JP6742245B2 - 多重特異性抗体 - Google Patents
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Description
2種類以上の抗原に結合する能力を有する二重特異性抗体または多重特異性抗体などの改変タンパク質は、当技術分野において公知である。そのような多重特異性結合タンパク質は、細胞融合、化学的コンジュゲーション、または組換えDNA技法を使って作製することができる。
a)第1抗原に特異的に結合する第1抗体の第1軽鎖および第1重鎖、ならびに
b)第2抗原に特異的に結合する第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖であって、第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖中の可変ドメインVLとVHとが互いに入れ替えられている、第2軽鎖および第2重鎖
を含む多重特異性抗体であって、
i)a)に記載の第1軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)またはヒスチジン(H)で(好ましい一態様では、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で)置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつa)に記載の第1重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されているか(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、または
ii)b)に記載の第2軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)またはヒスチジン(H)で(好ましい一態様では、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で)置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつb)に記載の第2重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、
多重特異性抗体に関する。
A)a)第1抗原に特異的に結合する第1抗体の第1軽鎖および第1重鎖、ならびに
b)第2抗原に特異的に結合する第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖であって、第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖中の可変ドメインVLとVHとが互いに入れ替えられている、第2軽鎖および第2重鎖
をコードする核酸分子を含むベクターであって、
i)a)に記載の第1軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)またはヒスチジン(H)で(好ましい一態様では、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で)置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつa)に記載の第1重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されているか(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、または
ii)b)に記載の第2軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)またはヒスチジン(H)で(好ましい一態様では、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で)置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつb)に記載の第2重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)
ベクターで、宿主細胞を形質転換する工程、
B)該抗体分子の合成を可能にする条件下で前記宿主細胞を培養する工程、および
C)該培養から該抗体分子を回収する工程。
[本発明1001]
a)第1抗原に特異的に結合する第1抗体の第1軽鎖および第1重鎖、ならびに
b)第2抗原に特異的に結合する第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖であって、第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖中の可変ドメインVLとVHとが互いに入れ替えられている、第2軽鎖および第2重鎖
を含む、多重特異性抗体であって、
i)a)に記載のの第1軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)、またはヒスチジン(H)で置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつa)に記載の第1重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されているか(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、または
ii)b)に記載の第2軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)、またはヒスチジン(H)で置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつb)に記載の第2重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、
多重特異性抗体。
[本発明1002]
a)第1抗原に特異的に結合する第1抗体の第1軽鎖および第1重鎖、ならびに
b)第2抗原に特異的に結合する第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖であって、第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖中の可変ドメインVLとVHとが互いに入れ替えられている、第2軽鎖および第2重鎖
を含む多重特異性抗体であって、
a)に記載の第1軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつa)に記載の第1重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、
多重特異性抗体。
[本発明1003]
a)に記載の第1軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸が、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)、またはヒスチジン(H)で置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつa)に記載の第1重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸が、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、本発明1001または本発明1002の多重特異性抗体。
[本発明1004]
a)に記載の第1軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸が、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)、またはヒスチジン(H)で(好ましい一態様では、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で)置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、123番目のアミノ酸が、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)、またはヒスチジン(H)で置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつa)に記載の第1重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸が、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されており(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、213番目のアミノ酸が、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、本発明1002の多重特異性抗体。
[本発明1005]
b)に記載の第2軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸が、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)、またはヒスチジン(H)で(好ましい一態様では、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で)置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつb)に記載の第2重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸が、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、本発明1001の多重特異性抗体。
[本発明1006]
a)に記載の第1軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸がリジン(K)で置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、123番目のアミノ酸がリジン(K)で置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつ
a)に記載の第1重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸がグルタミン酸(E)で置換されており(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、213番目のアミノ酸がグルタミン酸(E)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、
本発明1002の多重特異性抗体。
[本発明1007]
a)に記載の抗体の第1重鎖の第1CH3ドメインおよびb)に記載の抗体の第2重鎖の第2CH3ドメインが、それぞれ、抗体CH3ドメイン間の元の境界面を含む境界面において接することを特徴とし、
該界面は多重特異性抗体の形成を促進するように改変されており、
前記改変は、
i)一方の重鎖のCH3ドメインが、
多重特異性抗体内の他方の重鎖のCH3ドメインの元の境界面と接する前記一方の重鎖のCH3ドメインの元の境界面内において、
アミノ酸残基が、より大きな側鎖体積を有するアミノ酸残基で置き換えられ、それによって、前記一方の重鎖のCH3ドメインの境界面内に、他方の重鎖のCH3ドメインの境界面内のくぼみ内に配置されうる突起を生成するように、
改変されていること、
および
ii)他方の重鎖のCH3ドメインが、
多重特異性抗体内の前記一方の重鎖のCH3ドメインの元の境界面と接する前記他方の重鎖のCH3ドメインの元の境界面内において、
アミノ酸残基が、より小さな側鎖体積を有するアミノ酸残基で置き換えられ、それによって、前記他方の重鎖のCH3ドメインの境界面内に、前記一方の重鎖のCH3ドメインの境界面内の突起が内部に配置されうるくぼみを生成するように、
改変されていること
を特徴とする、前記本発明のいずれかの抗体。
[本発明1008]
より大きな側鎖体積を有するアミノ酸残基が、アルギニン(R)、フェニルアラニン(F)、チロシン(Y)、およびトリプトファン(W)からなる群より選択され、より小さな側鎖体積を有するアミノ酸残基が、アラニン(A)、セリン(S)、スレオニン(T)、およびバリン(V)からなる群より選択されることを特徴とする、本発明1007の抗体。
[本発明1009]
両CH3ドメイン間にジスルフィド架橋が形成されうるように、各CH3ドメインの対応する位置にアミノ酸としてシステイン(C)を導入することによって、両CH3ドメインがさらに改変されていることを特徴とする、本発明1007または1008の抗体。
[本発明1010]
