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KR20170097194A - 상처 치유 방법 - Google Patents

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KR20170097194A
KR20170097194A KR1020177020505A KR20177020505A KR20170097194A KR 20170097194 A KR20170097194 A KR 20170097194A KR 1020177020505 A KR1020177020505 A KR 1020177020505A KR 20177020505 A KR20177020505 A KR 20177020505A KR 20170097194 A KR20170097194 A KR 20170097194A
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Abstract

본 발명은 유산균 세포로 형질전환 시 면역 세포를 표적하는 단백질을 발현할 수 있는 플라스미드에 관한 것으로, 여기에서 상기 단백질은 쥐(murine)와 인간 CXCL12 1α; CXCL17 및 Ym1로 이루어진 군으로부터 선택된 단백질이다. 추가로, 본 발명은 상기 플라스미드로 형질전환된 유산균 및 인간과 동물에서 상처 치유를 위한 상기 유산균의 용도에 관한 것이다.

Description

상처 치유 방법
본 발명은 일반적으로 재조합 플라스미드, 및 특히 유산균 세포로 형질전환시 면역 세포를 표적하는 재조합 단백질을 발현할 수 있는 플라스미드에 관한 것으로, 상기 단백질은 쥐와 인간의 CXCL12 1α, CXCL17 및 Ym1로 이루어진 그룹으로부터 선택된다. 추가로, 본 발명은 상기 플라스미드로 형질전환된 유산균 및 인간과 동물에서 상처치료를 위한 상기 유산균의 용도에 관한 것이다.
상처 치유의 과정은 국소 미세환경의 성분이 시간에 따라 변하고 서로 다른 세포 유형이 다른 역할을 하는 중복된 단계 (응고단계, 염증단계 및 증식/재형성 단계)를 갖는다. 치료 과정에서 주요 역할을 하는 세포는 혈소판, 케라티노사이트/상피세포, 섬유아세포/근섬유아세포, 다른 면역세포 및 내피세포이다. 체내 모든 조직은 손상될 수 있고 치료 과정은 장기에 특이적이지만, 손상된 세포에 의해 유도된 초기 신호는 유사하다. 상처 치유의 가장 많은 연구 형태가 피부에 있다.
조직 손상은 항상성을 방해하여 응고과정을 개시하고 교감신경계를 활성화시킨다. 혈전을 형성하는 혈소판은 주로 PDGF(혈소판 유래 성장인자) 및 TGF(형질전환 성장인자)로 신호를 방출하여 국소환경을 변화시킨다 (참고문헌 1). 손상되고 스트레스 받은 세포는 호중구 및 단핵구와 같은 면역세포의 모집을 개시하는 경고신호를 방출한다. 상처난 조직 내에서, 면역세포는 다양한 사이토카인, VEGF-A, FGF, 및 EGF (혈관내피성장인자 A, 섬유아세포성장인자, 표피성장인자)와 같은 성장인자, ROS (활성산소종) 및 매트릭스 소화효소를 분비하여, 미세환경을 변화시키고, 치료 과정이, 손상되고 죽은 조직이 대식세포에 의해 제거되는 증식단계로 진입할 수 있도록 한다. 섬유아세포 및 케라티노사이트와 같은 상처 가장자리의 세포는 상처 중심 안쪽으로 이동하여 세포외 기질 및 콜라겐 층으로 상처 표면을 덮는다. 이후 상처 내 섬유아세포는 수축성 α-SMA (α-평활근 액틴)를 발현하는 근섬유아세포로 변환되어 상처가 수축되고 마침내 봉합될 수 있게 한다. 섬유아세포에서 근섬유아세포로의 변환은 미세환경으로부터의 신호에 따라 달라지고, 이중 일부는 면역세포, 주로 대식세포로부터 유래된다. 이 과정에서, 혈관은 새로 형성된 조직인 육아조직으로 성장한다. 인접한 영역으로의 혈류는 보통 이 단계에서 증가되어 면역세포 모집 및 괴사된 부위로 이동을 증가시키고, 이외에도 산소와 영양의 이용가능성을 증가시킨다.
상처 봉합 후, 괴사된 부위는 케라티노사이트/상피세포에 의해 재상피화되어 장기 장벽의 완전한 상태가 회복된다. 상처 봉합 후에도, 일부 조직 재형성이 일어나 매트릭스 구조가 정상화되고 관련된 면역세포의 대부분이 죽거나 그 부위를 떠난다. 또한 이 단계에서 죽은 또는 죽어가는 세포는 남아있는 조직 대식세포에 의해 섭취되고 제거 (식균)된다 (참고문헌 1). 신속한 상처 치유는 환자에게 합병증과 불편함을 줄여준다.
손상되거나 지연된 피부 또는 점막 상처 치유는 통증, 병원균에 대한 직접적인 노출, 조직 기능의 상실 및 온도와 체액 균형 조절의 상실을 야기하는 전세계적인 임상적 문제이다. 철저하게 조절된 상처 치유 과정이 손상되고 피부 또는 점막 상처가 보통보다 오랜 기간 동안 치료되지 않은 상태로 남아있는 몇 가지 조건이 있으며, 이는 최악의 경우 만성이 된다.
피부, 특히 사지로의 감소된 혈류는 치료 과정의 효율성을 현저하게 감소시킨다. 피부 관류가 감소되거나, PAD (말초동맥질환), 간헐성파행, 정맥 기능부전, 동맥경화성 플라크에 의한 혈관폐색과 같이 맥관구조의 기능이 손상되는 몇 가지 임상적인 증상이 있다. 상처 부위로의 혈류 장애로 인해 산소와 영양소가 부족해지고 조직 재형성을 돕는 세포가 괴사로 죽거나 현장에서 그들의 임무를 수행할 수 없게 한다. 또한, 주변 조직은 충분히 공급되지 않는 경우 기능을 상실하고 궁극적으로 죽기 시작한다. 조직은 재형성 단계 동안 대사적으로 매우 활동적이고 산소 소비가 높다.
피부 상처 치유를 악화시키는 또 다른 요인은 고혈당증과 당뇨병이다. 고혈당 상태에서 세포 신호와 면역계 기능은 손상을 받는다. 당뇨병으로 인한 합병증은 미세혈관 변화 및 말초신경세포 손상을 포함한다. 결과적으로, 당뇨병 환자는 보통 당뇨병성 발(diabetic foot)이라고 불리는 발의 만성 상처를 발생시킨다. 오늘날 이들 환자를 위한 가능한 치료법은 전신적 항생체 치료 및 봉합된 상처 드레싱과 함께 외과적인 괴사조직 제거 또는 콜라겐분해효소를 이용하여 죽은 조직을 제거하는 것이다. 성장인자와 생체적합물질을 만성 상처에 적용시킨 실험적인 연구들이 있다 (참고문헌 2)
C-X-C 모티프 케모카인 12 (CXCL12)로도 알려진 간질세포-유래 인자 1(SDF-1)은 인간에서 CXCL12 유전자에 의해 코딩되는 케모카인 단백질이다. WO 2009/079451는 개체의 상처 치유를 촉진하는데 효과적인 양의 SDF-1을 상처 또는 상처 부근의 영역에 직접 투여하는 것을 포함하는, 개체의 상처 치유를 촉진하는 방법을 개시한다.
특정 프로바이오틱스 (락토바실러스 루테리 ATCC PTA 6475)는 치료 과정 동안 식수에 보충되는 경우, 즉, 박테리아가 섭취되는 경우, 상처 치유를 촉진하는 것으로 나타났다 (참고문헌 9). 추가로, 락토바실러스 플란타럼 (Lactobacillus plantarum)의 배양으로부터의 상층액은 보통 만성 상처를 감염시키는 녹농균 (Pseudomonas aeruginosa)에 의한 생물막 형성을 억제하는 것으로 입증되었다 (참고문헌 10).
놀랍게도, 사이토카인과 같은 특이적인 단백질을 발현하도록 변형된 본 발명에 따른 유산균은 상처 치유를 촉진하는데 유용한 것으로 밝혀졌다. 유산균은 사람 피부에 드물게 존재하며 (참고문헌 13) 피부에 어떠한 개입을 위해 사용하는 예상된 선택의 박테리아는 아니다. 락토바실리 (Lactobacilli)는 대장균 (E. coli) 및 황색포도상구균 (S. aureus)과 같이 통상적으로 자주 사용되는 박테리아와 비교하여 상대적으로 느리게 성장하고 특별한 배지와 조건이 필요하기 때문에 함께 작용하기 어렵다. 또한, 락토바실리 (Lactobacilli)는 전사, 번역 및 단백질 폴딩을 위한 세포내 수단 (machinery)을 제한한다. 이러한 이유로, 이종 단백질을 코딩하는 뉴클레오티드 서열은 특정 박테리아 균주에 적합하도록 최적화되어야 한다.
상처 치유의 다른 단계는 치료 과정을 변화시키기 위해 변경될 수 있는 별개의 주요 사건을 포함한다. 치료 과정에서 혈관 재형성은 VEGF-A (혈관내피 성장인자 A) 및 CXCL12 (SDF-1로도 알려짐; SEQ ID NO: 3 및 6)와 같은 다양한 케모카인의 발현을 조절하는 저산소성 유도인자 1α (HIF-1α)의 유도에 따라 크게 달라진다. CXCL12는 조직에서 구성적으로 발현되며 다중 세포 작용을 유도하는 내피세포 및 백혈구에서 발견되는 수용체 CXCR4를 통해 작용한다. 다중 세포 작용을 유도한다 (참고문헌 3). CXCL12는 조직 재형성에 특화된 대식세포에서 높은 수준으로 발견된다 (참고문헌 4). 렌티바이러스 벡터를 이용한 CXCL12의 피부 과발현은 당뇨병 마우스에서 상처 치유를 개선시킨다 (참고문헌 5).
최근 발견된 또 다른 케모카인은 CXCL17 (SEQ ID NO: 9 및 12)이며, 이는 CXCL12와 같이 조직 대식세포의 표현형에 유사한 영향을 미친다. CXCL12와 유사하게, CXCL17은 세포 배양에서 측정된 VEGF-A와 함께 공동-조절된다 (참고문헌 6). CXCL17은 주로 점막 조직에서 발견되며 락토바실러스 카제이 (Lactobacillus casei)의 생존에 영향을 미치지 않으면서 피부에서도 발견되는 병원성 박테리아에 직접적으로 항균성을 나타내는 것으로 보고된바 있다 (참고문헌 7).
관심의 대상이 되는 다른 단백질은 키틴분해효소-유사 단백질인 Ym1 (SEQ ID NO: 15 및 18)이다. 키틴은 박테리아성 생물막의 공통적인 다당류이다. Ym1은 생물막 생성을 방해하고 조직 재형성 및 상처 치유를 위해 중요한 대식세포 기능을 유도하며 혈관세포 또는 상피세포에 의해 흡수되지 않기 때문에 대식세포에 특이적이다 (참고문헌 8).
결과적으로, 제1 측면에서 본 발명은 유산균에서 (즉, 유산균 세포에 형질전환 시) 단백질을 발현할 수 있는 재조합 플라스미드를 제공하고, 여기서, 상기 단백질은 인간 또는 동물 개체에서 피부 또는 점막 상처 치유와 같은 상처 치유를 개선시키는데 유용하다. 바람직하게는, 상기 단백질은 대식세포 및 이들의 전구체와 같은 면역세포를 표적할 수 있기 때문에 상처 치유에 유용하다. 바람직하게는, 상기 단백질은 사이토카인 또는 케모카인이다. 가장 바람직하게는, 상기 단백질은 쥐(murine) CXCL12, 특히 쥐 CXCL12-1α (SEQ ID NO: 3); 인간 CXCL12, 특히 인간 CXCL12-1α (SEQ ID NO: 6); 쥐 CXCL17 (SEQ ID NO: 9); 인간 CXCL17 (SEQ ID NO: 12); 쥐 Ym1 (SEQ ID NO: 15); 및 인간 Ym1 (SEQ ID NO: 18)로 이루어진 군으로부터 선택된다.
보다 구체적으로, 본 발명의 제1 측면은 유산균에서 (즉, 유산균 세포로 형질전환 시) 재조합 단백질을 발현할 수 있는 플라스미드를 제공하며, 여기서, 상기 플라스미드는 CXCL12, CXCL17 및 Ym1로부터 선택된 단백질을 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
보다 구체적으로, 뉴클레오티드 서열은 쥐 CXCL12, 특히 쥐 CXCL12-1α; 인간 CXCL12, 특히 인간 CXCL12-1α; 쥐 CXCL17; 인간 CXCL17; 쥐 Ym1; 또는 인간 Ym1을 코딩할 수 있다.
일 실시예에서, 플라스미드는 SEQ ID NO: 3 또는 2에 기재된 아미노산 서열 또는 이와 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 쥐 CXCL12-1α; SEQ ID NO: 6 또는 5에 기재된 아미노산 서열 또는 이와 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 인간 CXCL12-1α; SEQ ID NO: 9 또는 8에 기재된 아미노산 서열 또는 이와 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 쥐 CXCL17; SEQ ID NO: 12 또는 11에 기재된 아미노산 서열 또는 이와 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 인간 CXCL17; SEQ ID NO: 15 또는 14에 기재된 아미노산 서열 또는 이와 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 쥐 Ym1; 및 SEQ ID NO: 18 또는 17, 또는 이와 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열에 기재된 인간 Ym1로부터 선택한 단백질을 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
보다 구체적으로, 플라스미드는 유산균에서 단백질을 발현시키는데 사용하기 위한 것이고, 따라서 그러한 용도로 제공되거나 개조된다 (예를 들어, 유산균에서 특이적 또는 특정 용도로 고안, 선택, 개조 또는 변형됨). 따라서, 일 실시예에서, 플라스미드는 일반적으로 박테리아 또는 미생물에 비해 유산균에서 특이적 발현을 위한 것이다. 플라스미드는 예를 들어, 유산균에서 발현을 위해 선택 또는 변형된 코딩 서열 및/또는 이의 조절요소 (조절 서열)에 의해 유산균에서의 발현을 위해 개조될 수 있다.
따라서, 보다 구체적인 측면에서 플라스미드는 유산균에서 발현을 허용하거나 발현을 위한 특이적인 하나 이상의 조절 (즉, 발현 조절) 서열을 포함한다. 따라서, 플라스미드는 유산균에서 유래된 또는 유산균에서 발현에 적합하거나 특이적인 발현 조절 서열을 함유할 수 있다. 적절한 발현 조절은, 예를 들어 번역 (예를 들어, 개시코돈 및 종결코돈, 리보소말 결합 부위) 및 발현되는 단백질(들)을 코딩하는 뉴클레오티드 서열과 일치하는 해독틀에 연결된 전사 조절 요소 (예를 들어, 프로모터-작동 영역, 종결 정지 서열)를 포함한다. 조절 서열(들)은 상기 단백질을 코딩하는 뉴클레오티드 서열에 작동가능하게 연결되어, 작동, 또는 조절, 단백질을 발현시킨다. 플라스미드는 유산균 세포에 도입될 수 있다. 적합한 형질전환 기술은 문헌에 잘 기술되어 있다. 박테리아 세포는 플라스미드로부터 상기 단백질의 발현을 허용하는 조건 하에서 배양되거나 그렇지 않으면 유지될 수 있다. 이는 개체의 상처에서의 상태를 포함할 수 있다.
일 실시예에서, 단백질의 발현을 조절하는 플라스미드의 프로모터는 유산균에서 발현을 허용하거나, 발현에 특이적인 프로모터이다. 따라서, 플라스미드는 유산균에서 단백질을 발현할 수 있는 프로모터의 조절 (프로모터에 작동가능하게 결합된) 하에 단백질을 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함할 수 있다. 특정 바람직한 실시예에서, 플라스미드는 단백질(들)의 발현을 조절하는 프로모터이고 유산균 유래 프로모터이거나, 더욱 구체적으로는 유산균에서 발현된 유전자로부터 유래되거나 수득된 유산균 프로모터를 포함한다.
일부 실시예에서, 유산균 프로모터 외에도, 플라스미드는 또한 단백질(들)의 발현을 조절하기 위한 유산균 유래 또는 이로부터 수득된 다른 조절요소 또는 서열을 함유할 수 있다. 따라서, 예를 들어 그러한 다른 유산균 발현 조절요소 또는 서열은 상기 언급된 인핸서, 종결자 및/또는 번역 조절요소 또는 서열을 포함할 수 있다. 일부 실시예에서, 플라스미드는 또한, 예를 들어 작동서열 등의 프로모터 또는 하나 이상의 조절 유전자로부터의 발현을 제어 또는 조절하는, 하기에 추가로 언급되는 조절요소 또는 서열을 함유할 수 있다.
선택적으로 또는 부가적으로, 플라스미드는 유산균에서의 발현을 위해 코돈-최적화된 단백질(들)을 코딩하는 뉴클레오티드 서열에 의해 유산균에서 사용하기 위해 개조 (또는 변형 등)될 수 있다.
바람직한 일 실시예에서, 단백질의 발현을 위한 프로모터는 조절 (조절가능한) 또는 유도성 프로모터이다. 따라서, 단백질의 발현은 박테리아를 제공하거나 박테리아를 프로모터를 활성화시키거나 켜는 (유도하는) 조절분자 또는 유도인자와 접촉시킴으로써 제어되거나 조절될 수 있다 (예를 들어, 바람직하거나 적절한 시간에 개시됨). 이는 상처에 단백질을 전달하는데 유리하다.
따라서, 본 발명의 추가의 측면은 유산균에서 단백질을 발현하는데 사용하기 위한 발현 시스템을 제공하고, 상기 발현 시스템은 (i) 본원에 정의된 바와 같은 플라스미드, 여기서 상기 플라스미드는 유산균에서 단백질을 발현할 수 있는 유도성 프로모터의 조절 하에 상기 단백질을 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함하고; 및 (ii) 프로모터를 위한 유도인자 (또는 조절분자)를 포함한다. 발현 시스템은 편리하게는 상기 구성요소 (i) 및 (ii)를 포함하는 키트의 형태로 제공될 수 있다.
본 발명의 또 다른 측면은 본원에 정의된 바와 같은, 본 발명의 플라스미드로 형질전환된 (즉, 포함하는) 박테리아 또는 박테리아들 (즉, 박테리아 세포 또는 균주)이다. 구체적으로, 박테리아는 유산균이고, 이에 따라 본 발명은 본원에 정의된 바와 같은, 본 발명의 플라스미드를 포함하는 유산균들 (또는 유산균)을 제공한다. 다르게 표현하면, 이러한 본 발명의 측면은 본 발명의 플라스미드가 도입된 박테리아 (또는 박테리아 세포)를 제공한다.
본원에 추가로 기재된 바와 같이, 본 발명의 플라스미드 및 박테리아는 치료를 촉진하는데 유용하고, 따라서 손상된 조직을 일반적으로 포함하는 것으로 본원에 정의된 상처의 치료를 촉진하는데 특히 유용하다 (추가로 하기를 참조한다). 따라서, 본 발명의 추가의 측면은 치료에 사용하기 위한, 보다 구체적으로는 상처 치유에 사용하기 위한 상기 플라스미드 및 박테리아를 제공한다.
박테리아는 약학적 조성물의 형태로 치료될 개체의 상처에 투여하기 위해 제공될 수 있다. 따라서, 본 발명의 또 다른 측면은 적어도 하나의 약학적으로 허용가능한 담체 또는 부형제와 함께, 본원에 정의된 바와 같은, 본 발명의 박테리아를 포함하는 약학적 조성물을 제공한다.
보다 일반적으로, 본 발명은 본 발명의 박테리아를 포함하는 프로바이오틱 제품을 제공한다.
이러한 제품, 또는 약학적 조성물은 편리하게는 본 발명의 박테리아를 포함하는 상처 드레싱의 형태를 취할 수 있다. 따라서, 추가의 측면에서, 본 발명은 적어도 하나의 드레싱 재료와 함께, 상기 본원에 정의된 바와 같은, 본 발명의 박테리아를 포함하는 상처 드레싱을 제공한다.
본 발명의 또 다른 측면은 상처 치유에 사용하기 위한 약제 (또는 프로바이오틱 제품)의 제조를 위한, 본원에 정의된 바와 같은 본 발명의 플라스미드 또는 박테리아의 용도를 제공한다.
또한, 상처를 치료하기 위해 개체를 치료하는 방법을 제공하며, 상기 방법은 상기 개체, 또는 상기 개체의 상처에, 본원에 정의된 바와 같은 본 발명의 박테리아를 상처의 치료를 촉진하는데 유효한 양으로 투여하는 것을 포함한다.
본 발명의 다른 측면은 상처를 치료하기 위한 키트를 제공하며, 상기 키트는 다음을 포함한다:
(i) 본원에 정의된 바와 같은 본 발명의 플라스미드를 포함하는 유산균, 여기서 상기 플라스미드는 유산균에서 단백질을 발현할 수 있는 유도성 프로모터의 조절 하에 상기 단백질을 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함함; 및
(ii) 프로모터를 위한 유도인자 (또는 조절분자).
본 발명의 또 다른 측면은 다음을 포함하는, 상처 치유 시 개별적으로, 순차적으로 또는 동시에 사용하기 위한 복합 조제품으로서의 의약품 (예를 들어, 키트 또는 조합 제품)을 포함한다:
(i) 본원에 정의된 바와 같은 본 발명의 플라스미드를 포함하는 유산균, 여기서 상기 플라스미드는 유산균에서 단백질을 발현할 수 있는 유도성 프로모터의 조절 하에 상기 단백질을 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함함; 및
(ii) 프로모터를 위한 유도인자 (또는 조절분자).
본 명세서에서 용어 "상처 치유"는 상처의 치료를 촉진 또는 개선시키는 모든 측면을 포함하는 것으로 폭넓게 사용된다. 따라서, 상기 제시된 본 발명의 다양한 측면은 상처 치유를 촉진 또는 향상 또는 개선시키거나 단순하게 치료를 촉진 또는 향상시키는데 있어서 플라스미드 또는 박테리아의 유용성에 대해 선택적으로 정의될 수 있다.
따라서, 상처 치유는 더 빠른 상처 치유, 또는 보다 완전한 상처의 치유 또는 실제로 상처 치유의 모든 향상 또는 개선, 예를 들어 감소된 치료 시간, 예를 들어 부분적인 또는 완전한 상처의 봉합을 이루기 위한 감소된 시간, 개선된 상처 외관 (예를 들어, 치료된 또는 치료되고 있는 상처의 외관), 감소된 또는 개선된 흉터 형성, 만성 또는 저항성 상처 등의 치료 촉진 (즉, 본 발명의 박테리아의 상처로의 적용은 지금까지 치유되지 않거나 어떠한 치유의 징후도 보이지 않았던 상처의 치료를 유도, 또는 야기, 또는 개시한다)을 포함하거나 포괄할 수 있다. 상처는 하기에서 보다 상세하게 설명된다.
치료될 상처를 갖는 개체는, 모든 인간 또는 예를 들어 가축 (domestic animals), 축류 (livestock animals), 실험동물, 스포츠 동물 또는 동물원의 동물을 포함하는 동물 개체일 수 있다. 동물은 바람직하게는 포유동물이지만, 다른 동물, 예를 들어 새를 포함한다. 따라서, 동물은 영장류, 설치류 (예를 들어, 마우스 또는 래트), 또는 말, 개 또는 고양이일 수 있다. 가장 바람직하게는 개체는 인간이다.
유산균 (LAB) 또는 유산균목 (Lactobacillales)은 그람 양성, 낮은 GC, 내산성, 일반적으로 비포자성, 비호흡성 (nonrespiring), 간상형 (바실러스), 또는 구형 (코커스) 박테리아의 클레이드로, 공통의 대사 및 생리학적 특성을 공유한다. 이러한 박테리아는 탄수화물 발효의 주요 대사 최종 산물로서 젖산을 생산하고 산도 (낮은 pH 범위)에 대해 증가된 저항성을 특징으로 한다. 이러한 LAB의 특성은 이들이 유기산 생산 (예를 들어, 젖산)으로 인해 증가된 산도를 견딜 수 있기 때문에 천연 발효에서 다른 박테리아와 경쟁할 수 있도록 한다. 따라서, 산성화가 부패인자의 성장을 억제하기 때문에 LAB가 식품 발효에서 중요한 역할을 한다. 여러 LAB 균주는 또한 병원성 미생물의 부패와 성장을 추가로 억제하는 단백질성 박테리오신을 생산한다. LAB은 일반적으로 안전한 (GRAS) 상태로 인식되며 식품 산업에서 사용되는 가장 중요한 미생물 그룹 중 하나이다.
유산균 클레이드를 포함하는 핵심 속(genera)은 락토바실러스속 (Lactobacillus), 류코노스톡속 (Leuconostoc), 페디오코커스속 (Pediococcus), 락토코커스속 (Lactococcus), 및 스트렙토코커스속 (Streptococcus) 뿐만 아니라 보다 지엽적인 에어로코커스 (Aerococcus), 카르노박테리움 (Carnobacterium), 엔테로코커스 (Enterococcus), 오에노코커스 (Oenococcus), 스포로락토바실러스 (Sporolactobacillus), 테트라제노코커스 (Tetragenococcus), 바고코커스(Vagococcus), 및 바이셀라 (Weissella)이다. 이러한 속으로부터의 임의의 유산균은 본 발명의 범위 내에 포함되나, 특히 락토바실러스속 (Lactobacillus) 또는 락토코커스속 (Lactococcus)의 박테리아이다.
플라스미드는 하나 이상의 상기 단백질을 코딩할 수 있다. 따라서, 플라스미드는 CXCL12, CXCL17 및/또는 Ym1 단백질의 조합 (예를 들어, 2 또는 그 이상의 CXCL12, CXCL17 또는 Ym1)을 코딩할 수 있다. 선택적으로, 플라스미드는 2종 또는 그 이상의 종류의 CXCL12, CXCL17 및/또는 Ym1 단백질 (예를 들어, 쥐 및 인간 CXCL12 등)을 코딩할 수 있다. 하나 이상의 단백질을 코딩하는 경우, 단백질은 단일 프로모터의 제어 하에 단백질을 코딩하는 뉴클레오티드 서열로부터 발현될 수 있거나, 하나 이상의 프로모터가 사용될 수 있다. 예를 들어, 각 단백질은 개별적인 프로모터로부터 발현될 수 있고, 프로모터는 동일하거나 다를 수 있다. 동일한 플라스미드로부터 2종 이상의 단백질을 함께 발현하기 위한 기술은 당해 기술분야에 잘 알려져 있고, 예를 들어 번역 공역 기술 (translational coupling techniques)을 포함하고, 이를 달성하기 위한 방법은 당해 기술분야에 공지되어 있고 이용가능하다. 예를 들어, 다중 전이유전자는 P2A 및 T2A 서열을 사용하여 하나의 프로모터 하에 동시에 발현될 수 있다.
