DE3910084A1 - Polypeptide mit wachstumsfaktor-aktivitaet und nukleinsaeuresequenzen - Google Patents
Polypeptide mit wachstumsfaktor-aktivitaet und nukleinsaeuresequenzenInfo
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Description
Die Erfindung betrifft neue Polypeptide mit Wachstumsfaktor-
Aktivität, einschließlich chimäre Polypeptide,
und Verfahren zu ihrer Herstellung unter Verwendung
rekombinanter DNA-Techniken.
Eine große Zahl von Polypeptiden, die von Säugetierzellen
sekretiert werden, besitzen Wachstumsfaktor-Aktivität.
Die Sequenz dieser Polypeptide wird bei vielen Säugetieren
im wesentlichen beibehalten. Das Interesse an diesen
Verbindungen steht im Zusammenhang mit ihrer Onkogenizität.
Weiter besteht auch ein Interesse daran, zu wissen, wie
die Produktion der Wachstumsfaktoren gesteuert wird und wie
die Wachstumfaktoren wiederum die Zellaktivität steuern.
Es ist auch bekannt, daß die Infektion von Säugetierzellen
mit Viren zu einer Proliferation des Wachstums infizierter
Zellen führt. Für die vorliegende Erfindung von besonderem
Interesse sind die Mitglieder der Poxvirus-Familien, wie
Variola-Viren, Vaccinia-Viren und Viren, die mit bestimmten
Erkrankungen im Zusammenhang gebracht werden, wie
Shope Fibroma-Viren, Yaba-Tumorviren und Molluscum-contagiosum-
Virus (MCV).
Es wäre von Interesse zu wissen, ob Viren, welche bei
einer Infektion Zellproliferation hervorrufen, Polypeptide
produzieren, die mit Wachstumsfaktoren im Zusammenhang
stehen, als Wachstumsfaktor oder Wachstumfaktor-Rezeptor wirken.
Diese Verbindungen könnte man dann in Untersuchungen zur
Virusaktivität, in Assays zur Bestimmung der Anwesenheit
von Viren, in Nährmedium als Mitogene und bei der Entwicklung
therapeutischer Mittel zur Behandlung von Virusinfektionen
verwenden. Es wäre weiter von Interesse, Verbindungen,
die Agonisten oder Antagonisten der Wachstumsfaktoren
sein können, zur in vitro-Anwendung in wachsenden
Zellkulturen, zur Untersuchung mitotischer Prozesse
und für die Therapie zu entwickeln.
Venkatesan et al., J. Virol. (1982) 44 : 637-646 beschreibt
die DNA-Sequenzierung eines strukturierten Gens, das für
Vaccinia-Virusproteine kodiert. Es liegen jedoch keine
Erkenntnisse vor, daß eines dieser Proteine Wachstumsaktivität
besitzt. Cooper et al., ibid (1981) 37 : 284-294
berichtet über die Translation von mRNA's, die innerhalb
der invertierten terminalen Wiederholung des Vaccinia-
Virusgenoms kodiert sind. Über proliferative Erkrankungen
bei Mitgliedern der Poxvirus-Familie wurde für das Shope-
Fibroma-Virus (Shope, J. Exp. Med. [1932], 56 : 793-822),
Yaba-Tumorvirus (Niven et al., J. Path. Bacteriol. [1961]
81 : 1-14) und Molluscum-Kontagiosum-Virus (MCV) (Postlethwaite,
Arch. Environ. Health [1970] 21 : 432-452) berichtet.
Eine Beschreibung des epidermalen Wachstumsfaktors (EGF)
findet sich in Scott et al., Science (1983) 221 : 236-240
und Gray et al., Nature (1983) 303 : 722-725. Die Anwesenheit
von drei Disulfidbrücken in EGF und Transforming
Growth-Factor (TGF) wird von Savage et al., J. Biol. Chem.
(1973) 248 : 7669-7692 beschrieben, man vergleiche auch
Doolittle et al., Nature (1984) 307 : 558-560 und Australische
Patentanmeldung 8 50 06 288. Die Rezeptorbindungsregion des
EGF-Moleküls liegt in der Schleife zwischen dem dritten
und vierten Cysteinrest (Komoriya et al., Proc. Natl. Acad.
Sci. USA [1983] 81 : 1351-1355).
Neuere Beschreibungen des Vaccinia-Virus-Wachstumsfaktors
(VGF) finden sich in Brown et al., Nature (1985) 313 : 491-492;
Reisner, Nature (1985) 313 : 801-803 und Blomquist et al.,
Proc. Natl. Acad. Sci. USA (1984) 81 : 7263-7367. Natürlicher
Shope Fibroma-Virus-Wachstumsfaktor (SFGF) ist beschrieben
von W. C. Chang et al., in Molecular and Cellular Biol.
(1987) 7 : 535-540. Shope, J. Exp. Med. (1932) 56 : 793-802
berichtet, daß die Infektion erwachsender Kaninchen mit
Shope-Fibroma-Viren eine rasche Proliferation der Fibroplasten
verursacht, die zu einem gutartigen Fibrom führt.
Die Infektion neugeborener oder immunsupplimierter erwachsener
Kaninchen verursacht eine rasche Proliferation
der Fibrolasten, die zu einem invasivem atyptischen
Fibrosarkom führt, Allison, A. C., J. Natl. Cancer Inst.
(1066) 36 : 869-876; Smith, et al., J. Natl. Cancer Inst.
(1973) 50 : 1529-1539; Allison A. C., J. Natl. Cander Inst.
(1966) 35 : 859-868.
Der natürliche Myxoma-Virus-Wachstumsfaktor (MGF) wird
beschrieben von Upton et al., J. Virol. (1987) 61 : 1271-
1275. Die Infektion erwachsener Kaninchen mit Myxoma-
Viren führt zu einem rasch proliferierenden, invasiven
myxosarkomatosen Tumor, Strayer, D. S. und Sell, S.,
J. Natl. Cancer Inst. (1983) 71 : 105-116. Es wurde eine
DNA-Sequenz gefunden, die in der Lage ist, für einen konservierten
Wachstumsfaktor zu kodieren (natürlicher Molluscum
contagiosum-Virus-Wachstumsfaktor [MCGF], Porter, C. D.
und Archard L. C., J. Gen. Virol. (1987) 68 : 673-682. Die
Infektion von Menschen mit Molluscum contagiosum-Viren
induziert benigne Hauttumoren, die durch rasch
proliferierende Zellen charakterisiert sind, Brown et al.,
Sex. Transm. Dis. (1981) 8 : 227-234. Yaba-Tumorviren verursachen
subkutane Histocytoma bei Affen und Menschen,
Bearcroft et al., Nature (London) (1958) 182 : 195-196. Aufgrund
ihrer Verwandtschaft zu dem Shope-Fibrom-Virus,
Myxoma-Virus und Molluscum contagiosum-Virus nimmt man an,
daß der Yaba-Tumorvirus einen verwandten Wachstumsfaktor
besitzt.
Mäuse-EGF (mEGF) (Scott et al., 1983, siehe oben; Gray et
al., 1983, siehe oben) und Human-EGF (hEGF) (Gregory et al.,
Int. J. Pept. Protein Res. [1977] 9 : 107-118) sind als
homolog zu Human-, Mäuse- und Ratten-TGF (Marquardt et al.,
Proc. Natl. Acad. Sci. USA [1983] 80 : 4684-4688) und den
Resten 45 bis 85 eines Polypeptids mit 140 Resten,
Vaccinia-Wachstumsfaktor (VGF), für den das Vaccinia-Virusgenom
kodiert (Venkatesan et al., 1982, wie oben) bekannt.
Die Expression von Fremdpeptiden unter Verwendung eines
Baculovirusvektors in Insektenzellen ist beschrieben von
Maeda et al., Nature (1985) 315 : 592-594, und Carbonell
et al., J. of Virology (1985) 56 : 153-160.
Auf die Offenbarung der obigen Publikationen wird hiermit
bezug genommen.
Erfindungsgemäß werden neue Polypeptide und Polypeptidzusammensetzungen
zur Verfügung gestellt, die sich analog
in Fragmenten viraler Proteine finden und die als Mitogene
wirken und in Nährmedien, als Reagentien zur Detektion
von Wachstumsfaktor-Rezeptoren oder der Anwesenheit von
Wachstumsfaktoren und als Kompetitoren für den Transforming-
Wachstumsfaktor und epidermalen Wachstumsfaktor Anwendung
finden. Die Polypeptide und Polypeptid-Zusammensetzungen
finden auch therapeutische Anwendung, beispielsweise um die
Epithelialisierung und die Heilung von Verbrennungen und
Wunden zu fördern. Die neuen Peptide können synthetisiert
werden. Sie können als Oligopeptide oder Fusionsproteine
unter Anwendung rekombinianter Techniken in verschiedenen
Wirten gebildet werden.
Fig. 1 zeigt einen Vergleich der Aminosäuresequenz des
Vaccinia-Virusproteins mit bekannten Wachstumsfaktoren, wobei
die erste Aminosäure des VGF's Asparaginsäure (D) in
Position 20 vom Methionin ist, wobei dieses Position aa-24
der erfindungsgemäßen Peptide entspricht.
Fig. 2 zeigt einen Strukturvorschlag für reifes VGF
mit Asparagin (N)-Ersatzstellen. Potientelle Glykosilierungsstellen
in MGF und SFGF werden durch Sterne angezeigt.
Erfindungsgemäß werden neue Peptide und Peptidzusammensetzungen
zur Verfügung gestellt, die als Agonisten oder
Antagonisten des epidermalen Wachstumsfaktors (EGF) oder
Transforming-Wachstumsfaktors (TGF) wirken können. Sie
besitzen viele Anwendungsmöglichkeiten bei Zellkulturen,
in der Diagnostik, in der in vivo-Therapie und in Kombination
mit anderen Peptiden bei der Bildung von Hybrid-polypeptiden
als Immunogene zur Herstellung von Antikörpern. Polynukleotidsequenzen
können isoliert oder herstellt und in einen
Expressionsvektor zur Expression der erfindungsgemäßen
Peptide eingeführt werden.
Die erfindungsgemäßen Zusammensetzungen finden ihre Entsprechung
in Fragmenten viraler Proteine, insbesondere
Poxvirus-Proteine. Wie in Fig. 1 gezeigt, besitzt VGF ungeladene
und hydrophobe Reste in der Nähe des N-Terminus
zwischen den Resten 5 und15 und in der Nähe des C-Terminus
zwischen den Resten 100 und 124. In Analogie zu integralen
Membranglykoproteinen kann man diesen Resten eine N-
terminale hydrophobe Signalsequenz, die proteolytisch während
und unmittelbar nach der Translation entfernt wird und eine
C-terminale transmembranöse Substanz zuschreiben, die dazu
dient, das reife Protein in der Membran zu verankern.
Eine Spaltung des viralen Polypeptids bei arg-43 und arg-90
des reifen Peptids würde zur Freisetzung eines löslichen
Polypeptids führen. Man nimmt an, daß das VV-Polypeptid
mit 140 Resten zunächst zu einem Membran-assoziierten
Protein von etwa 121 Resten nach Entfernung der 1 g Aminosäuresequenz
führt. Nach intracellulärem Prozessieren erhält
man ein lösliches Wachstumsfaktorpeptid von etwa 77 Resten,
Cell (1985) 42 : 383-393.
Ein Vergleich des Myxoma-Wachstumsfaktors (MGF) und des
Shope-Fibroma-Wachstumsfaktors (SFGF) mit anderen Mitgliedern
der Wachstumsfaktor-Familie (siehe Fig. 1), zeigt
mehrere bemerkenswerte Unterschiede. MGF und SFGF,
synthetisiert als Prekursormoleküle, besitzen eine Signalsequenz
am N-Terminus. Im Gegensatz zu den anderen Wachstumsfaktoren
besitzen sie jedoch keine transmembrane
Domäne am C-Terminus, was zeigt, daß sie sekretierte Moleküle
sind. Eine Sequenzanalyse zeigt das signifikante Vorkommen
der Aminosäure Asparagin in MGF und SFGF. In sechs
Positionen ist bei MGF und SFGF Asparagin vorhanden,
während die anderen Mitglieder der Familie kein Asparagin
aufweisen. Von diesen Positionen ersetzt das Asparagin zwei
hoch konservierte Glycinreste in Position 8 und 31, wobei
das erste Cystein sich in Position 2 befindet. Beide
Glycinreste treten in Kombination mit hoch konservierten
Tyrosinresten in Positionen 9 und 32 auf. Aufgrund der hochkonservierten
Natur der Aminosäuren in diesem Molekül an
sich, nimmt man an, daß die darin vorhandenen Cysteinschleifen
mit der Rezeptorbindung und Funktion der Wachstumsfaktoren
in dieser Familie im Zusammenhang stehen.
Den Aminosäuren Glycin und Asparagin wird das höchste
β-Turnpotential zugeschrieben (Chou und Fassman, Ann. Rev.
Biochem. [1978] 47 : 251-276). Die Konservierung dieses
Turnpotentials scheint daher äußerst wichtig für die Wachstumfaktoraktivität
zu sein. Andere als die Myxoma- und
Shope-Wachstumsfaktoren benutzen beinahe ausschließlich
Glycin in wichtigen Turnregionen des Moleküls. Bei MGF und
SFGF sind diese Glycine beinahe alle in Asparagin umgewandelt
(siehe Fig. 2). Dies deutet auf eine wichtige
biologische Funktion hin, die auf den Ersatz des hochkonservierten
Glycinrestes durch den Asparaginrest zurückzuführen
ist. Es besteht die Möglichkeit, daß der Ersatz
des Glycins durch Asparagin in den konservierten Turnregionen
in der Struktur des Wachstumsfaktors zu einer
vergrößteren Funktionalität des Wachstumsfaktors führen
kann, entweder durch Verstärkung der Bindung an den EGF-
Rezeptor oder an einen verwandten Rezeptor unter Verstärkung
des direkten Effekts des Wachstumsfaktors in den
betroffenen Zellen oder durch Erhöhung der Stabilität des
Moleküls.
Zwei der neuen Asparaginpositionen in MGF und SFGF ergeben
potentielle N-verknüpfte Glykosilierungsstellen. Darüber
hinaus sind diese Stellen in zwei Cysteinschleifen vorhanden,
die eine variable Zahl an Aminosäuren ermöglichen. Die
neuen Asparaginpositionen bieten dem Wachstumsfaktor somit
neben der erhöhten Funktionalität zahlreiche Vorteile.
Einer dieser Vorteile könnte die Stabilisierung des
Proteins in vivo durch Schutz vor Abbau oder der immunogenen
Stellen durch Glykosilierung sein.
Die erfindungsgemäßen Polypeptide sind dadurch gekennzeichnet,
daß sie wenigstens eine Schleife oder einen
Kreis, üblicherweise drei Schleifen oder drei Kreise besitzen
die von brückenbildenden Cysteinen herrühren, wobei
der physiologisch aktive Teil des Moleküls mit einer
wachstumsfaktorverwandten Aktivität etwa 12 bis 65 Aminosäuren,
üblicherweise 15 bis 60 Aminosäuren umfaßt. Zwei
der drei Schleifen bestehen aus etwa 12 bis 15 Aminosäuren
(14 bis 17 annulare Aminosäuren), ausschließlich der
Cysteinbrücke. Insbesondere besteht eine dieser Schleifen
aus 12 oder 13 Aminosäuren (14 oder 15 annulare Aminosäuren)
und die andere aus 15 Aminosäuren (17 annulare
Aminosäuren), wobei die N-terminale proximale Schleife
üblicherweise aus 12 bis 13 Aminosäuren, insbesondere
12 Aminosäuren und die Mittelschleife aus 15 Aminosäuren
bestehen.
Die dritte oder C-proximale Schleife besteht aus 8 Aminosäuren
(10 annularen Aminosäuren) und besitzt einschließlich
der flankierenden Aminosäuren die folgende Formel:
worin
die Einbuchstabensymbole für Aminosäuren die übliche Bedeutung
besitzen, wobei C für Cystein, G für Glycin, N für
Asparagin, Y für Tyrosin und R für Arginin stehen;
aa²⁵ eine neutrale Aminosäure bedeutet, die aliphatisch, insbesondere mit 3 bis 4 Kohlenstoffatomen, oder aromatisch, insbesondere mit 9 Kohlenstoffatomen sein kann und die 0 bis 1 Hydroxygruppe aufweisen kann, beispielsweise Alanin, Serin, Threonin, Tyrosin oder Phenylalanin;
aa²⁷ eine neutrale oder basische Aminosäure mit insbesondere 3 bis 6 Kohlenstoffatomen bedeutet, die, wenn es sich um eine neutrale Aminosäure handelt, 0 bis 1 Carboxyamidgruppen aufweisen kann, beispielsweise Arginin, Alanin, Valin, Leucin, Isoleucin, Asparagin oder Glutamin;
aa²⁹ eine neutrale oder basische aliphatische oder aromatische Aminosäure bedeutet, wobei eine aromatische Aminosäure beispielsweise Histdin ist und eine aliphatische Aminosäure 2 bis 6, insbesondere 3 bis 6 Kohlenstoffatome, mit 0 bis 1 Hydroxygruppen aufweist, beispielsweise Serin, Threonin, Leucin, Valin, Isoleucin oder Arginin;
aa³⁰ eine neutrale, aliphatische oder aromatische Aminosäure ist, wobei eine aromatische Aminosäure beispielsweise Histidin ist und eine aliphatische Aminosäure 3 bis 6 Kohlenstoffatome und 0 bis 1 Hydroxygruppen aufweist, wie insbesondere Serin, Isoleucin und Valin;
aa³³ eine neutrale aliphatische Aminosäure mit 2 bis 6, insbesondere 3 bis 6 Kohlenstoffatomen und 0 bis 1 Hydroxygruppen bedeutet, wie insbesondere Serin, Threonin, Valin, Leucin oder Isoleucin oder eine saure Aminosäure bedeutet, beispielsweise Glutaminsäure und Asparaginsäure;
aa³⁵ eine neutrale oder saure Aminosäure mit 3 bis 6 Kohlenstoffatomen bedeutet, beispielsweise eine neutrale Aminosäure, wie Alanin, Valin, Leucin, Isoleucin und Serin und eine saure Aminosäure, wie Asparaginsäure und Glutaminsäure;
aa³⁸ eine aliphatische neutrale, mit einer Carboxamidgruppe substituierte Aminosäure mit 4 bis 5 Kohlenstoffatomen oder eine saure Aminosäure bedeutet, beispielsweise Asparagin, Glutamin, Asparaginsäure oder Glutaminsäure;
aa³⁹ eine aromatische Aminosäure oder eine neutrale aliphatische Aminosäure mit 3 bis 4 Kohlenstoffatomen, üblicherweise mit einem Hydroxysubstituenten, und vorzugsweise eine aromatische Aminosäure bedeutet, beispielsweise Phenylalanin, Histidin, Tyrosin, Serin oder Threonin;
aa⁴⁰ eine neutrale substituierte und unsubstituierte aliphatische Aminosäure mit 3 bis 6 Kohlenstoffatomen oder eine basische Aminosäure bedeutet, beispielsweise Alanin, Valin, Isoleucin, Glutamin oder Arginin;
m und n für 0 oder 1 stehen;
PP³ und PP⁴, die gleich oder verschieden sein können, entweder ein Wasserstoffatom bedeuten, was das Ende des Polypeptids ausdrückt, oder eine Polypeptidkette mit nicht mehr als insgesamt 1000 Aminosäuren, üblicherweise nicht mehr als insgesamt etwa 500 Aminosäuren bedeuten, wobei vorzugsweise wenigstens 90% der Aminosäuren, insbesondere wenigstens etwa 95% der Aminosäuren in einer der beiden Polypeptidketten vorhanden sind; wobei in einigen Fällen die Kette aus nur einer Aminosäure und nicht mehr als 100 Aminosäuren, häufig aus nicht mehr als ungefähr 50 Aminosäuren besteht, je nach Anwendung des Polypeptids und der Rolle, die die verlängerte Kette spielt; wobei die Polypeptidketten den natürlich vorkommenden Polypeptidketten, die mit natürlich vorkommenden Wachstumsfaktoren und Poxvirusproteinen in Zusammenhang stehen, verwandt sein können oder von den natürlich vorkommenden Ketten oder Fragmenten davon, die mit den in der Formel gezeigten spezifischen Polypeptidketten assoziiert sind, verschieden sein können und üblicherweise nicht verwandt sind.
aa²⁵ eine neutrale Aminosäure bedeutet, die aliphatisch, insbesondere mit 3 bis 4 Kohlenstoffatomen, oder aromatisch, insbesondere mit 9 Kohlenstoffatomen sein kann und die 0 bis 1 Hydroxygruppe aufweisen kann, beispielsweise Alanin, Serin, Threonin, Tyrosin oder Phenylalanin;
aa²⁷ eine neutrale oder basische Aminosäure mit insbesondere 3 bis 6 Kohlenstoffatomen bedeutet, die, wenn es sich um eine neutrale Aminosäure handelt, 0 bis 1 Carboxyamidgruppen aufweisen kann, beispielsweise Arginin, Alanin, Valin, Leucin, Isoleucin, Asparagin oder Glutamin;
aa²⁹ eine neutrale oder basische aliphatische oder aromatische Aminosäure bedeutet, wobei eine aromatische Aminosäure beispielsweise Histdin ist und eine aliphatische Aminosäure 2 bis 6, insbesondere 3 bis 6 Kohlenstoffatome, mit 0 bis 1 Hydroxygruppen aufweist, beispielsweise Serin, Threonin, Leucin, Valin, Isoleucin oder Arginin;
aa³⁰ eine neutrale, aliphatische oder aromatische Aminosäure ist, wobei eine aromatische Aminosäure beispielsweise Histidin ist und eine aliphatische Aminosäure 3 bis 6 Kohlenstoffatome und 0 bis 1 Hydroxygruppen aufweist, wie insbesondere Serin, Isoleucin und Valin;
aa³³ eine neutrale aliphatische Aminosäure mit 2 bis 6, insbesondere 3 bis 6 Kohlenstoffatomen und 0 bis 1 Hydroxygruppen bedeutet, wie insbesondere Serin, Threonin, Valin, Leucin oder Isoleucin oder eine saure Aminosäure bedeutet, beispielsweise Glutaminsäure und Asparaginsäure;
aa³⁵ eine neutrale oder saure Aminosäure mit 3 bis 6 Kohlenstoffatomen bedeutet, beispielsweise eine neutrale Aminosäure, wie Alanin, Valin, Leucin, Isoleucin und Serin und eine saure Aminosäure, wie Asparaginsäure und Glutaminsäure;
aa³⁸ eine aliphatische neutrale, mit einer Carboxamidgruppe substituierte Aminosäure mit 4 bis 5 Kohlenstoffatomen oder eine saure Aminosäure bedeutet, beispielsweise Asparagin, Glutamin, Asparaginsäure oder Glutaminsäure;
aa³⁹ eine aromatische Aminosäure oder eine neutrale aliphatische Aminosäure mit 3 bis 4 Kohlenstoffatomen, üblicherweise mit einem Hydroxysubstituenten, und vorzugsweise eine aromatische Aminosäure bedeutet, beispielsweise Phenylalanin, Histidin, Tyrosin, Serin oder Threonin;
aa⁴⁰ eine neutrale substituierte und unsubstituierte aliphatische Aminosäure mit 3 bis 6 Kohlenstoffatomen oder eine basische Aminosäure bedeutet, beispielsweise Alanin, Valin, Isoleucin, Glutamin oder Arginin;
m und n für 0 oder 1 stehen;
PP³ und PP⁴, die gleich oder verschieden sein können, entweder ein Wasserstoffatom bedeuten, was das Ende des Polypeptids ausdrückt, oder eine Polypeptidkette mit nicht mehr als insgesamt 1000 Aminosäuren, üblicherweise nicht mehr als insgesamt etwa 500 Aminosäuren bedeuten, wobei vorzugsweise wenigstens 90% der Aminosäuren, insbesondere wenigstens etwa 95% der Aminosäuren in einer der beiden Polypeptidketten vorhanden sind; wobei in einigen Fällen die Kette aus nur einer Aminosäure und nicht mehr als 100 Aminosäuren, häufig aus nicht mehr als ungefähr 50 Aminosäuren besteht, je nach Anwendung des Polypeptids und der Rolle, die die verlängerte Kette spielt; wobei die Polypeptidketten den natürlich vorkommenden Polypeptidketten, die mit natürlich vorkommenden Wachstumsfaktoren und Poxvirusproteinen in Zusammenhang stehen, verwandt sein können oder von den natürlich vorkommenden Ketten oder Fragmenten davon, die mit den in der Formel gezeigten spezifischen Polypeptidketten assoziiert sind, verschieden sein können und üblicherweise nicht verwandt sind.
Die Definitionen der Aminosäuren sind nachfolgend erläutert.
Neutral (Ne) | ||
aliphatisch (Al) | ||
unsubstituiert | G, A, V, L, I, P | |
substituiert @ | oxy | S, T |
thio | C, M | |
amido | N, Q | |
aromatisch (Ar) @ | unsubstituiert | F |
substituiert | Y | |
heterocyclisch | H, W |
Geladen (bei pH 6,0) | |
basisch (Ba) | |
K, R | |
sauer (Ac) | D, E |
Die Abkürzungen in Klammern beziehen sich auf bestimmte
Aminosäuregruppen. Mit "unsubstituiert" sind keine
weiteren Heterosubstituenten wie die in Glycin vorhandenen
Carboxy- und Aminogruppen, gemeint. Die Aminosäuren sind
natürlich vorkommende L-Aminosäuren.
Die neutralen Aminosäuren können auch nicht-polare oder
polare (aber ungeladene) Gruppen R aufweisen. Aminosäuren,
die unter diese Definition fallen, sind:
nicht-polare Aminosäuren | |
A, V, L, I, P, M, F, W | |
polare Aminosäuren | G, S, T, C, Y, N, Q |
Die Schleife zwischen den Cysteinen in Positionen 28 und
37 in obiger Formel enthält 0 bis 1 saure Aminosäure (S).
Die unmittelbar außerhalb der Schleife an die Cysteine
anschließenden Aminosäuren (d. h. die Aminosäuren 27 und
38) umfassen wenigstens eine geladene Aminosäure und
wenigstens eine Amido-substituierte aliphatische Aminosäure.
Von den in der Schleife (28 bis 37) enthaltenen
Aminosäuren sind 4 bis 6, üblicherweise 5 Aminosäuren,
neutrale aliphatische Aminosäuren und nicht mehr als 2,
üblicherweise 1, sind aromatische Aminosäuren.
Von besonderem Interesse sind Verbindungen, bei denen
das Polypeptid weniger als 130 Aminosäuren, insbesondere
weniger als 55 Aminosäuren, und wenigstens 44 Aminosäuren,
vorzugsweise wenigstens etwa 53 Aminosäuren, aufweist.
Von besonderem Interesse sind auch Polypeptide, die die
Aminosäuren 44 bis 88 und Fragmente davon von VGF (aa¹ bis
aa⁴⁷, siehe Fig. 1) umfassen.
