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WO2022177394A1 - Pd-l1 및 cd47에 대한 이중특이적 단일 도메인 항체 및 이의 용도 - Google Patents

Pd-l1 및 cd47에 대한 이중특이적 단일 도메인 항체 및 이의 용도 Download PDF

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WO2022177394A1
WO2022177394A1 PCT/KR2022/002530 KR2022002530W WO2022177394A1 WO 2022177394 A1 WO2022177394 A1 WO 2022177394A1 KR 2022002530 W KR2022002530 W KR 2022002530W WO 2022177394 A1 WO2022177394 A1 WO 2022177394A1
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WO
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amino acid
acid sequence
antibody
seq
antigen
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Application number
PCT/KR2022/002530
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English (en)
French (fr)
Inventor
성승용
이상범
Original Assignee
(주)샤페론
서울대학교 산학협력단
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Publication date
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    • C07K2319/30—Non-immunoglobulin-derived peptide or protein having an immunoglobulin constant or Fc region, or a fragment thereof, attached thereto

Definitions

  • the present invention relates to a bispecific single domain antibody against the immune checkpoint proteins PD-L1 and CD47 and uses thereof.
  • the immune cells of cancer patients develop tolerance to cancer antigens and can recognize cancer cells, but they are functionally suppressed and cannot effectively eliminate cancer cells.
  • the key to immunotherapy is to wake up immune cells that have fallen into resistance and induce them to become activated immune cells to destroy cancer cells.
  • Such immunotherapy includes cytokine therapeutics such as IFN- ⁇ and IL-2, cancer vaccines using dendritic cells, cell therapy using T cells, and immune checkpoint inhibitors (ICI) that block immune checkpoint proteins. ) and the like, and such therapeutic agents are commonly referred to as immuno-oncology therapy.
  • immune checkpoint inhibitors which are being developed competitively by international pharmaceutical companies, are immune checkpoint inhibitors.
  • Immune checkpoint protein is a cell membrane protein that inhibits the differentiation, proliferation, and activity of immune cells. Specifically, this protein is usually expressed in activated T cells, and is also called a co-inhibitory molecule because it has the function of reducing T cell proliferation, cytokine secretion, and cytotoxicity, and inhibiting excessive T cell activity.
  • co-inhibitory receptors CTLA-4 and PD-1 are expressed in T cells, and thus T cell activity is regulated through binding to the respective ligands B7.1/2 and PD-L1.
  • PD-L1 is expressed in cancer cells and inactivates cancer-specific T cells and induces apoptosis to protect cancer cells from immune attack by T cells. it can also be In addition, it is reported that cancer patients in which PD-L1 is ectopicly expressed in cancer cells have a worse prognosis than cancer patients who do not.
  • Immune checkpoint inhibitors are drugs that attack cancer cells by activating T cells by blocking the activity of immune checkpoint proteins involved in T cell suppression.
  • antibodies that recognize CTLA-4, PD-1, and PD-L1 are used.
  • the CTLA-4 inhibitor ipilimumab (Yervoy) was the first immune checkpoint inhibitor to obtain FDA approval in 2011 as a second-line treatment for metastatic melanoma.
  • the PD-1 blockers nivolumab (Opdivo) and pembrolizumab (Keytruda) obtained FDA approval for metastatic melanoma, respectively.
  • Atezolizumab (Tecentriq), an immune checkpoint inhibitor for PD-L1, was used for bladder cancer (2016), and avelumab (Bavencio) was used for the treatment of metastatic merkle cell carcinoma, a type of skin cancer, Dervaru. Mab (durvalumab (Imfinzi)) received FDA approval in 2017 for bladder cancer.
  • the PD-1 inhibitor chemiplimab (Libtayo) received FDA approval for squamous cell carcinoma.
  • these drugs are gaining FDA approval for the treatment of a growing number of carcinomas, expanding therapeutic indications.
  • six PD-1/PD-L1 inhibitors have been approved by the FDA for a total of 18 carcinomas.
  • immunomodulatory proteins such as B7-H4, ICOS, HVEM, PDL-2, and PVRIG are entering preclinical trials as new targets. Most of these therapeutics target a target expressed on T cells.
  • PD-L1 Programmed Death-Ligand 1
  • PD-1 Protein-Linked Death-Ligand 1
  • CD47 Cluster of Differentiation 47
  • NHL non-Hodgkin's lymphoma
  • MM multiple myeloma
  • ALL acute lymphoblastic leukemia
  • AML acute myeloid leukemia
  • CD47 is expressed on the cell surface and interacts with SIRP alpha (SIRPa), thrombospondin-1 (TSP1) and integrin proteins to participate in cell death, proliferation and immune responses.
  • SIRPa SIRP alpha
  • TSP1 thrombospondin-1
  • CD47 expressed in tumor cells interacts with SIRP alpha (SIRPa) expressed on the surface of macrophages to send a “don’t eat me” signal, thereby avoiding the phagocytosis of macrophages as well as tumor cells. It promotes the proliferation and growth of tumor cells by inhibiting vascular proliferation and the role of effector T-cells in the environment.
  • the present inventors have reached the present application by developing an immune checkpoint inhibitor that targets the immune checkpoint proteins PD-L1 and CD47.
  • the present invention provides a first single domain antibody (first sdAb) or antigen-binding fragment thereof that specifically binds to PD-L1 and a second single domain antibody that specifically binds to CD47 (second sdAb) or an antigen-binding fragment thereof bispecific antibody that bispecifically binds to PD-L1 and CD47 is provided.
  • the first sdAb or antigen-binding fragment thereof comprises CDR1 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2; CDR2 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 3; And it may include a CDR3 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 4.
  • the second sdAb or antigen-binding fragment thereof is CDR1 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 7; CDR2 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 8; And it may include a CDR3 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 9.
  • the first sdAb or antigen-binding fragment thereof is FR1 consisting of an amino acid sequence represented by any one of SEQ ID NOs: 13 and 17; FR2 consisting of the amino acid sequence shown in any one of SEQ ID NOs: 14 and 18; FR3 consisting of an amino acid sequence represented by any one of SEQ ID NOs: 15 and 19; And it may include a VHH domain comprising FR4 consisting of the amino acid sequence shown in any one of SEQ ID NOs: 16 and 20, more specifically (1) FR1 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 13; FR2 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 14; FR3 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 15; and FR4 consisting of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 16; or (2) FR1 consisting of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 17; FR2 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 18; FR3 consisting of the amino acid
  • first sdAb or antigen-binding fragment thereof may be monovalent, divalent, trivalent, tetravalent, or higher valency.
  • first sdAb or antigen-binding fragment thereof may be fused to each other via a peptide linker, and in some embodiments, includes the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 21.
  • the second sdAb or antigen-binding fragment thereof is FR1 consisting of an amino acid sequence represented by any one of SEQ ID NOs: 13 and 17; FR2 consisting of the amino acid sequence shown in any one of SEQ ID NOs: 14 and 18; FR3 consisting of an amino acid sequence represented by any one of SEQ ID NOs: 15 and 19; And it may include a VHH domain comprising FR4 consisting of the amino acid sequence shown in any one of SEQ ID NOs: 16 and 20, more specifically (1) FR1 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 13; FR2 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 14; FR3 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 15; and FR4 consisting of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 16; or (2) FR1 consisting of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 17; FR2 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 18; FR3 consisting of the amino acid
  • the second sdAb or antigen-binding fragment thereof may be monovalent, divalent, trivalent, tetravalent, or higher valency.
  • the second sdAb or antigen-binding fragment thereof may be fused to each other via a peptide linker.
  • the first sdAb or antigen-binding fragment thereof and/or the second sdAb or antigen-binding fragment thereof may be fused to each other via a peptide linker, and in some embodiments, represented by SEQ ID NO: 11 amino acid sequence.
  • the first sdAb and/or the second sdAb may comprise at least one or more amino acid substitutions, the at least one or more amino acid substitutions may be conservative substitutions, and non-genetic amino acids It may be a substitution with a coding amino acid or a synthetic amino acid.
  • HCAb heavy chain-only antibody in which an Fc fragment is fused to the first sdAb or antigen-binding fragment thereof, or to the second sdAb or antigen-binding fragment thereof.
  • bispecific and multivalent e.g., bivalent, 3 valency, tetravalent, or higher valency
  • the Fc fragment may be a fused HCAb.
  • the HCAb may consist of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 12.
  • sdAb may be fused to the Fc fragment via a peptide linker, and the Fc fragment may be human IgG1, IgG2, IgG3 or IgG4.
  • the HCAb may comprise at least one or more amino acid substitutions, wherein the at least one or more amino acid substitutions may be conservative substitutions, and substitution of amino acids with non-genetically encoded amino acids or synthetic amino acids.
  • an immunomodulatory agent, cytokine, cytotoxic agent, chemotherapeutic agent, diagnostic agent, antiviral agent, antimicrobial agent or drug may be conjugated.
  • the present invention provides a bispecific antibody that bispecifically binds to PD-L1 and CD47 conjugated to an immunomodulatory agent, cytokine, cytotoxic agent, chemotherapeutic agent, diagnostic agent, antiviral agent, antimicrobial agent or drug. It provides an antibody conjugate comprising.
  • the present invention also provides a nucleic acid molecule encoding the bispecific antibody that bispecifically binds to said PD-L1 and CD47.
  • the present invention provides an expression vector comprising the nucleic acid molecule.
  • the present invention provides a host cell transformed with the expression vector.
  • It provides a method for producing a bispecific antibody that bispecifically binds to PD-L1 and CD47, comprising a.
  • the present invention provides a bispecific antibody that bispecifically binds to PD-L1 and CD47, or a pharmaceutical composition for preventing or treating cancer containing the antibody conjugate as an active ingredient;
  • a method for preventing or treating cancer comprising administering to an individual a pharmaceutically effective amount of the bispecific antibody or the antibody conjugate that bispecifically binds to the PD-L1 and CD47; and the bispecific antibody that bispecifically binds to PD-L1 and CD47, or the use of the antibody conjugate for use in the prevention or treatment of cancer.
  • the cancer is melanoma, lung cancer, liver cancer, glioblastoma, ovarian cancer, colorectal cancer, head and neck cancer, bladder cancer, renal cell cancer, stomach cancer, breast cancer, metastatic cancer, prostate cancer, pancreatic cancer, non-Hodgkin's lymphoma , Hodgkin's lymphoma, multiple myeloma, leukemia, lymphoma, myelodysplastic syndrome, acute lymphoblastic leukemia, acute myeloid leukemia, chronic lymphocytic leukemia, chronic myelogenous leukemia, solitary myeloma and aplastic anemia. .
  • the pharmaceutical composition may further include a pharmaceutically acceptable carrier.
  • CHO-K1_PD-L1 cell line (CHO-K1 cells induced to express PD-L1 antigen) prepared according to an embodiment of the present invention and anti-PD-L1 HCAb (PDL1 Nb#01-IgG1) It is a diagram confirming the binding capacity (EC50) to the PD-L1 antigen expressed on the cell surface in response to each concentration.
  • Figure 1b shows the anti-PD-L1 HCAb (PDL1) after binding of the PD-1 protein to the CHO-K1_PD-L1 cell line (CHO-K1 cells induced to express the PD-L1 antigen) prepared according to an embodiment of the present invention; It is a diagram confirming the inhibitory ability (IC50) of Nb#01-IgG1) on the PD-L1/PD-1 interaction.
  • Figure 2a is a CHO-K1_PD-L1 cell line (CHO-K1 cells induced expression of the PD-L1 antigen) prepared according to an embodiment of the present invention and anti-PD-L1 bivalent HCAb (PP Nb-IgG4) It is a diagram confirming the binding capacity (EC50) to the PD-L1 antigen expressed on the cell surface in response to each concentration.
  • Figure 2b shows the anti-PD-L1 bivalent HCAb after binding of the PD-1 protein to the CHO-K1_PD-L1 cell line (CHO-K1 cells induced to express the PD-L1 antigen) prepared according to an embodiment of the present invention; It is a diagram confirming the inhibitory ability (IC50) of (PP Nb-IgG4) on the PD-L1/PD-1 interaction.
  • Figure 3a shows the expression on the cell surface by reacting the Expi-CHO_CD47 cell line (Expi-CHO cells induced to express CD47 antigen) prepared according to an embodiment of the present invention and anti-CD47 HCAb (CD47 Nb-IgG4) by concentration. It is a diagram confirming the binding ability (EC50) to the CD47 antigen.
  • FIG. 3b shows that after binding of the Expi-CHO_CD47 cell line (Expi-CHO cells induced to express CD47 antigen) prepared according to an embodiment of the present invention and the SIRPalpha protein, the anti-CD47 HCAb (CD47 Nb-IgG4) CD47/SIRPalpha It is a diagram confirming the inhibitory ability (IC50) on the interaction.
  • CHO-K1_PD-L1 cell line (CHO-K1 cells induced to express PD-L1 antigen) and anti-PD-L1 ⁇ CD47 HCAb (PPC Nb-IgG4) prepared according to an embodiment of the present invention. It is a diagram confirming the binding capacity (EC50) to the PD-L1 antigen expressed on the cell surface in response to each concentration.
  • Figure 4b shows the reaction of the Expi-CHO_CD47 cell line (Expi-CHO cells induced to express CD47 antigen) prepared according to an embodiment of the present invention and anti-PD-L1 ⁇ CD47 HCAb (PPC Nb-IgG4) by concentration. It is a diagram confirming the binding capacity (EC50) to the CD47 antigen expressed on the cell surface.
  • Figure 5a is anti-PD-L1 ⁇ CD47 HCAb after binding of PD-1 protein to the CHO-K1_PD-L1 cell line (CHO-K1 cells induced to express PD-L1 antigen) prepared according to an embodiment of the present invention; It is a diagram confirming the inhibitory ability (IC50) of (PPC Nb-IgG4) on the PD-L1/PD-1 interaction.
  • Figure 5b shows the anti-PD-L1 ⁇ CD47 HCAb (PPC Nb-IgG4) after binding of the Expi-CHO_CD47 cell line (Expi-CHO cells induced to express CD47 antigen) prepared according to an embodiment of the present invention and SIRPalpha protein; A diagram confirming the inhibitory ability (IC50) of CD47/SIRPalpha interaction.
  • FIG. 6 shows the PD-L1/PD-1 interaction inhibition ability of anti-PD-L1 ⁇ CD47 HCAb (PPC Nb-IgG4) prepared according to an embodiment of the present invention in CHO-L1_PD-L1 cells (PD-L1 protein CHO-K1 cells induced overexpression) and PD-1 expressing Jurkat cells were confirmed using the.
  • PPC Nb-IgG4 anti-PD-L1 ⁇ CD47 HCAb
  • FIG. 7 is a view confirming phagocytosis of anti-PD-L1 ⁇ CD47 HCAb (PPC Nb-IgG4) prepared according to an embodiment of the present invention.
  • Figure 8 is a diagram confirming the human RBC binding capacity (RBC binding) of the anti-PD-L1 ⁇ CD47 HCAb (PPC Nb-IgG4) prepared according to an embodiment of the present invention.
  • FIG. 9 is a view confirming human hemagglutination of anti-PD-L1 ⁇ CD47 HCAb (PPC Nb-IgG4) prepared according to an embodiment of the present invention.
  • 10 is an anti-PD-L1 ⁇ CD47 HCAb (PPC Nb-IgG4) prepared according to an embodiment of the present invention as a B16F10_PD-L1/CD47 cell line (a tumor cell line induced to express PD-L1 and CD47 antigens)
  • FIG. 11 is an anti-PD-L1 ⁇ CD47 HCAb (PPC Nb-IgG4) prepared according to an embodiment of the present invention as a B16F10_PD-L1/CD47 cell line (a tumor cell line induced to express PD-L1 and CD47 antigens)
  • PPC Nb-IgG4 prepared according to an embodiment of the present invention as a B16F10_PD-L1/CD47 cell line (a tumor cell line induced to express PD-L1 and CD47 antigens)
  • epitope refers to a protein determinant capable of specific binding to an antibody.
  • Epitopes generally consist of chemically active surface groupings of molecules, such as amino acids or sugar side chains, and generally have specific three-dimensional structural characteristics, as well as specific charge characteristics.
  • treatment refers to slowing, stopping, stopping, controlling, arresting, ameliorating or ameliorating a disorder or disease disclosed herein, e.g., the symptoms or complications of the disease, or the progression thereof. It refers to any process that may be reversible, but does not necessarily represent the complete elimination of all symptoms of a disease or disorder.
  • prevention means prophylactic treatment of a disease or disorder, eg, a disease, or delaying the onset or progression of the disease or disorder.
  • subject refers to a mammal, including but not limited to humans, bovines, horses, cats, dogs, rodents, or primates. In some embodiments, the subject is a human.
  • antibody is used in its broadest sense and includes, but is not limited to, monoclonal antibodies, polyclonal antibodies, multispecific antibodies (eg, bispecific antibodies), full-length antibodies, so long as they exhibit the desired antigen-binding activity. It encompasses a variety of antibody structures, including antibodies and antigen-binding fragments thereof.
  • antibody includes conventional four-chain antibodies, single domain antibodies, and antigen-binding fragments thereof.
  • the basic four-chain antibody unit is a heterotetrameric glycoprotein composed of two identical light (L) chains and two identical heavy (H) chains.
  • IgM antibodies consist of 5 of the basic heterotetrameric units and contain 10 antigen-binding sites with an additional polypeptide called the J chain, whereas IgA antibodies will polymerize to form multivalent aggregates in combination with the J chain. 2-5 of the possible basic 4-chain units.
  • a four-chain unit is generally about 150,000 daltons.
  • Each L chain is linked to the H chain by one covalent disulfide bond, while the two H chains are linked to each other by one or more disulfide bonds, depending on the H chain isotype.
  • Each H and L chain also has regularly spaced interchain disulfide bridges.
  • Each H chain has, at the N-terminus, a variable domain (VH) for each of the ⁇ and ⁇ chains followed by 3 constant domains (CH) and 4 CH domains for the ⁇ and ⁇ isotypes.
  • Each L chain has at its N-terminus a variable domain (VL) followed by a constant domain at its other end. VL is aligned with VH and CL is aligned with the first constant domain of the heavy chain (CH1). Mating of VH and VL together forms a single antigen-binding site.
  • immunoglobulins can be assigned to different classes or isotypes. There are five classes of immunoglobulins: ⁇ , ⁇ , ⁇ , ⁇ and ⁇ , each with a heavy chain designated as IgA, IgD, IgE, IgG and IgM.
  • the ⁇ and ⁇ classes are further divided into subclasses based on relatively few differences in CH sequence and function, for example, humans express the following subclasses: IgG1, IgG2A, IgG2B, IgG3, IgG4, IgA1 and IgA2.
  • HCAb heavy chain-only antibody
  • single-domain antibody refers to a single antigen-binding polypeptide having three complementarity determining regions (CDRs).
  • CDRs complementarity determining regions
  • single-domain antibodies are engineered from camelid HCAbs, and their heavy chain variable domains are referred to herein as “VHH” (the variable domain of the heavy chain of a heavy chain antibody).
  • the basic VHH has the following structure from N-terminus to C-terminus: FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4, wherein FR1-FR4 refer to framework regions 1-4 respectively, and CDR1-CDR3 denotes complementarity determining regions 1-3.
  • variable region refers to the amino-terminal domain of the heavy or light chain of an antibody.
  • the variable domains of the heavy and light chains may be referred to as “VH” and “VL” respectively. These domains are generally the most variable portion of an antibody (relative to other antibodies of the same class) and contain the antigen binding site.
  • Heavy chain-only antibodies from Camelidae species have a single heavy chain variable region referred to as “VHH”.
  • variable refers to the fact that certain segments of variable domains differ widely in sequence among antibodies.
  • the V domain mediates antigen binding and defines the specificity of a particular antibody for its particular antigen.
  • variability is not evenly distributed over the entire range of the variable domain. Instead, it is enriched in three segments called complementarity determining regions (CDRs) or hypervariable regions (HVRs) in both the heavy and light chain variable domains.
  • CDRs complementarity determining regions
  • HVRs hypervariable regions
  • the more highly conserved portions of variable domains are called framework regions (FR).
  • the variable domains of native heavy and light chains each comprise four FR regions, which are joined by three CDRs, which form loop linkages, predominantly adopt a beta-sheet configuration, and in some cases form part of the beta-sheet structure.
  • the CDRs in each chain are held together in close proximity by the FR regions, and the CDRs from the other chain contribute to the formation of the antigen binding site of the antibody (Kabat, Elvin A., Sequence of Immunological Interest, Fifth Edition, National Institute of Health, Bethesda, Md. (1991)).
  • the constant domains are not directly involved in the binding of an antibody to an antigen, but exhibit various effector functions, such as participation of the antibody in antibody-dependent cytotoxicity.
  • constant domain refers to the portion of an immunoglobulin molecule that has a more conserved amino acid sequence compared to the other portion of the immunoglobulin, the variable domain, which contains the antigen-binding site.
  • the constant domains contain the CH1, CH2 and CH3 domains of the heavy chain (collectively, CH) and the CHL (or CL) domain of the light chain.
  • full length antibody “intact antibody”, or “whole antibody” are used interchangeably to refer to an antibody in its substantially intact form, as opposed to antibody fragments.
  • full-length four-chain antibodies include those with heavy and light chains comprising an Fc region.
  • a full-length heavy chain-only antibody comprises a heavy chain variable domain (eg VHH) and an Fc region.
  • the constant domain may be a native sequence constant domain (eg, a human native sequence constant domain) or an amino acid sequence variant thereof.
  • an intact antibody may have one or more effector functions.
  • antibody fragment or “antigen-binding fragment” comprises a portion of an intact antibody, preferably the antigen-binding and/or variable region of an intact antibody.
  • antibody fragments include, but are not limited to, Fab, Fab', F(ab')2 and Fv fragments; diabody; linear antibody; single-chain antibody (scFv) molecules; single domain antibodies (such as VHH), and multispecific antibodies formed from antibody fragments.
  • Fv is the smallest antibody fragment containing a complete antigen-recognition and -binding site. This fragment consists of a dimer of one heavy and one light chain variable region domain in tight, non-covalent association.
  • Single-chain Fv also abbreviated “sFv” or “scFv” is an antibody fragment comprising VH and VL antibody domains linked to a single polypeptide chain.
  • the scFv polypeptide further comprises a polypeptide linker between the VH and VL domains that enables the scFv to form the desired structure for antigen binding.
  • “Diabodies” are sFv fragments with a short linker (about 5-10 residues) between the VH and VL domains such that interchain pairing of the V domain is achieved, thereby bivalent fragments, i.e., two Refers to a small antibody fragment prepared by resulting in a fragment having an antigen-binding site.
  • Bispecific diabodies are heterodimers of two “crossover” sFv fragments in which the VH and VL domains of the two antibodies are present in different polypeptide chains.
  • humanized antibody is used as a subset of “chimeric antibody”.
  • Humanized forms of non-human (eg, llama or camelid) antibodies are chimeric antibodies that contain minimal sequence derived from non-human immunoglobulin.
  • a humanized antibody is a non-human species (donor antibody) such as mouse, rat, rabbit, wherein residues from the CDRs (defined below) of the recipient have the desired specificity, affinity, and/or capacity;
  • donor antibody such as mouse, rat, rabbit
  • residues from the CDRs (defined below) of the recipient have the desired specificity, affinity, and/or capacity
  • a human immunoglobulin (recipient antibody) that is replaced with residues from the CDRs of a camel, llama, alpaca, or non-human primate.
  • framework (“FR”) residues of a human immunoglobulin are replaced with corresponding non-human residues.
  • a humanized antibody may comprise residues that are not found in the recipient antibody or in the donor antibody. These modifications can be made to further improve antibody performance, such as binding affinity.
  • HVR hypervariable region
  • HVR3 HVR3 displays the highest diversity of the three HVRs and is known to play a unique role in conferring microspecificity to antibodies. See, eg, Hamers-Casterman et al., Nature 363:446-448 (1993); Sheriff et al., Nature Struct. Biol. 3:733-736 (1996).
  • CDR complementarity determining region
  • Kabat Elvin A., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1991). Kabat complementarity determining regions (CDRs) are based on sequence variability and are most commonly used.
  • framework or “FR” residues are variable-domain residues other than HVR residues as defined herein.
  • sdAb antigen binding protein
  • a native antibody for example, is monospecific.
  • multispecific means that an antigen binding protein has polyepitope specificity (i.e., capable of specifically binding to two, three, or more, different epitopes in one biological molecule, or capable of specifically binding to an epitope in two, three, or more, different biological molecules).
  • Bispecific refers to an antigen binding protein having two different antigen-binding specificities.
  • the term “monospecific” as used herein refers to an antigen binding protein having one or more binding sites each of which binds the same epitope of the same antigen.
  • A refers to the presence of a specified number of binding sites in an antigen binding protein.
  • bivalent “trivalent”, “tetravalent”, “pentavalent” and “hexavalent” refer to two binding sites, three binding sites, four binding sites, five a binding site, and the presence of six binding sites.
  • Antibody effector functions refer to those biological activities attributable to the Fc region (native sequence Fc region or amino acid sequence variant Fc region) of an antibody, and vary by antibody isotype. Examples of antibody effector functions include: Clq binding and complement dependent cytotoxicity; Fc receptor binding; antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity (ADCC); phagocytosis; down regulation of cell surface receptors (eg, B cell receptors); and B cell activation.
  • “Complement dependent cytotoxicity” or “CDC” refers to lysis of a target cell in the presence of complement. Activation of the classical complement pathway is initiated by the binding of the first component (C1q) of the complement system to antibodies (of the appropriate subclass) that bind to their cognate antigens.
  • ADCC antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity
  • FcRs Fc receptors
  • cytotoxic cells eg, natural killer (NK) cells, neutrophils and macrophages
  • NK natural killer
  • cytotoxin a form of cytotoxicity that specifically binds these cytotoxic effector cells to antigen-bearing target cells and subsequently kills the target cells with a cytotoxin.
  • Fc region or “fragment crystallizable region” herein is used to define the C-terminal region of an immunoglobulin heavy chain, including a native-sequence Fc region and a variant Fc region.
  • Suitable native-sequence Fc regions for use in the antibodies described herein include human IgG1, IgG2 (IgG2A, IgG2B), IgG3 and IgG4.
  • Binding affinity generally refers to the strength of the sum total of non-covalent interactions between a single binding site of a molecule (eg, an antibody) and its binding partner (eg, an antigen). Unless otherwise specified, as used herein, "binding affinity” refers to an intrinsic binding affinity that reflects a 1:1 interaction between members of a binding pair. Binding affinity can be expressed as K d , K ff , K on , or K a . As used herein, the term equilibrium dissociation constant “K D ” or “K d ” refers to the dissociation constant of a particular antibody-antigen interaction and is the dichotomy of all antibody-binding domains present in solution of an antibody molecule at equilibrium.
