SK4272001A3 - Methods for therapeutic vaccination - Google Patents
Methods for therapeutic vaccination Download PDFInfo
- Publication number
- SK4272001A3 SK4272001A3 SK427-2001A SK4272001A SK4272001A3 SK 4272001 A3 SK4272001 A3 SK 4272001A3 SK 4272001 A SK4272001 A SK 4272001A SK 4272001 A3 SK4272001 A3 SK 4272001A3
- Authority
- SK
- Slovakia
- Prior art keywords
- cell
- epitope
- analog
- polypeptide antigen
- antigen
- Prior art date
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 90
- 238000002255 vaccination Methods 0.000 title abstract description 57
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 title description 7
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims abstract description 258
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims abstract description 254
- 239000000427 antigen Substances 0.000 claims abstract description 242
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 claims abstract description 241
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 claims abstract description 241
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims abstract description 225
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims abstract description 183
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 claims abstract description 164
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims abstract description 90
- 101150029707 ERBB2 gene Proteins 0.000 claims abstract description 87
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 claims abstract description 76
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims abstract description 71
- 210000000612 antigen-presenting cell Anatomy 0.000 claims abstract description 63
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 claims abstract description 40
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 claims abstract description 25
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 claims abstract description 20
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 139
- 108050003189 SH2B adapter protein 1 Proteins 0.000 claims description 132
- 102100041003 Glutamate carboxypeptidase 2 Human genes 0.000 claims description 130
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims description 112
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 112
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 claims description 108
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 claims description 83
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 claims description 77
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 claims description 73
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 claims description 72
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 claims description 63
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 claims description 57
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 claims description 56
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 claims description 54
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 49
- 230000003053 immunization Effects 0.000 claims description 47
- 238000002649 immunization Methods 0.000 claims description 45
- 208000026310 Breast neoplasm Diseases 0.000 claims description 43
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 42
- 206010006187 Breast cancer Diseases 0.000 claims description 41
- 230000004044 response Effects 0.000 claims description 40
- 206010060862 Prostate cancer Diseases 0.000 claims description 34
- 208000000236 Prostatic Neoplasms Diseases 0.000 claims description 32
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 claims description 32
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 claims description 28
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 claims description 28
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 claims description 27
- 230000004048 modification Effects 0.000 claims description 25
- 238000012986 modification Methods 0.000 claims description 25
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 claims description 23
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 claims description 23
- 101000707152 Homo sapiens SH2B adapter protein 1 Proteins 0.000 claims description 21
- 241000700605 Viruses Species 0.000 claims description 21
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims description 21
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 claims description 20
- 238000011282 treatment Methods 0.000 claims description 19
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims description 17
- 230000004927 fusion Effects 0.000 claims description 17
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 claims description 16
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 claims description 16
- 239000012528 membrane Substances 0.000 claims description 16
- 210000004443 dendritic cell Anatomy 0.000 claims description 14
- 238000003780 insertion Methods 0.000 claims description 14
- 230000037431 insertion Effects 0.000 claims description 14
- -1 trehalose diester Chemical class 0.000 claims description 14
- 102000003956 Fibroblast growth factor 8 Human genes 0.000 claims description 13
- 108090000368 Fibroblast growth factor 8 Proteins 0.000 claims description 13
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims description 13
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 claims description 13
- 241001529936 Murinae Species 0.000 claims description 12
- 125000000151 cysteine group Chemical group N[C@@H](CS)C(=O)* 0.000 claims description 12
- 210000002540 macrophage Anatomy 0.000 claims description 12
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 12
- 241000282412 Homo Species 0.000 claims description 11
- 108010063954 Mucins Proteins 0.000 claims description 11
- 229940088597 hormone Drugs 0.000 claims description 11
- 239000005556 hormone Substances 0.000 claims description 11
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 claims description 11
- 230000010076 replication Effects 0.000 claims description 11
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims description 10
- 102000054766 genetic haplotypes Human genes 0.000 claims description 10
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 claims description 9
- WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N D-mannopyranose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N 0.000 claims description 9
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims description 9
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims description 9
- 244000000010 microbial pathogen Species 0.000 claims description 9
- 239000003981 vehicle Substances 0.000 claims description 9
- 102100040245 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 5 Human genes 0.000 claims description 8
- 238000012217 deletion Methods 0.000 claims description 8
- 230000037430 deletion Effects 0.000 claims description 8
- 230000028327 secretion Effects 0.000 claims description 8
- 230000008685 targeting Effects 0.000 claims description 8
- 101150013553 CD40 gene Proteins 0.000 claims description 7
- 108010008707 Mucin-1 Proteins 0.000 claims description 7
- 102100034256 Mucin-1 Human genes 0.000 claims description 7
- 108060008682 Tumor Necrosis Factor Proteins 0.000 claims description 7
- 230000003308 immunostimulating effect Effects 0.000 claims description 7
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 claims description 7
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 claims description 7
- 108010074328 Interferon-gamma Proteins 0.000 claims description 6
- 102000004889 Interleukin-6 Human genes 0.000 claims description 6
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 claims description 6
- 102000000852 Tumor Necrosis Factor-alpha Human genes 0.000 claims description 6
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 claims description 6
- 229940100601 interleukin-6 Drugs 0.000 claims description 6
- 230000001991 pathophysiological effect Effects 0.000 claims description 6
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 claims description 6
- 102000000588 Interleukin-2 Human genes 0.000 claims description 5
- 108010002350 Interleukin-2 Proteins 0.000 claims description 5
- 102000004388 Interleukin-4 Human genes 0.000 claims description 5
- 108090000978 Interleukin-4 Proteins 0.000 claims description 5
- 108090001005 Interleukin-6 Proteins 0.000 claims description 5
- 229920000057 Mannan Polymers 0.000 claims description 5
- 230000002519 immonomodulatory effect Effects 0.000 claims description 5
- 239000004816 latex Substances 0.000 claims description 5
- 229920000126 latex Polymers 0.000 claims description 5
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 claims description 5
- 229930182490 saponin Natural products 0.000 claims description 5
- 150000007949 saponins Chemical class 0.000 claims description 5
- 229960000814 tetanus toxoid Drugs 0.000 claims description 5
- 239000003053 toxin Substances 0.000 claims description 5
- 231100000765 toxin Toxicity 0.000 claims description 5
- 108700012359 toxins Proteins 0.000 claims description 5
- 108010042708 Acetylmuramyl-Alanyl-Isoglutamine Proteins 0.000 claims description 4
- 108010029697 CD40 Ligand Proteins 0.000 claims description 4
- 102100032937 CD40 ligand Human genes 0.000 claims description 4
- 102100029968 Calreticulin Human genes 0.000 claims description 4
- 108090000549 Calreticulin Proteins 0.000 claims description 4
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 claims description 4
- 102000001706 Immunoglobulin Fab Fragments Human genes 0.000 claims description 4
- 108010054477 Immunoglobulin Fab Fragments Proteins 0.000 claims description 4
- 102000000589 Interleukin-1 Human genes 0.000 claims description 4
- 108010002352 Interleukin-1 Proteins 0.000 claims description 4
- 102000013462 Interleukin-12 Human genes 0.000 claims description 4
- 108010065805 Interleukin-12 Proteins 0.000 claims description 4
- 102000003816 Interleukin-13 Human genes 0.000 claims description 4
- 108090000176 Interleukin-13 Proteins 0.000 claims description 4
- 102000003812 Interleukin-15 Human genes 0.000 claims description 4
- 108090000172 Interleukin-15 Proteins 0.000 claims description 4
- 102100038895 Myc proto-oncogene protein Human genes 0.000 claims description 4
- 101710135898 Myc proto-oncogene protein Proteins 0.000 claims description 4
- 108010017324 STAT3 Transcription Factor Proteins 0.000 claims description 4
- 102100024040 Signal transducer and activator of transcription 3 Human genes 0.000 claims description 4
- 101710150448 Transcriptional regulator Myc Proteins 0.000 claims description 4
- 108010053099 Vascular Endothelial Growth Factor Receptor-2 Proteins 0.000 claims description 4
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 claims description 4
- 229960003983 diphtheria toxoid Drugs 0.000 claims description 4
- 229940028885 interleukin-4 Drugs 0.000 claims description 4
- 239000002245 particle Substances 0.000 claims description 4
- 239000001397 quillaja saponaria molina bark Substances 0.000 claims description 4
- 230000004936 stimulating effect Effects 0.000 claims description 4
- 238000001890 transfection Methods 0.000 claims description 4
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 claims description 4
- 102100035526 B melanoma antigen 1 Human genes 0.000 claims description 3
- OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N Calcium Chemical compound [Ca] OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 102100025680 Complement decay-accelerating factor Human genes 0.000 claims description 3
- 102100020715 Fms-related tyrosine kinase 3 ligand protein Human genes 0.000 claims description 3
- 101710162577 Fms-related tyrosine kinase 3 ligand protein Proteins 0.000 claims description 3
- 102400000921 Gastrin Human genes 0.000 claims description 3
- 102100039620 Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor Human genes 0.000 claims description 3
- 102000002812 Heat-Shock Proteins Human genes 0.000 claims description 3
- 108010004889 Heat-Shock Proteins Proteins 0.000 claims description 3
- 101000874316 Homo sapiens B melanoma antigen 1 Proteins 0.000 claims description 3
- 101000856022 Homo sapiens Complement decay-accelerating factor Proteins 0.000 claims description 3
- 102100037850 Interferon gamma Human genes 0.000 claims description 3
- 102000008070 Interferon-gamma Human genes 0.000 claims description 3
- 108010072866 Prostate-Specific Antigen Proteins 0.000 claims description 3
- 101000857870 Squalus acanthias Gonadoliberin Proteins 0.000 claims description 3
- 229920002472 Starch Polymers 0.000 claims description 3
- 102100033177 Vascular endothelial growth factor receptor 2 Human genes 0.000 claims description 3
- 239000011575 calcium Substances 0.000 claims description 3
- 229910052791 calcium Inorganic materials 0.000 claims description 3
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 claims description 3
- 238000007385 chemical modification Methods 0.000 claims description 3
- 239000012228 culture supernatant Substances 0.000 claims description 3
- 230000001472 cytotoxic effect Effects 0.000 claims description 3
- 239000003085 diluting agent Substances 0.000 claims description 3
- 230000003828 downregulation Effects 0.000 claims description 3
- 102000052116 epidermal growth factor receptor activity proteins Human genes 0.000 claims description 3
- 108700015053 epidermal growth factor receptor activity proteins Proteins 0.000 claims description 3
- 229940117681 interleukin-12 Drugs 0.000 claims description 3
- 244000000056 intracellular parasite Species 0.000 claims description 3
- 239000002502 liposome Substances 0.000 claims description 3
- 238000012423 maintenance Methods 0.000 claims description 3
- BSOQXXWZTUDTEL-ZUYCGGNHSA-N muramyl dipeptide Chemical compound OC(=O)CC[C@H](C(N)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](C)O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H](O)[C@@H]1NC(C)=O BSOQXXWZTUDTEL-ZUYCGGNHSA-N 0.000 claims description 3
- YOHYSYJDKVYCJI-UHFFFAOYSA-N n-[3-[[6-[3-(trifluoromethyl)anilino]pyrimidin-4-yl]amino]phenyl]cyclopropanecarboxamide Chemical compound FC(F)(F)C1=CC=CC(NC=2N=CN=C(NC=3C=C(NC(=O)C4CC4)C=CC=3)C=2)=C1 YOHYSYJDKVYCJI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 230000004481 post-translational protein modification Effects 0.000 claims description 3
- 239000008107 starch Substances 0.000 claims description 3
- 235000019698 starch Nutrition 0.000 claims description 3
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 claims description 3
- YYGNTYWPHWGJRM-UHFFFAOYSA-N (6E,10E,14E,18E)-2,6,10,15,19,23-hexamethyltetracosa-2,6,10,14,18,22-hexaene Chemical compound CC(C)=CCCC(C)=CCCC(C)=CCCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)C YYGNTYWPHWGJRM-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- LKKMLIBUAXYLOY-UHFFFAOYSA-N 3-Amino-1-methyl-5H-pyrido[4,3-b]indole Chemical compound N1C2=CC=CC=C2C2=C1C=C(N)N=C2C LKKMLIBUAXYLOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- WEVYNIUIFUYDGI-UHFFFAOYSA-N 3-[6-[4-(trifluoromethoxy)anilino]-4-pyrimidinyl]benzamide Chemical compound NC(=O)C1=CC=CC(C=2N=CN=C(NC=3C=CC(OC(F)(F)F)=CC=3)C=2)=C1 WEVYNIUIFUYDGI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 102000052587 Anaphase-Promoting Complex-Cyclosome Apc3 Subunit Human genes 0.000 claims description 2
- 108700004606 Anaphase-Promoting Complex-Cyclosome Apc3 Subunit Proteins 0.000 claims description 2
- 102100021569 Apoptosis regulator Bcl-2 Human genes 0.000 claims description 2
- 102000015735 Beta-catenin Human genes 0.000 claims description 2
- 108060000903 Beta-catenin Proteins 0.000 claims description 2
- 102100022002 CD59 glycoprotein Human genes 0.000 claims description 2
- 101150108242 CDC27 gene Proteins 0.000 claims description 2
- 108010021064 CTLA-4 Antigen Proteins 0.000 claims description 2
- 229940045513 CTLA4 antagonist Drugs 0.000 claims description 2
- 102100025064 Cellular tumor antigen p53 Human genes 0.000 claims description 2
- 101710163595 Chaperone protein DnaK Proteins 0.000 claims description 2
- 108010025464 Cyclin-Dependent Kinase 4 Proteins 0.000 claims description 2
- 102100036252 Cyclin-dependent kinase 4 Human genes 0.000 claims description 2
- 102100039498 Cytotoxic T-lymphocyte protein 4 Human genes 0.000 claims description 2
- 101100216227 Dictyostelium discoideum anapc3 gene Proteins 0.000 claims description 2
- 102100039328 Endoplasmin Human genes 0.000 claims description 2
- 101710146739 Enterotoxin Proteins 0.000 claims description 2
- 101710113436 GTPase KRas Proteins 0.000 claims description 2
- 108010052343 Gastrins Proteins 0.000 claims description 2
- 108010036652 HSC70 Heat-Shock Proteins Proteins 0.000 claims description 2
- 101710178376 Heat shock 70 kDa protein Proteins 0.000 claims description 2
- 101710152018 Heat shock cognate 70 kDa protein Proteins 0.000 claims description 2
- 102100027421 Heat shock cognate 71 kDa protein Human genes 0.000 claims description 2
- 101710113864 Heat shock protein 90 Proteins 0.000 claims description 2
- 102100034051 Heat shock protein HSP 90-alpha Human genes 0.000 claims description 2
- 101710154606 Hemagglutinin Proteins 0.000 claims description 2
- 101000897400 Homo sapiens CD59 glycoprotein Proteins 0.000 claims description 2
- 101000818517 Homo sapiens Zinc-alpha-2-glycoprotein Proteins 0.000 claims description 2
- 229920001202 Inulin Polymers 0.000 claims description 2
- 102100031413 L-dopachrome tautomerase Human genes 0.000 claims description 2
- 101710093778 L-dopachrome tautomerase Proteins 0.000 claims description 2
- 102100028389 Melanoma antigen recognized by T-cells 1 Human genes 0.000 claims description 2
- 102000003735 Mesothelin Human genes 0.000 claims description 2
- 108090000015 Mesothelin Proteins 0.000 claims description 2
- 108010008699 Mucin-4 Proteins 0.000 claims description 2
- 102100022693 Mucin-4 Human genes 0.000 claims description 2
- 101710093908 Outer capsid protein VP4 Proteins 0.000 claims description 2
- 101710135467 Outer capsid protein sigma-1 Proteins 0.000 claims description 2
- 241000223960 Plasmodium falciparum Species 0.000 claims description 2
- 101710176177 Protein A56 Proteins 0.000 claims description 2
- 241001454523 Quillaja saponaria Species 0.000 claims description 2
- 235000009001 Quillaja saponaria Nutrition 0.000 claims description 2
- BHEOSNUKNHRBNM-UHFFFAOYSA-N Tetramethylsqualene Natural products CC(=C)C(C)CCC(=C)C(C)CCC(C)=CCCC=C(C)CCC(C)C(=C)CCC(C)C(C)=C BHEOSNUKNHRBNM-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 102400001320 Transforming growth factor alpha Human genes 0.000 claims description 2
- 101800004564 Transforming growth factor alpha Proteins 0.000 claims description 2
- 102000003425 Tyrosinase Human genes 0.000 claims description 2
- 108060008724 Tyrosinase Proteins 0.000 claims description 2
- 102000005789 Vascular Endothelial Growth Factors Human genes 0.000 claims description 2
- 108010019530 Vascular Endothelial Growth Factors Proteins 0.000 claims description 2
- 102100021144 Zinc-alpha-2-glycoprotein Human genes 0.000 claims description 2
- 229910052782 aluminium Inorganic materials 0.000 claims description 2
- XAGFODPZIPBFFR-UHFFFAOYSA-N aluminium Chemical compound [Al] XAGFODPZIPBFFR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 235000021120 animal protein Nutrition 0.000 claims description 2
- 239000011324 bead Substances 0.000 claims description 2
- AOXOCDRNSPFDPE-UKEONUMOSA-N chembl413654 Chemical compound C([C@H](C(=O)NCC(=O)N[C@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@H](CCSC)C(=O)N[C@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](CC=1C=CC=CC=1)C(N)=O)NC(=O)[C@@H](C)NC(=O)[C@@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 AOXOCDRNSPFDPE-UKEONUMOSA-N 0.000 claims description 2
- 125000003636 chemical group Chemical group 0.000 claims description 2
- 231100000433 cytotoxic Toxicity 0.000 claims description 2
- PRAKJMSDJKAYCZ-UHFFFAOYSA-N dodecahydrosqualene Natural products CC(C)CCCC(C)CCCC(C)CCCCC(C)CCCC(C)CCCC(C)C PRAKJMSDJKAYCZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 2
- 239000000147 enterotoxin Substances 0.000 claims description 2
- 231100000655 enterotoxin Toxicity 0.000 claims description 2
- 125000004030 farnesyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])=C(C([H])([H])[H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])=C(C([H])([H])[H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])=C(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 claims description 2
- 125000002686 geranylgeranyl group Chemical group [H]C([*])([H])/C([H])=C(C([H])([H])[H])/C([H])([H])C([H])([H])/C([H])=C(C([H])([H])[H])/C([H])([H])C([H])([H])/C([H])=C(C([H])([H])[H])/C([H])([H])C([H])([H])C([H])=C(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 claims description 2
- 108010017007 glucose-regulated proteins Proteins 0.000 claims description 2
- 239000000185 hemagglutinin Substances 0.000 claims description 2
- 230000010354 integration Effects 0.000 claims description 2
- 229960003130 interferon gamma Drugs 0.000 claims description 2
- 238000007917 intracranial administration Methods 0.000 claims description 2
- 229940029339 inulin Drugs 0.000 claims description 2
- GZQKNULLWNGMCW-PWQABINMSA-N lipid A (E. coli) Chemical compound O1[C@H](CO)[C@@H](OP(O)(O)=O)[C@H](OC(=O)C[C@@H](CCCCCCCCCCC)OC(=O)CCCCCCCCCCCCC)[C@@H](NC(=O)C[C@@H](CCCCCCCCCCC)OC(=O)CCCCCCCCCCC)[C@@H]1OC[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](OC(=O)C[C@H](O)CCCCCCCCCCC)[C@@H](NC(=O)C[C@H](O)CCCCCCCCCCC)[C@@H](OP(O)(O)=O)O1 GZQKNULLWNGMCW-PWQABINMSA-N 0.000 claims description 2
- 125000001421 myristyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 claims description 2
- 125000001312 palmitoyl group Chemical group O=C([*])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 claims description 2
- 239000004033 plastic Substances 0.000 claims description 2
- 229920003023 plastic Polymers 0.000 claims description 2
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 claims description 2
- 229940031439 squalene Drugs 0.000 claims description 2
- TUHBEKDERLKLEC-UHFFFAOYSA-N squalene Natural products CC(=CCCC(=CCCC(=CCCC=C(/C)CCC=C(/C)CC=C(C)C)C)C)C TUHBEKDERLKLEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 238000007920 subcutaneous administration Methods 0.000 claims description 2
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 claims 4
- 108090000538 Caspase-8 Proteins 0.000 claims 2
- 108010017213 Granulocyte-Macrophage Colony-Stimulating Factor Proteins 0.000 claims 2
- HDTRYLNUVZCQOY-UHFFFAOYSA-N α-D-glucopyranosyl-α-D-glucopyranoside Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OC1C(O)C(O)C(O)C(CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- MZOFCQQQCNRIBI-VMXHOPILSA-N (3s)-4-[[(2s)-1-[[(2s)-1-[[(1s)-1-carboxy-2-hydroxyethyl]amino]-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino]-5-(diaminomethylideneamino)-1-oxopentan-2-yl]amino]-3-[[2-[[(2s)-2,6-diaminohexanoyl]amino]acetyl]amino]-4-oxobutanoic acid Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CCCCN MZOFCQQQCNRIBI-VMXHOPILSA-N 0.000 claims 1
- 102100030310 5,6-dihydroxyindole-2-carboxylic acid oxidase Human genes 0.000 claims 1
- 101710163881 5,6-dihydroxyindole-2-carboxylic acid oxidase Proteins 0.000 claims 1
- 101100347635 Acanthamoeba castellanii MIC gene Proteins 0.000 claims 1
- 102100021305 Acyl-CoA:lysophosphatidylglycerol acyltransferase 1 Human genes 0.000 claims 1
- 101100288313 Arabidopsis thaliana KTI4 gene Proteins 0.000 claims 1
- 102100038080 B-cell receptor CD22 Human genes 0.000 claims 1
- 102100024222 B-lymphocyte antigen CD19 Human genes 0.000 claims 1
- 102100022005 B-lymphocyte antigen CD20 Human genes 0.000 claims 1
- 101150017888 Bcl2 gene Proteins 0.000 claims 1
- 108010051479 Bombesin Proteins 0.000 claims 1
- 102000013585 Bombesin Human genes 0.000 claims 1
- 102100024217 CAMPATH-1 antigen Human genes 0.000 claims 1
- 102100032912 CD44 antigen Human genes 0.000 claims 1
- 108010065524 CD52 Antigen Proteins 0.000 claims 1
- MUJJVOYNTCTXIC-UHFFFAOYSA-N CNC(=O)c1ccc2-c3c(C)c(nn3CCOc2c1)-c1ncnn1-c1ccc(F)cc1F Chemical compound CNC(=O)c1ccc2-c3c(C)c(nn3CCOc2c1)-c1ncnn1-c1ccc(F)cc1F MUJJVOYNTCTXIC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 101150071146 COX2 gene Proteins 0.000 claims 1
- 101100114534 Caenorhabditis elegans ctc-2 gene Proteins 0.000 claims 1
- 101100507655 Canis lupus familiaris HSPA1 gene Proteins 0.000 claims 1
- 102100024423 Carbonic anhydrase 9 Human genes 0.000 claims 1
- 102100025475 Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5 Human genes 0.000 claims 1
- 102000004091 Caspase-8 Human genes 0.000 claims 1
- 102100026548 Caspase-8 Human genes 0.000 claims 1
- 102000005600 Cathepsins Human genes 0.000 claims 1
- 108010084457 Cathepsins Proteins 0.000 claims 1
- 108010066551 Cholestenone 5 alpha-Reductase Proteins 0.000 claims 1
- 102100030886 Complement receptor type 1 Human genes 0.000 claims 1
- 102100032768 Complement receptor type 2 Human genes 0.000 claims 1
- 102000009508 Cyclin-Dependent Kinase Inhibitor p16 Human genes 0.000 claims 1
- 108010009392 Cyclin-Dependent Kinase Inhibitor p16 Proteins 0.000 claims 1
- 102400000102 Eosinophil granule major basic protein Human genes 0.000 claims 1
- 108091072337 GAGE family Proteins 0.000 claims 1
- 102000040452 GAGE family Human genes 0.000 claims 1
- 102100039788 GTPase NRas Human genes 0.000 claims 1
- 108010070675 Glutathione transferase Proteins 0.000 claims 1
- 102000005720 Glutathione transferase Human genes 0.000 claims 1
- NMJREATYWWNIKX-UHFFFAOYSA-N GnRH Chemical compound C1CCC(C(=O)NCC(N)=O)N1C(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)NC(=O)CNC(=O)C(NC(=O)C(CO)NC(=O)C(CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)NC(=O)C(CC=1NC=NC=1)NC(=O)C1NC(=O)CC1)CC1=CC=C(O)C=C1 NMJREATYWWNIKX-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 102100024025 Heparanase Human genes 0.000 claims 1
- 102100026122 High affinity immunoglobulin gamma Fc receptor I Human genes 0.000 claims 1
- 101001042227 Homo sapiens Acyl-CoA:lysophosphatidylglycerol acyltransferase 1 Proteins 0.000 claims 1
- 101000884305 Homo sapiens B-cell receptor CD22 Proteins 0.000 claims 1
- 101000980825 Homo sapiens B-lymphocyte antigen CD19 Proteins 0.000 claims 1
- 101000897405 Homo sapiens B-lymphocyte antigen CD20 Proteins 0.000 claims 1
- 101100165850 Homo sapiens CA9 gene Proteins 0.000 claims 1
- 101000868273 Homo sapiens CD44 antigen Proteins 0.000 claims 1
- 101000914324 Homo sapiens Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5 Proteins 0.000 claims 1
- 101000914321 Homo sapiens Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 7 Proteins 0.000 claims 1
- 101000727061 Homo sapiens Complement receptor type 1 Proteins 0.000 claims 1
- 101000941929 Homo sapiens Complement receptor type 2 Proteins 0.000 claims 1
- 101100066427 Homo sapiens FCGR1A gene Proteins 0.000 claims 1
- 101000744505 Homo sapiens GTPase NRas Proteins 0.000 claims 1
- 101000878605 Homo sapiens Low affinity immunoglobulin epsilon Fc receptor Proteins 0.000 claims 1
- 101001014223 Homo sapiens MAPK/MAK/MRK overlapping kinase Proteins 0.000 claims 1
- 101000578784 Homo sapiens Melanoma antigen recognized by T-cells 1 Proteins 0.000 claims 1
- 101000961414 Homo sapiens Membrane cofactor protein Proteins 0.000 claims 1
- 101000623901 Homo sapiens Mucin-16 Proteins 0.000 claims 1
- 101000623904 Homo sapiens Mucin-17 Proteins 0.000 claims 1
- 101000934338 Homo sapiens Myeloid cell surface antigen CD33 Proteins 0.000 claims 1
- 101000693231 Homo sapiens PDZK1-interacting protein 1 Proteins 0.000 claims 1
- 101000617725 Homo sapiens Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 2 Proteins 0.000 claims 1
- 101001062222 Homo sapiens Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells Proteins 0.000 claims 1
- 101000738771 Homo sapiens Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C Proteins 0.000 claims 1
- 101000597785 Homo sapiens Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B Proteins 0.000 claims 1
- 241000681881 Human mammary tumor virus Species 0.000 claims 1
- 102100020793 Interleukin-13 receptor subunit alpha-2 Human genes 0.000 claims 1
- 102100038007 Low affinity immunoglobulin epsilon Fc receptor Human genes 0.000 claims 1
- 102100031520 MAPK/MAK/MRK overlapping kinase Human genes 0.000 claims 1
- 108010047230 Member 1 Subfamily B ATP Binding Cassette Transporter Proteins 0.000 claims 1
- 102100039373 Membrane cofactor protein Human genes 0.000 claims 1
- 102100023123 Mucin-16 Human genes 0.000 claims 1
- 102100023125 Mucin-17 Human genes 0.000 claims 1
- 102100034263 Mucin-2 Human genes 0.000 claims 1
- 108010008705 Mucin-2 Proteins 0.000 claims 1
- 101100022875 Mus musculus Meox1 gene Proteins 0.000 claims 1
- 102100025243 Myeloid cell surface antigen CD33 Human genes 0.000 claims 1
- 102100029438 Nitric oxide synthase, inducible Human genes 0.000 claims 1
- 101710089543 Nitric oxide synthase, inducible Proteins 0.000 claims 1
- 108010077077 Osteonectin Proteins 0.000 claims 1
- 102000009890 Osteonectin Human genes 0.000 claims 1
- 102100025648 PDZK1-interacting protein 1 Human genes 0.000 claims 1
- 108060006580 PRAME Proteins 0.000 claims 1
- 102000036673 PRAME Human genes 0.000 claims 1
- 101150000187 PTGS2 gene Proteins 0.000 claims 1
- 102100034640 PWWP domain-containing DNA repair factor 3A Human genes 0.000 claims 1
- 108050007154 PWWP domain-containing DNA repair factor 3A Proteins 0.000 claims 1
- 102000013566 Plasminogen Human genes 0.000 claims 1
- 108010051456 Plasminogen Proteins 0.000 claims 1
- 108010022233 Plasminogen Activator Inhibitor 1 Proteins 0.000 claims 1
- 102100039418 Plasminogen activator inhibitor 1 Human genes 0.000 claims 1
- 102100029165 Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells Human genes 0.000 claims 1
- 102100037422 Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C Human genes 0.000 claims 1
- 101710173693 Short transient receptor potential channel 1 Proteins 0.000 claims 1
- 102100030306 TBC1 domain family member 9 Human genes 0.000 claims 1
- 101150033985 TPI gene Proteins 0.000 claims 1
- 101150032817 TPI1 gene Proteins 0.000 claims 1
- 101710109927 Tail assembly protein GT Proteins 0.000 claims 1
- 108010017842 Telomerase Proteins 0.000 claims 1
- 101710145873 Thymosin beta Proteins 0.000 claims 1
- 102000004357 Transferases Human genes 0.000 claims 1
- 108090000992 Transferases Proteins 0.000 claims 1
- 102000004887 Transforming Growth Factor beta Human genes 0.000 claims 1
- 108090001012 Transforming Growth Factor beta Proteins 0.000 claims 1
- HDTRYLNUVZCQOY-WSWWMNSNSA-N Trehalose Natural products O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-WSWWMNSNSA-N 0.000 claims 1
- 108700015934 Triose-phosphate isomerases Proteins 0.000 claims 1
- 102100033598 Triosephosphate isomerase Human genes 0.000 claims 1
- LVTKHGUGBGNBPL-UHFFFAOYSA-N Trp-P-1 Chemical compound N1C2=CC=CC=C2C2=C1C(C)=C(N)N=C2C LVTKHGUGBGNBPL-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 102100035284 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B Human genes 0.000 claims 1
- UZQJVUCHXGYFLQ-AYDHOLPZSA-N [(2s,3r,4s,5r,6r)-4-[(2s,3r,4s,5r,6r)-4-[(2r,3r,4s,5r,6r)-4-[(2s,3r,4s,5r,6r)-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)-4-[(2s,3r,4s,5s,6r)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxyoxan-2-yl]oxy-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-3,5-dihydroxy-6-(hy Chemical compound O([C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]([C@@H]1O)O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]([C@@H]1O)O[C@H]1CC[C@]2(C)[C@H]3CC=C4[C@@]([C@@]3(CC[C@H]2[C@@]1(C=O)C)C)(C)CC(O)[C@]1(CCC(CC14)(C)C)C(=O)O[C@H]1[C@@H]([C@@H](O[C@H]2[C@@H]([C@@H](O[C@H]3[C@@H]([C@@H](O[C@H]4[C@@H]([C@@H](O[C@H]5[C@@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O5)O)[C@H](O)[C@@H](CO)O4)O)[C@H](O)[C@@H](CO)O3)O)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1)O)[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O UZQJVUCHXGYFLQ-AYDHOLPZSA-N 0.000 claims 1
- 102000013529 alpha-Fetoproteins Human genes 0.000 claims 1
- 108010026331 alpha-Fetoproteins Proteins 0.000 claims 1
- DNDCVAGJPBKION-DOPDSADYSA-N bombesin Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(N)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CC=1NC2=CC=CC=C2C=1)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H]1NC(=O)CC1)C(C)C)C1=CN=CN1 DNDCVAGJPBKION-DOPDSADYSA-N 0.000 claims 1
- 238000012258 culturing Methods 0.000 claims 1
- 108010048134 estramustine-binding protein Proteins 0.000 claims 1
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 claims 1
- 108020005243 folate receptor Proteins 0.000 claims 1
- 102000006815 folate receptor Human genes 0.000 claims 1
- 108010066264 gastrin 17 Proteins 0.000 claims 1
- GKDWRERMBNGKCZ-RNXBIMIWSA-N gastrin-17 Chemical compound C([C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(N)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)CNC(=O)[C@H]1NC(=O)CC1)C1=CC=C(O)C=C1 GKDWRERMBNGKCZ-RNXBIMIWSA-N 0.000 claims 1
- 108010037536 heparanase Proteins 0.000 claims 1
- 108040003607 interleukin-13 receptor activity proteins Proteins 0.000 claims 1
- 230000000527 lymphocytic effect Effects 0.000 claims 1
- 238000012737 microarray-based gene expression Methods 0.000 claims 1
- 238000012243 multiplex automated genomic engineering Methods 0.000 claims 1
- 239000012264 purified product Substances 0.000 claims 1
- 239000003488 releasing hormone Substances 0.000 claims 1
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 claims 1
- 101150047061 tag-72 gene Proteins 0.000 claims 1
- ZRKFYGHZFMAOKI-QMGMOQQFSA-N tgfbeta Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)CNC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CCSC)C(C)C)[C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 ZRKFYGHZFMAOKI-QMGMOQQFSA-N 0.000 claims 1
- 241000712461 unidentified influenza virus Species 0.000 claims 1
- 210000001151 cytotoxic T lymphocyte Anatomy 0.000 abstract description 103
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 abstract description 48
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 abstract description 24
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 abstract description 24
- 230000036039 immunity Effects 0.000 abstract description 7
- 230000024932 T cell mediated immunity Effects 0.000 abstract description 3
- 229940124590 live attenuated vaccine Drugs 0.000 abstract 1
- 229940023012 live-attenuated vaccine Drugs 0.000 abstract 1
- 229920003259 poly(silylenemethylene) Polymers 0.000 description 125
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 description 103
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 74
- 101001027382 Homo sapiens Fibroblast growth factor 8 Proteins 0.000 description 48
- 102100037680 Fibroblast growth factor 8 Human genes 0.000 description 45
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 description 45
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 45
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 39
- 210000004881 tumor cell Anatomy 0.000 description 39
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 36
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 35
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 33
- 239000000047 product Substances 0.000 description 33
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 25
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 22
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 21
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 20
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 20
- 238000011830 transgenic mouse model Methods 0.000 description 20
- 238000011238 DNA vaccination Methods 0.000 description 19
- 241000699660 Mus musculus Species 0.000 description 19
- 108010058846 Ovalbumin Proteins 0.000 description 19
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 19
- 210000002307 prostate Anatomy 0.000 description 19
- 108091054437 MHC class I family Proteins 0.000 description 18
- 108091054438 MHC class II family Proteins 0.000 description 18
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 18
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 18
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 18
- 108060006698 EGF receptor Proteins 0.000 description 16
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 16
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 15
- 235000014680 Saccharomyces cerevisiae Nutrition 0.000 description 15
- 238000007792 addition Methods 0.000 description 15
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 15
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 15
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 15
- 102000018713 Histocompatibility Antigens Class II Human genes 0.000 description 14
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 14
- 230000001086 cytosolic effect Effects 0.000 description 14
- 210000002443 helper t lymphocyte Anatomy 0.000 description 14
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 description 14
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 14
- 238000003757 reverse transcription PCR Methods 0.000 description 14
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 13
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 13
- 101000707150 Mus musculus SH2B adapter protein 1 Proteins 0.000 description 13
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 13
- 108010041986 DNA Vaccines Proteins 0.000 description 12
- 229940021995 DNA vaccine Drugs 0.000 description 12
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 12
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 12
- 210000000481 breast Anatomy 0.000 description 12
- 239000003102 growth factor Substances 0.000 description 12
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 12
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 12
- 102000003974 Fibroblast growth factor 2 Human genes 0.000 description 11
- 108090000379 Fibroblast growth factor 2 Proteins 0.000 description 11
- 102000008949 Histocompatibility Antigens Class I Human genes 0.000 description 11
- 241000235058 Komagataella pastoris Species 0.000 description 11
- 102000043129 MHC class I family Human genes 0.000 description 11
- 239000003098 androgen Substances 0.000 description 11
- 230000009260 cross reactivity Effects 0.000 description 11
- 239000012636 effector Substances 0.000 description 11
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 11
- 102000043131 MHC class II family Human genes 0.000 description 10
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 10
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 10
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 10
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 10
- 230000000875 corresponding effect Effects 0.000 description 10
- 238000001943 fluorescence-activated cell sorting Methods 0.000 description 10
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 10
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 10
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 10
- 230000001323 posttranslational effect Effects 0.000 description 10
- 102000015728 Mucins Human genes 0.000 description 9
- 108010029485 Protein Isoforms Proteins 0.000 description 9
- 102000001708 Protein Isoforms Human genes 0.000 description 9
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 9
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 9
- 238000011161 development Methods 0.000 description 9
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 9
- 230000006870 function Effects 0.000 description 9
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 9
- 238000000099 in vitro assay Methods 0.000 description 9
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 9
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 9
- 241000282326 Felis catus Species 0.000 description 8
- 206010027476 Metastases Diseases 0.000 description 8
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 8
- 229930195733 hydrocarbon Natural products 0.000 description 8
- 150000002430 hydrocarbons Chemical class 0.000 description 8
- 239000000463 material Substances 0.000 description 8
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 8
- 230000008569 process Effects 0.000 description 8
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 8
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 8
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 8
- NHBKXEKEPDILRR-UHFFFAOYSA-N 2,3-bis(butanoylsulfanyl)propyl butanoate Chemical compound CCCC(=O)OCC(SC(=O)CCC)CSC(=O)CCC NHBKXEKEPDILRR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 238000012413 Fluorescence activated cell sorting analysis Methods 0.000 description 7
- 241000287828 Gallus gallus Species 0.000 description 7
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 7
- 238000010171 animal model Methods 0.000 description 7
- 230000005875 antibody response Effects 0.000 description 7
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 7
- 238000001516 cell proliferation assay Methods 0.000 description 7
- 235000013330 chicken meat Nutrition 0.000 description 7
- 239000000562 conjugate Substances 0.000 description 7
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 7
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 7
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 7
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 7
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 7
- 230000003211 malignant effect Effects 0.000 description 7
- 206010061289 metastatic neoplasm Diseases 0.000 description 7
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 7
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 7
- 230000002018 overexpression Effects 0.000 description 7
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 7
- 230000001177 retroviral effect Effects 0.000 description 7
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 7
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 7
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 7
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 7
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 6
- 108010087819 Fc receptors Proteins 0.000 description 6
- 102000009109 Fc receptors Human genes 0.000 description 6
- 108010027412 Histocompatibility Antigens Class II Proteins 0.000 description 6
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 6
- 241000829100 Macaca mulatta polyomavirus 1 Species 0.000 description 6
- 101710175625 Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein Proteins 0.000 description 6
- 102000004022 Protein-Tyrosine Kinases Human genes 0.000 description 6
- 108090000412 Protein-Tyrosine Kinases Proteins 0.000 description 6
- 108090000848 Ubiquitin Proteins 0.000 description 6
- 102000044159 Ubiquitin Human genes 0.000 description 6
- 230000030741 antigen processing and presentation Effects 0.000 description 6
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 6
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 6
- 210000004556 brain Anatomy 0.000 description 6
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 6
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 6
- BRZYSWJRSDMWLG-CAXSIQPQSA-N geneticin Chemical compound O1C[C@@](O)(C)[C@H](NC)[C@@H](O)[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](C(C)O)O2)N)[C@@H](N)C[C@H]1N BRZYSWJRSDMWLG-CAXSIQPQSA-N 0.000 description 6
- 230000005847 immunogenicity Effects 0.000 description 6
- 201000001441 melanoma Diseases 0.000 description 6
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 6
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 6
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 6
- 241000894007 species Species 0.000 description 6
- 102000011022 Chorionic Gonadotropin Human genes 0.000 description 5
- 108010062540 Chorionic Gonadotropin Proteins 0.000 description 5
- 230000004988 N-glycosylation Effects 0.000 description 5
- 208000035871 PIK3CA-related overgrowth syndrome Diseases 0.000 description 5
- 238000002679 ablation Methods 0.000 description 5
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 5
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 5
- 230000003305 autocrine Effects 0.000 description 5
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 5
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 5
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 5
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 5
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 238000013461 design Methods 0.000 description 5
- 238000006471 dimerization reaction Methods 0.000 description 5
- 230000003328 fibroblastic effect Effects 0.000 description 5
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 5
- VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N glycyl-DL-alpha-alanine Natural products OC(=O)C(C)NC(=O)CN VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 229940084986 human chorionic gonadotropin Drugs 0.000 description 5
- 230000028996 humoral immune response Effects 0.000 description 5
- 229940121354 immunomodulator Drugs 0.000 description 5
- 238000009169 immunotherapy Methods 0.000 description 5
- 238000011065 in-situ storage Methods 0.000 description 5
- 210000003000 inclusion body Anatomy 0.000 description 5
- 210000003734 kidney Anatomy 0.000 description 5
- 230000001394 metastastic effect Effects 0.000 description 5
- 238000010837 poor prognosis Methods 0.000 description 5
- 230000004614 tumor growth Effects 0.000 description 5
- 239000004215 Carbon black (E152) Substances 0.000 description 4
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 4
- 102000001301 EGF receptor Human genes 0.000 description 4
- 201000008808 Fibrosarcoma Diseases 0.000 description 4
- 108010058597 HLA-DR Antigens Proteins 0.000 description 4
- 102000006354 HLA-DR Antigens Human genes 0.000 description 4
- 108010088652 Histocompatibility Antigens Class I Proteins 0.000 description 4
- WNGVUZWBXZKQES-YUMQZZPRSA-N Leu-Ala-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O WNGVUZWBXZKQES-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 4
- NWIBSHFKIJFRCO-WUDYKRTCSA-N Mytomycin Chemical compound C1N2C(C(C(C)=C(N)C3=O)=O)=C3[C@@H](COC(N)=O)[C@@]2(OC)[C@@H]2[C@H]1N2 NWIBSHFKIJFRCO-WUDYKRTCSA-N 0.000 description 4
- 238000005481 NMR spectroscopy Methods 0.000 description 4
- 108700001237 Nucleic Acid-Based Vaccines Proteins 0.000 description 4
- 108700020796 Oncogene Proteins 0.000 description 4
- 206010061535 Ovarian neoplasm Diseases 0.000 description 4
- 230000006052 T cell proliferation Effects 0.000 description 4
- 108010005233 alanylglutamic acid Proteins 0.000 description 4
- 230000000259 anti-tumor effect Effects 0.000 description 4
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 4
- 230000004663 cell proliferation Effects 0.000 description 4
- HVYWMOMLDIMFJA-DPAQBDIFSA-N cholesterol Chemical compound C1C=C2C[C@@H](O)CC[C@]2(C)[C@@H]2[C@@H]1[C@@H]1CC[C@H]([C@H](C)CCCC(C)C)[C@@]1(C)CC2 HVYWMOMLDIMFJA-DPAQBDIFSA-N 0.000 description 4
- 230000037029 cross reaction Effects 0.000 description 4
- 239000000839 emulsion Substances 0.000 description 4
- 210000002472 endoplasmic reticulum Anatomy 0.000 description 4
- 230000016784 immunoglobulin production Effects 0.000 description 4
- 239000002955 immunomodulating agent Substances 0.000 description 4
- 230000002584 immunomodulator Effects 0.000 description 4
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 4
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 4
- 239000007791 liquid phase Substances 0.000 description 4
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 4
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 4
- 102000035118 modified proteins Human genes 0.000 description 4
- 108091005573 modified proteins Proteins 0.000 description 4
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 4
- 229940023146 nucleic acid vaccine Drugs 0.000 description 4
- 238000011580 nude mouse model Methods 0.000 description 4
- 210000001672 ovary Anatomy 0.000 description 4
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 4
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 description 4
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 4
- 208000023958 prostate neoplasm Diseases 0.000 description 4
- 238000011471 prostatectomy Methods 0.000 description 4
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 4
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 4
- 238000001356 surgical procedure Methods 0.000 description 4
- 210000001550 testis Anatomy 0.000 description 4
- 210000001541 thymus gland Anatomy 0.000 description 4
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 4
- 230000014616 translation Effects 0.000 description 4
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 4
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 3
- 101100156752 Caenorhabditis elegans cwn-1 gene Proteins 0.000 description 3
- 201000009030 Carcinoma Diseases 0.000 description 3
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108091060211 Expressed sequence tag Proteins 0.000 description 3
- 108091008794 FGF receptors Proteins 0.000 description 3
- 102000044168 Fibroblast Growth Factor Receptor Human genes 0.000 description 3
- 102100023600 Fibroblast growth factor receptor 2 Human genes 0.000 description 3
- 101710182389 Fibroblast growth factor receptor 2 Proteins 0.000 description 3
- 108010070600 Glucose-6-phosphate isomerase Proteins 0.000 description 3
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 3
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 3
- 102000009465 Growth Factor Receptors Human genes 0.000 description 3
- 108010009202 Growth Factor Receptors Proteins 0.000 description 3
- JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N H-Gly-Phe-OH Natural products NCC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 3
- 108010021625 Immunoglobulin Fragments Proteins 0.000 description 3
- 102000008394 Immunoglobulin Fragments Human genes 0.000 description 3
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 3
- 102000018697 Membrane Proteins Human genes 0.000 description 3
- 108010052285 Membrane Proteins Proteins 0.000 description 3
- 108010021466 Mutant Proteins Proteins 0.000 description 3
- 102000008300 Mutant Proteins Human genes 0.000 description 3
- XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N N-alpha-L-glutamyl-L-phenylalanine Natural products OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 208000037273 Pathologic Processes Diseases 0.000 description 3
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 description 3
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 3
- APJPXSFJBMMOLW-KBPBESRZSA-N Phe-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 APJPXSFJBMMOLW-KBPBESRZSA-N 0.000 description 3
- NYQBYASWHVRESG-MIMYLULJSA-N Phe-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 NYQBYASWHVRESG-MIMYLULJSA-N 0.000 description 3
- 208000005718 Stomach Neoplasms Diseases 0.000 description 3
- NHUHCSRWZMLRLA-UHFFFAOYSA-N Sulfisoxazole Chemical compound CC1=NOC(NS(=O)(=O)C=2C=CC(N)=CC=2)=C1C NHUHCSRWZMLRLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- QJKMCQRFHJRIPU-XDTLVQLUSA-N Tyr-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 QJKMCQRFHJRIPU-XDTLVQLUSA-N 0.000 description 3
- 208000007097 Urinary Bladder Neoplasms Diseases 0.000 description 3
- 241000251539 Vertebrata <Metazoa> Species 0.000 description 3
- 108700020987 Wnt-1 Proteins 0.000 description 3
- 102000052547 Wnt-1 Human genes 0.000 description 3
- 238000002441 X-ray diffraction Methods 0.000 description 3
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 3
- 230000002411 adverse Effects 0.000 description 3
- 230000002776 aggregation Effects 0.000 description 3
- 238000004220 aggregation Methods 0.000 description 3
- 239000000556 agonist Substances 0.000 description 3
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 3
- 244000052616 bacterial pathogen Species 0.000 description 3
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 3
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 3
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 3
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 description 3
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 3
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 3
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 3
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 3
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 description 3
- 210000003754 fetus Anatomy 0.000 description 3
- 206010017758 gastric cancer Diseases 0.000 description 3
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 3
- XBGGUPMXALFZOT-UHFFFAOYSA-N glycyl-L-tyrosine hemihydrate Natural products NCC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 XBGGUPMXALFZOT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108010087823 glycyltyrosine Proteins 0.000 description 3
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 description 3
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 3
- 230000029226 lipidation Effects 0.000 description 3
- 230000033001 locomotion Effects 0.000 description 3
- 210000001165 lymph node Anatomy 0.000 description 3
- 238000013507 mapping Methods 0.000 description 3
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 3
- 230000009401 metastasis Effects 0.000 description 3
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 description 3
- 230000004660 morphological change Effects 0.000 description 3
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 3
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 3
- 210000000822 natural killer cell Anatomy 0.000 description 3
- 238000011275 oncology therapy Methods 0.000 description 3
- 230000000242 pagocytic effect Effects 0.000 description 3
- 210000000496 pancreas Anatomy 0.000 description 3
- 230000009054 pathological process Effects 0.000 description 3
- 230000007170 pathology Effects 0.000 description 3
- 108010073025 phenylalanylphenylalanine Proteins 0.000 description 3
- 108010051242 phenylalanylserine Proteins 0.000 description 3
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 3
- 201000001514 prostate carcinoma Diseases 0.000 description 3
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 3
- 238000011160 research Methods 0.000 description 3
- 235000017709 saponins Nutrition 0.000 description 3
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 3
- 210000003491 skin Anatomy 0.000 description 3
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 3
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 3
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 3
- 210000002784 stomach Anatomy 0.000 description 3
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 3
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 3
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 3
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 3
- 210000003171 tumor-infiltrating lymphocyte Anatomy 0.000 description 3
- 210000003932 urinary bladder Anatomy 0.000 description 3
- GZCWLCBFPRFLKL-UHFFFAOYSA-N 1-prop-2-ynoxypropan-2-ol Chemical compound CC(O)COCC#C GZCWLCBFPRFLKL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OSJPPGNTCRNQQC-UWTATZPHSA-N 3-phospho-D-glyceric acid Chemical compound OC(=O)[C@H](O)COP(O)(O)=O OSJPPGNTCRNQQC-UWTATZPHSA-N 0.000 description 2
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 2
- 102000013563 Acid Phosphatase Human genes 0.000 description 2
- 108010051457 Acid Phosphatase Proteins 0.000 description 2
- JAMAWBXXKFGFGX-KZVJFYERSA-N Ala-Arg-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O JAMAWBXXKFGFGX-KZVJFYERSA-N 0.000 description 2
- SUHLZMHFRALVSY-YUMQZZPRSA-N Ala-Lys-Gly Chemical compound NCCCC[C@H](NC(=O)[C@@H](N)C)C(=O)NCC(O)=O SUHLZMHFRALVSY-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- BUQICHWNXBIBOG-LMVFSUKVSA-N Ala-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)N BUQICHWNXBIBOG-LMVFSUKVSA-N 0.000 description 2
- YHZQOSXDTFRZKU-WDSOQIARSA-N Arg-Trp-Leu Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N)=CNC2=C1 YHZQOSXDTFRZKU-WDSOQIARSA-N 0.000 description 2
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 2
- 101100136076 Aspergillus oryzae (strain ATCC 42149 / RIB 40) pel1 gene Proteins 0.000 description 2
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102100026189 Beta-galactosidase Human genes 0.000 description 2
- 206010005003 Bladder cancer Diseases 0.000 description 2
- 241000699802 Cricetulus griseus Species 0.000 description 2
- AEJSNWMRPXAKCW-WHFBIAKZSA-N Cys-Ala-Gly Chemical compound SC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O AEJSNWMRPXAKCW-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- 150000008574 D-amino acids Chemical class 0.000 description 2
- 238000001712 DNA sequencing Methods 0.000 description 2
- 241000255581 Drosophila <fruit fly, genus> Species 0.000 description 2
- 238000012286 ELISA Assay Methods 0.000 description 2
- 241001198387 Escherichia coli BL21(DE3) Species 0.000 description 2
- 102000003971 Fibroblast Growth Factor 1 Human genes 0.000 description 2
- 108090000386 Fibroblast Growth Factor 1 Proteins 0.000 description 2
- DSPQRJXOIXHOHK-WDSKDSINSA-N Glu-Asp-Gly Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O DSPQRJXOIXHOHK-WDSKDSINSA-N 0.000 description 2
- PAQUJCSYVIBPLC-AVGNSLFASA-N Glu-Asp-Phe Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 PAQUJCSYVIBPLC-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- MTAOBYXRYJZRGQ-WDSKDSINSA-N Glu-Gly-Asp Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O MTAOBYXRYJZRGQ-WDSKDSINSA-N 0.000 description 2
- WTMZXOPHTIVFCP-QEWYBTABSA-N Glu-Ile-Phe Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 WTMZXOPHTIVFCP-QEWYBTABSA-N 0.000 description 2
- HVKAAUOFFTUSAA-XDTLVQLUSA-N Glu-Tyr-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O HVKAAUOFFTUSAA-XDTLVQLUSA-N 0.000 description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 2
- 102100031132 Glucose-6-phosphate isomerase Human genes 0.000 description 2
- UGVQELHRNUDMAA-BYPYZUCNSA-N Gly-Ala-Gly Chemical compound [NH3+]CC(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC([O-])=O UGVQELHRNUDMAA-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 2
- SWQALSGKVLYKDT-ZKWXMUAHSA-N Gly-Ile-Ala Chemical compound NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O SWQALSGKVLYKDT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 2
- SWQALSGKVLYKDT-UHFFFAOYSA-N Gly-Ile-Ala Natural products NCC(=O)NC(C(C)CC)C(=O)NC(C)C(O)=O SWQALSGKVLYKDT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- PFMUCCYYAAFKTH-YFKPBYRVSA-N Gly-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN PFMUCCYYAAFKTH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 2
- DBUNZBWUWCIELX-JHEQGTHGSA-N Gly-Thr-Glu Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O DBUNZBWUWCIELX-JHEQGTHGSA-N 0.000 description 2
- XBGGUPMXALFZOT-VIFPVBQESA-N Gly-Tyr Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 XBGGUPMXALFZOT-VIFPVBQESA-N 0.000 description 2
- UVTSZKIATYSKIR-RYUDHWBXSA-N Gly-Tyr-Glu Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O UVTSZKIATYSKIR-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 2
- 239000000579 Gonadotropin-Releasing Hormone Substances 0.000 description 2
- HVLSXIKZNLPZJJ-TXZCQADKSA-N HA peptide Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O)NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@@H](N)CC=1C=CC(O)=CC=1)C1=CC=C(O)C=C1 HVLSXIKZNLPZJJ-TXZCQADKSA-N 0.000 description 2
- 108010035452 HLA-A1 Antigen Proteins 0.000 description 2
- VYUXYMRNGALHEA-DLOVCJGASA-N His-Leu-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O VYUXYMRNGALHEA-DLOVCJGASA-N 0.000 description 2
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- PWUMCBLVWPCKNO-MGHWNKPDSA-N Ile-Leu-Tyr Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 PWUMCBLVWPCKNO-MGHWNKPDSA-N 0.000 description 2
- DRCKHKZYDLJYFQ-YWIQKCBGSA-N Ile-Thr Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O DRCKHKZYDLJYFQ-YWIQKCBGSA-N 0.000 description 2
- GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N Lactose Natural products OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)C(O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N 0.000 description 2
- KWTVLKBOQATPHJ-SRVKXCTJSA-N Leu-Ala-Lys Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)N KWTVLKBOQATPHJ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- ZRHDPZAAWLXXIR-SRVKXCTJSA-N Leu-Lys-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O ZRHDPZAAWLXXIR-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- LRKCBIUDWAXNEG-CSMHCCOUSA-N Leu-Thr Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LRKCBIUDWAXNEG-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 2
- 206010058467 Lung neoplasm malignant Diseases 0.000 description 2
- IGRMTQMIDNDFAA-UWVGGRQHSA-N Lys-His Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 IGRMTQMIDNDFAA-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- IEVXCWPVBYCJRZ-IXOXFDKPSA-N Lys-Thr-His Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 IEVXCWPVBYCJRZ-IXOXFDKPSA-N 0.000 description 2
- 108010031099 Mannose Receptor Proteins 0.000 description 2
- UNPGTBHYKJOCCZ-DCAQKATOSA-N Met-Lys-Ala Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O UNPGTBHYKJOCCZ-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- 241001467552 Mycobacterium bovis BCG Species 0.000 description 2
- NSTPXGARCQOSAU-VIFPVBQESA-N N-formyl-L-phenylalanine Chemical compound O=CN[C@H](C(=O)O)CC1=CC=CC=C1 NSTPXGARCQOSAU-VIFPVBQESA-N 0.000 description 2
- AJHCSUXXECOXOY-UHFFFAOYSA-N N-glycyl-L-tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)CN)C(O)=O)=CNC2=C1 AJHCSUXXECOXOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102400000058 Neuregulin-1 Human genes 0.000 description 2
- 108090000556 Neuregulin-1 Proteins 0.000 description 2
- 206010033128 Ovarian cancer Diseases 0.000 description 2
- DOXQMJCSSYZSNM-BZSNNMDCSA-N Phe-Lys-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O DOXQMJCSSYZSNM-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 2
- ROHDXJUFQVRDAV-UWVGGRQHSA-N Phe-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 ROHDXJUFQVRDAV-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N Phosphoric acid Chemical compound OP(O)(O)=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108091000080 Phosphotransferase Proteins 0.000 description 2
- 102100038358 Prostate-specific antigen Human genes 0.000 description 2
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 2
- 208000007660 Residual Neoplasm Diseases 0.000 description 2
- 241000235070 Saccharomyces Species 0.000 description 2
- 241000607142 Salmonella Species 0.000 description 2
- QPFJSHSJFIYDJZ-GHCJXIJMSA-N Ser-Asp-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO QPFJSHSJFIYDJZ-GHCJXIJMSA-N 0.000 description 2
- 230000005867 T cell response Effects 0.000 description 2
- MUMGGOZAMZWBJJ-DYKIIFRCSA-N Testostosterone Chemical compound O=C1CC[C@]2(C)[C@H]3CC[C@](C)([C@H](CC4)O)[C@@H]4[C@@H]3CCC2=C1 MUMGGOZAMZWBJJ-DYKIIFRCSA-N 0.000 description 2
- 206010043376 Tetanus Diseases 0.000 description 2
- 101710120037 Toxin CcdB Proteins 0.000 description 2
- 102100026144 Transferrin receptor protein 1 Human genes 0.000 description 2
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 2
- HJXOFWKCWLHYIJ-SZMVWBNQSA-N Trp-Lys-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O HJXOFWKCWLHYIJ-SZMVWBNQSA-N 0.000 description 2
- QZOSVNLXLSNHQK-UWVGGRQHSA-N Tyr-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 QZOSVNLXLSNHQK-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N Urea Chemical compound NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000700647 Variola virus Species 0.000 description 2
- 108010084455 Zeocin Proteins 0.000 description 2
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 2
- 208000009956 adenocarcinoma Diseases 0.000 description 2
- 108010076324 alanyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 2
- 108010047495 alanylglycine Proteins 0.000 description 2
- 238000004873 anchoring Methods 0.000 description 2
- 238000009167 androgen deprivation therapy Methods 0.000 description 2
- 230000003466 anti-cipated effect Effects 0.000 description 2
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000002238 attenuated effect Effects 0.000 description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 2
- 108010005774 beta-Galactosidase Proteins 0.000 description 2
- 230000008033 biological extinction Effects 0.000 description 2
- 201000008275 breast carcinoma Diseases 0.000 description 2
- 208000030270 breast disease Diseases 0.000 description 2
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 2
- 230000005907 cancer growth Effects 0.000 description 2
- 238000009566 cancer vaccine Methods 0.000 description 2
- 229940022399 cancer vaccine Drugs 0.000 description 2
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 2
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 2
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 2
- 239000013592 cell lysate Substances 0.000 description 2
- 230000008859 change Effects 0.000 description 2
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 2
- 235000012000 cholesterol Nutrition 0.000 description 2
- 239000011651 chromium Substances 0.000 description 2
- 238000002983 circular dichroism Methods 0.000 description 2
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 2
- 238000012790 confirmation Methods 0.000 description 2
- 230000001268 conjugating effect Effects 0.000 description 2
- 230000002596 correlated effect Effects 0.000 description 2
- 210000004405 cytokine-induced killer cell Anatomy 0.000 description 2
- 230000034994 death Effects 0.000 description 2
- 150000005690 diesters Chemical class 0.000 description 2
- FSXRLASFHBWESK-UHFFFAOYSA-N dipeptide phenylalanyl-tyrosine Natural products C=1C=C(O)C=CC=1CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 FSXRLASFHBWESK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000006185 dispersion Substances 0.000 description 2
- 230000008030 elimination Effects 0.000 description 2
- 238000003379 elimination reaction Methods 0.000 description 2
- 210000000981 epithelium Anatomy 0.000 description 2
- 230000001605 fetal effect Effects 0.000 description 2
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 2
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 2
- 108010042598 glutamyl-aspartyl-glycine Proteins 0.000 description 2
- XKUKSGPZAADMRA-UHFFFAOYSA-N glycyl-glycyl-glycine Chemical compound NCC(=O)NCC(=O)NCC(O)=O XKUKSGPZAADMRA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010015792 glycyllysine Proteins 0.000 description 2
- 108010084389 glycyltryptophan Proteins 0.000 description 2
- XLXSAKCOAKORKW-AQJXLSMYSA-N gonadorelin Chemical compound C([C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)NCC(N)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)NC(=O)[C@H](CC=1N=CNC=1)NC(=O)[C@H]1NC(=O)CC1)C1=CC=C(O)C=C1 XLXSAKCOAKORKW-AQJXLSMYSA-N 0.000 description 2
- 229940035638 gonadotropin-releasing hormone Drugs 0.000 description 2
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 2
- 238000005734 heterodimerization reaction Methods 0.000 description 2
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 2
- 102000057238 human FGF8 Human genes 0.000 description 2
- 238000011577 humanized mouse model Methods 0.000 description 2
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 2
- 230000000984 immunochemical effect Effects 0.000 description 2
- 230000001506 immunosuppresive effect Effects 0.000 description 2
- 238000010874 in vitro model Methods 0.000 description 2
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 2
- 206010022000 influenza Diseases 0.000 description 2
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 2
- 238000011221 initial treatment Methods 0.000 description 2
- BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N isopropyl beta-D-thiogalactopyranoside Chemical compound CC(C)S[C@@H]1O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N 0.000 description 2
- 239000008101 lactose Substances 0.000 description 2
- 230000003902 lesion Effects 0.000 description 2
- 108010051673 leucyl-glycyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 2
- 210000000265 leukocyte Anatomy 0.000 description 2
- 230000006517 limb development Effects 0.000 description 2
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 description 2
- 201000005202 lung cancer Diseases 0.000 description 2
- 208000020816 lung neoplasm Diseases 0.000 description 2
- HQKMJHAJHXVSDF-UHFFFAOYSA-L magnesium stearate Chemical compound [Mg+2].CCCCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O.CCCCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O HQKMJHAJHXVSDF-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 210000001161 mammalian embryo Anatomy 0.000 description 2
- 210000005075 mammary gland Anatomy 0.000 description 2
- 230000008774 maternal effect Effects 0.000 description 2
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 2
- 239000011859 microparticle Substances 0.000 description 2
- 230000005012 migration Effects 0.000 description 2
- 238000013508 migration Methods 0.000 description 2
- 229960004857 mitomycin Drugs 0.000 description 2
- 210000001616 monocyte Anatomy 0.000 description 2
- 229940035032 monophosphoryl lipid a Drugs 0.000 description 2
- 229940051875 mucins Drugs 0.000 description 2
- 230000003472 neutralizing effect Effects 0.000 description 2
- 239000003921 oil Substances 0.000 description 2
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 2
- 230000008520 organization Effects 0.000 description 2
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 2
- 101150040383 pel2 gene Proteins 0.000 description 2
- 101150050446 pelB gene Proteins 0.000 description 2
- 238000010647 peptide synthesis reaction Methods 0.000 description 2
- 210000003819 peripheral blood mononuclear cell Anatomy 0.000 description 2
- 230000002093 peripheral effect Effects 0.000 description 2
- 210000001322 periplasm Anatomy 0.000 description 2
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 description 2
- CWCMIVBLVUHDHK-ZSNHEYEWSA-N phleomycin D1 Chemical compound N([C@H](C(=O)N[C@H](C)[C@@H](O)[C@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)NCCC=1SC[C@@H](N=1)C=1SC=C(N=1)C(=O)NCCCCNC(N)=N)[C@@H](O[C@H]1[C@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@H](CO)O1)O[C@@H]1[C@H]([C@@H](OC(N)=O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1)O)C=1N=CNC=1)C(=O)C1=NC([C@H](CC(N)=O)NC[C@H](N)C(N)=O)=NC(N)=C1C CWCMIVBLVUHDHK-ZSNHEYEWSA-N 0.000 description 2
- 150000003904 phospholipids Chemical class 0.000 description 2
- 102000020233 phosphotransferase Human genes 0.000 description 2
- 230000003114 pinocytic effect Effects 0.000 description 2
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 2
- 239000013641 positive control Substances 0.000 description 2
- 230000003389 potentiating effect Effects 0.000 description 2
- 230000035935 pregnancy Effects 0.000 description 2
- 238000004321 preservation Methods 0.000 description 2
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 2
- 230000002035 prolonged effect Effects 0.000 description 2
- 230000001737 promoting effect Effects 0.000 description 2
- 201000005825 prostate adenocarcinoma Diseases 0.000 description 2
- 108020001580 protein domains Proteins 0.000 description 2
- 230000012743 protein tagging Effects 0.000 description 2
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 2
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 2
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 2
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 2
- 230000003248 secreting effect Effects 0.000 description 2
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 2
- 210000000952 spleen Anatomy 0.000 description 2
- 201000011549 stomach cancer Diseases 0.000 description 2
- 239000000829 suppository Substances 0.000 description 2
- 230000009885 systemic effect Effects 0.000 description 2
- 210000001685 thyroid gland Anatomy 0.000 description 2
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 2
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 2
- 230000010474 transient expression Effects 0.000 description 2
- 230000032258 transport Effects 0.000 description 2
- GETQZCLCWQTVFV-UHFFFAOYSA-N trimethylamine Chemical compound CN(C)C GETQZCLCWQTVFV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 210000002993 trophoblast Anatomy 0.000 description 2
- 201000005112 urinary bladder cancer Diseases 0.000 description 2
- 229940125575 vaccine candidate Drugs 0.000 description 2
- 229940124856 vaccine component Drugs 0.000 description 2
- 238000012795 verification Methods 0.000 description 2
- 230000008189 vertebrate development Effects 0.000 description 2
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JVJGCCBAOOWGEO-RUTPOYCXSA-N (2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-4-amino-2-[[(2s,3s)-2-[[(2s,3s)-2-[[(2s)-2-azaniumyl-3-hydroxypropanoyl]amino]-3-methylpentanoyl]amino]-3-methylpentanoyl]amino]-4-oxobutanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-carboxylatobutanoyl]amino]-6-azaniumy Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JVJGCCBAOOWGEO-RUTPOYCXSA-N 0.000 description 1
- LXJXRIRHZLFYRP-VKHMYHEASA-L (R)-2-Hydroxy-3-(phosphonooxy)-propanal Natural products O=C[C@H](O)COP([O-])([O-])=O LXJXRIRHZLFYRP-VKHMYHEASA-L 0.000 description 1
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 1
- QZCJOXAIQXPLNS-UHFFFAOYSA-N 1,1,2,2,3,3,4,4,4a,5,5,6,6,7,7,8,8,8a-octadecafluoronaphthalene 4-(2-aminoethyl)benzene-1,2-diol Chemical compound NCCc1ccc(O)c(O)c1.FC1(F)C(F)(F)C(F)(F)C2(F)C(F)(F)C(F)(F)C(F)(F)C(F)(F)C2(F)C1(F)F QZCJOXAIQXPLNS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 100676-05-9 Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OCC1C(O)C(O)C(O)C(OC2C(OC(O)C(O)C2O)CO)O1 OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MIJDSYMOBYNHOT-UHFFFAOYSA-N 2-(ethylamino)ethanol Chemical compound CCNCCO MIJDSYMOBYNHOT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QFVHZQCOUORWEI-UHFFFAOYSA-N 4-[(4-anilino-5-sulfonaphthalen-1-yl)diazenyl]-5-hydroxynaphthalene-2,7-disulfonic acid Chemical compound C=12C(O)=CC(S(O)(=O)=O)=CC2=CC(S(O)(=O)=O)=CC=1N=NC(C1=CC=CC(=C11)S(O)(=O)=O)=CC=C1NC1=CC=CC=C1 QFVHZQCOUORWEI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100026802 72 kDa type IV collagenase Human genes 0.000 description 1
- OPVPGKGADVGKTG-BQBZGAKWSA-N Ac-Asp-Glu Chemical compound CC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O OPVPGKGADVGKTG-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- 206010052747 Adenocarcinoma pancreas Diseases 0.000 description 1
- 206010001233 Adenoma benign Diseases 0.000 description 1
- 206010067484 Adverse reaction Diseases 0.000 description 1
- WYPUMLRSQMKIJU-BPNCWPANSA-N Ala-Arg-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O WYPUMLRSQMKIJU-BPNCWPANSA-N 0.000 description 1
- BUDNAJYVCUHLSV-ZLUOBGJFSA-N Ala-Asp-Ser Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O BUDNAJYVCUHLSV-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- KUDREHRZRIVKHS-UWJYBYFXSA-N Ala-Asp-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O KUDREHRZRIVKHS-UWJYBYFXSA-N 0.000 description 1
- WKOBSJOZRJJVRZ-FXQIFTODSA-N Ala-Glu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O WKOBSJOZRJJVRZ-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- VHVVPYOJIIQCKS-QEJZJMRPSA-N Ala-Leu-Phe Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 VHVVPYOJIIQCKS-QEJZJMRPSA-N 0.000 description 1
- 108010088751 Albumins Proteins 0.000 description 1
- 102000009027 Albumins Human genes 0.000 description 1
- 101710187573 Alcohol dehydrogenase 2 Proteins 0.000 description 1
- 101710133776 Alcohol dehydrogenase class-3 Proteins 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N Alpha-Lactose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)O[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N 0.000 description 1
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O Ammonium Chemical compound [NH4+] QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 1
- SBVJJNJLFWSJOV-UBHSHLNASA-N Arg-Ala-Phe Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 SBVJJNJLFWSJOV-UBHSHLNASA-N 0.000 description 1
- NABSCJGZKWSNHX-RCWTZXSCSA-N Arg-Arg-Thr Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N NABSCJGZKWSNHX-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 1
- RRGPUNYIPJXJBU-GUBZILKMSA-N Arg-Asp-Met Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O RRGPUNYIPJXJBU-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- FBLMOFHNVQBKRR-IHRRRGAJSA-N Arg-Asp-Tyr Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 FBLMOFHNVQBKRR-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- XUUXCWCKKCZEAW-YFKPBYRVSA-N Arg-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N XUUXCWCKKCZEAW-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- ILJQISGMGXRZQQ-IHRRRGAJSA-N Asp-Arg-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O ILJQISGMGXRZQQ-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- DZQKLNLLWFQONU-LKXGYXEUSA-N Asp-Cys-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)O DZQKLNLLWFQONU-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 1
- VFUXXFVCYZPOQG-WDSKDSINSA-N Asp-Glu-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O VFUXXFVCYZPOQG-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- JHFNSBBHKSZXKB-VKHMYHEASA-N Asp-Gly Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O JHFNSBBHKSZXKB-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- NRIFEOUAFLTMFJ-AAEUAGOBSA-N Asp-Gly-Trp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O NRIFEOUAFLTMFJ-AAEUAGOBSA-N 0.000 description 1
- KQBVNNAPIURMPD-PEFMBERDSA-N Asp-Ile-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O KQBVNNAPIURMPD-PEFMBERDSA-N 0.000 description 1
- HJCGDIGVVWETRO-ZPFDUUQYSA-N Asp-Lys-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O)C(O)=O HJCGDIGVVWETRO-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 1
- DYDKXJWQCIVTMR-WDSKDSINSA-N Asp-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O DYDKXJWQCIVTMR-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- WOPJVEMFXYHZEE-SRVKXCTJSA-N Asp-Phe-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O WOPJVEMFXYHZEE-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- GWIJZUVQVDJHDI-AVGNSLFASA-N Asp-Phe-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O GWIJZUVQVDJHDI-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- MGSVBZIBCCKGCY-ZLUOBGJFSA-N Asp-Ser-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O MGSVBZIBCCKGCY-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- 208000023275 Autoimmune disease Diseases 0.000 description 1
- 241000271566 Aves Species 0.000 description 1
- 108091008875 B cell receptors Proteins 0.000 description 1
- 208000003950 B-cell lymphoma Diseases 0.000 description 1
- 241000193830 Bacillus <bacterium> Species 0.000 description 1
- 244000063299 Bacillus subtilis Species 0.000 description 1
- 235000014469 Bacillus subtilis Nutrition 0.000 description 1
- 206010004446 Benign prostatic hyperplasia Diseases 0.000 description 1
- 241000589969 Borreliella burgdorferi Species 0.000 description 1
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- 208000003174 Brain Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 125000001433 C-terminal amino-acid group Chemical group 0.000 description 1
- PIGTXFOGKFOFTO-PPEDVFHSSA-N CC1(C)CC[C@@]2([C@H](O)C[C@]3(C)C(=CC[C@@H]4[C@@]5(C)CCC(O[C@@H]6O[C@@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@H]6O)C(O)=O)[C@@](C)(C=O)[C@@H]5CC[C@@]34C)[C@@H]2C1)C(O)=O Chemical compound CC1(C)CC[C@@]2([C@H](O)C[C@]3(C)C(=CC[C@@H]4[C@@]5(C)CCC(O[C@@H]6O[C@@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@H]6O)C(O)=O)[C@@](C)(C=O)[C@@H]5CC[C@@]34C)[C@@H]2C1)C(O)=O PIGTXFOGKFOFTO-PPEDVFHSSA-N 0.000 description 1
- 210000003359 CD4-positive helper T lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 108010009575 CD55 Antigens Proteins 0.000 description 1
- 241000282472 Canis lupus familiaris Species 0.000 description 1
- 102000014914 Carrier Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010078791 Carrier Proteins Proteins 0.000 description 1
- 241000700199 Cavia porcellus Species 0.000 description 1
- 102000019034 Chemokines Human genes 0.000 description 1
- 108010012236 Chemokines Proteins 0.000 description 1
- 102000009016 Cholera Toxin Human genes 0.000 description 1
- 108010049048 Cholera Toxin Proteins 0.000 description 1
- VYZAMTAEIAYCRO-UHFFFAOYSA-N Chromium Chemical compound [Cr] VYZAMTAEIAYCRO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000037164 Collema parvum Species 0.000 description 1
- 108010071942 Colony-Stimulating Factors Proteins 0.000 description 1
- 108010060123 Conjugate Vaccines Proteins 0.000 description 1
- 239000004971 Cross linker Substances 0.000 description 1
- NXQCSPVUPLUTJH-WHFBIAKZSA-N Cys-Ser-Gly Chemical compound SC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O NXQCSPVUPLUTJH-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N D-Mannitol Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N 0.000 description 1
- LXJXRIRHZLFYRP-VKHMYHEASA-N D-glyceraldehyde 3-phosphate Chemical compound O=C[C@H](O)COP(O)(O)=O LXJXRIRHZLFYRP-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- 108090000204 Dipeptidase 1 Proteins 0.000 description 1
- 102000016607 Diphtheria Toxin Human genes 0.000 description 1
- 108010053187 Diphtheria Toxin Proteins 0.000 description 1
- 101100118548 Drosophila melanogaster Egfr gene Proteins 0.000 description 1
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 1
- 101710181478 Envelope glycoprotein GP350 Proteins 0.000 description 1
- 102000056372 ErbB-3 Receptor Human genes 0.000 description 1
- 241000588722 Escherichia Species 0.000 description 1
- 241000672609 Escherichia coli BL21 Species 0.000 description 1
- 108050001049 Extracellular proteins Proteins 0.000 description 1
- 208000007659 Fibroadenoma Diseases 0.000 description 1
- 102100028412 Fibroblast growth factor 10 Human genes 0.000 description 1
- 102100035323 Fibroblast growth factor 18 Human genes 0.000 description 1
