JP7317029B2 - 修飾化合物及びその使用 - Google Patents
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Description
本出願は、電子書式の配列表と共に出願されている。配列表は、2019年2月8日に作成された368kbのサイズのCORE0148WOSEQ_ST25.txtという名称のファイルとして提供される。電子書式の配列表の情報は、その全体が参照によって本明細書に組み込まれる。
5’領域は、2~5つの連結修飾ヌクレオシドからなり、5’領域のヌクレオシドはそれぞれ、2’-修飾フラノシル糖部分を含み、
3’領域は、1~5つの連結修飾ヌクレオシドからなり、3’領域のヌクレオシドはそれぞれ、2’-修飾フラノシル糖部分を含み、
中央領域は、7~10個のヌクレオシドからなり、中央領域のヌクレオシドはそれぞれ、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分及び修飾糖部分から選択される糖部分を含み、
中央領域の最も3’側のヌクレオシド及び最も5’側のヌクレオシドはそれぞれ、2’-デオキシフラノシル糖部分または糖代替物から独立して選択される糖部分を含み、
中央領域は、
ホスホロチオエート以外の修飾ヌクレオシド間結合、及び/または5-メチルシトシン以外の修飾核酸塩基、及び/または修飾糖部分、を含む少なくとも1つの改変ヌクレオチドと、
非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分をそれぞれが含む少なくとも6つのヌクレオシドと、
を含む。
AUCG」(mCは、5位にメチル基を含むシトシン塩基を示す)など)が含まれる。
は、2つの環を含む修飾糖部分を意味し、第1の環における原子のうちの2つを連結する架橋を介して第2の環が形成され、それによって二環式構造が形成される。ある特定の実施形態では、二環式糖部分の第1の環は、フラノシル部分であり、二環式糖部分は、修飾フラノシル糖部分である。ある特定の実施形態では、二環式糖部分は、フラノシル部分を含まない。
icity)」は、オリゴマー化合物または親オリゴマー化合物を10μM以下で培養細胞に投与した後、同じ条件下で培養されるが、オリゴマー化合物または親オリゴマー化合物が投与されない細胞と比較してカスパーゼ活性化が少なくとも2倍増加することを意味する。ある特定の実施形態では、細胞毒性は、標準的なインビトロ細胞毒性アッセイを使用して測定される。
る発現または活性と比較したときの発現または活性の低減または遮断を指すが、必ずしも発現または活性の完全な除去は示さない。
によって示される複合基である。
ない標的RNAは、肝臓において発現し、治療においてオリゴマー化合物によって調節される。
結合修飾とも無関係に、核酸またはオリゴヌクレオチドにおける近接核酸塩基の順序を意味する。
の量、活性、及び/またはスプライシングを調節する。RNAi化合物という用語からは、RNaseHを介して作用するアンチセンスオリゴヌクレオチドは除外される。
たは複数の位置へと組み込むことができ、そのようなオリゴヌクレオチドは、相補的なオリゴマー化合物または核酸にハイブリダイゼーションする能力を有する。
デオキシキシロシル(α-L-XNA)、2’-β-L-デオキシキシロシル(β-L-XNA)。ある特定の実施形態では、DNA異性体は、2’-α-D-デオキシリボシル糖部分、2’-α-L-デオキシリボシル糖部分、2’-β-L-デオキシリボシル糖部分、または2’-β-D-デオキシキシロシル糖部分である。本明細書で使用される「DNA異性体」は、いずれの非フラノシル糖部分も含まない。
という式によって示される構造を含み、式中、Bxは、ヘテロ環式塩基部分であり、環は、5~7員を含み、ヒドロキシル、リン酸、ヌクレオシド間連結基、または複合リンカーに対して、環が2つの位置で付加される。
できる化合物量が増加する。ある特定の実施形態では、治療指数は、ALTの上昇に対する、修飾オリゴヌクレオチドが標的核酸を調節する量の比であり、ALTの上昇は、標準アッセイ(例えば、実施例12または実施例1に記載のアッセイ)によって測定される。ある特定の実施形態では、治療指数は、カスパーゼの上昇に対する、修飾オリゴヌクレオチドが標的核酸を調節する量の比であり、カスパーゼの上昇は、標準アッセイ(例えば、実施例13、実施例8、または実施例4に記載のアッセイ)によって測定される。
実施形態1
14~23個の連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドが、5’領域、中央領域、及び3’領域からなるギャップマーを含み、
前記5’領域が、2~5つの連結修飾ヌクレオシドからなり、前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、2’-修飾フラノシル糖部分を含み、
前記3’領域が、1~5つの連結修飾ヌクレオシドからなり、前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、2’-修飾フラノシル糖部分を含み、
前記中央領域が、7~10個のヌクレオシドからなり、前記中央領域のヌクレオシドがそれぞれ、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分及び修飾糖部分から選択される糖部分を含み、
前記中央領域の最も3’側のヌクレオシド及び最も5’側のヌクレオシドがそれぞれ、2’-デオキシフラノシル糖部分または糖代替物から独立して選択される糖部分を含み、
前記中央領域が、
ホスホロチオエート以外の少なくとも1つの修飾ヌクレオシド間結合、及び/または5-メチルシトシン以外の修飾核酸塩基及び/または修飾糖部分を含む少なくとも1つの修飾ヌクレオシドと、
非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分をそれぞれが含む少なくとも6つのヌクレオシドと、
を含む前記オリゴマー化合物。
前記5’領域が、2~4つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態1に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域が、2つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態1に記載のオリゴマー化
合物。
前記5’領域が、3つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態1に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域が、4つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態1に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域が、5つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態1に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、2’-修飾リボシル糖部分を含む、実施形態1~6のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の少なくとも1つのヌクレオシドが、二環式フラノシル糖部分を含む、実施形態1~7のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、二環式フラノシル糖部分を含む、実施形態1~8のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の少なくとも1つのヌクレオシドが、非二環式糖部分を含む、実施形態1~8のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の前記少なくとも1つのヌクレオシドの前記非二環式糖部分が、2’-置換リボシル糖部分である、実施形態10に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、非二環式糖部分を含む、実施形態1~7または実施形態10~11のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、2’-置換リボシル糖部分を含む、実施形態12に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、二環式糖部分及び非二環式糖部分、2’-置換リボシル糖部分から独立して選択される2’-修飾フラノシル糖部分を含む、実施形態1~7のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の二環式糖部分がそれぞれ、cEt、LNA、及びENAのうちから選択される、実施形態8~11または実施形態14のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の非二環式糖部分がそれぞれ、2’-MOE、2’-OMe、及び2’-NMAのうちから選択される2’-置換基を有する、実施形態10~14のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがいずれも、2’-F置換基を有する糖部分を含まない、実施形態1~16のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の核酸塩基がそれぞれ、チミン、ウラシル、グアニン、シトシン、5-メチルシトシン、及びアデニンのうちから独立して選択される、実施形態1~17のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシド間結合がそれぞれ、ホスホジエステルヌクレオシド間結合及びホスホロチオエートヌクレオシド間結合のうちから選択される、実施形態1~18のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域が、2~4つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態1~19のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域が、1つのヌクレオシドからなる、実施形態1~19のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域が、2つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態1~19のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域が、3つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態1~19のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域が、4つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態1~19のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域が、5つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態1~19のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、2’-修飾リボシル糖部分を含む、実施形態1~25のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の少なくとも1つのヌクレオシドが、二環式フラノシル糖部分を含む、実
施形態1~26のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、二環式フラノシル糖部分を含む、実施形態1~27のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の少なくとも1つのヌクレオシドが、非二環式糖部分を含む、実施形態1~27のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の前記少なくとも1つのヌクレオシドの前記非二環式糖部分が、2’-置換リボシル糖部分である、実施形態29に記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、非二環式糖部分を含む、実施形態1~26または実施形態29~30のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、2’-置換リボシル糖部分を含む、実施形態31に記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、二環式糖部分及び非二環式糖部分、2’-置換リボシル糖部分から独立して選択される2’-修飾フラノシル糖部分を含む、実施形態1~26のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の二環式糖部分がそれぞれ、cEt、LNA、及びENAのうちから選択される、実施形態27~30または実施形態33のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の非二環式糖部分がそれぞれ、2’-MOE、2’-OMe、及び2’-NMAのうちから選択される2’-置換基を有する、実施形態29~33のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがいずれも、2’-F置換基を有する糖部分を含まない、実施形態1~35のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の核酸塩基がそれぞれ、チミン、ウラシル、グアニン、シトシン、5-メチルシトシン、及びアデニンのうちから独立して選択される、実施形態1~36のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシド間結合がそれぞれ、ホスホジエステルヌクレオシド間結合及びホスホロチオエートヌクレオシド間結合のうちから選択される、実施形態1~37のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、7つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態1~38のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、8つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態1~38のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、9つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態1~38のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、10個の連結ヌクレオシドからなる、実施形態1~38のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域を前記5’領域及び3’領域に連結する2つのヌクレオシド間結合がそれぞれ、ホスホジエステルヌクレオシド間結合及びホスホロチオエートヌクレオシド間結合のうちから独立して選択される、実施形態1~42のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記ギャップマーからなる、実施形態1~43のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
複合基を含む、実施形態1~43のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記修飾オリゴヌクレオチドが、1~3つのリンカーヌクレオシドを含む、実施形態1~43または実施形態45のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記リンカーヌクレオシドが、前記ギャップマーの5’末端または3’末端に連結される、実施形態46に記載のオリゴマー化合物。
前記複合基が、GalNAcを含む、実施形態45~47のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
LICA-1を含む、実施形態45~47のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、修飾糖部分を1つのみ含む、実施形態1~49のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域内のヌクレオシド間結合がそれぞれ、ホスホジエステルヌクレオシド間結
合及びホスホロチオエートヌクレオシド間結合のうちから選択される、実施形態50に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の核酸塩基がそれぞれ、チミン、ウラシル、グアニン、シトシン、5-メチルシトシン、及びアデニンのうちから独立して選択される、実施形態50~51のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、ホスホロチオエート以外の修飾ヌクレオシド間結合を1つのみ含む、実施形態1~50または実施形態52のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
ホスホロチオエート以外の前記修飾ヌクレオシド間結合が、リンを含む、実施形態53に記載のオリゴマー化合物。
ホスホロチオエート以外の前記修飾ヌクレオシド間結合が、中性ヌクレオシド間結合である、実施形態53~54のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、ホスホロチオエート以外の修飾ヌクレオシド間結合を2つのみ含む、実施形態1~50または実施形態52のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
ホスホロチオエート以外の前記2つの修飾ヌクレオシド間結合がそれぞれ、リンを含む、実施形態56に記載のオリゴマー化合物。
ホスホロチオエート以外の前記修飾ヌクレオシド間結合の少なくとも1つが、中性ヌクレオシド間結合である、実施形態56~57のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
ホスホロチオエート以外の前記2つの修飾ヌクレオシド間結合が、中性ヌクレオシド間結合である、実施形態56~57のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、5-メチルシトシン以外の修飾核酸塩基を1つのみ含む、実施形態1~51または実施形態53~59のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の非修飾糖部分がそれぞれ、2’-β-D-デオキシリボシル糖部分である、実施形態1~60のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置2~9の1つに存在する、実施形態50~61のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置1~6の1つに存在する
、実施形態50~61のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置1~4の1つに存在する、実施形態50~61のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置2~4の1つに存在する、実施形態50~61のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置3~4の1つに存在する、実施形態50~61のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、糖代替物、二環式フラノシル糖部分、非二環式2’-修飾フラノシル糖部分、非二環式4’-修飾フラノシル糖部分、非二環式5’-修飾フラノシル糖部分、または修飾2’-デオキシフラノシル糖部分である、実施形態50~66のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、二環式リボシル糖部分、非二環式2’-修飾リボシル糖部分、非二環式4’-修飾2’-デオキシリボシル糖部分、非二環式5’-修飾2’-デオキシリボシル糖部分、または修飾2’-デオキシフラノシル糖部分である、実施形態67に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、二環式リボシル糖部分、非二環式2’-置換リボシル糖部分、非二環式4’-置換2’-デオキシリボシル糖部分、非二環式5’-置換2’-デオキシリボシル糖部分、または修飾された非置換2’-デオキシフラノシル糖部分である、実施形態68に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、2’-置換リボシル糖部分である、実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記2’-置換リボシル糖部分が、2’-F置換糖部分、2’-MOE置換糖部分、または2’-O-メチル置換糖部分である、実施形態70に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、4’-アルキル置換2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記4’-アルキル置換リボシル糖部分が、4’-メチル置換2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態72に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、5’-アルキル置換2’-デオキシリボシル
糖部分である、実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’-アルキル置換リボシル糖部分が、5’-メチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-エチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、または5’-アリル置換2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態74に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、修飾された非置換2’-デオキシフラノシル糖部分である、実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記修飾された非置換2’-デオキシフラノシル糖部分が、非置換のα-D-2’-デオキシリボシル糖部分、α-L-2’-デオキシリボシル糖部分、β-L-2’-デオキシリボシル糖部分、またはβ-D-2’-デオキシキシロシル糖部分である、実施形態76に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、二環式リボシル糖部分である、実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記二環式リボシル糖部分が、cEt、LNA、またはENAである、実施形態78に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、モルホリノ糖部分、cEt糖部分、2’-F糖部分、2’-O-メチル糖部分、2’-MOE糖部分、4’-メチル糖部分、5’-メチル糖部分、5’-アリル糖部分、5’-エチル糖部分、β-L-2’-デオキシリボシル糖部分、α-D-2’-デオキシリボシル糖部分、β-D-2’-デオキシキシロシル糖部分、またはα-L-2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、2’-O-メチル置換リボシル糖部分、非置換α-D-2’-デオキシリボシル糖部分、非置換α-L-2’-デオキシリボシル糖部分、または非置換β-L-2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態62に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、2’-O-メチル置換リボシル糖部分または非置換β-L-2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態81に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、モルホリノ糖部分、2’-O-メチル置換リボシル糖部分、非置換α-D-2’-デオキシリボシル糖部分、または非置換β-L-2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態63に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、モルホリノ糖部分、非置換α-D-2’-デオキシリボシル糖部分、または非置換β-L-2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態64に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、2’-F置換リボシル糖部分、2’-MOE置換リボシル糖部分、2’-O-メチル置換リボシル糖部分、5’-(S)-メチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-アリル置換2’-デオキシリボシル糖部分、非置換α-D-2’-デオキシリボシル糖部分、またはcEt二環式糖部分である、実施形態65に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、2’-MOE置換リボシル糖部分、2’-O-メチル置換リボシル糖部分、または5’-アリル置換2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態85に記載のオリゴマー化合物。
前記5’-アリル置換リボシル糖部分が、前記修飾糖部分の5’位が立体ランダムなものである、実施形態85または実施形態86に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、2’-F置換リボシル糖部分、2’-MOE置換リボシル糖部分、2’-O-メチル置換リボシル糖部分、4’-メチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(S)-メチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(R)-メチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(立体ランダム)-メチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(S)-エチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(R)-エチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(立体ランダム)-エチル2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(S)-アリル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(R)-アリル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(立体ランダム)-アリル置換2’-デオキシリボシル糖部分、非置換α-D-2’-デオキシリボシル糖部分、非置換α-L-2’-デオキシリボシル糖部分、非置換β-L-2’-デオキシリボシル糖部分、cEt糖部分、またはモルホリノ糖部分である、実施形態66に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、2’-F置換リボシル糖部分、2’-MOE置換リボシル糖部分、2’-O-メチル置換リボシル糖部分、4’-メチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(R)-メチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(S)-エチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(R)-エチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(S)-アリル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(R)-アリル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(立体ランダム)-アリル置換2’-デオキシリボシル糖部分、非置換β-L-2’-デオキシリボシル糖部分、cEt糖部分、またはモルホリノ糖部分である、実施形態88に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置1に存在する、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、モルホリノ糖部分、非置換β-L-2’-デオキシリボシル糖部分、または非置換α-D-2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態90に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、モルホリノ糖部分または非置換α-D-2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態90に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置2に存在する、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、2’-F置換リボシル糖部分、2’-MOE置換リボシル糖部分、2’-O-メチル置換リボシル糖部分、5’-(S)-メチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-アリル置換2’-デオキシリボシル糖部分、非置換α-D-2’-デオキシリボシル糖部分、またはcEt糖部分である、実施形態93に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、2’-MOE置換リボシル糖部分、2’-O-メチル置換リボシル糖部分、5’-(S)-メチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-アリル置換2’-デオキシリボシル糖部分、または非置換α-D-2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態93に記載のオリゴマー化合物。
前記5’-アリル置換2’-デオキシリボシル糖部分が、前記修飾糖部分の5’位が立体ランダムなものである、実施形態94または実施形態95に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置3に存在する、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、2’-F置換リボシル糖部分、2’-MOE置換リボシル糖部分、2’-O-メチル置換リボシル糖部分、4’-メチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(R)-メチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(S)-メチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(S)-エチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(R)-エチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(S)-アリル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(R)-アリル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(立体ランダム)-アリル置換2’-デオキシリボシル糖部分、非置換β-L-2’-デオキシリボシル糖部分、非置換β-D-2’-デオキシキシロシル糖部分、非置換α-L-2’-デオキシリボシル糖部分、非置換α-D-2’-デオキシリボシル糖部分、cEt糖部分、またはモルホリノ糖部分である、実施形態97に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、2’-F置換リボシル糖部分、2’-MOE置換リボシル糖部分、2’-O-メチル置換リボシル糖部分、4’-メチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(R)-メチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’
-(S)-エチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(R)-エチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(S)-アリル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(R)-アリル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(立体ランダム)-アリル置換2’-デオキシリボシル糖部分、非置換β-L-2’-デオキシリボシル糖部分、非置換β-D-2’-デオキシキシロシル糖部分、cEt糖部分、またはモルホリノ糖部分である、実施形態97に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置4に存在する、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、2’-F置換リボシル糖部分、2’-MOE置換リボシル糖部分、2’-O-メチル置換リボシル糖部分、4’-メチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(R)-メチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(S)-メチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(S)-エチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(R)-エチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(S)-アリル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(R)-アリル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(立体ランダム)-アリル置換2’-デオキシリボシル糖部分、非置換β-L-2’-デオキシリボシル糖部分、非置換α-L-2’-デオキシリボシル糖部分、非置換α-D-2’-デオキシリボシル糖部分、cEt糖部分、またはモルホリノ糖部分である、実施形態100に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、2’-F置換リボシル糖部分、2’-MOE置換リボシル糖部分、2’-O-メチル置換リボシル糖部分、4’-メチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(R)-メチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(S)-エチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(R)-エチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(S)-アリル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(R)-アリル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-(立体ランダム)-アリル置換2’-デオキシリボシル糖部分、非置換β-L-2’-デオキシリボシル糖部分、非置換α-L-2’-デオキシリボシル糖部分、非置換α-D-2’-デオキシリボシル糖部分、cEt糖部分、またはモルホリノ糖部分である、実施形態100に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置5に存在する、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、2’-O-メチル置換リボシル糖部分または非置換β-L-2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態103に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、非置換β-L-2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態103に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置6に存在する、実施形態
50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、2’-O-メチル置換リボシル糖部分、非置換β-L-2’-デオキシリボシル糖部分、非置換α-D-2’-デオキシリボシル糖部分、またはモルホリノ糖部分である、実施形態106に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置7に存在する、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、2’-O-メチル置換リボシル糖部分、非置換β-L-2’-デオキシリボシル糖部分、または非置換α-D-2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態108に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置8に存在する、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、2’-O-メチル置換リボシル糖部分、非置換β-L-2’-デオキシリボシル糖部分、または非置換α-D-2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態110に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置9に存在する、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、2’-O-メチル置換リボシル糖部分または非置換β-L-2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態112に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置10に存在する、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置1に存在するモルホリノ修飾糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置1に存在する修飾された非置換2’-デオキシフラノシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置1に存在する非置換β-
L-2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態116に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、非置換α-D-2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態116に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置2に存在する2’-置換リボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置2に存在する前記2’-置換リボシル糖部分が、2’-Fリボシル糖部分である、実施形態119に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置2に存在する前記2’-置換リボシル糖部分が、2’-MOEリボシル糖部分である、実施形態119に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置2に存在する前記2’-置換リボシル糖部分が、2’-O-メチルリボシル糖部分である、実施形態119に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置2に存在する5’-アルキル置換2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置2に存在する前記5’-アルキル置換2’-デオキシリボシル糖部分が、5’-(S)Me2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態123に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置2に存在する前記5’-アルキル置換2’-デオキシリボシル糖部分が、5’-アリル2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態123に記載のオリゴマー化合物。
前記5’-アリル2’-デオキシリボシル糖部分が、前記5’-アリル2’-デオキシリボシル糖部分の5’位が立体ランダムなものである、実施形態125に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置2に存在する修飾された非置換2’-デオキシフラノシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置2に存在する前記修飾された非置換2’-デオキシフラノシル糖部
分が、α-D-2’-デオキシリボシル修飾糖部分である、実施形態127に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置2に存在するcEt糖部分またはLNA糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置3に存在する2’-置換リボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置3に存在する前記2’-置換リボシル糖部分が、2’-Fリボシル糖部分である、実施形態130に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置3に存在する前記2’-置換リボシル糖部分が、2’-MOEリボシル糖部分である、実施形態130に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置3に存在する前記2’-置換リボシル糖部分が、2’-O-メチルリボシル糖部分である、実施形態130に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置3に存在する4’-アルキル置換2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置3に存在する前記4’-置換2’-デオキシリボシル糖部分が、4’-メチル2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態134に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置3に存在する5’-アルキル置換2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置3に存在する前記5’-アルキル置換2’-デオキシリボシル糖部分が、5’-(R)-メチル2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態136に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置3に存在する前記5’-アルキル置換2’-デオキシリボシル糖部分が、5’-(S)-メチル2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態136に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置3に存在する前記5’-アルキル置換2’-デオキシリボシル糖部分が、5’-(立体ランダム)-メチル2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態136に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置3に存在する前記5’-アルキル置換2’-デオキシリボシル糖部分が、5’-(R)-エチル2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態136に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置3に存在する前記5’-アルキル置換2’-デオキシリボシル糖部分が、5’-(S)-エチル2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態136に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置3に存在する前記5’-アルキル置換2’-デオキシリボシル糖部分が、5’-(立体ランダム)-エチル2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態136に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置3に存在する前記5’-アルキル置換2’-デオキシリボシル糖部分が、5’-(R)-アリル2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態136に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置3に存在する前記5’-アルキル置換2’-デオキシリボシル糖部分が、5’-(S)-アリル2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態136に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置3に存在する前記5’-アルキル置換2’-デオキシリボシル糖部分が、5’-(立体ランダム)-アリル2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態136に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置3に存在する修飾された非置換2’-デオキシフラノシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置3に存在する前記修飾された非置換2’-デオキシフラノシル糖部分が、α-D-2’-デオキシリボシル修飾糖部分である、実施形態146に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置3に存在する前記修飾された非置換2’-デオキシフラノシル糖部分が、α-L-2’-デオキシリボシル修飾糖部分である、実施形態146に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置3に存在する前記修飾された非置換2’-デオキシフラノシル糖部分が、β-L-2’-デオキシリボシル修飾糖部分である、実施形態146に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置3に存在する前記修飾された非置換2’-デオキシフラノシル糖部分が、β-D-2’-デオキシキシロシル修飾糖部分である、実施形態146に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置3に存在する二環式リボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置3に存在する前記二環式リボシル糖部分が、cEt糖部分またはLNA糖部分である、実施形態151に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置3に存在する前記二環式リボシル糖部分が、cEt糖部分である、実施形態151に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置3に存在する前記二環式リボシル糖部分が、LNA糖部分である、実施形態151に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置3に存在するモルホリノ糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置4に存在する2’-置換リボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置4に存在する前記2’-置換リボシル糖部分が、2’-Fリボシル糖部分である、実施形態156に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置4に存在する前記2’-置換リボシル糖部分が、2’-MOEリボシル糖部分である、実施形態156に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置4に存在する前記2’-置換リボシル糖部分が、2’-O-メチルリボシル糖部分である、実施形態156に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置4に存在する4’-アルキル置換2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置4に存在する前記4’-置換2’-デオキシリボシル糖部分が、4’-メチル2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態160に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置4に存在する5’-アルキル置換2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置4に存在する前記5’-アルキル置換2’-デオキシリボシル糖部分が、5’-(R)-メチル2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態162に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置4に存在する前記5’-アルキル置換2’-デオキシリボシル糖部分が、5’-(S)-メチル2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態162に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置4に存在する前記5’-アルキル置換2’-デオキシリボシル糖部分が、5’-(立体ランダム)-メチル2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態162に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置4に存在する前記5’-アルキル置換2’-デオキシリボシル糖部分が、5’-(R)-エチル2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態162に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置4に存在する前記5’-アルキル置換2’-デオキシリボシル糖部分が、5’-(S)-エチル2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態162に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置4に存在する前記5’-アルキル置換2’-デオキシリボシル糖部分が、5’-(立体ランダム)-エチル2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態162に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置4に存在する前記5’-アルキル置換2’-デオキシリボシル糖部分が、5’-(R)-アリル2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態162に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置4に存在する前記5’-アルキル置換2’-デオキシリボシル糖部分が、5’-(S)-アリル2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態162に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置4に存在する前記5’-アルキル置換2’-デオキシリボシル糖部分が、5’-(立体ランダム)-アリル2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態162に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置4に存在する修飾された非置換2’-デオキシフラノシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置4に存在する前記修飾された非置換2’-デオキシフラノシル糖部分が、α-D-2’-デオキシリボシル修飾糖部分である、実施形態172に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置4に存在する前記修飾された非置換2’-デオキシフラノシル糖部分が、α-L-2’-デオキシリボシル修飾糖部分である、実施形態172に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置4に存在する前記修飾された非置換2’-デオキシフラノシル糖部分が、β-L-2’-デオキシリボシル修飾糖部分である、実施形態172に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置4に存在する二環式リボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置4に存在する前記二環式リボシル糖部分が、cEt糖部分またはLNA糖部分である、実施形態176に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置4に存在する前記二環式リボシル糖部分が、cEt糖部分である、実施形態176に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置4に存在する前記二環式リボシル糖部分が、LNA糖部分である、実施形態176に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置4に存在するモルホリノ糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置5に存在する2’-O-メチル置換リボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置5に存在する修飾された非置換2’-デオキシフラノシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置5に存在する前記修飾された非置換2’-デオキシフラノシル糖部分が、β-L-2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態182に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置6に存在するモルホリノ糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置6に存在する2’-O-メチル置換リボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置6に存在する修飾された非置換2’-デオキシフラノシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置6に存在する前記修飾された非置換2’-デオキシフラノシル糖部分が、β-L-2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態186に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置6に存在する前記修飾された非置換2’-デオキシフラノシル糖部分が、α-D-2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態186に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置7に存在する2’-O-メチル置換リボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置7に存在する修飾された非置換2’-デオキシフラノシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置7に存在する前記修飾された非置換2’-デオキシフラノシル糖部分が、β-L-2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態190に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置7に存在する前記修飾された非置換2’-デオキシフラノシル糖部分が、α-D-2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態190に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置8に存在する2’-O-メチル置換リボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置8に存在する修飾された非置換2’-デオキシフラノシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置8に存在する前記修飾された非置換2’-デオキシフラノシル糖部分が、β-L-2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態194に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置8に存在する前記修飾された非置換2’-デオキシフラノシル糖部分が、α-D-2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態194に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置9に存在する2’-O-メチル置換リボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置9に存在する修飾された非置換2’-デオキシフラノシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の位置9に存在する前記修飾された非置換2’-デオキシフラノシル糖部分が、β-L-2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態198に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置2、位置3、位置4、位置5、位置6、位置7、位置8、または位置9に存在する2’-O-メチル置換リボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴ
マー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置2、位置3、位置4、位置8、または位置9に存在する2’-O-メチル置換リボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置2、位置3、または位置4に存在する2’-F置換リボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置3または位置4に存在する2’-F置換リボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置2、位置3、または位置4に存在する2’-MOE置換リボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置3または位置4に存在する4’-メチル置換2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置3または位置4に存在する5’-(R)-メチル置換2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置2、位置3、または位置4に存在する5’-(S)-メチル置換2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置3または位置4に存在する5’-(R)-エチル置換2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置3または位置4に存在する5’-(S)-エチル置換2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置3または位置4に存在する5’-(R)-アリル置換2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態50~61
または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置3または位置4に存在する5’-(S)-アリル置換2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置2、位置3、または位置4に存在する5’-(立体ランダム)-アリル置換2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置2、位置3、または位置4に存在するcEtリボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置3または位置4に存在するcEtリボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置2、位置3、または位置4に存在するLNAリボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置3または位置4に存在するLNAリボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置1、位置3、位置4、または位置6に存在するモルホリノ糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置1、位置3、または位置4に存在するモルホリノ糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、修飾された非置換2’-デオキシフラノシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置1、位置2、位置3、位置4、位置5、位置6、位置7、位置8、または位置9に存在する修飾された非置換2’
-デオキシフラノシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置1、位置2、位置3、位置4、位置5、または位置9に存在する修飾された非置換2’-デオキシフラノシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、非置換α-D-2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置1、位置2、位置3、位置4、位置6、または位置8に存在する非置換α-D-2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置1、位置2、または位置4に存在する非置換α-D-2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、非置換α-L-2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置3、位置4、または位置7に存在する非置換α-L-2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、非置換β-L-2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置1、位置3、位置4、位置5、位置6、位置7、位置8、または位置9に存在する非置換β-L-2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、前記中央領域の位置3、位置4、位置5、または位置9に存在する非置換β-L-2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記1つの修飾糖部分が、非置換β-D-2’-デオキシキシロシル糖部分である、実施形態50~61または実施形態67~69のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域におけるホスホロチオエート以外の前記1つの修飾ヌクレオシド間結合が、ホスホネートヌクレオシド間結合またはホスホトリエステルヌクレオシド間結合である、実施形態53~55または実施形態60~230のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域におけるホスホロチオエート以外の前記1つの修飾ヌクレオシド間結合が、アルキルホスホネートヌクレオシド間結合またはアルコキシホスホネートヌクレオシド間結合である、実施形態231に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域におけるホスホロチオエート以外の前記1つの修飾ヌクレオシド間結合が、メトキシプロピルヌクレオシド間結合である、実施形態232に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域におけるホスホロチオエート以外の前記1つの修飾ヌクレオシド間結合が、メチルホスホネートヌクレオシド間結合である、実施形態232に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域におけるホスホロチオエート以外の前記1つの修飾ヌクレオシド間結合が、イソプロピルホスホネートヌクレオシド間結合である、実施形態232に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域におけるホスホロチオエート以外の前記1つの修飾ヌクレオシド間結合が、イソブチルホスホネートヌクレオシド間結合である、実施形態232に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域におけるホスホロチオエート以外の前記1つの修飾ヌクレオシド間結合が、ホスホノアセテートヌクレオシド間結合である、実施形態231に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域におけるホスホロチオエート以外の前記1つの修飾ヌクレオシド間結合が、イソプロピルホスホトリエステルヌクレオシド間結合である、実施形態231に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域におけるホスホロチオエート以外の前記1つの修飾ヌクレオシド間結合が、テトラヒドロピランホスホトリエステルヌクレオシド間結合である、実施形態231に
記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域におけるホスホロチオエート以外の前記1つの修飾ヌクレオシド間結合が、ホルムアセタールヌクレオシド間結合である、実施形態53、実施形態55、または実施形態60~230のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域におけるホスホロチオエート以外の前記1つの修飾ヌクレオシド間結合が、アセトアミドヌクレオシド間結合である、実施形態53、実施形態55、または実施形態60~230のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域におけるホスホロチオエート以外の前記1つの修飾ヌクレオシド間結合が、チオアセトアミドヌクレオシド間結合である、実施形態53、実施形態55、または実施形態60~230のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域におけるホスホロチオエート以外の前記1つの修飾ヌクレオシド間結合が、前記中央領域の位置1のヌクレオシドと位置2のヌクレオシドとの間に存在する、実施形態231~242のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域におけるホスホロチオエート以外の前記1つの修飾ヌクレオシド間結合が、前記中央領域の位置2のヌクレオシドと位置3のヌクレオシドとの間に存在する、実施形態231~242のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域におけるホスホロチオエート以外の前記1つの修飾ヌクレオシド間結合が、前記中央領域の位置3のヌクレオシドと位置4のヌクレオシドとの間に存在する、実施形態231~242のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域におけるホスホロチオエート以外の前記1つの修飾ヌクレオシド間結合が、前記中央領域の位置4のヌクレオシドと位置5のヌクレオシドとの間に存在する、実施形態231~242のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域におけるホスホロチオエート以外の前記1つの修飾ヌクレオシド間結合が、修飾糖部分を含むヌクレオシドに直接連結される、実施形態231~246のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の前記2つの中性ヌクレオシド間結合が、ホスホネートヌクレオシド間結合、ホスホトリエステルヌクレオシド間結合、及びリンを含まない中性ヌクレオシド間結合から独立して選択される、実施形態56~230のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域におけるホスホロチオエート以外の前記修飾ヌクレオシド間結合の少なく
とも1つが、アルキルホスホネートヌクレオシド間結合またはアルコキシホスホネートヌクレオシド間結合である、実施形態248に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域におけるホスホロチオエート以外の前記修飾ヌクレオシド間結合の少なくとも1つが、メトキシプロピルヌクレオシド間結合である、実施形態248に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域におけるホスホロチオエート以外の前記修飾ヌクレオシド間結合の少なくとも1つが、メチルホスホネートヌクレオシド間結合である、実施形態248に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域におけるホスホロチオエート以外の前記修飾ヌクレオシド間結合の少なくとも1つが、イソプロピルホスホネートヌクレオシド間結合である、実施形態248に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域におけるホスホロチオエート以外の前記修飾ヌクレオシド間結合の少なくとも1つが、イソブチルホスホネートヌクレオシド間結合である、実施形態248に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域におけるホスホロチオエート以外の前記修飾ヌクレオシド間結合の少なくとも1つが、ホスホノアセテートヌクレオシド間結合である、実施形態248に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域におけるホスホロチオエート以外の前記修飾ヌクレオシド間結合の少なくとも1つが、イソプロピルホスホトリエステルヌクレオシド間結合である、実施形態248に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域におけるホスホロチオエート以外の前記修飾ヌクレオシド間結合の少なくとも1つが、テトラヒドロピランホスホトリエステルヌクレオシド間結合である、実施形態248に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域におけるホスホロチオエート以外の前記修飾ヌクレオシド間結合の少なくとも1つが、ホルムアセタールヌクレオシド間結合である、実施形態248に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域におけるホスホロチオエート以外の前記修飾ヌクレオシド間結合の少なくとも1つが、アセトアミドヌクレオシド間結合である、実施形態248に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域におけるホスホロチオエート以外の前記修飾ヌクレオシド間結合の少なく
とも1つが、チオアセトアミドヌクレオシド間結合である、実施形態248に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域におけるホスホロチオエート以外の前記2つの修飾ヌクレオシド間結合が、互いに隣接する、実施形態248~259のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域におけるホスホロチオエート以外の前記2つの修飾ヌクレオシド間結合が、互いに同じである、請求項248~260のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域におけるホスホロチオエート以外の前記修飾ヌクレオシド間結合の1つが、前記中央領域の位置1のヌクレオシドと位置2のヌクレオシドとの間に存在する、実施形態248~261のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域におけるホスホロチオエート以外の前記修飾ヌクレオシド間結合の1つが、前記中央領域の位置2のヌクレオシドと位置3のヌクレオシドとの間に存在する、実施形態248~261のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域におけるホスホロチオエート以外の前記修飾ヌクレオシド間結合の1つが、前記中央領域の位置3のヌクレオシドと位置4のヌクレオシドとの間に存在する、実施形態248~261のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域におけるホスホロチオエート以外の前記修飾ヌクレオシド間結合の1つが、前記中央領域の位置4のヌクレオシドと位置5のヌクレオシドとの間に存在する、実施形態248~261のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域におけるホスホロチオエート以外の前記修飾ヌクレオシド間結合の1つが、修飾糖部分を含むヌクレオシドに直接連結される、実施形態248~261のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域における5-メチルシトシン以外の前記1つの修飾核酸塩基が、2-チオチミン、6-メチルアデニン、イノシン、またはシュードウラシルである、実施形態60~266のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
5-メチルシトシン以外の前記1つの修飾核酸塩基が、前記中央領域の位置1、位置2、位置3、または位置4に存在する、実施形態267に記載のオリゴマー化合物。
5-メチルシトシン以外の前記1つの修飾核酸塩基が、前記中央領域の位置2、位置3、または位置4に存在する、実施形態267に記載のオリゴマー化合物。
5-メチルシトシン以外の前記1つの修飾核酸塩基が、前記中央領域の位置1に存在する、実施形態267に記載のオリゴマー化合物。
5-メチルシトシン以外の前記1つの修飾核酸塩基が、前記中央領域の位置2に存在する、実施形態267に記載のオリゴマー化合物。
5-メチルシトシン以外の前記1つの修飾核酸塩基が、前記中央領域の位置3に存在する、実施形態267に記載のオリゴマー化合物。
5-メチルシトシン以外の前記1つの修飾核酸塩基が、前記中央領域の位置4に存在する、実施形態267に記載のオリゴマー化合物。
5-メチルシトシン以外の前記1つの修飾核酸塩基が、2-チオチミンである、実施形態267または実施形態270のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
5-メチルシトシン以外の前記1つの修飾核酸塩基が、6-メチルアデニンである、実施形態267または実施形態271のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
5-メチルシトシン以外の前記1つの修飾核酸塩基が、イノシンである、実施形態267または実施形態271のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
5-メチルシトシン以外の前記1つの修飾核酸塩基が、シュードウラシルである、実施形態267~273のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記シュードウラシル核酸塩基を含むヌクレオシドが、非修飾リボシル糖部分を含む、実施形態277に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域のヌクレオシド間結合がそれぞれ、ホスホジエステルヌクレオシド間結合またはホスホロチオエートヌクレオシド間結合のうちから独立して選択される、実施形態1~52、実施形態60~230、または実施形態267~278のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域のヌクレオシド間結合がそれぞれ、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態279に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合を全く含まない、実施形態1~279のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記オリゴマー化合物のホスホロチオエートヌクレオシド間結合がそれぞれ、立体ランダムである、実施形態1~281のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記オリゴマー化合物のホスホロチオエートヌクレオシド間結合の少なくとも1つが、Rp配置を有する、実施形態1~281のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記オリゴマー化合物のホスホロチオエートヌクレオシド間結合の少なくとも1つが、Sp配置を有する、実施形態1~281のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、標的RNAに相補的である、実施形態1~284のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、前記標的RNAに少なくとも75%相補的である、実施形態285に記載のオリゴマー化合物。
前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、前記標的RNAに少なくとも80%相補的である、実施形態285に記載のオリゴマー化合物。
前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、前記標的RNAに少なくとも85%相補的である、実施形態285に記載のオリゴマー化合物。
前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、前記標的RNAに少なくとも90%相補的である、実施形態285に記載のオリゴマー化合物。
前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、前記標的RNAに少なくとも95%相補的である、実施形態285に記載のオリゴマー化合物。
前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、前記標的RNAに100%相補的である、実施形態285に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、標的mRNAまたは標的pre-mRNAである、実施形態285~291のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的mRNAまたは標的pre-mRNAが、マウス、ラット、サル、またはヒトのPTENのRNAではない、実施形態292に記載のオリゴマー化合物。
前記標的mRNAまたは標的pre-mRNAが、マウス、ラット、サル、またはヒトのSRB-1のRNAではない、実施形態292または実施形態293に記載のオリゴマ
ー化合物。
前記標的mRNAまたは標的pre-mRNAが、マウス、ラット、サル、またはヒトのMYD88のRNAではない、実施形態292~294のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的mRNAまたは標的pre-mRNAが、マウス、ラット、サル、またはヒトのHTTのRNAではなく、マウス、ラット、サル、またはヒトのSOD1のRNAではなく、マウス、ラット、サル、またはヒトのアルファ-シヌクレインのRNAではない、実施形態292~295のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、ヒトのRNAである、実施形態285~296のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、肝臓において発現する、実施形態285~297のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、肝臓標的である、実施形態285~298のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、肝臓において発現しない、実施形態285~297のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、肝臓標的ではない、実施形態285~298または実施形態300のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
肝臓における前記標的RNAの発現を調節することが、障害または状態の治療と関連する、実施形態285~299のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、肝臓の障害または状態である、実施形態302に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、中枢神経系において発現する、実施形態285~303のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、中枢神経系において発現しない、実施形態285~303のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、中枢神経系標的である、実施形態285~298、実施形態300、実施形態301、または実施形態304のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、中枢神経系標的ではない、実施形態285~305のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、MeCP2のRNA、DUX4のRNA、HDAC2のRNA、APPのRNA、アタキシン1のRNA、アタキシン2のRNA、アタキシン3のRNA、アタキシン6のRNA、アタキシン7のRNA、C9ORF72のRNA、UBE3AのRNA、プリオンのRNA、PMP22のRNA、タウのRNA、LRRK2のRNA、LINGO2のRNA、GYS1のRNA、KCNT1のRNA、IRF8のRNA、プログラニュリンのRNA、またはGFAPのRNAである、実施形態285~298、実施形態300~301、実施形態304、または実施形態306のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、HTTのRNAである、実施形態285~297、実施形態300~301、実施形態304、または306のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、MeCP2のRNAである、実施形態308に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、DUX4のRNAである、実施形態308に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、HDAC2のRNAである、実施形態308に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、アタキシン1のRNAである、実施形態308に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、アタキシン2のRNAである、実施形態308に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、アタキシン3のRNAである、実施形態308に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、アタキシン6のRNAである、実施形態308に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、アタキシン7のRNAである、実施形態308に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、C9ORF72のRNAである、実施形態308に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、アルファ-シヌクレインのRNAである、実施形態285~297、実施形態300~301、実施形態304、または実施形態306に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、UBE3AのRNAである、実施形態308に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、SOD1のRNAである、実施形態285~297、実施形態300~301、実施形態304、または実施形態306に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、プリオンのRNAである、実施形態308に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、PMP22のRNAである、実施形態308に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、タウのRNAである、実施形態308に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、LRRK2のRNAである、実施形態308に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、APPのRNAである、実施形態308に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、LINGO2のRNAである、実施形態308に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、GYS1のRNAである、実施形態308に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、KCNT1のRNAである、実施形態308に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、IRF8のRNAである、実施形態308に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、プログラニュリンのRNAである、実施形態308に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、GFAPのRNAである、実施形態308に記載のオリゴマー化合物。
中枢神経系における前記標的RNAの発現を調節することが、障害または状態の治療と関連する、実施形態304、実施形態306、または実施形態308~332のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、神経学的な障害または状態である、実施形態333に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、感覚ニューロンまたは運動ニューロンの機能を変化させる、実施形態333または実施形態334に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、感覚ニューロンの機能を変化させる、実施形態333~335のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、運動ニューロンの機能を変化させる、実施形態333~336のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、グリア細胞の機能を変化させる、実施形態333~337のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、アストロサイトの機能を変化させる、実施形態338に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、オリゴデンドロサイトの機能を変化させる、実施形態338に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、ミクログリアの機能を変化させる、実施形態338に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、上衣細胞の機能を変化させる、実施形態338に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、アルツハイマー病、筋萎縮性側索硬化症、パーキンソン病、脊髄小脳失調症、アンジェルマン症候群、アレキサンダー病、ラフォラ病、シャルコー・マリー・トゥース病、プリオン病、認知症、神経変性、MeCP2重複症候群、脳症、神経炎症、または多発性硬化症である、実施形態333~342のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、アルツハイマー病である、実施形態343に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、筋萎縮性側索硬化症である、実施形態343に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、パーキンソン病である、実施形態343に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、脊髄小脳失調症である、実施形態343に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、アンジェルマン症候群である、実施形態343に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、アレキサンダー病である、実施形態343に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、ラフォラ病である、実施形態343に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、シャルコー・マリー・トゥース病である、実施形態343に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、プリオン病である、実施形態343に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、認知症である、実施形態343に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、神経変性である、実施形態343に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、MeCP2重複症候群である、実施形態343に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、脳症である、実施形態343に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、神経炎症である、実施形態343に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、多発性硬化症である、実施形態343に記載のオリゴマー化合物。
実施形態1~358のいずれかに記載のオリゴマー化合物の親オリゴマー化合物が、インビトロで細胞毒性を有する、実施形態1~358のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物が、標準的なインビトロ細胞毒性アッセイにおいて細胞毒性を有する、実施形態359に記載のオリゴマー化合物。
実施形態1~360のいずれかに記載のオリゴマー化合物の親オリゴマー化合物がマウスに投与されると、前記マウスに肝毒性が生じる、実施形態1~360のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記マウスに対する前記親オリゴマー化合物の前記投与が、全身投与である、実施形態361に記載のオリゴマー化合物。
前記全身投与が、皮下投与である、実施形態362に記載のオリゴマー化合物。
前記マウスが、CD-1マウスである、実施形態361~363のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記マウスが、C57BL/6マウスである、実施形態361~363のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記マウスが、BALB/cマウスである、実施形態361~363のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物の前記投与の後に、前記マウスにおける血漿中ALTレベルが、リットル当たり500単位超である、実施形態361~366のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物の前記投与の後に、前記マウスにおける血漿中ASTレベルが、リットル当たり500単位超である、実施形態361~366のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物の前記投与の後に、前記マウスにおける血漿中ALTレベルが、リットル当たり1000単位超である、実施形態361~366のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物の前記投与の後に、前記マウスにおける血漿中ASTレベルが、リットル当たり1000単位超である、実施形態361~366のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記肝毒性が、前記親オリゴマー化合物の前記投与から24~48時間後に測定される、実施形態361~370のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記肝毒性が、前記親オリゴマー化合物の前記投与から72時間後に測定される、実施形態361~370のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記肝毒性が、前記親オリゴマー化合物の前記投与から3日後に測定される、実施形態361~370のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記肝毒性が、前記親オリゴマー化合物の前記投与から5日後に測定される、実施形態361~370のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記肝毒性が、前記親オリゴマー化合物の前記投与から7日後に測定される、実施形態361~370のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記肝毒性が、前記親オリゴマー化合物の前記投与から10日後に測定される、実施形態361~370のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記肝毒性が、前記親オリゴマー化合物の前記投与から14日後に測定される、実施形態361~370のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物が、1~10mg/kgで前記マウスに投与される、実施形態
361~377のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物が、10~25mg/kgで前記マウスに投与される、実施形態361~377のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物が、25~50mg/kgで前記マウスに投与される、実施形態361~377のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物が、50~100mg/kgで前記マウスに投与される、実施形態361~377のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物が、100~150mg/kgで前記マウスに投与される、実施形態361~377のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記マウスが、BALB/cマウスであり、前記親オリゴマー化合物が、150mg/kgで前記マウスに投与され、前記マウスにおける血漿中ALTレベルが、前記親オリゴマー化合物の前記投与から72時間後に測定される、実施形態361~363、実施形態366~370、実施形態372、または実施形態382のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
実施形態1~383のいずれかに記載のオリゴマー化合物が50mg/kgでマウスに投与されると、前記マウスに肝毒性が生じない、実施形態1~383のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
実施形態384に記載のオリゴマー化合物の前記投与の後に、前記マウスにおける血漿中ALTレベルが、リットル当たり100単位未満である、実施形態384に記載のオリゴマー化合物。
前記マウスにおける血漿中ALTレベルが、実施形態384または実施形態385に記載のオリゴマー化合物の親オリゴマー化合物が投与されたマウスにおける血漿中ALTレベルと比較して少なくとも10倍低く、実施形態384または実施形態385のオリゴマー化合物の前記投与及び血漿中ALT測定も、前記親オリゴマー化合物の前記投与及び血漿中ALT測定も、同じ方法で完結される、実施形態384または実施形態385に記載のオリゴマー化合物。
前記マウスにおける血漿中ALTレベルが、前記親オリゴマー化合物が投与された前記マウスにおける血漿中ALTレベルと比較して少なくとも100倍低い、実施形態386に記載のオリゴマー化合物。
前記マウスにおける血漿中ALTレベルが、前記親オリゴマー化合物が投与された前記
マウスにおける血漿中ALTレベルと比較して少なくとも500倍低い、実施形態386に記載のオリゴマー化合物。
実施形態359~388のいずれかに記載のオリゴマー化合物の、マウスにおける治療指数が、前記親オリゴマー化合物の治療指数と比較して増加している、実施形態359~388のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
実施形態365に記載のオリゴマー化合物の、マウスにおける治療指数が、前記親オリゴマー化合物の治療指数と比較して少なくとも2倍高い、実施形態389に記載のオリゴマー化合物。
ホスホロチオエート以外の前記少なくとも1つの修飾ヌクレオシド間結合、及び/または5-メチルシトシン以外の修飾核酸塩基及び/または修飾糖部分を含む前記少なくとも1つの修飾ヌクレオシド、を前記中央領域に含まないこと以外は同一のオリゴマー化合物が、マウスへの投与後に肝毒性を生じさせ、
前記そのこと以外は同一のオリゴマー化合物が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合と、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分と、チミン、ウラシル、アデニン、グアニン、シトシン、及び5-メチルシトシンから選択される核酸塩基と、からなる中央領域を有する、実施形態1~390のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
ホスホロチオエート以外の前記少なくとも1つの修飾ヌクレオシド間結合、及び/または5-メチルシトシン以外の修飾核酸塩基及び/または修飾糖部分を含む前記少なくとも1つの修飾ヌクレオシド、を前記中央領域に含み、前記修飾糖部分が、2’-O-メチル修飾糖部分である、実施形態391に記載のオリゴマー化合物。
前記2’-O-メチル修飾糖部分が、前記中央領域の位置2に存在する、実施形態392に記載のオリゴマー化合物。
前記そのこと以外は同一のオリゴマー化合物が、2’-O-メチル修飾糖部分を含まず、前記そのこと以外は同一のオリゴマー化合物が、前記2’-O-メチル修飾糖部分の代わりに非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を含む、実施形態392または実施形態393に記載のオリゴマー化合物。
前記そのこと以外は同一のオリゴマー化合物の核酸塩基配列が、前記標的RNAに100%相補的である、実施形態391~394のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記そのこと以外は同一のオリゴマー化合物が、実施形態391~395のいずれかに記載のオリゴマー化合物の親オリゴマー化合物である、実施形態391~395のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記オリゴマー化合物が、標準的なインビトロ活性アッセイにおいて100nM未満の
IC50で前記標的RNAを抑制する、実施形態285~396のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
実施形態285~397のいずれかに記載のオリゴマー化合物の親オリゴマー化合物が、標準的なインビトロ活性アッセイにおいて100nM未満のIC50で前記標的RNAを抑制する、実施形態285~397のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
標準的なインビトロ活性アッセイで測定された前記親オリゴマー化合物のIC50と、標準的なインビトロ活性アッセイで測定された実施形態285~398のいずれかに記載のオリゴマー化合物のIC50と、の間の差異が4倍未満である、実施形態285~398のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
標準的なインビトロ活性アッセイで測定された前記親オリゴマー化合物のIC50と、標準的なインビトロ活性アッセイで測定された実施形態285~398のいずれかに記載のオリゴマー化合物のIC50と、の間の差異が3倍未満である、実施形態285~398のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
標準的なインビトロ活性アッセイで測定された前記親オリゴマー化合物のIC50と、標準的なインビトロ活性アッセイで測定された実施形態285~398のいずれかに記載のオリゴマー化合物のIC50と、の間の差異が2倍未満である、実施形態285~398のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物の前記中央領域の糖部分がそれぞれ、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分であり、前記親オリゴマー化合物の前記中央領域のヌクレオシド間結合がそれぞれ、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態359~390または実施形態396~401のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物の核酸塩基配列が、前記標的RNAに100%相補的である、実施形態359~390または実施形態396~402のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
10~50mgの前記オリゴマー化合物がヒトに投与されると、前記ヒトに肝毒性が生じない、実施形態1~403のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
50~100mgの前記オリゴマー化合物がヒトに投与されると、前記ヒトに肝毒性が生じない、実施形態1~403のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
100~300mgの前記オリゴマー化合物がヒトに投与されると、前記ヒトに肝毒性が生じない、実施形態1~403のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記投与が、全身投与である、実施形態404~406のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
実施形態1~407のいずれかに記載のオリゴマー化合物と、第2のオリゴマー化合物と、を含む組成物であって、前記第2のオリゴマー化合物が、実施形態1~407のいずれかに記載のオリゴマー化合物に相補的である前記組成物。
前記第2のオリゴマー化合物が、実施形態1~407のいずれかに記載のオリゴマー化合物に少なくとも90%相補的な少なくとも14個の近接する連結ヌクレオシドを含む、実施形態408に記載の組成物。
前記第2のオリゴマー化合物が、実施形態1~407のいずれかに記載のオリゴマー化合物に100%相補的な少なくとも14個の近接する連結ヌクレオシドを含む、実施形態408に記載の組成物。
実施形態1~407のいずれかに記載のオリゴマー化合物を含む医薬組成物、または実施形態408~410のいずれかに記載の組成物であって、前記医薬組成物または組成物が、医薬的に許容可能な担体または希釈剤を含む前記医薬組成物または組成物。
実施形態1~411のいずれかに記載のオリゴマー化合物または組成物をヒト対象に投与することを含む方法。
実施形態1~411のいずれかに記載のオリゴマー化合物または組成物をヒト対象に投与することを含む、疾患または障害の治療方法。
ヒト対象における標的RNAの量または活性の調節方法であって、前記方法が、実施形態1~411のいずれかに記載のオリゴマー化合物または組成物を前記ヒト対象に投与すること、及びそれによって前記ヒト対象における前記標的RNAの量または活性を調節すること、を含む前記方法。
ヒト対象における疾患または障害の治療方法であって、前記方法が、実施形態1~411のいずれかに記載のオリゴマー化合物または組成物を、前記疾患または障害を有する前記ヒト対象に投与すること、及びそれによって前記ヒト対象における前記疾患または障害を治療すること、を含む前記方法。
前記疾患または障害が、肝疾患であり、前記オリゴマー化合物が、肝臓標的RNAの量または活性を調節する、実施形態413または実施形態415に記載の方法。
前記疾患または障害が、中枢神経系疾患であり、前記オリゴマー化合物が、中枢神経系標的RNAの量または活性を調節する、実施形態413または実施形態415に記載の方
法。
前記疾患または障害が、がん、神経変性疾患、循環器疾患、免疫疾患、遺伝性疾患、反復配列伸長疾患、筋肉消耗疾患、または代謝疾患である、実施形態413または実施形態415~417のいずれかに記載の方法。
前記投与の後の前記ヒト対象の血漿中ALTレベルが、前記投与の前のものと比較して3倍を超えない、実施形態412~418のいずれかに記載の方法。
前記投与の後の前記ヒト対象の血漿中ALTレベルが、リットル当たり150単位を超えない、実施形態412~418のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、肝損傷に感受性である、実施形態412~416または実施形態418~420のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、肝変性に感受性である、実施形態412~416または実施形態418~420のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、肝臓におけるアポトーシスの上昇に感受性である、実施形態412~416または実施形態418~420のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、肝疾患を有する、実施形態412~416または実施形態418~423のいずれかに記載の方法。
実施形態1~407のいずれかに記載のオリゴマー化合物の親オリゴマー化合物をマウスに投与することを含む、実施形態412~424のいずれかに記載の方法。
実施形態1~407のいずれかに記載のオリゴマー化合物の親オリゴマー化合物と細胞を接触させることを含む、実施形態412~424のいずれかに記載の方法。
前記親オリゴマー化合物の前記中央領域の糖部分がそれぞれ、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分であり、前記親オリゴマー化合物の前記中央領域のヌクレオシド間結合がそれぞれ、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態425または実施形態426に記載の方法。
オリゴマー化合物の設計方法であって、前記方法が、親オリゴマー化合物を出発物質とすること、及び実施形態1~407のいずれか1つに記載のオリゴマー化合物に至るように前記化合物の設計を変更すること、を含む前記方法。
オリゴマー化合物の設計方法であって、前記方法が、親オリゴマー化合物を同定すること、及び第2のオリゴマー化合物に至るように前記親オリゴマー化合物の設計を変更すること、を含み、前記第2のオリゴマー化合物が、実施形態1~407のいずれか1つに記載のオリゴマー化合物である前記方法。
オリゴマー化合物の肝毒性の改善方法であって、前記方法が、(i)マウスにおいてリットル当たり300単位超の血漿中ALTレベルを有する親オリゴマー化合物を同定するステップと、(ii)実施形態1~407のいずれか1つに記載のオリゴマー化合物を提供するステップと、を含む前記方法。
前記方法によって、前記親オリゴマー化合物と比較して治療指数が改善したオリゴマー化合物が設計される、実施形態428に記載の方法。
前記方法によって、前記親オリゴマー化合物と比較して肝毒性が低下したオリゴマー化合物が設計される、実施形態428または実施形態431に記載の方法。
前記第2のオリゴマー化合物の治療指数が、前記親オリゴマー化合物と比較して改善される、実施形態429に記載の方法。
マウスにおける前記第2のオリゴマー化合物の肝毒性が、前記親オリゴマー化合物と比較して低減される、実施形態429または実施形態433に記載の方法。
実施形態1~407のいずれか1つに記載のオリゴマー化合物の肝毒性が、前記親オリゴマー化合物と比較して低減される、実施形態430に記載の方法。
実施形態1~407のいずれかに記載のオリゴマー化合物をマウスに投与すること、及び実施形態1~407のいずれかに記載のオリゴマー化合物の親オリゴマー化合物を第2のマウスに別に投与すること、を含む方法であって、実施形態1~407のいずれかに記載のオリゴマー化合物の治療指数が、前記親オリゴマー化合物の治療指数と比較して改善される前記方法。
前記マウス、前記細胞、及び/または前記ヒト対象においてp21のRNAのレベルが測定される、実施形態412~436のいずれかに記載の方法。
オリゴマー化合物を対象に投与すること、及び前記対象におけるp21のRNAのレベルを測定すること、を含む方法。
実施形態1~407のいずれかに記載のオリゴマー化合物を対象に投与すること、及び前記対象におけるp21のRNAのレベルを測定すること、を含む方法。