A)SEQ ID NO:24の可変重鎖ドメイン(VH)およびSEQ ID NO:25の可変軽鎖ドメイン(VL)を含み、かつ
B)SEQ ID NO:26の可変重鎖ドメイン(VH)およびSEQ ID NO:27の可変軽鎖ドメイン(VL)を含み、
ヒトTWEAKに特異的に結合し、かつヒトIL17に特異的に結合する、前記本発明のいずれかの多重特異性抗体。
[本発明1011]
以下の工程を含む、本発明1001〜1010のいずれかの多重特異性抗体を調製するための方法:
A)a)第1抗原に特異的に結合する第1抗体の第1軽鎖および第1重鎖、ならびに
b)第2抗原に特異的に結合する第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖であって、第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖中の可変ドメインVLとVHとが互いに入れ替えられている、第2軽鎖および第2重鎖
をコードする核酸分子を含むベクターで宿主細胞を形質転換する工程であって、
i)a)に記載の第1軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)、またはヒスチジン(H)で(好ましい一態様では、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)で)置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつa)に記載の第1重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されているか(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、または
ii)b)に記載の第2軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)、またはヒスチジン(H)で(好ましい一態様では、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)で)置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつb)に記載の第2重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、工程、
B)該抗体分子の合成を可能にする条件下で前記宿主細胞を培養する工程、および
C)該培養から該抗体分子を回収する工程。
[本発明1012]
本発明1001〜1010のいずれかの多重特異性抗体のアミノ酸配列をコードする核酸。
[本発明1013]
本発明1012の核酸を宿主細胞中で発現させる能力を有する本発明1012の核酸を含有する発現ベクター。
[本発明1014]
本発明1001〜1010のいずれかの抗体を含む組成物。
[本発明1015]
本発明1001〜1010のいずれかの抗体と少なくとも1つの薬学的に許容される賦形剤とを含む薬学的組成物。
一方の結合アームにドメインの入れ替え/交換が施された多重特異性抗体(CrossMabVH-VL)は、WO2009/080252およびSchaefer, W. et al., PNAS, 108(2011)11187-1191に詳述されている(これらは参考文献として本明細書に組み入れられる)。これらは、第1抗原に対する軽鎖と第2抗原に対する間違った重鎖とのミスマッチによって生じる副生成物を(そのようなドメインの交換を伴わないアプローチと比較して)明らかに低減する。しかし、それらの調製物は副生成物を全く含まないわけではない。主要副生成物はベンス-ジョーンズ型相互作用に基づく-Schaefer, W. et al., PNAS, 108(2011)11187-1191のSupplementのFig. S1Iも参照されたい)。
a)第1抗原に特異的に結合する第1抗体の第1軽鎖および第1重鎖、ならびに
b)第2抗原に特異的に結合する第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖であって、第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖中の可変ドメインVLとVHとが互いに入れ替えられている、第2軽鎖および第2重鎖
を含む、多重特異性抗体であって、
i)a)に記載の第1軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸(ナンバリングはKabatに従う)は正荷電アミノ酸で置換されており、かつa)に記載の第1重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)は負荷電アミノ酸で置換されているか、または
ii)b)に記載の第2軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸(ナンバリングはKabatに従う)は正荷電アミノ酸で置換されており、かつb)に記載の第2重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)は負荷電アミノ酸で置換されている、
多重特異性抗体に関する。
i)a)に記載の第1軽鎖の定常ドメインCLにおける、正荷電アミノ酸による124番目のアミノ酸の置換(ナンバリングはKabatに従う)、およびa)に記載の第1重鎖の定常ドメインCH1における、負荷電アミノ酸による147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸の置換(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)
または
ii)b)に記載の第2軽鎖の定常ドメインCLにおける、正荷電アミノ酸による124番目のアミノ酸の置換(ナンバリングはKabatに従う)、およびb)に記載の第2重鎖の定常ドメインCH1における、負荷電アミノ酸による147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸の置換(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)
のどちらかを含む。ただし、前記多重特異性抗体は、i)で言及した修飾とii)で言及した修飾の両方を含むことはないものとする。
a)第1抗原に特異的に結合する第1抗体の第1軽鎖および第1重鎖、ならびに
b)第2抗原に特異的に結合する第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖であって、第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖中の可変ドメインVLとVHとが互いに入れ替えられている、第2軽鎖および第2重鎖
を含む多重特異性抗体であって、
i)a)に記載の第1軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)またはヒスチジン(H)で(好ましい一態様では、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で)置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつa)に記載の第1重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されているか(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、または
ii)b)に記載の第2軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)またはヒスチジン(H)で(好ましい一態様では、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で)置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつb)に記載の第2重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、
多重特異性抗体に関する。
a)第1抗原に特異的に結合する第1抗体の第1軽鎖および第1重鎖、ならびに
b)第2抗原に特異的に結合する第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖であって、第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖中の可変ドメインVLとVHとが互いに入れ替えられている、第2軽鎖および第2重鎖
を含む多重特異性抗体であって、
i)a)に記載の第1軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸(ナンバリングはKabatに従う)は正荷電アミノ酸で置換されており、かつa)に記載の第1重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)は負荷電アミノ酸で置換されている、
多重特異性抗体に関する。
a)第1抗原に特異的に結合する第1抗体の第1軽鎖および第1重鎖、ならびに
b)第2抗原に特異的に結合する第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖であって、第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖中の可変ドメインVLとVHとが互いに入れ替えられている、第2軽鎖および第2重鎖
を含む多重特異性抗体であって、
i)a)に記載の第1軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)またはヒスチジン(H)で(好ましい一態様では、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で)置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつa)に記載の第1重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、
多重特異性抗体に関する。
・軽鎖内では、可変軽鎖ドメインVLが、該抗体の可変重鎖ドメインVHで置き換えられており、かつ
・重鎖内では、可変重鎖ドメインVHが、該抗体の可変軽鎖ドメインVLで置き換えられており、かつ
・第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖中の定常ドメインCLおよびCH1は、互いに入れ替えられていない(無交換のままである)。
・第1抗体に由来する第1軽鎖内では、軽鎖のドメインの連続的配置(CL-VL)が無改変のままであり、かつ
・第1抗体に由来する第1重鎖では、重鎖のドメインの連続的配置(例えばCH1-VHまたはCH3-CH2-CH1-VH)が無改変のままである(それゆえに、第1抗体に特異的に結合する抗体はドメインの交換を含まず、特にVH/VLの交換を含まない)。
・(N末端からC末端の方向に)VL-CLという軽鎖ドメインの連続的配置を含む、該第1抗体に由来する第1軽鎖と、
・(N末端からC末端の方向に)CH1-VHという重鎖ドメインの連続配置を含む(一態様では、第1重鎖はN末端からC末端の方向にCH3-CH2-CH1-VHという重鎖ドメインの連続的配置を含む)、第1抗体に由来する第1重鎖
を含む。
i)第1Fabフラグメントの軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)またはヒスチジン(H)で(好ましい一態様では、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で)置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつ第1Fabフラグメントの重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されているか(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、または
ii)第2Fabフラグメントの軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)またはヒスチジン(H)で(好ましい一態様では、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で)置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつ第2Fabフラグメントの重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)。
