JP5656845B2 - 共溶媒を用いる酵素的な過酸の生成 - Google Patents
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Description
本出願は、参照によってそれぞれその全体が本明細書中に援用される米国仮特許出願第61/102,505号、同第61/102,512号、同第61/102,514号、同第61/102,520号、同第61/102,531号、および同第61/102,539号(それぞれ、2008年10月3日に出願)の利益を主張する。
(a)(i)カルボン酸エステル基質と、
(ii)CLUSTALWを用いて配列番号2と整列する炭水化物エステラーゼファミリー7(CE−7)シグネチャーモチーフ(signature motif)を有する酵素を含むみ、過加水分解活性を有する酵素触媒であって、
前記シグネチャーモチーフが、
(1)配列番号2の118−120と整列するアミノ酸位置におけるRGQモチーフ、
(2)配列番号2の179−183と整列するアミノ酸位置におけるGXSQGモチーフ、および
(3)配列番号2の298−299と整列するアミノ酸位置におけるHEモチーフ
を含み、前記酵素が配列番号2に対して少なくとも30%のアミノ酸同一性を含む酵素触媒と、
(iii)約2よりも小さいlog P(ここで、log Pは、オクタノールと水の間の物質の分配係数の対数であると定義され、P=[溶質]オクタノール/[溶質]水と表される)を有する有機溶媒を含み、前記酵素触媒のための基質ではない、少なくとも1つの共溶媒媒と
を含み、(i)〜(iii)の実質的に非水性の混合物である第1の成分を提供するステップと、
(b)水中の過酸素源を含む第2の成分を提供するステップと、
(c)前記第1の成分および前記第2の成分を混ぜ合わせて、水性反応混合物を形成するステップと
を含む、ペルオキシカルボン酸の生成方法が提供されており、前記共溶媒は、酵素触媒の過加水分解活性を実質的に損失することなく、水性反応混合物中にカルボン酸エステル基質を可溶化し、それにより、ペルオキシカルボン酸が生成される。
(a)(i)カルボン酸エステル基質と、
(ii)CLUSTALWを用いて配列番号2と整列するCE−7シグネチャーモチーフを有する酵素を含み、過加水分解活性を有する酵素触媒であって、
前記シグネチャーモチーフが、
(1)配列番号2の118−120と整列するアミノ酸位置におけるRGQモチーフ、
(2)配列番号2の179−183と整列するアミノ酸位置におけるGXSQGモチーフ、および
(3)配列番号2の298−299と整列するアミノ酸位置におけるHEモチーフ
を含み、前記酵素が配列番号2に対して少なくとも30%のアミノ酸同一性を含む酵素触媒と、
(iii)約2よりも小さいlog P(ここで、log Pは、オクタノールと水の間の物質の分配係数の対数であると定義され、P=[溶質]オクタノール/[溶質]水と表される)を有する有機溶媒を含み、前記酵素触媒のための基質ではない、少なくとも1つの共溶媒と
を含み、(i)〜(iii)の実質的に非水性の混合物である第1の成分を提供することと、
(b)水中の過酸素源を含む第2の成分を提供することと
を含む、ペルオキシカルボン酸を生成するための多成分系であって、
前記第1の成分および前記第2の成分を混ぜ合わせてペルオキシカルボン酸を含む水性反応混合物が生成され、前記共溶媒は、酵素触媒の過加水分解活性を実質的に損失することなく、水性反応混合物中にカルボン酸エステル基質を可溶化する。
(a)構造
[X]mR5
(式中、
Xは、式R6C(O)Oのエステル基であり、
R6は、場合によりヒドロキシル基またはC1〜C4アルコキシ基によって置換され得るC1〜C7線状、分枝状または環状ヒドロカルビル部分であり、場合により、R6は1つまたは複数のエーテル結合を含み(R6はC2〜C7である)、
R5は、場合によりヒドロキシル基によって置換され得るC1〜C6線状、分枝状、または環状ヒドロカルビル部分であり、ここで、R5中の各炭素原子は個々に1つ以下のヒドロキシル基または1つ以下のエステル基を含み、場合により、R5は、1つまたは複数のエーテル結合を含み、
mは、1からR5中の炭素原子の数までである)
を有し、25℃において少なくとも5ppmである水中での溶解度を有する1つまたは複数のエステルと、
(b)構造
を有する1つまたは複数のグリセリドと、
(c)式
の1つまたは複数のエステルと、
(d)1つまたは複数のアセチル化単糖、アセチル化二糖、またはアセチル化多糖と、
(e)(a)〜(d)の任意の組み合わせと
からなる群から選択される。
以下の配列は、37C.F.R.§§1.821−1.825(「ヌクレオチド配列および/またはアミノ酸配列の開示を含む特許出願の要件−配列規則(Requirements for Patent Applications Containing Nucleotide Sequences and/or Amino Acid Sequence Disclosures−the Sequence Rules)」)に従い、世界知的所有権機関(WIPO)基準ST.25(1998年)、ならびに欧州特許条約(EPC)および特許協力条約(PCT)規則5.2および49.5(aの2)および実施細則の208項および付録Cの配列表の要件と一致する。ヌクレオチドおよびアミノ酸配列データに対して使用される記号および形式は、37C.F.R.§1.822に記載される規則に従う。
(a)構造
[X]mR5
(式中、
Xは、式R6C(O)Oのエステル基であり、
R6は、場合によりヒドロキシル基またはC1〜C4アルコキシ基によって置換され得るC1〜C7線状、分枝状または環状ヒドロカルビル部分であり、場合により、R6は、1つまたは複数のエーテル結合を含み(R6はC2〜C7である)、
R5は、場合によりヒドロキシル基によって置換され得るC1〜C6線状、分枝状、または環状ヒドロカルビル部分であり、ここで、R5中の各炭素原子は個々に1つ以下のヒドロキシル基または1つ以下のエステル基を含み、場合により、R5は、1つまたは複数のエーテル結合を含み、
mは、1からR5中の炭素原子の数までである)
を有し、25℃において少なくとも5ppmである水中での溶解度を有する1つまたは複数のエステル、または
(b)構造
を有する1つまたは複数のグリセリド、または
(c)式
の1つまたは複数のエステル、または
(d)1つまたは複数のアセチル化単糖、アセチル化二糖、もしくはアセチル化多糖、または
(e)(a)〜(d)の任意の組み合わせ
を交換可能に指す。
Chem.48:395−399(2000年))、従って、トリアセチン中での酵素粉末の貯蔵は、log Pが2よりも小さい付加的な共溶媒(例えば、シクロヘキサノン、log P=0.94)(CowanおよびPlant)、1,2−プロパンジオール、log P=−1.41(Gunningら)、1,3−プロパンジオール、log P=−1.3(S−J.Kuoら,J.Am.Oil Chem.Soc.73:1427−1433(1996年)、ジエチレングリコールブチルエーテル、log P=0.56(N.Funasakiら,J.Phys.Chem.88:5786−5790(1984年)、トリエチレングリコール、log P=−1.75(L.Braekenら,ChemPhysChem 6:1606−1612(2005年))の使用がそうであるように、容認できない酵素活性の損失をもたらすことが予想されるであろう。CowanおよびPlantの上記の教示を適用すると、低いlog P値を有する上記の溶媒は、多成分系の酵素を含有する第1の成分中に、酵素の不活性化(第1の成分と水中に過酸素源を含む第2の成分との混合の前または後に)を伴わずに適切に含有できないことが予想されるであろう。
1. 小さい脂肪族の非極性またはわずかに極性の残基:Ala、Ser、Thr(pro、Gly)、
2. 極性の負帯電残基およびそのアミド:Asp、Asn、Glu、Gln、
3. 極性の正帯電残基:His、Arg、Lys、
4. 大きい脂肪族の非極性残基:Met、Leu、Ile、Val(Cys)、ならびに
5. 大きい芳香族残基:Phe、Tyr、およびTrp
のうちの1の中での交換であると定義される。
i)配列番号2のアミノ酸位置118−120におけるRGQモチーフ、
ii)配列番号2のアミノ酸位置179−183におけるGXSQGモチーフ、および
