Salmon Elles
Salmon Elles
Salmon Elles
Objectifs
Expliquer la taxonomie ancienne et rcente du genre
Salmonella
Spcifier les caractres bactriologiques, biochimiques,
pathognes
Prsenter les tableaux cliniques des fivres typhodes et
Plan
I- Gnralits : I-1- Dfinition et intrt I-2- Historique I-3- Rappels sur les mthodes de diffrentiation infra- spcifique des espces II- Taxonomie III- Caractres bactriologiques IV- Fivres typhodes V- Salmonelloses non typhodiques VI- Diagnostic biologique VII- Traitement curatif et prvention
Dfinition et intrt
Salmonella : Genre bactrien de la famille des Enterobacteriaceae, constitu de bacilles Gram ngatif, le plus souvent mobiles, pathognes pour lhomme et les animaux
Intrt : Ce genre regroupe de nombreuses espces pathognes pour lhomme, agents des fivres typhodes, fivres paratyphodes, et dautres salmonelloses communes lhomme et lanimal Ces maladies sont des maladies du pril fcal et peuvent tre prvenues par lapplication de mesures particulires dhygine et salubrit Elles sont responsables dpidmies parfois trs importantes
Historique
1813 : individualisation de la fivre typhode sur la base des signes cliniques et lsions ulcreuses de lintestin par Petit et Serres 1868 : MEE du rle de leau de boisson dans sa dissmination par Pettenkoffer 1880 : Dcouverte de lagent de la fivre typhode par Eberth, dans les coupes histologiques de ganglions lymphatiques de malades morts de cette maladie 1884 : Culture de la bactrie par Gaffky 1896 : MEE de la diversit antignique des souches de salmonelles par Widal 1918 : Etude spare des Ag somatiques O, flagellaires H, et de surface Vi par Weil, Flix, Mitzemacher 1926 : Inventaire de la diversit antignique de ces bactries, maintenant regroupes dans le genre Salmonella par White cette date. Kauffmann, puis Le Minor y ont contribu plutard
mort cellulaire et la production de nouveaux phages qui rinfectent dautres cellules. Ceci se traduit par la formation de plage ou linhibition de la croissance bactrienne
Temprs : leur ADN intgre le gnome bactrien, se
rfrant ltat lysogne ; 1 petite portion de cellules htes induisent naturellement les gnes du phage et la libration des phages intervient.
Salmonella enterica srotype typhi Utilise 87 variants adapts issus d1 mme bactriophage, le phage Vi II (40 ,41, 51) Ce set de phages permet de subdiviser les souches de ce srotype en 106 lysotypes LAg Vi est le rcepteur des phages. Les isolat doivent produire Vi pour tre sensibles aux phages
E1, et C1) Ce qui explique le systme de lysotypie complmentaire du srotype typhi mis au point par Nicolle, et compos de 13 bactriophages non adapts Vi, subdivisant le groupe A, le plus frquent, en 10 sous- lysotypes 2me systme : Publi en 1951 par Flix et Callow Permet de typer Salmonella srotype paratyphi B Compos de 12 bactriophages adapts et non adapts et reconnat 48 lysotypes
3me systme :
Taxonomie
Rgne Embranchement Classe Ordre Famille Genre Espce Bacteria Proteobacteria Gamma Proteobacteria Enterobacteriales Enterobacteriaceae Salmonella 2 espces (actuellement) et plusieurs sous- espces
Genre Salmonella
Ancienne taxonomie ;
Base sur des tests biochimiques et de srotypie En sappuyant sur les diffrents facteurs antigniques O (somatiques
paritaux) et H (flagellaires appartenant aux 2 phases possibles, H1 et H2), Kauffmann et White ont propos 1 shma srotypique d1 extrme richesse
Concept : 1 srotype, 1 espce propos par Kaufmann sur la base
de lidentification srologique des antignes somatique O et flagellaire H salmonelles en 1998 et davantage aujourdhui car 26 srovars ont t identifis en 1999