i)第1Fabフラグメントの軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)またはヒスチジン(H)で(好ましい一態様では、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で)置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつ第1Fabフラグメントの重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)。
・第1重鎖のCH3ドメインの少なくとも1つのアミノ酸を置換し、かつ
・第2重鎖のCH3ドメインの少なくとも1つのアミノ酸であって、多重特異性抗体の三次構造内で第1重鎖のCH3ドメインの前記少なくとも1つのアミノ酸に面しているアミノ酸を置換すること
によって改変され、第1重鎖および第2重鎖のCH3ドメイン内の各アミノ酸は、それぞれ、
・反対の側鎖電荷を持つアミノ酸が対向する重鎖中に導入されるように置換されるか、または
・大きな側鎖体積および小さな側鎖体積を持つアミノ酸が対向する重鎖に導入されることにより、一方のCH3ドメインに大きな側鎖体積を持つアミノ酸によって突起が作り出され、その突起が、小さな側鎖体積を持つアミノ酸によって作り出された他方のCH3ドメイン内に位置するくぼみ内に配置されうるように置換される。
a)に記載の抗体の第1重鎖の第1CH3ドメインおよびb)に記載の抗体の第2重鎖の第2CH3ドメインが、それぞれ、前記抗体CH3ドメイン間の元の境界面を含む境界面において接し、
該境界面は多重特異性抗体の形成を促進するように改変されていて、前記改変は、
i)一方の重鎖のCH3ドメインが、
多重特異性抗体内の他方の重鎖のCH3ドメインの元の境界面と接する前記一方の重鎖のCH3ドメインの元の境界面内において、
アミノ酸残基が、より大きな側鎖体積を有するアミノ酸残基で置き換えられ、それによって、前記一方の重鎖のCH3ドメインの境界面内に、他方の重鎖のCH3ドメインの境界面内のくぼみ中に配置されうる突起を生成するように、
改変されていること、
および
ii)他方の重鎖のCH3ドメインが、
多重特異性抗体内の前記一方の重鎖のCH3ドメインの元の境界面と接する前記他方の重鎖のCH3ドメインの元の境界面内において、
アミノ酸残基が、より小さな側鎖体積を有するアミノ酸残基で置き換えられ、それによって、前記他方の重鎖のCH3ドメインの境界面内に、前記一方の重鎖のCH3ドメインの境界面内の突起が内部に配置されうるくぼみを生成するように、
改変されていること。
a)T411N、T411R、T411Q、T411K、T411D、T411EおよびT411W、
b)D399R、D399W、D399YおよびD399K、
c)S400E、S400D、S400RおよびS400K、
d)F405I、F405M、F405T、F405S、F405VおよびF405W、
e)N390R、N390KおよびN390D、
f)K392V、K392M、K392R、K392L、K392FおよびK392E
からなる群より選択される。
(1)疎水性:ノルロイシン、Met、Ala、Val、Leu、Ile;
(2)中性親水性:Cys、Ser、Thr、Asn、Gln;
(3)酸性:Asp、Glu;
(4)塩基性:His、Lys、Arg;
(5)鎖の配向に影響を及ぼす残基:Gly、Pro;
(6)芳香族:Trp、Tyr、Phe。
1.a)第1抗原に特異的に結合する第1抗体の第1軽鎖および第1重鎖、ならびに
b)第2抗原に特異的に結合する第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖であって、第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖中の可変ドメインVLとVHとが互いに入れ替えられている、第2軽鎖および第2重鎖
を含む、多重特異性抗体であって、
i)a)に記載の第1軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)またはヒスチジン(H)で(好ましい一態様では、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で)置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつa)に記載の第1重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されているか(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、または
ii)b)に記載の第2軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)またはヒスチジン(H)で(好ましい一態様では、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で)置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつb)に記載の第2重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、
多重特異性抗体。
2.a)第1抗原に特異的に結合する第1抗体の第1軽鎖および第1重鎖、ならびに
b)第2抗原に特異的に結合する第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖であって、第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖中の可変ドメインVLとVHとが互いに入れ替えられている、第2軽鎖および第2重鎖
を含む、多重特異性抗体であって、
i)a)に記載の第1軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)またはヒスチジン(H)で(好ましい一態様では、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で)置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつa)に記載の第1重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、
多重特異性抗体。
3.a)に記載の第1軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)またはヒスチジン(H)で(好ましい一態様では、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で)置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつa)に記載の第1重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、態様1または態様2に記載の多重特異性抗体。
4.a)に記載の第1軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)またはヒスチジン(H)で置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつa)に記載の第1重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、態様1または態様2に記載の多重特異性抗体。
5.a)に記載の第1軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)またはヒスチジン(H)で(好ましい一態様では、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で)置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、123番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)またはヒスチジン(H)で置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつa)に記載の第1重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されており(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、213番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、態様4に記載の多重特異性抗体。
6.a)に記載の第1軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつa)に記載の第1重鎖の定常ドメインCH1において、213番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、態様1または態様2に記載の多重特異性抗体。
7.b)に記載の第2軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)またはヒスチジン(H)で(好ましい一態様では、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で)置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつb)に記載の第2重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、態様1または態様2に記載の多重特異性抗体。
8.b)に記載の第2軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)またはヒスチジン(H)で(好ましい一態様では、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で)置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつb)に記載の第2重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、態様1または態様2に記載の多重特異性抗体。
9.b)に記載の第2軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)またはヒスチジン(H)で(好ましい一態様では、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で)置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、123番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)またはヒスチジン(H)で置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつb)に記載の第2重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されており(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、213番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、態様8に記載の多重特異性抗体。
10.b)に記載の第2軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)またはヒスチジン(H)で置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつb)に記載の第2重鎖の定常ドメインCH1において、213番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、態様1または態様2に記載の多重特異性抗体。
11.a)に記載の第1軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸はリジン(K)で置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、123番目のアミノ酸はリジン(K)で置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつ
a)に記載の第1重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸はグルタミン酸(E)で置換されており(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、213番目のアミノ酸はグルタミン酸(E)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、
態様5に記載の多重特異性抗体。
