JP6309450B2 - セロトニン関連の医学的状態、アドレナリン関連の医学的状態、ノルアドレナリン関連の医学的状態、グルタミン酸関連の医学的状態および副腎皮質刺激ホルモン放出ホルモン関連の医学的状態の処置および診断のためのミクロrnaおよび該ミクロrnaを含む組成物 - Google Patents
セロトニン関連の医学的状態、アドレナリン関連の医学的状態、ノルアドレナリン関連の医学的状態、グルタミン酸関連の医学的状態および副腎皮質刺激ホルモン放出ホルモン関連の医学的状態の処置および診断のためのミクロrnaおよび該ミクロrnaを含む組成物 Download PDFInfo
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Description
(a)ミクロRNAの5’末端におけるヌクレオチドと、標的模倣物またはミクロRNA抵抗性標的における対応するヌクレオチド配列との間における1つのミスマッチ;
(b)ミクロRNAの1位〜9位におけるヌクレオチドのいずれか1つと、標的模倣物またはミクロRNA抵抗性標的における対応するヌクレオチド配列との間における1つのミスマッチ;あるいは
(c)ミクロRNAの12位〜21位におけるヌクレオチドのいずれか1つと、標的模倣物またはミクロRNA抵抗性標的における対応するヌクレオチド配列との間における3つのミスマッチ、ただし、この場合、連続するミスマッチは最大でも2つである。
セロトニンニューロンにおけるmiRの示差的発現
材料および実験手順
5HTニューロンのミクロRNAマイクロアレイ
ePET YFPマウスの12日目の胎児から得られる後脳細胞を培養し、選別して、5HTニューロンを周りの非5HTニューロンから区別した。miRNA集団を含む総RNAを製造者の説明書に従って精製し、標識し、Sanger miRBase(リリース12.0)に基づくAgilentマウスmiRNAマイクロアレイ(Agilent Tech、ミシサガ、オンタリオ、カナダ)設計番号021828に対してハイブリダイゼーションした。マイクロアレイを走査し、データを、Feature Extraction Software(Agilent Technologies)を使用して取り出し、処理した。走査後、GeneView.txtファイルの強度出力データを分析して、ミクロRNAの差のある相対的発現を、Partek(登録商標)Genomics Suite(Partek Inc.、セントルイス、ミズーリ)を使用して定量化した。データをlog2変換し、分位正規化し、GeneViewファイルにおけるフラグ“gIsGeneDetected”に従って選別した。666個のマウスmiRのうち、198個が、この選別工程を行ったとき、さらなる分析のために残った。その後、示差的に発現したmiRを、1.5倍の変化の閾値をANOVAに従って有意性により使用することによって同定した。コントラストをANOV検定の範囲内で計算した。Benjamini/Hochberg補正を偽陽性削減のために使用した(多重検定補正)。
Slc6a4、Htr1a、MaoAおよびTph2の3’UTR配列をマウスのゲノムDNAまたは全脳cDNAからPCR増幅した。3’UTRのPCRフラグメントを製造者の指針に従ってpGEM−Teasyベクター(Promega)に連結し、さらに、Psicheck2レポータープラスミド(Promega)におけるルシフェラーゼの3’末端での単一NotI部位にサブクローン化した。変異させた3’UTR配列(これはmiR−135シード配列を欠いている)を、シード一致配列全体にわたるプライマー突出とともに合成した。クローン化配向を診断的切断および配列決定によって確認した。
HEK293T細胞を70%〜85%の集密度にまで48ウエル形式でポリ−L−リシン上で成長させ、下記のプラスミドとともにポリエチレンイミンを使用してトランスフェクションした:5ngのPsicheck2−3’UTRプラスミドおよび特定のmiRNAのための、215ngの過剰発現ベクター、または空のmiR−vec過剰発現プラスミド。トランスフェクションの24時間後、細胞を溶解し、ルシフェラーゼレポーター活性を以前の記載のようにアッセイした[Chen A.他、Mol Endocrinol(2005)19:441〜58]。ウミシイタケルシフェラーゼの値を、(同じベクターから転写されるが、試験されている3’UTRによって影響されない)対照のホタルルシフェラーゼのレベルに対して正規化し、1条件あたり6回のウエル反復にわたって平均化した。
成体のC57BL/6Jオスマウス(10週齢)(ハーラン、エルサレム、イスラエル)を逆の12時間明暗周期で温度制御部屋(22±1℃)に収容した。食物および水を自由に摂取させた。すべての実験プロトコルがWeizman科学研究所の施設内動物管理使用委員会によって承認された。
成体マウスをそれらの暗期周期中に50mlの通気されたチューブに30分間入れた。
マウスを、以前に記載されたような社会的敗北プロトコルに供した[Krishnan V.他、Cell(2007)131:391〜404]。簡単に記載すると、マウスを攻撃的ICRマウスのホームケージに入れ、これらのマウスは5分間にわたって物理的に触れ合った。この期間中に、ICRマウスは侵入者マウスを攻撃し、侵入者は従属的態度を示した。その後、穴の開いた透明なプレキシガラス仕切り板を動物の間に置き、マウスを、感覚的接触を許すために24時間にわたって同じケージに留めた。その後、この手順を、その後の10日のそれぞれについて、見慣れないICRマウスを用いて繰り返した。
マウスは、三環系のイミプラミンまたはSSRIのフルオキセチンまたはNRIのレボキセチン(生理的食塩水において20mg/kg)または生理的食塩水のi.p.注射を受けた。長期注射を18日間〜21日間連続して行い、急性注射を脳の顕微解剖の24時間前に行った。
脳試料を、脳を取り出し、アクリル脳マトリックス(Stoelting)に置いた後で、マウスの縫線核(RN)から採取した。スライス片を、指定の解剖学的マーカーに基づいて、標準的なカミソリ刃(GEM)を使用して採取した。先を鈍くした14G注射器を使用して、RN領域を、マトリックスから取り出された3mmのスライス片から抜き取った。加えて、体幹の血液を、凝固を避けるためにEDTA含有チューブに集めた。遠心分離を3500gで4℃において30分間行った後、血漿を分離し、RNA精製まで−70℃で保った。
