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TW200900420A - Hepcidin, hepcidin antagonists and methods of use - Google Patents

Hepcidin, hepcidin antagonists and methods of use Download PDF

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TW200900420A
TW200900420A TW097103507A TW97103507A TW200900420A TW 200900420 A TW200900420 A TW 200900420A TW 097103507 A TW097103507 A TW 097103507A TW 97103507 A TW97103507 A TW 97103507A TW 200900420 A TW200900420 A TW 200900420A
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antibody
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monoclonal antibody
human
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TW097103507A
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Barbra Sasu
Mitsuru Haniu
Thomas Charles Boone
Xiao-Juan Bi
Ki-Jeong Lee
Tara Arvedson
Aaron Winters
Keegan Cooke
Zeqi Sheng
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Description

200900420 九、發明說明： 【發明所屬之技術領域】 本發明係關於海帕西。定、海帕西❹抗劑（包括結合海 帕西啶之抗體）及其調節海帕西啶活性之能力。 本申凊案主張2007年2月2曰申請之美國臨時申請案第 6〇/888,〇59號及2007年12月19日申請之美國臨時申請案第 61/〇15，138號之權利，其以引用的方式併入本文中。 【先前技術】 f 鐵為所有活的生物體生長發育所需之必需痕量元素。在 哺乳動物中藉由控制鐵吸收、鐵再循環及鐵自儲存其之細 胞中的釋放來調節鐵含量。鐵主要係在十二指腸及空腸上 段中由腸上皮細胞吸收。存在如下反饋機制：在缺乏鐵之 個體中增強鐵吸收且在鐵過量個體中降低鐵吸收（ΑΜπ· Ann. Rev. Genomics Hum. Genet. 1：75 (2000) ; Philpott, 价州〇/〇烈35:993 (2002) ; Bemler等人，細心淑政 仏”以· 29:495 (2001))。藉由骨髓中之網狀内皮巨噬細 胞、肝庫弗細胞（hepatic Kupffer cell)及脾使鐵自經降解紅 血球再循環。鐵釋放係由膜鐵轉運蛋白（ferr〇p〇rtin)所控 制，該膜鐵轉運蛋白為一種位於腸上皮細胞、巨噬細胞及 肝細胞（能夠釋放鐵於血漿中之主要細胞）之細胞表面上的 主要鐵輸出蛋白。海帕西啶與膜鐵轉運蛋白結合並藉由使 其自細胞表面内化且發生降解而降低其功能活性。 (Nemeth等人，306:2090-3, 2004 ; De domenico等 人 ’ Mol. Biol. Cell.，8:2569-2578, 2007)。 128410.doc 200900420
海帕西咬為調節鐵穩態之關鍵信號（philp〇u，丑 35:993 (2002)，Nicolas等人，pr<9C 99:4396 (2002))。尚含量之人類海帕西咬造成鐵含量降低 且反之亦然。導致缺乏海帕西Π定活性之海帕西D定基因突變 與年輕型血色素沈著症（一種嚴重鐵過量疾病）相關（Roetto 專人，Nat. Genet.，33:21-22，2003)。對小鼠之研究已證明 海帕西啶在控制正常鐵穩態方面之作用（Nic〇las等人，
Nat. Genet·，34:97-101，2003 ; Nicolas等人，proc. Natl. Acad. Sci. USA, 99:4596-4601, 2002 ; Nicolas等人，proc. Natl. Acad. Sci. USA，98:8780-8785, 2001)。 此外’不斷有資料暗示在發炎期間海帕西啶與鐵螯合 (參見例如 Weinstein等人，Blood, 100:3776-36781, 2002; K e m n a 專人 ’ B1 ο 〇 d, 10 6:1 8 6 4 -1 8 6 6，2 0 0 5 ; N i c ο 1 a s 等人， J. Clin. Invest., 1 1 0:1 037-1 044，2002 ; Nemeth 等人，J. Clin. Invest., 11 3 :127 1 -1276，2004 ; Nemeth 等人，Blood， 101:2461-2463，2003及 Rivera等人，Blood, l〇5:1797_i8〇2, 2005)。已在誘發脊椎動物之先天免疫系統之急性期反應 的炎性刺激（諸如感染）之後觀察到海帕西啶基因表現發生 大力上調。在小鼠中，展示海帕西啶基因表現因脂多醣 (LPS)、松節油、弗氏完全佐劑（Freundis c〇mpiete adjuvant)及腺病毒感染而上調。海帕西啶表現係由發炎性 細胞激素介白素_6(il-6)誘發。海帕西啶表現與炎性貧血 症之間的強相關性亦見於患有慢性炎性疾病（包括細菌、 真函及病毒性感染）之患者。 128410.doc 200900420 人類海帕西啶（一種具有抗微生物及鐵調節活性之25個 胺基酸的肽）係由兩個新穎抗微生物肽研究小組獨立發 現。（Krause 等人，尸五批 480:147 (2000) ; park 等 人，*/· 5/〇/· CT^m. 276:7806 (2001))。其亦被稱為 LEAP_ 1 (肝表現之抗微生物肽）。隨後在尋找由鐵調節之肝特異性 基因中鑑別在小鼠中編碼83個胺基酸之前導肽（pre_ propeptide)以及在大鼠及人類中編碼84個胺基酸之前導肽 的海帕西啶 cDNA(Pigeon等人，J.价〇/. c/zem. 276:7811 (2001))。首先使24個殘基之N-末端信號肽裂解以產生原海 帕西啶（pro-hepcidin)，隨後將其進一步加工以產生見於血 液及尿中之成熟海帕西啶。在人類尿液中，儘管亦存在較 短的22及20個胺基酸之肽’但主要形式含有25個胺基酸。 值得注意的是，該成熟肽含有8個以4個二硫橋形式鍵聯 之半胱胺酸殘基。Hunter等人（J.价〇/. C/zem., 277:37597-37603 (2002))使用HPLC滯留時間與自尿純化之天然海帕 西咬一致的化學合成海帕西啶藉由NMR而研究了海帕西咬 的結構。Hunter等人報導其測定結果：海帕西啶摺疊成含 有鄰位二硫鍵（C1-C8、C2-C7、C3-C6、C4-C5)之髮夹環 結構。最近以來’亦報導使用Hunter等人之結構資訊及推 理性NMR資料來推斷一致二硫鍵連接性分配，從而測定鱸 魚海帕西咬之結構（Lauth等人，乂 βζ·ο/. C/^w.，280:9272-9282 (2005))。然而，如本發明者在本文中所發現且揭 示’確定海帕西啶結構具有不同於先前技術所教示之二硫 鍵連接性。 1284l0.doc 200900420 美國專利公開案第2003/0187228號、第2004/0096987 號、第 2004/0096990 號、第 2005/0148025 號、第 2006/ 0019339號、第 2005/0037971 號及第 2007/0224186號；美國 專利第7,232,892號及第7,294,690號以及國際公開案第WO 02/98444號論述海帕西啶抗體，但未能揭示或提出本文中 所揭示之海帕西咬之結構構形。 因此’本說明書說明海帕西啶之結構的測定以及海帕西 咬之中心作用及其在鐵調節及對感染之先天免疫反應方面 的關鍵功能。此外’本申請案尤其提供生物活性海帕西 啶、針對生物活性海帕西啶之單株抗體、製造該等物質之 方法、測定生物活性海帕西咬之方法及調節海帕西咬活性 或其表現之方法及治療鐵穩態失調症之方法以及海帕西啶 拮抗劑及海帕西σ定促效劑。 【發明内容】 本發明之各種實施例大體而言係關於經純化之正確摺疊 的人類海帕西啶、針對其之單株抗體、保留正確摺疊的人 類海帕西啶之二硫鍵中之一或多者的海帕西啶變異體、製 k 3亥等物質之方法及使用該等物質偵測海帕西啶或調節海 帕西啶活性之方法。 咸信本申請案為關於在C1-C8、C2-C4、C3-C6及C5-C7 之間形成二硫鍵且預示緊湊及緊密摺疊之分子的生物活性 人類海帕西紅硫鍵連接性之首次報導。在-些實施例 中’本發明提供具有與天然物f —致之二硫鍵連接性及等 效生物活性的重組表現或合成產生之海帕西啶的大規模製 128410.doc 200900420 k。5亥重組或合成物暂 體，且適用於、於/α療需要其他海帕西啶之個 :且適用於製備侦測方法及套組中之已 物。正確擅疊的人類海…4準 足之大批製造亦使產味另、、目I丨"Μ3 與海帕西啶結合之單抶浐挪』使座生及測试 几體（尤其具高親和力及/戋特显科 之單株抗體）成為可能。兮刀及/次特異性 °χ等早株抗體（例如）適用於海帕西 啶偵測方法及診斷與治療方法。 、海帕西 在-態樣中，海帕西。定活性拮抗劑為一種 成熟生物活性人類海帕西 摺且之
疋（SEQ ID ΝΟ: 9)以所需親和力 —、早體。亦提供—種結合海帕西咬（seq⑴㈣· 9)讀制海帕西。定之鐵調節活性的單株抗體。在-實施例 中早株抗體在約1〇 8河或以下之EC5〇下降低細胞内鐵濃 度且/或增加循環鐵濃度。在其他實施例中，單株抗體在 哺乳動物中展現使紅血球計數（數目）或血紅素或血容比水 平增加及/或使網狀血球計數、網狀血球平均細胞容積及/ 或網狀血球血紅素含量正規化的特性。 在各種貝施例中，單株抗體與海帕西咬之構形抗原決定 基結合，該構形抗原決定基包含：㈣①歐9之胺基酸 1至5中之任一者（例如胺基酸1、2、3、4或5)及/或SEQ ID NO: 9之胺基酸10至13中之任一者（例如胺基酸1〇、u、i2 或13)及/或SEQ ID NO: 9之胺基酸14至22中之任一者（例如 胺基酸14、15、16、17、18、19、2〇、以或叫。在一相 關悲樣中，單株抗體與包含SEQ ID N〇: 9之位置丨〇處之 Cys及SEQ ID NO: 9之位置13處之Cys的構形環及/或包含 SEQ ID NO: 9之位置14處之Cys及SEQ ID NO: 9之位置22 128410.doc -10- 200900420 處之Cys的構形環結合。 在各種實施例中，單株抗體可包括以下抗體中之任一 者：抗體 Ab43、2.7、2.41、R9、1C9、1S1、1S2、1S3、 1S4、1S5、3B3、4E1 ' 7A3、9D12、12B9、15E1、 18D8、19C1、19D12、19H6、23F11 及26F11 ;或保留該等 抗體之 CDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2 或
CDRL3中之任一者、兩者、三者、四者、五者或六者且視 情況包括該（等）CDR中之一或兩個突變的抗體；或保留該 等抗體中之任一者之輕鏈或重鏈可變區的抗體；或結合於 人類海帕西啶上與抗體Ab43、2.7、2.41、R9、1C9、 1S1 、 1S2 、 1S3 、 1S4 、 1S5 、 3B3 、 4E1 、 7A3 、 9D12 、 12B9、15E1、i8D8、19C1、19m2、19則、23叩及 %?11相同之抗原決定基或與該等抗體競爭結合人類海帕 西啶達至少75°/。的抗體。 各種實施例亦提供編碼本文中所述之單株抗體中之任一 者的核酸、包含該等核酸序列之㈣及包含該等核酸或載 體之宿主細胞。在—相關態樣中，提供重組產生該等單株 抗體之方法，纟包括培養上述宿主細胞使得核 以便產生抗體且視情況自宿主細胞或培： 體。在-相關實施例中，提供-種由上述方法所產= 離抗體或試劑。 座生之刀 在另一態樣中，提供一 人類海帕西咬的 體中之任一者在 觸且偵測經結合 方法，其包含使來自 可使抗體與人類海帕 種偵測試樣中之 人類之試樣與上述抗 西。疋結合之條件下接 1284l〇.d〇c -II . 200900420 抗體。在—實施例中 支撐物上作她啶之第-抗體固定於固體 下為捕捉试劑且將海帕 試劑。在—相 + 啶之弟一抗體用作偵測 海帕西咬在試樣中之量。”伯…口抗體之…化 預德方於“ 该4偵测方法可用於多種診斷、 ε八心工方法，其包括診斷海帕西啶相關病症之方法、 ==與非炎性疾病之方法及監控使用海帕-拮 机；=1〗t療法的方法。 帕西咬含量盘… 高於某-臨限值之海 f ^之相關病症（諸如海帕西咬相關貧血 , 子有關，而低於該臨限值之含量# φ 患有海帕西。定相關病广门…患者不可能 咬含量mi 高於某一臨限值之海帕西 、A $病之存在有關，而低於該臨限值之含量指 不心者不可能患有炎性疾病。在一此 將冷齡* 士 1 二實施例甲，該等方法 =斷有缺⑽貧血症、炎性貧血症或混合性貧血症之 ^ ‘”、I控曰在抑制海帕西啶含量之療法，低於竿一庐 限值之海帕西咬含量指示海帕西咬抬抗劑之劑量為治: 效的且高於該臨限值含量 〜、 為治療有效的。㈣之劑量不 在另-態樣中，提供包含治療有效量之本文中所述 二醫“任者及西樂學上可接受之載劑、稀釋劑或賦形劑 的醫樂組合物。亦提供該等抗體用於製備供治療 八 量海帕西咬、海帕西咬相關病症、鐵穩態失調症或二 之人類用之藥物的用途。 ；正 各種實施例it 一步提供使用該等抗體之方法，“ 投與治療有效量之該抗體來治療具有高含量海帕西；= 1284I0.doc -12- 200900420 帕^定相關病症或鐵穩態失調症之哺乳動物或患有貧血症 之哺礼動物。在例示性實施例中’該嗔乳動物為患有選自 由以下各者組成之群之病狀 、 · 矸々届狀的人類.非洲鐵過量症 (African iron overload)、ct地中也贫丄一 ,Δ1 ,., 也中海貧血症、阿茲海默氏症 (A zheimer s disease)、貧血症、痒性貧 ⑴性|血症、忮性病貧血 血症、動脈硬化或動脈粥樣硬化（包括冠 管疾病或周邊閉塞性動脈疾病)、共濟失調、 與:有關之共濟失調、無鐵傳遞蛋白質貧血、癌症、血聚 銅-蛋白缺乏、化療誘發性貧血症、慢性腎病(卜H、 III、IV或V期）（包括末期腎病或慢性腎衰竭）、肝硬化、典 3Lt沈著症、膠原蛋白誘發性關節炎(C⑷、海帕西 定匕罝“海帕西灾)之病狀、先天性紅細胞生成異常性貧 血、充血性心臟衰竭、克羅恩氏病（Cr〇hn,s disease)、糖尿 病鐵生物刀布失調症、鐵穩態失調症^ 鐵轉運蛋白疾病、膜鐵轉運蛋白突變血色素沈著症、葉酸 =乏症、弗里德里希氏共濟失調听W、索性 &拉希氏症候群（gracile syndrome)、幽門螺旋桿 “（pyi〇ri)感染或其他細菌感染、哈勒沃登-施帕茨病 (HalIervordan Spau ―咖）、血色素沈著症、由轉鐵蛋白 受體起之企色素沈著症、血紅素病、肝炎 '肝炎 ( ’’τ、σ征）、C型肝炎、肝細胞癌、遺傳性血色素沈著 症、HIV或立μ & 土，， • 乂，、他病母性疾病、亨廷頓氏病（Huntington、 disease)、耸钟疋丄， °戥蛋白血症（hyperferr丨tinemia)、低色素性小 紅血球性當1 只血、血鐵過少症、抗胰島素症、缺鐵性貧血 128410.doc 200900420 症缺鐵症、鐵過量症、海帕西σ定過量之鐵缺乏病狀、年 幸i &素沈著症(HFE2)、多發性硬化症、轉鐵蛋白受體 γ HFE、血幼素（hem〇juveUn)、膜鐵轉運蛋白或其他鐵代 謝基因之犬變、新生兒血色素沈著症、與鐵有關之神經退 化性疾病、骨質減少、骨質疏鬆症、胰腺炎、泛酸鹽激酶 相關之神經退化性疾病、帕金森氏病s disease)瘤、皮病、異食癖、紫質症、遲發性皮膚紫質 假腦炎、肺血鐵質沈積症、紅血球病症、類風濕性關 即炎、敗血病、鐵粒幼紅細胞性貧血、全身性紅斑性狼瘡 症、地中海貧血症、中間型地中海貧血、輸血性鐵過量、 腫瘤、血管炎、維生素則缺乏症、維生素m2缺乏症及/或 威爾遜氏病（WilS0n，s disease)。 在另^、樣中，提供藉由以治療有效量投與（a)海帕西啶 活性拮抗劑或海帕西。定表現抑制劑及（b)紅血球生成刺激劑 來β療心有貧血症之哺乳動物的方法。例示性海帕西淀活 性拮抗劑包括結合人類海帕西啶之抗體。例示性海帕西啶 表現抑制劑包括結合人類海帕西啶核酸之聚核苷酸或寡核 苷酸。例不性紅血球生成刺激劑包括紅血球生成素、紅血 球生成素促效劑變異體以及結合及活化紅血球生成素受體 之肽或抗體。紅血球生成刺激劑包括（但不限於）依泊汀 α依泊’丁 β、依泊；^丁 δ、依泊汀ω、依泊汀ι、依泊汀《及其 類似物、模擬肽、模擬抗體及HIF抑制劑（參見美國專利公 開案第2005/0020487號，其揭示内容全部以引用方式併入 本文中）。詳言之，紅血球生成素包括（但不限於）如以下專 -J4- 128410.doc 200900420 矛j或專利申清案中所揭示之紅血球生成素分子或其變異體 或類似物，該等文獻各自以引用方式全部併入本文中：美 國專利弟 4,703,008號、第 5,441,868號、第 5,547,933 號、 第 5,618,698 號、第 5,621，080 號、第 5,756,349 號、第 5,955,422 號及第 5,856,298 號；及 WO 91/05867、WO 95/05465、WO 00/24893 及 WO 01/81405。在某些例示性實
施例中，紅血球生成刺激劑係選自由人類紅血球生成素 (SEQ ID NO: 72)及達貝泊汀（darbep〇etin)a(SEQ ID 73)組成之群。可根據該等方法治療之例示性貧血症形式 包括炎性貧血症、癌性貧血症、化療誘發性貧血症、缺鐵 性貧血症、鐵穩態失調症、膜鐵轉運蛋白疾病或由腎病引 起之貧血症。亦提供治療患有對使用紅血球生成刺激劑之 療法具有低反應性或甚純抗性哺㈣物的方 法，其包含投與治療有效量之海帕西咬活性抬抗劑或者治 療有效量之海帕西啶表現抑制劑。 在另一相關態樣中，亦提供用於治療與高海帕西咬含量 相關之病症或海帕西wω 定相關病症或鐵穩態失調症或患有貧 血症之哺乳動物的套組。 括⑷海帕㈣活師施例中，該套組包 或海帕西啶表現抑制劑及（b)紅 企球生成刺激劑及（視愔 該套組包括海帕西=):。“-例示性實施例中， 貼於容器上或與容器封梦：劑或海帕西。定表現抑制劑及 西啶活性枯t a、、於—起之標籤，該標籤描述海帕 數糾之用“ 13海帕西啶表現抑制劑連同紅血球生成刺 激劑之用法。在另—也 表王取利 例不性實施例中，該套組包括紅血球 128410.doc -15· 200900420 生成刺激劑及貼於容器上或與容器封裝於_起之… 標籤描述紅血球生成刺激劑連同海帕西 二遠 帕西咬表現抑制劑之用法。亦^劑或海 π徒供海帕西咬活性枯广杳丨士 海帕西啶表現抑制劑用於製備 Q几劑或 侑供連冋紅血球生成刺激劑— 起投與用之藥物的用途以及έ 、 夂，、工血球生成刺激劑用於製備供 連同海帕西咬活性拮抗劍亦、鬼二+ ± /、 子口仇幻或海帕西啶表現抑制劑一起 (" 用之藥物的料。在該等套組或用途中之任-者中，海帕 西咬活性拮抗劑（或海帕西口定表現抑制劑）及紅血球生 激劑可存在於獨立錢中或可—起被組合於單_醫藥組合 物中。在另-實施例中，海帕西❹性拮抗劑（或海帕: 啶表現抑制劑）或紅血球生成刺激劑或兩者可與鐵一起被 組3於單一醫藥組合物中或可存在於獨立小瓶中。 在一不同態樣中，提供一種包含化(^ m N〇: %的經純 化之正確摺疊的生物活性非尿源性人類海帕西啶之組合 物，其中在該組合物中至少8〇%、85%、9〇%、95% ' 或99%之人類海帕西啶具有C2_C4二硫鍵、c5_c7二硫鍵、° C1-C8二硫鍵及C3_C6二硫鍵。在一些實施例中，人類海 帕西啶已在細菌或其他非哺乳動物細胞中化學合成或產 生。可藉由此項技術中已知之方法（包括異核單量子相關 (heteronuclear single quantum correlation ^ HSQC), Morita 等人，Protein Science，12(6)，1216-1221 (2003))量化正確 指且的蛋白吳在〉谷液中之量。在一相關實施例中，提供使 用該等經純化之人類海帕西咬組合物之方法，例如用於產 生或自帛檢單株抗體’用於鑑別海帕西啶結合搭配物或用於 128410.doc -16- 200900420 =含㈣或特異性結合劑之組合物結合人類海帕西咬 -二化=之產生涉及(例如)使產生免疫球蛋白之細胞 生：免=帕西。定組合物接觸且分離由該細胞所產 =球蛋白。對於抗體或特異性結合劑之篩檢通常涉 西啶二使候選海帕西啶結合搭配物與經純化之人類海帕 :合物接m貞測候選海帕西咬結合搭配物與組合物 例中==西咬之間所形成的複合物。在另一相關實施 入捉進—步包含向哺乳動物投與候選海帕西咬結 己物。測試抗體或特異性結合劑結合人類海帕西口定之 :’:及(例如)使其與經純化之人類海帕西啶組合物或其 =適當㈣之片段接觸且情測人類海帕西咬與該抗體或 特.、性結合劑之間所形成的複合物。 在-相關態樣中，提供—種使包含seqidn〇:96之人 類海帕㈣多肽再摺疊成正確摺疊之生物活性形式的方 法，其包含⑷在促進變性之條件下使人類海帕西。定多狀暴 路於離液劑，及（b)在促進恢復成正確摺疊及生物活性形式 之條件下使⑷之產物暴露於氧化劑，及⑷回收包含生物 活性人類海帕西咬多肽之溶液’其中至少7〇%、至少 7外、至少80%、至少85%、至少86%、至少㈣、至少 嶋、至少89%、至少90%、至少9ι%、至少92%、至少 93%、至少94%、至少95%、至少州/〇、至少97%、至少 98〇/。或至少99%或以上之人類海帕西咬多肽具有aw二硫 鍵及琉鍵。可藉由此項技術中已知之方法（包括異 核單量子相關（HSQC)，M〇rha等人，ρΓ(^η 128410.doc 200900420 12(6)，1216-1221 (2003))量化正確摺疊的蛋白質在溶液中 之量。在一實施例中，正確摺疊之生物活性海帕西啶在細 胞基檢定中具有小於100 nMiEC5〇。在另一實施例中，正 確摺疊之生物活性海帕西啶在細胞基檢定中具有小於 HM之EC”。在一相關實施例中，⑻進一步包含使人類海 帕西啶多肽與除空氣以外之氧化劑接觸。在另一實施例 中，氧化在大於8之pH值下且在含有低於〇1%乙酸之溶液 中發生。 在不同態樣中，提供保留相同或相似二硫鍵連接性及 /或相同或相似預測三維結構之人類海帕西啶變異體。在 例示性實施例中，該變異體保留所有8個半胱胺酸殘基且 進步保留C2-C4二硫鍵及/或C5-C7二硫鍵。該等變異體 可展現促效劑或拮抗劑活性，亦即保留或抑制海帕西啶生 物活性（抗微生物或鐵調節活性）。在例示性實施例中，提 供一種包含在長度上與SEq m NO: 96至少70%、至少 75%、至少80%、至少85%、至少9〇%、至少％%、至少 96%、至少97〇/〇、至少98%或至少99% 一致之胺基酸序列的 海帕西啶類似肽。海帕西啶變異體可展現下列特性中之一 或多者：保留膜鐵轉運蛋白結合活性（亦即活化膜鐵轉運 蛋白或抑制膜鐵轉運蛋白鐵運輸）、促進或抑制成熟人類 海帕西啶（SEQ ID NO: 9)之鐵調節活性及/或降低或增加活 體内循環鐵含量。 在另一態樣中，提供一種可偵測作為主要條帶並具有低 於6 kd(例如3 kd±2)之近似分子量（如藉由在還原條件下進 1284l0.doc -18· 200900420 订十—烷基硫酸鈉聚丙烯醯胺 ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ 定）的SEQ m職9之_化成$人^*(SDS-PAG_剛 、、沭化成热人類海帕西啶的抗體》 上概述並不意欲限定本發明之每個態樣 分（诸如實施方式）中描述直 、他# -揭干1期整個文件係以統 愚不内谷來敍述’且應瞭解即使在此文件之同—句 :二衡並未發現本文中所描述之特徵一起的組合或 亦涵盍6亥等特徵之所有組合。 除亡述以外，作為另一態樣，本發明可包括在任 下在乾可上比由本文中特定段落所定義之變體窄的本發 斤有’、鈀例。舉例而言，本發明之某些態樣被描述為 且應瞭解屬之各成員單獨地為本發明之態樣。亦應瞭 解被描述為屬或對屬之成員進行選擇的態樣涵蓋該屬;:兩 個或兩個以上成員之組合。
應瞭解儘管在各種情況下使用”包含，，文字來介紹說明書 中之各種實施例，亦可使用，，由.....·組成”或”由.·...·： 本上組成π文字來描述相關實施例。應注意術語，，—”係指 -或夕個(種），例如” 一個免疫球蛋白分子”應被理解為表 不一或多個免疫球蛋白分子。因而，術語"一 I 個（種）"及”至少—個（種）"在本文中可互換使用。 亦應瞭解當描述值之範圍時，所描述之特徵可為範圍内 所見之個別值。舉例而言，”約ρΗ 4至約6之pH值”可為 (但不限於）PH 4、PH 4.2、pH 4.6、pH 5.1、pH 5.5 等及該 等值之間的任何值。另外，"約pH 4至約pH 6之pH值"不應 被解釋為意謂所討論之調配物的pH值在儲存期間在pH 4至 128410.doc 19 200900420 PH 6之範圍内變化2個阳值單位，而是意謂溶液之pH的值 可選於彼範圍，且於約彼pH值下溶液保持緩衝。在一些實 施例中’當使用術語”約”時，其意謂所列數字加上或減去 所列數字之5%、10%、15%或以上。可根據上下文確定所 欲之實際變化。儘管申請者創立本X中所述之本發明之全 部範疇，但申請者並不意欲主張其他人之先前技術著作中 所描述之標的。因此，在藉由專利局（patent 〇ffice)或其 他實體或個體使得申請者關注處於申請專利範圍範疇内之 法定先前技術的情況下，申請者保留在適用專利法下行使 修正權利的權利以便重新定義此種申請專利範圍之標的從 而明確將該法定先前技術或法定先前技術之明顯變化自此 種申請專利範圍之範疇中排除。亦預期由該經修正的申請 專利範圍所定義之本發明的變化為本發明之態樣。 【實施方式】 人類海帕西π定基因編碼84個殘基的前導肽（SEQ ID NO: 8)。相應cDNA及染色體組序列係分別示於SEq id NO: 7 及SEQ ID NO: 100中。首先使24個殘基的N-末端信號肽 (SEQ ID NO: 8之殘基1-24)裂解以產生原海帕西。定，隨後 將該原海帕西啶進一步藉由使前結構域（SEq id NO: 8之 殘基25-59)裂解而進行加工以產生25個殘基的成熟海帕西 啶（SEQ ID NO: 8之殘基 60-84，在 SEQ ID NO: 9 中所示）。 除主要25個胺基酸形式之外’可在尿中鑑別出長度為2〇或 22個胺基酸之其他N-末端截短形式（20個胺基酸，SEQ ID NO: 96;及22個胺基酸，SEQ ID NO: 98)。成熟人類海帕 128410.doc -20- 200900420 西啶含有八個在本文中依次被稱為C丨至C 8 (自N _末端至c _ 末端編號）之半胱胺酸殘基。 關於海帕西啶在本文中所報導之新穎二硫鍵連接性及相 應模型化二維結構亦使產生保留相同或相似二硫鍵連接性 、t用作海帕西定生物活性之調節劑的海帕西咬變異體成 為可此。舉例而言，可設計且產生與海帕西啶受體結合且 使海帕西啶受體活化之分子、與膜鐵轉運蛋白結合且引起 膜鐵轉運蛋白内化之分子或相對於海帕西啶充當競爭性抑 制劑之分子。 I.經·純化之正確摺|的人類海怕西咬組合物 可能需要使海帕西啶多肽”再摺疊”且氧化成適當三級結 構且產生二硫鍵以便為生物學上有效的。可使用本文中所 述之程序及此項技術中所熟知之其他程序實現再摺疊。該 等方法包括（例如）在離液劑存在下使溶解多肽試劑暴露於 通常高於7之pH值環境。離液劑為包括（但不限於）以下各 物之化合物：鹽酸胍（gUanidine hydr〇cM〇rideX胍鹽酸鹽 (guanidinium hydrochloride)，GdnHCl)、硫酸胍、尿素、 石’il氛Ssc納、十·一烧基肌胺酸納（sarcosyl)、十二院基辟酸 納、辛基硫酸納及/或其他能使蛋白質内之非共價分子間 鍵結斷裂從而使多肽鏈呈現大體上無規構形的化合物。 在大多數情況下，再摺疊/氧化溶液亦將含有特定比率 之還原劑及其氧化形式以產生特定氧化還原電位，此使得 二硫鍵改組（disulfide shuffling)可發生以便形成半胱胺酸 橋鍵。還原劑能夠轉移電子且（在此種情況下）"還原，，各種 128410.doc -21 - 200900420 原子之間的鍵。在本發明之各種實施例的情況下，還原劑 將破壞分子内及分子間相互作用（尤其彼等涉及二硫橋之 相互作用）。根據本發明之各種實施例，例示性還原劑包 括二硫蘇糖醇、麵胱甘肽、二硫赤藻糖醇或β_酼基乙醇。 一些^用氧化還原對包括半胱胺酸/胱胺、麩胱甘肽/二硫 雙GSH、氯化銅、二硫蘇糖醇DTT/二噻烷DTT及2-巯基乙 醇（bME)/二硫bME。在許多情形下，可使用共溶劑來提高 再指疊效率。常用共溶劑包括甘油、各種分子量之聚乙二 醇及精胺酸。 一旦再指疊後’可藉由此項技術中已知之多種技術來評 估海帕西啶多肽之二硫鍵連接性。在一態樣中，該技術為 NEM部分還原烷基化；在另一態樣中，其為傅立葉轉換質 4法（FT-MS)。在實例1及4中比較詳細地論述NEM部分還 原烷基化及FT-MS。 FT-MS(傅立葉轉換質譜法）可用於評估二硫鍵連接性。 如此項技術中所知，？丁_河8係基於帶電粒子在強大穩定磁 場中旋轉之原理。藉由偵測由旋轉離子所產生之電流，可 使用傅立葉轉換來確定離子之m/z。有利地，此程序使極 高質量解析度及執行適宜聯合質譜分析實驗之能力成為可 能。同時，其使蛋白水解片段在分析下之明確分配成為可 月匕（參見例如 Marshall 等人，Mass Spectrometry Reviews 17:1-35，1998 ; Lewis等人，Proc Natl Acad Sci U S A. 95:8596-601，1998 ; Li 等人，Anal Chem，66:2077-83, 1994)。在實例1及4中比較詳細地論述FT_MS。 128410.doc -22- 200900420 可藉由此項技術中已知之方法（包括異核單量子相關 (HSQC)，Morita等人 ’ protein Science，12(6), 1216」切 (2003))來量化正確摺疊的蛋白質在溶液十之量。錯誤摺疊 的蛋白質（諸如海帕西啶）將在HSQ^f中具有獨特交2 峰。原則上藉由對該等峰值求積分來量化錯誤摺疊百分 數。 II·海帕西咬括抗劑 ί 本發明之各種實施例提供兩種不同種類之海帕西咬结抗 劑的製法及用途··⑷海帕西啶活性拮抗劑或㈨海帕西啶 表現抑制劑。 如本文中所用，"海帕西口定活性拮抗劑”意謂-種抑制人 類海帕西咬鐵調節活性但並不抑制海帕或海㈣ 啶mRNA之表現的物質。 如本文中所用，”海帕西咬表現抑制劑，，意謂—種抑制海 帕西啶基因或海帕西啶_财之表現的物質。 儘：海帕西咬活性抬抗劑與海帕西咬表現抑制劑皆歸入 海帕西:疋拮抗劑”之—般種類’但兩者為互斥種類。 在一態樣中，海帕西啶活性 ^ ^ σ几片丨可為一種例如藉由抑 制海帕西啶與膜鐵轉運 批连，^ 連紊白之間的結合、抑制受海帕西啶 控制之細胞鐵滯留或促進 膜鐵轉運蛋白依賴性鐵運輸來抑 制海帕西啶之功能的物質。 社入、~ 、 類海帕西啶活性拮抗劑包括 、、·口 &海帕西。定且抑制兑 劑，勺括太令士 基於抗體或肽之特異性結合 匕括本文令所述之抗體中之任一者；與膜 結合但並不活化膜鐵轉運 、>、、 ’载運輸之海帕西咬變異體及 128410.doc -23- 200900420 其衍生物；及結合海帕西D定且抑制其活性的分子量視情況 低於約1000道爾頓之小分子有機化合物。 海帕西啶表現抑制劑包括與海帕西啶DNA或mRNA結合 且抑制海帕西錢現之聚核㈣或募核㈣，包括抑制海 帕西。疋表現之反義养核苷酸、抑制性RNA、DNA酶 '核糖 核酸酶、適體或其醫藥學上可接受之鹽。 A.抗海帕西咬抗艘及特異性結合劑 本發明之各種實施例提供結合人類海帕西啶之抗體（包 括單株抗體）、產生該等抗體之方法、使用該等抗體來偵 測海帕西啶之方法、包括該等抗體之醫藥調配物、製備該 等醫藥調配物之方法以及用該等醫藥調配物（包括與如下 所述之紅血球生成刺激劑的組合療法）治療患者之方法。 亦提供編碼該等抗體之核酸、包含該等核酸之載體及重組 宿主細胞以及產生該等抗體之方法。 術語”抗體”係以最廣泛意義使用且包括經完全裝配之抗 體、單株抗體、多株抗體、多特異性抗體（包括雙特異性 抗體）、可結合抗原之抗體片段（包括Fab，、F'(ab)2、Fv、 單鏈抗體、雙功能抗體）及包含上述物之重組肽（其限制條 件為該等者顯示所需生物活性）。涵蓋完整分子及/或片段 之多聚體或聚集體，包括化學衍生抗體。涵蓋任何同型類 或子類（包括 IgG、IgM、IgD、IgA及 IgE、IgGl、lgG2、 IgG3、IgG4、IgAl及IgA2)或任何異型之抗體。不同同型 具有不同效應功能；舉例而言’ IgG 1及IgG3同型具有抗體 依賴性細胞毒性（ADCC)活性。 128410.doc -24- 200900420 在一些實施例中，該等抗體展現所需特徵，諸如如由 kd(平衡解離常數)所衡量的對海帕西啶之結合親和力在卜 1〇_6 Μ或以下之範圍内或範圍降至1(rl6 M或更低（例如約 1〇-7、10' 10-9、10，、10.丨丨、1〇-12、1〇.丨3、〗0·]4、1〇15、 1〇-16 Μ或以下）。可在溶液平衡檢定中使用則八⑶“及/或 KinExA測定平衡解離常數，諸如實例13及14中所述。 Γ 在其他實施例中，抗體展現對於海帕西啶之特異性。如 本文中所用，當與不同家族中之其他無關蛋白質相比，抗 體對人類海帕西啶具有明顯較高之結合親和力且因此能夠 區分人類海帕西啶時，該抗體對於人類海帕西啶”具有特 異性”。在一些實施例中，該等抗體亦可與其他物種之海 帕西。定（諸如鼠類 '大鼠或靈長類海帕西咬）交又反應；而 在其他實施例中’該等抗體僅與人類或靈長類海帕西啶結 合而不與齧齒動物海帕西啶明顯結合。在例示性實施例 中，抗體與人類及食蟹猴海帕西咬結合但不與餐齒動物海 帕西咬明顯結合。在一些實施例中，對於海帕西。定具特異 性之抗體與同一家族之其他蛋白質交又反應，而在其他實 施例中，該等抗體使海帕西„定有別於其他相關家族成員 (包括防禦素（defensin)或小鼠hepc2)。 在其他實施例中’單株抗體在活體外且較佳亦在活體内 抑制（或中和）海帕西咬鐵調節活性。該等海帕西咬中和抗 體在治療上適用於海帕西咬相關病症或鐵穩態失調症。可 經由若干指標（例如鐵蛋白/鐵含量、紅血球計數、紅金球 特徵（血紅素含量及/或細胞容積）、早期紅血球特徵㈤狀 128410.doc .25· 200900420 血球數目、血紅素含量或細胞容積）（clinical
Hematology ’ 第三版，Lippincott，Williams 及 Wilkins ;編 者Mary L. Turgeon，19")、膜鐵轉運蛋白内化或鐵運輸） 來量測海帕西啶中和活性。在一例示性實施例中，在約 1(Τ8 Μ或以下之ECso下，單株抗體降低細胞内鐵濃度且/或 增加循環鐵濃度。 在一些實施例中，如本文中所述之單株抗體拮抗人類海 帕西啶之效應或抑制海帕西啶鐵調節活性。在一些實施 例中’如本文中所述之單株抗體在約1χ10-8 Μ或以下或約 lxl〇-7 Μ或以下之ECso下發揮效應。舉例而言，如由鐵蛋 白檢定所測定，抗體可在約1χ1〇-8 Μ或以下之EC5()下降低 細胞中之細胞内鐵含量或可在約1 χ 1 0-8 Μ或以下之£匚50下 降低鐵蛋白表現。在其他實施例中，如本文中所述之單株 抗體可使游離血清海帕西啶含量降低至少約20%、至少約 3 0%、至少約40%、至少約5〇%、至少約6〇%、至少約 70 /〇、至少約或至少約9〇%。在其他實施例中如本 文中所述之單株抗體可使紅血球計數（數目）、紅血球平均 細胞容積或紅血球血紅素含量增加，使血紅素增加，使血 容比增加，使Tsat增加，使循環（或血清）鐵含量增加且/或 使網狀血球計數、網狀血球平均細胞容積、網狀血球血紅 素含量或網狀血球數目增加或正規化。 在特定例示性實施例中，本發明涵蓋： 1)保留抗體 Ab43、2.7、2.41、R9、1C9、1S1、1S2、 1S3、1S4、1S5、3B3、4E1、7A3、9d12 i2B9 i5ei、 128410.doc •26- 200900420 18D8、19C1、19D12、19H6、23F11及 26F11 中之任一者的 CDRH1、CDRH2、CDRH3、CDRL1、CDRL2 或 CDRL3 中 之任一者、兩者、三者、四者、五者或六者且視情況包括 該（等）CDR中之一或兩個突變的單株抗體； 2) 保留抗體 Ab43、2.7、2.41、R9、1C9、1S1、1S2、 1S3、1S4、1S5、3B3、4E1、7A3、9D12、12B9、15E1、 18D8、19C1、19D12、19H6、23F11及 26F11 中之任一者之 所有CDRH1、CDRH2、CDRH3或重鏈可變區且視情況包 括該（等）CDR中之一或兩個突變的單株抗體； 3) 保留抗體 Ab43、2.7、2.41、R9、1C9、1S1、1S2、 1S3、1S4、1S5、3B3、4E1、7A3、9D12、12B9、15E1、 18D8、19C1、19D12、19H6、23F11 及 26F11 中之任一者之 所有CDRL 1、CDRL2、CDRL3或輕鏈可變區且視情況包括 該（等）CDR中之一或兩個突變的單株抗體； 4) 結合於與抗體 Ab43、2.7、2.41、R9、1C9、1S1、 152、 1S3、1S4、1S5、3B3、4E1、7A3 ' 9D12、12B9、 15E1、18D8、19C1、19D12、19H6、23F11 及 26F11 相同 之成熟人類海帕西啶抗原決定基（例如如經由X射線晶體分 析儀所測定）或包含SEQ ID NO: 9之胺基酸1-5内的胺基酸 及/或由SEQ ID NO: 9之胺基酸10-13所形成之環内的胺基 酸及/或由SEQ ID NO: 9之胺基酸14-22所形成之環内的胺 基酸之構形抗原決定基的單株抗體；及 5) 與抗體 Ab43、2.7、2.41、R9、1C9、lsi、1S2、 153、 1S4、1S5、3B3、4E1、7A3、9D12、12B9、15E1、 128410.doc -27- 200900420 D8、、19C1、19D12、19H6、23FimFU 競爭結合成熟 人類海帕西°定達超過約75%、超過約峨或超過約81%、 82%、83%、84%、85%、祕、87%、88%、89%、9〇%、 91%、92%、93%、94%或 95%之單株抗體。 在一實施例中，該抗體包含選自由SEQIDNO: 16_21組 成之群的胺基酸序列中之至少—個、兩個、三個、四個、 五個或所有胺基酸序列。在另—實施例中，該抗體包含選 Q ID NO. 28-33(2.7 CDR)組成之群的胺基酸序列 中之至少一個、兩個、三個、四㈤、五個或所有胺基酸序 列。在另一實施例中，該抗體包含選自由SEQ ID NO:. (2.4 1 CDR)組成之群的胺基酸序列中之至少一個兩 個四個、五個或所有胺基酸序列。在另一實施例 中’該抗體包含選自由SEQ m Nq: 52 57(r9⑽)組成 之群的胺基酸序列中之至少一個、兩個、三個、四個、五 個或所有胺基酸序列。在另—實施财，該抗體包含選自 由SEQ ID N〇 : 1U-116(1C9 CDR)組成之群的胺基酸序列 中之至少-個m三個、四個、五個或所有胺基酸序 列。在另-實施例中’該抗體包含選自由seq id n〇 : m-l26(3B3 CDR)組成之群的胺基酸序列巾之至少—個、 兩個、三個、四個、五個或所有胺基酸序列。在另—實施 例中，該抗體包含選自由SEQ m N〇: i3ii36(4Ei cdr) 組成之群的胺基酸序列中之至少一個、兩個、三個、四 個、五個或所有胺基酸序列。在另—實施例中，該抗體包 含選自由SEQIDNO: 141_146(7A3 CDR)組成之群的胺基 128410.doc -28- 200900420 > 一個、兩個、三個、四個、五個或所有胺 土 -夂歹’J。在另一實施例中’該抗體包含選自由柳I。 NO: 15^56(9^ CDR)組成之群的胺基酸序列中之至少 一個、兩個、三個、四個、五個或所有胺基酸序列。在另 一實施例中，該抗體包含選自由SEQ ID N〇 : 161_ 166(12B9 CDR)組成之群的胺基酸序列中 〜王y —個、兩 / 個、三個、四個、五個或所有胺基酸序列。在另一實施例 中，該抗體包含選自由SEQIDN〇: 171_176〇5eicdr)組 成之群的胺基酸序列中之至少一個、兩個、三個、四個、 五個或所有胺基酸序列。在另一實施例中，該抗體包含選 自由SEQ ID N0: 314_319(幽CDR)組成之群的胺基酸 序列中之至少一個、兩個、三個、四個、五個或所有胺基 酸序列。纟另-實施例中’該抗體包含選自由seq id NO · 324-3 29(1 9C1 CDR)組成之群的胺基酸序列中之至少 一個、兩個、三個、四個、五個或所有胺基酸序列。在另 一實鉍例中，該抗體包含選自由SEQ ID N〇 : 294-299 (19D12 CDR)組成之群的胺基酸序列中之至少一個、兩 個、三個、四個、五個或所有胺基酸序列。在另一實施例 中 β亥抗體包 3 遥自由 SEQ ID NO : 3 04-309(19H6 CDR) 組成之群的胺基酸序列中之至少一個、兩個、三個、四 個、五個或所有胺基酸序列。在另一實施例中，該抗體包 含選自由SEQ ID NO : CDR)組成之群的胺
基酸序列中之至少-個、兩個、三個、四個、五個或所有 胺基酸序列。在另一實施例中，該抗體包含選自由SEQ ID 128410.doc -29- 200900420 NO: 19H96(26F11 CDR)組成之群的胺基酸序列中之至少 -個、兩個、三個、四個 '五個或所有胺基酸序列。在另 -實施例巾，該抗體包含選自由SEQ ID N〇: 2〇3-2〇5及 131-133(1S1 CDR)組成之群的胺基酸序列中之至少一個、 兩個、三個、四個、五個或所有胺基酸序列。在另一實施 例中，該抗體包含選自由SEQ ID N〇: 214_216及144_ 146(1S2 CDR)組成之群的胺基酸序列中之至少—個、兩
個、三個、四個、五個或所有胺基酸序列。在另一實施例 中，該抗體包含選自由SEQidn〇:225_227及i64_i66(is3 CDR)組成之群的胺基酸序列中之至少—個、兩個、三 個、四個、五個或所有胺基酸序列。在另一實施例中，該 抗體包含選自由 SEq ID N〇: 236_238及 174 i76(is4 cdr) 組成之群的胺基酸序列中之至少一個、兩個、三個、四 個、五個或所有胺基酸序列。在另一實施例中，該抗體包 含選自由 SEQ ID N0: 247_249及184_186(185 cdr)組成之 群的胺基酸序列中之至少一個、兩個、三個、四個、五個 或所有胺基酸序列。 在一些貫施例中，該抗體包含所有三個輕鏈CDR、所有 二個重鏈CDR或所有六個CDR。在一些例示性實施例中， 抗體之兩個輕鏈CDR可與不同抗體之第三個輕鏈cdr組 » °或者’尤其當CDR具有高度同源性時一抗體之cDRX i 可與不同抗體之CDRL2及另一抗體之CDRL3組合。同樣， 抗體之兩個重鏈CDR可與不同抗體之第三重鏈cdr組合； 或尤其當CDR具有高度同源性時，一抗體之cdrhi可與不 128410.doc -30- 200900420 同抗體之CDRH2及另一抗體之CDRH3組合。 亦可使用一致CDR。在一例示性實施例中，該抗體包含在 SEQ ID NO: 74(XASNLES)、SEQ ID NO: 75(XQSNEE)及 SEQ ID NO: 76(QQXNEX)、SEQ ID NO: 28(RASESVDSYGNSFMH)、 SEQ ID NO: 77(WINTXSGVPTYADDFXG)、SEQ ID NO: 78(XXYYGX*A*Y) > SEQ ID NO: 19(TYGMS)、SEQ ID NO: 284(VIXYXXSNKYYADSVKG)、SEQ ID NO: 285 (WIXAXNGXXXXAXXXQX)、SEQ ID NO: 286(AQEGXAPDAFDI)、 ( SEQ ID NO: 287(QAWYSSTNVX)、SEQ ID NO: 288 (QAWDSSTAXX)、SEQ ID NO: 289(QSDYSSXXX**)中所 示之胺基酸序列中的一或多個胺基酸序列，其中X為任何 胺基酸且*可缺失或可為任何胺基酸。 在另一例示性實施例中，該抗體包含抗體之輕鏈及/或 重鏈可變區，例如SEQ ID NO: 15(Ab43重鏈可變區）及/或 SEQIDNO:13(Ab43輕鏈可變區）；SEQIDNO:27(2.7重 鏈可變區）及/或SEQ ID NO: 25(2.7輕鏈可變區）；SEQ ID 、 NO: 39(2.41重鏈可變區）及/或SEQ ID NO: 37(2.41輕鏈可 變區）；或SEQ ID NO: 51 (R9重鏈可變區）及/或SEQ ID NO: 49(R9輕鏈可變區）；SEQ ID NO: 110(1C9重鏈可變區）及/ 或 SEQ ID NO: 108(1C9 輕鏈可變區）；或 SEQ ID NO: 120(3B3重鏈可變區）及/或SEQ ID NO: 118(3B3輕鏈可變 區）；SEQ ID NO: 130(4E1 重鏈可變區）及 /或 SEQ ID NO·· 128(4£1輕鏈可變區）；或8£(^1〇1^〇:140(7八3重鏈可變區） 及/或 SEQ ID NO: 138(7A3 輕鏈可變區）；或SEQ ID NO: 128410.doc -31 - 200900420 150(9D12重鏈可變區）及/或SEQ ID no: 148(9D12輕鍵可變 區）；SEQ ID NO: 160(12B9重鏈可變區）及 / 或 SEQ ID NO: 158(12B9% 鍵可變區）；SEQIDNO: 170(15E1 重鍵可變區） 及/或SEQIDNO:168(15El輕鏈可變區）；SEQIDNO· 313(1808重鏈可變區）及/或8叫1〇]^〇:311(1808輕鏈可變 區）；SEQ ID NO: 3 23 (19C1 重鏈可變區）及 / 或 SEQ ID NO: 321 (19C1輕鏈可變區）；SEQ ID NO: 293( 19D12重鏈可變 區）及 / 或 SEQ ID NO: 291(1 9D1 2輕鏈可變區）；SEQ ID NO: 303(19H6重鏈可變區）及/或SEQ ID no: 301(19H6輕鏈可變 區）；SEQ ID NO: 180(23F11 重鏈可變區）及/或 SEQ ID NO: 178(23F11 輕鏈可變區）；SEQ ID NO: 190(26F11 重鏈可變 區）及/或SEQ ID NO: 188(26F11輕鏈可變區）；或SEQ ID NO: 202(1S1重鏈可變區）及/或SEQ ID NO: 128(1S1輕鏈可 變區）；SEQ ID NO: 2 13(1 S2輕鏈可變區）及/或SEQ ID NO: 140(1S2重鏈可變區）；SEQ ID NO: 224(1S3輕鏈可變區）及/ 或 SEQ ID NO: 160(1 S3重鏈可變區）；SEQ ID NO: 235(1 S4 輕鏈可變區）及/或SEQ ID NO: 170(1S4重鏈可變區）；或 SEQ ID NO: 246(1S5 輕鏈可變區）及 / 或 SEQ ID NO: 190(1S5重鏈可變區）。
