語應具有熟習此項技術者根據本揭示內容及上下文針對該等術語所給出之含義。然而,除非作出相反指定,否則如本說明書中所使用,以下術語具有所指示之含義且遵守以下慣例。
使用前綴Cx-y (其中xy 每一表示正整數(xy ))指示,以直接關聯指定並提及之作為整體之鏈或環結構或鏈及環結構之組合可由最多y 個且最少x 個碳原子組成。
含有一或多個雜原子之基團(例如雜芳基、雜芳基烷基、雜環基、雜環基烷基)中之成員數之指示係指所有環成員之原子總數或所有環及碳鏈成員之總和。
由碳鏈及碳環結構之組合組成之基團(例如環烷基烷基、芳基烷基)中之碳原子數之指示係指所有碳環及碳鏈成員之碳原子之總數。顯然,環結構具有至少三個成員。
一般而言,對於包含兩個或更多個子基之基團(例如雜芳基烷基、雜環基烷基、環烷基烷基、芳基烷基),最後命名之子基係基團連接點,例如取代基芳基-C1-6 烷基意指結合至C1-6 烷基之芳基,該C1-6 烷基結合至核心或結合至該取代基所連接之基團。
在如HO、H2 N、(O)S、(O)2 S、NC (氰基)、HOOC、F3 C或諸如此類等基團中,熟習此項技術者可自基團自身之自由價看到與分子之一或多個基團連接點。
烷基 表示可以直鏈(無支鏈)及具支鏈形式二者存在之單價、飽和烴鏈。若烷基 經取代,則取代可在所有攜帶氫之碳原子上彼此獨立地在每一情形下藉由單取代或多取代進行。
術語「C1-5 烷基」包括(例如) H3 C-、H3 C-CH2 -、H3 C-CH2 -CH2 -、H3 C-CH(CH3 )-、H3 C-CH2 -CH2 -CH2 -、H3 C-CH2 -CH(CH3 )-、H3 C-CH(CH3 )-CH2 -、H3 C-C(CH3 )2 -、H3 C-CH2 -CH2 -CH2 -CH2 -、H3 C-CH2 -CH2 -CH(CH3 )-、H3 C-CH2 -CH(CH3 )-CH2 -、H3 C-CH(CH3 )-CH2 -CH2 -、H3 C-CH2 -C(CH3 )2 -、H3 C-C(CH3 )2 -CH2 -、H3 C-CH(CH3 )-CH(CH3 )-及H3 C-CH2 -CH(CH2 CH3 )-。
烷基 之其他實例係甲基(Me;-CH3 )、乙基(Et;-CH2 CH3 )、1-丙基(正丙基;n -Pr;-CH2 CH2 CH3 )、2-丙基(i -Pr;異丙基;-CH(CH3 )2 )、1-丁基(正丁基;n -Bu;-CH2 CH2 CH2 CH3 )、2-甲基-1-丙基(異丁基;i -Bu;-CH2 CH(CH3 )2 )、2-丁基(第二丁基;sec -Bu;-CH(CH3 )CH2 CH3 )、2-甲基-2-丙基(第三丁基;t -Bu;-C(CH3 )3 )、1-戊基(正戊基;-CH2 CH2 CH2 CH2 CH3 )、2-戊基(-CH(CH3 )CH2 CH2 CH3 )、3-戊基(-CH(CH2 CH3 )2 )、3-甲基-1-丁基(異戊基;-CH2 CH2 CH(CH3 )2 )、2-甲基-2-丁基(-C(CH3 )2 CH2 CH3 )、3-甲基-2-丁基(-CH(CH3 )CH(CH3 )2 )、2,2-二甲基-1-丙基(新戊基;-CH2 C(CH3 )3 )、2-甲基-1-丁基(-CH2 CH(CH3 )CH2 CH3 )、1-己基(正己基;-CH2 CH2 CH2 CH2 CH2 CH3 )、2-己基(-CH(CH3 )CH2 CH2 CH2 CH3 )、3-己基(-CH(CH2 CH3 )(CH2 CH2 CH3 ))、2-甲基-2-戊基(-C(CH3 )2 CH2 CH2 CH3 )、3-甲基-2-戊基(-CH(CH3 )CH(CH3 )CH2 CH3 )、4-甲基-2-戊基(-CH(CH3 )CH2 CH(CH3 )2 )、3-甲基-3-戊基(-C(CH3 )(CH2 CH3 )2 )、2-甲基-3-戊基(-CH(CH2 CH3 )CH(CH3 )2 )、2,3-二甲基-2-丁基(-C(CH3 )2 CH(CH3 )2 )、3,3-二甲基-2-丁基(-CH(CH3 )C(CH3 )3 )、2,3-二甲基-1-丁基(-CH2 CH(CH3 )CH(CH3 )CH3 )、2,2-二甲基-1-丁基(-CH2 C(CH3 )2 CH2 CH3 )、3,3-二甲基-1-丁基(-CH2 CH2 C(CH3 )3 )、2-甲基-1-戊基(-CH2 CH(CH3 )CH2 CH2 CH3 )、3-甲基-1-戊基(-CH2 CH2 CH(CH3 )CH2 CH3 )、1-庚基(正庚基)、2-甲基-1-己基、3-甲基-1-己基、2,2-二甲基-1-戊基、2,3-二甲基-1-戊基、2,4-二甲基-1-戊基、3,3-二甲基-1-戊基、2,2,3-三甲基-1-丁基、3-乙基-1-戊基、1-辛基(正辛基)、1-壬基(正壬基);1-癸基(正癸基)等。
術語丙基、丁基、戊基、己基、庚基、辛基、壬基、癸基等無任何其他定義時意指具有相應碳原子數之飽和烴基,其中包括所有異構形式。
烷基 為另一(組合)基團(例如Cx-y 烷基 胺基或Cx-y 烷基 氧基)之一部分,則烷基 之上文定義亦適用。
術語伸烷基 亦可衍生自烷基伸烷基 為二價,與烷基 不同,且需要兩個結合配偶體。在形式上,第二價係藉由去除烷基 中之氫原子來產生。相應基團係(例如)-CH3 及-CH2 -、 -CH2 CH3 及-CH2 CH2 -或>CHCH3 等。
術語「C1-4 伸烷基」包括(例如)-(CH2 )-、-(CH2 -CH2 )-、-(CH(CH3 ))-、-(CH2 -CH2 -CH2 )-、-(C(CH3 )2 )-、-(CH(CH2 CH3 ))-、-(CH(CH3 )-CH2 )-、-(CH2 -CH(CH3 ))-、-(CH2 -CH2 -CH2 -CH2 )-、-(CH2 -CH2 -CH(CH3 ))-、-(CH(CH3 )-CH2 -CH2 )-、-(CH2 -CH(CH3 )-CH2 )-、-(CH2 -C(CH3 )2 )-、-(C(CH3 )2 -CH2 )-、-(CH(CH3 )-CH(CH3 ))-、-(CH2 -CH(CH2 CH3 ))-、-(CH(CH2 CH3 )-CH2 )-、-(CH(CH2 CH2 CH3 ))-、-(CH(CH(CH3 ))2 )-及-C(CH3 )(CH2 CH3 )-。
伸烷基 之其他實例係亞甲基、伸乙基、伸丙基、1-甲基伸乙基、伸丁基、1-甲基伸丙基、1,1-二甲基伸乙基、1,2-二甲基伸乙基、伸戊基、1,1-二甲基伸丙基、2,2-二甲基伸丙基、1,2-二甲基伸丙基、1,3-二甲基伸丙基、伸己基等。
一般術語伸丙基、伸丁基、伸戊基、伸己基等無任何其他定義時意指所有具有相應碳原子數之可想得到之異構形式,即伸丙基包括1-甲基伸乙基且伸丁基包括1-甲基伸丙基、2-甲基伸丙基、1,1-二甲基伸乙基及1,2-二甲基伸乙基。
伸烷基 為另一(組合)基團之一部分(例如在HO-Cx-y 伸烷基 胺基或H2 N-Cx-y 伸烷基 氧基中),則伸烷基 之上文定義亦適用。
烷基 不同,烯基 係由至少兩個碳原子組成,其中至少兩個毗鄰碳原子由C-C雙鍵接合在一起,且碳原子僅可為一個C-C雙鍵之一部分。若在如上文所定義具有至少兩個碳原子之烷基 中,在形式上去除毗鄰碳原子上之兩個氫原子並使自由價飽和以形成第二鍵,則形成相應烯基
烯基 之實例係乙烯基(vinyl、ethenyl)、丙-1-烯基、烯丙基(丙-2-烯基)、異丙烯基、丁-1-烯基、丁-2-烯基、丁-3-烯基、2-甲基-丙-2-烯基、2-甲基-丙-1-烯基、1-甲基-丙-2-烯基、1-甲基-丙-1-烯基、1-亞甲基丙基、戊-1-烯基、戊-2-烯基、戊-3-烯基、戊-4-烯基、3-甲基-丁-3-烯基、3-甲基-丁-2-烯基、3-甲基-丁-1-烯基、己-1-烯基、己-2-烯基、己-3-烯基、己-4-烯基、己-5-烯基、2,3-二甲基-丁-3-烯基、2,3-二甲基-丁-2-烯基、2-亞甲基-3-甲基丁基、2,3-二甲基-丁-1-烯基、己-1,3-二烯基、己-1,4-二烯基、戊-1,4-二烯基、戊-1,3-二烯基、丁-1,3-二烯基、2.3-二甲基丁-1,3-二烯等。
一般術語丙烯基、丁烯基、戊烯基、己烯基、丁二烯基、戊二烯基、己二烯基、庚二烯基、辛二烯基、壬二烯基、癸二烯基等無任何其他定義時意指所有具有相應碳原子數之可想得到之異構形式,即丙烯基包括丙-1-烯基及丙-2-烯基,丁烯基包括丁-1-烯基、丁-2-烯基、丁-3-烯基、1-甲基-丙-1-烯基、1-甲基-丙-2-烯基等。
烯基 可視情況以相對於雙鍵之順式或反式或EZ 定向存在。
烯基 為另一(組合)基團之一部分(例如在Cx-y 烯基 胺基或Cx-y 烯基 氧基中)時,烯基 之上文定義亦適用。
伸烷基 不同,伸烯基 係由至少兩個碳原子組成,其中至少兩個毗鄰碳原子由C-C雙鍵接合在一起,且碳原子僅可為一個C-C雙鍵之一部分。若在如上文所定義具有至少兩個碳原子之伸烷基 中,在形式上去除毗鄰碳原子處之兩個氫原子並使自由價飽和以形成第二鍵,則形成相應伸烯基
伸烯基 之實例係伸乙烯基、伸丙烯基、1-甲基伸乙烯基、伸丁烯基、1-甲基伸丙烯基、1,1-二甲基伸乙烯基、1,2-二甲基伸乙烯基、伸戊烯基、1.1-二甲基伸丙烯基、2,2-二甲基伸丙烯基、1,2-二甲基伸丙烯基、1.3-二甲基伸丙烯基、伸己烯基等。
一般術語伸丙烯基、伸丁烯基、伸戊烯基、伸己烯基等無任何其他定義時意指所有具有相應碳原子數之可想得到之異構形式,即伸丙烯基包括1-甲基伸乙烯基且伸丁烯基包括1-甲基伸丙烯基、2-甲基伸丙烯基、1,1-二甲基伸乙烯基及1,2-二甲基伸乙烯基。
伸烯基 可視情況以相對於雙鍵之順式或反式或EZ 定向存在。
伸烯基 為另一(組合)基團之一部分(如在例如HO-Cx-y 伸烯基 胺基或H2 N-Cx-y 伸烯基 氧基中)時,伸烯基 之上文定義亦適用。
烷基 不同,炔基 係由至少兩個碳原子組成,其中至少兩個毗鄰碳原子係由C-C三鍵接合在一起。若在如上文所定義具有之至少兩個碳原子烷基 中,在形式上去除在每一情形下於毗鄰碳原子處之兩個氫原子並使自由價飽和以形成其他兩個鍵,則形成相應炔基
炔基 之實例係乙炔基、丙-1-炔基、丙-2-炔基、丁-1-炔基、丁-2-炔基、丁-3-炔基、1-甲基-丙-2-炔基、戊-1-炔基、戊-2-炔基、戊-3-炔基、戊-4-炔基、3-甲基-丁-1-炔基、己-1-炔基、己-2-炔基、己-3-炔基、己-4-炔基、己-5-炔基等。
一般術語丙炔基、丁炔基、戊炔基、己炔基、庚炔基、辛炔基、壬炔基、癸炔基等無任何其他定義時意指所有具有相應碳原子數之可想得到之異構形式,即丙炔基包括丙-1-炔基及丙-2-炔基,丁炔基包括丁-1-炔基、丁-2-炔基、丁-3-炔基、1-甲基-丙-1-炔基、1-甲基-丙-2-炔基等。
若烴鏈攜帶至少一個雙鍵以及至少一個三鍵二者,則按照定義其屬炔基 子基團。
炔基 為另一(組合)基團之一部分(如例如在Cx-y 炔基 胺基或Cx-y 炔基氧基 中),則炔基 之上文定義亦適用。
伸烷基 不同, 炔基 係由至少兩個碳原子組成,其中至少兩個毗鄰碳原子由C-C三鍵接合在一起。若在如上文所定義具有至少兩個碳原子之伸烷基 中,在形式上去除在每一情形下於毗鄰碳原子處之兩個氫原子並使自由價飽和以形成其他兩個鍵,則形成相應伸炔基
伸炔基 之實例係伸乙炔基、伸丙炔基、1-甲基伸乙炔基、伸丁炔基、1-甲基伸丙炔基、1,1-二甲基伸乙炔基、1,2-二甲基伸乙炔基、伸戊炔基、1,1-二甲基伸丙炔基、2,2-二甲基伸丙炔基、1,2-二甲基伸丙炔基、1,3-二甲基伸丙炔基、伸己炔基等。
一般術語伸丙炔基、伸丁炔基、伸戊炔基、伸乙炔基等無任何其他定義時意指所有具有相應碳原子數之可想得到之異構形式,即伸丙炔基包括1-甲基伸乙炔基且伸丁炔基包括1-甲基伸丙炔基、2-甲基伸丙炔基、1,1-二甲基伸乙炔基及1,2-二甲基伸乙炔基。
伸炔基 為另一(組合)基團之一部分(如例如在HO-Cx-y 伸炔基 胺基或H2 N-Cx-y 伸炔基 氧基中),則伸炔基 之上文定義亦適用。
雜原子 意指氧、氮及硫原子。
鹵代烷基 ( 鹵代烯基、鹵代炔基 ) 係藉由用可相同或不同的鹵素原子彼此獨立地替代烴鏈之一或多個氫原子自先前定義之烷基 ( 烯基、炔基 ) 衍生。若鹵代烷基 ( 鹵代烯基、鹵代炔基) 欲進一步經取代,則取代可在所有攜帶氫之碳原子上彼此獨立地在每一情形下以單取代或多取代之形式進行。
鹵代烷基 ( 鹵代烯基、鹵代炔基 ) 之實例係-CF3 、-CHF2 、-CH2 F、-CF2 CF3 、-CHFCF3 、-CH2 CF3 、-CF2 CH3 、-CHFCH3 、-CF2 CF2 CF3 、-CF2 CH2 CH3 、-CF=CF2 、-CCl=CH2 、-CBr=CH2 、-C≡C-CF3 、-CHFCH2 CH3 、-CHFCH2 CF3 等。
亦自先前所定義之鹵代烷基(鹵代烯基、鹵代炔基)衍生術語鹵代伸烷基(鹵代伸烯基、鹵代伸炔基)。與鹵代烷基(鹵代烯基、鹵代炔基)不同,鹵代伸烷基(鹵代伸烯基、鹵代伸炔基)係二價且需要兩個結合配偶體。在形式上,第二價係藉由自鹵代烷基(鹵代烯基、鹵代炔基)去除氫原子來形成。
相應基團係(例如) -CH2 F及-CHF-、-CHFCH2 F及-CHFCHF-或>CFCH2 F等。
若相應含有鹵素之基團為另一(組合)基團之一部分,則上文定義亦適用。
鹵素 係指氟、氯、溴及/或碘原子。
環烷基 係由子基團單環烴環二環烴環螺烴環 構成。該等系統係飽和的。在二環烴環中,兩個環接合在一起,從而使得其具有至少兩個共用碳原子。在螺烴環中,一個碳原子(螺原子)同時屬兩個環。
環烷基 欲經取代,則取代可在所有攜帶氫之碳原子上彼此獨立地在每一情形下以單取代或多取代之形式進行。環烷基 自身可作為取代基經由環系統之每一適宜位置連接至分子。
環烷基 之實例係環丙基、環丁基、環戊基、環己基、環庚基、二環[2.2.0]己基、二環[3.2.0]庚基、二環[3.2.1]辛基、二環[2.2.2]辛基、二環[4.3.0]壬基(八氫茚基)、二環[4.4.0]癸基(十氫萘)、二環[2.2.1]庚基(降崁基)、二環[4.1.0]庚基(降蒈基)、二環[3.1.1]庚基(蒎基)、螺[2.5]辛基、螺[3.3]庚基等。
環烷基 為另一(組合)基團之一部分(如例如在Cx-y 環烷基 胺基、Cx-y 環烷基氧基 或Cx-y 環烷基 烷基中),則環烷基 之上文定義亦適用。
環烷基 之自由價係飽和的,則獲得脂環族基團
因此,術語伸環烷基 可衍生自先前所定義之環烷基。環烷基 不同,伸環烷基 係二價且需要兩個結合配偶體。在形式上,第二價係藉由自環烷基 去除氫原子來獲得 相應基團係(例如):
環己基及(伸環己基)。
伸環烷基 為另一(組合)基團之一部分(如例如在HO-Cx-y 伸環烷基 胺基或H2 N-Cx-y 伸環烷基 氧基中),則伸環烷基 之上文定義亦適用。
環烯基 亦係由子基團單環烴環二環烴環螺烴環 構成。然而,該等系統係不飽和的,即存在至少一個C-C雙鍵,但無芳香族系統。若在如上文所定義之環烷基 中,在形式上去除毗鄰環碳原子處之兩個氫原子並使自由價飽和以形成第二鍵,則獲得相應環烯基
環烯基 欲經取代,則取代可在所有攜帶氫之碳原子上彼此獨立地在每一情形下以單取代或多取代之形式進行。環烯基 自身可作為取代基經由環系統之每一適宜位置連接至分子。
環烯基 之實例係環丙-1-烯基、環丙-2-烯基、環丁-1-烯基、環丁-2-烯基、環戊-1-烯基、環戊-2-烯基、環戊-3-烯基、環己-1-烯基、環己-2-烯基、環己-3-烯基、環庚-1-烯基、環庚-2-烯基、環庚-3-烯基、環庚-4-烯基、環丁-1,3-二烯基、環戊-1,4-二烯基、環戊-1,3-二烯基、環戊-2,4-二烯基、環己-1,3-二烯基、環己-1,5-二烯基、環己-2,4-二烯基、環己-1,4-二烯基、環己-2,5-二烯基、二環[2.2.1]庚-2,5-二烯基(降莰烷-2.5-二烯基)、二環[2.2.1]庚-2-烯基(降莰烯基)、螺[4.5]癸-2-烯基等。
環烯基 為另一(組合)基團之一部分(如例如在Cx-y 環烯基 胺基、Cx-y 環烯基 氧基或Cx-y 環烯基 烷基)時,環烯基 之上文定義亦適用。
環烯基 之自由價係飽和的,則獲得不飽和脂環族基團
因此,術語伸環烯基 可衍生自先前所定義之環烯基。環烯基 不同,伸環烯基 係二價的且需要兩個結合配偶體。在形式上,第二價係藉由自環烯基 去除氫原子來獲得 相應基團係(例如):
環戊烯基及(伸環戊烯基)等。
伸環烯基 為另一(組合)基團之一部分(如例如在HO-Cx-y 伸環烯基 胺基或H2 N-Cx-y 伸環烯基 氧基中),則伸環烯基 之上文定義亦適用。
芳基 表示具有至少一個芳香族碳環之單環、二環或三環碳環。較佳地,其表示具有6個碳原子之單環基團(苯基)或具有9個或10個碳原子之二環基團(2個6員環或1個6員環與1個5員環),其中第二環亦可為芳香族,或然而亦可為部分飽和的。
芳基 欲經取代,則取代可在所有攜帶氫之碳原子上彼此獨立地在每一情形下以單取代或多取代之形式進行。芳基 自身可作為取代基經由環系統之每一適宜位置連接至分子。
芳基 之實例係苯基、萘基、二氫茚基(2,3-二氫茚基)、茚基、蒽基、菲基、四氫萘基(tetrahydronaphthyl)(1,2,3,4-四氫萘基、四氫萘基(tetralinyl))、二氫萘基(1,2-二氫萘基)、茀基等。最佳者係苯基。
芳基 為另一(組合)基團之一部分(如例如在芳基 胺基、芳基 氧基或芳基 烷基中),則芳基 之上文之定義亦適用。
芳基 之自由價係飽和的,則獲得芳香族基團
術語伸苯基 亦可衍生自先前所定義之芳基。芳基 不同,伸苯基 係二價的且需要兩個結合配偶體。在形式上,第二價係藉由自芳基 去除氫原子來形成。相應基團係(例如):
苯基及(鄰伸苯基、間伸苯基、對伸苯基)、
萘基及等。
伸芳基 為另一(組合)基團之一部分(如例如在HO-伸芳基 胺基或H2 N-伸芳基 氧基中),則伸芳基 之上文定義亦適用。
雜環基 表示如下環系統:其藉由在烴環中用基團-O-、-S-或-NH-彼此獨立地替代一或多個基團-CH2 -或藉由用基團=N-替代一或多個基團=CH-自先前所定義之環烷基環烯基芳基 衍生,其中可存在總共不超過5個雜原子,在兩個氧原子之間及在兩個硫原子之間或在一個氧與一個硫原子之間必須存在至少一個碳原子,且該環作為整體必須具有化學穩定性。雜原子可視情況存在於所有可能的氧化階段(硫 亞碸-SO、碸-SO2 -;氮 N-氧化物)中。在雜環基 中, 雜芳香族環,即無雜原子為芳香族系統之一部分。
環烷基環烯基芳基 衍生之直接結果為雜環基 係由子基團單環雜環二環雜環三環雜環螺雜環 構成,該等環可以飽和或不飽和形式存在。
不飽和意指所討論之環系統中存在至少一個雙鍵,但不形成任何雜芳香族系統。在二環雜環中,兩個環連接在一起,從而使得其具有至少兩個共用(雜)原子。在螺雜環中,一個碳原子(螺原子)同時屬兩個環。
雜環基 經取代,則取代可在所有攜帶氫之碳及/或氮原子上彼此獨立地在每一情形下以單取代或多取代之形式進行。雜環基 自身可作為取代基經由環系統之每一適宜位置連接至分子。雜環基 上之取代基不計為雜環基 之成員數。
雜環基 之實例係四氫呋喃基、吡咯啶基、吡咯啉基、咪唑啶基、噻唑啶基、咪唑啉基、吡唑啶基、吡唑啉基、六氫吡啶基、六氫吡嗪基、環氧乙烷基、氮丙啶基、氮雜環丁基、1,4-二噁烷基、氮雜環庚基、二氮雜環庚基、嗎啉基、硫嗎啉基、高嗎啉基、高六氫吡啶基、高六氫吡嗪基、高硫嗎啉基、硫嗎啉基-S -氧化物、硫嗎啉基-S,S -二氧化物、1,3-二氧戊環基、四氫吡喃基、四氫噻喃基、[1.4]-氧氮雜環庚基、四氫噻吩基、高硫嗎啉基-S,S -二氧化物、噁唑啶酮基、二氫吡唑基、二氫吡咯基、二氫吡嗪基、二氫吡啶基、二氫-嘧啶基、二氫呋喃基、二氫吡喃基、四氫噻吩基-S -氧化物、四氫噻吩基-S,S -二氧化物、高硫嗎啉基-S -氧化物、2,3-二氫氮雜環丁二烯基(2,3-dihydroazet)、2H -吡咯基、4H -吡喃基、1,4-二氫吡啶基、8-氮雜-二環[3.2.1]辛基、8-氮雜-二環[5.1.0]辛基、2-氧雜-5-氮雜二環[2.2.1]庚基、8-氧雜-3-氮雜-二環[3.2.1]辛基、3,8-二氮雜-二環[3.2.1]辛基、2,5-二氮雜-二環-[2.2.1]庚基、1-氮雜-二環[2.2.2]辛基、3,8-二氮雜-二環[3.2.1]辛基、3,9-二氮雜-二環[4.2.1]壬基、2,6-二氮雜-二環[3.2.2]壬基、1,4-二氧雜-螺[4.5]癸基、1-氧雜-3,8-二氮雜-螺[4.5]癸基、2,6-二氮雜-螺[3.3]庚基、2,7-二氮雜-螺[4.4]壬基、2,6-二氮雜-螺[3.4]辛基、3,9-二氮雜-螺[5.5]十一烷基、2.8-二氮雜-螺[4,5]癸基等。
其他實例係下文所圖解說明之結構,其可經由每一攜帶氫之原子連接(交換氫):