12.b)に記載の第2軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸はリジン(K)で置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、123番目のアミノ酸はリジン(K)で置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつ
b)に記載の第2重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸はグルタミン酸(E)で置換されており(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、213番目のアミノ酸はグルタミン酸(E)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、
態様9に記載の多重特異性抗体。
13.a)に記載の第1軽鎖の定常ドメインCLおよびb)に記載の第2軽鎖の定常ドメインCLがカッパアイソタイプである、前記態様のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
14.a)に記載の第1軽鎖の定常ドメインCLはラムダアイソタイプであり、かつb)に記載の第2軽鎖の定常ドメインCLはカッパアイソタイプである、態様1〜12のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
15.a)に記載の第1軽鎖の定常ドメインCLおよびb)に記載の第2軽鎖の定常ドメインCLがラムダアイソタイプである、態様1〜12のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
16.124番目のアミノ酸が、独立して、リジン(K)でもアルギニン(R)でもヒスチジン(H)でも置換されておらず、かつカッパアイソタイプである、a)に記載の第1軽鎖またはb)に記載の第2軽鎖のいずれかの定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で(好ましい一態様では グルタミン酸(E)で)置換されている(ナンバリングはKabatに従う)、前記態様のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
17.a)に記載の抗体の第1重鎖の第1CH3ドメインおよびb)に記載の抗体の第2重鎖の第2CH3ドメインが、それぞれ、抗体CH3ドメイン間の元の境界面を含む境界面において接することを特徴とし、
該境界面は多重特異性抗体の形成を促進するように改変されており、
前記改変は、
i)一方の重鎖のCH3ドメインが、
多重特異性抗体内の他方の重鎖のCH3ドメインの元の境界面と接する前記一方の重鎖のCH3ドメインの元の境界面内において、
アミノ酸残基が、より大きな側鎖体積を有するアミノ酸残基で置き換えられ、それによって、前記一方の重鎖のCH3ドメインの境界面内に、他方の重鎖のCH3ドメインの境界面内のくぼみ内に配置されうる突起を生成するように、
改変されていること、
および
ii)他方の重鎖のCH3ドメインが、
多重特異性抗体内の前記一方の重鎖のCH3ドメインの元の境界面と接する前記他方の重鎖のCH3ドメインの元の境界面内において、
アミノ酸残基が、より小さな側鎖体積を有するアミノ酸残基で置き換えられ、それによって、前記他方の重鎖のCH3ドメインの境界面内に、前記一方の重鎖のCH3ドメインの境界面内の突起が内部に配置されうるくぼみを生成するように、
改変されていること、
を特徴とする、
前記態様のいずれか1つに記載の抗体。
18.より大きな側鎖体積を有するアミノ酸残基が、アルギニン(R)、フェニルアラニン(F)、チロシン(Y)およびトリプトファン(W)からなる群より選択され、より小さな側鎖体積を有するアミノ酸残基が、アラニン(A)、セリン(S)、スレオニン(T)およびバリン(V)からなる群より選択されることを特徴とする、態様17に記載の抗体。
19.両CH3ドメイン間にジスルフィド架橋が形成されうるように、各CH3ドメインの対応する位置にアミノ酸としてシステイン(C)を導入することによって、両CH3ドメインがさらに改変されていることを特徴とする、態様17または態様18に記載の抗体。
20.二重特異性である、前記態様のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
21.ヒトTWEAKに特異的に結合し、かつヒトIL17に特異的に結合する、前記態様のいずれか1つに記載の多重特異性抗体であって、
A)SEQ ID NO:24の可変重鎖ドメイン(VH)およびSEQ ID NO:25の可変軽鎖ドメイン(VL)を含み、かつ
B)SEQ ID NO:26の可変重鎖ドメイン(VH)およびSEQ ID NO:27の可変軽鎖ドメイン(VL)を含む、
多重特異性抗体。
22.a)SEQ ID NO:24の可変重鎖ドメイン(VH)およびSEQ ID NO:25の可変軽鎖ドメイン(VL)を含むヒトTWEAKに特異的に結合する第1抗体の第1軽鎖および第1重鎖、ならびに
b)SEQ ID NO:26の可変重鎖ドメイン(VH)およびSEQ ID NO:27の可変軽鎖ドメイン(VL)を含むヒトIL-17に特異的に結合する第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖であって、第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖中の可変ドメインVLとVHとが互いに入れ替えられている、第2軽鎖および第2重鎖
を含む二重特異性抗体であって、
i)a)に記載の第1軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で置換されており、かつa)に記載の第1重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、
二重特異性抗体。
23.a)に記載の第1軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で(好ましい一態様では、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で)置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、123番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)またはヒスチジン(H)で置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつa)に記載の第1重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されており(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、213番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、態様21に記載の二重特異性抗体。
24.がん、または炎症性疾患、自己免疫疾患、関節リウマチ、乾癬性関節炎、筋疾患、例えば筋ジストロフィー、多発性硬化症、慢性腎臓疾患、骨疾患、例えば多発性骨髄腫における骨変性、全身性エリテマトーデス、ループス腎炎、および血管損傷の処置に使用するための、態様21〜23のいずれか1つに記載の抗体。
25.がん、または炎症性疾患、自己免疫疾患、関節リウマチ、乾癬性関節炎、筋疾患、例えば筋ジストロフィー、多発性硬化症、慢性腎臓疾患、骨疾患、例えば多発性骨髄腫における骨変性、全身性エリテマトーデス、ループス腎炎、および血管損傷を処置するための医薬を製造するための、態様21〜23のいずれか1つに記載の抗体の使用。
26.ヒトIgG1またはヒトIgG4サブクラスであることを特徴とする、態様1〜23のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
27.変異L234AおよびL235A(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)を持つヒトIgG1サブクラスであることを特徴とする、態様1〜23および態様26のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
28.変異L234A、L235AおよびP329G(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)を持つヒトIgG1サブクラスであることを特徴とする、態様1〜23および態様26〜27のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
29.変異S228PおよびL235E(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)を持つヒトIgG4サブクラスであることを特徴とする、前記態様1〜23および態様26のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
30.変異S228P、L235EおよびP329G(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)を持つヒトIgG4サブクラスであることを特徴とする、態様1〜23および態様26〜29のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
31.以下の工程を含む、態様1〜23および態様26〜30のいずれか1つに記載の多重特異性抗体を調製するための方法:
A)a)第1抗原に特異的に結合する第1抗体の第1軽鎖および第1重鎖、ならびに
b)第2抗原に特異的に結合する第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖であって、第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖中の可変ドメインVLとVHとが互いに入れ替えられている、第2軽鎖および第2重鎖
をコードする核酸分子を含むベクターであって、
i)a)に記載の第1軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)またはヒスチジン(H)で(好ましい一態様では、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で)置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつa)に記載の第1重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されているか(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、または
ii)b)に記載の第2軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)またはヒスチジン(H)で(好ましい一態様では、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で)置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつb)に記載の第2重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)
ベクターで、宿主細胞を形質転換する工程、
B)該抗体分子の合成を可能にする条件下で前記宿主細胞を培養する工程、および
C)該培養から該抗体分子を回収する工程。
32.態様1〜23および態様26〜30のいずれか1つに記載の多重特異性抗体のアミノ酸配列をコードする核酸。
33.態様32に記載の核酸を宿主細胞中で発現させる能力を有する態様32に記載の核酸を含有する発現ベクター。
34.態様33に記載のベクターを含む宿主細胞。
35.態様1〜23および態様26〜30のいずれか1つに記載の抗体を含む組成物。
36.態様1〜23および態様26〜30のいずれか1つに記載の抗体と少なくとも1つの薬学的に許容される賦形剤とを含む薬学的組成物。
37.治療を必要とする患者を処置するための方法であって、治療有効量の態様1〜23および態様26〜30のいずれか1つに記載の抗体を、患者に投与することを特徴とする方法。
38.以下の工程を含む、多重特異性抗体の副生成物を低減するための方法:
A)a)第1抗原に特異的に結合する第1抗体の第1軽鎖および第1重鎖、ならびに
b)第2抗原に特異的に結合する第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖であって、第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖中の可変ドメインVLとVHとが互いに入れ替えられている、第2軽鎖および第2重鎖