- 102100027842 Fibroblast growth factor receptor 3 Human genes 0.000 description 1
- 101710182396 Fibroblast growth factor receptor 3 Proteins 0.000 description 1
- 102100027844 Fibroblast growth factor receptor 4 Human genes 0.000 description 1
- 208000003098 Ganglion Cysts Diseases 0.000 description 1
- 206010017993 Gastrointestinal neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 108700039691 Genetic Promoter Regions Proteins 0.000 description 1
- 108700007698 Genetic Terminator Regions Proteins 0.000 description 1
- 208000032612 Glial tumor Diseases 0.000 description 1
- 206010018338 Glioma Diseases 0.000 description 1
- UKKNTTCNGZLJEX-WHFBIAKZSA-N Gln-Ser Chemical compound NC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O UKKNTTCNGZLJEX-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- OYRVWOGRRQDEQH-MLVLNPCWSA-N Gln-Tyr-Ile-Lys-Ala-Asn-Ser-Lys-Phe-Ile-Gly-Ile-Thr-Glu-Leu Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)CC)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C(C)CC)C(=O)N[C@@H](C(C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O)C(C)CC)C1=CC=CC=C1 OYRVWOGRRQDEQH-MLVLNPCWSA-N 0.000 description 1
- NLKVNZUFDPWPNL-YUMQZZPRSA-N Glu-Arg-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(O)=O NLKVNZUFDPWPNL-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- LSPKYLAFTPBWIL-BYPYZUCNSA-N Glu-Gly Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O LSPKYLAFTPBWIL-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- ZWQVYZXPYSYPJD-RYUDHWBXSA-N Glu-Gly-Phe Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 ZWQVYZXPYSYPJD-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- ZWABFSSWTSAMQN-KBIXCLLPSA-N Glu-Ile-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O ZWABFSSWTSAMQN-KBIXCLLPSA-N 0.000 description 1
- YBAFDPFAUTYYRW-YUMQZZPRSA-N Glu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O YBAFDPFAUTYYRW-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- HVYWQYLBVXMXSV-GUBZILKMSA-N Glu-Leu-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O HVYWQYLBVXMXSV-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- MFNUFCFRAZPJFW-JYJNAYRXSA-N Glu-Lys-Phe Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 MFNUFCFRAZPJFW-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- SOEPMWQCTJITPZ-SRVKXCTJSA-N Glu-Met-Lys Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N SOEPMWQCTJITPZ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- YBTCBQBIJKGSJP-BQBZGAKWSA-N Glu-Pro Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O YBTCBQBIJKGSJP-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- BDISFWMLMNBTGP-NUMRIWBASA-N Glu-Thr-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O BDISFWMLMNBTGP-NUMRIWBASA-N 0.000 description 1
- YQAQQKPWFOBSMU-WDCWCFNPSA-N Glu-Thr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O YQAQQKPWFOBSMU-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 1
- ZQNCUVODKOBSSO-XEGUGMAKSA-N Glu-Trp-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O ZQNCUVODKOBSSO-XEGUGMAKSA-N 0.000 description 1
- 102000030595 Glucokinase Human genes 0.000 description 1
- 108010021582 Glucokinase Proteins 0.000 description 1
- 102000005731 Glucose-6-phosphate isomerase Human genes 0.000 description 1
- SXRSQZLOMIGNAQ-UHFFFAOYSA-N Glutaraldehyde Chemical compound O=CCCCC=O SXRSQZLOMIGNAQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- TVDHVLGFJSHPAX-UWVGGRQHSA-N Gly-His-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CN=CN1 TVDHVLGFJSHPAX-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- XVYKMNXXJXQKME-XEGUGMAKSA-N Gly-Ile-Tyr Chemical compound NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 XVYKMNXXJXQKME-XEGUGMAKSA-N 0.000 description 1
- CLNSYANKYVMZNM-UWVGGRQHSA-N Gly-Lys-Arg Chemical compound NCCCC[C@H](NC(=O)CN)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N CLNSYANKYVMZNM-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- JPVGHHQGKPQYIL-KBPBESRZSA-N Gly-Phe-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CC=CC=C1 JPVGHHQGKPQYIL-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- IRJWAYCXIYUHQE-WHFBIAKZSA-N Gly-Ser-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)CN IRJWAYCXIYUHQE-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- SOEGEPHNZOISMT-BYPYZUCNSA-N Gly-Ser-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O SOEGEPHNZOISMT-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- WNGHUXFWEWTKAO-YUMQZZPRSA-N Gly-Ser-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)CN WNGHUXFWEWTKAO-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- 102100028972 HLA class I histocompatibility antigen, A alpha chain Human genes 0.000 description 1
- 102100028976 HLA class I histocompatibility antigen, B alpha chain Human genes 0.000 description 1
- 102100028971 HLA class I histocompatibility antigen, C alpha chain Human genes 0.000 description 1
- 102100036242 HLA class II histocompatibility antigen, DQ alpha 2 chain Human genes 0.000 description 1
- 108010075704 HLA-A Antigens Proteins 0.000 description 1
- 108010032218 HLA-A*23 antigen Proteins 0.000 description 1
- 108010074032 HLA-A2 Antigen Proteins 0.000 description 1
- 102000025850 HLA-A2 Antigen Human genes 0.000 description 1
- 108010013476 HLA-A24 Antigen Proteins 0.000 description 1
- 108010086377 HLA-A3 Antigen Proteins 0.000 description 1
- 108010058607 HLA-B Antigens Proteins 0.000 description 1
- 101710165610 Heat-stable 19 kDa antigen Proteins 0.000 description 1
- 102000005548 Hexokinase Human genes 0.000 description 1
- 108700040460 Hexokinases Proteins 0.000 description 1
- 108010093488 His-His-His-His-His-His Proteins 0.000 description 1
- 101000627872 Homo sapiens 72 kDa type IV collagenase Proteins 0.000 description 1
- 101000971171 Homo sapiens Apoptosis regulator Bcl-2 Proteins 0.000 description 1
- 101000917237 Homo sapiens Fibroblast growth factor 10 Proteins 0.000 description 1
- 101000878128 Homo sapiens Fibroblast growth factor 18 Proteins 0.000 description 1
- 101000917134 Homo sapiens Fibroblast growth factor receptor 4 Proteins 0.000 description 1
- 101000930801 Homo sapiens HLA class II histocompatibility antigen, DQ alpha 2 chain Proteins 0.000 description 1
- 101100395312 Homo sapiens HLA-C gene Proteins 0.000 description 1
- 101000990912 Homo sapiens Matrilysin Proteins 0.000 description 1
- 101000842302 Homo sapiens Protein-cysteine N-palmitoyltransferase HHAT Proteins 0.000 description 1
- 101000766306 Homo sapiens Serotransferrin Proteins 0.000 description 1
- 101000990915 Homo sapiens Stromelysin-1 Proteins 0.000 description 1
- 101000611183 Homo sapiens Tumor necrosis factor Proteins 0.000 description 1
- 108010001336 Horseradish Peroxidase Proteins 0.000 description 1
- 241000701109 Human adenovirus 2 Species 0.000 description 1
- 102000004157 Hydrolases Human genes 0.000 description 1
- 108090000604 Hydrolases Proteins 0.000 description 1
- 206010020751 Hypersensitivity Diseases 0.000 description 1
- 102000009490 IgG Receptors Human genes 0.000 description 1
- 108010073807 IgG Receptors Proteins 0.000 description 1
- JXUGDUWBMKIJDC-NAKRPEOUSA-N Ile-Ala-Arg Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O JXUGDUWBMKIJDC-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 1
- DFFTXLCCDFYRKD-MBLNEYKQSA-N Ile-Gly-Thr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)O)N DFFTXLCCDFYRKD-MBLNEYKQSA-N 0.000 description 1
- UAQSZXGJGLHMNV-XEGUGMAKSA-N Ile-Gly-Tyr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)O)N UAQSZXGJGLHMNV-XEGUGMAKSA-N 0.000 description 1
- KEKTTYCXKGBAAL-VGDYDELISA-N Ile-His-Ser Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N KEKTTYCXKGBAAL-VGDYDELISA-N 0.000 description 1
- BCVIOZZGJNOEQS-XKNYDFJKSA-N Ile-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)[C@@H](C)CC BCVIOZZGJNOEQS-XKNYDFJKSA-N 0.000 description 1
- FZWVCYCYWCLQDH-NHCYSSNCSA-N Ile-Leu-Gly Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(=O)O)N FZWVCYCYWCLQDH-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- GVNNAHIRSDRIII-AJNGGQMLSA-N Ile-Lys-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N GVNNAHIRSDRIII-AJNGGQMLSA-N 0.000 description 1
- DTPGSUQHUMELQB-GVARAGBVSA-N Ile-Tyr-Ala Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 DTPGSUQHUMELQB-GVARAGBVSA-N 0.000 description 1
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical compound C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 description 1
- 102000018071 Immunoglobulin Fc Fragments Human genes 0.000 description 1
- 108010091135 Immunoglobulin Fc Fragments Proteins 0.000 description 1
- 206010061218 Inflammation Diseases 0.000 description 1
- 102000003814 Interleukin-10 Human genes 0.000 description 1
- 108090000174 Interleukin-10 Proteins 0.000 description 1
- 208000037396 Intraductal Noninfiltrating Carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 208000008839 Kidney Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N L-histidine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- CZCSUZMIRKFFFA-CIUDSAMLSA-N Leu-Ala-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O CZCSUZMIRKFFFA-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- KSZCCRIGNVSHFH-UWVGGRQHSA-N Leu-Arg-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(O)=O KSZCCRIGNVSHFH-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- GPXFZVUVPCFTMG-AVGNSLFASA-N Leu-Arg-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C GPXFZVUVPCFTMG-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- ILJREDZFPHTUIE-GUBZILKMSA-N Leu-Asp-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O ILJREDZFPHTUIE-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- HYIFFZAQXPUEAU-QWRGUYRKSA-N Leu-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C HYIFFZAQXPUEAU-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- KEVYYIMVELOXCT-KBPBESRZSA-N Leu-Gly-Phe Chemical compound CC(C)C[C@H]([NH3+])C(=O)NCC(=O)N[C@H](C([O-])=O)CC1=CC=CC=C1 KEVYYIMVELOXCT-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- VGPCJSXPPOQPBK-YUMQZZPRSA-N Leu-Gly-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O VGPCJSXPPOQPBK-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- KXODZBLFVFSLAI-AVGNSLFASA-N Leu-His-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C)CC1=CN=CN1 KXODZBLFVFSLAI-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- QNBVTHNJGCOVFA-AVGNSLFASA-N Leu-Leu-Glu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O QNBVTHNJGCOVFA-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- KYIIALJHAOIAHF-KKUMJFAQSA-N Leu-Leu-His Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 KYIIALJHAOIAHF-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- RXGLHDWAZQECBI-SRVKXCTJSA-N Leu-Leu-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O RXGLHDWAZQECBI-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- VCHVSKNMTXWIIP-SRVKXCTJSA-N Leu-Lys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O VCHVSKNMTXWIIP-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- MJTOYIHCKVQICL-ULQDDVLXSA-N Leu-Met-Phe Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)N MJTOYIHCKVQICL-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- LQUIENKUVKPNIC-ULQDDVLXSA-N Leu-Met-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O LQUIENKUVKPNIC-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- ZDBMWELMUCLUPL-QEJZJMRPSA-N Leu-Phe-Ala Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 ZDBMWELMUCLUPL-QEJZJMRPSA-N 0.000 description 1
- INCJJHQRZGQLFC-KBPBESRZSA-N Leu-Phe-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)NCC(O)=O INCJJHQRZGQLFC-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- DAYQSYGBCUKVKT-VOAKCMCISA-N Leu-Thr-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O DAYQSYGBCUKVKT-VOAKCMCISA-N 0.000 description 1
- OZTZJMUZVAVJGY-BZSNNMDCSA-N Leu-Tyr-His Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O)N OZTZJMUZVAVJGY-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- NPBGTPKLVJEOBE-IUCAKERBSA-N Lys-Arg Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N NPBGTPKLVJEOBE-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- JPNRPAJITHRXRH-BQBZGAKWSA-N Lys-Asn Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O JPNRPAJITHRXRH-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- GCMWRRQAKQXDED-IUCAKERBSA-N Lys-Glu-Gly Chemical compound [NH3+]CCCC[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CCC([O-])=O)C(=O)NCC([O-])=O GCMWRRQAKQXDED-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- FMIIKPHLJKUXGE-GUBZILKMSA-N Lys-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN FMIIKPHLJKUXGE-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- ATNKHRAIZCMCCN-BZSNNMDCSA-N Lys-Lys-Phe Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CCCCN)N ATNKHRAIZCMCCN-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- DAHQKYYIXPBESV-UWVGGRQHSA-N Lys-Met-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)NCC(O)=O DAHQKYYIXPBESV-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- SPNKGZFASINBMR-IHRRRGAJSA-N Lys-Met-His Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N SPNKGZFASINBMR-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- LUAJJLPHUXPQLH-KKUMJFAQSA-N Lys-Phe-Ser Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N LUAJJLPHUXPQLH-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- IOQWIOPSKJOEKI-SRVKXCTJSA-N Lys-Ser-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O IOQWIOPSKJOEKI-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- DIBZLYZXTSVGLN-CIUDSAMLSA-N Lys-Ser-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DIBZLYZXTSVGLN-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- MYTOTTSMVMWVJN-STQMWFEESA-N Lys-Tyr Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 MYTOTTSMVMWVJN-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- 108010010995 MART-1 Antigen Proteins 0.000 description 1
- 208000030070 Malignant epithelial tumor of ovary Diseases 0.000 description 1
- 206010064912 Malignant transformation Diseases 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N Maltose Natural products O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)OC(O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N 0.000 description 1
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 1
- 229930195725 Mannitol Natural products 0.000 description 1
- 102100030417 Matrilysin Human genes 0.000 description 1
- 108010076557 Matrix Metalloproteinase 14 Proteins 0.000 description 1
- 108010071463 Melanoma-Specific Antigens Proteins 0.000 description 1
- 102000007557 Melanoma-Specific Antigens Human genes 0.000 description 1
- JHKXZYLNVJRAAJ-WDSKDSINSA-N Met-Ala Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O JHKXZYLNVJRAAJ-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- QXOHLNCNYLGICT-YFKPBYRVSA-N Met-Gly Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O QXOHLNCNYLGICT-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- WWWGMQHQSAUXBU-BQBZGAKWSA-N Met-Gly-Asn Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O WWWGMQHQSAUXBU-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- NLDXSXDCNZIQCN-ULQDDVLXSA-N Met-Phe-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CCSC)CC1=CC=CC=C1 NLDXSXDCNZIQCN-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- 101100502747 Mus musculus Fgf8 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000186359 Mycobacterium Species 0.000 description 1
- 241000186362 Mycobacterium leprae Species 0.000 description 1
- 241000187479 Mycobacterium tuberculosis Species 0.000 description 1
- WUGMRIBZSVSJNP-UHFFFAOYSA-N N-L-alanyl-L-tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)C(N)C)C(O)=O)=CNC2=C1 WUGMRIBZSVSJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-leucine Natural products CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010079364 N-glycylalanine Proteins 0.000 description 1
- 241001644525 Nastus productus Species 0.000 description 1
- 206010061309 Neoplasm progression Diseases 0.000 description 1
- 206010029113 Neovascularisation Diseases 0.000 description 1
- 206010029260 Neuroblastoma Diseases 0.000 description 1
- 108090000189 Neuropeptides Proteins 0.000 description 1
- 102000003797 Neuropeptides Human genes 0.000 description 1
- 108010038807 Oligopeptides Proteins 0.000 description 1
- 102000015636 Oligopeptides Human genes 0.000 description 1
- 108700006640 OspA Proteins 0.000 description 1
- 208000007571 Ovarian Epithelial Carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 206010061328 Ovarian epithelial cancer Diseases 0.000 description 1
- 238000010222 PCR analysis Methods 0.000 description 1
- 206010061902 Pancreatic neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 241000282320 Panthera leo Species 0.000 description 1
- 241001494479 Pecora Species 0.000 description 1
- 108010087702 Penicillinase Proteins 0.000 description 1
- FIRWJEJVFFGXSH-RYUDHWBXSA-N Phe-Glu-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 FIRWJEJVFFGXSH-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- GLUBLISJVJFHQS-VIFPVBQESA-N Phe-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 GLUBLISJVJFHQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- OVJMCXAPGFDGMG-HKUYNNGSSA-N Phe-Gly-Trp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O OVJMCXAPGFDGMG-HKUYNNGSSA-N 0.000 description 1
- WEMYTDDMDBLPMI-DKIMLUQUSA-N Phe-Ile-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)N WEMYTDDMDBLPMI-DKIMLUQUSA-N 0.000 description 1
- YKUGPVXSDOOANW-KKUMJFAQSA-N Phe-Leu-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O YKUGPVXSDOOANW-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- YTILBRIUASDGBL-BZSNNMDCSA-N Phe-Leu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 YTILBRIUASDGBL-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- KNYPNEYICHHLQL-ACRUOGEOSA-N Phe-Leu-Tyr Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 KNYPNEYICHHLQL-ACRUOGEOSA-N 0.000 description 1
- GKZIWHRNKRBEOH-HOTGVXAUSA-N Phe-Phe Chemical compound C([C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C([O-])=O)C1=CC=CC=C1 GKZIWHRNKRBEOH-HOTGVXAUSA-N 0.000 description 1
- AFNJAQVMTIQTCB-DLOVCJGASA-N Phe-Ser-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 AFNJAQVMTIQTCB-DLOVCJGASA-N 0.000 description 1
- BPCLGWHVPVTTFM-QWRGUYRKSA-N Phe-Ser-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O BPCLGWHVPVTTFM-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- IAOZOFPONWDXNT-IXOXFDKPSA-N Phe-Ser-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O IAOZOFPONWDXNT-IXOXFDKPSA-N 0.000 description 1
- 102000001105 Phosphofructokinases Human genes 0.000 description 1
- 108010069341 Phosphofructokinases Proteins 0.000 description 1
- 102000012288 Phosphopyruvate Hydratase Human genes 0.000 description 1
- 108010022181 Phosphopyruvate Hydratase Proteins 0.000 description 1
- 241000235648 Pichia Species 0.000 description 1
- 241000224016 Plasmodium Species 0.000 description 1
- 241000276498 Pollachius virens Species 0.000 description 1
- 108091036414 Polyinosinic:polycytidylic acid Proteins 0.000 description 1
- 239000004793 Polystyrene Substances 0.000 description 1
- ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N Potassium Chemical compound [K] ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XQSREVQDGCPFRJ-STQMWFEESA-N Pro-Gly-Phe Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O XQSREVQDGCPFRJ-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- 102100033237 Pro-epidermal growth factor Human genes 0.000 description 1
- 101710093543 Probable non-specific lipid-transfer protein Proteins 0.000 description 1
- 208000004403 Prostatic Hyperplasia Diseases 0.000 description 1
- 239000004365 Protease Substances 0.000 description 1
- 102100030616 Protein-cysteine N-palmitoyltransferase HHAT Human genes 0.000 description 1
- 108010011939 Pyruvate Decarboxylase Proteins 0.000 description 1
- 102000013009 Pyruvate Kinase Human genes 0.000 description 1
- 108020005115 Pyruvate Kinase Proteins 0.000 description 1
- 108020005067 RNA Splice Sites Proteins 0.000 description 1
- 238000010240 RT-PCR analysis Methods 0.000 description 1
- 101710100969 Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3 Proteins 0.000 description 1
- 201000000582 Retinoblastoma Diseases 0.000 description 1
- 206010039491 Sarcoma Diseases 0.000 description 1
- 229940124639 Selective inhibitor Drugs 0.000 description 1
- SSJMZMUVNKEENT-IMJSIDKUSA-N Ser-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CO SSJMZMUVNKEENT-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- WDXYVIIVDIDOSX-DCAQKATOSA-N Ser-Arg-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CO)CCCN=C(N)N WDXYVIIVDIDOSX-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- VBKBDLMWICBSCY-IMJSIDKUSA-N Ser-Asp Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O VBKBDLMWICBSCY-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- PVDTYLHUWAEYGY-CIUDSAMLSA-N Ser-Glu-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O PVDTYLHUWAEYGY-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- AEGUWTFAQQWVLC-BQBZGAKWSA-N Ser-Gly-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O AEGUWTFAQQWVLC-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- BXLYSRPHVMCOPS-ACZMJKKPSA-N Ser-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO BXLYSRPHVMCOPS-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- HBTCFCHYALPXME-HTFCKZLJSA-N Ser-Ile-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O HBTCFCHYALPXME-HTFCKZLJSA-N 0.000 description 1
- GZSZPKSBVAOGIE-CIUDSAMLSA-N Ser-Lys-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O GZSZPKSBVAOGIE-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- XUDRHBPSPAPDJP-SRVKXCTJSA-N Ser-Lys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CO XUDRHBPSPAPDJP-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- WGDYNRCOQRERLZ-KKUMJFAQSA-N Ser-Lys-Phe Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CO)N WGDYNRCOQRERLZ-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- IFLVBVIYADZIQO-DCAQKATOSA-N Ser-Met-Lys Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N IFLVBVIYADZIQO-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- UGTZYIPOBYXWRW-SRVKXCTJSA-N Ser-Phe-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O UGTZYIPOBYXWRW-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- XKFJENWJGHMDLI-QWRGUYRKSA-N Ser-Phe-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)NCC(O)=O XKFJENWJGHMDLI-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- BSXKBOUZDAZXHE-CIUDSAMLSA-N Ser-Pro-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O BSXKBOUZDAZXHE-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- NVNPWELENFJOHH-CIUDSAMLSA-N Ser-Ser-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CO)N NVNPWELENFJOHH-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- LZLREEUGSYITMX-JQWIXIFHSA-N Ser-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CO)N)C(O)=O)=CNC2=C1 LZLREEUGSYITMX-JQWIXIFHSA-N 0.000 description 1
- UQGAAZXSCGWMFU-UBHSHLNASA-N Ser-Trp-Asp Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N UQGAAZXSCGWMFU-UBHSHLNASA-N 0.000 description 1
- 241000287219 Serinus canaria Species 0.000 description 1
- 241000607768 Shigella Species 0.000 description 1
- 101710084578 Short neurotoxin 1 Proteins 0.000 description 1
- 101710173694 Short transient receptor potential channel 2 Proteins 0.000 description 1
- BQCADISMDOOEFD-UHFFFAOYSA-N Silver Chemical compound [Ag] BQCADISMDOOEFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 229920002125 Sokalan® Polymers 0.000 description 1
- 241000191967 Staphylococcus aureus Species 0.000 description 1
- 241000194017 Streptococcus Species 0.000 description 1
- 102100030416 Stromelysin-1 Human genes 0.000 description 1
- 208000005400 Synovial Cyst Diseases 0.000 description 1
- 230000017274 T cell anergy Effects 0.000 description 1
- 101150006914 TRP1 gene Proteins 0.000 description 1
- 108010055044 Tetanus Toxin Proteins 0.000 description 1
- 239000004098 Tetracycline Substances 0.000 description 1
- MQBTXMPQNCGSSZ-OSUNSFLBSA-N Thr-Arg-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)O)CCCN=C(N)N MQBTXMPQNCGSSZ-OSUNSFLBSA-N 0.000 description 1
- OHAJHDJOCKKJLV-LKXGYXEUSA-N Thr-Asp-Ser Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O OHAJHDJOCKKJLV-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 1
- BIYXEUAFGLTAEM-WUJLRWPWSA-N Thr-Gly Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O BIYXEUAFGLTAEM-WUJLRWPWSA-N 0.000 description 1
- MECLEFZMPPOEAC-VOAKCMCISA-N Thr-Leu-Lys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N)O MECLEFZMPPOEAC-VOAKCMCISA-N 0.000 description 1
- AHERARIZBPOMNU-KATARQTJSA-N Thr-Ser-Leu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O AHERARIZBPOMNU-KATARQTJSA-N 0.000 description 1
- REJRKTOJTCPDPO-IRIUXVKKSA-N Thr-Tyr-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O REJRKTOJTCPDPO-IRIUXVKKSA-N 0.000 description 1
- IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N Thymidine Chemical compound O=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N 0.000 description 1
- 101710182532 Toxin a Proteins 0.000 description 1
- 108010033576 Transferrin Receptors Proteins 0.000 description 1
- 102100023935 Transmembrane glycoprotein NMB Human genes 0.000 description 1
- SNJAPSVIPKUMCK-NWLDYVSISA-N Trp-Glu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O SNJAPSVIPKUMCK-NWLDYVSISA-N 0.000 description 1
- DZIKVMCFXIIETR-JSGCOSHPSA-N Trp-Gly-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O DZIKVMCFXIIETR-JSGCOSHPSA-N 0.000 description 1
- WHJVRIBYQWHRQA-NQCBNZPSSA-N Trp-Phe-Ile Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C1=CC=CC=C1 WHJVRIBYQWHRQA-NQCBNZPSSA-N 0.000 description 1
- DYIXEGROAOVQPK-VFAJRCTISA-N Trp-Thr-Lys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)N)O DYIXEGROAOVQPK-VFAJRCTISA-N 0.000 description 1
- DLZKEQQWXODGGZ-KWQFWETISA-N Tyr-Ala-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 DLZKEQQWXODGGZ-KWQFWETISA-N 0.000 description 1
- WTXQBCCKXIKKHB-JYJNAYRXSA-N Tyr-Arg-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O WTXQBCCKXIKKHB-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- GAYLGYUVTDMLKC-UWJYBYFXSA-N Tyr-Asp-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 GAYLGYUVTDMLKC-UWJYBYFXSA-N 0.000 description 1
- NRFTYDWKWGJLAR-MELADBBJSA-N Tyr-Asp-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)N)C(=O)O NRFTYDWKWGJLAR-MELADBBJSA-N 0.000 description 1
- JKUZFODWJGEQAP-KBPBESRZSA-N Tyr-Gly-Lys Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N)O JKUZFODWJGEQAP-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- FBHBVXUBTYVCRU-BZSNNMDCSA-N Tyr-His-Leu Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC=1C=CC(O)=CC=1)C1=CN=CN1 FBHBVXUBTYVCRU-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- WTTRJMAZPDHPGS-KKXDTOCCSA-N Tyr-Phe-Ala Chemical compound C[C@H](NC(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)[C@@H](N)Cc1ccc(O)cc1)C(O)=O WTTRJMAZPDHPGS-KKXDTOCCSA-N 0.000 description 1
- QPOUERMDWKKZEG-HJPIBITLSA-N Tyr-Ser-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 QPOUERMDWKKZEG-HJPIBITLSA-N 0.000 description 1
- PWKMJDQXKCENMF-MEYUZBJRSA-N Tyr-Thr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O PWKMJDQXKCENMF-MEYUZBJRSA-N 0.000 description 1
- 108091008605 VEGF receptors Proteins 0.000 description 1
- SLLKXDSRVAOREO-KZVJFYERSA-N Val-Ala-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O SLLKXDSRVAOREO-KZVJFYERSA-N 0.000 description 1
- 102000016549 Vascular Endothelial Growth Factor Receptor-2 Human genes 0.000 description 1
- 102000009484 Vascular Endothelial Growth Factor Receptors Human genes 0.000 description 1
- 241000607626 Vibrio cholerae Species 0.000 description 1
- 208000004354 Vulvar Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 1
- 230000001154 acute effect Effects 0.000 description 1
- 239000000654 additive Substances 0.000 description 1
- 230000006838 adverse reaction Effects 0.000 description 1
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 1
- 238000001261 affinity purification Methods 0.000 description 1
- 108010086434 alanyl-seryl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010070944 alanylhistidine Proteins 0.000 description 1
- 108010011559 alanylphenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 230000029936 alkylation Effects 0.000 description 1
- 238000005804 alkylation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000000172 allergic effect Effects 0.000 description 1
- 230000000735 allogeneic effect Effects 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-PHYPRBDBSA-N alpha-D-galactose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-PHYPRBDBSA-N 0.000 description 1
- KOSRFJWDECSPRO-UHFFFAOYSA-N alpha-L-glutamyl-L-glutamic acid Natural products OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(CCC(O)=O)C(O)=O KOSRFJWDECSPRO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000004075 alteration Effects 0.000 description 1
- 229940037003 alum Drugs 0.000 description 1
- WNROFYMDJYEPJX-UHFFFAOYSA-K aluminium hydroxide Chemical compound [OH-].[OH-].[OH-].[Al+3] WNROFYMDJYEPJX-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- ILRRQNADMUWWFW-UHFFFAOYSA-K aluminium phosphate Chemical compound O1[Al]2OP1(=O)O2 ILRRQNADMUWWFW-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 229910000147 aluminium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 1
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 1
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 1
- 230000019552 anatomical structure morphogenesis Effects 0.000 description 1
- 210000003484 anatomy Anatomy 0.000 description 1
- 102000001307 androgen receptors Human genes 0.000 description 1
- 108010080146 androgen receptors Proteins 0.000 description 1
- 230000002491 angiogenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000002547 anomalous effect Effects 0.000 description 1
- 230000010056 antibody-dependent cellular cytotoxicity Effects 0.000 description 1
- 230000027645 antigenic variation Effects 0.000 description 1
- 210000000709 aorta Anatomy 0.000 description 1
- 108010038850 arginyl-isoleucyl-tyrosine Proteins 0.000 description 1
- 108010038633 aspartylglutamate Proteins 0.000 description 1
- 108010047857 aspartylglycine Proteins 0.000 description 1
- 108010092854 aspartyllysine Proteins 0.000 description 1
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical compound [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000010668 atopic eczema Diseases 0.000 description 1
- 238000013475 authorization Methods 0.000 description 1
- 230000001363 autoimmune Effects 0.000 description 1
- 102000006635 beta-lactamase Human genes 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-QUYVBRFLSA-N beta-maltose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QUYVBRFLSA-N 0.000 description 1
- 230000008827 biological function Effects 0.000 description 1
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 1
- 229960000074 biopharmaceutical Drugs 0.000 description 1
- 230000008499 blood brain barrier function Effects 0.000 description 1
- 210000001218 blood-brain barrier Anatomy 0.000 description 1
- 210000001185 bone marrow Anatomy 0.000 description 1
- 201000003149 breast fibroadenoma Diseases 0.000 description 1
- 239000007975 buffered saline Substances 0.000 description 1
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 1
- 238000002619 cancer immunotherapy Methods 0.000 description 1
- 230000000711 cancerogenic effect Effects 0.000 description 1
- 239000002775 capsule Substances 0.000 description 1
- 239000004202 carbamide Substances 0.000 description 1
- 231100000504 carcinogenesis Toxicity 0.000 description 1
- 231100000315 carcinogenic Toxicity 0.000 description 1
- 230000000747 cardiac effect Effects 0.000 description 1
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 description 1
- 238000006555 catalytic reaction Methods 0.000 description 1
- 230000020411 cell activation Effects 0.000 description 1
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 1
- 230000022534 cell killing Effects 0.000 description 1
- 230000009087 cell motility Effects 0.000 description 1
- 239000006285 cell suspension Substances 0.000 description 1
- 210000002421 cell wall Anatomy 0.000 description 1
- 239000001913 cellulose Substances 0.000 description 1
- 229920002678 cellulose Polymers 0.000 description 1
- 210000003679 cervix uteri Anatomy 0.000 description 1
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 1
- 239000003638 chemical reducing agent Substances 0.000 description 1
- 238000002512 chemotherapy Methods 0.000 description 1
- 210000004978 chinese hamster ovary cell Anatomy 0.000 description 1
- 229910052804 chromium Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 1
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 238000004140 cleaning Methods 0.000 description 1
- 238000011260 co-administration Methods 0.000 description 1
- 230000004186 co-expression Effects 0.000 description 1
- 239000011248 coating agent Substances 0.000 description 1
- 238000000576 coating method Methods 0.000 description 1
- 230000002860 competitive effect Effects 0.000 description 1
- 230000024203 complement activation Effects 0.000 description 1
- 230000004154 complement system Effects 0.000 description 1
- 230000009827 complement-dependent cellular cytotoxicity Effects 0.000 description 1
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 1
- 238000000205 computational method Methods 0.000 description 1
- 229940031670 conjugate vaccine Drugs 0.000 description 1
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 1
- 238000011443 conventional therapy Methods 0.000 description 1
- 238000004132 cross linking Methods 0.000 description 1
- 239000003431 cross linking reagent Substances 0.000 description 1
- 239000013078 crystal Substances 0.000 description 1
- 210000004748 cultured cell Anatomy 0.000 description 1
- 208000035250 cutaneous malignant susceptibility to 1 melanoma Diseases 0.000 description 1
- WZHCOOQXZCIUNC-UHFFFAOYSA-N cyclandelate Chemical compound C1C(C)(C)CC(C)CC1OC(=O)C(O)C1=CC=CC=C1 WZHCOOQXZCIUNC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000001945 cysteines Chemical class 0.000 description 1
- 230000001461 cytolytic effect Effects 0.000 description 1
- 230000003013 cytotoxicity Effects 0.000 description 1
- 231100000135 cytotoxicity Toxicity 0.000 description 1
- 231100000263 cytotoxicity test Toxicity 0.000 description 1
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 1
- 230000007123 defense Effects 0.000 description 1
- 230000006735 deficit Effects 0.000 description 1
- 230000002939 deleterious effect Effects 0.000 description 1
- 239000003398 denaturant Substances 0.000 description 1
- 238000001212 derivatisation Methods 0.000 description 1
- 239000008121 dextrose Substances 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 1
- 239000000539 dimer Substances 0.000 description 1
- PSLWZOIUBRXAQW-UHFFFAOYSA-M dimethyl(dioctadecyl)azanium;bromide Chemical compound [Br-].CCCCCCCCCCCCCCCCCC[N+](C)(C)CCCCCCCCCCCCCCCCCC PSLWZOIUBRXAQW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 238000004090 dissolution Methods 0.000 description 1
- 230000006334 disulfide bridging Effects 0.000 description 1
- 239000002552 dosage form Substances 0.000 description 1
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 description 1
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 1
- 230000013020 embryo development Effects 0.000 description 1
- 239000003995 emulsifying agent Substances 0.000 description 1
- 230000002121 endocytic effect Effects 0.000 description 1
- 230000012202 endocytosis Effects 0.000 description 1
- 210000001163 endosome Anatomy 0.000 description 1
- 210000003238 esophagus Anatomy 0.000 description 1
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 1
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 1
- 230000002349 favourable effect Effects 0.000 description 1
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 description 1
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 description 1
- 230000035558 fertility Effects 0.000 description 1
- 230000004720 fertilization Effects 0.000 description 1
- 238000013100 final test Methods 0.000 description 1
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 1
- MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N fluorescein-5-isothiocyanate Chemical compound O1C(=O)C2=CC(N=C=S)=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000013467 fragmentation Methods 0.000 description 1
- 238000006062 fragmentation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000002538 fungal effect Effects 0.000 description 1
- 229930182830 galactose Natural products 0.000 description 1
- 229940044627 gamma-interferon Drugs 0.000 description 1
- 208000010749 gastric carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 230000002496 gastric effect Effects 0.000 description 1
- 210000001647 gastrula Anatomy 0.000 description 1
- 238000002523 gelfiltration Methods 0.000 description 1
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 1
- 230000009206 glutamatergic signaling Effects 0.000 description 1
- 102000006602 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Human genes 0.000 description 1
- 108020004445 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Proteins 0.000 description 1
- 150000002334 glycols Chemical class 0.000 description 1
- 230000002414 glycolytic effect Effects 0.000 description 1
- 102000035122 glycosylated proteins Human genes 0.000 description 1
- 108091005608 glycosylated proteins Proteins 0.000 description 1
- 108010067216 glycyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010082286 glycyl-seryl-alanine Proteins 0.000 description 1
- 108010089804 glycyl-threonine Proteins 0.000 description 1
- YMAWOPBAYDPSLA-UHFFFAOYSA-N glycylglycine Chemical compound [NH3+]CC(=O)NCC([O-])=O YMAWOPBAYDPSLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010081551 glycylphenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 210000003714 granulocyte Anatomy 0.000 description 1
- 210000003128 head Anatomy 0.000 description 1
- 208000014829 head and neck neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 1
- 229940022353 herceptin Drugs 0.000 description 1
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010018006 histidylserine Proteins 0.000 description 1
- 102000057041 human TNF Human genes 0.000 description 1
- 239000003906 humectant Substances 0.000 description 1
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 description 1
- 125000001183 hydrocarbyl group Chemical group 0.000 description 1
- 230000003301 hydrolyzing effect Effects 0.000 description 1
- 150000004679 hydroxides Chemical class 0.000 description 1
- 206010020718 hyperplasia Diseases 0.000 description 1
- 210000003016 hypothalamus Anatomy 0.000 description 1
- 239000012642 immune effector Substances 0.000 description 1
- 230000008105 immune reaction Effects 0.000 description 1
- 229940124452 immunizing agent Drugs 0.000 description 1
- 229940127121 immunoconjugate Drugs 0.000 description 1
- 238000002991 immunohistochemical analysis Methods 0.000 description 1
- 230000002055 immunohistochemical effect Effects 0.000 description 1
- 239000000568 immunological adjuvant Substances 0.000 description 1
- 230000006054 immunological memory Effects 0.000 description 1
- 230000001771 impaired effect Effects 0.000 description 1
- 230000001976 improved effect Effects 0.000 description 1
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 1
- 238000007901 in situ hybridization Methods 0.000 description 1
- 238000005462 in vivo assay Methods 0.000 description 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 230000004054 inflammatory process Effects 0.000 description 1
- 230000028709 inflammatory response Effects 0.000 description 1
- 238000013383 initial experiment Methods 0.000 description 1
- 150000007529 inorganic bases Chemical class 0.000 description 1
- 230000002452 interceptive effect Effects 0.000 description 1
- 108010088383 interleukin-6 receptor alpha Proteins 0.000 description 1
- 201000003159 intraductal papilloma Diseases 0.000 description 1
- 238000010255 intramuscular injection Methods 0.000 description 1
- 239000007927 intramuscular injection Substances 0.000 description 1
- 238000007912 intraperitoneal administration Methods 0.000 description 1
- 238000011835 investigation Methods 0.000 description 1
- 230000001788 irregular Effects 0.000 description 1
- 230000007794 irritation Effects 0.000 description 1
- 108010044374 isoleucyl-tyrosine Proteins 0.000 description 1
- JJWLVOIRVHMVIS-UHFFFAOYSA-N isopropylamine Chemical compound CC(C)N JJWLVOIRVHMVIS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000000155 isotopic effect Effects 0.000 description 1
- 230000002147 killing effect Effects 0.000 description 1
- 238000011813 knockout mouse model Methods 0.000 description 1
- 108010053037 kyotorphin Proteins 0.000 description 1
- 210000002429 large intestine Anatomy 0.000 description 1
- 230000002015 leaf growth Effects 0.000 description 1
- 108010044311 leucyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010034529 leucyl-lysine Proteins 0.000 description 1
- 230000021633 leukocyte mediated immunity Effects 0.000 description 1
- 108020001756 ligand binding domains Proteins 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 1
- 230000004807 localization Effects 0.000 description 1
- 208000037841 lung tumor Diseases 0.000 description 1
- 230000001926 lymphatic effect Effects 0.000 description 1
- 125000003588 lysine group Chemical group [H]N([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(N([H])[H])C(*)=O 0.000 description 1
- 210000003712 lysosome Anatomy 0.000 description 1
- 230000001868 lysosomic effect Effects 0.000 description 1
- 108010054155 lysyllysine Proteins 0.000 description 1
- ZLNQQNXFFQJAID-UHFFFAOYSA-L magnesium carbonate Chemical compound [Mg+2].[O-]C([O-])=O ZLNQQNXFFQJAID-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 239000001095 magnesium carbonate Substances 0.000 description 1
- 229910000021 magnesium carbonate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019359 magnesium stearate Nutrition 0.000 description 1
- 230000014759 maintenance of location Effects 0.000 description 1
- 230000036212 malign transformation Effects 0.000 description 1
- 239000000594 mannitol Substances 0.000 description 1
- 235000010355 mannitol Nutrition 0.000 description 1
- 201000006512 mast cell neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 208000006971 mastocytoma Diseases 0.000 description 1
- 102000006240 membrane receptors Human genes 0.000 description 1
- 108020004084 membrane receptors Proteins 0.000 description 1
- 210000003716 mesoderm Anatomy 0.000 description 1
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 description 1
- 229910052751 metal Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000002184 metal Substances 0.000 description 1
- 108010005942 methionylglycine Proteins 0.000 description 1
- 108010085203 methionylmethionine Proteins 0.000 description 1
- 230000003278 mimic effect Effects 0.000 description 1
- 150000007522 mineralic acids Chemical class 0.000 description 1
- 230000009456 molecular mechanism Effects 0.000 description 1
- 238000002625 monoclonal antibody therapy Methods 0.000 description 1
- 210000005087 mononuclear cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000010172 mouse model Methods 0.000 description 1
- 210000003097 mucus Anatomy 0.000 description 1
- 230000000869 mutational effect Effects 0.000 description 1
- 210000004897 n-terminal region Anatomy 0.000 description 1
- 210000003739 neck Anatomy 0.000 description 1
- 230000009826 neoplastic cell growth Effects 0.000 description 1
- 210000005036 nerve Anatomy 0.000 description 1
- 210000002569 neuron Anatomy 0.000 description 1
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 1
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- QYSGYZVSCZSLHT-UHFFFAOYSA-N octafluoropropane Chemical compound FC(F)(F)C(F)(F)C(F)(F)F QYSGYZVSCZSLHT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000002246 oncogenic effect Effects 0.000 description 1
- 102000027450 oncoproteins Human genes 0.000 description 1
- 108091008819 oncoproteins Proteins 0.000 description 1
- 150000007524 organic acids Chemical class 0.000 description 1
- 235000005985 organic acids Nutrition 0.000 description 1
- 150000007530 organic bases Chemical class 0.000 description 1
- 229940099789 ospa protein Drugs 0.000 description 1
- 230000002611 ovarian Effects 0.000 description 1
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001301 oxygen Substances 0.000 description 1
- 239000006174 pH buffer Substances 0.000 description 1
- 238000004806 packaging method and process Methods 0.000 description 1
- 201000002094 pancreatic adenocarcinoma Diseases 0.000 description 1
- 230000003076 paracrine Effects 0.000 description 1
- 210000002990 parathyroid gland Anatomy 0.000 description 1
- 238000007911 parenteral administration Methods 0.000 description 1
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 1
- 230000001575 pathological effect Effects 0.000 description 1
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 1
- 230000035515 penetration Effects 0.000 description 1
- 229950009506 penicillinase Drugs 0.000 description 1
- 239000000863 peptide conjugate Substances 0.000 description 1
- 229940023041 peptide vaccine Drugs 0.000 description 1
- 230000008823 permeabilization Effects 0.000 description 1
- 210000001539 phagocyte Anatomy 0.000 description 1
- 238000009520 phase I clinical trial Methods 0.000 description 1
- 108010073101 phenylalanylleucine Proteins 0.000 description 1
- 238000003566 phosphorylation assay Methods 0.000 description 1
- 230000001766 physiological effect Effects 0.000 description 1
- 239000006187 pill Substances 0.000 description 1
- 230000008884 pinocytosis Effects 0.000 description 1
- 210000002826 placenta Anatomy 0.000 description 1
- 230000003169 placental effect Effects 0.000 description 1
- 229920002704 polyhistidine Polymers 0.000 description 1
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 description 1
- 229920002223 polystyrene Polymers 0.000 description 1
- 230000002980 postoperative effect Effects 0.000 description 1
- 229910052700 potassium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011591 potassium Substances 0.000 description 1
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 1
- 230000001376 precipitating effect Effects 0.000 description 1
- MFDFERRIHVXMIY-UHFFFAOYSA-N procaine Chemical compound CCN(CC)CCOC(=O)C1=CC=C(N)C=C1 MFDFERRIHVXMIY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960004919 procaine Drugs 0.000 description 1
- 230000000750 progressive effect Effects 0.000 description 1
- 210000001236 prokaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000002062 proliferating effect Effects 0.000 description 1
- 201000007094 prostatitis Diseases 0.000 description 1
- 235000019833 protease Nutrition 0.000 description 1
- 235000019419 proteases Nutrition 0.000 description 1
- 230000020801 protein mannosylation Effects 0.000 description 1
- 229940024999 proteolytic enzymes for treatment of wounds and ulcers Drugs 0.000 description 1
- XNSAINXGIQZQOO-SRVKXCTJSA-N protirelin Chemical compound NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H]1NC(=O)CC1)CC1=CN=CN1 XNSAINXGIQZQOO-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- 230000005855 radiation Effects 0.000 description 1
- 230000007420 reactivation Effects 0.000 description 1
- 229940044551 receptor antagonist Drugs 0.000 description 1
- 239000002464 receptor antagonist Substances 0.000 description 1
- 230000033300 receptor internalization Effects 0.000 description 1
- 230000022983 regulation of cell cycle Effects 0.000 description 1
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 1
- 210000005084 renal tissue Anatomy 0.000 description 1
- 238000009877 rendering Methods 0.000 description 1
- 230000027272 reproductive process Effects 0.000 description 1
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 description 1
- 238000012552 review Methods 0.000 description 1
- 239000011435 rock Substances 0.000 description 1
- CVHZOJJKTDOEJC-UHFFFAOYSA-N saccharin Chemical compound C1=CC=C2C(=O)NS(=O)(=O)C2=C1 CVHZOJJKTDOEJC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000009291 secondary effect Effects 0.000 description 1
- 230000034655 secondary growth Effects 0.000 description 1
- 230000000405 serological effect Effects 0.000 description 1
- 108010048397 seryl-lysyl-leucine Proteins 0.000 description 1
- 125000005629 sialic acid group Chemical group 0.000 description 1
- 230000019491 signal transduction Effects 0.000 description 1
- 229910052709 silver Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000004332 silver Substances 0.000 description 1
- 210000000813 small intestine Anatomy 0.000 description 1
- 238000011172 small scale experimental method Methods 0.000 description 1
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 238000005063 solubilization Methods 0.000 description 1
- 230000007928 solubilization Effects 0.000 description 1
- 230000002269 spontaneous effect Effects 0.000 description 1
- 230000006641 stabilisation Effects 0.000 description 1
- 238000011105 stabilization Methods 0.000 description 1
- 230000000087 stabilizing effect Effects 0.000 description 1
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 1
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 1
- 238000011301 standard therapy Methods 0.000 description 1
- 238000011272 standard treatment Methods 0.000 description 1
- 230000003068 static effect Effects 0.000 description 1
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 1
- 201000000498 stomach carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 1
- 230000008093 supporting effect Effects 0.000 description 1
- 238000001308 synthesis method Methods 0.000 description 1
- 239000003826 tablet Substances 0.000 description 1
- 108091035539 telomere Proteins 0.000 description 1
- 102000055501 telomere Human genes 0.000 description 1
- 208000001608 teratocarcinoma Diseases 0.000 description 1
- 229960003604 testosterone Drugs 0.000 description 1
- 229940118376 tetanus toxin Drugs 0.000 description 1
- 229960002180 tetracycline Drugs 0.000 description 1
- 229930101283 tetracycline Natural products 0.000 description 1
- 235000019364 tetracycline Nutrition 0.000 description 1
- 150000003522 tetracyclines Chemical class 0.000 description 1
- TXEYQDLBPFQVAA-UHFFFAOYSA-N tetrafluoromethane Chemical compound FC(F)(F)F TXEYQDLBPFQVAA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940126622 therapeutic monoclonal antibody Drugs 0.000 description 1
- 108010061238 threonyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010031491 threonyl-lysyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 210000002105 tongue Anatomy 0.000 description 1
- 231100000331 toxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000002588 toxic effect Effects 0.000 description 1
- 231100000041 toxicology testing Toxicity 0.000 description 1
- 210000003437 trachea Anatomy 0.000 description 1
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 1
- 108091007466 transmembrane glycoproteins Proteins 0.000 description 1
- 150000003626 triacylglycerols Chemical class 0.000 description 1
- 239000001226 triphosphate Substances 0.000 description 1
- 235000011178 triphosphate Nutrition 0.000 description 1
- UNXRWKVEANCORM-UHFFFAOYSA-N triphosphoric acid Chemical compound OP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O UNXRWKVEANCORM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000003648 triterpenes Chemical class 0.000 description 1
- 239000000107 tumor biomarker Substances 0.000 description 1
- 230000004565 tumor cell growth Effects 0.000 description 1
- 230000005740 tumor formation Effects 0.000 description 1
- 102000003390 tumor necrosis factor Human genes 0.000 description 1
- 230000005751 tumor progression Effects 0.000 description 1
- 230000037455 tumor specific immune response Effects 0.000 description 1
- 231100000588 tumorigenic Toxicity 0.000 description 1
- 230000000381 tumorigenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000005760 tumorsuppression Effects 0.000 description 1
- 108010005834 tyrosyl-alanyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 239000012646 vaccine adjuvant Substances 0.000 description 1
- 229940124931 vaccine adjuvant Drugs 0.000 description 1
- 229940124676 vascular endothelial growth factor receptor Drugs 0.000 description 1
- 210000003462 vein Anatomy 0.000 description 1
- 229940118696 vibrio cholerae Drugs 0.000 description 1
- 229960004854 viral vaccine Drugs 0.000 description 1
- 210000003905 vulva Anatomy 0.000 description 1
- 230000003442 weekly effect Effects 0.000 description 1
- 238000011816 wild-type C57Bl6 mouse Methods 0.000 description 1
- 210000005253 yeast cell Anatomy 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
- C07K16/28—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
- C07K16/30—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants from tumour cells
- C07K16/3069—Reproductive system, e.g. ovaria, uterus, testes, prostate
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/0005—Vertebrate antigens
- A61K39/0011—Cancer antigens
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K40/00—Cellular immunotherapy
- A61K40/10—Cellular immunotherapy characterised by the cell type used
- A61K40/19—Dendritic cells
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K40/00—Cellular immunotherapy
- A61K40/20—Cellular immunotherapy characterised by the effect or the function of the cells
- A61K40/24—Antigen-presenting cells [APC]
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K40/00—Cellular immunotherapy
- A61K40/40—Cellular immunotherapy characterised by antigens that are targeted or presented by cells of the immune system
- A61K40/41—Vertebrate antigens
- A61K40/42—Cancer antigens
- A61K40/4202—Receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
- A61K40/4203—Receptors for growth factors
- A61K40/4205—Her-2/neu/ErbB2, Her-3/ErbB3 or Her 4/ ErbB4
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P15/00—Drugs for genital or sexual disorders; Contraceptives
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
- A61P37/02—Immunomodulators
- A61P37/04—Immunostimulants
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/475—Growth factors; Growth regulators
- C07K14/50—Fibroblast growth factor [FGF]
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
- C07K14/70503—Immunoglobulin superfamily
- C07K14/70539—MHC-molecules, e.g. HLA-molecules
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
- C07K14/71—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants for growth factors; for growth regulators
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/30—Immunoglobulins specific features characterized by aspects of specificity or valency
- C07K2317/34—Identification of a linear epitope shorter than 20 amino acid residues or of a conformational epitope defined by amino acid residues
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2799/00—Uses of viruses
- C12N2799/02—Uses of viruses as vector
- C12N2799/021—Uses of viruses as vector for the expression of a heterologous nucleic acid
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
- Y02A50/00—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
- Y02A50/30—Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Mycology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Reproductive Health (AREA)
- Oncology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Gynecology & Obstetrics (AREA)
- Pregnancy & Childbirth (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Endocrinology (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Medicines Containing Plant Substances (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
Description
Imunogénna kompozícia a spôsob selekcie imunogénneho analógu
Oblasť techniky
Predkladaný vynález sa týka nových spôsobov boja proti chorobám, napríklad rakovine, pre ktoré je charakteristická prítomnosť produktov bunkovej génovej expresie, ktoré nevyvolávajú žiadnu alebo len slabú imunitnú reakciu. Predovšetkým sa vynález týka spôsobov indukovania imunitnej odpovedi organizmu riadenej cytotoxickými T-lymfocytmi (CTL), pomocou ktorej sú bunky nesúce epitopy z produktov génovej expresie napadané a hubené CT lýmfocytmi. Vynález sa tiež týka spôsobu prípravy imunogénnych modifikovaných polypeptídových antigénov, ktoré sú odvodené zo slabých imunogénnych antigénov.
Vynález sa ďalej týka sérií aplikácií technológie autovakcinácie (Applicants AutoVac technology, ktorá je predmetom patentu WO 95/05849) V oblasti terapeutickej vakcinácie proti rakovine.
Doterajší stav techniky
Myšlienka uskutočniť očkovanie proti rakovine je stará viac než sto rokov a v priebehu celého tohoto obdobia, zvlášť od konca dvadsiateho storočia, sa jej venuje opakovane až výbušná aktivita.
Behom posledných 10 rokov však došlo k výraznému rozvoju porozumenia základným molekulovým mechanizmom imunitnej odozvy. Medzi najdôležitejšie medzníky tohoto obdobia patria objavy stále sa rozširujúceho zoznamu cytokínov a rastových faktorov, pochopenie mechanizmu interakcie medzi T a B bunkami, ako aj určenie ciest spracovávania bunkového antigénu, vrátane úlohy a štruktúry molekúl MHC triedy I a II pri prezentácii antigénu. Dôležitým objavom v oblasti nádorovej imunológie, aj keď dodnes nie celkom pochopeným, bolo vysvetlenie mechanizmov tvoriacich základ indukcie imunologickej tolerancie v hostiteľovi. Všetky tieto výskumy vychádzali z obrovského úsilia vyvinúť nové liečebné postupy pre rakovinu.
Podľa toho, ako pacient získava nádorovú imunitu, sa režim imunoterapie delí na pasívny a aktívny. Pri pasívnych imunoterapeutických režimoch pacient dostáva imúnitné zložky, napríklad cytokíny, protilátky, cytotoxické T-bunky alebo lymfocytmi aktivované usmrcovacie bunky (LAK). Naproti tomu protokoly pre aktívnu špecifickú imunoterapiu zahrnujú aktívnu indukciu nádorovej imunity vakcináciou nádorovej bunky alebo jej antigénových zložiek. Táto forma liečenia je výhodná, pretože imunita trvá dlhšie.
Pasívne a aktívne nádorové vakcíny sa zameriavali na indukciu buď humorálnej alebo celulárnej imunitnej odozvy. Pre aktívne vakcíny je spoľahlivo určené, že indukcia CD4 pozitívnych T pomocných buniek je potrebná, aby sa sekundárne indukovali buď protilátky alebo cytotoxické CD8 pozitívne T bunky.
Pasívna vakcinácia protilátkami
Od objavu technológie monoklonovej protilátky v polovine sedemdesiatych rokov sa vyvinul celý rad terapeutických monoklonových protilátok namierených proti špecifickému nádoru alebo s ním spojeným antigénom. Monoklonová protilátková terapia však so sebou prináša niekolko vážnych problémov:
- Injekčná aplikácia cudzích látok vyvolá u pacienta imunitnú reakciu na vpichnuté protilátky, ktorá môže viesť ku zníženiu liečebného účinku, rovnako ako aj k vážnym alergickým vedľajším účinkom.
- Monoklonové protilátky sa musia obvykle podávať vo veľkom množstve. To je problém, pretože výrobné ceny monoklonových protilátok sú obrovské.
- Monoklonové protilátky sa musia podávať parenterálne a vzhladom k tomu, že je potrebné relatívne veľké množstvo, pacienti musia byť behom liečby často hospitalizovaný.
- Injekčná aplikácia monoklonových protilátok sa musí opakovať v relatívne krátkom intervale (týždne), aby sa zachoval liečebný účinok.
- Monoklonové protilátky nie sú obvykle schopné aktivovať sekundárne efektorové systémy imunitného systému, napríklad komplement, NK-bunky alebo makrofágy usmrcujúce nádorové bunky.
Posledne menovaná nevýhoda je zvlášť dôležitá pri terapii rakoviny a môže byť významnou príčinou toho, prečo nie je monoklonová protilátková terapia rakoviny v niektorých prípadoch práve úspešná. Takzvané „poľudštené monoklonové protilátky používané v súčasnosti mnohými spoločnosťami sú menej imunogénne, ale bohužiaľ sú aj menej schopné aktivovať sekundárne imunitné efektorové systémy. Naviac sa vyskytli príklady sekundárneho rastu nádorov, ktoré nemali antigén pôvodného nádoru, pretože tieto protilátky rozhodne nie sú z hľadiska pôsobenia na nádorové bunky „neškodnými divákmi, ktorý by neniesli nádorový antigén.
Nízka efektorová schopnosť monoklonových protilátok viedla k vývoju monoklonových protilátok chemicky viazaných na rôzne toxíny a rádioizotopy. Spoločnosť Pharmacia Upjohn AB napríklad vyvinula konjugát medzi nádorovo špecifickou monoklonovou protilátkou a toxínom A Staphylococcus aureus s cieľom aktivovať T bunky v nádore. Medarex Inc. vyvinul bišpecifické monoklonové protilátky obsahujúce nádorovo špecifický fragment Fab, ako aj fragment protilátky špecifický k Fc-receptoru, s cielom aktivovať makrofág hubiaci nádorové bunky. Obidva prípravky sú účinnejšie než samotná monoklonová protilátka, ale sú tiež drahšie a viac imunogénne. Protilátky konjugované na rádioizotopy sú tiež drahé a imunogénne, naviac sa u nich prejavujú iné obecne toxické vedľajšie účinky.
Objavenie technológie monoklonovéj protilátky bolo významným krokom vpred, ktorý umožnil výrobu dobre definovaných molekúl s vysokou väzobnou afinitou. Vzhľadom k tomu, že sú tieto protilátky monoklonové, reagujú len s jedným typom epitopu na nádorovom antigéne. To je hlavná príčina, prečo nie sú obvykle schopné aktivovať systém komplementu alebo sa viazať na Fc-receptory NK-buniek a makrofágov. Tieto velmi mocné systémy efektorov obvykle vyžadujú spoločné umiestenie rozmanitých fragmentov Fc protilátok vystupujúcich z antigénu.
Iný výskumný pracovníci sa pokúsili použiť kombináciu dvoch monoklonových protilátok, čo viedlo ku zlepšeniu účinnosti postupu. Miesto napadania nádorových buniek vysoko špecifickými polyklonovými protilátkami sa však zdá oveľa rozumnejšie sa zamerať na vlastné zvláštnosti nádoru alebo na nádorové antigény (so zvýšenou expresiou) alebo na receptory rastového faktoru. Takéto protilátky by boli schopné naplno aktivovať už zmienené sekundárne efektorové systémy. Okrem toho je pravdepodobné, že lokálna zápalová reakcia indukovaná týmito efektorovými systémami môže viesť 1 k sekundárnym účinkom na bunkách („neškodných divákoch), expresiu príslušného nádorového antigénu, k aktivácii nádorovo špecifických TIL (nádor prestupujúcich lymfocytov) v nádorovom tkanive. Takéto účinky zaznamenali u Medarex Inc. pri použití svojich bi-špecifických konjugátov monoklonových protilátok.
ktoré nemajú rovnako ako
Od objavu technológie monoklonovej protilátky sa potencionálne využitie polyklonových protilátok k liečbe rakoviny príliš nerozvíjalo (s výnimkou nižšie opísaných antigénov). Jedným z hlavných dôvodov je, že dobre definované nádorové špecifiky alebo s nádorom spojené povrchové antigény boli charakterizovane až v posledných rokoch, ale hlavne u mnohých z nich sa ukázalo, že sú vlastnými antigénmi, a preto sú neimunogénne. Preto by sa mali xenogénne polyklonové protilátky nevyhnutne používať pre štúdium týchto účinkov. Avšak takéto protilátky indukujú silnú imunitnú odozvu proti injektovaným cudzím polyklonovým protilátkam, ktorá rýchlo odstraňuje terapeutické účinky.
Aktívna vakcinácia pre indukciu protilátok
Nedávne pokusy indukovať terapeutické polyklonové protilátky aktívnou vakcináciou pacientov s rakovinou boli úspešné. Boli vyvinuté vakcíny proti vlastným uhľovodíkovým antigénom viazaným na membráne (napríklad cez kyslík viazané anomálne exprimované antigény Tn a sTn a gangliové liposacharidy GM2 a GD3). Tieto malé uhľovodíkové štruktúry sú však veľmi slabými antigénmi, preto sa musia použiť konjugáty týchto molekúl s nosičovými molekulami, ako je hemokyanín kliešťov (KHL) alebo ovčie mucíny (obsahujúce Tn a sTn) . U pacientov s melanómom viedla indukcia anti-GM2 protilátok k predĺženiu obdobia bez choroby a celkové prežitie potom dosiahlo minimálne 51 mesiacov. Tiež štúdie fáze II uskutočnené na náhodne vybraných pacientkách s rakovinou prsníka s použitím konjugátu sTn a KLH v adjuvans DETOX-B (BIOMIRA, Inc.) ukázali, že sTn imúnne pacientky mali výrazne dlhší priemerný čas prežitia než kontrolné pacientky. Ďalším príkladom aktívnej indukcie polyklonových protilátok proti rakovine je použitie idiotypickej špecifickej vakcinácie proti B-bunkovým lymfómom, ktoré, akokoľvek slubné, je účinné len proti tomuto typu rakoviny.
Konečne americká spoločnosť Aphton Inc. vyvinula aktívnu konjugovanú vakcínu proti hormónu uvoľňujúcemu gonadotropín (GnRH) a gastrínu. Ukázalo sa, že táto vakcína je schopná regulovať biologickú aktivitu uvedených hormónov, ktoré môžu tiež fungovať ako autokrinné rastové faktory pre určité nádorové bunky. Úspešná II. fáza klinických skúšok sa uskutočňovala na pacientoch s gastrointestinálnou rakovinou a III. fáza klinických skúšok prebieha.
Cytotoxické T-bunky
Niekolko skupín jasne demonštrovalo, že nádorovo špecifické cytotoxické T bunky (CTL*) sú prítomné v mnohých nádoroch. Tieto CT lymfocyty sa nazývajú nádor prestupujúce lymfocyty (TIL). Avšak tieto bunky prejavujú akúsi necitlivosť alebo sú anergické pri niektorých odlišných možných mechanizmoch, vrátane sekrécie imunosupresívnych cytokínov nádorovými bunkami, nedostatku spolustimulujúcich signálov, zníženia (down-regulation) počtu molekúl MHC triedy I atd.
Uskutočnilo sa veľa pokusov izolovať nádorovo špecifické peptidy viazané HLA triedy I rozpoznané TIL lymfocytmi, a niektoré z nich boli úspešné (napr. peptidy z melanómových antigénov). Takéto peptidy sa používajú k indukcii
I nádorovo špecifickej imunitnej odozvy v tele hostiteľa, ale praktické využitie nádorovo špecifických peptidov vo vakcínach sa obmedzuje na ohraničenú časť populácie, vzhľadom k tomu, že HLA triedy I sú z hľadiska väzby peptidov úzko špecifické. Naviac je obvykle relatívne obtiažne vyvolať CTL odozvu in vivo použitím syntetických peptidov, pretože tieto látky majú malý biologický polčas, ako aj kvôli ťažkostiam s exogénnou iniciáciou molekúl MHC triedy I.
Rad iných prístupov sa zameral na vyvolanie nádorovo špecifickej imunitnej odozvy CTL, vrátane použitia cytokínov (napr. IL-2, IFN-γ, IL-6, IL-4, IL-10 alebo GM-CSF) alebo spolustimulujúcich molekúl (B7), či už v rozpustnej forme alebo expresiou transfektovanej nádorovej bunky. S rôznym úspechom sa ďalej použila imunizácia celými alogénnymi alebo autológnymi bunkami alebo nádorovými antigénmi pripravenými vo špeciálnych adjuvans určenými pre prezentáciu antigénu spôsobom prezentácie antigénu cez MHC triedy I alebo nádorovými antigénmi exprimovanými v napr. vektoroch kiahní atd. Medzi nádorovými imunológmi preto stále prevláda presvedčenie, že jedna z najlepších ciest eliminácie nádorov je vyvolať silnú špecifickú proti nádorovú odozvu CTL.
Odhliadnuc od toho, že tieto liečby sú obvykle velmi drahé a obtiažne reprodukovateľné, ukazuje sa tiež, že je ťažké získať dobrú imunitnú odozvu proti nádoru, pretože mnohé nádorové antigény sú pravé vlastné proteíny, voči ktorým sa zdá byť väčšina T buniek tolerantná. Zdá sa preto nevyhnutné indukovať v pacientovi riadený bunkový autoimunitný stav.
Podstata vynálezu
Predmetom predkladaného vynálezu je poskytnutie vylepšených spôsobov a činidiel pre indukciu imunitných reakcií v organizme hostitela proti nežiadúcim antigénom, napr. nádorovým antigénom. Ďalej je predmetom vynálezu spôsob prípravy polypeptidových analógov takýchto nežiaducich antigénov, analógov, ktoré sú schopné indukovať účinnú imunitnú odozvu práve proti nežiadúcemu antigénu.
Súhrn
Antigény sa do istej miery dogmaticky predstavujú dvomi úplne oddelenými cestami: exogénnou (trieda II) a endogénnou (trieda I) .
Stručne povedané, cudzí proteín z vonkajšieho priestoru bunky alebo z bunkovej membrány sa absorbuje na APC ako endozóme, ktorý fúzuje s intracelulárnym kompartmentom, ktorý obsahuje proteolytické enzýmy a molekuly MHC triedy II. Niektoré z produkovaných peptidov sa viažu k triede II, ktoré sa potom premiestnia do bunkovej membrány.
Pre endogénnu cestu triedy I je charakteristická prevaha prezentácie cytosolických proteínov. Predpokladá sa, že dochádza k štiepaniu sprostredkovanému proteázou a následnému transportu peptidov do endoplazmatického retikula (ER) prostredníctvom molekúl TAP umiestnených v membráne ER. V ER sa peptidy viažu k triede I a následne sa transportujú do plazmatickej membrány.
Tieto dve cesty však nie sú úplne odlišné. Napríklad je známe, že dendritické bunky, a do určitej miery makrofágy, sú schopné endocytózy (pinocytózy) extracelulárnych proteínov a následne ich prezentovať v kontexte s MHC triedy I. Skôr sa tiež ukázalo, že použitím špecifických spôsobov podania, napríklad spojením s peletkami oxidu železitého, sú exogénne antigény schopné postupovať cestou triedy I (Rock, 1996). Tento mechanizmus sa zdá byť ústredný vzhladom k dôležitosti sprievodnej expresie tak triedy I ako aj triedy II na rovnakej APC na vyvolanie klastra troch bunkových typov. Interakcie tohoto klastra troch bunkových typov navrhol Mitchison (1987) a pozdnejšie iný autori. Ukázali dôležitosť súbežnej prezentácie epitopov triedy I a triedy II na tej istej APC. Podľa nedávno opísaného mechanizmu aktivácie CTL (porovnaj Lanzavecchia: Náture, 393, 1998, 413; Matzinger:
Náture Med., 5, 1999, 616; Ridge et al.: Náture, 393, 1998,
478; Schoenberger et al.: Náture, 393, 1998, 480; Ossendrop et al. : J. Exp. Med., 187, 1998, 693 a Mackey et al.: J. Immunol., 161, 1998, 2094) sú špecializované APC prezentujúce antigén na MHC triedy II rozpoznané T pomocnými bunkami. Výsledkom je aktivácia ACP (sprostredkovaná interakciou CD40L na T pomocnej .bunke a CD40 na APC). To umožňuje APC priamo stimulovať CT lymfocyty, ktoré sa týmto aktivujú (porovnaj tiež obr. 2).
Už skôr bolo demonštrované, že vloženie cudzej MHC triedy II, ktoré obmedzuje epitop T pomocnej bunky na vlastný antigén, poskytuje antigén schopný indukovať silné odozvy krížovo reagujúcich protilátok zamerané proti nemodifikovanému vlastnému antigénu (porovnaj patent žiadateľa WO 95/05849). Ukázalo sa, že indukcia autoprotilátok je spôsobená pomocou špecifickej T bunky indukovanej vloženým cudzím epitopom.
Dospeli sme však k záveru, že modifikované vlastné antigény by mali byť schopné - pomocou vhodných adjuvans - tiež indukovať silné odozvy CTL proti vlastným epitopom obmedzeným MHC triedy I, a preto sa technológia opísaná v patente WO 95/05849 môže tiež použiť pre uskutočnenie vakcinácie proti intracelulárnym a iným bunkovým antigénom, ktorých epitopy sa prezentujú v kontexte MHC triedy I.
Technológia autovakcinácie opísaná v patente WO 95/05849 má účinok, že pri aplikácii modifikovaného vlastného antigénu na vyvolanie cesty spracovávania antigénu cez MHC triedy II, je poskytnutá pomoc .špecifickej T bunky samoreaktivným B bunkám, (porovnaj obr. 1 a Dalum I. et al.: J. Immunol., 157, 1996, 4796-4804, a tiež Dalum I. et al.: Náture Biotechnol., 17, 1999, 666-669). Bolo ukázané, že potencionálne samoreagujúce B lymfocyty rozoznávajúce vlastné proteíny sú fyziologicky prítomné u normálnych jedincov. K tomu, aby tieto B lymfocyty boli indukované k skutočnej produkcii protilátok, ktoré reagujú s relevantnými vlastnými proteínmi, je však potrebná asistencia T-pomocných lymfocytov produkujúcich cytokín (THbunky alebo TH-lymfocyty). Obyčajne sa táto pomoc neuskutoční, pretože T-lymfocyty obecne nerozoznajú epitopy T-buniek odvodené z vlastných proteínov, keď sú prezentované bunkami prezentujúcimi antigén (APC). Zavedením „cudzieho elementu do vlastného proteínu (to je zavedením imunologický signifikantnej modifikácie) sa však T-bunky rozoznávajúce cudzí prvok aktivujú práve rozpoznaním cudzieho epitopu na APC (sprvu napríklad mononukleárnej bunky). Polyklonové Blymfocyty (prezentujúce T-bunkový epitop) schopné rozpoznať vlastné epitopy na modifikovanom vlastnom proteíne si tiež internalizujú antigén a následne prezentujú jeho epitop alebo jeho epitopy cudzej T-bunky a aktivované T-lymfocyty potom zaistia cytokínovú pomoc týmto samoreaktivným polyklonovým Blymfocytom. Vzhladom k tomu, že protilátky produkované týmito polyklonovými B-lymfocytmi reagujú s rôznymi epitopmi na modifikovanom polypeptide, aj s tými, ktoré sú obsiahnuté v natívnom polypeptide, indukuje sa protilátka krížovo reaktívna s nemodifikovaným vlastným proteínom. Záverom, Tlymfocyty je možné viesť k tomu, aby jednali akoby populácia polyklonových B-lymfocytov rozpoznávala úplne cudzí antigén, aj keď vo skutočnosti len vložený epitop/epitopy je/sú cudzie pre hostiteľa. Tým sa indukujú protilátky schopné krížovej reakcie s nemodifikovanými vlastnými antigénmi.
Ako už bolo povedané,. CTL* lymfocyty tiež vyžadujú pomoc špecifickej T-bunky, ale mechanizmus tohoto procesu nie je dosial objasnený.
Predkladaný vynález vychádza z našej novej teórie, že vlastné proteíny obsahujúce cudzie epitopy MHC triedy II, následkom exogénnej absorpcie, môžu získať prístup k ceste spracovávania antigénu MHC triedy I, napríklad ceste makrofágov a dendritických .búniek. Týmto spôsobom by sa mohla indukovať silná odozva CTL proti subdominantným epitopom vo vlastnom proteíne. Alebo sa môžu aplikovať gény kódujúce modifikované nádorové antigény ako vakcíny nukleových kyselín, ktoré nakoniec tiež vedú k imunitným odozvám sprostredkovaným MHC triedy II, ako aj MHC triedy I.
Nádorové bunky sú velmi slabými bunkami prezentujúcimi antigén v dôsledku nedostatočnej expresie MHC triedy I, nedostatku spolustimulačných molekúl alebo sekrécie imunosupresívnych cytokínov apod. Použitím autovakcinačných prípravkov a vakcinačného protokolu zmieneného vyššie môže byť modifikovaný nádorový antigén prezentovaný molekulami MHC triedy I ako aj MHC triedy II na špecializovaných bunkách prezentujúcich antigén. Spoločná prezentácia subdominantných vlastných epitopov na molekulách MHC triedy I a imunodominantných cudzích epitopov na molekulách MHC triedy II by sprostredkovala priamu cytokínovú pomoc od T-pomocných buniek obmedzených aktivovanými MHC triedy I až po ČT lymfocyty obmedzené MHC triedy II (obr. 2) . Podlá nášho názoru to povedie ku špecifickému narušeniu autotolerancie T-bunky voči nádorovému antigénu, čím sa dosiahne presne to, čo vyžaduje imunoterapia rakoviny.
Záverom je možné povedať, že vakcína pripravená vyššie naznačenou technológiou indukuje odozvu humorälnych autoprotilátok so sekundárnou aktiváciou komplementu a na protilátke závislú bunkovú cytotoxickú aktivitu (ADCC) . Tiež sa očakáva, že sa indukuje odozva cytotoxickéj T-bunky namierená proti napr. nádorovo špecifickému membránovému antigénu.
Predmetom predloženého vynálezu je preto v najširšom a najobecnejšom rámci spôsob indukovania imunitnej reakcie proti polypeptidovému antigénu u živočícha, vrátane človeka, pričom zmienený polypeptidový antigén je v živočíchovi slabo imunogénny alebo neimunogénny, spôsob zahrnujúci účinnú simultánnu prezentáciu v imunologický účinnom množstve
1) aspoň jedného CTL epitopu odvodeného z polypeptidového antigénu a/alebo aspoň jedného B-bunkového epitopu odvodeného z bunkového polypeptidového antigénu a
2) aspoň jedného epitopu prvej pomocnej T-bunky (THepitopu), ktorý je pre živočícha cudzí, pomocou buniek prezentujúcich antigén (APC), ktoré sú prítomné v imunologickom systéme živočícha.
Vo špecifickejšom variante nového spôsobu je predmetom vynálezu spôsob zníženia zastúpenia bunkového polypeptidového človeka, pričom zmienený je v živočíchovi slabo pomocou indukcie odozvy antigénu v živočíchovi, vrátane bunkový polypeptidový antigén imunogénny alebo neimunogénny, špecifického cytotoxického T-lymfocytu (CTL) proti bunkám nesúcim bunkový polypeptidový antigén na svojom povrchu alebo skrývajúcim bunkový polypeptidový antigén vo svojom intracelulárnom kompartmente, spôsob zahrnujúci uskutočnenie simultánnej prezentácie
1) aspoň jedného CTL epitopu odvodeného z bunkového polypeptidového antigénu a
2) aspoň jedného epitopu prvého T-pomocného lymfocytu (TH), ktorý je pre živočícha cudzí, v živočíchovi pomocou vhodnej, bunky prezentujúcej antigén (APC) .
Súčasťou predkladaného vynálezu je tiež nová stratégia prípravy imunogénnych činidiel. Táto nová stratégia zahrnuje výber a výrobu analógov slabých bunkových antigénov, kde cieľom je zachovať podstatnú časť známych a predpovedaných CTL epitopov a súčasne zaviesť aspoň jeden cudzí TH epitop.
Predmetom vynálezu sú ďalej určité špecifické imunogénne prípravky založené na známych nádorových antigénoch ako aj zloženie týchto prípravkov.
Konečne, predmetom vynálezu sú fragmenty nukleových kyselín, vektory, transformované bunky a iné nástroje molekulárne biologických postupov pre prípravu analógov nádorových antigénov.
Podrobný opis vynálezu
Definície
Pre objasnenie možností predkladaného vynálezu sa ďalej podrobne definuje a vysvetľuje rad pojmov používaných v predkladanom opise vynálezu a v patentových nárokoch.
„Bunkový polypeptidový antigén znamená v opise vynálezu a v patentových nárokoch polypeptid obmedzený na bunku, ktorá sa akosi vzťahuje k patologickému procesu. Okrem toho bunka prezentuje na svojom povrchu CTL epitopy polypeptidového antigénu viazaného na molekuly MHC triedy I. Bunkové polypeptidové antigény môžu byť preto skutočnými intracelulárnymi antigénmi (a tým sú nedostupné pre humorálnu imunologickú odozvu) alebo antigénmi viazanými na povrch buniek. Bunkový polypeptidový antigén môže byť produktom expresie génu vlastnej bunky, intracelulárneho parazita, vírusu alebo inej bunky. V posledne menovanou prípade je polypeptidový antigén následne spojený s bunkou, ktorá je súčasťou patologického procesu.
Výrazy „T-lymfocyt a „T-bunka sa používajú zameniteľné pre lymfocyty pochádzajúce z týmusu, ktoré odpovedajú za rôzne bunkou sprostredkované imunitné odozvy a tiež za efektorové funkcie, akou je napríklad pomocná aktivita v humorálnej imunitnej odozve. Obdobne sa výrazy „B-lymfocyt a „B-bunka používajú zameniteľné pre lymfocyty produkujúce protilátky.
„Bunka prezentujúca antigén (APC) je bunka, ktorá prezentuje epitopy T-bunkám. Typickými bunkami prezentujúcimi antigén sú makrofágy, dendritické bunky a iné fagocytické a pinocytické bunky. Malo by sa uviesť, že B-bunky tiež fungujú ako APC tým, že prezentujú TH epitopy viazané na molekuly MHC triedy II TH bunkám, ale keď sa obecne vo špecifikácii a v patentových nárokoch používa výraz APC, znamená to vyššie uvedené fagocytické a pinocytické bunky.
„Pomocné T-lymfocyty alebo „TH bunky označujú CD4 pozitívne T-bunky, ktoré pomáhajú B-bunkám a cytotoxickým Tbunkám rozpoznať TH epitopy viazané na molekuly MHC triedy II na bunkách prezentujúcim antigén.
Výraz „cytotoxický T-lymfocyt (CTL) sa použije pre CD8 pozitívne T-bunky, ktoré vyžadujú k aktivácii asistenciu TH buniek.
„Špecifická imunitná odozva označuje v predkladanom kontexte polyklonovú imunitnú odozvu prevážne zameranú proti molekule alebo skupine kváziidentických molekúl alebo alternatívne proti bunkám prezentujúcim CTL epitopy molekuly alebo skupiny kváziidentických molekúl.
„Slabo imunogénny alebo neimunogénny polypetidový antigén sa tu používa na označenie polypeptidov, ktoré majú aminokyselinovú sekvenciu slabých bunkových proteínových antigénov odvodených z príslušného živočícha (napr. človeka), ale tento výraz tiež zahŕňa polypeptidy s identickou aminokyselinovou sekvenciu ako majú analógy takýchto proteínov izolovaných z iných druhov. Pod tento výraz spadajú aj formy polypeptidov, ktoré majú odlišné glykozylačné profily, pretože sa produkujú v heterológnych systémoch (napr. v kvasinkách alebo v iných než cicavčích eukaryotických systémoch expresie alebo dokonca v prokaryotických systémoch). Malo by sa však uviesť, že použitím tohoto výrazu sa r myslí, že diskutovaný polypeptid je obyčajne neimunogénny alebo len slabo imunogénny vo svojej prirodzenej lokalite v tele živočícha, ktorý sa má liečiť.
Výrazom „polypeptid sa v predloženom kontexte označujú tak krátke polypeptidy s 2 až 10 aminokyselinovými zvyškami, oligopeptidy s 11 až 100 aminokyselinovými zvyškami, ako aj polypeptidy s viac ako 100 aminokyselinovými zvyškami. Okrem toho sa tiež pod tento výraz zahrnujú proteíny, t.j. funkčné biomolekuly obsahujúce aspoň jeden polypeptid; keď obsahujú aspoň dva polypeptidy, môžu tvoriť komplexy viazané kovalentne alebo nekovalentne. Polypeptid (polypeptidy) v proteíne je glykozylovaný a/alebo lipidovaný a/alebo obsahuje protetické skupiny.
Výraz „subsekvencia znamená akýkoľvek spojitý úsek aspoň 3 aminokyselín alebo prípadne aspoň troch nukleotidov, odvodených priamo z prírodnej aminokyselinovej sekvencie, resp. sekvencie nukleových kyselín.
Výraz „živočích v predkladanom kontexte obecne označuje živočíšne druhy (predovšetkým cicavcov), napr. Homo sapiens, Canis domesticus atd. a nie jednotlivého živočícha. Výraz však tiež označuje populáciu takýchto živočíšnych druhov, pretože je dôležité, že všetci jednotlivci imunizovaný spôsobom podľa tohto vynálezu prechovávajú u seba v podstate rovnaký slabý bunkový polypeptidový antigén umožňujúci imunizáciu živočíchov rovnakým imunogénom (imunogénmi). Keď sa napríklad vyskytujú genetické varianty polypeptidov v rozdielnych ľudských populáciách, môže byť potrebné použiť pre tieto populácie odlišné imunogény, aby sa podarilo v každej populácii narušiť autotoleranciu voči slabému bunkovému polypeptidovému antigénu.
Výrazom „zníženie (down-regulation) bunkového polypeptidového antigénu sa v tomto dokumente rozumie pokles množstva a/alebo aktivity príslušného antigénu v živom organizme. Zníženie je možné docieliť niekoľkými mechanizmami. Najjednoduchší z nich je prostý zásah do aktívneho miesta väzbou protilátky. Do rámca predloženého vynálezu tiež spadá, že výsledkom väzby protilátky je odstránenie polypeptidu pomocou čistiacich buniek (napr. makrofágov a iných fagocytických buniek), a čo je ešte dôležitejšie, že bunky nesúce alebo skrývajúce antigén sú likvidované živočíšnymi CT lymfocytmi.
Vyjadrenie „uskutočnenie simultánnej prezentácia vhodnou APC znamená, že živočíšny imunitný systém podlieha riadenej imunitnej výzve, výsledkom ktorej je simultánna prezentácia príslušných epitopov pomocou APC. Ako sa ukáže ďalej, takéto vyprovokovanie imunitného systému sa môže uskutočniť mnohými spôsobmi, z ktorých je najdôležitejšia vakcinácia polypeptidom obsahujúcim „farmacíny (t.j. vakcína, ktorá sa podáva pre liečbu alebo na zlepšeniu prebiehajúcej choroby) alebo „farmacínom nukleovej kyseliny. Dôležité je dosiahnuť, aby sa imunitné kompetentné bunky v živočíchovy konfrontovali s APC bunkami, ktoré zobrazujú príslušné epitopy imunologický účinným spôsobom.