在一些實施例中，提供一種包含具有與選自由以下各者 組成之群的胺基酸序列至少約65%、70%、75%、80%、 81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、 90% ' 91% ' 92% ' 93% ' 94% ' 95% ' 96% ' 97% ' 98% > 99%或99%以上一致之胺基酸序列之多肽的抗體：SEQ ID 128410.doc -32- 200900420 NO·· 15(Ab43重鏈可變區）、27(2·7重鏈可變區）、39(m 鏈可變區）、51(R9重鏈可變區）、u〇(1C9重鏈可變區）、 120(3B3重鏈可變區）、13q(4e1重鏈可變區）、重鍵 可變區）、150(9D12重鏈可變區）、16〇(12B9重鏈可變區卜 170(15E1重鏈可變區）、313(18D8重鏈可變區）、323(i9ci 重鏈可變區）、293(19D12重鏈可變區）、303(19H6重鏈可 變區）、180(23F11重鏈可變區）、19〇(26FU重鏈可變區）、 202(1S1重鏈可變區）、13(Ab43輕鏈可變區）、25(2·7輕鏈 可變區）、37(2.41輕鏈可變區）' 49(R9輕鏈可變區）、 108(109¼鏈可變區）、ιΐ8(3Β3輕鏈可變區）、128(4E1輕鏈 可變區）、138(7A3輕鏈可變區）、i48(9D12輕鏈可變區）、 158(1 2B9輕鏈可變區）、168(1 5E1輕鏈可變區）、311(18D8 輕鏈可變區）、321(19C1輕鏈可變區）、291(19D12輕鏈可 變區）、301 (1 9H6輕鏈可變區）、1 78(23F11輕鍵可變區）、 188(26?11輕鏈可變區）、213(182輕鏈可變區）、224(183輕 鏈可變區）、235(1 S4輕鏈可變區）及246(1 S5輕鏈可變區）， 該多肽進一步包含在SEQIDNO:16-21(Ab43CDR)、28-33(2.7 CDR) ' 40-45(2.41 CDR) ' 52-57(R9 CDR) > 111-116(1C9 CDR)、121-126(3B3 CDR)、131-136(4E1 CDR)、 141-146(7A3 CDR)、151-156(9D12 CDR)、161-166(12B9 CDR)、171-176(15E1 CDR)、314-319(18D8 CDR)、324-329(19C1 CDR) ' 294-299( 19D12 CDR)、304-309(19H6 CDR)' 181-1 86(23F11 CDR)' 191 -196(26F 11 CDR) > 203-205 及 13 1-13 3( 1S1 重鏈 CDR)、214-216及 144-146( 1S2輕鏈 128410.doc -33- 200900420 CDR)、225-227 及 164-166(1 S3 輕鏈 CDR)、236-238 及 Μ-ΐ 76(1 S4 輕鏈 CDR) 以及 247-249 及 184-186(1 S5 輕鏈 CDR) 中 所示之胺基酸序列中之至少一或多個胺基酸序列。在上述 實施例之任一者中，該多肽包括包含一或兩個對SEQ ID NO: 16-21(Ab43 CDR)、28-33(2.7 CDR)、40-45(2.41 CDR)、52-57(R9 CDR)、111-116(1C9 CDR)、121-126(3B3 CDR)、131-136(4E1 CDR)、141-146(7A3 CDR) > 151-156(9D12 CDR)、161-166(12B9 CDR)、171-176(15E1 CDR)、314-319(18D8CDR)、324-329(19C1CDR)、294-299(19D12 CDR)、304-309(19H6 CDR)、181-186(23F11 CDR)、191-1 96(26F 11 CDR)、203-205及 131-133(1S1 重鏈 CDR)、21 4-21 6 及 144-146( 1S2 輕鏈 CDR)、225-227 及 164-166(1 S3 輕鏈 CDR)、23 6-238 及 174-176(1 S4輕鏈 CDR)以及 247-249及184-186(1 S5輕鏈CDR)中所示之胺基酸序列中的 任一者之修飾的序列。 亦提供抗體 1C9、3B3、4E1、7A3、9D12、12B9、 15E1、23F11及26F11中之每一者之全長輕鏈及重鏈的 cDNA及胺基酸序列。編碼抗體1C9、3B3、4E1、7A3、 9D12 、 12B9 、 15E1 、 23F11 、 26F11 、 1S2 、 1S3 、 1S4及 1S5之全長輕鍵（包括丨互定區）的cDNA序列係分別示於SEQ ID NO: 197 、 208 、 219 、 230 、 241 、 252 、 256 、 260 、 264、217、228、239 及 250 中。抗體 1C9、3B3、4E1、 7A3、9D12、12B9、15E1、23F11、26F11、1S2、1S3、 1 S4及1 S5之全長輕鏈（包括恆定區）之胺基酸序列係分別示 128410.doc -34- 200900420 於SEQ ID NO: 198(其中殘基丨_20相當於信號肽且其餘為成 熟多狀）、209(其中殘基1 -1 9相當於信號肽且其餘為成熟多 狀）、22〇(其中殘基卜20相當於信號肽且其餘為成熟多 狀）、231(其中殘基卜別相當於信號肽且其餘為成熟多 狀）、242(其中殘基卜19相當於信號肽且其餘為成熟多 肽）、253(其中殘基uo相當於信號肽且其餘為成熟多 肽）、257(其中殘基丨—別相當於信號肽且其餘為成熟多 肽）、261(其中殘基相當於信號肽且其餘為成熟多 肽）、265(其中殘基丨_19相當於信號肽且其餘為成熟多 肽）、218(其中殘基丨—22相當於信號肽且其餘為成熟多 肽）、229(其中殘基丨_22相當於信號肽且其餘為成熟多 肽）、240(其中殘基丨_22相當於信號肽且其餘為成熟多肽） 及251(其中殘基丨_22相當於信號肽且其餘為成熟多肽）中。 編碼抗體 1C9、3B3、4E1、7A3、9D12、12B9、15E1、 23F11、26F11及1S1之全長重鏈（包括恆定區）的CDNA序列 係分別示於 SEQ ID NO: 199、210、221、232、243、 254、258、262、266 及 206 中。抗體 1C9、3B3、4E1、 7A3、9D12、12B9、15E1、23F11、26F11 及 1S1 之全長重 鏈（包括恆定區）之胺基酸序列係分別示於SEQ ID NO: 2〇〇(其中殘基1-19相當於信號肽且其餘為成熟多肽）、 211(其中殘基1-19相當於信號肽且其餘為成熟多肽）、 222(其中殘基1-19相當於信號肽且其餘為成熟多肽）、 233(其中殘基1-19相當於信號肽且其餘為成熟多肽）、 244(無信號肽）、255(其中殘基1-19相當於信號肽且其餘為 128410.doc -35- 200900420 成熟多狀）、259(其中殘基卜丨9相當於信號肽且其餘為成熟 多狀）、263(其中殘基^汕相當於信號肽且其餘為成熟多 肽）、267(其中殘基卜19相當於信號肽且其餘為成熟多肽） 及207(其中殘基丨_19相當於信號肽且其餘為成熟多肽）中。 在本發明之一些實施例中，抗體包含SEq ID N〇: 207(1S1 重鏈）之胺基酸 2〇_467&SEQ ID N〇: 220(1S1 輕鏈） 之胺基酸21-234;或SEQ ID NO: 233(1S2重鏈）之胺基酸 20-466 及 SEQ ID NO: 218(1S2 輕鏈）之胺基酸 23_234;或 SEQ ID NO: 255(1 S3 重鏈）之胺基酸 20-466 及 SEQ ID NO: 229(1S3 輕鏈）之胺基酸 23·234;或 SEQ ID NO: 259(1S4 重 鏈）之胺基酸20-466及SEQ ID NO: 240(1S4輕鏈）之胺基酸 23-234;或 SEQ ID NO: 267(1S5 重鏈）之胺基酸 2〇_466 及 8丑卩10>^0:251(185輕鏈）之胺基酸23-23 4。 如本文中所用之術語"單株抗體"係指獲自一群大體上同 質之抗體之抗體（至於彼術語"抗體”係如本文中所定義）， 亦即無論由融合瘤產生還是由重組DNA技術所產生，構成 該群之個別抗體除可以微量存在之可能天然存在之突變或 替代性後轉譯修飾以外為一致的。單株抗體之非限制性實 例包括执類、兔、大鼠、難、肷合、人類化或人類抗體、 完全裝配之抗體、多特異性抗體（包括雙特異性抗體）、可 結合抗原之抗體片段（包括Fab1、F’（ab)2、Fv、單鍵抗I*、 雙功能抗體）、最大抗體、奈米抗體及包含上述物之重組 肽（其限制條件為該等者顯示所需生物活性）或其變異體或 衍生物。人類化或修飾抗體序列使其更類似於人類之内容 128410.doc -36- 200900420 係描述於例如 Jones 等人，Nature 32 1:522-525 (1986); Morrison等人，Proc. Natl. Acad. Sci., U.S.A.，81:685 1-6855 (1984) ； Morrison 及 Oi, Adv. Immunol., 44:65-92 (1988) ; Verhoeyer等人，Science 239:1534-1536 (1988); Padlan, Molec. Immun. 28:489-498 (1991) ； Padlan, Molec. Immunol. 3 1(3):169-217 (1994);及 Kettleborough，C.A.等 人，Protein Eng. 4(7):773-83 (1991) ; Co, M. S.等人 (1994), J. Immunol. 152, 2968-2976 ； Studnicka 等人 Protein Engineering 7: 805-814 (1994)中；其每一者以引用方式全 部併入本文中。一種分離人類單株抗體之方法為使用噬菌 體展示技術。噬菌體展示法係描述於例如Dower等人，WO 91/17271、McCafferty 等人，WO 92/01047 及 Caton 與 Koprowski, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 87:6450-6454 (1990)中，其每一者以引用方式全部併入本文中。另一種 分離人類單株抗體之方法使用不產生内源性免疫球蛋白且 經工程化而含有人類免疫球蛋白基因座之轉殖基因動物。 參見例如 Jakobovits 等人 ’ Proc. Natl. Acad. Sci. USA， 90:2551 (1993) ; Jakobovits 等人，Nature，362:255-258 (1993) ; Bruggermann 等人，Year in immun。.，7:33 (1993) ; WO 91/10741、WO 96/34096、WO 98/24893 或美 國專利申請公開案第200301 944〇4號、第2003003 1667號或 第200201992 13號；其各自以引用方式全部併入本文中。 "經分離”抗體係指已自其自然環境之組份中|監別出且分 離出的抗體（至於彼術語"抗體"係如本文中所定義）。其自 128410.doc •37· 200900420 然環境之污染物組份為會干擾抗體之診斷性或治療性用途 的物質且可包括酶、激素及其他蛋白質性或非蛋白質性溶 ' 某二實施例中，抗體將被純化（1)至大於抗體之95重 量％且最佳超過99重量％，⑺至足以獲得至少15跡末端 或内部胺基酸序列殘基之程度，或（3)至具有均一性（藉由 在還原或非還原條件下使用庫馬斯藍（c_assie biue)或較 佳銀染色之SDS_PAGE得知）。經分離之天然存在的抗體包 广括重組細胞内之原位抗體，此係因為抗體自然環境中之至 % 少一個組份將不會存在。然而，經分離之抗體通常將藉由 至少一個純化步驟來製備。 "免疫球蛋白"或”天然抗體”為四聚醣蛋白。在天然存在 之免疫球蛋白中，每個四聚體係由兩對一致之多肽鏈組 成，各對具有一個”輕”鏈（約25 kDa)及一個”重"鍵（約5〇_7〇 kDa) °各鏈之胺基末端部分包括具有約1〇〇至11〇或更多個 主要負責抗原識別之胺基酸的”可變"（"\^，）區。各鏈之羧基 末端部分界定主要負責效應功能之恆定區。免疫球蛋白可 " 視其重鏈之恆定域之胺基酸序列而被分成不同種類。重鍵 被分類為謬（μ)、德耳塔（△)、伽馬（γ)、阿爾法（…及厄普西 隆（ε)且將抗體之同型分別定義為Ig]VI、igD、igG、IgA及 IgE。若干該等者可被進一步分成子類或同型，例如 IgGl、IgG2、IgG3、IgG4、IgAl 及 IgA2。不同同型具有 不同效應功能；舉例而言，IgGl及IgG3同型具有抗體依賴 性細胞毒性（ADCC)活性。人類輕鏈被分類為卡帕（κ)及拉 姆達（λ)輕鏈。在輕鏈及重鏈之内，可變區及悝定區係由具 1284I0.doc -38- 200900420 有約12或更多個胺基酸之"J"區域接合，其中重鏈亦包括 具有約10或更多個胺基酸之"D"區域。通常參見 Fundamental Immunology ’ 第 7章（paul，W.編，第二版， Raven Press，Ν·Υ· (1989))。 異型為可具有免疫原性且在人類中由特定等位基因編碼 之抗體序列上（通常為恆定區上）之變體。已鑑別出五種人 類 IGHC 基因（IGHG1、IGHG2、IGHG3、IGHA2 及 IGHE 基 因）之異型且分別將其指定為Glm、G2m、G3m、A2m及 Em異型。已知至少18種〇111異型：nGlm⑴、nGlm(2)、
Glm(l、2、3、17)或 Glm(a、X、f、z)、G2m(23)或 G2m(n)、G3m(5、6、10、11、13、14、15、16、、 24 、 26 、 27 、 28)或 G3m(bl 、 C3 、 b5 、 bO 、 b3 、 b4 、 s 、 t §1、e5、u、v、g5)。存在兩種 A2m 異型 A2m(l)及 A2m(2)。 關於抗體之結構及產生之詳細描述，參見R〇th，D B.及
Craig, N.L.，Ce//，94:41 1-414 (1998)，該文獻以引用方式 全部併入本文中。簡言之，產生編碼重鏈及輕鏈免疫球蛋 白序列之DNA之過程主要發生於發育B細胞中。在重排及 接合各種免疫球蛋白基因片段之前，通常發現v、d、j& 恆定（C)基因片段在單個染色體上相對地緊密接近。在b細 胞刀化期間，V、D、J(或在輕鏈基因之情況下僅v及基 口片攸之各適當豕族成員中之一者經重組而形成重鏈及輕 鏈免疫球蛋白基因之功能重排可變區。此基因片段重排過 程似乎為連續的。首先，使得重鏈〇與；接合，接著重鏈v 128410.doc -39- 200900420 與DJ接合且輕鏈乂與〗接合。除乂、〇及）片段重排之外，經 由在輕鍵之V及J片段接合且重鏈之〇及j片段接合之位置處 的可變重組在免疫球蛋白重鏈及輕鏈之初級譜（repert〇ire) 中產生其他多變性。輕鏈中之該變化通常發生於V基因片 段之最後密碼子及J片段之首個密碼子内。在〇與Jh片段之 間的重鏈染色體上出現接合之相似不精確性且可能遍及多 達10個核苷酸。此外，可將若干核苷酸插入並非由染色體 組DNA所編碼之D與jH基因片段之間及Vh與D基因片段之 間。該等核苷酸之添加被稱為N區多樣性。可變區基因片 段之该等重排及可在該接合期間出現之可變重組的淨效應 為產生初級抗體譜。 術語”高變”區係指互補判定區或CDR之胺基酸殘基（亦即 如由 Kabat等人，Sequences of Proteins of Immunological Interest ’ 弟五版 ’ pubiic Health Service, National Institutes of Health’ Bethesda，Md. (1991)所描述，輕鏈可 變域中之殘基24-34(Ll)、50-56(L2)及89-97(L3)以及重鏈 可變域中之 31-35(H1)、50-65(H2)及 95-102(H3))。甚至單 個CDR儘管具有比含有所有CDR之完整抗原結合位點低之 親和力，但其仍可識別且結合抗原。 高變”環π之殘基的替代性定義係由Chothia等人，j. 79(5: 901-917 (1987)描述為輕鏈可變域中之殘基 26-32(1^1)、50-52(1^2)及91-96(1^3)以及重鏈可變域中之殘 基 26-32(Η1)、53·55(Η2)及 96-101(Η3)。 ”構架”或FR殘基為除高變區殘基以外之彼等可變區殘 128410.doc -40- 200900420 基。 "抗體片段”包含完整免疫球蛋白之一部分（較佳完整抗體 之抗原結合或可變區）且包括由抗體片段形成之多特異性 (雙特異性、三特異性等）抗體。可藉由重組DNA技術或藉 由酶促或化學裂解完整抗體來產生免疫球蛋白之片段。
抗體片段之非限制性實例包括Fab、Fab’、F(ab’）2、 卩¥(可變區）、域抗體（£1八13，含有乂11域）（\\^<1等人，他加6 341:544-546，1989)、互補判定區（Cdr)片段、單鏈抗體 (scFv，在單個多肽鏈上含有vh及VL域）（Bird等人， Science 242:423-426，1988 及 Huston 等人，Proc. Natl. Acad· Sci. USA 85:5 879-5 883, 1988，視情況包括多肽連接 子，且視情況具有多特異性，Gruber等人，J. Immunol. 152: 53 68 (1994))、單鏈抗體片段、雙功能抗體（在單個多 肽鏈上具有與另一鏈之互補VL及VH域成對之VH及VL 域）（EP 404,097 ; WO 93/11161 ;及 Hollinger 等人，Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90:6444-6448 (1993))、三功能抗 體、四功能抗體、微型抗體（scFv經由肽連接子（無鉸鏈）或 經由 IgG鉸鏈與 CH3 融合）（01afsen 等人，pr〇tein Eng Des Sel. 2004年4月，17(4):3 15-23)、線性抗體（串聯Fd片段 (VH-CHl-VH-CHl)(Zapata等人，？1>€^111丑11经.，8(10):1057-1062 (1995)))、螯合重組抗體（crAb ’其可結合於同一抗原 上之兩個相鄰抗原決定基）（Neri等人，j Mol Biol. 246:367-73, 1995)、雙抗體（bibody)(雙特異性 Fab-scFv)或 三抗體（tribody)(三特異性 Fab-(scFv)(2))(Schoonjans 等 128410.doc -41 - 200900420 人，J Immunol. 165:7050-57, 2000 ； Willems 等人，J Chromatogr B Analyt Technol Biomed Life Sci. 786:161-76, 2003)、亦可包含在細胞内保留或指導抗體之細胞信號序 列（Mhashilkar 等人，EMBO J 14:1542-51，1995 ; Wheeler 等人，FASEB J. 1 7:1733-5，2003)的内抗體（Biocca等人， EMBO J. 9:101-108，1990 ; Colby等人，Proc Natl Acad Sci U S A. 101:17616-21，2004)、穿膜抗體（transbody)(含有與 scFv融合之蛋白轉導域（PTD)的可滲透細胞之抗體）（Heng 等人 ’ Med Hypotheses. 64:1105-8，2005)、奈米抗體（約 15 kDa重鏈可變域）（Cortez-Retamozo等人，Cancer Research 64:2853-57，2004)、小分子免疫治療藥物（srnall modular immunopharmaceutical)(SMIP)(W003/041600、美國專利公 開案20030 133939及美國專利公開案200301 18592)、抗原 結合域免疫球蛋白融合蛋白、駱駝化抗體（camelized antibody)(其中VH與含有鉸鏈、CHI、CH2及CH3域之怪定 區重組）（Desmyter 等人，J. Biol. Chem. 276:26285-90, 2001 ; Ewert等人，Biochemistry 41:3628-36，2002;美國 專利公開案第20050136049號及第2005 0037421號）、含 VHH之抗體、重鏈抗體（HCAb ’兩個具有H2L2結構之重鏈 之同源二聚體）或其變異體或衍生物以及含有足以賦予多 肽特異性抗原結合之免疫球蛋白之至少一部分（諸如CDR 序列）的多肽，其限制條件為抗體保留所需生物活性。 術§吾”變異體π當與抗體結合使用時係指在可變區或相當 於可變區之部分中含有至少一個胺基酸取代、缺失或插入 128410.doc -42· 200900420 之抗體的多肽序列’其限制條件為變異體保留所需結合親 和力或生物活性。此外’如本文中所述之抗體可在恆定區 中具有胺基酸修飾以改良抗體之效應功能，包括半衰期或 清除率、ADCC及/或CDC活性。舉例而言，該等修飾可= 高抗體藥物動力學作用或提高抗體在治療癌症時之有效 性。參見Shields等人，J. Biol. Chem., 276(9):6591 66〇4
(2001)，該文獻以引用方式全部併入本文中。在“οι之情 況下，對纟定區(尤其鉸鏈或⑽區)之修飾可使效應功 (包括ADCC及/或CDC活性）增加或降低。在其他實施例 中，IgG2恆定區被修飾以減少抗體-抗原聚集體形成。在
IgG4之情況下，對恆定區（尤其鉸鏈區）之修飾可減少半抗 體形成。 術語”修飾”當與本文中所述之抗體或多肽結合使用時包 括（但不限於）一或多個胺基酸變化（包括取代、插入或缺 失）；不干擾海帕西啶結合活性之化學修飾；藉由與治療 劑或診斷劑接合進行之共價修飾；標記（例如使用放射性 核種或各種酶）；共價聚合物連接，諸如聚乙二醇化（用聚 乙二醇衍生化）；及藉由化學合成非天然胺基酸進行之插 入或取代。在一些實施例中，本發明之經修飾多肽（包括 抗體）將保留本發明之未經修飾分子之結合特性。 術語”衍生物"當與本發明之抗體或多肽結合使用時係指 藉由與治療劑或診斷劑接合、標記（例如使用放射性核種 或各種酶）、共價聚合物連接（諸如聚乙二醇化）（用聚乙二 醇衍生化）及經由化學合成非天然胺基酸進行之插入或取 128410.doc -43 - 200900420 代而被共價修飾的抗體或多肽。在一些實施例中’本發明 之衍生物將保留本發明之未衍生化分子之結合特性。 製造雙特異性或其他多特異性抗體之方法在此項技術中 係已知的且包括化學交聯、使用白胺酸拉鏈[Kostelny等 人，J. Immunol. 148:1 547-1553，1992]、雙功能抗體技術 [Hollinger等人，Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:6444-48, 1993] 、scFv二聚體[Gruber等人，J. Immunol. 1 52: 5368, 1994] 、線性抗體[Zapata 等人，Pr〇tein Eng. 8:1057-62, 1995] 及螯合重組抗體…⑼等人，j m〇1 Biol. 246:367-73, 1995]。 因此’可藉由此項技術中已知之技術來產生多種包含抗 體之重鏈可變區或輕鏈可變區之一個、兩個及/或三個 CDR的組合物。 抗趙之重組產生 亦提供視情況可操作地連接於為宿主細胞所識別之控制 序列的編碼本文中所述之單株抗體之經分離核酸、包含該 等核酸之載體及宿主細胞以及產生該等抗體之重組技術， 該等技術可包含培養宿主細胞以便表現核酸且視情況自宿 主細胞培養物或培養基中回收抗體。 1藉由蛋白質直接定庠來泪丨丨郎· Μ、、+ a A、成4、π .
之染色體 128430.doc 自產生單株抗體之細胞中分離編碼單株抗體 -44 - 200900420 組或cDNA且進行定序。 使用標準技術進行選殖（參見例如Sambr〇〇k等人（1989) Molecular Cloning: a Lab〇rat〇ry Guide，第 13 卷，c〇id
Spring Harbor press，該文獻以引用方式併入本文中）。舉 例而言，可藉由反轉錄p〇lyA + mRNA(較佳膜相關mRNA)來 構建cDNA庫且使用對人類免疫球蛋白多肽基因序列具有 特異性之探針篩檢該庫。然而在一實施例中，使用聚合酶 鏈反應（PCR)來擴增編碼所關注之免疫球蛋白基因片段（例 如輕鏈或重鏈可變片段）的eDNA(或全長cDNA之部分）。可 容易地將擴增序列選殖入任何適當載體（例如表現載體、 小基因載體或噬菌體展示載體）中。應瞭解，所用之特定 選殖方法並非關鍵，只要有可能測定所關注之免疫球蛋白 多狀之某些部分的序列即可。 抗體核酸之一種來源為藉由自經所關注之抗原免疫之動 物中獲得B細胞且使其與永生細胞融合而產生的融合瘤。 或者，可自經免疫動物之B細胞（或整個脾）中分離核酸。 編碼抗體之核酸的另一種來源為（例如）經由噬菌體展示技 術所產生之該等核酸的庫。可藉由標準技術（諸如淘選 (panning))鑑別編碼所關注之肽（例如具有所需結合特徵之 可變區肽）的聚核苷酸。 可測定編碼免疫球蛋白多肽之整個可變區的序列；然而 有時將適於僅定序可變區之一部分（例如編碼cDR^部 分）。使用標準技術進行定序（參見例如Sambr〇〇k等人 (1989) Molecular Cl〇ning: a Laboratory ㈤也，第 13卷， 128410.doc -45- 200900420
Cold Spring Harbor Press 及 Sanger，F 等人（1977) pr〇c
Natl· Acad· Sci. USA 74: 5463-5467，該等文獻以引用方式 併入本文中）。藉由比較經選殖核酸之序列與人類免疫球 蛋白基因及cDNA之公開序列，熟習此項技術者將能夠容 易地視所定序之區而確定⑴融合瘤免疫球蛋白多肽（包括 重鏈之同型）之生殖系片段使用及（ϋ)重鏈及輕鏈可變區之 序列，包括由N區添加及體細胞突變過程所產生之序列。 免疫球蛋白基因序列資訊之一來源為國家生物技術資訊中 心（National Center for Biotechnology Information),
National Library of Medicine, National Institutes of Health, Bethesda，Md。 如本文中所用，"經分離"核酸分子或，，經分離，，核酸序列 為（1)自核酸之天然來源中通常與核酸分子締合之至少一種 污染物核酸分子中鑑別出且分離出或（2)經選殖、擴增、標 記或以別的方式使得有別於背景核酸以便可測定所關注之 核酸之序列的核酸分子。經分離核酸分子在形式或背景方 面不同於見於自然界之核酸分子。然而，經分離核酸分子 包括含於通常表現抗體之細胞中之核酸分子，其中（例如） 核酸分子處於不同於天然細胞之染色體位置處。 一旦分離後，可將DNA可操作地連接至表現控制序列或 置於表現载體中，隨後將其轉染於不另外產生免疫球蛋白 之宿主細胞中以便指導單株抗體在重組寄主細胞中之合 成。抗體之重組產生在此項技術中係熟知的。 表現控制序列係指對於可操作連接之編碼序列在特定宿 128410.doc -46- 200900420 -中之表現所必需的dna序列。適合於原核生物之 控2序列（例如）包括啟動子、（視情況）操縱子序列及核糖 體結合位點。已知真核細胞利用啟動子、多聚腺嘌呤信號 及增強子。
核酸當與另—核酸序列處於功能關係時為可操作連接 的。舉例而言’若前序列或分泌前導序列之DNA被表現為 參=多肽之分泌的前體蛋白f (preprotein)，則可操作地將 該前序列或分泌前導序狀DNA連接至多肽之DNA ;若啟 動子或增強子影響序列轉錄，則可操作地將該啟動子或增 強子連接至編碼序列；或若核糖體結合位點被定位以有助 於轉譯’料操作地將該核糖體結合位點連接至編碼序 列。—般而纟’ ”可操作地連接’，意謂所連接之DNA序列為 鄰接的，並在分泌前導序列之情況下為鄰接的且處於閱讀 相㈣ing phase)。，然而，增強子並非必定鄰接。藉由在 適宜限制性位點處之連接來實現連接。若該等位點不存 在，則根據習知做法使用合成寡核皆酸接頭（adapt〇r)或連 接子。 一許多載體在此項技術中係已知的。載體組份可包括下列 -或多者：信號序列(其可例如指導抗體之分泌)、複製起 點、-或多個選擇性標記基因(其可例如賦予抗生素或其 他藥物抗性，補足#養缺陷型缺陷或提供何在培養基中 獲得之關鍵營養幻、增強子元件、啟動子及轉錄終:序 列，所有該等者在此項技術中係熟知的。 細胞、細胞株及細胞培養物通常可互換使用且在本文中 128410.doc •47- 200900420 所有該等名稱包括子代。轉型體及轉型細胞包括在不考慮 轉移數之情況下源自其之主要個體細胞及培養物。亦應瞭 解，所有子代可能歸因於有意或無意突變而在dna含量方 面並非精確―致。包括如針對在初始轉型細胞中所筛檢的 具有相同功能或生物活性之突變體子代。 例不性宿主細胞包括原核生物、酵母或高級真核生物細 胞（亦即多細胞生物體）。原核宿主細胞包括真細菌，諸如 革蘭氏陰性或革蘭氏陽性生物體，例如腸桿菌科 (ErUer〇bacteriaceae)，諸如埃希氏菌屬（Escherichia)(例如 大腸桿菌（£· co/〇)、腸桿菌屬⑶价、歐文氏菌屬 、克雷伯氏鹵屬（尺/、變形桿菌屬 (Prok⑽）、沙門氏菌屬（tSfl/w〇we//ar)(例如鼠傷寒沙門氏菌 (〜/m〇似//α⑽/„_所謂謂））、沙雷氏菌屬价心如）（例如黏 質沙雷菌（心則〜以⑼則））及志賀氏菌屬（別如/⑷以 及芽孢桿菌屬（如以出)（諸如枯草芽孢桿菌（反⑷及地 衣芽孢桿菌（凡、假單胞菌屬而則謝) 及鏈黴菌屬（Arepiomwa)。真核微生物（諸如絲狀真菌或 酵母）為重組多肽或抗體之適當選殖或表現宿主。在低級 真核宿主微生物中最常使用釀酒酵母 cerevbke)或常見烘焙酵母。然而，若干其他菌屬、菌種 及菌株在本文中通常為可利用且適用的，諸如有畢赤酵母 屬（·Ρί·ο/π·α)(例如巴斯德畢赤酵母$尸似⑺…））、粟酒裂殖 酵母（Schizosctccharomyces pombe) ’，先魯維板遠屬 (K/wj/veromya)，亞羅酵母屬（y^r〇>Wa);念珠菌屬 128410.doc -48- 200900420 (Candida) ·，ι 氏本敬(^jyichoderma ;粗糙;脈孢菌 (TVewrospora crawa);許旺酵母屬（iSc/zwimm’omycM) ’ 諸如 西方§午旺酵母;及絲狀真 ΐί ’邊如紅徽屬（TVewro^ora)、青徽屬（Pern’c/Z/iMm)、彎頸 黴屬（7b/_y/7〇c/cj^Wm)及麯黴屬（hpergH/似）宿主（諸如構巢 麵徽（儿mWw/aMs)及黑麵徽（j. n/ger))。 表現糖基化多肽或抗體之宿主細胞可源自於多細胞生物 體。無脊椎動物細胞之實例包括植物及昆蟲細胞。已鑑別 眾多桿狀病毒菌株及變異體以及來自諸如以下者之宿主之 相應允許性昆蟲宿主細胞：草地黏蟲（办 /"rwg/periia)(毛蟲^)、埃及伊蚊ae幻;ρίζ.)(蚊子）、白紋 伊蚊 a/6i^ciWlS)(蚊子）、黑腹果蠅（Dr〇iSO/7/„7i? 似ier)(果蠅）及中國家蠶⑺〇w紗X w〇r〇。多種適於 轉染該等細胞之病毒株可公開獲得，例如苜蓿丫紋夜蛾
(Autographa californica)NPV 之 L-1 變異體及中國家蠶 NPV 之Bm-5菌株。 脊椎動物宿主細胞亦為適當宿主且自該等細胞重組產生 多肽或抗體已成為常規程序。適用哺乳動物宿主細胞株之 實例為中國倉鼠卵細胞，包括CHOK1細胞（ATCC CCL61)、DXB-11、DG-44 及中國倉鼠卵細胞 /-DHFr (CHO，Urlaub等人，pr0c. Natl. Acad Sci USA 77:4216
(1980));由 SV40轉型之猴腎臟 cvi 株（COS-7，ATCC CRL 1 65 1) ’人類胚腎株（經次選殖而生長於懸浮培養物中之 細胞，[Graham專人，乂厂卜0/_ 36:59 (1977)];幼倉鼠 128410.doc -49- 200900420 腎臟細胞（ΒΗΚ，ATCC CCL 10);小鼠賽托利細胞（mouse sertoli cell)(TM4 5 Mather, Biol. Reprod. 23: 243-251 (1980));猴腎臟細胞（CV1 ATCC CCL 70);非洲綠猴腎臟 細胞（VERO-76，ATCC CRL-1587);人類宮頸癌細胞 (HELA，ATCC CCL 2);犬腎臟細胞（MDCK，ATCC CCL 34);布法羅大鼠肝細胞（buffalo rat liver cell)(BRL 3A， ATCC CRL 1442);人類肺細胞（W138，ATCC CCL 75);人 類肝細胞瘤細胞（Hep G2，HB 8065);小鼠乳房腫瘤（MMT 060562 > ATCC CCL 5 1) ; TRI 細胞（Mather 等人，Annals N.Y. Acad. Sci. 383:44-68 (1982)) ; MRC5 細胞或 FS4 細 胞；或哺乳動物骨髓瘤細胞。 為了產生抗體，將宿主細胞以上述核酸或載體轉型或轉 染且培養於適當時經改良之習知營養培養基中以誘發啟動 子、選擇轉型體或擴增編碼所需序列之基因。此外，具有 多個經選擇性標記隔開之轉錄單位複本的新穎載體及經轉 染細胞株尤其適用於表現抗體。 可於多種培養基中培養用以產生本文中所述之抗體的宿 主細胞。諸如漢姆氏FI 0(Ham's FI 0)(Sigma)、最低必需培 養基（MEM，Sigma)、RPMI-1640(Sigma)及達爾伯克改良 伊格爾 培養基（Dulbeeco's Modified Eagle's Medium)(DMEM，Sigma)之市售培養基適用於培養宿主細 胞。此外，於Ham等人，Meth. Εηζ· 58:44 (1979)、Barnes 等人，Anal. Biochem. 102:255 (1980)、美國專利第 4,767,704 號、第 4,657,866 號、第 4,927,762 號、第 128410.doc -50- 200900420 4,560,655 號或第 5，122 469 號、w〇 9〇1〇343〇、w〇 00195或美國專利參考案第30,985號令所描述之培養基中 之任者可用作宿主細胞之培養基。該等培養基中之任一 者可根據需要補充以激素及/或其他生長因子（諸如胰島 素、轉鐵蛋白或上皮生長因子）、鹽（諸如氯化納、的鹽、 鎖鹽及磷酸鹽）、緩衝液（諸如HEpES)、料酸（諸如腺普 及胸苷）、抗生素（諸如GentamycinTM藥）、痕量元素（其被 定義為通常以微莫耳範圍内之最終濃度存在之無機化合 物）及葡萄糖或等效能源。亦可包括熟習此項技術者已知 之適當濃度的任何其他必需補充。培養條件(諸如溫度、 PH值及其類似條件）為彼等先前對於選擇用於表現之宿主 細胞所用之條件且應為一般熟習此項技術者所顯而易見。 -旦培養宿主細胞後’可於細胞内在周質空間中產生抗 體或抗體可被直接分泌於培養基中。若在細胞内產生抗 體，則作為第一步驟’(例如)藉由離心或超漉移除微粒碎 片（宿主細胞或溶解片段）。 可使用（例如m填灰石層析、陽離子或陰離子交換層析 或較佳親和層析（使用所關注之抗原或蛋白質錢蛋白質g 作為親和配位體）來純化抗體。蛋白fA可詩純化基於人 類γ!、γ2或γ4重鏈之抗體（Undmark等人，j 62:1-13 (1983))。對於所古,β 、所有小鼠同型及人類γ3推薦使 用蛋白質G(GUSS等人，EMB〇J 5:1567_1575 (胸》。親 和配位體所連接之基質大多數通常為遣脂糖，但亦可利用 其他基質。機械穩定性基質（諸如受控微孔玻璃或聚（苯乙 128410.doc 200900420 烯二乙稀基）苯）相較於使用賓脂糖可能達成之效果而古允 許比較快之流動速率及比較短之處理時間。當抗體包含^ 3域時，Bakerbond ΑΒχτΜ樹腊 α τ· Baker，PhiIIipsburgH N.L)適用於純化。視欲回收之抗體而定，亦可能使用其他 蛋白質純化技術’諸如乙醇沈殿、逆相HpLc、層析聚 焦、SDS-PAGE及硫酸銨沈殿。 嵌合及人類化抗體 因為相較於親本齧齒動物單株抗體而言，嵌合或人類化 抗體在人類中之免疫原性較低，所以其可詩治療人類且 過敏風險會低得多1 &，在涉及向人類活體内投藥之治 療應用中涵蓋該等抗體。 舉例而言’單獨地或以接合體形式反覆活體内投與人類 之鼠類抗體將在接受者中導致免疫反應，有時將之稱為 HAMA反應（人類抗小鼠抗體）。若需要反覆投藥，則 HAMA反應可能限制醫藥之有效性。可藉由使用親水性聚 合物（諸如聚乙二醇）對抗體作化學修飾或藉由使用遺傳工 程法使抗體結合結才冓更類似於人類纟降低抗體之免疫原 性0 如本文中所用，短語"嵌合抗體"係指含有源自兩種通常 源自於不同物種之不同抗體之序列的抗體。嵌合抗體最通 常包含與人類恆定ig域融合之齧齒動物單株抗體之可變ig 域。可使用此項技術中已知之標準程序產生該等抗體（參 見 Morrison，S. L·等人（1984)⑶⑽士 Human Antib〇dy
Molecules , Mouse Antigen Binding Domains with Human 128410.doc -52- 200900420
Constant Regi〇n Domains, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81, 6841 6855 ’ 及Bouhanne, G. L.等人，Nature 312, 643-646. (1984))。儘官已證明一些嵌合單株抗體在人類中具有較低 免疫原性，但齧齒動物可變Ig域仍能引起明顯的人類抗齧 齒動物反應。 短π人類化抗體"係指源自非人類抗體之抗體，通常為 齧齒動物單株抗體。或者’人類化抗體可源自嵌合抗體。 可由多種方法獲得人類化抗體，包括（例如）：（1)將非人 類互補判定區（CDR)接枝於人類構架及惺定區上（一種在此 項技術中稱為經由"CDR接枝”進行人類化之方法）或（2)移 植整個非人類可變域，但藉由置換表面殘基以類人表面來 掩蔽該等可變域（一種在此項技術中稱為”鑲飾 (veneering)"之方法）。該等方法揭示於（例如）J〇nes等人，
Nature 321.522-525 (1986) ; Morrison 等人，Proc. Natl. Acad. Sci·, U.S.A., 81:6851-6855 (1984) ; Morrison及 Oi,
Adv. Immunol.，44:65_92 (1988) ; Verh〇eyer等人， 239:1534-1536 (1988) ； Padlan, Molec. Immun. 28:489-498 (1991)； Padlan, Molec. Immunol. 31(3):169-217 (1994)； 及 Kettleborough，C.A.等人，protein Eng. 4(7):773-83 (1991)中’該等文獻各自以引用方式全部併入本文中。 CDR接枝涉及將來自小鼠重鏈及輕鏈可變Ig域之六個 CDR中之一或多者引入人類可變Ig域之適當構架區中。此 技術（Riechmann, L·等人 ’ Nature 332，323 (1988))利用保 守構架區（FR1-FR4)作為支架（scaff〇id)以支撐主要與抗原 128410.doc -53 - 200900420 接觸之CDR環。然而CDR接枝之明顯的不利之處為，因為 構架區之胺基酸能促進抗原結合且因為CDR環之胺基酸合 衫響兩個可變1§域之締合，所以CDR接枝可能產生具有比 原始小氣抗體顯著低之結合親和力的人類化抗體。為保持 人類化單株抗體之親和力，可藉由選擇最為接近地類似於 原始小鼠抗體之構架區的人類構架區且藉由由抗原結合位
點之電腦模型化所辅助的構架或CDR内之單個胺基酸的定 點突變來改良CDR接枝技術（例如c〇, M s等人dm)，厂
Immunol. 152, 2968-2976)。 一種將抗體人類化之方法包含將非人類重鏈及輕鍵序列 與人類重鏈及輕鏈序列㈣，基於該比對進行選擇且以人 類構架置換非人類構架，進行分子模型化以預測人類化序 列之構形且與親本抗體之構形比較。在此方法之後為⑶汉 區中會干擾CDR之結構之殘基的反覆回復突變，直至人類 化序列模型之所預測構形極為近似於親本非人類抗體之非 人類CDR的構形為止。該等人類化抗體可經進一步衍生以 促進吸收及清除率（例如經由Ashwell受體）（參見例如美國 專利第5,530，101號及第5,585,〇89號）。 已報導若干藉由合理設計對小鼠單株抗體進行人類化的
方法（參見例如2002年7月11日所公開之20020091240、WO 92/11018及美國專利第5,693,762號、美國專利第5,766,866 號）。 人類工程tTM抗艎 短語"人類工程化TM抗體，，係指源自非人類抗體之抗體， 128410.doc •54- 200900420 通$為蓄齒動物皁株抗體或可能為後合抗體。抗體可變域 之人類工程化ΤΜ已由Studnicka[參見例如studnicka等人， 美國專利第 5,766,886 號；Studnicka 等人，Pr〇tein Engineering 7: 805-814 (1994)]描述為一種降低免疫原性同 時保持抗體分子之結合活性的方法。根據該方法，已對各 可變區胺基酸賦以取代風險。以下列三種風險中之一者區 分胺基酸取代：（1)低風險變化為降低免疫原性之可能性最 大但破壞抗原結合之機會最小的彼等變化；（2)中等風險變 化為能進一步降低免疫原性但影響抗原結合或蛋白質指疊 之機會較大的彼等變化；（3)高風險殘基為對於結合或保持 抗體結構而言係重要的但帶有會影響抗原結合或蛋白質摺 a：之最鬲風險的彼等殘基。歸因於脯胺酸之三維結構性角 色，即使脯胺酸處通常為低風險位置，仍通常認為該脯胺 酸處之修飾為至少中等的風險變化。 齧齒動物抗體之輕鏈及重鏈之可變區可藉由在經確定在 人類環境中不可能不利影響抗原結合或蛋白質摺疊但可能 降=免疫原性之位置處用人類胺基酸取代而進行人類工程 化。儘管可使用任何人類可變區（包括個別VH或VL序列 或人類一致VH或VL序列或個別或一致人類生殖系序列）， 但通常使用與齧齒動物序列具有最高—致性或同源性之人 類序列來使取代數最小化。可改變在任何數目之低風險位 置處或所有低風險位置處之胺基酸殘基。舉例而言，在經 比對之氣類及人類胺基酸殘基不同之各低風險位置處，引 入胺基酸修飾以使用人類殘基置換S齒動物殘基。此外， 128410.doc -55, 200900420 可改變在任何數目之中等驗位置處或所有中等風險位置 處之胺基酸殘基。在例示性實施例中，使所有低風險位置 及中等風險位置自齧齒動物序列變為人類序列。 構建含有經修飾重鏈及/或輕鏈可變區之合成基因且使 其與人類γ重鏈及/或·鏈恆定區連接。任何類別或子類 之任何人類重鏈及輕鏈恆定區可與人類工程化頂抗體可變 區組合使用。 來自經工程化而含有人類免疫球蛋白基因座之轉殖基因動 物的抗體 亦可使用不ϋ内源十生免疫球蛋白且經工程化而含有人 類免疫球蛋白&因座之轉殖基因動力來產±海帕西咬之抗 體。舉例而言，WO 98/24893揭示具有人類㈣因座之： 殖基因動物，|中該等動物歸因於内源性重鏈及輕鍵基因 座之失活而不會產生功能性内源性免疫球蛋白。w〇 91/741亦揭示能夠發動對於免疫原的免疫反應之轉殖基因 非靈長類哺乳動物宿主，其中抗體具有靈長類恆定區及/ 或可變區且其巾編碼内㈣免疫球蛋白之基因隸取代或 失活。WO 96/30498揭示使用Cre/L〇4統來修飾哺乳動物 中之免疫球蛋白基因座，諸如以便置換所有或一部分恆定 區或可變區以形成經修飾抗體分子^ w〇 94/〇26〇2揭示具 有失活内源性Ig基因座及功能性人類Ig基因座之非人類哺 乳動物宿主。美國專利第5,939,598號揭示製造轉殖基因小 鼠之方法，其中小鼠缺乏内源性重鏈且表現包含一或多個 異種恆定區之外源性免疫球蛋白基因座。 128410.doc -56- 200900420 使用如上所述之轉殖基因動物，可產生針對所選抗原分 子的免疫反應’並可自該動物取得產生抗體之細胞且用於 產生分泌人類源性單株抗體之融合瘤。免疫方案、佐劑及 其類似者在此項技術中係已知的，且用於使（例如）如W〇 96/33735中所述之轉殖基因小鼠免疫。可測試單株抗體抑 制或中和相應蛋白質之生物活性或生理效應的能力。 亦參見 Jakobovits等人，Proc. Natl. Acad. Sci. USA， 90.255 1 (1993) ’ Jakobovits 等人，Nature，362:255-258 (1993) ; Bruggermann 等人，Year in Immun〇 , 7:33 (1993);及美國專利第5,591，669號、美國專利第5,589,369 5虎、美國專利第5,545,807號；及美國專利申請案第 20020199213號。美國專利申請案第2〇〇30092125號描述使 動物之免疫反應偏向所需抗原決定基之方法。亦可由活體 外活化B細胞產生人類抗體（參見美國專利第5,567,6 10號及 第 5,229,275 號）。 藉由嗔菌艘展示技術產生抗體 製造重組人類抗體基因譜之技術及經編碼抗體片段於絲 狀喔菌體表面上之展示法的進展已提供了另一種產生人類 源性抗體之方法。嗟菌體展示法係描述於例如Dower等 人，WO 91/17271、McCafferty 等人，WO 92/01047 以及