をコードする核酸分子を含むベクターであって、多重特異性抗体の副生成物を低減するために以下の置換が含まれているベクターで、宿主細胞を形質転換する工程:
i)a)に記載の第1軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)またはヒスチジン(H)で(好ましい一態様では、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で)置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつa)に記載の第1重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されているか(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、または
ii)b)に記載の第2軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)またはヒスチジン(H)で(好ましい一態様では、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で)置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつb)に記載の第2重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、
B)該抗体分子の合成を可能にする条件下で前記宿主細胞を培養する工程、および
C)該培養から該抗体分子を回収する工程。
39.以下の工程を含む、多重特異性抗体の副生成物を低減するための方法:
A)a)第1抗原に特異的に結合する第1抗体の第1軽鎖および第1重鎖、ならびに
b)第2抗原に特異的に結合する第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖であって、第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖中の可変ドメインVLとVHとが互いに入れ替えられている、第2軽鎖および第2重鎖
をコードする核酸分子を含むベクターであって、以下の置換が含まれているベクターで、宿主細胞を形質転換する工程:
i)a)に記載の第1軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)またはヒスチジン(H)で(好ましい一態様では、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)で)置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつa)に記載の第1重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されているか(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、または
ii)b)に記載の第2軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)またはヒスチジン(H)で(好ましい一態様では、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)で)置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつb)に記載の第2重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、
B)該抗体分子の合成を可能にする条件下で前記宿主細胞を培養する工程、および
C)副生成物プロファイルが低減している該抗体分子を該培養から回収する工程。
40.以下の工程を含む、多重特異性抗体の副生成物を低減するための方法:
A)a)第1抗原に特異的に結合する第1抗体の第1軽鎖および第1重鎖、ならびに
b)第2抗原に特異的に結合する第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖であって、第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖中の可変ドメインVLとVHとが互いに入れ替えられている、第2軽鎖および第2重鎖
をコードする核酸分子を含むベクターであって、以下の置換が含まれているベクターで、宿主細胞を形質転換する工程:
i)a)に記載の第1軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)またはヒスチジン(H)で(好ましい一態様では、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)で)置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつa)に記載の第1重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、
B)該抗体分子の合成を可能にする条件下で前記宿主細胞を培養する工程、および
C)副生成物プロファイルが低減している該抗体分子を該培養から回収する工程。
41.a)第1抗原に特異的に結合する第1抗体の第1軽鎖および第1重鎖、ならびに
b)第2抗原に特異的に結合する第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖であって、第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖中の可変ドメインVLとVHとが互いに入れ替えられている、第2軽鎖および第2重鎖
を含む多重特異性抗体の、副生成物の形成を低減するための(または副生成物プロファイルを低減するための)、以下の置換の使用:
i)a)に記載の第1軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸を、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)またはヒスチジン(H)で(好ましい一態様では、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で)置換し(ナンバリングはKabatに従う)、かつa)に記載の第1重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸を、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換すること(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、または
ii)b)に記載の第2軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸を、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)またはヒスチジン(H)で(好ましい一態様では、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で)置換し(ナンバリングはKabatに従う)、かつb)に記載の第2重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸を、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換すること(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)。
42.a)第1抗原に特異的に結合する第1抗体の第1軽鎖および第1重鎖、ならびに
b)第2抗原に特異的に結合する第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖であって、第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖中の可変ドメインVLとVHとが互いに入れ替えられている、第2軽鎖および第2重鎖
を含む多重特異性抗体の、副生成物の形成を低減するための(または副生成物プロファイルを低減するための)、以下の置換の使用:
i)a)に記載の第1軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸を、独立して、リジン(K)、アルギニン(R)またはヒスチジン(H)で(好ましい一態様では、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で)置換し(ナンバリングはKabatに従う)、かつa)に記載の第1重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸を、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換すること(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)。
43.少なくとも2つのFabフラグメントを含み、第1Fabフラグメントが第1抗原に特異的な少なくとも1つの抗原結合部位を含み、かつ第2Fabフラグメントが第2抗原に特異的な少なくとも1つの抗原結合部位を含み、第2Fabフラグメントにおいて、第2軽鎖および第2重鎖中の可変ドメインVLとVHとは互いに入れ替えられており、かつFcドメインを欠く、態様1〜16および態様20〜23のいずれか1つに記載の多重特異性抗体。
44.2〜4つのFabフラグメントを含む、態様43に記載の多重特異性抗体。
45.ヒトAng-2およびVEGFに特異的に結合する、態様43または態様44に記載の多重特異性抗体。
46.抗体を生産する方法であって、態様34の宿主細胞を、前記抗体が生産されるように培養する工程を含む方法。
47.宿主細胞から抗体を回収する工程をさらに含む、態様46に記載の方法。
SEQ ID NO:1 野生型(wt)<Ang-2>軽鎖(LC)
SEQ ID NO:2 野生型(wt)<Ang-2>重鎖(HC)
SEQ ID NO:3 VH-VL交換した野生型(wt)<VEGF>重鎖(HC)
SEQ ID NO:4 VH-VL交換した野生型(wt)<VEGF>軽鎖(LC)
SEQ ID NO:5 Q124K置換を持つ<Ang-2>軽鎖(LC)
SEQ ID NO:6 K147E置換を持つ<Ang-2>重鎖(HC)
SEQ ID NO:7 K213E置換を持つ<Ang-2>重鎖(HC)
SEQ ID NO:8 E123K置換を持つ<Ang-2>軽鎖(LC)
SEQ ID NO:9 Q124K置換およびE123K置換を持つ<Ang-2>軽鎖(LC)
SEQ ID NO:10 K147E置換およびK213E置換を持つ<Ang-2>重鎖(HC)
SEQ ID NO:11 Q124R置換およびE123K置換を持つ<Ang-2>軽鎖(LC)
SEQ ID NO:12 Q124E置換を持つ<VEGF>軽鎖(LC)
SEQ ID NO:13 E124K置換およびE123K置換を持つ<Ang-2>軽鎖(LC)
SEQ ID NO:14 K147E置換およびK213D置換を持つ<Ang-2>重鎖(HC)
SEQ ID NO:15 野生型(wt)<IL-17>軽鎖(LC)
SEQ ID NO:16 野生型(wt)<IL-17>重鎖(HC)
SEQ ID NO:17 VH-VL交換した野生型(wt)<TWEAK>重鎖(HC)
SEQ ID NO:18 VH-VL交換した野生型(wt)<TWEAK>軽鎖(LC)
SEQ ID NO:19 Q124K置換およびE123R置換を持つ<IL-17>軽鎖(LC)
SEQ ID NO:20 K147E置換およびK213E置換を持つ<IL-17>重鎖(HC)
SEQ ID NO:21 Q124E置換を持つ<TWEAK>軽鎖(LC)
SEQ ID NO:22 K147E置換およびK213D置換を持つ<IL-17>重鎖(HC)
SEQ ID NO:23 Q124K置換およびE123K置換を持つ<IL-17>軽鎖(LC)
SEQ ID NO:24 <TWEAK>305-HC4可変重鎖ドメインVH
SEQ ID NO:25 <TWEAK>305-LC2可変軽鎖ドメインVL
SEQ ID NO:26 <IL-17>HC136可変重鎖ドメインVH
SEQ ID NO:27 <IL-17>LC136可変軽鎖ドメインVL
SEQ ID NO:28 VH-VL交換した野生型(wt)<TWEAK>重鎖(HC)(末端GKジペプチドを含む)
SEQ ID NO:29 K147E置換およびK213E置換を持つ<IL-17>重鎖(HC)(末端GKジペプチドを含む)
SEQ ID NO:30 K147E置換およびK213D置換を持つ<IL-17>重鎖(HC)(末端GKジペプチドを含む)
SEQ ID NO:31 野生型(wt)<Ang-2>重鎖(HC)(末端GKジペプチドを含む)