mRNA(ミクロRNAを含む)を、miRNeasyミニキット(Qiagen)を製造者の説明書に従って使用して、選別されたニューロン、凍結された脳打ち抜き物および血漿から単離し、miScript逆転写キットmiRNAを使用して処理し、cDNAを作製した。その後、cDNA試料を、SYBR(登録商標)Green PCRキット(Qiagen)を製造者の指針に従って使用して、AB7500サーモサイクラー(Applied Biosystems)で分析した。それぞれのmiRのための特異的プライマーを市販のユニバーサルプライマーと一緒に使用し、一方、U6のsnRNAを内部対照として使用した。
プレ−miR−135bを、制限酵素のAgeI部位を加えるプライマーとともにマウスのゲノムDNAからPCRによって増幅し、その後、pGEM−T Easyベクター(Promega、マディソン、ウィスコンシン)に挿入した。pGEM−T Easyの配列決定、ならびに、AgeIによるpGEM−T EasyおよびpEGFPベクター(Clontech laboratories Inc.、マウンテンビュー、カリフォルニア)の両方の消化の後、未成熟miR−135b配列をpEGFPベクターに連結して、発現プラスミドpEGFP−miR−135bを構築した。その後で、pEGFP−miR−135bを、pCSC−E/Syn−eGFPプラスミドを同じ酵素で切断するのと並行してBamHIおよびBsrGIによって切断し、miR−135b−eGFP配列をpCSC−E/Synに連結して、pCSC−eSNY−pre−miR−135b−eGFPプラスミドを構築し、これを制限エンドヌクレアーゼ分析およびDNA配列決定によって確認した。
組換えレンチウイルスを、以前の記載のように[Naldini L他、Proc Natl Acad Sci USA(1996)93:11382〜8]、HEK293T細胞における一過性トランスフェクションによって作製した。簡単に記載すると、感染性レンチウイルスをトランスフェクション後48時間および72時間で集め、0.45μm細孔の酢酸セルロースフィルターでろ過し、超遠心分離によって濃縮した。
定位手術およびレンチウイルス送達部位の精密な制御を提供するために、本発明者らは、コンピューター誘導定位機器およびモーター駆動ナノインジェクター(Angle Two(商標)Stereotaxic Instrument、myNeurolab)を使用した。以前に記載されたように[Singer O.他、Nat Neurosci(2005)、8、1343〜9]、マウスを全身麻酔下で定位装置に置き、座標を、FranklinおよびPaxinosの図譜によって定義されるように決定した。レンチウイルス調製物を、モーター駆動のナノインジェクターシステムにつながれるHamilton注射器を使用して送達し、溶液を1分毎に0.2μlの速度で注入した。2週間の回復期間の後、マウスを行動研究および生理学的研究に供し、その後で麻酔し、リン酸塩緩衝化4%パラホルムアルデヒドにより灌流した。固定された脳を、免疫組織化学を使用して注入部位の正確さを確認するために30μのスライス片に連続切片化した。
免疫組織化学のために使用される手順を以前の記載のように行った[Chen A他、J Neurosci(2006)26:5500〜10]。GFP免疫染色のために、本発明者らは、一次抗体としての、ウサギにおいて惹起されるビオチン化抗GFP抗体(Abcam、ケンブリッジ、英国)、および、二次抗体としてのストレプトアビジンコンジュゲート化Cy2[Jackson Immunoresearch Laboratories Inc、ウエスト・グローブ、ペンシルベニア、米国)を使用した。
すべての行動評価を、試験部屋に各試験の前の2時間慣らした後で暗期の期間中に行った。
尾懸垂試験をTSE尾懸垂モニター(TSE Systems、バドホンブルグ、ドイツ)で行った。それぞれのマウスをその尾の先端によってテープ固定し、力センサーから10分間ぶら下げた。不動で過ごした時間と、もがいて過ごした時間とを、事前設定された閾値に基づくソフトウエアによって計算し、記録した。
尾懸垂試験を以前の記載のように行った[Krishnan VおよびNestler EJ、Nature(2008)455:894〜902]。手短に言えば、使用された装置は、25℃の水が15cmの深さにまで満たされたプラスチックバケツ(18cmの直径)であった。それぞれのマウスをバケツの中心に置いて、6分間のビデオ記録された試験期間を開始した。2〜6分の試験期間中において不動で過ごした時間の継続期間を、EtoVision XT(Noldus、ヴァーヘニンゲン、オランダ)を使用して自動的にスコア化した。
歩行運動における差から生じる行動的影響の可能性について制御するために、マウスの自発運動活性を、馴化に数日先立つ48時間の期間にわたって調べた。マウスを、特殊化されたホームケージに1匹ずつ収容し、自発運動を、InfraMotシステム(TSE Systems、バドハンブルグ、ドイツ)を使用して測定した。
データを平均+/−SEMとして表した。統計学的有意性について検定するために、スチューデントt検定を、2つの群のみが比較される場合には使用した(例えば、マイクロアレイ検証qPCRの間など)。1元配置ANOVAを使用して、多数の群の間を比較した(例えば、ルシフェラーゼアッセイにおける異なる処置の間など)。2元配置ANOVAを、2つの独立変数の場合には使用した(例えば、SSRIおよびNRIの注入、急性および長期の両方の継続期間において)。ポストホックt検定を必要なときには使用して、統計学的有意性を明らかにした。群間の差は、p<0.05であるとき、有意であると見なした。