iii)配列番号2のアミノ酸位置298−299におけるHEモチーフ
を含み、また前記酵素は、配列番号2に対して少なくとも30%のアミノ酸同一性を含む。
[X]mR5
によって提供されるエステルを含み、式中、
X=式R6C(O)Oのエステル基であり、
R6=場合によりヒドロキシル基またはC1〜C4アルコキシ基によって置換され得るC1〜C7線状、分枝状または環状ヒドロカルビル部分であり、場合により、R6=C2〜C7の場合にR6は1つまたは複数のエーテル結合を含み、
R5=場合によりヒドロキシル基によって置換され得るC1〜C6線状、分枝状、または環状ヒドロカルビル部分であり、ここで、R5中の各炭素原子は個々に1つ以下のヒドロキシル基または1つ以下のエステル基を含み、場合により、R5は1つまたは複数のエーテル結合を含み、
m=1からR5中の炭素原子の数までであり、
前記エステルは、25℃において少なくとも5ppmである水中での溶解度を有する。
本発明で開示される方法および系において使用するための共溶媒は、約2よりも小さいlog Pを有する有機溶媒を含む。いくつかの実施形態では、共溶媒は、好ましくは、アルコールである。共溶媒は、好ましくは、トリプロピレングリコールメチルエーテル、ジプロピレングリコールメチルエーテル、プロピレングリコールメチルエーテル、ジエチレングリコールブチルエーテル、ジプロピレングリコール、トリエチレングリコール、1,2−プロパンジオール、N−エチル−2−ピロルジノン(pyrroldinone)、イソプロパノール、エタノール、乳酸エチル、1,3−プロパンジオール、またはこれらの任意の組み合わせを含むことができる。本発明の方法および系のいくつかの実施形態では、共溶媒は、トリプロピレングリコールメチルエーテルを含む。
セファロスポリンCデアセチラーゼ(E.C.3.1.1.41、系統名セファロスポリンCアセチルヒドロラーゼ、CAH)は、セファロスポリンC、7−アミノセファロスポラン酸、および7−(チオフェン−2−アセトアミド)セファロスポラン酸などのセファロスポリンに結合したアセチルエステルを加水分解する能力を有する酵素である(Abbott,B.and Fukuda,D.,Appl.Microbiol.30(3):413−419(1975年))。CAHは、炭水化物エステラーゼファミリー7と呼ばれる構造的に関連する酵素のより大きいファミリーに属する(CE−7、Coutinho,P.M.,Henrissat,B.「Carbohydrate−active enzymes:an integrated database approach」 in 「Recent Advances in Carbohydrate Bioengineering」H.J.Gilbert,G. Davies,B. HenrissatおよびB. Svensson編(1999年)The Royal Society of Chemistry,Cambridge,3−12頁を参照)。
RGQQSSEDTSISLHGHALGWMTKGILDKDTYYYRGVYLDAVRALEVISSFDEVDETRIGVTGGSQGGGLTIAAAALSDIPKAAVADYPYLSNFERAIDVALEQPYLEINSFFRRNGSPETEVQAMKTLSYFDIMNLADRVKVPVLMSIGLIDKVTPPSTVFAAYNHLETEKELKVYRYFGHE(配列番号49).
本発明の方法および系は、炭水化物エステラーゼファミリー7に属する酵素のペルヒドロラーゼ活性を用いて水性反応条件下で工業的に有用な有効濃度の過酸をその場で生成する際に使用することができる。いくつかの実施形態では、ペルヒドロラーゼ活性を有する酵素は、構造的および機能的にセファロスポリンCデアセチラーゼ(CAH)と分類される。他の実施形態では、ペルヒドロラーゼ活性を有する酵素は、構造的および機能的にアセチルキシランエステラーゼ(AXE)と分類される。
本発明の方法において、反応物および生成物を分析するために様々な分析方法を使用することができ、これには、滴定、高速液体クロマトグラフィ(HPLC)、ガスクロマトグラフィ(GC)、質量分析(MS)、キャピラリー電気泳動法(CE)、U.Karstら(Anal.Chem.,69(17):3623−3627(1997年))によって記載される分析手順、ならびに本発明の実施例において記載されるような2,2’−アジノ−ビス(3−エチルベンゾタゾリン(ethylbenzothazoline))−6−スルホナート(ABTS)アッセイ(S.Minningら、Analytica Chimica Acta 378:293−298(1999年)および国際公開第2004/058961A1号パンフレット)が含まれるが、これらに限定されない。
J.Gabrielsonら(J.Microbiol.Methods 50:63−73(2002年))によって記載される方法は、過酸、または過酸化水素および酵素基質の最小殺生物濃度(MBC)を決定するために使用することができる。アッセイ法は、XTTの還元阻害に基づいており、ここで、XTT((2,3−ビス[2−メトキシ−4−ニトロ−5−スルホフェニル]−5−[(フェニルアミノ)カルボニル]−2H−テトラゾリウム、分子内塩、モノナトリウム塩)は、490nmまたは450nmで測定される光学濃度(OD)の変化によって微生物の呼吸活性を示す酸化還元色素である。しかしながら、消毒薬および防腐剤の活性を試験するために利用可能な様々なその他の方法が存在し、生存可能なプレートのカウント、直接的な顕微鏡のカウント、乾燥重量、濁度測定、吸光度、バイオルミネセンスなどが含まれるが、これらに限定されない(例えば、Brock,Semour S.「Disinfection,Sterilization,and Preservation」,第5版,Lippincott Williams & Wilkins,Philadelphia,PA,USA,2001年を参照)。
本発明の方法に従って生成した、酵素触媒により発生されたペルオキシカルボン酸は、様々な硬い表面/無生物体の用途において生物学的汚染物質の濃度を低減するために使用することができ、例えば、医療機器(例えば、内視鏡)、織物(例えば、衣類、カーペット)、食品の調理用の表面、食品貯蔵および食品包装装置、食品の包装に使用される材料、鶏の孵化場および成育施設、動物の囲い、ならびに微生物および/または抗ウィルス活性を有する使用済みプロセス水の汚染除去のために使用することができる。酵素により発生されたペルオキシカルボン酸は、プリオン(例えば、特定のプロテアーゼ)を不活性化して、さらに殺生物活性を提供するように設計された配合物中で使用することができる。好ましい態様では、本発明のペルオキシカルボン酸組成物は、特に、加圧滅菌することができない医療機器および食品包装装置のための消毒剤として有用である。ペルオキシカルボン酸含有配合物は、GRASまたは食品グレード成分(酵素、酵素基質、過酸化水素、および緩衝液)を用いて調製することができるので、酵素により発生されたペルオキシカルボン酸は、動物の屠殺体、食肉、果物および野菜の汚染除去のため、または加工食品の汚染除去のためにも使用することができる。酵素により発生されたペルオキシカルボン酸は、その最終形態が粉末、液体、ゲル、フィルム、固体またはエアロゾルである製品に組み込むことができる。酵素により発生されたペルオキシカルボン酸は、有効な汚染除去をそれでも提供する濃度まで希釈されてもよい。