前記対象が、マウスである、実施形態438または実施形態439に記載の方法。
前記対象が、ヒトである、実施形態438または実施形態439に記載の方法。
前記p21のRNAのレベルが、前記投与から24時間以内に測定される、実施形態437~441のいずれかに記載の方法。
前記p21のRNAのレベルが、前記投与から24~48時間後に測定される、実施形態437~441のいずれかに記載の方法。
医学的治療において使用するための、実施形態1~411のいずれか1つに記載のオリゴマー化合物または組成物。
細胞をオリゴマー化合物と接触させること、及び前記細胞におけるp54nrbタンパク質の細胞局在を検出すること、を含む方法。
核小体におけるp54nrbタンパク質の相対量を、異なるオリゴマー化合物と接触させた他の細胞と比較して決定することを含む、実施形態445に記載の方法。
核小体におけるp54nrbの相対量を、前記細胞のその他の部分におけるp54nrbの量と比較して決定することを含む、実施形態445または実施形態446に記載の方法。
前記細胞が、少なくとも96個のウェルを含むプレート中のものである、実施形態445~447のいずれかに記載の方法。
p54nrbの細胞局在の前記検出が、前記細胞をp54nrb抗体と接触させることを含む、実施形態445~448のいずれかに記載の方法。
実施形態445~449に記載の方法のいずれかを含む、忍容可能なオリゴマー化合物のスクリーニング方法。
前記オリゴマー化合物が、実施形態1~407のいずれかに記載のオリゴマー化合物である、実施形態445~450のいずれかに記載の方法。
12~23個の連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化
合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドが、5’領域、中央領域、及び3’領域を含み、
前記5’領域が、1~5つの連結修飾ヌクレオシドからなり、
前記3’領域が、1~5つの連結修飾ヌクレオシドからなり、
前記中央領域が、7~11個の連結ヌクレオシドからなり、式:
(Nd1)(Nx)(Ny)(Nz)(Nd)q
を有し、式中、Nx、Ny、及びNzの1つが、安全性増強ヌクレオシドであり、
Nx、Ny、及びNzのその他の2つが、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル、DNA異性体、及びDNA模倣体から独立して選択され、
Nd1、及びそれぞれのNdが、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル、DNA異性体、及びDNA模倣体から独立して選択され、
qが、2~7である前記オリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、NxまたはNyである、実施形態1に記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、Nxである、実施形態1に記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、Nyである、実施形態1に記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、Nzである、実施形態1に記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、糖代替物、二環式フラノシル糖部分、非二環式2’-修飾フラノシル糖部分、非二環式4’-修飾フラノシル糖部分、または非二環式5’-修飾フラノシル糖部分のうちから選択される糖部分を有する、実施形態452~456のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、モルホリノ、2’-O-メチル-2’-β-D-デオキシリボシル糖部分、cEt二環式糖部分、LNA糖部分、ENA糖部分、5’-メチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-エチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-アリル置換2’-デオキシリボシル糖部分、及び2’-β-L-デオキシキシロシル糖部分のうちから選択される糖部分を有する、実施形態452~457のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-O-メチル-修飾糖部分及び5’-修飾糖部分のうちから選択される糖部分を有する、実施形態452~458のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-O-メチル置換リボシル糖部分を有する、実施形態459に記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、糖代替物である、実施形態452~457のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記糖代替物が、モルホリノ、修飾モルホリノ、及びF-HNAのうちから選択される、実施形態461に記載のオリゴマー化合物。
Nd1が、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分である、実施形態452~462のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
Nd1が、DNA異性体である、実施形態452~462のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
Nd1が、DNA模倣体である、実施形態452~462のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
2’-β-D-デオキシリボシル以外の糖部分を含む前記中央領域ヌクレオシドの数が3を超えない、実施形態452~465のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
DNA異性体がそれぞれ、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、2’-β-L-デオキシリボシル、2’-α-D-デオキシキシロシル、1,2’-α-L-デオキシキシロシル、及び2’-β-L-デオキシキシロシルのうちから独立して選択される糖部分を有する、実施形態452~466のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
DNA模倣体がそれぞれ、5’-メチル-2’-β-D-デオキシリボシル及び5’-エチル-2’-β-D-デオキシリボシルのうちから独立して選択される糖部分を有する、実施形態452~467のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域における前記安全性増強ヌクレオシド以外のヌクレオシドがそれぞれ、2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を有する、実施形態452~463のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
少なくとも1つのヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエート結合である、452~469のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
少なくとも4つのヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエート結合である、実施形態452~470のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
少なくとも1つのヌクレオシド間結合が、中性ヌクレオシド間結合である、実施形態4
52~471のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
少なくとも1つの中性ヌクレオシド間結合が、ホスホネートヌクレオシド間結合である、実施形態452~472のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
少なくとも1つの中性ヌクレオシド間結合が、メトキシプロピルヌクレオシド間結合である、実施形態452~474のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
ヌクレオシド間Nd1-Nx、ヌクレオシド間Nx-Ny、ヌクレオシド間Ny-Nz、またはヌクレオシド間Nz-隣接Ndのうちから選択される、前記中央領域の少なくとも1つのヌクレオシド間結合が、中性ヌクレオシド間結合である、実施形態452~475のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記修飾オリゴヌクレオチドが、1つの中性結合を含み、その他のヌクレオシド間結合がそれぞれ、ホスホジエステル及びホスホロチオエートから独立して選択される、
実施形態475に記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、Nxであり、2’O-メチル-置換ヌクレオシドである、実施形態542~454または実施形態457~476のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、Nyであり、2’O-メチル-置換ヌクレオシドである、実施形態2~453、実施形態455、または実施形態457~476のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、Nyであり、5’-置換2’-デオキシリボシル糖部分を有する、実施形態452~453、実施形態455、または実施形態457~476のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、Nzであり、5’-置換2’-デオキシリボシル糖部分を有する、実施形態452または実施形態457~476のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’-置換リボシル糖部分が、5’-メチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、5’-エチル置換2’-デオキシリボシル糖部分、または5’-アリル置換2’-デオキシリボシル糖部分である、実施形態479または実施形態480に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の少なくとも1つのヌクレオシドが、二環式フラノシル糖部分を含む、実施形態477~481に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、二環式フラノシル糖部分を含む、実施形態477~482のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の二環式糖部分がそれぞれ、cEt、LNA、及びENAのうちから選択される、実施形態482または実施形態483のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の少なくとも1つのヌクレオシドが、非二環式糖部分を含む、実施形態452~482または実施形態484のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の前記少なくとも1つのヌクレオシドの前記非二環式糖部分が、2’-置換リボシル糖部分である、実施形態485に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の非二環式糖部分がそれぞれ、2’-MOE、2’-OMe、及び2’-NMAのうちから選択される2’-置換基を有する、実施形態485~487のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域が、2’-MOE修飾ヌクレオシド及びLNA修飾ヌクレオシドを含む、実施形態477~480のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域が、2’-MOE修飾ヌクレオシド及びcEt修飾ヌクレオシドを含む、実施形態477~480のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の少なくとも1つのヌクレオシドが、二環式フラノシル糖部分を含む、実施形態477~489に記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、二環式フラノシル糖部分を含む、実施形態477~490のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の二環式糖部分がそれぞれ、cEt、LNA、及びENAのうちから選択される、実施形態490または実施形態491のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の少なくとも1つのヌクレオシドが、非二環式糖部分を含む、実施形態490または実施形態492のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の前記少なくとも1つのヌクレオシドの前記非二環式糖部分が、2’-置換リボシル糖部分である、実施形態493に記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の非二環式糖部分がそれぞれ、2’-MOE、2’-OMe、及び2’-NMAのうちから選択される2’-置換基を有する、実施形態490または実施形492~494のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域が、2’-MOE修飾ヌクレオシド及びLNA修飾ヌクレオシドを含む、実施形態477~490または実施形態492~495のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域が、2’-MOE修飾ヌクレオシド及びcEt修飾ヌクレオシドを含む、実施形態477~490または実施形態492~495のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、二環式フラノシル糖部分を含み、前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、非二環式糖部分を含む、実施形態477~480のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、LNA糖部分を含み、前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、2’MOE糖部分を含む、実施形態477~480のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、cEt糖部分を含み、前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、2’MOE糖部分を含む、実施形態477~480のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記修飾オリゴヌクレオチドが、標的RNAに相補的な核酸塩基配列を有し、前記標的RNAが、mRNAまたはpre-mRNAである、実施形態452~500のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、肝臓において発現するタンパク質をコードする、実施形態501に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、CNSにおいて発現するタンパク質をコードする、実施形態502に記載のオリゴマー化合物。
前記オリゴマー化合物が、毒性を有さない、実施形態452~503のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
対照化合物が毒性を有し、前記対照化合物の前記中央領域のヌクレオシドがそれぞれ、2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を含むヌクレオシドであること以外は前記対照化
合物が前記オリゴマー化合物と同一である、実施形態452~504のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記オリゴマー化合物がある用量で動物に投与されると生じる循環ALTレベルが、少なくとも1回の適合用量について前記対照化合物が同じ用量で動物に投与されると生じる前記ALTレベルと比較して少なくとも3倍低い、実施形態505に記載のオリゴマー化合物。
リットル当たり300単位超に循環ALTを上昇させる前記オリゴマー化合物の最低用量が、リットル当たり300単位超に循環ALTを上昇させる前記対照化合物の最低用量と比較して少なくとも3倍高い、実施形態505または実施形態506に記載のオリゴマー化合物。
前記オリゴマー化合物が、細胞における前記標的RNAを低減する能力を有する、実施形態502~507のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記オリゴマー化合物が、対照化合物と同等のRNA低減活性を有し、前記対照化合物の前記中央領域のヌクレオシドがそれぞれ、2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を含むヌクレオシドであること以外は前記対照化合物が前記オリゴマー化合物と同一である、実施形態508に記載のオリゴマー化合物。
前記対照化合物のRNA低減活性と比較して前記RNA低減活性の低下度合いが2倍を超えないである、実施形態509に記載のオリゴマー化合物。
12~23個の連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドが、5’領域、中央領域、及び3’領域を含み、
前記5’領域が、1~5つの連結ヌクレオシドからなり、少なくとも1つの5’領域ヌクレオシドが修飾され、
前記3’領域が、1~5つの連結ヌクレオシドからなり、少なくとも1つの3’領域ヌクレオシドが修飾され、
前記中央領域が、7~11個の連結ヌクレオシドからなり、式:
(Nd1)L1(Nd2)L2(Nd3)L3(Nd4)L4(Nd)q
を有し、式中、Nd1、Nd2、Nd3、Nd4、及びそれぞれのNdが、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を含むヌクレオシド、DNA異性体糖部分を含むヌクレオシド、またはDNA模倣体糖部分を含むヌクレオシド、のうちから独立して選択され、L1、L2、L3、及びL4がそれぞれ、ヌクレオシド間結合であり、
L1、L2、L3、及びL4の少なくとも1つが、中性ヌクレオシド間結合である前記オリゴマー化合物。
L1が、中性ヌクレオシド間結合である、実施形態511に記載のオリゴマー化合物。
L2が、中性ヌクレオシド間結合である、実施形態511に記載のオリゴマー化合物。
L3が、中性ヌクレオシド間結合である、実施形態511に記載のオリゴマー化合物。
前記中性結合が、ホスホネートヌクレオシド間結合である、実施形態511~514のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中性結合が、メトキシプロピルヌクレオシド間結合である、実施形態511~515のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
残りのヌクレオシド間結合がそれぞれ、ホスホジエステルヌクレオシド間結合またはホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態511~516のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
実施形態452~517のいずれかに記載のオリゴマー化合物または組成物をヒト対象に投与することを含む方法。
実施形態452~517のいずれかに記載のオリゴマー化合物または組成物をヒト対象に投与することを含む、疾患または障害の治療方法。
ヒト対象における標的RNAの量または活性の調節方法であって、前記方法が、実施形態452~517のいずれかに記載のオリゴマー化合物または組成物を前記ヒト対象に投与すること、及びそれによって前記ヒト対象における前記標的RNAの量または活性を調節すること、を含む前記方法。
ヒト対象における疾患または障害の治療方法であって、前記方法が、実施形態452~517のいずれかに記載のオリゴマー化合物または組成物を、前記疾患または障害を有する前記ヒト対象に投与すること、及びそれによって前記ヒト対象における前記疾患または障害を治療すること、を含む前記方法。
前記疾患または障害が、肝疾患であり、前記オリゴマー化合物が、肝臓標的RNAの量または活性を調節する、実施形態520または実施形態521に記載の方法。
前記疾患または障害が、中枢神経系疾患であり、前記オリゴマー化合物が、中枢神経系標的RNAの量または活性を調節する、実施形態520または実施形態521に記載の方法。
前記疾患または障害が、がん、神経変性疾患、循環器疾患、免疫疾患、遺伝性疾患、反復配列伸長疾患、筋肉消耗疾患、または代謝疾患である、実施形態519~523のいず
れかに記載の方法。
前記投与の後の前記ヒト対象の血漿中ALTレベルが、前記投与の前のものと比較して3倍を超えない、実施形態518~524のいずれかに記載の方法。
前記投与の後の前記ヒト対象の血漿中ALTレベルが、リットル当たり150単位を超えない、実施形態518~525のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、肝損傷に感受性である、実施形態518~526のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、肝変性に感受性である、実施形態518~527のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、肝臓におけるアポトーシスの上昇に感受性である、実施形態518~528のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、肝疾患を有する、実施形態518~529のいずれかに記載の方法。
実施形態452~517のいずれかに記載のオリゴマー化合物の親オリゴマー化合物をマウスに投与することを含む、実施形態518~530のいずれかに記載の方法。
実施形態452~517のいずれかに記載のオリゴマー化合物の親オリゴマー化合物と細胞を接触させることを含む、実施形態518~531のいずれかに記載の方法。
前記親オリゴマー化合物の前記中央領域の糖部分がそれぞれ、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分であり、前記親オリゴマー化合物の前記中央領域のヌクレオシド間結合がそれぞれ、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態518~532に記載の方法。
オリゴマー化合物の設計方法であって、前記方法が、親オリゴマー化合物を出発物質とすること、及び実施形態452~517のいずれか1つに記載のオリゴマー化合物に至るように前記化合物の設計を変更すること、を含む前記方法。
オリゴマー化合物の設計方法であって、前記方法が、親オリゴマー化合物を同定すること、及び第2のオリゴマー化合物に至るように前記親オリゴマー化合物の設計を変更すること、を含み、前記第2のオリゴマー化合物が、実施形態452~517のいずれか1つに記載のオリゴマー化合物である前記方法。
オリゴマー化合物の肝毒性の改善方法であって、前記方法が、(i)マウスにおいてリットル当たり300単位超の血漿中ALTレベルを有する親オリゴマー化合物を同定するステップと、(ii)実施形態452~517のいずれか1つに記載のオリゴマー化合物を提供するステップと、を含む前記方法。
前記方法によって、前記親オリゴマー化合物と比較して治療指数が改善したオリゴマー化合物が設計される、実施形態536に記載の方法。
前記方法によって、前記親オリゴマー化合物と比較して肝毒性が低下したオリゴマー化合物が設計される、実施形態534~537に記載の方法。
前記第2のオリゴマー化合物の治療指数が、前記親オリゴマー化合物と比較して改善される、実施形態535~538に記載の方法。
マウスにおける前記第2のオリゴマー化合物の肝毒性が、前記親オリゴマー化合物と比較して低減される、実施形態535~539に記載の方法。
実施形態452~517のいずれか1つに記載のオリゴマー化合物の肝毒性が、前記親オリゴマー化合物と比較して低減される、実施形態540に記載の方法。
実施形態452~517のいずれかに記載のオリゴマー化合物をマウスに投与すること、及び実施形態452~517のいずれかに記載のオリゴマー化合物の親オリゴマー化合物を第2のマウスに別に投与すること、を含む方法であって、実施形態452~517のいずれかに記載のオリゴマー化合物の治療指数が、前記親オリゴマー化合物の治療指数と比較して改善される前記方法。
前記マウス、前記細胞、及び/または前記ヒト対象においてp21のRNAのレベルが測定される、実施形態518~542のいずれかに記載の方法。
実施形態452~517のいずれかに記載のオリゴマー化合物を対象に投与すること、及び前記対象におけるp21のRNAのレベルを測定すること、を含む方法。
前記対象が、マウスである、実施形態543または実施形態544に記載の方法。
前記対象が、ヒトである、実施形態543または実施形態544に記載の方法。
前記p21のRNAのレベルが、前記投与から24時間以内に測定される、実施形態543~546のいずれかに記載の方法。
前記p21のRNAのレベルが、前記投与から24~48時間後に測定される、実施形態437~441のいずれかに記載の方法。
医学的治療において使用するための、実施形態452~517のいずれか1つに記載のオリゴマー化合物または組成物。
前記オリゴマー化合物が、実施形態452~517のいずれかに記載のオリゴマー化合物である、実施形態445~449のいずれかに記載の方法。
12~21個の連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドが、A-B-Cという式を有し、式中、Aが、5’領域であり、Bが、中央領域であり、Cが、3’領域であり、
前記5’領域が、1~5つの連結ヌクレオシドからなり、前記5’領域の少なくとも1つのヌクレオシドが、修飾糖を含む修飾ヌクレオシドであり、
前記3’領域が、1~5つの連結ヌクレオシドからなり、前記3’領域の少なくとも1つのヌクレオシドが、修飾糖を含む修飾ヌクレオシドであり、
前記中央領域が、7~11個の連結ヌクレオシドからなり、
前記中央領域の最も5’側の部分が、下記の式:
(Nda)(Nx)(Ny)(Nz)(Ndb)
を有し、式中、Nx、Ny、及びNzの1つが、安全性増強ヌクレオシドであり、
Nx、Ny、及びNzのその他の2つが、DNAヌクレオシド、DNA異性体、修飾DNA異性体、及びDNA模倣体から独立して選択され、
Nda及びNdbがそれぞれ、DNAヌクレオシド、DNA異性体、修飾DNA異性体、及びDNA模倣体から独立して選択される前記オリゴマー化合物。
前記5’領域が、1つのヌクレオシドからなる、実施形態551に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域が、2~5つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態551に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域が、2~4つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態551に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域が、2つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態551に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域が、3つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態551に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域が、4つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態551に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域が、5つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態551に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、修飾ヌクレオシドである、実施形態551~558のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、修飾糖を含む修飾ヌクレオシドである、実施形態551~559のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の修飾ヌクレオシドがそれぞれ、同じ修飾を有する、実施形態551~560のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の少なくとも2つのヌクレオシドが、異なる修飾を有する修飾ヌクレオシドである、実施形態551~560のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、2’-修飾リボシル糖部分を含む、実施形態551~562のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の少なくとも1つのヌクレオシドが、二環式フラノシル糖部分を含む、実施形態551~563のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、二環式フラノシル糖部分を含む、実施形態551~564のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の少なくとも1つのヌクレオシドが、非二環式糖部分を含む、実施形態551~565のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の前記少なくとも1つのヌクレオシドの前記非二環式糖部分が、2’-置換リボシル糖部分である、実施形態566に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、非二環式糖部分を含む、実施形態551~567のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、2’-置換フラノシル糖部分を含む、実施形
態568に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、二環式糖部分及び非二環式2’-置換リボシル糖部分から独立して選択される2’-修飾フラノシル糖部分を含む、実施形態551~569のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、二環式糖部分を含む、実施形態551~570のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、非二環式2’-置換リボシル糖部分を含む、実施形態551~571のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の二環式糖部分がそれぞれ、cEt、LNA、及びENAのうちから選択される、実施形態551~572のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の二環式糖部分がそれぞれ、cEt糖部分である、実施形態551~573のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の二環式糖部分がそれぞれ、LNA糖部分である、実施形態551~574のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の非二環式糖部分がそれぞれ、2’-MOE、2’-OMe、及び2’-NMAのうちから選択される2’-置換基を有する、実施形態551~575のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがいずれも、2’-F置換基を有する糖部分を含まない、実施形態551~576のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがいずれも、2’-MOE置換基を有する糖部分を含まない、実施形態551~577のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがいずれも、2’-OMe置換基を有する糖部分を含まない、実施形態551~578のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがいずれも、cEt糖部分を含まない、実施形態551~579のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがいずれも、LNA糖部分を含まない、実施形態551~
580のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の核酸塩基がそれぞれ、チミン、ウラシル、グアニン、シトシン、5-メチルシトシン、及びアデニンのうちから独立して選択される、実施形態551~581のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシド間結合がそれぞれ、ホスホジエステルヌクレオシド間結合及びホスホロチオエートヌクレオシド間結合のうちから選択される、実施形態551~582のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域が、1つのヌクレオシドからなる、実施形態551~583のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域が、2~5つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態551~583のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域が、2~4つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態551~583のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域が、2つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態551~583のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域が、3つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態551~583のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域が、4つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態551~583のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域が、5つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態551~583のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、修飾ヌクレオシドである、実施形態551~590のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、修飾糖部分を含む修飾ヌクレオシドである、実施形態551~591のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の修飾ヌクレオシドがそれぞれ、同じ修飾を有する、実施形態551~5
92のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の少なくとも2つのヌクレオシドが、異なる修飾を有する修飾ヌクレオシドである、実施形態551~592のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、2’-修飾リボシル糖部分を含む、実施形態551~594のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の少なくとも1つのヌクレオシドが、二環式フラノシル糖部分を含む、実施形態551~595のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、二環式フラノシル糖部分を含む、実施形態551~596のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の少なくとも1つのヌクレオシドが、非二環式糖部分を含む、実施形態551~597のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の前記少なくとも1つのヌクレオシドの前記非二環式糖部分が、2’-置換リボシル糖部分である、実施形態598に記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、非二環式糖部分を含む、実施形態551~599のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、2’-置換フラノシル糖部分を含む、実施形態600に記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、二環式糖部分及び非二環式2’-置換リボシル糖部分から独立して選択される2’-修飾フラノシル糖部分を含む、実施形態551~601のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、二環式糖部分を含む、実施形態551~602のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、非二環式2’-置換リボシル糖部分を含む、実施形態551~602のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の二環式糖部分がそれぞれ、cEt、LNA、及びENAのうちから選択される、実施形態551~603のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の二環式糖部分がそれぞれ、cEt糖部分である、実施形態551~605のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の二環式糖部分がそれぞれ、LNA糖部分である、実施形態551~606のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の非二環式糖部分がそれぞれ、2’-MOE、2’-OMe、及び2’-NMAのうちから選択される2’-置換基を有する、実施形態551~607のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがいずれも、2’-F置換基を有する糖部分を含まない、実施形態551~608のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがいずれも、2’-MOE置換基を有する糖部分を含まない、実施形態551~609のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがいずれも、2’-OMe置換基を有する糖部分を含まない、実施形態551~610のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがいずれも、cEt糖部分を含まない、実施形態551~611のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがいずれも、LNA糖部分を含まない、実施形態551~612のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の核酸塩基がそれぞれ、チミン、ウラシル、グアニン、シトシン、5-メチルシトシン、及びアデニンのうちから独立して選択される、実施形態551~613のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシド間結合がそれぞれ、ホスホジエステルヌクレオシド間結合及びホスホロチオエートヌクレオシド間結合のうちから選択される、実施形態551~614のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の前記修飾ヌクレオシドが、前記3’領域の前記修飾ヌクレオシドの修飾と同じ修飾を有する、実施形態551~615のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の少なくとも1つの修飾ヌクレオシドと、前記3’領域の1つの修飾ヌク
レオシドとが、互いに異なる修飾を含む、実施形態551~615のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域及び前記3’領域が共に、少なくとも1つの非二環式2’-置換修飾ヌクレオシド及び少なくとも1つの二環式ヌクレオシドを含む、実施形態551~617のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記二環式ヌクレオシドが、cEtヌクレオシドである、実施形態618のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記二環式ヌクレオシドが、LNAヌクレオシドである、実施形態618に記載のオリゴマー化合物。
前記非二環式2’-修飾ヌクレオシドが、2’-MOEヌクレオシドである、実施形態618~620のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記非二環式2’-修飾ヌクレオシドが、2’-OMeヌクレオシドである、実施形態618~620のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域または前記3’領域の少なくとも1つのヌクレオシドが、非修飾DNAヌクレオシドである、実施形態618~622のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、式:
(Nda)(Nx)(Ny)(Nz)(Ndb)(Ndc)q
を有し、式中、Ndcがそれぞれ、非修飾DNAヌクレオシド、DNA異性体、2’-修飾DNA異性体、及びDNA模倣体から独立して選択され、qが、2~6である、実施形態551~623のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、7つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態551~624のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、8つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態551~624のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、9つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態551~624のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、10個の連結ヌクレオシドからなる、実施形態551~624のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、11個の連結ヌクレオシドからなる、実施形態551~624のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
Nxが、前記安全性増強ヌクレオシドである、実施形態551~629のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
Nyが、前記安全性増強ヌクレオシドである、実施形態551~629のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
Nzが、前記安全性増強ヌクレオシドである、実施形態551~629のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、DNA異性体もしくは修飾DNA異性体であるか、または糖代替物、二環式フラノシル糖部分、もしくは非二環式修飾フラノシル糖部分のいずれかを含む修飾ヌクレオシドである、実施形態551~632のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、DNA異性体もしくは修飾DNA異性体であるか、または糖代替物、二環式フラノシル糖部分、非二環式2’-修飾フラノシル糖部分、非二環式3’-修飾フラノシル糖部分、非二環式4’-修飾フラノシル糖部分、もしくは非二環式5’-修飾フラノシル糖部分のいずれかを含む、実施形態551~33のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、モルホリノ、修飾モルホリノ、修飾シクロヘキセニル、または修飾テトラヒドロピランから選択される糖代替物を含む、実施形態551~634のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、モルホリノ、修飾モルホリノ、CeNA、F-CeNA、HNA、OMe-HNA、またはF-HNAから選択される糖代替物を含む、実施形態551~634のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、2’-β-L-デオキシリボシル、2’-α-D-デオキシキシロシル、2’-α-D-デオキシリボシル、2’-α-L-デオキシキシロシル、及び2’-β-L-デオキシキシロシルのうちから選択される糖部分を含むDNA異性体である、実施形態551~634のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、及び2’-β-L-デオキシリボシルのうちから選択される糖部分を
含むDNA異性体である、実施形態551~634のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-修飾糖部分を含む修飾DNA異性体であり、前記糖部分が有する立体構造が、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、2’-β-L-デオキシリボシル、2’-α-D-デオキシキシロシル、1,2’-α-L-デオキシキシロシル、及び2’-β-L-デオキシキシロシルであり、2’位が、ヒドロキシル置換基、フルオロ置換基、またはO-C1-C10アルコキシ置換基でさらに置換される、実施形態551~634のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-修飾糖部分を含む修飾DNA異性体であり、前記糖部分が有する立体構造が、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、2’-β-L-デオキシリボシル、2’-α-D-デオキシキシロシル、1,2’-α-L-デオキシキシロシル、及び2’-β-L-デオキシキシロシルであり、2’位が、ヒドロキシル置換基、フルオロ置換基、またはOMe置換基でさらに置換される、実施形態551~634のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-修飾糖部分を含む修飾DNA異性体であり、前記糖部分が有する立体構造が、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、2’-β-L-デオキシリボシル、2’-α-D-デオキシキシロシル、1,2’-α-L-デオキシキシロシル、及び2’-β-L-デオキシキシロシルであり、2’位が、フルオロ置換基またはOMe置換基でさらに置換される、実施形態551~634のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、及び2’-β-L-デオキシリボシルのうちから選択される糖部分を含む修飾DNA異性体であり、2’位が、ヒドロキシル置換基、フルオロ置換基、またはOMe置換基でさらに置換される、実施形態551~634のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、二環式フラノシル糖部分を含む修飾ヌクレオシドである、実施形態551~634のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、cEt、LNA、α-L-LNA、及びENAのうちから選択される、実施形態551~634のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-置換フラノシル糖部分を含む、実施形態551~634のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドの前記2’-置換フラノシル糖部分が、ハロ、アリル、アミノ、アジド、SH、CN、OCN、CF3、OCF3、O-C1-C10アルコキシ、
O-C1-C10置換アルコキシ、C1-C10アルキル、C1-C10置換アルキル、S-アルキル、N(Rm)-アルキル、O-アルケニル、S-アルケニル、N(Rm)-アルケニル、O-アルキニル、S-アルキニル、N(Rm)-アルキニル、O-アルキレニル-O-アルキル、アルキニル、アルカリル、アラルキル、O-アルカリル、O-アラルキル、O(CH2)2SCH3、O(CH2)2ON(Rm)(Rn)、またはOCH2C(=O)-N(Rm)(Rn)から選択される2’置換基を有し、式中、Rm及びRnがそれぞれ、独立して、H、アミノ保護基、または置換もしくは非置換のC1-C10アルキルである、実施形態645に記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドの前記2’-置換フラノシル糖部分が、ハロ、O-C1-C10アルコキシ、O-C1-C10置換アルコキシ、C1-C10アルキル、C1-C10置換アルキル、S-アルキル、N(Rm)-アルキル、O(CH2)2ON(Rm)(Rn)、またはOCH2C(=O)-N(Rm)(Rn)から選択される2’置換基を有し、式中、Rm及びRnがそれぞれ、独立して、H、アミノ保護基、または置換もしくは非置換のC1-C10アルキルである、実施形態645に記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドの前記2’-置換フラノシル糖部分が、フルオロ、OMe、MOE、NMAから選択される2’置換基を有する、実施形態645に記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-OMeまたは2’-MOEを含む2’-置換フラノシル糖部分を含む、実施形態551~648のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-OMeを含む2’-置換フラノシル糖部分を含む、実施形態551~649のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-OMe修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を含む、実施形態551~650のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、ハロ、アリル、アミノ、アジド、SH、CN、CF3、OCF3、C1-C10アルキル、C1-C10置換アルキル、S-アルキル、N(Rm)-アルキル、N(Rm)-アルケニル、N(Rm)-アルキニル、O-アルキレニル-O-アルキル、アルキニル、アルカリル、またはアラルキルから選択される3’置換基を有する3’-修飾フラノシル糖部分を含む、実施形態551~634のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、C1-C10アルキルまたはC1-C10置換アルキルから選択される3’置換基を有する3’-修飾フラノシル糖部分を含む、実施形態551~634または実施形態652のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、3’-メチルフラノシル糖部分を含む、実施形態551~634または実施形態652~653のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、ハロ、アリル、アミノ、アジド、SH、CN、OCN、CF3、OCF3、O-C1-C10アルコキシ、O-C1-C10置換アルコキシ、C1-C10アルキル、C1-C10置換アルキル、S-アルキル、N(Rm)-アルキル、O-アルケニル、S-アルケニル、N(Rm)-アルケニル、O-アルキニル、S-アルキニル、N(Rm)-アルキニル、O-アルキレニル-O-アルキル、アルキニル、アルカリル、アラルキル、O-アルカリル、O-アラルキル、O(CH2)2SCH3、O(CH2)2ON(Rm)(Rn)、またはOCH2C(=O)-N(Rm)(Rn)から選択される4’置換基を有する4’-修飾フラノシル糖部分を含み、式中、Rm及びRnがそれぞれ、独立して、H、アミノ保護基、または置換もしくは非置換のC1-C10アルキルである、実施形態551~634のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、4’-メチルを有する4’-修飾フラノシル糖部分を含む、実施形態551~634または実施形態655のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、以下に示される構造を有し、式中、Rが、任意選択の2’置換基を示し、Bxが、ヘテロ環式塩基部分である、実施形態551~634のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
Rが、H、OH、OMe、F、またはMOEのうちから選択される、実施形態657に記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、ハロ、アリル、アミノ、アジド、SH、CN、OCN、CF3、OCF3、O-C1-C10アルコキシ、O-C1-C10置換アルコキシ、C1-C10アルキル、C1-C10置換アルキル、S-アルキル、N(Rm)-アルキル、O-アルケニル、S-アルケニル、N(Rm)-アルケニル、O-アルキニル、S-アルキニル、N(Rm)-アルキニル、O-アルキレニル-O-アルキル、アルキニル、アルカリル、アラルキル、O-アルカリル、O-アラルキル、O(CH2)2SCH3、O(CH2)2ON(Rm)(Rn)、またはOCH2C(=O)-N(Rm)(Rn)から選択される5’置換基を有する5’-修飾フラノシル糖部分を含み、式中、Rm及びRnがそれぞれ、独立して、H、アミノ保護基、または置換もしくは非置換のC1-C10アルキルである、実施形態551~634のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、5’-メチル、5’-エチル、または5’-アリルから選択される5’置換基を有する5’-修飾フラノシル糖部分を含む、実施形態551~
634または実施形態659のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、5’-(R)-メチル-または5’-(R)-エチルから選択される5’置換基を有する5’-修飾フラノシル糖部分を含む、実施形態551~634または実施形態659~660のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、5’-(R)-メチル-2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を含む、実施形態551~634または実施形態659~661のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、5’-(R)-エチル-2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を含む、実施形態551~634または実施形態659~662のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-F修飾糖部分を含まない、実施形態551~663のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、cEt修飾糖部分を含まない、実施形態551~664のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-MOE修飾糖部分を含まない、実施形態551~665のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、ヒポキサンチン核酸塩基を含む、実施形態551~666のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、A、T、G、C、mC、及びUのうちから選択される核酸塩基を含む、実施形態551~667のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、cEt、MOE、LNA、またはFANA以外の修飾ヌクレオシドである、実施形態551~668のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