5HTニューロンを、ePET YFPの胚のRNから単離し、それらのmiR発現プロフィルを、miRマイクロアレイを使用して、同じ核から得られる非5HTニューロンと比較した(図1A)。14個のmiRが、非5HTニューロンと比較して5HTニューロンにおいて、2倍を超えてアップレギュレーションされることが見出され、27個が、2倍を超えてダウンレギュレーションされることが見出された(表2A〜表2B(下記)参照)。アレイ結果の代表的な検証を、5HTニューロンにおいてアップレギュレーションされるmiR(例えば、miR−375(P=0.0071;図1B)など)について、また、ダウンレギュレーションされるmiR(例えば、miR−135a(P=0.0075;図1C)など)についてリアルタイムPCRを使用して行った。5HTニューロンの調節因子としてのmiRの役割をさらに研究するために、広範囲の生物情報学的分析を仮説に基づいた様式で行った。精神病理に伴うことがこれまでに明らかにされた既知セロトニン関連遺伝子の標的化予測をマイクロアレイ結果と組み合わせた。RNにおける5HTニューロンにおいて発現される下記の4つのタンパク質コード標的遺伝子を試験のために選定した:セロトニン輸送体(これは5HT再取り込に関わっている)(これはまた、SERTまたはSlc6a4として知られている)、セロトニン阻害受容体1a(これはまた、Htr1aとして知られている)、トリプトファンヒドロキシラーゼ2(Tph2)(これは脳における5HT合成の律速酵素である)、および、モノアミンヒドロキシラーゼ(MaoA)(これは5HTを不活性化する)。これらの遺伝子についてのミクロRNA標的化予測を、Target Scan[www(dot)targetscan(dot)org]およびMiranda[www(dot)microrna(dot)org]の2つの異なるウエブ型アルゴリズムを使用して行い、非5HT細胞と比較して、5HTニューロンのmiRアレイにおいて少なくとも±1.5の差で変化している91個のmiRのリストと組み合せた。miRアレイデータおよび生物情報学的分析に基づいて、8個のmiRをさらなるインビトロ研究のために選定した(図1D〜図1G)。
miR−19は1型ベータアドレナリン作動性受容体(Adrb1)を特異的に標的とする
材料および実験手順
Psicheck2ルシフェラーゼ発現プラスミドへの3’UTRのクローン化
ADRb1の3’UTR配列をマウスのゲノムDNAからPCR増幅した。変異させた3’UTR配列(これは4つすべてのmiR−19シード一致部を欠いている)が、Epoch Biolabs,Inc.(テキサス、米国)によって合成された。3’UTRのPCRフラグメントを製造者の指針に従ってpGEM−Teasyベクター(Promega)に連結し、さらに、Psicheck2レポータープラスミド(Promega)におけるルシフェラーゼの3’末端での単一NotI部位にサブクローン化した。クローン化配向を診断的切断および配列決定によって確認した。
HEK293T細胞またはHT22ニューロン細胞を70%〜85%の密集度まで48ウエル形式でポリ−L−リシン上で成長させ、下記のプラスミドとともにポリエチレンイミンを使用してトランスフェクションした:Psicheck2−3’UTRプラスミド、pEGFPプラスミドでのpre−mmu−miR−19b過剰発現またはpEGFPプラスミド単独(clontech)、miR−19bノックダウン(KD)プラスミド(Genecopoeia)または対照KDプラスミド(Genecopoeia)。トランスフェクションの24時間後、細胞を溶解し、ルシフェラーゼレポーター活性を以前の記載のようにアッセイした[Chen A.他、Mol Endocrinol(2005)19:441〜58]。ウミシイタケルシフェラーゼの値を、(同じベクターから転写されるが、試験されている3’UTRによって影響されない)対照のホタルルシフェラーゼのレベルに対して正規化し、1条件あたり6回のウエル反復にわたって平均化した。
いくつかの反復体をその3’UTRに含有する別個の進化的に保存されたmiRNA標的配列を用いたストレス関連遺伝子についての生物情報学的分析により、miR−19が、1型ベータアドレナリン作動性受容体(Adrb1)の標的化のための強い候補として明らかにされた(この場合、3つの強く保存されたmiR−19シード一致部と、1つのそれほど保存されていないmiR−19シード一致部とがArrb1の3’UTRに存在する)。Adrb1は、扁桃体、海馬および室傍核(PVN)を含めて脳の様々な領域において発現されるアドレナリン作動性受容体である。扁桃体のAdrb1は以前には、影響を不安様行動[Fu A他、Brain Res(2008)1211:85〜92;Rudoy CAおよびVan Bockstaele EJ、Prog Neuropsychopharmacol Biol Psychiatry(2007)31:1119〜29]および恐怖記憶[Roozendaal B他、J Neurosci(2004)24:8161〜9;Roozendaal B他、Neuroscience(2006)138:901〜10]に及ぼすとして記載された。興味深いことに、Adrb1は、扁桃体のCRF陽性細胞の表面に見出されたものであり、Gを介してその影響を発揮し、それにより、アデニル酸シクラーゼ(AC)をさらに活性化するGタンパク質共役受容体(GPCR)である。ACをコードする10個の遺伝子(すなわち、ADCY1〜10)が知られている。これらのうちの3つ(ADCY1、ADCY7およびADCY9)が、miR−19によって標的とされることが生物情報学的に予測された。ADCY1は脳特異的な発現を有しており、マウス前脳におけるその過剰発現が認知記憶およびLTPを高めることが以前に示された[Wang H他、Nat Neurosci(2004)7:635〜42]。
miR−19aおよびmiR−19bは慢性的ストレスの後のPFCおよび扁桃体においてアップレギュレーションされる
材料および実験手順
動物および収容
miR17〜92flx/flxマウス[Ventura A他、Cell(2008)875〜86:(5)132;7]をCamKIIa−Creマウス[Dragatsis I他、Genesis、(2000)26(2):133〜5]と交雑する。トランスジェニックマウスまたは成体C57BL/6J雄マウスを逆の12時間の明暗周期で温度制御部屋(22±1℃)に収容する。食物および水を自由に摂取させる。すべての実験プロトコルがWeizmann科学研究所の施設内動物管理使用委員会によって承認された。
