JP2014503187A - 身体からヘプシジンを除去するためのヘプシジン結合核酸の使用 - Google Patents
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Abstract
【選択図】なし
Description
a)ヘプシジンと結合可能な核酸分子を準備することと、
b)ヘプシジンと核酸分子との結合が可能な条件下で核酸分子と体液とを接触させて、ヘプシジンと核酸分子との複合体を形成させることと、
c)体液から複合体を除去すること、または体液からヘプシジンを除去することと
を含む。
a)X1はAであり、X2はGであり、X3はBであり、X4はSであり、X5はCであり、かつX6はUであるか、
b)X1は存在せず、X2はGであり、X3はBであり、X4はSであり、X5はCであり、かつX6はUであるか、または
c)X1はAであり、X2はGであり、X3はBであり、X4はSであり、X5はCであり、かつX6は存在しない。
a)第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’AGCGUGUC3’を含み、かつ第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GGUGCGCU3’を含むか、
b)第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’AGCGUGUC3’を含み、かつ第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GGCAUGCU3’を含むか、
c)第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’AGUGUGUC3’を含み、かつ第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GAUGCGCU3’を含むか、
d)第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’AGUGUGUC3’を含み、かつ第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GGCAUGCU3’を含むか、
e)第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’AGCGUGCC3’を含み、かつ第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GGUGCGCU3’を含むか、または
f)第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’AGCGCGCC3’を含み、かつ第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GGCGCGCU3’を含む。
a)X1は存在せず、X2はGであり、X3はBであり、X4はSであり、X5はCであり、かつX6は存在しないか、
b)X1は存在せず、X2は存在せず、X3はBであり、X4はSであり、X5はCであり、かつX6は存在しないか、または
c)X1は存在せず、X2はGであり、X3はBであり、X4はSであり、X5は存在せず、かつX6は存在しない。
a)第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GCGCGC3’を含み、かつ第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GCGCGC3’を含むか、
b)第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GGUGUC3’を含み、かつ第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GGCAUC3’を含むか、
c)第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GGCGUC3’を含み、かつ第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GGCGCC3’を含むか、
d)第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GCGCC3’を含み、かつ第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GGCGC3’を含むか、または
e)第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GGCGC3’を含み、かつ第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GCGCC3’を含む。
a)X1はAであり、X2はGであり、X3はRであり、X4はYであり、X5はCであり、かつX6はUであるか、
b)X1は存在せず、X2はGであり、X3はRであり、X4はYであり、X5はCであり、かつX6はUであるか、または
c)X1はAであり、X2はGであり、X3はRであり、X4はYであり、X5はCであり、かつX6は存在しない。
a)第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’AGGCUCG3’を含み、かつ第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CGGGCCU3’を含むか、
b)第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’AGGCCCG3’を含み、かつ第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CGGGCCU3’を含むか、
c)第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’AGGCUUG3’を含み、かつ第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CGAGCCU3’を含むか、または
d)第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’AGACUUG3’を含み、かつ第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CGAGUCU3’を含む。
a)X1は存在せず、X2はGであり、X3はRであり、X4はYであり、X5はCであり、かつX6は存在しないか、
b)X1は存在せず、X2は存在せず、X3はRであり、X4はYであり、X5はCであり、かつX6は存在しないか、
c)X1は存在せず、X2はGであり、X3はRであり、X4はYであり、X5は存在せず、かつX6は存在しない。
a)第一の連結ヌクレオチドサブストレッチが5’GGAC3’、5’GGAU3’および5’GGA3’の群から選択されるヌクレオチド配列を含み、かつ第三の連結ヌクレオチドサブストレッチがヌクレオチド配列5’GUCC3’を含むか、
b)第一の連結ヌクレオチドサブストレッチがヌクレオチド配列5’GCAG3’を含み、かつ第三の連結ヌクレオチドサブストレッチがヌクレオチド配列5’CUGC3’を含むか、
c)第一の連結ヌクレオチドサブストレッチがヌクレオチド配列5’GGGC3’を含み、かつ第三の連結ヌクレオチドサブストレッチがヌクレオチド配列5’GCCC3’を含むか、
d)第一の連結ヌクレオチドサブストレッチがヌクレオチド配列5’GAC3’を含み、かつ第三の連結ヌクレオチドサブストレッチがヌクレオチド配列5’GUC3’を含むか、
e)第一の連結ヌクレオチドサブストレッチがヌクレオチド配列5’ACUUGU3’を含み、かつ第三の連結ヌクレオチドサブストレッチが5’GCAAGU3’および5’GCAAGC3’の群から選択されるヌクレオチド配列を含むか、または
f)第一の連結ヌクレオチドサブストレッチがヌクレオチド配列5’UCCAG3’を含み、かつ第三の連結ヌクレオチドサブストレッチがヌクレオチド配列5’CUGGA3’を含み、
好ましくは、第一の連結ヌクレオチドサブストレッチがヌクレオチド配列5’GAC3’を含み、かつ第三の連結ヌクレオチドサブストレッチがヌクレオチド配列5’GUC3’を含む。
a)X1はGであり、X2はSであり、X3はVであり、X4はBであり、X5はSであり、かつX6はCであるか、
b)X1は存在せず、X2はSであり、X3はVであり、X4はBであり、X5はSであり、かつX6はCであるか、または
c)X1はGであり、X2はSであり、X3はVであり、X4はBであり、X5はSであり、かつX6は存在しない。
a)X1は存在せず、X2はSであり、X3はVであり、X4はBであり、X5はSであり、かつX6は存在しないか、
b)X1は存在せず、X2は存在せず、X3はVであり、X4はBであり、X5はSであり、かつX6は存在しないか、または
c)X1は存在せず、X2はSであり、X3はVであり、X4はBであり、X5は存在せず、かつX6は存在しない。
a)第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GCUGUG3’を含み、かつ第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CACAGC3’を含むか、
b)第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CGUGUG3’を含み、かつ第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CACACG3’を含むか、
c)第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CGUGCU3’を含み、かつ第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’AGCACG3’を含むか、
d)第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CGCGCG3’を含み、かつ第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CGCGCG3’を含むか、
e)第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GCCGUG3’を含み、かつ第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CACGCG3’を含むか、
f)第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GCGGUG3’を含み、かつ第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CACCGC3’を含むか、
g)第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GCUGCG3’を含み、かつ第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CGCAGC3’を含むか、
h)第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GCUGGG3’を含み、かつ第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CCCAGC3’を含むか、または
i)第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GCGGCG3’を含み、かつ第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CGCCGC3’を含む。
本発明をさらなる特徴、実施形態および利点が理解され得る図面、実施例および配列表により詳細に説明する。
