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TWI822815B - 抗-人類pd-l1之抗體及其用途 - Google Patents

抗-人類pd-l1之抗體及其用途 Download PDF

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TWI822815B
TWI822815B TW108124494A TW108124494A TWI822815B TW I822815 B TWI822815 B TW I822815B TW 108124494 A TW108124494 A TW 108124494A TW 108124494 A TW108124494 A TW 108124494A TW I822815 B TWI822815 B TW I822815B
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游成州
楊時穰
謝宗翰
詹美琦
葉舒平
徐銓龍
胡齡月
蕭至倫
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財團法人生物技術開發中心
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Abstract

本發明係關於一種抗-PD-L1抗體或其抗原結合片段,係包含:一含有三個SEQ ID NO: 2-4、6-8、10-12、14-16或18-20所示序列的CDR的重鏈可變區;和/或一含有三個SEQ ID NO: 22-24、26-28、30-32、34-36或38-40所示序列的CDR的輕鏈可變區;其中該抗體是嵌合的、人源化的、複合的或人類抗體。

Description

抗-人類PD-L1之抗體及其用途
本發明係關於一種新的人類序列單株抗體,尤其是關於對於PD-L1具有高親和力的PD-L1特異性結合人類單株抗體,更特別的,本發明係關於此類抗體分子用於治療與診斷人類疾病的用途。
細胞程式死亡-1(Programmed cell death-1,PD-1)蛋白質是CD28家族中的一種抑制性受體,該家族中亦包含CD28、CTLA-4、ICOS與BTLA。PD-1表現於活化的B細胞、T細胞與骨髓細胞上(Bennett,Luxenberg et al.2003),而部分腫瘤細胞上與活化的B細胞、T細胞、樹突細胞、巨噬細胞、纖維母細胞會表現其配體,也就是細胞程式死亡-配體1(programmed cell death-ligand 1,PD-L1)(Hansen,Du Pasquier et al.2009),PD-L1可與PD-1結合,以誘導T細胞產生細胞凋亡或耗竭而減弱細胞的免疫反應,因此,使用單株抗體(針對PD-1或PD-L1)阻斷PD-1/PD-L1路徑是一種有潛力的治療方法,許多的人類癌症相關研究也針對此種治療方法加以探索(Sanmamed and Chen.2014),這些研究的結果表示PD-L1可促進PD-1/PD-L1路徑活化,因此於幫助腫瘤躲避免疫系統中扮演重要的角色。
在許多固態瘤中皆已觀察到有PD-L1的表現,像是乳癌(Qin,Zeng et al.2015)、肺癌(Ameratunga,Asadi et al.2016)、胃癌(Wu,Zhu et al.2006)、大腸直腸癌(Rosenbaum,Bledsoe et al.2016)、肝細胞癌(Kan and Dong 2015)、腎細胞癌(Shin,Jeon et al.2016)、睪丸癌(Cierna,Mego et al.2016)和甲狀腺乳突癌(Chowdhury,Veyhl et al.2016),除此之外,於許多癌症類型中,許多整合分析也顯示,當PD-L1的過度表現時,通常意味著其病情不樂觀,因此,目前仍需要更有效的抗-PD-L1抗體來治療或診斷與PD-L1有關的疾病或病症。
於一方面,本發明係關於可特異性結合人類PD-L1的抗體。本發明所揭示的一種抗體,包含一含有三個重鏈互補決定區(complementarity-determining regions,CDR):HCDR1、HCDR2與HCDR3的重鏈可變區,其具有SEQ ID NO:2-4、6-8、10-12、14-16或18-20之序列;與一含有三個輕鏈互補決定區:LCDR1、LCDR2與LCDR3的輕鏈可變區,其具有SEQ ID NO:22-24、26-28、30-32、34-36或38-40之序列。
於一些實施例中,該HCDR1之序列為GYIFISFWIH(SEQ ID NO:2)、該HCDR2之序列為NIDPSDSETHYNQKFKD(SEQ ID NO:3)、該HCDR3之序列為LDGDYGRAY(SEQ ID NO:4);或該HCDR1之序列為GYIFISFWIH(SEQ ID NO:6)、該HCDR2之序列為NIDPSDSETHYNEKFRD(SEQ ID NO:7)、該HCDR3之序列為LDGDYGRAY(SEQ ID NO:8);或該HCDR1之序列為GYAFSTSWIN(SEQ ID NO:10)、該HCDR2之序列為RIYPGDGDINYNGKFKD(SEQ ID NO:11)、或該HCDR3之序列為SNHYYFDF(SEQ ID NO:12);或該 HCDR1之序列為GYAFSTSWMN(SEQ ID NO:14)、該HCDR2之序列為RIYPGDEDTNYNGNFKG(SEQ ID NO:15)、該HCDR3之序列為SDNYYFDY(SEQ ID NO:16);或是該HCDR1之序列為GFTFSDSGMH(SEQ ID NO:18)、該HCDR2之序列為YISAGSYTIYYADIVKG(SEQ ID NO:19)、該HCDR3之序列為GDWYFAV(SEQ ID NO:20);其中該HCDR之序列係根據Chothia方法定義。