Vorzugsweise bedeutet
aa²⁹ eine substituierte oder unsubstituierte
aliphatische Aminosäure mit 3 bis 6 Kohlenstoffatomen
und 0 bis 1 Hydroxygruppe, insbesondere Serin
oder Valin; oder eine aromatische Aminosäure, insbesondere
Histidin;
aa³⁰ bedeutet vorzugsweise Histidin, Serin oder eine unsubstituierte aliphatische Aminosäure mit 5 bis 6 Kohlenstoffatomen, insbesondere Isoleucin;
aa³³ bedeutet vorzugsweise eine substituierte oder unsubstituierte aliphatische Aminosäure mit 0 bis 1 Hydroxygruppen und 3 bis 6 Kohlenstoffatomen;
aa³⁵ bedeutet vorzugsweise eine aliphatische Aminosäure mit 3 bis 6 Kohlenstoffatomen;
aa³⁸ bedeutet vorzugsweise Glutamin oder Glutaminsäure;
aa³⁹ bedeutet vorzugsweise eine aromatische Aminosäure, insbesondere Histidin oder Phenylalanin;
aa⁴⁰ bedeutet vorzugsweise eine neutrale oder basische Aminosäure.
aa³⁰ bedeutet vorzugsweise Histidin, Serin oder eine unsubstituierte aliphatische Aminosäure mit 5 bis 6 Kohlenstoffatomen, insbesondere Isoleucin;
aa³³ bedeutet vorzugsweise eine substituierte oder unsubstituierte aliphatische Aminosäure mit 0 bis 1 Hydroxygruppen und 3 bis 6 Kohlenstoffatomen;
aa³⁵ bedeutet vorzugsweise eine aliphatische Aminosäure mit 3 bis 6 Kohlenstoffatomen;
aa³⁸ bedeutet vorzugsweise Glutamin oder Glutaminsäure;
aa³⁹ bedeutet vorzugsweise eine aromatische Aminosäure, insbesondere Histidin oder Phenylalanin;
aa⁴⁰ bedeutet vorzugsweise eine neutrale oder basische Aminosäure.
Von besonderem Interesse ist die Anwesenheit von zwei
Schleifen, wobei die C-proximale Schleife mit der zweiten
Schleife verbunden ist und wobei die Aminosäuren der
zweiten Schleife in einem weiten Bereich variieren können.
Die zweite Schleife umfaßt vorzugsweise etwa 14 bis
16 Aminosäuren ohne die Cysteinbrücke, insbesondere
etwa 15 Aminosäuren. Von diesen Aminosäuren sind 6 bis 9,
vorzugsweise 7 bis 9 und insbesondere in etwa 8, aliphatische
Aminosäuren, die substituiert oder unsubstituiert sein
können, wobei vorzugsweise nicht mehr als etwa 3, insbesondere
1 bis 2 Aminosäuren, substituiert sind. Es sind
2 bis 4 aromatische Aminosäuren, insbesondere 3 aromatische
Aminosäuren vorhanden, vorzugsweise Histidin und Tyrosin.
Es sind 2 bis 4 saure Aminosäuren, vorzugsweise 3 saure
Aminosäuren vorhanden, insbesondere Asparaginsäure.
Weiter sind 0 bis 2, insbesondere 1 basische Aminosäure
vorhanden, vorzugsweise Arginin. Zweckmäßigerweise ist das
Cystein, das die Schleife bildet, die dem Cystein der
anderen Schleife am nächsten liegt, durch 0 bis 2,
üblicherweise 0 bis 1 Aminosäure und insbesondere durch
Arginin, separiert.
Von besonderem Interesse für einige Anwendungsgebiete
sind die Verbindungen der folgenden Formel:
worin
die Symbole aa²⁵ bis aa⁴⁰ die oben angegebenen Bedeutungen
besitzen;
PP¹ und PP², die gleich oder verschieden sein können, Wasserstoffatome bedeuten können und damit den Terminus des angegebenen Polypeptids bilden oder Polypeptide bedeuten können, die insgesamt bis zu etwa 1000 Aminosäuren, insbesondere bis zu etwa 500 Aminosäuren und insgesamt aber auch nur 1 Aminosäure umfassen können oder einzeln und getrennt Polypeptide mit 1 bis 100 Aminosäuren, insbesondere etwa 1 bis 75 Aminosäuren und besonders bevorzugt etwa 5 bis 50 Aminosäuren bedeuten können, wobei diese Polypeptide bestimmte Anwendungen bei der Modifizierung der konkret beschriebenen Sequenz für einen gegebenen Zweck finden können und wobei PP¹ und PP² gleich sein können wie oder verschieden sein können von dem natürlichen Poxvirus-Polypeptid, üblicherweise aber verschieden sind;
aa¹ eine Aminosäure sein kann, insbesondere eine aliphatische Aminosäure, basische Aminosäure oder saure Aminosäure, vorzugsweise eine unsubstituierte aliphatische Aminosäure mit 2 bis 6 Kohlenstoffatomen, einschließlich Glycin, Leucin, Valin, Lysin, Glutaminsäure und Asparaginsäure;
aa³ eine neutrale Aminosäure mit insbesondere 2 bis 4 Kohlenstoffatomen bedeutet, vorzugsweise Asparagin, Glycin und Prolin;
aa⁴ eine aliphatische oder aromatische Aminosäure bedeutet, insbesondere eine Aminosäure mit 2 bis 6 Kohlenstoffatomen, die neutral oder sauer sein kann und die insbesondere 3 bis 6 Kohlenstoffatome aufweist, einschließlich Prolin, Asparaginsäure, Histidin, Serin und Leucin;
aa⁵ eine saure oder neutrale, substituierte aliphatische Aminosäure, insbesondere Glutaminsäure oder Asparaginsäure, oder eine Hydroxy-substituierte Aminosäure mit 3 bis 4 Kohlenstoffatomen, insbesondere Serin, bedeutet;
aa⁶ eine unsubstituierte aliphatische Aminosäure mit 2 bis 6, üblicherweise 2 bis 3 Kohlenstoffatomen oder eine aromatische Aminosäure bedeutet, insbesondere Glycin, Histidin oder Tyrosin;
aa⁷ eine saure, basische oder neutrale Aminosäure mit insbesondere 3 bis 6 Kohlenstoffatomen bedeutet, wie Glutaminsäure, Asparaginsäure, Lysin und Threonin;
aa⁸ eine neutrale unsubstituierte aliphatische Aminosäure mit 2 bis 3 Kohlenstoffatomen oder eine mit einer Carboxamidgruppe substituierte Aminosäure mit 4 bis 5 Kohlenstoffatomen bedeutet, beispielsweise Asparagin, Glutamin oder Glycin;
aa¹¹ eine aliphatische oder aromatische neutrale Aminosäure, insbesondere eine aliphatische Aminosäure, vorzugsweise mit 5 bis 6 Kohlenstoffatomen und besonders bevorzugt Leucin oder Phenylalanin bedeutet;
aa¹² eine aromatische Aminosäure oder eine Carboxamid- substituierte aliphatische Aminosäure mit 4 bis 5 Kohlenstoffatomen, insbesondere Histidin oder Asparagin, bedeutet;
aa12a eine neutrale aliphatische oder saure Aminosäure, insbesondere Glycin, Asparagin oder Asparaginsäure, bedeutet;
aa¹⁴ eine saure Aminosäure oder neutrale aliphatische, substituierte oder unsubstituierte Aminosäure mit 4 bis 5 Kohlenstoffatomen und 0 bis 1 Hydroxygruppen und insbesondere Asparaginsäure, Threonin oder Valin bedeutet;
aa¹⁶ eine Bindung oder eine neutrale oder basische aliphatische, substituierte oder unsubstituierte Aminosäure mit 4 bis 6 Kohlenstoffatomen, insbesondere Isoleucin, Arginin oder Methionin, bedeutet;
Ar¹ eine aromatische Aminosäure, die einen carbocyclischen oder heterocyclischen Ring aufweisen kann, bedeutet, einschließlich Histidin, Phenylalanin oder Tyrosin;
aa17a eine neutrale aliphatische, substituierte oder unsubstituierte Aminosäure mit 3 bis 6, insbesondere 3 bis 5 Kohlenstoffatomen und 0 bis 1 Hydroxygruppen bedeutet, einschließlich Valin, Leucin, Isoleucin und Threonin;
aa17b eine neutrale unsubstituierte Aminosäure mit 5 bis 6 Kohlenstoffatomen oder eine saure Aminosäure und insbesondere Valin, Isoleucin oder Glutaminsäure bedeutet;
aa¹⁸ eine neutrale aliphatische, substituierte oder unsubstituierte Aminosäure mit 2 bis 6, vorzugsweise 3 bis 6 Kohlenstoffatomen und 0 bis 1 Hydroxygruppen und insbesondere Alanin, Serin oder Glutamin bedeutet;
aa¹⁹ irgendeine Aminosäure sein kann, insbesondere eine aliphatische saure oder basische Aminosäure mit insbesondere 4 bis 6 Kohlenstoffatomen, vorzugsweise 5 bis 6 Kohlenstoffatomen, insbesondere Arginin, Leucin, Valin und Glutaminsäure;
aa²⁰ eine saure Aminosäure oder aliphatische Carboxamid- substituierte Aminosäure bedeutet, einschließlich Asparaginsäure, Asparagin, Glutaminsäure oder Glutamin;
aa²¹ eine neutrale unsubstituierte aliphatische Aminosäure oder basische Aminosäure mit 3 bis 6 Kohlenstoffatomen und 0 bis 1 Hydroxy- oder Carboxamid-Gruppen bedeutet, einschließlich Isoleucin, Leucin, Asparagin, Serin, Threonin, Lysin und Arginin;
aa²² eine Bindung oder eine saure Aminosäure, wie Asparaginsäure oder Glutaminsäure, oder eine neutrale aliphatische Aminosäure, insbesondere Valin, bedeutet;
aa22a eine neutrale aliphatische Aminosäure mit 0 bis 1 Hydroxygruppen, insbesondere 1 Hydroxygruppe, und vorzugsweise Serin, bedeutet;
aa22b eine neutrale aliphatische Aminosäure mit 4 bis 6 Kohlenstoffatomen, insbesondere Leucin oder Isoleucin, bedeutet;
aa²³ eine Bindung oder eine neutrale aliphatische, substituierte oder unsubstituierte Aminosäure mit 2 bis 6 Kohlenstoffatomen und 0 bis 1 Hydroxysubstituenten bedeutet, einschließlich Glycin, Serin, Threonin und Asparagin;
aa²⁴ eine aliphatische Aminosäure, insbesondere eine thiosubstituierte aliphatische Aminosäure und vorzugsweise Methionin, Prolin, oder eine aromatische Aminosäure, insbesondere Tyrosin, bedeutet;
aa⁴¹ eine neutrale substituierte oder unsubstituierte aliphatische oder saure Aminosäure mit 4 bis 6 Kohlenstoffatomen, insbesondere Valin, Asparagin oder Asparaginsäure, bedeutet;
aa⁴³ eine neutrale aliphatische, saure oder basische substituierte oder unsubstituierte Aminosäure mit 4 bis 6 Kohlenstoffatomen bedeutet, einschließlich Valin, Leucin, Isoleucin, Arginin, Lysin und Asparaginsäure;
aa⁴⁴ irgendeine Aminosäure sein kann, insbesondere eine nicht-basische Aminosäure, wobei diese Aminosäure sauer, neutral oder aromatisch sein kann und, wenn es sich nicht um eine aromatische Aminosäure handelt, sie 3 bis 6 Kohlenstoffatome aufweist, insbesondere Asparaginsäure, Alanin, Leucin, Trypthophan oder Threonin; und
p für 0 oder 1 steht.
PP¹ und PP², die gleich oder verschieden sein können, Wasserstoffatome bedeuten können und damit den Terminus des angegebenen Polypeptids bilden oder Polypeptide bedeuten können, die insgesamt bis zu etwa 1000 Aminosäuren, insbesondere bis zu etwa 500 Aminosäuren und insgesamt aber auch nur 1 Aminosäure umfassen können oder einzeln und getrennt Polypeptide mit 1 bis 100 Aminosäuren, insbesondere etwa 1 bis 75 Aminosäuren und besonders bevorzugt etwa 5 bis 50 Aminosäuren bedeuten können, wobei diese Polypeptide bestimmte Anwendungen bei der Modifizierung der konkret beschriebenen Sequenz für einen gegebenen Zweck finden können und wobei PP¹ und PP² gleich sein können wie oder verschieden sein können von dem natürlichen Poxvirus-Polypeptid, üblicherweise aber verschieden sind;
aa¹ eine Aminosäure sein kann, insbesondere eine aliphatische Aminosäure, basische Aminosäure oder saure Aminosäure, vorzugsweise eine unsubstituierte aliphatische Aminosäure mit 2 bis 6 Kohlenstoffatomen, einschließlich Glycin, Leucin, Valin, Lysin, Glutaminsäure und Asparaginsäure;
aa³ eine neutrale Aminosäure mit insbesondere 2 bis 4 Kohlenstoffatomen bedeutet, vorzugsweise Asparagin, Glycin und Prolin;
aa⁴ eine aliphatische oder aromatische Aminosäure bedeutet, insbesondere eine Aminosäure mit 2 bis 6 Kohlenstoffatomen, die neutral oder sauer sein kann und die insbesondere 3 bis 6 Kohlenstoffatome aufweist, einschließlich Prolin, Asparaginsäure, Histidin, Serin und Leucin;
aa⁵ eine saure oder neutrale, substituierte aliphatische Aminosäure, insbesondere Glutaminsäure oder Asparaginsäure, oder eine Hydroxy-substituierte Aminosäure mit 3 bis 4 Kohlenstoffatomen, insbesondere Serin, bedeutet;
aa⁶ eine unsubstituierte aliphatische Aminosäure mit 2 bis 6, üblicherweise 2 bis 3 Kohlenstoffatomen oder eine aromatische Aminosäure bedeutet, insbesondere Glycin, Histidin oder Tyrosin;
aa⁷ eine saure, basische oder neutrale Aminosäure mit insbesondere 3 bis 6 Kohlenstoffatomen bedeutet, wie Glutaminsäure, Asparaginsäure, Lysin und Threonin;
aa⁸ eine neutrale unsubstituierte aliphatische Aminosäure mit 2 bis 3 Kohlenstoffatomen oder eine mit einer Carboxamidgruppe substituierte Aminosäure mit 4 bis 5 Kohlenstoffatomen bedeutet, beispielsweise Asparagin, Glutamin oder Glycin;
aa¹¹ eine aliphatische oder aromatische neutrale Aminosäure, insbesondere eine aliphatische Aminosäure, vorzugsweise mit 5 bis 6 Kohlenstoffatomen und besonders bevorzugt Leucin oder Phenylalanin bedeutet;
aa¹² eine aromatische Aminosäure oder eine Carboxamid- substituierte aliphatische Aminosäure mit 4 bis 5 Kohlenstoffatomen, insbesondere Histidin oder Asparagin, bedeutet;
aa12a eine neutrale aliphatische oder saure Aminosäure, insbesondere Glycin, Asparagin oder Asparaginsäure, bedeutet;
aa¹⁴ eine saure Aminosäure oder neutrale aliphatische, substituierte oder unsubstituierte Aminosäure mit 4 bis 5 Kohlenstoffatomen und 0 bis 1 Hydroxygruppen und insbesondere Asparaginsäure, Threonin oder Valin bedeutet;
aa¹⁶ eine Bindung oder eine neutrale oder basische aliphatische, substituierte oder unsubstituierte Aminosäure mit 4 bis 6 Kohlenstoffatomen, insbesondere Isoleucin, Arginin oder Methionin, bedeutet;
Ar¹ eine aromatische Aminosäure, die einen carbocyclischen oder heterocyclischen Ring aufweisen kann, bedeutet, einschließlich Histidin, Phenylalanin oder Tyrosin;
aa17a eine neutrale aliphatische, substituierte oder unsubstituierte Aminosäure mit 3 bis 6, insbesondere 3 bis 5 Kohlenstoffatomen und 0 bis 1 Hydroxygruppen bedeutet, einschließlich Valin, Leucin, Isoleucin und Threonin;
aa17b eine neutrale unsubstituierte Aminosäure mit 5 bis 6 Kohlenstoffatomen oder eine saure Aminosäure und insbesondere Valin, Isoleucin oder Glutaminsäure bedeutet;
aa¹⁸ eine neutrale aliphatische, substituierte oder unsubstituierte Aminosäure mit 2 bis 6, vorzugsweise 3 bis 6 Kohlenstoffatomen und 0 bis 1 Hydroxygruppen und insbesondere Alanin, Serin oder Glutamin bedeutet;
aa¹⁹ irgendeine Aminosäure sein kann, insbesondere eine aliphatische saure oder basische Aminosäure mit insbesondere 4 bis 6 Kohlenstoffatomen, vorzugsweise 5 bis 6 Kohlenstoffatomen, insbesondere Arginin, Leucin, Valin und Glutaminsäure;
aa²⁰ eine saure Aminosäure oder aliphatische Carboxamid- substituierte Aminosäure bedeutet, einschließlich Asparaginsäure, Asparagin, Glutaminsäure oder Glutamin;
aa²¹ eine neutrale unsubstituierte aliphatische Aminosäure oder basische Aminosäure mit 3 bis 6 Kohlenstoffatomen und 0 bis 1 Hydroxy- oder Carboxamid-Gruppen bedeutet, einschließlich Isoleucin, Leucin, Asparagin, Serin, Threonin, Lysin und Arginin;
aa²² eine Bindung oder eine saure Aminosäure, wie Asparaginsäure oder Glutaminsäure, oder eine neutrale aliphatische Aminosäure, insbesondere Valin, bedeutet;
aa22a eine neutrale aliphatische Aminosäure mit 0 bis 1 Hydroxygruppen, insbesondere 1 Hydroxygruppe, und vorzugsweise Serin, bedeutet;
aa22b eine neutrale aliphatische Aminosäure mit 4 bis 6 Kohlenstoffatomen, insbesondere Leucin oder Isoleucin, bedeutet;
aa²³ eine Bindung oder eine neutrale aliphatische, substituierte oder unsubstituierte Aminosäure mit 2 bis 6 Kohlenstoffatomen und 0 bis 1 Hydroxysubstituenten bedeutet, einschließlich Glycin, Serin, Threonin und Asparagin;
aa²⁴ eine aliphatische Aminosäure, insbesondere eine thiosubstituierte aliphatische Aminosäure und vorzugsweise Methionin, Prolin, oder eine aromatische Aminosäure, insbesondere Tyrosin, bedeutet;
aa⁴¹ eine neutrale substituierte oder unsubstituierte aliphatische oder saure Aminosäure mit 4 bis 6 Kohlenstoffatomen, insbesondere Valin, Asparagin oder Asparaginsäure, bedeutet;
aa⁴³ eine neutrale aliphatische, saure oder basische substituierte oder unsubstituierte Aminosäure mit 4 bis 6 Kohlenstoffatomen bedeutet, einschließlich Valin, Leucin, Isoleucin, Arginin, Lysin und Asparaginsäure;
aa⁴⁴ irgendeine Aminosäure sein kann, insbesondere eine nicht-basische Aminosäure, wobei diese Aminosäure sauer, neutral oder aromatisch sein kann und, wenn es sich nicht um eine aromatische Aminosäure handelt, sie 3 bis 6 Kohlenstoffatome aufweist, insbesondere Asparaginsäure, Alanin, Leucin, Trypthophan oder Threonin; und
p für 0 oder 1 steht.
Besonders bevorzugt ist es, wenn PP¹ die folgende Sequenz
besitzt:
worin
PP¹′ in Kombination mit den nachfolgenden Aminosäuresymbolen
der obigen Sequenz ein Äquivalent von PP¹ ist.
Die obige Sequenz liegt im Rahmen der
Definition von PP¹; PP¹′ kann ein Wasserstoffatom oder eine
Aminosäuresequenz sein. Eine Aminosäure oder mehrere Aminosäuren,
symbolisiert durch aa -x (x bedeutet eine Zahl) kann
oder können eine Bindung bedeuten, um die Zahl der Aminosäuren
in der N-terminalen Kette zu reduzieren. Es kann
daher die gesamte angegebene Aminosäuresequenz oder ein
Teil davon vorliegen. Wenn ein Teil dieser Sequenz vorliegt,
umfaßt die Sequenz vorzugsweise benachbarte Aminosäuren,
d. h. Aminosäuren in der numerischen Reihenfolge ohne
Deletionen. Üblicherweise ist wenigstens eine Aminosäure,
insbesondere sind wenigstens 3 und besonders bevorzugt
wenigstens 6 Aminosäuren vorhanden, wobei die verbleibenden
Upstream-Aminosäuren fehlen können, so daß PP¹′ an aa-a,
aa-6 oder dergleichen gebunden sein kann;
aa-1 kann irgendeine Aminosäure sein, insbesondere eine aliphatische Aminosäure mit etwa 3 bis 6 Kohlenstoffatomen, vorzugsweise neutral oder basisch und insbesondere bevorzugt Lysin, Arginin, Prolin, Asparagin oder Serin;
aa-2 kann eine aliphatische oder aromatische Aminosäure sein, insbesondere eine aliphatische Aminosäure mit, besonders bevorzugt, etwa 3 bis 6 Kohlenstoffatomen;
aa-3 kann eine aliphatische oder aromatische, insbesondere eine aliphatische, polare oder nicht-polare Aminosäure mit 2 bis 6, üblicherweise 2 bis 5 Kohlenstoffatomen sein, die im allgemeinen 0 bis 1 Hydroxygruppe aufweist;
aa-4 kann eine aliphatische, neutrale oder basische Aminosäure mit im allgemeinen 3 bis 6 Kohlenstoffatomen, üblicherweise 5 bis 6 Kohlenstoffatomen sein, wie insbesondere Asparagin, Prolin ode Lysin;
aa-5 kann eine aliphatische, insbesondere eine neutrale Aminosäure mit im allgemeinen 3 bis 6 Kohlenstoffatomen sein, insbesondere Valin oder Isoleucin;
aa-6 bedeutet eine neutrale oder saure Aminosäure, die, wenn es sich um eine aliphatische Aminosäure handelt, etwa 3 bis 6, insbesondere 4 bis 6 Kohlenstoffatome aufweist, vorzugsweise Isoleucin, Valin oder Asparaginsäure;
aa-7, aa-8, aa-9, aa-12, aa-14, aa-15, aa-16, aa-17, aa-19, aa-20, aa-21 und aa-23 sind polare oder nicht-polare, aliphatische Aminosäuren mit 3 bis 6 Kohlenstoffatomen, insbesondere polare Aminosäuren mit 0 bis 1 Hydroxysubstituenten, oder aromatische Aminosäuren;
aa-10 und aa-25 sind nicht-polare aliphatische Aminosäuren oder saure Aminosäuren mit 2 bis 6, insbesondere 2 bis 3 Kohlenstoffatomen;
aa-13, aa-22 und aa-24 sind polare aliphatische Aminosäuren oder saure Aminosäuren mit 4 bis 5 Kohlenstoffatomen, die insbesondere einen Carboxamido-Substituenten aufweisen;
aa-11 und aa-18 sind aliphatische, polare oder nicht-polare Aminosäuren oder saure Aminosäuren.
aa-1 kann irgendeine Aminosäure sein, insbesondere eine aliphatische Aminosäure mit etwa 3 bis 6 Kohlenstoffatomen, vorzugsweise neutral oder basisch und insbesondere bevorzugt Lysin, Arginin, Prolin, Asparagin oder Serin;
aa-2 kann eine aliphatische oder aromatische Aminosäure sein, insbesondere eine aliphatische Aminosäure mit, besonders bevorzugt, etwa 3 bis 6 Kohlenstoffatomen;
aa-3 kann eine aliphatische oder aromatische, insbesondere eine aliphatische, polare oder nicht-polare Aminosäure mit 2 bis 6, üblicherweise 2 bis 5 Kohlenstoffatomen sein, die im allgemeinen 0 bis 1 Hydroxygruppe aufweist;
aa-4 kann eine aliphatische, neutrale oder basische Aminosäure mit im allgemeinen 3 bis 6 Kohlenstoffatomen, üblicherweise 5 bis 6 Kohlenstoffatomen sein, wie insbesondere Asparagin, Prolin ode Lysin;
aa-5 kann eine aliphatische, insbesondere eine neutrale Aminosäure mit im allgemeinen 3 bis 6 Kohlenstoffatomen sein, insbesondere Valin oder Isoleucin;
aa-6 bedeutet eine neutrale oder saure Aminosäure, die, wenn es sich um eine aliphatische Aminosäure handelt, etwa 3 bis 6, insbesondere 4 bis 6 Kohlenstoffatome aufweist, vorzugsweise Isoleucin, Valin oder Asparaginsäure;
aa-7, aa-8, aa-9, aa-12, aa-14, aa-15, aa-16, aa-17, aa-19, aa-20, aa-21 und aa-23 sind polare oder nicht-polare, aliphatische Aminosäuren mit 3 bis 6 Kohlenstoffatomen, insbesondere polare Aminosäuren mit 0 bis 1 Hydroxysubstituenten, oder aromatische Aminosäuren;
aa-10 und aa-25 sind nicht-polare aliphatische Aminosäuren oder saure Aminosäuren mit 2 bis 6, insbesondere 2 bis 3 Kohlenstoffatomen;
aa-13, aa-22 und aa-24 sind polare aliphatische Aminosäuren oder saure Aminosäuren mit 4 bis 5 Kohlenstoffatomen, die insbesondere einen Carboxamido-Substituenten aufweisen;
aa-11 und aa-18 sind aliphatische, polare oder nicht-polare Aminosäuren oder saure Aminosäuren.
Von besonderem Interesse ist ein N-terminales Fragment
aus aa-1 bis aa-24 oder aa-1 bis aa-7, insbesondere aa-1
bis aa-6. pp¹′ kann zweckmäßigerweise eine nicht-verwandte
Aminosäuresequenz sein, die als Fusionsprotein dienen kann,
insbesondere um ein immunogenes Peptid zur Herstellung von
Anitkörpern gegen die Verbindung zur Verfügung zu stellen.
Der Hauptpunkt der erfindungsgemäßen Peptide ist die
Sequenz aa²⁵ bis aa⁴⁰, insbesondere die Sequenz von dem
Cystein in Position 28 bis zu dem Cystein in Position 37
und die Schleifen, die von den Cysteinen in Positionen 2
und 10 und den Cysteinen in Positionen 15 und 26 gebildet
werden. Es ist wünschenswert, daß die durch die Cysteine
in Positionen 28 und 37 gebildete Schleife in Verbindung
mit der Schleife vorliegt, die durch die Cysteine in
Positionen 15 und 26 gebildet wird.
Chimäre Polypeptidsequenzen kann man herstellen durch
Kombination von Fragmenten verschiedener Polypeptide, die
eine Sequenz besitzen, welche im wesentlichen den natürlich
vorkommenden Polypeptidketten ähnlich sind, die mit natürlich
vorkommenden Wachstumfaktoren und Poxvirus-Proteinen
assoziiert sind. Die erhaltenen chimären Polypeptide haben
etwa 40 bis 65 Aminosäuren, üblicherweise etwa 45 bis 60
Aminosäuren, insbesondere 49 bis 53 Aminosäuren. In jedem
Fall bleibt die Rahmenstruktur der Cysteine erhalten, wobei
die Cysteinbrücken Schleifen der zuvor beschriebenen Größe
definieren. Man kann demnach ein Fragment eines Wachstumsfaktors,
der im wesentlichen mit VGF (siehe beispielsweise
Fig. 1) homolog ist, oder einen anderen Wachstumsfaktor,
der die gleiche Rahmenstruktur wie die erfindungsgemäßen
Peptide und ähnliche physiologische Aktivität besitzt,
verwenden. Die Herkunft der Wachstumsfaktoren ist nicht auf
Säugetiere beschränkt, sie können vielmehr stammen von
Primaten, beispielsweise Menschen, Nagetieren, beispielsweise
Ratten und Mäusen, Rindern, Vögeln, Schweinen und dergleichen.