a)ヘプシジンと結合可能な核酸分子を準備することと、
b)ヘプシジンと核酸分子との結合が可能な条件下で核酸分子と体液とを接触させて、ヘプシジンと核酸分子との複合体を形成させることと、
c)体液から複合体を除去すること、または体液からヘプシジンを除去することと
を含む。
アミンと活性化カルボン酸、
アミンと活性化カルバミン酸エステル、
アミンとイソシアナート/イソチオシアナート、
アミンとハロゲン化物、
アミンとマレイミド部分、
アミンとアルデヒド/ケトン、
ヒドロキシルアミンまたはヒドラジドとケトン/アルデヒド、
ヒドラジン誘導体と活性化カルボン酸、
ヒドラジンとイソシアナート/イソチオシアナート、
ヒドラジンとハロゲン化物、
ヒドラジンとマレイミド部分、
ヒドラジンとアルデヒド/ケトン:
ヒドラジンとアルデヒド/ケトン、次いで還元的アミノ化
チオールとハロゲン化物、
チオールとマレイミド、
チオールと活性化チオール、
チオールとビニルスルホンなどのMichael付加反応、
アジドとアルキンとCu塩などの「クリックケミストリー」相互作用パートナー(Kolbら,2001)、
アルキルまたはアリールP(III)部分を用いたStaudinger反応によるアジドと活性化カルボン酸、
求電子性トラップに付着したアジドと三価ホスフィン(Staudingerライゲーション)、
アジドとホスフィノチオールエステル―無痕跡型Staudingerライゲーション、
イミンを形成し、次いで対応するアミンに任意に還元され得るアジドとアルデヒド/ケトン+PPh3(Staudinger)、
アミンとカルボキシル基―
カルボン酸官能基とアミン、ヒドラジンのようなアミノ官能基、
Cis−ジオール(例えば、RNA分子の3’末端上に存在するもの)がジ−アルデヒドに酸化され、次いで、例えばホウ水素化物による還元後に、例えばアミンまたはヒドラジン誘導体を有する環状アミンを形成、
チオエステルとシステイン―天然のライゲーションおよび誘導体、
ホスホチオアートとα−ハロカルボニル含有コンジュゲート、
例えばリン酸活性化によりリン酸とアミンからホスホルアミダート、
例えば活性化によりリン酸とアルコールからホスホジエステル、
アルデヒドから第二級アミンの形成(ホウ水素化物による還元後)、ヒドラジノ基からヒドラゾンの形成、セミカルバジドからセミカルバゾンの形成、
システイン誘導体とチオエステルペプチド
エポキシドとアミン
Diels Alder反応などのペリ環化反応を生じるアルケン/アルキンとジエン/ジイン
アルデヒドとヒドロキシルアミンとの反応によるオキシム形成、
ヒドロキシまたはアミノとエポキシド。
a)赤血球産生の減少
b)赤血球破壊の増加
c)失血。
a)IL−6−受容体アンタゴニスト、例えばトシリズマブまたはアトリズマブなど、
b)TNF−アンタゴニスト、例えばエタネルセプト、インフリキシマブ、アダリムマブ、セルトリズマブなど、
c)IL−1受容体アンタゴニスト、例えばアナキンラなど、
d)CD20結合分子、例えばリツキシマブおよびイブリツマブなど
がある。
ビオチン化ヒトD−ヘプシジン−2を標的として用いて、ヒトヘプシジン、具体的にはヒトヘプシジン−25、ヒトヘプシジン−22およびヒトヘプシジン−20と結合する核酸をいくつか作成することができた。そのヌクレオチド配列を図1〜9に示す。核酸をアプタマーで、すなわち、ビオチン化ヒトD−ヘプシジン−25との直接プルダウンアッセイ(実施例3)、競合プルダウンアッセイ(実施例3)および/または表面プラズモン共鳴測定(実施例4)を用いてD−核酸レベルで、またはシュピーゲルマーレベルで、すなわち、競合プルダウンアッセイ(実施例3)、表面プラズモン共鳴測定(実施例4)および/またはin vivoアッセイ(実施例5および6)により、ヒトヘプシジン−25(ヒトL−ヘプシジン−25)の天然の立体配置を有するL−核酸レベルで特徴付けた。シュピーゲルマーおよびアプタマーは実施例2に記載されている通りに合成したものであった。
S 強い水素結合 GまたはC;
W 弱い水素結合 AまたはU;
R プリン GまたはA;
Y ピリミジン CまたはU;
K ケト GまたはU;
M イミノ AまたはC;
B Aではない C、UまたはG;
D Cではない A、GまたはU;
H Gではない A、CまたはU;
V Uではない A、CまたはG;
N 全ヌクレオチド A、G、CまたはU
図1、図2、図3および図4に示されるように、A型ヘプシジン結合核酸は中央部のヌクレオチドストレッチを1つ含み、中央部のヌクレオチドストレッチは、潜在的なヘプシジン結合モチーフを定めるヌクレオチドストレッチ(本明細書ではヌクレオチドボックスとも呼ばれる)を少なくとも2つ、すなわち第一のヌクレオチドストレッチであるボックスAおよび第二のヌクレオチドストレッチであるボックスBを含む。
a)229−B1−001とその誘導体、223−C5−001とその誘導体、223−B5−001、223−A5−001、223−A3−001、223−F5−001、223−G4−001、223−A4−001、238−E2:5’GGCGUGAUAGUGC3’(配列番号203);
b)229−B4−001、229−C2−001、229−E2−001:5’GGAGUGUUAGUUC3’(配列番号204);
c)229−G1−001:5’GGCGUGAGAGUGC3’(配列番号205);
d)229−C4−001、236−G2−001:5’AGCGUGAUAGUGC3’(配列番号206);
e)238−A1−001:5’GGCGUGUUAGUGC3’(配列番号207);
f)236−D1−001:5’GGGAUAUAGUGC3’(配列番号202)。
a)5’GCAG3’と5’CUGC3’(229−C2−001、229−B4−001、229−E2−001、237−A7−001)
b)5’GAC3’と5’GUC3’(229−B1−001とその誘導体、229−G1−001)
c)5’ACUUGU3’と5’GCAAGU3’(229−C4−001)
d)5’ACUUGU3’と5’GCAAGC3’(236−G2−001)
e)5’UCCAG3’と5’CUGGA3’(229−D1−001)
f)5’GGGC3’と5’GCCC3’(238−A1−001)がある。
a)5’AAUU3’(229−B1とその誘導体)
b)5’CCA3’(223−C5とその誘導体)
c)5’CUA3’(223−F5−001)
d)5’UCA3’(223−G4−001)
e)5’AAUA3’(229−G1−001)。
a)5’GGACBYAGUCC3’(配列番号208)(223−C5−001、223−C5−002、223−C5−006、223−C5−007、223−B5−001、223−A5−001、223−A3−001、223−F5−001、223−G4−001、238−E2−001)、好ましくは5’GGACCCAGUCC3’(配列番号193)、5’GGACCUAGUCC3’(配列番号194)もしくは5’GGACUCAGUCC3’(配列番号195)もしくは5’GGACGUAGUCC3’(配列番号214)、より好ましくは5’GGACCCAGUCC3’(配列番号193)、5’GGACCUAGUCC3’(配列番号194)もしくは5’GGACUCAGUCC3’(配列番号195);
b)5’GGAUACAGUCC3’(配列番号209)(223−A4−001);
c)5’GCAGGYAAUCUGC3’(配列番号210)(229−C2−001、229−B4−001、229−E2−001)、好ましくは5’GCAGGUAAUCUGC3’(配列番号196)もしくは5’GCAGGCAAUCUGC3’(配列番号197)、より好ましくは5’GCAGGUAAUCUGC3’(配列番号196);
d)5’GACAAUWGUC3’(配列番号211)(229−B1−001とその誘導体、229−G1−001)、好ましくは5’GACAAUUGUC3’(配列番号198)もしくは5’GACAAUAGUC3’(配列番号157);
e)5’ACUUGUCGAAAGCAAGY3’(配列番号212)(229−C4−001、236−G2−001);
f)5’UCCAGGUUCUGGA3’(配列番号109)(229−D1−001);
g)5’GGGCUGAGCCC3’(配列番号190)(238−A1−001);
h)5’GCAGAUAAUCUGC3’(配列番号191)(237−A7−001);または
i)5’GGACCAGUCC3’(配列番号192)(223−C5−008)。
X1はGであるかまたは存在せず、X2はSであるかまたは存在せず、X3はVであるかまたは存在せず、X4はBであるかまたは存在せず、X5はSであるかまたは存在せず、かつX6はCであるかまたは存在せず、
好ましくは、
a)X1はGであり、X2はSであり、X3はVであり、X4はBであり、X5はSであり、かつX6はCであるか、
b)X1は存在せず、X2はSであり、X3はVであり、X4はBであり、X5はSであり、かつX6はCであるか、
d)X1はGであり、X2はSであり、X3はVであり、X4はBであり、X5はSであり、かつX6は存在しないか、
e)X1は存在せず、X2はSであり、X3はVであり、X4はBであり、X5はSであり、かつX6は存在しないか、
f)X1は存在せず、X2は存在せず、X3はVであり、X4はBであり、X5はSであり、かつX6は存在しないか、
g)X1は存在せず、X2はSであり、X3はVであり、X4はBであり、X5は存在せず、かつX6は存在しないか、または
f)X1は存在せず、X2は存在せず、X3はVであるかもしくは存在せず、X4はBであるかもしくは存在せず、X5は存在せず、X6は存在しない。
a)223−C5−001、223−F5−001、223−G4−001:5’GCACUCG3’(第一の末端ヌクレオチドストレッチ)と5’CGAGUGC3’(第二の末端ヌクレオチドストレッチ);
b)229−B1−002:5’GCUGUG3’(第一の末端ヌクレオチドストレッチ)と5’CACAGC3’(第二の末端ヌクレオチドストレッチ);
c)229−B1−001、229−G1−001:5’CGUGUG3’(第一の末端ヌクレオチドストレッチ)と5’CACACG3’(第二の末端ヌクレオチドストレッチ);
d)229−D1−001:5’CGUGCU3’(第一の末端ヌクレオチドストレッチ)と5’AGCACG3’(第二の末端ヌクレオチドストレッチ);
e)223−C5−006:5’CGCGCG3’(第一の末端ヌクレオチドストレッチ)と5’CGCGCG3’(第二の末端ヌクレオチドストレッチ)
f)229−B1−007:5’GCCGUG3’(第一の末端ヌクレオチドストレッチ)と5’CACGGC3’(第二の末端ヌクレオチドストレッチ)
g)229−B1−008:5’GCGGUG3’(第一の末端ヌクレオチドストレッチ)と5’CACCGC3’(第二の末端ヌクレオチドストレッチ)
h)229−B1−009:5’GCUGCG3’(第一の末端ヌクレオチドストレッチ)と5’CGCAGC3’(第二の末端ヌクレオチドストレッチ)
i)229−B1−010:5’GCUGGG3’(第一の末端ヌクレオチドストレッチ)と5’CCCAGC3’(第二の末端ヌクレオチドストレッチ)
j)229−B1−011:5’GCGGCG3’(第一の末端ヌクレオチドストレッチ)と5’CGCCGC3’(第二の末端ヌクレオチドストレッチ)。
223−C5−001−5’−PEG:KD=4.44nM;
229−B1−002−5’−PEG:KD=1.92nM。
図5および6に示されるように、B型ヘプシジン結合核酸は、潜在的なヘプシジン結合モチーフを定める中央部のヌクレオチドストレッチを1つ含む。
X1はAであるかまたは存在せず、X2はGであるかまたは存在せず、X3はBであるかまたは存在せず、X4はSであるかまたは存在せず、X5はCであるかまたは存在せず、かつX6はUであるかまたは存在せず、
好ましくは、
a)X1はAであり、X2はGであり、X3はBであり、X4はSであり、X5はCであり、かつX6はUであるか、
b)X1は存在せず、X2はGであり、X3はBであり、X4はSであり、X5はCであり、かつX6はUであるか、