根據本發明的實施例,一人類抗-PD-L1抗體的一重鏈可變區的序列中,含有如圖1A-1E中所示SEQ ID NO:1、5、9、13或17的序列。
另一方面,本發明關於可特異性結合人類PD-L1的抗體,其包含一具有LCDR1、LCDR2與LCDR3的輕鏈可變區,其中,該LCDR1之序列為RASESVDSFGNSFMH(SEQ ID NO:22)、該LCDR2之序列為LASNLES(SEQ ID NO:23)、該LCDR3之序列為QQNNEDPLT(SEQ ID NO:24);或該LCDR1之序列為RASESVDSNGNSFMH(SEQ ID NO:26)、該LCDR2之序列為LASNLES(SEQ ID NO:27)、該LCDR3之序列為QQNNDDPWT(SEQ ID NO:28);或該LCDR1之序列為RASEDIRTYLN(SEQ ID NO:30)、該LCDR2之序列為YTSRLHS(SEQ ID NO:31)、該LCDR3之序列為QQVHTLPPWT(SEQ ID NO:32);或該LCDR1之序列為RASDDIRTYLN(SEQ ID NO:34)、該LCDR2之序列為YTSRLHS(SEQ ID NO:35)、該LCDR3之序列為QQVHTLPPWT(SEQ ID NO:36);或該LCDR1之序列為RSSQSLVHINGNTYLE(SEQ ID NO:38)、該LCDR2之序列為KVSNRFS(SEQ ID NO:39)、該LCDR3之序列為SQGSHVPWT(SEQ ID NO:40);其中該LCDR之序列係根據Chothia方法定義。
根據本發明的實施例,一可特異性結合人類PD-L1的抗體的一輕鏈可變區序列中,含有如圖2A-2E中所示SEQ ID NO:21、25、29、33或37的序列。
另一方面,本發明關於一可特異性結合人類PD-L1的抗體,其包含一具有HCDR1、HCDR2與HCDR3的重鏈可變區與一具有LCDR1、LCDR2與LCDR3的輕鏈可變區,其中,該HCDR1之序列為GYIFISFWIH(SEQ ID NO:2)、該HCDR2之序列為NIDPSDSETHYNQKFKD(SEQ ID NO:3)、該HCDR3之序列為LDGDYGRAY(SEQ ID NO:4);或該HCDR1之序列為GYIFISFWIH(SEQ ID NO:6)、該HCDR2之序列為NIDPSDSETHYNEKFRD(SEQ ID NO:7)、該HCDR3之序列為LDGDYGRAY(SEQ ID NO:8);或該HCDR1之序列為GYAFSTSWIN(SEQ ID NO:10)、該HCDR2之序列為RIYPGDGDINYNGKFKD(SEQ ID NO:11)、或該HCDR3之序列為SNHYYFDF(SEQ ID NO:12);或該HCDR1之序列為GYAFSTSWMN(SEQ ID NO:14)、該HCDR2之序列為RIYPGDEDTNYNGNFKG(SEQ ID NO:15)、該HCDR3之序列為SDNYYFDY(SEQ ID NO:16);或該HCDR1之序列為GFTFSDSGMH(SEQ ID NO:18)、該HCDR2之序列為YISAGSYTIYYADIVKG(SEQ ID NO:19)、該HCDR3之序列為GDWYFAV(SEQ ID NO:20);而該LCDR1之序列為RASESVDSFGNSFMH(SEQ ID NO:22)、該LCDR2之序列為LASNLES(SEQ ID NO:23)、該LCDR3之序列為QQNNEDPLT(SEQ ID NO:24);或該LCDR1之序列為RASESVDSNGNSFMH(SEQ ID NO:26)、該LCDR2之序列為LASNLES(SEQ ID NO:27)、該LCDR3之序列為QQNNDDPWT(SEQ ID NO:28);或該LCDR1之序列為RASEDIRTYLN(SEQ ID NO:30)、該LCDR2之序列為YTSRLHS(SEQ ID NO:31)、該LCDR3之序列為QQVHTLPPWT(SEQ ID NO:32);或該LCDR1之序列為RASDDIRTYLN(SEQ ID NO:34)、該LCDR2之序列為YTSRLHS(SEQ ID NO:35)、該LCDR3之序列為QQVHTLPPWT(SEQ ID NO:36);或該LCDR1之序列為RSSQSLVHINGNTYLE(SEQ ID NO:38)、該LCDR2之序列為KVSNRFS(SEQ ID NO:39)、該LCDR3之序列為SQGSHVPWT(SEQ ID NO:40);其中該HCDR與LCDR之序列係根據Chothia方法定義。
在部分實施例中,所述之可特異性結合人類PD-L1的抗體的一重鏈可變區序列具有SEQ ID NO:1、5、9、13或17之序列,且該可特異性結合人類PD-L1的抗體的一輕鏈可變區序列具有SEQ ID NO:21、25、29、33或37之序列。
在部分實施例中,所述之可特異性結合人類PD-L1的抗體的一重鏈可變區序列具有SEQ ID NO:1之序列,且該可特異性結合人類PD-L1的抗體的一輕鏈可變區序列具有SEQ ID NO:21之序列。
在部分實施例中,所述之可特異性結合人類PD-L1的抗體的一重鏈可變區序列具有SEQ ID NO:5之序列,且該可特異性結合人類PD-L1的抗體的一輕鏈可變區序列具有SEQ ID NO:25之序列。
在部分實施例中,所述之可特異性結合人類PD-L1的抗體的一重鏈可變區序列具有SEQ ID NO:9之序列,且該可特異性結合人類PD-L1的抗體的一輕鏈可變區序列具有SEQ ID NO:29之序列。
在部分實施例中,所述之可特異性結合人類PD-L1的抗體的一重鏈可變區序列具有SEQ ID NO:13之序列,且該可特異性結合人類PD-L1的抗體的一輕鏈可變區序列具有SEQ ID NO:33之序列。
在部分實施例中,所述之可特異性結合人類PD-L1的抗體的一重鏈可變區序列具有SEQ ID NO:17之序列,且該可特異性結合人類PD-L1的抗體的一輕鏈可變區序列具有SEQ ID NO:37之序列。
在一些實施例中,所述之可特異性結合人類PD-L1的抗體為一完整抗體、一Fab片段、一F(ab’)2片段或一ScFv片段。
