TWI648288B

TWI648288B - 寡核苷酸螯合複合物之調配物、用途及方法

Info

Publication number: TWI648288B
Application number: TW102117593A
Authority: TW
Inventors: 米歇爾巴茲涅; Michel Bazinet; 安德魯維隆; Andrew Vaillant
Original assignee: 加拿大商雷普利可公司; Replicor Inc.
Priority date: 2012-05-18
Filing date: 2013-05-17
Publication date: 2019-01-21
Also published as: SG11201407261XA; EA201401276A1; CN104379152A; BR112014028568B1; IN2014DN08982A; SI2849760T1; AU2013262415A1; US9616083B2; JP2018058853A; JP6294308B2; CA2873526C; CO7131388A2; TW201408689A; DOP2014000263A; EA034799B1; IL235402B; CN104379152B; PT2849760T; LT2849760T; ES2767333T3

Abstract

本發明描述用寡核苷酸螯合複合物治療病毒感染、高膽固醇血症、高三酸甘油酯血症、阿茲海默症(Alzheimer's disease)、普里昂(prion)疾病及裘馨氏肌肉萎縮(Duchene's muscular dystrophy)之醫藥組合物及方法。

Description

寡核苷酸螯合複合物之調配物、用途及方法

相關申請案之交叉引用

本申請案主張2012年5月18日申請之美國臨時申請案第61/648,694號之優先權，其全部內容以引用的方式併入本文中。

本發明係關於治療疾病之方法，其涉及投與或使用寡核苷酸(ON)螯合複合物。該等疾病可包括病毒感染、高膽固醇血症、高三酸甘油酯血症、阿茲海默症、普里昂(prion)疾病或裘馨氏肌肉萎縮。

ON螯合物複合物為由二價或多價金屬陽離子以分子間方式連接之兩個或兩個以上ON。ON螯合複合物中和ON之固有螯合性，該固有螯合性會導致該等化合物之投藥相關副作用。ON螯合物複合物之投藥為新穎的投與個體ON之方法，其中與未螯合之ON(其為以如在項技術中常用之鈉鹽形式投與之ON)有關之投藥相關副作用減少。該等副作用可包括靜脈內輸注情況下之顫抖、發熱及發冷，或皮下投藥情況下注射部位處之硬化、炎症及疼痛。此外，藉由將ON製備為螯合複合物，其藥物動力學性質可得到改良，從而與如國際申請公開案第WO 2012/021985及美國申請公開案第2012/0046348號(其以全文引用的方式併入本文中)中所描述之未螯合之ON相比在類似給藥下提供增加之治療效能。

因此需要提供藉由序列依賴性或非序列依賴性機制起作用之ON 螯合複合物，其具有針對多種疾病病況(包括病毒感染、高膽固醇血症、高三酸甘油酯血症、阿茲海默症或普里昂疾病)之治療作用且引起與ON投藥相關之常見副作用之減少或消除。

因此，此項技術中需要提供治療上述疾病病況之方法，其包含投與需要治療之個體包含ON螯合複合物之醫藥組合物。

根據本說明，現提供藉由投與呈螯合複合物形式之寡核苷酸來治療任何可受寡核苷酸治療影響之疾病病況的方法。

根據本說明書，現提供調配為螯合複合物之寡核苷酸之用途，其係用於治療任何可受寡核苷酸治療影響之疾病病況。

根據本說明書，現提供調配為螯合複合物之寡核苷酸之用途，其係用於製造用以治療任何可受寡核苷酸治療影響之疾病病況的藥劑。

提供一種治療病毒感染之方法，其包含投與需要治療之個體抗病毒ON螯合複合物之步驟。

提供一種抗病毒ON螯合複合物之用途，其係用於治療病毒感染。

提供一種抗病毒ON螯合複合物之用途，其係用於製造用以治療病毒感染之藥劑。

在一個實施例中，抗病毒寡核苷酸螯合複合物包含至少一個選自SEQ ID NO：1-6或SEQ ID NO：10-18之寡核苷酸。

提供一種治療高膽固醇血症之方法，其包含投與需要治療之個體抗膽固醇ON螯合複合物之步驟。

在一個實施例中，抗膽固醇寡核苷酸螯合複合物包含至少一個選自SEQ ID NO：1、2、3、5、6、10、11、12、15、16或17之寡核苷酸。

提供一種治療高三酸甘油酯血症之方法，其包含投與需要治療之個體抗三酸甘油酯ON螯合複合物之步驟。

提供一種治療阿茲海默症之方法，其包含投與需要治療之個體抗阿茲海默ON螯合複合物之步驟。

提供一種治療普里昂疾病之方法，其包含投與需要治療之個體抗普里昂ON螯合複合物之步驟。

提供一種治療由mRNA成熟期間之錯誤剪接引起之疾病(其包括裘馨氏肌肉萎縮(DMD))的方法，其包含投與經設計以校正DMD中之錯誤剪接之ON螯合複合物之步驟。

提供一種抗病毒ON螯合複合物之用途，其係用於製造用以治療病毒感染之藥劑。在一個實施例中，抗病毒寡核苷酸螯合複合物包含至少一個選自SEQ ID NO：1-6或SEQ ID NO：10-18之寡核苷酸。

提供一種抗膽固醇ON螯合複合物之用途，其係用於治療高膽固醇血症。

提供一種抗膽固醇ON螯合複合物之用途，其係用於製造用以治療高膽固醇血症之藥劑。

提供一種抗三酸甘油酯ON螯合複合物之用途，其係用於治療高三酸甘油酯血症。

提供一種抗三酸甘油酯ON螯合複合物之用途，其係用於製造用以治療高三酸甘油酯血症之藥劑。

在一個實施例中，抗三酸甘油酯寡核苷酸螯合複合物包含至少一個選自SEQ ID NO：1、2、3、5、6、10、11、12、15、16或17之寡核苷酸。

提供一種抗阿茲海默症ON螯合複合物之用途，其係用於治療阿茲海默症。

提供一種抗阿茲海默症ON螯合複合物之用途，其係用於製造用以治療阿茲海默症之藥劑。

提供一種抗普里昂ON螯合複合物之用途，其係用於治療普里昂疾病。

提供一種抗普里昂ON螯合複合物之用途，其係用於製造用以治療普里昂疾病之藥劑。

提供一種經設計以校正DMD中之錯誤剪接之ON螯合複合物之用途，其係用於治療由mRNA成熟期間之錯誤剪接引起之疾病(其包括裘馨氏肌肉萎縮(DMD))。

提供一種經設計以校正DMD中之錯誤剪接之ON螯合複合物之用途，其係用於製造用以治療由mRNA成熟期間之錯誤剪接引起之疾病(其包括裘馨氏肌肉萎縮(DMD))的藥劑。