c)X1はAであり、X2はGであり、X3はBであり、X4はSであり、X5はCであり、かつX6は存在しないか、
d)X1は存在せず、X2はGであり、X3はBであり、X4はSであり、X5はCであり、かつX6は存在しないか、
e)X1は存在せず、X2は存在せず、X3はBであり、X4はSであり、X5はCであり、かつX6は存在しないか、
f)X1は存在せず、X2はGであり、X3はBであり、X4はSであり、X5は存在せず、かつX6は存在しないか、または
g)X1は存在せず、X2は存在せず、X3はBであるかもしく存在せず、X4はSであるかもしくは存在せず、X5は存在せず、かつX6は存在しない。
a)238−D2−001:5’AGCGUGUC3’(第一の末端ヌクレオチドストレッチ)と5’GGUGCGCU3’(第二の末端ヌクレオチドストレッチ)、
b)238−D4−001:5’AGCGUGUC3’(第一の末端ヌクレオチドストレッチ)と5’GGCAUGCU3’(第二の末端ヌクレオチドストレッチ)、
c)238−H1−001:5’AGUGUGUC3’(第一の末端ヌクレオチドストレッチ)と5’GAUGCGCU3’(第二の末端ヌクレオチドストレッチ)、
d)238−A2−001:5’AGUGUGUC3’(第一の末端ヌクレオチドストレッチ)と5’GGCAUGCU3’(第二の末端ヌクレオチドストレッチ)、
e)238−G2−001:5’AGCGUGCC3’(第一の末端ヌクレオチドストレッチ)と5’GGUGCGCU3’(第二の末端ヌクレオチドストレッチ)、
f)238−G3−001:5’AGCGCGCC3’(第一の末端ヌクレオチドストレッチ)と5’GGCGCGCU3’(第二の末端ヌクレオチドストレッチ)、
g)238−D4−002:5’GCGCGC3’(第一の末端ヌクレオチドストレッチ)と5’GCGCGC3’(第二の末端ヌクレオチドストレッチ)、
h)238−D4−006:5’GGUGUC3’(第一の末端ヌクレオチドストレッチ)と5’GGCAUC3’(第二の末端ヌクレオチドストレッチ)、
i)238−D4−012:5’GGCGUC3’(第一の末端ヌクレオチドストレッチ)と5’GGCGCC3’(3’−末端ヌクレオチドストレッチ)、
j)238−D4−008:5’GCGCC3’(第一の末端ヌクレオチドストレッチ)と5’GGCGC3’(第二の末端ヌクレオチドストレッチ)、
k)238−D4−004:5’GGCGC3’(第一の末端ヌクレオチドストレッチ)と5’GCGCC3’(第二の末端ヌクレオチドストレッチ)。
238−D4−002−5’−PEG:0.53nM、
238−D4−008−5’−PEG:0.64nM。
図7および8に示されるように、C型ヘプシジン結合核酸は、潜在的なヘプシジン結合モチーフを定める中央部のヌクレオチドストレッチを1つ含む。
X1はAであるかまたは存在せず、X2はGであるかまたは存在せず、X3はRであるかまたは存在せず、X4はYであるかまたは存在せず、X5はCであるかまたは存在せず、X6はUであるかまたは存在せず、
好ましくは、
a)X1はAであり、X2はGであり、X3はRであり、X4はYであり、X5はCであり、かつX6はUであるか、
b)X1は存在せず、X2はGであり、X3はRであり、X4はYであり、X5はCであり、かつX6はUであるか、
c)X1はAであり、X2はGであり、X3はRであり、X4はYであり、X5はCであり、かつX6は存在しないか、
d)X1は存在せず、X2はGであり、X3はRであり、X4はYであり、X5はCであり、かつX6は存在しないか、
e)X1は存在せず、X2は存在せず、X3はRであり、X4はYであり、X5はCであり、かつX6は存在しないか、
f)X1は存在せず、X2はGであり、X3はRであり、X4はYであり、X5は存在せず、かつX6は存在しないか、または
g)X1は存在せず、X2は存在せず、X3はRであるかもしくは存在せず、X4はYであるかもしくは存在せず、X5は存在せず、かつX6は存在しない。
a)238−C4−001、238−E3−001:5’AGGCUCG3’(第一の末端ヌクレオチドストレッチ)と5’CGGGCCU3’(第二の末端ヌクレオチドストレッチ)、
b)238−F2−001:5’AGGCCCG3’(第一の末端ヌクレオチドストレッチ)と5’CGGGCCU3’(第二の末端ヌクレオチドストレッチ)、
c)238−A4−001:5’AGGCUUG3’(第一の末端ヌクレオチドストレッチ)と5’CGAGCCU3’(第二の末端ヌクレオチドストレッチ)、
d)238−E1−001:5’AGACUUG3’(第一の末端ヌクレオチドストレッチ)と5’CGAGUCU3’(第二の末端ヌクレオチドストレッチ)、
e)238−C4−002:5’GGCUCG3’(第一の末端ヌクレオチドストレッチ)と5’CGGGCC3’(第二の末端ヌクレオチドストレッチ)、
f)238−C4−006:5’GGCCG3’(第一の末端ヌクレオチドストレッチ)と5’CGGCC3’(第二の末端ヌクレオチドストレッチ)
g)238−C4−010:5’GCGCG3’(第一の末端ヌクレオチドストレッチ)と5’CGCGC3’(第二の末端ヌクレオチドストレッチ)。
A型、B型およびC型ヘプシジン結合核酸に関係しないその他のヘプシジン結合核酸を図9に示す。これらのヘプシジン核酸の結合親和性をプラズモン共鳴測定およびA型ヘプシジン結合核酸229−G1−001との競合結合実験により決定した。全核酸がA型ヘプシジン結合核酸229−G1−001よりも弱い結合親和性を示した(図9)。
小規模な合成
2’TBDMS RNAホスホラミダイト化学(DamhaおよびOgilvie,1993)を用いたABI394合成装置(Applied Biosystems、Foster City、CA、USA)での固相合成により、アプタマー(D−RNA核酸)およびシュピーゲルマー(L−RNA核酸)を生成した。D立体配置およびL立体配置のrA(N−Bz)−、rC(Ac)−、rG(N−ibu)−およびrU−ホスホラミダイトをChemGenes社(Wilmington、MA)から購入し、ゲル電気泳動によりアプタマーおよびシュピーゲルマーを精製した。
2’TBDMS RNAホスホラミダイト化学(DamhaおよびOgilvie,1993)を用いたAktaPilot100(「A」にウムラウト有り)合成装置(Amersham Biosciences;General Electric Healthcare、Freiburg)での固相合成により、シュピーゲルマーを生成した。L−rA(N−Bz)−、L−rC(Ac)−、L−rG(N−ibu)−およびL−rU−ホスホラミダイトをChemGenes社(Wilmington、MA)から購入した。異なる5’−アミノ修飾物質、例えば5’−アミノ−HEG−HEGリンカーをAmerican International Chemicals社(Framingham、MA、USA)から購入した。未修飾シュピーゲルマーまたは5’−アミノ修飾シュピーゲルマーの合成をL−riboG、L−riboC、L−riboAまたはL−riboUで修飾した細孔径1000ÅのCPG (Link Technology、Glasgow、UK)から開始した。カップリング(1サイクル当たり15分)には、アセトニトリル中0.3Mのベンジルチオテトラゾール(CMS−Chemicals、Abingdon、UK)と、アセトニトリル中0.1Mの各ホスホラミダイト溶液3.5等量とを用いた。酸化−キャッピングサイクルを用いた。さらに、オリゴヌクレオチド合成用の標準的な溶媒および試薬をBiosolve社(Valkenswaard、NL)から購入した。シュピーゲルマーをDMT−ONで合成し、脱保護の後、Source15RPC溶媒(Amersham)を用いた調製用RP−HPLCにより精製した(Wincottら,1995)。80%酢酸を用いて5’DMT基を除去した(RTで30分)。次いで、2MのNaOAc水溶液を加え、5Kの再生セルロース膜(Millipore、Bedford、MA)を用いた接線流ろ過によりシュピーゲルマーを脱塩した。
シュピーゲルマーのin vivoでの血漿中滞留時間を長くするために、シュピーゲルマーを5’末端で40kDaのポリエチレングリコール(PEG)部分と共有結合させた。
PEG化(PEG化の方法の詳細な技術に関しては、欧州特許出願EP 1 306 382号を参照されたい)では、精製した5’アミノ修飾シュピーゲルマーをH2O(2.5ml)とDMF(5ml)と緩衝液A(5ml;クエン酸・H2O[7g]、ホウ酸[3.54g]、リン酸[2.26ml]および1M NaOH[343ml]を混合し、水を加えて最終体積11にして調製;1M HClでpH=8.4に調整)の混合物に溶かした。
直接プルダウンアッセイ
ビオチン化ヒトD−ヘプシジン−25(配列番号7)に対するヘプシジン結合核酸のアプタマー(D−RNA核酸)としての親和性をプルダウンアッセイ形式で37℃で測定した。アプタマーは、[γ−32P]標識ATP(Hartmann Analytic、Braunschweig、Germany)を用いて5’−リン酸をT4ポリヌクレオチドキナーゼ(Invitrogen、Karlsruhe、Germany)により標識したものであった。標識アプタマーの比放射能は200,000〜800,000cpm/pmolであった。低濃度で平衡状態に達するように、アプタマーを変性および再結合後に、選択緩衝液(20mMトリス−HCl、pH7.4;137mM NaCl;5mM KCl;1mM MgCl2;1mM CaCl2;0.1%[w/vol]Tween−20)中、濃度20pM、37℃で様々な量のビオチン化ヒトD−ヘプシジンとともに2〜12時間インキュベートした。使用済みのプラスチック製品または固定化マトリックスの表面に結合パートナーが吸着するのを防ぐために、ヒト血清アルブミン(Sigma−Aldrich、Steinheim、Germany)10μg/mlと酵母RNA(Ambion、Austin、USA)10μg/mlを選択緩衝液に補充した。ビオチン化ヒトD−ヘプシジンの濃度範囲を32pM〜500nMに設定し、総反応体積は1mlであった。ビオチン化ヒトD−ヘプシジンおよびアプタマーとビオチン化ヒトD−ヘプシジンとの複合体を、選択緩衝液で予め平衡化し総体積12μlで再懸濁させたニュートラアビジンまたはストレプトアビジンUltralink Plus粒子(Thermo Scientific、Rockford、USA)6μlで固定化した。粒子をサーモミキサー中、各温度で30分間、懸濁状態に保った。上清の分離と適当な洗浄の後に、固定化された放射能をシンチレーションカウンターで定量した。結合の百分率をビオチン化ヒトD−ヘプシジンの濃度に対してプロットし、1:1の化学量論を仮定してソフトウェアアルゴリズム(GRAFIT;Erithacus Software;Surrey U.K.)を用いて解離定数を得た。
様々なヘプシジン結合核酸のアプタマーを比較するために、競合により序列化するアッセイを行った。これを行うために、利用できる最も類縁のアプタマーを放射性標識し(上を参照されたい)参照物質として用いた。変性および再結合後に、これを0.8mlの選択緩衝液中、ニュートラアビジンアガロースまたはストレプトアビジンUltralink Plus(ともにThermo Scientific社製)へ固定化および競合なしでの洗浄を行った後のビオチン化ヒトD−ヘプシジン−25との結合が約5〜10%となる条件下、37℃でビオチン化ヒトD−ヘプシジンとともにインキュベートした。変性および再結合した過剰な非標識D−RNAアプタマー変異体を様々な濃度(例えば、10、50および250nM)まで標識参照アプタマーとともに加え、結合反応を並行させた。被検アプタマーが標的との結合に関して参照アプタマーと競合するため、結合特性に従って結合シグナルが減少した。次いで、このアッセイで最も活性が高かったアプタマーを新たな参照物質として、さらなるアプタマー変異体の比較分析に用いることができた。