本発明の方法および系に関して、本明細書において記載される配列の遺伝子および遺伝子産物は、異種宿主細胞において、特に微生物宿主の細胞において産生され得る。遺伝子および核酸分子の発現のための好ましい異種宿主細胞は、真菌または細菌ファミリーにおいて見出すことができ、広範な温度、pH値、および溶媒耐性にわたって増殖する微生物宿主である。例えば、細菌、酵母、および糸状菌はどれも適切に本発明の核酸分子の発現の宿主となり得ると考えられる。ペルヒドロラーゼは、細胞内、細胞外、または細胞内および細胞外の両方の組み合わせにおいて発現され得るが、ここで、細胞外発現によって、発酵産物からの所望のタンパク質の回収は、細胞内発現によって産生されるタンパク質の回収方法よりも容易になる。転写、翻訳およびタンパク質生合成装置は、細胞バイオマスを発生させるために使用される細胞原料に対して不変なままであり、機能性遺伝子は構わずに発現されるであろう。宿主株の例としては、アスペルギルス属、トリコデルマ属、サッカロミセス属、ピキア属、ファフィア属、カンジダ属、ハンゼヌラ属、ヤロウィア属、クルイベロミセス属、サルモネラ属、バチルス属、アシネトバクター属、ザイモモナス属、アグロバクテリウム属、エリスロバクター属(Erythrobacter)、クロロビウム属、クロマチウム属、フラボバクテリウム属、サイトファーガ属、ロドバクター属、ロドコッカス属、ストレプトミセス属、ブレビバクテリウム属、コリネバクテリア属、マイコバクテリウム属、ディノコッカス属、エシェリキア属、エルウィニア属、パンテア属、シュードモナス属、スフィンゴモナス属、メチロモナス属、メチロバクター属、メチロコッカス属、メチロサイナス属、メチロミクロビウム属(Methylomicrobium)、メチロシスティス属(Methylocystis)、アルカリゲネス属、シネコシスティス属、シネココッカス属、アナベナ属、チオバチルス属、メタノバクテリウム属、クレブシエラ属、およびミキソコッカス属などの細菌、真菌または酵母種が挙げられるが、これらに限定されない。一実施形態では、細菌宿主株には、クルイベロミセス属、エシェリキア属、バチルス属、およびシュードモナス属が含まれる。好ましい実施形態では、細菌宿主細胞は、エシェリキア・コリ(Escherichia coli)である。
本発明の方法および系に従って本発明のペルヒドロラーゼ触媒を産生するために様々な培養方法を適用することができる。例えば、組換え微生物宿主から過剰発現される特定の遺伝子産物の大規模の産生は、バッチおよび連続培養方法の両方によって生成することができる。
以下の実施例は、本発明の好ましい態様を実証するために提供される。以下の実施例において開示される技術は、本発明の実施において十分に機能することが本発明者らによって発見された技術を示し、従って、その実施のために好ましいモードを構成すると考えられることは、当業者によって認識されるべきである。しかしながら、当業者は、本発明の開示を考慮して、開示される特定の実施形態において多くの変化が成され、そしてそれでもなお本発明の趣旨および範囲から逸脱することなく同様または類似の結果を得ることができると認識すべきである。
katGカタラーゼ破壊E.コリ(E.coli)株の構築
配列番号32および配列番号33と同定されるプライマーを用いるPCR(94℃で0.5分間、55℃で0.5分間、70℃で分間1、30サイクル)によって、カナマイシン耐性遺伝子のコード領域(kan、配列番号30)をプラスミドpKD13(配列番号31)から増幅して、配列番号34と同定されるPCR産物を生じた。katG核酸配列は配列番号35として提供され、対応するアミノ酸配列は配列番号36である。E.コリ(E.coli)MG1655(ATCC(登録商標)47076TM)を、λ−Redリコンビナーゼ遺伝子を含有する温度感受性プラスミドpKD46(配列番号37)で形質転換し(DatsenkoおよびWanner,2000年,PNAS USA 97:6640−6645)、LB−ampプレートにおいて30℃で24時間選択した。エレクトロポレーション(BioRad Gene Pulser、0.2cmキュベット、2.5kV、200W、25μF)によって、MG1655/pKD46を50〜500ngのPCR産物で形質転換し、LB−kanプレートにおいて37℃で24時間選択した。数個のコロニーをLB−kanプレート上に画線し、42℃で一晩インキュベートして、pKD46プラスミドをキュアリングした。コロニーをチェックして、kanR/ampSの表現型を確認した。PUREGENE(登録商標)DNA精製システム(Gentra Systems,Inc.,Minneapolis,MN)を用いて数個のコロニーからゲノムDNAを単離し、配列番号38および配列番号39と同定されるプライマーを用いてPCRによりチェックして、katG遺伝子の破壊を確認した。いくつかのkatG破壊株を、FLPリコンビナーゼを含有する温度感受性プラスミドpCP20(配列番号40)で形質転換し、kan遺伝子を切除するために使用し、LB−ampプレートにおいて37℃で24時間選択した。数個のコロニーをLBプレート上に画線し、42℃で一晩インキュベートして、pCP20プラスミドをキュアリングした。2つのコロニーをチェックして、kanS/ampSの表現型を確認し、MG1655KatG1およびMG1655KatG2と命名した。
katEカタラーゼ破壊E.コリ(E.coli)株の構築
配列番号41および配列番号42と同定されるプライマーを用いるPCR(94℃で0.5分間、55℃で0.5分間、70℃で1分間、30サイクル)によって、カナマイシン耐性遺伝子(配列番号30)をプラスミドpKD13(配列番号31)から増幅して、配列番号43と同定されるPCR産物を生じた。katE核酸配列は配列番号44として提供され、対応するアミノ酸配列は配列番号45である。E.コリ(E.coli)MG1655(ATCC(登録商標)47076TM)を、λ−Redリコンビナーゼ遺伝子を含有する温度感受性プラスミドpKD46(配列番号37)で形質転換し、LB−ampプレートにおいて30℃で24時間選択した。エレクトロポレーション(BioRad Gene Pulser、0.2cmキュベット、2.5kV、200W、25μF)によって、MG1655/pKD46を50〜500ngのPCR産物で形質転換し、LB−kanプレートにおいて37℃で24時間選択した。数個のコロニーをLB−kanプレート上に画線し、42℃で一晩インキュベートして、pKD46プラスミドをキュアリングした。コロニーをチェックして、kanR/ampSの表現型を確認した。PUREGENE(登録商標)DNA精製システムを用いてゲノムDNAを数個のコロニーから単離し、配列番号46および配列番号47と同定されるプライマーを用いてPCRによりチェックして、katE遺伝子の破壊を確認した。いくつかのkatE破壊株を、FLPリコンビナーゼを含有する温度感受性プラスミドpCP20(配列番号40)で形質転換し、kan遺伝子を切除するために使用し、LB−ampプレートにおいて37℃で24時間選択した。数個のコロニーをLBプレート上に画線し、42℃で一晩インキュベートして、pCP20プラスミドをキュアリングした。2つのコロニーをチェックして、kanS/ampSの表現型を確認し、MG1655KatE1およびMG1655KatE2と命名した。
katGカタラーゼおよびkatEカタラーゼ破壊E.コリ(E.coli)株(KLP18)の構築
配列番号41および配列番号42と同定されるプライマーを用いるPCR(94℃で0.5分間、55℃で0.5分間、70℃で1分間、30サイクル)によって、カナマイシン耐性遺伝子(配列番号30)をプラスミドpKD13(配列番号31)から増幅して、配列番号43と同定されるPCR産物を生じた。E.コリ(E.coli)MG1655KatG1を、λ−Redリコンビナーゼ遺伝子を含有する温度感受性プラスミドpKD46(配列番号37)で形質転換し、LB−ampプレートにおいて30℃で24時間選択した。エレクトロポレーション(BioRad Gene Pulser、0.2cmキュベット、2.5kV、200W、25μF)によって、MG1655KatG1/pKD46を50〜500ngのPCR産物で形質転換し、LB−kanプレートにおいて37℃で24時間選択した。数個のコロニーをLB−kanプレート上に画線し、42℃で一晩インキュベートして、pKD46プラスミドをキュアリングした。コロニーをチェックして、kanR/ampSの表現型を確認した。PUREGENE(登録商標)DNA精製システムを用いてゲノムDNAを数個のコロニーから単離し、配列番号46および配列番号47と同定されるプライマーを用いてPCRによりチェックして、katE遺伝子の破壊を確認した。いくつかのkatE破壊株(ΔkatE)を、FLPリコンビナーゼを含有する温度感受性プラスミドpCP20(配列番号40)で形質転換し、kan遺伝子を切除するために使用し、LB−ampプレートにおいて37℃で24時間選択した。数個のコロニーをLBプレート上に画線し、42℃で一晩インキュベートして、pCP20プラスミドをキュアリングした。2つのコロニーをチェックして、kanS/ampSの表現型を確認し、MG1655KatG1KatE18.1およびMG1655KatG1KatE23と命名した。MG1655KatG1KatE18.1は、E.コリ(E.coli)KLP18と称される。