提供一種治療高膽固醇血症之方法，該方法包含投與包含SEQ ID NO：20之寡核苷酸螯合複合物。

提供一種包含SEQ ID NO：20之寡核苷酸螯合複合物之用途，其係用於治療高膽固醇血症。

提供一種包含SEQ ID NO：20之寡核苷酸螯合複合物之用途，其係用於製造用以治療高膽固醇血症之藥劑。

提供一種治療裘馨氏肌肉萎縮之方法，該方法包含投與包含SEQ ID NO：19之寡核苷酸螯合複合物。

提供一種包含SEQ ID NO：19之寡核苷酸螯合複合物之用途，其係用於治療裘馨氏肌肉萎縮。

提供一種包含SEQ ID NO：19之寡核苷酸螯合複合物之用途，其係用於製造用以治療裘馨氏肌肉萎縮之藥劑。

提供一種治療C型肝炎感染之方法，該方法包含投與包含SEQ ID NO：7之寡核苷酸螯合複合物。

提供一種包含SEQ ID NO：7之寡核苷酸螯合複合物之用途，其係用於治療C型肝炎感染。

提供一種包含SEQ ID NO：7之寡核苷酸螯合複合物之用途，其係用於製造用以治療C型肝炎感染之藥劑。

提供一種包含抗病毒寡核苷酸螯合複合物之醫藥調配物，其係用於治療病毒感染。

提供一種包含抗膽固醇寡核苷酸螯合複合物之醫藥調配物，其係用於治療高膽固醇血症。

提供一種包含抗三酸甘油酯寡核苷酸螯合複合物之醫藥調配物，其係用於治療高三酸甘油酯血症。

提供一種包含抗阿茲海默症寡核苷酸螯合複合物之醫藥調配物，其係用於治療阿茲海默症。

提供一種包含抗普里昂寡核苷酸螯合複合物之醫藥調配物，其係用於治療普里昂疾病。

提供一種包含螯合複合物之醫藥調配物，其係用於治療高膽固醇血症，其中該螯合複合物包含SEQ ID NO：20。

提供一種包含螯合複合物之醫藥調配物，其係用於治療裘馨氏肌肉萎縮，其中該螯合複合物包含SEQ ID NO：19。

提供一種包含螯合複合物之醫藥調配物，其係用於治療C型肝炎感染，其中該螯合複合物包含SEQ ID NO：7。

在一個實施例中，寡核苷酸螯合複合物係藉由二價金屬陽離子製備。

在另一實施例中，寡核苷酸螯合複合物係藉由鈣製備。

在另一實施例中，寡核苷酸螯合複合物係藉由鎂製備。

在另一實施例中，寡核苷酸螯合複合物係藉由鐵(2+)、錳、銅及/或鋅製備。

在另一實施例中，寡核苷酸螯合複合物包含兩種或兩種以上不同二價金屬陽離子。

在另一實施例中，寡核苷酸螯合複合物包含鈣及鎂。

在另一實施例中，寡核苷酸螯合複合物包含至少一個雙股寡核苷酸。

在另一實施例中，寡核苷酸螯合複合物包含至少一個具有至少一個硫代磷酸鍵之寡核苷酸。

在另一實施例中，寡核苷酸螯合複合物包含至少一個完全硫代磷酸化寡核苷酸。

在另一實施例中，寡核苷酸螯合複合物包含至少一個具有一個經2'修飾之核糖之寡核苷酸。

在另一實施例中，寡核苷酸螯合複合物包含至少一個其中各核糖均經2' O-甲基化之寡核苷酸。

在另一實施例中，寡核苷酸螯合複合物包含至少一個具有至少一個5'甲基胞嘧啶之寡核苷酸。

在另一實施例中，寡核苷酸螯合複合物包含至少一個其中各胞嘧啶均為5'甲基胞嘧啶之寡核苷酸。

在另一實施例中，寡核苷酸螯合複合物含有至少一個經完全硫代磷酸化且其中所有核糖均具有2' O甲基修飾且所有胞嘧啶均呈5'甲基胞嘧啶形式之寡核苷酸。

在另一實施例中，寡核苷酸螯合複合物包含至少一個選自SEQ ID NO：1-6或SEQ ID NO：10-18之寡核苷酸。

在另一實施例中，寡核苷酸螯合複合物經調配以用於皮下投藥。

在另一實施例中，寡核苷酸螯合複合物經調配以用於靜脈內輸注。

在另一實施例中，寡核苷酸螯合複合物經調配以用於藉由選自由以下方式組成之群之方式投藥：眼內投藥、口服攝取、經腸投藥、吸入、肌肉內注射、腹膜內注射、鞘內注射、鞘內輸注、氣管內投藥、靜脈內注射及局部投藥。

在另一實施例中，寡核苷酸螯合複合物經調配以用於噴霧投藥。

在另一實施例中，引起感染之病毒為B型肝炎病毒。

在另一實施例中，引起感染之病毒為嗜肝DNA病毒。

在另一實施例中，引起感染之病毒為D型肝炎病毒。

在另一實施例中，引起感染之病毒為流行性感冒病毒。

在另一實施例中，引起感染之病毒係選自由以下組成之群：逆轉錄病毒科(retroviridae)之成員、HIV-1、HIV-2、疱疹病毒科(herpesviridae)之成員、HSV-1、HSV-2、細胞巨大病毒、痘病毒科(poxviridae)之成員、副黏病毒科(paramyxoviridae)之成員、呼吸道融合性病毒、副流感病毒、布尼亞病毒科(bunyaviridae)之成員、漢他病毒(hantavirus)、絲狀病毒科(filoviridae)之成員、伊波拉病毒(Ebola virus)、馬堡病毒(Marburg virus)、黃病毒科(flaviviridae)之成員、黃熱病病毒、登革熱病毒(dengue virus)、西尼羅河病毒(West Nile virus)、C型肝炎病毒、正黏病毒科(orthomyxoviridae)之成員、披衣病毒科(togaviridae)之成員、冠狀病毒科(coronaviridae)之成員、棒狀病毒科(rhabdoviridae)之成員及沙粒病毒科(arenaviridae)之成員。

在另一實施例中，寡核苷酸螯合複合物包含SEQ ID NO：2(REP 2055)。

在另一實施例中，寡核苷酸螯合複合物包含SEQ ID NO：18(REP 2139)。

在另一實施例中，寡核苷酸螯合複合物包含SEQ ID NO：11(REP 2148)。

現將參考隨附圖式：

圖1說明ON之常見生理化學特徵。A)藉由高效液相層析共同分離REP 2006及具有所定義序列之21單元型硫代磷酸化ON。B)藉由質譜分析鑑別21單元型ON中之物質。C)藉由質譜分析鑑別REP 2006 ON中之物質。

圖2A說明不依賴於ON序列之ON之一般化學特徵。與序列無關，任何ON均呈具有疏水性及親水性活性之聚合物形式。硫代磷酸化(此圖中之化學結構中描繪)用於增加ON聚合物之疏水性但不影響親水性。圖2B將二價及三價金屬陽離子之ON螯合作用之性質概念化。金屬陽離子(由灰色實心圓形表示)經由磷酸二酯鍵中兩個或三個非橋氧或硫原子之間的金屬離子橋(由省略號表示)分子間連接ON聚合物之親水性表面。

圖3說明在二價或多價金屬陽離子存在下於不同ON及二價金屬陽離子濃度下ON之溶液性質之模型。A)低二價/三價金屬陽離子、低ON濃度產生二聚體或低階ON螯合複合物。B)增加二價/三價金屬陽離子濃度可引起溶液中更完全的ON螯合複合物形成。C)在二價或三價金屬存在下進一步增加ON濃度能夠產生具有增加之金屬濃度之更高階的ON螯合複合物。(A)至(C)中之所有螯合複合物均借助於具有仍暴露於水性環境之親水性表面而可溶於水溶液中，因此保持可溶性。D)在充足的ON及金屬濃度下，所有親水性表面現均限制於ON螯合複合物內，僅保留疏水性表面暴露於水性環境。此引起ON螯合複合物沈澱。

圖4說明螢光-ON螯合複合物之溶液性質對螢光偏振之作用。在增加之金屬濃度下，ON螯合複合物形成之尺寸(及質量)亦增加(參見圖3)且因此在溶液中更緩慢地滾動。溶液中複合物之此滾動減緩引起螢光偏振增加及mP值提高。

如國際申請公開案第2012/021985號及美國申請公開案第2012/0046348號(其內容以全文引用的方式併入本文中)中所描述，含有任何二價簡單金屬陽離子(諸如(但不限於)Ca²⁺、Mg²⁺及Fe²⁺)之水溶液中之ON均不以鹽形式存在，而以ON之螯合複合物形式存在。該等複合物包含ON二聚體或更高階分子團，其中ON係經由二價金屬離子橋在其磷酸二酯主結構處連接(參見圖2B)。在特定ON及金屬陽離子濃度下，該等螯合複合物在水溶液中穩定且可溶且有效地使ON螯合複合物中之任何二價陽離子藉由溶液相互作用而螯合。此螯合複合物形成亦可使用具有3+電荷或更大電荷之簡單金屬陽離子進行(如圖2B中描繪)。因此，ON充當多價金屬陽離子螯合劑且不與多價金屬陽離子形成鹽。

ON螯合複合物可含有不同的多價金屬陽離子，包括鈣、鎂、鈷、鐵、錳、鋇、鎳、銅、鋅、鎘、汞及鉛。亦進一步證明該等多價金屬陽離子之螯合引起形成ON螯合複合物，其包含兩個或兩個以上由金屬陽離子連接之ON且在ON長度大於6個核苷酸及具有磷酸二酯或硫代磷酸酯鍵聯之ON存在下發生。可視情況將ON之各鍵聯硫代磷酸化。螯合作用亦在含有核糖處之2'修飾(諸如2' O甲基)或含有經修飾之鹼基(5'甲基胞嘧啶或4-硫尿嘧啶)之ON情況下發生。該等2'修飾可存在於一或多個或所有核糖上且經修飾之鹼基可存在於一或多個鹼基上或全體存在於各鹼基上(亦即所有胞嘧啶均呈5'甲基胞嘧啶形式)。此外，ON螯合複合物可包含含有多個修飾之ON，諸如各鍵聯均經硫代磷酸化、各核糖經2'修飾及各鹼基經修飾。與ON螯合複合物形成相容之ON修飾進一步定義於下文中。此外，金屬陽離子之螯合作用不依賴於所存在之核苷酸之序列，但改為依賴於對所有ON共有之生理化學特徵(參見圖2A)。

儘管ON螯合複合物之形成可用任何二價金屬陽離子實現，但意欲用作藥物之ON螯合複合物應較佳僅含有鈣及/或鎂，但亦可含有微量的鐵、錳、銅或鋅且不應包括鈷、鋇、鎳、鎘、汞、鉛或任何其他此處未列舉之二價金屬。

重要的是，ON螯合複合物之形成不在一價陽離子(Na⁺、K⁺或NH₄ ⁺)情況下發生且因此不可能用任何一價陽離子進行。因此，術語「ON鹽」更準確地僅限於具有一價陽離子或具有不與ON形成螯合複合物之陽離子的ON鹽。