- 2 espces : S. enterica et S. bongori. Lespce bongori a pour habitat uniquement les animaux. - 6 sous- espces de lespce enterica : S. enterica, S. salame; S. arizonae ; S. diarizonae; S. houtenae ; S. indica. La 1re a pour habitat lhomme et les animaux sang chaud, les 5 autres sont retrouves chez les animaux (vertbrs) sang froid - Trs nombreux srotypes
Ex. Salmonella enterica, sous espce enterica, srotype typhi,
Salmonella ser typhimurium Salmonella ser greenside Salmonella IIIa 18:Z4, Z23
Salmonella typhimurium S. II 50:z :e, n,x Salmonella greenside Arizona hinshawii ser. 7a, 7b: 1,2;5
en arobiose et en anarobiose
Exigences nutritionnelles rduites. La plupart se multiplient
contenant 2 inhibiteurs de la flore Gram+ ; les sels biliaires et le cristal violet). Le caractre recherch dans ce milieu tant la fermentation du lactose dont lutilisation est rvle par lindicateur color du milieu, le rouge neutre
rondes, lisses (S), bords rguliers, de 2 3 mm de diamtre aprs 18H dincubation. Il existe des diffrences dans la rapidit de dveloppement des colonies. Ex, celles de Shiguella sont plus petites que celles de E. coli
Les colonies peuvent apparatre muqueuses avec 1
consistance glatineuse et 1 tendance la confluence et souvent 1 diamtre double de celui des autres entrobactries >24H
Les colonies aspect rugueux ( R ) se rencontrent le plus
denveloppe) Antignes O :
- Sont thermostables (rsistant 2H 1 chauffage 100C) - Sont 1 fraction protinique qui rend le complexe antignique - Sont 1 fraction polyosidique qui dtermine la spcificit de lantigne - Sont trs toxiques (1/20mg suffit pour tuer la souris en 24H) : 1 fraction lipidique qui, lie au polyoside, est responsable de la toxicit (endotoxine). Inject lhomme ou lanimal, lantigne O provoque de la fivre, 1 leucopnie suivi de leucocytose avec lymphopnie et osinophilie
culturaux et mtaboliques identiques celles des autres bactries de la famille des enterobactries
Bacilles Gram ngatif Taille ; (0,1 6 x 0,3) microns Mobiles, except celles
cultures donnent des colonies naines (aspect constant chez les srovars abortusovis, typhisuis, exceptionnellement chez les mutants
Mur muqueux visible seulement aprs plusieurs jours.
Exceptionellement, on peut isoler des souches de Salmonella poussant sous forme de colonies muqueuses dont les dimensions et laspect rappellent Klebsiella (cette aptitude se perd aprs quelques mois de conservation)
fermentant le glucose
Les souches auxotrophes appartiennent aux srovars dont
le pouvoir pathogne est restreint 1 hte particulier Ex. S. typhi, paratyphi A, sendai que lon nisole que chez lhomme; abortusovis que lon ne trouve que chez les ovins, gallanarum- pullorum chez les volailles Elles ne peuvent donc pas pousser sur le citrate de Simmons qui ne contient pas de facteurs de croissance (le citrate y est la seule source de C)
- composition : vert de malachite, MgCl2 et ph acide - permettent lenrichissement en Salmonella, lexception de S. typhi et S. paratyphi A,B, et C
Milieu
Caractres bactriologiques: Genre 2 indicateurs prsents dans le Production Hektoen Salmonella de dH2S Suspicion de milieu: partir Salmonella si
Bleu de bromothymol (indicateur de pH) Fuschine acide (se colore en prsence daldhyde) thiosulfate La fermentation ou non de 3 types de glucides ; saliciline, saccharose et lactose Contient du lactose pouvant tre ferment Contient du thiosulfate pouvant donner du H2S Critre de diffrentiation: lactose Colonies gristres de 1 2 mm de diamtre transparentes ou grises ambres: colonies bleu- vert centre noir
Slectivit/ composition
Caractres recherchs
Rsultats
Glose SS
EMB
Contient 3 inhibiteurs ; -Sels biliaires - vert brillant - forte concentration en citrate de Na+ Inhibition des G+ ; croissance difficile des G- autres que Salmonella et Shigella Contient 2 colorants ; bleu de mthylne qui inhibe majorit de flore G+ (suf strptocoque D); Bien que les entrobactries lactosesy developpent, les