Caton及 Koprowski，Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 87:6450-6454 (1990)中，該等文獻各自以引用方式全部併入本文 中。由噬菌體技術所產生之抗體通常係作為抗原結合片段 (例如Fv或Fab片段）產生於細菌中且因此缺乏效應功能。 128410.doc -57- 200900420 σ、下兩種策略中之-者引入效應功能：可將該等片段 工程化成完整抗體以表現於哺乳動物細胞中或卫程化成具 有能夠觸發效應功能之第二結合位點的雙特異性 段。
通常’藉由PCR來獨立選殖抗體之Fd片段(ία)及輕 鏈（VL-CL)且隨機重組於組合誦體展示庫中，隨後可針對 與特定抗原之結合對其進行選擇。使抗體片段表現於嗤菌 體表面上’且經由若干輪抗原結合及再擴增卜種稱為淘 選之程序）來實現藉由抗原結合選擇^或Fab(及因此含有 編碼抗體片段之DNA之噬菌體）。富集對抗原具特異性之 抗體片段且最終加以分離。 亦可在用於將齧齒動物單株抗體人類化之方法（稱為”定 向選擇”）中使用噬菌體展示技術（參見Jespers，L. s•等人， Bio/Technology 12, 899-903 (1994))。對此，小鼠單株抗體 之Fd片段可結合人類輕鏈庫被展示，且所得雜合Fab庫可 隨後藉由抗原加以選擇。小鼠Fd片段藉此提供引導選擇之 模板。隨後，使所選人類輕鏈與人類Fd片段庫組合。對所 得庫之選擇獲得完完全人類類Fab。 已描述多種關於自噬菌體展示庫獲得人類抗體之程序 (參見例如 Hoogenboom 等人，J. Mol. Biol.，227.381 (1991) ; Marks等人，J. Mol_ Biol，222:581-597 (1991).美 國專利第 5,565,332 號及第 5,573,905 號；ciackson，T 及
Wells J. A.，TIBTECH 12, 173-184 (1994))。尤其是，源自 噬菌體展示庫之抗體之活體外選擇及進化已成為一種有效 128410.doc -58- 200900420 手段（參見 Burton，D. R.及 Barbas III, C. F·，Adv. Immunol· 57，191-280 (1994);及 Winter，G.等人-Annu.Rev. Immunol. 12，433-455 (1994);美國專利申請案第 20020004215 號及 WO 92/01047 ; 2003 年 10 月 9 日公開之美 國專利申請案第200301 903 17號及美國專利第6,054,287 號；美國專利第5,877,293號）。
Watkins, "Screening of Phage-Expressed Antibody
Libraries by Capture Lift," Methods in Molecular Biology, Antibody Phage Display: Methods and Protocols 178: 187-1 93及2003年3月6日所公開之美國專利申請公開案第 20030044772號描述藉由捕捉轉印（capture lift)(一種涉及 使候選結合分子固定於固體支撐物上之方法）來篩檢噬菌 體表現抗體庫或其他結合分子之方法。 抗體片段 如上所述，抗體片段包含完整全長抗體之一部分，較佳 包含完整抗體之抗原結合或可變區且包括由抗體片段形成 之線性抗體及多特異性抗體。抗體片段之非限制性實例包 括 Fab、Fab’、F(ab’）2、Fv、Fd、域抗體（dAb)、互補判定 區（CDR)片段、單鏈抗體（SCFv)、單鏈抗體片段、雙功能 抗體、三功能抗體、四功能抗體、微型抗體、線性抗體、 螯合重組抗體、三抗體或雙抗體、内抗體、奈米抗體、小 分子免疫治療藥物（SMIP)、抗原結合域免疫球蛋白融合蛋 白、駱駝化抗體、含VHH之抗體或其突變蛋白或衍生物以 及含有足以職予多肽特異性抗原結合之免疫球蛋白之至少 128410.doc -59- 200900420 一部分（諸如CDR序列）的多肽，其限制條件為抗體保留所 需生物活性。可藉由修飾全抗體產生該等抗原片段或使用 重組DNA技術或肽合成重新合成該等抗原片段。 術語”雙功能抗體"係指具有兩個抗原結合位點之小抗體 片段，該等片段包含在同一多肽鏈（VH VL)中與輕鏈可變 域（VL)連接之重鏈可變域（VH)。藉由使用過短而使得同一 鏈上之兩個域之間不可成對的連接子，迫使該等域與另一 鏈之互補域成對，且產生兩個抗原結合位點。雙功能抗體 更充分地描述於（例如）EP 404,097、WO 93/11161及 Hollinger等人，proc. Natl· Acad, Sci. uSa，90:6444_6448 (1993)中。 單鍵Fv”或"scFv"抗體片段包含抗體之γΗ域及vL域（其 中該等域存在於單一多肽鏈中）’且視情況包含介於Vh域 與VL域之間的多肽連接子，此使卜能夠形成抗原結合所需 之結構（Bird等人，242:423-426，1988 及 Huston 等 人，Proc?· iVai/. Sc厂[AS1」85:5879-5883，1988)。Fd片 段由V Η域及C Η 1域組成。 其他抗體片段包括由νΗ域組成之域抗體（dAb)片段（Ward 等人，iVaiMre 341:544-546，1989)。 ”線性抗體’·包含一對串聯Fd片段（VH-CH1-VH-CH1)，其 形成一對抗原結合區。線性抗體可具有雙特異性或單特異 性（Zapata等人 ’ Protein Eng· 8:1057-62 (1995))。 由經由肽連接子（無鉸鏈）或經由IgG鉸鏈與CH3融合之 scFv組成的"微型抗體”已描述於〇lafsen等人，Pr〇tein 128410.doc -60- 200900420
Des Sel. 2004年 4 月；17(4):315-23 中。 術語"最大抗體"係指與免疫球蛋白之Fc區共價連接之二 價 scFv，參見例如 Fredericks 等人，Protein Engineering, Design & Selection, 17:95-106 (2004)及 Powers 等人， Journal of Immunological Methods, 25 1:123-135 (2001) 〇
缺乏輕鏈之功能性重鏈抗體天然存在於某些動物物種 (诸如s蔓士餐、斑紋鬚潘：及絡它科（Co所，諸如路 駝、單峰駝、羊駝及美洲駝）中。在該等動物中，抗原結 合位點縮減至單個域（VHh域）。該等抗體僅使用重鏈可變 區形成抗原結合區，亦即該等功能性抗體為僅具有結構 H2L2之重鏈同源二聚體（被稱為I，重鏈抗體”或，，HCAb”）。據 報導路殷化VHH與含有鉸鏈、CH2及CH3域且缺少CH1域之 IgG2及IgG3恆定區重組。典型僅vHi片段難以以可溶性形 式產生’但當將構架殘基改成更類似於VHh時可獲得溶解 度及特異性結合方面之改良。（參見例如Reichman等人，J
Immunol Methods 1999, 23 1:25-38)。已發現駱駝化 Vhh 域 以高親和力與抗原結合（Desmyter等人，j价〇/ 276:26285-90，2001)且在溶液中具有高穩定性（£评咕等 人，仍0仏㈣⑴π 41:3628_36, 2〇〇2)。產生具有駱駝化重 鏈之抗體之方法描述於例如美國專利公開案第 〇〇5〇i36〇49唬及第20(^00374^號中。替代性支架可由較 為接近地匹配鯊魚V_NAR支架且可為長穿透環結構提供構 架之類人類可變域構成。 因為重鏈抗體之可變域為分子質量僅為15 kDai最小全 128410.doc -61 - 200900420 功能性抗原結合片段，所以此實體被稱為奈米抗體 (Cortez-Retamozo 等人，Cancer Research 64:2853-57, 2004)。可如 Conrath 等人s C/z ㈣ οΜπ 45: 2807-12, 2001)中所述自經免疫單峰轮產生奈米抗體庫。 内抗體為展現細胞内表現且可調控細胞内蛋白質功能之 單鏈抗體（Biocca等人，五9:101-108，1990; Colby 等人，/Voc dead i/ S i〇i:17616-21，2004)。可 如 Mhashilkar 等人（五細<9 / 14:1542-51，1995)及 Wheeler等 人J. 17:1733-5. 2003)中所述產生包含保留細胞内 區域中之抗體構建之細胞信號序列的内抗體。穿膜抗體為 細胞可滲透性抗體，其中蛋白質轉導域（PTD)與單鏈可變 片·^又（scFv)抗體融合（Heng等人，Mei/Z/ypoi/jesej·. ό^ΙΙί^- β, 2005) 。 另外涵蓋作為對乾標蛋白質具有特異性之Smip或結合 域免疫球蛋白融合蛋白的抗體。該等構建體為包含與為實 現抗體效應功能所必需之免疫球蛋白域融合之抗原結合域 的單鏈多肽。參見例如wo 03/041600、美國專利公開案 20030 133939及美國專利公開案2〇〇3〇1 18592。 多價抗體 在一些實施例中，可能需要產生多價或甚至多特異性 (例如雙特異性、三特異性等）單株抗體。該抗體可具有針 對靶標抗原之至少兩個不同抗原決定基之結合特異性或者 其可結合於兩個不同分子，例如結合於靶標抗原且結合於 、、、田胞表面蛋白或受體。舉例而言，雙特異性抗體可包括— 128410.doc -62- 200900420 結合於靶標之臂及另一結合於白血球上之觸發分子（諸如τ 細胞受體分子（例如CD2或CD3)，或IgG2Fc受體（FqR) ’ 諸如 FcYRI(CD64)、FcYRn(CD32)&FcYRni(CDi⑼的臂， 以便使細胞防禦機制集中於表現靶標之細胞。在另一實例 中又特異性抗體可用於使細胞毒性劑定位於表現旣標抗 原之、’、田胞。δ亥專抗體具有乾標結合臂及結合細胞毒性劑 (例如沙泊寧（Sap〇rin)、抗干擾素_6〇、長春花生物鹼、蓖 麻毒素A鏈、曱胺喋呤或放射性同位素半抗原）之臂。可將 多特異性抗體製備成全長抗體或抗體片段。 另外’本文中所揭示之抗海帕西啶抗體亦可加以構建而 摺疊成夕價形式’该等形式可改善結合親和力、特異性及/ 或增加血液中之半衰期。可藉由此項技術中已知之技術製 備抗海帕西啶抗體之多價形式。 雙特異性或多特異性抗體包括交聯或"雜接合"抗體。舉 例而a，雜接合形式之抗體之一者可與抗生物素蛋白偶 合，另一者與生物素偶合。可使用任何適宜交聯法製造雜 接合抗體。適當交鍵劑以及若干交聯技術在此項技術中係 熟知的且被揭示於美國專利第4,676,980號中。設計另一種 方法以藉由在scFv之C末端處添加抗生蛋白鏈菌素編碼序 列來製造四聚體。抗生蛋白鏈菌素由四個亞單位組成，因 此當摺疊scFv-抗生蛋白鏈菌素時，四個亞單位締合，從 而形成四聚體（Kipriyanov 等人，Hum Antibodies Hybridomas 6(3): 93-101 (I995)，該文獻之揭示内容以引 用方式全部併入本文中）。 128410.doc -63- 200900420 根據另一種製造雙特異性抗體之方法，可將抗體分子對 之間的界面工程化以使自重組細胞培養物回收之雜二聚體 的百分比最大化。一界面包含抗體恆定域之ch3域之至少 一部分。在該方法中，來自第一抗體分子之界面的一或多 個小胺基酸側鏈經較大側鏈（例如酪胺酸或色胺酸）置換。 藉由以較小胺基酸側鏈（例如丙胺酸或蘇胺酸）置換大胺基 酸側鏈而於第二抗體分子之界面上產生尺寸與大側鏈一致 或類似之補償性”空腔"。此提供使雜二聚體之產率增加並 超過其他不當最終產物（諸如同源二聚體）的機制❶參見 1996年9月6日公開之WO 96/27011。 自抗體片段產生雙特異性或多特異性抗體之技術亦已描 述於文獻中。舉例而言’可使用化學鍵聯製備雙特異性或 三特異性抗體。Brennan等人，Science，229:81 (1985)描述 一種使完整抗體發生蛋白水解分裂以產生F(ab，）2片段之程 序。使該等片段在二硫醇錯合劑亞砷酸鈉存在下還原以使 鄰近二硫醇穩定且防止分子間二硫鍵形成。隨後將所產生 之Fab片段轉化為硫石肖基苯甲酸酯（tnb)衍生物。隨後藉 由以疏基乙胺還原將Fab'-TNB衍生物之一者再轉化成Fab'· 巯醇且與等莫耳量之另一 Fab，_TNBs生物混合以形成雙特 異性抗體。所產生之雙特異性抗體可用作選擇性固定酶之 δ式劑。Better等人，Science 240: 1041-1043 (1988)揭示由 、-’田菌刀/必功月b性抗體片段（參見例如Better等人，skerra等 人 Science 240: 1038_1041 〇988))。舉例而言，Fab，_SH 片 段可直接自大腸桿菌回收且以化學方式偶合以形成雙特異 128410.doc -64 - 200900420 性抗體（Carter等人，Bio/Technology 10:163-167 (1992); Shalaby等人，j. Exp. Med. 175:217-225 (1992)) °
Shalaby等人，J. Exp. Med. 175:217-225 (1992)描述完完 全人類類化雙特異性抗體F(ab，）2分子之產生。由大腸桿菌 獨立分泌各Fab’片段且使其經受活體外定向化學偶合以形 成雙特異性抗體。由此所形成之雙特異性抗體能夠結合於 過度表現HER2受體之細胞及正常人T細胞，且觸發人類細 胞毒性淋巴細胞針對人類乳房腫瘤靶標之溶胞活性。 亦已描述各種直接由重組細胞培養物製造及分離雙特異 性或多特異性抗體片段之技術。舉例而言，已使用白胺酸 拉鏈（例如GCN4)產生雙特異性抗體。（通常參見Kostelny 等人，J. Immunol. 148(5):1547-1553 (1992))。藉由基因融 合將來自Fos及Jun蛋白之白胺酸拉鏈肽連接於兩個不同抗 體之Fab’部分。在鉸鏈區將抗體同源二聚體還原以形成單 體且隨後再氧化以形成抗體雜二聚體。該方法亦可用於產 生抗體同源二聚體。 如上所述，雙功能抗體為雙特異性抗體之一實例。參見 例如 Hollinger等人，卩]*〇(；.^3【1.八。丑(18(^.1；8八，90:6444-6448 (1993)。可藉由二硫鍵使二價雙功能抗體穩定。 亦可藉由非共價締合以（scFv2)2構型或雙四功能抗體形 式產生穩定單特異性或雙特異性Fv四聚體。或者，兩個不 同scFv可串聯接合以形成雙_scFv。 亦已報導另一種藉由使用單鏈Fv(;sFv)二聚體製造雙特 異性抗體片·^又之咸略。參見Gruber等人，J. Immunol. 128410.doc -65 - 200900420 152:5368 (1994)。一種方法為使用連接子或二硫鍵連接兩 個 scFv 抗體（Mallender 及 Voss，J. Biol. Chem. 269:199-2061994、WO 94/13806及美國專利第 5,989,830號，該等 文獻之揭示内容以引用方式全部併入本文中）。 或者’雙特異性抗體可為如Zapata等人，pr〇tein Eng. 8(10):1057-1062 (1995)中所述產生之”線性抗體"。簡言 之，該等抗體包含一對串聯Fd片段（VH-CH1-VH-CH1)，其 形成一對抗原結合區。線性抗體可具有雙特異性或單特異 \ 性。 亦涵蓋兩價以上之抗體。舉例而言，可製備三特異性抗 體。（Tutt等人，J. Immunol. 147:60 (1991))。 "螯合重組抗體”為識別靶標抗原之相鄰及非重疊抗原決 定基且具有足以同時結合於兩個抗原決定基之可撓性的雙 特異性抗體（Neri 等人，J Μο/ 246:367-73，1995)。 雙特異性Fab-scFv("雙抗體”）及三特異性Fab_(scFv)(2) , (二抗體'）之產生描述於Schoonjans等人（J /mmwwo/. 165.7050-57，2000)及 Willems 等人（J C/zromaiogr 5 rec/rno/ 价 owed Lz/e «SW. 786:161-76，2003)中。對於雙抗 體或三抗體而言’ scFv分子與VL-CL(L)及VH-CHKFd)鏈 之一或兩者融合（例如）以產生三抗體，其中兩個“卜與Fab 之C末端融合，而在雙抗體中一個scFv與Fab之C末端融 合〇 在另一種方法中’在將游離半胱胺酸引入親本蛋白質中 之後產生二聚體、三聚體及四聚體。使用具有可變數目 128410.doc •66· 200900420 (兩個至四個）的馬來醯亞胺基團之肽基交聯劑來使所關注 之蛋白質與游離半胱胺酸交聯（cochran等人，Immunity 12 (3): 241-50 (2000)，該文獻之揭示内容全部併入本文中）。 抗體篩檢法 亦提供鑑別結合海帕西啶、交叉阻斷（cr〇ss_bl〇ck)本文 中之例示性抗體及/或抑制海帕西咬活性之抗體的方法。 該等方法可利用本文中所提供之經高度純化之生物活性正 確摺疊非尿源性人類海帕西啶（在細菌或非哺乳動物細胞 中化學合成或產生）的組合物。 可針對結合親和力藉由此項技術中已知之方法筛檢抗 體舉例而5，可使用凝膠位移檢定、西方墨點法、放射 (生心n己跳爭檢疋、層析共分級（c〇_fracti〇_i〇n h Chr〇mat〇graPhy)、共同沈澱法、交聯法、ELISA及其類似 方法，該等方法描述於（例如）(：請咖pr〇t〇c〇ls & Molecular Biology (1999) J〇hn & s〇ns，Νγ中該文 獻以引用方式全部併入本文中。 為對”、σ σ於乾私抗原上之所需抗原決定基的抗體作初始 篩檢，可進行諸如描述於Antib〇dies，ALab〇rat〇ryManuai，
Cold Spring Harbor Laboratory, Harlow^ David Lane ^ (1 988)中之常規交又阻斷檢定。亦可使用常規競爭性結合 才双疋，其中未知抗體以其抑制靶標與本發明之靶標特異性 抗體結合之能力為表徵。可使用完整抗原、其片段(諸如 胞外域）或線性抗原決定基。抗原決定基定位描述於 Champe等人，j. Bi〇1 Chem 27〇 ΐ388 ΐ394 (Η%)中。 128410.doc -67- 200900420 在活體外結合檢定之一種變體中，提供一種方法，其包 含（a)使經固定海帕西啶與候選抗體接觸，及（b)偵測該候 選抗體與該海帕西啶之結合性。在一替代性實施例中，將 候選抗體固定且偵測海帕西啶之結合性。使用此項技術中 所熟知之方法中之任一者實現固定，包括共價結合至支撐 物、珠粒或層析樹脂，以及非共價高親和力相互作用，諸 如抗體結合，或使用抗生蛋白鏈菌素/生物素結合，其中 經固疋化合物包括生物素部分。可⑴使用未經固定之化合 物上之放射性標記，（Π)使用非固定化合物上之螢光標 δ己，（iii)使用對非固定化合物具有免疫特異性之抗體， (iv)使用非固定化合物上可激發經固定化合物所連接之螢 光支撐物的標記以及此項技術中所熟知且常規實施之其他 技術來實現結合之偵測。 可藉由使海帕西啶與抗體接觸，在測試抗體存在及不存 在之情況下比較海帕西啶活性且判定抗體之存在是否使海 帕西。疋之活性降低來鑑別抑制或中和人類海帕西咬活性之 抗體。可使用適當動物模型（包括本文中所述之彼等者中 之任一者）活體内評估特定抗體或抗體組合之生物活性。 在例示性實施例中，本發明包括用於鑑別與標靶抗原相 互作用或抑制標把抗原之生物活性（亦即抑制碟酸化、二 聚化、配位體誘發之受體活化或細胞内信號傳導等）之抗 體的尚通量篩檢（high throughput screening ，HTS)檢定。 HTS檢疋可以有效方式篩檢大量化合物。基於細胞之hts 系統係用於研究標靶抗原與其結合搭配物之間的相互作 128410.doc -68- 200900420 用HTS檢定係設計用以鑑別具有所需特性之”化學靶物 (h“s)"或”先導化合物” ’可由此設計修飾以改良所 性。 在本發明之另一個實施例中，採用對於標靶抗原多肽具 有合適結合親和力之CDRs内的胺基酸具有1、2、3或3個 以上修飾之CDRs或抗體片段的高通量篩檢。 特異性結合劑 其他海帕西啶特異性結合劑可以例如基於抗體之CE)R 1 或藉由各種肽或有機化合物庫中篩檢出展現所需對於人類 海帕西啶之結合特性的肽或化合物來製備。海帕西啶特異 性結合劑包括含有胺基酸序列與鼠類抗體Ab43(SEQ m NO: 16-21)、鼠類抗體 2.7(SEQ ID NO: 28-33)、鼠類抗體 2.41(SEQ ID NO: 40-45)、大鼠抗體 R9(SEQ ID NO: 52-
5 7)，或人類抗體1C9(SEQ ID NO: 1 11-116)、人類抗體 3B3(SEQ ID NO: 121-126)、人類抗體4E1(SEQ ID NO: 131-136)、人類抗體 7A3(SEQ ID NO: 141-46)、人類抗體 、 9D12(SEQ ID NO: 151-156)、人類抗體 12B9(SEQ ID NO: 161-166)、人類抗體 15E1(SEQ ID NO: 171-176)、人類抗 體 18D8(SEQ ID NO: 314-319)、人類抗體 19C1(SEQ ID NO: 3 24-3 29)、人類抗體 19D12(SEQ ID NO: 294-299)、人 類抗體 19H6(SEQ ID NO: 304-309)、人類抗體 23F11(SEQ ID NO: 181-186)、人類抗體 26F11(SEQ ID NO: 191-196)或 人類抗體1S1(SEQ ID NO: 203-205及131-133)或人類抗體 1S2(SEQ ID NO: 214-216 及 144-146)或人類抗體 1S3(SEQ 128410.doc •69- 200900420 ID NO: 225-227及 164-166)或人類抗體 1S4(SEQ ID NO: 236-238及 174-176)或人類抗體 1S5(SEQ ID NO: 247-249及 184-186)之一或多個〇〇118至少80%、810/。、820/0、83%、 84%、850/〇、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、 93%、94%、95%、96%、97%、98%、99% 或 99% 以上一致 之肽。 海帕西啶特異性結合劑亦包括肽抗體（peptibody)。術語 "肽抗體"係指包含連接於至少一個肽之抗體Fc域的分子。 肽抗體之產生係大體描述於2000年5月4日公開之PCT公開 案WO 00/24782中。任何該等肽可在存在連接子或不存在 連接子之情況下串聯（亦即順次）連接。含有半胱胺醯基殘 基之肽可與另一含有Cys之肽交聯，其中之任一者或兩者 可與媒劑連接。具有一個以上CyS殘基之任何肽亦可形成 狀内二硫鍵。可使任何該等肽衍生，例如可將羧基末端以 胺基封端，可將半胱胺酸封端，或胺基酸殘基可經除胺基 酉文殘基以外之部分取代（參見例如Bhatnagar等人，J. Med.
Chem. 39: 3814-9 (1996)及 Cuthbertson 等人，J. Med.
Chem· 40: 2876_82 (1997)，該等文獻以引用方式全部併入 本文中）可類似於抗體之親和力成熟來優化狀序列，或 者另外藉由丙胺酸掃描或無規突變或定點突變，接著篩檢 以鑑別最佳結合物來改變肽序列。L〇wman，Ann. Rev
Biophys· Biomol. Struct. 26: 401-24 (1997)。可將各種分子 插入特異性結合劑結構中，例如插入特異性結合劑之肽部 刀本身内或特異性結合劑之肽與媒劑部分之間，同時保留 128410.doc -70- 200900420 特異性結合劍之所 _其片段，·聚乙二醇或 月匕肪酸、胪折 . #關刀子，諸如葡聚糖； 所ϋ之τΓ 醇群、小碳水化合物、肽、如本文中 分(包括螢光劑、放射性標記，諸如放射 ^)RNA ^ 养核'聚核芽酸、干擾（或其 他）A、酶、激素或其類似 $八认，、，上 无、&此項技術者應瞭解 適合於以此方式插入之其 aH ^ ^ 卞且忒寻分子涵蓋於本發 月之耗#内。此包括兩 U J女）所而刀子插入於兩個視情況 由適虽連接子接合之連續胺基酸之間。 亦涵蓋海帕西魏抗體之發展。蛋白質配位體與其受體 之相互作用常常發生於相對較大之界面處。然而，如就人 類生長激素及其受體而言所證明，在界面處僅少數關鍵殘 基促成大部分結合能。c—等人，如·晴,267: 383·6 (1的5)。大多數蛋白質配位體僅在恰當拓撲結構中展示結 。抗原决定基或起與結合無關之作肖。因此，僅"肽"長度 (通吊^至4G個胺基gt)之分子可結合於給定較大蛋白質配位 體之受體蛋白。該等肽可模擬大蛋白質配位體之生物活性 (’’肽促效劑，，）或經由競爭性結合抑制大蛋白質配位體之生 物活性（"肽拮抗劑”）。 噬菌體展示技術已作為有效方法出現於鑑別該等肽促效 劑及拮抗劑之過程中。參見例如Sc〇u等人Science 249: 386 (1990)，Devlin等人，Science 249: 404 (1990) ; 1993年 ό 月 29日頒布之美國專利第5,223,4〇9號；1998年3月31日頒布 之美國專利第5,733J31號；19%年3月12日頒布之美國專 12841〇,doc -71 - 200900420 利第5,498,530號；1995年7月11曰頒布之美國專利第 5,432,018號；1994年8月16日頒布之美國專利第5,338,665 號；1999年7月13日頒布之美國專利第5,922,545號；μ% 年12月19日公開之WO 96/40987 ;及1998年4月16日公開之 WO 98/15833(該等文獻各自以引用方式全部併入本文 中）。在肽噬菌體展示庫中，可藉由與絲狀噬菌體之鞘蛋 白融合來展示隨機肽序列。若需要，則可將所展示肽相對 於丈體之抗體固定胞外域進行親和性溶離。可藉由逐輪親 和純化及再增殖而富集所保留噬菌體。可將最佳結合肽定 序以鑑別肽之一或多個結構性相關家族内的關鍵殘基。參 見例如 Cwirla等人，Science 276: 1696·9 〇997)，其中鑑 別兩個不同豕族。肽序列亦可能暗示哪個殘基可藉由丙胺 酸掃描或DNA水平上之突變而被安全置換。可形成突變庫 且對其篩檢以進一步優化最佳結合物之序列。[籍邮〜
Ann. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 26: 401-24 (1997)。 蛋白質-蛋白質相互作用之結構分析亦可用來指出可模 擬大蛋白質配位體之結合活性的肽。在此種分析中，晶體 結構可顯示大蛋白質配位體之關鍵殘基之一致性及相對定 位 了根據此設計肽。參見例如Takasaki等人’ Nature Biotech 15: 1266-70 (1997)。該等分析方法亦可用於研究 受體蛋白與肽（由噬菌體展示所選擇）之間的相互作用，該 相互作用可提示為提高結合親和力對肽作進—步修飾。 在肽研究中其他方法與噬菌體展示展開競爭。肽庫可與 礼糖抑制體之羧基末端融合且表現於大腸桿菌中。另一種 128410.doc -72- 200900420 基於大腸桿菌之方法允許藉由與肽聚醣關聯脂蛋白（pAL) 融合而展示於細胞外膜上。在下文中，該等及相關方法被 總％為’大腸桿菌展示”。在另一種方法中，在核糖體釋放 之剞彳τ止隨機RNA之轉譯，從而產生仍與相關RNA連接之 多肽庫。在下文中，此種及相關方法被總稱為，，核糖體展 示”。其他方法使用肽與RNA之化學鍵聯。參見例如
Roberts及 Szostak，Proc Natl Acad Sci USA, 94. 12297-303 (1997)。在下文中，此種及相關方法被總稱為"rna-肽篩 檢''。已開發出化學衍生肽庫’其中將肽固定於穩定非生 物材料（諸如聚乙烯棒或溶劑可滲透性樹脂）上。另一化學 衍生肽庫使用光微影來掃描固定於玻璃載片上之肽。在下 文申’ s亥等及相關方法被總稱為''化學-肽篩檢，，。化學-肽 篩檢之有利之處可在於其允許使用D-胺基酸及其他非天然 類似物以及非肽元件。生物方法與化學方法綜述於WeUs 及 Lowman，Curr. Opin. Biotechnol.，3: 355-62 (1992)中。 在概念上’可使用嗔菌體展示及如上所述之其他方法發 現任何蛋白質之肽模擬物。該等方法已被用於抗原決定基 定位以便鑑別蛋白質-蛋白質相互作用中之關鍵胺基酸且 作為用以發現新治療劑之線索。參見例如Cortese等人， Curr. Opin. Biotech. 7: 616-21 (1996)。目前將肽庫最常用 於免疫研究，諸如抗原決定基定位。參見Kreeger，The Scientist 10(13):19-20 (1996)。 可針對結合於本文中所述之海帕西啶多肽或調節（亦即 增加或降低）本文中所述之海帕西啶多肽之活性的能力薛 128410.doc -73- 200900420 檢之化合物的來源包括（1)無機及有機化與 物庫及（3)由隨機肽或模擬肽、寡核#酸或干、（2)天然產 組合庫。 幾刀子組成之 化學庫可易於合成或可講自料商業來源，且可 知化合物或經由天'然產㈣檢鑑別為”化學乾物，，^先導 物"之化合物的結構類似物。 導 天然產物庫之來源為微生物（包括細菌及真菌）、動物、 植物或其他植被或海洋生物，且可葬由^ τ ^ 稭由以下方式形成用於 師檢之混合物庫：⑴自土壤、植物或海洋微生物酸酵且提 取醱酵液或⑺提取生物體本身。天_物庫包括㈣化合 物、非核糖體肽及其（非天然存在）變異體。關於綜述，參 見 282:63-68 (1998)。 組合庫係由大量肽、募核苷酸或有機化合物組成且可易 於藉由傳統自動合成法、PCR、選殖或專屬合成法製備。 特別關注肽及券核苷酸組合庫。所關注之其他庫包括肽、 蛋白質、肽模擬物、多並行合成集合（multiparaUel synthetic collection)、重組物及多肽庫。關於組合化學及 由此所產生之庫的綜述，參見Myers, Opk β沁的/m〇/. 8:701-707 (1997)。關於肽模擬物庫之綜述及 實例，參見Al-Obeidi等人，Mo/. 9(3):205-23 (1998) ; Hruby 等人，Cwrr CAew 价〇/, 1(1):114-19 (1997) ; Dorner 等人，Bioorg Med Chem, 4(5):709-15 (1996)(烷基化二肽）。 海帕西σ定特異性結合劑亦包括如由Hays等人/« 128410.doc -74- 200900420 幻;，23(10):514-522 (2005)中所述之支架蛋白 (該文獻以引用方式全部併入本文中）及如美國公開案第 2006-02 86603號及第2006-0223 114號中所述之Avimer蛋白 技術（兩文獻以引用方式全部併入本文中）。 抗體或特異性結合劑之薛檢法 亦提供4監別結合海帕西啶及/或交叉阻斷本文中所述之 例不性抗體及/或抑制海帕西啶活性之抗體或特異性結合 劑的方法。該等方法可利用本文中所提供之經高度純化之 生物活性正確摺疊非尿源性人類海帕西啶（在細菌或非哺 乳動物細胞中化學合成或產生）的組合物。 可針對結合親和力藉由此項技術中已知之方法篩檢抗體 或特異性結合劑。舉例而言，可使用凝膠位移檢定、西方 墨點法、放射性標記競爭檢定、層析共分級、共同沈澱 法、交聯法、ELISA及其類似方法，該等方法描述於（例 如）Current Protocols in Molecular Biology (1999) J〇hn
Wiley & Sons，NY中，該文獻以引用方式全部併入本文 中。 為對結合於靶標抗原上之所需抗原決定基的抗體或特異 性結合劑作初始篩檢’可進行諸如描述於Antib〇dies，A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Harlow 及David Lane編（1988)中之常規交又阻斷檢定。亦可使用 常規競爭性結合檢定，其中未知抗體以其抑制靶標與本發 明之靶標特異性抗體結合之能力為表徵。可使用完整抗 原、其片段（諸如胞外域）或線性抗原決定基。抗原決定基 128410.doc -75- 200900420 定位描述於champe等人，】Biol Chem. 270: ms_i394 (1995)中。 f 在活體外結合檢定之—種變體中，本發明提供—種方 法，其包含（a)使經固定海帕西啶與候選抗體或特異性結合 劑接觸’及⑻細候選抗體或特異性結合劑與該海：： 啶之結合性。在一替代性實施例中，將候選抗體或特異性 結合劑固定且價測海帕西唆之結合性。使用此項技術中所 熟知之方法中之任一者實現固定，包括共價結合至支俨 物、珠粒或層析樹脂’以及非共價高親和力相互作用二 如抗體結合’或使用抗生蛋白鏈菌素/生物素結合 ㈣定化合物包括生物素部分。可⑴使用未經固定之:人 物上之放射性標記，(ii)使用非固定化合物上之螢光： 記，⑽使㈣非^化合物具有免疫特異性之抗體f ㈣使用非固定化合物上可激發經固定化合物所連接: 光支撐物的標記以及此項技術中所熟知且常 = 技術來實現結合之偵測。 e之其他 在—些實施例中’可藉由使海帕㈣與 結合劑胸，在測試抗體（或特異性結合劑）存在 之情況下比較海帕西咬活性且判定抗體(或特…Λ: 之存在是否使海帕西咬之活性降低 :::) 海帕西。定活性之抗體或特異性結合劑。可使用=人類 型(包括本文中所述之彼等者中之任一者)活體二：: 抗體或特異性結合劑或 沖估特疋 活性。 丨戈抗體或特異性結合劑之組合的生物 128410.doc -76- 200900420 本發明亦涵蓋用以鑑別與靶標抗原相
據此設計修飾以改良所需特性。
在一些實施例中，本發明亦; 互作用或抑制靶標抗原之生物 聚化、配位體誘發受體活化或 的高通量篩檢（HTS)檢定。HT 在另一實施例中，採用針對對CDR(其對靶標抗原多肽 具有合適結合親和力）内的胺基酸具有1、2、3或3個以上 之修飾之CDR或抗體片段的高通量篩檢。 B.抑制性寡核苷酸 可根據本文中所述之方法使用之海帕西咬表現抑制劑包 括抑制劑寡核苷酸或聚核苷酸，包括其醫藥學上可接受之 鹽’例如鈉鹽。非限制性實例包括：反義寡核苷酸 [Eckstein, Antisense Nucleic Acid Drug Dev., 10: 117-121 (2000) ； Crooke, Methods Enzymol., 313: 3-45 (2000)；
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Engl. J. Med., 351\ 3805-2816 (2004) I Vinores, Curr. Opin. Mo/. 77^r·，5673-679 (2003)以及 Kourlas及 Schiller 等人， C7/”，TTzer.，25: 36-44 (2006)]或誘 _ 寡核誓酸[Morishita等 A » Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 92: 5855-5859 (1995)； Alexander 等人’ J以oc., 2料：2446-2454 (2005) ; Mann 及 Dzau，/· C/k. /πναί., 1071-1075 (2000)以及 Nimjee 等人，Mec/., 56: 555-583 (2005)]。上述文獻據此以引用方式全部併入本文中，特別 強調與設計、製備及使用抑制性寡核苷酸之方法有關之文 獻的彼等章節。諸如Ambion Inc.(Austin，TX)、Darmacon Inc.(Lafayette, CO) 、InvivoGen(San Diego, CA)及
Molecular Research Laboratories, LLC(Herndon，VA)之供應 商製造定製siRNA分子。此外，可利用商用套組產生定製 siRNA分子，諸如SILENCERTM他财構建套組（Ambi〇n
Inc.，Austin，TX)或 psiRNA 系統（Inviv〇Gen, San meg〇, CA) 〇 ’ 抑制性寡核苷酸可與靶標基因之編碼部分、基因中之3, =5,未轉譯區或内含子序㈣者乾標mRNA中之編碼或内 含子序列互補。内含子序列通常保守性較低且因此可提供 128410.doc -79· 200900420 車乂大特異性。在一實施例，^ ^ ^ ^ 種之基因產物之表$見…抑龍㈣錢抑制-種物 產物之表現’但其在另一物種中之同系物並非如 ’在其他實施例中’抑制 種（例如人類與靈長類或人類與鼠類）中之抑^基因於兩個物 在·^實施例中’抑制性寡核㈣能夠與海帕西咬基因 或 mRNA(SEQ ID NO: 99(小鼠）咬 SE〇 τη M八 其反向股)之至少8、9、二: >。。 或12個連續驗基在適度或 南嚴格條件下雜交。在草此主 — 又隹杲些知况下，視互補區之長度而 疋，在不影響抑制功能之情況下可容許一個、兩個或兩個 以上錯配。在一些實施例中，抑制性寡核普酸為反義寡核 苦酸、抑制性讓（包括siRNA或RNAi或shRNA)、dna 酶二核糖核酸酶(視情況為錘頭狀核糖核酸酶)、適體或其 醫樂學上可接受之鹽。在_實施例中，寡核苷酸與_山 N〇··⑽之至少1()個驗基互補。在—實施例中，寡核苦酸 靶向位於海帕西啶mRNAi3,未轉譯區附近之核苷酸。 以抑制性寡核苷酸把向之mRNA位點的選擇 在募核普酸之設言十中所使用 <特異性序列可為含於無標 之經表現基因信使内之核苷酸的任何鄰近序列。可使用此 項技術中已知之程式及算法來選擇合適靶標序列。此外， 可利用經設計用來預測指定單股核酸序列之二級結構的程 式且允卉選擇彼等可能存在於摺疊mRNA之經暴露單股區 中的序列來選擇最佳序列。用於設計合適募核苷酸之方法 及組合物可見於（例如）美國專利第6,251，588號中，該文獻 内谷以引用方式全部併入本文中。 128410.doc * 80 - 200900420 已展示大多數mRNA含有若干二級及三級結構。RNA中 之二級結構元件主要係由同_ RNA分子之不同區域之間的 Watson-Crick型相互作用形成。重要二級結構元件包括分 子内雙版區、髮夾環、雙鏈體RNA中之突起（bulge)及内 環。當二級結構元件彼此接觸或與單股區接觸而產生較複 雜的三維結構時形成三級結構元件。若干研究者已量測大 置RNA雙鏈體結構之結合能且已獲得一套可用於預測rNa 之二級結構的法則（參見例如Jaeger等人，1989, Proc. Natl.
Acad. Sci· USA 86:7706 ;及 Turner等人，1988，Annu. Rev.
Bl〇PhyS. BloPhys· Chem. 17:167)。該等法則適用於鑑別 RNA結構元件，且尤其適用於鑑別可為mRNA之片段的單 股RNA區以確定siRNA、核糖核酸酶或反義技術之標靶。 反義募核苷緩 已展示反義养核苷酸於細胞中之組成性表現可能經由阻 轉睪或防止拼接而抑制基因表現。適當抑制性寡核苷酸 °為單版且3有（例如）長度為至少12、1 5或18個驗基、與 mRNA或DNA分子充分互補且分子具特異 性之片段使得其與mRNA或DNA分子雜交且抑制轉錄、拼 接或轉°通常少於3G個驗基之長度上的互補性係蜂绰有 餘ί的0 支配抑制性募核苷酸序列之靶標位點之因 酸長产、紝 ’、^何乔极甘 活性V”&親和力絲標序列可及性。可針對序列抑制 L ,之效能藉由量測靶標蛋白質轉譯及靶標相關表 制（例如4田Βέϊ W i t抑 、、匕培養物中之細胞增殖之抑制）來活體外篩檢序 128410.doc -81 - 200900420 列。通常已知可使用反義寡核苷酸靶向RNA之大部分區域 (5’及3’未轉譯區、AUG啟始、編碼、拼接點及内含子）。 可使用k代辑酸自曰反義募核苷酸。修飾雜環或糖之磷酸 二酯鍵亦可使效率提高。使用硫代磷酸酯來修飾磷酸二酯 鍵。已將N3'-P5’胺基磷酸酿鍵描述為使寡核苦酸對核酸酶 穩定及增加與RNA之結合。肽核酸（pNA)鍵為核糖及磷酸 一 S日月架之元全置換且對核酸酶穩定，提高對RN A之結合 親和力且不允許為RNAse Η所裂解。其基本結構亦應經受 修飾，此可使其作為反義組份最佳化。關於雜環之修飾， 已證明某些雜環修飾在不干擾RNAse Η活性之情況下加強 反義效應。該修飾之一實例為c_5噻唑修飾。最終，亦可 顧及糖之修飾。在細胞培養物中及活體内2，_〇_丙基及2，_ 曱氧基乙氧基核糖修飾使募核苷酸對核酸酶穩定。 預期具穩疋性、具有對核酸酶之高抗性、具有適當藥物 動力學性質以便允許以無毒性劑量運輸至靶標組織位點且
具有橫穿質膜之能力的抑制性募核苷酸用作治療劑。 短干擾RNA 短干擾（si)RNA技術（亦稱為RNAi)通常涉及由與特定序 列同源之雙股RNA(dsRNA)所誘發的該序列之mRNA之降 解，藉此”干擾”相應基因之表現。可藉由引入對應於任何 所選基因之mRNA之所有或實質部分的dsRNA來壓製該基 因。看來，當長dsRNA被表現時，其最初由核糖核酸酶m 加工成長度為少至21至22個鹼基對之較短dsRNA寡核苷 酸。因此，可藉由引入或表現相對較短之同#dsRNA來獲 128410.doc -82- 200900420 得siRNA。例示性siRNA具有約21個核苷酸之有義鏈及反 義鏈，其構成雙股RNA之約19個核苷酸並在各3,端處具有 兩個核苷酸之懸垂物。實際上，使用相對較短之同源 dsRNA可具有某些優勢。 哺乳動物細胞具有至少兩個受雙股RNA(dsRNA)影響之 徑。如上所述’在序列特異性siRNA途徑中，首先使起 始dsRNA分裂為短干擾rNA ^認為短干擾rnA提供使特異 性信使RNA可被靶向以便降解的序列資訊。與此相反，藉 由任何序列之dsRNA觸發非特異性途徑，只要其長度為至 少約30個鹼基對即可。 非特異性效應因dsRNA活化以下兩種酶而出現：pkr， 呈其活性形式時使轉譯起始因子eIF2罐酸化以停止所有蛋 白吳合成，及2'，51-募腺苷酸合成酶（2’,5’-AS)，其合成可 活化RNase L(—種靶向所有爪^^八之非特異性酶）之分子。 非特異性途徑可使宿主呈現應激反應或病毒性感染反應且 通常’較佳使非特異性途徑之效應最小化。重要地為，較 長dsRNA似乎為誘發非特異性途徑所需且因此預期比約3 〇 個鹼基對短之dsRNA藉由RNAi實現基因抑制（參見Hunter 專人 ’ 1975，J. Biol. Chem. 250:409-17 ; Manche等人， 1992，Mol. Cell. Biol. 12:5239-48 ; Minks等人，1979，J. Biol. Chem. 254:l〇l8〇_3 ;及 Elbashir等人，2001，Nature 411:494-8)° 已證明siRNA為降低多種細胞類型之基因表現之有效方 法。siRNA通常使基因表現降低至比使用反義技術所獲低 128410.doc -83· 200900420 ,2001, Nature
用以實現RNAi之雙股寡核苷酸較佳為小於3〇個鹼基對 之長度，例如約25、24、
之水平且常常完全消除表現（參見Bass 41 1:428-9)。在哺乳動物細胞中，siRNA 1 8或1 7個 23 、 22 、 21 、 20 、 19 、 鹼基對或更小之長度且含有與靶標mRNA充分互補之片段 以便允許與靶標mRNA雜交。視情況dsRNA寡核苷酸可包 括3'懸垂物末端。例示性2_核苷酸3,懸垂物可由任何類型 之核糖核苷酸殘基組成且甚至可由2，_脫氧胸苷殘基組成， 此可降低RNA合成成本且可增強siRNA在細胞培養基中及 轉染細胞内之核酸酶抗性（參見Elbashi等人，2001，Nature 41 1:494-8)。例示性dsRNA可化學合成或使用合適表現载 體活體外或活體内產生（參見例如Elbashir等人，2〇〇1, Genes Dev. 15:188-200)。在此項技術令已知，可由啟動子 (諸如T7 RNA聚合酶啟動子）轉錄較長RNA。 在本發明之一些實施例中亦可使用50、75、1〇〇或甚至 500個鹼基對或更多之較長dsRNA。儘管可視所處理細胞 之性質、基因乾標及熟習此項技術者可易於辨識之其他因 素而定使用其他濃度，但用於實現RNAi之dsRNA之例示性 漢度為約 0.05 nM、0,1 nM、0.5 nM、1.0 nM、1,5 nM、25 nM或 1 〇〇 nM。 siRNA技術之其他組合物、方法及應用提供於美國專利 申請案第6,278,039號、第5,723,750號及第5,244,805號 128410.doc -84- 200900420 中，該等申請案以引用方式全部併入本文中。
短髮夾RNA 與siRNA相比，shRNA在沉默長壽及輸送選擇方面提供 優勢。關於綜述，參見例如HannonfA，Nature，43 1:371-3 78，2004。已報導產生shRNA(其在細胞内被加工成具有 類siRNA特性之短雙鏈體RNA)的載體（Brummelkamp等 人 ’ Science 296，550-553，2000 ; Paddison等人，Genes Dev. 16，948-958 (2002))。該等載體提供可在將載體穩定 整合於宿主細胞基因組中之後調控持續基因沉默之基因沉 默試劑的可再生來源。此外，可易於以經設計用來輸送允 許異位mRNA表現之DN A構建體之無數方法中的任一種方 法將核心沉默"髮夾”卡匣插入反轉錄病毒、豆狀病毒或腺 病母載體中’從而有助於shRNA輸送至寬範圍之細胞類型 中（Brummelkamp 等人，Cancer Cell 2:243-247，2002 ; Dirac，等人，j. Biol chem. 278:1 173 1-1 1734, 2003 ; Michiels 等人，Nat. Biotechnol. 20:1154-1157，2002 ;