至少一部分已知的ON與血液中之蛋白質組分之短暫相互作用可能係由ON與金屬結合蛋白質(諸如白蛋白及金屬依賴性凝結級聯中之蛋白質)之相互作用介導。因此與未螯合之ON相比，以螯合複合物形式投與ON(其顯著降低或消除ON與二價金屬結合蛋白質之相互作用之傾向)可減少血液中之該等蛋白質相互作用且引起較少的ON投藥副作用(諸如短暫抗凝結作用)且亦可能增加到達目標器官(例如肝臟、肺或脾)之ON劑量部分。在本發明之前，未知且從未描述該蛋白質相互作用減緩對治療活性之影響。

螢光偏振為用於檢驗分子間相互作用之常用方法。在此項技術中，用螢光標籤(例如FITC)標記誘餌(亦即任何ON)。在溶液中，誘餌分子在溶液中由於布朗運動(Brownian motion)而自由滾動，從而引起當誘餌經歷正確波長之光之激發時產生較弱的偏振螢光。藉由利用足夠分子量(至少與誘餌尺寸相同)之配位體，誘餌與配位體之間的相互作用引起對溶液中複合物之滾動之顯著抑制。作為溶液中滾動受到抑制之結果，在激發時螢光發射變為顯著偏振的。因此藉由此技術，可在對任一種結合搭配物均無物理約束之情況下量測溶液中之相互作用。螢光偏振被報導為無量綱mP，其與反應中之結合誘餌分子之比例成正比。舉例而言，若極小比例之誘餌分子由特定配位體結合，則螢光偏振極弱且因此mP值較低。在光譜之另一端，若大部分誘餌分子由特定配位體結合(或具有較高配位體濃度)，則將存在顯著螢光偏振且因此mP值較大。以此方式，可藉由在固定量之經螢光標記之誘餌存在下改變配位體之濃度來產生特定誘餌-配位體相互作用之結合等溫線。

本文中，使用不同的經螢光標記之ON檢驗其在多價金屬陽離子存在下之複合物形成。儘管藉由螢光偏振監測複合物形成需要該等ON經螢光標記，但將此標記貼附至ON之3'端以免妨礙所述ON之含氮鹼基或磷酸二酯主結構。此外，螢光標籤藉由剛性3碳連接子保持遠離ON以進一步排除溶液中正常ON性質之任何擾動。因此，本文中使用螢光偏振且藉由經螢光標記之ON觀測之任何ON複合物形成均為未經標記之ON(無論是否複合)之溶液性質之精確表示。

此項技術中之標準明確教示藉由ON鈉鹽向需要治療之個體投與ON之實務。此係藉由在臨床試驗中以鈉鹽形式投與許多ON來例示，該等鈉鹽包括福米韋森(Fomivirisen)(ISIS 2922)、米博美森(Mipomersen)(ISIS 301012)、瑞科韋森(Trecovirsen)(GEM 91)、庫司替森(Custirsen)(OGX-011/ISIS 112989)、吉那森(Genasense) (G3139)、阿普卡森(Aprinocarsem)(ISIS 3531/LY 900003)、PRO-51(GSK 2402968)及ALN-RSV01(Geary等人，2002,Clin.Pharmacokinetics,41：255-260；Yu等人，2009,Clin.Pharmacokinetics,48：39-50；Sereni等人，1999,J.Clin.Pharmacol.,39：47-54；Chi等人，2005,J.Nat.Canc.Inst.,97：1287-1296；Marshall等人，2004,Ann.Oncol.,15：1274-1283；Grossman等人，2004,Neuro-Oncol,6：32-40；Goemans等人，2011 NEJM 364：1513-1522)。當前尚無公開之資料教示使用鈣或鎂或任何其他二價金屬調配用於任何非經腸投藥途徑之寡核苷酸。

許多與鈉鹽ON之投藥相關聯之副作用可歸因於其螯合作用。由ON引起之血液抗凝結作用至少部分係由於ON螯合血清鈣，因此損害鈣依賴性凝結級聯而引起。血清鈣之螯合作用及其可引起之潛在血清低鈣血症亦與靜脈內投與ON所觀測到之副作用一致，該等副作用包括發熱、顫抖、虛弱及動脈血壓降低(後者係在快速靜脈內輸注或注射情況下發生)。皮下注射ON觀測到之注射部位反應(硬化、發炎、觸痛(tenderness)及疼痛)至少部分歸因於注射部位由ON引起之鈣及可能的其他二價陽離子(諸如鎂)或多價陽離子之局部螯合作用。已顯示ON以螯合複合物投與可減少許多該等副作用(參見WO 2012/021985)。

術語寡核苷酸(ON)係指核糖核酸(RNA)及/或脫氧核糖核酸(DNA)之寡聚物或聚合物。此術語包括由經修飾之核鹼基(包括5'甲基胞嘧啶及4'硫尿嘧啶)、糖及共價核苷間(主幹)鍵聯組成之ON以及具有功能類似之非天然存在之部分的ON。該等經修飾或經取代之ON優於原生形式，由於其理想性質，諸如降低之免疫反應性、增強之細胞攝取、增強之針對核酸目標之親和力及在核酸酶存在下增加之穩定性。ON亦可為雙股。

ON可包括各種修飾，例如穩定化修飾，且因此可在磷酸二酯鍵聯及/或糖上及/或鹼基上包括至少一個修飾。舉例而言，ON可包括(但不限於)一或多種修飾，或經完全修飾以含有所有具有所述修飾之鍵聯或糖或鹼基。經修飾之鍵聯可包括硫代磷酸酯鍵聯、二硫代磷酸酯鍵聯及/或甲基膦酸酯鍵聯。當經修飾之鍵聯有用時，ON可包括磷酸二酯鍵聯。其他有用修飾包括(但不限於)糖之2'位置之修飾，包括2'-O-烷基修飾，諸如2'-O-甲基修飾、2' O-甲氧基乙基(2' MOE)、2'-胺基修飾、2'-鹵基修飾，諸如2'-氟；及/或非環狀核苷酸類似物。此項技術中亦已知且可使用其他2'修飾，諸如鎖核酸(locked nucleic acid)。詳言之，ON在所有各處均具有經修飾之鍵聯或每一個鍵聯均經修飾，例如硫代磷酸化；具有3'-覆蓋物及/或5'-覆蓋物；包括末端3'-5'鍵聯；ON為由兩個或兩個以上由連接子接合之ON序列組成之連環體或包括由兩個或兩個以上由連接子接合之ON序列組成之連環體。鹼基修飾可包括胞嘧啶鹼基之5'甲基化(5'甲基胞嘧啶或在核苷酸情形中，5'甲基胞苷)及/或尿嘧啶鹼基之4'硫基化(4'硫尿嘧啶或在核苷酸情形中，4'硫尿核苷)。可將不同的化學上相容的經修飾之鍵聯組合，其中合成條件為化學上相容的，諸如使寡核苷酸具有硫代磷酸酯鍵聯、2'核糖修飾(諸如2' O-甲基化)及經修飾之鹼基(諸如5'甲基胞嘧啶)。ON可進一步由所有該等不同修飾完全修飾(例如各鍵聯經硫代磷酸化、各核糖經2'修飾及各鹼基經修飾)。

在本說明書中，術語「抗病毒ON」係指任何滿足以下條件之ON：其借助於其特定生化活性(序列依賴性的或非序列依賴性的)而具有藉由免疫學或其他機制來直接或間接抑制病毒複製之一些態樣或直接或間接增強宿主清除病毒感染之能力的能力。

在本發明中，術語「抗病毒ON螯合複合物」係指由多價金屬陽離子以分子間方式連接之兩個或兩個以上抗病毒ON於溶液中之複合物。抗病毒ON螯合複合物可含有兩個或兩個以上具有不同序列之 ON。

在本發明中，術語「抗膽固醇ON」係指任何滿足以下條件之ON：其借助於其特定生化活性(序列依賴性的或非序列依賴性的)而具有直接或間接降低個體中異常升高之總血清膽固醇及/或低/極低密度脂蛋白血清含量之能力。

在本發明中，術語「抗膽固醇ON螯合複合物」係指由多價金屬陽離子以分子間方式連接之兩個或兩個以上抗膽固醇ON之複合物。抗膽固醇ON螯合複合物可含有個種或兩個以上具有不同序列之ON。

在本發明中，術語「抗三酸甘油酯ON」係指任何滿足以下條件之ON：其借助於其特定生化活性(序列依賴性的或非序列依賴性的)而具有直接或間接降低個體中異常升高之血清三酸甘油酯含量之能力。

在本發明中，術語「抗三酸甘油酯ON螯合複合物」係指由多價金屬陽離子以分子間方式連接之兩個或兩個以上抗三酸甘油酯ON之複合物。抗三酸甘油酯ON螯合複合物可含有兩個或兩個以上具有不同序列之ON。