miR−19bのKD配列をRNAポリメラーゼIII−H1プロモーターの後においてレンチウイルスプラスミドにクローン化した。加えて、プレ−miR−19b配列をレンチウイルスプラスミドにおいてニューロン特異的プロモーター(強化型シナプシン、ESyn)の後にクローン化した。レンチウイルスをインビボでのmiR−19−KD実験およびプレ−miR−19b過剰発現発現(OE)実験の両方のために作製する。これらのレンチウイルスを使用して、miR−19bのレベルを、miR−19のレベルが行動的/薬理学的攻撃の後で変化することが見出される標的領域において操作する。
miR−19を前脳において欠いているマウスを作製するために、本発明者らは、miRクラスターmiR17〜92の条件的形態を有するマウスを用いて、CreリコンビナーゼをCamKIIaプロモーターの下にコードする遺伝子を有するマウスを育種中である。miR−19ファミリーはmiR−19aおよびmiR−19bを含む。マウスゲノムにおいて、miR−19bは2つの同一コピー(miR−19b−1およびmiR−19b−2)を有する。miR19aおよびmiR−19b−1は、同じmiRNAクラスターに、すなわち、miR17〜92に位置し、これに対して、miR−19b−2は、異なるゲノム遺伝子座(miR106a〜363)に位置する。後者は、マウス組織における発現をほとんど、または全く有していないようであり、したがって、miR17〜92クラスターのノックアウトは、前脳におけるmiR−19aおよびmiR−19b発現レベルに対する非常に大きな影響を可能にするために十分であることが予想される。
miR17〜92クラスターを前脳において欠いているマウス、または、miR−19が特異的に操作されたマウス(特定の脳領域おいて過剰発現またはダウンレギュレーション(KD)されたマウス)が、ADRb1、ADCY1ならびに他の転写物および遺伝子産物の発現レベルについて調べられるであろう。これらの動物はまた、不安様行動、自発運動活性および記憶成績について試験されるであろう。さらに、miR−19aおよびmiR−19bの発現レベルが、WT型マウスにおけるノルアドレナリン再取り込み阻害剤のレボキセチンによる急性および長期の全身的処置の後で興味の対象である種々の領域(例えば、海馬、扁桃体および前脳)において調べられる。
miRNA−19とAdrb1との間における生理学的つながりを、レボキセチン(ノルアドレナリン再取り込み阻害剤(NRI))が急性または長期のどちらかで注射されたマウスの前頭前皮質(PFC)におけるmiR−19a/bのレベルを評価することによって研究した(図12A〜図12D)。図12A〜図12Dに示されるように、miR−19a/bレベルがレボキセチンの急性投与の後ではダウンレギュレーションされ(図12、図12B)、レボキセチンの長期投与の後ではアップレギュレーションされた(図12C、図12D)。
miRNA−19およびカナビノイド受容体1(CB1)
材料および実験手順
動物および収容
実施例3A(上記)において記載される通り。
実施例3A(上記)において記載される通り。
CB1は、脳における最も豊富に発現されるGPCRの1つであり、皮質、扁桃体、海馬、脳幹神経節および小脳において特に多い(図15A〜図15B)[Herkenham M.他、The Journal of neuroscience:the official journal of the Society for Neuroscience(1991)11:563〜583;Mackie,K.、Handbook of experimental pharmacology(2005)299〜325]。CB1受容体が、神経伝達を調整するためにCB1受容体がうまく配置される軸索および軸索終末において高度に発現される。本発明者らは、CB1が、miRNA−19との適合性を有する2つのシード部位を含有することを見出した。
慢性的ストレスに供されたマウスにおける示差的に発現されるmiRNAの同定
材料および実験手順
Ago2タンパク質の免疫沈殿
同じ群(「感受性あり」、「立ち直りが速い」または対照)の一部である3匹の動物から得られた3個の扁桃体のプールを、RNase阻害剤、プロテアーゼ阻害剤およびホスファターゼ阻害が補充されたNP40緩衝液において均質化した。試料を、4℃で2時間、絶えず撹拌しながら維持した。その後、試料を、12000rpmで20分間、微量遠心分離器において4℃で遠心分離し、上清を、氷上に保たれた新しいチューブに入れ、ペレットを捨てた。磁気プロテインGビーズ(Dynabeads、Invitrogen)を、室温で10分間、回転とともにAgo2モノクローナル抗体(WAKO)とインキュベーションした。数回の洗浄の後、試料をAgo2被覆のプロテインGビーズに加え、撹拌下、4℃で一晩インキュベーションした。翌日、ビーズをPBSにより3回洗浄した。RNA精製のために、ビーズをRLT緩衝液において均質化した(RNeasyキット、miRNA補助プロトコル)。ウエスタンブロット分析のために、ビーズを、タンパク質をビーズから遊離させるために試料緩衝液において煮沸した。
Ago2免疫沈殿試料からのRNAを、Qiagenの補助プロトコル1:miRNA含有総RNAの調製に従って、RNeasyプラスキット(Qiagen)を使用して単離した。すべての他の目的のためのRNAを、miRNeasyミニキット(Qiagen)を製造者の推奨法に従って使用して、凍結された脳打ち抜き物から単離し、RNAの完全性を、Agilent2100バイオアナライザーを使用して評価した。Ago2免疫沈殿の後の、ストレス負荷マウスの組織に由来するRNAを、Affymetrix miRNA 2.0アレイ(濃縮RNAプロトコル)およびAffymetrix Mouse Gene 1.0STアレイでさらに分析した。
慢性的ストレスパラダイムに供されたマウスの扁桃体から単離される示差的に発現されるmiRNA、および/または、「立ち直りが速い」もしくは「感受性あり」の行動表現型に伴う示差的に発現されるmiRNAを同定し、かつ、研究するために、社会的敗北プロトコルを使用した(方法の節を参照)。
次に、Ago2のIP実験の具体的な結果に基づいて、同じ戦略を、社会的敗北プロトコルに供されたマウスの脳でのmiRNAおよびそれらの標的mRNAにおける潜在的な違いを明らかにするために実行した。
