JP6893970B2 - インターフェロンアルファ及びオメガ抗体アンタゴニスト - Google Patents
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Description
れらの抗体又は断片をコードするポリヌクレオチド、並びに上記を製造及び使用する方法
に関する。
容体であるIFNAR(IFNAR1とIFNAR2とのヘテロ二量体)を介してシグナ
ルを伝達して、その結果、抗ウイルス、抗増殖、及び免疫調節効果をもたらすサイトカイ
ンのファミリーである。ヒトにおいて、I型IFNは、少なくとも12のIFN−αタン
パク質サブタイプと、IFN−β、IFN−ε、IFN−κ、及びIFN−ωのそれぞれ
の1つのサブタイプとで構成されている。IFN−Iの放出は微生物リガンド及び無菌リ
ガンドの両方に応答して生じる。受容体への結合時に、IFN−Iは、JAK1及びTY
K2の活性化によってシグナル伝達カスケードを開始し、これによりSTAT1〜6を含
むいくつかのSTATファミリーメンバーのリン酸化反応がもたらされる。STAT1及
びSTAT2の活性化により、IFN調節因子9(IRF9)との複合体が形成され、I
FN刺激遺伝子因子3(ISGF3)複合体としても知られるこの複合体は、核内でIF
N刺激応答配列(ISRE)に結合し、その結果、IRF7及びCXCL10(IP−1
0)を含む多くのインターフェロン刺激遺伝子(ISG)の転写がもたらされる(Gon
zalez−Navajasら、Nature reviews.Immunology
12,125(Feb,2012))。IFN−Iは、v−crk肉腫ウイルスCT1
0発癌遺伝子相同体(トリ)様(CRKL)、マイトジェン活性化タンパク質キナーゼ(
MAPK)、ホスホイノシチド3−キナーゼ(PI3K)を含む他の経路を介し、かつ活
性化B細胞の核因子κ−軽鎖エンハンサー(NF−κβ)を介した細胞機能も調節する(
Hervas−Stubbsら、Clinical cancer research:
an official journal of the American Asso
ciation for Cancer Research 17,2619(May
1,2011))。
乾癬、シェーグレン病、全身性硬化症、関節リウマチ、免疫性血小板減少症(ITP)、
エカルディ−グチエール症候群(AGS)、筋炎、分類不能型免疫不全症(CVID)、
及び自己免疫性甲状腺疾患などのいくつかの免疫媒介炎症性疾患又は自己免疫疾患は、患
者の少なくとも部分母集団中において全血及び/又は全組織中に存在する一般にIFNシ
グネチャと呼ばれるIFN誘導性遺伝子の転写の過剰発現、又はIFN−Iの上昇に関連
している。
す慢性の自己免疫疾患又は免疫媒介炎症性疾患である。この疾患は異質な臨床像を有する
広範な症状を示し、全身性、皮膚性、腎性、筋骨格性、神経性、及び血液性の症状を含む
場合がある。SLEの重症度には大きなばらつきがあり、また、これは慢性的に寛解又は
再発しながら活動サイクルの拡大を伴い、好転又は軽快までに数週間、数ヶ月、又は数年
の期間を要する場合がある。IFN−αは、SLE患者において上昇し、自己寛容性の損
失を促進すると考えられている。IFN−αは持続的な樹状細胞活性化、ひいては抗原提
示、及びSLEに寄与するTreg機能の抑制に寄与することが示されている。更に、I
FN−αは市販のSLE治療用BENLYSTA(商標)の標的であるBLySの発現を
誘導する。IFN−Iの産生又は応答に関連する多くの多型性が特定されており、これら
は確認されているSLEに関連する多形現象の半数超を計上する(Ghodke−Pur
anik & Niewold,International journal of
clinical rheumatology 8,doi:10.2217/ijr.
13.58(2013))。様々なIFN−αサブタイプを中和する抗体(pan−IF
N−α抗体)がSLEに対する臨床試験で評価されている(例えば国際公開公報第WO0
2/066649号、同第WO05/059106号、同第WO06/086586号、
同第WO09/135861号を参照されたい)。
−I活性の約15%を構成する(Adolf,Virology 175,410(Ap
r,1990)。IFN−ω遺伝子発現は、SLE患者において上昇することが報告され
ており(Genes and immunity 4,177(Apr,2003)(H
anら)、Hum Genomics Proteomics 2009,(2009)
(Yaoら))、また、DCの分化を誘導するIFN−ωの能力が報告されている(Wa
lker and Tough,European journal of immun
ology 36,1827(Jul,2006))現在臨床試験中の抗IFN−α抗体
(シファリムマブ(MEDI−545)、ロンタリズマブ、及びAGS−009)は、I
FN−ωを中和しない。これらの抗体の臨床試験データは、抗IFN−α抗体を用いた治
療後の患者におけるI型IFNシグネチャの部分的な低減を示しており(Ann Rhe
um Dis70:1905〜1913,2011(Merrillら)、Arthri
tis Rheum 60:1785〜1796,2009(Yaoら))、ロンタリズ
マブ(pan−抗IFN−α抗体)でのフェーズ2の試験データでは、インターフェロン
シグネチャメトリック(ISM)が低中度から重度に活性な狼瘡被検者の所定のバイオマ
ーカー定義群で、第24週にSLEの兆候及び症状、フレア率、及びステロイド負担の改
善を示した。ISM−Highとして予め定義されたより高レベルのIFN誘導性遺伝子
発現を有する患者においては有効性が認められなかった(Kalunianら、2012
ACR/ARHP Annual Meeting;Abstract# 2622,
2012)。
angら、2013;Clinical Pharmacology & Therap
eutics公認記事プレビュー、14 February 2013;doi:10.
1038/clpt.2013.35)。IFNAR1遮断物は、IFN−βを含む全て
のI型IFNによって誘導されたIFNシグナル伝達を消失させる可能性がある。IFN
−βをコードする遺伝子の特異的欠失が、機能的IFN−βを有する同様に曝露されたマ
ウスと比較して、ウイルス宿主に対する実質的な感受性を被るので、IFN−βは、抗ウ
イルス防衛においてより重要な役割を果たすことができる(J Virol 85:71
86〜7194(Lazearら)、J Virol 74(7):3404〜340,
2000(Deonarainら)、Circulation 110:3540〜35
43,2004(Deonarainら)、J Virol 80:3438〜3444
,2006(Gerlachら))。したがって、抗IFNAR1抗体は副作用のリスク
を上昇させ得る。
疫抑制剤、又はB細胞調節剤が挙げられる。これらの治療薬は毒性及び他の深刻な副作用
を示す場合があり、全ての狼瘡患者の治療には適さない場合がある。したがって、狼瘡及
び他の免疫媒介炎症性疾患又は自己免疫疾患に対する更なる治療的処置の必要性が存在す
る。
、4、5、6、7、8、9、10、又は11のヒトインターフェロンアルファ(IFN−
α)サブタイプに結合し、それらの生物活性を中和する、単離されたモノクローナル抗体
である。
3、4、5、6、7、8、9、10、又は11のヒトインターフェロンアルファ(IFN
−α)サブタイプに結合し、それらの活性を中和する、単離されたモノクローナル抗体で
あり、この抗体は、少なくとも約1×10-9M以下、約1×10-10M以下、約5×10-
11M以下、又は約1×10-11M以下のIC50でヒトIFN−ωの生物活性を中和する。
0-10M以下、又は約1×10-10M以下のIC50値で少なくとも3、4、5、6、7、8
、9、10、又は11のヒトIFN−αサブタイプの活性を中和する。
補性決定領域(HCDR)1(HCDR1)、2(HCDR2)、及び3(HCDR3)
のアミノ酸配列、並びに配列番号118、119、及び120の軽鎖相補性決定領域(L
CDR)1(LCDR1)、2(LCDR2)、及び3(LCDR3)のアミノ酸配列を
含む。
19、及び160のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及
びLCDR3のアミノ酸配列を含む。
−αF、IFN−αG、IFN−αH2、IFN−αI、IFN−αJ1、IFN−αK
、IFN−αWA、及びIFN−α4aからなる群から選択される少なくとも10のヒト
IFN−αサブタイプを中和する。
おいて配列番号1のヒトIFNωに結合する。
19、及び162のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及
びLCDR3のアミノ酸配列を含む。
IFN−αB2、IFN−αC、IFN−αF、IFN−αG、IFN−αH2、IFN
−αJ1、及びIFN−α4aを中和する。
3%、94%、95%、96%、97%、98%、又は99%同一の重鎖可変領域(VH
)アミノ酸配列、及び配列番号150と少なくとも90%、91%、92%、93%、9
4%、95%、96%、97%、98%、又は99%同一の軽鎖可変領域(VL)アミノ
酸配列を含む。
を含む。
物である。
チドである。
、宿主細胞によって生成された抗体を回収することとを含む、本発明の抗体の生成方法で
ある。
患者に、前記疾患を治療又は予防するのに十分な時間投与することを含む、免疫媒介炎症
性疾患又は自己免疫性疾患の治療方法である。
疫性血小板減少症(ITP)、エカルディ−グチエール症候群(AGS)、全身性硬化症
、シェーグレン症候群、筋炎、分類不能型免疫不全症(CVID)、自己免疫性甲状腺疾
患、I型糖尿病、関節リウマチ、移植片拒絶反応、又は移植片対宿主病(GVHD)であ
る。
は、完全に記載されているかのように、参照により本明細書に組み込まれる。
意図するものではないと理解すべきである。特に断らないかぎり、本明細書において使用
される全ての技術用語及び科学用語は、本発明が属する技術分野における当業者によって
一般的に理解されているものと同じ意味を有する。
を実施するために使用することができるが、例示となる材料及び方法が本明細書に記載さ
れる。本発明を説明及び特許請求する上で以下の用語が用いられる。
とは、抗体が抗原又は抗原中のエピトープに他の抗原とよりも高い親和性で結合すること
を指す。典型的には、この抗体は、1×10-8M以下(例えば1×10-9M以下、1×1
0-10M以下、1×10-11M以下、又は1×10-12M以下)の解離定数(KD)で抗原又
は抗原中のエピトープに結合し、典型的には、非特異的抗原(例えばBSA、カゼイン)
に結合する場合のKDより少なくとも10倍未満のKDで結合する。解離定数は標準的手法
を用いて測定することができる。しかしながら、抗原又は抗原中のエピトープに特異的に
結合する抗体は、例えばヒト又はサル(例えばカニクイザル(Macaca fascicularis)(
マカクザル(cynomolgus)、シノ(cyno))又はチンパンジー(Pan troglodytes)(チ
ンパンジー(chimpanzee)、チンプ(chimp))といった他の関連抗原、例えば他の種か
らの同一の抗原(相同体)に対して交差反応性を有し得る。抗原又は抗原中のエピトープ
に特異的に結合する抗体は、少なくとも1つのインターフェロンアルファ(IFN−α)
サブタイプ及びインターフェロンオメガ(IFN−ω)などの2つ又は3つ以上の別個の
抗原間で共有されるエピトープに更に結合することができる(即ちIFN−αサブタイプ
及びIFN−ωと交差反応する抗体)。
抗体アンタゴニスト」とは、組み換えヒトインターフェロンオメガ(IFN−ω)及び/
又は少なくとも1つの組み換えヒトインターフェロンアルファ(IFN−α)サブタイプ
の生物活性を部分的に又は完全に阻害する抗体又は抗体断片を指す。中和抗体は、本明細
書に記載するように、IFN−α及び/又はIFN−ωの生物活性のアッセイを用いて特
定することができる。IFN−α及び/又はIFN−ω中和抗体は、測定されるIFN−
α及び/又はIFN−ωの生物活性を20%、30%、40%、50%、60%、70%
、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%又は10
0%阻害することが可能である。
インターフェロンの全ての天然のサブタイプを指す。天然のIFN−αは、構造相同性の
高い別個の遺伝子によってコードされた少なくとも12の密接に関連するタンパク質サブ
タイプからなる(Weissmann and Weber,Prog Nucl Ac
id Res Mol Biol.,33:251,1986;18:805〜816,
1998)。ヒトインターフェロンの命名法は以下のウェブサイトに掲載されている。h
ttp://www_genenames_org/genefamilies/_IF
N.表4は、他のI型IFNに加えて本明細書で使用されるIFN−αサブタイプの配列
を示す。
れるアミノ酸配列及びUniProt受入番号P05000を有するものを指す。ヒトI
FN−ωは、位置80(T80)でのスレオニンからグルタミン酸への置換を有する配列
番号2の変異体を更に含む。
NARに結合する、ヒトインターフェロン−αの全ての天然のサブタイプ、並びにインタ
ーフェロン−β、インターフェロン−ε、インターフェロン−ω、及びインターフェロン
−κの1つのサブタイプを指す。
FNAR2である周知のインターフェロン受容体を指す。IFNAR1及びIFNAR2
のタンパク質配列は、それぞれ配列番号26及び27に示される。IFNAR1の成熟細
胞外ドメインは、配列番号26の残基28〜436の範囲であり、IFNAR2の成熟細
胞外ドメインは、配列番号27の残基27〜243の範囲である。
ヒト、ヒト化、及びキメラモノクローナル抗体を含むモノクローナル抗体、抗体断片、少
なくとも2つの無傷の抗体又は抗体断片から形成される二重特異性抗体又は多重特異性抗
体、二量体の、四量体の、若しくは多量体の抗体、一本鎖抗体、ドメイン抗体、並びに必
要な特異性の抗原識別部を含む免疫グロブリン分子の任意の他の修飾された構成を含む免
疫グロブリン分子を含む。
、IgG、及びIgMの5つの大きなクラスに割り当てることができる。IgA及びIg
Gは、アイソタイプIgA1、IgA2、IgG1、IgG2、IgG3及びIgG4に更に下
位分類される。任意の脊椎動物種の抗体軽鎖は、これらの定常領域のアミノ酸配列に基づ
き、2つの明らかに異なる種類(即ちカッパ(k)及びラムダ(λ))のうちの1つに割
り当てることができる。
鎖相補性決定領域(LCDR)1、2、及び3、重鎖可変領域(VH)、又は軽鎖可変領
域(VL)などの重鎖及び/又は軽鎖抗原結合部位を保有する免疫グロブリン分子の一部
を指す。抗体断片としては、周知のFab、F(ab’)2、Fd、及びFvの断片、並
びに1つのVHドメインからなるドメイン抗体(dAb)が挙げられる。VHドメイン及
びVLドメインは、合成リンカーを介して一緒に連結して様々な種類の一本鎖抗体設計を
形成することができ、VHドメイン及びVLドメインが別々の一本鎖抗体構築物で発現さ
れる場合、VH/VLドメインが分子内又は分子間で対合して、一本鎖Fv(scFv)
又は二重特異性抗体などの一価の抗原結合部位を形成する。これに関しては、例えば国際
公開公報第WO1998/44001号、同第WO1988/01649号、同第WO1
994/13804号、同第WO1992/01047号で説明されている。
。抗原結合部位は、様々な用語を用いて定義される:(i)相補性決定領域(CDR)、
これは、配列変異性に基づいてVH内に3つ(HCDR1、HCDR2、HCDR3)、
及びVL内に3つ(LCDR1、LCDR2、LCDR3)存在する(Wu及びKaba
t,J Exp Med 132:211〜50,1970、Kabatら、Seque
nces of Proteins of Immunological Intere
st,5th Ed.Public Health Service,National
Institutes of Health,Bethesda,Md.,1991)
。(ii)「超可変領域」、「HVR」、又は「HV」が、VH内に3つ(H1、H2、
H3)及びVL内に3つ(L1、L2、L3)存在する。この領域は、抗体可変ドメイン
であり、Chothia and Lesk(Chothia and Lesk,Mo
l.Biol.196:901〜17,1987)により定義される構造において超可変
性である。他の用語には、「IMGT−CDR」(Lefrancら、Dev.Comp
arat.Immunol.27:55〜77,2003)及び「Specificit
y Determining Residue Usage」(SDRU)(Almag
ro,Mol Recognit 17:132〜43,2004)が含まれる。国際免
疫遺伝情報(IMGT)データベース(http://www_imgt_org)は、
抗原結合部位の標準化番号付け及び定義を提供している。CDR、HV、及びIMGTの
表記間の対応については、Lefrancら、Dev.Comparat.Immuno
l.27:55〜77,2003に記載されている。
個体群を指す。モノクローナル抗体は非特異性であっても多重特異性であってもよい。
azikaniら、J Mol Biol 273:927〜48,1997)に準じて
番号付けされた抗体VL残基及びVH残基である。
のを除く、可変領域の残りの配列である。抗原結合部位が上記のような様々な用語によっ
て定義され得るため、フレームワークの正確なアミノ酸配列は抗原結合部位がどのように
定義されるかに依存する。
がヒト免疫グロブリン配列に由来する抗体を指す。ヒト化抗体がフレームワーク領域内に
置換を含む場合があり、それにより、当該フレームワークは、発現したヒト免疫グロブリ
ン又は生殖系列遺伝子配列の正確な複製物でない場合がある。
公開第US2009/0118127号に記載の方法に従って適合されたヒト化抗体を指
す。ヒト適合抗体は、CDR1及びCDR2ループ、並びにCDR3ループの一部の最大
CDRとFRとの類似性、長さ適合性、及び配列類似性に基づいてアクセプターヒトフレ
ームワークを選択することによりヒト化される。
来する重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を有する抗体を指す。抗体が定常領域を含む場合、
定常領域もヒト起源の配列に由来する。
ブリン遺伝子を使用する系から得られた場合のヒト起源の配列に「由来する」重鎖可変領
域又は軽鎖可変領域を含む。そのような例示的な系は、ファージ上に提示されるヒト免疫
グロブリン遺伝子ライブラリ、及び本明細書に記載されるヒト免疫グロブリン遺伝子座を
保有するマウスなど、遺伝子組み換え非ヒト動物を含む。「ヒト抗体」は、例えば天然に
存在する体細胞突然変異又は意図的な置換導入により、ヒト生殖系列又は再編成された免
疫グロブリン配列と比較したとき、アミノ酸の相違を含み得る。典型的には、「ヒト抗体
」は、アミノ酸配列において、ヒト生殖系列又は再編成された免疫グロブリン遺伝子によ
ってコードされるアミノ酸配列と、少なくとも約80%、81%、82%、83%、84
%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94
%、95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一である。いくつかの場
合では、「ヒト抗体」は、例えばKnappikら(2000)J Mol Biol
296:57〜86)に記載されるヒトフレームワーク配列分析から得られたコンセンサ
スフレームワーク配列、又は例えばShiら(2010)J Mol Biol.397
:385〜96,2010、及び国際公開公報第WO2009/085462号に記載さ
れるファージ上に提示されるヒト免疫グロブリン遺伝子ライブラリに組み込まれた合成H
CDR3を含み得る。
が、合成CDR及び/若しくは合成フレームワークを組み込むファージディスプレイなど
の系を用いて生成することができるか、又は抗体特性を改善するためにインビトロ突然変
異誘発に供することができ、インビボでヒト抗体生殖系列レパートリー内に天然に存在し
ない抗体をもたらす。
該ヒト抗体は、発現したヒト免疫グロブリン又は生殖系列遺伝子配列の正確な複製物でな
い場合がある。しかしながら、抗原結合部位が非ヒト種由来である抗体は、「ヒト抗体」
の定義には含まれない。
、又は単離された様々なIFN−αサブタイプ又はIFN−ωなどの抗体及び他のタンパ
ク質を含む。
意味する。エピトープは通常、アミノ酸又は多糖類側鎖のような部分の化学的に活性な(
極性、非極性、又は疎水性など)表面基からなり、特定の3次元構造特性及び特定の電荷
特性を有し得る。エピトープは、立体配座空間単位を形成する連続した及び/又は連続し
ていないアミノ酸からなり得る。連続していないエピトープについて、抗原の直鎖配列の
異なる部分からのアミノ酸は、タンパク質分子の折り畳みを通じて、3次元空間において
近接する。
原内の2つの別個のエピトープに結合する抗体を指す。二重特異性抗体は他の関連抗原と
交差反応性を有してもよく、又は少なくとも1つのIFN−αサブタイプ及びIFN−ω
などの2つ若しくは3つ以上の別個の抗原間で共有されるエピトープに結合してもよい。
に、単独薬剤として同時に、又は単独薬剤として順次に任意の順序で、ヒトなどの動物種
に投与され得ることを意味する。
は、それぞれ、IFN−α及びIFN−ωがその受容体IFNARに結合した結果として
生じる任意の活性を指す。IFN−α及びIFN−ωの1つの生物活性は、シグナル伝達
性転写因子2(STAT2)、インターフェロン調節因子9(IRF9)、及びSEAP
を標準的な方法を用いて安定に発現するHEK293細胞におけるISG54などのイン
ターフェロン誘導性プロモーター下で、分泌胚アルカリホスファターゼ(SEAP)の発
現を誘導するIFN−α及びIFN−ωの能力である。別のIFN−α及びIFN−ωの
生物活性は、本明細書に記載されるように、末梢血単核細胞(PBMC)又は全血からの
ケモカインIP−10(CXCL10)の産生の誘導である。
可能である、ポリヌクレオチドを意味する。ベクターポリヌクレオチドは典型的には、生
物系内でこれらのポリヌクレオチドの複製又は維持を促進するように機能する複製起点、
ポリアデニル化シグナル、又は選択マーカーなどの要素を含んでいる。そのような生物系
の例としては、細胞、ウイルス、動物、植物、及びベクターを複製することができる生物
学的成分を利用して再構成された生物系を挙げることができる。ベクターを構成するポリ
ヌクレオチドは、DNA若しくはRNA分子又はこれらのハイブリッド分子であり得る。
ードされるポリペプチドの翻訳を指示するために、生物系又は再構成生物系において利用
することができるベクターを意味する。
共有結合を介して連結されたヌクレオチド鎖からなる分子を意味する。二本鎖及び一本鎖
DNA及びRNAが、ポリヌクレオチドの典型的な例である。
チドを形成する少なくとも2つのアミノ酸残基を含む分子を意味する。50アミノ酸未満
の小ポリペプチドを「ペプチド」と呼ぶ場合がある。
本発明は、ヒトインターフェロンオメガ(IFN−ω)及び複数のヒトインターフェロ
ンアルファ(IFN−α)のサブタイプ(抗IFN−α/ω抗体)に結合し、その活性を
中和するモノクローナル抗体を提供する。本発明は、少なくとも部分的に、IFN−α単
独の場合と比較して同様の免疫調節効果を有する狼瘡病原におけるINF−ωの役割の理
解に基づく。IFN−ωが、狼瘡患者の血清中に存在し、かつそこで活性であることが判
明しており、IFN−ωが、IFN−αと比較して同様のサイトカイン放出プロファイル
及び遺伝子発現プロファイル、樹状細胞分化、並びにT細胞に依存しないB細胞の活性化
を誘導することが判明しており、これは、IFN−α及びIFN−ωを中和して治療効果
を最大化する理論的根拠の基礎を提供する。本発明は、少なくとも部分的に、本発明のI
FN−α/ω抗体が結合するIFN−ωと複数のIFN−αサブタイプとによって共有さ
れる中和性が最小のエピトープを特定することにも基づく。本発明のIFN−α/ω抗体
は、IFN−ω及び複数のIFN−αサブタイプを中和し得るため、これらは、複数のI
FN−αサブタイプを中和するがIFN−ωは中和しない抗体と比較して、I型IFN及
びIFNシグネチャのSLE関連調製物を中和する上でより効力があり得る。したがって
、本発明の抗体は、狼瘡を含む免疫媒介炎症性疾患又は自己免疫疾患の治療により効果的
であり得る。本発明のIFN−α/ω抗体はIFN−βを中和しないため、全てのI型I
FNを遮断することが予測される抗IFNAR療法と比較して、より好ましい安全性及び
PKプロファイルを有し得る。
の実施形態における本発明の一実施形態は、ヒトインターフェロンオメガ(IFN−ω)
及び少なくとも3、4、5、6、7、8、9、10、又は11のヒトインターフェロンア
ルファ(IFN−α)サブタイプに結合し、それらの生物活性を中和する、単離されたモ
ノクローナル抗体である。
の各々のいくつかの実施形態では、ヒトIFN−ωの活性が、シグナル伝達性転写因子2
(STAT2)、インターフェロン調節因子9(IRF9)、及びSEAP(本明細書で
説明する「ISREアッセイ」)を安定に発現するHEK293細胞におけるインターフ
ェロン誘導性ISG54プロモーター下での分泌胚アルカリホスファターゼ(SEAP)
のヒトIFN−ωによって誘導された発現である場合、本発明の抗体は、少なくとも約1
×10-9M以下、約1×10-10M以下、約5×10-11M以下、又は約1×10-11M以
下のIC50でヒトIFN−ωの活性を中和する。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、IFN−ω、並びにIFN−αA、
IFN−αB2、IFN−αC、IFN−αF、IFN−αG、IFN−αH2、IFN
−αI、IFN−αJ1、IFN−αK、IFN−αWA、及びIFN−α4aからなる
群から選択される少なくとも3、4、5、6、7、8、9、10、又は11のヒトインタ
ーフェロンアルファ(IFN−α)サブタイプを中和する。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、IFN−ω、並びにIFN−αA、
IFN−αH2、及びIFN−αKを中和する。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、IFN−ω、並びにIFN−αA、
IFN−αG、IFN−αH2、及びIFN−αKを中和する。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、IFN−ω、並びにIFN−αF、
IFN−αG、IFN−αH2、及びIFN−αKを中和する。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、IFN−ω、並びにIFN−αA、
IFN−αF、IFN−αG、IFN−αH2、及びIFN−αKを中和する。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、IFN−ω、並びにIFN−αA、
IFN−αF、IFN−αG、IFN−αH2、IFN−αJ1、及びIFN−αKを中
和する。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、IFN−ω、並びにIFN−αA、
IFN−αB、IFN−αG、IFN−αH2、及びIFN−αKを中和する。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、IFN−ω、並びにIFN−αA、
IFN−αB、IFN−αF、IFN−αG、IFN−αH2、及びIFN−αKを中和
する。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、IFN−ω、並びにIFN−αA、
IFN−αB、IFN−αC、IFN−αG、IFN−αH2、及びIFN−αKを中和
する。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、IFN−ω、並びにIFN−αA、
IFN−αB、IFN−αC、IFN−αF、IFN−αG、及びIFN−α4aを中和
する。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、IFN−ω、並びにIFN−αA、
IFN−αB、IFN−αF、IFN−αG、IFN−αH2、IFN−αI、及びIF
N−αKを中和する。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、IFN−ω、並びにIFN−αA、
IFN−αB、IFN−αF、IFN−αG、IFN−αH2、IFN−αJ1、及びI
FN−αKを中和する。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、IFN−ω、並びにIFN−αA、
IFN−αB、IFN−αC、IFN−αF、IFN−αG、IFN−αH2、IFN−
αJ1、及びIFN−αKを中和する。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、IFN−ω、並びにIFN−αA、
IFN−αB、IFN−αC、IFN−αF、IFN−αG、IFN−αH2、IFN−
αI、IFN−αJ1、IFN−αK、及びIFN−α4aを中和する。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、IFN−ω、並びにIFN−αA、
IFN−αB、IFN−αC、IFN−αF、IFN−αG、IFN−αH2、IFN−
αI、IFN−αJ1、IFN−αWA、及びIFN−α4aを中和する。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、IFN−ω、並びにIFN−αA、
IFN−αB、IFN−αC、IFN−αF、IFN−αG、IFN−αH2、IFN−
αJ1、IFN−αK、IFN−αWA、及びIFN−α4aを中和する。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、IFN−ω、並びにIFN−αA、
IFN−αB、IFN−αC、IFN−αF、IFN−αG、IFN−αH2、IFN−
αI、IFN−αJ1、IFN−αK、IFN−αWA、及びIFN−α4aを中和する
。
の実施形態における本発明の抗体は、IFN−ωを中和することに加えて、少なくとも3
、4、5、6、7、8、9、10、又は11のヒトインターフェロンアルファ(IFN−
α)サブタイプに結合し、これらを中和し得る。これらのIFN−αサブタイプ及びIF
N−ωは、標準的な方法を使用した組み換え発現によって産生することができる。分泌を
指示するために使用され得る例示的なシグナル配列は、配列番号21〜25に示される。
の実施形態における本発明の抗体のIFN−α及びIFN−ωを中和する能力は、インタ
ーフェロン応答性プロモーター下でレポーター遺伝子を発現する細胞株を使用して種々の
IFN−αサブタイプ及び/又はIFN−ωで細胞を刺激するレポーター遺伝子アッセイ
で試験することができる。例えば、完全に活性なI型IFNシグナル伝達経路を発現する
(STAT2及びIRF9を安定に発現する)ように設計され、IFN−α/β誘導性I
SG54プロモーターの制御下で、SEAPレポーター遺伝子でトランスフェクトされた
HEK−Blue(商標)IFN−α/β細胞(InvivoGen(San Dieg
o,CA)を、本明細書に記載したように使用することができる。周知の方法を用いて、
アルカリホスファターゼからのシグナルは検出可能であり、阻害に関するIC50は計算可
能である。
の各々のいくつかの実施形態では、ヒトIFN−ωの生物活性が本明細書の実施例1に記
載されるように、アッセイ「ISREレポーター遺伝子アッセイ」を用いて、シグナル伝
達性転写因子2(STAT2)、インターフェロン調節因子9(IRF9)、及びSEA
Pを安定に発現するHEK293細胞におけるインターフェロン誘導性ISG54プロモ
ーター下での分泌胚アルカリホスファターゼ(SEAP)発現の阻害である場合、本発明
の抗体は、約1×10-9M以下、約1×10-10M以下、約5×10-11M以下、又は約1
×10-11M以下のIC50値でヒトIFN−ωの生物活性を中和する。
の各々のいくつかの実施形態では、IC50が本明細書に記載の「ISREレポーター遺伝
子アッセイ」で測定されるとき、本発明の抗体は、少なくとも約1×10-10M以下のI
C50値でヒトIFN−ωの生物活性を中和する。
の各々のいくつかの実施形態では、IC50が本明細書に記載の「ISREレポーター遺伝
子アッセイ」で測定されるとき、本発明の抗体は、約1×10-10M〜約6×10-12Mの
IC50値でヒトIFN−ωの生物活性を中和する。当業者であれば、ISREレポーター
遺伝子アッセイのアッセイ偏差が、典型的にはおよそ約0.28(log(M))のpI
C50の範囲内であり得ることを理解するであろう。したがって、用語「約」は、アッセイ
における典型的な標準偏差を表す。例えば、1×10-9MのIC50の典型的なSDは、約
0.53×10-9〜1.9×10-9である。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、少なくとも約2×10-10M以下、
約1.5×10-10M以下、又は約1×10-10M以下のIC50値で少なくとも3、4、5
、6、7、8、9、10、又は11のヒトIFN−αサブタイプにおける生物活性を中和
する。
の各々のいくつかの実施形態では、IC50が本明細書に記載の「ISREレポーター遺伝
子アッセイ」を用いて測定されるとき、本発明の抗体は、少なくとも約1×10-10M以
下のIC50値でヒトIFN−ωの活性、及び約2×10-10M以下、約1.5×10-10M
以下、又は約1×10-10M以下のIC50値で少なくとも6のヒトIFN−αサブタイプ
の活性を中和する。
の各々のいくつかの実施形態では、IC50が本明細書に記載の「ISREレポーター遺伝
子アッセイ」を用いて測定されるとき、本発明の抗体は、少なくとも約1×10-10M以
下のIC50でヒトIFN−ωの活性、及び約2×10-10M以下、約1.5×10-10M以
下、又は約1×10-10M以下のIC50値で少なくとも10のヒトIFN−αサブタイプ
の活性を中和する。
の各々のいくつかの実施形態では、IC50が本明細書に記載の「ISREレポーター遺伝
子アッセイ」を用いて測定されるとき、本発明の抗体は、少なくとも約1×10-10M以
下のIC50でヒトIFN−ωの活性、及び約1×10-10M以下のIC50値で少なくとも
6のヒトIFN−αサブタイプの活性を中和する。
の各々のいくつかの実施形態では、IC50が本明細書に記載の「ISREレポーター遺伝
子アッセイ」を用いて測定されるとき、本発明の抗体は、少なくとも約1×10-10M以
下のIC50でヒトIFN−ωの活性、及び約1×10-10M以下のIC50値で少なくとも
10のヒトIFN−αサブタイプの活性を中和する。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、250U/mlのインターフェロン
によって誘導された全血中の白血球インターフェロンによって誘導されたIP−10放出
を、10μg/mlの抗体の存在下では抗体の不在下と比較して約50%以上阻害する。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、全血中の全身性紅斑性狼瘡(SLE
)免疫複合体によって誘導されたIP−10放出を、10μg/mlの抗体の存在下では
抗体の不在下と比較して約50%以上阻害する。
の実施形態における本発明の抗体は、IFNによって誘導された末梢血単核細胞(PBM
C)又は全血からのIP−10放出などのIFNによって誘導されたサイトカイン放出を
阻害する能力を評価することによってその中和能力を試験することができる。例えば、P
BMCは、試験されるIFN及び抗体の予め形成された複合体で処置した標準的なプロト
コルを使用して健常ボランティアからのヘパリン化全血から単離され、IP−10の放出
は、Milliplexサイトカイン/ケモカインキット(Millipore、Pre
mixed 39 plex)のような標準的な方法を使用して測定される。本発明の抗
体は、抗体の不在下でのIFNによって誘導されたIP−10放出と比較して、IP−1
0放出を少なくとも30%、40%、50%、60%、70%、75%、80%、85%
、90%、95%、96%、97%、98%、99%、又は100%阻害することができ
る。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、約1×10-10M以下、約5×10-
11M以下、約1×10M-11以下、又は約5×10-12M以下の解離定数(KD)でヒトI
FN−ωに結合する。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、IFN−ω、並びに約5×10-10
M以下、約1×10-10M以下、約5×10-11M以下、約1×10-11M以下、又は約5
×10-12M以下のKDを有するIFN−αA、IFN−αB2、IFN−αC、IFN−
αF、IFN−αG、IFN−αH2、IFN−αI、IFN−αJ1、IFN−αK、
IFN−αWA、及びIFN−α4aからなる群から選択される少なくとも3、4、5、
6、7、8、9、10、又は11のヒトインターフェロンアルファ(IFN−α)サブタ
イプに結合する。
法を用いて実験により決定することができる。そのような方法では、ProteOn X
PR36、Biacore 3000、若しくはKinExA装置、ELISA、又は当
業者に周知の競合的結合アッセイを利用することができる。特定の抗原/IFN−ω又は
IFN−αサブタイプの相互作用の測定された親和力は、異なる条件(例えば、容量オス
モル濃度、pH)下で測定したときに様々であり得る。したがって、親和性及び他の結合
パラメータ(例えば、KD、Kon、Koff)の測定は、好ましくは標準化条件及び例えば本
明細書に記載の緩衝液などの標準化緩衝液を用いて行われる。当業者であれば、例えばB
iacore 3000又はProteOnを用いた親和性測定での内部エラー(標準偏
差(SD)として測定されるもの)が典型的には、典型的な検出範囲内で測定した場合、
5〜33%の範囲内であり得ることを理解するであろう。したがって、用語「約」は、ア
ッセイにおける典型的な標準偏差を表す。例えば、KDが1×10-9Mの場合の典型的な
SDは、最大±0.33×10-9Mである。
は、ヒトIFN−ω及び/又はIFN−αサブタイプでパニングすることによって、かつ
任意に更なる抗体親和性成熟によって、変異体又は断片のライブラリから選択され得る。
一例示的なパニングキャンペーンでは、ファージライブラリを逐次的に、又はチンパンジ
ーIFN−ω並びにヒトIFN−αサブタイプのIFN−α2、IFN−α1、IFN−
αH2、IFN−αG、及びIFN−αFの混合物を用いてパニングしてもよい。あるい
は、本発明の抗体は、チンパンジー及びマカクザル(cynomolgus)IFN−ω、ヒトIF
N−αサブタイプのIFN−αD、IFN−αJ1、IFN−αC、IFN−αB2、I
FN−αH2、IFN−αA、IFN−α4a、IFN−αG、IFN−αF、IFN−
αWA、及びIFN−αIでマウスを免疫して、IFN−ω及び様々なIFN−αサブタ
イプへの結合のためにそのハイブリオーマ(hybriomas)をスクリーニングし、続いて本
明細書で説明する方法を用いて抗体の中和能力を評価することによって生成してもよい。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、それぞれ配列番号109、114、
及び121の重鎖相補性決定領域(HCDR)1(HCDR1)、2(HCDR2)、及
び3(HCDR3)のアミノ酸配列、並びに配列番号118、119、及び120の軽鎖
相補性決定領域(LCDR)1(LCDR1)、2(LCDR2)、及び3(LCDR3
)のアミノ酸配列を含む。
10、IFWM3322、IFWM3385、IFWM3416、IFWM3310、I
FWM3400、IFWM3321、IFWM3522、IFWM3524、IFWM3
320、IFWM3304、IFWM3520、IFWM3399、IFWM3314、
IFWM3331、IFWM3405、IFWM3442、IFWM3525、IFWM
3423、IFWM3444、及びIFWM3421である。これらの抗体は、約1×1
0-10 M以下のIC50値でヒトIFN−ω及び少なくとも3つのIFN−αサブタイプ
を中和し、LCDR1(配列番号118)、LCDR2(配列番号119)、LCDR3
(配列番号120)、HCDR2(配列番号114)、及びHCDR3(配列番号121
)のコンセンサスアミノ酸配列、並びにHCDR1(配列番号109)の定常(constant
)アミノ酸配列を含む。少なくとも配列番号28、31、157、又は158のVH残基
位置103、配列番号35、39、40、42、46、52、53、54、71、73、
75、又は135のVL残基位置30、31、32、50、91〜94、又は96、並び
に配列番号57、61、62、68、及び150のVL残基位置30、31、32、50
、51、92〜95、又は97に置換を有する抗体は、親IFWM371抗体と比較して
改善された効力を有する抗体をもたらした。
QSIX1X2X3X4、[式中、
X1はG、D、A、R、E、S、又はNであり、
X2はD、G、N、S、R、E、又はKであり、
X3はF、A、N、T、S、又はVであり、
X4はY、Nであるか、又は欠失している]。
X5AS、[式中、
X5はF、W、又はGである]。
QQX6X7X8X9PX10T、[式中、
X6はA、G、S、又はWであり、
X7はL、Y、H、W、F、又はIであり、
X8はD、又はSであり、
X9は、F、T、L、N、又はWであり、
X10はL、F、又はIである]。