Bis zu drei Verbindungsstellen (junctures) können erforderlich
sein, je nach Herkunft der Fragmente und Länge des
gewünschten Polypeptids. Wünschenswerterweise erfolgen die
Verbindungen am gleichen Punkt zwischen aa-6 und aa¹;
aa¹¹ und aa¹⁵; aa²⁵ und aa²⁹; und aa⁴² und aa⁵³. Die
Sequenz zwischen etwa aa-6 und etwa aa¹⁵ wird als N-
terminale Sequenz bezeichnet; diejenige zwischen etwa aa¹⁴ und
etwa aa²⁹ wird als zentrales Fragment bezeichnet; und diejenige
zwischen etwa aa²⁵ und dem Ende des Peptids (im allgemeinen
aa⁴⁴ bis aa⁴⁷) wird als C-terminale Domäne bezeichnet.
Der exakte Verbindungspunkt kann in Abhängigkeit
von der Lokalisierung der Restriktionsstellen etc. variieren.
Zusätzlich kann eine extreme N-terminale Sequenz, die etwa
aa-24 bis aa-7, insbesondere aa-23 bis aa-7 umfaßt, mit
dem chimären Polypeptid verbunden werden. Die Fragmente
weisen im allgemeinen etwa 15 bis 50, üblicherweise 15 bis
45 Aminosäuren auf, da aa²⁰ nicht die 20. Aminosäure der
Verbindung, sondern lediglich die spezifische Sequenz
bezeichnet, die spezifisch definiert wurde (siehe Fig. 1).
Mehrere zweckmäßige Restriktionsstellen sind in den
synthetischen Genen vorgesehen, welche zur Konstruktion
der chimären Polypeptide verwendet werden. Soweit möglich,
lassen die Restriktionsstellen die Aminosäuresequenzen des
Wachstumsfaktorgens unverändert. In einigen Fällen jedoch
ergibt die Inkorporation einer neuen Restriktionsstelle
eine geänderte Aminosäuresequenz. Von besonderem Interesse
ist es, wenn die für VGF kodierende Sequenz modifiziert
wird, um eine KpnI-Restriktionsstelle einzuführen, und zwar
durch Veränderung der Aminosäuresequenz bei aa¹³ bis aa¹⁵
von GDC zu GTC und um eine Sph I-Stelle bei aa²³ bis aa²⁸
einzuführen durch Veränderung der Sequenz GMYCRC zu
GYACVC. Diese Veränderungen ergeben zweckmäßige Stellen,
um Fragmente des VGF-Gens mit Fragmenten aus anderen Wachstumsfaktoren
zu verknüpfen. Beispielsweise kann das Genfragment
aa²⁶ bis aa⁴⁷ zweckmäßig mit einem Genfragment
aus Aminosäuren, die für α-TGF kodieren, entsprechend
den Resten aa-6 bis aa²⁵, verbunden werden, um ein TGF/VGF-
Hybridpolypeptid zu produzieren. Die Sequenz des chimären
Peptids umfaßt demnach aa-6 bis aa¹³ (N-Terminus) und
aa¹⁴ bis aa²⁵ (Zentralfragment), abgeleitet von α-TGF,
und aa²⁶ bis aa⁴⁷ (C-Terminus) abgeleitet von VGF und
modifiziert wie oben angegeben.
Die Herstellung von Plasmiden, welche in der Lage sind,
chimäre Proteine mit Aminosäuresequenzen zu exprimieren,
die von Fragmenten aus mehr als einem Wachstumsfaktor oder
Poxvirus-Polypeptid mit Sequenzänderungen soweit erforderlich,
um eine zweckmäßige Restriktionsstelle einzuführen,
abgeleitet sind, sind näher im experimentellen Teil beschrieben.
Fusionsproteine kann man ebenfalls herstellen, wenn ein
Wachstumsfaktor oder ein chimäres Polypeptid, gebunden
an die N-terminale Aminosäure einer Signalsequenz oder
die N-terminale Aminosäure eines exprimierten Bakterien-,
Bakteriophagen- oder eukaryontischen Gens, exprimiert wird.
Zusätzlich kann man eine enzymatische oder chemische
Spaltungsstelle im Anschluß an die Leadersequenz vorsehen,
um eine Spaltung des reifen Polypeptids von der
Leadersequenz zu ermöglichen. Die Herstellung von Plasmiden,
welche in der Lage sind, diese Fusionspolypeptide zu
exprimieren, sowie Verfahren zur Abspaltung und Isolierung
der gewünschten Polypeptide sind im experimentellen
Teil näher beschrieben.
Die erfindungsgemäßen Polypeptide und Zusammensetzungen kann
man auf verschiedene Weise je nach ihrer Größe herstellen.
Wenn die Peptide insbesondere weniger als etwa 80, und ganz
besonders weniger als etwa 60 Aminosäuren umfassen, können
sie nach üblichen Synthesen hergestellt werden, siehe
beispielsweise Merrifield, Solid-Phase Peptide Synthesis,
"The Peptides Analysis, Synthesis Biology", Special Methods
in Peptide Synthesis, Part A. , Vol. 2, Gross und Meinhofer
(Hrsg. Academic Press, NY, 1980, Seiten 1-284, sowie US-PS
41 27 526.
Alternativ kann man Hybrid-DNA-Technologien anwenden, wenn
DNA-Sequenzen benutzt werden können, die für das gewünschte
Polypeptid oder einen Prekursor davon kodieren. DNA-
Sequenzen, die für den gewünschten Wachstumsfaktor kodieren,
können unter Anwendung herkömmlicher Techniken synthetisiert
werden, beispielsweise mittels überlappender Einzelstränge,
die ligiert werden können, um die gewünschte Kodierungssequenz
zu bilden. Die Termini kann man so vorsehen, daß sie
Restriktionsstellen bilden oder ein Terminus oder beide
Termini können zur Ligierung an komplementäre Enden eines
Expressionsvektors stumpf sein (blunt-ended). Zur Expression
der Sequenz ist ein Initial-Methionin vorgesehen. Geeignete
Expressionsvektoren stehen im allgemeinen zur Verfügung und
sind zahlreich in der Literatur beschrieben.
Anstatt das gewünschte Gen zu synthetisieren, kann das
Wachstumsfaktorgen auch anhand von verschiedenen Techniken
isoliert werden. Wenn der Wachstumsfaktor beispielsweise
ein viraler Wachstumsfaktor ist, kann die für das Polypeptid
einschließlich des Wachstumsfaktors kodierende mRNA aus dem
Virus isoliert, die mRNA revers transkribiert, die erhaltene
Einzelstrang-(ss)-DNA als Templat zur Herstellung einer
Doppelstrang(ds)-DNA verwendet und das ds-DNA-Gen isoliert
werden. Eine weitere Technik besteht darin, ein Stück der
viralen DNA zu isolieren und unter Verwendung einer in geeigneter
Weise deqentierten Sonde, welche eine Region der
am besten konservierten Sequenzen in einem Wachstumsfaktorgen
umfaßt, die Sequenzen zu identifizieren, die für einen
Faktor im viralen Genom kodieren. Die Sonde kann beträchtlich
kürzer als die vollständige Sequenz sein, sie sollte aber
eine Länge von wenigstens 10, vorzugsweise wenigstens 14 und
insbesondere bevorzugt wenigstens 20 Nukleotide aufweisen.
Längere Oligonukleotide bis zur vollen Länge des Wachstumsfaktorgens
sind ebenfalls brauchbar. Man kann DNA-
und RNA-Sonden verwenden.
Zur Anwendung werden die Sonden in typischer und detektierbarer
Weise markiert (beispielsweise mit ³²P oder biotinylierten
Nukleotiden) und mit einer Einzelstrang-DNA
oder RNA aus dem Organismus, in welchem das Gen gesucht
wird, inkubiert. Eine Hydridisierung wird mit Hilfe der
markierten Sonden detektiert, nachdem die Einzelstrang-
und Doppelstrang (hybridisiert)-DNA (oder DNA/RNA) getrennt
wurden, beispielsweise unter Verwendung von Nitrocellulosepapier.
Für den Gebrauch mit Oligonukleotiden geeignete
Hybridisierungstechniken sind dem Fachmann bekannt.
Obwohl die Sonden üblicherweise mit einer detektierbaren
Markierung verwendet werden, die eine leichte Identifizierung
ermöglicht, sind auch unmarkierte Oligonukleotide brauchbar,
und zwar sowohl als Prekursoren markierter Sonden als
auch zur Anwendung bei Methoden, die eine direkte
Detektion der Doppelstrang-DNA (oder DNA/RNA) ermöglichen.
Der Ausdruck "Oligonukleotide" umfaßt daher sowohl markierte
als auch unmarkierte Formen.
Nachdem man die gewünschte DNA-Sequenz erhalten hat, kann
man sie dann auf verschiedene Weise manipulieren und für
die Expression vorsehen; beispielsweise kann man chimäre
Polypeptidsequenzen herstellen durch Kombination von Genfragmenten
aus wenigstens zwei Polypeptiden, die Sequenzen aufweisen,
die zu wenigstens 30% mit natürlich vorkommenden Wachstumsfaktoren,
welche an den EGF-Rezeptor ("natürliche
Liganden") binden, homolog sind. Es ist besonders wünschenswert,
daß die dreidimensionale Struktur, insbesondere
die Struktur der Schleifen des Polypeptids erhalten
bleibt, insbesondere derjenige Teil (oder diejenigen Teile)
der Struktur, der für die Bindung an den EGF-Rezeptor
und für die biologische Aktivität der natürlich vorkommenden
Wachstumsfaktoren, welche an den EGF-Rezeptor
binden, verantwortlich ist.
Je nach Herkunft der Fragmente und Länge des gewünschten
Polypeptids kann man in den synthetischen Genen, welche
zur Konstruktion der chimären Polypeptide wie oben beschrieben
verwendet werden, zweckmäßige Restriktionsstellen
vorsehen. Soweit möglich, läßt (lassen) die
Restriktionsstelle(n) die Aminosäuresequenzen des Polypeptids
unverändert. In einigen Fällen jedoch kann die
Inkorporation einer neuen Restriktionsstelle (oder neuere
Restriktionsstellen) zu einer geänderten Aminosäuresequenz
ohne Veränderung der Aktivität des Proteins führen.
Wenn das Gen in einem Wirt exprimiert werden soll, welcher
die Wildtyp-transkriptionalen und translationalen Regulatorregionen
des Wachstumsfaktors erkennt, kann das gesamte
Gen mit seinen Wildtyp-5′- und 3′-Regulatorregionen in
einen geeigneten Expressionsvektor eingeführt werden.
Es existieren zahlreiche Expressionsvektoren
die von Replikationssystemen von Säugetierviren, wie
Simian Virus 40, Adenovirus, Bovin-papilloma-Virus,
Vaccinia-Virus, Insektenbaculovirus etc. Gebrauch machen. Diese
Replikationssysteme sind entwickelt worden, um Marker
zur Verfügung zu stellen, welche die Selektion von
Transfektanten ermöglichen und zweckmäßige Restriktionsstellen
zur Verfügung stellen, in welche das Gen insertiert
werden kann.
Wenn das Gen in einem Wirt exprimiert werden soll, welcher
die natürlich vorkommenden Wildtyp-transkriptionalen und
translationalen Regulatorregionen nicht erkennt, sind
weitere Manipulationen erforderlich. Eine Vielzahl von
3′-transkriptionalen Regulatorregionen sind bekannt und
können abwärts von den Stopkodons insertiert werden. Die
nicht-kodierende 5′-Region aufwärts vom gewünschten Gen
kann durch Endonukleaserestriktion, Ba131-Resektion oder
dergleichen entfernt werden. Wenn eine zweckmäßige
Restriktionsstelle nahe des 5′-Terminus des gewünschten Gens
vorliegt, kann man dieses alternativ einer Restriktion
unterziehen und einen Adaptor zur Verknüpfung des gewünschten
Gens an die Promotorregion verwenden, wenn der
Adaptor die verlorenen Nukleotide des gewünschten Gens
bereitstellt. Man kann verschiedene Strategien verfolgen,
um eine Expressionskassette zur Verfügung zu stellen,
die in der 5′-3′-richtung der
Transkription eine Transkriptions-Regulatorregion und
eine Translations-Initiator-Region, die auch Regulatorsequenzen
zur Induzierung der Regulation aufweisen kann;
das gewünschte Gen unter der Transkriptions- und Translations-
Kontrolle der Initiatorregion; und eine die Transkription
und Translation beendete Region umfaßt.
Die Wahl geeigneter Regulatorsequenzen muß die folgenden
Faktoren, welche die Expression beeinflußen, berücksichtigen.
Bei der Transkriptions-Regulierung sind die Menge und
die Stabilität der Messenger-RNA wichtige Faktoren, welche
die Expression der Genprodukte beeinflussen. Die Menge an
mRNA wird bestimmt durch die Kopienzahl des betreffenden
Gens, die relative Effizienz ihres Promotors und die
Faktoren, welche den Promotor regulieren, wie Enhancer
oder Repressoren. Man nimmt an, daß die Initiierung in der
Region erfolgt, die unmittelbar aufwärts vom Beginn der
Kodierungssequenz liegt.
Der Promotor in prokaryontischen Zellen umfaßt Nukleotidsequenzen,
die die Effiezienz der Transkription beeinflussen
können. Die Sequenzen beinhalten die Regulatorregionen
bei etwa -35 und -10 Nukleotiden vom Start der DNA-Kette.
Effiziente Promotoren sind solche, bei denen die Nukleotidsequenz
der -35 und -10-Regulatorregionen im wesentlichen
gleich ist mit den Konsensussequenzen dieser Regionen
in bakteriellen Promotoren aus sehr effizienten Genen.
Im allgemeinen beträgt die Länge dieser Regionen etwa
5 Nukleotide bzw. 6 Nukleotide und jede Sequenz kann um
etwa 1 Nukleotid in der Länge und/oder in der Sequenz
variieren. Eine bevorzugte Sequenz für die -35-Konsensus-
Regulatorsequenz stammt vom trp-Promotor, nämlich TGACA,
und eine bevorzugte Sequenz für die -10-Konsensus-
Regulatorsequenz stammt vom lac-Promotor, nämlich TATAAT.
Nicht nur die Nukleotidsequenzen, sondern auch der Abstand
der Konsenussequenzen der -35 und -10-Regulatorregionen
zueinander ist wichtig für die Erzielung optimaler
Transkription des gewünschten Gens. Im allgemeinen sind
die Konsensussequenzen der -35 und -10-Regulatorregionen
durch etwa 16 bis 18 Nukleotide, vorzugsweise durch etwa
17 Nukleotide, getrennt. Jede Sequenz kann um etwa 1 Nukleotid
variieren.
Geeignete Beispiele für Transkriptions-Regulatorregionen oder
Promotoren sind für Bakterien der β-gal-Promotor,
der linke und rechte λ-Promotor, trp- und lac-Promotor,
trp-lac-Fusionspromotor, etc. Synthetische Promotoren mit
Sequenzen, die diesen Sequenzen im wesentlichen ähnlich
sind, können ebenfalls Anwendung finden. Ein bevorzugter
Promotor für Bakterien ist ein Fusionspromotor, der die
-35-Regulatorregion des trp-Promotors und die -10-Regulatorregion
des lac-Promotors umfaßt. Bei dem am stärksten
bevorzugten Promotor ist die -35-trp-Konsensussequenz etwa
17 Nukleotide aufwärts von der -10-lac-Konsensussequenz
lokalisiert. Beispiele bei Hefen sind glykolytische Enzym-
Promotoren, wie ADH-I- und II-Promotoren, GPK-Promotor
und PGI-Promotor, trp-Promotor etc. Beispiele bei Säugetierzellen
sind SV40-early und late-Promotoren, Adenovirus-
major-late-Promotoren, I5-Promotor, oder Enhancersequenzen
und dergleichen.
Die Transkriptions-Regulatorregion kann zusätzlich
Regulatorsequenzen umfassen, welche eine Modulierung der
Expressionszeit des gewünschten Gens ermöglichen, beispielsweise
durch Anwesenheit oder durch Fehlen von Nährstoffen
oder Expressionsprodukten im Nährmedium, Temperatur und
dergleichen. Die Expression des gewünschten Gens kann beispielsweise
durch die Temperatur des Wachstumsmediums für
den Wirt, durch Anwendung einer Regulatorsequenz, umfassend
den Bakteriophase-λ-PL-Promotor, den Bakteriophage-λ-
OL-Operator und das Gen CI857, das für den temperaturempfindlichen
CI-Repressor im Expressionsvektor kodiert,
reguliert werden. Dies ermöglicht die Regulierung des
Promotors durch Wechselwirkung zwischen dem Repressor
und dem Operator bei niedrigen Temperaturen, beispielsweise
etwa 30°C. Eine Erhöhung der Temperatur auf etwa 42°C würde
den Repressor inaktivieren und die Expression des gewünschten
Gens ermöglichen.
Zu einem Beispiel für eine Modulierung unter Anwendung von
Wachstumsnährmedien zählt die Regulierung des lac- oder
des trp-lac-Hybridpromotors, die durch Verwendung des Gens
für den LacI-Repressors erfolgen kann, welcher an die
lac-Promotorregion abwärts von der -10-Regulatorregion
bindet. Das LacI-Repressorgen kann auf einem Episom, vorzugsweise
dem LacI-enhanced Mutanten vorliegen oder es kann
sich in der Expressionskassette selbst befinden. Das Vorliegen
einer signifikanten Konzentration des Repressormoleküls
im Wachstummedium inhibiert die Promotorfunktion
in Abwesenheit von Induktoren. Die Zugabe von IPTG oder
Lactose zu dem Zellwachstumsmedium des Wirts verstärkt demnach
die Promotorfunktion. Bei Verwendung des Bakterienstammes
Lac⁺ kann man Lactose als Induktor anstelle von
IPTG verwenden. In eukaryontischen und prokaryontischen
Systemen können die Terminationsregionen auch Sequenzen
oder Strukturen enthalten, welche die Stabilität der
mRNA-Spezies erhöhen und eine bessere Expression ermöglichen.
Die transkriptionale Regulatorregion kann demnach zusätzlich
Regulatorsequenzen enthalten, die die Transkription
beenden und Sequenzen oder Strukturen zur Verfügung
stellen, welche den Abbau der mRNA inhibieren und somit
die Stabilität der mRNA-Spezies erhöhen und eine bessere
Expression ermöglichen. Mehrere Beispiele prokaryontischer
Sequenzen sind bekannt, beispielsweise der Trp-Terminator,
der Gen 32(T4)-Terminator, oder synthetische Terminatoren,
deren Sequenz dem Gen 32 ähnlich ist.
In eukaryontischen Systemen sorgen die transkriptionalen
Terminations-, RNA- Spaltungs- und Polyadenylierungs-
Regionen für die Reifung der mRNA-Transkripte und sind
für eine effiziente Expression erforderlich. Die native
3′-untranslatierte Region kann genügen; das Polyadenylierungssignal
von beispielsweise SV40, das insbesondere eine
Spleißstelle enthält, welche zu einer effizienteren
Expression führt, kann ebenfalls verwendet werden. Alternativ
kann die 3′-untranslatierte Region, die sich von
einem in einem bestimmten Zelltyp (z. B. Ig in Myelomzellen)
stark exprimierten Gen ableitet, mit dem gewünschten
Gen fusioniert werden. Derartige 3′-Sequenzen
können auch mit den 5′-Regulatorsequenzen des gleichen
hoch-exprimierten Gens gepaart werden und sie können sogar
kodierende Regionen im Leserahmen umfassen, um Fusionsproteine
wie unten beschrieben zu erzeugen.
Vom Standpunkt der Translations-Regulierung unter Anwesenheit
von mRNA kann die Expression durch Beeinflussung
der Initiationsrate (Ribosomenbindung an die mRNA), der
Elongationsrate (Translokation der Ribosomen über die
mRNA), der Rate der post-translationalen Modifikationen
und der Stabilität des Genproduktes reguliert werden.
Die Elongationsrate wird wahrscheinlich durch die Verwendung
von Kodons beeinflußt. Die Verwendung von Kodons
für seltene tRNA's kann die Translationsrate reduzieren.
Vorzugsweise verwendet man daher Kodons, die häufig in
Genen vorkommen, welche üblicherweise durch die Wirtszelle
exprimiert werden, um die Translationsrate zu erhöhen.
Bei Prokaryonten liegt abwärts von den -35 und -10-
Regulatorregionen eine Konsensus-Nukleotidsequenz vor, im
allgemeinen AGGA und als Shine-Dalgarno-Sequenz bezeichnet,
von der man annimmt, daß sie an der ribosomalen Bindung
beteiligt
ist. Das Optimum der ribosomalen Bindung und die
Initiierung der Translation kann durch Verwendung einer
Ribosomen-Bindungsstelle erreicht werden, die in der Wirtszelle
für ein hoch-exprimiertes Gen in Funktion tritt.
Es liegen auch Anzeichen für die Anwesenheit von Nukleotidsequenzen,
welche die Shine-Dalgarno-Sequenz umgeben, und
Sequenzen innerhalb der Kodierungsregion vor, welche die
Ribosomenbindung beeinflussen können, möglicherweise durch
die Bildung von Struktureinheiten, durch welche das
Ribosum die Initiierungsstelle erkennt. Die Veränderung
der Nukleotidsequenzen der Kodierungsregion kann daher
dazu benutzt werden, eine optimale Bindung und Initiierung
der Translation zu erreichen. Die Sequenz der ersten etwa
7 bis 30 Kodons nach dem Initiierungskodon ATG kann auch
die Bindung und Expression beeinflussen. Vorzugsweise erhält
man die Leadersequenz und die Shine-Dalgarno-Sequenz
vom gleichen Gen oder man kann, wenn sie von verschiedenen
Genen erhalten worden sind, die Kodons der Leadersequenz
modifizieren, z. B. durch Degenerierung der Kodons
um die Nukleotidsequenz des natürlichen Gens, das der
Leadersequenz folgt, zu approximieren.
Die Position der AGGA-Sequenz in bezug auf das Initiierungs-
ATG-Kodon kann die Expression beeinflussen. Im allgemeinen
ist die Shine-Dalgarno-Sequenz etwa 5 bis 9 Nukleotide
vom Initiierungskodon lokalisiert. Es ist jedoch auch unerwarteterweise
eine hohe Expression unter Verwendung von
Expressionskassetten zu erzielen, wobei die Shine-
Dalgarno-Sequenz etwa 10 bis 13 Nukleotide, vorzugsweise
11 bis 12 Nukleotide, vom Initiierungskodon lokalisiert
ist.
Die Stabilität der mRNA wird bestimmt durch die Empfindlichkeit
der mRNA gegenüber Ribonuklease-Enzymen. Im
allgemeinen wird eine Exonukleaseverdauung durch die Anwesenheit
struktureller Einheiten an den Enden der mRNA-,
Palindrom-Strukturen, veränderten Nukleotiden oder
spezifischen Nukleotiden
verhindert. Man nimmt an, daß die Endonuklease-Verdauung
an spezifischen Erkennungsstellen innerhalb der mRNA
erfolgt und daß eine stabile mRNA diese Stellen nicht aufweist.
Es gibt auch Hinweise, daß mRNA's mit hoher
Translation auch durch die Anwesenheit von Ribosomen auf
der mRNA vor Abbau geschützt werden.
Die Stabilität des Expressionsproduktes kann erreicht
werden, indem man ein Fusionsprotein synthetisiert, in
welchem das gewünschte Polypeptid in Verbindung mit einem
zweiten Polypeptid oder Fragment davon exprimiert wird.
Vorzugsweise erreicht man die Stabilität des Expressionsproduktes,
indem man ein Fusionsprotein synthetisiert, in
welchem das gewünschte Polypeptid an eine Leadersequenz
gebunden exprimiert wird. Eine für eine N-terminale Aminosäuresequenz
kodierende DNA-Sequenz von einem hoch
exprimierten Bakterien- oder Bakteriophagen-Gen, wie dem
Bakteriophagen-λ-N-Proteingen, cro-Gen oder β-Galactosidase-
oder einem eukaryontischen Gen, wird aufwärts und
im Leserahmen mit dem gewünschten Gen verbunden. Die
Leadersequenz umfaßt üblicherweise etwa 8 bis etwa 50, vorzugsweise
etwa 15 bis etwa 45, insbesondere 18 bis 25, N-
terminale Aminosäuren.
Die Expression des gewünschten Polypeptides als Fusionsprotein
mit einer Leadersequenz von einem anderen Gen hat
mehrere Vorteile, neben der Tatsache, daß dem Expressionsprodukt
Stabilität verliehen wird. Die Anwesenheit der
N-terminalen Aminosäuren ermöglicht beispielsweise die
Anwendung üblicher Reinigungstechniken zur Reinigung jedes
Polypeptides. Die N-terminalen Aminosäuren besitzen beispielsweise
besondere antigene Eigenschaften und die
spezifischen Antikörper gegen die N-terminalen Aminosäuren
des N-Proteins kann man daher als Mittel zur Reinigung der
Fusionsproteine, die den N-Terminus des N-Proteins enthalten,
benutzen. Darüber hinaus hat der N-Terminus des
N-Proteins eine stark positive Ladung, was die Reinigung
des gewünschten Proteins durch Ionenaustausch-Chromatographie
und dergleichen erleichtert.
Die Leadersequenz kann auch eine hydrophobe Aminosäuresequenz
sein, die zusätzlich als Signalsequenz für die
Sekretion wirken kann. Eine für die Signalsequenz kodierende
DNA-Sequenz wird aufwärts und im Leserahmen mit dem gewünschten
Gen verbunden. Üblicherweise umfaßt die Signalsequenz
eine Spaltungsstellen, die durch eine Signalsequenz-
Peptidase erkannt wird. Die Anordnung des gewünschten Polypeptids
unmittelbar nach der Signalsequenz-Spaltungsstelle
ermöglicht es daher, das gewünschte Polypeptid
spezifisch von der Signalsequenz abzuspalten und als reifes
Polypeptid zu sekretieren. Beispiele hydrophober Aminosäure-
Sequenzen sind die bakterielle alkalische Phosphatase-
Signalsequenz; die OMP-A-B-C-D-E- oder F-Signal-Sequenzen,
die LPP-Signalsequenz, β-Lactamase-Signalsequenz; und
Toxin-Signalsequenzen und Mutanten davon. Bei eukaryontischen
Zellen können die Signalsequenzen auch die Signalsequenzen
von Simian-TGF-β, P97-Gen (Human-Melanom-Antigen),
K. lactis-Killertoxinsequenz, α-mating type-Faktor und
andere Killertoxin-Signalsequenzen oder die normale
Signalsequenz, welche mit dem gewünschten Gen assoziiert
ist, zusammen mit den Mutanten der Signalsequenzen umfassen.
Andere brauchbare Leadersequenzen sind hydrophile Sequenzen,
beispielsweise die N-terminalen 41-Aminosäurereste des
Amphiregulins, die für die Modifikation der Funktion des
gewünschten Polypeptids sorgen. Zusätzlich kann ein
cytotoxisches Mittel, wie ein Toxin A-Kettenfragment,
Ricin-A-Kette, das die Bildung des Schlangengifts verhindernde
Peptid (snake venow growth arresting peptide) oder ein Targetmolekül, wie ein Hormon oder Antikörper,
kovalent mit der Leadersequenz verbunden werden,
wobei in den meisten Fällen nur ein minimaler Effekt auf
die biologische Aktivität des gewünschten Genproduktes
zu beobachten ist. Wie für die anderen Leadersequenzen
beschrieben, wird eine für die Leadersequenz kodierende
DNA-Sequenz aufwärts von und im Leserahmen mit den gewünschten
Gen verbunden.