在一些實施例中,所述之可特異性結合人類PD-L1的抗體為一完整人類抗體。
在一些實施例中,所述之可特異性結合人類PD-L1的抗體包含一選自IgG1、IgG2或IgG4異構物的重鏈恆定區與一選自κ亞型或λ異構物的輕鏈恆定區。
在一些實施例中,本發明的抗體(或其結合片段)可透過與另一可做為第二標靶的特異性結合結構域接合,而形成一雙特異性或多特異性抗體的一部分,該可做為第二標靶的特異性結合結構域可為抗-CD3、抗-ICOS或抗-TIM3等。在另一些實施例中,本發明的抗體(或其結合片段)可透過與一藥物(payload)接合,而形成一抗體-藥物複合體(antibody-drug conjugate,ADC),該藥物(payload)可選自其能夠調節該些表現PD-L1或PD-1之細胞的功能的藥物,例如(可包括)DM1、MMAE或MMAF。
於另一方面,本發明係關於一可用於治療和/或預防PD-1和/或PD-L1訊息傳遞路徑相關疾病的醫藥組合物,其中該醫藥組合物包含上述可特異性結合人類PD-L1的抗體或一其結合片段,該與PD-L1相關疾病可能為一癌症,而該癌症可能包含:黑色素瘤、非小細胞肺癌、腎癌、乳癌、白血病、癌 症或其他晚期固態瘤。
圖1A-1E顯示複合的人類重鏈(圖1A、1E12;圖1B、3F11;圖1C、3E10;圖1D、8H3;圖1E、5E6)可變區序列,其係對應於小鼠抗人PD-L1抗體設計而成。
圖2A-2E顯示複合的人類輕鏈(圖2A、1E12;圖2B、3F11;圖2C、3E10;圖2D、8H3;圖2E、5E6)可變區序列,其係對應於小鼠抗人PD-L1抗體設計而成。
圖3A-3B闡明各種抗體與PD-L1的結合。圖3A顯示使用ELISA測定人類抗-PD-L1抗體與PD-L1的結合;圖3B顯示使用Biacore 2000(GE Healthcare)測定人類抗-PD-L1抗體與PD-L1間的結果。
圖4A-4B說明各種抗體阻斷PD-L1與PD-1結合的能力。圖4A為抗體1E12和3F11;圖4B為抗體3E10、8H3和5E6。
圖5顯示各種抗體造成PD-1/PD-L1阻斷的能力。
圖6顯示使用流式細胞儀測定抗-PD-L1抗體與HCC821細胞的結合。
圖7A與7B顯示使用流式細胞儀測定抗-PD-L1抗體與MDA-MB-231細胞的結合及內化。
圖8顯示使用抗-PD-L1抗體3F11於人類組織樣品中進行免疫組織化學染色。
圖9顯示抗-PD-L1單株抗體用於治療鼠同源MC38直腸癌膜型的體內功效。
本發明係關於一種新的人類序列單株抗體,該人類單株抗體可以高親和力與PD-L1特異性結合,且對使用者產生治療功效。本發明所述之該抗體可為人類或人源化抗體,可做為用於治療和/或預防PD-L1相關之各種疾病的治療劑,於本說明書中,有針對該些疾病的更完整敘述。
更特別的,根據本發明的實施例,所述之抗體(或其抗原結合片段)可與人類PD-L1或其片段中的表位特異性結合的,其中該人類PD-L1具有SEQ ID NO:51的胺基酸序列,且該表位包含:位置178之賴胺酸(Lysine)殘基及位置179之蘇胺酸(Threonine)殘基。
根據本發明的實施例,所述之抗體可以是全長的抗體(如一IgG1或IgG4抗體),或僅包含一抗原結合部分(如一Fab、F(ab’)2或scFv片段),並且可根據需求進行修飾,以改變其功能。
根據本發明的實施例,所述之抗體或其抗原結合片段可與人類PD-L1特異性結合。PD-L1,也稱為CD274或B7同源物1,是一種分子量為40kDa的第1型穿膜蛋白,被認為於特定情況下(如懷孕、組織自體移植、自身免疫性疾病和其它免疫相關疾病等),在抑制免疫系統的作用中扮演很重要的角色。一般來說,當免疫系統遇到外來抗原時,會產生內源性或外源性的危險訊息,以引發抗原特異性CD8+ T細胞和/或CD4+輔助細胞增殖,然而PD-L1與PD-1或B7.1的結合會產生一抑制訊號,從而減少這些T細胞的增殖,並且還可以誘導細胞凋亡,而這進一步的調控是由下調Bcl-2基因所介導。
本說明書中所述的專有名詞“抗體”具有其一般的含義,且包含由二硫鍵相互連接的兩條重鏈(H)與兩條輕鏈(L),每條重鏈包含一含有三個CDR(HCDR1、HCDR2與HCDR3)與四個框架區(framework region,FR)的重鏈可變區(以HCVR或VH表示);每條輕鏈包含一含有三個CDR(LCDR1、LCDR2與LCDR3)與四個FR的輕鏈可變區(以LCVR或VL表示)。在本發明的不同實施例中,抗-PD-L1抗體(或其抗原結合部分)的FR可與人類胚系序列相同,或再經天然或人工修飾。一胺基酸共有序列可基於針對兩個或多個CDR之並列分析(side-by-side analysis)來定義。
本說明書中所述的專有名詞“抗原結合片段”,其包含一可特異性結合一抗原且形成一複合物的抗體的任何片段。一抗原結合片段之非限制性實例包括:(1)Fab片段;(2)F(ab’)2片段;(3)Fd片段;(4)Fv片段;(5)單鏈Fv(single-chain Fv;scFv)分子;(6)dAb片段;及(7)由模擬一抗體的高度變異區的胺基酸殘基(例如一分離的CDR,像是CDR3胜肽或一拘束FR3-CDR3-FR4胜肽)所組成的最小識別單位(minimal recognition unit)。其他經過工程改造的分子,如結構域特異性抗體、單結構域抗體、結構域剔除抗體、嵌合抗體、CDR移植抗體、雙抗體、三抗體、四抗體、微抗體、奈米抗體(例如單價奈米抗體、二價奈米抗體等)、小型模組化免疫藥物(small modular immunopharmaceutical,SMIP)與鯊魚可變IgNAR結構域(shark variable IgNAR domain),也都包含於本說明書所述的“抗原結合片段”語詞表述中。
一抗體的抗原結合片段一般包含至少一個可變結構域。該可變結構域可為具有任何大小或任何胺基酸組成,且通常包含至少一個CDR,其與一個或多個框架序列相鄰或在框架內。在具有與VL結構域相關連的VH結構域的 抗原結合片段中,VH結構域與VL結構域可透過任何合適的排列方式而彼此相對排列,舉例來說,可變區可以是含有VH-VH、VH-VL或VL-VL的二聚體,或者,抗體的抗原結合片段可含有單體的VH或VL結構域。