CXCL12, CXCL17 또는 Ym1 단백질은 자연적 또는 천연 단백질 (즉, 뉴클레오티드는 자연에서 발견되는 것과 같은 아미노산 서열을 갖는 단백질을 코딩할 수 있다)일 수 있고, 이러한 단백질이 발생하는 모든 종으로부터 유래될 수 있다. 일반적으로, 단백질은 포유류 단백질일 것이고, 상기에 기재된 바와 같이 인간 및 쥐 단백질이 바람직하다. 그러나, 천연 뉴클레오티드 서열 또는 단백질 서열은 단백질의 기능 또는 활성이 실질적으로 또는 현저하게 변하지 않는 한, 예를 들어, 단백질의 활성이 실질적으로 유지되는 한, 예를 들어 하나 이상의 아미노산 추가, 삽입, 결실 및/또는 치환에 의해 변형될 수 있다. 상기 단백질은 천연 단백질의 단편 또는 절단된 변이체일 수 있다. 예를 들어, 서열 변형 변이체 단백질은 그것이 유래된 모단백질의 적어도 80, 85, 90 또는 95%의 활성을 나타낼 수 있다. 이는 해당 단백질의 활성에 대해 당업계에 공지된 테스트에 따라 평가될 수 있다. 예를 들어, 활성은 단백질로 처리된 배양 세포에서 결찰에 따른 수용체 인산화 또는 칼슘 유동 시스템, 시험관 내 (in vitro) 세포 주화성 시스템, 생체 내(in vivo) 감염 단백질에 대한 세포 회복 모델에서 측정될 수 있다. 주화성을 바탕으로 한 시험관 내 (in vitro) 검정은 참고문헌 22와 32에 기재되어 있다. 참고문헌 33은 사용될 수 있는 추가의 시험관 내 (in vitro) 케모카인 활성 테스트를 기재한다. 따라서, 용어 "CXCL12", "CXCL17" 또는 "Ym1"은 천연 단백질뿐만 아니라 기능적으로 동일한 이의 변이체 또는 유도체를 포함한다. 따라서, 단백질은 합성 또는 서열-변형 변이체일 수 있거나, 하나 이상의 다른 변형, 예를 들어 번역후 변형 등을 포함할 수 있다.
상기 기재된 바와 같이, 코딩된 단백질은 천연 인간 또는 쥐 단백질에 대해 상기 기재된 아미노산 서열, 즉, 쥐 및 인간 CXCL12에 대해 각각 SEQ ID NOS. 3 및 6, 쥐 및 인간 CXCL17에 대해 각각 SEQ ID NOS. 9 및 12, 쥐 및 인간 Ym1에 대해 각각 SEQ ID NOS. 15 및 18, 또는 전술한 모든 서열과 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 가질 수 있다. 유리하게는, 상기 추가로 기재된 바와 같이, 이러한 천연 단백질을 코딩하는 뉴클레오티드 서열은 유산균에서의 발현을 위해 코돈-최적화될 수 있다. 이것은 코딩된 단백질의 변형된 아미노산 서열을 야기할 수 있다. 예를 들어 코돈 최적화된 서열은 유산균에 적합한 (또는 더 적합한) 분비 서열과 같은 서열을 코딩할 수 있다. 따라서, 코돈-최적화된 뉴클레오티드 서열에 의해 코딩된 "최적화된" 단백질은 천연 단백질과 비교하여 변경된 또는 치환된 선도서열 또는 신호서열 (예를 들어, 분비서열)을 포함할 수 있다. 바람직한 일 실시예에서, 코돈 최적화된 서열에 의해 코딩된 단백질의 성숙 또는 절단된 형태는 천연 단백질과 동일하다. 코돈-최적화된 뉴클레오티드 서열에 의해 코딩된 단백질은 하기 표 4에 나열된 SEQ ID NOS. 2, 5, 8, 11, 14, 또는 17에 기재된 아미노산 서열을 가질 수 있다. 따라서, 플라스미드에 의해 코딩된 단백질은 쥐 및 인간 CXCL12에 대해 각각 SEQ ID NOS. 2 및 5, 쥐 및 인간 CXCL17에 대해 각각 SEQ ID NOS. 8 및 11, 쥐 및 인간 Ym1에 대해 각각 SEQ ID NOS. 14 및 17, 또는 전술한 모든 서열과 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 가질 수 있다.
다른 실시예에서, 코딩된 단백질(들)은 상기 임의의 아미노산 서열과 적어도 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89% 90%, 91% 92% 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 가질 수 있다.
서열 동일성은 당해 기술분야에 공지되어 있고 용이하게 이용할 수 있는 방법 및 소프트웨어에 의해 용이하게 결정될 수 있다. 따라서, 서열 동일성은 임의의 편리한 방법으로 평가될 수 있다. 그러나, 서열 사이의 서열 동일성 정도를 결정하기 위해, 서열의 다중 정렬을 만드는 컴퓨터 프로그램, 예를 들어 Clustal W가 유용하다 (참고문헌 24). ALIGN (참고문헌 25), FASTA (참고문헌 26 및 참고문헌 27), BLAST 및 갭핑 BLAST (참고문헌 28)와 같이 서열 쌍을 비교하고 정렬하는 프로그램도 이러한 목적으로 유용하며, 기본설정을 이용하여 사용될 수 있다. 또한, 유럽생물정보연구소 (European Bioinformatics institute)의 Dali 서버는 단백질 서열의 구조-기반 정렬을 제공한다 (참고문헌 29, 참고문헌 30 및 참고문헌 31). 다중 서열 정렬 및 백분율 동일성 계산은 표준 BLAST 파라미터 (예를 들어, 이용가능한 모든 생물체로부터의 서열을 이용함, 매트릭스 Blosum 62, 갭 코스트: 존재 11, 연장 1)를 사용하여 결정될 수 있다. 선택적으로, 다음의 프로그램 및 파라미터를 사용할 수 있다: 프로그램: Align Plus 4, 버전 4.10 (Sci Ed Central Clone Manager Professional Suite). DNA 비교: 전체 비교, 표준 1차 스코어링 매트릭스, 미스매치 페널티 = 2, 오픈 갭 페널티 = 4, 신장 갭 페널티 = 1. 아미노산 비교: 전체 비교, BLOSUM 62 스코어링 매트릭스.
본원에 정의된 자연발생 폴리펩티드 서열의 변이체는, 예를 들어 당해 기술분야에 공지된 표준 분자 생물학적 기술, 예를 들어, 부위-특이적 또는 무작위 돌연변이 (예를 들어, 유전자 셔플링 또는 오류 발생이 쉬운 PCR을 이용함)와 같은 표준 돌연변이 기술을 이용하여 합성적으로 생성될 수 있다.
본원에 정의된 단백질의 유도체는 또한 코딩될 수 있다. 유도체는 상기 기재된 단백질 또는 예를 들어, 아미노산이 글리코실화 등에 의해 화학적으로 변형된 이의 변이체를 의미한다.
단백질이 천연 단백질의 서열에 대해 아미노산 치환을 포함하는 경우, 치환은 바람직하게는 보존적 치환일 수 있다. 용어 "보존적 아미노산 치환"은 아미노산이 유사한 물리화학적 특성을 갖는 아미노산, 즉 동일한 클래스/그룹의 아미노산으로 대체된 (치환된) 임의의 아미노산 치환을 말한다. 예를 들어, 작은 잔기 글리신 (G), 알라닌 (A) 세린 (S) 또는 트레오닌 (T); 소수성 또는 지방족 잔기 류신 (L), 이소류신 (I); 발린 (V) 또는 메티오닌 (M); 친수성 잔기 아스파라긴 (N) 및 글루타민 (Q); 산성 잔기 아스파르트산 (D) 및 글루탐산 (E); 양전하 (염기성) 잔기 아르기닌 (R), 리신 (K) 또는 히스티딘 (H); 또는 방향족 잔기 페닐알라닌 (F), 티로신 (Y) 및 트립토판 (W)은 단백질 기능 또는 활성을 실질적으로 변경하지 않고 교체가능하게 치환될 수 있다.
상기 기재된 바와 같이, 단백질의 발현을 위한 유도성 프로모터를 사용하는 것이 바람직하다. "유도성"은 기능 (즉, 코딩 뉴클레오티드 서열의 전사를 가능하게 하는 또는 야기하는 활성, 또는 효과)이 조절 또는 제어될 수 있는 임의의 프로모터를 의미한다. 따라서, 용어 "유도성"은 "조절가능한" (또는 "조절된")과 동의어이며, 이와 교환가능하게 사용될 수 있다. 따라서, 단백질의 구성적 발현은 존재하지 않는다. 이에 따라, 단백질의 발현은 유도되거나, 켜질 수 있다 (보다 구체적으로 켜지고 꺼질 수 있음). 보다 구체적으로, 발현은 제한된 시간 또는 소정의 시간 동안 유도되거나 켜질 수 있다. 이것은 발현이 일정 기간 후에 중단되고/중단되거나 박테리아 세포가 죽기 때문이다.
일부 실시예에서, 프로모터가 유도될 때까지 (또는 선택적으로 활성화되는 것으로 칭함) 프로모터로부터의 발현 (전사)가 없을 수 있다. 그러나, 임의의 생물학적 시스템과 같이, 활성의 결핍은 절대적이지 않을 수 있으며, 프로모터 활성 또는 유도가 부재된 일부 기본 프로모터 활성일 수 있다. 그러나, 바람직한 일 실시예에서 유도되지 않은 프로모터의 임의의 기본 발현은 낮거나, 최소이거나, 중요하지 않거나, 더욱 바람직하게는 최소허용정도 또는 무시할 수 있는 정도이다. 따라서, 유도성 프로모터로부터의 발현은, 프로모터가 유도되지 않을 때에 비해, 프로모터가 유도될 때 유리하게 측정가능하게 증가하거나 명백하게 증가한다.
유산균에서 사용하기 위한 유도성 프로모터를 포함하는 유도성 프로모터는 당해 기술분야에 잘 알려져 있으며, 유산균에서의 발현에 적합한 임의의 적절한 유도성 프로모터가 사용될 수 있다.
유도성 프로모터는 유도인자 또는 활성인자 분자의 존재 하에 유도될 수 있고 (또는 활성화됨), 이는 프로모터에 직접 또는 간접적으로 작용할 수 있고, 프로모터를 유도하기 위해, 또는 보다 일반적으로 프로모터의 유도 또는 활성화를 야기하거나 가능하게 하기 위해 추가될 수 있으며, 단백질의 발현을 허용하고, 또는 플라스미드를 함유하는 박테리아의 조건의 변화, 예를 들어, 유산균에 대한 변화 조건, 예를 들어, 특정 영양분의 결핍 또는 고갈을 유도하여 도입될 수 있다 (또는 활성화될 수 있음), 프로모터의 유도인자는 조절 유전자에 의해 코딩될 수 있고, 일 실시예에서는 스스로 유도되거나 활성화될 수 있다. 따라서, 용어 "유도인자"는 본원에서 임의의 조절 분자, 또는 실제로 유도성 프로모터를 활성화하거나 작동시킬 수 있고, 또는 유도성 프로모터가 유도되도록 하거나 이를 야기할 수 있는 임의의 허용조건을 포함하는 것으로 폭넓게 사용된다. 유도성 프로모터의 유도는 (예를 들어, 플라스미드를 함유하는 유산균과 접촉하는) 조절 분자 또는 프로모터 유도 (활성화)를 허용하는 조건의 도입을 포함할 수 있다. 일부 실시예에서, 유도인자는 활성 펩티드일 수 있다. 이것은, 예를 들어 하기에 추가로 기재된 바와 같이 프로모터를 직접 또는 간접적으로 유도하는데 작용할 수 있다.
상기한 바와 같이, 유산균으로부터 수득된 또는 유래된 프로모터가 바람직하다. 이들은 천연 프로모터이거나 변형된 또는 돌연변이 프로모터일 수 있다. 적합한 프로모터는, 예를 들어 상처에서 유산균을 성장시킴으로써, 또는 상처의 박테리아에서 어떤 유전자가 발현되는지 또는 상승조절되는지 결정함으로써 확인될 수 있다. 이후 이러한 유전자로부터의 프로모터가 확인될 수 있다. 선택적으로, 실험실에서 사용하기 위한 상기 프로모터 또는 발현 시스템을 함유하는 발현 플라스미드를 포함하여, 유산균에서의 또는 유산균에서 사용하기 위한 수많은 상이한 프로모터 및 발현 시스템이 확인 및 설명되었으며, 또는 당해 기술분야에서 이용가능하다. 임의의 상기 공지된 플라스미드 또는 발현 시스템은 본 발명의 재조합 플라스미드를 위한 기초로 사용될 수 있다.
다양한 유도성 발현 시스템이 당해 기술분야에 락토바실리 (Lactobacilli)와 같은 LAB와 함께 사용하기 위한 것으로 공지되어 있다. 일례로는 참고문헌 19에 기재된 락토바실러스 플란타럼 (L. plantarum) NC8의 망간 운반체의 망간 고갈-유도성 프로모터를 기반으로 하는 자가-유도 시스템을 포함한다. 이러한 시스템은 재조합 단백질 생산을 위한 외부 유도인자의 추가를 필요로 하지 않는다.
참고문헌 20 (Duong et al)은 넓은 범위의 pWV01 레플리콘을 기반으로 하며, 프락토올리고당 (FOS), 락토오스 또는 트레할로오스 대사 또는 수송, 또는 해당작용과 연관된 오페론으로부터의 프로모터를 함유하는 락토바실리 (lactobacilli)와 함께 사용하기 위한 발현 벡터를 기술한다. 그러한 프로모터는 이들의 특정 탄수화물에 의해 유도될 수 있고 글루코스에 의해 억제될 수 있다.
보다 구체적으로, 유도성 발현 시스템은 LAB 단백질, 특히 박테리오신 생산과 관련된 유도성 프로모터를 포함할 수 있다. 상기 프로모터의 활성은 박테리오신 레귤론을 기반으로 한 같은 종류의 조절 시스템, 예를 들어 외부적으로 첨가된 활성인자 펩티드 (즉, 펩티드 형태의 유도인자/조절분자)와 활성인자 펩티드에 의한 유도 시 이 프로모터를 활성화하는데 필요한 반응 조절인자 및 히스티딘 단백질 키나아제를 코딩하는 유전자에 반응하는 두 가지 구성요소의 조절 (신호 전달) 시스템에 의해 제어될 수 있다.
일 실시예에서, 발현 시스템은 nisA 프로모터와 nisRK 조절 유전자의 조합을 기반으로 한, 니신-제어 발현 (NICE) 시스템을 기초로 할 수 있다. 이 시스템은 락토코커스 락티스 (Lactococcus lactis) 니신 유전자 클러스터로부터 유래된 프로모터와 조절 유전자를 기반으로 하며, 락토코키 (lactococci), 락토바실리 (lactobacilli) 및 다른 그람 양성 박테리아에 대한 조절된 유전자 발현 시스템을 개발하기 위해 사용되어 왔다 (참고문헌 15 및 참고문헌 21에서 간략하게 검토됨). NICE 시스템은 락토코키 (Lactococci)에서 효율적이고 잘 조절되면서, 이들 시스템은 중요한 기저 활성을 나타낼 수 있다. 이것은 히스티딘 키나아제와 반응 조절 유전자를 염색체에 통합하여 발현 시스템을 특별히 고안한 숙주 균주로 제한함으로써 회피할 수 있다.
또 다른 일 실시예에서, 발현 시스템은 사카신 A 레귤론에 의한 클래스 II q박테리오신 사카신 A (spp 유전자) 또는 사카신 P 레귤론에 의한 사카신 P (spp 유전자)의 생성과 관련된 유전자 및 프로모터를 기반으로 할 수 있다. 그러한 벡터는 pSIP 벡터로 공지되어 있고, 번역 융합 클로닝에 대한 유전자 조작된 NcoI 부위를 갖는 사카신 A 또는 사카신 P 구조 유전자로부터 유래된 프로모터 요소를 포함한다. 레귤론 및/또는 상이한 레플리콘으로부터의 상이한 프로모터를 함유하는 다양한 상기 벡터들이 참고문헌 21 및 참고문헌 15에 기재되어 있고, 임의의 이러한 벡터들은 본 발명의 재조합 플라스미드를 위한 기초로 사용될 수 있다.
대표적인 일 실시예에서, 프로모터는 이의 관련된 또는 동족 조절 유전자와 함께, 사카신 A 또는 P 레귤론 유래 PsapA, PsppA or PorfX 프로모터일 수 있다.
특히 바람직한 일 실시예에서, 플라스미드는, 도 12에 도시되고 참고문헌 21에 기재된 벡터 pSIP411을 기반으로 하여, pSH71 레플리콘, 사카신 P 레귤론 유래 PorfX 프로모터 및 같은 종류의 조절 유전자를 포함한다. 플라스미드 pSIP411은 본원에서 pLAB112로 명명된다. 바람직하게는, 상기와 같은 실시예에서 사용하기 위한 유도인자는 펩티드 SppIP를 기초로 한 활성 펩티드, 예를 들어 SEQ ID NO.19의 서열, 또는 이와 적어도 80% (또는 더욱 특히 적어도 85, 90 또는 95) 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 활성 펩티드이다. 바람직한 일 실시예에서, 상기 재조합 플라스미드는 SEQ ID NO: 20에 기재된 뉴클레오티드 서열을 갖는 pLAB112로 명명된 플라스미드로부터 유래된다.
유도성 프로모터 (또는 유도성 발현 시스템)의 사용은 보다 제어된 이점, 특히 상처 세팅에서, 즉 박테리아가 개체 또는 상처에 투여될 때, 단백질의 연장된 발현의 이점을 제공할 수 있다. 상처 치유를 촉진하는데 더 나은 효과를 위해, 상처 부위 (예를 들어, 상처 표면)에서 일정시간 동안, 예를 들어 40, 45, 50, 55 또는 60 분, 특히 적어도 한 시간 또는 그 이상 동안 박테리아에 의해 단백질이 발현되는 것이 유리하다. 따라서, 단백질은 한정된 시간, 소정의 시간 또는 연장된 기간 동안 발현될 수 있다. 하기 실시예에 나타난 결과는 본 발명에 따른 플라스미드와 박테리아를 사용하여 상처 표면에서 약 한 시간 동안 단백질을 발현시킬 수 있다는 것을 보여준다. 상기 플라스미드와 박테리아는 일부 실시예에서 2, 3, 또는 4시간 또는 그 이상의 시간 동안 (예를 들어, 상처에서) 단백질의 발현이 가능하도록 최적화될 수 있다.
따라서, 단백질의 지속적인 발현 및 전달이 바람직하며, 이는 본 발명의 형질전환된 박테리아를 사용함으로써 제공될 수 있다. "지속적인" 또는 "연장된"은 일정 시간, 예를 들어 적어도 한시간 동안 (또는 상기 논의된 바와 같음) 단백질의 발현이 있고, 이후 단백질의 전달이 있음을 의미한다. 특히, 이것은 단백질을 직접적으로 투여하는 것과 비교하여 (즉, 박테리아에 의해 발현되는 것 보다는 단백질 생산물로서) 증가된 기간 동안 단백질이 효과를 나타낼 수 있도록 한다.
상기 논의된 바와 같이, 단백질(들)을 코딩하는 뉴클레오티드 서열은 실험실에서의 발현을 위해 코돈 최적화될 수 있다. 따라서, 바람직한 실시예에서, 단백질을 코딩하는 재조합 플라스미드에서 뉴클레오티드 서열 (또는 인서트)은 쥐 CXCL12, 인간 CXCL12, 쥐 CXCL17, 인간 CXCL17, 쥐 Ym1 및 인간 Ym1을 각각 코딩하는 SEQ ID NOS. 1, 4, 7, 10, 13 및 16에 기재된 코돈-최적화된 뉴클레오티드 서열 또는 이와 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 뉴클레오티드 서열로부터 선택될 수 있다.
따라서, 대표 실시예에서, 재조합 플라스미드는 SEQ ID NO: 1에 기재된 뉴클레오티드 서열을 포함하는, mLrCK1로 명명된 플라스미드; SEQ ID NO: 1에 기재된 뉴클레오티드 서열을 포함하는, mLrCK1.4로 명명된 플라스미드; SEQ ID NO: 1에 기재된 뉴클레오티드 서열을 포함하는, mLrCK1.7로 명명된 플라스미드; SEQ ID NO: 4에 기재된 뉴클레오티드 서열을 포함하는, hLrCK1로 명명된 플라스미드; SEQ ID NO: 7에 기재된 뉴클레오티드 서열을 포함하는, mLrCK2로 명명된 플라스미드; SEQ ID NO: 10에 기재된 뉴클레오티드 서열을 포함하는, hLrCK2로 명명된 플라스미드; SEQ ID NO: 13에 기재된 뉴클레오티드 서열을 포함하는, hLrMP1로 명명된 플라스미드; 및 SEQ ID NO: 16에 기재된 뉴클레오티드 서열을 포함하는, mLrMP2로 명명된 플라스미드로 이루어진 군으로부터 선택될 수 있다.
일부 실시예에서, 본 발명의 플라스미드는 다음의 코돈 최적화된 인서트 mLrCK1 (즉, SEQ ID NO: 1의 뉴클레오티드 서열), mLrCK1.4 (즉, SEQ ID NO: 1의 뉴클레오티드 서열), mLrCK1.7 (즉, SEQ ID NO: 1의 뉴클레오티드 서열), hLrCK1 (즉, SEQ ID NO: 4의 뉴클레오티드 서열), mLrCK2 (즉, SEQ ID NO: 7의 뉴클레오티드 서열), hLrCK2 (즉, SEQ ID NO: 10의 뉴클레오티드 서열), hLrMP1 (즉, SEQ ID NO: 13의 뉴클레오티드 서열), 및 mLrMP2 (즉, SEQ ID NO: 16의 뉴클레오티드 서열)의 뉴클레오티드 서열과 적어도 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89% 90%, 91% 92% 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 서열 동일성을 갖는 뉴클레오티드 서열을 포함한다.
뉴클레오티드 분자의 서열 동일성은 당해 기술분야에 공지된 방법 및 소프트웨어에 의해 결정될 수 있고 예를 들어, 디폴트 값 및 변수 팸팩터를 포함하는, GCG 패키지를 이용한 FASTA Search, 및 6개 뉴클레오티드의 윈도우를 포함하는 12.0의 갭 크리에이션 페널티 세트와 4.0의 갭 신장 페널티 세트로 당해 기술분야에서 이용가능하다.
뉴클레오티드 서열과 관련된 상기 서열 동일성은 SEQ ID NO: 1, 4, 10, 13 또는 16에 기재된 뉴클레오티드 서열과 기능적으로 동일할 수 있다. 상기 뉴클레오티드 서열은 CXCL12, CXCL17 또는 Ym1 단백질 각각에 대해 기능적 등가물로 여겨질 수 있는 폴리펩티드를 코딩하는 경우, 기능적으로 동등한 것으로 간주될 수 있다. 바람직한 기능적 등가물은 상기 기재된 바람직한 단백질을 코딩하는 것이다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 상기 기재된 재조합 플라스미드로 형질전환된 박테리아 균주를 제공한다. 바람직하게는, 상기 박테리아 균주는 락토바실러스 (Lactobacillus) 균주 또는 락토코커스 (Lactococcus) (예를 들어, 락토코커스 락티스 (Lactococcus lactis)) 균주와 같은 유산균 균주이다. 더욱 바람직하게는, 박테리아 균주는 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC 또는 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) DSM20016과 같은 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) 균주이다. 상기 균주 (락토바실러스 루테리 R2LC/DSM20016 및 락토코커스 락티스)는 6종의 개체의 팔뚝 피부 생물군의 계통발생적 분석으로 측정된 바와 같이 인간 피부에서 발견되지 않는다 (참고문헌 13).
플라스미드, 발현 시스템, 박테리아 및 키트 뿐만 아니라, 본 발명의 추가의 생산품은 박테리아를 함유하는 약학적 조성물 및 의료장치를 포함한다. 이러한 조성물 및 장치는, 특히 상처 드레싱, 포장재, 면봉, 이식체 등을 포함하거나, 실제로 상처 부위 (예를 들어, 수술 상처 부위)에 도입하거나 존재할 수 있는 전체 또는 부분적으로 내재된 의료장치, 예를 들어 줄 (line) 또는 카테터 또는 이식물을 포함할 수 있다. 또한, 프로바이오틱 제품, 즉 개체에게 투여하기 위한, 예를 들어 경구 투여용, 예를 들어 소비 또는 섭취용, 또는 예를 들어 수술하는 동안 상처에 국소 적용하거나 상처 부위에 직접 투여, 또는 직장 내, 질내 등으로 투여하기 위한 박테리아 함유 제품을 포함한다.
따라서, 본 발명에 따른 제품 (예를 들어, 플라스미드, 박테리아 균주, 프로바이오틱스 및 상처 드레싱 등)은 의학적 치료, 특히 인간 또는 동물 개체에서 상처 치유를 촉진하는데 유용하다. 본원에 사용된 바와 같이, 용어 "상처 치유 촉진"은 봉합을 증대, 개선, 증가, 또는 유도하고, 상처를 치유, 또는 회복하는 것을 의미한다. 본 발명의 바람직한 측면에서, 인간 또는 동물 개체는 감소된 말초혈액관류 (말초동맥질환), 고혈당증 또는 신경병증과 같이 상처 치유를 악화시키는 근본적인 질환으로 인해 상처 치유를 필요로 하거나, 또는 개체는, 예를 들어 (후천적이거나 유전적인) 근본적인 질환으로 인한 어떠한 이유로 또는 의학적 치료 효과로 면역력이 약화될 수 있다. 특히 개체는 당뇨병을 앓고 있을 수 있다.