  • K D concentration of antigen required to occupy work of
  • K d concentration of antigen required to occupy work of
  • the determination of K D assumes that all binding agents are in solution.
  • the dissociation constant (K D or K d ) is used as an indicator of the affinity of an antibody for an antigen.
  • K D or K d is used as an indicator of the affinity of an antibody for an antigen.
  • easy analysis can be carried out by the Scatchard method using antibodies marked with various marker agents, as well as by the use of over-the-counter, measurement kits, according to the user's manual and experimental operating methods attached to the kit. It is possible.
  • the K D values that can be derived using these methods are expressed in units of M (Mols).
  • Percent (%) amino acid sequence identity and “homology” with respect to a peptide, polypeptide or antibody sequence are, if necessary, after sequence alignments and gap introductions, and as part of sequence identity, optional to achieve maximum percent sequence identity. It is defined as the percentage of amino acid residues in a candidate sequence that are identical to amino acid residues in a specific peptide or polypeptide sequence, without consideration of conservative substitutions. Alignment for purposes of determining percent amino acid sequence identity may be accomplished in a variety of ways that are within the skill in the art, for example, using publicly available computer software such as BLAST, BLAST-2, ALIGN or MEGALIGNTM (DNATAR) software. can One skilled in the art can determine suitable parameters for measuring alignment, including any algorithms necessary to achieve maximal alignment over the full length of the sequences being compared.
  • the present invention provides a first single domain antibody (first sdAb) or antigen-binding fragment thereof (anti-PD-L1) that specifically binds to PD-L1 (hereinafter referred to as “anti-PD-L1 ⁇ CD47 bsAb”) sdAb); and a bispecific antibody that bispecifically binds to PD-L1 and CD47, comprising a second single domain antibody (second sdAb) or antigen-binding fragment thereof (anti-CD47 sdAb) that specifically binds to CD47
  • first sdAb antigen-binding fragment thereof
  • second sdAb antigen-binding fragment thereof
  • an anti-PD-L1 ⁇ CD47 bsAb specifically a bispecific sdAb in which an anti-PD-L1 sdAb and an anti-CD47 sdAb are fused
  • an anti-PD-L1 ⁇ CD47 heavy chain-only antibody (HCAb) e.g.
  • an anti-PD-L1 ⁇ CD47 bsAb-Fc fusion protein in which a crystalline fragment (Fc fragment) of human immunoglobulin G (IgG) is fused to an anti-PD-L1 sdAb and/or an anti-CD47 sdAb), and its manufacture and use.
  • a crystalline fragment (Fc fragment) of human immunoglobulin G (IgG) is fused to an anti-PD-L1 sdAb and/or an anti-CD47 sdAb
  • the present invention provides a bispecific antibody that bispecifically binds to PD-L1 and CD47 comprising an anti-PD-L1 ⁇ CD47 bsAb.
  • the bispecific antibody bispecifically binding to PD-L1 and CD47 comprising the anti-PD-L1 ⁇ CD47 bsAb is a first antigen-binding moiety that specifically binds to PD-L1.
  • the anti-PD-L1 sdAb is CDR1 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2; CDR2 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 3; and CDR3 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 4.
  • the anti-CD47 sdAb is CDR1 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 7; CDR2 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 8; and CDR3 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 9.
  • the CDR sequences are provided in Tables 6 and 12.
  • the anti-PD-L1 ⁇ CD47 bsAb may include any suitable sequence for the FR region.
  • the FR sequence may be an amino acid sequence shown in Tables 1 to 4 below.
  • the anti-PD-L1 sdAb may include the following FR1, FR2, FR3 and FR4: FR1 consisting of an amino acid sequence represented by any one of SEQ ID NOs: 13 and 17;
  • FR2 consisting of the amino acid sequence shown in any one of SEQ ID NOs: 14 and 18;
  • FR3 consisting of an amino acid sequence represented by any one of SEQ ID NOs: 15 and 19;
  • FR4 consisting of the amino acid sequence represented by any one of SEQ ID NOs: 16 and 20.
  • the anti-PD-L1 sdAb may comprise the following FR1, FR2, FR3 and FR4:
  • FR1 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 13;
  • FR2 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 14;
  • FR3 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 15;
  • FR4 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 16; or
  • FR2 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 18;
  • FR3 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 19;
  • FR4 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 20.
  • the anti-PD-L1 sdAb may comprise the following FR1, FR2, FR3 and FR4:
  • FR1 consisting of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 13;
  • FR2 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 14;
  • FR3 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 15;
  • FR4 consisting of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 16.
  • the anti-PD-L1 sdAb may include a VHH domain comprising the FR region.
  • the anti-PD-L1 sdAb contains at least 80% (such as at least any 80%, 58%, 90%, 91%, 92%, 93% , 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%) sequence homology.
  • the anti-CD47 sdAb may comprise the following FR1, FR2, FR3 and FR4:
  • FR1 consisting of an amino acid sequence represented by any one of SEQ ID NOs: 13 and 17;
  • FR2 consisting of the amino acid sequence shown in any one of SEQ ID NOs: 14 and 18;
  • FR3 consisting of an amino acid sequence represented by any one of SEQ ID NOs: 15 and 19;
  • FR4 consisting of the amino acid sequence represented by any one of SEQ ID NOs: 16 and 20.
  • the anti-CD47 sdAb may comprise the following FR1, FR2, FR3 and FR4:
  • FR1 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 13;
  • FR2 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 14;
  • FR3 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 15;
  • FR4 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 16; or
  • FR2 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 18;
  • FR3 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 19;
  • FR4 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 20.
  • the anti-CD47 sdAb may comprise the following FR1, FR2, FR3 and FR4:
  • FR1 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 17;
  • FR2 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 18;
  • FR3 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 19;
  • FR4 consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 20.
  • the anti-CD47 sdAb may include a VHH domain comprising the FR region.
  • the anti-CD47 sdAb contains the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 6, or at least 80% (such as at least any 80%, 58%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94 of the amino acid sequence). %, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%) sequence homology.
  • the anti-PD-L1 sdAb binds to an epitope of PD-L1
  • the anti-CD47 sdAb binds to an epitope of CD47
  • the K D of the anti-PD-L1 ⁇ CD47 bsAb binding to PD-L1 and CD47, respectively, is 10 -6 M to 10 -12 M, 10 -6 M to 10 -11 M, 10 -6 M to 10 -10 M, 10 -6 M to 10 -9 M, or 10 -6 M to 10 -8 M.
  • the EC 50 of the anti-PD-L1 ⁇ CD47 bsAb may be less than 500 nM in FACS analysis, specifically 0.1 nM to 500 nM, 0.1 nM to 400 nM, 0.1 nM to 300 nM, 0.1 nM to 200 nM, 0.1 nM to 100 nM, 0.1 to 50 nM, 0.1 to 10 nM, 1 nM to 500 nM, 1 nM to 400 nM, 1 nM to 300 nM, 1 nM to 200 nM, 1 nM to 100 nM, 1 to 50 nM or 1 to 10 nM.
  • the anti-PD-L1 ⁇ CD47 bsAb may have any suitable number of valences for each epitope of PD-L1 and CD47.
  • the anti-PD-L1 ⁇ CD47 bsAb may be divalent, trivalent, tetravalent, pentavalent, hexavalent, or higher with respect to PD-L1 and CD47, respectively. See, for example, P. Chames and D. Baty, Chapter 6. Bispecific Single Domain Antibodies, Springer-Verlag Berlin Heidelberg, 2011.
  • the anti-PD-L1 ⁇ CD47 bsAb can be fused to an anti-PD-L1 sdAb and an anti-CD47 sdAb directly via a peptide bond or indirectly via a peptide linker.
  • the length, degree of flexibility and/or other properties of the peptide linker may have some effect on properties, including but not limited to affinity, specificity or ability to bind one or more specific antigens or epitopes. For example, a longer peptide linker can be selected to ensure that two adjacent domains do not sterically interfere with each other.
  • peptide linkers include flexible moieties (eg, glycine and serine) such that adjacent domains are free to move relative to each other.
  • a glycine-serine doublet may be a suitable peptide linker.
  • the peptide linker may be of any suitable length.
  • the peptide linker is at least about any of 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 75, 100 or more amino acids in length.
  • the peptide linker may have a naturally occurring sequence, or a non-naturally occurring sequence.
  • the anti-PD-L1 ⁇ CD47 bsAb may be bivalent to PD-L1, and the bivalent anti-PD-L1 sdAb comprises the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 21.
  • the anti-PD-L1 ⁇ CD47 bsAb includes the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 11.
  • a single domain antibody (sdAb) comprises a heavy chain variable domain from a heavy chain-only antibody (eg, VHH (variable domain of heavy chain of a heavy chain antibody) in camelidae), a light chain derived from a conventional four-chain antibody, Binding molecules that naturally lack a single domain (such as VH or VL), humanized heavy chain single antibodies, human single domain antibodies produced by transgenic mice or rats expressing human heavy chain segments, and manipulations other than those derived from antibodies domains and single domain scaffolds.
  • the sdAb may be derived from any species, including but not limited to mouse, rat, human, camel, llama, lamprey, fish, shark, goat, rabbit, and bovine. It may also contain naturally occurring sdAb molecules from species other than Camelidae.
  • sdAbs are derived from naturally occurring single domain antigen binding molecules known as heavy chain antibodies lacking a light chain. Such single domain molecules are disclosed, for example, in WO 94/04678 and Hamers-Casterman, et al., (1993) Nature 363:446-448.
  • VHHs Variable domains derived from heavy chain molecules that naturally lack a light chain are known herein as VHHs to distinguish them from the conventional VHs of four chain immunoglobulins.
  • VHH molecules may be derived from antibodies produced in camelid species such as camel, llama, vicuna, dromedary, alpaca and guanaco.
  • Species other than Camelidae can produce heavy chain molecules that naturally lack light chains, and such VHHs are within the scope of the present application.
  • sdAbs can be recombinant, CDR-grafted, humanized, camelized, de-immunized and/or generated in vitro (eg, selected by phage display).
  • the amino acid sequence of a framework region may be altered by “camelization” of specific amino acid residues in the framework region. Camelization is the replacement or substitution of one or more amino acid residues in the amino acid sequence of the (naturally occurring) VH domain from a conventional four-chain antibody by one or more of the amino acid residues occurring at the corresponding position(s) in the VHH domain of the heavy chain antibody. and may be performed in a manner known in the art.
  • the sdAb may also be a human sdAb produced by a transgenic mouse or rat expressing a human heavy chain segment. See, for example, patents US20090307787A1, US8,754,287, US20150289489A1, US20100122358A1, and WO 2004049794.
  • VHH domains for a particular antigen or target can be obtained from (na ⁇ ve or immune) libraries of camelid VHH sequences.
  • Such a method may or may not involve screening such a library using said antigen or target, or at least a portion, fragment, antigenic determinant or epitope thereof, using one or more screening techniques known per se.
  • screening techniques known per se.
  • Such libraries and techniques are described, for example, in patents WO 99/37681, WO 01/90190, WO 03/025020 and WO 03/035694.
  • VHH libraries obtained from (na ⁇ ve or immune) VHH libraries, such as by techniques such as random mutagenesis and/or CDR shuffling, as described for example in patent WO 00/43507
  • a VHH library obtained from a (na ⁇ ve or immunized) VHH library can be used.
  • sdAbs can be generated from conventional four-chain antibodies. See, for example, Ward et al., Nature 1989 Oct. 12; 341 (6242): 544-6, Holt et al., Trends Biotechnol., 2003, 21(11):484-490; Patent WO 06/030220; and WO 06/003388.
  • the sdAb according to the present invention may be a chimeric antibody.
  • Certain chimeric antibodies are described, for example, in patent US4,816,567; and Morrison et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81:6851-6855 (1984)).
  • a chimeric antibody may comprise a non-human variable region (eg, a variable region derived from a camelid species, such as a llama) and a human constant region.
  • chimeric antibodies can be humanized. Typically, non-human antibodies are humanized to reduce immunogenicity to humans, while retaining the specificity and affinity of the parental non-human antibody.
  • a humanized antibody comprises one or more variable domains in which HVRs, eg, CDRs, (or portions thereof) are derived from a non-human antibody, and FRs (or portions thereof) are derived from human antibody sequences.
  • a humanized antibody will optionally also comprise at least a portion of a human constant region.
  • some FR residues are replaced with corresponding FR residues from a non-human antibody (eg, the antibody from which the HVR residues are derived), eg, to restore or improve antibody specificity or affinity. substituted with a residue.
  • the bispecific antibody bispecifically binding to PD-L1 and CD47 comprising the anti-PD-L1 ⁇ CD47 bsAb may be an anti-PD-L1 ⁇ CD47 HCAb or antigen-binding fragment thereof.
  • the anti-PD-L1 ⁇ CD47 HCAb may be one in which the anti-PD-L1 ⁇ CD47 bsAb described herein is fused to one or more CH2 and/or CH3 domains, eg, an Fc fragment. It may also be fused to one or more CH2 and/or CH3 domains, for example an Fc fragment, to an anti-PD-L1 sdAb and/or an anti-CD47 sdAb described herein.
  • the CH2 and/or CH3 domain is derived from an immunoglobulin.
  • the immunoglobulin may be IgA, IgD, IgE, IgG or IgM, and specifically may be IgG.
  • the anti-CD47 HCAb may comprise an Fc fragment of an IgG, such as an IgG1, IgG2, IgG3 or IgG4, wherein the Fc fragment is a human Fc, such as a human IgG1 (hIgG1) Fc, hIgG2 Fc, hIgG3 Fc or hIgG4 Fc.
  • the anti-PD-L1 ⁇ CD47 HCAb may be monomeric or multimeric.
  • multimeric, bispecific and multivalent e.g., bivalent, trivalent, tetravalent, or higher valence.
  • the anti-PD-L1 ⁇ CD47 bsAb, anti-PD-L1 sdAb or anti-CD47 sdAb may be fused to a CH2 and/or CH3 domain, specifically an Fc fragment, via a peptide linker.
  • the length, degree of flexibility and/or other properties of the peptide linker may have some effect on properties, including but not limited to affinity, specificity or ability to bind one or more specific antigens or epitopes. For example, a longer peptide linker can be selected to ensure that two adjacent domains do not sterically interfere with each other.
  • peptide linkers include flexible moieties (eg, glycine and serine) such that adjacent domains are free to move relative to each other.
  • a glycine-serine doublet may be a suitable peptide linker.
  • the peptide linker may be of any suitable length. In some embodiments, the peptide linker is at least about any of 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 75, 100 or more amino acids in length.
  • the peptide linker may have a naturally occurring sequence, or a non-naturally occurring sequence.
  • a sequence derived from the hinge region of a heavy chain-only antibody can be used as a linker. See, eg, patent WO 1996/34103.
  • the peptide linker may be a hIgG1 hinge, a hIgG2 hinge, a hIgG3 hinge, a hIgG4 hinge, or a variant thereof.
  • the anti-PD-L1 ⁇ CD47 HCAb contains the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 12, or at least 80% (eg, at least any 80%, 88%, 90%, 91%, 92% of the amino acid sequence) , 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%) sequence homology.
  • the bispecific antibody bispecifically binding to PD-L1 and CD47 comprising the anti-PD-L1 ⁇ CD47 bsAb is the C-terminus of the anti-PD-L1 sdAb and/or the anti-CD47 sdAb. It may be a bispecific Fab-like antibody fragment (bsFab) fused to the N-terminus of the CH1 and CK domains.
  • bsFab bispecific Fab-like antibody fragment
  • the CH1 and CK domains are derived from immunoglobulins.
  • the immunoglobulin may be IgA, IgD, IgE, IgG or IgM, and specifically may be IgG.
  • the IgG may be IgG1, IgG2, IgG3 or IgG4, and may be human IgG1, IgG2, IgG3 or IgG4.
  • the bispecific antibody bispecifically binding to PD-L1 and CD47 comprising the anti-PD-L1 ⁇ CD47 bsAb includes an amino acid sequence variant.
  • Amino acid sequence variants of an antibody can be prepared by introducing appropriate modifications into the nucleic acid sequence encoding the antibody, or by peptide synthesis. Such modifications include, for example, deletions, and/or insertions and/or substitutions of residues within the amino acid sequence of the antibody. Any combination of deletions, insertions, and substitutions can be made to lead to the final construct, provided that the final construct retains the desired characteristics, eg, antigen-binding.
  • substitutions, insertions, or deletions may occur within one or more hypervariable regions (HVRs) so long as such alterations do not substantially reduce the ability of the antibody to bind antigen.
  • HVRs hypervariable regions
  • conservative alterations that do not substantially reduce binding affinity can be made in HVRs. Such changes may be outside of HVR “hotspots” or CDRs.
  • the amino acid substitution may be at least one (eg, any 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, or 10) amino acid substitution.
  • the at least one amino acid substitution may be a conservative substitution, a substitution with a non-genetically encoded amino acid or a synthetic amino acid.
  • the amino acid substitution may be in a CDR region and may comprise at least 1 (eg, any 1, 2, 3, or 4) amino acid substitution in CDR1, CDR2 and/or CDR3.
  • the amino acid substitution may be in the FR region and at least 1 (eg, any 1, 2, 3, 4, 5 or 6) amino acid substitution in FR1, FR2, FR3 and/or FR4. may include.
  • Such amino acid sequence insertions also include amino- and/or carboxyl-terminal fusions ranging in length from one residue to polypeptides containing 100 or more residues, as well as intrasequence insertions of single or multiple amino acid residues.
  • terminal insertions include antibodies with an N-terminal methionyl residue.
  • Other insertional variants of the antibody molecule may include a fusion to the N- or C-terminus of the antibody to a polypeptide or (eg, in the case of ADEPT) enzyme that increases the serum half-life of the antibody.
  • one or more amino acid modifications may be made to a bispecific antibody that bispecifically binds to PD-L1 and CD47, including an anti-PD-L1 ⁇ CD47 bsAb provided herein (eg, an anti-PD-L1 ⁇ CD47 HCAb). ) to the Fc region, thereby generating Fc region variants.
  • An Fc region variant may comprise a human Fc region sequence (eg human IgG1, IgG2, IgG3 or IgG4 Fc) comprising amino acid modifications (eg substitutions) at one or more amino acid positions.
  • the bispecific antibody bispecifically binding to PD-L1 and CD47 comprising the anti-PD-L1 ⁇ CD47 bsAb is linked to, fused to, or conjugated to a diagnostic moiety or biocompatibility modulator. (eg, shared or non-covalent), or otherwise associated therewith.
  • a diagnostic moiety or biocompatibility modulator eg, shared or non-covalent
  • peptides or polypeptides eg, biotoxins, biomarkers, purification tags, etc.
  • proteins, polymers, nucleic acid molecules, small molecules, mimetics, synthetic drugs, inorganic molecules, organic molecules, or radioisotopes are conjugated or can be assembled.
  • the bispecific antibody that bispecifically binds to PD-L1 and CD47 comprising the anti-PD-L1 ⁇ CD47 bsAb may be a biological molecule (eg, a peptide or nucleotide), a small molecule, a fluorophore, or a radioactive It may be conjugated or associated with a diagnostic or detectable agent, marker or reporter, which may be isotope. Labeled modulators monitor the development or progression of diseases associated with PD-L1 and/or CD47, such as cancer, or determine the efficacy of a particular therapy comprising an antibody disclosed herein (ie, theragnosis), or future treatment. It may be useful as part of a clinical trial procedure to determine the course. Such markers or reporters may also be useful in purifying the antibodies disclosed herein.
  • the bispecific antibody bispecifically binding to PD-L1 and CD47 including the anti-PD-L1 ⁇ CD47 bsAb is an immunomodulatory agent, cytokine, cytotoxic agent, chemotherapeutic agent, diagnostic agent, antiviral agent , antimicrobial agents or drugs.
  • the present invention relates to a PD-L1 comprising an anti-PD-L1 ⁇ CD47 bsAb according to the present invention conjugated to an immunomodulatory agent, cytokine, cytotoxic agent, chemotherapeutic agent, diagnostic agent, antiviral agent, antimicrobial agent or drug. and a bispecific antibody that bispecifically binds to CD47.
  • the invention also provides a nucleic acid molecule encoding a bispecific antibody that bispecifically binds to PD-L1 and CD47 comprising an anti-PD-L1 ⁇ CD47 bsAb disclosed herein, an expression vector comprising said nucleic acid molecule, A host cell transformed with the expression vector is provided.
  • the present invention provides a method comprising the steps of: (a) culturing the host cell under conditions such that the bispecific antibody is expressed; and (b) recovering the expressed bispecific antibody.
  • DNA encoding a bispecific antibody that bispecifically binds to PD-L1 and CD47 comprising an anti-PD-L1 ⁇ CD47 bsAb disclosed herein is prepared using conventional procedures (e.g., by using oligonucleotide probes capable of specifically binding to genes encoding antibody heavy and light chains) and can be readily isolated and sequenced. Isolated and subcloned hybridoma cells (or phage or yeast-derived colonies) can serve as a preferred source of such DNA. More particularly, isolated DNA (which may be modified) can be used to clone constant and variable region sequences for the production of antibodies.
  • RNA from selected cells conversion to cDNA, and amplification by PCR using antibody specific primers.
  • Suitable primers are well known in the art and are readily available from many commercial sources as exemplified herein.
  • DNA encoding the antibody is cloned into a recombinant expression vector and host including mammalian cells, insect cells, plant cells, yeast, and bacteria. introduced into the cell.
  • modulators are introduced into and expressed by monkey COS cells, NS0 cells, Chinese hamster ovary (CHO) cells, or myeloma cells that do not otherwise produce the desired construct.
  • the nucleic acid molecule is present in a vector, where appropriate, together with a promoter controlling the expression of the nucleic acid.
  • Said vector is used in its most general sense and includes any intermediate vehicle for a nucleic acid that enables the nucleic acid to be introduced into, for example, prokaryotic and/or eukaryotic cells and, where appropriate, integrated into the genome.
  • Vectors of this kind are preferably replicated and/or expressed in cells.
  • a vector may comprise a plasmid, phagemid, bacteriophage or viral genome.
  • Such plasmids generally relate to constructs of extrachromosomal genetic material capable of replicating independently of chromosomal DNA, usually circular DNA duplexes.
  • the host cell or recombinant host cell refers to a cell into which the expression vector is introduced.
  • Recombinant host cells and host cells refer to the particular subject cell as well as the progeny of such cells. Because certain modifications may occur in subsequent generations due to mutations or environmental influences, such progeny may not in fact be identical to the parent cell, but are still included within the scope of the term host cell as used herein.
  • Such cells may comprise a vector as described above.
  • nucleic acid molecules encoding such antibodies can be integrated into well-known and commercially available protein production systems, including various types of host cells, to provide the desired pharmaceutical product in preclinical, clinical, or commercial quantities.
  • a nucleic acid molecule encoding an antibody is engineered into a vector or expression vector that provides for efficient integration into a selected host cell and subsequent high expression levels of the antibody.
  • Nucleic acid molecules encoding the antibodies disclosed herein preferably and vectors comprising these nucleic acid molecules may be used for transfection of suitable mammalian, plant, bacterial or yeast host cells, although prokaryotic systems may also be used. Transfection can be accomplished by any known method for introducing a polynucleotide into a host cell. Methods for introducing heterologous polynucleotides into mammalian cells are well known in the art and include dextran-mediated transfection, calcium phosphate precipitation, polybrene-mediated transfection, protoplast fusion, electroporation, polynucleotides in liposomes ( ), and direct microinjection of DNA into the nucleus.
  • Nucleic acid molecules can also be introduced into mammalian cells by viral vectors.
  • Methods for transforming mammalian cells are well known in the art.
  • Methods of transforming plant cells are also well known in the art and include, for example, Agrobacterium-mediated transformation, biolistic transformation, direct injection, electroporation, and viral transformation.
  • Methods for transforming bacterial and yeast cells are also well known in the art.
  • host-expression vector systems can be used to express the antibodies disclosed herein.
  • Such host-expression systems represent a vehicle in which the coding sequence of interest can be expressed and subsequently purified, as well as cells capable of expressing the molecules of the invention in situ when transformed or transfected with the appropriate nucleotide coding sequence.
  • Such systems include microorganisms such as bacteria (e.g., E. coli, B. subtilis (B) transformed with recombinant bacteriophage DNA, plasmid DNA or cosmid DNA expression vectors containing modulator coding sequences.
  • subtilis subtilis
  • Streptomyces yeast
  • yeast eg, Saccharomyces, Pichia
  • insect cell systems infected with recombinant viral expression vectors eg, baculoviruses
  • Plant cell systems infected with a recombinant viral expression vector eg, cauliflower mosaic virus, CaMV; tobacco mosaic virus, TMV
  • a recombinant plasmid expression vector eg, Ti plasmid
  • a modulator coding sequence for example, Nicotiana (Nicotiana), Arabidopsis (Arabidopsis), silverfish rice, corn, wheat, potato, etc.
  • recombinant expression containing a promoter derived from the genome of a mammalian cell eg, the metallothionein promoter
  • a mammalian virus eg, adeno
  • an antibody disclosed herein has been produced by recombinant expression or any of the other techniques disclosed herein, it can be produced by any method known in the art for the purification of immunoglobulins, or more generally by any method for the purification of proteins. can be purified by other standard techniques.
  • the present invention provides a bispecific antibody that bispecifically binds to PD-L1 and CD47 comprising the anti-PD-L1 ⁇ CD47 bsAb disclosed herein, or an antibody conjugate comprising the bispecific antibody as an active ingredient. It provides a pharmaceutical composition for the prevention or treatment of cancer containing.
  • the invention also provides a bispecific antibody, or said bispecific antibody, that bispecifically binds to PD-L1 and CD47 comprising a pharmaceutically effective amount of an anti-PD-L1 ⁇ CD47 bsAb disclosed herein as disclosed herein. It provides a method for preventing or treating cancer, comprising administering to an individual a pharmaceutical composition comprising an antibody conjugate comprising a.
  • the invention also provides a bispecific antibody that bispecifically binds to PD-L1 and CD47 comprising an anti-PD-L1 ⁇ CD47 bsAb disclosed herein for use in the prevention or treatment of cancer, or The use of an antibody conjugate comprising a bispecific antibody is provided.
  • the cancer is a cancer that requires activation of T cells by blocking the activity of immune checkpoint proteins, for example, melanoma, lung cancer, liver cancer, glioblastoma, ovarian cancer, colorectal cancer, head and neck cancer, bladder cancer, renal cell cancer , gastric cancer, breast cancer, metastatic cancer, prostate cancer, pancreatic cancer, non-Hodgkin's lymphoma, Hodgkin's lymphoma, multiple myeloma, leukemia, lymphoma, myelodysplastic syndrome, acute lymphoblastic leukemia, acute myeloid leukemia, chronic lymphocytic leukemia, chronic myelogenous leukemia , but may be selected from the group consisting of solitary myeloma and aplastic anemia, but is not limited thereto.