IX11X12SDSDT、[式中、
X11はD、又はAであり、
X12はP、又はAである]。
ARHPGLX13WAPDFDY、[式中、
X13はA、又はNである]。
GYSFTSYW
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、それぞれ配列番号109、114、
121、159、119、及び160のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR
1、LCDR2、及びLCDR3のアミノ酸配列を含む。
22、IFWM3524、IFWM3320、IFWM3304、IFWM3520、I
FWM3399、IFWM3314、IFWM3331、IFWM3405、IFWM3
442、IFWM3525、IFWM3423、IFWM3444、及びIFWM342
1である。これらの抗体は、約1×10-10M以下のIC50値でヒトIFN−ω及び少な
くとも6つのIFN−αサブタイプを中和し、LCDR1(配列番号159)、LCDR
2(配列番号119)、LCDR3(配列番号160)、HCDR2(配列番号114)
、及びHCDR3(配列番号121)のコンセンサスアミノ酸配列、並びにHCDR1(
配列番号109)の定常アミノ酸配列を含む。
QSIX14X15X16X17、[式中、
X14はG、D、A、E、S、又はNであり、
X15はD、G、N、S、R、又はRであり、
X16はF、A、N、S、又はVであり、
X17はY、Nであるか、又は欠失している]。
QQX18X19X20X21PX22T、[式中、
X18はA、G、又はSであり、
X19は、Y、H、W、又はFであり、
X20はD、又はSであり、
X21は、F、T、L、又はWであり、
X22はL、F、又はIである]。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、それぞれ配列番号109、114、
121、161、119、及び162のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR
1、LCDR2、及びLCDR3のアミノ酸配列を含む。
25、IFWM3423、IFWM3444、及びIFWM3421である。これらの抗
体は、少なくとも約2×10-10M以下、約1.5×10-10M以下、又は約1×10-10
M以下のIC50値でヒトIFN−ω及び少なくとも10のIFN−αサブタイプを中和し
、LCDR1(配列番号161)、LCDR2(配列番号119)、LCDR3(配列番
号162)、HCDR2(配列番号114)、及びHCDR3(配列番号121)のコン
センサス配列、並びにHCDR1(配列番号109)の一定のアミノ酸配列を含む。
QSIX23X24X25X26、[式中、
X23はA、又はDであり、
X24はN、又はGであり、
X25はF、N、又はSであり、
X26はY、Nであるか、又は欠失している]。
QQX27X28X29X30PX31T、[式中、
X27はG、又はSであり、
X28は、Yであり、
X29はDであり、
X30はF、T、又はLであり、
X31はL、F、又はIである]。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、ヒトIFN−ω、並びにIFN−α
A、IFN−αB2、IFN−αC、IFN−αF、IFN−αG、IFN−αH2、I
FN−αI、IFN−αJ1、IFN−αK、IFN−αWA、及びIFN−α4aから
なる群から選択される少なくとも10のヒトIFN−αサブタイプを中和する。
実施形態の各々のいくつかの実施形態では、本抗体は、ヒトIFN−ω、並びに少なくと
もヒトIFN−αサブタイプのIFN−αA、IFN−αB2、IFN−αC、IFN−
αF、IFN−αG、IFN−αH2、IFN−αJ1、及びIFN−α4aを中和する
。
実施形態の各々のいくつかの実施形態では、本抗体は、IFN−αD又はIFN−α1に
結合せず、又はこれを中和しない。
実施形態の各々のいくつかの実施形態では、本抗体は、IFN−βに結合せず、又はこれ
を中和しない。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、
配列番号109のHCDR1アミノ酸配列、
配列番号111、112、又は113のHCDR2アミノ酸配列、
配列番号115、又は116のHCDR3アミノ酸配列、
配列番号76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87
、88、89、90、又は91のLCDR1アミノ酸配列、
配列番号93、94、又は95のLCDR2アミノ酸配列、及び
配列番号96、97、98、99、100、101、102、103、104、105
、106、又は107のLCDR3アミノ酸配列を含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号
a)それぞれ109、113、116、77、93、及び104、
b)それぞれ109、113、116、85、93、及び96、
c)それぞれ109、113、115、79、95、及び107、
d)それぞれ109、113、116、76、93、及び103、
e)それぞれ109、113、115、85、93、及び96、
f)それぞれ109、113、115、89、95、及び100、
g)それぞれ109、113、116、86、93、及び105、
h)それぞれ109、113、115、76、93、及び103、
i)それぞれ109、113、116、80、93、及び97、
j)それぞれ109、113、116、84、93、及び97、
k)それぞれ109、113、116、90、93、及び97、
l)それぞれ109、113、116、88、93、及び102、
m)それぞれ109、113、116、87、93、及び105、
n)それぞれ109、113、116、91、93、及び106、
o)それぞれ109、113、115、80、93、及び97、
p)それぞれ109、113、116、83、93、及び101、
q)それぞれ109、113、116、82、94、及び98、
r)それぞれ109、113、115、78、95、及び100、
s)それぞれ109、111、116、81、93、及び106、
t)それぞれ109、113、116、82、94、及び99、
u)それぞれ109、113、115、81、93、及び106、
v)それぞれ109、112、116、81、93、及び106、又は
w)それぞれ109、113、116、81、93、及び106のHCDR1、HCD
R2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3アミノ酸配列を含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、それぞれ配列番号109、113、
116、77、93、及び104のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、
LCDR2、及びLCDR3のアミノ酸配列を含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、それぞれ配列番号109、113、
116、85、93、及び96のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、L
CDR2、及びLCDR3のアミノ酸配列を含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、それぞれ配列番号109、113、
115、79、95、及び107のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、
LCDR2、及びLCDR3のアミノ酸配列を含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、それぞれ配列番号109、113、
116、76、93、及び103のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、
LCDR2、及びLCDR3のアミノ酸配列を含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、それぞれ配列番号109、113、
115、85、93、及び96のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、L
CDR2、及びLCDR3のアミノ酸配列を含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、それぞれ配列番号109、113、
115、89、95、及び100のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、
LCDR2、及びLCDR3のアミノ酸配列を含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、それぞれ配列番号109、113、
116、86、93、及び105のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、
LCDR2、及びLCDR3のアミノ酸配列を含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、それぞれ配列番号109、113、
115、76、93、及び103のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、
LCDR2、及びLCDR3のアミノ酸配列を含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、それぞれ配列番号109、113、
116、80、93、及び97のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、L
CDR2、及びLCDR3のアミノ酸配列を含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、それぞれ配列番号109、113、
116、84、93、及び97のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、L
CDR2、及びLCDR3のアミノ酸配列を含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、それぞれ配列番号109、113、
116、90、93、及び97のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、L
CDR2、及びLCDR3のアミノ酸配列を含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、それぞれ配列番号109、113、
116、88、93、及び102のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、
LCDR2、及びLCDR3のアミノ酸配列を含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、それぞれ配列番号109、113、
116、87、93、及び105のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、
LCDR2、及びLCDR3のアミノ酸配列を含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、それぞれ配列番号109、113、
116、91、93、及び106のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、
LCDR2、及びLCDR3のアミノ酸配列を含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、それぞれ配列番号109、113、
115、80、93、及び97のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、L
CDR2、及びLCDR3のアミノ酸配列を含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、それぞれ配列番号109、113、
116、83、93、及び101のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、
LCDR2、及びLCDR3のアミノ酸配列を含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、それぞれ配列番号109、113、
116、82、94、及び98のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、L
CDR2、及びLCDR3のアミノ酸配列を含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、それぞれ配列番号109、113、
115、78、95、及び100のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、
LCDR2、及びLCDR3のアミノ酸配列を含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、それぞれ配列番号109、111、
116、81、93、及び106のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、
LCDR2、及びLCDR3のアミノ酸配列を含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、それぞれ配列番号109、113、
116、82、94、及び99のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、L
CDR2、及びLCDR3のアミノ酸配列を含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、それぞれ配列番号109、113、
115、81、93、及び106のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、
LCDR2、及びLCDR3のアミノ酸配列を含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、それぞれ配列番号109、112、
116、81、93、及び106のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、
LCDR2、及びLCDR3のアミノ酸配列を含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、それぞれ配列番号109、113、
116、81、93、及び106のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、
LCDR2、及びLCDR3のアミノ酸配列を含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本抗体は、VH及びVLを含み、このVHは、配列番
号28、31、157、又は158のアミノ酸配列を含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本抗体は、VH及びVLを含み、このVLは、配列番
号35、39、40、42、46、52、53、54、57、61、62、68、71、
73、75、135、又は150のアミノ酸配列を含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本抗体は、配列番号28、31、157、又は158
のVH、及び配列番号35、39、40、42、46、52、53、54、57、61、
62、68、71、73、75、135、又は150のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28及び40、28及び3
9、31及び62、28及び54、31及び39、31及び68、28及び42、31及
び54、28及び53、28及び73、28及び75、28及び52、28及び35、2
8及び135、31及び53、28及び46、28及び61、31及び57、157及び
71、28及び150、31及び71、158及び71、又は28及び71のVH及びV
Lを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本抗体は、VH及びVLを含み、このVHは、配列番
号28、30、31、157、又は158のアミノ酸配列を含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本抗体は、配列番号28、30、31、157、又は
158のHCDR1、HCDR2、及びHCDR3アミノ酸配列、並びに配列番号29、
32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、4
5、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58
、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、
73、74、75、123、124、125、126、127、128、129、130
、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140
、141、142、143、144、145、146、147、74、148、149、
150、151、152、又は153のVLのLCDR1、LCDR2、及びLCDR3
アミノ酸配列を含み、これらのCDRは、Kabat、Chothia、及び/又はIM
GTに従って定義される。
の各々のいくつかの実施形態では、本抗体は、VH及びVLを含み、このVLは、配列番
号29、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、
44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、5
7、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70
、71、73、74、75、123、124、125、126、127、128、129
、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139
、140、141、142、143、144、145、146、147、74、148、
149、150、151、152、又は153のアミノ酸配列を含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、VH及びVLを含み、このVHは、
配列番号28、30、31、157、又は158のアミノ酸配列を含み、VLは配列番号
29、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、4
4、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57
、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、
71、73、74、75、123、124、125、126、127、128、129、
130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、
140、141、142、143、144、145、146、147、74、148、1
49、150、151、152、又は153のアミノ酸配列を含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号2
9のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号3
2のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号3
3のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号3
4のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号3
5のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号3
6のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号3
7のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号3
8のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号3
9のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号4
0のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号4
1のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号4
2のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号4
3のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号4
4のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号4
5のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号4
6のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号4
7のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号4
8のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号4
9のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号5
0のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号5
1のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号5
2のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号5
3のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号5
4のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号5
5のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号5
6のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号5
7のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号5
8のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号5
9のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号6
0のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号6
1のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号6
2のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号6
3のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号6
4のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号6
5のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号6
6のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号6
7のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号6
8のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号6
9のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号3
2のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号3
3のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号3
4のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号3
5のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号3
6のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号3
7のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号3
8のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号3
9のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号4
0のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号4
1のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号4
2のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号4
3のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号4
4のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号4
5のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号4
6のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号4
7のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号4
8のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号4
9のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号5
0のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号5
1のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号5
2のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号5
3のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号5
4のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号5
6のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号5
7のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号5
8のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号5
9のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号6
0のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号6
1のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号6
2のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号6
3のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号6
4のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号6
5のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号6
6のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号6
7のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号6
8のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号6
9のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号3
2のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号3
3のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号3
4のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号3
5のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号3
6のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号3
7のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号3
8のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号3
9のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号4
0のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号4
1のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号4
2のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号4
3のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号4
4のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号4
5のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号4
6のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号4
7のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号4
8のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号4
9のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号5
0のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号5
1のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号5
2のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号5
3のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号5
4のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号5
6のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号5
7のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号5
8のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号5
9のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号6
0のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号6
1のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号6
2のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号6
3のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号6
5のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号6
6のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号6
7のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号6
8のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号6
9のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号7
0のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号7
0のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号30のVH及び配列番号7
0のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号7
1のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号31のVH及び配列番号7
1のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号1
23のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号1
24のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号1
25のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号1
26のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号1
27のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号1
28のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号1
29のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号1
30のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号1
31のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号1
32のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号1
33のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号1
34のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号1
35のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号1
36のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号1
37のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号1
38のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号1
39のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号1
40のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号1
41のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号7
3のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号1
42のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号1
43のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号7
4のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号7
5のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号1
44のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号1
45のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号1
46のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号1
47のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号1
48のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号1
49のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号1
50のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号1
51のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号1
52のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号28のVH及び配列番号1
53のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号157のVH及び配列番号
71のVLを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号158のVH及び配列番号
71のVLを含む。
を含む本発明の抗IFN−ω/a抗体の変異体は、本発明の範囲内である。例えば、変異
体は、VH及び/又はVL中に抗体の特性に悪影響を及ぼさない1、2、3、4、5、6
、7、8、9、10、又は11のアミノ酸置換を含み得る。いくつかの実施形態では、配
列同一性は、本発明のVH又はVLアミノ酸配列の約90%、91%、92%、93%、
94%、95%、96%、97%、98%、又は99%であり得る。同一性パーセントは
、例えばペアワイズアライメントによって、Vector NTI.9.0.0(Inv
itrogen,Carslbad、CA)のAlignXモジュールのデフォルト設定
を用いて決定することができる。例示的な修飾は、例えば、抗体の特性に不利な改変を加
えることのない、抗原結合部位又はフレームワーク内での保存的アミノ酸置換である。保
存的置換は、例えば安定性又は親和性といった抗体の特性を向上させるためにも行われ得
る。保存的置換とは、それらの側鎖が関連するアミノ酸ファミリー内で起こる置換である
。遺伝的にコードされるアミノ酸は、4つのファミリーに分類することができる:(1)
酸性(アスパラギン酸塩、グルタミン酸塩);(2)塩基性(リジン、アルギニン、ヒス
チジン);(3)非極性(アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェ
ニルアラニン、メチオニン、トリプトファン);及び(4)非荷電極性(グリシン、アス
パラギン、グルタミン、システイン、セリン、トレオニン、チロシン)。フェニルアラニ
ン、トリプトファン、及びチロシンは、時に、芳香族アミノ酸として共に分類される。あ
るいは、アミノ酸のレパートリーを、(1)酸性(アスパラギン酸塩、グルタミン酸塩)
;(2)塩基性(リジン、アルギニン、ヒスチジン)、(3)脂肪族(グリシン、アラニ
ン、バリン、ロイシン、イソロイシン、セリン、トレオニン)、ただしセリン及びトレオ
ニンは、任意に脂肪族−ヒドロキシルとして個別にグループ分けされる;(4)芳香族(
フェニルアラニン、チロシン、トリプトファン);(5)アミド(アスパラギン、グルタ
ミン);及び(6)イオウ含有(システイン及びメチオニン)(Stryer(ed.)