在本發明中，術語「抗阿茲海默症ON」係指任何借助於其特定生化活性(序列依賴性的或非序列依賴性的)而具有以下能力之ON：A.直接或間接停止、延緩或逆轉腦部中之類澱粉蛋白-β積聚或表現；B.直接或間接停止、延緩或逆轉腦部中之阿茲海默症斑塊形成或生長；及/或C.直接或間接停止、延緩或逆轉與阿茲海默症進程相關聯之神經功能障礙。

在本發明中，術語「抗阿茲海默症ON螯合複合物」係指由多價金屬陽離子以分子間方式連接之兩個或兩個以上抗阿茲海默症ON之複合物。

在本說明書中，術語「抗普里昂ON」係指任何借助於其特定生化活性(序列依賴性的或非序列依賴性的)而具有以下能力之ON：A.直接或間接停止、延緩或逆轉末梢或腦部中之普里昂蛋白質形成；及/或B.直接或間接停止、延緩或逆轉與普里昂疾病相關聯之神經功能障礙。

在本發明中，術語「抗普里昂ON螯合複合物」係指由多價金屬陽離子以分子間方式連接之兩個或兩個以上抗普里昂ON之複合物。抗普里昂ON螯合複合物可含有兩個或兩個以上具有不同序列之ON。

在本申請案中，術語「簡併型ON」意欲意謂在每一位置處均具有變量(N)之單股ON，諸如NNNNNNNNNN。各鹼基以變量方式合成使得此ON實際上呈具有相同長度及生理化學性質之不同隨機生成序列之群體形式。舉例而言，對於長度為40個鹼基之簡併型ON，群體中之任何特定序列將理論上僅表示全部部分之1/4⁴⁰或8.3×10^-25。鑒於1莫耳=6.022×10²³個分子及1莫耳40單元型ON之質量為約12-14kg(視所存在之序列及修飾而定)之事實，任何具有特定序列之ON有效地在任何製劑中僅出現不超過一次。因此，在該製劑中觀測到的任何螯合物形成或生物活性必須歸因於ON之非序列依賴性(或與序列無關的)生理化學性質，因為預期任何具有所定義序列之ON(在製劑中唯一)均不會提供任何來源於其特定核苷酸序列之活性。

作為此概念之進一步說明，實例I藉由高壓液相層析及質譜分析法比較REP 2006(具有簡併型、完全硫代磷酸化序列之40單元型ON)與具有所定義之序列(亦經完全硫代磷酸化)之21單元型ON之表徵且明確表明任何具有類似尺寸及化學修飾(亦即硫代磷酸化)之ON均將具有不受所存在之核苷酸之序列影響的高度類似(若不相同)之生理化學特徵(參見圖1A-1C)。

在本申請案中，術語「核酸聚合物」或NAP意欲表示任何不含序列特定功能性之單股ON。NAP之生化活性不依賴於ON之鐸樣(Toll-like)受體識別、與目標核酸之雜交或適體相互作用(其需要來源於所存在之特定次序之核苷酸的特定二級/三級ON結構)。NAP可包括如上文所描述之鹼基及/或鍵及/或糖修飾。

ON可藉由許多序列依賴性或非序列依賴性的機制發揮其治療作用。序列依賴性機制為需要特定核酸序列來獲得活性之機制且其中活性係由所存在之核苷酸序列中之一或多個變化而降低。此特定序列可涵蓋整個長度之ON或僅其一部分(序列主結構)。序列依賴性ON之實例包括：

1.反義ON(單股或雙股(例如小型干擾RNA(siRNA)或小型髮夾RNA(shRNA))與相關信使RNA(mRNA)(亦即病毒mRNA或宿主mRNA)中與疾病病況(亦即病毒感染或膽固醇調節)有關之特定部分互補且當引入細胞中時，其藉由RNAse H或RNA誘導之沉默複合物(RISC)引導該等目標mRNA之降解。

2.硬脂酸阻斷ON為單股反義ON，其與mRNA之特定部分互補，但其經工程改造以不活化RNAse H。該等ON與其目標mRNA之雜交產生雙股結構，該雙股結構提供用於通常作用於mRNA之蛋白質之立體障礙。該等ON可用於阻斷特定mRNA之轉譯或阻礙特定mRNA之轉錄後剪接及成熟作用。該等ON可經工程改造以藉由ON中各核糖之完全2'核糖修飾(諸如2' O甲基化)或使ON中各核糖上具有2'核糖修飾來阻斷RNAse H(因為其並非該等ON之作用機制所必需)之活化。

3.適體為具有能夠進行特定蛋白質相互作用(亦即與病毒蛋白質或宿主蛋白質)之特定三維構形且不易於與宿主DNA或RNA相互作用之ON。適體亦可包括Spiegelmer，其使用L-核苷酸以賦予ON抗核酸酶降解性。

4.免疫刺激性ON利用特定6單元型核酸主結構(XXCGXX)刺激哺乳動物中之免疫反應。不同物種之最佳主結構不同，但其嚴格依賴於與XXCGXX主結構一致之特定序列。

5.微型RNA(miRNA)結合於與疾病病況(亦即病毒複製或膽固醇調節)有關之天然存在之miRNA且阻斷其功能。

反義ON可應用於多種疾病病況，諸如藉由催化病毒mRNA之降解來靶向病毒活性(例如ALN-RSV01；Zamora等人，2011,Am.J.Respir.Crit.Care Med.183：531-538)或藉由催化ApoB100 mRNA之降解來靶向LDL及VLDL之產生(例如米博美森[Kynamro^TM]；Raal等人，2010,Lancet 375：998-1006)。反義ON亦可用於校正基因轉錄物之錯誤剪接(該錯誤剪接可產生異常蛋白質)，諸如校正肌縮蛋白基因轉錄物之錯誤剪接(其發生於裘馨氏肌肉萎縮中)(例如PRO-051，Goemans等人，2011,NEJM 364：1513-1522)。

miRNA可用於多種疾病病況，諸如與細胞內天然存在之miR-122(其與LDL調節及VLDL產生以及C型肝炎之產生有關)雜交且催化其降解(例如米拉韋森：2013年3月27日NEJM，印刷前之電子版)。

非序列依賴性ON之唯一報導之實例為硫代磷酸化NAP，其借助於其生理化學性質(如兩性聚合物)選擇性地以尺寸(長度)依賴性方式與兩性蛋白質結構發生相互作用(參見例如美國專利第8,008,269號)。

預期任何ON(無論其在生理學環境中如何發揮其生物作用)在寡核苷酸進入血液循環中時均將形成二價陽離子介導之相互作用，該血液循環含有一些游離二價或三價陽離子，但其中大部分血清二價金屬與蛋白質結合(例如鈣與鈣結合蛋白(諸如白蛋白、凝血酶及纖維蛋白原)結合)。因此，在活體內環境中，大部分二價金屬介導之寡糖相互作用可能係由蛋白質而非另一種寡核苷酸(螯合複合物中)進行。因為已證實許多ON在根據其設計(是否為單股的反義、siRNA、shRNA或 miRNA)進行活體內投藥時具有可預測之功能，因此似乎可逆轉該等鈣介導之蛋白質相互作用(儘管對ON之可耐受性態樣具有影響(如國際申請公開案第WO2012/021985號及美國申請公開案第2012/0046348號中所描述))從而不阻礙活體內ON之器官積聚、ON之細胞內轉運及該等ON與其核酸目標之相互作用。可適當地預測該等相互作用之可逆轉性係依賴於該等二價金屬介導之寡聚蛋白質相互作用。由於投與寡核苷酸之螯合複合物將可能阻礙該等蛋白質相互作用(如美國申請公開案第2012/0046348號中所描述)，因此熟習此項技術者將適當地預測投與ON螯合複合物將改變ON(尤其硫代磷酸化ON(PS-ON)，已知其在腎、肝臟、肺及脾中聚積且在此項技術中認為依賴於ON-蛋白質相互作用)之藥物動力學性質(及器官積聚)。

此外，如美國申請公開案第2012/0046348號中所描述之ON螯合複合物之製劑涉及在無任何蛋白質情況下且在二價金屬陽離子之濃度高於血液循環中通常存在之濃度的情況下相互作用之ON且由如美國申請公開案第2012/0046348號中所描述之技術教示適當地預測該等ON螯合複合物將損失其通常與血液中之蛋白質相互作用之能力(無論最終活體內結果如何，所有ON必須經由血液循環轉變)。因此儘管投與ON螯合複合物將活體內阻止或降低ON之螯合性質且因此減少由寡糖之螯合作用引起之副作用，但在本發明之前尚不可預測或顯見若使用ON製備ON螯合複合物調配物(其係離體且在非生理環境中形成)，則在以螯合複合物形式投與時其是否能夠保留其特定器官積聚及功能性(與以鈉鹽形式投與個體時ON之活性相比)。由於ON螯合複合物並非活體內形成，因此其不能活體內解離及/或細胞內轉運及/或使用正確的蛋白質及/或其他生物化學相互作用以發揮其功能(例如黏接至互補DNA或RNA股或與蛋白質中之兩性螺旋相互作用或與特定蛋白質形成序列特異性適體相互作用)。此外，投與預先形成之ON螯合複合物與投與呈簡單ON鹽形式之相同ON相比可引起宿主個體內所需位置處之積聚減少。因此，在本發明之前尚未知曉當引入生理環境中時或當投與個體時，任何特定ON螯合複合物均將保留其原始的未螯合之ON鹽之生物化學功能性。