較佳地,雜環基係4員至8員單環且具有一或兩個獨立地選自氧、氮及硫之雜原子。
較佳雜環基係:六氫吡嗪基、六氫吡啶基、嗎啉基、吡咯啶基、氮雜環丁基、四氫吡喃基、四氫呋喃基。
雜環基 為另一(組合)基團之一部分(如例如在雜環基 胺基、雜環基 氧基或雜環基 烷基中),則雜環基 之上文定義亦適用。
雜環基 之自由價係飽和的,則獲得雜環基團
術語伸雜環基 亦衍生自先前所定義之雜環基。雜環基 不同,伸雜環基 係二價的且需要兩個結合配偶體。在形式上,第二價係藉由自雜環基 去除氫原子來獲得 相應基團係(例如):
六氫吡啶基及
2,3-二氫-1H -吡咯基及等。
伸雜環基 為另一(組合)基團之一部分(如例如在HO-伸雜環基 胺基或H2 N-伸雜環基 氧基中),則伸雜環基 之上文定義亦適用。
雜芳基 表示具有至少一個雜芳香族環之單環雜芳香族環或多環,其與相應芳基環烷基 ( 環烯基 ) 相比,代替一或多個碳原子含有一或多個彼此獨立地選自氮、硫及氧之相同或不同雜原子,其中所得基團必須化學穩定。存在雜芳基 之先決條件係雜原子及雜芳香族系統。
雜芳基 欲經取代,則取代可在所有攜帶氫之碳及/或氮原子上彼此獨立地在每一情形下以單取代或多取代之形式進行。雜芳基 自身可作為取代基經由環系統之每一適宜位置(碳及氮二者)連接至分子。雜芳基 上之取代基不計為雜芳基 之成員數。
雜芳基 之實例係呋喃基、噻吩基、吡咯基、噁唑基、噻唑基、異噁唑基、異噻唑基、吡唑基、咪唑基、三唑基、四唑基、噁二唑基、噻二唑基、吡啶基、嘧啶基、嗒嗪基、吡嗪基、三嗪基、吡啶基-N -氧化物、吡咯基-N -氧化物、嘧啶基-N -氧化物、嗒嗪基-N -氧化物、吡嗪基-N -氧化物、咪唑基-N -氧化物、異噁唑基-N -氧化物、噁唑基-N -氧化物、噻唑基-N -氧化物、噁二唑基-N -氧化物、噻二唑基-N -氧化物、三唑基-N -氧化物、四唑基-N -氧化物、吲哚基、異吲哚基、苯并呋喃基、苯并噻吩基、苯并噁唑基、苯并噻唑基、苯并異噁唑基、苯并異噻唑基、苯并咪唑基、吲唑基、異喹啉基、喹啉基、喹喏啉基、㖕啉基、酞嗪基、噁唑啉基、苯并三嗪基、吲嗪基、噁唑并吡啶基、咪唑并吡啶基、萘啶基、苯并噁唑基、吡啶并吡啶基、嘧啶并吡啶基、嘌呤基、蝶啶基、苯并噻唑基、咪唑并吡啶基、咪唑并噻唑基、喹啉基-N -氧化物、吲哚基-N -氧化物、異喹啉基-N -氧化物、喹唑啉基-N -氧化物、喹喏啉基-N -氧化物、酞嗪基-N -氧化物、吲嗪基-N -氧化物、吲唑基-N -氧化物、苯并噻唑基-N -氧化物、苯并咪唑基-N -氧化物等。
其他實例係下文所圖解說明之結構,其可經由每一攜帶氫之原子連接(交換氫):


較佳地,雜芳基係5員至6員單環或9員至10員二環,其各自具有1至4個獨立地選自氧、氮及硫之雜原子。
雜芳基 為另一(組合)基團之一部分(如例如在雜芳基 胺基、雜芳基 氧基或雜芳基 烷基中),雜芳基 之上文定義亦適用。
雜芳基 之自由價係飽和的,則獲得雜芳香族基團
術語伸雜芳基 亦衍生自先前所定義之雜芳基。雜芳基 不同,伸雜苯基 係二價的且需要兩個結合配偶體。在形式上,第二價係藉由自雜芳基 去除氫原子來獲得 相應基團係(例如):
吡咯基及等。
伸雜芳基 為另一(組合)基團之一部分(如例如在HO-伸雜芳基 胺基或H2 N-伸雜芳基 氧基中),則伸雜芳基 之上文定義亦適用。
取代 意指直接結合至所考慮原子之氫原子經另一原子或另一原子基團(取代基 )替代。取決於起始條件(氫原子數),可在一個原子上進行單取代或多取代。僅在取代基及欲取代原子之所允許之價彼此對應且取代產生穩定化合物(即產生不自發轉化(例如藉由重排、環化或消除)之化合物)時,經特定取代基之取代才係可能的。
二價取代基(例如=S、=NR、=NOR、=NNRR、=NN(R)C(O)NRR、=N2 或諸如此類)僅可係碳原子上之取代基,而二價取代基=O及=NR亦可係硫上之取代基。通常,取代可藉由僅在環系統處之二價取代基實施,且需要替代兩個孿位氫原子(即結合至在取代之前為飽和之相同碳原子之氫原子)。因此,經二價取代基取代僅在環系統之基團-CH2 -或硫原子(僅=O基團或=NR基團、可能一或兩個=O基團或例如一個=O基團及一個=NR基團,每一基團替代自由電子對)處係可能的。
立體化學 / 溶劑合物 / 水合物: 除非明確指示,否則在整個說明書及隨附申請專利範圍中,給定化學式或名稱應涵蓋互變異構物及所有立體、光學及幾何異構物(例如鏡像異構物、非鏡像異構物、E/Z 異構物等)及其外消旋物,以及不同比例之分離鏡像異構物之混合物、非鏡像異構物之混合物或前述任一形式之混合物(倘若存在此等異構物及鏡像異構物),以及其鹽(包括醫藥上可接受之鹽)及其溶劑合物(例如水合物),包括游離化合物之溶劑合物及水合物或該化合物之鹽之溶劑合物及水合物。
一般而言,實質上純之立體異構物可根據熟習此項技術者已知之合成原理來獲得,例如藉由分離相應混合物、藉由使用立體化學上純之起始材料及/或藉由立體選擇性合成。業內已知如何製備光學活性形式,例如藉由拆分外消旋形式或藉由(例如)自光學活性起始材料開始合成及/或藉由使用手性試劑來製備。
本發明之鏡像異構純化合物或中間體可經由不對稱合成來製備,例如藉由製備且隨後分離可藉由已知方法(例如藉由層析分離或結晶)來分離之適當非鏡像異構化合物或中間體,及/或藉由使用手性試劑(例如手性起始材料、手性觸媒或手性助劑)來實施。
此外,熟習此項技術者已知如何自相應外消旋混合物製備鏡像異構純化合物,例如藉由在手性固定相上層析分離相應外消旋混合物,或藉由使用適當拆分劑拆分外消旋混合物(例如藉助外消旋化合物與光學活性酸或鹼之非鏡像異構鹽形成,隨後拆分該等鹽且自鹽釋放期望化合物),或藉由利用光學活性手性助劑試劑衍生化相應外消旋化合物,隨後進行非鏡像異構物分離並去除手性助劑基團,或藉由動力學拆分外消旋物(例如藉由酶拆分);藉由在適宜條件下自鏡像晶體之晶團進行鏡像選擇性結晶,或藉由在光學活性手性助劑存在下自適宜溶劑進行(分級)結晶。
片語「醫藥上可接受 」在本文中用於指在合理醫學判斷範圍內適用於與人類及動物組織接觸且無過度毒性、刺激性、過敏反應或其他問題或併發症且與合理益處/風險比相稱之彼等化合物、材料、組合物及/或劑型。
如本文所使用,「醫藥上可接受之鹽」係指所揭示化合物之衍生物,其中藉由製備其酸式或鹼式鹽來修飾母體化合物。醫藥上可接受之鹽之實例包括(但不限於)鹼性殘基(例如胺)之無機酸鹽或有機酸鹽、酸性殘基(例如羧酸)之鹼性鹽或有機鹽及諸如此類。
舉例而言,此等鹽包括來自以下之鹽:苯磺酸、苯甲酸、檸檬酸、乙磺酸、富馬酸、龍膽酸、氫溴酸、鹽酸、馬來酸、蘋果酸、丙二酸、苦杏仁酸、甲磺酸、4-甲基-苯磺酸、磷酸、柳酸、琥珀酸、硫酸及酒石酸。
其他醫藥上可接受之鹽可利用來自以下之陽離子形成:氨、L-精胺酸、鈣、2,2’-亞胺基雙乙醇、L-離胺酸、鎂、N -甲基-D-葡萄糖胺、鉀、鈉及參(羥基甲基)-胺基甲烷。
本發明之醫藥上可接受之鹽可藉由習用化學方法自含有鹼性或酸性部分之母體化合物來合成。通常,此等鹽可藉由使該等化合物之游離酸或鹼形式與足量之適當鹼或酸於水或於有機稀釋劑(如乙醚、乙酸乙酯、乙醇、異丙醇或乙腈或其混合物)中進行反應來製備。
除上文所提及之酸以外之(例如)可用於純化或分離本發明化合物之鹽(例如三氟乙酸鹽)亦係本發明之一部分。
在諸如以下等代表圖中,

字母A具有環指定之功能,以使得更易於(例如)指示所討論環與其他環之連接。
對於確定其所結合之毗鄰基團及價至關重要之二價基團而言,出於清晰目的(若需要)將相應結合配偶體指示於括號中,如在以下代表圖中:
或(R2 ) -C(O)NH-或(R2 ) -NHC(O)-;
在諸如以下等代表圖中,