,Biochemistry,2nd ed,WH Freeman and Co.,
1981)としてグループ分けすることができる。更に、ポリペプチド中のいずれの天然
残基も、アラニンスキャニング突然変異誘発法に関して上述したように、アラニンと置換
することができる(MacLennanら、(1998)Acta Physiol.S
cand.Suppl.643:55〜67、Sasakiら、(1998)Adv.B
iophys.35:1〜24)。当業者であれば、所望のアミノ酸置換を、そのような
置換が望ましい時点で決定することができる。結果として得られた抗体変異体は、本明細
書に記載するアッセイを用いてその特性を試験することができる。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗IFN−α/ω抗体は、配列番号28と少
なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、
又は99%同一の重鎖可変領域(VH)アミノ酸配列、及び配列番号71と少なくとも9
0%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、又は99%
同一の軽鎖可変領域(VL)アミノ酸配列を含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗IFN−α/ω抗体は、配列番号28と少
なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、
又は99%同一の重鎖可変領域(VH)アミノ酸配列、及び配列番号150と少なくとも
90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、又は99
%同一の軽鎖可変領域(VL)アミノ酸配列を含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗IFN−α/ω抗体は、配列番号28と少
なくとも95%同一の重鎖可変領域(VH)アミノ酸配列、及び配列番号71と少なくと
も95%同一の軽鎖可変領域(VL)アミノ酸配列を含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗IFN−α/ω抗体は、配列番号28と少
なくとも95%同一の重鎖可変領域(VH)アミノ酸配列、及び配列番号150と少なく
とも95%同一の軽鎖可変領域(VL)アミノ酸配列を含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗IFN−α/ω抗体は、配列番号28と少
なくとも97%同一の重鎖可変領域(VH)アミノ酸配列、及び配列番号71と少なくと
も97%同一の軽鎖可変領域(VL)アミノ酸配列を含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗IFN−α/ω抗体は、配列番号28と少
なくとも97%同一の重鎖可変領域(VH)アミノ酸配列、及び配列番号150と少なく
とも97%同一の軽鎖可変領域(VL)アミノ酸配列を含む。
って行うことができる。あるいは、変異体のライブラリは、既知の方法、例えば、ランダ
ムコドン(NNK)又は非ランダムコドン、例えば11個のアミノ酸(Ala、Cys、
Asp、Glu、Gly、Lys、Asn、Arg、Ser、Tyr、Trp)をコード
するDVKコドンを用いて、続いて所望の特性を有する変異体のライブラリをスクリーニ
ングすることによって生成することができる。
領域を有しているが、当業者であれば、代替的な実施形態が、1つの重鎖又は軽鎖の可変
領域を有してもよいとことを認識するであろう。単一の可変領域を用いて、例えばヒトI
FN−ω又は様々なヒトIFN−αサブタイプに結合することができる2ドメイン特異的
抗原結合断片を形成することができる可変ドメインをスクリーニングすることができる。
このスクリーニングは、例えば、国際公開公報第WO92/01047号に開示される階
層的二重コンビナトリアルアプローチを用いたファージディスプレイスクリーニング法に
よって実現され得る。このアプローチでは、H鎖クローン又はL鎖クローンのいずれかを
含む個別のコロニーを用いて、他方の鎖(L又はH)をコードするクローンの完全なライ
ブラリに感染させ、結果として得られた2鎖特異的抗原結合ドメインを記載されるような
ファージディスプレイ法に基づいて選択する。したがって、個別のVH及びVLポリペプ
チド鎖は、国際公開公報第WO92/01047号に開示される方法を用いて、ヒトIF
N−ω又は様々なIFN−αサブタイプに特異的に結合する追加の抗体を特定するのに有
用である。
えば、Kohler及びMilsteinのハイブリドーマ法(Nature 256:
495,1975)を用いてモノクローナル抗体を生成することができる。ハイブリドー
マ法においては、マウス又はハムスター、ラット、若しくはサルなどの他の宿主動物を、
ヒトIFN−ω及び/又は様々なIFN−αサブタイプ若しくはこれらのタンパク質の断
片で免疫化し、続いて標準的な方法を用いて免役化した動物からの脾臓細胞と骨髄腫細胞
とを融合させてハイブリドーマ細胞を形成する(Goding,Monoclonal
Antibodies:Principles and Practice,pp.59
〜103(Academic Press,1986))。1個の不死化したハイブリド
ーマ細胞から発生したコロニーを、結合特異性、交差反応性又はその欠如、及び抗原の親
和性などの所望の特性を有する抗体の生成についてスクリーニングする。
ば、Balb/cマウスを用いて、マウス抗ヒトIFN−α/ω抗体を生成することがで
きる。Balb/cマウス及び他の非ヒト動物において作製された抗体は、よりヒト様の
配列を生成するために、様々な技術を用いてヒト化することができる。ヒトアクセプター
フレームワークの選択を含む例示的なヒト化技術は当業者に既知であり、これにはCDR
グラフト法(米国特許第5,225,539号)、SDRグラフト法(米国特許第6,8
18,749号)、リサーフェーシング法(Padlan,Mol Immunol 2
8:489〜499,1991)、特異性決定残基リサーフェーシング法(米国特許出願
公開第20100261620号)、ヒト適合(又はヒトフレームワーク適合)(米国特
許公開第US2009/0118127号)、超ヒト化(米国特許第7,709,226
号)、及びガイド選択法(Osbournら、(2005)Methods 36:61
〜68,2005;U.S.Pat.No.5,565,332)が含まれる。
/22653号で説明される開示などの技術により、結合親和性を維持するために改変し
たフレームワーク支持残基を組み込むことによって(逆突然変異)、所望の抗原に対する
それらの選択性又は親和性を向上させるように更に最適化することができる。
使用して、標的タンパク質に対してヒト抗体を生成することができ、これは例えば、国際
公開公報第WO90/04036号、米国特許第6150584号、国際公開公報第WO
99/45962号、国際公開公報第WO02/066630号、国際公開公報第WO0
2/43478号、Lonbergら、Nature 368:856〜9,1994、
Greenら(1994)Nature Genet.7:13〜21;Green &
Jakobovits(1998)Exp.Med.188:483〜95;Lonb
erg and Huszar(1995)Int.Rev.Immunol.13:6
5〜93;Bruggemannら(1991)Eur.J.Immunol.21:1
323〜1326;Fishwildら(1996)Nat.Biotechnol.1
4:845〜851;Mendezら(1997)Nat.Genet.15:146〜
156;Green(1999)J.Immunol.Methods 231:11〜
23;Yangら(1999)Cancer Res.59:1236〜1243;Br
uggemann及びTaussig(1997)Curr.Opin.Biotech
nol.8:455〜458;国際公開公報第WO02/043478号)に記載される
。そのようなマウスにおける内因性免疫グロブリン遺伝子座は、破壊又は欠失されてもよ
く、相同又は非相同組み換え、導入染色体、又はミニ遺伝子を使用して、少なくとも1つ
の完全な又は部分的なヒト免疫グロブリン遺伝子座をマウスゲノム内に挿入することがで
きる。Regeneron(http://_www_regeneron_com)、
Harbour Antibodies(http://_www_harbouran
tibodies_com)、Open Monoclonal Technology
,Inc.(OMT)(http://_www_omtinc_net)、KyMab
(http://_www_kymab_com)、Trianni(http://_
www.trianni_com)、及びAblexis(http://_www_a
blexis_com)などの企業が、上記の技術を用いて選択された抗原に指向するヒ
ト抗体の提供に取り組み得る。
Fv)、又は非対合若しくは対合抗体可変領域など)を発現するように操作されるファー
ジディスプレイライブラリから選択され得る(Knappikら(2000)J.Mol
Biol.296:57〜86;Krebsら(2001)J.Immunol.Me
th.254:67〜84;Vaughanら(1996)Nature Biotec
hnology 14:309〜314;Sheetsら(1998)PITAS(US
A)95:6157〜6162;Hoogenboom及びWinter(1991)J
.Mol.Biol.227:381;Marksら(1991)J.Mol.Biol
.222:581)。本発明の抗体は、例えば、Shiら(2010)J.Mol.Bi
ol.397:385〜96及び国際公開公報第WO09/085462号に記載される
バクテリオファージpIX外被タンパク質との融合タンパク質として抗体の重鎖及び軽鎖
可変領域を発現するファージディスプレイライブラリから単離され得る。ライブラリをヒ
トIFN−ω及びIFN−αのファージ結合に関してスクリーニングしてもよく、得られ
た陽性クローンを更に特徴付けし、Fabはクローンライセートから単離して全長IgG
として発現させてもよい。ヒト抗体を単離するためのそのようなファージディスプレイ法
は、例えば米国特許第5,223,409号、同第5,403,484号、及び第5,5
71,698号(Ladnerら)、Dowerらの米国特許第5,427,908号、
及び第5,580,717号、McCaffertyらの米国特許第5,969,108
号及び第6,172,197号、並びにGriffithsらの米国特許第5,885,
793号、第6,521,404号、第6,544,731号、第6,555,313号
、第6,582,915号及び第6,593,081号に説明されている。
任意の好適な技術を用いて実施してもよい。免疫原性抗原は、精製タンパク質、又は全細
胞若しくは細胞若しくは組織抽出物を含むタンパク質混合物の形態で動物に投与されても
よく、あるいは抗原は、動物の身体内で、前記抗原又はその一部をコードする核酸から新
たに形成されてもよい。
はビオチン化ヒトIFN−αGに対してパニングしてもよい。3回のパニングの後、抗原
としてヒトIFN−α2、IFN−αG、及びIFN−ωを用いたポリクローナルファー
ジELISA法を実施して、各パニング実験の特異的富化を検出することができる。IF
N−α2、IFN−αG、及びIFN−ωに対する結合剤の富化を示すファージを回収し
て、標準ELISAアッセイにてFabフォーマットにおける追加のIFN−αサブタイ
プに対する結合に関して更にスクリーニングしてもよい。特定されたFabクローンは完
全長の抗体にクローニングされ、本明細書で説明するProteOn及びISREレポー
ター遺伝子アッセイを用いてヒトIFN−ω及び様々なIFN−αサブタイプの親和性及
び中和能力に関して更に特徴付けされてもよい。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明のIFN−α/ω抗体は、ヒト生殖系列遺伝因
子IGHV5−51(配列番号155)由来のVHフレームワークを含む。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明のIFN−α/ω抗体は、ヒト生殖系列遺伝因
子IGKV1D−39(配列番号156)由来のVLフレームワークを含む。
施形態における本発明の抗体は、IgA型、IgD型、IgE型、IgG型、又はIgM
型のものであってもよい。本発明の抗体は、IgG1型、IgG2型、IgG3型、Ig
G4型のものであってもよい。
って強化又はサイレンシングすることが可能である。例えば、C1q結合、補体依存性細
胞傷害(CDC)、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害(ADCC)、貧食、細胞表面受容体
(例えば、B細胞受容体(BCR))の下方調節などのFcエフェクター機能は、これら
の活性に関与するFcの残基を修飾することによって提供及び/又は制御され得る。本発
明の抗体の薬物動態特性は、抗体の半減期を延長するFcドメインの残基を突然変異させ
ることによって強化することができる(Strohl(2009)Curr Opin
Biotechnol 20:685〜91)。例示的なFc修飾は、IgG4 S22
8P/L234A/L235A、IgG2 M252Y/S254T/T256E(Da
ll’Acquaら(2006)J.Biol.Chem.281:23514〜24;
又は米国特許第6,737,056号に記載されるもののIgG2のV234A/G23
7A/P238S、V234A/G237A/H268Q、H268A/V309L/A
330S/P331、若しくはIgG2のV234A/G237A/P238S/H26
8A/V309L/A330S/P331S(国際公開公報第WO11/066501号
)(EU番号付けに準ずる残基番号付け)である。
くつかの実施形態における本発明の抗体は、グリコシル化、異性化、脱グリコシル化など
のプロセスによって、又はポリエチレングリコール部分の付加(ペグ化)及び脂質化など
の天然には存在しない共有結合修飾によって翻訳後修飾してもよい。そのような修飾は、
インビボあるいはインビトロで生じ得る。例えば、本発明の抗体は、ポリエチレングリコ
ールと接合(PEG化)することによって薬物動態プロファイルを改善することができる
。接合は当業者に既知の技術によって実施され得る。治療用抗体のPEGとの接合によっ
て、機能を妨害せずに薬力学的動態が強化されることが示されている(Knighら(2
004)Platelets 15:409〜18、Leongら(2001)Cyto
kine 16:106〜19、Yangら(2003)Protein Eng.16
:761〜70)。
生物物理学的特性を改善するように修飾された本発明の抗体又はその断片は、発明の範囲
内である。抗体の安定性は、(1)内在的な安定性に影響を及ぼす個々のドメインのコア
パッキング、(2)HCとLCとの対合により影響を受けるタンパク質/タンパク質の界
面相互作用、(3)極性及び荷電残基の埋め込み、(4)極性及び荷電残基のためのH結
合ネットワーク、並びに(5)他の分子内及び分子間力の間の表面電荷及び極性残基の分
布、を含むいくつかの因子によって影響を受ける((Wornら(2001)J.Mol
.Biol.305:989〜1010)。構造を不安定にする可能性のある残基は、抗
体の結晶構造に基づいて、あるいは場合によっては分子モデリングによって特定すること
が可能であり、また、抗体の安定性に対するこれらの残基の作用は、特定された残基に変
異を含む変異体を生成及び評価することにより試験することができる。抗体安定性を改善
する方法の1つは、示差走査熱量測定法(DSC)で測定した場合の熱転移中点温度(T
m)を上昇させることである。一般に、タンパク質のTmは、その安定性と相関性を示すが
、溶液中でのそのアンフォールディングし易さ及び改変し易さ、並びにそのタンパク質の
アンフォールディングし易さに応じた分解プロセスとは負の相関性を示す(Remmel
eら(2000)Biopharm 13:36〜46,)。多くの研究で、DSCによ
って熱安定性として測定された薬剤の物理的安定性のランク付けと他の方法で測定された
物理的安定性との間に相関性があることが判明している(Guptaら(2003)AA
PS PharmSci 5E8、Zhangら(2004)J.Pharm.Sci.