Stegmele等人，Pr〇c. Natl Acad Sci USA i〇2:i32i2_ 13217, 2005 ; Khvorova等人，Cell, 115:209-216 (2003))。 髮夾可以左手髮夾（亦即5,_反義-環-有義-3，）或右手髮夾 (亦即5 -有義_環_反義_3,)形式組織成。siRNA亦可視髮夾 組織而定在有義股或反義股之5，或3,端含有懸垂物。較 佳，若存在任何懸垂物，則其處於髮夾之3，端上且包含1至 6個驗基。1垂物可能未經修佛4可含有一或多種特異性 或穩定化修飾，諸如2,位置之南素或〇-烷基修飾或核苷酸 128410.doc -85* 200900420 間修飾，諸如硫代磷酸酯、二硫代磷酸酯或膦酸甲酯修 飾。該等懸垂物可為核糖核酸、脫氧核糖核酸或核糖核酸 與脫氧核糖核酸之組合。 r κ 另外’髮夾可進一步包含5'-最末端核苷酸上之磷酸酯基 團。5'-最末端核苷酸之麟酸化係指存在一或多個連接於5，_ 末端核苷酸之糖部分之5'碳的磷酸酯基團。較佳，在將繼 Dicer加工之後形成反義股之區域之5,端上僅存在一個磷酸 酉旨基團。在一例示性實施例中，右手髮夾可包括不具有5, 填酸醋基團之5'端（亦即有義區之游離5’端）或可具有以防止 填酸化之方式經修飾的有義區之游離5最末端核苷酸的5, 碳。此可藉由多種方法達成，包括（但不限於）添加磷酸化 阻隔基團（例如5’-0-烷基）或消除y-ΟΗ官能基（例如5，_最末 知核苷酸為51-脫氧核苷酸）。在髮夾為左手髮夾之情況 下’較佳使5·-最末端核苷酸之5,碳位置磷酸化。 具有比26個鹼基對長之莖長度的髮夾可由Dicer加工， 使得某些部分不為促進mRNA降解之所得siRNA2部分。 因此可包含有義核苷酸之第一區及可包含反義核苷酸之第 二區亦可含有一段互補（或至少大體上彼此互補）但與靶標 mRNA相同或與靶標mRNA互補或不與靶標mRNA相同或不 與輕標mRNA互補的核芽酸。儘f敵贴之莖可由除懸垂 物外之互補或部分互補反義股及有義股組成，但化舰亦 可包括下列部分：⑴處於最終以⑽切割位點之遠端之分 子部分，其含有大體上與革巴標mRNA互補/同源之區域；及 ⑺處於D咖切割位點之近端之莖區域（亦即鄰近於環之區 128410.doc • 86 - 200900420 域），其與靶標mRNA無關或僅 讦其认4 t A a 丨刀相關（例如互補/同源）。 土；右干參數（包括（但不限於 風 摆兮筮-π β …、力子特性或分布）來選 擇第一區域之核苷酸含量。 f"
^飾之侧Α可保留後〇1㈣工之雙鏈體中之修飾。 =性實施例中，在髮夹為於分子之3,端上含有η個核 偏垂物之右手髮夹(例…環，的情況下，可 將2’-〇-甲基修飾添加至在髮夾之5,端之位置2、位置… 或位置卜2及3處的核*酸。具有該構型之髮夾之—加 工亦可保留完整有義股之5,端，因此保留後以⑽加工之雔 鏈體中的化學修飾模式。呈該構型之3,懸垂物之存在可： 尤其有利的，此係因為含有指定修飾模式之鈍端分子可進 -步由Dicer以一定方式加工使得帶有2,修飾之核苦酸被移 除。在存在/保留垂物之情況下’帶有有義修飾之核皆 酸之所得雙鏈體可就沉默特異性及功能性而言具有極度有 利之特性。例示性修飾模式之實例詳細描述於美國專利申 請案公開案第2005/0223427號、國際公開案第w〇 2004/090105號及第WO/2005/078094號中，該等文獻中之 每一者的揭示内容以引用方式全部併入本文中。 shRNA可包含隨機或根據任何合理設計選擇程序選取之 序列。舉例而s ’合理設計算法描述於國際公開案第W〇 2004/045543 A2號、美國專利申請公開案第2〇〇5/〇255487 號中，該等文獻之揭示内容以引用方式全部併入本文中。 另外’可能需要完全或部分基於内部穩定性平均分布 ("AISP”）或内部穩定性區域分布（”RISP”）選擇可有助於細 I28410.doc •87· 200900420 胞機器之接近或加工之序列。 核糖核酸酶 核糖核酸酶為能夠催化mRNA之特異性裂解從而防止轉 澤之酶促RNA分子。（關於综述，參見R〇ssi，1994, ί
Biology 4:469-471)。核糖核酸酶作用機制涉及核糖核酸酶 刀子與互補靶標RNA之序列特異性雜交，接著涉及内切核 苷酸裂解事件。核糖核酸酶分子較佳包括（1)一或多個與靶 私mRNA互補之序列及（2)造成mRNA裂解之所熟知催化序 列或功能性等效序列（參見例如美國專利第5,〇93,246號， 其以引用方式全部併入本文中）。 儘官使mRNA在位點特異性識別序列處裂解的核糖核酸 酶可用於破壞靶標mRNA，但或者可使用錘頭狀核糖核酸 酶。錘頭狀核糖核酸酶使mRNA在由與靶標mRNA形成互 補鹼基對之側翼區所限定的位置處裂解。較佳，靶標 mRNA具有以下的兩個鹼基之序列：5，_ug_3，。錘頭狀核 糖核酸酶之構建及製備纟此項技術中係熟知的且更為充分 地描述於Haseloff及Gerlach，1988,胸㈣MUM，】；及 pct申請案第w〇89/05852號中，該等文獻之内容以引用方 式全部併入本文中。 基因革巴向性核糖核_可含有與㈣灿财之兩個區域 互補之雜交區i或’該兩個區域中之每一者為至少5、6、 7、8、9、1〇、11、12、13、Μ、15、16、17、18、19或 20個鄰接核苷酸（但其無需皆為相同長度）。 可將鐘頭狀核糖核酸酶序列嵌入^RNA(諸如轉移 128410.doc -88- 200900420 RNA(tRNA))中以提高活體内裂解效率（perrinian等人， 1995，Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 92:6175-79 ; de Feyter及 Gaudron, Methods in Molecular Biology，第 74 卷，第 43 章，"Expressing Ribozymes in Plants"，由 Turner，P. C編， Humana Press Inc·, Totowa, N.J)。尤其為 tRNA融合核糖核 酸酶之RNA聚合酶III所介導之表現在此項技術中係熟知的 (參見 Kawasaki 等人，1998，Nature 393:284-9 ; Kuwabara 等人 ’ 1998，Nature Biotechnol. 16:961-5 ;及 Kuwabara 等 人，1998，Mol. Cell 2:617-27 ; Koseki等人，1999, J. Virol 73:1 868-77 ; Kuwabara等人，1999，Proc. Natl. Acad. Sci. USA，96:1886-91 ; Tanabe等人，2000, Nature 406:473- 4)。通常在給定把標cDNA序列内存在若干潛在錘頭狀核 糖核酸酶裂解位點。核糖核酸酶較佳經工程化以便使裂解 識別位點位於靶標mRNA之5，端附近以提高效率且最小化 非功能性mRNA轉錄物之細胞内積累。此外，使用位於編 碼靶標mRNA之不同部分之靶標序列中的任何裂解識別位 點將允許選擇性I巴向一個或其他乾標基因。 本發明之核糖核酸酶亦包括RNA内切核糖核酸酶（"Cech 型核糖核酸S#”）’諸如天然存在於嗜熱四膜蟲 (Tetrahymena thermophila)中之一者（稱為 IVS 或 L-19 IVS RNA)且已廣泛描述於 Zaug等人，1984，Science，224:574-578 ; Zaug等人 ’ 1986，Science 23 1:470-475 ; Zaug等人， 1986，Nature 324:429-433 ;公開國際專利申請案第 W088/04300號；及 Been 等人，1986，Cell 47:207-216 中。 -89- 128410.doc 200900420
Ceeh型核糖核酸酶具有8個驗基對之活性位點，該活性位 點=標RNA序列雜交，隨後發生㈣魏裂解。本發明 :、皮等靶向存在於靶標基因或核酸序列中之8個鹼基對 之活性位點序列的Cech型肖糖核酸酶。 :杉I酶可由經修飾募核苷酸（例如就改良穩定性、 靶向性等而言)組成且應能化學合成得到或經由表現載體
產生因為不同於反義分子之核糖核酸酶具有催化性，所 以較低細胞内濃度係為效率所需的。 —實她例中，可藉由首先鑑別足以由引起有 ㈣除之㈣部分來設計核糖核酸酶。同-序列之諸部分 可隨後被併入核糖核酸酶中。 二重螺旋形成 或者T藉由革巴向與基因之調節區域（亦即啟動子及/或 增強子）互補之脫氧核糖核苦酸序列以形成可防止基因於 體内革巴標細胞中之轉錄的三重螺旋結構來降低乾標基因表 現。（通常參見叫咖，C·，州，Anticancer Drug ―， 6.569-84 f Helene C4 笼乂 _，c.專人，l992, Ann N Y Acad Sci 66〇:27-36;^ahemi992，BiGassaysl4:8G7_l5)。， 欲用於二重螺旋形成以抑制轉錄之核酸分子較佳為單股 ^脱氧核糖核㈣·组成。該等寡核《之鹼基組成應經 由Hoogsteen鹼基配對法則代，社_木旧t 丁古只J促進二重螺旋形成，此通常 要嗓呤或t定之適當片段存在於雙鏈體之一股上。核苦酸 序列可基於t定，此將在所得三重螺旋之三個缔合股上產 生TAT及CGC三聯體。富含㈣分子向雙鍵體之單股之舍 I28410.doc -90. 200900420 二二區域在與該股平行之方位上提供鹼基互補。此外， 可達擇富含嘴吟（例如含有一如殘基）之核酸分子。 二子將與富含GC對之崎雙鏈體形成三重螺旋，其；大 夕^令殘基位於票雙鏈體之單股上K 之三個股上產生CGC三聯體。 窒累疋 或者，可藉由產生所謂”之字形”核酸分子來增加 重螺旋形成而言被乾向之乾標序列。以交替5,〜二 之字形'，分子，使得其與雙鏈體之第一股驗基配對 ，與另-股驗基配對，從而消除適 存在於雙鏈體之-股上的必要性。 DNA酶 或者，可使用DNA酶來抑制革巴標基因之表現。罐酶包 =反義與核糖核酸酶技術之某些機械特徵。對難酶進 二设計以使其識別特^標核酸序列，此極為類似於反義 养核苦酸。然而其亦具有催化性且可特異性裂解綱 酸。 目前存在兩種基本類型之DNA酶’其兩者皆由― 及Joyce鑑別（參見例如美國專利第6,i i 〇,462號）。【〇_23 DNAit包含連接兩f之環結構。該兩臂藉由識別特定乾標 核酸序列而提供特里料，& , 吁〃、性而％結構在生理條件下提供催化 功能。 較佳’單體單_序列為約18至22個核苦酸之 g/c富集序列。高G/c含量有助於確保驗酶與乾標序列 之間的較強相互作用。可使該酶㈣信使之特異性反義識 128410.doc -91 · 200900420 另J序列可分配於dna酶之兩臂之間。 製造及投與DNA酶之方法可見於（例如）美國專利第 6’1 10,462號中。另外，熟習此項技術者將認識到，如同反 義募核苷酸，DNA酶可視情況經修飾以提高穩定性且改善 對降解之抗性。 抑制性募核苷酸之輸送 抑制性募核苦酸可藉由經由已置有編碼具有適當調節序 列（包括啟動子）之抑制性寡核苷酸之D N A的載體（包括病毒 載體或質體）轉型或轉染而直接投與或輸送至細胞，以使 抑制性寡核苦酸表現於所需細胞中。已 時㈣、穩定轉染及使用範圍介於反轉錄病毒至 病毒輸送。涵蓋藉由複製或複製缺陷型載體輸送核酸抑制 ^亦可由組成性或誘導性啟動子系統驅動表現（Paddison 等人，Methods Mol. Biol. 265:85-100, 2004)。在其他實施 例中，表現可能處於組織或發育特異性啟動子之控制下。 舉例而言，可藉由使用諸如脂質轉染胺 (LiP〇fectamine)2000(Life Techn〇1〇gies)或 〇1咖-她_ (Life Technologies)之載體組合物進行轉染而引入載體。對 於在共轉染編碼hGFP之pAD3後的哺乳動物細胞株，可使 用螢光顯微鏡術來檢查轉染效率（KehIenback等人，1998, J· Cell Biol. 141:863-74)。 輸送途徑將為提供如根據如上所述之標準所量測之最佳 抑制效應者。藉由陽離子脂質體所介導之輸送、由反轉錄 病毒载體輸送及直接輸送為有效的。 128410.doc •92· 200900420 其他已知輪枝+ τ, 方法描述於以下俨題Λ”其η
Therapy)”之章節中。 卜铩碭為基因療法（Gene Π在足以在抑制新蛋白w八 , 性庫之時間播 貝S成之後周轉（turnover)内源 J叫傻精由若干拾 苷酸之有效性，該 之任一者來評估抑制性寡核 mRNA含量之$ # 疋包括用於測定現有人類海帕西啶 用識別人類==::鏈反應或北方墨點分析或使 帕西啶含量之”正a 抗體之西方墨點分析。儘管海 / 之正㊉”範圍小於約25 ng/mL^，伸低於約1〇 ng/mL之量測值 1—低於約10 中，海帕西咬含西咬之抑制。在另-實施例 分析法所評估)且低於範圍小於約—Μ如由質譜 法所評估)：=約Μ™ (如由歸析 )J知不海帕西啶之抑制。 、有拮抗劑活性之海帕西咬多肽變異體 ^類海帕西咬多狀而論’涵蓋包括一或多個相對於天 成’、、、人類海帕西啶序列而言之取代、插入或缺失但保留 斤有八個半胱胺酸且抑制海帕西啶生物活性（例如抗微生 物及/或鐵凋節活性)的拮抗劑變異體。變異體可保留a C4及/或C5-C7二硫鍵且視情況亦保留C1-C8及C3-C6二硫 鍵。亦涵蓋保留膜鐵轉運蛋白結合活性但不引起膜鐵轉運 蛋白内化或降解之海帕西啶變異體以及保留海帕西啶受體 、-、口 口活性但不活化膜鐵轉運蛋白受體之海帕西啶變異體。 易於如第IV章節（多肽變異體之產生）中所述製備拮抗劑 變異體’且可在本文中所述之活體外或活體内檢定中之任 一者中針對抑制海帕西啶鐵調節活性之能力對其進行筛 128410.doc -93 - 200900420 檢。 III.具有促效劑活性之海帕西咬多肽變異艘 亦涵蓋包括一或多個相對於天然成熟人類海帕西啶序列 而言之取代、插人或缺失但保留所有八個半胱胺酸且保留 海帕西啶生物活性（例如抗微生物及/或鐵調節活性）的人類 海帕西啶多肽之促效劑變異體。變異體可保留C2_C4&/或 C5-C7二硫鍵且視情況亦保留CI-C8及C3_C6二硫鍵。亦涵 蓋保留膜鐵轉運蛋白結合活性且/或保留海帕西啶受體結 合活性之海帕西啶變異體。 易於如第IV章節（多肽變異體之產生）中所述製備促效劑 k異體，且可在本文中所述之活體外或活體内檢定中之任 一者中針對海帕西啶鐵調節活性之保持力對其進行篩檢。 IV·多肽變異艘及衍生物之產生 可易於藉由一般熟習此項技術者所熟知之技術修飾本發 明之海帕西啶多肽（包括海帕西啶變異體）或本發明之抗海 帕西啶抗體。潛在突變包括一或多個殘基之插入、缺失或 取代。插入或缺失較佳處於約丨至5個胺基酸、更佳丨至3個 胺基酸且最佳1至2個胺基酸之範圍内。 缺失變異體為任何胺基酸序列之至少一個胺基酸殘基被 移除的多肽。可在蛋白質之一或兩個末端處實現缺失或藉 由移除多肽内（内部）之一或多個殘基來實現缺失。製備缺 失變異體之方法為此項技術中之常規方法。參見例如
Sambrook等人，（1989) Molecular cl〇ning: A Laborat〇ry
Guide 弟 1 3 卷，Cold Spring Harbor Press，其揭示内容 128410.doc -94- 200900420 以引用方式全部併入本文中。 胺基酸序賴人包括長度_介於—個殘基至含有數百 或更多個殘基之多肽之間的胺基及/或缓基末端融合以及 一或多個胺基酸之内部序職^如同本文中所述之 變異體類型中之任-者-樣，插入型變異體可經設計使得 所得多肽保留與其所源自之親本多肽相同之生物學特性或 展現與其所源自之親本多狀無關之新賴物理、化學及 生物學特性。製備插入變異體之方法在此項技術中亦為常 規且熟知的（Sambro〇k等人，見上述）。 包3本發明之多肽(包括海帕西啶變異體)或本發明之 體及異源性多肽的融人I白泛 几 的嘁口蛋白為由本發明所涵蓋之特定 之插入變異體。可盥所關 、玉 ，、所關庄之多肽融合的異源性 限制性實例包括且右具诚 k括具有長循環半衰期之蛋白質，諸如（但不 SIT球：白恆定區(例如h區域允許鐘別所關注之 二有助於純化所關注之多肽之序列;及促 進夕亞基蛋白之形成之序列。 製造抗體融合士、+上 〜¥ 蛋之方法在此項技術令係熟知的。夂見 例如美國專利第6 3〇6 3 >見 乂、,丄 唬其揭不内容以弓I用方式全部 开入文中。在本發明之某些實施财，產生可 合scFv抗體與異源性 匕括使甘入 蛋白。適當連接子序接之可撓性連接子的融合 蛋白之能力且^曰“別之所得融合 基的序列(參見例如W〇 % 原決疋 全部併入本文中）。 ”揭不内谷以引用方式 128410.doc •95· 200900420 取代支異體為多肽胺基酸序列巾 .^ T之至V —個殘基被移除 且在移除該殘基之處插入不同殘其 ’、 …U承“ 殘基的彼等變異體。藉由選 擇取代來Λ現多肽或抗體之生物特性 竹庄之修飾，該等取代在 /、以下效應方面明顯不同：⑷維持取代區域内多肽骨芊之 結構’例如呈摺疊或螺旋構形；(b)維_位點處之：子 之帶電性或疏水性；或⑷維持大部分側鏈。在本發明之某 些實施例中，設計取代變異體，亦 八 ' 或夕個特定（與隨 機相反）胺基酸殘基經特定胺基酸殘基取代。該等類型之 典型變化包括保守性取代及/或以一殘基取代另一殘基(基 於天然及取代殘基之相似特性）。 保守性取代展示於表丨中.在"較佳取代”標題下可見最 保守性取代。若該等取代未導致生物活性之變化，則可引 入較多實質性變化且篩檢產物。 表1 始 例示性 較佳殘基取代 Ala (A) val、leu、ile val Arg (R) lys、gin、asn lys Asn (N) gin、his、asp、lys、gin arg Asp (D) glu 、 asn glu Cys (C) ser ' ala ser Gin (Q) asn 、 glu asn GIu (E) asp 、 gin asp Giy (G) ala His (H) asn、gin、lys、arg i. 128410.doc -96- 200900420
He⑴ leu、val、met、ala、 leu phe、正白胺酸 Leu (L) 正白胺酸、ile、val、 ile met、ala、phe Lys (K) arg、gin、asn arg Met (Μ) leu、phe、ile leu Phe (F) leu、val、ile、ala、tyr Pro (P) ala Ser (S) thr Thr(T) ser ser Trp (W) tyr ' phe tyr Tyr (Y) trp 、 phe 、 thr 、 ser Phe Val (V) ile、leu、met、phe leu ala、正白胺酸 具有共有側鏈特性之胺基酸殘基通常係如下歸類。 (1) 疏水性：正白胺酸、met、ala、val、ieu、ne . (2) 中性親水性：c y s、s e r、t h r ; (3) 酸性：asp、glu ; (4) 驗性.asn、gin、his、lys、arg ; (5) 影響鏈取向之殘基：gly 、pro ；及 (6) 方族性：trp、tyr、phe。 抗體變異艎 在某些實例中，製備抗體變異體，旨在修飾與抗原決定 基結合直接有關之彼等胺基酸殘基。在其他實施例中，出 128410.doc -97- 200900420 於本文中所論述之目的，需要修飾不與抗原決定基結合直 接有關之殘基或在任何情況下不與抗原決定基結合有關之 殘基。涵蓋CDR區及/或構架區中之任一者内之突變。 為確定哪些抗體胺基酸殘基對於抗原決定基識別及結合 而言係重要的，可進行丙胺酸掃描突變以產生取代變異 體 參見例如 Cunningham 等人，Science, 244:1 08 1 -1 085 (1989)，其揭示内谷以引用方式全部併入本文中。在該方 法中，以丙胺酸殘基一次一個地置換個別胺基酸殘基且相 對於未修飾抗體而言根據結合特異性抗原決定基之能力對 所得抗海帕西啶抗體進行篩檢。對結合能力降低之經修飾 抗體定序以確定哪個殘基發生改變，此表明其在結合或生 物學特性中之重要性。 可藉由將隨機胺基酸變化引入親本抗體序列中之親和力 成熟製備抗體之取代變異體。參見例如〇uwehand等人，
Vox Sang 74(增刊 2):223-232, 1998 ; Rader 等人，proc Natl. Acad. Sci. USA 95:8910-8915，1998 ; Dall，AcqUa 等 人 ’ Curr. 〇pin· Struct Bi〇1 8:443_45〇，1998，其揭示内 各以引用方式全部併入本文中。親和力成熟涉及製備及篩 檢抗海帕西啶抗體或其變異體且涉及自所得變異體中選出 相對於親本抗海帕西啶抗體而言具有改良生物學特性（諸 如增加之結合親和力）的彼等變異體。產生取代變異體之 一種適宜方式為使用噬菌體展示之親和力成熟。簡言之， 使若干高變區位點突變以在各位點處產生所有可能之胺基 取代。因此所產生之變異體以單價方式被表現於絲狀嗟菌 1284l0.doc -98- 200900420
體顆粒表面上，其中該等變異體與封裝於各顆粒内之mi3 之基因III產物融合。隨後根據生物活性（例如結合親和力） 篩選嗟菌體展示之變異體。參見例如WO 92/0 1 047、WO 93/1 12366、WO 95/1 53 88及 WO 93/19172。 當前抗體親和力成熟方法屬於兩種突變類別：隨機與非 隨機。易錯PCR、增變菌株（Low等人，乂仰〇/ 2'6〇, 359-68, 1996)及飽和突變（Nishimiya等人，j 价〇/ 275:12813-20, 2000 ； Chowdhury, P. S. Methods Mol Biol. 178，269-85，2002)為隨機突變法（Rajpai等人 ’ dad *SW ί/ 5 i 102:8466-71，2005)之典型實例。非隨機技 術常常使用丙胺酸掃描或定點突變來產生特定突變蛋白之 有限集合。以下進一步詳細描述某些方法。 經泠湯選法達疗之麂和力成澍-通常在遞減量之抗原存 在下經由對候選抗體之若干輪淘選進行重組抗體之親和力 成熟。遞減每輪抗原之量選出對抗原具有最高親和力之抗 體，藉此自一大堆起始物質中獲得高親和力抗體。經由淘 選進行之親和力成熟在此項技術中係熟知的且（例如）描述 ^Huls# K{Cancer Immunol Immunother. 50:163-71, 2001) 中。使用嗟菌體展示技術之親和力成熟法描述於本文令別 處且在此項技術中係已知的（參見例如Daugherty等人，
Proc ΝαΠ Acad Sci U S 9Ί.,2029-34, 2QQ0)。 穿變（TooAr-i/irow# wwiagewab)-精確突變（LTM) (Rajpal等人，ZVoc iVa，/ Jcad t/ S 儿 102:8466-71, 2005)提供一種迅速定位抗體結合位點之方法。對於 128410.doc -99- 200900420 LTM，選取9個代表由2G個天然胺基酸所提供之主要側鍵 化學性質的胺基酸以便剖析在抗體之所有六個cdr中之每 一位置處對結合之功能性側鏈貢獻。產生一 t列單個位置突變，其中各"野生型"殘基經9個所選胺基 酸之-者㈣、統地取代。將突變咖組合以在不會阻止所 有突變蛋白之；t量展示的情況下產生㈣度及尺寸遞增之 組合性單鏈可變片段（seFV)庫。在陽性選擇之後，對具有 改良結合性之純系定序且定位有益突變。
#錯/^-易錯咖涉及核酸於不同選擇輪次之間的隨機 化。隨機化因所用聚合酶之固有誤差率而以較低比率發 生’但可藉由使用在轉錄期間具有高固有誤差率之聚合酶 (Hawkins等人，j Mol Bi〇1 226:889 96，1992)進行易錯 PCR(ZaCC〇l〇等人，j. Mol. Bi〇1 285:775 783, 1999)而得以 增強。在突變週期之後，使用此項技術_之常規方法選擇 對抗原具有改良親和力之純系。 利用基因改組及定向進化之技術亦可用於製備抗海帕西 变抗體或其變異體且根據所需活性對其進㈣檢。舉例而 言，Jermutus等人，Proc Natl Acad % u s A , %⑴：75 8〇 (2001)展示將所定製之基於核糖體展示之活體外選擇策略 與藉由DNA改組達成之活體外多樣化組合以推算出士之 ，Tumour Biol. 用噬菌體展示與 解離速率或熱力學穩定性；Fermer等人 2004年1月-4月；25(1-2):7-13報導組合使 DNA改組使親和力提高幾 人 ’ Proc Natl Acad Sci 乎—個數量級。Dougherty等 U s A. 2000 年 2 月 29 日； 128410.doc -100- 200900420 97(5):2029-203 4報導⑴功能性純系以出人意料之高頻率存 在於超突變庫中；（Π)功能增強的突變體良好呈現於該等 庫中’且（iii)導致較高親和力之大多數scFv突變對應於遠 離結合位點之殘基。 或者或另外，分析抗原抗體複合物之晶體結構以鑑別抗 體與抗原之間的接觸點或使用電腦軟體模擬該等接觸點可 為有益的。根據本文中所詳述之技術’該等接觸殘基及鄰 近殘基為用於取代之候選者。一旦產生該等變異體後，如 本文中所述使其經受篩檢且可選取在一或多個相關檢定中 具有優良特性之抗體用於進一步開發。 具有經修飾碳水化合物之抗體 亦可產生相對於親本抗體而言具有經修倚糖基化模式之 抗體變異體，例如添加或刪除結合於特異性結合劑或抗體 之碳水化合物部分中之一或多者且/或添加或刪除特異性 結合劑或抗體中之一或多個糖基化位點。 多肽（包括抗體）之糖基化通常為冰連接或〇_連接。…連 接係指碳水化合物部分與天冬醯胺酸殘基之側鏈連接。三 肽序列天冬醯胺酸-X-絲胺酸及天冬醯胺酸_χ_蘇胺酸（其; X為除脯胺酸外之任何胺基酸）為碳水化合物部分與天冬醯 胺酸側鏈之酶促連接的識別序列。該等三肽序列中之任— 者於多肽中之存在產生潛在糖基化位點。因此，連接糖 基化位點可藉由改變胺基酸序列使得其含有該等三肽序列 中之一或多者而添加至特異性結合劑或抗體中。〇·連接糠 基化係指糖N-乙醯半乳胺糖、半乳糖或木糖中之一者與羚 128410.doc -101 · 200900420 土I的連接’該红基胺基酸最常為絲胺酸或蘇胺酸， <亦可使用5 &基脯胺酸或5_經基離胺酸。…連接糖基化 位.’.έ可藉由使-或多個絲胺酸或蘇胺酸殘基插人或取代至 初始特異性結合劑或抗體之序財而添加至特異性結合劑 或抗體中。 經改變之效應功能
可將半胱胺酸殘基移除或引人抗體或含有以之多肽之Fc 區域中，藉此消除或增加該區域内之鏈間二硫鍵形成。因 此所產生之同源二聚特異性結合劑或抗體可具有改良之内 化此力及/或增加之補體介導性細胞殺死及抗體依賴性細 胞 f 性（ADCC)。參見Car〇n等人，；Exp Med. 176:1191- 1 195 (1992)及 Shopes，b. J, !mmun〇1 148:2918_2922 (1992)。同源、一聚特異性結合劑或抗體亦可如等人， eaneer Reseafeh 53:2560_2565 (1993)中所述使用異雙功能 乂聯劑來製備。或者’特異性結合劑或抗體可經工程化， 其具有雙重Fc區域且藉此可具有增強之補體溶解及ADCC 能力。參見Stevenson等人，心〜叹〜以如 3:219-230 (1989)。 已顯不CDR内之序列可導致抗體與MHC π類結合且觸發 不S辅助性Τ細胞反應。保守性取代可使特異性結合劑或 抗體保留結合活性但降低其觸發不當τ細胞反應之能力。 亦涵盍移除重鏈或輕鏈之Ν_末端2〇個胺基酸中之一或多 者。 在些貝細例中，本發明亦涵蓋產生具有改變的碳水化 128410.doc -102· 200900420 合物結構從而導致效應因子活性改變之抗體分子，包括展 現改良ADCC活性之海藻糖化不存在或減少之抗體分子。 多種實現此舉之方法在此項技術中係已知的。舉例而言， 藉由使抗體分子與FcyRII][受體結合來介導ADCC效應因子 活！生’已顯示此取決於在CH2域之Asn-297處N-連接糖基 化之碳水化合物結構。非海藻糖化抗體以增加的親和力結 合此受體且比天然海藻糖化抗體更有效觸發FcyRIII所介導 之效應功能。舉例而言’非海藻糖化抗體在已敲除a_i，6_ 海藻糖基轉移酶之CHO細胞中的重組性產生導致ADCC活 性增加 i〇〇 倍的抗體（Yamane-Ohnuki 等人，Biotechnol Bioeng. 2004年9月5日；87(5):614 -22)。可經由降低此酶或 其他酶在海藻糖化途徑中之活性（例如經由siRNA或反義 RNA處理）、使細胞株工程化以敲除該（等）酶或以選擇性糖 基化抑制劑培養來實現相似效應（Rothman等人，M〇1
Immunol· 1989 年 12 月；26(12):Π13-23)。某些宿主細胞株 (例如Lec 13或大鼠融合瘤ΥΒ2/0細胞株）天然產生具有較低 海藻糖化程度之抗體。Shields等人，J Biol Chem. 2002年 7月 26 日；277(30):26733-40 ; Shinkawa等人，J Biol Chem. 2003年1月31日；278(5):3466_73。亦已（例如經由在過度表 現GnTIII酶之細胞中重組性產生抗體）確定對分碳水化合物 含量之增加使ADCC活性增加。Umana等人，Nat Biotechnol. 1999年2月；17(2):176-80。已預期僅缺乏兩個 海藻糖殘基中之一者可足以提高ADCC活性。Ferrara等 人，J Biol Chem. 2005年 12月 5 曰）。 128410.doc 103 - 200900420 其他共價修飾 、多肽或抗體之共價修飾亦包括於本發明之料内。若可 適用則其可藉由化學合成或藉由酶促或化學裂解多狀或 抗體來達成。可藉由使所靶向胺基酸殘基與能夠與所選側 鍵或N或C末端殘基反應之有機衍生試劑反應來引入其他 類型之共價修飾。 珉通书使半胱胺醯基殘基與α_ _代乙酸鹽（及相應胺）(諸 如氯乙酸或氯乙醯胺）反應以得到m甲基或㈣胺基甲基 衍生物。亦藉由與溴代三氟丙酮、α，_β_(5_咪唑基)丙 酸、氯乙醯基碟酸鹽、Ν_院基馬來酿亞胺、3_石肖基·2·。比咬 基一硫化物、甲基2-吼啶基二硫化物、對氯汞基苯曱酸 鹽、2-氣汞基-4-確基苯紛或氣_7_硝基苯并_2_氧雜^,3-二 °坐反應而得到半胱胺醯基殘基。 因為焦碳酸二乙酯對於組胺醯基側鏈相對具有特異性， 所以藉由與該試劑在pH 5.5-7.0下反應而得到組胺醯基殘 基。對溴苯甲醯甲基溴化物亦適用；該反應較佳在〇1 M 二甲胂酸鈉中在pH 6.0下進行。 離胺基及胺基末端殘基與丁二酸或其他羧酸酸酐反 應。使用該等試劑來衍生化具有逆轉離胺醯基殘基之電荷 的效應。其他適用於衍生化含α_胺基之殘基的試劑包括諸 如吡啶甲醯亞胺酸甲酯之亞胺基酯、磷酸吡哆醛、吡哆 搭、氣棚氫化物、三硝基苯續酸、〇_曱基異脲、2,4_戊二 酮及與乙醛酸鹽之轉胺酶催化反應。 藉由與一或數種習知試劑（其中有苯甲醯曱搭、2,3_丁二 128410.doc -104- 200900420 酮、1，2-環己二酮及茚三酮）反應來修飾精胺醯基殘基。精 胺殘基之衍生化由於胍官能基之高ρ κ a而需要在驗性條 件下進行反應。此外，該等試劑可與離胺酸基團以及精胺 酸ε -胺基反應。 可進行酪胺醯基殘基之特異性修飾，特別關注藉由與芳 族重氮化合物或四硝基甲烷反應而將光譜標記引入酪胺酿 基殘基中。最通常，使用Ν-乙醯咪。坐及四硝基甲院來分別 形成0-乙醯基酪胺醯基物質及3-硝基衍生物。使用>25j咬 13 1 I換化赂胺酿基殘基以製備用於放射免疫檢定之標記蛋 白。 藉由與碳化二亞胺（R-N.dbd.C.dbd.N-R，）反應來選擇性修 飾羧基側基（天冬胺醯基或麩胺醯基），其中R及R，為不同燒 基’諸如1-環己基-3-(2-嗎琳基-4-乙基）碳化二亞胺或1_乙 基-3-(4-氮鏽-4,4-二曱基戊基）碳化二亞胺。此外’將天冬 胺醯基及麩胺醯基殘基藉由與銨離子反應轉化成天冬醯胺 醯基及麩醯胺醯基殘基。 常常分別將麵醯胺醯基及天冬醯胺醯基殘基去醯胺化以 形成相應麩胺醯基及天冬胺醯基殘基。該等殘基係在中性 或驗性條件下被去醯胺化。該等殘基之去醯胺化形式屬於 本發明之範疇。 其他修飾包括脯胺酸及離胺酸之羥基化、絲胺醯基或羥 丁胺醯基殘基之羥基之磷酸化、離胺酸、精胺酸及組胺酸 側鍵之 α-胺基之甲基化（t. e. Creighton，Proteins: Structure and Molecular Properties, W.H. Freeman & Co., San 128410.doc -105- 200900420
Francisco ’第79-86頁（1983))、N-末端胺之乙醯化及任何C 末端羧基之醯胺化。 另一類型之共價修飾涉及使醣苷與特異性結合劑或抗體 化學或酶促偶合。該等程序為有利的，因為其並不需要在 具有N-或〇-連接糖基化之糖基化能力之宿主細胞中產生多 狀或抗體。視所用偶合模式而定，糖可連接於（a)精胺酸及 組胺酸、（b)游離羧基、（c)游離硫氫基（諸如半胱胺酸之彼 等硫氫基）、（d)游離羥基（諸如絲胺酸 '蘇胺酸或羥基脯胺 酸之彼等羥基）、（e)芳族殘基（諸如苯丙胺酸、酪胺酸或色 胺酸之彼等殘基）或（f)麩醯胺酸之醯胺基。該等方法描述 於1987年9月11日公開之WO 87/05330以及Apiin及Wriston， CRCCnt.Rev, Biochem.，第 259-306 頁（1981)中。 可以化學或酶促方式實現任何存在於多肽或抗體上之碳 水化合物部分的移除。化學去糖基化需要將特異性結合劑 或抗體暴露於化合物三氟曱烷磺酸或等效化合物。該處理 導致除連接糖（N-乙酸葡糖胺或N_乙醯半乳胺糖）外之大部 刀或所有糖裂解，同時使特異性結合劑或抗體保持完整。 akimuddin專人，Arch. Biochem. Biophys. 259: 52 (1987) 及 Edge 等人，Anal. Bi〇chem，118: 13ι(ΐ98ι)描述化學去 糖基化。可如由 Thotakura等人，Meth Enzym〇i ΐ38: Μ。 (1987)所描述藉由使用多種内切糖苷酶及外切糖苷酶來實 現特異性結合劑或抗體上之碳水化合物部分的酶促裂解。 對本發明之海帕西啶活性拮抗劑（包括抗海帕西啶抗體 或海帕西啶變異體）的另一類共價修飾包含使多肽、特^ 128410.doc -106- 200900420 性結合劑或抗體與多種非蛋白質聚合物(例如聚乙二醇、 聚丙二醇、聚乙氧基化多元醇、$乙氧基化山梨糖醇、聚 乙氧基化葡萄糖、$乙氧基化甘油、聚環氧院或多醣聚合 (諸士葡聚糖))中之一者連接。該等方法在此項技術中係 已矣的參見例如美國專利第4,64〇,835號、第4,496，_
號、第 4,301，144 號、第 4,67〇,417號、第 4,79i，i92 號、第 4，179,337 號、帛 4,766，1〇6 號、帛 4 179,337 號、第 4,495,285號、第 4,609,546 號或 Ep 315 —。 v.基因療法 °藉由使用此項技術中已知之任何合適方法經由離體、 原位或活體内進行|因療法而實現將海帕西咬促效劑或抬 抗劑輸送至適當細胞。舉例而言，對於活體内療法而言， 可將編碼所需海帕西啶活性拮抗劑或海帕西啶表現抑制劑 之核@夂單獨地或與載體、脂質體或沈澱物結合直接注入個 體中’且在一些實施例中可注入需要表現海帕西啶活性拮 抗劑或海帕西啶表現抑制劑之位點處。對於離體治療而 言，移出個體細胞，將核酸引入該等細胞中，且將經修飾 細胞直接或（例如）以囊封於植入患者中之多孔膜内的方式 返回至個體體内。參見例如美國專利第4,892,538號及第 5,283，187 號。 存在多種可用於將核酸引入活細胞中之技術。該等技術 視是否將核酸活體外轉移至培養細胞中或活體内轉移至所 欲宿主之細胞中而變化。適用於將核酸活體外轉移至哺乳 動物細胞中之技術包括使用脂質體、電穿孔、顯微注射、 1284I0.doc •107· 200900420
、田紀嘁合、化學處理、DEAE_葡聚糖及磷酸鹽沈澱法。其 他活體内核酸轉移技術包括使用病毒載體（諸如腺病毒、 疱疹單純I病毒、腺相關病毒或反轉錄病毒）轉染及基於脂 質之系統。核酸及轉染試劑視情況與微粒締合。例示性轉 柒试劑或方法包括磷酸鈣或氯化鈣共同沈澱、dEAE_葡聚 糖所介導之轉染、第四銨兩性DOTMA((二油醯氧基丙基） 二甲銨溴化物’由GIBCO-BRL以脂質體（Lipofectin)形式 商品化）（Felgner等人 ’（1987) Pr〇c Natl. Acad. Sci. USA 84, 7413-7417 ; Malone等人，（1989)卩刚._1八。3丄86· USA 86，6077-6081);具有側接三甲銨頭部之親脂性麩胺 酸二醋（Ito等人 ’（1990) Biochem. Biophys. Acta 1023, 124-132);可代謝親本脂質’諸如陽離子脂質二（十八烷 基）醯胺基甘胺醯基精胺（DOGS, Transfectam，Promega)及 二棕櫚醯基填脂醯基乙醇戊基精胺（DPPES)(J. P. Behr (1986) Tetrahedron Lett. 27, 5861-5864 ; J. P. Behr等人， (1989) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86，6982-6986);可代謝 第四銨鹽（DOTB、甲基硫酸N-(l-[2,3-二油醯氧基；I丙基）_ N，N，N-三曱銨（DOTAP)(Boehringer Mannheim)、聚（伸乙基 亞胺）（PEI)、二油醯酯、ChoTB、ChoSC、DOSCKLeventis 等人，（1990) Biochim. Inter. 22，235-241) ; 3β[Ν-(Ν'，Ν'- 二甲基胺基乙烧）-胺曱醯基]膽固醇（DC-Chol)、二油醯基 磷脂醯基乙醇胺Φ〇ΡΕ)/3β[Ν-(Ν'，Ν'-二曱基胺基乙烷）_胺 甲酿基]膽固醇（DC-Chol)—比一混合物（Gao等人，（1991) Biochim. Biophys. Acta 1065，8-14);精胺、亞精胺、脂多 128410.doc •108- 200900420 胺（lipopolyamine)(Behr等人，Bioconjugate Chem，1994，5: 382-389);親脂性聚離胺酸（LPLL)(Zhou等人，（1991) Biochim. Biop hys. Acta 939，8-18);具有過量構脂醯膽驗 / 膽固醇之[[(1,1，3,3-四曱基丁基）曱苯氧基]乙氧基]乙基]二 甲基苄銨氫氧化物（DEBDA氫氧化物）（Ballas等人，（1988) Biochim. Biophys. Acta 939, 8-18);溴化十六烧基三甲基 錢（CTAB)/DOPE 混合物（Pinnaduwage 等人，（1989) Biochim. Biophys. Acta 985，33-37);與填脂醯乙醇胺混合 之麩胺酸與DOPE、CTAB、DEBDA、溴化二（十二烷基）銨 (DDAB)及十八胺之親脂性二酯（TMAG)(Rose等人，（1991) Biotechnique 10, 520-525) ； DDAB/DOPE(TransfectACE, GIBCO BRL)及帶有脂質之募半乳糖。提高轉移效率之例 示性轉染增強子試劑包括（例如）DEAE-葡聚糖、聚凝胺、 溶酶體分裂性肽（Ohmori N I等人，Biochem Biophys Res Commun 1997年6月27曰；23 5(3):726-9)、基於軟骨素之蛋 白聚糖、硫酸化蛋白聚糖、聚伸乙基亞胺、聚離胺酸 (Pollard Η等人，J Biol Chem，1998 273 (13):7507-1 1)、整 合素結合性肽CYGGRGDTP、直鏈葡聚糖壬醣、甘油、”繫 栓"於募核苷酸之3，-末端核苷間鍵處之膽甾醇基（Letsinger， R. L. 1989 Proc Natl Acad Sci USA 86:(17):6553-6)、溶血 磷脂、溶血磷脂醯膽鹼、溶血磷脂醯乙醇胺及丨_油醯基溶 血填脂酿膽驗。 在某些情形下，可能需要使用將含核酸之載體引至乾標 細胞之試劑來輸送核酸。該等，，靶向”分子包括對靶標細胞 128410.doc •109· 200900420
上之細胞表面膜蛋白具特異性的抗體或靶標細胞上之受體 的配位體。當使用脂質體時，結合於與内飲作用相關之細 胞表面膜蛋白的蛋白質可用於靶向及/或促進吸收。該等 蛋白質之實例包括對特定細胞類型具有嗜性之衣殼蛋白及 其片段、在循環中經受内化之蛋白質之抗體及靶向細胞内 定位且增強細胞内半衰期之蛋白質。在其他實施例中，可 使用受體所介導之内飲作用。該等方法描述於（例如等 人，1987或Wagner等人，199〇中。關於目前已知之基因標 。己及基因療法方案之纟示述，參見Anders〇n 1992。亦灸見 WO 93/25673及其中所引用之參考文獻。關於基因療法技 術之其他综述，參見Friedmann, Science, 244: 1275-1281 (1989) ; Anderson，Nature ’ 增刊第 392卷，第 6679號，第 25-30 I (1998) ； Verma, Scientific American: 68-84 (1990) ;及 Miller，Nature, 357: 455460 (1992) 〇 VL海帕西咬相關病症之料方法及使料帕㈣结抗劑 之療法的監控 亦提供用於診斷海帕西啶相關病症(諸如海帕西啶相關 貧血症或其他海帕西啶過量或海帕西啶缺乏之疾病）的方 法’及監控療法(包括使用海帕西啶活性拮抗劑或海帕西 。定表現抑制劑之療法）對於該疾病之有效性的方法。為確 定海帕西咬相關貧血症之存在或不存在，使來自串者之生 物試樣與本文中所揭示之抗海帕㈣抗體中之—或多者在 足以允許形成免疫複合物之條件下及時間内接觸。隨㈣ 測抗海帕西備與生物試樣中之海帕西咬之間所形成的 128410.doc -110- 200900420 免疫複口 ##由$測抗體與海帕西咬之間所形成的免疫 複合物之量來量化試樣中海帕西D定之量。在某些方法中， 將生物試樣自患者分離且以本文中所揭示之抗海帕西咬抗 體中之-或多者培育，I高於某一臨限值之抗體-海帕西 嘴複合物之量與海帕西咬相關貧血症之存在相關聯，且低 於該臨限值之量指示該患者不可能具有海帕西仙關貧血 症。舉例而言’正常範圍内之量指示患者不可能具有海帕 西口定相關貧1症。t由某些檢^(亦即共同擁有之美國專 利申請案第1 1/880,3 13號及國際專利申請案第 PCT/US2007/016477號中所描述的質譜分析技術，該等文 獻之揭示内容以引用方式全部併入本文中）測定時血清海 帕西啶之正常範圍通常小於丨〇 ng/m卜但將視檢定及所測 試群體之子集而變化。 亦提供區分炎性疾病與非炎性疾病之方法。為確定炎性 疾病之存在或不存在，使來自患者之生物試樣與本文中所 揭示之抗海帕西啶抗體中之一或多者在足以允許形成免疫 複合物之條件下及時間内接觸。可使用此項技術中已知之 各種免疫檢定，包括（但不限於）：使用諸如放射免疫檢 定、ELISA(酶聯免疫吸附檢定）、”夾心”免疫檢定、免疫 放射檢定（immunoradiometric assay)、凝勝擴散沈澱反 應、免疫擴散檢定、原位免疫檢定（例如使用膠體金、酶 或放射性同位素標記）、西方墨點法、沈澱反應、凝集檢 疋（例如凝膠凝集檢定、血球凝集檢定）、補體固定檢定、 免疫螢光檢定、蛋白質A檢定及免疫電泳檢定等之技術的 128410.doc 111 200900420 競爭性及非競爭性檢定系統。在一實施例中，藉由偵測第 一抗體上之標記來偵測抗體結合。在另一實施例中，藉由 偵測第二抗體或試劑與第一抗體之結合來偵測第一抗體。 在另一實施例中，標記第二抗體。許多用於偵測免疫檢定 中之結合的方法在此項技術中係已知的且處於本發明之範 缚内。Harlow & Lane之 Antibodies: A Laboratory Manual (1988)或最近版本；immunoassays: A Practical Approach
Oxford University Press, Gosling, J. P.(編）（2001)或最近版 r 本；及 /或 Current Protocols in Molecular Biology (Ausubel 等人），其定期更新。該等檢定之實例通常涉及連接於表 面或基質之抗體、所添加之患者血清及允許複合物形成所 用之時間；用以移除未結合複合物之適當洗滌程序、繼之 以允許複合物之偵測之第二抗體的添加（夾心EUSA)或用 以偵測抗體表面上之自由海帕西啶結合位點的海帕西啶之 可偵測型式（競爭ELISA)。如由上述方法所制，高於某 -臨限值之海帕西啶含量與炎性疾病之存在有關，且低於 &亥6¾限值之含量指+电. 知不患者不可能患有炎性疾病。當海帕西 啶含量在正常範圍内時患者不可能患有炎性疾病。當海帕 西啶含量超過正常範圍(例如20，時，詳言之當含旦 處於20與1〇〇〇 ng/ml$ „ 虫屯 里 之間時患者可能患有炎性疾病。例千 性海帕西啶相關炎性 ’、 人汪疾病包括癌性貧血症、慢性 症、炎性貧血症、化瘩 貝血 〜、誘毛性貧血症、慢性腎病（I期、ττ 期、ΠΙ期、IV期或 )、 / 11 心臟衰竭、癌症、類二二慢性腎衰竭、充血性 頰風濕性關節炎、全身性紅斑性狼瘡 128410.doc •112- 200900420 症、克羅恩氏病、幽門螺旋桿 ^ Q „ 干囷感木或其他細菌感染、c 型肝炎、HIV及其他病毒性 ,,, , 、病動脈硬化、動脈粥樣硬 1肝硬化、騰腺炎、敗血病、血管炎、鐵缺乏、低色素 小紅血球性貧血及海帕西啶過量病狀。 曰在其他方法中，測試獲自患者之生物試樣的海帕西咬含 置。使用本文中所揭示之抗海帕西口定抗體中之一或多者在 足以允許形成免疫複合物之條件下及時間内培育生物試
