톰부스바이러스과

Tombusviridae
톰부스바이러스과
Tombusviridae virion.jpg
바이러스 분류 e
(순위 미지정): 바이러스
영역: 리보비리아
왕국: 오르토나비라과
문: 키트리노비리코타
클래스: 톨루카비리세테스
주문: 톨리비랄레스
패밀리: 톰부스바이러스과

톰부스바이러스과(Tombusviridae)는 단가닥 양감각 RNA 식물 바이러스 과이다.3개의 아과,[1][2] 17개 속, 95종이 있다. 95종이 있다.그 이름은 토마토 부시 스턴트 바이러스 (TBSV)[3]에서 유래되었다.

게놈

톰부스바이러스과 게놈 지도

Dianthovirus의 게놈이 초당적인 [4]것을 제외하고, 모든 바이러스는 비분할(단일) 선형 게놈을 가지고 있습니다.게놈은 길이가 약 4.6-4.8kb이고, 5' 캡과 폴리(A) 꼬리가 없으며, 4-6개의 ORF를 암호화합니다.중합효소는 ORF1 내에서 판독 이벤트가 발생하는 부위인 황색 중지 코돈을 인코딩하여 복제에 필요한 두 가지 생성물을 생성합니다.바이러스에 [5]의해 암호화된 헬리케이스는 없다.

구조.

RNA는 크기가 27~42K인 단층 단백질 180단위로 구성된 20면체(T=3) 캡시드에 캡슐화되어 있으며, 비리온은 직경이 28~35nm이며,[1][6] 포락되어 있지 않다.

라이프 사이클

바이러스 복제는 세포질이고 용원성이다.호스트 셀로의 진입은 호스트 셀로의 침투에 의해 이루어집니다.복제는 양성 좌초 RNA 바이러스 복제 모델을 따릅니다.서브게놈 RNA 전사의 조기 종료 모델을 이용한 양성 가닥 RNA 바이러스 전사가 전사 방법이다.리크 스캔, -1 리보솜 프레임시프트, 바이러스 개시 및 종료 억제에 의해 번역이 이루어집니다.그 바이러스는 요세관 유도 바이러스 이동에 의해 숙주 세포에서 빠져나간다.식물은 자연의 숙주 역할을 한다.전송 경로는 기계, 시드 베어링 및 컨택입니다.[1][7]

이 과의 바이러스는 주로 토양에 매개되며 일부는 키트리디알목의 진균에 의해 전염되고 다른 일부는 알려지지 않은 벡터에 의해 전염된다.바이러스 종은 물, 감염된 토양으로의 뿌리 성장, 식물, 꽃가루 또는 씨앗 사이의 접촉에 의해 퍼질 수 있습니다.이 바이러스들은 이식이나 기계적 접종에 의해 성공적으로 전염될 수 있으며, 바이러스온과 유전 물질만 [6]감염된다.

레플리케이션

Tombusviridae의 구성원은 음의 가닥 템플릿을 사용하여 세포질에서 복제합니다.복제 과정은 플러스(+RNA)의 여분을 남기며, 바이러스 RNA가 복제의 템플릿 역할을 할 뿐만 아니라 RNA [5]합성을 조작·조절할 수 있다고 생각된다.

RNA 합성의 수준은 상보적 RNA 가닥 합성을 위해 개시 부위를 조절하는 핵심 프로모터 서열을 포함하는 RNA의 특정 요소(예: RNA1 및[8][9] 2)의 시스 작용 특성에 영향을 받는 것으로 나타났다.이 메커니즘은 [5][7][10]게놈 내에서 코드화된 RNA 의존성 RNA 중합효소에 의해 인식되는 것으로 생각된다.

Tombusviridae의 바이러스는 숙주 대사 효소인 GAPDH를 복제 센터에서 함께 사용하는 것으로 밝혀졌다.GAPDH는 (-)RNA 가닥에 결합하고 이를 복제효소 복합체에 유지하여 합성된 (+)RNA 가닥을 내보내고 숙주 세포에 축적할 수 있다.GAPDH의 하향 조절은 바이러스 RNA 축적을 감소시키고 (+)RNA [11]복사본의 잉여를 제거하였다.