93:3076〜89、Maaら(1996)Int.J.Pharm.140:155
〜68、Bedu−Addoら(2004)Pharm.Res.21:1353〜61
、Remmeleら(1997)Pharm.Res.15:200〜8)。これらの薬
剤の研究は、FabのTmが対応するmAbの長期の物理的安定性と密接な関係があるこ
とを示唆している。フレームワーク又はCDR内のいずれかにおけるアミノ酸の相違は、
Fabドメインの熱安定性に有意な作用を有し得る(Yasuiら(1994)FEBS
Lett.353:143〜6)。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、ヒトIFN−ωへの結合に関して配
列番号28のVH及び配列番号71のVLを含む単離された抗体と競合する。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、ヒトIFN−ωへの結合に関して配
列番号28のVH及び配列番号150のVLを含む単離された抗体と競合する。
合は、周知の方法を用いてインビトロでアッセイすることができる。例えば、非標識抗体
の存在下での、MSD Sulfoタグ(商標)NHS−エステル標識抗体の、ヒトIF
N−ωへの結合は、ELISA法によって評価することができ、さもなければBioac
ore分析法若しくはフローサイトメトリーを用いて本発明の抗体との競合を示すことも
可能である。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、ヒトインターフェロンオメガ(IF
N−ω)及び少なくとも3、4、5、6、7、8、9、10、又は11のヒトインターフ
ェロンアルファ(IFN−α)サブタイプに結合し、それらの生物活性を中和し、この抗
体は、少なくとも残基F27、L30、及びR33において配列番号1のIFN−ωに結
合する。
中和活性に必要な最小のエピトープを規定する。いくつかの抗体/IFN−α複合体又は
抗体/IFN−ω複合体の結晶構造は、それらの3つの残基が抗体結合に対して主に寄与
することを明らかにした。F27残基は、本発明の抗体が結合しないIFN−αD(α1
)を除く全てのヒトIFN−αに保存される。L30及びR33はどちらも全てのヒトI
FN−α及びヒトIFN−ωに保存される。F27のエピトープへの寄与の更なる確証は
、様々なカニクイザルIFN−αサブタイプに関する結合研究から明らかである。本発明
の抗体は、ヒトヒトIFN−αDと同様に位置27(S27)にセリンを有するカニクイ
ザルIFN−α13に結合しない。
のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、少なくとも残基S25、P26、F27、
L28、L30、K31、R33、R34、及びD35において配列番号1のヒトIFN
−ωに結合する。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、ヒトインターフェロンオメガ(IF
N−ω)及び少なくとも3、4、5、6、7、8、9、10、又は11のヒトインターフ
ェロンアルファ(IFN−α)サブタイプに結合し、それらの生物活性を中和し、この抗
体は、残基F27を含む1つ又は2つ以上の残基において配列番号1のIFN−ωに結合
する。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、ヒトインターフェロンオメガ(IF
N−ω)及び少なくとも3、4、5、6、7、8、9、10、又は11のヒトインターフ
ェロンアルファ(IFN−α)サブタイプに結合し、それらの生物活性を中和し、かつB
LyS、CD40L、IL−6、CD27、BDCA2、IL−12、IL−23、IF
N−αD、IL−17、CD20、IL−10、CD22、IL−21、ICOS、IC
OSL、又はIFN−γに結合する二重特異性抗体である。
N−ωのBLyS分泌物誘導の実証を考慮すると、SLE患者におけるIFN−α/ωの
複合遮断は、抗IFN−α特異的アプローチと比較してBLyS濃度の低減により効果的
であり得る。SLE患者におけるIFNシグネチャ及びIFN活性の程度は、可溶性BL
yS濃度と相関するものと思われる。
の実施形態における本発明のIFN−α/ω抗体を遺伝子操作して、本発明の範囲に更に
包含される二重特異性抗体にすることができる。本発明の抗体のVL領域及び/又はVH
領域を、公開された方法を用いて遺伝子操作して、TandAb(登録商標)デザインな
どの構造として一本鎖二重特異性抗体(国際公開公報第WO99/57150号、米国特
許公開第US2011/0206672号)、又は米国特許第US5869620号、国
際公開公報第WO95/15388号、同第WO97/14719号、若しくは同WO1
1/036460号で開示されるもののような構造としての二重特異性scFVにするこ
とができる。
ることもでき、ここで各抗体のアームは別個の抗原又はエピトープに結合する。そのよう
な二重特異性抗体は、典型的には、米国特許第7,695,936号、国際公開公報第W
O04/111233号、米国特許出願公開第2010/0015133号、米国特許出
願公開第2007/0287170号、国際公開公報第WO2008/119353号、
米国特許出願公開第2009/0182127号、米国特許出願公開第2010/028
6374号、米国特許出願公開第2011/0123532号、国際公開公報第WO20
11/131746号、国際公開公報第WO2011/143545号、又は米国特許出
願公開第2012/0149876号、に記載されるものなどの技術を用いて、2つの抗
体重鎖間のCH3相互作用を調節して二重特異性抗体を形成することによって作製される
。
非対称突然変異を導入して、還元条件下で2つの親単一特異性ホモ二量体抗体から二重特
異性ヘテロ二量体抗体を形成して、国際公開公報第WO2011/131746号に記載
の方法に従って二硫化結合異性化を実現することによって、インビトロの無細胞環境下で
生成することができる。これらの方法では、第1の単一特異性二価抗体(例えば本発明の
抗IFN−α/ω抗体)及び第2の単一特異性二価抗体(例えば抗BLyS抗体、抗CD
40L抗体、抗IL−6抗体、抗CD27抗体、抗BDCA2抗体、抗IL−12抗体、
抗IL−23抗体、抗IFN−αD抗体、抗IL−17抗体、抗CD20抗体、抗IL−
10抗体、抗CD22抗体、抗IL−21抗体、抗ICOS抗体、抗ICOSL抗体、又
は抗IFN−γ抗体)を、ヘテロ二量体の安定性を促進する特定の置換をCH3ドメイン
に有するように遺伝子操作して、ヒンジ領域中のシステインをジスルフィド結合異性化さ
せるのに十分な還元条件下で抗体を一緒にインキュベートして、それにより、Fabアー
ム交換によって二重特異性抗体を生成する。インキュベーション条件は、最適に非還元条
件へと戻してもよい。用いられ得る例示的な還元剤は、2−メルカプトエチルアミン(2
−MEA)、ジチオスレイトール(DTT)、ジチオエリスリトール(DTE)、グルタ
チオン、トリス(2−カルボキシエチル)ホスフィン(TCEP)、L−システイン、及
びβ−メルカプトエタノールであり、2−メルカプトエチルアミン、ジチオスレイトール
、及びトリス(2−カルボキシエチル)ホスフィンからなる群から選択される還元剤が好
ましい。例えば、pH5〜8、例えばpH7.0又は7.4で、少なくとも25mMの2
−MEAの存在下又は少なくとも0.5mMのジチオスレイトールの存在下で、少なくと
も20℃で、少なくとも90分のインキュベーションを用いてもよい。
、K409R及び/又はF405Lである。
、例えば、二重可変ドメイン免疫グロブリン(DVD)(国際公開公報第WO2009/
134776号)、又は異なる特異性を有する2つの抗体アームを接続する様々な二量体
化ドメインを含む構造(国際公開公報第WO2012/022811号、米国特許第5,
932,448号、同第6,833,441号)である。DVDは、構造VH1−リンカ
ー−VH2−CHを有する重鎖、及び構造VL1−リンカー−VL2−CLを有する軽鎖
を含む完全長抗体であり、リンカーは任意である。
D27、BDCA2、IL−12、IL−23、IFN−αD、IL−17、CD20、
IL−10、CD22、IL−21、ICOS、ICOSL、又はIFN−γに結合する
VH及びVLは、本明細書に記載の方法を用いて新たに生成してもよく、あるいは既存の
単一特異性抗体を遺伝子操作して生成してもよい。本発明の二重特異性抗体を生成するた
めに用いられ得る例示的な抗BLyS抗体は、BENLYSTA(登録商標)である。使
用し得る例示的なCD40L抗体は、米国特許第5,474,771号、同第5,747
,037号、国際公開公報第WO01/68860号、同第WO06/033702号、
又は同第WO08/118356号に記載されるものである。使用し得る例示的な抗IL
−6抗体は、国際公開公報第WO06/119115号、同第WO10/056948号
、同第WO10/088444号、又は同第WO07/076927号に記載されるもの
である。使用し得る例示的な抗CD27抗体は、国際公開公報第WO13/138586
号、同第WO11/130434号、又は同第WO12/004367号に記載されるも
のである。使用し得る例示的なIL−12及びIL−23抗体はSTELARA(登録商
標)であり、使用し得る例示的なIL−23抗体は、国際公開公報第WO07/0059
55号、同第WO07/027714号、同第WO08/103432号、同第WO07
/106769号、同第WO07/147019号、又は同第WO08/134659号
に記載されるものである。使用し得る例示的なIL−17抗体は、国際公開公報WO06
/013107号、同第WO06/054059号、同第WO07/070750号、同
第WO08/134659号、同第WO07/149032号、同第WO08/0211
56号、同第WO08/047134号、同第WO09/130459号、同第WO10
/025400号、同第WO11/053763、及びWO12/095662号に記載
されるものである。
の実施形態における本発明の別の実施形態は、ヒトインターフェロンオメガ(IFN−ω
)及び特定のVH及びVL配列を有する少なくとも3、4、5、6、7、8、9、10、
又は11のヒトインターフェロンアルファ(IFN−α)サブタイプに結合し、それらの
生物活性を中和する、単離された抗体であり、ここで抗体VHは第1のポリヌクレオチド
によってコードされ、抗体VLは第2の合成ポリヌクレオチドによってコードされる。ポ
リヌクレオチドは相補的デオキシ核酸(deoxynucleic acid)(cDNA)であってもよ
く、また好適な宿主内で発現するために最適化されたコドンであってもよい。コドン最適
化は周知の技術である。
の各々のいくつかの実施形態では、本発明の抗体VH又はVLをコードするポリヌクレオ
チドは、配列番号72、92、108、110、117、又は122の配列を含む。
うちのいずれかをコードする単離されたポリヌクレオチドである。特定の例示的なポリヌ
クレオチドが本明細書に開示されるが、遺伝コードの縮重又は所与の発現系におけるコド
ンの好ましさを考慮すると、本発明の抗体をコードする他のポリヌクレオチドも本発明の
範囲内に含まれる。例示的なポリヌクレオチドは、例えば配列番号72、92、108、
110、117、又は122に示す配列を有するポリヌクレオチドである。本発明の抗体
のVH若しくはVL又はそれらの断片をコードするポリヌクレオチド配列は、意図される
宿主細胞におけるヌクレオチド配列の発現を可能にする、プロモーター又はエンハンサー
などの1つ又は2つ以上の調節因子に操作可能に連結され得る。ポリヌクレオチドはcD
NAであってもよい。
なベクターは、プラスミドベクター、ウイルスベクター、バキュロウイルス発現ベクター
、トランスポゾン系ベクター、又は任意の手段によって所与の生物又は遺伝的背景に本発
明の合成ポリヌクレオチドを導入するのに適した任意の他のベクターであってもよい。例
えば、任意に定常領域に連結される本発明の抗体の軽鎖及び/又は重鎖可変領域をコード
するポリヌクレオチドが、発現ベクターに挿入される。軽鎖及び/又は重鎖は、同じ又は
異なる発現ベクターにクローニングされ得る。免疫グロブリン鎖をコードするDNAセグ
メントは、免疫グロブリンポリペプチドの発現を確実にする発現ベクター中の制御配列に
操作可能に連結されてもよい。そのような制御配列は、シグナル配列、プロモーター(例
えば、天然に会合する又は異種プロモーター)、エンハンサー因子、及び転写終結配列を
含み、抗体を発現するように選択された宿主細胞と適合性があるように選択される。ベク
ターが適切な宿主内に組み込まれると、宿主は、組み込まれたポリヌクレオチドによって
コードされたタンパク質の高レベル発現に適した条件下で維持される。
いずれかとして宿主生物において複製可能である。通常、発現ベクターは、所望のDNA
配列で形質転換されたこれらの細胞の検出を可能にするように、アンピシリン耐性、ヒグ
ロマイシン耐性、テトラサイクリン耐性、カナマイシン耐性、又はネオマイシン耐性など
の選択マーカーを含む。
胞における発現の場合、例示的なプロモーターとしては、lacl、lacZ、T3、T
7、gpt、lambda P、及びtrcが挙げられる。真核細胞における発現の場合
、例示的なプロモーターとしては、軽鎖及び/又は重鎖免疫グロブリン遺伝子プロモータ
ー及びエンハンサー因子、サイトメガロウイルス即時初期プロモーター、単純ヘルペスウ
イルスチミジンキナーゼプロモーター、初期及び後期SV40プロモーター、レトロウイ
ルスからの長鎖末端反復配列に存在するプロモーター、マウスメタロチオネイン−Iプロ
モーター、及び様々な当該技術分野に既知の組織特異的プロモーターが挙げられる。酵母
細胞における発現の場合、例示的なプロモーターは、ADH1プロモーター、PGK1プ
ロモーター、ENOプロモーター、PYK1プロモーター等の構成的プロモーター、又は
GAL1プロモーター、GAL10プロモーター、ADH2プロモーター、PH05プロ
モーター、CUP1プロモーター、GAL7プロモーター、MET25プロモーター、M
ET3プロモーター、CYC1プロモーター、HIS3プロモーター、ADH1プロモー
ター、PGKプロモーター、GAPDHプロモーター、ADC1プロモーター、TRP1
プロモーター、URA3プロモーター、LEU2プロモーター、ENOプロモーター、T
P1プロモーター、及びAOX1などの調節可能プロモーター(例えばピキアにおいて使
用するため)である。適切なベクター及びプロモーターの選択は、十分に当業者のレベル
内である。
構築物を生成するために市販されている。例として以下のベクターを提供する。細菌性:
pBs、phagescript、PsiX174、pBluescript SK、p
Bs KS、pNH8a、pNH16a、pNH18a、pNH46a(Stratag
ene,La Jolla,Calif.,USA);pTrc99A、pKK223−
3、pKK233−3、pDR540、及びpRIT5(Pharmacia,Upps
ala,Sweden)。真核:pWLneo、pSV2cat、pOG44、PXR1
、pSG(Stratagene)pSVK3、pBPV、pMSG、及びpSVL(P
harmacia)。
。用語「宿主細胞」は、ベクターが導入される細胞を指す。用語「宿主細胞」は、特定の
対象細胞だけでなく、そのような細胞の後代、及び特定の対象細胞から生成された安定し
た細胞株も指すように意図されることを理解されたい。変異又は環境の影響のどちらかに
より、特定の修飾が後の世代に起こる可能性があるため、そのような後代は親細胞と同一
ではない可能性があるが、本明細書で使用される用語「宿主細胞」の範囲内に依然として
含まれる。そのような宿主細胞は、真核細胞、原核細胞、植物細胞、又は古細菌(archea
l)細胞であってもよい。
ラチア、及び様々なシュードモナス種などの他の腸内細菌科である。酵母などの他の微生
物も発現に有用である。好適な酵母宿主細胞の例は、サッカロマイセス(例えばS.セレ
ビジアエ)及びピチアである。例示的な真核細胞は、哺乳類、昆虫類、鳥類、又は他の動
物由来の真核細胞であり得る。哺乳類真核細胞には、不死化細胞株、例えばハイブリドー
マ、又は骨髄腫細胞株、例えばSP2/0(American Type Cultur
e Collection(ATCC)、Manassas、VA、CRL−1581)
、NS0(European Collection of Cell Culture
s(ECACC)、Salisbury,Wiltshire,UK、ECACC No
.85110503)、FO(ATCC CRL−1646)及びAg653(ATCC
CRL−1580)マウス細胞株が含まれる。ヒト骨髄腫細胞株の一例は、U266(
ATTC CRL−TIB−196)である。他の有用な細胞系としては、CHO−K1
SV(Lonza Biologics(Walkersville,MD))、CHO
−K1(ATCC CRL−61)、又はDG44などの、チャイニーズハムスターの卵
巣(CHO)細胞に由来するものが挙げられる。
、宿主細胞によって生成された抗体を回収することとを含む、本発明の抗体の生成方法で
ある。抗体を作成及び精製する方法は当該技術分野において周知である。合成されると(
化学的又は組み換えのいずれかで)、全ての抗体、それらの二量体、個々の軽鎖及び/若
しくは重鎖、又はVH及び/若しくはVLなどの他の抗体断片は、硫酸アンモニウム沈殿
法、親和性カラム法、カラムクロマトグラフィー法、高速液体クロマトグラフィー(HP
LC)精製法、ゲル電気泳動法などを含む標準的な手順により精製することができる(概
要はScopes,Protein Purification(Springer−V
erlag,N.Y.,(1982)を参照)。対象抗体は、実質的に純粋、例えば、対
象抗体等以外の細胞残屑、巨大分子などの汚染物を含まない、例えば、少なくとも約80
%〜85%純粋、少なくとも約85%〜90%純粋、少なくとも約90%〜95%純粋、
又は少なくとも約98%〜99%以上純粋であり得る。
3、4、5、6、7、8、9、10、又は11のヒトインターフェロンアルファ(IFN
−α)に結合し、それらの生物活性を中和する抗体の生成方法であり、この方法は、
抗体のVHをコードする第1のポリヌクレオチド及び抗体のVLをコードする第2のポ
リヌクレオチドを発現ベクターに組み込むことと、
発現ベクターを用いて宿主細胞を転換することと、
VL及びVHが発現して抗体を形成する条件下の培地内で宿主細胞を培養することと、
宿主細胞又は培地から抗体を回収することと、を含む。
生物学法を用いてベクター内に組み込まれる。宿主細胞の形質転換、培養、抗体発現、及
び精製は、周知の方法を用いて行われる。
本発明のIFN−α/ω抗体は、全身性紅斑性狼瘡(SLE)若しくは皮膚紅斑性狼瘡
(CLE)を含む狼瘡などの免疫媒介炎症性疾患若しくは自己免疫疾患、又は乾癬、免疫
性血小板減少症(ITP)、エカルディ−グチエール症候群(AGS)、全身性硬化症、
シェーグレン症候群、筋炎、分類不能型免疫不全症(CVID)、自己免疫性甲状腺疾患
、I型糖尿病、関節リウマチ、移植片拒絶反応、若しくは移植片対宿主病(GVHD)な
どの免疫媒介炎症性疾患の治療に利用され得る。これらの疾患は、IFN−α及び/若し
くはIFN−ω、又はI型IFNシグネチャの生成の増加に関連し得る。
、4、5、6、7、8、9、10、又は11のヒトインターフェロンアルファ(IFN−
α)サブタイプに結合し、それらの生物活性を中和する、単離された抗体の治療有効量を
、それを必要とする患者に、免疫媒介炎症性疾患又は自己免疫疾患を治療するのに十分な
時間投与することを含む、免疫媒介炎症性疾患又は自己免疫疾患の治療方法である。
3、4、5、6、7、8、9、10、又は11のヒトインターフェロンアルファ(IFN
−α)サブタイプに結合し、それらの生物活性を中和する、単離された抗体の治療有効量
を、それを必要とする患者に、狼瘡を治療するのに十分な時間投与することを含む、狼瘡
の治療方法である。
CLE)である。
小板減少症(ITP)、エカルディ−グチエール症候群(AGS)、全身性硬化症、シェ
ーグレン症候群、筋炎、分類不能型免疫不全症(CVID)、自己免疫性甲状腺疾患、I
型糖尿病、関節リウマチ、移植片拒絶反応、又は移植片対宿主病(GVHD)である。
3、4、5、6、7、8、9、10、又は11のヒトインターフェロンアルファ(IFN
−α)サブタイプに結合し、それらの生物活性を中和する、単離された抗体の治療有効量
を、それを必要とする患者に、慢性ウイルス感染症を治療するのに十分な時間投与するこ
とを含む、慢性ウイルス感染症の治療方法である。
年、IFN−Iは、慢性ウイルス感染症において、少なくとも部分的にIL−10及びプ
ログラム細胞死1リガンド1(PDL1)によって媒介される機構を通じて免疫抑制的役
割を有することが実証された(Teijaroら、Science 340,207〜2
11,(2013)、Wilsonら、Science 340,202〜207,20
13)。複数のIFN−αサブタイプ及びIFN−ωの複合遮断は、ウイルス存続を助長
する免疫抑制環境を下方調節することによってHIV及びC型肝炎を含む慢性ウイルス感
染症を有する患者に薬効を提供し得る。
障害を有する傾向があるか、又はその障害にかかりやすい患者、その障害が予防されるべ
き患者も含まれる。治療を必要とする個人としては、その障害又はその障害の症状を既に
有している者が挙げられる。有益な又は望ましい臨床結果としては、感知可能又は感知不
可能にかかわらず、症状の緩和、疾患程度の減少、病状の安定化(即ち悪化しない)、疾
患進行の遅延又は緩徐化、病状の改善又は一時的緩和、及び寛解(部分的又は全体的にか
かわらず)が挙げられる。「治療」は、治療を受けなかった場合に予期される生存と比較
して、生存をより長引かせることも意味し得る。
22、23、24、25、26、又は27に示すVH、VL、HCDR、及び/又はLC
DR領域、並びに抗体IFWM3308、IFWM3307、IFWM3410、IFW
M3322、IFWM3385、IFWM3416、IFWM3310、IFWM340
0、IFWM3321、IFWM3522、IFWM3524、IFWM3320、IF
WM3304、IFWM3520、IFWM3399、IFWM3314、IFWM33
31、IFWM3405、IFWM3442、IFWM3525、IFWM3423、I
FWM3444、及びIFWM3421を含む。
の実施形態における本発明の方法に用いられ得る他の例示的抗体は、ヒトインターフェロ
ンオメガ(IFN−ω)及び少なくとも3、4、5、6、7、8、9、10、又は11の
ヒトインターフェロンアルファ(IFN−α)サブタイプに結合し、それらの生物活性を
中和する抗体であり、この抗体は、少なくとも残基F27、L30、及びR33において
配列番号1のIFN−ωに結合する。
の実施形態における本発明の方法に用いられ得る他の例示的抗体は、少なくとも残基S2
5、P26、F27、L28、L30、K31、R33、R34、及びD35において配
列番号1のヒトIFN−ωに結合する抗体である。
うな動物の例としては、ヒト、齧歯類、イヌ、ネコ、及び家畜などの哺乳動物が挙げられ
る。
細書で定める投薬量で投与するために調製される。SLEは、遺伝因子及び環境因子の両
方がその発生に寄与する慢性の多臓器自己免疫疾患である。
合体の組織沈着を特徴とする。皮膚性、筋骨格性、血液性、神経性、及び腎性合併症の組
み合わせは患者に見られ、これは拡大及び寛解の期間を経る。狼瘡腎炎は、SLEの症例
として定義され、腎炎、蛋白尿、血尿、及び/又は腎不全の診断を伴う。狼瘡腎炎患者に
おいては、腎障害は蛋白尿(>0.5g/24時間)及び/又は尿検体中の赤血球若しく
は円柱を特徴とする。
リガが、IFN−α、及びIFN−ωとは関連するが、IFN−βとは関連しないI型I
FN応答を引き起こすことが示唆されている。したがって、本発明のIFN−α/ω抗体
は、狼瘡及び他の免疫媒介炎症性疾患に対し、IFN−ω及び複数のIFN−αサブタイ
プを広域に阻害し、同時に抗ウイルス防御により重要な役割を果たし得、またその分子が
狼瘡中で生物学的関連(releavance)を全く有さない場合があるIFN−βの機能を留保
する(spare)より効果的な治療を提供し得る。例えば、抗IFN−β抗体は、SLE及
びAGS患者のいずれの患者血清活性の中和にも失敗しており、疾患はIFN−I活性及
びIFNシグネチャの上昇にも関連していた(Hooksら、Arthritis an
d Rheumatism 25:396〜400,1982、Huaら、Arthri
tis and Rheumatism 54:1906(Jun,2006)、Ric
eら、Lancet Neurology doi:10.1016/S1474〜44
22(13)70258〜8(2013))。
挙げられる。
疼痛、衰弱、発熱、倦怠、口腔組織の潰瘍、皮膚症状(例えば鼻及び頬全体の蝶形発疹、
太陽光により誘発された皮膚発赤)、異常な体重減少若しくは体重増加、貧血症、リンパ
球及び/若しくは血小板数の低下、神経学的若しくは神経精神病学的症状(例えば思考障
害、記憶障害、錯乱、抑うつ、頭痛、癲癇発作、卒中)、腎臓障害(例えば腎炎(例えば
糸球体腎炎))、太陽若しくは光過敏症、脱毛、ストレス若しくは寒さによる指の紫化若
しくは蒼白化、血管病変若しくは他の血管症状、又は心膜炎若しくは胸膜炎などの心肺症
状が挙げられる。インターロイキン上昇レベルIL−1、IL−6、IL−10、Il−
12、IL−17、IL−18、IL−5、及びIL−16、TNF−α又はI型インタ
ーフェロン、並びにIFN誘導性遺伝子の過剰発現が狼瘡患者において立証されている。
患者は、二本鎖DNA(dsDNA)、リボ核タンパク質(RNP)、SS−a/Ro、
SS−b/La、リン脂質、ヒストン、又はカルジオリピンといった、核及び細胞成分に
対する自己抗体の高い濃度を有し得る。患者は、少なくとも1つの組織中に免疫複合体の
堆積を有し得る。
y(ACR)の推奨する方法を使用して、あるいはClassification of
Systemic Lupus ErythematosusのためのSystemi
c Lupus International Collaborating Clin
ics Criteria(SLICC)によって、診断又は分類することができる。例
えば、2012 SLICC基準は、11の基準のうちの少なくとも4つ(うち少なくと
も1つの臨床的基準及び1つの免疫学的基準)、又は抗DNA抗体(ADA)若しくは抗
核酸抗体(ANA)の存在下における生検で実証された狼瘡腎炎を患者に要求している。
臨床的基準とは、急性皮膚狼瘡、慢性皮膚狼瘡、口若しくは鼻潰瘍、非瘢痕性脱毛症、関
節炎、漿膜炎、腎症状、神経症状、溶血性貧血、白血球減少症、又は血小板減少症(<1
00,000/mm3)である。免疫学的基準としては、ANA、ADA、抗Sm、抗リ
ン脂質抗体、低補体(C3、C4、又はCH50)、又は直接クームス試験(溶血性貧血
の存在には含めない)(Petreら、Arthritis and Rheumati
sm Aug 2012)が挙げられる。活動性疾患は、1つのBritish Isl
es Lupus Activity Groupの「A」基準、又は2つのBILAG
「B」基準、SLE Disease Activity Index(SLEDAI)
、又はFurieらのArthritis Rheum 61(9):1143〜51(
2009)で説明される全身性紅斑性狼瘡(SLE)レスポンダ指数(SRI)によって
定義することができる。
アによって定義することができる。BILAG 2004指数は、BILAGスコアを決
定するのに用いられる(YeeらのArthritis & Rheumatism 5
4:3300〜3305,2006、IsenbergらのRheumatology
44:902〜906;2005を参照されたい)。BILAG 2004指数は、9つ
の器官系領域(全身、皮膚粘膜、神経精神、筋骨格、心肺、胃腸、眼、腎臓、及び血液)
にわたる97の臨床的兆候、症状、及び検査値を評価する。97の症状を、前月(4週間
の)重症度に関して、また前検査からのあらゆる変化(新規、改善、安定、悪化、非存在
)に関して評価する。続いて各器官系カテゴリーの検査結果から9つの各領域に対して単
一のアルファベットスコア(A〜E)を導く。表2にBILAGカテゴリーを示す。
変化の発現に応じて、急性(ACLE)、亜急性(SCLE)、慢性(CCLE)、又は
間欠性(ICLE)CLEに更に分類される。様々なCLE形態の分類及び臨床症状は、
Kuhn及びLandmannのJ Autiommunity 48〜49:14〜1
9,2014で考察されている。
関することが報告されている(KarageorgasらのJ Biomed Biot
echnol 273907,2011、BaechlerらのProc Natl A
cad Sci USA 100:2610〜2615,2003、Bennettらの
J Exp Med 197:711〜723,2003、Dall’eraらのAnn
Rheum Dis 64:1692〜1697,2005、NiewoldらのGe
nes Immun 8:492〜502,2007)。そのクリアランス障害と関連し
た自己抗体の優勢によってIFN生成のフィードバックサイクルがもたらされ、Fc受容
体に依存する免疫複合体から形質細胞様樹状細胞(pDC)への内在化によって、IFN
の増量、ひいてはIFNシグネチャの確立がもたらされる。臨床試験では、IFNシグネ
チャを示す患者の大部分において、SLE患者における抗IFN−α抗体は、I型IFN
シグネチャの部分的な低下、及び予備分析においてわずかな有効性を示した(Petri
らのArthritis and rheumatism 65,1011(Apr,2
013)、Merrill JらのAnnals of the rheumatic
diseases 70,314(2011)、KennedyらのThe 10th
International Congress on SLE,Buenos Air
es,Argentina Oral Presentation 5,022,(Ap
ril 20th,2013))。
merican College of Rheumatology、European
League Against Rheumatism)により作成された認可済み指
針書、及び治療を実践する医師の選択に基づく。狼瘡患者は、診断が下された後に適切な
管理を施してもなお長期に渡り疾患活動性を継続して有し、多くの場合、新たな器官系又
は特定の器官系の損傷を伴う。狼瘡の疾患活動性には、フレア(又は疾患活動性の寛解・
再発)、慢性活動性疾患、及び長期静止状態の3つのパターンがある。これらの疾患パタ
ーンは、体系的臨床的評価、定期的な実験室試験、疾患活動性の標準化指標、並びにこれ
らの評価と健康状態及び生活の質に対する患者自身の認識との統合を用いて特徴付けされ
る。患者のフレアの兆候及び症状が持続又は悪化すれば、医師は薬剤及び/又は用量の変
更が正当であることを見出し得る。狼瘡の制御に用いられる薬剤としては、(1)例えば
ナプロキセン(Aleve)、及びイブプロフェン(Advil、Motrin、他のも
の)などの市販のNSAID、並びに処方により入手可能なより強力なNSAIDを含む
NSAID、(2)例えばヒドロキシクロロキン(Plaquenil)などの抗マラリ
ア剤、(3)例えばPrednisone及び他の種類のコルチコステロイドなどのコル
チコステロイド、並びに(4)例えばシクロホスファミド(Cytoxan)、アザチオ
プリン(Imuran、Azasan)、ミコフェノール酸塩(Cellcept)、レ
フルノミド(Arava)、及びメトトレキサート(Trexall)などの免疫抑制剤
が挙げられるが、こられに限定されない。
その有効性を試験してもよい。そのようなインビトロ試験は、例えば、全血中のSLE患
者の免疫複合体によって誘導されたIFN産生の阻害の評価、あるいは本明細書に記載さ
れる全血中のIFNシグネチャを低下する抗体の能力の評価であり得る。糸球体腎炎を含
むヒト狼瘡のいくつかの特徴を有する時間依存性かつ雌バイアスの疾患を示すNZB/N
ZW F1マウスなどの狼瘡の動物モデルを更に用いてもよい。しかしながら、マウスは
IFN−ωを産生しないため、本発明の抗体の有効性を評価するためのこれらのモデルと
しての利用はより制限される。
使用される「I型インターフェロンシグネチャ」又は「インターフェロンシグネチャ」は
、IFN−Iによって誘導された遺伝子のサブセットの上方調節を意味する。3〜27遺
伝子の範囲の様々なI型IFNシグネチャが既知である。これらのシグネチャは、例えば
、SLEの治療のため、かつSLE患者の層別化を目的としたI型IFN阻害剤の標的結
合を評価するための薬力学的マーカーとして利用され得る。
un,2009)で説明される21の上方調節された(upreguated)遺伝子からなる例示
的なI型インターフェロンシグネチャを表3に示す。他の例示的なI型インターフェロン
シグネチャは、Tcherepanova,IらのAnnals of the rhe
umatic diseases 71(Suppl3)(2012)、及びRicha
rdson,BらのDevelopment of A Quantitative P
CR Method to Determine Interferon Signat
ure Metric Status in SLE Patients:Distri
bution and Clinical & Serological Associ
ations in Two Lupus Clinical Trials ACR/
ARHP 2012 Annual Meeting Abstract 620(20
12)で説明されている。
L−6、CD27、BDCA2、IL−12、IL−23、IFN−αD、IL−17、
又はCD20を中和する。
本発明は、本明細書で説明する本発明の抗IFN−α/ω抗体を含む医薬組成物を提供
し、以下に列記される番号付けされた実施形態の各々のいくつかの実施形態では、医薬的
に許容される担体を提供する。治療上の使用では、本発明の抗IFN−α/ω抗体は、医
薬的に許容される担体内の活性成分として、有効量の抗IFN−α/ω抗体を含有する医
薬組成物として調製することができる。用語「担体」は、活性化合物と共に投与される希
釈剤、補助剤、賦形剤、又はビヒクルを指す。そのようなビヒクルは、水、及び落花生油
、大豆油、鉱物油、ゴマ油等の、石油、動物、植物、又は合成物起源のものを含む油等の
液体であってもよい。例えば、0.4%生理食塩水及び0.3%グリシンを用いることが
できる。これらの溶液は滅菌され、一般には粒子状物質を含まない。これらは、通常の周
知の滅菌技術(例えば、濾過)によって滅菌することができる。この組成物は、生理学的
状態に近づける場合に必要な、pH調整剤及び緩衝剤、安定剤、増粘剤、平滑剤並びに着
色剤等の医薬的に許容される補助物質を含有することができる。そのような医薬製剤中の
本発明の分子又は抗体の濃度は幅広く変化してもよく、即ち約0.5重量%未満、通常は
少なくとも約1重量%から最大で15若しくは20重量%、25重量%、30重量%、3
5重量%、40重量%、45重量%、又は50重量%までであってもよく、また、選択さ
れる特定の投与方法に従って、主として必要とされる用量、液体の体積、粘度等に基づい
て選択される。好適なビヒクル及び製剤(他のヒトタンパク質、例えばヒト血清アルブミ
ンを含む)は、例えば、Remington:The Science and Pra
ctice of Pharmacy,21st Edition,Troy,D.B.e
d.,Lipincott Williams and Wilkins,Philad
elphia,PA 2006,Part 5,Pharmaceutical Man
ufacturing pp 691〜1092に記載され、特にpp.958〜989
を参照されたい。
の実施形態における本発明の方法における抗IFN−α/ω抗体の投与方法は、例えば、
皮内、筋肉内、腹腔内、静脈内、又は皮下、肺、経粘膜(経口、経鼻、膣内、直腸)など
の非経口的投与、又は当該技術分野において周知の当業者に理解される他の手法などの任
意の好適な経路であってもよい。
の実施形態における本発明の方法における抗IFN−α/ω抗体は、例えば静脈内(i.