Výraz „imunologický účinné množstvo má bežný význam v obore, t.j. množstvo imunogénu schopné indukovať imunitnú odozvu, ktorá významne angažuje patogénnych činiteľov, ktorý sa spoločne s imunogénom podieľajú na imunologických rysoch.
Keď sa použije výraz, že sa slabé bunkové polypeptidové antigény „modifikujú, myslí sa chemická modifikácia toho polypeptidu, ktorý tvorí hlavný reťazec príslušného polypeptidu. Takouto modifikáciu môže byť napr. derivatizácia (napr.
alkylácia) kyselinovej modifikácie kyselinovej určitých sekvencii, zahŕňajú sekvencie.
aminokyselinových zvyškov v aminoako sa však ukáže ďalej, výhodné zmeny primárnej štruktúry aminoKeď sa hovorí o „tolerancii a „autotolerancii, rozumie sa tým, že priemerný jedinec v populácii nezaháji imunitnú odozvu proti polypeptidu, pretože polypeptidy, ktoré sú terčmi spôsobu podía predkladaného vynálezu, sú vlastné proteíny populácie, ktorá má byť vakcinovaná alebo proteíny, ktoré nevyvolávajú účinnú imunitnú odozvu. Nie je však možné vylúčiť, že tu a tam niektorý jednotlivci v živočíšnej populácii môžu byť schopný produkovať protilátky proti natívnemu polypeptidovému antigénu, napr. ako súčasť poruchy autoimunity. V každom prípade, obyčajne bude živočích autotolerantný len voči vlastnému polypeptidovému antigénu, ale nie je možné vylúčiť, že bude tiež tolerantný aj k analógom odvodeným z iných živočíšnych druhov alebo z populácie s rozdielnym fenotypom.
„Cudzí T-bunkový epitop je peptid schopný sa viazať na molekulu MHC a stimulovať T-bunky v živočíšnom druhu. Výhodnými cudzími epitopmi sú „promiskuitné epitopy, t.j. tie epitopy, ktoré sa viažu k prevážnej časti molekúl MHC triedy II v živočíšnom druhu alebo populácii. Týchto promiskuitných epitopov je známy len velmi obmedzený počet a budú detailne diskutované ďalej. K tomu, aby boli imunogény, ktoré sa používajú podía predloženého vynálezu, účinné v čo možná najväčšej časti živočíšnej populácie, môže byť potrebné 1) vložiť niekolko cudzích T-bunkových epitopov do jedného analógu alebo 2) pripraviť niekolko analógov, kde každý z nich má vložený iný promiskuitný epitop. Koncepcia cudzích T-bunkových epitopov zahrnuje aj použitie kryptických
T-bunkových epitopov, t.j. epitopov, ktoré sú odvodené od vlastného proteinu a ktoré sa imunologický prejavujú len vtedy, keď existujú v izolovanej forme a nie ako súčasť príslušného vlastného proteinu.
„Cudzí epitop T pomocného lymfocytu (cudzí TH epitop) je cudzí T bunkový epitop, ktorý sa viaže na molekulu MHC triedy II a môže byť prezentovaný na povrchu bunky prezentujúcej antigén (APC) vzťahujúcej sa k molekule MHC triedy II.
„CTL epitop je peptid schopný sa viazať na molekulu MHC triedy I.
„Funkčnou časťou (bio)molekuly sa v predloženom kontexte myslí časť molekuly, ktorá je zodpovedná za aspoň jeden biochemický alebo fyziologický účinok molekuly. V obore je dobre známe, že mnoho enzýmov a iných efektorových molekúl obsahuje aktívne miesto, ktoré je zodpovedné za účinky príslušnej molekuly. Ostatné časti molekuly môžu mať stabilizačnú úlohu alebo zvyšujú rozpustnosť, a nemusia sa brať do úvahy, ak táto ich úloha nie je relevantná v kontexte určitého uskutočnenia predloženého vynálezu. Napríklad je možné použiť určité cytokíny ako modifikujúci podiel analógu (porovnaj nižšie uvedenú podrobnú diskusiu) a v tamto prípade je otázka stability nepodstatná, pretože potrebnú stabilitu' poskytuje spojenie s analógom.
Výraz „adjuvans má svoj obvyklý význam v obore vakcinačnej technológie, t.j. ide o látku alebo zmes látok, ktoré 1) nie sú samy o sebe schopné zvyšovať špecifickú imunitnú odozvu proti imunogénu vakcíny, ale ktoré 2) sú však schopné posilovať imunitnú odozvu proti imunogénu. Alebo ináč povedané, vakcinácia samotným adjuvans nemôže vyvolať imunitnú odozvu proti imunogénu, vakcinácia imunogénom môže alebo nemusí vyvolať imunitnú odozvu voči imunogénu, ale kombinovaná vakcinácia imunogénu s adjuvans indukuje imunitnú odozvu proti imunogénu, ktorá je silnejšia než odozva vyvolaná samotným imunogénom.
„Zacielenie molekuly v predloženom kontexte znamená, že sa molekula po zavedení do živočíšneho organizmu prednostne objaví v určitom tkanive (tkanivách) alebo sa prednostne spojí s určitými bunkami alebo typmi buniek. Tento účinok je možné dosiahnuť radom spôsobov, vrátane prípravy molekuly v zmesi, ktorá uľahčuje zacielenie alebo, že sa do molekuly vložia skupiny, ktoré uľahčujú zacielenie. Tieto otázky budú detailne diskutované ďalej.
„Stimulácia imunitného systému znamená, že látka alebo zmes vykazuje všeobecný, nešpecifický imunostimulačný účinok. Rad adjuvans a predpokladaných adjuvans (napr. určité cytokíny) sa podieľa na schopnosti stimulovať imunitný systém. Výsledkom použitia imunostimulačného · činidla je zvýšená „pohotovosť imunitného systému, čo znamená, že súčasná alebo následná imunizácia imunogénom indukuje podstatne účinnejšiu imunologickú odozvu v porovnaní s použitím samotného imunogénu.
Výhodné prípady uskutočnenia
Pre indukciu odozvy CTL proti bunke prezentujúcej na svojom povrchu epitopy odvodené z polypeptidového antigénu je obyčajne potrebné, aby sa aspoň jeden CTL epitop, ak je prítomný, spojil s molekulou MHC triedy I na povrchu APC. Ďalej je výhodné, aby sa aspoň jeden prvý cudzí TH epitop, ak je prítomný, spojil s molekulou MHC triedy II na povrchu APC.
Výhodnými APC bunkami prezentujúcimi epitopy sú dendritické bunky a makrofágy, ale podľa predloženého vynálezu sa dáva prednosť pino- alebo fágocytickým APC, ktoré sú schopné simultánne prezentovať 1) CTL epitopy viazané na molekuly MHC triedy I a 2) TH epitopy viazané na molekuly MHC triedy II.
Podľa predloženého vynálezu je bunkový polypeptidový antigén výhodne vybraný z nádorových antigénov a iných vlastných proteínov, ktoré súvisia s patologickými procesmi, ale tiež z vírusových antigénov a antigénov odvodených z intracelulárnych parazitov alebo baktérie will. V obore je dobre známe, že práve tieto patogénne antigény sú často relatívne slabými imunogénmi (napr. antigény z mykobaktérií, ako Mycobacterium tuberculosis a Mycobacterium leprae, ale tiež z prvokov, napr. Plasmodium spp.) Veríme, že spôsob podľa vynálezu, odhliadnuc od toho, že zavádza možnosť tvorby protilátky a odozvy CTL proti pravým vlastným antigénom, je schopný zvýšiť často nedostatočnú imunitnú odozvu vedenú organizmom proti takýmto intracelulárnym antigénom.
Obyčajne je výhodné konfrontovať imunitný systém s velkou frakciou aminokyselinovej sekvencie polypeptidového antigénu, ktorý je terčom vakcíny. Preto vo výhodnom uskutočnení vynálezu sa prezentácia CTS epitopu a prvého cudzieho TH epitopu pomocou APC uskutočňuje tým, že sa živočíšnemu imunitnému systému prezentuje aspoň jeden prvý analóg bunkového polypeptidového antigénu, pričom tento prvý analóg obsahuje obmenu aminokyselinovej sekvencie bunkového polypeptidového antigénu, pričom tato obmena obsahuje aspoň CTL epitop a prvý cudzí TH epitop. To je v kontraste napr. so stratégiou vakcinácie DNA, kde je expresia CTL a TH epitopov na jednej a tej istej bunke, ale ako častí oddelených polypeptidov; takáto DNA stratégia vakcinácie je tiež predmetom uskutočnenia tohoto vynálezu, ale veríme, že dva epitopy ako súčasť toho istého polypeptidu obvykle zvýšia imunitnú odozvu a že každopádne bude potrebné zaistiť len jeden produkt expresie.
Pre maximalizáciu šancí zahájenia účinnej imunitnej odozvy je výhodné, aby vyššie zmienený prvý analóg obsahoval podstatný podiel známych a predpokladaných CTL epitopov bunkového polypeptidového antigénu, t.j. podiel známych a predpovedaných CTL epitopov, ktoré viažu dostatočné podiely molekúl MHC triedy I zastúpené v populácii. Napríklad je výhodné, keď podstatný podiel známych a predpokladaných CTL epitopov v aminokyselinovéj sekvencií analógu je rozpoznaný aspoň 50-tými percentami MHC-I haplotypmi, ktoré rozpoznávajú všetky známe a predpokladané CTL epitopy v bunkovom polypeptidovom antigéne, ale ešte výhodnejšie je vyššie percento, napríklad aspoň 60, 70, 80 a aspoň 90 %. Zvlášť výhodné je použitie analógov, v ktorých sú prítomné všetky známe CTL epitopy bunkového polypeptidového antigénu, t.j. blízko 100 % známych CTL epitopov. Preto je tiež zvlášť výhodné, keď v podstate všetky predpovedané CTL epitopy bunkového polypeptidového antigénu sú prítomné v aspoň prvom analógu.
Metódy prognózy prítomnosti CTL epitopov sú v obore dobré známe (porovnaj napr. Rothbard et al.: EMBO J., 7 (1988), 93100) .
Ako bude zrejmé z tejto špecifikácie a patentových nárokov, očakáva sa, že tu popisované nové spôsoby umožnia účinnú indukciu odoziev CTL proti bunkovým polypeptidovým antigénom.
V prípadoch čisto intracelulárneho bunkového polypeptidového antigénu je indukcia odoziev CTL proti bunkám skrývajúcim antigén jedinou cestou k dosiahnutiu ich zníženia špecificky imunologickými prostriedkami. V prípade membránových antigénov je však výhodné indukovať odozvu proti slabému bunkovému polypeptidovému antigénu. Keď sa však zvýši humorálna imunitná odozva proti slabému bunkovému antigénu, je výhodné podstatne obmedziť protilátkovú odozvu na interakciu s tými časťami antigénu, ktoré sú obyčajne vystavené možnej interakcii s protilátkami. Ináč by to najskôr viedlo k indukcii protilátkovej odozvy proti častiam antigénu, ktoré obyčajne nezamestnávajú humorálny imunitný systém, ale to opäť zvyšuje riziko zavedenia krížovej reaktivity s antigénmi, ktoré nemajú nič spoločného s žiadnou patológiou. Jednou elegantnou cestou k dosiahnutiu tohto obmedzenia je vakcinácia nukleovou kyselinou s analôgom slabého bunkového antigénu, ktorého extracelulárna časť je buď nezmenená alebo obsahuje TH epitop, ktorý zásadne nemení trojrozmernú štruktúru extracelulárnej časti antigénu. Imunizácia sa môže, ako jedna možná alternatíva, uskutočniť tak s imunogénom adresovaným CTL, ako aj s imunogénom adresovaným B-bunke, pričom imunogén adresovaný B-bunke nie je v podstate schopný ovplyvniť imunizáciu proti intracelulárnej časti terčového antigénu (imunogén adresovaný B-bunke by napríklad nemusel mať žiadnu neextracelulárnu látku z antigénu).
Indukcia odozvy protilátok sa môže dosiahnuť radom spôsobov dobre známych odborníkom v technike. Napríklad aspoň jeden prvý analóg môže obsahovať časť skladajúcu sa z modifikácie štruktúry bunkového polypeptidového antigénu, pričom v dôsledku tejto modifikácie imunizácia živočícha prvým analôgom indukuje v živočíchovy tvorbu protilátok proti bunkovému polypeptidovému antigénu - tento variant je zvlášť vhodný pri vakcinácii nukleovej kyseliny, ako sa uvádza vyššie. Alternatívne môže spôsob podía tohto vynálezu zahrnovať prezentáciu imunitnému systému živočícha imunogenicky účinného množstva aspoň jedného druhého analógu bunkového polypeptidového antigénu, ktorý obsahuje takúto modifikáciu. Vyhovujúci spôsob k dosiahnutiu žiaduceho účinku modifikácie je zahrnutie aspoň jedného druhého cudzieho TH epitopu do druhého analógu, t.j. stratégia podobná tej, ktorá sa použila pre prvý analóg.
V prípadoch, v ktorých je žiaduce tiež zahájiť účinnú humorálnu imunitnú odozvu, je výhodné, keď prvý a/alebo druhý analóg(y) obsahuje podstatný podiel epitopov B-bunky bunkového polypeptidového antigénu, zvlášť podstatný podiel takých epitopov B-bunky, ktoré sú v prirodzenej forme antigénu v príslušnom živočíchovi extracelulárne.
Vyššie diskutované obmeny a modifikácie slabého antigénu bunkového polypeptidu sa môžu vyskytovať v rôznych formách. Je výhodné, keď obmena a/alebo modifikácia zahrnuje substitúciu a/alebo odstránenie a/alebo vloženie a/alebo adíciu aminokyseliny. Tieto základné operácie vzťahujúce sa k manipulácii, s aminokyselinovou sekvenciou by mali pokryť tak zmeny jednotlivých aminokyselín, ako aj operácie zahŕňajúce väčšie úseky aminokyselín (ako je posúvanie amínokyselinových úsekov vnútri polypeptidového antigénu; to je zvlášť zaujímavé, keď antigén je pravý intracelulárny antigén, pretože len úvahy týkajúce sa zachovania CTL epitopov sú relevantné). Pochopíme, že zavedenie jednej samotnej aminokyseliny, napr. vložením alebo odstránením, môže spôsobiť, že sa objaví cudzí TH epitop v sekvencii analógu, t.j. objavenie sa sekvencie, ktorá viaže molekulu MHC triedy II. Väčšinou je však výhodné (a dokonca potrebné) zaviesť známy cudzí TH epitop a takáto operácia bude vyžadovať substitúciu a/alebo vloženie kyseliny (alebo niekedy adíciu formou buď konjugácie k nosnému proteínu alebo fúzie polypeptidu pomocou metód molekulárnej biológie). Je výhodné, aby počet aminokyselinových vložení, odstránení, substitúcií alebo adícií bol najmenej 2, napríklad 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 a 25 vložení, substitúcií, adícií alebo odstránení. Ďalej je výhodné, aby počet aminokyselinových substitúcií nepresahoval 150, napríklad najviac 100, 90, 80 a najviac 70. Zvlášť je výhodné, aby počet substitúcií, vložení, odstránení' alebo adícií nepresahoval 60 a obzvlášť by počet nemal presiahnuť 50 alebo dokonca 40. . Najvýhodnejší je počet, ktorý nepresahuje 30.
Výhodné prípady uskutočnenia vynálezu zahrnujú modifikáciu zavedením prinajmenšom jedného cudzieho imunodominantného TH epitopu. Pochopíme, že otázka imunitnej dominancie epitopu Tbunky závisí na príslušnom živočíšnom druhu. Výraz „imunodominancia, ako je tu požitý, jednoducho označuje epitopy, ktoré u vakcinovaného jedinca alebo populácie spôsobia významnú imunitnú odozvu, ale je dostatočne známe, že epitop T-bunky, ktorý je imunodominantný u jedného jedinca, nie je nutne imunodominantný u iného jedinca toho istého druhu, aj napriek tomu, že v ňom môže byť schopný viazať molekuly MHCII. Ideálne imunodominantné TH epitopy sú tie, ktoré nezávisle na polypeptide, na ktorom vytvárajú subsekvenciu, spôsobia aktiváciu TH buniek - inými slovami, pravým rysom niektorých TH epitopov je to, že v podstate nikdy nie sú skryté, pretože takmer vždy sú spracované bunkami APC a prezentované v kontexte molekuly MHC-II na povrchu APC.
Iným dôležitým bodom je problém MHC reštrikcie epitopov Tbunky. Prirodzene sa vyskytujúce epitopy T-bunky sú obecne obmedzené MHC, t.j. určité peptidy tvoriace epitop T-bunky sa účinne viažu iba k podskupine molekúl MHC triedy II. To má zase ten účinok, že v mnohých prípadoch použitie jedného špecifického epitopu T-bunky poskytne vakcinačnú zložku, ktorá je účinná iba na časť populácie a podía velkosti tejto časti môže byť potrebné začleniť viac T-bunkových epitopov do tej istej molekuly, alebo alternatívne pripraviť multikomponentnú vakcínu, v ktorej sú zložky obmenami antigénu, ktoré sú jedna od druhej odlíšitelné povahou zavádzaného Tbunkového epitopu.
Keď je MHC reštrikcia použitých T-buniek úplne neznáma (napr. pri nedostatočne definovanom zložení MHC u vakcinovaného živočícha), podiel populácie pokrytý zložením špecifickej vakcíny sa môže určiť podľa vzorca n
f popuká i=l kde pi je početnosť jedincov v populácii s odozvou na i-tý cudzí epitop T-bunky prítomný v zložení vakcíny a n je celkový počet cudzích epitopov T-bunky v zložení vakcíny. Potom vakcína, ktorá obsahuje 3 cudzie T-bunkové epitopy a má početnosť odozvy v populácii 0,8, 0,7 a 0,6 dáva
- 0,2 x 0,3 x 0,4 = 0,976
t.j. 97,6 % populácie štatisticky vykáže odozvu na vakcínu sprostredkovanú MHC-II.
Vyššie uvedený vzorec nie je upotrebiteľný v situáciách, kde je viac či menej presne známy profil MHC reštrikcie použitých peptidov. Ak napríklad určitý peptid viaže iba molekuly ludskej MHC-II kódované HLA-DR alelami DRI, DR3, DR5 a DR7, potom sa pri použití tohoto peptidu spoločne s iným peptidom, ktorý viaže zvyšné molekuly MHC-II kódované HLA-DR alelami, dosiahne 100 % pokrytie v danej populácii. Podobne, ak druhý peptid viaže len DR3 a DR5, jeho pridaním sa pokrytie danej populácie vôbec nezvýši. Ak sa výpočet citlivosti populácie založí čisto na MHC reštrikcii epitopov T-bunky vo vakcíne, potom sa podiel populácie pokrytý kompozíciou špecifickej vakcíny určí podía vzorca:
(III) kde cpj je suma početností alelických haplotypov kódujúcich MHC molekuly v populácii, ktoré viažu každý ' jeden z epitopov T-bunky vo vakcíne a ktoré náležia k j-tému z 3 známych HLA miest (DP, DR a DQ) ; v praxi sa najprv určí, ktoré molekuly MHC rozpoznajú každý epitop T-bunky vo vakcíne a potom sa tieto molekuly zaradia podía typu (DP, DR a DQ) následne sa jednotlivé početnosti odlišne zaradených alelických haplotypov sčítajú pre každý typ, čím sa získajú epi, <p2 a φ3.
Môže dôjsť k tomu, že hodnota pi vo vzorci II prevyšuje odpovedajúcu teoretickú hodnotu Πχ:
(IV) kde Vj je suma početností alelického haplotypu kódujúceho MHC molekuly v populácii, ktoré viažu i-tý epitop T-bunky vo vakcíne a ktoré náležia k j-tému z 3 známych HLA miest (DP, DR a DQ) . Znamená to, že u l-m populácie je početnosť respondentov fZbyt*. i = (Pi - Πχ)/(1- πχ) . Vzorec III je potom (V) možné previesť na tvar V:
' n f populácie = 1 Π (1 “ P, )+ 1 “ Π (1 “ ftbytk.i ) ;=i /=1 kde sa výraz 1 - fZbytk. í položí = 0, ak má zápornú hodnotu. Je zrejmé, že vzorec V vyžaduje, aby boli všetky epitopy z hľadiska haplotypu zmapované voči identickým skupinám haplotypov.
Keď sa teda majú vybrané T-bunkové epitopy zaradiť do analógu, je dôležité pracovať so všetkými dostupnými znalosťami o epitopoch: 1) populačná početnosť respondentov pre každý epitop, 2) údaje o MHC reštrikcii a 3) populačná početnosť relevantných haplotypov.
Existuje rad prírodných „promiskuitných T-bunkových epitopov, ktoré sú aktívne u mnohých jedincov nejakého živočíšneho druhu alebo živočíšnej populácie a ich použitie vo vakcíne je výhodné, pretože sa zníži potreba veľkého množstva rôznych analógov v jednej a tej istej vakcíne.
Promiskuitný epitop môže byť podlá vynálezu prírodné sa vyskytujúci ludský T-bunkový epitop, ako sú epitopy z tetanového toxoidu (napr. epitopy P2 a P30), záškrtový toxoid, chrípkový vírus hemaglutinínu (HA) a P. falciparum CS antigén.
V priebehu rokov sa identifikoval rad iných promiskuitných T-bunkových epitopov. Zvlášť peptidy schopné viazať vo velkom rozsahu molekuly HLA-DR kódované rozdielnymi alelami HLA-DR, ktoré všetky predstavujú možné T-bunkové epitopy pre zavedenie do analógov použitých podlá predloženého vynálezu.
Porovnaj tiež epitopy diskutované v nasledujúcich odkazoch, ktoré sú tu všetky zahrnuté ako referencie: WO 98/23635 (Frazer I.H. et al., prihlásený na univerzite v Queenslande) ; Southwood S. et al., J. Immunol. 160 (1998), 33633373; Sinigaglia F. et al., . Náture 336 (1988), 778-780;
Rammensee H.G. et al., Immunogenetics 41:4 (1995), 178-228;
Chicz R.M. et al., J.Exp. Med. 178 (1993), 27-47; Hanuner J. et al., Celí 14 (1993), 197-203; Falk K. et al.,
Immunogenetics 39 (1994), 230-242. Ďalšie odkazy sa zaoberajú tiež HLA-DQ a -DP ligandmi. Všetky epitopy zahrnuté v týchto piatych odkazoch sú relevantné ako kandidáti prírodných epitopov pre použitie v predkladanom vynáleze, pretože sa jedná o epitopy so spoločným námetom.
Alternatívne epitopom môže byť akýkolvek umelý T-bunkový epitop, ktorý je schopný viazať vo veľkom rozsahu haplotypy. V tejto súvislosti peptidy pan DR epitopu („PÄDRE) opísané v patente WO 95/07707 a v odpovedajúcom článku Alexander, J. et al., ' Immunity 1 (1994), 751-761 (obidve práce sú tu zahrnuté ako odkazy) sú zaujímavými kandidátmi na použitie podľa predloženého vynálezu. Za pozornosť stojí, že najúčinnejšie PADRE peptidy objavené v zmienených textoch nesú D-aminokyseliny s C- a N-koncami, aby sa zlepšila stabilita pri podaní. Cieľom predkladaného vynálezu je však predovšetkým začlenenie relevantných epitopov ako častí modifikovaného antigénu, ktorý by sa potom následne mal enzymaticky rozštiepiť vnútri lyzozómového kompartmentu APC, aby umožnil následnú prezentáciu v súvislosti s molekulou MHC-II, a preto nie je výhodné začleňovať D-aminokyseliny k epitopom používaným v tomto vynáleze.
Jedným zvlášť výhodným peptidom PADRE je ten, ktorý má aminokyselinovú sekvenciu ÄKFVAAWTLKAAA alebo jej imunologický účinnú subsekvenciu. Tento a iné epitopy, ktoré rovnako nemajú MHC reštrikciu sú výhodné T-bunkové epitopy, ktoré by mali byť prítomné v analógoch použitých vo spôsoboch podlá tohoto vynálezu. Takéto superpromiskuitné epitopy umožnia najjednoduchšie prípady uskutočnenia vynálezu, kedy sa len jeden samotný analóg prezentuje vakcinovanému živočíšnemu imunitnému systému.
Charakteristika vyššie uvedenej obmeny alebo modifikácie výhodne zahrnuje, že:
- aspoň jeden prvý podiel je zahrnutý do prvého a/alebo druhého analógu/analógov, pričom tento prvý podiel zacieli analóg na bunku prezentujúcu antigén (APC) a/alebo
- aspoň jeden 'druhý podiel je zahrnutý do prvého a/alebo druhého analógu/analógov, pričom tento druhý podiel stimuluje imunitný systém a/alebo
- aspoň jeden tretí podiel je zahrnutý do prvého a/alebo druhého analógu/analógov, pričom tento tretí podiel optimalizuje prezentáciu analógu imunitnému systému.
funkčných a štrukturálnych rysoch týchto prvých, druhých a tretích podielov je možné povedať, že môžu byť prítomné ako postranné skupiny viazané kovalentne alebo nekovalentne k vhodným chemickým skupinám v aminokyselinovej sekvencií bunkového polypeptidového antigénu alebo v jej subsekvencii. Je dôležité, aby úseky aminokyselinových zvyškov odvodené z polypeptidového antigénu boli derivatizované bez zmeny primárnej aminokyselinovej sekvencie alebo pri najmenšom bez zavedenia zmien do peptidových väzieb medzi jednotlivými aminokyselinami v reťazci.
Podiely tiež môžu byť vo forme fúznych partnerov amino31 kyselinovej sekvencie bunkového polypeptidového antigénu. V tejto súvislosti je treba zmieniť, že obidve možnosti zahrnujú možnosť konjugácie aminokyselinovéj sekvencie k nosičovi (porovnaj nižšie uvedenú diskusiu). Inými slovami, v predloženom kontexte výraz „fúzny proteín nie je vyhradený len fúznemu konštruktu pripravenému pomocou expresie DNA fragmentu kódujúceho tento konštrukt, ale tiež konjugátu medzi dvomi proteínmi, ktoré sú spojené pomocou peptidovej väzby v následnej chemickej reakcii.
Ako už bolo povedané, analóg môže tiež zahrnovať zavedenie prvého podielu, ktorý smeruje analóg k APC alebo k Blymfocytu. Napríklad, prvý podiel môže byť špecificky viazaný partner pre B-lymfocytový špecifický povrchový antigén alebo pre APC špecifický povrchový antigén. V technike je známych vela takýchto špecifických povrchových antigénov. Podielom môže byť napríklad uhlovodík, pre ktorý existuje receptor na B-lymfocyte alebo na APC (napr. manán alebo manóza). Inokedy druhým podielom môže byť haptén. Ako prvý podiel sa tiež môže použiť fragment protilátky, ktorá špecificky rozpoznáva povrchové molekuly na APC bunkách alebo lymfocytoch (povrchovou molekulou môže byt napr. FCy receptor makrofágov a monocytov, napríklad FCy RI , alebo inokedy každý iný špecifický povrchový marker, napríklad CD40 alebo CTLA-4). Je dobré si uvedomiť, že všetky tieto príkladné zacielené molekuly sa môžu použiť ako súčasť adjuvans (viď ďalej) . CD40 ligand, protilátky proti CD40 alebo ich varianty, ktoré viažu CD40, smerujú analóg k dendritickým bunkám. Posledné výsledky súčasne ukázali, že interakcia s molekulou CD40 spôsobí, že pre získanie odozvy CTL nie sú TH bunky podstatné. Z toho vyplýva predpoklad, že obecné použitie molekúl, ktoré viažu CD40, ako prvý podiel (alebo ako adjuvans, viď ďalej) podstatne zvýši odozvu CTL; použitie takýchto molekúl viazajúcich CD40 ako adjuvans a ako „prvých podielov vo zmysle predkladaného vynálezu považujeme za pôvodný, úplne nový prínos.
Ako alternatívu alebo doplnok k zacieleniu analógu k určitému typu bunky pre dosiahnutie zvýšenej imunitnej odozvy je možné zvýšiť úroveň citlivosti imunitného systému zahrnutím vyššie zmieneného druhého podielu, ktorý stimuluje imunitný systém. Typickými príkladmi takýchto druhých podielov sú cytokíny, proteíny tepelného šoku a hormóny, vrátane ich účinných zložiek.
Vhodnými cytokínmi pre použitie podlá vynálezu sú tie, ktoré v zložení vakcíny obvykle poslúžia tiež ako adjuvans, napr. interferón y (IFN-γ), Flt3 ligand ,(Flt3L), interleukín 1 (IL-1), interleukín 2 (IL-2), interleukín 4 (IL-4), interleukín 6 (IL-6), interleukín 12 (IL-12), interleukín 13 (IL-13), interleukín 15 (IL-15) a faktor stimulujúci granulocyto.vo-makrofágovú kolóniu (GM-CSF) ; ako druhý podiel ináč stačí aj funkčná časť cytokínovej molekuly. Otázka využitia týchto cytokínov ako adjuvans sa diskutuje ďalej.
Druhým podielom môže byť tiež toxín, ako napríklad listeriolycín (LLO) ,. lipid A a tepelne nestály enterotoxín. Zaujímavé možnosti poskytuje tiež rad mykobakteriálnych derivátov, napríklad MDP (muramyl dipeptid), CFA (úplné Freundové adjuvans) a diestery trihalózy TDM a TDE.
Vhodné proteíny tepelného šoku použité ako druhé podiely podlá tohoto vynálezu môžu byť HSP70, HSP90, HSC70, GRP94 a kalretikulín (CRT).
Dôležitým prípadom uskutočnenia tohoto vynálezu je tiež možnosť zavedenia tretieho podielu, ktorý posiluje prezentáciu analógu imunitnému systému. V technike bolo opísaných niekolko príkladov tohoto princípu. Napríklad sa vie, že lipidačné ukotvenie palmitoylu v proteíne OspA Borrelia burgdorferi sa môže využiť tak, aby poskytlo seba posilujúce polypeptidy (viď napr. WO 96/40718) . Zdá sa, že lipidované proteíny tvoria štruktúry podobné micelám s jadrom skladajúcim sa z lipidačné ukotvených časti polypeptídov a zvyšných časti molekuly z neho vyčnievajúcich, výsledkom čoho sú násobné prezentácie antigénových determinantov. Toto použitie a s ním súvisiace prístupy využívajúce rôzne lipidačné ukotvenia (napr. skupiny myristylu, farnezylu, geranyl-geranylu, N-acyl diglyceridu a GPI ukotvenie) sú preto výhodnými prípadmi uskutočnenia vynálezu, zvlášť preto, že získanie takéhoto lipidačného ukotvenia v rekombinantne pripravovanom proteíne je dosť priamočiare a vyžaduje len napríklad prírodné sa vyskytujúcu signálnu sekvenciu ako fúzneho partnera pre analóg. Inou možnosťou je použitie C3d fragmentu komplementového faktoru C3 alebo samotného C3 (porovnaj Dempsey et al.: Science 271 (1996), 348-350 a Lou a Kohler: Náture Biotechnology 16 (1998), 458-462).
Je dôležité poznamenať, že pri pokuse použiť spôsob podía tohoto vynálezu proti napr. membránovo viazaným polypeptidovým antigénom, ktoré sú vystavené extracelulárnemu kompartmentu, je najvýhodnejšie, aby prvý a/alebo druhý analóg (analógy) mal celkovú terciárnu štruktúru bunkového polypeptidového antigénu. V predkladanom popise a v patentových nárokoch to znamená, že celková terciárna štruktúra tej časti polypeptidového antigénu, ktorá je extracelulárne vystavená sa zachováva, pretože, ako sa uvádza vyššie, terciárna štruktúra obligátnych intracelulárnych polypeptídov neangažuje humorálny imunitný systém. Vo skutočnosti, ako súčasť vakcinačnej stratégie je často žiaduce sa vyhnúť tomu, aby bol extracelulárnemu kompartmentu vystavený predpokladaný B-bunkový epitopu odvodený od intracelulárnej časti polypeptidových antigénov; týmto spôsobom sa minimalizujú potencionálne nepriaznivé účinky spôsobené krížovou reaktivitou s inými antigénmi.
Pre účely predloženého vynálezu je však dostačujúce, keď obmena/modifikácia (či už zaradenie, adícia, odstránenie alebo substitúcia) vedie k vzniku cudzieho T-bunkového epitopu a súčasne zachová podstatný počet CTL epitopov v polypeptidovom antigéne (a niekedy tiež podstatný počet Bbunkových epitopov).
Nasledujúci vzorec opisuje konštrukty obecne pokryté týmto vynálezom:
(MODi) sl ( PAGel) nl (MOD2) s2 (PAGe2) n2........... (MODX) sx (PAGex) nx (I) kde PAGei-PAGex sú x-té GTL a/alebo B-bunkové epitopy obsahujúce sekvencie dôležitého polypeptidového antigénu, ktoré nezávisle môžu a nemusia byť identické a ktoré obsahujú alebo neobsahujú cudzie postranné skupiny, x je celé číslo > 3, nl - nx sú x-té celé čísla > 0 (aspoň jedno > 1), MODi-MODx sú xté modifikácie zaradené medzi zachované epitopy a sl-sx sú xté celé čísla £ 0 (aspoň jedno je >1, keď sa žiadna postranná skupina nezaradí do sekvencií). Vymedzením obecných funkčných obmedzení imunogenity konštruktov vynález pamätá na všetky druhy permutácií pôvodnej antigénovej sekvencie aj na ich všetky modifikácie. Do vynálezu sú takto zahrnuté analógy získané vypustením častí sekvencie polypeptidového antigénu, ktoré napríklad vykazujú nepriaznivé účinky in vivo alebo vypustením častí, ktoré sú obyčajne íntracelulárne, a tak môžu spôsobiť nežiaduce imunologické reakcie (viď detailnú diskusiu ďalej).
Ďalšie rozpracovanie vyššie uvedeného princípu zahrnuje použitia CTL a/alebo B-bunkových epitopov s viac než jedným antigénom súvisiacim s patológiou. Existuje napríklad niekolko antigénov súvisiacich s rakovinou, ktoré prejavujú svoje onkogenické účinky len v mutovanej forme - príkladom sú mutované K-ras a P53, ktoré obidva patria k základným proteínom regulácie normálneho bunkového cyklu a ktoré obidva sú produktmi, expresie v absolútne normálnych bunkách. V niektorých prípadoch sa ukázalo, že CTL rozoznajú mutované peptidy z týchto antigénov. Preto je dôležité, že imunitný systém reaguje len na mutované peptidy a nie na nemutované časti, ak sa ponúka antigénová špecifická imunoterapia.
Navrhli sme stratégiu, pri ktorej sa sekvencie 8-25 aminokyselín proteínov súvisiacich s ochorením môžu použiť ako ďalšie epitopy v konštrukte autovakcíny - vo výhodnom prípade uskutočnenia vložené epitopy súčasne umožňujú vznik TH epitopov v konečnom konštrukte, viď vyššie uvedenú diskusiu. Epitopy použité k tomuto účelu by mali obsahovať mutovanú oblasť proteínu súvisiaceho s ochorením. Použitím takéhoto prístupu by malo byť možné generovať CTL lymfocyty (a eventuálne protilátky, kde je to vhodné) len proti mutovanej forme antigénu súvisiaceho s ochorením. V prípadoch, kedy antigén súvisiaci s ochorením umožňuje tvorbu TH epitopu, použitie skutočne cudzieho TH epitopu sa môže úplne vynechať. Uskutočnením tohto princípu môže byť napr. vakcinácia vakcínou nukleovej' kyseliny, ktorá kódujú analóg polypeptidového antigénu (napr. Her2 alebo PSM), do ktorej sa zaraďuje aspoň jeden TH epitop a aspoň jeden peptid odvodený z iného antigénu súvisiaceho s ochorením (napr.
peptid z mutovanej časti nejakého onkogénneho proteínu). Vo výhodnom uskutočnení sa zavedie aspoň jeden TH epitop, ako dôsledok zavedenia peptidu.
Ďalej je výhodné, keď obmena a/alebo modifikácia obsahuje aplikovateľnú duplicitu, keď je to vhodné, aspoň jedného Bbunkového epitopu alebo aspoň jedného CTL epitopu bunkového polypeptidového antigénu. Výsledkom tejto stratégie je, že sa imunitnému systému prezentujú násobné kópie výhodných epitopických oblastí, a takto maximalizujú pravdepodobnosť účinnej imunitnej odozvy. Toto uskutočnenie vynálezu teda zužitkováva početných prezentácií epitopov odvodených z polypeptidového antigénu (t.j. vzorec I, kde sa aspoň jeden B-bunkový epitop vyskytuje vo dvoch polohách).
Tohoto účinku sa dosiahne radom postupov, napríklad jednoducho prípravou fúznych polypeptidov obsahujúcich štruktúru (PAG) m, kde m je celé číslo > 2, a potom zavedením vyššie diskutovaných modifikácii do aspoň jednej zo sekvencií polypeptidového antigénu.
Alternatívnym uskutočnením vynálezu, ktorého výsledkom je tiež výhodná prezentácia viacerých (napr. aspoň dvoch) kópií dôležitých epitopických oblastí antigénu imunitnému systému, je kovalentné párovanie antigénu, jeho subsekvencie alebo jeho obmien s určitými molekulami. Môžu sa použiť napríklad polyméry, ako uhľovodíky, napr. dextrán (viď Lees A. et al.·. Vaccine 12 (1994), 1160-1166; Lees A. et al. : J. Tmmunol. 145 (1990), 3594-3600), ale tiež manóza a manán sú vhodnými alternatívami. Integrálne membránové proteíny z napr. E. coli a iných baktérii sú tiež užitočnými konjugačnými partnermi. Výhodnými a užitočnými konjugačnými partnermi sú aj tradičné molekuly nosičov, ako kliešťový hemokyanín (KLH), tetanový toxín, záškrtový toxín a hovädzie albumínové sérum (BSA) .
Zachovanie niekedy prospešnej podstatnej časti B-bunkových epitopov alebo dokonca celkovej terciárne štruktúry proteínu, ktorý je predmetom modifikácie, ako sa tu popisuje, je možné dosiahnuť niekoľkými spôsobmi. Jednou z možností je jednoducho pripraviť polyklonové antisérum smerované proti polypeptidovému antigénu (napr. antisérum pripravené v králikovi) a potom ho použiť ako testovací reagent (napr. v konkurenčnej ELISA) proti modifikovaným proteinom, ktoré sa produkujú. Modifikované verzie (analógy), ktoré reagujú s antisérom v rovnakom rozsahu ako polypeptidový antigén, sú považované za tie, ktoré majú zachovanú tú istú celkovú ťerciárnu štruktúru ako polypeptidový antigén, zatiaľ čo analógy vykazujúce obmedzenú (ale stále významnú a špecifickú) reaktivitu s takýmto antisérom sú považované za také, ktoré majú zachovanú podstatnú časť pôvodných Bbunkových epitopov.
Alebo sa môže pripraviť a použiť testovacia tabulka na základe výberu monoklonových protilátok reaktívnych s rozdielnymi epitopmi na polypeptidovom antigéne. Tento postup má výhodu v tom, že umožňuje 1) epitopické mapovanie príslušného polypeptidového antigénu, a 2) mapovanie epitopov, ktoré sa udržujú v pripravených analógoch.
Treťou možnosťou by samozrejme bolo vylúštiť trojrozmernú štruktúru polypeptidového antigénu alebo jeho biologicky aktívnej skrátenej časti (viď vyššie) a toto porovnať s rozriešenou trojrozmernou štruktúrou pripravených analógov. Trojrozmerná štruktúra sa môže určiť štúdiom RTG difrakcií a NMR spektroskopiou. Ďalšie informácie týkajúce sa trojrozmernej štruktúry sa môžu do istej miery získať štúdiom cirkulárneho dichroizmu, ktorého výhodou je potreba len malého množstva čistého polypeptidu (zatiaľ čo RTG difrakcia vyžaduje kryštalický polypeptid a NMR vyžaduje obstaranie izotopových variant polypeptidu) na získanie užitočných informácií o terciárnej štruktúre danej molekuly. Pre získanie rozhodujúcich údajov je však potrebná RTG difrakčná analýza a/alebo NMR spektroskopia, pretože cirkulárny dichroizmus môže poskytnúť len neprime potvrdenie správnej trojrozmernej Štruktúry prostredníctvom informácií o sekundárnych štruktúrnych prvkoch.
V súčasnosti existujú v zásade tri uskutočniteľné spôsoby ako získať prezentáciu relevantných epitopov imunitnému systému: tradičná podjednotková vakcinácia polypeptidovými antigénmi, aplikácia geneticky modifikovanej živej vakcíny a vakcinácia nukleovej kyseliny. Tieto tri možnosti sa diskutujú oddelene v nasledujúcom texte.
.1
Polypeptidová vakcinácia
Tento spôsob , vyžaduje aplikovať do príslušného živočícha imunologický účinné množstvo aspoň jedného prvého analógu a pokiaľ je to relevantné, aj imunologický účinné množstvo aspoň jedného druhého analógu. Je výhodné, keď sa aspoň jeden prvý a/alebo druhý analóg/analógy formulujú spoločne s farmaceutický, a imunologický prijateľným nosičom a/alebo vehikulom a voliteľne s adjuvans.
Pri uskutočňovaní prezentácie analógu živočíšnemu imunitnému systému pomocou jeho podania živočíchovi, prebieha príprava polypeptidu podľa obecne uznávaných princípov v technike.
Príprava vakcín, ktoré obsahujú peptidové sekvencie ako aktívne zložky, je v technike obecne dobre známa, príkladom čoho sú US patenty 4608251; 6601903; 4599231; 4599230; 4596792 a 4578770, ktoré všetky sú tu zahrnuté ako odkazy. Typicky sa tieto vakcíny pripravujú k injekčnej aplikácii buď ako roztoky alebo ako suspenzie, ale tiež sa môžu pripraviť v pevnej forme vhodnej pre rozpustenie alebo suspendovanie v kvapaline pred vlastnou aplikáciu injekcie. Preparáty môžu byť tiež emulziíikované. Aktívna imunogénna zložka sa často mieša s farmaceutický prijateľným základom, ktorý je s ňou kompatibilný. Vhodnými základmi sú napríklad voda, fyziologický roztok, dextróza, glycerol, etanol a ich kombinácia. Naviac, ak je to žiaduce, vakcína môže obsahovať malé množstvo pomocných látok, ako sú zvlhčovadlá a emulgátory, pH pufre alebo adjuvans podporujúce účinok vakcíny (viď detailnú diskusiu o adjuvans ďalej).
Vakcíny sa obvykle aplikujú parenterálne pomocou injekcie, napríklad buď subkutánne, intradermálne, subdermálne alebo intramuskulárne. Ďalšou vhodnou aplikačnou formou sú čipky a v niektorých prípadoch orálne, . bukálne, podjazykové, intraperitoneálne, intravaginálne, análne a intrakraniálne formy. Tradičné vehikulá a nosiči pre čipky môžu zahrnovať napríklad polyalkalénové glykoly alebo triglyceridy; čipky sa môžu pripraviť zo zmesí obsahujúcich 0,5 až 10 % aktívnej zložky, výhodne 1-2 %. Orálne formy obsahujú obvykle používané základy, ako napríklad farmaceutický čistý manit, laktózu, škrob,. stearát horečnatý, sacharín sodný, celulózu, uhličitan horečnatý a pod. Tieto zmesi majú formu roztokov, suspenzií, tabliet, piluliek, kapsúl, spojito sa uvoľňujúcich látok a práškov a obsahujú 10-95 % aktívnej zložky, výhodne 25-70 %. Pre orálne prípravky je zaujímavým partnerom toxín cholery (a tiež možným konjugačným partnerom). Polypeptidy pre vakcíny môžu byť v neutrálnej forme alebo ako soli.
Farmaceutický prijateľné soli zahrnujú adičné soli kyselín (utvorené s voľnými aminoskupinami peptidu), ktoré sú pripravené s anorganickými kyselinami, ako napríklad kyselina chlorovodíková alebo fosforečná, alebo s organickými kyselinami, ako octová, šťavelóvá, vínna, mandlová a podobne. Soli tvorené s voľnými karboxylovými skupinami sa tiež môžu získať z anorganických zásad, napríklad hydroxidu sodného, draselného, amónneho, vápenatého alebo železitého a z organických zásad, ako sú izopropylamín, trimetylamín, 2etylamino etanol, histidín, prokain a podobne.
Vakcíny sa aplikujú spôsobom, ktorý odpovedá dávkovanému prípravku a v takom množstve, ktoré bude terapeuticky účinné a imunogénne. Velkosť aplikovanej dávky závisí na liečenom subjekte, vrátane napríklad schopnosti imunitného systému jednotlivca zahájiť imunitnú odozvu alebo vrátane stupňa požadovanej ochrany. Vhodné dávkovanie sa pohybuje v rozsahu niekolko stoviek mikrogramov aktívnej zložky na vakcináciu, prednostne v rozsahu okolo 0,1 až 2000 pg (dokonca sa zvažujú vyššie množstvá v rozsahu 1-10 mg), napríklad v rozsahu asi 0,5 až 1000 pg, výhodne v rozsahu 1 až 500 pg a najmä v rozmedzí 10 až 100 pg. Vhodné režimy pre prvé podanie a druhé injekcie sú tiež variabilné, ale je ich možné odhadnúť pomocou prvej aplikácie nasledovanou postupnými očkovaniami alebo inými aplikáciami.
Spôsob aplikácie sa môže široko meniť. Použiteľný je každý z obvyklých spôsobov aplikácie vakcíny. Zahrnuje orálne podanie fyziologicky prijateľnej pevnej látky alebo fyziologicky prijateľnej disperzie, parenterálne podanie, pomocou injekcie a podobne. Dávkovanie vakcíny závisí na aplikačnej ceste a bude sa meniť s vekom osoby, ktorá má byť vakcinovaná a na formulácii antigénu.
Niektoré polypeptidy vakcíny sú vo vakcíne dostatočne imunogénne, ale u niektorých iných sa zvýši imunitná odozva pridaním adjuvans. Zvlášť výhodný je adjuvans, ktorý preukázateľne uľahčuje narušenie autotolerancie k vlastným antigénom.
Sú známe rôzne spôsoby, ktorými sa docieľuje posilujúceho účinku vakcíny. Obecné princípy a spôsoby sa detailne popisujú v The Theory and Practical Application of Adjuvants, Duncan E.S. Stewart-Tull (red.), Jon Wiley & Sons, Ltd., 1995, ISBN 0-471-95170-6, a tiež v Vaccines: New Generation Immunological Adjuvats, Gregoriadis G. et al. (red.), Plénum Press, New York, 1995, ISBN 0-306-45283-9; obidve publikácie sú tu týmto zahrnuté ako odkazy.
Výhodné adjuvans uľahčujú absorpciu vakcínových molekúl APC bunkami, ako sú dendritické bunky a ich aktiváciu. Príklady, ktoré nemajú byť obmedzujúce, sú vybrané zo skupiny zahrnujúcej adjuvans: zameraných na imunitu; imunomodulačné .adjuvans, · napríklad toxín, cytokín · a mykobakteriálne deriváty;' olejový prípravok; polymér; adjuvans tvoriaci micely; saponín; matrix imunostimulačného komplexu (ISCOM matrix); častice; DDA; hliníkový adjuvans; DNA adjuvans; γinulín; a obalové adjuvans. Obecne by malo byť zaznamenané, že vyššie uvedené popisy, ktoré sa týkajú zlúčenín a činidiel užitočných ako prvý, druhý a tretí podiel v analógoch tiež odkazuje mutatis mutandis na ich využitie v adjuvans vakcíny tohoto vynálezu.
Aplikácia adjuvans zahrnuje použitie činidiel ako sú hydroxid hlinitý alebo fosforečnan hlinitý (alum), obyčajne používané ako 0,05 až 0,1 percentný roztok v pufrujúcom fyziologickom roztoke, s primiešanými syntetickými polymérmi cukrov (napr. Carbopol®) používanými v 0,25 % roztoke, agregácia proteínu vo vakcíne zahrievaním pri teplote 70 101 °C po dobu od 30 sekúnd do 2 minút a tiež agregácia prostredníctvom sieťovacích činidiel. Tiež sa môže využiť agregácia k albumínu pomocou reaktivácie s protilátkami upravenými pepsínom (Fab fragmenty), zmes s bakteriálnymi bunkami, napríklad C. parvum alebo endoxíny alebo liposacharidové zložky gramnegatívnych baktérii, emulzia vo fyziologicky prijateľnom olejovom vehikule, napríklad manid monooleát (Aracel A) alebo emulzia s 20 % roztokom perfluóruhlíka (Fluosol-DA) používaným ako bloková náhrada. Prímesky s olejmi, napr. skvalénom a IFA sú tiež výhodné.
Podlá tohoto vynálezu sú zaujímavými kandidátmi na adjuvans DDA (dimetyldioktadecylamónium bromid), DNA a γ-inulín, ale tiež Freundové úplné a neúplné adjuvans, rovnako ako saponíny z druhu Quillaja, ako QuilA a QS21. Ďalšími možnosťami sú monofosforyl lipid A (MPL) a vyššie uvedené C3 a C3d.
Aj o lipozómových prípravkoch sa vie, že majú posilujúce účinky, preto patria podľa tohoto vynálezu k výhodným adjuvans.
Ďalšími výhodnými volbami adjuvans podľa tohto vynálezu sú matrixy imunostimulačných komplexov (ISCOM® matrix) zvlášť preto, že bolo ukázané, že tieto typy adjuvans sú schopné zvyšovať aktiváciu expresie MHC triedy II pomocou APC buniek. Matrix ISCOM® sa skladá z (voliteľne frakcionovaných) saponínov (triterpénoidov) z Quillaja saponaria, cholesterolu a fosfolipidu. Po zmiešaní s imunogénnym proteínom vzniká časticový prípravok, známy ako ISCOM častica, kde saponín tvorí podľa hmotnosti 60-70 %, cholesterol a fosfolipid 10-15 % a proteín 10-15 %. Detaily týkajúce sa zloženia a využitia imunostimulačných komplexov je možno nájsť v už zmienených publikáciách týkajúcich sa adjuvans, ale aj v Morein B. et al.: Clin Immunother. 3 (1995), 461-475, alebo v Bar I.G. and Mitchell G.F.: Immunol. And Celí Biol. 74 (1996), 8-25 (obidve sú tu zahrnuté ako referencie), kde sú užitočné inštrukcie k príprave úplných imunostimulačných komplexov.
Ďalšou velmi zaujímavou (a teda výhodnou) možnosťou, ako dosiahnuť posilujúceho účinku, je použitie techniky opísanej v Gosselin · et al., 1992 (ktorá je tu zahrnutá ako odkaz). Stručne povedané, prezentácia relevantného antigénu, ako je antigén predloženého vynálezu, sa môže zvýšiť konjugáciou antigénu s protilátkou (alebo antigénom, ktorý viaže fragmenty protilátky) proti Fcy receptorom na monocytoch/makrofágoch. Zvlášť u konjugátov medzi antigénom a anti-FcyRI bolo. ukázané, že zvyšujú imunogenicitu pre vakcinačné účely.
Iné možnosti sa týkajú použitia zacielených a imunomodulačných látok (t.j. cytokínov), zmienených vyššie, ako kandidátov na prvé a druhé podiely v modifikovaných analógoch. V tejto súvislosti do úvahy tiež prichádzajú syntetické činidlá indukujúce cytokíny, ako poly I:C.
Vhodné mykobakteriálne deriváty sa vyberajú zo skupiny zloženej z muramyl dipeptidov, úplného Freundovho adjuvans, RIBI a diesteru trihalózy, napríklad TDM a TDE.
Vhodnými, na imunitu zameranými adjuvans sú látky zo skupiny pozostávajúcej z CD40 ligandu a CD40 protilátok alebo ich špecificky viazaných fragmentov (porovnaj vyššie uvedenú diskusiu), manózy, Fab fragmentu a CTLA-4.
Vhodné polymérne adjuvans sú zo skupiny pozostávajúcej z uhlovodíkov, ako je dextrán> PEG, škrob, manán a manóza, plastických polymérov a latexu, ako sú latexové guličky.
Ďalším iným zaujímavým spôsobom modulácie imunitnej odozvy je začlenenie imunogénu (volitelne spolu s adjuvans a farmaceutický prijatelnými nosičmi a vehikulmi) do „virtuálnej lymfatickej uzliny (VLN) (patentované lekárske zariadenie vyvinuté ImmunoTherapy, Inc., 360 Lexington Avenue, New York, NY 10017-6501). VLN (tenučké trubičkovité zariadenie) napodobuje štruktúru a funkciu lymfatickej uzliny. Vložením VLN pod kožu sa vytvorí lokálny sterilný zápal s prudkým vzrastom cytokínov a chemokínov. T- a B-bunky, rovnako ako APC bunky, rýchlo reagujú na signály nebezpečenstva, presťahujú sa do zapáleného miesta a hromadia sa vnútri pórovitého matrixu VLN. Ukázalo sa, že potrebná dávka antigénu na zahájenie imunitnej odozvy voči antigénu sa pri použití VLN zníži a že vakcináciou poskytnutá imunitná ochrana prevyšuje konvenčnú imunizáciu s použitím RIBI ako adjuvans. Technológia sa stručne popisuje v Gelber C. et al.: Elicitation o f Robust Cellular and Humoral Immune Responses to Small Amounts of Immunogens Using a Novel Medical Device Designated the Virtual Lymph Node, v „From the Laboratory to the Clinic, Book of Abstracts, October 12th - 15th 1998, Seascape Resort, Aptos, Kalifornia.
Posledné výsledky výskumu ukázali, že spolupodávanie H2 agonistov zvyšuje prežitie NK buniek a CT lymfocytov v nádore. Preto sa zvažuje zahrnúť H2 agonistov ako adjuvans do spôsobov tohoto vynálezu.
Predpokladá sa, že by sa vakcína mala aplikovať aspoň raz za rok, napríklad aspoň 1, 2, 3, 4, 5, 6 a 12-krát ročne.
Špecifickejšie sa očakáva 1-12 krát ročne, napríklad 1, 2,
3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 alebo 12-krát za rok jedincovi, ktorý to potrebuje. Skôr bolo ukázané, že imunitná pamäť indukovaná použitím výhodných autovakcín podľa tohto vynálezu nie je trvalá, a preto sa imunitný systém musí periodicky podnecovať analógmi.
Vzhladom ku genetickej variabilite môže imunitný systém rôznych jedincov reagovať na ten istý peptid odlišne. Vakcína podía tohoto vynálezu preto môže zahrnovať niekolko rozdielnych polypeptídov, aby sa zvýšila imunitná odozva (porovnaj tiež vyššie uvedenú diskusiu o volbe pri zavádzaní cudzích T-bunkových epitopov). Vakcína môže obsahovať dva alebo viacej polypeptídov, ako boli definované vyššie.
Vakcíny môžu preto obsahovať 3 až 20 rôznych modifikovaných alebo nemodifikovaných polypeptídov, napríklad 3-10 rôznych polypeptídov. Obvykle je však snaha udržať počet peptidov na minimu, napríklad 1 alebo 2 peptidy.
Živé vakcíny
Druhou alternatívou, ako uskutočniť prezentáciu imunitnému systému, je technológia živej vakcíny. Pri živej vakcinácii sa prezentácia imunitnému systému uskutoční tým, že sa živočíchovi podá nepatogénny mikroorganizmus, ktorý sa transformuje fragmentom nukleovej kyseliny, ktorý kóduje potrebné epitopické oblasti alebo kompletný prvý a/alebo druhý analóg. Inou možnosťou je transformácia mikroorganizmus vektorom, ktorý obsahuje takýto fragment nukleovej kyseliny. Nepatogénnym organizmom môže byť akýkoľvek vhodne oslabený bakteriálny druh (oslabený pomocou vynechania alebo pomocou odstránenia produktov patogénnej expresie technológiou rekombinantnej DNA), napr. Myco-bacterium bovis BCG., nepatogénny Streptococcus spp., E. coli, Salmonella spp., Vibrio cholerae, Shigella atd. Prehľady, ktoré pojednávajú o príprave známych živých vakcín, je možné napríklad nájsť v Saliou P.: Rev. Prat. 45 (1995), 1492-1496 a Walker P.D.:
I
Vaccine 10 (1992), 977-990, ktoré sú tu obidva zahrnuté ako odkazy. Detaily týkajúce sa fragmentov nukleových kyselín a vektorov používaných v tomto vynáleze sa diskutujú ďalej.
U polypeptidovej vakcíny môžu býť TH epitop a/alebo prvý a/alebo druhý á/alebo tretí podiel, ak sú prítomné, vo forme fúznych partnerov aminokyselinovej sekvencie odvodenej z bunkového polypeptidového antigénu.
Ako alternatíva k bakteriálnym živým vakcínam sa môže fragment nukleovej kyseliny vynálezu, diskutovaný ďalej, začleniť do nezhubného vírusového vektora vakcíny. Jednou z možností je kiahňový vírus, napr. ovčie kiahne, MVA (modifikovaný vírus ovčích kiahní), kiahne kanárikov, vtáctva, kurčiat atd. Alebo sa môže použiť, obmena vírusu prostého oparu.
Obvykle sa-nepatogénny mikroorganizmus alebo vírus aplikuje živočíchovi iba raz, ale v niektorých prípadoch môže byť potrebná viac ako jedna aplikácia za život.
Mikroorganizmus sa tiež môže transformovať nukleovou kyselinou (kyselinami), ktorá obsahujú oblasti kódujúce prvé, druhé a/alebo tretie podiely, napr. vo forme imunomodulačných látok popísaných vyššie, ako sú cytokíny diskutované ako užitočné adjuvans. Výhodný prípad tohto uskutočnenia je, keď kódovaná oblasť pre analóg a kódovaná oblasť pre imunomodulátor majú rozdielne úseky otvoreného záznamu alebo sú aspoň riadené rozdielnymi promótormi. Tým je vylúčené, aby sa analóg alebo epitopy produkovali ako fúzny partneri k imunomodulátoru. Alebo sa ako transformačné činidlá môžu použiť dva rozdielne nukleotidová fragmenty.
Vakcinácia nukleovej kyseliny
Technológia vakcinácie nukleovej kyseliny (známa tiež ako „imunizácia nukleovou kyselinou, „genetická imunizácia, „génová imunizácia a „DNA vakcinácia) ponúka, ako alternatíva ku klasickej aplikácii peptidovej vakcíny, rad atraktívnych rysov.
Predne, na rozdiel od tradičnej vakcinácie, vakcinácia nukleovou kyselinou nevyžaduje zdroj spotrebovávajúci veľké množstvo pripravovaných imunogénnych činidiel (napríklad vo forme priemyslovo fermentovaných mikroorganizmov produkujúcich analógy potrebné k polypeptidovej vakcinácii). Okrem toho nie je potrebné zariadenie na čistenie a posttranslačnú úpravu imunogénu. A nakoniec, pretože vakcinácia nukleovou kyselinou sa opiera o biochemickú výbavu .vakcinovaného jedinca, aby produkovala expresný produkt zavedenej nukleovej kyseliny, očakáva sa, že nastane optimálna posttranslačná úprava produktu expresie; to je zvlášť dôležité pri autovakcinácii, pretože, ako sa uvádza vyššie, by sa mala zachovať podstatná časť pôvodných B-bunkových epitopov v analógoch odvodených z polypeptidových sekvencii vystavených extracelulárnemu vplyvu, a pretože B-bunkové epitopy sa spravidla môžu vytvárať z častí lubovolných (bio)molekúl (napr. uhľovodíkov, lipidov, proteínov atd.). Preto natívne glykozylačné a lipidačné profily imunogénu môžu byť dosť dôležité pre celkovú imunogenicitu a to je najlepšie zaistené hostiteľom produkujúcim imunogén.
Dôležitá forma uskutočnenie spôsobu podlá vynálezu sa preto týka uskutočnenia prezentácia tým, že sa do APC zavedie in vivo aspoň jeden fragment nukleovej kyseliny, ktorý kóduje a exprimuje aspoň jeden CTL epitop a/alebo aspoň jeden Bbunkový epitop a aspoň jeden prvý cudzí Th epitop (alternatívne sa aplikujú aspoň dva rozdielne fragmenty nukleovej kyseliny, kde jeden kóduje aspoň jeden CTL epitop a druhý aspoň jeden cudzí TH epitop). Výhodne sa to urobí použitím fragmentu nukleovej kyseliny, ktorý kóduje a exprimuje vyššie diskutovaný prvý analóg. Ak je prvý analóg vybavený už detailne opísanými TH epitopmi a/alebo prvým a/alebo druhým a/alebo tretím podielom, potom sú tieto vo forme fúznych partnerov k aminokyselinovej sekvencii odvodenej z bunkového polypeptidového antigénu a fragmentom nukleovej kyseliny bude kódovaný tento fúzny konštrukt.
Podobne, ako u tradičného vakcinačného prístupu, sa vakcinácia nukleovou kyselinou môže kombinovať s tým, že sa do APC zavedie in vivo aspoň jeden fragment nukleovej kyseliny, ktorý kóduje a exprimuje druhý analóg. Úvahy týkajúce sa prvého, druhého a tretieho podielu a TH epitopov sa vzťahujú aj na tento prípad.
Zavádzanou nukleovou kyselinou je pri tejto forme uskutočnenia vynálezu výhodne DNA, ktorá môže byť vo forme prostej DNA, DNA s nabitými alebo elektroneutrálnymi lipidmi, DNA tvorenej v lipozómoch, DNA zahrnutej do vírusového vektora, DNA pripravenej s proteínom alebo polypeptidom uľahčujúcim indikáciu, DNA pripravenej s zacieleným proteínom alebo polypeptidom, DNA pripravenej s činidlami zrážajúcimi vápnik, DNA spojenej s molekulou inertného nosiča a DNA pripravenej s adjuvans. V tejto súvislosti stojí za zmienku, že prakticky všetky úvahy týkajúce sa použitia adjuvans v tradičnom vakcinačnom prípravku platia pre prípravu DNA vakcín. Preto všetky tu opísané význaky, ktoré sa týkajú použitia adjuvans v súvislosti s polypeptidovými vakcínami, platia mutatis mutandis pri ich použití v technológii vakcinácie nukleovej kyseliny. To isté platí pre ostatné úvahy týkajúce sa prípravy, formy a spôsobu aplikácie vakcíny, a preto tiež vyššie uvedené úvahy v súvislosti s tradičnou vakcináciou platia mutatis mutandis na ich použitie v technológii vakcinácie nukleovej kyseliny.
Zvlášť výhodným typom prípravku vakcíny nukleovej kyseliny sú mikročastice obsahujúce DNA. Vhodné mikročastice sú napr. opísané v WO 98/31398.
Okrem toho môže nukleová kyselina (nukleové kyseliny) použitá ako imunizačné činidlo obsahovať oblasti kódujúce prvé, druhé a/alebo tretie podiely, napr. vo forme imunomodulačných látok opísaných vyššie, napríklad cytokíny, diskutované ako užitočné adjuvans. Výhodná forma tohoto uskutočnenia je, keď kódovaná oblasť pre analóg a kódovaná oblasť pre imunomodulátor majú rozdielne úseky otvoreného záznamu alebo sú aspoň riadené rozdielnymi promótormi. Tým je vylúčené, aby sa analóg alebo epitopy produkovali ako fúzny partneri imunomodulátora. Alebo sa môžu použiť dva rozdielne nukleotidové fragmenty, ale to je menej výhodné vzhľadom k výhode, ktorú má spoločná expresia, keď sú obidve kódujúce oblasti obsiahnuté v jednej a tej istej molekule.
Obvykle sa nukleová kyselina vakcíny zavádza ako vektor, v ktorom je expresia riadená vírusovým promótorom. Detailnejšia diskusia týkajúca sa vektorov podía tohto vynálezu sa uvádza ďalej. Podrobnejšie závery týkajúce sa formy a použitia vakcín nukleových kyselín sú dostupné napr.
v Donnelly J. J. et al: Annu. Rev. Immunol. 15 (1997) , 6187648 a Donnelly J.J. et al: Life Sciences 60 (1997), 163-172. Obidva tieto odkazy sú tu zahrnuté ako odkazy.
Dôležitá časť tohoto vynálezu patrí novému spôsobu výberu vhodných imunogénnych analógov bunkového polypeptidového antigénu, ktorý je v živočíchovi slabo imunogénny alebo neimunogénny, pričom imunogénny analóg je schopný v živočíchovi indukovať odozvu CTL proti bunkám zobrazujúcim MHC molekulu triedy I viazanú na epitop odvodený z bunkového polypeptidového antigénu. Tento spôsob zahrnuje kroky:
a) identifikáciu aspoň jednej subsekvencie aminokyselinovej sekvencie bunkového polypeptidového antigénu, kde príslušná subsekvencia neobsahuje známe alebo predpokladané CTL epitopy,
b) prípravu aspoň jedného predpokladaného imunogénneho analógu bunkového polypeptidového antigénu vložením do aminokyselinovej sekvencie bunkového polypeptidového antigénu aspoň jedného pre živočícha cudzieho TH epitopu vo vnútri aspoň jednej subsekvencie určenej v kroku a) a
c) výber analógu alebo analógov pripravených v kroku b) , u ktorých sa overila schopnosť indukcie CTL odozvy v živočíchovi.
Ináč, uvedený spôsob výberu zahrnuje prípravu fragmentu nukleovej kyseliny pre účely vakcinácie nukleovou kyselinou. Za tejto situácie sa požaduje, aby kódovaný peptid obsahoval aspoň jeden TH epitop.
Keď je analóg odvodený z antigénu, ktorý je vystavený extracelulárnej fázy, je výhodné, aby sekvencia určená v kroku a) ďalej neobsahovala cysteínové zvyšky alebo ináč, aby TH epitop vložený v kroku b) podstatne nemenil charakter cysteínových zvyškov. Tento prístup uľahčuje zachovanie priestorových B-bunkových epitopov vo výslednom prípravku, ktoré sú podobné B-bunkovým epitopom v slabom bunkovom polypeptidovom antigéne.
Z rovnakých dôvodov je výhodné, aby subsekvencia určená v kroku a) ďalej neobsahovala známe alebo predpokladané glyk'ozýlačné miesta alebo ináč, aby TH epitop vložený v kroku b) podstatne nemenil glykozylačný charakter.
Určité slabé bunkové polypeptidové antigény uplatňujú nežiaduce účinky patofyziologickou funkciou. Je žiaduce, aby sa tieto účinky neprejavovali u vakcinačných prípravkov, a preto je výhodné, aby subsekvencia identifikovaná v kroku a) podstatne prispievala k patofyziologickému účinku bunkového polypeptidového antigénu a aby zavedenie TH epitopu v kroku b) redukovalo alebo eliminovalo zmienený patofyziologický účinok. Príkladom tohto prístupu je odstránenie aktívneho miesta v enzýme, v hormóne alebo v cytokíne a jeho zámena za cudzí TH epitop.
Ďalšia dôležitá úvaha patrí otázke imunologickej krížovej reaktivite polypeptidového produktu vakcíny s inými vlastnými proteínmi, ktoré nesúvisia s patológiou. Tejto krížovej reaktivite je lepšie sa vyhnúť, preto jedno dôležité uskutočnenie spôsobu tohto vynálezu je to, kde subsekvencia určená v kroku a) je homologická k aminokyselinovej sekvencií odlišného proteínového antigénu živočícha a kde zavedenie TH epitopu v kroku b) tuto homológiu reálne odstraňuje.
S týmto uskutočnením súvisí uskutočnenie, kde akékoľvek aminokyselinové sekvencie, ktoré 1) nie sú obvykle vystavené extracelulárnej fázy a 2) ktoré môžu tvoriť B-bunkové epitopy slabého bunkového polypeptidového antigénu, nie sú zachované v analógu. Môže sa to dosiahnuť výmenou takýchto aminokyselinových sekvencií za Th epitopy, ktoré netvoria Bbunkové epitopy, ich úplným odstránením alebo ich čiastočným odstránením.
Na druhej strane je výhodné, aby sa všetky „pravé Bbunkové epitopy slabého bunkového polypeptidového antigénu čo najviac zachovali, a preto dôležité uskutočnenie spôsobu výberu podlá vynálezu sa týka toho, aby zavedenie cudzieho TH epitopu v kroku b) malo za výsledok zachovanie podstatného podielu B-bunkových epitopov bunkového polypeptidového antigénu. Zvlášť je výhodné, keď si analóg uchová celkovú terciárnu štruktúru bunkového polypeptidového antigénu.
Príprava v kroku b) sa výhodne uskutočňuje prostriedkami molekulárnej biológie alebo syntézou peptidov v pevnej alebo kvapalnej fázy. Kratšie peptidy sa výhodne pripravujú bežnými technológiami syntézy v pevnej alebo kvapalnej fázy. Súčasný pokrok v tejto technológii však umožňuje týmito prostriedkami vyrobiť polypeptidy a proteíny v plnej dĺžke, a preto spadá do rámca predloženého vynálezu tiež príprava dlhých konštruktov syntetickými prostriedkami.
Potom, čo boli vyššie diskutovaným spôsobom identifikované užitočné analógy, je potrebné vyrábať analóg vo veľkom merítku. Polypeptidy sa pripravujú spôsobmi dobre známymi v technike.
Je to možné uskutočniť prostriedkami molekulárnej biológie, ktoré v prvom kroku zahrnujú prípravu transformovanej bunky tak, že sa do vektora zavedie šekvencia nukleovej kyseliny kódujúca analóg, ktorý bol vybraný uvedeným spôsobom, a že sa vektorom transformuje vhodná hostitelská bunka. Nasledujúcim krokom je kultivácia transformovanej bunky za podmienok ulahčujúcich expresiu fragmentu nukleovej kyseliny kódujúceho analóg bunkového antigénu a následne spätné získanie analógu z kultivačného supernatantu alebo priamo z buniek, napríklad vo forme lyzátu. Ináč sa môže analóg pripraviť vo velkom rozsahu syntézou peptidov v pevnej alebo kvapalnej fázy.
Nakoniec sa produkt môže podía zvolenej hostitelské bunky alebo podía použitej metódy syntézy podrobiť umelým posttranslačným modifikáciám. Tými môžu byť schémy „refolding (nariasenia) známe v technike, spracovanie s enzýmami (aby sa dosiahlo glykozylácie alebo odstránenie nežiaducich fúznych partnerov), chemická modifikácia (opäť je možná glykozylácia) a konjugácia, napr. s tradičnými nosičovými bunkami.
Malo by sa poznamenať,,že výhodné analógy tohoto vynálezu (a tiež relevantné analógy používané v spôsoboch tohto vynálezu) zahrnujú modifikácie, ktorých výsledkom sú peptidy aspoň zo 70 % sekvenčne identické s polypeptidovým antigénom alebo s jeho subsekvenciou o dĺžke aspoň 10 aminokyselín. Vyššia sekvenčná identita je výhodnejšie, napríklad aspoň 75 % alebo dokonca aspoň 80 % alebo 85 %. Sekvenčná identita proteínov a nukleových kyselín sa môže vypočítať ako (Nref-Ndi.f) * 100/Nref, kde Ndif je celkový počet neidenťických zvyškov vo dvoch zoradených sekvenciách a Nref je počet zvyškov v jednej zo sekvencií. Podľa toho DNA sekvencia AGTCAGTC je zo 75 % sekvenčne identická so sekvenciou AATCAATC (Ndif=2 a Nref=8) .
Príklady špecifických cieľov pre spôsob podľa vynálezu
Ako už bolo povedané, výhodnými slabými bunkovými polypeptidovými antigénmi sú nádorové antigény. Ich zoznam, ktorý nie je obmedzujúci, uvádza nasledujúca tabulka.
Antigén Odkazy
5-a reduktáza Délos, S., Carsol, J.L., Fina, F.,
Raynaud, J.P., Martin, P.M.: 5alphareductase and 17beta-hydroxysteroid dehydrogenase expression in epithelial cells from hyperplastic and malignant human prostate. Int. J. Cancer, Mar 16, 75:6 (1998), 840-846.
a -fetoproteín Esteban, C., Terrier, P., Frayssinet,
C., Uriel, J.: Expression of the a -
fetoproteín | gene in | human breast |
cancer. Tumour. Biol., | 17:5 (1996), | |
2999-305. | ||
Harada, Y., | Ohuchi, N. | , Masuko, T., |
Funaki, Y., | Mori, S ., | Satomi, S., |
Hasimoto, Y.: Characterization of a new breast cancer-associated antigén and its relationship to MUC1 and TAG-
72 antigéns. | Toho ku J. Exp. Med., | Nov | |
180:3 (1996), | 273-288. | ||
Dihlmann, S., | Amler, L.C., | Schwab, | M., |
Wenzel, A. : | Variations | in | the |
expression | of the | adenomatous | |
polyposis coli (APC) tumor | suppressor |
9:3 (1997), 119-127.
gene in human cancer celí lines of different tissue origin. Oncol. Res.,
APRÍL
BAGE β-katenín
Bcl2
Bcr-abl (b3a2)
L.E., Sordat, B., Rimoldi, D., Tschopp, J. : APRÍL, a new ligand of the tumor necrosos factor family, stimulates tumor celí growth. J. Exp. Med., Sep 21, 188:6 (1998), 1185-1190. Bôel, P., Wildmann, C., Sensi, M.L., Brasseur, R., Renauld, J.C., Coulie, P., Boon, T and Van der Bruggen, P.: BAGE: a new gene encoding an antigén recognized on human melanomas by čytolytic lymphocytes. Immunity, 2 (1995), 167-175.
Hugh, TJ., Dillon, S.A., O'Dowd, G., Getty, B., Pignatelli, M.,Poston,
G.J., Kinsela, A.R.: beta-catenin expression in primary and metastatic colorectal carcinoma. Int. J. Cancer, Aug 12, 82:4 (1999), 504-511.
Kóty, P.P., Zhang, H., Levitt, M.L.: Antisense . bcl-2 treatment increases programmed celí death in non-small celí lung cancer celí lines. Lung Cancer, Feb 23:2 (1999), 115-127. Verfaillie, C.M., Bhatia, R., Miller, W., Mortari, F., Roy, V., Burger, S., Mc Cullough, J., Stieglbauer, K., Dewald, G.,Heimfeld, S., Miller, J.S., Mc Glave, P.B.: BCR/ABL-negative promitive progenitors suitable for.
transplantation can be selected from the marrow of most early-chronic phase but not accelerated-phase chronic myelogenous leukémia patiens. Blood,
CA-125
CASP-8/FLICE
Katepsíny
CD19
CD20
Jun 1, 87:11 (1996), 4770-4779.
Bast, R.C, Jr., Xu, F.J., Yu Y.H., Barnhill, S., Zhang, Z., Mills, G.B.: CA 125: the pást and the future. Int. J. Biol. Markers, Oct-Dec 13:4 (1998),
179-187.
Mandruzzato, S., Brasseur, F., Andry, G., Boon, T., van der Bruggen, P.: A CASP-8 mutation recognized by cytolytic T lymphocytes on a human head and neck carcinoma. J. Exp. Med., Aug 29, 186:5 (1997), 785-793.
Thomssen, C., Schmitt, M., Goretzki, L., Oppelt, P., Pache, L., Dettmar, P., Jänicke, F., Graeff, H.: Prognostic value of the cysteine proteases cathepsins B.and cathepsin L in human breast cancer. Clin. Cancer Res., Jul 1:7 (1995), 741-746. Scheuermann, R.H., Racila, E.: CD19 antigén in leukémia and lymphoma diagnosis and immunotherapy. Leuk. Lymphoma, Aug 18:5-6 (1995), 385-397. Knox, S.J., Goris, M.L., Trisler, K., Negrin, R., Davis, T., Liles, T.M., Grillo-López, A., Chinn, P., Varns, C., Ning, S.C., Fowler, S., Deb, N., Becker, M., Marquez, C., Levy, R.: Yttrium-90-labeled anti-CD20 monoclonal antibody therapy of recurrent B-cell lymphoma. Clin.
Cancer res., Mar 2:3 (1996), 457-470.
Shubinsky, G., Schlesinger, M.,
CD21
CD23
CD22
CD33
CD35
Polliack, A., Rabinowitz, R.: Pathways controlling the expression of surface CD21 (CR2) and CD23 (Fc (epsilon) IIR) proteins in human malignant B cells. Leuk. Lymphoma, May 25:5-6 (1997),
521-530.
Shubinsky, G., Schlesinger, M., Polliack, A., Rabinowitz, R.: Pathways controlling the expression of surface CD21 (CR2) and CD23 (Fc (epsilon) IIR) proteins in human malignant B cells. Leuk. Lymphoma, May 25:5-6 (1997),
521-530.
French, R.R., Penney, C.A., Browning, A.C., Stirpe, F., George, A.J., Glennie, M.'J.: Delivery of the ribosome-inactivating protein, gelonin, tolymphoma cells via CD22 and CD38 using bispecific antibodies. Br. J. Cancer, May 71:5 (1995), 986-994. Nakase, K., Kita, K., Shiku, H., Tanaka, I., Našu, k., Dohy, H., Kyo, T., Tsutani, H., Kamada, N.: Myeloid antigén, CD13,CD14, and/or CD33 expression is restricted to certain lymphoid neoplasms. Am. J. Clin. Pathol., Jun 105:6 (1996), 761-768. Yamakawa, M., Yamada, K., Tsuge, T., Ohrui, H., Ogata, T., Dobashi, M., Imai, Y.: Protection of thyroid cancer cells by complement-regulatory factors. Cancer, Jun 1 73:11 (1994),
2808-2817.
CD4 4
CD4 5
CD4 6
CD5
Naot, D., Sionov, R.V., Ish-Shalom,
D.: CD44: structure, function, and association with the malignant process. Adv. Cancer Res., 71 (1997),
241-319.
Buzzi, M., Lu, L., Lombardi, A. J. Jr., Posner, M.R., Brautigan, D.L.,
Fast, L. D., Frackelton, A.R. Jr. : Dif ferent iation-induced changes in proteintyrosin phosphatase activity and commensurate expression of CD45. in human. leukémia celí lines. Cancer Res., Jul 15, 52:14 (1992), 4027-4035. Yamakawa, M., Yamada, K., Tsuge, T., Ohrui, H., Ogata, T., Dobashi, M., Imai, Y.: Protection of thyroid cancer cells by complement-regulatory factors. Cancer, Jun 1 73:11 (1994),
2808-2817.
Stein, R., Witz, I.P., Ovadia, J., Goldenberg, D.M., Yron, I.: CD5+B cells and naturally occurring autoantibodies in cancer patiens. Clin. Exp. Immunol., Sep 85:3 (1991),
418-423.
CD52
Ginaldi, L., De Martinis, M., Matutes,
E., Farahat, N., Morilla, R., Dyer,
M.J., Catovsky, D.: Levels of expression of CD52 in normál and leukémie B and T cells: correlation with in vivo therapeutic responses to
Campath-1H. Leuk. Res., Feb 22:2 (1998), 185-191.
CD55
CD59
CDC27
CDK4
CEA (791Tgp72) Spendlove, I., Li, L., Carmichael, J.
and Durrant, L.G.: Decay accelerating factor (CD55): A target for cancer vaccine? Cancer Res., 59 (1999), 22822286.