さらに、ヘプシジン結合シュピーゲルマーの親和性を解析するために競合プルダウンアッセイを行った。これを行うために、ビオチン化ヒトL−ヘプシジン−25と結合するシュピーゲルマーを用いた。シュピーゲルマーの5’末端にD立体配置のグアノシン残基をさらに2個加えることで、シュピーゲルマーをT4ポリヌクレオチドキナーゼにより放射性標識することができた(上を参照されたい)。変性および再結合後に、標識シュピーゲルマーおよび0.032〜500nMの範囲の競合分子(様々なヘプシジン種、切断型のヘプシジンまたはシュピーゲルマー;下を参照されたい)の5倍希釈物一組を、選択緩衝液0.8ml中、37℃で2〜4時間、一定量のビオチン化ヒトL−ヘプシジンとともにインキュベートした。選択されたペプチド濃度において、最終的に最低競合分子濃度で約5〜10%の放射性標識シュピーゲルマーの結合が得られるようにした。1つの型の競合プルダウンアッセイでは、変性および再結合した過剰な非標識L−RNAシュピーゲルマー変異体を競合分子として使用し、未修飾型およびPEG化型のものを試験した。別のアッセイ方法では、各種の種由来の非ビオチン化L−ヘプシジン−25(例えばヒトL−ヘプシジン−25、カニクイザルL−ヘプシジン−25、マーモセットL−ヘプシジン−25またはラットL−ヘプシジン−25など)または非ビオチン化N末端切断型L−ヘプシジン−20およびL−ヘプシジン−22を、シュピーゲルマーとの結合に関してビオチン化L−ヘプシジンと競合させた。ビオチン化L−ヘプシジン−25および結合シュピーゲルマーを1.5〜3μlのストレプトアビジンUltralink Plusマトリックス(Thermo Scientific、Rockford、USA)に固定化し、洗浄およびシンチレーションカウントを行った後(上を参照されたい)、結合した放射性標識シュピーゲルマーの正規化した百分率を競合分子の対応する濃度に対してプロットした。得られた解離定数をGraFitソフトウェアを用いて算出した。
Biacore 2000機器(Biacore AB、Uppsala、Sweden)を用いて、ビオチン化ヒトD−ヘプシジン−25に対するヘプシジン結合核酸のアプタマーの結合およびビオチン化ヒトL−ヘプシジン−20に対するヘプシジン結合核酸のシュピーゲルマーの結合を、ヒト、ラットおよびマウスL−ヘプシジン25に対する結合とともに解析した。
慢性疾患による貧血に関しては現在のところ、炎症誘発性サイトカイン、特にIL−6により肝細胞でのヘプシジンの合成および放出が刺激されると考えられている。次いでヘプシジンが、鉄輸送体であるフェロポーチンを発現する様々な種類の細胞と結合する。この相互作用によりヘプシジン−フェロポーチン複合体の内部移行および分解が誘導され、次いで血清鉄が減少する。血清鉄の慢性的な減少が赤血球生成に悪影響を及ぼし、最終的には貧血が発症する。ヒトヘプシジン−25がマウスにおいて血清鉄減少を誘導するという既知の特性(Rivera,2005)を炎症による貧血のモデルとして用いた。シュピーゲルマーの活性をin vivoで試験するために、C57BL/6マウスでヒト−ヘプシジン−25により低鉄血症状態を誘導した。このモデルでシュピーゲルマーを特徴付けるために、マウスにシュピーゲルマーによる予防的処置を施行してhu−ヘプシジンの作用を阻止した。
雌性C57Bl/6マウス(Elevage Janvier、France、6週齢、1群当たりn=6〜7)に抗ヘプシジンシュピーゲルマー(10〜20ml/kg体重)または溶媒(5%グルコース、10〜20ml/kg体重)の単回静脈内注射を施行した。30分後に合成ヒトヘプシジン−25(Bachem、Weil am Rhein、Germany、カタログ番号H−5926)を1〜2mg/kg体重の用量で腹腔内に注射した(10ml/kg体重)。ヘプシジン注射の2時間後に血液を採取した。鉄量決定および全血球計算用に血清および血漿の試料をそれぞれ得た。各個体の血清鉄、ヘモグロビン値、ヘマトクリット値、白血球数、赤血球数、血小板数、平均血球体積および平均赤血球ヘモグロビン値を決定した。
合成ヒト−ヘプシジン−25の注射により血清鉄の急激な減少がみられた。注射の2時間後に血清鉄濃度は溶媒処置個体の値の56%に減少した。上記in vivoでの結果は、これよりヘプシジン用量の高いほぼ同じ実験で約25%の減少を報告したRiveraら(Riberaら)により発表されたデータと一致するものである。図14に示されるように、ヒトヘプシジンを注射する前にシュピーゲルマー239−D4−008−5’−PEGを投与することにより、血清鉄の減少が完全に阻止される(対照の98%)。
慢性疾患による貧血におけるインターロイキン−6(IL−6)の主な役割は、IL−6受容体抗体のトシリズマブを用いて明らかにされている。この抗体による治療の有効性はキャッスルマン病の患者(Nishimoto,2008)およびカニクイザルの関節炎モデル(Hashizume,2009)で示されている。IL−6が非ヒト霊長類においてヘプシジン分泌を誘導して貧血をもたらすという既知の特性を炎症による貧血の別のモデルとして用いた(Asano,1990;Klug,1994)。抗ヘプシジンシュピーゲルマーの有効性を示す評価項目として、パラメータであるヘモグロビン値の代わりに血清鉄含有量を選択した。カニクイザルにおいてヒト組換えIL−6により低鉄血症状態を誘導した。このモデルは、合成ヒトヘプシジンを用いた他のすべての実験と同様に抗ヘプシジンシュピーゲルマーも内因性ヘプシジンと結合するということを示すのに重要なものであった。シュピーゲルマーの活性をin vivoで試験するために、カニクイザルにおいてヒト−組換えIL−6により低鉄血症状態を誘導した。このモデルでシュピーゲルマーを特徴付けるために、カニクイザルにシュピーゲルマーによる予防的処置を施行してカニクイザル−ヘプシジンの作用を阻止した。
雄性カニクイザル(Roberto C.Hartelust、Tilburg、The Netherlands、34〜38か月齢、1群当たりn=3)に抗ヘプシジンシュピーゲルマー(1ml/kg体重)または溶媒(5%グルコース、1ml/kg体重)の単回静脈内注射を施行した。30分後に組換えヒトIL−6(Miltenyi Biotech、Bergisch Gladbach、Germany)を10μg/kg体重の用量で皮下に注射した(1ml/kg体重)。IL−6注射の8時間後に血液を採取した。鉄量決定および全血球計算用に血清および血漿の試料をそれぞれ得た。各個体の血清鉄、ヘモグロビン値、ヘマトクリット値、白血球数、赤血球数、血小板数、平均血球体積および平均赤血球ヘモグロビン値を決定した。
組換えヒトIL−6の注射により血清鉄の減少がみられた。注射の8時間後に血清鉄濃度は投与前の溶媒処置個体/IL−6処置個体の値の27%に減少した。図15に示されるように、ヒトIL−6を注射する前にシュピーゲルマー238−D4−008−5’−PEGを投与することにより、血清鉄の減少が完全に阻止される。
この実験では、分子質量14.602ダルトンのヘプシジン結合核酸(シュピーゲルマーNOX−H94−002、PEG修飾されていないシュピーゲルマーNOX−H94の誘導体)、透過性の高い透析膜および高対流条件を用いて、ヒト全血のin vitroでの血液透析ろ過におけるシュピーゲルマーNOX−H94−002の除去を示した。
シュピーゲルマーNOX−H94−002を5%グルコースに溶かし、10mg/mlのストック溶液とした。
Cl血漿=QB(1−0.0107×TP)((SPC×Hct+(1−Hct))((Ca−Cv)/Ca)+(QU×Cv/Ca))[ml/分]
(式中、QBは血流速度、QUFは限外ろ過速度(10ml/分)、CvおよびCaは静脈(透析器排出口)および動脈(透析器注入口)の溶質濃度、Hctは試料採取時の患者のヘマトクリット値、TPは試料採取時の総タンパク質濃度[g/L]である)。血液細胞からの溶質移行を説明するために、溶質分配係数(略語:SPC)(β2m、シスタチンC、ミオグロビン、レチノール結合タンパク質に対するもの)を0とした。
タンパク質β2−ミクログロビン(Mr11.800)、シスタチンC(Mr13.300)、ミオグロビン(Mr17.600)およびレチノール結合タンパク質(Mr21.000)のクリアランスを決定し、透析実験の妥当性を示した。タンパク質クリアランスは使用した透析器に関して知られている範囲内にある。シュピーゲルマーは球状タンパク質としてふるまうわけではなく、このことはクリアランス値が分子量のほぼ同じタンパク質マーカー(例えば、シスタチンC)の範囲ではなく、レチノール結合タンパク質の範囲にあることを説明するものである。
ヘプシジン結合核酸をアフェレーシス処置に使用することができるか否かを試験するために、ヘプシジン結合シュピーゲルマーNOX−H94−3×HEG−アミノを用いた。NOX−H94−3×HEG−アミノはNOX−H94シュピーゲルマー配列を5’アミノ修飾した誘導体であり、分子のシュピーゲルマー部分とアミノ官能基との間にヘキサエチレングリコール部分が3つ挿入されている。このアミノ官能基はシュピーゲルマーとSepharose担体とを共有結合させるための柄として用いられる。
Sepharose担体へのシュピーゲルマーの固定化
NHS活性化Sepharose 4 Fast Flow(16〜23μmol NHS/ml溶媒、#17−0906−01、GE Healthcare、Bio−Sciences AB、Sweden)200μlを1mMの冷HCl(1mL)で洗浄した。担体を遠心分離で圧縮し上清を除去することにより、HCl溶液を除去した。この担体に、シュピーゲルマーNOX−H94−3×HEG−アミノをTheorell & Stenhagen’s Universal緩衝液pH8.25(33mMクエン酸ナトリウム、33nMリン酸ナトリウム、57mMホウ酸ナトリウム、pH8.25)に溶かした0.314μmol/ml溶液(31.4nmol、12.3OD)100μlを直ちに加えた。懸濁液を25℃で2時間、Eppendorf Thermomixer Comfort機(Eppendorf、Hamburg、Germany)でインキュベートし、担体を圧縮して上清を除去した。結合溶液である上清をさらなる解析用に保存した。次いで、担体をPBS緩衝液で洗浄した後(3×100μl)、0.5Mエタノールアミンと0.5M NaClとを含有する溶液(pH8.3)で予洗した(1 ×300μl)。合わせた洗浄液である上清をさらなる解析用に保存した。0.5Mエタノールアミンと0.5M NaClとを含有する溶液(pH8.3)300μlを加え、25℃で2時間、Eppendorf Thermomixer Comfort機(Eppendorf、Hamburg、Germany)でインキュベートすることにより担体のNHSエステル活性化部位をブロックし、担体を圧縮して上清であるブロッキング液を採取し、解析用に保存した。次いで、担体を滅菌水で洗浄した後(1×100μl)、0.1Mトリス−HCl(pH8)(Applichem、BioChemica)および0.1M酢酸ナトリウム(pH5)により3×100μlで交互に洗浄した。最後に担体を1×300μlで滅菌水により洗浄し、洗浄液を合わせた。さらなる解析用に保存しておいた結合溶液の上清、合わせた洗浄液およびブロッキング液を以下のように処理した:260nmでの吸光度単位を測定し(図16)、次いで、試料を陰イオン交換HPLC(DNA−Pac PA200カラム、4×250mm、Dionex社製、移動相A:25mMトリス、1mM EDTA、10mM NaClO4、10%ACN;移動相B:25mMトリス、1mM EDTA、500mM NaClO4、0%ACN。勾配:20〜55%のBで19分間、カラム温度85℃)で解析し、NOX−H94−3×HEG−アミノに起因する試料中のODの百分率を決定した。クロマトグラムの例に関しては図17を参照されたい。担体と結合したヘプシジン結合シュピーゲルマーNOX−H94−3×HEG−アミノの量を、出発物質であるNOX−H94−3×HEG−アミノの量と、結合溶液、ブロッキング液および洗浄液中で決定されたNOX−H94−3×HEG−アミノの量との差として算出した(図16)。