樣。_測生物試樣中海帕西咬與特異性結合於海帕西 咬之抗體之間所形成的免疫複合物。用於該等方法中之生 =試樣可為獲自患者且預期含有海帕西0 定之任何試樣。適 當生物試樣包括血液、血清、血漿、尿及骨髓。適當抗體 包括來自A類細m動H、山羊、㈣或任何其 他物種之抗體。 將生物試樣與抗體一起以反應混合物形式在足以允許於 海帕西咬與對海帕西。定具有免疫特異性之抗體之間形成免 疫複合物的條件下及時間内進行培育。舉例而言，可將生 物試樣及一或多種抗海帕西啶抗體在4<t下培育24_48小 時。 繼培育之後，測試反應混合物中免疫複合物之存在與 否。可藉由多種已知技術（諸如放射免疫檢定（RIA)及酶聯 免疫吸附檢定（ELISA))實現對抗海帕西啶抗體與存在於生 物試樣中之海帕西啶之間所形成之免疫複合物的偵測。適 當檢定在此項技術中係熟知的且詳細描述於學術文獻及專 利文獻（Harlow及Lane，1988)中。可使用之檢定包括（但不 128410.doc -113 - 200900420 限於）雙單株抗體夾心免疫檢定技術（美國專利第4,3 76,11 0 號）；單株-多株抗體夾心檢定（Wide等人，1 970);，，西方墨 點”方法（美國專利第4,452,901號）；標記配位體之免疫沈 澱（Brown等人，1980);酶聯免疫吸附檢定（Raines及R〇ss， 1982);免疫細胞化學技術，包括使用螢光染料（Br〇〇ks等 人’ 1980);及活性中和法（Bowen-Pope等人，1984)。其他 免疫檢定包括（但不限於）描述於美國專利第3,8 17,827號、 第 3,850,752 號、第 3,901，654 號、第 3,935,074 號、第 3,984,533 號、第 3,996,345 號 '第 4,034,074 號及第 4,098,876號中之彼等免疫檢定。 出於偵測目的，抗海帕西啶抗體可經標記或未經標記。 未標記抗體可用於凝集檢定或與結合於免疫複合物之經標 記偵測試劑（例如抗免疫球蛋白、蛋白質G、蛋白質A或凝 集素及第二抗體或其抗原結合片段，該等者能夠與特異性 結合於海帕西啶之抗體結合）組合使用。若抗海帕西啶抗 體經標s己’則報導基團（rep0rter gr0Up)可為此項技術中已 知之任何適當報導基團’包括放射性同位素、螢光基團 (例如螢光素或若丹明（rh〇damine))、發光基團、酶、生物 素及染料顆粒。本身可直接偵測之標記包括螢光或發光染 料、金屬或金屬螯合物、電化學標記、放射性核種（例如 3 2P、14C、1251、3H或13II)、磁性標記或珠粒（例如 DYNABEADS)、順磁性標記或比色標記（例如膠體金、有 色玻璃或塑性珠粒）。該等可偵測標記可直接與抗海帕西 11定抗體或债測試劑接合或可與連接於抗海帕西σ定抗體或债 128410.doc -114- 200900420 极1之珠粒或顆粒締合。可經由結合經標記特異性結合 搭配物而㈣之標記包括生物素、異經基洋地普毒 f (dlg〇Xigenin)、麥芽糖、寡組胺酸、2,二硝基笨、苯基 =鹽、爾…咖A。可藉由產生可偵測反應產物: 間接读測之間接標記包括此項技術中所熟知之各種酶，諸 2驗性填酸酶、辣根過氧化物酶、β·半乳料酶、黃嗓呤 氧化酶、葡萄糖氧化酶或其他酿氧化酶或可分解適當受質 以形成有色或螢光反應產物之螢光素酶。 、 在某些檢定中，將未標記抗海帕西啶抗體固定於一固體 支撐物上以用作捕捉生物試樣中之海帕西咬之π捕捉劑"（或 試劑）。固體支撐物可為一般熟習此項技術者已知之可連 接抗體之任何物質。舉例而言，固體支撐物可為微量滴定 盤中之測試孔或硝化纖維素或其他適當膜。或者，支撐物 可為管狀物、珠粒、顆粒或盤狀物，諸如玻璃、玻璃纖 維：乳膠或塑性材料(諸如聚乙#、聚丙烯、聚苯乙烯或 聚氯乙烯）或多孔基質。其他物質包括王复脂糖、葡聚糖、 聚丙烯醯胺、耐論（nylon)、葡聚糖凝膠（Sephadex)、纖維 素或多酷。支撐物亦可為磁性顆粒或纖維光學感應器，諸 如揭示於（例如）美國專利第5,359,68丨號中之彼等支撐物。 經固定之抗海帕西啶抗體可為多株抗體或一或多種單株抗 體（諸如彼等本文中所述者）或多株抗體與一或多種單株抗 體之組合。可使用多種熟習此項技術者已知之技術將抗體 固定於固體支撐物上，該等技術詳細描述於專利及學術文 獻中。在本發明之内容中，術語，，固定”係指非共價締合（諸 128410.doc -115- 200900420 如吸附）及共價連接（其可為支撐物上之官能基與抗原之間 直接鍵結或可為經由交聯劑鍵結）。涵蓋藉由吸附固定至 微量滴定盤中之孔上或固定至膜上。在該等情況下，可藉 由使抗海帕西啶抗體與固體支撐物在適當緩衝液中接觸適 虽長的時間來實現吸附。接觸時間隨溫度而變化，但通常 為、、勺1小日守與約i天之間。一般而言，使塑料微量滴定盤 (包括聚苯乙烯或聚氯乙烯）之孔與量之範圍介於約10 ng至 約1〇 Mg且較佳約1〇〇 ng至約i㈣的肽接觸足以固定足量之 肽。 、、裡回疋之後，通常將支撐物上之剩餘蛋白質結合位點阻 斷。可使用-般熟習此項技術者已知之任何適當阻斷劑， 包括牛血清白蛋白、TweenTM 2〇TM(sigma ^⑽c〇 , %
Loms，Mo.)、熱鈍化正常山羊血清（ngs)或（亦含 =劑、鹽及消泡劑之脫脂奶粉緩衝溶液)。隨後使用 te疑3有海帕西啶之生物 ^ 休口月支撐物。可應用純試 樣，或更通常，可將試樣稀 逋㊉稀釋於含有少量（0」 重里Λ-5.0重量％)蛋白質（諸如 衝容洛Φ Λ NGS或BLOTTO)之緩 衝-液中。-般而言，適當接觸時間(亦 段足以偵測對於含有海帕西 守間）為一 鸿牲里ΛΛ 4 定之5式樣内之海帕西啶具有免 疫特異性的抗體或抗原結合 、百免 sg gg 之存在的時間。齡#，姐 觸時間足以獲得為在結合 接 衡時所獲得之社入水平夕系 體或抗體片段之間平 α 口水千之至少約95%的好a卜亚 習此項技術者將認識到， — 13 σ 7平。一般熟 ,.,, 易於糟由檢定在一7 @ μ & β 生之…水平來確定實現平衡 ：夺嶋 而之時間。在室溫 I284I0.doc -116 - 200900420 下，約30分鐘之培育時間通常係足夠的。 可隨後藉由使用適當緩衝液（諸如含耗1% Μ— 2〇 之剛）洗務固體支擇物來移除未結合試樣。結合於免疫複 合物（藉由使捕捉劑與來自試樣之海帕西。定結合所形成）中 之海帕西㈣彳貞測試劑可隨後被添加。該侧試劑可為多 株抗體或—或多種單株抗體（諸如彼等本文中所述者）或多 株抗體與—或多種單株抗體（諸如彼等本文中所述者）或任 何抗體之Fab部分之组合。偵測試劑可經直接標記，亦即 其包含至少一 _第一可偵測標記或"報導"分子。或者，偵 測6式劑可為未標記抗海帕西啶抗體。隨後藉由使經標記第 二抗體或試劑與第一抗體結合來偵測此未標記抗海帕西啶 抗體。舉例而言’若第—抗體為鼠類免疫球蛋白， 則第二抗體可為經標記抗鼠類免疫球蛋白抗體。同樣’若 第抗體為兔免疫球蛋白，則第二抗體可為經標記抗兔免 疫球蛋白抗體。 將偵測试劑與免疫複合物—起培育—段足以偵測結合抗 體或其抗原結合片段之時間。可通常藉由檢定在一段時間 内發生之結合的水平來確定適當的時間長度。隨後移除未 結^標記㈣測試劑且使用適當較或分析儀器來價測結 合標=或㈣試劑。用於偵測報導基團之方法視報導基團 之性質而定。對於放射性標記，閃爍計數或自動放射攝影 法通吊為適當的。光譜法可用於偵測染料、發光或化學發 光邛刀及各種色原體、螢光標記及類似物。可使用與不同 報導基團（通常放射性或登光基團或酶）偶合之抗生物素蛋 128410.doc -117- 200900420 白偏测生物辛。i甬受开μ + i < /通㊉了藉由添加受質(通常歷時特定一段 守θ)’接著對反應產物進行丼显 视退仃尤°日或其它分析來偵測酶報 包括辣根過氧化物酶、β_半乳糖㈣、鹼性鱗酸酶 葡萄糖魏酶）。與所用料方法無關，大於本底（亦即 ::!自具有正常海帕西咬含量之個體之生物試樣所觀測 3里)至少兩倍之結合痛測試劑的含量指示與海帕西啶 之表現相關的病症之存在。 ( 在#代1·生實施例中，試樣及㈣試劑可同時與捕捉劑接 觸而非依序添加。在另一替代性實施例中，可將試樣及 偵測試劑一起預培育，隨後添加至捕捉劑中。其它變化易 於為一般熟習此項技術者所瞭解。 另實她例中，藉由競爭性結合檢定測定存在於試樣 '、·帕西定的畺。競爭性結合檢定依賴於經標記標準物 (m海帕西咬多肽或其免疫反應性部分）與測試試樣分析 物（海帕西。定多狀）競爭結合有限量之抗海帕.定抗體的能 2 游離海帕西咬與結合海帕西咬之後，藉由經結 合/未結合海帕西啶與已知標準物之相關比率來量化海帕 西°疋。測試試樣令之海帕西咬多肽之量與結合於抗體之標 準物之罝成反比。為便於測定經結合之標準物之量，通常 將抗體固定於固體支撐物上以便可便利地使結合於抗體之 標準物及分析物與保持未結合之標準物及分析物分離。因 此，在該等實施例中，本發明涵蓋使生物試樣與經標記成 燕海帕西啶（或其保留海帕西啶之抗原性之經標記片段）及 結合於成熟海帕西啶之抗體接觸且偵測所形成之抗體標記 128410.doc -118- 200900420 海帕西u定複合物之量。 / 製備與固體支撐物或可偵測標記之接合物通常包含使用 化學交聯劑。交聯試劑含有至少兩個反應性基團且通常被 分成同官能交聯劑（含有相同反應性基團）與雜官能交聯劑 (含有不同反應性基團）。可經由胺、硫氫基偶合或非特異 性反應之同雙官能交聯劑可獲自許多商業來源。馬來醯亞 胺、烷基及芳基鹵化物、（X-齒醯基及吡啶基二硫化物為硫 醇反應性基團。馬來醯亞胺、烧基及芳基_化物及α__ 基與硫氫基反應以形成硫醇醚鍵，而吡啶基二硫化物與硫 氫基反應以產生混合型二硫化物。吡啶基二硫化物產物可 裂解。亞胺基酯亦極適用於蛋白質_蛋白質交聯。 雜雙g忐交聯劑具有兩個或兩個以上允許依序與蛋白質 之特定基團接合從而使不當聚合或自接合最小化之不同反 應性基團。當胺之修飾成問題時亦使用雜雙官能試劑。胺 有日守可見於大为子之活性位點處且對於該等胺之修飾可能 導致活性喪失。其他部分（諸如硫氫基、減、苯紛及碳 水化口物）可為更合適之標4步策略允許偶合可容許 使胺修飾成具有其他可及基團之蛋白質的蛋白f。多種雜 又吕月fa又聯劑（為成功接合各自组合不同屬性）可市面上講 得。在-端具有胺反應性且在另—端具有硫氫基反應性之 乂 ％劑為十分普通的。若使用雜雙官能試劑，則最不穩定 基團通ΐ首先發生反應以確保有效交聯且避免不當聚合。 ;如本文在實例27-28中所示，τ用於診斷某些疾病病況 (諸如A !生貧血症及癌，}生貧血症）的指帛《成熟海帕西。定 128410.doc •119· 200900420 (SEQ ID NO: 8之胺基酸6〇_84)之含量而非原海帕西μ剛 IDn〇:8之胺基酸25_84)之含量。因此，在一較佳實施例 中，將結合於正確摺4之成熟海帕西咬（SEQ ID NO: 9)之 抗體用作捕捉劑與债測試劑。亦可使用結合於天然存在之 N-末端截短型式（例如缺少成熟海帕西。定之至多兩個或至 多五個N-末端胺基酸)的抗體。涵蓋捕捉劑與偵測試劑之 !同組合：舉例而言’捕捉劑可為結合於成熟海帕西咬之 ★彳原夬定基之單株抗體且偵測試劑可為結合於成孰海 帕西咬之第二抗原決定基之不同單株抗體。較佳使用對於 海帕西蚊不同抗原決定基具有特異性之抗體以便最小化 捕捉劑與偵測試劑之間的競爭咬 … 肀及干擾。或者，捕捉劑可為 體作：I:帕西°疋之多株抗體且偵測試劑可為單株抗 西:作^另替代性實施例’捕捉劑可為結合於成熟海帕 :之单株抗體且偵測試劑可為多株抗體。在前述實施例 之任一者中，捕捉劑或偵 之組合。 了為夕株抗體與單株抗體
V 在一些實施例中，將成熟海 m ,v ,. , 四定特異性早株抗體用作 捕捉劑或偵測試劑或用作兩者。 完八π a人$ & 成热海帕西啶特異性抗體 凡王不結合原海帕西啶或 盘用Up 飞使传抗體可區分成熟海帕西咬 原海帕西啶之較低親和力杜人 , ihM . 、〇 σ於原海帕西啶。舉例而 。此種早株抗體可結合於成 可纟士人Λ盾、'么从市 w疋< Ν-末鈿，或其 域逆銶、的占％ ★ 、j出（例如歸因於受前結構 竦遮蔽）的成熟海帕西啶之抗原決定基。 再 在利用結合於存在於成熟 w四足與原海帕西啶中之抗 128410.d〇c -120- 200900420 原決疋基之單株抗體的實施例中，.飞装.a ^ 一 只1夕J τ，涵盍視情況進一步的改 進藉由自存在於同一试樣令之總海帕西口定（原海帕西咬 加成熟海帕西咬）之量中減去存在於試樣中之原海帕西咬 之量來確定單獨成熟海帕西啶之量。可藉由在如同如上所
述之彼等者之技财使用原海怕西咬特異性多株及/或單 株抗體來確定原海帕西啶之量。原海帕西咬特異性抗體完 全不結合成熟海帕西咬或以使得抗體可區分原海帕西咬與 成熟海帕西啶之較低親和力結合於成熟海帕西啶。舉例而 言’該等抗體可結合於唯存在於海帕㈣之前結構域（seq ID NO: 8之胺基酸25_59)中的線性或構形抗原決定基。在 該等㈣財，可料或同時敎總海帕_及原海帕西 4之量。為原海帕㈣在血清中迅速降解成海帕西咬， 所以在某些實施例中將弗林（fuHn)抑制劑添加至生物試樣 中以防止或減少原海帕西σ定的降解。 在利用結合於25-胺基酸成熟海帕西啶之單株抗體的一 些實施例中，單株抗體並不結合降解產物（亦即海怕西口定_ 22及海帕西。定_20)。 在用則貞測總海帕西。定及原海帕西。定之同時檢定的一個 實施例中，捕捉劑為結合於存在於成熟海帕西。定與原海帕 西咬中之抗原決定基之抗體，且同時使用兩種偵测試劑。 第-偵測試劑為結合於存在於成熟海帕西啶與原海帕西啶 中之抗原蚊基之經標記抗體且第二㈣試劑為經不同二 記之原海帕西咬特異性抗體。舉例而t，第1測試^ 以可在第-波長下債測出之發光染料標記，而第讀 128410.doc • 121 · 200900420 劑係以可在第二波長下偵測出之螢光染料標記。因此，在 此種實例中，捕捉劑將結合試樣中之總海帕西啶（成熟海 帕西疋加原海帕西„定）’第一偵測試劑將债測總海帕西。定 之里且弟—偵測试劑將價測原海帕西σ定之量。自總海帕西 咬之®中減去原海帕西啶之量將獲得成熟海帕西啶之量。 在其他替代性實施例中’可使用兩種不同捕捉劑：結合於 存在於成热海帕西啶與原海帕西啶中之抗原決定基之第〜 捕捉劑及作為原海帕西啶特異性抗體之第二捕捉劑，視情 況使用結合存在於成熟海帕西啶與原海帕西啶中之抗原決 定基之偵測試劑。 關於進行同時檢定之其他實施例在此項技術中係熟知 的包括（例如）Khan等人，Clin. Vaccine Immunol·，13 (1) 45 52 (2GG6年1月）中所描述之多路系統’其涉及差異編碼 螢光U珠套組。關於在單個表面上進行多個同時檢定之 其他貝她例包括具有複數個不連續、可尋址位置以便偵測 I ⑯數個不同分析物之表面。該等格式包括蛋白質微陣列或 i白質晶片"(參見例如化及Ilag，】CeU M〇i Med 6: 29 340 (2002))及毛細管裝置（參見例如美國專利第 ，’944唬）。在該等實施例中，各不連續表面位置具有 =定不同刀析物於各位置處以便偵測之不同抗體。表面吁 或者具有或多個固定在表面之不連續位置處之不連續顆 粒（例如微粒或杏半罢g+ , 乂不木顆粒），其中各組顆粒含有針對不同分 析物之不同捕捉劑。 互補抗體對(結合於海帕西啶上之不同抗原決定基使得 】28410，d〇c •122- 200900420 配對適合於用於夾心檢定之抗體）係難以鑑別的。使用使 競爭或干擾最小化之互補對可提高檢定之敏感度達20倍至 5 0倍。在一些實施例中，本發明之免疫檢定能夠量測範圍 介於0.01 ng/mL至10 eg/mL之海帕西咬含量。 適用於夹心免疫檢定之抗體對包括下列抗體對： (1) 當配對之一抗體為結合於與抗體181相同之抗原決定 基或與抗體1S1競爭結合於SEQ ID NO: 9之成熟人類海帕 西啶達至少約75%、80%、85%、90°/。或以上的抗體時，適 當第二抗體可為： Ο)結合於與抗體23F11相同之抗原決定基或與抗體 23F11；{兄等·結合於seq id NO: 9之成熟人類海帕西D定達至 少約75%、80%、85%、90%或以上的抗體；或 (b) 結合於與抗體1 5 E1相同之抗原決定基或與抗體 15E1競爭結合於SEQ m NCh 9之成熟人類海帕西啶達至少 約75❶/〇、80°/。、85%、90°/。或以上的抗體；或 (c) 結合於與抗體12B9相同之抗原決定基或與抗體 12B9競爭結合於SEQ m N〇: 9之成熟人類海帕西啶達至少 約75°/。、80%、85%、90%或以上的抗體； (2) 當配對之一抗體為結合於與抗體丨2B9相同之抗原決 定基或與抗體12B9競爭結合於SEQ ID N0: 9之成熟人類海 帕西啶達至少約75%、8〇%、85%、9〇%或以上的抗體時， 適當第二抗體可為： U)結合於與抗體18D8相同之抗原決定基或與抗體 18D8競爭結合於SEQ m no: 9之成熟人類海帕西啶達至少 128410.doc -123- 200900420 約75%、80%、85%、90%或以上的抗體；或 (b) 結合於與抗體19C1相同之抗原決定基或與抗體 19C1競爭結合於SEQ ID NO: 9之成熟人類海帕西咬達至少 約75%、80°/。、85%、90%或以上的抗體；或 (c) 結合於與抗體19D12相同之抗原決定基或與抗體 19D12競爭結合於SEQ ID NO: 9之成熟人類海帕西咬達至 少約75%、80%、85%、90%或以上的抗體；或 (d) 結合於與抗體19H6相同之抗原決定基或與抗體 19H6競爭結合於SEQ ID NO: 9之成熟人類海帕西咬達至少 約75% ' 80%、85%、90%或以上的抗體；或 (e) 結合於與抗體1S1相同之抗原決定基或與抗體iS1 竞兄_結合於S E Q Ϊ D Ν 0: 9之成熟人類海帕西σ定達至少約 75%、80%、85%、90%或以上的抗體；或 (3)當配對之一抗體為結合於與抗體23F1丨相同之抗原決 定基或與抗體23F11競爭結合於SEQ ID NO: 9之成熟人類 海帕西啶達至少約75%、80%、85%、9〇%或以上的抗體 時’適當第二抗體可為： (a) 結合於與抗體18D8相同之抗原決定基或與抗體 18D8競爭結合於SEq ID N0: 9之成熟人類海帕西啶達至少 約75%、80%、85%、90%或以上的抗體；或 (b) 結合於與抗體19C1相同之抗原決定基或與抗體 19C1競爭結合於SEQ id NO: 9之成熟人類海帕西啶達至少 約75%、80%、85%、90。/。或以上的抗體；或 (c) 結合於與抗體19D12相同之抗原決定基或與抗體 128410.doc •124- 200900420 19D12競爭結合於SEQ ID NO: 9之成熟人類海帕西咬達至 少約75%、80%、85°/。、90%或以上的抗體；或 (d) 結合於與抗體19H6相同之抗原決定基或與抗體 19H6競爭結合於SEQ ID NO: 9之成熟人類海帕西咬達至少 約75%、80%、85%、90°/。或以上的抗體；或 (e) 結合於與抗體1S1相同之抗原決定基或與抗體4£1 競爭結合於SEQ ID NO: 9之成熟人類海帕西σ定達至少約 75%、80%、85%、90%或以上的抗體；或
(f)結合於與抗體3Β3相同之抗原決定基或與抗體3Β3 競爭結合於SEQ ID NO: 9之成熟人類海帕西咬達至少約 75%、80%、85%、90%或以上的抗體； 決 海 (4)當配對之一抗體為結合...........…丨κ沉 定基或與抗體15Ε1競爭結合於SEQ ID NO: 9之成熟人 帕西啶達至少約75%、8〇%、85%、9〇%或以上的抗體 適當第二抗體可為： 灶< (a)結合於與抗體1S1相同之抗原決定基或與抗體1S1 競爭結合於SEQ ID N〇: 9之成熟人類海帕西啶達至少約 75 /〇、80%、85%、90%或以上的抗體。 在—些實施例t ’詩監控使料帕㈣拮抗劑之療法 之有效性的方法包括監控試樣中或動者中 之海帕西啶含量的尚儿^ 、 頰心者）中 、交化。控海帕西π定含量之方法$ ^ A (a)培育在使用太令士 3里又万法可包含 本中所揭示之抗海帕西啶抗體中之一或多 者進仃治療之前獲自*者 一 許备^心者的弟一生物試樣，其中在足以女 疫设合物形成之條件 ”下及時間内進行培育；（b)偵剛生 I284I0,cj〇c -125- 200900420 物式樣中之海帕西σ定與特異性結合海帕西咬之抗體或抗原 結合片段之間所形成的免疫複合物；及視情況（c)在隨後時 7 (諸如繼使用本文中所揭示之抗海帕西咬抗體中之一或 夕者進饤治療之後）使用采自患者之第二生物試樣重複步 驟⑷及⑻’·及⑷比較對於第—及第二生物試樣所摘測之 免疫複合物的數量。 其他監控方法包括量測（3)海帕西啶與治療劑之間的複合 物之血液（例如血清或血黎）#環含量及視情況⑻存在於循 環中之游離海㈣咬之量。舉例而言，可使用結合於複合 物之治療抗體部分的抗人類Fc抗體及結合於複合物之海帕 西啶部分之"成對"抗海帕西啶抗體的F a b片段偵測海帕西 啶與治療抗體之間的複合物。或者，可使用抗遺傳型抗體 替代抗人類Fc抗體。作為另一替代性實施例，可使用含有 非人類FC(例如人類Fc經鼠類Fc置換）之抗海帕西啶抗體替 代Fab片段。 作為另一實例，可在自生物試樣中移除海帕西啶治療抗 體複合物之後使用已固定於固體支撐物上之抗人類^抗體 或抗遺傳型抗體偵測游離海帕西啶。隨後量測保持不與固 體支撐物結合之游離海帕西啶之量。游離海帕西啶之該含 量可反映治療抗體在移除可得循環海帕西啶方面之有2 性。 用於該等方法中之生物試樣可為獲自患者並將預期含有 海帕西啶之任何試樣。例示性生物試樣包括血液、血清、 血漿、尿及骨髓。可在開始治療之前或在治療方案之中途 1284l0.doc • 126- 200900420 獲得第-生物試樣。應以類似方式但在其他治療之後的某 時獲得第二生物試樣。可在治療完成時或中途獲得第二生 物試樣，其限制條件為至少—部分治療在第一與第二生物 试樣的分離之間進行。 ^通常可如上所述進行兩種試樣之培育㈣測程序。第二 試樣中之免疫複合物之數量相對於第—試樣有所減少指示 海帕西咬含量降低且反映治療成功。亦可以類似方式分析 c
J ^離血清耗西°定’且游離血清海帕西。定之減少指示治療 成功。 診斷方法或監控方法可適用 … 週用之海怕.定相關病症、炎性 疾病及鐵穩態疾病或病症包 ΛΓ ，丄 _ 不限於）非洲鐵過量症、 α地中海貧血症、阿茲海默 π α —分 員灰症、癌性貧血症、 fe性病負血症、炎性貧血 压 (包括& 動脈硬化或動脈粥樣硬化
Sr: :腦血管疾病或周邊閉塞性動脈疾幻、 共濟失調、與鐵有關之共濟失調 ） 癌症、血渡銅藍蛋白缺乏症 辱遞蛋白貝負血、 腎病"、一二貧…曼性腎/ 竭)、肝硬化、典型i色素二括末期腎病或慢性腎衰 炎（CIA)、海帕西 :正膠原蛋白誘發性關節 胞生成異常性貧 病狀、先天性紅細 病、鐵生物分布失 克羅恩氏病、糖尿 刀布失凋、鐵穩態失調症 轉運蛋白疾病、膜鐵轉運蛋白突變 ^谢㈣、膜鐵 乏症、弗里德里希& 素沈著症、葉酸缺 化里希氏共濟失調、索 候群、幽Η螺# p 如病、格拉希氏症 4菌感染或其他細菌感染、哈勒沃登·施 J28410.doc -127- 200900420 帕：欠病、血色辛；才签、片 + 色素:卢著广Γ/Γ 蛋白受體2突㈣起之血 肝、肝炎、肝炎（Br〇ck综合征）、c型 症二:：癌、海帕西咬缺乏症、遺傳性血色素沈著 症、病毒性疾病、亨廷，氏病、高鐵蛋白血 低色素性小紅血球性貧血、 症、妯播w分 血鐵過少症、抗胰島素 鐵缺多、，貝血症、缺鐵症、鐵過量症、海帕西咬過量之 ’載夬乏病狀、年輕型血色辛沈 症、轉鐵蛋白受體2、HFE =(:)、多發性硬化 ^ m^ 幼素、臈鐵轉運蛋白或其 因之突變、新生兒血色素沈著症、與鐵有關之 ”二"疾病、骨質減少、骨質疏鬆症、胰腺炎、泛酸 ^数酶相關之神經退化性疾病、帕金森氏症、癩皮病、異 於癖'紫質症、遲發性皮膚紫質症、假腦炎、肺血鐵質沈 ^症、紅血球病症、類風濕性關節炎、敗血病、鐵粒幼紅 、田胞I·生貧血、全身性紅斑性狼瘡症、地中海貧血症、中間 型地中海貧灰'輸血性鐵過量、腫瘤、血管炎、維生素恥 缺乏症、維生素B12缺乏症及/或威爾遜氏病。 設定對於診斷本文中所述之疾病病況之合適臨限值及如 中所述之預後L控的方法在此項技術中係熟知的。舉 例而言’使用相同方案相對於來自充分代表性數目之患病 個體（例如確認具有疾病或病狀之群體）之海帕西咬含量分 斤來自充刀代表性數目之正常個體（例如未偵測出病狀的 健康群體）之流體試樣中的海帕西咬含量。可確定使得區 分大多數正常群體與大多數患病群體之臨限值載止點。或 者，可根據資料確定陰性、不確定性及陽性結果之適用終 128410.doc -128- 200900420 點值。舉例而言，可確定包括大 但排除幾乎所古* — *群體之海帕西啶 應地，可確定包括大7之正常範圍（指示陰性結果）。相 區分患有炎:二Γ陽性結果)。同樣，可確定使得 性貧血症之群體中之海帕西σ定含量與患有缺鐵 屈之群體中之海帕西啶含臨 ^ 可指示患者患有炎 < 值。適用終點值 百犬性負血症、缺鐵性| 症。臨限值之合適炊 ；正或混5性貧血 k〜點值可經確定以優化 感性且考相 h特錢或敏 素包括實驗室測古::::二流行病學因素。欲考慮之因 值或高卜__ 是否有必要有高陽性預測 預測值以及疾病在測試群體令之流行率。 徵海㈣❹料抗敎轉用途 亦提< Q σ人類海帕西。定之海帕西。定活性拮抗 本文中所述之單抶浐神, 〈匕枯 早株抗體)用以治療有需要之個體的用途。 在例示性實施例中，該個體可能處於高海帕西咬含量、海 帕西°疋相關病症、鐵穩態失調症或貧血症風險之下或患有 海帕西啶相關病症、鐵穩態失調症或貧血症。 。 如本文中所用，"治療,，係指對於處於疾病或病症之風險 之下或具有患上疾病或病症之傾向之個體的預防性治療與 對於患有疾病或病症之個體的治療性治療。 在預防性方法中投與治療劑可發生在不當疾病或病症之 症狀表現之則’使得該疾病或病症得以預防或其進展得以 延缓。因此’當與預防性方法結合使用時，術語"治療有 效性”意謂在治療之後少數個體（平均）出現不當疾病或病症 128410.doc -129- 200900420 或症狀之嚴重程度出現進展。 當與涉及在個體表現疾或 治療性方法法人#用拉 Γ之症狀後投與治療劑的 之後術語”治療性有效性"意謂在治療 為達成治療目的，”哺乳動物上 善或消除。 動物&括人類、家畜及農畜以及動物園動物、競技動 物或玩賞動物，諸如狗、馬、猶 技動 為人類。 〜哺乳動物較佳 ί 如本文中所用，”海帕西啶相關 之昱堂沲以二—人 係才曰由破壞鐵穩態 帕西°定含量（例如相對W程度或所儲存鐵之 海帕西咬過量或海帕西咬缺乏） 邊存载之
Jb 〇 ΛΛ ^ At . 或/、其相關聯的病 鐵·破棱可反過來導致繼發疾病，諸如貧 各 性或忮性發炎病狀可引起海帕西啶表現上調，j ,t 7 環鐵含量降低且該循環鐵含貧血=可¥致循 貧血症惡化。例示性海帕西_==或使現有 症、慢性病貧血症、炎性貧血症=疾病包括癌性貧血 性腎病π期^日 療誘發性貧血症、慢 1竭L 1期、1殘或⑽）、末期腎病、慢性 …、充血性心臟衰竭、癌症、類風 性紅斑性狼瘡症、克羅因 尺全身 九 m疾、幽門螺旋桿菌 細讀感染、c型肝炎、HIV及 ：:、他 化、動Μ辦媒麻儿 母f生疾病、動脈硬 動脈粥樣硬化、肝硬化、胰腺炎、敗血病、血Μ 鐵缺乏、低色素性小紅血球性、 S火 及/每帕西σ定過詈、法助。 含語，，鐵穩^疾病(或病症)”係指個體鐵 需要·之病狀。其包括海帕西咬相關病症，·與高含 128410.doc •130· 200900420 量海帕西啶不相關然而將受益於海帕西啶活性抑制之病 狀，諸如不由海帕西啶所引起之鐵穩態破壞；當異常鐵吸 收、再循環、代謝或排泄導致正常鐵血液含量或組織分布 遭又破壞時所產生之疾病；當鐵失調為另—疾病或病狀 (諸士發《癌症或化療）之後果時所產生之疾病；由異常 鐵：：含量或組織分布引起之疾病或病症；及可藉由調節 —或刀布而/σ療之疾病或病症。可導致海帕西。定過量 之該等鐵穩態疾病或病症、海帕西咬相關病症及發炎病狀 2非限制(·生實例包括非洲鐵過量症、α地中海貧血症、吋 狄海’’、犬氏症、貧血症、癌性貧血症、慢性病貧血症、炎性 貧金症、動脈硬化或動脈粥樣硬化（包括冠狀動脈病、腦 血管疾病或周邊閉塞性動脈疾病）、共濟失調、與鐵 之共濟失調、益鏰值.典：ώ所分 "'、鐵傳遞蛋白貝貧血、癌症、血漿銅藍蛋白 /乏症化療誘發性貧血症、慢性腎/腎病（I、II、In、Ιν 2期)（包括，期腎病或慢性腎衰竭）、肝硬化、典型灰色 :::症、膠原蛋白誘發性關節炎(cia)、海帕西啶 (南海帕西口定）之、由办 丄 置 病狀、先天性紅細胞生成異常性貧血、 血性心臟衰竭、克羅恩氏病、糖尿病、鐵生物充 鐵穩離尖士苗产 料土仞刀邛失調、 運蛋白”^鐵代料亂、膜鐵轉運蛋白疾病、膜鐵轉 濟= 沈著症、葉酸缺…弗里德里希氏共 ;Γ €染、哈勒…帕茨病、血色= 正由轉鐵蛋白受體2突變 血:匕 病、肝炎、肝类❶ 巴I况者症、血紅素 火（h0ck綜合征）、c型肝炎、肝細 128410.doc -131 - 200900420 傳性血色素沈著症、Hlv 病、高鐵蛋白血症、低色素二扃^ 症、低色素、紅血球性貧血、血鐵過少 私 曰島素症、缺鐵性貧血症、缺鐵症、鐵過量症、海 帕西σ定過量之鐵缺彡，戌灿 ^ 海 年㈣血色素沈著症（咖2)、 多發性硬化症、轉鐵蛋白受體2、咖、血幼素、膜鐵轉 運蛋白或其他鐵代謝基因之突變、新生兒血色素沈著症、 與财關之神經退化性疾病、骨質減少1質《症1 广冑火、泛酸鹽激酶相關之神經退化性疾病、帕金森氏症、 癩皮病、異食癖、紫質症、遲發性皮膚紫質症、假腦炎、 肺血鐵貝/t積症、紅Α球病症、類風濕性關節炎、敗也 病、鐵粒幼紅細胞性貧血 '全身性紅斑性狼瘡症、地中海 貧血症、中間型地中海貧血、輸血性鐵過量、腫瘤、血管 炎、維生素B6缺乏症、維生素B12缺乏及/或威爾遜氏病。 與鐵調節破壞有關之非炎性病狀包括（但不限於）維生素 B6缺乏、維生素B12缺乏、葉酸缺乏症、癩皮病、索性脊 知病、假腦炎、巴金森氏病（Fasan〇等人，j 96.909 (2006)及Kaur等人，々心幺細…v，3:327 (2004))、阿茲海默氏症、冠心病、骨質減少及骨質疏鬆症 (Guggenbuhl等人，/价 16:18〇9 (2005))、血紅 素病及其他紅血球代謝病症（papanik〇iaou等人， 105:4103 (20〇5))及周邊閉塞性動脈疾病。 各種其他鐵指標及其濃度正常範圍列於表2中。 128410.doc -132- 200900420 表2 鐵指標 -^- 一 正常含量（範圍） 一一^- 血清鐵 50-170 pg/dL -， jk紅素 11.5-18 g/dL -^ ^- 血容比 37-54% ^ 紅血球計數(RBC) 4.6-6,2 X 1〇12細胞/公升(男性） 4.25-5.4 X 1〇12細胞/公升(如降、 平均紅血球血紅素量(MCH) 27-32 pg ~~――^1__________ 紅血球血紅素平均濃度(MCHC) 32-36% -------^^ 紅血球平均體積(MCV) 80-96 fL -----一 紅血球分布寬度(RDW) n·5-14·5%(電阻抗法)或10.2-11 8%(雷 網狀血球計數 18-158 X 1(Γ細胞/公升 (對於男性0.8-2.50/〇;斜於如|4〇8-40/。）___一· 總鐵結合力(TffiC) 250-450 pg/dL ~ -^ 一 轉鐵蛋白鐵飽和百分率(Tsat) 15-50% " 鐵蛋白 12-120 pg/L ' 葉酸 3-16 ng/mL(血清)及 130-628 ng/mL(紅血球） 維生素B12 200-900 pg/ml 患者之鐵指標含量超出表2中所列正常範圍指示該患者 可受益於使用海帕西啶活性拮抗劑之治療。因為海帕西啶 在鐵穩態中具有重要作用，所以海帕西σ定含量及活性將與 鐵穩態之破壞及/或鐵指標相關聯。高海帕西啶含量與低 於表2中所示正常範圍之血清鐵含量、低血紅素及血容 比、低或正常Tsat及高或正常鐵蛋白值、及c-反應性蛋白 (CRP)升高或其他發炎標記所測得之高發炎病況相關聯。 如本文中所用，短語海帕西。定活性拮抗劑之"治療有效 夏係指造成所需治療效應（亦即提供"治療功效”）之量。例 示性治療效應包括循環鐵含量增加或鐵利用性提高、紅血 球計數提高、紅血球平均細胞容積增加、紅血球血紅素含 量提高、血紅素增加（例如增加20.5 g/dL)、血容比提高、 Tsat提尚、網狀血球計數提高、網狀血球平均細胞容積提 128410.doc -133 - 200900420 或正㊉化、網狀血球血紅素含量提高、或血清或血漿中 之游離海帕西嘴含量降低、或上述參數之任-者正常化。 二匕類參數恢復至正常範圍不為治療功效所必需；舉例而 言，在正常方向上可測量之變化（提高或降低）可由臨床醫 師考慮為所需之治療效應。當用於個別活性成份單獨投與 時’該術語係指該單獨成份。當用於組合時，該術語係指 產生治療效應之各活性成份之組合f，無論是組合、連續
或同時投與。舉例而言’在海帕西。定活性拮抗劑（或海帕 西啶表現抑制劑）與紅血球生成刺激劑連合投與之態樣 中/α療有效量意指提高或正常化上述參數之任一者的組 合量。 為便於診斷患者，諸如圖9Β之決策樹可用於解釋海帕西 咬含量，且可心㈣❹者或解釋者決W療程及濃 度讀數之顯著性。預測海帕西咬值在具有炎症鐵過量及膜 鐵轉運蛋白疾病之患者中升高，在患有血色素沈著症、血 紅素病及其他紅血球病症之患者中受到抑制。圖9Β之決策 樹顯示海帕西啶含量之測量如何鳄仆楨 17間化懷疑患有鐵代謝病症 之患者的診斷及/或評估。圖9Α展千太τ、a，曰△ Μ Λ展不在不測量海帕西啶含 量之情況下的決策樹評估。 用於本文中所述之治療之組合物；^ 士七士 σ物及本文中所述之治療方 法可利用一或多種單獨使用或盥Α #、、Λ w λ人 X/、再他治療劑組合使用以獲 得所需效應的海帕西啶活性拮枋南u十^ 又 心柷劑（或海帕西啶表現抑制 劑）。 組合療法 128410.doc -134· 200900420 另外可有利地將兩種或兩種以上抗體（其結合於相同或 不同靶標抗原)共同混合或將本發明之抗體與第二治療劑 共投與以提供改良功效。同時投與兩種治療劑並不需要同 時或藉由相同途徑投與該等試劑，只要在該等試劑發揮其 治療效應期間的時段存在重疊即可。涵蓋同時或依序投 與，如在不同日或週投與。 在例示性實施财，本發明之方法包括投與單個抗體以 及不同抗體之組合《”混合物”。肖等抗體混合物可由於其 含有利用不同效應機制之抗體而具有某些優勢。該等呈組 合形式之抗體可展現協同治療效應。 尤其涵蓋使用海帕西啶活性拮抗劑(或海帕西啶表現抑 制劑)及紅血球生成刺激劑之組合療;去。在纟種實施例 中，海帕西咬活性拮抗劑（或海帕西咬表現抑制劑）及紅灰 球生成刺激劑可用於改善患m症之患者的治療。詳言 之’對尤其諸如紅血球生成素或其類似物(依泊依： 叮β、達貝泊叫之紅血球生成刺激#卜療法具有低反應性 (包括無反應)之患者將受益於使用海帕西啶活性拮抗劑或 海帕西咬表現抑制劑的聯合治療。在—實施例中，組合療 法包括使用至少一種結合於人類海帕西咬之抗體及至少一 種紅血球生成刺激劑的治療。 亦涵蓋使用海帕西錢性拮抗劑（或海帕㈣表現抑制 劑）及鐵聲合劑（使鐵儲存量於體内進行再分配）之组合療 螯合劑為能夠結合鐵且自組織或循環中移除鐵之試 1。實例包括去鐵胺（DeSferal®)及去鐵斯若（deferasir〇x) 128410.doc -135- 200900420 ㈣心㈣及去鐵酮（1，2_二甲基_3_經基吡咬斗嗣）。在一些 實施例中，海帕西咬活性拮抗劑（或海帕西咬表現抑制劑） 及紅血球生成刺激劑可用於改善患有繼發於輸血依賴性鐵 過量之鐵負荷病症或具有鐵分布不均病症（❹弗里德里 希氏共濟失調）之患者的治療。 如本文中所用，”紅血球生成刺激劑，，意謂直接或間接導 致紅血球生成素焚體活化（例如藉由結合於受體且導致受 體之二聚化或藉由刺激内源性紅血球生成素表現）之化合 物紅血球生成刺激劑包括結合於紅血_球生成素受體且活 化紅血球生成素受體之紅血球生成素及其變異體、類似物 或衍生物，結合於紅血球生成素受體且活化該受體之抗 體’或結合於紅血球生成素受體且活化紅血球生成素受體 之肽，或視情況分子量小於約丨000道爾頓且結合於紅血球 生成素欠體且活化紅血球生成素受體之小分子有機化合 物。紅血球生成刺激劑包括（但不限於）依泊汀α、依泊汀 β、依泊汀δ、依泊汀ω、依泊汀ι、依泊汀ς及其類似物、 聚乙二醇化紅血球生成素、胺甲醯基化紅血球生成素、模 擬狀（包括EMPl/hematide)、模擬抗體及HIF抑制劑（參見美 國專利公開案第2005/0020487號，其揭示内容以引用方式 全部併入本文中）。例示性紅血球生成刺激劑包括紅血球 生成素、達貝泊汀（darbepoetin)、紅血球生成素促效劑變 異體及結合且活化紅血球生成素受體之肽或抗體（且包括 美國專利申請公開案第2003/02 15444號及第2006/0040858 號中所報導之化合物，該等文獻中之每一者之揭示内容以 128410.doc -136- 200900420 引用方式全部併入本文中）以及如以下專利或專利申請案 中所揭示之紅血球生成素分子或其變異體或類似物，該等 文獻各自以引用方式全部併入本文中：美國專利第 f 4,703,008 號 5,618,698 號 5,767,078 號 5.830.85 1 號 6.030.086 號 6,583,272 號 6,750,369 號 第 5,441，868 號 第 5,621，080 號 第 5,773,569 號 第 5,856,298 號 第 6,310,078 號 第 6,586,398 號 第 5,547,933 號、第 第 5,756,349 號、第 第 5,955,422 號、第 第 5,986,047 號、第 第 6,391，633 號、第 第 6,900,292 號、第 第 7,084,245 號、第 第 7,030,226 號 7,217,689 號；PCT 公開案第 WO 91/05867 號、第 WO 95/05465 號、第 WO 99/66054號、第 WO 00/24893 號、第 WO 01/81405號、第 WO 00/61637號、第 WO 01/36489號、 第 WO 02/014356號、第 WO 02/19963號、第 WO 02/20034 號、第 WO 02/49673 號、第 WO 02/085940 號、第 WO 03/029291 號、第 WO 2003/055526號、第 WO 2003/084477 號、第 WO 2003/094858號、第 WO 2004/002417號、第 WO 2004/002424 號、第 WO 2004/009627 號、第 WO 2004/024761 號、第 WO 2004/033651 號
2004/035603 號、第 WO 2004/101600 號、第 WO 2004/101611 號、第 WO 2004/018667 號、第 WO 2005/001 136 號、第 WO 2004/043382 號 2004/101606 號 2004/106373 號 2005/001025 號 2005/021579 號
第 WO 第 WO 第 WO 第 WO 第 WO 第 WO 128410.doc •137 200900420
2005/025606 號 、 第 WO 2005/032460 號 第 WO 2005/051327 號 、 第 WO 2005/063808 號 第 WO 2005/063809 號 第 WO 2005/070451 號 、 第 WO 2005/081687 號 第 WO 2005/084711 號 、 第 WO 2005/103076 號 、 第 WO 2005/100403 號 第 WO 2005/092369號' 第WO 2006/50959號' 第 WO 2006/02646 號、第wo 2006/29094 號 ;及美國公開 案 第 US 2002/0155998 號 第 US 2003/0077753 號 > 第 US 2003/0082749 號 第 US 2003/0143202 號 、 第 US 2004/0009902 號 第 US 2004/0071694 號 、 第 US 2004/0091961 號 第 US 2004/0143857 號 、 第 US 2004/0157293 號 第 US 2004/0175379 號 % 第 US 2004/0175824 號 、 第 US 2004/0229318 號 X 第 US 2004/0248815 號 、 第 US 2004/0266690 號 第 US 2005/0019914 號 、 第 US 2005/0026834 號 > 第 US 2005/0096461 號 第 US 2005/0107297 號 第 US 2005/0107591 號 、 第 US 2005/0124045 號 > 第 US 2005/0124564 號 第 US 2005/0137329 號 第 US 2005/0142642 號 > 第 US 2005/0143292 號 、 第 US 2005/0153879 號 第 US 2005/0158822 號 、 第 US 2005/0158832 號 、 第 US 2005/0170457 號 > 第 US 2005/0181359 號 第 US 2005/0181482 號 > 第 US 2005/0192211 號 第 US 2005/0202538 號 ·> 第 US 2005/0227289 號 第 US 2005/0244409 號 、 第 US 128410.doc -138- 200900420 2006/0088906號、第 US 2006/0111279號。 紅企球生成素包括（但不限於）包含如SEQ ID NO: 72中所 示之胺基酸序列的多肽。SEQ ID NO: 72之胺基酸1至165 構成任何命名為依泊汀之分子（例如依泊汀α、依泊汀β、 依泊汀δ、依泊汀ω、依泊汀ι、依泊汀γ、依泊汀ζ及其類 似物）之成熟蛋白質。另外，依泊汀亦包括經一或多種水 溶性聚合物（諸如聚乙二醇（包括PEG-EPO-β))化學修飾的 上述依泊汀中之任一者。亦涵蓋與SEQ. ID NO: 72具有 65%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、 94%、95°/。、96°/。、97%、98°/。或 99°/。一致性且仍保持紅血 球生成活性之紅jk球生成素類似物。 重組性人類紅血球生成素之例示性序列、製造、純化及 用途描述於若干專利公開案中，包括（但不限於）Lin美國專 利4,703,008及Lai等人美國專利4,667,016，該等專利中之 每一者以引用方式全部併入本文中。達貝泊汀為在 rHuEPO之胺基酸序列中具有向兩種其他碳水化合物鏈提 供之五個變化的高糖基化紅血球生成素類似物。更特定言 之’達貝泊汀α在SEQ ID NO: 72之胺基酸殘基30及88處含 有兩種其他N-連接碳水化合物鏈。達貝泊汀及其他紅血球 生成素類似物之例示性序列、製造、純化及用途描述於若 干專利公開案中’包括Strickland等人，91/05867、Elliott 等人，WO 95/05465、Egrie 等人，WO 00/24893 及 Egrie 等 人，WO 01/8丨405，該等公開案之每一者以引用方式全部 併入本文中。天然存在或類似多肽之衍生物包括彼等經化 128410.doc -139- 200900420 學修飾以（例如）連接水溶性聚合物（例如《乙二醇化） 射性核種或其他診斷性或靶向性或治療部分之衍生物。 術語，，紅血球生成活性，，意謂如在活體内檢定（例如低氧紅 血球增生小鼠檢定）中所證明之刺激紅血球生成之活性、。 參見例如Cotes 及 Bangham，細 _ 191:1065 (1961)。 醫藥調配物之投與及製備 ( 在某些實施例中，可將用於實施本發明之方法之海帕西 啶活性拮抗劑或抗體調配於包含適合於所需輸送方法之載 劑的醫藥組合物中。合適載劑包括當與海帕西啶活性拮抗 劑或抗體組合時保持海帕西啶之高親和力結合性且不與個 體免疫系統反應的任何物質。實例包括（但不限於）若干標 準醫藥载劑（諸如無菌磷酸鹽緩衝生理食鹽水溶液、抑菌 水及其類似物）中之任一者。可使用多種水性載劑，例如 水、緩衝水、〇.4%生理食鹽水、〇 3%甘胺酸及其類似物且 可包括經受適度化學修飾之穩定性增強之其他蛋白質（諸 如白蛋白、脂蛋白、球蛋白等）或其類似物。 調配物中之例示性抗體濃度可介於約〇1 mg/ml至約18〇 mg/ml或約(M mg/mL至約 5〇 mg/mL、或約 〇 5 mg/mL至約
25 mg/mL或者約2 mg/mL至約1〇 rng/mL之範圍内。可在pH 緩衝溶液中（例如在pH值範圍介於約4·5至約6.5或約4·8至 約5.5或者約5.〇時）製備抗體之水性調配物。適合於此範圍 内之pH值之緩衝液的實例包括乙酸鹽（例如乙酸納）、丁二 酸鹽（諸如丁二酸鈉）、葡糖酸鹽、組胺酸、檸檬酸鹽及其 他有機酸緩衝液。緩衝液濃度視（例如）緩衝液及調配物之 128410.doc -140- 200900420 m!V[至約200 mM或約1〇 mM至約60 所需專渗性而可為約1 mM。 亦可使抗體穩定$ .、会、* 之 <> 透劑可包括於調配物中。例示性滲 透劑包括多元醇，諸如甘露糖醇、蔗糖或海藻糖。儘管高 或低合液可為合適的，但水性調配物較佳為等滲的。 調配物中之多元醇之例示性濃度可介於約1 w/v%至約15 w/v%之範圍内。 f
亦可將界面活性劑添加至抗體調配物中以降低所調配抗 體之聚市且/或最小化微粒於調配物中之形成且/或降低吸 附。例示性界面活性劑包括非離子界面活性劑，諸如聚山 梨醇知（例如聚山梨醇酯20或聚山梨醇酯80)或泊洛沙姆 (P〇1〇XamerS)(例如泊洛沙姆1 88)。界面活性劑之例示性濃 度可介於約o.ool w/v%至約0·5 w/v%或約〇 〇〇5 w/v%至約 0.2 w/v%或者約〇·0〇4 w/v%至約〇 〇1 w/v%之範圍内。 在一 Λ把例中，調配物含有以上所確定之試劑（亦即抗 體、緩衝液、多元醇及界面活性劑）且基本上不含一或多 種防腐劑，諸如苄醇、苯酚、間曱酚、氣丁醇及苄索氣銨 (benzethonium C1)。在另一實施例中，防腐劑可（例如）以 範圍介於約0.1%至約2%或者約0.5%至約〖％之濃度包括於 調配物中。一或多種其他醫藥學上可接受之載劑、賦形劑 或穩定劑（諸如彼等描述於Remingt〇n，s pharmaceuticaI Sciences第16版’ Osol，A.編（1980)中者）可包括於調配物 中’其限制條件為其並未不利地影響調配物之所需特徵。 可接受之載劑、賦形劑或穩定劑在所用劑量及濃度下對受 128410.doc 141 200900420 體無毒性且包括··其他緩衝劑；共溶劑；抗氧化劑，包括 抗壞血酸及甲硫胺酸；螯合劑，諸如EDTA ;金屬複合物 (例如Zn-蛋白複合物）；可生物降解聚合物，諸如聚酯；及/ 或鹽形成性平衡離子，諸如鈉。 藉由使具有所需純度之抗體與可選生理上可接受之载 ^、賦形劑或穩定劑（Remington's Pharmaceutical Sciences f.