v.)注射、又は筋肉内若しくは皮下若しくは腹腔内ボーラス注入などの任意の好適な経
路によって患者に投与してもよい。i.v.注射は、例えば15、30、60、90、1
20、180、又は240分間、又は1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11
、又は12時間にわたって与えられてもよい。
れる疾患を緩和する、又は少なくとも部分的に阻止するのに十分な量(「治療有効量」)
であり、場合によっては0.005mg/kg〜約100mg/kg(例えば約0.05
mg/kg〜約20mg/kg、若しくは約0.1mg/kg〜約20mg/kg、若し
くは約1mg〜約20mg/kg、若しくは約4mg/kg、約8mg/kg、約16m
g/kg、又は約24mg/kg、又は例えば約1、2、3、4、5、6、7、8、9、
若しくは10mg/kg)であってもよいが、例えば約15、16、17、18、19、
20、21、22、23、24、25、30、40、50、60、70、80、90、又
は100mg/kgなどのように更に高くてもよい。
られてもよく、又はこの用量は、例えば500、400、300、250、200、若し
くは100mg/m2など、患者の表面積に基づいてもよい。狼瘡などの免疫媒介炎症性
疾患の治療には通常1〜8用量(例えば1、2、3、4、5、6、7、又は8用量)を投
与してもよいが、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、
20用量、又はそれ以上の用量を投与してもよい。
かの実施形態における抗IFN−α/ω抗体の投与は、1日、2日、3日、4日、5日、
6日、1週間、2週間、3週間、1ヶ月、5週間、6週間、7週間、2ヶ月、3ヶ月、4
ヶ月、5ヶ月、6ヶ月以上後に繰り返すことができる。長期にわたる投与の場合、治療過
程を繰り返すことも可能である。繰り返し投与は、同一用量であっても異なる用量であっ
てもよい。例えば、本発明の方法における抗IFN−α/ω抗体は、静脈内注射により、
1週間間隔で0.1mg/kg、1mg/kg、5mg/kg、8mg/kg、又は16
mg/kgを8週間投与し、続いて2週間毎に8mg/kg又は16mg/kgを更に1
6週間投与し、続いて4週間毎に8mg/kg又は16mg/kgを投与してもよい。
のいくつかの実施形態における方法で、例えば6ヶ月以上の期間で週1回などの維持療法
によって投与してもよい。
形態における方法における抗IFN−α/ω抗体は、治療開始後第1、2、3、4、5、
6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20
、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、
34、35、36、37、38、39、若しくは40日目のうちの少なくとも1日に、若
しくは1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、1
6、17、18、19、若しくは20週目のうちの少なくとも1週に、又はこれらの任意
の組み合わせで、単回投与、若しくは24、12、8、6、4、若しくは2時間毎の分割
投与、又はこれらの任意の組み合わせを用いて、1日に例えば0.5、0.9、1.0、
1.1、1.5、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、1
5、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28
、29、30、40、45、50、60、70、80、90、又は100mg/kg/日
などの約0.1〜100mg/kgの用量で提供してもよい。
ける方法における抗IFN−α/ω抗体は、狼瘡などの免疫媒介炎症性疾患若しくは自己
免疫疾患の発生リスクを低減させるために、自己免疫疾患の免疫媒介炎症性疾患の発症を
遅延させるために、かつ/又は、狼瘡などの免疫媒介炎症性疾患若しくは自己免疫疾患が
寛解中の再発リスクを低減させるために、予防的に投与することもできる。
g〜約100mg/kg、例えば約50ng〜約30mg/kg、又はより好ましくは約
5mg〜約25mg/kgの本発明の抗IFN−α/ω抗体を含むように調製することが
できる。
施形態の各々のいくつかの実施形態における静脈内注射用の抗IFN−α/ω抗体を含む
静脈内注射用医薬組成物は、80kgの患者に投与するためには、最大で約200mlの
滅菌リンガー液及び約8mg〜約2400mg、約400mg〜約1600mg、又は約
400mg〜約800mgの抗INF−α/ω抗体を含むように作製してもよい。非経口
投与可能な組成物を調製する方法は周知であり、例えば、「Remington’s P
harmaceutical Science」(15th ed.,Mack Pub
lishing Company,Easton,PA)に、より詳細に記載されている
。
標準的な研究技術によって決定することができる。例えば、インビトロアッセイを用いて
最適な用量範囲の特定に役立てることができる。任意に、SLEを含む狼瘡などの免疫媒
介炎症性疾患又は自己免疫疾患の治療において有効であり得る本発明のIFN−α/ω抗
体は、当該技術分野で周知の適切な動物モデルにIFN−α/ω抗体を投与することによ
って決定することができる。特定の有効用量の選択は、当業者であればいくつかの因子の
考慮に基づいて(例えば臨床試験によって)決定することができる。そのような因子には
、治療又は予防しようとする疾患、疾患症状、患者の体重、患者の免疫状態、及び当業者
に既知の他の因子が含まれる。製剤に用いられる正確な用量は、投与経路、及び疾患の重
篤度にも依存し、医師の判断及び各患者の状況に基づいて決定されなければならない。有
効量は、インビトロ又は動物モデル試験系から導出される用量反応曲線から推定すること
ができる。本発明の抗体の有効性及び有効量について、本明細書に記載したモデルのうち
のいずれかを用いて試験することができる。
各々のいくつかの実施形態における抗IFN−α/ω抗体は、貯蔵のために凍結乾燥した
後に、使用前に好適な担体中で再構成することができる。この技術は、従来のタンパク質
調製物に関して有効であることが示されており、既知の凍結乾燥法及び還元技術を用いる
ことができる。
各々のいくつかの実施形態における抗IFN−α/ω抗体は、第2の治療薬と併せて、同
時に、逐次に、又は別個に投与することができる。
B細胞調節剤であってもよい。
ドニゾロン、デフラザコート(deflazcort)、ヒドロキシクロロキン、アザチオプリン、
メトトレキサート、シクロホスファミド、ミコフェノール酸モフェチル(MMF)、ミコ
フェノール酸ナトリウム、シクロスポリン、レフルノミド、タクロリムス、リツキシマブ
(商標)、又はベリムマブ(商標)である。
以下に、本明細書の他の箇所に記載した開示に従った本発明の更なる特定の実施形態を
列挙する。本明細書に開示される本発明に関連するものとして説明される上記の本発明の
実施形態の特徴は、これらの番号付けされた更なる実施形態の各々及び全てにも関する。
8、9、10、又は11のヒトインターフェロンアルファ(IFN−α)サブタイプと結
合し、それらの生物活性を中和する、単離されたモノクローナル抗体。
2)前記ヒトIFN−ω及び前記ヒトIFN−αサブタイプの前記生物活性が、シグナ
ル伝達性転写因子2(STAT2)、インターフェロン調節因子9(IRF9)、及びS
EAPを安定に発現するHEK293細胞におけるインターフェロン誘導性ISG54プ
ロモーター下でのヒトIFN−ω又はヒトIFN−αサブタイプに誘導された分泌胚アル
カリホスファターゼ(SEAP)の発現である、実施形態1に記載の抗体。
3)前記抗体が、少なくとも約1×10-9M以下、約1×10-10以下、約5×10-11
以下、又は約1×10-11M以下のIC50でヒトIFN−ωの生物活性を中和する、実施
形態1又は2に記載の抗体。
4)前記抗体が、少なくとも約1×10-10M以下のIC50値で前記ヒトIFN−ωの
前記生物活性を中和する、実施形態1〜3のいずれか一項に記載の抗体。
5)前記抗体が、約1×10-10M〜約6×10-12MのIC50値で前記ヒトIFN−ω
の前記活性を中和する、実施形態1〜4のいずれか一項に記載の抗体。
6)前記抗体が、少なくとも約1×10-10M以下のIC50値で少なくとも3、4、5
、6、7、8、9、10、又は11のヒトIFN−αサブタイプの前記活性を中和する、
実施形態1〜5のいずれか一項に記載の抗体。
7)前記IFN−αサブタイプが、IFN−αA、IFN−αB2、IFN−αC、I
FN−αF、IFN−αG、IFN−αH2、IFN−αI、IFN−αJ1、IFN−
αK、IFN−αWA、及びIFN−α4aからなる群から選択される、実施形態6に記
載の抗体。
8)前記抗体が、それぞれ配列番号109、114、及び121の重鎖相補性決定領域
(HCDR)1(HCDR1)、2(HCDR2)、及び3(HCDR3)のアミノ酸配
列、並びに配列番号118、119、及び120の軽鎖相補性決定領域(LCDR)1(
LCDR1)、2(LCDR2)、及び3(LCDR3)のアミノ酸配列を含む、実施形
態7に記載の抗体。
9)前記抗体が、IFN−αA、IFN−αB2、IFN−αC、IFN−αF、IF
N−αG、IFN−αH2、IFN−αI、IFN−αJ1、IFN−αK、IFN−α
WA、及びIFN−α4aからなる群から選択される少なくとも6つのヒトIFN−αサ
ブタイプを中和する、実施形態1〜5のいずれか一項に記載の抗体。
10)前記抗体が、それぞれ配列番号109、114、121、159、119、及び
160のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR
3のアミノ酸配列を含む、実施形態9に記載の抗体。
11)前記抗体が、IFN−αA、IFN−αB2、IFN−αC、IFN−αF、I
FN−αG、IFN−αH2、IFN−αI、IFN−αJ1、IFN−αK、IFN−
αWA、及びIFN−α4aからなる群から選択される少なくとも10のヒトIFN−α
サブタイプを中和する、実施形態1〜5のいずれか一項に記載の抗体。
12)前記抗体が、少なくともアミノ酸残基F27、L30、及びR33において配列
番号1のヒトIFN−ωと結合する、実施形態11に記載の抗体。
13)前記抗体が、それぞれ配列番号109、114、121、161、119、及び
162のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR
3のアミノ酸配列を含む、実施形態1〜5のいずれか一項に記載の抗体。
14)前記抗体が、少なくとも前記ヒトIFN−αサブタイプのIFN−αA、IFN
−αB2、IFN−αC、IFN−αF、IFN−αG、IFN−αH2、IFN−αJ
1、及びIFN−α4aを中和する、実施形態11〜13のいずれか一項に記載の抗体。
15)前記抗体が、IFN−αI、IFN−αK、又はIFN−αWAを更に中和する
、実施形態14に記載の抗体。
16)前記抗体が、
a)250U/mLのインターフェロンによって誘導された全血中での白血球インタ
ーフェロン誘導性IP−10放出を、10μg/mlの抗体の存在下で約50%以上阻害
するか、又は
b)全血中の全身性紅斑性狼瘡(SLE)免疫複合体によって誘導されたIP−10
の放出を、10μg/mlの抗体の存在下で約50%以上阻害する、実施形態1〜15の
いずれか一項に記載の抗体。
17)前記抗体が、配列番号28と少なくとも90%、91%、92%、93%、94
%、95%、96%、97%、98%、又は99%同一の重鎖可変領域(VH)アミノ酸
配列、及び配列番号150と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95
%、96%、97%、98%、又は99%同一の軽鎖可変領域(VL)アミノ酸配列を含
む、実施形態1〜16のいずれか一項に記載の抗体。
18)
a)配列番号109のHCDR1のアミノ酸配列、
b)配列番号111、112、又は113のHCDR2のアミノ酸配列、
c)配列番号115又は116のHCDR3のアミノ酸配列、
d)配列番号76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86
、87、88、89、90、又は91のLCDR1のアミノ酸配列、
e)配列番号93、94、又は95のLCDR2のアミノ酸配列、及び
f)配列番号96、97、98、99、100、101、102、103、104、
105、106、又は107のLCDR3のアミノ酸配列を含む、実施形態1〜17のい
ずれか一項に記載の抗体。
19)配列番号、
a)それぞれ109、113、116、77、93、及び104、
b)それぞれ109、113、116、85、93、及び96、
c)それぞれ109、113、115、79、95、及び107、
d)それぞれ109、113、116、76、93、及び103、
e)それぞれ109、113、115、85、93、及び96、
f)それぞれ109、113、115、89、95、及び100、
g)それぞれ109、113、116、86、93、及び105、
h)それぞれ109、113、115、76、93、及び103、
i)それぞれ109、113、116、80、93、及び97、
j)それぞれ109、113、116、84、93、及び97、
k)それぞれ109、113、116、90、93、及び97、
l)それぞれ109、113、116、88、93、及び102、
m)それぞれ109、113、116、87、93、及び105、
n)それぞれ109、113、116、91、93、及び106、
o)それぞれ109、113、115、80、93、及び97、
p)それぞれ109、113、116、83、93、及び101、
q)それぞれ109、113、116、82、94、及び98、
r)それぞれ109、113、115、78、95、及び100、
s)それぞれ109、111、116、81、93、及び106、
t)それぞれ109、113、116、82、94、及び99、
u)それぞれ109、113、115、81、93、及び106、
v)それぞれ109、112、116、81、93、及び106、又は
w)それぞれ109、113、116、81、93、及び106のHCDR1、HC
DR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3の配列を含む、実施形態
18に記載の抗体。
20)前記抗体が、ヒト化されている又はヒトである、実施形態1〜19のいずれか一
項に記載の抗体。
21)前記ヒト抗体重鎖可変領域フレームワークがヒト生殖系列遺伝子IGHV5−5
1(配列番号155)由来である、実施形態20に記載の抗体。
22)前記ヒト抗体軽鎖可変領域フレームワークがヒト生殖系列遺伝子IGKV1D−
39(配列番号156)由来である、実施形態21に記載の抗体。
23)前記抗体が、IgG1、IgG2、IgG3、又はIgG4サブタイプのもので
ある、実施形態1〜22のいずれか一項に記載の抗体。
24)前記抗体がFc領域内に少なくとも1つの置換を有する、実施形態23に記載の
抗体。
25)前記置換が、置換M252Y/S254T/T256E、V234A/G237
A/P238S/H28A/V309L/A330S/P331S又はP238S/L2
34A/L235Aを含み、残基の番号付けがEU番号付けに準ずる、実施形態24に記
載の抗体。
26)重鎖可変領域(VH)及び軽鎖可変領域(VL)を含み、
a)VHが配列番号28、31、157、又は158のアミノ酸配列を含む、実施形
態1〜26のいずれか一項に記載の抗体。
27)前記VLが配列番号35、39、40、42、46、52、53、54、57、
61、62、68、71、73、75、135、又は150のアミノ酸配列を含む、実施
形態26に記載の抗体。
28)配列番号、
a)それぞれ28及び40、
b)それぞれ28及び39、
c)それぞれ31及び62、
d)それぞれ28及び54、
e)それぞれ31及び39、
f)それぞれ31及び68、
g)それぞれ28及び42、
h)それぞれ31及び54、
i)それぞれ28及び53、
j)それぞれ28及び73、
k)それぞれ28及び75、
l)それぞれ28及び52、
m)それぞれ28及び35、
n)それぞれ28及び135、
o)それぞれ31及び53、
p)それぞれ28及び46、
q)それぞれ28及び61、
r)それぞれ31及び57、
s)それぞれ157及び71、
t)それぞれ28及び150、
u)それぞれ31及び71、
v)それぞれ158及び71、又は
w)それぞれ28及び71、の前記VH及び前記VLを含む、実施形態27に記載の
抗体。
29)前記抗体が二重特異性である、実施形態1〜28のいずれか一項に記載の抗体。
30)前記抗体が、BLyS、CD40L、IL−6、CD27、BDCA2、IL−
12、IL−23、IFN−αD、IL−17、CD20、IL−10、CD22、IL
−21、ICOS、ICOSL、又はIFN−γと結合する、実施形態29に記載の抗体
。
31)実施形態1〜30のいずれか一項に記載の抗体と、医薬的に許容される担体と、
を含む、医薬組成物。
32)前記抗体VH若しくはVL、又は実施形態1〜28のいずれか一項に記載の抗体
VH及びVLをコードするポリヌクレオチド。
33)実施形態32に記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
34)実施形態33に記載のベクターを含む宿主細胞。
35)実施形態19に記載の抗体の生成方法であって、前記抗体が発現する条件下で実
施形態33に記載の宿主細胞を培養することと、前記宿主細胞によって生成された抗体を
回収することとを含む、方法。
36)免疫媒介炎症性疾患又は自己免疫疾患の治療に使用するための、実施形態1〜3
0のいずれか一項に記載の抗体。
37)
a)前記免疫媒介炎症性疾患又は前記自己免疫疾患であって、任意選択的に狼瘡、乾
癬、免疫性血小板減少症(ITP)、エカルディ−グチエール症候群(AGS)、全身性
硬化症、シェーグレン症候群、筋炎、分類不能型免疫不全症(CVID)、自己免疫性甲
状腺疾患、I型糖尿病、関節リウマチ、移植片拒絶反応、又は移植片対宿主病(GVHD
)である、前記免疫媒介炎症性疾患又は前記自己免疫疾患、
b)慢性ウイルス感染症であって、任意にHIV又はC型肝炎感染症である、慢性ウ
イルス感染症に使用するための、実施形態36に記載の抗体。
38)狼瘡の治療に使用するための、実施形態1〜30のいずれか一項に記載の抗体。
39)狼瘡が全身性紅斑性狼瘡(SLE)又は皮膚紅斑性狼瘡(CLE)である、狼瘡
に使用するための、実施形態38に記載の抗体。
40)治療される患者が、
a)狼瘡腎炎を有するか、又は
b)I型インターフェロンシグネチャを示す、免疫媒介炎症性疾患又は狼瘡の治療に
使用するための、実施形態1〜30のいずれか一項に記載の抗体。
41)第2の治療薬と組み合わせて実施形態37〜40に従って使用するための、実施
形態1〜30のいずれか一項に記載の抗体。
42)前記第2の治療薬が、
a)BLyS、CD40L、IL−6、CD27、BDCA2、IL−12、IL−
23、IFN−αD、IL−17、CD20、IL−10、CD22、IL−21、IC
OS、ICOSL、若しくはIFN−γと結合する抗体、
b)コルチコステロイド、抗マラリア剤、免疫抑制剤、細胞毒性剤、若しくはB細胞
調節剤、又は
c)プレドニゾン、プレドニゾロン、メチルプレドニゾロン、デフラザコート(defl
azcort)、ヒドロキシクロロキン、アザチオプリン、メトトレキサート、シクロホスファ
ミド、ミコフェノール酸モフェチル(MMF)、ミコフェノール酸ナトリウム、シクロス
ポリン、レフルノミド、タクロリムス、リツキシマブ(商標)、又はベリムマブ(商標)
である、実施形態41に記載の抗体。
43)前記抗体がIFN−αD、IFN−α1、及び/又はIFN−βを中和しない、
実施形態1〜30のいずれか一項に記載の抗体。
ISREレポーター遺伝子アッセイ(「ISREレポーター遺伝子アッセイ」)
完全に活性なI型IFNシグナル伝達経路を発現する(STAT2及びIRF9を安定
に発現する)ように操作され、IFN−α/β誘導性ISG54プロモーターの制御下で
、SEAPレポーター遺伝子でトランスフェクトされたHEK−Blue(商標)IFN
−α/β細胞(InvivoGen(San Diego,CA)を使用した。これらの
細胞を、10%ウシ胎児血清、100ug/mLのブラストサイジン、及び30ug/m
LのゼオシンでDulbeccoの改変イーグル培地中のコラーゲンI型コーティングさ
れたT150フラスコにて、37℃、5%CO2で増殖させた。細胞を採取し、50,0
00細胞/mLの384ウェルプレートに、50μL/ウェルでプレーティングした。プ
レーティングした細胞を37℃、5%CO2で24時間インキュベートした。試験したイ
ンターフェロン試料を調製し、使用済みのHEK ISRE無血清培地中で希釈し、IF