NHS活性化Sepharose 4 Fast Flow(16〜23μmol NHS/ml溶媒、#17−0906−01、GE Healthcare)1mLを5mLの使い捨てカラム(Qiagen、Germany)に入れた。イソプロパノール保存液を取り除き、0.5Mエタノールアミンと0.5M NaClとを含有する溶液(pH8.3)2mLで担体を洗浄した。溶液を取り除き、再び0.5Mエタノールアミンと0.5M NaClとを含有する溶液(pH8.3)2mLを加えた。カラムを密閉して4時間振盪し、溶液を取り出し、担体を滅菌水で洗浄した後(1×2mL)、0.1Mトリス−HCl(pH8)(Applichem,BioChemica)および0.1M酢酸ナトリウム(pH5)により4×3mLで交互に洗浄した。最後に担体を1×3mLで滅菌水により洗浄した。
ヒトプール血漿(リチウム−ヘパリン−血漿、個々の女性15人および男性15人の血漿に由来するプール、PLHI−123−E、ロット番号E708238およびE808238、Sera Laboratories Industries、UK)に、水に溶かしたヘプシジンの10μMストック溶液を用いてヘプシジン−25(ロット番号1025854、Bachem)を加え、最終濃度を別個に50nMおよび500nMとした。
NOX−H94−3×HEG−アミノと結合した担体15μLおよびエタノールアミンでブロックしたSepharose担体(NOX−H94−3×HEG−アミノは結合していない)15μLをそれぞれ、50nMまたは500nMヘプシジン(「負荷ヘプシジン」と呼ぶ、図20Bを参照されたい)を添加した血漿150μLとともに、サーモシェーカー中、25℃、550rpmで攪拌しながら2時間インキュベートした。インキュベーション後、試料を小型遠心分離機で5秒間遠心分離し、上清を新たなチューブに移した(「未結合ヘプシジン」と呼ぶ、図20Bを参照されたい)。担体を2回活性炭処理済みでヘプシジンを含まない、脱線維素および脱脂を行ったヒト血清(#1005.HSdcs,Nova Biologics、USA)50μLで3回洗浄し、洗浄画分を新たなチューブにまとめて採取した(「洗浄」と呼ぶ、図20Bを参照されたい)。
Bachem社のELISAキット(ヘプシジン−25、ヒト、EIA、ヒト血清/血漿用のExtraction−freeキット、Bachem Ltd.、Peninsula Laboratories、LLC、S−1337)を用いて試料中のヘプシジンを決定した。製造者のプロトコルIIに従ってELISAを行ったが、プロトコルと異なる部分のみを以下に記す。図18に記載されているように、10%ブランクマトリックスをアッセイ希釈液(BD Bio BD sciences、OptEIA(商標)#555213)で段階希釈することにより10点標準曲線を作成した。図19に示されるように、品質管理試料を、ヘプシジンをブランクマトリックスに加えた10倍ストック溶液として調製した。品質管理試料は、検量曲線に従って高レベル(HiQC)、中レベル(MeQC)および低レベル(LoQC)の試料として設計され、これに定量上限(ULOQ)試料および定量下限(LLOQ)試料が加えられている。アッセイ用には、ストックをマトリックスを含まないアッセイ希釈液で1:10に希釈した(ストック溶液25μL+アッセイ希釈液225μL)。図19に示されるように、被検試料をその予想されるヘプシジン濃度に合わせて希釈した。
実験の節に記載されているプロトコルを用いて、ヘプシジン結合核酸であるシュピーゲルマーNOX−H94−3×HEG−アミノを共有結合により担体と効率的に結合させた。製造者のプロトコルに従いエタノールアミン溶液を用いて担体の活性部位をブロックした。この後に担体を洗浄した。260nmでの吸光度単位(略語:OD)を測定することにより、担体と結合したNOX−H94−3×HEG−アミノの量を決定することができたが(図16)、このとき、結合反応の副生成物であるN−ヒドロキシスクシンイミドも260nmでの吸光度をもつため、さらに結合溶液、合わせた洗浄液およびブロッキング液も陰イオン交換HPLCクロマトグラムにより解析して(図17)、溶液中に残ったNOX−H94−3×HEG−アミノに起因する260nmでの吸光度の百分率を決定した(図16および17)。図からわかるように、測定されたODのうちN−ヒドロキシスクシンイミドを除いたNOX−H94−3×HEG−アミノ出発物質に相当するODの百分率は低く(図16)、出発物質NOX−H94−3×HEG−アミノの12.3OD(31.4nmolに相当)のうち9.4OD(24nmolに相当)がNHS活性化Sepharoseと結合していた。これは1mLのSepharoseに120nmolのNOX−H94−3×HEGが負荷されたことに相当する(図16)。
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Claims (104)
- 対象由来の体液中のヘプシジンレベルを低下させる方法であって、
a)ヘプシジンと結合可能な核酸分子を準備することと、
b)ヘプシジンと前記核酸分子との結合が可能な条件下で前記核酸分子と体液とを接触させて、ヘプシジンと前記核酸分子との複合体を形成させることと、
c)前記体液から前記複合体を除去すること、または前記体液から前記ヘプシジンを除去することと
を含む方法。 - 前記核酸分子が、5’→3’方向に第一の末端ヌクレオチドストレッチと、中央部のヌクレオチドストレッチと、第二の末端ヌクレオチドストレッチとを含み、前記中央部のヌクレオチドストレッチが32〜40個のヌクレオチド、好ましくは32〜35個のヌクレオチドを含む、請求項1に記載の方法。
- 前記核酸分子が、5’→3’方向に第二の末端ヌクレオチドストレッチと、中央部のヌクレオチドストレッチと、第一の末端ヌクレオチドストレッチとを含み、前記中央部のヌクレオチドストレッチが32〜40個のヌクレオチド、好ましくは32〜35個のヌクレオチドを含む、請求項1に記載の方法。
- 前記中央部のヌクレオチドストレッチが核酸分子とヘプシジンとの結合に必須である、請求項2〜3のいずれか1項に記載の方法。
- 前記中央部のヌクレオチドストレッチが、ヌクレオチド配列5’RKAUGGGAKUAAGUAAAUGAGGRGUWGGAGGAAR3’(配列番号182)または5’RKAUGGGAKAAGUAAAUGAGGRGUWGGAGGAAR3’(配列番号183)を含む、請求項2〜4のいずれか1項に記載の方法。
- 前記中央部のヌクレオチドストレッチが、ヌクレオチド配列5’RKAUGGGAKUAAGUAAAUGAGGRGUWGGAGGAAR3’(配列番号182)、好ましくはヌクレオチド配列5’GUAUGGGAUUAAGUAAAUGAGGAGUUGGAGGAAG3’(配列番号184)を含む、請求項2〜5のいずれか1項に記載の方法。
- 前記第一の末端ヌクレオチドストレッチが5〜8個のヌクレオチドを含み、前記第二の末端ヌクレオチドストレッチが5〜8個のヌクレオチドを含む、請求項5〜6のいずれか1項に記載の方法。
- 前記第一の末端ヌクレオチドストレッチと前記第二の末端ヌクレオチドストレッチが二本鎖構造を形成し、好ましくはこのような二本鎖構造が、前記第一の末端ヌクレオチドストレッチと前記第二の末端ヌクレオチドストレッチが互いにハイブリダイズすることにより形成される、請求項5〜7のいずれか1項に記載の方法。
- 前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’X1X2X3SBSBC3’を含み、前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GVBVYX4X5X63’を含む、請求項5〜8のいずれか1項に記載の方法であって、
X1がAであるかまたは存在せず、X2がGであるかまたは存在せず、X3がBであるかまたは存在せず、X4がSであるかまたは存在せず、X5がCであるかまたは存在せず、X6がUであるかまたは存在しない方法。 - 前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’X1X2X3SBSBC3’を含み、前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GVBVBX4X5X63’を含む、請求項5〜9のいずれか1項に記載の方法であって、
a)X1がAであり、X2がGであり、X3がBであり、X4がSであり、X5がCであり、かつX6がUであるか、
b)X1が存在せず、X2がGであり、X3がBであり、X4がSであり、X5がCであり、かつX6がUであるか、または
c)X1がAであり、X2がGであり、X3がBであり、X4がSであり、X5がCであり、かつX6が存在しない
方法。 - a)前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’AGCGUGUC3’を含み、かつ前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GGUGCGCU3’を含むか、
b)前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’AGCGUGUC3’を含み、かつ前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GGCAUGCU3’を含むか、
c)前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’AGUGUGUC3’を含み、かつ前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GAUGCGCU3’を含むか、
d)前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’AGUGUGUC3’を含み、かつ前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GGCAUGCU3’を含むか、
e)前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’AGCGUGCC3’を含み、かつ前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GGUGCGCU3’を含むか、または
f)前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’AGCGCGCC3’を含み、かつ前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GGCGCGCU3’を含む、
請求項5〜10のいずれか1項に記載の方法。 - 前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’X1X2X3SBSBC3’を含み、前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GVBVYX4X5X63’を含む、請求項5〜9のいずれか1項に記載の方法であって、
a)X1が存在せず、X2がGであり、X3がBであり、X4がSであり、X5がCであり、かつX6が存在しないか、
b)X1が存在せず、X2は存在せず、X3がBであり、X4がSであり、X5がCであり、かつX6が存在しないか、または
c)X1が存在せず、X2がGであり、X3がBであり、X4がSであり、X5が存在せず、かつX6が存在しない
方法。 - 前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’X1X2X3SBSBC3’を含み、前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GVBVYX4X5X63’を含む、請求項5〜9のいずれか1項に記載の方法であって、
X1が存在せず、X2が存在せず、X3がBであるかまたは存在せず、X4がSであるかまたは存在せず、X5が存在せず、X6が存在しない方法。 - a)前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GCGCGC3’を含み、かつ前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GCGCGC3’を含むか、