Jarvis, G.A., Li, J., Hakulinen, J., Brady, K.A., Nordling, S., Dahyia, R., Meri, S.: Expression and function of the complement membráne attack complex inhibitor protectin (CD59) in human prostate cancer. Int. J. Cancer, Jun 11, 71:6 (1997), 1049-1055.
Wang, R. F., Wang, X., Atwood, A. C., Topalian, S.L., Rosenberg, S.A.: Cloning genes encoding MHC class IIrestricted antigens: mutated CDC27 as a tumor antigén. Science, May 21, 284:5418 (1999), 1351-1354.
Wôlfel, T., Hauer, M., Schneider, J., Serrano, M., Wôlfel, C., KlehmannHieb, .E., de Plaen, E.,Hankeln, T., Meyer zum Btischenfelde, K., and Beach, D. : A pl6lNK4a-insensitive CDK4 mutant targeted by cytolytic T lymphocytes in a. human melanoma. Science, Sep 1, 269:5228 (1995), 1281-1284.
Kass, E., Schlom, J., Thompson, J,, Guadagni, F., Graziano, P., Greiner, J.W. : Induction of protective host immunity to carcinoembryonic antigén (CEA), a self-antigen in CEA transgenic mice, by immunizing with a recombinant vaccinia-CEA virus. Cancer c-myc
Cox-2
DCC
DcR3
E6 / E7
Res., Feb 1, 59:3 (1999), 676-683. Watson, P.H., Pon, R.T., Shiu, R.P.: Inhibition of c-myc expression by phpsphorothioate antisense oligonucleotide identifies a critical role for c-myc in the growth of human breast cancer. Cancer Res., Aug 1, 51:15, (1991), 3996-4000.
Tsujii, M. et al.: Cycloxygenase regulates antiogenesis induced by colon cancer cells. Celí, 93 (1998),
705-716.
Gotley, D.C., Reeder, J.A., Fawcett, J., Walsh, M.D., Bates, P., Simmons, D.L., Antalis, T.M.: The deleted in colon cancer (DDC) gene i.s consistently expressed in colorectal cancers and metastases. Oncogene, Aug 15, 13:4 (1996), 787-795.
Pitti, R. et al.: Genomic amplif ication of a decoy receptor for Fas ligand in lung and colon cancer. Náture, .396 (1998), 699-703.
Steller, M.A., Zou, Z., Schiller, J.T., Baserga, R.: Transformation by human papillomavirus 16 E6 and E7: role of the insulin-like growth factor 1 receptor. Cancer Res., Nov 1, 56:21 (1996), 5087-5091.
Yang, X.D., Jia, X.C., Corvalan, J.R.,
Wang, P., Davis, C.G., Jakobovits, A.:
Eradication of established tumors by a fully human monoclonal antibody to the
EGFR
ΕΜΒΡ
Ena78 farsyl transferáza
FGF8b a FGF8a
FLK-l/KDR epidermal growth factor receptor without comcomitant chemotherapy. Cancer Res., 59 (6), 1999, 1236-1243. Shiina, H., Igawa, M., Ishibe, T.: Clinical study on estramustine binding protein (EMBP) in human prostate. Prostate, Sep29:3 (1996), 169-176. Arenberg, D.A. et al.: Epithelialneutrophil activating peptide (ENA-78) is an important angiogenic factor in
non-small | celí lung cancer. | J. | Clin. | |
Invest., | 102 (1998), 465· | -472. | ||
Dorkin, | TJ., Robinson, | M.C. | Z | Marsh, |
C., | ||||
Bjartell, | A., Neal, D.E. | , Leung, | H.Y. : | |
FGF8 over-expression | in | prostate |
cancer is associated with decreased patient survival and. persists in androgen independent disease. Oncogene, Apr 29, 18:17 (1999), 27552761.
Fong, T. Annie, T. et al.: SU5416 is a potent and selective inhibítor of the vascular endothelial growth factor receptor. (Flk-1/KDR) that inhibits tyrosine kinase catalysis, tumor vacularization and growth of multiple tumor type. Cancer Res., 59 (1999),
99-106.
Kys. listová
Dixon, K.H., Mulligan, T., Chung,
K.N., Elwood, P.C., Cowan, K.H.:
Effects of folate receptor expression following stable -transfection into
G250
Skupina GAGE
Gastrín 17 wild type and methotrexatetransport deficient ZR- human breast cancer cells. J. Biol. Chem.z Nov 25, 267:33 (1992), 24140-24147.
Divgi, C.R., Bander, N.H., Scott, A.M., O'Donoghue, J.A., Sgouros, G., Welt, S., Finn, R.D., Morrissey, F., Capitelli, P., Williams, J.M., Deland, D., Nakhre, A., Oosterwijk, E., Gulec, S.,Graham, M.C., Larson, S.M., Old, L.J.: Phase I/II radioimmunotherapy trial with iodine-131-labeled monoclonal antibody G250 in metastatic renal celí carcinoma. Clin. Cancer Res., Nov 4:11 (1998), 2729-2739.
De Backer, O., 10 others,Boon, T., van der Bruggen, P.: Characterization of the GAGE genes that are expressed in various human cancers and in normál testis. Cancer Res., Jul 1:59 (13) (1999), 3157-3165.
Watson, S.A., Michaeli, D., Grimes,
S., Morris, | T.M., | Crosbee, D., |
Wilkinson, | M., | Robinson, ' G., |
Robertson, | J.F., | Steele, R.J., |
Hardcastle, | J.D. : | Anti-gastrin |
antibodies | raised | by gastrimmune |
inhibit growth of the | human colorectal | |
tumour AP5. | Int. J. | Cancer, Apr 10, |
Hormón uvolňujúci Gastrín
61:2 (1995), 233-240.
Wang, Q.J., Knezetic, J.A., Schally,
A.V., Pour, P.M., Adrián, T.E.:
(Bombesin)
GD2 / GD3
GM2
GnRH
GnTV
Bombesin may> stimulate proliferation of human pancreatic cancer cells through an autocrine pathway. Int. J. Cancer, Nov 15, 68:4 (1996), 528-534.
Wiesner, D.A., Sweeley, C.C. : Circulating gangliosides of breastcancer patiens. Int. J. Cancer, Jan 27, 60:3 (1995), 294-299.
Bahk, J. Y., Hyun, J. S., Lee, H., Kim, M.O.,Cho, G.J., Lee, B.H., Choi, W.S.: Expression of gonadotropin-releasing hormone (GnRH) and GnRH receptor mRNA in prostate'cancer cells and effect of GnRH on the proliferation of prostate cancer cells. Urol. Res., 26:4 (998), 259-264.
Hengstler, J.G., Arand, M., Herero, M.E.,Oesch, F.: Polymorphism of Nacetyltransferases, glutathione, Stransferases, microsomal epoxide hydrolase and sulfotransferases: influence of cancer susceptibility. Recent Results Cancer Res., 154 (1998), 47-85.
GP1 gplOO/Pmel g
Wagner, S.N., Wagner, C.,
Schulterwolter, T., Goos, M.: Analysis of Pmel 17/gpl00 expression in primary human tissue specimens: implications for melanoma immuno- and gene-therapy. Cancer Immunol. Immunother., Jun 44:4 (1997), 239-247.
Kirkin, A.F., Dzhandzhugazyan, K.,
Zeuthen, J.:
gp-100-in4
Melanoma-associated gpl5 gp75 / TRP-1 antigens recognized by cytotoxic Tlymphocytes. APMIS, Jul 106:7 (1998),
665-679.
Maeurer, M. J. et al.: New treatment options for patients with melanoma: review of melanoma-derived T-cell epitope-based peptide vaccines.
Melanoma Res., Feb 6 (1), 1996, 11-24. Lewis, J.J., Houghton, A.N.: Definition of tumor antigens suitable for vaccine construction. Semin. Cancer Biol., Dec 6:6 (1995), 321-327.
hCG
Hoermann, R., Gerbes, A.L., Spoettl,
G., JUungst, D., Mann, K.: Immunoreactive human chorionic gonadotropin and its free beta subunit in sérum and ascites of patiens with malignant tumors. Cancer Res., Mar 15,
52:6 (1992), 1520-1524.
Heparanáza
Vlodavsky, I., Friedmann, Y., Elkin, M., Aingorn, H., Atzmon, R., IshaiMichaeli, R., Bitan, M., Pappo, O., Peretz, T., Michal, I., Spector, L., Pecker, I.: Mammalian heparanase:
gene cloning, expression and function in tumor progression and metastasis (viz poznámky). Nat.Med., Jul 5:7 (1999), 793-802.
Her2 / neu
6:6 (1995), 321-327.
Lewis, J.J., Houghton, A.N.: Definition of tumor antigens suitable for vaccine cinstruction. Semin. Cancer Biol., Dec
HMTV
Hsp70 hTERT(telomeráza)
IGFR1
IL-13R
ÍNOS
Kahl, L.P., Carroll, A.R., Rhodes, P., Wood, J., Read, N.G.: An evaluation of the putative human mammary tumour retrovirus associated with peripheral blood monocytes. Br. J. Cancer, Apr 63:4 (1991), 534-540.
Jaatela, M. et al.: Hsp70 exerts itsanti-apoptotic function downstream of caspase-3-like proteases. EMBO J., Nov 2, 17(21), 1998, 6124-6134. Vonderheide, R.H., Hahn, W.C.,
Schultze, J.L., Ňadier, L.M.:The telomerase catalytic subunit is a widely expressed tumor-associated antigén recognized by cytotoxic Tlymphocytes. Immunity June, 10 (1999),
673-679.
Ellis, M.J. et al.: Insulin-like growth factors in human breast cancer. Breast Cancer Res. Treat., 52 (1998), 175-184. Murata, T., Obiri, N.I., Debinski, W., Puri, R.K. : Structure of IL-13 receptor: analysis of subunit composition in cancer and immune cells. Biochem. Biophys. Res. Commun., Sep 8, 238:1 (1997), 90-94.
Klotz, T., Bloch, W., Volberg, C., Engelmann, U., Addicks, K.: Selective expression of inducible nitric oxide synthase in human prostate carcinoma. Cancer, May 15, 82:10 (1998), 18971903.
Ki 67
KIAA0205
Gerdes, J., Schwab, U., Lemke, H. a Stein, H. : Production of a mouse monoclonal antibody reactive with a human nuclear antigén associated with celí proliferation. Int. J. Cancer, 31 (1983), 13-20.
Gueguen, M., Patard, J.J., Gaugler, B., Brasseur, F., Renauld, J.C., Van Cangh, P.J., Boon, T., Van den Eynde, B.J.: An antigén recognized by autologous CTLs on a human bladder carcinoma. J. Immunol., Jun 15, 160:12 (1998), 61886194.
K-ras,H-ras,N
ras Abrams, | S.I., | Hand, P.H., Tsang K. Y., |
Schlom, | J.: | Mutant ras epitopes as |
targets | for | cancer vaccines. Semin. |
KSA (C017-1A)
LDLR-FUT
Oncol., Feb 23:1 (1996), 118-134.
Zhang, S., Zhang, H.S., Reuter, V.E., Slovin, S.F., Scher, H.I., Livingston, P.O.: Expression of potential target antigens for immunotherapy on primary and matastatic prostate cancers. Clin. Cancer Res., Feb 4:2 (1998), 295-302. Caruso, M.G., Osella, A.R.,
Notarnicola, M., Berloco, P., Leo, S., Bonfiglio, C., Di Leo, A.: Prognostic value of low density lipoprotein receptor expression in colorectal carcinoma. Oncol. Rep., Jul-Aug 5:4 (1998), 927-930.
Marchand, M. et al.: Tumor regressions observed in patients with (MAGE1,
MAGE3) metastatic melanoma
Skupina MAGE
Mammaglobín
Mapl7
Melan-A / MART-1
Mezotelín
MIC A/B
MT-MMP, ako napr. MMP2, MMP3, MMP7 treated with an antigenic peptide encoded by Gene MAGE-3 and presented by HLA-A1. Int. J. Cancer, Jan 18:80
S., Darrow, Persio, J., (2), 1999, 219-230.
Watson, M.A., Dintzis,
C.M., Voss, L.E., . Di
Jensen, R., Fleming, T.P.: Mammaglobin expression in primary, metastatic and occult breast cancer. Cancer Res., Jul
1, 59:13 (1999), 3028-3031.
Kocher, O., Cheresh, P., Lee, S.W.: Identification and partial characterization of a novel membraneassociated protein (MAP17) up-regulated in human carcinomas and modulating celí replication and tumor growth. Am. J. Pathol., Aug 149:2 (1996), 493-500. Lewis, J.J., Houghton, A.N.: Definition of tumor antigens suitable for vaccine construction . Semin. Cancer Biol., Dec 6: (1995), 321-327.
Chang, K. et al.: Molecular cloning of mesothelin, a differentiation antigén present on mesothelium, mesotheliomas, and ovarian cancers. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, Jan 9:93 (1), 1996, 136-140. Groh, V., Steinle, A., Bauer, S. a Spies, T.: Recognition of stressinduced MHC molecules by intestinal epithelial gammadelta T cells. Science,
279 (1998), 1737-1740.
Sato, H., Seiki, M.: Membrane-type matrix metalloproteinases in a MMP9
Moxl
Mucin ako napr. MUC-1, MUC-2, MUC-3 a MUC-4
MUM1
NY-ESO-1
Osteonektín
Tumormetastasis (MT-MMPs). J.
Biochem. (Tokyo) , Feb 119 (2), 1996, 209-215.
Candia, A.F., Hu, J., Crosby, J., Lalley, P.A., Noden, D.,Nadeau, J.H., Wright, C.V.: Mox-1 and Mox-2 define a novel homeobox gene subfamily and are differentially expressed during early mesodermal patterning in mouse embryos. Development, Dec 116:4 (1992), 1123-1136.
Lewis,J.J., Houghton, Α.Ν.: Definition of tumor antigens suitable for vaccine construction. Semin. Cancer Biol., Dec 6:6 (1995), 321-327.
Kirkin, A.F., Dzhandzhugazyan, K., Zeuthen, J. : Melanoma- associated antigens recognized by cytotoxic T lymphocytes. APMIS, Jul 106:7 (1998), 665-679.
Jáger, E. et al·.: Simultaneous humoral and cellular immune response against cancer-testis antigén NY-ESO-1: definition of human histocompatibility leukocyte antigén (HLA)-A2-binding peptide epitopes. J. Exp. Med., 187 (1998), 265-270.
Graham, J.D., Balleine, R.L., Milliken, J.S., Bilous, A.M., Ckarke, C.L.: Expression of osteonectin mRNA in human breast tumours is inversely correlated with oestrogen receptor p 15
P170 / MDR1 p53 p97 / melanotransferín
PAI-1 content. Eur. J. Cancer, Sep 33:10 (1997), 1654-1660.
Yoshida, S., Todoroki, T., Ichikawa, Y., Hanai, S., Suzuki, H., Hori, M., Fukao, K., Miwa, M., Uchida, K.: Mutations of pl6Ink4/CDKN2 and pl5Ink4B/MTS2 genes in biliary tract cancers. Cancer Res., Jul 1, 55:13 (1995), 2756-60.
Trock, B.J., Leonessa, F., Čiarke, R.: Multidrug resistance in breast cancer: a meta-analysis of MDRl/gpl70 expression and its possible functional significance. J. Natl. Cancer ínst., Jul 2, 89:13 (1997), 917-931.
Roth, J., Dittmer, D., Rea, D.,
Tartaglia, J., Paoletti, E., Levine, A.J.: p53 as a target for cancer vaccines: recombinant canarypox vírus vector expressing p53 protect mice against lethal tumor celí challenge. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, May 14, 93:10 (1996), 4781-4786.
Furukawa, K.S., Furukawa, K., Reál,
F.X., Old,L.J., Lloyd, K.O.: A unuque antigenic epitope of human melanoma is carried on the common melanoma glycoproteingp95/p97. J. Exp. Med., eb 1, 169:2 (1989), 585-590.
Grondahl-Hansen, J., Christensen,
I.J., Rosenquist, C., Brunner, N., Mouridsen, H.T., Dano, K., BlichertToft, M. : High levels of urokinaseΊΟ
PDGF
Plazminogén (uPA)
PRÁME
Probazín
Progenipojetín PSA type plasminogen activator and its inhibítor PAI-1 in cytosolic extracts of breast carcinomas are associated with poor prognosis. Cancer Res., Jun
1, 53:11 (1993), 2513-2521.
Vassbotn, F.S., Andersson, M., Westermark, B., Heldin, C. H., Ostman, A. : Reversion of autocrine transformation by a dominánt negatíve platelet-derived growth factor mutant. Mol.' Celí Biol., Jul 13:7 (1993),
4066-4076.
Naitoh, H., Eguchi, Y., Ueyama, H., Kodama, M., Hattori, T.: Localization of urokinase-type plasminogen activator inhibitor-1, 2 a plasminogen in colon cancer. Jpn. J. Cancer Res., Jan 86:1 (1995), 48-56.
Dzhandzhugazyan, K., Melanoma-associated antigens recognized by cytotoxic T lymphocytes. APMIS, Jul 106:7 (1998),
665-679.
Kirkin, A.F., Zeuthen, J.
Matuo, Y., Nishi, N., Muguruma, Y., Yoshitake, Y., Kurata, N., Wada, F.: Localization of prostatic basic protein („probasin) in the rat prostates by use of monoclonala antibody. Biochem. Biophys. Res. Commun., Jul 16, 130:1 (1985), 293300.
Sanda, M.G., Smith, D.C., Charles,
L.G., Hwang, C., Pienta, K.J., Schlom,
PSM
RAGE-1
Rb
RCAS1
J., Milenic,D., Panicali, D., Montie, J. E.: Recombinant vaccinia - PSA (PROSTVAC) can induce a prostatespecific immune response in androgenmodulated human prostate cancer. Urology, Feb 53:2 (1999), 260-266. Kawakami, M., Nakayama, J.: Enhanced expression of prostate-specific membráne antigén gene in prostate cancer as revealed by in situ hybridization. Cancer Res., Jun 15, 57:12 (1997), 2321-2324.
Gaugler, B., 7 ostatní ch, Van den
Eynde, B.J.: A new gene coding for an antigén recognized by autologous cytolytic T lymphocytes on a human renal carcinoma. Immunogenetics, 44(5), 1996, 323-330.
Dosaka-Akita, H., Hu, S.X., Fujino, M., Harada, M., Kinoshita, I.,. Xu,
H. J., Kuzumaki, N., Kawakami, Y., Benedict, W.F.: Altered retinoblastoma protein expression in nonsmall celí lung cancer: its synergistic effects with altered ras and p53 protein status on prognosis. Cancer, Apr 1, 79:7(1997), 1329-1337.
Sonoda, K., Nakashima, M., Kaku, T., Kamura, T., Nakano, H., Watanabe, T.: A novel tumor-associated antigén expressed in human uterine and ovarian carcinomas. Cancer, Apr 15, 77(8),
1996, 1501-1509.
SART-1
Kikuchi M., Nakao, M., Inoue, Y., Matsunaga, K., Shichijo, S., Yamana,
H., Itoh, K·: Identification of a SART-l-derived peptide capable of inducing HLA-A24-restricted and tumorspecific cytotoxic T lymphocytes. Int. J. Cancer, May 5, 81:3 (1999), 459466.
Skupina SSX génu
Gure, A.O., Tuureci, 0., Sahin, U., Tsang, S., Scanlan, M.J., Jäger, E., Knuth, A., Pfreundschuh, M., Old, L.J., Chen, Y.T.: SSX: a multigene family with several .members transcribed in normál testis and human cancer. Int. J. Cancer, Sep 17, 72:6
S TAT 3
STn(skup.mucínu) (1997), 965-971.
Bromberg, J.F., Wrzeszczynska, M.H., Devgan, G., Zhao, Y., Pestell, R.G., Albanese, C., Darnell, J.E. Jr.: Stat3 as an oncogene. Celí, Aug 6, 98(3) , 1999, 295-303.
Sandmaier, B.M., Oparin, D.V.,
Holmberg, L.A., Reddish, M.A., macLean, G.D., Longenecker, B.M.: Evidence of a cellular immune response against sialyl-Tn in breast and ovarian cancer patients after highdose chemotherapy, stem celí rescue, and immunization with Theratope STnKLH cancer vaccine. J. Immunother, Jan
TAG-72
22:1 (1999), 54-66.
Kuroki, M., Fernsten, P.D.,
Wunderlich, D., Colcher, D., Simpson,
TGF-α
TGF-β
J.F., Poole, D.J., Schlom, J.: Serological mapping of the TAG-72 tumor-associated antigén using 19 distinct monoclonal antibodies. Cancer Res., Aug 15, 50:16 (1990), 4872-4879. Imanishi, K., Yamaguchi, K., Suzuki, M., Honda, S., Yanaihara, N., Abe, K.: Production of transforming growth factor-'alpha in human tumour celí lines. Br. J. Cancer, May 59:5 (1989),
761-765.
Picon, A., Gold, L.I., Wang, J., Cohen, A., Friedman, E.: A subset of metastatic human colon cancers elevated growth
Cancer Epidemiol. Biomarkers Prev., Jun 7:6 (1998), 497-504.
Bao, L., Loda, .M., Janmey, P.A., Stewart, R., Anand-Apte, B., a Zetter, B.R.: Thymosin beta 15: a novel regulátor of tumor celí upregulated in metastatic cancer. Náture Medicíne 2(12), 1996,
1322-1328.
Moradi, M.M., Carson, L.F., Weinberg, A.F., Twiggs, L.B.,
S.: Sérum and ascitic of interleukin-1,
Tymozín β 15 levels of factor betal.
expresses transforming
TNF- a motility prostate
B., Haney, Ramakrishnan, fluid levels interleukin-6 and tumor necrosos factor-alpha in patiens with ovarian epithelial cancer. Cancer, Oct 15,
72:8 (1993), 2433-2440.
ΤΡΑ
ΤΡΙ
TRP-2
Týrozináza
VEGF
ZAG
Maulard, C., Toubert, M.E., Chretien, Y., Delanian, S., Dufour, B., Housset, M.: Sérum tisue polypeptide antigén (S-TPA) in bladder cancer as a tumor marker. A prospective study. Cancer, jan 15, 73:2 (1994), 394-398.
Nishida, Y., Sumi, H., Mihara, H.: Athiol prothease inhibitor released from cultured human malignant melanoma cells. Cancer Res., Aug 44:8 (1984),
3324-3329.
Parkhurst, M.R., Fitzgeald E.B., Southwood, S., Sette, A., Rosenberg S.A., Kawakami, Y.: Identification of a shared HLA-A*0201-restricted T-cell epitope from the melanoma antigén tyrosinase-related protein 2 (TRP2). Cancer Res., Nov 1, 58:21 (1998),
4895-4901.
Kirkin, A.F., Dzhandzhugazyan, K., Zeuthen, J.: Melanoma-associated antigens recognized by cytotoxic T lymphocytes. APMIS, Jul 106:7 (1998),
665-679.
Hyodo, I., Doi, T., Endo, H., Hosokawa, Y., Nishikawa, Y., Tanimizu, M., Jinno, K., Kotani, Y.: Clinical significance of plasma vascular endothelial growth factor in gastrointestinal cancer. Eur. J. Cancer, Dec 34:13 (1998), 2041-2045. Sanchez, L.M., Chirino, A.J.,
Bjorkman, P.J.: Crystal structure of pl6lNK4
Glutatión S-transferáza human ZAG, a fat-depleting factor related to MHC molecules. Science, 19, 283 (5409),1999, 1914-1919.
Quelle, D.E., Ashmun, R.A., Hannon,
G. J., Rehberger, P.A., Trono, D., Richter, K.H., Walker, C., Beach, D., Sherr, C.J., Serrano, M.: Cloning and characterization of murine pl6INK4a and pl5INK4b genes. Oncogene, Aug 17, 11(4), 1995, 635-645.
Hengstler, J.G., Arand, M., Herrero,
M.E., Oesch, F.: Polymorphisms of Nacetyltransferases, glutathione Stransfeŕases, microsomal epoxide hydrolase ainfluence on cancer susceptibility. Recent Results Cancer Res., 154 1998, 47-85.
V nasledujúcej časti sa podrobne popisuje rad špecifických nádorových antigénov.
Špecifický membránový antigén prostaty, PSM
V USA je rakovina prostaty druhou najrozšírenejšou príčinou úmrtia následkom rakoviny (približne 40 000 ročne), a 200 tisíc pacientov ročne je diagnostikovaných (Boring 1993) . Asi každý jedenásty muž ochorie rakovinou prostaty. Okrem toho sa približne u 40 - 60 % pacientov rakoviny prostaty nakoniec choroba rozšíri mimo oblasť prostaty (Babaian 1994) . Hlavnou stratégiou v predkladanom vynáleze je využitie terapeutickej vakcinácie ako doplnkovej liečby k prostatektómii, aby sa eliminovalo reziduálne nádorové tkanivo a metastáze.
Niektoré patologické stavy sa lokalizujú v predstojnej žľaze, vrátane benígneho rastu (BPH), infekcie (prostatitis) a neoplazie (rakovina prostaty).
Biologická agresívnosť rakoviny prostaty je premenlivá. U niektorých pacientpv zostáva objavený nádor latentným histologickým tumorom a nikdy sa nestane klinicky významný. U iných pacientov nádor rýchlo rastie, metastázuje a zahubí pacienta v relatívne krátkom čase (2-5 rokov).
Bežnou primárnou liečbou rakoviny prostaty je prostatektómia. Vzhladom k rozsiahlemu rozptylu rakovinných buniek sa však väčšina pacientov s rakovinou prostaty nelieči lokálnym chirurgickým zákrokom. Pacienti s neohraničenou chorobou sa nakoniec liečia systémovou abláciou androgénu, ale ročná úmrtnosť v dôsledku rakoviny prostaty vôbec neklesla v priebehu 50 rokov, od kedy sa ablácia androgénu stala štandardnou terapiou metastazujúcej choroby.
PSM je membránový proteín vysoko špecifický pre prostatické tkanivá, tak benígne ako aj malígne, napriek tomu bola expresia PSM pozorovaná tiež v iných tkanivách, napríklad v obličkovom tkanive a v obličkových tumoroch, v tenkom čreve, v mozgu a v nádorových neovaškularizáciach. Preto, aj keď bola operácia úspešná, by sa u pacientov s odstránenou predstojnou žľazou mohla teoreticky prejaviť expresia PSM na reziduálnom nádorovom tkanive prostaty alebo v metastázach vzniklých z tohoto nádoru. Od vyvolania silnej CTL odozvy a/alebo silnej polyklonovej protilátkovej odozvy proti PSM sa očakáva eliminácia reziduálneho nádorového tkaniva.
Je zaujímavé, že po deprivačnej terapii androgénu pacientov s rakovinou prostaty je následne pozorovaná zvýšená aktivácia expresia PSM (Wright 1996) . Tým by sa po deprivačnej terapii androgénu stala liečba zameraná na PSM velmi vhodnou.
Prvý raz bol PSM identifikovaný v roku 1987 ako výsledok výroby monoklonovej protilátky 7E11-C5.3, použitej proti izolovanej ludskej bunke rakoviny prostaty LNCaP (Horoszewicz 1987). Protilátka rozpoznala tak normálny ako aj malígny prostatický epitel a použila sa v roku 1993 na čistenie a určenie aminokyselinovej sekvencie proteínu PSM a konečne na klonovanie génu (Israeli 1993) .
PSM je transmembránový glykoproteín typu II s molekulovou hmotnosťou 84 kD, ako sa predpokladá zo sekvencie nukleovej kyseliny, zatial čo glykozylovaná forma má pozorovanú molekulovú hmotnosť 100 - 120 kD. Sekvenovanie génu kódujúceho PSM odkrylo predpokladanú membránovú oblasť v súvislosti s tromi zvyškami cytosolického arginínového ukotvenia. Extracelulárnu časť PSM'tvorí 707 z celkových 750 aminokyselín proteínu, zatial čo v cytoplazmatickej doméne sa predpokladá dĺžka 19 aminokyselín (Israeli 1993). Pre PSM špecifická mRNA detegovaná v prostatickom nádorovom tkanive indikuje, že nádorový antigén nie' je nenormálne glykozylovaný proteín, ako tomu je v prípade napr. Tn- alebo sTnnádorových antigénov.
Celá dĺžka PSM cDNA bola transfektovaná do PSM negatívnej ludskej prostatickej rakovinnéj bunkovej línii PC-3 a v nej exprimovaná (Kahn 1994) . Okrem toho sa cDNA v plnej dĺžke (2,65 kilobáz) podrobila transkripcii a translácii in vitro (Kahn 1994) .
Nedávno bolo demonštrované, že PSM má hydrolytickú aktivitu podobnú N-acylovanej α-viazanej kyslej dipeptidáze (NAALADáza) - tým sa vo skutočnosti demonštrovalo, že tieto dva proteíny sú identické. NAALADáza je membránovo viazaná hydroláza nervového systému, ktorá katabolizuje neuropeptid N-acetylaspartyl glutamátu (NAAG), aby ovplyvnila glutamatergické signálne procesy. Zatial nie je známe, či tato aktivita PSM má nejakú relevantnú biologickú funkciu.
Tiež je pomerne dôležité predpovedať, či je možné očakávať nežiaducu krížovú reaktivitu s inými proteínmi dostupnými pre CTL alebo protilátky, ktorá by nasledovala po liečbe autovakcínou, ktorá indukuje PSM špecifické imunitné odozvy. Bolo ukázané, že časť kódujúcej oblasti PSM génu (pozície aminokyselín 418-567) má 54 % homológiu s ľudským receptorom transferínu (Israeli 1993) . Tiež sa našla úplná sekvenčná identita s enzýmom NAALADázy (viď vyššie). Žiadna funkčne relevantná podobnosť s inými známymi peptidázami nebola identifikovaná.
Homológia s receptorom transferínu je veľmi nízka a bude prednostne narušená v niektorom z konštruktov tohoto vynálezu. Neočakáva sa, že pozorovaná sekvenčná identita s ľudskou NAALADázou bude prekážkou pre PSM vakcínu, čiastočne kvôli nízkej schopnosti protilátok a CTL prenikať cez hematoencefalickú bariéru. Vôbec sa teda neočakáva, dokonca ani u konštruktov veľmi podobných PSM, že u pacientov dôjde ku krížovej reaktivite s inými proteínmi, ktorá by znemožnila túto aplikáciu.
Zo skorších štúdií je zrejmé, že PSM má expresiu na väčšine prostatických nádorových bunkách a na testovaných metastázach pochádzajúcich z prostaty. Ďalej, väčšina iných testovaných nádorov, napríklad karcinómy, sarkómy a melanómy rôznych tkanív, ako aj rozsiahly rad neprostatických ľudských nádorových buniek, sa ukázali ako PSM negatívne.
Naviac, velmi mnoho iných tkanív sa tiež ukázalo ako PSM negatívnych. Do tejto skupiny patrí tlsté črevo, prsia, pľúca, vaječníky, pečeň, močový mechúr, deloha, priedušnice, slezina, slinivka, jazyk, pažerák, žalúdok, štítna žľaza a prištítne telieska, nadobličky, lymfatické uzliny, aorta, dutá žila, pokožka, mliečna žľaza a placenta. Metódou RT-PCR sa však objavila existencia PSM mRNA aj u niektorých z uvedených tkanív.
Aj keď sa PSM nachádza prevážne ako molekula membránovo viazaná na prostatickom tkanive, malé množstvo PSM môže byť detegované aj v sére normálnych jedincov a zvýšené hladiny u pacientov s rakovinou prostaty (Rochon 1994, Murphy 1995) . Hladina cirkulujúcej PSM u týchto pacientov preto umožňuje sérologický monitoring účinnosti PSM vakcíny.
.Na základe všetkých dosial dostupných údajov je možné záverom konštatovať, že PSM je velmi špecifický antigén ludského prostatického tkaniva a z neho pochádzajúcich nádorov. To znamená, že u pacientov, ktorý podstúpili prostatektómiu, predstavuje PSM nádorovo kvazišpecifický vlastný antigén. Účinná PSM vakcína preto pravdepodobne zasiahne hlavne prostatické alebo z prostaty pochádzajúce metastázové tkanivo.
Ako bude zrejmé z príkladu 1, spôsob tohoto vynálezu prednostne vyžaduje, aby sa cudzí TH-bunkový epitop zaviedol do časti PSM aminokyselinovej sekvencie definovanej pomocou sekvenčného identifikačného čísla: dve pozície z 16-52 a/alebo 87-108 a/alebo 210-230 a/alebo 269-289 a/alebo 29880
324 a/alebo 442-465 a/alebo 488-514 a/alebo 598-630 a/alebo 643-662 a/alebo 672-699. Súčasťou vynálezu je okrem toho tiež modifikovaná molekula PSM, ktorá má cudzí TH-epitop vložený v týchto pozíciách.
Podľa toho je predmetom predkladaného vynálezu tiež analóg ľudskej PSM, ktorý je u ľudí imunogénny, pričom tento analóg zahrnuje podstatnú časť všetkých známych a predpokladaných CTL a B-bunkových epitopov PSM a zahrnuje aspoň jeden cudzí TH epitop, ako sa tu diskutuje. Výhodnými analógmi PSM sú tie, v ktorých aspoň jeden cudzí TH epitop je prítomný ako vložený do aminokyselinovej sekvencie PSM alebo ako náhrada časti aminokyselinovej sekvencie PSM alebo ako výsledok odstránenia časti aminokyselinovej sekvencie PSM a najvýhodnejšími analógmi sú tie, v ktorých sa cudzí TH— bunkový epitop zavedie do časti aminokyselinovej sekvencie PSM definovanej pomocou sekvenčného identifikačného čísla: 2 pozície 16-52 a/alebo 87-108 a/alebo 210-230 a/alebo 269-289 a/alebo 298-324 a/alebo 442-465 a/alébo 488-514 a/alebo 598630 a/alebo 643-662 a/alebo 672-699.
Ľudský choriónický gonadotropín (HCG)
Súvislosť medzi embryonálnymi markermi a malígnymi fenotypmi sa diskutuje už po mnoho desaťročí. Narastajúci objem údajov naznačuje,' že aspoň jeden takýto marker, ľudský choriónický gonadotropín beta (hCGP), je súhlasne detegovaný v rakovinných bunkách najrôznejšieho histologického pôvodu, a že expresia týchto proteínov je často v korelácii so vzrastajúcimi metastatickými vlastnosťami. Humorálna imunitná odozva zameraná proti tomuto rozpustnému proteínu môže redukovať riziká šírenie nádoru a/alebo znížiť recidívu nového primárneho rastu v pooperačnom období.
Ľudský choriónický gonadotropín patrí do skupiny glykoproteínových hormónov, vrátane hormónu stimulovaného folikulom (FSH), hormónu stimulovaného štítnou žľazou (TSH) a hormónu žltého telieska (LH), ktoré všetky sú dôležitými regulátormi génovej expresie v reprodukčnom procese a prežitia plodu. Členovia tejto rodiny hormónov sú heterodiméry zdielajúce spoločný a-reťazec. β-reťazec je jedinečný pre každý hormón a dáva mu špecifičnosť, ktorá sa u β-reťazca LH prejavuje najsilnejšou sekvenčnou homológiou k ϊιΟΘβ (okolo 80 %) . Zdanlivá molekulová hmotriosť celého hCG je 37 kD, z ktorej. jednu tretinu tvoria uhľovodíky.· Posttranslačné sacharidové modifikácie zahrnujú uhľovodíky viazané tak cez N, ako aj cez O. Prítomnosť početných zvyškov sialovej kyseliny dáva proteínu silný záporný náboj. Kryštalická štruktúra celkového hCG bola vyriešená (Lapthorn et al.,
1994).
Na základe kryštalickej štruktúry sa ukázalo, že hCG vykazuje homológiu k rodine rastových faktorov vrátane PDGF a ΤβΕβ (Lapthorn et al., 1994). To naznačuje, že expresia hCG môže pomôcť regulovať rast rakovinnej. bunky.
Ľudský choriónický gonadotropín je glykoproteínový hormón produkovaný placentárnymi syncytiotrofoblastmi skoro po oplodnení a je podstatný pre zdarný priebeh tehotenstva u žien.
Patofyziologická úloha embryonálnych markerov pre rozvoj alebo udržaní rakovinnej hmoty nie je známa. Je však zaujímavé si Všimnúť, že trofoblasty (ktoré tieto proteíny obyčajne produkujú) majú tak angiogenické ako aj invazívne vlastnosti, ktoré sú obidve potrebné pre rakovinnú bunku. Ďalej bolo naznačené, že hCG (alebo jeho subjednotky) môžu inhibovať imunitnú reakciu materských buniek na tkanivo plodu. Štúdie napríklad ukázali, že hCG priamo potlačuje odozvy T buniek (Jacoby et al., 1984) a je pravdepodobné, že v dôsledku imunitné potlačeného odčerpávanie (v tomto prípade) primárneho melanómu lymfatickými uzlinami, vzniká priaznivejšie prostredie pre vytváranie nádorových metastáz. V dôsledku toho môže expresia hCG3 napomôcť šíreniu rakovinných buniek do sekundárnych miazgových orgánov. Konečne, ako už bolo zmienené, preukázala sa štruktúrna homológia medzi hCG a radom rastových faktorov. Inou možnosťou preto je, že sekrécia hCG rakovinnými bunkami môže podporovať rast nádoru.
Expresia hCG£ bola pozorovaná u mnohých rôznych typov rakoviny, napríklad: a) adenokarcinóm prostaty: pozitívny nález hCGP v tkanivových sekciách bol pozorovaný u pacientov so špatnou prognózou, bez ohladu na histologický typ nádoru (Sheaff et al., 1996); b) rôzne druhy plúcnych nádorov: dlaždiove bunky (SQCC), adenokarcinóm (AC) a velké bunky (LLC), všetky vykazujú vysoké percento reaktivity voči hCGp (Boucher et al., 1995); c) adenokarcinóm pankreasu (Syrigos et al., 1998); d) neuroblastómy, rakoviny mozgu,, retinoblastómy (Acevedo et al.,. 1997); e) malígny melanóm (Doi et al., 1996); f) rakovina močového mechúra (Lazar et al., 1995). Nedávny článok opisuje DNA prístup, v ktorom sa myši imunizovali prípravkami s expresiou hCG3 (Geissler et al., 1997) . U tohoto modelu in vivo inhibícia rastu nádoru silne súvisela s aktivitou CTL, ale boli tiež detegované aj vysoké hladiny protilátok (ktoré neutralizujú biologický účinok intaktného hCG na jeho bunkový receptor).
Použitie hCG ako imunogénu sa popisuje v niekoľkých publikáciách so zameraním na jeho využitie ako anti83 koncepčnej vakcíny (Talwar et al., 1976 a Talwar et al.,
1994) . Klinická skúška zamedzujúca plodnosti s využitím vakcíny proti celému hCG sa ukázala ako vysoko účinná a spolahlivá (Talwar et al., 1994). Bola tiež uskutočnená prvá fáza klinických skúšok na pacientoch trpiacimi rakovinou s vakcínou proti syntetickému peptidu hCGp ukončenému karboxylovou skupinou konjugovaného na záškrtový toxoid (Triozzi et al., 1994) a druhá fáza skúšok prebieha. Napriek tomu, že myšlienka využiť hCGp ako cielenú vakcínu proti rakovine sa už nejaký čas objavuje, nebola nikdy skúmaná v súvislosti s technológiou äutovakcinácie.
Je známe, že bunky z neembryonálneho tkaniva alebo benígnych nádorov nemajú expresiu hCGp.. Preto by vakcinácia proti tejto molekule nemala mať prípadné vedľajšie účinky (odhliadnuc od účinkov na tehotenstvo) . Pretože má expresiu na toľkých rozdielnych druhoch rakoviny, označuje sa táto molekula ako „rozhodný rakovinný biomarker (Acevedo et al., 1995 a Regelson W., 1995) a ako taká je atraktívnym cieľom ďalšieho výskumu.
Vhodné živočíšne modely pre ďalšie štúdie efektívnosti vakcíny na báze hCG je možné nájsť v Acevedo et al. : Cancer Det. and Prev. Supí. 1, (1987), 477-^48 6 a v Kellen et al. :
Cancer Immunol. Imun. Ther. 13 (1982), 2-4.
Her2
Predpokladá sä, že receptory tyrozín kinázy Her2 a EGFr hrajú zásadnú úlohu v malígnej transformácii normálnych buniek a v pokračujúcom raste rakovinných buniek. Zvýšená expresia väčšinou vedie k špatným prognózam. V priebehu niekoľkých minulých rokov sa veľa publikácií zaoberalo využitím protilátok proti týmto receptorom k liečbe rakoviny pri zvýšenej expresii jedného z nich alebo obidvoch receptorov. Genentech Inc. ukončil niekoľko úspešných klinických skúšok u pacientov s rakovinou prsníka s použitím monoklonovej protilátky proti Her2 a nedávno získal oprávnenie FDA na predaj preparátu monoklonovej protilátky proti Her2, Herceptinu®.
Technológia autovakcinácie opísaná v tomto vynáleze by pri aplikácii na Her2 vyvolala polyklonové protilátky, ktoré by prevážne reagovali s Her2. Od týchto protilátok sa očakáva, že napadnú a eliminujú nádorové bunky, ako aj zabránia metastatickým bunkám sa rozvinúť do metastáz. Efektorový mechanizmus tohoto protinádorového účinku by bol sprostredkovaný cez komplement a bunkovú cytotoxicitu závislú na protilátke.
V závislosti na výbere prípravkov by vyvolané autoprotilátky mohli tiež inhibovať rast rakovinných buniek pomocou inhibície oligo-dimerizácie závislej na rastovom faktore a internalizáciou receptorov. Čo však je najdôležitejšie, od analógov Her2 sa očakáva, že budú schopné indukovať odozvy CTL proti známym a/alebo predpokladaným Her2 epitopom zobrazeným nádorovými bunkami.
Her2 patrí do skupiny receptorov epidermálnych rastových faktorov (c-erbB), ktorá k dnešku pozostáva zo štyroch rozdielnych receptorov označovaných: c-erbB-Ι (EGFr), c-erbB2 (Her2, c-Neu), c-erbB3 a c-erbB-4 (Salomon et al., 1995). C-erbB-3 a c-erbB-4 nie sú charakterizované tak dobre ako EGFr a Her2. Her2 je integrálny glykoproteín. Hotový protein má molekulovú hmotnosť 185 kD so štruktúrnymi rysmi, ktoré sa veľmi podobajú EGFr receptoru (Prigent et al., 1992). EGFr je tiež integrálny membránový receptor pozostávajúci z jednej subjednotky. Má zdanlivú molekulovú hmotnosť 170 kD a pozostáva z povrchovej ligandy viažucej domény 621 aminokyselín, z jedinej hydrofóbnej transmembránovej domény 23 aminokyselin a z velmi zachovanej cytoplazmatickéj tyrozin kinázovej domény 542 aminokyselín. Proteín je N-glykozylovaný (Prigent et al., 1994).
Všetky proteíny tejto skupiny sú tyrozin kinázy. Interakcia s ligandom vedie k dimerizácii receptora, ktorá zvyšuje katalytickú aktivitu tyrozin kinázy (Bernard, 1995, Chantry,
1995). Proteíny tejto skupiny sú schopné homo- a heterodimerizácie, ktorá je dôležitá pre ich aktivitu. EGFr prenáša účinky podporujúce rast a stimuluje absorpciu glukózy a aminokyselin bunkami (Prigent et al., 1992). Her2 tiež prenáša signály podporujúce rast. Len EGFr viaže EGF a TGF-a. Tieto ligandy sa neviažu na iné receptory z tejto skupiny (Prigent et al., 1992). Ligandy pre Her2 nie sú úplne určené. Bolo však ukázané, že heregulín indukuje fosforyláciu pomocou aktivácie Her2. Nezdá sa, že by to bolo spôsobené priamou väzbou na receptor, ale predpokladá sa, že heregulín je ligandom pre erbB-3 a erbB-4, ktorý potom aktivuje Her2 pomocou oligodimerizácie (Solomon e.t al., 1995).
Homológia medzi proteínmi skupiny EGF receptoru je najvýraznejšia v doméne tyrozin kinázy v cytoplazmatickej časti molekúl (82 % medzi EGFr a Her2). V extracelulárnej oblasti je homológia nižšia - od 41 % do 46 % v rôznych doménach (Prigent et al., 1992).
Epidermálny receptor rastového faktoru je na normálnom tkanive exprimovaný v malom množstve, ale má zvýšenú expresiu u mnohých typov nádorov. EGFr má zvýšenú expresiu u rakoviny prsníka (Earp et al., 1993, Eppenberger, 1994), u gliómov (Schlegel et al., 1994), u rakoviny žalúdka (Tkunaga et al.,
1995), u nádoru horných kožných vrstiev (Fujii 1995), u rakoviny vaječníkov (van Dam et al., 1994) a u iných. Her2 je tiež exprimovaný na niekoľkých normálnych ľudských tkanivách v malom množstve, najtypickejšie na sekrečnom epiteli. Zvýšená expresia Her2 nastáva u asi 30 % rakovín prsníka, žalúdka, slinivky, močového mechúra a vaječníkov.
Expresia týchto receptorov sa mení v závislosti na stupni diferenciácie nádorov a na type nádoru, napr. u rakoviny prsníka majú primárne nádory zvýšenú expresiu obidvoch receptorov, zatial čo u rakoviny žalúdka sa zvýšená expresia objaví až v pozdnejšom štádiu v metastázových nádoroch (Salomon et al., 1995). Počet receptorov so zvýšenou expresiou na rakovinných bunkách je vyšší než 106/bunku pre niekoľko nádorov rakoviny hlavy a krku, vulvy, .prsníka a vaječníkov, ako sa zistilo izoláciou týchto buniek z tkaniva pacientov (Dean et al., 1994).
Existuje niekoľko dôvodov, pre ktoré skupina EGFr receptorov predstavuje vhodný ciel nádorovej imunoterapie. Po prvé, tieto receptory majú zvýšenú expresiu u mnohých typov rakoviny, čo by malo smerovať imunitnú odozvu proti nádoru. Po druhé, nádory často exprimujú alebo zvýšene exprimujú ligandy pre túto skupinu receptorov a niektoré sú hypercitlivé na účinky bujnenia sprostredkované ligandmi. Po tretie, pacienti s nádormi, ktoré majú zvýšenú expresiu receptorov rastového faktoru, majú často velmi špatnú prognózu. Zvýšená expresia je úzko spojené so špatnou prognózou predovšetkým u rakoviny prsníka, pľúc a močového mechúra a zrejme súvisí s invazivnými/metastatickými fenotypmi, ktoré sú prakticky necitlivé na konvenčnú liečbu (Eccles et al., 1994).
Zvýšená expresia Her2 je v niektorých prípadoch výsledkom zosilnenia génu a v iných prípadoch výsledkom zvýšenej transkripcie a translácie. Zvýšená expresia Her2 je spojená so špatnou prognózou u rakoviny prsníka, vaječníkov, žalúdka, močového mechúra, prípadne aj pri rozsiahlejšej rakovine plúc (Solomon et al., 1995).
Fáza I klinických skúšok sa uskutočňovala s bišpecifickou protilátkou u pacientov s pokročilou rakovinou prsníka a vaječníkov. Protilátka bola bišpecifická proti Her2 a FcyRI (Weiner et al., 1995). Účinný rozpad nádorových buniek so zvýšenou expresiou Her2 sa pozoroval u bišpecifickej protilátky proti Her2 a CD3 (Zhu et al., 1995).
Liečba myší so štiepom ludského karcinómu žalúdka monoklonovou protilátkou proti Her2 predĺžila život myší (Ohniski et al., 1995). Protinádorové aktivity monoklonových protilátok proti Her2 in vitro a in vivo neprebiehajú rovnakým mechanizmom; môžu pôsobiť ako čiastočné ligandové agonisty, meniť premenu receptora Her2 a fosforyláciu alebo môžu ovplyvniť dimerizáciu (Lupu et al., 1995).
Podobne bolo ukázané, že protilátky k EGFr tiež narušujú interakcie s rastovým faktorom (Baselga et al., 1994, Modjahedi et al., 1993a, Wu et al., 1995, Modjahedi et al., 1993b, Tosi et al., 1995, Dean et .al., 1994, Bier et al., 1995, Modjahedi et al., 1996, Valone 1995).
Jedno z dôležitých uskutočnení tohoto vynálezu spočíva preto v tom, že sa cudzí T-bunkový epitop zavedie do časti aminokyselinovej sekvencie Her2 definovanej pomocou číslovania v sekvenčnom identifikačnom čísle: 3 pozície 5-25 a/alebo 59-73 a/alebo 103-117 a/alebo 149-163 a/alebo 210-224 a/alebo 250-264 a/alebo 325-339 a/alebo 369-383 a/alebo 465479 a/alebo 579-593 a/alebo 632-652 a/alebo 653-667 a/alebo 661-675 a/alebo 695-709 a/alebo 710-730, viď príklady uskutočnenia vynálezu.
Predmetom vynálezu je preto tiež analóg ludského Her2, ktorý je u ludí imunogénny a ktorý zahrnuje podstatnú časť všetkých známych a predpokladaných CTL a B-bunkových epitopov Her2 a obsahuje aspoň jeden cudzí TH epitop, ako sa tu diskutuje. Je výhodné, keď je tento aspoň jeden cudzí TH epitop prítomný ako vložený do aminokyselinovej sekvencie Her2 alebo ako náhrada časti aminokyselinovej sekvencie Her2 alebo ako výsledok odstránenia časti aminokyselinovej sekvencie Her2. Najvýhodnejšími analógmi sú tie, ktoré boli definované vyššie, t.j. v ktorých sa cudzí TH-bunkový epitop zavedie do časti aminokyselinovej sekvencie Her2 definovanej pomocou sekvenčného identifikačného čísla: 3 pozície 5-25 a/alebo 59-73 a/alebo 103-117 a/alebo 149-163 a/alebo 210-224 a/alebo 250-264 a/alebo 325-339 a/alebo 369-383 a/alebo 465479 a/alebo 579-593 a/alebo 632-652 a/alebo 653-667 a/alebo 661-675 a/alebo 695-709 a/alebo 710-730.
FGF8b
Niekolko výskumníkov ukázalo, že FGF8b môže vyvolať bujnenie, transformáciu, diferenciáciu a v niektorých prípadoch silno zvýšiť tvorbu nádorov z materských buniek a tkanív (Tanaka 1992, Kouhara 1994, Lorenzi 195, MacArthur 1995a, Crossley 1996a, 1996b, Ghosh 1996, Ohuchi 1997a, RudraGanguly 1998). Tieto účinky sú primárne sprostredkované väzbou FGF8b k fibroblastovým receptorom rastového faktoru
FGFR2, FGFR3 a FGFR4 (MacArthur 1995b, Blunt 1997, Tanaka
1998) . Ukázalo sa teda, že bunky s expresiou jedného z týchto receptorov a FGF8b poskytujú autokrinnú kaskádu signalizujúcu rast, ktorá vedie k bujneniu'. Najpravdepodobnejšie je biologický účinok FGF8b sprostredkovaný cestou JAK/STAT3, pretože sme my aj iný autori pozorovali, že prídavok FGF8b do rastového média určitých buniek vyvolá fosforyláciu STAT3, rys podozrivý z toho, že urobí bunky odolné, voči zániku (Catlett - Falcone 1999).
K vyššie zmienenému pozorovaniu in vitro bolo naviac nedávno dokázané, že expresia FGF8(b) je významne viac aktivovaná u rakoviny prostaty a prsníka (Marsh 1999, Dorkin
1999) . Veríme preto, že autovakcína proti FGF8(b) bude velmi účinným prostriedkom k liečbe radu nádorov s expresiu FGF8 alebo snáď zvýši ich citlivosť na látky indukujúce ich zánik.
Rakovina prostaty
Biologická agresivita prostatických karcinómov je rôzna. U niektorých pacientov zostane objavený nádor latentným histologickým nádorom a nikdy sa nestane klinicky významným. U iných pacientov má nádor rýchlu progresiu, metastázuje a usmrtí pacienta v relatívne krátkom čase (2-5 rokov).
K diagnostickým účelom a k sledovaniu odozvy na terapiu rakoviny prostaty sa primárne používa stanovenie cirkulujúcich hladín dvoch proteínov: prostatickej kyslej fosfatázy (PAP) a prostatického špecifického antigénu (PSA) (Nguyen 1990, Henntu 1989). Vzhľadom k narušeniu normálnej stavby prostatickej žľazy v dôsledku vývoja karcinómu sa tieto rozpustné proteíny dostanú do obehu, kde môžu byť stanovené ako markery pre napr. šírenie metastáz.
' Bežnou primárnou liečbou rakoviny prostaty je prostatektómia. Vzhladom k rýchlemu šíreniu rakovinných buniek však väčšina pacientov s rakovinou prostaty nie je lokálnym chirurgickým zákrokom vyliečená. Pacienti s neomrzeným priebehom choroby podstúpia liečbu systémovou abláciou androgénu, ale ročná úmrtnosť na rakovinu prostaty za posledných 50 rokov, kedy sa ablácia androgénu stala štandardnou liečbou metastatickej choroby, nepoklesla.
RT-PCR analýza ukázala, že FGF8 mRNA je produkovaná líniami ľudských prostatických epiteliálnych nádorových buniek LNCaP, PC-3, ALVA-31 a DU145, pričom FGF8b je najvýznačnej šou izoformou (Tanaka 1995, Ghosh 1996). Rast LNCaP buniek citlivých na androgén sa stimuluje prídavkom rekombinantného FGF8b (Tanaka 1995), zatial čo rast DU145 buniek by sa mohol inhibovať pomocou transfekcie vírusom s expresiu „antisense FGF8b (Rudra-Ganguly 1998). Toto, spoločne s dôkazom z vývojových štúdií diskutovaným ďalej, ukazuje úlohu FGF8b pri udržiavaní karcinogénneho stavu týchto bunkových línií.
Použitím FGF8a cDNA k hybridizačným experimentom in situ Leung so spolupracovníkmi ukázali, že vysoký podiel (80 % (n=106) a 71 % (n=31)) prostatických karcinómov produkuje FGF8 mRNA a že množstvo FGF8 mRNA koreluje so závažnosťou nádorov (P<0,0016, resp. P<0,05)(Leung 1996, Dorkin 1999). Použitie monoklonovej anti-FGF8b protilátky ukázalo, že práve tato izoforma je zodpovedná za zvýšenú expresiu FGF8b (Dorkin 1999) . Naviac, ľudia s nádormi s expresiou vysokých hladín FGF8 majú horšie vyhliadky na prežitie (P=0,034) a táto expresia FGF8 pretrváva v prostatických nádoroch nezávislých na androgéne (Dorkin 1999). Podía výsledkov uvádzaných Dorkinom a spolupracovníkmi expresia FGF8b v prostatickom karcinóme môže predpovedať pacientovo prežitie.
Imunohistochemická analýza s použitím monoklonovej protilátky proti FGF8 detegovala proteín v 93 % (n=43) ľudských prostatických karcinómoch (Tanaka 1998) . Normálne prostatické. tkanivo alebo benígna prostatická hyperplazia produkuje nízke hladiny FGF8 mRNA a neobsahuje stanovitelné množstvo proteínu FGF8 (Leung 1996, Yoshimura 1996, Ghosh 1996, Tanaka 1998, Dorkin 1999).
Z týchto výsledkov vyplýva, že autovakcína proti FGF8(b) by bola reaktívna proti prostatickému nádorovému tkanivu, a tým nesmierne cenná pre liečbu rakoviny prostaty.
Rakovina prsníka
Bežnou liečbou rakoviny prsníka je chirurgický zákrok. Vzhľadom k rozsiahlemu šírenia buniek rakoviny prsníka nie je však značná časť pacientov s rakovinou prsníka vyliečená lokálnym chirurgickým zákrokom.
Pacienti 's neohraničenou chorobou sa nakoniec liečia abláciou androgénu, chemoterapiou a/alebo ožarovaním. Úmrtnosť pri ochorení rakovinou prsníka je však stále relatívne vysoká.
FGF8 sa pôvodne izoloval z bunkovej línie myšieho karcinómu prsníka (SC-3), z ktorej mohla byť indukovaná expresia pridaním androgénu do média (Nonomura 1990). O proteínu je tiež známe, že vyvoláva bujnenie týchto, aj iných cicavčích buniek. V poslednom čase sa preukázalo, že FGF8b mRNA sa vyskytuje v ôsmych (n=8) bunkových líniách ludského karcinómu prsníka (MDA-MB-231, MDA-MB-415, ZR 75-1, T-47-D, SK-BR-III, PMC-42, HBL-100 a MCF-7) (Tanaka 1995, Payson 1996, Wu 1997, Marsh 1998).
U transgenetických myší Wnt-1 infikovaných vírusom myšieho nádoru prsníka (MMTV) sa rozvinuli prsníkové nádory. Transkripcia FGF8 sa aktivovala v 50 % týchto nádorov (MacArthur 1995c, Kapoun 1997).
Transgenetické myši, ktoré nesú FGF8b cDNA riadenú promótorom velmi špecifického myšieho prsníkového nádorového vírusu (MMTV) vykazovali spontánny rozvoj FGF8b s expresiou prsníkových nádorov (Coombes, osobná diskusia).
Najnovšie údaje ukazujú, že expresia FGF8(b) je u rakoviny prsníka nadmerne aktivovaná (Tanaka 1998, Marsh 1999). Tanaka a spolupracovníci použili v imunohistochemických štúdiách novú monoklonovú protilátku FGF8. Ukázali, že FGF8 sa vyskytoval v 67 % (n=12) prípadov rakoviny, prsníka a že androgénové receptory sa vyskytli v 89 % prípadov ochorenia prsníka pozitívnych na FGF8 (hyperplazia, fibroadenóm, intraduktálny papilóm a karcinómy), čo by umožnilo zapojenie slučky podporujúcej autokrinný rast do progresie karcinómov prsníka (Tanakaka 1998). S použitím semikvantitatívnej metódy RT-PCR sa ukázalo, že zvýšené hladiny FGF8 mRNA sa našli v malígnych pri porovnaní s nemalígnymi tkanivami prsníka. Významne viac malígnych tkanív malo expresiu FGF8 (p=0,019) vo významne vyšších hladinách (p=0,031) (68 karcinómov prsníka a 24 nemalígnych tkanív prsníka) (Marsh 1999).
Funkcia FGF8(b) ako autokrinného rastového faktora sa ešte úplne nepreukázala. Avšak skutočnosť, že velké množstvo nádorov má zvýšenú expresiu FGF8b, hovorí silne pre to, že autovakcína proti FGF8b by mohla byť účinná proti vysokému percentu karcinómov prsníka a prostaty. Údaje uvádzané Marshom, Dorkinom a Tanakom nasvedčujú tomu, že autovakcína proti FGF8(b) by mohla byť použitá pre liečbu rakoviny tak prsníka ako aj prostaty a do istej miery menej presné údaje uvádzané Dorkinom a kol. sú ďalšou podporou názoru, že FGF8 je zapojený do progresívneho rastu ľudských rakovinných buniek.
Popis FGF8b
FGF8 patrí do skupiny fibroblastických rastových faktorov (FGFs). Tieto proteíny regulujúce rast sú proteíny malých amínokyselinových zvyškov «200, ktoré všetky sa podieľajú na vyvolaní bujnenia a diferenciácii širokej oblasti buniek. Posledný prehľad, ako sa podieľajú fibroblastické rastové faktory na vývoji končatín stavovcov, priniesol Johnson 1997. Členovia skupiny FGF sú evolučné príbuzný a zdieľajú identitu aminokyselinovej sekvencie z 20 - 50 %.
FGF8b je strihovým variantom FGF8, pôvodne nazývaným androgénom indukovaný rastový faktor (AIGF). AIGF sa prvýkrát identifikoval ako proteín vylučovaný bunkovou líniou (SC3) myšieho karcinómu prsníka pri stimulácii androgénom (Nonomura 1990). U myší obsahuje gén FGF8· 6 exónov potenciálne kódovaný pre osem rôznych FGF8-izoforiem (FGF8ah), ktoré sa odlišujú len v N-koncoch molekúl (Crossley 1995, MacArthur 1995b). Ľudský FGF8 má rovnakú génovú štruktúru ako gén u čeľadi myšovitých. Avšak kvôli stop kodónu v exóne IB môže ludský FGF8 existovať vo štyroch rôznych izoformách, totiž FGF8a, FGF8b, FGF8e a FGF8f (Gemel 1996). Génové štruktúry a aminokyselinové sekvencie štyroch ľudských izoforiem znázorňuje obrázok 5.
Hotový FGF8b obsahuje 193 aminokyselinových zvyškov a má vypočítanú molekulovú hmotnosť 22,5 kDa. Vysoko zásaditý proteín obsahuje 21 arginínových a 14 lyzínových zvyškov, výsledkom čoho je vypočítaný izoelektrický bod 10,84 a vypočítaný pozitívny náboj 19,8 pri pH « 7,0. Obsahuje dva cysteínové zvyšky a má dve možné N-glykozylačné polohy. Vzhladom k povahe uskutočnených výskumov týkajúcich sa FGF8b sa veľmi málo vie o proteínovej časti FGF8b. Bol však heterológne exprimovaný z baktérie, vyčistený s použitím hexahistidínového značenia s C-koncom a potom in vitro prevedených do rozpustného a biologicky aktívneho stavu (MacArthur 1995a, Blunt 1997).
Biologická aktivita FGF8b
Ako už bolo povedané, FGF8 (b) sa prvý raz izoloval ako faktor uvoľňovaný bunkovou líniou myšieho prsného nádoru závislom na androgéne a bolo ukázané, že tento proteín môže indukovať bujnenie týchto buniek. Morfologické zmeny imitujú tie, ktoré indukuje testosterón, o ktorom sa tiež vie, že indukuje syntézu FGF8(b) mRNA (Tanaka 1992). Bujnenie sa môže inhibovať antisense oligoproteínmi FGF8(b) (Nonomura 1990, Tanaka 1992 a Yamanishi 1994). Skutočne, rast bunkovej línie DU145 ľudského karcinómu prostaty sa môže inhibovať transfekciou vírusom s expresiou antisense FGF8b (RudraGanguly 1998). Najnovšie údaje ukazujú, že FGF8b indukuje fosforyláciu STAT3 - proteínu, o ktorom sa predpokladá, že sa podieľa na obrane proti odumretiu (Catlett-Falcone 1999, Johnston, C.L., nepublikované výsledky).
Niekolko výskumníkov ukázalo, že FGFŠb je velmi účinný pri indukcii transformácie buniek NIH3T3 alebo SC115 (Miyashita 1994, Kouhara 1994, Lorenzi 1995, MacArthur 1995a). Použitím rekombinantne exprimovaných proteínov sa tiež ukázalo, že táto indukcia morfologických zmien je omnoho účinnejšia s FGF8b než s FGF8a alebo FGF8c (MacArthur 1995a, Ghosh
1996). Je zaujímavé, že samotná N-koncová polovica molekuly FGF8b sa ukázala ako dostačujúca pre transformáciu NIH3T3 buniek, a dokonca malý FGF8b špecifický peptid (QVTVQSSPNFT) umožňuje v koncentráciiO,1% séru, aby bunky rástli 2-3krát pomalší odpovedá normálu (Rudra-Ganguly 1998) . Naviac bolo opísané, že NIH3T3 bunky stabilne transfektované vektorom kódujúcim FGF8b sú v prípade vnútroočnej injekčnej aplikácii do holých myší silne nádorotvorné (Kouhara 1994, Ghosh 1996).
Je známe, že in vivo má FGF8b expresiu v určitých štádiách vývoja stavovcov. Biologické úlohy pripisované FGF8b zhrňuje tabuľka 1. Pre prehľad zapojenie FGF8(b) do vývoja stavovcov viď. Goldfarb 1999 a Johnson 1997.
Tabuľka 1: Rozličné miesta/tkanivá produkujúce FGF8 a navrhnutá biologická úloha, prípadne úlohy
Dej/mechanizmus/výskyt (druh)_
Prítomnosť vo vyvíjajúcich sa zárodkoch končatín (myši)
Výrastky krídiel zárodkov (kurčatá)
Indukcia tvorby ektopických končatín z mezodermu (kurčatá)
Indukcia tvorby stredného mozgu z kaudálneho medzimozgu (kurčatá)
Iniciácia výrastkov krídiel u bezkrídelného mutantu (kurčatá)
Úloha pri dorzoventrálnej modelácii gastruly (danio páskované)
Potrebný behom gastrulačného, kardiálneho, kraniofaciálneho, predomozgového, stredomozgového a celeberálneho vývoja (tkanivo špecificky knockoutovaných myší)
Úloha v morfogenézii zubov (myši)
Odkazy
Heikinheimo 1994, Ohuchi 1994
Kuwana 1997,
Xu 1998
Crossley 1996b
Crossley 1996a
Ohuchi 1997a
Furthauer 1997
Meyers 1998
Kettunen 1998
Predpokladá sa, že FGF8b pôsobí prostredníctvom väzieb na receptory fibroblastického rastového faktoru (RGFR). 0 FGF8b je zvlášť známe, že je schopný aktivovať FGFR2c, FGFR3c, FGFR4c a do určitej miery tiež FGFRlc, ale nie FGFRlb, -2b alebo -3b (MacArthur 1995b, Blunt 1997). V prípade indukcie rastu ektopických kuracích končatín to implikuje interakcie FGF10, FGFR2 a FGF8, a že to by mohlo pre rast stačiť (Kuwana 1997, Xu 1998). Tieto výsledky podporujú hypotézu, že FGF8 (b) môže pôsobiť v auto- a parakrinnom režime, ktoré vedie k normálnemu rastu a formovaniu niektorých anatomických štruktúr béhom vývoja stavovcov. Je dôležité, že FGF8 „úplne knokoutovaných myší neprežije najskôr vďaka komplikovanému zapojeniu proteínu v embryonálnom vývoji.
Homológia k iným proteínom
Velmi dôležité je predpovedať, či je možné očakávať nežiaducu krížovú reaktivitu s inými proteínmi prístupnými pre protilátky, ktorá by nastala po liečbe s autovakcínou indukujúcou FGF8 špecifické autoprotilátky. Vďaka vysokej sekvenčnej identite medzi FGF8b a ostatnými molekulami FGF8 je možné očakávať krížové reakcie autovakcíny s týmito proteínmi. Podlá všetkého by to však bolo vhodné, lebo o žiadnom z týchto proteínov nie je známa expresia v tkanivách alebo bunkových líniách, v ktorých už nie je expresia FGF8b.
Aminokyselinové zvyšky 55 - 175 FGF8b ukazujú relatívne nízky, ale významný stupeň sekvenčnej identity s ostatnými FGF. Obecne je prijaté (a niekoľkokrát dokázané), že významný stupeň sekvenčnej identity medzi dvomi proteínovými doménami sa tiež zobrazí vo velmi podobnej terciárnej štruktúre. Predpokladá sa takto, že všetci členovia FGF skupiny sú si obecne štruktúrne blízky. Trojrozmerná štruktúra FGF2 sa vyriešila z kryštalickej formy, ako aj v roztoku (Ago 1991,
Zhang 1991, Zhu 1991, Eriksson 1993, Blaber 1996, Moy 1996) . FGF2 je zložený výhradne z beta-sheet štruktúry zahrnujúcej trojité opakovanie štvoršraubového antiparalelné betameandru. Tato beta-barelová štruktúra je úplne zachovaná medzi interkleukinom 1, FGF2 (alebo bázickým FGF) a FGFl (alebo kyslým FGF). Nukleárna magnetická rezonancia FGF2 v roztoku ukázala, že N-koncová časť molekuly tvorí relatívne flexibilnú štruktúru. Ostávajúca časť FGF8b (aminokyselinové zvyšky 1-54 a 176-215) len ukazuje nízky stupeň sekvenčnej identity k známym proteínom.
Na základe štruktúrnych a iných dostupných údajov je obecne prijímané, že trojrozmerný štruktúrny skelet ostatných fibroblastických rastových faktorov je velmi podobný štruktúre FGFl a FGF2. Tieto štruktúrne úvahy sú dôležitými faktormi nášho návrhu molekúl mutantnej autovakcíny FGF8b.
Dôležité je, že vďaka relatívne nízkej sekvenčnej identite medzi FGF8 a akýmkoľvek iným členom skupiny FGF bude povrch FGF8 veľmi rozdielny od iných FGF, čím sa minimalizujú krížové reakcie autovakcínou FGF8b generovaných protilátok s inými členmi skupiny FGF. Vzhľadom k.veľmi nízkej homológii s inými proteínmi, než sú fibroblastické rastové faktory, neočakávame, že autovakcína proti FGF8b bude krížovo reagovať s akýmikoľvek inými proteínmi.
Je však treba zdôrazniť, že autovakcína proti FGF8b bude pravdepodobne krížovo reagovať so všetkými izoformami FGF8. Nepredpokladá sa, že by to robilo ťažkosti, pretože žiadna z izoforiem FGF8 sa u dospelých jedincov nevyskytuje vo významnom množstve. Je dokonca možné, že tieto krížové reakcie budú prospešné pri liečbe rakoviny, pretože sa ukázalo, že aspoň niektoré rakovinné bunkové línie obsahujú okrem FGF8b ešte iné izoformy.
Rozloženie FGF8b v tkanivách
Bolo by optimálne, keby sa indukované autoprotilátky a následné efektorové mechanizmy, ako aj očakávaná odozva CTL zvýšená autovakcináciou zamerali len na tkanivo, ktoré má byť u pacienta eliminované. Preto je tkanivové rozloženie antigénu, ktorý je terčom autovakcíny, veľmi dôležité z hľadiska bezpečnosti vakcíny.
Tabuľka 2: Expresia FGF8b v rôznych tkanivách a bunkách
Človek
Bunkové línie rakoviny prsníka (MDA-MB-231, MDA-MB-415, ZR 75-1, T-47-D, SK-BR-HI, PMC-42, HBL-100 a MCF-7)
Nádory prsníka
Normálne tkanivo prsníka
Rakovina prostaty (93 %)
Choroby prsníka
Pro statické nádorové bunky (LNCaP,
PC-3, DU145 a ALVA 31)
Obličky plodu
Dospelá prostata, semenníky, obličky, neuróny
Teratokarcinomatické bunky (Tera-2)
Čeľaď myšovitých
Bunkové línie rakoviny prsníka (SC-115, RENCA)
Hypotalamus, semenníky
Nádory prsníka (Wnt-1, transgénny) ((RT-PCR) Tanaka 1995, Payson 1996, Wu 1997,
Marsh 1999) ((mAb) Tanaka 1998, (RT-PCR) Marsh 1999) ((RT-PCR) Wu 1997, Marsh 1999, (mAb) Tanaka 1998) ((in situ hyb.) Leung 1996,
Dorkin 1999, (mAb)
Tanaka 1998) ((mAb) Tanaka 1998) ((RT-PCR) Tanaka 1995, Ghosh 1996, Schmitt 1996) ((NB) Ghosh 1996) ((RT-PCR) Ghosh 1996, Wu
1997, Dorkin 1999) ((RT-PCR) Wu 1997) ((RT-PCR) Yoshimura 1996) ((RT-PCR) Yoshimura 1996) ((NB) MacArthur 1995c)
Mozog embrya
Vaječníky, semenníky
Vývoj tváre a a zárodkov končatín
Gastrula
Kurčatá
Mozog embrya
Vývoj končatín ((in situ hyb.) Crossley 1995, Heikinheimo 1994, Ohuchi 1994, Shimamura 1997, (RT-PCR) Blunt 1997) (NB) Valve 1997) ((pAb) MacÁrthur 1995b, (insitu hyb.) Heikinheimo 1994, Ohuchi 1994, Crossley 1995) ((in situ hyb.) Crossley 1995) ((in situ hyb.) Crossley 1996a) ((in situ hyb.) Ohuchi 1997a,b)
Potkan
Prostata a semenníky ((RT-PCR) Schmitt 1996)
Tabulka ukazuje široký výber tkanivového rozloženia a bunkových línií s expresiou FGF8b. Tiež z nej vyplýva, že väčšina údajov týkajúcich sa rozloženia v tkanivách bolo získaných citlivou metódou RT-PCR. To preto, že NB analýza nezachytí FGF8b mRNA v žiadnom normálnom tkanive s výnimkou obličiek plodu. Z týchto obmedzených údajov sa obecne prijíma, že expresia FGF8b mRNA u dospelých jedincov je velmi obmedzená, a tak autovakcína proti FGF8b by pravdepodobne nemala byť reaktívna proti normálnemu tkanivu. Ďalšie analýzy tkanivového rozloženia proteínu sú potrebné preto, že malé množstvo FGF8b by mohlo mať reakcie v neznámych systémoch u dospelých. Podía nášho názoru však nič nenasvedčuje tomu, že autovakcína proti FGF8b by mala pôsobiť vážne nežiaduce účinky na pacientov.
100
Účinky protilátok proti FGF8b
Doposiaľ neboli publikované žiadne pokusy liečiť rakovinu prostaty použitím monoklonových protilátok. V liečbe rakoviny prsníka monoklonovými protilátkami však prebiehajú klinické skúšky.
Protilátky proti FGF8b budú pravdepodobne blokovať interakcie medzi FGF8b a jeho receptormi, čím budú inhibovať dráždenie bunkových membrán a bujnenie buniek a velmi pravdepodobne znížia pohyblivosť a invazívnosť rakovinných buniek.
Predmetom vynálezu sú preto tiež uskutočnenia tu opísaných spôsobov, kedy sa cudzí T-bunkový epitop zavedie do časti aminokyselinovej sekvencie FGF8b definovanej pomocou sekvenčného identifikačného čísla: šesť pozícií z 1-54 a/alebo 178215 a/alebo 55-58 a/alebo 63-68 a/alebo 72-76 a/alebo 85-91 a/alebo 95-102 a/alebo 106-111 a/alebo 115-120 a/alebo 128134 a/alebo 138-144 a/alebo 149-154 a/alebo 158-162 a/alebo 173-177. Malo by sa poznamenať, že je zvlášť nevýhodné zaraďovať obmeny alebo modifikácie do pozícií 26-45, a do Ckoncov počínajúc aminokyselinami 186-215, pretože tieto úseky majú najmenšiu homológiu s nedávno objaveným proteínom FGF18, ktorý zrejme má expresiu v rade nenádorových tkanív.
Predmetom vynálezu je preto tiež analóg ludského/myšieho FGF8b, ktorý je u ludí imunogénny a ktorý zahrnuje podstatnú časť všetkých známych a predpokladaných CTL a B-bunkových epitopov FGF8b a obsahuje aspoň jeden cudzí TH epitop, ako sa tu diskutuje. Je výhodné, keď je tento aspoň jeden cudzí TH epitop prítomný ako vložený do aminokyselinovej sekvencie FGF8b alebo ako náhrada časti aminokyselinovej sekvencie FGF8b alebo ako výsledok odstránenia časti aminokyselinovej
101 sekvencie FGF8b. Najvýhodnejšími analógmi v tomto uskutočnení sú tie, v ktorých sa cudzí TH-bunkový epitop zavedie do časti aminokyselinovej sekvencie FGF8b definovanej pomocou sekvenčného identifikačného čísla: šesť pozícií z 1-54 a/alebo 178-215 a/alebo 55-58 a/alebo 63-68 a/alebo 72-76 a/alebo 85-91 a/alebo 95-102 a/alebo 106-111 a/alebo 115-120 a/alebo 128-134 a/alebo 138-144 a/alebo 149-154 a/alebo 158162 a/alébo 173-177.
Mucíny
Predmetom vynálezu sú tiež spôsoby vynálezu, ktoré využívajú špecificky modifikované obmeny ľudských mucínov (hlienov), zvlášť ktoréhokoľvek z MUC-1 až MUC-4, výhodne MUC-1. Analógy zahrnujú nasledujúcu štruktúru
TR (-S-P-S-(TR) m) n kde TR je tandemové opakovanie odvodené z prirodzene sa vyskytujúceho mucínu, P je cudzí TH-epitop, ako sa o ňom pojednáva v tomto dokumente, S je inertný vložkový peptid, ktorý má od 0 do 15, aminokyselinových zvyškov, výhodne medzi 0 a 10 aminokyselinovými zvyškami, n je celé číslo od 1 do 30 a m je celé číslo od 1 do 10, výhodne od 3 do 5.
Keď sa takýto mucínový analóg produkuje v napr. línii ľudských buniek alebo prečistením z tkaniva, priamy výsledok obvykle nemá požadovanú glykozylačnú štruktúru, t.j. anomálna mucíne analóg pochádzajúcom rekombinantne a následne produkt glykozylačná štruktúra svedčí o z nádoru. Je však možné pripraviť v napr. E. coli alebo synteticky glykozylovať enzymaticky tak, aby sa dosiahla Tn alebo S-Tn glykozylačná štruktúra špecifická pre expresiu MUC-1
102 v nádoroch. Ináč by polypeptid mohol byť pripravený v cicavčej bunkovej línii alebo bunkovej línii hmyzu, t.j. v bunkách Drosophila, ktorým chýba relevantný enzým, alebo intracelulárnou expresiou proteínu (pri vylúčení sekrečného signálneho peptidu), kde sa nevyskytuje glykozylácia.
Fragmenty nukleových kyselín a vektory vynálezu
Z vyššie uvedeného opisu oceníme, že sa analógy môžu pripravovať technológiou rekombinantných génov, ale tiež chemickými syntézami alebo semisyntézami; druhé dva výbery sú zvlášť relevantné, keď sa modifikácia týka pripojenia k proteínovým nosičom (napr. KLH, záškrtový toxoid, tetanový toxoid a BSA) a k neproteínovým molekulám, napríklad uhľovodíkové polyméry, a samozrejme tiež v prípade, keď modifikácia zahrnuje adíciu postranných reťazcov alebo postranných skupín na peptidový reťazec polypeptidu.
Z hladiska rekombinantnej génovej technológie a samozrejme aj z hladiska imunizácie nukleovou kyselinou sú dôležitými chemickými produktmi fragmenty nukleových kyselín kódujúce potrebné epitopické oblasti a analógy. Preto významná časť tohoto vynálezu sa týka fragmentu nukleovej kyseliny, ktorý kóduje vyššie opísaný analóg každého z relevantných nádorovo špecifických polypeptidov, výhodne polypeptid, do ktorého bol zavedený cudzí TH-bunkový epitop vložením a/alebo adíciou, výhodne substitúciou a/alebo odstránením. Fragmenty nukleových kyselín tohto vynálezu sú buď fragmenty DNA alebo RNA.
Fragmenty nukleových kyselín tohto vynálezu budú obvykle vložené do vhodných vektorov, aby vytvorili vektory nesúceho príslušné fragmenty nukleových kyselín tohto vynálezu pre
103 klonovanie alebo expresiu; takéto nové vektory sú tiež časťou tohoto vynálezu. Detaily, ktoré sa týkajú stavby týchto vektorov tohto vynálezu, sa budú diskutovať v súvislosti s transformovanými bunkami a mikroorganizmami. Vektory môžu byť, podľa účelu a typu aplikácie, vo forme plazmidov, fágov, kozmidov, minichromozómov alebo vírusov, ale dôležitým vektorom je aj prostá DNA, ktorá má v určitých bunkách len prechodnú expresiu. Výhodné klonovacie a expresné vektory tohto vynálezu sú schopné autonómnej replikácie, tým umožňujú velký počet kópii vyžitelných pre vysokú expresiu alebo pre vysokú replikáciu pre následné klonovanie.