星號指定作為取代基之各別基團之連接點。
基團或取代基通常選自多種具有相應基團名稱(例如Ra Rb 等)之可選基團/取代基。若在分子之不同部分中重複使用此一基團來定義本發明之化合物,則應指出各次使用均應視為彼此完全獨立。
出於本發明之目的,治療有效量 意指能夠消除疾病症狀或預防或緩解該等症狀或延長治療患者之存活之物質之量。
RAS 家族蛋白質 意指包括KRAS (V-Ki-ras2克爾斯頓大鼠肉瘤病毒性致癌基因同系物)、NRAS (神經胚細胞瘤RAS病毒性致癌基因同系物)及HRAS (哈維鼠類肉瘤病毒致癌基因)及其任何突變體。
SOS1 抑制劑化合物 係如下化合物:其結合至SOS1並藉此防止SOS1介導之核苷酸交換,且隨後降低呈GTP結合形式之RAS之含量。更特定而言,SOS1抑制劑化合物顯示對SOS1之催化位點與RAS家族蛋白質之結合之藥理學抑制。因此,此一化合物與SOS1 (例如SOS1上之催化位點)相互作用,且降低與RAS家族蛋白質之結合程度(相對於在不添加SOS1抑制劑化合物之情形下之該結合)。因此,當與在不添加該抑制劑化合物之情形下所達成之結合相比,設想SOS1抑制劑化合物將與RAS家族蛋白質之結合程度至少降低約5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或甚至100%。本文中揭示量測與SOS1之催化位點結合之適宜測試系統。該化合物可以化學方式合成(例如小分子)或以微生物方式產生(例如單株抗體)及/或包含於(例如)樣品中,例如來自(例如)植物、動物或微生物之細胞提取物。較佳地,SOS1抑制劑化合物係小分子。
縮寫列表
本發明之特徵及優點自以下詳細實例將變得顯而易見,該等詳細實例藉助實例說明本發明之原理而並不限制其範圍:
本發明之化合物之製備
概述
除非另有說明,否則所有反應均在可商業獲得之裝置中使用在化學實驗室中常用之方法來實施。將對空氣及/或水分敏感之起始材料儲存在保護性氣體下,且在保護性氣體(氮氣或氬氣)下實施使用其之相應反應及操作。
本發明之化合物係根據CAS規則使用軟體Autonom (Beilstein)來命名。若欲藉由結構式及其命名法二者代表化合物,則在衝突之情形下以結構式為準。
微波反應 係在由Biotage製造之起始器/反應器中或在由CEM製造之Explorer中或在由Anton Paar製造之Synthos 3000或Monowave 3000中於密封容器(較佳地2 mL、5 mL或20 mL)中、較佳地在攪拌下實施。
層析
薄層層析係在由Merck製造之玻璃上之現成矽膠60 TLC板(含有螢光指示劑F-254)上實施。
本發明之實例化合物之製備型高壓層析 (RP HPLC) 係在Agilent或Gilson系統上實施,該等系統具有由Waters (名稱:SunFire™ Prep C18, OBD™ 10 µm, 50 × 150 mm或SunFire™ Prep C18 OBD™ 5 µm, 30 × 50 mm或XBridge™ Prep C18, OBD™ 10 µm, 50 × 150 mm或XBridge™ Prep C18, OBD™ 5 µm, 30 × 150 mm或XBridge™ Prep C18, OBD™ 5 µm, 30 × 50 mm)及YMC (名稱:Actus-Triart Prep C18, 5 µm, 30 × 50 mm)製造之管柱。
使用不同梯度之H2 O/乙腈來溶析化合物,同時對於Agilent系統而言,將5%酸性改性劑(20 mL HCOOH對1 L H2 O/乙腈(1/1))添加至水(酸性條件)。對於Gilson系統而言,水添加0.1% HCOOH。
對於在鹼性條件下Agilent系統之層析而言,亦使用H2 O/乙腈梯度,同時藉由添加5%鹼性改性劑(50 g NH4 HCO3 + 50 mL NH3 (25%於H2 O中)對1 L H2 O)將水製成鹼性。對於Gilson系統而言,如下將水製成鹼性:將5 mL NH4 HCO3 溶液(158 g於1 L H2 O中)及2 mL NH3 (28%於H2 O中)補充至1 L H2 O。
本發明之中間體及實例化合物之超臨界流體層析 (SFC) 係在具有以下管柱之JASCO SFC-系統上實施:Chiralcel OJ (250 × 20 mm, 5 µm)、Chiralpak AD (250 × 20 mm, 5 µm)、Chiralpak AS (250 × 20 mm, 5 µm)、Chiralpak IC (250 × 20 mm, 5 µm)、Chiralpak IA (250 × 20 mm, 5 µm)、Chiralcel OJ (250 × 20 mm, 5 µm)、Chiralcel OD (250 × 20 mm, 5 µm)、Phenomenex Lux C2 (250 × 20 mm, 5 µm)。
中間體及最終化合物之分析型 HPLC ( 反應控制 ) 係使用由Waters (名稱:XBridgeTM C18, 2.5 µm, 2.1 × 20 mm或XBridgeTM C18, 2.5 µm, 2.1 × 30 mm或Aquity UPLC BEH C18, 1.7 µm, 2.1 × 50mm)及YMC (名稱:Triart C18, 3.0 µm, 2.0 × 30 mm)及Phenomenex (名稱:Luna C18, 5.0 µm, 2.0 × 30 mm)製造之管柱來實施。在每一情形下分析型設備亦裝配有質量檢測器。
HPLC- 質譜法 /UV- 光譜法
使用HPLC-MS裝置(具有質量檢測器之高效液相層析)產生用於表徵本發明之實例化合物之滯留時間/MS-ESI+ 。給予在注射峰處溶析之化合物滯留時間tRet. = 0.00。
HPLC- 方法 ( 製備型 )
製備型 HPLC1
HPLC: 333及334幫浦
管柱: Waters X-Bridge C18 OBD, 10 µm, 30 × 100 mm,部件號186003930
溶劑: A:於H2 O中之10 mM NH4 HCO3 ;B:乙腈(HPLC級)
檢測: UV/Vis-155
流速: 50 mL/min
梯度: 0.00 - 1.50 min:1.5% B
1.50 - 7.50 min:變化
7.50 - 9.00 min:100% B
製備型 HPLC2
HPLC: 333及334幫浦
管柱: Waters Sunfire C18 OBD, 10 µm, 30 × 100 mm,部件號186003971
溶劑: A:H2 O + 0.2% HCOOH;B:乙腈(HPLC級) + 0.2% HCOOH
檢測: UV/Vis-155
流速: 50 mL/min
梯度: 0.00 - 1.50 min:1.5% B
1.50 - 7.50 min:變化
7.50 - 9.00 min:100% B
HPLC- 方法 ( 分析型 )
LCMSBAS1
HPLC: Agilent 1100系列
MS: Agilent LC/MSD SL
管柱: Phenomenex Mercury Gemini C18, 3 µm, 2 × 20 mm,部件號00M-4439-B0-CE
溶劑: A:於H2 O中之5 mM NH4 HCO3 /20 mM NH3 ;B:乙腈(HPLC級)
檢測: MS:正及負模式
質量範圍: 120 - 900 m/z
流速: 1.00 mL/min
管柱溫度: 40℃
梯度: 0.00 - 2.50 min:5% B → 95% B
2.50 - 2.80 min:95% B
2.81 - 3.10 min:95% B → 5% B
VAB
HPLC: Agilent 1100/1200系列
MS: Agilent LC/MSD SL
管柱: Waters X-Bridge BEH C18, 2.5 µm, 2.1 × 30 mm XP
溶劑: A:於H2 O中之5 mM NH4 HCO3 /19 mM NH3 ;B:乙腈(HPLC級)
檢測: MS:正及負模式
質量範圍: 100 - 1200 m/z
流速: 1.40 mL/min
管柱溫度: 45℃
梯度: 0.00 - 1.00 min:5% B → 100% B
1.00 - 1.37 min:100% B
1.37 - 1.40 min:100% B → 5% B
RND-FA-3.5
HPLC: Agilent Infinity-1290系列
MS: Agilent SQD-6150 (API-ES +/- 3000 V)
MSD信號設置: 正掃描100 - 1000,負掃描100 - 1000
管柱: Aquity BEH C18, 2.1 × 50 mm, 1.7 μm
溶析液: A:於水中之0.1%甲酸;B:於乙腈中之0.1%甲酸
檢測信號: UV 215 nm (帶寬4,參考關閉)
光譜: 範圍:200 - 400 nm;步長:2 nm
峰寬: > 0.025 min (0.5 S)
注射: 0.5 µL注射,在沖洗埠處洗針
流速: 0.8 mL/min
管柱溫度: 45℃
梯度: 0.0 - 0.2 min:2% B
0.2 - 1.5 min:2% B → 98% B
1.5 - 2.6 min:98% B
2.6 - 2.61 min:98% B → 2% B
2.61 - 3.2 min:2% B
GVK_LCMS_18
HPLC:Agilent Infinity-1290系列
MS:Agilent SQD -6130 (API-ES + 3500 V/ -3000 V)
MSD信號設置:正掃描100 - 1200,負掃描100 - 1200
管柱:Aquity BEH C18, 2.1 × 50mm, 1.7µm
溶析液:A 於乙腈中之0.1%甲酸;B 於水中之0.1%甲酸
檢測信號:UV 215/254 nm (帶寬4,參考關閉)
光譜:範圍:200 - 400 nm;步長:2 nm
峰寬:> 0.025 min (0.5 S)
注射:0.5 µL注射,在沖洗埠處洗針。
流速: 0.8 mL/min
管柱溫度: 60℃
梯度:0.0 - 0.4 min:97% B
0.4 - 2.2 min:97% B → 2% B
2.2 - 2.6 min:2% B
2.6 - 2.61 min:2% B → 97% B
2.61 - 3.0 min:97% B
GVK_LCMS_02
UPLC: Waters UPLC
MS: Micromass Triple quad (ESI)
毛細管電壓: 3500
錐電壓: 25至50V
脫溶劑氣: 600 L/h
脫溶劑溫度: 350℃
MSD信號設置: 正掃描100 - 1000,負掃描100 - 1000
管柱: Aquity BEH C18, 2.1 × 50 mm, 1.7 μm
溶析液: A:於水中之0.1%甲酸;B:於乙腈中之0.1%甲酸
檢測信號: UV-二極體陣列
光譜: 範圍:200 - 400 nm;解析度:1.2 nm
取樣速率: 10點/sec
注射: 0.5 µL注射,洗針
流速: 0.4 mL/min
管柱溫度: 35℃
梯度: 0.0 - 0.5 min:5% B
0.5 - 2.0 min:50% B
2.0 - 3.5 min:100% B
3.5 - 5.0 min:100% B → 5% B
5.0 - 5.50 min:5% B
GVK_LCMS_31
HPLC: Agilent Infinity-1290系列
MS: Agilent-6130四級桿LCMS (ESI/APCI,多模式+ 3500 V/ - 3000 V)
充電電壓: 2000
Fragmenter: 50至70
電暈電壓: 4 µ amp
脫溶劑溫度: 300℃
脫溶劑氣: 600 L/h
MSD信號設置: 正掃描100 - 1200,負掃描100 - 1200
管柱: Aquity BEH C18, 2.1 × 50 mm, 1.7 μm
溶析液: A:於乙腈中之0.1%甲酸;B:於水中之0.1%甲酸
檢測信號: UV 215 nm (帶寬4,參考關閉);UV 254 nm (帶寬4,參考關閉)
光譜: 範圍:200 - 400 nm;步長:2 nm
峰寬: > 0.025 min (0.5 S)
注射: 0.5 µL注射,在沖洗埠處洗針
流速: 0.8 mL/min
管柱溫度: 50℃
梯度: 0.0 - 0.2 min:2% A
0.2 - 2.3 min:98% A
2.3 - 3.4 min:98% A → 2% A
3.4 - 3.41 min:2% A
3.41 - 3.5 min:2% A
GVK_LCMS_34
HPLC: Agilent Infinity-1290系列
MS: Agilent-6130四級桿LCMS (APCI-ES + 3500 V/ - 3500 V)
錐電壓: 25至50 V
脫溶劑氣: 600 L/h
脫溶劑溫度: 350℃
MSD信號設置: 正掃描100 - 1000,負掃描100 - 1000
管柱: Aquity BEH C18, 2.1 × 50 mm, 1.7 μm
溶析液: A:於水中之0.1%甲酸;B:於乙腈中之0.1%甲酸
檢測信號: UV 215 nm (帶寬4,參考關閉);UV 254 nm (帶寬16,參考關閉)
光譜: 範圍:190 - 400 nm;步長:2 nm
峰寬: > 0.05 min (0.5 S)
注射: 0.5 µL注射,在沖洗埠處洗針
流速: 0.8 mL/min
管柱溫度: 60℃
梯度: 0.0 - 0.4 min:2% B
0.4 - 2.2 min:2% B → 98% B
2.2 - 2.6 min:98% B
2.6 - 2.61 min:98% B → 2% B
2.61 - 3.0 min:2% B
GVK_LCMS_35
UPLC: Waters Acquity UPLC H-Class系統
MS: Waters SQ檢測器2 (ESI);
毛細管電壓: 3.50 kV
錐電壓: 50 V
脫溶劑氣: 750 L/h
脫溶劑溫度: 350℃
MSD信號設置: 正掃描100 - 1200,負掃描100 - 1200
管柱: Aquity BEH C18, 2.1 × 50 mm, 1.7 μm
溶析液: A:於乙腈中之0.05%甲酸;B:於水中之0.05%甲酸
檢測信號: UV-二極體陣列
光譜: 範圍:200 - 400 nm;解析度:1.2 nm
取樣速率: 10點/sec
注射: 0.5 µL注射,注射前洗滌15 sec且注射後洗滌20 sec
流速: 0.6 mL/min
管柱溫度: 35℃
梯度: 0.0 - 0.3 min:97% B
0.3 - 2.2 min:97% B → 2% B
2.2 - 3.30 min:2% B
3.30 - 4.50 min:2% B → 97% B
4.51 - 5.50 min:97% B
GVK_LCMS_21
LC: Agilent Infinity 1290系列
MS: Agilent 6130四級桿lcms(SQ)
MSD信號設置: 正/負掃描80-1200
管柱: Aquity BEH C18, 2.1 × 50 mm, 1.7 μm
溶析液: A:水+ 0.1%甲酸;B:乙腈(HPLC級) + 0.1%甲酸
檢測信號: UV 215/254 nm (帶寬4,參考關閉)
光譜: 範圍:200 - 400 nm;步長:2.0 nm
峰寬: > 0.01 min (0.2 s)
注射: 0.5 µL標準注射
流速: 0.8 mL/min
管柱溫度: 60℃
梯度: 0.0 - 0.2 min:3% B
0.2 - 1.5 min:3% B → 95% B
1.5 - 2.5 min:95% B
2.5 - 2.6 min:95% B → 3% B
2.6 - 3.2 min:3% B
GVK_LCMS_22
HPLC: Agilent Infinity-1290系列
MS: Agilent SQD-6150 (API-ES +/- 3000 V)
MSD信號設置: 正掃描100 - 1000,負掃描100 - 1000
管柱: Aquity BEH C18, 2.1 × 50 mm, 1.7 μm
溶析液: A:於水中之0.1%甲酸;B:於乙腈中之0.1%甲酸
檢測信號: UV 215 nm (帶寬4,參考關閉)
光譜: 範圍:200 - 400 nm;步長:2 nm
峰寬: > 0.025 min (0.5 S)
注射: 0.5 µL注射,在沖洗埠處洗針
流速: 0.8 mL/min
管柱溫度: 45℃
梯度: 0.0 - 0.2 min:2% B
0.2 - 1.5 min:2% B → 98% B
1.5 - 2.6 min:98% B
2.6 - 2.61 min:98% B →2% B
2.61 - 3.2 min:2% B
D_LC_SSTD
HPLC: Agilent 1100/1200 (二元幫浦1)
管柱: (Waters) XBridge BEH C18, 30 × 3.0 mm;2.5 µm
溶析液: A:於水中之0.2%甲酸;B:乙腈
檢測信號: UV 254 nm (帶寬4,參考550 nm,帶寬100)
光譜: 範圍:190 - 400 nm;步長:2 nm
峰寬: > 0.01 min
注射: 1.0 µL
流速: 2.30 mL/min
管柱溫度: 50℃
梯度: 0.1 - 1.4 min:97% A → 100% B
1.4 - 1.6 min:100% B
1.6 - 1.8 min:100% B → 97% A
D_LC_BSTD
HPLC: Agilent 1100/1200 (二元幫浦1)
管柱: (Waters) XBridge BEH C18, 30 × 3.0 mm;2.5 µm
溶析液: A:於水中之0.2%氨(25%);B:乙腈
檢測信號: UV 254 nm (帶寬4,參考550 nm,帶寬100)
光譜: 範圍:190 - 400 nm;步長:2 nm
峰寬: > 0.01 min
注射: 1.0 µL
流速: 2.00 mL/min
管柱溫度: 50℃
梯度: 0.1 - 1.4 min:97% A → 100% B
1.4 - 1.6 min:100% B
1.6 - 1.8 min:100% B → 97% A
GVK_LCMS_19
RRLC: Agilent RRLC
MS: Agilent SQD
毛細管電壓: 3.50 kV
錐電壓: 25至50 V
脫溶劑氣: 600 L/h
脫溶劑溫度: 350℃
管柱: XBridge C18, 4.6 × 75 mm, 3.5 µm
溶析液: A:10 mM乙酸銨;B:乙腈
流速: 2.0 mL/min
管柱溫度: 35℃
梯度: [時間(min) / B%]:0/10、0.2/10、2.5/75、3.0/100、4.8/100、5.0/10
GVK_LCMS_41
UPLC: Waters Acquity-UPLC
MS: SQ檢測器-2
毛細管電壓: 3.50 kV
錐電壓: 50 V
脫溶劑氣: 750 L/h
脫溶劑溫度: 350℃
管柱: AQUITY UPLC BEH C18 1.7 µm, 2.1 × 50 mm
溶析液: A:於乙腈中之0.07%甲酸;B:於水中之0.07%甲酸
流速: 0.6 mL/min
管柱溫度: 35℃
梯度: [時間(min) / B%]:0/97、0.3/97、2.2/2、3.3/2、4.5/2、4.51/97
本發明之化合物及中間體係藉由下文所闡述之合成方法來製備,其中通式之取代基具有上文所給出之含義。該等方法意欲說明本發明,而非限制其標的物及該等實例所主張化合物之範圍。倘若未闡述起始化合物之製備,則其可商業獲得或其合成闡述於先前技術中或其可類似於本文所闡述之已知先前技術化合物或方法來製備,即合成該等化合物為有機化學家所熟知。文獻中所闡述之物質可根據已公開之合成方法來製備。
本發明之化合物 (I) 之一般反應方案及合成途徑匯總
方案 1

本發明之化合物(I) 可利用方案1中所繪示之合成途徑逐步製備。
縮醛A-2 可經由相應醛A-1 之縮醛化來製備。
A-7 可經由不同途徑來製備:
一種方法開始係利用經取代或未經取代之丙二酸酯對A-2 進行親核芳香族取代以提供中間體A-3 (引入R2 )。使中間體A-3 進行去羧作用產生A-4 ,A4在親核芳香族取代中利用構建單元B-5 (參見下文)進行轉化。使所得酯A-5 皂化且隨後利用構建單元C-1 (引入R1 )進行醯胺化在單一步驟中提供中間體A-7
在替代方法中,利用經取代或未經取代之丙二酸酯(引入R2 )轉化化合物A-2 ,且然後利用構建單元B-5 (參見下文)進行處理以在單一步驟中得到化合物A-5 。使所得酯A-5 皂化且隨後利用構建單元C-1 (引入R1 )進行醯胺化,提供中間體A-7
另一途徑開始係利用經取代或未經取代之丙二酸酯(引入R2 )對A-2 進行親核芳香族取代,之後利用構建單元B-5 (參見下文)進行親核芳香族取代以在單一步驟中提供化合物A-6 。藉由使二酯A-6 皂化、原位去羧且隨後利用構建單元C-1 (引入R1 )進行醯胺化在單一步驟中達成使A-6 直接轉化成A-7
最終化合物(I) 可藉由使縮醛A-7 去保護並環化來製備。化合物(I) 可在方案1中未繪示之可選步驟(尤其在R1 R2 中)中進一步衍生化以獲得其他/額外化合物(I)
因此,本發明之一個態樣係如本文所定義之化合物(I) 之製造,其包含使如本文所定義之化合物A-7 閉環;視情況進一步包含使如本文所定義之化合物A-5 與如本文所定義之胺C-1 反應;視情況進一步包含使如本文所定義之化合物A-4 與如本文所定義之化合物B-5 反應;視情況進一步包含使如本文所定義之化合物A-3 反應以獲得如本文所定義之化合物A-4 ;視情況進一步包含使如本文所定義之化合物A-2 反應以獲得如本文所定義之化合物A-3 ,視情況進一步包含使如本文所定義之化合物A-1 反應以獲得如本文所定義之化合物A-2
方案 2

或者,本發明之化合物(I) 可利用方案2中所繪示之合成途徑逐步製備。
自β-側氧基二酯E-1 起始,相應α,β-二側氧基酯E-3 可經由與DMF-縮醛反應獲得之中間體E-2 來製備。利用胺C-1 之閉環產生羥基吡啶酮環E-4 。在利用醯胺將羥基轉移至相應磺酸酯(例如甲苯磺酸酯、三氟甲磺酸酯等,E-5 )之後,鈀催化之交叉偶合產生吡啶酮醯胺E-6 ,其容許進行第二閉環以獲得期望之二環吡啶并嘧啶-二酮支架(E-7 )。由此獲得之E-7 可經活化(利用例如六氯環三磷氮烯、SOCl2 、POCl3 或諸如此類)以與構建單元B-5 反應,從而得到本發明之最終化合物(I) (其亦可在額外步驟中衍生化)。
因此,本發明之一個態樣係如本文所定義之化合物(I) 之製造,其包含利用選自六氯環三磷氮烯、SOCl2 及POCl3 之試劑使如本文所定義之化合物E-7 活化且使經活化之E-7 與如本文所定義之化合物B-5 反應;視情況進一步包含使如本文所定義之化合物E-6 反應以獲得如本文所定義之化合物E-7 ;視情況進一步包含使如本文所定義之化合物E-5 與如本文所定義之醯胺R3 -CONH2 反應;視情況進一步包含使如本文所定義之化合物E-4 反應以獲得如本文所定義之化合物E-5 ;視情況進一步包含使如本文所定義之化合物E-3 與如本文所定義之胺C-1 反應;視情況進一步包含使如本文所定義之化合物E-2 反應以獲得如本文所定義之化合物E-3 ;視情況進一步包含使如本文所定義之化合物E-1 反應以獲得如本文所定義之化合物E-2
方案 3

構建單元B-5 可以方案3中所繪示之合成起始來逐步製備。
(雜)芳基乙胺系統B-5 可自(雜)芳基溴化物B-1 來製備,該(雜)芳基溴化物B-1 經由金屬催化之交叉偶合轉化成相應乙醯基(雜)芳基B-2 。手性亞磺醯胺B-3 形成之後為立體選擇性還原以提供B-4 。最終,亞磺醯胺之裂解提供期望之手性(雜)芳基乙胺B-5
或者,乙醯基(雜)芳基B-2 可鏡像選擇性地還原為相應醇B-6 ,其然後轉變成疊氮化物B-7 且可進而經氫化以獲得手性構建單元B-5
因此,本發明之一個態樣係如本文所定義之化合物B-5 之製造,其包含使如本文所定義之化合物B-7 還原;視情況進一步包含使如本文所定義之化合物B-6 反應以獲得如本文所定義之化合物B-7 ;視情況進一步包含使如本文所定義之化合物B-2 還原以獲得如本文所定義之化合物B-6
中間體 A-2 之合成
用於合成 A-2a 之實驗程序

A-1a (150.00 g, 785.28 mmol, 1.0當量)於苯(1500 mL)中之攪拌溶液添加乙二醇(48.69 g, 785.28 mmol, 1.0當量)及催化量之對甲苯磺酸(13.51 g, 78.53 mmol, 0.1當量)。使反應混合物回流,直至觀察到起始材料之完全轉化為止。使溶劑在減壓下蒸發,用DCM稀釋殘餘物並用碳酸氫鈉水溶液洗滌。將有機層合併,乾燥(Na2 SO4 )並在減壓下濃縮。藉由急速管柱層析(溶析液:於己烷中之10%乙酸乙酯)進行進一步純化產生期望產物A-2a
以下中間體A-2 (表1)可自不同嘧啶A-1 起始以類似方式獲得。若需要,則藉由層析純化粗產物A-2
1
中間體 A-3 之合成
用於合成 A-3a 之實驗程序