サーモトガ・ネアポリタナ(Thermotoga neapolitana)からのペルヒドロラーゼのクローニングおよび発現
GENBANK(登録商標)(受入番号AAB70869)において報告されるようなサーモトガ・ネアポリタナ(Thermotoga neapolitana)からのアセチルキシランエステラーゼをコードする遺伝子のコード領域を、E.コリ(E.coli)における発現に対して最適化されたコドン(DNA2.0、Menlo Park,CA)を用いて合成した。その後、配列番号27および配列番号28と同定されるプライマーを用いるPCR(94℃で0.5分間、55℃で0.5分間、70℃で1分間、30サイクル)によって、遺伝子のコード領域を増幅した。得られた核酸産物(配列番号29)をpTrcHis2−TOPO(登録商標)にサブクローニングして、SW196と同定されるプラスミドを生じた。プラスミドpSW196を用いてE.コリ(E.coli)KLP18を形質転換し、株KLP18/pSW196を生じた。KLP18/pSW196を、LB培地中、37℃で振とうさせながら、OD600nm=0.4〜0.5まで増殖させ、この時点で、IPTGを1mMの最終濃度になるまで添加し、インキュベーションを2〜3時間続けた。細胞を遠心分離によって収集し、SDS−PAGEを実施して、全可溶性タンパク質の20〜40%でペルヒドロラーゼの発現を確認した。
ペルヒドロラーゼを発現するE.コリ(E.coli)KLP18形質転換体の発酵
酵母抽出物(Amberex 695、5.0g/L)、K2HPO4(10.0g/L)、KH2PO4(7.0g/L)、クエン酸ナトリウム二水和物(1.0g/L)、(NH4)2SO4(4.0g/L)、MgSO4七水和物(1.0g/L)およびクエン酸第二鉄アンモニウム(0.10g/L)を含有する0.5Lの種培地を2Lの振とうフラスコに入れることによって、発酵槽の種培養物を調製した。培地のpHを6.8に調整し、培地をフラスコ中で滅菌した。殺菌後の添加は、グルコース(50重量%、10.0mL)および1mLのアンピシリン(25mg/mL)保存液を含んだ。種培地に、2
0%のグリセロール中のE.コリ(E.coli)KLP18/pSW196の培養物を1mL播種し、35℃および300rpmで培養した。KH2PO4(3.50g/L)、FeSO4七水和物(0.05g/L)、MgSO4七水和物(2.0g/L)、クエン酸ナトリウム二水和物(1.90g/L)、酵母抽出物(Amberex 695、5.0g/L)、Biospumex 153K消泡剤(0.25mL/L、Cognis Corporation)、NaCl(1.0g/L)、CaCl2二水和物(10g/L)、およびNIT微量元素溶液(10mL/L)を含有する35℃の8Lの培地を含む14Lの発酵槽(Braun)に、約1〜2のOD550において、種培養物を移した。微量元素溶液は、クエン酸一水和物(10g/L)、MnSO4水和物(2g/L)、NaCl(2g/L)、FeSO4七水和物(0.5g/L)、ZnSO4七水和物(0.2g/L)、CuSO4五水和物(0.02g/L)およびNaMoO4二水和物(0.02g/L)を含有した。殺菌後の添加は、グルコース溶液(50%w/w、80.0g)およびアンピシリン(25mg/mL)保存液(16.00mL)を含んだ。グルコース溶液(50%w/w)を流加のために使用した。グルコース濃度が0.5g/Lまで低下したときにグルコースの供給を開始し、0.31g供給/分から始まり、毎時それぞれ0.36、0.42、0.49、0.57、0.66、0.77、0.90、1.04、1.21、1.41、1.63g/分まで徐々に増大させ、その後速度を一定に保持した。培地中のグルコース濃度を監視し、濃度が0.1g/Lを超えたら、供給速度を低下または一時的に停止した。OD550=56とOD550=80との間で、種々の株に対する16mLのIPTG(0.5M)の添加によって誘導を開始した。溶存酸素(DO)濃度を空気飽和の25%に調節した。DOは、初めはインペラーの撹拌速度(400〜1400rpm)によって、その後通気速度(2〜10slpm)によって調節した。pHを6.8に調節した。pH調節のためにNH4OH(29%w/w)およびH2SO4(20%w/v)を使用した。ヘッドの圧力は0.5バールであった。IPTG添加の16時間後に、細胞を遠心分離によって収集した。
噴霧乾燥サーモトガ・ネアポリタナ(Thermotoga neapolitana)ペルヒドロラーゼの調製
実施例5で記載したように調製されたサーモトガ・ネアポリタナ(Thermotoga neapolitana)細胞ペーストを、pH7.4の50mMのリン酸ナトリウム緩衝液中に200g湿細胞重量/Lの最終濃度で懸濁させた。12,000psi(〜82.74MPa)の入口圧力で操作されるAPV1000ホモジナイザーによって単一バスで、懸濁液中の細胞を溶解させた。得られたライセートを65℃で約30分間加熱処理し、ホモジネートを室温まで冷却し、得られた固体を遠心分離で除去した。0.1ミクロンのフィルタを用いて遠心分離からの上澄みをろ過し、30K NMWCOフィルタを用いて、得られたろ液(ペルヒドロラーゼを含有する)を34mgタンパク質/mLの最終タンパク質濃度まで濃縮した。重量によりタンパク質の濃度の約3倍の濃度になるまで、マルトデキストリンをタンパク質溶液に添加し、225℃の入口温度および76℃の乾燥器出口温度を用いて、得られた溶液を噴霧乾燥させた。得られた粉末中のタンパク質濃度は20.3重量%であり、乾燥固体含量は93.2重量%であった。
サーモトガ・ネアポリタナ(Thermotoga neapolitana)ペルヒドロラーゼによる過酢酸生成に対する添加溶媒の効果
90.0gの脱イオン水と、0.350gのTURPINAL(登録商標)SL((1−ヒドロキシ−1−ホスホノエチル)ホスホン酸、水中60重量%、Thermphos International,Hague,Netherlands)と、水中30重量%の過酸化水素3.20gとの第1の混合物を、50%の水酸化ナトリウム水でpH7.2に調整し、混合物の最終重量を脱イオン水で100.0gに調整した。55.76gのトリアセチンと、4.20gの重炭酸ナトリウムと、2.50gのCAB−O−SIL(登録商標)M5ヒュームドシリカ(Cabot,Boston,Massachusetts)と、0.270gの噴霧乾燥サーモトガ・ネアポリタナ(Thermotoga neapolitana)ペルヒドロラーゼ(実施例6)と、トリプロピレングリコールメチルエーテル(DOWANOL(登録商標)TPM、Dow Chemical Corporation,Midland,MI)、ジプロピレングリコールメチルエーテル(DOWANOL(登録商標)DPM)、プロピレングリコールメチルエーテル(DOWANOL(登録商標)PM)、ジエチレングリコールブチルエーテル(DOWANOL(登録商標)DB)、ジプロピレングリコール(DOWANOL(登録商標)DPG)、トリエチレングリコール、1,2−プロパンジオール、N−エチル−2−ピロルジノン、イソプロパノール、エタノール、乳酸エチル、および1,3−プロパンジオールからなる群から選択される37.43gの1つの有機溶媒との第2の混合物を調製した。第2の混合物の1.0gのアリコートを急速に攪拌しながら(溶解していない固体を懸濁させるため)取り出し、これに、水中の過酸化水素およびTURPINAL(登録商標)SLの第1の混合物(pH7.2)9.00mLを25℃で攪拌しながら添加して混合し、得られた混合物は、255mMのトリアセチン、254mMの過酸化水素および0.055mgタンパク質/mLの噴霧乾燥ペルヒドロラーゼを含有した。各溶媒に対する対照反応も行い、タンパク質を添加せずに過酸化水素によるトリアセチンの化学的な過加水分解によって生成された過酢酸の濃度を決定した。
Supelco Discovery C8カラム(10cm×4.0mm、5μm)(カタログ#569422−U)w/プレカラムSupelco Supelguard Discovery C8(Sigma−Aldrich、カタログ#59590−U)、10マイクロリットルの注入体積、1.0mL/分および周囲温度におけるCH3CN(Sigma−Aldrich、#270717)および脱イオン水による勾配法:
添加溶媒の存在または不在下におけるサーモトガ・ネアポリタナ(Thermotoga neapolitana)ペルヒドロラーゼによる過酢酸生成の比較