Ndがそれぞれ、DNAヌクレオシド、DNA異性体、修飾DNA異性体、及びDNA模倣体のうちから独立して選択される、実施形態551~669のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
DNA異性体がそれぞれ、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、2’-β-L-デオキシリボシル、2’-α-D-デオキシキシロシル、2’-α-D-デオキシリボシル、2’-α-L-デオキシキシロシル、及び2’-β-L
-デオキシキシロシルのうちから選択される糖部分を含む、実施形態670に記載のオリゴマー化合物。
DNA異性体がそれぞれ、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、及び2’-β-L-デオキシリボシルのうちから選択される糖部分を含む、実施形態671に記載のオリゴマー化合物。
修飾DNA異性体がそれぞれ、2’-修飾糖部分を含み、前記糖部分が有する立体構造が、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、2’-β-L-デオキシリボシル、2’-α-D-デオキシキシロシル、1,2’-α-L-デオキシキシロシル、及び2’-β-L-デオキシキシロシルであり、2’位が、ヒドロキシル置換基、フルオロ置換基、またはO-C1-C10アルコキシ置換基でさらに置換される、実施形態670に記載のオリゴマー化合物。
修飾DNA異性体がそれぞれ、2’-修飾糖部分を含み、前記糖部分が有する立体構造が、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、2’-β-L-デオキシリボシル、2’-α-D-デオキシキシロシル、1,2’-α-L-デオキシキシロシル、及び2’-β-L-デオキシキシロシルであり、2’位が、ヒドロキシル置換基、フルオロ置換基、またはOMe置換基でさらに置換される、実施形態673に記載のオリゴマー化合物。
修飾DNA異性体がそれぞれ、2’-修飾糖部分を含み、前記糖部分が有する立体構造が、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、2’-β-L-デオキシリボシル、2’-α-D-デオキシキシロシル、1,2’-α-L-デオキシキシロシル、及び2’-β-L-デオキシキシロシルであり、2’位が、フルオロ置換基またはOMe置換基でさらに置換される、実施形態674に記載のオリゴマー化合物。
修飾DNA異性体がそれぞれ、2’-修飾糖部分を含み、前記糖部分が、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、及び2’-β-L-デオキシリボシルのうちから選択され、2’位が、ヒドロキシル置換基、フルオロ置換基、またはOMe置換基でさらに置換される、実施形態675に記載のオリゴマー化合物。
DNA模倣体がそれぞれ、以下の式:
の1つによって示される構造を含み、
式中、Xが、OまたはSであり、Bxが、ヘテロ環式塩基部分を示す、実施形態670に記載のオリゴマー化合物。
DNA模倣体がそれぞれ、以下の式:
の1つによって示される構造を含み、式中、Xが、OまたはSであり、Bxが、ヘテロ環式塩基部分を示し、R1が、H、OH、ハロ、アリル、アミノ、アジド、SH、CN、OCN、CF3、OCF3、O-C1-C10アルコキシ、O-C1-C10置換アルコキシ、C1-C10アルキル、C1-C10置換アルキル、S-アルキル、N(Rm)-アルキル、O-アルケニル、S-アルケニル、N(Rm)-アルケニル、O-アルキニル、
S-アルキニル、N(Rm)-アルキニル、O-アルキレニル-O-アルキル、アルキニル、アルカリル、アラルキル、O-アルカリル、O-アラルキル、O(CH2)2SCH3、O(CH2)2ON(Rm)(Rn)、またはOCH2C(=O)-N(Rm)(Rn)のうちから選択され、式中、Rm及びRnがそれぞれ、独立して、H、アミノ保護基、または置換もしくは非置換のC1-C10アルキルである、実施形態670に記載のオリゴマー化合物。
R1が、H、OH、OMe、またはFである、実施形態678に記載のオリゴマー化合物。
R1が、Fではない、実施形態678に記載のオリゴマー化合物。
DNA模倣体がそれぞれ、以下の式:
によって示される構造を含み、
式中、Xが、Oであり、Bxが、ヘテロ環式塩基部分を示し、R1が、Hである、実施形態670に記載のオリゴマー化合物。
DNA模倣体が、5’-メチル-2’-β-D-デオキシリボシル、5’-エチル-2’-β-D-デオキシリボシル、及び5’-アリル-2’-β-D-デオキシリボシルのうちから選択される糖部分を有する、実施形態670に記載のオリゴマー化合物。
DNA模倣体が、2’-フルオロ-β-D-アラビノフラノシル糖部分を含む、実施形態670に記載のオリゴマー化合物。
前記DNA模倣体が、2’-フルオロ-β-D-アラビノフラノシル糖部分を含まない、実施形態670に記載のオリゴマー化合物。
Ndがそれぞれ、DNAヌクレオシドである、実施形態551~684のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、DNA異性体、修飾DNA異性体、及びDNA模倣体のうちから選択される4つを超えないヌクレオシドを含む、実施形態551~685のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、DNA異性体、修飾DNA異性体、及びDNA模倣体のうちから選択される3つを超えないヌクレオシドを含む、実施形態551~685のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、DNA異性体、修飾DNA異性体、及びDNA模倣体のうちから選択される2つを超えないヌクレオシドを含む、実施形態551~685のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、DNA異性体、修飾DNA異性体、及びDNA模倣体のうちから選択される1つを超えないヌクレオシドを含む、実施形態551~685のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、安全性増強ヌクレオシドを厳密に1つ含み、前記中央領域における残りのヌクレオシドが、DNAヌクレオシドである、実施形態551~689のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
ヌクレオシド間Nda-Nx、ヌクレオシド間Nx-Ny、ヌクレオシド間Ny-Nz、またはヌクレオシド間Nz-隣接Ndbのうちから選択される、前記中央領域の少なくとも1つのヌクレオシド間結合が、中性ヌクレオシド間結合である、実施形態551~690のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中性結合が、ホスホネートヌクレオシド間結合である、実施形態691に記載のオリゴマー化合物。
前記中性結合が、メトキシプロピルヌクレオシド間結合である、実施形態691に記載のオリゴマー化合物。
残りのヌクレオシド間結合がそれぞれ、ホスホジエステルヌクレオシド間結合またはホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態691に記載のオリゴマー化合物。
実施形態551~690のいずれかに記載の修飾オリゴヌクレオチドのキラル富化集団であって、前記中央領域が、特定の立体化学的配置を有する少なくとも1つの特定のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を有する前記キラル富化集団。
前記中央領域が、(Sp)配置を有する少なくとも1つのホスホロチオエートヌクレオシド間結合を有する、実施形態695に記載のキラル富化集団。
中央領域が、(Rp)配置を有する少なくとも1つのホスホロチオエートヌクレオシド間結合を有する、実施形態695に記載のキラル富化集団。
前記中央領域が、それぞれのホスホロチオエートヌクレオシド間結合に対して独立に選択される特定の立体化学的配置を有する、実施形態695に記載のキラル富化集団。
前記中央領域の前記それぞれのホスホロチオエートヌクレオシド間結合が、(Sp)配置を有する、実施形態698に記載のキラル富化集団。
前記中央領域が、(Rp)配置を有する1つのホスホロチオエートヌクレオシド間結合を有し、前記中央領域の残りのホスホロチオエートヌクレオシド間結合がそれぞれ、(Sp)配置を有する、実施形態698に記載のキラル富化集団。
前記中央領域が、(Sp)ホスホロチオエートヌクレオシド間結合に隣接する(Rp)ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を有する、実施形態695に記載のキラル富化集団。
前記中央領域が、第2の(Rp)ホスホロチオエートヌクレオシド間結合に隣接する(Rp)ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を有する、実施形態695に記載のキラル富化集団。
前記中央領域が、第2の(Rp)ホスホロチオエートヌクレオシド間結合に隣接する(Rp)ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を有し、前記中央領域の残りのホスホロチオエートヌクレオシド間結合がそれぞれ、(Sp)配置を有する、実施形態695に記載のキラル富化集団。
(Rp)配置または(Sp)配置を有さないホスホロチオエートヌクレオシド間結合がそれぞれ、立体ランダムである、実施形態696、実施形態697、実施形態701、または実施形態702のいずれかに記載のキラル富化集団。
複合基を含む、実施形態551~704のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記複合基が、前記複合基の残部を前記修飾オリゴヌクレオチドに付加する連結基を含み、前記連結基が、1~5つのヌクレオシドを含む、実施形態705に記載のオリゴマー化合物。
前記オリゴマー化合物が、前記修飾オリゴヌクレオチドのヌクレオシド以外には追加のヌクレオシドを含まない、実施形態1~705のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、標的RNAに相補的である、実施形態551~707のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、前記標的RNAに少なくとも85%相補的である、実施形態708に記載のオリゴマー化合物。
前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、前記標的RNAに少なくとも90%相補的である、実施形態708に記載のオリゴマー化合物。
前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、前記標的RNAに少なくとも95%相補的である、実施形態708に記載のオリゴマー化合物。
前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、前記標的RNAに100%相補的である、実施形態711に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、標的mRNAまたは標的pre-mRNAである、実施形態708~712のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的mRNAまたは標的pre-mRNAが、マウス、ラット、サル、またはヒトのPTENのRNAではない、実施形態713に記載のオリゴマー化合物。
前記標的mRNAまたは標的pre-mRNAが、マウス、ラット、サル、またはヒトのSRB-1のRNAではない、実施形態713または実施形態714に記載のオリゴマー化合物。
前記標的mRNAまたは標的pre-mRNAが、マウス、ラット、サル、またはヒトのMYD88のRNAではない、実施形態713~715のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的mRNAまたは標的pre-mRNAが、マウス、ラット、サル、またはヒトのHTTのRNAではなく、マウス、ラット、サル、またはヒトのSOD1のRNAではなく、マウス、ラット、サル、またはヒトのアルファ-シヌクレインのRNAではない、実施形態713~716のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、ヒトのRNAである、実施形態708~717のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、肝臓において発現する、実施形態708~718のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、肝臓標的である、実施形態708~719のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、肝臓において発現しない、実施形態708~718のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、肝臓標的ではない、実施形態708~718または実施形態721のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
肝臓における前記標的RNAの発現を調節することが、障害または状態の治療と関連する、実施形態708~722のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、肝臓の障害または状態である、実施形態723に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、中枢神経系において発現する、実施形態708~724のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、中枢神経系において発現しない、実施形態708~724のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、中枢神経系標的である、実施形態708~725のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、中枢神経系標的ではない、実施形態708~726のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、MeCP2のRNA、DUX4のRNA、HDAC2のRNA、APPのRNA、アタキシン1のRNA、アタキシン2のRNA、アタキシン3のRNA、アタキシン6のRNA、アタキシン7のRNA、C9ORF72のRNA、UBE3AのRNA、プリオンのRNA、PMP22のRNA、タウのRNA、LRRK2のRNA、LINGO2のRNA、GYS1のRNA、KCNT1のRNA、IRF8のRNA、プログラニュリンのRNA、またはGFAPのRNAである、実施形態708~727のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、HTTのRNAである、実施形態708~729のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、MeCP2のRNAである、実施形態729に記載のオリゴマー化
合物。
前記標的RNAが、DUX4のRNAである、実施形態729に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、HDAC2のRNAである、実施形態729に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、アタキシン1のRNAである、実施形態729に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、アタキシン2のRNAである、実施形態729に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、アタキシン3のRNAである、実施形態729に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、アタキシン6のRNAである、実施形態729に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、アタキシン7のRNAである、実施形態729に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、C9ORF72のRNAである、実施形態729に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、アルファ-シヌクレインのRNAである、実施形態708~727に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、UBE3AのRNAである、実施形態729に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、SOD1のRNAである、実施形態708~727のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、プリオンのRNAである、実施形態708~727のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、PMP22のRNAである、実施形態708~727のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、タウのRNAである、実施形態708~727のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、LRRK2のRNAである、実施形態708~727のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、APPのRNAである、実施形態708~727のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、LINGO2のRNAである、実施形態708~727のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、GYS1のRNAである、実施形態708~727のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、KCNT1のRNAである、実施形態708~727のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、IRF8のRNAである、実施形態708~727のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、プログラニュリンのRNAである、実施形態708~727のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、GFAPのRNAである、実施形態708~727のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
中枢神経系における前記標的RNAの発現を調節することが、障害または状態の治療と関連する、実施形態725~753のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、神経学的な障害または状態である、実施形態754に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、感覚ニューロンまたは運動ニューロンの機能を変化させる、実
施形態754~755に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、感覚ニューロンの機能を変化させる、実施形態754~756のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、運動ニューロンの機能を変化させる、実施形態754~757のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、グリア細胞の機能を変化させる、実施形態754~758のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、アストロサイトの機能を変化させる、実施形態754~759のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、オリゴデンドロサイトの機能を変化させる、実施形態754~760のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、ミクログリアの機能を変化させる、実施形態754~761のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、上衣細胞の機能を変化させる、実施形態754~762のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、アルツハイマー病、筋萎縮性側索硬化症、パーキンソン病、脊髄小脳失調症、アンジェルマン症候群、アレキサンダー病、ラフォラ病、シャルコー・マリー・トゥース病、プリオン病、認知症、神経変性、MeCP2重複症候群、脳症、神経炎症、または多発性硬化症である、実施形態754~763のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、アルツハイマー病である、実施形態764に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、筋萎縮性側索硬化症である、実施形態764に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、パーキンソン病である、実施形態764に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、脊髄小脳失調症である、実施形態764に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、アンジェルマン症候群である、実施形態764に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、アレキサンダー病である、実施形態764に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、ラフォラ病である、実施形態764に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、シャルコー・マリー・トゥース病である、実施形態764に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、プリオン病である、実施形態764に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、認知症である、実施形態764に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、神経変性である、実施形態764に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、MeCP2重複症候群である、実施形態764に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、脳症である、実施形態764に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、神経炎症である、実施形態764に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、多発性硬化症である、実施形態764に記載のオリゴマー化合物。
実施形態551~779のいずれかに記載のオリゴマー化合物の親オリゴマー化合物が、インビトロで細胞毒性を有する、実施形態551~779のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物が、標準的なインビトロ細胞毒性アッセイにおいて細胞毒性を
有する、実施形態780に記載のオリゴマー化合物。
実施形態551~781のいずれかに記載のオリゴマー化合物の親オリゴマー化合物がマウスに投与されると、前記マウスに肝毒性が生じる、実施形態551~781のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記マウスに対する前記親オリゴマー化合物の前記投与が、全身投与である、実施形態782に記載のオリゴマー化合物。
前記全身投与が、皮下投与である、実施形態783に記載のオリゴマー化合物。
前記マウスが、CD-1マウスである、実施形態782~784のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記マウスが、C57BL/6マウスである、実施形態782~784のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記マウスが、BALB/cマウスである、実施形態782~784のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物の前記投与の後に、前記マウスにおける血漿中ALTレベルが、リットル当たり500単位超である、実施形態782~784のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物の前記投与の後に、前記マウスにおける血漿中ASTレベルが、リットル当たり500単位超である、実施形態782~788のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物の前記投与の後に、前記マウスにおける血漿中ALTレベルが、リットル当たり1000単位超である、実施形態782~789のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物の前記投与の後に、前記マウスにおける血漿中ASTレベルが、リットル当たり1000単位超である、実施形態782~790のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記肝毒性が、前記親オリゴマー化合物の前記投与から24~48時間後に測定される、実施形態782~791のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記肝毒性が、前記親オリゴマー化合物の前記投与から72時間後に測定される、実施形態782~791のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記肝毒性が、前記親オリゴマー化合物の前記投与から3日後に測定される、実施形態782~791のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記肝毒性が、前記親オリゴマー化合物の前記投与から5日後に測定される、実施形態782~791のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記肝毒性が、前記親オリゴマー化合物の前記投与から7日後に測定される、実施形態782~791のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記肝毒性が、前記親オリゴマー化合物の前記投与から10日後に測定される、実施形態782~791のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記肝毒性が、前記親オリゴマー化合物の前記投与から14日後に測定される、実施形態782~791のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物が、1~10mg/kgで前記マウスに投与される、実施形態782~791のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物が、10~25mg/kgで前記マウスに投与される、実施形態782~791のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物が、25~50mg/kgで前記マウスに投与される、実施形態782~791のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物が、50~100mg/kgで前記マウスに投与される、実施形態782~791のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物が、100~150mg/kgで前記マウスに投与される、実施形態782~791のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記マウスが、BALB/cマウスであり、前記親オリゴマー化合物が、150mg/kgで前記マウスに投与され、前記マウスにおける血漿中ALTレベルが、前記親オリゴマー化合物の前記投与から72時間後に測定される、実施形態782~791のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
実施形態551~804のいずれかに記載のオリゴマー化合物が50mg/kgでマウスに投与されると、前記マウスに肝毒性が生じない、実施形態551~804のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
実施形態805に記載のオリゴマー化合物の前記投与の後に、前記マウスにおける血漿中ALTレベルが、リットル当たり100単位未満である、実施形態805に記載のオリゴマー化合物。
前記マウスにおける血漿中ALTレベルが、実施形態384または実施形態385に記載のオリゴマー化合物の親オリゴマー化合物が投与されたマウスにおける血漿中ALTレベルと比較して少なくとも10倍低く、実施形態384または実施形態385のオリゴマー化合物の前記投与及び血漿中ALT測定も、前記親オリゴマー化合物の前記投与及び血漿中ALT測定も、同じ方法で完結される、実施形態805または実施形態806に記載のオリゴマー化合物。
前記マウスにおける血漿中ALTレベルが、前記親オリゴマー化合物が投与された前記マウスにおける血漿中ALTレベルと比較して少なくとも100倍低い、実施形態807に記載のオリゴマー化合物。
前記マウスにおける血漿中ALTレベルが、前記親オリゴマー化合物が投与された前記マウスにおける血漿中ALTレベルと比較して少なくとも500倍低い、実施形態807に記載のオリゴマー化合物。
実施形態782~809のいずれかに記載のオリゴマー化合物の、マウスにおける治療指数が、前記親オリゴマー化合物の治療指数と比較して増加している、実施形態782~809のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
実施形態365に記載のオリゴマー化合物の、マウスにおける治療指数が、前記親オリゴマー化合物の治療指数と比較して少なくとも2倍高い、実施形態810に記載のオリゴマー化合物。
ホスホロチオエート以外の前記少なくとも1つの修飾ヌクレオシド間結合、及び/または5-メチルシトシン以外の修飾核酸塩基及び/または修飾糖部分を含む前記少なくとも1つの修飾ヌクレオシド、を前記中央領域に含まないこと以外は同一のオリゴマー化合物が、マウスへの投与後に肝毒性を生じさせ、
前記そのこと以外は同一のオリゴマー化合物が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合と、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分と、チミン、ウラシル、アデニン、グアニン、シトシン、及び5-メチルシトシンから選択される核酸塩基と、からなる中央領域を有する、実施形態551~811のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
ホスホロチオエート以外の前記少なくとも1つの修飾ヌクレオシド間結合、及び/また
は5-メチルシトシン以外の修飾核酸塩基及び/または修飾糖部分を含む前記少なくとも1つの修飾ヌクレオシド、を前記中央領域に含み、前記修飾糖部分が、2’-O-メチル修飾糖部分である、実施形態812に記載のオリゴマー化合物。
前記2’-O-メチル修飾糖部分が、前記中央領域の位置2に存在する、実施形態813に記載のオリゴマー化合物。
前記そのこと以外は同一のオリゴマー化合物が、2’-O-メチル修飾糖部分を含まず、前記そのこと以外は同一のオリゴマー化合物が、前記2’-O-メチル修飾糖部分の代わりに非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を含む、実施形態812~814に記載のオリゴマー化合物。
前記そのこと以外は同一のオリゴマー化合物の核酸塩基配列が、前記標的RNAに100%相補的である、実施形態812~815のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記そのこと以外は同一のオリゴマー化合物が、実施形態812~816のいずれかに記載のオリゴマー化合物の親オリゴマー化合物である、実施形態812~816のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記オリゴマー化合物が、標準的なインビトロ活性アッセイにおいて100nM未満のIC50で前記標的RNAを抑制する、実施形態708~817のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
実施形態708~818のいずれかに記載のオリゴマー化合物の親オリゴマー化合物が、標準的なインビトロ活性アッセイにおいて100nM未満のIC50で前記標的RNAを抑制する、実施形態708~818のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
標準的なインビトロ活性アッセイで測定された前記親オリゴマー化合物のIC50と、標準的なインビトロ活性アッセイで測定された実施形態708~819のいずれかに記載のオリゴマー化合物のIC50と、の間の差異が4倍未満である、実施形態708~819のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
標準的なインビトロ活性アッセイで測定された前記親オリゴマー化合物のIC50と、標準的なインビトロ活性アッセイで測定された実施形態708~820のいずれかに記載のオリゴマー化合物のIC50と、の間の差異が3倍未満である、実施形態708~820のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
標準的なインビトロ活性アッセイで測定された前記親オリゴマー化合物のIC50と、標準的なインビトロ活性アッセイで測定された実施形態708~821のいずれかに記載のオリゴマー化合物のIC50と、の間の差異が2倍未満である、実施形態708~821のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物の前記中央領域の糖部分がそれぞれ、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分であり、前記親オリゴマー化合物の前記中央領域のヌクレオシド間結合がそれぞれ、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態708~822のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物の核酸塩基配列が、前記標的RNAに100%相補的である、実施形態708~823のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
10~50mgの前記オリゴマー化合物がヒトに投与されると、前記ヒトに肝毒性が生じない、実施形態551~824のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
50~100mgの前記オリゴマー化合物がヒトに投与されると、前記ヒトに肝毒性が生じない、実施形態551~824のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
100~300mgの前記オリゴマー化合物がヒトに投与されると、前記ヒトに肝毒性が生じない、実施形態551~824のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記投与が、全身投与である、実施形態825~827のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
実施形態551~828のいずれかに記載のオリゴマー化合物と、第2のオリゴマー化合物と、を含む組成物であって、前記第2のオリゴマー化合物が、実施形態551~828のいずれかに記載のオリゴマー化合物に相補的である前記組成物。
前記第2のオリゴマー化合物が、実施形態551~828のいずれかに記載のオリゴマー化合物に少なくとも90%相補的な少なくとも14個の近接する連結ヌクレオシドを含む、実施形態829に記載の組成物。
前記第2のオリゴマー化合物が、実施形態551~828のいずれかに記載のオリゴマー化合物に100%相補的な少なくとも14個の近接する連結ヌクレオシドを含む、実施形態830に記載の組成物。
実施形態551~828のいずれかに記載のオリゴマー化合物を含む医薬組成物、または実施形態829~831のいずれかに記載の組成物であって、前記医薬組成物または組成物が、医薬的に許容可能な担体または希釈剤を含む前記医薬組成物または組成物。
実施形態551~832のいずれかに記載のオリゴマー化合物または組成物をヒト対象に投与することを含む方法。
実施形態551~832のいずれかに記載のオリゴマー化合物または組成物をヒト対象に投与することを含む、疾患または障害の治療方法。
ヒト対象における標的RNAの量または活性の調節方法であって、前記方法が、実施形態551~832のいずれかに記載のオリゴマー化合物または組成物を前記ヒト対象に投与すること、及びそれによって前記ヒト対象における前記標的RNAの量または活性を調節すること、を含む前記方法。
ヒト対象における疾患または障害の治療方法であって、前記方法が、実施形態551~832のいずれかに記載のオリゴマー化合物または組成物を、前記疾患または障害を有する前記ヒト対象に投与すること、及びそれによって前記ヒト対象における前記疾患または障害を治療すること、を含む前記方法。
前記疾患または障害が、肝疾患であり、前記オリゴマー化合物が、肝臓標的RNAの量または活性を調節する、実施形態835~836に記載の方法。
前記疾患または障害が、中枢神経系疾患であり、前記オリゴマー化合物が、中枢神経系標的RNAの量または活性を調節する、実施形態835~837に記載の方法。
前記疾患または障害が、がん、神経変性疾患、循環器疾患、免疫疾患、遺伝性疾患、反復配列伸長疾患、筋肉消耗疾患、または代謝疾患である、実施形態834~838のいずれかに記載の方法。
前記投与の後の前記ヒト対象の血漿中ALTレベルが、前記投与の前のものと比較して3倍を超えない、実施形態834~839のいずれかに記載の方法。
前記投与の後の前記ヒト対象の血漿中ALTレベルが、リットル当たり150単位を超えない、実施形態834~840のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、肝損傷に感受性である、実施形態834~841のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、肝変性に感受性である、実施形態834~842のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、肝臓におけるアポトーシスの上昇に感受性である、実施形態834~843のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、肝疾患を有する、実施形態834~844のいずれかに記載の方法。
実施形態551~832のいずれかに記載のオリゴマー化合物の親オリゴマー化合物をマウスに投与することを含む、実施形態834~841のいずれかに記載の方法。
実施形態551~832のいずれかに記載のオリゴマー化合物の親オリゴマー化合物と細胞を接触させることを含む、実施形態833~846のいずれかに記載の方法。
前記親オリゴマー化合物の前記中央領域の糖部分がそれぞれ、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分であり、前記親オリゴマー化合物の前記中央領域のヌクレオシド間結合がそれぞれ、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態846~847に記載の方法。
オリゴマー化合物の設計方法であって、前記方法が、親オリゴマー化合物を出発物質とすること、及び実施形態551~833のいずれか1つに記載のオリゴマー化合物に至るように前記化合物の設計を変更すること、を含む前記方法。
オリゴマー化合物の設計方法であって、前記方法が、親オリゴマー化合物を同定すること、及び第2のオリゴマー化合物に至るように前記親オリゴマー化合物の設計を変更すること、を含み、前記第2のオリゴマー化合物が、実施形態551~833のいずれか1つに記載のオリゴマー化合物である前記方法。
オリゴマー化合物の肝毒性の改善方法であって、前記方法が、(i)マウスにおいてリットル当たり300単位超の血漿中ALTレベルを有する親オリゴマー化合物を同定するステップと、(ii)実施形態551~833のいずれか1つに記載のオリゴマー化合物を提供するステップと、を含む前記方法。
前記方法によって、前記親オリゴマー化合物と比較して治療指数が改善したオリゴマー化合物が設計される、実施形態851に記載の方法。
前記方法によって、前記親オリゴマー化合物と比較して肝毒性が低下したオリゴマー化合物が設計される、実施形態851~852に記載の方法。
前記第2のオリゴマー化合物の治療指数が、前記親オリゴマー化合物と比較して改善される、実施形態853に記載の方法。
マウスにおける前記第2のオリゴマー化合物の肝毒性が、前記親オリゴマー化合物と比較して低減される、実施形態851~852に記載の方法。
実施形態551~833のいずれか1つに記載のオリゴマー化合物の肝毒性が、前記親オリゴマー化合物と比較して低減される、実施形態855に記載の方法。
実施形態551~833のいずれかに記載のオリゴマー化合物をマウスに投与すること、及び実施形態551~833のいずれかに記載のオリゴマー化合物の親オリゴマー化合物を第2のマウスに別に投与すること、を含む方法であって、実施形態551~833のいずれかに記載のオリゴマー化合物の治療指数が、前記親オリゴマー化合物の治療指数と比較して改善される前記方法。
前記マウス、前記細胞、及び/または前記ヒト対象においてp21のRNAのレベルが測定される、実施形態833~857のいずれかに記載の方法。
実施形態551~833のいずれかに記載のオリゴマー化合物を対象に投与すること、及び前記対象におけるp21のRNAのレベルを測定すること、を含む方法。
前記対象が、マウスである、実施形態858または実施形態859に記載の方法。
前記対象が、ヒトである、実施形態858または実施形態859に記載の方法。
前記p21のRNAのレベルが、前記投与から24時間以内に測定される、実施形態858~861のいずれかに記載の方法。
前記p21のRNAのレベルが、前記投与から24~48時間後に測定される、実施形態858~862のいずれかに記載の方法。
医学的治療において使用するための、実施形態551~832のいずれか1つに記載のオリゴマー化合物または組成物。
前記オリゴマー化合物が、毒性を有さない、実施形態551~832のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
対照化合物が毒性を有し、前記対照化合物の前記中央領域のヌクレオシドがそれぞれ、2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を含むヌクレオシドであること以外は前記対照化合物が前記オリゴマー化合物と同一である、実施形態551~832のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記オリゴマー化合物がある用量で動物に投与されると生じる循環ALTレベルが、少なくとも1回の適合用量について前記対照化合物が同じ用量で動物に投与されると生じる
前記ALTレベルと比較して少なくとも3倍低い、実施形態866に記載のオリゴマー化合物。
リットル当たり300単位超に循環ALTを上昇させる前記オリゴマー化合物の最低用量が、リットル当たり300単位超に循環ALTを上昇させる前記対照化合物の最低用量と比較して少なくとも3倍高い、実施形態866または実施形態867に記載のオリゴマー化合物。
前記オリゴマー化合物が、細胞における前記標的RNAを低減する能力を有する、実施形態865~868のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記オリゴマー化合物が、対照化合物と同等のRNA低減活性を有し、前記対照化合物の前記中央領域のヌクレオシドがそれぞれ、2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を含むヌクレオシドであること以外は前記対照化合物が前記オリゴマー化合物と同一である、実施形態869に記載のオリゴマー化合物。
前記対照化合物のRNA低減活性と比較して前記RNA低減活性の低下度合いが2倍を超えない、実施形態870に記載のオリゴマー化合物。
ヒト対象における標的RNAの量または活性の調節方法であって、前記方法が、実施形態551~832のいずれかに記載のオリゴマー化合物または組成物を前記ヒト対象に投与すること、及びそれによって前記ヒト対象における前記標的RNAの量または活性を調節すること、を含む前記方法。
ヒト対象における疾患または障害の治療方法であって、前記方法が、実施形態551~832のいずれかに記載のオリゴマー化合物または組成物を、前記疾患または障害を有する前記ヒト対象に投与すること、及びそれによって前記ヒト対象における前記疾患または障害を治療すること、を含む前記方法。
前記疾患または障害が、肝疾患であり、前記オリゴマー化合物が、肝臓標的RNAの量または活性を調節する、実施形態872~873に記載の方法。
前記疾患または障害が、中枢神経系疾患であり、前記オリゴマー化合物が、中枢神経系標的RNAの量または活性を調節する、実施形態872~873に記載の方法。
前記疾患または障害が、がん、神経変性疾患、循環器疾患、免疫疾患、遺伝性疾患、反復配列伸長疾患、筋肉消耗疾患、または代謝疾患である、実施形態872~874のいずれかに記載の方法。
前記投与の後の前記ヒト対象の血漿中ALTレベルが、前記投与の前のものと比較して
3倍を超えない、実施形態872~876のいずれかに記載の方法。
前記投与の後の前記ヒト対象の血漿中ALTレベルが、リットル当たり150単位を超えない、実施形態872~877のいずれかに記載の方法。
ヒト対象における疾患または障害の治療方法であって、前記方法が、実施形態1~410、実施形態452~518、実施形態551~828、または実施形態864~871のいずれかに記載のオリゴマー化合物または組成物を、前記疾患または障害を有する前記ヒト対象に投与すること、及びそれによって前記ヒト対象における前記疾患または障害を治療すること、を含む前記方法。
前記疾患または障害が、CNSの疾患または障害ではない、実施形態879に記載の方法。
前記疾患または障害が、筋肉の疾患または障害である、実施形態879に記載の方法。
前記疾患または障害が、肺の疾患または障害である、実施形態879に記載の方法。
前記疾患または障害が、腎臓の疾患または障害である、実施形態879に記載の方法。
前記疾患または障害が、眼の疾患または障害である、実施形態879に記載の方法。
前記疾患または障害が、膵臓の疾患または障害である、実施形態879に記載の方法。
標的RNAに対する活性についてオリゴマー化合物のライブラリーをスクリーニングする方法であって、オリゴマー化合物の前記ライブラリーが、実施形態1~410、実施形態452~218、実施形態551~831、または実施形態864~871のいずれかに記載のオリゴマー化合物を複数含む前記方法。
12~21個の連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドが、A-B-Cという式を有し、式中、Aが、5’領域であり、Bが、中央領域であり、Cが、3’領域であり、
前記5’領域が、1~5つの連結ヌクレオシドからなり、前記5’領域の少なくとも1つのヌクレオシドが、修飾糖を含む修飾ヌクレオシドであり、
前記3’領域が、1~5つの連結ヌクレオシドからなり、前記3’領域の少なくとも1つのヌクレオシドが、修飾糖を含む修飾ヌクレオシドであり、
前記中央領域が、7~11個の連結ヌクレオシドからなり、
前記中央領域の最も5’側の部分が、下記の式:
(Nda)(Nx)(Ny)(Nz)(Ndb)
を有し、式中、Nx、Ny、及びNzの1つが、安全性増強ヌクレオシドであり、
Nx、Ny、及びNzのその他の2つが、DNAヌクレオシド、DNA異性体、修飾DNA異性体、及びDNA模倣体から独立して選択され、
Nda及びNdbがそれぞれ、DNAヌクレオシド、DNA異性体、修飾DNA異性体、及びDNA模倣体から独立して選択される前記オリゴマー化合物。
前記5’領域が、1つのヌクレオシドからなる、実施形態887に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域が、2~5つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態887に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域が、2~4つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態887に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域が、2つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態887に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域が、3つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態887に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域が、4つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態887に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域が、5つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態887に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、修飾ヌクレオシドである、実施形態887~894のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、修飾糖を含む修飾ヌクレオシドである、実施形態887~895のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の修飾ヌクレオシドがそれぞれ、同じ修飾を有する、実施形態887~896のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の少なくとも2つのヌクレオシドが、異なる修飾を有する修飾ヌクレオシドである、実施形態887~896のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、2’-修飾リボシル糖部分を含む、実施形態887~898のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の少なくとも1つのヌクレオシドが、二環式フラノシル糖部分を含む、実施形態887~899のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、二環式フラノシル糖部分を含む、実施形態887~900のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の少なくとも1つのヌクレオシドが、非二環式糖部分を含む、実施形態887~900のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の前記少なくとも1つのヌクレオシドの前記非二環式糖部分が、2’-置換リボシル糖部分である、実施形態902に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、非二環式糖部分を含む、実施形態887~889または実施形態902~903のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、2’-置換フラノシル糖部分を含む、実施形態904に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、二環式糖部分及び非二環式2’-置換リボシル糖部分から独立して選択される2’-修飾フラノシル糖部分を含む、実施形態887~905のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、二環式糖部分を含む、実施形態887~901または実施形態906のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、非二環式2’-置換リボシル糖部分を含む、実施形態887~889または実施形態902~906のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の二環式糖部分がそれぞれ、cEt、LNA、及びENAのうちから選択される、実施形態887~903または実施形態906~907のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の二環式糖部分がそれぞれ、cEt糖部分である、実施形態887~903または実施形態906~909のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の二環式糖部分がそれぞれ、LNA糖部分である、実施形態887~903または実施形態906~907または実施形態909のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の非二環式糖部分がそれぞれ、2’-MOE、2’-OMe、及び2’-NMAのうちから選択される2’-置換基を有する、実施形態887~900、実施形態902~906、または実施形態908~911のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがいずれも、2’-F置換基を有する糖部分を含まない、実施形態887~912のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがいずれも、2’-MOE置換基を有する糖部分を含まない、実施形態887~913のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがいずれも、2’-OMe置換基を有する糖部分を含まない、実施形態887~914のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがいずれも、cEt糖部分を含まない、実施形態887~915のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがいずれも、LNA糖部分を含まない、実施形態887~916のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の核酸塩基がそれぞれ、チミン、ウラシル、グアニン、シトシン、5-メチルシトシン、及びアデニンのうちから独立して選択される、実施形態887~917のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシド間結合がそれぞれ、ホスホジエステルヌクレオシド間結合及びホスホロチオエートヌクレオシド間結合のうちから独立して選択される、実施形態887~918のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域が、1つのヌクレオシドからなる、実施形態887~919のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域が、2~5つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態887~919のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域が、2~4つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態887~919のい
ずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域が、2つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態887~919のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域が、3つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態887~919のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域が、4つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態887~919のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域が、5つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態887~919のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、修飾ヌクレオシドである、実施形態887~926のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、修飾糖部分を含む修飾ヌクレオシドである、実施形態887~927のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の修飾ヌクレオシドがそれぞれ、同じ修飾を有する、実施形態887~928のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の少なくとも2つのヌクレオシドが、異なる修飾を有する修飾ヌクレオシドである、実施形態887~928のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、2’-修飾リボシル糖部分を含む、実施形態887~930のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の少なくとも1つのヌクレオシドが、二環式フラノシル糖部分を含む、実施形態887~931のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、二環式フラノシル糖部分を含む、実施形態887~932のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の少なくとも1つのヌクレオシドが、非二環式糖部分を含む、実施形態887~933のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の前記少なくとも1つのヌクレオシドの前記非二環式糖部分が、2’-置換リボシル糖部分である、実施形態934に記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、非二環式糖部分を含む、実施形態887~935のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、2’-置換フラノシル糖部分を含む、実施形態936に記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、二環式糖部分及び非二環式2’-置換リボシル糖部分から独立して選択される2’-修飾フラノシル糖部分を含む、実施形態887~937のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、二環式糖部分を含む、実施形態887~935または実施形態938のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、非二環式2’-置換リボシル糖部分を含む、実施形態887~932または実施形態934~938のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の二環式糖部分がそれぞれ、cEt、LNA、及びENAのうちから選択される、実施形態887~935または実施形態938~939のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の二環式糖部分がそれぞれ、cEt糖部分である、実施形態887~935、実施形態938~939、または実施形態941のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の二環式糖部分がそれぞれ、LNA糖部分である、実施形態887~935、実施形態938~939、または実施形態941のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の非二環式糖部分がそれぞれ、2’-MOE、2’-OMe、及び2’-NMAのうちから選択される2’-置換基を有する、実施形態887~932、実施形態934~938、または実施形態940のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがいずれも、2’-F置換基を有する糖部分を含まない、実施形態887~944のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがいずれも、2’-MOE置換基を有する糖部分を含まない、実施形態887~945のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがいずれも、2’-OMe置換基を有する糖部分を含まない、実施形態887~946のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがいずれも、cEt糖部分を含まない、実施形態887~947のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがいずれも、LNA糖部分を含まない、実施形態887~948のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の核酸塩基がそれぞれ、チミン、ウラシル、グアニン、シトシン、5-メチルシトシン、及びアデニンのうちから独立して選択される、実施形態887~949のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシド間結合がそれぞれ、ホスホジエステルヌクレオシド間結合及びホスホロチオエートヌクレオシド間結合のうちから独立して選択される、実施形態887~950のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の前記修飾ヌクレオシドが、前記3’領域の前記修飾ヌクレオシドの修飾と同じ修飾を有する、実施形態887~951のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の少なくとも1つの修飾ヌクレオシドと、前記3’領域の1つの修飾ヌクレオシドとが、互いに異なる修飾を含む、実施形態887~951のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域及び前記3’領域が共に、少なくとも1つの非二環式2’-置換修飾ヌクレオシド及び少なくとも1つの二環式ヌクレオシドを含む、実施形態887~898実施形態900、実施形態902~903、実施形態906、実施形態909~932、実施形態934~935、実施形態938、実施形態941~953のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記二環式ヌクレオシドが、cEtヌクレオシドである、実施形態954に記載のオリゴマー化合物。
前記二環式ヌクレオシドが、LNAヌクレオシドである、実施形態954に記載のオリゴマー化合物。
前記非二環式2’-修飾ヌクレオシドが、2’-MOEヌクレオシドである、実施形態954~956のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記非二環式2’-修飾ヌクレオシドが、2’-OMeヌクレオシドである、実施形態954~956のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域または前記3’領域の少なくとも1つのヌクレオシドが、非修飾DNAヌクレオシドである、実施形態954~958のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、式:
(Nda)(Nx)(Ny)(Nz)(Ndb)(Ndc)q
を有し、式中、Ndcがそれぞれ、非修飾DNAヌクレオシド、DNA異性体、修飾DNA異性体、及びDNA模倣体から独立して選択され、qが、2~6である、実施形態887~959のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、7つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態887~960のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、8つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態887~960のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、9つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態887~960のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、10個の連結ヌクレオシドからなる、実施形態887~960のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、11個の連結ヌクレオシドからなる、実施形態887~960のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
Nxが、前記安全性増強ヌクレオシドである、実施形態887~965のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
Nyが、前記安全性増強ヌクレオシドである、実施形態887~965のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
Nzが、前記安全性増強ヌクレオシドである、実施形態887~965のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、DNA異性体もしくは修飾DNA異性体であるか、または糖代替物、二環式フラノシル糖部分、もしくは非二環式修飾フラノシル糖部分のいずれかを含む修飾ヌクレオシドである、実施形態887~968のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、DNA異性体もしくは修飾DNA異性体であるか、または糖代替物、二環式フラノシル糖部分、非二環式2’-修飾フラノシル糖部分、非二環式3’-修飾フラノシル糖部分、非二環式4’-修飾フラノシル糖部分、もしくは非二環式5’-修飾フラノシル糖部分のいずれかを含む、実施形態887~969のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、モルホリノ、修飾モルホリノ、修飾シクロヘキセニル、または修飾テトラヒドロピランから選択される糖代替物を含む、実施形態887~970のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、モルホリノ、修飾モルホリノ、CeNA、F-CeNA、HNA、OMe-HNA、またはF-HNAから選択される糖代替物を含む、実施形態887~970のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、2’-β-L-デオキシリボシル、2’-α-D-デオキシキシロシル、2’-α-D-デオキシリボシル、2’-α-L-デオキシキシロシル、及び2’-β-L-デオキシキシロシルのうちから選択される糖部分を含むDNA異性体である、実施形態887~970のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、及び2’-β-L-デオキシリボシルのうちから選択される糖部分を含むDNA異性体である、実施形態887~970または実施形態973のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-修飾糖部分を含む修飾DNA異性体であり、前記糖部分が有する立体構造が、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、2’-β-L-デオキシリボシル、2’-α-D-デオキシキシロシル、1,2’-α-L-デオキシキシロシル、及び2’-β-L-デオキシキシロシルであり、2’位が、ヒドロキシル置換基、フルオロ置換基、またはO-C1-C10アルコキシ置換基でさらに置換される、実施形態887~970のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-修飾糖部分を含む修飾DNA異性体であり、前記糖部分が有する立体構造が、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、2’-β-L-デオキシリボシル、2’-α-D-デオキシキシロシル、
1,2’-α-L-デオキシキシロシル、及び2’-β-L-デオキシキシロシルであり、2’位が、ヒドロキシル置換基、フルオロ置換基、またはOMe置換基でさらに置換される、実施形態887~970または実施形態975のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-修飾糖部分を含む修飾DNA異性体であり、前記糖部分が有する立体構造が、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、2’-β-L-デオキシリボシル、2’-α-D-デオキシキシロシル、1,2’-α-L-デオキシキシロシル、及び2’-β-L-デオキシキシロシルであり、2’位が、フルオロ置換基またはOMe置換基でさらに置換される、実施形態887~970または実施形態975~976のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、及び2’-β-L-デオキシリボシルのうちから選択される糖部分を含む修飾DNA異性体であり、2’位が、ヒドロキシル置換基、フルオロ置換基、またはOMe置換基でさらに置換される、実施形態887~970または実施形態975~977のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、二環式フラノシル糖部分を含む修飾ヌクレオシドである、実施形態887~970のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、cEt、LNA、α-L-LNA、及びENAのうちから選択される、実施形態887~970のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-置換フラノシル糖部分を含む、実施形態887~970のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドの前記2’-置換フラノシル糖部分が、ハロ、アリル、アミノ、アジド、SH、CN、OCN、CF3、OCF3、O-C1-C10アルコキシ、O-C1-C10置換アルコキシ、C1-C10アルキル、C1-C10置換アルキル、S-アルキル、N(Rm)-アルキル、O-アルケニル、S-アルケニル、N(Rm)-アルケニル、O-アルキニル、S-アルキニル、N(Rm)-アルキニル、O-アルキレニル-O-アルキル、アルキニル、アルカリル、アラルキル、O-アルカリル、O-アラルキル、O(CH2)2SCH3、O(CH2)2ON(Rm)(Rn)、またはOCH2C(=O)-N(Rm)(Rn)から選択される2’置換基を有し、式中、Rm及びRnがそれぞれ、独立して、H、アミノ保護基、または置換もしくは非置換のC1-C10アルキルである、実施形態981に記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドの前記2’-置換フラノシル糖部分が、ハロ、O-C1-C10アルコキシ、O-C1-C10置換アルコキシ、C1-C10アルキル、C1-C10置換アルキル、S-アルキル、N(Rm)-アルキル、O(CH2)2ON(Rm)(Rn)、またはOCH2C(=O)-N(Rm)(Rn)から選択される2’置換基を有し、式中、Rm及びRnがそれぞれ、独立して、H、アミノ保護基、または置換もしく
は非置換のC1-C10アルキルである、実施形態981に記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドの前記2’-置換フラノシル糖部分が、フルオロ、OMe、MOE、NMAから選択される2’置換基を有する、実施形態981に記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-OMeまたは2’-MOEを含む2’-置換フラノシル糖部分を含む、実施形態887~978または実施形態981~984のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-OMeを含む2’-置換フラノシル糖部分を含む、実施形態887~978または実施形態981~986のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-OMe修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を含む、実施形態887~978または実施形態981~986のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、ハロ、アリル、アミノ、アジド、SH、CN、CF3、OCF3、C1-C10アルキル、C1-C10置換アルキル、S-アルキル、N(Rm)-アルキル、N(Rm)-アルケニル、N(Rm)-アルキニル、O-アルキレニル-O-アルキル、アルキニル、アルカリル、またはアラルキルから選択される3’置換基を有する3’-修飾フラノシル糖部分を含む、実施形態887~970のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、C1-C10アルキルまたはC1-C10置換アルキルから選択される3’置換基を有する3’-修飾フラノシル糖部分を含む、実施形態887~970または実施形態988のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、3’-メチルフラノシル糖部分を含む、実施形態887~970または実施形態988~989のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、ハロ、アリル、アミノ、アジド、SH、CN、OCN、CF3、OCF3、O-C1-C10アルコキシ、O-C1-C10置換アルコキシ、C1-C10アルキル、C1-C10置換アルキル、S-アルキル、N(Rm)-アルキル、O-アルケニル、S-アルケニル、N(Rm)-アルケニル、O-アルキニル、S-アルキニル、N(Rm)-アルキニル、O-アルキレニル-O-アルキル、アルキニル、アルカリル、アラルキル、O-アルカリル、O-アラルキル、O(CH2)2SCH3、O(CH2)2ON(Rm)(Rn)、またはOCH2C(=O)-N(Rm)(Rn)から選択される4’置換基を有する4’-修飾フラノシル糖部分を含み、式中、Rm及びRnがそれぞれ、独立して、H、アミノ保護基、または置換もしくは非置換のC1-C10アルキルである、実施形態887~970のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、4’-メチルを有する4’-修飾フラノシル糖部分を含む、実施形態887~970または実施形態991のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、以下に示される構造を有し、式中、Rが、任意選択の2’置換基を示し、Bxが、ヘテロ環式塩基部分である、実施形態887~970のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
Rが、H、OH、OMe、F、またはMOEのうちから選択される、実施形態993に記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、ハロ、アリル、アミノ、アジド、SH、CN、OCN、CF3、OCF3、O-C1-C10アルコキシ、O-C1-C10置換アルコキシ、C1-C10アルキル、C1-C10置換アルキル、S-アルキル、N(Rm)-アルキル、O-アルケニル、S-アルケニル、N(Rm)-アルケニル、O-アルキニル、S-アルキニル、N(Rm)-アルキニル、O-アルキレニル-O-アルキル、アルキニル、アルカリル、アラルキル、O-アルカリル、O-アラルキル、O(CH2)2SCH3、O(CH2)2ON(Rm)(Rn)、またはOCH2C(=O)-N(Rm)(Rn)から選択される5’置換基を有する5’-修飾フラノシル糖部分を含み、式中、Rm及びRnがそれぞれ、独立して、H、アミノ保護基、または置換もしくは非置換のC1-C10アルキルである、実施形態887~970のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、5’-メチル、5’-エチル、または5’-アリルから選択される5’置換基を有する5’-修飾フラノシル糖部分を含む、実施形態887~970または実施形態995のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、5’-(R)-メチル-または5’-(R)-エチルから選択される5’置換基を有する5’-修飾フラノシル糖部分を含む、実施形態887~970または実施形態995~996のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、5’-(R)-メチル-2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を含む、実施形態887~970または実施形態995~997のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、5’-(R)-エチル-2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を含む、実施形態887~970または実施形態995~998のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-F修飾糖部分を含まない、実施形態887~999のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、cEt修飾糖部分を含まない、実施形態887~1000のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-MOE修飾糖部分を含まない、実施形態887~1001のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、ヒポキサンチン核酸塩基を含む、実施形態887~1002のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、チミン、ウラシル、グアニン、シトシン、5-メチルシトシン、及びアデニンのうちから選択される核酸塩基を含む、実施形態887~1003のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、cEt、MOE、LNA、またはFANA以外の修飾ヌクレオシドである、実施形態887~1004のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
Ndがそれぞれ、DNAヌクレオシド、DNA異性体、2’-修飾DNA異性体、及びDNA模倣体のうちから独立して選択される、実施形態887~1005のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
DNA異性体がそれぞれ、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、2’-β-L-デオキシリボシル、2’-α-D-デオキシキシロシル、2’-α-D-デオキシリボシル、2’-α-L-デオキシキシロシル、及び2’-β-L-デオキシキシロシルのうちから選択される糖部分を含む、実施形態1006に記載のオリゴマー化合物。
DNA異性体がそれぞれ、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、及び2’-β-L-デオキシリボシルのうちから選択される糖部分を含む、実施形態1007に記載のオリゴマー化合物。
修飾DNA異性体がそれぞれ、2’-修飾糖部分を含み、前記糖部分が有する立体構造が、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、2’-β-
L-デオキシリボシル、2’-α-D-デオキシキシロシル、1,2’-α-L-デオキシキシロシル、及び2’-β-L-デオキシキシロシルであり、2’位が、ヒドロキシル置換基、フルオロ置換基、またはO-C1-C10アルコキシ置換基でさらに置換される、実施形態1006に記載のオリゴマー化合物。
修飾DNA異性体がそれぞれ、2’-修飾糖部分を含み、前記糖部分が有する立体構造が、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、2’-β-L-デオキシリボシル、2’-α-D-デオキシキシロシル、1,2’-α-L-デオキシキシロシル、及び2’-β-L-デオキシキシロシルであり、2’位が、ヒドロキシル置換基、フルオロ置換基、またはOMe置換基でさらに置換される、実施形態1009に記載のオリゴマー化合物。
修飾DNA異性体がそれぞれ、2’-修飾糖部分を含み、前記糖部分が有する立体構造が、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、2’-β-L-デオキシリボシル、2’-α-D-デオキシキシロシル、1,2’-α-L-デオキシキシロシル、及び2’-β-L-デオキシキシロシルであり、2’位が、フルオロ置換基またはOMe置換基でさらに置換される、実施形態1010に記載のオリゴマー化合物。
修飾DNA異性体がそれぞれ、2’-修飾糖部分を含み、前記糖部分が、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、及び2’-β-L-デオキシリボシルのうちから選択され、2’位が、ヒドロキシル置換基、フルオロ置換基、またはOMe置換基でさらに置換される、実施形態1011に記載のオリゴマー化合物。
DNA模倣体がそれぞれ、以下の式:
の1つによって示される構造を含み、
式中、Xが、OまたはSであり、Bxが、ヘテロ環式塩基部分を示す、実施形態1006に記載のオリゴマー化合物。
DNA模倣体がそれぞれ、以下の式:
の1つによって示される構造を含み、
式中、Xが、OまたはSであり、
Bxが、ヘテロ環式塩基部分を示し、
R1が、H、OH、ハロ、アリル、アミノ、アジド、SH、CN、OCN、CF3、OCF3、O-C1-C10アルコキシ、O-C1-C10置換アルコキシ、C1-C10アルキル、C1-C10置換アルキル、S-アルキル、N(Rm)-アルキル、O-アルケニル、S-アルケニル、N(Rm)-アルケニル、O-アルキニル、S-アルキニル、N(Rm)-アルキニル、O-アルキレニル-O-アルキル、アルキニル、アルカリル、アラルキル、O-アルカリル、O-アラルキル、O(CH2)2SCH3、O(CH2)2ON(Rm)(Rn)、またはOCH2C(=O)-N(Rm)(Rn)(Rm及びRnはそれぞれ、独立して、H、アミノ保護基、または置換もしくは非置換のC1-C10アルキルである)のうちから選択され、
前記DNA模倣体が、
という構造を含むのであれば、R1が、H以外である、実施形態1006に記載のオリゴマー化合物。
R1が、H、OH、OMe、またはFである、実施形態1014に記載のオリゴマー化合物。
R1が、Fではない、実施形態1014に記載のオリゴマー化合物。
DNA模倣体がそれぞれ、以下の式:
によって示される構造を含み、
式中、Xが、Sであり、Bxが、ヘテロ環式塩基部分を示し、R1が、Hである、実施形態1006に記載のオリゴマー化合物。
前記DNA模倣体が、5’-メチル-2’-β-D-デオキシリボシル、5’-エチル-2’-β-D-デオキシリボシル、及び5’-アリル-2’-β-D-デオキシリボシルのうちから選択される糖部分を有する、実施形態1006に記載のオリゴマー化合物。
前記DNA模倣体が、2’-フルオロ-β-D-アラビノフラノシル糖部分を含む、実施形態1006に記載のオリゴマー化合物。
前記DNA模倣体が、2’-フルオロ-β-D-アラビノフラノシル糖部分を含まない、実施形態1006に記載のオリゴマー化合物。
Ndがそれぞれ、DNAヌクレオシドである、実施形態887~1020のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、DNA異性体、修飾DNA異性体、及びDNA模倣体のうちから選択される4つを超えないヌクレオシドを含む、実施形態887~1021のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、DNA異性体、修飾DNA異性体、及びDNA模倣体のうちから選択される3つを超えないヌクレオシドを含む、実施形態887~1021のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、DNA異性体、修飾DNA異性体、及びDNA模倣体のうちから選択される2つを超えないヌクレオシドを含む、実施形態887~1021のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、DNA異性体、修飾DNA異性体、及びDNA模倣体のうちから選択される1つを超えないヌクレオシドを含む、実施形態887~1021のいずれかに記載
のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、安全性増強ヌクレオシドを厳密に1つ含み、前記中央領域における残りのヌクレオシドが、DNAヌクレオシドである、実施形態887~1025のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
ヌクレオシド間Nda-Nx、ヌクレオシド間Nx-Ny、ヌクレオシド間Ny-Nz、またはヌクレオシド間Nz-隣接Ndbのうちから選択される、前記中央領域の少なくとも1つのヌクレオシド間結合が、中性ヌクレオシド間結合である、実施形態887~1026のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中性結合が、ホスホネートヌクレオシド間結合である、実施形態1027に記載のオリゴマー化合物。
前記中性結合が、メトキシプロピルヌクレオシド間結合である、実施形態1027に記載のオリゴマー化合物。
残りのヌクレオシド間結合がそれぞれ、ホスホジエステルヌクレオシド間結合またはホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態1027に記載のオリゴマー化合物。
実施形態887~1026のいずれかに記載の修飾オリゴヌクレオチドのキラル富化集団であって、前記中央領域が、特定の立体化学的配置を有する少なくとも1つの特定のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を有する前記キラル富化集団。
前記中央領域が、(Sp)配置を有する少なくとも1つのホスホロチオエートヌクレオシド間結合を有する、実施形態1031に記載のキラル富化集団。
中央領域が、(Rp)配置を有する少なくとも1つのホスホロチオエートヌクレオシド間結合を有する、実施形態1031に記載のキラル富化集団。
前記中央領域が、それぞれのホスホロチオエートヌクレオシド間結合に対して独立に選択される特定の立体化学的配置を有する、実施形態1031に記載のキラル富化集団。
前記中央領域の前記それぞれのホスホロチオエートヌクレオシド間結合が、(Sp)配置を有する、実施形態1034に記載のキラル富化集団。
前記中央領域が、(Rp)配置を有する1つのホスホロチオエートヌクレオシド間結合を有し、前記中央領域の残りのホスホロチオエートヌクレオシド間結合がそれぞれ、(S
p)配置を有する、実施形態1034に記載のキラル富化集団。
前記中央領域が、(Sp)ホスホロチオエートヌクレオシド間結合に隣接する(Rp)ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を有する、実施形態1031に記載のキラル富化集団。
前記中央領域が、第2の(Rp)ホスホロチオエートヌクレオシド間結合に隣接する(Rp)ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を有する、実施形態1031に記載のキラル富化集団。
前記中央領域が、第2の(Rp)ホスホロチオエートヌクレオシド間結合に隣接する(Rp)ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を有し、前記中央領域の残りのホスホロチオエートヌクレオシド間結合がそれぞれ、(Sp)配置を有する、実施形態1031に記載のキラル富化集団。
(Rp)配置または(Sp)配置を有さないホスホロチオエートヌクレオシド間結合がそれぞれ、立体ランダムである、実施形態1032、実施形態1033、実施形態1037、または実施形態1038のいずれかに記載のキラル富化集団。
複合基を含む、実施形態887~1040のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記複合基が、前記複合基の残部を前記修飾オリゴヌクレオチドに付加する連結基を含み、前記連結基が、1~5つのヌクレオシドを含む、実施形態1041に記載のオリゴマー化合物。
前記オリゴマー化合物が、前記修飾オリゴヌクレオチドのヌクレオシド以外には追加のヌクレオシドを含まない、実施形態887~1041のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、標的RNAに相補的である、実施形態887~1043のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、前記標的RNAに少なくとも85%相補的である、実施形態1044に記載のオリゴマー化合物。
前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、前記標的RNAに少なくとも90%相補的である、実施形態1044に記載のオリゴマー化合物。
前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、前記標的RNAに少なくとも95%相
補的である、実施形態1044に記載のオリゴマー化合物。
前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、前記標的RNAに100%相補的である、実施形態1047に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、標的mRNAまたは標的pre-mRNAである、実施形態1044~1048のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的mRNAまたは標的pre-mRNAが、マウス、ラット、サル、またはヒトのPTENのRNAではない、実施形態1049に記載のオリゴマー化合物。
前記標的mRNAまたは標的pre-mRNAが、マウス、ラット、サル、またはヒトのSRB-1のRNAではない、実施形態1049または実施形態1050に記載のオリゴマー化合物。
前記標的mRNAまたは標的pre-mRNAが、マウス、ラット、サル、またはヒトのMYD88のRNAではない、実施形態1049~1051のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的mRNAまたは標的pre-mRNAが、マウス、ラット、サル、またはヒトのHTTのRNAではなく、マウス、ラット、サル、またはヒトのSOD1のRNAではなく、マウス、ラット、サル、またはヒトのアルファ-シヌクレインのRNAではない、実施形態1049~1052のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、ヒトのRNAである、実施形態1044~1053のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、肝臓において発現する、実施形態1044~1054のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、肝臓標的である、実施形態1044~1055のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、肝臓において発現しない、実施形態1044~1054のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、肝臓標的ではない、実施形態1044~1054または実施形態1057のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
肝臓における前記標的RNAの発現を調節することが、障害または状態の治療と関連する、実施形態1044~1056のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、肝臓の障害または状態である、実施形態1059に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、中枢神経系において発現する、実施形態1044~1060のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、中枢神経系において発現しない、実施形態1044~1060のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、中枢神経系標的である、実施形態1044~1061のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、中枢神経系標的ではない、実施形態1044~1062のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、白色脂肪細胞において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、褐色脂肪細胞において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、脂肪細胞において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、マクロファージにおいて発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、がん細胞において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、腫瘍細胞において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、平滑筋細胞において発現する、実施形態1044~1064のいず
れかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、リンパ球において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、肺細胞において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、心筋細胞(heart muscle cell)において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、心筋細胞(cardiomyocyte)において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、内皮細胞において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、線維芽細胞において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、グリア細胞において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、シュワン細胞において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、膵細胞において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、腎細胞において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、ベータ細胞において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、非実質細胞において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、肝細胞において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、オリゴデンドロサイトにおいて発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、アストロサイトにおいて発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、ミクログリアにおいて発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、上衣細胞において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、感覚ニューロンにおいて発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、運動ニューロンにおいて発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、骨格筋において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、心筋において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、平滑筋において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、脂肪組織において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、白色脂肪組織において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、脾臓において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに
記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、骨において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、骨髄において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、腸において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、副腎において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、精巣において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、卵巣において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、膵臓において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、下垂体において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、前立腺において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、皮膚において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、表皮において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、子宮において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、膀胱において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、脳において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、糸球体において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、遠位尿細管上皮において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、乳房組織において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、肺において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、心臓において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、腎臓において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、神経節において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、前頭皮質において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、脊髄において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、三叉神経節において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、坐骨神経において発現する、実施形態1044~1064のいずれ
かに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、後根神経節において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、精巣上体脂肪において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、横隔膜において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、結腸において発現する、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、白色脂肪細胞標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、褐色脂肪細胞標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、脂肪細胞標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、マクロファージ標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、がん細胞標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、腫瘍細胞標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、平滑筋細胞標的である、実施形態158~178のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、リンパ球標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、肺細胞標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、心筋細胞(heart muscle cell)標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、心筋細胞(cardiomyocyte)標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、内皮細胞標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、線維芽細胞標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、グリア細胞標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、シュワン細胞標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、膵細胞標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、腎細胞標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、ベータ細胞標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、非実質細胞標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、肝細胞標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、オリゴデンドロサイト標的である、実施形態1044~1064の
いずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、アストロサイト標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、ミクログリア標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、上衣細胞標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、感覚ニューロン標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、運動ニューロン標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、骨格筋標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、心筋標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、平滑筋標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、脂肪組織標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、白色脂肪組織標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、脾臓標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、骨標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、骨髄標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、腸標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、副腎標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、精巣標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、卵巣標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、膵臓標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、下垂体標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、前立腺標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、皮膚標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、表皮標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、子宮標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、膀胱標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、脳標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオ
リゴマー化合物。