A-2a (80.00 g, 340.33 mmol, 1.0當量)溶解於DMSO (400 mL)中,且利用碳酸銫(220.53 g, 680.66 mmol, 2.0當量)及丙二酸二甲酯(49.42 g, 374.36 mmol, 1.1當量)進行處理。將所得混合物加熱至80℃持續10小時。在起始材料完全轉化之後,用乙酸乙酯稀釋反應混合物且傾倒於冰冷水上。用乙酸乙酯萃取水層。將有機層合併並用0.1 N甲酸水溶液洗滌。使有機層乾燥(Na2 SO4 )並在減壓下濃縮。藉由急速管柱層析(溶析液:於己烷中之30%乙酸乙酯)進行進一步純化產生期望產物A-3a
以下中間體A-3 (表2)可自不同嘧啶A-2 起始以類似方式獲得。若需要,則藉由層析純化粗產物A-3
2
用於合成 A-3c 之實驗程序

將2-氟-丙二酸二甲基酯(72.30 g, 481.99 mmol, 1.1當量)於無水DMF (300 mL)中之攪拌溶液冷卻至5℃,且利用氫化鈉(20.16 g , 876.35 mmol, 2.0當量)進行逐份處理。在室溫下攪拌10分鐘之後,添加溶解於DMF (50 mL)中之A-2a (103.00 g, 438.17 mmol, 1.0當量),且將所得混合物再攪拌2小時。完全轉化之後,將反應混合物傾倒於冰冷水上,且用乙酸乙酯萃取水層。將有機層合併,乾燥(Na2 SO4 )並在減壓下濃縮。藉由急速管柱層析(溶析液:於己烷中之15%乙酸乙酯)進行進一步純化產生期望產物A-3c (HPLC方法:GVK_LCMS_31;tret = 1.756 min;[M+H]+ = 350)。
中間體 A-4 之合成
用於合成 A-4a 之實驗程序

A-3a (40.00 g, 120.95 mmol, 1.0當量)於DMSO (120 mL)中之攪拌溶液用氯化鋰(20.32 g, 483.79 mmol, 4.0當量)處理,且加熱至120℃持續2小時。在起始材料完全轉化之後,用二乙醚稀釋所得反應混合物且傾倒於冰冷水上。用二乙醚萃取水層,將有機層合併,乾燥(Na2 SO4 )並在減壓下濃縮。藉由鹼性反相層析(溶析液:於水中之20%乙腈)及正相層析(於己烷中之18%乙酸乙酯)進行進一步純化產生期望產物A-4a
以下中間體A-4 (表3)可自不同嘧啶A-3 起始以類似方式獲得。若需要,則藉由層析純化粗產物A-4
3
中間體 A-5 之合成
用於合成 A-5a 之實驗程序

A-4a (3135 mg, 11.50 mmol, 1.5當量)及B-5a (1450 mg, 7.67 mmol, 1.0當量)溶解於無水DMSO (10 mL)中,且添加DIPEA (2670 µL, 15.33 mmol, 2.0當量)。將反應混合物在80℃下攪拌6小時,直至達成B-5a 之完全轉化為止。將反應混合物過濾且藉由鹼性反相層析(梯度溶析:於水中之25%至65%乙腈)純化濾液,得到期望產物A-5a
以下中間體A-5 (表4)可自不同嘧啶A-4 及胺B-5 起始以類似方式獲得。若需要,則藉由層析純化粗產物A-5
4





用於合成 A-5v 之實驗程序

A-2b (500 mg, 2.262 mmol, 1.0當量)於無水DMSO (4.0 mL)中之溶液用2-氟-丙二酸二甲基酯(281 µL, 2.262 mmol, 1.0當量)及碳酸鈉(360 mg, 3.393 mmol, 1.5當量)處理。將所得混合物在室溫下攪拌4 d,直至觀察到起始材料之完全轉化為止。添加三乙胺(627 µL, 4.524 mmol, 2.0當量)及B-5a (642 mg, 3.393 mmol, 1.5當量),且將反應混合物在80℃下再攪拌16小時。完全轉化之後,用NaHCO3 水溶液使反應淬滅,並用DCM萃取水層。將有機層合併,乾燥(Na2 SO4 )並在減壓下濃縮。藉由鹼性反相層析(梯度溶析:於水中之15%至85%乙腈)進行進一步純化產生期望產物A-5v (HPLC方法:VAB, tret = 0.945 min;[M+H] + = 430.3)。
中間體 A-6 之合成
用於合成 A-6a 之實驗程序

A-2a (50 mg, 0.213 mmol, 1.0當量)溶解於DMSO (0.5 mL)中,且利用2-氟-丙二酸二甲基酯(27 µL, 0.221 mmol, 1.0當量)及碳酸鉀(58.8 mg, 0.425 mmol, 2.0當量)進行處理。將所得混合物在100℃下攪拌5分鐘,直至觀察到起始材料之完全轉化為止。添加三乙胺(89 µL, 0.639 mmol, 3.0當量)及B-5a (60.2 mg, 0.318 mmol, 1.5當量),且將反應混合物在60℃下再攪拌3小時。將反應混合物過濾,且藉由鹼性反相層析(梯度溶析:於水中之35%至75%乙腈)純化濾液,得到期望產物A-6a
以下中間體A-6 (表5)可自不同嘧啶A-5 起始以類似方式獲得。若需要,則藉由層析純化粗產物A-6
5
中間體 A-7 之合成
用於合成 A-7a 之實驗程序

A-5a (200.0 mg, 0.470 mmol, 1.0當量)將溶解於DMSO (2 mL)及ACN (1 mL)。添加氫氧化鈉水溶液(20%, 313 µL, 1.881 mmol, 4當量),且將所得混合物攪拌30分鐘,直至觀察到起始材料之完全轉化為止。添加三乙胺(130 µL, 0.933 mmol, 2.0當量)、1-甲基-環丙胺鹽酸鹽(62.8 mg, 0.583 mmol, 1.3當量)及HATU (266.3 mg, 0.700 mmol, 1.5當量),且將所得混合物攪拌20分鐘,直至觀察到完全轉化為止。添加水並用DCM稀釋該混合物。用DCM萃取水層,將有機層合併並經硫酸鎂乾燥。所得粗產物A-7a 可不經進一步純化即用於下一步驟中。
以下中間體A-7 (表6)可自不同嘧啶A-5 起始且與各種胺C-1 或其相應鹽偶合以類似方式獲得。若需要,則藉由層析純化粗產物A-7
6
用於合成 A-7dp 之實驗程序

A-6a (16.0 mg, 0.032 mmol, 1.0當量)溶解於DMSO (1.5 mL)中。添加氫氧化鈉水溶液(20%, 16 µL, 0.096 mmol, 3.0當量),且將所得混合物攪拌30分鐘,直至觀察到起始材料之完全轉化為止。添加三乙胺(8.5 µL, 0.061 mmol, 2.0當量)、1-氟甲基-環丙胺鹽酸鹽(4.8 mg, 0.038 mmol, 1.3當量)及HATU (17.3 mg, 0.045 mmol, 1.5當量),且將所得混合物攪拌20分鐘,直至觀察到完全轉化為止。添加水並用DCM稀釋該混合物。用DCM萃取水層,將有機層合併並經硫酸鎂乾燥。所得粗產物A-7dp 可不經進一步純化即用於下一步驟中。
以下中間體A-7 (表7)可自不同嘧啶A-6 起始且與各種胺C-1 或其相應鹽偶合以類似方式獲得。若需要,則藉由層析純化粗產物A-7


7
中間體 B-1 之合成
用於合成 D-2a 之實驗程序

在0℃下向D-1a (20.00 g, 172.24 mmol, 1.0當量)於DCM (200 mL)中之攪拌溶液添加EDCI (49.35 g, 258.37 mmol, 1.5當量)、三乙胺(26.14 g, 258.37 mmol, 1.5當量)、DMAP (0.21 g, 1.72 mmol, 0.01當量)及N ,O -二甲基羥胺鹽酸鹽(25.20 g, 258.37 mmol, 1.5當量)。使反應混合物升溫至室溫並攪拌16小時。在起始材料完全轉化之後,將1 N HCl添加至該反應混合物。用EtOAc萃取水層,將合併之有機層用飽和NaHCO3 水溶液洗滌,經Na2 SO4 乾燥並在減壓下濃縮。藉由急速管柱層析(於己烷中之5%乙酸乙酯)純化粗產物,從而產生期望產物D-2a
以下中間體D-2 (表8)可自不同酸D-1 起始以類似方式獲得。若需要,則藉由層析純化粗產物D-2
8
用於合成 D-3a 之實驗程序

在-15℃下向D-2a (150 mg, 0.942 mmol, 1.0當量)於THF (5 mL)中之攪拌溶液緩慢添加3-溴苯基溴化鎂(0.5 N, 2.26 mL, 1.130 mmol, 1.2當量)。使反應混合物升溫至室溫並攪拌3小時。在起始材料完全轉化之後,添加水。用EtOAc萃取水層,將有機層合併,經Na2 SO4 乾燥並在減壓下濃縮。藉由急速管柱層析(溶析液:於己烷中之10%乙酸乙酯)純化粗產物,從而產生期望產物D-3a
用於合成 D-3b 之實驗程序

將1,3-二溴-2-氟-苯(15.95 g, 62.82 mmol, 1.0當量)於無水THF (100 mL)中之攪拌溶液冷卻至-78℃。逐滴添加正丁基鋰(1.6 N, 47.1 mL, 75.36 mmol, 1.2當量),且將所得混合物在-78℃下攪拌30分鐘。緩慢添加溶解於THF (40 mL)中之D-2b (10.00 g, 62.82 mmol, 1.0當量)。完全轉化之後,添加飽和氯化銨水溶液。用EtOAc萃取水層,將有機層合併,經Na2 SO4 乾燥並在減壓下濃縮。藉由層析在矽膠(梯度溶析:於石油醚中之10%至20%乙酸乙酯)上純化粗產物,從而產生期望產物D-3b
以下中間體D-3 (表9)可自不同醯胺D-2 起始以類似方式獲得。若需要,則藉由層析純化粗產物D-3
9
用於合成 B-1a 之實驗程序

在0℃下向D-3d (150 g, 738.89 mmol, 1.0當量)於DCM (1.5 L)中之攪拌溶液緩慢添加三氟化二乙基胺基硫(178.64 g, 1108.33 mmol, 1.5當量)。使反應混合物升溫至室溫並攪拌16小時。在起始材料完全轉化之後,添加冰水。用EtOAc萃取水層,將有機層合併,經Na2 SO4 乾燥並在減壓下濃縮。粗產物B-1a 不經進一步純化即用於下一步驟中。
以下中間體B-1 (表10)可自不同溴苯D-3 起始以類似方式獲得。若需要,則藉由層析純化粗產物B-1
10
用於合成 D-5a 之實驗程序

在室溫下向溴二氟乙酸乙酯(126.50 g, 623 mmol, 2.5當量)於DMSO (225 mL)中之攪拌溶液添加銅粉(39.26 g, 623 mmol, 2.5當量)。1小時後,添加B-1f (75.00 g, 249.26 mmol, 1.0當量),且將所得混合物加熱至70℃並再攪拌3小時。在起始材料完全轉化之後,添加冰水及EtOAc。藉由過濾去除不溶物,並用EtOAc萃取水層。將有機層合併,經Na2 SO4 乾燥並在減壓下濃縮。藉由管柱層析(梯度溶析:於石油醚中之0%至10%乙酸乙酯)純化粗產物,從而產生期望產物D-4a
用於合成 B-1g 之實驗程序

在0℃下向D-4a (100.00 g, 336.62 mmol, 1.0當量)於無水甲苯(1 L)中之攪拌溶液緩慢添加甲基溴化鎂(1 N, 1.34 L, 1340 mmol, 4.0當量)。將所得混合物在室溫下攪拌1小時。在起始材料完全轉化之後,添加飽和氯化銨水溶液,並用EtOAc萃取水層。將有機層合併,經Na2 SO4 乾燥並在減壓下濃縮。藉由層析(於己烷中之25%乙酸乙酯)純化粗產物,從而產生期望產物B-1g
用於合成 D-5a 之實驗程序

B-1h (480.00 g, 2274 mmol, 1.0當量)及乙烷-1,2-二硫醇(213.78 g, 2274 mmol, 1.0當量)溶解於甲苯(5 L)中,在室溫下添加TsOH (78.24 g, 454.9 mmol, 0.2當量),且將所得混合物加熱至回流持續24小時。在起始材料完全轉化之後,添加10% NaOH水溶液,並用EtOAc萃取水層。將有機層合併,用水及鹽水洗滌,經Na2 SO4 乾燥並在減壓下濃縮。藉由層析(梯度溶析:於石油醚中之0%至10%乙酸乙酯)純化粗產物,從而產生期望產物D-5a
用於合成 B-1i 之實驗程序

在-70℃下向1,3-二溴-5,5-二甲基咪唑啶-2,4-二酮(793.8 g, 2785 mmol, 4.0當量)於DCM (1.5 L)中之攪拌溶液添加HF-吡啶(70%, 800 mL, 30800 mmol, 44當量)。向此混合物逐滴添加溶解於DCM (0.5 L)中之D-5a (200.00 g, 696.28 mmol, 1.0當量)。將溫度保持在-60℃以下持續4小時,且然後將所得混合物在室溫下再攪拌16小時。在起始材料完全轉化之後,添加2 N NaOH水溶液及30% NaHSO3 水溶液。將有機層用水及鹽水洗滌,經Na2 SO4 乾燥並在減壓下濃縮。藉由管柱層析在矽膠(梯度溶析:於石油醚中之0%至3%乙酸乙酯)上純化粗產物,從而產生期望產物B-1i
用於合成 B-1j 之實驗程序

B-1i (140.00 g, 448.79 mmol, 1.0當量)溶解於DCM (1.5 L)中,且在0℃下添加DBU (102.32 g, 673.19 mmol, 1.5當量)。將所得混合物在室溫下攪拌6小時。在起始材料完全轉化之後,將該混合物用DCM稀釋,用0.5 N HCl水溶液、水及鹽水洗滌,經Na2 SO4 乾燥並在減壓下濃縮。藉由層析(梯度溶析:於石油醚中之0%至10%乙酸乙酯)純化粗產物,從而產生期望產物B-1j
用於合成 B-1k 之實驗程序

在0℃下向B-1j (130.00 g, 562.68 mmol, 1.0當量)及2-硝基苯磺醯氯(124.35 g, 562.68 mmol, 1.0當量)於乙腈(1.3 L)中之攪拌溶液緩慢添加K3 PO4 (23.86 g, 112.54 mmol, 0.2當量)及水合肼(56.27 g, 1125.36 mmol, 2.0當量)。將所得混合物在室溫下攪拌24小時。在起始材料完全轉化之後,添加水,並用EtOAc萃取水層。將有機層合併,用水及鹽水洗滌,經Na2 SO4 乾燥並在減壓下濃縮。藉由管柱層析在矽膠(梯度溶析:於石油醚中之0%至5%乙酸乙酯)上純化粗產物,從而產生期望產物B-1k
中間體 B-2 之合成
用於合成 B-2a 之實驗程序

B-1a (125.0 g, 555.54 mmol, 1.0當量)溶解於無水1,4-二噁烷(1.2 L)中。添加三乙胺(140.27 mL, 1388.85 mmol, 2.5當量)及三丁基(1-乙氧基乙烯基)錫(240.66 g, 666.65 mmol, 1.2當量),且將所得溶液用氬吹掃15分鐘。添加雙(三苯基膦)氯化鈀(II)(3.90 g, 5.6 mmol, 0.01當量),且將反應混合物在高壓釜中加熱至100℃持續16小時。在起始材料完全轉化之後,使反應混合物冷卻至室溫,且利用1 N HCl進行處理並再攪拌16小時。用EtOAc萃取水層,使合併之有機層經Na2 SO4 乾燥,過濾並將溶劑在減壓下去除。粗產物B-2a 不經進一步純化即用於下一步驟中。
以下中間體B-2 (表11)可自不同溴苯B-1 起始以類似方式獲得。若需要,則藉由層析純化粗產物B-2
11
用於合成 D-6a 之實驗程序

在室溫下向B-2i (80.00 g, 368.60 mmol, 1.0當量)於THF (800 mL)中之攪拌溶液添加TMS-乙炔(54.31 g, 552.94 mmol, 1.5當量)、三乙胺(111.69 g, 1105.84 mmol, 3.0當量)、CuI (4.034 g, 36.86 mmol, 0.1當量)及Pd(PPh3 )2 Cl2 (25.88 g, 36.87 mmol, 0.1當量)。將所得混合物加熱至回流持續16小時。在起始材料完全轉化之後,添加冰水及EtOAc,並用EtOAc萃取水層。將有機層合併,經Na2 SO4 乾燥並在減壓下濃縮。藉由急速管柱層析(梯度溶析:於己烷中之0%至10%乙酸乙酯)純化粗產物,從而產生期望產物D-6a
用於合成 B-2j 之實驗程序

在室溫下向D-6a (60.00 g, 256.04 mmol, 1.0當量)於DCM (1.2 L)及甲醇(1.2 L)中之攪拌溶液添加碳酸鉀(353.87 g, 2560.38 mmol, 10.0當量)。將所得混合物攪拌2小時。在起始材料完全轉化之後,添加冰水且用DCM萃取水層。將有機層合併,經Na2 SO4 乾燥並在減壓下濃縮。藉由急速管柱層析(梯度溶析:於己烷中之20%乙酸乙酯)純化粗產物,從而產生期望產物B-2j
用於合成 B-2k 之實驗程序

於鐵氟龍(teflon)燒瓶中將B-2j (98.00 g, 604.34 mmol, 1.0當量)溶解於1,1,1,3,3,3-六氟丙醇(500 mL)中。添加HF-吡啶(70%, 250 mL, 9625 mmol, 16當量),且將燒瓶密封。將所得混合物在室溫下攪拌3 d。在起始材料完全轉化之後,添加冰水及EtOAc,並用EtOAc萃取水層。將有機層合併,用飽和NaHCO3 水溶液及鹽水洗滌,經Na2 SO4 乾燥並在減壓下濃縮。藉由急速管柱層析(梯度溶析:於己烷中之0%至20%乙酸乙酯)純化粗產物,從而產生期望產物B-2k
用於合成 D-8a 之實驗程序

在-78℃下向D-7a (120.00 g, 479.98 mmol, 1.0當量)於THF (1.2 L)中之攪拌溶液逐滴添加甲基溴化鎂(1 N, 720 mL, 720.00 mmol, 1.5當量)。將所得混合物在相同溫度下攪拌3小時。在起始材料完全轉化之後,添加飽和氯化銨水溶液,並用EtOAc萃取水層。將有機層合併,經Na2 SO4 乾燥並在減壓下濃縮。藉由層析在矽膠(梯度溶析:於石油醚中之0%至10%乙酸乙酯)上純化粗產物,從而產生期望產物D-8a
用於合成 B-2l 之實驗程序

在室溫下向D-8a (24.00 g, 90.21 mmol, 1.0當量)於乙腈(240 mL)中之攪拌溶液添加四丙基過釕酸銨(3.166 g, 9.01 mmol, 0.1當量)及4-甲基嗎啉N -氧化物(15.83 g, 135.30 mmol, 1.5當量)。將所得混合物在相同溫度下攪拌4小時。在起始材料完全轉化之後,藉由過濾去除不溶物並將濾液在減壓下濃縮。藉由層析在矽膠(梯度溶析:於石油醚中之0%至5%乙酸乙酯)上純化粗產物,從而產生期望產物B-2l
用於合成 D-9a 之實驗程序

在室溫下向B-2l (22.00 g, 83.32 mmol, 1.0當量)於DMSO (220 mL)中之攪拌溶液添加溴二氟乙酸乙酯(50.74 g, 249.95 mmol, 3.0當量)及銅粉(15.75 g, 250.00 mmol, 3.0當量)。將所得混合物加熱至80℃並攪拌16小時。在起始材料完全轉化之後,添加冰水及二乙醚。藉由過濾去除不溶物,並用二乙醚萃取水層。將有機層合併,經Na2 SO4 乾燥並在減壓下濃縮。藉由層析(梯度溶析:於石油醚中之0%至3%乙酸乙酯)純化粗產物,從而產生期望產物D-9a
用於合成 B-2m 之實驗程序