b)前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GGUGUC3’を含み、かつ前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GGCAUC3’を含むか、
c)前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GGCGUC3’を含み、かつ前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GGCGCC3’を含むか
d)前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GCGCC3’を含み、かつ前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GGCGC3’を含むか、または
e)前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GGCGC3’を含み、かつ前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GCGCC3’を含む、
請求項13に記載の方法。 - 前記核酸が、配列番号115〜119、配列番号121、配列番号142、配列番号144、配列番号146、配列番号148、配列番号151、配列番号152、配列番号175または配列番号176のいずれか1つによる核酸配列を含む、請求項1〜14のいずれか1項に記載の方法。
- 前記中央部のヌクレオチドストレッチが、ヌクレオチド配列5’GRCRGCCGGVGGACACCAUAUACAGACUACKAUA3’(配列番号185)または5’GRCRGCCGGVAGGACACCAUAUACAGACUACKAUA3’(配列番号186)を含む、請求項2〜4のいずれか1項に記載の方法。
- 前記中央部のヌクレオチドストレッチが、ヌクレオチド配列5’GRCRGCCGGGGGACACCAUAUACAGACUACKAUA3’(配列番号215)、好ましくはヌクレオチド配列5’GACAGCCGGGGGACACCAUAUACAGACUACGAUA3’(配列番号187)を含む、請求項2〜4および16のいずれか1項に記載の方法。
- 前記第一の末端ヌクレオチドストレッチが4〜7個のヌクレオチドを含み、前記第二の末端ヌクレオチドストレッチが4〜7個のヌクレオチドを含む、請求項16〜17のいずれか1項に記載の方法。
- 前記第一の末端ヌクレオチドストレッチと前記第二の末端ヌクレオチドストレッチが二本鎖構造を形成し、好ましくはこのような二本鎖構造が、第一の末端ヌクレオチドストレッチと第二の末端ヌクレオチドストレッチが互いにハイブリダイズすることにより形成される、請求項18に記載の方法。
- 前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’X1X2X3SBSN3’を含み、前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’NSVSX4X5X63’を含む、請求項16〜19のいずれか1項に記載の方法であって、
X1がAであるかまたは存在せず、X2がGであるかまたは存在せず、X3がRであるかまたは存在せず、X4がYであるかまたは存在せず、X5がCであるかまたは存在せず、X6がUであるかまたは存在しない方法。 - 前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’X1X2X3SBSN3’を含み、前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’NSVSX4X5X63’を含む、請求項16〜20のいずれか1項に記載の方法であって、
a)X1がAであり、X2がGであり、X3がRであり、X4がYであり、X5がCであり、かつX6がUであるか、
b)X1が存在せず、X2がGであり、X3がRであり、X4がYであり、X5がCであり、かつX6がUであるか、
c)X1がAであり、X2がGであり、X3がRであり、X4がYであり、X5がCであり、かつX6が存在しない
方法。 - a)前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’AGGCUCG3’を含み、かつ前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CGGGCCU3’を含むか、
b)前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’AGGCCCG3’を含み、かつ前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CGGGCCU3’を含むか、
c)前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’AGGCUUG3’を含み、かつ前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CGAGCCU3’を含むか、または
d)前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’AGACUUG3’を含み、かつ前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CGAGUCU3’を含む、
請求項16〜21のいずれか1項に記載の方法。 - 前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’X1X2X3SBSN3’を含み、前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’NSVSX4X5X63’を含む、請求項16〜20のいずれか1項に記載の方法であって、
a)X1が存在せず、X2がGであり、X3がRであり、X4がYであり、X5がCであり、かつX6が存在しないか、
b)X1が存在せず、X2が存在せず、X3がRであり、X4がYであり、X5がCであり、かつX6が存在しないか、または
c)X1が存在せず、X2がGであり、X3がRであり、X4がYであり、X5が存在せず、かつX6が存在しない
方法。 - 前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GGCUCG3’を含み、前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CGGGCC3’を含む、請求項16〜20および23のいずれか1項に記載の方法。
- 前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’X1X2X3SBSN3’を含み、前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’NSVSX4X5X63’を含む、請求項16〜20のいずれか1項に記載の方法であって、
X1が存在せず、X2が存在せず、X3がRであるかまたは存在せず、X4がYであるかまたは存在せず、X5が存在せず、X6が存在しない方法。 - 前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GGCCG3’を含み、かつ前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CGGCC3’を含むか、または
前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GCGCG3’を含み、かつ前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CGCGC3’を含む、請求項16〜20および25のいずれか1項に記載の方法。 - 前記核酸分子が、配列番号122〜126、配列番号154、配列番号159、配列番号163または配列番号174のいずれか1つによる核酸配列を含む、請求項1〜4および16〜26のいずれか1項に記載の方法。
- 前記中央部のヌクレオチドストレッチが、5’→3’方向にボックスAと連結ヌクレオチドストレッチとボックスBとを含むか、または5’→3’方向にボックスBと連結ヌクレオチドストレッチとボックスAとを含む、請求項2〜4のいずれか1項に記載の方法であって、
前記ボックスAがヌクレオチド配列5’WAAAGUWGAR3’(配列番号188)を含み、前記連結ヌクレオチドストレッチが10〜18個のヌクレオチドを含み、前記ボックスBがヌクレオチド配列5’RGMGUGWKAGUKC3’(配列番号189)を含む方法。 - 前記ボックスAが、5’UAAAGUAGAG3’(配列番号199)、5’AAAAGUAGAA3’(配列番号200)、5’AAAAGUUGAA3’(配列番号201)および5’GGGAUAUAGUGC3’(配列番号202)の群から選択されるヌクレオチド配列、好ましくはヌクレオチド配列5’UAAAGUAGAG3’(配列番号199)を含む、請求項28に記載の方法。
- 前記ボックスBが、5’GGCGUGAUAGUGC3’(配列番号203)、5’GGAGUGUUAGUUC3’(配列番号204)、5’GGCGUGAGAGUGC3’(配列番号205)、5’AGCGUGAUAGUGC3’(配列番号206)および5’GGCGUGUUAGUGC3’(配列番号207)の群から選択されるヌクレオチド配列、好ましくはヌクレオチド配列5’GGCGUGAUAGUGC3’(配列番号203)を含む、請求項28および29のいずれか1項に記載の方法。
- 前記連結ヌクレオチドストレッチが、5’→3’方向に第一の連結ヌクレオチドサブストレッチと、第二の連結ヌクレオチドサブストレッチと、第三の連結ヌクレオチドサブストレッチとを含み、前記第一の連結ヌクレオチドサブストレッチと前記第三の連結ヌクレオチドサブストレッチが、それぞれ互いに独立して3〜6個のヌクレオチドを含む、請求項28〜30のいずれか1項に記載の方法。
- 前記第一の連結ヌクレオチドサブストレッチと前記第三の連結ヌクレオチドサブストレッチが二本鎖構造を形成し、好ましくはこのような二本鎖構造が、前記第一の連結ヌクレオチドサブストレッチと前記第三の連結ヌクレオチドサブストレッチが互いにハイブリダイズすることにより形成される、請求項31に記載の方法。
- 前記二本鎖構造が3〜6個の塩基対からなる、請求項31〜32のいずれか1項に記載の方法。
- 請求項31〜33のいずれか1項に記載の方法であって、
a)前記第一の連結ヌクレオチドサブストレッチが、5’GGAC3’、5’GGAU3’および5’GGA3’の群から選択されるヌクレオチド配列を含み、かつ前記第三の連結ヌクレオチドサブストレッチがヌクレオチド配列5’GUCC3’を含むか、
b)前記第一の連結ヌクレオチドサブストレッチがヌクレオチド配列5’GCAG3’を含み、かつ前記第三の連結ヌクレオチドサブストレッチがヌクレオチド配列5’CUGC3’を含むか、
c)前記第一の連結ヌクレオチドサブストレッチがヌクレオチド配列5’GGGC3’を含み、かつ前記第三の連結ヌクレオチドサブストレッチがヌクレオチド配列5’GCCC3’を含むか、
d)前記第一の連結ヌクレオチドサブストレッチがヌクレオチド配列5’GAC3’を含み、かつ前記第三の連結ヌクレオチドサブストレッチがヌクレオチド配列5’GUC3’を含むか、
e)前記第一の連結ヌクレオチドサブストレッチがヌクレオチド配列5’ACUUGU3’を含み、かつ前記第三の連結ヌクレオチドサブストレッチが、5’GCAAGU3’および5’GCAAGC3’の群から選択されるヌクレオチド配列を含むか、または
f)前記第一の連結ヌクレオチドサブストレッチがヌクレオチド配列5’UCCAG3’を含み、かつ前記第三の連結ヌクレオチドサブストレッチがヌクレオチド配列5’CUGGA3’を含み、