與完整的抗體分子一樣,抗原結合片段可以是單特異性或多特異性(例如雙特異性)。一抗體的多特異性抗原結合片段通常包含至少兩個不同的可變結構域,其中每個可變結構域都能與一單獨的抗原或同一抗原上的不同表位產生特異性結合。本發明揭示的抗體的抗原結合片段可經由使用本領域的常規技術而形成任何具多特異性的抗體形式,其包括本發明揭示的雙特異性抗體形式。
本發明的抗體可以一種能夠特異性靶定PD-L1的抗體-藥物複合體(ADCs)形式使用。位於ADCs上的綴合物可用於調控表現PD-L1的免疫細胞,或是調控與表現PD-L1之細胞相互作用的細胞(如表現PD-1的細胞),這些ADCs可以使用本發明的任何抗體或其抗原結合片段,與該抗體(或結合片段)複合的藥物(小分子化學藥物)可為ADCs中常用的任何藥物,而複合的方法可為本領域中的通常方法。
當應用於多胜肽時,專有名詞如“基本相似性”或“基本相似”意指經由使用默認空位加權(default gap weight)或BLAST的GAP或BESTFIT程序進行最佳化比對時,兩段胜肽序列之間具有至少95%的序列一致性,甚至可高達98%或99%的序列一致性。根據本發明的實施例,係使用GCG軟體中的GAP與RESTFIT程序與默認參數,以確定彼此緊密相關的多肽間的序列同源性或序列一致性。
在本發明的實施例中,一抗PD-L1抗體或其抗體結合片段係包含一重鏈可變區與一輕鏈可變區,其中該重鏈可變區包含三個CDR:CDRH1(或HCDR1)、CDRH2(或HCDR2)與CDRH3(或HCDR3),而該輕鏈可變區包含三個CDR:CDRL1(或LCDR1)、CDRL2(或LCDR2)與CDRL3(或LCDR3)。
本說明書中所述的專有名詞“PD-1或PD-L1相關疾病”意指一與PD-1/PD-L1訊息傳遞路徑所造成的免疫抑制或耗竭相關的疾病,包括自體免疫性疾病、神經病學失調、中風、癌症(N.Kuol et al.,Immunotherapy,2018,10(2):149-160)。本說明書中所述的專有名詞“治療”意指減輕一疾病或情況的症狀,並非一定為完全治癒。
參照圖1A-1E與2A-2E,於本發明的部分實施例中,該CDRH1包含SEQ ID NO:2的胺基酸序列、該CDRH2包含SEQ ID NO:3的胺基酸序列、該CDRH3包含SEQ ID NO:4的胺基酸序列、該CDRL1包含SEQ ID NO:22的胺基酸序列、該CDRL2包含SEQ ID NO:23的胺基酸序列、而該CDRL3包含SEQ ID NO:24的胺基酸序列。
於本發明的部分實施例中,該CDRH1包含SEQ ID NO:6的胺基酸序列、該CDRH2包含SEQ ID NO:7的胺基酸序列、該CDRH3包含SEQ ID NO:8的胺基酸序列、該CDRL1包含SEQ ID NO:26的胺基酸序列、該CDRL2包含SEQ ID NO:27的胺基酸序列、而該CDRL3包含SEQ ID NO:28的胺基酸序列。
於本發明的部分實施例中,該CDRH1包含SEQ ID NO:10的胺基酸序列、該CDRH2包含SEQ ID NO:11的胺基酸序列、該CDRH3包含SEQ ID NO:12的胺基酸序列、該CDRL1包含SEQ ID NO:30的胺基酸序列、該CDRL2 包含SEQ ID NO:31的胺基酸序列、而該CDRL3包含SEQ ID NO:32的胺基酸序列。
於本發明的部分實施例中,該CDRH1包含SEQ ID NO:14的胺基酸序列、該CDRH2包含SEQ ID NO:15的胺基酸序列、該CDRH3包含SEQ ID NO:16的胺基酸序列、該CDRL1包含SEQ ID NO:34的胺基酸序列、該CDRL2包含SEQ ID NO:35的胺基酸序列、而該CDRL3包含SEQ ID NO:36的胺基酸序列。
於本發明的部分實施例中,該CDRH1包含SEQ ID NO:18的胺基酸序列、該CDRH2包含SEQ ID NO:19的胺基酸序列、該CDRH3包含SEQ ID NO:20的胺基酸序列、該CDRL1包含SEQ ID NO:38的胺基酸序列、該CDRL2包含SEQ ID NO:39的胺基酸序列、而該CDRL3包含SEQ ID NO:40的胺基酸序列。
於本發明的部分實施例中,所述之抗-PD-L1抗體或其抗原結合片段,包含一含有SEQ ID NO:1的胺基酸序列的重鏈可變區,與一含有SEQ ID NO:21的胺基酸序列的輕鏈可變區。更佳的,該重鏈可變區係由SEQ ID NO:41的核苷酸序列編碼,而該輕鏈可變區係由SEQ ID NO:46的核苷酸序列編碼。
於本發明的部分實施例中,一抗-PD-L1抗體或其抗原結合片段,包含一含有SEQ ID NO:5的胺基酸序列的重鏈可變區,與一含有SEQ ID NO:25的胺基酸序列的輕鏈可變區。更佳的,該重鏈可變區係由可SEQ ID NO:45的核苷酸序列編碼,而該輕鏈可變區係由SEQ ID NO:47的核苷酸序列編碼。
於本發明的部分實施例中,一抗-PD-L1抗體或其抗原結合片段,包含一含有SEQ ID NO:9的胺基酸序列的重鏈可變區,與一含有SEQ ID NO:29的胺基酸序列的輕鏈可變區。更佳的,該重鏈可變區係由SEQ ID NO:49的核苷酸序列編碼,而該輕鏈可變區係由SEQ ID NO:48的核苷酸序列編碼。
於本發明的部分實施例中,一抗-PD-L1抗體或其抗原結合片段,包含一含有SEQ ID NO:13的胺基酸序列的重鏈可變區,與一含有SEQ ID NO:33的胺基酸序列的輕鏈可變區。更佳的,該重鏈可變區係由SEQ ID NO:44的核苷酸序列編碼,而該輕鏈可變區係由SEQ ID NO:43的核苷酸序列編碼。
於本發明的部分實施例中,一抗-PD-L1抗體或其抗原結合片段,包含一含有SEQ ID NO:17的胺基酸序列的重鏈可變區,與一含有SEQ ID NO:37的胺基酸序列的輕鏈可變區。更佳的,該重鏈可變區係由SEQ ID NO:42的核苷酸序列編碼,而該輕鏈可變區係由SEQ ID NO:50的核苷酸序列編碼。