Wenn die Leadersequenz keine Signalsequenz ist oder keine
natürliche Spaltungsstelle enthält, kann man zusätzliche
Aminosäuren insertieren, um eine enzymatische oder chemische
Spaltungsstelle für die Abspaltung des Leaderpeptids nach der
Reinigung des Fusionsproteins zur Verfügung stellen, so
daß das maturierte Polypeptid anschließend gereinigt werden
kann. Beispielsweise erleichtert die Einführung der säurelabilen
Aspartyl-Prolin-Brücken zwischen den zwei Segmenten
des Fusionsproteins ihre Abtrennung bei niedrigem pH-Wert.
Diese Methode ist nicht geeignet, wenn das gewünschte
Polypeptid säure-labil ist. Weiterhin kann man das Fusionsprotein
beispielsweise mit Cyanogenbromid, das spezifisch
auf die Carboxygruppen der Methioninreste ist, abspalten.
Die Anordnung eines Methionins zwischen der Leadersequenz
und dem gewünschten Polypeptid ermöglicht die Freisetzung
des gewünschten Polypeptides. Diese Methode ist nicht
geeignet, wenn das gewünschte Polypeptid Methioninreste
enthält.
Wenn die Leadersequenz eine Signalsequenz umfaßt, kann man
die gewünschten Gene mit Sekretions-Leadersequenzen mit
oder ohne die Leadersequenz so exprimieren, daß die
Sequenz erhalten bleibt oder gespalten wird. Um zusätzlich
einen hohen Anteil des gewünschten Polypeptids als
reifes, gespaltenes und wiedergefaltetes, in das Medium
sekretiertes Peptid zu erhalten, ist es bevorzugt, einen
Promotor anzuwenden, wie den pac-Promotor, der bei niedriger
Temperatur, beispielsweise bei etwa 30°C, wirkt. Unerwarteterweise
kann bei niedrigen Temperaturen eine hohe
Sekretion erzielt werden. Eine äußerst hohe Expression
kann die vollständige translationale Modifikation des Proteins
verhindern, was zu einer Aggregation und Akkumulierung
des ungespaltenen Prekursors (d. h. Strukturprotein und
Sekretorleader) führt. In ähnlicher Weise führt ein Wachstum
bei erhöhten Temperaturen, beispielsweise 42°C, ebenfalls
zu Aggregation und Akkumulation des ungespaltenen
Prekursors.
Die Herstellung von Fusionsproteinen mit Methoden zur
Spaltung und Wiederfaltung der gewünschten Polypeptide ist
näher in der bereits oben erwähnten US-Anmeldung 2 64 098
(PCT/US 88/03 972) beschrieben.
Nach jeder DNA-Manipulation bei der Einwirkung der
Kassette, wird das Plasmid geklont und isoliert. Soweit
erforderlich, wird die jeweilige Kassettenkomponente auf
ihre Sequenz analysiert, um sicherzustellen, daß die
richtige Sequenz erhalten worden ist. Je nach Art der
Manipulation kann die gewünschte Sequenz aus dem Plasmid
herausgeschnitten und in einen anderen Vektor eingeführt
werden, oder das Plasmid kann einer Restriktion unterworfen
werden und die Expressionskassettenkomponente kann entsprechend
manipuliert werden. In einigen Fällen wird ein
Shuttle-Vektor benutzt, dann nämlich, wenn der Vektor zur
Replikation in anderen Wirten, die unterschiedliche
Replikationssysteme erfordern, in der Lage ist. Dies kann
gegebenenfalls weitere Marker erfordern, welche in den beiden
Wirten ihre Funktionalität entfalten. Wenn derartige Marker
erforderlich sind, können sie im Vektor enthalten sein.
Das die Kassette enthaltende Plasmid, zwei Replikationssysteme
und der (die) Marker können nach Bedarf von einem
Wirt in den anderen transferiert werden. Für die Selektion
kann man jeden brauchbaren Marker verwenden. Zweckmäßigerweise
ist eine Restistenz gegenüber Neomycin oder
Tetramycin erwünscht. Obwohl jedoch ein Selektionsmarker
besonders zweckmäßig ist, kann man auch andere Screening-
Verfahren für transformierte Zellen einsetzen, siehe
G. Reipin et al., Current Genectics, 1982, 189-193.
Transformierte Zellen kann man auch mittels der von ihnen
produzierten spezifischen Produkte screenen, beispielsweise
kann die Synthese des gewünschten Produkts durch immunologische
oder enzymatische Methoden bestimmt werden.
Die Expressionskassette kann innerhalb eines Replikationssystems
für den Episomenerhalt in einer geeigneten Wirtszelle
enthalten sein. Sie kann auch ohne ein Replikationssystem
vorliegen, wobei sie in das Wirtsgenom integriert
werden kann. Die DNA kann in den Wirt anhand bekannter
Techniken eingeführt werden, wie durch Transformation unter
Verwendung von Calciumphosphat-gefällter DNA, Transfektion
durch Kontaktieren der Zellen mit dem Virus, Mikroinjektion
der DNA in Zellen oder dergleichen. Sobald das
gewünschte Gen in einen geeigneten Wirt eingeführt ist,
kann man den Wirt zur Expression des gewünschten Gens
kultivieren.
Eine Vielzahl von Wirtszellen kann verwendet werden. Beispiele
prokaryontischer Wirtszellen sind gram-negative
Organismen, wie E. Coli, beispielsweise, JM109, JM101
und JM107; HB101, DH1 oder DH5. Besonders geeignet sind
gram-positive Organismen, wie B. Subtilis, welche keinen
periplasmatischen Raum besitzen und die Polypeptide direkt
in das Wachstumsmedium sekretieren können. Zu eukaryontischen
Wirtszellen zählen Hefezellen, Insektenzellen und Säugetierzellen,
beispielsweise COS-Zellen, CHO-Zellen, Affennierenzellen
und Seidenraupenzellen (sf9).
Das Konstrukt, das das gewünschte Gen und die für die
Regulierung der Expression sorgenden flankierenden Regionen
enthalten, kann man anhand geeigneter Methoden einführen,
beispielsweise durch Transformation mit z. B. Calciumphosphatgefällter
DNA, Transfektion, Transduktion, Konjugation,
Mikroinjektion etc. Man kann den Wirt dann in einem geeigneten
Nährmedium kultivieren, bis er in großer Menge
vorliegt. Wenn der Promotor nicht induzierbar ist, kann man
permissive Bedingungen anwenden, beispielsweise eine Veränderung
der Temperatur, den Verbrauch eines metabolitischen
Produktes oder Nährmittels oder deren Anwendung im Überschuß
und dergleichen.
Wenn die Regulatorsequenz beispielsweise den Bakteriophage-
λ-PL-Promotor, den Bakteriophage-λ-OL-Operator und den
CI857-temperaturempfindlichen Repressor umfaßt, kann man
die Wirtszellen bei permissiven Temperaturen, im allgemeinen
bei etwa 30°C kultivieren, wobei die Transkription aus dem
PL-Promotor reprimiert wird und die Wirtszellen ungehindert
durch die Synthese des Fremdgenproduktes, die zusätzlich
toxisch gegenüber dem Wirtsorganismus sein können, wachsen
können. Wenn die Wirtszellen die optimale Dichte erreicht
haben, kann man die Temperatur erhöhen, beispielsweise
auf etwa 42°C, wobei der CI-Repressor inaktiviert wird,
so daß die Transkription aus dem PL-Promotor ermöglicht
wird. Maximale Sekretion erhält man durch Anwendung des
lac-Promotors oder eines trp-lac-Promotors und durch
Induktion mit einem metabolitischen Induktor, wie Lactose,
für einen lac⁺-Wirtsstamm und indem man lac Iq auf einem
Vektor vorsieht. Beispiele für Wirtszellen, die mit einem
derartigen System verwendet werden können, sind DH1, DH5
oder HB101.
Wenn das Produkt in der Wirtszelle erhalten bleibt, werden
diese Zellen geernet, lysiert und das Produkt wird isoliert
und durch Extraktion, Prezipitation, Chromatographie,
Elektrophorese und dergleichen gereinigt. Wenn das Produkt
sekretiert ist, wird das Nährmedium gesammelt und das
Produkt wird mittels üblicher Methoden beispielsweise durch
Affinitätschromatographie, isoliert. Um ein aktives Protein
zu produzieren, kann es erforderlich sein, dem Protein die
Wiederfaltung zu ermöglichen. Wenn das Protein als Fusionsprotein
mit der Leadersequenz exprimiert wird, kann die
Leadersequenz durch Behandlung mit beispielsweise Ameisensäure
oder Cyanogenbromid entfernt werden. Die Leadersequenz
wird vorzugsweise nach Wiederfaltung des Proteins
entfernt.
Die rekombinanten Produkte können glykosiliert (Wildtyp-
Glykosierung oder eine andere Glykosilierung) oder nichtglykosiliert
sein. Die Glykosilierung unterscheidet sich
im allgemeinen um nicht mehr als etwa 50%, üblicherweise
nicht mehr als etwa 20%, von der Wildtyp-Glykosilierung.
Das Ausmaß der Glykosilierung hängt ab sowohl von der
Sequenz des betreffenden Peptids als auch von dem Organismus,
in welchem es produziert wurde. Die Expression des Produktes
in E. coli-Zellen führt demnach zu einem unglykosilierten
Produkt und die Expression des Produktes in Insektenzellen
führt demnach im allgemeinen zu einem Produkt mit geringerer
Glykosilierung als die Expression in Säugetierzellen.
Die erfindungsgemäßen Peptide finden breite Anwendung in
vitro und in vivo als Agonisten oder Antagonisten für Wachstumsfaktoren,
wie den epidermalen Wachstumsfaktor (EGF)
und transforming-Wachstumsfaktor, insbesondere α-TGF. Die
Verwendung der Wachstumsfaktoren per se oder in Kombination
mit anderen Mitteln, insbesondere Polypeptiden, zur
Regulierung des Zellwachstums und für andere Aktivitäten
ist beispielsweise in Handbook of Experimental Pharmacology,
Tissue Growth Factors, Hrsg. Baseraga, Bd. 57,
Springer-Verlag, Berlin, 1981, Kap. 3, insbesondere S. 98-
109, und Carpenter, Ann. Rev. Biochem. (1979) 48 : 193-216
beschrieben.
Human-EGF scheint mit Human-Urogastron identisch zu sein
und übt mehrere Effekte auf das prenatale und neonatale
Gewebewachstum aus. Zu diesen Effekten zählen das vorzeitige
Öffnen der Augen, Wundheilung, das Durchbrechen
der Schneidzähne und die beschleunigte Reifung der Lunge.
EGF-Rezeptoren finden sich bei vielen Geweben der Erwachsenen.
Es wurde gefunden, daß EGF die Phosphorylierung
seines eigenen Rezeptors stimuliert und außerdem mit der
verstärkten Knochenresorption in Zusammenhang steht.
Der Transforming-Wachstumsfaktor, insbesondere α-TGF, besitzt
viele Aktivitäten, die denjenigen des EGF analog
sind. TGF bindet an den EGF-Rezeptor, was zur Phosphorylierung
des Rezeptors, Verstärkung der Tyrosin-spezifischen
Kinaseaktivität und Stimulierung des Zellwachstums führt,
siehe Cohon in Biological Response Mediators und
Modulators (Hrsg. August J. T.), Academic, New York,
1983 S. 7-12; Tam et al., Nature (1984) 309 : 376-378;
Ibbotson et al., Science (1983) 221 : 1292-1294.
Myxoma- und Shope Fibroma-Viren induzieren eine signifikante
Erhöhung des proliferativen Potentials von Zellen in dem
befallenden Gebiet. Während Vaccinia-Viren nur zu geringer
Proliferation an der Infektionsstelle führen, induzieren
Shope-Fibroma-Viren eine starke Proliferation, so daß es
zur Tumorbildung kommt, die bei erwachsenen Kaninchen gutartig
ist, bei immunsupprimierten Erwachsenen oder Neugeborenen
aber proliferativ und invasiv ist. Myxoma-Viren
induzieren einen sich rasch disseminierenden Myxosarkoma-
Tumor. Obwohl diese Proliferation auch anderen viralen
Faktoren zugeschrieben werden könnte, scheinen die viralen
Wachstumsfaktoren an der durch eine Virusinfektion induzierten
Zellproliferation in starkem Maße beteiligt zu sein.
Die erfindungsgemäßen Verbindungen finden insbesondere
Anwendung als Agonisten für EGF, zur Wundheilung, wie zur
Epithelialisierung von Wunden, beispielsweise Verbrennungen,
Augenwunden, chirugischen Schnitten und dergleichen. Die
Wirkstoffe kann man in einem zweckmäßigen Träger verwenden,
z. B. Silvadene, und in einer Menge, die ausreicht, um die
Epithelialisierung und/oder die Wundheilung zu fördern. Im
allgemeinen liegt diese Menge im Bereich von etwa 0,01
bis 10,0 µg/ml, üblicherweise etwa 0,075 bis 5,0 µg/ml
und vorzugsweise 0,5 bis 5 µg/ml EFG-Äquivalenten. Die
Formulierung wird so über die Wunde verteilt, daß die Wunde
vollständig damit bedeckt ist. Die Behandlung kann 4× pro
Tag oder auch nur 1× pro Tag oder seltener erfolgen, je
nach der Art der Wunde, dem Ansprechen der Wunde auf die
Behandlung, der Konzentration des Wirkstoffes und dergleichen.
Die erfindungsgemäßen Verbindungen und Mittel
kann man auch als Reagentien in Diagnose-Assays oder zur
Herstellung von Reagentien, wie polykonalen oder monoklonalen
Antikörpern, verwenden. Sie können als Reagentien
auch zur Detektion analoger Wachstumsfaktoren oder zur
Detektion von Antikörpern gegen die Wachstumsfaktoren in
physiologischen Flüssigkeiten, wie Blut, verwendet werden.
Je nach Anwendungszweck der Reagentien kann man die Polypeptide
markieren oder unmarkiert einsetzen. Zahlreiche
Markierungen sind bekannt, die direkt oder indirekt zu
detektierbaren Signalen führen. Derartige Markierungen
(labels) sind Radionuklide, Enzyme, fluoreszierende Mittel,
Partikel, chemilumineszierende Mittel, Enzymsubstrate oder
-kofaktoren, Enzyminhibitoren, magnetische Teilchen etc.,
siehe beispielsweise US-PS 36 54 090, 38 17 837,
39 35 074, 39 96 345, 42 77 437, 43 74 925 und 43 66 241.
Es gibt zahlreiche Methoden zur Verknüpfung der Markierungen
mit den Polypeptiden. Dazu zählen die Verwendung einer
N-terminalen Aminogruppe zur Funktionalisierung unter
Bildung eines Pyrazolons, wobei andere freie Aminogruppen
geschützt sind. Das Pyrazolon kann dann mit verschiedenen
Reagentien, beispielsweise Aminogruppen, in Kontakt gebracht
werden, um eine Verbindung zu der Einheit herzustellen,
die ein detektierbares Signal liefert. Durch
Schützen der Argininaminosäuren, die mit der dritten
Schleife assoziiert sind oder proximal dazu vorliegen,
können weitere Arginine in bekannter Weise zur Konjugation
an Aminogruppen oder Thiogruppen funktionalisiert werden.
Alternativ kann man das Polypeptid mit einem aktiven Agens,
beispielsweise einer aktivierten Carbonsäure, in Kontakt
bringen und statisch substituierten, wobei biologisch
aktives Material als Ergebnis der statistischen Substitution
von biologisch inaktivem Material getrennt werden kann.
Je nach Synthesemethode kann das Polypeptid schließlich
modifiziert werden, um die gewünschte Funktionalität im
Rahmen des Syntheseverfahrens zur Verfügung zu stellen.
Die erfindungsgemäßen Verbindungen und Mittel können auch
zur Kontrolle der EGF-Rezeptoren verwendet werden. Sie
können außerdem zur Kontrolle der Zellantwort auf EGF und/
oder TGF verwendet werden, indem man für eine
Kompetition zwischen diesen natürlich vorkommenden Materialien
und den erfindungsgemäßen Verbindungen sorgt. Auf diese
Weise kann man einen Wechsel in der Rezeptorkonformation
verfolgen.
Die erfindungsgemäßen Verbindungen und Mittel kann man auch
für viele therapeutische Zwecke, zu denen die Stimulierung
des Wachstums oder Kontrolle der Knochenbildung zählen,
verwenden. Man kann die Verbindungen in geeigneten
physiologischen Trägern intraperitoneal, subkutan,
intravenös, intraarteriell oder durch Applikationen an die
betreffende Stelle verabreichen. Darüber hinaus können die
erfindungsgemäßen Mittel in Form von Liposomen, wobei gegebenenfalls
Antikörper verwendet werden können, um die
Mittel an den gewünschten Ort zu bringen, einsetzen. Zu geeigneten
Trägern zählen Phosphat-gepufferte Saline, Saline, Wasser
oder dergleichen. Die Konzentration des Additivs kann in
einem weiten Bereich je nach Anwendung und Zweck variieren.
Die Formulierungen können auch weitere Additive enthalten,
wie EGF, TGF, andere Wachstumsfaktoren, Bakteriozide,
beispielsweise Antibiotika, bakteriostatische Mittel,
Puffer etc.
Zur Herstellung von Antikörpern für die Injektion in
Säugetiere bindet man solche erfindungsgemäße Polypeptide,
bei denen PP1-4 für ein Wasserstoffatom oder kurzkettige
Oligopeptidketten (mit weniger als fünf Aminosäuren) stehen,
an antigene Polypeptide oder Proteine. Das Antigenprotein
hat weniger als etwa 60 Aminosäuren und üblicherweise ein
Molekulargewicht von nicht mehr als 100 Kilodaltons (kDal).
Es gibt zahlreiche Methoden zur Bindung an Polypeptide,
entweder an einer bestimmten Stelle oder statistisch, unter
Verwendung bifunktioneller Reagentien, wie p-Maleimidobenzoesäure,
Glutaraldehyd, p,p′-Benzidin etc. Übliche
Antigenproteine sind Rinderserumalbumin, Keyhole-limpethemocyanin,
Tetanustoxoid etc. Die erfindungsgemäßen
Polypeptide werden an das Antigenproteine in ausreichender
Zahl gebunden, so daß für eine gewünschte Immunogenantwort
Sorge getragen ist. Üblicherweise erfolgen zwei oder mehrere
Boosterinjektionen nach der ersten Injektion. Für die Gewinnung
der Antisera wird Blut aus dem immunisierten Wirt
entfernt und die Immunoglobulinfraktion isoliert. Zur Gewinnung
von monoklonalen Antikörpern wird die Milz isoliert
und die Splenocyten werden mit einem geeigneten Fusionspartner
anhand üblicher Methoden fusioniert. Die erhaltenen
Hybridome unterwirft man dann einem Screening auf Antikörper,
die an die epitopen Stellen des Polypeptids binden.
Diese Antikörper kann man für viele Zwecke verwenden, beispielsweise
als diagnostische Reagentien, in der Therapie
etc. Wenn man die Antikörper als Reagentien verwendet,
können sie markiert oder unmarkiert vorliegen, wie oben
im Zusammenhang mit den Polypeptiden beschrieben.
Die nachfolgenden Beispiele erläutern die Erfindung.
A. Synthetische TGF-Oligonukleotide
B. Synthetische VGF-Oligonukleotide
C. Synthetische EGF-Oligonukleotide
B. Synthetische VGF-Oligonukleotide
C. Synthetische EGF-Oligonukleotide
A. Plasmid pLEBam
B. Plasmid pBM11
C. Plasmid pBM11M4
D. Plasmid pBM11M5
E. Plasmid pBM11/NDP
F. Plasmid pBM11/PAD
G. Plasmid pBM11/PAK
H. Plasmid pTCPt
I. Plasmid plac/cro-βgal
J. Plasmid ptac/cro-βgal
K. Plasmid pRSV
L. Plasmid pAc610
M. Plasmids pTox1 and pTox2
N. TakPak
B. Plasmid pBM11
C. Plasmid pBM11M4
D. Plasmid pBM11M5
E. Plasmid pBM11/NDP
F. Plasmid pBM11/PAD
G. Plasmid pBM11/PAK
H. Plasmid pTCPt
I. Plasmid plac/cro-βgal
J. Plasmid ptac/cro-βgal
K. Plasmid pRSV
L. Plasmid pAc610
M. Plasmids pTox1 and pTox2
N. TakPak
A. Herstellung des Plasmids pLEBam/TVV,
B. Herstellung des Plasmids pLEBam/TVV und der Fragmente davon.
B. Herstellung des Plasmids pLEBam/TVV und der Fragmente davon.
A. Modifizierter synthetischer TGF
B. Modifiziertes synthetisches TGF-VGF-Hybrid
B. Modifiziertes synthetisches TGF-VGF-Hybrid
A. Modifizierter synthetischer VGF
B. Modifizierter synthetischer TGF-VGF-Hybride
C. Synthetischer EGF
B. Modifizierter synthetischer TGF-VGF-Hybride
C. Synthetischer EGF
A. Herstellung von pBM11/PAD/EGF
B. Herstellung von pBM11/PAD/nVGFa
B. Herstellung von pBM11/PAD/nVGFa
A. Herstellung von pBM11/PAK/nVGFa (Alkalische Phosphatase-
Signalsequenz/nVGFa mit natürlichem VGF N-Terminus und
Sequenz GTC und GYACRC)
B. Herstellung von pBM11/PAK/EGF
C. Herstellung von TacPak/EGF (alkalische Phosphatase- Signalsequenz/Human-EGF
B. Herstellung von pBM11/PAK/EGF
C. Herstellung von TacPak/EGF (alkalische Phosphatase- Signalsequenz/Human-EGF
A. Herstellung von pTCPt/EGF ((trp-35)16bp(lac10)
(lacSD)11bp(ATC)/alkalische Phosphatase-Signal/Human-
EGF/trans. term.-NEO
B. Herstellung von pTCPt/nVGFa ((trp-35)16bp(lac-10) (lacSD)(croSD)11pb(ATG)/alkalische Phosphatase-Signal/ N-terminale VGFa mit Sequenz GTC und GYAGRC)/trans, term.-NEO)
C. Herstellung von pTNPt/EGF ((trp-35)17bp(lac-10)(nSD) 8bp(ATG)/alkalische Phosphatase-Signal/Human EGF/ trans. term.-NEO)
B. Herstellung von pTCPt/nVGFa ((trp-35)16bp(lac-10) (lacSD)(croSD)11pb(ATG)/alkalische Phosphatase-Signal/ N-terminale VGFa mit Sequenz GTC und GYAGRC)/trans, term.-NEO)
C. Herstellung von pTNPt/EGF ((trp-35)17bp(lac-10)(nSD) 8bp(ATG)/alkalische Phosphatase-Signal/Human EGF/ trans. term.-NEO)
A. Herstellung des Plasmids PRSV/VGF
B. Herstellung des Plasmids pAc/VGF
C. Herstellung von pAc/SFGF
B. Herstellung des Plasmids pAc/VGF
C. Herstellung von pAc/SFGF
A. Festphasen-Synthese von BGF und TGF
B. Isolierung rekombinanter in prokaryontischen Zellen hergestellter Polypeptide
C. Isolierung von VGF und SFGF, hergestellt durch eukaryontische Expression in natürlichen Genen
D. Natürlicher EGF
B. Isolierung rekombinanter in prokaryontischen Zellen hergestellter Polypeptide
C. Isolierung von VGF und SFGF, hergestellt durch eukaryontische Expression in natürlichen Genen
D. Natürlicher EGF
A. Mitogen-Assay
B. Assay zur Stimulierung des Wachstums von Kolonien auf Softagar
C. EGF-Rezeptorbindungs-Inhibitions-Assay
D. Radioimmuno-Assay
E. Wundheilung
B. Assay zur Stimulierung des Wachstums von Kolonien auf Softagar
C. EGF-Rezeptorbindungs-Inhibitions-Assay
D. Radioimmuno-Assay
E. Wundheilung
A. EGF-Rezeptorbindung
B. Mitogen-Aktivität
C. Wundheilung
B. Mitogen-Aktivität
C. Wundheilung
A. VGF hergestellt in Affennierenzellen (BSC-1)
B. VGF hergestellt in CHO-Zellen
C. VGF hergestellt in Seidenraupen
D. Immunologischer Vergleich von VGF und TGF
B. VGF hergestellt in CHO-Zellen
C. VGF hergestellt in Seidenraupen
D. Immunologischer Vergleich von VGF und TGF
Die folgenden Expressionsplasmide, alle transformiert in
E. Coli HB101, wurden zum angegebenen Datum bei der
Amcerican Type Culture Collection, 12 301 Parklawn Drive,
Rockville, MD 20 852 hinterlegt, sie haben den nachfolgend
angegebenen ATCC-Hinterlegungsnummern erhalten:
Es wurden die in Maniatis et al., 1982, "Molecular Cloning:
A Laboratory Manual", Cold Spring Harbor Laboratory,
CSH, New York beschriebenen allgemeinen Klonierungstechniken
verwendet. Alle DNA-modifizierenden Enzyme wurden von
Handelsfirmen erhalten. Sie wurden entsprechend des Anweisungen
des Herstellers eingesetzt. Die Materialien und
Vorrichtungen zur DNA-Reinigung und -Trennung wurden ebenfalls
entsprechend den Anweisungen der Hersteller eingesetzt.
Es wurden synthetische Wachstumsfaktor-Gene hergestellt,
welche von Gastzellkodons Gebrauch machen, die für eine
hohe Expression optimiert sind. Zusätzlich wurden mehrere
zweckmäßige Restriktionsstellen in den synthetischen Genen
vorgesehen. Soweit möglich, ließen die neuen Restriktionsstellen
die Aminosäuresequenz des Wachstumsfaktorgens unverändert.
In einigen Fällen jedoch, führten die neuen
Restriktionsstellen zu einer veränderten Aminosäuresequenz.
Diese Stellen unterteilen die synthetischen Gene in etwa
drei Teile, nämlich die N-terminale, mittlere und C-
terminale Domäne.
Das natürliche VGF-Genprodukt enthält eine extreme
N-terminale Domäne, die kein Gegenstück im reifen
TGF hat. VGF-Fragmente, die diese Domäne nicht besitzen,
werden als verkürzt bezeichnet. Die Restriktionsstellen
wurden zur ersten Konstruktion der endgültigen Gene aus
teilweise synthetischen Oligonukleotidfragmenten verwendet,
welche von einer Restriktionsstelle zu der anderen
sich erstrecken. Die Oligonukleotide wurden an einem
Oligonukleotid-Synthesizer von Applied Biosystems
synthetisiert und an einem Acrylamidgel gereinigt. Die
Oligonukleotide wurden am 5′-Ende unter Verwendung von
T4-Polynukleotidkinase phosphoryliert. Jedes Oligonukleotid
wurde dann mit dem Komplement verbunden.