好ましくは前記第一の連結ヌクレオチドサブストレッチがヌクレオチド配列5’GAC3’を含み、かつ前記第三の連結ヌクレオチドサブストレッチがヌクレオチド配列5’GUC3’を含む
方法。 - 前記第二の連結ヌクレオチドサブストレッチが3〜5個のヌクレオチドを含む、請求項31〜34のいずれか1項に記載の方法。
- 前記第二の連結ヌクレオチドサブストレッチが、5’VBAAW3’、5’AAUW3’および5’NBW3’の群から選択されるヌクレオチド配列を含む、請求項31〜35のいずれか1項に記載の方法。
- 前記第二の連結ヌクレオチドサブストレッチが、ヌクレオチド配列5’VBAAW3’、好ましくは5’CGAAA3’、5’GCAAU3’、5’GUAAU3’および5’AUAAU3’の群から選択されるヌクレオチド配列を含む、請求項36に記載の方法。
- 前記第二の連結ヌクレオチドサブストレッチが、ヌクレオチド配列5’AAUW3’、好ましくはヌクレオチド配列5’AAUU3’または5’AAUA3’、より好ましくはヌクレオチド配列5’AAUA3’を含む、請求項36に記載の方法。
- 前記第二の連結ヌクレオチドサブストレッチがヌクレオチド配列5’NBW3’を含み、好ましくは前記第二の連結ヌクレオチドサブストレッチが、5’CCA3’、5’CUA3’、5’UCA3’、5’ACA3’、5’GUU3’、5’UGA3’および5’GUA3’の群、より好ましくは5’CCA3’、5’CUA3’、5’UCA3’、5’ACA3’および5’GUU3’の群から選択されるヌクレオチド配列を含む、請求項36に記載の方法。
- 前記連結ヌクレオチドストレッチが、5’GGACBYAGUCC3’(配列番号208)、5’GGAUACAGUCC3’(配列番号209)、5’GCAGGYAAUCUGC3’(配列番号210)、5’GACAAUWGUC3’(配列番号211)、5’ACUUGUCGAAAGCAAGY3’(配列番号212)、5’UCCAGGUUCUGGA3’(配列番号109)、5’GGGCUGAGCCC3’(配列番号190)、5’GCAGAUAAUCUGC3’(配列番号191)および5’GGACCAGUCC3’(配列番号192)の群から選択されるヌクレオチド配列を含み、好ましくは前記連結ヌクレオチドストレッチが、5’GGACCCAGUCC3’(配列番号193)、5’GGACCUAGUCC3’(配列番号194)、5’GGACUCAGUCC3’(配列番号195)、5’GGACGUAGUCC3’(配列番号214)、5’GCAGGUAAUCUGC3’(配列番号196)、5’GCAGGCAAUCUGC3’(配列番号197)、5’GACAAUUGUC3’(配列番号198)および5’GACAAUAGUC3’(配列番号157)の群から選択されるヌクレオチド配列を含む、請求項28〜39のいずれか1項に記載の方法。
- 前記第一の末端ヌクレオチドストレッチが4〜7個のヌクレオチドを含み、前記第二の末端ヌクレオチドストレッチが4〜7個のヌクレオチドを含む、請求項28〜40のいずれか1項に記載の方法。
- 前記第一の末端ヌクレオチドストレッチと前記第二の末端ヌクレオチドストレッチが二本鎖構造を形成し、好ましくはこのような二本鎖構造が、第一の末端ヌクレオチドストレッチと第二の末端ヌクレオチドストレッチが互いにハイブリダイズすることにより形成される、請求項28〜41のいずれか1項に記載の方法。
- 前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’X1X2X3BKBK3’を含み、前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’MVVVX4X5X63’を含む、請求項28〜42のいずれか1項に記載の方法であって、
X1がGであるかまたは存在せず、X2がSであるかまたは存在せず、X3がVであるかまたは存在せず、X4がBであるかまたは存在せず、X5がSであるかまたは存在せず、X6がCであるかまたは存在しない方法。 - 前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’X1X2X3BKBK3’を含み、前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’MVVVX4X5X63’を含む、請求項28〜43のいずれか1項に記載の方法であって、
a)X1がGであり、X2がSであり、X3がVであり、X4がBであり、X5がSであり、かつX6がCであるか、
b)X1が存在せず、X2がSであり、X3がVであり、X4がBであり、X5がSであり、かつX6がCであるか、または
c)X1がGであり、X2がSであり、X3がVであり、X4がBであり、X5がSであり、かつX6が存在しない
方法。 - 前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GCACUCG3’を含み、前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CGAGUGC3’を含む、請求項28〜44のいずれか1項、好ましくは請求項44に記載の方法。
- 前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’X1X2X3BKBK3’を含み、前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’MVVVX4X5X63’を含む、請求項28〜43のいずれか1項に記載の方法であって、
a)X1が存在せず、X2がSであり、X3がVであり、X4がBであり、X5がSであり、かつX6が存在しないか、
b)X1が存在せず、X2が存在せず、X3がVであり、X4がBであり、X5がSであり、かつX6が存在しないか、または
c)X1が存在せず、X2がSであり、X3がVであり、X4がBであり、X5が存在せず、かつX6が存在しない
方法。 - a)前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GCUGUG3’を含み、かつ前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CACAGC3’を含むか、
b)前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CGUGUG3’を含み、かつ前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CACACG3’を含むか、
c)前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CGUGCU3’を含み、かつ前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’AGCACG3’を含むか、
d)前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CGCGCG3’を含み、かつ前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CGCGCG3’を含むか、
e)前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GCCGUG3’を含み、かつ前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CACGCG3’を含むか、
f)前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GCGGUG3’を含み、かつ前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CACCGC3’を含むか、
g)前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GCUGCG3’を含み、かつ前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CGCAGC3’を含むか、
h)前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GCUGGG3’を含み、かつ前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CCCAGC3’を含むか、または
i)前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’GCGGCG3’を含み、かつ前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CGCCGC3’を含む、請求項28〜46のいずれか1項に記載の方法。 - 前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’X1X2X3BKBK3’を含み、前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’MVVVX4X5X63’を含む、請求項28〜43のいずれか1項に記載の方法であって、
X1が存在せず、X2が存在せず、X3がVであるかまたは存在せず、X4がBであるかまたは存在せず、X5が存在せず、X6が存在しない方法。 - 前記第一の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CGUG3’を含み、前記第二の末端ヌクレオチドストレッチがヌクレオチド配列5’CACG3’を含む、請求項28〜43および48のいずれか1項に記載の方法。
- 前記核酸分子が、配列番号29、配列番号33、配列番号34、配列番号39〜41、配列番号43、配列番号46、配列番号137〜141または配列番号173のいずれか1つによる核酸配列を含む、請求項1〜4および28〜49および48のいずれか1項に記載の方法。
- 前記核酸分子が、配列番号127〜131のいずれか1つによる核酸配列を含む、請求項1に記載の方法。
- 前記ヘプシジンが、ヒトヘプシジン−25、ヒトヘプシジン−22、ヒトヘプシジン−20、サルヘプシジン−25、サルヘプシジン−22またはサルヘプシジン−20、好ましくはヒトヘプシジン−25である、請求項1〜51のいずれか1項に記載の方法。
- 前記ヘプシジンが、配列番号1によるアミノ酸配列を有する、請求項1〜52のいずれか1項、好ましくは請求項52に記載の方法。
- 前記核酸分子が修飾基を含み、好ましくは、前記修飾基を含む前記核酸分子の生物体からの排泄速度が、ヘプシジンと結合可能で前記修飾基を含まない核酸分子に比べて減少している、請求項1〜53のいずれか1項に記載の方法。
- 前記核酸分子が修飾基を含み、好ましくは、前記修飾基を含む前記核酸分子の生物体内での滞留時間が、ヘプシジンと結合可能で前記修飾基を含まない核酸分子に比べて増加している、請求項1〜53のいずれか1項に記載の方法。
- 前記修飾基が、生分解性および非生分解性の修飾を含む群から選択され、好ましくは前記修飾基が、直鎖ポリ(エチレン)グリコール、分岐ポリ(エチレン)グリコール、ヒドロキシエチルデンプン、ペプチド、タンパク質、多糖、ステロール、ポリオキシプロピレン、ポリオキシアミダート、ポリ(2−ヒドロキシエチル)−L−グルタミンおよびポリエチレングリコールを含む群から選択される、請求項54および55に記載の方法。
- 前記修飾基が、直鎖ポリ(エチレン)グリコールまたは分岐ポリ(エチレン)グリコールからなるPEG部分であり、前記ポリ(エチレン)グリコール部分の分子量が、好ましくは約20,000〜約120,000Da、より好ましくは約30,000〜約80,000Da、最も好ましくは約40,000Daである、請求項56に記載の方法。
- 前記修飾基がヒドロキシエチルデンプン部分であり、前記ヒドロキシエチルデンプン部分の分子量が、好ましくは約10,000〜約200,000Da、より好ましくは約30,000〜約170,000Da、最も好ましくは約150,000Daである、請求項56に記載の方法。.