表3(本明細書中下記)は、従来のフィルターを使用して分析された予備的アレイ結果を例示した。
ストレス応答の調節因子としてのmiR−15aおよびmiR−15b
材料および実験手順
総RNA抽出
扁桃体組織を急性ストレス手順の90分後に解剖した。総RNAを、miRNAを保存するためにmiRNeasyキット(Qiagen)を使用して単離した。凍結された脳打ち抜き物を溶解緩衝液に移し、直ちに均質化した。ニューロン一次培養物またはN2a細胞培養物を氷上においてウエル内で溶解した。さらなる処理を製造者の推奨法に従って行った。RNA抽出物を使用まで−80℃で貯蔵した。
miRNAの示差的発現を製造者の説明書に従ってAgilent(Agilent、サンタクララ、カリフォルニア、米国)またはAffymetrix(Affymetrix、サンタクララ、カリフォルニア、米国)のmiRNAマイクロアレイによってアッセイした。miRNAの示差的発現を、Agilentアレイを使用して評価するために、1試料あたり100ngの総RNA(3つの対照試料および2つの急性ストレス試料)をそれぞれ、製造者の説明書に従って標識し、ハイブリダイゼーションさせた。アレイを、Agilentマイクロアレイスキャナーを使用して走査した。データを、Agilent Feature Extractionソフトウエアv9を使用して抽出し、Partek(登録商標)Genomics Suite(Partek Inc.、セントルイス、ミズーリ、米国)を使用して分析した。GeneView.txtファイルからのデータを対数変換および分位正規化に供した。miRNAの示差的発現を、Affymetrixアレイを使用して評価するために、1試料あたり1μgの総RNA(2つの対照試料および2つの急性ストレス試料)をそれぞれ、製造者の説明書に従って標識し、ハイブリダイゼーションさせた。アレイを、Affymetrixマイクロアレイスキャナーを使用して走査した。データを、Affymetrixスキャナーソフトウエアを使用して抽出し、Affymetrix miRNAQCtoolソフトウエアのデフォルトパラメータを使用して正規化した(バックグラウンド調節、分位正規化、対数変換および閾値決定)。4つのファイルからの正規化データを、Partek Genomicsソフトウエアにインポートした。これらのマイクロアレイのいずれにも提示されない遺伝子は除いた。miRNA分布における違いのために、(それぞれのアレイについて約1の標準誤差に対応する)異なる対数比カットオフをそれぞれのアレイについて選定した:Agilentについては0.2、Affimetrixについては0.4。対数比がカットオフよりも大きいmiRNAをアレイ間で比較した。共通するmiRNAを記録する。
CRFR1の3’UTR配列をマウスのゲノムDNAからPCR増幅した。3’UTRのPCRフラグメントを製造者の指針に従ってpGEM−Teasyベクター(Promega)に連結し、さらに、Psicheck2レポータープラスミド(Promega)におけるルシフェラーゼの3’末端での単一NotI部位にサブクローン化した。クローン化配向を診断的切断および配列決定によって確認した。
HEK293T細胞を70%〜85%の密集度まで48ウエル形式でポリ−L−リシン上で成長させ、下記のプラスミドとともにポリエチレンイミンを使用してトランスフェクションした:Psicheck2−3’UTRプラスミド、pEGFPプラスミドでのpre−mmu−miR−15過剰発現またはpEGFPプラスミド単独(clontech)。トランスフェクションの24時間後、細胞を溶解し、ルシフェラーゼレポーター活性を以前の記載のようにアッセイした[Chen A.他、Mol Endocrinol(2005)19:441〜58]。ウミシイタケルシフェラーゼの値を、(同じベクターから転写されるが、試験されている3’UTRによって影響されない)対照のホタルルシフェラーゼのレベルに対して正規化し、1条件あたり6回のウエル反復にわたって平均化した。
miR−15aおよびmiR−15bが、急性拘束ストレス後90分でアップレギュレーションされるように出現した(図7A〜図7B)。miR−15aおよびmiR−15bの両方がCRFR1−3’UTRを標的とすることが生物情報学的に予測された(図7C)。HEK293T細胞におけるmiR−15bのインビトロ過剰発現は、CRFR1−3’UTRによって制御されるルシフェラーゼ発現のレベルを著しく低下させた(図7D)。
FKBP5に対するmiR15の影響
材料および実験手順
実施例4A(本明細書中上記)において例示される通り。
アレイの結果に基づいて、miR−15aおよびFK506結合タンパク質5(これはまたFKBP5として知られている)はともに、対照群と比較して、「感受性あり」マウスおよび「立ち直りが速い」マウスにおいてアップレギュレーションされた(図20A〜図20B)。このことは、慢性的ストレスの結果としてのRISC複合体におけるそれらのアップレギュレーションを示唆している。
miR−181はグルタミン酸受容体を調節する
材料および実験手順
Psicheck2ルシフェラーゼ発現プラスミドへの3’UTRのクローン化
Grm1、Grik3、Grm5、Grik2およびGrm7の3’UTR配列をマウスのゲノムDNAからPCR増幅した。3’UTRのPCRフラグメントを製造者の指針に従ってpGEM−Teasyベクター(Promega)またはpJET1.2ベクター(Fermentas)のどちらかに連結し、さらに、Psicheck2レポータープラスミド(Promega)におけるルシフェラーゼの3’末端での単一NotIまたはXhoI部位にサブクローン化した。クローン化配向を診断的切断および配列決定によって確認した。
マウスを、以前に記載されたような社会的敗北プロトコルに供した[Krishnan V.他、Cell(2007)131:391〜404]。簡単に記載すると、マウスを攻撃的ICRマウスのホームケージに入れ、ホームケージにおいてマウスは5分間にわたって物理的に触れ合った。この期間中に、ICRマウスは侵入者マウスを攻撃し、侵入者は従属的態度を示した。その後、穴の開いた透明なプレキシガラス仕切り板を動物の間に置き、マウスを、感覚的接触を許すために24時間にわたって同じケージに留めた。その後、この手順を、その後の10日のそれぞれについて、見慣れないICRマウスを用いて繰り返した。