- 1. Human-TGF-N-terminale Domäne
- 2. Modifizierte, mittlere Human-TGF-Domäne, wobei die Humansequenz QEDK in QEEK, die sich in Ratten-TGF findet, abgeändert wurde:
- 3. Human-TGF-C-terminale Domäne:
- 1. VGF-extreme-N-terminale Domäne:
- 2. Modifizierte VGF-N-terminale Domäne mit der Asp-Pro-Spaltungsstelle, wobei die Sequenz HGT die natürliche Sequenz HGD ersetzt:
- 3. Modifizierte VGF-mittlere Domäne, wobei die Sequenz GYAC die natürliche Sequenz GMYC ersetzt:
- 4. VGF C-terminale Domäne, 5′-Ende:
- 5. Modifizierte VGF C-terminale Domäne, 5′-Ende, wobei die Sequenz VCS die natürliche Sequenz RCS ersetzt:
- 6. VGF C-terminale Domäne, 3′-Fragment, endend bei YQR anstelle von PNT, dem abgeleiteten C-Terminus von natürlich sekretiertem VGF:
Drei Sätze überlappender, synthetischer, für Human-
EGF kodierender Oligonukleotide 1 (A, B), 2 (A, b) und
3 (A, B) wurden an einem Oligonukleotid-Synthesizer von
Applied Biosystems synthetisiert und an einem Acrylamidgel
gereinigt. Die Oligonukleotide wurden am 5′-Ende
unter Verwendung von T4-Polynukleotid-Kinase
phosphoryliert. Jedes Oligonukleotid wurde dann mit
seinem Komplement verbunden.
A. Plasmid pLEBam wurde aufgrund seiner geeigneten BssHII
und BamHI-Restriktionsstellen dazu verwendet, synthetische
Oligonukleotidfragmente zu klonieren. Ein Plasmid mit
NcoI- und BamHII-Restriktionsstellen, wie pBM11 oder pBM11/
NDP (wie unten beschrieben), kann zur Klonierung der
synthetischen Nukleotidfragmente und anderer gewünschter
DNA-Sequenzen verwendet werden.
B. Plasmid pBM11 ermöglicht
die Klonierung des gewünschten Gens an einer
BamHI-Restriktionsstelle abwärts von den für die 33 N-
terminalen Aminosäuren des Bakteriophagen-λ-N-Gens kodierenden
DNA-Sequenzen. Nach Induktion des λ-PL-Promotors durch
Inaktivierung des temperaturempfindlichen C1857-Repressors
bei 42°C, wird das fremde Genprodukt als C-terminaler Teil
eines Fusionsproteins exprimiert, das die N-terminale
Sequenz des N-Gens besitzt.
C. Plasmid pBM11M4 ist von pBM11 abgeleitet und
ermöglicht die Klonierung des gewünschten Gens an einer
BamHI-Restriktionsstelle direkt nach dem ersten Methionin
des N-Gens. Das Plasmid pBM11/M4 enthält auch eine NcoI-
Stelle im Neomycingen.
D. Plasmid pBM11M5 ist von pBM11 abgeleitet, in dem eine
NcoI-Stelle, die in dem Neomycin-Resistenz-Gen vorhanden
ist, durch eine auf die Stelle gezielte Mutagenese
entfernt worden ist. Die Klonierung des gewünschten
Gens in pBM11/M5 erfordert keine teilweise Verdauung des
Vektors mit NcoI.
E. Plasmid pBM11/NDP ist von pBM11 abgeleitet und besitzt DNA-
Sequenzen, die für ein säurelabiles Asparagin-Prolindipeptid
kodieren, welches zwischen den Sequenzen
insertiert ist, die für das N-Gen und ein gewünschtes
Gen kodieren. Das Plasmid enthält eine NcoI-Stelle und
eine ClaI-Stelle zur Klonierung eines gewünschten Gens
abwärts vom PL-Promotor.
F. Plasmid pBM11/PAD ist vom Plasmid pBM11M4 abgeleitet und ermöglicht
die Klonierung eines gewünschten Gens an HindIII, SmaI
oder BamHI abwärts von einer modifizierten alkalischen
Phosphatase-Signalsequenz.
G. Plasmid pBM11/PAK, ist vom Plasmid pBM11M4 abgeleitet und ermöglicht
die Klonierung eines gewünschten Gens an HindIII,
SmaI oder BamHI abwärts von einer alkalischen Phosphatase-
Signalsequenz.
H. Plasmid pTCPt, ist so konstruiert, daß es die tac-
Promotorelemente aufweist und die cro-SD zur Expression
des gewünschten Gens hinter der alkalischen Phosphatase-
Signalsequenz verwendet. Ein Beispiel für die Konstruktion
dieses Plasmids ist nachfolgend im Zusammenhang mit der
Konstruktion von pTCPt/EGF beschrieben.
Dieses Plasmid ist so konstruiert, daß es die tac-Promotorelemente
aufweist und das N-Gen SD zur Expression eines
gegebenen Gens hinter der alkalischen Phosphatase-Signalsequenz
verwendet. Es hat einen pBR322-H 87468 00070 552 001000280000000200012000285918735700040 0002003910084 00004 87349intergrund mit dem
Neomycin-Resistenz-Gen. Das Plasmid pTNPt wurde folgendermaßen
konstruiert:
Das Plasmid pbM16t/VGFa wurde mit EcoRI und BamHI
verdaut und das 2,8-kb-Fragment wurde isoliert. Das
2,8-kb-Fragment wurde an einen EcoRI-BamHI-Linker
ligiert und ein korrektes Konstrukt wurde durch
Restriktionsanalyse isoliert, es wird als Zwischenprodukt
I bezeichnet.
Die HindIII-Stelle nahe dem Neomycin-Resistenz-Gen
wurde von dem Zwischenprodukt I-Plasmid durch Verdauung
mit HindIII unter Bildung stumpfer Enden und unter
Verwendung eines Klenow-Fragmentes entfernt und erneut
ligiert. Dies ergab ein Zwischenprodukt II-Plasmid,
dem die HindIII-Stelle fehlte.
Das 2,8-kb-EcoRI-BamHI-Fragment von pBM16t/VGFa,
dem die HindIII-Stelle fehlte, wurde durch Verdauung
des p-Zwischenproduktes-II mit EcoRI und BamHI isoliert.
Das erhaltene 2,8-kb-Fragment wurde durch Agarosegelelektrophorese
isoliert.
Das Plasmid pBM11/PAK ist identisch mit pBM11/PAK/EGF,
außer daß es eine Linkerregion mit HindIII, SamI und
BamHI-Stellen abwärts von der alkalischen Phosphatase-
Signalsequenz anstelle des EGF-Gens enthält. pBM11/PAK
wurde mit BsmI und BamHI verdaut und das 150-bp-
Fragment, das das N-Gen SD, die alkalische Phosphatase-
Signalsequenz und die Linkerregion enthält, wurde
isoliert.
Die Oligonukleotide TacA⁺ und TacA- wurden an einem
Oligonukleotid-Synthesizer von Applied Biosystems
synthetisiert und so konstruiert, daß sie einen
EcoRI-Überhang am 5′-Ende aufweisen, wobei die trp-35-
Konsensussequenz von der lac-10-Konsensussequenz durch
17 Nukleotide innerhalb derer eine SstI-Stelle angeordnet
ist, getrennt ist. Die Sequenz enthielt auch das
5′-Ende von lac mRNA, die lac-Repressor-Bindungsstelle
und einen BsmI-Überhang.
Das 2,8-kb-EcoRI-BamHI-Fragment, das 150-bp-BsmI-BamHI-
Fragment und die Oligonukleotide TacA⁺ und TacA- wurden
unter Verwendung von DNA-Ligase ligiert und die DNA
wurde dazu verwendet, kompetentes JM109 (lacIq) zu
transformieren. Ein korrektes Konstrukt wurde durch
Restriktionsanalyse und DNA-Sequenzierung isoliert.
I. Plasmid plac/cro-β gal besteht aus der Operator-
Promotor-Region von E. Coli Lactose (lac)-Operon, sowie den
ribosomalen Bindungsstellen von lac und cro.
Die von diesem Vektor exprimierten Fusionsproteine
bestehen aus dem N-Terminus des Bakteriophagen-
β-cro-Proteins, der Aminosäuresequenz, für die die
insertierte DNA kodiert, und dem C-Terminus der
β-Galactosidase. Die Kontrollelemente dieses Vektors
bestehen aus der Operator-Promotor-Region des E. Coli
Lactose (lac)-Operons, sowie den ribosomalen Bindungsstellen
von lac und cro.
J. Plasmid ptac/cro-β-gal ermöglicht die Klonierung des
gewünschten Gens abwärts von den N-terminalen 21 Aminosäuren
des bakteriellen Cro-Proteins. Das Plasmid wurde wie in der
US-Anmeldung 2 64 098 beschrieben, konstruiert. Der
Expressionsvektor ptac/cro-β-gal ist ähnlich plac/cro-β-gal,
mit der Ausnahme, daß der Promotor von ptac/cro-β-gal
aus der -35-Region des Promotors des Tryptophanoperons
und der Pribnow-Box des lac-Operons besteht. Dieser
Hybridpromotor ermöglicht eine höhere Expressions als
plac/cro-β-gal.
K. Plasmid pRSV ermöglicht die Expression eines gewünschten
Gen in eukaryontischen Zellen mit dem RSV LTR-Promotor,
siehe Gorman et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA (1982) 79 :
6777-6781.
L. Plasmid pAc610, siehe Smith et al., Molec Cell. Biol.
(1983) 12 : 2156-2165, ermöglicht die Expression eines Fremdgens
in Insektenzellen.
M. Die Plasmide pTox1 und pTox2 ermöglichen die Expression
eines gewünschten Gens in Hefezellen unter Verwendung der
X. Lactis-Killertoxin-Signalsequenz (EMBO 6, 229-234 [1987];
Biochem, Biophys. Res. Comm. 144, 613-619 [1987]. Dieses
Konstrukt weist das URA3-Gen zur Selektion in Hefen und
das AMP-Gen zur Selektion in Bakterien auf. Die Transkription
beginnt mit dem CYCl-Promotor und der GAL "Aufwärts-
Aktivierungssequenz" (Methods Enzymol., 101, 181-191 [1983]),
und endet innerhalb des 3′-Endes des FLP-Gens (Mol.
Cell. Biol., 5, 2770-2780 (1985). Das Konstrukt weist
sowohl den 2 Mikron-Ursprung und den 2 pBR322-Ursprung für
die Replikation in Hefe und E. Coli auf. Die Killertoxin
N-terminale Region mit der Signalsequenz und die
Kex2-Spaltungsstelle wurden in die Ligonukleotide eingeführt,
sie enthielten die A-T-reiche Region unmittelbar
im Anschluß an das Initiatorkodon, um optimale
Translationsinitiierungs- und Elongationssignale aufrechtzuerhalten.
Mehrere Restriktionsstellen wurden konstruiert,
um die Insertion der gewünschten Gene abwärts von
der Signal-Spaltungsstelle und der Kex2-Spaltungsstelle
zu ermöglichen.
Plasmid plGSD5(-ATG), ein Hefe-Expressionsvektor
(Methods Enzymol. 101 : 181-191 [1983], wurde mit
EcoRI und EspI verdaut und das 3,0-kb-Fragment wurde
isoliert.
Plasmid pLGSD5(-TAG) wurde mit EcoRI und EspI verdaut
und das 2,1-kb-Fragment wurde isoliert.
Die 2,1-kb- und 3-kb-EcoRI-EspI-Fragmente wurden unter
Verwendung von DNA-Ligase ligiert und die DNA wurde
dazu verwendet, kompetentes HB101 zu transformieren.
Ein korrektes Konstrukt wurde durch Restriktionsanalyse
isoliert.
Das Plasmid pLGSD5(-ATG) wurde mit EcoRI und BamHI
verdaut und das 1,8-kb-Fragment wurde isoliert. Die
BamHI-Stelle liegt innerhalb eines Linkers vor, der
4 bp aufwärts des CYCl-Initiators insertiert wurde.
Die Oligonukleotide wurden konstruiert, um die Kodons
für die Signalsequenz von K. Lactis-Killertoxin an die
BamHI-Bindungsstelle abwärts des CYCl-Initiators zu
binden. Um optimale Translationsinitiierung zu erhalten,
wurden 13 bp der A-T-reichen Sequenz aufwärts des
Killertoxin-Initiatorkodons mitaufgenommen. Diese
Sequenz entspricht der für Hefe-Initiierungskodons bestimmten
Konsensussequenz. Eine BglII-Stelle wurde direkt
aufwärts der A-T-Region vorgesehen, um eine Mutagenese
der Initiierungsregion und der Signalsequenz zu ermöglichen.
Eine HindIII-Stelle wurde 10 Nukleotide aufwärts
der Signalspaltungsstelle angeordnet, um die
Mutagenese von abwärts gelegenen Sequenzen die
Ligierung eines gewünschten Gens zu ermöglichen. In
pTox1 wurde eine AvaI, XhoI-Stelle direkt abwärts des
Signalspaltungsstelle angebracht, während in pTox2 eine
NaeI-Stelle an der Signalspaltungsstelle zur Blunt-end-
Klonierung direkt über der Signalspaltung, die von
Gly-Leu in Ala-Glys umgewandelt wurde, angebracht wurde.
Auflösung des Heteroduplex an der Spaltungsstelle
sollte zur Bildung von Klonen, die die pToxI-Sequenz
enthalten und zur Bildung von solchen Klonen führen,
welche die pTox2-Sequenz enthalten. In beiden
Konstrukten kodieren die anschließenden Sequenzen für
den Rest der Killertoxin-Prektursorsequenz bis zur Kex2-
Lys-Arg-Spaltungsstelle. An diesem Punkt wurden mehrere
Restriktionsstellen (StuI, SalI, AccI, HincII und BamHI) angeordnet, um die Klonierung des
gewünschten Gens zu erleichtern. Die StuI-Stelle ermöglicht
eine Blunt-ended-Klonierung direkt nach dem Arg-Kodon
der Kex2-Spaltungsstelle. Die Oligonukleotide haben einen
BamHI-Überhang am 5′-Ende und einen HindIII-Überhang am
3′-Ende, um die Klonierung in den Intermediatel-Vektor
zu ermöglichen. Die erhaltene Sequenz hat keine der beiden
Stellen mehr.
Diese Oligonukleotide wurden an einem Synthesizer von
Applied Biosystems synthetisiert und durch Gelelektrophorese
gereinigt. Anschließend wurden sie unter Verwendung
von T4-Kinase phosphoryliert und die komplementären Paare
wurden verbunden (annealed), ligiert und Gel-gereinigt.
Der IntermediateI-Vektor wurde mit EcoRI und HindIII
verdaut und anschließend mit alkalischer Kälberphosphatase
behandelt. Durch diese Behandlung wurde ein
kleines EcoRI-HindIII-Fragment entfernt und es blieb
eine HindIII-Stelle aufwärts der FLP-3′-Sequenz zurück.
Das 1,8-kb-EcoRI-BamHI-Fragment wurde mit dem Oligonukleotid-
Fragment unter Verwendung von DNA-Ligase
ligiert und das erhaltene Fragment wurde Gel-gereinigt
und anschließend an den EcoRI-HindIII-IntermediateI-
Vektor ligiert. Die DNA wurde dazu verwendet, kompetentes
HB101 zu transformieren. Korrekte Konstrukte wurden
unter Anwendung der Restriktionsanalyse und einer DNA-
Sequenzierung identifiziert und ein Klon mit der
Sequenz von pTox1 und ein anderer mit der Sequenz von
pTox2 wurden isoliert. Beiden Klonen fehlte die BamHI-
Stelle an der Verbindungsstelle der Oligonukleotide und
des IntermediateI-Vektors.
Der synthetische chimäre als TTV oder (TGF/TGF/VGF) bezeichnete
Wachstumsfaktor wurde im Klonierungsvektor pLEBam zusammengefügt.
Dieser Hybridwachstumsfaktor enthielt die
Aminosäuresequenz von Human-TGF in den amino-terminalen
zwei Dritteln des Gens mit der Ausnahme, daß die
natürliche Humansequenz QEDK in die Sequenz QEEK geändert
wurde. Der Carboxy-Terminus wurde von der Aminosäuresequenz
von VGF abgeleitet und mit der Sequenz YQR aufwärts
von der natürlichen Sequenz PNT terminiert. Das
Plasmid pLEBam wurde mit BssHII und BamHI verdaut.
BssHII-BamHI pLEBam wurde anschließend mit den Oligonukleotiden
TGF101, 102, 103 und 104 und VGF1, 2, 3 und
4 unter Verwendung der DNA-Ligase liegiert und die erhaltenen
Plasmide wurden zur Transformierung kompetenter
HB101 verwendet. Die Transformanten wurden an
Ampicillin selektiert und einem Screening durch
Restriktionsanalyse unter Verwendung von EcoRI, NcoI
und BamHI und durch Nukleotid-Sequenzierung unter Verwendung
der Maxam-Gilbert-Vorschrift unterzogen. Es
wurde ein korrektes Konstrukt isoliert und als
pLEBam/TTV bezeichnet.
Der synthetische, chimäre als TVV oder (TGF/VGF/VGF)
bezeichnete Wachstumsfaktor wurde im Klonierungsvektor
pLEBam zusammengefügt. Dieser Hybridwachstumsfaktor
enthielt die Aminosäuresequenz von Human-TGF in der
N-terminalen Domäne des Gens. Die mittlere und C-terminale
Domäne sind von der verkürzten VGF-Sequenz abgeleitet
und enden mit der Sequenz YQR aufwärts von der natürlichen
Sequenz PNT. Zusätzlich besitzt das Gen GYACVC
anstelle von GMYCRC.
Das Plasmid pLEBam/TTV wurde mit KpnI und SphI verdaut
und das 4,3-KpnI-SphI-Fragment wurde Gel-
gereinigt. Durch die Verdauung wurde die mittlere
TGV-Domäne von dem synthetischen Gen TTV im
Klonierungsplasmid pLEBam entfernt.
Die Oligonukleotide VGF101a und 102a wurden an das
4,3-kb-KpnI-SphI-Fragment von pLEBam/TTV unter Verwendung
von DNA-Ligase ligiert und die erhaltene
Mischung wurde dazu verwendet, kompetentes HB101 zu
transformieren. Die Transformanten wurden an
Ampicillin selektiert und einem Screening mittels
Nukleotidsequensierung unter Verwendung der
Sanger-dideoxy-Methode unterzogen. Ein korrektes
Konstrukt wurde isoliert und als pLEBam/TVV bezeichnet.
Das modifizierte Human-TGF wurde in diesem System
als Teil einer Fusion mit den 33-N-terminalen
Aminosäuren des N-Gens exprimiert und es besitzt
die Sequenz QEEK anstelle der Humansequenz QEDK.
Das Plasmid pBM11/TTV wurde mit SpHI und PvuI
verdaut und das 780-bp-SphI-PvuI-Fragment wurde Gel-
gereinigt. Dieses Fragment enthält einen Teil des
pBM11-Plasmids am PvuI-Ende und am SphI-Ende, das
N-Gen und die N-terminalen beiden Drittel des
Human-TGF-Gens.
Das Plasmid pBM11/N/TTV wurde mit BamHI und PvuI
verdaut und das 5-kb-BamHI-PvuI-Fragment wurde Gel-
gereinigt.
Die Oligonukleotide TGF 205 und 206, das 780-bp-
SphI-PvuI-Fragment und da 5-kb-BamHI-PvuI-Fragment
pBM11/N/TTV wurden zusammen ligiert und dazu verwendet,
kompetentes HB101 zu transformieren. Die
Transformanten wurden an Neomycin selektiert und
einem Screening durch Restriktionsanalyse unter
Verwendung von EcoRI und Nukleotidsequenzierung entsprechend
der Sanger-Dideoxymethode unterzogen.
Ein korrektes Konstrukt wurde isoliert und als
pBM11/N/TGF bezeichnet.
In diesem Konstrukt wurde ein synthetisches
modifiziertes chimäres TTV-Gen als C-terminaler
Teil eines Fusionsproteins mit den ersten 33 Aminosäuren
des N-Gens am N-Terminus exprimiert. Dieser
Hybridwachstumsfaktor enthielt die Aminosäuresequenz
von Human-TGF in den beiden aminoterminalen
Dritteln des Gens mit der Ausnahme, daß die
Sequenz QEEK die natürliche Humansequenz QEDK
ersetzt. Der Carboxyterminus wurde von der Aminosäuresequenz
von VGF abgeleitet und mit der Sequenz
YQR aufwärts der natürlichen Sequenz PNT beendet.
Das Plasmid pLEBam/TTV wurde mit NcoI verdaut
und die Enden abgestumpft, indem unter
Verwendung des Klenow-Fragments von DNA-
Polymerase die Überhänge eingefüllt wurden.
Die DNA wurde anschließend mit BamHI verdaut
und das 170-bp-NcoI(blunt)-BamHI TTV-Fragment
wurde Gel-gereinigt.
Das Plasmid pBM11 wurde mit BamHI verdaut.
Mit BamHI verdautes pBM11, das NcoI(blunt)-BamHI TTV-
Fragment, und BamHI-Linker (5′GATCCG3′) wurden unter
Verwendung von DNA-Ligase zusammen ligiert und die
erhaltene Mischung wurde dazu verwendet, kompetentes
HB101 zu transformieren. Die Transformanten wurden
an Neomycin selektiert und einem Screening unter
Verwendung einer Restriktionsanalyse und einer
Nukleotidsequenzierung unter Anwendung der Sanger-
Dideoxymethode unterzogen. Ein korrektes Konstrukt
wurde isoliert und als pBM11/N/TTV bezeichnet.
Die N-terminale Sequenz des synthetischen VGFA-Gens
ist eine verkürzte Version der natürlichen VGF-
Sequenz und beginnt mit der Sequenz DIPAIR. In diesem
Plasmid ist das VGFA-Fragment abwärts der 32 Aminosäuren
des λ-N-Proteins und des Dipeptids Asparaginsäure-
prolin lokalisiert. Um die KpnI-Klonierungsstelle
zu konservieren, wurde die synthetische
Sequenz so geändert, daß sie für CLHCGTC anstelle
der natürlichen VGF-Sequenz CLHGDC kodiert und mit
der Sequenz YQR aufwärts von der natürlichen
Sequenz PNT endet. Zusätzlich kodiert das VGFA-Gen
für die Sequenz GYACVC, die die natürliche Sequenz
GMYCRC ersetzt.
Das Plasmid pLEBam/TVV wurde mit KpnI und
BamHI verdaut und das 80-bp-KpnI-BamHI-Fragment
wurde Gel-gereinigt. Dieses Fragment enthält
die C-terminalen zwei Drittel des synthetischen
VGF-Gens mit der KpnI-Stelle am 5′-Ende.
Das Plasmid pBM11/N/TTV wurde mit BamHI verdaut
und die 5′-Phosphate wurden durch Behandlung mit
mit intestinaler alkalischer Kälberphosphatase entfernt.
Das 5,6-kp-BamHI-Plasmidfragment wurde Gel-
gereinigt.
Die Oligonukleotide VGF 103a, 104a, das 5,6-kb-BamHI-
Fragment von pBM11 und das 80-bp-KpnI-BamHI-Fragment
von pBLEBam/TVV wurden miteinander unter Verwendung
von DNA-Ligase ligiert und anschließend dazu verwendet,
kompetentes HB101 zu transformieren. Die Transformanten
wurden an Neomycin selektiert und einem Screening
durch Restriktionsanalyse unter Verwendung von ClaI
und Nukleotidsequenzierung gemäß der Sander-Dideoxymethode
unterzogen. Ein korrektes Konstrukt wurde
isoliert und als pBM11/NDP/VGFA bezeichnet. Dieses
Konstrukt besitzt die Sequenzen GTC und GYACVC anstelle
der authentischen VGF-Sequenzen GDC und
GMYCRC.
Die N-terminale Sequenz von VGFa ist eine verkürzte
Version der natürlichen VGF-Sequenz und sie beginnt mit
der Sequenz DIPAIR. Zusätzlich enthält die
VGFa-Sequenz die Sequenzen GTC und GYACRC anstelle der
natürlichen VGF-Sequenzen GDC und GMYCRC. In diesem
Plasmid ist das VGFa-Gen abwärts der 32 Aminosäuren
des λ-N-Proteins und des Dipeptid Asparaginsäure-
Prolin lokalisiert. Behandlung des gereinigten Fusionsproteins
mit Ameisensäure führt zur Spaltung an der
säurelabilen Asparaginsäure-Prolin-Peptidbindung, so
daß die Trennung des VGFa-Proteins von dem λ-N-Protein-
Aminoterminus ermöglicht wird. Die Spaltung erfolgt derart,
daß das VGFa-Protein den Prolinrest am Aminoterminus
behält.
Das Plasmid pBM11/DP/VGFA (10 µg) wurde mit
30 Einheiten SphI verdaut und die 5′-Phosphate wurden
durch Behandlung mit intestinaler alkalischer
Kälberphosphatase entfernt. Das 5-kb-Plasmidfragment
wurde nach Elektrophorese an einem Agarosegel gewonnen.
Das Plasmid pBM11/DP/VGFA (10 µg) wurde mit 30
Einheiten EcoRI und anschließend mit 30 Einheiten
SphI verdaut. Das 70-bp-Fragment wurde nach
Elektrophorese an einem Agarosegel gewonnen.
Das 24-bp-Fragment, das die Oligonukleotide VGF 1A und
2A enthält, das 5-kb-SphI-Fragment und das 70-bp-EcoRI-
SphI-Fragment pBM11/DP/VGFA wurde ligiert und die
Mischung wurde dazu verwendet, kompetente E. Coli
HB101-Zellen zu transformieren. Die Transformanten
wurden einem Screening durch Nukleotidsequenzierung
unter Verwendung der Sanger-Dideoxynukleotidmethode
unterzogen. Ein korrekter Klon wurde isoliert und
als pBM11/NDP/VGFa bezeichnet.
In diesem Konstrukt wird das synthetische
modifizierte, chimäre TTV-Gen als C-terminaler Teil
des Fusionsproteins mit den ersten 32 Aminosäuren
des N-Gens am N-Terminus exprimiert. Ein säurelabiles
Asparaginsäure-Prolin-Dipeptid trennt die beiden
Fusionsteile. Der Hybridwachstumsfaktor enthält die
Aminosäuresequenz von Human-TGF in den amino-
terminalen zwei Dritteln des Gens mit der Ausnahme,
daß die Sequenz QEEK anstelle der natürlichen Human-
TMR-Sequenz QEDK vorliegt. Der Carboxyterminus
wurde von der Aminosäuresequenz von VGF abgeleitet
und mit der Sequenz YQR aufwärts der natürlichen
Sequenz PNT beendet.
Das Plasmid pBM11/NDP/VGFA wurde mit NcoI verdaut
und das 5-kb-NcoI-Plasmidfragment wurde Gel-
gereinigt. Dieses Fragment hat einen NcoI-Überhang
an der Asparaginsäure-Prolin-Spaltungsstelle
abwärts der für die ersten 32 Aminosäuren des N-
Gens kodierenden Sequenzen. Die andere NcoI-Stelle befindet
sich in dem Neomycin-Resistenz-Gen.
Das Plasmid pBM11/N/TTV wurde mit NcoI und BamHI
verdaut und das 0,6-kb-NcoI-BamHI-Plasmidfragment
wurde Gel-gereinigt. Dieses Fragment besitzt den
NcoI-Überhang in dem Neomycin-Resistenz-Gen.
Das Plasmid pLEBam/TTV wurde mit NcoI und BamHI verdaut
und das NcoI-BamHI 170-bp-Fragment, das das
synthetische TGF/TGF/VGF-Gen enthält, wurde Gel-gereinigt.
Dieses Fragment besitzt den NcoI-Überhang
am 5′-Ende des Gens und den BamHI-Überhang am 3′-Ende
des Gens.