치유될 상처는 개체의 신체 임의의 부위에 대한 임의의 부상, 외상 또는 손상을 포함할 수 있다. 상기 방법으로 치료될 수 있는 상처의 예로는 급성 질환 또는 상처; 예를 들어, 열화상 (고온 또는 저온), 화학적 화상, 방사선 화상, 전기 화상, 자외선에 과도한 노출로 인한 화상 (예를 들어, 일광화상); 노동 및 출산의 결과로 회음부와 같은 신체 조직 손상; 의료시술 과정에서 지속되는 부상, 예를 들어 외음절개술, 자상, 절개, 찰과상을 포함하는 외상으로 유도된 부상; 사고로 지속되는 부상; 만성 질환뿐만 아니라 수술 후 부상; 예를 들어 욕창, 와창, 궤양, 당뇨병과 관련된 질환, 원활하지 못한 혈액 순환, 및 모든 종류의 여드름을 포함한다. 또한, 상처는 피부염, 치과 수술 후의 상처; 치주질환; 외상 후 상처; 및 종양 관련 상처를 포함할 수 있다. 추가의 예로, 예를 들어 위염 또는 염증성 장질환에서 발생하는 위장의 상처가 있다.
따라서, 용어 "상처"는 본원에서 조직의 완전한 상태에 대한 임의의 파괴 또는 조직에 대한 임의의 손상 또는 부상을 포함하는 것으로 폭넓게 사용된다. 따라서, 상기 용어는 (예를 들어, 사고 부상 또는 외상, 수술 또는 다른 의도되거나 고의의 부상 또는 질환으로 인해) 야기된다고 하더라도, 조직에 대한 임의의 손상, 외상 또는 부상 또는 임의의 병변을 포함한다. 외상은 임의의 물리적 또는 기계적 부상 또는 병원균 또는 생물학적 또는 화학적 제제를 포함하는 외용 제제에 의해 야기되는 임의의 손상을 포함할 수 있다. 조직 손상은 또한 저산소증, 허혈 또는 재관류로 인해 야기될 수 있다. 상처는 모든 종류의 화상을 포함할 수 있다. 상처는 급성 또는 만성일 수 있다. 만성 상처는, 치료 단계, 예를 들어 염증 단계에서 지연된 임의의 상처, 또는 30, 40, 50 또는 60일 또는 그 이상 동안 치료되지 않은 임의의 상처로 기술될 수 있다. 상처는 신체의 내부 또는 외부 표면 또는 조직 내에 또는 위에 존재할 수 있다.
일 구체예에서, 상처는 신체의 외부 표면 또는 조직 상에 있고, 예를 들어 이것은 가죽 (즉, 피부) 상처 또는 점막 상처, 특히 외부 점막 조직 또는 신체 표면 (예를 들어, 눈, 귀 또는 코내 등)의 상처이다. 또 다른 일 실시예에서, 상처는 위장의 상처이다. 다른 일 실시예에서, 상처는 위장 상처가 아니다 (즉, 위장 상처 이외의 다른 상처이다).
박테리아는 임의의 편리한 방법 또는 바람직한 방법, 예를 들어 경구, 또는 국소적, 또는 상처 부위에 직접 투여, 예를 들어 박테리아를 함유하는 약학적 조성물 또는 드레싱 또는 장치의 직접 주사 또는 투입 또는 적용 또는 도입에 의해 투여될 수 있다. 다른 실시예에서, 구강 내, 또는 비강 내 또는 흡입, 직장 내 또는 질내로 투여될 수 있다. 따라서, 박테리아는 신체 임의의 구멍에, 구멍을 통해 투여될 수 있다. 위장 상처에 투여하기 위해, 박테리아는 경구로 투여될 수 있다.
박테리아는 절차에 따라, 당해 기술분야에 공지된 통상적인 수단을 이용하여 상기 임의의 경로에 의해 투여하기 위해 임의의 편리한 방법 또는 바람직한 방법으로 제형화되거나 제조될 수 있다. 따라서, 약학적 조성물, 의료장치 및 드레싱 등 뿐만 아니라, 본 발명의 프로바이오틱 제품은, 영양 보충제 또는 식품, 예를 들어 기능성 식품으로 제형화되어 제공될 수 있다.
경구 투여 형태는 분말, 정제, 캡슐 및 액체 등을 포함한다. 국소 투여를 위해, 제품은 액체, 예를 들어 현탁액, 또는 스프레이, 에어로졸 (분말 또는 액체), 겔, 크림, 로션, 페이스트, 연고 또는 고약 등으로 제형화되거나, 또는 임의의 드레싱 형태, 예를 들어 고체 지지체 또는 기질을 포함하거나 미포함하는 붕대, 석고, 패드, 스트립, 면봉, 스폰지, 매트 등으로 제형화될 수 있다. 또한, 박테리아는 이식물 (예를 들어 보철물), 튜브, 줄, 카테터 등과 같은 의료장치의 표면 (예를 들어 코딩됨)에 제공될 수 있다.
박테리아는 임의의 편리한 형태 또는 바람직한 형태, 예를 들어 활성 또는 성장 배양물 또는 냉동건조 또는 동결건조 형태로 제공될 수 있다.
본 발명에 따른 박테리아 균주는 피부 또는 점막의 상처 표면을 치료하기 위해 국소 또는 경구 투여용으로 제형화될 수 있다. 결과적으로, 본 발명은 추가로 본 발명에 따른 박테리아 균주를 포함하는 프로바이오틱 제품을 제공한다. 상기 프로바이오틱 제품은, 예를 들어 약학적 조성물, 바람직하게는 경구 투여용이다. 선택적으로, 국소 적용을 위한 프로바이오틱 제품은, 예를 들어 로션 또는 로션-소독 상처 드레싱이고, 본 발명에 따른 박테리아 균주를 포함한다.
본 발명의 제품 (즉, 약학적 조성물 또는 장치 또는 드레싱 등)은 또한 유도인자 (유도성 프로모터가 사용되는 경우)을 함유할 수 있다. 이는 제품의 일부 (예를 들어, 드레싱에 삽입되거나 포함됨) 또는 별도로, 예를 들어 상기 정의된 바와 같이 키트 또는 조합품의 일부로 제공될 수 있다.
제품 (예를 들어, 드레싱 또는 장치)에 함께 공동으로 제형화되는 경우, 박테리아와 유도인자는 박테리아가 유도인자와 분리되어 있는 구성으로 제공될 수 있고, 사용 시 함께 합쳐진다 (또는 접촉된다). 예를 들어, 박테리아와 유도인자는 서로 결합되는 (예를 들어, 접촉 또는 혼합됨) 분리된 칸에 있거나, 또는 사용 시 깨지거나 붕괴되거나 개방될 수 있는 벽 (예를 들어, 멤브레인 또는 다른 칸막이)으로 분리될 수 있다.
선택적으로, 유도인자는 (예를 들어, 박테리아를 함유하는 키트에서도, 또는 박테리아를 함유하는 제품에서) 별도로 제형화되어 제공될 수 있고, 유도인자와 박테리아 (또는 박테리아를 함유하는 제품)은 사용하는 동안 함께 합쳐질 수 있다. 이는 개체에게 투여 전, 투여 동안 또는 투여 이후일 수 있다. 예를 들어, 박테리아를 포함하는 제품은 첫 번째로 투여될 수 있고, 이후 유도인자는 박테리아에 첨가되거나 적용될 수 있다. 또 다른 일 실시예에서, 박테리아와 유도인자는 투여 전에, 예를 들어 투여 바로 전에 또는 바로 직전에, 또는 투여하는 동안 예비혼합될 수 있다.
박테리아가 냉동건조 또는 동결건조 형태로 제공되는 경우, 박테리아는 투여 전에, 예를 들어 사용하기 전에 또는 사용 중에 재구성하거나, 재현탁하는 것이 바람직할 수 있다. 이것은 상처 및 사용되는 제품의 형태에 따라 달라진다. 예를 들어, 일부 상처의 경우, 박테리아가 재구성되고/재현탁되어 활성 상태로 되기에 충분한 액체로 존재할 수 있다. 그러나, 다른 실시예에서, 액체는 박테리아의 재구성을 위한 (또는 선택적으로 발현되고, 현탁 또는 재현탁을 위한) 액체로 제공되는 것이 바람직할 수 있다. 이는 별도의 용기 또는 컨테이너 (예를 들어, 키트 또는 조합품의 일부), 또는 컨테이너, 또는 용기 또는 장치의 개별적인 칸에 제공될 수 있다. 액체는 유도인자를 포함하거나 함유할 수 있고, 유도인자가 존재하는 경우, 별도의 용기 또는 컨테이너 또는 칸에 제공될 수 있다. 액체는 동결건조된 박테리아의 재구성 또는 현탁에 적합한 임의의 액체, 예를 들어 물, 또는 수용액, 또는 버퍼 또는 성장 또는 배양 배지일 수 있다.
따라서, 두 개의 구획 시스템 (예를 들어, 드레싱 또는 장치 또는 컨테이너 또는 용기 (예를 들어, 병)의 예로, 하나의 칸에 동결건조된 박테리아를 포함하고, 나머지 칸에는 액체를 포함할 수 있다. 액체는 선택적으로 유도인자를 함유할 수 있다. 사용 시, 또는 사용 전에, 두 개의 구획은 혼합되거나 접촉되어 상처에 적용될 수 있다. 보다 구체적인 실시예에서, 박테리아는 액체 형태로 상처에 투여될 수 있고, 이후 별도의 드레싱이 적용될 수 있다. 따라서, 간단한 일 실시예에서, 키트는 단순히 동결건조된 박테리아를 포함하는 제 1 용기 또는 컨테이너와 박테리아의 재구성을 위한 액체를 함유하는 제2 용기 또는 컨테이너를 포함할 수 있음을 알 수 있다. 선택적으로, 키트는 제2 용기에 또는 별도의 제3 용기 또는 컨테이너에 함유된 유도인자를 또한 함유할 수 있다.
따라서, 예를 들어 상기 프로바이오틱 제품은 바람직하게는 유산균 균주에서 발현되도록 단백질의 발현을 활성화할 수 있는 활성 펩티드를 포함한다. 상기 활성 펩티드는 바람직하게는 펩티드 SppIP (즉, SEQ ID NO: 19의 아미노산 서열 또는 이와 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 서열을 포함하는 펩티드)이다.
피부 상처의 경우, 상기 상처 드레싱은 한 칸에는 동결건조된 박테리아를 포함하고 다른 한 칸에는 활성 펩티드를 포함할 수 있다. 상처에 적용하는 경우, 두 구획은 서로 합쳐져 박테리아가 활성 펩티드와 접촉된다. 선택적으로, 박테리아는 방수 석고의 접착면 또는 삼출물과 접촉하는 드레싱면 상에 겔-유사 구조로 함유될 수 있다. 사용 시, 활성 펩티드는 수동으로 박테리아에 적용되고 석고 또는 드레싱은 상처 영역에 적용된다.
생존 박테리아는 또한 하이드로콜로이드, 예를 들어 천연 젤라틴에 포함된다. 박테리아는 하이드로콜로이드, 예를 들어 가소화 및 건조된 젤라틴 필름 내로 가교결합됨으로써 삽입될 수 있고, 수화될 때까지 저장하는 동안 생존력이 유지된다. 생존 박테리아는 또한 가교결합된 전기방사 하이드로겔 섬유 내에 캡슐화될 수 있다. 이 형태에서, 박테리아는 동결건조할 필요가 없다.
위장관의 상처의 경우, 적어도 두 개의 분리된 구획을 포함하는 정제가 고안되며, 여기서 한 칸은 동결건조 박테리아를 포함하고, 나머지 다른 칸은 액체와 활성 펩티드를 포함한다. 정제는 섭취 전에 짜내서 두 구획을 분리하는 내부 멤브래인을 깨뜨리고 내용물을 혼합한다. 구강 내 (예를 들어, 잇몸) 상처를 위해, 본 발명의 박테리아는 고점성의 페이스트로 투여될 수 있다.
구체적으로, 피부에 국소 투여하기 위한 제형은 약학적으로 허용가능한 담체에 투여되도록 연고, 크림, 겔, 및 페이스트를 포함할 수 있다. 국소 제형은 당해 기술분야에 공지된 바와 같이 유성 또는 수용성 연고기제를 사용하여 제조될 수 있다. 예를 들어, 이들 제형은 식물성 오일, 동물성 지방, 더욱 바람직하게는 석유로부터 수득되는 반고체 탄화수소를 포함할 수 있다. 사용되는 특정 성분은 백색 연고, 황색 연고, 아세틸 에스테르 왁스, 올레산, 올리브 오일, 파라핀, 바셀린, 백색 바셀린, 경랍, 전분 글리세라이트, 백색 왁스, 황색 왁스, 라놀린, 무수 라놀린, 및 글리세릴 모노스테아레이트를 포함할 수 있다. 예를 들어 글리세롤 에테르 및 유도체, 폴리에틸렌 글리콜, 폴리옥실 40 스테아레이트, 및 폴리소르베이트를 포함하는 다양한 수용성 연고기제도 사용될 수 있다.
박테리아 균주는 상처에 활성 물질을 전달하기 위한 기질, 고체 지지체, 및/또는 상처 드레싱 상에 그리고/또는 내부에 제공될 수 있다. 고체 지지체 또는 기질은 의료장치 또는 이의 일부일 수 있다. 본원에 사용된 바와 같이, 용어 "기질" 또는 "고체 지지체" 및 "상처 드레싱"은 제조 및 상처에 적용 시 보호, 흡수, 배수 등을 위한 임의의 기질을 광범위하게 말한다.
일 실시예에서, 본 발명은 형질전환된 박테리아 균주와 결합되거나 이를 포함하는 상처 치유 물질 또는 드레싱을 제공하고, 드레싱은 본 발명의 형질전환된 박테리아를 투여하기 위한 비히클이다. 선택적으로, 비히클은 석고 또는 붕대일 수 있다. 본 발명은 상업적으로 이용가능한 수많은 종류의 기질 및/또는 지지체 중 어느 하나를 포함할 수 있고, 상처 치유 물질의 선택은 치료될 상처의 특성에 따라 달라지게 된다. 가장 일반적으로 사용되는 상처 드레싱은 하기에 간략하게 기재하였다.
투명 필름 드레싱은, 예를 들어 폴리우레탄, 폴리아미드, 또는 젤라틴으로 구성된다. 이러한 합성 필름은 수증기 산소 및 다른 기체에는 투과성이지만 물과 박테리아에는 비투과성이며, 흡수성이 낮고 삼출물이 적은 상처에 적합하며), 하이드로콜로이드 (폴리우레탄 발포체에 결합된 친수성 콜로이드 입자), 하이드로겔 (약 적어도 60%의 물을 함유하는 교차결합 폴리머는 더 높은 흡수성을 가지고 상처 부위로부터 독성 성분을 제거하고 상처 영역의 습도와 온도를 유지함), 발포체 (친수성 또는 소수성, 예를 들어 폴리우레탄 발포체의 변형을 통해 생산된 고분자 발포체 드레싱은 우수한 흡수성을 가지고 수증기에 투과됨), 알긴산칼슘 (해조콜로이드 유래 알긴산칼슘의 섬유의 비-직조 합성물인, 알긴산 염류는 메우 높은 흡수력을 가진다. 이들은 또한 알긴산염과 삼출물 사이의 이온-교환이 불용성 알긴산칼슘을 가용성 알긴산나트륨으로 변환시키기 때문에 자가융해성 창상 절제를 촉진하며, 습기를 갖는 상처 부위, 상처 치유에 이상적인 손상되지 않은 표면을 제공한다.) 및 셀로판 (가소제를 포함하는 셀룰로오스)이 있다. 상처의 모양 및 크기가 측정될 수 있고, 상처에 대해 측정치를 바탕으로 정확한 부위에 맞춤화된 상처 드레싱이 상처에 제공될 수 있다. 상처 부위가 기계적 강도, 두께, 민감도 등의 측면에서 다를 수 있기 때문에, 기질은 기구 및/또는 부위의 다른 요구를 특이적으로 처리하도록 만들어질 수 있다. 예를 들어, 기질의 두께는 고도로 분산된 위치, 예를 들어 손가락 끝에 대해 최소화될 수 있다. 다른 상처 부위, 예를 들어 손가락, 발목, 무름, 팔꿈치 등은 더 높은 기계적 스트레스에 노출될 수 있고, 다층의 기질을 필요로 한다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 본 발명에 따른 박테리아 균주를 이를 필요로 하는 인간 또는 동물 개체에게 투여하는 것을 포함하는, 인간 또는 동물 개체에서 상처 치유를 위한 방법을 제공한다. 상기 박테리아 균주는 바람직하게는 본원에 전술된 바와 같이 약학적 조성물 또는 상처 드레싱에 포함된다. 이와 같은 방법에서, 인간 또는 동물 개체는 바람직하게는 감소된 말초혈액관류, (말초동맥질환), 고혈당증 또는 신경병증과 같은 약화된 상처 치유를 야기하는 근본적인 질환으로 인해 상처 치유를 필요로 한다.
하기 실시예에서 수득되고 포함된 결과는 발명의 이점을 입증한다. 특히, 개선된 상처 치유 (예를 들어, 보다 양호하거나 보다 빠른 상처 봉합 측면에서)가 예를 들어, 직접 단백질 제조 (즉, 단순 단백질, 박테리아 없음) 또는 박테리아만 단독 (단백질을 발현하도록 변형되지 않은 박테리아, 예를 들어 재조합 플라스미드를 함유하지 않음)인 경우와 비교하여 본 발명의 단백질-발현 형질전환 박테리아를 사용함으로써 수득될 수 있다. 또한, 개선된 효과는 박테리아가 상처에 투여될 때, 형질전환된 박테리아 배양물로부터 수득된 상층액의 투여에 비해 나타날 수 있다. 따라서, 단백질을 발현하는 유산균 숙주를 이용하여 상처에 단백질을 전달하는 것이 유리하다. 이는 상승효과가 있는 것으로 판단된다. 즉, 상처 치유에 대한 박테리아의 효과와 단백질의 효과 사이에 상승효과가 있을 수 있다. 따라서, 일부 실시예에서, 형질전환되지 않은 해당 박테리아 (즉, 플라스미드를 함유하지 않음)의 효과와 단백질로 제공된 (즉, 원 위치에서(in situ) 박테리아로부터 발현되지 않음) 단백질의 효과에 비례하여 상처에 대한 형질전환된 박테라아의 누적효과보다 더 큰 효과가 있을 수 있다.
이러한 측면에서, 예를 들어 상처 부위에서 pH를 낮추는 박테리아의 효과는 단백질의 활성을 증가 또는 강화 또는 촉진하는데 도움을 줄 수 있는 것으로 판단된다. 이론에 얽매이는 것을 바라지는 않지만, 추가로 본 발명에 따른 형질전환된 박테리아의 투여는 상처 부위에서 대식세포 활성을 촉진하는데 이로운 효과를 나타낼 수 있는 것으로 판단된다. 예를 들어, 대식세포의 수를 증가시킬 수 있다.
형질전환된 박테리아의 상처 치유에 대한 효과는 즉각적이거나 그렇지 않을 수 있고, 효과를 나타내는데 다소 시간 (개선된 상처 치유가 관찰되기 전에, 예를 들어 효과를 나타내는데 1, 2, 3, 4, 5 또는 6 또는 그 이상, 또는 더 긴 시간, 예를 들어 8, 10, 12, 15, 18, 20 또는 24시간 또는 그 이상, 또는 1, 2, 3, 4, 5 또는 6일 또는 그 이상, 또는 더 길게, 예를 들어 8, 10, 12, 15, 18, 20 또는 24일 또는 그 이상)이 걸릴 수 있다. 노인의 만성 상처는 처리군과 대조군 사이에서 차이를 보이는데 더 긴 시간이 걸릴 수 있고, 예를 들어 약 12주가 걸릴 수 있다.
본 발명의 특별히 중요한 유용성은 만성 상처, 특히 궤양의 치료 및 특히 당뇨성 족부 궤양의 치료에 있다.
당뇨병을 앓고 있는 사람의 만성 족부 궤양의 유병률은 약 18%이다. 2013년에, 유럽 인구는 7억 4250만에 도달하였고, 당뇨병 환자 수는 3270만명이며, 이 중 290만-580만명이 만성 족부 궤양을 앓고 있다. 이러한 유형의 궤양의 평균 지속기간은, 표준 치료를 받은 경우 상처의 25% 미만이 12주 이내에 치료되는 몇 개월 범위이다. 이 질환의 최종 단계는 영향을 받은 다리의 절단이다. 오늘날 만성 족부 궤양을 앓고 있는 사람들의 치료는 1차 진료, 홈 케어, 양로원, 친척, 자가 관리 및 상처 클리닉 내원으로 나누어진다. 현재 치료법은 오프-로딩(off-loading), 수술적 창상 절제를 이용한 죽은 조직의 제거, 상처 드레싱의 반복적인 교체, 전신성 항생제에 의존하고, 특별한 경우에는 살아있는 유충 또는 콜라게나아제로 처리하며 스웨덴의 몇몇 지역에서 고압산소 치료가 제공될 수 있다. 근본적인 원인이 또한 더 큰 동맥의 장애를 포함하는 경우, 정맥 이식으로 우회하여 외과적으로 교정될 수 있다. 오늘날 상처는 2일 또는 3일마다 치료된다. 임의의 제안된 형태 또는 제형으로 제안된 변형 유산균을 처리하는 것은 이러한 실질적인 일상을 방해하지 않는다. 따라서, 본 발명의 처리에 의한 이러한 상처의 개선된 치유는 상당한 경제적 이익이 될 뿐만 아니라, 환자에게 개인적인 이득이 된다.
박테리아는 활성이고 생체 내(in vivo)에서 일정 기간 동안 (예를 들어, 약 1시간) 상처 표면에 코딩된 단백질을 생성하고 전달한다. 이후 박테리아는 불활성화되고 죽는다. 느린 또는 죽은 유산균은 드레싱이 정상으로 바뀔 때까지 상처/드레싱 환경에서 위험을 나타내지 않을 수 있다.
본 발명에 따른 생물치료제 (biotherapeutic)는 단백질 약물 합성물과 비교하여 현저하게 낮은 생산 비용을 가질 것이다. 이는 생물치료제가 스스로 상처에 활성 단백질을 생성하기 때문이다.
발의 기능 상실을 동반하는 당뇨성 족부 궤양과 같은 개방형 상처는 상당한 불편을 야기하고, 심지어 환자에게 장애를 유발하며, 상당한 위험 또는 감염, 이에 따라 연장된 항생제의 사용 및 최후에는 절단 수술에 이르는, 생활의 질에 상당히 부정적인 영향을 미친다. 따라서, 상처 치유는 환자에게 굉장한 개인적 이득이 되고, 항생제 사용 (결과적으로 항생제 내성의 확산)도 줄여주는 이점을 갖는다. 본 발명에 따라 상기 만성 상처를 치료하는 것은 상처에 내인성 경고 신호를 증폭시킬 수 있고 지연된 또는 만성 상처의 치료 과정을 촉진할 수 있으며, 치료 시간을 단축시킬 수 있는 것으로 판단된다.
추가로, 본 발명은 의료진에 의한 사용의 유연성 및 용이성에 이점을 가질 수 있다.
본 발명에 따른 대표적인 방법 및 바람직한 실시예는 하기 비제한적인 실시예 및 도면을 참조하여 추가로 기술될 것이다:
도 1. OD 0.285 및 0.51에서 시작해서 10 또는 50 ng/ml의 프로모터 활성 펩티드 SppIP를 첨가하여 밤새 배양하고 재접종된 mLrCK1 락토코커스 락티스 (Lactococcus lactis)에서의 시간 경과에 따른 성장 (A) 및 pH (B).
도 2. OD 0.5에서 시작하여 밤새 배양하고 재접종된 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC에서 시간에 따라 바이오이미징으로 시험관 내 (in vitro)에서 측정한 pLAB112_Luc의 발현. 시간 0에서 기준 이미지를 획득하였다. 이후 프로모터 활성 펩티드 SppIP (50 ng/ml) 및 기질 D-루시페린 (150 ㎍/ml)을 즉시 첨가하였다. 플레이트를 5분에서 그리고 매 30분 마다 1400분 동안 이미지화하였다. 모든 샘플에 사용된 배지는 MRS이다. 펩티드는 프로모터 활성 펩티드 SppIP이다. 각 그룹은 8개의 샘플로 구성된다.
도 3. OD 0.5에서 시작해서 밤새 배양하고 재접종하여 1일 된 피부 전층 상처에 적용된 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC에서 pLAB112_Luc의 발현. 생체 내(in vivo) 발현은 시간이 경과함에 따라 비침습적 바이오이미징으로 측정하였다. 1일된 피부 전체 두께 상처를 갖는 5마리의 마취된 마우스에서 시간 0의 기준 이미지를 획득하였다. 그 다음, 프로모터 활성화 펩티드 SppIP (50 ng/ml) 및 기질 D-루시페린 (150 ㎍/ml)으로 활성화된 락토바실러스 루테리(Lactobacillus reuteri) R2LC_ pLAB112_Luc 25 ㎕를 상처 중간에 첨가하고 5분에서 그리고 매 15분 마다 270분 동안 이미지화하였다.
도 4. 건강한 마우스에서 상처 치유 시간. 50 % (A), 75 % (B) 또는 완전히 (100 %) (C) 상처 표면이 치유된 시간, 모든 그룹은 n=5, A, B, C, 일원분산분석, 본페로니는 모든 컬럼을 비교한다.
도 5. 건강한 마우스에서 시간 경과에 따른 상처 크기 (A) 및 상처 노출 (B). 눈금을 포함하는 이미지로 매일 측정한 상처 크기, 모든 그룹은 n=5이다. A, 이원분산분석, 본페로니는 모든 컬럼을 비교하고, d0-d5가 분석되었다. 시간 및 처리로 인한 변화. 대조군과 비교하여 d1 및 d2에 R2LC_pLAB112_LrCK1.4에 의해 감소된 상처 크기. B, 일원분산분석, 본페로니는 모든 컬럼을 비교하고, 모든 날이 분석되었다. 전체 치료 과정 동안 R2LC_pLAB112_LrCK1.4에 의해 감소된 상처 노출.