  • immune checkpoint proteins for example, melanoma, lung cancer, liver cancer, glioblastoma, ovarian cancer, colorectal cancer, head and neck cancer,
  • a bispecific antibody that bispecifically binds to PD-L1 and CD47 comprising an anti-PD-L1 ⁇ CD47 bsAb disclosed herein above, or an antibody conjugate comprising the bispecific antibody Since is the same as described above, the specific description refers to the above, and below, only the specific configuration of the pharmaceutical composition and use will be described.
  • the pharmaceutical composition according to the present invention bispecifically binds to PD-L1 and CD47 comprising one or more (eg 2 or 3) anti-PD-L1 ⁇ CD47 bsAbs disclosed herein described herein. a bispecific antibody, or an antibody conjugate comprising the bispecific antibody.
  • cancer By administering the pharmaceutical composition according to the present invention to an individual, specifically, a cancer patient, cancer can be prevented or treated.
  • compositions according to the present invention may be formulated as desired using art recognized techniques, depending on the type of antibody described herein, the intended mode of delivery, and numerous other variables.
  • suitable pharmaceutically acceptable carriers including excipients and adjuvants, which are relatively inert substances well known in the art and which facilitate administration or aid in processing the active compound into pharmaceutically optimized formulations for delivery, are also included. It can be formulated to contain.
  • a variety of pharmaceutically acceptable carriers including, for example, vehicles, adjuvants, and diluents, are readily available from numerous commercial sources.
  • a class of pharmaceutically acceptable auxiliary substances such as pH adjusters and buffers, tonicity adjusters, stabilizers, wetting agents and the like are also available.
  • Certain non-limiting exemplary carriers include saline, buffered saline, dextrose, water, glycerol, ethanol, and combinations thereof.
  • compositions according to the present invention may be formulated for enteral, parenteral or topical administration.
  • all three types of agents can be used simultaneously to achieve systemic administration of the active ingredient.
  • Excipients as well as formulations for parenteral and non-parenteral drug delivery are known in the art.
  • Formulations suitable for parenteral administration include aqueous solutions of the active compounds in water-soluble form, for example, water-soluble salts.
  • Suspensions of the active compound suitable for oily injection suspensions may also be administered.
  • Suitable lipophilic solvents or vehicles include fatty oils such as sesame oil, or synthetic fatty acid esters such as ethyl oleate or triglycerides.
  • Aqueous injection suspensions may contain substances which increase the viscosity of the suspension and include, for example, sodium carboxymethyl cellulose, sorbitol, and/or dextran.
  • the suspension may also contain stabilizers.
  • Liposomes can also be used to encapsulate agents for delivery to cells.
  • Formulations suitable for enteral administration include hard or soft gelatin capsules, pills, tablets including coated tablets, elixirs, suspensions, syrups or inhalants and controlled release forms thereof.
  • the antibodies disclosed herein are administered orally, intravenously, intraarterially, subcutaneously, parenterally, intranasally, intramuscularly, intracardiac, intraventricularly, intratracheally, buccal, rectal, intraperitoneal, intradermal, to a subject in need thereof. , topical, transdermal, and intrathecal, or otherwise by implantation or inhalation. Appropriate formulations and routes of administration can be selected depending on the intended use and treatment regimen.
  • the pharmaceutical composition according to the present invention is administered in a pharmaceutically effective amount for the treatment or prevention of cancer.
  • the pharmaceutically effective amount refers to the amount of an antibody or pharmaceutical composition comprising the same that will elicit a biological or medical response in a subject, which is sought by a physician or other clinician.
  • multiple doses of the antibody or pharmaceutical composition comprising the same may be administered at a specific frequency to achieve an amount of therapy having a prophylactic and/or therapeutic effect.
  • the pharmaceutically effective amount typically depends on the weight of the subject being treated, its physical condition, the breadth of the condition being treated, and the age of the subject being treated.
  • the antibodies disclosed herein range from about 10 ng/kg body weight to about 100 mg/kg body weight, from about 50 ⁇ g/kg body weight to about 5 mg/kg body weight, from about 100 ⁇ g/kg body weight to about 10 mg body weight per dose.
  • /kg body weight range about 100 ⁇ g/kg body weight to about 20 mg/kg body weight range, may be administered in an amount ranging from 0.5 mg/kg body weight to about 20 mg/kg body weight, but is not limited thereto.
  • the antibody may be at least about 100 ⁇ g/kg body weight, at least about 250 ⁇ g/kg body weight, at least about 750 ⁇ g/kg body weight, at least about 3 mg/kg body weight, at least about 5 mg/kg body weight, or at least about 10 mg/kg body weight It may be administered in a dose of kg body weight, but is not limited thereto.
  • the pharmaceutical composition according to the present invention may contain a dose of about 100 mg to about 10,000 mg, a dose of about 200 mg to about 9,000 mg, a dose of about 300 mg to about 8,000 mg, a dose of about 400 mg to 7,000 mg, and a dose of 500 mg to It may be administered in a dose of 5,000 mg, but is not limited thereto.
  • the pharmaceutical composition according to the present invention is usually administered to a patient multiple times.
  • Exemplary treatment regimens entail administration once every two weeks, once a month, or once every 3 to 6 months.
  • a patient may receive the antibody (eg, as an intravenous formulation) every 4 weeks as a cycle, eg, once every 28 days.
  • Dosing frequency can be adjusted according to the pharmacokinetic profile of the antibody in the patient. For example, the half-life of an antibody may require a dosing frequency of two weeks.
  • two or more antibodies with different binding specificities may be administered simultaneously, in which case the dosage of each antibody administered falls within the ranges given.
  • Dosage and frequency depend on the half-life of the antibody in the patient. In general, human antibodies exhibit the longest half-life, followed by humanized antibodies, chimeric antibodies, and non-human antibodies. The dosage and frequency of administration may vary depending on whether the treatment is prophylactic or therapeutic.
  • the duration of a treatment regimen depends on the disease being treated, the age and condition of the patient, the stage and type of the patient's disease, how the patient responds to treatment, and the like. The clinician will closely monitor the effect of the therapy and may make any adjustments as necessary.
  • the agents are used in combination, the two or more therapeutic agents are administered simultaneously or sequentially in any order, i.e., the antibody disclosed herein is administered prior to, concurrently with, or with the second therapeutic agent. It may be administered subsequent to the administration of
  • human PD-L1 protein or human CD47 protein was mixed with an adjuvant (GERBU), and one alpaca was immunized by intramuscular injection three times. Three rounds of immunization were carried out, and on the 14th day after the last immunization, 10 ml of blood was collected from alpaca and the immune response was analyzed through ELISA. Antibody production was determined by dispensing the immune antigen at a concentration of 1 ⁇ g/ml into a 96-well microplate using a coating buffer and coating at 4° C. overnight. The 96-well microplate was washed three times with PBST, and then treated with 5% skim milk at room temperature for 2 hours to inhibit non-specific binding and blocked (blocking).
  • GERBU adjuvant
  • the serum samples obtained before immunization (day 0), 14 days (day 14), 28 days (day 28), and 42 days (day 42) after immunization were treated with stepwise dilution concentrations. Then, the 96-well microplate was washed 5 times with PBST, and then reacted with goat anti-Llama IgG HRP antibody at room temperature for 1 hour. Antibodies bound to immune antigens were checked by TMB reaction.
  • An immune library was constructed by amplifying a gene encoding a single domain antibody binding to the immune antigen identified in ⁇ Example 1>.
  • peripheral blood mononuclear cells PBMCs
  • a gene fragment encoding a single domain antibody was amplified using a specific primer from total RNA (Total RNA) extracted from isolated peripheral blood mononuclear cells (PBMC), and cloned into pComb3x vector.
  • Total RNA total RNA
  • the size of the prepared immune library was 5.4 ⁇ 10 8 .
  • the immune library prepared in ⁇ Example 2> was transformed into the XL1-blue strain.
  • the transformed XL1-blue strain was added to 10 ml of 2x YT medium containing 2% glucose and 100 ⁇ g/ml ampicillin and cultured in a shaker at 37°C. It was cultured at OD 600 until the absorbance became 0.5, and M13K07 phage (Invitrogen) was added to 1 ⁇ 10 11 pfu/ml. After stationary incubation at 37°C for 30 minutes, additional incubation was performed for 30 minutes at 200 rpm in a shaking stirrer at 37°C. The culture medium was centrifuged at room temperature and 4,000 rpm for 15 minutes to remove the supernatant.
  • the immune antigen was dispensed in a 96-well microplate using a coating buffer at a concentration of 5 ⁇ g/ml, and coated overnight at 4°C.
  • the library to be used for screening single-domain antibodies (the library of ⁇ Example 3>) was dispensed into a 96-well microplate and reacted at room temperature for 30 minutes. Thereafter, the operation of transferring the library to a new well and reacting at room temperature for 30 minutes was repeated 4 times. This work was done to reduce the library binding non-specifically to the microplate wells. Libraries were transferred to 1.7 ml tubes and stored at 4° C. until use.
  • the microplate coated with the immune antigen was washed 5 times with PBST and then blocked with 5% skim milk at room temperature for 2 hours. After washing with PBST 5 times, the library with reduced non-specific binding rate was dispensed with a binding solution (2.5% skim milk, 0.5% tween 20) at 5 ⁇ 10 12 virions/well and reacted at room temperature for 30 minutes. After washing 10 times with a washing solution (PBS, 0.5% tween 20), it was further washed 3 times with PBST.
  • the single domain antibody specifically bound to the immune antigen was selectively eluted by adding 5 ⁇ g of the immune antigen per well and reacting at room temperature for 30 minutes at 500 rpm.
  • the eluted phages were infected with XL-1 blue cells in the logarithmic growth phase, and then plated on 2x YT agar medium. Panning for the second selection was repeated under the same conditions as above. Single phage clones generated on agar medium were each amplified and screened using FACS.
  • a gene encoding the immune antigen was inserted into the pCMV6-GFP vector to construct a pCMV6-immune antigen-GFP plasmid.
  • Expi-CHO cells were washed with DPBS and centrifuged for 3 minutes at room temperature and 1,200 rpm. The supernatant was removed and the cells were resuspended in 2% skim milk and blocked at 4°C for 30 minutes.
  • the cells were centrifuged at room temperature and 1200 rpm for 3 minutes to remove the supernatant, washed twice with DPBS, and aliquoted to 3 ⁇ 10 5 cells/100 ⁇ l/well in a 96-well microplate. Monoclonal phage was added to each well, reacted at 4°C for 1 hour, and then washed twice with DPBS. An antibody (M13 major coat protein Alexa Flour 647 (Santacruz)) that specifically binds phage to cells is dispensed and reacted at 4° C. for 30 minutes while blocking light. Cells were washed twice with DPBS, resuspended in fresh DPBS, and analyzed by FACS using an Accuri C6 (BD) instrument. Clones screened using the FACS system were selected and sequencing was performed.
  • BD Accuri C6
  • TGEX-Fc IgG1
  • TGEX-Fc IgG4
  • ExpiFectamineTM CHO Reagent Gibco, 100033021
  • 920 ⁇ l of OptiPROTM medium were added with 20 ⁇ g of plasmid DNA encoding a single domain antibody fused with human IgG Fc domain and 1 ml of OptiPROTM medium mixture. After reacting at room temperature for 5 minutes, it was added to the cultured cells. Cells were cultured for 20 hours at 125 rpm in a shaker incubator maintained in 8% CO 2 .
  • ExpiFectamine TM CHO enhancer (Gibco) and 6 ml of ExpiCHO Feed (Gibco) to enhance the expression of a single domain antibody fused with a human IgG Fc domain are put into it, and 5% CO 2 is maintained at 125° C. in a shaker incubator. Incubated at rpm for 5 days. The cultured cells were centrifuged at 4,000 rpm at 4° C. for 30 minutes, and the supernatant was filtered using a 0.2 ⁇ m syringe filter.
  • the supernatant was loaded onto a HiTrap protein G HP column (GE Healthcare), washed with PBS, and then a single domain antibody fused with a human IgG Fc domain was eluted from the column using an IgG elution buffer (Thermo).
  • the eluted sample was neutralized by adding 1M Tris-HCl (pH 9.0) and stored at 4°C until use.
  • a bivalent single domain antibody was prepared by linking the clones selected in ⁇ Example 5> using two G2S linkers (GGSGGS).
  • the nucleotide encoding the bivalent single domain antibody was obtained through gene synthesis (Macrogen, Korea).
  • a gene synthesized for expression and purification of a single domain antibody fused with a human IgG4 Fc domain was cloned into a TGEX-Fc (IgG4) expression vector. Thereafter, expression and purification were performed in the same manner as described in Example ⁇ 6-1>.
  • each single domain antibody that specifically binds to each of the PD-L1 and CD47 antigens was selected.
  • the nucleotide sequence encoding each single domain antibody was linked using a peptide linker, and two single domain antibodies specifically binding to PD-L1 and a single domain antibody binding specifically to CD47 were linked in order (anti- PD-L1 sdAb ⁇ anti-PD-L1 sdAb ⁇ anti-CD47 sdAb).
  • the nucleotide sequence encoding the trivalent bispecific single domain antibody was obtained through gene synthesis (Macrogen, Korea).
  • a gene synthesized for expression and purification of a bispecific single domain antibody fused with a human IgG4 Fc domain was cloned into a TGEX-Fc (IgG4) expression vector, and the same method as that described in Example ⁇ 6-1>. was expressed and purified.
  • Anti-PD-L1 HCAb (PDL1 Nb#01-IgG1), anti-PD-L1 bivalent HCAb (PP Nb-IgG4), anti-CD47 HCAb purified in ⁇ Example 6> and ⁇ Example 7> ( The binding ability of CD47 Nb-IgG4) and anti-PD-L1 ⁇ CD47 HCAb (PPC Nb-IgG4) and immune antigens was confirmed by FACS.
  • the CHO-K1_PD-L1 cell line (CHO-K1 cells overexpressing the PD-L1 antigen) or the Expi-CHO_CD47 cell line (Expi-CHO cells overexpressing the CD47 antigen) were washed with DPBS at room temperature, 1,200 rpm for 3 Centrifuged for minutes. The supernatant was removed and the cells were resuspended in 2% skim milk and blocked at 4°C for 30 minutes. The cells were centrifuged at room temperature and 1,200 rpm for 3 minutes to remove the supernatant, and then washed twice with DPBS.
  • anti-PD-L1 HCAb (PDL1 Nb#01-IgG1), anti-PD-L1 bivalent HCAb (PP Nb-IgG4) , anti-CD47 HCAb (CD47 Nb-IgG4), and anti-PD-L1 ⁇ CD47 HCAb (PPC Nb-IgG4) were treated for each concentration, and an isotype control antibody was used as a negative control.
  • the cells were reacted at 4° C. for 1 hour, and then washed twice with DPBS.
  • an antibody that specifically binds to the human Fc domain (Anti-human IgG Fc APC antibody (Biolegend)) was treated and reacted at 4° C. for 30 minutes while blocking light.
  • Cells were washed twice with DPBS, resuspended in 100 ⁇ l of DPBS, and analyzed by FACS using an Accuri C6 (BD) instrument.
  • BD Accuri C6
  • Anti-PD-L1 HCAb (PDL1 Nb#01-IgG1), anti-PD-L1 bivalent HCAb (PP Nb-IgG4), anti-CD47 HCAb purified in ⁇ Example 6> and ⁇ Example 7> ( The inhibitory ability of CD47 Nb-IgG4) and anti-PD-L1 ⁇ CD47 HCAb (PPC Nb-IgG4) on the PD-1/PD-L1 or CD47/SIRPalpha interaction was evaluated.
  • anti-PD-L1 HCAb for PD-1/PD-L1 interaction (PDL1 Nb#01-IgG1), anti-PD-L1 bivalent HCAb (PP Nb-IgG4) or anti-PD-L1 ⁇
  • PPC Nb-IgG4 the CHO-K1_PD-L1 cell line (CHO-K1 cells constantly expressing the PD-L1 antigen) was dispensed at 2 ⁇ 10 5 cells per well in a 96-well microplate, 10 ⁇ g/ml of human PD-1-His protein was treated.
  • anti-PD-L1 HCAb (PDL1 Nb#01-IgG1), anti-PD-L1 bivalent HCAb (PP Nb-IgG4) or anti-PD-L1 ⁇ CD47 HCAb (PPC Nb-IgG4) were treated by concentration, respectively. and the negative control group was treated with an isotype control antibody.
  • the cells were reacted at 4°C for 1 hour, and after washing 3 times with DPBS, an antibody that specifically binds to His antigen (Goat anti-His APC) was added and reacted at 4°C for 30 minutes while blocking light.
  • CHO-K1_PD-L1 cells CHO-K1 cells constantly expressing PD-L1 antigen
  • BD Accuri C6
  • Expi-CHO_CD47 cells (CD47 antigen constant Expressing Expi-CHO cells) were aliquoted at 2 ⁇ 10 5 cells per well in a 96-well microplate, and treated with 10 ⁇ g/ml of human SIRPalpha-His protein.
  • each concentration of anti-CD47 sdAb (CD47 Nb-IgG4) or anti-PD-L1 ⁇ CD47 HCAb (PPC Nb-IgG4) was treated, and the negative control group was treated with an isotype control antibody.
  • the amount of SIRPalpha-His protein remaining in Expi-CHO_CD47 cells was checked with Accuri C6 (BD) equipment, thereby anti-CD47 sdAb
  • the inhibitory ability of (CD47 Nb-IgG4) or anti-PD-L1 ⁇ CD47 HCAb (PPC Nb-IgG4) on the CD47/SIRPalpha interaction was evaluated.
  • Example 10 Affinity evaluation with an immune antigen of a single or bispecific monodomain antibody fused with a human IgG Fc domain
  • Anti-PD-L1 HCAb (PDL1 Nb#01-IgG1), anti-PD-L1 bivalent HCAb (PP) purified in ⁇ Example 6> and ⁇ Example 7> using Octet RED 96e (ForteBio) equipment Nb-IgG4), anti-CD47 HCAb (CD47 Nb-IgG4), and anti-PD-L1 ⁇ CD47 HCAb (PPC Nb-IgG4) were measured for the affinity (K d ) of the immune antigen protein.
  • an anti-human Fc-coated biosensor tip (Fortebio) was used at 5 ⁇ g/ml of anti-PD-L1 HCAb (PDL1 Nb#01-IgG1), anti-PD-L1 bivalent HCAb (PP Nb-IgG4).
  • anti-CD47 HCAb CD47 Nb-IgG4
  • anti-PD-L1 ⁇ CD47 HCAb PPC Nb-IgG4
  • PD-L1 and CD47 antigens were diluted stepwise in 2-fold using 1X kinetic buffer (ForteBio) at 10-400 nM and reacted with stirring at 30°C and 1,000 rpm.
  • the association and dissociation reactions of the samples were analyzed for 200 and 400 seconds, respectively.
  • the resulting data were analyzed using a 1:1 interaction model (Global fitting) method.
  • CHO-K1_PD-L1 cells CHO-K1 cells induced overexpression of PD-L1 antigen
  • PD-1 expressing Jurkat cells The in vitro efficacy of (PPC Nb-IgG4) was evaluated.
  • CHO-K1_PD-L1 cells (CHO-K1 cells induced overexpression of PD-L1 antigen) were seeded at 2 ⁇ 10 4 cells per well in a 96-well microplate, and then in an incubator maintained at 5% CO 2 16 incubated for hours. After removing the medium, anti-PD-L1 ⁇ CD47 HCAb (PPC Nb-IgG4) was treated for each concentration and reacted for 1 hour.
  • Jurkat cells were prepared at 5 ⁇ 10 5 cells/100 ⁇ l and then treated with PHA to a concentration of 0.5 mg/ml, and added to CHO-K1_PD-L1 cells treated with anti-PD-L1 ⁇ CD47 HCAb (PPC Nb-IgG4). and reacted for 48 hours. Thereafter, the supernatant was evaluated for the in vitro efficacy of anti-PD-L1 ⁇ CD47 HCAb (PPC Nb-IgG4) by measuring the IL-2 concentration through ELISA.
  • the in vitro effectiveness of the anti-PD-L1 ⁇ CD47 HCAb (PPC Nb-IgG4) purified in ⁇ Example 7> was determined by the degree of phagocytosis activation of macrophages by CD47 antigen-specific binding and the human RBC binding (Human RBC binding), hemagglutination (Hemagglutination) was confirmed and evaluated.
  • THP-1 cells 5 ⁇ 10 6 cells of THP-1 cells were aliquoted into 100 pie dishes and cultured for 24 hours in an incubator maintained in 5% CO 2 . After reacting with 40 nM PMA for 24 hours, the medium was removed and stained with 1 ⁇ M deep red dye. After staining, the medium was replaced and rested for 48 hours. THP-1 cells removed with trypsin were mixed with prey cells (Raji cells) stained with 3 ⁇ M CFSE in a ratio of 8:1, and then treated with anti-PD-L1 ⁇ CD47 HCAb (PPC Nb-IgG4) by concentration. and co-cultured for 4 hours. Thereafter, the degree of phagocytosis was evaluated using FACS.
  • the cells were treated with an antibody that specifically recognizes human IgG4 (anti human IgG4) as a secondary antibody, and reacted at 4°C for 1 hour.
  • Cells were washed with DPBS, and the degree of anti-PD-L1 ⁇ CD47 HCAb (PPC Nb-IgG4) binding to RBCs was evaluated through FACS.
  • the in vivo efficacy of the anti-PD-L1 ⁇ CD47 HCAb (PPC Nb-IgG4) purified in ⁇ Example 7> was evaluated using a tumor cell line (B16F10 cells) induced to express human PD-L1 and human CD47 in C57BL/6 mice.
  • the anti-tumor effect of anti-PD-L1 ⁇ CD47 HCAb (PPC Nb-IgG4) was evaluated.
  • a monovalent monovalent monovalent PD-L1 containing human IgG1 Fc domain was used.
  • the domain antibody was expressed and purified, and the purified monovalent single domain antibody was named anti-PD-L1 HCAb (PDL1 Nb#01-IgG1).
  • the amino acid sequence of the anti-PD-L1 HCAb (PDL1 Nb#01-IgG1) comprising a human IgG1 Fc domain is shown in Table 7 below.
  • the amino acid sequence of the anti-PD-L1 bivalent sdAb (PP Nb) except for the human IgG4 Fc domain in the anti-PD-L1 bivalent HCAb (PP Nb-IgG4) is shown in Table 8 below, and the human IgG4 Fc domain
  • Anti-PD-L1 HCAb (PDL1 Nb#01-IgG1) and anti-PD- purified in ⁇ Experimental Example 1> using FACS in the same manner as in ⁇ Example 8> and ⁇ Example 9>
  • the antigen-binding ability of HCAb (PP Nb-IgG4) ( FIGS. 1A and 2A ) and the inhibitory ability ( FIGS. 1B and 2B ) of L1 2 on the PD-1/PD-L1 interaction were evaluated.
  • anti-PD-L1 HCAb (PDL1 Nb#01-IgG1) was found in CHO-K1_PD-L1 cells (CHO-K1 cells constantly expressing PD-L1 antigen).
  • the antigen-binding ability of 23.31 nM (EC50) was confirmed, and the inhibitory ability on the PD-1/PD-L1 interaction was confirmed as 4.60 nM (IC50).
  • anti-PD-L1 bivalent HCAb (PP Nb-IgG4) was 1.93 in CHO-K1_PD-L1 cells (CHO-K1 cells constantly expressing PD-L1 antigen).
  • the antigen-binding ability of nM (EC50) was confirmed, and the inhibitory ability on the PD-1/PD-L1 interaction was confirmed to be 2.86 nM (IC50).
  • the anti-PD-L1 HCAb confirmed the antigen affinity of 7.08 nM with the PD-L1 antigen
  • the anti-PD-L1 bivalent HCAb confirmed an antigen affinity of 4.58 nM with the PD-L1 antigen.
  • a single domain antibody specific for CD47 including a human IgG4 Fc domain was expressed and purified in the same manner as in Example ⁇ 6-1>.
  • the purified single domain antibody was named anti-CD47 HCAb (CD47 Nb-IgG4).
  • the amino acid sequence of the anti-CD47 HCAb (CD47 Nb-IgG4) comprising a human IgG4 Fc domain is shown in Table 13 below.
  • anti-CD47 HCAb (CD47 Nb-IgG4) had an antigen-binding capacity of 3.78 nM (EC50) in Expi-CHO_CD47 cells (Expi-CHO cells constantly expressing CD47 antigen). was confirmed, and the inhibitory ability on the CD47/SIRPalpha interaction was confirmed to be 7.28 nM (IC50).
  • the anti-CD47 HCAb (CD47 Nb-IgG4) confirmed an antigen affinity of 2.78 nM with the CD47 antigen.
  • a single domain antibody containing a human IgG4 Fc domain and dual specific for PD-L1 and CD47 antigens as immune antigens was prepared using the clones selected in Experimental Example ⁇ 1-1>.
  • the nucleotide sequence encoding the anti-PD-L1 sdAb (PDL1 Nb#01) selected in Experimental Example ⁇ 1-1> and the anti-CD47 sdAb (CD47 Nb#01) selected in Experimental Example ⁇ 2-1> Genes were synthesized in the same manner as in ⁇ Example 7> using the nucleotide sequence encoding the Nb-IgG4).
  • the amino acid sequence of the PD-L1 ⁇ CD47 trivalent sdAb except for the human IgG4 Fc domain in the anti-PD-L1 ⁇ CD47 trivalent HCAb (PPC Nb-IgG4) is shown in Table 15 below, and the human IgG4 Fc domain
  • PD-L1 antigen of anti-PD-L1 ⁇ CD47 trivalent HCAb (PPC Nb-IgG4) purified in Experimental Example ⁇ 3-1> using FACS in the same manner as in ⁇ Example 8>, and CD47 antigen binding ability was confirmed.
  • the anti-PD-L1 ⁇ CD47 trivalent HCAb (PPC Nb-IgG4) was compared to CHO-K1_PD-L1 cells (CHO-K1 cells constantly expressing the PD-L1 antigen).
  • CHO-K1_PD-L1 cells CHO-K1 cells constantly expressing the PD-L1 antigen.
  • an antigen-binding capacity of 13.33 nM (EC50) was confirmed, and an antigen-binding capacity of 18.80 nM (EC50) was observed in Expi-CHO_CD47 cells (Expi-CHO cells constantly expressing CD47 antigen).
  • the anti-PD-L1 ⁇ CD47 trivalent HCAb (PPC Nb-IgG4) had an inhibitory ability on the PD-1/PD-L1 interaction of 9.15 nM (IC50). and the inhibitory ability on the CD47/SIRPalpha interaction was confirmed to be 22.44 nM (IC50).
  • the anti-PD-L1 ⁇ CD47 trivalent HCAb (PPC Nb-IgG4) showed excellent affinity of 6.84 nM to the PD-L1 antigen and 3.62 nM to the CD47 antigen.