此外，因為螯合性及與溶液中之二價金屬形成螯合複合物之能力為任何ON所固有，因此驗證在以螯合複合物形式投與任何特定ON時均可保留生物活性可提供明確證據及教示，其表明當以螯合複合物形式投與時可保留任何ON之生物活性(與其特定作用方式或目標疾病無關)。

當前正研發若干種基於抗病毒ON之藥物以用於治療病毒感染，該等藥物包括用於治療HBV之NAP REP 9AC(REP 2055或SEQ ID NO：2、REP 9AC'(REP 2139或SEQ ID NO：18)及REP 9AC-m(REP 2148或SEQ ID NO：11)，用於治療HCV之米拉韋森及用於治療呼吸道融合性病毒(RSV)之ALN-RSV01。該等ON中之每一者均具有不同作用機制：基於核酸之聚合物阻斷HBV病毒進入且亦阻止HBV表面抗原蛋白質(HBsAg)(一種抑制免疫功能之蛋白質)釋放至血液中；米拉韋森(miRNA)阻斷微型RNA mir-122之作用，已知微型RNA mir-122在HCV複製中起作用；且ALN-RSV01(siRNA)阻斷RSV衣殼蛋白質之合成，從而阻止產生RSV病毒粒子。所有該等ON藥物均可在個體中極有效地發揮其預期效果：REP 9AC/REP 9AC'可充分地清除血液中之HBsAg，米拉韋森可充分抑制mir-122功能且ALN-RSV-01可充分阻斷衣殼蛋白質產生。然而在所有非經腸投與該等基於ON之化合物之情況下，其均與投藥相關副作用相關聯，諸如在藉由靜脈內輸注投與時引起發熱、打冷顫、顫抖或在藉由皮下投藥投與時引起注射部位處之疼痛、炎症或硬化。

若干種ON已在人類患者中展示治療高膽固醇血症及高三酸甘油酯血症之功效。該等ON為米博美森(Kynamro^TM)、第二代反義寡核苷酸(其靶向Apo B100之合成)、PCS-GalNAc(靶向PCSK9及NAPs之糖結合型siRNA)(參見實例V)。

亦在動物中證實NAP能夠活體外及活體內阻止普里昂疾病之發展(Kocisko等人，2006,Antimicrobial Agents and Chemotherapy 50：1034-1044)。

使用寡核苷酸校正疾病病況中之異常RNA剪接亦為多種疾病病況中經認可之治療性介入(Du及Gatti,2009,Curr.Op.Mol.Ther.,11：116-123)。在裘馨氏肌肉萎縮情況下，寡核苷酸PRO-051經設計以在成熟期間結合於肌縮蛋白RNA且誘導成熟mRNA中外顯子51之跳讀(skipping)，從而恢復患病肌肉纖維中之正常肌縮蛋白產生(Goemans等人，2011,NEJM 364：1513-1522)。然而，經典的PRO-051投藥係藉由注射部位反應實現，其結果至少部分歸因於ON之螯合介導之性質，如美國申請公開案第2012/0046348號中所描述。

宜將所有該等基於ON之藥物均製備為ON螯合物以最小化其投藥相關副作用，限制條件為其可保留其生物化學功能性。本發明證明ON可製備為螯合複合物且仍保留其生物化學功能性。調配物中之ON螯合複合物可來源於任何具有抗病毒活性之ON，其實例提供於表1中。

LNA=鎖核酸，PS=硫代磷酸酯化，2' OMe=2' O甲基，2' MOE=2'甲氧基乙基、5' MeC=5'甲基胞嘧啶

此外，上述組合物可包括生理學及/或醫藥學上可接受之載劑、佐劑、媒劑及/或賦形劑。載劑之特徵可視投藥途徑而定。術語「醫藥學上可接受之載劑、佐劑、媒劑及/或賦形劑」係指可投與個體、併入本文中所描述之組合物中且不破壞該等組合物之藥理學活性之載劑、佐劑、媒劑或賦形劑。可用於本文中所描述之醫藥組合物中之醫藥學上可接受之載劑、佐劑、媒劑及賦形劑包括(但不限於)以下：離子交換劑、氧化鋁、硬脂酸鋁、卵磷脂、自乳化藥物遞送系統(「SEDDS」)、醫藥劑型中所用界面活性劑(諸如Tweens或其他類似的聚合遞送基質)、血清蛋白(諸如人類血清白蛋白)、緩衝物質(諸如磷酸鹽)、甘胺酸、山梨酸、山梨酸鉀、飽和植物脂肪酸之偏甘油酯混合物、水、鹽或電解質(諸如硫酸魚精蛋白)、磷酸氫二鈉、磷酸氫鉀、氯化鈉、鋅鹽、膠態二氧化矽、三矽酸鎂、聚乙烯吡咯啶酮、基於纖維素之物質、聚乙二醇、羧甲基纖維素鈉、聚丙烯酸鹽、蠟、聚乙烯-聚氧丙烯阻斷聚合物、聚乙二醇、羊毛脂、癸酸鈉或十四烷基麥芽糖苷(TDM)、TDM衍生物或其他烷基化醣。環糊精(α-環糊精、β-環糊精及γ-環糊精)或經化學修飾之衍生物(諸如羥基烷基環糊精，包括2-羥基丙基-β-環糊精及3-羥基丙基-β-環糊精)或其他溶解之衍生物亦可用於增強本文中所描述之組合物之遞送。

本文中所描述之組合物可含有如下文所描述之其他治療劑且可例如根據諸如醫藥調配技術中熟知的技術使用適用於所需投藥模式之類型之習知固體或液體媒劑或稀釋劑以及醫藥添加劑(例如賦形劑、黏合劑、防腐劑、穩定劑、香料等)來調配。

本文中所描述之組合物可藉由任何合適方法投與，例如經口投藥，諸如以液體懸浮液、錠劑、膠囊、粒劑或散劑形式；舌下投藥；頰內投藥；非經腸投藥，諸如藉由皮下投藥、靜脈內投藥、肌肉內投藥、鞘內注射或輸注技術(例如以無菌可注射水溶液或非水溶液或懸浮液形式)；經鼻投藥，諸如藉由噴霧吸入；局部投藥，諸如以乳膏劑或軟膏劑形式；或直腸投藥，諸如以栓劑或灌腸劑形式；以含有無毒、醫藥學上可接受之媒劑或稀釋劑之劑量單元調配物形式投藥。本發明之組合物可例如以適用於立即釋放或持續釋放之形式投與。立即釋放或持續釋放可使用合適醫藥組合物實現，或尤其在持續釋放情況下，可使用諸如皮下植入劑或滲透泵之裝置實現。因此，上述組合物可適合於藉由以下途徑中之任一種投藥：眼內投藥、口服攝取、經腸投藥、吸入、皮下注射、肌肉內注射、腹膜內注射、鞘內注射或輸注、氣管內投藥、靜脈內注射或輸注或局部地投藥。

用於經口投藥之例示性組合物包括懸浮液，其可含有例如用於傳遞主體之微晶纖維素、作為懸浮劑之褐藻酸或褐藻酸鈉、作為黏度增強劑之甲基纖維素及甜味劑或調味劑(諸如此項技術中已知的甜味劑或調味劑)；及立即釋放錠劑，其可含有例如微晶纖維素、磷酸氫鈣、澱粉、硬脂酸鎂及/或乳糖及/或其他賦形劑、黏合劑、增效劑、崩解劑、稀釋劑及潤滑劑(諸如此項技術中已知的該等試劑)。本發明之組合物亦可藉由舌下及/或頰內投藥經由口腔遞送。模製錠、壓製錠或冷凍乾燥錠劑為例示性可用形式。例示性組合物包括本發明組合物與速溶型稀釋劑(諸如甘露醇、乳糖、蔗糖及/或環糊精)之調配物。該等調配物中亦可包括高分子量賦形劑，諸如纖維素(avicel)或聚乙二醇(PEG)。該等調配物亦可包括輔助黏膜黏著之賦形劑，諸如羥基丙基纖維素(HPC)、羥基丙基甲基纖維素(HPMC)、羧基甲基纖維素鈉(SCMC)、順丁烯二酸酐共聚物(例如Gantrez)，及用於控制釋放之試劑，諸如聚丙烯酸共聚物(例如卡波莫934(Carbopol 934))。亦可添加潤滑劑、滑動劑、香料、著色劑及穩定劑以便於製造及使用。