XLT4
DCLS
XLT4
Caractres bactriologiques: Genre Salmonella - + + + Subs. v V Enteric a Subs. Salama e Subs. Arizona e Subs. Diarizo nae + v + + + + +
ONP Glati btagl Alphaglut G nase ucuro amyl (2H) (36C) nidase transfras e
Malo nate
Subs. Houten ae
Subs. Indica
Ex. Salmonella enterica subs. Enterica : Caractristiques ; ONPG-. ADH-, LDC+, ODC+ (typhi ODC-, paratyphi LDC-), citrate +,H2S+ (typhi citrate -, H2S traces), urase-, TDA-, indole-, VP-, glatinasesucres + sauf inositol, saccharose, amygdaline, Hors API 20 E ; Gaz + (sauf typhi), souvent sensible phage 01
lame avec culture humide, surtout pour la recherche des Ag flagellaires H (aprs avoir vrifi que la souche nest pas auto- agglutinable, avec de
somatique commun (facteur O majeur) A lintrieur du groupe, les diffrents srotypes se distinguent surtout par les Ag flagellaires H Dans certains cas, lAg somatique est cach par lAg Vi qui est uniquement retrouv chez S. typhi et paratyphi C et quelques rares souches de Dublin Seul S. typhi est O inagglutinable par la prsence d1 Ag Vi, mais ses caractristiques biochimiques remarquables (ODC-, citrate -, gaz-) permettent de ldentifier rapidement Lagglutinabilit par le srum Vi et lagglutination somatique O aprs chauffage d1 suspension pendant 10min 100C permettent de confirmer le rsultat Lagglutination doit tre immdiate
cd possdant 2 spcificits Agniques diffrentes. Sont exceptionnellement triphasiques 2 gnes sont alternativement exprims : fliC et fljB Celles-ci pourront tre MEE par les srums anti- H correspondants Dans certains cas, l1 des 2 spcificits est prpondrente, lautre ne pouvant tre dtecte quaprs essaimage sur 1 glose molle contenant de lantisrum dirig contre la phase qui sexprime (mthode de Sven Gard) LAg H est recherch lorsque lAg O a t dtermin. Les srum anti- O,45 06,7,8 - O9 (qui reprsentent 90% des
La caractrisation lysotypique, gnotypique dans des centres spcialiss permettent 1 bonne identification
particulirement adaptes lhomme, nayant pas dautre hte naturel connu, et sont responsables dinfections svres
Ces 2 dernires sont responsables des fivres typhodes Dautres comme S. typhimurium ont de multiples htes naturels.
augmentation rapide de la population; urbanisation rapide; Eau rare ; systmes de sant peu dvelopps
Depuis le dbut des annes 70, les souches de S. typhi
rsistant au chloramphnicol, lampicilline et au cotrimoxazole par 1 mcanisme plasmidique posent 1 problme de sant publique dans les pays dendmie
- limportance de linoculum - la virulence de la souche : Facteurs de virulence cods par des gnes prsents sur le chromosome (S. typhi), ce qui explique la gravit constante de linfection - les facteurs tenant lhte
diminution de la motilit intestinale (mdicaments, diabte) peuvent contribuer rendre pathognes des inoculum faibles
Importance du terrain : diabte, personnes ges,
muqueuse par les bactries. Il sy trouve la 2me ligne de dfense reprsente par les IgA, le mucus intestinal et les dfensines (peptides anti- microbiens permabilisant les membranes bactriennes) avec les entrocytes (induction d1 activit phagocytaire par les salmonelles et les cellules M de la plaque de Peyer) qui permettent leur internalisation rapide et le contact avec les cellules immunocomptentes de la sous- muqueuse (macrophages et lymphocytes) et mme, induire leur apoptose.
Celle- ci provoque des signes cliniques (fivre,tuphos, bradycardie) et biologique (leucopnie) et 1 irritation des plaques de PEYER qui peuvent entraner des hmorragies intestinales et des perforations.