Obecný profil vektora tohto vynálezu zahrnuje nasledujúce charakteristické rysy vo smere 5' - 3' a v uskutočniteľnom spojovaní: promótor riadiaci expresiu fragmentu nukleovej kyseliny vynálezu, voliteľne sekvenciu nukleovej kyseliny kódujúcej hlavný peptid, ktorý umožňuje sekréciu fragmentu nukleovej kyseliny vynálezu alebo jeho začlenenie do membrány polypeptidového fragmentu a sekvenciu nukleovej kyseliny, kódujúcej terminátor. Keď sa operuje s expresnými vektormi v producentských kmeňoch alebo bunkových líniách, je z hľadiska génovej stability transformovaných buniek výhodné, aby sa vektor pri zavádzaní do hostiteľskej bunky začlenil do jej genómu. Naopak, keď sa pracuje s vektormi, ktoré ša majú použiť na ovplyvnenie expresie in vivo (t.j. pri použití vektora v DNA vakcinácii), je z bezpečnostných dôvodov výhodnejšie, aby sa vektor nemohol integrovať do genómu hostitelskej bunky; typickým príkladom je použitie prostej DNA alebo neintegrovaných vírusových vektorov, ktorých volba je veľmi dobre známa odborníkovi v technike.
Vektory tohto vynálezu sa používajú k transformácii hostitelských buniek tak, aby produkovali analóg vynálezu.
104
Takéto transformované bunky, ktoré sú tiež predmetom tohoto vynálezu, môžu byť kultivované bunky alebo bunkové línie používané k rozmnožovaniu fragmentov nukleových kyselín a vektorov vynálezu, alebo k produkcii rekombinantných analógov tohoto vynálezu. Ináč transformované bunky môžu byť vhodné živé vakcinačné kmene, do ktorých sa fragment nukleovej kyseliny (jeden jediný alebo násobné kópie) vloží tak, aby ovplyvnil sekréciu alebo integráciu do membrány baktérie alebo bunkovej steny analógu.
Výhodnými transformovanými bunkami vynálezu sú mikroorganizmy, ako baktérie [napríklad druhy Escherichia (napr. E. coli), Bacillus (napr. Bacillus subtilis), Salmonella alebo Mycobacterium (predovšetkým nepatogénne, napr. M. bovis BCG)], kvasinky (napr. Saccharomyces cerevisiae) a prvoci. Ináč sa transformované bunky odvodzujú od multicelulárnych organizmov, ako sú bunky húb, hmyzu, rastlín alebo cicavcov. Najvýhodnejšie sú ľudské bunky, viď diskusiu o bunkových líniách a vektoroch ďalej.
Z hľadiska klonovania a/alebo optimalizovanej expresie je výhodné, aby transformované bunky boli schopné replikovať fragment nukleovej kyseliny tohoto vynálezu. Výhodnými užitočnými uskutočneniami vynálezu sú bunky s expresiou nukleového fragmentu; môžu sa použiť pre prípravu analógu v malom alebo veľkom merítku alebo v prípade nepatogénnej baktérie ako zložky vakcíny pre živú vakcínu.
Pri príprave analógu tohto vynálezu pomocou transformovaných buniek je výhodné, aj keď rozhodne nie podstatné, keď sa produkt expresie buď vyexportuje do kultivačného média alebo sa nanesie na povrch transformovanej bunky.
105
Keď sa identifikuje účinná producentská bunka, je výhodné na jej základe ustaviť stabilnú bunkovú liniu, ktorá nesie vektor vynálezu a ktorá má expresiu fragmentu nukleovej kyseliny kódujúceho analóg. Tato stabilná bunková línia výhodne vylučuje alebo nesie analóg vynálezu, a tým sa uľahčuje jeho čistenie.
Plazmidové vektory obsahujúce replikačné a riadiace sekvencie, ktoré sú odvodené z druhov kompatibilných s hostiteľskou bunkou sa obecne používajú v spojení s hostiteľmi. Vektor obvykle nesie replikačné miesto, rovnako ako značkujúce sekvencie, ktoré sú schopné uskutočniť fenotypovú selekciu v transformovaných bunkách. Napríklad E. coli sa typicky transformuje pomocou pBR322, plazmidom odvodeným z druhov E. coli (viď napr. Bolivar et al., 1977). Plazmid pBR322 obsahuje gény pre rezistenciu voči ampicilínu a tetracyklínu, a tak je jednoduchým prostriedkom k identifikácii transformovaných buniek. Plazmid pBR alebo iný mikrobiálny plazmid alebo fág musí tiež obsahovať alebo sa modifikuje, aby obsahoval, promótory ktoré môžu byť použité prokaryotickými mikroorganizmami pre expresiu.
Najbežnejšie používané promótory pri konštrukcii rekombinantnej DNA zahrnujú B-laktamázu (penicilinázu) a systémy laktózového promótoru (Chang et al., 1978; Itakura et al., 1977; Goeddel et al., 1979) a systém tryptofánového promótoru (trp) (Goeddel et al., 1979; EP-A-0 036 776). Aj keď sú uvedené promótory najčastejšie používané, boli objavené a využité aj ďalšie mikrobiálne promótory a detaily týkajúce sa ich nukleotidových sekvencií boli publikované, čo odborníkovi umožňuje ich funkčne spojiť s plazmidovými vektormi (Siebwenlist et al., 1980). Určité gény z prokaryotických buniek môžu mať účinnú expresiu v E. coli
106 zo svojich vlastných promótorových sekvencii, čím sa dopredu vylúči potreba pridávať umelo iný promótor.
Okrem prokaryotických sa môžu použiť tiež eukaryotické mikróby, napríklad kvasinkové kultúry, kde by promótor bol schopný riadiť expresiu. Saccharomyces cerevisiase alebo bežné pekárske kvasinky sú najčastejšie používané eukaryotické mikroorganizmy, ale rad iných kmeňov je obecne dostupný, napríklad Pichla pastoris. Pre expresiu v Saccharomyces sa obvykle používa napríklad plazmid YRp7 (Stinchcomb et al., 1979; Kingsman et al.,1979; Tschemper et al., 1980). Tento plazmid už obsahuje gén trpí, ktorý poskytuje selekčný markér pre mutantný kmeň kvasiniek, ktorý nie je schopný rásť v tryptofáne, napríklad ATCC č. 44076 alebo PEP4-1 (Jones, 1977). Prítomnosť lézie trpí, ako charakteristického genómu kvasinkovej hostiteľskej bunky, potom poskytuje účinné prostredie pre detegovanie transformačného rastu v neprítomnosti tryptofánu.
Vhodné promótorové sekvencie v kvašinkových vektoroch zahrnujú promótory 3-fosfoglycerát kinázy (Hitzman et al., 1980) alebo iných glykolytických enzýmov (Hess et al., 1968; Holland et al., 1978), ako sú enoláza, glyceraldehyd-3-fosfát dehydrogenáza, hexokináza, pyruvát dekarboxyláza, fosfofruktokináza, glukóza-6-fosfát izomeráza, 3-fosfoglycerát mutáza, pyruvát kináza, trifosfát izomeráza, fosfoglukóza izomeráza a glukokináza. Pri konštruovaní vhodných plazmidov expresie sú terminačné sekvencie súvisiace s týmito génmi tiež napojené do expresného vektora 3' sekvencie, ktorá sa má exprimovať, aby poskytla polyadenyláciu mRNA a termináciu.
Iné promótory, ktoré majú ešte naviac výhodu transkripcie riadenej podmienkami rastu, sú promótorové oblasti pre
107 alkohol dehydrogenázu 2, izocytochrómu C, kyslú fosfatázu, degradačné enzýmy súvisiace s metabolizmom dusíka a skôr zmienenú glyceraldehyd-3-fosfát dehydogenázu a enzýmy zodpovedné za využitie maltózy a galaktózy. Vhodný je každý plazmidový vektor obsahujúci s kvasinkami kompatibilný promótor, začiatok replikácie a terminačné sekvencie.
Okrem mikroorganizmov sa ako hostitelia tiež môžu použiť bunkové kultúry odvodené z mnohobunkových organizmov. V podstate sa dá pracovať s každou takou bunkovou kultúrou, či už zo stavovcov alebo bezstavovcov. Najväčší záujem je však o bunky stavovcov a ich rozmnožovanie v kultúrach (tkanivová kultúra) sa stalo v posledných rokoch rutinným procesom (Tissue Culture, 1973). Príklady takýchto užitočných hostiteľských bunkových línii sú bunky VERO a HeLa, bunkové línie z vaječníkov čínskych chrčkov (CHO) a bunkového línie W138, BHK, COS-7 293 a MDCK.
Expresné vektory pre tieto bunky obvykle zahrnujú (pokial je to potrebné) začiatok replikácie, promótor umiestnený pred génom, o expresiu ktorého ide, spolu s akýmikoľvek potrebnými miestami, ktoré viažu ribosóm, strihové miesta RNA, polyadenylačné miesta a transkripčné terminátorové sekvencie.
Pre využitie . v bunkách cicavcov sú často riadiace funkcie vektorov expresie z vírusového materiálu. Napríklad obecne používané promótory sú odvodené z polyómu, z Adenovírusu 2 a najčastejšie zo Simian vírusu 40 (SV40). Prvotné a pozdnejšie promótory vírusu SV40 sú zvlášť užitočné, pretože sa obidva lahko získajú z vírusu ako fragment, ktorý tiež obsahuje SV40 vírusový začiatok replikácie (Fiers et al., 1978). Tiež sa môžu použiť menšie alebo väčšie fragmenty SV40 za predpokladu, že je zahrnutých približne 250 bp sekvencie
108 rozkladajúcej sa od miesta HindlII smerom k miestu BglI umiestnenému vo vírusovom začiatku replikácie. Ďalej je tiež možné, a často žiaduce, využiť promótorické alebo riadiace sekvencie obvykle súvisiace s požadovanou génovou sekvenciou za predpokladu, že tieto riadiace sekvencie sú kompatibilné so systémami hostiteľskej bunky.
Začiatok replikácie môže byť zaistený buď konštrukciou vektora s vloženým exogénnym začiatkom, ktorý napríklad môže byť získaný z SV40 alebo z iného vírusu (napr. Polyom, Adeno, VSV, BPV), alebo mechanizmom chromozornáInej replikácie hostitelskej bunky. Keď sa vektor integruje do chromozómu hostiteľskej bunky, druhý spôsob často stačí.
Kompozície vynálezu
Predmetom vynálezu je tiež imunogenická kompozícia, ktorá zahrnuje ako účinné imunogénne činidlo aspoň jeden z tu opísaných analógov vo zmesi s farmaceutický a imunologický prijateľným nosičom, · vehikulom, riedidlom, základom a voliteľné adjuvans, porovnaj tiež pojednanie o týchto entitách vo vyššie uvedenom opise spôsobov tohoto vynálezu.
Ďalej je predmetom vynálezu tiež zloženie kompozície pre indukciu produkcie protilátok proti akémukoľvek z vyššie uvedených nádorových antigénov; kompozícia zahrnuje
- fragment nukleovej kyseliny alebo vektor vynálezu a
- farmaceutický a imunologický prijatelné riedidlo a/alebo vehikulum a/alebo nosič a/alebo základ a/alebo adjuvans.
Príprava a iné zvláštnosti týkajúce sa týchto kompozícii sa už vyššie diskutovali v príslušnej časti tákajúcej sa imunizácie nukleovou kyselinou.
109
Prehľad obrázkov na výkresoch
Obr. 1: Tradičné chápanie autóvakcinácie.
A: Tolerančné dominantné vlastné epitopy prezentované na MHC triedy II na nejakej bunke prezentujúcej antigén (APC) sú ignorované v dôsledku vyčerpania repertoáru T-pomocných buniek (Th) (T-pomocné bunky sú vyznačené bodkovanými čiarami). Vložené cudzie imunodominantné T-bunkové epitopy prezentované na MHC triedy II aktivujú T-pomocné bunky a Bbunky.
B: T-pomocné bunky a B- bunky špecifické pre natívne časti vlastného proteínu prezentujúceho cudzie imunodominantné T bunkové epitopy na . MHC triedy II sa aktivujú pomocou cytokínovej pomoci poskytovanej T pomocnou bunkou.
Obr. 2: Princíp autóvakcinácie pre vyvolanie reakcie CTL.
Vložené cudzie imunodominantné T bunkové epi.topy prezentované na MHC triedy II aktivujú T-pomocné bunky. CT lymfocyty rozpoznávaním subdominantných vlastných epitopov prezentovaných na MHC triedy I sa aktivujú priľahlými aktivovanými T-pomocnými bunkami.
Obr. 3: Schematické znázornenie polypeptidu Her2 s vyznačením epitopických oblastí a N-glykozylačných miest.
Sú predstavené 4 extracelulárne domény, transmembránová doména (TM) a 2 intracelulárne domény s vyznačením miest s rôznymi stupňami homológie a miest obsahujúcich predpokladané/určené CTL epitopy.
110
Obr.4: Schematické znázornenie ľudského PSM polypeptidu s vyznačením oblastí pre vloženie epitopov P2 a P30.
i
Obr. 5: FGF gény a proteíny.
A: Exón-intrónová štruktúra génov ľudského a myšieho FGF8.
Dole je znázornených osem rožných strihových foriem (z práce Gemel, 1996).
B: Aminokyselinová sekvencia rôznych izoforiem FGF8.
Polypeptidové časti jedinečné pre FGB8b, FGB8f a FGB8e sú vyznačené tučné, kurzívou alebo podtrhnutím písma. FGF8 je najkratším variantom, ktorý neobsahuje žiadnu z týchto zvýraznených sekvencii. Od signálneho peptidu sa očakáva, že sa pripojí cez C-koniec k Ala22. Dva cysteínové zvyšky nájdené vo hotovom FGF8 (všetky izoformy) sú vyznačené tučným podtrhnutím. Dve miesta možnej N-glykozylácie FGF8b sú označené Ň. Číslovanie odpovedá FGF8b.
Obr.’6: Znázornenie štyroch rôznych variantov FGF8b navrhnutých pre autovakcináciu.
Vrchný panel: Teoretické modely bodov vloženia epitopov používajúce ako chemický vzorec kryštálovú štruktúru FGF2.
Spodný panel: Aminokyselinové sekvencie divokého typu FGF8b (WT) a štyri varianty F30N, F2I, F30I a F2C. Signálny peptid je vyznačený jednoduchým podtrhnutím. Vložené peptidy sú podtrhnuté dvakrát. N-koncová sekvencia (MetAla) všetkých variantov je pre generovanie Kozákovej sekvencie (Kozák 1991) pre lepšiu transláciu v eukaryotických systémoch.
111
Príklady uskutočnenia vynálezu
Príklad 1
Vakcinácia proti PSM
V nasledujúcom texte sa opíše, ako je možné vyvíjať ludskú autovakcína proti PSM modifikáciou molekuly vložením jedného alebo viacerých promiskuitných cudzích T bunkových epitopov, aby sa odkrylo pole imunogenizovaných PSM molekúl.
Prípravky budú testované z hľadiska schopnosti vyvolať špecifické odozvy CTL proti PSM nesúcim nádorové bunky. Ďalej budú prípravky testované z hľadiska schopnosti indukovať protilátky, ktoré sú krížovo reaktívne s natívnymi časťami molekuly PSM. Následne sa Vyhodnotí účinnosť rôznych prípravkov v niekolkých skúškach in vitro a v živočíšnych modeloch in vivo. Indukované protilátky sa budú testovať na ich schopnosť aktivovať komplement klasickou cestou a iniciovať ADCC cez Fc-receptory. Nakoniec sa budú rozdielne molekuly testovať na živočíšnych modeloch ľudského karcinómu prostaty.
Stratégia navrhovania PSM autovakcíny
V krátkosti, vakcinačný plán PSM vyžaduje tieto experimentálne úlohy:
Návrh a vytvorenie tabuľky ludských PSM mutantov
Klonovanie ludských a potkaních/myších PSM sekvencií. Mutačná práca pre vytvorenie imunogenizované hPSM molekúl.
Expresia divokých a imunogenizovaných hPSM molekúl v E. coli a/alebo Pichia pastoris a/alebo cicavčích bunkách a/alebo bunkách hmyzu (ako je bunková línia S2) .
112
Čistenie, refolding a charakterizácia imunogenizovaných hPSM molekúl.
Vakcinácia DNA proti PSM
Vytvorenie hPSM DNA vakcinačných vektorov kódujúcich imunogenizované hPSM molekuly.
Testovanie hPSM vakcinačných vektorov v experimentoch in vitro a in vivo.
Výber kandidátov hPSM
Imunizácia myší/králikov.
- ELISA.
FACS analýza.
V prípade odozvy protilátky: skúška bujnenia nádorovej bunky.
Skúšky T-buniek.
Testovanie hPSM mutantov in vivo
- Model pevný nádor/metastáza v myšiach.
Koncepčná štúdia: indukcia CTL autovakcináciou
Zostavenie imunogenizovaných myších/potkaních PSM odpovedajúcich vybraným hPSM kandidátom (napr. vo forme DNA vakcín).
Testovanie imunitnej odozvy vyvolanej myšími/potkaními PSM mutantmi skúškami in vitro·. imunochemické skúšky, ELISA, FACS analýza, bunkové analýzy, komplementová lýzia buniek nesúcich PSM, skúška ADCC, skúška aktivity CTL, skúška bujnenia nádorovej bunky, skúšky prezentácie T-buniek.
Testovanie mPSM mutantov „in vivo v modeli pevný nádor/metastáza u myší.
113
Názvoslovie konštruktov hPSM
PSM je typom II membránového proteínu 750 aminokyselín, porovnaj sekvenčné identifikačné číslo: 2, ktoré dáva štyri sekvencie divokého typu s výnimkou, že Gly nahradzuje Trp v polohe 2 následkom zavedenia Ncol miesta a Kozákovej sekvencie do sekvenčného identifikačného čísla: 1, kde ggt nahradzuje tgg v polohách 4-6. Pre niektoré prípravky ludskej autovakcíny založenej na PSM sa však môže použiť aj natívny PSM (t.j. PSM majúci Trp v polohe 2).
Extracelulárnu časť PSM tvorí 707 aminokyselín s C-koncom, zatial čo o cytoplazmatickej oblasti sa. predpokladá, že má dĺžku 19 aminokyselín a transmembránová časť proteínu pozostáva z 24 aminokyselín (aminokyseliny 20 - 43) .
Ako východzí bod pre prípravky môže byť tiež použitý strihový variant PSM'. Naša verzia tohto strihového variantu má aminokyselinovú sekvenciu odpovedajúcu zvyškom 58 - 750 v sekvenčnom identifikačnom čísle: 2. Pre jednoduchosť názvoslovia sa oblasti v PSM' číslujú podľa číslovania v PSM (to znamená, že napr. oblasť 2 pozostáva z aminokyselín 87108 v PSM a aminokyselín 30-51 v PSM'), zrovnaj tiež nižšie uvedenú diskusiu týkajúcu sa sekvenčných oblastí.
Všetky genetické prípravky ludského PSM sa označujú hPSM . (alebo hPSM' . , ak sa ako východzí bod použije
PSM'), kde prvá je vstupná oblasť použitá pre vloženie P2 a druhá _ je vstupná oblasť pre P30. Keď P2 a P30 nie sú v proteíne, označuje sa číslom 0 (nula). Úplná dĺžka divokého typu hPSM sa označuje hPSMO.O a divoký typ hPSM bez cytoplazmatickej a transmembránovej časti sa označuje hPSM-^0.0. Trinásť plánovaných imunogenizovaných génov hPSM,
114
ktoré všetky obsahujú jeden P2 epitop a | jeden P30 | epitop sa | ||
pomenujú | hPSMl.l, | hPSM6.1, hPSM8.1, | hPSMI0.1, | hPSMI.6, |
hPSMI.8, | hPSMI.10, | hPSMI.2, hPSMI.3, | hPSMI.5, | hPSM2.1, |
hPSM3.1, | hPSMI0.3, | hPSM6.3, hPSM'10.3, | hPSM'6.3, | hPSM8.3, |
hPSM'8.3 a hPSM5.1, detaily viď nižšie,
V hPSMl.l sa obidva epitopy P2 a P30 vložili v tandeme do vstupnej oblasti č. 1 (membránu pokrývajúca oblasť) . Teoreticky sa o tomto mutantovi hPSMl.l môže uvažovať ako o veľmi atraktívnom kandidátovi pre indukciu produkcie protilátky, pretože celá extracelulárna doména tejto molekuly je intaktná. Pre indukciu odoziev CTL s použitím imunizácie nukleovou kyselinou sú považované za užitočné také prípravky ako sú hPSM10.3 a hPSM6.3.
Pre uľahčenie postupov klonovania a mutagenézie sa urobilo mnoho molekulárnej konštrukčnej práce za použitia časti buď s N-koncom (aminokyseliny 1-436) alebo s C-koncom (aminokyseliny 437-750) génu hPSM ako východzieho materiálu. Tieto dve časti génu hPSM sa označujú hPSMI a hPSMII kde prvá _ je vstupná oblasť používaná pre vloženie ’P2 a druhá _ je vstupná oblasť pre P30. Opäť, keď P2 alebo P30 nie sú v proteíne, použije sa číslo 0 (nula) a divoké typy sa označujú hPSMIO.O a hPSMIIO.0. Špeciálny variant hPSMlO.O bez cytoplazmatickej časti hPSM sa označuje hPSMI-í-0.0.
Väčšina mutagenéznej práce sa prakticky uskutočnila s použitím hPSMIO.O a hPSMIIO.O ako východzieho materiálu.
Exprimované hPSM mutantné proteíny sa budú označovať
PROS_._, kde; prvá _ je vstupná oblasť používaná pre vloženie P2 a druhá _ je vstupná oblasť pre P30. Keď P2 alebo P30 nie sú v proteíne, označuje sa ako 0 (nula). Divoký
115 typ hPSM sa označujú PROS.O. Pre proteínový produkt hPSM aminokyselín 437-750 je označenie PROSIIO.O. Proteíny s HIS značením sa nazývajú HIS-PROS_._. Ako His značenie sa použilo sekvenčné identifikačné číslo: 21 pre expresiu v kvasinkách a baktériách, zatial čo sekvenčné identifikačné č.: 23 pre expresiu v bunkách cicavcov.
Klonovanie ludskej sekvencie PSM
Bunková línia LNCaP, ktorá má svoj pôvod v metastázových léziách ludského prostatového adenokarcinómu sa zakúpila od American Type Culture Collection (ATCC). Z tejto bunkovej línie sa izoluje mRNA a podrobí sa reverznej transkripcii s použitím štandardnej súpravy, aby sa získala cDNA kódujúca ľudskú PSM sekvenciu. S použitím rozdielnych sád špecifických primerov hPSM sa získajú PCR produkty kódujúce PSM(437-750) a ďalej sa klonujú do pUcl9 (plazmid č. pMR300) a overujú sa sekvenovaním DNA. Tato C-koncová časť divokého typu PSM sa označuje hPSM časť II (hPSMIIO.O).
Podobne sa klonuje divoký typ hPSM časť I (hPSMIO.O) do pUcl9 s použitím primárov pre zosilnenie časti I tak s (hPSMIO.O) ako aj bez (hPSMIIO.O) transmembránových a cytoplazmatických domén. Klony sa riadene sekvenujú a hPSMIO.O a hPSMIIO.O sa fúzujú pomocou ligácie v mieste EcoRI. Výsledné klony hPSMO.O (sekv. id. č.: 2) a hPSMIO.O sa subklonujú do radu prokaryotických a eukaryotických expresných vektorov a sekvencie sa opäť overia. Intracelulárne exprimované formy ľudskej PSM (označené hPSM' - aminokyseliny 58-750 sekv. id. č. : 2) sa tiež konštruujú s použitím cDNA ako východzím materiálom. Tato sekvencia sa tiež subklonuje do cicavčích expresných vektorov a použije sa ako východzí materiál pre
116 niektoré konštrukty hPSM autovakcín, napr. hPSM'10.3 a hPSM'6.3.
Klonovanie potkaních a myších PSM sekvencií
Dva klony EST (expressed sekvence tag) obsahujúce cDNA sekvencie myších PSM (z obličiek plodov myší a myších makrofágov) sa zakúpili od American Type Culture Collection (ATCC). Tieto EST klony spolu pokrývajú myšiu sekvenciu PSM cDNA, a tým tak celú dĺžku myšieho PSM (sekv. id. č.: 7 a 8) ako aj. myší PSM'(sekv. id. č.: 9 a 10) a subklonujú sa do bakteriálnych vektorov a cicavčích expresných vektorov. Myšie PSM autovakcínové konštrukty sa môžu tiež pripraviť vložením P30 do cDNA myšieho PSM.
Expresia divokého typu hPSM v E. coli
C-koncová časť (aminokyseliny 437-750) hPSM, hPSMIIO.O sa klonuje do bakteriálneho expresného vektora pET28b, aby sa získal produkt s N-koncovým polyhistidínovým chvostom (HIS), ktorý ' napomáha jednoduchému čistenie vo veľkom merítku a identifikácii s protilátkami anti-poly-HIS. Proteínový produkt označený poly-HIS, hPSMIIO.O (proteínový produkt budúceho HIS-PROSIIO.0), sa exprimuje v E. coli.
DNA kódujúca skrátený divoký typ ludskej PSM, hPSM-s-cytO.0 sa tiež exprimovala z pET28b kmeňa E. coli BL21(DE3), kde sa produkt expresie lokalizuje v inklúznych telieskach. SDS-PAGE analýza bakteriálneho lyzátu ukázala produkt s očakávanou migráciou a Western blotting analýza s králičím anti-HISPROSIIO.O tiež dáva predpokladaný pás. Ďalej N-koncové sekvenovanie piatych aminokyselín tohoto produktu eluovaného z SDS-PAGE gélu dáva očakávané aminokyselinové sekvencie.
117
Konštrukty divokého typu hPSM, hPSMO.O, hPSMAO.O (rovnako ako dva hPSM mutanty, hPSMl.l a hPSM6.1, viď ďalej)' sa klonovali do rôznych expresných vektorov E. coli, aby sa umožnila účinnejšia expresia a určitý stupeň posttranslačnej úpravy („folding) rekombinantných proteínov v E. coli. Vybrané systémy expresie sú:
PMCT6, ktorý vytvára obmeny N-koncových HIS označených expresných rekombinantných proteínov,
PGH433, ktorý exprimuje rekombinantné proteíny v súvislosti s 22 aminokyselinami pelB vedúcej sekvencie, ktorá by mala smerovať proteín do periplazmatického priestoru baktérie E. coli a
PMal-p2, v ktorom sú rekombinantné proteíny exprimované ako C-koncové fúzie proteínu viažuceho maltózu (MBP) obsahujúce prírodnú MBP periplazmatickú vedúcu sekvenciu. Protilátky proti MBP sa môžu použiť k detekcii fúzie proteínov a uhlovodíkový pripojený stĺpec sa môže použiť na afinitné čistenie produktu.
Avšak experimenty expresie divokých typov proteínov hPSM z týchto vektorov na E. coli ukázali zreteľnú úroveň expresie len z pMCT6. Problémy získania periplazmatickej expresie divokých typov proteínov hPSM nie sú dnes ešte vyriešené.
Expresia divokého typu hPSM v Pichia pastoris
Vzhladom k relatívne vysokej molekulovej hmotnosti proteínu PSM a relatívne vysokému stupňu jeho glykozylácie (približne 16 % molekulovej hmotnosti) a preto, aby sa uľahčilo čistenie bez stabilizačného kroku, rozhodlo sa použiť alternatívnu
118 technológiu pre eukaryotickú expresiu rekombinantných proteínov. Niekolko dobre charakterizovaných eukaryotických expresných systémov sa vyhodnotilo a pre počiatočný screening hPSM mutantov sa vybrali kvasinky Pichia pastoris ako alternatíva k expresii na E. coli.
Systém expresie založený na kvasinkách Pichia pastoris sa aplikuje na PSM konštrukciách. Očakáva sa, že sa glykozylačný profil rekombinantných proteínov exprimovaných v tomto organizme viacej podobá cicavčiemu glykozylačnému profilu než napr. Saccharomyces cerevisiae vzhladom k menej rozvetvenej mänozylácii rekombinantného proteínu. Ukázalo sa, že absorpcia antigénov dendritickými bunkami sprostredkovaná receptormi manózy dáva asi stokrát účinnejšiu prezentáciu T bunkám v porovnaní s endocytickou absorpciou v kvapalnej fázy. Preto manozylácia môže hrať úlohu v antigenicite (a predovšetkým v schopnosti vyvolať CTL odozvu) u hPSM mutantov a iných antigénov, proti ktorým je CTL odozva žiaduca.
Kmeň Pichia pastoris, rovnako ako aj dva rôzne expresné vektory sa zakúpili od Invitrogénu. Vektor pPICZo/A nesie metanolom indukovatelný promótor, ktorý sa nachádza pred polyklonovým miestom, zatial čo vektor pGAPZaA exprimuje proteíny nezávisle. Obidva vektory kódujú sekrečný signál afaktoru, aby sa rekombinantné proteíny exportovali do média. Selekčný systém týchto vektorov je odolný voči zeocínu. Sekvencie kódujúce hPSMO.O a hPSM-^O.O (rovnako ako jeden mutant hPSM, hPSM.l, porovnaj ďalej) sa subklonovali do týchto vektorov (v skladbe s C-koncovým c-myc identifikačným epitopom, sekv. ident. č.: 27).
Štyri kmene Pichia pastoris (X-33, SMD1168, GS115 a KM71) odlišujúce sa napríklad podmienkami rastu sa transformovali
119 s každým z týchto (linearizovaných) plazmidov s využitím elektroporácie. Transformačný proces sa niekoľkokrát opakoval s menšími obmenami, aby sa získal veľký počet klonov rezistentných k zeocínu. Expresia divokého typu hPSM-^0.0 (rovnako ako hPSMl.l, viď ďalej) sa získala v systéme Pichia pastoris. Produkty expresie by sa mohli primárne detegovať vo Western blotting lyzátoch transformantov Pichia pastoris tak s použitím monoklonovej protilátky anti-hPSM, ako aj monoklonovej protilátky anti-c-myc. Rekombinantné produkty sa však detegovali intracelulárne.
Expresia divokého typu hPSM v cicavčích bunkách
Ku konečnému testovaniu a produkcii vybraných molekúl sa tiež zavedie expresný systém CHO (chinese hamster ovary vaječníky čínskych chrčkov) buniek.
Doposiaľ sa CHO. bunky transfektovali typom hPSM a hPSMl.l v rámci hlavných sekvencii (prípadne bez nich) v cicavčom expresnom vektore pcDNA3.1. Získali sa bunky rezistentné voči geneticínu. V bunkách COS prechodne transfektovanými tými istými konštruktmi boli detegované tak hPSMO.O ako aj hPSMl.l vo Western blotting analýze bunkových peliet s použitím monoklonovej protilátky anti-hPSM.
Tkanivové rozloženie hPSM
K určeniu, či hPSM expresia môže byť detegovaná v rôznych ľudských orgánoch, vrátane prostaty, krvi a mozgu, sa kúpil komerčný súbor. Metóda je založená na detekcii bodovej škvrny polyA, ktorá obsahuje mRNA extrahovanú z 50 rôznych ľudských tkanív. Predbežné výsledky neukazujú hyperexpresiu hPSM v tkanivách, ako je krv alebo mozog. Avšak po dátumu priority
120 predloženej prihlášky iný autori demonštrovali prítomnosť PSM v iných tkanivách (porovnaj vyššie).
Návrh hPSM mutantov
Pri navrhovaní mutačného postupu s PSM je velmi dôležité zachovať niektoré oblasti proteínu v modifikovaných konštruktoch, napríklad potencionálne a identifikované T bunkové epitopy, B bunkové epitopy a disulfidové môstiky cysteínových zvyškov. Preto, po určení takýchto „zakázaných oblastí vnútri sekvencie PSM, zostane obmedzený počet „otvorených oblastí 20 alebo viacej aminokyselín, ktoré sú vhodné pre výmenu s cudzími T pomocnými epitopmi P2 a/alebo P30. Podľa definície sa tiež transmembránová oblasť považuje za „otvorenú, pretože autoprotilátky zamerané proti tejto oblasti nie sú relevantné a predpokladá sa, že eliminácia tejto sekvencie zvýši rozpustnosť mutovaných PSM proteínov, ale nie je možné vylúčiť, že tato oblasť obsahuje dôležité CTL epitopy, a preto sa transmembránová oblasť uchováva v napr. hPSM10.3.
Podľa nášho očakávaním, že autovakcína indukuje odozvu CTL, by bolo dôležité identifikovať a zachovať potenciálne subdominantné CTL epitopy v konštruktoch. Dva takéto epitopy sú známe z literatúry: 1) peptid zahrnujúci PSM aminokyseliny
4-12 (LLHETDSAV) môže byť prezentovaný na Iudskej molekule MHC triedy I HLA-A2.1 (Tjoa 1996) a 2) PSM(711-719) (ALFDIESKV) tiež viaže HLA-A2.1 (Earp 1995). Podrobne sme tiež skúmali PSM aminokyselinovú sekvenciu, aby sme hlavne identifikovali zakotvené zvyšky HLA triedy I, ako opisujú Rammensee a kol. (Rammensee 1995), pre najrozšírenejšie typy HLA triedy I (HLA-A1, HLA-A2, HLA-A3, HLA-A23, HLA-A24 a HLAA28), ktoré dovedna tvoria 80 % HLA-A typov v Iudskej
121 populácii. Podobne sa identifikovali potenciálne HLA-B a HLAC epitopy a označili ich ako „zakázané oblasti.
Pretože pôvodným zámerom bolo použiť C57/black x SJL F1 hybridnú myš, po rozhodnutí používať pre testovanie PSM autovakcínových konštruktov transgenetické myši, boli určité T pomocné epitopy potencionálnych myší H-2b a H-2S identifikované a označené ako „zakázané oblasti (Rammensee 1995).
Dôležité je tiež zachovať známe väzobné oblasti protilátok v molekule PSM, pretože by mohli byť dôležité pre indukciu špecifických vlastných protilátok proti PSM. Bolo už opísaných päť takých oblastí: PSM(63-68), PSM(132-137), PSM(482-487) (WO 94/09820), PSM(716-723) a PSM(l-7) (Murphy
1996). S použitím počítačovej metódy Hoppa a Woodsa k prognóze antigénových determinantov bolo predpovedaných päť oblastí: PSM(63-69), PSM(183-191) , PSM(404-414), PSM(479-486) a PSM(716-723) (Hopp 1983), z ktorých sa niektoré prekrývali s experimentálne nájdenými B bunkovými epitopmi. Tieto oblasti sa tiež zachovávajú v molekulách kandidujúcich na PSM vakcínu.
PSM proteín obsahuje 4 cysteínové aminokyselín 22, 196, 466 a 597), ktoré v imunogenizovaných konštruktoch kvôli ich významu pri tvorbe disulfidových môstikov.
zvyšky (pozície budú zachované . potencionálnemu
Na základ vyššie uvedených „zakázaných a „otvorených oblastí v hPSM proteíne sa určilo 10 oblastí vhodných pre vstup cudzích T pomocných epitopov:
Vstupné oblasti v hPSMI (od iniciačného miesta do miesta
122
EcoRI, aminokyseliny (aa) 1-437):
Oblasť | 1: | aa po | 16-52 v PSM (4 TM = 37 aa). | aa pred TM, | TM (24 aa) a |
Oblasť | 2: | aa | 87-108 v PSM, aa 30-51 v PSM' (22 aa) | ||
Oblasť | 3: | aa | 210-230 v PSM, | aa 153-173 v | PSM' (21 aa) |
Oblasť | 4: | aa | 269-289 v PSM, | aa 212-232 v | PSM' (21 aa) |
Oblasť | 5: | aa | 298-324 v PSM, | aa 241-267 v | PSM' (27 aa) |
Vstupné | oblasti v hPSMII (od | EcoRI do konečného miesta | |||
437-750) | |||||
Oblasť | 6: | aa | 442-465 v PSM, | aa 385-408 v | PSM' (24 aa) |
Oblasť | 7: | aa | 488-514 v PSM, | aa 431-457 v | PSM' (27 aa) |
Oblasť | 8: | aa | 598-630 v PSM, | aa 541-573 v | PSM' (33 aa) |
Oblasť | 9: | aa | 643-662 v PSM, | aa 586-605 v | PSM' (20 aa) |
Oblasť | 10 | : . aa | l 672-699 v PSM, | aa 615-642 v PSM' (28 aa) |
Vstupné oblasti, rovnako ako „zakázané oblasti, znázorňuje obr. 4.
Rad rôznych imunogenizovaných PSM konštruktov sa pripraví substitúciou segmentu aminokyselín z dvoch vyššie uvedených oblastí za P2 alebo P30. Každý mutantný proteín bude teda obsahovať P2 ako aj P30 a hoci takéto konštrukty slúžia len ako príklady - predmetom predkladaného vynálezu sú tiež jednotlivé mutanty. Experimentálne sa mutácie pripravia v klonoch hPSMI, resp. HPSMII cDNA a dve mutované časti budú následne kombinované pomocou ligácie (v polohe EcoRI). Epitopy P2 a P30 sa najprv vložia do vstupných oblastí 1, 2, 3, 5, 6, 8 a 10, aby sa vytvorili mutanty.
P2 a P30 sekvencie sú:
123
Ρ2: QYIKANSKFIGITEL (sekv. id. č.: 12, 15 aminokys.), v tomto prípade kódovanom nukleotidovou sekvenciou cag tac atc aaa get aac tcc aaa ttc atc ggt atc acc gag ctg (sekv. id. č.: 11, 45 nukleotidov), kde tučné vyznačená šekvencia je miesto Sací. V závislosti na voľbe klonového vektora a systému expresie môžu nastať aj iné voľby kodónov.
P30: FNNFTVSFWLRVPKVSASHLE (sekv. id. č.: 14, 21 aminokys.), v tomto prípade kódovanom nukleotidovou sekvenciou ttc aac aac ttc acc gta agc ttc tgg ctg cgt gtt ccg aaa gtt agc gCT AGC cag_gig gaa (sekv. id. č.: 13, 63 nukleotidov), kde tučné označenie odpovedá miestu HindlII, jednoduché podtrhnutie miestu £co47III, veľké písmená miestu BstNI a dvojité podtrhnutie miestu Nhel.
Nasledujúca tabuľka zhrňuje ľudské PSM prípravky používané v tomto vynáleze:
Konštrukt | pozícia P2 v proteíné | pozícia P30 v proteíne |
hPSMO.0 | 4- | 4- |
hPSM4-0.0 | 4- | 4- |
hPSM'0.0 | 4- | 4- |
hPSMl.1 | 17-31 | 32-52 |
hPSM6.1 | 448-462 | 21-41 |
hPSM8.1 | 606-620 | 21-41 |
hPSMl0.1 | 674-688 | 21-41 |
hPSMl.6 | 24-38 | 443-463 |
hPSMl.8 | 24-38 | 607-627 |
hPSMl.10 | 24-38 | 673-693 |
hPSMl.2 | 24-38 | 87-107 |
hPSMl.3 | 24-38 | 210-230 |
hPSMl.5 | 24-38 | 301-321 |
hPSM2.1 | 91-105 | 21-41 |
124
hPSM3.1 | 213-227 | 21-41 |
hPSM5.1 | 305-319 | 21-41 |
hPSM8.0 | 606-620 | -? |
hPSMIO.O | 674-688 | -ŕ |
hPSMO.1 | -? | 21-41 |
hPSMl.O | 24-38 | -ť |
hPSM6.3 | 448-462 | 210-230 |
hPSM8.3 | 606-620 | 210-230 |
hPSM10.3 | 674-688 | 210-230 |
hPSM'6.3 | 391-405 | 153-173 |
hPSM'8.3 | 549-563 | 153-173 |
hPSM'10.3 | 617-631 | 153-173 |
Molekulové konštrukcie hPSM mutantov
Mutácie pre vloženie sekvencií kódujúcich P2 a P30 sa pripravili s použitím tak hPSMIO.O ako aj hPSMIIO.O ako východzieho materiálu.
Pre vytvorenie väčšiny hPSM mutantov sa P2 a P30 najprv vložia do hPSMIO.O vo vstupnej pozícii 1. Výsledný materiál (hPSMIl.O, resp. HPSMIO.l) sa následne použije ako východzí materiál pre mutagenéziu, aby sa P2 a P30 vložili do pozícií 2, 3 a 5 a pre ligáciu s epitopom mutujúcim hPSMII. HPSMIl.O sa konštruoval použitím SOE (single overlap extension) PCR a následným overením sekvencie. hPSMIO.l sa konštruoval použitím technikou „Quick Change a následným overením sekvencie.
P2 epitop sa vloží do hPSMIl.O v polohách 2, 3 a 5 s použitím SOE-PCR za vzniku hPSMI1.2, hPSMI1.3 a hPSMI1.5. Tieto konštrukcie sa kombinujú s hPSMIIO.O za vzniku hPSM1.2,
125 hPSM1.3 a hPSM1.5.
HPSMI2.1, hPSMI3.1 a hPSMI5.1 sa konštruovali pomocou SOEPCR s použitím hPSMIO.l ako východzím materiálom. Tento materiál sa zhromaždil s hPSMIO.O pomocou ligácie v mieste
EcoRI, aby sa vytvorili mutanty s úplnou dĺžkou hPSM2.1, hPSM3.1 a hPSM5.1.
P2 epitop sa vložil do troch rôznych pozícií hPSMIIO.O, aby sa vytvorili hPSMII6.0, hPSMII8.0 a hPSMIIlO.O technikou „Quick Change a sled týchto klonov sa následne overil.
Následne bol hPSMIO.l spojený s hPSMII6.0, hPSMII8.0 a hPSMIIlO.O, aby sa získali hPSM6.1, hPSM8.1 a hPSMIO.l a klony boli sekvenčne overené.
Zaradenie P30 epitopu do hPSMII sa uskutoční súčastne, aby sa vytvorili hPSMII0.6, hPSMII0.8 a hPSMIIO.10 s použitím SOE-PCR.
HPSM1.1 bol konštruovaný použitím dvoch dvoj krokových mutácií PCR nasledovaných ligáciou na HindlII mieste vnútri sekvencie epitopu. Úplná dĺžka konštruktu sa sekvenčne overila.
hPSM10.3, hPSM'10.3 a hPSM6.3 sa zostavujú s použitím SOEPCR. Niektoré iné varianty hPSM s P2 a P30 zaradenými do extracelulárnej časti hPSM sa bežne konštruujú (hPSM'6.3, hPSM8.3, hPSM'8.3).
Okrem pôvodne uvažovaných mutantov, z ktorých každý obsahuje tak P2 ako aj P30, sa zostavili štyri mutanty obsahujúce len jeden cudzí epitop a ich sled sa overil:
126 hPSMl.O, hPSM8.0, hPSMIO.O a hPSMO.1.
Expresia hPSM mutantov v E. coli
V experimentoch v malom merítku sa podrobilo sedem hPSM mutantov, hPSMl.l, hPSM6.1, hPSM8.1, hPSMIO.l, hPSM2.1, hPSM3.1 a hPSM5.1 expresii z pET28b v kmeni E. coli BL21 (DE3) a IPTG indukovatelné produkty s očakávanou veľkosťou boli identifikované pomocou Coomassie Blue zafarbenými SDSPAGE gélmi. Produkt hPSMl.l však nebol detegovatelný. Hladiny expresie týchto mutantov boli veľmi nízke pri porovnaní s produktmi konštruktu divokého typu hPSMri-0.0. Z tohoto dôvodu sa nedá očakávať uspokojujúca úroveň expresie hPSM mutantov s použitím pET systému v E. coli, preto je potrebné použiť iné systémy expresie E. coli a/alebo iný hostiteľský organizmus.
Ako sa uvádza vyššie, hPSM6.1 a hPSMl.l sa subklonujú do rozdielnych expresných vektorov E.coli, aby sa vytvorili
- N-konové His-značkované obmeny exprimovaných rekombinantných proteínov s použitím vektora pMCT6,
- obmeny proteínov exprimované s pelB vedúcou sekvenciou, ktorá smeruje proteín do periplazmického priestoru baktérie E. coli s použitím vektora pGH433 a
- obmeny rekombinantných proteínov exprimovaných ako Ckoncový fúzny proteín k proteínu viažucemu maltózu (MBP) s použitím vektora pMal-p2.
Doposiaľ sa nepodarilo získať dostatočnú úroveň expresie zo žiadneho z týchto prípravkov.
Pretože hPSMO.0 má zreteľnú expresiu v E. coli, zatial čo podobná úroveň expresie hPSMO.0 s úplnou dĺžkou alebo hPSM
127 mutantov nebola pozorovaná, je možné, že prítomnosť cytoplazmatickej časti hPSM molekuly môže nejakým spôsobom „inhibovať expresiu prípravkov hPSM s úplnou dĺžkou v E. coli. Pre overenie tejto hypotézy sme najprv pripravili dva genetické prípravky hPSMl.1 a hPSM6.1 bez cytoplazmatických domén. Pri experimentoch v E. coli však tieto -^cyt génové produkty mali len slabú expresiu.
Expresia mutantov hPSM v Pichia pastoris
Pre expresiu hPSMl.1 mutantného proteín z kvasiniek Pichia pastoris, sa sekvencia hPSMl.l subklonuje (v rámci s c-myc Ckoncovým identifikačným epitopom, sekv. id. č: 27) do dvoch rôznych expresných vektorov pPICZaA a pGAPZaA a sekvencie sa overia. Expresia hPSMl.l (ako aj hPSM+O.O, viď vyššie) sa deteguje intracelulárne v transformantoch Pichia pastoris.
Expresia mutantov hPSM v cicavčích bunkách
Ako už bolo zmienené vyššie, hPSMl.l sa subklonoval do cicavčích expresných vektorov pcDNA3.1(+) a pZeoSV2 a tieto (aj iné) prípravky môžu byť použité pre expresiu v napr. CHO bunkách. Prechodná expresia hPSMl.l ako aj hPSMO.O bola získaná v COS bunkách, ako sa overilo metódou Western blotting.
DNA vakcinácia
DNA vakcinácia, pokial je účinná, sa velmi dobre hodí pre PSM autovakcínu - zvlášť preto, lebo sa ukázalo, že táto forma podania podporuje tak imunitné reakcie sprostredkované CTL, ako aj tvorbu protilátok. Preto bolo zámerom uskutočniť paralelnú štúdiu s cieľom vyskúmať účinok DNA vakcinácie myší
128 s vhodnými vektormi kódujúcimi ubiquitín imunogenizovaných myší a/alebo myší TNFoí. DNA vakcinácia s hPSM (a/alebo s mutantmi) kódujúca DNA ako takú sa tiež uskutoční.
Štúdium uskutočnitelnosti s použitím imunogenizovaného ubiquitínu pre DNA vakcináciu
Štúdium uskutočniteľnosti stanovujúce účinok DNA vakcinácie s imunogenizovaným vlastným proteínom sa uskutočnila s použitím ubiquitínu s vloženým T pomocným epitopom z vaječného albumínu (UbiOVA) ako modelovým proteínom. Sekvencie kódujúce UbiOVA ako aj divoký typ ubiquitínu sa subklonovali do cicavčieho expresného vektora pcDNA3.1(-).
Skupiny myší 5 BALB/c sa imunizovali 40 pg pcDNA-UbiOVA alebo pcDNA-ubiquitínového prípravku buď intramuskulárne do kvadriceptu alebo intradermálne. Kontrolná skupina dostávala proteín UbiOVA v úplnom Freundovom adjuvans. Po troch a šiestych týždňoch sa imunizácia opakovala len s tým rozdielom, že UbiOVA proteín sa emulgoval v neúplnom Freudovom adjuvans.
Myšiam sa pravidelne odoberala krv a stanovoval sa titer protilátky proti ubiquitínu. Vo skupine UbiOVA vakcinovanej DNA sa získal len veľmi slabý titer protilátky proti ubiquitínu. Následne boli všetky skupiny podporené UbiOVA proteínom v neúplnom Freundovom adjuvans a odoberali sa vzorky krvi, aby sa zistilo, či vakcinácia UbiOVA a (a nie ubiquitínom) znásobí odozvu protilátok proti UbiOVA proteínu. Výsledky tohoto experimentu ukázali, žé nie je podstatný rozdiel medzi UbiOVA skupinou a kontrolnou skupinou, u všetkých myší sa silno vyvíjali protilátky proti ubiquitínu na základe tejto jedinej podpory UbiOVA/FIA.
129
DNA vakcinácia s použitím hPSM prípravkov
Priebežne sa uskutočňujú rôzne experimenty s použitím hPSM prípravkov. Rôzne divoké typy ľudskej PSM a autovakcinačných prípravkov (ako napr. hPSMO.O, hPSM-?0.0, hPSM'0.0, hPSMl.l, hPSM10.3) sa subklonovali do DNA vakcinačných vektorov (ako pcDNA3.1( + ), pcDNA3.1(-), pVAX a p'ZeoSV2). Do niektorých konštrukcií sa zahrnuli rôzne vedúce sekvencie (ako CDlla, tPA a IL5 vedúca sekvencia; sekv. id. č: 29, 25 a 31) priamo cez N-konce a do kostry, aby sa umožnila sekrécia exprimovaných hPSM proteínov in vivo. Všetky konštrukcie v DNA vakcinačných vektoroch sa overili sekvenovaním DNA a transláciou in vitro.
Rôzne druhy myší (ako Balb/cA, Balb/cJ, DBA/2 a A/J) boli naočkované vyššie opísanou hPSM DNA vakcínou buď intradermálne alebo intramuskulárne a vakcinácia sa niekoľkokrát podporila rovnakými prípravkami.
Vzorky séra sa odoberajú behom imunizačnej doby a skladujú sa pri -20 °C. Tieto vzorky sa potom budú analyzovať na prítomnosť protilátok reaktívnych s divokým typom hPSM.
U týchto myší sa tiež zaviedla skúška na monitorovanie rýchlosti množenia CTL a T pomocných buniek.
Predbežné výsledky naznačujú, že vyvolanie odoziev tak CTL ako aj protilátok proti PSM je možné uskutočniť.
130
Čistenie/charakterizácia hPSM s HIS-značkovaním (437-750) (HIS-PROSIIO.0)
Divoké hPSMII s HIS-značkovaním (HIS-PROSIIO.0), sú exprimované z pET28b a solubilizované inklúzne telieska sa nanesú na stĺpec FPLC gélovej filtrácie a eluujú sa pufrom, ktorý obsahuje 8 M močovinu. Pre optimalizáciu postupu sa frakcie, ktoré prevážne obsahujú hPSM, podrobia rôznym refolding podmienkam. U rozpusteného produktu dialyzovaného proti Tris pufru sa s použitím strieborne zafarbenej SDS-PAGE určila čistota vyššia než 90 %.
Králiky sa imunizovali prečisteným HIS-PROSIIO.0, aby sa výsledné antisérum použilo k pozdnejšej detekcii a prípadnému afinitnému čisteniu hPSM mutantov.
Čistenie/charakterizácia rozpustných hPSM (PROS-ŕO.O)
Divoký typ hPSM bez cytoplazmatickej a transmembránovej časti, PROS+0.0, sa exprimuje v kmeni E. coli BL21 (DE3) na základe indukcie s IPTG a mohol byť detegovaný v inklúznych telieskach. SDS-PAGE tohoto bakteriálneho lyzátu a následná Western blotting s králičím anti-HIS-PROSIIO.0 ukázali produkt s očakávanou migráciu. N-koncové sekvenovanie prvých piatych aminokyselín tohoto produktu eluovaného z SDS-PAGE gélu ukázalo očakávanú sekvenciu odpovedajúcu ľudskému PSM. Produkt sa podrobil rozsiahlym sériám solubilizačných a refolding experimentov. Produkt, ktorý zostane v roztoku, sa môže získať v Tris pufri bez denaturantov alebo reduktantov, ale SDS-PAGE analýza odhalila, že materiál pravdepodobne vytvára velké agregáty. Myši a králičí sa imunizovali týmto materiálom, aby sa získala protilátka proti hPSM, napríklad pre analytické účely - antiséra nereagujú
131 s LNCap hPSM.
Pripravila sa dávka premytých inklúznych teliesok E. coli k imunizácii králikov, aby sa vytvorilo polyklonálne antisérum proti PSM. Približne 50 % obsahu proteínu vo vlhkom peletizovanom materiále tvoril PROSTO.0. Antiséra nereagujú s LNCap hPSM vo Western blotting.
Príprava peptidov hPSM konjugovaných s KLH pre imunizáciu
Tri pentadekamérne peptidy sa syntetizovali, aby sa pripravili imunogénne konjugáty B bunkových epitopov známeho hPSM s molekulou imunologického nosiča, a tak sa získalo polyklonálne antisérum schopné rozpoznať hPSM. Tieto peptidy obsahujú na každom konci B-bunkový epitop PSM a 5-6 ohraničujúcich PSM aminokyselín.
Peptidy sa pripravujú automatickou syntézou, HPLC čistením a kontrolným sekvenovaním Edmanovou degradáciu.
Chemicky viazané konjugáty sa pripravujú sieťovaním epitopu B bunky obsahujúceho hPSM peptidy KLH v štandardnom jednokrokovom procese s glutáraldehydom ako sieťovadlom.
Syntéza peptidov P2 a P30 s ohraničujúcimi hPSM sekvenciami
Bolo navrhnutých šesť peptidov, ktoré odpovedajú P2 a P30 epitopom s 5 ohraničujúcimi hPSM aminokyselinami na každom konci. Ohraničujúce aminokyseliny odpovedajú vstupným miestam epitopu 6, 8 a 10. Peptidy sa použijú napríklad v testoch množenia T-buniek, ale tiež pre iné účely, ako ELISA a iné skúšky in vitro. Peptidové sekvencie sú:
132
PSMpep007 | P2 vložený v pozícii 6 | ||
QERGVQYIKANSKFIGITELRVDCT (sekv. | id. č. : | 15) | |
PSMpepOO8 | P2 vložený v pozícii 8 AWLRQYIKANSKFIGITELEMKTY (sekv. | id. č.: | 16) |
PSMpep009 | P2 vložený v pozícii 10 MFLERQYIKANSKFIGITELHVIYA (sekv. | id. č.: | 17) |
PSMpepOlO | P30 vložený v pozícii 6 NSRLLFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEVDCTP | (sekv. id | . č. : |
PSMpepOll | 18) P30 vložený v pozícii 8 WLRKFNN FTVŠ FWLRVPKVS AS HLE S FDS L | (sekv. id | . č. : |
PSMpep012 | 19) P30 vložený v pozícii 10 LMFLEFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEPSSHN | (sekv. id | . č: |
Epitopy P2 | 20) a P30 sú podtrhnuté. Peptidy | sa pripravili | |
automatickou | syntézou a podrobili sa procesu | HPLC čistenia, | |
po ktorom | nasledovalo kontrolné sekvenovanie Edmanovou |
degradáciou.
Testy imunogenity
Rôzne experimentálne projekty boli iniciované pre výrobu materiálu a pre zavedenie skúšok imunogenicity určené pre budúce testovanie a výber medzi mutovanými PSM prípravkami.
Vytváranie polyklonových králičích anti-HIS-PROSIIO.0 a antiKHL-PSM-peptidových konjugovaných antisér
Dva králiky sa imunizovali prečisteným HIS-PROSIIO.0, Ckoncovou časťou hPSM proteinu s HIS-značkovaním
133 (aminokyseliny 437-750) emulgovanou 1:1 s kompletným Freundovým adjuvans a dvakrát, podporenou (v 28. a 55. dni) rovnakým antigénom emulgovaným v neúplnom Freundovom adjuvans.
Dva králičí sa imunizovali koktailom pozostávajúcim z konjugátu peptidu KLH-PSM plus každý z troch volných peptidov. Každý z týchto volných peptidov obsahoval skôr definovaný Bbunkový epitop hPSM. Koktail sa emulgoval 1:1 s úplným Freundovým adjuvans. Králičí sa preočkovali dvakrát (v 28. a
55. dni) rovnakým antigénom emulgovaným v neúplnom Freundovom adjuvans.
Krížová reaktivita medzi anti-HIS-PROSIIO.0 a PSMpepOO5 a krížová reaktivita medzi konjugátom anti-KLH-PSM peptidu plus peptidmi a HIS-PROSIIO.0 sa demonštrovala testom ELISA. AntiHIS-PROSIIO . 0 protilátka má schopnosť rozpoznať prirodzené hPSM v lyzátoch buniek LNCaP vo Western blotting.
Imunizácia myší retrovírusovo exprimovaným hPSMO.O
V súčasnom stave PSM projektu je stále vážnou prekážkou nedostatok protilátok, ktoré sú schopné rozpoznať správne posttranslačne upravené natívne hPSM. Preto sa uskutočnil imunizačný experiment s použitím retrovírusovo exprimovaného hPSMO.O.
Šesť skupín Balb/c myší sa imunizovalo buď: 1) mitomycínom C spracovaným BALB/c bunkami 'f ibrosarkómu (79.24.H8), prenášaným hPSMO.O cDNA (CMV-Koz-hPSM), 2) mitomycínom C spracovaným BALB/c bunkami fibrosarkómu (79.24.H8), prenášaným prázdnym vektorom (CMVBipep) , 3) bunkami v balení BOSC transfektovanými hPSMO.O cDNA (CMV-Koz-hPSM), 4) bunkami
134 v balení BOSC transfektovanými prázdnym vektorom (CMVBipep), 5) retrovírusovým kmeňom exprimujúcim hPSMO.O cDNA (CMV-KozhPSM ) , alebo 6) retrovírusový kmeň, prázdny vektor (CMVBipep). 1
V niekolkých časových intervaloch sa myšiam odobrala krv a získané séra sa testovali na reaktivitu proti HIS-PROIIO.O (ELISA). Bohužiaľ, žiadna z myší nevyvíjala protilátky schopné špecificky rozpoznať preparát HIS-PROSIIO.0.
Zavedenie anti-hPSM metódy ELISA
Prečistený HIS-PROSIIO.0 sa použil na potiahnutie polystyrénových mikrotitračných doštičiek (Maxisorp) pre vytvorenie skúšky ELISA pre testovanie napr. supernatantu hybridómu alebo myšie a králičie antiséra. Séra z BALB/c myší imunizovaných rovnakým preparátom HIS-PROSIIO.0 reagovali s imobilizovaným HIS-PROSIIO.0 pri 0,5 pg na často používaný chrenovou peroxidázou označený králičí anti-myší Ig ako sekundárnou protilátkou.
Použitím tejto ELISA analýzy sa demonštrovala už zmienená schopnosť antiséra, vyvolaná u králikov proti konjugátu KHLPSMpep004-PSMpep005-PSMpep006 vo zmesi s voľnými peptidmi, reagovať s imobilizovaným HIS-PROSIIO.
Použití AquaBind® mikrotitračných doštičiek (viď údaje v patente WO 94/03530, kde sa opisujú mikrotitračné povrchy potiahnuté trezylom aktivovaným dextránom, ktoré sa teraz označujú registrovanou ochrannou známkou AquaBind), sa ELISA analýzou stanovili imobilizované PSM peptidy (PSMpep004, PSMpep005 a PSMpep006). AquaBind® doštičky potiahnuté týmito peptidmi môžu detegovať králičie antisérum vyvolané proti
135 rovnakému antigénovému preparátu. Ako sa uvádza vyššie, králičie anti-HIS-PROSIIO.0 sa môže detegovat na AquaBind® doštičkách potiahnutých PSMpep005.
Zavedenie anti-hPSM „Western blot použitím LNCaP buniek a monoklonovej protilátky 7E11C5
B bunkový hybridom 7E11C5, ktorý vylučuje myšiu monoklonovú protilátku IgG2a proti intracelulárnemu epitopu ludského PSM, bol kúpený od ATCC. Kultivačný supernatant z asi 90 % mŕtvych buniek sa zozbieral a použil v metóde Western blotting pre detekciu ľudského PSM tak v membránovo obohatených preparátoch LNCaP buniek, ako aj v bunkových lyzátoch LNCaP. Tato protilátka sa čistila za použitia proteínových G stĺpcov a jej reaktivita s LNCaP sa overovala metódou Western blotting.
Zavedenie metódy FACS k detekcii hPSM na LNCaP bunkách
Zaviedli sme dve vzájomne nezávislé FACS metódy pre detekciu hPSM na LNCaP bunkách. Bolo potrebné sa vyrovnať s niekoľkými problémami: LNCaP bunky rastú velmi pomaly a v nepravidelných zhlukoch, preto musela byť optimalizovaná metóda prípravy suspenzií jednotlivých buniek. Po druhé, epitop rozpoznaný mAb 7E11C5 sa v literatúre definuje ako súčasť cytoplazmatickej domény hPSM. Bol preto vyvinutý spôsob fixácie a permeabilizácie buniek. Za týmto účelom sa proteín G prečistený protilátkou 7E11C5 konjugoval s FITC a potom sa mohol použiť v FACS analýze bez sekundárnej protilátky.
Bola tiež zavedená metóda FACS využívajúca anti-hPSM monoklonovú protilátku J591, ktorá rozoznáva epitop na
136 extracelulárnej časti hPSM. Protilátka sa získala od BZL Biologicals and FITS konjugated a následne sa použila k FACS analýze a triedeniu napríklad LNCaP buniek a hPSM transfektantov (viď ďalej).
Zavedenie testov cytotoxicity
Zaviedol sa spôsob čistenia dendritických buniek z kostnej dréne myší. S použitím modelových proteínov sa optimalizovala imunizácia myší dendritickými bunkami s modelovými peptidmi triedy I, ako aj proteín. Okrem toho sa myši tiež imunizovali modelovým proteínom (β-galaktozidázou) vo forme ISCOMS. Prečistené T-bunky z imunizovaných myší sa in vitro restimulovali rôznymi formami odpovedajúcich antigénov. Následne sa u týchto restimulovaných CT lymfocytov merala schopnosť lýzie rôznych druhov delových buniek (vrátane dendritických buniek s modelovými peptidmi triedy I, rovnako ako transfektantov exprimujúcich retrovírusovo exprimovaný cytozólický peptid triedy I). Zaviedli sa dve rôzne in vitro skúšky na meranie CTL aktivity s použitím buď uvolňovania chrómu alebo DNA fragmentácie (metóda JAM) ako miery cytotoxicity. Velmi pekné výsledky sa získali s modelovým proteínom β-galaktózidázy a s rôznymi kombináciami MHC triedy I a triedy II viažucimi modelové peptidy.
Zavedenie nástrojov narušujúcich autotoleranciu voči myšiemu PSM v myšiach
Zámerom je študovať, či sa môže narušiť autotolerancia k myšiemu PSM v myšiach pomocou imunizácie a/alebo DNA vakcinácie proti myšovitým PSM použitím autovakcinačných myšovitých PSM molekúl.
137
Ako sa uvádza vyššie, bola získaná cDNA kódujúca PSM myšovitých (mPSM) a DNA sekvenovaná. Vytvorili sa štyri varianty mPSM molekúl vložením P30 do dobre definovaných pozícii buď do mPSM s úplnou dĺžkou alebo do mPSM'. Prípravky sú uvedené v nasledujúcej tabulke:
mPSM aminokyseliny dĺžka molekuly substituované P30 (počet aminokyselín)
mPSMO.0 | 4- | 752 | |||
mPSM'0.0 | 4- | 694 | |||
mPSMX | 255-271 | (sekv. | id. | č. : 8) | 756 |
mPSMY | 689-700 | (sekv. | id. | č. : 8) | 760 |
mPSM'X | 197-213 | (sekv. | id. | č.: 10) | 698 |
mPSM'Y | 631-642 | (sekv. | id. | č.: 10) | 702 |
Najprv | sa divoký | typ mPSM a | analógové | molekuly subklonujú |
do DNA vakcinačných vektorov a použijú sa k DNA vakcinácii myší.
Úmyslom je analyzovať imunitné odozvy, napríklad odozvy CTL a eliminovať nádor u myši. Preto budú nádorové bunkové línie myšovitých transfektované s divokým typom PSM myšovitých (fúzovaných spolu s identifikačným značením, napr. c-myc epitop, sekv. id. č.: 27, pre detekčné účely).
PSM nádorové modely in vivo
Skúšky množenia T buniek s P2 a P30 u myší
Uskutočnili sa série experimentov množenia T buniek, aby sa určila T bunková imunogenicita P2 a P30 peptidov u rôznych druhov myší (BALB/cA (H-2d) , C3H/Hen (H-2k) , DBA/1 (H-2q) a
138
C57BL/6 (H-2b) ) . Je dobre známe, že tieto epitopy sú u ludi promiskuitné, ale promiskuitu T buniek bolo potrebné tiež potvrdiť použitím M&Es experimentálneho usporiadania. Týmto sa ukázalo, že P30 je imunogénny k T bunkám u druhov BALB/cA a C57BL/6, zatial čo ani P2 ani P30 nie sú imunogénne pre T bunky u C3H/Hen. U DBA/1 je možné vyvolať T bunky proti P2.
Vytvorenie hPSM exprimujúceho myšie nádorové bunky
Vytvorila sa tabulka hPSM exprimujúcich nádorové bunky pre použitie hPSM špecifického nádorového modelu u myší, ako aj pre skúšky množenia nádorových buniek.
Jedným prístupom je vytvorenie bunkových línii prenosom nádorových bunkových línii myšovitých s retrovírusovými vektormi kódujúcimi úplný divoký typ hPSMO.O cDNA.
Skonštruovali sa tri rôzne prípravky kódujúce úplný divoký typ cDNA kódujúcej ludský PSM vložený do polyklonálneho miesta retrovírusového vektora CMVBipep. Z týchto prípravkov dva obsahovali krátku Kozákovu sekvenciu umiestnenú pred východzím kodónom.
Tieto prípravky sa preniesli do troch rôznych myších nádorových bunkových línií: P815 (mastocytóm, H-2d) , B16-F10 (melanóm, H-2b) a 79.24.H8 (fibrosarkóm, H-2d) s použitím bunkovej línie v balení BOSC. Zo všetkých troch typov buniek sa získali klony rezistentné voči geneticínu a PCR analýzou génomickej vzorky DNA sa overilo, že retrovírusové prípravky boli integrované do hostitelských buniek. Dosial nebolo možné detegovať exprimovaný PSM génový produkt metódou Western blot alebo FACS analýzou s použitím 7E11C5 monoklonovej protilátky.
139
Transfekciou sa vytvorili dve stabilné myšie nádorové bunkové línie uchovávajúce membránovo viazaný divoký typ ludského PSM. Ta sa uskutočnila pomocou hPSMO.O cDNA subklonovanej do cicavčieho expresného vektora pcDNA3.1(-?) . riadeného CMV promótorom a obsahujúceho Kozákovu sekvenciu umiestnenú pred východzím kodónom.
Výsledný plazmid sa transfektoval do dvoch rôznych myších línií nádorových buniek: 79.24.H8 (fibrosarkóm odvodený z BALB/c) a SalN (fibrosarkóm odvodený z A/J) . Získali sa kultúry rezistentné voči geneticínu a podrobili sa Western blotting a FACS analýzami s použitím J591 a 7E11C5 anti-hPSM monoklonových protilátok. Použitím J591 pri FACS boli bunky triedené niekoľkokrát, až sa získala hPSM pozitívna populácia. Expresia hPSM sa opäť overila intracelulárnym FACS farbením s použitím 7E11C5 protilátky. FACS analýzou sa tiež kontrolovalo, že hladiny expresie MHC triedy I sú rovnaké ako hladiny materských bunkových línií.
Kultúry 79.24.H8 a SalN bunkových línií exprimujúce hPSM sa klonovali pri obmedzenom riedení. Získalo sa niekoľko klonov a tie boli testované pre rozdielne hladiny hPSM expresie FACS analýzou s použitím anti-hPSM monoklonovej protilátky J591.
Bunky 79.24.H8 s expresiou kódujúcim B7.1 pre použitie pre monitorovanie špecifických uvoľňovania gama-interferónu.
pomocou FACS s použitím anti-B7.1
Zavedenie špecifických nádorových hPSM sa transfektovali génom v napr. analýzach in vitro CTL odoziev na hPSM a/alebo Bunky sa raz roztriedili antiséra.
modelov hPSM u myší
Bolo rozhodnuté zaviesť aspoň dva nádorové modely in vivo u
140 imunitné vyhovujúcich myší, aby sa určil protinádorový účinok protilátok vzniklých v myšiach proti molekulám imunogenizovaného hPSM. Dúfajme, že sa to podarí injektovaním syngenetických myších nádorových bunkových línií modifikovaných, aby exprimovali divoký typ hPSM na povrch membrány. Použijú sa bunky tvoriace pevné nádory a/alebo tie, o ktorých sa vie, že metastázujú. V modelu sa použijú bunkové línie, ktoré sa môžu implantovať do syngenetických myší bez toho, aby boli odmietnuté kvôli prítomnosti cudzích hPSM molekúl. Schopnosť hPSM vakcín eliminovať takéto nádorové bunky sa využije pre výber kandidátov na hPSM vakcínu.
Pre vyhodnotenie rastu SalN buniek transfekovaných úplným ludským PSM, sa rôzne dávky (2.106 a 5.106) hPSM transfektujúce SalN bunky (S-PSM, päťkrát triedené) injektovali subkutánne do dolnej časti pravej slabiny skupiny myší A/J. Pevné nádory sa však nezistili. Následne sa injektovali tri klony S-PSM buniek s rôznou úrovňou expresie hPSM subkutánne do troch skupín A/J myší v dávke 107 buniek na 1 myš. Veľkosť zistených nádorov sa merala dvojrozmerne, a tak sa vo výsledku získala veľkosť nádoru v mm2. Tieto hodnoty sa porovnali pre tri sledované skupiny. V rozmedzí 3 - 6 dní sa u všetkých myší vyvinula štruktúra podobná pevnému nádoru, ktorá približne do 15 dní zase zmizla. Je to zrejme dané prítomnosťou ľudského PSM na povrchu nádorových buniek, aj keď to zatiaľ nebolo overené. Bunky SalN transfektované iba pcDNA3.1 vektorom pokračujú u myší v raste ako pevné nádory.
Podobný priebeh sa pozoroval u myší injektovaných ΙΟ6, 5.106 alebo ΙΟ7 79.24.H8 buniek transfektovaných hPSM a niekoľkokrát triedených z hľadiska expresie hPSM. Tieto bunky (nazývané 79-PSM) tiež netvoria nádor ani u Balb/c, ani
141 u DBA/2. Ak sa však klonom hPSM transfektované 79.24.H8 bunky, 79-PSM.3, injektujú do myší Balb/c alebo DBA/2, vyvíjajú myši štruktúry podobné pevným nádorom, ktoré behom 10-20 dní zase.zmizli. Vektorom transfektované bunky 79.24.H8 rastú v myšiach Balb/c ďalej.
Zostáva ešte zhodnotiť, či sú tieto „nádory liečiteľné, alebo či sa zavedie lepší nádorový model založený na opísaných S-PSM a 79-PSM bunkových líniách a klonoch.
Závery
Pri molekulárne konštrukčnej práci sme boli úspešný pri klonovaní ľudského génu PSM a pri získaní myšieho PSM cDNA. Vyrobila sa séria úplne sekvenovaných imunogenizovaných hPSM autovakcínových prípravkou. Mutanty hPSM, rovnako ako rôzne divoké typy molekúl hPSM, boli exprimované v E. coli a zistilo sa, a tiež overilo, že úroveň expresie v E. coli je veľmi nízka. Polyklonálne protilátky proti polovine hPSM s Ckoncom sa indukovali u králikov. Značné úsilie sa venovalo realizácii rôznych expresných značení (His značenie a proteínová fúzia viažuca maltózu), rovnako ako alternatívnym expresným Systémom k E. coli. Rekombinantný divoký typ a/alebo autovakcína hPSM boli detegované v transfektovanej Pichia . pastoris a v.bunkách cicavcov. Urobili sa užitočné úvahy týkajúce sa technológie DNA vakcinácie a uskutočnili sa predbežné štúdie uskutočniteľnosti. Prebiehajúce experimenty DNA vakcinácie s auto-vakcinačnými molekulami hPSM ukazujú sľubné predbežné výsledky. Zaviedli sa rôzne skúšky in vitro užitočné pre testovanie a výber medzi mutovanými PSM prípravkami, vrátane imunochemických skúšok a FACS analýz. Myšie nádorové bunky sa stabilne transfektovali úplným divokým typom . hPSM a pomocou FACS sa roztriedili podľa
142 povrchovej expresie hPSM. Získali sa klony týchto bunkových línii. Xenogénne nádorové modely in vivo u myší sa vyhodnocujú s použitím týchto hPSM nesúcich syngenetické myšie nádorové bunky. Uskutočnila sa séria skúšok množenia T buniek, aby sa vybrali druhy myší vhodné pre nádorové modely. Optimalizovali sa skúšky CTL a získali sa uspokojivé výsledky s modelovými antigénmi pri použití rôznych imunizačných spôsobov a podmienok týchto skúšok. Okrem toho sa zaviedli nástroje potrebné pre štúdium narušovania tolerancie k myšiemu PSM pomocou imunizácie proti myším PSM autovakcínam.
Príklad 2
Výroba autovakcíny Her2
Ľudská autovakcína proti Her2 sa môže vyvinúť modifikáciou molekuly vložením jedného alebo viacerých promiskuitných cudzích T bunkových epitopov, aby sa odkryl úsek imunogenízovaných Her2 molekúl. Tieto modifikované proteíny sa testujú na schopnosť indukovať, protilátky, ktoré sú krížovo reaktívne s natívnymi časťami molekuly Her2. Následne sa v niekoľkých skúškach in vitro a v živočíšnych modeloch in vivo vyhodnotí efektívnosť rôznych konštruktov (to sa môže týkať DNA vakcinácie) a modifikovaných proteínov. Bude sa analyzuje indukcia špecifických CTL odoziev proti Her2 nesúcemu nádorové bunky. Bude sa tiež testovať schopnosť indukovaných protilátok aktivovať komplement klasickou cestou a iniciovať ADCC prostredníctvom Fc-receptorov. Nakoniec sa rôzne modifikované molekuly budú testovať v živočíšnych /
modeloch ľudskej rakoviny prsníka, aby sa vyskúšala ich účinnosť pri liečbe nádorov.
Imunogénne potkanie a ľudské molekuly sa budú konštruovať
143 s promiskuitnými T-bunkovými epitopmi v rôznych polohách v molekule.
Behom vakcinácie proti celej extracelulárnej doméne Her2 môže do určitej miery dochádzať ku krížovým reakciám protilátok s inými EGFr receptormi, pretože niektoré z týchto receptorov sú v extracelulárnej doméne homologické až zo 4046 %. Preto sa plánuje, že sa zachované oblasti Her2 porušia vložením cudzích T bunkových epitopov aspoň L do niektorých modifikovaných proteínov (detaily viď ďalej).
Oblasti Her2, ktoré môžu byť potencionálne CTL alebo Bbunkovými epitopmi, zostanú pri navrhovaní konštruktov zachované a sú ukázané na obr. 3. Odôvodnenie pre využitie týchto polôh je nasledujúce:
Sekvencie ludského Her2 je možné rozdeliť na rad domén, základom ktorých je výhradne primárna štruktúra proteínu.
Extracelulárna (receptorová) časť:
1-173: Doména I (N-koncová doména hotového polypeptidu).
174-323: Doména II (doména bohatá na cysteín, 24 cysteínových zvyškov).
324-483: Doména III (doména, ktorá viaže ligand v homologickom EGF receptore).
484-623: Doména IV (doména bohatá na cysteín, 20 cysteínových zvyškov).
624-654: Transmembránová doména (TM zvyšky 654-675).
Intracelulárna (kinázová) časť:
144
655-1010: Doména tyrosín kinázy (jadro TK domény 725992) .
1011-1235: Doména C-koncov.
Výber miest v aminokyselinovej sekvencii Her2, ktoré majú byt nahradené buď P2 alebo P30 ľudskými T pomocnými epitopmi berie do úvahy nasledujúce parametre (bez ohladu na prioritu):
1. Známe a predpokladané CTL epitopy
2. Homológia príbuzných receptorov (zvlášť EGFR)
3. Zachovanie cysteínových zvyškov
4. Predpovedané špirálové, α-helixové a β-sheet štruktúry·
5. Potencionálne miesta N-glykozylácie
6. Predikcia exponovaných a skrytých aminokyselinových' zvyškov
7. Organizácia domény
CTL epitopy sa vyskytujú ako klastry v doménach I, III, TM, a vo dvoch alebo troch „horúcich bodoch v doméne TK. V súlade s vynálezom sa majú tieto domény z veľkej časti zachovať.
Oblasti s vysokým stupňom homológie s inými receptormi sú pravdepodobne štruktúrne významné pre „celkovú terciárnu štruktúru Her2, a teda pre rozpoznanie protilátkou, zatial čo oblasti s nízkou homológiou je preto potencionálne možné obmeňovať len lokálnymi zmenami štruktúry.
Cysteínové zvyšky sa často zapojujú do intramolekulárnych disulfidových môstikov, a sú preto velmi dôležité pre
145 terciárnu štruktúru a nemali by sa meniť. Oblasti, u ktorých sa predpokladá, že tvoria a-helixovú a β-sheet štruktúru, je výhodné nevyužívať ako vstupné body pre cudzie epitopy, pretože tieto oblasti sú pravdepodobne dôležité pre posttranslačnú úpravu proteínu (folding).
Tiež by sa prednostne mali zachovať potenciálne Nglykozylačné miesta, pretože je velmi žiaduca manozylácia proteínu (napríklad expresiou v kvasinkách), porovnaj prítomnosť receptorov manózy na APC bunkách.
Oblasti, u ktorých sa predpokladá (podľa ich hydrofóbnych vlastností), že sú vnútri molekuly, by bolo výhodné zachovať, pretože by mohli byť zapojené do posttranslačnej úpravy (folding). Na rozdiel od toho oblasti vystavené rozpúšťadlu ponúkajú polohy pre vstup modelových TH epitopov P2 a P30.
A konečne sa berie do úvahy tiež organizácia proteínových domén, pretože je relevantná pre štruktúru a funkciu proteínu.
Stratégia sa zameriava na zachovanie štruktúry extracelulárnej časti Her2, ako je len možné, pretože sa jedná o tú časť proteínu, ktorá je relevantná ako ciel pre neutralizáciu protilátok. Naproti tomu intracelulárna časť natívnej membrány, ktorá viaže Her2 na povrchu rakovinných buniek, je pre humorálny imunitný systém nedostupná.
Dôvodom pre začlenenie tejto časti do vakcíny je preto len prítomnosť CTL epitopov. Je preto pochopiteľné, že sem sa umiestni jeden alebo viacej epitopov. Keď sa ukáže, že nie je možné exprimovať úplnú molekulu Her2 v E. coli alebo v kvasinkách, intracelulárna časť sa môže skrátiť za prvým
146 „horúcim bodom CTL epitopu (okolo polohy 800) . Ďalšie CTL epitopy sa potom môžu pridať k C-koncovej časti skrátenej molekuly.