本發明的抗體係經由ELISA確認其與PD-L1間的特異性結合。簡言之,先將PD-L1塗覆於96孔的ELISA孔盤(0.1μg/孔),經抗-PD-L1抗體結合後,使用帶有辣根過氧化物酶(horse radish peroxidase,HRP)的山羊抗小鼠IgG做為二級抗體,再使用3,3’,5,5’-四甲基聯苯胺(Tetramethylbenzidine,TMB)做為呈色劑,以檢測抗體與PD-L1的結合,並以OD405下的吸光值做為評估標準。
如圖3A所示,經小鼠融合瘤生產的多種抗-人類PD-L1抗體(1E12、3F11、8H3、3E10與5E6單株抗體)均顯示出可與PD-L1產生具特異性的緊密結合,圖3B也顯示該些抗體經BIAcore T200(GE Healthcare)所測得的結合參數與親和力。簡言之,將一CM5 BIAcore晶片與人類PD-L1一起塗覆於活化通道,再以不同濃度的小鼠融合瘤抗-人類PD-L1抗體(1E12、3F11、8H3、3E10與5E6單株抗體)及其變體,依次注射至活性通道中,並以一僅使用緩衝液注射的通道做為空白控制組;而親合力係以單循環動力學方法測定,經由BIAcore T200評估軟體將所得數據與1:1結合模型擬合,以獲得動力學常數(Ka:結合常數;Kd:解離常數;KD=Ka/Kd)。
本發明的抗體可與人類PD-L1間產生具特異性的緊密結合,表示該些抗體應可干擾PD-1與PD-L1間的結合,因此使用ELISA檢測本發明的各種抗體阻斷PD-1與PD-L1結合的能力。首先,將PD-L1-Fc塗覆於96孔盤上(100ng/每孔),並於每孔加入5μg的PD-1-生物素與不同濃度的抗-人類-PD-L1抗體,並於37℃下反應1小時以進行結合,接著經PBS沖洗後,加入帶有HRP的鏈黴親合素,再以TMB進行呈色,並以OD405下所測得之吸光值定量與PD-L1-Fc結合的PD-1-生物素。
如圖4A所示,本發明的單株抗體(如1E12與3F11)可有效的阻斷PD-1與PD-L1的結合,而控制組的小鼠IgG則無法阻斷該結合。相同的,圖4B亦顯示單株抗體3E10、8H3與5E6可干擾PD-1與PD-L1的結合,而控制組的小鼠IgG也一樣無法阻斷該結合。
除了如上述實驗於體外測試本發明的抗體與PD-L1分子間的結合,同時亦於分別表現PD-1或PD-L1且相互作用的細胞上進行相關的結合測試。舉例而言,可使用任一商業上可獲得的試劑組,例如構自Promega(Maddison,WI,USA)的試劑套組,進行PD-1/PD-L1的阻斷試驗。Promega所提供的PD-1/PD-L1阻斷生物性檢驗是一種細胞型的生物發光檢測,此檢測試劑組中含有兩種經基因工程的細胞株:(1)PD-1作用細胞,為一種表現人類PD-1與一由NFAT反應子(NFAT response element,NFAT-RE)驅動之螢光素酶報告基因(luciferase reporter)的Jurkat T細胞;(2)PD-L1 aAPC/CHO-K1細胞,為一種表現 人類PD-L1與一以抗原非依賴性方式活化同源TCR之基因工程細胞表面蛋白的CHO-K1細胞。
當將該兩種細胞共培養時,PD-1/PD-L1間的交互作用會抑制TCR的訊息傳遞與由NFAT-RE驅動的生物發光,此時加入本發明的抗-PD-L1抗體以阻斷PD-1/PD-L1的交互作用,而釋放抑制訊號,進而促進TCR的活化以及由NART-RE驅動的生物發光,後續使用Bio-GloTM螢光素酶分析系統與常規的發光計(例如,購自Promega的GloMax® Discover system)進行生物發光信號的檢測與定量。
如圖5所示,本發明的單株抗體,如1E12、3F11、3E10與8H3,皆顯示出具有阻斷PD-1/PD-L1交互作用的特異性與有效活性,且本發明的其他抗體也顯示出類似的活性,這些結果證實,本發明之抗體可有效減輕因細胞間PD-1與PD-L1的交互作用所造成的免疫抑制。因此,本發明的抗體應可做為一種治療劑,用於因PD-1與/或PD-L1訊息傳遞所造成之免疫抑制或耗竭而引發的相關疾病。此類疾病包括各種癌症。
為了進一步驗證本發明的抗體於癌症治療中的效用,遂檢測該些抗體與表現於癌症細胞上之PD-L1間的結合能力。例如,使用高度表現PD-L1之HCC827細胞(肺腺癌),透過流式細胞儀檢測抗-PD-L1抗體與PD-L1表現細胞間的結合。簡言之,將HCC827細胞(具高PD-L1表現量)與抗-PD-L1抗體共培養1小時,再以流式細胞儀進行分析。如圖6所示,本發明的單株抗體1E12、3E10、3F11與8H3,可與HCC827細胞結合,表示該些抗體皆可辨認癌細胞表面上的PD-L1。本發明的其他抗體也顯示出類似的活性。因此,本發明的抗體 可用於治療癌症,透過與癌細胞表面上的PD-L1結合,進而抑制PD-L1所造成的免疫抑制或耗竭。
除了阻斷PD-1/PD-L1交互作用外,與PD-L1結合的抗體也可促進受體的細胞內化/回收,受體的細胞內化或回收也能使PD-L1無法與PD-1產生作用。因此,進一步檢測本發明的抗-PD-L1抗體是否具有促使PD-L1被細胞內化的能力。簡言之,為了瞭解此等PD-L1的阻斷/回收過程,係將MDA-MB-231細胞(人類乳腺癌細胞株,為一種上皮細胞)以1μg/mL抗-PD-L1抗體,於4℃與37℃下進行處理,並監測24小時。然後,並於不同的時間點,使用流式細胞儀分析。
如圖7A與7B所示,單株抗體1E12、3F11可與MDA-MB-231細胞結合並被其內化,且內化現象只發生於37℃而非4℃,並呈時間相關性。這些結果表示,本發明的抗體藉由與PD-L1結合而阻斷PD-1/PD-L1,並且能促使PD-L1被細胞內化,受器內化可使PD-L1無法作用,而阻斷PD-L1相關的訊息傳遞路徑,比僅與PD-L1結合更有效,因此,本發明的抗體可更有效的治療PD-L1相關的癌症或疾病。