N試料50μLを各ウェルに添加した。プレーティングした細胞を37℃、5%CO2で
20時間インキュベートした。室温で20分間インキュベートした後、60μL/ウェル
のQUANTI−Blue(登録商標)を濾過水中に再縣濁した20μLのプレーティン
グした細胞上清から、アルカリホスファターゼが検出された。光密度をBiotek S
ynergyプレートリーダー上で、650nmで読み取った。
行った。HEK−Blue(登録商標)IFN−α/β細胞(InvivoGen(Sa
n Diego,CA)を、無選別培地(DMEM+Glutamax/10%(FBS
,Gibco))100μL中の50,000細胞/ウェルでプレーティングし、37℃
で終夜インキュベートさせた。翌日、I型IFN刺激因子を、別の96ウェルU底トラン
スファープレート(BD Falcon)において、I型IFN阻害剤あり又はなしで調
製して(即ち組み換えインターフェロン、白血球IFN、ICによって誘導されたIFN
調製物、血清など)、37℃で10分間予熱した。インキュベータから細胞プレートを取
り出し、培地を取り除き、96ウェルU底トランスファープレートにおいて調製した10
0μLの適切な処置物と交換した。細胞を再び37℃で24時間置いた。翌日、40μL
の上清を、160μLのQUANTI−Blue(登録商標)SEAP基材(Inviv
ogen)を含む96ウェル平底プレート(BD Falcon)に移した。プレートを
約15分間発色させ、650nmの吸光度で分光計を使用して読み取った。
VeriPlexヒトインターフェロン多重ELISAキット(PBL Assay
Science、カタログ番号51500−1)を用いた多重ELISAを用いて、製造
業者の指示に従い、中国南京市出身の2つの独立したSLEコーホートの血漿、及び米国
の白人コーホートから収集した血清を可溶性IFN−ω及びIFN−αに関して分析した
。多重ELISAは多くのIFN−αサブタイプを検出するが、全てを検出せず、全IF
N−α濃度対IFN−ωの量的な違いは正確に反映しない場合がある。
コーホート(図1B)の各コーホートの両方からの特定の患者において上昇したことが判
明した。図1Aは、上昇したIFN−α又はIFN−ωを有することが判明した患者のみ
の結果を示す。白人群の血清試料を、ISREレポーター遺伝子アッセイを用いてIFN
−I活性に関して更にスクリーニングした。ELISAによって最高量の検出可能IFN
タンパク質を示したドナーは、レポーター遺伝子アッセイにおいてISRE誘導の最高濃
度を示した(図1C)。
より優れたSLE免疫複合体によって誘導されたIFNの阻害をもたらす
SLE免疫複合体によって誘導されたIFN(SLEに存在するI型IFN環境をより
良好に表わす刺激である)を減少させるためのIFN−αのみの阻害、又はIFN−ω及
びIFN−αの両方の阻害の効果を評価した。ヒトPBMCを2名の個別のSLEドナー
から調製した免疫複合体で刺激することにより、SLE免疫複合体によって誘導されたI
FNを調製し、この馴化培地をIFN阻害剤及び対照の存在下のI型IFN誘導性レポー
ター遺伝子アッセイ(ISREレポーター遺伝子アッセイ)で利用した。
タンパク質A/Gカラム(Thermo Scientific、カタログ番号899
58)を使用し、製造業者の指示に従い、SLEドナー232及び293の血漿(IFN
活性に関して予備スクリーニングした)、並びに健常対照の血漿(Astarte Bi
ologics)をIgG精製に利用した。プールされた健常ドナーの調製物からの血清
(Life Technologies、カタログ番号34005100)を、健常対照
のIgGの精製に用いた。免疫複合体形成のための溶解物を生成するために、HEK29
3T細胞(ATCC、カタログ番号CRL−3216)を1×DPBS(Life Te
chnologies、カタログ番号14190−250)中で5×107細胞/mlに
濃縮した。溶解物を生成するために、10分間の凍結解凍を4サイクル実施し、30分間
の初期凍結を除いては、−80℃で凍結し、37℃で解凍した。4回目の凍結解凍後、細
胞残屑を400×gで5分間の遠心分離によって除去した。精製IgG調製物及び細胞溶
解物を、続いてBCAタンパク質アッセイ(Pierce、カタログ番号23225)を
用いて、製造業者の指示に従い定量した。免疫複合体で刺激した馴化培地調製物を生成す
るため、Cell Preparation管(BD Vacutainer、カタログ
番号362753)を用いて健常ドナーのヘパリンナトリウム化血液からのPBMCを単
離し、RPMI 1640(Life Technologies、カタログ番号118
75−085)+10% FBS(Life Technologies、カタログ番号
16140−063)培地で2×106細胞/mlに再懸濁して、2ml/ウェルの6ウ
ェルプレートにプレーティングした。SLEからの精製IgG及び健常血清を細胞溶解物
と各500ug/mlの同等の濃度でプレミックスし、RTで30分間インキュベートし
、続いて2ml/ウェルでPBMCに添加し、37℃で24時間インキュベートした。プ
レートを1000rpmで5分間遠心分離にかけ、PBMC免疫複合体刺激馴化培地を回
収し、アリコートし、将来の使用のために−80℃で保存した。
HEK−Blue IFN−α/β細胞(Invivogen)を96ウェル平底プレ
ート中の200μl DMEM(Life Technologies)+10%ウシ胎
児血清(Life Technologies)に50,000細胞/ウェルでプレーテ
ィングし、37℃で5時間インキュベートして、細胞をプレートに付着させた。5時間後
、HEK Blue細胞をインキュベータから取り出し、上清を、ドナー232 PBM
C馴化培地の1:6希釈物、又はドナー293馴化培地1:81希釈物と交換し(希釈剤
としてHEK Blue細胞培養培地を用いて)、0.4、2、10、50、及び100
μg/mlの広域の抗IFN−αアンタゴニストmAb(M24、ヒトIgG1)に加え
て固定濃度20μg/mlのアイソタイプ対照(R&D Systems、ネズミIgG
1)、100μg/mlの抗IFN−αと組み合わせて20μg/mlの抗IFN−ωア
ンタゴニストmAb(eBioscience、クローンOMG5、ネズミIgG1)、
又は100μg/mlのヒトIgG1アイソタイプ対照(Southern Biote
ch)と組み合わせた20μg/mlのネズミIgG1アイソタイプ対照、の処置を加え
たか、又は加えなかった。細胞を37℃で終夜インキュベートした。翌日、各ウェルから
40μlの細胞上清を取り除き、別個の96ウェル平底プレート中の160μlのQua
nti−Blueアルカリホスファターゼ基質(Invivogen)に添加した。上清
を基質と10分間反応させ、プレートを650nm波長の分光光度計で読み取った。Gr
aphPad Prismで光学濃度をプロットした。
遮断と比較してSLE関連IFN−I活性の強化された抑制をもたらした(図2)。予測
通り、健常ドナーからの免疫複合体で刺激されたPBMCからの馴化培地(HV IC馴
化培地)は、SLE患者の免疫複合体のインターフェロン産生能(interferogenic poten
tial)を示す検出可能なISRE活性を有さなかった。
ケモカイン分泌、IFN遺伝子シグネチャ、樹状細胞の成熟及び活性化、並びにB細胞
の成熟を誘導するIFN−ωの能力を、IFN−αと比較して評価した。これらの研究で
は、最も広く用いられる治療的IFN−α分子であるIFN−αA及びIFN−α2を、
代表的なIFN−αサブタイプ対照として主に用いた。いくつかのアッセイでは、IFN
−αB2を用いた。
6名の健常ヒトドナーから単離したPBMCをIFN−αA(IFN−α2)又はIF
N−ωで刺激し、上清及びペレット剤を回収して分析した。処置後3、6、及び24時間
。25のサイトカインのパネル(L−1β、IL−1RA、IL−2、IL−2R、IL
−4、IL−5、IL−6、IL−7、IL−8、IL−10、IL−12、IL−13
、IL−15、IL−17、TNF−α、IFN−α、IFN−γ、GM−CSF、MI
P−1α、MIP−1β、IP−10、MIG、Eotaxin、RANTES、及びM
CP−1)を、Luminexイムノアッセイを用いて上清から測定した。IFN−ω及
びIFN−α2はいずれも検出可能なIP−10、MCP−1、IL−1RA、IL−6
、MIP−1α、及びMIP−1βのレベルを高めた。図3は、IFN−ω及びIFN−
α2によるIP−10の誘導を示す。IL−8の分泌は、これらの試験における両方の処
置によって減少された。IFN−α又はIFN−ω処置によってIL−2R、IL−12
、及びRANTESのレベルは変更されなかった(RANTESのみが上昇した1ドナー
の例外を除く)。サイトカインパネルの他の全ての検体は、IFN−α又はIFN−ω処
置に関連して変化することはなかった、又は検出限界を下回っていた。
ene IFN panel signature)を用いてマイクロアレイによって評価し、IFN−ω及びI
FN−αによって誘導された発現における可能な類似及び/又は差異を評価した。IFN
−ωで処置したヒトPBMCは、IFN−αAで処置した細胞と比較して、ほぼ(neary
)区別不能な定性的及び動的遺伝子発現応答を示した。未処置の対照に対してIFN−α
A処置によって調節された遺伝子の92.5%を、3時間時点でIFN−ω処置で更に調
節した。処置後6時間及び24時間時点で、IFN−α処置によって調節された遺伝子の
97.83%及び99.25%を、それぞれIFN−ωによっても調節した(データは示
さず)。
IFN−ωによって誘導された区別不可能な定性サイトカイン放出及び遺伝子発現プロフ
ァイルは、これらは同様の免疫調節効果を付与し得ることを示す。
た。
のみの、又はIFN−α又はIFN−ωを伴った存在下で、標準的な方法を用いて3日間
、精製単球をDCに分化した。細胞を採取し、8色FACSによって表面マーカーの発現
に関して分析した。IFN−α及びIFN−ωは、特徴的なDC表面マーカー発現CD8
3、及びCD80、CD86、CD40、CD11cを誘導し、発現又は単球マーカーC
D14を低減した。培養の開始時に抗IFN−α又は抗IFN−ωのいずれかを濃度50
μg/mlで添加することによりDCの分化が部分的に阻害されたが、アイソタイプ抗体
には何の効果もなかった(データ示さず)。
を採取し、洗浄し、新鮮培地で再懸濁し、精製したCD4+T細胞を用いてDC:CD4
+T細胞比率1:10、1:20、及び1:100で培養した。6日目に上清を回収して
、26サイトカイン/ケモカイン用の多重ビーズアッセイを用いて、分泌サイトカインに
関して分析した。IFN−α又はIFN−ωのいずれかの存在下で分化されたDCは、T
細胞特異性サイトカインIFN−γ及びIL−17の分泌によって示されるように、CD
4+細胞を活性化した。抗IFN−α又は抗IFN−ω抗体のいずれかの存在下で分化さ
れたDCは、CD4+T細胞の活性化を誘導しなかった。図4Aは、抗IFN−α又は抗
IFN−ω抗体の存在下で分化されたDCによって活性化されたCD4+細胞から誘導さ
れたIFN−γ分泌物が欠如していることを示す。図4Bは、抗IFN−α又は抗IFN
−ω抗体の存在下で分化されたDCによって活性化されたCD4+細胞から誘導されたI
L−17分泌物が欠如していることを示す。IFN−α及びIFN−ωは、IL−4、I
L−5、IL−12p40、及びIL−13(データ示さず)の分泌も誘導した。全ての
培養条件はGM−CSFを含んでいた。データは2つの研究を表す。エラーバーはLum
inex3連のSDを示す。図に示す実験では、データは、1:20のDC:CD4 T
細胞比が用いられたことを示した。
B細胞は、病原性自己抗体及びサイトカインの生成を介して、またT細胞に抗原を提示
することにより、狼瘡病原に決定的に重要な役割を果たす。B細胞の活性化及び機能的成
熟は、T細胞依存性(TD)又はT細胞非依存性(TI)の方法で生じ得る。TIのB細
胞の応答においては、TLRリガンド又は樹状細胞誘導サイトカインがT細胞のヘルプの
代替となることができるために、B細胞はT依存性耐性対照(T-dependent tolerance co
ntrol)から放出される。TLRリガンド(例えば二本鎖DNA)及びDC誘導サイトカ
イン(例えばI型IFN)が疾患病因に寄与すると考えられるSLEにおいては、TIの
B細胞はおそらく適切な機構を示す。自己抗体の生成の他にも、自己反応性B細胞は、自
己抗原をT細胞に提示して炎症促進性サイトカインを分泌することにより重要な病原性役
割を果たすと考えられる。IFN−αは、T細胞誘導因子の不在下で、B細胞受容体(B
CR)及びCpG(それぞれ特異的な抗原及びTLRシグナルを模倣する)に対する抗体
によって活性化されたヒトB細胞によって炎症促進性IL−6の生成を増進することが報
告されている。更に、形質球様DCとの同時培養も、可溶性因子に依存するCD86発現
レベルによって決定されるB細胞の活性化を増進することが示されている。ヒトB細胞に
よるCD86発現及び炎症促進性サイトカインの生成を増進するIFN−ωの能力を、T
細胞非依存性培養系を用いて調査した。示されるようにCpG(ODN−2006)、抗
BCR、並びにCpG及び抗BCR、並びに様々な濃度のIFN−α2(α2b)又はI
FN−ωを用いて、末梢血B細胞を培養した(IFN濃度の単位はU/ml)。3日後、
フローサイトメトリーによってCD86発現(平均蛍光レベル)を決定し、上清を、IL
−6を含む26−plexのLuminexイムノアッセイによって分析した。結果を複
製試料±SDの平均値として表した。
用量依存的なIFN−ωによって誘導された上方調節が観察されたが、一方で刺激なしの
Bリンパ球の同時培養は弱い効果しか示さなかった。INF−ωは、IFN−α2Bと比
較してより近いCD86の発現を誘導した。図5Aは、1ドナーのB細胞からIFN−ω
によって誘導されたCD86の発現を示す。IFN−ωは、試験した両方のドナー試料で
、IFN−α2Bと比較してより近い程度のCpG及び抗BCR/CpG刺激によるIL
−6の生成も用量依存的に誘導した。図5Bは、1ドナーのB細胞からIFN−ωによっ
て誘導されたIL−6の分泌を示す。
BLyS(BAFF)はB細胞生存因子であり、臨床的に有効なヒトSLE中の標的で
ある。IFN−α処置は、投薬から24時間後に患者から単離したPBMCをマイクロア
レイ及びqPCR分析することによって決定されるように、インビボでBLyS遺伝子発
現を誘導することが判明している。よって、BLySの分泌を誘導するIFN−ωの能力
を評価した。
−αを用いて細胞を72時間の間刺激し、その時点で上清を回収して、ELISAによっ
て可溶性BLySに関して分析した。結果を複製試料±SDの平均値として表した。
では同様にコンピテントであった。1名のドナーからの結果を図6に示す。
るヒトI型IFN抗原の生成
表4に示す20の個別の組み換えヒトI型IFN−αをクローニングし、配列番号21
〜25のようなシグナル配列を用い、標準的な方法を用いて、HEK 293細胞におい
て発現させた。タンパク質は特に指示しない限りはヒトである。発現レベル及び可溶性を
改善するために、ヒトIFN−ωの位置80の単一のアミノ酸突然変異体であるIFN−
ωT80Eを生成し、HEK 293細胞において発現させた。T80E IFN−ω変
異体(配列番号2)は、野生型タンパク質と同等の活性を有した。IFN−αD及びIF
N−α1は、位置114の1つのアミノ酸が異なる(バリン対アラニン)。αA及びα2
は、位置23の1つのアミノ酸が異なる(αAのリシン対α2のアルギニン)。α4は2
つの形態4a及び4bを有し、これらは位置51(α4aのアラニン対α4bのスレオニ
ン)及び114(α4aのグルタミン酸対α4bのバリン)の2つのアミノ酸が異なる。
これらの変異は受容体結合領域外に位置し、活性に影響を及ぼさない。抗体は、これらの
変異体の対(αD/α1、αA/α2、及びα4a/α4b)を等しく良好に中和しする
ことが判明し、その後のいくつかの実験では、各対1つの抗原のみを使用した。
IFN−α及びIFN−ωに結合するFabsを、ShiらのJ Mol Biol
397:385−96,2010、国際公開公報第WO2009/085462号;米国
特許出願公開第US2010/0021477号で説明されるように新たなpIXファー
ジディスプレイライブラリから選択した。要約すると、ライブラリは、ヒト足場を多様化
することによって作製されたものであり、生殖系列VH遺伝子であるIGHV1−69*
01、IGHV3−23*01及びIGHV5−51*01を、H3ループを介してヒトI
GHJ−4ミニ遺伝子で組み換え、そしてヒト生殖系列VLκ遺伝子であるO12(IG
KV1−39*01)、L6(IGKV3−11*01)、A27(IGKV3−20*0
1)及びB3(IGKV4−1*01)をIGKJ−1ミニ遺伝子で組み換えることで、
完全なVH及びVLドメインを構築した。多様化に際し、重鎖及び軽鎖可変領域内の、タ
ンパク質抗原及びペプチド抗原と高頻度に接していると確認された位置に相当するH1、
H2、L1、L2及びL3ループ周辺の位置を選択した。選択した位置での配列多様性は
、それぞれのIGHV又はIGLV遺伝子のIGHV又はIGLV生殖系列遺伝子ファミ
リーそれぞれの位置で生じる残基に制限した。7〜14アミノ酸長の単鎖〜中鎖型の合成
ループを利用することにより、H3ループにおいて多様性が発生した。H3でのアミノ酸
分布を、ヒト抗体において観察されるアミノ酸の変動を模倣するよう設計した。ライブラ
リ設計の詳細は、ShiらのJ.Mol.Biol.397、385−96、2010年
に記載されている。ライブラリを生成するために利用した足場は、これらのヒトVH及び
VL生殖系列遺伝子起源に準じて命名した。IFN−及びIFN−に対するパニング実験
では、3つの重鎖ライブラリを、4個の生殖系列軽鎖又は生殖系列軽鎖ライブラリと組み
合わせることで12個の固有VH:VLの組み合わせを生成した。
かに対してパニングした。3回のパニングの後、抗原としてヒトIFN−α2、IFN−
αG、及びマカクザルIFN−ωを用いたポリクローナルファージELISA法を実施し
て、各パニング実験の特異的富化を検出した。IFN−α2、IFN−αG、及びIFN
−ωに対する結合剤の富化を実証したこれらのパニング実験で回収されたファージを、モ
ノクローナルFabのELISAで更にスクリーニングして、ここで個々のFabクロー
ンから発現したFabタンパク質を結合剤として用いた。陰性対照の3倍である20nM
のビオチン化抗原に対する結合シグナルを有するFabクローンを、2次Fabスクリー
ニングのために選択した。選択(select)FabをIgG1/κ背景にクローニングし、
更にProteOn及びISREレポーター遺伝子アッセイを用いて特徴付けした。これ
らのアッセイから、mAb IFWM371を更なる改変及び親和性成熟のために選択し
た。
ター遺伝子アッセイを用いて測定した、IFWM371の親和性(KD)及びIC50値を
示す。IFN−α1(IFN−αD)を除き、全てのヒトIFN−αタンパク質に結合し
たIFWM371を、179pM〜10nMの範囲で試験した。抗体は、IFN−α1(
IFN−αD)には結合しなかった。抗体は、ヒト、チンパンジー、及びマカクザルIF
N−ωにも結合したが、IFN−βには結合しなかった。IFWM371は、抗体が中和
しなかったIFN−α1(αD)を除いて、試験された全てのIFN−α分子に対する中
和活性を示した。IFWM371はVH IFWH591(配列番号28)及びVL P
H9L4(生殖系列O12)(配列番号29)を含む。
エピトープ及びパラトープ、IFN−αサブタイプ及びIFN−ωに対する広範な結合
特異性の構造的基礎を明らかにし、親和性及び特異性を改善するための改変を支持するた
めするため、IFWM371のFabと複合したヒトIFN−ω T80Eの結晶学的研
究を実施した。
ーニングし、HEK293細胞において発現し、アフィニティ、イオン交換、及びサイズ
排除クロマトグラフィーを用いて精製した。Fabは、20mMのトリス(pH7.4)
、50mMのNaClに受容された。C末端6xHisタグを有するヒトIFN−ω T
80E変異体(以下、単にIFN−ωと呼ぶ)をHEK293細胞内で発現させた。タン
パク質は、20mMのトリス(pH7.4)、50mMのNaClに受容された。
FN−ω)で混合し、4℃で終夜インキュベートし、20mm HEPES(pH7.5
)、0.25MのNaClで平衡したSuperdex 200カラムで精製し、続いて
Amicon−Ultra 10kDaカットオフを用いて9.96mg/mlに濃縮す
ることによって調製した。X回折に適した結晶を、MMS播種した20%のPEG 3K
、0.2Mの第二リン酸アンモニウムから得た(Obmolova,G.,Malia,
T.J.,Teplyakov,A.,Sweet,R.& Gilliland,G.