  • the in vitro efficacy of anti-PD-L1 ⁇ CD47 trivalent HCAb (PPC Nb-IgG4) against PD-L1 antigen was confirmed in the same manner as in Example ⁇ 11-1> in CHO-K1_PD-L1 cells.
  • the anti-PD-L1 ⁇ CD47 trivalent HCAb (PPC Nb-IgG4) interferes with the interaction between (CHO-K1 cells constantly expressing PD-L1) and jurkat cells expressing PD-1, and expression from jurkat cells
  • the in vitro efficacy was evaluated by measuring the IL-2 concentration.
  • the anti-PD-L1 ⁇ CD47 trivalent HCAb (PPC Nb-IgG4) interfered with jurkat cells expressing PD-1 and CHO-K1 cells expressing PD-L1 to CHO
  • anti-PD-L1 ⁇ CD47 trivalent HCAb (PPC Nb-IgG4) interferes with THP-1 cells and CD47 antigen-expressing prey cells (Raji cells) to express CD47.
  • the binding capacity of 1.44 nM (EC50) to prey cells was confirmed.
  • the CD47 monoclonal antibody (Competitor) used as a positive control was confirmed to bind to human RBC at 2.93 nM or higher, whereas the anti-PD-L1 ⁇ CD47 trivalent HCAb (PPC Nb-IgG4) RBC binding was not confirmed even at 3 ⁇ M, the maximum concentration used in the experiment.
  • the CD47 monoclonal antibody (Competitor) used as a positive control showed hemagglutination at 11.72 nM or higher, whereas the anti-PD-L1 ⁇ CD47 trivalent HCAb (PPC Nb-IgG4) was Hemagglutination was not observed even at the maximum concentration of 3 ⁇ M used in the experiment.
  • anti-PD-L1 ⁇ CD47 trivalent HCAb PPC Nb-IgG4
  • tumor cells expressing PD-L1 and CD47 antigens B16F10 cells
  • the antitumor effect was observed through intraperitoneal administration in the formed mouse model.
  • anti-PD-L1 ⁇ CD47 trivalent HCAb (PPC Nb-IgG4) exhibited an antitumor effect of about 49.4% compared to the negative control group (Isotype group), and anti-PD-L1 ⁇ Compared to the group treated with each antibody constituting the CD47 trivalent HCAb (PPC Nb-IgG4) in combination (anti-PD-L1 bivalent HCAb (PP Nb-IgG4) + anti-CD47 HCAb (CD47 Nb-IgG4)) It was confirmed that about 38.8% of the antitumor effect appeared.
  • anti-PD-L1 ⁇ CD47 trivalent HCAb PPC Nb-IgG4
  • tumor cells expressing PD-L1 and CD47 antigens B16F10 cells
  • the anti-PD-L1 ⁇ CD47 trivalent HCAb (PPC Nb-IgG4) exhibited an antitumor effect of up to about 74.4% compared to the negative control group (Isotype group).
  • the single domain antibody according to the present invention exhibits excellent affinity for CD47, an immune checkpoint protein, and an antitumor effect, and thus can be usefully used as an immune checkpoint inhibitor for immunochemotherapy.

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Abstract

본 발명은 PD-L1 및 CD47에 대한 이중특이적 단일 도메인 항체 및 이의 용도에 관한 것으로, 구체적으로 면역관문 단백질(immune checkpoint protein)인 PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 단일 도메인 항체를 제작하였고, 이의 면역 항원에 대한 친화성 및 항종양 효과를 확인하였으므로, 상기 이중특이적 단일 도메인 항체를 면역관문 억제제로 면역항암요법에 유용하게 이용할 수 있다.

Description

PD-L1 및 CD47에 대한 이중특이적 단일 도메인 항체 및 이의 용도
본 발명은 면역관문 단백질(immune checkpoint protein)인 PD-L1 및 CD47에 대한 이중특이적 단일 도메인 항체 및 이의 용도에 관한 것이다.
최근에 인체의 면역시스템을 이용해 새롭게 개발된 면역항암요법의 치료 효과가 입증되면서 기존의 화학치료제 및 표적치료제를 사용하였던 항암치료요법은 면역치료제를 이용하는 면역항암요법으로 변화하고 있다.
기본적으로 암환자의 면역세포는 암 항원에 대해 내성(tolerance)이 생겨서 암세포를 인식할 수는 있지만 기능적으로는 억제되어 있어서 암세포를 효과적으로 제거하지 못한다. 내성에 빠진 면역세포를 깨워서 활성화된 면역세포로 유도하여 암세포를 파괴하는 것이 면역치료의 핵심이다. 이러한 면역치료에는 IFN-γ, IL-2 등 사이토카인 치료제, 수지상세포를 이용한 암백신, T 세포를 이용한 세포치료제, 면역관문 단백질(immune checkpoint protein)을 차단하는 면역관문 억제제 (immune checkpoint inhibitor, ICI) 등이 있으며, 이러한 치료제를 통상적으로 면역항암제(immuno-oncology therapy)라고 부른다. 그 중에서도 국제적인 제약회사들이 경쟁적으로 개발하고 있는 면역항암제는 면역관문 억제제이다.
면역관문 단백질(immune checkpoint protein)은 세포막 단백질로서 면역세포의 분화, 증식, 활성을 억제한다. 구체적으로, 이 단백질은 대체로 활성화된 T 세포에서 발현되어서, T 세포의 증식, 사이토카인 분비, 세포독성을 감소시키고, T 세포의 과도한 활성을 억제하는 기능이 있기 때문에 co-inhibitory 분자라고도 불린다. 대표적으로 T 세포에는 co-inhibitory 수용체인 CTLA-4와 PD-1이 발현되어 있어서 각각의 리간드인 B7.1/2 및 PD-L1과의 결합을 통해 T 세포의 활성을 조절하게 된다. 한편, PD-L1은 암세포에서 발현되어 암 특이적인 T 세포를 비활성화시키고 세포사멸을 유도하여 T 세포의 면역공격으로부터 암세포를 보호해 주는 중요한 분자방패(molecular shield) 역할을 하고 있어서 암의 면역회피 기전이 되기도 한다. 또한, 암세포에 이소성(ectopic)으로 PD-L1이 발현된 암환자는 그렇지 않은 암환자에 비해 예후가 더 나쁜 것으로 보고되고 있다.
면역관문 억제제는 이러한 T 세포 억제에 관여하는 면역관문 단백질의 활성을 차단하여 T 세포를 활성화시켜 암세포를 공격하는 약제로서 대표적으로 CTLA-4, PD-1, PD-L1을 인식하는 항체를 사용한다. CTLA-4 억제제인 이피리무맙(ipilimumab (Yervoy))이 면역관문 억제제 중에서는 처음으로 전이 흑색종에 대한 2차 치료제로 2011년 FDA 승인을 획득하였다. 이후 2014년 PD-1 차단제인 니보루맙(nivolumab (Opdivo))과 펨브롤리주맙(pembrolizumab (Keytruda))이 전이 흑색종에 대해 각각 FDA 승인을 획득하였다. 이후 PD-L1에 대한 면역관문 억제제인 아테조리주맙(atezolizumab(Tecentriq))이 방광암에 대해서(2016년), 아베루맙(avelumab (Bavencio))이 피부암의 일종인 전이 머클세포암 치료에, 더바루맙(durvalumab (Imfinzi))이 방광암에 대해서 2017년에 FDA 승인을 획득하였다. 2018년에는 PD-1 저해제인 케미프리맙 (cemiplimab(Libtayo))가 피부편평상피암에 대해 FDA 승인을 얻었다. 현재 이들 약제는 치료 적응증을 확대하면서 점점 더 많은 암종의 치료에 대해 FDA 승인을 얻고 있다. 2019년 기준 6종의 PD-1/PD-L1 저해제는 총 18개 암종에 대해 FDA 승인을 얻었다. 이외에도 B7-H4, ICOS, HVEM, PDL-2, PVRIG 등 면역조절단백질 등이 새로운 타겟으로 전임상시험에 진입하고 있다. 대부분의 이러한 치료제들은 T 세포상에 발현되어 있는 타겟을 표적으로 하고 있다.
이렇게 T 세포 중심의 편향적인 타겟발굴 경향을 극복하기 위해 최근에는 대식세포, 수지상세포 등 myeloid 계열의 세포에서 발현되는 면역관문 단백질을 표적으로 하는 억제제들이 개발되고 있다. 이 중에 CSF1R, CD47, TLR7 등이 중요한 타겟으로 부상되고 있다.
T 세포의 활성을 억제시킴으로써 종양세포가 면역체계로부터 공격을 회피할수 있도록 하는 면역관문단백질의 하나인 PD-L1(Programmed Death-Ligand 1)은 림프계 및 비림프성 조직의 백혈구 및 비조혈(Nongematopoietic) 세포에서 주로 발현하며 대장암, 췌장암, 흑색종 및 자궁경부암 등 다양한 종양세포의 표면에서도 발현한다. 특히 활성화된 T 세포 표면에서 발현하는 PD-1(Programmed Death-1)과 상호작용하여 TCR-매개 T 세포 활성화(TCR mediated T-cell activation), 사이토카인 발현(Cytokine release) 및 T 세포의 증식(T-cell proliferation)을 억제함으로서 T 세포의 면역 반응을 부정적으로 조절한다.
1980년 인간 난소암에서 종양 항원으로 처음 동정된 CD47(Cluster of Differentiation 47)은 비-호지킨 림프종(NHL), 다발성 골수종(MM), 급성 림프모구성 백혈병(ALL), 급성 골수성 백혈병(AML), 만성 골수성 백혈병, 방광암 및 고형암을 비롯하여 다수의 인간 종양세포에서 발현된다.
CD47은 세포 표면에서 발현하여 SIRP 알파(SIRPa), 트롬보스폰딘-1(TSP1) 및 인테그린 단백질과 상호작용하여 세포의 사멸, 증식 및 면역반응에 관여한다. 특히 종양세포에서 발현되는 CD47은 대식세포(Macrophage) 표면에서 발현하는 SIRP 알파(SIRPa)와 상호작용하여 “나를 먹지 마” 신호를 보냄으로써 대식세포의 식세포 작용(Phagocytosis)으로부터 회피할 뿐만 아니라, 종양환경 내에서 혈관 증식 및 작동 T 세포(effector T-cell)의 역할을 억제하여 종양세포의 증식 및 성장을 촉진한다.
글로벌 제약사인 길리어드의 마그롤리맙(Magrolimab)은 CD47을 타겟으로 하는 항체치료제로 임상시험이 진행중에 있으며 최근 다국적 글로벌 제약사에서 CD47 항체치료제를 기반으로 한 이중항체 개발이 활발하게 이루어지고 있다.
이에, 본 발명자들은 면역관문 단백질인 PD-L1과 CD47을 타겟으로 하는 면역관문 억제제를 개발함으로써, 본 출원에 이르게 되었다.
[선행기술문헌]
[특허문헌]
미국 공개특허 제2020-0181259호
국제 공개특허 제2011-143624호
미국 등록특허 제8,008,449호
[비특허문헌]
Pol Specenier (2016): Ipilimumab in melanoma, Expert Review of Anticancer Therapy.
DB Johnson, C Peng et al. Nivolumab in melanoma: latest evidence and clinical potential. Ther Adv Med Oncol 2015, Vol. 7(2) 97-106
Liu J, Wang L, Zhao F, Tseng S, Narayanan C, Shura L, et al. (2015) Pre-Clinical Development of a Humanized Anti-CD47 Antibody with Anti-Cancer Therapeutic Potential. PLoS ONE 10(9): e0137345.
본 발명의 목적은 면역관문 단백질(immune checkpoint protein)인 PD-L1 및 CD47에 대한 이중특이적 단일 도메인 항체 및 이의 용도를 제공하는 것이다.
본 발명의 목적을 달성하기 위하여, 본 발명은 PD-L1에 특이적으로 결합하는 제1 단일 도메인 항체(제1 sdAb) 또는 이의 항원-결합 단편 및 CD47에 특이적으로 결합하는 제 2단일 도메인 항체(제2 sdAb) 또는 이의 항원-결합 단편을 포함하는, PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체를 제공한다.
본 발명의 일 양태에서, 상기 제1 sdAb 또는 이의 항원-결합 단편은 서열번호 2로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 CDR1; 서열번호 3으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 CDR2; 및 서열번호 4로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 CDR3를 포함할 수 있다.
또한, 상기 제2 sdAb 또는 이의 항원-결합 단편은 서열번호 7로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 CDR1; 서열번호 8로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 CDR2; 및 서열번호 9로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 CDR3를 포함할 수 있다.
또한, 상기 제1 sdAb 또는 이의 항원-결합 단편은 서열번호 13 및 17 중 어느 하나로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR1; 서열번호 14 및 18 중 어느 하나로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR2; 서열번호 15 및 19 중 어느 하나로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR3; 및 서열번호 16 및 20 중 어느 하나로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR4를 포함하는 VHH 도메인을 포함할 수 있고, 보다 구체적으로 (1) 서열번호 13으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR1; 서열번호 14로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR2; 서열번호 15로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR3; 및 서열번호 16으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR4; 또는 (2) 서열번호 17로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR1; 서열번호 18로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR2; 서열번호 19로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR3; 및 서열번호 20으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR4를 포함하는 VHH 도메인을 포함할 수 있으며, 보다 더 구체적으로 서열번호 13으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR1; 서열번호 14로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR2; 서열번호 15로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR3; 및 서열번호 16으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR4를 포함하는 VHH 도메인을 포함할 수 있다. 일부 구현예에서, 상기 제1 sdAb는 서열번호 1로 표시되는 아미노산 서열을 포함한다.
또한, 상기 제1 sdAb 또는 이의 항원-결합 단편은 1가, 2가, 3가, 4가, 또는 더 높은 가수일 수 있다. 또한, 상기 제1 sdAb 또는 이의 항원-결합 단편 간 펩티드 링커를 통해 서로 융합될 수 있고, 일부 구현예에서 서열번호 21로 표시되는 아미노산 서열을 포함한다.
또한, 상기 제2 sdAb 또는 이의 항원-결합 단편은 서열번호 13 및 17 중 어느 하나로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR1; 서열번호 14 및 18 중 어느 하나로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR2; 서열번호 15 및 19 중 어느 하나로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR3; 및 서열번호 16 및 20 중 어느 하나로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR4를 포함하는 VHH 도메인을 포함할 수 있고, 보다 구체적으로 (1) 서열번호 13으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR1; 서열번호 14로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR2; 서열번호 15로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR3; 및 서열번호 16으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR4; 또는 (2) 서열번호 17로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR1; 서열번호 18로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR2; 서열번호 19로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR3; 및 서열번호 20으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR4를 포함하는 VHH 도메인을 포함할 수 있으며, 보다 더 구체적으로 서열번호 17로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR1; 서열번호 18로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR2; 서열번호 19로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR3; 및 서열번호 20으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR4를 포함하는 VHH 도메인을 포함할 수 있다. 일부 구현예에서, 상기 제2 sdAb는 서열번호 6으로 표시되는 아미노산 서열을 포함한다.
또한, 상기 제2 sdAb 또는 이의 항원-결합 단편은 1가, 2가, 3가, 4가, 또는 더 높은 가수일 수 있다. 또한, 상기 제2 sdAb 또는 이의 항원-결합 단편 간 펩티드 링커를 통해 서로 융합될 수 있다.
본 발명의 일 양태에서, 상기 제1 sdAb 또는 이의 항원-결합 단편 및/또는 제2 sdAb 또는 이의 항원-결합 단편은 펩티드 링커를 통해 서로 융합될 수 있고, 일부 구현예에서 서열번호 11로 표시되는 아미노산 서열을 포함한다.
본 발명의 일 양태에서, 상기 제1 sdAb 및/또는 제2 sdAb는 적어도 1개 이상의 아미노산 치환을 포함할 수 있고, 상기 적어도 1개 이상의 아미노산 치환이 보존적 치환일 수 있으며, 아미노산의 비-유전자 코딩 아미노산 또는 합성 아미노산으로의 치환일 수 있다.
본 발명의 일 양태에서, 상기 제1 sdAb 또는 이의 항원-결합 단편, 또는 제2 sdAb 또는 이의 항원-결합 단편에 Fc 단편이 융합된 중쇄-단독 항체(HCAb)를 제공한다.
본 발명의 일 양태에서, 상기 제1 sdAb 또는 이의 항원-결합 단편 및/또는 제2 sdAb 또는 이의 항원-결합 단편의 2개 이상의 카피를 포함하는, 이중특이적 및 다가(예컨대, 2가, 3가, 4가, 또는 더 높은 가수)이고, Fc 단편이 융합된 HCAb일 수 있다. 일부 구현예에서, 상기 HCAb는 서열번호 12로 표시되는 아미노산 서열로 이루어질 수 있다.
본 발명의 일 양태에서, 상기 Fc 단편에 sdAb가 펩티드 링커를 통해 융합될 수 있고, 상기 Fc 단편은 인간 IgG1, IgG2, IgG3 또는 IgG4일 수 있다.
본 발명의 일 양태에서, 상기 HCAb는 적어도 1개 이상의 아미노산 치환을 포함할 수 있고, 상기 적어도 1개 이상의 아미노산 치환이 보존적 치환일 수 있으며, 아미노산의 비-유전자 코딩 아미노산 또는 합성 아미노산으로의 치환일 수 있다.
본 발명의 일 양태에서, 면역조정제, 사이토카인, 세포독성제, 화학요법제, 진단제, 항바이러스제, 항미생물제 또는 약물이 접합될 수 있다. 이에, 본 발명은 면역조정제, 사이토카인, 세포독성제, 화학요법제, 진단제, 항바이러스제, 항미생물제 또는 약물에 접합된 상기 PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체를 포함하는 항체 접합체를 제공한다.
또한, 본 발명은 상기 PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체를 암호화하는, 핵산 분자를 제공한다.
또한, 본 발명은 상기 핵산 분자를 포함하는, 발현 벡터를 제공한다.
또한, 본 발명은 상기 발현 벡터로 형질전환된 숙주 세포를 제공한다.
또한, 본 발명은
(a) 이중특이적 항체가 발현되도록 하는 조건 하에 상기 숙주 세포를 배양하는 단계; 및
(b) 발현된 이중특이적 항체를 회수하는 단계
를 포함하는, PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체를 생산하는 방법을 제공한다.
또한, 본 발명은 상기 PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체, 또는 상기 항체 접합체를 유효성분으로 함유하는, 암 예방 또는 치료용 약학적 조성물; 상기 PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체, 또는 상기 항체 접합체를 약학적으로 유효한 양으로 개체에 투여하는 단계를 포함하는, 암 예방 또는 치료 방법; 및 암의 예방 또는 치료에 사용하기 위한 상기 PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체, 또는 상기 항체 접합체의 용도를 제공한다.
본 발명의 일 앙태에서, 상기 암은 흑색종, 폐암, 간암, 교세포종, 난소암, 대장암, 두경부암, 방광암, 신장세포암, 위암, 유방암, 전이암, 전립선암, 췌장암, 비호지킨 림프종, 호지킨 림프종, 다발성 골수종, 백혈병, 림프종, 골수이형성증후군, 급성 림프모구성 백혈병, 급성 골수성 백혈병, 만성 림프구성 백혈병, 만성 골수성 백혈병, 고립성 골수종 및 재생불량성 빈혈로 이루어진 군으로부터 선택되는 것일 수 있다.
본 발명의 일 양태에서, 상기 약학적 조성물은 약학적으로 허용되는 담체를 더 포함할 수 있다.
본 발명에서는 면역관문 단백질(immune checkpoint protein)인 PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 단일 도메인 항체를 제작하였고, 이의 면역 항원에 대한 친화성 및 항종양 효과를 확인하였으므로, 상기 이중특이적 단일 도메인 항체를 면역관문 억제제로 면역항암요법에 유용하게 이용할 수 있다.
도 1a는 본 발명의 일 실시예에 따라 제작한 CHO-K1_PD-L1 세포주(PD-L1 항원의 발현을 유도한 CHO-K1 세포)와 항-PD-L1 HCAb(PDL1 Nb#01-IgG1)를 농도별로 반응하여 세포 표면에서 발현하는 PD-L1 항원에 대한 결합능 (EC50)을 확인한 도이다.
도 1b는 본 발명의 일 실시예에 따라 제작한 CHO-K1_PD-L1 세포주(PD-L1 항원의 발현을 유도한 CHO-K1 세포)와 PD-1 단백질의 결합 후 항-PD-L1 HCAb(PDL1 Nb#01-IgG1)가 PD-L1/PD-1 상호작용에 미치는 억제능(IC50)을 확인한 도이다.
도 2a는 본 발명의 일 실시예에 따라 제작한 CHO-K1_PD-L1 세포주(PD-L1 항원의 발현을 유도한 CHO-K1 세포)와 항-PD-L1 2가 HCAb(PP Nb-IgG4)를 농도별로 반응하여 세포 표면에서 발현하는 PD-L1 항원에 대한 결합능 (EC50)을 확인한 도이다.
도 2b는 본 발명의 일 실시예에 따라 제작한 CHO-K1_PD-L1 세포주(PD-L1 항원의 발현을 유도한 CHO-K1 세포)와 PD-1 단백질의 결합 후 항-PD-L1 2가 HCAb(PP Nb-IgG4)가 PD-L1/PD-1 상호작용에 미치는 억제능(IC50)을 확인한 도이다.
도 3a는 본 발명의 일 실시예에 따라 제작한 Expi-CHO_CD47 세포주(CD47 항원의 발현을 유도한 Expi-CHO 세포)와 항-CD47 HCAb(CD47 Nb-IgG4)를 농도별로 반응하여 세포 표면에서 발현하는 CD47 항원에 대한 결합능(EC50)을 확인한 도이다.
도 3b는 본 발명의 일 실시예에 따라 제작한 Expi-CHO_CD47 세포주(CD47 항원의 발현을 유도한 Expi-CHO 세포)와 SIRPalpha 단백질의 결합 후 항-CD47 HCAb(CD47 Nb-IgG4)가 CD47/SIRPalpha 상호작용에 미치는 억제능(IC50)을 확인한 도이다.
도 4a는 본 발명의 일 실시예에 따라 제작한 CHO-K1_PD-L1 세포주(PD-L1 항원의 발현을 유도한 CHO-K1 세포)와 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)를 농도별로 반응하여 세포 표면에서 발현하는 PD-L1 항원에 대한 결합능(EC50)을 확인한 도이다.
도 4b는 본 발명의 일 실시예에 따라 제작한 Expi-CHO_CD47 세포주(CD47 항원의 발현을 유도한 Expi-CHO 세포)와 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)를 농도별로 반응하여 세포 표면에서 발현하는 CD47 항원에 대한 결합능(EC50)을 확인한 도이다.
도 5a는 본 발명의 일 실시예에 따라 제작한 CHO-K1_PD-L1 세포주(PD-L1 항원의 발현을 유도한 CHO-K1 세포)와 PD-1 단백질의 결합 후 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)가 PD-L1/PD-1 상호작용에 미치는 억제능(IC50)을 확인한 도이다.
도 5b는 본 발명의 일 실시예에 따라 제작한 Expi-CHO_CD47 세포주(CD47 항원의 발현을 유도한 Expi-CHO 세포)와 SIRPalpha 단백질의 결합 후 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)가 CD47/SIRPalpha 상호작용에 미치는 억제능(IC50)을 확인한 도이다.
도 6은 본 발명의 일 실시예에 따라 제작한 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)의 PD-L1/PD-1 상호작용 저해능을 CHO-L1_PD-L1 세포(PD-L1 단백질의 과발현을 유도한 CHO-K1 세포)와 PD-1이 발현하는 Jurkat 세포를 이용하여 확인한 도이다.
도 7은 본 발명의 일 실시예에 따라 제작한 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)의 식세포작용(phagocytosis)을 확인한 도이다.
도 8은 본 발명의 일 실시예에 따라 제작한 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)의 인간 RBC 결합능(RBC binding)을 확인한 도이다.
도 9는 본 발명의 일 실시예에 따라 제작한 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)의 인간 적혈구응집반응(Hemagglutination)을 확인한 도이다.
도 10은 본 발명의 일 실시예에 따라 제작한 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)를 B16F10_PD-L1/CD47 세포주(PD-L1과 CD47 항원의 발현을 유도한 종양세포주)로 종양형성을 유도한 C57BL/6 마우스에 복강 투여 후 항종양 효과를 확인한 도이다.
도 11은 본 발명의 일 실시예에 따라 제작한 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)를 B16F10_PD-L1/CD47 세포주(PD-L1과 CD47 항원의 발현을 유도한 종양세포주)로 종양형성을 유도한 C57BL/6 마우스에 정맥 투여 후 항종양 효과를 확인한 도이다.
이하, 본 발명이 속하는 기술 분야에서 통상의 지식을 가진 자가 용이하게 실시할 수 있도록 본 발명의 실시형태를 들어 상세히 설명한다. 본 발명의 실시형태는 당업계에서 평균적인 지식을 가진 자에게 본 발명을 더욱 완전하게 설명하기 위해서 제공되는 것이다. 따라서 본 발명의 실시형태는 여러 가지 다른 형태로 변형될 수 있으며, 본 발명의 범위가 이하 설명하는 실시형태로 한정되는 것은 아니다.
본 발명에서, 용어 "에피토프"는 항체에 특이적 결합을 할 수 있는 단백질 결정요인을 의미한다. 에피토프는 일반적으로 분자, 예컨대 아미노산 또는 당 측쇄의 화학적 활성 표면 그룹화로 이루어지고 일반적으로 특이적 3차원 구조 특징, 뿐만 아니라 특이적 전하 특징을 갖는다.
용어 "치료"는 본원에 개시된 장애 또는 질환, 예를 들어 질환의 증상 또는 합병증을 늦추거나, 중단시키거나, 중지시키거나, 제어하거나, 정지시키거나, 완화하거나 또는 개선하는 것, 또는 그의 진행을 역전시키는 것일 수 있지만, 반드시 모든 질환 또는 장애 증상의 완전한 제거를 나타내는 것은 아닌 모든 과정을 의미한다.
용어 "예방"은 질환 또는 장애, 예를 들어 질환의 예방적 치료, 또는 질환 또는 장애의 발병 또는 진행을 지연시키는 것을 의미한다.
용어 "개체" 또는 "대상체"는, 비제한적으로, 인간, 소과, 말, 고양이, 개, 설치류, 또는 영장류를 포함하는, 포유동물을 지칭한다. 일부 구현예에서, 개체는 인간이다.
용어 "항체"는 이의 가장 넓은 의미로 사용되고, 이들이 원하는 항원-결합 활성을 나타내는 한, 비제한적으로 단클론성 항체, 다클론성 항체, 다중특이적 항체 (예를 들면, 이중특이적 항체), 전장 항체 및 이의 항원-결합 단편을 포함하는, 다양한 항체 구조를 포괄한다. 용어 "항체"는 종래의 4-쇄 항체, 단일 도메인 항체, 및 이의 항원-결합 단편을 포함한다.