在氬氣氛下將D-10a (20.00 g, 121.98 mmol, 1.0當量)及2,2,2-三氟碘乙烷(51.23 g, 243.95 mmol, 2.0當量)添加至參(二亞苄基丙酮)-二鈀(7.819 g, 8.54 mmol, 0.1當量)、xantphos (7.05 g, 12.20 mmol, 0.1當量)及碳酸銫(118.93 g, 365.94 mmol, 3.0當量)於THF (200 mL)中之攪拌懸浮液。將所得混合物攪拌1分鐘,且然後於密封管中加熱至80℃持續12小時。在起始材料完全轉化之後,添加冰水及EtOAc,並用EtOAc萃取水層。將有機層合併,經Na2 SO4 乾燥並在減壓下濃縮。藉由急速管柱層析純化粗產物,從而產生期望產物B-2m
中間體 B-3 之合成
用於合成 B-3a 之實驗程序

B-2a (170.00 g, 903.53 mmol; 1.0當量)溶解於THF (1.7 L)中。在室溫下添加(R) -(+)-2-甲基-2-丙烷亞磺醯胺(164.13 g; 1355.33 mmol; 1.5當量)及四乙醇鈦(618.03 g, 2710.66 mmol; 3.0當量),且將所得反應混合物加熱至80℃持續16小時。在起始材料完全轉化之後,添加冰水及EtOAc,並用EtOAc萃取水層。將有機層合併,經Na2 SO4 乾燥並在減壓下濃縮。粗產物B-3a 不經進一步純化即用於下一步驟中。
以下中間體B-3D-10 (表12)可自不同苯乙酮B-2D-9 起始以類似方式獲得。若需要,則藉由層析純化粗產物。
12
中間體 B-4 之合成
用於合成 B-4a 之實驗程序

B-3a 溶液(170.00 g, 583.53 mmol; 1.0當量)溶解於THF (1.7 L)中且冷卻至0℃。添加硼氫化鈉(21.59 g; 583.51 mmol; 1.0當量),且將所得反應混合物在室溫下攪拌6小時。在起始材料完全轉化之後,添加冰水及EtOAc,並用EtOAc萃取水層。將有機層合併,經Na2 SO4 乾燥並在減壓下濃縮。藉由層析(梯度溶析:於石油醚中之33%乙酸乙酯)純化粗產物,從而產生期望產物B-4a
以下中間體B-4 (表13)可自不同亞磺醯胺B-3 起始以類似方式獲得。若需要,則藉由層析純化粗產物B-4
13
用於合成 B-4n 之實驗程序

D-11a 溶液(26.00 g, 71.55 mmol; 1.0當量)溶解於冷卻至-78℃之THF (260 mL)及水(5 mL)中。添加硼氫化鈉(8.156 g; 214.63 mmol; 3.0當量),且使所得反應混合物升溫至室溫並攪拌4小時。在起始材料完全轉化之後,添加冰水及EtOAc,並用EtOAc萃取水層。將有機層合併,經Na2 SO4 乾燥並在減壓下濃縮。藉由反相層析純化粗產物,從而產生期望產物B-4n
用於合成 B-4o 之實驗程序

在室溫下向B-4n (5.00 g, 15.46 mmol, 1.0當量)於THF (50 mL)中之攪拌溶液添加碳酸銫(15.12 g, 46.38 mmol, 3.0當量)及18-冠-6 (2.04 g, 7.73 mmol, 0.5當量)。將所得混合物加熱至80℃持續16小時。在起始材料完全轉化之後,添加水及EtOAc,並用EtOAc萃取水層。將有機層合併,經Na2 SO4 乾燥並在減壓下濃縮。藉由急速管柱層析(於己烷中之80% EtOAc)及反相層析純化粗產物,產生期望產物B-4o
用於合成 B-4p 之實驗程序

在室溫下向B-4n (1.00 g, 3.09 mmol, 1.0當量)於THF (10 mL)中之攪拌溶液添加第三丁醇鉀(0.52 g, 4.64 mmol, 1.5當量)及18-冠-6 (2.04 g, 7.73 mmol, 0.5當量)。使所得混合物升溫至80℃持續16小時。在起始材料完全轉化之後,添加水及EtOAc,並用EtOAc萃取水層。將有機層合併,經Na2 SO4 乾燥並在減壓下濃縮。藉由HPLC純化粗產物,產生期望產物B-4p
中間體 B-6 之合成
用於合成 B-6a 之實驗程序

將苯乙酮B-2n (5.00 g, 24.3 mmol, 1.0當量)溶解於甲苯(15 mL)及2-甲基四氫呋喃(5.0 mL)中。添加第三戊醇鈉(281 µL, 50%於甲苯中,1.21 mmol, 5 mol%),且將反應混合物用Ar氣氛吹掃。將(R )-RUCY-Xyl-BINAP (58.0 mg, 49.0 µmol, 0.2 mol%)添加至該反應混合物。向反應混合物中裝填氫氣氛(3巴)並在室溫下攪拌19小時,直至達成B-2n 之完全轉化為止。將反應用EtOAc (50 mL)稀釋並用水(1 × 50 mL)、HCl水溶液(1 × 10 mL, 1.0 M)及水(1 × 50 mL)洗滌。使有機層經Na2 SO4 乾燥,過濾並在真空中濃縮,得到期望產物。
以下中間體B-6 (表14)可自不同苯乙酮B-2 起始以類似方式獲得。若需要,則藉由層析純化粗產物。
14
中間體 B-5 之合成
用於合成 B-5a 之實驗程序

B-4a (13.20 g, 45.00 mmol; 1.0當量)於1,4-二噁烷(100 mL)中之溶液冷卻至0℃,且利用於1,4-二噁烷中之4 N HCl (50.00 mL, 200.00 mmol, 4.4當量)進行處理。將反應混合物攪拌3小時。在起始材料完全轉化之後,將該反應混合物在減壓下濃縮,過濾沈澱物並用二乙醚洗滌,以獲得呈HCl鹽之期望產物B-5a
以下苄胺B-5 (表15)可自不同亞磺醯胺B-4 起始以類似方式獲得。若需要,則藉由層析純化粗產物B-5 且作為HCl鹽分離出。
15
用於合成 B-5k 之實驗程序 ( 替代 )

將醇B-6a (2.00 g, 9.61 mmol, 1.0當量)溶解於無水甲苯(20 mL)中。隨後添加二氮雜雙環十一烯(1.73 mL, 11.5 mmol, 1.2當量)及疊氮膦酸二苯基酯(2.28 mL, 10.6 mmol, 1.1當量)。將反應混合物在40℃下攪拌18小時,直至達成B-6a 之完全轉化為止。使反應混合物冷卻至室溫,並用Na2 CO3 水溶液(2 × 10 mL)洗滌有機層。由此獲得之疊氮化物B-7a 不經分離,但在下一步驟中直接轉化。
Pd/C (200 mg, 10% w/w, 10% Pd)將添加至有機層。向反應混合物中裝填H2 氣氛(10巴)並攪拌24小時,直至達成B-7a 之完全轉化為止。將反應過濾並將揮發性物質在真空中去除。將殘餘物溶解於甲基第三丁基醚(30 mL)中,且利用於二噁烷中之HCl (4.8 mL, 4 M)進行處理。將白色沈澱物過濾,用甲基第三丁基醚(20 mL)洗滌並在真空中進一步乾燥,得到期望產物B-5k 。若需要,則藉由層析純化粗產物。
以下中間體B-5 (表16 )可自不同醇B-6 起始經由疊氮化物B-7 以類似方式獲得。
16
中間體 C-1 之合成
用於合成 D-13a 之實驗程序

在0℃下向D-12a (6.50 g, 35.093 mmol, 1.0當量)於DCM (100 mL)中之攪拌溶液逐滴添加三氟化二乙基胺基硫(8.48 g, 52.67 mmol, 1.5當量)。使反應混合物緩慢升溫至室溫並攪拌16小時。在起始材料完全轉化之後,添加飽和NaHCO3 水溶液。用DCM萃取水層,將有機層合併,經Na2 SO4 乾燥並在減壓下濃縮。藉由層析在矽膠(梯度溶析:於石油醚中之0%至12%乙酸乙酯)上純化粗產物,從而產生期望產物D-13a
用於合成 C-1a 之實驗程序

在0℃下向D-13a (2.40 g, 11.582 mmol, 1.0當量)於1,4-二噁烷(5.0 mL)中之攪拌溶液添加於1,4-二噁烷中之4 N HCl (10 mL, 40.00 mmol, 3.5當量)。使反應混合物升溫至室溫並攪拌16小時。在起始材料完全轉化之後,將反應混合物在減壓下濃縮。將N -戊烷添加至粗產物。將固體材料過濾並用正戊烷洗滌,產生呈HCl鹽之期望產物C-1a
用於合成 D-15a 之實驗程序:

將胺基酸D-14a (2.00 g, 19.7 mmol, 1.0當量)及鄰苯二甲酸酐(2.92 g, 19.7 mmol, 1.0當量)懸浮於乙酸(20 mL)中。使反應混合物回流,且將所獲得之溶液在此溫度下攪拌3小時。使反應混合物冷卻至0℃,同時產物D-15a 結晶。添加水(20 mL),且將反應混合物在此溫度下攪拌1小時。將沈澱物過濾,用水洗滌並在真空中進一步乾燥,得到期望產物。若需要,則藉由層析進一步純化粗產物(tret = 1.03 min;[M-H]+ = 230.0;HPLC方法D_LC_SSTD)。
用於合成 D-16a 之實驗程序:

將酸D-15a (2.00 g, 8.6 mmol, 1.0當量)懸浮於甲苯(10 mL)及N ,N -二甲基甲醯胺(0.1 mL)中。在室溫下添加亞硫醯氯(1.08 g, 9.1 mmol, 1.05當量),然後使反應混合物回流,且將所獲得之溶液在此溫度下攪拌3小時,直至達成D-15a 之完全轉化為止(利用苄胺淬滅)。使反應混合物冷卻至室溫,同時產物D-16a 結晶。添加庚烷(10 mL),且使反應混合物進一步冷卻至5℃並在此溫度下攪拌1小時。將沈澱物過濾,用水洗滌並在真空中進一步乾燥,得到期望產物。若需要,則藉由層析進一步純化粗產物(tret = 1.27 min;[M+H]+ = 246/247/248;HPLC方法D_LC_SSTD,在用苄胺淬滅後為苄基醯胺;1 H NMR (400 MHz, CDCl3 ) δ ppm 1.70-1.85 (m, 2 H), 2.10-2.31 (m, 2 H), 7.64-8.11 (m, 4 H)。
用於合成 D-17a 之實驗程序:

將醯氯D-16a (2.00 g, 8.0 mmol, 1.0當量)及10% Pd/C (無水,100 mg, 5% w/w)懸浮於四氫呋喃(12 mL)及2,6-二甲基吡啶(1.03 g, 9.6 mmol, 1.2當量)中。將反應混合物在3巴及30℃下氫化。20小時後,添加額外觸媒(25 mg),且再繼續氫化24小時。此後,將反應混合物過濾且將濾液蒸發。使殘餘物在甲苯與NaHCO3 水溶液之間分配。將有機相分離,且再次用NaHCO3 溶液洗滌並最後用檸檬酸溶液洗滌。使有機層乾燥(Na2 SO4 )並在減壓下濃縮。若需要,則藉由層析進一步純化粗產物(tret = 1.26 min;[M+H]+ = 216;HPLC方法D_LC_BSTD)。
用於合成 D-18a 之實驗程序:

將醛D-17a (2.00 g, 9.3 mmol, 1.0當量)溶解於二氯甲烷(12 mL)中,且在室溫下緩慢添加雙(2-甲氧基乙基)胺基三氟化硫之50%甲苯溶液(9.90 g, 22.3 mmol, 2.4當量)。攪拌兩天之後,利用NaHCO3 水溶液及額外二氯甲烷(15 mL)小心地處理反應混合物。使有機層乾燥(Na2 SO4 )並在減壓下濃縮。若需要,則藉由層析或結晶進一步純化粗產物D-18a (tret = 1.24 min;[M+H]+ = 238;HPLC方法D_LC_SSTD)。
(欲用於轉化D-17a 之潛在替代氟化劑係(例如) (二乙基胺基)二氟鋶四氟硼酸鹽及四氟化硫)
用於 合成 C-1a 之實驗程序

將醯亞胺D-18a (15.0 g, 63.2 mmol, 1.0當量)懸浮於N-(2-羥基乙基)乙二胺(45 mL)中,且將混合物加熱至80℃。在此溫度下2小時之後,使反應混合物冷卻至40℃並添加甲醇(30 mL)。將混合物再次加熱至80℃,且在60℃-70℃及大氣壓下將產物C-1a 作為甲醇溶液蒸餾出。將添加甲醇及蒸餾步驟重複兩次。產物C-1a 可作為甲醇溶液直接用於下一步驟中(1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 )δ (ppm) = 0.44-0.81 (m, 4 H), 5.64 (t,J = 57.1 Hz, 1 H)。未報告δ (ppm)下之甲醇質子= 3.18 (d, 3H), 4.08 (q, 1H))。
用於合成 D-20a 之實驗程序

D-19a (5.00 g, 58.08 mmol, 1.0當量)於DCM (50 mL)中之攪拌溶液添加(S )-(-)-1-苯基乙胺(6.21 g, 58.08 mmol, 1.0當量)及硫酸鎂(13.94 g, 116.16 mmol, 2.0當量)。將反應混合物在室溫下攪拌16小時。在起始材料完全轉化之後,藉由過濾去除不溶物並將濾液在減壓下濃縮。粗產物D-20a 不經進一步純化即用於下一步驟中。
用於合成 D-21a D-21b 之實驗程序

在0℃下向D-20a (8.00 g, 42.27 mmol, 1.0當量)於乙腈(80 mL)及DMF (8 mL)中之攪拌溶液添加氟氫化鉀(2.64 g, 33.85 mmol, 0.8當量)及三氟乙酸(5.30 g, 46.49 mmol, 1.1當量)。將反應混合物攪拌10分鐘,然後添加三甲基-三氟甲基-矽烷(9.02 g, 63.43 mmol, 1.5當量),且將所得混合物升溫至室溫並再攪拌16小時。在起始材料完全轉化之後,添加水及乙酸乙酯,用乙酸乙酯萃取水層,且將合併之有機層用鹽水洗滌且經Na2 SO4 乾燥並在減壓下濃縮。藉由SFC純化粗產物,從而產生期望產物D-21aD-21b
用於合成 C-1b 之實驗程序

D-21a (2.00 g, 7.714 mmol, 1.0當量)溶解於於甲醇中之3 N HCl (6.00 mL, 18.00 mmol, 2.3當量)中,並在室溫下攪拌5分鐘。將溶劑在減壓下去除,且將所得固體材料溶解於甲醇(20 mL)中。添加氧化鋁載鈀(10 wt-%, 200.00 mg, 0.188 mmol, 0.025當量),且將所得混合物在室溫下攪拌16小時。完全轉化之後,藉由過濾去除不溶物且將濾液在減壓下濃縮。將二乙醚添加至粗產物。將固體材料過濾並用二乙醚洗滌,產生呈HCl鹽之期望產物C-1b
以下胺C-1 (表17)可自不同中間體D-21 起始以類似方式獲得。若需要,則藉由層析純化粗產物C-1 且作為HCl鹽分離出。
17
用於合成 D-23a 之實驗程序

D-22a (330 mg, 1.293 mmol, 1.0當量)於THF (1.0 mL)中之攪拌溶液添加三乙胺(99%, 544 µL, 3.875 mmol, 3.0當量)及TBTU (518.8 g, 1.616 mmol, 1.3當量)。將反應混合物在室溫下攪拌15分鐘,然後添加二甲胺鹽酸鹽(110.7 mg, 1.358 mmol, 1.1當量)。將所得混合物再攪拌2小時。在起始材料完全轉化之後,添加水及DCM且用DCM萃取水層。將有機層合併,經MgSO4 乾燥並在減壓下濃縮。粗產物D-23a 不經進一步純化即用於下一步驟中。
以下醯胺D-23 (表18)可自不同酸D-22 起始以類似方式獲得。若需要,則藉由層析純化粗產物D-23
18
用於合成 C-1d 之實驗程序

D-23a (360 mg, 1.275 mmol, 1.0當量)溶解於DCM (5.0 mL)中,且利用於1,4-二噁烷中之4 N HCl (2.55 mL, 10.200 mmol, 8.0當量)進行處理。將反應混合物攪拌18小時。在起始材料完全轉化之後,將溶劑在減壓下部分去除。將固體材料過濾並乾燥,產生呈HCl鹽之期望產物C-1d
以下醯胺C-1 (表19)可自不同中間體D-23 起始以類似方式獲得。若需要,則藉由層析純化粗產物C-1 且作為HCl鹽分離出。
19
中間體 E-3 之合成
用於合成 E-3a 之實驗程序:

在0℃下,將3-側氧基戊二酸二甲基酯E-1a (10.0 g, 57.4 mmol, 1.0當量)與N ,N -二甲基甲醯胺二甲基縮醛(7.60 mL, 57.4 mmol, 1.0當量)合併於2-甲基四氫呋喃(75 mL)中。在0℃-4℃下攪拌3小時之後,使反應混合物升溫至室溫,且緩慢添加鹽酸水溶液(4 N, 26 mL) (中間體E-2a 未分離出)。在室溫下攪拌3小時之後,將有機層分離,用水且然後鹽水洗滌並在減壓下濃縮。若需要,則藉由蒸餾或層析進一步純化粗產物E-3a (tret = 0.99/1.04 min;[M+H]+ = 203;HPLC方法D_LC_SSTD)。
中間體 E-4 之合成
用於合成 E-4a 之實驗程序:

在室溫下,將2-甲醯基-3-側氧基戊二酸二甲基酯E-3a (4.34 g, 21.5 mmol, 1.15當量)及胺C-1a 之甲醇溶液(2.00 g 18.7 mmol, 1.0當量,於14.5 mL甲醇中)合併於甲醇(5.5 mL)中。在此溫度下攪拌過夜之後,添加NaOMe (3.8 mL, 21.5 mmol, 1.15當量,30% w/w於甲醇中),用額外甲醇(2 mL)沖洗。在室溫下攪拌2小時之後,緩慢添加水(24 mL),之後添加濃鹽酸(4.7 mL)。將沈澱物過濾,用水洗滌並在真空中進一步乾燥,得到期望產物。若需要,則藉由層析純化粗產物(tret = 1.06 min;[M-H]+ = 258;HPLC方法D_LC_SSTD)。
中間體 E-5 之合成
用於合成 E-5a 之實驗程序:

將4-羥基吡啶酮E-4a (2.00 g, 7.7 mmol, 1.0當量)懸浮於乙腈(16 mL)中。在室溫下添加三乙胺(1.61 mL, 11.6 mmol, 1.5當量),之後分多次添加對甲苯磺醯氯(1.47 g, 7.7 mmol, 1.0當量),用乙腈(4 mL)沖洗。將反應混合物在室溫下攪拌2小時直至達成完全轉化為止,然後在旋轉蒸發儀中濃縮,且用水(20 mL)進行處理。在室溫下攪拌1小時之後,將沈澱物過濾,用水洗滌並在真空中進一步乾燥,得到期望產物。若需要,則藉由層析純化粗產物(tret = 1.34 min;[M-H]+ = 414;HPLC方法D_LC_SSTD)。
中間體 E-6 之合成
用於合成 E-6a 之實驗程序:

將甲苯磺酸酯E-5a (4.00 g, 9.78 mmol, 1.0當量)、乙醯胺(686 mg, 11.6 mmol, 1.0當量)、K3 PO4 (2.26 g, 10.6 mmol, 1.1當量)、氯化鈀(π-桂醯基)二聚體(75.2 mg, 145 µmol, 1.5 mol%)及Xantphos (168 mg, 290 µmol, 3.0 mol%)懸浮於二噁烷(20 mL)中。將反應混合物用Ar氣氛吹掃,並在回流下攪拌2小時直至達成完全轉化為止。在50℃下,添加濃HCl (36%, 83 µL, 968 mmol, 0.1當量)及水(40 mL)。使反應進一步冷卻並在室溫下攪拌2小時。將沈澱物過濾,用水洗滌並在真空中進一步乾燥,得到期望產物。若需要,則藉由層析純化粗產物E-6a (tret = 1.123 min;[M+H]+ = 301.0;HPLC方法D_LC_SSTD)。
中間體 E-7 之合成
用於合成 E-7a 之實驗程序:

將乙醯胺E-6a (2.50 g, 8.33 mmol, 1.0當量)懸浮於甲醇NH3 (7 M, 20 mL)中並在室溫下攪拌5天,直至達成E-6a 之完全轉化為止。將溶劑在真空中去除,且將固體殘餘物溶解於甲醇(10 mL)中。將NaOH水溶液(1 M, 10 mL)添加至反應混合物,且將反應在50℃下攪拌20分鐘。將反應混合物過濾,用甲醇(5 mL)洗滌殘餘固體並使用HCl水溶液(1 M,約10 mL)將濾液中和。將沈澱物過濾,用水及乙腈洗滌並在真空中進一步乾燥,得到期望產物。若需要,則藉由層析純化粗產物E-7a (tret = 0.885 min;[M+H]+ = 268.0;HPLC方法D_LC_SSTD)。
本發明之化合物 (I) 之合成
用於合成 I-1 之實驗程序

A-7a (272.0 mg, 0.586 mmol, 1.0當量)溶解於2-丙醇(0.5 mL)中。添加5 N HCl水溶液(586 µL, 2.928 mmol, 5.0當量),且將所得混合物在50℃下攪拌1小時,直至觀察到起始材料之完全轉化為止。利用氨水使反應混合物鹼化,過濾且藉由鹼性反相層析(梯度溶析:於水中之20%至60%乙腈)純化濾液,得到期望產物。
用於合成 I-97 之實驗程序

E-7a (1.00 g, 3.74 mmol, 1.0當量)懸浮於MeCN (20 mL)中。添加K3 PO4 (2.00 g, 9.42 mmol, 2.5當量)及六氯環三磷氮烯(1.30 g, 3.74 mmol, 1.0當量),且將反應混合物在室溫下攪拌1小時。添加苯乙胺鹽酸鹽B-5k (930 mg, 4.12 mmol, 1.1當量),且將反應混合物再攪拌1小時。添加NH3 水溶液(25%, 2.0 mL),且在1小時之後添加飽和K2 CO3 溶液(20 mL)。將雙相反應混合物在室溫下攪拌16小時,且將有機層在真空中濃縮。若需要,則藉由層析純化粗產物I-97
以下化合物I (表20)可自不同縮醛A-7 起始或自不同構建單元E-7B-5 起始以類似方式獲得。若需要,則藉由層析純化粗產物。


20
用於合成 I-104 I-105 之實驗程序

A-7ct (90 mg, 0.196 mmol, 1.0當量)溶解於2-丙醇(0.5 mL)中。添加2 N HCl水溶液(500 µL, 1.000 mmol, 5.1當量),且將所得混合物在50℃下攪拌3小時,直至觀察到起始材料之完全轉化為止。利用氨水使反應混合物鹼化,過濾且藉由鹼性反相層析(梯度溶析:於水中之15%至85%乙腈)純化濾液,得到期望產物。
以下化合物I (表21)可自不同嘧啶A-7 起始以類似方式獲得。若需要,則藉由層析純化粗產物。
21
用於合成 I-110 之實驗程序

A-7ak (56.0 mg, 0.120 mmol, 1.0當量)溶解於2-丙醇(0.5 mL)中。添加2 N HCl水溶液(500 µL, 1.000 mmol, 8.3當量),且將所得混合物在50℃下攪拌1小時,直至觀察到起始材料之完全轉化為止。添加2 M NaOH水溶液(500 µL, 1.000 mmol, 8.3當量),且將所得混合物在室溫下再攪拌1小時,直至觀察到中間體之完全轉化為止。將反應混合物過濾且藉由鹼性反相層析(梯度溶析:於水中之30%至70%乙腈)純化濾液,得到期望產物。
以下化合物I (表22)可自不同嘧啶A-7 起始以類似方式獲得。對於一些化合物之製備,亦已使用其他鹼(如氨水)代替NaOH水溶液。若需要,則藉由層析純化粗產物。
22




用於合成 I-131 之實驗程序

I-1 (179.0 mg, 0.445 mmol, 1.0當量)溶解於乙腈(1.5 mL)中。逐滴添加NBS (80.8 mg, 0.454 mmol, 1.0當量)於乙腈(0.5 mL)中之溶液,且將所得混合物在室溫下攪拌1小時,直至觀察到起始材料之完全轉化為止。用DCM稀釋反應混合物且用水洗滌。將有機層合併,乾燥(MgSO4 )並在減壓下濃縮以提供期望產物I-131
以下化合物I (表23)可自不同化合物I 起始以類似方式獲得。若需要,則藉由層析純化粗產物。
23





用於合成 I-155 之實驗程序

I-131 (23.0 mg, 0.048 mmol, 1.0當量)溶解於二噁烷(0.75 mL)及水(0.25 mL)中。添加碳酸銫(90%, 26.0 mg, 0.072 mmol, 1.5當量)、雙(二苯基膦基)二茂鐵]二氯鈀(II) (與DCM複合) (3.9 mg, 0.005 mmol, 0.1當量)及三甲基硼氧六環(99%, 7.5 µL, 0.054 mmol, 1.1當量)。用氬吹掃燒瓶,且將反應混合物在100℃下攪拌16小時,直至觀察到起始材料之完全轉化為止。用DCM稀釋反應混合物,且用NaHCO3 水溶液洗滌。將有機層合併,乾燥(MgSO4 )並在減壓下濃縮。藉由鹼性反相層析(梯度溶析:於水中之25%至85%乙腈)進行純化得到期望產物。
以下化合物I (表24)可自不同化合物I 起始以類似方式獲得。若需要,則藉由層析純化粗產物。
24




用於合成 I-179 之實驗程序

I-137 (50.0 mg, 0.107 mmol, 1.0當量)溶解於二噁烷(0.8 mL)及水(0.2 mL)中。添加碳酸鉀(90%, 33.0 mg, 0.214 mmol, 2.0當量)、雙(二苯基膦基)二茂鐵]二氯鈀(II) (與DCM複合) (9.0 mg, 0.011 mmol, 0.1當量)及環丙基酸(14.0 mg, 0.161 mmol, 1.5當量)。用氬吹掃燒瓶,且將反應混合物在100℃下攪拌4小時,直至觀察到起始材料之完全轉化為止。用DCM稀釋反應混合物,且用NaHCO3 水溶液洗滌。將有機層合併,乾燥(MgSO4 )並在減壓下濃縮。藉由鹼性反相層析(梯度溶析:於水中之25%至85%乙腈)進行純化得到期望產物(HPLC方法:LCMSBAS1, tret. = 1.27 min;[M+H]+ = 429;IC50 = 11 nM)。
以下實例闡述本發明化合物之生物活性,而不將本發明限於該等實例。
(I) 化合物之特徵在於其在治療領域中之許多可能應用。
KRAS::SOS1 AlphaScreen 結合分析
此分析可用於檢驗化合物抑制SOS1與KRAS G12D之間的蛋白質-蛋白質相互作用之功效。此展示化合物之分子作用模式。低IC50 值指示SOS1抑制劑化合物在此分析設置中之高功效:
試劑:
• 內部產生的帶GST標籤之SOS1 (564_1049_GST_TEV_ECO)
• GST-TEV-SOS1 (564 -1049)係購自Viva Biotech Ltd.
• 6×His-Tev-K-RasG12D(1-169)Avi係購自Xtal BioStructures, Inc. (批號X129-110)
• GDP (Sigma目錄號G7127)
• AlphaLISA麩胱甘肽接受體珠粒(PerkinElmer,目錄號AL109)
• AlphaScreen鏈黴抗生物素蛋白(Streptavidin)供體珠粒(PerkinElmer目錄號6760002)
• 分析板:Proxiplate-384 PLUS,白色(PerkinElmer,目錄號6008289)
分析緩衝液:
• 1 × PBS
• 0.1% BSA
• 100 µM EDTA或無EDTA (除非其用星號標記,否則表格中之IC50 係在無EDTA之情形下量測)
• 0.05% Tween 20
KRAS::SOS1 GDP混合物:
在使用之前將10 nM (最終分析濃度) KRAS G12D、10 µM (最終分析濃度) GDP及5 nM (最終分析濃度) GST-SOS1 混合於分析緩衝液中並保持在室溫下。
珠粒混合物:
在使用之前將AlphaLISA麩胱甘肽接受體珠粒及AlphaScreen鏈黴抗生物素蛋白供體珠粒以各自10 µg/mL之濃度(最終分析濃度)混合於分析緩衝液中並保持在室溫下。
分析方案:
將化合物稀釋至100 µM之最終起始濃度且以一式兩份進行測試。使用Access Labcyte工作站利用Labcyte Echo 550或555聲學分配器產生分析準備板(Assay-ready plate,ARP)。對於起始濃度為100 µM之化合物,將150 nL化合物溶液以連續1:5稀釋之11個濃度一式兩份轉移至每孔。
使用全自動化機器人系統在低於100 Lux之黑暗房間中進行該分析。將10 µL KRAS::SOS1 GDP混合物添加至管柱1-24中至150 nL化合物溶液(該分析中之最終稀釋1:100,最終DMSO濃度1%)。
30分鐘培育時間之後,將5 µL珠粒混合物添加至管柱1-23中。將板於黑暗培育器中保持在室溫下。再培育60分鐘之後,使用PerkinElmer Envision HTS多標記讀取器使用來自PerkinElmer之AlphaScreen規範來量測信號。每一板含有以下對照:
• 經稀釋之DMSO + KRAS::SOS1 GDP混合物+珠粒混合物
• 經稀釋之DMSO + KRAS::SOS1 GDP混合物
結果計算:
使用4參數對數模型來計算並分析IC50 值。
本文所揭示之實例化合物表格含有使用以上分析測定之IC50 值。
細胞增殖分析
細胞增殖分析用於檢驗化合物在活體外抑制SOS1介導之癌細胞系增殖、生長及細胞凋亡之功效。此展示化合物之分子作用模式。低IC50 值指示SOS1抑制劑化合物在此分析設置中之高功效。具體而言,觀察到SOS1抑制劑化合物對KRAS突變人類癌細胞系之增殖展示強效抑制性效應,而不對BRAF V600E突變癌細胞系或非成癮KRAS野生型人類癌細胞系展示強效抑制性效應。此證實SOS1抑制劑化合物端視於RAS家族蛋白質功能,選擇性地靶向癌細胞之分子作用模式。
利用以下人類細胞系以三維(3D)非錨定依賴性軟瓊脂條件實施細胞增殖分析:
NCI-H358:具有KRAS G12C突變之人類非小細胞肺癌(NSCLC);
PC-9:具有野生型KRAS及EGFR缺失19突變之人類非小細胞肺癌(NSCLC);
NCI-H1792:具有KRAS G12C突變之人類非小細胞肺癌(NSCLC);
SW900:具有KRAS G12V突變之人類非小細胞肺癌(NSCLC);
A-549:具有KRAS G12S突變之人類非小細胞肺癌(NSCLC);
NCI-H2122:具有KRAS G12C突變之人類非小細胞肺癌(NSCLC);
NCI-H520:具有野生型KRAS之人類非小細胞肺癌(NSCLC);MIA PaCa-2:具有KRAS G12C突變之人類胰臟癌細胞(PAC);
DLD-1:具有KRAS G13D突變之人類結腸癌;
A-375:具有野生型KRAS但具有BRAFV600E突變之人類黑色素瘤癌,其用作在利用SOS1抑制劑化合物治療後無反應之細胞系;
所有細胞系(PC-9除外)均可自美國模式培養物保藏所(American Type Culture Collection,ATCC)購得。PC-9可自歐洲驗證細胞培養物保藏所(European Collection of Authenticated Cell Cultures,ECACC)購得。
所用材料
96孔Ultra低結合板,來自Corning (CLS2474-24EA);
4%瓊脂糖凝膠1 ×液體40 mL,來自Gibco (18300-012);
RPMI-1640培養基(ATCC® 30-2001™);
Leibovitz´s L-15 (Gibco,目錄號11415);
F-12K (ATCC,目錄號30-2004);
DMEM (Lonza BE12-604F);胎牛血清(FBS),來自HyClone (SH30071.03);
Alamar Blue,來自Invitrogen (DAL1100CSTM1)
細胞培養
使用RPMI培養基使NCI-H358細胞(ATCC HTB-182)、DLD-1細胞(ATCC CCL-221)、NCI-H520細胞(ATCC HTB-182)、PC-9細胞(ECACC 90071810)、NCI-H1792細胞(ATCC CRL-5895)及NCI-H2122細胞(ATCC CRL-5985)生長於細胞培養瓶(175 cm2 )中。SW900細胞(ATCC HTB-59)生長於Leibovitz’s L-15培養基中,A-549細胞(ATCC CCL-185)生長於F12K培養基中,MIA PaCa-2細胞(ATCC CRL-1420)及A-375 (ATCC-CRL-1619)生長於DMEM培養基中。針對所有所列示細胞系之細胞培養基均補充有10% FBS。培養物係在37℃及5% CO2 下於潮濕氣氛中培育,其中一週進行2-3次培養基更換或轉種。SW900細胞係在不添加CO2 之情形下培養。
分析條件
分析設置係由以下構成:
• 底部層,其由90 µL包括1.2%瓊脂糖之培養基組成
• 細胞層,其由60 µL包括0.3%瓊脂糖之培養基組成
• 頂部層,其由30 µL包括測試化合物(無瓊脂糖)之培養基組成
對於底部層之製備,將4%瓊脂糖(微波加熱)與培養基(對於所有細胞系(SW900除外)均包括2% FBS,對於SW900,使用10% FCS以達成細胞生長)混合直至培養基中瓊脂糖之最終稀釋為1.2%。每一孔填充有90 µL底部層懸浮液且冷卻至室溫持續1小時。對於細胞層,使細胞胰蛋白酶化,計數並平鋪於60 µL包括0.3%瓊脂糖之培養基(2% FBS)中(1500個細胞/孔)。在冷卻至室溫持續1小時後,將板在37℃及5% CO2 下於潮濕氣氛中培育過夜。第二天,以一式三份添加化合物(30 µL連續稀釋液)。測試化合物之濃度覆蓋10微莫耳與0.13奈莫耳(最低)之間的範圍。於培養基中稀釋化合物(原液:10 mM於100% DMSO中)。將細胞在37℃及5% CO2 下於潮濕氣氛中培育14天。
檢測
每孔添加20 µL/孔AlamarBlue懸浮液且在培育器中培育4-24小時。使用螢光讀數儀(2030 VICTOR X5, Perkin Elmer)測定螢光強度。激發波長為544/15 nm,發射590 nm。在單一療法中,使用具有可變希爾斜率(hill slope)之S形曲線分析程式(GraphPAD Prism)藉由迭代計算來擬合數據以確定IC50 值。
ERK 磷酸化分析
ERK磷酸化分析用於檢驗化合物在活體外抑制SOS1介導之KRAS突變人類癌細胞系中之信號轉導之功效。此藉由干擾RAS家族蛋白質信號轉導級聯來展示化合物之分子作用模式。低IC50 值指示SOS1抑制劑化合物在此分析設置中之高功效。觀察到SOS1抑制劑化合物對KRAS突變人類癌細胞系中之ERK磷酸化展示抑制性效應,由此證實SOS1抑制劑化合物對RAS家族蛋白質信號轉導之分子作用模式。
使用以下人類細胞系來實施ERK磷酸化分析:
DLD-1 (ATCC CCL-221):具有KRAS G13D突變之人類結腸癌;
所用材料
RPMI-1640培養基(ATCC® 30-2001™)
胎牛血清(FBS),來自HyClone (SH30071.03)
非必需胺基酸,來自Thermo Fischer Scientific (11140035)
丙酮酸鹽,來自Thermo Fischer Scientific (11360039)
Glutamax,來自Thermo Fischer Scientific (35050061)
384板,來自Greiner Bio-Glutamax (781182)
Proxiplate™ 384,來自PerkinElmer Inc. (6008280)
AlphaLISA SureFire Ultra p-ERK1/2 (Thr202/Tyr204)分析套組(ALSU-PERK-A500)
EGF,來自Sigma (E4127)
接受體混合物:蛋白質A接受體珠粒,來自PerkinElmer (6760137M)
供體混合物:AlphaScreen鏈黴抗生物素蛋白塗覆之供體珠粒,來自PerkinElmer (6760002)
曲美替尼
星狀孢菌素(Staurosporine),來自Sigma Aldrich (S6942)
分析設置:
於Greiner TC 384板中將DLD-1細胞(ATCC CCL-221)以50,000個細胞/孔接種於/60 µL具有10% FBS、非必需胺基酸、丙酮酸鹽及glutamax之RPMI中。將細胞在室溫下培育1小時,且然後於培育器中在37℃及5% CO2 下於潮濕氣氛中培育過夜。然後使用Labcyte Echo 550裝置添加60 nL化合物溶液(10 mM DMSO原液)。在上文所提及之培育器中培育1小時之後,添加3 µL表皮生長因子(EGF,最終濃度50 ng/mL)。10分鐘後,將培養基去除,且藉由添加20 µL來自AlphaLISA SureFire Ultra pERK1/2 (Thr202/Tyr204)分析套組之具有添加的蛋白酶抑制劑、100 nM曲美替尼+ 100 nM星狀孢菌素之1.6倍溶解緩衝液來溶解細胞。在室溫下振盪培育20分鐘之後,將6 µL每一溶解物樣品轉移至384孔Proxiplate且利用AlphaLISA SureFire Ultra pERK1/2 (Thr202/Tyr204)分析套組分析pERK (Thr202/Tyr204)。在柔和光下添加3 µL接受體混合物及3 µL供體混合物,且在黑暗中在室溫下培育2小時,之後在Perkin Elmer Envision讀板儀上使用針對Proxiplate之384 AlphaScreen設置來量測信號。藉由迭代計算利用可變希爾斜率來擬合數據。使用預設擬合曲線來擬合S形曲線斜率以確定IC50 值。
表25顯示利用所揭示分析獲得之用於選擇本發明化合物(I) 之數據。