前記標的RNAが、糸球体標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、遠位尿細管上皮標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、乳房組織標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、肺標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、心臓標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、腎臓標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、神経節標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、前頭皮質標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、脊髄標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、三叉神経節標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、坐骨神経標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、後根神経節標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、精巣上体脂肪標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、横隔膜標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、結腸標的である、実施形態1044~1064のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、MeCP2のRNA、DUX4のRNA、HDAC2のRNA、APPのRNA、アタキシン1のRNA、アタキシン2のRNA、アタキシン3のRNA、アタキシン6のRNA、アタキシン7のRNA、C9ORF72のRNA、UBE3AのRNA、プリオンのRNA、PMP22のRNA、タウのRNA、LRRK2のRNA、LINGO2のRNA、GYS1のRNA、KCNT1のRNA、IRF8のRNA、プログラニュリンのRNA、またはGFAPのRNAである、実施形態1044~1186のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、HTTのRNAである、実施形態1044~1186のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、MeCP2のRNAである、実施形態1187に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、DUX4のRNAである、実施形態1187に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、HDAC2のRNAである、実施形態1187に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、アタキシン1のRNAである、実施形態1187に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、アタキシン2のRNAである、実施形態1187に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、アタキシン3のRNAである、実施形態1187に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、アタキシン6のRNAである、実施形態1187に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、アタキシン7のRNAである、実施形態1187に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、C9ORF72のRNAである、実施形態1187に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、アルファ-シヌクレインのRNAである、実施形態1044~1186に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、UBE3AのRNAである、実施形態1187に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、SOD1のRNAである、実施形態1044~1186のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、プリオンのRNAである、実施形態1187に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、PMP22のRNAである、実施形態1187に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、タウのRNAである、実施形態1044~1187のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、LRRK2のRNAである、実施形態1187に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、APPのRNAである、実施形態1187に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、LINGO2のRNAである、1187に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、GYS1のRNAである、実施形態1187のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、KCNT1のRNAである、実施形態1187のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、IRF8のRNAである、実施形態1187のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、プログラニュリンのRNAである、実施形態1187のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、GFAPのRNAである、実施形態1187のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAの発現を調節することが、障害または状態の治療と関連する、実施形態1044~1211のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、アルツハイマー病、筋萎縮性側索硬化症、パーキンソン病、脊髄小脳失調症、アンジェルマン症候群、アレキサンダー病、ラフォラ病、シャルコー・マリー・トゥース病、プリオン病、認知症、神経変性、MeCP2重複症候群、脳症、神経炎症、または多発性硬化症である、実施形態1212のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、アルツハイマー病である、実施形態1212に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、筋萎縮性側索硬化症である、実施形態1212に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、パーキンソン病である、実施形態1212に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、脊髄小脳失調症である、実施形態1212に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、アンジェルマン症候群である、実施形態1212に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、アレキサンダー病である、実施形態1212に記載のオリゴマ
ー化合物。
前記障害または状態が、ラフォラ病である、実施形態1212に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、シャルコー・マリー・トゥース病である、実施形態1212に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、プリオン病である、実施形態1212に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、認知症である、実施形態1212に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、神経変性である、実施形態1212に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、MeCP2重複症候群である、実施形態1212に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、脳症である、実施形態1212に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、神経炎症である、実施形態1212に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、多発性硬化症である、実施形態1212に記載のオリゴマー化合物。
実施形態887~1228のいずれかに記載のオリゴマー化合物の親オリゴマー化合物が、インビトロで細胞毒性を有する、実施形態887~1228のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物が、標準的なインビトロ細胞毒性アッセイにおいて細胞毒性を有する、実施形態1228に記載のオリゴマー化合物。
実施形態887~1229のいずれかに記載のオリゴマー化合物の親オリゴマー化合物がマウスに投与されると、前記マウスに肝毒性が生じる、実施形態887~1229のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記マウスに対する前記親オリゴマー化合物の前記投与が、全身投与である、実施形態1230に記載のオリゴマー化合物。
前記全身投与が、皮下投与である、実施形態1230に記載のオリゴマー化合物。
前記マウスが、CD-1マウスである、実施形態1230~1232のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記マウスが、C57BL/6マウスである、実施形態1230~1232のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記マウスが、BALB/cマウスである、実施形態1230~1232のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物の前記投与の後に、前記マウスにおける血漿中ALTレベルが、リットル当たり500単位超である、実施形態1230~1236のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物の前記投与の後に、前記マウスにおける血漿中ASTレベルが、リットル当たり500単位超である、実施形態1230~1237のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物の前記投与の後に、前記マウスにおける血漿中ALTレベルが、リットル当たり1000単位超である、実施形態1230~1238のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物の前記投与の後に、前記マウスにおける血漿中ASTレベルが、リットル当たり1000単位超である、実施形態1230~1239のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記肝毒性が、前記親オリゴマー化合物の前記投与から24~48時間後に測定される、実施形態1230~1240のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記肝毒性が、前記親オリゴマー化合物の前記投与から72時間後に測定される、実施形態1230~1241のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記肝毒性が、前記親オリゴマー化合物の前記投与から3日後に測定される、実施形態1230~1241のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記肝毒性が、前記親オリゴマー化合物の前記投与から5日後に測定される、実施形態1230~1241のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記肝毒性が、前記親オリゴマー化合物の前記投与から7日後に測定される、実施形態1230~1241のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記肝毒性が、前記親オリゴマー化合物の前記投与から10日後に測定される、実施形態1230~1241のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記肝毒性が、前記親オリゴマー化合物の前記投与から14日後に測定される、実施形態1230~1241のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物が、1~10mg/kgで前記マウスに投与される、実施形態1230~1241のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物が、10~25mg/kgで前記マウスに投与される、実施形態1230~1241のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物が、25~50mg/kgで前記マウスに投与される、実施形態1230~1241のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物が、50~100mg/kgで前記マウスに投与される、実施形態1230~1241のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物が、100~150mg/kgで前記マウスに投与される、実施形態1230~1241のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記マウスが、BALB/cマウスであり、前記親オリゴマー化合物が、150mg/kgで前記マウスに投与され、前記マウスにおける血漿中ALTレベルが、前記親オリゴマー化合物の前記投与から72時間後に測定される、実施形態1230~1241のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
実施形態887~1253のいずれかに記載のオリゴマー化合物が50mg/kgでマウスに投与されると、前記マウスに肝毒性が生じない、実施形態887~1253のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
実施形態1254に記載のオリゴマー化合物の前記投与の後に、前記マウスにおける血
漿中ALTレベルが、リットル当たり100単位未満である、実施形態1254に記載のオリゴマー化合物。
前記マウスにおける血漿中ALTレベルが、実施形態1254または実施形態1255に記載のオリゴマー化合物の親オリゴマー化合物が投与されたマウスにおける血漿中ALTレベルと比較して少なくとも10倍低く、実施形態1254または実施形態1255のオリゴマー化合物の前記投与及び血漿中ALT測定も、前記親オリゴマー化合物の前記投与及び血漿中ALT測定も、同じ方法で完結される、実施形態1254または実施形態1255に記載のオリゴマー化合物。
前記マウスにおける血漿中ALTレベルが、前記親オリゴマー化合物が投与された前記マウスにおける血漿中ALTレベルと比較して少なくとも100倍低い、実施形態1256に記載のオリゴマー化合物。
前記マウスにおける血漿中ALTレベルが、前記親オリゴマー化合物が投与された前記マウスにおける血漿中ALTレベルと比較して少なくとも500倍低い、実施形態1256に記載のオリゴマー化合物。
実施形態1230~1258のいずれかに記載のオリゴマー化合物の、マウスにおける治療指数が、前記親オリゴマー化合物の治療指数と比較して増加している、実施形態1230~1258のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
実施形態1259に記載のオリゴマー化合物の、マウスにおける治療指数が、前記親オリゴマー化合物の治療指数と比較して少なくとも2倍高い、実施形態1259に記載のオリゴマー化合物。
ホスホロチオエート以外の前記少なくとも1つの修飾ヌクレオシド間結合、及び/または5-メチルシトシン以外の修飾核酸塩基及び/または修飾糖部分を含む前記少なくとも1つの修飾ヌクレオシド、を前記中央領域に含まないこと以外は同一のオリゴマー化合物が、マウスへの投与後に肝毒性を生じさせ、
前記そのこと以外は同一のオリゴマー化合物が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合と、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分と、チミン、ウラシル、アデニン、グアニン、シトシン、及び5-メチルシトシンから選択される核酸塩基と、からなる中央領域を有する、実施形態887~1229のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
ホスホロチオエート以外の前記少なくとも1つの修飾ヌクレオシド間結合、及び/または5-メチルシトシン以外の修飾核酸塩基及び/または修飾糖部分を含む前記少なくとも1つの修飾ヌクレオシド、を前記中央領域に含み、前記修飾糖部分が、2’-O-メチル修飾糖部分である、実施形態1261に記載のオリゴマー化合物。
前記2’-O-メチル修飾糖部分が、前記中央領域の位置2に存在する、実施形態1262に記載のオリゴマー化合物。
前記そのこと以外は同一のオリゴマー化合物が、2’-O-メチル修飾糖部分を含まず、前記そのこと以外は同一のオリゴマー化合物が、前記2’-O-メチル修飾糖部分の代わりに非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を含む、実施形態1261~1263に記載のオリゴマー化合物。
前記そのこと以外は同一のオリゴマー化合物の核酸塩基配列が、前記標的RNAに100%相補的である、実施形態1261~1264のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記そのこと以外は同一のオリゴマー化合物が、実施形態1202~1206のいずれかに記載のオリゴマー化合物の親オリゴマー化合物である、実施形態1261~1265のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記オリゴマー化合物が、標準的なインビトロ活性アッセイにおいて100nM未満のIC50で前記標的RNAを抑制する、実施形態1044~1266のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
実施形態1044~1266のいずれかに記載のオリゴマー化合物の親オリゴマー化合物が、標準的なインビトロ活性アッセイにおいて100nM未満のIC50で前記標的RNAを抑制する、実施形態1044~1266のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
標準的なインビトロ活性アッセイで測定された前記親オリゴマー化合物のIC50と、標準的なインビトロ活性アッセイで測定された実施形態1044~1268のいずれかに記載のオリゴマー化合物のIC50と、の間の差異が4倍未満である、実施形態1044~1268のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
標準的なインビトロ活性アッセイで測定された前記親オリゴマー化合物のIC50と、標準的なインビトロ活性アッセイで測定された実施形態1044~1268のいずれかに記載のオリゴマー化合物のIC50と、の間の差異が3倍未満である、実施形態1044~1268のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
標準的なインビトロ活性アッセイで測定された前記親オリゴマー化合物のIC50と、標準的なインビトロ活性アッセイで測定された実施形態1044~1268のいずれかに記載のオリゴマー化合物のIC50と、の間の差異が2倍未満である、実施形態1044~1268のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物の前記中央領域の糖部分がそれぞれ、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分であり、前記親オリゴマー化合物の前記中央領域のヌクレオシド間結合がそれぞれ、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態1044~1271のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物の核酸塩基配列が、前記標的RNAに100%相補的である、実施形態1044~1272のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
10~50mgの前記オリゴマー化合物がヒトに投与されると、前記ヒトに肝毒性が生じない、実施形態887~1273のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
50~100mgの前記オリゴマー化合物がヒトに投与されると、前記ヒトに肝毒性が生じない、実施形態887~1273のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
100~300mgの前記オリゴマー化合物がヒトに投与されると、前記ヒトに肝毒性が生じない、実施形態887~1273のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記投与が、全身投与である、実施形態1274~1276のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
実施形態887~1277のいずれかに記載のオリゴマー化合物と、第2のオリゴマー化合物と、を含む組成物であって、前記第2のオリゴマー化合物が、実施形態887~1277のいずれかに記載のオリゴマー化合物に相補的である前記組成物。
前記第2のオリゴマー化合物が、実施形態887~1277のいずれかに記載のオリゴマー化合物に少なくとも90%相補的な少なくとも14個の近接する連結ヌクレオシドを含む、実施形態1278に記載の組成物。
前記第2のオリゴマー化合物が、実施形態887~1277のいずれかに記載のオリゴマー化合物に100%相補的な少なくとも14個の近接する連結ヌクレオシドを含む、実施形態1278に記載の組成物。
実施形態887~1277のいずれかに記載のオリゴマー化合物を含む医薬組成物、または実施形態1278~1280のいずれかに記載の組成物であって、前記医薬組成物または組成物が、医薬的に許容可能な担体または希釈剤を含む前記医薬組成物または組成物。
実施形態887~1281のいずれかに記載のオリゴマー化合物または組成物をヒト対象に投与することを含む方法。
実施形態887~1281のいずれかに記載のオリゴマー化合物または組成物をヒト対象に投与することを含む、疾患または障害の治療方法。
ヒト対象における標的RNAの量または活性の調節方法であって、前記方法が、実施形態887~1281のいずれかに記載のオリゴマー化合物または組成物を前記ヒト対象に投与すること、及びそれによって前記ヒト対象における前記標的RNAの量または活性を調節すること、を含む前記方法。
ヒト対象における疾患または障害の治療方法であって、前記方法が、実施形態887~1281のいずれかに記載のオリゴマー化合物または組成物を、前記疾患または障害を有する前記ヒト対象に投与すること、及びそれによって前記ヒト対象における前記疾患または障害を治療すること、を含む前記方法。
前記疾患または障害が、肝疾患であり、前記オリゴマー化合物が、肝臓標的RNAの量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記疾患または障害が、中枢神経系疾患であり、前記オリゴマー化合物が、中枢神経系標的RNAの量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記疾患または障害が、がん、神経変性疾患、循環器疾患、免疫疾患、遺伝性疾患、反復配列伸長疾患、筋肉消耗疾患、または代謝疾患である、実施形態1284~1287のいずれかに記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、白色脂肪細胞標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、褐色脂肪細胞標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、脂肪細胞標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、マクロファージ標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、がん細胞標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、腫瘍細胞標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、平滑筋細胞標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、リンパ球標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、肺細胞標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、心筋細胞(heart muscle cell)標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、心筋細胞(cardiomyocyte)標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、内皮細胞標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、線維芽細胞標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、グリア細胞標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、シュワン細胞標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、膵細胞標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、腎細胞標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、ベータ細胞標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、非実質細胞標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、肝細胞標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、オリゴデンドロサイト標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、アストロサイト標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、ミクログリア標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、上衣細胞標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、感覚ニューロン標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、運動ニューロン標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、骨格筋標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、心筋標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、平滑筋標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、脂肪組織標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、白色脂肪組織標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、脾臓標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、骨標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、骨髄標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、腸標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、副腎標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、精巣標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、卵巣標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、膵臓標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、下垂体標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、前立腺標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、皮膚標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、表皮標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、子宮標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、膀胱標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、脳標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、糸球体標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、遠位尿細管上皮標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、乳房組織標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、肺標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、心臓標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、腎臓標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、神経節標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、前頭皮質標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、脊髄標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、三叉神経節標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、坐骨神経標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、後根神経節標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、精巣上体脂肪標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、横隔膜標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、結腸標的の量または活性を調節する、実施形態1284または実施形態1285に記載の方法。
前記投与の後の前記ヒト対象の血漿中ALTレベルが、前記投与の前のものと比較して3倍を超えない、実施形態1282~1349のいずれかに記載の方法。
前記投与の後の前記ヒト対象の血漿中ALTレベルが、リットル当たり150単位を超えない、実施形態1282~1350のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、肝損傷に感受性である、実施形態1282~1351のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、肝変性に感受性である、実施形態1282~1352のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、肝臓におけるアポトーシスの上昇に感受性である、実施形態1282~1353のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、肝疾患を有する、実施形態1282~1354のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、腎疾患を有する、実施形態1282~1355のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、腎臓損傷に感受性である、実施形態1282~1356のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、心疾患を有する、実施形態1282~1357のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、心臓損傷に感受性である、実施形態1282~1358のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、膵炎を有する、実施形態1282~1359のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、膵損傷に感受性である、実施形態1282~1360のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、神経学的疾患を有する、実施形態1282~1361のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、神経学的損傷に感受性である、実施形態1282~1362のいずれかに記載の方法。
実施形態887~1281のいずれかに記載のオリゴマー化合物の親オリゴマー化合物をマウスに投与することを含む、実施形態1282~1363のいずれかに記載の方法。
実施形態887~1281のいずれかに記載のオリゴマー化合物の親オリゴマー化合物と細胞を接触させることを含む、実施形態1282~1363のいずれかに記載の方法。
前記親オリゴマー化合物の前記中央領域の糖部分がそれぞれ、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分であり、前記親オリゴマー化合物の前記中央領域のヌクレオシド間結合がそれぞれ、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態1364または実施形態1365に記載の方法。
オリゴマー化合物の設計方法であって、前記方法が、親オリゴマー化合物を出発物質とすること、及び実施形態887~1281のいずれか1つに記載のオリゴマー化合物に至るように前記化合物の設計を変更すること、を含む前記方法。
オリゴマー化合物の設計方法であって、前記方法が、親オリゴマー化合物を同定すること、及び第2のオリゴマー化合物に至るように前記親オリゴマー化合物の設計を変更すること、を含み、前記第2のオリゴマー化合物が、実施形態887~1281のいずれか1つに記載のオリゴマー化合物である前記方法。
オリゴマー化合物の肝毒性の改善方法であって、前記方法が、(i)マウスにおいてリットル当たり300単位超の血漿中ALTレベルを有する親オリゴマー化合物を同定するステップと、(ii)実施形態887~1281のいずれか1つに記載のオリゴマー化合物を提供するステップと、を含む前記方法。
前記方法によって、前記親オリゴマー化合物と比較して治療指数が改善したオリゴマー化合物が設計される、実施形態1368または実施形態1369に記載の方法。
前記方法によって、前記親オリゴマー化合物と比較して肝毒性が低下したオリゴマー化合物が設計される、実施形態1368または実施形態1369に記載の方法。
前記第2のオリゴマー化合物の治療指数が、前記親オリゴマー化合物と比較して改善される、実施形態1368に記載の方法。
マウスにおける前記第2のオリゴマー化合物の肝毒性が、前記親オリゴマー化合物と比較して低減される、実施形態1368または実施形態1369に記載の方法。
実施形態887~1281のいずれか1つに記載のオリゴマー化合物の肝毒性が、前記親オリゴマー化合物と比較して低減される、実施形態1368に記載の方法。
実施形態887~1281のいずれかに記載のオリゴマー化合物をマウスに投与すること、及び実施形態887~1281のいずれかに記載のオリゴマー化合物の親オリゴマー化合物を第2のマウスに別に投与すること、を含む方法であって、実施形態887~1281のいずれかに記載のオリゴマー化合物の治療指数が、前記親オリゴマー化合物の治療指数と比較して改善される前記方法。
前記マウス、前記細胞、及び/または前記ヒト対象においてp21のRNAのレベルが測定される、実施形態1282~1375のいずれかに記載の方法。
実施形態887~1281のいずれかに記載のオリゴマー化合物を対象に投与すること、及び前記対象におけるp21のRNAのレベルを測定すること、を含む方法。
前記対象が、マウスである、実施形態1377に記載の方法。
前記対象が、ヒトである、実施形態1377に記載の方法。
前記p21のRNAのレベルが、前記投与から24時間以内に測定される、実施形態1377~1379のいずれかに記載の方法。
前記p21のRNAのレベルが、前記投与から24~48時間後に測定される、実施形態1377~1380のいずれかに記載の方法。
医学的治療において使用するための、実施形態887~1281のいずれか1つに記載のオリゴマー化合物または組成物。
前記オリゴマー化合物が、毒性を有さない、実施形態887~1281のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
対照化合物が毒性を有し、前記対照化合物の前記中央領域のヌクレオシドがそれぞれ、2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を含むヌクレオシドであること以外は前記対照化合物が前記オリゴマー化合物と同一である、実施形態887~1281のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記オリゴマー化合物がある用量で動物に投与されると生じる循環ALTレベルが、少なくとも1回の適合用量について前記対照化合物が同じ用量で動物に投与されると生じる前記ALTレベルと比較して少なくとも3倍低い、実施形態1384に記載のオリゴマー化合物。
リットル当たり300単位超に循環ALTを上昇させる前記オリゴマー化合物の最低用量が、リットル当たり300単位超に循環ALTを上昇させる前記対照化合物の最低用量と比較して少なくとも3倍高い、実施形態1384または実施形態1385に記載のオリゴマー化合物。
前記オリゴマー化合物が、細胞における前記標的RNAを低減する能力を有する、実施形態1384~1386のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記オリゴマー化合物が、対照化合物と同等のRNA低減活性を有し、前記対照化合物の前記中央領域のヌクレオシドがそれぞれ、2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を含むヌクレオシドであること以外は前記対照化合物が前記オリゴマー化合物と同一である、実施形態1387に記載のオリゴマー化合物。
前記対照化合物のRNA低減活性と比較して前記RNA低減活性の低下度合いが2倍を超えない、実施形態1388に記載のオリゴマー化合物。
ヒト対象における標的RNAの量または活性の調節方法であって、前記方法が、実施形態887~1281のいずれかに記載のオリゴマー化合物または組成物を前記ヒト対象に投与すること、及びそれによって前記ヒト対象における前記標的RNAの量または活性を調節すること、を含む前記方法。
ヒト対象における疾患または障害の治療方法であって、前記方法が、実施形態887~1281のいずれかに記載のオリゴマー化合物または組成物を、前記疾患または障害を有する前記ヒト対象に投与すること、及びそれによって前記ヒト対象における前記疾患または障害を治療すること、を含む前記方法。
前記疾患または障害が、肝疾患であり、前記オリゴマー化合物が、肝臓標的RNAの量または活性を調節する、実施形態1390または実施形態1391に記載の方法。
前記疾患または障害が、中枢神経系疾患であり、前記オリゴマー化合物が、中枢神経系標的RNAの量または活性を調節する、実施形態1390または実施形態1391に記載の方法。
前記疾患または障害が、がん、神経変性疾患、循環器疾患、免疫疾患、遺伝性疾患、反復配列伸長疾患、筋肉消耗疾患、または代謝疾患である、実施形態1390~1393のいずれかに記載の方法。
前記投与の後の前記ヒト対象の血漿中ALTレベルが、前記投与の前のものと比較して3倍を超えない、実施形態1390~1394のいずれかに記載の方法。
前記投与の後の前記ヒト対象の血漿中ALTレベルが、リットル当たり150単位を超えない、実施形態1390~1395のいずれかに記載の方法。
ヒト対象における疾患または障害の治療方法であって、前記方法が、実施形態887~1281のいずれかに記載のオリゴマー化合物または組成物を、前記疾患または障害を有する前記ヒト対象に投与すること、及びそれによって前記ヒト対象における前記疾患または障害を治療すること、を含む前記方法。
前記疾患または障害が、CNSの疾患または障害ではない、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、白色脂肪細胞の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、褐色脂肪細胞の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、脂肪細胞の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、マクロファージの疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、がん細胞の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、腫瘍細胞の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、平滑筋細胞の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、リンパ球の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、肺細胞の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、心筋細胞(heart muscle cell)の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、心筋細胞(cardiomyocyte)の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、内皮細胞の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、線維芽細胞の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、グリア細胞の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、シュワン細胞の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、膵細胞の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、腎細胞の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、ベータ細胞の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、非実質細胞の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、肝細胞の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、オリゴデンドロサイトの疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、アストロサイトの疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、ミクログリアの疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、上衣細胞の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、感覚ニューロンの疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、運動ニューロンの疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、骨格筋の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、心筋の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、平滑筋の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、脂肪組織の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、白色脂肪組織の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、脾臓の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、骨の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、骨髄の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、腸の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、副腎の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、精巣の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、卵巣の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、膵臓の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、下垂体の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、前立腺の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、皮膚の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、表皮の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、子宮の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、膀胱の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、脳の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、糸球体の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、遠位尿細管上皮の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、乳房組織の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、肺の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、心臓の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、腎臓の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、神経節の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、前頭皮質の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、脊髄の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、三叉神経節の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、坐骨神経の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、後根神経節の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、精巣上体脂肪の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、横隔膜の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
前記疾患または障害が、結腸の疾患または障害である、実施形態1397に記載の方法。
標的RNAに対する活性についてオリゴマー化合物のライブラリーをスクリーニングする方法であって、オリゴマー化合物の前記ライブラリーが、実施形態887~1281のいずれかに記載のオリゴマー化合物を複数含む前記方法。
12~21個の連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドが、A-B-Cという式を有し、式中、Aが、5’領域であり、Bが、中央領域であり、Cが、3’領域であり、
前記5’領域が、1~5つの連結ヌクレオシドからなり、前記5’領域の少なくとも1つのヌクレオシドが、修飾糖を含む修飾ヌクレオシドであり、
前記3’領域が、1~5つの連結ヌクレオシドからなり、前記3’領域の少なくとも1つのヌクレオシドが、修飾糖を含む修飾ヌクレオシドであり、
前記中央領域が、7~11個の連結ヌクレオシドからなり、
前記中央領域の最も5’側の部分が、下記の式:
(Nda)(Nx)(Ny)(Nz)(Ndb)
を有し、式中、Nx、Ny、及びNzの1つが、安全性増強ヌクレオシドであり、
Nx、Ny、及びNzのその他の2つが、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分、DNA異性体、修飾DNA異性体、及びDNA模倣体から独立して選択され、Nda及びNdbがそれぞれ、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分、DNA異性体、修飾DNA異性体、及びDNA模倣体から独立して選択される前記オリゴマー化合物。
前記5’領域が、1つのヌクレオシドからなる、実施形態1461に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域が、2~5つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態1461に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域が、2~4つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態1461に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域が、2つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態1461に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域が、3つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態1461に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域が、4つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態1461に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域が、5つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態1461に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、修飾ヌクレオシドである、実施形態1461~1468のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、修飾糖を含む修飾ヌクレオシドである、実施形態1461~1469のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の修飾ヌクレオシドがそれぞれ、同じ修飾を有する、実施形態1461~1470のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の少なくとも2つのヌクレオシドが、異なる修飾を有する修飾ヌクレオシドである、実施形態1461~1470のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、2’-修飾リボシル糖部分を含む、実施形態1461~1472のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の少なくとも1つのヌクレオシドが、二環式フラノシル糖部分を含む、実施形態1461~1473のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、二環式フラノシル糖部分を含む、実施形態1461~1474のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の少なくとも1つのヌクレオシドが、非二環式糖部分を含む、実施形態1461~1474のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の前記少なくとも1つのヌクレオシドの前記非二環式糖部分が、2’-置換リボシル糖部分である、実施形態1476に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、非二環式糖部分を含む、実施形態1461~1474または実施形態1476~1477のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、2’-置換フラノシル糖部分を含む、実施形態1478に記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、二環式糖部分及び非二環式2’-置換リボシル糖部分から独立して選択される2’-修飾フラノシル糖部分を含む、実施形態1461~1474または実施形態1476~1477のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、二環式糖部分を含む、実施形態1461~1477または実施形態1480のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがそれぞれ、非二環式2’-置換リボシル糖部分を含む、実施形態1461~1474または実施形態1476~1480のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の二環式糖部分がそれぞれ、cEt、LNA、及びENAのうちから選択される、実施形態1461~1477または実施形態1480~1481のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の二環式糖部分がそれぞれ、cEt糖部分である、実施形態1461~1477または実施形態1480~1481のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の二環式糖部分がそれぞれ、LNA糖部分である、実施形態1461~1477または実施形態1480~1481のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の非二環式糖部分がそれぞれ、2’-MOE、2’-OMe、及び2’-NMAのうちから選択される2’-置換基を有する、実施形態1461~1474、実施形態1476~1480、または実施形態1482~1485のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがいずれも、2’-F置換基を有する糖部分を含まない、実施形態1461~1486のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがいずれも、2’-MOE置換基を有する糖部分を含まない、実施形態1461~1487のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがいずれも、2’-OMe置換基を有する糖部分を含まない、実施形態1461~1488のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがいずれも、cEt糖部分を含まない、実施形態1461~1489のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシドがいずれも、LNA糖部分を含まない、実施形態1461~1490のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の核酸塩基がそれぞれ、チミン、ウラシル、グアニン、シトシン、5-メチルシトシン、及びアデニンのうちから独立して選択される、実施形態1461~1491のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域のヌクレオシド間結合がそれぞれ、ホスホジエステルヌクレオシド間結合及びホスホロチオエートヌクレオシド間結合のうちから独立して選択される、実施形態1461~1492のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域が、1つのヌクレオシドからなる、実施形態1461~1493のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域が、2~5つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態1461~1493のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域が、2~4つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態1461~1493のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域が、2つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態1461~1493のい
ずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域が、3つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態1461~1493のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域が、4つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態1461~1493のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域が、5つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態1461~1493のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、修飾ヌクレオシドである、実施形態1461~1500のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、修飾糖部分を含む修飾ヌクレオシドである、実施形態1461~1501のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の修飾ヌクレオシドがそれぞれ、同じ修飾を有する、実施形態1461~1502のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の少なくとも2つのヌクレオシドが、異なる修飾を有する修飾ヌクレオシドである、実施形態1461~1502のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、2’-修飾リボシル糖部分を含む、実施形態1461~1504のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の少なくとも1つのヌクレオシドが、二環式フラノシル糖部分を含む、実施形態1461~1505のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、二環式フラノシル糖部分を含む、実施形態1461~1506のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の少なくとも1つのヌクレオシドが、非二環式糖部分を含む、実施形態1461~1506のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の前記少なくとも1つのヌクレオシドの前記非二環式糖部分が、2’-置換リボシル糖部分である、実施形態1508に記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、非二環式糖部分を含む、実施形態1461~1509のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、2’-置換フラノシル糖部分を含む、実施形態1510に記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、二環式糖部分及び非二環式2’-置換リボシル糖部分から独立して選択される2’-修飾フラノシル糖部分を含む、実施形態1461~1511のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、二環式糖部分を含む、実施形態1461~1512のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがそれぞれ、非二環式2’-置換リボシル糖部分を含む、実施形態1461~1512のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の二環式糖部分がそれぞれ、cEt、LNA、及びENAのうちから選択される、実施形態1461~1509または実施形態1512~1513のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の二環式糖部分がそれぞれ、cEt糖部分である、実施形態1461~1509、実施形態1512~1513、または実施形態1515のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の二環式糖部分がそれぞれ、LNA糖部分である、実施形態1461~1509、実施形態1512~1513、または実施形態1515のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の非二環式糖部分がそれぞれ、2’-MOE、2’-OMe、及び2’-NMAのうちから選択される2’-置換基を有する、実施形態1461~1506、実施形態1508~1512、または実施形態1514のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがいずれも、2’-F置換基を有する糖部分を含まない、実施形態1461~1518のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがいずれも、2’-MOE置換基を有する糖部分を含まない、実施形態1461~1519のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがいずれも、2’-OMe置換基を有する糖部分を含まない、実施形態1461~1520のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがいずれも、cEt糖部分を含まない、実施形態1461~1521のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシドがいずれも、LNA糖部分を含まない、実施形態1461~1522のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域の核酸塩基がそれぞれ、チミン、ウラシル、グアニン、シトシン、5-メチルシトシン、及びアデニンのうちから独立して選択される、実施形態1461~1523のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記3’領域のヌクレオシド間結合がそれぞれ、ホスホジエステルヌクレオシド間結合及びホスホロチオエートヌクレオシド間結合のうちから独立して選択される、実施形態1461~1524のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の前記修飾ヌクレオシドが、前記3’領域の前記修飾ヌクレオシドの修飾と同じ修飾を有する、実施形態1461~1525のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域の少なくとも1つの修飾ヌクレオシドと、前記3’領域の1つの修飾ヌクレオシドとが、互いに異なる修飾を含む、実施形態1461~1525のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域及び前記3’領域が共に、少なくとも1つの非二環式2’-置換修飾ヌクレオシド及び少なくとも1つの二環式ヌクレオシドを含む、実施形態1461~1474、実施形態1476~1477、実施形態1480、実施形態1483~1506、実施形態1508~1509、実施形態1512、実施形態1515~1527のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記二環式ヌクレオシドが、cEtヌクレオシドである、実施形態1528のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記二環式ヌクレオシドが、LNAヌクレオシドである、実施形態1528に記載のオリゴマー化合物。
前記非二環式2’-修飾ヌクレオシドが、2’-MOEヌクレオシドである、実施形態1528~1530のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記非二環式2’-修飾ヌクレオシドが、2’-OMeヌクレオシドである、実施形態1528~1530のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記5’領域または前記3’領域の少なくとも1つのヌクレオシドが、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分である、実施形態1528~1532のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、式:
(Nda)(Nx)(Ny)(Nz)(Ndb)(Ndc)q
を有し、
式中、Ndcがそれぞれ、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分、DNA異性体、修飾DNA異性体、及びDNA模倣体から独立して選択され、qが、2~6である、実施形態1461~1533のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、7つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態1461~1534のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、8つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態1461~1534のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、9つの連結ヌクレオシドからなる、実施形態1461~1534のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、10個の連結ヌクレオシドからなる、実施形態1461~1534のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、11個の連結ヌクレオシドからなる、実施形態1461~1534のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
Nxが、前記安全性増強ヌクレオシドである、実施形態1461~1539のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
Nyが、前記安全性増強ヌクレオシドである、実施形態1461~1539のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
Nzが、前記安全性増強ヌクレオシドである、実施形態1461~1539のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、DNA異性体もしくは修飾DNA異性体であるか、または糖代替物、二環式フラノシル糖部分、もしくは非二環式修飾フラノシル糖部分のいずれかを含む修飾ヌクレオシドである、実施形態1461~1542のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、DNA異性体もしくは修飾DNA異性体であるか、または糖代替物、二環式フラノシル糖部分、非二環式2’-修飾フラノシル糖部分、非二環式3’-修飾フラノシル糖部分、非二環式4’-修飾フラノシル糖部分、もしくは非二環式5’-修飾フラノシル糖部分のいずれかを含む、実施形態1461~1543のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、モルホリノ、修飾モルホリノ、修飾シクロヘキセニル、または修飾テトラヒドロピランから選択される糖代替物を含む、実施形態1461~1544のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、モルホリノ、修飾モルホリノ、2’-フルオロアラビノース、2’-フルオロリボース、CeNA、F-CeNA、HNA、OMe-HNA、またはF-HNAから選択される糖代替物を含む、実施形態1461~1544のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、2’-β-L-デオキシリボシル、2’-α-D-デオキシキシロシル、2’-α-D-デオキシリボシル、2’-α-L-デオキシキシロシル、及び2’-β-L-デオキシキシロシルのうちから選択される糖部分を含むDNA異性体である、実施形態1461~1544のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、及び2’-β-L-デオキシリボシルのうちから選択される糖部分を含むDNA異性体である、実施形態1461~1544または実施形態1547のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-修飾糖部分を含む修飾DNA異性体であり、前記糖部分が有する立体構造が、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、2’-β-L-デオキシリボシル、2’-α-D-デオキシキシロシル、1,2’-α-L-デオキシキシロシル、及び2’-β-L-デオキシキシロシルであり、2’位が、ヒドロキシル置換基、フルオロ置換基、またはO-C1-C10アルコキシ置換基でさらに置換される、実施形態1461~1544のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-修飾糖部分を含む修飾DNA異性体であり、前記糖部分が有する立体構造が、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、2’-β-L-デオキシリボシル、2’-α-D-デオキシキシロシル、
1,2’-α-L-デオキシキシロシル、及び2’-β-L-デオキシキシロシルであり、2’位が、ヒドロキシル置換基、フルオロ置換基、またはOMe置換基でさらに置換される、実施形態1461~1544または実施形態1549のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-修飾糖部分を含む修飾DNA異性体であり、前記糖部分が有する立体構造が、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、2’-β-L-デオキシリボシル、2’-α-D-デオキシキシロシル、1,2’-α-L-デオキシキシロシル、及び2’-β-L-デオキシキシロシルであり、2’位が、フルオロ置換基またはOMe置換基でさらに置換される、実施形態1461~1544または実施形態1549~1550のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、及び2’-β-L-デオキシリボシルのうちから選択される糖部分を含む修飾DNA異性体であり、2’位が、ヒドロキシル置換基、フルオロ置換基、またはOMe置換基でさらに置換される、実施形態1461~1544または実施形態1549~1551のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、二環式フラノシル糖部分を含む修飾ヌクレオシドである、実施形態1461~1544のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、cEt、LNA、α-L-LNA、及びENAのうちから選択される、実施形態1461~1544のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-置換フラノシル糖部分を含む、実施形態1461~1544のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドの前記2’-置換フラノシル糖部分が、ハロ、アリル、アミノ、アジド、SH、CN、OCN、CF3、OCF3、O-C1-C10アルコキシ、O-C1-C10置換アルコキシ、C1-C10アルキル、C1-C10置換アルキル、S-アルキル、N(Rm)-アルキル、O-アルケニル、S-アルケニル、N(Rm)-アルケニル、O-アルキニル、S-アルキニル、N(Rm)-アルキニル、O-アルキレニル-O-アルキル、アルキニル、アルカリル、アラルキル、O-アルカリル、O-アラルキル、O(CH2)2SCH3、O(CH2)2ON(Rm)(Rn)、またはOCH2C(=O)-N(Rm)(Rn)から選択される2’置換基を有し、式中、Rm及びRnがそれぞれ、独立して、H、アミノ保護基、または置換もしくは非置換のC1-C10アルキルである、実施形態1555に記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドの前記2’-置換フラノシル糖部分が、ハロ、O-C1-C10アルコキシ、O-C1-C10置換アルコキシ、C1-C10アルキル、C1-C10置換アルキル、S-アルキル、N(Rm)-アルキル、O(CH2)2ON(Rm)(Rn)、またはOCH2C(=O)-N(Rm)(Rn)から選択される2’置換基を有し、式中、Rm及びRnがそれぞれ、独立して、H、アミノ保護基、または置換もしく
は非置換のC1-C10アルキルである、実施形態1555に記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドの前記2’-置換フラノシル糖部分が、フルオロ、OMe、MOE、NMAから選択される2’置換基を有する、実施形態1555に記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-OMeまたは2’-MOEを含む2’-置換フラノシル糖部分を含む、実施形態1461~1558のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-OMeを含む2’-置換フラノシル糖部分を含む、実施形態1461~1559のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-OMe修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を含む、実施形態1461~1560のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、ハロ、アリル、アミノ、アジド、SH、CN、CF3、OCF3、C1-C10アルキル、C1-C10置換アルキル、S-アルキル、N(Rm)-アルキル、N(Rm)-アルケニル、N(Rm)-アルキニル、O-アルキレニル-O-アルキル、アルキニル、アルカリル、またはアラルキルから選択される3’置換基を有する3’-修飾フラノシル糖部分を含む、実施形態1461~1544のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、C1-C10アルキルまたはC1-C10置換アルキルから選択される3’置換基を有する3’-修飾フラノシル糖部分を含む、実施形態1461~1544または実施形態1562のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、3’-メチルフラノシル糖部分を含む、実施形態1461~1544または実施形態1562~1563のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、ハロ、アリル、アミノ、アジド、SH、CN、OCN、CF3、OCF3、O-C1-C10アルコキシ、O-C1-C10置換アルコキシ、C1-C10アルキル、C1-C10置換アルキル、S-アルキル、N(Rm)-アルキル、O-アルケニル、S-アルケニル、N(Rm)-アルケニル、O-アルキニル、S-アルキニル、N(Rm)-アルキニル、O-アルキレニル-O-アルキル、アルキニル、アルカリル、アラルキル、O-アルカリル、O-アラルキル、O(CH2)2SCH3、O(CH2)2ON(Rm)(Rn)、またはOCH2C(=O)-N(Rm)(Rn)から選択される4’置換基を有する4’-修飾フラノシル糖部分を有し、式中、Rm及びRnがそれぞれ、独立して、H、アミノ保護基、または置換もしくは非置換のC1-C10アルキルである、実施形態1461~1544のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、4’-メチルを有する4’-修飾フラノシル糖部分を含む、実施形態1461~1544または実施形態1565のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、以下に示される構造を有し、式中、Rが、任意選択の2’置換基を示し、Bxが、ヘテロ環式塩基部分である、実施形態1461~1544のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
Rが、H、OH、OMe、F、またはMOEのうちから選択される、実施形態1567に記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、ハロ、アリル、アミノ、アジド、SH、CN、OCN、CF3、OCF3、O-C1-C10アルコキシ、O-C1-C10置換アルコキシ、C1-C10アルキル、C1-C10置換アルキル、S-アルキル、N(Rm)-アルキル、O-アルケニル、S-アルケニル、N(Rm)-アルケニル、O-アルキニル、S-アルキニル、N(Rm)-アルキニル、O-アルキレニル-O-アルキル、アルキニル、アルカリル、アラルキル、O-アルカリル、O-アラルキル、O(CH2)2SCH3、O(CH2)2ON(Rm)(Rn)、またはOCH2C(=O)-N(Rm)(Rn)から選択される5’置換基を有する5’-修飾フラノシル糖部分を含み、式中、Rm及びRnがそれぞれ、独立して、H、アミノ保護基、または置換もしくは非置換のC1-C10アルキルである、実施形態1461~1544のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、5’-メチル、5’-エチル、または5’-アリルから選択される5’置換基を有する5’-修飾フラノシル糖部分を含む、実施形態1461~1544または実施形態1569のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、5’-(R)-メチル-または5’-(R)-エチルから選択される5’置換基を有する5’-修飾フラノシル糖部分を含む、実施形態1461~1544または実施形態1569~1570のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、5’-(R)-メチル-2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を含む、実施形態1461~1544または実施形態1569~1571のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、5’-(R)-エチル-2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を含む、実施形態1461~154または実施形態1569~1572のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-F修飾糖部分を含まない、実施形態1461~1573のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、cEt修飾糖部分を含まない、実施形態1461~1574のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、2’-MOE修飾糖部分を含まない、実施形態1461~1575のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、ヒポキサンチン核酸塩基を含む、実施形態1461~1576のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、チミン、ウラシル、グアニン、シトシン、5-メチルシトシン、及びアデニンのうちから選択される核酸塩基を含む、実施形態1461~1577のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記安全性増強ヌクレオシドが、cEt、MOE、LNA、またはFANA以外の修飾ヌクレオシドである、実施形態1461~1578のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
Ndがそれぞれ、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分、DNA異性体、2’-修飾DNA異性体、及びDNA模倣体のうちから独立して選択される、実施形態1461~1579のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
DNA異性体がそれぞれ、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、2’-β-L-デオキシリボシル、2’-α-D-デオキシキシロシル、2’-α-D-デオキシリボシル、2’-α-L-デオキシキシロシル、及び2’-β-L-デオキシキシロシルのうちから選択される糖部分を含む、実施形態1580に記載のオリゴマー化合物。
DNA異性体がそれぞれ、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、及び2’-β-L-デオキシリボシルのうちから選択される糖部分を含む、実施形態1581に記載のオリゴマー化合物。
修飾DNA異性体がそれぞれ、2’-修飾糖部分を含み、前記糖部分が有する立体構造が、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、2’-β-
L-デオキシリボシル、2’-α-D-デオキシキシロシル、1,2’-α-L-デオキシキシロシル、及び2’-β-L-デオキシキシロシルであり、2’位が、ヒドロキシル置換基、フルオロ置換基、またはO-C1-C10アルコキシ置換基でさらに置換される、実施形態1580に記載のオリゴマー化合物。
修飾DNA異性体がそれぞれ、2’-修飾糖部分を含み、前記糖部分が有する立体構造が、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、2’-β-L-デオキシリボシル、2’-α-D-デオキシキシロシル、1,2’-α-L-デオキシキシロシル、及び2’-β-L-デオキシキシロシルであり、2’位が、ヒドロキシル置換基、フルオロ置換基、またはOMe置換基でさらに置換される、実施形態1583に記載のオリゴマー化合物。
修飾DNA異性体がそれぞれ、2’-修飾糖部分を含み、前記糖部分が有する立体構造が、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、2’-β-L-デオキシリボシル、2’-α-D-デオキシキシロシル、1,2’-α-L-デオキシキシロシル、及び2’-β-L-デオキシキシロシルであり、2’位が、フルオロ置換基またはOMe置換基でさらに置換される、実施形態1584に記載のオリゴマー化合物。
修飾DNA異性体がそれぞれ、2’-修飾糖部分を含み、前記糖部分が、2’-β-D-デオキシキシロシル、2’-α-L-デオキシリボシル、及び2’-β-L-デオキシリボシルのうちから選択され、2’位が、ヒドロキシル置換基、フルオロ置換基、またはOMe置換基でさらに置換される、実施形態1585に記載のオリゴマー化合物。
DNA模倣体がそれぞれ、以下の式:
の1つによって示される構造を含み、
式中、Xが、OまたはSであり、Bxが、ヘテロ環式塩基部分を示す、実施形態1580に記載のオリゴマー化合物。
DNA模倣体がそれぞれ、以下の式:
の1つによって示される構造を含み、
式中、Xが、OまたはSであり、
Bxが、ヘテロ環式塩基部分を示し、
R1が、H、OH、ハロ、アリル、アミノ、アジド、SH、CN、OCN、CF3、OCF3、O-C1-C10アルコキシ、O-C1-C10置換アルコキシ、C1-C10アルキル、C1-C10置換アルキル、S-アルキル、N(Rm)-アルキル、O-アルケニル、S-アルケニル、N(Rm)-アルケニル、O-アルキニル、S-アルキニル、N(Rm)-アルキニル、O-アルキレニル-O-アルキル、アルキニル、アルカリル、アラルキル、O-アルカリル、O-アラルキル、O(CH2)2SCH3、O(CH2)2ON(Rm)(Rn)、またはOCH2C(=O)-N(Rm)(Rn)(Rm及びRnはそれぞれ、独立して、H、アミノ保護基、または置換もしくは非置換のC1-C10アルキルである)のうちから選択され、
前記DNA模倣体が、
という構造を含むのであれば、R1が、H以外である、実施形態1580に記載のオリゴマー化合物。
R1が、H、OH、OMe、またはFである、実施形態1588に記載のオリゴマー化合物。
R1が、Fではない、実施形態1588に記載のオリゴマー化合物。
DNA模倣体がそれぞれ、以下の式:
によって示される構造を含み、
式中、Xが、Sであり、Bxが、ヘテロ環式塩基部分を示し、R1が、Hである、実施形態1580に記載のオリゴマー化合物。
前記DNA模倣体が、5’-メチル-2’-β-D-デオキシリボシル、5’-エチル-2’-β-D-デオキシリボシル、及び5’-アリル-2’-β-D-デオキシリボシルのうちから選択される糖部分を有する、実施形態1580に記載のオリゴマー化合物。
前記DNA模倣体が、2’-フルオロ-β-D-アラビノフラノシル糖部分を含む、実施形態1580に記載のオリゴマー化合物。
前記DNA模倣体が、2’-フルオロ-β-D-アラビノフラノシル糖部分を含まない、実施形態1580に記載のオリゴマー化合物。
Ndがそれぞれ、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分である、実施形態1461~1594のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、DNA異性体、修飾DNA異性体、及びDNA模倣体のうちから選択される4つを超えないヌクレオシドを含む、実施形態1461~1595のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、DNA異性体、修飾DNA異性体、及びDNA模倣体のうちから選択される3つを超えないヌクレオシドを含む、実施形態1461~1595のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、DNA異性体、修飾DNA異性体、及びDNA模倣体のうちから選択される2つを超えないヌクレオシドを含む、実施形態1461~1595のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、DNA異性体、修飾DNA異性体、及びDNA模倣体のうちから選択される1つを超えないヌクレオシドを含む、実施形態1461~1595のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域が、安全性増強ヌクレオシドを厳密に1つ含み、前記中央領域における残りのヌクレオシドが、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分である、実施形態1461~1599のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
ヌクレオシド間Nda-Nx、ヌクレオシド間Nx-Ny、ヌクレオシド間Ny-Nz、またはヌクレオシド間Nz-隣接Ndbのうちから選択される、前記中央領域の少なくとも1つのヌクレオシド間結合が、中性ヌクレオシド間結合である、実施形態1461~1600のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中性結合が、ホスホネートヌクレオシド間結合である、実施形態1601に記載のオリゴマー化合物。
前記中性結合が、メトキシプロピルヌクレオシド間結合である、実施形態1601に記載のオリゴマー化合物。
残りのヌクレオシド間結合がそれぞれ、ホスホジエステルヌクレオシド間結合またはホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態1601に記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域の少なくとも1つのヌクレオシド間結合が、2’-5’ヌクレオシド間結合である、実施形態1461~1600のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記中央領域のヌクレオシド間結合の厳密に1つが、2’-5’ヌクレオシド間結合である、実施形態1461~1600のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
ヌクレオシド間Nda-Nx、ヌクレオシド間Nx-Ny、ヌクレオシド間Ny-Nz、またはヌクレオシド間Nz-隣接Ndbのうちから選択される、前記中央領域の少なくとも1つのヌクレオシド間結合が、2’-5’ヌクレオシド間結合である、実施形態1461~1600のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
実施形態1461~1607のいずれかに記載の修飾オリゴヌクレオチドのキラル富化集団であって、前記中央領域が、特定の立体化学的配置を有する少なくとも1つの特定のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を有する前記キラル富化集団。
前記中央領域が、(Sp)配置を有する少なくとも1つのホスホロチオエートヌクレオシド間結合を有する、実施形態1608に記載のキラル富化集団。
中央領域が、(Rp)配置を有する少なくとも1つのホスホロチオエートヌクレオシド
間結合を有する、実施形態1608に記載のキラル富化集団。
前記中央領域が、それぞれのホスホロチオエートヌクレオシド間結合に対して独立に選択される特定の立体化学的配置を有する、実施形態1608に記載のキラル富化集団。
前記中央領域の前記それぞれのホスホロチオエートヌクレオシド間結合が、(Sp)配置を有する、実施形態1608に記載のキラル富化集団。
前記中央領域が、(Rp)配置を有する1つのホスホロチオエートヌクレオシド間結合を有し、前記中央領域の残りのホスホロチオエートヌクレオシド間結合がそれぞれ、(Sp)配置を有する、実施形態1608に記載のキラル富化集団。
前記中央領域が、(Sp)ホスホロチオエートヌクレオシド間結合に隣接する(Rp)ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を有する、実施形態1608に記載のキラル富化集団。
前記中央領域が、第2の(Rp)ホスホロチオエートヌクレオシド間結合に隣接する(Rp)ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を有する、実施形態1608に記載のキラル富化集団。
前記中央領域が、第2の(Rp)ホスホロチオエートヌクレオシド間結合に隣接する(Rp)ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を有し、前記中央領域の残りのホスホロチオエートヌクレオシド間結合がそれぞれ、(Sp)配置を有する、実施形態1608に記載のキラル富化集団。
(Rp)配置または(Sp)配置を有さないホスホロチオエートヌクレオシド間結合がそれぞれ、立体ランダムである、実施形態1609、実施形態1610、実施形態1614、または実施形態1615のいずれかに記載のキラル富化集団。
複合基を含む、実施形態1461~1617のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記複合基が、前記複合基の残部を前記修飾オリゴヌクレオチドに付加する連結基を含み、前記連結基が、1~5つのヌクレオシドを含む、実施形態1618に記載のオリゴマー化合物。
前記オリゴマー化合物が、前記修飾オリゴヌクレオチドのヌクレオシド以外には追加のヌクレオシドを含まない、実施形態1461~1618のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、標的RNAに相補的である、実施形態1461~1620のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、前記標的RNAに少なくとも85%相補的である、実施形態1621に記載のオリゴマー化合物。
前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、前記標的RNAに少なくとも90%相補的である、実施形態1621に記載のオリゴマー化合物。
前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、前記標的RNAに少なくとも95%相補的である、実施形態1621に記載のオリゴマー化合物。
前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、前記標的RNAに100%相補的である、実施形態1621に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、標的mRNAまたは標的pre-mRNAである、実施形態1621~1625のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的mRNAまたは標的pre-mRNAが、マウス、ラット、サル、またはヒトのPTENのRNAではない、実施形態1626に記載のオリゴマー化合物。
前記標的mRNAまたは標的pre-mRNAが、マウス、ラット、サル、またはヒトのSRB-1のRNAではない、実施形態1626または実施形態1627に記載のオリゴマー化合物。
前記標的mRNAまたは標的pre-mRNAが、マウス、ラット、サル、またはヒトのMYD88のRNAではない、実施形態1626~1628のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的mRNAまたは標的pre-mRNAが、マウス、ラット、サル、またはヒトのHTTのRNAではなく、マウス、ラット、サル、またはヒトのSOD1のRNAではなく、マウス、ラット、サル、またはヒトのアルファ-シヌクレインのRNAではない、実施形態1626~1629のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、ヒトのRNAである、実施形態1621~1630のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、肝臓において発現する、実施形態1621~1631のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、肝臓標的である、実施形態1621~1632のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、肝臓において発現しない、実施形態1621~1631のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、肝臓標的ではない、実施形態1621~1631または実施形態1634のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
肝臓における前記標的RNAの発現を調節することが、障害または状態の治療と関連する、実施形態1621~1635のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、肝臓の障害または状態である、実施形態1636に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、中枢神経系において発現する、実施形態1621~1637のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、中枢神経系において発現しない、実施形態1621~1637のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、中枢神経系標的である、実施形態1621~1638のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、中枢神経系標的ではない、実施形態1621~1639のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、白色脂肪細胞において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、褐色脂肪細胞において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、脂肪細胞において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、マクロファージにおいて発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、がん細胞において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、腫瘍細胞において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、平滑筋細胞において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、リンパ球において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、肺細胞において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、心筋細胞(heart muscle cell)において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、心筋細胞(cardiomyocyte)において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、内皮細胞において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、線維芽細胞において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、グリア細胞において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、シュワン細胞において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、膵細胞において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、腎細胞において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、ベータ細胞において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、非実質細胞において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、肝細胞において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、オリゴデンドロサイトにおいて発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、アストロサイトにおいて発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、ミクログリアにおいて発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、上衣細胞において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、感覚ニューロンにおいて発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、運動ニューロンにおいて発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、骨格筋において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、心筋において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、平滑筋において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、脂肪組織において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、白色脂肪組織において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、脾臓において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、骨において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、骨髄において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、腸において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、副腎において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、精巣において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、卵巣において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、膵臓において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、下垂体において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、前立腺において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、皮膚において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、表皮において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、子宮において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、膀胱において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、脳において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、糸球体において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、遠位尿細管上皮において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、乳房組織において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、肺において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、心臓において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、腎臓において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、神経節において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、前頭皮質において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、脊髄において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、三叉神経節において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、坐骨神経において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、後根神経節において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、精巣上体脂肪において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、横隔膜において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、結腸において発現する、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、白色脂肪細胞標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、褐色脂肪細胞標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、脂肪細胞標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、マクロファージ標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、がん細胞標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、腫瘍細胞標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、平滑筋細胞標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、リンパ球標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、肺細胞標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、心筋細胞(heart muscle cell)標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、心筋細胞(cardiomyocyte)標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、内皮細胞標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、線維芽細胞標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、グリア細胞標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、シュワン細胞標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、膵細胞標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、腎細胞標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、ベータ細胞標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、非実質細胞標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、肝細胞標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、オリゴデンドロサイト標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、アストロサイト標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、ミクログリア標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、上衣細胞標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、感覚ニューロン標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、運動ニューロン標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、骨格筋標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、心筋標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、平滑筋標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、脂肪組織標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、白色脂肪組織標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、脾臓標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、骨標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、骨髄標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、腸標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、副腎標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、精巣標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、卵巣標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、膵臓標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、下垂体標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、前立腺標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、皮膚標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、表皮標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、子宮標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、膀胱標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、脳標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、糸球体標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、遠位尿細管上皮標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、乳房組織標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、肺標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、心臓標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、腎臓標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、神経節標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、前頭皮質標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、脊髄標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、三叉神経節標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、坐骨神経標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、後根神経節標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、精巣上体脂肪標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、横隔膜標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、結腸標的である、実施形態1621~1641のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、MeCP2のRNA、DUX4のRNA、HDAC2のRNA、APPのRNA、アタキシン1のRNA、アタキシン2のRNA、アタキシン3のRNA、アタキシン6のRNA、アタキシン7のRNA、C9ORF72のRNA、UBE3AのRNA、プリオンのRNA、PMP22のRNA、タウのRNA、LRRK2のRNA、LINGO2のRNA、GYS1のRNA、KCNT1のRNA、IRF8のRNA、プログラニュリンのRNA、またはGFAPのRNAである、実施形態1621~1763のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、HTTのRNAである、実施形態1621~1763のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、MeCP2のRNAである、実施形態1764に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、DUX4のRNAである、実施形態1764に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、HDAC2のRNAである、実施形態1764に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、アタキシン1のRNAである、実施形態1764に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、アタキシン2のRNAである、実施形態1764に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、アタキシン3のRNAである、実施形態1764に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、アタキシン6のRNAである、実施形態1764に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、アタキシン7のRNAである、実施形態1764に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、C9ORF72のRNAである、実施形態1764に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、アルファ-シヌクレインのRNAである、実施形態1621~1763に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、UBE3AのRNAである、実施形態1764に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、SOD1のRNAである、実施形態1621~1763のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、プリオンのRNAである、実施形態1764に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、PMP22のRNAである、実施形態1764に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、タウのRNAである、実施形態1621~1764のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、LRRK2のRNAである、実施形態1764に記載のオリゴマー