miR−181dのレベルが、慢性的ストレスに苦しむマウスにおいて著しく増大した(図23)。miR−181と潜在的なmRNA標的との間における相互作用を見出そうとする試みにおいて、本発明者らは、miR−181が多くの型のグルタミン酸受容体を潜在的に調節し得ることを発見した。一般に、グルタミン酸受容体は下記の2つのグループに分けることができる:イオンチャネル型グルタミン酸受容体(iGluR)、これは、グルタミン酸がこの受容体が結合するときに活性化するイオンチャネル細孔を形成する;および、代謝型グルタミン酸受容体(mGluR)、これは、Gタンパク質を伴うシグナル伝達カスケードを介して原形質膜上のイオンチャネルを間接的に活性化する。
miR−182aは、正常なニューロン活性の微調整因子であり、また、精神病理学的行動の微調整因子である
材料および実験手順
Psicheck2ルシフェラーゼ発現プラスミドへの3’UTRのクローン化
Htr1aの3’UTR配列をマウスのゲノムDNAからPCR増幅した。3’UTRのPCRフラグメントを製造者の指針に従ってpGEM−Teasyベクター(Promega)に連結し、さらに、Psicheck2レポータープラスミド(Promega)におけるルシフェラーゼの3’末端での単一NotI部位にサブクローン化した。クローン化配向を診断的切断および配列決定によって確認した。
HEK293T細胞を70%〜85%の密集度まで48ウエル形式でポリ−L−リシン上で成長させ、下記のプラスミドとともにポリエチレンイミンを使用してトランスフェクションした:Psicheck2−3’UTRプラスミド、pEGFPプラスミドでのpre−mmu−miR−182過剰発現またはpEGFPプラスミド単独(clontech)。トランスフェクションの24時間後、細胞を溶解し、ルシフェラーゼレポーター活性を以前の記載のようにアッセイした[Chen A.他、Mol Endocrinol(2005)19:441〜58]。ウミシイタケルシフェラーゼの値を、(同じベクターから転写されるが、試験されている3’UTRによって影響されない)対照のホタルルシフェラーゼのレベルに対して正規化し、1条件あたり6回のウエル反復にわたって平均化した。
マウスを、以前に記載されたような社会的敗北プロトコルに供した[Krishnan V.他、Cell(2007)131:391〜404]。簡単に記載すると、マウスを攻撃的ICRマウスのホームケージに入れ、これらのマウスは5分間にわたって物理的に触れ合った。この期間中に、ICRマウスは侵入者マウスを攻撃し、侵入者は従属的態度を示した。その後、穴の開いた透明なプレキシガラス仕切り板を動物の間に置き、マウスを、感覚的接触を許すために24時間にわたって同じケージに留めた。その後、この手順を、その後の10日のそれぞれについて、見慣れないICRマウスを用いて繰り返した。
脳試料を、脳を取り出し、アクリル脳マトリックス(Stoelting)に置いた後で、マウスの縫線核(RN)から採取した。スライス片を、指定の解剖学的マーカーに基づいて、標準的なカミソリ刃(GEM)を使用して採取した。先を鈍くした14G注射器を使用して、RN領域を、マトリックスから取り出された3mmのスライス片から抜き取った。
mRNA(ミクロRNAを含む)を、miRNeasyミニキット(Qiagen)を製造者の説明書に従って使用して、選別されたニューロン、凍結された脳打ち抜き物および血漿から単離し、miScript逆転写キットmiRNAを使用して処理し、cDNAを作製した。その後、cDNA試料を、SYBR(登録商標)Green PCRキット(Qiagen)を製造者の指針に従って使用して、AB7500サーモサイクラー(Applied Biosystems)で分析した。それぞれのmiRのための特異的プライマーを市販のユニバーサルプライマーと一緒に使用し、一方、U6のsnRNAを内部対照として使用した。
プレ−miR−182を、制限酵素のAgeI部位を加えるプライマーとともにマウスのゲノムDNAからPCRによって増幅し、その後、pGEM−T Easyベクター(Promega、マディソン、ウィスコンシン)に挿入した。pGEM−T Easyの配列決定、ならびに、AgeIによるpGEM−T EasyおよびpEGFPベクター(Clontech laboratories Inc.、マウンテンビュー、カリフォルニア)の両方の消化の後、未成熟miR−182配列をpEGFPベクターに連結して、発現プラスミドpEGFP−miR−182を構築した。その後で、pEGFP−miR−182を、pCSC−E/Syn−eGFPプラスミドを同じ酵素で切断するのと並行してBamHIおよびBsrGIによって切断し、miR−182−eGFP配列をpCSC−E/Synに連結して、pCSC−eSNY−pre−miR−182−eGFPプラスミドを構築し、これを制限エンドヌクレアーゼ分析およびDNA配列決定によって確認した。
組換えレンチウイルスを、以前の記載のように[Naldini L他、Proc Natl Acad Sci USA(1996)93:11382〜8]、HEK293T細胞における一過性トランスフェクションによって作製した。簡単に記載すると、感染性レンチウイルスをトランスフェクション後48時間および72時間で集め、0.45μm細孔の酢酸セルロースフィルターでろ過し、超遠心分離によって濃縮した。
現在に至るまで、miR−182は、主に癌関連の研究(例えば、ヒト肺腺癌細胞、神経膠腫、乳癌、膀胱癌、メラノーマおよびDNA修復など)において報告されていた。加えて、miR−182は、発達過程(例えば、内耳および網膜の発達など)に関与すること、Tリンパ球の活性化において免疫系に関与すること、また、狼瘡疾患に関与することが見出された。神経系においては、miR−182が、感覚器官特異的なラット後根神経節において、また、概日時計調整因子として暗示され、一方で、プレ−miR−182の遺伝子変化型の間における相関が大うつ病患者において見出された[Saus E他、Hum Mol Genet(2010)19(20):4017〜25]。加えて、miR−182が、立ち直りが速い行動から学習性無力行動までの雄ラットの前頭前皮質においてダウンレギュレーションされるとして他の12個のmiRの中に列挙された[Smalheiser NR他、Int J Neuropsychopharmacol、(2011)1〜11]。