第版〇s〇l，A，編（1980))混合來製備海帕西π定活性拮抗 劑或抗體之/σ療凋配物以便呈凍乾調配物或水溶液形式儲 存。可接又之載劑、賦形劑或穩定劑在所用劑量及濃度下 對受體無毒性且包括：緩衝液，諸如賴鹽、檸檬酸鹽及 ,、他有機自夂]几氧化劑，包括抗壞血酸及曱硫胺酸；防腐 劑(諸如十八烷基二甲基苄基氣化銨丨氯化六羥季銨；氯 苄烷叙、苄索氣銨；苯酚、丁醇或苄醇；烷基對羥基苯甲 酸酉旨’諸如對經基苯甲酸曱醋或對經基笨甲酸丙_ ;兒茶 恥，Ρ曰1苯一酚，環己醇；3_戊醇；及間曱酚卜低分子量 (低於約1 〇個殘基)多肽；蛋白質，諸如血清白蛋白、明膠 :免疫球蛋白；親水聚合物，諸如聚乙烯吡咯啶酮；胺基 -夂諸如甘胺酸、麵胺酿胺、天冬醯胺酸、、组胺酸、精胺 酸或離胺酸；單醣、雙酶及其他碳水化合物，包括葡萄 :甘路糖、麥芽糖或糊精；冑合劑，諸如edta ;糖 ^諸如薦糖、甘露糖醇' 海藥糖或山梨糖醇；鹽形成性 ^衡離子，諸如鈉，金屬複合物（例如a.蛋白複合物）；及/ 或非離子表面活性劑，諸如TWeentm、plur〇nicstm或 聚乙二醇（PEG)。 128410.doc -142- 200900420 在一實施例中，合適調配物含有與滲透化且穩定化之滲 透劑（諸如多元醇、山梨糖醇、蔗糖或氣化鈉）組合之等滲 緩衝液（諸如磷酸鹽、乙酸鹽或TRIS緩衝液）。該滲透劑之 實例為5%山梨糖醇或蔗糖。此外，調配物可視情況包 括界面活性劑以便防止聚集且穩定在〇 〇1至〇 〇2重量/體積 %下。調配物之pH值可介於4.5_65或45_5.5之範圍内。抗 體之醫藥調配物之其他例示性描述可見於仍 2〇〇3/oU3316及美國專利第6，171，58ό號中該等專利各自 以引用方式全部併入本文中。 本文中之調配物亦可含有一種以上為所治療之特定適應 症所必需的活性化合物，較佳含有彼等具有彼此並無不= 和:之互補活性的活性化合物。舉例而言，可能需要進一 步提供免疫抑制劑。該等分子適當以組合形式以對所欲目 標有效之量存在。 亦可（例如）分別藉由凝聚技術或界面聚合將活性成份包 埋於所製備之微膠囊（例如羥甲基纖維素或明膠微膠囊及 聚_(甲基丙烯酸甲酯）微膠囊）中，包埋於膠狀藥物輸送系 、’先(例如脂質體、白蛋白微球體、微乳液、奈米顆粒及奈 米囊^ )或巨乳液中。該等技術揭示於Remington's Phamaceutleal Seienees，第 16版，〇喊 a 編（i98〇)中。 、亦涵皿抗體之懸浮液及晶體形式。製造懸浮液及晶體形 式之方法為熟習此項技術者已知。 欲用於法W H _ 直内技藥之調配物必須為無菌的。在—此 例中，本路日日4 " 、·且合物可藉由習知熟知殺菌技術殺菌。舉 128410.doc -143 - 200900420 J二:易於精由經由無菌過濾膜進行過濾來實現手… :斤㈣可經封装以供使用或在無菌條=囷。 在投與之前_製劑與無菌溶液組合。 ；東乾， 通常使用冷凍乾燥過程以穩 當多肽在液體袓人你^ 便長期儲存，尤其 由三步組成：冷凌、 a 7果钇各循％通常 及p〇Ili '人乾燥及第二次乾燥；Williams ί 38卷，g2T二。f〜⑽㈣1_如11。1^，第 液直至=休59頁（1984)。在冷❹驟中，冷卻溶 二並 分冷凍。在此步驟時溶液中之體積水形成冰。 曰由使用真空降低腔室壓至低於冰之蒸氣壓來進行之第 一次乾燥階段冰昇華。最終，在第二次乾燥階段在低腔室 壓及高存放溫度下移除吸附水或結合水。該過程產生稱為 凍乾塊之物質。此後可在使用之前將該塊復水。 儘管抗菌劑之稀溶液有時用於產生用以非經腸投藥之藥 物仁凍乾物質之標準復水規範為添回大量純水（通常相 當於在冷；東乾燥期間所移除之體積）；Chen, DrUg
Development and Industrial Pharmacy ,第 18卷，第 11 及 12 期，第 1311-1354頁（1992)。 在某些情況下已指示賦形劑充當凍乾產物之穩定劑； Carpenter 等人，Developments in Biological
Standardization，第 74 卷，第 225-239 頁（1991)。舉例而 言’已知賦形劑包括多元醇（包括甘露糖醇、山梨糖醇及 甘油）；糖（包括葡萄糖及蔗糖）；及胺基酸（包括丙胺酸、 甘胺酸及麩胺酸）。 128410.doc -144- 200900420 此外，多元醇及糖亦诵赍田 吊用以保護多肽免於冷凍及乾燥 所引發之損傷且以乾燥狀態增強健存期間之穩定性。—般 而言，糖(詳言之雙，)在冷康乾燥過程中與在儲存期間為 有效的。亦報導其他_之分子（包括㈣及㈣及諸如 PVP之聚合物）作為凍乾製品之穩定劑。 為用於注射，醫藥調配物及/或藥物可為適合於以如上 所述之適當溶液復水之粉末1等實例包括（但不限於）冷
柬乾燥、旋轉乾燥或噴霧乾燥粉末、非晶形粉末、顆粒、 沈澱物或微粒。為用於注射’調配物可視情況含有穩定 劑、PH調節劑、界面活性劑、生物可用性改質劑及該等試 劑之組合。 可製備持續釋放性製劑。持續釋放性製劑之合適實例包 括含有抗體之固體疏水性聚合物的半透性基質，該等基質 呈成型物品形式，例如薄膜或微囊。持續釋放性基質之實 例包括聚酯、水凝膠（例如聚（2_羥乙基_甲基丙烯酸酯）或 聚（乙稀醇））、聚乳酸交酯（美國專利第3,773,919號）、L-麵 胺酸與γ乙基-L-麩胺酸酯之共聚物、不可降解伸乙基_乙酸 乙烯酯、諸如Lupron Depot™(由乳酸_乙醇酸共聚物及 乙酸梵丙瑞林（leuprolide acetate)組成之可注射性微球體） 之可降解乳酸-乙醇酸共聚物及聚-D-(-)-3-羥丁酸。儘管諸 如伸乙基-乙酸乙烯酯及乳酸-乙醇酸之聚合物能夠經1〇〇天 釋放分子’但某些水凝膠經更短時限釋放蛋白質。當膠囊 化抗體長時間保留於身體内時，其可由於暴露於37^下之 濕氣而變性或凝集從而導致生物活性喪失及免疫原性可能 128410.doc -145- 200900420 之變化。可視所涉及之機制而設計合理方案以便穩定化。 舉例而言，若發現聚集機制為經由硫代二硫化物互換而形 成分子間S--S鍵，則可藉由修飾硫氫基殘基、凍乾酸性溶 液、控制水份含量、使肖適當添加劑及產±特冑聚合物基 質組合物來實現穩定化。 在某些實施例中’本發明之調配物可經設計成短效、快 速釋放、長效或如本文中所述之持續釋放。因此，醫藥調 配物亦可經調配以便控釋或緩釋。 組合物之治療有效量將變务 肝支化且視疾病之厭重程度及欲治 f 療之個體之體重及全|~工a y , 王身狀况而定，但通常介於每次施用約 1_0 Kg/kg至約 100 s ^ KgA 約 10 pg/kg至約 30 mg/kg或約 〇」 mg/kg至約 l〇 mg/kg岑約]w n n g次約1 mg/kg至約10 mg/kg體重之範圍 内。可根據需要視病症古，忘灿+ G π y /正次病狀之反應及個體對療法之耐受 f·生而母日&日、母週、每月兩次、每月或在頻率上更多 或更少投樂。可需要經較長時間（諸如4、$、6、7、8、 或12週或更長時間_ 曰 )之、，隹持劑董直至病症症 發生且可根據需要調節厅為抑制 ^ ^ ^ ^ θ里療法之進展易於藉由習知 技術及檢定加以監控。 9 $ 性別及飲食、投率心之年齡、體重、全身健康狀況、 間隔時間、投藥途徑、排出率及筚&έΒ 合而調節特定劑量。含 手及老物組 有有效置之以上劑型之任一者較# 處於常規實驗之範圍 可孕乂佳 益…X 因此較佳處於本發明之範-内 猎由任何合適方彳八 、乾可内。 八王身或局部投與海帕西嗦 或抗體，該等方式七4 疋活性拮抗劑 々式包括經由非經腸、皮τ、 又r 腹膜内、肺内 1284W.doc -146- 200900420 及：内且若局部療法需要，則進行病灶 -包括靜脈内、動脈内、腹膜内、非丄腸途 外，可嗝木益山e h鞘内投藥。此 卜了適·精由脈搏注射尤其以特異性結合 :減劑量投與特異性結合試劑或抗體。較佳藉由二 =脈内或皮下注射(部分視投藥是否為暫時性㈣續性 :)進行投藥。涵蓋其他投藥方法，包括表:(1;: 經直腸、經„或局部投藥，例如經由安置 f' 、斤“位附近之導管。在某些實施例 0 m η 以範圍介於 〇 W mg/kg至⑽mg/kg之劑量以範圍介於每日至 月（例如母天、每隔—天、每隔兩天或每週]、3、4 °、 次)之頻次，較佳範圍介於_45 mg/kg、〇i至 二 ，0.1至10 mg/kg之劑量以每週2或3次之頻次或—月一 4 g ::mg/kg靜脈内投與呈生理溶液形式之本發 ：： 結合試劑或抗體。 寸”性 VIII.診斷及治療套組 =方便起見，可以套組（亦即預定量之試劑與進行 Μ之用法說明書之封裝組合）形式提供 BA Mi , 八T尸汀揭不之 二體。虽抗體經酶標記時’該套組將包括酶所需之受質及 因子（例如提供可偵測發色團或螢光團之受質前驅體）。 衝液。ν= = Γ::，諸如穩…緩衝 衝夜1胞級衝液）及其類似物。各種試劑之相 很大程度上變化以提供大體上優化檢 f :濃度。特定言之，該等試劑可以包括賦形劑二 ^東乾）形式提供，該等乾粉呈溶解時將提供具有合適= 128410.doc -147· 200900420 度之試劑溶液。 亦提供適用於多種診斷檢定（包括例如免疫檢定，諸如 ELISA(爽心式或競爭形式））之診斷試劑及包含—或多種該 等試劑之套組。在某些實施例中，該等套組可包括至少二 種本發明之第-肽（視情況為如本文中所述之經正確摺疊 成熟海帕西啶標準物）或第一抗體或抗原結合片段、其功 能性片段或其混合物及產生信號之構件。當使用該套组時 套組之組份可經預先附著於固體支撐物上或可經塗佈於固 體支#物之表面上。在某些實施例中，信號產生構件可盘 本發明之抗體預先相關聯或可需要在使用前與—或多種組 伤（例如緩衝液、抗體_酶結合物、酶受質或其類似物）組 U套組亦可包括其他試劑，例如用於降低對固相表面之 非特異結合性的阻斷試劑、洗蘇試劑、酶受質及其類似 、口相表面可壬官、珠粒、微量滴定盤、微球體或其他 適二於固义蛋白質、肽或多肽之物質之形式。較佳，催化 干發光或顯色產物形成或化學發光或顯色受質降低之 ::言號產生構件之組份。該等酶在此項技術中係熟知的： 情況該套以S所述之捕捉劑及㈣試劑之任一者。視 、、且亦可包含實現本發明之方法之用法說明書。 亦提供一絲4 a 曰 。定活性拮抗裝於容器(諸如小瓶或航)中之海帕西 劑且進或海帕西啶表現抑制劑)及紅血球生成刺激 標籤描述：i含附著於或封裝於容器上之標籤的套組，該 之内容物治：：：容：且提供適應症及’或關於使用容器 摩如本文中所述之一或多種疾病病況的用法說 I28410.doc -148- 200900420 明書。 在一態樣中，該套組係用於治療與 ^ 關聯之病症且包含海帕西啶3量升高相 抑制劑)及紅血球生成刺激劑。：;=(或海帕…現 括用於經口或非經腸(例如靜脈内):::=進-步包 中，該套組包含海帕西❹性/=之鐵°在另一態樣 制劑）及附著於或封裝於容^U海帕西°定表現抑 西啶活性拮抗劑(或海帕：：：’該標籤描述海帕 激劑之用法。在另表現抑制劑）與紅血球生成刺 甘力 悲樣中，該峑έ日勹A , 劑及附著於或封裝於容器上之3紅血球生成刺激 成刺激劑與海帕㈣活性1 ^錢描述紅血球生 之用法。在某些實施例中 西啶表現抑制劑）及紅 疋活性括抗劑（或海帕 立小瓶形式或共同…^刺激劑及(視情況)鐵係呈獨 中，海…活—醫藥組合物中。在另-態樣 單個醫藥組合物形^ Γ 西咬表現抑制劑）與鐵以 刺激劑與鐵以單個醫藥:合例中’紅血球生成 如以上组合療法音铲 不需要同-時間或^所討論，同時投與兩種治療劑並 等試劑發揮^療2间―途徑投與該等試劑，只要在該 /、〆〇療效應期門 同時或依序投與，如Γ 間上之重疊即可。涵蓋 亦可製備本文中所揭不：曰或週投與。 中所揭示之抗體、肽、療及诊斷套組，其包含本文 者及使用組合物 結合片段或聚核转之至少- ‘、、’ ^斷試劑或治療劑之用法說明書。適 128410.doc -149. 200900420 用於該等套組之容器可通f包含 ^ ,, 彳固小瓶、試管、嫜 瓶、瓶、注射器或其他合適容器， 入铷夕,^ ^ 该（荨）診斷及/或治療組 物之一或夕者可置於其中且較佳適當等分於其中。告亦 提供第二治療剤時，該套組亦 ,弟一不同容器，此第
一矽斷及/或治療組合物可置於I /( Α τ 或者，可將複數種 化曰物製備成單個醫藥組合物且 竹其封裝於早個容器構 件（諸如小瓶、燒瓶、注射哭、
瓶或其他合適單個容器） 。本發明之套組通常亦將包括以緊密封閉方式含㈣ ⑷小瓶以便商業鎖售的構件，諸如該(等)所需小瓶保留 於其中之注射或吹塑容器。當放射性標記、產色、榮光生 :或其他類型之可谓測標記或债測構件包括於該套組中 時’可將標記試劑提供於與診斷或治療組合物本身相同之 容器中或可將其或者置於第二不同容器構件中，此第二組 合物可置於且適當等分於該第三不同容器構件中。或者， 可將偵測試劑及標記製備於單個容器構件中且在大多數情 况下’該套組通常亦將包括以緊密封閉方式含有該⑷小 瓶以便商業銷售及/或便利封裝及輸送之構件。 亦提i、Λ現本文中所述之診斷或監控方法之器件或裝 置。該裝置可包括一試樣可輸入其中之腔室或管、—流體 處理系統（視情況包括使該試樣直接流至該器件之閥門或 泵視情況自血液中分離血漿或血清之過濾器、用於添加 捕捉浏或偵測试劑之混合室）及（視情況）一用於偵測與捕捉 劑免疫複合物結合之可偵測標記之量的檢測器件。試樣可 為被動式流動（例如藉由毛細管、靜水或一旦施用於試樣 128410.doc •150· 200900420 ，並不而要進—步操作器件之其他力）或主 藉由施加經由機械 一 J机動（例如 之力）或藉由主動力力壓所產生 力與破動力之組合而流動。 在相關實施例中， 枝六认 亦棱供一處理器、一電腦可讀内在乃 一儲存於計算機可福 貝内存及 ,,., °貝内存上且適合於在處理器上執行以^ 成本文中所述之太、1 , 讯仃以几 方法之任一者及/或以計算結果形式得 海帕西啶之偵泪,丨人曰 个^八仔到 + ~ 3罝及認為”正常”之臨限值位準之g π # 或範圍使得在"正當 +之L限值 之-或多者相Μ Μ 3讀如本文巾所述之病狀 ㈣。在某些實施針 進-步k供含有完成類似功 讀介質。人嚅4T斤次㊉用私序的電腦可 電腦服二 系統、環境及/或組態之實例包括個人 Γ二器電腦、手持式或膝上型設備、多處理機系 、'先、基於微處理播夕会β 機之系、·充、視訊轉接器、可編程消費者電 口又備網絡P c、迷作钟笞擁 丄 纟栈、大型計算機、包括以上系 統或设備之任—者八々 刀式计异環境或此項技術中已知之 任何其他系統。 海帕西咬活性抬抗劑之非治療用途 用於^斤揭不之杬體可用作靶標抗原之親和純化試劑或 抗原之診斷檢定中，例如價測其於特定細胞、組 =血：：中之表現。該等抗體亦可用於活體内診斷檢定。 如&而°99’為了達到該等目的，將抗體以放射性核種（諸 如 In、99tc、】4Γ、131 125 # Η、32卩或35S)標記以便可 免疫閃燦攝影術定位位點。 本文中所揭示之抗體可用於任何已知檢定方法，諸如競 128410.doc -151 - 200900420 爭性結合檢定、直接及間接夾心檢定（諸如ELisA)及免疫 沈殿檢定。Zola，Monoclonal Antibodies : A Manual of Techniques，第 147-158 頁（CRC Press, Inc. 1987)。該等抗 體亦可用於免疫組織化學分析以便使用此項技術中已知之 方法標記細胞試樣。 實例 實例1--自尿純化海帕西啶 與/6 ·人類海帕西咬係自敗血病患者之尿（經金黃色葡 萄球囷（*S. 及肺炎鍵球菌（s. 感染，商業 上獲得且使用由 Park等人，Journal Biol. Chem.，276:7806-7810，2001所描述之方法純化）中分離。簡言之，將約2 L 冷凍尿融解且經0.45及0.22 μ過濾器過濾，且裝填於10 mL 柱床體積CM macroprep(BioRad)管柱上且使其與流速為每 小時80 mL之PBS平衡。將管柱以PBS洗滌直至溶離劑之 〇D280低於〇· 1。將海帕西咬以5%於水中之乙酸溶離。因為 溶離劑含有數種其他肽，所以將該物質進一步藉由RP-HPLC(C18)使用含有〇.1〇/0 TFA之乙腈相對於0.1% TFA水溶 液之梯度純化。使用質譜儀分析含有海帕西啶之Hplc溶 離份。 尉量允.·在Agilent 11 00高效液相層析（HPLC)系統上使 用來自 Antek Instruments(Houston，TX，USA)16 之 7000 型 CLND氮特異性偵測器進行clND分析。於Agilent C3逆相 管柱（5 μηι，0.2 cmx5 cm)上使用緩衝液B相對於A之線性 梯度（A=0.〇4% TFA 水溶液；B =含有 0.04% TFA 之 MeOH)、 128410.doc -152- 200900420 0-80¾ B經14分鐘以〇·5毫升/分鐘之流速實現層析分離β CLND條件為i〇5〇°c熱解溫度、ρμτ電壓700 V、範圍25 X 及檢測态輸出1 V ;在214 nm下偵測UV吸光度。使用溶解 於DMSO中之咖啡鹼標準物（99%，Sigma_Aiddch)(標準 物：8、80、160、320、640、1280、1920 及 4480 奈克（ng) 氮專效物）製備CLND反應校準曲線。將海帕西α定試樣溶解 於已知體積之（50% MeOH/H2〇)中且由CLND反應與海帕西 咬注射體積及氮計數之數學相關性來確定濃度。此方法用 於量化所有後續海帕西啶製備方法。 實例2--CHO源性重組人類海帕西咬（rhjjepc)表現及純化 藉由使用包含SEQ ID NO: 1 〇 1並編碼人類原海帕西啶 (SEQ ID NO: 1 02)之DN A轉染AM-1/細胞週期蛋白D中國倉 鼠卵巢（AM-1/D CHO)細胞（參見美國專利第6,210,924號， 其以引用方式全部併入本文中）來穩定表現人類海帕西 咬。根據製造商建議使用Lipofectamine™ 2000(LF2000)試 劑（Invitrogen Corporation, Carlsbad，CA)進行轉染。簡言 之，將4xl06個AM-1/D CHO細胞在轉染於i〇〇_mm直徑塑 料 BD-Falcon™ 皮氏（Petri)培養皿（BD Biosciences，Bedford, ΜΑ)中之前塗佈於1 〇 mL補充以5%胎牛血清、1 χ青黴素-鏈 黴素及麩醯胺酸（Invitrogen)、非必需胺基酸（invitrogen)、 丙酮酸鈉及次黃嘌呤鈉/胸苷（HT)補充劑（lnvitr〇gen)之達 爾伯克改良伊格爾培養基（Dulbecco's Modified Eagle's
Medium)(D-MEM，Invitrogen)中歷時24小時。將約30 pg 人 類原海帕西啶質體DNA使用限制酶pvu i(New England 128410.doc -153 - 200900420
Biolabs，Inc.，Ipswich, ΜΑ)線性化且稀釋於 2 mL
OptiMEM(Invitrogen)中。將經稀釋之DNA與稀釋於2 mL
OptiMEM中之75 pL LF2000混合且將混合物在室溫下培育 20分鐘。將DNA-LF2000混合物添加至細胞中且培育隔夜 以供轉染。在第二天，添加新鮮生長培養基且將細胞在3 7 。(：下以5% C〇2培養48小時且隨後以1:20及1:50之稀釋度塗 佈於HT選擇培養基中。 在轉染之後約2週，存活細胞為藉由極限稀釋選殖於％ ( 孔板中之單細胞。使用抗原海帕西°定多株抗體測定純系之 海帕西啶表現。基於西方分析，擴增純系丨丨8_34以供大規 模產生。將約2-3 X 107個細胞用以接種一個c〇rning⑧
CellBIND® 850 cm 聚本乙烯滾瓶（Corning Incorporated
Corning，NY) ’且隨後使細胞以1:1〇擴增。將各滾瓶以25〇 mL高葡萄糖DMEM、10%經透析胎牛血清（FBS)、ιχ麵酿 胺酸、lx非必需胺基酸及lx丙酮酸鈉（皆來自Invitr〇gen)接 . 種。將1 0% C〇2/平衡空氣於培養基中鼓泡2-3秒，隨後封 、 閉各滚瓶。將滚瓶在37°C下以0.75轉數/分（rpm)旋轉之輥 请架培育。當該等細胞為約85-90%長滿率時（在培養約 天之後），丟棄生長培養基且將該等細胞以1〇〇 mL磷酸鹽 緩衝鹽水（PB S)及200 mL生產培養基洗滌，該生產培養基 由50% D-MEM/50% Ham’s F12、lx麩醯胺酸、lx非必需胺 基酸、lx丙酮酸鈉（全部來自匕…⑺以幻及15〇/〇二曱亞砜 (Sigma-Aldrich，St. Louis，M0)組成。 將含有人類海帕西啶之改良性培養基每7天採集一次且 128410.doc -154- 200900420 隨後經0.45/0.1 μηι乙酸纖維素過濾器（corning
Incorporated)過慮於 10 ml柱床體積 CM macroprep(BioRad) 管柱上，且與流速為每小時80 ml之PBS平衡。將管柱以 卩38洗蘇直至溶離劑之〇〇28()低於〇,1。將海帕西11定以5%於 水中之乙酸溶離。藉由分析性RP-HPLC(C4管柱）檢定CM 溶離份。偵測具有一内片之rhHepc 25、rhHepc 24、 rhHepc 22、rhHepc 21、rhHepc 27 及 rhHepc 24。將合併 CM裝填於半製備性C4 Vydac管柱（10X250 mm)上。將溶離 份收集且藉由分析性RP-HPLC/MS檢定。根據靜質量及滯 留時間合併rhHepc 25溶離份。 實例3 —大腸桿菌源性重組人類海帕西啶表現及再摺疊 將包含SEQ ID NO: 1 0 1並編碼人類原海帕西啶（seQ ID NO: 102)之DNA表現於大腸桿菌中。在培養之後，將細胞 藉由離心收集’藉由微流化劑溶解且洗條。將來自大腸桿 菌糊狀物之包涵體以1:1 〇之重量與體積比在室溫下溶解於 ό Μ鹽酸胍、50 mM Tris-HCl、6 mM DTT(pH值為 8.5)中 1 小時。隨後將混合物以1:25在4°C下稀釋於2 Μ尿素、50 mM Tris-HCl、160 mM精胺酸' 3 mlV[半胱胺酸（pH值為 8,5)中並攪拌3-4天。將該溶液藉由0.45 μΜ過濾淨化且引 至5 mM檸檬酸鹽中，隨後使用濃HC1降低ρΗ值至3.〇。以3 MWCO膜進行1〇倍濃縮且與2 μ尿素、5 mM檸檬酸（pH值 為3.0)交換緩衝液。再次將混合物藉由離心淨化且以Na〇H 調節至pH值為4.5，隨後裝填於S-ΗΡ管柱。將管柱以20 mM乙酸鈉、25 0 mM NaCl、2 Μ尿素（pH值為4.5)運作。運 1284I0.doc -155- 200900420 作達750 mM NaCl之梯度，同時藉由RP-MS檢定溶離份且 根據預期質量及滯留時間合併。藉由以經由添加每mg原海 帕西咬3 mU蛋白酶所獲之Kex蛋白酶培育而酶促分解蛋白 質之前區段。將混合物在室溫下於包含30 mM TRIS(pH值 為7.0)及5 mM CaCh之緩衝液中培育1.5小時。將合併物再 次使用逆相HPLC純化。 實例4—海帕西啶之化學合成、純化及特性化 使用 ABI433 合成儀（Applied Biosystems，Foster City, CA)採用使用ι·〇 M N，N’-二環己基碳化二亞胺（DCC)/1-羥 基苯并三唑水合物（Η0ΒΤ)(1··1)偶合化學處理與N-曱基-吡 11各啶酮（ΝΜΡ)及20%(ν/ν)哌啶/ΝΜΡ去保護化學處理的Να-Fmoc/側鏈 Au正交保護策略（E. Atherton及R.C. Sheppard， Solid Phase Peptide Synthesis: A Practical Approach, IRL Press, Oxford, 1989)化學合成人類海帕西啶肽序列（肩_ DTHFPICIFCCGCCHRSKCGMCCKT-游雜瘦，SEQ ID NO: 9)。將單胺基酸偶合循環（1 mm〇i標度）用於合成，且由58 分鐘偶合時間及3+15分鐘？111〇(>去保護時間組成。將卩111〇(>
ThifBi^-Wang 樹脂（0.12 mmol 當量標度，Novabiochem)用 於合成。將下列側鏈保護策略與Na-Fmoc-保護胺基酸 (Novabiochem)—起使用：AspfBu)、Asn(Trt)、Gln(Trt)、 ThrfBu)、His(Trt)、Cys(Trt)、Arg(Pbf)、SeifBu)及 Lys(Boc)。繼樹脂上鏈裝配及移除^末端Fmoc基團之後， 將經側鍵保5蒦及树脂結合之人類海帕西σ定狀衍生物以二氣 甲烷（DCM)洗滌且乾燥。藉由以總體積為2〇 mL之三氟乙 128410.doc -156- 200900420 酸（tFA)/H2〇/三異丙基矽烷（TIS)/3,6•二氧雜_丨，8·辛烷_二 硫醇（D〇DT)(v/v為92.5 :2.5:2,5:2· 5)之新近製備的混合物在 緩慢攪拌（通常2至3小時）下處理來實現側鏈去保護及自固 體支撐物分解。將溶液過濾以移除聚合固體支撐物且隨後 4發。將殘餘物以冰冷乙醚（5〇 mL)處理且將沈澱肽藉由 離心（在2,000 rpmT10分鐘）收集，隨後傾析醚溶液且在真 空中乾燥該肽。 將乾燥肽在攪拌及超音波處理下於純TFA(2 mL)中複 配，且隨後在攪拌下逐滴稀釋於由6 值為4 5)與6 MEW0.5 M Tris/20 mM EDTA(pH^ ^ 8.5)^ 1:1 .ta ^ ^ t ^ 的新鮮緩衝溶液（100 mL)中。將Tds(2_羧基乙基）膦鹽酸鹽 (TCEP，1 mmol)添加至溶液中且攪拌2小時。隨後將經縮 減之含有人類海帕西啶的溶液裝填於phen〇menex … 10 μηι 300 A C18 250x21.2 mm管柱上以便製備性純化。使 用含有0.1% TFA之乙腈相對於〇 1% TFA水溶液之線性梯度 實現層析分離。溶離梯度法為在2〇毫升/分鐘之流速下1〇= 25% B歷時Η分鐘，接著25_4〇% B歷時％分鐘。藉由 LC/MS 分析使用 Waters Acquity UpLCLCT p隨^ 系統（z_ 喷霧電離偶合飛行時間（TOF)質譜儀；管柱：八糾⑽
Eclipse XDB-C18 2_ 1x50 mm，1.8 mm)鑑別含有預期分子 貝里之經縮減人類海帕西啶及低於30%之任何其他質量可 偵測之雜質的溶離份且加以合併。滞留時間（Rt)=5 ,a分 鐘 ’ C113H178N34〇3lS9，計算分子量=2795 〇9 Da(單—同位 素）’實驗觀測分子量=2795·7〇 Da。隨後將集合溶離份以 128410.doc -157- 200900420 水及乙腈稀釋至i L以提供25%(v/v)之近似最終乙腈組合 物。在麩胱甘肽/二硫化麵胱甘肽（GSH/GSSG)氧化還原系 統（300 mg GSSG及152 mg GSH)存在下在pH值為 8_0〜8.3(經28-30% NH4OH調節之溶液，Baker)時伴以50-60 RPM攪拌實覌二硫鍵形成歷時ι6_24小時。由分析性 LC/MS監控二硫鍵形成之進展。 在16-24小時摺豐之後，隨後將含有人類海帕西σ定之溶 液以純TFA調節至pH值為2且蒸發乙腈溶劑組份。隨後將 含有人類海帕西啶之粗製摺疊溶液裝填於phen_enex
Jupiter 10 μιη，300 A，C18，250x21.2 mm管柱上以便製備 性純化。溶離線性梯度法為在20毫升/分鐘之流速下1〇_ 25%緩衝液b歷時15分鐘，接著25-35%緩衝液b歷時4〇分 鐘。藉由LC/MS 於 Waters Acquity UPLC-LCT Premier 系統 上分析溶離份，且合併含有>95%人類海帕西啶之溶離份 並將之凍乾。將含有分子量相當於摺疊人類海帕西啶之物 質但具有不良LC純度（50-95%)之溶離份合併，康乾，再懸 浮於不含TFA之30%乙腈/水（濃度為約〇.丨毫克肽/毫升）中， 以飽和碳酸銨調節至pH值為7·5_8.〇且保持24小時。使用 Phen〇menex Jupiter 10 μιη，3〇〇 A，C|8，25〇χ1〇 贿管桎 以5毫升/分鐘進行此第二人類海帕西啶集合物之半製備性 規模純化，且合併含有>95%人類海帕西啶之溶離份並將 之柬乾。人類海帕西啶之總產率為35 mg。滯留時間 (Rt)=5,05分鐘；C113H17qN34〇31S9，計算分子量=2787 〇3 Da(單一同位素）；實驗觀測分子量=2787·7〇 藉由還原 128410.doc -158- 200900420 性烷基化-肽作圖法以及傅立葉轉換離子回旋共振質譜分 析（F0urier-transf0rm i〇n cyclotr〇n res〇nance mass spectrometry analysis)測定化學合成之人類海帕西啶之二 硫鍵連接性。 實例5 —合成、重組及尿海帕西啶之分析及比較
\ 為證明天然、重組及合成物質之等效性，將如實例1中 所述自尿純化之人類海帕西啶相對於CH〇源性重組生成物 質（實例2)、大腸桿菌源性重組生成物質（實例3)及化學合 成物質（實例4)進行比較。比較IRMpD碎裂譜（圖”。儘管 直接序列分配對於所有觀測片段而言係不可能的，但所有 試樣之MS/MS指紋圖譜係一致的。亦藉由碰撞活化解離 (CAD)以及ECD使試樣解離且譜圖對於所有製備物而言係 -致的。甚至生物分子離子之結構之少許變化可極大地改 變其串聯質譜。因此，藉由該等不同解離技術所獲之所有 四種海帕西咬製備物之等效性表明二硫鍵連接性對於所分 析的所有四種形式之海帕西啶係一致的。 亦在圖2中比較所有四種海帕西咬製備物之—維】η n魔 譜且證實所有製備物係等效的。在實例2中說明所用方 法。uhHepc之1D譜上之少番至s m 之夕里差異知因於試樣之間的pH& 孤輕微錯配；此在組胺酸環f子共振及來自兩個非常接近 於羧基之側接蘇胺酸殘基之共振上具有最顯著效應且盘不 同構形形式有關。某些試樣展示在順式構形中具有脯胺酸 殘基之少量形式的小.。當在純化過程期
端天冬㈣時，、性超㈣有少量（<5%)^J I28410.doc -159- 200900420 肽。 合成、重組表現及天然海帕西啶之結構一致性允許製備 大批量正確摺疊製品以用於抗體生成及測試。 實例6--活髖外海帕西啶活性鐵蛋白檢定 在活體外細胞檢定中針對鐵調節生物活性檢定根據實例 1、2、3及4所純化或產生之人類海帕西啶。誘導表現於 293細胞中之膜鐵轉運蛋白刺激鐵輸出且降低細胞内鐵含 S且由此降低鐵蛋白含量（Nemeth等人，以“％ 306:2090-2093, 2004)。可以劑量依賴性方式藉由海帕西啶 處理降低膜鐵轉運蛋白之作用.已顯示此作用歸因於海帕 西啶誘發性内化及膜鐵轉運蛋白降解且由此降低鐵輸出。 將表現四環素誘導性膜鐵轉運蛋白基因之293細胞以每 孔5 0,〇〇〇個細胞（7〇_8〇%密度广塗佈於96孔則〇(：〇以塗佈有聚 D離胺酸之板中的補充以5%胎牛血清及青黴素/鏈黴素/麩 醯胺西夂補充劑（〇丨13€：〇8尺1^)之〇]\4丑]^[中。在以50/。（：〇2在3 7 °C下培育隔夜之後，將該培養基置換為檢定培養基（如上 所述’但補充以用於海帕西°定誘導之2.5 pg/ml多西環素、 用於鐵補充孔之2.5 gg/ml檸檬酸鐵及用於海帕西啶處理孔 之1 Kg /ml海帕西β定）。將該板如上所述進一步培育1 7_2〇小 時’隨後於冷PBS中洗滌該等孔且溶解於冰上的12〇卜丨之 1% Trit〇n溶解緩衝液中歷時15分鐘。將100 μΐ溶解產物用 於鐵蛋白分析（Olympus AU400臨床化學分析儀）且1〇 μι溶 解產物用於BCA蛋白質檢定（Pierce)。將鐵蛋白結果根據 蛋白質含量進行正規化。 128410.doc -160- 200900420 =尿、重組或合成海帕西咬處理該等細胞皆使得鐵保持 力提高’此表明所有三種製備物具有生物學活性。因為所 有三種製備物展現相同二硫鍵連接性及生物活性，所以其 可被視為等效物，從而允許使用合成及重組製備物用: 體製造及測試。 實例藉由部分還原性烷基化進行尿海帕西啶之二硫鍵 定位 使用兩種不同技術（NEM部分還原性烷基化及傅立葉轉 換質譜分析（FT-MS))研究自尿純化之㈣性人類海帕西咬 肽之二硫鍵連接性。 簡§之，人類海帕西啶係由如下所述之敗血病患者之尿 純化。使用3 mM TCEP之部分還原使海帕西啶中之二硫鍵 隨時間逐步還原。由丁啦處理而化學還原之二硫鍵易於 由NEM烷基化，且可藉由肽之序列分析鑑別烷基化 半胱胺酸。此技術證明，海帕西啶之二硫鍵連接性不同於 由Hunter等人（前述）所推斷之二硫鍵連接性。經直接測定 之海帕西啶二硫鍵連接性C1_C8、C2_C4、C3_C6&C5_C7 提供緊湊及緊密摺疊的分子。 才法將經純化之海帕西啶（20_30叫）溶解於〇1 M檸檬 酸鹽緩衝液（1〇〇 μ1)(ρΗ 3.0)或 0.1〇/〇 TFA(100 μ1)(ρΗ 2 〇)中 且以3 μΐ 〇.1 μ參-(2_羧基乙基）膦鹽酸鹽（TCEp)處理。 TCEP之最終濃度為3 mM。在37°C下還原8分鐘。將部分還 原海帕西啶立即以20μ10.5MNEM處理，接著添加30μll M Tris緩衝液（pH 7,0)及100 μι 8 M鹽酸胍。溶液之沖值保 128410.doc -161 - 200900420 持低於6以防止二硫鍵重排。在室溫下進行NEM-烷基化20 分鐘。使反應物直接經受使用Vydac C 1 8管柱（2· 1 X1 50 mm) 之逆相HPLC以純化烷基化肽。將經NEM改良之肽以25% B 至50% B之線性梯度經30分鐘在每分鐘0.25 ml之流速下對 於溶劑A使用0.1% TFA且對於溶劑B使用90%乙腈-0.1% TFA進行溶離。將NEM-衍生物收集，乾燥且在溶於15 μΐ 0.2% TFA-50%乙腈中之後由MALDI質譜儀分析。將試樣 之一等份裝填至不鏽鋼板或金板上且與基質ex-氰基-4羥基 肉桂酸（4-HCCA)共結晶。使用裝備有337-nm氮雷射器之 Voyager DE-STR飛行時間質譜儀（Perkin-ElmerBiosystems Inc.)獲得MALDI質譜。以線性模式用通常設定為25000 V 之加速電壓以及95%之柵極電壓、0.05%之導線及150 ns之 提取延遲時間進行量測。藉由使用氧化胰島素B鏈 (MH+ = 3496.96)之標準物進行外部校準實現飛行時間與質 量的換算。 對於各種NEM衍生物，選取含有2-NEM-Cys之衍生物來 測定優先還原之半胱胺酸且對進一步還原的試樣進行如下 序列分析：將2-NEM-衍生物溶解於20 μΐ 0.05% TEA中且 以0.5 μΐ 2-巯基乙醇在45°C下還原20分鐘。使試樣直接經 受肽定序。經NEM-標記之半胱胺酸歸因於異構形式而表 現為PTH-Pro與PTH-Met之間的雙重峰。整合兩個峰以便 量化NEM-Cys。將含有4至6種海帕西σ定之NEM-衍生物之 溶離份組合且以蛋白分解方式消化。將乾燥試樣再次於 0.1 M Tris緩衝液中復水且以嗜熱菌蛋白酶（1 pg)消化。在 128410.doc -162- 200900420 3 7°(：下消化隔夜。使試樣經受使用％如(：（：18管柱（2.：^150 mm)之逆相HPLC。將肽以2% B至35% B之線性梯度純化3〇 分鐘且表終以60% B洗縣。將熱分解肽乾燥且於0.2% TFA-50%乙腈（15 μΐ)中復水。將試樣之一等份（1 μΙ)裝填於該板 上且乾燥。添加上述基質4_HCCA且使其結晶以便進行 MALDI質譜分析。將剩餘試樣定序以確定ΝΕΜ-標記之位
笋凝#譜分#F7VI/61法）：使用在7特斯拉下運作之改良 Bruker Q-FTMS獲取所有FTMS(傅立葉轉換質譜分析）資 料。忒儀器裝備有置於磁場之邊緣場中並距離離子單元之 背面收集板約G.3 m之陰極電子長絲。以pEG3_〇〇溶液 使用標準Francel方程式外部校準該儀器。各校準物離子之 計算質量相對於量測值的誤差低於U ppm。使用前端四 極子分離㈣料；在随8單元巾㈣以“作為碰撞 氣體之氣體輔助式動態捕獲來捕獲離子。 為進行IRMPD(紅外多光子解離）實驗，在15%_4〇%之雷 射器功率下開啟Synrad⑶巧射器· ms。使用直接制 模式在900 kHz之獲取頻寬下㈣離子且採集512 &數據 點1時域信鮮充填—次且❹正弦視窗切趾，隨後進 行幅度模式傅立葉轉換。 對於ECD(電子捕獲解離）串聯Ms實驗， ^ A⑺加熱。相對於捕獲板上之電壓將+〇5v偏職加 於長絲上。對於MS3實驗，在IRMpD之後將所關注之子離 子以CHEF線性調頻脈衝分離’纟中對應於所關注離子之 128410.doc -163 - 200900420 回紅頻率之RF振幅下有凹陷（notch)。藉由”低能量，，ECD使 經分離之子離子進一步破碎；在開始電子輻照時將氬氣脈 衝於離子單元中。 .结求.·將海帕西啶以pH值為2之TCEP部分還原，引起僅 一個二硫鍵之初級還原（分解）且形成兩個緊密溶離峰，兩 者在分子量上相當於2NEM烷基化產物（指定為以及沘，圖 3A)。為測定峰〜及孔中之NEM標記位點，藉由別爪抓降 解法定序經純化之肽。對在位置C5處之PTH_NEM_半胱胺 酸的偵測證明此殘基經還原且烷基化。亦發現C7之院基 化，但C8亦似乎經烷基化。序列殘留（一種通常對在所標 5己殘基後（尤其在較長定序產物中）之殘基賦予假陽性信號 之所熟知現象）大概歸因於海帕西咬之高半胱胺酸及脯胺 酸含量而為此分析中之明顯障礙（Grant等人，Meth.
Emzymol，，289:395-419, 1997; Himkapiller等人，Meth〇ds in protien sequence analysis. Clifton, New Jersey： Humana Press; 1982)。為檢驗第二NEMjf記位點，將經定序試樣 於玻璃纖維過濾器上以溴化氰（CNBr)處理且再次定序。該 等結果展示C7(而非C8)由NEM明顯烷基化。因此，推斷C5 及C7為主要烷基化物質且由此C5-C7鍵在還原之前已存 在。在峰2a中C4未經完全標記，其表明不存在存在於内源 性人類海帕西啶之主要物質中之C4-C5鍵。 對峰2b進行類似分析。將（：2明確確定為第一 NEM烷基化 位點且偵測出C4與C5具有大量烷基化產物。斷定C5位置 處烷基化之存在係由如上所述之殘留現象所引起。由顯示 128410.doc -164 胃 200900420 未發現C2-C5或C4-C5鍵之先前資料消除C2-C5鍵之可能 性。該等結果與以下事實一致：若相鄰半胱胺酸C4與C5 之間的二硫鍵存在於内源性海帕西咬製備物中，則其將必 須以過低而不可偵測之濃度存在。此資料表明C2及C4為 主要NEM-烷基化形式，藉此表明C2-C4二硫鍵連接性。 為還原更多二硫鍵，將試樣進一步以pH值為3之3 mM TCEP處理。MALDI質譜分析表明，層析譜中之主峰分別 對應於4-、6-及8-NEM烷基化產物（圖3B)。部分還原及烷 基化4-及6-NEM產物仍含有完整二硫鍵，而8-NEM產物為 完全烷基化形式且由此不適用於分析。為測定殘餘二硫 鍵，將該等4-及6-NEM衍生物組合且進一步以嗜熱菌蛋白 酶在pH值為6.6下消化（保持低於pH 7以防止二硫鍵重排且 因此分離仍含有二硫鍵之片段或由二硫鍵接合在一起之 肽）。藉由Edman定序鑑別部分烷基化肽月段。在未經NEM 標記之經分離肽片段中所鑑別之半胱胺酸對在烷基化之後 仍與二硫鍵形成有關。肽Th-Ι展示兩個對應於IC(SEQ ID NO: 9之殘基 6-7)及 GMCCKT(SEQ ID NO: 9之殘基 20-25) 之序列。展示殘基22(C7)經NEM標記且由此不與連接兩個 肽之雙硫橋有關。殘基7及23(C1及C8)皆未經標記，其表 明兩個肽之間的鍵為C1-C8。肽Th-2展示單個序列 (IFCCGCCHRSKC ; SEQ ID NO: 9 之殘基 8-19)，其中將殘 基10、13及14(C2、C4及C5)以NEM修飾且由此不由二硫鍵 連接。將殘基11及19(C3及C6)偵測為未經修飾半胱胺酸。 因為單體肽經分離，所以消除肽間二硫鍵之可能性且表明 128410.doc -165 - 200900420 存在C3-C6二硫鍵。該等肽之MALDI分析證明該等標識。 部分還原性烷基化肽產物之FTMS分析亦確認二硫鍵連 接性且不對由Ednam降解所發現之殘留現象敏感。 圖6展示根據所有NEM部分烷基化分析所得到之複合二 硫鍵連接性標識，其證明在人類尿海帕西啶中，天然二硫 鍵連接性為 C1-C8、C2-C4、C3-C6 及 C5-C7。 亦使用評估FTMS二硫鍵連接性。所得譜較為複雜且因 為不直接觀測出標準b/y離子系列，所以直接序列標識有 困難。其係大概歸因於肽中之四個完整二硫鍵。可基於精 確質量量測假定數種標識。舉例而言，觀測到雙倍帶電離 子具有698.7794之m/z，相當於1395.5443 Da之中性粒子質 量。該精確質量表明此片段含有由單二硫鍵接合之兩個内 部肽片段（DTHFPIC，SEQ ID NO: 9之殘基 1-7及 MCCKT， SEQ ID NO: 9之殘基21-25)。此片段之理論單一同位素質 量為1395.5444(0.1 ppm質量一致）。不可假定與此質量一 致之其他碎體離子（在不存在内部重排之情況下）超過1 0 ppm。通常使用低能量碎裂法（諸如IRMPD)並未觀測到内 部碎體離子之形成。大概藉由在似乎引起新碎裂過程之完 整分子中由四個二硫鍵所誘發之環狀結構而有助於觀測該 等内部片段。在二硫鍵完全還原物質之IRMPD譜中未觀測 到該等内部片段。 後續低能量ECDMS3實驗顯示m/z為 698.7794之雙倍帶 電子離子。在此MS3譜中所觀測之主要片段為兩個m/z為 83 1.3585及550.212之單獨帶電離子，其分別對應於兩個内 128410.doc -166 - 200900420 部片段DTHFPIC(SEQ ID NO: 9 之殘基 1-7)及 MCCKT(SEQ ID NO: 9之殘基21-25)。亦觀測到對應於SH基團喪失之較 低強度離子。該等標識暗示該等兩個肽區域在完整結構中 由二硫鍵連接；其表明C1與C7或C8連接。 對IRMPD譜中之大多數富於多電荷之離子進行類似MS3 實驗。根據精確質量量測，將MS3片段指定為内部肽 CHRSK(SEQ ID NO: 9 之殘基 14-18)及 MCC(SEQ ID NO: 9 之殘基2 1 -23)，其暗示該等肽在如圖6中所示之完整分子中 由二硫鍵連接。 具有二硫鍵連接性之人類海帕西咬之三維結構的所提出 模型描述於圖7(右）中。 實例8--人類海帕西啶之NMR二硫鍵及結構分析 亦藉由NMR光譜法測定人類海帕西啶之結構。該等其中 於形成二硫鍵之所有半胱胺酸殘基之質子之間直接觀測到 NOE(核奥氏效應）的資料揭示如下二硫鍵連接性：與先前 所引述之部分烷基化還原結果一致之C7-C23(CM-C8)、 C11-C19(C3-C6)、C10-C13(C2-C4)及 C14-C22(C5-C7)。該 等實驗觀測結果允許確定海帕西啶之三維結構與先前所公 開結構（Hunter等人，2002)有顯著差別。由CHO源性重組 人類海帕西啶得到之結果顯示在用於該等實驗中之濃度及 溫度條件下隨時間之最佳穩定性分布，其對於高品質溶液 NMR研究具有重要作用。穩定性指示參數為如由展示於圖 2中之NMR 1H線寬所量測之物質聚集百分數及分子於溶液 中之單分散性程度。 128410.doc -167- 200900420 iVMi?轼截！實，驗··藉由將5% D20添加於獲自最後純化 步驟之uhHepc水溶液中來製備NMR試樣。為便於NMR結 構研究，製備CHO源性rhHepcidin於90% H2O/10% D20及 99.999% D20(Sigma-Aldrich)中之 1 mM溶液。使未經調節 之pH值接近3。使用裝備有TXI超低溫探針之Bruker DRX-600儀器在325 K下進行所有實驗。藉由標準2D NMR方法 獲得譜標識及大多數NOE限制（參見Wuthrich，John Wiley & Sons, 1986)。根據2D 13C HSQC譜獲得α及β-碳原子之 13C化學位移。該等譜標識得以進一步確認且由分析2D 1H-13C HMBC實驗獲得立體特異性標識（參見Hansen, Biochemistry, 30:10457-66，1991)。根據 2D NOESY或雜交 TOCSY-NOESY實驗獲得半胱胺酸間NOE(Kessler等人， Angew. Chem. Int. Edn Engl., 27:564, 1988)。根據以高數 位分辨率（0.5 Hz)記錄之2D TOCSY實驗獲得3JHNHa(三鍵J 偶合）。基於鄰近Ηα-Ηβ及C’-Ηβ及兩鍵Ctx-Ηβ偶合模式獲 得所有殘基（除C22以外）之立體特異性質子標識。C22顯示 具有排除此殘基之立體特異性標識之簡併化學位移的Ηβ質 子。藉由在將來自Η20之CHO源性rhHepc復水於D20溶液 中之後記錄1D質子譜來追蹤Η-D交換。藉由使用激發雕刻 脈衝序列獲得水抑制。所有NMR譜之外部參比物為在0.0 ppm下之DSS(2,2-二曱基-2-矽雜戊烷-5-磺酸鈉鹽）。 二禮#ϋ #炫.·藉由同核2D TOCSY與2D NOESY實驗 之組合完全標識CHO源性rhHepc之質子譜；依序連接性標 識展示於圖4中。藉由化學交換增寬屬於C13及C 14之共振 128410.doc -168· 200900420 (圖2)且僅在高溫及低pH值下可易於觀測。 將NOESY譜使用NMRPipe處理且使用Sparky軟件套件分 析。將二維資料在維數上充零一次且使用貝爾正弦位移平 方切趾函數（shifted sine-bell squared apodization function) 進行傅立葉變換。基於NOESY峰體積且藉由使用"分離旋 轉對近似值"來校準距離限制。根據與Stoke法則相符之在 293 K下為〜1·5 ns之亞曱基質子與在325 K為〜65 ns之亞甲 基質子之間的交又馳豫（/325 »2.4 )估算翻滚時間。該 k"293 x325 ) 等相關時間對應於單分子於水溶液中之翻滾且證明雙旋轉 近似值正確。 C7-C23(C1-C8)及 C11-C19(C3-C6)二硫鍵之二硫鍵連接 性表現為相應Ηα質子之間的極強（2.1人）NOE相互作用。因 為在肽中高度充斥β質子共振，所以通常難以觀測到該等 質子之間的直接ΝΟΕ連接性。然而，在TOCSY-NOESY中 繼實驗中，Ηβ-Ηβ ΝΟΕ峰呈現遠離對角線且可經明確標 識。此實驗中所觀測之C10(HP)-C13(HP)(C2-C4)及 C14(HP)-C22(HP)(C5-C7)N0E相互作用展示於圖5中。亦 在pH值為〜7及321 K下所記錄之2D NOESY譜中觀測到相 對較強（〜2.7 A)C10(Hp)-C13(H3)(C2-C4)NOE交叉峰，其 中 Ηβ共振經充分分離（〜60 Hz)。C14(Hp)-C22(HP)(C5-C7) 中繼NOE峰對於在2D NOESY中出現較短混合時間之微弱 直接C14(Ha)-C22(Hp)(C5-C7)相互作用具有較小貢獻。為 移除此貢獻，在500 ms NOESY混合時間期間使用Ha共振 128410.doc -169- 200900420 之預飽和進行2D TOCSY-NOESY實驗。此實 同Cl4(Hp)-C22(Hp)(C5-C7)交叉峰強度，此現象證實其主 要由Hb質子（<3人）之間的相互作用引起。在不同半胱胺酸 殘基對之間未觀測到其他NOE連接性。總而言之，該等結 果證明圖ό中所揭示之二硫鍵連接性且反驳先前所報導之 二硫鍵連接性（Hunter等人，2002)。 Γ 弟海西啶之溶漩TViWT?.结褲..3維結構計算基於質子間 NOE限制，φ角之二鍵j_偶合常數彳3〜、。及對於使用 TALOS軟件套件獲自（^及以化學位移值之γ角的寬鬆角限 制藉由 CYANA 2.1(參見 Guntert，Meth. Mol. Biol. 278.353 78，2GG4)根據擴展幾何學計算結構且允許該等結 構基於20,0()()步扭轉㈣力學基模擬退火錢。在計算後 期’在實現收斂之後，基於經確定處於慢交換中之醯胺 (獲自2h交換實驗）併入氫鍵限制。此時，接著根據所提出 連接性模式添加二硫鍵限制。在圖7中將由2〇個最低能量 ㈣所計算之海帕㈣平均結構與獲自先前所公開結構集 合（Hunter 等人，2〇〇2，诗、+.、 】述）之平均結構進行比較。兩個 试驗展不類似β_摺疊組件 的最顯著差異為此環之卷曲顯。兩種結構之間 由C2-C4及C5_C7二硫鍵確定：根卷:在吾，構:很可能 此顯著差異將對與分子結 體/所報¥之結構上之 基。 σ之抗體表現徹底不同抗原決定 實例9__海帕西咬變異艘之合成及活性 根據實例4中所描沭 这之—般程序化學合成多種海帕西啶 128410.doc -170. 200900420 變異體。合成在N末端處缺少5個胺基酸之海帕西咬變異 體’稱為"海帕西口定20”或”hepc2〇l,。亦合成其中所有8個半 胱胺酸殘基經2_胺基丁酸置換而因此完全破壞形成二硫鍵 之能力之線性海帕西啶變異體。亦合成ci_c8、海 帕西啶變異體，其中半胱胺酸2、4、5及7經2-胺基丁酸取 代以便允許形成僅兩個二硫鍵（C 1-C8及C3-C6)。 與所公開結果（Nemeth等人，Blood, 107:328-333, 2006) 一致，N-末端截短變異體hepc2〇具有嚴重減弱生物活性。 其中所有8個半胱胺酸殘基經替換之線性海帕西啶變異體 亦為失活的。當分子處於完全還原態（亦即無二硫鍵連接 )T使用含有天然半胱胺酸殘基之海帕西咬亦產生類 、、·果而’此還原物質不穩定且生物活性隨時間恢 復。 實例10-·針對KLH_接合物質之鼠類抗人類海帕西啶單株抗 體的製備 在如下小鼠中產生人類海帕西°定特異性單株抗體 (mAb)2.7及2.41。使用標準EDC化學處理使重組性表現及 再摺疊人類海帕西啶與載體蛋白KLh結合，隨後投與動 物。簡言之，將超過4倍莫耳量之EDC(pierce)直接添加至 含有等置人類海帕西啶及KLh之MES緩衝溶液中。使反應 在RT下進行2小時。隨後將人類海帕西啶_KLH結合物乳化 於1.1比例之完全傳氏佐劑（Complete Freund's Adjuvant)(pierce)或RIBI(Sigma)與PBS(Gibco)中。在頸背 及後腿處以皮下方式使用50 pg海帕西啶-KLH/乳化佐劑使 128410.doc -171 - 200900420 BDF 1小鼠及C57BL/6免疫。1 4妥接，由-^ n必 又14天後，皮下以及腹膜内輸送 25 pgKRIBI佐劑中之人類海帕西啶_^^^以便進行第二次 免疫。繼此免疫之後10天，抽血以評估抗人類海帕西：： 清濃度。 f
繼滴定抽血之後約2週，將丨個C57Bi/6小鼠腹膜内補充 以75盹懸浮於PBS中之人類海帕西啶。繼此補充之後； 天，將脾臟無菌地移除且處理以便融合。簡言之，將脾臟 破壞成單細胞懸浮液且溶解RBC。將sp2/〇AGi4骨髓瘤細 胞與脾細胞以SP2/0與脾細胞之丨：2 5比率混合。隨後使用 電融合技術融合此細胞懸浮液。將所得融合瘤塗佈於使用 富集生長培養基且藉由2個完全培養基互換來維持之外孔 板中。在第二個培養基變化之後3天，根據抗人類海帕西 啶特異性IgG經由ELISA篩檢融合瘤。簡言之，將丨〇〇奈克/ 孔之NeutraVidin(Pierce)塗佈於標準£[18八板上。將該等板 洗務且隨後以於PBS中之1% BSA、i% gt血清、〇 5〇/〇