40.0gの脱イオン水と、0.1575gのTURPINAL(登録商標)SL((1−ヒドロキシ−1−ホスホノエチル)ホスホン酸、水中60重量%、Thermphos International)と、水中30重量%の過酸化水素1.44gとの第1の混合物を、50%の水酸化ナトリウム水でpH7.2に調整し、混合物の最終重量を脱イオン水で46.87gに調整した。2.78gのトリアセチンと、0.210gの重炭酸ナトリウムと、0.125gのCAB−O−SIL(登録商標)M5(Cabot)と、0.0135gの噴霧乾燥サーモトガ・ネアポリタナ(Thermotoga neapolitana)ペルヒドロラーゼ(実施例6)との第2の混合物を調製し、水中の過酸化水素およびTURPINAL(登録商標)SLの第1の混合物(pH7.2)を25℃で攪拌しながら第2の混合物に添加し、得られた混合物は、255mMのトリアセチン、254mMの過酸化水素および0.055mgタンパク質/mLの噴霧乾燥ペルヒドロラーゼを含有した。Karstら(上記)によって記載される方法に従って、反応混合物中の過酢酸の濃度の決定を実施した。対照反応も行い、ペルヒドロラーゼを添加せずに過酸化水素によるトリアセチンの化学的な過加水分解によって生成された過酢酸の濃度を決定した。
攪拌反応と比較して2コンパートメント噴霧ボトルを用いたその場での過酸発生のための溶媒の使用
2000ppmのTURPINAL(登録商標)SL((1−ヒドロキシ−1−ホスホノエチル)ホスホン酸、水中60重量%、Thermphos International)を含有する0.20Mのクエン酸ナトリウム緩衝液100gと、280gの脱イオン水と、水中30重量%の過酸化水素5.20gとの第1の混合物を、50%の水酸化ナトリウム水でpH7.2に調整し、混合物の最終重量を脱イオン水で400gに調整した。83.4gのトリアセチンと、3.75gのCAB−O−SIL(登録商標)M5(Cabot)と、0.750gの噴霧乾燥サーモトガ・ネアポリタナ(Thermotoga neapolitana)ペルヒドロラーゼ(実施例6)と、プロピレングリコールメチルエーテル(DOWANOL(登録商標)PM)、トリプロピレングリコールメチルエーテル(DOWANOL(登録商標)TPM)、ジエチレングリコールメチルエーテル(DOWANOL(登録商標)DM)、プロピレングリコールn−ブチルエーテル(DOWANOL(登録商標)PNB)、プロピレングリコールn−プロピルエーテル(DOWANOL(登録商標)PnP)、プロピレングリコールモノメチルエーテルアセタート(DOWANOL(登録商標)PMA)、ジプロピレングリコール、エタノール、イソプロパノール、および1,2−プロパンジオールから選択される単一の溶媒62.1gとを含有する第2の混合物を別個に調製した。25℃における第1の反応では、反応の最初の30〜60秒間、1.0gの第1の混合物を9.0gの第2の混合物と共に攪拌し(6.5〜6.0の反応pH)、サンプルを抜き出して、過酢酸の生成について分析し、得られた反応混合物は、255mMのトリアセチン、103mMの過酸化水素および100μgタンパク質/mLの噴霧乾燥ペルヒドロラーゼを含有した。Karstら(上記))によって記載される方法に従って、反応混合物中の過酢酸の濃度の決定(以下の表8)を実施した。対照反応も行い、ペルヒドロラーゼを添加せずに過酸化水素によるトリアセチンの化学的な過加水分解によって生成された過酢酸の濃度を決定した。
サーモトガ・マリティマ(Thermotoga maritima)ペルヒドロラーゼを酵素触媒として用いたペルオキシカルボン酸の生成
サーモトガ・マリティマ(Thermotoga maritima)からのペルヒドロラーゼのクローニングおよび発現は、前の実施例1〜4に記載された方法に従って達成される。サーモトガ・マリティマ(Thermotoga maritima)ペルヒドロラーゼを発現する細菌の形質転換体の発酵は、前の実施例5に従って実施され、噴霧乾燥サーモトガ・マリティマ(Thermotoga maritima)ペルヒドロラーゼの調製は、実施例6で記載された方法を用いて達成される。サーモトガ・マリティマ(Thermotoga maritima)ペルヒドロラーゼのクローニング、発現、および調製のための技術に関する付加的な情報は、米国特許出願公開第2009/0005590号明細書(参照によって本明細書中に援用される)において入手可能である。
攪拌反応と比較して、2コンパートメント噴霧装置を用い、サーモトガ・マリティマ(Thermotoga maritima)ペルヒドロラーゼ用いたその場での過酸発生のための溶媒の使用
2000ppmのTURPINAL(登録商標)SL((1−ヒドロキシ−1−ホスホノエチル)ホスホン酸、水中60重量%、Thermphos International)を含有する0.20Mのクエン酸ナトリウム緩衝液100gと、280gの脱イオン水と、水中30重量%の過酸化水素5.20gとの第1の混合物を50%の水酸化ナトリウム水でpH7.2に調整し、混合物の最終重量を脱イオン水で400gに調整する。83.4gのトリアセチンと、3.75gのCAB−O−SIL(登録商標)M5(Cabot)と、0.750gの噴霧乾燥サーモトガ・マリティマ(Thermotoga maritima)ペルヒドロラーゼ(実施例10)と、プロピレングリコールメチルエーテル(dowanol(登録商標)PM)、トリプロピレングリコールメチルエーテル(dowanol(登録商標)TPM)、ジエチレングリコールメチルエーテル(dowanol(登録商標)DM)、プロピレングリコールn−ブチルエーテル(dowanol(登録商標)PNB)、プロピレングリコールn−プロピルエーテル(dowanol(登録商標)PnP)、プロピレングリコールモノメチルエーテルアセタート(dowanol(登録商標)PMA)、ジプロピレングリコール、エタノール、イソプロパノール、および1,2−プロパンジオールから選択される単一の溶媒62.1gとを含有する第2の混合物を別個に調製する。25℃における第1の反応では、反応の最初の30〜60秒間、1.0gの第1の混合物を9.0gの第2の混合物と共に攪拌し(6.5〜6.0の反応pH)、サンプルを抜き出して、過酢酸の生成について分析し、得られた反応混合物は、255mMのトリアセチン、103mMの過酸化水素および100μgタンパク質/mLの噴霧乾燥ペルヒドロラーゼを含有する。Karstらによって記載される方法(上記)に従って、反応混合物中の過酢酸の濃度の決定を実施する。対照反応も行い、ペルヒドロラーゼを添加せずに過酸化水素によるトリアセチンの化学的な過加水分解によって生成された過酢酸の濃度を決定する。
例示的な2成分系
2成分その場型の過酸消毒薬配合物の一例は、以下に記載される。
た重量の約2.6重量%を構成し、成分Aに対する成分Bの重量比は約38:1である。2成分その場型の過酸消毒薬配合物のための特定の用途では、成分Aに対する成分Bの比率が1:1〜10:1の範囲内にあるのが望ましいこともあり、この場合、10部〜1部(重量による)の成分Bが1部(重量による)の成分Aと混合されて、消毒に有効な濃度の過酸を生成する。例えば、第1の用途では、固定比率の二液型スプレー(Model DLS100、Take5)または可変比率の二液型スプレー(Model DLS200、Take5)などの2コンパートメント噴霧ボトルが用いられ、ここでは、成分Aに対する成分Bの最大比率10:1が用いられる。第2の用途では、壊すことのできるシールで隔てられた2つの別々のコンパートメントを含有する単一のボトルが用いられ、ここでは、2つの別々のコンパートメントの体積比は、1:1、または5:1または10:1である。これらの用途のそれぞれにおいて、2成分型配合物は、成分Bに対する成分Aの所望の比率で混合されて、所望の反応物の濃度および生成物の最終濃度を提供することができない。
バチルス・スブチリス(Bacillus subtilis)ATCC(登録商標)31954TMペルヒドロラーゼを用いるプロピレングリコールジアセタートまたはエチレングリコールジアセタートの過加水分解