Transmembránová oblasť je pravdepodobne nezávislá jednotka posttranslačnéj úpravy a jej nahradenie TH epitopmi, napríklad P2 alebo P30, pravdepodobne neovplyvní štruktúru Her2 a posttranslačnú úpravu. Naviac TM doména môže pôsobiť velké problémy pre expresiu v kvasinkách a E. coli a mala by byť v každom prípade substituovaná. Vo všetkých prípravkoch by sa preto mal epitop prednostne umiestniť do tejto domény (možná ju nechať nedotknutú v konštrukcii 1, pretože obsahuje niekolko CTL epitopov a pretože je akýmsi spôsobom zapojený do prenosu signálov na viazanie ligandu).
Extracelulárna doména sa v princípe môže držať nezmenená tým, že sa P2 a P30 umiestnia do intracelulárnych a transmembránových domén, čím sa maximalizuje počet potenciálnych Bbunkových epitopov a interferencia so štruktúrou je čo možná najmenšia. Vysoký stupeň homológie k EGFR, Her-3 a Her-4 však vytvára riziko krížovej reaktivity k týmto receptorom, 'ktorá môže (i keď nemusí) byť nežiaduca. Naviac boli opísané niektoré monoklonové protilátky, ktoré fungujú ako antagonisty receptorov (pravdepodobne stimuláciou heterodimerizácie alebo ligandovej väzby) a zväčšujú velkost nádoru in vivo. Preto sa v extracelulárnej doméne vyberajú také pozície, u ktorých je nádej, že znížia tieto riziká.
Výber zahrnuje všetky už skôr zmienené parametre a zakladá sa na dvoch rôznych predpokladoch:
(i) Zaradenie do oblastí, ktoré sa nezachovávajú (s ohľadom na príslušné receptory), pomôže udržať terciárnu štruktúru a môže znižovať nechcenú aktiváciu protilátkami.
147 (ii) Zaradenie do zachovaných oblastí môže zmeniť štruktúru, ale súčasne môže znížiť riziko krížovej reaktivity narušením sekvencií, ktoré s ňou najviac súvisia.
Obidva predpoklady sú špekulatívne, ale pretože je veľmi ťažké predpovedať účinok umiestnenia epitopu v každej pozícii proteínu, niektoré z týchto pozícií byli zahrnuté do prípravkov.
Uvažovalo sa o tom, že by mohlo byť výhodné úplne odstrániť dve domény bohaté na cysteín. Predpovedalo sa vytvorenie špirálovitej štruktúry vystavenej rozpúšťadlu a možnosť vytvoriť nezávislé jednotky posttranslačnej úpravy (folding) zrejme zapojené do dimerizácie (ako svedčí veľa cysteínov, ktoré mohli slúžiť na udržanie pevnej štruktúry potrebnej pre vytvorenie dimerizačnej domény). Odstránenie týchto štruktúr môže preto eliminovať riziko aktivácie protilátkami, ako aj znížiť počet krížovo reagujúcich protilátok, pretože tieto domény sú najlepšie zachovanou extracelulárnou časťou proteínu.' Produkcia takýchto domén bohatých na cysteín by mohla byť naviac problematická v E. coli alebo kvasinkových bunkách.
Nasledujúce podrobnosti konštruktov, ktoré používajú P2 a P30 epitopy, nie sú obmedzujúcimi príkladmi: P2 epitop sa primárne umiestni do extracelulárnej domény Her2 v kombinácii s P30 epitopom, ktorý substituuje časť alebo celú membránovú oblasť. P2 epitop sa umiestni podľa vyššie uvedených
kritérií. Výhodné konštrukty majú | nasledujúcu | štruktúru: | |
Názov konštruktov | Poloha P2 | Poloha P30 | Dĺžka |
hHER2MA2-lA | 59-73 | 632-652 | 795 |
hHER2MA2-2A | 103-117 | 632-652 | 795 |
hHER2MA2-3A | 149-163 | 632-652 | 795 |
148
hHER2MA2-4A | 210-224 | 632-652 | 795 |
hHER2MA2-5A | 250-264 | 632-652 | 795 |
hHER2MA2-6A | 325-339 | 632-652 | 795 |
hHER2MA2-7A | 369-383 | 632-652 | 795 |
hHER2MA2-8A | 465-489 | 632-652 | 795 |
hHER2MA2-9A | 579-593 | 632-652 | 795 |
hHER2MA2-lB | 59-73 | 661-675 | 795 |
hHER2MA2-2B | 103-117 | 661-675 | 795 |
hHER2MA2-3B | 149-163 | 661-675 | 795 |
hHER2MA2-4B | 210-224 | 661-675 | 795 |
hHER2MA2-5B | 250-264 | 661-675 | 795 |
hHER2MA2-6B | 325-339 | 661-675 | 795 |
hHER2MA2-7B | 369-383 | 661-675 | 795 |
hHER2MA2-8B | 465-479 | 661-675 | 795 |
hHER2MA2-9B | 579-593 | 661-675 | 795 |
hHER2MA2-lY | 59-73 | 710-730 | 795 |
hHER2MA2-2Y | 103-117 | 710-730 | 795 |
hHER2MA2-3Y | 149-163 | 710-730 | 795 |
hHER2MA2-4Y | 210-224 | 710-730 | 795 |
hHER2MA2-5Y | 250-264 | 710-730 | 795 |
hHER2MA2-6Y | 325-339 | 710-730 | 795 |
hHER2MA2-7Y | 369-383 | 710-730 | 795 |
hHER2MA2-8Y | 465-479 | 710-730 | 795 |
hHER2MA2-9Y | 579-593 | 710-730 | 795 |
hHER2MA2-Z | 695-709 | 710-730 | 795 |
hHER2MA2-C | 653-667 | 632-652 | 795 |
hHER2MA2-BX | 695-709 | 661-675 | 795 |
hHER2MA2-AX | 695-709 | 632-652 | 795 |
hHER2MA2-4E | 210-224 | 5-25 | 795 |
hHER2MA2-6E | 325-339 | 5-25 | 795 |
hHER2MA2-8E | 465-479 | 5-25 | 795 |
hHER2MA5-4D | 210-224 | 632-652* | 666 |
hHER2MA5-6D | 325-339 | 632-652* | 666 |
149 hHER2MA5-8D hHER2MA6-C
465-479
632-652
666
653-667
632-652 702
Poloha epitopu označuje prvú a poslednú aminokyselinovú polohu epitopu vzhladom k východziemu bodu zrelého Her2. DÍžka znamená dĺžku aminokyselín úplného konštruktu. Vo všetkých prípravkov, okrem tých, ktorých pozícia je označená *, epitop nahradzuje úsek aminokyseliny s rovnakou dĺžkoú.
znamená, že epitop je skôr vložený do Her2, než aby substituoval jeho časť. Všetky vyššie uvedené konštrukty sú preto skrátené obdoby zrelého Her2, kde vynechaná časť je z C-konca.
Väčšina prípravkov existuje v rôznych obmenách, napríklad vo vektore pcDNA3.1+, vo fúzii s prírodnou signálnou peptidovou sekvenciou Her2, vo vektore pMT/BiP/V5-His-A ako fúzia s BiP hlavným peptidom pre expresiu v bunkách Drosophila a bez vedúcej sekvencie vo vektore pET28b pre expresiu v bunkách E. coli.
Nižšie sa opisujú modely, ktoré majú slúžiť pre screening a výber modifikovaných Her2 proteínov.
1. Indukcia protilátok v transgenetickej myši s potkaním Her2 a v králikoch vzhladom k potkaniemu a ľudskému Her2 sa bude skúmať konvenčnou technológiou ELISA po aspoň troch imunizáciách. Komerčne dostupné protilátky k ľudskému a potkaniemu Her2 budú použité ako pozitívne kontroly.
2. Tieto králičie protilátky sa použijú na štúdium predpokladanej inhibície rastu ľudských a transgenetikých myších nádorových buniek so zvýšenou expresiou Her2 v in vitro modeli.
3. T bunkové množenie PBL od pacientov imunizovaných tetanom
150 smerom k vybraným ľudským molekulám Her2 bude skúmané konvenčnými spôsobmi.
4. Schopnosť modifikovaných potkaních molekúl Her2 indukovať odozvy CTL v transgenetických myšiach s potkaním Her2 sa bude študovať použitím nádorov z týchto myší, ako cielov.
5. Zamýšľa sa syntéza vybranej sady peptidov, ktorá v transmembránovej oblasti ľudského Her2 zahrnuje P2 a P30 epitopy. Tieto peptidy sa budú testovať z hľadiska množenia PBL získaných z ludí dopredu imunizovaných tetanovým toxoidom, aby sa zistilo, či P2 a P30 epitopy sa môžu účinne spracovávať mimo sekvencie vnútri Her2 a prezentovať sa T bunkám.
6. Je dosť možné, že vybrané ľudské modifikované proteíny Her2 sa budú testovať na tvorbu neutralizačných protilátok v myši, ktorá sa geneticky vybaví tak, aby exprimovala len ludské VDJ gény. Taká myš je dostupná u spolupracujúcej firmy Abdenix, Fremont, CA, USA.
Boli opísané štyri dobre definované transgenetické myšie modely pre rakovinu prsníka, ktoré obsahujú potkaní onkogén Her2. Prvé tri skupiny transgenetických myší exprimujú aktivovaný onkogén Her2, zatial čo štvrtý model využíva neaktivovaný Her2. Všetky modely používajú MMTV promótor na riadenie expresie v prsníkových žľazách.
Rozhodli sme sa použiť dva modely transgenetických myší: 1) model agresívnejšieho nádoru opísaného Mullerom a spol., ktorý vyžíva aktivovaný onkogén Her2 (Muller et al, 1989) a 2) model menej agresívneho nádoru, v ktorom inaktivovaný Her2 tvorí ložisko nádorov prsníkovej žľazy s dlhou latenciou (Guy et al, 1992). Obidve skupiny transgenetických myší boli kúpené od Jackson a/alebo Charles Rivers Laboratories.
151
V počiatočných experimentoch sa tieto myši ponechajú, aby produkovali protilátky a CTL odozvy pomocou imunizácie a podporou modifikovanými potkaními Her2 proteínmi. Incidencia nádorov sa potom búde sledovať opísanými postupmi (Muller et al, 1989; Guy et al, 1992; Katsumata et al, 1995). Hladina protilátok sa zmeria ELISA analýzou. Aktivita CTL sa určí pomocou vytvorenia delových buniek exprimujúcich potkaní Her2, ako bolo uvedené vyššie.
Alternatívne sa pre pokusy pasívnej vakcinácie môže použiť model xenograftu karcinómu u holých myší. Holým myšiam sa môžu transplantovať ľudské nádory a ich inhibíciu sa je možné pokúsiť pasívnym prenosom séra z normálnych alebo humanizovaných myší imunizovaných modifikovanými Her2 proteínmi. Zatiaľ čo toto by mohlo byť užitočné pre štúdium úlohy protilátok na potlačenie nádorov, aktivitu CTL nie je možné v tomto systéme priamo merať.
.V druhom modeli in vivo by sa nádory v myšiach tiež vytvárali pomocou transplantácie bunkových línií z nádorov transgenetických myší opísaných vyššie. Bunkové línie generované z týchto myší by sa preniesli do odpovedajúceho druhu myší a boli by lokalizované podľa štandardných protokolov.
Prenos myších nádorových buniek so zvýšenou expresiou potkanieho Her2:
V tomto systéme sa budú bunky transfektovať potkaními génmi a prenesú sa do MHC kompatibilných myší. Inhibícia rastu nádoru by sa dosiahla vytvorením odoziev proti Her2.
V týchto systémoch modifikované Her2 proteíny by sa použili
152 ako vakcína v adjuvans pre vytvorenie protilátok a CTL odoziev.
DNA vakcinácia sa môže úspešne použiť v niekoľkých systémoch na zahájenie účinnej imunitnej odozvy. Priebežne sme sledovali prostriedky uvoľňovania DNA použitím modifikovaných vlastných proteínov. Našim zámerom je využiť prístup DNA vakcinácie na stanovenie účinkov modifikovaných Her2 konštruktov na inhibíciu nádorov v transgenetických myších modeloch rakoviny prsníka. Podobný prístup môže byť potom aplikovaný na liečenie tohoto ochorenia u ludí.
Príklad 3
Výroba vakcíny proti FGF8b
Nasledujúca časť popisuje ako je možné vyvinúť ludskú autovakcínu proti FGF8b modifikáciou molekuly vložením jedného alebo viacerých promiskuitných cudzích T bunkových epitopov, aby sa odkrylo pole imunogenizovaných „FGF8b molekúl. Prípravky sa budú testovať z hľadiska schopnosti indukovať protilátky, ktoré sú krížovo reaktívne s autentickými časťami molekuly FGF8b. Následne sa v niekoľkých skúškach in vitro a v živočíšnych modeloch in vivo vyhodnotí účinnosť rôznych 'konštruktov. Indukované protilátky sa budú testovať z hľadiska ich schopnosti aktivovať komplement klasickou cestou a iniciovať ADCC cez Fc-receptory. Nakoniec sa budú rôzne molekuly testovať v živočíšnych modeloch ľudskej rakoviny prostaty a prsníka.
153
Konštrukcia autovakcíny proti FGF8b
Vďaka úplnej identite myších a ľudských FGF8b polypeptidov sa všetky prípravky môžu použiť k experimentom tak u ľudí ako aj u myší.
Promiskuitný tetanový toxoid T pomocných bunkových epitopov P2 a P30 úspešne používaný v ludskej TNFa vakcíne sa vloží do FGF8b polypeptidu. Vzhľadom k malej veľkosti FGF8b budú prípravky vyrobené s jedným epitopom na molekulu. Iné promiskuitné T pomocné bunkové epitopy, ako je chrípkový hemoglutinínový epitop HA (307-319) a iné tu diskutované Tbunkové epitopy je možné tiež vziať do úvahy (O'Sullivan 1991).
Pripravili sa 4 rôzne imunogenizované FGF8b konštrukty s epitopmi rozmiestenými pozdĺž molekuly. Tieto štyri prípravky sa urobia na základe viacnásobných a párových zoradení FGF skupiny proteínov. Párové zoradenie FGF2 a FGF8b sa použije ako základ pre analýzu predpokladanej sekundárnej štruktúry v celej molekule FGF8b (t.j. β-sheet rozloženie). Zvyšky, ktoré sa zachovajú medzi FGF2 a FGF8b, netvoria klastry na žiadnom mieste trojrozmernej štruktúry, čo indikuje, že molekula nemá žiadne jednotlivé oblasti, ktoré nie je možné nahradiť bez zhubných účinkov na schopnosť posttranslačných úprav. Aminokyselinové zvyšky v FGF2, ktoré sú v jednej línií s cysteínovými zvyškami v FGF8b, sú trojrozmerne umiestnené veľmi tesne jeden k druhému, čo naznačuje, že tvoria v FGF8b disulfidovú väzbu, a že zoradenie je správne. Tiež sa počíta s flexibilitou Nkoncovej časti FGF2.
Obmena FGF8b s P30 epitopom v N-konci (F30N) sa navrhla,
154 aby nezostala medzera v zoradení aminokyselinových zvyškov FGF8b proteínu a P30 epitopu (sekv. id. č: 14) a na základe vyhodnotenia rôznych pozícii s ohladom na chemické vlastnosti každého aminokyselinového zvyšku. Uvažovali sa len N-koncové oblasti predpokladanej β-barrelovej štruktúry. V prípade F30N je podobných 9 z 21 zvyškov. S využitím tohoto pseudoalgoritmu je možné očakávať, že substitúciami dôjde k minimálnym zmenám celkovej štruktúry. Sekvencie štyroch rôznych prípravkov, rovnako ako aj trojrozmerné znázornenia nahradených aminokyselín ukazuje obr. 6.
Obmena FGF8b s epitopom P2 (sekv. id. č: 12) v C-konci (F2C) bola pôvodne navrhovaná ako F30N. Tam však už existuje predpokladaný dobrý epitop Kd v pozíciách 195-203. Preto sa P2 epitop vkladá presne do C-konca tohto epitopu. Do úvahy opäť prichádzajú len C-koncové oblasti predpokladanej βbarrelovej štruktúry.
Vnútorné obmeny FGF8b (F30I a F2I) boli konštruované nahradením vonkajších špirál v štruktúre FGF2 epitopmi P2 a P30, pričom β-barrelová štruktúrna podstata FGF zostane podía všetkého nezmenená.
Imunogenizované molekuly FGF8b boli exprimované v Eschericia coli, čo uľahčuje produkciu proteínov vo velkom merítku za minimálnu cenu. Aj keď FGF8b obsahuje dve potenciálne glykozylačné miesta (Asn31 a Asnl77), bakteriálne exprimovaný rekombinantný FGF8b sa ukázal ako biologicky aktívny (MacArthur, 1995a; Blunt, 1997).
čistenia a posttranslačnej úpravy boli pripravované v His označenej verzii, čo umožňuje väzbu k Ninabitej kolóne.
Pre uľahčenie obmeny FGF8b
155
Čistenie molekúl sa uskutočňuje využívaním vysokého kladného náboja proteínových molekúl alebo His značenia a refolding sa uskutoční štandardnými postupmi, ktoré počítajú s tvorbou disulfidových môstikov.
I
Štyri imunogenizované molekuly sa môžu tiež spoločne s divokým typom FGF8b cDNA vložiť do DNA vakcinačných vektorov.
Mapovanie a výber modifikovaných molekúl FGF8b
Štyri imunogenizované molekuly FGF8 boli exprimované v baktériách a následne sa čistili od inklúznych teliesok. Paralelne sa prípravky použijú ako DNA vakcíny. Rozdielne prípravky sa potom porovnajú z hladiska ich schopnosti indukovať rôzne účinky, ktoré sú žiadané pre liečbu pacientov s rakovinou prostaty a prsníka. Tento výskum sa uskutoční s využitím niekoľkých rozdielnych skúšok in vitro a in vivo. Experimentálne výsledky nakoniec vytvoria základ pre konečný výber jedného alebo dvoch kandidátov pre ľudskú FGF8b vakcínu.
Modely in vitro
Analýzy v systéme myšovitých
Myši rôznych haplotypov, ako aj králiky sa imunizujú rôznymi konštruktmi FGF8b v kompletnom Freundovom adjuvans a následne sa podporia aspoň dvakrát rovnakým antigénom emulzifikovaným v neúplnom Freundovom adjuvans. Tým sa môže porovnať schopnosť rôznych konštruktov narušiť B-bunkovú toleranciu. DNA vakcinácia sa uskutoční na iných živočíchoch s použitím prečistenej DNA v úplnom Freundovom adjuvans/
156 neúplnom Freundovom adjuvans intramuskulárnou injekciou v 14 denných intervaloch.
Vzorky séra sa získajú v niekoľkých časových etapách behom imunizačného rozvrhu a schopnosť rozdielnych konštruktov indukovať protilátky špecifické pre FGF8b sa určí konvenčnou ELISA metódou (Rochon, 1994). Komerčné polyklonové antisérum, ako aj komerčná monoklonová protilátka vyvolaná proti FGF8b (R&D) by sa použili pre pozitívnu kontrolu. Proteín FGF8b je komerčne dostupný (R&D), ale tiež sa bude vyrábať vedia s inými FGF8b konštruktmi a následným čistením/refolding. Tento produkt sa potom použije na potiahnutie platničiek v priamej ELISA metóde pre testovanie myšieho/králičieho séra imunizovaného obmenami FGF8b proteínu.
Cenným nástrojom pre skúmanie účinkov vakcinácie proti FGF8b bude rakovinná bunková línia závislá na FGF8b. Niekolko pozitívnych FGF8b rakovinných bunkových línií, napr. MCF-7 alebo SC-3 sa opisujú v literatúre. Taká myšia rakovinná bunková línia závislá na FGF8b bude identifikovaná použitím kvantitatívnej RT-PCR, experimentmi bunkového množenia a skúškami fosforylácie STAT-3.
Prítomnosť FGF8b viazaných na FGF receptor na bunkovom povrchu sa bude detegovať s protilátkami špecifickými na FGF8b v FACS alebo ELISA analýzach. Protilátky zamerané proti niekoľkým rôznym FGF receptorom sú komerčne dostupné (R&D).
Konštrukty budú porovnané s ohľadom na ich schopnosť indukovať protilátky schopné aktivovať komplementovú lýziu buniek produkujúcich/nesúcich FGF8b. Môže to byť detegované jednou z myších nádorových bunkových línií, ktorá má skôr opísanú expresiu FGF8b alebo alternatívne použitím buniek
157 osmoticky naplnených FGF8b. Séra z normálnych alebo transgenetických myši (viď ďalej) imunizovaných ľudskými FGF8b konštruktmi budú inkubované s bunkovou líniou a následne s čerstvým komplementom morčaťa. Protilátka sprostredkujúca komplementovú lýziu buniek môže byť detegovaná štandardnými postupmi. Schopnosť indukovaných protilátok sprostredkovať ADCC sa môže študovať meraním uvoľňovania 51Cr z označených buniek exprimujúcich FGF8b. Efektorovými bunkami budú PBMC zo syngenetických myší. Pre zavedenie skúšky môže byť vhodná myšia bunková línia schopná sprostredkováť ADCC (pozitívna ná Fc-receptory) ako efektorová bunka s protilátkou proti ludskému FGF8b.
Uskutočníme tiež skúšku šírenia nádoru, aby sa ukázalo, že kandidáti na FGF8b vakcíny nijak nepodporujú autoprotilátkou indukovaný rast nádoru. Vzorky séra z imunizovaných myší budú inkubované s FGF8b exprimujúceho nádorové bunky. Šírenie nádorových buniek sa potom môže detegovať podlá ich schopnosti inkorporovať 3H-tymidín, ktorý sa následne pridá k bunkám.
Pretože FGF8b je známy tým, že indukuje množenie radu buniek cicavcov, bude tiež potrebné vyskúšať rast podporujúce účinky rôznych proteínov. To sa môže uskutočnilo použitím proliferačných skúšok, ktoré použil Marsh, 1999.
Biologický účinok FGF8b na bunky cicavcov by sa mal neutralizovať autoprotilátkami. To je možné demonštrovať použitím rekombinantného FGF8b a napr. NIH3T3 v štúdiách množenia buniek (a ich morfologických zmien). Prídavok autoprotilátok by mal odstrániť transformačnú aktivitu FGF8b.
158
Imunizačný protokol
Počet živočíchov, ktorý sa zúčastní FGF8b autovakcinačného imunizačného experimentu, musí závisieť na očakávanej penentrácii choroby v modeli, a tým na počtu potrebnému na získanie štatisticky významnej informácie. Imunizačný protokol musí byť založený na skúsenosti, ktorú máme z projektu TNFa autovakcinácie. Rôzne imunizačné protokoly sa používali k imunizácii myší s rôznymi TNFa analógmi pré špecifické účely, ale najviac pokusov sa uskutočnilo s nasledujúcim protokolom:
1. Myši by sa mali individuálne označiť značkou buď v uchu alebo transpondérmi, 10 zvierat v každej klietke. Samce a samičky sa podlá všetkého musia vyhodnocovať oddelene, ale my v žiadnom prípade nebudeme mať obidve pohlavia v jednej a tej istej klietke. Zvieratá by sa mali ponechať v kľude aspoň 3 dni po transporte a,značkovaniu.
2. Antigén o koncentrácii 1 mg/ml v PBS pufri sa emulzifikuje s rovnakým objemom Freundovho kompletného antigénu (CFA) (Difco alebo Sigma). Emulzia sa kontroluje umiestnením kvapky emulzie na vodnú hladinu a sledovaním, či kvapka drží pohromade alebo disperguje. V miešaní sa pokračuje dokiaľ kvapka nedisperguje.
3. Štandardnou imunizačnou dávka je 100 pg antigénu y objeme 100 μΐ + 100 μΐ adjuvans. Tak celkový imunizačný objem je 200 μΐ, podávaný subkutánne (s.c.), do chrbta zvieraťa.
4. Podpory sa aplikovali v 2 - 3 týždenných intervaloch.
Podporný imunizačný materiál sa pripravuje presne rovnako ako imunizačný, ale použije sa Freundov neúplný adjuvans. Asi tri podporné dávky indukujú maximálny titer. A tak sa najvyššie titry získajú po 6 - 9 týždňoch od prvej imunizácie.
159
5. Krv sa odoberá kapilárne z oka v množstve 50 - 100 μΐ, obvykle pred prvou iminuzáciou a týždeň po každej podpore. Tiež sa môže použiť krv z chvosta a pre stanovenia titru môže stačiť 10 - 20 μΐ.
Počiatok imunizačného programu závisí na vývoji choroby a na prijatej stratégii. Pôvodne sme sa chceli pokúsiť vytvoriť maximálnu imunitu čo najskôr, ale je obtiažne zahájiť imunizácie skôr, ako vo veku asi 5 týždňov. Potom by sa mali vysoké titre udržovať podporou v 6 - 8 týždenných intervaloch, po troch počiatočných podporách. Je tu však potencionálny problém, ak je FGF8b potrebný pre normálný vývoj mladej myši, a to hovorí v prospech pozdnejšieho zahájenia imunizácie u dospelej myši.
Analýzy v ludskom systéme
Pri výbere medzi rôznymi FGF8b konštruktmi sa bude skúmať schopnosť ľudských buniek prezentujúcich antigén prezentovať vložené imunogénne T-bunkové epitopy ľudským T bunkám. To sa uskutoční použitím rovnakých in vitro skúšok pre P2 a P30, ako sa použili pre TNFa vakcínu. Ľudské T bunkové línie, ktoré sú špecifické pre P2 a P30, sa získajú od donorov vakcinovaných proti tetanu. Antigén prezentujúce bunky (PBMC) z tých' istých donorov sa budú inkubovať s rôznymi konštruktmi a pridajú sa T bunkové línie. Úroveň prezentácie vložených T bunkových epitopov sa potom môže porovnať meraním stimulácie T bunkových línií.
Živočíšne modely in vivo
Aspoň tri rozdielne systémy môžu byť použité pre monitorovanie, či sú indukované FGF8b protilátky schopné
160 riadiť na FGF8b závislý účinok in vivo.
Myšiam sa bude transplantovať myší FGF8 exprimujúci nádorové bunky a inhibícia progresie nádoru sa bude skúšať akutovakcináciou používajúcou modifikované FGF8b proteíny alebo FGF8b DNA vakcíny. Ideálny systém zahrnuje použitie buniek izolovaných z myších nádorov. Alternatívne použijeme iné bunkové línie myšovitých (napr. Balb/3T3) trvalo transfektovaných s FGF8b DNA v expresnom vektore.
Na experimenty s pasívnou vakconáciou sa použije model myšieho xenograftového karcinómu. Holým myšiam sa budú transplantovať ludské nádory a o inhibíciu nádorov sa budeme pokúšať prenosom séra z normálnych alebo humanizovaných myší imunizovaných modifikovanými FGF8b proteínmi alebo FGF8b DNA vakcínami. Mohlo by to byť veľmi užitočné pre štúdium schopnosti vyvolanie protilátok na potlačenie nádorov.
Iný prístup pre overenie koncepcie zahrnuje použitie myši transgenetickej pre FGF8b. U týchto myši, ktoré nesú FGF8b cDNA riadenú velmi špecifickým promótorom myšieho prsníkového nádorového vírusu (MMTV), sa ukázalo, že spontánne vyvíjajú FGF8b exprimujúci prsníkové nádory (Coombes, osobná diskusia). Autovakcinácia týchto myší rôzne obmenenými FGF8b proteínmi alebo FGF8b DNA vakcínami nám ukáže, či autovakcína umožní myši potlačiť alebo odmietnuť nádory.
Možnou cestou pre overenie koncepcie by bolo použitie Wnt-1 transgenetickej myši (MacArthur, 1995c). O indukcii rakoviny prsníku vírusom MMTV sa uvádza, že aktivuje expresiu FGF8 vo viac ako polovine myších vyvíjajúcich sa nádorov. Závislosť nádorov na FGF8b by sa mohla zaviesť, keď naša autovakcína (autovakcíny) potlačí výskyt alebo rýchlosť rastu nádorov.
161
Skutočnosť, že transgenetické myši často vykazujú nefyziologické imunologické obrazy tolerancie, neovplyvní príliš tento projekt, pretože FGF8b polypeptidy sú u ľudí a myší identické.
Keby sa nakoniec ukázal priaznivý účinok FGF8b imunizácie na myšom modeli a vybrali sa vhodný kandidáti pre ľudskú vakcínu, bolo by možné uskutočniť obmedzený počet toxikologických štúdii. Pre získanie konečného potvrdenia koncepcie sa môžu následne uskutočniť vakcinačné štúdie u pacientov s rakovinou prsníka a prostaty.
Významné je to, že v prípade pozitívnych výsledkov experimentov na modeloch in vivo, sa na základe dostupných údajov zostaví viacej mutantov.
Príklad 4
Príprava analógu MUC-1
Pripravila sa len jedna autovakcinačná molekula MUC-1. Ta obsahuje celkom deväť opakovaní mucínu, z ktorých každé má sekvenciu sekv. id. č: 33. Prípravok začína tromi týmito sekvenciami, , nasleduje P2 epitop, tri ' ďalšie mucínové sekvencie, P30 epitop a ukončujú ho tri mucínové sekvencie.
Prípravok sa pripravil s N-koncom označeným UNI-HIS (sekv. id. č: 23) alebo bez neho. Obidve varianty boli exprimované v E. coli. Identita exprimovaných proteínov sa potvrdila tak Western blotting ako aj N-koncovým sekvenovaním. Proteín sa exprimujú v rozpustnej forme, ale ako dimér, čo je trochu prekvapujúce.
162 f
HIS označená MUC-1 molekula sa prečistila kovovou afinitnou chromatografiou. Množstvo čistého proteínu a jeho čistota nie sú v súčasnosti známe.
Príklad 5
Narušenie autotolerancie v modelovom systéme myšovitých
V CTL experimentoch, v ktorých sa myši imunizujú dendritickými bunkami pulzujúcimi s epitopmi tak triedy I ako aj triedy II, bola predbežne vykázaná zvýšená CTL indukcia, keď sa imunizujú ako aj restimulujú in vitro peptidom triedy
I a triedy II, v porovnaní s imunizáciou a restimuláciou iba s epitopom triedy I. Táto situácia je porovnateľná s imunizáciou autovakcínou, u ktorej sa cudzí epitop triedy
II vloží do vlastného proteínu. Absorpcia a spracovanie týchto molekúl špecializovanými bunkami prezentujúcimi antigén, napríklad dendritickými bunkami, vedie k prezentácii cudzieho epitopu triedy II spoločne s niektorými vlastným epitopmi triedy I. Je známe, že je možné vyvolať autoreaktívne CT lymfocyty, ale prítomnosť cudzích pomocných epitopov triedy II môže velmi pravdepodobne zvýšiť túto CTL indukciu.
Potenciálna výhoda predkladaného vynálezu spočívajúca v indukcii vlastných reaktívnych CTL sa v súčasnosti skúma vo vaječnom albumíne transgenetických myši. Existujú štyri rôzne transgenetické línie s rozdielnou úrovňou expresie vaječného albumínu a tolerančných stavov, porovnaj Kurts C et alz J. Exp. Med. 186 (1997), 239-245, ktorý opisujú RIP-mOVA transgenetické myši (exprimujúce vaječný albumín v pankrease, obličke a týmuse, a ktoré majú vysoký stupeň tolerancie)
163 a Kurts C et al: J. Exp. Med. 188 (1998), 409-414, opisujúci RIP-0VAnízky a RIP-OVAvysoký transgenetické myší s nízkou a vysokou expresiou vaječného albumínu. Posledná línia, RIP0VAstredný, ktorá exprimuje vaječný albumín na prostrednej úrovni sa získala od Dr. Williama R. Heatha, spoluautora dvoch vyššie uvedených odkazov.
V tele sa vyskytujú rôzne stupne tolerancie voči rôznym antigénom. Jeden z najmenších stupňov tolerancie sa našiel vo veľkom množstve na cirkulujúcich antigénoch. Tieto antigény všetky vstúpia do týmusu, kde sa odstránia vlastné reaktívne T-bunky. Tieto antigény spadajú pod „centrálnu toleranciu. Na druhej strane tkanivovo špecifické antigény nevstupujú priamo do týmusu a sú obecne pod „periférnou toleranciou, ktorá sa napríklad prejavuje T-bunkovou anergiou.
Vyrábajú sa dva autovakcinačné prípravky vaječného albumínu. Obidve sa vzťahujú k sekvencií s prístupovým č: J00845 v EMBL, kde sa sekvencie z P30 (sekv. id. č: 14) vkladajú do dvoch rôznych pozícií.
V prípravku „0VA3.1 sa P30 vkladá do pozície odpovedajúcej aminokyseline č. 272-292 vo vaječnom albumíne. V prípravku „OVA3.2 sa P30 vkladá do pozície odpovedajúcej aminokyseline č. 321-341 vo vaječnom albumíne. Tieto prípravky sa vložili do vektora pVaxl a použili k DNA imunizácii.
Myši sa imunizujú intradermálne raz, každá so 100 pg DNA. Tri týždne po tejto imunizácii sa odstráni slezina a urobia sa CTL skúšky s použitím delových buniek exprimujúcich dominantný epitop vaječného albumínu SIINFEKL a zmiešaný peptid FILKSINE ako kontrola. Imunizácie podlá očakávania poskytujú zreteľnú indukciu CTL v divokom type C57BL/6 myší,
164 pretože tak vaječný albumín, ako aj P30 sú v týchto myšiach cudzie.
Teraz máme v úmysle imunizovať 4 línie vaječných albumínových transgenetických myší týmito autovakcinačnými konštruktmi. RIP-OVAnizky, RIP-OVAstredný a RIP-OVAvysoký exprimujú zvyšujúce sa množstvá vaječného albumínu a majú rôzne stupne tolerancie a ako už bolo povedané, RIP-mOVA má vysoký stupeň tolerancie.
V týchto štyroch líniách transgenetických myší bude cudzí len P30. Vaječný albumín je u týchto myší vlastným antigénom, a preto sa jedná o pravú autovakcináciu pre indukciu CTL voči vaječnému albumínu.
Predbežné výsledky získané pre myši RIP-OVAnizky, ktoré majú najnižší stupeň „periférnej tolerancie k vaječnému albumínu, ukazujú, že tak vaječný albumín s vloženým P30 ako aj prírodné sa vyskytujúce molekuly vaječného albumínu sú schopné indukovať odozvy CTL - očakáva, sa, že len transgenetické myši majúce vysoký stupeň tolerancie budú schopné pozdvihnúť odozvu CTL proti modifikovaným molekulám vaječného albumínu a nie proti prírodnej forme.
Zoznam publikácii
Ago H et al. (1991) J. Biochem (Tokyo), 110, 360-3
Abdel-Nabi H et al. (1992) Sem. Urol. 10, 45-54
Acevedo et al. (1995) Cancer 76, 1467-1475
Acavedo et al. (1997) Cancer Detect. Prev. 21, 295-303 Adelstein S et al. (1991) Science 251, 1223-1225
Babian RJ et al. (1994) J. Urol. 152, 1952-1955 Bernard JA et al. (1995) Gastroenterol. 108 (2) 564-580
165
Bier H et al. (1995) Eur. Árch. Otorhinolaryngol. 252 (7)
433-439
Bouchard L et al. (1989) Celí 57 (6) 931-36
Blaber M et al. (1996) Biochemistry 35, 2086-94
Blunt AG et al. (1997) J. Biol. Chem. 272, 3733-8
Boring CC et al. (1993) CA Cancer J. Clin. 43, 7-26
Boucher et al. (1995) Hum. Pathol. 26, 1201-1206
Callahan R (1996) Breast Cancer Res. Treat. 39, 33-44 Carter RE (1996) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93, 749-753 Chang et al. (1981) Fertil. Steril. 36, 659-663
Chantry A (1995) J. Biol. Chem. 270 (7) 3068-73
Crossley PH et al. (1996b) Celí 84, 127-36
Crossley PH et al. (1995) Development 121, 439-51
Crossley PH, Martinez, S. and Martin, G.R. (1996a) Midbrain development induced by FGF8 in chick embryo. Náture 380, 66-8
Dean C et al. (1994) Int. J. Cancer, suppl 8, 103-107
Dillioglugil Q et al. (1995) Eur. Urol. 28, 85-101
Doi et al. (1996) Int. J. Cancer 65, 454-459
Douglas TH et al. (1995) J. Surg. Oncol. 59 (4) 246-250 .
Earp HS et al. (1995) Breast Cancer Res. Treat 35 (1) 115-32
Eccles SA (1994) Invasion Metastasis 14 (1-6) 337-48
Eppenberger U et al. (1994) J. Neurooncol. 22 (3) 249-54
Dorkin TJ et al. (1999) Oncogene 18, 2755-2761
Eriksson AE et al. (1993) Protein. Sci. 2, 1274-84
Fernadez-Teran M et al. (1997) Dev. Biol. 189, 246-55
Fujii K et al. (1995) Exp. Celí. Res. 216 (1) 261-72
Furst J et al. (1994) Urol. Res. 22, 107-113
Furthauer et al. (1997) Development 124, 4253-64
Geissler et al. (1997) Lab. Invest. 76, 859-871
Gemel J et al. (1996) Genomics 35, 253-7
Ghosh AK et al. (1996) Celí Growth Differ 7, 1425-34
Goldfarb M et al. (1996) Cytokine Growth Factor Rev 7, 311166
325 | ||
Goodnow CC | et | al |
Goodnow CC | et | al |
Greenberg | NM | et |
(1988) Náture 334, 676-682 (1991) Náture 352, 532-536 il. (1995) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 92
3439-3443
Guy CT et al. (1992) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89, 10578-82
Heikinheimo M et al. (1994) Mech. Dev. 48, 129-138
Henttu P and Vihko P (1989) Bioch. Biophys. Res. Com. 160
903-910
Hop TP and Woods KR (1983) Mol. Immunol. 20, 483-489 Horoszewicz JSH et al. (1983) Cancer Res. 43, 1803-1818 Horoszewicz JSH et al. (1987) Anticancer Res. 7, 927-936 Hishikawa M et al. (1998) Biochem. Biophys. Res. Com. 244
258
'-191 | al. | (1996) | Cytokine Growth | Factor Rev. 7, | |
I | et | ||||
RS | et | al. | (1994) | Cancer Res. 54, | 1807-1811 |
RS | et | al. | (1993) | Cancer Res. 53, | 227-230 |
RS | ét | al. | (1994) | Cancer Res. 54, | 6306-6310 |
Jacoby et al. (1984) Adv. Immunol. 35, 157-208
Johnosn RL and Tabin CJ (1997) Celí 90, 979-990
Kahn D et al. (1994) J. Urol. 152, 1490-1495
Kapoun AM and Shackleford GM (1997) Oncogene 14, 2985-9 Kettunen P and Thesleff I (1998) Dev. Dyn. 211, 256-268 Koga M et al. (1995) J. Steroid Biiochem. Mol. Biol. 54, 1-6 Kouhara H et al. (1994) Oncogene 9, 455-462
Kozák M (1991) J. Celí Biol. 115, 887-903
Lapthorn et al. (1994) Náture 369, 455-461
Lazar et al. (1995) Cancer Res. 55, 3735-3738
Leek J et al. (1995) British j. Cancer 72, 583-588
Leung HY et al. (1996) Oncogene 12, 1833-1835
Lopes AD (1990) Cancer Res. 50, 6423-6429
Loric S et al. (1995) Clin. Chem. 41 (12) 1698-1704
167
Lupu R et al. (1995) Semin. Cancer. Biol. 6, 135-145
MacArthur CA et al. (1995a) Celí Growth Differ. 6, 817-825
MacArthur CA et al. (1995b) Development 121, 3603-3613
MacArthur CA et al. (1995c) J Virol 69, 2501-7
Manabe et al. (1985) Gastroenterology 89, 1319-1325
Marsh SK et al. (1999) Oncogene 18, 1053-1060
Martin L et al. (1993) J. Immunol. 150 (49) 1234-43
Mattei MG et al. (1995) Mamm Genome 6, 196-197
McDonnell WM and Askari FD (1996) New Engl. J. Med. 334, 4245
Meyers EN et al. (1998) Nat. Genet 18, 136-141
Milich DR et al. (1994) J. Immunol. 153 (1) 429-435
Milner PG et al. (1989) Biochem Biophys. Res. Comm. 165, 1096-1103
Miyashita Y et al. (1994) Jpn. J. Cancer Res. 85, 1117-1123 (1993a) Br. J. Cancer 67 (2) 254-261 (1993b) Celí. Biophys. 22 (1-3) 129-146 (1996) Br. J. Cancer 73 (2) 228-235
Moy FJ et al. (1996) Biochemistry 35, 13552-13561 Muller WJ et al. (1988) Celí 54 (1) 105-115 (1996) Prostate 28, 266-271 (1995) Prostate 26, 164-168 (1995) Anticancer Research 15 (4) 1473-79 :1990) Clin. Chem. 35, 1450-1455
Nonomura N et al. (1990) Cancer Res. 50, 2316-21 O'Sullivan D et al. (1991) J. Immunology 147, 2663-9 Ohnishi Y et al. (1995) Br. J. Cancer 71 (5) 969-73 Ohuchi H et al. (1997a) Development 124, 2235-44 Ohuchi H et al. (1997b) Mech. Dev. 62, 3-13
Ohuchi H et al. (1994) Biochem Biophys Res. Commun. 204, 8828
Payson RA et al. (1996) Oncogene 13, 47-53
Pillai et al. (1996) FEBS Lett. 387, 23-26
Modjtahedi H et al. Modjtahedi H et al. Modjtahedi H et al.
Murphy GP et al. Murphy GP et al. Murphy GP et al. Nguyen L et al.
168
Pollard M and Luckert PH (1994) Anticancer Res. 14, 901-903 Prigent SA and Lemoine NR (1992) Progress in Growth Factor
Research 4, 1-24
R&D focus, Drug News (1966) 5, 21, 9 1
Rammensee H-G et al. (1995) Immunogenetics 41, 178-228 Regelson W (1995) Cancer 76, 1299-1301
Rieš LAG et al. (1996) SEER Cancer Statistics Review, 1973 1993: Tables and Graphs, National Cancer Inštitúte,
Bethesda, MD
Rinker-Schaeffer CW et al. (1995) Genomics 30 (1) 105-108
Rochon YP et al. (1994) Prostate 25, 219-223
Rock KL et al. (1996). Vaccine 14, 1560-1568
Rock KL and Clark K (1996) J. Immunol. 156, 3721-3726
Rudra-Ganguly N et al. (1998) Oncogene 16, 1487-92
Salomon DS et al. (1995) Critical reviews in
Oncology/Hematology 19, 183-232
Sato B et al. (1993) J. Steroid Biochem. Mol. Biol. 47, 91-98 Schlegel J et al. (1994) J. Neurooncol. 22 (3) 249-254
Schmitt JF et al. (1996) J. Steroid Biochem. Mol. Bio. 57,
173-178
Sheaff et al. (1996) J. Clin. Pathol. 49, 329-332
Sherman L et al. (1998) Genes Dev. 12, 1058-71
Shimamura K and Rubenstein JL (1997) Development 124, 27092718
Shirai A and Klinman DM (1993) AIDS Res. Hum. Retroviruses 9, 979-983
Sokoloff M et al. (1996) Cancer 77 (9) 1862-1872
Steinhoff U et al. (1994) Eur. J. Immunol. 24 (3) 773-776
Stevens VC (1986) Ciba Found. Symp. 119, 200-225 Su SL et al. (1995) Cancer Res. 55, 1441-1443
Syrigos | et | al. | (1998) | 1 Gut | 42, | 88-91 |
Talwar | et | al. | (1976) | PNAS | 73, | 218-222 |
Talwar | et | al. | (1994) | PNAS | 91, | 8532-8536 |
169
Tanaka A et al. (1992) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89, 89288932
Tanaka A et al. (1998) Cancer Research 58, 2053-2056
Tanaka A et al. (1995) FEBS Lett. 363, 226-230
Thomas H et al. (1996) Br. J. Cancer 73 (1) 65-72
Tjoa B et al. (1996) Prostate 28, 65-69
Tjoa B et al. (1995) Prostate 27, 63-69
Tokunaga A et al. (1995) Cancer 75 (6 suppl.) 1418-1425 Tosi E et al. (1995) Int. J. Cancer 62 (5) 643-650 Triozzi et al. (1994) Int. J. One. 5, 1447-1453 Troyer JK et al. (1995) Int. J. Cancer 62, 552-558 Valone FH et al. (1995) J. Clin. Oncol. 13 (9) 2281-2292 Valve E et al. (1997) Biochem Biophys Res. Commun. 232, 173177 van Dam PA et al. (1994) J. Clin. Pathol. 47 (10) 914-919 Weiner LM et al. (1995) Cancer Res. 55 (20) 4586-4593 Wright GL Jr et al. (1996) Urology 48, 326-334
Wu J et al. (1997) J. Steroid Biochem. Mol. Biol. 62, 1-10
Wu X, Fan Z, Masui H, Rosen N, Mandelsohn J. : Apoptosis induced by an anti-epidermal growth factor receptor monoclonal antibody in a human colorectal carcinoma celí line and its delay by insulin
Wynant GE et al. (1991) Prostate 18, 229-241
Xu X et al. (1998) Development 125, 753-765
Yamanishi H et al. (1995) J'. Steroid Biochem. Mol. Biol. 52, 49-53
Yoshimura K et al. Yoshimura K et al.
Yogeeswaran and Salk (1981) Science 212, 1514-1516 Yokoyama H et al. (1998) Dev. Biol. 196, 1-10 (1996) Cancer Lett 103, 91-97 (1997) Am. J. Med. Genet. 72, 354-362
Yung RA and Davis RW (1983) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 80, 1194-1198
Zhang JD et al. (1991) [published erratum appears in Proc.
170
Natl. Acad. Sci USA 88 (12): 5477], Proc. Natl. Acad
Sci. USA 88, 3446-3450
Zhu Z et al. (1995) Int. J. Cancer 62 (3) 319-324
Zhu X et al. (1991) Science 251, 90-93
171
ZOZNAM SEKVENCII <110> M&E Biotech A/S STEINAA, Lucilla NIELSEN, Klaus Gregorius DALUM, Iben HAANING, Jesper LEÁCH, Dana .BIRK, Peter MOURITSEN, Soren GAUTAM, Anand KARLSSON, Gunilla <120> NOVÉ SPÔSOBY TERAPEUTICKEJ VAKCINÁCIE <130> 22113 PC 1 <140>
<141>
<160> 33 <170> Patentln Ver. 2.1 <210> 1 <211> 2253 <212> DNA <213> Horno sapiens <220>
<221> CDS . .
<222> (1)..(2253) <220>, <221> misc_feature <222> (58)..(2253) <223 > Ľudská PSM' <220> ' .
<221> misc^feature <222> (4). . .(6) , ,, <223> Ggt alebo tgg kódujúci Gly, resp. Trp <400> 1 atg ggt aat ctc ctt cac gaa acc gac tcg get gtg gcc acc gcg ege
172
Met Gly 1 - | Asn | Leu | Leu His 5 | Glu Thr Asp | Ser 10 | Ala.Val | Ala | Thr | Ala 15 | Arg | ||||||
cgc | ccg | cgc | tgg | ctg | tgc | get | ggg | gcg | ctg | gtg | ctg | gcg | ggt | ggc | ttc | 96 |
Arg | Pro | Arg | Trp | Leu | Cys | Ala | Gly | Ala | Leu | Val. | Leu | Ala | Gly | Gly | Phe | |
20 | 25 | 30 | ||||||||||||||
ttt | ctc | ctc | ggc | ttc | ctc | ttc | ggg | tgg | ttt | ata | aaa | tcc | tcc | aat | gaa | 144 |
Phe | Leu | Leu | Gly | Phe | Leu | Phe | Gly | Trp | Phe | íle | Lys | Ser | Ser | Asn | Glu | |
35 | 40 | 45 | ||||||||||||||
get | act | aac | att | act | cca | aag | cat | aat | atg | aaa | gca | ttt | ttg | gat | gaa | 192 |
Ala | Thr | Asn | íle | Thr | Pro | Lys | His | Asn | Met | Lys | Ala | Phe | Leu | Asp | Glu | |
50 | 55 | 60 | ||||||||||||||
ttg | aaa | get | gag | aac | atc | aag | aag | ttc | tta | tat | aat | ttt | aca | cag· | ata | 240 |
Leu | Lys | Ala | Glu | Asn | íle | Lys | Lys | Phe | Leu | Tyr | Asn | Phe | Thr | Gin | íle | |
65 | 70 | 75 | 80 | |||||||||||||
cca | cat | tta | gca | gga | aca | gaa | caa | aac | ttt | cag | ctt | gca | aag | caa | att | 288 |
Pro | His | Leu | Ala | Gly | Thr | Glu | Gin | Asn | Phe | Gin | Leu | Ala | Lys | Gl'n | íle | |
85 | 90 | 95 | ||||||||||||||
.caa | tcc | cag | tgg | aaa | gaa | ttt | ggc | ctg | gat | tct | gtt | gag | cta | gca | cat | 336 |
Glň | Ser | Gin | Trp | Lys | Glu | Phe | Gly | Leu | Asp | Ser | Val | Glu | Leu | Alá | His | |
100 | 105 | 110 | ||||||||||||||
tat | gat | gtc | ctg | ttg | tcc | tac | cca | aat | aag | act | cat | ccc | aac' | tac | atc | 384 |
Tyr | Asp | Val | Leu | Leu | Ser | Tyr | Pro | Asn | Lys | Thr | His | Pro | Asn | Tyr | íle | |
115 | 120 | 125 | ||||||||||||||
tca | ata | att | aat | gaa | gat | gga | aat | gag | att | ttc | aac | aca | tca | tta | ttt | 432 |
Ser | íle | íle | Asn | Glu | Asp | Gly | Asn | Glu | íle | Phe | Asn | Thr | Ser | Leu | Phe | |
130 | 135 | 140 | ||||||||||||||
gaa | cca | cct | cct | cca | gga | tat | gaa | aat | gtt | tcg | gat | att | gta | cca | cct | 480 |
Glu | Pro. | Pro | Pro | Pro | Gly | Tyr | Glu | Asn | Val | Ser | Asp | íle | Val | Pro | Pro ' | |
.145 | 150 | 155 | 160 | |||||||||||||
ttc | agt | get | ttc | tct | cct | caa | gga | atg | cca | gag | ggc | gat | cta | gtg | tat | 528 |
Phe | Ser | Alá | Phe | Ser | Pro | Gin | Gly | Met | Pro | Glu | Gly | Asp | Leu | val | Tyr | |
165 | 170 | 175 | ||||||||||||||
gtt | aac | tat | gca | ega | act | gaa | gac | ttc | ttt | aaa | ttg | gaa | cgg | gac | atg | 57 6 |
Val | Asn | Tyr- | Ala | Arg | Thr | . Glu | Asp | Phe | Phe | Lys | Leu | Glu | •Arg | Asp | Met |
173
180 185 190
aaa atc aat | tgc Cys | tct Ser | ggg aaa | att íle 200 | gta Val | att íle | gcc . Ala | aga tat ggg | aaa Lys | gtt Val | 624 | |||||
Lys | íle Asn 195 | Gly | Lys | Arg | Tyr 205 | Gly | ||||||||||
ttc | aga | gga | aat | aag | gtt | aaa | aat | gcc | cag | ctg | gca | ggg | gcc | aaa | gga | 672 |
Phe | Arg. | Gly | Asn | Lys | Val | Lys | Asn | Ala | Gin | Leu | Ala | Gly | Ala | Lys | Gly | |
210 | 215 | 220 | ||||||||||||||
gtc | att | ctc | tac | tcc | gac | cct | get | gac | tac | ttt | get | cct | ggg | gtg | aag | 720 |
Val | íle | Leu | Tyr | Ser | Asp | Pro | Ala | Asp | Tyr | Phe | Ala | Pro | Gly | Val | Lys | |
225 | 230 | 235 | 240 | |||||||||||||
tcc | tat | cca | gat | ggt | tgg | aat | ctt | cct | gga | ggt | ggt | gtc | cag | cgt | gga | 768 |
Ser | Tyr | Pro | Asp | Gly | Trp | Asn | Leu | Pro | Gly | Gly | Gly | Val | Gin | Arg | Gly | |
245 | 250 | 255 | ||||||||||||||
aat | atc | cta | aat | ctg | aat | ggt | gca | gga | gac | cct | ctc | aca | cca | ggt | tac | 816 |
Asn | íle | Leu | Asn | Leu | Asn | Gly | Ala | Gly | Asp | Pro | Leu | Thr | Pro | Gly | Tyr . | |
260 | 265 | 270 | ||||||||||||||
cca | gca | aat | gaa | tat | get | tat | agg | cgt | gga | att | gca | gag | get | gtt | ggt | 864 |
Pro | Ala | Asn | Glu | Tyr | Ala | Tyr | Arg | Arg | Gly | íle | Ala | Glu | Ala | Val | Gly | |
275 | 280 | 285 | ||||||||||||||
ctt | cca | agt | att | cct | gtt | cat | cca | att | gga | tac | tat | gat | gca | cag | aag | 912 |
Leu | Pro | Ser | íle | Pro | Val | His | Pro | íle | Gly | Tyr | Tyr | Asp | Ala | Gin | Lys | |
290 | 295 | 300 | ||||||||||||||
ctc | cta | gaa | aaa | atg | ggt | ggc | tca | gca | cca | cca. | gat | . agc | agc | tgg | aga | 960 |
Leu | Leu | Glu | Lys | Met | Gly | Gly | Ser | Ala | Pro. | Pro | Asp | Ser | Ser | Trp | Arg | |
305 | 310 | 315 | 320 | |||||||||||||
gga | agt | ctc | aaa | gtg | ccc | tac | aat | gtt | gga | cct | ggc | ttt | act | gga | aac | 1008 |
Gly | Ser | Leu | Lys | Val | Pro | Tyr | Asn | Val | Gly | ' Pro | Gly | Phe | Thr | Gly | Asn | |
325 | 330 | 335 | ||||||||||||||
ttt | tct | aca | caa | aaa | gtc | aag | atg | cac | atc | cac | tct | acc | aat | gaa | gtg | 1056 |
Phe | Ser | Thr | Gin | Lys | Val | Lys | Met | His | íle | His | Ser | Thr | Asn | Glu | Val | |
340 | 345 | 350 | ||||||||||||||
aca | aga | att | tac | aat | gtg | ata | ggt | act | ctc | aga | gga | gca | .gtg | gaa | cca | 1104 |
Thr | Arg | íle | Tyr | Asn | Val | íle | Gly | Thr | Leu | Arg | Gly | Ala | Val | Glu | Pro | |
355 | 360 | 365 | ||||||||||||||
gac | aga | tat | gtc | att | ctg | gga | ggt | cac | cgg | gac | tca | tgg | gtg | ttt | ggt | 1152 |
Asp | Arg | Tyr | Val | íle | Leu | Gly | Gly | His | Arg | Ásp | ' Ser | Trp | Val | Phe | Gly | |
370 | 375 | 380 |
174
ggt Gly 385 | att íle | gac cct | cag Gin | agt Ser 390 | gga Gly | gca get Ala Ala | gtt Val | g t ť. Val 395 | cat His | gaa Glu | att íle | gtg Val | agg Arg 40Ô . | 1200 | |
Asp | Pro | ||||||||||||||
age | ttt | gga | aca | ctg | aaa | aag | gaa ggg | tgg | aga' | cct | aga | aga | aca | att | 1248 |
Ser | Phe | Gly | Thr | Leu | Lys | Lys | Glu Gly | Trp | Arg | Pro | Arg | Arg | Thr | íle | |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
ttg | ttt | gca | age | tgg. | gat | gca | gaa gaa | ttt | ggt | ctt. | ctt | ggt | tet | act | 1296 |
Leu | Phe | Ala | Ser | Trp | Asp | Ala | Glu Glu | Phe | Gly | Leu | Leu | Gly | Ser | Thr | |
420 | 425 | 430 | |||||||||||||
gag | tgg | gca | gag | gag | aat | tca | aga ctc | ctt | caa | gag | cgt | ggc | gtg | get | 1344 |
Glu | Trp | Ala | Glu | Glu | Asn | Ser | Arg Leu | Leu | Gin | Glu | Arg | Gly | Val | Ala | |
435 | 440 | 445 | |||||||||||||
tat | att | aat | get | gac | tca | tet | ata gaa | gga | aac | tac | act | ctg' | aga | gtt | 1392 |
Tyr | íle | Asn | Ala | Asp | Ser | Ser | íle .Glu | Gly | Asn | Tyr | Thr | Leu | Arg | Val | |
450 | 455 | 460 | |||||||||||||
gat | tgt | aca. | ccg | ctg | atg | tac | age ttg | gta | cac | aac | cta | aca | aaa | gag | 1440 |
Asp | Cys | Thr | Pro | Leu | Met | Tyr | Ser Leu | Val | His | Asn | Leu | Thr | Lys | Glu | |
465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
ctg | aaa | age | cct | gat | gaa | ggc | ttt gaa | ggc | aaa | tet | ctt | tat | . gaa | agt | 1488 |
Leu | Lys | Ser | Pro | Asp | Glu | Gly | Phe Glu | Gly | Lys | Ser | Leu | Tyr | Glu. | Ser | |
485 | 490 | 495 | |||||||||||||
tgg | act | aaa | aaa | agt | cct | tcc | cca gag | ttc | agt | ggc | atg | ccc | agg | ata | 1536 |
Trp | Thr | Lys | Lys | Ser | Pro | Ser | Pro Glu | Phe | Ser | Gly | Met | Pro | Arg | íle | |
500 | 505 | 510 | |||||||||||||
age | aaa | ttg | gga | tet | gga | aat | gat ttt | gag | gtg | ttc | ttc | caa | ega | ctt | 1584 |
Ser | Lys | Leu | Gly | Ser | Gly | Asn | Asp Phe | Glu | Val | Phe | Phe | Gin | Arg | Leu . | |
' 515 | 520 | 525 | |||||||||||||
gga | att | get | tca. | ggc. | aga | gca | cgg tat | act | aaa | aat | tgg | gaa | aca | aac | 1632 |
Gly | íle | Ala | Ser | Gly | Arg | Ala | Arg Tyr | Thr | Lys | Asn | Trp | Glu | Thr | Asn | |
530 | 535 | 540 | |||||||||||||
aaa | ttc | age | ggc | tat | cca | ctg | tat cac. | agt. | gtc- | tat | .gaa | aca | tá t | gag | 1680 |
Lys | Phe | Ser | Gly | Tyr | Pro | Leu | Tyr His | Ser | Val | Tyr' | Glu | •.Thr | Tyr | Glu . | |
545: | 550 | 555 ' | 560 | ||||||||||||
ttg | gtg | gaa | aag | ttt | tat | gat | cca atg | ttt | aaa | tat | cac | ctc | act | gtg | 1728 |
Leu | Val | Glu | Lys | Phe | Tyr | Asp | Pro . Met | Phe | Lys | Tyr | His | Leu | Thr | Val | |
565 | 570 | 575 |
175
gcc Ala. | cág gtt | ega Arg 580 | gga Gly | ggg Gly | atg gtg | ttt Phe 585 | gag Glu | cta gcc aat | tcc Ser 590 | ata íle | gtg Val | 1776 | ||||
Gin | Val | Met | Val | Leu | Ala Asn | |||||||||||
ctc | cct | ttt | gat | tgt | ega | gat | tat | get | gta | gtt | tta | aga | aag . | tat | get | 1824 |
Leu | Pro | Phe | Asp | Cys. | Arg | Asp | Tyr | Ala | Val | Val | Leu | Arg. | Lys | Tyr. | Ala | |
595 | 600 | 605 | ||||||||||||||
gac | aaa | atc | tac | agť | att | tet | atg | aaa | cat | cca | cag | gaa | atg | aag | aca | 1872 |
Asp | Lys | íle | Tyr | Ser | íle | Ser | Met | Lys | His | Pro | Gin | Glu | Met | Lys | Thr | |
610 | 615 | 620 | ||||||||||||||
tac | agt | gta | tca | ttt | gat | tca | ctt | ttt | tet | gca | gta | aag | aat | ttt | aca | 1920 |
Tyr'. | Ser | Val | Ser | Phe | Asp | Ser. | Leu | Phe, | Ser | Ala | Val | Lys | Asn | Phe' | Thr | |
625 | 630 | 635 | 640 | |||||||||||||
gaa | att | get | tcc | aag | ttc | agt | gag | aga | ctc | cag | gac | ttt | gac | aaa | age | 1968 |
Glu | íle | Ala | Ser | Lys | Phe | Ser | Glu | Arg | Leu | Gin | Asp | Phe | Asp | Lys | Ser | |
645 | 650 | 655 | ||||||||||||||
aac | cca | ata | gta | tta | aga | atg | atg | aat | gat | caa | ctc | atg | ttt | ctg | gaa | 2016 |
Asn | Pro | íle | Val | Leu | Arg | Met | Met | Asn | Asp | Gin | Leu | Met | Phe | Leu | Glu | |
660 | 665 | 670 | ||||||||||||||
aga | gca | ttt | att | gat | cca | tta | ggg | tta | cca | gac | agg | cct | ttt | tat | agg | 2064 |
Arg | Ala | Phe | íle | Asp | Pro | Leu | Gly | Leu | Pro | Asp | Arg· | Pro | Phe | Tyr | Arg | |
675 | 680 | 685 | ||||||||||||||
cat | gtc | atc | tat | get | cca | age | age | cac | aac | aag | tat | gca | . ggg | gag | tca | 2112 |
His | Val | íle | Tyr | Ala | Pro | Ser | Ser | His | Asn | Lys | Tyr | Ala | Gly | Glu | Ser | |
690 | 695 | 700 | ||||||||||||||
ttc | cca | gga | att | tat | gat | get | ctg | ttt | gat | att | gaa. | age | aaa | gtg | gac | 2160 |
Phe | Pro | Gly | íle | Tyr | Asp | Ala | Leu | Phe | Asp | íle | Glu | Ser | Lys | Val | Asp | |
705 | 710 | 715 | 720 | |||||||||||||
cct | tcc | aag | gcc | tgg | . gga | gaa | gtg | aag | aga | 'cag | att | tat | gtt | gca | gcc | 2208 |
Pro | Ser | Lys | Ala | Trp | Gly | Glu | Val | Lys | Arg. | Gin | íle' | Tyr | Val | Ala | Ala | |
725 | 730 | 73.5 | ||||||||||||||
ttc | aca | gtg' | cag | gca | get | gca | •gag | .act | ttg | agt | gaa | gta | gcc. | taa | 225 3 | |
Phe | Thr | Val | Gin | Ala | Ala | Ala | Glu | Thr | Leu | Ser | Glu | Val | Ala | |||
740 | 745 | 750 |
176 <210> 2 <211> 750 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 2
Met Gly Asn Leu Leu His Glu Thr Asp Ser Ala Val Ala Thr Ala Arg | |||||||||||||||
1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
Arg | Pro | Arg | Trp | Leu | Cys | Ala | Gly | Ala | Leu | Val | Leu | Ala | Gly | Gly | Phe |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Phe | Léu | Leu | Gly | Phe | Leu | Phe | Gly | Trp | Phe | íle | Lys | Ser | Ser | Asn | Glu |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Ala | Thr | Asn | íle | Thr | Pro | Lys | His | Asn | Met | Lys | Ala | Phe . | Leu | Asp | Glu |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Leu | Lys | Ala | Glu | Asn | íle | Lys | Lys | Phe | Leu | Tyr | Asn | Phe | Thr | Gin | íle |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Pro | His | Leu | Ala | Gly | Thr | Glu | Gin | Asn | Phe | Gin | Leu | Ala | Lys | Gin | íle |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Gin | Ser | Gin | Trp | Lys | Glu | Phe | Gly | Leu | Asp | Ser | Val | Glu | Leu | Ala | His |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Tyr | Asp | Val | Leu | Lev | Ser | Tyr | Pro | Asn | Lys | Thr | His | Pro | Asn | Tyr | íle |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Ser | . íle | íle | Asn | Glu | Asp | Gly | Asn | Glu | íle | Phe | Asn | Thr | Sér | Leu | Phe |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Glu | Pro | Pro | Pro | Pro | Gly | Tyr | Glu | Asn | Val | Ser | Asp | íle | Val | Pro | Pro |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Phe | Ser | Ala | Phe | Ser | Pro | Gin | Gly | Met | Pro | Glu | Gly | Asp | Leu | Val | Tyr |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Val | Asn | Tyr | Ala | Arg | Thr | Glu | Asp | Phe | Phe | Lys | Leu | Glu | Arg· | Asp | Met |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Lys | íle | Asn | Cys | Ser | Gly | Lys | íle | Val | íle | Ala- | Arg | Tyr | Gly | Lys | Val |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Phe | Arg | Gly | Asn | Lys | Val | Lys | Asn | Ala | Gin | Leu | Ala | Gly | Ala | Lys | Gly |
210 | 215 | 2.20 | |||||||||||||
Val | íle | Leu | Tyr: | Ser | Asp | Pro | Ala | Ašp. | Tyr | Phe | Ala | Pro | Gly | Val | Lys |
177
225
230
235 240
Ser | Tyr | Pro | Asp | Gly 245 | Trp | Asn | Leu | Pro | Gly 250 | Gly | Gly | Val | Gin | Arg 255 | Gly |
Asn | íle | Leu | Asn 260 | Leu | Asn | Gly | Ala | Gly 265 | Asp | Pro | Leu | Thr | Pro 270 | Gly | Tyr |
Pro | Ala | Asn 275 | Glu | Tyr | Ala | Tyr | Arg 280 | Arg | Gly | íle | Ala | Glu 285. | Ala | Val | Gly |
Leu | Pro 290 | Ser | íle | Pro | Val | His 295 | Pro | íle | Gly | Tyr | Tyr 300 | Asp | Ala | Gin | Lys |
Leu 305 | Leu | Glu | Lys | Met | Gly 310 | Gly | Ser | Ala | Pro | Pro 315 | Asp | Ser | Ser | Trp | Arg 320. |
Gly | Ser | Leu | Lys | Val 325 | Pro | Tyr | Asn | Val | Gly 330 | Pro | Gly | Phe | Thr | Gly 335 | Asn |
Phe | Ser | Thr | Gin 340 | Lys | Val | Lys | Met | His 345 | íle | His | Ser | Thr | Asn 350 | Glu | Val |
Thr | Arg | He 355' | Tyr | Asn | Val | íle | Gly 360 | Thr | Leu | Arg | Gly | Ala 365 | Val | Glu | Pro |
Asp. Arg . 370 | Tyr | Val | íle | Leu | Gly 375 | Gly | His | Arg | Asp | Ser .380 | Trp | Val | Phe | Gly | |
Gly 385 | íle | Asp | Pro | Gin | Ser 390 | Gly | Ala | Ala | Val | Val 395 | His | Glu | íle | Val | Arg 400 |
Ser | Phe' | Gly | Thr | Leu 405 | Lys | Lys | Glu | Gly. | Trp 410 | Arg | Pro | Arg | Arg | Thr 415 | íle |
Leu | Phé | Ala | Ser. 420 | Trp | Asp; | Ala | Glu | Glu 425 | Phe | Gly | Leu | Leu | Gly 430 | Ser | Thr |
Glu. | Trp | Ala 435. | Glu | Glu | Asn | Sér | Arg 4 40 | Leu | Leu | Gin | Glu | Arg 445 | Gly | Val | Ala |
Tyr | íle .450 | Asn | Ala | Asp | Ser | Ser 455 | íle | Glu | Gly | Asn | Tyr 460 | . Thr | Leu | Arg | Val |
Asp | Cys | Thr | Pro | Leu | Met | Tyr | Ser | Leu | Val | His. | Asn | Leu | Thr | Lys | Glu |
465
470 475 480
178
Leu Lys | Ser | Pro | Asp 485 | Glu Gly Phe Glu Gly 490 | Lys | Ser Leu | Tyr | Glu 495 | Ser | ||||||
Trp | Thr | Lys | Lys | Ser | Pro | Ser | Pro | Glu | Phe | Ser | Gly | Met | Pro | Arg | íle |
500 | 505 | 510 | |||||||||||||
Ser | Lys | Leu. | Gly | Ser | Gly | Asn | Asp | Phe | Glu | Val | Phe | Phe | Gin | Arg | Leu |
515 | 520 | 525 | |||||||||||||
Gly | íle | Ala | Ser | Gly | Arg | Ala | Arg | Tyr | Thr | Lys | Asn | Trp | Glu | Thr | Asn |
530 | 535 | 540 | |||||||||||||
Lys | Phe | Ser | Gly | Tyr | ,Pro | Leu | Tyr | His | Ser | Val | Tyr | Glu | Thr | Tyr | Glu |
545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
Leu | Val- | Glu | Lys | Phe | Tyr | Asp | Pro | Met | Phe | Lys | Tyr | His | Leu | Thr | Val |
565 | 570 | 575 | |||||||||||||
Ala | Gin | Val | Arg | Gly | Gly | Met | Val | Phe | Glu | Leu | Ala | Asn | Ser | íle | Val |
580 | 585 | 590 | |||||||||||||
Leu | Pro | Phe | Asp | Cys | Arg | Asp | Tyr | Ala | Val | Val | Leu | Arg | Lys | Tyr | Ala |
595 | 600 | 605 | |||||||||||||
Asp | Lys | íle | Tyr | Ser | íle | Ser | Met | Lys | His | Pro | Gin | Glu | Met | Lys | Thr |
610 | 615 | 620. | |||||||||||||
Tyr | Ser | Val | Ser | Phe | Asp | Ser | Leu | Phe | Ser | Ala | Val· | Lys | Asn | Phe. | Thr |
625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
Glu | íle | Ala | Ser | Lys | Phe | Ser | Glu | Arg | Leu | Gin | Asp | Phe | Asp | Lys | Ser |
645 | 650 | 655 | |||||||||||||
Asn | Pro | íle | Val | Leu | Arg | Met | Met | Asn | Asp | Gin | Leu | Met | Phe | Leu | Glu |
660 | 665 | 670 | |||||||||||||
Arg | Ala | Phe | íle | Asp | Pro | Leu·: | Gly. | Leu | Pro | Asp | Arg | Pro | Phe | TyX | Arg |
675 | 680 | 685 | |||||||||||||
His | Val | íle | Tyr | Ala | Pro | Ser | Ser | His | Asn | Lys | Tyr | Ala | Gly | ' Gl.u' | Ser |
.690 | 695 | 700. | |||||||||||||
Phe | Pro. | Gly | íle | Tyr | Asp | Ala | Leu | Phe | Asp | íle | Glu | Ser | .Lys | Val | Asp |
705 | 710 | 715 | 720 | ||||||||||||
Pro. | Ser- | Lys | Ala | Trp. | . Gly | Glu | vár | Lys | Arg | Gin | íle | Tyr | Val | Ala | Ala |
;725. | 730 | 735 | |||||||||||||
Phé | .Thr | Val | Gin | Ala | .Ala | .Ala | Glu | Thr | Leu | Ser | Gl.u | Val. | Ala |
179
740 | 745 | 750 | |||||||||||||
<210> 3 | |||||||||||||||
<211> 3768 | |||||||||||||||
<212> DNA | |||||||||||||||
<213> Homo sapiens | |||||||||||||||
<220> | |||||||||||||||
<221> CDS | |||||||||||||||
<222>.(1)..ι | 13768): | ||||||||||||||
<400> 3 | |||||||||||||||
atg gag | ctg | gcg. | gcc | ttg | tgc | ege | tgg | ggg | ctc | ctc | ctc· | gcc | ctc | ttg | 4.8 |
Met Glu | Leu | Ala | Ala | Leu | Cys | Arg | Trp | Gly | Leu | Leu | Leu | Ala | Leu | Leu | |
-20 | -15 | -10 | |||||||||||||
ccc ccc | gga | gcc | gcg | age | acc | caa | gtg | tgc | acc | .ggc | aca | gac | atg | aag | 96 |
Pro Pro | Gly | Ala | Ala | Ser | Thr | Gin | Val | Cys | Thr | Gly | Thr | Asp | Met | Lys | |
-5 | -1 | ľ | 5 | ||||||||||||
ctg cgg | ctc | cct | gcc | agt | ccc | gag | acc | cac | ctg | gac | atg | ctc | ege | cac .. | 144 |
Leu Arg | Leu | Pro | Ala | Ser | Pro | Glu | Thr | His | Leu | Asp | Met | Leu | Arg | His | |
10 . | 15 | '20 | 25 | ||||||||||||
ctc tac | cag | ggc | tgc | cag | gtg | gtg | cag | gga | aac | ctg | gaa | ctc | acc | tac | 192 |
Leu Tyr | Gin- | Gly | Cys | Gin | Val | Val | Gin | Gly | Asn. | Leu | Glu | Leu | Thr | Tyr | |
30 | 35 | 40 | |||||||||||||
ctg ccc | acc | aat | gcc | age | ctg | .tcc | ttc | ctg. | cag | gat | atc | cag | gag | gtg | 240 |
Leu Pro | Thr | Asn | Ala | Ser | Léu | Ser | Phe | Leu | Gin. | Asp | . íle | Gin | Glu' | Val | |
45 | . 50 | . 55 | |||||||||||||
cag ggc | tac | gtg | ctc | atc | get | cac | áac | caa | gtg | agg | cag. | gtc | cca | ctg | 288 |
Gin Gly | Tyr | Val. | Leu | íle | Ala | His | Ašn | Gin | Val | Arg | Gin | Val | Pro. | Leu' | |
60 | 65 | 70 | |||||||||||||
cag agg | ctg | cgg | att | gtg | ega | ggc | acc | cag | ctc | ttť | gag. | gac | aac | '.t á t | 336 |
Gin Arg | Léu. | Arg | íle. | Val: | Arg | Gly. | Thr | Gin | Leu | Phé: | Glu | Asp | Asn | Tyr | |
75 | .80 | 85. | |||||||||||||
gcc' čtg | gcc | gtg | cta | gac | aat | gga | gac | ccg | ctg | aac | aat | acc | acc | cct | 384 |
Ala Leu | 'Ala | Val.·. | Leu' | Asp | Asn | Gly | Asp | Pro | Leu | Asn | Asn | Thr | Thr | Pro | |
90 | . '95 | 100 | . 105 |
180
gtc Val | aca ggg gcc Thr Gly Ala | tcc Ser .110 | cca Pro | gga ggc ctg cgg | gag Glu | ctg cag | ctt' Leu | ega Arg 120 | agc Ser | 432 | ||||||
Gly | Gly | Leu | Arg 115 | Leu | Gin | |||||||||||
ctc | aca | gag | atc | ttg | aaa | gga | ggg | gtc | ttg. | atc | cag | cgg | aac | ccc | cag | 480 |
Leu | Thr | Glu | íle | Leu | Lys | Gly | Gly | Val | Leu | íle | Gin | Arg. | Asn | Pro | Gin | |
125 | 130 | 135 | ||||||||||||||
ctc | tgc | tac | cag | gac | acg | att | ttg | tgg | aag | gac | atc | ttc | cac | aag | aac | 528 |
Leu | Cys | Tyr | Gin | Asp | Thr | íle | Leu | Trp | Lys | Asp | íle | Phe | His | Lys | Asn | |
140 | 145 | 150 | ||||||||||||||
aac | cag | ctg | get | ctc | aca | ctg | ata | gac | acc | aac | ege | tet | cgg | gcc | tgc | 576 |
Asn | Gin | Leu | Ala | Leu | Thr | Leu | íle | Asp | Thr | Asn | Arg | Ser | Arg | Ala | Cys | |
155 | 160 | 165 | ||||||||||||||
cac | ccc | tgt | tet | ccg | atg | tgt | aag | ggc | tcc. | ege | tgc | tgg | gga | gag | agt | 624 |
His | Pro | Cys | Ser | Pro | Met | Cys. | Lys. | Gly | Ser | Arg | Cys | Trp | Gly | Glu | Ser | |
170. | 175 | 180 | 185 | |||||||||||||
tet | gag | gat | tgt | cag | agc | ctg | acg | ege | act | gtc | tgt | gcc | ggt | ggc | tgt | 672 |
Ser | . Glu | Asp | Cys, | Gin | Ser. | Leu | Thr | Arg | Thr | Val | Cys | Ala | Gly | Gly | Cys | |
190 | 195 | 200 | ||||||||||||||
gcc | ege | tgc | aag | ggg | cca | ctg | ccc | act | gac | .tgc .tgc | cat | gag | cag | tgt | 720 | |
Ala | . Arg | Cys | Lys | Gly | Pro | Leu | Pro | Thr. | Asp | Cys | Cys | His | Glu | Gin | Cys | |
205 | ·?’ | 210 | 215 | |||||||||||||
get | gcc | ,ggc | tgc | acg | ggc | ccc | aag | cac | tet | gac | tgc | ctg | gcc | tgc | ctc | 7 68' |
Ala | Ala | Gly | Cys | Thr | Gly | Pro | Lys | His | Ser | Asp | Cys | Leu | Ala | Cys | Leu | |
.220 | 225 | 230 | ||||||||||||||
cac | ttc | aac | cac | agt | ggc | atc | tgt | gag | ctg | cac | tgc | cca | gcc | ctg | gtc | .816. |
His | Phe | Asn | His | Ser | Gly | Tie | Cys | Glu | Leu. | His | Cys | Pro' | Ala | Leu | Val | |
235 | 240 | 245 | ||||||||||||||
acc | tac | aac | aca | gac | acg | ttt | gag | tcc | . atg' | ccc | aat | cc.c | gag | ggc. | cgg | . 864 |
Thr | Tyr | Asn | Thr | Asp | Thr | Phe | Glu | Ser | Meť | Pro | Asn | Pro | Glú | Gly Arg· | ||
250 | 255 | 260 | 265 | |||||||||||||
tat' | aca | ttc | ggc | gcč | agc | tgt | gtg | act | gcc | tgt | ccc | tac | aac | tac | ctt | 912 |
Tyr | Thr | . Phe | Gly' | Ala | Ser | Cys | Val | Thr | Ala | Cys | Pro | Tyr | Ásn | Tyr | Leu · | |
270 | 275 | 280 | ||||||||||||||
tet | acg | gac | gtg | gga | tcc | tgc | acc | ctc | gtc | tgc | ccc | ctg | Cac | aac | caa | 960. |
Ser | T.hr | Asp | Val | Gly | Ser | Cys | Thr. | Leu | Vaľ | Cys | Pro | Leu | His | Asn | Gin- | |
285. | 290 | 295 |
181
gag gtg aca | gca Ala | gag Glu | gat Asp | gga aca Gly Thr 305 | cag cgg Gin Arg | tgt gag aag Cys Glu Lys 310 | tgc Cys | age Ser | aag Lys | 1008 | ||||||
Glu | Val | Thr. 300. | ||||||||||||||
ccc | tgt | gcc | ega | gtg | tgc | tat | ggt- | ctg' | ggc | atg | gag | cac | ttg | ega | gag | 1056 |
Pro | Cys | Ala- | Arg | Val | Cys | Tyr | Gly | Leu | Gly | Met | Glu | His | Leu | Arg | Glu | |
315 | 320 | 325 | ||||||||||||||
gtg | agg | gca | gtt | acc | agt | gcc | aat | atc | cag | gag | ttt | get | ggc. | tgc | aag | 1104 |
Val | Arg | Ala | Val | Thr | Ser | Ala | Asn | íle | Gin | Glu | Phe | Ala | Gly | Cys | Lys | |
330 | 335 | 340 | 345 | |||||||||||||
aag | atc | ttt. | ggg | age | ctg | gca | ttt | ctg | ccg | gag | age | ttt | gat | ggg | gac | 1152 |
Lys | .íle | Phe | Giy | Ser | Leu | Ala. | Phe | Leu | Pro | Glu | Ser | Phe | Asp | Gly | Asp | |
350 | 355 | 360 | ||||||||||||||
cca | gcc | tcc | aac | act | gcc | ccg | ctc | cag | cca | gag | cag | ctc | caa | gtg | ttt | 1200 |
Pro | Ala | Ser | Asn | Thr | Ala | Pro | Leu | Gin | Pro | Glu | Gin | Leu | Gin | Val | Phe | |
365 | 370 | 375 | ||||||||||||||
gag | act | ctg | gaa | gag | atc | aca | ggt | tac | cta | tac | atc | tca | gca | tgg | ccg | 1248 |
Glu | Thr | Leu | Glu | Glu | He | Thr | Gly | Tyr | Leu | Tyr | íle | Ser | Ala | Trp | Pro | |
380 | 385 | 390 | ||||||||||||||
gac | age | ctg | cct. | gac | ctc | age | gtc. | ttc | cag | aac | ctg | caa | .gta | atc | cgg | 1296 |
Asp | Ser | Leu | Pro | Asp | Leu | Ser | val | Phe | Gin | Asn | Leu | Gin | Val | íle | Arg | |
395 | '400 | 405 | ||||||||||||||
gga | ega | att | ctg | cac | aat | ggc | gcc | tac | tcg | ctg | acc | ctg | caa | ggg | ctg | 1344 |
Gly | Arg | íle | Leu | His | Asn | Gly | Ala | TyX | Ser | Leu | Thr | Leu | .Gin | Gly | Leu | |
410 | 415 | 420 | 425 | |||||||||||||
ggc | atc | age | tgg | cťg | ggg | ctg | ege | tca | ctg | agg | gaa | ctg | ggc | ágt | gga | 1392 |
Gly | íle’ | Ser | Trp | Leu | Gly. | Leu | Arg | Ser | Leu | Arg | Glu | Leu | Gly | Ser | Gly | |
430 | 435 | •4 40. | ||||||||||||||
ctg | gcc | ctc | atc | cac | cat | aac | acc | cac | ctc; | tgc | ttc· | gtg | cac | .acg | gtg | 1440 |
Leu | Ala; | Leu | íle. | His' | His | Asn | Thr | His | Leu | Cýs. | Phe | Val | His. | Thr | Val | |
• 'i | 445 | 450 | 455 | |||||||||||||
CCC | tgg | gac | cag | ctc | ttt | cgg | aac | ccg | cac | caa | get | ctg | čtc | cac | act | '.1488 |
Pro | Trp | Äšp | Gin | Leu | Ph.e | Arg | Asn | Pro | His | Gin | 'Ala | Leu | Leu | His | Thr' | |
460 | .4 65 | 470 | ||||||||||||||
gcc | aac | cgg | cca | .gag | gac | gag | tgt | gtg | ggc | gág. | ggc | ' čtg | gcc | tgc | cac | 1536 |
182
1584 atc íle 650 ·
Ala cag
Gin
490 gtc
Val ega
Arg ttg
Leu ttt
Phe cct
Pro
570 tcc
Ser' cct
Pro ggc
Glý gcg
Ala-
Asn 475 | Arg | Pro | Glu | Asp | Glu Cys Val Gly 480 | Glu Gly 485 | Leu Ala Cys | His | ||||||
ctg | tgc | gcc | ega | ggg | cac | tgc | tgg | ggt | cca | ggg | ccc | áčc | cag | tgt |
Leu | Cys | Ala | Arg | Gly | . His | Cys | Trp | . Gly | Pro | Gly | Pro | Thr | Gin | Cys |
495 | 500 | 505 | ||||||||||||
aac | tgc | agc | cag | ttc | Ctt | cgg | ggc | cag | gag | tgc | gtg | gag | gaa | tgc |
Asn | Cys | Ser | Gin | Phe | Leu | Arg | Gly | Gin | Glu | Cys | Val | Glu | Glu | Cys |
510 | 515 | 520 | ||||||||||||
gta | ctg | cag | ggg | ctc | ccc | agg | gag | tat | gtg | aat | gcc | agg | cac | tgt |
Val | Leu | Gin | Gly | Leu | Pro | Arg | Glu | Tyr | Val | Asn | Ala | Arg | His | Cys. |
525 | 530 | v*.- | 535 | |||||||||||
ccg | tgc | cac. | cct | gag | tgt | cag | ccc | cag | aat | ggc | tca | gtg | acc | tgt |
Pro | Cys | His | Pro | Glu | Cys | Gin | Pro | Gin | Asn | Gly | Ser | Val | Thr | Cys |
540 | 545 | 550 | ||||||||||||
gga Gly | ccg | . gag | get | gac | cag | tgt | gtg | gcc | tgt | gcc | cac | tat | aag | gac |
Pro | 'r'Glu | Ala | Asp | Gin | Cys | Val | Ala | Cys | Ala. | His | Tyr | Lys | Asp | |
555 | 560 | 565 | ||||||||||||
ccc | ttc | tgc- | gtg | gcc | ege | tgc | ccc | agc | ggt | gtg | aaa | cct | gac | ctc. |
Pro | Phe | Cys | Val | Ala | Arg | Cys | Pro | Ser | Gly | Val | Lys | Pro | Asp | Leu |
.575 | 580 | 585 | ||||||||||||
tac Tyr | atg | ccc | atc | tgg | aag | ttt | cca | gat | gag | gag | ggc | gca | tgc | cag |
Met | Pro | íle | Trp | Lys | Phe | Pro | Asp | Glu | Glu. | Gly | Ala | Cys | Gin | |
590 | 595 | 600 | ||||||||||||
tgc | ccc | atc | aac | tgc | acc | cac | tcc | tgt | gtg | gac | ctg | gat | gac | aag |
Cys | .Pro | íle | A^h;, | •Cys | Thr | His | Ser. | Cys | Val | Asp | Leu | Asp | Asp | Lýs |
605 | 610 | 615. | ||||||||||||
tgc | ccc | gcc | gag- | cag | aga | gcc . | agc | cct | ctg | acg | tcc | atc | gtc | tet : |
Cys | Pro | Ala | Glu | Gin | Arg | Ala | Ser. | Pro | Leu | Thr · | Ser | íle | Vaľ· | Ser |
620 | 625 | .63.0 | ||||||||||||
gtg | gtt ' | ggc- | att | ctg. ctg | gtc | gtg.. | gtc | ttg | ggg' | gtg | gtc: | ttt; | ggg | |
Val | .Val | Gly | íle | Leu | Leu ' | Val: | Val. | Val | Leu· | Glý. Val · | Val | Phé: | Gly | |
.635 | 640 | 645 . | ||||||||||||
ctc | atc | aag' | ega. | cgg | cag | cag | aag . | atc | cgg | aag | tac | acg | atg | cgg |
Leu | íle. | Lys ' | Arg Arg.i | Gin ; | Gin-Lys | íle , | Arg | Lýs | Tyr.. | Thr | Met | Arg' |
655 . · 660 ·. 665
163.2
1680
1728
1776
1824
1872
1920
1968
2064
2016 aga ctg ctg cag gaa acg gag ctg .gtg gag . Arg. Leu Leu Gin Glu Thr Glu Leu -.Vaľ Glu ccg ctg· aca cct acc ega Pro Leu Thr Pro Ser Gly .