기본 4-쇄 항체 유닛은 2개의 동일한 경 (L) 쇄 및 2개의 동일한 중 (H) 쇄로 구성된 헤테로사량체성 당단백질이다. IgM 항체는 J 쇄로 불리는 추가의 폴리펩티드와 함께 기본 헤테로사량체 유닛들 중 5개로 이루어지고, 10개의 항원-결합 부위를 함유하는 반면, IgA 항체는 J 쇄와 조합으로 다가 집합체를 형성하기 위해 중합화할 수 있는 기본 4-쇄 유닛들 중 2-5개를 포함한다. IgG의 경우에, 4-쇄 유닛은 일반적으로 약 150,000 달톤이다. 각각의 L 쇄는 1개의 공유 디설파이드 결합에 의해 H 쇄에 연결되는 반면, 2개의 H 쇄는 H 쇄 아이소타입에 의존하여 하나 이상의 디설파이드 결합에 의해 서로에 연결된다. 각각의 H 및 L 쇄는 또한 규칙적으로 이격된 쇄간 디설파이드 브릿지를 갖는다. 각각의 H 쇄는 N-말단에서, α 및 γ 쇄의 각각에 대하여 가변 도메인 (VH) 이어서 3개의 불변 도메인 (CH) 그리고 μ 및 ε 아이소타입에 대하여 4개의 CH 도메인을 갖는다. 각각의 L 쇄는 N-말단에서, 이의 다른 단부에 가변 도메인 (VL) 이어서 불변 도메인을 갖는다. VL은 VH와 정렬되고 CL은 중쇄의 제1 불변 도메인 (CH1)과 정렬된다. VH 및 VL의 짝짓기는 단일 항원-결합 부위를 함께 형성한다. 임의의 척추동물 종으로부터 L 쇄는, 그들의 불변 도메인의 아미노산 서열에 기반하여, 카파 및 람다로 불리는, 2개의 분명히 구별되는 유형들 중 하나로 배정될 수 있다. 그들의 중쇄의 불변 도메인 (CH)의 아미노산 서열에 의존하여, 면역글로불린은 상이한 클래스 또는 아이소타입으로 배정될 수 있다. 면역글로불린의 5개의 클래스가 있다: α, δ, ε, γ 및 μ, 각각으로 지정된 중쇄를 갖는, IgA, IgD, IgE, IgG 및 IgM. γ 및 α 클래스는 CH 서열 및 기능에서 상대적으로 소수의 차이에 근거하여 서브클래스로 추가 분할되고, 예를 들면, 인간은 하기 서브클래스를 발현시킨다: IgG1, IgG2A, IgG2B, IgG3, IgG4, IgA1 및 IgA2.
용어 "중쇄-단독 항체" 또는 "HCAb"는, 중쇄를 포함하지만 4-쇄 항체에서 일반적으로 발견된 경쇄가 부족한 기능성 항체를 지칭한다.
용어 "단일-도메인 항체", "나노바디" 또는 "sdAb"는 3개의 상보성 결정 영역 (CDR)를 갖는 단일 항원-결합 폴리펩티드를 지칭한다. sdAb 단독은 상응하는 CDR-함유 폴리펩티드와 짝짓기 없이 항원에 결합할 수 있다. 일부 경우에, 단일-도메인 항체는 낙타과 HCAb로부터 조작되고, 그들의 중쇄 가변 도메인은 "VHH" (중쇄 항체의 중쇄의 가변 도메인)으로서 본원에서 지칭된다. 기본 VHH는 N-말단부터 C-말단까지 하기 구조를 갖는다: FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4, 여기에서 FR1 내지 FR4는 프레임워크 영역 1 내지 4 각각을 지칭하고, CDR1 내지 CDR3은 상보성 결정 영역 1 내지 3을 지칭한다.
항체의 "가변 영역" 또는 "가변 도메인"은 항체의 중쇄 또는 경쇄의 아미노-말단 도메인을 지칭한다. 중쇄 및 경쇄의 가변 도메인은 "VH" 및 "VL" 각각으로서 지칭될 수 있다. 이들 도메인은 일반적으로 (동일한 클래스의 다른 항체에 비하여) 항체의 최대 가변성 부분이고 항원 결합 부위를 함유한다. 낙타과 종으로부터 중쇄-단독 항체는 "VHH"로서 지칭되는 단일 중쇄 가변 영역을 갖는다.
용어 "가변"은 가변 도메인의 특정한 분절이 항체들 중 서열에서 광범위하게 상이하다는 사실을 지칭한다. V 도메인은 항원 결합을 매개하고 이의 특정 항원에 대하여 특정 항체의 특이성을 정의한다. 하지만, 가변성은 가변 도메인의 전체 범위에 걸쳐서 고르게 분포되지 않는다. 대신에, 중쇄 및 경쇄 가변 도메인 둘 모두에서 상보성 결정 영역 (CDR) 또는 초가변 영역 (HVR)로 불리는 3개의 분절에서 농축된다. 가변 도메인의 더욱 고도로 보존된 부분은 프레임워크 영역 (FR)로 불린다. 천연 중쇄 및 경쇄 각각의 가변 도메인은, 루프 연결을 형성하는, 3개의 CDR로 연결된, 베타-시트 구성을 주로 채택하는, 그리고 일부 경우에 베타-시트 구조의 일부를 형성하는, 4개의 FR 영역을 포함한다. 각각의 쇄에서 CDR는 FR 영역에 의해 아주 근접하여 함께 유지되고, 다른 쇄로부터 CDR는 항체의 항원 결합 부위의 형성에 기여한다 (Kabat, Elvin A., Sequence of Immunological Interest, Fifth Edition, National Institute of Health, Bethesda, Md. (1991)을 참고한다). 불변 도메인은 항원에 대한 항체의 결합에 직접적으로 관여되지 않지만, 다양한 이펙터 기능, 예컨대 항체-의존적 세포 독성에서 항체의 참여를 나타낸다.
용어 "불변 도메인"은, 항원-결합 부위를 함유하는, 면역글로불린의 다른 부분, 가변 도메인에 비하여 더 많은 보존된 아미노산 서열을 가지고 있는 면역글로불린 분자의 부분을 지칭한다. 불변 도메인은 중쇄의 CH1, CH2 및 CH3 도메인 (집합적으로, CH) 및 경쇄의 CHL (또는 CL) 도메인을 함유한다.
용어 "전장 항체", "온전한 항체", 또는 "전체의 항체"는, 항체 단편과 대조적으로, 이의 실질적으로 온전한 형태로 항체를 지칭하기 위해 호환적으로 사용된다. 특이적으로, 전장 4-쇄 항체는 Fc 영역을 포함하는 중쇄 및 경쇄를 가진 것들을 포함한다. 전장 중쇄-단독 항체는 중쇄 가변 도메인 (예컨대 VHH) 및 Fc 영역을 포함한다. 불변 도메인은 천연 서열 불변 도메인 (예를 들면, 인간 천연 서열 불변 도메인) 또는 이의 아미노산 서열 변이체일 수 있다. 일부 경우에, 온전한 항체는 하나 이상의 이펙터 기능을 가질 수 있다.
"항체 단편" 또는 "항원-결합 단편"은 온전한 항체의 한 부분, 바람직하게는 온전한 항체의 항원 결합 및/또는 가변 영역을 포함한다. 항체 단편의 예는 비제한적으로 Fab, Fab', F(ab')2 및 Fv 단편; 디아바디; 선형 항체; 단일-쇄 항체 (scFv) 분자; 단일 도메인 항체 (예컨대 VHH), 및 항체 단편으로부터 형성된 다중특이적 항체를 포함한다. "Fv"는 완전 항원-인식 및 -결합 부위를 함유하는 최소 항체 단편이다. 이 단편은 치밀한, 비-공유 회합에서 1개의 중쇄 및 1개의 경쇄 가변 영역 도메인의 이량체로 이루어진다. "단일-쇄 Fv" 또한 약칭 "sFv" 또는 "scFv"는 단일 폴리펩티드 쇄에 연결된 VH 및 VL 항체 도메인을 포함하는 항체 단편이다. 바람직하게는, scFv 폴리펩티드는 scFv가 항원 결합을 위하여 원하는 구조를 형성할 수 있도록 하는 VH와 VL 도메인 사이의 폴리펩티드 링커를 추가로 포함한다. "디아바디"는 V 도메인의 쇄내가 아닌 쇄간 짝짓기가 달성되도록 VH와 VL 도메인 사이의 짧은 링커 (약 5-10개의 잔기)를 가진 sFv 단편을 작제하고, 그것에 의해 2가 단편, 즉, 2개의 항원-결합 부위를 갖는 단편을 초래함으로써 제조된 작은 항체 단편을 지칭한다. 이중특이적 디아바디는 2개의 항체의 VH 및 VL 도메인이 상이한 폴리펩티드 쇄에서 존재하는 2개의 "교차" sFv 단편의 헤테로이량체이다.
용어 "인간화된 항체"는 "키메라 항체"의 서브셋으로서 사용된다.
비-인간 (예를 들면, 라마 또는 낙타과) 항체의 "인간화된" 형태는 비-인간 면역글로불린으로부터 유래된 최소 서열을 함유하는 키메라 항체이다. 일부 구현예에서, 인간화된 항체는 수령체의 (이하에서 정의된) CDR로부터의 잔기가 원하는 특이성, 친화성, 및/또는 수용력을 갖는 비-인간 종 (공여체 항체) 예컨대 마우스, 랫트, 토끼, 낙타, 라마, 알파카, 또는 비-인간 영장류의 CDR로부터의 잔기로 대체되는 인간 면역글로불린 (수령체 항체)이다.
일부 사례에서, 인간 면역글로불린의 프레임워크 ("FR") 잔기는 상응하는 비-인간 잔기로 대체된다. 또한, 인간화된 항체는 수령체 항체에서 또는 공여체 항체에서 발견되지 않는 잔기를 포함할 수 있다. 이들 변형은 항체 성능, 예컨대 결합 친화성을 추가로 개선하기 위해 실시될 수 있다.
용어 "초가변 영역", "HVR", 또는 "HV"는, 본원에서 사용된 경우 서열에서 초가변성이고/거나 구조적으로 정의된 루프를 형성하는 항체 가변 도메인의 영역을 지칭한다. 일반적으로, 단일 도메인 항체는 3개의 HVR (또는 CDR): HVR1 (또는 CDR1), HVR2 (또는 CDR2), 및 HVR3 (또는 CDR3)을 포함한다. HVR3 (또는 CDR3)은 3개의 HVR의 최고 다양성을 표시하고, 항체에 미세 특이성 부여에서 고유의 역할을 한다고 알려져 있다. 예를 들면, Hamers-Casterman et al., Nature 363:446-448 (1993); Sheriff et al., Nature Struct. Biol. 3:733-736 (1996)을 참고한다.
용어 "상보성 결정 영역" 또는 "CDR"은 카밧 시스템에 의해 정의된 바와 같이 초가변 영역을 지칭하는데 사용된다. Kabat, Elvin A., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1991)을 참고한다. 카밧 상보성 결정 영역 (CDR)는 서열 가변성에 근거하고 가장 흔하게 사용된다.
용어 "프레임워크" 또는 "FR" 잔기는 본원에서 정의된 바와 같이 HVR 잔기 이외의 가변-도메인 잔기이다.
용어 "특이적"은 항원의 특정 에피토프에 대하여 항원 결합 단백질 (예컨대 sdAb)의 선택적 인식을 지칭한다.
천연 항체는, 예를 들어, 단일특이적이다. 본원에서 사용된 바와 같이 용어 "다중특이적"은 항원 결합 단백질이 폴리에피토프 특이성을 갖는 (즉, 1개의 생물학적 분자에서 2개의, 3개의, 또는 초과의, 상이한 에피토프에 특이적으로 결합할 수 있거나 2개의, 3개의, 또는 초과의, 상이한 생물학적 분자에서 에피토프에 특이적으로 결합할 수 있는) 것을 나타낸다. 본원에서 사용된 바와 같이 "이중특이적"은 항원 결합 단백질이 2개의 상이한 항원-결합 특이성을 갖는 것을 나타낸다.
본원에서 사용된 바와 같이 용어 "단일특이적"은 동일한 항원의 동일한 에피토프를 결합시키는 하나 이상의 결합 부위 각각을 갖는 항원 결합 단백질을 나타낸다.
용어 "가"는 항원 결합 단백질에서 결합 부위의 명시된 수의 존재를 나타낸다. 예를 들어, 용어 "2가" "3가", "4가", "5가" 및 "6가"는 항원 결합 단백질에서 2개의 결합 부위, 3개의 결합 부위, 4개의 결합 부위, 5개의 결합 부위, 및 6개의 결합 부위의 존재를 나타낸다.
"항체 이펙터 기능"은 항체의 Fc 영역 (천연 서열 Fc 영역 또는 아미노산 서열 변이체 Fc 영역)에 기인하는 그들 생물학적 활성을 지칭하고, 항체 아이소타입으로 다양하다. 항체 이펙터 기능의 예는 하기를 포함한다: C1q 결합 및 보체 의존적 세포독성; Fc 수용체 결합; 항체-의존적 세포-매개된 세포독성 (ADCC); 식균작용; 세포 표면 수용체 (예를 들면, B 세포 수용체)의 하향 조절; 및 B 세포 활성화. "보체 의존적 세포독성" 또는 "CDC"는 보체의 존재 하에서 표적 세포의 용해를 지칭한다. 고전적 보체 경로의 활성화는 보체 시스템의 제 1 성분 (C1q)의 그들의 동족 항원에 결합되는 (적당한 서브클래스의) 항체에 대한 결합에 의해 개시된다. "항체-의존적 세포-매개된 세포독성" 또는 ADCC는 특정한 세포독성 세포 (예를 들면, 자연 살해 (NK) 세포, 중성구 및 대식세포)에 존재하는 Fc 수용체 (FcR)에 결합되어 있는 분비된 Ig가 이들 세포독성 이펙터 세포를 항원-보유 표적 세포에 특이적으로 결합시키고 후속으로 표적 세포를 세포독소로 사멸시키는 세포독성의 한 형태를 지칭한다.
본원에서 용어 "Fc 영역" 또는 "단편 결정화가능 영역"은, 천연-서열 Fc 영역 및 변이체 Fc 영역을 포함하는, 면역글로불린 중쇄의 C-말단 영역을 정의하는데 사용된다. 본원에서 기재된 항체에서 사용하기 위한 적합한 천연-서열 Fc 영역은 인간 IgG1, IgG2 (IgG2A, IgG2B), IgG3 및 IgG4를 포함한다.
"결합 친화성"은 일반적으로 분자 (예를 들면, 항체)의 단일 결합 부위와 이의 결합 파트너 (예를 들면, 항원) 사이의 비-공유 상호작용의 총계의 강도를 지칭한다. 달리 명시되지 않는 한, 본원에서 사용된 바와 같이, "결합 친화성"은 결합 쌍의 구성원 사이의 1:1 상호작용을 반영하는 고유 결합 친화성을 지칭한다. 결합 친화성은 Kd, Koff, Kon, 또는 Ka로 표시될 수 있다. 본원에서 사용된 바와 같이, 용어 평형 해리 상수 "KD" 또는 "Kd"는 특정 항체-항원 상호작용의 해리 상수를 지칭하고, 평형에서 항체 분자의 용액에 존재하는 모든 항체-결합 도메인의 이분의 일을 차지하는데 필요한 항원의 농도를 기재하고, M의 단위로 표현된다. KD의 측정은 모든 결합 제제가 용액내인 것을 전제한다. 해리 상수 (KD 또는 Kd)는 항원에 대한 항체의 친화성을 나타내는 지표로서 사용된다. 예를 들어, 쉬운 분석은 다양한 마커 제제들로 마킹된 항체를 이용하는 스캐차드(Scatchard) 방법에 의해, 뿐만 아니라 키트에 부착된 사용자의 매뉴얼 및 실험 작동 방법에 따른, 일반의약품, 측정 키트 이용에 의해 가능하다. 이들 방법을 사용하여 유래될 수 있는 KD 값은 M (Mols)의 단위로 표현된다.
펩티드, 폴리펩티드 또는 항체 서열에 대하여 "퍼센트 (%) 아미노산 서열 동일성" 및 "상동성"은, 최대 퍼센트 서열 동일성을 달성하기 위해, 필요하면, 서열 정렬 및 갭 도입 후, 그리고 서열 동일성의 일부로서 임의의 보존적 치환 고려 없이, 특이적 펩티드 또는 폴리펩티드 서열에서 아미노산 잔기와 동일한 후보 서열에서 아미노산 잔기의 백분율로서 정의된다. 퍼센트 아미노산 서열 동일성의 결정 목적을 위한 정렬은 당업계에서 기술 내에 있는 다양한 방식으로, 예를 들어, 공공연하게 이용가능한 컴퓨터 소프트웨어 예컨대 BLAST, BLAST-2, ALIGN 또는 MEGALIGNTM (DNATAR) 소프트웨어를 사용하여 달성될 수 있다. 당업계에서 숙련가는, 비교될 서열의 전장에 걸쳐 최대 정렬을 달성하는데 필요한 임의의 알고리즘을 비롯하여 정렬 측정을 위한 적당한 파라미터를 결정할 수 있다.
본 발명은 (이후 "항-PD-L1×CD47 bsAb"로 지칭되는) PD-L1에 특이적으로 결합하는 제1 단일 도메인 항체(제1 sdAb) 또는 이의 항원-결합 단편 (항-PD-L1 sdAb); 및 CD47에 특이적으로 결합하는 제2 단일 도메인 항체(제2 sdAb) 또는 이의 항원-결합 단편 (항-CD47 sdAb)을 포함하는, PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체, 예컨대, 항-PD-L1×CD47 bsAb, 구체적으로 항-PD-L1 sdAb 및 항-CD47 sdAb가 융합된 이중특이적 sdAb, 항-PD-L1×CD47 중쇄-단독 항체(HCAb) (예를 들면, 인간 면역글로불린 G (IgG)의 결정성 단편(Fc 단편)이 항-PD-L1 sdAb 및/또는 항-CD47 sdAb에 융합된 항-PD-L1×CD47 bsAb-Fc 융합 단백질), 그리고 이의 제조 및 용도에 관한 것이다.
이에, 본 발명은 항-PD-L1×CD47 bsAb를 포함하는 PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체를 제공한다.
본 발명에서, 상기 항-PD-L1×CD47 bsAb를 포함하는 PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체는 제1 항원 결합 부분으로 PD-L1에 특이적으로 결합하는 제1 단일 도메인 항체(제1 sdAb) 또는 이의 항원-결합 단편 (항-PD-L1 sdAb); 및 제2 항원 결합 부분으로 CD47에 특이적으로 결합하는 제2 단일 도메인 항체(제2 sdAb) 또는 이의 항원-결합 단편 (항-CD47 sdAb)이 융합된 항-PD-L1×CD47 bsAb일 수 있다.
본 발명에서, 상기 항-PD-L1 sdAb는 서열번호 2로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 CDR1; 서열번호 3으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 CDR2; 및 서열번호 4로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 CDR3를 포함한다.
또한, 상기 항-CD47 sdAb는 서열번호 7로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 CDR1; 서열번호 8로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 CDR2; 및 서열번호 9로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 CDR3를 포함한다.
상기 CDR 서열은 표 6 및 표 12에서 제공된다.
본 발명에서, 상기 항-PD-L1×CD47 bsAb는 FR 영역에 대하여 임의의 적합한 서열을 포함할 수 있다. 구체적으로, 상기 FR 서열은 하기 표 1 내지 표 4로 표시되는 아미노산 서열일 수 있다.
[표 1]
Figure PCTKR2022002530-appb-img-000001
[표 2]
Figure PCTKR2022002530-appb-img-000002
[표 3]
Figure PCTKR2022002530-appb-img-000003
[표 4]
Figure PCTKR2022002530-appb-img-000004
보다 구체적으로, 상기 항-PD-L1 sdAb는 하기 FR1, FR2, FR3 및 FR4를 포함할 수 있다:서열번호 13 및 17 중 어느 하나로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR1;
서열번호 14 및 18 중 어느 하나로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR2;
서열번호 15 및 19 중 어느 하나로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR3; 및
서열번호 16 및 20 중 어느 하나로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR4.
보다 더 구체적으로, 상기 항-PD-L1 sdAb는 하기 FR1, FR2, FR3 및 FR4를 포함할 수 있다:
(1) 서열번호 13으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR1;
서열번호 14로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR2;
서열번호 15로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR3; 및
서열번호 16으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR4; 또는
(2) 서열번호 17로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR1;
서열번호 18로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR2;
서열번호 19로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR3; 및
서열번호 20으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR4.
보다 더 구체적으로, 상기 항-PD-L1 sdAb는 하기 FR1, FR2, FR3 및 FR4를 포함할 수 있다:
서열번호 13으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR1;
서열번호 14로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR2;
서열번호 15로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR3; 및
서열번호 16으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR4.
본 발명에서, 상기 항-PD-L1 sdAb는 상기 FR 영역을 포함하는 VHH 도메인을 포함할 수 있다.
구체적으로, 상기 항-PD-L1 sdAb는 서열번호 1로 표시되는 아미노산 서열, 또는 상기 아미노산 서열에 적어도 80%(예컨대 적어도 임의의 80%, 58%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99%) 서열 상동성을 갖는 이의 변이체를 포함할 수 있다.
또한, 상기 항-CD47 sdAb는 하기 FR1, FR2, FR3 및 FR4를 포함할 수 있다:
서열번호 13 및 17 중 어느 하나로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR1;
서열번호 14 및 18 중 어느 하나로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR2;
서열번호 15 및 19 중 어느 하나로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR3; 및
서열번호 16 및 20 중 어느 하나로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR4.
보다 더 구체적으로, 상기 항-CD47 sdAb는 하기 FR1, FR2, FR3 및 FR4를 포함할 수 있다:
(1) 서열번호 13으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR1;
서열번호 14로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR2;
서열번호 15로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR3; 및
서열번호 16으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR4; 또는
(2) 서열번호 17로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR1;
서열번호 18로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR2;
서열번호 19로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR3; 및
서열번호 20으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR4.
보다 더 구체적으로, 상기 항-CD47 sdAb는 하기 FR1, FR2, FR3 및 FR4를 포함할 수 있다:
서열번호 17로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR1;
서열번호 18로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR2;
서열번호 19로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR3; 및
서열번호 20으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR4.
본 발명에서, 상기 항-CD47 sdAb는 상기 FR 영역을 포함하는 VHH 도메인을 포함할 수 있다.
구체적으로, 상기 항-CD47 sdAb는 서열번호 6으로 표시되는 아미노산 서열, 또는 상기 아미노산 서열에 적어도 80%(예컨대 적어도 임의의 80%, 58%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99%) 서열 상동성을 갖는 이의 변이체를 포함할 수 있다.
본 발명에서, 상기 항-PD-L1 sdAb는 PD-L1의 에피토프에 결합하고, 항-CD47 sdAb는 CD47의 에피토프에 결합한다.
또한, 상기 항-PD-L1×CD47 bsAb의 PD-L1 및 CD47 각각과 결합의 KD는 10-6 M 내지 10-12 M, 10-6 M 내지 10-11 M, 10-6 M 내지 10-10 M, 10-6 M 내지 10-9 M, 또는 10-6 M 내지 10-8 M일 수 있다.
또한, 상기 항-PD-L1×CD47 bsAb의 EC50은 FACS 분석에서 500 nM 미만일 수 있고, 구체적으로 0.1 nM 내지 500 nM, 0.1 nM 내지 400 nM, 0.1 nM 내지 300 nM, 0.1 nM 내지 200 nM, 0.1 nM 내지 100 nM, 0.1 내지 50 nM, 0.1 내지 10 nM, 1 nM 내지 500 nM, 1 nM 내지 400 nM, 1 nM 내지 300 nM, 1 nM 내지 200 nM, 1 nM 내지 100 nM, 1 내지 50 nM 또는 1 내지 10 nM일 수 있다.
본 발명에서, 상기 항-PD-L1×CD47 bsAb는 PD-L1 및 CD47 각각의 에피토프에 대하여 가수의 임의의 적합한 수를 가질 수 있다. 구체적으로, 항-PD-L1×CD47 bsAb는 PD-L1 및 CD47 각각에 대하여 2가, 3가, 4가, 5가, 6가, 또는 더 높은 가수일 수 있다. 예를 들면, P. Chames and D. Baty, Chapter 6. Bispecific Single Domain Antibodies, Springer-Verlag Berlin Heidelberg, 2011을 참고한다.
또한, 상기 항-PD-L1×CD47 bsAb는 항-PD-L1 sdAb 및 항-CD47 sdAb가 펩티드 결합을 통해 직접적으로 또는 펩티드 링커를 통해 간접적으로 융합될 수 있다. 상기 펩티드 링커의 길이, 가요성 정도 및/또는 다른 특성은, 하나 이상의 특정 항원 또는 에피토프에 대하여 비제한적으로 친화성, 특이성 또는 결합능을 포함하는, 특성에서 일부 영향을 미칠 수 있다. 예를 들어, 더 긴 펩티드 링커는 2개의 인접한 도메인이 서로를 입체적으로 방해하지 않는다는 것을 보장하도록 선택될 수 있다. 일부 구현예에서, 펩티드 링커는 인접한 도메인이 서로에 대하여 자유롭게 움직이도록 가요성 잔기 (예컨대 글리신 및 세린)을 포함한다. 예를 들어, 글리신-세린 더블릿은 적합한 펩티드 링커일 수 있다. 또한, 펩티드 링커는 임의의 적합한 길이일 수 있다. 일부 구현예에서, 펩티드 링커는 적어도 약 임의의 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 75, 100개 또는 더 많은 아미노산 길이이다.
또한, 상기 펩티드 링커는 자연 발생 서열, 또는 비-자연 발생 서열을 가질 수 있다.
일부 구현예에서, 상기 항-PD-L1×CD47 bsAb는 PD-L1에 대하여 2가일 수 있고, 2가의 항-PD-L1 sdAb는 서열번호 21로 표시되는 아미노산 서열을 포함한다. 또한, 상기 항-PD-L1×CD47 bsAb는 서열번호 11로 표시되는 아미노산 서열을 포함한다.