25
代謝 ( 微粒體 ) 穩定性分析:
利用合併之肝微粒體(小鼠(MLM)、大鼠(RLM)或人類(HLM))在37℃下分析測試化合物之代謝降解。74 µL/時間點之最終培育體積含有TRIS緩衝液(pH 7.5;0.1 M)、氯化鎂(6.5 mM)、微粒體蛋白(小鼠/大鼠0.5 mg/mL,人類試樣1 mg/mL)及最終濃度為1 µM之測試化合物。在37℃下較短之預培育期後,藉由添加8 µL還原型β-菸鹼醯胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADPH, 10 mM)起始反應且藉由在不同時間點後將等分試樣轉移至溶劑中來終止。另外,在無NADPH之培育物中監測NADPH非依賴性降解,在最後時間點藉由添加乙腈終止。藉由離心(1811 g, 5 min)粒化淬滅之培育物。藉由LC-MS/MS分析上清液之等分試樣中母化合物之量。
自在微粒體培育期間測試藥物之消失時程計算活體外固有清除率(CL固有,活體外 )。將每一圖擬合至呈C (t ) =C 0 *exp(-ke *t )形式之一階消除速率常數,其中C (t )及C 0 係在培育時間t 及預培育時之不變測試藥物之濃度且ke 係不變藥物之消失速率常數。隨後,將CL固有,活體外 (μL min-1 ·蛋白質量)值轉換為全身之CL固有,活體外 (mL min-1 ·kg-1 )。使用生理參數將CL固有,活體外 數據放大。為更佳地進行跨物種比較,將預測清除率表示為個別物種中肝血流之百分比[QH%]。一般而言,期望化合物跨物種之高穩定性(對應於低QH%)。
表26顯示利用所揭示分析獲得之用於選擇本發明化合物(I) 之代謝穩定性數據。
26
CYP3A4 分析之時間依賴性抑制 (TDI 3A4)
在人類肝微粒體(0.02 mg/mL)中利用咪達唑侖(midazolam)(15 µM)作為受質來分析對CYP3A4之時間依賴性抑制。在NADPH存在下使測試化合物以25 uM之濃度與人類肝微粒體(0.2 mg/mL)一起預培育0分鐘及30分鐘。在預培育之後,將培育物以1:10稀釋且添加受質咪達唑侖用於主要培育(15分鐘)。利用乙腈使主要培育淬滅,且經由LC/MS-MS量化羥基-咪達唑侖之形成。羥基-咪達唑侖自30分鐘預培育之形成相對於自0分鐘預培育之形成用作讀出。小於100%之值意指與0分鐘預培育相比,受質咪達唑侖在30分鐘預培育時代謝至較低程度。一般而言,期望在30分鐘預培育時之較低效應(對應於接近100%之值)。
表27顯示利用所揭示分析獲得之用於選擇本發明化合物(I) 之數據。
27
脫靶可能性之測定
某些靶標(44個)均視為與活體內不良藥物反應強烈相關,如出版物Reducing safety-related drug attrition: the use of in vitro pharmacological profiling , Nature Review Drug Discovery 11, 909-922 (2012年12月)中所提及。此論文係若干家大型製藥公司安全性藥理學小組之間的協同合作,目的係確立活體外藥理學分析之核心組套(panel)。Eurofins Cerep (France)商業上提供對其SafetyScreen44TM 組套之量測(包含該等脫靶)以在初步安全性評價中進行合理第一步。可針對此組套分析本發明之化合物(I) 以研究脫靶可能性。
治療用途
由於其生物性質,本發明之化合物、其互變異構物、外消旋物、鏡像異構物、非鏡像異構物、其混合物及所有以上所提及形式之鹽可適於治療特徵在於過度或異常細胞增殖之疾病(例如癌症)。
舉例而言,可利用本發明之化合物治療以下癌症、腫瘤及其他增殖性疾病,但並不限於此:
頭部及頸部之癌症/腫瘤/癌:例如以下之腫瘤/癌/癌症:鼻腔、鼻旁竇、鼻咽、口腔(包括嘴唇、牙齦、牙槽脊、臼齒後三角(retromolar trigone)、口腔底、舌、硬齶、頰黏膜)、口咽(包括舌底、扁桃腺、扁桃弓、軟齶、扁桃體窩、咽壁)、中耳、喉(包括上喉部、聲門、聲門下、聲帶)、下嚥、唾液腺(包括小唾液腺);
肺之癌症/腫瘤/癌:例如非小細胞肺癌(NSCLC) (鱗狀細胞癌、梭形細胞癌、腺癌、大細胞癌、透明細胞癌、細支氣管肺泡)、小細胞肺癌(SCLC) (燕麥細胞癌、中間細胞癌、合併燕麥細胞癌);
縱膈之贅瘤:例如神經性腫瘤(包括神經纖維瘤、神經鞘瘤、惡性神經鞘瘤、神經肉瘤、神經節神經母細胞瘤、神經節瘤、神經胚細胞瘤、嗜鉻細胞瘤、副神經節瘤)、生殖細胞瘤(包括精原細胞瘤、畸胎瘤、非精原細胞瘤)、胸腺腫瘤(包括胸腺瘤、胸腺脂肪瘤、胸腺癌、胸腺類癌)、間質瘤(包括纖維瘤、纖維肉瘤、脂肪瘤、脂肪肉瘤、黏液瘤、間皮瘤、平滑肌瘤、平滑肌肉瘤、橫紋肌肉瘤、黃色肉芽腫、間葉瘤、血管瘤、血管內皮瘤、血管外皮細胞瘤、淋巴管瘤、淋巴管外皮細胞瘤、淋巴管肌瘤);
胃腸(GI)道之癌症/腫瘤/癌:例如以下之腫瘤/癌/癌症:食道、胃(胃癌)、胰臟、肝及膽道系統(包括肝細胞癌(HCC),例如兒童期HCC、纖維板層HCC、合併HCC、梭形細胞HCC、透明細胞HCC、巨細胞HCC、癌肉瘤HCC、硬化性HCC;肝母細胞瘤;膽道癌;膽管細胞癌;肝囊腺癌;血管肉瘤、血管內皮瘤、平滑肌肉瘤、惡性神經鞘瘤、纖維肉瘤、克拉茨金瘤(Klatskin tumor))、膽囊、肝外膽管、小腸(包括十二指腸、空腸、迴腸)、大腸(包括盲腸、結腸、直腸、肛門;結腸直腸癌、胃腸間質腫瘤(GIST))、泌尿生殖系統(包括腎,例如腎盂、腎細胞癌(RCC)、腎胚細胞瘤(維爾姆斯氏腫瘤(Wilms’ tumor))、腎上腺樣瘤、格拉維茨氏瘤(Grawitz tumor);輸尿管;膀胱,例如臍尿管癌、尿路上皮癌;尿道,例如遠端、球膜、前列腺;前列腺(雄激素依賴性、雄激素非依賴性、閹割抗性、激素非依賴性、激素抵抗性)、陰莖);
睪丸之癌症/腫瘤/癌:例如精原細胞瘤、非精原細胞瘤,
婦科癌症/腫瘤/癌:例如以下之腫瘤/癌/癌症:卵巢、輸卵管、腹膜、子宮頸、陰門、陰道、子宮體(包括子宮內膜、子宮底);
乳房之癌症/腫瘤/癌:例如乳癌(浸潤性導管癌、膠質性癌、小葉侵襲性癌、管狀癌、腺體樣囊狀癌、乳頭狀癌、髓樣癌、黏液癌)、激素受體陽性乳癌(雌激素受體陽性乳癌、助孕酮受體陽性乳癌)、Her2陽性乳癌、三陰性乳癌、乳房之佩吉特氏病(Paget’s disease);
內分泌系統之癌症/腫瘤/癌:例如以下之腫瘤/癌/癌症:內分泌腺、甲狀腺(甲狀腺癌/腫瘤;乳頭狀、濾泡狀、未分化性、髓樣)、副甲狀腺(副甲狀腺癌/腫瘤)、腎上腺皮質(腎上腺皮質癌/腫瘤)、腦下腺(包括促乳素瘤、顱咽管瘤)、胸腺、腎上腺、松果腺、頸動脈體、胰島細胞腫瘤、副神經節、胰臟內分泌腫瘤(PET;非功能性PET、胰多肽瘤(PPoma)、胃泌素瘤、胰島素瘤、血管活性腸肽瘤(VIPoma)、升糖素瘤、體抑素瘤、生長激素釋放因子瘤(GRFoma)、促腎上腺皮質素瘤(ACTHoma))、類癌腫瘤;
軟組織之肉瘤:例如纖維肉瘤、纖維性組織細胞瘤、脂肪肉瘤、平滑肌肉瘤、橫紋肌肉瘤、血管肉瘤、淋巴管肉瘤、卡波西氏肉瘤(Kaposi’s sarcoma)、血管球瘤、血管外皮細胞瘤、滑膜肉瘤、腱鞘巨細胞瘤、胸膜及腹膜之單發性纖維瘤、瀰漫型間皮瘤、惡性周圍神經鞘瘤(MPNST)、顆粒細胞瘤、明亮細胞肉瘤、黑色素細胞神經鞘瘤、神經叢肉瘤(plexosarcoma)、神經胚細胞瘤、神經節神經母細胞瘤、神經上皮瘤、骨外尤恩氏肉瘤(extraskeletal Ewing’s sarcoma)、副神經節瘤、骨外軟骨肉瘤、骨外骨肉瘤、間葉瘤、腺泡狀軟組織肉瘤、上皮樣肉瘤、腎外橫紋肌樣瘤、促結締組織增生性小細胞腫瘤;
骨肉瘤:例如骨髓瘤、網狀細胞肉瘤、軟骨肉瘤(包括中央軟骨肉瘤、外周軟骨肉瘤、透明細胞軟骨肉瘤、間葉型軟骨肉瘤)、骨肉瘤(包括骨膜外骨肉瘤、骨膜骨肉瘤、高級別表面骨肉瘤、小細胞骨肉瘤、輻射誘發之骨肉瘤、佩吉特氏病肉瘤)、尤恩氏腫瘤、惡性巨細胞瘤、牙釉質瘤、(纖維性)組織細胞瘤、纖維肉瘤、脊索瘤、小圓細胞肉瘤、血管內皮瘤、血管外皮細胞瘤、骨軟骨瘤、骨樣骨瘤、成骨細胞瘤、嗜伊紅球性肉芽腫、軟骨胚細胞瘤;
間皮瘤:例如胸膜間皮瘤、腹膜間皮瘤;
皮膚之癌症:例如基底細胞癌、鱗狀細胞癌、默克爾氏細胞癌(Merkel´s cell carcinoma)、黑色素瘤(包括皮膚性黑色素瘤、表淺擴散型黑色素瘤、惡性小痣性黑色素瘤、肢端小痣性黑色素瘤、結節性黑色素瘤、眼內黑色素瘤)、日光性角化症、眼瞼癌;
中樞神經系統及腦之贅瘤:例如星細胞瘤(大腦星細胞瘤、小腦星細胞瘤、瀰漫性星細胞瘤、原纖維性星細胞瘤、未分化性星細胞瘤、毛細胞性星細胞瘤、原漿性星細胞瘤、肥胖細胞性星細胞瘤)、神經膠母細胞瘤、神經膠質瘤、寡樹突神經膠細胞瘤、寡星細胞瘤、室管膜瘤、室管膜母細胞瘤、脈絡叢腫瘤、髓母細胞瘤、腦脊髓膜瘤、神經鞘瘤、血管母細胞瘤、血管瘤、血管外皮細胞瘤、神經瘤、神經節瘤、神經胚細胞瘤、視網膜母細胞瘤、喉神經鞘瘤(例如聽覺)、脊軸腫瘤;
淋巴瘤及白血病:例如B細胞非霍奇金氏淋巴瘤(non-Hodgkin lymphoma,NHL) (包括小淋巴球性淋巴瘤(SLL)、淋巴漿細胞樣淋巴瘤(LPL)、外套細胞淋巴瘤(MCL)、濾泡性淋巴瘤(FL)、瀰漫性大細胞淋巴瘤(DLCL)、柏基特氏淋巴瘤(Burkitt’s lymphoma,BL))、T細胞非霍奇金氏淋巴瘤(包括未分化大細胞淋巴瘤(ALCL)、成年T細胞白血病/淋巴瘤(ATLL)、皮膚T細胞淋巴瘤(CTCL)、外周T細胞淋巴瘤(PTCL))、淋巴母細胞性T細胞淋巴瘤(T-LBL)、成年T細胞淋巴瘤、淋巴母細胞性B細胞淋巴瘤(B-LBL)、免疫細胞瘤、慢性B細胞淋巴球性白血病(B-CLL)、慢性T細胞淋巴球性白血病(T-CLL)、B細胞小淋巴球性淋巴瘤(B-SLL)、皮膚T細胞淋巴瘤(CTLC)、原發性中樞神經系統淋巴瘤(PCNSL)、免疫母細胞瘤、霍奇金氏病(HD) (包括結節性淋巴球為主型HD (NLPHD)、結節硬化性HD (NSHD)、混合細胞型HD (MCHD)、富含淋巴球經典型HD、淋巴球減少型HD (LDHD))、大顆粒性淋巴球白血病(LGL)、慢性骨髓性白血病(CML)、急性骨髓性/髓性白血病(AML)、急性淋巴/淋巴母細胞性白血病(ALL)、急性前骨髓細胞性白血病(APL)、慢性淋巴球性/淋巴白血病(CLL)、幼淋巴球性白血病(PLL)、毛細胞白血病、慢性骨髓性/髓性白血病(CML)、骨髓瘤、漿細胞瘤、多發性骨髓瘤(MM)、漿細胞瘤、骨髓發育不良症候群(MDS)、慢性骨髓單核球性白血病(CMML);
原發灶不明之癌症(CUP);
上文所提及之特徵在於其在體內之特定位置/起源之所有癌症/腫瘤/癌意欲包括原發性腫瘤及源自其之轉移性腫瘤二者。
上文所提及之所有癌症/腫瘤/癌可藉由其組織病理學分類進行進一步區分:
上皮癌症,例如鱗狀細胞癌(SCC) (原位癌、表淺侵襲性癌、疣狀癌、假性肉瘤、未分化型癌、移行細胞癌、淋巴上皮癌)、腺癌(AC) (分化良好型腺癌、黏液性腺癌、乳頭狀腺癌、多形性巨細胞腺癌、導管腺癌、小細胞腺癌、戒環細胞腺癌、梭形細胞腺癌、透明細胞腺癌、燕麥細胞腺癌、膠樣腺癌、腺鱗性腺癌、黏液表皮樣腺癌、腺樣囊性腺癌)、黏液性囊腺癌、腺泡細胞癌、大細胞癌、小細胞癌、神經內分泌腫瘤(小細胞癌、副神經節瘤、類癌);嗜酸性細胞癌;
非上皮癌,例如肉瘤(纖維肉瘤、軟骨肉瘤、橫紋肌肉瘤、平滑肌肉瘤、血管肉瘤、巨細胞肉瘤、淋巴肉瘤、纖維性組織細胞瘤、脂肪肉瘤、血管肉瘤、淋巴管肉瘤、神經纖維肉瘤)、淋巴瘤、黑色素瘤、生殖細胞瘤、血液腫瘤、混合型及未分化型癌;
本發明之化合物可用於第一線、第二線或任何其他線之治療背景中之治療性方案中。
本發明之化合物可用於預防、短期或長期治療上文所提及之疾病,視情況亦與放射療法及/或手術組合。
當然,上文亦包括本發明之化合物在治療以上疾病之各種方法中藉由向有需要之患者投與治療有效劑量之用途,以及該等化合物用於製造用於治療此等疾病之藥劑之用途,以及包括本發明之此等化合物之醫藥組合物,以及包括本發明之此等化合物之藥劑之製備及/或製造及諸如此類。
與其他活性物質之組合
本發明之化合物可單獨使用或與一或若干種其他藥理學活性物質組合使用,該等其他藥理學活性物質係例如現有技術或標準照護化合物,例如細胞增殖抑制劑、抗血管生成物質、類固醇或免疫調節劑/檢查點抑制劑及諸如此類。
可與本發明之化合物組合投與之藥理學活性物質包括(但不限於)激素、激素類似物及抗激素(例如他莫昔芬(tamoxifen)、托瑞米芬(toremifene)、雷洛昔芬(raloxifene)、氟維司群(fulvestrant)、乙酸甲地孕酮、氟他胺、尼魯米特(nilutamide)、比卡魯胺(bicalutamide)、胺魯米特(aminoglutethimide)、乙酸環丙孕酮、非那雄胺(finasteride)、乙酸布舍瑞林(buserelin acetate)、氟氫可體松(fludrocortisone)、氟羥甲基睪酮(fluoxymesterone)、甲羥助孕酮、奧曲肽(octreotide))、芳香酶抑制劑(例如阿那曲唑(anastrozole)、來曲唑(letrozole)、利阿唑(liarozole)、伏氯唑(vorozole)、依西美坦(exemestane)、阿他美坦(atamestane))、LHRH激動劑及拮抗劑(例如乙酸戈舍瑞林(goserelin acetate)、亮丙瑞林(leuprolide))、生長因子及/或其相應受體(諸如血小板源生長因子(PDGF)、纖維母細胞生長因子(FGF)、血管內皮生長因子(VEGF)、表皮生長因子(EGF)、胰島素樣生長因子(IGF)、人類表皮生長因子(HER,例如HER2、HER3、HER4)及肝細胞生長因子(HGF)等生長因子及/或其相應受體)之抑制劑,抑制劑係例如(抗)生長因子抗體、(抗)生長因子受體抗體及酪胺酸激酶抑制劑,例如西妥昔單抗、吉非替尼、阿法替尼、尼達尼布、伊馬替尼、拉帕替尼、伯舒替尼(bosutinib)、貝伐珠單抗及曲妥珠單抗);抗代謝物(例如抗葉酸劑,例如胺甲喋呤(methotrexate)、雷替曲塞(raltitrexed)、嘧啶類似物(例如5-氟尿嘧啶(5-FU))、核糖核苷及去氧核糖核苷類似物、卡培他濱及吉西他濱、嘌呤及腺苷類似物(例如巰嘌呤、硫鳥嘌呤、克拉屈濱(cladribine)及噴司他汀(pentostatin))、阿糖胞苷(ara C)、氟達拉濱(fludarabine));抗腫瘤抗生素(例如蒽環類,例如多柔比星(doxorubicin)、多克希爾(doxil)(聚乙二醇化脂質體鹽酸多柔比星、美斯特(myocet)(非聚乙二醇化脂質體多柔比星)、道諾黴素(daunorubicin)、泛艾黴素(epirubicin)及伊達比星(idarubicin)、絲裂黴素-C、博來黴素(bleomycin)、放線菌素D (dactinomycin)、普卡黴素(plicamycin)、鏈脲黴素(streptozocin));鉑衍生物(例如順鉑、奧沙利鉑、卡鉑);烷基化劑(例如雌氮芥、二氯甲基二乙胺(meclorethamine)、美法侖(melphalan)、氮芥苯丁酸(chlorambucil)、白消安(busulphan)、達卡巴嗪(dacarbazin)、環磷醯胺、異環磷醯胺、替莫唑胺(temozolomide)、亞硝基脲(例如卡莫司汀(carmustin)及洛莫司汀(lomustin))、噻替派(thiotepa));抗有絲分裂劑(例如長春花生物鹼(Vinca alkaloid),例如長春鹼(vinblastine)、長春地辛(vindesin)、長春瑞濱(vinorelbin)及長春新鹼(vincristine);及紫杉烷,例如太平洋紫杉醇、多西他賽);血管生成抑制劑(例如他喹莫德(tasquinimod));微管蛋白抑制劑;DNA合成抑制劑、PARP抑制劑;拓撲異構酶抑制劑(例如表鬼臼毒素(epipodophyllotoxin),例如依託泊苷(etoposide)及凡畢複(etopophos)、替尼泊苷(teniposide)、安吖啶(amsacrin)、托泊替康、伊立替康、米托蒽醌(mitoxantrone))、絲胺酸/蘇胺酸激酶抑制劑(例如PDK 1抑制劑、Raf抑制劑、A-Raf抑制劑、B-Raf抑制劑、C-Raf抑制劑、mTOR抑制劑、mTORC1/2抑制劑、PI3K抑制劑、PI3Kα抑制劑、雙重mTOR/PI3K抑制劑、STK 33抑制劑、AKT抑制劑、PLK 1抑制劑、CDK抑制劑、極光激酶抑制劑)、酪胺酸激酶抑制劑(例如PTK2/FAK抑制劑)、蛋白質蛋白質相互作用抑制劑(例如IAP活化劑、Mcl-1、MDM2/MDMX)、MEK抑制劑、ERK抑制劑、FLT3抑制劑、BRD4抑制劑、IGF-1R抑制劑、TRAILR2激動劑、Bcl-xL抑制劑、Bcl-2抑制劑、Bcl-2/Bcl-xL抑制劑、ErbB受體抑制劑、BCR-ABL抑制劑、ABL抑制劑、Src抑制劑、雷帕黴素類似物(例如依維莫司、替西羅莫司、利達莫司、西羅莫司(sirolimus))、雄激素合成抑制劑、雄激素受體抑制劑、DNMT抑制劑、HDAC抑制劑、ANG1/2抑制劑、CYP17抑制劑、放射藥劑、蛋白酶體抑制劑、諸如免疫檢查點抑制劑等免疫治療劑(例如CTLA4、PD1、PD-L1、PD-L2、LAG3及TIM3結合分子/免疫球蛋白,例如伊匹單抗、尼沃魯單抗、派姆單抗)、ADCC (抗體依賴性細胞介導之細胞毒性)增強劑(例如抗CD33抗體、抗CD37抗體、抗CD20抗體)、T細胞接合器(例如雙特異性T細胞接合器(BiTEs® ),如例如CD3 × BCMA、CD3 × CD33、CD3 × CD19)、PSMA × CD3)、腫瘤疫苗及各種化學治療劑,例如阿米福汀(amifostin)、阿那格雷(anagrelid)、氯膦酸鹽(clodronat)、非爾司亭(filgrastin)、干擾素、干擾素α、甲醯四氫葉酸、丙卡巴肼(procarbazine)、左旋咪唑、美司鈉(mesna)、米托坦(mitotane)、帕米膦酸(pamidronate)及卟吩姆(porfimer)。
當兩種或更多種物質或原理欲用作組合治療方案之一部分時,其可經由相同投與途徑或經由不同投與途徑、在基本上同一時間(即同時、並行)或不同時間(例如依序、相繼、交替、連續或根據任一其他類型之交替方案)來投與。
當該等物質或原理欲經由相同投與途徑同時投與時,其可作為不同醫藥調配物或組合物或作為組合醫藥調配物或組合物之一部分來投與。同樣,當兩種或更多種活性物質或原理欲用作組合治療方案之一部分時,該等物質或原理中之每一者可以相同量且根據當化合物或原理單獨使用時所使用之相同方案投與,且此組合使用可產生協同效應或可不產生協同效應。然而,當兩種或更多種活性物質或原理之組合使用產生協同效應時,則亦可在仍達成期望治療作用的同時降低欲投與之一種、多種或所有物質或原理之量。此可(例如)在仍獲得期望藥理學或治療效應的同時用於避免、限制或降低與使用該等物質或原理中之一或多者(在其以其通常量使用時)相關的任何不希望之副作用。
當然,上文包括用於與上文組合夥伴組合使用之本發明化合物之製備及製備方法。亦包括用於與本發明之化合物組合使用之上文所提及組合夥伴之製備及製備方法。
此外,本發明亦涵蓋套組,其包含至少一種本發明之化合物及一或多種選自由用於治療如上文所闡述疾病及病症之其他藥物組成之群之其他組分,及如下文所闡述之裝置。
調配物
用於投與本發明之化合物之適宜製劑將對熟習此項技術者顯而易見,且包括(例如)錠劑、丸劑、膠囊、栓劑、菱形錠劑、糖錠劑、溶液(特定而言用於注射(s.c.、i.v.、i.m.)及輸注(可注射物)之溶液)、酏劑、糖漿、小藥囊、乳液、吸入劑或可分散粉末。醫藥活性化合物之含量應在組合物整體之0.1 wt.-%至90 wt.-%、較佳地0.5 wt.-%至50 wt.-%範圍內,即足以達成下文所指定劑量範圍之量。若需要,則每天可分若干次給予指定劑量。
適宜錠劑可藉由(例如)將本發明之活性物質與已知賦形劑(例如惰性稀釋劑、載劑、崩解劑、佐劑、表面活性劑、結合劑及/或潤滑劑)混合來獲得。錠劑亦可包含若干層。
因此,可藉由利用通常用於錠劑包衣之物質(例如可力酮(collidone)或蟲膠、阿拉伯樹膠、滑石、二氧化鈦或糖)將以類似於錠劑之方式產生之核心包衣來製備包衣錠劑。為達成延遲釋放或防止不相容性,核心亦可由許多層組成。類似地,錠劑包衣可由許多層組成以達成延遲釋放,可使用用於錠劑之上文所提及之賦形劑。
含有本發明之活性物質或其組合之糖漿或酏劑可另外含有甜味劑,例如糖精、賽克拉美(cyclamate)、甘油或糖;及增味劑,例如矯味劑,例如香草醛或柑橘提取物。其亦可含有懸浮液佐劑或增稠劑(例如羧甲基纖維素鈉),潤濕劑(例如,脂肪醇與環氧乙烷之縮合產物)或防腐劑(例如對羥基苯甲酸酯)。
注射及輸注用之溶液係以常用方式製備,例如添加等滲劑、防腐劑(例如對羥基苯甲酸酯)或穩定劑(例如乙二胺四乙酸之鹼金屬鹽),視情況使用乳化劑及/或分散劑,同時(例如)若使用水作為稀釋劑,則可視情況使用有機溶劑作為溶劑化劑或溶解助劑,且轉移至注射小瓶或安瓿或輸注瓶中。
含有一或多種活性物質或活性物質組合之膠囊可藉由(例如)將活性物質與惰性載劑(例如乳糖或山梨醇)混合並將其裝入明膠膠囊中來製備。
適宜栓劑可藉由(例如)將其與出於此目的提供之載劑(例如中性脂肪或聚乙二醇或其衍生物)混合來製得。
可使用之賦形劑包括(例如)水;醫藥上可接受之有機溶劑,例如石蠟(例如,石油餾分)、植物油(例如,花生油或芝麻油)、單官能或多官能醇(例如,乙醇或甘油);載劑,例如天然礦物粉末(例如,高嶺土(kaolin)、黏土、滑石、白堊)、合成礦物粉末(例如,高度分散之矽酸及矽酸鹽)、糖(例如,蔗糖、乳糖及葡萄糖)、乳化劑(例如,木質素、亞硫酸鹽廢液、甲基纖維素、澱粉及聚乙烯吡咯啶酮)及潤滑劑(例如,硬脂酸鎂、滑石、硬脂酸及月桂基硫酸鈉)。
藉由常用方法、較佳地藉由經口或經皮途徑、最佳地藉由經口途徑投與製劑。對於經口投與而言,錠劑除上文所提及之載劑以外當然亦可含有諸如檸檬酸鈉、碳酸鈣及磷酸二鈣等添加劑以及諸如澱粉(較佳地馬鈴薯澱粉)、明膠及諸如此類等各種添加劑。此外,諸如硬脂酸鎂、月桂基硫酸鈉及滑石等潤滑劑可同時用於製錠製程。在水性懸浮液之情形下,除上文所提及之賦形劑以外,活性物質亦可與各種增味劑或著色劑組合。
對於非經腸用途而言,可使用活性物質與適宜液體載劑之溶液。
每天可施加之式(I) 化合物之劑量範圍通常在1 mg至2000 mg、較佳地150 mg至1000 mg範圍內。
用於靜脈內使用之劑量為1 mg至1000 mg (以不同輸注速率),較佳地介於5 mg與500 mg之間(以不同輸注速率)。
然而,端視體重、年齡、投與途徑、疾病之嚴重程度、個體對藥物之反應、其調配物之性質及藥物投與時間或間隔(每天一或多個劑量之連續或間歇治療)而定,有時可能需要偏離指定量。因此,在一些情形下,使用低於上文給出之最低劑量可能已足矣,而在其他情形下可能不得不超出上限。當大量投與時,可適當地將其分成許多較小劑量在一天中不同時間投與。
以下調配物實例說明本發明而非限制其範圍:
醫藥調配物之實例
將精細研磨之活性物質、乳糖及一些玉米澱粉混合在一起。使該混合物過篩,然後用聚乙烯吡咯啶酮之水溶液進行潤濕,捏合,濕法製粒並乾燥。將該等顆粒、剩餘玉米澱粉及硬脂酸鎂過篩並混合在一起。壓製該混合物以產生具有適宜形狀及大小之錠劑。
將精細研磨之活性物質、一些玉米澱粉、乳糖、微晶纖維素及聚乙烯吡咯啶酮混合在一起,將混合物過篩並與剩餘玉米澱粉及水一起處理以形成顆粒,使該顆粒乾燥並過篩。添加羧甲基澱粉鈉及硬脂酸鎂並加以混合,並將混合物壓製以形成適宜大小之錠劑。
將活性物質、乳糖及纖維素混合在一起。使該混合物過篩,然後用水進行潤濕,捏合,濕法製粒並乾燥或乾法製粒或直接與硬脂酸鎂進行最終摻和並壓製成具有適宜形狀及大小之錠劑。當濕法製粒時,添加額外之乳糖或纖維素及硬脂酸鎂,且壓製該混合物以產生具有適宜形狀及大小之錠劑。