本文中所描述之化合物之有效量可由一般熟習此項技術者確定，且包括用於成年人之每天每公斤體重約0.1至50毫克活性化合物之例示性劑量，該例示性劑量可以單次劑量投與或以個別分次劑量形式投與，諸如每天1至5次或在特定投藥週期間以多次劑量投與。應理解，用於任何特定個體之特定劑量及給藥頻率可變化且將視多種因素而定，包括所用特定化合物之活性、該化合物之代謝穩定性及作用時長、個體之物種、年齡、體重、一般健康狀況、性別及飲食、投藥模式及時間、排泄率及清除率、藥物組合及特定病狀之嚴重性。較佳治療個體包括動物，最佳為哺乳動物物種，諸如人類，及家畜，諸如犬、貓及其類似物。

藉由參考以下實例可更容易地理解本發明。

實例I

形成ON螯合複合物

圖1A詳細說明藉由HPLC(使用疏水性管柱)分離兩種ON製劑，該兩種ON製劑同時共同注射至管柱中。該等製劑中之第一種製劑稱為內標且為具有特定定義序列之21單元硫代磷酸化ON，第二種製劑為REP 2006(40單元簡併性硫代磷酸化ON)。該兩種製劑僅基於其生理化學性質(亦即尺寸及疏水性)而分離為不同定義之峰；該等ON中存在之各核苷酸序列對其生理化學性質沒有有意義的影響且因此對其分離無影響。因此，內標以一個嚴格定義之峰溶離出管柱，其與REP 2006相比滯留時間較短，僅歸因於該兩種ON聚合物之尺寸差異。應注意，REP 2006峰之任一側上之肩係歸因於較長ON生產中之典型失效序列。儘管REP 2006具有異源序列性質，但如21單元特定序列其由HPLC解析為一個類似明確定義之峰，說明REP 2006製劑中所有種類之共同生理化學性質(即使存在極大量的不同序列)。在HPLC分離REP 2006及21單元之峰後，該等峰可經質譜分析(MS)以鑑別該等定義峰內存在之種類(圖1B及1C)。

在圖1B中，21單元解析為單一種類，其MW為7402.6Da，與具有所定義序列之PS-ON一致。然而，REP 2006之MS分析(圖1C)顯示存在非常多種類，其質量範圍具有幾乎理想正態分佈，與其完全簡併性質一致。此質量範圍為由C₄₀(最小種類)至A₄₀(最大種類)，且由於該等種類之質量接近質量範圍之中心，該等種類之盛行率由種類數目增加而極小(峰強度)。此係因為越來越多數目之不同序列將產生類似質量。REP 2006中之所有不同ON種類在HPLC分離期間在疏水性管柱上具有相同滯留時間之事實明確證明所有相同尺寸及相同化學修飾(亦即硫代磷酸化)之ON將具有高度類似的(若不相同)生理化學性質，且因此可視為在任何應用或性質中具有類似功能，其不依賴特定ON分子中存在之核苷酸序列。因此，任何特定簡併性ON(例如REP 2003、REP 2004，參見表2)觀測到的任何ON螯合複合物形成不能依賴所存在之ON序列且必須依賴任何ON之守恆生理化學性質。

藉由如上文所描述之螢光偏振(FP)檢驗ON銨鹽與多種二價金屬陽離子之相互作用。在ON合成期間，使用公認的試劑及合成方案藉由剛性3碳連接子使各ON在3'端處與螢光異硫氰酸鹽(FITC)結合。該等ON由於合成作用而分解且保持為銨鹽。此實例中所用ON描述於表2中。

表2實例I中所用單股ON

N=簡併序列(隨機合併有A、G、C或T)

PS=每一鍵處硫代磷酸化

2' O Me=各核糖處2' O甲基化

所使用之經3' FITC標記之ON為REP 2032-FL(6單元型硫代磷酸化簡併型寡聚去氧核苷酸)、REP 2003-FL(10單元型硫代磷酸化簡併型DNA ON)、REP 2004-FL(20單元型硫代磷酸化簡併型寡聚去氧核苷酸)、REP 2006-FL(40單元型硫代磷酸化簡併型DNA ON)、REP 2031-FL(40單元型聚胞啶硫代磷酸化DNA ON；SEQ ID NO：1)、REP 2107-FL(40單元型硫代磷酸化簡併型RNA ON，其中各核糖均由2' O甲基化修飾)、REP 2086-FL(40單元型硫代磷酸化簡併型RNA ON，其中各核糖均由2' O甲基化修飾)、REP 2055-FL(具有序列[AC]₂₀之硫代磷酸化DNA ON；SEQ ID NO：2)、REP 2057(具有序列[AG]₂₀之硫代磷酸化DNA ON；SEQ ID NO：3)及REP 2139-FL(具有序列[2'OMeA-2'OMe、5' MeC]₂₀之硫代磷酸化RNA ON，其中各核糖均經2' O甲基修飾且各胞嘧啶均經5'甲基化；SEQ ID NO：18)。將該等ON中之每一者製備為於1mM TRIS中之0.5mM原料(pH 7.2)。使用該等原料在FP緩衝液(10mM TRIS、80mM NaCl、1mM EDTA、10Mm β-巰基乙醇及0.1% Tween®-20)中製備3nM螢光ON溶液。在進行FP量測之前，使用 EDTA移除溶液中之任何二價金屬。該等緩衝溶液中之每一者亦含有80mM NaCl以評估在一莫耳過量一價陽離子存在下之ON複合物形成。向溶液中之每一種螢光ON添加多種量之ACS級二價(2+)金屬之氯化物鹽(如表3中所描述)。藉由螢光偏振(由無量綱單位「mP」定量)增加來監測二聚體或更高階ON螯合複合物之形成，使得ON螯合複合物之形成增加可引起更大的質量變化(參見圖3)。所引起之溶液中該等ON螯合物之滾動減緩引起發射之螢光之偏振增加(參見圖4)。該等實驗之結果呈現於表3中。

平均值及標準差係基於兩次重複量測。ND=未確定，*n=1

在各種情況下，在所有二價陽離子存在下，在所有ON情況下均發現螢光偏振之顯著增加，表明形成具有該等二價金屬陽離子之ON螯合複合物。該等結果證明以下觀點：

‧ON在鈣及鎂存在下形成二聚體及更高階複合物。預期可使用所有其他二價金屬陽離子形成該等複合物。該等ON複合物之形成涉及ON與該等二價金屬陽離子之相互作用。

‧由於所測試之ON之簡併性，ON複合物之形成不能歸因於含氮鹼基之間經由傳統沃森-克里克(Watson-Crick)相互作用進行之雜交。此外，REP 2031(SEQ ID NO：1)、REP 2055(SEQ ID NO：2)、REP 2057(SEQ ID NO：3)或REP 2139(SEQ ID NO：18)在所用實驗條件下無法自我雜交。

‧ON複合物之形成係穩定的且其可溶於水溶液中且因為該等複合物似乎合併有所述二價金屬作為所形成之複合物之一部分，因此該等ON複合物具有使所述二價金屬自溶液(ON複合物係於該溶液中形成)螯合之作用。

‧該等金屬之螯合作用及ON螯合複合物之形成不依賴於特定核苷酸序列(如由在簡併性ON情況下觀測到的螯合作用證明)且亦在核苷酸修飾(包括磷酸二酯鍵或2'核糖部分之修飾或鹼基之修飾(例如5'甲基胞嘧啶))情況下發生。

‧在此實例中，該等金屬之螯合作用在長度為6-40個核苷酸之ON情況下發生，表明可使用具有任何長度或長度大於40個核苷酸之ON形成ON螯合物。

實例II

用雙股ON形成ON螯合複合物

如WO 2012/021985中所描述由兩個單股互補ON(其在水溶液中經由沃森-克里克相互作用彼此雜交)形成雙股ON。因為雙股ON仍具有在所形成之DNA螺旋之外側上暴露之磷酸二酯主結構，因此其應能夠在二價陽離子存在下形成螯合複合物。為測試此假設，藉由使REP 2055-FL(40單元型聚AC；SEQ ID NO：2)與REP 2033-FL(40單元型聚TG；SEQ ID NO：6)雜交及使REP 2057-FL(40單元型聚AG；SEQ ID NO：3)與REP 2056-FL(40單元型聚TC；SEQ ID NO：5)雜交來製備兩種不同的雙股DNA ON。因為ON雜交產生雙螺旋，因此可藉由與用於製備複合物之單股ON相比之螢光偏振增加來偵測所引起之質量增加。在1X FP緩衝液中將單股ON(REP 2055-FL(SEQ ID NO：2)、Rep 2033-FL(SEQ ID NO：6)、Rep 2057-FL(SEQ ID NO：3)及REP 2056-FL(SEQ ID NO：5))各稀釋至20nM。亦在1X FP緩衝液(10nM每一種ON)中進行如上文鑑別之兩個互補對之雜交且藉由螢光偏振增加來確認雜交。接著雙股構築體暴露於100mM CaCl₂或100mM MgCl₂。藉由螢光偏振之進一步增加來監測ON螯合複合物形成(參見表4)。此實驗之結果證實兩種ON互補對成功雜交為雙股ON，如由螢光偏振增加證明。此外，向該等雙股ON中添加CaCl₂或MgCl₂可引起螢光偏振進一步增加，表明該等雙股ON亦可在二價金屬陽離子存在下形成螯合複合物。該等結果亦明顯表明雙股ON可與任何二價陽離子形成ON螯合物且預期亦將具有使二價陽離子自溶液螯合之作用。