Tween 20溶液阻斷。隨後將丨奈克/孔之生物素標記人類海 帕西啶添加至板中且培育i小時。在洗滌之後，將5〇…相 關融合瘤上清液自培養板轉移於薛檢板上且將該等者再次 培育1小時。在洗滌之後，使用多株山羊抗mu igG Fc特異 性HRP標記Ab偵測鼠類IgG_人類海帕西啶複合物。在適當 洗滌之後，使用TMB(Pierce)目測複合物。隨後將藉由此 方法所鑑別之陽性純系轉移至48孔板上以便擴增。 實例11—藉由病毒性免疫製備鼠類抗人類海帕西啶單株抗 體 Ab43 128410.doc -172· 200900420 藉由下列病毒性免疫法在小鼠中產生人類海帕西。定特異 性單株抗體Ab43。使用ViraPower腺病毒表現系統（產品目 錄號 K4930-00，Invitrogen，Carlsbad, CA)產生腺病毒表現 性人類海帕西咬。帶有人類海帕西咬cDNA(rAd-hHepc)之 重組性腺病毒構建如下：簡言之，藉由將人類海帕西啶基 因插入 pENTRl A(Invitrogen)中來構建 pENTR-hHepc。使所 得人類海帕西啶基因與attP DNA片段側接以便允許在 pAd/CMV/V5-DEST 中與 attB DNA片段重組。藉由 pENTR-hHepc與pAd/CMV V5-DEST使用LR選殖酶之間的重組反應 構建 PAd/CMV-hHepc。為產生 rAd-hHepc，將 pAd/CMV-hHepc藉由Pac I線性化且使用Lipofectamine 2000轉染於 293T細胞中。將經轉染293T細胞培養直至觀測到約80%細 胞病變效應（CPE)。經轉染細胞展示擴大且呈圓形形態， 細胞溶解及可見噬菌斑。將含有RAd-hHepc之細胞收集且 用於rAd-hHepc之擴增。將RAd-hHepC藉由CsCl梯度法純 化且使用Adeno-X快速滴定套組（BD Biosciences，Palo Alto, CA)滴定。 將C57B1/6小鼠以50 μΐ 1.25χ109個感染單位（i.f.u)之rAd-hHepc於兩者後腿之四頭肌中得以免疫。在rAd-hHepc免疫 之後10天將脾臟無菌地移除且處理以便融合。 實例12 —大鼠抗人類海帕西啶單株抗體R9之產生 使用經改良之RIMMS法在大鼠中產生人類海帕西啶特異 性單株抗體（mAb)。簡言之，使兩個8-10週齡雌性Lewis大 鼠（Charles River Laboratory)各自在11天療程内接受5輪使 128410.doc -173 - 200900420 用人類海怕西啶_KLH結合蛋白之免疫。在每次免疫之 前，將大鼠以氧氣與異氟烷之氣體混合物麻醉。對於在第 〇天進行第一次免疫，將10 Mg抗原於體積為600 μΐ之傅氏 完全佐劑（DIFC0)中乳化，將3〇〇 μ1該抗原混合物沿大鼠 之背部以50微升/部位皮下投與6個與汲皮淋巴結鄰近之部 位，其t兩個部位處於頸背且兩個部位在腹股溝及小腿之 兩側。將另外300 μΐ抗原混合物沿腹部投與至6個毗連部 位，其中兩個在腋窩、大腿及小腿之兩側。除始終使用 RIBI(Corixa CORP，目錄號R7〇〇)佐劑之外，在第3天、第6 天、第8天及第11天以類似方式提供加強免疫。 在最後一次免疫之後一天，藉由使用二氧化碳窒息對大 鼠施加無痛致死術。將兩側腿彎部、表面腹股溝、腋窩及 鰓部淋巴結無菌地分離且使用2χ青黴素-鏈黴素-麩醯胺酸 (Gibco)BD培養基洗滌兩次。將淋巴細胞自淋巴結中釋放 且再次於BD培養基中洗蘇單細胞懸浮液，隨後與小鼠骨 髓瘤細胞 Sp2/0-Agl4(ATCC，CRL-1581)以 2.5:1之比率藉 由電融合進行融合。簡言之，將細胞洗滌且以lxl07細胞/ 毫升再懸浮於2 ml Cytofusion培養基C(Cytopulse Sciences) 中且轉移至融合室中。藉由使用具有增強器400之ECM 2001(BTX Inc. San Diego)施加 3個 1500 V之脈衝 30 ，接 著施加60 V之脈衝3秒來進行電融合。將細胞在RT下回 收，30分鐘後以3xl04細胞/孔平缓再懸浮且接種於96孔板 中，將該板置於1〇〇 μΐ補充以10% FBS、5% Origen選殖因 子（BioVeris™)、lx青黴素-鏈黴素-麩醯胺酸（Gibco)及lx 1284l0.doc -174- 200900420 OPI(草醯乙酸、丙酮酸及胰島素）（Sigma)之BD培養基中。 在培養24小時之後，將100 μΐ 2XHAT(0.1 mM次黃嘌呤、 〇·16 mM胸苷、4 mM胺基喋呤）（Sigma)添加至各自孔中。5 天後更換培養基且在培育1週之後收集改良性培養基以便 初步篩檢。將陽性純系擴增，單細胞選殖且由多重檢定確 認。 實例13—完全人類抗體之產生 將 XenomouseTM IgG2icX及 IgG4icX小鼠以 KLH-接合之人 類海帕西啶（SEQ ID NO: 9)使用標準方法免疫。以針對固 定至板上之生物素標記人類海帕西啶之單一濃度篩檢 23,040 IgG2上清液及11，520 IgG4上清液。根據此篩檢， 使用抗體捕捉ELISA測試617 IgG2及1013 IgG4上清液關於 與人類與小鼠生物素標記海帕西啶之結合性，其中所捕捉 抗體之量限於使上清液之間的濃度差效應最小化。在抗體 濃度範圍内量測溶液相海帕西咬抗體結合性之橋接ELISA 中進一步表徵一流試樣（70 IgG2及110 IgG4)。此檢定提供 抗體結合性之相對親和力分級。
來自IgG2及IgG4板之每一者之上清液指定如下： 1C9(SEQ ID NO: 107-116)' 3B3(SEQ ID NO: 117-126)' 4E1(SEQ ID NO: 127-136)' 7A3(SEQ ID NO: 137-146)' 9D12(SEQ ID NO: 147-156) ' 12B9(SEQ ID NO: 157-166)、15E1(SEQ ID NO: 167-176)、18D8(SEQ ID NO: 310-319)、19C1(SEQ ID NO: 320-329)、19D12(SEQ ID NO: 290-299)、19H6(SEQ ID NO: 300-309)、23F11 (SEQ 128410.doc •175- 200900420 ID NO: 177-186)及 26F11(SEQ ID NO: 187-196)。 由BIAcore測定該等抗體與人類海帕西σ定之結合親和 力，若如由BIAcore所估算之KD低於1 〇〇 ρΜ，貝1J由KinExA 確認。引導抗體之KD為1 pM與大於400 pM之間的範圍 内。 藉由競爭ELISA測定與Hepc20(SEQ ID NO: 96)之相對物 種交叉反應性及結合性。結果表明與人類海帕西°定相比之 相對結合性為：低於食蟹猴海帕西啶（SEQ ID NO: 6)2倍、 C 低於小鼠海帕西啶（SEQ ID NO: 80)500至>1000倍及低於犬 海帕西啶（SEQ ID NO: 92) 150至 >1500倍。 實例14--抗體與人類及小鼠海帕西啶之結合性分析 使用BIAcore進行溶液平衡結合性分析以研究R9、 Ab43、2.7及2.41抗體與重組性小鼠海帕西啶（SEQ ID NO: 80)及人類海帕西啶（SEQ ID NO: 9)之相互作用。 袭/澇馮片肩面··根據製造商之用法說明書將蛋 白質以10微升/分鐘之運作緩衝液（DPBS : Dulbecco磷酸鹽 、 緩衝液 SalinelX, GIBCO 14190，具有 0.005% Biacore界面 活性劑P-20)流速固定至BIAcore上。首先以100 pL EDC(75 mg/mL於水中之N-乙基-N-(二甲胺-丙基）碳化二亞胺，來 自BIAcore)與NHS( 11.5 mg/mL於水中之N-經基琥ί白酸亞 胺，來自Biacore)之1:1混合物之注射液活化感應器晶片之 羧化基質。以30微升/分鐘注射1 80 pL重組性人類海帕西啶 或重組性鼠類海帕西咬（〜20 pg/ml於1 0 mM乙酸納（Ph值為 4.0)中）以固定於感應器晶片上。以100 pL乙醇胺注射液 128410.doc -176- 200900420 (1.0M，來自Biacore)使感應器晶片之過量反應性基團失活。 於經固定海帕西啶表面上之抗體/海帕西啶相互作用之 f衡,結合尨分#.·將固定濃度之抗體以各種濃度之海帕西 啶在室溫下培育數小時，隨後穿過經固定海帕西啶表面。 在每次試樣注射之後，藉由注射30 pL 10 nM甘胺酸（pH值 為1.5)使表面再生。所獲結合信號與在溶液中呈平衡狀態 之游離抗體成正比。使用一或雙曲線一位點式同源結合模 型（KinExA™ 軟件，Sapidyne Instruments Inc.，Boise ID)由 競爭曲線之非線性回歸分析計算平衡解離常數（KD)。表3 概述與重組性小鼠及人類海帕西啶之R9、Ab43、2.7及 2.41結合性的結果。 表3
抗體 人類海帕西啶 95% Cl 小鼠海帕西咬 95% Cl R9 21 nM 13-28 nM 20 nM 13-27 nM Ab43 560 pM 400-700 pM 14 nM 12-16 nM 2.7 110 pM 80-150 pM 40 nM 27-44 nM 2.41 50 pM 20-90 pM 30 nM 24-38 nM 實例15--抗人類海帕西啶抗體至重組性犬海帕西啶之結 合性 下列實例描述針對重組性犬海帕西π定（rcyno)之各種抗體 的KinExA及BIAcore結合性分析。 與rcynoHepc之mAb 2.7及2.41結合性的KinExA溶液平 衡.结合汊分#。根據製造商之用法說明書將反應性凝膠6x 珠粒（Pierce, Rockford, IL)預先塗以 rcyno 海帕西咬（SEQ ID NO: 6)且以BSA阻斷。將固定濃度之抗體2.7及2.41以各種 濃度之rcyno海帕西咬在室溫下培育8小時，隨後穿過塗有 128410.doc •177- 200900420 rcyno海帕西咬之珠粒。藉由經螢光（Cy5)標記之山羊抗鼠 類 IgG(H+L)抗體（Jackson Immuno Research, West Grove, PA)量化與珠粒結合之抗體之量。結合信號與呈平衡狀態 之游離抗體之濃度成正比。使用雙曲線一位點式同源結合 模型（KinExA™ Pro軟件）根據競爭曲線之非線性回歸獲得 平衡離解常數（KD)。該等結果闡明於表4中。 表4
抗體 KD(對於 rcynohepc) 95% CI 2.7 〜16 pM 11-23 pM 2.41 〜9 pM 6-14 pM 與rcynoHepc之mAb R9及Ab43結合性的BIAcore溶液平 衡,结合汊分#。抗體表面固定：將抗體R9及Ab43固定於 CM5晶片上。根據製造商之用法說明書以1 0微升/分鐘之 運作緩衝液（DPBS : Dulbecco磷酸鹽緩衝液SalinelX， GIBCO 14190，具有 0.005°/。BIAcore 界面活性劑 P-20)流速 進行固定。首先以100 μΐ EDC(75 mg/mL於水中之N-乙基-N-(二甲胺-丙基）碳化二亞胺，來自BIAcore)與NHS(11.5 mg/mL於水中之N-經基琥拍酷亞胺，來自BIAcore)之1:1混 合物注射液活化感應器晶片之羧化基質。以30微升/分鐘 注射180 gL抗體（〜20 pg/ml於10 mM乙酸鈉（pH值為4.0)中） 以固定於感應器晶片上。以100 pL乙醇胺注射液（1.0 Μ， 來自BIAcore)使感應器晶片之過量反應性基團失活。 BIAcore分析：將固定濃度之rcynoHepc以各種濃度之 mAb R9及Ab43在室溫下培育數小時，隨後穿過經固定抗 體表面。所獲結合信號與在溶液中呈平衡狀態之自由 128410.doc -178- 200900420 rcynoHepc成正比。使用一曲線一位點式同源結合模型 (KinExA™軟件，Sapidyne Instruments Inc.，Boise ID)由競 爭曲線之非線性回歸分析計算平衡解離常數（KD)。R9與 Ab43顯示對rcyno海帕西啶之顯著結合親和力。該等結杲 闡明於表5中。 表5
抗體 Kd(對於 rcynohepc) 95% CI R9 〜10 nM 9~12nM 43 〜100 pM 60-160 pM 實例16--在酶聯免疫吸附檢定（ELIsa)中表徵海帕西啶特 異性單株抗體結合活性 將96孔E·I.A./R·I·A·平底板（Costar 35 9)使用於0.1M乙酸 鈉（pH值為5.5 )中之經生物素結合重組性人類海帕西啶或經 生物素結合鼠類海帕西σ定以1 〇〇至1 〇〇〇 ng/ml在4°C下塗佈 隔夜。將該等板以含有2% BSA及0.2%山羊血清（GIBC0)之 PBS在室溫下阻斷！小時。在洗滌該等板之後，將5 〇 —融 合瘤改良性培養基添加至各孔中且於震盪器上在RT下培育 2小時。將該等板以洗滌液（0.05%於Pbs中之Tween-20)洗 滌3 -人且以5 〇微升/孔之辣根過氧化物酶結合性山羊抗大鼠 IgG(Chemicon)在RT下培育3〇分鐘。在洗滌該等板3次之 後’添加50微升/孔之TMB受質（KPL)且使其在RT下培育5_ 1〇分鐘。經由添加50 μΐ 0,5 Ν ΗΑ〇4停止反應且於微定量 盤式讀取器中在450 nm下讀取該板。將經免疫大鼠之抗血 清用作陽性對照抗體且將僅培養基用作本底對照。 鑑別大鼠單株抗體R9對人類與鼠類海帕西啶具有特異 128410.doc 179· 200900420 性。經由細胞分選儀（Becton Dickinson, FACSDiva)以每孔 1個細胞分選融合瘤細胞株以便次選瘦。 實例17--抗海帕西啶抗體識別不同結構抗原決定基 藉由評估抗體在與不同海帕西啶變異體形成前複合物之 後結合成熟人類海帕西咬（S EQ ID Ν0: 9)之能力來評價抗 人類海帕西啶抗體之抗原決定基特異性。 根據製造商之用法說明書將重組性海帕西啶以1 〇微升/ 分鐘之運作緩衝液（DPBS : Dulbecco磷酸鹽緩衝液 SalinelX，GIBCO 14190，具有 0.005% BIAcore界面活性劑 P-20)流速固定至CM5晶片上。首先以1〇〇 EDC(75 mg/mL於水中之N-乙基-N-(二曱胺-丙基）碳化二亞胺，來 自BIAcore)與NHS(11.5 mg/mL於水中之N-羥基琥珀醯亞 胺，來自BIAcore)之1:1混合物之注射液活化感應器晶片之 羧化基質。以30微升/分鐘注射180 μ]： rhHepc(〜20 pg/ml於 10 mM乙酸鈉（pH值為4_0)中）以固定於感應器晶片上。以 100 μΐ^乙醇胺注射液（1.〇 M，來自BIAc〇re)使感應器晶片 之過量反應性基團失活。 用於前複合物之海帕西啶形式為：作為陽性對照之正確 摺疊海帕西啶，C1-C8、C3_C6*帕西啶變異體（參見實例 9)、海帕西啶2〇(N-末端截短形式，參見實例9)及線性海帕 西啶（實例9)。將1 nM抗體溶液41、 2.7、43 及 R9)以 10
體之彡辰度成正比。該等結果闡明於表6中。 128410.doc •180- 200900420 表6 與海帕西咬表面之結合性 抗體 無競爭 摺疊海帕西咬 C1-C8 C3-C6 Hepc20 線性海帕西。定 R9 100% 79% 63% 88% 100% Ab43 100% 11% 25% 100% 100% 2.7 100% 2% 3% 3% 100% 2.41 100% 0% 1% 1% 99% 表7中闡明對表6中之資料的解釋以提供不同抗海帕西啶 抗體結合不同抗原決定基之能力的表述。 表7 與溶液抗原決定基之結合性 抗體 摺疊海帕西α定 C1-C8 C3-C6 Hepc20 線性海帕西°定 R9 + + + - Ab43 ++++ +++ - - 2.7 ++++ ++++ +++ - 2.41 ++++ ++++ +++ - 結合性範圍介於++++(對海帕西。定表面之0%抗體結合性 且因此受溶液中之海帕西。定10 0 %抑制）至（對海帕西°定表面 之100%抗體結合性且因此不受溶液中之海帕西啶抑制）。 該等資料指示就抗原性而言所有抗體需要摺疊肽。某些抗 體在分子之N-末端處需要5個胺基酸（例如Ab43及在更小程 度上為R9)。對於某些抗體（例如R9)，消除C2-C4及C5-C7 二硫鍵極大降低海帕西啶分子之抗體識別作用。 實例18--在鐵反應性p-内醯胺酶檢定中可由抗海帕西啶抗 體中和活體外海帕西啶活性 海帕西啶使膜鐵轉運蛋白内化且自細胞表面中移除，藉 此抑制鐵釋放且提昇細胞内鐵濃度。活體外評價抗人 類海帕西咬抗體對此海帕西咬所介導之鐵螯合的效 128410.doc -181 - 200900420 應。構建含有多西環素（doxy eye line)誘導性膜鐵轉運蛋 白（Fpn)表現構築體以及含有來自具有下列調節mRNA 轉譯之核苷酸序列之鐵蛋白之5'鐵反應元（IRE)之一複 本之β-内醯胺酶（BLA)表現構築體的293細胞株： (tcggccccgcctcctgccaccgcagattggccgctagccctccccgagcgccctg cctccgagggccggcgcaccataaaagaagccgccctagccacgtcccctcgcag ttcggcggtcccgcgggtctgtctcttgcttcaacagtgtttggacggaacagatccg gggactctcttccagcctccgaccgccctccgatttcctctccgcttgcaacctccgg gaccatcttctcggccatctcctgcttctgggacctgccagcaccgtttttgtggttag ctccttcttgccaacc)(SEQ ID NO: 103)。將該等采自 70-80%長 滿培養物之293/Fpn/BLA細胞以2·8χ105細胞/毫升塗佈於含 有 5% FBS(Invitrogen目錄號 10099-141)及 PSQ(Invitrogen目 錄號 10378-016)之 DMEM(Invitrogen 目錄號 11965)中，接著 以90微升/孔（25,000細胞/孔）塗佈於BioCoat聚D離胺酸塗佈 板（Becton-Dickinson 目錄號 35-6640)中且在 37°C 下以 5% C02培育。在同一天結束時，製得具有100 pg/mL多西環素 之檢定培養基溶液（DMEM 5% FBS PSQ)，將其以10微升/ 孔添加至該板中且將該板培育隔夜或培育至少20小時。次 日，將培養基自孔中移除且置換為DMEM 5% FBS PSQ、 2.5 pg/mL檸檬酸鐵、50 ng/mL合成人類海帕西啶及抗體連 續稀釋液（2.7、2.41及Ab43，其如以下實例8及9中所述般 產生）之預製得混合物，將所有物質製備於96孔聚丙烯深 孔阻斷板中，隨後立即添加至檢定板上。將混合物以100 微升/孔添加且在37°C及5% C02下於細胞培養恆溫箱中培 128410.doc -182- 200900420 育隔夜。隨後將板自恆溫箱中移出且平衡至室溫10分鐘， 隨後以2〇微升/孔添加經製備之Invitr〇gen GeneBiazer (^戶4八/]^顯影試劑（111¥心〇§611^^#〖1085)且在黑暗中培 月9 0刀鐘。亦將顯影试劑添加至含有1 〇 〇 pL檢定培養基 (DMEM 5% FBS PSQ)之不具有細胞之對照檢定板之16孔 中且培育相同時間。隨後使用Envisi〇n Mumiabel讀取器 (Perkin-Elmer Inc.)藉由在409 nm下激發且在447 nm(藍色） 及520 nm(綠色）下讀取發射光來讀取藍色及綠色螢光信 5虎。該等結果描述於圖8_1〇中。確定mAB 43、2 7及2 u 分別在1.380X10-8、170(^0-8及1 636 1〇-8之此5〇下降低細 胞内鐵濃度。 實例19--抗海帕西啶抗體中和小鼠中之人類海帕西啶 在以足以產生低鐵反應之量投與人類海帕西啶之小鼠中 活體内評價抗人類海帕西啶抗體之活性。在第〇天時，使 用抗人類海帕西啶之鼠類單株抗體（Ab2 7)對雌性c57bl/6 小鼠進行皮下注射。對照小鼠接受鼠類IgGl作為同型對 照。在第3天時’使小鼠接受25叫大腸桿菌源性重組人類 海帕西灿hHepe)之單次腹膜内注射。兩個小時後分析灰 清鐵含量。以生理食鹽水處理之對照動物具有正常血清鐵 含量，而以料西錢同型對照抗體處理之動物展示血鐵 過少症。結果闡明於_中。i mg與〇.5mgmAb27提供 :計上顯著預防作用而免於低鐵反應。儘管在0·25叫劑 量之Ab 2.7下觀測到血鐵過少症減少，但將較低劑量（〇25 及mg)定義為非中和劑量。統計表表示具有將所有組與 128410.doc -183- 200900420 生理食鹽水對照進行比較之Dunnett事後檢驗的an〇va。 實例20 —經AAV運載之海帕西啶之抗體中和作用使正常早 期紅it球特徵恢復 在小鼠中A AV所介導之人類海帕西咬表現產生與鐵喪失 一致之低色性小紅血球性貧血。在該等過度表現人類海帕 西Π疋之小执中活體内δ平彳貝抗人類海帕西σ定抗體之活性。給 雄性C5 7B1/6小队注射含有人類海帕西σ定或β_半乳糖苦酶 (β-gal)之表現卡匣之AAV(1.5xl〇12顆粒/小鼠，靜脈内）以 ί 便作為陰性對照。將小鼠保持兩週以便組成性產生 huHepc，隨後使用1毫克/小鼠之Ab 2.7或同型對照 (muIgGl)以如圖12A中所示之各種投與頻次（每週卜欠、兩 次及4次）進行處理。在第五天抽血以便測定血清鐵含量及 早期紅血球（網狀血球）特徵（網狀血球計數、網狀血球血紅 素含IE (CHr)及網狀血球平均細胞容積（Retic. MCV》。 結果闡明於圖12B-12E中。在接收4次投與Ab2.7之小鼠 中血清鐵含量恢復至正常，但對於同型對照確未恢復。所
I 、 有接收Ab2.7之小鼠展示網狀血球產生提高。在給予4次及 2次投與Ab 2.7之小鼠中網狀血球血紅素含量（cHr)為正 常’但仍在使用1次投與之組或同型對照組中發現低色 性。以4次及2次投與Ab2.7進行處理使網狀血球（Retic. MCV)恢復至正常體積，但小紅血球症仍存在於ί次投與組 及同型對照組中。與使用同型對照處理之注射有β — gal之動 物進行統計比較以破定尋找正常紅jk球特徵恢復（具有 Dunnett事後檢驗之ANOVA)。 128410.doc -184- 200900420 實例21--病毒性海帕西啶過度表現引起對紅血球生成素之 低反應性 下列實例研究海帕西啶及海帕西啶活性拮抗劑對紅血球 生成素低反應性小鼠之作用。 如圖13B中所示，在小鼠中aAV所介導之人類海帕西啶 表現之滴定導致血清海帕西啶含量及劑量依賴性血鐵過少 症提咼。選擇A AV-人類海帕西啶之劑量以便提供紅血球生 成素抵抗表型且於與在先前研究中在癌症患者試樣中所偵 測之類似範圍内表現海帕西啶含量（如共同申請中並共同 擁有之美國專利申請案第11/880,3 13號及國際專利申請案 第PCT/US2007/016477號中所述’其揭示内容以引用方式 全部併入本文中）。給雄性C57BL/6小鼠注射表現人類海帕 定或GFP之AAV作為表現對照（每組n=4)。經由尾部靜脈 給小鼠注射（人類海帕西啶，IxlO12至3xl012顆粒/小鼠· ㈣’ 3X1012顆粒/小鼠）。使蛋白質表現以便發育兩週，隨 後M °在兩週時’自小氣中收集血清且測定鐵及海帕西 咬含i。結果報導於圖13Β中。 為評價海帕西哈料& 疋對 '工血球生成素抵抗之效應，給雄性 L/6 j既’主射含有人類海帕西啶或GFp之表現卡匣之 A仰xl0】2顆粒/小良，肝門靜脈輸送）以便作為陰性對昭 (每組n=5)。將小鼠佴拄 ’、 %保持3週以便組成性產生人類海帕西 啶’且隨後抽血以 乂測疋基線血紅素（Hb)含量。在第4週時 將小昧、以達貝泊汀〇 (^克/公斤/小鼠）或生理食鹽水處 理作為陰性對照。 在第5週時，再次量測血紅素含量。結 128410.doc -185- 200900420 杲展示於圖13 A中。過度表現人類海帕西啶之小鼠對高劑 量之達貝泊汀α具有抗性。對達貝泊汀α之抗性顯示高海帕 西11定含量足以引起對紅血球生成素之低反應性。 實例22 —在病毒性海帕西啶過度表現模型中使用海帕西啶 活性拮抗劑與紅血球生成刺激劑之組合療法 以抗海帕西啶抗體處理具有紅血球生成素抵抗表型之小 鼠使對使用達貝泊汀α進行處理之反應性恢復。給雄性 C57BL/6小鼠注射含有編碼人類海帕西咬或GFp之基因之 AAV(5 X 1 〇12顆粒/小鼠，靜脈内）以便作為表現對照（每組 n=5)。在保持兩週以形成組成性蛋白表現之後，給小鼠抽 血以測定基線血紅素（Hb)含量，隨後使用Ab 2.7( 1毫克/小 鼠）或同型對照以各種投與頻次處理。在第一次投藥次 曰’將該等鼠以達貝泊汀a(100 pg/kg，皮下）處理。投藥 時程之示意圖發表於圖15A中。 海帕西啶之中和作用使對達貝泊汀α之反應性恢復。週 一-週三•週五投與抗體導致如由Hb含量之增量所量測之對 達貝泊汀α處理的部分反應；使用相同抗體投與但不進行 達貝泊yja處理之組未展示Hb含量升高。（參見圖15B)在每 曰（週一至週五）接收Ab 2.7投與之小鼠中獲得對達貝泊 之最大反應。（參見圖15C)。如由Hb含量所量測，兩份及 三份劑量抗體與達貝泊汀α處理組合導致部分反應。（參見 圖15D)。如圖15Ε中所示，對達貝泊汀α處理之抗體劑量及 近似抗體劑量影響對抗海帕西啶抗體處理之整個Hb反應 (結果不同於對照，其中使用Dunnett事後檢驗之AN〇VA之 128410.doc -186- 200900420 p<0.01以雙星號註釋）。因此，海帕西咬之抗體所介導之中 和作用展示對於由海帕西啶含量升高所引起之貧血症的有 效治療。 實例23--鼠類海帕西啶1之siRNA之設計及合成 葳癀廣妨西啶7 见4活邀介鏔撿..將CHO-mHepcidij^ 定細胞（Helen Kim)以30,000細胞/孔接種於96孔板中。第 二天，藉由移除培養基且添加1 〇〇 μ1轉染複合物來轉染細 胞。如下製造轉染複合物：將1 μΐ 1 〇〇 μΜ siRNA添加至於 I 管 A 中之 1 25 μΐ 〇pti-MEM(Invitrogen #3 1985)中·。在管 b 中’將15μlTransIT-TKO轉染試劑（Mirus#MIR-2154)添加 至125 μΐ Opti-MEM中。將兩個管在室溫下培育12分鐘。 將兩管之内容物混合且在室溫下培育1 5分鐘，隨後添加至 該等細胞中。在18小時後轉染後，移除培養基且使用ι〇〇 μΐ lxQuantiGene溶胞混合物（Panomics # QG 0502)溶解細 胞。使用分支DNA檢定（QuantiGene檢定套組，panomics #
QG0003)分析溶解產物之 mHepcidin 及 mCyclophilin A c
mRNA含量。參見表8關於CHO-mHepcidin細胞中之siRNA 序列及mRNA敲除％。 siRNA #6及#10轉換至PENTR-U6-shRNA表現構築體：藉 由2階段重疊PCR產生pENTR-U6-shRNA表現構築體。步驟 1經由5'-PCH反應及3'-PCR反應產生2個重疊序列。5，-Pcr 反應產生含有attB 1重組位點、hU6啟動子、siRNA有義序 列、環及siRNA反義序列之序列。總體積為1 〇 μΐ之反應如 下：lxPCR Supermix(Invitrogen #10572-014)、1 pMattB- 128410.doc -187- 200900420
111-U6 正向引子（5'-GGGGACAAGTTTGTACAAAAAAGC AGGCTTAGATCTGAATTCAATTTACGCGTGGGATCCAAG GTC-3’，SEQ ID NO: 105)、0.1 μΜ REV-U6-shRNA 引 子（對於 #6 ： 5，-CTTTTCTCATGAAAAAGGCTGCAGCT CTGTAGCGGTGTTTCGTCC-3'(SEQ ID NO: 63)及 #10: 5，-TACATCTCATGAATGTAGTCTGTC TCATCTGTCGGTGTTTCGTCC-3'(SEQ ID NO: 67)具有唯一性）及 0.5 ng(l pl)pSuppressor 模 板質體（IMGENEX #IMG-700)。3'-PCR反應產生含有 shRNA有義、環及反義序列、PolIII終止子及attB2重組位 點之序列。總體積為10 μΐ之反應如下：1 X PCR Supermix(Invitrogen #10572-014)、1 μΜ AttB-202反向引 子（GGGGACCACTTTGTACAA GAAAGCTGGGTAAAAA， SEQ ID NO: 106)、0.1 μΜ FW-U6-shRNA 引子（對於 #6 : 5，-CTTTT TCATGAGAAAAGGCTGCAGCTCTGTAGCTTTTTACCCAGC-3' (SEQ ID NO: 63)及 #10 : 5'-TACATTCATGAGATGTAGT CTGTCTCATCTGTCTTTTTACCCAGC-3'(SEQ ID NO: 67) 具有唯一性）。兩個反應之PCR條件如下：3分鐘95°C循環1 次、95°C 45 s、52°C 45 s、72°C 45 s循環 30次及 5 分鐘 72°C循環1次。PCR之步驟2組合來自步驟1之5'及3'PCR產 物用於退火/填充反應以產生全長序列：attBl-hU6啟動子-有義-環-反義-終止子-attB2。總體積為20 μΐ之反應如下： 將來自步驟1之PCR產物：5'及3'PCR反應液混合且在熱循 環器中使用下列條件運作：95°C 2分鐘、52°C 2分鐘、72 °C 2分鐘（循環5次）加72°C 10分鐘。 128410.doc -188- 200900420 藉由如下將Gateway BP重組於pDONR221中以產生 pENTR構築體來重組PCR產物：將7.5 ng(l μΐ) pDONR221(Invitrogen #12536-017)、1 μΐ 5χΒΡ反應緩衝液 (Invitrogen #52891)、1 μΐ ΒΡ選殖酶（Invitrogen #1 1789-01 3)及2·5 μΐ重疊PCR產物混合在一起且在室溫下培育2小 時。隨後添加1 μΐ蛋白酶K(Invitrogen #52895)且在37°C下 培育10分鐘。將整個6 μΐ重組反應液轉移至One Shot ToplO化學感受態細胞（Invitrogen #C4040-03)中且塗佈於 LB-卡那黴素（LB-kanamycin)板上。選擇且擴增菌落。藉 由使用M13FW及M13REV定序引子對U6-shRNA區域進行 DNA定序來確認質體DNA。 表8 siRNA 編號 siRNA序列(有義，5，-3’） 在 CHO-mHepcidin 細胞 中藉由siRNA之 mRNA敲除％ 在HEK293細胞 中藉由AAV-shRNA 之 mRNA 敲除％ SEQ ID NO： 1 UGUAAAUGC UGU AAC AAU U 95 58 2 GCU GUAAAU GCU GUAACAA 95 59 3 GUG UGG UAU CUG UUG CAAA 96 60 4 GCAGACAUU GCG AUACCAA 90 61 5 AUACCAAUG CAG AAGAGAA 94 62 6 CUACAGAGC UGC AGC CUU U 95 69 63 7 GAAGAGAGA CAC CAA CUU C 88 64 一 8 ACU UCCCCAUCU GCAUCUU 27 65 9 CUGAGCAGC ACC ACC UAU C 86 66 10 ACAGAU GAGACA GAC UAC A 96 81 67 128410.doc -189- 200900420 11 CAAUGC AGAAGA GAAGGAA 86 68 12 AAU UCC CAG UGU GGU AUC U 65 69 實例24--在炎性貧血症之小鼠模型中使用海帕西啶表現抑 制劑與紅血球生成刺激劑之組合療法 在如下之鼠類炎性貧血症模型中評價使用海帕西啶表現 抑制劑與紅血球生成刺激劑之組合療法。 產生鼠類海帕西咬抑制之聚核苷酸海帕西σ定表現抑制劑 製備如下。在如實例23中所述之AAV表現系統中將經證明 (具有針對海帕西啶之活體外特異活性的siRNA(siRNA 6 CUACAGAGCUGCAGCCUUU(SEQ ID NO: 70) ； siRNA 10 ACAGAUGAGACAGACUACA(SEQ ID NO: 71))轉化成 shRNA。 給小鼠以門靜脈方式注射含有陰性對照shRNA(抗螢光 素酶，2 X 1012顆粒/小鼠）或特異性抗海帕西啶 shRNA(shRNA 6，5x10"顆粒/小鼠=低劑量；2xl012顆粒 / 小鼠=培養基劑量；及shRNAlO，2xl012顆粒/小鼠=高劑 ί 量）之AAV病毒。在該等小鼠中藉由以流產布氏桿菌 (Brucellaabortus)(BA)(5xl08 顆粒/小鼠，提供 7天，隨後採 集）處理來誘發發炎。亦評價無發炎誘發及無shRNA處理 之對照小鼠以測定未經處理動物中之平均海帕西啶含量。 使用MALDI-TOF質譜分析測定小鼠海帕西啶含量。使 用MSIA-tips(具有經固定之抗小鼠海帕西啶抗體R9之親和 性移液管）自小鼠血清中提取海帕西啶。將經提取之海帕 西啶溶離於MALDI靶標上以供飛行時間質譜檢測。將人類 128410.doc -190- 200900420 海帕西啶用作定量之内標物。 在注射shRNA之後25天測定血清海帕西啶及血清血紅素 含量。以抗海帕西啶shRNA處理之小鼠展示海帕西咬含量 對非發炎性水準之抑制。參見圖14A。海帕西啶mRNA含 量與彼等血清海帕西咬之含量一致。 給平行組中之小鼠注射如上所述之病毒（陰性對照或海 帕西啶特異性shRNA)且IS天後以流產布氏桿菌處理以誘 發炎性貧血症。在第19天時，給動物注射l〇〇 pg/kg Aranesp以刺激促紅血球形成性反應且一週以後（如上所述 之同一採集時點）測定血紅素（Hb)含量。圖14B展示不進行 發k性處理之對照動物通常對Aranesp響應並伴有Hb升高 3-4 g/dL，而以BA處理之動物對Aranesp反應遲鈍。與此 相反，進行BA處理並接受海帕西啶表現抑制劑之小鼠展 示對Aranesp響應。因此，以海帕西啶表現抑制劑進行處 理以抑制海帕西啶至前發炎性水準並與Aranesp處理組合 產生正常血紅蛋白含量。參見圖14B。該等結果展示以海 帕西啶表現抑制劑進行處理恢復對Aranesp之反應性。 實例25__在炎性貧血症之小鼠模型中使用抗海帕西咬抗體 與紅血球生成刺激劑之組合療法 在如下之鼠類炎性貧血症模型中亦評價使用海帕西啶活 性拮抗劑與紅血球生成刺激劑之組合療法。 產生小鼠使得鼠類海帕西啶丨經敲除且置換為人類海帕 西11疋。在第0天給雌性小鼠（人類海帕西啶表現與野生型同 窩仔對照之純合子）注射流產布氏桿_(2><1()8顆粒/小鼠， 128410.doc • 191 · 200900420 腹膜内）且隨後在第, 抽血以評估血紅素含量。隨後在第 6天至第9天以抗體9 7 4·' m ， 7或同型對照抗體（1毫克/小鼠/天）處理 小鼠。在第7天投盘这目，A ' '、違貝泊>τα(100微克/公斤/小鼠）且在第 13天評價Hb含量。舲士电 ^ 方案之示思圖展示於圖16A中。 仍具有小鼠海帕西哈丨| m 疋1基因之野生型對照小鼠在存在或 不存在Ab 2.7之情況下並不響應達貝泊、汀α。（參見圖 16Β)。如由維持穩定a紅素含量所示，以抗體2·?處理之
人類敲入型小鼠顯示對達貝泊、汀α處理之反應性恢復。（參 見圖16C)。 該等結果證明海帕西π定活性#抗劑可用於在海帕西。定過 畺之條件下中和海帕西啶且在海帕西啶所介導之貧也症 (諸如炎性貧血症）中恢復對紅血球生成試劑之反應性。 實例26—量測患者中之海帕西啶含量 如先前在同在申請中並共同擁有之美國專利申請案第 1 1/880,3 13號及國際專利申請案第1>(：：丁/1；82〇〇7/〇16477號中 所述般S測人類患者中之海帕西啶含量，該等文獻之揭示 内谷以引用方式全部併入本文中。以下再現該方法。 自患有癌性貧血症之患者（獲自Pr〇te〇Genex)或志願者 (對照）採集試樣。藉由SPE使用〇asis HLB mElution 96孔 板（Waters，Milford，ΜΑ)提取1〇〇 各試樣、血清空白及 由 7 個非零濃度（1〇、25、50、1〇〇、250、500、1000 ng/mL)組成之一式兩份校準標準物。洗滌溶劑為3〇%甲醇/ 水，且以氫氧化敍調節pH值為約1 〇。溶離溶劑為9〇。/。甲醇 /水溶液，且以乙酸調節pH值為約5。將SPE板以500 pL甲 128410.doc -192- 200900420 醇活化且以500 μΐ^水調節，隨後將丨〇〇叫血清試樣及200 μ!^内標物裝填於溶離板上，以35〇 水及35〇叫洗滌溶劑 洗滌。使用1 00 pL溶離溶劑進行溶離且以丨〇〇叫水稀釋。 藉由LC-MS/MS分析所得200 pL溶離液。 將20 μΐ各提取試樣注入p〇iaris ci8A，5 μηι HPLC管柱 (2_lx50 mm，Varian)中。LC流速設定為300微升/分鐘。 HPLC移動相A為5:95甲醇/水且移動相B為95:5甲醇/水，兩 者皆含有0.1 %甲酸。梯度條件設定如下：〇_〇丨分鐘，等度 2%8/98%八；0.1-4.5分鐘，2%丑至95%丑；4.5-4.9分鐘， 95% B ; 4.9-5_0 分鐘，95% B 至 2¾ B ; 5.0-6.0 分鐘，等度 2% B。 將來自 Applied Biosystems(Foster City, CA)之具有 Turbo ESI源之Sciex API4000三重四極質譜儀以離子躍遷為w/z 930.60至历々l10.15之MRM模式用於海帕西啶偵測。藉由 將海帕西啶及内標物之LC峰面積之比率與獲自一系列標準 物之比率進行比較來實現量化，其中已知海帕西啶及内標 物之量。 此實驗允許測定假定含有大量健康個體之對照群體中之 海帕西啶的血清含量以及罹患癌性貧血症（A〇c)之患者之 海帕西啶的血清含量。該等結果展示於圖丨8中。
隨後分析各患者試樣之其他鐵指標濃度以確定患者是否 患有發炎或缺鐵性貧血症（圖19)。該等參數量測如下：於 Olympus AU400臨床實驗室分析儀上使用標準程序量測血 /月鐵UIBC鐵蛋白及CRP ;使用標準ELISA方法（R & D I28410.doc •193- 200900420 系統）量測s T fR。 實例27--市售DRG原海帕西啶ELISA並不偵測成熟海帕 西咬 下列實例證明市售原海帕西啶ELISA套組（DRG Inti. Inc.，Germany)不能夠偵測試樣中之成熟海帕西啶。 產生多種合成及重組海帕西咬製備物（包括合成產生之 海帕西啶（如實例3中所述）、重組產生之海帕西啶（如實例2 中所述）及自尿中分離之海帕西啶（如實例1中所述D以便評 價與重組性原海帕西啶相比各海帕西啶製備物之反應性。 海帕西咬試樣之每一者顯示活體外及活體内生物活性。市 售原海帕西17疋丑1^18八套組（0尺0 1111;1.111〇.，〇61'111311)^)/[貞測重 組性原海帕西啶（圖20A)，但不偵測多種成熟海帕西啶製 備物（圖20B)。亦使用DRG原海帕西啶ELISA套組測試其他 形式之海帕西啶’包括shHepc(合成產生之摺疊人類海帕 西啶）、rhHepc(以前肽形式重組性表現於大腸桿菌中隨後 摺疊且分解之物質）、shHePc20(在N-末端處缺少5個胺基 酸之海帕西啶變異體）、shHepc ABU(由5-胺基丁酸（ABU) 取代半胱胺酸殘基以消除二硫鍵形成之海帕西。定線性型 式）、尿海帕西啶（自敗血病患者尿中純化）及C1_c8、C3-C6海帕西啶（歸因於在C2、C4、C5及C7處之ABU取代而缺 少兩個二硫鍵連接之分子形式）。與根據成熟海帕西啶所 觀測之結果類似’該等形式之海帕西α定不受Drg原海帕西 啶ELISA偵測。 以上資料證實市售DRG原海帕西啶ELISA套組不能偵測 128410.doc -194 - 200900420 成熟海帕西Π定。 實例28一在癌性貧血症（AoC)患者中海帕西啶（但非DRG原 海帕西啶）與發炎相關聯 已嘗試使用DRG原海帕西啶ELISA套組來使海帕西啶與 發炎性病況相關聯。（參見例如Hsu等人，Blood
Purification，24..311-16，2006 ; Kemna 等人，Blood， 106.1864-66，2005，Ouz 等人，Anadolu Kardiyoloji Dergisi’ 6.239-42，2006 ’ Taes等人，Clinical Chemistry & Laboratory Medicine，42:387-89，2004 ; Theurl 等人， Blood，107:4142-48, 2006)。然而，此實例顯示使用DRg原 海帕西啶ELISA套組所量測之原海帕西啶含量並不與患者 之成熟海帕西定含里相關聯，原海帕西σ定含量亦不與患者 之發炎性病況相關聯。 為可靠評估原海帕西啶濃度，在—系列不同緩衝液或血 /月中在2 5 C下培月6 0分鐘之後量測原海帕西咬標準物。藉 由夾心免疫檢定使用用於捕捉之Ab2.7(Ab2.7偵測成熟海 帕西。定中之抗原決定基）及用於偵測之生物素標記兔抗原 海帕西啶多株抗體（其偵測前區段中之抗原決定基）來測定 原海帕西咬濃度。展示於圖21中之結果證明在血清中原海 帕西咬係不可偵測的’此表明其迅速發生降解。 西方墨點法實驗確認除非添加弗林抑制劑，否則原海帕 西咬在血清中發生降解（圖22)。將原海帕西啶（2 111§)在37 C下培育12小時或立即添加，隨後在存在或不存在弗林抑 制劑之情況下使僅培養基或含有丨〇%胎牛血清之培養基跑 128410.doc •195- 200900420 凝膠。將未還原試樣使用NuPage 4_12% Bis_Tris凝勝分 離，點墨於硝化纖維素膜上且使用兔抗海帕西啶多株抗血 清、接著抗兔HRP-接合之第二抗體偵測。 假定在血清中原海帕西啶具有不穩定性質，在患者試樣 中使用DRG原海帕西啶ELISA套組所偵測之原海帕西啶含 量升高可能反映原海帕西啶或另一蛋白質之沁末端部分分 解。為確定血清原海帕西啶含量是否與血清海帕西啶含量 相關，在對照供體及癌性貧血症（A〇c)患者之血清中量測 海帕西啶及原海帕西啶含量。使用同在申請中並共同擁有 之美國專利申請案第11/88〇,313號及國際專利申請案第 PCT/US2007/016477號中所述之基於質譜分析之定量方法 測定海帕西啶濃度，該等申請案之揭示内容以引用方式全 部併入本文中。在AoC患者（r=〇 1〇14 ; NS)或對照供體（r= -0.1128 ; NS)中於由基於質譜分析之定量方法所量測之海 帕西咬含量與由DRG原海帕西啶EUSA套組所量測之原海 帕西α疋含量之間未發現顯著相關性。（圖1 9)。因此，如由 DRG原海帕西啶ELIS Α套組所量測之原海帕西啶含量升高 不能用作海帕西σ定含量之替代者。 為確疋在患有發炎之患者中如由DRG原海帕西咬ELIS A 套組所量測之海帕西咬或原海帕西咬含量是否升高，將兩 個指標與患者血清中之C-反應性蛋白含量相比。 CRP為發炎之公認標兄。在癌性貧血症患者中觀測到cRp 與海帕西啶含量之間的強相關性（圖24A)，但在該等患者 中未觀測到CRP與DRG原海帕西啶之間的相關性（圖24B)。 128410.doc -196- 200900420 正常供體展示CRP與海帕西啶或DRG原海帕西啶之間無顯 著相關性’但在該等供體中CRP含量並未顯著升高，從而 使相關性難以偵測。海帕西咬（但非原海帕西„定）展示在癌 性貧血症患者中與CRP之相關性且因此可用作發炎之標 I己。 因為大多數常用實驗室參數受急性期反應影響，所以使 區刀乂性貧血症（AI)與缺鐵性貧企症（ida)及混合性貧血症 (AI與IDA之要素）複雜化。使用可溶性轉鐵蛋白受體（sTfR) 及鐵蛋白（Ft)值之比已於文獻中描述為一種用以提供較為 精確之診斷的方法。參見Punn〇nen等人，B1〇〇d，89:1〇52_ 57，1997。炎性貧血症特徵在於低sTfR/log Ft商（值低於 1)，而高比值預示IDA。因此，sTfR/l〇g Ft比值當與發炎 性標記組合以辅助診斷混合性貧血症與純ID A時可充當三 種病狀之精確預測值。 測試如由DRG原海帕西啶ELISA套組所量測之海帕西啶 與原海帕西咬的辅助此診斷之能力。在AI中如由sTfR/1〇g Ft所測定之海帕西啶含量升高。在A〇c患者中海帕西啶含 里與 sTfR/l〇g Ft 值強烈有關（r=_〇 64〇7 ; p<〇 〇〇〇1)。因 此，在AoC患者中海帕西啶含量與sTfR/1〇g以值強烈相 關，此展示清楚相關性且輔助患者診斷（圖25A)。對於 DRG原海帕西啶，未發現該相關性（圖25B)。 使用組合作為發炎之標記之CRP及sTfR/1〇g Ft的決策 樹’可將癌性貧血症患者再分成彼等患有AI '混合性貧血 症、IDA及未知病因貧血症（稱為"其他類型之患者（圖 128410.doc -197- 200900420 二觀測到具有高海帕西咬含量之患者全部患有ai或混 &性貝血症。（圖26)。觀測到具有低或無海帕西咬含量之 患者患有ΠΜ或未知病因貧★症。如同在中請中並共同擁 有之吴國專利巾請㈣丨丨/ 8 8 Q，3丨3號及國際專财請案第 PCT/US2GG7/()16477號中所描述且以上詳細論述之基於質 譜分析之定量方法所量測的海帕西。定含量可用於診斷炎性 貧血症’該等文獻之揭示内容以引用方式全部併入本文 中。 f
實例29_·海帕西啶之夹心ELISA中之多株抗體 因為多株抗體表示針對免疫原之不同抗體之複雜混合 物，所以其表示一種偵測存在於蛋白質中之所有可能之抗 原决疋基的方法。為確定針對海帕西啶之單株抗體夹心 ELISA為可能的，使用針對KLH•接合之成熟人類海帕西咬 之多株抗體進行初步實驗。 將來自多株兔抗血清之IgG塗佈於微量滴定盤上，將成 熟海帕西啶稀釋且添加至該板上且使用來自相同來源之生 物素標記IgG偵測經結合海帕西啶。所有抗體以1〇之 濃度使用。如圖27所示，此實驗能夠偵測經結合海帕西 啶，其表明其可能量測呈夾心格式之海帕西 /、、、叫此檢· 定之敏感度較低，其表明兩種抗體同時結合海帕西啶之能 力可爿b為罕見情況。 實例30 —海帕西啶之夾心免疫檢定中之單株抗體 下列實例描述一種用以測定試樣中之海帕西啶含量的夾 心免疫檢定。 128410.doc -198- 200900420 使用Biacore分析，測試經抗體1S1塗佈之表面上的海帕 西σ疋與另一抗體之同時結合（圖28)。根據製造商之用法說 明書使用0.005% P-20/PBS緩衝液連續流將抗Hepc抗體1S1 固疋於感應器晶片表面上。簡言之，藉由注入6〇 0含有 0.2 Μ Ν-乙基-Ν -(一甲基胺基丙基）碳化二亞胺（edc)及 〇.〇5 Μ Ν-羥基琥珀醯亞胺（NHS)之混合物來活化感應器晶 片表面上之叛基。接著注入濃度為2〇 pg/mL的稀釋於1 〇 mM乙酸鹽（pH值為4·〇)中之1S1。藉由注入6〇叫i m乙醇 胺使表面上之過量反應性基團失活。對於Ab iS1表面而 言，最終固定水平為5,000·6,000共振單位（RU)。亦於感應 器晶片上製備空白模擬偶合參考表面。將2〇 11河大腸桿菌 源性人類海帕西啶注射於1S1抗體表面上且與其結合。隨 後將50 nM抗體2.7、23F11、26F11及1S1注射於海帕西啶 /1S1表面上。在抗體注入之後，藉由注入30 μι 10 mM HC1(PH值為2.0)使該等表面再生。 對於複合物形式之結合存在高選擇性。用於上述競爭性 核疋中之鼠類抗體2.7不能與1S1形成夾心對，且相較於 而。26F11顯示與1 § 1同時結合於海帕西咬之能力 顯著較低。
貝例31 —針對成熟海帕西啶之單株抗體可用於構建夾心 ELISA 根據實例30中所獲2Biac〇re結果，針對與1S1"成對"之 月匕力對先剛已證明對海帕西啶具有反應性之丨丨〇〇種抗體進 订4私。僅鑑別出〗丨種抗體或約丨％抗體為合適的。因此看 128410.doc •199· 200900420 來形成可用於展開海帕西啶之夾心檢定之"對”的能力敕為 罕見。當將1S1及23F11裝配成夾心ELISA格式時，用於侦 測海帕西咬含量之免疫檢定之敏感度得以改良5〇倍。如圖 29中所示，該檢定證明能夠在5〇倍預先稀釋步驟之後量娜 正常血清中之海帕西啶含量。轴線表示海帕西啶含量預先 稀釋度。 實例32--競爭性結合檢定 下列實例描述一種用以測定海帕西啶含量之競爭性結合 檢定。在一方案中，存在於血清中之未標記海帕西啶與生 物素標記海帕西啶競爭結合抗海帕西啶抗體（例如抗體 2.7)。 使用不同濃度（1.4-300 ng/ml)之攙入緩衝液（5% BSA:I- 阻断緩衝液）、兔血清或混合人類血清中之海帕西咬標準 物測定海帕西。定含量❶將海帕西咬添加至等體積4〇 ng/mL 之Ab2_7中且培育120分鐘。將25微升/孔之混合溶液添加 至塗有1-2 pg/mL GxM捕捉抗體之黑色半區域板中，以 0-25 nM添加25微升/孔之生物素標記海帕西啶。將板以板 薄膜密封物覆蓋且在室溫（25°C )下於約<200 RPM之板式震 盛器上培育約60分鐘。洗滌該板且隨後添加50微升/孔之 Poly辣根過氧化物酶擴增試劑（1:2000)。使該板靜置30分 鐘且隨後以板式洗滌器使用PBS或KPL緩衝液洗滌6次。將 該板輕拍乾燥且迅速添加發光受質（Femt〇或Pico)。以光度 6十（購自：[11^\ 340)使用？6!111;〇或1>丨〇〇受質對該板讀數，歷 日rr 1秒。結果表明在兔血清與緩衝液中海帕西咬在1 _ 1 〇〇 128410.doc -200- 200900420 ng/ml之濃度範圍内皆為可量測的。（圖3〇)。 犯合人類血_清看來似乎具有大於2 〇 ng/ml之現有海帕西 咬含量。據測定對於各種隨機所選擇的血清，人類血清十 之海帕西啶含量大體上在卜川ng/ml之範圍内變化（圖 31) ° 使用上述所測定之兔血清中之海帕西咬標準物，測試 種來自正常人類個體之隨機血清。海帕西啶含量自不可摘 測至超過50 ng/mi變化。參見圖32。該等值與經由同在申 请中並共同擁有之美國專利申請案第1 1/880,3 13號及國際 專利申請案第！>(：丁/1；82007/016477號中所述的基於質譜分 析之疋里方法所置測的海帕西咬含量之結果不符，後者通 常給出低得多之值，其中該等專利申請案之揭示内容以引 用方式全部併入本文中。 實例33 —對獲得生物試樣中之海帕西啶濃度之各種方法的 比較結果 對藉由各種技術（包括質譜分析（實例25)、競爭性 EUSA(實例32)及夾心ELISA(實例30_3 1))所獲之海帕西啶 含1進行比較。結果示於圖3 3中。 為了揭示案之完整性起見，明確將本文中所引用之所有 專利文件及文獻文章以引用方式全部併入本說明書中。 僅為了說明本發明而閣述了以上描述及實例，而並非意 机存在限制性。因為熟習此項技術者可想到對體現本發明 之精神及貫質的所述實施例進行修改，所以應將本發明廣 泛地解釋丨包㈣於隨附申請專利㈣及纟等效體之範脅 128410.doc -201 - 200900420 内的所有變化。 【圖式簡單說明】 圖1展示人類海帕西α定之所有四種製劑的IRMPD FTMS 譜，其顯示所有三種合成及重組製劑與尿海帕西啶之等效性。 圖2展示人類海帕西σ定之四種製劑的ID ]H NMR譜，其 顯示所有三種合成及重組製劑與尿海帕西啶之等效性。 圖3 Α展示經部分還原及烷基化之海帕西啶在pH值為2時 之HPLC分析。 圖3B展示經部分還原及烷基化之海帕西啶在pH值為3時 之HPLC分析。 圖4展示重組人類海帕西啶之主鏈指紋區之二維 NOESY(深色）-TOCSY(淺色）覆蓋圖，其顯示主鏈共振分 酉己。 圖5展示如實例8中所論述之ωΐ-解耦2D TOCSY& ω!-解 耦2D TOCSY-NOESY實驗的覆蓋圖。Htx質子之共振位置標 有不完整箭頭。星號表示摺疊偽影（folding artifact)。 圖6為人類海帕西π定多肽之示意圖，其指示由兩種部分 烷基化還原技術測定且由NMR確認之各種二硫鍵。 圖 7展示由 Hunter 等人所獲（J. Biol. Chem., 277:37597-603, 2002)(左侧）及如實例8中所測定（右側）之人類海帕西 啶的一般主鏈結構。 圖8展示鼠類抗海帕西啶抗體Ab 43在β-内醯胺酶鐵反應 檢定中降低細胞内鐵濃度之功能能力。 圖9展示鼠類抗海帕西啶抗體2.7在β-内醯胺酶鐵反應檢 128410.doc - 202 - 200900420 定中降低細胞内鐵濃度之功能能力。 圖ίο展示鼠類抗海帕西咬抗體2.41在卜内酷胺酶鐵反應 檢定中降低細胞内鐵濃度之功能能力。 圖11顯示抗海帕西啶抗體中和注射於小鼠中之人類海帕 西咬。 圖12顯示對人類海帕西啶病毒性表現小鼠之抗體中和作 用使正常早期紅血球特徵恢復。 圖13 A展示海帕西啶之病毒性過度表現導致對紅血球生 成素之低反應性。 圖13B展不腺病毒相關病毒（AAV)所介導之海帕西啶表 現與所得血清鐵濃度的滴定結果。 圖14展不在炎性貧血症模型中抑制海帕西啶使對 Aranesp®(達貝泊汀α)之反應性恢復。 圖15Α展示實例22之實驗程序之示意圖。 圖1 5Β-Ε顯示在病毒性過度表現海帕西咬之小鼠中抗海 巾白西啶抗體使對紅血球生成素之反應性恢復。 圖16展示在患有炎性貧血症之人類海帕西σ定敲入（kn〇ck_ ⑺）小鼠中由抗海帕西啶抗體治療對海帕西啶之中和作用使 對紅血球生成素之反應性恢復。 圖1 7A展示關於在無海帕西D定量測之情況下評估患者之 鐵指標及疾病病況的決策樹。 圖17B展示關於使用海帕西啶含量量測來評估患者之理 論決策樹。 圖18顯示海帕西啶含量在癌性貧也症（A〇c)患者中升 128410.doc -203 - 200900420 高，但在正常患者中並不升高。 圖19顯不海帕西啶含量與炎性貧血症之診斷有關而與缺 鐵性貧血症之診斷無關。 圖20展示市售DRG原海帕西啶eusa不能偵測成熟海帕 西π定。 圖2 1展不由夾心免疫檢定所量測之原海帕西啶濃度，其 顯示原海帕西啶在血清中不可偵測。 圖22展示原海帕西啶西方墨點法bi〇〇結果其 才曰示除非藉由弗林抑制劑（fuHn之存在加以保 護’否則原海帕西啶在A清中發生降解。 圖23展示在患者試樣中海帕西啶含量與原海帕西啶含量 (如由市售DRG原海帕西啶ELISA所量測）並不相關。 圖24A-B展示海帕西啶含量與如由c反應性蛋白所評估 之k )生病況有關（A)，而原海帕西咬含量與如由c反應性蛋 白所評估之炎性病況無關（B)。 圖25 A-B展示海帕西啶含量有助於炎性貧血症之診斷 (A)，而原海帕西啶含量並不有助於炎性貧血症之診 ⑻。 y 圖26A-B顯示海帕西啶含量與炎性貧血症之診斷有關 (A) ’而原海帕西啶含量與炎性貧血症之診斷無關（B)。 圖27顯示針對成熟海帕西啶之多株抗體可用於構建夹心 ELISA。 ~ 圖28展示Biacore實驗結果，其顯示兩種單株抗體可立即 與海帕西啶結合。 128410.doc 204- 200900420 圖2 9顯tf可使用針對成熟海帕西。定之單株抗體構建九、、 ELISA。 圖3 0展示如由競爭性結合檢定所測定之存在於緩衝夜 兔血清及混合人類血清中之海帕西咬的濃度。 圖3 1顯示海帕西π定在人類金清中之量測结果。 圖3 2顯示使用競爭性結合檢定所量測之存在於正 、 ^人类員 血清中之海帕西咬的濃度。 圖33展示使用夾心ELISA、競爭性ELISA及質
