ORF7b

ORF7b
베타코로나바이러스NS7B단백질
식별자
기호.bCoV_NS7B
팜PF11395
인터프로IPR021532

ORF7b는 베타코로나바이러스속 코로나바이러스에서 발견되는 유전자로, 보조 단백질인 베타코로나바이러스 NS7b 단백질을 [1]발현한다.그것은 알려지지 않은 [1][2]기능을 가진 짧고, 매우 소수성이 강한 막 통과 단백질이다.

구조.

ORF7b 단백질은 세포질에서 [1]막 위상이 C 말단을 지향하는 단일 막 통과 나선을 가진 막 통과 단백질이다.SARS-CoV에서는 44개의 아미노산 잔류물이고, SARS-CoV-2에서는 약 85%의 염기서열 [2]동일성을 가진 43개의 잔류물이다.

표현과 현지화

ORF7b는 ORF7a와 [3]겹치는 중복 유전자이다.단백질은 아마도 유출 [1]스캔을 통해 하위 유전자 RNA에서 발현될 것이다.SARS-CoV에서는 Golgi 기구에 국소화되어 있으며, Golgi 기구는 막 통과 나선 서열을 [1][4]필요로 한다.SARS-CoV-2에서는 소포체와 [5]관련이 있는 것으로 보고되었다.

기능.

ORF7b 단백질의 기능은 잘 특성화되지 않았습니다.사스-CoV의 삭제가 [1][6]복제에 영향을 미치는지 여부에 대한 연구에서 일관되지 않은 증거가 있지만 바이러스 [1][3]복제에 필수적인 것은 아니다.SARS-CoV에서, 그것은 바이러스 이온에 포함된 것으로 확인되었고, 이것은 작은 바이러스 구조 [1][7]단백질임을 암시합니다.ORF7b 영역에서 결실 돌연변이를 일으켜 ORF7b와 ORF8 사이의 융합단백질을 발생시키는 SARS-CoV-2 변이가 명확하지 않은 [2][8]것으로 확인되었다.

레퍼런스

  1. ^ a b c d e f g h Liu, DX; Fung, TS; Chong, KK; Shukla, A; Hilgenfeld, R (September 2014). "Accessory proteins of SARS-CoV and other coronaviruses". Antiviral Research. 109: 97–109. doi:10.1016/j.antiviral.2014.06.013. PMC 7113789. PMID 24995382.
  2. ^ a b c Redondo, Natalia; Zaldívar-López, Sara; Garrido, Juan J.; Montoya, Maria (7 July 2021). "SARS-CoV-2 Accessory Proteins in Viral Pathogenesis: Knowns and Unknowns". Frontiers in Immunology. 12: 708264. doi:10.3389/fimmu.2021.708264. hdl:10261/249329. PMC 8293742. PMID 34305949.
  3. ^ a b Pekosz, Andrew; Schaecher, Scott R.; Diamond, Michael S.; Fremont, Daved H.; Sims, Amy C.; Baric, Ralph S. (2006). "Structure, Expression, and Intracellular Localization of the SARS-CoV Accessory Proteins 7a and 7b". The Nidoviruses. Advances in Experimental Medicine and Biology. 581: 115–120. doi:10.1007/978-0-387-33012-9_20. ISBN 978-0-387-26202-4. PMC 7123408. PMID 17037516.
  4. ^ Schaecher, Scott R.; Diamond, Michael S.; Pekosz, Andrew (October 2008). "The Transmembrane Domain of the Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus ORF7b Protein Is Necessary and Sufficient for Its Retention in the Golgi Complex". Journal of Virology. 82 (19): 9477–9491. doi:10.1128/JVI.00784-08. PMC 2546951. PMID 18632859.
  5. ^ Zhang, Jing; Cruz-cosme, Ruth; Zhuang, Meng-Wei; Liu, Dongxiao; Liu, Yuan; Teng, Shaolei; Wang, Pei-Hui; Tang, Qiyi (December 2020). "A systemic and molecular study of subcellular localization of SARS-CoV-2 proteins". Signal Transduction and Targeted Therapy. 5 (1): 269. doi:10.1038/s41392-020-00372-8. PMC 7670843. PMID 33203855.
  6. ^ McBride, Ruth; Fielding, Burtram (7 November 2012). "The Role of Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS)-Coronavirus Accessory Proteins in Virus Pathogenesis". Viruses. 4 (11): 2902–2923. doi:10.3390/v4112902. PMC 3509677. PMID 23202509.
  7. ^ Schaecher, Scott R.; Mackenzie, Jason M.; Pekosz, Andrew (15 January 2007). "The ORF7b Protein of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus (SARS-CoV) Is Expressed in Virus-Infected Cells and Incorporated into SARS-CoV Particles". Journal of Virology. 81 (2): 718–731. doi:10.1128/JVI.01691-06. PMC 1797472. PMID 17079322.
  8. ^ Su, Yvonne C. F.; Anderson, Danielle E.; Young, Barnaby E.; Linster, Martin; Zhu, Feng; Jayakumar, Jayanthi; Zhuang, Yan; Kalimuddin, Shirin; Low, Jenny G. H.; Tan, Chee Wah; Chia, Wan Ni; Mak, Tze Minn; Octavia, Sophie; Chavatte, Jean-Marc; Lee, Raphael T. C.; Pada, Surinder; Tan, Seow Yen; Sun, Louisa; Yan, Gabriel Z.; Maurer-Stroh, Sebastian; Mendenhall, Ian H.; Leo, Yee-Sin; Lye, David Chien; Wang, Lin-Fa; Smith, Gavin J. D. (25 August 2020). "Discovery and Genomic Characterization of a 382-Nucleotide Deletion in ORF7b and ORF8 during the Early Evolution of SARS-CoV-2". mBio. 11 (4). doi:10.1128/mBio.01610-20. hdl:11343/277716. PMC 7374062. PMID 32694143.