본 발명에 따른 단일 도메인 항체(sdAb)는 중쇄-단독 항체로부터의 중쇄 가변 도메인 (예를 들면, 낙타과에서 VHH (중쇄 항체의 중쇄의 가변 도메인)), 종래의 4-쇄 항체로부터 유래된 경쇄, 단일 도메인 (예컨대 VH 또는 VL)이 자연적으로 결여된 결합 분자, 인간화된 중쇄 단독 항체, 인간 중쇄 분절을 발현시키는 유전자이식 마우스 또는 랫트에 의해 생산된 인간 단일 도메인 항체, 및 항체로부터 유래된 것들 이외 조작된 도메인 및 단일 도메인 스캐폴드를 비제한적으로 포함할 수 있다. sdAb는 마우스, 랫트, 인간, 낙타, 라마, 칠성장어, 어류, 상어, 염소, 토끼, 및 소과를 비제한적으로 포함하는 임의의 종으로부터 유래될 수 있다. 또한 낙타과 이외 종으로부터의 자연 발생 sdAb 분자를 포함할 수 있다.
또한, sdAb는 경쇄가 결여된 중쇄 항체로서 공지된 자연 발생 단일 도메인 항원 결합 분자로부터 유래된다. 그와 같은 단일 도메인 분자는, 예를 들어 WO 94/04678 및 Hamers-Casterman, et al., (1993) Nature 363:446-448에서 개시된다. 경쇄가 자연적으로 결여된 중쇄 분자로부터 유래된 가변 도메인은 본원에서 VHH로서 공지되어 이것을 4개의 쇄 면역글로불린의 종래의 VH와 구별시킨다. 그와 같은 VHH 분자는 낙타과 종, 예를 들어, 낙타, 라마, 비쿠냐, 단봉 낙타, 알파카 및 과나코에서 생성된 항체로부터 유래될 수 있다. 낙타과 이외의 다른 종은 경쇄가 자연적으로 결여된 중쇄 분자를 생산할 수 있고, 그와 같은 VHH는 본원의 범위 내이다
또한, sdAb는 재조합, CDR-그라프팅, 인간화, 낙타화, 탈-면역화 및/또는 시험관내 생성될 수 있다 (예를 들면, 파아지 디스플레이에 의해 선택된다). 일부 구현예에서, 프레임워크 영역의 아미노산 서열은 프레임워크 영역에서 특이적 아미노산 잔기의 "낙타화"에 의해 변경될 수 있다. 낙타화는 중쇄 항체의 VHH 도메인에서 상응하는 위치(들)에 발생하는 아미노산 잔기의 하나 이상에 의해 종래의 4-쇄 항체로부터 (자연 발생) VH 도메인의 아미노산 서열에서 아미노산 잔기의 하나 이상의 대체 또는 치환을 지칭하며, 당업계에 공지된 방식으로 수행될 수 있다.
또한, sdAb는 인간 중쇄 분절을 발현시키는 유전자이식 마우스 또는 랫트에 의해 생산된 인간 sdAb일 수 있다. 예를 들면, 특허 US20090307787A1, US8,754,287, US20150289489A1, US20100122358A1, 및 WO 2004049794를 참고한다.
또한, 특정 항원 또는 표적에 대한 자연 발생 VHH 도메인은 낙타과 VHH 서열의 (미접촉 또는 면역) 라이브러리로부터 수득될 수 있다. 그와 같은 방법은 상기 항원 또는 표적을 이용하는 그와 같은 라이브러리, 또는 그 자체로 공지된 하나 이상의 스크리닝 기술을 이용하는 이의 적어도 일부분, 단편, 항원성 결정요인 또는 에피토프 스크리닝을 관여시킬 수 있거나 아닐 수 있다. 그와 같은 라이브러리 및 기술은 예를 들어 특허 WO 99/37681, WO 01/90190, WO 03/025020 및 WO 03/035694에서 기재된다. 대안적으로, (미접촉 또는 면역) VHH 라이브러리로부터 유래된 개선된 합성 또는 반-합성 라이브러리, 예컨대 예를 들어 특허 WO 00/43507에서 기재된 바와 같이, 기술 예컨대 무작위 돌연변이유발 및/또는 CDR 셔플링에 의해 (미접촉 또는 면역) VHH 라이브러리로부터 수득된 VHH 라이브러리는 사용될 수 있다.
또한, sdAb는 종래의 4-쇄 항체로부터 생성될 수 있다. 예를 들어, Ward et al., Nature 1989 Oct. 12; 341 (6242): 544-6, Holt et al., Trends Biotechnol., 2003, 21(11):484-490; 특허 WO 06/030220; 및 WO 06/003388를 참고한다.
또한, 본 발명에 따른 sdAb는 키메라 항체일 수 있다. 특정한 키메라 항체는, 예를 들면, 특허 US4,816,567; 및 Morrison et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81:6851-6855 (1984))에서 기재된다. 일부 구현예에서, 키메라 항체는 비-인간 가변 영역 (예를 들면, 낙타과 종, 예컨대 라마로부터 유래된 가변 영역) 및 인간 불변 영역을 포함할 수 있다. 또한, 키메라 항체는 인간화될 수 있다. 전형적으로, 비-인간 항체는 인간화되어 인간에 대한 면역원성을 감소시키는 반면, 친계 비-인간 항체의 특이성 및 친화성을 유지시킨다. 일반적으로, 인간화된 항체는 HVR, 예를 들면, CDR, (또는 이의 부분)이 비-인간 항체로부터 유래되고, FR (또는 이의 부분)이 인간 항체 서열로부터 유래되는 하나 이상의 가변 도메인을 포함한다. 인간화된 항체는 임의로 또한 인간 불변 영역의 적어도 한 부분을 포함할 것이다. 일부 구현예에서, 인간화된 항체에 있어서 일부 FR 잔기는, 예를 들면, 항체 특이성 또는 친화성을 회복 또는 개선하기 위해, 비-인간 항체 (예를 들면, HVR 잔기가 유래되는 항체)로부터 상응하는 잔기로 치환된다.
본 발명에서, 상기 항-PD-L1×CD47 bsAb를 포함하는 PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체는 항-PD-L1×CD47 HCAb 또는 이의 항원-결합 단편일 수 있다.
구체적으로, 항-PD-L1×CD47 HCAb는 본원에 기재된 항-PD-L1×CD47 bsAb가 하나 이상의 CH2 및/또는 CH3 도메인, 예를 들면 Fc 단편에 융합된 것일 수 있다. 또한, 본원에 기재된 항-PD-L1 sdAb 및/또는 항-CD47 sdAb에 하나 이상의 CH2 및/또는 CH3 도메인, 예를 들면 Fc 단편에 융합된 것일 수 있다.
상기 CH2 및/또는 CH3 도메인은 면역글로불린으로부터 유래된다. 상기 면역글로불린은 IgA, IgD, IgE, IgG 또는 IgM일 수 있고, 구체적으로 IgG 일 수 있다. 일부 구현예에서, 항-CD47 HCAb는 IgG, 예컨대, IgG1, IgG2, IgG3 또는 IgG4의 Fc 단편을 포함할 수 있고, 상기 Fc 단편은 인간 Fc, 예컨대 인간 IgG1 (hIgG1) Fc, hIgG2 Fc, hIgG3 Fc 또는 hIgG4 Fc일 수 있다.
상기 항-PD-L1×CD47 HCAb는 단량체성 또는 다량체성일 수 있다. 또한, 다량체성일 경우, 예를 들면, 본원에서 기재된 항-PD-L1 sdAb 및 항-CD47 sdAb의 2개 이상의 카피를 포함하는, 이중특이적 및 다가 (예를 들면, 2가, 3가, 4가, 또는 더 높은 가수)일 수 있다.
본 발명에서, 상기 항-PD-L1×CD47 bsAb, 항-PD-L1 sdAb 또는 항-CD47 sdAb는 CH2 및/또는 CH3 도메인, 구체적으로 Fc 단편은 펩티드 링커를 통해 융합될 수 있다. 상기 펩티드 링커의 길이, 가요성 정도 및/또는 다른 특성은, 하나 이상의 특정 항원 또는 에피토프에 대하여 비제한적으로 친화성, 특이성 또는 결합능을 포함하는, 특성에서 일부 영향을 미칠 수 있다. 예를 들어, 더 긴 펩티드 링커는 2개의 인접한 도메인이 서로를 입체적으로 방해하지 않는다는 것을 보장하도록 선택될 수 있다. 일부 구현예에서, 펩티드 링커는 인접한 도메인이 서로에 대하여 자유롭게 움직이도록 가요성 잔기 (예컨대 글리신 및 세린)을 포함한다. 예를 들어, 글리신-세린 더블릿은 적합한 펩티드 링커일 수 있다. 또한, 펩티드 링커는 임의의 적합한 길이일 수 있다. 일부 구현예에서, 펩티드 링커는 적어도 약 임의의 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 75, 100개 또는 더 많은 아미노산 길이이다.
또한, 상기 펩티드 링커는 자연 발생 서열, 또는 비-자연 발생 서열을 가질 수 있다. 예를 들어, 중쇄-단독 항체의 힌지 영역으로부터 유래된 서열이 링커로서 사용될 수 있다. 예를 들어, 특허 WO 1996/34103를 참고한다. 일부 구현예에서, 상기 펩티드 링커는 hIgG1 힌지, hIgG2 힌지, hIgG3 힌지, hIgG4 힌지 또는 이들의 변이체일 수 있다.
본 발명에서, 상기 항-PD-L1×CD47 HCAb는 서열번호 12로 표시되는 아미노산 서열, 또는 상기 아미노산 서열에 적어도 80%(예컨대 적어도 임의의 80%, 88%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99%) 서열 상동성을 갖는 이의 변이체를 포함할 수 있다.
본 발명에서, 상기 항-PD-L1×CD47 bsAb를 포함하는 PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체는 항-PD-L1 sdAb 및/또는 항-CD47 sdAb의 C-말단이 CH1 및 Cκ 도메인의 N-말단에 융합된 이중특이적 Fab-유사 항체 단편(bispecific Fab-like antibody fragment, bsFab)일 수 있다.
상기 CH1 및 Cκ 도메인인은 면역글로불린으로부터 유래된다. 상기 면역글로불린은 IgA, IgD, IgE, IgG 또는 IgM일 수 있고, 구체적으로 IgG 일 수 있다. 상기 IgG는 IgG1, IgG2, IgG3 또는 IgG4일수 있고, 인간 IgG1, IgG2, IgG3 또는 IgG4일 수 있다.
본 발명에 따른 bsFab 및 이의 제조 기술은 P. Chames and D. Baty, Chapter 6. Bispecific Single Domain Antibodies, Springer-Verlag Berlin Heidelberg, 2011을 참고한다.
본 발명에서, 상기 항-PD-L1×CD47 bsAb를 포함하는 PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체는 아미노산 서열 변이체를 포함한다. 항체의 아미노산 서열 변이체는 항체를 인코딩하는 핵산 서열에의 적당한 변형 도입에 의해, 또는 펩티드 합성에 의해 제조될 수 있다. 그와 같은 변형은, 예를 들어, 항체의 아미노산 서열 내에서 잔기의 결실, 및/또는 삽입 및/또는 치환을 포함한다. 결실, 삽입, 및 치환의 임의의 조합은 최종 작제물에 이르도록 만들어질 수 있고, 단 최종 작제물은 원하는 특징, 예를 들면, 항원-결합을 보유한다. 일부 구현예에서, 치환, 삽입, 또는 결실은 그와 같은 변경이 항원을 결합시키는 항체의 능력을 실질적으로 감소시키지 않는 한 하나 이상의 초가변 영역(HVR) 내에서 발생할 수 있다. 예를 들어, 결합 친화성을 실질적으로 감소시키지 않는 보존적 변경은 HVR에서 실시될 수 있다. 그와 같은 변경은 HVR "핫스팟" 또는 CDR의 외부일 수 있다.
또한, 상기 아미노산 치환은 적어도 1개(예컨대, 임의의 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 또는 10개)의 아미노산 치환일 수 있다. 또한, 상기 적어도 1개의 아미노산 치환은 보존적 치환일 수 있고, 비-유전자 코딩 아미노산 또는 합성 아미노산으로의 치환일 수 있다. 일부 구현예에서, 상기 아미노산 치환은 CDR 영역에 있을 수 있고, CDR1, CDR2 및/또는 CDR3에서 적어도 1개(예컨대, 임의의 1, 2, 3, 또는 4개)의 아미노산 치환을 포함할 수 있다. 일부 구현예에서, 상기 아미노산 치환은 FR 영역에 있을 수 있고, FR1, FR2, FR3 및/또는 FR4에서 적어도 1개(예컨대, 임의의 1, 2, 3, 4, 5 또는 6개)의 아미노산 치환을 포함할 수 있다.
또한, 상기 아미노산 서열 삽입은 1개의 잔기부터 100개 이상의 잔기를 함유하는 폴리펩티드까지 길이 범위의 아미노- 및/또는 카복실-말단 융합, 뿐만 아니라 단일 또는 다중 아미노산 잔기의 서열내 삽입을 포함한다. 말단 삽입의 예는 N-말단 메티오닐 잔기를 가진 항체를 포함한다. 항체 분자의 다른 삽입 변이체는 항체의 혈청 반감기를 증가시키는 폴리펩티드 또는 (예를 들면, ADEPT의 경우) 효소에 대한 항체의 N- 또는 C-말단에의 융합을 포함할 수 있다.
또한, 하나 이상의 아미노산 변형은 본원에서 제공된 항-PD-L1×CD47 bsAb를 포함하는 PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체 (예를 들면, 항-PD-L1×CD47 HCAb)의 Fc 영역에 도입되어, 그것에 의해 Fc 영역 변이체를 생성할 수 있다. Fc 영역 변이체는 하나 이상의 아미노산 위치에서 아미노산 변형 (예를 들면 치환)을 포함하는 인간 Fc 영역 서열 (예를 들면, 인간 IgG1, IgG2, IgG3 또는 IgG4 Fc)을 포함할 수 있다.
본 발명에서, 상기 항-PD-L1×CD47 bsAb를 포함하는 PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체는 진단 모이어티 또는 생체적합성 조절제와 연결되거나, 그에 융합되거나, 그에 접합되거나 (예를 들어, 공유 또는 비-공유), 또는 달리 그와 회합될 수 있다. 예를 들어, 펩티드 또는 폴리펩티드(예를 들어, 생물독소, 바이오마커, 정제 태그 등), 단백질, 중합체, 핵산 분자, 소분자, 모방제, 합성 약물, 무기 분자, 유기 분자 또는 방사성동위원소가 접합 또는 회합될 수 있다.
또한, 상기 항-PD-L1×CD47 bsAb를 포함하는 PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체는 생물학적 분자(예를 들어, 펩티드 또는 뉴클레오티드), 소분자, 형광단, 또는 방사성동위원소일 수 있는 진단제 또는 검출가능한 작용제, 마커 또는 리포터에 접합 또는 회합될 수 있다. 표지된 조정자는 PD-L1 및/또는 CD47과 관련된 질환, 예컨대 암의 발생 또는 진행을 모니터링하는데, 또는 본원에 개시된 항체를 포함하는 특정한 요법의 효능을 결정하거나 (즉 테라그노시스), 또는 향후의 치료 과정을 결정하는 임상 시험 절차의 일부로서 유용할 수 있다. 이러한 마커 또는 리포터는 또한 본원에 개시된 항체를 정제하는데 유용할 수 있다.
또한, 상기 항-PD-L1×CD47 bsAb를 포함하는 PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체는 면역조정제, 사이토카인, 세포독성제, 화학요법제, 진단제, 항바이러스제, 항미생물제 또는 약물에 접합될 수 있다. 이에, 본 발명은 면역조정제, 사이토카인, 세포독성제, 화학요법제, 진단제, 항바이러스제, 항미생물제 또는 약물에 접합된 본 발명에 따른 항-PD-L1×CD47 bsAb를 포함하는 PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체를 포함하는 항체 접합체을 제공한다.
또한, 본 발명은 본원에 개시된 항-PD-L1×CD47 bsAb를 포함하는 PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체를 암호화하는 핵산 분자, 상기 핵산 분자를 포함하는 발현 벡터, 상기 발현 벡터로 형질전환된 숙주 세포를 제공한다.
또한, 본 발명은 (a) 이중특이적 항체가 발현되도록 하는 조건 하에 상기 숙주 세포를 배양하는 단계; 및 (b) 발현된 이중특이적 항체를 회수하는 단계를 포함하는, 이중특이적 항체를 생산하는 방법을 제공한다.
본 발명에서, 본원에 개시된 항-PD-L1×CD47 bsAb를 포함하는 PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체를 코딩하는 DNA는 통상적인 절차를 사용하여 (예를 들어, 항체 중쇄 및 경쇄를 코딩하는 유전자에 특이적으로 결합할 수 있는 올리고뉴클레오티드 프로브를 사용함으로써) 용이하게 단리되고 서열분석될 수 있다. 단리되고 서브클로닝된 하이브리도마 세포 (또는 파지 또는 효모 유래 콜로니)는 이러한 DNA의 바람직한 공급원으로서의 역할을 할 수 있다. 보다 특히, 단리된 DNA (변형될 수 있음)는 항체의 제조를 위해 불변 및 가변 영역 서열을 클로닝하는데 사용될 수 있다.
하나의 예시적인 방법은 선택된 세포로부터의 RNA의 추출, cDNA로의 전환, 및 항체 특이적 프라이머를 사용한 PCR에 의한 증폭을 수반한다. 적합한 프라이머는 관련 기술분야에 널리 공지되어 있고, 본원에 예시된 바와 같이 많은 상업적 공급원으로부터 용이하게 이용가능하다. 조합 라이브러리의 스크리닝에 의해 단리된 재조합 인간 또는 비-인간 항체를 발현시키기 위해, 항체를 코딩하는 DNA를 재조합 발현 벡터 내로 클로닝하고, 포유동물 세포, 곤충 세포, 식물 세포, 효모, 및 박테리아를 포함한 숙주 세포 내에 도입된다. 일부 구현예에서, 달리 목적하는 구축물을 생산하지 않는 원숭이 COS 세포, NS0 세포, 차이니즈 햄스터 난소(CHO) 세포 또는 골수종 세포 내로 조정자가 도입되어 그에 의해 발현된다.
본 발명에서, 상기 핵산 분자는 벡터 내에, 적절한 경우에 핵산의 발현을 제어하는 프로모터와 함께 존재한다. 상기 벡터는 그의 가장 일반적인 의미로 사용되고, 핵산이 예를 들어 원핵 및/또는 진핵 세포 내로 도입되고 적절한 경우에 게놈 내로 통합될 수 있게 하는, 핵산을 위한 임의의 중간 비히클을 포함한다. 이러한 종류의 벡터는 바람직하게는 세포 내에서 복제되고/거나 발현된다. 벡터는 플라스미드, 파지미드, 박테리오파지 또는 바이러스 게놈을 포함할 수 있다. 상기 플라스미드는 일반적으로 염색체 DNA와 독립적으로 복제할 수 있는 염색체외 유전 물질 구축물, 통상적으로 원형 DNA 듀플렉스에 관한 것이다.
관련 기술분야의 통상의 기술자에게 널리 공지된 방법을 사용하여 항체 코딩 서열 및 적절한 전사 및 번역 제어 신호를 포함하는 발현 벡터를 구축할 수 있다. 이들 방법은, 예를 들어, 시험관내 재조합 DNA 기술, 합성 기술, 및 생체내 유전자 재조합을 포함한다.
본 발명에서, 상기 숙주 세포 또는 재조합 숙주 세포는 발현 벡터가 도입된 세포를 의미한다. 재조합 숙주 세포 및 숙주 세포는 특정한 대상 세포뿐만 아니라 이러한 세포의 자손도 의미한다. 돌연변이 또는 환경적 영향으로 인해 후속 세대에서 특정 변형이 발생할 수 있기 때문에, 이러한 자손은 사실상 모세포와 동일하지 않을 수 있지만, 여전히 본원에 사용된 용어 숙주 세포의 범주 내에 포함된다. 이러한 세포는 상기 기재된 바와 같은 벡터를 포함할 수 있다.
또한, 관련 기술분야에서 인식되는 분자 생물학 기술 및 현재의 단백질 발현 방법론을 사용하여, 본원에 개시된 항체의 실질적인 양이 생산될 수 있다. 보다 구체적으로, 이러한 항체를 코딩하는 핵산 분자는 다양한 유형의 숙주 세포를 포함한 널리 공지되고 상업적으로 입수가능한 단백질 생산 시스템 내로 통합되어, 전임상, 임상, 또는 상업적인 양의 목적하는 제약 제품을 제공할 수 있다. 일부 구현예에서, 항체를 코딩하는 핵산 분자는 선택된 숙주 세포 내로의 효율적인 통합 및 후속적인 항체의 높은 발현 수준을 제공하는 벡터 또는 발현 벡터 내로 조작된다.
바람직하게는 본원에 개시된 항체를 코딩하는 핵산 분자 및 이들 핵산 분자를 포함하는 벡터는 적합한 포유동물, 식물, 박테리아 또는 효모 숙주 세포의 형질감염에 사용될 수 있지만, 원핵 시스템이 또한 사용될 수 있다. 형질감염은 폴리뉴클레오티드를 숙주 세포 내로 도입하기 위한 임의의 공지된 방법에 의해 이루어질 수 있다. 이종 폴리뉴클레오티드를 포유동물 세포 내로 도입하는 방법은 관련 기술분야에 널리 공지되어 있고, 덱스트란-매개 형질감염, 인산칼슘 침전, 폴리브렌-매개 형질감염, 원형질체 융합, 전기천공, 리포솜 내 폴리뉴클레오티드(들)의 캡슐화, 및 DNA의 핵 내로의 직접 미세주사를 포함한다. 또한, 핵산 분자를 바이러스 벡터에 의해 포유동물 세포 내로 도입할 수 있다. 포유동물 세포를 형질전환하는 방법은 관련 기술분야에 널리 공지되어 있다. 식물 세포를 형질전환하는 방법이 또한 관련 기술분야에 널리 공지되어 있고, 예를 들어, 아그로박테리움-매개 형질전환, 바이오리스틱 형질전환, 직접 주사, 전기천공, 및 바이러스 형질전환을 포함한다. 박테리아 및 효모 세포를 형질전환하는 방법이 또한 관련 기술분야에 널리 공지되어 있다.
많은 상업적으로 입수가능한 다양한 숙주-발현 벡터 시스템이 본원에 개시된 항체를 발현시키는데 사용될 수 있다. 이러한 숙주-발현 시스템은 관심 코딩 서열이 발현되고 후속해서 정제될 수 있는 비히클을 나타낼 뿐만 아니라, 적절한 뉴클레오티드 코딩 서열로 형질전환되거나 형질감염된 경우에 본 발명의 분자를 계내 발현할 수 있는 세포를 나타낸다. 이러한 시스템은 조정자 코딩 서열을 함유하는 재조합 박테리오파지 DNA, 플라스미드 DNA 또는 코스미드 DNA 발현 벡터로 형질전환된 미생물, 예컨대 박테리아 (예를 들어, 이. 콜라이(E. coli), 비. 서브틸리스(B. subtilis), 스트렙토미세스(streptomyces)); 조정자 코딩 서열을 함유하는 재조합 효모 발현 벡터로 형질감염된 효모 (예를 들어, 사카로미세스(Saccharomyces), 피키아(Pichia)); 조정자 코딩 서열을 함유하는 재조합 바이러스 발현 벡터 (예를 들어, 바큘로바이러스)로 감염된 곤충 세포 시스템; 재조합 바이러스 발현 벡터 (예를 들어, 콜리플라워 모자이크 바이러스, CaMV; 담배 모자이크 바이러스, TMV)로 감염되거나 또는 조정자 코딩 서열을 함유하는 재조합 플라스미드 발현 벡터 (예를 들어, Ti 플라스미드)로 형질감염된 식물 세포 시스템 (예를 들어, 니코티아나(Nicotiana), 아라비돕시스(Arabidopsis), 좀개구리밥, 옥수수, 밀, 감자 등); 또는 포유동물 세포의 게놈으로부터 유래되거나 (예를 들어, 메탈로티오네인 프로모터) 또는 포유동물 바이러스로부터 유래된 (예를 들어, 아데노바이러스 후기 프로모터; 백시니아 바이러스 7.5K 프로모터) 프로모터를 함유하는 재조합 발현 구축물을 보유하는 포유동물 세포 시스템 (예를 들어, COS, CHO, BHK, 293, 3T3 세포)을 포함하나, 이에 제한되지는 않는다.
본원에 개시된 항체가 재조합 발현 또는 본원에 개시된 다른 기술 중 어느 하나에 의해 생산되었으면, 이는 면역글로불린의 정제에 대해 관련 기술분야에 공지된 임의의 방법에 의해, 또는 보다 일반적으로 단백질의 정제에 대한 임의의 다른 표준 기술에 의해 정제될 수 있다.
또한, 본 발명은 본원에 개시된 항-PD-L1×CD47 bsAb를 포함하는 PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체, 또는 상기 이중특이적 항체를 포함하는 항체 접합체를 유효성분으로 함유하는, 암의 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 제공한다.
또한, 본 발명은 약학적으로 유효량의 본원에 개시된 본원에 개시된 항-PD-L1×CD47 bsAb를 포함하는 PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체, 또는 상기 이중특이적 항체를 포함하는 항체 접합체를 포함하는 약학적 조성물을 개체에게 투여하는 단계를 포함하는, 암의 예방 또는 치료 방법을 제공한다.
또한, 본 발명은 암의 예방 또는 치료에 사용하기 위한 본원에 개시된 본원에 개시된 항-PD-L1×CD47 bsAb를 포함하는 PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체, 또는 상기 이중특이적 항체를 포함하는 항체 접합체의 용도를 제공한다.
본 발명에서, 상기 암은 면역관문 단백질의 활성을 차단하여 T 세포를 활성화시키는 것이 필요한 암으로, 예컨대 흑색종, 폐암, 간암, 교세포종, 난소암, 대장암, 두경부암, 방광암, 신장세포암, 위암, 유방암, 전이암, 전립선암, 췌장암, 비호지킨 림프종, 호지킨 림프종, 다발성 골수종, 백혈병, 림프종, 골수이형성증후군, 급성 림프모구성 백혈병, 급성 골수성 백혈병, 만성 림프구성 백혈병, 만성 골수성 백혈병, 고립성 골수종 및 재생불량성 빈혈로 이루어진 군으로부터 선택될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서, 상기 본원에 개시된 항-PD-L1×CD47 bsAb를 포함하는 PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체, 또는 상기 이중특이적 항체를 포함하는 항체 접합체에 대한 내용은 전술한 바와 동일하므로, 구체적은 설명은 상기 내용을 원용하고, 이하에서는 약학적 조성물 및 용도의 특유한 구성에 대해서만 설명하도록 한다.
본 발명에 따른 약학적 조성물은 본원에 기재된 1종 이상 (예를 들어, 2 또는 3종)의 본원에 개시된 항-PD-L1×CD47 bsAb를 포함하는 PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체, 또는 상기 이중특이적 항체를 포함하는 항체 접합체를 포함할 수 있다.
본 발명에 따른 약학적 조성물을 개체, 구체적으로 암 환자에 투여함으로써, 암을 예방 또는 치료할 수 있다.