메모들

연구 결과 톰버스 바이러스로부터 식물에 감염되면 바이러스 RNA 게놈에서 직접 태어난 결함이 있는 간섭 RNA가 포함되며 숙주 게놈은 없는 것으로 나타났다.작은 크기와 시스 작용 요소를 가진 바이러스 DI RNA는 RNA [12][13][14]복제를 연구하기 위한 생체 내 및 시험관 내 템플릿이다.

서브게놈 RNA는 일부 단백질의 합성에 사용된다; 그것들은 (-)스트랜드 합성의 조기 종료에 의해 생성된다. sgRNA와 sgRNA 음성의 템플릿은 감염된 [6]세포에서 발견된다.

분류법

이 과는 다음과 같은 아과와 속(-virinae는 아과를, -virus는 [2]속)을 포함한다.

마지막으로, [2]루테 바이러스라는 한 속은 아군에 할당되지 않았다.

레퍼런스

  1. ^ a b c "Viral Zone". ExPASy. Retrieved 15 June 2015.
  2. ^ a b c "Virus Taxonomy: 2020 Release". International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). March 2021. Retrieved 16 May 2021.
  3. ^ 노스캐롤라이나 주 하빌리와 R. H. 사이몬스(1989)추정 RNA 중합효소 및 핵산 헬리케이스의 배열 모티브에 기초한 루테오바이러스와 다른 RNA 식물 바이러스 간의 진화적 관계.핵산 연구 17:23, 9543-55
  4. ^ Wiley InterScience 생명과학 백과사전:톰부스바이러스과
  5. ^ a b c ICTV: 패밀리 - Tombusviridae, 바이러스 분류.국제바이러스분류위원회 2012 제9차 보고서, 페이지 1111-1138, 2011년 11월 23일, doi:10.1016/B978-0-12-384684-6.00096-3
  6. ^ a b c ICTVdB: Universal Virus Database 버전3 00.074 。톰부스바이러스과
  7. ^ a b Beth L. Nicholson, Pui Kei K.Lee, K.A흰색: 내부 RNA 복제 요소는 Tombusviridae의 앞부분에 널리 분포합니다.Microbiol., 2012년 8월 6일, doi:10.3389/fmicb.2012.00279
  8. ^ Lommel SA, Weston-Fina M, Xiong Z, Lomonossoff GP (September 1988). "The nucleotide sequence and gene organization of red clover necrotic mosaic virus RNA-2". Nucleic Acids Res. 16 (17): 8587–602. doi:10.1093/nar/16.17.8587. PMC 338578. PMID 3047682.
  9. ^ Mizumoto H, Tatsuta M, Kaido M, Mise K, Okuno T (November 2003). "Cap-independent translational enhancement by the 3' untranslated region of red clover necrotic mosaic virus RNA1". J. Virol. 77 (22): 12113–21. doi:10.1128/JVI.77.22.12113-12121.2003. PMC 254280. PMID 14581548.
  10. ^ K. 앤드류 화이트, 피터 D.톰버스바이러스의 분자생물학의 진보: 유전자 발현, 게놈 복제 및 재조합, 핵산 연구와 분자생물학의 진보, Vol. 78, 2004, 페이지 187-226, doi:10.1016/S0079-6603(04)78005-8
  11. ^ Wang, R. and Nagy, P. (2008) 토마토 부쉬 스턴트 바이러스 바이러스 바이러스 유전자 RNA 합성을 위한 숙주 대사 효소의 RNA 결합 기능을 공동 최적화합니다.셀 호스트 및 마이크로베 3:3 178 ~187
  12. ^ NCBI: 토마토 부쉬 스턴트 바이러스(TBSV-P DI-4)의 간섭 RNA-4 결함, 토마토 부쉬 스턴트 바이러스(TBSV-P DI-5)의 간섭 RNA-5 결함
  13. ^ Yamamura, Yoshimi; Scholthof, Herman B. (1 September 2005). "Tomato bushy stunt virus: a resilient model system to study virus-plant interactions". Molecular Plant Pathology. 6 (5): 491–502. doi:10.1111/j.1364-3703.2005.00301.x. PMID 20565674.
  14. ^ Scholthof, Karen-Beth G.; Scholthof, Herman B.; Jackson, Andrew O. (1 August 1995). "The Effect of Defective Interfering RNAs on the Accumulation of Tomato Bushy Stunt Virus Proteins and Implications for Disease Attenuation". Virology. 211 (1): 324–328. doi:10.1006/viro.1995.1410. PMID 7645230.

외부 링크