急性ストレスによるmiR182発現レベルの調節
材料および実験手順
実施例5A(本明細書中上記)において記載される通り。
miR182レベルに対する急性ストレスの影響を調べた。図26に例示されるように、急性不動ストレスは、低下したmiR182発現レベルをストレス誘導後24時間でマウスの縫線核(RN)において引き起こした(P<0.01)。miR182は、低下した発現レベルを急性ストレスの後および慢性的ストレスの後の両方で縫線核において明らかにした。このことは、miR182が、5−HTレベルをシナプスにおいて調整するその標的遺伝子Htr1aにおそらくは影響することによって、ストレスに対する分子応答の縫線核における調整においてある一定の役割を有することを示唆している。
ルシフェラーゼアッセイを使用して、miR182の11個の予測された標的遺伝子(これらは広範囲の生物情報学の後で選定された)を調べた(図27A)。標的遺伝子の3’UTRをインビトロ試験して、miR182が、コンジュゲート化されたレポーター遺伝子ルシフェラーゼの活性によって測定されるような抑制効果を有するかを調べた。試験された11個の遺伝子のうち、3つの遺伝子、すなわち、Dscam(ダウン症候群細胞接着分子)、L1cam(細胞接着分子L1)およびTsnax(トランスリン会合タンパク質X)により、ルシフェラーゼアッセイの場合のようにmiR182による抑制効果が明らかにされた(図27A)。miR182の上記標的遺伝子の3’UTRを試験したとき、miR182についての保存されたシード一致配列が、Tsnax、L1camおよびDscamにおいて両方で認められ、このことは、このmiR−標的相互作用が機能的役割を有することを示唆した(データは示されず)。
成体マウスの血漿および脳におけるmiR135レベルの調節
材料および実験手順
miR135過剰発現ウイルスベクターおよびmiR135KDウイルスベクターのクローン化
miR135b KDプラスミドのpEZX−H1−miR135KD−CMV−mCherryおよび対照のpEZX−H1−対照KD−CMV−mCherryをGeneCopeia(米国)から購入した。H1プロモーターおよびKD配列を、隣接NheI部位を有するプライマーを使用して増幅し、pGEM−T Easyに連結した。pGEM−T Easyを配列決定し、pGEM−T Easyおよびp156−pRRL−CMV−GFPの両方をNheI部位により消化した後、H1−KD miRと、ニック導入のp156とを連結して、p156−pRRL−H1−miR135bKD−CMV−GFPおよびp156−pRRL−H1−対照KD−CMV−GFPを作製した。
すべての行動評価を、試験部屋に各試験の前の2時間慣らした後の暗期の期間中に行った。
明暗移動試験装置および実験条件は以前に記載された通りであった。簡単に記載すると、装置は、マウスが試験開始時に入れられた暗い覆い付きチャンバーと、マウスが5分の試験の期間中に自由に移ることができる明るく照明されたチャンバーとの2つのチャンバーを含んでいた。明るい区画で過ごした時間、明所で移動した距離、明るいチャンバーを訪れるまでの待ち時間、および、明暗移動の回数を、ビデオ録画追跡システム(VideoMot2;TSE Systems、バドハンブルグ、ドイツ)を用いて定量化した。
オープンフィールド試験を、マウスが10分の試験のために入れられる120luxで照明された50×50×22cmの白色箱において行った。中心で過ごした時間、中心における訪問回数、中心を訪れるまでの待ち時間、後ろ足立ち回数、および、移動した総距離を、ビデオ録画追跡システム(VideoMot2;TSE Systems、バドハンブルグ、ドイツ)を使用して定量化した。
この試験装置は十字形状を有し、2つの障壁と、2つの開放されている非常に低い照明された(6lux)アームとを含んでいた。進入回数、移動した距離、および、開放アームで過ごした時間が、5分の試験の期間中、ビデオ録画追跡システム(VideoMot2;TSE Systems、バドハンブルグ、ドイツ)を使用して自動的にスコア化された。
miR135レベルに対する抗うつ剤投与の影響を、RNからセロトニン作動性ニューロンによって神経支配され、かつ、気分調節に関与することが知られている脳部位、すなわち、扁桃体(AMY)および前頭前皮質(PFC)において試験した。AMYにおいて、miR135の両方の変化体が急性セロトニン再取り込み阻害剤(SSRI)およびノルアドレナリン再取り込み阻害剤(NRI)によってアップレギュレーションされたが、これらの薬物の長期投与による場合にはアップレギュレーションされなかった(miR135aについて、SSRIについてはP=0.0001、NRIについてはp=0.003、図28A;miR−135bについて、SSRIについてはp=0.0001、NRIについてはp=0.003、図28B)。PFCにおいて、miR135bのレベルが急性でのSSRIおよびNRIによってアップレギュレーションされ(SSRIについてはP=0.0183、NRIについてはp=0.0013、図28c)、しかし、miR135aのレベルは有意に変化しなかった(図28D)。加えて、長期SSRIはmiR135aおよびmiR135bの低下したレベルをPFCにおいて引き起こした(miR135aについてはP=0.0241、図28C;miR135bについてはP=0.0067、図28D)。
miR135ノックダウン系の確立;クローン化、レンチウイルス作製、ならびに、インビトロおよびインビボでの検証
材料および実験手順
miR135KDウイルスベクターのクローン化