. 2112
183
670 675 680
gcg atg ccc aac | cag gcg cag atg | cgg atc ctg aaa | gag Glu. | acg Thr 695 ' | gag Glu | ctg Leu | 2160 | |||||||||
Ala | Met | Pro Asn 685 | Gin | Ala | Gin Met | Arg íle 690 ' | Leu | Lys | ||||||||
agg | aag | gtg | aag. | gtg | ctt | gga | tet | ggc | get | ttt | ggc | aca | gtč | tac | aag | 2208. |
Arg | ..Lýs | Val | Lys | Val | Leu | Gly | Ser | Gly | Ala | Phe | Gly | Thr | Val | Tyr | Lys | |
700 | 705 | 710 | ||||||||||||||
ggc | atc | tgg | atc | cct | gat | ggg | gag | aat | gtg | aaa | att | cca | gtg | gcc | atc | 2256 |
Gly | íle. | Trp | íle. | Pro | Asp | Gly | Glu | Asn | Val | Lys | íle | Pro | Val | Ala | íle. | |
715 | 720 | 725 | ||||||||||||||
aaa | gtg | ttg | agg | gaa | aac | aca | tcc | ccc | aaa | gcc | aac | aaa | gaa. | atc | tta | 2304 |
Lys | Val | Leu | Arg. | Glu | Asn | Thr | Ser' | Pro | Lys | Ala | Asn | Lys | Glu | íle | Leu | |
730 | 735 | 740 | 745 | |||||||||||||
gac | gaa | gca | tac | gtg | atg | get | ggt | gtg | ggc | tcc | cca | tat | gtc | tcc | ege | • 2352 |
Asp | Glu | Ala | Tyr | Val | Met | Ala | Gly | Val | Gly | Ser | Pro | Tyr | Val | Ser | Arg | |
750 | 755 | 760 | ||||||||||||||
ctt. | ctg | ggc | atc | tgc | ctg | aca | tcc | acg | gtg | cag | ctg | gtg | aca | cág | ctt | 2400 |
Leu | Leu | Gly | íle. | Cys | Leu | Thr | Ser | Thr | Val | Gin | Leu | Val | Thr | Gin | Leu | |
765 | 770 | 775 | ||||||||||||||
atg | ccc | tat | ggc | tgc | ctc | tta | gac | cat | gtc | cgg | gaa | aac | ege | gga. | ege | 2448 |
Met | Pro | Tyr | Gly | Cys | Leu | Leu | Äsp | His | Val | Arg | Glu | Asn | Arg | Gly. | Arg | |
780 | 785 | 790 | ||||||||||||||
ctg | ggc | tcc | cag | gac | ctg | ctg | aac | tgg | tgt. | atg | cag | att | gcc | aag | ggg. | 2496 |
Leu | Gly | Ser | Gin | Asp | Leu | Leu | Asn | Trp | Cys | Met | Gin. | íle | Ala | Lys | Gi.y | |
'795 | 800 | 805 | ||||||||||||||
atg | age | tác | . ctg | gag | gat | gtg | cgg | ctc | gta | cac | agg | gac | ttg | gcc | get | 2544 |
Met | Ser | Tyr | Leu | Glu | Asp | Val | Arg· | Leu | Val | His | Arg Asp | Leu’ | Ala | Ala | ||
81Ó | 815 | 820 | 825 | |||||||||||||
cgg | aac | gtg | ctg | gtc | aag | agt | ccc | aac | cat | gtc | aaa | att | aca | gac | ttc | 2592 |
Arg | Asn | Val | Leu | Val | Lys | Ser | Pro | Asn | His | Val | Lys | íle | Thr | Asp' | Phe | |
830 | 835 | 840 | ||||||||||||||
ggg. | ctg | get | cgg | ctg | ctg | gac | att | gac | gag | aca | gag | tac | cat | gca | gat | . 2640 |
Gly- | Leu | Ala | Arg | Leu | Leu | Asp | íle | Asp | Glu | Thr | Glu | Tyr | His. | Ala | Asp | |
8 45 | 850 | 855 |
184
ggg ggc aag gtg | ccc Pro | atc íle | aag Lys | tgg atg gcg | ctg gag tcc att ctc | cgc Arg | 2688 | ||||||||
Gly | Gly | Lys Val 860 | Trp 865 | Met | Ala | Leu | Glu | Ser 870. | íle | Leu | |||||
cgg | cgg | ttc acc | cac | cag | agt | gat | gtg | tgg | agt | tat | ggt· | gtg | act | gtg | 2736 |
Arg | Arg 875 | Phe Thr | His | Gin | Ser 880 | Asp | Val | Trp | Ser | Tyr 885 | Gly | Val | Thr | Val | |
tgg | gag | ctg atg | act | ttt | ggg | gcc | aaa | cct | tac | gat | ggg | atc | cca | gcc | 2784 |
.Trp 890 | Glu | Leu Met | Thr | Phe 895 | Gly | Ala | Lys | Pro | Tyr 900 | Asp | Gly | íle | Pro | Ala 905 | |
cgg | gag | atc cct | gac | ctg | ctg | gaa | aag | ggg | gag | cgg | ctg | ccc | cag | ccc | 2832 |
Arg | Glu | íle Pro | Asp 910 | Leu | Leu | Glu | Lys | Gly 915 | Glu | Arg | Leu | Pro | Gin 920 | Pro | |
ccc | atc | tgc acc | att | gat | gtc | tac | atg | atc | atg | gtc | aaa | tgt | tgg | atg | 2880 |
Pró | íle | Cys Thr ' 925 | íle | Asp | Val | Tyr | Met 930 | íle | Met | Val | Lys | Cys 935 | Trp | Met | |
att | gac | tet gaa | tgt | cgg | cca | aga | ttc | cgg | gag | ttg | gtg | tet | gaa | ttc | 2928 |
íle | Asp | Ser Glu 940 | Cys | Arg | Pro | Arg 945 | Phe | Arg | Glu | Leu | Val 950 | Ser | Glu | Phe | |
tcc | cgc | atg gcc | agg | gac | ccc | cag | cgc | ttt | gtg | gtc | atc | cag | aat | gag | 2976 |
Ser | Arg 955 | Met Ala | Arg | Asp | Pro 960 | Gin | Arg | Phe | Val | Val 965 | íle | Gin | Asn | Glu | |
gac | ttg | ggc cca | gcc | agt | ccc | ttg | gac | age | acc | ttc | tac | cgc | tca | ctg | ' 3024 |
Asp 970 | Leu | Gly. Pro | Ala | Ser 975 | Pro | Leu | Asp | Ser | Thr 980 | Phe | Tyr | Arg | Ser | Leu 985 ..· | |
ctg | gag | gac gat | gac | atg | ggg | gac. | ctg | gtg | gat | get | gag | gag | tat. | ctg | 3072 |
Leu | Glu | Asp Asp | Asp 990 | Met | Gly | Asp | Leu | Val 995 | Asp | Ala | Glu | Glu Tyr 1000 | Leu | ||
gta | ccc | cag cag. | ggc | ttc. | ttc | tgt | cca | gac | cct | gcc. | ccg | ggc. | get | ggg | 3120 |
Val | Pro | Gin Gin 1005 | Gly | Phe | Phe | Cys Pro . 1010 | Asp | Pro | Ala | Pro Gly 1015 | Ala | Gly | |||
ggc | atg | gtc cac | cac | agg | cac | cgc | age | tca- | tet | acc | agg' | agt | ggc | ggt. | 3168 |
Gly | Met Val His. 1020 | His | Arg | His Arg . . 1025 | Ser | Ser | Sér | Thr Arg 1030 | •Ser | Gly | Gly · | ||||
ggg | gac | ctg aca | cta | ggg | ctg | gag | ccc | tet | gaá- | gag | i gag | gcc | ccc | agg | 3216 |
Gly | Asp L035 | Leu Thr | Leu | Gly Leu 1040 | Glu | Pro | Ser | Glu | Glu L045 | Glu | Ala | . Pro | Arg |
185
·. tet cca Ser Pro 1050 | ctg Leu | gca Ala | ccc tcc Pro Ser 1055 | gaa Glu | ggg Gly | get Ala | ggc tcc Gly Ser 1060 | gat Asp | gta Val | ttť Phe | gat ggt Asp Gly ' 1065 | 3264. |
gac ctg | gga | atg | ggg gca | gcc | aag | .999 | ctg caa | age | ctc | ccc | aca cat | 3312 |
Asp Leu | Gly | Meť | Gly Ala | Ala | Lys | Gly | Leu Gin | Ser | Leu | Pro | Thr His | |
1070' | 1075 | 1080 | ||||||||||
gac ccc | age | cct | cta cag | cgg | tac | agt | gag gac | CCC | aca | gta | ccc ctg | 3360 |
Asp Pro | Ser | Pro | Leu Gin | Arg | Tyr | Ser | Glu Asp | Pro | Thr | Val | Pro Leu | |
1085 | 1090 | 1095 | ||||||||||
ccc tet. | gag | act | gat ggc | tac | gtt | gcc | ccc ctg | acc | tgc | age | ccc cag | 3408 |
.Pro Ser | Glu | Thr. | Asp Gly | Tyr | Val. | Ala | Pro Leu | Thr | Cys | Ser | Pro Gin | |
1100 | ' 1105 | 1110 | ||||||||||
•cct gaa' | tat | gtg | aac cag | cca | gat | gtt | cgg ccc | cag | ccc | ccť | tcg ccc | 3456 |
Pro Glu | Tyr | Val | Asn:Gin | Pro | Asp | Val | Arg Pro | Gin | Pro | Pro | Ser Pro | |
1115 | 1120 | 1125 | ||||||||||
ega gag | ggc | cct | ctg cct | get | gcc | ega | cct get | ggt. | gcc | act | ctg gaa | 3504 |
Arg Glu | Gly | Pro | Leu Pro | Ala | Ala | Arg | Pro Ala | Gly | Ala | Thr | Leu Glu | |
1130 . | 1135 | 1140 | 1145 | |||||||||
agg.gcc | aag | act | ctc tcc | cca | ggg | aag | aat ggg | gtc | gtc. | aaa | gac gtt | 3552 |
Arg Ala | Lys | Thr | Leu Ser | Pro | Gly | Lys | Asn Gly | Val | Val | Lys | Asp'Val | |
.1150 | 1155 | : 160. . | ||||||||||
ttt gcc | ttt | ggg | ggt gcc | gtg | gag | aac | ccc gag | tac | ttg | aca | ccc cag | 3600 |
Phe Ala | Phe | Gly | Gly Ala | Val | Glu | Asn | Pro Glu | Tyr | Leu- | Thr | Pro Gin . | |
1165 | 1170 | 1175 | ||||||||||
gga gga | get | gcc | cct cag | ccc | cac | cct | ccť· cct | gcc | ttc | agč | cca gcc | 3648 |
. Gly Gly | Ala | Ala | Pro Gin | Pro | His | Pro. | Pro Pro | Ala | Phe | Ser | Pro: Ala | |
1180 | 1185 | 1190 | ||||||||||
ttc gac | aac | ctc | tat tac | . tgg | gac | cag | gac.· cca | cca | gag | cgg | ggg get | 3696 |
Phe Ásp | Asn | Leu | Tyr Tyr | Trp | Asp | Gin | Asp Pro | • Pró | Glu | Arg | ’Gly Ala | |
1195 | 1200 | ' 1205 | ||||||||||
cca ccc | age | •acc | ttc .aaa | ggg | aca | cct | acg gca | . gag | aac | cca | gag tac' | 37 4 4 |
P-ro Pro | Ser | Thr· | Phe Lys' | Gly | Thr | Pro | •Thr Ala | Glu | Asn. | Pro | Glu Tyr | |
.1210 | 1215 | 1220 | ' 1225 | |||||||||
ctg ggt | ctg | gac | gtg cca | gtg | tga | 3768 | ||||||
Leu Gly | Leu | Asp | Val Pro | Val |
1230
186 <210> 4 <211> 1255 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 4
Met Glu Leu Ala Ala • 1 5
Pro'Pro Gly Ala Ala 20
Leu Arg Leu Pro Ala 35
Leu Tyr Gin Gly Cys 50
Leu Pro Thr Asn Ala 65
Gin Gly Tyr Val Leu 85
Gin Arg Leu Arg íle 100
Ala Leu Ala Val Leu 115
Val Thr Gly Ala Ser 130
Leu Thr Glu íle Leu 145
Leu Cys Tyr Gin Asp 165
Asn Gin Leu Ala Leu 180- .
His Pro Cys Ser Pro .195
Leu Cys Arg Trp Gly Leu Leu Leu Ala Leu Leu 10 15
Ser Thr Gin Val Cys Thr Gly Thr Asp Met Lys 25 30
Ser Pro Glu Thr His Leu Asp Met Leu Arg His 40' 45
Gin Val Val Gin Gly Asn Leu Glu Leu Thr Tyr 55 60
Ser Leu Ser Phe Leu Gin Asp íle Gin Glu Val 70 ' 75 80 íle Ala His Asn Gin Val Arg Gin Val Pro. Leu
95
Val Arg Gly Thr Gin Leu Phe Glu Asp Asn Tyr . 105 110
Asp Asn Gly Asp Pro Leu Asri Asn Thr Thr Pro 120 . 125
Pro Gly Gly Leu Arg Glu Leu Gin Leu Arg Ser 135 . 140 .
Lys Gly Gly Val Leu íle Gln; Arg Asn Pro Gin 150 155. 160
Thr íle Leu Trp Lys Asp íle Phe His Lys Asn 170 175
Thr. Leu íle Asp Thr Asn Arg Ser Arg Ala-Cys 185 190 . Met Cys Lys Gly Ser Arg Cys Trp Gly Glu Ser
200 . 205
187
Ser Glu Asp | Cys Gin Ser | Leu Thr Arg Thr Val Cys Ala Gly Gly Cys | |||||||||||||
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Ala | Arg | Cys | Lys | Gly | Pro | Leu | Pro | Thr | Asp | Cys | Cys | His | Glu | Gin | Cys' |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Ala | Ala | Gly | Cys | Thr | Gly | Pro | Lys | His | Ser | Asp | Cys | Leu | Ala | Cys | Leu |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
His | Phe | Asn | His | Ser | Gly | íle | Cys | Glu | Leu | His | Cys | Pro | Ala | Leu | Val |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
Thr | Tyr | Asn | Thr | Asp· | Thr | Phe | Glu | Ser | Met | Pro | Asn | Pro | Glu | Gly | Arg |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
Tyr | Thr' | .Phe | Gly | Ala | Ser | Cys | Val | Thr | Ala | Cys | Pro | Tyr | Asn | Tyr | Leu |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
Ser | Thr | Asp | Val | Gly | Ser | Cys | Thr | Leu | Val | Cys | Pro' | Leu | His | Asn | Gin |
305 | .310 | 315 | 320· | ||||||||||||
Glu | Val | Thr | Ala | Glu | Asp | Gly | Thr | Gin | Arg | Cys | Glu | Lys | Cys | Ser | Lys |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Pro | Cys | Ala | Arg | Val | Cys | Tyr | Gly | Leu | Gly | Met | Glu | His | Leu | Arg | Glu |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
Val | Arg | Ala | Val | Thr | Ser | Ala | Asn | íle | Gin | Glu | Phe | Ala | Gly | Cys | Lys |
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
Lys | íle | Phe | Gly | Ser | Leu | Ala | Phe | Leu | Pro | Glu | Ser | Phe | Asp. | Gly | Asp |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
Pro | Ala | Ser | Asn | Thr | Ala | Pro | Leu | Gin | Pro | Glu | Gin | Leu | Gin | Val | Phe |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
Glu | Th'r | Leu | Glu | Glu | íle | Thr | Gly | Tyr | Leu | Tyr dle | Ser | Ala | Trp | Pro | |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
Asp | Ser | Leu | Pro | Asp | Leu | Ser | Val | Phe | Gin | Asn | Leu | Gin | Val | Iíe | Arg |
420 | 425 | 430 | |||||||||||||
Gly | Arg | íle | Leu | His | Asn | Gly | Ala | Tyr | Ser | Leu | Thr | Leu | Gin | Gly | Leu |
435 | 4 4 0. | .4 45 | |||||||||||||
Gly | íle | Ser | Trp | Leu | Gly | Leu. Arg | Ser | Leu | Arg | Glu | Leu | Gly | Ser | Gly | |
450 | 455 | 460 | |||||||||||||
Leu | Ala | Leu | íle | His | His | Asn | Thr | His | Leu | Cys | Phe | Val | His | Thr | Val |
465 | 470 | 475 | 480 |
188
Pro Trp Asp Gin Leu | Phe | Arg | Asn | Pro His Gin Ala Leu Leu His | Thr | ||||||||||
485 | 490 | 495 | |||||||||||||
Ala | Asn | Arg | Pro | Glu | Asp | Glu | Cys | Val | Gly | Glu | Gly | Leu | Ala | Cys | His |
500 | 505 | 510 | |||||||||||||
Gl.n | Leu | Cys | Ala | Arg | Gly | His | Cys | Trp | Gly | Pro | Gly | Pro | Thr | Gin | Cys |
515 | 520 | 525 | |||||||||||||
Val | Asn | Cys | Ser | Gin | Phe | Leu | Arg | Gly | Gin | Glu | Cys | Val | Glu | Glu | Cys |
530 | 535 | 540 | |||||||||||||
Arg | Val | Leu | Gin | Gly | Leu | Pro | Arg | Glu | . Tyr | Val | Asn | Ala | Arg | His | Cys |
545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
Leu | Pro | Cys | His | Pro | Glu | Cys | Gin | Pro | Gin | Asn | Gly | Ser | Val | Thr | Cys |
565 | 570 | 575 | |||||||||||||
Phe | Gly | Pro | Glu | Ala | Asp | Gin | Cys | Val | Ala | Cys | Ala | His | Tyr | Lys | Asp |
580 | 585 | 590 | |||||||||||||
Pro | Pro | Phe | Cys | Val | Ala | Arg | Cys | Pro | Ser | Gly | Val | Lys | pro | Asp | Leu |
595 | 600 | 605 | |||||||||||||
Ser | Tyr | Met. | Pro | íle | Trp | Lys | Phe· | Pro | Asp | Glu | Glu | Gly | Ala | Cys | Gin |
610 | 615 | 620 | |||||||||||||
Pro | Cys | Pro | íle | Asn | Cys | Thr | His | Ser | Cys | Val | Asp | Leu | Asp | Asp | Lys |
625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
Gly | Cys | Pro. | Ala | Glu | Gin | Arg | Ala | Ser | Pro | Leu | Thr' | Ser | íle | Val | Ser |
645· | 650 | 655 | |||||||||||||
Ala | Val | Val | Gly | íle | Leu | Leu | Val | Val | Val | Leu | Gly | Val | Val | Phe | Gly |
660 | 665 | 670 | |||||||||||||
íle | Leu | íle | Lys | Arg | Arg | Gin | Gin | Lys | íle | Arg | Lys | Tyr | Thr | Met | Arg |
675 | 680 | 685. | |||||||||||||
Arg | Leu | Leu | Gin | Glu | Thr | Glu | Leu | Val | Glu | Pro | Leu | Thr | P.ro | Ser | Gly |
690 | 695 | 700 | |||||||||||||
Ala | Met | Pro | Asn | Gin | Ala | Gin | Met' | Arg | íle | Leu | Lys | Glu | Thr | Glu | Leu |
705 | 710 | .715 | 720 |
189
Arg Lys Val Lys Val | Leu | Gly | Ser | Gly Ala 730 | Phe | Gly | Thr | Vaľ | Tyr 735 | Lys | |||||
725 | |||||||||||||||
Gly | íle | Trp | íle | Pro | Asp | Gly | Glu | Asn | Val | Lys | íle | Pro | Val | Ala | íle |
740 | 745 | 750 | |||||||||||||
Lys | Val. | Leu | Arg | Glu | Asn | Thr | Ser | Pro | Lys | Ala | Asn | Lys | Glu | íle | Leu |
755 | 760 | 765 | |||||||||||||
Asp | Glu | Ala | Tyr | Val | Met | Ala | Gly | Val | Gly | Ser | Pro | Tyr | Val | Ser | Arg |
770 | 775 | 780 | |||||||||||||
Leu | Leu | Gly | íle | Cys | Leu | Thr | Ser | Thr | Val | Gin | Leu | Val | Thr | Gin | Leu |
785 | 790 | 795 | 800 | ||||||||||||
Met | Pro | Tyr | Gly | Cys | Leu | Leu | Asp. | His | Val | Arg | Glu | Asn | Arg Gly | Arg | |
805 | 810 | 815 | |||||||||||||
Leu | Gly | Ser | Gin | Asp | Leu | Leu | Asn | Trp | Cys | Met | Gin | íle | Ala | Lys | Gly |
820 | 825 | 830 | |||||||||||||
Met | Ser | Tyr | Leu | Glu | Asp | Val | Arg | Leu | Val | His | Arg | Asp | Leu | Ala | Ala |
835 | 840 | 845 | |||||||||||||
Arg | Asn | Val | Leu | Val | Lys | Ser | Pro | Asn | His | Val | Lys | íle | Thr | Asp | Phe |
850 | 855 | 860 | |||||||||||||
Gly | Leu | Ala | Arg | Leu | Leu | Asp | íle | Asp | Glu | Thr | Glu | Tyr. | His | Ala | Ásp |
865 | 870 | 875 | 880 | ||||||||||||
Gly | Gly | Lys | Val | Pro | íle. | Lys | Trp | Met | Ala | Leu | Glu | Ser | íle | Leu | Arg |
885 | 890. | 895 | |||||||||||||
Arg | Arg | Phe | .Thr | His | Gin | Ser | Asp | Val | Trp | Ser | Tyr | Gly | Val | Thr | Val |
900 | 905 | 910 | |||||||||||||
Trp | Glu | Leu | Met | Thr- | Phe | Gly | Ala | Lys | Pro | Tyr | Asp | Gly | He | Pro | Ala |
915 | 920 | 925 | |||||||||||||
Arg | Glu | íle | Pro | Asp | Leu | Leu | Glu | Lys | Gly | Glu | Arg | Leu | Pro | Gin | Pro |
930 | 935 | 940 | |||||||||||||
Pro | íle | Cys | Thr | íle | Asp | Val | Tyr | Met | íle | Met | Val | Lys | Cys | Trp | Met |
945 | 950 | 955 | 960 | ||||||||||||
íle | Asp | Ser | Glu | Cys | Arg | Pro | Arg | Phe | Arg | Glu | Leu | Val | Sér | Glu | Phe |
965 | 970 | 975 | |||||||||||||
Ser | Arg | Met- | Ala | Arg | Asp | Pro | Gin | Arg | Phe | Val | Val | íle. | Gin | Asn | Glu |
980 985 . ' 990
190
Asp Leu Gly | Pro | Ala | Ser | Pro Leu Asp . 1000 | Ser | Thr | Phe Tyr 1005 | Arg | Ser | Leu | |
995 | |||||||||||
Leu Glu | Asp | Asp | Asp | Met | Gly Asp Leu | Val | Asp | Ala Glu | Glu | Tyr | Leu |
1010 | 1015 | 1020 | |||||||||
Val Pro | Gin | Gin | Gly | Phe | Phe Cys Pro | Asp | Pro | Ala Pro | Gly | Ala | Gly |
025 | 1030 | 1035 | 1040 | ||||||||
Gly Met | Val | His | His | Arg | His Arg Ser | . Ser | Ser | Thr Arg | Ser | Gly. | Gly |
1045 | 1050 | 1055 | |||||||||
Gly Asp | Leu | Thr. | Leu | Gly | Leu Glu Pro | Ser | Glu | Glu Glu | Ala | Pro | Arg |
1060 | 1065 | 1070 | |||||||||
Ser Pro | Leu | Ala | Pro | Ser | Glu Gly Ala | Gly | Ser | Asp Val | Phe | Asp | Gly |
1075 | 1080 | 1085. | |||||||||
Asp Leu | Gly | Met | Gly | Ala | Ala Lys Gly | Leu | Gin | Ser Leu | Pro | Thr | His |
1090 | ' 1095 | 1100 | |||||||||
Asp Pro | Ser | Pro | Leu | Gin | Arg Tyr Ser | Glu | Asp | ’Pro Thr | Val | Pro | Leu |
105 | 1110 | 1115 | 1120 | ||||||||
Pro Ser | Glu | Thr | Asp | Gly | Tyr Val Ala | Pro | Leu | Thr Cys | Ser | Pro | Gin |
1125 | 1130 | 1135 | |||||||||
Pro.Glu | Tyr | '.Val | Asn | Gin | Pro Asp Val | Arg | Pro | Gin Pro | Pro | Ser | Pro |
114 0 | 1145 | 1150 | |||||||||
Arg Glu | Gly | Pro | Leu | Pro | Ala Ala Arg | Pro | . Ala | Gly Ala | Thr | Leu' | Glu |
1155 | 1160 | 1165 | |||||||||
Arg Ala | Lys | Thr | Leu | Ser | Pro Gly Lys | Asn | •Gly | Val Val | Lys. | Asp | Val |
1170 | 1175 | 1180 | |||||||||
Phe Ala | Phe | Gly | Gly | Ala | Val Glu Asn | Pro | Glu | Tyr Leu | Thr | Pro | Gin |
185 | 1190 | • 1195 | 1200 | ||||||||
Gly Gly | Ala | Alä | Pro | Gin | Pro'·His Pro | Pro | Pro | Ala Phe | Ser | Pro. | Ala |
1205 | 1210. | 1215 | |||||||||
Phe Asp | Asn | Leu | Tyr | Tyr | Trp Asp Gin Asp | Pro | Pro Glu | Arg | Gly | Äla |
1220 1225 1230.
191
Pro Pro Ser Thr Phe Lys Gly Thr Pro Thr Ala Glu Asn Pro Glu Tyr 1235 1240 1245
Leu Gly Leu Asp Val Pro Val 1250 1255 <210> 5 <211> 648 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
<221> CDS <222> (1)..(648) <400> 5
atg ggc | agc ccc | cgc Arg 5 | tcc gcg | ctg Leu | agc Ser | tgc Cys 10 | ctg ctg ttg cac ttg | ctg Leu | 48 | |||||||
Met 1 | Gly | Ser | Pro | Ser | Ala | Leu | Leu | Leu | His | Leu 15 | ||||||
gtt | ctc | tgc | ctc | caa | gcc | cag | gta | act | gtt | cag | tcc | tca | cct | aat | ttt | 96 |
Val | Leu | Cys | Leu | Gin | Ala | Gin | Val | Thr | Val | .Gin | Ser | Ser | Pro | Asn | Phe | |
20 | 25 | 30 | ||||||||||||||
aca | cag | cat | gtg. | agg | gag | cag | agc | ctg | gtg | acg | gat | cag | ctc | agc | cgc | 144 |
Thr | Gin | His | Val | Arg | Glu | Gin | Ser | Leu | Val | Thr | Asp | Gin | Leu | Ser | Arg | |
35 | 40 | 45 | ||||||||||||||
cgc | ctc | atc | cgg | acc | tac | cag | ctc | tac | agc | cgc | acc | agc | ggg | aag | cac | 192 |
Arg | Leu | íle | Arg | Thr | Tyr | Gin | Leu | Tyr | Ser | Arg | Thr | Ser | Gly | Lys | His | |
50 | 55 | . 60 | ||||||||||||||
'gtg | cag | . gtc | ctg | gcc | aac | aag | cgc | atc | aac | gcc. | atg | gca | gaa | gac | gga | 240 |
Val | Gin | Val | Leu | Ala | Asn | Lys | Arg | íle | Asn | AÍa | Met | Ala | 'Glu | Asp | Gly | |
65 | 70 | 75 | 80 | |||||||||||||
gac | ccc | ttc | gcg | aag | ctc | att | gtg | gag | .acc | gat | act | ttt | gga | agc | aga | 288 |
Asp | Pro | Phe | Ala | Lys | Leu | íle | Val | Glu | Thr | Asp | Thr | Phe | Gly | Ser | Arg | |
v | 85 | 90 | 95 | |||||||||||||
gtc | ega | gtt | cgc | ggc | gca | gag | aca | ggt | ctc | tac | atc | tgc | atg | aac | aag | 336 |
Val | Arg | Val | Arg | Gly | Ala | Glu | Thr | Gly | Leu | Tyr | íle | Cys | Met | Asn | Lys | |
100 | 105 | 110 | ||||||||||||||
aag | ggg | aag | cta | att | gcc | aág | agc | aac | ggc | aaa | ggc | aag | gac | tgc | gta | 384 |
Lys | Gly | Lys | Leu | íle | Ala | Lys | Ser | . Asn | Gly | Lys | Gly | Lys | Asp | Čys | Val | |
115 | 120 | 125 |
192
ttc Phe | aca Thr 130 | gag Glu | atc íle | gtg Val | ctg Leu | gag Glu 135 | aac Asn | aac Asn | tac Tyr | acg Thr | gcg Ala 140- | ctg. Leu | cag Gin | aac Asn | gcc Ala | 432 |
aag | tac | gag | ggc | tgg | tac | atg | gcc | ttt | acc | cgc | aag | ggc | cgg | ccc | cgc | 480 |
Lys | Tyr | Glu | Gly | Trp | Tyr | Met | Ala | Phe | Thr | Arg | Lys | Gly | Arg | Pro | Arg | |
145 | 150 | 155 | 160 | |||||||||||||
aag | ggc | tcc | aag | acg | cgc | cag | cat | cag | cgc | gag | gtg | cac | ttc | atg | aag | 528 |
Lys | Gly | Ser | Lys | Thr | Arg | Gin | His | Gin | Arg | Glu | Val | His | Phe | Met | Lys | |
165 | 170 | 175 | ||||||||||||||
cgc | ctg | ccg | cgg | ggc | cac | cac | acc | acc | gag | cag | agc | ctg | cgc | ttc | gag | 576 |
Arg | Leu | Pro | Arg | Gly | His | His | Thr | Thr | Glu | Gin | Ser | Leu | Arg | Phe | Glu | |
180 | 185 | 190 | ||||||||||||||
ttc | ctc | aac | tac | ccg | ccc | ttc | acg | cgc | agc | ctg | cgc | ggc | agc | cag | agg | . 624 |
Phe | Leu | Asn | Tyr | Pro | Pro | Phe | Thr | Arg | Ser | Leu | Arg | Gly | Ser | Gin | Arg | |
195 | 200 | 205 | ||||||||||||||
act | tgg | gcc | ccg | gag | ccc | ega | tag | 648 | ||||||||
Thr | Trp | Ala | Pro | Glu | Pro | Arg |
210. 215 <210> 6 <211> 215’ <212> PRT
<213> Homo | sapiens | ||||||||||||||
<400> 6. | |||||||||||||||
Met | Gly | Ser | Pro | Arg | Ser | Ala | Leu | Ser | Cys | Leu· | Leu | Leu | His | Leu | Leu |
' 1 | 5' | 10 | 15 | ||||||||||||
Val | Leu | Cys | Leu | Gin | Ala | Gin | Val | Thr | Val | Gin. | Ser | Ser | Pro | Asn | Phe |
20 | 25 | 30. | |||||||||||||
Thr | Gin | His | Val | Arg | Glu | Gin | Ser | Leu | Val | Thr | Asp | Gin | Leu | Ser | Arg |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Arg | Leu | íle | Arg | Thr | Tyr | Gin | Leu | Tyr | Ser | Arg | Thr | Ser | Gly | Lys | His |
50 | 55 | . 60 | |||||||||||||
Val | Gin | Val | Leu | Ala | Asn | Lys | Arg | Tie | Asn | Ala | Met | Ala | Glu | Asp | Gly |
193
65 | 70 . | . 75 | .80 | ||||||||||||
Asp | Pro | Phe | Ala | Lys | Leu | íle | Val | Glu | Thr | Asp | Thr | Phe | Gly | Ser | Arg |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Val | Arg | Val | Arg | Gly | Ala | Glu | Thr | Gly | Leu | Tyr | íle | Cys | Met | Asn | Lys |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Lys | Gly | Lys | Leu | íle | Ala | Lys | Ser | Asn | Gly | Lys | Gly | Lys | Asp | Cys | Val |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Phe | Thr | Glu | íle | Val | Leu | Glu | Asn | Asn | Tyr | Thr | Ala | Leu | Gin | Asn | Ala |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Lys | Tyr | Glu | Gly | Trp | Tyr | Met | Ala | Phe | Thr | Arg | Lys | Gly | Arg | Pro | Arg |
145 | 150 | '155 | 160 | ||||||||||||
Lys | Gly | Ser | Lys | Thr | Arg | Gin | His | Gin | Arg | Glu | Val | His | Phe | Met | Lys |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Arg. | Leu | Pro | Arg | Gly | His | His | Thr | Thr | Glu | Gin | Ser | Leu | Arg | Phe | Glu |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Phe | Leu | Asn | Tyr | Pro | Pro | Phe | Thr | Arg | Ser | Leu | Arg | Gly | Ser | Gin | Arg |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Thr | Trp | Ala | Pro | .Glu | Pro | Arg |
210 215
<210> | 7 | |
<211> | 2256 | |
<212> | DNA | |
<213> | Mus | musculus |
<220> | ||
<221> | CDS | |
<222> | (D · | . (225.6) |
<400> | 7 ··. |
atg | tgg | aac | gca | ctg | cag | gac | aga | gac | tcc | gcg | gag | gtc | ctg | gga | cac |
Met | Trp | Asn | Ala | Leu | Gin | Asp | Arg | Asp | Ser | Ala | Glu | Val | Leu | Gly | His |
1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
cgc | cag | cgc | tgg | ctc | cgt | gtt· | ggg | aca | ctg | gtg | ctg- | get | tta | acc | gga |
194
Arg Gin | Arg | Trp 20 | Leu Arg Val | Gly | Thr 25 | Leu | Val | Leu | Ala | Leu 30 | Thr | Gly | ||||
acc | ttc | ctc | att | ggc | ttc | ctc | ttt | ggg | tgg | ttt | ata | aaa | cct | tcc | aat | 144 |
Thr | Phe | Leu | íle | Gly | Phe | Leu | Phe | Gly | Trp | Phe | íle | Lys | Pro | Ser | Asn | |
35 | 40 | 45 | ||||||||||||||
gaa | get | ačt | ggt | aat | gtt | tcc | cat | tet | ggc· | atg | aag | aag | gag | ttt | ttg | 192 |
Glu | Ala | Thr | Gly | Asn | Val | Ser | His | Ser | Gly | Met | Lys | Lys | Glu | Phe | Leu | |
50 | 55 | 60 | ||||||||||||||
cat | gaa | ttg | aag | . get | gag | aac | atc | aaa | aaa | ttt | tta | tác | aat | ttc | aca | 240 |
His | Glu | Leu | Lys | Ala | Glu | Asn | íle | Lys | Lys | Phe | Leu | Tyr | Asn | Phe | Thr | |
65 | 70 | 75 | 80 | |||||||||||||
cgg | aca' | cca | cac | ttg | gca | gga | aca | caa | aat | aat | ttt | gag | ctt | gca | aag | 288 |
Arg | Thr | Pro | His | Leu | Ala | Gly | Thr | Gin | Asn | Asn | Phe | Glu | Leu | Ala | Lys | |
85 | 90 | 95 | ||||||||||||||
caa | att | cat | gac | cag | tgg | aaa | gaa | ttt | ggc | ctg | gat | ttg | gtt | gag | tta | 336 |
Gin | íle | His | Asp | Gin | Trp | Lys | Glu | Phe | Gly | Leu | Asp. | Leu | Val | Glu | Leu | |
100 | 105 | 110 | ||||||||||||||
teč | cat | tac | gat | gtc | ttg | ctg | tcc | tat | cca | aat | aaa | act | cat | cct | aac | 384 |
Ser | His | Tyr | Asp | Val | Leu | Leu | Ser | Tyr | Pro | Asn | Lys | Thr | His | Pro | Asn | |
115 | 120 | 125 | ||||||||||||||
tat | atc | tca | ata | att | aat | gaa | gat | gga | aat | gag | att | ttc | aaa. | aca | tca | 432 |
Tyr | íle | Ser | íle | íle | Asn | Glu | Asp | Gly | Asn | Glu | íle | Phe | Lys | Thr | Ser | |
130 | 135 | 140· | ||||||||||||||
tta | tet | gaa | cag | cca | ccc | cca | gga | tat·' | gag | aat | ata | tca | gat | gta | gtg | 480 |
Leu | Ser | Glu | Gin | Pro | Pro | Pro | Gly | Tyr | Glu | Asn | íle | Ser | Asp | Val | Val | |
145 | 150 | 1 | 155 | 160 | ||||||||||||
cca | cca | tac | agt | gcc | ttc | tet | cca | caa | ggg | aca | cca | gag | ggt | gat | cta | 528 |
Pro | Pro | Tyr | Ser | Ala | Phe | Ser | Pro | Gin | Gly | Thr. | Pro | Glu | Gly | Asp | Leu | |
165 | 170 | 175 | ||||||||||||||
gtg | tat | gtc | aac | tat | gca | ega | act | gaa | gac | ttc | ttt | aaa | ctg | gaa | cgg | 576 |
Val. | Tyr | Val | Asn | Tyr | Ala | Arg | Thr | Glu | Asp | Phe | Phe | Lys | Leu | Glu | Arg . | |
180 | 185 | 190 | ||||||||||||||
gaa | atg | aag | atc | agt | tgt | tet | ggg | aag | att | gtg | att | gcc | aga | tat | ggg | 624 |
Glu | Met | Lys' | íle | Ser | Cys | Ser | Gly | Lys | íle | Val | íle | Ala | Arg | Tyr | Gly | |
195 | 200 | 205 | ||||||||||||||
aaa | gtg | ttc | aga | gga | aat | atg | gtt | aaa | aat | get | caa | ctg | gca | ggg | gca | 672 |
Lys | Val | Phe | Arg | Gly | Asn | Met· | Val | Lys | Asn | Ala | Gin | Leu | Ala | Gly | Ala |
195
210 | 215 | 220 | ||||||||||||||
aaa | gga | atg | att | ctg | tac | tca | gac | cct | get | gac | tac | ttt | gtt | cct | gcg | 720 |
Lys | Gly | Met | íle | Leu | Tyr | Ser | Asp | Pro | Ala | Asp | Tyr | Phe | Val | Pro | Alä | |
225 | 230 | 235 | 240 | |||||||||||||
gtg | aag | tcc | tat | cca | gat | ggc | tgg | aac | ctc | cct' | gga | ggt | ggt | gtc | caa | 768 |
Val | Lys | Ser | Tyr | Pro | Asp | Gly | Trp | Asn | Leu | Pro | Gly | Gly | Gly | Val | Gin | |
245 | 250 | 255 | ||||||||||||||
cgt | gga | aat | gtc | tta | aat | ctt | aat | ggt | gca | ggt | gac | ccg | ctc | aca | cca | 816 |
Arg | Glý | Asn | Val | Leu | Asn | Leu | Asn | Gly | Ala | Gly | Asp | Pro | Leu | Thr | Pro | |
260 | 265 | 270 | ||||||||||||||
ggt | tac | cca | gca | aat | gaa | cat | get | tat | agg | cat; | gag | ttg | aca | aac | get | 864 |
Gly | Tyr | Pro | Ala | Asn | Glu | His | Ala | Tyr | Arg | His | Glu | Leu | Thr | Asn | Ala | |
275 | 280 | 285 | ||||||||||||||
gtt | ggc | ctt | . cca | agt | att | cct | gtc | cat | cct | att | gga | tat | gat | gat | gca | 912 |
Val | Gly | Leu | Pro | Ser | íle | Pro | Val | His | Pro | íle | Gly | Tyr | Asp | Asp | Ala | |
290 | 295 | 300 | ||||||||||||||
cag | aaa | ctc | tta | gaa | cac | atg | ggt | ggt | cca | gca | ccc | cct | gac | agt | agc | 960 |
Gin | Lys | Leu | Leu | Glu | His | Met | Gly | Gly | Pro | Ala | Pro | Pro | Asp | Ser | Ser | |
305 | 310 | 315 | 320 | |||||||||||||
tgg. | aag | gga | gga | tťá | aaa | gtg | cct | tac | aac | gtg | gga | cct | ggc | ttt | get | 1008 |
Trp | Lys | Gly | Gly | Leu | Lys | Val | Pro | Tyr | Asn | Val | Gly | Pro | Gly | Phe | Ala | |
325 | 330 | 335 | ||||||||||||||
gga | aac | ttt | tca | aca | caa | aag | gtc | aag | atg | cat | att | cac· | tet | tac | act | 1056 |
Gly | Asn | Phe | Ser | Thr | Gin | Lys | Val | Lys | Met | His | íle. | His | . Ser | Tyr | Thr | |
340 | 345 | 350 | ||||||||||||||
aaa | gtg | aca | aga | atc | tat | aat | gtc | att | ggc | acc | ctc | aaa | gga | get | ctg | .· 1104 |
Lys | Val | Thr | Arg | íle | Tyr | Asn | Val | íle | Gly | Thr | Leu | Lys | Gly | Ala | Leu | |
355 | 360 | 365 | ||||||||||||||
gaa | cca | gac | aga | tat | gtt | att | ctt | gga | ggt | cac | ega. | gac. | get | tgg | gta | 1152 |
Glu | Pro | Asp | Arg | Tyr | Val | íle | Leu | Gly | Gly | His. | Arg | Asp | Ala | Trp | Val | |
370. | 375 | 380 | ||||||||||||||
ttt | ggt | ggc | att | gac | cct | cag | agť | gga | gca. | get | gtt | gtt | cat | gaa | att | 1200 |
Phe | Gly | Gly | íle | Asp | Pro | Gin. | Ser | Gly | Ala | Ala | Val | Val | His | Glu | íle | |
385 | 390 | 395 | 400 |
196
gtg cgg agc | ttt Phe | gga Gly 405 | acc Thr | ctg Leu | aag aag aaa | gga Gly | cgg Arg | agg Arg | cct Pro | aga Arg 415 | agg Arg | 1248 | ||||
Val | Arg | Ser | Lys | Lys | Lys 410 | |||||||||||
aca | att | ttg | ttt' | gca | agc | tgg | gat | gca | gaa | gaa | ttt | ggc | ctt | ctt | ggt | 1296 |
Thr | íle | Leu | Phe | Ala | Ser | Trp | Asp | Ala | Glu | Glu | Phe | Gly | Leu | Leu | Gly | |
420 | 425 | 430 | ||||||||||||||
tet | act | gag | tgg | gca | gag | gaa | cat | tca | aga | ctc | cta | caa | gag | ega | ggt | 1344 |
Ser | Thr | Glu | Trp | Ala | Glu | Glu | His | Ser | Arg | Leu | Leu | Gin | Glu | Arg | Gly | |
435 | 440 | 445 | ||||||||||||||
gtg | get | tat | att | aat | get | gat | tet | tcc | ata | gaa | gga | aat | tac | act | cta. | 1392 |
Val | Ala | Tyr | íle | Asn | Ala | Asp | Ser | Ser | íle | Glu' | Gly | Asn | Tyr | Thr | Leu | |
450 | 455 | 460 | ||||||||||||||
aga | gtt | gat | tgc | aca | cca | ctg | atg | tac | agc | tta | gtg | tac | aac | cta | aca | 1440 |
Arg | Val | Asp | Cys | Thr | Pro | Leu | Met | Tyr | Ser | Léu | Val | Tyr | Asn | Leu | Thr | |
465 | 470 | 475 | 480 | |||||||||||||
aaa | gag | ctg | caa | agc | cca | gat | gaa | ggt | ttt | gaa | gga | aaa | tet | ctt | tat | 1488 |
Lys | Glu | Leu | Gin | Ser | Pro | Asp | Glu | Gly | Phe | Glu | Gly | Lys | Ser | Leu | Tyr | |
485 | 490 | 495 | ||||||||||||||
gac | agc | tgg | aaa | gaa | aag | agt | cct | tca | cct | gag | ttc | att | gga | atg | ccc | 1536 |
Asp | Ser | Trp | Lys | Glu | Lys | Ser | Pro | Ser | Pro | Glu | Phe | íle | Gly | Met | Pro | |
500 | 505 | 510 | ||||||||||||||
aga | att | agc | aag | ctg | ggg | tet | ggc | aat | gat | ttt | gaa | gtg | . ttc | ttc | caa '· | 1584 |
Arg | íle | Ser | Lys | Leu | Gly | Ser | Gly | Asn | Asp | Phe | Glu | Val | Phe | Phe | Gin | |
515 | 520 | 525 | ||||||||||||||
aga | ctt. | gga | att | get | tca | ggc | aga | gcc | ega | tat | act | aaa | aat | tgg | aaa | 1632 |
Arg | Leu | Čly | íle | Ala | Ser | Gly | Arg | Ala | Arg | Tyr | Thr | Lys | Asn | Trp | Lys | • |
530 | 535 | 540 | ||||||||||||||
act | aac | aaa | gtc | agc | agc | tat | cct | ctc | tat | cac | agt | gtc | tat | gaa | aca.' .. | . 1680 |
Thr | Asn | Lyš | Val | Ser | Ser | Tyr | Pro | Leu | Tyr | His | Ser | Val | Tyr | Glu | Thr | |
5 45 | 550 | '555 | 560 | |||||||||||||
tat | gag | ctg | gta | gta | aaa | ttt | tat | gac | cca | aca | ttt | aaa | tac | cac | ctc | 1728 |
Tyr | Glu | Leu | Val | Val | Lys | Phe | Tyr | Asp | Pro | Thr | Phe | Lys' | Tyr | His | Leu | |
565 | 570 | 575 | ||||||||||||||
act | gtg | gcc | cag | gtt | ega | gga | gcg | atg | gta | ttt | .gaa | ctt | gcc | aat | tet.. | 177 6 |
Thr | Val | Ala | Gin | Val | Arg· | Gly | Ala | Me.t | Val | Phe | Glu | Leu | Ala | Asn | Ser |
580 ' 585· . 590
197
ata íle | gtg Val | ctt ccc | ttt Phe | gac Asp | tgc Cys | caa Gin 600 | agt Ser | tat Tyr | get gta | get Ala 605 | ctg Leu | aag Lys | aag Lys | 1824 | ||
Leu 595 | Pro | Ala | Val | |||||||||||||
tat | get | gac | act | atc | tac | aat | att | tca | atg | aaa | cat | cca | caa | gaa | atg | 1872 |
Tyr | Ala | Asp | Thr | íle | Tyr | Asn | íle | Ser | Met | Lys | His | Pro | Gin | Glu | Met | |
610 | 61.5 | 620 | ||||||||||||||
aag | get | tac | atg | ata | tca | ttt | gat | tca | ctg | ttt | tet | gca | gtc | aat | aat | 1920 |
Lys | Ala | Tyr | Met | íle | Ser | Phe | Asp | Ser | Leu | Phe | Ser | Ala | Val | Asn | Asn | |
625 | 630 | 635 | 640 | |||||||||||||
ttt | aca | gat | gtt | gca | tet | aag | ttc | aat | cag | aga | ctg | caa | gag | tta | gac | 1968 |
Phe | Thr | Asp | Val | Ala | Ser | Lys | Phe | Asn | Gin | Arg | Leu | Gin | Glu | Leu | Asp | |
645 | 650 | 655 | ||||||||||||||
aaa. | age | aac | ccc | ata | tta | ctg | aga | att | atg | aat | gac | cag | ctg | atg | tat | 2016 |
Lys | Ser | Asn | Pro | íle | Leu | Leu | Arg | íle | Met | Asn | Asp | Gin | Leu | Met | Tyr | |
660 | 665 | 670 | ||||||||||||||
ctg | gaa | cgt | gca | ttc | att | gat | cct | tta | ggc | tta | cca | gga | agg | cct | ttc | 2064 |
Leu | Glu | Arg | Ala | Phe | íle | Asp | Pro | Leu | Gly | Leu | Pro | Gly | Arg | Pro | Phe. | |
675 | 680 | 685 | ||||||||||||||
tac | . agg | cat | acc | atc | tat | get | cca | age | age | cac | aac | aag | tat | gča | gga | 2112 |
Tyr | Arg | His | Thr | íle | Tyr | Ala | Pro | Ser | Ser | His | Asn | Lys | Tyr | Ala | Glý | |
690 | 695 | 700 | ||||||||||||||
gaa | tca | ttc | cct | ggg | att | tat | gat | gcc | ctt | ttt | gät | ata | agt | age | aaa | 2160 |
Glu | Ser | Phe | Pro | Gly | íle | Tyr | Asp | Ala | Leu | Phe | Asp | íle | Ser | Ser | Lys' | |
705 | 710 | 715 | 720 | |||||||||||||
gtc | aat | get | tet | aag | gcc | tgg | aac | gaa | gtg | aag | aga | cag | att | tet | att | 2208 |
Val | Asn | Ala | Ser | Lys | Ala | Trp | Asn | Glu | Val | Lys | Arg | Gin | íle | Ser | íle | |
725 | 730 | 735 | ||||||||||||||
gca | acc | ttt | aca | gtg | caa | get | gca | gca | gag | act | ctg | agg | gaa | gta. | get | 2256 |
Ala | Thr | Phe | Thr | Val | Gin | Ala | Ala | Ala | Glu | Thr | Leu | Arg | Glu | Val | Ala | |
740 | 745 | 750 |
<210> 8 <211> 752 <212> FRT <213> Mus musculus <400> 8
Met Trp Asn Ala Leu Gin Asp Arg Asp Ser Ala Glu Val Leu Gly His 1 5 . 10 15 '
198
Arg Gin Arg Trp Leu. Arg Val Gly Thr Leu Val Leu Ala Leu Thr Gly | |||||||||||||||
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Thr | Phe | Leu | íle | Gly | Phe | Leu | Phe | Gly | Trp | Phe | íle | Lys | Pro | Ser | Asn |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Glu | Ala | Thr | Gly | Asn | Val | Ser | His | Ser | Gly | Met | Lys | Lys | Glu | Phe | Leu |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
His | Glu | Leu | Lys | Ala | Glu | Asn | íle | Lys | Lys | Phe | Leu | Tyr | Asn | Phe | Thr |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Arg | Thr | Pro | His | Leu | Ala | Gly | Thr | Gin | Asn | Asn | Phe | Glu | Leu | Ala | Lys |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Gin | íle | His | Asp | Gin | Trp | Lys | Glu | Phe | Gly | Leu | Asp | Leu | Val | Glu | Leu |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Ser | His | Tyr | Asp | Val | Leu | Leu | Ser | Tyr | Pro | Asn | Lys | Thr | His | Pro | Asn |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Tyr | íle | Ser | íle | íle | Asn | Glu | Asp | Gly | Asn | Glu | íle | Phe | Lys | Thr | Ser |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Leu | Ser | Glu | Gin | Pro | Pro | Pro | Gly | Tyr | Glu | Asn | íle | Ser | Asp | Val | Val |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Pro | Pro | Tyr | Ser | Ala | Phe | Ser | Pro. | Gin | Gly | Thr | Pro | Glu | Gly | Asp | Leu |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Val | Tyr | Val | Asn | Tyr | Ala | Arg | Thr | Glu | Asp | Phe | Phe | Lys | Leu | Glu | Arg |
180 | 185 | 190. | |||||||||||||
Glu | Met | Lys | íle | Ser | Cys | Ser | Gly. | Lys | íle | Val | He | Äla | Arg. | Tyr | Gly |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Lys | Val | Phe | Arg | Gly | Asn | Met | Val | Lys | Asn | Ala | Gin· | Leu | Ala | Gly | Ala |
210 | 215 | 22 0 | |||||||||||||
Lys | Gly | Met | .íle | Leu | Tyr | Ser | Asp | Pro | Ala | Asp | Tyr. | Phe | Val | Pro | Ala |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Val | Lys | Ser | Tyr | Pro | Asp | Gly | Trp | Asn | Leu | Pro | Gly | Gly | Gly | Val | Gin |
245 250 255
199
Arg Gly Asn | Val 260 | Leu Asn Leu | Asn Gly , 2 65 | Ala | Gly Asp | Pro | Leu 270 | Thr | Pro | ||||||
Gly | Tyr | Pro | Ala | Asn | Glu | His | Ala | Tyr | Arg | His. | Glu | Leu | Thr | Asn | Ala |
275. | 280 | 285 | 1 | - | |||||||||||
Val | Gly | Leu | Pro | Ser | íle | Pro | Val | His | Pro | íle | Gly | Tyr | Asp | Asp | Ala |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
Gin | Lys | Leu | Leu | Glu | His | Met | Gly | Gly | Pro | Ala | Pro | Pro | Asp | Ser | Ser |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
Trp | Lys | Gly | Gly | Leu | Lys | Val | Pro | Tyr | Asn | Val | Gly | Pro | Gly | Phe | Ala |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Gly | Asn | Phe | Ser | Thr. | Gin | Lys | Val | Lys | Met | His | íle | His | Ser | Tyr | Thr |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
Lys | Val | Thr | Arg | íle | Tyr | Asn | Val | íle | Gly | Thr | Leu | Lys | Gly | Ala | Leu |
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
Glu | Pro | Asp | Arg | Tyr | Val | íle | Leu | Gly | Gly | His | Arg | Asp | Ala | Trp | Val |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
Phe | Gly | Gly | íle | Asp | Pro | Gin | Ser | Gly | Ala | Ala | Val | Val | His | Glu | íle |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
Val | Arg | Ser | Phe | Gly | Thr | Leu | Lys | Lys | Lys | Gly | Arg | Arg | Pro | Arg | Arg |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
Thr | íle | Leu | Phe | Ala | Ser | Trp | Asp | Ala | Glu | Glu | Phe | Gly | Leu | Leu | Gly |
420 | 425 | 43Ó | |||||||||||||
Ser | Thr | Glu | Trp | Ala | Glu | Glu | His | Ser | Arg | Leu | Leu | Gin | Glu | Arg | Gly |
435 | 440 | 4 45 | |||||||||||||
Val | Ala | Tyr | íle' | Asn | Ala | Asp | Ser | Ser | .Iie | Glu | Gly | Asn | Tyr | Thr | Leu |
450 | 455 | 460 | |||||||||||||
Arg | Val | Asp | Cys | Thr | Pro | Leu | Met | Tyr | Ser | Leu | Val | Tyr | Asn | Leu- | .Thr |
465 | 470 | 475 | 480 | ||||||||||||
Lys | Glu | Leu | Gin | Ser | Pro | Asp | Glu | Gly | Phe | Glu | Gly | Lys | Ser | Leu | Tyr |
485 | 490 | 495 | |||||||||||||
Asp | Ser | Trp | Lys | Glu | Lys | Ser | Pro | Ser | Pro | Glu | Phe | íle | Gly Met | Pro | |
500 | 505 | 510 | |||||||||||||
Arg | íle | Ser | Lys | Leu | Gly | Ser | Gly | Asn | Asp | Phe | Glu | Val | Phe | Phe | Gin |
515 520 525
200
Arg Leu Gly íle Ala .530
Thr Asn Lys Val Ser 549
Tyr Glu Leu Val Val 565
Thr Val Ala Gin Val 580 íle Val Leu Pro Phe 595
Tyr Ala Asp Thr íle 610
Lys Ala Tyr Met íle 625
Phe Thr· Asp Val Ala 645
Lys Ser Asn Pro íle 660
Leu Glu Arg Ala Phe 675
Tyr Arg His Thr íle 690
Glu Ser Phe Pro Gly 705 . . Val Asn Ala Ser Lys 725
Ala- Thr Phe Thr Val 740
Ser Gly Arg Ala Arg Tyr Thr Lys Asn Trp 535 540
Ser Tyr Pro Leu Tyr His Ser Val Tyr Glu 550 555
Lys Phe Tyr Asp Pro Thr Phe Lys Tyr His 570 ' 575
Arg Gly Ala Met Val Phe Glu Leu Ala. Asn 585 590
Asp Cys Gin Ser Tyr Ala Val Ala Leu Lys 600 605
Tyr Asn íle Ser Met Lys His Pro Gin Glu 615 620
Ser Phe Asp Ser Leu Phe Ser Ala Val Asn 630 635
Ser Lys Phe Asn Gin Arg Leu Gin Glu Leu 650 655
Leu Leu Arg íle Met Asn Äsp Gin Leu Met 665 670 íle Asp Pro Leu Gly Leu Pro Gly Arg Pro .680 685
Tyr Ala Pro Ser Ser His Asn Lys Tyr Ala 695 700 íle Tyr Asp Ala Leu Phe Asp íle Ser Ser 710 715 '
Ala.Trp Asn Glu Val Lys Arg Gin íle Ser 730 7.35
Gin Ala Ala Ala Glu Thr Leu Arg Glu Val 745 -750.
Lys
Thr 5 60··
Leu
Ser
Lys
Met
Asn
640
Asp
Tyr .Phe
Gly
Lys
720 íle
Ala
201 <210> 9 <211Χ 2082 .
<212> DNA <213> Mus musculus ,<220>
<221> CDS <222> (1)..(2082) <400> 9
atg Met 1 | aag Lys | aag gag ttt | ttg cat Leu His | gaa Glu | ttg Leu | aag get gag | aac atc aaa | aaa Lys | 48 | |||||||
Lys | Glu | Phe 5 | Lys 10 | Ala | Glu | Asn | íle | Lys 15 | ||||||||
ttt | tta | tac | aat | ttc. | aca | cgg | aca | cca | cac | ttg | gca | gga | aca | caa | aat | 96 |
Phe | Leu | Tyr | Asn | Phe | Thr | Arg | Thr | Pro | His | Leu · | Ala | Gly | Thr | Gin | Asn | |
20 | 25 | . .30 | ||||||||||||||
aat | ttt | gag- | ctt | gca | aag | caa | att | cat | gac | cag | tgg | aaa | gaa | ttt | ggc | 144 |
Asn | Phe | Glu | Leu | Ala | Lys | Gin | íle | His | Asp | Gin | Trp | Lys | Glu | Phe | Gly | |
35 | 40 | 45 | ||||||||||||||
ctg | gat | ttg | gtt | gag | tta | tcc | cat | tac | gat | gtc | ttg | ctg | tcc | tat. | cca | 192 |
Leu | Asp | Leu. | Val | Glu | Leu | Ser | His | Tyr | Asp | Val | Leu | Leu | Ser | Tyr | Pro | |
50 | 55 | 60 | ||||||||||||||
aat | aaa | act | cat | ccť | aac | tat | atc | tca | ata | att | aat | gaa | gat | gga | aat | 240 |
Asn | Lys | Thr | His | Pro | Asn | Tyr | íle | . Ser | íle | íle | Asn | Glu | Asp | Gly | Asn | |
65 | 70 | 75 | 80 | |||||||||||||
gag | att | ttc | aaa | aca | tca | tta | tet | gaa | cag | cca | ccc | cca | gga | tat | gag | 288. |
Glu | íle' | Phe | Lys | Thr | Ser | Leu· | Ser | Glu | Gin | Pro | Pro | Pro | Gly | Tyr | Glu | |
85 | 90 | 9.5 | ||||||||||||||
aat | ata | tca | gat | gta | gtg | cca | cca | tac | agt | gcc | ttc | tet | cca | caa | ggg | 336 |
Asn | íle | Ser | Asp | Val | Val | Pro | Pro | Tyr | Ser | Ala | Phe | Ser | Pro | Gin | Gly | |
100 | 105 | 110 | ||||||||||||||
aca | cca | gag | ggt | gat | cta | gtg | tat | gtc | aac | tat | gca | ega | act | gaa. | gac | 38.4 |
Thr | Pro | Glu | Gly | Asp | Leu | Val | Tyr | Val | Asn | Ty.r | Ala | Arg | Thr | Glu | Asp | |
115 | 120 | 125 | ' '. | |||||||||||||
ttc | ttt | aaa | ctg | gaa | cgg | gaa | atg | ' aag | atc | agt | tgt | tet | . ggg | aag | . att | 432 |
Phe | Phe | Lys | Leu | Glu | Arg | Glu | Met | Lys' | íle | Šer | Cys | Ser | Gly. | Lys | íle | |
130 | 135 | '140 | ||||||||||||||
gtg | att | gcc | aga | tat | ggg | aaa | gtg | ttc | aga | gga | aat | atg | gtt | aaa | aat . | 480 |
Val | íle | Ala | Arg | Tyr | Gly | Lys | Val | Phe | Arg | Gly | Asn | Met | Val | Lys | Asn | |
145 | 150 | 155 | 160 |
202
get Ala | caa Gin | ctg gca ggg gca | aaa Lys | gga Gly | atg Met | att íle 170 | ctg Leu | tac Tyr | tca Ser | gac Asp | cct Pro 175 | get Ala i | 528 | |||
Leu | Ala | Gly 165 | Ala | |||||||||||||
gac | tac | ttt | gtt | cct | gcg | gtg | aag | tcc | tat | cca | gat | ggc | tgg | aac | ctc | 576 |
Asp | Tyr | Phe | Val | Pro | Ala | Val | Lys | Ser | Tyr | Pro | Asp | Gly | Trp | Asn | Leu | |
180 | 185 | 190 | ||||||||||||||
cct | gga | ggt | ggt | gtc | caa | cgt | gga | aat | gtc | tta | aat | ctt | aat | ggt | gca | 624 |
Pro' | Gly | Gly | Gly | Val | Gin | Arg | Gly | Asn | Val | Leu | Asn | Leu | Asn | Gly. | Ala | |
195 | 200 | 205 | ||||||||||||||
ggt | gac' | ccg | ctc | aca | cca | ggt | tac | Cca | gca | aat | gaa | cat | get | tat | agg | 672 |
Gly | Asp | Pro | Leu | Thr | Pro | Gly | Tyr | Pro | Ala | Asn | Glu | His | Ala | Tyr | Arg . | |
210 | 215 | 220 | ||||||||||||||
cat | gag | ttg | aca | aac | get | gtt | ggc | ctt | cca | agt | att | cct | gtc | cat | cct | 720 |
His | Glu | Leu | Thr | Asn | Ala | Val | Gly | Leu | Pro | Ser | íle | Pro | Val | His | Pro | |
225 | 230 | 235 | 240 | |||||||||||||
att | gga | tat | gat | gat | gca | cag | aaa | ctc | tta | gaa' | cac | atg | ggt | ggt | cca | 768 |
íle | Gly | Tyr | Asp | Asp | Ala | Gin | Lys | Leu | Leu | Glu | His | Met | Gly | Gly | Pro | |
245 | 250 | 255 | ||||||||||||||
gca | ccc | cct | gac | agt | agc | tgg | aag | gga | gga | tta | aaa | gtg | cct | . tac | aac | 816 |
Ala | Pro | Pro | Asp | Ser | Ser | Trp | Lys | Gly | Gly | Leu | Lys | Val | Pro | Tyr | Asn | |
260 | 265 | 270 | ||||||||||||||
gtg | gga | cct | ggc | . ttt. | get | gga | aac | ttt | tca | aca | caa | aag | gtc | aag | atg | 864 |
Val | Gly | Pro. | Gly | Phe | Ala | Gly | Asn | Phe | Ser. | Thr | Gin | Lys | Val | Lys | Met. | |
275 | 280 | 285 | ||||||||||||||
cat | att | cac | tct | tac | act | aaa | gtg. | aca | aga | atc | tat | aat | gtc | att | ggc | 912 |
His | íle | His | Ser | Tyr | Thr | Lys | Val | Thr | Arg | íle | Tyr | Asn | Val | íle | Gly | |
290 | 295 | 300 | ||||||||||||||
acc | ctc | aaa | gga | get | ctg | gaa | cca | gac | aga | tat | g t.ť | att | ctt | gga | ggt | . 960 |
Thr | Leu | Lys | Gly | Ala | Leu | Glu | Pro | Asp- | Arg | Tyr | Val | íle | Leu | Gly | Gly | |
305 | 31Ό | 315 | 320 | |||||||||||||
cac | ega | gac | get | tgg | gta | ttt | ggt | ggc | att | gac | cct | cag | agt | gga | gca | 1008 |
His | Arg | Asp | Ala | Trp | Val | Phe | Gly | Gly | íle | Asp | Pro | Gin | Ser | Gly | Ala. |
325 330 335
203
get Ala | gtt.gtt | cat His 340 | gaa Glu | att íle | gtg cgg Val Arg | age Ser 345 | ttt Phe | gga Gly | acc Thr | ctg aag aag | aaa Lys | 1056 | ||||
Val | Val | Leu | Lys 350 | Lys | ||||||||||||
gga. | cgg | agg | cct | aga | agg | aca | att | ttg | ttt. | gca | age | tgg | gat | gca | gaa | 1104 |
Gly | Arg | Arg | Pro | Arg | Arg | Thr | íle | Leu | Phe | Ala | Ser | Trp | Asp | Ala | Glu | |
355 | 360 | 365 | ||||||||||||||
gaa | ttt | ggc | ctt | ctt | ggt | tet | act | gag | tgg | gca | gag | gaa | cat | tca | aga. | 1152 |
Glu | Phe | Gly | Leu | Leu | Gly | Ser | Thr | Glu | Trp | Ala | Glu | Glu | His | Ser | Arg | |
370 | 375 | 380 | ||||||||||||||
ctc | cta | caa | gag | ega | ggt | gtg | get | tat | att | aat | get | gat | tet | tcc | ata | 1200 |
Leu | Leu | Gin | Glu | Arg | Gly | Val | Ala | Tyr | íle | Asn | Ala | Asp | Ser | Ser | íle | |
385 | 390 | 395 | 400 | |||||||||||||
gaa | gga | aat | tac | act | cta | aga | gtt | gat | tgc | aca | cca | ctg | atg | tac | age | 1248 |
Glu | Gly | Asn | Tyr | Thr | Leu | Arg | Val | Asp | Cys | Thr | Pro | Leu | Met | Tyr | Ser | |
405 | 410 | 415 | ||||||||||||||
tta | gtg | tac | aac | cta | aca | aaa | gag | ctg | caa | age | cca | gat | gaa | ggt | ttt | 1296 |
Leu | Val | Tyr | Asn | Leu | Thr | Lys | Glu | Leu | Gin | Ser | Pro | Asp | Glu | Gly | Phe | |
420 | 425 | 430 | ||||||||||||||
gaa | gga | aaa | tet | ctt | tat | gac | age | tgg | aaa | gaa | aag | agt | cct | tča. | cct. | . 1344 |
Glu | Gly | Lys | Ser | Leu | Tyr | Asp | Ser | Trp | Lys | Glu | Lys | Ser | Pro | Ser | Pro · | |
435 | 440 | 445 | ||||||||||||||
gag | ttc | att | gga | atg | ccc | aga | att | age | aag | ctg | ggg | tet | ggc | aat | gat | 1392 |
Glu | Phe | íle | Gly | Met | Pro | Arg | íle | Ser | Lys | Leu | Gly | Ser | Gly | Asn | Asp | |
450 | 455 | 460 | ||||||||||||||
ttt | gaa | gtg | ttc | ttc | caa | aga | ctt | gga | att | get | tca | ggc | aga | gcc | ega | 1440 |
Phe | Glu | Val | Phe | Phé | Gin | Arg | Leu | Gly | íle | Ala | Ser | Gly Arg | Ala | Arg | ||
465 | 470 | 475. | 480' | |||||||||||||
tat | act | aaa | aat | tgg | aaa | act | aac | aaa | gtc | age | age | tat | cct | ctc | tat | 14 88 |
Tyr | Thr | Lys | Asn | Trp | Lys | Thr | Asn | Lys | Val | Ser | Ser | Tyr | Pro | Leu | Tyr | |
4 85 | 490 | 495 | ||||||||||||||
cac | agt | gtc | tat | gaa | aca | tat | gag | ctg | gta | gta | aaa | ttt | tat | gac | cca | 1536 |
His | . Ser | Val | Tyr | Glu | Thr | Tyr | . Glu | Leu | Val | Val | Lys | Phe | Tyr | Asp | Pro | |
500 | 505 | 510 | ||||||||||||||
aca | ttt | aaa | tac | cac | ctc | act | gtg | gcc | cag | gtt | ega | gga | gcg | atg | gta | 1584 |
Thr | Phe | Lys | Tyr | His | Leu | Thr | Val | Ala | Gin | Val | Arg | Gly | Ala | Met | Val’ | |
515 | 520 | 525 | ||||||||||||||
ttt | gaa | ctt | gcc | aat | tet | ata | gtg | ctt | ccc | ttt | gac | tgc | caa | agt | tat | 1632 |
204
Phe | Glu Leu 530 | Ala | Asn | Ser | íle 535 | Val | Leu | Pro | Phe | Asp 540 | Cys | Gin | Ser | Tyr | ||
get | gta | get | ctg | aag | aag | tat | get | gac | act | atc | tac | aat · | att. | tca | atg | 1680 |
Ala | Val | Ala | Leu | Lys | Lys | Tyr | Ala | Asp | Thr | íle | Tyr | Asn | íle· | Ser | Met | |
545 | 550 | 555 | 560 | |||||||||||||
aaa | cat | cca | caa | gaa | atg | aag | get | tac | atg | ata | tca | ttt | gat | tca | ctg | 1728 |
Lys | His | Pro | Gin | Glu | Met | Lys | Ala | Tyr | Met | íle | Ser | Phe | Asp | Ser | Leu | |
565 | 570 | 575 | ||||||||||||||
ttt | tet | gca | gtc | aat | aat | ttt | aca | gat | gtt | gca | tet | aag | ttc | aat | Cag | 1776 |
Phe | Ser | Ala | Val | Asn | Asn | Phe | Thr | Asp | Val | Ala | Ser | Lys | Phe | Asn' | Gin | |
580 | 585 | 590 | ||||||||||||||
aga | ctg | caa | gag | tta | gac | aaa | agc | aac | ccc | ata | tta | ctg | aga | att | atg | 1824 |
Arg | Leu | Gin | Glu | Leu | Asp | Lys | Ser | Asn | Pro | íle | Leu | Leu | Arg | íle | Met | |
595 | 600 | 605 | ||||||||||||||
aat | gac | cag | ctg | . atg | tat | ctg | gaa | cgt | gca | ttc | att | gat· | cct | tta | ggc | 1872 |
Asn | Asp | Gin | Leu, Met | Tyr | Leu | Glu | Arg | Ala | Phe | íle | Asp | Pro | Leu | Gly | ||
610 | 615 | 620 | ||||||||||||||
tta | cca | gga | agg | cct | ttc | tac | agg | cat | acc | atc | tat | get | cca | agc | agc | 1920 |
Leu | Pro | Gly | Arg | Pro | Phe | Tyr | Arg | His | Thr | íle | Tyr | Ala | Pro | Ser | Ser | |
625 | 630 | 635 | 640 | |||||||||||||
cac | aac | aag | tat | gca | gga | gaa | tca | ttc | cct | ggg | att | tat | gat | gcc | ctt | 1968 |
His | Asn | Lys | ' Tyr | Ala | Gly | Glu | Ser | Phe | Pro | Gly | íle | Tyr | Asp | Ala | Leu | |
645 | 650 | 655 | ||||||||||||||
ttt | gat | ata | agt | agc | aaa | gtc | aat | get | tet | aag | gcc | tgg | aac | gaa | gtg | 2016 |
Phe | Asp | íle | Ser | Ser | Lys | Vaľ | Asn | Ala | Ser | Lys | Ala | Trp | Asn | Glu | Val | |
660 | 665 | 670 | ||||||||||||||
aag | aga | cag | att | tet | att | gca | acc | ttt | aca | gtg | caa | get | gca' | gča | gag | 2064 |
Lys | Arg | Gin | íle | Ser | íle | Ala | Thr | Phe | Thr | Val | Gin. | Ala | Ala | Ala | Glu | |
675 | 680 | 685 | ||||||||||||||
act | ctg | agg | gaa | gta | get | 2082 | ||||||||||
Thr | Leu | Arg | Glu | Val | Ala |
690 <210> 10
205
<211> 694 <212> PRT <213> Mus musculus | |||||||||||||||
<400> 10 | |||||||||||||||
Met | Lys | Lys | Glu | Phe | Leu | His | Glu | Leu | Lys | 'Ala | Glu | Asn | íle | Lys | Lys |
1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
Phe | Leu | Tyr | Asn | Phe | Thr | Arg | Thr | Pro | His | Leu | Ala | Gly | Thr | Gin | Asn |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Asn | Phe | Glu | Leu | Ala | Lys | Gin | íle | His | Asp | Gin | Trp | Lys | Glu | Phe | Gly |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Leu | Asp | Leu | Val | Glu | Leu | Ser | His | Tyr | Asp | Val | Leu | Leu | Ser | Tyr | Pro |
50' | 55 | 60 | |||||||||||||
Asn | Lys | Thr | His | Pro | Asn | Tyr | íle | Ser | íle | íle | Asn | Glu | Asp | Gly | Asn |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Glu | íle | Phe | Lys | Thr | Ser | Leu | Ser | Glu | Gin | Pro | Pro | Pro | Gly | Tyr | Glu |
Λ | 85 | 90 | 95 | ||||||||||||
Asn | íle | Ser | Asp | Val | Val | Pro | Pro | Tyr | Ser | Ala | Phe | Ser | Pro | Gin | Gly |
- | 100 | 105 | 110 | ||||||||||||
Thr | Pro | Glu | Gly | Asp | Leu | Val | Tyr | Val | Asn | Tyr | Ala | Arg | Thr | Glu | Asp |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Phe | Phe | Lys | Leu | Glu | Arg | Glu | Met | Lys | íle | Ser | Cys | Ser | Gly | Lys | íle |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Val | íle | Ala | Arg | Tyr | Glý | Lys | Val | Phe | Arg | Gly | Asn | Met | Val | Lys | Asn |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Ala | Gin | Leu | Ala | Gly | Ala | Lys | Gly | Met | Tie’ | Leu | Tyr | Ser | Asp | Pro | Ala |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Asp | Tyr | Phe | Val | Pro | Ala | Val | Lys | Ser | Tyr | Pro | Asp | Gly | Trp | Asn | Leu |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Pro | Gly | Gly | Gly | Val | Gin | Arg | Gly | Asn | Val | Leu | Asn | Leu | Asn | Gly | Ala |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Gly | Asp | Pro | Leu | Thr | Pro | Gly | Tyr | Pro | Ala | Asn | Glu | His | Ala | Tyr | Arg |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
His | Glu | Leu | Thr | Asn | Ala | Val | Gly | Leu | Pro | Ser | íle | Pro | Val | His | Pro |
225 | 230' | 235 | 240 |
206
íle Gly Tyr Asp Asp | Ala | Gin Lys | Leu Leu'Glu His Met Gly Gly | Pro | |||||||||||
245 | 250 . | 255 | |||||||||||||
Ala | Pro | Pro | Asp | Ser | Ser | Trp | Lys | Gly | Gly | Leu | Lys | Val | Pro | Tyr | Asn |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
Val | Gly | Pro | Gly | Phe | Ala | Gly | Asn | Phe | Ser | Thr | Gin | Lys | Val | Lys | Met |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
His | íle | His' | Ser | Tyr | Thr | Lys | Val | Thr | Arg | Tie | Tyr | Asn | Val | íle | Gly |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
Thr | Leu | Lys | Gly | Ala | Leu | Glu | Pro | Asp | Arg | Tyr | Val | íle | Leu | Gly | Gly |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
His | Arg | Asp | Ala | Trp | Val | Phe | Gly | Gly | íle | Asp | Pro | Gin | Ser | Gly | Ala |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Ala | Val | Val | His | Glu | íle | Val | Arg | Ser | Phe | Gly | Thr | Leu | Lys | Lys | Lys |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
Gly | Arg | Arg | Pro | Arg | Arg | Thr | . íle | Leu | Phe | Ala | Ser | Trp | Asp | Ala | Glu |
355' | 360 | 365 | |||||||||||||
Glu | Phe | Gly | Leu | Leu | Gly | Ser | Thr | Glu | Trp | Ala | Glu | Glu | His | Ser | Arg |
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
Leu | Leu | Gin | Glu | Arg | Gly | Val | Ala | Tyr | íle. | Asn | Ala | Asp | Ser | Ser | íle |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
Glu | Gly | Asn | Tyr | Thr | Leu | Arg | Val | Asp | Cys | Thr | Pro | Leu | Met | Tyr | Ser |
405 | 410 | 415 | |||||||||||||
Leu | Val | Tyr | Asn | Leu | Thr | Lys | Glu | Leu | Gin | Ser | Pro | Asp | Glu | Gly | Phe |
420 | 425' | 430 | |||||||||||||
Glu | Gly | Lys | Ser | Leu | Tyr | Asp | Ser | Trp | Lys | Glu | Lys | Ser | Pro | Ser | Pro |
435 | 440 | 445 | |||||||||||||
Glu | Phe | íle | Gly | Met | Pro | Arg | íle | Ser | Lys: | Leu | Giy | . Ser | Gly | Asn | Asp |
450 | 455 | 460 | |||||||||||||
Phe | Glu | Val | Phe | Phe | Gin | Arg | Leu | Gly | íle | Ala | Ser | Gly | Arg | Ala | Arg |
465 | 470 | 475 | 4 80 |
207
Tyr | Thr | Lys Asn | Trp 485 | Lys | Thr | Asn Lys | Val 490 | Ser | Ser | Tyr | Pro | Leu . 495 | Tyr | ||
His | Ser | Val | Tyr | Glu | Thr | Tyr | Glu | Leu | Val | Val | Lys | Phe | Tyr | Asp· | Pro |
500 | 505 | 510 | |||||||||||||
Thr | Phe | Lys | Tyr | His | Leu | Thr | Val | Ala | Gin | Val | Arg | Gly | Ala | Met | Val |
515 | 520 | 525 | |||||||||||||
Phe | Glu | Leu | Ala | Asn | Ser | íle | Val | Leu | Pro | Phe | Asp | Cys | Gin | Ser | Tyr |
.530 | 535 | 540 | |||||||||||||
Ala | Val | Ala | Leu | Lys | Lys | Tyr | Ala | Asp | Thr | íle | Tyr | Asn | íle | Ser | Met |
545 | 550 | 555 | 560 | ||||||||||||
Lys | His | Pro | Gin | Glu | Met | Lys | Ala | Tyr | Met | íle | Ser | Phe | Asp | Ser | Leu |
565 | 570 | 575 | |||||||||||||
Phe | Ser | Ala | Val | Asn | Asn | Phe | Thr | Asp | Val | Alá | Ser | Lys | Phe | Asn | Gin |
580 | 585 | 590 | |||||||||||||
Arg | Leu | Gin | Glu | Leu | Asp | Lys | Ser | Asn | Pro | Tie | Leu | Leu | Arg | íle | Met |
595 | 600 | 605 | |||||||||||||
Asn | Asp | Gin | Leu | Met | Tyr | Leu | Glu | Arg | Ala | Phe | íle | Asp | Pro | Leu | Gly |
610 | 615 | 620 | |||||||||||||
Leu | Pro | Gly | Arg | Pro | Phe | Tyr | Arg | His | Thr | íle | Tyr | Ala | Pro | Ser | Ser |
625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
His | Asn | Lys | Tyr | Ala | Gly | Glu | Ser | Phe | Pro | Gly | íle | Tyr | Asp | Ala | Leu |
645 | 650 | 655 | |||||||||||||
Phe | Asp | íle | Ser | Ser | Lys | Val | Asn | Ala | Ser. | Lys | Ala | Trp | Asn | Glu | Val |
660 | 665 | 670 | |||||||||||||
Lys | Arg | Gin | íle | Ser | íle | Ala | Thr | Phe | Thr | Val | Gin | Ala | Ala | Ala | Glu |
675 | 680 | 685 |
Thr Leu Arg Glu Val Ala . 690 <210> 11 <211>.45 <212> DNA <213> Clostridium tetani <220>
208
<221> CDS · | |||||||||||||
<222> (l)..i | (45) | ||||||||||||
<400> 11 | |||||||||||||
cag tac atc | aaa | get | aac | tcc | aaa | ttc | atc | ggt | atc | acc | gag | ctg | 45 |
Gin Tyr íle | Lys | Ala | Asn | Ser | Lys | Phe | íle | Gly | íle | Thr | Glu | Leu |
1 | 5 | 10 | 15 |
<210> <211> | 12 15 | ||
<212> | PRT | ||
<213> | Clostridium tetani | ||
<400> | 12 | ||
Gin Tyr íle Lys Ala Asn Ser Lys | Phe íle Gly | íle Thr Glu Leu | |
1 | 5 | .10 | 15 |
<210> | 13 |
<211> | 63 |
<212> | DNA |
<213> Clostridium tetani· <220>
<221> CDS
<222> (1)..(63) | |||||||||||||
<4Ó0> 13 | |||||||||||||
ttc aac.aac | ttc | acc | gta | agc | ttc | tgg | ctg. | cgt | gtt | ccg | aaa | gtt | agc |
Phe Asn Asn | Phe | Thr | Val | Ser | Phe | Trp | Leu | Arg | Val | Pro | Lys. | Val | Ser |
1 | 5 | 10 | . 15 |
get agc cac ctg gaa 63
Ala Ser His Leu Glu_. _
20 | |
<210> | 14 |
<211> | 21 |
<212> | PRT |
<213> | Clostridium tetani |
<400> | 14 |
209
Phe Asn Asn Phe Thr Val Ser Phe Trp Leu Arg Val Pro Lys Val Ser 1 5 10' 15
Ala Ser His Leu Glu 20 <210> 15 <211> 25 <212> PRT <213> Umelá sekvencia <220>
<223> Popis umelej sekvencie: Fúzia epitopu tetánového toxínu a PMS <400> 15
Gin Glu Arg Gly Val Gin Tyr íle Lys Ala Asn Ser Lys Phe íle Gly 1 5. 10 15 íle Thr Glu Leu Arg Val Asp Cys Thr 20 25 <210> 16 <211>. 25 <212> PRT <213> Umelá sekvencia <220>
<223> Popis umelej sekvencie: Fúzia epitopu tetánového toxínu a PMS <400> 16 .