バチルス・スブチリスからの野生型ペルヒドロラーゼを発現する形質転換体(Bacillus subtilis)ATCC(登録商標)31954TM(KLP18/pSW194)のホモジネートを、ジチオスレイトール(1mM)を含有する0.05Mのリン酸カリウム緩衝液(pH7.0)中で、細胞ペースト(20重量%の湿細胞重量)の懸濁液から調製した。粗ホモジネートを遠心分離して細胞片を除去し、清澄化細胞抽出物を生じ、これを65℃で30分間加熱処理した。得られた混合物を遠心分離し、加熱処理した上澄みを30KのMWCO(分子量カットオフ)膜において32mg/mLの全溶解固体の濃度まで濃縮し、清澄化、加熱処理した細胞抽出物のSDS−PAGEによって、ペルヒドロラーゼが少なくとも85〜90%純粋であることが示された。次に、この濃縮物に、固体1グラムあたり2.06グラムのNaH2PO4および1.17グラムのNa2HPO4を添加し、約3:1であるリン酸緩衝液対加熱処理細胞抽出タンパク質の比率(wt/wt)を生じた。この溶液を脱イオン水により30重量%に希釈し、次に、Buchi B−290実験室用噴霧乾燥器を用いて噴霧乾燥し(180℃の入口温度、70℃の出口温度)、得られた噴霧乾燥粉末は、25.5重量%のタンパク質(Bradfordタンパク質アッセイ)を含有し、94.3重量%の乾燥固体であった。
T.マリティマ(T.maritima)およびT.ネアポリタナ(T.neapolitana)野生型および変異体ペルヒドロラーゼを用いるプロピレングリコールジアセタートまたはエチレングリコールジアセタートの過加水分解
ジチオスレイトール(1mM)を含有する0.05Mのリン酸カリウム緩衝液(pH7.0)中の細胞ペースト(20重量%湿細胞重量)の懸濁液を、16,000psi(〜110MPa)の作動圧力を有するFrench Pressに2回通すことによって、サーモトガ・ネアポリタナ(Thermotoga neapolitana)野生型ペルヒドロラーゼ(KLP18/pSW196)、サーモトガ・ネアポリタナ(Thermotoga neapolitana)C277S変異体ペルヒドロラーゼ(KLP18/pSW196/C277S)、サーモトガ・ネアポリタナ(Thermotoga neapolitana)C277T変異体ペルヒドロラーゼ(KLP18/pSW196/C277T)、サーモトガ・マリティマ(Thermotoga maritima)野生型ペルヒドロラーゼ(KLP18/pSW228)、サーモトガ・マリティマ(Thermotoga maritima)C277S変異体ペルヒドロラーゼ(KLP18/pSW228/C277S)、およびサーモトガ・マリティマ(Thermotoga maritima)C277T変異体ペルヒドロラーゼ(KLP18/pSW228/C277T)を発現する形質転換体の細胞抽出物を、それぞれ抽出した。溶解細胞を12,000×gで30分間遠心分離して、清澄化細胞抽出物を生じ、これを全可溶性タンパク質についてアッセイした(Bradfordアッセイ)。上澄みを75℃で20分間加熱した後、氷浴中で2分間失活させた。11,000×gで10分間の遠心分離によって、沈殿したタンパク質を除去し、得られた加熱処理した抽出タンパク質の上澄みのSDS−PAGEによって、CE−7酵素は調製物中の全タンパク質の約85〜90%を構成することが示された。加熱処理された抽出タンパク質の上澄みをドライアイス中で凍結し、使用まで−80℃で貯蔵した。
E.コリ(E.coli)KLP18におけるサーモトガ・ネアポリタナ(Thermotoga neapolitana)アセチルキシランエステラーゼ変異体の発現
共有の同時出願された同時係属中の米国特許出願代理人整理番号CL4392USNAに記載されるようなアセチルキシランエステラーゼ突然変異を含むプラスミドは、アミノ酸残基位置277にAla、Val、Ser、またはThrを置き換えることによって、野生型サーモトガ・ネアポリタナ(Thermotoga neapolitana)ペルヒドロラーゼ(配列番号14)から調製した(配列番号73)。プラスミドを用いて、E.コリ(E.coli)KLP18を形質転換した(実施例3)。形質転換体をLB−アンピシリン(100μg/mL)プレート上に蒔き、37℃で一晩インキュベートした。20%(v/v)のグリセロールが補充された2.5mLのLB培地を用いて細胞をプレートから収集し、得られた細胞懸濁液の1.0mLのアリコートを−80℃で凍結させた。1mLの解凍した細胞懸濁液を、KH2PO4(5.0g/L)、FeSO4七水和物(0.05g/L)、MgSO4七水和物(1.0g/L)、クエン酸ナトリウム二水和物(1.90g/L)、酵母抽出物(Amberex 695、5.0g/L)、Biospumex 153K消泡剤(0.25mL/L、Cognis Corporation)、NaCl(1.0g/L)、CaCl2二水和物(0.1g/L)、およびNIT微量元素溶液(10mL/L)を含有する0.7Lの培地と共に、1LのAPPLIKON(登録商標)Bioreactor(Applikon(登録商標)Biotechnology,Foster City,CA)に移した。微量元素溶液は、クエン酸一水和物(10g/L)、MnSO4水和物(2g/L)、NaCl(2g/L)、FeSO4七水和物(0.5g/L)、ZnSO4七水和物(0.2g/L)、CuSO4五水和物(0.02g/L)およびNaMoO4二水和物(0.02g/L)を含有した。殺菌後の添加は、グルコース溶液(50%w/w、6.5g)およびアンピシリン(25mg/mL)保存液(2.8mL)を含んだ。グルコース溶液(50%w/w)は、流加にも使用した。グルコース濃度が0.5g/L以下に低下した40分後に開始し、0.03g供給/分から始まり、毎時それぞれ0.04、0.04、0.05、0.06、0.07、0.08、0.09、0.12、および0.14g/分まで徐々に増大させ、その後速度を一定にした。培地中のグルコース濃度を監視し、濃度が0.1g/Lを超えたら、供給速度を低下または一時的に停止した。OD550=50で、0.8mLのIPTG(0.05M)の添加によって誘導を開始した。初めは攪拌(400〜1000rpm)によって、その後は通気(0.5〜2slpm)によって溶存酸素(DO)濃度を空気飽和の25%に調節した。温度を37℃に調節し、pHを6.8に調節し、pH調節のためにNH4OH(29%w/w)およびH2SO4(20%w/v)を使用した。IPTG添加の20時間後に、遠心分離(5,000×gで15分)によって細胞を収集した。E.コリ(E.coli)KLP18/pSW196(サーモトガ・ネアポリタナ(Thermotoga neapolitana)野生型ペルヒドロラーゼ)の細胞培養物を、実施例2に記載されるように増殖させた。
半精製した野生型T.ネアポリタナ(T.neapolitana)アセチルキシランエステラーゼまたはT.ネアポリタナ(T.neapolitana)変異体アセチルキシランエステラーゼを含有する細胞ライセートの調製
E.コリ(E.coli)KLP18/pSW196(サーモトガ・ネアポリタナ(Thermotoga neapolitana)野生型ペルヒドロラーゼ)の細胞培養物を、実施例5に記載されるように増殖させた。得られた細胞ペーストを、1.0mMのDTTを補充した50mMのリン酸緩衝液(pH7.0)中に再懸濁させた(20%w/v)。再懸濁した細胞をFrench圧力セルに2回通し、95%よりも多い細胞溶解を保証した。溶解細胞を12,000×gで30分間遠心分離し、上澄みを75℃で20分間加熱した後、氷浴中で2分間失活させた。11,000×gで10分間の遠心分離によって、沈殿したタンパク質を除去した。SDS−PAGEにより、CE−7酵素は、加熱処理抽出物の上澄み中の全タンパク質の約85〜90%を構成することが示された。
T.ネアポリタナ(T.neapolitana)アセチルキシラン野生型エステラーゼおよびC277エステラーゼ変異体の比活性および過加水分解/加水分解比
反応(40mLの全体積)は、トリアセチン(100mM)と、過酸化水素(100mM)と、以下のアセチルキシランエステラーゼ変異体:T.ネアポリタナ(T.neapolitana)C277S変異体ペルヒドロラーゼ(E.コリ(E.coli)KLP18/pSW196/C277Sからの0.010mg/mLの加熱処理した全抽出タンパク質)、T.ネアポリタナ(T.neapolitana)C277T変異体ペルヒドロラーゼ(E.コリ(E.coli)KLP18/pSW196/C277T)からの0.010mg/mLの加熱処理した全抽出タンパク質、T.ネアポリタナ(T.neapolitana)C277A変異体ペルヒドロラーゼ(E.コリ(E.coli)KLP18/pSW196/C277Aからの0.0125mg/mLの加熱処理した全抽出タンパク質)、およびT.ネアポリタナ(T.neapolitana)C277V変異体ペルヒドロラーゼ(E.コリ(E.coli)KLP18/pSW196/C277Vからの0.0125mg/mLの加熱処理した全抽出タンパク質)(実施例16に記載されるように調製)のうちの1つとを含有するリン酸緩衝液(50mM、pH7.2)中、25℃で実行した。反応物および酵素を最初に混合するために、反応の最初の30秒間だけ反応を攪拌した。