所 量測且於隨機人類供體中所偵測之海帕西啶含量的比較& 果。 、° 高C反 圖3 4顯示具有高海帕西咬含量之AoC患者亦具有 應性蛋白（CRP含量）。 i 128410.doc 205-

Claims (1)

  1. 200900420 十、申請專利範圍： 1 · 一種與人類海帕西啶（hepcidin)特異性結合之分離之單株 抗體’其中該人類海帕西啶由SEq ID NO: 9中所示之胺 基酸序列組成且具有包含四個二硫鍵環形.成於位於S Eq ID NO: 9中殘基7與23、1〇與13、11與19、及14至22之間 之構形。 2.如請求項1之分離之單株抗體，其中該抗體以如BIAc〇re 或KlnExA所測量之約1X1 (Γ7 Μ或以下之kd與該人類海帕 西α定結合。 3·如請求項1之分離之單株抗體，其中該抗體以如BIAc〇re 或ΚιηΕχΑ所測量之約！ χ丨〇-8 μ或以下之Kd與該人類海帕 西。定結合。 4. 如請求項1之分離之單株抗體，其中該抗體以如mAc〇re 或ΚιηΕχΑ所測量之約丨χ丨〇_9 μ或以下之kd與該人類海帕 西咬結合。 5. 如請求項1之分離之單株抗體，其中該抗體另外拮抗人 類海帕西。定之活性。 6. 如請求項1之分離之單株抗體，其中如鐵蛋白檢定所測 定’該抗體在約1χ1〇-8厘或以下之ECso降低鐵蛋白表現 程度。 7. 如請求項1之分離之單株抗體，其中該抗體在約ιχ1〇_8 M 或以下之ECm降低個體之細胞内鐵含量。 8. 如請求項1之分離之單株抗體，其中該抗體使個體之循 環鐵含量或Tsat增加。 128410.doc 200900420 9· 項1之t離之單株抗體’其十該抗體使個體中至 y 、、工素或血谷比之一者或兩者的量增加。 10·如；1求項1之分離之單株抗體，其中該抗體使個體中至 =血球計數、紅血球計數中之紅i球血紅素含量或紅 球千均細胞容積、或其任何組合之—者增加。 請求項i之分離之單株抗體，其中該抗體使個體中至 =網狀血球計數、網狀血球計數中之網狀血球血紅素含 〆 \ 量或網狀血球平均細胞容積'或其任何組合之一者增 加。 12·=請求項！之分離之單株抗體，其中該抗體降低個體灰 清中游離海帕西咬的含量。 13·如請求項12之分離之單株抗體，其中在該個體中該含量 降低至少約20%。 14’如請求項7_13中任一項之分離之單株抗體，其中該個體 為哺乳動物。 15.如請求項14之分離之單株抗體，其中該哺乳動物為 類。 1 6. 士叫求項1之分離之單株抗體，其中該抗體與該人類海 帕西啶之一個抗原決定基（epitope)結合，該抗原決定義 包3至少一個位於SEq ID NO: 9之位置1至5内之胺美 酸。 土 17.如請求項丨之分離之單株抗體，其中該抗體與該人類海 帕西啶之一個抗原決定基結合，該抗原決定基包含至少 一個位於SEQ ID NO: 9之位置10至13内之胺基酸。 128410.doc 200900420 1 8.如請求項〗之分離之單株抗體，其中該抗體與該人類海 帕西唆之一個抗原決定基結合，該抗原決定基包含至少 一個位於SEQ ID NO: 9之位置14至22内之胺基酸。 1 9.如請求項丨之分離之單株抗體，其中該抗體與該人類海 帕西疋之一個抗原決定基結合，該抗原決定基包含至少 一個位於SEQ ID NO: 9之位置6至25内之胺基酸。 2〇.如清求項1之分離之單株抗體，其中該抗體與位於SEQ ID NO: 9之位置1〇及13之胺基酸之間的二硫鍵所形成之 ί展結合。 21 ·如請求項}之分離之單株抗體，其中該抗體與位於s£q ID NO: 9之位置14及22之胺基酸之間的二硫鍵所形成之 壤結合。 22. 如請求項丨之分離之單株抗體，其中該抗體與該人類海 帕西啶中由至少兩個環所形成之抗原決定基結合，該等 環之第一者係由位於SEQ ID NO: 9之位置10及13之胺基 酉文之間的二硫鍵形成，該等環之第二者係由位於seq⑴ NO: 9之位置14及22之胺基酸之間的二硫鍵形成。 23. —種分離之單株抗體，其與SEQ id 9之人類海帕西 啶結合且抑制海帕西啶之鐵調節活性。 24. 種分離之單株抗體，其與SEQ ID NO: 9之人類海帕西 啶結合且使循環鐵濃度或Tsat增加。 25. 如請求項1之分離之單株抗體，其與一種選自由Ab43、 1S1 1S2、1S3、1S4、1S5、2.7、2_41、R9、1C9、 3B3 4E1、7A3、9D12、12B9、15E1、18D8、19C1、 128410.doc 200900420 19D12、19H6、23F11及26F11組成之群之抗體競爭結合 於海帕西啶（SEQ ID NO: 9)達至少約75%。 26. —種與SEQ ID NO: 9之人類海帕西啶特異性結合之分離 之單株抗體，該抗體包含一個多肽具有與SEQ ID NO: 1 5 或SEQ ID NO: 13至少65%—致之胺基酸序列，該多肽包 含至少一個選自由SEq ID NO: 16-21組成之群之胺基酸 序列且任何序列包含至少一個胺基酸變化於SEQ ID NO: 16-21中之任一者。 27. 如請求項！之分離之單株抗體，其中該抗體包含至少一 個選自由SEQ ID NO: 16-21組成之群之胺基酸序列。 28·如請求項！之分離之單株抗體，其中該抗體包含至少三 個選自由SEQ ID NO: 16-21組成之群之胺基酸序列。 29. 種與SEQ ID NO: 9之人類海帕西。定特異性結合之分離 之單株抗體，該抗體包含一個多肽具有與SEQ ID NO: 27 或SEQ id NO: 25至少65%—致之胺基酸序列，該多肽包 含至少一個選自由SEQ ID NO: 28-33組成之群之胺基酸 序列且任何序列包含至少一個胺基酸變化於SEQ ID NO: 28-33中之任一者。 30. 如請求項丄之分離之單株抗體，其包含至少一個選自由 SEQ Π) NO: 28-33組成之群之胺基酸序列。 3 1 ·如請求項丨之分離之單株抗體，其包含至少三個選自由 SEQ 1〇 NO: 28-33組成之群之胺基酸序列。 32. —種與SEQ ID N〇: 9之人類海帕西啶特異性結合之分離 之單株抗體，該抗體包含一個多肽具有與SEq ID NO: 39 128410.doc 200900420 或SEQ ID NO: 37至少65%—致之胺基酸序列，該多肽包 含至少一個選自由SEQ ID NO: 40-45組成之群之胺基酸 序列且任何序列包含至少一個胺基酸變化於SEQ ID NO: 40-45中之任一者。 3 3.如請求項1之分離之單株抗體，其包含至少一個選自由 SEQ ID NO: 40-45組成之群之胺基酸序列。 3 4.如請求項1之分離之單株抗體，其包含至少三個選自由 SEQ ID NO: 40-45組成之群之胺基酸序列。 35. 如請求項1之分離之單株抗體，其包含SEQ ID NO: 74(XASNLES)之胺基酸序列，其中X為任何胺基酸。 36. 如請求項1或35之分離之單株抗體，其包含SEQ ID NO: 75(XQSNEE)之胺基酸序列，其中X為任何胺基酸。 3 7.如請求項1或35之分離之單株抗體，其包含SEQ ID NO: 76(QQXNEX)之胺基酸序列，其中X為任何胺基酸。 38. 如請求項1或35之分離之單株抗體，其包含SEQ ID NO: 16(RASESVDSYGNSFMH)之胺基酸序歹ij。 39. 如請求項1或35之分離之單株抗體，其包含SEQ ID NO: 77(WINTXSGVPTYADDFXG)之胺基酸序歹ij，其中X為任 何胺基酸。 40. 如請求項1或35之分離之單株抗體，其包含SEQ ID NO: 78(XXYYGX*A* Y)之胺基酸序歹ij ，其中X為任何胺基 酸，*可缺失或可為任何胺基酸。 41. 如請求項1或35之分離之單株抗體，其包含SEQ ID NO: 43(TYGMS)之胺基酸序列。 128410.doc 200900420 42. 如請求項1之分離之單株抗體，其包含SEQ ID NO: 283(VIXYXXSNKYYADSVKG)之胺基酸序列，其中X為 任何胺基酸。 43. 如請求項1之分離之單株抗體，其包含SEQ ID NO: 284(WIXAXNGXXXXAXXXQX)之胺基酸序列，其中X為 任何胺基酸。 44. 如請求項1之分離之單株抗體，其包含SEQ ID NO: 285(AQEGXAPDAFDI)之胺基酸序列，其中X為任何胺基 酸。 45. 如請求項1之分離之單株抗體，其包含SEQ ID NO: 286(QAWYSSTNVX)之胺基酸序列，其中X為任何胺基 酸。 46. 如請求項1之分離之單株抗體，其包含SEQ ID NO: 287(QAWDSSTAXX)之胺基酸序列，其中X為任何胺基 酸。 47. 如請求項1之分離之單株抗體，其包含SEQ ID NO: 288(QSDYSSXXX**)之胺基酸序列，其中X為任何胺基 酸，*可缺失或可為任何胺基酸。 48. —種與SEQ ID NO: 9之人類海帕西啶特異性結合之分離 之單株抗體，該抗體包含一個多肽具有與SEQ ID NO: 51 或SEQ ID NO: 49至少65°/。一致之胺基酸序列，該多肽包 含至少一個選自由SEQ ID NO: 52-57組成之群之胺基酸 序列且任何序列包含至少一個胺基酸變化於SEQ ID NO: 52-57中之任一者。 128410.doc 200900420 49.如請求項1之分離之單株抗體，其包含至少一個選自由 SEQ ID NO: 52-57組成之群之胺基酸序列。 5〇·如請求項丨之分離之單株抗體，其包含至少三個選自由 SEQ ID NO: 52-57組成之群之胺基酸序列。 5 1. 種與SEQ ID NO: 9之人類海帕西π定特異性結合之分離 之單株抗體，該抗體包含一個多肽具有與SEQ ID NO: 或SEQ ID NO: 108至少65%—致之胺基酸序列，該多 月太包含至少一個選自由SEQ ID NO: 111-116組成之群之 月安基酸序列且任何序列包含至少一個胺基酸變化於SEQ ID NO: U1_U6中之任一者。 5 2.如請求項1之分離之單株抗體，其包含至少一個選自由 SEQ ID NO: 111-116組成之群之胺基酸序列。 53. 如請求項1之分離之單株抗體，其包含至少三個選自由 SEQ ID No: 111 -11 6組成之群之胺基酸序歹^。 54. 一種與SEQ ID NO: 9之人類海帕西啶特異性結合之分離 之單株抗體’該抗體包含一個多肽具有與SEQ ID NO: 12〇或SEQ ID NO: 11 8至少65%—致之胺基酸序列，該多 狀包含至少一個選自由SEQ ID NO: 12 1-126組成之群之 胺基酸序列且任何序列包含至少一個胺基酸變化於SEq ID NO: 121-126 中之任一者。 55. 如請求項1之分離之單株抗體，其包含至少一個選自由 SEQ ID NO: 121-126組成之群之胺基酸序列。 56. 如請求項1之分離之單株抗體，其包含至少三個選自由 SEQ ID NO: 121-126組成之群之胺基酸序列。 128410.doc 200900420 57，一種與SEQ ID NO: 9之人類海帕西咬特異性結合之分離 之單株抗體’該抗體包含一個多肽具有與SEQ ID N〇: 130或SEQ ID NO: 128至少65%—致之胺基酸序列，該多 肽包含至少一個選自由SEQ ID NO: 13 1-136組成之群之 胺基酸序列且任何序列包含至少一個胺基酸變化於SEq ID NO: 131-136 中之任一者。 58.如請求項1之分離之單株抗體，其包含至少一個選自由 SEQ ID NO: 131-136組成之群之胺基酸序列。 5 9.如請求項1之分離之單株抗體，其包含至少三個選自由 SEQ ID NO: 13 1 -1 3 6組成之群之胺基酸序列。 60. —種與SEQ ID NO: 9之人類海帕西啶特異性結合之分離 之單株抗體’該抗體包含一個多肽具有與SEQ ID Ν〇. 140或SEQ ID NO: 138至少65%—致之胺基酸序列，該多 肽包含至少一個選自由SEQ ID NO: 141-146組成之群之 胺基酸序列且任何序列包含至少一個胺基酸變化於SEq ID NO: 141-146 中之任一者。 6 1.如請求項1之分離之單株抗體，其包含至少一個選自由 SEQ ID NO: 14 1-146組成之群之胺基酸序列。 62. 如請求項1之分離之單株抗體’其包含至少三個選自由 SEQ ID NO: 14 1-1 46組成之群之胺基酸序列。 63. —種與SEQ ID NO: 9之人類海帕西啶特異性結合之分離 之單株抗體，該抗體包含一個多肽具有與SEq ID Ν(). 150或SEQ ID NO: 148至少65%—致之胺基酸序列，該多 肽包含至少一個選自由SEQ ID NO: 15 1-1 56組成之群之 128410.doc 200900420 個1胺基酸變化於SEQ 胺基酸序列且任何序列包含至少—個胺美 ID NO: 151-156 中之任一者。 少一個選自由
    胺基酸序列且任何序列包含至少一個胺基酸變化於seq ID NO: 161-166 中之任一者。 64.如請求項1之分離之單株抗體，其包含至少 SEQ ID NO: 151-156組成之群之胺基酸序列 67,如請求項】之分離之單株抗體，其包含至少一個選自由 SEQ ID NO: 161-1 66組成之群之胺基酸序列。 68_如請求項！之分離之單株抗體，其包含至少三個選自由 SEQ ID NO: 161-166組成之群之胺基酸序列。 69. —種與SEQ ID NO: 9之人類海帕西啶特異性結合之分離 之單株抗體’該抗體包含一個多肽具有與SEq ID Ν〇: 170或SEQ ID NO: 168至少65%—致之胺基酸序列，該多 肽包含至少一個選自由SEQ ID NO: 171-176組成之群之 胺基酸序列且任何序列包含至少一個胺基酸變化於SEq ID NO: 171-176 中之任一者。 7 〇 ·如請求項1之分離之單株抗體，其包含至少一個選自由 SEQ ID NO: 171-1 76組成之群之胺基酸序列。 128410.doc 200900420 71.如請求項1之分離之單株抗體，其包含至少三個選自由 SEQ ID NO: 171-176組成之群之胺基酸序列。 72· —種與SEQ ID NO: 9之人類海帕西啶特異性結合之分離 之單株抗體，該抗體包含一個多肽具有與SEQ ID NO: 313(Ab 18D8 可變重鏈）或 SEQ ID NO: 311(Ab 18D8 可變 輕鏈）至少65%—致之胺基酸序列，該多肽包含至少一個 選自由SEQ ID NO: 31 4-319組成之群之胺基酸序列且任 何序列包含至少一個胺基酸變化於SEQ ID NO: 314-319 中之任一者。 73·如請求項1之分離之單株抗體，其包含至少一個選自由 SEQ ID NO: 3 14-31 9組成之群之胺基酸序列。 74. 如請求項1之分離之單株抗體，其包含至少三個選自由 SEQ ID NO: 314-31 9組成之群之胺基酸序列。 75. —種與SEQ ID NO: 9之人類海帕西咬特異性結合之分離 之單株抗體，該抗體包含一個多肽具有與SEQ ID NO: 323或SEQ ID NO: 321至少65%—致之胺基酸序列，該多 肽包含至少一個選自由SEQ ID NO: 3 24-3 29組成之群之 胺基酸序列且任何序列包含至少一個胺基酸變化於SEQ ID NO: 324-329 中之任一者。 76. 如請求項1之分離之單株抗體，其包含至少一個選自由 SEQ ID NO: 324-329組成之群之胺基酸序列。 77. 如請求項1之分離之單株抗體，其包含至少三個選自由 SEQ ID NO: 324-329組成之群之胺基酸序列。 78. —種與SEQ ID NO: 9之人類海帕西啶特異性結合之分離 128410.doc 10 200900420 之卓株抗體’該抗體包含一個多狀具有與SEQ id NO. 293或SEQ ID NO: 291至少650/。一致之胺基酸序列，該多 肽包含至少一個選自由SEQ ID NO: 294-299組成之群之 胺基酸序列且任何序列包含至少一個胺基酸變化於SEQ ID NO: 294-299 中之任一者。 79. 如請求項i之分離之單株抗體，其包含至少一個選自由 SEQ ID NO: 294-299組成之群之胺基酸序列。 80. 如請求項1之分離之單株抗體，其包含至少三個選自由 SEQ ID NO: 294-299組成之群之胺基酸序列。 81. —種與SEQ ID N〇: 9之人類海帕西啶特異性結合之分離 之單株抗體’該抗體包含一個多肽具有與SEq ID NO 303或SEQ ID NO: 301至少65%—致之胺基酸序列，該多 肽包含至少一個選自由SEQ ID NO: 304-309組成之群之 胺基酸序列且任何序列包含至少一個胺基酸變化於sEq ID NO: 3 04-3 09 中之任一者。 82. 如咕求項1之分離之單株抗體，其包含至少一個選自由 SEQ ID NO: 304-309組成之群之胺基酸序列。 83 ·如請求項i之分離之單株抗體，其包含至少三個選自由 SEQ ID NO: 304-309組成之群之胺基酸序列。 84'種與SEQ ID N0: 9之人類海帕西啶特異性結合之分離 之單株抗體，該抗體包含一個多肽具有與SEQ ID N〇: 180或SEQ ID NO: 178至少65%一致之胺基酸序列，該多 肽包含至少一個選自由SEQ ID Ν〇: 18ι_ΐ86組成之群之 胺基酸序列且任何序列包含至少一個胺基酸變化於seq 128410.doc -11 - 200900420 ID NO: 181-186 中之任一者。 85. 如請求項i之分離之單株抗體，其包含至少一個選自由 SEQ ID N0: 181_186組成之群之胺基酸序列。 86. 如請求項！之分離之單株抗體’其包含至少三個選自由 SEQ ID NO: 181-186組成之群之胺基酸序列。 87· —種與SEq ID no: 9之人類海帕西啶特異性結合之分離 之單株抗體，該抗體包含一個多肽具有與SEq ID Ν〇. 190或SEQ ID NO: 188至少65%—致之胺基酸序列，該多 肽包含至少一個選自由SEq ID NO: 191-1 96組成之群之 胺基酸序列且任何序列包含至少一個胺基酸變化於SEq ID NO: 191-196 中之任一者。 8 8 ·如請求項丨之分離之單株抗體，其包含至少一個選自由 SEQ ID NO: 191-196組成之群之胺基酸序列。 89. 如請求項1之分離之單株抗體，其包含至少三個選自由 SEQ ID NO: 191-196組成之群之胺基酸序列。 90. —種與SEQ ID NO: 9之人類海帕西啶特異性結合之分離 之單株抗體，該抗體包含一個多肽具有與SEQ ID NO: 202或SEQ ID NO: 128至少65%—致之胺基酸序列，該多 肽包含至少一個選自由SEQ ID NO: 13 1-133及203-205組 成之群之胺基酸序列且任何序列包含至少一個胺基酸變 化於 SEQ ID NO: 13 1-133及 203-205 中之任一者。 9 1 ·如請求項1之分離之單株抗體，其包含至少一個選自由 SEQ ID NO: 131-133及203-205組成之群之胺基酸序列。 92.如請求項1之分離之單株抗體，其包含至少三個選自由 128410.doc -12- 200900420 SEQ ID NO: 131-133及203-205組成之群之胺基酸序列。 93. —種與SEQ ID NO: 9之人類海帕西啶特異性結合之分離 之單株抗體’該抗體包含一個多肽具有與SEQ ID NO: 140或SEQ ID NO: 213至少65%—致之胺基酸序列，該多 肽包含至少一個選自由SEQ ID NO: 144-146及214-216組 成之群之胺基酸序列且任何序列包含至少一個胺基酸變 化於 SEQ ID NO: 144-146 及 214-216 中之任一者。 94. 如請求項1之分離之單株抗體，其包含至少一個選自由 SEQ ID NO: 144-146及214-216組成之群之胺基酸序列。 95. 如請求項1之分離之單株抗體，其包含至少三個選自由 SEQ ID NO: 144-146及214-216組成之群之胺基酸序列。 96. —種與SEQ ID NO: 9之人類海帕西啶特異性結合之分離 之單株抗體，該抗體包含一個多肽具有與SEQ ID NO: 1 60或SEQ ID NO: 224至少65%—致之胺基酸序列，該多 肽包含至少一個選自由SEQ ID NO: 164-166及225-227組 成之群之胺基酸序列且任何序列包含至少一個胺基酸變 化於 SEQ ID NO: 164-166及225-227 中之任一者。 97·如請求項1之分離之單株抗體，其包含至少一個選自由 SEQ ID NO: 164-166及225-227組成之群之胺基酸序列。 9 8.如請求項1之分離之單株抗體，其包含至少三個選自由 SEQIDNO: 164-166及225-227組成之群之胺基酸序列。 99. 一種與SEQ ID NO: 9之人類海帕西啶特異性結合之分離 之單株抗體’該抗體包含一個多肽具有與SEQ ID NO: 170或SEQ ID NO: 235至少650/。一致之胺基酸序列，該多 128410.doc -13- 200900420 &包含至少一個選自由SEQ ID NO: 174-176及23 6-23 8組 成之群之胺基酸序列且任何序列包含至少一個胺基酸變 化於 SEQ id NO: 174-176及 23 6-238 中之任一者。 100. 如清求項丨之分離之單株抗體，其包含至少一個選自由 SEQ ID NO: 174-176及236-238組成之群之胺基酸序列。 101. 如請求項丨之分離之單株抗體，其包含至少三個選自由 SEQ ID NO: 174-176及236-238組成之群之胺基酸序列。 102. —種舆SEq iD N〇: 9之人類海帕西啶特異性結合之分離 之單株抗體，該抗體包含一個多肽具有與SEQ ID NO: 190或SEQ ID NO: 246至少65%—致之胺基酸序列，該多 肽包含至少一個選自由SEQ ID NO: 194-196及247-249組 成之群之胺基酸序列且任何序列包含至少一個胺基酸變 化於 SEQ ID NO: 194-196及 247-249 中之任一者。 103. 如請求項丨之分離之單株抗體，其包含至少一個選自由 SEQ ID NO: 194-196及247-249組成之群之胺基酸序列。 104. 如請求項1之分離之單株抗體，其包含至少三個選自由 SEQ ID NO: 194-196及247-249組成之群之胺基酸序列。 105. 如請求項1之分離之單株抗體，其中該抗體包含一個選 自由 SEQ ID NO: 16、28、40、52、111、121、131、 141、151、161、171、181、191、214、225、236、 247、294、304、3 14及324組成之群之胺基酸序列、一 個選自由 SEQ ID NO: 17、29、41、53、112、122、 132、142、152、162、172、182、192、215、226、 23 7、248、295、3 05、3 15及325組成之群之胺基酸序列 128410.doc -14- 200900420 及一個選自由 SEQIDNO: 18、30、42、54、113、123、 133、143、153、163、173、183、193、216、227、 238、249、296、306、3 16及326組成之群之胺基酸序 列0 106.如請求項1之分離之單株抗體’其中該抗體包含一個選 自由 SEQ ID NO: 19、31、43、55、114、124、134、 144 、 154 、 164 、 174 、 184 、 194 、 203 、 297 、 307 、 317 及327組成之群之胺基酸序列、一個選自由SEq ID N〇: ί / V 20、32、44、56、115、125、135、145、155、165、 175、185、195、204、298、308、318 及 328 組成之群之 胺基酸序列及一個選自由SEQ ID NO: 21、33、45、57、 11ό、126、136、146、156、166、176、186、196、 205、Μ9、3〇9、3 19及329組成之群之胺基酸序列。 107.如請求項丨之分離之單株抗體’其中該抗體包含一個胺 基酸序列與一個選自由以下組成之群之胺基酸序列至少 9〇〇/。一致：SEQ ID NO: 14、SEQ ID N0: 12、SEQ m NO. 26、SEQ ID NO: 24、SEQ id NO: 39、SEQ ID NO 49 ' SEQ ID NO 120、 SEQ ID NO 128、 SEQ ID NO 150、 SEQ ID NO 158、 SEQ ID NO 180、 SEQ ID NO 188、 SEQ ID NO 37、SEQ ID NO: 51、SEQ It) NO: 110、SEQ ID NO: 108、SEQ ID NO: 118、SEQ ID NO: 130、SEQ ID NO: 140、SEQ ID NO: 138、SEQ ID NO: 148、SEQ ID NO: 160、SEQ ID NO: 170、SEQ ID NO: 168、SEQ ID NO: 178、SEQ ID NO: 190、SEQ ID NO: 128410.doc -15- 200900420 202、SEQ ID NO: 212、SEQ ID NO: 218、SEQ ID NO: 224、SEQ ID NO: 235、SEQ ID NO: 246、SEQ ID NO: 293、SEQ ID NO: 291、SEQ ID NO: 303、SEQ ID NO: 301、SEQ ID NO: 313、SEQ ID NO: 311、SEQ ID NO: 323及 SEQ ID NO: 321。 108· —種包含一個重鏈及一個輕鏈之分離之單株抗體，其中 該重鏈包含SEQ ID NO: 207之胺基酸20-467且其中該輕 鏈包含SEQ ID NO: 220之胺基酸21-234。 109. —種包含一個重鏈及一個輕鏈之分離之單株抗體，其中 該重鏈包含SEQ ID NO: 233之胺基酸20-466且其中該輕 鏈包含SEQ ID NO: 2 18之胺基酸23-234。 110. —種包含一個重鏈及一個輕鏈之分離之單株抗體，其中 該重鏈包含SEQ ID NO: 255之胺基酸20-466且其中該輕 鏈包含SEQ ID NO: 229之胺基酸23-234。 111. 一種包含一個重鏈及一個輕鏈之分離之單株抗體，其中 該重鏈包含SEQ ID NO: 259之胺基酸20-466且其中該輕 鏈包含SEQ ID NO: 240之胺基酸23-234。 112. —種包含一個重鏈及一個輕鏈之分離之單株抗體，其中 該重鏈包含SEQ ID NO: 267之胺基酸20-466且其中該輕 鏈包含SEQ ID NO: 25 1之胺基酸23-234。 113. 如請求項1-13、15-35及42-112中任一項之分離之單株抗 體，其中該抗體為嵌合、人類化或完全人類抗體。 114. 如請求項113之分離之單株抗體，其中該抗體為嵌合抗 體，其中該嵌合係於小鼠與人類之間或駱駝與人類之 128410.doc -16- 200900420 間。 115.如請求項1-13、15-35及42-112中任一項之分離之單株抗 體’其中該單株抗體為人類化抗體。 116·如請求項1-13、15-35及42-112中任一項之分離之單株抗 體’其中該單株抗體為單鏈Fv抗體片段。 117. 如請求項1-13、15-35及42-112中任一項之分離之單株抗 體’其中該單株抗體為Fab片段、F(ab，）2片段、Fd、域抗 一（Ab)、雙功能抗體（diabody)、最大抗體（maxibody)或 不米抗體（nanobody)。 118. 如請求項1-13、15-35及42-112中任一項之分離之單株抗 體’其中該抗體為人類抗體。 119如請求項1-13、15-3 5及42-112中任一項之分離之單株抗 體其包含人類一致抗體序列、人類生殖系（germline)抗 體序列或人類生殖系一致抗體序列之構架胺基酸序列。 120·如請求項1-13、15-3 5及42-112中任一項之分離之單株抗 體’其中該抗體為IgA、IgG、IgE、IgD或IgM同型。 121. 如請求項1-13、15-35及42-112中任一項之分離之單株抗 體’其中該抗體為IgGl、IgG2、IgG3或IgG4同型。 122. 如請求項1-13、15-35及42-112中任一項之分離之單株抗 體’其結合人類海帕西啶（SEQ ID NO: 9)與食蟹猴 (eyn〇m〇l〇gous monkey)海帕西啶（SEQ ID NO: 6)。 123. 如請求項1-13、15-35及42-112中任一項之分離之單株抗 體’其結合人類海帕西啶（SEQ ID NO: 9)與鼠類海帕西 啶（SEQ ID NO: 80)。 128410.doc -17- 200900420 124. 如清求項1之分離之早株抗體，其中該机體亦與一種由 25個與SEQ ID NO: 9至少70%—致之胺基酸組成且具有8 個半胱胺酸殘基的多肽結合。 125. 如請求項124之分離之單株抗體，其中該多肽由位於SEQ ID NO: 2之位置59至83之胺基酸組成。 126. 如請求項125之分離之單株抗體，其中該多肽由sEq ID NO: 6中所示之胺基酸序列組成。 ί 127. 如請求項ι_13、15_35、42-112及124_126中任—項之分離 之單株抗體，其包含可偵測標記。 128. —種分離之核酸分子，其包含一個編碼如請求項卜^了中 任一項之抗體的核苷酸序列。 129. 種表現載體，其包含如請求項128之核酸分子可操作 地連接於一個調控序列。 削·-種宿主細胞，其包含如請求項129之載體或如請求項 1 2 8之核酸分子。 種使用如吻求項13〇之宿主細胞產生抗體之方法，其 包含如請求項130之宿主細胞在適宜條件下培養以使該 核酸表現產生該抗體。 132. 如請求項13〗之方法， 其進—步包含自該宿主細胞培養 物回收該抗體。 脣 133. -種組合物’其包含如請 藥學上可接受之_、稀釋…6中任—項之抗體及醫 ^ h 稀釋劑或賦形劑。 134. —種偵測生物試樣 含.9 i 員海帕西啶存在的方法，其包 3 ·忒忒樣與如請求項丨_127 ^ 中任一項所述之單株抗體之 128410.doc -18· 200900420 i:西:ΐ:使該單株抗體與seq id n〇: 9之成熟人類 /母帕西啶結合之條件女 或所結合之海帕㈣。°^及_所結合之單株抗體 ^长項134之方去，其中該單株抗體結合於與 相同之抗原決定基，式你> 二，、抗體1S1競爭結合於SEQ ID • 9之成熟人類海帕西啶達約乃％。 136. 如請求項135之方法， ΤΓΛ、 "進一步包含該試樣與結合SEQ ID NO: 9之成熟海帕西咬
    口足之第二单株抗體培育。 137. 如請求項136之方法，复士 其中该第二皁株抗體結合於與抗 體23F11相同之抗原決定基，或與抗體別^競爭結合於 SEQlDN〇:9之成熟人類海帕㈣達約75%。 、 士。月求項136之方法’其中該第二單株抗體結合於與抗 體15 E1相同之抗原決t | „ ?决疋基，或與抗體15E1競爭結合於 剛1〇紙9之成熟人類海帕西咬達約75%。 139. 如請求項136之方法，其中該第二單株抗體結合於愈抗 體12B9相同之抗原決定基，或與抗體刪競爭結合於 SEQ m N0: 9之成熟人類海帕西啶達約75%。 140. 如請求項134之方法’纟中該單株抗體結合於與抗體 12B9相同之抗原決定基，或與抗體12則競爭結合於卿 ID NO: 9之成熟人類海帕西咬達約75%。 ML如請求項14〇之方法，其進一步包含該試樣與結合 ID NO: 9之成熟海帕西啶之第二單株抗體培育。 142.如請求項141之方法，其中該第二單株抗體結合於與抗 體18D8相同之抗原決定基，或與抗體18D8競爭結合於 128410.doc -19· 200900420 SEQ ID NO: 9之成熟人翻、'叙l亦—土 頌海帕西"定達約7 5 %。 143.如請求項14!之方法，复 ，、中該弟二單株抗體結合於與抗 體19 C 1相同之抗原決定其，々命> a I 或與抗體19C1競爭結合於 SEQ ID NO: 9之成熟人类育浪μ工a 土 硕海帕西啶達約75%。 144·如請求項ι41之方法，装 ~中该弟二單株抗體結合於與抗 體19012相同之抗原決定其 + t 又暴，或與抗體19D12競爭結合於 SEQ ID NO: 9之成熟人_、、叙从工A 、頌海帕西啶達約75〇/〇。 145·如請求項1 4丨之方法，装 ' π亥第一單株抗體結合於盘技 體19Η6相同之抗原決定其 、 Ί ’或與抗體19Η6競爭結人私 seQiDno:9之成熟人類 肀，。口於 頌海帕西啶達約75%。 146_如請求項141之方法，发 /、 % —早株抗體結合於斑於 體isi相同之抗原決定義 + ^ 或與抗體1S1競爭結合於SFn ID NO: 9之成熟人類海 ^SEQ w TO西啶達約75%。 147. 如請求項134之方法， 、中S亥卓株抗體結合於盘括辦 23F11相同之抗原決定 /、抗體 % ’或與抗體23F11競爭姓入於 SEQIDNO: 9之成熟人類盔u τ、、、σ σ於 \ 顯海帕西啶達約75%。 148. 如請求項147之方法，装 m 升進—步包含該試樣與結入SPn ID NO: 9之成熟海帕西啶 SEQ 定之第二單株抗體培育。 149. 如請求項148之方法，|丄 ，、中該第二單株抗體結合 體18D8相同之抗原決定发 於與抗 %，或與抗體18D8競爭社人认 SEQ ID NO: 9之成熟人_兔u 肀、、。合於 負海帕西啶達約7 5 %。 150. 如清求項1 4 8之方法，甘山 μ 1 〜中該第二單株抗體結合於盥a 體19C1相同之抗原决定 0於與抗 cr,^ I，或與抗體19C1競爭沾人狄 SEQ ID NO: 9之成熟人类 ’ ”'口 δ於 員海帕西啶達約75%。 128410.doc '20. 200900420 151. 如請求項1 4 8之方法，足士斗外 〜中邊弟二單株抗體結合於與抗 體19D12相同之抗原決定| 上 〜’或與抗體19D12競爭結合於 SEQ ID NO: 9之成熟人類也 頌海帕西啶達約75%。 152. 如清求項1 4 8之方法，甘_ 士、？ …中该弟二單株抗體結合於與抗 體19H6相同之抗原決定其 々&丄 ’或與抗體19H6競爭結合於 SEQ ID NO: 9之成熟人類、，叙 頌海帕西啶達約7 5 %。 153. 如請求項i 48之方法，波出#姑 ，、中该弟二單株抗體結合於與抗 體1 5E1相同之抗原決定其 r 义暴，或與抗體1S1競爭結合於 SEQ ID NO: 9之成熟人類、、备 頌海帕西啶達約75%。 154. 如請求項1 48之方法，复士 #战 〃中邊弟二單株抗體結合於與抗 體3Β3相同之抗原決定基 心暴，或與抗體3Β3競爭結合於SEQ idn〇:9之成熟人類海怕西啶達約75%。 155. 如請求項134之方法1中該單株抗體結合於與抗體 15E1相同之机原决&基，或與抗體ι5Ει競爭結合於seq idno:9之成熟人類海帕西啶達約75%。 156·如請求項155之方法’其進-步包含該試樣與結合SEQ ID NO: 9之成熟海帕西。定之第二單株抗體培育。 !57_如請求項156之方法，其中該第二單株抗體結合於與抗 體1S1相同之^原決定基，或與抗體1S1競爭結合於SEq ID NO: 9之成熟人類海帕西啶達約75〇/〇。 158. 如請求項1 34之方法，甘4 、 ”進一步包含該試樣與結合SEQ ID NO: 9之成熟海怕西„定之多株抗體培育。 159. 如請求項158之方法，其中將該單株抗體固定於一種固 體支撐物上。 128410.doc -21 . 200900420 160. 如清求項159之方法，其中該多株抗體被標記。 161. 如請求項158之方法，其中將該多株抗體固定於一種固 體支撐物上。 162. 如請求項161之方法，其中該單株抗體被標記。 163. 如請求項134之方法，其中將該抗體固定於—種固體支 撑物上，且該方法進一步包含使該海帕西啶與如請求項 12 7中任一項之弟一抗體接觸以彳貞測所結合之海帕西 口定。 164如請求項134之方法，其中該生物試樣係自人類分離。 165•如請求項1 34之方法，其中該生物試樣係選自由以下組 成之群：血漿、血清、尿、及源自彼等之任何部分。 166.如請求項ι63之方法’其中該第二抗體識別—個抗原決 定基與固定於該固體支撐物上之抗體所識別之抗原決定 基不同。 167•如請求項1 63之方法，其中該第二抗體被標記。 168.如請求項164之方法，其包含定量該試樣中海帕西啶之 量 ° 169·如請求項134之方法，其包含已知量之純化海帕西啶標 準物與該抗體培育。 Π0.如請求項169之方法，其包含使用多數已知量之海帕西 咬標準物測定標準曲線。 171.如請求項！34之方法，其中該方法為競爭性酶聯免疫吸 附檢定（ELISA)。 172· —種用於偵測生物試樣中人類海帕西啶之免疫檢定套 128410.doc -22· 200900420 一項之抗體 組，該套組包含一或多種如請求項丨_丨27中任 及視情況作為.標準物之純化海帕西咬。 西啶之免疫檢定套 173. —種用於偵測生物試樣中人類海杨 組，其包含： ⑷捕捉劑，其包含一種與SEQiDn〇: 9中所示之胺基 酸序列組成之人類海帕西啶特異性結合的抗體；及 (bH貞測試劑’其包含如請求項卜127中任一項之抗 體，該抗體與該人類海帕西咬在—個不同於⑷中之抗體 所識別之抗原決定基結合。 174.如請求項173之套組，其中該捕捉劑為多株抗體。 Π5.-種用於制生物試樣中人類海帕西啶之免疫檢定套 組，其包含： ⑷债測試劑’其包含一種與SEQ ID N〇: 9中所示之胺 基酸序列組成之人類海帕西啶特異性結合的抗體；及 (b)捕捉試劑，其包含如請求項】_127中任一項之抗 i 體，該抗體與該人類海帕西3定在_個不同於⑷中之抗體 所識別之抗原決定基結合。 176. 如請求項175之套組，其中該偵測試劑為多株抗體。 177. 如請求項173或175之免疫檢定套組，其進一步包含純化 之海帕西啶作為標準物。 178. 如叫求項1 73之免疫檢定套組，其中該捕捉劑包含一種 選自由 Ab43、1S1、1S2、1S3、1S4、1S5、2.7、2.41、 R9 1C9、3B3、4E1、7A3、9D12、12B9、18D8、 19C1、19D12、19H6、15E1、23F11及 26F11 組成之群的 128410.doc •23· 200900420 抗體。 179.—種診斷海帕西啶相關病症之方法，其包含： ⑷使來自疑患有該病症之人類之生物試樣與如請求項 i-m中任-項所述之抗體巾之至少—者在可使該抗體與 人類海帕西啶結合之條件下接觸；及 (b)偵測及/或定量與該抗體結合之海帕西啶， 其中如⑻中所定量，該試樣中海帕西咬之量高於一· 限值⑽reSh〇ld level)指示存在海帕西„定相關病症，低於 6亥臨限值指示不存在海帕西啶相關病症。 180.如凊求項179之方法，其中將該抗體固定於一種固 擇物上。 ⑻.如請求項179之方法，其中該病症係選自由以下組成之 群：貧血症、敗血病、炎性貧企症、癌性貧血症、化療 誘發性貧血症、慢性炎性貧血症、充血性心臟衰竭、末 期腎病、慢性腎病（1、n、m、1¥或¥期）、缺鐵性貧血 症、鐵穩態失調症、膜鐵轉運蛋白（ferr〇p〇rtin)疾病、血 色素沈著症、糖尿病、炎症、類風濕性關節炎、動脈硬 化、腫瘤、血管炎、全身性紅斑性狼瘡症、血紅素病及 紅血球病症。 182. —種區分炎性疾病與非炎性疾病之方法，其包含： ⑷使來自疑患有該病症之人類之生物試樣與如請求項 M27中任-項所述之抗體中之至少—者在可使該抗體與 人類海帕西啶結合之條件下接觸；及 (b)偵測及/或定量與該抗體結合之海帕西啶， 128410.doc •24· 200900420 其中如（b)中所定量，海帕西啶之量高於_個臨限值指示 存在炎性疾病，低於該臨限值指示不存在炎性疾病。曰 183. 如請求項182之方法，其中將該抗體固定於—種^ 撐物上。 又 184. ^請求項182之方法，其中該炎性疾病為癌性貧血症、 杈性病貧血症、炎性貧血症、化療誘發性貧血症、慢性 腎病(I、II、m、期)、末期腎病、慢性腎衰：、 充血性心臟衰竭、癌症、類風濕性關節炎、全身性紅斑 性狼瘡症、克羅恩氏病（Crohn’s disease)、幽門螺旋桿菌 (H. Pyelori)感染或其他細菌感染、〇型肝炎、Η”及其他 病毒性疾病、動脈硬化、動脈粥樣硬化、肝硬化、肝 炎、胰腺炎、敗血病、血管炎、鐵缺乏症、貧血症、低 色素性小紅血球性（micr〇Cytic)貧血及海帕西啶過量病 狀。 185. —種監控投與海帕西啶拮抗劑治療的方法，其包含： (a) 使已被投與海帕西啶拮抗劑之人類之生物試樣與如 凊求項1-127中任一項所述之抗體中之至少一者在可使該 抗體與人類海帕西啶結合之條件下接觸；及 (b) 偵測及/或定量與該抗體結合之海帕西咬， 其中如⑻中所定量，海帕西咬之量高於一個臨限值指示 ⑽白西咬拮抗劑之劑量不為治療有效的，低於該臨限值 指示海帕西啶拮抗劑之劑量為治療有效的。 如請求項185之方法，其中將該抗體固定於一種固體支 撐物上。 128410.doc -25· 200900420 187. -種如請求項M26中任 製造用以治療個體之鐵稃能：：株抗體的用途’其用於 188. 如請求項187 “心失調症的藥物。 下組成之群·#其中該鐵穩態失調症係選自由以 又〈群.負血症、敗血 症、化療誘發性貧血症、^^ Π血症、癌性貧血 衰竭、末期g e 又欠性貧血症、充血性心臟 禾期腎病、慢性瞥佐η 鐵性貧血症、鐵穩態失1二;;H、IW期）、缺 素沈著症、糖尿病、炎症、運蛋白疾病、血色 化、腫瘤、血W '入直 濕性關節炎、動脈硬 δ火 王身性紅斑性讲，容Γ*· , 紅血球病症。 狼蒼症、血紅素病及 189. —種如請求 瘁且右1 之、且“勿的用途，其用於製造用以治 療”有焉量海帕西啶之哺乳動物的藥物。 190·:?Γ:求項133之組合物的用途，其用於製造用以治 潔有貧血症之哺乳動物的藥物。 191，如請求項190之用途，其"哺乳動物為患有以下病症 ，人類：貧血症、敗血病、炎性貧血症、癌性貧血症、 慢性炎性貧血症、充血性心臟衰竭、末期腎病、慢性腎 病（卜Π、ΠΙ、卩或¥期）、缺鐵性貧血症、鐵穩態失調 症、膜鐵轉運蛋白疾病、血色素沈著症、糖尿病、炎 症、類風濕性關節炎、動脈硬化、腫瘤、血管炎、全身 性紅斑性狼瘡症、血紅素病及紅企球病症。 192. —種小瓶或預裝填注射器，其包含如請求項m之組合 物。 193. —種（a)以約1〇-7 Μ或以下之KD結合SEQ ID N〇: 9組成之 128410.doc -26- 200900420 人類海帕西啶之抗體及（b)一種選自由紅血球生成素、紅 血球生成素變異物及結合紅血球生成素之抗體組成之群 之紅血球生成刺激劑的用途，其用於製造用以治療有需 要之哺乳動物的藥物。 194·如明求項！ 93之用途，其中該結合人類海帕西。定之抗體 及該紅血球生成刺激劑係於同一組合物中。 195.如凊求項193或194之用途，其中該藥物係與鐵組合 用。 r 士《月求項1 95之用途；’其中該鐵係、經口或全身投藥。 197.-種以約10-7河或以下之Kd結合_ ι〇 n〇: 9組成之人 類海帕西咬之抗體的用途，其用於製造用以治療對於紅 血球生成刺激劑之療法低反應之哺乳動物的藥物。 脈^求項197之用途，其進—步包含投與紅血球生 激劑。 跳如請求項193、194、197及198中任—項之用途，其中該 哺乳動物患有選自由以下組成之群的病狀：敗血病、貧 疒X ί·生貝血症、癌性貧血症、化療誘發性貧血症、 企性心臟衰竭、末期腎病、慢性腎病(ι、Η、出、… =期)、缺鐵性貧血症、鐵穩態失調症、膜鐵轉運蛋白 疾病、血色素沈著症、糖成 糖尿病類風濕性關節炎、動脈 更化、腫瘤、灰營杰、；i ζ 4 目尺全身性紅斑性狼瘡症、血紅素 涡、紅血球病症及腎衰竭。 胤如請求項193、194、197及198中任一項 哺乳動物患有貧血症。 、途、中該 128410.doc -27· 200900420 2 .如°月未項193、194、197及198中任一項夕田 ^ 項之用途，其中該 抗體係選自由嵌合抗體、 H ^ n 頰化抗體、人類抗體、抗體 乃奴及單鏈抗體組成之群。 胤如請求項193、194、197A1 哺乳動物為人類。 項之用述，其中該 2〇3·如請求項193、194及198 .. 1 項之用途，其中該紅血 表生成刺激劑為_则〇:72之人類紅 204.如請求項193 ' 194 不玍成京 ,^ 及198中任-項之用4，其中該紅血 球生成刺激劑為SEq m , Μ〈違貝泊〉丁 ct (darbeP〇ietin alfa)。 2〇5·種用於治療與高海帕西哈人旦知狀^ — ^ 四疋含里相關之病症或鐵穩態失 调症的套組，其包会如往 、 明求項1 -1 2 6中任一項之抗體及紅 血球生成刺激劑。 206.如請求項205之套 甲§亥抗體及該紅血球生成刺激 劑係於一個小瓶中。 207·如請求項206之套組，盆 半七八4包机— /、進一步包含經口或全身投藥之 鐵。 208.如請求項207之套 *、、'且其中該鐵及該抗體係於一個小瓶 中。 209·如請求項207之套組，1 + v 、、 其中該紅血球生成刺激劑及該鐵 係於一個小瓶中。 210·—種用於治療鱼离 ^ '、每帕西啶含量相關之病症或鐵穩態失 調症的套組，其包Α ^ 匕3如凊求項1-126中任一項之抗體及貼 於容器上或與容号钮& a B封凌之標籤，該標籤描述該抗體與紅 128410.doc -28. 200900420 血球生成刺激劑之用法。 211·-種用於治療與高海帕西咬含量相關之病症的套植，其 :含紅血球生成刺激劑及貼於容器上或與容器封袭之標 籤，該標籤描述該紅血球生成刺激劑與如請求項I·〗％ 任一項之抗體之用法。 212.2:項210或2U之套組，其進一步包含-個標籤描述 «亥抗體及该紅血球生成刺激劑與鐵治療之用法。 213.如凊求項205或2 11之套組，立中兮έ 紅血球生成素或達貝泊:丁 /、〜球生成刺激劑為 2Μ.-種包含SEqIDn〇:96中所示之胺基酸序列的生物活性 純化非尿源非哺乳動物之人類海帕㈣的組合物， 至少75%之該人類海帕西。定具有C2-C4二硫鍵、c 硫鍵、C1-C8二硫鍵及C3_C6二硫鍵。 犯種鑑別與人類海帕西咬結合之化合物 含： 丹包 t.) 使候選化合物與如請求項川之組合物接觸；及 偵則該候選化合物與該組合物中之人類海帕西 的複合物，：a：巾族人& ^ 足之間 〃、中複合物之偵測指示該候選化合物盘人盤 海帕西啶結合。 人類 216. 一種鑑別盘人冰κ ^ 含. 一颉海帕西啶結合之化合物的方法，其包 使候選化合物與如請求項214之組合物接觸； 偵測該候選化合物與該組合物中之人類海帕西啶 、中後合物之偵測指示該候選化合物與人頬 128410.doc -29- 200900420 海帕西啶結合；及 將該候選化合物製成適於投與哺乳動物之藥物。 217. —種產生人類海帕西啶之抗體的方法，包含： 使產生免疫球蛋白之細胞與如請求項214之組合物接 觸；及 分離由該細胞所產生之免疫球蛋白。 218. —種測試包含抗體之相人& & Λ &物、.、。合人類海帕西咬之能力的 方法，其包含： 使該包含抗體之会且A 4k A , >·*上、 ’ σ物與如睛求項214之組合物接 觸；及 债測》亥柷體與人類海帕西啶之間的複合物，其中複合 物之偵測指示該抗體與人類海帕西啶結合。 219. — 種使包含 SEQ ID NO. qa ή匕- Μυ. 96中所不之胺基酸序列之人類海 帕西啶多肽再摺疊成生物 取王物活性形式的方法，其包含： (a) 在促進變性之條件下你,扣、占丄上 1来件下使人類海帕西啶多肽暴露於離 液劑（chaotropic agent); (b) 在促進恢復成正確摺疊及生物活性形式之條件下使 (a)之產物暴露於氧化劑；及 ⑷回收包含該生物活性人類海帕西"定多肽之溶液，其 中至v /〇之„亥人類海帕西咬多肽至少具有C2_c4:硫鍵 及C5-C7二硫鍵。 220. 如請求項219之方牛 甘1 " 法中（b)包含使該人類海帕西啶多 肽與空氣以外之氧化劑接觸。 221. 如請求項21 9之方、'表 万去，其中該氧化劑包含麵胱甘肽。 128410.doc -30- 200900420 222. 如請求項219之方法，其中（a)在低於5之？11發生。 223. 如凊求項219之方法，其中（b)在含有低於〇1%乙酸之溶 液中發生。 224. 如請求項219之方法，其中0)在大於8之？11發生。 225. 如請求項21 9之方法，其中該離液劑為胍或其鹽。 226. 如請求項225之方法，其中該胍係以範圍介於約4 M至約 6 Μ之濃度存在。 / 227.如請求項219.226中任-項之方法，其進—步包含純化該 、 人類海帕西。定多肽。 228. —種海帕西啶肽類似物，包含一個胺基酸序列與seq① NO: 96中所示之胺基酸序列至少7G%—致，其保留所有8 個半胱胺酸且另保留C2-CM二硫鍵。 229. -種海帕西。定肽類似物，包含一個胺基酸序列與卿 NO: 96中所示之胺基酸序列至少鳩一致，其保留所有8 個半胱胺酸且另保留C5、C7:硫鍵。 230. 如請求項229之海帕西咬類似肽，其進—步保留Ο心二 硫鍵。 別_如請求項228_23〇中任—項之海帕西咬類似肽， 鐵轉運蛋白結合活性。 /、保遠膜 瓜如請求初1之海帕西錢似肽，其活化膜鐵轉運蛋 白。 233. 如請求項228謂中任—項之海帕西錢⑽， 體内循環鐵含量。 ^降低活 234. 如叫求項231之海帕西啶類似肽’其抑制膜鐵轉運蛋白 128410.doc * 31 · 200900420 鐵運輸。 235. 如請求項228_2对任〜項之海帕西㈣似肽，其抑制 SEQ ID NO: 9之成熟人類海帕西π定之鐵調節活性。 236. 如請求項228_2财任—項之海帕㈣類似肽，其增加活 體内循環鐵含量。 237. —種與人類海帕西啶特異性結合之分離之單株抗體，其 中該人類海帕西啶由SEQ ID NO: 9中所示之胺基酸序列
    組成且具有包含至少一個二硫鍵環形成於位於SEq ID NO: 9中殘基10與13及14至22之間之構形。 /' 128410.doc 32-
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