A partir des gg msentriques, par le canal thoracique, des
Salmonella gagnent le courant sanguin (hmoculture +), et dissminent dans tous les organes (reins, foie, vsicule biliaire. Finalement, lorganisme infect produit des Ac contre les Ag bactriens (srodiagnostic +), qui contribue la gurison
60jours (parfois diarrhe fugace dans les 12 48H suivant 1 repas contaminant)
Troubles peu spcifiques : constipation plus
frquente que diarrhe chez ladulte, cphales, sensation de malaise, dcalage thermique
atteindre 40C le premier septnaire ou fivre leve demble. Fivre en plateau 39- 40C dans la deuxime semaine
Classique dissociation pouls temprature dans 50% des
cas
thorax, de labdomen (tches roses lenticulaires dont la mise en culture permet disoler les salmonelles
myocardiques ou crbrales (encphalites) N.B ; En labsence de traitement, 5% des malades deviennent des porteurs asymptomatiques, parfois durant toute leur vie
Fivres paratyphodes
o
o o
ds au dveloppement de lindustrie agro- alimentaire (lait pasteuris contamin secondairement, crmes glaces, dveloppement du commerce international de fruits et lgumes)
( lexception de S. typhimurium et parfois S. enteridis qui peuvent donner des infections systmiques)
par production de toxines et par linduction de marqueurs de linflammation modifiant le transport des lectrolytes et des liquides travers la muqueuse la fois sur le chromosome et sur 1 plasmide (Ex. S. typhimurium). Ceci explique que pour 1 mme srovar, 1 souche soit plus ou moins pathogne
structures de surface (lipopolysaccharides, flagelles, antigne Vi) ou des facteurs cods par des gnes de virulence
- Portage transitoire ou chronique asymptomatique (persistance de salmonelles dans les urines ou dans les selles au-del de 1 an aprs infection symptomatique. Il est favoris par la prsence d1 lithiase vsiculaire) - gastro- entrite - bactrimie (fait souvent suite gastro- entrite)
Complications possibles ; formes septicmiques et viscrales
(infections endovasculaires; colites; infections uro- gnitales, pneumonies et empymes; infections du SNC; manifestations osto- articulaires, infections des parties molles, infections splniques, ) Ces dernires sobservent surtout chez des terrains particuliers
Diagnostic biologique
Repose sur ;
la MEE de la Salmonella
Orientation clinique
Gastro- entrite fbrile : - en zone dendmie
- au cours d1 pidmie - chez 1 sujet vivant au contact d1 sujet malade ou 1 porteur chronique
Episodes fbriles rcurrents
- chez 1 sujet aux antcdents de lithiase (biliaires ou mme rnales) - chez 1 terrain particulier (immuno- dprim, drpanocytaire, vieillard, nourrissons,)
Septicmie Symptomatologie vocatrice ; dissociation pouls- temprature ,
Prlvements et transport
Diffrents sites (ou types) de prlvements en fonction de la clinique 2 princiapux types de prlvement ;
- le sang (hmoculture) : 10 20ml (1 2 ml chez le NRS et lenfant) de sang dans le flacon. A effectuer de prfrence concomittement la fivre et avant dbut dATBiothrapie (sinon, fentre de 48 72H observer) - les selles (coproculture) : dans 1 pot strile muni d1 cuillre ou d1 spatule. Ecouvillonnage rectal possible chez lenfant
Autres types de prlvement ;
- Pus (si abcs) - Urines : 2me jet dans 1 flacon strile prvu cet effet
Transport:
- Doit seffectuer le plus rapidement possible afin que les selles soient immdiatement techniques. Si ce nest pas possible, conserver + 4C sans dpasser 12H. - Transport immdiat du flacon dhmoculture au laboratoire
- 90% des cas durant la 1re semaine de la maladie (1er septenaire) - 75% des cas durant la 2me semaine de la maladie (2me septnaire) - 40% des cas durant la troisime semaine de la maladie (3me septnaire)
avec le systme automatique (dtection de production de CO2 rflectomtrie ou fluorescence), procder lexamen du bouillon suivant : - Etat frais - Coloration de Gram
La microscopie permet dorienter le choix du milieu ;
- milieux gloss non slectifs tel glose colombia avec 5% de sang incub en arobiose 2 jrs et en anarobiose 5jrs - milieux slectifs SS, Hekton
Identification par les caractres biochimiques Lespce en cause est ensuite prcise par ses caractres
antigniques
traitement que le sujet nest pas devenu porteur chronique de Salmonella et donc, quil ne constitue pas 1 source de contamination pour
- Etat frais permet de dceler la prsence de leucocytes et dhmaties (ventuellement de parasites), Salmonella tant 1 germe invasif - Etalement sur lames + coloration au bleu de mthylne ou au Giemsa (aprs schage) : permet de dceler la prsence dhmaties