도 6. 상처 유도 전 대퇴동맥 결찰에 의한 허혈 유도, 모든 그룹에서 n=4이다. 시간 경과에 따른 마취된 마우스의 허혈성 다리 (A) 및 대측의 영향을 받지 않은 해당 다리 (B)에서 Laser Speckle Contrast Analysis를 이용하여 측정한 혈류. 데이터는 관류 단위 (PFU)로 표현된다. A 및 B, 이원분산분석, 본페로니는 모든 컬럼을 비교하고, d0-d7에서 분석되었다. 시간 또는 처리에 의한 변화는 관찰되지 않았다.
도 7. 상처 유도 당시 허혈을 앓고 있던 마우스에서 상처 치유에 대한 시간. 50% (A), 75 % (B) 또는 완전히 (100 %) (C) 상처 표면이 치유되는 시간, 모든 그룹은 n=4이다. A, B, C, 일원분산분석, 본페로니는 모든 컬럼을 비교한다.
도 8. 상처 유도 당시 그 위치에 국소 허혈을 갖는 마우스에서 시간 경과에 따른 상처 크기 및 상처 노출. 상처 크기는 눈금을 포함하는 이미지로부터 매일 측정되었고, 모든 그룹은 n=4이다. A, 이원분산분석, 본페로니는 모든 컬럼을 비교하고, d0-d7에서 분석되었다. 시간 및 처리로 인한 변화. 대조군과 비교하여 d1및 d2에 R2LC_pLAB112_LrCK1.4 상처 크기 감소. B, 일원분산분석, 본페로니는 모든 컬럼을 비교하고, 모든 날에서 분석되었다. 전체 치료 과정 동안 R2LC_pLAB112_LrCK1.4에 의한 상처 노출 감소.
도 9. 알록산 모노하이드레이트의 단일 정맥 주사로 당뇨병을 유도한 후 체중 (A) 및 혈당 (B). 당뇨 대조군은 n=4, 당뇨 R2LC_pLAB112_Luc는 n=5, 당뇨 R2LC_pLAB_LrCK1.4는 n=4이다. A 및B, 이원분산분석, 본페로니는 모든 컬럼을 비교하고, d0-d6에서 분석되었다. 치간 또는 처리로 인한 변화는 관찰되지 않았다.
도 10. 상처 유도 시 당뇨를 앓고 있던 마우스에서 상처 치유에 대한 시간. 50% (A), 75 % (B) 또는 완전히 (100 %) (C) 상처 표면이 치유되는 시간, 당뇨 대조군은 n=4, 당뇨 R2LC_pLAB112_Luc는 n=5, 당뇨 R2LC_pLAB_LrCK1.4는 n=4이다. A, B, C, 일원분산분석, 본페로니는 모든 컬럼을 비교한다.
도 11. 상처 유도 시 당뇨를 앓고 있던 마우스에서 시간 경과에 따른 상처 크기 및 상처 노출. 상처 크기는 눈금이 포함된 이미지로부터 매일 측정되었고, 당뇨 대조군은 n=4, 당뇨 R2LC_pLAB112_Luc는 n=5, 당뇨 R2LC_pLAB_LrCK1.4는 n=4이다. A, 이원분산분석, 본페로니는 모든 컬럼을 비교하고, d0-d7에서 분석되었다. 시간에 의한 변화. B, 일원분산분석, 본페로니는 모든 컬럼을 비교하고, 모든 날에 분석되었다. 차이없음. (p=0.08).
도 12. pSIP411 플라스미드.
도 13. 11일 동안 비침습적 바이오이미징 (IVIS Spectrum)에 의한 발광 신호의 검출을 이용한 상처 가장자리 진피 (40 μg DNA)에서 플라스미드 발현의 정량화 (n=10).
도 14. 건강한 마우스에서 상처 치유에 대한 시간. 50% (A), 75 % (B) 또는 완전히 (100 %) (C) 상처 표면이 치유되는 시간(n=8 pCTR, n=9 pCXCL12). A, B, C, 스튜던트 비쌍체 양측 t 검정.
도 15. 건강한 마우스에서 시간 경과에 따른 상처 크기 (A) 및 상처 노출 (B). 상처 크기는 눈금을 포함하는 이미지로부터 매일 측정하였다 (n=8 pCTR, n=9 pCXCL12). (A) 이원분산분석, 본페로니는 모든 컬럼을 비교하고, d0-d7에서 분석되었다. 시간에 의한 변화. (B) 스튜던트 양측 비쌍체 t 검정. 전체 치료 과정 동안 pCXCL12에 의한 상처 노출이 감소되는 경향 (p=0.08).
도 16. 광학 밀도 (OD) 및 ml 당 콜로니 형성 단위 (CFU/ml)로 표현된 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC에 대한 박테리아 농도의 측정.
도 17. 서로 다른 농도의 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC_pLAB112_LrCK1.4로 처리한 건강한 마우스에서의 시간 경과에 따른 상처 크기 (A) 및 상처 노출 (B). 상처 크기는 눈금이 포함된 이미지로부터 매일 측정되었다. A, 이원분산분석, 본페로니는 모든 컬럼을 비교하고, d0-d2에서 분석되었다. 시간 및 처리에 의한 변화. (A) 이원분산분석 본페로니는 모든 컬럼을 비교하고, (B) 일원분산분석 본페로니는 모든 컬럼을 비교한다 (p<0.05). 미처리 상ㅊ와 비교하여 OD 0.2, 0.5, 1.0 및 1.25에서 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC__pLAB112_LrCK1.4의 처리에 의한 상처 노툴 감소. (대조군, n=15; OD 0.2, n=4; 0.5, n=10, OD 1.0, n=4; OD 1.25, n=5).
도 18. 이틀 동안 하루에 한 시점에서 서로 다른 농도의 쥐 CXCL12 1α로 처리된 건강한 마우스에서 시간에 따른 상처 크기 (A) 및 상처 노출 (B). 상처 크기는 눈금을 포함한 이미지로부터 매일 측정하였다. A, 이원분산분석, 본페로니는 모든 컬럼을 비교하고, d0-d2에서 분석되었다. 시간에 의한 변화. B, 첫 이틀 동안의 상처 노출 (대조군, n=15; 0.2 ㎍ CXCL12 1α, n=4; 0.6 ㎍ CXCL12 1α, n=5, 1.0 ㎍ CXCL12 1α, n=4).
도 19. 매일 한 시간 동안 10분 마다 0.2 ㎍의 재조합 단백질로 처리한 건강한 마우스에서 시간에 따른 상처 크기 (A) 및 상처 노출 (B). 상처 크기는 눈금을 포함한 이미지로부터 매일 측정하였다. A, 이원분산분석, 본페로니는 모든 컬럼을 비교하고, d0-d2에서 분석되었다. 시간에 의한 변화. B, 첫 이틀 동안의 상처 노출. (미처리, n=15; CXCL12 1α, n=6; CXCL17, n=9, Ym1, n=9).
도 20. 피부 표피 펀치 생검 상처에서 측정된 재상피화. 패널 A는 미처리, 또는 LB_Luc 또는 LB_LrCK1로 처리한 표피 상처를 포함하는 피부 디스크를 24시간 배양한 후 배양 배지에서 측정한 pH를 보여준다. 패널 B는 배양 14일 후 노출된 표피 위의 상처 가장자리로부터 성장한 새롭게 형성된 표피 슬리브의 길이를 보여준다. *은 차이를 나타내고, 일원분산분석 본페로니는 선택된 컬럼을 비교한다 (p<0.05).
도 21. 동결건조 상태로부터 재생 직후 시간에 따라 바이오이미지로 시험관 내 (in vitro) 측정한 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC에서의 pLAB112_Luc의 시험관 내 (in vitro) 발현. 시간 0에서 기준 이미지를 획득하였다. 이후 프로모터 활성 펩티드 SppIP (50 ng/ml)와 기질 D-루시페린 (150 ㎍/ml)를 바로 첨가하였다. 플레이트는 5분에 이미지화하였고, 이후 930분 동안 매 5-15분마다 이미지화하였다. 모든 샘플에 사용된 배지는 MRS이다. 펩티드는 프로모터 활성 펩티드 SppIP이다. 각 그룹은 4개의 샘플로 구성된다.
도 22. 동결건조 상태로부터 재생하고 1일 된 피부 전층 상처에 적용한 직후 시간에 따라 바이오이미지로 생체 내 (in vivo) 측정한 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC에서의 pLAB112_Luc의 생체 내 (in vivo) 발현. 그 다음 프로모터 활성 펩티드 SppIP (50 ng/ml)와 기질 D-루시페린 (150 ㎍/ml)으로 활성화된 25 ㎕ 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC_ pLAB112_Luc를 상처 중간에 첨가하였고, 마우스를 5분에서 이미지화하였고, 이후 270분 동안 매 15분마다 이미지화하였다.
도 23. 동결건조되고, 재생된 다음 유도된 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC_pLAB112_LrCK1.4로 처리한 건강한 마우스에서 시간에 따른 상처 크기 (A) 및 상처 노출 (B). 상처 크기는 눈금을 포함하는 이미지로부터 매일 측정하였다. (A) 이원분산분석, 본페로니는 모든 컬럼을 비교하고, d0-d2에 분석되었다. 시간 및 처리에 의한 변화. (B) 일원분산분석 본페로니는 모든 컬럼을 비교한다 (p<0.05). 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC_pLAB112_Luc에 비해 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC_pLAB112_LrCK1.4로 처리한 후 감소된 상처 크기가 관찰되었고, 이때 박테리아는 동결건조되고 바로 재생된 다음 유도되어 상처에 적용되었다 (R2LC_pLAB112_Luc, n=4, R2LC_pLAB112_LrCK1.4, n=5).
도 24. 건강한 마우스에서 시간 경과에 따른 상처 크기 (A) 및 상처 노출 (B). 상처 크기는 눈금이 포함된 이미지로부터 매일 측정되었다. 변화는 시간과 처리로 인한 것이며 pH 7.35의 현탁액과 비교하여 pH 6.35의 CXCL12 1α에 의해 상처 크기가 감소되는 경향이 있다 (p=0.07) (pH 7.35; n=8, pH 6.35; n=5, pH 5.35; n=4). 일원분산분석, 본페로니는 모든 컬럼을 비교한다.
도 25. 건강한 마우스에서 시간 경과에 따른 상처 크기 (A) 및 상처 노출 (B). 상처 크기는 눈금이 포함된 이미지로부터 매일 측정되었다. 관찰된 변화는 오직 시간으로 인한 것이며 두 개의 서로 다른 박테리아 현탁액 (R2LC_pLAB112_Luc; n=4, R2LC_pLAB112_LrCK1; n=5) 사이에 다른 점은 없었다. 스튜던트 양측 비쌍체 t 검정.
도 26. 상처가 OD 0.5, 1.0, 및 OD 1.25의 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC_pLAB112_LrCK1로 처리한 진피 (A), 표피 (B) 및 모낭 (C)에서 상처 유도 이틀 후 상처 바로 옆 피부 부위의 CXCL12 1α 수준 측정. 일원분산분석, 본페로니는 모든 컬럼을 비교한다.
도 27. 대조군 상처 및 OD 0.5, 1.0, 및 OD 1.25의 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC_pLAB112_LrCK1로 처리된 상처에서 상처 유도 이틀 후 상처 옆 피부의 진피 (A) 및 표피 (B)에서 F4/80+ 대식세포의 밀도 측정. (대조군, n=15; 0.5, n=10, OD 1.0, n=4; OD 1.25, n=5). 일원분산분석, 본페로니는 ㅁ모든 컬럼을 비교한다.
도 28. 건강한 마우스에서 상처 치유 시간. 상처는 pLAB112 (L.L_pLAB112_LrCK1)로 형질전환된 락토바실러스 락티스 (Lactococcus Lactis) 또는 대조군 락토바실러스 락티스 (Lactococcus Lactis)로 처리하였다. 50% (A), 75% (B) 또는 완전히 (100%) (C) 상처 표면이 치유된 시간, 두 그룹 모두 n=5이다. 스튜던트 양측 비쌍체 t 검정.
도 29. 건강한 마우스에서 시간 경과에 따른 상처 크기 (A) 및 상처 노출 (B). 상처 크기는 눈금을 포함하는 이미지로부터 매일 측정되었고, 두 그룹 모두 n=5. 변화는 시간과 처리로 인한 것이며 상처 크기는 대조군 락토코커스 락티스 (Lactococcus Lactis)와 비교하여 d1 내지 d4에서 L.L_pLAB112_LrCK1에 의해 감소된다. 스튜던트 양측 비쌍체 t 검정.
도 30. 1시간 동안 재조합 케모카인으로 처리한 건강한 마우스에서 상처 치유 시간. 50% (A), 75% (B) 또는 완전히 (100%) (C) 상처 표면이 치유된 시간 (대조군; n=11, mCXCL12 1α; n=6, mCXCL17; n=8, mYm1; n=9). 일원분산분석, 본페로니는 모든 컬럼을 비교한다.
도 31. 1시간 동안 재조합 케모카인으로 처리한 건강한 마우스에서 시간 경과에 따른 상처 크기 (A) 및 상처 노출 (B). 상처 크기는 눈금이 포함된 이미지로부터 매일 측정되었다 (대조군; n=11, mCXCL12 1?; n=6, mCXCL17; n=8, mYm1; n=9). 변화는 시간 및 처리로 인한 것이며 상처 크기는 대조군과 비교하여 CXCL12 1α, CXCL17 및 Ym1에 의해 감소된다. 일원분산분석, 본페로니는 모든 컬럼을 비교한다.
도 32. 미처리 또는 서로 다르게 처리한 건강한 마우스에서 첫 24시간 동안의 상처 봉합. (비처리, n=15; 0.2 ㎍ CXCL12 1α, n=4; 0.6 ㎍ CXCL12 1α, n=5; 1.0 ㎍ CXCL12 1α, n=4; 0.2 ㎍ CXCL12 1α 1hr, n=6; 0.2 ㎍ CXCL17 1hr, n=9, 0.2 ㎍ Ym1 1hr, n=9; R2LC_pLAB112_Luc OD 0.5, n=4; R2LC_ pLAB112_LrCK1.4 OD 0.2, n=4; R2LC_pLAB112_LrCK1.4 OD 0.5, n=10, R2LC_pLAB112_LrCK1.4 OD 1.0, n=4; R2LC_pLAB112_LrCK1.4 OD 1.25; n=5, 동결건조된 R2LC_pLAB112_Luc, n=4, 동결건조된 R2LC_pLAB112_LrCK1.4, n=5, R2LC_pLAB112_Luc 상층액; n=4, R2LC_pLAB112_LrCK1.4 상층액, n=5, pCTR n=8; pCXCL12, n=9). 이 데이터세트에 대한 통계 분석은 이루어지지 않았다.
도 33. DSS-유도 질환 활성의 일간(daily) 평가 (A) 및 1-7일에서 총 질환 부담 평가 (B). 비히클로 처리한 대조군과 비교하여 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) pLAB112_Luc 및 pLAB112_LrCK1.4의 처리에 의한 DSS-유도 대장염 질환 활성의 유사한 개선 (DSS+비히클; n=5, DSS+R2LC_pLAB112_Luc; n=6, DSS+R2LC_pLAB112_LrCK1.4; n=7), 일원분산분석, 본페로니는 모든 컬럼을 비교한다.
도 34. DSS-유도 질환 활성의 일간(daily) 평가 (A) 및 1-8일에서 총 질환 부담 평가 (B). 종래에 설명된 바와 같이 (참고문헌 16), 질병 활성은 관련 임상 증상을 측정하여 평가하였다. 화살표는 치료의 개시를 나타낸다. pLAB112_Luc (DSS+R2LC_pLAB112_Luc; n=6, DSS+R2LC_pLAB112_LrCK1.4; n=6)로 처리한 것과 비교하여 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) pLAB112_LrCK1.4의 처리에 의한 DSS-유도 대장염 질환 활성의 개선, 스튜던트 양측 비쌍체 t 검정.
도 35. 시간 0, 그리고 미처리, R2LC Luc 또는 R2LC LrCK1로 처리한 후 24시간에 건강한 마우스에서 유도된 전층 피부 상처 (지름 5 mm)의 대표 이미지. 이미지는 마취된 마우스에서 눈금을 포함하여 찍은 것이다.
실시예
재료 및 방법
유전자 컨스트럭트 디자인 및 생산
플라스미드 백본 pLAB112 (pSIP411와 동일; Refs. 11 및 15; 표 1)은 라스 액셀슨 교수로부터 제공받았다 (노르웨이 식품 연구소). 락토코커스 락티스 (Lactococcus lactis) MG1363 박테리아는 pLAB112로 형질전환되고 24시간 동안 확장되었다. 그 다음 플라스미드를 정제하고 DNA 생산물을 겔 상에서 확인하였다.
pSIP411/pLAB112의 주요 특징
특징 위치 (SEQ ID NO: 20)
복제 결정요인 (레플리콘 영역) 260-2010
ermB (에리트로마이신 내성 마커) 2342-2840
PsppIP (유도성 프로모터) 3139-3290
sppK (히스티딘 단백질 키나아제) 3305-4647
sppR (반응 조절인자) 4653-5396
gusA (베타-글루쿠로니다아제) 5853-7658
PorfX (유도성 프로모터) 5689-5835
전사 종결인자 129-155; 5428-5460; 5602-5624
멀티클로닝 부위 1-35; 5851-5856; 7662-7673
쥐 CXCL12-1α에 대한 서열은 DNA2.0 (Menlo Park, CA, USA)을 사용하여 스웨덴 농과대학 (SLU)의 스테판 루스에 의해 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri)에서 번역을 위해 최적화되었다. 최적화된 서열 (SEQ ID NO: 1)은 플라스미드 벡터 pJ204에서 DNA 2.0에 의해 합성되었다.
인간 CXCL12-1α, 쥐 CXCL17, 인간 CXCL17, 쥐 Ym1 및 인간 Ym1에 대한 서열은 GenScript (Piscataway, NJ, USA)를 사용하여 SLU의 스테판 루스에 의해 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri)에서 번역을 위해 최적화 되었다. 최적화된 서열은 SEQ ID NO: 4 (인간 CXCL12-1α); SEQ ID NO: 7 (쥐 CXCL17); SEQ ID NO: 10 (인간 CXCL17); SEQ ID NO: 13 (쥐 Ym1); 및 SEQ ID NO: 16 (인간 Ym1)에 기재된 바와 같다.
프라이머는 pLAB112에 인서트 (hCXCL12opt), 171 bp를 탐지하기 위해 디자인 되었다:
5' GCAGCCTTAACAGTCGGCACCT3' (SEQ ID NO: 22);
5'ACGTGCAACAATCTGCAAAGCAC3' (SEQ ID NO: 23).
인서트의 말단은 또한 분자 프로세싱 (molecular processing)을 계속하기 위해 최적화되어 인서트는 신규 벡터 pLAB112에 적합하다. 최적화된 mCXCL12opt 서열을 플라스미드 PJ204에 전달하였다. 대장균 (E. coli) PK401은 pJ204로 형질전환 시켰다. 플라스미드 (pLAB112 and pJ204)를 NEB2 버퍼에서 제한효소 XhoI 및 NcoI으로 절단하였다. 이후 단편 mCXCL12opt를 겔 상에서 정제하였다. mCXCL12opt 인서트를 T4 DNA 리가아제를 사용하여 pLAB112 벡터에 연결시켜 컨스트럭트 mLrCK1를 제조하였다. pLAB112 벡터에서 인서트 컨스트럭트를 PCR로 확인하였다. 그 다음 컨스트럭트를 서열 분석으로 확인하였다 (마크로젠). 마지막으로, 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) 균주 R2LC 및 DSM 20016를 mLrCK1로 형질전환시키고 컨스트럭트에 대해 양성인 두 개의 R2LC 클론 (4 및 7)을 모으고 이들 콜로니로부터의 플라스미드 mLrCK1 (현재 mLrCK1.4 및 mLrCK1.7)를 다시 서열 분석으로 확인하였다 (마크로젠).
플라스미드 hLrCK1, mLrCK2, hLrCK2, mLrMP1 및 hLrMP2를 동일한 프로토콜 및 절차에 따라 유사한 방식으로 생성하였다 (하기 표 2를 참조한다).
플라스미드 개요
플라스미드 설명
pLAB112 pSIP411와 동일 (참고문헌 15 및 SEQ ID NO: 20)
mLrCK1 최적화된 mCXCL12-1α 인서트를 포함하는 pLAB112
mLrCK1.4 형질전환된 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC 클론 4 유래 mLrCK1
mLrCK1.7 형질전환된 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC 클론 7 유래 mLrCK1
hLrCK1 최적화된 hCXCL12-1α 인서트를 포함하는 pLAB112
mLrCK2 최적화된 mCXCL17 인서트를 포함하는 pLAB112
hLrCK2 최적화된 hCXCL17 인서트를 포함하는 pLAB112
hLrMP1 최적화된 인간 Ym1 인서트를 포함하는 pLAB112
mLrMP2 최적화된 쥐 Ym1 인서트를 포함하는 pLAB112
pLAB112_Luc 루시페라아제 인서트를 포함하는 pLAB112
플라스미드 발현의 시험관 내 (In vitro) 분석
밤새 배양하고, 재접종하여 OD 0.5로 성장시킨 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC pLAB112_Luc를 96웰 플레이트에 도말하거나 (200 ㎕/웰) 동결건조된 제제로부터 즉시 재현탁하였다. 발광 강도는 비침습적 바이오이미징 (IVIS Spectrum, Perkin Elmer)을 사용하여 측정하였다. 시간 0에서 기준 이미지를 획득하였다. 그 다음 활성 펩티드 SppIP (50 ng/ml)와 D-루시페린 (150 ㎍/ml)을 즉시 첨가하였다. 이후 플레이트를 5분에 그리고 14000분 동안 매 30분 마다 이미지화 하였다. 데이터는 리빙 이미지 3.1 소프트웨어 (Perkin Elmer)를 사용하여 정량화 하였고, 비교 분석을 위해 이미징 파라미터를 유지하였다. 래디언스 (radiance)는 플라스미드 발현에 비례하는 것으로 간주하였다.
동물
실험은 웁살라 지역 실험동물 윤리 위원회의 승인을 받았다. C57Bl/6 (Taconic) 및 C57Bl/6을 바탕으로 하는 (원래 잭슨 래보라토리가 출처인) CX3CR1+/GFP 마우스를 사용하였다. 실험을 진행하는 동안 동물은 물과 식이를 자유롭게 섭취하였다.
상처 유도
마우스를 마취시키고 (1-3% 이소플루레인, 200 ml/분) 뒷다리의 털을 면도 후 제모 크림 (Veet®)을 1분 도포하고 물로 씻어내어 제거하였다. 멸균 펀치 생검 바늘 (직경 5mm)을 사용하여 전층 (표피, 진피 및 피하조직) 상처를 유도하였다. 국부적 국소 진통제 (Embla cream)를 처음 5일 동안 매일 적용하였다.
국소 상처 치료
상처를 매일 25 ㎕ 식염수, 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC pLAB112_Luc 또는 R2LC pLAB112_LrCK1로 처리하였다. 박테리아를 밤새 배양하고, 재접종하여 OD 0.5로 성장시키고 활성 펩티드 SppIP (50 ng/ml)를 적용하기 5분 전에 예비 활성화시킨 다음 상처 표면 중간에 국소적으로 첨가하였다. 투여량 실험을 위해, 상처를 이틀 동안 매일 25 ㎕ 식염수 또는 밤새 배양하고 재접종하여 OD 0.5로 성장시키고, 적용하기 5분 전에 활성 펩티드 SppIP (50 ng/ml)로 예비활성화시키며, OD 0.2, 0.5, 1.0 또는 1.25의 농도에서 상처 표면의 중간에 국소적으로 첨가된 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC pLAB112_LrCK1로 처리하였다. 각각의 단백질에 대한 비교 실험을 위해, 상처를 매일 10㎕의 식염수 또는 쥐 CXCL12, CXCL17 또는 Ym1으로 처리하였다 (한 시간 동안 10분 간격으로 60 ㎕의 식염수에 용해된 총 200 ng의 단백질이 주어짐). CXCL12의 투여량 증가 연구를 위해, 200 ng, 600 ng 또는 1 ㎍을 10 ㎕의 식염수에 용해하여 하루에 한번 동시에 상처에 첨가하였다.
플라스미드 발현의 생체 내 (In vivo ) 분석
락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC pLAB112_Luc를 밤새 배양하고, 재접종하여 OD 0.5로 성장시켰다. 발광 강도는 비침습적 바이오이미징 (IVIS Spectrum, Perkin Elmer)을 사용하여 측정하였다. 시간 0에서 기준 이미지를 획득하였다. 그 다음 25 ㎕의 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC pLAB112_Luc를 상처 중간에 첨가하였다. 박테리아를 활성 펩티드 SppIP (50 ng/ml)와 D-루시페린 (150 ㎍/ml)을 적용하기 5분 전에 예비 활성화 시켰다. 마우스를 270분 동안 매 15분 마다 이미지화하였다. 데이터는 리빙 이미지 3.1 소프트웨어 (Perkin Elmer)를 사용하여 정량화하였고, 비교 분석을 위해 이미징 파라미터를 유지하였다. 래디언스 (radiance)는 플라스미드 발현에 비례하는 것으로 간주하였다.
상처 크기 및 외관 모니터링
상처의 크기 및 외관을 마취시킨 마우스 (1-3% 이소플루레인, 200 ml/분)에서 통상적인 사진을 획득하여 매일 모니터링하였다. 획득 시 이미지에 눈금이 포함되어 있고 상처 크기는 ImageJ (NIH의 무료 소프트웨어)를 사용하여 분석하였다. 상처의 크기가 <0.5 mm2인 경우, 상처가 치료된 것으로 간주하였다.
피부 혈류 모니터링
치유 상처를 갖는 전체 뒷다리의 혈류를 마취된 마우스에서 (1-3% 이소플루레인, 200 ml/분) 비침습적 Laser Speckle Contrast Analysis를 이용하여 측정하고 PIMSoft 3 (Perimed)로 데이터를 분석하였다. 다리를 (프레임 1.4 x1.4 cm) 20회로 평균화하여 10 이미지/초로 2분 동안 이미지화하였다. 데이터는 관류 단위 (PFU)로 표현하였다.
관류 감소
마우스를 마취시키고 (1-3% 이소플루레인, 200 ml/분) 뒷다리 허혈을 표피 상복부 동맥 분지 위의 대퇴동맥 결찰 및 절제로 유도하였다.