SEQ ID NO:32 VH-VL交換した野生型(wt)<VEGF>重鎖(HC)(末端GKジペプチドを含む)
SEQ ID NO:33 K147E置換を持つ<Ang-2>重鎖(HC)(末端GKジペプチドを含む)
SEQ ID NO:34 K213E置換を持つ<Ang-2>重鎖(HC)(末端GKジペプチドを含む)
SEQ ID NO:35 K147E置換およびK213E置換を持つ<Ang-2>重鎖(HC)(末端GKジペプチドを含む)
SEQ ID NO:36 K147E置換およびK213D置換を持つ<Ang-2>重鎖(HC)(末端GKジペプチドを含む)
SEQ ID NO:37 野生型(wt)<IL-17>重鎖(HC)(末端GKジペプチドを含む)
SEQ ID NO:38 VH-VL交換した野生型(wt)<VEGF>重鎖(HC)1つにグリシン-セリンリンカーを介してカップリングされた野生型(wt)<Ang-2>重鎖(HC)2つを含むFab2-CrossFab重鎖(HC)
SEQ ID NO:39 VH-VL交換した野生型(wt)<VEGF>重鎖(HC)1つにグリシン-セリンリンカーを介してカップリングされたK147E置換およびK213E置換を持つ<Ang-2>重鎖(HC)2つを含むFab2-CrossFab重鎖(HC)
SEQ ID NO:40 K147E置換およびK213E置換を持つ<Ang-2>重鎖(HC)1つにグリシン-セリンリンカーを介してカップリングされた、VH-VL交換した野生型(wt)<VEGF>重鎖(HC)1つを含む、CrossFab-Fab重鎖(HC)
SEQ ID NO:41 K147E置換およびK213E置換を持つ<Ang-2>重鎖(HC)1つにグリシン-セリンリンカーを介してカップリングされた、VH-VL交換した野生型(wt)<VEGF>重鎖(HC)1つを含む、CrossFab-Fab重鎖(HC)
SEQ ID NO:42 野生型(wt)<Ang-2>重鎖(HC)1つにグリシン-セリンリンカーによってカップリングされた、VH-VL交換した野生型(wt)<VEGF>重鎖(HC)2つの重鎖を含む、CrossFab2-Fab重鎖(HC)
SEQ ID NO:43 K147E置換およびK231E置換を持つ<Ang-2>重鎖(HC)1つにグリシン-セリンリンカーを介してカップリングされた、VH-VL交換した野生型(wt)<VEGF>重鎖(HC)2つを含む、CrossFab2-Fab重鎖(HC)
SEQ ID NO:44 VH-VL交換した、K147E置換を持つ<VEGF>重鎖(HC)
SEQ ID NO:45 VH-VL交換した、Q124K置換を持つ<VEGF>軽鎖(LC)
SEQ ID NO:46 VH-VL交換した、K147E置換およびK213E置換を持つ<VEGF>重鎖(HC)
SEQ ID NO:47 VH-VL交換した、E123K置換およびQ124K置換を持つ<VEGF>軽鎖(LC)
ヒト免疫グロブリン軽鎖および重鎖のヌクレオチド配列に関する一般情報は、Kabat, E.A., et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th ed., Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD(1991)に提供されている。抗体鎖のアミノ酸は、上に定義したようにKabat(Kabat, E.A., et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th ed., Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD(1991))によるナンバリングシステムに従ってナンバリングされ、言及される。
DNAの操作には、Sambrook, J. et al., Molecular Cloning: A laboratory manual; Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York, 1989に記載されているように、標準的方法を使用した。分子生物学用試薬は製造者の説明書に従って使用した。
所望の遺伝子セグメントは、化学合成によって作製されたオリゴヌクレオチドから調製した。唯一の制限エンドヌクレアーゼ切断部位に挟まれた600〜1800bp長の遺伝子セグメントを、PCR増幅を含むオリゴヌクレオチドのアニーリングおよびライゲーションによってアセンブルし、次に、表示した制限部位、例えばKpnI/SacIまたはAscI/PacIによって、pPCRScript(Stratagene)系pGA4クローニングベクターにクローニングした。サブクローニングされた遺伝子フラグメントのDNA配列はDNA配列決定によって確認した。遺伝子合成フラグメントは、Geneart(ドイツ・レーゲンスブルク)に、所与の仕様書に従って発注された。
DNA配列は、MediGenomix GmbH(ドイツ・マルティンストリート)またはSequiserve GmbH(ドイツ・ファターシュテッテン)において行われた両鎖シーケンスによって決定された。
配列の生成、マッピング、解析、アノテーションおよび図解には、GCG(Genetics Computer Group、ウィスコンシン州マディソン)のソフトウェアパッケージ・バージョン10.2およびInfomaxのVector NTl Advanceスイート・バージョン8.0を使用した。
記載する抗体の発現には、CMV-イントロンAプロモーターを持つcDNA編成またはCMV-イントロンAプロモーターを持たないcDNA編成に基づくか、CMVプロモーターを持つゲノム編成に基づく、一過性発現(例えばHEK293 EBNAまたはHEK293-Fにおける一過性発現)細胞用の発現プラスミドの変異体を応用した。
・大腸菌におけるこのプラスミドの複製を可能にする複製起点、および
・大腸菌においてアンピシリン耐性を付与するβ-ラクタマーゼ遺伝子
を含有していた。
・5'端のユニーク制限部位(1つまたは複数)
・ヒトサイトメガロウイルス由来の前初期エンハンサーおよびプロモーター、
・次に、cDNA編成の場合はイントロンA配列、
・ヒト抗体遺伝子の5'-非翻訳領域、
・免疫グロブリン重鎖シグナル配列、
・cDNAとしての、または免疫グロブリンエクソン-イントロン編成を持つゲノム編成としての、ヒト抗体鎖(野生型またはドメイン交換されたもの)
・ポリアデニル化シグナル配列を含む3'非翻訳領域、および
・3'端のユニーク制限部位(1つまたは複数)。
Current Protocols in Cell Biology(2000), Bonifacino, J.S., Dasso, M., Harford, J.B., Lippincott-Schwartz, J. and Yamada, K.M.(eds.), John Wiley & Sons, Inc.に記載されているように、標準的細胞培養技法を使用した。
10%Ultra Low IgG FCS(ウシ胎児血清、Gibco(登録商標))、2mM L-グルタミン(Gibco(登録商標))、および250μg/mlジェネティシン(Gibco(登録商標))を補足したDMEM(ダルベッコ変法イーグル培地、Gibco(登録商標))中で培養した付着培養HEK293-EBNA細胞(エプスタイン・バーウイルス核抗原を発現するヒト胎児腎臓細胞株293; American type culture collection受託番号ATCC#CRL-10852、ロット959218)における各発現プラスミド(例えば重鎖および修飾重鎖、ならびに対応する軽鎖および修飾軽鎖をコードするもの)の一過性共トランスフェクションによって、多重特異性抗体を発現させた。トランスフェクションには、FuGENE(商標)6 Transfection Reagent(Roche Molecular Biochemicals)を、FuGENE(商標)試薬(μl)対DNA(μg)の比率を4:1(3:1から6:1までの範囲)にして使用した。タンパク質は、(修飾および野生型)軽鎖および重鎖コードプラスミドのモル比を、それぞれ1:1(等モル)(1:2から2:1までの範囲)にして、各プラスミドから発現させた。3日目に、4mMのL-グルタミン、グルコース[Sigma]およびNAA[Gibco(登録商標)]を細胞に供給した。トランスフェクション後の5〜11日目に、多重特異性抗体を含有する細胞培養上清を、遠心分離によって収穫し、-20℃で保存した。例えばHEK293細胞などにおけるヒト免疫グロブリンの組換え発現に関する一般情報は、Meissner, P. et al., Biotechnol. Bioeng. 75(2001)197-203に記載されている。
HEK293-F系(Invitrogen)を製造者の説明書に従って使用し、各プラスミド(例えば重鎖および修飾重鎖、ならびに対応する軽鎖および修飾軽鎖をコードするもの)の一過性トランスフェクションによって、多重特異性抗体を作製した。簡単に述べると、振とうフラスコまたは撹拌発酵槽において無血清FreeStyle(商標)293発現培地(Invitrogen)中で懸濁培養したHEK293-F細胞(Invitrogen)に、4つの発現プラスミドと293fectin(商標)またはfectin(Invitrogen)との混合物で、トランスフェクションを行った。2L振とうフラスコ(Corning)の場合、HEK293-F細胞を1.0E*6細胞/mLの密度で600mLに接種し、120rpm、8%CO2でインキュベートした。翌日、細胞に、約1.5E*6細胞/mLの細胞密度で、A)それぞれ重鎖または修飾重鎖および対応する等モル比の軽鎖をコードするプラスミドDNA(1μg/mL)計600μgを含む20mLのOpti-MEM(Invitrogen)とB)20mlのOpti-MEM+1.2mLの293fectinまたはfectin(2μl/mL)との混合物約42mLを使って、トランスフェクションを行った。発酵中は、グルコース消費量に応じて、グルコース溶液を加えた。分泌された抗体を含有する上清を5〜10日後に収穫し、抗体を上清から直接精製するか、上清を凍結して保存した。
精製された抗体および誘導体のタンパク質濃度は、Pace, et al., Protein Science, 1995, 4, 2411-1423に従い、アミノ酸配列に基づいて算出されるモル吸光係数を使用し、280nmにおける光学密度(OD)を決定することによって決定した。
プロテインAアガロースビーズ(Roche)を用いる免疫沈降によって細胞培養上清中の抗体および誘導体の濃度を見積もった。60μlのプロテインAアガロースビーズをTBS-NP40(50mM Tris、pH7.5、150mM NaCl、1%Nonidet-P40)中で3回洗浄した。次に、1〜15mLの細胞培養上清を、前もってTBS-NP40中で平衡化したプロテインAアガロースビーズに適用した。室温で1時間インキュベートした後、ビーズを、Ultrafree-MCフィルターカラム(Amicon)上、0.5mLのTBS-NP40で1回、0.5mLの2×リン酸緩衝食塩水(2×PBS、Roche)で2回、および0.5mLの100mMクエン酸Na pH5.0で手短に4回、洗浄した。35μlのNuPAGE(登録商標)LDS Sample Buffer(Invitrogen)を加えることによって、結合している抗体を溶出させた。試料の半分を、それぞれNuPAGE(登録商標)試料還元剤と混和するか、還元しないでおき、70℃で10分加熱した。その結果、5〜30μlを4-12%NuPAGE(登録商標)Bis-Tris SDS-PAGE(Invitrogen)(非還元SDS-PAGEにはMOPS緩衝液を使用し、還元SDS-PAGEにはNuPAGE(登録商標)酸化防止ランニング緩衝液添加物(Invitrogen)を含むMES緩衝液を使用した)に適用し、クーマシーブルーで染色した。
濾過した細胞培養上清から、標準的プロトコールを参照して、タンパク質を精製した。簡単に述べると、抗体をプロテインA Sepharoseカラム(GE healthcare)に適用し、PBSで洗浄した。抗体の溶出をpH2.8で達成した後、直ちに試料を中和した。凝集したタンパク質は、PBSにおける、または20mMヒスチジン、150mM NaCl pH6.0におけるサイズ排除クロマトグラフィー(Superdex 200、GE Healthcare)によって、単量体型抗体から分離した。単量体型抗体フラクションをプールし、(必要なら)例えばMILLIPORE Amicon Ultra(30MWCO)遠心分離濃縮器を使って濃縮し、凍結し、-20℃または-80℃で保存した。試料の一部を、例えばSDS-PAGE、サイズ排除クロマトグラフィー(SEC)または質量分析による、後続のタンパク質分析および分析的キャラクタリゼーション用に用意した。