因為本發明的抗-PD-L1抗體可與PD-L1產生具特異性的緊密結合,因此亦可用於檢測於多種癌細胞中高量表現的PD-L1。如圖8所示,於人類組織樣本中進行之抗-PD-L1抗體3F11的免疫組織化學染色顯示,在正常組織中,只呈現微弱的染色(例如扁桃體和平滑肌),而肺癌組織則呈很強烈的染色。以上結果表示,本發明的抗-PD-L1抗體可用於檢測出可表現PD-L1的細胞或組織,例如癌細胞。因此,該些抗體可做為診斷劑,用以檢測癌症和用於治療期間和/或治療後的癌症預測/監測。
上述的實施例清楚的顯示,本發明的抗-PD-L1抗體可與PD-L1產生特異性的緊密結合。該些抗體亦能夠干擾PD-1與PD-L1間的交互作用,並阻斷PD-1/PD-L1的結合。除此之外,該些抗體亦可促使PD-L1的細胞內化,使PD-L1無法與PD-1結合。因此,本發明的抗體可做為治療與PD-1/PD-L1交互作用相關疾病的有效治療劑。此類相關疾病包括(例如)癌症。而癌症之實例可包括但不限於:肺癌、乳癌、前列腺癌、大腸直腸癌等。另外,本發明的抗體可做為檢測PD-L1的試劑,其可用於診斷PD-L1的表現或用於治療期間中的預後。
本發明的某些實施例係關於一種用於治療或減輕由PD-1和/或PD-L1訊息傳遞路徑所引起的相關疾病之病症/症狀的方法;此類疾病可包括癌症。為了檢測本發明的抗體用於治療癌症的效用,因此使用鼠同源模型加以驗證。簡言之,於第0天,將MC38細胞(大腸腺癌細胞)經皮下注射至C51BL/6小鼠;於第6、9、13天,將小鼠以本發明的抗體(如1E12、3F11、3E10與8H3)處理,每次的劑量皆為5mpk(mg/kg),並以一IgG(非抗-PD-L1)做為控制組,且監測各組的腫瘤生長直至第16天。
如圖9所示,本發明的抗-PD-L1單株抗體(例如,1E12、3F11、3E10及8H3)可於此體內大腸直腸癌模型中有效抑制腫瘤生長。本發明的其他抗體也具有類似的功效。這些結果清楚的說明,本發明的抗體具有用於治療癌症的臨床用途,像是用於肺癌、乳癌、前列腺癌、大腸直腸癌等。
此外,本發明的抗體對人類PD-L1具有高度特異性,該些抗體以可高特異性與高親和力辨識獨特的表位,也因此特性,使得該些抗體可更有利於做為治療劑使用。的確,於MDA-MB231乳癌細胞的小鼠異種移植模型中, 本發明的抗體(3F11與1E12)會隨時間而積聚於腫瘤中,換言之,其結合強度會隨時間增加至120小時而遞增。相反的,FDA批准的抗體Atezolizumab則沒有足夠的結合親留力(binding avidity),而分布於整個動物體內。其結果也顯示,Atezolizumab相對上會較快被系統清除,且於第120小時,已無太多的結合。因為本發明的抗體可緊密的與癌細胞結合,因此很少的抗體會出現於循環系統而被系統清除,也因此,本發明的抗體具有更長的體內半衰期。綜上所述,本發明的抗體可以較低的劑量與較低的給藥頻率方式使用,如此可顯著的降低治療成本,並使任何潛在的不良反應減至最小。
與現存的抗-PD-L1抗體相比,本發明的抗體具有更優的藥物代謝動力學特性(例如,更高的親留力及更長的半衰期),此特性似乎是由於其與人類PD-L1上不同表位結合。根據表位圖譜,本發明的抗體係與人類PD-L1上位於包含殘基171-180及206-210之區域內的表位結合,這些殘基區域與目前已知抗體的結合表位不同,舉例來說,現有的抗體(如Atezolizumab、Durvalumab)其主要與PD-L1上的殘基E58與R125結合(Lee et al.,Scientific Reports,(2017),7:5532)。
使用丙胺酸掃描進一步分析與本發明抗體結合的表位位置,其結果顯是殘基178與179對於結合是特別重要,如下表所示:
Figure 108124494-A0305-02-0019-1
O:不影響結合-:影響結合
綜上所述,本發明的抗體可與PD-L1產生特異性的緊密結合,包含細胞表面上的PD-L1。表現PD-L1的細胞包含癌細胞,例如肺癌細胞、大腸直腸癌細胞(如MC38細胞)、乳癌細胞(MDA-MB-231細胞)等,該些抗體可干擾PD-1與PD-L1的結合,以阻斷PD-1和/或PD-L1的訊息傳遞路徑。除此之外,本發明的抗體與PD-L1結合後,還可促使PD-L1被細胞內化,使PD-L1無法與PD-1產生作用,且結果也顯示,本發明的抗體可減輕或逆轉因PD-1和/或PD-L1訊息傳遞路徑所造成的免疫抑制或耗竭。因此,本發明的抗體可做為用於治療或減輕由PD-1和PD-L1交互作用所引起的免疫抑制或耗竭相關疾病之病症的治療劑。
本發明抗體與人類PD-L1上的未知表位結合,且與該些新表位結合可產生不可預期的高特異性與親留力,進而提升其與腫瘤細胞結合的藥物代謝動力學特性(例如更集中的結合於腫瘤細胞上,而非游離於循環系統中,以及更長的半衰期)。因此,本發明的抗體可以較低的劑量與較低的給藥頻率方式使用,藉以降低治療成本與副作用,並增加患者的使用意願。
雖然以有限數量的實施例說明本發明的實施方式,本領域具通常知識的技術人員仍有可能加以修改或變化,因此本發明的保護範圍應只受專利範圍限制,而非受限於上述實施例。
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<213> Mus musculus
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<212> PRT
<213> Mus musculus
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<212> PRT
<213> Mus musculus
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<212> PRT
<213> Mus musculus
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<212> PRT
<213> Mus musculus