L.(2010)Promoting crystallization of ant
ibody−antigen complexes via microseed ma
trix screening.Acta Crystallogr D Biol C
rystallogr 66,927〜33.)。
、20%グリコールを補充した母液(20% PEG 3350、0.2M(NH4)2H
PO4、pH7.9)に数秒間浸漬し、100Kの窒素流中で急速凍結させた。X線回折
データは、Osmic(登録商標)VariMax(登録商標)共焦点光学系、Satu
rn944CCD検出器、及びX−stream(商標)2000極低温冷却システム(
Rigaku,TX)を備えたRigaku MicroMax(商標)−007HFマ
イクロフォーカスX線ジェネレータを用いて収集した。回折強度は1/4度画像の205
度の結晶回転にわたって検出された。X線データをXDSプログラムで処理した。X線デ
ータ統計を表6に示す。
(MR)により解析した。MRの検索モデルは、Fab15(PDB ID 3NA9;
Luo,J.,Obmolova,G.,Huang,A.,Strake,B.,Te
plyakov,A.,Malia,T.,Muzammil,S.,Zhao,Y.,
Gilliland,G.L.& Feng,Y.(2010)Coevolution
of antibody stability and Vkappa CDR−L3
canonical structure.J Mol Biol402,708〜1
9)及びIFN−α4Aの結晶構造であった。しかしながら、IFN−ωのMR溶液は激
しい分子間衝突のため得ることができなかった。Fab IFWM371のみに位相合わ
せ(phased)された電子密度マップの検査は、IFN−ω分子の半分超の電子密度が消失
していることを示した。しかしながら、IFN−ω分子の残部はその密度に容易にフィッ
トした。続いてPHENIXで構造を精密化し、COOTを用いてモデルの調整を実行し
た。
称単位中に1つの複合体が存在した。IFN−ω分子の分子構造モデルは、ヘリカルセグ
メントAB並びにヘリックスD及びEに対応する残基23〜39及び119〜153を含
んでいた。残基の番号付けは、配列番号1に示されるIFN−ωアミノ酸配列に準ずる。
ヘリックスA、B、及びC、並びに接続ループを無秩序化した。Fab分子構造モデルは
、軽鎖に1〜212残基(配列番号29)、及び重鎖に1〜222残基(配列番号28)
を含んでいた。C末端6xHisタグ、鎖間ジスルフィド結合、及び重鎖の137〜14
1の残基を無秩序化した。更に、抗体/抗原界面に広範な水素結合ネットワークを形成す
る多くの水分子が存在した(図7B)。
id 3se4、40の残基に関して0.54ÅのCα rmsd)の対応する部分とほ
ぼ同一であり、また約40のCa原子に対して0.42Åの平均RMSDを有するIFN
−α2(6つのIFN−α2分子、PDBコード1rh2)と非常に似通っていた。IF
N−ω/Fab IFWM371中のIFN−ωのモデルは、ヘリックスC及びDの部分
、並びに接続ループ(ループAB)のみを含んでいた。電子密度中に他の部分は存在しな
かった。結晶パッキング分析は、消失したヘリックスのための十分な空間が存在しないこ
とを示した。回折データを慎重に分析することにより、これが、双晶化又は不正確な空間
群の割り当てなどの異常に起因するアーチファクトでないことが示された。したがって、
これは、IFN−ωタンパク質が結晶化プロセス中に開裂した可能性が高い。
EのM146及びK150の残基からなる立体配座エピトープを認識した(図8A)。パ
ラトープはLCDR2を除く5つのCDRからの残基で構成されている。パラトープ残基
は一連のポケットを形成し、そこに、IFN−ωの短いABへリックスの残基F27、L
30、及びR33の側鎖がドッキングする。図8Bは、IFWM371のVL及びVH中
のパラトープ残基を示す。抗体と抗原との間の相互作用の大半が、ファンデルワールス(
vdw)及び疎水性パッキング、並びに抗体−抗原間の水素結合であると考えられる。図
8Cは、IFN−ωとIFWM371との間の相互作用の2D相互作用マップを示す。図
では、IFN−ωエピトープ残基は灰色で強調され、VLパラトープ残基は枠で囲まれ、
VHパラトープ残基は円で囲まれている。図は、大半の抗原/抗体相互作用が、IFN−
ωABヘリックスの3つのエピトープ残基F27、L30、及びR33によって形成され
ることを実証する。したがって、IFN−ωのこの領域がエピトープの主要部分を構成し
ている。この複合体の別の特徴は、水分子が抗原識別を媒介する重要な役割を果たしてい
ると考えられることである。3つの水クラスタ(WC)が界面に存在した。WC1は、H
CDR3とIFN−ωのR34、F36、及びE147との間の水素結合相互作用に寄与
した。WC2はVH/VL対合、並びにFvと主エピトープ残基L30、R33、及びそ
の隣接残基との間の水素結合を媒介した。WC3水分子は界面の辺縁部に存在し、おそら
く相互作用に対する重要性は低い。
N−αD又はIFN−α1は除く。IFWM371はIFN−βとは結合しない。IFN
の配列アラインメントを図9に示す。IFWM371エピトープ残基は、サブタイプ間で
大部分が保存されており、これはIFNM371の広範な特異性がエピトープ保存の結果
であることを示している。しかしながら、IFWM371が結合しないIFN−αD又は
IFN−α1は、F27ではなくS27を含み、これはF27側鎖の疎水性接触の大部分
を喪失することにつながる。F27はHCDR2、HCDR3、及びLCDR3の残基に
よって形成された深いポケットにドッキングするため、側鎖接触の喪失は、IFN−αD
及びIFN−α1タンパク質による結合が非常に少ないか又は存在しないためである可能
性が最も高い。これは、F27が結合する「ホットスポット」残基のうちの1つであるこ
とを更に示す。P26は良好に保存されない残基である。His又はLeu残基はいくつ
かのIFN−αサブタイプにおいてこの位置を占める。寸法及び形状の違いのために、こ
の残基はIFWM371とこれらの突然変異を有するIFN−αとの間の局所相互作用に
大きな影響を及ぼし得る。
IFWM371重鎖及び軽鎖CDR残基のアラニンスキャンを実施し、続く親和性成熟
への取り組みに導いた。いくつかの溶媒曝露の低い又は溶剤に曝露されていない残基を除
く、重鎖及び軽鎖両方のCDR中の全ての残基をアラニンと置換した。CDRの天然残基
がアラニンである場合、チロシン及び/又はセリン及び/又はアスパラギン酸と置換した
。可能性のある発生傾向を有する1つの位置(IFWH591中W104、配列番号28
)をアラニン、チロシン、セリン、及びアスパラギン酸で置換した。突然変異させたmA
bをHEK293細胞内で一時的に発現させ、細胞上清のIFNのパネルに対する結合活
性をELISAによって試験した。2つのVH突然変異体、IFWH591 R59A(
配列番号30)及びIFWH591 N103A(配列番号31)は、親mAbと比較し
て著しく改善された結合を有した。
ライブラリ設計
2つの別個のVLライブラリ(PH9L4L2及びPH9L4L3)を設計して、親和
性成熟IFWM371軽鎖PH9L4(O12)(配列番号29)に対して使用した。ラ
イブラリPH9L4L2の多様化のために選択された位置は、抗タンパク質及び抗ペプチ
ド複合体で頻繁に見られる残基位置に基づいた。各位置を多様化するために用いられた残
基をIGKV遺伝子の生殖系列遺伝子ファミリー内でコードした(Shiら(2010)
J.Mol.Biol.397:385−96)。ライブラリの複雑性は、親和性成熟の
間に多様性が十分に評価されるように107ライブラリメンバーを超えないように制限さ
れた(実際のライブラリ複雑性は3.57)。表7は、ライブラリ中のVLLPH9L4(
O12)のLCDR1位置30、31、及び32、LCDR2位置50、並びにLCDR
3位置91、92、93、94、及び96のライブラリ設計多様化スキームを示す。残基
番号付けはKabatに準ずる。
ンパク質複合体間の構造分析に基づいて選択し、各位置における多様性は、抗体−タンパ
ク質構造、並びに各位置での生殖系列遺伝子中のアミノ酸の使用の分析に基づいて設計し
た(G.RaghunathanらのAntigen−binding site an
atomy and somatic mutations in antibodie
s that recognize different types of anti
gens.J.Mol Recognit.25:103〜113(2012))。LC
DR3の場合、各位置が異なる生化学的性質のアミノ酸(即ち、極性/無極性、正/負に
帯電)を有するように、多様性を天然のレパートリーを超えて拡大した。更に、位置ごと
の各アミノ酸の相対度数を変化させ、これをSloningライブラリ合成技術によって
実現した。表8はPH9L4L3のライブラリ組成を示す。残基番号付けはKabatに
準ずる。
軽鎖ライブラリPH9L4L2又はPH9L4L3と親重鎖IFWH591(配列番号
28)とを組み合わせることにより、親和性成熟ライブラリを生成した。続いてライブラ
リを用いて高親和性抗体を選択するためにパニングした。いくつかの親和性成熟パニング
実験は、IFN−ωのみ又はいくつかのIFN−αサブタイプのみのいずれかに対する結
合に偏って改善したが、両方は改善しなかった。大半のIFN−αサブタイプ及びIFN
−ωに関して改善されたIC50を用いて広範な中和抗体を生成するために、互いに対して
より多様化されたIFN−αサブタイプのサブセット(IFN−α2、IFN−α4a、
IFN−αF、及びIFN−αG)を各パニングラウンド間でマカクザル又はヒトIFN
−ωで交互にパニングした。各パニング実験に対して合計3ラウンドのパニングを実施し
た。
物をFabのELISAに用いて、IFWM371と比較したヒトIFN−α4a、IF
N−αF、及びIFN−ωに対するこれらの親和性を決定した。IFWM371Fabは
これらの抗原に弱く結合したため、抗原に対するより高い親和性を有するFab IFW
F477を比較のための代理Fabとして用いた。42のクローンを、ELISAの代理
Fabと比較して数倍高い結合活性を示すものとして特定した。いくつかの変異体は、L
CDR1に1つのアミノ酸挿入を含んでおり、これは原ライブラリ設計の一部ではないが
、ライブラリ合成の間に挿入された。全体として、VLの親和性成熟は、代理Fabと比
較して結合の顕著な改善をもたらした。2つのライブラリの最高のクローンのそれぞれが
、ヒトIFN−ωに対し代理Fab IFWF477と比較して23倍を超える高さの結
合活性を示した。
親重鎖IFWH591(配列番号28)、並びに実施例7で説明したアラニンスキャン実
験で特定された改善された結合活性を有する2つのVH変異体のIFWH624(IFW
H591 R59A配列番号30)及びIFWH629(IFWH591 N103A、
配列番号31)とを組み合わせた。続いて、合計126の変換されたmAb(42の軽鎖
と3つの重鎖との組み合わせ)を発現させて、更に特徴付けした。表9は、親及び選択(
select)親和性成熟抗体、並びにこれらの重鎖及び軽鎖可変領域を示す。
対する親和性をProteOnによって測定した。48ウェルプレートのHEK293E
細胞中でmAbを対照と共に一時的に3連でトランスフェクトし、細胞上清を本実験で使
用した。アッセイのスループットを改善するために、個別の抗原の濃度を1つのみ使用し
た。表10は、親IFWM371及び選択(select)親和性成熟抗体に対するKD値を示
す。mAbの大半は、試験された全ての抗原に対する結合親和性の顕著な改善を示した。
それらのうちのいくつかは、親mAbと比較して100倍超の改善を示した。
を阻害する能力に関してISREアッセイにおいて特徴付けし、また、これらの溶解度特
性及び生物物理学的特性を評価した。選択抗体に関し、ISREアッセイのIC50値を表
11及び表12に示す。11の組み換えIFN−αサブタイプ及びIFN−ωに対するい
くつかの抗体に関して、IC50値は2桁以下のpMであった。これは、その抗原に対する
IC50が1桁から2桁のnMの範囲である親mAbのIFWM371と比較して100倍
を超える改善を示す。親抗体として、親和性成熟された抗体はIFN−αD又はIFN−
βを中和しなかった。最も強力な親和性成熟された抗体mAbのIFWM3423は、そ
れが結合した全てのインターフェロンサブタイプに対して概ね1桁ピコモルのIC50を有
した。
中和活性、溶解度特性、及び生物物理学的特性に基づき、IFWM371、IFWM3
331(IFWB3066)、IFWM3399(IFWB3134)、IFWM342
1(IFWB3156)、及びIFWM3423(IFWB3158)の親和性成熟由来
の4つのmAbを更に分析した。これらのmAbの重鎖はIFWH591(配列番号28
)又はIFWH629(配列番号31)のいずれかからなり、これらの軽鎖はIFWL9
84(配列番号71)、又はIFWL1048(配列番号53)、又はIFWL1073
(配列番号61)のいずれかからなる。
性化モチーフ(D55−S56)を含むいくつかの潜在的翻訳後修飾(PTM)モチーフ
、びにHCDR1(W33)及びCDR−H3(W104)に潜在的酸化部位をそのCD
R内に含む。
DR1に1つの異性化モチーフ(D30−G31)を含み、一方でIFW1073(配列
番号61)のVLはLCDR3(W92及びW94)に潜在的酸化部位、並びにLCDR
1(N31−S32)に脱アミド部位を含む。
チロシン(D52Y)に復帰突然変異させた。P53をアラニンに突然変異させた。HC
DR3中のW104(VH_W104)をアラニン、チロシン、セリン、又はアスパラギ
ン酸と置換した。突然変異させた重鎖を3つの異なる軽鎖と共発現させて、ISREアッ
セイで試験した。これらの実験から、重鎖IFWH615(配列番号157)及びIFW
H617(配列番号158)を有する抗体を更に特徴付けした。
Mリスクを低減するために、実施例6で説明したIFWM371/IFN−ω複合体構造
から得た構造的情報の案内に従い、潜在的PTMモチーフを除去するための一連の突然変
異を設計した。更に、共通の軽鎖IFWL984を有するIFWM3421(IFWB3
156)及びIFWM3423(IFWB3158)の溶解度特性を改善するために、抗
体軽鎖全体の表面疎水性を低減させるために、これらのCDRにおけるいくつかの疎水性
残基での一連の突然変異を発生させた。IFN−ω及び白血球IFNを阻害するため、実
施例11で説明された方法を用いて、親IFWH591を有するHEK293E細胞内で
IFWL984変異体を発現させ、細胞上清内で発現した抗体をISREレポーター遺伝
子アッセイでスクリーニングした。結果として得られた抗体IFWB3196(D30E
F32Y)、IFWB3201(D30S、G31S)、及びIFWB3202(D3
0S、G31S、F32Y)は良好な中和活性を保持した。表13は、親IFWH591
重鎖可変領域(配列番号28)及び変異体IFWL984軽鎖を有する、生成された抗体
のVL配列を示す。親IFWM3421はIFWH591のVHを有し、親IFWM34
23はIFWH629のVHを有する。表14は、選択(select)発生された抗体IFN
−ω及び白血球IFNを中和するためのIC50値を示す。
HEK293E細胞内で生成された軽鎖を重鎖IFWH591と共発現させ、抗体を含む
上清をISREアッセイでスクリーニングした。表15は生成された抗体のVH及びVL
配列を示し、表16はIFN−ω及び白血球IFNに対する抗体のIC50値を示す。IF
WB3210(D30S)、IFWB3211(D30E)、及びIFWB3223(D
30S、G31S)を含むLCDR1中のDGモチーフ(D30−G31)が除去された
、変異体IFWL1048鎖を有する結果として得られた抗体は、親mAb(IFWB3
056(VL:IFWL1048、VH:IFWH591)、及びIFWB3134(V
L:IFWL1048、VH:IFWH629))としての同様の中和活性を示した。し
かしながら、IFWB3219(D30E、A32Y)、IFWB3227(D30S、
G31S、F94L)、及びIFWB3230(D30S、G31S、A32Y、F94
L)を含む、疎水性を低減するためにDGモチーフが除去され、かつ置換がなされた、変
異体IFWL1048鎖を有する得られた抗体は、親mAbと比較してより低い活性を示
した。
W92及びW94)上に潜在的な酸化部位を含んでいた。IFWL1073(QQGWD
WPLT、配列番号98)のLCDR3を、多くの親和性成熟された抗体(QQSYDF
PLT、配列番号154)のLCDR3中に存在することが特定されたコンセンサス配列
LCDR3と置換した。更に、LCDR1の潜在的脱アミド部位(N31〜S32)に対
処するためにいくつかの突然変異体を設計した。IFWL1073の14の生成された変
異体をIFWH591と組み合わせ、48ウェルのHEK293Eの一過性トランスフェ
クションにて発現させた。細胞上清を、組み換えヒトIFN−ω及びウイルスによって誘
導された白血球によって発現されたIFNに対する中和活性に関してISREアッセイで
直接試験した。突然変異W93Y及び/又はW95Fを有するmAbは、いくらかの中和
活性の改善を示した。CDR−L1を置換又は短縮することによってNSモチーフを除去
する突然変異体は、中和活性の低減又は消失を示した。表17は生成された抗体のVH及
びVL配列を示し、表18はIFN−ω及び白血球IFNに対するIC50値を示す。
FWH591又はIFWH629のいずれかと組み合わせ、発現及び精製のためにスケー
ルアップした。表19は、抗体のVL/VH対合を示す。表20は、様々な組み換えIF
N−αサブタイプ及びIFN−ωに対する選択得られた抗体のIC50値を示す。
生成された抗体のうちのいくつかは、上記のISREアッセイを用いて測定された、1
00pM以下のIC50でIFN−ω及び複数のIFN−αサブタイプを中和した。これら
の抗体の可変領域配列を表21に示す。表22は抗体のLCDR1配列を示し、表23は
LCDR2を示し、表24はLCDR3を示し、表25はHCDR1を示し、表26はH
CDR2を示し、表27はHCDR3を示す。図10はISREアッセイでの各I型IF
NのIC50値を示す。
全血からのIFNによって誘導されたIP−10の放出を阻害する抗体の能力によって
、白血球IFNを中和する抗体の能力を評価した。
型IFNを阻害する能力を更に特徴付けした。全ての特徴付けされた抗体はIgG1/κ
型であった。抗体IFWM3522、IFWM3525、IFWM3399、及びIFW
M3423をアッセイで使用した。
240μlの全血(Biological Specialty Corporati
on)を、細胞培養培地(10%のHI FBS及び1%のペンストレップ(penn strep
)を有するRPMI1640)中に希釈したIFN又はIFN含有馴化培地あり又はなし
の30μIの抗体(抗IFN−α/ω又はアイソタイプ対照)を含む96ウェルのU底プ
レートの各ウェルに添加した。刺激のために、250U/ml(最終容量)のヒト白血球
IFN(Sigma−Aldrich)、及び10μl/ウェルのSLE免疫複合体で処
理した馴化培地を利用した。IFNと抗体との混合物を室温で20〜30分間プレインキ
ュベートした後に、全血に添加した。プレートを37℃で20〜22時間かけて終夜イン
キュベートした。翌日、室温でプレートを400×gで5分間遠心分離にかけて血漿を除
去し、−20℃で凍結させた。各処置からの複製試料をCXCL10/IP−10 EL
ISAキット(Qiagen)を用いて分析した。解凍時に、回収した血漿を、試料希釈
緩衝液を用いて2.5倍に希釈して、アッセイで使用した。標準の希釈に関して以下のわ
ずかな改変を加えた他は製造業者のプロトコルに従った。抗原標準の2倍希釈液を濃度4
000pg/mlから開始して31.25pg/mlで完了して作製した。反応停止後3
0分以内に450nmの吸光度でプレートを読み取った。Softmax Proを用い
て分析を実施した。
関連する細胞型中の内因性IFN−I調製物を中和する能力に関して選択抗体を特徴付
けした。全血のIFN刺激はインビトロ及びインビボのIP−10(CXCL10)放出
を誘導する(Arico,E.らのConcomitant detection of
IFNalpha signature and activated monocy
te/dendritic cell precursors in the peri
pheral blood of IFNalpha−treated subject
s at early times after repeated local cy
tokine treatments.J Transl Med 9,67,doi:
10.1186/1479〜5876〜9〜67(2011).、Mohty,A.M.