NuPAGE(登録商標)Pre-Castゲルシステム(Invitrogen)を製造者の説明書に従って使用した。具体的には、10%または4-12%NuPAGE(登録商標)Novex(登録商標)Bis-TRIS Pre-Castゲル(pH6.4)、およびNuPAGE(登録商標)MES(NuPAGE(登録商標)酸化防止ランニング緩衝液添加物を含む還元ゲル)またはMOPS(非還元ゲル)ランニング緩衝液を使用した。
抗体の凝集状態およびオリゴマー状態を決定するためのサイズ排除クロマトグラフィー(SEC)は、HPLCクロマトグラフィーによって行った。簡単に述べると、プロテインA精製抗体を、Agilent HPLC 1100システムで、300mM NaCl、50mM KH2PO4/K2HPO4、pH7.5中のTosoh TSKgel G3000SWカラムに適用するか、Dionex HPLCシステムで、2×PBS中のSuperdex 200カラム(GE Healthcare)に適用した。溶出したタンパク質をUV吸光度およびピーク面積の積分によって定量した。BioRad Gel Filtration Standard 151-1901を標準とした。
この項では、VH/VL交換が施された多重特異性抗体(VH/VL CrossMab)の、その正しいアセンブリに重点をおいたキャラクタリゼーションを説明する。予想一次構造を、脱グリコシル化インタクトCrossMabおよび脱グリコシル化/プラスミン消化あるいは脱グリコシル化/制限LysC消化CrossMabのエレクトロスプレーイオン化質量分析(ESI-MS)によって分析した。
作製した抗体の各抗原(例えばANG2およびVEGF)への結合は、表面プラズモン共鳴により、BIACORE計器(GE Healthcare Biosciences AB、スウェーデン国ウプサラ)を使って調べられる。簡単に述べると、アフィニティー測定のために、各抗原に対して抗体を提示するために、ヤギ抗ヒトIgG、JIR109-005-098抗体を、アミンカップリングによってCM5チップ上に固定化する。結合は、HBS緩衝液(HBS-P(10mM HEPES、150mM NaCl、0.005%Tween 20、ph7.4)中、25℃(あるいは37℃)で測定される。抗原(R&D Systemsまたは自社精製物)をさまざまな濃度で溶液として加えた。80秒〜3分の抗原注入によって会合を測定し、チップ表面をHBS緩衝液で3〜10分洗浄することによって解離を測定し、1:1ラングミュア結合モデルを使ってKD値を見積もった。システム固有のベースラインドリフトを補正するため、およびノイズ信号を低減するために、陰性対照データ(例えば緩衝液曲線)を試料曲線から差し引く。センサーグラムの解析およびアフィニティーデータの計算には、各Biacore Evaluation Softwareを使用した。
一方の結合アームにVH/VLドメインの交換/入れ替え(CrossMAbVh-VL)が施され、CH1/CL境界面に単一荷電アミノ酸置換を持つ、アンジオポエチン-2(ANG2)およびVEGFに結合する多重特異性抗体の生産および発現
最初の実施例では、一般的方法の項で述べたように、古典的な分子生物学的技法によって、ヒトアンジオポエチン-2(ANG2)およびヒトVEGFに結合する多重特異性抗体を作製した。この多重特異性抗体を、上述のように、HEK293細胞において一過性に発現させる。これらの各多重特異性抗体の一般スキームを図1A〜Cに示す。比較のために、CH1/CL境界面に置換を持たない野生型(wt)VH/VLドメイン交換/入れ替え抗体も調製した。CH1CL境界面のごく近傍にある他の代替置換(例えばEP2647707で言及されているもの)も比較のために使用した。表2aに示すアミノ酸配列をコードする核酸を含有するプラスミドを使って多重特異性抗体を発現させた。
一方の結合アームにVH/VLドメインの交換/入れ替え(CrossMAbVh-VL)が施され、CH1/CL境界面に単一荷電アミノ酸置換を持つ、アンジオポエチン-2(ANG2)およびVEGFに結合する多重特異性抗体の精製およびキャラクタリゼーション
上で発現させた多重特異性抗体を、プロテインAアフィニティークロマトグラフィーとサイズ排除クロマトグラフィーとの組み合わせにより、上清から精製した。多重特異性抗体は全て、良好な収量で生産することができ、安定である。
予想一次構造を、脱グリコシル化インタクトCrossMabおよび脱グリコシル化/プラスミン消化あるいは脱グリコシル化/制限LysC消化CrossMabのエレクトロスプレーイオン化質量分析(ESI-MS)によって分析した。
一方の結合アームにVH/VLドメインの交換/入れ替え(CrossMAbVh-VL)が施され、CH1/CL境界面に単一荷電アミノ酸置換を持つ、アンジオポエチン-2(ANG2)およびVEGFに結合する多重特異性抗体の抗原結合特性
先の実施例1Aおよび1Bの多重特異性抗体の各ターゲット抗原、すなわちANG2およびVEGFへの結合を、Biacore(登録商標)によって評価した。
ヒトVEGFA-121への表示の抗体の結合を、表面プラズモン共鳴により、BIACORE(登録商標)T200計器(GE Healthcare)を使って調べた。10000(RU)前後の抗His抗体(1μg/mlの抗His抗体;注文コード:28995056; GE Healthcare Bio-Sciences AB、スウェーデン)を、GE Healthcareが供給するアミンカップリングキットを使用することによって、SシリーズCM5チップ(GE Healthcare BR-1005-30)にpH5.0でカップリングした。固定化手順中は、HBS-N(10mM HEPES、150mM NaCl pH7.4、GE Healthcare)をランニング緩衝液として使用した。続く速度論的キャラクタリゼーションでは、試料緩衝液およびランニング緩衝液をpH7.4のPBS-T(0.05%Tween 20を含む10mMリン酸緩衝食塩水)とした。フローセルを25℃に、また試料ブロックを12℃に設定し、速度論的キャラクタリゼーションに先だってランニング緩衝液で2回プライミングした。
ヒトAng-2-RBD-Fcへの表示の抗体の結合を、表面プラズモン共鳴により、BIACORE(登録商標)T200計器(GE Healthcare)を使って調べた。8000(RU)前後のヤギ抗ヒトF(ab')2(10μg/ml抗ヒトF(ab)'2;注文コード:28958325; GE Healthcare Bio-Sciences AB、スウェーデン)を、GE Healthcareが供給するアミンカップリングキットを使用することによって、SシリーズCM5チップ(GE Healthcare BR-1005-30)にpH5.0でカップリングした。固定化手順中は、HBS-N(10mM HEPES、150mM NaCl pH7.4、GE Healthcare)をランニング緩衝液として使用した。続く速度論的キャラクタリゼーションでは、試料緩衝液およびランニング緩衝液をpH7.4のPBS-T(0.05%Tween 20を含む10mMリン酸緩衝食塩水)とした。フローセルを25℃に、また試料ブロックを12℃に設定し、速度論的キャラクタリゼーションに先だってランニング緩衝液で2回プライミングした。
一方の結合アームにVH/VLドメインの交換/入れ替え(CrossMAbVh-VL)が施され、CH1/CL境界面に単一荷電アミノ酸置換を持つ、アンジオポエチン-2(ANG2)およびVEGFに結合する多重特異性抗体の安定性
抗体コンストラクトの安定性を評価するために、以下の手順に従って熱安定性ならびに凝集開始温度を評価した。
一方の結合アームにVH/VLドメインの交換/入れ替え(CrossMAbVh-VL)が施され、CH1/CL境界面に単一荷電アミノ酸置換を持つ、アンジオポエチン-2(ANG2)およびVEGFに結合する多重特異性抗体の生産収量
表示した多重特異性抗体の生産収量をプロテインA精製(ProtA)後に評価した。結果を表2fに示す。
一方の結合アームにVH/VLドメインの交換/入れ替え(CrossMAbVh-VL)が施され、CH1/CL境界面に異なる荷電アミノ酸置換を持つ、アンジオポエチン-2(ANG2)およびVEGFに結合する多重特異性抗体の生産および発現
最初の実施例では、一般的方法の項で述べたように、古典的な分子生物学的技法によって、ヒトアンジオポエチン-2(ANG2)およびヒトVEGFに結合する多重特異性抗体を作製した。この多重特異性抗体を、上述のように、HEK293細胞において一過性に発現させる。これらの各多重特異性抗体の一般スキームを図1A〜Cに示す。比較のために、CH1/CL境界面に置換を持たない野生型(wt)VH/VLドメイン交換/入れ替え抗体も調製した。表3aに示すアミノ酸配列をコードする核酸を含有する発現プラスミドを使って多重特異性抗体を発現させた。
一方の結合アームにVH/VLドメインの交換/入れ替え(CrossMAbVh-VL)が施され、CH1/CL境界面に単一荷電アミノ酸置換を持つ、アンジオポエチン-2(ANG2)およびVEGFに結合する多重特異性抗体の精製およびキャラクタリゼーション
上で発現させた多重特異性抗体を、プロテインAアフィニティークロマトグラフィーとサイズ排除クロマトグラフィーとの組み合わせにより、上清から精製した。多重特異性抗体は全て、良好な収量で生産することができ、安定である。
予想一次構造を、脱グリコシル化インタクトCrossMabおよび脱グリコシル化/プラスミン消化あるいは脱グリコシル化/制限LysC消化CrossMabのエレクトロスプレーイオン化質量分析(ESI-MS)によって分析した。
一方の結合アームにVH/VLドメインの交換/入れ替え(CrossMAbVh-VL)が施され、CH1/CL境界面に異なる荷電アミノ酸置換を持つ、アンジオポエチン-2(ANG2)およびVEGFに結合する多重特異性抗体の抗原結合特性
先の実施例2Aおよび2Bの多重特異性抗体の各ターゲット抗原、すなわちANG2およびVEGFへの結合を、実施例1Cで概説したように、Biacore(登録商標)によって評価した。
一方の結合アームにVH/VLドメインの交換/入れ替え(CrossMAbVh-VL)が施され、CH1/CL境界面に単一荷電アミノ酸置換を持つ、アンジオポエチン-2(ANG2)およびVEGFに結合する多重特異性抗体の安定性
抗体コンストラクトの安定性を評価するために、実施例1Dで概説したように、熱安定性および凝集開始温度を評価した。
一方の結合アームにVH/VLドメインの交換/入れ替え(CrossMAbVh-VL)が施され、CH1/CL境界面に異なる荷電アミノ酸置換を持つ、IL-17およびTWEAKに結合する多重特異性抗体の生産および発現
最初の実施例では、一般的方法の項で述べたように、古典的な分子生物学的技法によって、ヒトIL-17およびヒトTWEAKに結合する多重特異性抗体を作製し、上述のように、HEK293細胞において一過性に発現させた。これらの各多重特異性抗体の一般スキームを図1A〜Cに示す。比較のために、CH1/CL境界面に置換を持たない野生型(wt)VH/VLドメイン交換/入れ替え抗体も調製した。表4aに示すアミノ酸配列をコードする核酸を含有する発現プラスミドを使って多重特異性抗体を発現させた。
一方の結合アームにVH/VLドメインの交換/入れ替えが施され(CrossMAbVh-VL)、CH1/CL境界面に異なる荷電アミノ酸置換を持つ、IL-17およびTWEAKに結合する多重特異性抗体の精製およびキャラクタリゼーション
上で発現させた多重特異性抗体を、プロテインAアフィニティークロマトグラフィーとサイズ排除クロマトグラフィーとの組み合わせにより、上清から精製した。多重特異性抗体は全て、良好な収量で生産することができ、安定である。
予想一次構造を、脱グリコシル化インタクトCrossMabおよび脱グリコシル化/プラスミン消化あるいは脱グリコシル化/制限LysC消化CrossMabのエレクトロスプレーイオン化質量分析(ESI-MS)によって分析した。
Fcフラグメントを欠き、1つの結合アームにVH/VLドメインの交換/入れ替えを含み、かつCH1/CL境界面に1つまたは複数の荷電アミノ酸置換を含む、Ang2およびVEGFに結合する二価および三価多重特異性抗体の生産および発現
さらなる一実施例では、一般的方法の項で述べたように、古典的な分子生物学的技法によって、ヒトAng2およびヒトVEGFに結合する多重特異性抗体を作製し、上述のように、HEK293細胞において一過性に発現させた。生成した抗体は、VEGFに特異的に結合する結合アーム中に、VH/VLドメインの交換が施されたFabフラグメントを含み、Ang2に特異的に結合するもう1つの結合アームに、ドメインの交換が施されていないFabフラグメントを含んでおり、同時に、当該多重特異性抗体はFcフラグメントを欠いていた。したがって、第1軽鎖はヒトAng2に特異的に結合する抗体に由来し、N末端からC末端の方向にドメインVL-CLを含む。第1(抗Ang2)抗体の重鎖と第2(抗VEGF)抗体の重鎖は、グリシン-セリンペプチドリンカーによって接続される。VEGFに特異的に結合する抗体の重鎖では、元の可変ドメインVHが、その抗VEGF抗体に由来する可変ドメインVLで置き換えられている。したがって、抗Ang2の重鎖と抗VEGF抗体の重鎖とを含むポリペプチドは、N末端からC末端の方向に、ドメインVH(Ang2)-CH1(Ang2)リンカー-VL(VEGF)-CH1(VEGF)を含む。ヒトVEGFに特異的に結合する軽鎖では、元の可変ドメインVLがその抗VEGF抗体の可変ドメインVHで置き換えられている。したがって、抗VEGF抗体の修飾軽鎖は、N末端からC末端の方向に、ドメインVH-CLを含む。CH1/CL境界面中の異なるアミノ酸の置換を表5bに示す。