平均值及標準差係基於三次重複量測。

實例III

ON螯合複合物在活體外不同包膜病毒中之抗病毒活性

進行實驗以檢驗ON螯合複合物在來自不同病毒家族之三種不同包膜病毒中之抗病毒活性：單純疱疹-2(HSV-2)菌株MS(疱疹病毒科(herpesviridae))、流行性感冒A(INFA)菌株Hong Kong(influenza A strain Hong Kong)(正黏病毒科(orthomyxoviridae))及呼吸道融合性病毒(RSV)菌株Long(respiratory syncytial virus strain Long)(副黏病毒科(paramyxoviridae))。對於每一種病毒，藉由量測每一種病毒之宿主細胞之病毒細胞病變效應之抑制來活體外比較具有已知抗病毒活性之ON與其鈣螯合物之功效。對於HSV-2及RSV，使用Vero細胞且對於INFA，使用MDCK細胞。對於HSV-2抗病毒評估，使用斑塊減少分析法且對於INFA及RSV，使用細胞病變效應(CPE)分析法。

對於斑塊減少分析法，使用Vero生長培養基將Vero細胞以75,000個細胞/孔接種於24孔板中。板在37℃及5% CO₂下培育隔夜。第二天，吸出培養基且添加含約100個斑塊形成單位(pfu)之HSV之200μL 體積分析培養基(含有2% FBS之Vero生長培養基)。在37℃及5% CO₂下使病毒吸附於細胞上保持1小時。藉由將其於含有0.5%甲基纖維素之分析培養基中稀釋來製備化合物。在培育期後，將1mL各種藥物稀釋物添加至板之三個重複槽孔中(不吸出病毒接種物)。將板培育兩天以允許斑塊形成。接著自各孔吸出培養基且固定細胞且使用含有結晶紫(Crystal Violet)之20%甲醇染色。藉由顯微鏡檢驗來枚舉斑塊且資料標繪為病毒控制百分比。

對於CPE分析法，在測試化合物存在下混合病毒與細胞且培育分析法所需之時間(HSV-2培育5天且INFA及RSV培育7天)。預先確定每一種病毒之效價使得對照孔呈現由病毒複製引起之85%至95%細胞活力損失。因此，在化合物阻止病毒複製時觀測到抗病毒作用或細胞保護。使用藉由連續稀釋製備之12種濃度藉由一式三份量測來評估樣品之抗病毒功效以確定IC₅₀值且藉由重複量測來確定細胞毒性(若可偵測)。為達成此研究之目的，各項分析法中之FBS濃度均為0.5%。在分析法結束時，分析板用可溶性基於四唑之染料MTS(3-(4,5-二甲基噻唑-2-基)-5-(3-羥基甲氧基苯基)-2-(4-磺酸基苯基)-2H-四唑)染色以測定細胞活力。藉由代謝活性細胞之線粒體酶使MTS代謝以產生可溶性甲產物，該可溶性甲產物使得能夠快速定量分析細胞活力及化合物細胞毒性。此試劑為無需在臨用前製備之穩定、單一溶液。在分析法結束時，每孔添加10-25μL MTS試劑(10%最終濃度(以體積計))且接著微量滴定板在37℃、5% CO₂下培育4-6小時以評估細胞活力。使用黏著性板密封劑替代蓋子，將經密封之板翻轉若干次以混合可溶性甲產物且藉由Molecular Devices Vmax或SpectraMax Plus板讀取器在490/650nm下以分光光度方式對板進行讀取。評估抗病毒活性之化合物包括REP 2055鈣螯合物及REP 2139鈣螯合物(參見表5)。REP 2055(具有序列[AC]₂₀之40單元型硫代磷酸化DNA ON；SEQ ID NO：2) 及REP 2139(具有序列[2'OMeA-2'OMe、5' MeC]₂₀之40單元型硫代磷酸化RNA ON；SED ID NO：18)為具有針對包膜病毒之廣譜抗病毒活性之NAP(Bernstein等人，2008 Antimicrobial Agents Chemother.,52：2727-2733；Cardin等人，2009,Virology J.6：214；Vaillant等人，2006,Antimicrobial Agents Chemother.,50：1393-1401；Guzman等人，2007,Antiviral Therapy,12：1147-1156；Lee等人，Virology,372：107-117；Matsumura等人，2009,Gastroenterology,137：673-681及美國專利8,008,269、8,008,270及8,067,385)。唯一需要的用於抗病毒活性之NAP修飾為ON中各鍵之硫代磷酸化。包括2'核糖修飾(諸如2' O甲基化)及/或鹼基修飾(諸如5'甲基胞嘧啶及/或4'硫尿嘧啶)之其他修飾對於NAP之抗病毒活性具有可忽略不計的影響，但可用於最佳化人類患者中之可耐受性。根據國際申請公開案第WO 2012/021985號及美國申請公開案第2012/0046348號製備呈鈣螯合物形式之REP 2055及REP 2139(使用每100mg ON即存在30mg CaCl₂之比率)。

在所檢驗之所有三種病毒中，確認REP 2055鈣螯合物及REP 2139鈣螯合物之抗病毒活性。此證明具有針對HSV-2、RSV及INFA之廣譜抗病毒活性之NAP ON可以螯合複合物形式製備且仍在該等病毒中呈現抗病毒活性。此外，因為該等ON之抗病毒活性可在其以ON螯合物形式投藥時持續，因此投與其他類型之呈ON螯合物形式之ON(反義、siRNA、miRNA等)亦可能不會對該等ON之生物活性產生顯著影響。此可歸因於特定蛋白質相互作用(在NAP或適體或CpG ON情況下)或核酸相互作用(在反義、siRNA或miRNA情況下)之親和力遠大於ON螯合複合物中ON/多價金屬陽離子相互作用之事實。結合ON螯合物與未經螯合之ON鹽相比毒理學性質得到改良之結果，該等實驗表明經螯合之抗病毒ON與其未經螯合之對應物相比可能為更理想的抗病毒藥物。此外，預期由基於核酸之聚合物製備之ON螯合物通常將具有針對包膜病毒之廣譜抗病毒活性，如美國專利8,008,269、8,008,270及8,067,385中所揭示。

實例IV

ON螯合物為針對人類患者中之慢性HBV感染之有效抗病毒劑

每週一次向前在慢性HBV感染患者投與類似莫耳劑量之REP 2055(根據如上文所描述之此項技術中之標準製備為簡單鈉鹽溶液)及REP 2139(製備為鈣螯合複合物(根據國際申請公開案第WO 2012/021985號及美國申請公開案第2012/0046348號每100mg REP 2139使用30mg CaCl₂製備))。藉由血液中HBV表面抗原蛋白質(HBsAg)之含量之降低(如由Abbott Architect^TM平台量測)來評估當使用類似給藥方案以類似莫耳劑量給予時，鈉鹽NAP(REP 2055)及鈣螯合物NAP(REP 2139-Ca)之投藥之抗病毒作用。REP 2055及REP 2139-Ca之抗病毒作用呈現於表6。

表6 REP 2055及REP 2139-Ca清除慢性HBV感染患者中之血清HBsAg之效果類似

REP 2055及REP 2139-Ca在類似莫耳劑量下阻斷受HBV感染之細胞中SVP釋放(其通常為所有針對HBV感染之NAP之治療相關作用機制)之活性相等。此活性特定地需要將NAP細胞內轉運至肝細胞中以實現此功能性。當以類似的單藥療法方案給予時，REP 2055及REP 2139-Ca在HBV感染患者中實現類似的HBsAg減少或清除，從而證明該兩種不同NAP之抗病毒活性類似及REP 2139之呈鈣螯合複合物形式之調配物對其器官積聚、細胞內轉運或生化活性無顯著影響。

該等結果表明儘管可能藉由阻斷一些蛋白質相互作用而具有改良ON之可耐受性之能力，但ON螯合複合物亦能夠以該方式分解從而不影響ON之器官積聚(在上述實例中於肝臟中)或細胞內轉運(在上述實例中轉運至肝細胞中)，器官積聚及細胞內轉運通常為尤其NAP之生化活性及多種ON所必需的。熟習此項技術者無法由美國申請公開案第2012/0046348號中之教示預測ON螯合複合物具有阻止與ON可耐受性之一些態樣有關之蛋白質相互作用(如美國申請公開案第2012/0046348號中教示)同時仍產生其未改變的器官積聚、細胞內轉運及生化活性之能力。