E.コリ(E.coli)KLP18におけるサーモトガ・マリティマ(Thermotoga maritima)アセチルキシランエステラーゼ変異体の発現
共有の同時出願された同時係属中の米国特許出願代理人整理番号CL4392USNAに記載されるようなアセチルキシランエステラーゼ突然変異を含むプラスミドは、アミノ酸残基位置277にAla、Val、Ser、またはThrを置き換えることによって、野生型サーモトガ・マリティマ(Thermotoga maritima)(配列番号16)から調製した(配列番号74)。プラスミドを用いてE.コリ(E.coli)KLP18を形質転換した(実施例3)。形質転換体を、LB培地中37℃で振とうさせながら、OD600nm=0.4〜0.5まで増殖させ、この時点で、IPTGを1mMの最終濃度まで添加し、インキュベーションを2〜3時間続けた。遠心分離によって細胞を収集し、SDS−PAGEを実施して、全可溶性タンパク質の20〜40%におけるアセチルキシランエステラーゼの発現を確認した。
半精製したT.マリティマ(T.maritima)アセチルキシランエステラーゼ変異体を含有する細胞ライセートの調製
実施例15に記載されるものと同様の発酵プロトコールを用いて、細胞培養物(実施例16で記載したように調製した)を1Lのスケール(Applikon)で増殖させた。5,000×gで15分間の遠心分離によって細胞を収集し、次に、1.0mMのDTTを補充した50mMのリン酸緩衝液(pH7.0)中に再懸濁した(20%w/v)。再懸濁した細胞をFrench圧力セルに2回通し、95%よりも多い細胞溶解を保証した。溶解細胞を12,000×gで30分間遠心分離し、上澄みを75℃で20分間加熱した後、氷浴中で2分間失活させた。11,000×gで10分間の遠心分離によって、沈殿したタンパク質を除去した。SDS−PAGEにより、CE−7酵素は、調製物中の全タンパク質の約85〜90%を構成することが示された。
T.マリティマ(T.maritima)アセチルキシラン野生型エステラーゼおよびC277エステラーゼ変異体の比活性および過加水分解/加水分解比
反応(40mLの全体積)は、トリアセチン(100mM)と、過酸化水素(100mM)と、以下のアセチルキシランエステラーゼ変異体:T.マリティマ(T.maritima)C277S変異体ペルヒドロラーゼ(E.コリ(E.coli)KLP18/pSW228/C277Sからの0.010mg/mLの加熱処理した全抽出タンパク質)、T.マリティマ(T.maritima)C277T変異体ペルヒドロラーゼ(E.コリ(E.coli)KLP18/pSW228/C277Tからの0.010mg/mLの加熱処理した全抽出タンパク質)、T.マリティマ(T.maritima)C277A変異体ペルヒドロラーゼ(E.コリ(E.coli)KLP18/pSW228/C277Aからの0.0125mg/mLの加熱処理した全抽出タンパク質)、およびT.マリティマ(T.maritima)C277V変異体ペルヒドロラーゼ(E.コリ(E.coli)KLP18/pSW228/C277Vからの0.0125mg/mLの加熱処理した全抽出タンパク質)(実施例19に記載されるように調製)のうちの1つとを含有するリン酸緩衝液(50mM、pH7.2)中、25℃で実行した。反応物および酵素を最初に混合するために、反応の最初の30秒間だけ反応を攪拌した。
ペルヒドロラーゼを用いる過酢酸の生成
トリアセチン(2mM)、過酸化水素(10mM)、および0.1μg/mL〜2.0μg/mLの加熱処理した細胞抽出タンパク質(上記のように調製、加熱処理は85℃で20分間実施した)を含有する反応(100mLの全体積)を、10mMの重炭酸ナトリウム緩衝液(初期pH8.1)中、20℃で実行した。Karstら(上記)によって記載される方法に従って、反応混合物中の過酢酸の濃度の決定を実施した。1分、5分、20分、40分および60分で生成した過酢酸濃度は、表15に記載される。
ペルヒドロラーゼを用いる過酢酸の生成
トリアセチン(20mM)、過酸化水素(10mM)、および0.1μg/mL〜2.0μg/mLの加熱処理した細胞抽出タンパク質(上記のように調製、加熱処理は85℃で20分間実施した)を含有する反応(100mLの全体積)を、10mMの重炭酸ナトリウム緩衝液(初期pH8.1)中、20℃で実行した。Karstら(上記)によって記載される方法に従って、反応混合物中の過酢酸の濃度の決定を実施した。1分、5分、20分、40分および60分で生成した過酢酸濃度は、表16に記載される。
ペルヒドロラーゼを用いる過酢酸の生成
トリアセチン(100mM)、過酸化水素(100mM)、および10μg/mL〜50μg/mLの加熱処理したT.ネアポリタナ(T.neapolitana)またはT.マリティマ(T.maritima)野生型またはC277変異体ペルヒドロラーゼ(上記のように調製した、加熱処理した細胞抽出タンパク質として、加熱処理は75℃で20分間実施した)を含有するリン酸緩衝液(50mM、pH7.2)中、反応(40mLの全体積)を25℃で実行した。反応物および酵素を最初に混合するために、反応の最初の30秒間だけ反応を攪拌した。Karstら(上記)によって記載される方法に従って、反応混合物中の過酢酸の濃度の決定を実施した。1分、5分、および30分で生成した過酢酸濃度は、表17に記載される。
ペルヒドロラーゼを用いる過酢酸の生成
トリアセチン(100mMまたは150mM)、過酸化水素(100mM、250mMまたは420mM)、および加熱処理したT.ネアポリタナ(T.neapolitana)またはT.マリティマ(T.maritima)野生型、C277SまたはC277T変異体ペルヒドロラーゼを含有する重炭酸ナトリウム緩衝液(1mM、初期pH6.0)中、反応(10mLの全体積)を25℃で実行した。420mMの過酸化水素を用いて実行した反応は、さらに、500ppmのTURPINAL(登録商標)SLを含有した。反応物および酵素を最初に混合するために、反応の最初の30秒間だけ反応を攪拌した。Karstら(上記)によって記載される方法に従って、反応混合物中の過酢酸の濃度の決定を実施した。1分、5分、および30分で生成した過酢酸濃度は、表18に記載される。
Claims (29)
- (a)(i)カルボン酸エステル基質と;
(ii)CLUSTALWを用いて配列番号2と整列する炭水化物エステラーゼファミリー7(CE−7)シグネチャーモチーフを有する酵素を含み、ペルヒドロリシス活性を有する酵素触媒であって、
該シグネチャーモチーフが、
(1)配列番号2の118−120と整列するアミノ酸位置でRGQモチーフ、
(2)配列番号2の179−183と整列するアミノ酸位置でGXSQGモチーフ、および
(3)配列番号2の298−299と整列するアミノ酸位置でHEモチーフ
を含み、該酵素が配列番号2、配列番号4、配列番号6、配列番号8、配列番号10、配列番号12、配列番号14、配列番号16、配列番号18、配列番号20、配列番号22、配列番号24、配列番号26、配列番号54、配列番号60、配列番号64、配列番号68、配列番号72、配列番号73および配列番号74からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも90%の同一性を有する酵素触媒と;
(iii)2よりも小さいlog P、ここで、log Pは、オクタノールと水の間の物質の分配係数の対数として定義され、P=[溶質]オクタノール/[溶質]水と表される、を有する有機溶媒を含み、該酵素触媒のための基質ではない、少なくとも1つの共溶媒と;
を含み、(i)〜(iii)の2000ppm未満の水濃度を有する調合物である第1の成分を備えるステップと:
(b)水中の過酸素源を含む第2の成分を備えるステップと:
(c)該第1の成分および該第2の成分を混ぜ合わせて、水性反応調合物を形成させるステップと:
を含む、ペルオキシカルボン酸を生成させるための方法であって、
ここで上記共溶媒は、上記酵素触媒のペルヒドロリシス活性を、同じ反応条件下における当該共溶媒の不在下の当該酵素触媒と比べて減少させることなく、上記水性反応調合物に上記カルボン酸エステル基質を可溶化し、それにより、ペルオキシカルボン酸を生成させる、上記方法。 - 表面を殺菌するための方法であって、
請求項1に記載の方法のステップ(c)において形成される水性反応調合物を上記表面に適用するステップを含む、上記方法。 - 衣料品または繊維製品を処理するための方法であって、
漂白、汚れの除去、臭気軽減、衛生化、殺菌、またはこれらの混ぜ合わせのために、請求項1に記載の方法のステップ(c)において形成される水性反応調合物を該衣料品または繊維製品に適用するステップを含む、上記方法。 - 前記水性反応調合物が、噴霧によって前記表面または前記衣料品に適用される、請求項1〜3のいずれか一項に記載の方法。
- 前記第1の成分が、1:1〜1:10の質量比で前記第2の成分と組み合わせられる、請求項1〜3のいずれか一項に記載の方法。
- 前記共溶媒が、20質量%〜80質量%の量で前記第1の成分中に存在する、請求項1〜3のいずれか一項に記載の方法。
- 前記基質が、前記第1の成分中に、その成分の10質量%〜60質量%の量で存在する、請求項1〜3のいずれか一項に記載の方法。
- 前記第1の成分が、55質量%のカルボン酸エステル基質、40質量%の共溶媒、0.3質量%の酵素触媒、および2.5質量%の充填剤を含み、前記第2の成分が、95質量%の水、1.5質量%の重炭酸ナトリウム、および1質量%の過酸素源を含む、請求項1〜3のいずれか一項に記載の方法。
- 前記第1の成分が、55.5質量%のトリアセチン、41質量%のトリプロピレングリコールメチルエーテル、およびサーモトガ・ネアポリタナもしくはサーモトガ・マリティマペルヒドロラーゼ、またはペルヒドロリシス活性を改善する1つまたは複数の点突然変異を有するサーモトガ・ネアポリタナもしくはサーモトガ・マリティマペルヒドロラーゼの変異誘導体を含む0.3質量%の噴霧乾燥酵素粉末、および2.5質量%のヒュームドシリカを含み、前記第2の成分が、96質量%の水、0.2質量%の過酸化水素安定剤、および3.2質量%の、30%過酸化水素を含む溶液とを含む、請求項8に記載の方法。
- 前記第1の成分および前記第2の成分を混ぜ合わせて水性反応調合物を形成する際に、前記カルボン酸エステル基質の初期濃度が100mMであり、前記過酸素源の初期濃度が100mMであり、前記酵素触媒の初期濃度が0.1mg/mLである、請求項1または2に記載の方法。
- 前記第1の成分および前記第2の成分を混ぜ合わせて水性反応調合物を形成する際に、前記カルボン酸エステル基質の初期濃度が10mMであり、前記過酸素源の初期濃度が10mMであり、前記酵素触媒の初期濃度が0.01mg/mLである、請求項1または3に記載の方法。
- 前記カルボン酸エステル基質がトリアセチンを含み、前記過酸素源が過酸化水素を含み、前記酵素触媒が、配列番号16および配列番号74からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項7に記載の方法。
- 前記カルボン酸エステル基質が、100mg/mL未満の水に対する溶解度を有する、請求項1〜3のいずれか一項に記載の方法。
- 前記酵素が、配列番号2の179−183と整列するアミノ酸位置でLXDモチーフをさらに含む、請求項1〜3のいずれか一項に記載の方法。
- 前記酵素触媒が、配列番号14および配列番号73からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項1〜3のいずれか一項に記載の方法。
- 前記共溶媒が、トリプロピレングリコールメチルエーテル、ジプロピレングリコールメチルエーテル、プロピレングリコールメチルエーテル、ジエチレングリコールブチルエーテル、ジプロピレングリコール、トリエチレングリコール、1,2−プロパンジオール、N−エチル−2−ピロリジノン、イソプロパノール、エタノール、乳酸エチル、1,3−プロパンジオール、またはこれらのいずれかの組み合わせを含む、請求項1〜3のいずれか一項に記載の方法。
- 前記共溶媒がトリプロピレングリコールメチルエーテルを含む、請求項16に記載の方法。
- 前記ペルオキシカルボン酸が、C3〜C10ペルオキシカルボン酸である、請求項1〜3のいずれか一項に記載の方法。
- 前記ペルオキシカルボン酸が、過酢酸、過プロピオン酸、過酪酸、ペル乳酸、ペルグリコール酸、ペルメトキシ酢酸、過β−ヒドロキシ酪酸、またはこれらのいずれかの組み合わせ
を含む、請求項1〜3のいずれか一項に記載の方法。 - 酵素触媒が、微生物細胞、透過処理微生物細胞、微生物細胞抽出物、部分精製酵素、または精製酵素の形態で備える、請求項1〜3のいずれか一項に記載の方法。
- 酵素触媒が可溶性または不溶性担体の中または上に固定化される、請求項20に記載の方法。
- 酵素触媒はカタラーゼ活性がない、請求項1〜3のいずれか一項に記載の方法。
- (a)(i)カルボン酸エステル基質と;
(ii)CLUSTALWを用いて配列番号2と整列するCE−7シグネチャーモチーフを有する酵素を含み、ペルヒドロリシス活性を有する酵素触媒であって、
該シグネチャーモチーフが、
(1)配列番号2の118−120と整列するアミノ酸位置でRGQモチーフ、
(2)配列番号2の179−183と整列するアミノ酸位置でGXSQGモチーフ、および
(3)配列番号2の298−299と整列するアミノ酸位置でHEモチーフ
を含み、該酵素が配列番号2、配列番号4、配列番号6、配列番号8、配列番号10、配列番号12、配列番号14、配列番号16、配列番号18、配列番号20、配列番号22、配列番号24、配列番号26、配列番号54、配列番号60、配列番号64、配列番号68、配列番号72、配列番号73および配列番号74からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも90%の同一性を有する酵素触媒と;
(iii)2よりも小さいlog P、ここで、log Pは、オクタノールと水の間の物質の分配係数の対数として定義され、P=[溶質]オクタノール/[溶質]水と表される、を有する有機溶媒を含み、該酵素触媒のための基質ではない、少なくとも1つの共溶媒と;
を含み、(i)〜(iii)の2000ppm未満の水濃度を有する調合物である第1の成分を備えることと:
(b)水中の過酸素源を含む第2の成分を備えることと:
を含む、ペルオキシカルボン酸を生成させるための多成分システムであって、
該第1の成分および該第2の成分を混ぜ合わせてペルオキシカルボン酸を含む水性反応調合物を生成させ、ここで上記共溶媒は、上記酵素触媒のペルヒドロリシス活性を、同じ反応条件下における当該共溶媒の不在下の当該酵素触媒と比べて減少させることなく、該水性反応調合物に上記カルボン酸エステル基質を可溶化する、上記システム。 - 前記第1の成分を保存するための第1のコンパートメントと、前記第2の成分を保存するための第2のコンパートメントとをさらに含む、請求項23に記載のシステム。
- 前記第1のコンパートメントからの前記第1の成分の少なくとも一部と、前記第2のコンパートメントからの前記第2の成分の少なくとも一部とを受け、それによって、該第1の成分の少なくとも一部と、該第2の成分の少なくとも一部とを含む混合物の形成を可能にする混合コンパートメントをさらに含む、請求項24に記載のシステム。
- 前記第1の成分の少なくとも一部が、1:1〜1:10の質量比で前記第2の成分の少なくとも一部と混和される、請求項25に記載のシステム。
- 前記混合コンパートメントから水性反応調合物を分注するためのノズルをさらに含む、請求項26に記載のシステム。
- 前記第1のコンパートメントからの前記第1の成分の少なくとも一部と、前記第2のコンパートメントからの該第2の成分の少なくとも一部とを受け、該第1の成分の少なくとも一部を、該第2の成分の少なくとも一部と同時に分注するためのノズルをさらに含む、請求項27に記載のシステム。
- 第1の成分および第2の成分がノズルにより表面に送達され、該表面上で、第1の成分および第2の成分の混合を可能にする、請求項23に記載のシステム。
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