고혈당 유도
멸균 식염수에 즉시 용해된 알록산 모노하이드레이트의 1회 투여량 (8 mg/ml, 1 ㎕/g 체중)을 꼬리 정맥에 주사하였다. 혈당 및 체중을 실험이 진행되는 동안 매일 모니터링하였다. 고혈당은 혈당이 >16.7 mmol/l인 것으로 정의된다.
통계 분석
데이터는 평균 ± SEM으로 나타내었다. host 테스트를 사용하여 시간에 따른 치유 과정을 분석한 후 본페로니를 포함하는 이원분산분석은 모든 컬럼을 비교한다. host 테스트를 사용하여 n>2의 그룹에서 한 시점에 치유 과정을 분석한 후 본페로니를 포함하는 일원분산분석은 모든 컬럼을 비교하고, 스튜던트 양측 비쌍체 t 검정을 이용하여 n=2인 경우 한 시점에서 치유과정을 분석한다. p<0.05는 통계적으로 유의한 것으로 간주되었다.
실시예 1: 플라스미드 LrCK1로 형질전환된 박테리아의 성장
밤새 배양하고, 재접종하여 OD 0.3 또는 0.5로 성장시킨 mLrCK1를 포함하는 락토코커스 락티스 (Lactococcus lactis)는 활성 펩티드 SppIP (SEQ ID NO: 19)를 10 또는 50 ng/ml로 첨가 시 성장 장애를 보이지 않았다. 이러한 성장 실험 동안, pH를 측정하였고 성장 단계에서 pH 저하가 가장 두드러졌으며 Mes-배지에서 성장 시 pH 6.7 정도에서 안정화되었다 (도 1). (피부의 pH=5,5, 상처에서의 pH=7.15-8.9, 여기서, 알칼리성 pH는 낮은 치유율과 연관되어 있다 (참고문헌 14))
실시예 2: 플라스미드 pLAB112_Luc의 발현
밤새 배양하고 재접종하여 2시간 동안 성장시킨 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC에서 플라스미드 pLAB112_Luc의 시험관 내(in vitro) 발현은 600분 이상 (10h.) 높은 상태로 유지되었다. 활성화 펩티드 SppIP로 활성화되지 않은 플라스미드로부터의 누출/발현은 없었다 (도 2).
밤새 배양하고 재접종하여 2시간 동안 성장시킨 pLAB112_Luc를 포함하는 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC를 마취된 마우스의 1일된 피부 전층 상처에 두는 경우, 박테리아는 상처 부위에 제한되고 플라스미드 발현은 처음 1시간 동안 높았지만 신호는 4시간 이상 동안 검출되었다 (도 3).
실시예 3: 건강한 마우스에서 개선된 상처 치유
상처는 치료 과정 동안 매일 모니터링 되었다. 건강한 마우스에서 매일 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC_pLAB112_mLrCK1.4를 1회 도포한 경우, 상처에 아무것도 도포하지 않은 대조군 마우스와 대조균인 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC (pLAB112_Luc)를 매일 도포한 마우스와 비교하여 75% 상처 표면 봉합 및 완전한 (100%) 상처 봉합에 대한 시간이 감소되었다 (도 4). 상처 치유에 미치는 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC_pLAB112_mLrCK1.4의 영향은 상처 유도 후 첫 번째 날동안 가장 두드러졌다. 상처 크기는, 상처에 아무것도 도포하지 않은 대조군 마우스와 비교하여, 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC_pLAB112_mLrCK1.4를 매일 도포함으로써 (상처 유도 1일 또는 2일 후) 추가로 감소되었다. 이 그룹에서, 커브 아래의 면적으로 측정된 총 상처 노출은 상처에 아무것도 도포하지 않은 대조군 마우스와 비교하여 감소되었다 (도 5). 도 35는 시간 0 및 미처리하거나 R2LC Luc 또는 R2LC LrCK1의 처리 24시간 후 건강한 마우스에서 유도된 전층 피부 상처 (직경 5mm)의 대표 이미지를 보여준다.
실시예 4: 손상된 조직 관류를 갖는 건강한 마우스에서의 개선된 상처 치유
피부 관류는 상처가 유도된 다리의 대퇴동맥 결찰로 상처를 유도한 날에 50% 감소하였다 (도 6 및 표 3). 허혈을 갖는 마우스에서, 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC_pLAB112_mLrCK1.4을 매일 1회 적용하는 경우, 대조균 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC (pLAB112_Luc)를 매일 적용한 마우스 뿐만 아니라 상처에 아무것도 적용하지 않은 대조군 마우스와 비교하여 50% 및 75% 상처 표면 봉합에 대한 시간이 감소하였다 (도 7). 또한, 감소된 피부 관류를 갖는 마우스에서 상처 치유에 대한 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC_pLAB112_mLrCK1.4의 효과는 상처 유도 후 첫 번째 날 동안 가장 두드러졌고, 상처 유도 후 1일 및 2일에 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC_pLAB112_mLrCK1.4를 매일 적용함으로써 상처에 아무것도 적용하지 않은 대조군 마우스에 비해 상처 크기가 감소하였다. 이 그룹에서, 총 상처 노출은 상처에 아무것도 적용하지 않은 대조군 마우스에 비해 감소하였다 (도 8).
마취된 마우스에서 Laser Speckle Contrast Analysis로 측정된 기저 피부 관류. 데이터는 관류 (PFU)에서 단위 평균 ± SEM로 표현하였고, 모든 그룹은 n=4이다.
건강한 마우스 허혈 마우스 감소(%)
대조군 62.5±4.3 34.0±1.8 46
R2LC_pLAB112_Luc 57.3±2.7 31.3±1.1 46
R2LC_pLAB112_LrCK1.4 65.0±7.2 30.8±0.4 52
실시예 5: 고혈당 마우스에서의 개선된 상처 치유
마우스에 알록산을 이용하여 당뇨병을 유발시켰고, 이들은 이후 상처 치유 과정 동안 고혈당 상태(>16.7 mmol/l)를 유지하였으며, 체중 감소는 없었다 (도 9). 당뇨병을 앓고 있는 마우스에서, 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC_pLAB112_LrCK1.4를 매일 1회 적용하는 경우, 상처에 아무것도 적용하지 않은 대조군 마우스 및 대조균 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC (pLAB112_Luc)를 매일 적용한 마우스에 비해 75% 상처 표면 봉합에 대한 시간이 감소하였다 (도 10). Luc를 갖는 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC를 매일 적용한 경우와 상처에 아무것도 적용하지 않은 대조군 마우스에 비해 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC_pLAB112_mLrCK1.4를 매일 적용한 당뇨 마우스의 상처 노출은 감소되는 경향 (p=0.08)이 있었다 (도 11).
실시예 6: CXCL12을 코딩하는 플라스미드로 트렌스펙션된 상처 가장자리 피부에서 CXCL12 피부 과발현
CMV 프로모터 (SEQ ID NO: 24) (V260-20, Invitrogen, Waltham, MA, USA)를 포함하는 pVAX1 백본 상에 플라스미드를 구성하고, pCTR (SEQ ID NO: 25)로 언급된 인서트 -copGFP-T2A-Luc2- 또는 pCXCL12 (SEQ ID NO:26)로 언급된 인서트 -CXCL12-P2A-copGFP-T2A-Luc2-를 종래 문헌에 기술된 바와 같이 도입하였다 (참고문헌 18). CXCL12에 대한 분비 서열을 쥐 IgG 분비 서열로 대체하였다. 따라서, pCTR 플라스미드는 녹색 형광 단백질(GFP) 및 루시페라아제를 코딩하지만 케모카인은 코딩하지 않는다. 플라스미드 (총 부피 100 ㎕ 식염수에 40 ㎍)를 상처 가장자리의 4곳의 피부 위치에 주사하였다. 마취를 하고 바이오이미징 장치 (IVIS Spectrum, Perkin Elmer)를 이용하여 이미지를 수득하기 10분 전에 D-루시페린 (150 mg/kg, #122796, Perkin Elmer, Waltham, MA, USA)을 복강 주사한 후 루시페라아제 활성을 기반으로 시간이 경과함에 따라 이식유전자 발현을 측정하였다. 데이터를 Living Image 3.1 software (Perkin Elmer)로 정량화하였고 비교 분석을 위해 이미징 파라미터를 유지시켰다. 반대측 참조 영역을 뺀 관심 영역을 선택하여 세팅을 유지하였다. 래디언스는 플라스미드 발현에 비례하는 것으로 간주하였다.
상처 가장자리의 진피에서의 플라스미드 발현을 비침습적 바이오이미징을 사용하여 측정하였고 CXCL12의 발현과 동일한 플라스미드에 의해 코딩된 루시페라아제 효소에 의해 생성된 빛과 상관관계가 있다. 발현은 이틀째에 정점에 이르렀고 이후 상처가 봉합되고 진피가 재형성됨에 따라 감소되었다 (도 13). CXCL12의 과발현은 완전한 상처 치유를 촉진하지는 않았으나 pCTR에 비해 상처 표면의 75% 봉합 시간을 단축시켰다 (도 14). 상처 표면은 상처 유도 및 진피 트렌스펙션 후 4-6일째의 pCTR에 비해 pCXCL12 진피 발현에 의해 감소 되었다 (도 15). 이러한 결과는 이 시스템으로 상처에 CXCL12를 전달하는 경우, 첫 24시간에는 극적인 효과가 없지만 이후 시점에서는 그보다 작은 효과가 있음을 보여준다.
실시예 7: Luc 및 LrCK1을 이용한 국소 처리의 용량 반응 락토바실러스 루테리 ( Lactobacillus reuteri )
락토바실러스 (Lactobacillus)를 밤새 배양하고 재접종하여 OD 0.5로 성장시킨 다음 MRS에서 OD 0.2, 0.5, 1.0 및 1.25로 희석 또는 농축하였다. 4가지의 다른 농도를 10-9 10배로 희석하고 각 샘플의 10 ㎕를 에리트로마이신을 포함하는 MRS 아가에 도말하여 37℃, 5% 이산화탄소에서 하룻밤 동안 혐기성 챔버에서 밤새 배양하였다. 플레이트 상의 콜로니를 계수하고 ml 당 콜로니 형성 단위로 농도를 표현하였다 (CFU/ml).
투여량 실험을 위해, 상처를 25 ㎕ 식염수 또는 밤새 배양하고 재접종하여 OD 0.5로 성장시킨 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC pLAB112_LrCK1.4로 이틀 동안 매일 처리하였고, 활성 펩티드 SppIP (50 ng/ml)를 적용하기 5분 전에 예비활성화시켰으며, 상처 표면 중간에 OD 0.2, 0.5, 1.0 또는 1.25의 농도로 국소 첨가하였다. OD 0.5의 25 ㎕에서, 5x107 박테리아 (2x109 cfu/ml)가 존재하고 1000회의 투여 기간을 의미한다.
박테리아 농도는 광학 밀도로 측정하였고, ml 당 콜로니 형성 단위를 도 16에 나타내었다. 상처에 투여하기 전과 같이 배양 및 활성화된 R2LC__pLAB112_LrCK1.4의 최소 투여량 (OD 0.2는 2x107 박테리아와 같음)은 24시간 후 가장 작은 상처 크기를 나타내었고, 4가지의 다른 모든 농도에서 상처 유도 후 24 시간 및 48시간에 현저하게 촉진된 상처 봉합이 나타났으며 (도 17A), 이에 따라 처리하지 않은 상처에 비해 첫 48시간에 대한 상처 노출이 감소되었다 (도 17B). 이러한 결과는 가장 큰 효과를 나타내는 최소 투여량보다 103배 많은 (OD 1.25는 1x1010 박테리아와 같음) 용량을 투여하는 것 또한, 처리를 하지 않은 상처 및 최대 상처 봉합을 나타내는 용량과 같은 정도로 처리한 상처에 비해 첫 48시간에 상처 치유를 현저하게 촉진한다는 것을 나타낸다. 최대 투여량이 주어진 상처에서 염증 유도 또는 다른 부정적인 부작용에 대한 징후는 관찰되지 않았다. 상기 데이터는 적은 용량의 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC_LrCK1도 상처 치유를 촉진한다는 것을 보여준다.
실시예 8: 국소 치료제로서 mCXCL12 1α의 투여량 증가
상처 표면에 투여된 mCXCL12 1α의 용량 효과를 조사하기 위해, 0.2 ㎍, 0.6 ㎍ 또는 1 ㎍의 mCXCL12 1α (RnD Systems)를 10 ㎕의 식염수에 용해하여 이틀 동안 매일 상처에 전달하였다. 투여는 하루에 한번하였다.
하루에 한번 단일 시점에 mCXCL12 1α를 매일 전달한 경우 미처리군과 같이 처음 이틀 동안은 상처 치유가 촉진되지 않았다 (도 18A, B). 이들 데이터는 CXCL12 1α의 지속적인 전달이, 1시간 동안 10분 간격으로 매일 총 0.2 ㎍의 mCXCL12 1α가 주어져 첫 48시간에 치유를 촉진하기 때문에 상처 치유를 촉진시킨다는 것을 보여준다 (도 18 및 19).
실시예 9: 인간 피부 생검에서 재상피화 검정.
기증 동의서를 얻어 웁살라 대학 병원에서 일상적인 유방 감소를 가진 건강한 백인 여성으로부터 멸균한 정상 인간 피부를 수득하였다. 샘플을 2% 송아지 혈청 (Hyclone®, HyClone Laboratories, Logan USA)이 보충된 생리학적 DMEM으로 덮고 멸균 조건 하에 실험실로 옮겼다.
종래 문헌에 기술된 바와 같이 (참고문헌 17), 피하를 제거하고 남은 진피와 표피를 6 mm 피부 생검 펀치 (Integra Miltex, York, PA, USA)와 멸균 가위로 절단하였다. 6 mm 직경의 각 피부 디스크의 중앙에서 3 mm 피부 생검 펀치와 멸균 가위로 표피를 제거하였다. 그런 다음 샘플을 표피면을 위로하여 멸균한 24 웰 플레이트에 하나씩 차례로 놓았다. 모든 배양 배지 (DMEM)는 2 또는 10 %의 BSA와 항생제 (에리트로마이신 10 ㎍/ml, Sigma Aldrich, Buchs, Swizerland)로 보충하였다. 진피쪽에 영양을 유지시키기 위해, 즉 피부의 진피쪽에 최대 농도로 영양을 유지시키기 위해, 0.5 ml 배지를 각 웰에 첨가하고 매일 배지를 교체하였다. 배지 교체와 동시에 10 ㎕의 MRS 내 106개의 락토바실러스 루테리 (Lactobacilus reuteri) R2LC_Luc 또는 락토바실러스 루테리 (Lactobacilus reuteri) R2LC_LrCK1을 부유 피부 디스크의 표피 상처 중간에 두었다. 박테리아를 MRS에 접종하고 2-4시간 동안 성장시켜 지수기가 되도록 하였다. 샘플을 37℃, 5% 이산화탄소 및 95% 습도에서 14일 동안 배양하였다.
시료를 중간을 통해 반으로 절단한 다음 절반은 pH 7.38, 4% 포름알데히드에 밤새 고정시키고 에탄올-자일렌 시리즈를 통해 탈수하여 최종적으로 파라핀에 삽입하였다. 시료 중앙부에서부터 시작하여 단면 (10 μm)을 고정, 재수화, 및 헤마톡실린 및 에오신으로 염색하였다. 이미지를 Leica DFC420 C 카메라 및 Plan Fluot 40x0.7 NA 대물렌즈를 포함하는 Leica Leits Dmrb를 사용하여 캡쳐하였다. 재상피화 또는 표피 슬리브(sleeve) 길이는 ImageJ (NIH)를 이용한 이미지에서 측정되었다.
락토바실러스 (Lactobacillus)를 배지의 피부 디스크에 첨가하고 24시간 후 측정시 배양 배지의 pH가 낮아졌다 (도 20A). 피부 디스크에 유도된 상처의 가장자리의 표피는, 배양 배지에 10% FCS가 존재하는 경우, 증식하여 노출된 진피를 덮었고, 스킨 디스크가 2% FCS가 공급된 배지에서 배양된 경우, 배양 14일 후에 증식이 거의 나타나지 않았다 (도 20B). R2LC pLAB112 Luc 또는 R2LC pLAB112_LrCK1로 처리된 피부 디스크에서 육안상으로 악영향이 탐지되지 않았고, 증가된 재상피화는 피부 디스크가 14일 동안 R2LC pLAB112_LrCK1로 처리된 상처에서 측정되었다 (도 20B).
실시예 10: 동결건조 및 재생 후 박테리아의 기능성
동결건조에 대한 서로 다른 프로토콜 및 35가지의 서로 다른 제형을 테스트하고 생존율을 최대 2달 동안 측정하였다. 또한, 동결건조된 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri)의 더 큰 배치는 우수의약품제조관리기준에 따라 대규모의 산업화된 생산과 동일한 세팅으로 생산되었다. 이 배치의 동결건조된 샘플을 -20 내지 40℃ 범위의 온도에서 최대 2달 동안 저장한 후 생존율을 분석하였다. 동결건조된 박테리아는 동일한 부피의 물 또는 SppIP (50ng/ml)를 포함하는 MRS 배지를 첨가하여 재생시켰고, 이를 96 웰 플레이트에 도말하거나 상기한 바와 같이 1일된 상처에 직접 적용하여 시험관 내(in vitro) 및 생체 내(in vivo) 발현을 즉시 분석하였다.
가장 유망한 제형의 경우, 생존율이 동결건조 직후에서부터 +4 ℃에서 저장한 샘플을 2달 째에 측정한 분석때까지 안정하였다. 생존율은 현재 식이 보조제로 판매되는 동결건조된 박테리아의 허용가능한 범위 이내였다. 소생 직후 동결건조된 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC_pLAB112_Luc에서 플라스미드 발현을 측정하는 것은 발현의 즉각적인 유도를 나타내며, 이는 450분에 정점에 이른 후 감소하였다 (도 21). 24시간 (1440분) 후에는 발현이 없었고 살아있는 박테리아도 없었다. 동결건조된 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC_pLAB112_Luc가 재생되어 50 ng/ml (SppIP)로 유도되고 마우스의 피부 상처에 바로 놓여지면 (25 ㎕ 당 5x107), 발현은 직접적으로 증가하고, 용액에 용해된 성장기의 신선한 박테리아를 첨가하였을 때와 유사한 패턴으로 약 1시간 동안 높게 유지 되었다 (도 3).
동결건조된 박테리아 (25 ㎕ 당 5x107)를 다시 재생시키고, 유도하여 마우스의 피부 상처에 바로 두었을 경우, 상처 치유에 대한 효과를 테스트하였다. 상처는 이틀 동안 매일 모니터링하였고, 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC_pLAB112_LrCK1로 처리된 상처는 이 프로토콜을 사용하더라도 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri ) R2LC_pLAB112_Luc로 처리된 상처에 비해 촉진된 치유를 나타내었다 (도 23). 이러한 데이터는 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC_pLAB112가 생체 내(in vivo) 상처 치유를 촉진하기에 충분한 양으로 CXCL12를 생산하고 전달하기 위해 지수기로 사전배양될 필요가 없음을 나타낸다.
실시예 11: 케모카인 신호전달의 pH 의존적 효과
케모카인은 그 자체로 또는 다른 케모카인과 함께 상호작용하여 단량체, 이량체 또는 다량체로 나타날 수 있다 (참고문헌 22). 서로 다른 조합 및 구조는 상이한 수용체 신호전달을 유도하며 따라서 상이한 세포 반응을 유도한다 (참고문헌 34). 이는 새로운 미개척 분야로 가능성의 조합은 국소 조직 미세환경에 따라 달라진다. 또한 국소적 pH는 국소 대식세포 기능에 영향을 미친다 (참고문헌 23).
케모카인 효능의 pH 의존적 효과에 대한 연구를 위해, 0.2 ㎍ CXCL12 1α를 pH 7.35, 6.35 또는 5.35의 식염수 10 ㎕에 용해하여 이틀 동안 매일 상처에 적용하였다.
케모카인을 함유하는 버퍼에서 pH를 변경하는 것은 처리된 상처의 치유 패턴에 영향을 미치며, CXCL12가 pH 6.35의 식염수에 현탁된 경우, CXCL12가 pH 7.35의 식염수에 현탁된 경우와 비교하여 상처 유도 하루 후 상처 크기가 더 작은 경향이 있었다 (p=0.07) (도 24). 이들 데이터는 pH 6.35가 상처 치유 촉진을 유도하는 측면에서 상처 표면에 적용된 재조합 CXCL12의 효과를 증가시킨다는 것을 나타낸다.
실시예 12: 효과를 위한 상처 표면으로 박테리아 현장 케모카인 전달의 중요성
신선한 상층액으로 상처를 처리하기 위해, 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC_pLAB112_Luc 및 R2LC_pLAB112_LrCK1을 37℃에서 10 ml의 MRS에 접종하고 OD 0.5로 성장시켜, 원심분리한 다음 (>2000 rpm, 5분), 1 ml MRS에 재현탁시키고, 활성화시킨 후 (SppIP, 50 ng/ml) 4시간 동안 성장시켰다. 이후 샘플을 원심분리하고 (>2000 rpm, 5분) 상층액을 저장하였다. 25 ㎕의 상기 상층액을 이틀 동안 매일 한번씩 상처에 적용하였다.
락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC_pLAB112_LrCK1에 의한 상처 표면으로의 직접적인 CXCL12 1α의 박테리아성 전달의 중요성은 상처 유도 후 유도된 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri)로부터의 신선한 상층액을 이틀 동안 매일 상처에 첨가한 모델에서 입증하였다. 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC_pLAB112_Luc 또는 R2LC_pLAB112_LrCK1로부터의 신선한 상층액으로 처리한 경우 상처 크기 또는 총 상처 노출 (p=0.2595)에 차이는 없었다 (도 25).
실시예 13: 락토바실러스 ( Lactobacillus ) 전달 CXCL12는 상처 주변 피부에서 CXCL12의 수준을 증가시킨다.
정량적 분석을 위해, 상처 주변 피부 (상처로부터 0-100 μm)를 실험 마지막 날에 제거하고 액체 질소에 급속 동결시켜 절편화 하였다 (10 μm). 얼음처럼 차가운 메탄올에 고정하고 (10분) 0.5 % Triton-X (15 min)에 투과한 후 (15분), 조직을 대식세포 항원 F4/80 (클론 BM8, eBioscience)과 CXCL12 1α (폴리클로날, Abcam)를 표적하는 항체와 배양하고, 세척한 다음 Alexa Fluor488 및 Nordic Lights 557 (Invitrogen)에 결합된 매칭 2차 항체로 배양하였다. 조직을 최종적으로 세척하고 라인-스캐닝 공초점 현미경 (0.5 광학 줌을 갖는 피에조 모터-제어 WPlanApo 40x/1.0를 포함하는, Zeiss LSM 5 Live, Zeiss, Oberkochen, Germany)을 사용하여 이미지화하기 전에 고정 (Fluoromount, #0100-10, Southern Biotech, Birmingham, AL, USA)하였다. 단백질 수준과 대식세포를 ImageJ (NIH) 및 IMARIS 소프트웨어 8.2 (Bitplane, Zurich, Switzerland)를 사용하여 이미지에서 정량화 하였다. 현미경 세팅은 획득하는 동안 비교가 가능하도록 유지시켰다. CXCL12 1α 측정 값은 평균 형광 강도 (MFI)로 나타내었다.
상이한 용량으로 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC_pLAB112_LrCK1을 이틀 동안 매일 한번 씩 상처에 처리하는 경우, 미처리된 상처 옆의 피부와 비교하여, 상처 바로 옆의 피부는 CXCL12 1α의 증가된 피부 조직 수준을 나타내었고 이는 진피, 표미 및 모낭 모두에서 나타났다.
실시예 14: 락토바실러스 ( Lactobacillus ) 전달 CXCL12은 상처 주변 피부에서 대식세포를 증가시킨다.
상이한 용량으로 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC_pLAB112_LrCK1을 이틀 동안 매일 한번 씩 상처에 처리하는 경우, OD 0.2 및 0.5의 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC_pLAB112_LrCK1을 상처에 적용시, 미처리 상처 옆의 진피에 비해, 상처 유도 이틀 후 상처 바로 옆의 진피에서 F4/80+ 대식세포의 농도가 증가되었다 (도 27A). F4/80+ 대식세포는 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC_pLAB112_LrCK1을 OD 1.25로 상처 표면에 공급시, 미처리 상처 옆의 표피와 비교하여, 상처 유도 이틀 후 상처 옆의 표피에서 증가되었다 (도 27B).
실시예 15: 락토바실러스 락티스 ( Lactococcus Lactis )를 이용한 상처 치유 촉진에 대한 효과 확인
박테리아에 의해 생산된 특정 케모카인의 국소적이고 지속적인 전달이 박테리아 균주와 관계없이 메카니즘에 중요하다는 것을 보여주기 위해, 다른 균주를 사용하여 케모카인을 생산하고 상처 표면에 직접적으로 전달하였으며, 락토코커스 락티스 (Lactococcus Lactis)는 pLAB112 (mLrCK1)로 형질전환시켰다. 박테리아를 락토바실러스 루테리 (Lactobacuillus reuteri)를 사용한 처리법에 기재된 것과 동일한 프로토콜에 따라 하루에 한번 건강한 마우스의 전층 상처에 적용하였다.
이 모델에서 mCXCL12 1α의 전달은 상처 봉합을 촉진하고 (도 28), 상처 크기 및 노출을 감소시키는 경향을 나타냈다 (도 29).
실시예 16: 재조합 단백질로 전달된 mCXCL12 , mCXCL17 Ym1의 처리에 의한 상처 봉합 시간의 적절한 효과
전달 방식 및 유산균에 의해 활성화된 지속적인 단백질 생산이 메카니즘에 중요하다는 것을 입증하기 위해, 쥐 재조합 mCXCL12 1α, mCXCL17, mYm1 (60 ㎕에 용해된 총 200ng, 모두 RnD Systems) 또는 대조군으로 식염수를 한 시간 동안 10분마다 하루에 한번씩 상처에 전달하였다.
mCXCL12 1α의 경우, 복강 내로 30 ng의 전달은 3시간 후 현저하게 증가된 면역세포의 보충을 유도하고, 이는 25μm2의 영역에 200ng이 높은 용량으로 간주되는 이유이다.