Die 5-kb-NcoI und 0,6-kb-NcoI-BamHI-Plasmidfragmente
wurden mit dem 170-bp-NcoI-BamHI-TTV-Gen unter Verwendung
der DNA-Ligase ligiert und die erhaltene
Mischung wurde dazu verwendet, kompetentes HB101
zu transformieren. Die Transformanten wurden an
Neomycin derart selektiert, daß nur Kolonien mit
korrekt konstruiertem Neomycin-Resistenz-Gen überlebten.
Die Transformanten wurden durch Restriktionsanalyse
mit NcoI und Nukleotidsequenzierung unter
Verwendung der Sanger-Dideoxymethode einem Screening
unterzogen. Ein korrektes Konstrukt wurde isoliert und
als pBM11/NDP/TTV bezeichnet.
In diesem Konstrukt wurde das synthetische modifizierte
chimäre VTV-Gen als C-terminaler Teil eines Fusionsproteins
mit den ersten 32 Aminosäuren des N-Gens am
N-Terminus exprimiert. Ein säurelabiles Asparaginsäure-
Prolin-Dipeptid trennt die beiden Fusionsteile. Der
Hybridwachstumsfaktor enthielt die Aminosäuresequenz
des Human-TGF in der mittleren Domäne, wobei die Aminosäuresequenz
QEEK die natürliche Sequenz QEDK ersetzt.
Die N-terminalen und C-terminalen Domänen wurden von
der verkürzten VGF-Sequenz abgeleitet und beginnen mit
der Sequenz DIPAIR und enden mit der Sequenz VQR, die
sich aufwärts der natürlichen Sequenz PNT befindet.
Das Plasmid pBM11/N/TTV wurde mit BamHI und NcoI
verdaut und das 5-kb-BamHI-NcoI-Fragment wurde Gel-
gereinigt. Dieses Fragment enthält einen BamHI-
Überhang am 3′-Ende der Sequenzen, die für die ersten
32 Aminosäuren des N-Gens kodieren sowie eine NcoI-
Stelle in dem Neomycin-Resistenzgen.
Das Plasmid pBM11/N/TTV wurde mit KpnI und NcoI verdaut
und das 700-bp-KpnI-NcoI-Fragment wurde Gel-
gereinigt. Dieses Fragment ist aus einem Teil des
Plasmids pBM11 gebildet, das einen Teil des
Neomycin-Resistenzgenz am NcoI-Überhang und die
C-terminale VGF-Domäne des synthetischen TTV-Gens
am KpnI-Überhang enthält.
Die Oligonukleotide VGF 103a und 104a, das 5-kb-
BamHI-NcoI-Fragment von pBM11 und das 700-bp-KpnI-
NcoI-Fragment von pBM11/N/TTV wurden zusammen unter
Verwendung der DNA-Ligase ligiert und anschließend
dazu verwendet, kompetentes HB101 zu transformieren.
Die Transformanten wurden an Neomycin selektiert
und eine Screening durch Restriktionsanalyse unter
Verwendung von ClaI und Nukleotidsequenzierung gemäß
der Sanger-Dideoxymethode unterzogen.
In diesem Konstrukt wurde das synthetische modifizierte
chimäre TVV-Gen als C-terminaler Teil eines Fusionsproteins
mit den ersten 32 Aminosäuren des N-Gens am
N-Terminus exprimiert. Ein säurelabiles Asparaginsäure-
Prolin-Dipeptid trennt die beiden Fusionsteile. Der
Hybridwachstumsfaktor enthielt die Aminosäuresequenz von
Human-TGF in der N-terminalen Domäne. Die mittlere und
C-terminalen Domäne wurden von der verkürzten VGF-Sequenz
abgeleitet und enden mit der Sequenz YQR. Zusätzlich
ersetzt diese Sequenz GYACVC die Sequenz GMYCRC.
Das Plasmid pBM11/NDP/VGFa wurde mit NcoI und BglII
verdaut und das 4,3-kb-Fragment wurde Gel-gereinigt.
Der NcoI-Überhang ist an der Asparagin-Prolin-
Spaltungsstelle unmittelbar abwärts der ersten 32 Aminosäuren
des N-Gens angeordnet.
Das Plasmid pBM11M5 wurde mit BamHI und BglII verdaut
und das 1,2-kb-Fragment wurde Gel-gereinigt.
Dieses Fragment unterscheidet sich von dem normalen
pBm11-Fragment dadurch, daß die NcoI-Selle im Neomycin-
Resistenzgen entfernt wurde. Alle nachfolgenden
Vektoren, denen diese NcoI-Stelle fehlt, werden als
pBM16 bezeichnet.
Das Plasmid pLEBam/TVV wurde mit NcoI und BamHI verdaut
und das 170-bp-NcoI-BamHI-Fragment wurde Gel-
gereinigt. Dieses synthetische Genfragment hat die
NcoI-Stelle am 5′-Ende und die BamHI-Stelle am 3′-Ende.
Das 4,3-kb-NcoI-BamHI-Fragment von pBM11/NDP/VGFa und
1,2-kb-BamHI-BglII-Fragment von pBM11M5 und das
synthetische 170-bp-NcoI-BamHI-TVV-Genfragment wurden
zusammen unter Verwendung der DNA-Lignase ligiert und
die erhaltene Mischung wurde dazu verwendet, kompetentes
HB101 zu transformieren. Die Transformanten wurden
an Neomycin selektiert und einem Screening durch
Restriktionsanalyse und Nukleotidsequenzierung unter Verwendung
der Sanger-Dideoxymethode unterzogen. Das Plasmid
wird als pBM16 bezeichnet, um den Verlust der NcoI-
Restriktionsstelle im Neomycin-Resistenzgen anzugeben.
In diesem Kontrukt wird das Human-EGF-Gen als Teil
einer Fusion mit den 32 N-terminalen Aminosäuren des
N-Gens exprimiert, welches sich abwärts einer Asp-Pro-
Spaltungsstelle befindet.
Das Plasmid pBM11/DP/VGFA wurde mit NcoI verdaut und
die 5′-Phosphatasen wurden durch Behandlung mit
intestinaler alkalischer Kälberphosphatase entfernt. Das
5-kb-Plasmidfragment wurde Gel-gereinigt. Dieses Fragment
hat einen NcoI-Überhang an der Asp-Pro-Spaltungsstelle
abwärts derjenigen Sequenzen, die für die ersten
32 Aminosäuren des N-Gens kodieren. Die andere NcoI-
Stelle befindet sich im Neomycin-Resistenzgen.
Das Plasmid pBM11/N/TTV wurde mit NcoI und BamHI verdaut
und das 0,6-kb-NcoI-BamHI-Plasmidfragment wurde
Gel-gereinigt. Dieses Fragment hat den NcoI-Überhang
im Neomycin-Resistenzgen.
Die drei Sätze der annellierten EGF-Oligonukleotide
mit eine NcoI-Überhang am 5′-Ende und einem BamHI-
Überhang am 3′-Ende, das 5-kb-NcoI-Fragment von pBM11
und das 0,6-kb-NcoI-BamHI-Fragment von pBM11 wurden
zusammen unter Verwendung der T4-DNA-Ligase ligiert
und die erhaltene Mischung wurde dazu verwendet,
kompetentes E. Coli HB101 zu transformieren. Die
Transformanten wurden an Neomycin derart selektiert,
daß nur Kolonien mit einem korrekt konstruierten
Neomycin-Resistenzgen überleben. Die Transformanten
wurden einem Screenung durch Restriktionsanalyse unter
Verwendung von EcoRT und BamHI und durch DNA-Sequenzierung,
wie oben beschrieben, unterzogen.
Die synthetischen Oligonukleotide wurden so konstruiert,
daß sie die Insertion einer für ein modifiziertes
alkalische Phosphatase-Signalpeptid kodierenden DNA und
einer Linker-Region mit drei Klonierungsstellen
(HindIII, SmaI und BamHI) in den pBM11-Expressionsvektor
abwärts vom PL-Promotor und der ribosomalen
N-Gen-Bindungsstelle ermöglichen. Die Nukleotidsequenz
wurde optimiert, so daß sie so ähnlich wie möglich der
Nukleotidsequenz des Aminoterminus des λ-N-Gens war,
da die λ-N-Gensequenz sich zusammen mit derjenigen
ihrer ribosomalen Bindungsstelle als wirksam für die
Ribosomeninitiierung und -translation erwiesen hat.
Zusätzlich wurde die zweite Aminosäure der alkalischen
Phosphatase-Signalsequenz, nämlich die basische Aminosäure
Lysin, durch die saure Aminosäure Asparaginsäure
ersetzt.
Das Plasmid pBM11/NDP/EGF (30 µg) wurde mit 30 Einheiten
EcoRI verdaut und anschließend mit 4 Einheiten
des Klenow-Fragments der DNA-Polymerase verdaut,
um stumpfe Enden zu erzeugen. Die DNA wurde schließlich
mit 30 Einheiten BamHI verdaut und das 0,7-kb-
Fragment des EGF-Gens wurde nach Elektrophorese an
einem Agraosegel gewonnen. Die auf diese Weise
gereinigte DNA hat eine stumpfe EcoRI-Stelle am
5′-Ende und einen BamHI-Überhang am 3′-Ende.
Das Plasmid pBM11/PAD (18 µg) wurde mit 30 Einheiten
HindIII verdaut und anschließend mit dem Klenow-
Fragment behandelt, um stumpfe Enden zu erzeugen.
Die DNA wurde anschließend mit PvuI verdaut und das
0,5-kb-PvuI-HindIII (blunt)-Fragment wurde nach
Elektrophorese an einem Agarosegel gewonnen.
Das Plasmid pBM11/PAD (18 µg) wurde mit 30 Einheiten
PvuI und anschließend mit 30 Einheiten BamHI verdaut.
Das 5,2-kb-Fragment wurden nach Elektrophorese an einem
Agarosegel gewonnen.
Das 0,17-kb-EcoRI(blunt)-Fragment, das 0,5-kb-PvuI-
HindIII(blunt)-Fragment und das 5,2-kb-PvuI-BamHI-
Fragment wurden miteinander ligiert und die erhaltene
Mischung wurde dazu verwendet, kompetentes E. Coli HB101
zu transformieren. Die Transformanten wurden mittels
DNA-Sequenzierung, wie oben beschrieben, einem Screening
unterworfen. Die gewünschte Signalsequenz/EGF-Region
hatte die folgende Sequenz:
Die Wirksamkeit der Produktion von Fremdprotein im
pBM11/PAD-Expressionssystem und die Möglichkeit
funktionell wirksame Fremdproteine vom Fusionsprodukt
zu reinigen, wurde beispielhaft unter Verwendung von
pBM11/PAD/EGF gezeigt. Nach Größenausschluß-
Chromatographie (TSK-250), wurden 10,3 mg
Äquivalente des aktiven EGF-Fusionspolypeptids aus
23 g (8 l) E. Coli gewonnen, das zur Expression des
EGF-Gens dereprimiert war. 40% der EGF-Aktivität
stammte aus EGF, von dem die Signalsequenz abgespalten
war.
Es wurden synthetische Oligonukleotide konstruiert,
um das synthetische VGFa-Gen mit einer modifizierten
alkalischen Phosphatase-Signalsequenz zu verbinden,
so daß eine optimale Signalsequenz-Spaltungsstelle durch
Kodierung für die zusätzlichen N-terminalen Reste zur
Verfügung gestellt wird, welche umittelbar abwärts der
Signalsequenz-Spaltungsstelle in natürlichem VGF, welche
oben als extremer N-Terminus bezeichnet wurde, auftreten.
Die n-VGFa-Sequenz enthält die Sequenzen GTC und GYACRC
anstelle der natürlichen VGF-Sequenzen GDC und GMYCRC
und sie endet mit der Sequenz YQR aufwärts der natürlichen
Sequenz PNT. In diesem Expressionssystem bleibt für die
Hauptmenge der Moleküle die Signalsequenz an das
nVGFa gebunden, wobei ein Fusionsprotein mit nVGFa am
C-Terminus gebildet wird.
Das Plasmid pBM11/PAD wurde mit HindIII und PvuI
verdaut und das 0,5-kb-Fragment wurde Gel-gereinigt.
Die HindIII-Stelle ist am C-Terminus der modifizierten
alkalischen Phosphatase-Signalsequenz lokalisiert.
Das Plasmid pBM11/NDP/VGFa wurde mit PvuI und BamHI
verdaut und das 5,2-kb-Plasmidfragment wurde Gel-
gereinigt.
Das Plasmid pBM11/NDP/VGFa wurde mit NcoI verdaut und
die 5′-Überhänge wurden durch Behandlung mit
S1-Nuklease entfernt. Dies ergab ein stumpfes Ende am
ersten Kodon des VGFa-verkürzten synthetischen Gens.
Die DNA wurde anschließend mit BamHI verdaut und das
170-bp-NcoI(blunt)-BamHI-Fragment wurde Gel-gereinigt.
Die Oligonukleotide VGF105 und 106, das 0,5-kb-HindIII-
PvuI-Fragment von pBM11/PAD, das 5,2-kb-PvuI-BamHI-
pBM11-Fragment und das 170-bp-NcoI(blunt)-BamHI-
synthetische VGFa-Gen wurden miteinander unter Verwendung
von DNA-Ligase ligiert und die erhaltene Mischung
wurde dazu verwendet, kompetentes HB101 zu transformieren.
Die Transformanten wurden an Neomycin selektiert und
einem Screening durch Restriktionsanalyse und Nukleotidsequenzierung
unter Anwendung der Sanger-Dideoxymethode
unterzogen. Es wurde ein korrektes Konstrukt
isoliert, das die modifizierte alkalische Phosphatase-
Signalfrequenz in Übereinstimmung mit dem nVFa-Gen enthielt.
Das Plasmid pBM11/PAD/nVGF wurde in vitro (Morinaga et
al., Biotechnology [1984]2 : 636-643) mutagenisiert, um
die für die zweite Aminosäure in der Signalsequenz
kodierenden Kodons zu ändern, nämlich um den Asp (D)-
Kodon wieder in den Kodon für Lys (K), den in der
natürlichen Sequenz gefundenen Rest, zu ändern. Diese
Mutagenese ergab auch eine Einführung einer PvuI-Stelle
in die Signalsequenz.
In dieser Expressionskassette ist das EGF-Gen Teil einer
Fusion mit der alkalischen Phosphatase-Signalsequenz.
Das Plasmid pBM11/PAD/EGF wurde in vitro mutagenisiert,
um die für die zweite Aminosäure in der Signalsequenz
kodierenden Kodons zu verändern, d. h. um den Asp (D)-
Kodon in den Kodon für Lys (K), den in der natürlichen
Sequenz gefundenen Rest, zu überführen. Diese Mutagenese
ergab auch eine Einführung einer PvuI-Stelle in die
Signalsequenz.
Das Plasmid pl35-1 wurde vom Plasmid pDR540
(Pharmacia) abgeleitet und enthielt das Cro-Gen SD
und eine BglII-Stelle abwärts vom lac SD. pDR540
ist ein Expressionsvektor, der den trp-lac-Hybrid
promotor enthält. pl35-1 wurde mit BglII und BamHI
verdaut und mit bakterieller alkalischer Phosphatase
behandelt.
Das Plasmid pBM11/PAK/EGF wurde mit PvuII und BamHI
verdaut und das ∼230-bp-Fragment, das für einen Teil
der alkalischen Phosphatase-Signalsequenz und
Human-EGF kodiert, wurde isoliert.
Die synthetischen Oligonukleotide TacPak1 und TacPak2
wurden mit einem Überhang, der mit der BglII-
Stelle von pl35-1 verträglich ist und einem PvuII-Überhang
konstruiert, der mit der PvuII-Stelle in dem
alkalischen Phosphatase/EGF PvuII/BamHI-Fragment
verträglich ist. Die Oligonukleotide wurden an einem
Oligonukleotid-Synthesizer von Applied Biosystems
synthetisiert.
Das mit pl35-1 verdaute BglII-BamHI, das 230-bp-Pak/EGF-
Fragment und die Oligonukleotide TacPak1 und TacPak2
wurden miteinander unter Verwendung von DNA-Ligase
ligiert, in kompetentes HB101 transformiert, wobei
ein korrektes Konstrukt durch DNA-Sequenzierung
isoliert wurde.
Dieses Plasmid ist so konstruiert, daß es die tac-
Promotorelemente enthält und cro SD zur Expression von
Human-EGF hinter der alkalischen Phosphatase-Signalsequenz
verwendet. Es hat einen pBR322-Hintergrund mit
dem Neomycin-Resistenzgen.
TacPak/EGF wurde mit HindIII verdaut und anschließend
mit dem Klenow-Fragment der DNA-
Polymerase verdaut, um stumpfe Enden zu erzeugen.
Die DNA wurde anschließend mit BamHI verdaut und
das 420-bp-Fragment, das die tac-Promotorelemente
und die für die alkalische Phosphatase-Signalsequenz
und Human-EGF kodierende Region enthält,
wurde durch Agarose-Gelelektrophorese isoliert.
pBM16t/NDP/VGFa wurde mit EcoRI verdaut und anschließend
mit dem Klenow-Fragment behandelt, um
stumpfe Ende zu erzeugen. Die DNA wurde anschließend
mit BamHI verdaut und das 2,8-kb-Fragment
wurde isoliert. Dieses DNA-Fragment enthält den
pBR322-Ursprung, das Neomycin-Resistenzgen, dessen
NcoI-Stelle entfernt wurde, und den Gen-32-ähnlichen
Transkriptionsterminator abwärts der BamHI-Stelle.
Das 2,8-kb-EcoRI(blunt)-BamHI-Fragment von pBM16/NDP/VGFa
wurde mit dem 420-bp-HindIII(blunt)-BamHI-Fragment
von TacPak/EGF ligiert und die erhaltene DNA wurde
dazu verwendet, kompetentes JM109(lacIq) zu
transformieren. Ein korrektes Konstrukt wurde aufgrund
seiner Resistenz gegenüber Neomycin und mittels DNA-
Sequenzierung isoliert.
Dieses Plasmid hat die tac-Promotorelemente und verwendet
das cro SD zur Expression des modifizierten
VGF-Gens mit der N-terminalen Extension abwärts der
alkalischen Phosphatase-Signalsequenz. Das Plasmid hat
einen pBR322-Hintergrund mit dem Neomycin-Resistenzgen.
Das Plasmid pBM11/PAK/nVGFa wurde mit PvuI und
BamHI verdaut und das 350-bp-Fragment wurde durch
Gelelektrophorese isoliert. Dieses Fragment enthält
den Hauptteil der alkalischen Phosphatase-Signalsequenz
und das nVGFa-Gen.
Das Plasmid pTCPt/EGF wurde mit PvuI und BamHI verdaut
und das 2,8-kb-Fragment wurde durch Gelelektrophorese
isoliert.
Das 2,8-kb-Fragment und das 350-bp-Fragment wurden
unter Verwendung von DNA-Ligase ligiert und die DNA
wurde dazu verwendet, kompetentes JM109 (lacIq) zu
transformieren. Ein korrektes Konstrukt wurde mittels
Restriktionsanalyse isoliert.
Das 2,8-kb-Fragment und das 350-bp-Fragment wurden
unter Verwendung von DNA-Ligase ligiert und die
DNA wurde dazu verwendet, kompetentes JM109 (lacIq) zu
transformieren. Ein korrektes Konstrukt wurde durch
Restriktionsanalyse isoliert.
Dieses Plasmid enthält die tac-Promotorelemente und
verwendet das N-Gen SD zur Expression von Human EGF hinter
der alkalischen Phosphatase-Signalsequenz. Es hat einen
pBR322-Hintergrund mit dem Neomycin-Resistenz-Gen.
Das Plasmid pTNPt wurde mit PvuI und BamHI verdaut
und das 2,8-kb-Fragment wurde mittels Gelelektrophorese
isoliert.
Das Plasmid pBM11/PAK/EGF wurde mit PvuI und BamHI
verdaut und das 300-bp-Fragment wurde isoliert.
Das 2,8-kb-Fragment und das 300-kb-Fragment wurden
unter Verwendung von DNA-Ligase ligiert und die DNA
wurde in kompetentes JM109 (LacIq) transformiert.
Ein korrektes Konstrukt wurde mittels Restriktionsanalyse
und DNA-Sequenzierung isoliert.
Transfektion dieses Plasmids in Chinese Hamster-
Ovarialzellen ergab eine Produktion von natürlichem
VGF.
Das Plasmid pRSV wurde mit HindIII und BglII verdaut,
und das 4-kb-Fragment wurde Gel-gereinigt. Die
vorstehenden Enden wurden mit dem Klenow-Fragment der
DNA-Polymerase abgestumpft und die 5′-Phosphatasen wurden
anschließend mit intestinaler alkalischer Kälberphosphatase
entfernt.
Ein subkloniertes Genomfragment von Vaccinia-DNA wurde
mit DdeI verdaut, die vorspringenden Enden wurden unter
Verwendung des Klenow-Fragments abgestumpft und das
550-bp-DdeI-Fragment wurde Gel-gereinigt.
Das 4-kb-HindIII(blunt)-BglII(blunt)-Fragment von pRSV
und das 550-bp-DdeI(blunt)-Fragment von Vaccinia-DNA
wurden miteinander unter Verwendung von DNA-Ligase
ligiert und die Transformanten wurden mit Ampicillin
selektiert und einem Screening mittels Restriktionsanalyse
unterworfen. Ein korrektes Konstrukt wurde
isoliert und als pRSV/VGF bezeichnet.
Das Plasmid pRSV/VGF wurde mit dem Plasmid pRSV durch
Calciumphosphat-Fällung in Chinese Hamster-Ovarialzellen
(CHO) kotransfektiert. Die Transfektanten wurden
durch Southern dot blot-Hydridisierung einem Screening
unterworfen und ein positiver als pRSV/VGF52 bezeichneter
Klon wurde isoliert.
Ein weiteres Expressionssystem zur Expression des
rekombinanten VGF-Proteins ist ein Insektensystem, siehe
Maeda et al. und Carbonell et al., siehe oben. In einem
derartigen System verwendet man Autographa california
nuclear polyherosis-Virus (AcNPV als Vektor zur
Expression von Fremdgenen. Das Virus wächst in
Spodoptera frugiperda-Zellen. Das Hüllgen kann in die
nicht-essentiellen Regionen (beispielsweise das Polyhedringen)
des Virus kloniert werden und wird unter die
Kontrolle eines AcNPV-Promotors (beispielsweise der
Polyhedrin-Promotor) gestellt. Eine erfolgreiche
Insertion des VGF-Genkonstrukts führt zur Inaktivierung
des Polyhedringens und Produktion eines nicht-
okkludierten rekombinanten Virus (d. h. eines Virus,
dem die Proteinhülle fehlt, für die das Polyhedringen
kodiert). Diese rekombinanten Viren werden anschließend
zur Infizierung von Spodoptera frugiperda-Zellen verwendet,
in denen das insertierte Gen exprimiert wird.
Das VGF-Gen wird unter die Kontrolle eines geeigneten
Promotors für ein Insektenzellsystem gestellt. Das
Plasmid pAc610 enthält das Polyhedringen in einem Plasmidvektor
geklont, der einen Ampicillin-Resistenz-Marker
besitzt. In dieses Gen sind Polylinker insertiert, die
sich 50 Basen abwärts der transkriptionalen Startstelle
des Polyhedringens und 7 Basen vor dem ersten ATB befinden.
Das VGF-Gen ist in eine zweckmäßige Polylinkerstelle
kloniert, so daß es unter der Kontrolle des
Polyhedrinpromotors steht. Das ATG-Initiations-Methionin-
Kodon und die translationalen Terminationskodons sind
diejenigen des VGF-Gens; die transkriptionalen Startstellen
und Polyadenylierungssignale sind diejenigen des
Polyhedringens.
Das Plasmid pAc610 wurde mit SmaI und BamHI verdaut.
Das Plasmid pRSV/VGF wurde mit HindIII verdaut und die
vorstehenden Enden wurden unter Verwendung des Klenow-
Fragments abgestumpft. Die DNA wurde anschließend in
BglII verdaut und 560-bp-Fragment wurde Gel-gereinigt.
Das SmaI-BamHI-Fragment von pAc610 und das 560-bp-Fragment
von pRSV/VGF, enthaltend das VGF-Gen, wurden unter Verwendung
von DNA-Ligase ligiert und die Transformanten
wurden mittels Restriktionsanalyse einem Screening unterworfen.
Ein korrektes Konstrukt wurde isoliert und als
pAc/VGF bezeichnet.
Das Plasmit pAcVGF wurde mit AcNPV-Wildtyp-Baculovirus-
DNA in Sf9-Insektenzellen (Spodoptera frugiperda) kotransfektiert.
Die Transfektanten wurden hinsichtlich
eines Okklusions-negativen Phenotyps in Plaque-Assays
einem Screening unterworfen. Eine Okklusions-negative
Plaque wurde isoliert und nach fünf Runden erfolgreicher
Plaque-Reinigung wurde ein hoher Titer an
rekombinanten Virus (Stock) erhalten.
Das Plasmid pAc710 wurde mit BamHI und SmaI verdaut.
Die SmaI-Stelle in diesem Plasmid befindet sich
abwärts des Baculovirus-Polyhedrin-Genpromotors.
Das 3,7-kb-BglII-Fragment des 19-kb-BamHI-C-Fragments
der Shope-Fibroma-Virusgenom-DNA wurde in einem
BamHI verdautes SP64-Plasmid kloniert und als
SP64/3,7 bezeichnet. Das Plasmid SP64/3,7 wurde
mit HincII verdaut und das 1-kb-HincII-Fragment
wurde Gel-gereinigt. Das 1-kb-Fragment wurde anschließend
mit Sau3a verdaut und das 430-bp-HincII-
Sau3a-Fragment wurde Gel-gereinigt.
Das BamHI-SmaI verdaut pAc610 wurde mit dem 430-bp-HincII-Sau3a-Fragment,
enthaltend das SFGF-Gen,
ligiert und die erhaltene Mischung wurde in
kompetentes E. Coli HB101 transformiert. Die
Transformanten wurden mittels Restriktionsanalyse
einem Screenung unterzogen, und es wurde ein
korrektes Konstrukt isoliert und als pAc/SFGF bezeichnet.
Die dem verkürzten VGF entsprechende Sequenz beginnend
mit der Sequenz DIPAIR und endend mit der
Sequenz LVDY, wurde an einem Peptid-Syntheziser von
Applied Biosystems, Modell 430A, unter Verwendung
einer Standardvorschrift hergestellt. Behandlung
des endgültigen Peptidharzes mit flüssiger HF unter
Standard-"low-high"-Bedingungen ergab das rohe
entschützte Peptid. Das Peptid wurde einer
Chromatofokusierung an PBE94 (Pharmacia) unterzogen.
Das teilweise gereinigte Peptid wurde bei pH 6,5
eluiert. Eine kurze Behandlung mit 0,2 N Natriumhydroxid
führte zur Entfernung der Cystein-Schutzgruppen
(Ethylcarbamoyl). Das Peptid wurde in Gegenwart
von oxidiertem und reduziertem Glutathion
oxidiert. Reinigung mittels Gelfiltration und HPLC
lieferte hochreines VGF mit folgender Sequenz:
DIPAIRLCGPEGDGYCLHGDCIHARDIDGMYCRCSHGYTGIRCQHVVLVDY
Human- und Ratten-TGF-α wurden chemisch im wesentlichen
wie oben für VGF beschrieben, synthetisiert
und durch Penninsula Labs zur Verfügung gestellt.