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<212> PRT
<213> Mus musculus
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<213> Mus musculus
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<213> Mus musculus
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<212> PRT
<213> Mus musculus
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Figure 108124494-A0305-02-0031-39
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<212> PRT
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Figure 108124494-A0305-02-0032-43
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<212> PRT
<213> Mus musculus
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Figure 108124494-A0305-02-0032-44
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<213> Mus musculus
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Figure 108124494-A0305-02-0032-45
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Figure 108124494-A0305-02-0033-46
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Figure 108124494-A0305-02-0033-47
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<213> Mus musculus
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<213> Mus musculus
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<212> PRT
<213> Mus musculus
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Figure 108124494-A0305-02-0035-51
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<212> PRT
<213> Mus musculus
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Figure 108124494-A0305-02-0035-53
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<212> PRT
<213> Mus musculus
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Figure 108124494-A0305-02-0035-54
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<212> DNA
<213> Mus musculus
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Figure 108124494-A0305-02-0035-55
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<213> Mus musculus
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Figure 108124494-A0305-02-0036-57
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<212> DNA
<213> Mus musculus
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<212> DNA
<213> Mus musculus
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Figure 108124494-A0305-02-0036-59
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<212> DNA
<213> Mus musculus
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Figure 108124494-A0305-02-0037-62
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<212> DNA
<213> Mus musculus
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Figure 108124494-A0305-02-0037-63