Ala Val Val Leu Arg Gin Tyr íle Lys Ala Asn Ser Lys Phe íle Gly 1 5 .10 15 .
íle Thr.Glu Leu Glu Met Lys Thr Tyr 20 25 <210> 17
210
PMS <211> 25 <212> PRT <213> Umelá sekvencia <220>
<223> Popis umelej sekvencie: Fúzia epitopu tetánového toxínu <400> 17
Met Phe Leu Glu Arg Gin Tyr íle Lys Ala Asn Ser Lys Phe íle Gly 1 5 10 ' '15 íle Thr Glu Leu His Val íle Tyr Ala 20 25 <210> 18 <211> 31 <212> PRT .
<213> Umelá sekvencia <220>
<223> Popis umelej sekvencie: Fúzia epitopu tetánového toxínu <400> 18
Asn Ser . Arg Leu Leu Phe Asn Asn Phe Thr Val . Ser. Phe Trp Leu Arg 15 10 .15
Val Pro Lys Val Ser Ala Ser His Leu Glu Val Asp Cys Thr Pro 20 25 30 <210> 19 <211> 31' <212> PRT <213> Umelá sekvencia <220>
<223> Popis umelej sekvencie: Fúzia epitopu tetánového toxínu <400> 19
Val Val .Leu Arg Lys Phe Asn Asn Phe Thr Val Ser Phe Trp Leu Arg 1 ... 5 10 15
PMS
PMS
Val Pro Lys Val
Ser Ala Ser His Leu Glu Ser.Phe Asp Ser Leu
211
25 30 <210> 20 <211> 31 <212> PRT <213> Umelá sekvencia <220>
<223> Popis umelej sekvencie: Fúzia epitopu tetánového toxínu a PMS <400> 20
Leu Met Phe Leu Glu Phe Asn Asn Phe Thr Val Ser Phe Trp Leu Arg
5 10 15
Val. Pro Lys Val Ser Ala Ser His Leu Glu Pro Ser Ser His Asn
25 30 .
<210> 21 <211> 18 <212> DNA <213> Umelá sekvencia <220>.
<223> Popis umelej sekvencie: Umelé His zakončenie <220>
<221> CDS <222> (1) . . (18) <400> 21 cat čat cat cat cat cat 18
His His His His His His
1 | 5 |
<210> 22 | |
<211> 6 | |
<212> PRT <213> Umelá | sekvencia |
212 <223> Popis umelej sekvencie: Umelé His zakončenie <400> 22
His His His His His His 1 5 <210> 23 <211> 42 <212> DNA <213> Umelá sekvencia <220>
<223> Popis umelej sekvencie: Umelé His zakončenie <220>
<221> CDS <222> (1)..(42) <400> 23 atg aaa cac caa cac caa cat caa cat caa cat caa cat caa 42
Met Lys His Gin His Gin His Gin His Gin His Gin His Gin '5 10 <210> 24 <211> 14 <212> PRT <213> Umelá sekvencia <223> Popis umelej sekvencie: Umelé His zakončenie <400> 24 . .
Met Lys His. Gin His Gin' His Gin His Gin His Gin His Gin 1., 5' 10 <210> 25 <211> 69 <212> DNA <213> MuS' musculuš
213 <220>
<221> CDS <222> (1)..(69) <400> 25 atg gat gca atg aag aga ggg ctc tgc tgt gtg ctg ctg ctg tgt gga. 48
Met Asp Ala Met Lys Arg Gly Leu Cys Cys Val Leu Leu. Leu Cys Gly
5 10 15 gca gtc ttc gtt tcg Ala Val Phe Val Ser ccc agc Pro Ser <210> 26 <211> 23 <212> PRT <213> Mus- musculus <400> 26
Met Asp Ala Met Lys Arg Gly Leu Cys Cys Val Leu Leu Leu Cys Gly 1 5 10 15
Ala Val Phe Val Ser. Pro Ser . . 20
<210> 27 <211> 33 | |
<212> DNA <213> Homo | sapiens |
<220> <221> CDS <222> (1).. | .(33) |
<400> 27 |
gaa caa aaa ctc atc Glu Gin Lys Leu íle
5 tca gaa gag gat ctg aat Ser.Glu Glu Asp Leu Asn <210> 28
214 <211> 11 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 28
Glu Gin Lys Leu íle Ser Glu Glu Asp Leu Asn 1 5 10 <210> 29 <211> 75 <212> DNA <213> Homo sapiens <220>
<221> CDS | ||||||||||||
<222> (1).. | (75) | |||||||||||
<400> 29 | ||||||||||||
atg aag gat | tcc | tgc | atc | act | gtg | atg | gcc | atg | gcg | ctg | ctg | tet |
Met Lys Asp | Ser | Cys | íle | Thr | Val | Met | Ala | Met | Ala | Leu | Leu | Ser |
1 | 5 | 10 | 15 | |||||||||
ttc ttt ttc | ttc | gcg | ccg | gcc | tcg | age | ||||||
Phe Phe Phe | Phe. | Ala | Pro | Ala | Ser | Ser | ||||||
20 | 25 |
<210> 30 <211> 25 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 30
Met Lys Asp Ser Cys íle Thr Val Met Ala· Met Ala Leu Leu Ser Gly 1 5 10 15
Phe Phe Phe Phe Ala Pro Ala Ser Ser
20 | ||
<210> | 31 | |
<211> | 60 | |
<212> | DNA | |
<213> | Mu s | musculus |
<220> |
215
t- <221> | CDS | |||||||||||||
<222> | {1)..( | [60) | ||||||||||||
<400> | 31 | |||||||||||||
atg aga agg | atg | ctt | ctg | cac | ttg | agt | gtt | ctg | act | ctc | age | tgt | gtc | |
Met Arg Arg | Met | Leu | Leu | His | Leu | Ser | Val | Leu | Thr | Leu | Ser | Cys | Val | |
1 | 5 | 10 | 15 |
tgg gcc act gcc 60.
Trp Ala Thr Ala <210> 32 <211> 20 <212> PRT <213> Mus musculus <400> 32
Met Arg Arg Met Leu Leu His Leu Ser Val Leu Thr Leu Ser Cys Val 1 5 10 . 15
Trp Ala Thr Ala 20 <210> 33 <211> 20 <212> PRT
<213> Homo sapiens | |||
<400> 33 | |||
Pro Ala Pro | Gly Ser Thr Ala Pro | Pro Ala His Gly Val | Thr Ser Ala |
1 | 5 | 10 | 15 |
Pro Asp Thr Arg
Claims (5)
- PATENTOVÉNÁROKY1. Použitie1) aspoň jedného CTL epitopu odvodeného od s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu, ktorý je v živočíchovi slabo imunogénny alebo neimunogénny a
- 2) aspoň jedného prvého T-pomocného lymfocytického (TH) epitopu, ktorý je pre živočícha cudzí, alebo1) aspoň jedného fragmentu nukleovej kyseliny kódujúceho CTL epitop odvodený od s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu, ktorý je v živočíchovi slabo imunogénny alebo neimunogénny a2) aspoň jedného fragmentu nukleovej kyseliny kódujúceho T-pomocný lymfocytický (TH) epitop, ktorý je pre živočícha cudzí alebo nepatogénneho mikroorganizmu alebo vírusu, ktorý nesie fragment nukleovej kyseliny kódujúci alebo exprimujúci1) aspoň jeden CTL epitop odvodený od s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu, ktorý je v živočíchovi slabo imunogénny alebo neimunogénny a2) aspoň jeden prvý T-pomocný lymfocytický (TH) epitop, ktorý je pre živočícha cudzí, prvého TH cytotoxická na prípravu imunogénnej kompozície na negatívnu reguláciu buniek exprimujúcich s bunkou asociovaný polypeptídový antigén tým, že sa prostredníctvom vhodnej antigénprezentujúcej bunky (APC) v živočíchovi vyvolá simultánna prezentácia aspoň jedného CTL epitopu a aspoň jedného epitopu, a tým sa indukuje špecifická T-lymfocytová (CTL) odpoveď v živočíchovi216 proti bunkám nesúcim na svojom povrchu s bunkou asociovaný polypeptidový antigén alebo obsahujúcim s bunkou asociovaný antigén vo svojom intracelulárnom kompartmente.2. Použitie podľa nároku 1, kde živočích je človek.3. Použitie podľa nároku 1 alebo, kde uvedený aspoň jeden CTL epitop, ak je prezentovaný, je spojený s molekulou MHC typu I na povrchu APC a/alebo kde uvedený aspoň jeden prvý cudzí TH epitop, ak je prezentovaný, je spojený s molekulou MHC typu II na povrchu APC.4. Použitie podľa ktoréhokoľvek z predchádzajúcich nárokov, kde APC je dendritická bunka alebo makrofág.5. Použitie podľa ktoréhokoľvek z predchádzajúcich nárokov, kde polypeptidový antigén je vybraný z nádorového polypeptidového antigénu, vlastného proteínu, vírusového polypeptidového antigénu a polypeptidového antigénu, ktorý pochádza z vnútrobunkového parazita alebo baktérie.6. Použitie podľa ktoréhokoľvek z predchádzajúcich nárokov, kde rezentácia CTL epitopu a prvého cudzieho TH epitopu prostredníctvom APC sa uskutočňuje tým, že sa imunitnému systému živočícha prezentuje aspoň jeden prvý analóg polypeptidového antigénu, pričom menovaný prvý analóg obsahuje obmenu aminokyselinovej sekvencie polypeptidového antigénu, pričom uvedená obmena obsahuje aspoň CTL epitop a prvý cudzí TH epitop.7. Použitie podľa nároku 6, kde aspoň prvý analóg obsahuje podstatnú časú známych a predpokladaných CTL epitopov s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu.2178. Použitie podľa nároku 7, kde podstatná časť známych a predpokladaných CTL epitopov v aminokyselinovéj sekvencii aspoň jedného prvého analógu je rozpoznávaná aspoň 90 % haplotypov MHC-I, ktoré rozpoznávajú všetky známe a predpokladané CTL epitopy v s bunkou asociovanom polypeptídovom antigéne.9. Použitie podľa ktoréhokolvek z nárokov 6 až 8, kde v podstate všetky známe CTL epitopy s bunkou asociovaného polypeptídového antigénu sú prítomné v aspoň jednom prvom analógu a/alebo kde v podstate všetky predpokladané CTL epitopy s bunkou asociovaného polypeptídového antigénu sú prítomné v aspoň jednom prvom analógu.10. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 6 až 9, kde aspoň jeden prvý analóg ďalej modifikovanej štruktúry polypeptídového modifikácie je, vyvolá v tele pozostávajúcu z asoc iovaného zahŕňa čast s bunkou antigénu, pričom výsledkom tejto že imunizácia živočícha prvým analógom živočícha produkciu protilátok proti s bunkou asociovanému polypeptídovému antigénu.11. Použitie podľa ktoréhokolvek z predchádzajúcich nárokov, ktoré ďalej zahŕňa použitie aspoň jedného druhého analógu polypeptídového antigénu alebo fragmentu nukleovej kyseliny kódujúceho druhý analóg polypeptídového antigénu alebo aspoň jedného nepatogénneho mikroorganizmu alebo vírusu nesúceho fragment nukleovej kyseliny kódujúci aspoň jeden druhý analóg polypeptídového antigénu na prípravu imunogénnej kompozície na zaistenie prezentácie imunogenicky účinného množstva aspoň jedného druhého analógu polypeptídového antigénu imunitnému systému218 živočícha, pričom tento druhý analóg obsahuje modifikáciu štruktúry polypeptidového antigénu a výsledkom tejto modifikácie je, že imunizácia živočícha druhým analógom vyvolá produkciu protilátok proti s bunkou asociovanému polypeptídovému antigénu.12. Použitie podľa nároku 11, kde sa pri modifikácii do druhého analógu včlení aspoň jeden druhý cudzí TH epitop.13. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 6 až 12, kde prvý a/alebo druhý analóg (analógy) obsahuje (obsahujú) podstatnú časť B-bunkového epitopu s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu.14. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 6 až 13, kde variácia a/alebo modifikácia zahŕňa substitúciu a/alebo deléciu a/alebo inzerciu a/alebo adíciu aminokyseliny.15. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 6 až 14, kde variácia a/alebo modifikácia zahŕňa začlenenie aspoň jednej prvej časti do prvého a/alebo druhého analógu (analógov), pričom uvedená prvá časť efektívne smeruje analóg k bunke prezentujúcej antigén (APC) a/alebo začlenenie aspoň jednej druhej časti do prvého a/alebo druhého analógu (analógov), pričom uvedená druhá časť stimuluje imunitný systém, a/alebo začlenenie aspoň jednej tretej časti do prvého a/alebo druhého analógu (analógov), pričom zmienená tretia časť optimalizuje prezentáciu analógu imunitnému systému.21916. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 6 až 15, kde variácia a/alebo modifikácia zahŕňa duplikáciu aspoň jedného B-bunkového epitopu alebo aspoň jedného CTL epitopu s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu.17. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 6 až 16, kde variácia a/alebo modifikácia zahŕňa zavedenie hapténu.18. Použitie podľa ktoréhokoľvek z predchádzajúcich nárokov, kde prvý a/alebo druhý cudzí TH epitop (epitopy) je (sú) imunodominantný (imunodominantné).19. Použitie podľa ktoréhokoľvek z predchádzajúcich nárokov, kde prvý a/alebo druhý cudzí TH epitop (epitopy) je (sú) promiskuitný (promiskuitné).20. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 12 až 19, kde prvý a/alebo druhý cudzí TH epitop (epitopy) sa vyberie (vyberú) z prírodného TH epitopu a umelej peptídovej sekvencie, ktorá viaže MHC-II.21. Použitie podľa nároku 20, kde. prírodný TH epitop sa vyberie z epitopu tetanového toxoidu, ako je P2 alebo P30, epitopu záškrtového toxoidu, hemaglutinínového epitopu vírusu chrípky a CS epitopu P. falciparum.22. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 12 až 21, kde prvý a/alebo druhý TH epitop (epitopy) a/alebo prvá a/alebo druhá a/alebo tretia časť je prítomná vo forme vedľajších skupín viazaných kovalentnou alebo nekovalentnou väzbou k vhodným chemickým skupinám v amínokyselinovej sekvencií s bunkou asociovaného220 polypeptidového antigénu alebo jej subsekvencii a/alebo fúznych partnerov aminokyselinovéj sekvencie odvodených s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu.23. Použitie podľa nároku 22, kde je prvá častí v podstate špecifickým väzbovým partnerom pre APC špecifický povrchový antigén, ako sacharid, pre ktorý na APC existuje špecifický receptor, napr. manán alebo manóza.24. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 15 až 23, kde druhá je cytokín vybraný z interferónu γ (IFN-γ) , Flt3L, interleukínu 1 (IL-1), interleukínu 2 (IL-2), interleukínu4 (IL-4), interleukínu 6 (IL-6), interleukínu 12 (IL-12), interleukínu 13 (IL-13), interleukínu 15 (IL-15) a faktoru stimulujúceho granulocyt-makrofágové kolónie (GM-CSF) alebo jeho účinná časť; proteín tepelného šoku vybraný z HSP70, HSP90, HSC70, GRP94 a kalretikulínu (CRT) alebo jeho účinná častí; alebo, hormón.25. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 15 až 24, kde je tretia častí lipid, ako napríklad palmitoylová skupina, myristylová skupina, farnezylová skupina, geranylgeranylová skupina, GPI-kotva a N-acyl diglyceridová skupina.26. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 6 až 25, kde prvý a/alebo druhý analóg (analógy) má (majú) v podstate výslednú celkovú terciárnu štruktúru s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu.22127. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 6 až 26, kde sa prezentácia prostredníctvom APC uskutoční podaním imunogénne účinného množstva aspoň jedného prvého analógu živočíchovi.28. Použitie podľa nároku 27, kde sa tiež podáva imunologický účinné množstvo aspoň jedného druhého analógu.29. Použitie podľa nároku 27 alebo 28, kde menovaný aspoň jeden prvý a/alebo druhý analóg (analógy) je formulovaný spoločne s farmaceutický a imunologický vhodným nosičom a/alebo vehikulom a prípadne adjuvantom.30. Použitie podľa nároku 29, kde zmienený adjuvant umožňuje príjem aspoň prvého a/alebo druhého analógu (analógov) APC bunkami, ktorými sú napríklad dendritické bunky.31. Použitie podľa nároku 30, kde je zmienený adjuvant zvolený zo skupiny pozostávajúcej z adjuvantu zameraného na imunitu; adjuvantu modulujúceho imunitu, ako je toxín, cytokín a mykobakteriálny derivát; olejového preparátu; polyméru; adjuvantu formujúceho micely; saponínu; imunostimulačný komplexný matrix (ISCOM matrix); častice; DDA; alumíniových adjuvantov; DNA adjuvantov; γ-inulínu a zapuzdrujúceho adjuvantu.32. Použitie podľa nároku 31, kde cytokínom je cytokín definovaný v nároku 24 alebo jeho účinná časú, kde toxín je zvolený zo skupiny pozostávajúcej z listeriolycínu (LLO), lipidu A (MPL, L180.5/RaILPS) a tepelne nestáleho enterotoxínu a ďalej kde mykobakteriálny derivát je zvolený zo skupiny pozostávajúcej z muramyl · dipeptídu,222 úplného Freundovho adjuvans, RIBI a diesteru trehalózy, ako TDM a TDE, a ďalej kde adjuvant zameraný na imunitu je zvolený zo skupiny pozostávajúcej z ligandu CD40, protilátky CD40 alebo ich špecificky sa viažúcich fragmentov, manózy, Fab fragmentu a CTLA-4 a ďalej kde olejový preparát obsahuje skvalén alebo neúplné Freundovo adjuvans, a ďalej kde polymér je zvolený zo skupiny pozostávajúcej zo sacharidu, ako dextránu, PEG, škrobu, manánu a manózy, plastického polyméru, ako latexu, ako latexových guličiek, a ďalej kde saponín je z Quillaja saponaria, Quil A a QS21, a kde častice obsahujú latex alebo dextŕán.33. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 27 až 32 zahŕňajúce podanie lieku formou vybranou z orálnej, parenterálnej, intradermálnej, subdermálnej, intrakutánnej, subkutánnej, peritoneálnej, bukálnej, sublingválnej , epidurálnej, spinálnej, análnej a intrakraniálnej formy.34. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 27 až 33 zahŕňajúce aspoň jedno podanie ročne, ako aspoň 2, 3, 4, 5, 6 a 12 podaní ročne.35. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 1 až 5, kde sa prezentácia uskutoční podaním nepatogénneho mikroorganizmu alebo vírusu nesúceho fragment nukleovej kyseliny, ktorý kóduje a exprimuje aspoň jeden CTL epitop a aspoň jeden TH epitop živočíchovi.36. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 6 až 14, kde sa prezentácia uskutočni podaním nepatogénneho mikroorganizmu alebo vírusu, ktorý nesie aspoň jeden fragment nukleovej223 kyseliny, ktorý kóduje a exprimuje aspoň prvý analóg živočíchovi.37. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 15 až 26, kde TH epitop a/alebo prvá a/alebo druhá a/alebo tretia časé (časti) sú vo forme fúznych partnerov aminokyselinových sekvencií odvodených od s bunkou asociovaného polypeptídového antigénu, a ďalej kde sa prezentácia uskutoční podaním nepatogénneho mikroorganizmu alebo vírusu, ktorý nesie aspoň jeden fragment nukleovej kyseliny kódujúci a exprimujúci prvý a/alebo druhý analóg živočíchovi.38. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 11 až 14 alebo 36, kde sa prezentácia uskutoční podaním nepatogénneho mikroorganizmu alebo vírusu, ktorý nesie aspoň jeden fragment nukleovej kyseliny kódujúci a exprimujúci aspoň druhý analóg živočíchovi.39. Použitie podľa nároku 38, kde sa nepatogénny mikroorganizmus alebo vírus podá živočíchovi raz.40. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 1 až 5, kde sa prezentácia uskutoční in vivo zavedením do APC aspoň jedného fragmentu nukleovej kyseliny.41. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 6 až 14, kde sa prezentácia uskutoční in vivo zavedením do APC aspoň jedného fragmentu nukleovej kyseliny kódujúceho a exprimujúceho prvý analóg.42. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 15 až 26, kde TH epitop a/alebo prvá a/alebo druhá a/alebo tretia čast224 (časti) sú vo forme fúznych partnerov aminokyselinových sekvencii odvodených od s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu, a ďalej kde sa prezentácia uskutoční in vivo zavedením do APC aspoň jedného fragmentu nukleovej kyseliny kódujúceho a exprimujúceho prvý a/alebo druhý analóg.43. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 11 až 14 a 41, ktoré ďalej zahŕňa použitie aspoň jedného fragmentu nukleovej kyseliny kódujúceho a exprimujúceho druhý analóg na výrobu farmaceutickej kompozície na in vivo zavedenie do APC aspoň jedného fragmentu nukleovej kyseliny kódujúceho a exprimujúceho druhý analóg.44. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 1 až 5, kde sa prezentácia uskutoční in vivo spoločným zavedením do APC aspoň dvoch fragmentov nukleovej kyseliny, kde jeden kóduje a exprimuje aspoň jeden CTL epitop a kde druhý kóduje a exprimuje aspoň jeden prvý cudzí TH epitop, a ďalej kde prvý cudzí TH epitop sa definuje podľa ktoréhokoľvek z nárokov 1, 2 a 21 až 24.45. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 40 až 44, kde sa zavádzaný fragment (fragmenty) nukleovej kyseliny vyberá (vyberajú) z čistej DNA, DNA formulovanej s nabitými alebo nenabitými lipidmi, DNA formulovanej v lipozómoch, DNA obsiahnutej vo vírusovom vektore, DNA formulovanej s proteínom alebo polypeptídom, ktorý umožňuje transfekciu, DNA formulovanej so zameriavacím proteínom alebo polypeptídom, DNA formulovanej so zameriavacím sacharidom, DNA formulovanej so zrážadlom vápnika, DNA kopulovanej s molekulou inertného nosiča a DNA formulovanej s adjuvantom.22546. Použitie podľa nároku 45, kde je adjuvant zvolený zo skupiny pozostávajúcej z adjuvantov uvedených v ktoromkoľvek z nárokov 30 až 32.47. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 40 až 46, kde spôsob podávania je definovaný v nárokoch 33 alebo 34.48. Spôsob výberu imunogénneho analógu s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu, ktorý je v živočíchovi slabo imunogénny alebo neimunogénny, kde zmienený imunogénny analóg je schopný vyvolať v živočíchovi reakciu CTL proti bunkám vykazujúcim molekulu MHC typu I viazanú na epitop odvodený od s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu, vyznačujúci sa tým, že zahŕňaa) identifikáciu aspoň jednej subsekvencie amínokyselinovej sekvencie s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu, ktorý neobsahuje známe alebo predpokladané CTL epitopy,b) prípravu aspoň jedného predpokladaného imunogénneho analógu s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu zavedením aspoň jedného TH epitopu cudzieho pre živočícha do aminokyselinovej sekvencie s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu v polohe ležiacej v aspoň jednej subsekvencie identifikovanej v bode a) , ac) selekciu toho (tých) analógu (analógov) pripravených v bode b) , ktorý je (sú) preukázateľne schopný vyvolať reakciu CTL u živočíchov.2264 9. Spôsob podľa nároku 48 vyznačujúci sa tým, že1) subsekvencia identifikovaná v bode a) ďalej neobsahuje cysteínové zvyšky alebo alternatívne, TH epitop zavedený v bode b) v podstate nemení usporiadanie cysteínovych zvyškov a/alebo2) subsekvencia identifikovaná v bode a) ďalej neobsahuje známe alebo predpokladané glykozylačné miesta, alebo alternatívne, TH epitop zavedený v bode b) v podstate nemení charakter glykozylácie a/alebo
- 3) subsekvencia , identifikovaná v bode a) sa významne podieľa na patofyziologickom efekte spôsobenom s bunkou asociovaným polypeptídovým antigénom a kde zavedenie cudzieho TH epitopu v bode b) redukuje alebo ruší zmienený patofyziologický efekt a/alebo
- 4) subsekvencia identifikovaná v bode a) je homologická k aminokyselinovéj sekvencii rozdielneho proteínového antigénu živočícha a zavedenie TH epitopu v bode b) v podstate odstráni homológiu a/alebo
- 5) zavedenie cudzieho TH epitopu v bode b) má za následok zachovanie podstatnej časti B-bunkových epitopov s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu.50. Spôsob podľa nároku 49, variantu 5, vyznačuj úci sa tým, že analóg má celkovú terciárnu štruktúru s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu.51. Spôsob prípravy bunky produkujúcej analóg s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu, vyznačuj ú ci sa tým, že zahŕňa zavedenie sekvencie nukleovej kyseliny kódujúcej analóg do vektoru, pričom analóg sa227 volí spôsobom opísaným v ktoromkoľvek z nárokov 48 až 50, a vhodná hostiteľská bunka sa transformuje týmto vektorom.52. Spôsob prípravy analógu s bunkou asociovaného polypeptidového antigénu, vyznačujúci sa tým, že zahŕňa kultiváciu bunky získanej metódou podľa nároku 51 za podmienok uľahčujúcich expresiu sekvencie nukleovej kyseliny kódujúcej s bunkou asociovaný polypeptidový antigén a získanie analógu z kultivačného supernatantu alebo z buniek.53. Spôsob podľa nároku 52, vyznačujúci sa tým, že ďalej zahŕňa krok čistenia získaného analógu a prípadne podrobenie prečisteného produktu umelým posttranslačným modifikáciám ako je refolding, úprava enzýmami, chemická modifikácia a konjugácia.54. Použitie podľa ktoréhokoľvek z nárokov 1 až 47 alebo spôsob podľa ktoréhokoľvek z nárokov 48 až 53, kde slabý s bunkou asociovaný antigén sa vyberie zo skupiny skladajúcej sa z 5-a-reduktázy, α-fetoproteínu, AM-1, APC, APRÍL, BAGE, β-katenínu, Bcl2, bcr-abl (b3a2), CA-125,CASP-8/FLICE, katepsínov, CD19, CD20, CD21, CD23, CD22,CD33, CD35, CD44, CD45, CD46, CD5, CD52, CD55 (791Tgp72), CD59, CDC27, CDK4, CEA, c-myc, Cox-2, DCC, DcR3, E6/E7, EGFR, EMBP, Ena78, farzyl transferázy, FGF8a alebo FGF8b, FLK-l/KDR, receptora kyseliny listovej, G250, rodiny GAGE, gastrínu 17, hormónu uvoľňujúceho gastrín (Bombezín), GD2/GD3/GM2, GnRH, GnTV, GP1, gplOO/Pmel 17, gpl00-in4, gpl5, gp75/TRP-l, hCG, heparanázy, Her2/neu, HMTV, Hsp70, hTERT (telomerázy), IGFR1, IL-13R, iNOS, Ki 67, KIAA0205,K-ras, H-ras, N-ras, KSA (CO17-1A), LDLR-FUT, rodiny MAGE (MAGE-1, MAGE-2, MAGE-3 atď.), mamaglobínu, MAP17, Melan228A/MART-1, mezotelínu, MIC A/B, MT-MPP, Moxl, mucínu, ako je MUC-1, MUC-2, MUC-3 a MUC-4, ktoré sú anomálne glykozylované, MUM-1, NY-ESO-1, osteonektínu, pl5, P170/MDR1, p53, p97/ melanotransferínu, PAI-1, PDGF, plazminogénu (uPA), PRÁME, probazínu, , progenipoietínu, PSA, PSM, RAGE-1, Rb, RCAS1, SART-1, génovej rodiny SSX, STAT3, STn (asociovaného s mucínom), TAG-72, TGF-a, TGF-β, tymozínu β 15, TNF-a, TPA, TPI, TRP2, tyrozinázy, VEGF, ZAG, pl6INK4 a glutatión S-transferázy.55. Použitie alebo spôsob podľa nároku 54, kde s bunkou asociovaný polypeptídový antigén je ľudský PSM.56. Použitie alebo spôsob podľa nároku 55, kde cudzí T-bunkový epitop sa zavádza v oblasti aminokyselinovej sekvencie PSM definovanej ako SEQ ID č. 2, pozície 16-52 a/alebo 87-108 a/alebo 210-230 a/alebo 269-289 a/alebo 298-324 a/alebo 442-465 a/alebo 488-514 a/alebo 598-630 a/alebo 643-662 a/alebo 672 - 699.57. Použitie podľa nároku 55 alebo 56, kde sa farmaceutická kompozícia používa na liečbu alebo zlepšenie stavu rakoviny prostaty.58. Použitie alebo spôsob podľa nároku 54, kde s bunkou asociovaný polypeptídový antigén je fibroblastový rastový faktor 8b (FGF8b).59. Použitie alebo spôsob podľa nároku 58, kde sa cudzí Tbunkový epitop zavádza v oblasti aminokyselinovej sekvencie FGF8b definovanej ako SEQ ID č. 6, pozície 1-54 a/alebo 178-215 a/alebo 55-58 a/alebo 63-68 a/alebo 72-76 a/alebo 85-91 a/alebo 95-102 a/alebo 106-111 a/alebo 115120 a/alebo 128-134 a/alebo 138-144 a/alebo 149-154 a/alebo 158-162 a/alebo 173-177, pričom toto zavedenie229 prednostne nepostihuje aminokyseliny 26-45 a aminokyseliny 186-215.60. Použitie podľa nároku 58 alebo 59, kde sa farmaceutická kompozícia používa na liečbu alebo zlepšenie stavu rakoviny, ako je rakovina prostaty a rakovina prsníka.61. Použitie alebo spôsob podľa nároku 54, kde s bunkou asociovaný polypeptídový antigén je Her2.62. Použitie alebo spôsob podľa nároku 61, kde sa cudzí Tbunkový epitop zavádza v oblasti aminokyselinovéj sekvencie Her2 definovanej ako SEQ ID č. 3, pozície 5-25 a/alebo 59-73 a/alebo 103-117 a/alebo 149-163 a/alebo 210224 a/alebo 250-264 a/alebo 325-339 a/alebo 369-383 a/alebo 465-479 a/alebo 579-593 a/alebo 632-652 a/alebo 653-667 a/alebo 661-675 a/alebo 695-709 a/alebo 710-730.63. Použitie alebo spôsob podľa nároku 61 alebo 62, kde sa farmaceutická kompozícia používa na liečbu alebo zlepšenie stavu rakoviny prsníka.64. Analóg ľudského PSM, ktorý je u ľudí imunogénny, pričom tento analóg obsahuje podstatnú čast všetkých známych a predpokladaných CTL a B-bunkových epitopov PSM a ďalej obsahuje aspoň jeden cudzí TH epitop definovaný podľa ktoréhokoľvek z nárokov 18 až 21.65. Analóg podľa nároku 64, kde aspoň jeden cudzí TH epitop je prítomný ako inzert do aminokyselinovéj sekvencie PSM alebo ako substitúcia časti aminokyselinovéj sekvencie PSM alebo ako výsledok delécie časti aminokyselinovéj sekvencie PSM.66. Analóg podľa nároku 65, kde je cudzí TH epitop zavedený v pozíciách definovaných v nároku 56.23067. Analóg ľudského Her2, ktorý je u ľudí imunogénny, pričom tento analóg obsahuje podstatnú čast všetkých známych a predpokladaných CTL· a B-bunkových epitopov Her2 a ďalej obsahuje aspoň jeden cudzí TH epitop definovaný podľa ktoréhokoľvek z nárokov 18 až 21.68. Analóg podľa nároku 67, kde aspoň jeden cudzí TH epitop je prítomný ako inzert do aminokyselinovej sekvencie PSM alebo ako substitúcia časti aminokyselinovej sekvencie PSM alebo ako výsledok delécie časti aminokyselinovej sekvencie PSM.69. Analóg podľa nároku 68, kde je cudzí TH epitop zavedený v pozíciách definovaných v nároku 62.70. Analóg ľudského/myšacieho FGF8b, ktorý je u ľudí imunogénny, pričom obsahuje podstatnú čast všetkých známych a predpokladaných CTL a B-bunkových epitopov FGF8b a ďalej obsahuje aspoň jeden cudzí TH epitop definovaný v ktoromkoľvek z nárokov 18 až 21.71. Analóg podľa nároku 70, kde aspoň jeden cudzí TH epitop je prítomný ako inzert v aminokyselinovej sekvencií FGF8b alebo ako substitúcia časti aminokyselinovej sekvencie FGF8b alebo ako výsledok delécie časti aminokyselinovej sekvencie FGF8b.72. Analóg podľa nároku 71, kde je cudzí TH epitop zavedený v pozíciách definovaných v nároku 59.73. Imunogénna kompozícia, vyznačujúca sa tým, že ako účinné imunogénne činidlo obsahuje analóg podľa ktoréhokoľvek z nárokov 64 až 72 v zmesi s farmaceutický a imunologický vhodným nosičom alebo vehikulom a prípadne adjuvantom.231Ί4. Fragment nukleovej kyseliny kódujúci analóg podľa ktoréhokoľvek z nárokov 64 až 72.75. Vektor nesúci fragment nukleovej kyseliny podľa nároku 74.76. Vektor podľa nároku 75, ktorý je schopný autonómnej replikácie.77. Vektor podľa nároku 75 alebo 76 zvolený zo skupiny pozostávajúcej z plazmidu, fágu, kozmidu, minichromozómu a vírusu.78. Vektor podľa ktoréhokoľvek z nárokov 75 až 77, ktorý obsahuje v smere 5'-> 3' a v operabilnom spojení promotor na poháňanie expresie fragmentu nukleovej kyseliny podľa nároku 74, prípadne sekvenciu nukleovej kyseliny kódujúcu vedúci peptid, ktorý umožňuje sekréciu polypeptidového fragmentu alebo jeho integráciu do membrány, fragment nukleovej kyseliny podľa nároku 74 a prípadne sekvenciu nukleovej kyseliny kódujúcej terminátor.79. Vektor podľa ktoréhokoľvek z nárokov 75 až 78, ktorý sa, zavedený do hostiteľskej bunky, integruje do genómu hostiteľskej bunky alebo nie je schopný integrácie do genómu hostiteľskej bunky.80. Transformovaná bunka nesúca vektor podľa ktoréhokoľvek z nárokov 75 až 79.81. Kompozícia na indukciu produkcie protilátok proti PSM, Her2 alebo FGF8b, vyznačujúca sa tým, že obsahuj e1) fragment nukleovej kyseliny podľa nároku 74 alebo vektor podľa ktoréhokoľvek z nárokov 75 až 79 a2) farmaceutický a imunologický vhodné riedidlo a/alebo vehikulum a/alebo adjuvans.23282. Stabilná bunková línia nesúca vektor podl'a ktoréhokoľvek z nárokov 75 až 79, ktorá exprimuje fragment nukleovej kyseliny podľa nároku 74 a ktorá prípadne na svojom povrchu vylučuje alebo nesie analóg podľa ktoréhokoľvek z nárokov 64 až 72.83. Spôsob prípravy bunky podľa nároku 80, vyznačujúci sa tým, že zahŕňa transformáciu hostiteľskej bunky fragmentom nukleovej kyseliny podľa nároku 74 alebo vektorom podľa ktoréhokoľvek z nárokov 75 až 79.
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
DKPA199801261 | 1998-10-05 | ||
US10501198P | 1998-10-20 | 1998-10-20 | |
PCT/DK1999/000525 WO2000020027A2 (en) | 1998-10-05 | 1999-10-05 | Methods for therapeutic vaccination |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
SK4272001A3 true SK4272001A3 (en) | 2003-02-04 |
Family
ID=26065489
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
SK427-2001A SK4272001A3 (en) | 1998-10-05 | 1999-10-05 | Methods for therapeutic vaccination |
Country Status (25)
Country | Link |
---|---|
US (3) | US7005498B1 (sk) |
EP (1) | EP1117421B2 (sk) |
JP (1) | JP2002526419A (sk) |
KR (1) | KR100731820B1 (sk) |
CN (1) | CN1325115C (sk) |
AT (1) | ATE269100T1 (sk) |
AU (1) | AU751709B2 (sk) |
CA (1) | CA2345817C (sk) |
CZ (1) | CZ20011049A3 (sk) |
DE (1) | DE69918146T2 (sk) |
EA (1) | EA003634B1 (sk) |
EE (1) | EE200100203A (sk) |
ES (1) | ES2222728T3 (sk) |
HK (1) | HK1039749B (sk) |
HR (1) | HRP20010319A2 (sk) |
HU (1) | HUP0103976A3 (sk) |
IL (1) | IL141868A0 (sk) |
MX (1) | MXPA01003503A (sk) |
NO (1) | NO20011586L (sk) |
NZ (1) | NZ511055A (sk) |
PL (1) | PL202399B1 (sk) |
PT (1) | PT1117421E (sk) |
SK (1) | SK4272001A3 (sk) |
TR (1) | TR200100936T2 (sk) |
WO (1) | WO2000020027A2 (sk) |
Families Citing this family (149)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
AU1072897A (en) | 1995-12-12 | 1997-07-03 | Karolinska Innovations Ab | Peptide binding the klvff-sequence of amyloid beta |
TWI239847B (en) | 1997-12-02 | 2005-09-21 | Elan Pharm Inc | N-terminal fragment of Abeta peptide and an adjuvant for preventing and treating amyloidogenic disease |
US7964192B1 (en) | 1997-12-02 | 2011-06-21 | Janssen Alzheimer Immunotherapy | Prevention and treatment of amyloidgenic disease |
US20080050367A1 (en) | 1998-04-07 | 2008-02-28 | Guriq Basi | Humanized antibodies that recognize beta amyloid peptide |
US7790856B2 (en) | 1998-04-07 | 2010-09-07 | Janssen Alzheimer Immunotherapy | Humanized antibodies that recognize beta amyloid peptide |
KR100731820B1 (ko) | 1998-10-05 | 2007-06-25 | 파멕사 에이/에스 | 치료적 백신화를 위한 새로운 방법 |
US6913749B2 (en) | 1998-11-02 | 2005-07-05 | Resistentia Pharmaceuticals Ab | Immunogenic polypeptides for inducing anti-self IgE responses |
US7198920B1 (en) * | 1999-01-29 | 2007-04-03 | Corika Corporation | HER-2/neu fusion proteins |
CZ20013709A3 (cs) * | 1999-04-23 | 2002-11-13 | Pharmexa A/S | Analog interleukinu 5, fragment nukleové kyseliny, vektor, buňka, přípravky a pouľití |
US7060670B1 (en) | 1999-05-05 | 2006-06-13 | Neurochem (International) Limited | Stereoselective antifibrillogenic peptides and peptidomimetics thereof |
US6500641B1 (en) * | 1999-05-06 | 2002-12-31 | Wake Forest University School Of Medicine | Compositions and methods for identifying antigens which elicit an immune response |
EA008762B1 (ru) * | 2000-02-21 | 2007-08-31 | Фармекса А/С | АНАЛОГ АУТОЛОГИЧНОГО Аβ ИЛИ АРР ЖИВОТНОГО И СПОСОБЫ ЕГО ПРИМЕНЕНИЯ |
CZ20022748A3 (cs) | 2000-02-21 | 2004-03-17 | Pharmexa A/S | Nová metoda regulace obsahu amyloidu |
US7229623B1 (en) | 2000-08-03 | 2007-06-12 | Corixa Corporation | Her-2/neu fusion proteins |
DE10042598A1 (de) * | 2000-08-30 | 2002-03-28 | Gsf Forschungszentrum Umwelt | Rekombinantes MVA mit der Fähigkeit zur Expression des HER-2/Neu-GENS |
US8435939B2 (en) | 2000-09-05 | 2013-05-07 | Biokine Therapeutics Ltd. | Polypeptide anti-HIV agent containing the same |
AU2001285721A1 (en) * | 2000-09-06 | 2002-03-22 | Pharmexa A/S | Method for down-regulating IgE |
AU2002210407A1 (en) * | 2000-10-27 | 2002-05-06 | Pharmexa A/S | Therapeutic vaccine formulations containing chitosan |
US7700751B2 (en) | 2000-12-06 | 2010-04-20 | Janssen Alzheimer Immunotherapy | Humanized antibodies that recognize β-amyloid peptide |
WO2002066056A2 (en) * | 2001-02-19 | 2002-08-29 | Pharmexa A/S | Synthetic vaccines comprising polyhydroxypolymer carriers |
US7097837B2 (en) | 2001-02-19 | 2006-08-29 | Pharmexa A/S | Synthetic vaccine agents |
WO2009003492A1 (en) | 2007-07-03 | 2009-01-08 | Dako Denmark A/S | Mhc multimers, methods for their generation, labeling and use |
US7604955B2 (en) | 2001-08-13 | 2009-10-20 | Swey-Shen Alex Chen | Immunoglobulin E vaccines and methods of use thereof |
MY144532A (en) * | 2001-08-20 | 2011-09-30 | Lundbeck & Co As H | Novel method for down-regulation of amyloid |
WO2003059379A2 (en) * | 2002-01-17 | 2003-07-24 | Pharmexa A/S | Immunogenic carcinoembryonic antigen (cea) |
US8623822B2 (en) | 2002-03-01 | 2014-01-07 | Bracco Suisse Sa | KDR and VEGF/KDR binding peptides and their use in diagnosis and therapy |
US7261876B2 (en) | 2002-03-01 | 2007-08-28 | Bracco International Bv | Multivalent constructs for therapeutic and diagnostic applications |
AU2003278807A1 (en) | 2002-03-01 | 2004-08-13 | Bracco International B.V. | Kdr and vegf/kdr binding peptides and their use in diagnosis and therapy |
US7794693B2 (en) | 2002-03-01 | 2010-09-14 | Bracco International B.V. | Targeting vector-phospholipid conjugates |
MY139983A (en) | 2002-03-12 | 2009-11-30 | Janssen Alzheimer Immunotherap | Humanized antibodies that recognize beta amyloid peptide |
JP2005528373A (ja) * | 2002-03-26 | 2005-09-22 | イミュネックス・コーポレーション | 免疫プロトコルにFlt3リガンドを用いる方法 |
US20090110702A1 (en) | 2002-07-12 | 2009-04-30 | The Johns Hopkins University | Mesothelin Vaccines and Model Systems and Control of Tumors |
US9200036B2 (en) | 2002-07-12 | 2015-12-01 | The Johns Hopkins University | Mesothelin vaccines and model systems |
JP2006521090A (ja) * | 2002-07-12 | 2006-09-21 | ザ ジョンズ ホプキンス ユニバーシティー | メゾテリンワクチンおよびモデルシステム |
KR100555211B1 (ko) * | 2002-07-16 | 2006-03-03 | 주식회사 팬제노믹스 | 항암효과를 갖는 Her-2/neu DNA 백신 |
AU2003261723A1 (en) | 2002-08-27 | 2004-03-19 | Takeda Chemical Industries, Ltd. | Cxcr4 antagonist and use thereof |
GB0228796D0 (en) * | 2002-12-11 | 2003-01-15 | Adjuvantix Ltd | Valency |
SE0301109D0 (sv) * | 2003-04-14 | 2003-04-14 | Mallen Huang | Nucleotide vaccine composition |
EP1622942B1 (en) * | 2003-05-01 | 2014-11-19 | ImClone LLC | Fully human antibodies directed against the human insulin-like growth factor-1 receptor |
TWI374893B (en) | 2003-05-30 | 2012-10-21 | Janssen Alzheimer Immunotherap | Humanized antibodies that recognize beta amyloid peptide |
EA008827B1 (ru) * | 2003-06-25 | 2007-08-31 | Фармекса А/С | Очистка вариантов her-2 |
JP4579912B2 (ja) | 2003-06-25 | 2010-11-10 | ビーエヌ・イミュノセラピューティクス・インコーポレイテッド | Her−2変異体の精製 |
US20070014807A1 (en) * | 2003-09-03 | 2007-01-18 | Maida Anthony E Iii | Multiplex vaccine |
WO2005033278A2 (en) * | 2003-09-30 | 2005-04-14 | Ludwig Institute For Cancer Research | In vivo efficacy of ny-eso-1 plus iscom |
US20070184023A1 (en) * | 2003-10-30 | 2007-08-09 | Pharmexa A/S | Method for down-regulation of vegf |
US20090028874A1 (en) * | 2003-12-24 | 2009-01-29 | Leiden University Medical Center | Synthetic Protein as Tumor-Specific Vaccine |
US7674456B2 (en) * | 2004-06-14 | 2010-03-09 | Charles Wiseman | Breast cancer cell lines and uses thereof |
US20070190072A1 (en) * | 2004-09-30 | 2007-08-16 | Csl Limited Ludwig Institute For Cancer Research | In vivo efficacy of ny-eso-1 plus adjuvant |
WO2007001448A2 (en) | 2004-11-04 | 2007-01-04 | Massachusetts Institute Of Technology | Coated controlled release polymer particles as efficient oral delivery vehicles for biopharmaceuticals |
TW200635607A (en) | 2004-12-15 | 2006-10-16 | Elan Pharm Inc | Humanized Aβ antibodies for use in improving cognition |
AU2006228872A1 (en) * | 2005-03-31 | 2006-10-05 | Pharmexa A/S | Immunogenic EGFR peptides comprising foreign Tcell stimulating epitope |
CN100354002C (zh) * | 2005-05-31 | 2007-12-12 | 中国人民解放军第三军医大学第一附属医院 | 一种新的以异种免疫细胞为细胞载体的细胞疫苗及其制备方法 |
KR101246428B1 (ko) | 2005-06-17 | 2013-03-21 | 필라델피아 헬스 앤드 에듀케이션 코포레이션 디/비/에이 드렉셀 유니버시티 컬리지 오브 메디슨 | 항-PDGFRα 항체를 이용하여 이차 골 종양을 치료하는 방법 |
MX2007015933A (es) * | 2005-06-17 | 2008-04-21 | Mannkind Corp | Metodos y composiciones para generar respuestas inmunes multivalentes contra espitopes dominantes y subdominantes, expresados en celulas cancerigenas y estromas tumorales. |
WO2007070682A2 (en) | 2005-12-15 | 2007-06-21 | Massachusetts Institute Of Technology | System for screening particles |
WO2007085266A1 (en) * | 2006-01-30 | 2007-08-02 | Dako Denmark A/S | High-speed quantification of antigen specific t-cells in whole blood by flow cytometry |
CN101484587B (zh) * | 2006-02-03 | 2014-02-12 | 英克隆有限责任公司 | Igf-ir拮抗剂作为辅药用于前列腺癌的治疗 |
AU2007215503A1 (en) * | 2006-02-09 | 2007-08-23 | Transtech Pharma, Inc. | Rage fusion proteins and methods of use |
EP2007435B1 (en) | 2006-03-31 | 2019-12-18 | Massachusetts Institute Of Technology | System for targeted delivery of therapeutic agents |
US8784810B2 (en) | 2006-04-18 | 2014-07-22 | Janssen Alzheimer Immunotherapy | Treatment of amyloidogenic diseases |
EA017291B1 (ru) * | 2006-05-05 | 2012-11-30 | Транстек Фарма, Инк. | Белки слияния на основе rage, их композиции и способы их применения |
US8367113B2 (en) | 2006-05-15 | 2013-02-05 | Massachusetts Institute Of Technology | Polymers for functional particles |
WO2007137586A2 (en) * | 2006-05-31 | 2007-12-06 | Pharmexa A/S | Random insertion of peptides |
WO2007150030A2 (en) * | 2006-06-23 | 2007-12-27 | Massachusetts Institute Of Technology | Microfluidic synthesis of organic nanoparticles |
NZ597998A (en) * | 2006-10-06 | 2013-08-30 | Bavarian Nordic Inc | Methods for treating cancer with mva |
WO2008075371A2 (en) * | 2006-12-21 | 2008-06-26 | Biokine Therapeutics Ltd. | T-140 peptide analogs having cxcr4 super-agonist activity for immunomodulation |
WO2008098165A2 (en) | 2007-02-09 | 2008-08-14 | Massachusetts Institute Of Technology | Oscillating cell culture bioreactor |
US20080199467A1 (en) * | 2007-02-15 | 2008-08-21 | Mjalli Adnan M M | Immunoglobulin fusion proteins and methods of making |
EP2361930A3 (en) | 2007-03-26 | 2011-10-26 | Dako Denmark A/S | Multimers of MHC-peptide complexes and uses thereof in Borrelia infectious diseases |
US20090074828A1 (en) * | 2007-04-04 | 2009-03-19 | Massachusetts Institute Of Technology | Poly(amino acid) targeting moieties |
US8003097B2 (en) | 2007-04-18 | 2011-08-23 | Janssen Alzheimer Immunotherapy | Treatment of cerebral amyloid angiopathy |
US8613920B2 (en) | 2007-07-27 | 2013-12-24 | Janssen Alzheimer Immunotherapy | Treatment of amyloidogenic diseases |
WO2009023266A1 (en) * | 2007-08-14 | 2009-02-19 | Ludwig Institute For Cancer Research | Generation of antibodies to cell-surface receptors and cancer-associated proteins including egfr family members |
EP2853267B1 (en) * | 2007-09-21 | 2016-12-07 | The Regents of the University of California | Targeted interferon demonstrates potent apoptotic and anti-tumor activities |
EP2197908A2 (en) | 2007-09-27 | 2010-06-23 | Dako Denmark A/S | Mhc multimers in tuberculosis diagnostics, vaccine and therapeutics |
EP2620157A3 (en) | 2007-10-12 | 2013-10-16 | Massachusetts Institute of Technology | Vaccine nanotechnology |
JO3076B1 (ar) | 2007-10-17 | 2017-03-15 | Janssen Alzheimer Immunotherap | نظم العلاج المناعي المعتمد على حالة apoe |
NZ601827A (en) * | 2007-10-18 | 2014-01-31 | Bavarian Nordic Inc | Use of mva to treat prostate cancer |
US10968269B1 (en) | 2008-02-28 | 2021-04-06 | Agilent Technologies, Inc. | MHC multimers in borrelia diagnostics and disease |
US10722562B2 (en) * | 2008-07-23 | 2020-07-28 | Immudex Aps | Combinatorial analysis and repair |
AU2009279365A1 (en) * | 2008-08-05 | 2010-02-11 | The University Of Queensland | Antigen-presenting scaffolds |
GB0817244D0 (en) * | 2008-09-20 | 2008-10-29 | Univ Cardiff | Use of a protein kinase inhibitor to detect immune cells, such as T cells |
US11992518B2 (en) | 2008-10-02 | 2024-05-28 | Agilent Technologies, Inc. | Molecular vaccines for infectious disease |
US10369204B2 (en) | 2008-10-02 | 2019-08-06 | Dako Denmark A/S | Molecular vaccines for infectious disease |
US8591905B2 (en) | 2008-10-12 | 2013-11-26 | The Brigham And Women's Hospital, Inc. | Nicotine immunonanotherapeutics |
US8343498B2 (en) | 2008-10-12 | 2013-01-01 | Massachusetts Institute Of Technology | Adjuvant incorporation in immunonanotherapeutics |
US8343497B2 (en) | 2008-10-12 | 2013-01-01 | The Brigham And Women's Hospital, Inc. | Targeting of antigen presenting cells with immunonanotherapeutics |
US8277812B2 (en) | 2008-10-12 | 2012-10-02 | Massachusetts Institute Of Technology | Immunonanotherapeutics that provide IgG humoral response without T-cell antigen |
US9067981B1 (en) | 2008-10-30 | 2015-06-30 | Janssen Sciences Ireland Uc | Hybrid amyloid-beta antibodies |
US7998488B2 (en) | 2008-11-14 | 2011-08-16 | Baxter International Inc. | Vaccine formulations and uses thereof |
JP5792630B2 (ja) | 2009-01-28 | 2015-10-14 | エピミューン,インコーポレイティド | Pan−dr結合ポリペプチドおよびその使用 |
CN102448491A (zh) | 2009-04-01 | 2012-05-09 | 迈阿密大学 | 疫苗组合物和其使用方法 |
EP2432893B1 (en) * | 2009-05-19 | 2019-05-01 | University Of Miami | Compositions, kits and methods for in vitro antigen presentation, assessing vaccine efficacy, and assessing immunotoxicity of biologics and drugs |
JP5715622B2 (ja) | 2009-06-14 | 2015-05-07 | バイオカイン セラピューティックス リミテッド | 血小板レベルを増大させるためのペプチド療法 |
BR112012000032A2 (pt) | 2009-07-03 | 2016-03-15 | Bionor Immuno As | meios terapêuticos e diagnósticos inovadores |
BR112012003977A2 (pt) * | 2009-08-26 | 2017-06-06 | Selecta Biosciences Inc | composições que induzem ajuda de célula t |
AU2010291900A1 (en) * | 2009-09-14 | 2012-03-22 | The Trustees Of The University Of Pennsylvania | Vaccines and immunotherapeutics comprising IL-15 receptor alpha and/or nucleic acid molecules encoding the same, and methods for using the same |
WO2011119484A1 (en) * | 2010-03-23 | 2011-09-29 | Iogenetics, Llc | Bioinformatic processes for determination of peptide binding |
KR102117350B1 (ko) * | 2010-04-13 | 2020-06-02 | 이뮤노베이티브 테라피스, 엘티디. | 조절 t 세포들의 저해를 위한 방법 및 조성물 |
EA030813B1 (ru) | 2010-05-26 | 2018-10-31 | Селекта Байосайенсиз, Инк | Способы генерации антительного иммунного ответа и увеличения местной индукции иммунных цитокинов при использовании синтетических наноносителей, соединенных с адъювантами |
US9994443B2 (en) | 2010-11-05 | 2018-06-12 | Selecta Biosciences, Inc. | Modified nicotinic compounds and related methods |
CN106434676B (zh) * | 2010-11-12 | 2020-10-23 | 宾夕法尼亚大学托管会 | 共有前列腺抗原、编码所述抗原的核酸分子以及包含所述核酸分子的疫苗及其用途 |
WO2012092934A1 (en) | 2011-01-06 | 2012-07-12 | Bionor Immuno As | Monomeric and multimeric immunogenic peptides |
CN102716472A (zh) * | 2011-03-31 | 2012-10-10 | 李光辉 | 一种肿瘤疫苗及其合成方法 |
CN107693798A (zh) | 2011-04-29 | 2018-02-16 | 西莱克塔生物科技公司 | 用于降低细胞毒性t淋巴细胞应答的致耐受性合成纳米载体 |
SG10201604236RA (en) * | 2011-05-26 | 2016-07-28 | Geneius Biotechnology Investments Llc | Modulated Immunodominance Therapy |
CN103702687A (zh) | 2011-07-29 | 2014-04-02 | 西莱克塔生物科技公司 | 产生体液和细胞毒性t淋巴细胞(ctl)免疫应答的合成纳米载体 |
WO2013040015A2 (en) * | 2011-09-13 | 2013-03-21 | Immunotope, Inc. | Cytotoxic t-lymphocyte-inducing immunogens for prevention, treatment, and diagnosis of cancer |
CN103063836B (zh) * | 2011-10-18 | 2016-03-30 | 复旦大学附属华山医院 | 检测分枝杆菌感染的试剂、方法和试剂盒 |
CA2864841C (en) | 2012-02-17 | 2020-07-07 | Keith L. Knutson | Methods and materials for generating cd8+ t cells having the ability to recognize cancer cells expressing a her2/neu polypeptide |
US9439942B2 (en) | 2012-04-24 | 2016-09-13 | Biokine Therapeutics Ltd. | Peptides and use thereof in the treatment of large cell lung cancer |
PT2844282T (pt) | 2012-05-04 | 2019-07-23 | Pfizer | Antigénios associados à próstata e regimes de imunoterapêutica baseados em vacinas |
KR20150029678A (ko) | 2012-06-06 | 2015-03-18 | 바이오노르 이뮤노 에이에스 | 백신 |
EA201492262A1 (ru) | 2012-06-06 | 2015-08-31 | Бионор Иммуно Ас | Конструкция пептидного каркаса |
KR102110873B1 (ko) | 2012-09-11 | 2020-05-14 | 온코세라피 사이언스 가부시키가이샤 | Ube2t 펩티드 및 이를 포함하는 백신 |
EP2908851A1 (en) | 2012-10-19 | 2015-08-26 | Bavarian Nordic Inc. | Methods and compositions for the treatment of cancer |
US9803021B2 (en) | 2012-12-07 | 2017-10-31 | The Regents Of The University Of California | CD138-targeted interferon demonstrates potent apoptotic and anti-tumor activities |
EP3421997B1 (en) * | 2012-12-28 | 2020-06-17 | Cellestis Limited | A cell mediated immune response assay |
US10093745B2 (en) | 2013-05-29 | 2018-10-09 | The Regents Of The University Of California | Anti-CSPG4 fusions with interferon for the treatment of malignancy |
WO2015007337A1 (en) | 2013-07-19 | 2015-01-22 | Bionor Immuno As | Method for the vaccination against hiv |
EP3142689B1 (en) | 2014-05-13 | 2020-11-11 | Bavarian Nordic A/S | Combination therapy for treating cancer with a poxvirus expressing a tumor antigen and a monoclonal antibody against tim-3 |
CA2951616A1 (en) | 2014-07-11 | 2016-01-14 | Bionor Immuno As | Method for reducing and/or delaying pathological effects of human immunodeficiency virus i (hiv) or for reducing the risk of developing acquired immunodeficiency syndrome (aids) |
US20210260181A1 (en) * | 2014-09-16 | 2021-08-26 | Altimmune, Inc | Coronavirus immunogenic compositions and uses thereof |
US9616114B1 (en) | 2014-09-18 | 2017-04-11 | David Gordon Bermudes | Modified bacteria having improved pharmacokinetics and tumor colonization enhancing antitumor activity |
US20180066018A1 (en) * | 2015-03-11 | 2018-03-08 | Board Of Regents Of The University Of Nebraska | Conformationally stable analogs of the response selective c5a agonist ep67 |
BR112017020058A2 (pt) * | 2015-03-20 | 2018-06-05 | Childrens Nat Medical Ct | processo para produzir uma célula-t específica, composição, banco de células-t específicas, método de tratamento, e, banco ou instalação de armazenamento de células. |
US20180140694A1 (en) | 2015-05-04 | 2018-05-24 | Bionor Immuno As | Dosage regimen for hiv vaccine |
CN107847572A (zh) | 2015-05-13 | 2018-03-27 | 艾吉纳斯公司 | 用于癌症治疗和预防的疫苗 |
CN116196426A (zh) | 2015-07-16 | 2023-06-02 | 百欧肯治疗有限公司 | 治疗癌症的组合物及方法 |
CA3000776A1 (en) * | 2015-10-06 | 2017-04-13 | Invectys | Polyepitope constructs for use in immunotherapy |
CA3014530A1 (en) | 2016-02-23 | 2017-08-31 | Biolinerx Ltd. | Methods of treating acute myeloid leukemia |
CN105879058B (zh) * | 2016-05-10 | 2017-11-14 | 华中科技大学 | 一种结核病基因药物及其制备方法 |
US11129906B1 (en) | 2016-12-07 | 2021-09-28 | David Gordon Bermudes | Chimeric protein toxins for expression by therapeutic bacteria |
US11180535B1 (en) | 2016-12-07 | 2021-11-23 | David Gordon Bermudes | Saccharide binding, tumor penetration, and cytotoxic antitumor chimeric peptides from therapeutic bacteria |
BR112019018748A2 (pt) | 2017-03-11 | 2020-04-07 | Selecta Biosciences Inc | métodos e composições relacionados ao tratamento combinado com anti-inflamatórios e nanocarreadores sintéticos compreendendo um imunossupressor |
WO2019061297A1 (zh) * | 2017-09-29 | 2019-04-04 | 苏州工业园区唯可达生物科技有限公司 | 一种cd4辅助性t细胞表位融合肽及其疫苗 |
MA52363A (fr) | 2018-04-26 | 2021-03-03 | Agenus Inc | Compositions peptidiques de liaison à une protéine de choc thermique (hsp) et leurs méthodes d'utilisation |
US20240269254A1 (en) | 2018-10-05 | 2024-08-15 | Bavarian Nordic A/S | Combination Therapy for Treating Cancer with an Intravenous Administration of a Recombinant MVA and an Immune Checkpoint Antagonist or Agonist |
CN111068069B (zh) * | 2018-10-18 | 2022-05-20 | 中国医学科学院药物研究所 | 一种免疫靶向功能性脂质体及其制备方法与用途 |
AU2019385665A1 (en) | 2018-11-20 | 2021-05-27 | Bavarian Nordic A/S | Therapy for treating cancer with an intratumoral and/or intravenous administration of a recombinant MVA encoding 4-1BBL (CD137L) and/or CD40l |
GB201907413D0 (en) | 2019-05-24 | 2019-07-10 | Univ Helsinki | Viral vector |
EP4061406A1 (en) | 2019-11-20 | 2022-09-28 | Bavarian Nordic A/S | Recombinant mva viruses for intratumoral and/or intravenous administration for treating cancer |
EP4103587A1 (en) | 2020-02-14 | 2022-12-21 | Immunor AS | Corona virus vaccine |
EP4103210A4 (en) * | 2020-02-14 | 2024-03-20 | Altimmune Inc | IMMUNOGENIC CORONAVIRUS COMPOSITIONS AND USES THEREOF |
CN112980857A (zh) * | 2021-04-26 | 2021-06-18 | 重庆医科大学附属儿童医院 | 一种编码分泌性野生型gaa蛋白的核苷酸组合物、腺相关病毒载体及其药物和应用 |
WO2023118508A1 (en) | 2021-12-23 | 2023-06-29 | Bavarian Nordic A/S | Recombinant mva viruses for intraperitoneal administration for treating cancer |
EP4452306A1 (en) | 2021-12-23 | 2024-10-30 | Bavarian Nordic A/S | Therapy for modulating immune response with recombinant mva encoding il-12 |
WO2024121411A1 (en) * | 2022-12-09 | 2024-06-13 | Strike Pharma Ab | Optimized tag moiety |
WO2024149832A1 (en) | 2023-01-12 | 2024-07-18 | Bavarian Nordic A/S | RECOMBINANT MODIFIED saRNA (VRP) FOR CANCER VACCINE |
Family Cites Families (21)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO1986007383A1 (en) | 1985-06-04 | 1986-12-18 | Biotechnology Research Partners, Ltd. | Autoantigen vaccines |
US4772685A (en) * | 1985-10-02 | 1988-09-20 | Merck & Co., Inc. | Immunogenic peptides of human interleukin-1 and the corresponding anti-peptide antibodies |
US5126399A (en) * | 1986-04-30 | 1992-06-30 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Methods and compositions for the preparation and use of site-directed immunologic reagents |
JPH03504975A (ja) * | 1988-06-14 | 1991-10-31 | セル―エスシーアイ コーポレイション | 異種官能性細胞免疫剤、それを含有するワクチン及びその使用方法 |
ES2055785T3 (es) * | 1989-01-17 | 1994-09-01 | Eniricerche Spa | Peptidos sinteticos y su uso como vehiculos universales para la preparacion de conjugados inmunogenos aptos para el desarrollo de vacunas sinteticas. |
IT1237764B (it) * | 1989-11-10 | 1993-06-17 | Eniricerche Spa | Peptidi sintetici utili come carriers universali per la preparazione di coniugati immunogenici e loro impiego per lo sviluppo di vaccini sintetici. |
DK96493D0 (da) * | 1993-08-26 | 1993-08-26 | Mouritsen Og Elsner Aps | Fremgangsmaade til at inducere antistofresponser mod selvproteiner og autovaccine fremstillet ved fremgangsmaaden |
JP3926839B2 (ja) | 1993-09-14 | 2007-06-06 | エピミューン,インコーポレイティド | 万能dr−結合性ペプチドを用いる免疫応答の改変 |
US5501063A (en) | 1994-09-06 | 1996-03-26 | Kimberly-Clark Corporation | Apparatus and method of reducing the force to expel a tampon from a tampon applicator and the applicator itself |
AUPN015794A0 (en) | 1994-12-20 | 1995-01-19 | Csl Limited | Variants of human papilloma virus antigens |
US6410690B1 (en) * | 1995-06-07 | 2002-06-25 | Medarex, Inc. | Therapeutic compounds comprised of anti-Fc receptor antibodies |
WO1997041227A1 (en) | 1996-05-01 | 1997-11-06 | T Cell Sciences, Inc. | Plasmid-based vaccine for treating atherosclerosis |
CA2261990A1 (en) * | 1996-07-25 | 1998-02-05 | Therion Biologics Corporation | Recombinant pox virus for immunization against tumor-associated antigens |
AUPO390396A0 (en) * | 1996-11-29 | 1996-12-19 | Csl Limited | Novel promiscuous T helper cell epitopes |
WO1998025574A2 (en) * | 1996-12-10 | 1998-06-18 | Sloan-Kettering Institute For Cancer Research | Stimulation of an immune response to differentiation antigen stimulated by altered antigen |
EP1005374B1 (en) | 1997-01-22 | 2007-04-18 | Zycos Inc. | Microparticles for delivery of nucleic acid |
GB9711957D0 (en) | 1997-06-09 | 1997-08-06 | Isis Innovation | Methods and reagents for vaccination |
GB9717953D0 (en) | 1997-08-22 | 1997-10-29 | Smithkline Beecham Biolog | Vaccine |
PT1584685E (pt) | 1998-02-05 | 2011-06-17 | Glaxosmithkline Biolog Sa | Derivados de antigénios associados a tumores da família mage, utilizados para a preparação de proteínas de fusão com epítopos auxiliares t e de composições para vacinação |
WO1999056919A1 (de) | 1998-04-30 | 1999-11-11 | Manfred Schneider | Werkzeugmaschine mit werkzeugwechsel |
KR100731820B1 (ko) * | 1998-10-05 | 2007-06-25 | 파멕사 에이/에스 | 치료적 백신화를 위한 새로운 방법 |
-
1999
- 1999-10-05 KR KR1020017004399A patent/KR100731820B1/ko not_active IP Right Cessation
- 1999-10-05 PT PT99945967T patent/PT1117421E/pt unknown
- 1999-10-05 AT AT99945967T patent/ATE269100T1/de active
- 1999-10-05 SK SK427-2001A patent/SK4272001A3/sk unknown
- 1999-10-05 JP JP2000573386A patent/JP2002526419A/ja active Pending
- 1999-10-05 ES ES99945967T patent/ES2222728T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1999-10-05 HU HU0103976A patent/HUP0103976A3/hu unknown
- 1999-10-05 MX MXPA01003503A patent/MXPA01003503A/es not_active Application Discontinuation
- 1999-10-05 CN CNB998117609A patent/CN1325115C/zh not_active Expired - Fee Related
- 1999-10-05 EP EP99945967.0A patent/EP1117421B2/en not_active Expired - Lifetime
- 1999-10-05 PL PL347977A patent/PL202399B1/pl not_active IP Right Cessation
- 1999-10-05 CZ CZ20011049A patent/CZ20011049A3/cs unknown
- 1999-10-05 EA EA200100425A patent/EA003634B1/ru not_active IP Right Cessation
- 1999-10-05 TR TR2001/00936T patent/TR200100936T2/xx unknown
- 1999-10-05 IL IL14186899A patent/IL141868A0/xx not_active IP Right Cessation
- 1999-10-05 CA CA2345817A patent/CA2345817C/en not_active Expired - Lifetime
- 1999-10-05 AU AU58510/99A patent/AU751709B2/en not_active Expired
- 1999-10-05 WO PCT/DK1999/000525 patent/WO2000020027A2/en not_active Application Discontinuation
- 1999-10-05 US US09/806,703 patent/US7005498B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1999-10-05 EE EEP200100203A patent/EE200100203A/xx unknown
- 1999-10-05 NZ NZ511055A patent/NZ511055A/en not_active IP Right Cessation
- 1999-10-05 DE DE69918146T patent/DE69918146T2/de not_active Expired - Lifetime
-
2001
- 2001-03-28 NO NO20011586A patent/NO20011586L/no not_active Application Discontinuation
- 2001-05-04 HR HR20010319A patent/HRP20010319A2/hr not_active Application Discontinuation
-
2002
- 2002-02-09 HK HK02101047.9A patent/HK1039749B/zh not_active IP Right Cessation
-
2003
- 2003-05-19 US US10/441,779 patent/US7820633B2/en not_active Expired - Fee Related
-
2005
- 2005-08-11 US US11/202,516 patent/US7807441B2/en not_active Expired - Fee Related
Also Published As
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
AU751709B2 (en) | Novel methods for therapeutic vaccination | |
US10166276B2 (en) | Compositions and methods for treatment of non-hodgkins lymphoma | |
US9447144B2 (en) | MHC class II restricted T cell epitopes from the cancer antigen, NY ESO-1 | |
EP1502602A2 (en) | Methods for therapeutic vaccination | |
JP7616662B2 (ja) | 癌の予防、治療及び/または検出において使用するための新規ペプチドベースの化合物 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
FB9A | Suspension of patent application procedure |