miR135b KDプラスミドのpEZX−H1−miR135KD−CMV−mCherryおよび対照のpEZX−H1−対照KD−CMV−mCherryをGeneCopeia(米国)から購入した。H1プロモーターおよびKD配列を、隣接NheI部位を有するプライマーを使用して増幅し、pGEM−T Easyに連結した。pGEM−T Easyを配列決定し、pGEM−T Easyおよびp156−pRRL−CMV−GFPの両方をNheI部位により消化した後、H1−KD miRと、ニック導入のp156とを連結して、p156−pRRL−H1−miR135bKD−CMV−GFPおよびp156−pRRL−H1−対照KD−CMV−GFPを作製した。
マウスの5−HT関連行動に対するRNにおける低下したmiR135レベルの影響を評価するために、プラスミドに基づくmiR135b阻害剤を利用し、その効率をルシフェラーゼアッセイで試験した。このアッセイでは、HEK293T細胞が、miR135OEプラスミド、miR135KDプラスミドおよび3’UTRプラスミドにより共トランスフェクションされ、miR135bKDプラスミドが、Slc6a4およびHtr1aの3’UTRに対するmiR135の抑制効果を阻止し得るかが試験された。Htr1aの3’UTRのmiR135b抑制効果がmiR135KDプラスミドによって阻止された(図30A)。同様に、Slac6a4の3’UTRに対するmiR135bの影響がmiR135KDによって阻止された(図30B)。これらの結果は、miR135KDプラスミドが実際にmiR135の生物学的活性を阻止することを示している。
成体マウスのRNにおけるmiR135ノックダウンの行動的影響
材料および実験手順
行動評価
マウスを、実施例6(上記)で記載されるような不安およびうつ病様行動についての試験を使用することによって行動的に特徴づけした。
miR135KDレンチウイルスのインビトロおよびインビボ検証の後で、miR135KDレンチウイルスを使用して、miR135のレベルをRNにおいて操作し、また、マウスの行動に対するそれらの影響を試験した。成体マウスに、miR135KDレンチウイルスまたはKD対照レンチウイルスのどちらかをRNに対して注入し、回復期間の後、マウスを不安およびうつ病様行動について試験した。miR135は5−HTの負の調節因子を抑制するので、本発明者らは、miR135KDがシナプスにおける5−HTレベルを低下させ、それによって、増大した不安およびうつ病様行動を引き起こすことを予想した。
5−HTニューロンにおけるmiR135の過剰発現
材料および実験手順
miR135aを5−HTニューロンにおいて過剰発現するマウスを、miR135およびその標的遺伝子の発現レベルと行動的なものの両方で、それらの同腹子対照に対して比較した。
miR135のレベルを特異的にマウスのRNにおける5−HTニューロンにおいて操作することの影響を不安およびうつ病様行動について試験した。その目的のために、遺伝子系を、Cre−loxP系を使用して開発した。具体的には、5−HT特異性を、Creリコンビナーゼを5−HT RN陽性ニューロンにおいて特異的に発現するePET Creマウスを使用して得、miR135の過剰発現を、5−HT特異的Cre系統(ePET Cre)を、miR135aについての条件的過剰発現を有するトランスジェニックマウス系統と交雑することによって行った(図32)。
Claims (14)
- セロトニンレベルの上昇が治療上有益である医学的状態を処置する必要のあるヒト対象 において、前記セロトニンレベルの上昇が治療上有益である医学的状態を処置するための、miR−135、miR−135の前駆体、または前記miR−135もしくは前記miR−135の前駆体をコードする外因性ポリヌクレオチドを有効成分として含む医薬組成物。
- 前記miR−135または前記miR−135の前駆体をコードする前記外因性ポリヌクレオチドが核酸構築物中に含まれており、前記外因性ポリヌクレオチドが、シス作用調節要素の転写制御下にある、請求項1に記載の医薬組成物。
- 前記シス作用調節要素は神経膠細胞中で特異的に活性である、請求項2に記載の医薬組成物。
- 前記miR−135は、配列番号61〜62に示される通りである、請求項1に記載の医薬組成物。
- 前記miR−135前駆体は、配列番号58〜60に示される通りである、請求項1に 記載の医薬組成物。
- 前記miR−135前駆体は、修飾された骨格、修飾されたヌクレオシド間連結、および修飾された塩基からなる群から選択される修飾を含む、請求項1に記載の医薬組成物。
- 前記修飾された骨格は、ホスホロチオアート;キラルなホスホロチオアート;ホスホロジチオアート;ホスホトリエステル;アミノアルキルホスホトリエステル;メチルホスホナート;アルキルホスホナート;キラルなホスホナート;ホスフィナート;ホスホルアミダート;アミノアルキルホスホルアミダート;チオノホスホルアミダート;チオノアルキルホスホナート;チオノアルキルホスホトリエステル;ボラノホスフェート、ホスホジエステル、ペプチド核酸(PNA)、および2’−O−メトキシエチルからなる群から選択される修飾を含む、請求項6に記載の医薬組成物。
- 前記miR−135は、糖およびヌクレオシド間連結の両方に修飾を含む、請求項1に記載の医薬組成物。
- 前記医学的状態は、うつ病、不安、ストレス、疲労、損なわれた認知機能、パニック発作、脅迫行動、嗜癖、社会恐怖、睡眠障害、食品関連障害、成長障害および生殖障害からなる群から選択される、請求項1に記載の医薬組成物。
- 前記医学的状態は気分障害である、請求項1に記載の医薬組成物。
- miR−135またはmiR−135の前駆体をコードする核酸配列を含む核酸構築物と、医薬的に許容される担体または希釈剤とを含む医薬組成物であって、前記核酸配列が、神経膠細胞中で特異的に活性であるシス作用調節要素の転写制御下にあり、前記医薬組成物が、セロトニンレベルの上昇が治療上有益である医学的状態を処置する必要のあるヒ ト対象において、前記セロトニンレベルの上昇が治療上有益である医学的状態を処置するためのものである、医薬組成物。
- 前記miR−135は、配列番号61〜62に示される通りである、請求項11に記載の医薬組成物。
- 前記miR−135前駆体は、配列番号58〜60に示される通りである、請求項11 に記載の医薬組成物。
- 前記miR−135は、糖およびヌクレオシド間連結の両方に修飾を含む、請求項11に記載の医薬組成物。
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