該等結果明確證明ON螯合物治療慢性HBV感染之有效性。可將其他在活體內或在人類個體中具有針對HBV之活性或針對其他病毒感染之有效性的ON製備為鈣螯合物且得益於本文中呈現之揭示內容，能夠可靠地預期可保留其治療效能同時總體上改良化合物投藥期間或整個治療方案期間之可耐受性。本文中揭示ON螯合複合物不改變ON在人類患者中之作用，ON之治療活性需要保留特定器官積聚、細胞內區域化及生物化學相互作用，且亦明確教示任何可調配為螯合複合物之ON均可用於實現其所設計之治療作用(與其作用機制無關，無論為反義、siRNA、miRNA、shRNA或NAP)且將對降低投藥相關副作用具有附加利益，如美國申請公開案第2012/0046348號中所教示。

此外，因為已證實NAP係藉由阻斷HBV表面抗原之釋放來起到針對HBV之作用，因此其將亦具有針對D型肝炎病毒(一種無關病毒，其產生取決於HBV表面抗原)之活性。因此，亦預期NAP螯合複合物將具有針對D型肝炎病毒感染之活性。

重要的是，上述實例中投與患者之ON螯合複合物展示投藥相關副作用之顯著改良：REP 2139鈣螯合物之靜脈內輸注可在兩小時內完成且僅在極罕見情況下伴有輕度顫抖或打冷顫。相反，以與REP 2139-Ca類似之莫耳劑量以簡單鈉鹽形式投與人類患者之REP 2055需要超過10小時以完成靜脈內輸注且仍幾乎始終伴有中度發熱、打冷顫及顫抖。此外，可在人類患者中每天藉由皮下注射投與REP 2139鈣螯合物持續五週而不引起注射部位反應，同時引起血清HBsAg減少。在皮下投與簡單ON鈉鹽時，無法在不出現注射部位反應情況下使用此投藥途徑。

該等觀測結果表明抗病毒ON螯合複合物為在不損失抗病毒活性情況下投與個體抗病毒ON同時極大改良投藥相關副作用之有效方法。

該等觀測結果進一步表明任何NAP或反義ON(包括經典反義、siRNA、miRNA或shRNA ON)均可調配為ON螯合複合物而不妨礙ON之所欲生物作用且亦不妨礙ON特定生物分佈或細胞內轉運。

實例V

NAP降低活體內血清三酸甘油酯及膽固醇

為檢驗NAP是否可在餵食高果糖(HF)飲食之倉鼠中阻止高膽固醇血症及高三酸甘油酯血症發作，每週3次藉由腹膜內注射對接受HF飲食之動物投與REP 2031(40單元型完全硫代磷酸化寡去氧胞嘧啶核苷酸(SEQ ID NO：1))，持續4週。監測與高膽固醇血症及肥胖症有關之若干參數(參見表9)。

該等結果表明REP 2031投藥對與HF飲食相關之三酸甘油酯及膽固醇增加產生抑制。因此，ON可在高膽固醇血症預防中具有治療活性。

先前已存在高膽固醇血症及/或高三酸甘油酯血症之人類患者接受每週一次REP 2055之投藥，REP 2055係以鈣螯合複合物形式製備。使用經認可之實驗室程序及測試方法監測REP 2055投藥對總血清膽固醇、LDL及三酸甘油酯之作用。REP 2055治療對血清膽固醇動力學之作用展示於表10中。

LDL=低密度脂蛋白，Pre=治療前基線，Treat=REP 2055治療實現之最低含量

在膽固醇及三酸甘油酯升高之患者(患者1-3)中，REP 2055治療引起總膽固醇及LDL膽固醇以及血清三酸甘油酯降低。在具有正常膽固醇但具有輕度至中度三酸甘油酯升高之患者(患者4及5)中，REP 2055治療對總膽固醇含量及LDL膽固醇含量無顯著作用，但仍引起血清三酸甘油酯降低。該等資料表明NAP REP 2055具有降低或正常化總膽固醇及LDL膽固醇以及三酸甘油酯之能力。

在以上實例中，兩種不同NAP(REP 2031[SEQ ID NO：1]及REP 2055[SEQ ID NO：2]，各具有不同序列但具有相同的生理化學性質)能夠在活體內實現類似的降低血清膽固醇及三酸甘油酯之作用。該等結果明確證明NAP之降低血清膽固醇及三酸甘油酯之非序列依賴性活性，且表明可預期本文中所描述之任一種NAP均具有與本文中展示之REP 2013及REP 2055類似的作用。

因為NAP之抗病毒活性、抗三酸甘油酯、抗膽固醇及抗普里昂活性係來源於硫代磷酸化寡核苷酸之相同的與序列無關之性質，因此關於NAP在調配為螯合複合物時仍保留其針對病毒感染之抗病毒活性之本揭示內容可提供明確的證據，其證明NAP在以ON螯合複合物形式投與時亦保留其抗三酸甘油酯、抗膽固醇及抗普里昂活性。

<110> 加拿大商雷普利可公司安德魯維隆米歇爾巴茲涅

<120> 寡核苷酸螯合複合物之調配物、用途及方法

<130> 05016051-36TW

<150> US 61/648694

<151> 2012-05-18

<160> 20

<170> FastSEQ for Windows Version 4.0

<210> 1

<211> 40

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> REP 2031，完全硫代磷酸化

<400> 1

<210> 2

<211> 40

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> REP 2055，完全硫代磷酸化

<400> 2

<210> 3

<211> 40

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> REP 2057，完全硫代磷酸化

<400> 3

<210> 4

<211> 40

<212> RNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 完全硫代磷酸化，完全2' O甲基核糖，各胞嘧啶均經5'甲基化

<400> 4

<210> 5

<211> 40

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> REP 2056，完全硫代磷酸化

<400> 5

<210> 6

<211> 40

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> REP 2133，完全硫代磷酸化

<400> 6

<210> 7

<211> 16

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> miRNA，LNA/DNA，完全硫代磷酸化

<220>

<221> misc_feature

<222> 3,6,9,12,15

<223> LNA

<220>

<221> modified_base

<222> 12,15

<223> m5c

<400> 7

<210> 8

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> siRNA

<220>

<221> misc_feature

<222> 20,21

<223> 脫氧胸腺嘧啶核苷

<220>

<221> misc_feature

<222> 1-18

<223> 核糖核苷酸

<400> 8

<210> 9

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> siRNA

<220>

<221> misc_feature

<222> 19,20

<223> 脫氧胸腺嘧啶核苷

<220>

<221> misc_feature

<222> 1-18

<223> 核糖核苷酸

<400> 9

<210> 10

<211> 40

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 完全硫代磷酸化

<400> 10

<210> 11

<211> 40

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> REP 2148，完全硫代磷酸化，C=5'甲基胞嘧啶

<400> 11

<210> 12

<211> 40

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 完全硫代磷酸化，C=5'甲基胞嘧啶

<400> 12

<210> 13

<211> 40

<212> RNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 完全硫代磷酸化，完全2' O甲基核糖

<400> 13

<210> 14

<211> 40

<212> RNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 完全硫代磷酸化，完全2' O甲基核糖

<400> 14

<210> 15

<211> 40

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 完全硫代磷酸化

<400> 15

<210> 16

<211> 40

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 完全硫代磷酸化

<400> 16

<210> 17

<211> 40

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 完全硫代磷酸化

<400> 17

<210> 18

<211> 40

<212> RNA

<213> 人工序列

<220>

<223> REP 2139，完全硫代磷酸化，完全2' O甲基核糖， C=5'甲基胞嘧啶

<400> 18

<210> 19

<211> 20

<212> RNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 反義，完全硫代磷酸化，完全2' O甲基核糖

<400> 19

<210> 20

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 完全硫代磷酸化

<220>

<221> misc_feature

<222> 1-5,16-20

<223> 2'MOE DNA

<220>

<221> modified_base

<222> 12,15

<223> m5c

<400> 20

Claims

一種抗病毒寡核苷酸螯合複合物之用途，其係用於製造用以治療病毒感染之藥劑，其中該寡核苷酸螯合複合物係由二價金屬陽離子製備。
如請求項1之用途，其中該寡核苷酸螯合複合物係由鈣製備。
如請求項1之用途，其中該寡核苷酸螯合複合物係由鎂製備。
如請求項1之用途，其中該寡核苷酸螯合複合物包含鈣及鎂。
如請求項1至4中任一項之用途，其中該寡核苷酸螯合複合物包含至少一個寡核苷酸，其具有至少一個硫代磷酸酯鍵聯。
如請求項1至4中任一項之用途，其中該寡核苷酸螯合複合物包含至少一個具有一個2'經修飾之核糖之寡核苷酸。
如請求項1至4中任一項之用途，其中該寡核苷酸螯合複合物包含至少一個寡核苷酸，其具有至少一個5'甲基胞嘧啶。
如請求項1至4中任一項之用途，其中該寡核苷酸螯合複合物包含選自SEQ ID NO：1至6或SEQ ID NO：10至18之寡核苷酸。
如請求項1至4中任一項之用途，其中該寡核苷酸螯合複合物經調配以用於皮下投藥或靜脈內輸注。
如請求項1之用途，其中引起該感染之病毒為B型肝炎病毒或D型肝炎病毒(hepatitis delta virus)。