E. Coli B (HB101), enthaltend die pBM11/NDP/Wachs
tumsfaktorplasmide, wurden in Luria-Brühe bei 30°C
kultiviert. Die Dichte der Kultur wurde bei 550 nm
gemessen und sobald die Dichte eine Absorption von
0,7 bis 0,9 erreicht hatte, wurde die Synthese des
Wachstumsfaktor-Fusionsproteins durch Erhöhung der
Temperatur auf 42° induziert. Die Kultur wurde bei
dieser Temperatur 5 bis 20 h inkubiert und die
Bakterien wurde anschließend durch Zentrifugieren
isoliert und bei -70°C bis zum Gebrauch eingefroren.
Zur Isolierung des rekombinanten Proteins, wurden
die Zellen in einem Puffer aufgetaut, der 0,05 M
NaH₂PO₄, pH 7,2, 0,5 M NaCl, 0,01 M EDTA enthielt.
150 ml Puffer wurden zur Herstellung von 50 g
Bakterien verwendet. Die Zellen wurden durch
15minütige Ultraschall-Behandlung auf Eis unter Verwendung
eines 6,35 mm-Behälters, 50% Pulsrate bei
60 W zerstört. Nach der Zerstörung der Zellen wurde
das unlösliche Protein durch 90minütiges Zentrifugieren
bei 12 000 Upm in einem GSA-Rotor isoliert.
Das das unlösliche Protein enthaltende Pellet wurde
anschließend erneut in 50 ml 6 M Guanidin-hydrochlorid
suspendiert. Das unlösliche Material wurde
durch 2stündiges Zentrifugieren bei 25 000 Upm
in einer Beckman-Typ-30-Ultrazentrifuge isoliert.
Der Überstand wurde gesammelt und bei -20°C bis zum
weiteren Gebrauch aufbewahrt.
Die Reinigung des Fusionsproteins erfolgte entweder an
einer Sephacryl S3000- oder Fractogel-HW-55-Säule, die
mit 1 M Guanidin-hydrochlorid äquilibriert wurde. Die das
Fusionsprotein enthaltenden Fraktionen waren diejenigen,
die ein Polypeptid mit einem Molekulargewicht enthielten,
das übereinstimmte mit dem Molekulargewicht des Polypeptids
(bestimmt an einen 15% Polyacrylamid-Harnstoffgel),
für das das synthetische Gen kodiert.
Um eine aktive Form des rekombinanten Wachstumsfaktors zu
erhalten, ließ man das Fusionsprotein sich wieder falten,
indem man es in einem 50-mM-Tris-HCl-Puffer, pH 8,7, enthaltend
1 M Guanidin-Hydrochlorid, 1,25 mM reduziertes
Glutathion und 0,25 mM oxidiertes Glutahion, 3 bis 10 Tage
bei 4°C inkubierte. Die biologische Aktivität des Wachstumsfaktors
wurde mittels eines kompetitiven Rezeptor-
Bindungs-Assays wie oben beschrieben (siehe Beispiel I. C)
verfolgt. Sobald ein maximaler Aktivitätsspiegel erhalten
wurde, wurde das Protein gegen destilliertes Wasser
dialysiert und bis zur Trockene lyophilisiert.
Falls die Entfernung der Leadersequenz gewünscht ist, wird
das Protein entweder durch Resuspendieren in 70%iger
Ameisensäure und 3tätigem Inkubieren bei 40°C oder durch
Inkubieren über Nacht bei Raumtemperatur in einem 100fachen
molaren Überschuß an Cyanogenbromid gespalten. Das gespaltene
Produkt wurde gegen destilliertes Wasser
dialysiert und zur Trockene lyophilisiert.
Um den rekombinanten Wachstumsfaktor weiter zu reinigen,
wurde der Wachstumsfaktor erneut in 40%igem Acetonitril,
0,1% TFA suspendiert und mittels HPLC unter Verwendung
einer BioRad-TSK-250-Säule gereinigt. Die den Wachstumsfaktor
enthaltenden Fraktionen wurden vereinigt und weiter
unter Anwendung der Umkehrphasen-HPLC, entweder an Waters
µBondpak C-18 oder Rainin Dynamax C-8, gereinigt. Das
Eluierungsmittel war ein linearer Gradient von 20 bis 40%
Acetonitril, enthaltend 0,1% TFA. Die die Rezeptor-
Bindungsaktivität enthaltenden Fraktionen wurden vereinigt,
lyophilisiert und bis zum Gebrauch bei -20°C aufbewahrt.
- i) N/TGF
Rekombinanter modifizierter Human-TGF wurde aus dem Plasmid pBM11/N/TGF produziert. Er enthielt 33 Aminosäuren des N-Gens am N-Terminus und die Sequenz QEEK anstellee der natürlichen Humansequenz QEDK.
- i) PAD/nVGFa
Rekombinantes modifiziertes VGF wurde aus dem Plasmid pBM11/PAD/nVGFa produziert, welches die extreme N-terminale Sequenz von VGF und die modifizierten Sequenzen GTC und GYACRC anstelle der natürlichen VGF-Sequenz GDC und GMYCRC enthielt. Das nVGFa-Fragment wurde als Fusionsprotein mit einer modifizierten alkalischen Phosphatase-Signalsequenz am N-Terminus exprimiert und war an der Sequenz YQR am C-Terminus verkürzt. - ii) NDP/VGFa
Rekombinantes modifiziertes VGF wurde aus dem Plasmid pBM11/Nd/VGFa, beginnend mit der DIPAIR- Sequenz und endend an der YKQR-Sequenz in VGF, produziert. Es hat die modifizierten Sequenzen GTC und GYACRC anstelle der natürlichen VGF-Sequenzen GDC und GMYCRC. Das VGFa-Fragment wurde als Fusionsprotein mit 32 Aminosäuren des N-Gens am N-Terminus und dem säurelabilen Dipeptid Asparaginsäure- Prolin exprimiert. - iii) VGFa
Das VGF-Fragment wurde wie oben unter 2.b) beschrieben hergestellt und nach Abspaltung vom Fusionsprotein durch Säurebehandlung weiter mittels HPLC gereinigt. - iv) NDP/VGFA
Rekombinantes modifiziertes VGF wurde aus dem Plasmid pBM11/NDP/VGFA, das bei der DIPAIR-Sequenz beginnt und an der YKQR-Sequenz in VGF endet und die Sequenzen GTC und GYACVC anstelle der natürlichen VGF-Sequenzen GDC und GYMCRC besitzt, hergestellt. Das VGFA-Fragment wurde als Fusionsprotein mit 32 Aminosäuren des N-Gens am N-Terminus und dem säurelabilen Dipeptid Asparaginsäure- Prolin exprimiert.
- i) N/TTV (TGF/TGF/VGF)
Rekombinantes modifiziertes TTV wurde aus pBM11/ N/TTV produziert und enthielt die Aminosäuresequenz von Human-TGF in den amino-terminalen zwei Dritteln des Gens mit Ausnahme der Sequenz QEEK anstelle der natürlichen Humansequenz QEDK. Der Carboxy-Terminus wurde von der Aminosäuresequenz von VGF abgeleitet und mit der Sequenz YQR aufwärts der natürlichen Sequenz PNT beendet. Das TTV-Fragment wurde als Fusionsprotein mit 33 Aminosäuren des N-Gens am N-Terminus exprimiert. - ii) NDP/TTV
Rekombinantes TTV wurde aus dem Plasmid pBM11/N/TTV produziert und wie oben unter a) beschrieben, modifiziert, mit der Ausnahme, daß das TTV-Fragment als Fusionsprotein mit 32 Aminosäuren des N-Gens am N-Terminus und dem säurelabilen Dipeptid Asparaginsäure- Prolin exprimiert wurde. - iii) NDP/VTV
Rekombinantes modifiziertes VTV wurde aus dem Plasmid pBM11/NDP/VTV produziert und enthielt die Aminosäuresequenz von Human-TGF in der mittleren Domäne, wobei die natürliche Sequenz QEDK durch die Aminosäuresequenz QEEK ersetzt ist. Die N-terminalen und C-terminalen Domänen wurden von der verkürzten VGF-Sequenz abgeleitet und beginnen mit der Sequenz DIPAIR und enden mit der Sequenz YQR. Das VTV- Fragment wurde als Fusionsprotein mit 32 Aminosäuren des N-Gens am N-Terminus und dem säurelabilen Dipeptid Asparaginsäure-Prolin exprimiert. - iv) NDP/TTV
Rekombinantes modifiziertes VTV wurde aus dem Plasmid pBM11/NDP/TVV erzeugt und enthielt die Aminosäuresequenz von Human-TGF in der N-terminalen Domäne des Gens. Die mittlere und C-terminale Domäne wurden von der verkürzten VGF-Sequenz abgeleitet und enden mit der Sequenz YQR. Zusätzlich weist das synthetische Gen die Modifikation GYACVC statt GMYCRC auf. Das TVV-Fragment wurde als Fusionsprotein mit 32 Aminosäuren des N-Gens am N-Terminus und dem säurelabilen Dipeptid Asparaginsäure-Prolin exprimiert.
Bakterielle Wirte mit Expressionskassetten, welche die
tac oder lac-Promotoren umfassen, wurden bei 30 bis 37°C
bis zu einer optischen Dichte von A600=0,2 bis 0,8
entweder in LB-Brühe oder einem chemisch definierten
Medium, wie M9-Medium, supplementiert mit Thiamin und
Glukose, kultiviert. Ein geeignetes Antibiotikum wurde
in das Wachstumsmedium zur Selektion der die Expressionskassette
enthaltenden Wirte gegeben. Die Bakterienkulturen
wurden mit einer Konzentration von 100 bis 1000 mM
IPTG induziert und 16 bis 24 h bei 30°C kultiviert.
Bei Expressionskassetten, denen ein lacqI-Gen fehlte,
hatten die bakteriellen Wirte einen F-Faktor mit dem
lacqI-Gen, wie JM109, XK1, JM103 etc. Beispiele für
bakterielle Wirte bei Expressionskassetten mit dem
lacI-Gen sind HB101, DH1, DH5 etc. Wenn der bakterielle
Wirt ein funktionelles lac-Operon (lac+) aufweist,
kann die Expressionskassette mit 1% Lactose induziert
werden. Nach der Induktionsperiode kann man die Wachstumsfaktoren
entweder aus dem Medium oder dem Zellpellet
isolieren.
Aus den Expressionskassetten TacPak/EGF und pTcCPt/
EGF erzeugtes Human-EGF wurde aus dem Medium in
aktiver Form isoliert, wobei die alkalische
Phosphatase-Signalsequenz entfernt war. Etwa 85%
des aktiven EGF wurden im Medium gefunden, der Rest
war mit dem Zell-Pellet assoziiert. Diese Expressionskassetten
ergaben 4 mg/l aktives EGF. Die Zellen
wurden aus dem Medium durch Zentrifugieren entfernt
und das Medium wurde durch einen Amicon SY30,
30 000 Mr-Spiral-Trennfilter und anschließend durch
eine Q-Sepharose-Säule gegeben. Das hochgereinigte
Human-EGF wurde 20 mM NaPO₄, pH 7, mit einem 0 bis
0,5 M NaCl-Gradienten eluiert. Alternativ kann man
die Wachstumsfaktoren aus dem Zell-Pellet durch
osmotischen Schock oder Ultraschallbehandlung
isolieren und in im wesentlichen gleicher Weise wie
oben beschrieben, reinigen.
Rekobinantes nVGFa wurde aus der Expressionskassette
pTCPt/nVGFa erzeugt. Das nVGFa wurde aus
dem Zell-Pellet durch Ultraschallbehandlung isoliert
und es wurde gezeigt, daß es etwa 40% des gesamten
Bakterienproteins ausmachte.
Natürliche VGF wurde durch Infektion von Affenierenzellen
mit Vaccinia-Viren produziert.
Cercopithecus-Affennieren (BSC-1)-Zellmonoschichten
wurden mit 15 Plaque-bildenden Einheiten (pfu) pro
Zelle an gereinigtem VV infiziert (Stamm WR,
kultiviert in Hela-Zellen und gereinigt durch
Sedimentation mit einem Sucrose-Dichtegradienten,
(Moss B., [1981] in Gene Amplification and Analysis,
Hrsg. Chirickjian, J. G. und Papis, T. S. [Elsevier/
North-Holland, NY], Bd. 2, S. 253-266). Die
infizierten Zellen wurden bei 37°C mit etwa 1 ml Eagle's
Grundmedium, das mit 2% fötalem Kälberserum pro 2 ×10⁶-
Zellen ergänzt wurde, inkubiert. Mock-infizierte Zellen
wurden in identischer Weise behandelt. Die Zellkulturüberstände
wurden mittels Zentrifugieren bei geringen
Umdrehungszahlen geklärt und lyophilisiert. Der Rückstand
wurde anschließend erneut in 1 M Essigsäure suspendiert
und intensiv gegen 0,2 M Essigsäure dialysiert. Unlösliches
Material wurde abzentrifugiert und der Überstand
wurde lyophilisiert und in 1/100 des ursprünglichen
Volumens der 1 M Essigsäure resuspendiert und bei 4°C
aufbewahrt.
Natürliches VGF wurde auch durch Transfektion des Plasmids
pRSV/VGF produziert, das das VGF-Genfragment in Chinese-
Hamster-Ovarialzellen enthielt. Die transfektierten
Zellen wurden expandiert und das Medium und das Zell-
Pellet wurden auf die Anwesenheit vo VGF mittels Immun
präzipitation unter Verwendung eines Antriserums gegen
ein N-terminales VGF-Peptid untersucht.
Die Wirtszelle für AcNPV ist Spodoptera frugiperda
(sf9). Um einen rekombinanten Virusvorrat zu erzeugen,
wurde das VGF enthaltende Plasmid mit
AcNPV DNA vermischt und sf9-Zellen unter Verwendung
der Calciumphosphat-Technik transfektiert. Die
rekombinanten Viren wurden aus dem Medium isoliert
und an sf9-Zellen-Plaque gereinigt. Die rekombinanten
Plaquen wurden durch Hybridisierung unter Verwendung
von Radio-markiertem VGF DNA als Sonde identifiziert.
Sobald die rekombinanten Viren identifiziert waren,
wurden sie an sf9-Zellen expandiert. Die rekombinanten
Viren wurden dann dazu verwendet, sf-Zellen zu
infizieren. Die Zellen wurden lysiert und die Überstände
einem Screening auf Produktion des VGF-Proteins
unterzogen, welches wie oben für Vaccinia-Virus
infizierte Säugetierzellen beschrieben, gereinigt
wurde.
Die vorausgesagte Sequenz des in den Insektenzellen
produzierten VGF ist:
DSGNAIETTSPEITNATTDIPAIRLCGPEGDGYCLHGDCIHARDIDGMYCRCSHGYTGIR
CQHVVLMYQRSENPNTTTSYIPSPGIMLVLVGIIIITCCLLSVYRFTRRTKLPIQDMVVP
CQHVVLMYQRSENPNTTTSYIPSPGIMLVLVGIIIITCCLLSVYRFTRRTKLPIQDMVVP
Eine potentielle Glykosilierungsstelle liegt am
Asparagin in Position 15 vom N-terminalen Ende des
Polypeptids vor.
Diese 121-Restsequenz beginnt mit der N-terminalen
Sequenz, die direkt für VGF bestimmt wurde, das aus
VV-infizierten Affenzellen isoliert wurde (d. h.
beim Rest 20 des offenen VGF-Leserahmens) und setzt
sich bis zum letzten Rest des offenen Leserahmens
fort. Es fehlt demnach das Signalpeptid (Reste 1 bis
19 des offenen Leserahmens), die transmembrane
Sequenz ist aber umfaßt
(YIPSPGIMLVLVGIIIITCCLLSVY).
Das vorausgesagte Molekulargewicht des Peptids mit
121 Resten ist 13,304 ohne Kohlehydratanteil. Das
scheinbare Molekulargewicht des Baculovirus-
erzeugten VGF beträgt 17 000, was signifikant geringer
ist als das Molekulargewicht des aus VV-infizierten
Zellen erhaltenen Produkts. Dies bedeutet, daß die
beiden Formen wahrscheinlich in unterschiedlicher
Weise prozessiert worden sind. Dem Baculovirus-erzeugten
VGF kann ein weiterer Teil der N-terminalen
Sequenz und/oder ein Teil der C-terminalen Sequenz
fehlen und/oder es kann sich in der Art und im Ausmaß
der Glykosilierung unterscheiden.
Das Plasmid pAc/SFGF wurde mit AcNPV-Wildtyp-
Baculovirus-DNA in Sf9-Insektenzellen (Spodoptera
frugiperda) kotransfektiert. Die Transfektanten wurden
mittels Plaque-Assays auf einen Okklusions-negativen
Phenotyp einem Screening unterworfen. Eine
Okklusions-negative Plaque wurde isoliert und nach
5maliger intensiver Plaque-Reinigung wurde ein
hoher Titer rekombinanter Viren erhalten. Mittels
Southern Analysis konnte gezeigt werden, daß die
rekombinanten Viren das SFGF-Gen enthielten.
Natürliches EGF wurde aus Mäusespeicherdrüsen isoliert
und von Collaborative Research bezogen.
Die Mitogenese-Assays wurden folgendermaßen durchgeführt:
Diploide Humanfibrolasten, die aus Explantaten
der Vorhaut von Neugeborenen erhalten worden sind,
wurden in einer Dichte von 3 × 10⁴-Zellen/Vertiefungen
(Platten mit 96 Vertiefungen, Nunclon, Roskilde,
Dänemark) eingesät und die zur Konfluenz in
Dulbecco's modifizierten Eagle's Medium (GIBCO)/10%igem
Serum von neugeborenen Kälbern kultiviert. Die Kulturen
wurden dann in ein Medium gegeben, das 0,2% Serum von
neugeborenen Kälbern enthielt. 2 Tage später wurde das
zu testende EGF (10 ng/ml) oder der zu testende Wachstumsfaktor
(10 ng Äquivalent EGF/ml) zugegeben. Nach
8 h wurden die Kulturen mit 5-(¹²⁵I-)-Jodo-2′-deoxyuridin
(Amersham, 10 lCi/ml, 5 Ci/mg; 1 Ci=37GBq)
markiert und die in das TCA-unlösliche Material
inkorporierte Isotopenmenge wurde wie beschrieben bestimmt
(Twardzik et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA
[1985] 182 : 5300 : 5304).
Eine 0,5 ml Basisschicht eines 0,5%igen Agars (Agar
Noble; Difco Laboratories, Detroit, Michigan) in Wachstumsmedium
wurde zu Costar-Gewebekulturplatten mit
24 Vertiefungen gegeben. Die Agarbasisschicht wurde mit
0,5 ml eines 0,3%igen Agars in Wachstumsmedium,
enthaltend 1 bis 1,5 × 10⁴-Zellen/ml NRK-Zellen oder
einer anderen Zellinie und unterschiedliche Konzentrationen
des zu bestimmenden Faktors überschichtet. Die
Platten wurden bei 37°C in einer feuchten Atmosphäre
mit 5% CO₂ in der Luft inkubiert und nach 7 Tagen durch
Zugabe von 0,5 ml des 0,3%igen Agars in Wachstumsmedium,
der die gleichen Konzentrationen des zu bestimmenden
Faktors enthielt, gefüttert. Die Kolonien wurden unfixiert
und ungefärbt ausgezählt. Die Zahl der Kolonien
mit mehr als 6 Zellen wurden gewertet.
Die Radiorezeptor-Assays wurden folgendermaßen durchgeführt:
Das von Cohen und Carpenter, Proc. Natl. Acad.
Sci. USA (1975) 72 : 1317-1321 beschriebene Verfahren wurde
zur Bindung von ¹²⁵I-markiertem EGF (¹²⁵I-EGF) an seinen
Rezeptor an Monoschichten von A431-Zellen modifiziert.
Die Zellen (1 × 10³ pro Well) wurden an 24-Well-Platten
(Linbro, Flow Laboratories) mit Formalin in phosphatgepufferter
Saline vor dem Assay fixiert. Die Formalin-
fixierten Zellen haften besser an den Platten als unfixierte
Zellen, so daß die Werte verläßlich sind. Unter
diesen Assay-Bedingungen sättigt ¹²⁵I-EGF (1 × 10¹⁰ cpm/nmol)
die Bindung bei 3 nM; die Assays wurden mit 10% des
Sättigungswertes durchgeführt. Die Wachstumsfaktorkonzentrationen
sind ausgedrückt als ng-Äquivalente
EGF/ml, d. h. die Menge, die erforderlich ist, um eine
Inhibierung der ¹²⁵I-EGF-Bindung hervorzurufen, die
derjenigen äquivalent ist, die durch eine bekannte Menge
EGF hervorgerufen wird.
Jeweils 50 µl Reaktionsmedium enthielten die folgenden
Bestandteile: 20 mM Natriumphosphat bei pH 7,4, 200 mM
NaCl, 40 mM Dithiotreitol, 0,1% Rinderserumalbumin,
0,1% NaN₃, ¹²⁵sI-markiertes Peptid (2 × 10⁴ cpm), entsprechend
den 17 Carboxyl-terminalen Resten von α-TGF
(Linsley et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA [1985]
82 : 356-369), Antiserum in einer endgültigen Verdünnung von
1 : 5000 und weitere Additive. Die Reaktion wurde durch die
Zugabe von Antiserum gestartet und 90 Min. bei 23° fortgeführt.
Anschließend wurde ein gleiches Volumen von 10%
Formalin-fixiertem S. Aureus (Pansorbin, Calbiochem) zugegeben.
Die Inkubation wurde für weitere 30 Min. bei
23°C fortgesetzt. Das Immunoadsorbens wurde durch
Sedimentation entfernt und die Menge an gebundenem ¹²⁵I-
markiertem Peptid wurde gemessen. Die Menge an gebundenem
Peptid ist um die in Abwesenheit von Antikörpern (weniger
als 5% der Gesamtmenge) gemessene nicht-spezifische
Bindung korrigiert und ausgedrückt als prozentuale maximale
Bindung.
Thermische Verletzungen der Mittelhaut wurden am dorsalen
Thorax anästethisierter weiblicher Yorkshireschweine
(13,5 kg; 30 lbs) erzeugt, deren Rücken rasiert und mit
einer handelsüblichen Enthaarungscreme enthaart worden
ist. Ein Messingkörper (3 × 3 cm, 147 g) wurde in einem
Wasserbad von 70°C äquilibriert und genau 10 Sek. mit
der Haut in Kontakt gebracht. Die entstandenen Blasen
wurden dann entfernt. Es wurden 5 Mittelhautverbrennungen
auf jeder Seite des Rückgrats angebracht, die
voneinander etwa 2,5 cm getrennt waren. Die Verbrennungen
wurden 2 × täglich mit etwa 3 ml einer Trägercreme
(Silvadene®) alleine oder mit der Trägercreme,
die den Wachstumsfaktor enthielt, behandelt oder sie
blieben unbehandelt. Nach 9 oder 10 Tagen Behandlung
mit natürlichem VGF, wurden die Schweine anesthetisiert
und der Schorf wurde von den Brandwunden entfernt.
Biopsien wurden von jeder Wunde aus den re-epithelialisierten
Flächen vorgenommen.
Ein 5 Monate altes Schwein mit 20,5 kg wurde mit 20 mg/kg
Ketamin und 2 mg/kg Rompum anästhetisiert. Der dorsale
Thorax wurde rasiert, mit Betadin behandelt und sorgfältig
mit Saline gespült. Sechs 5 × 5 cm Donortransplantate
wurden auf jeder Seite des dorsalen Thorax
mit einem Padgett-Dermatom bei 60/1000 Inch in zwei
Streifen bei 30/1000 Inch entnommen. Die topsiche Behandlung
erfolgte mit 1 ml Saline in 20 g Silvadene,
die gleichmäßig auf die sechs Wunden auf der linken
Seite verteilt wurden. Die rechte Seite wurde mit 1 ml
des zu testenden Wachstumsfaktors in 20 g Silvadene, über
alle sechs Wunden gleichmäßig verteilt behandelt. Alle
Wunden wurden großflächig mit Brandbinden bedeckt und
in üblicher Weise versorgt. Die Tiere wurden an den Tagen
1, 2, 3, 4, 7, 8, 9, 10 und 11 nach der Operation wie
oben beschrieben anästhetisiert. Der Verband wurde entfernt
und die Wunden wurden leicht mit Betadin abgewischt
und sorgfältig mit Saline gespült. Das betreffende
Mittel wurde aufgetragen und die Wunden wurden
wie oben beschrieben versorgt.
Dieser Assay dient zur Bestimmung der Fähigkeit der
Moleküle an den EGF-Rezeptor zu binden, wobei die Fähigkeit
die Bindung des EGF an seinen Rezeptor zu inhibieren,
gemessen wird. Alle bis jetzt isolierten Wachstumsfaktoren
und chimären Wachstumsfaktoren, modifiziert oder
verkürzt, waren um EGF-Rezeptorbindungs-Inhibierungsassay
wirksam. Eine Zusammenfassung dieser Ergebnisse ist nachfolgend
dargestellt:
Ein Vergleich der Bindungsinhibierungskurven für natürliches
Mäuse-EGF mit dem bakteriell exprimierten rekombinanten
chimären Wachstumsfaktor N/TTV (Fusionspolypeptid
der 32 N-terminalen Aminosäuren des λ-N-Gens
und des modifizierten und verkürzten TGF/VGF-Hybrids)
zeigt, daß keine Unterschiede in der Bindungsaktivität
bestehen.
Die Aktivität mehrerer gereinigter Wachstumsfaktoren
wurde getestet. Die in allen Fällen gemessene Aktivität
war vergleichbar mit der Aktivität von EGF. Die
getesteten Verbindungen sind nachfolgend zusammengestellt:
Die Wirkung von natürlichem oder synthetischem
TGF, EGF und VGF sowie die Wirkung von rekombinanten
Wachstumsfaktoren auf Mittelhautverletzungen wurde
wie im Beispiel VI E.1 beschrieben, bestimmt. Der
Prozentsatz der ursprünglich verbrannten Fläche,
der abgeheilt war, wurde durch computergestützte
Telemetrie gemessen, wobei die prozentuale Re-
Epithelialisierung der Wunde bestimmt wurde. Unbehandelte
Wunden waren zu etwa 15% re-epithelialisiert.
Die Behandlung mit Silvadene alleine oder mit
Silvadene mit EGF führte zu einer etwa 50%igen
Reepithelialisierung. Die Behandlung mit synthetischem
TGF oder natürlichem VGF ergab eine Reepithelialisierung
von etwa 90%. Die optimale Konzentration zur
Förderung der Reepithelialisierung war bei EGF 1 bis
10µg/ml; synthetisches TGF und natürliches VGF
verursachten ein maximales Ansprechen bei 0,1 µg/ml.
Ähnliche Experimente wie die oben beschriebenen wurden
vorgenommen, um den Effekt auf die Wundheilung von
TGF, einer modifizierten, verkürzten Form von VGF
(VGFa) oder einer modifizierten, verkürzten,
chimären Fusion von TGF und VGF (TTV), die alle
durch rekombinante Methoden in Bakterien erzeugt
wurde, zu bestimmen. Die rekombinanten Wachstumsfaktoren
und Hybridwachstumsfaktoren beschleunigten
die Wundheilung im gleichen Ausmaß wie synthetisches
TGF oder natürliches VGF, wobei die optimale
Konzentration bei 0,1 µg/ml lag.