상처에서 높은 프로테아제 활성은, 하나의 단일 시점에 재조합 단백질로 제공되는 경우, 케모카인을 분해할 수 있고, 따라서 상처 봉합을 강화하기 위해 단백질이 다시 박테리아에 의한 생산되는 것이 요구된다. 또한, 유산균은 상처 치유를 위한 유익한 국소 환경을 제공할 수 있다 (도 1B, 4, 5, 24, 30 및 31).
실시예 17: 건강한 마우스의 상처 봉합에 대한 서로 다른 처리법의 효과 비교
건강한 마우스에서 첫 24시간 동안의 상처 봉합을 수행된 모든 다른 처리법에 대해 분석하였다 (도 32). 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC_Luc로 처리하거나 한 시점에서 CXCL12 1α의 낮은 단일 용량으로 상처에 투여하는 것은 첫 24시간 동안 치유에 영향을 미치는 것이 명확하다.
상처 표면에 1시간 동안 10분 마다 전달된 CXCL12 1α, CXCL17 및 Ym1은 첫 24시간 동안 상처 봉합을 촉진하는 경향이 있으나, 이러한 효과는 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) R2LC_LrCK1에 의해 상처 표면에 1시간 동안 지속적으로 CXCL12 1α가 전달된 경우 더욱 분명해진다. 진피 과발현을 통한 CXCL12의 전달은 오히려 24시간 상처 봉합에 해로운 영향을 미친다.
실시예 18: pLAB112 _ mLrCK1 .4를 포함하는 락토바실러스 루테리 ( Lactobacillus reuteri )에 의한 점막 표면의 상처 치유 촉진
상처 표면으로 국소적이고 지속적인 CXCL12의 전달이 전체적인 메카니즘을 통해 피부 상피 및 장 상피 둘 다에 작용하는 테스트하기 위해, DSS-유도 대장염의 2가지 실험 프로토콜을 사용하였다. DSS (덱스트란 설페이트 소듐)은 결장의 점막 표면에 상처를 유도하는 것으로 알려져 있다 (참고문헌 16).
첫 번째 프로토콜의 경우, 마우스를 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri)로 14일 동안 하루에 한번 위관영양법 (1ml OD 0.5 회전 및 0.1 ml에 재현탁)으로 처리하고 DSS를 7-14일에 식수에 공급하였다. 이 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) 균주는 결장에 콜로니를 형성하기 때문에, 이 프로토콜을 이용하여 대장염이 유발되었을 때 결장의 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) pLAB112_mLrCK1의 존재가 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) pLAB112_Luc와 비교하여 유익한지 평가하는 것이 목적이다.
두 번째 프로토콜은 명백한 대장염을 치료하는 것이 목적으로, 1-8일에 식수에 용해한 DSS를 마우스에 공급하고 5-8일에 매일 3회씩 위관영양법으로 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri)를 투여하였다.
대장염의 중증도는 체중 감소, 대변 농도 및 혈액 성분을 포함하는 임상적 파라미터를 바탕으로 매일 평가되었고, 쿠퍼와 그의 동료에 의해 상세하게 기술된 스코어링 방법인 DAI (Disease Activity Index)로 나타내었다 (참고문헌 16).
락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) pLAB112_Luc와 pLAB112_LrCK1.4의 전처리에 의해 DSS-유도 대장염 질환 활성의 유사한 개선이 있었고, 그 효과는 오직 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri)로 인한 것으로 나타났다.
대조적으로, pLAB112_Luc (도 34)를 처리에 대해 관찰되지 않았던 대장염 마우스에 락토바실러스 루테리 (Lactobacillus reuteri) pLAB112_LrCK1.4가 투여되었을 때 전달된 케모카인의 효과가 나타나 질환의 진전이 개선되었다.
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서열목록 요약
SEQ ID NO: 설명
1. mLrCK1_opt DNA
2. mLrCK1_opt 단백질
3. mCXCL12 천연 단백질
4. hLrCK1_opt DNA
5. hLrCK1_opt 단백질
6. hCXCL12 천연 단백질
7. mLrCK2_opt DNA
8. mLrCK2_opt 단백질
9. mCXCL17 천연 단백질
10. hLrCK2_opt DNA
11. hLrCK2_opt 단백질
12. hCXCL17 천연 단백질
13. mYm1_opt DNA
14. mYm1 단백질
15. mYm1 천연 단백질
16. hYm1_opt DNA
17. hYm1 단백질
18. hYm1 천연 단백질
19. SppIP; 활성 펩티드
20. pSIP411 DNA
21. pSIP411 단백질
22. PCR 프라이머
23. PCR 프라이머
24. pVAX1 DNA
25. pCTR DNA 인서트
26. pCXCL12 DNA 인서트
SEQUENCE LISTING <110> Phillipson, Mia Roos, Stefan Vgesj, Evelina <120> Methods for wound healing <130> 27.34.126097 <150> 1451658-7 <151> 2014-12-23 <160> 26 <170> PatentIn version 3.5 <210> 1 <211> 299 <212> DNA <213> Mus musculus <220> <221> CDS <222> (3)..(293) <400> 1 cc atg gca aaa ttt tgg aag aaa gca cta tta aca att gca gcc tta 47 Met Ala Lys Phe Trp Lys Lys Ala Leu Leu Thr Ile Ala Ala Leu 1 5 10 15 aca gtc ggc acc tcc gca gga att aca agc gtt tct gcc aaa ccg gta 95 Thr Val Gly Thr Ser Ala Gly Ile Thr Ser Val Ser Ala Lys Pro Val 20 25 30 agt ttg tca tat cga tgt cca tgc cgg ttt ttc gaa tct cat att gca 143 Ser Leu Ser Tyr Arg Cys Pro Cys Arg Phe Phe Glu Ser His Ile Ala 35 40 45 cgc gct aat gtc aaa cac tta aag att ctt aat act cct aat tgt gct 191 Arg Ala Asn Val Lys His Leu Lys Ile Leu Asn Thr Pro Asn Cys Ala 50 55 60 ttg cag att gtt gca cgt tta aag aat aac aat cgt caa gtt tgt atc 239 Leu Gln Ile Val Ala Arg Leu Lys Asn Asn Asn Arg Gln Val Cys Ile 65 70 75 gat cca aag ctt aaa tgg att caa gag tac tta gaa aag gcc tta aac 287 Asp Pro Lys Leu Lys Trp Ile Gln Glu Tyr Leu Glu Lys Ala Leu Asn 80 85 90 95 aaa taa ctcgag 299 Lys <210> 2 <211> 96 <212> PRT <213> Mus musculus <400> 2 Met Ala Lys Phe Trp Lys Lys Ala Leu Leu Thr Ile Ala Ala Leu Thr 1 5 10 15 Val Gly Thr Ser Ala Gly Ile Thr Ser Val Ser Ala Lys Pro Val Ser 20 25 30 Leu Ser Tyr Arg Cys Pro Cys Arg Phe Phe Glu Ser His Ile Ala Arg 35 40 45 Ala Asn Val Lys His Leu Lys Ile Leu Asn Thr Pro Asn Cys Ala Leu 50 55 60 Gln Ile Val Ala Arg Leu Lys Asn Asn Asn Arg Gln Val Cys Ile Asp 65 70 75 80 Pro Lys Leu Lys Trp Ile Gln Glu Tyr Leu Glu Lys Ala Leu Asn Lys 85 90 95 <210> 3 <211> 89 <212> PRT <213> Mus musculus <400> 3 Met Asp Ala Lys Val Val Ala Val Leu Ala Leu Val Leu Ala Ala Leu 1 5 10 15 Cys Ile Ser Asp Gly Lys Pro Val Ser Leu Ser Tyr Arg Cys Pro Cys 20 25 30 Arg Phe Phe Glu Ser His Ile Ala Arg Ala Asn Val Lys His Leu Lys 35 40 45 Ile Leu Asn Thr Pro Asn Cys Ala Leu Gln Ile Val Ala Arg Leu Lys 50 55 60 Asn Asn Asn Arg Gln Val Cys Ile Asp Pro Lys Leu Lys Trp Ile Gln 65 70 75 80 Glu Tyr Leu Glu Lys Ala Leu Asn Lys 85 <210> 4 <211> 299 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> CDS <222> (3)..(293) <400> 4 cc atg gca aaa ttt tgg aag aaa gca cta tta aca att gca gcc tta 47 Met Ala Lys Phe Trp Lys Lys Ala Leu Leu Thr Ile Ala Ala Leu 1 5 10 15 aca gtc ggc acc tcc gca gga att aca agc gtt tct gcc aaa ccg gta 95 Thr Val Gly Thr Ser Ala Gly Ile Thr Ser Val Ser Ala Lys Pro Val 20 25 30 agt ttg tca tat cga tgt cca tgc cgg ttt ttc gaa tct cat gtt gca 143 Ser Leu Ser Tyr Arg Cys Pro Cys Arg Phe Phe Glu Ser His Val Ala 35 40 45 cgc gct aat gtc aaa cac tta aag att ctt aat act cct aat tgt gct 191 Arg Ala Asn Val Lys His Leu Lys Ile Leu Asn Thr Pro Asn Cys Ala 50 55 60 ttg cag att gtt gca cgt tta aag aat aac aat cgt caa gtt tgt atc 239 Leu Gln Ile Val Ala Arg Leu Lys Asn Asn Asn Arg Gln Val Cys Ile 65 70 75 gat cca aag ctt aaa tgg att caa gag tac tta gaa aag gcc tta aac 287 Asp Pro Lys Leu Lys Trp Ile Gln Glu Tyr Leu Glu Lys Ala Leu Asn 80 85 90 95 aaa taa ctcgag 299 Lys <210> 5 <211> 96 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 5 Met Ala Lys Phe Trp Lys Lys Ala Leu Leu Thr Ile Ala Ala Leu Thr 1 5 10 15 Val Gly Thr Ser Ala Gly Ile Thr Ser Val Ser Ala Lys Pro Val Ser 20 25 30 Leu Ser Tyr Arg Cys Pro Cys Arg Phe Phe Glu Ser His Val Ala Arg 35 40 45 Ala Asn Val Lys His Leu Lys Ile Leu Asn Thr Pro Asn Cys Ala Leu 50 55 60 Gln Ile Val Ala Arg Leu Lys Asn Asn Asn Arg Gln Val Cys Ile Asp 65 70 75 80 Pro Lys Leu Lys Trp Ile Gln Glu Tyr Leu Glu Lys Ala Leu Asn Lys 85 90 95 <210> 6 <211> 89 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 6 Met Asn Ala Lys Val Val Val Val Leu Val Leu Val Leu Thr Ala Leu 1 5 10 15 Cys Leu Ser Asp Gly Lys Pro Val Ser Leu Ser Tyr Arg Cys Pro Cys 20 25 30 Arg Phe Phe Glu Ser His Val Ala Arg Ala Asn Val Lys His Leu Lys 35 40 45 Ile Leu Asn Thr Pro Asn Cys Ala Leu Gln Ile Val Ala Arg Leu Lys 50 55 60 Asn Asn Asn Arg Gln Val Cys Ile Asp Pro Lys Leu Lys Trp Ile Gln 65 70 75 80 Glu Tyr Leu Glu Lys Ala Leu Asn Lys 85 <210> 7 <211> 386 <212> DNA <213> Mus musculus <220> <221> CDS <222> (3)..(380) <400> 7 cc atg gca aaa ttt tgg aag aaa gca cta tta aca att gca gcc tta 47 Met Ala Lys Phe Trp Lys Lys Ala Leu Leu Thr Ile Ala Ala Leu 1 5 10 15 aca gtc ggc acc tcc gca gga att aca agc gtt tct gcc agc cca aat 95 Thr Val Gly Thr Ser Ala Gly Ile Thr Ser Val Ser Ala Ser Pro Asn 20 25 30 cca ggg gtc gcc aga tct cac ggc gac cag cac ctg gct cct agg aga 143 Pro Gly Val Ala Arg Ser His Gly Asp Gln His Leu Ala Pro Arg Arg 35 40 45 tgg ctc ctg gaa ggc ggc caa gaa tgt gag tgc aaa gat tgg ttc ctg 191 Trp Leu Leu Glu Gly Gly Gln Glu Cys Glu Cys Lys Asp Trp Phe Leu 50 55 60 caa gcc ccg aag aga aaa gcc aca gct gtg ctg ggg cca cca aga aag 239 Gln Ala Pro Lys Arg Lys Ala Thr Ala Val Leu Gly Pro Pro Arg Lys 65 70 75 cag tgc ccc tgt gat cat gtg aag ggc aga gaa aag aaa aat aga cac 287 Gln Cys Pro Cys Asp His Val Lys Gly Arg Glu Lys Lys Asn Arg His 80 85 90 95 caa aag cac cac aga aag agc caa aga ccc tcc aga gcc tgc cag caa 335 Gln Lys His His Arg Lys Ser Gln Arg Pro Ser Arg Ala Cys Gln Gln 100 105 110 ttt ctc aaa agg tgt cac cta gcc agc ttt gct ctg cct ttg tag 380 Phe Leu Lys Arg Cys His Leu Ala Ser Phe Ala Leu Pro Leu 115 120 125 ctcgag 386 <210> 8 <211> 125 <212> PRT <213> Mus musculus <400> 8 Met Ala Lys Phe Trp Lys Lys Ala Leu Leu Thr Ile Ala Ala Leu Thr 1 5 10 15 Val Gly Thr Ser Ala Gly Ile Thr Ser Val Ser Ala Ser Pro Asn Pro 20 25 30 Gly Val Ala Arg Ser His Gly Asp Gln His Leu Ala Pro Arg Arg Trp 35 40 45 Leu Leu Glu Gly Gly Gln Glu Cys Glu Cys Lys Asp Trp Phe Leu Gln 50 55 60 Ala Pro Lys Arg Lys Ala Thr Ala Val Leu Gly Pro Pro Arg Lys Gln 65 70 75 80 Cys Pro Cys Asp His Val Lys Gly Arg Glu Lys Lys Asn Arg His Gln 85 90 95 Lys His His Arg Lys Ser Gln Arg Pro Ser Arg Ala Cys Gln Gln Phe 100 105 110 Leu Lys Arg Cys His Leu Ala Ser Phe Ala Leu Pro Leu 115 120 125 <210> 9 <211> 119 <212> PRT <213> Mus musculus <400> 9 Met Lys Leu Leu Ala Ser Pro Phe Leu Leu Leu Leu Pro Val Met Leu 1 5 10 15 Met Ser Met Val Phe Ser Ser Pro Asn Pro Gly Val Ala Arg Ser His 20 25 30 Gly Asp Gln His Leu Ala Pro Arg Arg Trp Leu Leu Glu Gly Gly Gln 35 40 45 Glu Cys Glu Cys Lys Asp Trp Phe Leu Gln Ala Pro Lys Arg Lys Ala 50 55 60 Thr Ala Val Leu Gly Pro Pro Arg Lys Gln Cys Pro Cys Asp His Val 65 70 75 80 Lys Gly Arg Glu Lys Lys Asn Arg His Gln Lys His His Arg Lys Ser 85 90 95 Gln Arg Pro Ser Arg Ala Cys Gln Gln Phe Leu Lys Arg Cys His Leu 100 105 110 Ala Ser Phe Ala Leu Pro Leu 115 <210> 10 <211> 386 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> CDS <222> (3)..(380) <400> 10 cc atg gca aaa ttt tgg aag aaa gca cta tta aca att gca gcc tta 47 Met Ala Lys Phe Trp Lys Lys Ala Leu Leu Thr Ile Ala Ala Leu 1 5 10 15 aca gtc ggc acc tcc gca gga att aca agc gtt tct gcc tca tta aat 95 Thr Val Gly Thr Ser Ala Gly Ile Thr Ser Val Ser Ala Ser Leu Asn 20 25 30 cca gga gta gca cgg ggt cat cga gat cgg gga caa gca agt cgg cgt 143 Pro Gly Val Ala Arg Gly His Arg Asp Arg Gly Gln Ala Ser Arg Arg 35 40 45 tgg tta caa gaa ggt ggt caa gaa tgt gaa tgt aaa gat tgg ttt tta 191 Trp Leu Gln Glu Gly Gly Gln Glu Cys Glu Cys Lys Asp Trp Phe Leu 50 55 60 cgt gct cca cgt cgg aag ttt atg act gtt agt ggt ctt cca aag aaa 239 Arg Ala Pro Arg Arg Lys Phe Met Thr Val Ser Gly Leu Pro Lys Lys 65 70 75 caa tgt cct tgt gat cat ttt aag gga aat gtt aag aaa act cga cac 287 Gln Cys Pro Cys Asp His Phe Lys Gly Asn Val Lys Lys Thr Arg His 80 85 90 95 caa cgt cat cac cgg aaa cct aat aag cat tca cgg gca tgt caa caa 335 Gln Arg His His Arg Lys Pro Asn Lys His Ser Arg Ala Cys Gln Gln 100 105 110 ttt ctt aaa caa tgt caa ctt cgt tct ttt gct ctt cct ctt taa 380 Phe Leu Lys Gln Cys Gln Leu Arg Ser Phe Ala Leu Pro Leu 115 120 125 ctcgag 386 <210> 11 <211> 125 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 11 Met Ala Lys Phe Trp Lys Lys Ala Leu Leu Thr Ile Ala Ala Leu Thr 1 5 10 15 Val Gly Thr Ser Ala Gly Ile Thr Ser Val Ser Ala Ser Leu Asn Pro 20 25 30 Gly Val Ala Arg Gly His Arg Asp Arg Gly Gln Ala Ser Arg Arg Trp 35 40 45 Leu Gln Glu Gly Gly Gln Glu Cys Glu Cys Lys Asp Trp Phe Leu Arg 50 55 60 Ala Pro Arg Arg Lys Phe Met Thr Val Ser Gly Leu Pro Lys Lys Gln 65 70 75 80 Cys Pro Cys Asp His Phe Lys Gly Asn Val Lys Lys Thr Arg His Gln 85 90 95 Arg His His Arg Lys Pro Asn Lys His Ser Arg Ala Cys Gln Gln Phe 100 105 110 Leu Lys Gln Cys Gln Leu Arg Ser Phe Ala Leu Pro Leu 115 120 125 <210> 12 <211> 119 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 12 Met Lys Val Leu Ile Ser Ser Leu Leu Leu Leu Leu Pro Leu Met Leu 1 5 10 15 Met Ser Met Val Ser Ser Ser Leu Asn Pro Gly Val Ala Arg Gly His 20 25 30 Arg Asp Arg Gly Gln Ala Ser Arg Arg Trp Leu Gln Glu Gly Gly Gln 35 40 45 Glu Cys Glu Cys Lys Asp Trp Phe Leu Arg Ala Pro Arg Arg Lys Phe 50 55 60 Met Thr Val Ser Gly Leu Pro Lys Lys Gln Cys Pro Cys Asp His Phe 65 70 75 80 Lys Gly Asn Val Lys Lys Thr Arg His Gln Arg His His Arg Lys Pro 85 90 95 Asn Lys His Ser Arg Ala Cys Gln Gln Phe Leu Lys Gln Cys Gln Leu 100 105 110 Arg Ser Phe Ala Leu Pro Leu 115 <210> 13 <211> 1226 <212> DNA <213> Mus musculus <220> <221> CDS <222> (3)..(1220) <400> 13 cc atg gca aaa ttt tgg aag aaa gca cta tta aca att gca gcc tta 47 Met Ala Lys Phe Trp Lys Lys Ala Leu Leu Thr Ile Ala Ala Leu 1 5 10 15 aca gtc ggc acc tcc gca gga att aca agc gtt tct gcc tac caa ctt 95 Thr Val Gly Thr Ser Ala Gly Ile Thr Ser Val Ser Ala Tyr Gln Leu 20 25 30 atg tgt tac tac act tca tgg gct aaa gat cgt cca att gaa ggt tct 143 Met Cys Tyr Tyr Thr Ser Trp Ala Lys Asp Arg Pro Ile Glu Gly Ser 35 40 45 ttt aag cca gga aat att gat cct tgt ctt tgt aca cat ctt att tac 191 Phe Lys Pro Gly Asn Ile Asp Pro Cys Leu Cys Thr His Leu Ile Tyr 50 55 60 gct ttt gct ggt atg caa aat aat gaa att act tac aca cac gaa caa 239 Ala Phe Ala Gly Met Gln Asn Asn Glu Ile Thr Tyr Thr His Glu Gln 65 70 75 gat tta cgt gat tac gaa gct ctt aat ggt ctt aag gat aag aat act 287 Asp Leu Arg Asp Tyr Glu Ala Leu Asn Gly Leu Lys Asp Lys Asn Thr 80 85 90 95 gaa ctt aag aca ctt ctt gca att ggt gga tgg aag ttt gga cca gct 335 Glu Leu Lys Thr Leu Leu Ala Ile Gly Gly Trp Lys Phe Gly Pro Ala 100 105 110 cct ttt agt gca atg gtt tca act cca caa aat cgg caa att ttt att 383 Pro Phe Ser Ala Met Val Ser Thr Pro Gln Asn Arg Gln Ile Phe Ile 115 120 125 caa agt gta att cgg ttt tta cgg caa tac aat ttt gat gga ctt aat 431 Gln Ser Val Ile Arg Phe Leu Arg Gln Tyr Asn Phe Asp Gly Leu Asn 130 135 140 ctt gat tgg caa tac cca ggt agt cga gga tca cca cct aag gat aag 479 Leu Asp Trp Gln Tyr Pro Gly Ser Arg Gly Ser Pro Pro Lys Asp Lys 145 150 155 cat tta ttt agt gtt ctt gta aaa gaa atg cga aag gct ttt gaa gaa 527 His Leu Phe Ser Val Leu Val Lys Glu Met Arg Lys Ala Phe Glu Glu 160 165 170 175 gaa agt gtt gaa aag gat att cca cgt ctt ctt ctt act agt aca ggt 575 Glu Ser Val Glu Lys Asp Ile Pro Arg Leu Leu Leu Thr Ser Thr Gly 180 185 190 gca gga att att gat gta att aag tca ggt tac aag att cca gaa ctt 623 Ala Gly Ile Ile Asp Val Ile Lys Ser Gly Tyr Lys Ile Pro Glu Leu 195 200 205 agt caa tca ctt gat tac att caa gtt atg act tac gat tta cac gat 671 Ser Gln Ser Leu Asp Tyr Ile Gln Val Met Thr Tyr Asp Leu His Asp 210 215 220 cct aag gat ggt tac aca gga gaa aat tct cca ctt tac aag agt cct 719 Pro Lys Asp Gly Tyr Thr Gly Glu Asn Ser Pro Leu Tyr Lys Ser Pro 225 230 235 tac gat att gga aag agt gct gat ctt aat gtt gat tct att att agt 767 Tyr Asp Ile Gly Lys Ser Ala Asp Leu Asn Val Asp Ser Ile Ile Ser 240 245 250 255 tac tgg aaa gat cat gga gct gca tca gaa aag ctt att gtt ggt ttt 815 Tyr Trp Lys Asp His Gly Ala Ala Ser Glu Lys Leu Ile Val Gly Phe 260 265 270 cca gct tac gga cac act ttt att ctt tca gat cca tct aag aca ggt 863 Pro Ala Tyr Gly His Thr Phe Ile Leu Ser Asp Pro Ser Lys Thr Gly 275 280 285 att gga gca cct act att tct aca ggt cca cct gga aag tat act gat 911 Ile Gly Ala Pro Thr Ile Ser Thr Gly Pro Pro Gly Lys Tyr Thr Asp 290 295 300 gaa agt ggt ctt tta gct tac tac gaa gtt tgt aca ttt tta aat gaa 959 Glu Ser Gly Leu Leu Ala Tyr Tyr Glu Val Cys Thr Phe Leu Asn Glu 305 310 315 gga gct aca gaa gtt tgg gat gca cca caa gaa gta cct tat gca tac 1007 Gly Ala Thr Glu Val Trp Asp Ala Pro Gln Glu Val Pro Tyr Ala Tyr 320 325 330 335 cag ggt aat gaa tgg gtt gga tac gat aat gta cgt agt ttt aag ctt 1055 Gln Gly Asn Glu Trp Val Gly Tyr Asp Asn Val Arg Ser Phe Lys Leu 340 345 350 aag gct caa tgg ctt aag gat aat aat tta ggt gga gca gtt gta tgg 1103 Lys Ala Gln Trp Leu Lys Asp Asn Asn Leu Gly Gly Ala Val Val Trp 355 360 365 cca ctt gat atg gat gat ttt tct ggt agt ttt tgt cat caa cgg cac 1151 Pro Leu Asp Met Asp Asp Phe Ser Gly Ser Phe Cys His Gln Arg His 370 375 380 ttt cct ctt act tca aca ctt aag ggt gat ctt aat att cat tca gca 1199 Phe Pro Leu Thr Ser Thr Leu Lys Gly Asp Leu Asn Ile His Ser Ala 385 390 395 tct tgt aag gga cca tat taa ctcgag 1226 Ser Cys Lys Gly Pro Tyr 400 405 <210> 14 <211> 405 <212> PRT <213> Mus musculus <400> 14 Met Ala Lys Phe Trp Lys Lys Ala Leu Leu Thr Ile Ala Ala Leu Thr 1 5 10 15 Val Gly Thr Ser Ala Gly Ile Thr Ser Val Ser Ala Tyr Gln Leu Met 20 25 30 Cys Tyr Tyr Thr Ser Trp Ala Lys Asp Arg Pro Ile Glu Gly Ser Phe 35 40 45 Lys Pro Gly Asn Ile Asp Pro Cys Leu Cys Thr His Leu Ile Tyr Ala 50 55 60 Phe Ala Gly Met Gln Asn Asn Glu Ile Thr Tyr Thr His Glu Gln Asp 65 70 75 80 Leu Arg Asp Tyr Glu Ala Leu Asn Gly Leu Lys Asp Lys Asn Thr Glu 85 90 95 Leu Lys Thr Leu Leu Ala Ile Gly Gly Trp Lys Phe Gly Pro Ala Pro 100 105 110 Phe Ser Ala Met Val Ser Thr Pro Gln Asn Arg Gln Ile Phe Ile Gln 115 120 125 Ser Val Ile Arg Phe Leu Arg Gln Tyr Asn Phe Asp Gly Leu Asn Leu 130 135 140 Asp Trp Gln Tyr Pro Gly Ser Arg Gly Ser Pro Pro Lys Asp Lys His 145 150 155 160 Leu Phe Ser Val Leu Val Lys Glu Met Arg Lys Ala Phe Glu Glu Glu 165 170 175 Ser Val Glu Lys Asp Ile Pro Arg Leu Leu Leu Thr Ser Thr Gly Ala 180 185 190 Gly Ile Ile Asp Val Ile Lys Ser Gly Tyr Lys Ile Pro Glu Leu Ser 195 200 205 Gln Ser Leu Asp Tyr Ile Gln Val Met Thr Tyr Asp Leu His Asp Pro 210 215 220 Lys Asp Gly Tyr Thr Gly Glu Asn Ser Pro Leu Tyr