將活性物質溶解於水中,其pH為水自身的pH或視情況為pH 5.5至6.5,並添加氯化鈉以使溶液具有等滲性。過濾所獲得之溶液以去除致熱源並將濾液在無菌條件下轉移至安瓿中,然後將其滅菌並藉由熔化密封。安瓿含有5 mg、25 mg及50 mg活性物質。

Claims (23)

  1. 一種式(I) 化合物,, 其中R1 Ra1 Ra1 係選自由以下組成之群:C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C2-6 烯基、C2-6 炔基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基,其中該等C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C2-6 烯基、C2-6 炔基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基全部視情況經一或多個相同或不同的Rb1 及/或Rc1 取代; 每一Rb1 獨立地選自由以下組成之群:-ORc1 、-NRc1 Rc1 、鹵素、-CN、-C(O)Rc1 、-C(O)ORc1 、-C(O)NRc1 Rc1 、-S(O)2 Rc1 、-S(O)2 NRc1 Rc1 、-NHC(O)Rc1 、-N(C1-4 烷基)C(O)Rc1 、-NHC(O)ORc1 及-N(C1-4 烷基)C(O)ORc1 ; 每一Rc1 獨立地選自由以下組成之群:氫、C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C2-6 烯基、C2-6 炔基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基,其中該等C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C2-6 烯基、C2-6 炔基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基全部視情況經一或多個相同或不同的Rd1 及/或Re1 取代; 每一Rd1 獨立地選自由以下組成之群:-ORe1 、-NRe1 Re1 、鹵素、-CN、-C(O)Re1 、-C(O)ORe1 、-C(O)NRe1 Re1 、-S(O)2 Re1 、-S(O)2 NRe1 Re1 、-NHC(O)Re1 、-N(C1-4 烷基)C(O)Re1 、-NHC(O)ORe1 及-N(C1-4 烷基)C(O)ORe1 ; 每一Re1 獨立地選自由以下組成之群:氫、C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C2-6 烯基、C2-6 炔基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基;R2 係選自由以下組成之群:氫、C1-4 烷基、C3-6 環烷基、3員至6員雜環基及鹵素;R3 係選自由以下組成之群:氫、C1-4 烷基及C1-4 鹵代烷基; 環系統A 係選自由以下組成之群:C6-10 芳基、5員至10員雜芳基及9員至10員二環雜環基;p 表示1、2或3; 每一R4 獨立地選自由以下組成之群:C1-4 烷基、C2-4 烯基、C2-4 炔基、C1-4 鹵代烷基、羥基-C1-4 烷基、羥基-C1-4 鹵代烷基、C3-6 環烷基、3員至6員雜環基、羥基-C3-6 環烷基、經3員至6員雜環基取代之C1-4 鹵代烷基、經羥基、鹵素、-NH2 、-SO2 -C1-4 烷基及二價取代基=O取代之3員至6員雜環基,而=O可僅係非芳香族環中之取代基; 或其鹽。
  2. 如請求項1之化合物或鹽,其中R1 Ra1 Ra1 係選自由以下組成之群:C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基,其中該等C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基全部視情況經一或多個相同或不同的Rb1 及/或Rc1 取代; 每一Rb1 獨立地選自由以下組成之群:-ORc1 、-NRc1 Rc1 、鹵素、-CN、-C(O)Rc1 、-C(O)ORc1 及-C(O)NRc1 Rc1 ; 每一Rc1 獨立地選自由以下組成之群:氫、C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基,其中該等C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基全部視情況經一或多個相同或不同的Rd1 及/或Re1 取代; 每一Rd1 獨立地選自由以下組成之群:-ORe1 、-NRe1 Re1 、鹵素、-CN、-C(O)Re1 、-C(O)ORe1 及-C(O)NRe1 Re1 ; 每一Re1 獨立地選自由以下組成之群:氫、C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基。
  3. 如請求項2之化合物或鹽,其中R1 Ra1 Ra1 係選自由以下組成之群:C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基及5員至10員雜芳基,其中該等C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基及5員至10員雜芳基全部視情況經一或多個相同或不同的Rb1 及/或Rc1 取代; 每一Rb1 獨立地選自由以下組成之群:-ORc1 、鹵素及-C(O)NRc1 Rc1 ; 每一Rc1 獨立地選自由以下組成之群:氫、C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基,其中該等C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基全部視情況經一或多個相同或不同的Rd1 及/或Re1 取代; 每一Rd1 獨立地選自由-ORe1 及鹵素組成之群; 每一Re1 獨立地選自由氫及C1-6 烷基組成之群。
  4. 如請求項1之化合物或鹽,其中R1 Ra1 Ra1 係選自由C3-10 環烷基及C4-10 環烯基組成之群,其中該等C3-10 環烷基及C4-10 環烯基二者均視情況經一或多個相同或不同的Rb1 及/或Rc1 取代; 每一Rb1 獨立地選自由以下組成之群:-ORc1 、-NRc1 Rc1 、鹵素、-CN、-C(O)Rc1 、-C(O)ORc1 及-C(O)NRc1 Rc1 ; 每一Rc1 獨立地選自由以下組成之群:氫、C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基,其中該等C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基全部視情況經一或多個相同或不同的Rd1 及/或Re1 取代; 每一Rd1 獨立地選自由以下組成之群:-ORe1 、-NRe1 Re1 、鹵素、-CN、-C(O)Re1 、-C(O)ORe1 、-C(O)NRe1 Re1 ; 每一Re1 獨立地選自由以下組成之群:氫、C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基。
  5. 如請求項4之化合物或鹽,其中R1 係C3-8 環烷基,其視情況經一或多個相同或不同的Rb1 及/或Rc1 取代; 每一Rb1 獨立地選自由以下組成之群:-ORc1 、鹵素及-C(O)NRc1 Rc1 ; 每一Rc1 獨立地選自由以下組成之群:氫、C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、3員至8員雜環基、苯基及5員至6員雜芳基,其中該等C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、3員至8員雜環基、苯基及5員至6員雜芳基全部視情況經一或多個相同或不同的Rd1 及/或Re1 取代; 每一Rd1 獨立地選自由-ORe1 及鹵素組成之群; 每一Re1 獨立地選自由氫及C1-6 烷基組成之群。
  6. 如請求項5之化合物或鹽,其中R1 係C3-8 環烷基,其視情況經一或多個選自由以下組成之群之相同或不同的取代基取代:C1-4 烷基、C1-4 鹵代烷基、C1-4 烷氧基-C1-4 烷基、5員至6員雜芳基、苯基、鹵代苯基、鹵素、3員至6員雜環基、-C(O)N(C1-4 烷基)2 及羥基。
  7. 如請求項1之化合物或鹽,其中R1 係選自由C1-6 烷基及C1-6 鹵代烷基組成之群。
  8. 如請求項1之化合物或鹽,其中R1 係3員至10員雜環基,其視情況經一或多個相同或不同的Rb1 及/或Rc1 取代; 每一Rb1 獨立地選自由以下組成之群:-ORc1 、-NRc1 Rc1 、鹵素、-CN、-C(O)Rc1 、-C(O)ORc1 及-C(O)NRc1 Rc1 ; 每一Rc1 獨立地選自由以下組成之群:氫、C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基,其中該等C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基全部視情況經一或多個相同或不同的Rd1 及/或Re1 取代; 每一Rd1 獨立地選自由以下組成之群:-ORe1 、-NRe1 Re1 、鹵素、-CN、-C(O)Re1 、-C(O)ORe1 及-C(O)NRe1 Re1 ; 每一Re1 獨立地選自由以下組成之群:氫、C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基、C3-10 環烷基、C4-10 環烯基、3員至10員雜環基、C6-10 芳基及5員至10員雜芳基。
  9. 如請求項8之化合物或鹽,其中R1 係3員至10員雜環基,其視情況經一或多個選自由以下組成之群之相同或不同的取代基取代:C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基及C6-10 芳基。
  10. 如請求項9之化合物或鹽,其中R1 係3員至8員雜環基,其視情況經一個選自由以下組成之群之取代基取代:C1-6 烷基、C1-6 鹵代烷基及C6-10 芳基。
  11. 如請求項1之化合物或鹽,其中R1 係5員至6員雜芳基,其視情況經C1-4 烷基取代。
  12. 如請求項1至11中任一項之化合物或鹽,其中 環系統A 係選自由以下組成之群:C6-10 芳基、5員至10員雜芳基及9員至10員二環雜環基;p 表示1或2; 每一R4 獨立地選自由以下組成之群:C1-4 烷基、C2-4 炔基、C1-4 鹵代烷基、羥基-C1-4 鹵代烷基、經3員至6員雜環基、鹵素及二價取代基=O取代之C1-4 鹵代烷基,而=O可僅係非芳香族環中之取代基。
  13. 如請求項1至11中任一項之化合物或鹽,其中Ap 個取代基R4 一起具有亞結構RA 係選自由以下組成之群:C1-4 烷基、C1-4 鹵代烷基、羥基-C1-4 烷基、羥基-C1-4 鹵代烷基、經3員至6員雜環基取代之C1-4 鹵代烷基、C3-6 環烷基、羥基-C3-6 環烷基、3員至6員雜環基、3員至6員羥基-雜環基、鹵素及-SO2 -C1-4 烷基;RB 係選自由氫及-NH2 組成之群;RC 係選自由以下組成之群:氫、C1-4 烷基及鹵素; 或RA RC 與其所連接之碳原子一起形成5員至6員非芳香族碳環、5員至6員非芳香族雜環或5員至6員雜芳基,其中該等5員至6員非芳香族碳環、5員至6員非芳香族雜環及5員至6員雜芳基全部視情況經一或多個鹵素或經側氧基取代。
  14. 如請求項13之化合物或鹽,其中Ap 個取代基R4 一起具有亞結構RA 係選自由以下組成之群:C1-4 鹵代烷基、羥基-C1-4 鹵代烷基及經3員至6員雜環基取代之C1-4 鹵代烷基;RB 係氫;RC 係選自由以下組成之群:氫、C1-4 烷基及氟; 或RA RC 與其所連接之碳原子一起形成5員至6員非芳香族碳環、5員至6員非芳香族雜環或5員至6員雜芳基,其中該等5員至6員非芳香族碳環、5員至6員非芳香族雜環及5員至6員雜芳基全部均視情況經一或多個氟或經側氧基取代。
  15. 一種如請求項1至14中任一項之化合物或其醫藥上可接受之鹽之用途,其用於製造用於治療及/或預防疾病及/或病狀之藥劑,其中抑制SOS1與RAS家族蛋白質或RAC1之相互作用具有治療益處。
  16. 一種如請求項1至14中任一項之化合物或其醫藥上可接受之鹽之用途,其用於製造用於治療及/或預防癌症之藥劑。
  17. 如請求項15及16中任一項之用途,其中該藥劑係在至少一種其他藥理學活性物質之前、之後或與其一起投與。
  18. 如請求項15及16中任一項之用途,其中該藥劑係與治療有效量之至少一種其他藥理學活性物質組合投與。
  19. 如請求項17之用途,其中該至少一種其他藥理學活性物質係MEK及/或其突變體之抑制劑。
  20. 如請求項18之用途,其中該至少一種其他藥理學活性物質係MEK及/或其突變體之抑制劑。
  21. 如請求項16之用途,其中該癌症係選自由以下組成之群:胰臟癌、肺癌、結腸直腸癌、膽道癌、多發性骨髓瘤、黑色素瘤、子宮癌、子宮內膜癌、甲狀腺癌、急性髓性白血病、膀胱癌、尿路上皮癌、胃癌、子宮頸癌、頭頸部鱗狀細胞癌、瀰漫性大B細胞淋巴瘤、食道癌、慢性淋巴球性白血病、肝細胞癌、乳癌、卵巢癌、前列腺癌、神經膠母細胞瘤、腎癌及肉瘤。
  22. 一種醫藥組合物,其包含如請求項1至14中任一項之化合物或其醫藥上可接受之鹽及一或多種醫藥上可接受之賦形劑。
  23. 一種醫藥製劑,其包含如請求項1至14中任一項之化合物或其醫藥上可接受之鹽及至少一種(較佳地一種)其他藥理學活性物質。
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