Die Fähigkeit von modifiziertem verkürztem VGFa
die Wundheilung nach Entnahme von Donor-Transplantaten
zu beschleunigen, wurde bestimmt. Der Behandlungsplan
war wie oben beschrieben (siehe Beispiel XI) unter
Verwendung von 1 ml VGFa, 5 µg/ml in 20 g Silvadene.
Von den Wunden wurden täglich Fotographien angefertigt.
Die Ergebnisse sind nachfolgend zusammengestellt:
Das modifizierte VGFa beschleunigte die Wundheilung
im Vergleich zur Kontrolle. Fotografien aim Tag 8
nach der Operation zeigten wesentliche Unterschiede
nach Behandlung mit Saline und VGFa.
1. Das aus BSC-1-Zellen 24 h nach der Infektion mit
VV erhaltene Medium wurde auf die Anwesenheit von
Material getestet, das mit ¹²⁵I-EGF um die Bindung
an EGF-Rezeptor-reiche Human-Epidermoid-Karzinomzellen
(A431) konkurrieren kann. Die VV-infizierten
Zellen setzten eine Aktivität frei, die mit EGF
konkurriert und als VGF bezeichnet wird. Das
Kontrollmedium von mock-infizierten BSC-1-Kontrollkulturen
enthielt eine minimale Aktivität, die mit
EGF konkurriert.
Beim Verfolgen der VGF-Produktion wurden zum
frühesten Untersuchungszeitpunkt (2 h nach Infektion)
höhere VGF-Spiegel im Kulturmedium beobachtet.
Nach 12 h wurde ein Maximum an Aktivität im Kulturüberstand
gefunden. Eine nur leichte Erhöhung war
nach 24 h zu beobachten.
Die VGF-Produktion hat sich als Funktion der
Multiplizität der Virusinfektion erwiesen, wie
in der nachfolgenden Tabelle gezeigt wird.
Die mit EGF konkurrierende und in VV-infizierten BSC-1-
Zellen gefundene Aktivität wurde teilweise aus Säure-
extrahierten Kulturüberständen 24 h nach der Infektion
wie oben beschrieben gereinigt. Säuresolubilisierte
Polypeptide (10,5 mg) aus den Überständen wurden auf
eine mit 1 M Essigsäure äquilibrierte Biogel-P10-Säule
gegeben. Proben jeder Fraktion wurden auf Aktivität, die
mit EGF konkurrierte, getestet. Die wirksamste Fraktion
(Fraktion 42) eluierte kurz nach dem Mr 29 000-Carbon
säureanhydrase-Marker mit einem scheinbaren Mr von 25 000.
Das Molekulargewicht wurde unter Verwendung von vernetzten
Bio-Sil-TSK-250-HPLC-Sizingsäulen bestätigt,
wobei die gesamte Aktivität als Hauptpeak in der Region
des Mr 25 000-Proteinmarkers eluierte. 1 µg teilweise
gereinigtes VGF war äquivalent zu 90 ng EGF im Radio-
Rezeptor-Kompetitionsassay.
Vereinigte Fraktionen aus der Gelfiltrationssäule (25-35)
wurden durch Vakuumzentrifugen konzentriert, in
0,05% Trifluoressigsäure (TFA) resuspendiert, geklärt
und in eine 3,9 mm × 30 cm µBondapak C₁₈-Säule (Waters,
Milford, MA) injiziert. Die Peptide wurden mit einem
linearen Gradienten aus 20 bis 60% Acetonitril in
0,05% TFA bei einer Fließrate von 1,0 ml/Min. bei
22°C eluiert. Aliquote Teile jeder Fraktion wurden in
einem Radiorezeptor-Assay auf EGF-kompetitive Aktivität
untersucht. Das der höchsten Aktivität entsprechende
Peptid wurde isoliert, mit 0,05% TFA verdünnt, in
eine µBondapak-Säule injiziert und unter Anwendung
isokratischer Bedingungen eluiert. Die Acetonitril-
Konzentration war etwa 22 bis 25%.
Ein Vergleich der VGF-Spiegel, die durch BSC-1-Zellen
produziert wurden, welche mit 15 pfu VV pro Zelle
infiziert waren, mit denjenigen von α-TGF, produziert
durch Retrovirus-transformierte Zellen ist in der nachfolgenden
Tabelle gezeigt.
Die biologische Aktivität von in CHO-Zellen hergestelltem
VGF wurde unter Verwendung des EGF-Rezeptor-Bindungsassays
untersucht. Das Kulturwachstumsmedium wurde ohne
weitere Reinigung verwendet. Der Wachstumsfaktor bindet
an den EGF-Rezeptor.
Die biologische Aktivität von teilweise gereinigtem
(etwa 50%) VGF, hergestellt in Seidenraupen unter
Anwendung des EGF-Rezeptor-Bindungsassays bestimmt. Es
erfolgte eine Bindung an den EGF-Rezeptor.
In dem oben beschriebenen Radioimmunoassay wurde ein
50%iger Ersatz des Antigens aus Antikörpern gegen das
Molekül mit 17 Carboxyl-terminalen Aminosäuren des Ratten-
TGF-α bei einer Antigenkonzentration von etwa 0,2 bis
0,3 ng Äquivalenten-EGF (Konkurrenz von ¹²⁵I-markiertem
α-TGF mit α-TGF) beobachtet. Wenn VGF bei äquivalenten
Konzentrationen getestet wurde, war keine Kompetition
zu beobachten. In einem kompetitiven Radioimmunoassay
auf natives EGF, zeigten VGF-Präparationen selbst bei
50 ng EGF-Äquivalenten/ml einen minimalen Ersatz (<10%)
von ¹²⁵I-EGF aus einem polyklonalen Antikörper gegen
natives EGF.
Diese Ergebnisse lassen den Schluß zu, daß VGF ein
potentes Epithelialisierungsmittel ist, das mit anderen
Wachstumsfaktoren vergleichbar ist, die vorher getestet
wurden und die Mitogenaktivität besitzen. Die erfindungsgemäßen
Polypeptide kann man in verschiedenen Wirten zur
Induktion einer Immunogenantwort, zur Erhöhung der Zell-
Proliferation, zur Wundheilung und dergleichen verwenden.
Bei Wunden wird Epithelialisierung und Vaskularisierung
sowie eine rasche Wiederherstellung der Wundfestigkeit,
d. h. Beständigkeit gegenüber Ablösung und Einreißen,
beobachtet. Die hier in Rede stehenden Wirte umfassen
Säugetiere, wie Nagetiere, Haustiere, Primaten und
Menschen.
Erfindungsgemäß werden neue Peptide und Zusammensetzungen
zur Verfügung gestellt, die ein breites Anwendungsgebiet
finden, beispielsweise in der Diagnose, in vitro und in
vivo-Effekte auf Zellen ausüben, als Mitogene wirken,
als Additive in Nährmedien brauchbar sind, als Agonisten
und Antagonisten gegen EGF und TGF brauchbar sind, als
Immunogene und Therapeutika wirken, die Wundheilung
fördern und dergleichen. Weiter werden kleine Oligopeptide
mit Bindungsaktivität zur Verfügung gestellt,
die für sich genommen oder in Kombination mit anderen
Polypeptiden verwendet werden können, mit anderen Polypeptiden
zur Variation der Eigenschaft der anderen Polypeptide
fusioniert werden können, was zu einer Bindung
der Polypeptide an Zellen mit Wachstumsfaktor-Rezeptoren
führt. Auf diese Weise kann man reversibel verschiedene
Polypeptide an Zellen mit Wachstumsfaktor-Rezeptoren
binden, wobei die Eigenschaften der Zellen in vorbestimmter
Weise beeinflußt werden.
Auf die Offenbarung aller Publikationen und Patentanmeldungen,
die in der vorliegenden Anmeldung erwähnt werden,
wird hiermit Bezug genommen.
Claims (39)
1. DNA-Sequenzen, die für Polypeptide kodieren, die
- (1) in der Lage sind, an einen EGF-Rezeptor zu binden,
- (2) im wesentlichen die gleiche Schleifenstruktur besitzen, wie in natürlich vorkommender Wachstumsfaktor, der in der Lage ist, an einen EGF-Rezeptor ("natürlicher Ligand") zu binden und
- (3) zu wenigstens 30% homolog sind mit einem natürlichen
Liganden, wobei das Polypeptid drei Domänen
umfaßt, die jeweils eine Aminosäure darstellen, die
wenigstens zu etwa 30% mit den Fragmenten der
gleichen oder verschiedenen natürlichen Liganden
homolog sind und die die gleiche relative Position
wie die Fragmente der natürlichen Liganden einnehmen,
wobei es sich bei den erwähnten Domänen um
folgende handelt:
eine erste Domäne von wenigstens etwa 11 N-terminalen Aminosäuren, beginnend etwa bei Aminosäure aa-6 bis aa¹ und endend bei etwa Aminosäure aa¹¹ bis aa¹⁵;
eine zweite Domäne mit wenigstens etwa 11 Zentralfragment- Aminosäuren, beginnend etwa bei Aminosäure aa¹¹ bis aa¹⁵ und endend etwa bei Aminsäure aa²⁵ bis aa²⁹;
eine dritte Domäne von wenigstens etwa 14 C-terminalen Aminosäuren, beginnend etwa bei Aminosäure aa²⁵ bis aa²⁹ und endend etwa bei Aminosäure aa⁴⁰ bis aa⁴³; und
wobei die DNA-Sequenz gegebenenfalls zusätzlich für eine vierte Domäne von wenigstens etwa 6 extremen N-terminalen Aminosäuren kodiert, beginnend etwa bei Aminosäure aa-7 bis aa-1 und endend etwa bei Aminosäure aa-45 bis aa-7, wobei gegebenenfalls eine Aminosäuresequenz, die selektiv gespalten werden kann, am Carboxy-Terminus der vierten Domäne insertiert und mit dem Aminoterminus der ersten Domäne verbunden ist, unter der Voraussetzung, daß, wenn das Polypeptid eine mit dem natürlichen Liganden identische Aminosäuresequenz besitzt, die für die vierte Domäne kodierende DNA-Sequenz vorhanden ist und für andere Aminosäuren kodiert als für die extremen N-terminalen Aminosäuren des natürlichen Liganden.
2. DNA-Sequenzen nach Anspruch 1, dadurch gekennzeichnet,
daß der natürliche Ligand VGF, TGF-α, MGF, EGF, SFGF
oder Amphiregulin ist.
3. DNA-Sequenzen nach Anspruch 1 oder 2, dadurch gekennzeichnet,
daß die DNA-Sequenz zusätzlich für eine
Leadersequenz kodiert, wobei gegebenenfalls eine
Aminosäuresequenz, die selektiv gespalten werden kann,
am Carboxy-Terminus der Leadersequenz insertiert und
mit dem Aminoterminus der ersten Domäne, oder wenn die
vierte Domäne vorhanden ist, mit dem Aminoterminus der
vierten Domäne verbunden ist.
3. DNA-Sequenzen nach Anpruch 3, dadurch gekennzeichnet,
daß die Leadersequenz ein N-terminales Fragment eines
λ-N-Proteins, λ-cro-Proteins oder des Amphiregulins
ist.
5. DNA-Sequenzen nach Anspruch 3, dadurch gekennzeichnet,
daß die Leadersequenz eine Signalsequenz oder ein Mutant
davon ist.
6. DNA-Sequenzen nach Anspruch 5, dadurch gekennzeichnet,
daß die Signalsequenz eine alkalische
Phosphatase-Signalsequenz, eine Affen-TGF-β-Signalsequenz
oder eine K. Lactis-Killertoxin-Signalsequenz
ist.
7. DNA-Sequenzen nach einem der Ansprüche 1 bis 6, dadurch
gekennzeichnet, daß wenigstens eine der Domänen
zu wenigstens etwa 30% homolog mit einem Fragment von
VGF, TGF-α, EGF oder SFGF ist.
8. DNA-Sequenzen nach eineem der Ansprüche 1, 4 oder 6,
dadurch gekennzeichnet, daß die DNA-Sequenz für VGF
kodiert.
9. DNA-Sequenzen nach einem der Ansprüche 1, 4 oder 6,
dadurch gekennzeichnet, daß die DNA-Sequenz für TGF
kodiert.
10. DNA-Sequenzen nach einem der Ansprüche 1, 4 oder 6,
dadurch gekennzeichnet, daß die DNA-Sequenz für EGF
kodiert.
11. DNA-Sequenzen nach Anspruch 1, dadurch gekennzeichnet,
daß die DNA-Sequenz für SFGF kodiert.
12. DNA-Sequenzen nach Anspruch 1, dadurch gekennzeichnet,
daß die Sequenz wenigstens eine Änderung in der für einen
natürlichen Liganden kodierenden Sequenz umfaßt, derart,
daß die Aminosäuresequenzen HGD in HGT; GMYC in GYAC;
RCS in VCS; CLHGDC in CLHGTC und GMYCRC in GYACVC
geändert sind.
13. DNA-Sequenzen, kodierend für ein Polypeptid und eine
Leadersequenz von etwa 8 bis 45 N-terminalen Aminosäuren
von einem Bakteriophagen-λ-N-Protein oder cro-Protein,
Amphiregulin, T4-Gen 32 oder einer bakteriellen
alkalischen Phosphatase-Signalsequenz, einschließlich
der Modifikationen davon, welche mit dem Amino-Terminus
des Polypeptids, gegebenenfalls über eine selektiv
spaltbare Aminosäuresequenz, verbunden ist, wobei das
Polypeptid drei Domänen umfaßt und die Sequenz jeder
Domäne wenigstens im wesentlichen der Sequenz eines
Fragments eines natürlich vorkommenden Wachstumsfaktors,
der in der Lage ist, an einen EGF-Rezeptor
zu binden ("natürlicher Ligand"), entspricht und die
gleiche relative Position wie die Fragmente des natürlichen
Liganden aufweist, wobei es sich um folgende
Domänen handelt:
eine erste Domäne mit wenigstens etwa 11 N-terminalen Aminosäuren, beginnend etwa bei Aminosäure aa-6 bis aa¹ und endend etwa bei Aminsosäure aa¹¹ bis aa¹⁵;
eine zweite Domäne mit wenigstens etwa 11 Zentralfragment- Aminosäuren, beginnend etwa bei Aminosäure aa¹¹ bis aa¹⁵ und endend etwa bei etwa Aminosäure aa²⁵ bis aa²⁹;
eine dritte Domäne mit wenigstens etwa 14 Amino- C-terminalen Aminosäuren, beginnend etwa bei Aminosäure aa²⁵ bis aa²⁹ und endend etwa bei Aminosäure aa⁴⁰ bis aa⁴⁷.
eine erste Domäne mit wenigstens etwa 11 N-terminalen Aminosäuren, beginnend etwa bei Aminosäure aa-6 bis aa¹ und endend etwa bei Aminsosäure aa¹¹ bis aa¹⁵;
eine zweite Domäne mit wenigstens etwa 11 Zentralfragment- Aminosäuren, beginnend etwa bei Aminosäure aa¹¹ bis aa¹⁵ und endend etwa bei etwa Aminosäure aa²⁵ bis aa²⁹;
eine dritte Domäne mit wenigstens etwa 14 Amino- C-terminalen Aminosäuren, beginnend etwa bei Aminosäure aa²⁵ bis aa²⁹ und endend etwa bei Aminosäure aa⁴⁰ bis aa⁴⁷.
14. DNA-Sequenzen nach Anspruch 13, dadurch gekennzeichnet,
daß die Leadersequenz etwa 32 oder 33 N-terminale
Aminosäuren des N-Gens umfaßt.
15. DNA-Sequenzen nach Anspruch 14, dadurch gekennzeichnet,
daß das Polypeptid TGF-α, VGF, VGFA, VGFa
oder EGF ist.
16. DNA-Sequenzen nach Anspruch 13, dadurch gekennzeichnet,
daß die Leadersequenz eine alkalische
Phosphatase-Signalsequenz oder eine modifizierte
alkalische Phosphatase-Signalsequenz ist.
17. DNA-Sequenzen nach Anspruch 16, dadurch gekennzeichnet,
daß das Polypeptid VGFa, nVGFa oder EGF ist.
18. DNA-Sequenzen nach Anspruch 14, dadurch gekennzeichnet,
daß das Polypeptid folgende Aminosäuresequenz besitzt:
MVVSHFNDCPDSHTQFCFHG
TCRFLVQEEKPACVCSHGYT
GIRCQHVVLVDYQR.
MVVSHFNDCPDSHTQFCFHG
TCRFLVQEEKPACVCSHGYT
GIRCQHVVLVDYQR.
19. DNA-Sequenzen nach Anspruch 14, dadurch gekennzeichnet,
daß das Polypeptid folgende Aminosäuresequenz besitzt:
MDIPAIRLCGPEGDGYCLHG
TCRFLVQEEKPACVCSHGYT
GIRCQHVVLVDYQR.
MDIPAIRLCGPEGDGYCLHG
TCRFLVQEEKPACVCSHGYT
GIRCQHVVLVDYQR.
20. DNA-Sequenzen nach Anspruch 14, dadurch gekennzeichnet,
daß das Polypeptid die folgende Aminosäuresequenz besitzt:
MVVSHFNDCFDSHTQFCFHGT
CIHARDIDGYACVCSHGYTGI
RCQHVVLVDYQR.
MVVSHFNDCFDSHTQFCFHGT
CIHARDIDGYACVCSHGYTGI
RCQHVVLVDYQR.
21. DNA-Sequenzen nach Anspruch 13, dadurch gekennzeichnet,
daß die Leadersequenz etwa 21 N-terminale
Aminosäuren des Cro-Proteins umfaßt.
22. DNA-Sequenzen nach Anspruch 21, dadurch gekennzeichnet,
daß das Polypeptid die folgende Aminosäuresequenz
besitzt:
MVVSHFNDCFDSHTQFCFHG
TCRFLVQEEKPACVCSHGYT
GIRCQHVVLVDYQR.
MVVSHFNDCFDSHTQFCFHG
TCRFLVQEEKPACVCSHGYT
GIRCQHVVLVDYQR.
23. DNA-Sequenzen nach Anspruch 13, dadurch gekennzeichnet,
daß die Leadersequenz etwa 8 Amino-N-
terminale Aminosäuren des T4-Gens 32 umfaßt.
24. DNA-Sequenzen nach Anspruch 23, dadurch gekennzeichnet,
daß das Polypeptid folgende Aminosäuresequenz
besitzt:
VVSHFNDCPDSHTQFCFHGT
CRFLVQEEKPACVCSHGYTG
IRCQHVVLVDYQR.
VVSHFNDCPDSHTQFCFHGT
CRFLVQEEKPACVCSHGYTG
IRCQHVVLVDYQR.
25. Expressionskassette, umfassend in Transkriptionsrichtung
eine in einer Gastzelle funktionelle, Transkriptions-
und Translations-Initiierungs-Regulatorregion;
eine DNA-Sequenz nach einem der Ansprüche 1 bis
24 und eine in der Gastzelle funktionelle, Transkriptions-
und Translations-Terminations-Regulatorregion.
26. Gastzelle, enthaltend eine Expressionskassette nach
Anspruch 25.
27. Plasmide, enthaltend die funktionellen Domänen von
pBM11/NDP/EGF, pBM11/PAD/EGF; pBM11/PAK/EGF;
pBM11/N/TGF; pBM11/NDP/VGFA; pBM11/NDP/VGFa;
pBM11/PAD/nVGFa; pBM11/PAK/nVGFa; pRSV/VGF; pAc/SFGF;
pAc/VGF; ptac/TTV; TacPak/EGF; pTCPt/EGF; pTCPt/nVGFa;
pBM11/N/TTV, pBM11/NDP/TTV; pBM11/NDP/VTV;
pBM16/NDP/TVV.
pBM11/NDP/EGF, pBM11/PAD/EGF; pBM11/PAK/EGF;
pBM11/N/TGF; pBM11/NDP/VGFA; pBM11/NDP/VGFa;
pBM11/PAD/nVGFa; pBM11/PAK/nVGFa; pRSV/VGF; pAc/SFGF;
pAc/VGF; ptac/TTV; TacPak/EGF; pTCPt/EGF; pTCPt/nVGFa;
pBM11/N/TTV, pBM11/NDP/TTV; pBM11/NDP/VTV;
pBM16/NDP/TVV.
28. Polypeptide, dadurch gekennzeichnet, daß sie
- (1) in der Lage sind, an einen EGF-Rezeptor zu binden,
- (2) im wesentlichen die gleiche Schleifenstruktur besitzen, wie ein natürlich vorkommender Wachstumsfaktor, der in der Lage ist, an einen EGF-Rezeptor ("natürlicher Ligand") zu binden und
- (3) zu wenigstens 30% homolog sind mit einem natürlichen
Liganden, wobei das Polypeptid drei Domänen
umfaßt, die jeweils eine Aminosäure darstellen, die
wenigstens zu etwa 30% mit den Fragmenten der
gleichen oder verschiedenen natürlichen Liganden
homolog sind und die die gleiche relative Position
wie die Fragmente der natürlichen Liganden einnehmen,
wobei es sich bei den erwähnten Domänen um
folgende handelt:
eine erste Domäne von wenigstens etwa 11 N-terminalen Aminosäuren, beginnend etwa bei Aminosäure aa-6 bis aa¹ und enden etwa bei Aminosäure aa¹¹ bis aa¹⁵;
eine zweite Domäne mit wenigstens etwa 11 Zentralfragment- Aminosäuren, beginnend etwa bei Aminosäure aa¹¹ bis aa¹⁵ und endend etwa bei Aminosäure aa²⁵ bis aa²⁹;
eine dritte Domäne von wenigstens etwa 14 C-terminalen Aminosäuren, beginnend etwa bei Aminosäure aa²⁵ bis aa²⁹ und endend etwa bei Aminosäure aa⁴⁰ bis aa⁴³; und
wobei die DNA-Sequenz gegebenenfalls zusätzlich für eine vierte Domäne von wenigstens etwa 6 extremen N-terminalen Aminosäuren kodiert, beginnend etwa bei Aminosäure aa-7 bis aa-1 und enden etwa bei Aminosäure aa-45 bis aa-7, wobei gegebenenfalls eine Aminosäuresequenz, die selektiv gespalten werden kann, am Carboxy-Terminus der vierten Domäne insertiert und mit dem Aminoterminus der ersten Domäne verbunden ist, unter der Voraussetzung, daß, wenn das Polypeptid eine mit dem natürlichen Liganden identische Aminosäuresequenz besitzt, die für die vierte Domäne kodierende DNA-Sequenz vorhanden ist und für andere Aminosäuren kodiert als für die extremen N-terminalen Aminosäuren des natürlichen Liganden.
29. Verfahren zur Herstellung eines Polypeptids nach
Anspruch 28, dadurch gekennzeichnet, daß man eine
Gastzelle, die die Expressionskassette nach Anspruch
25 enthält, in einem geeigneten Kulturmedium kultiviert,
wobei das Polypeptid exprimiert wird, und das Polypeptid
isoliert.
30. Polypeptide mit folgender Aminosäuresequenz oder
Fragmente davon mit wenigstens 37 Aminosäuren, die
wenigstens etwa die Aminosäuren 1 bis 37 umfassen:
worin
X¹ eine Bindung oder eine Aminosäure bedeutet;
X² eine Bindung oder 1 bis 2 Aminosäuren bedeutet;
X³ eine Bindung oder 1 bis 4 Aminosäuren bedeutet;
wobei X¹, X² und X³ gleich oder verschieden sein können.
X¹ eine Bindung oder eine Aminosäure bedeutet;
X² eine Bindung oder 1 bis 2 Aminosäuren bedeutet;
X³ eine Bindung oder 1 bis 4 Aminosäuren bedeutet;
wobei X¹, X² und X³ gleich oder verschieden sein können.
31. Polypeptide nach Anspruch 30, wobei wenigstens eine
der nachstehenden Aminosäuren die angegebene Bedeutung
besitzt:
aa¹⁴ steht für Threonin; aa²⁴ steht für Tyrosin; aa²⁵ steht für Analin und aa²⁷ steht für Valin.
aa¹⁴ steht für Threonin; aa²⁴ steht für Tyrosin; aa²⁵ steht für Analin und aa²⁷ steht für Valin.
32. Polypeptide nach Anspruch 30, wobei die Aminosäuresequenz
aa-6 bis aa⁴⁷ umfaßt.
33. Polypeptide nach Anspruch 32, wobei aa¹⁴ für Threonin,
aa²⁴ für Tyrosin und aa²⁵ für Analin steht.
34. Polypeptide nach Anspruch 33, wobei die Aminosäuren
aa-6 bis aa¹³ der Aminosäuresequenz durch die folgende
Aminosäuresequenz ersetzt sind:
35. Polypeptid nach Anspruch 33, wobei die Aminosäuren
aa¹⁴ bis aa²⁷ der Aminosäuresequenz durch die folgende
Aminosäuresequenz ersetzt sind:
36. Polypeptide nach Anspruch 35, wobei aa²² durch Glutaminsäure
ersetzt ist.
37. DNA-Sequenzen, die für ein Polypeptid
nach einem der Ansprüche 30 bis 36 kodieren.
38. Pharmazeutisches Mittel, enthaltend wenigstens ein
Polypeptid nach einem der Ansprüche 28 oder 30 bis 36,
gegebenenfalls zusammen mit pharmazeutisch üblichen
Trägern und/oder Zusatzstoffen.
39. Verwendung der Polypeptide nach einem der Ansprüche
28 oder 30 bis 36 in Nährmedien und bei Diagnoseassays.
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Cited By (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP0444961A1 (de) * | 1990-03-02 | 1991-09-04 | Bristol-Myers Squibb Company | Her3: Ein neues EGF-Rezeptor Homologes |
EP0739984A1 (de) * | 1995-04-26 | 1996-10-30 | San Tumorforschungs-Gmbh | Bivalente Polypeptiden die mindestens zwei Bereichen enthalten |
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JPS6028994A (ja) * | 1983-07-08 | 1985-02-14 | Wakunaga Seiyaku Kk | 〔21―ロイシン〕ヒトウロガストロン |
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JP2554459B2 (ja) * | 1984-07-02 | 1996-11-13 | アース製薬 株式会社 | β−ウロガストロン遺伝子、対応プラスミド組換体及び対応形質転換体 |
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GB8507666D0 (en) * | 1985-03-25 | 1985-05-01 | Wellcome Found | Epidermal growth factor production |
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GB2210618B (en) * | 1987-10-08 | 1991-10-16 | British Bio Technology | Synthetic egf gene |
EP0372005A4 (de) * | 1987-10-30 | 1990-06-26 | Oncogen | Expressionssysteme zur erzeugung von polypeptiden in prokaryotischen zellen. |
ES2081801T3 (es) * | 1987-10-30 | 1996-03-16 | Bristol Myers Squibb Co | Plasmidos de expresion. |
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-
1992
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Cited By (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP0444961A1 (de) * | 1990-03-02 | 1991-09-04 | Bristol-Myers Squibb Company | Her3: Ein neues EGF-Rezeptor Homologes |
EP0739984A1 (de) * | 1995-04-26 | 1996-10-30 | San Tumorforschungs-Gmbh | Bivalente Polypeptiden die mindestens zwei Bereichen enthalten |
EP0910569A1 (de) * | 1996-04-10 | 1999-04-28 | Human Genome Sciences, Inc. | Extrazellulären proteinen oder epidermalen wachstums faktoren ähnelndes protein |
EP0910569A4 (de) * | 1996-04-10 | 2002-05-08 | Human Genome Sciences Inc | Extrazellulären proteinen oder epidermalen wachstums faktoren ähnelndes protein |
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