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<212> DNA
<213> Mus musculus
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Figure 108124494-A0305-02-0038-66
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<212> DNA
<213> Mus musculus
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Figure 108124494-A0305-02-0038-68
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<212> DNA
<213> Mus musculus
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Figure 108124494-A0305-02-0038-70
Figure 108124494-A0305-02-0039-71
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<212> DNA
<213> Mus musculus
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Figure 108124494-A0305-02-0039-72
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<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 51
Figure 108124494-A0305-02-0039-73
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Figure 108124494-A0305-02-0041-76

Claims (9)

  1. 一種抗-人類PD-L1抗體或其抗原結合片段,係特異性結合人類PD-L1(SEQ ID NO:51)之殘基171-180及206-210結合表位,其包含(a)一具有SEQ ID NO:2序列的HCDR1、一具有SEQ ID NO:3序列HCDR2、一具有SEQ ID NO:4序列的HCDR3,與一具有SEQ ID NO:22序列的LCDR1、一具有SEQ ID NO:23序列的LCDR2、一具有SEQ ID NO:24序列的LCDR3;(b)一具有SEQ ID NO:6序列的HCDR1、一具有SEQ ID NO:7序列的HCDR2、一具有SEQ ID NO:8序列的HCDR3,與一具有SEQ ID NO:26序列的LCDR1、一具有SEQ ID NO:27序列的LCDR2、一具有SEQ ID NO:28序列的LCDR3;(c)一具有SEQ ID NO:10序列的HCDR1、一具有SEQ ID NO:11序列HCDR2、一具有SEQ ID NO:12序列的HCDR3,與一具有SEQ ID NO:30序列的LCDR1、一具有SEQ ID NO:31序列的LCDR2、一具有SEQ ID NO:32序列的LCDR3;(d)一具有SEQ ID NO:14序列的HCDR1、一具有SEQ ID NO:15序列的HCDR2、一具有SEQ ID NO:16序列的HCDR3,與一具有SEQ ID NO:34序列的LCDR1、一具有SEQ ID NO:35序列的LCDR2、一具有SEQ ID NO:36序列的LCDR3;或(e)一具有SEQ ID NO:18序列的HCDR1、一具有SEQ ID NO:19序列的HCDR2、一具有SEQ ID NO:20序列的HCDR3,與一具有SEQ ID NO:38序列的LCDR1、一具有SEQ ID NO:39序列的LCDR2、一具有SEQ ID NO:40序列的LCDR3。
  2. 如請求項1中所述之抗-人類PD-L1抗體或其抗原結合片段,其中a.該重鏈可變區包含SEQ ID NO:1的序列,且該輕鏈可變區包含SEQ ID NO:21的序列; b.該重鏈可變區包含SEQ ID NO:5的序列,且該輕鏈可變區包含SEQ ID NO:25的序列;c.該重鏈可變區包含SEQ ID NO:9的序列,且該輕鏈可變區包含SEQ ID NO:29的序列;d.該重鏈可變區包含SEQ ID NO:13的序列,且該輕鏈可變區包含SEQ ID NO:33的序列;或e.該重鏈可變區包含SEQ ID NO:17的序列,且該輕鏈可變區包含SEQ ID NO:37的序列。
  3. 如請求項1-2中任一所述之抗-人類PD-L1抗體或其抗原結合片段,其中該抗體或其抗原結合片段可抑制PD-L1相關之訊息傳遞路徑。
  4. 如請求項1-2中任一所述之抗-人類PD-L1抗體或其抗原結合片段,可進一步包含一藥物複合物,係以共價鍵與該抗體或其抗原結合片段形成一抗體-藥物複合體(ADC)。
  5. 如請求項1-2中任一所述之抗-人類PD-L1抗體或其抗原結合片段,其中該抗體或其抗原結合片段係與一第二抗體結合片段形成一雙特異性抗體。
  6. 一種用於治療PD-1或PD-L1相關疾病的醫藥組合物,其中該醫藥組合物包含任一如請求項1-5中之抗-人類PD-L1抗體或其抗原結合片段與一醫藥學上可接受之載體。
  7. 如請求項6所述之醫藥組合物,其中該疾病為一癌症。
  8. 如請求項6中所述之醫藥組合物,其中該癌症為肺癌、乳癌、前列腺癌或大腸直腸癌。
  9. 一種檢測PD-L1表現量的方法,包含將一樣品與如請求項1-5中任一之該抗-人類PD-L1抗體或其抗原結合片段接觸。
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