또한, 본 발명에 따른 약학적 조성물은 본원에 기재된 항체의 형태, 의도된 전달 방식, 및 수많은 다른 변수에 따라, 관련 기술분야에서 인식되는 기술을 사용하여 목적하는 바와 같이 제제화될 수 있다. 또한, 관련 기술분야에 널리 공지되어 있고 투여를 용이하게 하거나 또는 전달을 위해 제약상 최적화된 제제로 활성 화합물을 가공하는 것을 보조하는 비교적 불활성 물질인 부형제 및 보조제를 포함하는 적합한 제약상 허용되는 담체를 함유하도록 제제화될 수 있다. 예를 들어, 비히클, 보조제, 및 희석제를 포함한 다양한 제약상 허용되는 담체는 수많은 상업적 공급원으로부터 용이하게 입수가능하다. 또한, 제약상 허용되는 보조 물질 분류, 예컨대 pH 조정제 및 완충제, 장성 조정제, 안정화제, 습윤제 등이 또한 입수가능하다. 특정의 비제한적 예시적인 담체는 염수, 완충 염수, 덱스트로스, 물, 글리세롤, 에탄올, 및 그의 조합을 포함한다.
또한, 본 발명에 따른 약학적 조성물은 경장, 비경구 또는 국소 투여를 위해 제제화될 수 있다. 사실상, 모든 3가지 유형의 제제를 동시에 사용하여 활성 성분의 전신 투여를 달성할 수 있다. 비경구 및 비-비경구 약물 전달을 위한 부형제 뿐만 아니라 제제가 관련 기술분야에 공지되어 있다. 비경구 투여에 적합한 제제는 수용성 형태의 활성 화합물, 예를 들어, 수용성 염의 수용액을 포함한다. 또한, 유성 주사 현탁액에 적절한 활성 화합물의 현탁액이 투여될 수 있다. 적합한 친지성 용매 또는 비히클은 지방 오일, 예를 들어, 참깨 오일, 또는 합성 지방산 에스테르, 예를 들어, 에틸 올레에이트 또는 트리글리세리드를 포함한다. 수성 주사 현탁액은 현탁액의 점도를 증가시키는 물질을 함유할 수 있고, 예를 들어, 소듐 카르복시메틸 셀룰로오스, 소르비톨, 및/또는 덱스트란을 포함한다. 임의로, 현탁액은 또한 안정화제를 함유할 수 있다. 또한 리포솜을 사용하여 세포로의 전달을 위해 작용제를 캡슐화할 수 있다.
경장 투여에 적합한 제제는 경질 또는 연질 젤라틴 캡슐, 환제, 코팅된 정제를 비롯한 정제, 엘릭시르, 현탁액, 시럽 또는 흡입제 및 그의 제어 방출 형태를 포함한다.
일반적으로, 본원에 개시된 항체는 이를 필요로 하는 대상체에게 경구, 정맥내, 동맥내, 피하, 비경구, 비강내, 근육내, 심장내, 뇌실내, 기관내, 협측, 직장, 복강내, 피내, 국소, 경피, 및 척추강내, 또는 달리 이식 또는 흡입에 의한 것을 포함하나 이에 제한되지는 않는 다양한 경로에 의해 생체내 투여될 수 있다. 투여의 적절한 제제 및 경로는 의도된 용도 및 치료 요법에 따라 선택될 수 있다.
본 발명에 따른 약학적 조성물은 암의 치료 또는 예방을 위한 약학적으로 유효량으로 투여된다. 상기 약학적으로 유효량은 의사 또는 다른 임상의에 의해 추구되는, 대상체에서 생물학적 또는 의학적 반응을 도출할 항체 또는 이를 포함하는 약학적 조성물의 양을 의미한다. 또한, 예방 및/또는 치료 효과를 갖는 요법의 양을 달성하기 위해 특정 빈도로 다중 용량의 항체 또는 이를 포함하는 약학적 조성물을 투여할 수 있다.
상기 약학적으로 유효량은 전형적으로 치료될 대상체의 체중, 그의 신체 상태, 치료될 상태의 광범위함, 및 치료될 대상체의 연령에 따라 좌우된다. 일반적으로, 본원에 개시된 항체는 용량당 약 10 ng/kg 체중 내지 약 100 mg/kg 체중 범위, 약 50 μg/kg 체중 내지 약 5 mg/kg 체중 범위, 약 100 μg/kg 체중 내지 약 10 mg/kg 체중 범위, 약 100 μg/kg 체중 내지 약 20 mg/kg 체중 범위, 0.5 mg/kg 체중 내지 약 20 mg/kg 체중 범위의 양으로 투여될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다. 또한, 항체는 적어도 약 100 μg/kg 체중, 적어도 약 250 μg/kg 체중, 적어도 약 750 μg/kg 체중, 적어도 약 3 mg/kg 체중, 적어도 약 5 mg/kg 체중, 또는 적어도 약 10 mg/kg 체중의 용량으로 투여될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
또한, 본 발명에 따른 약학적 조성물은 약 100 mg 내지 약 10,000 mg의 용량, 약 200 mg 내지 약 9,000 mg의 용량, 약 300 mg 내지 약 8,000 mg 용량, 약 400 mg 내지 7,000 mg 용량, 500 mg 내지 5,000 mg 용량으로 투여될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에 따른 약학적 조성물은 통상적으로 환자에게 다수회 투여된다. 예시적인 치료 요법은 2주마다 1회, 1개월 1회, 또는 3 내지 6개월마다 1회 투여를 수반한다. 예를 들어, 환자는 사이클로서 4주마다, 예를 들어 28일마다 1회 항체를 (예를 들어, 정맥내 제제로서) 제공받을 수 있다. 투여 빈도는 환자에서의 항체의 약동학적 프로파일에 따라 조정될 수 있다. 예를 들어, 항체의 반감기는 2주 투여 빈도를 필요로 할 수 있다. 일부 방법에서, 상이한 결합 특이성을 갖는 2종 이상의 항체가 동시에 투여될 수 있고, 이러한 경우에 투여되는 각각의 항체의 투여량은 제시된 범위 내에 속한다.
투여량 및 빈도는 환자에서의 항체의 반감기에 따라 달라진다. 일반적으로, 인간 항체가 가장 긴 반감기를 나타내고, 그 다음으로 인간화 항체, 키메라 항체, 및 비인간 항체이다. 투여량 및 투여 빈도는 치료가 예방적인지 또는 치료적인지에 따라 달라질 수 있다.
치료 요법의 지속기간은 치료될 질환, 환자의 연령 및 상태, 환자의 질환의 병기 및 유형, 환자가 치료에 어떻게 반응하는지 등에 좌우된다. 임상의는 요법의 효과를 면밀하게 관찰하고 필요에 따라 임의의 조정을 행할 수 있다. 작용제가 조합되어 사용되는 경우에, 2종 이상의 치료제는 동시에 또는 임의의 순서로 순차적으로 투여되고, 즉 본원에 개시된 항체는 제 2 치료제를 투여하기 전에, 제 2 치료제와 공동으로, 또는 제 2 치료제의 투여에 후속하여 투여될 수 있다.
이하, 본 발명을 실시예 및 실험예에 의해 상세히 설명한다.
단, 하기 실시예 및 실험예는 본 발명을 예시하는 것일 뿐, 본 발명의 내용이 하기 실시예 및 실험예에 한정되는 것은 아니다.
<실시예 1> 면역 및 채혈
면역 항원으로 인간 PD-L1 단백질 또는 인간 CD47 단백질을 면역보조제(GERBU)와 혼합하여 1마리의 알파카에 3회에 걸쳐 근육주사를 통해 면역하였다. 3차에 걸쳐 면역을 진행하였고 마지막 면역 후 14일째 알파카로부터 혈액을 10 ㎖씩 채혈하여 ELISA를 통해 면역 반응을 분석하였다. 항체 생성 여부는 1 ㎍/㎖의 농도로 면역 항원을 코팅버퍼를 이용하여 96웰 마이크로플레이트에 분주하여 4℃에서 하룻밤 동안 코팅하였다. 96웰 마이크로플레이트는 PBST로 3회 세척 후, 비특이적 결합을 억제하기 위하여 5% 스킴 밀크(skim milk)를 상온에서 2시간 동안 처리하여 블로킹(blocking)하였다. 이후 PBST로 3회 세척 후, 면역 전(day 0), 면역 후 14일(day 14), 28일(day 28), 42일(day 42)에 확보한 혈청 시료를 단계별 희석 농도로 처리하였다. 이후 96웰 마이크로플레이트는 PBST로 5회 세척 후, goat anti-Llama IgG HRP 항체를 상온에서 1시간 동안 반응 하였고 TMB 반응으로 면역 항원에 결합 된 항체 여부를 확인하였다.
<실시예 2> 라이브러리 제작 및 평가
상기 <실시예 1>에서 확인한 면역 항원에 결합하는 단일도메인 항체를 코딩하는 유전자 증폭을 통해 면역 라이브러리를 구축하였다. 라이브러리 구축을 위해 혈액으로부터 피콜(Ficoll)을 이용하여 말초혈액 단핵세포(PBMC)를 분리하였다. 분리된 말초혈액 단핵세포(PBMC)로부터 추출한 총 RNA(Total RNA)로부터 특이 프라이머(specific primer)를 이용하여 단일 도메인 항체를 코딩하는 유전자 단편을 증폭하였고, pComb3x vector에 클로닝하였다. 제작된 면역 라이브러리의 크기는 5.4×108이었다.
<실시예 3> 라이브러리 증폭
상기 <실시예 2>에서 제작한 면역 라이브러리를 XL1-blue 균주에 형질전환(transformation)하였다. 형질전환한 XL1-blue 균주는 2% 글루코스, 100 ㎍/㎖ 암피실린을 함유한 10 ㎖의 2x YT 배지에 첨가하여 37℃ 진탕교반기에서 배양하였다. OD600에서 흡광도가 0.5가 될 때까지 배양하고 M13K07 파아지(Invitrogen)를 1×1011 pfu/㎖가 되도록 첨가하였다. 이후 37℃에서 30분간 정치배양 후 37℃ 진탕교반기에서 200 rpm으로 30분 추가 배양하였다. 배양액은 상온, 4,000 rpm에서 15분간 원심분리하여 상등액을 제거하였다. 이후 100 ㎍/㎖ 암피실린, 50 ㎍/㎖ 카나마이신을 함유한 2x YT 배지 10 ㎖를 첨가하여 배양액의 펠렛을 재부유하고 30℃ 진탕배양기에서 250 rpm으로 하룻밤 동안 배양하였다. 이후 4℃, 4,000 rpm에서 30분간 원심분리하였다. 상등액은 PEG 침전법을 이용하여 침전하였고 4℃, 12,000 rpm에서 30분간 원심분리하였다. 펠렛은 PBS로 재부유하였으며 4℃, 13,000 rpm에서 5분간 원심분리 하여 상등액을 새로운 튜브에 옮겨 사용하기 전까지 4℃에서 보관하였다.
<실시예 4> 바이오패닝(bio-panning)
면역 항원에 특이적인 단일도메인 항체를 선별하기 위해 96웰 마이크로플레이트에 5 ㎍/㎖의 농도로 코팅버퍼를 이용하여 면역 항원을 분주하였고 4℃에서 하룻밤 동안 코팅하였다. 단일도메인 항체를 선별하기 위해 사용될 라이브러리(상기 <실시예 3>의 라이브러리)는 96-웰 마이크로플레이트에 분주하여 상온에서 30분간 반응하였다. 이후 새로운 웰에 라이브러리를 옮기고 상온에서 30분간 반응하는 작업을 4회 반복하였다. 이러한 작업은 마이크로플레이트 웰에 비특이적으로 결합하는 라이브러리를 감소시키기 위해 실시하였다. 라이브러리는 1.7 ㎖ 튜브에 옮기고 사용하기 전까지 4℃에서 보관하였다. 면역 항원이 코팅된 마이크로플레이트는 PBST로 5회 세척한 뒤 5% 스킴 밀크를 첨가하여 상온에서 2시간 동안 블로킹하였다. 이후 PBST로 5회 세척한 뒤 비특이적 결합률이 감소된 라이브러리를 바인딩 용액(2.5% 스킴 밀크, 0.5% tween 20)과 함께 5×1012 virions/well으로 분주하여 상온에서 30분간 반응하였다. 이후 세척 용액(PBS, 0.5% tween 20)으로 10회 세척 후 PBST로 3회 추가 세척하였다. 면역 항원에 특이적으로 결합된 단일도메인 항체는 웰당 5 ㎍ 면역 항원을 첨가한 뒤 상온, 500 rpm으로 30분간 반응하여 선택적으로 용출시켰다. 용출된 파아지는 대수증식기의 XL-1 blue 세포에 감염시킨 뒤, 2x YT 한천 배지에 도말하였다. 두 번째 선별을 위한 패닝을 위해 위와 동일한 조건 하에서 반복하였다. 한천배지에 생성된 단일 파아지 클론은 각각 증폭하여 FACS를 이용하여 스크리닝하였다.
<실시예 5> 파아지 스크리닝
Expi-CHO 세포에서 면역 항원의 일시적 과발현을 유도하기 위해 면역 항원을 암호화하는 유전자를 pCMV6-GFP 벡터에 삽입하여 pCMV6-면역 항원-GFP 플라스미드를 구축하였다. Expi-CHO 세포는 DPBS로 세척한 뒤 상온, 1,200 rpm에서 3분간 원심분리하였다. 상등액을 제거하고 2% 스킴 밀크로 세포를 재부유하여 4℃에서 30분간 블로킹하였다. 세포는 상온, 1200 rpm에서 3분간 원심분리하여 상등액을 제거한 뒤 DPBS로 2회 세척하였고, 96 웰 마이크로플레이트에 3×105 cells/100 ㎕/well이 되도록 분주하였다. 각 웰에 단일클론 파아지를 첨가하여 4℃에서 1시간 동안 반응한 뒤 DPBS로 2회 세척하였다. 세포에 파아지를 특이적으로 결합하는 항체(M13 major coat protein Alexa Flour 647(Santacruz))를 분주하고 빛을 차단한 채로 4℃에서 30분간 반응한다. 세포는 DPBS로 2회 세척 후 새로운 DPBS로 재부유하여 Accuri C6(BD) 장비를 이용하여 FACS 분석하였다. FACS 시스템을 이용하여 스크리닝된 클론을 선별하고, 염기서열분석을 진행하였다.
<실시예 6> 인간 IgG Fc 도메인이 융합된 단일도메인 항체의 발현 및 정제
<6-1> 인간 IgG Fc 도메인이 융합된 1가 단일도메인 항체의 발현 및 정제
상기 <실시예 5>에서 선별한 클론은 TGEX-Fc(IgG1) 또는 TGEX-Fc(IgG4) 발현 벡터에 클로닝하였다. 인간 IgG Fc 도메인이 융합된 단일 도메인 항체의 발현을 위해 생존률 95~99%의 Expi-CHO 세포를 계수하여 7×106 세포를 25 ㎖의 배양배지(Expi-CHO expression medium (Gibco))에 첨가하였고, 8% CO2가 유지되는 37℃ 진탕 배양기에서 125 rpm으로 하룻밤 동안 배양하였다. 이후 80 ㎕의 ExpiFectamine™ CHO Reagent(Gibco, 100033021)와 920 ㎕의 OptiPRO™ medium 혼합액에 인간 IgG Fc 도메인이 융합된 단일도메인 항체를 코딩하는 20 ㎍의 플라스미드 DNA와 1 ㎖의 OptiPRO™ medium 혼합액을 첨가하여 상온에서 5분간 반응한 뒤 배양된 세포에 첨가하였다. 세포는 8% CO2가 유지되는 진탕배양기에서 125 rpm으로 20시간 배양하였다. 이후 인간 IgG Fc 도메인이 융합된 단일도메인 항체의 발현을 강화시키는 150 ㎕의 ExpiFectamineTM CHO enhancer(Gibco)와 6 ㎖의 ExpiCHO Feed(Gibco)를 넣고 5% CO2가 유지되는 32℃ 진탕배양기에서 125 rpm으로 5일간 배양하였다. 배양된 세포는 4℃에서 4,000 rpm으로 30분간 원심분리하였고, 상등액을 0.2 ㎛ 실린지 필터를 이용하여 필터링하였다. 이후 HiTrap protein G HP column(GE Healthcare)에 상등액을 로딩하고, PBS로 세척한 뒤 IgG elution buffer(Thermo)를 이용하여 인간 IgG Fc 도메인이 융합된 단일 도메인 항체를 column으로 부터 용리하였다. 용리된 시료는 1M Tris-HCl(pH 9.0)을 첨가하여 중화한 뒤 사용하기 전까지 4℃에서 보관하였다.
<6-2> 인간 IgG4 Fc 도메인이 융합된 2가 단일도메인 항체의 발현 및 정제
상기 <실시예 5>에서 선별한 클론을 2개의 G2S 링커 (GGSGGS)를 이용하여 연결함으로써 2가 단일 도메인 항체를 제작하였다. 상기 2가 단일 도메인 항체를 코딩하는 뉴클레오타이드는 유전자 합성(마크로젠, 대한민국)을 통해 확보하였다. 인간 IgG4 Fc 도메인이 융합된 단일도메인 항체의 발현 및 정제를 위해 합성된 유전자는 TGEX-Fc(IgG4) 발현벡터에 클로닝하였다. 이후, 상기 실시예 <6-1>에 기재된 방법과 동일한 방법으로 발현 및 정제하였다.
<실시예 7> 인간 IgG4 Fc 도메인이 융합된 이중특이적(bispecific) 단일도메인 항체의 발현 및 정제
상기 <실시예 5>에서 선별한 클론 중 PD-L1과 CD47 항원 각각에 특이적으로 결합하는 단일도메인 항체를 각 1종씩 선별하였다. 각 단일도메인 항체를 코딩하는 뉴클레오타이드 서열은 펩티드 링커를 이용하여 연결하였으며, PD-L1에 특이적으로 결합하는 단일도메인 항체 2개와 CD47에 특이적으로 결합하는 단일도메인 항체를 순서대로 연결하였다(항-PD-L1 sdAb×항-PD-L1 sdAb×항-CD47 sdAb). 이러한 3가 이중특이적 단일도메인 항체를 코딩하는 뉴클레오타이드 서열은 유전자 합성(마크로젠, 대한민국)을 통해 확보하였다. 인간 IgG4 Fc 도메인이 융합된 이중특이적 단일 도메인 항체의 발현 및 정제를 위해 합성된 유전자를 TGEX-Fc(IgG4) 발현벡터에 클로닝하였며, 상기 실시예 <6-1>에 기재된 방법과 동일한 방법으로 발현 및 정제하였다.
<실시예 8> FACS를 이용한 인간 IgG Fc 도메인이 융합된 단독 또는 이중특이적 단일도메인 항체와 면역 항원의 결합능 평가
상기 <실시예 6> 및 <실시예 7>에서 정제한 항-PD-L1 HCAb(PDL1 Nb#01-IgG1), 항-PD-L1 2가 HCAb(PP Nb-IgG4), 항-CD47 HCAb(CD47 Nb-IgG4), 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)와 면역 항원의 결합능을 FACS를 통해 확인하였다.
구체적으로, CHO-K1_PD-L1 세포주(PD-L1 항원이 과발현되는 CHO-K1 세포) 또는 Expi-CHO_CD47 세포주(CD47 항원이 과발현된 Expi-CHO 세포)는 DPBS로 세척한 뒤 상온, 1,200 rpm에서 3분간 원심분리하였다. 상등액을 제거하고 2% 스킴 밀크로 세포를 재부유하여 4℃에서 30분간 블로킹하였다. 세포는 상온, 1,200 rpm에서 3분간 원심분리하여 상등액을 제거한 뒤 DPBS로 2회 세척하였다. 이후 각 웰에 3×105 cells/100 ㎕/well로 세포를 분주한 뒤, 항-PD-L1 HCAb(PDL1 Nb#01-IgG1), 항-PD-L1 2가 HCAb(PP Nb-IgG4), 항-CD47 HCAb(CD47 Nb-IgG4), 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)를 각각 농도별로 처리하였고, 음성대조군으로 isotype control 항체를 사용하였다. 세포는 4℃에서 1시간 동안 반응한 뒤, DPBS로 2회 세척하였다. 이후, 인간 Fc 도메인에 특이적으로 결합하는 항체(Anti-human IgG Fc APC 항체(Biolegend))를 처리하고 빛을 차단한 채로 4℃에서 30분간 반응하였다. 세포는 DPBS로 2회 세척 후 100 ㎕의 DPBS로 재부유하여 Accuri C6 (BD) 장비를 이용하여 FACS 분석하였다.
<실시예 9> FACS를 이용한 인간 IgG Fc 도메인이 융합된 단독 또는 이중특이적 단일도메인 항체의 면역 항원 상호작용에 대한 억제능 평가
상기 <실시예 6> 및 <실시예 7>에서 정제한 항-PD-L1 HCAb(PDL1 Nb#01-IgG1), 항-PD-L1 2가 HCAb(PP Nb-IgG4), 항-CD47 HCAb(CD47 Nb-IgG4), 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)는 PD-1/PD-L1 또는 CD47/SIRPalpha 상호작용에 미치는 억제능을 평가하였다.
구체적으로, PD-1/PD-L1 상호작용에 대한 항-PD-L1 HCAb(PDL1 Nb#01-IgG1), 항-PD-L1 2가 HCAb(PP Nb-IgG4) 또는 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)의 평가를 위해 CHO-K1_PD-L1 세포주(PD-L1 항원이 일정하게 발현하는 CHO-K1 세포)를 96 웰 마이크로플레이트에 웰당 2×105 cell에 분주하고, 10 ㎍/㎖의 인간 PD-1-His 단백질을 처리하였다. 이후 항-PD-L1 HCAb(PDL1 Nb#01-IgG1), 항-PD-L1 2가 HCAb(PP Nb-IgG4) 또는 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)를 각각 농도별로 처리하였으며, 음성대조군은 isotype control 항체를 처리하였다. 세포는 1시간 동안 4℃에서 반응하였으며 DPBS로 3회 세척 후, His 항원에 특이적으로 결합하는 항체(Goat anti-His APC)를 첨가하여 빛을 차단한 채로 4℃에서 30분간 반응 하였다. 세포는 DPBS로 3회 세척 후 100 ㎕의 DPBS로 재부유하였고, Accuri C6 (BD) 장비로 CHO-K1_PD-L1 세포(PD-L1 항원이 일정하게 발현하는 CHO-K1 세포)에 남아있는 PD-1-His 단백질 양을 확인함으로써 항-PD-L1 HCAb(PDL1 Nb#01-IgG1), 항-PD-L1 2가 HCAb(PP Nb-IgG4) 또는 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)가 PD-1/PD-L1 상호작용에 미치는 억제능을 평가하였다.
또한, 항-CD47 sdAb(CD47 Nb-IgG4) 또는 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)가 CD47/SIRPalpha 상호작용에 미치는 영향을 평가하기 위해 Expi-CHO_CD47 세포(CD47 항원이 일정하게 발현하는 Expi-CHO 세포)를 96웰 마이크로플레이트에 웰당 2×105 cell에 분주하고, 10 ㎍/㎖의 인간 SIRPalpha-His 단백질을 처리하였다. 이후 항-CD47 sdAb(CD47 Nb-IgG4) 또는 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4) 각각 농도별로 처리하였으며, 음성대조군은 isotype control 항체를 처리하였다. 그 다음, 상기에 기재된 방법과 동일한 방법으로 Accuri C6 (BD) 장비로 Expi-CHO_CD47 세포에(CD47 항원이 일정하게 발현하는 Expi-CHO 세포) 남아있는 SIRPalpha-His 단백질 양을 확인함으로써 항-CD47 sdAb(CD47 Nb-IgG4) 또는 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)가 CD47/SIRPalpha 상호작용에 미치는 억제능을 평가하였다.
<실시예 10> 인간 IgG Fc 도메인이 융합된 단독 또는 이중특이적 단일도메인 항체의 면역 항원과의 친화도 평가
Octet RED 96e (ForteBio) 장비를 이용하여 상기 <실시예 6> 및 <실시예 7>에서 정제한 항-PD-L1 HCAb(PDL1 Nb#01-IgG1), 항-PD-L1 2가 HCAb(PP Nb-IgG4), 항-CD47 HCAb(CD47 Nb-IgG4), 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)와 면역 항원 단백질의 친화도(Kd)를 측정하였다.
구체적으로, anti-human Fc가 코팅된 바이오센서팁(Fortebio)을 5 ㎍/㎖의 항-PD-L1 HCAb(PDL1 Nb#01-IgG1), 항-PD-L1 2가 HCAb(PP Nb-IgG4), 항-CD47 HCAb(CD47 Nb-IgG4), 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)가 각각 분주된 96-웰 마이크로플레이트(Greiner)에서 1.5 nm 수준으로 포화 결합 시켰다. PD-L1 및 CD47 항원은 10 ~ 400 nM로 1X kinetic buffer(ForteBio)를 이용하여 2배수로 단계별 희석하였으며 30℃, 1,000 rpm으로 교반하면서 반응하였다. 시료의 결합과 해리 반응은 각각 200, 400초 동안 분석하였다. 결과 데이터는 1:1 상호작용 모델(Global fitting) 방법을 이용하여 분석하였다.
<실시예 11> 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)의 in vitro 유효성 및 안전성 평가
<11-1> PD-L1 항원에 대한 in vitro 유효성 평가
CHO-K1_PD-L1 세포(PD-L1 항원의 과발현을 유도한 CHO-K1 세포)와 PD-1이 발현하는 Jurkat 세포를 이용하여 상기 <실시예 7>에서 정제한 항-PD-L1×CD47 HCAb (PPC Nb-IgG4)의 in vitro 유효성을 평가하였다.
구체적으로, CHO-K1_PD-L1 세포(PD-L1 항원을 과발현을 유도한 CHO-K1 세포)를 96웰 마이크로플레이트에 웰당 2×104 cell로 분주한 뒤 5% CO2가 유지되는 배양기에서 16시간 동안 배양하였다. 이후 배지를 제거하였고, 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)를 농도별로 처리하고 1시간 동안 반응하였다. Jurkat 세포는 5×105 cell/100 ㎕로 준비한 뒤 PHA를 0.5 mg/㎖가 되도록 처리하였고, 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)가 처리된 CHO-K1_PD-L1 세포에 첨가하여 48시간 동안 반응하였다. 이후 상등액은 ELISA 방법을 통하여 IL-2 농도를 측정하여 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)의 in vitro 유효성을 평가하였다.
<11-2> CD47 항원에 대한 in vitro 유효성 및 안전성 평가
상기 <실시예 7>에서 정제한 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)의 in vitro 유효성은 CD47 항원 특이적 결합에 의한 대식세포(macrophage)의 식세포 작용(Phagocytosis) 활성화 정도와 인간 RBC 결합(Human RBC binding), 적혈구응집반응(Hemagglutination)을 확인하여 평가하였다.