らのInduction of IP−10/CXCL10 secretion as
an immunomodulatory effect of low−dose
adjuvant interferon−alpha during treatme
nt of melanoma.Immunobiology 215,113〜123
,doi:10.1016/j.imbio.2009.03.008(2010))。
IP−10はSLE中で上昇し、いくつかの研究では疾患活性及び疾患の臨床症状と相関
することが示されている(Bauer,J.W.らのInterferon−regul
ated chemokines as biomarkers of systemi
c lupus erythematosus disease activity:a
validation study.Arthritis and rheumati
sm 60,3098〜3107,doi:10.1002/art.24803(20
09)、Kong,K.O.らのEnhanced expression of in
terferon−inducible protein−10 correlates
with disease activity and clinical mani
festations in systemic lupus erythematos
us.Clinical and experimental immunology
156,134〜140,doi:10.1111/j.1365〜2249.2009
.03880.x(2009)、Rose,T.らのIFNalpha and its
response proteins,IP−10 and SIGLEC−1,ar
e biomarkers of disease activity in syst
emic lupus erythematosus.Annals of the r
heumatic diseases 72,1639〜1645,doi:10.11
36/annrheumdis−2012〜201586(2013))。
mAbの能力をインビトロで検査した。IFN−Iは、感染の制御を助けるために、ウイ
ルスなどの感染性因子に応答して急速に生成される。ヒト白血球IFNは、ウイルス感染
後に白血球によって生成され、大半がIFN−αサブタイプ及びIFN−ωからなる、天
然のIFNの混合物である。IFN−ωは、これらの調製物中の全IFN−I活性の約1
5%を構成すると考えられる。重要なことに、感染は、SLEの誘発及び増悪の両方に潜
在的に寄与すると考えられる。この研究では、阻害剤又は対照の存在下でヒト白血球IF
Nを2名の健常ヒトドナーからの全血試料に添加し、血漿をIFN曝露から24時間後の
IP−10放出に関して評価した。抗IFN−α/ωmAb:IFWM3522及びIF
WM3525(図11A)、並びにIFWM3399(図11B)は全て、試験された両
方のドナー中で、白血球IFNによって誘導されたIP−10放出を用量依存的に中和し
た。
SLEの顕著な特徴は、典型的には臨床的に定義された疾患の発生に先立つ、抗二本鎖
DNA(抗dsDNA)などの自己抗体の存在である。核酸リガンドに結合した自己抗体
は、SLE患者におけるI型IFNの内因性誘導因子であると考えられている。自己抗原
のクリアランス障害と関連した圧倒的多数の自己抗体は、IFN生成のフィードバックサ
イクルに至り、形質細胞様樹状細胞(pDC)への免疫複合体のFc受容体依存性の内在
化が、循環するIFNの増量及びIFN遺伝子シグネチャの確立につながる。
験した。
患者由来の免疫複合体を健常ドナーのPBMC及び細胞培養から回収したIFN含有馴化
培地(IC92及びIC163)に添加した。次に、阻害剤又は対照の存在下で馴化培地
を4名の健常ドナーからの健常ドナー全血に添加して、IFNによって誘導されたIP−
10放出に対するIFN−α/ω中和の影響を決定した。IFWM3522、IFWM3
525、及びIFWM3399は全て、両方のSLE免疫複合体によって誘導されたIF
N調製物を用いた全ての全血ドナー中で、IP−10放出を用量依存的に中和した。図1
2Aは、1名のドナー(SLEドナー92)からの抗体IFWM3522及びIFWM2
525によりヒト全血中でSLE免疫複合体によって誘導されたIFNに刺激されたIP
−10の放出を示す。図12Bは、抗体IFWM3399及びアイソタイプ対照に関する
結果を示す。
抗IFN−α/ωmAbは、両方の滅菌リガンド(免疫複合体、実施例12)、及び微
生物リガンド(白血球IFN、実施例11)への曝露後にヒト初代細胞から生成された内
因性IFN−I調製物の強力な用量依存的中和を実証した。生理学的I型IFNを中和す
るIFN−α/ωmAbの効力を、SLE患者の血清及び血漿からのIFN−I活性を中
和する抗体の能力によって更に評価した。この方法は、インビトロでは再現(recapitula
te)が困難であり得るIFNスペクトルを含み得る患者からの実際に循環するIFN−I
環境を中和する抗体の能力を評価する。
HEK Blue(α/β)細胞(InvivoGen)を50,000細胞/ウェル
(合計容量200μlのDMEM+10% FBS)でプレーティングし、37℃で終夜
インキュベートした。翌日、本アッセイにおける30分のインキュベーション後に1.0
以上のOD達成を基準に予め選択されたプール血漿(3ドナー)又は血清(13ドナー)
を解凍して、DMEM+10% FBSと1:1(v/v)の比率で混合した。予めプレ
ーティングしたHEK Blue細胞から上清を除去して、100μlのSLE血漿又は
血清/培地混合物と置き換え、37℃で終夜インキュベートさせた。翌日、40μlの馴
化培地を除去し、新しいプレートに160μlのQuanti−Blue基質(Invi
voGen)を添加して、30分間インキュベートさせた。分光光度計を用いて650ナ
ノメートル波長でプレートを読み取り、GraphPad Prismを用いてIC50値
を計算した。
ISREアッセイを用いて、中国人患者のコーホート(SLEコーホート1)のSLE
血清、及び主にアフリカ系アメリカ人コーホート(SLEコーホート2)のSLE血漿を
IFN−I活性に関して予備スクリーニングした。1.0以上のODを有するSLEドナ
ーの血清又は血漿試料は、アンタゴニスト抗体による阻害が容易に測定され得るように十
分なIFN−I活性の窓を有していると決定された。続いてこれらのドナー試料をプール
して、反復実験及び抗体の滴定を実現するのに十分な試料堆積を生成する血清又は血漿ス
トックを生成した。SLE患者における定性的かつ定量的IFN−I応答の潜在的な多様
性をより良好に捕捉するために、様々な人種/民族コーホートからのSLE患者試料を利
用した。アフリカ系アメリカ人及びアジア人ドナーは、白人ドナーと比較してより高いI
FN−I活性を有すると考えられる。試験された抗IFN−α/ωmAbは、プールされ
たSLE患者の血清及び血漿試料中のIFN−I活性を用量依存的に中和した。両方のS
LEコーホートからのプール試料を用いた2つの独立した実験からのIC50値を表28に
示す。
I型IFNは、健常対照と比較して一部のSLE患者でも過剰発現する遺伝子のスペク
トルを誘導する。このIFN遺伝子シグネチャを示すSLE患者の血漿試料は、健常ドナ
ーPBMC又は細胞株に添加されたときに同様の遺伝子のセットの過剰発現を誘導するこ
とができ、この活性は、IFN−αを標的とする抗体によって主に中和される(Huaら
、Arthritis and rheumatism 54,1906〜1916,d
oi:10.1002/art.21890(2006))。
果を決定するためのアッセイを開発した。IFN−I誘導性遺伝子MX1(ミクソウイル
ス耐性1)発現をIFN−I活性のマーカーとして用いた。
SLE又は健常血液をナトリウムヘパリン管に回収してから2〜4時間後に、240μ
lを抗IFN−α/ω抗体又はヒトIgG1アイソタイプ対照を含む96ウェルのU底プ
レートにプレーティングした。PBSに希釈した抗体を、240μlの血液に30μl/
ウェルで添加した。37℃で24時間インキュベートした後、PAXgene安定試薬(
QIAGEN)を96ディープウェルプレートに添加し、血液試料を移して、ピぺッティ
ングにより十分に混合した。プレートを封止して、更なる処理のために−80℃で凍結し
た。解凍後、試料を2mlのSafe−Lock管(Eppendorf)に移して、5
000×gで10分間回転させた。上清を吸引して、試料ペレットを渦動によって432
μlのDNase/RNaseフリー水に再懸濁させた。試料を5000×gで更に遠心
分離して、ペレットを350μlのBR1緩衝液に再懸濁させた。次に300μlのBR
2緩衝液を添加し、続いて40μlのプロテイナーゼKを添加し、試料を55℃でインキ
ュベートし、800rpmで10分間振盪した。精製の残部に関しては製造業者のプロト
コルに従った(QIAGEN、カタログ番号762164)。各試料の全RNAのうち1
20ngをiScript cDNA Synthesisキット(BIO−RAD)を
用いてcDNAに変換し、ヒトMX1及びβ−アクチニン(ACTB)用のプライマー/
プローブ対(それぞれカタログ番号Hs00895608_m1及びHs0106066
5_g1)をqPCRに対して利用した。データをViia7 Real Time P
CRシステム上に収集して、GraphPad Prismで分析し、ACTB(dCT
)に対するMX1の発現の変化を示した。
患者の血中のIFN−Iシグネチャを低減させるIFN−α/ω抗体の能力を、MX1
遺伝子発現をIFN−I活性のマーカーとして用いて評価した。
れた抗IFN−α/ω抗体は、24時間のインキュベーション後、SLE患者血中のMX
1発現を用量依存的に減少させ、最高の抗体濃度で、MX1の発現を健常対照で観察され
るレベル近くに正規化した。図13は、βアクチン発現に対して正規化された1名のSL
EドナーにおけるMX1発現への抗体処置の効果を示し、これは健常対照と比較して上昇
した基準MX1発現を有する複数名のドナーを表す。
様々なカニクイザルI型IFNを中和する選択抗IFN−α/ω抗体の能力を、ISR
Eレポーター遺伝子アッセイを用いて評価した。
Sino Biological)、IFN−α8(Sino Biological)
、及びIFN−α13(Sino Biological)を本アッセイで使用した。各
IFNに対して予め決定されたEC75値を用いてIC50値を決定した。(IFN−α2
で0.078ng/ml、IFN−α4で2.68ng/ml、IFN−α8で0.66
ng/ml、IFN−α13で18.4)。選択抗IFN−α/ωmAbのIC50を表2
9に示す。表20のデータは2つの独立した実験の平均である。IFN−α/ωmAbの
IFWM3525及びIFWM3522は、試験に利用可能なヒト抗原とオルソロガスマ
カクザル抗原との間で同様の交差中和特性を示した。この分子がヒトIFN−αDと同様
に位置27(S27)にセリンを有するため、マカクザルIFN−α13の欠如が予期さ
れた。
結晶化、X線データ収集、及び構造決定を、以下の変更を除いて本質的に実施例6で説
明したように実施した。
N−ω)のFabを4℃で終夜インキュベートし、続いて精製なしで50mMのTris
(pH7.4)/20mMのNaCl中8.37mg/mLに濃縮した。X線データ収集
の結晶をMMS播種したHEPES(pH7.5、0.2M Li2SO4、18% P
EG3350)から得た。
補充した合成母液(0.1M HEPES(pH7.5)、20% PEG3350、0
.2M LiSO4)に結晶を浸し、液体窒素中で急速凍結させた。APS(Argon
ne National Lab)でX線データを収集した。ELN ATeplyak
−2013−0014。回折データをXDSで処理した。構造精密化統計を表30に提供
する。
デルは23〜39及び118〜153の残基を含んでいた。IFN−ω分子の大半は電子
密度を全く有さず、これらのための余地が結晶内に存在しなかったが、これはIFN−ω
の開裂も起きたことを示す。
常に似通っていた。個別の成分(VH、VL、及びIFNω)の主鎖構造は全て、ほぼ同
一であった(それぞれCα rmsd 0.17、0.23、及び0.36Å)。
ね合わせて、VHを4度回転させ、抗原を11度回転させ、その結果、IFN−ω分子を
VLに対して大きくシフトさせる。第2に、水素結合及び水構造(特にWC2)は、2つ
の構造間で異なった(図14A及び14B)。IFN−ωのR33は、患者のM371複
合体内にHCDR3のD107との塩橋を含む6つの水素結合を作製した(図14A)。
成熟形態では、IFN−ωのR33及びVHのD107の両方の側鎖の電子密度の定義は
さほど明確ではなく、これらは遠く離れており(図示せず)、したがって電荷−電荷相互
作用の数及び強さを減少させるように考えられる(図14B)。M371中のVHのH9
9に関与する水分子は、現在は存在しない(図14A、14B)。第3に、HCDR3の
F108は、抗原結合に関与していないが、これはVL/VH界面の一部である。これは
存在する構造内に2つの代替的コンフォメーションを採用する(図14C)。VLのL9
6I突然変異と共に、VL/VHドメインの相対回転が、これを単一の回転異性体に低減
させた。したがって、これは成熟突然変異のその部分がより良好なFv対合をもたらした
と考えられる。第4に、成熟中に2つの位置をF(A50F及びY32F)に突然変異さ
せた。Y32はIFN−ω主鎖を有する2つの水素結合を形成する。しかしながら、これ
らもFへの突然変異の結果として失われた(図14D)。A50F変異は抗原との新たな
接触を全く生じさせない。むしろ、フェニル環がVHのW104とスタックして、これが
続いて抗原とパックする(packs)(図14D)。LCDR3では、2つの更なる疎水性
突然変異(T94L及びL96I)が、抗原のL30及びF27に対するより良好な疎水
性ポケットを形成すると考えられる。2つの更なる負電荷突然変異(S39D及びS93
D)は、溶媒に対する場合を除いていかなる相互作用も形成しない。全体的には、親和性
の改善は、極性相互作用を低減させるが、抗原及びVL/VH対合と共に、より良好な疎
水性パッキングを支持/強化する成熟プロセスの結果である。
相互作用mAbを示す。エピトープ残基はM371構造のものと同一である。パラトープ
残基もほぼ同一である(図15)。しかしながら、上述したように、成熟プロセスは、多
くの構造的及び相互作用の差異をもたらし、これが結合親和性の改善の原因である可能性
がある。
結晶化、X線データ収集、及び構造決定を、本質的に実施例6で説明したように実施し
た。
剰IFN−ω、1.92:1.12mg)で混合し、4℃で終夜インキュベートし、20
mm HEPES(pH7.5)、0.25MのNaCl(10%グリセロール)で平衡
したSuperdex 200カラムで精製し、続いて9.79mg/mlに濃縮するこ
とによって調製した。X回析に適する結晶を、IFN−ω/Fab3186結晶からの種
を用いたMMS播種によって、18%PEG 3K、0.2Mクエン酸ナトリウムから得
た。
20% PEG3350、0.2Mクエン酸ナトリウム25%グリセロール)に数秒間浸
漬し、液体窒素中で急速凍結させた。APS(Argonne National La
b)でX線データを収集した。回折データをXDS10で処理した。
R)により解析した。MRの検索モデルは、IFN−ω/FabM371の結晶構造であ
った。続いてPHENIXで構造を精密化し、COOTを用いてモデルの調整を実行した
。他の全ての結晶学的計算は、CCP4プログラムスイートを用いて行った。全ての分子
グラフィックを、PyMolを用いて生成した。構造精密化統計を表31に提供する。
1と非常に似通っていた。IFN−ω分子の分子構造モデルはヘリカルセグメントAB並
びにヘリックスD及びEに対応する残基23〜39及び119〜153を含む。ヘリック
スA、B、及びC、並びに接続ループを無秩序化する。IFN−ωのこれらの失われた部
分は、M371及びM3421複合体構造で判明した限定されたタンパク質分解のためで
ある可能性がある。Fab分子構造モデルは、軽鎖の場合1〜213の残基、重鎖の場合
1〜222の残基を含む。C末端6xHisタグ、鎖間ジスルフィド結合、及び重鎖の1
37〜141の残基を無秩序化する。低い回折分解能のため、溶媒水分子を含まなかった
。
。Ab/Ag相互作用の大部分は、ABへリックスのエピトープ残基F27、L30、及
びR33によるものである。したがって、IFN−ωのこの領域がエピトープの主な部分
を構成していると考えられる。親M371と比較して、このエピトープは、IFWM35
25のHCDR3との相互作用を形成するIFN−ωのヘリックスEからの残基をもう2
つ含む。
特異性を有する。これは、IFNβ及びIFN−α−D/1には結合しない。IFNの配
列アラインメント(図9)は、IFN−ω及びIFN−αサブタイプの間でIFWM35
25エピトープ残基の大半が保存されていることを示す。更に、IFN−α(PDBコー
ド2RH2、(これは、PDB中でCαの痕跡のみが利用可能であったため、蓄積したデ
ータを用いて再構成及び精密化した)及びIFN−ωのエピトープ残基の構造の比較は、
エピトープ残基が非常に似通った主鎖及び側鎖構造を有することを示す。したがって、配
列及び構造の保存(又はエピトープ保存)は、IFWM3525によるIFN−α/ωの
広範な結合の原因であると考えられる。
以下の態様を包含し得る。
[1] ヒトインターフェロンオメガ(IFN−ω)及び少なくとも3、4、5、6、7、8、9、10、又は11のヒトインターフェロンアルファ(IFN−α)サブタイプと結合し、それらの生物活性を中和する、単離されたモノクローナル抗体。
[2] 前記ヒトIFN−ω及び前記ヒトIFN−αサブタイプの前記生物活性が、シグナル伝達性転写因子2(STAT2)、インターフェロン調節因子9(IRF9)、及びSEAPを安定に発現するHEK293細胞におけるインターフェロン誘導性ISG54プロモーター下での前記ヒトIFN−ω又は前記ヒトIFN−αサブタイプによって誘導された分泌胚アルカリホスファターゼ(SEAP)の発現である、上記[1]に記載の抗体。
[3] 前記抗体が、少なくとも約1×10 −9 M以下、約1×10 −10 M以下、約5×10 −11 M以下、又は約1×10 −11 M以下のIC 50 で前記ヒトIFN−ωの前記生物活性を中和する、上記[2]に記載の抗体。
[4] 前記抗体が、少なくとも約1×10 −10 M以下のIC 50 値で前記ヒトIFN−ωの前記生物活性を中和する、上記[3]に記載の抗体。
[5] 前記抗体が、約1×10 −10 M〜約6×10 −12 MのIC 50 値で前記ヒトIFN−ωの前記活性を中和する、上記[4]に記載の抗体。
[6] 前記抗体が、少なくとも約2×10 −10 M以下、約1.5×10 −10 M以下、又は約1×10 −10 M以下のIC 50 値で少なくとも3、4、5、6、7、8、9、10、又は11のヒトIFN−αサブタイプを中和する、上記[5]に記載の抗体。
[7] 前記IFN−αサブタイプが、IFN−αA、IFN−αB2、IFN−αC、IFN−αF、IFN−αG、IFN−αH2、IFN−αI、IFN−αJ1、IFN−αK、IFN−αWA、及びIFN−α4aからなる群から選択される、上記[6]に記載の抗体。
[8] a)配列番号109のHCDR1アミノ酸配列、
b)配列番号111、112、又は113のHCDR2アミノ酸配列、
c)配列番号115又は116のHCDR3アミノ酸配列、
d)配列番号76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、又は91のLCDR1アミノ酸配列、
e)配列番号93、94、又は95のLCDR2アミノ酸配列、及び
f)配列番号96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、又は107のLCDR3アミノ酸配列を含む、上記[6]に記載の抗体。
[9] 前記抗体が、それぞれ配列番号109、113、及び116の重鎖相補性決定領域(HCDR)1(HCDR1)、2(HCDR2)、及び3(HCDR3)のアミノ酸配列、並びにそれぞれ配列番号82、94、及び99の軽鎖相補性決定領域(LCDR)1(LCDR1)、2(LCDR2)、及び3(LCDR3)のアミノ酸配列を含む、上記[8]に記載の抗体。
[10] 前記抗体が、それぞれ配列番号109、114、及び121の重鎖相補性決定領域(HCDR)1(HCDR1)、2(HCDR2)、及び3(HCDR3)のアミノ酸配列、並びにそれぞれ配列番号118、119、及び120の軽鎖相補性決定領域(LCDR)1(LCDR1)、2(LCDR2)、及び3(LCDR3)のアミノ酸配列を含む、上記[6]に記載の抗体。
[11] 前記抗体が、IFN−αA、IFN−αB2、IFN−αC、IFN−αF、IFN−αG、IFN−αH2、IFN−αI、IFN−αJ1、IFN−αK、IFN−αWA、及びIFN−α4aからなる群から選択される少なくとも6つのヒトIFN−αサブタイプを中和する、上記[6]に記載の抗体。
[12] 前記抗体が、それぞれ配列番号109、114、121、159、119、及び160のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3のアミノ酸配列を含む、上記[11]に記載の抗体。
[13] 前記抗体が、IFN−αA、IFN−αB2、IFN−αC、IFN−αF、IFN−αG、IFN−αH2、IFN−αI、IFN−αJ1、IFN−αK、IFN−αWA、及びIFN−α4aからなる群から選択される少なくとも10のヒトIFN−αサブタイプを中和する、上記[6]に記載の抗体。
[14] 前記抗体が、少なくともアミノ酸残基F27、L30、及びR33において配列番号1のヒトIFN−ωと結合する、上記[13]に記載の抗体。
[15] 前記抗体が、それぞれ配列番号109、114、121、161、119、及び162のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3のアミノ酸配列を含む、上記[14]に記載の抗体。
[16] 前記抗体が、少なくとも前記ヒトIFN−αサブタイプのIFN−αA、IFN−αB2、IFN−αC、IFN−αF、IFN−αG、IFN−αH2、IFN−αJ1、及びIFN−α4aを中和する、上記[15]に記載の抗体。
[17] 前記抗体が、IFN−αI、IFN−αK、又はIFN−αWAを更に中和する、上記[16]に記載の抗体。
[18] 前記抗体が、
a)250U/mLのインターフェロンによって誘導された全血中での白血球インターフェロンによって誘導されたIP−10の放出を、10μg/mlの抗体の存在下で前記抗体の不在下と比較して約50%以上阻害する、あるいは
b)全血中の全身性紅斑性狼瘡(SLE)免疫複合体によって誘導されたIP−10の放出を、10μg/mlの抗体の存在下で前記抗体の不在下と比較して約50%以上阻害する、上記[14]に記載の抗体。
[19] 前記抗体が、配列番号28と少なくとも90%、95%、又は97%同一の重鎖可変領域(VH)アミノ酸配列、及び配列番号150と少なくとも90%、95%、又は97%同一の軽鎖可変領域(VL)アミノ酸配列を含む、上記[5]に記載の抗体。
[20] 配列番号、
a)それぞれ109、113、116、77、93、及び104、
b)それぞれ109、113、116、85、93、及び96、
c)それぞれ109、113、115、79、95、及び107、
d)それぞれ109、113、116、76、93、及び103、
e)それぞれ109、113、115、85、93、及び96、
f)それぞれ109、113、115、89、95、及び100、
g)それぞれ109、113、116、86、93、及び105、
h)それぞれ109、113、115、76、93、及び103、
i)それぞれ109、113、116、80、93、及び97、
j)それぞれ109、113、116、84、93、及び97、
k)それぞれ109、113、116、90、93、及び97、
l)それぞれ109、113、116、88、93、及び102、
m)それぞれ109、113、116、87、93、及び105、
n)それぞれ109、113、116、91、93、及び106、
o)それぞれ109、113、115、80、93、及び97、
p)それぞれ109、113、116、83、93、及び101、
q)それぞれ109、113、116、82、94、及び98、
r)それぞれ109、113、115、78、95、及び100、
s)それぞれ109、111、116、81、93、及び106、
t)それぞれ109、113、116、82、94、及び99、
u)それぞれ109、113、115、81、93、及び106、
v)それぞれ109、112、116、81、93、及び106、あるいは
w)それぞれ109、113、116、81、93、及び106のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3の配列を含む、上記[19]に記載の抗体。
[21] 前記抗体が、ヒト化されている又はヒトである、上記[20]に記載の抗体。
[22] 前記ヒト抗体重鎖可変領域フレームワークがヒト生殖系列遺伝子IGHV5−51(配列番号155)由来である、上記[21]に記載の抗体。
[23] 前記ヒト抗体軽鎖可変領域フレームワークがヒト生殖系列遺伝子IGKV1D−39(配列番号156)由来である、上記[22]に記載の抗体。
[24] 前記抗体が、IgG1、IgG2、IgG3、又はIgG4サブタイプのものである、上記[21]に記載の抗体。
[25] 前記抗体がFc領域内に少なくとも1つの置換を有する、上記[24]に記載の抗体。
[26] 前記置換が、置換M252Y/S254T/T256E、V234A/G237A/P238S/H28A/V309L/A330S/P331S、又はP238S/L234A/L235Aを含み、残基の番号付けがEU番号付けに準ずる、上記[25]に記載の抗体。
[27] 重鎖可変領域(VH)及び軽鎖可変領域(VL)を含み、
a)前記VHが配列番号28、31、157、又は158のアミノ酸配列を含む、上記[19]に記載の抗体。
[28] 前記VLが配列番号35、39、40、42、46、52、53、54、57、61、62、68、71、73、75、135、又は150のアミノ酸配列を含む、上記[27]に記載の抗体。
[29] 配列番号、
a)それぞれ28及び40、
b)それぞれ28及び39、
c)それぞれ31及び62、
d)それぞれ28及び54、
e)それぞれ31及び39、
f)それぞれ31及び68、
g)それぞれ28及び42、
h)それぞれ31及び54、
i)それぞれ28及び53、
j)それぞれ28及び73、
k)それぞれ28及び75、
l)それぞれ28及び52、
m)それぞれ28及び35、
n)それぞれ28及び135、
o)それぞれ31及び53、
p)それぞれ28及び46、
q)それぞれ28及び61、
r)それぞれ31及び57、
s)それぞれ157及び71、
t)それぞれ28及び150、
u)それぞれ31及び71、
v)それぞれ158及び71、あるいは
w)それぞれ28及び71、の前記VH及び前記VLを含む、上記[28]に記載の抗体。
[30] 配列番号28のVHアミノ酸配列及び配列番号150のVLアミノ酸配列を含む、上記[19]に記載の抗体。
[31] 前記抗体が二重特異性である、上記[1]、[20]、又は[29]に記載の抗体。
[32] 前記抗体が、BLyS、CD40L、IL−6、CD27、BDCA2、IL−12、IL−23、IFN−αD、IL−17、CD20、IL−10、CD22、IL−21、ICOS、ICOSL、又はIFN−γと結合する、上記[31]に記載の抗体。
[33] 上記[1]、[20]、又は[29]に記載の抗体と、医薬的に許容される担体と、を含む、医薬組成物。
[34] (i)上記[20]若しくは[29]に記載の抗体VH若しくはVL、又は(ii)上記[20]若しくは[29]に記載の抗体VH及びVLをコードするポリヌクレオチド。
[35] 上記[35]のポリヌクレオチドを含むベクター。
[36] 上記[35]のベクターを含む宿主細胞。
[37] 上記[20]に記載の抗体の生成方法であって、前記抗体が発現する条件下で上記[36]に記載の宿主細胞を培養することと、前記宿主細胞によって生成された前記抗体を回収することと、を含む、方法。
[38] 免疫媒介炎症性疾患、自己免疫疾患、又は慢性ウイルス感染症の治療方法であって、上記[1]、[20]、又は[29]に記載の単離された抗体の治療有効量を、それを必要とする患者に、前記疾患又は前記感染症を治療するのに十分な時間投与することを含む、方法。
[39] 前記免疫媒介炎症性疾患又は前記自己免疫疾患とは、狼瘡、乾癬、免疫性血小板減少症(ITP)、エカルディ−グチエール症候群(AGS)、全身性硬化症、シェーグレン症候群、筋炎、分類不能型免疫不全症(CVID)、自己免疫性甲状腺疾患、I型糖尿病、関節リウマチ、移植片拒絶反応、又は移植片対宿主病(GVHD)である、上記[38]に記載の方法。
[40] 狼瘡が、全身性紅斑性狼瘡(SLE)又は皮膚紅斑性狼瘡(CLE)である、上記[39]に記載の方法。
[41] 前記患者が狼瘡腎炎を有する、上記[40]に記載の方法。
[42] 前記患者がI型インターフェロンシグネチャを示す、上記[38]に記載の方法。
[43] 前記慢性ウイルス感染症がHIV又はC型肝炎感染症である、上記[38]に記載の方法。
[44] 前記抗体が上記[20]又は[29]に記載の抗体を含む、上記[38]に記載の方法。
[45] 前記抗体が、二重特異性抗体である、上記[38]に記載の方法。
[46] 前記二重特異性抗体が、BLyS、CD40L、IL−6、CD27、BDCA2、IL−12、IL−23、IFN−αD、IL−17、CD20、IL−10、CD22、IL−21、ICOS、ICOSL、又はIFN−γを中和する、上記[45]に記載の方法。
[47] 第2の治療薬を更に投与する、上記[38]に記載の方法。
[48] 前記第2の治療薬が、BLyS、CD40L、IL−6、CD27、BDCA2、IL−12、IL−23、IFN−αD、IL−17、CD20、IL−10、CD22、IL−21、ICOS、ICOSL、又はIFN−γと結合する抗体である、上記[47]に記載の方法。
[49] 前記第2の治療薬がコルチコステロイド、抗マラリア剤、免疫抑制剤、細胞毒性剤、又はB細胞調節剤である、上記[47]に記載の方法。
[50] 前記第2の治療薬がプレドニゾン、プレドニゾロン、メチルプレドニゾロン、デフラザコート、ヒドロキシクロロキン、アザチオプリン、メトトレキサート、シクロホスファミド、ミコフェノール酸モフェチル(MMF)、ミコフェノール酸ナトリウム、シクロスポリン、レフルノミド、タクロリムス、リツキシマブ(商標)、又はベリムマブ(商標)である、上記[49]に記載の方法。
[51] 前記抗体がIFN−αD、IFN−α1、及び/又はIFN−βを中和しない、上記[1]〜[32]のいずれか一項に記載の抗体。
Claims (4)
- 抗IFN抗体又はその抗原結合断片を含む医薬組成物であって、
抗体又はその抗原結合断片は重鎖可変領域と軽鎖可変領域を含み、
(i)重鎖可変領域が、それぞれ配列番号109、113、及び116の重鎖相補性決定領域(HCDR)1(HCDR1)、2(HCDR2)、及び3(HCDR3)のアミノ酸配列を含み、並びに軽鎖可変領域が、それぞれ配列番号82、94、及び99の軽鎖相補性決定領域(LCDR)1(LCDR1)、2(LCDR2)、及び3(LCDR3)のアミノ酸配列を含み、あるいは
(ii)重鎖可変領域が、配列番号28の重鎖可変領域アミノ酸配列を含み、及び軽鎖可変領域が、配列番号150の軽鎖可変領域アミノ酸配列を含み、
患者における免疫媒介炎症性疾患、自己免疫疾患、又は慢性ウイルス感染症の治療に用いるためのものである、医薬組成物。 - (a)前記免疫媒介炎症性疾患又は前記自己免疫疾患が、狼瘡、乾癬、免疫性血小板減少症(ITP)、エカルディ−グチエール症候群(AGS)、全身性硬化症、シェーグレン症候群、筋炎、分類不能型免疫不全症(CVID)、自己免疫性甲状腺疾患、I型糖尿病、関節リウマチ、移植片拒絶反応、又は移植片対宿主病(GVHD)である;
(b)前記患者がI型インターフェロンシグネチャを示す;及び/又は
(c)前記慢性ウイルス感染症がHIV又はC型肝炎感染症である、請求項1に記載の医薬組成物。 - 狼瘡が、全身性紅斑性狼瘡(SLE)又は皮膚紅斑性狼瘡(CLE)である、請求項2に記載の医薬組成物。
- 前記患者が狼瘡腎炎を有する、請求項2又は3に記載の医薬組成物。
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