- 前記修飾基がリンカーを介して前記核酸分子と結合し、好ましくは前記リンカーが生分解性リンカーである、請求項54〜58のいずれかに記載の方法。
- 前記修飾基が、前記核酸分子の5’末端ヌクレオチドおよび/または3’末端ヌクレオチド、ならびに/あるいは前記核酸分子の5’末端ヌクレオチドと3’末端ヌクレオチドとの間にある前記核酸のヌクレオチドと結合している、請求項54〜59のいずれか1項に記載の方法。
- 前記生物体が、動物の身体またはヒトの身体、好ましくはヒトの身体である、請求項54〜60のいずれか1項に記載の方法。
- 前記核酸分子のヌクレオチドまたは前記核酸分子を形成しているヌクレオチドがL−ヌクレオチドである、請求項1〜61のいずれか1項に記載の方法。
- 前記核酸分子がL−核酸である、請求項1〜62のいずれか1項に記載の方法。
- 前記核酸分子が、ヘプシジンと結合可能な結合部分を少なくとも1つ含み、このような結合部分がL−ヌクレオチドからなる、請求項1〜63のいずれか1項に記載の方法。
- 疾患を治療および/または予防するための方法であるか、あるいは疾患を治療および/または予防するための方法の一部分であるか、あるいはこのような方法に用いられるか、またはそれに関連して用いられる、請求項1〜64のいずれか1項に記載の方法。
- 前記核酸分子が担体に固定化されている、請求項1〜65のいずれかに記載の方法。
- 担体に固定化されている前記核酸分子がex vivoで存在する、請求項66に記載の方法。
- 前記核酸分子が、請求項54〜60のいずれか1項で明確にされる修飾基を含むことにより修飾され、修飾核酸分子を形成する、請求項1〜65のいずれかに記載の方法。
- ヘプシジンと前記修飾核酸分子との複合体を前記修飾基に対するリガンドと接触させて、前記体液から前記複合体を除去する、請求項68に記載の方法。
- 前記修飾核酸分子が、前記修飾核酸分子と任意に追加の成分とを含む医薬組成物の一部分であり、前記追加の成分が、薬学的に許容される補形剤、薬学的に許容される担体および薬学的に活性な物質を含む群から選択される、請求項68および69のいずれかに記載の方法。
- 前記リガンドが、担体に固定化されかつex vivoで存在する、請求項69〜70のいずれか1項に記載の方法。
- 前記核酸分子が、前記核酸の3’末端または5’末端で前記担体に固定化されている、請求項66および67のいずれかに記載の方法。
- 前記核酸分子または前記リガンドが、共有結合、非共有結合、水素結合、van der Waals相互作用、クーロン力の相互作用、疎水性相互作用または配位結合により固定化されている、請求項66〜72のいずれかに記載の方法。
- 前記担体が、好ましくは有機高分子および/または無機高分子を含む固体担体である、請求項66〜67、71〜73のいずれかに記載の方法。
- 前記固体担体が、多孔質ガラス、粘土、セルロース、デキストラン、アクリル、アガロース、ポリスチレン、Sepharose、シリカビーズ、アクリル酸系アミノ担体およびメタクリル酸系アミノ担体からなる群より選択される、請求項74に記載の方法。
- 前記体液が前記体液と透析液とを隔てる半透膜と接触し、ヘプシジンおよび/またはヘプシジンと前記核酸分子との複合体が前記半透膜を介してを前記体液から前記透析液に拡散することにより、前記体液中のヘプシジンレベルが低下する、請求項1〜65のいずれかに記載の方法。
- 前記核酸分子が修飾されていない、請求項76に記載の方法。
- ヘプシジンと前記非修飾核酸分子の前記複合体が、前記体液から前記透析液に拡散する、請求項76〜77のいずれかに記載の方法。
- 前記核酸分子が、請求項54〜60のいずれか1項で明確にされる修飾基を含み、修飾核酸分子を形成する、請求項76に記載の方法。
- 前記修飾核酸分子が前記透析液中に存在する、請求項79に記載の方法。
- 前記体液が血液、血漿または血清である、請求項1〜80のいずれかに記載の方法。
- 前記対象が腎機能障害を有する、請求項1〜81のいずれかに記載の方法。
- 前記方法がex vivoでの方法である、請求項1〜82のいずれか1項に記載の方法。
- 前記体液を、前記体液が採取されるまたは採取された身体に戻さない、請求項83に記載の方法。
- 前記体液が貯蔵血液である、請求項83〜84のいずれか1項に記載の方法。
- 担体に固定化された核酸分子を調製する方法であって、
前記核酸分子がヘプシジンと結合可能であり、
ヘプシジンと結合可能な核酸分子と、活性化された担体とを反応させて、前記核酸分子の3’末端、5’末端またはその両方と前記担体との間で結合を形成させることを含む
方法。 - 前記活性化された担体を、ヘプシジン以外の体液成分とは共有結合しないようにブロックすることをさらに含む、請求項86に記載の方法。
- 前記担体がSepharoseである、請求項86〜87に記載の方法。
- NHS−エステルを用いて前記Sepharose担体を活性化させる、請求項88に記載の方法。
- 前記活性化されたSepharose担体を、エタノールアミン処理によりブロックする、請求項89に記載の方法。
- 前記核酸分子がアミノ官能基部分を含み、かつ前記核酸分子が、弱塩基性溶液中で、活性化されたSepharose担体に固定化される、請求項86〜90のいずれかに記載の方法。
- 前記アミノ官能基部分が、3つのヘキサエチレングリコール部分を含み、前記3つのヘキサエチレングリコール部分が、前記核酸分子と前記アミノ官能基部分との間に配置されている、請求項91に記載の方法。
- 担体に固定化された核酸分子であって、ヘプシジンと結合可能な核酸分子。
- 請求項1〜75のいずれか1つに記載の核酸分子であるか、またはこれを含む、請求項93に記載の核酸分子。
- 請求項1〜85のいずれかに記載の方法で使用する、医療装置。
- 請求項1〜85のいずれか1つで明確にされる核酸分子および/または請求項93〜94のいずれか1つに記載の核酸分子を含む、請求項95に記載の医療装置。
- 対象、好ましくは哺乳動物、より好ましくはヒトの体液中のヘプシジンレベルを低下させる方法で使用する核酸分子であって、前記核酸が、ヘプシジンと結合可能な核酸分子である核酸分子。
- 請求項1〜85のいずれか1項に記載の核酸分子であるか、またはこれを含む、請求項97に記載の核酸分子。
- 対象の体液からヘプシジンを除去する方法で使用する核酸分子であって、請求項1〜85のいずれか1項で明確にされる核酸分子である核酸分子。
- 前記方法が、請求項1〜85のいずれか1項で明確にされる方法である、請求項99に記載の核酸分子。
- 貧血患者を治療する方法で使用する核酸分子であって、1〜85のいずれか1項で明確にされる核酸分子である核酸分子。
- 前記治療が、好ましくはヘプシジンと前記核酸分子との相互作用により、前記患者の体液からヘプシジンを除去することを含む、請求項101に記載の核酸分子。
- 前記核酸分子が体外装置内に、好ましくは固定化されて存在し、前記体液が前記患者の身体から取り出されて、前記体外装置の中を通過し、前記患者の体内に戻る、請求項102に記載の核酸分子。
- 前記体液が血液または血漿である、請求項103に記載の核酸分子。
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