구체적으로, 5×106 cell의 THP-1 세포를 100 파이 디쉬에 분주하여 5% CO2가 유지되는 배양기에서 24시간 동안 배양하였다. 이후 40 nM의 PMA로 24시간 동안 반응한 뒤 배지를 제거하였으며, 1 μM의 deep red dye로 염색하였다. 염색을 마친 후 배지로 교체한 뒤 48시간 동안 레스팅(resting)하였다. Trypsin으로 떼어낸 THP-1 세포는 3 μM의 CFSE로 염색된 prey cell (Raji 세포)과 8:1의 비율로 혼합한 뒤 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)를 농도별로 처리하여 4시간 동안 공동 배양(Co-culture)하였다. 이후 FACS를 이용하여 식세포작용(Phagocytosis) 정도를 평가하였다.
인간 RBC(Red blood cell)와 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)의 결합능을 확인하기 위해 RBC를 DPBS로 7회 세척한 뒤, DPBS로 12%(v/v)가 되도록 희석하였다. 96 well V bottom 플레이트에 50 ㎕의 2×의 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)를 분주한 뒤 12%(v/v) RBC를 50 ㎕ 첨가하여 4℃에서 1시간 동안 반응하였다. 세포는 DPBS로 세척 후 인간 IgG4를 특이적으로 인식하는 항체(anti human IgG4)를 2차 항체로 처리하였고, 4℃에서 1시간 동안 반응하였다. 세포는 DPBS로 세척 후 FACS를 통해 RBC에 결합한 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)의 정도를 평가하였다.
항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)의 적혈구응집반응(Hemagglutination)을 평가하기 위해 RBC를 DPBS로 7회 세척한 뒤, DPBS로 6%(v/v)가 되도록 희석하였다. 96 well U bottom 플레이트에 50 ㎕의 2×의 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)를 분주한 뒤 6%(v/v) RBC를 50 ㎕ 첨가하였다. 상온에서 1시간 동안 반응 후 육안으로 관찰하면서 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)에 의한 적혈구응집반응(Hemogglutination)을 평가하였다.
<실시예 12> 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)의 in vivo 유효성 평가
상기 <실시예 7>에서 정제한 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)의 in vivo 유효성은 인간 PD-L1과 인간 CD47 발현을 유도한 종양 세포주(B16F10 세포)를 C57BL/6 마우스에 주입하여 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)에 의한 항종양 효과를 평가하였다.
구체적으로, 6-8주령 된 C57BL/6 암컷 마우스에 B16F10_PD-L1×CD47 세포주(인간 PD-L1과 인간 CD47의 과발현을 유도한 B16F10 세포)를 8×105 cell/100 ㎕를 주입하였다. 종양 크기가 가로 × 세로의 크기로 3 × 3 mm에 도달할 때까지 종양 형성을 유도하였다. 이후, 2일 간격으로 10 mpk의 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)를 7회에 걸쳐 복강 투여하고 종양 크기를 측정하였다. 마지막 복강 투여 후 2일 간격으로 1주일간 종양 크기를 측정하여 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)의 in vivo 유효성을 평가하였다.
정맥 투여를 통한 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)의 항종양 효과를 확인하기 위해 동일한 마우스 종양 모델을 이용하여 3일 간격으로 5, 10 mpk의 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)를 7회에 걸쳐 정맥 투여한 뒤 종양 크기를 측정하였다. 마지막 정맥 투여 3일 후 종양 크기를 측정하여 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)의 in vivo 유효성을 평가를 하였다.
<실험예 1> 항-PD-L1 HCAb(PDL1 Nb#01-IgG1)의 제작 및 in vitro 특성 평가
<1-1> 항-PD-L1 HCAb(PDL1 Nb#01-IgG1) 제작
면역 항원으로 인간 PD-L1 항원을 이용하여 상기 <실시예 5>에 기재된 방법과 동일한 방법으로 PD-L1 항원에 특이적인 단일 도메인 항체 클론을 선별하여 염기서열분석을 진행하였다. 상기 선별한 항-PD-L1 sdAb(PDL1 Nb#01)의 아미노산 서열은 하기 [표 5] 및 [표 6]에 나타내었다.
또한, 상기 선별한 항-PD-L1 sdAb(PDL1 Nb#01)을 이용하여 실시예 <6-1>에 기재된 방법과 동일한 방법으로 인간 IgG1 Fc 도메인을 포함하는 PD-L1에 특이적인 1가 단일 도메인 항체를 발현 및 정제하였고, 정제된 1가 단일 도메인 항체는 항-PD-L1 HCAb(PDL1 Nb#01-IgG1)으로 명명하였다. 인간 IgG1 Fc 도메인을 포함하는 항-PD-L1 HCAb(PDL1 Nb#01-IgG1)의 아미노산 서열은 하기 [표 7]에 나타내었다.
또한, 상기 선별한 항-PD-L1 sdAb(PDL1 Nb#01) 클론을 이용하여 실시예 <6-2>에 기재된 방법과 동일한 방법으로 인간 IgG4 Fc를 포함하는 PD-L1에 특이적인 2가 단일 도메인 항체를 발현 및 정제하였고, 정제된 2가 단일 도메인 항체는 항-PD-L1 2가 HCAb(PP Nb-IgG4)로 명명하였다. 항-PD-L1 2가 HCAb(PP Nb-IgG4)에서 인간 IgG4 Fc 도메인을 제외한 항-PD-L1 2가 sdAb(PP Nb)의 아미노산 서열은 하기 [표 8]에 나타내었고, 인간 IgG4 Fc 도메인을 포함하는 항-PD-L1 2가 HCAb(PP Nb-IgG4)의 아미노산 서열은 하기 [표 9]에 나타내었다.
[표 5]
Figure PCTKR2022002530-appb-img-000005
[표 6]
Figure PCTKR2022002530-appb-img-000006
[표 7]
Figure PCTKR2022002530-appb-img-000007
[표 8]
Figure PCTKR2022002530-appb-img-000008
[표 9]
Figure PCTKR2022002530-appb-img-000009
<1-2> 항-PD-L1 HCAb(PDL1 Nb#01-IgG1) 및 항-PD-L1 2가 HCAb(PP Nb-IgG4)의 항원 결합능 및 PD-1/PD-L1 상호작용에 대한 억제능 평가
상기 <실시예 8>과 <실시예 9>에 기재된 방법과 동일하게 FACS를 이용하여 상기 <실험예 1>에서 정제한 항-PD-L1 HCAb(PDL1 Nb#01-IgG1) 및 항-PD-L1 2가 HCAb(PP Nb-IgG4)의 항원 결합능(도 1a 및 도 2a)과 PD-1/PD-L1 상호작용에 미치는 억제능(도 1b 및 도 2b)을 평가하였다.
그 결과, 도 1a 및 도 1b에 나타낸 바와 같이, 항-PD-L1 HCAb(PDL1 Nb#01-IgG1)는 CHO-K1_PD-L1 세포(PD-L1 항원이 일정하게 발현하는 CHO-K1 세포)에서 23.31 nM(EC50)의 항원 결합능이 확인되었고, PD-1/PD-L1 상호작용에 미치는 억제능은 4.60 nM(IC50)으로 확인되었다.
또한, 도 2a 및 도 2b에 나타낸 바와 같이, 항-PD-L1 2가 HCAb(PP Nb-IgG4)는 CHO-K1_PD-L1 세포(PD-L1 항원이 일정하게 발현하는 CHO-K1 세포)에서 1.93 nM(EC50)의 항원 결합능이 확인되었고, PD-1/PD-L1 상호작용에 미치는 억제능은 2.86 nM(IC50)으로 확인되었다.
<1-3> 항-PD-L1 HCAb(PDL1 Nb#01-IgG1) 및 항-PD-L1 2가 HCAb(PP Nb-IgG4)와 면역 항원과의 친화도 평가
상기 <실험예 1>에서 정제한 항-PD-L1 HCAb(PDL1 Nb#01-IgG1) 및 항-PD-L1 2가 HCAb(PP Nb-IgG4)는 각각 PD-L1 항원과의 친화도를 상기 <실시예 9>에 기재된 방법과 동일한 방법으로 평가하였다.
그 결과, 표 10에 나타낸 바와 같이, 항-PD-L1 HCAb(PDL1 Nb#01-IgG1)는 PD-L1 항원과 7.08 nM의 항원친화력을 확인하였고, 항-PD-L1 2가 HCAb(PP Nb-IgG4)는 PD-L1 항원과 4.58 nM의 항원 친화력을 확인하였다.
[표 10]
Figure PCTKR2022002530-appb-img-000010
<실험예 2> 항-C47 HCAb(CD47 Nb-IgG4) 제작 및 in vitro 특성 평가
<2-1> 항-C47 HCAb(CD47 Nb-IgG4) 제작
면역 항원으로 인간 CD47 항원을 이용하여 상기 <실시예 5>에 기재된 방법과 동일한 방법으로 CD47 항원에 특이적인 단일도메인 항체 클론을 선별하여 염기서열분석을 진행하였다. 상기 선별한 항-CD47 sdAb(CD47 Nb#01)의 아미노산 서열은 하기 [표 11] 및 [표 12]에 나타내었다.
또한, 상기 선별한 항-CD47 sdAb(CD47_Nb_#01)을 이용하여 실시예 <6-1>에 기재된 방법과 동일한 방법으로 인간 IgG4 Fc 도메인을 포함하는 CD47에 특이적인 단일 도메인 항체를 발현 및 정제하였고, 정제된 단일 도메인 항체는 항-CD47 HCAb(CD47 Nb-IgG4)로 명명하였다. 인간 IgG4 Fc 도메인을 포함하는 항-CD47 HCAb(CD47 Nb-IgG4)의 아미노산 서열은 하기 [표 13]에 나타내었다.
[표 11]
Figure PCTKR2022002530-appb-img-000011
[표 12]
Figure PCTKR2022002530-appb-img-000012
[표 13]
Figure PCTKR2022002530-appb-img-000013
<2-2> 항-CD47 HCAb(CD47 Nb-IgG4)의 항원 결합능 및 CD47/SIRPalpha 상호작용에 대한 억제능 평가
상기 <실시예 8>과 <실시예 9>에 기재된 방법과 동일하게 FACS를 이용하여 상기 실험예 <2-1>에서 정제한 항-CD47 HCAb(CD47 Nb-IgG4)의 항원 결합능(도 3a)과 CD47/SIRPalpha 상호작용에 미치는 억제능(도 3b)을 평가하였다.
그 결과, 도 3a 및 도 3b에 나타낸 바와 같이, 항-CD47 HCAb(CD47 Nb-IgG4)는 Expi-CHO_CD47 세포(CD47 항원이 일정하게 발현하는 Expi-CHO 세포)에서 3.78 nM(EC50)의 항원 결합능이 확인되었고, CD47/SIRPalpha 상호작용에 미치는 억제능은 7.28 nM(IC50)으로 확인되었다.
<2-3> 항-CD47 HCAb(CD47 Nb-IgG4)와 면역 항원과의 친화도 평가
상기 <실험예 2-1>에서 정제한 항-CD47 HCAb(CD47 Nb-IgG4)와 CD47 항원과의 친화도를 상기 <실시예 10>에 기재된 방법과 동일한 방법으로 평가하였다.
그 결과, 표 14에 나타낸 바와 같이, 항-CD47 HCAb(CD47 Nb-IgG4)는 CD47 항원과 2.78 nM의 항원 친화력을 확인하였다.
[표 14]
Figure PCTKR2022002530-appb-img-000014
<실험예 3> 항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4) 제작 및 in vitro 특성 평가
<3-1> 항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4) 제작
인간 IgG4 Fc 도메인을 포함하며 면역 항원으로 PD-L1 및 CD47 항원에 이중 특이적인 단일도메인 항체는 상기 실험예 <1-1>에서 선별한 클론을 이용하여 제작하였다. 상기 실험예 <1-1>에서 선별한 항-PD-L1 sdAb(PDL1 Nb#01)을 코딩하는 뉴클레오타이드 서열과 상기 실험예 <2-1>에서 선별한 항-CD47 sdAb(CD47 Nb#01)을 코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 이용하여 상기 <실시예 7>에 기재된 방법과 동일한 방법으로 유전자 합성하고 TGEX-Fc(IgG4) 발현 벡터에 클로닝한 후 발현 및 정제하여 항-PD-L1×CD47 HCAb(PPC Nb-IgG4)로 명명하였다.
상기 항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4)에서 인간 IgG4 Fc 도메인을 제외한 PD-L1×CD47 3가 sdAb의 아미노산 서열은 하기 [표 15]에 나타내었고, 상기 인간 IgG4 Fc 도메인을 포함한 항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4)의 아미노산 서열은 하기 [표 16]에 나타내었다.
[표 15]
Figure PCTKR2022002530-appb-img-000015
[표 16]
Figure PCTKR2022002530-appb-img-000016
<3-2> 항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4)의 면역 항원 결합능 평가
상기 <실시예 8>에 기재된 방법과 동일한 방법으로 FACS를 이용하여 상기 실험예 <3-1>에서 정제한 항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4)의 PD-L1 항원 및 CD47 항원 결합능을 확인하였다.
그 결과, 도 4a 및 도 4b에 나타낸 바와 같이, 항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4)는 CHO-K1_PD-L1 세포(PD-L1 항원이 일정하게 발현하는 CHO-K1 세포)에서 13.33 nM(EC50)의 항원 결합능이 확인되었고, Expi-CHO_CD47 세포(CD47 항원이 일정하게 발현하는 Expi-CHO 세포)에서 18.80 nM(EC50)의 항원 결합능이 나타났다.
<3-3> 항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4)의 PD-1/PD-L1 및 CD47/SIRPalpha 상호작용에 대한 억제능 평가
상기 <실시예 9>에 기재된 방법과 동일한 방법으로 FACS를 이용하여 상기 실험예 <3-1>에서 정제한 항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4)의 PD-1/PD-L1 및 CD47/SIRPalpha 상호작용에 대한 억제능을 평가하였다.
그 결과, 도 5a 및 도 5b에 나타낸 바와 같이, 항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4)는 PD-1/PD-L1 상호작용에 미치는 억제능이 9.15 nM(IC50)로 확인되었고, CD47/SIRPalpha 상호작용에 미치는 억제능은 22.44 nM(IC50)로 확인되었다.
<3-4> 항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4)와 면역 항원과의 친화도 평가
상기 실험예 <3-1>에서 정제한 항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4)와 PD-L1 항원 및 CD47 항원과의 친화도를 상기 <실시예 10>에 기재된 방법과 동일한 방법으로 평가하였다.
그 결과, 표 17에 나타낸 바와 같이, 항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4)는 PD-L1 항원에 대해 6.84 nM, CD47 항원에 대해 3.62 nM의 우수한 친화력을 확인하였다.
[표 17]
Figure PCTKR2022002530-appb-img-000017
<실험예 4> 항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4)의 in vitro 유효성 및 안전성 평가
상기 실험예 <3-1>에서 정제한 항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4)를 이용하여 in vitro 유효성 및 안전성 평가를 수행하였다.
<4-1> PD-L1 항원에 대한 항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4)의 in vitro 유효성 평가
항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4)의 PD-L1 항원에 대한 in vitro 유효성을 확인은 상기 실시예 <11-1>에 기재된 방법과 동일한 방법으로 CHO-K1_PD-L1 세포(PD-L1을 일정하게 발현하는 CHO-K1 세포)와 PD-1을 발현하는 jurkat 세포간의 상호작용을 항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4)가 방해하여 jurkat 세포로부터 발현된 IL-2 농도를 측정함으로서 in vitro 유효성을 평가하였다.
그 결과, 도 6에 나타낸 바와 같이, 항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4)는 PD-1을 발현하는 jurkat 세포와 PD-L1을 발현하는 CHO-K1 세포에 간섭하여 CHO-K1 세포와 jurkat 세포의 상호작용에 1.45 nM(IC50)의 저해 효능이 확인되었다.
<4-2> CD47 항원에 대한 항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4)의 식세포작용 평가
항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4)의 CD47 항원에 대한 in vitro 유효성 확인은 상기 실시예 <11-2>에 기재된 방법과 동일한 방법으로 PMA에 의해 THP-1 세포를 대식세포화 하였다. 이후 CD47 항원이 발현하는 prey 세포(Raji 세포)에 선택적 결합을 통해 대식세포에 의한 식세포작용 정도를 평가하였다.
그 결과, 도 7에 나타낸 바와 같이, 항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4)는 THP-1 세포와 CD47 항원이 발현하는 prey 세포(Raji 세포) 간에 간섭하여 CD47을 발현하는 prey 세포에 1.44 nM(EC50)의 결합능을 확인하였다.
<4-3> CD47 항원에 대한 항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4)의 인간 RBC 결합능 평가
인간 RBC는 CD47을 발현하는 특징 때문에 CD47 항원에 특이적으로 결합하는 항체의 경우 인간 RBC 결합을 통해 빈혈과 같은 부작용을 유발할 수 있다. 따라서 항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4)와 인간 RBC와의 결합능을 확인하여 항체의 안전성을 평가하였다. 상기 실시예 <11-2>에 기재된 방법과 동일한 방법으로 인간 RBC와 결합능을 FACS를 이용하여 평가하였다.
그 결과, 도 8에 나타낸 바와 같이, 양성대조군으로 사용한 CD47 단클론항체(Competitor)는 2.93 nM 이상에서 인간 RBC와의 결합이 확인된 반면, 항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4)는 실험에서 사용한 최대 농도인 3 μM 에서도 RBC 결합이 확인되지 않았다.
<4-4> CD47 항원에 대한 항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4)의 적혈구응집반응 평가
인간 RBC와 CD47 항원 특이적 항체와의 결합은 적혈구 응집반응을 유발한다. 따라서 적혈구와 항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4)의 결합을 상기 실시예 <11-2>에 기재된 방법과 동일한 방법 적혈구 응집반응을 평가 함으로서 항체의 안전성을 확인하였다.
그 결과, 도 9에 나타낸 바와 같이, 양성대조군으로 사용한 CD47 단클론항체(Competitor)는 11.72 nM 이상에서 적혈구 응집 반응이 확인된 반면, 항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4)는 실험에 사용한 최대 농도인 3 μM 농도에서도 적혈구 응집반응이 확인되지 않았다.
<실험예 5> 항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4)의 in vivo 유효성 평가
상기 실험예 <3-1>에서 정제한 항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4)의 in vivo 유효성 평가는 마우스 종양모델을 이용하여 수행하였다.
<5-1> 복강 투여에 의한 항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4)의 항종양 효과 확인
상기 <실시예 12>에 기재된 방법과 동일한 방법으로 항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4)는 PD-L1과 CD47 항원이 발현하는 종양세포(B16F10 세포)를 주입하여 종양이 형성된 마우스 모델에서 복강 투여를 통해 항종양 효과를 관찰하였다.
그 결과, 도 10에 나타낸 바와 같이, 항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4)는 음성대조군(Isotype group) 대비 약 49.4%의 항종양 효과가 나타나고, 항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4)를 구성하는 각각의 항체를 병용으로 처리한(항-PD-L1 2가 HCAb(PP Nb-IgG4) + 항-CD47 HCAb(CD47 Nb-IgG4))그룹 대비 약 38.8%의 항종양 효과가 나타남을 확인하였다.
<5-2> 정맥 투여에 의한 항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4)의 항종양 효과 확인
상기 <실시예 12>에 기재된 방법과 동일한 방법으로 항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4)는 PD-L1과 CD47 항원이 발현하는 종양세포(B16F10 세포)를 주입하여 종양이 형성된 마우스 모델에서 정맥 투여를 통해 항종양 효과를 관찰하였다.
그 결과, 도 11에 나타낸 바와 같이, 항-PD-L1×CD47 3가 HCAb(PPC Nb-IgG4)는 음성대조군(Isotype group) 대비 최대 약 74.4%의 항종양 효과가 나타남을 확인하였다.
본 발명에 따른 단일 도메인 항체는 면역관문 단백질(immune checkpoint protein)인 CD47에 대한 우수한 친화성 및 항종양 효과를 나타내므로, 면역관문 억제제로 면역항암요법에 유용하게 이용될 수 있다.

Claims (33)

  1. PD-L1에 특이적으로 결합하는 제1 단일 도메인 항체(제1 sdAb) 또는 이의 항원-결합 단편; 및 CD47에 특이적으로 결합하는 제2 단일 도메인 항체(제2 sdAb) 또는 이의 항원-결합 단편을 포함하는, PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체.
  2. 제 1항에 있어서, 상기 제1 sdAb 또는 이의 항원-결합 단편은 서열번호 2로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 CDR1; 서열번호 3으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 CDR2; 및 서열번호 4로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 CDR3를 포함하는, PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체.
  3. 제 1항에 있어서, 상기 제2 sdAb 또는 이의 항원-결합 단편은 서열번호 7로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 CDR1; 서열번호 8로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 CDR2; 및 서열번호 9로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 CDR3를 포함하는, PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체.
  4. 제 1항에 있어서, 상기 제1 sdAb 또는 이의 항원-결합 단편은 하기의 VHH 도메인을 포함하는, PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체:
    (1) 서열번호 13 및 17 중 어느 하나로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR1;
    (2) 서열번호 14 및 18 중 어느 하나로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR2;
    (3) 서열번호 15 및 19 중 어느 하나로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR3; 및
    (4) 서열번호 16 및 20 중 어느 하나로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR4.
  5. 제 4항에 있어서, 상기 제1 sdAb 또는 이의 항원-결합 단편은 하기의 VHH 도메인을 포함하는, PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체:
    서열번호 13으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR1;
    서열번호 14로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR2;
    서열번호 15로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR3; 및
    서열번호 16으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR4.
  6. 제 1항에 있어서, 상기 제2 sdAb 또는 이의 항원-결합 단편은 하기의 VHH 도메인을 포함하는, PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체:
    (1) 서열번호 13 및 17 중 어느 하나로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR1;
    (2) 서열번호 14 및 18 중 어느 하나로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR2;
    (3) 서열번호 15 및 19 중 어느 하나로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR3; 및
    (4) 서열번호 16 및 20 중 어느 하나로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR4.
  7. 제 6항에 있어서, 상기 제2 sdAb 또는 이의 항원-결합 단편은 하기의 VHH 도메인을 포함하는, PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체:
    서열번호 17로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR1;
    서열번호 18로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR2;
    서열번호 19로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR3; 및
    서열번호 20으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진 FR4.
  8. 제 5항에 있어서, 상기 제1 sdAb는 서열번호 1 및 21 중 어느 하나로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체.
  9. 제 7항에 있어서, 상기 제2 sdAb는 서열번호 6으로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체.
  10. 제 1항에 있어서, 상기 제1 sdAb 또는 이의 항원-결합 단편은 펩티드 링커를 통해 제2 sdAb 또는 이의 항원-결합 단편과 서로 융합되는 것인, PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체.
  11. 제 10항에 있어서, 상기 펩티드 링커를 통해 서로 융합되는 제1 sdAb 및 제2 sdAb는 서열번호 11로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체.
  12. 제 1항 내지 제 11항 중 어느 한 항에 있어서, 적어도 1개 이상의 아미노산 치환을 포함하는, PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체.
  13. 제 12항에 있어서, 적어도 1개 이상의 아미노산 치환이 보존적 치환인, PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체.
  14. 제 13항에 있어서, 적어도 1개의 아미노산 치환이 아미노산의 비-유전자 코딩 아미노산 또는 합성 아미노산으로의 치환인, PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체.
  15. 제 1항에 있어서, 상기 제1 sdAb 또는 이의 항원-결합 단편, 또는 제2 sdAb 또는 이의 항원-결합 단편에 Fc 단편이 융합된 중쇄-단독 항체(HCAb)인, PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체.
  16. 제 15항에 있어서, 상기 HCAb는 단량체성 또는 다량체성인, PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체.
  17. 제 15항에 있어서, 상기 Fc 단편은 인간 IgG1, IgG2, IgG3 또는 IgG4인, PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체.
  18. 제 15항에 있어서, 상기 제1 sdAb 또는 이의 항원-결합 단편 및 제2 sdAb 또는 이의 항원-결합 단편이 펩티드 링커를 통해 Fc 단편에 융합되는, PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체.
  19. 제 15항에 있어서, 상기 HCAb는 서열번호 12로 표시되는 아미노산 서열로 이루어진, PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체.
  20. 제 15항에 있어서, 적어도 1개 이상의 아미노산 치환을 포함하는, PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체.
  21. 제 20항에 있어서, 적어도 1개 이상의 아미노산 치환이 보존적 치환인, PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체.
  22. 제 21항에 있어서, 적어도 1개의 아미노산 치환이 아미노산의 비-유전자 코딩 아미노산 또는 합성 아미노산으로의 치환인, PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체.
  23. 제 1항에 있어서, 면역조정제, 사이토카인, 세포독성제, 화학요법제, 진단제, 항바이러스제, 항미생물제 또는 약물에 접합된 PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체.
  24. 면역조정제, 사이토카인, 세포독성제, 화학요법제, 진단제, 항바이러스제, 항미생물제 또는 약물에 접합된 제1항의 PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체를 포함하는 항체 접합체.
  25. 제 1항의 PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체를 암호화하는 핵산 분자.
  26. 제 25항의 핵산 분자를 포함하는 발현 벡터.
  27. 제 26항의 발현 벡터로 형질전환된 숙주 세포.
  28. (a) 이중특이적 항체가 발현되도록 하는 조건 하에 제 26항의 숙주 세포를 배양하는 단계; 및
    (b) 발현된 이중특이적 항체를 회수하는 단계
    를 포함하는, PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체를 생산하는 방법.
  29. 제 1항의 PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체 또는 제 24항의 항체 접합체를 유효성분으로 함유하는, 암 예방 또는 치료용 약학적 조성물.
  30. 제 29항에 있어서, 상기 암은 흑색종, 폐암, 간암, 교세포종, 난소암, 대장암, 두경부암, 방광암, 신장세포암, 위암, 유방암, 전이암, 전립선암, 췌장암, 비호지킨 림프종, 호지킨 림프종, 다발성 골수종, 백혈병, 림프종, 골수이형성증후군, 급성 림프모구성 백혈병, 급성 골수성 백혈병, 만성 림프구성 백혈병, 만성 골수성 백혈병, 고립성 골수종 및 재생불량성 빈혈로 이루어진 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는, 약학적 조성물.
  31. 제 29항에 있어서, 상기 약학적 조성물은 약학적으로 허용되는 담체를 더 포함하는 것을 특징으로 하는, 약학적 조성물.
  32. 제 1항의 PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체 또는 제 24항의 항체 접합체를 약학적으로 유효한 양으로 개체에 투여하는 단계를 포함하는, 암 예방 또는 치료 방법.
  33. 암의 예방 또는 치료에 사용하기 위한 제 1항의 PD-L1 및 CD47에 이중특이적으로 결합하는 이중특이적 항체 또는 제 24항의 항체 접합체의 용도.
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