Lys Ser Pro Tyr 225 230 235 240 Asp Ile Gly Lys Ser Ala Asp Leu Asn Val Asp Ser Ile Ile Ser Tyr 245 250 255 Trp Lys Asp His Gly Ala Ala Ser Glu Lys Leu Ile Val Gly Phe Pro 260 265 270 Ala Tyr Gly His Thr Phe Ile Leu Ser Asp Pro Ser Lys Thr Gly Ile 275 280 285 Gly Ala Pro Thr Ile Ser Thr Gly Pro Pro Gly Lys Tyr Thr Asp Glu 290 295 300 Ser Gly Leu Leu Ala Tyr Tyr Glu Val Cys Thr Phe Leu Asn Glu Gly 305 310 315 320 Ala Thr Glu Val Trp Asp Ala Pro Gln Glu Val Pro Tyr Ala Tyr Gln 325 330 335 Gly Asn Glu Trp Val Gly Tyr Asp Asn Val Arg Ser Phe Lys Leu Lys 340 345 350 Ala Gln Trp Leu Lys Asp Asn Asn Leu Gly Gly Ala Val Val Trp Pro 355 360 365 Leu Asp Met Asp Asp Phe Ser Gly Ser Phe Cys His Gln Arg His Phe 370 375 380 Pro Leu Thr Ser Thr Leu Lys Gly Asp Leu Asn Ile His Ser Ala Ser 385 390 395 400 Cys Lys Gly Pro Tyr 405 <210> 15 <211> 398 <212> PRT <213> Mus musculus <400> 15 Met Ala Lys Leu Ile Leu Val Thr Gly Leu Ala Ile Leu Leu Asn Val 1 5 10 15 Gln Leu Gly Ser Ser Tyr Gln Leu Met Cys Tyr Tyr Thr Ser Trp Ala 20 25 30 Lys Asp Arg Pro Ile Glu Gly Ser Phe Lys Pro Gly Asn Ile Asp Pro 35 40 45 Cys Leu Cys Thr His Leu Ile Tyr Ala Phe Ala Gly Met Gln Asn Asn 50 55 60 Glu Ile Thr Tyr Thr His Glu Gln Asp Leu Arg Asp Tyr Glu Ala Leu 65 70 75 80 Asn Gly Leu Lys Asp Lys Asn Thr Glu Leu Lys Thr Leu Leu Ala Ile 85 90 95 Gly Gly Trp Lys Phe Gly Pro Ala Pro Phe Ser Ala Met Val Ser Thr 100 105 110 Pro Gln Asn Arg Gln Ile Phe Ile Gln Ser Val Ile Arg Phe Leu Arg 115 120 125 Gln Tyr Asn Phe Asp Gly Leu Asn Leu Asp Trp Gln Tyr Pro Gly Ser 130 135 140 Arg Gly Ser Pro Pro Lys Asp Lys His Leu Phe Ser Val Leu Val Lys 145 150 155 160 Glu Met Arg Lys Ala Phe Glu Glu Glu Ser Val Glu Lys Asp Ile Pro 165 170 175 Arg Leu Leu Leu Thr Ser Thr Gly Ala Gly Ile Ile Asp Val Ile Lys 180 185 190 Ser Gly Tyr Lys Ile Pro Glu Leu Ser Gln Ser Leu Asp Tyr Ile Gln 195 200 205 Val Met Thr Tyr Asp Leu His Asp Pro Lys Asp Gly Tyr Thr Gly Glu 210 215 220 Asn Ser Pro Leu Tyr Lys Ser Pro Tyr Asp Ile Gly Lys Ser Ala Asp 225 230 235 240 Leu Asn Val Asp Ser Ile Ile Ser Tyr Trp Lys Asp His Gly Ala Ala 245 250 255 Ser Glu Lys Leu Ile Val Gly Phe Pro Ala Tyr Gly His Thr Phe Ile 260 265 270 Leu Ser Asp Pro Ser Lys Thr Gly Ile Gly Ala Pro Thr Ile Ser Thr 275 280 285 Gly Pro Pro Gly Lys Tyr Thr Asp Glu Ser Gly Leu Leu Ala Tyr Tyr 290 295 300 Glu Val Cys Thr Phe Leu Asn Glu Gly Ala Thr Glu Val Trp Asp Ala 305 310 315 320 Pro Gln Glu Val Pro Tyr Ala Tyr Gln Gly Asn Glu Trp Val Gly Tyr 325 330 335 Asp Asn Val Arg Ser Phe Lys Leu Lys Ala Gln Trp Leu Lys Asp Asn 340 345 350 Asn Leu Gly Gly Ala Val Val Trp Pro Leu Asp Met Asp Asp Phe Ser 355 360 365 Gly Ser Phe Cys His Gln Arg His Phe Pro Leu Thr Ser Thr Leu Lys 370 375 380 Gly Asp Leu Asn Ile His Ser Ala Ser Cys Lys Gly Pro Tyr 385 390 395 <210> 16 <211> 1181 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> CDS <222> (3)..(1175) <400> 16 cc atg gca aaa ttt tgg aag aaa gca cta tta aca att gca gcc tta 47 Met Ala Lys Phe Trp Lys Lys Ala Leu Leu Thr Ile Ala Ala Leu 1 5 10 15 aca gtc ggc acc tcc gca gga att aca agc gtt tct gcc tac aag ctt 95 Thr Val Gly Thr Ser Ala Gly Ile Thr Ser Val Ser Ala Tyr Lys Leu 20 25 30 gtt tgt tac tac act tca tgg tct caa tac cga gaa ggt gat gga agt 143 Val Cys Tyr Tyr Thr Ser Trp Ser Gln Tyr Arg Glu Gly Asp Gly Ser 35 40 45 tgt ttt cca gat gct ctt gat cgg ttt tta tgt aca cat att att tac 191 Cys Phe Pro Asp Ala Leu Asp Arg Phe Leu Cys Thr His Ile Ile Tyr 50 55 60 tct ttt gca aat att agt aat gat cac att gat aca tgg gaa tgg aat 239 Ser Phe Ala Asn Ile Ser Asn Asp His Ile Asp Thr Trp Glu Trp Asn 65 70 75 gat gtt act ctt tac ggt atg ctt aat aca ctt aag aat cgt aat cca 287 Asp Val Thr Leu Tyr Gly Met Leu Asn Thr Leu Lys Asn Arg Asn Pro 80 85 90 95 aat tta aag act tta ctt agt gta ggt gga tgg aat ttt ggt tct caa 335 Asn Leu Lys Thr Leu Leu Ser Val Gly Gly Trp Asn Phe Gly Ser Gln 100 105 110 cgg ttt agt aag att gct tca aat act caa tct cgt cgg aca ttt att 383 Arg Phe Ser Lys Ile Ala Ser Asn Thr Gln Ser Arg Arg Thr Phe Ile 115 120 125 aaa agt gtt cca cca ttt tta cgt act cat ggt ttt gat gga ctt gat 431 Lys Ser Val Pro Pro Phe Leu Arg Thr His Gly Phe Asp Gly Leu Asp 130 135 140 tta gca tgg ctt tat cca ggt cga cgt gat aag caa cac ttt act aca 479 Leu Ala Trp Leu Tyr Pro Gly Arg Arg Asp Lys Gln His Phe Thr Thr 145 150 155 ctt att aaa gaa atg aag gct gaa ttt att aag gaa gca caa cct ggt 527 Leu Ile Lys Glu Met Lys Ala Glu Phe Ile Lys Glu Ala Gln Pro Gly 160 165 170 175 aaa aag caa ctt ctt ctt agt gct gca tta tca gct gga aag gtt act 575 Lys Lys Gln Leu Leu Leu Ser Ala Ala Leu Ser Ala Gly Lys Val Thr 180 185 190 att gat agt tca tac gat att gca aag att agt caa cat ctt gat ttt 623 Ile Asp Ser Ser Tyr Asp Ile Ala Lys Ile Ser Gln His Leu Asp Phe 195 200 205 att tca att atg aca tac gat ttt cac ggt gct tgg cgg ggt act aca 671 Ile Ser Ile Met Thr Tyr Asp Phe His Gly Ala Trp Arg Gly Thr Thr 210 215 220 gga cat cac agt cca tta ttt cgt gga caa gaa gat gct tca cct gat 719 Gly His His Ser Pro Leu Phe Arg Gly Gln Glu Asp Ala Ser Pro Asp 225 230 235 cgg ttt tct aat act gat tat gca gtt ggt tac atg ctt cgg tta gga 767 Arg Phe Ser Asn Thr Asp Tyr Ala Val Gly Tyr Met Leu Arg Leu Gly 240 245 250 255 gct cca gca tct aaa ctt gta atg ggt att cct act ttt gga cga tca 815 Ala Pro Ala Ser Lys Leu Val Met Gly Ile Pro Thr Phe Gly Arg Ser 260 265 270 ttt aca tta gct tct agt gaa act ggt gtt gga gca cca att tca ggt 863 Phe Thr Leu Ala Ser Ser Glu Thr Gly Val Gly Ala Pro Ile Ser Gly 275 280 285 cca gga att cct ggt cgt ttt act aag gaa gct gga aca ctt gca tac 911 Pro Gly Ile Pro Gly Arg Phe Thr Lys Glu Ala Gly Thr Leu Ala Tyr 290 295 300 tac gaa att tgt gat ttt ctt cgg ggt gct act gtt cat cga aca ctt 959 Tyr Glu Ile Cys Asp Phe Leu Arg Gly Ala Thr Val His Arg Thr Leu 305 310 315 gga caa caa gta cct tat gca act aaa ggt aat caa tgg gtt gga tac 1007 Gly Gln Gln Val Pro Tyr Ala Thr Lys Gly Asn Gln Trp Val Gly Tyr 320 325 330 335 gat gat caa gaa agt gtt aag tca aag gta caa tac ctt aag gat cga 1055 Asp Asp Gln Glu Ser Val Lys Ser Lys Val Gln Tyr Leu Lys Asp Arg 340 345 350 caa tta gct ggt gca atg gta tgg gct ctt gat ctt gat gat ttt caa 1103 Gln Leu Ala Gly Ala Met Val Trp Ala Leu Asp Leu Asp Asp Phe Gln 355 360 365 ggt agt ttt tgt gga caa gat ctt cgt ttt cca ctt act aat gct att 1151 Gly Ser Phe Cys Gly Gln Asp Leu Arg Phe Pro Leu Thr Asn Ala Ile 370 375 380 aag gat gca tta gct gca aca taa ctcgag 1181 Lys Asp Ala Leu Ala Ala Thr 385 390 <210> 17 <211> 390 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 17 Met Ala Lys Phe Trp Lys Lys Ala Leu Leu Thr Ile Ala Ala Leu Thr 1 5 10 15 Val Gly Thr Ser Ala Gly Ile Thr Ser Val Ser Ala Tyr Lys Leu Val 20 25 30 Cys Tyr Tyr Thr Ser Trp Ser Gln Tyr Arg Glu Gly Asp Gly Ser Cys 35 40 45 Phe Pro Asp Ala Leu Asp Arg Phe Leu Cys Thr His Ile Ile Tyr Ser 50 55 60 Phe Ala Asn Ile Ser Asn Asp His Ile Asp Thr Trp Glu Trp Asn Asp 65 70 75 80 Val Thr Leu Tyr Gly Met Leu Asn Thr Leu Lys Asn Arg Asn Pro Asn 85 90 95 Leu Lys Thr Leu Leu Ser Val Gly Gly Trp Asn Phe Gly Ser Gln Arg 100 105 110 Phe Ser Lys Ile Ala Ser Asn Thr Gln Ser Arg Arg Thr Phe Ile Lys 115 120 125 Ser Val Pro Pro Phe Leu Arg Thr His Gly Phe Asp Gly Leu Asp Leu 130 135 140 Ala Trp Leu Tyr Pro Gly Arg Arg Asp Lys Gln His Phe Thr Thr Leu 145 150 155 160 Ile Lys Glu Met Lys Ala Glu Phe Ile Lys Glu Ala Gln Pro Gly Lys 165 170 175 Lys Gln Leu Leu Leu Ser Ala Ala Leu Ser Ala Gly Lys Val Thr Ile 180 185 190 Asp Ser Ser Tyr Asp Ile Ala Lys Ile Ser Gln His Leu Asp Phe Ile 195 200 205 Ser Ile Met Thr Tyr Asp Phe His Gly Ala Trp Arg Gly Thr Thr Gly 210 215 220 His His Ser Pro Leu Phe Arg Gly Gln Glu Asp Ala Ser Pro Asp Arg 225 230 235 240 Phe Ser Asn Thr Asp Tyr Ala Val Gly Tyr Met Leu Arg Leu Gly Ala 245 250 255 Pro Ala Ser Lys Leu Val Met Gly Ile Pro Thr Phe Gly Arg Ser Phe 260 265 270 Thr Leu Ala Ser Ser Glu Thr Gly Val Gly Ala Pro Ile Ser Gly Pro 275 280 285 Gly Ile Pro Gly Arg Phe Thr Lys Glu Ala Gly Thr Leu Ala Tyr Tyr 290 295 300 Glu Ile Cys Asp Phe Leu Arg Gly Ala Thr Val His Arg Thr Leu Gly 305 310 315 320 Gln Gln Val Pro Tyr Ala Thr Lys Gly Asn Gln Trp Val Gly Tyr Asp 325 330 335 Asp Gln Glu Ser Val Lys Ser Lys Val Gln Tyr Leu Lys Asp Arg Gln 340 345 350 Leu Ala Gly Ala Met Val Trp Ala Leu Asp Leu Asp Asp Phe Gln Gly 355 360 365 Ser Phe Cys Gly Gln Asp Leu Arg Phe Pro Leu Thr Asn Ala Ile Lys 370 375 380 Asp Ala Leu Ala Ala Thr 385 390 <210> 18 <211> 383 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 18 Met Gly Val Lys Ala Ser Gln Thr Gly Phe Val Val Leu Val Leu Leu 1 5 10 15 Gln Cys Cys Ser Ala Tyr Lys Leu Val Cys Tyr Tyr Thr Ser Trp Ser 20 25 30 Gln Tyr Arg Glu Gly Asp Gly Ser Cys Phe Pro Asp Ala Leu Asp Arg 35 40 45 Phe Leu Cys Thr His Ile Ile Tyr Ser Phe Ala Asn Ile Ser Asn Asp 50 55 60 His Ile Asp Thr Trp Glu Trp Asn Asp Val Thr Leu Tyr Gly Met Leu 65 70 75 80 Asn Thr Leu Lys Asn Arg Asn Pro Asn Leu Lys Thr Leu Leu Ser Val 85 90 95 Gly Gly Trp Asn Phe Gly Ser Gln Arg Phe Ser Lys Ile Ala Ser Asn 100 105 110 Thr Gln Ser Arg Arg Thr Phe Ile Lys Ser Val Pro Pro Phe Leu Arg 115 120 125 Thr His Gly Phe Asp Gly Leu Asp Leu Ala Trp Leu Tyr Pro Gly Arg 130 135 140 Arg Asp Lys Gln His Phe Thr Thr Leu Ile Lys Glu Met Lys Ala Glu 145 150 155 160 Phe Ile Lys Glu Ala Gln Pro Gly Lys Lys Gln Leu Leu Leu Ser Ala 165 170 175 Ala Leu Ser Ala Gly Lys Val Thr Ile Asp Ser Ser Tyr Asp Ile Ala 180 185 190 Lys Ile Ser Gln His Leu Asp Phe Ile Ser Ile Met Thr Tyr Asp Phe 195 200 205 His Gly Ala Trp Arg Gly Thr Thr Gly His His Ser Pro Leu Phe Arg 210 215 220 Gly Gln Glu Asp Ala Ser Pro Asp Arg Phe Ser Asn Thr Asp Tyr Ala 225 230 235 240 Val Gly Tyr Met Leu Arg Leu Gly Ala Pro Ala Ser Lys Leu Val Met 245 250 255 Gly Ile Pro Thr Phe Gly Arg Ser Phe Thr Leu Ala Ser Ser Glu Thr 260 265 270 Gly Val Gly Ala Pro Ile Ser Gly Pro Gly Ile Pro Gly Arg Phe Thr 275 280 285 Lys Glu Ala Gly Thr Leu Ala Tyr Tyr Glu Ile Cys Asp Phe Leu Arg 290 295 300 Gly Ala Thr Val His Arg Thr Leu Gly Gln Gln Val Pro Tyr Ala Thr 305 310 315 320 Lys Gly Asn Gln Trp Val Gly Tyr Asp Asp Gln Glu Ser Val Lys Ser 325 330 335 Lys Val Gln Tyr Leu Lys Asp Arg Gln Leu Ala Gly Ala Met Val Trp 340 345 350 Ala Leu Asp Leu Asp Asp Phe Gln Gly Ser Phe Cys Gly Gln Asp Leu 355 360 365 Arg Phe Pro Leu Thr Asn Ala Ile Lys Asp Ala Leu Ala Ala Thr 370 375 380 <210> 19 <211> 20 <212> PRT <213> Lactobacillus <400> 19 Met Ala Gly Asn Ser Ser Asn Phe Ile His Lys Ile Ile Lys Gln Ile 1 5 10 15 Phe Thr His Arg 20 <210> 20 <211> 7673 <212> DNA <213> artificial <220> <223> Recombinant plasmid <220> <221> CDS <222> (5853)..(7658) <400> 20 gaattcggta ccccgggttc gaaggcgcca agcttcaaat tacagcacgt gttgctttga 60 ttgatagcca aaaagcagca gttgataaag caattactga tattgctgaa aaattgtaat 120 ttataaataa aaatcacctt ttagaggtgg tttttttatt tataaattat tcgtttgatt 180 tcgctttcga tagaacaatc aaagcgagaa taaggaagat aaatcccata agggcgggag 240 cagaatgtcc gagactaatt catgagatcg attttttatt aaaacgtctc aaaatcgttt 300 ctgagacgtt ttagcgttta tttcgtttag ttatcggcat aatcgttaaa acaggcgtta 360 tcgtagcgta aaagcccttg agcgtagcgt gctttgcagc gaagatgttg tctgttagat 420 tatgaaagcc gatgactgaa tgaaataata agcgcagcgt ccttctattt cggttggagg 480 aggctcaagg gagtttgagg gaatgaaatt ccctcatggg tttgatttta aaaattgctt 540 gcaattttgc cgagcggtag cgctggaaaa atttttgaaa aaaatttgga atttggaaaa 600 aaatgggggg aaaggaagcg aattttgctt ccgtactacg accccccatt aagtgccgag 660 tgccaatttt tgtgccaaaa acgctctatc ccaactggct caagggtttg aggggttttt 720 caatcgccaa cgaatcgcca acgttttcgc caacgttttt tataaatcta tatttaagta 780 gctttattgt tgtttttatg attacaaagt gatacactaa ttttataaaa ttatttgatt 840 ggagtttttt aaatggtgat ttcagaatcg aaaaaaagag ttatgatttc tctgacaaaa 900 gagcaagata aaaaattaac agatatggcg aaacaaaaag gtttttcaaa atctgcggtt 960 gcggcgttag ctatagaaga atatgcaaga aaggaatcag aataaaaaaa ataagcgaaa 1020 gctcgcgttt ttagaaggat acgagttttc gctacttgtt tttgataagg taatatatca 1080 tggctattaa atactaaagc tagaaatttt ggatttttat tatatcctga ctcaattcct 1140 aatgattgga aagaaaaatt agagagtttg ggcgtatcta tggctgtcag tcctttacac 1200 gatatggacg aaaaaaaaga taaagataca tggaatagta gtgatgttat acgaaatgga 1260 aagcactata aaaaaccaca ctatcacgtt atatatattg cacgaaatcc tgtaacaata 1320 gaaagcgtta ggaacaagat taagcgaaaa ttggggaata gttcagttgc tcatgttgag 1380 atacttgatt atatcaaagg ttcatatgaa tatttgactc atgaatcaaa ggacgctatt 1440 gctaagaata aacatatata cgacaaaaaa gatattttga acattaatga ttttgatatt 1500 gaccgctata taacacttga tgaaagccaa aaaagagaat tgaagaattt acttttagat 1560 atagtggatg actataattt ggtaaataca aaagatttaa tggcttttat tcgccttagg 1620 ggagcggagt ttggaatttt aaatacgaat gatgtaaaag atattgtttc aacaaactct 1680 agcgccttta gattatggtt tgagggcaat tatcagtgtg gatatagagc aagttatgca 1740 aaggttcttg atgctgaaac gggggaaata aaatgacaaa caaagaaaaa gagttatttg 1800 ctgaaaatga ggaattaaaa aaagaaatta aggacttaaa agagcgtatt gaaagataca 1860 gagaaatgga agttgaatta agtacaacaa tagatttatt gagaggaggg attattgaat 1920 aaataaaagc ccccctgacg aaagtcgaag ggggctttta ttttggtttg atgttgcgat 1980 taatagcaat acgattgcaa taaacaaaat gatcccctta gaagcaaact taagagtgtg 2040 ttgatagtgc attatcttaa aattttgtat aataggaatt gaagttaaat tagatgctaa 2100 aaataggaat tgaagttaaa ttagatgcta aaaatttgta attaagaagg agggattcgt 2160 catgttggta ttccaaatgc gtaatgtaga taaaacatct actgttttga aacagactaa 2220 aaacagtgat tacgcagata aataaatacg ttagattaat tcctaccagt gactaatctt 2280 atgacttttt aaacagataa ctaaaattac aaacaaatcg tttaacttca ggagagatta 2340 catgaacaaa aatataaata tctcaaactt tttaacgagt gaaaaagtac tcaaccaaat 2400 aataaaacaa ttgaatttaa aagaaaccga taccgtttac gaaattggaa caggtaaagg 2460 gcatttaacg acgaaactgg ctaaaataag taaacaggta acgtctattg aattagacag 2520 tcatctattc aacttatcgt cagaaaaatt aaaactgaat actcgtgtca ctttaattca 2580 ccaagatatt ctacagtttc aattccctaa caaacagagg tataaaattg ttgggaatat 2640 tccttacaat ttaagcacac aaattattaa aaaagtggtt tttgaaagcc gtgcgtctga 2700 catctatctg actgttgaag aaggattcta caagcgtacc ttggatattc accgaacact 2760 agggttgctc ttgcacactc aagtctcgat tcagcaattg cttaagctgc cagcggaatg 2820 ctttcatcct aaaccaaaag taaacagtgt cttaataaaa cttacccgcc ataccacaga 2880 tgttccagat aaatattgga agctatataa gtactttgtt tcaaaatggg tcaatcgaga 2940 atatcgtcaa ctgtttacta aaaatcagtt tcgtcaagca atgaaacacg ccaaagtaaa 3000 caatttaagt accattactt atgagcaagt attgtctatt tttaatagtt atctattatt 3060 taacgggagg aaataattct atgagtcgct tttttaaatt tggaaagtta cacgttacta 3120 aagggaatgg agaccggggt cgacccttca atagagttct taacgttaat ccgaaaaaaa 3180 ctaacgttaa tattaaaaaa taagatccgc ttgtgaatta tgtataattt gattagacta 3240 aagaatagga gaaagtatga tgatatttaa aaaactttct cgttaagata ggttgttggt 3300 gagcatgtta tatacggatg tatcggtttc cttaatgcaa aattttgttg ctatcttatt 3360 aatttttcta ttatatagat atattcaaag aaagataaca tttaaacgga tcatattaga 3420 tattttaata gcgattattt tttcaatatt atatctgttt atttcagatg cgtcattact 3480 tgtaatggta ttaatgcgat tagggtggca ttttcatcaa caaaaagaaa ataagataaa 3540 aacgactgat acagctaatt taattctaat tatcgtgatc cagttattgt tagttgcggt 3600 tgggactatt attagtcagt ttaccatatc gattatcaaa agtgatttca gccaaaatat 3660 attgaacaat agtgcaacag atataacttt attaggtatt ttctttgctg ttttatttga 3720 cggcttgttc tttatattat tgaagaataa gcggactgaa ttacaacatt taaatcaaga 3780 aatcattgaa ttttcgttag aaaaacaata ttttatattt atatttattt tatttatagt 3840 aatagaaatt attttagcag ttgggaatct tcaaggagta acagccacga tattattaac 3900 cattatcatt attttttgtg tccttatcgg gatgactttt tggcaagtga tgcttttttt 3960 gaaggcttat tcgattcgcc aagaagccaa tgaccaattg gtccggaatc aacaacttca 4020 agattatcta gtcaatatcg aacagcagta caccgaatta cggcgattta agcatgatta 4080 tcaaaacatc ttattatcgt tggagagttt tgccgaaaag ggcgatcagc aacagtttaa 4140 ggcgtattac caagaattat tagcacaacg gccaattcaa agtgaaatcc aaggggcagt 4200 cattgcacaa ctcgactact tgaaaaatga tcctattcga ggattagtca ttcaaaagtt 4260 tttggcagcc aaacaggctg gtgttacttt aaaattcgaa atgaccgaac caatcgaatt 4320 agcaaccgct aatctattaa cggttattcg gattatcggt attttattag acaatgcgat 4380 tgaacaagcc gttcaagaaa ccgatcaatt ggtgagttgt gctttcttac aatctgatgg 4440 tttaatcgaa attacgattg aaaatacggc cagtcaagtt aagaatctcc aagcattttc 4500 agagttaggc tattcaacga aaggcgctgg tcgggggact ggtttagcta atgtgcagga 4560 tttgattgcc aaacaaacca atttattctt agaaacacag attgaaaata gaaagttacg 4620 acagacattg atgattacgg aggaaactta atttgtatcc cgtttattta ttagaggatg 4680 atttacagca acaagcgatt tatcagcaaa ttatcgcgaa tacgattatg attaacgaat 4740 ttgcaatgac tttaacatgc gctgccagtg atactgagac attgttggcg gcaattaagg 4800 atcagcaacg aggtttattc tttttggata tggaaattga ggataaccgc caagccggtt 4860 tagaagtggc aactaagatt cggcagatga tgccgtttgc gcaaattgtc ttcattacaa 4920 cccacgagga actgacatta ttaacgttag aacgaaaaat agcgccttta gattacattc 4980 tcaaggacca aacaatggct gaaatcaaaa ggcaattgat tgatgatcta ttgttagctg 5040 agaagcaaaa cgaggcggca gcgtatcacc