Se fait sur milieu slectif avant et aprs prculture sur milieux denrichissement
Milieux denrichissement :
- au slnite : milieu de Leifson - au ttrathionate : Mueller- Kauffmann - Y ajouter 0,5 mL de selles. A repiquer aprs 3 6H maximum dincubation 37C afin dviter la multiplication des bactries commensales mal inhibes audel de ce dlai
Milieux slectifs pour Salmonella- Shigella ;
- glose Hektoen - glose Salmonella Shigella (SS) - milieux chromognes (permettent 1 diffrenciation plus aise des salmonelles (SM ID2, OSCM II,)
N.B ; - Incubation des diffrents milieux 37C - Il nya pas de milieux denrichissement pour Shigella
+
-
Gaz
H2S
+
+
+
+ (le plus souvent)
Citrate
ONPG LDC
(suspensions standardises 0 et H)
Permet de dtecter la prsence dans le sang dAc dirigs
Widal ngatif lors de la 1re semaine), atteignant leur maximum vers le 14me jour, restent en plateau jusqu la 4me semaine puis disparaissent rapidement. Ils
Diagnostic biologique
rapidement pour atteindre 1 maximum de 1/800me 1/ 1600me vers le 14me jour, restent en plateau jusqu la 4me semaine et diminuent ensuite
A linverse des Ac anti- O, ils ne disparaissent pas
prcocment des ATB : les Ac anti-O ne peuvent pas apparatre et les Ac anti-H ne peuvent atteindre qu1 taux faible. Parfois, ni les Ac anti-O, ni les Ac anti-H nappairaissent
Des rcidives de fivre typhode peuvent sobserver mme
chez des sujets porteurs de taux levs dAc anti- O et anti- H (la prsence dAc nassure pas toujours limmunit)
Le sujet vaccin peut avoir 1 persistance des Ac anti TH,
AH et BH. Cette signature srologique ne doit pas dans ce cas, faire considrer le diagnostic comme positif
coproculture ; les hmocultures et le srodiagnostic sont ngatifs, la Salmonelle restant purement digestive
Chez les terrains particuliers cits plus haut, les
Salmonella mineures sont susceptibles de franchir la barrire intestinale, provoquer 1 septicmie et donner des hmocultures +
Traitement curatif
ATB utilis doit avoir 1 activit bactricide rapide ATB doit avoir des concentrations sriques et tissulaires
Traitement curatif
Autres ATB utiliss :
- Cphalosporines : C3G sont utiliss avec efficacit (les C1G et C2G ne doivent pas tre utiliss car bien qutant -actives in vitro, nont pas montr defficacit suffisante dans le T3 des FT) - Fluoroquinolones : efficacit remarquable du fait de leur excellent pntration cellulaire et de leur forte concentration biliaire et intestinale - Lazithromycine : bien quayant 1 activit modeste in vitro, a 1 bonne concentration intracellulaire et sest montr aussi efficace que la ciprofloxacine. Souvent utilise pour les souches rsistantes aux fluoroquinolones N.B ; Les gastro- entrites Salmonella gurissent le plus souvent spontanment ; le T3 se rsume le plus souvent la
Traitement curatif
Corticodes et T3 adjuvants :
Rhydratation + rgime sans rsidu indispensables Corticodes rservs aux fivres typhodes dtat de choc ou de troubles de conscience pour 1 dure nexcdant pas 48H (risque de rechutes si ce dlai dpass)
Chirurgie : cas de perforation digestive et abcs Antibiothrapie prolonge pour les atteintes osseuses Porteurs chroniques : Difficults dradication de S. typhi
quand il existe 1 lithiase vsiculaire ou rnale. 1 T3 par amoxicilline (6g/jr) pendant 6 semaines peut permettre lradication ou ciprofloxacine (1g/jr) ou (norfloxacine (800mg/jr) pendant 4 semaines peut permettre lradication . La cholcystectomie tant discute en cas dchec
Prophylaxie
Mesures gnrales ;
Distribution deau contrle bactriologiquement et
assainissement de toutes les eaux de boissons Traitement des eaux uses Pasteurisation des aliments (ufs, beurre et lait en particulier) Eviction scolaire jusqu la gurison clinique Isolement des malades Enqutes pidmiologiques (pidmies,) et dpistage des porteurs chroniques (3 coprocultures ngatives permettent de conclure larrt du portage) Traitement des pisodes aiges et des porteurs chroniques Surveillance pidmiologique nationale (restaurateurs, collectivits,) Lavage des mains avant le repas Utilisation de latrines bien construites et rpondant aux
Prophylaxie
Vaccination :
En raison de sa tolrance mdiocre, le vaccin inerte
complet TAB, seul disponible pendant longtemps a t abandonn malgr son faible cot
2 autres sont actuellement disponibles ;
- vaccin inerte fractionn (Typhim Vi par AventisPasteur; Typherix par GlaxoSmithKline) - vaccin vivant attnu (vivotif Berna Vaccine) N.B; Elle est obligatoire pour lexercice de certaines professions (militaires) et pour des sujets qui voyagent d1
FIN