i)CrossFabVH-VL-(Fab)フォーマットの二価多重特異性Ang2-VEGF二重特異性抗体(図7Dに示す一般構造);
ii)(CrossFabVH-VL)2-Fabフォーマットの三価多重特異性Ang2-VEGF二重特異性抗体(図8C(neu)に示す一般構造);
iii)(Fab)2-CrossFabVH-VLフォーマットの三価多重特異性Ang2-VEGF二重特異性抗体(図8Dに示す一般構造)。
Fcフラグメントを欠き、1つの結合アームにVH/VLドメインの交換/入れ替えを含み、かつCH1/CL境界面に異なる荷電アミノ酸置換を含む、ANG2およびVEGFに結合する二価および三価多重特異性抗体の生産および発現
分泌されたタンパク質を、アフィニティー精製を使用する標準的手順によって精製した。
Fcフラグメントを欠き、1つの結合アームにVH/VLドメインの交換/入れ替えを含み、かつCH1/CL境界面に異なる荷電アミノ酸置換を含む、ANG2およびVEGFに結合する二価および三価多重特異性抗体の抗原結合特性
各々のターゲット抗原、すなわちANG2およびVEGFへの前記実施例4Aおよび4Bの多重特異性抗体の結合をBiacore(登録商標)によって評価した。
ヒトVEGFA-121への表示した抗体の結合は、表面プラズモン共鳴により、BIACORE(登録商標)T200 計器(GE Healthcare)を使って調べた。GE Healthcareによって供給されるアミンカップリングキットを使用することによって、目標50RUのVEFGA-121-Hisを、SシリーズC1チップ(GE Healthcare BR-1005-35)に、pH5.0でカップリングした。固定化手順中は、HBS-N(10mM HEPES、150mM NaCl pH7.4、GE Healthcare)をランニング緩衝液として使用した。続く速度論的キャラクタリゼーションでは、試料緩衝液およびランニング緩衝液をpH7.4のPBS-T(0.05%Tween 20を含む10mMリン酸緩衝食塩水)とした。フローセルを25℃に、また試料ブロックを12℃に設定し、速度論的キャラクタリゼーションに先だってランニング緩衝液で2回プライミングした。
ヒトAng-2-RBD-Fcへの表示の抗体の結合を、表面プラズモン共鳴により、BIACORE(登録商標)T200計器(GE Healthcare)を使って調べた。8000(RU)前後のヤギ抗ヒトF(ab')2(10μg/ml抗ヒトF(ab)'2;注文コード:28958325; GE Healthcare Bio-Sciences AB、スウェーデン)を、GE Healthcareが供給するアミンカップリングキットを使用することによって、SシリーズCM5チップ(GE Healthcare BR-1005-30)にpH5.0でカップリングした。固定化手順中は、HBS-N(10mM HEPES、150mM NaCl pH7.4、GE Healthcare)をランニング緩衝液として使用した。続く速度論的キャラクタリゼーションでは、試料緩衝液およびランニング緩衝液をpH7.4のPBS-T(0.05%Tween 20を含む10mMリン酸緩衝食塩水)とした。フローセルを25℃に、また試料ブロックを12℃に設定し、速度論的キャラクタリゼーションに先だってランニング緩衝液で2回プライミングした。
VEGF結合アームにVH/VLドメインの交換/入れ替え(CrossMAbVh-VL)が施され、VEGF結合アームのCH1/CL境界面に異なる荷電アミノ酸置換を持つ、アンジオポエチン-2(ANG2)およびVEGFに結合する多重特異性抗体の生産および発現
さらにもう1つの実施例として、ヒトアンジオポエチン-2(ANG2)およびヒトVEGFに結合する多重特異性抗体を、一般的方法の項で述べたように、古典的な分子生物学的技法によって作製した。この多重特異性抗体を、上述のように、HEK293細胞において一過性に発現させる。これらの各多重特異性抗体の一般スキームを、異なる荷電アミノ酸による置換がVH/VLドメインの交換/入れ替えを含む結合アームのCH1/CL境界面内に存在することを示している図1Bに示す。比較のために、CH1/CL境界面に置換を持たない野生型(wt)VH/VLドメイン交換/入れ替え抗体も調製した。表6aに示すアミノ酸配列をコードする核酸を含有する発現プラスミドを使って多重特異性抗体を発現させた。
一方の結合アームにVH/VLドメインの交換/入れ替え(CrossMAbVh-VL)が施され、CH1/CL境界面に異なる荷電アミノ酸置換を持つ、アンジオポエチン-2(ANG2)およびVEGFに結合する多重特異性抗体の精製およびキャラクタリゼーション
上で発現させた多重特異性抗体を、プロテインAアフィニティークロマトグラフィーとサイズ排除クロマトグラフィーとの組み合わせにより、上清から精製した。多重特異性抗体は全て、良好な収量で生産することができ、安定である。
予想一次構造を、脱グリコシル化インタクトCrossMabおよび脱グリコシル化/プラスミン消化あるいは脱グリコシル化/制限LysC消化CrossMabのエレクトロスプレーイオン化質量分析(ESI-MS)によって分析した。
Claims (13)
- a)第1抗原に特異的に結合する第1抗体の第1軽鎖および第1重鎖、ならびに
b)第2抗原に特異的に結合する第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖であって、第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖中の可変ドメインVLとVHとが互いに入れ替えられている、第2軽鎖および第2重鎖
を含む多重特異性抗体であって、
a)に記載の第1軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつa)に記載の第1重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、
多重特異性抗体。 - a)に記載の第1軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸が、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつa)に記載の第1重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸が、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、請求項1に記載の多重特異性抗体。
- a)に記載の第1軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸が、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、123番目のアミノ酸が、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつa)に記載の第1重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸が、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されており(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、213番目のアミノ酸が、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、請求項1に記載の多重特異性抗体。
- a)に記載の第1軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸がリジン(K)で置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、123番目のアミノ酸がリジン(K)で置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつa)に記載の第1重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸がグルタミン酸(E)で置換されており(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、213番目のアミノ酸がグルタミン酸(E)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、
請求項1に記載の多重特異性抗体。 - a)に記載の抗体の第1重鎖の第1CH3ドメインおよびb)に記載の抗体の第2重鎖の第2CH3ドメインが、それぞれ、抗体CH3ドメイン間の元の境界面を含む境界面において接することを特徴とし、
該界面は多重特異性抗体の形成を促進するように改変されており、
前記改変は、
i)一方の重鎖のCH3ドメインが、
多重特異性抗体内の他方の重鎖のCH3ドメインの元の境界面と接する前記一方の重鎖のCH3ドメインの元の境界面内において、
アミノ酸残基が、より大きな側鎖体積を有するアミノ酸残基で置き換えられ、それによって、前記一方の重鎖のCH3ドメインの境界面内に、他方の重鎖のCH3ドメインの境界面内のくぼみ内に配置されうる突起を生成するように、
改変されていること、
および
ii)他方の重鎖のCH3ドメインが、
多重特異性抗体内の前記一方の重鎖のCH3ドメインの元の境界面と接する前記他方の重鎖のCH3ドメインの元の境界面内において、
アミノ酸残基が、より小さな側鎖体積を有するアミノ酸残基で置き換えられ、それによって、前記他方の重鎖のCH3ドメインの境界面内に、前記一方の重鎖のCH3ドメインの境界面内の突起が内部に配置されうるくぼみを生成するように、
改変されていること
を特徴とする、請求項1に記載の抗体。 - より大きな側鎖体積を有するアミノ酸残基が、アルギニン(R)、フェニルアラニン(F)、チロシン(Y)、およびトリプトファン(W)からなる群より選択され、より小さな側鎖体積を有するアミノ酸残基が、アラニン(A)、セリン(S)、スレオニン(T)、およびバリン(V)からなる群より選択されることを特徴とする、請求項5に記載の抗体。
- 両CH3ドメイン間にジスルフィド架橋が形成されうるように、各CH3ドメインの対応する位置にアミノ酸としてシステイン(C)を導入することによって、両CH3ドメインがさらに改変されていることを特徴とする、請求項5または6に記載の抗体。
- A)SEQ ID NO:24の可変重鎖ドメイン(VH)およびSEQ ID NO:25の可変軽鎖ドメイン(VL)を含み、かつ
B)SEQ ID NO:26の可変重鎖ドメイン(VH)およびSEQ ID NO:27の可変軽鎖ドメイン(VL)を含み、
ヒトTWEAKに特異的に結合し、かつヒトIL17に特異的に結合する、請求項1に記載の多重特異性抗体。 - 以下の工程を含む、請求項1〜8のいずれか一項に記載の多重特異性抗体を調製するための方法:
A)a)第1抗原に特異的に結合する第1抗体の第1軽鎖および第1重鎖、ならびに
b)第2抗原に特異的に結合する第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖であって、第2抗体の第2軽鎖および第2重鎖中の可変ドメインVLとVHとが互いに入れ替えられている、第2軽鎖および第2重鎖
をコードする核酸分子を含むベクターで宿主細胞を形質転換する工程であって、
a)に記載の第1軽鎖の定常ドメインCLにおいて、124番目のアミノ酸は、独立して、リジン(K)またはアルギニン(R)で置換されており(ナンバリングはKabatに従う)、かつa)に記載の第1重鎖の定常ドメインCH1において、147番目のアミノ酸または213番目のアミノ酸は、独立して、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)で置換されている(ナンバリングはKabat EUインデックスに従う)、工程、
B)該抗体分子の合成を可能にする条件下で前記宿主細胞を培養する工程、および
C)該培養から該抗体分子を回収する工程。 - 請求項1〜8のいずれか一項に記載の多重特異性抗体のアミノ酸配列をコードする核酸。
- 請求項10に記載の核酸を宿主細胞中で発現させる能力を有する請求項10に記載の核酸を含有する発現ベクター。
- 請求項1〜8のいずれか一項に記載の抗体を含む組成物。
- 請求項1〜8のいずれか一項に記載の抗体と少なくとも1つの薬学的に許容される賦形剤とを含む薬学的組成物。
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