gagaaaattt atttagttat aaaataggtc 5100 ctcgcttttt ctcattacca ttaaaggaag ttgtttattt atatactgaa aaagaaaatc 5160 cgggtcatat taatttgtta gccgttacca gaaaggttac ttttccagga aatttaaatg 5220 cgctggaagc ccaatatcca atgctctttc ggtgtgataa aagttactta gttaacctat 5280 ctaatattgc caattatgac agtaaaacac ggagtttaaa atttgtagat ggcagtgagg 5340 caaaagtctc gttccggaaa tcacgggaac tagtggccaa attaaaacaa atgatgtagc 5400 gcctgcaggc acgccaaatg atcccagtaa aaagccaccc gcatggcggg tggcttttta 5460 ttagccctag aagggcttcc cacacgcatt tcagcgcctt agtgccttag tttgtgaatc 5520 ataggtggta tagtcccgaa atacccgtct aaggaattgt cagataggcc taatgactgg 5580 cttttataat atgagataat gccgactgta ctttttacag tcggttttct aatgtcacta 5640 acctgccccg ttagttgaag aaggttttta tattacagct ccagatctac cggtttaatt 5700 tgaaaattga tattagcgtt taacagttaa attaatacgt taataatttt tttgtcttta 5760 aatagggatt tgaagcataa tggtgttata gcgtacttag ctggccagca tatatgtatt 5820 ctataaaata ctattacaag gagattttag cc atg gta cgt cct gta gaa acc 5873 Met Val Arg Pro Val Glu Thr 1 5 cca acc cgt gaa atc aaa aaa ctc gac ggc ctg tgg gca ttc agt ctg 5921 Pro Thr Arg Glu Ile Lys Lys Leu Asp Gly Leu Trp Ala Phe Ser Leu 10 15 20 gat cgc gaa aac tgt gga att gat cag cgt tgg tgg gaa agc gcg tta 5969 Asp Arg Glu Asn Cys Gly Ile Asp Gln Arg Trp Trp Glu Ser Ala Leu 25 30 35 caa gaa agc cgg gca att gct gtg cca ggc agt ttt aac gat cag ttc 6017 Gln Glu Ser Arg Ala Ile Ala Val Pro Gly Ser Phe Asn Asp Gln Phe 40 45 50 55 gcc gat gca gat att cgt aat tat gcg ggc aac gtc tgg tat cag cgc 6065 Ala Asp Ala Asp Ile Arg Asn Tyr Ala Gly Asn Val Trp Tyr Gln Arg 60 65 70 gaa gtc ttt ata ccg aaa ggt tgg gca ggc cag cgt atc gtg ctg cgt 6113 Glu Val Phe Ile Pro Lys Gly Trp Ala Gly Gln Arg Ile Val Leu Arg 75 80 85 ttc gat gcg gtc act cat tac ggc aaa gtg tgg gtc aat aat cag gaa 6161 Phe Asp Ala Val Thr His Tyr Gly Lys Val Trp Val Asn Asn Gln Glu 90 95 100 gtg atg gag cat cag ggc ggc tat acg cca ttt gaa gcc gat gtc acg 6209 Val Met Glu His Gln Gly Gly Tyr Thr Pro Phe Glu Ala Asp Val Thr 105 110 115 ccg tat gtt att gcc ggg aaa agt gta cgt atc acc gtt tgt gtg aac 6257 Pro Tyr Val Ile Ala Gly Lys Ser Val Arg Ile Thr Val Cys Val Asn 120 125 130 135 aac gaa ctg aac tgg cag act atc ccg ccg gga atg gtg att acc gac 6305 Asn Glu Leu Asn Trp Gln Thr Ile Pro Pro Gly Met Val Ile Thr Asp 140 145 150 gaa aac ggc aag aaa aag cag tct tac ttc cat gat ttc ttt aac tat 6353 Glu Asn Gly Lys Lys Lys Gln Ser Tyr Phe His Asp Phe Phe Asn Tyr 155 160 165 gcc gga atc cat cgc agc gta atg ctc tac acc acg ccg aac acc tgg 6401 Ala Gly Ile His Arg Ser Val Met Leu Tyr Thr Thr Pro Asn Thr Trp 170 175 180 gtg gac gat atc acc gtg gtg acg cat gtc gcg caa gac tgt aac cac 6449 Val Asp Asp Ile Thr Val Val Thr His Val Ala Gln Asp Cys Asn His 185 190 195 gcg tct gtt gac tgg cag gtg gtg gcc aat ggt gat gtc agc gtt gaa 6497 Ala Ser Val Asp Trp Gln Val Val Ala Asn Gly Asp Val Ser Val Glu 200 205 210 215 ctg cgt gat gcg gat caa cag gtg gtt gca act gga caa ggc act agc 6545 Leu Arg Asp Ala Asp Gln Gln Val Val Ala Thr Gly Gln Gly Thr Ser 220 225 230 ggg act ttg caa gtg gtg aat ccg cac ctc tgg caa ccg ggt gaa ggt 6593 Gly Thr Leu Gln Val Val Asn Pro His Leu Trp Gln Pro Gly Glu Gly 235 240 245 tat ctc tat gaa ctg tgc gtc aca gcc aaa agc cag aca gag tgt gat 6641 Tyr Leu Tyr Glu Leu Cys Val Thr Ala Lys Ser Gln Thr Glu Cys Asp 250 255 260 atc tac ccg ctt cgc gtc ggc atc cgg tca gtg gca gtg aag ggc gaa 6689 Ile Tyr Pro Leu Arg Val Gly Ile Arg Ser Val Ala Val Lys Gly Glu 265 270 275 cag ttc ctg att aac cac aaa ccg ttc tac ttt act ggc ttt ggt cgt 6737 Gln Phe Leu Ile Asn His Lys Pro Phe Tyr Phe Thr Gly Phe Gly Arg 280 285 290 295 cat gaa gat gcg gac ttg cgt ggc aaa gga ttc gat aac gtg ctg atg 6785 His Glu Asp Ala Asp Leu Arg Gly Lys Gly Phe Asp Asn Val Leu Met 300 305 310 gtg cac gac cac gca tta atg gac tgg att ggg gcc aac tcc tac cgt 6833 Val His Asp His Ala Leu Met Asp Trp Ile Gly Ala Asn Ser Tyr Arg 315 320 325 acc tcg cat tac cct tac gct gaa gag atg ctc gac tgg gca gat gaa 6881 Thr Ser His Tyr Pro Tyr Ala Glu Glu Met Leu Asp Trp Ala Asp Glu 330 335 340 cat ggc atc gtg gtg att gat gaa act gct gct gtc ggc ttt aac ctc 6929 His Gly Ile Val Val Ile Asp Glu Thr Ala Ala Val Gly Phe Asn Leu 345 350 355 tct tta ggc att ggt ttc gaa gcg ggc aac aag ccg aaa gaa ctg tac 6977 Ser Leu Gly Ile Gly Phe Glu Ala Gly Asn Lys Pro Lys Glu Leu Tyr 360 365 370 375 agc gaa gag gca gtc aac ggg gaa act cag caa gcg cac tta cag gcg 7025 Ser Glu Glu Ala Val Asn Gly Glu Thr Gln Gln Ala His Leu Gln Ala 380 385 390 att aaa gag ctg ata gcg cgt gac aaa aac cac cca agc gtg gtg atg 7073 Ile Lys Glu Leu Ile Ala Arg Asp Lys Asn His Pro Ser Val Val Met 395 400 405 tgg agt att gcc aac gaa ccg 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Gln Pro Gly Glu Gly Tyr Leu Tyr Glu Leu Cys Val Thr Ala 245 250 255 Lys Ser Gln Thr Glu Cys Asp Ile Tyr Pro Leu Arg Val Gly Ile Arg 260 265 270 Ser Val Ala Val Lys Gly Glu Gln Phe Leu Ile Asn His Lys Pro Phe 275 280 285 Tyr Phe Thr Gly Phe Gly Arg His Glu Asp Ala Asp Leu Arg Gly Lys 290 295 300 Gly Phe Asp Asn Val Leu Met Val His Asp His Ala Leu Met Asp Trp 305 310 315 320 Ile Gly Ala Asn Ser Tyr Arg Thr Ser His Tyr Pro Tyr Ala Glu Glu 325 330 335 Met Leu Asp Trp Ala Asp Glu His Gly Ile Val Val Ile Asp Glu Thr 340 345 350 Ala Ala Val Gly Phe Asn Leu Ser Leu Gly Ile Gly Phe Glu Ala Gly 355 360 365 Asn Lys Pro Lys Glu Leu Tyr Ser Glu Glu Ala Val Asn Gly Glu Thr 370 375 380 Gln Gln Ala His Leu Gln Ala Ile Lys Glu Leu Ile Ala Arg Asp Lys 385 390 395 400 Asn His Pro Ser Val Val Met Trp Ser Ile Ala Asn Glu Pro Asp Thr 405 410 415 Arg Pro Gln Gly Ala Arg Glu Tyr Phe Ala Pro Leu Ala Glu Ala Thr 420 425 430 Arg Lys Leu Asp Pro Thr Arg Pro Ile Thr Cys Val Asn Val Met Phe 435 440 445 Cys Asp Ala His Thr Asp Thr Ile Ser Asp Leu Phe Asp Val Leu Cys 450 455 460 Leu Asn Arg Tyr Tyr Gly Trp Tyr Val Gln Ser Gly Asp Leu Glu Thr 465 470 475 480 Ala Glu Lys Val Leu Glu Lys Glu Leu Leu Ala Trp Gln Glu Lys Leu 485 490 495 His Gln Pro Ile Ile Ile Thr Glu Tyr Gly Val Asp Thr Leu Ala Gly 500 505 510 Leu His Ser Met Tyr Thr Asp Met Trp Ser Glu Glu Tyr Gln Cys Ala 515 520 525 Trp Leu Asp Met Tyr His Arg Val Phe Asp Arg Val Ser Ala Val Val 530 535 540 Gly Glu Gln Val Trp Asn Phe Ala Asp Phe Ala Thr Ser Gln Gly Ile 545 550 555 560 Leu Arg Val Gly Gly Asn Lys Lys Gly Ile Phe Thr Arg Asp Arg Lys 565 570 575 Pro Lys Ser Ala Ala Phe Leu Leu Gln Lys Arg Trp Thr Gly Met Asn 580 585 590 Phe Gly Glu Lys Pro Gln Gly Gly Lys Gln 595 600 <210> 22 <211> 22 <212> DNA <213> artificial <220> <223> PCR primer <400> 22 gcagccttaa cagtcggcac ct 22 <210> 23 <211> 23 <212> DNA <213> artificial <220> <223> PCR primer <400> 23 acgtgcaaca atctgcaaag cac 23 <210> 24 <211> 2999 <212> DNA <213> artificial <220> <223> 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gttgccagcc atctgttgtt tgcccctccc ccgtgccttc cttgaccctg gaaggtgcca 900 ctcccactgt cctttcctaa taaaatgagg aaattgcatc gcattgtctg agtaggtgtc 960 attctattct ggggggtggg gtggggcagg acagcaaggg ggaggattgg gaagacaata 1020 gcaggcatgc tggggatgcg gtgggctcta tggcttctac tgggcggttt tatggacagc 1080 aagcgaaccg gaattgccag ctggggcgcc ctctggtaag gttgggaagc cctgcaaagt 1140 aaactggatg gctttctcgc cgccaaggat ctgatggcgc aggggatcaa gctctgatca 1200 agagacagga tgaggatcgt ttcgcatgat tgaacaagat ggattgcacg caggttctcc 1260 ggccgcttgg gtggagaggc tattcggcta tgactgggca caacagacaa tcggctgctc 1320 tgatgccgcc gtgttccggc tgtcagcgca ggggcgcccg gttctttttg tcaagaccga 1380 cctgtccggt gccctgaatg aactgcaaga cgaggcagcg cggctatcgt ggctggccac 1440 gacgggcgtt ccttgcgcag ctgtgctcga cgttgtcact gaagcgggaa gggactggct 1500 gctattgggc gaagtgccgg ggcaggatct cctgtcatct caccttgctc ctgccgagaa 1560 agtatccatc atggctgatg caatgcggcg gctgcatacg cttgatccgg ctacctgccc 1620 attcgaccac caagcgaaac atcgcatcga gcgagcacgt actcggatgg aagccggtct 1680 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cacttcaaga actctgtagc accgcctaca tacctcgctc tgctaatcct gttaccagtg 2580 gctgctgcca gtggcgataa gtcgtgtctt accgggttgg actcaagacg atagttaccg 2640 gataaggcgc agcggtcggg ctgaacgggg ggttcgtgca cacagcccag cttggagcga 2700 acgacctaca ccgaactgag atacctacag cgtgagctat gagaaagcgc cacgcttccc 2760 gaagggagaa aggcggacag gtatccggta agcggcaggg tcggaacagg agagcgcacg 2820 agggagcttc cagggggaaa cgcctggtat ctttatagtc ctgtcgggtt tcgccacctc 2880 tgacttgagc gtcgattttt gtgatgctcg tcaggggggc ggagcctatg gaaaaacgcc 2940 agcaacgcgg cctttttacg gttcctgggc ttttgctggc cttttgctca catgttctt 2999 <210> 25 <211> 347 <212> DNA <213> artificial <220> <223> insert <400> 25 gctagcatgg acgccaaggt cgtcgccgtg ctggccctgg tgctggccgc gctctgcatc 60 agtgacggta aaccagtcag cctgagctac cgatgcccct gccggttctt cgagagccac 120 atcgccagag ccaacgtcaa gcatctgaaa atcctcaaca ctccaaactg tgcccttcag 180 attgttgcac ggctgaagaa caacaacaga caagtgtgca ttgacccgaa attaaagtgg 240 atccaagagt acctggagaa agccttaaac aagggatcag gtgccacgaa cttctctctg 300 ttaaagcaag caggagacgt ggaagaaaac cccggtccca aaagctt 347 <210> 26 <211> 5395 <212> DNA <213> artificial <220> <223> vector <400> 26 gactcttcgc gatgtacggg ccagatatac gcgttgacat tgattattga ctagttatta 60 atagtaatca attacggggt cattagttca tagcccatat atggagttcc gcgttacata 120 acttacggta aatggcccgc ctggctgacc gcccaacgac ccccgcccat tgacgtcaat 180 aatgacgtat gttcccatag taacgccaat agggactttc cattgacgtc aatgggtgga 240 ctatttacgg taaactgccc acttggcagt acatcaagtg tatcatatgc caagtacgcc 300 ccctattgac gtcaatgacg gtaaatggcc cgcctggcat tatgcccagt acatgacctt 360 atgggacttt cctacttggc agtacatcta cgtattagtc atcgctatta ccatggtgat 420 gcggttttgg cagtacatca atgggcgtgg atagcggttt gactcacggg gatttccaag 480 tctccacccc attgacgtca atgggagttt gttttggcac caaaatcaac gggactttcc 540 aaaatgtcgt aacaactccg ccccattgac gcaaatgggc ggtaggcgtg tacggtggga 600 ggtctatata agcagagctc tctggctaac tagagaaccc actgcttact ggcttatcga 660 aattaatacg actcactata gggagaccca agctggctag cgtttaaact taagcttcgc 720 caccatggag agcgacgaga gcggcctgcc cgccatggag atcgagtgcc gcatcaccgg 780 caccctgaac ggcgtggagt tcgagctggt gggcggcgga gagggcaccc ccaagcaggg 840 ccgcatgacc aacaagatga agagcaccaa aggcgccctg accttcagcc cctacctgct 900 gagccacgtg atgggctacg gcttctacca cttcggcacc taccccagcg gctacgagaa 960 ccccttcctg cacgccatca acaacggcgg ctacaccaac acccgcatcg agaagtacga 1020 ggacggcggc gtgctgcacg tgagcttcag ctaccgctgc gaggccggcc gcgtgatcgg 1080 cgacttcaag gtggtgggca ccggcttccc cgaggacagc gtgatcttca ccgacaagat 1140 catccgcagc aacgccaccg tggagcacct gcaccccatg ggcgataacg tgctggtggg 1200 cagcttcgcc cgcaccttca gcctgcgcga cggcggctac cacagcttcg tggtggacaa 1260 ccacatgcac ttcaagagcg ccatccaccc cagcatcctg cagaacgggg gccccatgtt 1320 cgccttccgc cgcgtggagg agctgcacag caacaccgag ctgggcatcg tggagtacca 1380 gcacgccttc aagaccccca tcgccttcgc cagatcccgc gctcagtcgt ccaattctgc 1440 cgtggacggc accgccggac ccggctccac cggatctcgc gagggcagag gaagtcttct 1500 aacatgcggt gacgtggagg agaatcccgg ccctatggaa gatgccaaaa acattaagaa 1560 gggcccagcg ccattctacc cactcgaaga cgggaccgcc ggcgagcagc tgcacaaagc 1620 catgaagcgc tacgccctgg tgcccggcac catcgccttt accgacgcac atatcgaggt 1680 ggacattacc tacgccgagt acttcgagat gagcgttcgg ctggcagaag ctatgaagcg 1740 ctatgggctg aatacaaacc atcggatcgt ggtgtgcagc gagaatagct tgcagttctt 1800 catgcccgtg ttgggtgccc tgttcatcgg tgtggctgtg gccccagcta acgacatcta 1860 caacgagcgc gagctgctga acagcatggg catcagccag cccaccgtcg tattcgtgag 1920 caagaaaggg ctgcaaaaga tcctcaacgt gcaaaagaag ctaccgatca tacaaaagat 1980 catcatcatg gatagcaaga ccgactacca gggcttccaa agcatgtaca ccttcgtgac 2040 ttcccatttg ccacccggct tcaacgagta cgacttcgtg cccgagagct tcgaccggga 2100 caaaaccatc gccctgatca tgaacagtag tggcagtacc ggattgccca agggcgtagc 2160 cctaccgcac cgcaccgctt gtgtccgatt cagtcatgcc cgcgacccca tcttcggcaa 2220 ccagatcatc cccgacaccg ctatcctcag cgtggtgcca tttcaccacg gcttcggcat 2280 gttcaccacg ctgggctact tgatctgcgg ctttcgggtc gtgctcatgt accgcttcga 2340 ggaggagcta ttcttgcgca gcttgcaaga ctataagatt caatctgccc tgctggtgcc 2400 cacactattt agcttcttcg ctaagagcac tctcatcgac 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cagccgaact gttcgccagg 4140 ctcaaggcga gcatgcccga cggcgaggat ctcgtcgtga cccatggcga tgcctgcttg 4200 ccgaatatca tggtggaaaa tggccgcttt tctggattca tcgactgtgg ccggctgggt 4260 gtggcggacc gctatcagga catagcgttg gctacccgtg atattgctga agagcttggc 4320 ggcgaatggg ctgaccgctt cctcgtgctt tacggtatcg ccgctcccga ttcgcagcgc 4380 atcgccttct atcgccttct tgacgagttc ttctgaatta ttaacgctta caatttcctg 4440 atgcggtatt ttctccttac gcatctgtgc ggtatttcac accgcataca ggtggcactt 4500 ttcggggaaa tgtgcgcgga acccctattt gtttattttt ctaaatacat tcaaatatgt 4560 atccgctcat gagacaataa ccctgataaa tgcttcaata atagcacgtg ctaaaacttc 4620 atttttaatt taaaaggatc taggtgaaga tcctttttga taatctcatg accaaaatcc 4680 cttaacgtga gttttcgttc cactgagcgt cagaccccgt agaaaagatc aaaggatctt 4740 cttgagatcc tttttttctg cgcgtaatct gctgcttgca aacaaaaaaa ccaccgctac 4800 cagcggtggt ttgtttgccg gatcaagagc taccaactct ttttccgaag gtaactggct 4860 tcagcagagc gcagatacca aatactgtcc ttctagtgta gccgtagtta ggccaccact 4920 tcaagaactc tgtagcaccg cctacatacc tcgctctgct 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Claims (26)

  1. 유산균에서 CXCL12, CXCL17 및 Ym1로 이루어진 군으로부터 선택된 단백질을 발현할 수 있는 플라스미드.
  2. 제1항에 있어서, 상기 플라스미드는 다음에서 선택한 단백질을 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 플라스미드:
    (i) SEQ ID NO: 3 또는 2에 기재된 아미노산 서열, 또는 상기 서열과 적어도 80%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 쥐(murine) CXCL12-1α;
    (ii) SEQ ID NO: 6 또는 5에 기재된 아미노산 서열, 또는 상기 서열과 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 인간 CXCL12-1α;
    (iii) SEQ ID NO: 9 또는 8에 기재된 아미노산 서열, 또는 상기 서열과 적어도 80%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 쥐(murine) CXCL17;
    (iv) SEQ ID NO: 12 또는 11에 기재된 아미노산 서열, 또는 상기 서열과 적어도 80%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 인간 CXCL17;
    (v) SEQ ID NO: 15 또는 14에 기재된 아미노산 서열, 또는 상기 서열과 적어도 80%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 쥐(murine) Ym1; 및
    (vi) SEQ ID NO: 18 또는 17, 또는 상기 서열과 적어도 80%의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열에 기재된 인간 Ym1.
  3. 제1항 또는 제2항에 있어서, 상기 플라스미드는 유산균에서 발현되는 하나 이상의 조절 서열을 포함하고, 상기 조절 서열은 유산균으로부터 수득되거나 유래된 것인 플라스미드.
  4. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 단백질의 발현은 조절가능한 것인 플라스미드.
  5. 제1항 내지 제4항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 플라스미드는 유도성 프로모터의 조절 하에 상기 하나 이상의 단백질을 코딩하는 하나 이상의 뉴클레오티드 서열을 포함하는 것인 플라스미드.
  6. 제1항 내지 제5항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 플라스미드는 유산균의 니신 레귤론(regulon), 사카신 A(sakacin A) 레귤론 또는 사카신 P(sakacin P) 레귤론 유래 조절 요소 및 유도성 프로모터를 포함하는 플라스미드.
  7. 제5항 또는 제6항에 있어서, 상기 유도성 프로모터는 사카신 P(sakacin P) 레귤론 유래 PorfX 프로모터인 플라스미드.
  8. 제1항에 있어서, pSIP411로 명명된 플라스미드로부터 유래된 것인 플라스미드.
  9. 제1항 내지 제8항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 단백질을 코딩하는 뉴클레오티드 서열은 유산균에서 발현하기 위해 코돈 최적화된 것인 재조합 플라스미드.
  10. 제1항 내지 제9항 중 어느 한 항에 있어서, SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 13, 및 SEQ ID NO: 16의 서열을 포함하는 뉴클레오티드 서열로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 뉴클레오티드 서열, 또는 상기 서열과 적어도 80%의 서열 동일성을 갖는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 플라스미드.
  11. 제1항 내지 제10항 중 어느 한 항에 따른 플라스미드로 형질전환된 유산균 균주.
  12. 제10항에 있어서, 락토바실러스(Lactobacillus) 균주인 것인 박테리아 균주.
  13. 제12항에 있어서, 락토바실러스 루테리(Lactobacillus reuteri)의 균주인 것인 박테리아 균주.
  14. 제11항 내지 제13항 중 어느 한 항에 따른 박테리아 균주를 포함하는 상처 드레싱(dressing).
  15. 제11항 내지 제13항 중 어느 한 항에 따른 박테리아 균주를 포함하는 약학적 조성물.
  16. 치료에 사용하기 위한 제1항 내지 제13항 중 어느 한 항에 따른 플라스미드 또는 박테리아 균주.
  17. 인간 또는 동물 개체에서 상처 치유에 사용하기 위한 제1항 내지 제13항 중 어느 한 항에 따른 플라스미드 또는 박테리아 균주.
  18. 인간 또는 동물 개체에서 피부 또는 점막 상처 치유에 사용하기 위한 제1항 내지 제13항, 제16항 또는 제17항 중 어느 한 항에 따른 플라스미드 또는 박테리아 균주.
  19. 다음을 포함하는 상처 치유용 키트:
    (i) 제1항 내지 제10항 중 어느 한 항에 정의된 본 발명의 t 플라스미드를 포함하는 유산균, 여기서, 상기 플라스미드는 유산균에서 상기 단백질을 발현할 수 있는 유도성 프로모터의 조절 하에 상기 단백질을 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함함; 및
    상기 프로모터를 위한 유도인자.
  20. 제19항에 있어서,
    (i) 제1항 내지 제10항 중 어느 한 항에 정의된 플라스미드를 포함하는 유산균, 여기에서, 상기 플라스미드는 유산균에서 상기 단백질을 발현할 수 있는 유도성 프로모터의 조절 하에 상기 단백질을 코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함함; 및
    (ii) 상기 프로모터를 위한 유도인자; 를 포함하고,
    상처 치유 시 개별적으로, 순차적으로 또는 동시에 사용하기 위한 복합 조제품으로서의 의약품인 키트.
  21. 제11항 내지 제13항 중 어느 한 항에 따른 박테리아 균주를 포함하는 의료장치.
  22. 제11항 내지 제13항, 제14항, 제15항, 제19항 또는 제20항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 박테리아는 동결건조된 것인 균주, 상처 드레싱, 약학적 조성물, 키트 또는 의료장치.
  23. 제22항에 있어서, 상기 키트는 동결건조된 박테리아를 재현탁하기 위한 액체를 추가로 포함하는 키트.
  24. 제23항에 있어서, 상기 액체는 상기 유도인자를 포함하는 키트.
  25. 제19항, 제20항, 또는 제22항 내지 제24항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 키트는 상기 박테리아를 포함하는 상처 드레싱을 포함하는 키트.
  26. 제19항, 제20항, 또는 제22항 내지 제24항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 키트는 상처 드레싱을 추가로 포함하는 키트.
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