化合物。
前記標的RNAが、APPのRNAである、実施形態1764に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、LINGO2のRNAである、1764に記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、GYS1のRNAである、実施形態1764のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、KCNT1のRNAである、実施形態1764のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、IRF8のRNAである、実施形態1764のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、プログラニュリンのRNAである、実施形態1764のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAが、GFAPのRNAである、実施形態1764のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記標的RNAの発現を調節することが、障害または状態の治療と関連する、実施形態1621~1788のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、アルツハイマー病、筋萎縮性側索硬化症、パーキンソン病、脊髄小脳失調症、アンジェルマン症候群、アレキサンダー病、ラフォラ病、シャルコー・マリー・トゥース病、プリオン病、認知症、神経変性、MeCP2重複症候群、脳症、神経炎症、または多発性硬化症である、実施形態1789に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、アルツハイマー病である、実施形態1790に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、筋萎縮性側索硬化症である、実施形態1790に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、パーキンソン病である、実施形態1790に記載のオリゴマー
化合物。
前記障害または状態が、脊髄小脳失調症である、実施形態1790に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、アンジェルマン症候群である、実施形態1790に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、アレキサンダー病である、実施形態1790に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、ラフォラ病である、実施形態1790に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、シャルコー・マリー・トゥース病である、実施形態1790に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、プリオン病である、実施形態1790に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、認知症である、実施形態1790に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、神経変性である、実施形態1790に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、MeCP2重複症候群である、実施形態1790に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、脳症である、実施形態1790に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、神経炎症である、実施形態1790に記載のオリゴマー化合物。
前記障害または状態が、多発性硬化症である、実施形態1790に記載のオリゴマー化合物。
実施形態1461~1805のいずれかに記載のオリゴマー化合物の親オリゴマー化合
物が、インビトロで細胞毒性を有する、実施形態1461~1805のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物が、標準的なインビトロ細胞毒性アッセイにおいて細胞毒性を有する、実施形態1806に記載のオリゴマー化合物。
実施形態1461~1805のいずれかに記載のオリゴマー化合物の親オリゴマー化合物がマウスに投与されると、前記マウスに肝毒性が生じる、実施形態1461~1805のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記マウスに対する前記親オリゴマー化合物の前記投与が、全身投与である、実施形態1808に記載のオリゴマー化合物。
前記全身投与が、皮下投与である、実施形態1809に記載のオリゴマー化合物。
前記マウスが、CD-1マウスである、実施形態1808~1810のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記マウスが、C57BL/6マウスである、実施形態1808~1810のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記マウスが、BALB/cマウスである、実施形態1808~1810のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物の前記投与の後に、前記マウスにおける血漿中ALTレベルが、リットル当たり500単位超である、実施形態1807~1813のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物の前記投与の後に、前記マウスにおける血漿中ASTレベルが、リットル当たり500単位超である、実施形態1807~1814のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物の前記投与の後に、前記マウスにおける血漿中ALTレベルが、リットル当たり1000単位超である、実施形態1807~1815のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物の前記投与の後に、前記マウスにおける血漿中ASTレベルが、リットル当たり1000単位超である、実施形態1807~1816のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記肝毒性が、前記親オリゴマー化合物の前記投与から24~48時間後に測定される、実施形態1807~1817のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記肝毒性が、前記親オリゴマー化合物の前記投与から72時間後に測定される、実施形態1807~1817のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記肝毒性が、前記親オリゴマー化合物の前記投与から3日後に測定される、実施形態1807~1817のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記肝毒性が、前記親オリゴマー化合物の前記投与から5日後に測定される、実施形態1807~1817のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記肝毒性が、前記親オリゴマー化合物の前記投与から7日後に測定される、実施形態1807~1817のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記肝毒性が、前記親オリゴマー化合物の前記投与から10日後に測定される、実施形態1807~1817のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記肝毒性が、前記親オリゴマー化合物の前記投与から14日後に測定される、実施形態1807~1817のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物が、1~10mg/kgで前記マウスに投与される、実施形態1807~1817のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物が、10~25mg/kgで前記マウスに投与される、実施形態1807~1817のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物が、25~50mg/kgで前記マウスに投与される、実施形態1807~1817のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物が、50~100mg/kgで前記マウスに投与される、実施形態1807~1817のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物が、100~150mg/kgで前記マウスに投与される、実施形態1807~1817のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記マウスが、BALB/cマウスであり、前記親オリゴマー化合物が、150mg/kgで前記マウスに投与され、前記マウスにおける血漿中ALTレベルが、前記親オリゴマー化合物の前記投与から72時間後に測定される、実施形態1807~1817のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
実施形態1461~1830のいずれかに記載のオリゴマー化合物が50mg/kgでマウスに投与されると、前記マウスに肝毒性が生じない、実施形態1461~1830のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
実施形態1831に記載のオリゴマー化合物の前記投与の後に、前記マウスにおける血漿中ALTレベルが、リットル当たり100単位未満である、実施形態1831に記載のオリゴマー化合物。
前記マウスにおける血漿中ALTレベルが、実施形態1831または実施形態1832に記載のオリゴマー化合物の親オリゴマー化合物が投与されたマウスにおける血漿中ALTレベルと比較して少なくとも10倍低く、実施形態1831または実施形態1832のオリゴマー化合物の前記投与及び血漿中ALT測定も、前記親オリゴマー化合物の前記投与及び血漿中ALT測定も、同じ方法で完結される、実施形態1831または実施形態1832に記載のオリゴマー化合物。
前記マウスにおける血漿中ALTレベルが、前記親オリゴマー化合物が投与された前記マウスにおける血漿中ALTレベルと比較して少なくとも100倍低い、実施形態1833に記載のオリゴマー化合物。
前記マウスにおける血漿中ALTレベルが、前記親オリゴマー化合物が投与された前記マウスにおける血漿中ALTレベルと比較して少なくとも500倍低い、実施形態1833に記載のオリゴマー化合物。
実施形態1807~1835のいずれかに記載のオリゴマー化合物の、マウスにおける治療指数が、前記親オリゴマー化合物の治療指数と比較して増加している、実施形態1807~1835のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
実施形態1836に記載のオリゴマー化合物の、マウスにおける治療指数が、前記親オリゴマー化合物の治療指数と比較して少なくとも2倍高い、実施形態1836に記載のオリゴマー化合物。
ホスホロチオエート以外の前記少なくとも1つの修飾ヌクレオシド間結合、及び/または5-メチルシトシン以外の修飾核酸塩基及び/または修飾糖部分を含む前記少なくとも1つの修飾ヌクレオシド、を前記中央領域に含まないこと以外は同一のオリゴマー化合物が、マウスへの投与後に肝毒性を生じさせ、
前記そのこと以外は同一のオリゴマー化合物が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合と、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分と、チミン、ウラシル、アデニン、
グアニン、シトシン、及び5-メチルシトシンから選択される核酸塩基と、からなる中央領域を有する、実施形態1461~1805のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
ホスホロチオエート以外の前記少なくとも1つの修飾ヌクレオシド間結合、及び/または5-メチルシトシン以外の修飾核酸塩基及び/または修飾糖部分を含む前記少なくとも1つの修飾ヌクレオシド、を前記中央領域に含み、前記修飾糖部分が、2’-O-メチル修飾糖部分である、実施形態1838に記載のオリゴマー化合物。
前記2’-O-メチル修飾糖部分が、前記中央領域の位置2に存在する、実施形態1839に記載のオリゴマー化合物。
前記そのこと以外は同一のオリゴマー化合物が、2’-O-メチル修飾糖部分を含まず、前記そのこと以外は同一のオリゴマー化合物が、前記2’-O-メチル修飾糖部分の代わりに非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を含む、実施形態1838~1840に記載のオリゴマー化合物。
前記そのこと以外は同一のオリゴマー化合物の核酸塩基配列が、前記標的RNAに100%相補的である、実施形態1838~1841のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記そのこと以外は同一のオリゴマー化合物が、実施形態1838~1842のいずれかに記載のオリゴマー化合物の親オリゴマー化合物である、実施形態1838~1842のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記オリゴマー化合物が、標準的なインビトロ活性アッセイにおいて100nM未満のIC50で前記標的RNAを抑制する、実施形態1621~1843のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
実施形態1621~1843のいずれかに記載のオリゴマー化合物の親オリゴマー化合物が、標準的なインビトロ活性アッセイにおいて100nM未満のIC50で前記標的RNAを抑制する、実施形態1621~1843のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
標準的なインビトロ活性アッセイで測定された前記親オリゴマー化合物のIC50と、標準的なインビトロ活性アッセイで測定された実施形態1621~1845のいずれかに記載のオリゴマー化合物のIC50と、の間の差異が4倍未満である、実施形態1621~1845のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
標準的なインビトロ活性アッセイで測定された前記親オリゴマー化合物のIC50と、標準的なインビトロ活性アッセイで測定された実施形態1621~1845のいずれかに記載のオリゴマー化合物のIC50と、の間の差異が3倍未満である、実施形態1621~1845のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
標準的なインビトロ活性アッセイで測定された前記親オリゴマー化合物のIC50と、標準的なインビトロ活性アッセイで測定された実施形態1621~1845のいずれかに記載のオリゴマー化合物のIC50と、の間の差異が2倍未満である、実施形態1621~1845のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物の前記中央領域の糖部分がそれぞれ、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分であり、前記親オリゴマー化合物の前記中央領域のヌクレオシド間結合がそれぞれ、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態1621~1848のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記親オリゴマー化合物の核酸塩基配列が、前記標的RNAに100%相補的である、実施形態1621~1849のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
10~50mgの前記オリゴマー化合物がヒトに投与されると、前記ヒトに肝毒性が生じない、実施形態1461~1850のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
50~100mgの前記オリゴマー化合物がヒトに投与されると、前記ヒトに肝毒性が生じない、実施形態1461~1850のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
100~300mgの前記オリゴマー化合物がヒトに投与されると、前記ヒトに肝毒性が生じない、実施形態1461~1850のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記投与が、全身投与である、実施形態1851~1853のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
実施形態1461~1854のいずれかに記載のオリゴマー化合物と、第2のオリゴマー化合物と、を含む組成物であって、前記第2のオリゴマー化合物が、実施形態1461~1854のいずれかに記載のオリゴマー化合物に相補的である前記組成物。
前記第2のオリゴマー化合物が、実施形態1851~1853のいずれかに記載のオリゴマー化合物に少なくとも90%相補的な少なくとも14個の近接する連結ヌクレオシドを含む、実施形態1855に記載の組成物。
前記第2のオリゴマー化合物が、実施形態1461~1854のいずれかに記載のオリゴマー化合物に100%相補的な少なくとも14個の近接する連結ヌクレオシドを含む、実施形態1855に記載の組成物。
実施形態1461~1854のいずれかに記載のオリゴマー化合物を含む医薬組成物、または実施形態1855~1857のいずれかに記載の組成物であって、前記医薬組成物
または組成物が、医薬的に許容可能な担体または希釈剤を含む前記医薬組成物または組成物。
実施形態1461~1858のいずれかに記載のオリゴマー化合物または組成物をヒト対象に投与することを含む方法。
実施形態1461~1858のいずれかに記載のオリゴマー化合物または組成物をヒト対象に投与することを含む、疾患または障害の治療方法。
ヒト対象における標的RNAの量または活性の調節方法であって、前記方法が、実施形態1461~1858のいずれかに記載のオリゴマー化合物または組成物を前記ヒト対象に投与すること、及びそれによって前記ヒト対象における前記標的RNAの量または活性を調節すること、を含む前記方法。
ヒト対象における疾患または障害の治療方法であって、前記方法が、実施形態1461~1858のいずれかに記載のオリゴマー化合物または組成物を、前記疾患または障害を有する前記ヒト対象に投与すること、及びそれによって前記ヒト対象における前記疾患または障害を治療すること、を含む前記方法。
前記疾患または障害が、肝疾患であり、前記オリゴマー化合物が、肝臓標的RNAの量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記疾患または障害が、中枢神経系疾患であり、前記オリゴマー化合物が、中枢神経系標的RNAの量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記疾患または障害が、がん、神経変性疾患、循環器疾患、免疫疾患、遺伝性疾患、反復配列伸長疾患、筋肉消耗疾患、または代謝疾患である、実施形態1861~1864のいずれかに記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、白色脂肪細胞標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、褐色脂肪細胞標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、脂肪細胞標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、マクロファージ標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、がん細胞標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、腫瘍細胞標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、平滑筋細胞標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、リンパ球標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、肺細胞標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、心筋細胞(heart muscle cell)標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、心筋細胞(cardiomyocyte)標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、内皮細胞標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、線維芽細胞標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、グリア細胞標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、シュワン細胞標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、膵細胞標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、腎細胞標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、ベータ細胞標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、非実質細胞標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、肝細胞標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、オリゴデンドロサイト標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、アストロサイト標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、ミクログリア標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、上衣細胞標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、感覚ニューロン標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、運動ニューロン標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、骨格筋標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、心筋標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、平滑筋標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、脂肪組織標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、白色脂肪組織標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、脾臓標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、骨標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、骨髄標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、腸標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、副腎標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、精巣標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、卵巣標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、膵臓標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、下垂体標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、前立腺標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、皮膚標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、表皮標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、子宮標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、膀胱標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、脳標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、糸球体標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、遠位尿細管上皮標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、乳房組織標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、肺標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、心臓標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、腎臓標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、神経節標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、前頭皮質標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、脊髄標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、三叉神経節標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、坐骨神経標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、後根神経節標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、精巣上体脂肪標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、横隔膜標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記オリゴマー化合物が、結腸標的の量または活性を調節する、実施形態1861または実施形態1862に記載の方法。
前記投与の後の前記ヒト対象の血漿中ALTレベルが、前記投与の前のものと比較して3倍を超えない、実施形態1802~1926のいずれかに記載の方法。
前記投与の後の前記ヒト対象の血漿中ALTレベルが、リットル当たり150単位を超えない、実施形態1802~1926のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、肝損傷に感受性である、実施形態1802~1928のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、肝変性に感受性である、実施形態1802~1928のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、肝臓におけるアポトーシスの上昇に感受性である、実施形態1802~1930のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、肝疾患を有する、実施形態1802~1931のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、腎疾患を有する、実施形態1802~1932のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、腎臓損傷に感受性である、実施形態1802~1933のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、心疾患を有する、実施形態1802~1934のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、心臓損傷に感受性である、実施形態1802~1935のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、膵炎を有する、実施形態1802~1936のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、膵損傷に感受性である、実施形態1802~1937のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、神経学的疾患を有する、実施形態1802~1938のいずれかに記載の方法。
前記ヒト対象が、神経学的損傷に感受性である、実施形態1802~1939のいずれかに記載の方法。
実施形態1461~1858のいずれかに記載のオリゴマー化合物の親オリゴマー化合物をマウスに投与することを含む、実施形態1859~1940のいずれかに記載の方法。
実施形態1461~1858のいずれかに記載のオリゴマー化合物の親オリゴマー化合物と細胞を接触させることを含む、実施形態1859~1940のいずれかに記載の方法。
前記親オリゴマー化合物の前記中央領域の糖部分がそれぞれ、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分であり、前記親オリゴマー化合物の前記中央領域のヌクレオシド間
結合がそれぞれ、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態1941または実施形態1942に記載の方法。
オリゴマー化合物の設計方法であって、前記方法が、親オリゴマー化合物を出発物質とすること、及び実施形態1461~1858のいずれか1つに記載のオリゴマー化合物に至るように前記化合物の設計を変更すること、を含む前記方法。
オリゴマー化合物の設計方法であって、前記方法が、親オリゴマー化合物を同定すること、及び第2のオリゴマー化合物に至るように前記親オリゴマー化合物の設計を変更すること、を含み、前記第2のオリゴマー化合物が、実施形態1461~1858のいずれか1つに記載のオリゴマー化合物である前記方法。
オリゴマー化合物の肝毒性の改善方法であって、前記方法が、(i)マウスにおいてリットル当たり300単位超の血漿中ALTレベルを有する親オリゴマー化合物を同定するステップと、(ii)実施形態1461~1858のいずれか1つに記載のオリゴマー化合物を提供するステップと、を含む前記方法。
前記方法によって、前記親オリゴマー化合物と比較して治療指数が改善したオリゴマー化合物が設計される、実施形態1945または実施形態1946に記載の方法。
前記方法によって、前記親オリゴマー化合物と比較して肝毒性が低下したオリゴマー化合物が設計される、実施形態1945または実施形態1946に記載の方法。
前記第2のオリゴマー化合物の治療指数が、前記親オリゴマー化合物と比較して改善される、実施形態1945に記載の方法。
マウスにおける前記第2のオリゴマー化合物の肝毒性が、前記親オリゴマー化合物と比較して低減される、実施形態1945または実施形態1946に記載の方法。
実施形態1461~1858のいずれか1つに記載のオリゴマー化合物の肝毒性が、前記親オリゴマー化合物と比較して低減される、実施形態1945に記載の方法。
実施形態1461~1858のいずれかに記載のオリゴマー化合物をマウスに投与すること、及び実施形態1461~1858のいずれかに記載のオリゴマー化合物の親オリゴマー化合物を第2のマウスに別に投与すること、を含む方法であって、実施形態1461~1858のいずれかに記載のオリゴマー化合物の治療指数が、前記親オリゴマー化合物の治療指数と比較して改善される前記方法。
前記マウス、前記細胞、及び/または前記ヒト対象においてp21のRNAのレベルが測定される、実施形態1859~1952のいずれかに記載の方法。
実施形態1461~1858のいずれかに記載のオリゴマー化合物を対象に投与すること、及び前記対象におけるp21のRNAのレベルを測定すること、を含む方法。
前記対象が、マウスである、実施形態1954に記載の方法。
前記対象が、ヒトである、実施形態1954に記載の方法。
前記p21のRNAのレベルが、前記投与から24時間以内に測定される、実施形態1954~1956のいずれかに記載の方法。
前記p21のRNAのレベルが、前記投与から24~48時間後に測定される、実施形態1954~1956のいずれかに記載の方法。
医学的治療において使用するための、実施形態1461~1858のいずれか1つに記載のオリゴマー化合物または組成物。
前記オリゴマー化合物が、毒性を有さない、実施形態1461~1858のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
対照化合物が毒性を有し、前記対照化合物の前記中央領域のヌクレオシドがそれぞれ、2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を含むヌクレオシドであること以外は前記対照化合物が前記オリゴマー化合物と同一である、実施形態1461~1858のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記オリゴマー化合物がある用量で動物に投与されると生じる循環ALTレベルが、少なくとも1回の適合用量について前記対照化合物が同じ用量で動物に投与されると生じる前記ALTレベルと比較して少なくとも3倍低い、実施形態1961に記載のオリゴマー化合物。
リットル当たり300単位超に循環ALTを上昇させる前記オリゴマー化合物の最低用量が、リットル当たり300単位超に循環ALTを上昇させる前記対照化合物の最低用量と比較して少なくとも3倍高い、実施形態1961または実施形態1962に記載のオリゴマー化合物。
前記オリゴマー化合物が、細胞における前記標的RNAを低減する能力を有する、実施形態1961~1963のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
前記オリゴマー化合物が、対照化合物と同等のRNA低減活性を有し、前記対照化合物の前記中央領域のヌクレオシドがそれぞれ、2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を含むヌクレオシドであること以外は前記対照化合物が前記オリゴマー化合物と同一である、実施形態1964に記載のオリゴマー化合物。
前記対照化合物のRNA低減活性と比較して前記RNA低減活性の低下度合いが2倍を超えない、実施形態1965に記載のオリゴマー化合物。
ヒト対象における標的RNAの量または活性の調節方法であって、前記方法が、実施形態1461~1858のいずれかに記載のオリゴマー化合物または組成物を前記ヒト対象に投与すること、及びそれによって前記ヒト対象における前記標的RNAの量または活性を調節すること、を含む前記方法。
ヒト対象における疾患または障害の治療方法であって、前記方法が、実施形態1461~1858のいずれかに記載のオリゴマー化合物または組成物を、前記疾患または障害を有する前記ヒト対象に投与すること、及びそれによって前記ヒト対象における前記疾患または障害を治療すること、を含む前記方法。
前記疾患または障害が、肝疾患であり、前記オリゴマー化合物が、肝臓標的RNAの量または活性を調節する、実施形態1967または実施形態1968に記載の方法。
前記疾患または障害が、中枢神経系疾患であり、前記オリゴマー化合物が、中枢神経系標的RNAの量または活性を調節する、実施形態1967または実施形態1968に記載の方法。
前記疾患または障害が、がん、神経変性疾患、循環器疾患、免疫疾患、遺伝性疾患、反復配列伸長疾患、筋肉消耗疾患、または代謝疾患である、実施形態1967~1970のいずれかに記載の方法。
前記投与の後の前記ヒト対象の血漿中ALTレベルが、前記投与の前のものと比較して3倍を超えない、実施形態1967~1971のいずれかに記載の方法。
前記投与の後の前記ヒト対象の血漿中ALTレベルが、リットル当たり150単位を超えない、実施形態1967~1972のいずれかに記載の方法。
ヒト対象における疾患または障害の治療方法であって、前記方法が、実施形態1461~1858のいずれかに記載のオリゴマー化合物または組成物を、前記疾患または障害を有する前記ヒト対象に投与すること、及びそれによって前記ヒト対象における前記疾患または障害を治療すること、を含む前記方法。
前記疾患または障害が、CNSの疾患または障害ではない、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、白色脂肪細胞の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、褐色脂肪細胞の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、脂肪細胞の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、マクロファージの疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、がん細胞の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、腫瘍細胞の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、平滑筋細胞の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、リンパ球の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、肺細胞の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、心筋細胞(heart muscle cell)の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、心筋細胞(cardiomyocyte)の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、内皮細胞の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、線維芽細胞の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、グリア細胞の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、シュワン細胞の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、膵細胞の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、腎細胞の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、ベータ細胞の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、非実質細胞の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、肝細胞の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、オリゴデンドロサイトの疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、アストロサイトの疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、ミクログリアの疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、上衣細胞の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、感覚ニューロンの疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、運動ニューロンの疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、骨格筋の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、心筋の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、平滑筋の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、脂肪組織の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、白色脂肪組織の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、脾臓の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、骨の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、骨髄の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、腸の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、副腎の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、精巣の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、卵巣の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、膵臓の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、下垂体の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、前立腺の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、皮膚の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、表皮の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、子宮の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、膀胱の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、脳の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、糸球体の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、遠位尿細管上皮の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、乳房組織の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、肺の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、心臓の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、腎臓の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、神経節の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、前頭皮質の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、脊髄の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、三叉神経節の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、坐骨神経の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、後根神経節の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、精巣上体脂肪の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、横隔膜の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
前記疾患または障害が、結腸の疾患または障害である、実施形態1974に記載の方法。
標的RNAに対する活性についてオリゴマー化合物のライブラリーをスクリーニングする方法であって、オリゴマー化合物の前記ライブラリーが、実施形態1461~1858のいずれかに記載のオリゴマー化合物を複数含む前記方法。
ある特定の実施形態では、本明細書に記載の化合物は、連結ヌクレオシドからなるオリ
ゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であるか、または連結ヌクレオシドからなるオリゴヌクレオチドからなるオリゴマー化合物である。オリゴヌクレオチドは、非修飾オリゴヌクレオチドであり得るか、または修飾オリゴヌクレオチドであり得る。修飾オリゴヌクレオチドは、非修飾オリゴヌクレオチドと比較して少なくとも1つの修飾を含む(すなわち、少なくとも1つの修飾ヌクレオシド(修飾糖部分及び/または修飾核酸塩基を含む)及び/または少なくとも1つの修飾ヌクレオシド間結合)を含む。
A.修飾ヌクレオシド
修飾ヌクレオシドは、修飾糖部分、修飾核酸塩基、または修飾糖部分と修飾核酸塩基との両方を含む。
ある特定の実施形態では、糖部分は、非二環式修飾フラノシル糖部分である。ある特定の実施形態では、修飾糖部分は、二環式または三環式のフラノシル糖部分である。ある特定の実施形態では、修飾糖部分は、糖代替物である。そのような糖代替物は、他の型の修飾糖部分の置換に対応する置換を1つまたは複数含み得る。
Res.,25,4429-4443,1997を参照のこと)。非二環式修飾糖部分に適した4’-置換基の例としては、限定されないが、アルコキシ(例えば、メトキシ)、アルキル、及びManoharan et al.,WO2015/106128に記載のものが挙げられる。非二環式修飾糖部分に適した5’-置換基の例としては、限定されないが、5’-メチル(RまたはS)、5’-アリル、5’-エチル、5’-ビニル、
及び5’-メトキシが挙げられる。ある特定の実施形態では、非二環式修飾糖は、複数の非架橋糖置換基を含み、例えば、2’-F-5’-メチル糖部分、ならびにMigawa
et al.,WO2008/101157 and Rajeev et al.,US2013/0203836に記載の修飾糖部分及び修飾ヌクレオシドである。Martinez-Montero,et al.,Rigid 2’,4’-difluororibonucleosides:synthesis,conformational analysis,and incorporation into nascent RNA by HCV polymerase.J.Org.Chem.,2014,79:5627-5635では、2’,4’-ジフルオロ修飾糖部分について記載されている。2’-修飾(OMeまたはF)及び4’-修飾(OMeまたはF)を含む修飾糖部分は、Malek-Adamian,et al.,J.Org.Chem,2018,83:9839-9849にも記載されている。
.S.7,399,845、Bhat et al.,U.S.7,569,686、Swayze et al.,U.S.7,741,457、及びSwayze et al.,U.S.8,022,193を参照のこと)、4’-C(CH3)(CH3)-O-2’及びその類似体(例えば、Seth et al.,U.S.8,278,283を参照のこと)、4’-CH2-N(OCH3)-2’及びその類似体(例えば、Prakash et al.,U.S.8,278,425を参照のこと)、4’-CH2-O-N(CH3)-2’(例えば、Allerson et al.,U.S.7,696,345、及びAllerson et al.,U.S.8,124,745を参照のこと)、4’-CH2-C(H)(CH3)-2’(例えば、Zhou,et al.,J.Org.Chem.,2009,74,118-134を参照のこと)、4’-CH2-C(=CH2)-2’及びその類似体(例えば、Seth et al.,U.S.8,278,426を参照のこと)、4’C(RaRb)-N(R)-O-2’、4’-C(RaRb)-O-N(R)-2’、4’-CH2-O-N(R)-2’、及び4’-CH2-N(R)-O-2’(R、Ra、及びRbはそれぞれ、独立して、H、保護基、またはC1-C12アルキルである)(例えば、Imanishi et al.,U.S.7,427,672を参照のこと)、4’-C(=O)-N(CH3)2-2’、4’-C(=O)-N(R)2-2’、4’-C(=S)-N(R)2-2’、及びその類似体(例えば、Obika et al.,WO2011052436A1,Yusuke,WO2017018360A1を参照のこと)、を含む二環式糖が挙げられる。
式中:
xは、0、1、または2であり、
nは、1、2、3、または4であり、
Ra及びRbはそれぞれ、独立して、H、保護基、ヒドロキシル、C1-C12アルキル、置換C1-C12アルキル、C2-C12アルケニル、置換C2-C12アルケニル、C2-C12アルキニル、置換C2-C12アルキニル、C5-C20アリール、置換C5-C20アリール、ヘテロ環ラジカル、置換ヘテロ環ラジカル、ヘテロアリール、置換ヘテロアリール、C5-C7脂環式ラジカル、置換C5-C7脂環式ラジカル、ハロゲン、OJ1、NJ1J2、SJ1、N3、COOJ1、アシル(C(=O)-H)、置換アシル、CN、スルホニル(S(=O)2-J1)、またはスルホキシル(S(=O)-J1)であり、
J1及びJ2はそれぞれ、独立して、H、C1-C12アルキル、置換C1-C12アルキル、C2-C12アルケニル、置換C2-C12アルケニル、C2-C12アルキニル、置換C2-C12アルキニル、C5-C20アリール、置換C5-C20アリール、アシル(C(=O)-H)、置換アシル、ヘテロ環ラジカル、置換ヘテロ環ラジカル、C1-C12アミノアルキル、置換C1-C12アミノアルキル、または保護基である。
rivastava et al.,J.Am.Chem.Soc.,2017,129,8362-8379、Elayadi et al.,、Christiansen,et al.,J.Am.Chem.Soc.1998,120,5458-5463、Wengel et a.,U.S.7,053,207、Imanishi et al.,U.S.6,268,490、Imanishi et al.U.S.6,770,748、Imanishi et al.,U.S.RE44,779、Wengel et al.,U.S.6,794,499、Wengel et al.,U.S.6,670,461、Wengel et al.,U.S.7,034,133、Wengel et al.,U.S.8,080,644、Wengel et al.,U.S.8,034,909、Wengel et al.,U.S.8,153,365、Wengel et al.,U.S.7,572,582、及びRamasamy et al.,U.S.6,525,191、Torsten et al.,WO2004/106356、Wengel et al.,WO1999/014226、Seth et al.,WO2007/134181、Seth et al.,U.S.7,547,684、Seth et al.,U.S.7,666,854、Seth et al.,U.S.8,088,746、Seth et al.,U.S.7,750,131、Seth et al.,U.S.8,030,467、Seth
et al.,U.S.8,268,980、Seth et al.,U.S.8,546,556、Seth et al.,U.S.8,530,640、Migawa
et al.,U.S.9,012,421、Seth et al.,U.S.8,501,805、ならびにAllerson et al.,米国特許公開第US2008/0039618号、及びMigawa et al.,同第US2015/0191727号を参照のこと。
α-L-メチレンオキシ(4’-CH2-O-2’)二環式ヌクレオシドまたはα-L-LNA二環式ヌクレオシドは、アンチセンスオリゴヌクレオチドに組み込まれており、こうしたアンチセンスオリゴヌクレオチドは、アンチセンス活性を示した(Frieden
et al.,Nucleic Acids Research,2003,21,6365-6372)。本明細書では、二環式ヌクレオシドの一般的な説明は、両方の異性配置を含む。本明細書に例示される実施形態において特定の二環式ヌクレオシド(例えば、LNA)の位置が特定されるとき、当該二環式ヌクレオシドは、別段の指定がない限り、β-D配置を有する。
の位置に続く「修飾」という用語(「2’-修飾」など)は、糖部分が、指定の修飾を2’位に含み、追加の修飾及び/または置換基を含み得ることを示す。4’-2’架橋糖部分は、2’-修飾され、かつ4’-修飾されているか、または代替的に表現すると、「2’,4’-修飾」されている。フラノシル環の位置に続く「置換」という用語(「2’-置換」または「2’-4’-置換」など)は、オリゴヌクレオチドにおける非修飾糖部分に見られるもの以外に置換基を有するのは当該位置(複数可)のみであることを示す。したがって、下記の糖部分は、下記の式によって示される。
によって示され、
式中、Bは、核酸塩基であり、L1及びL2はそれぞれ、独立して、ヌクレオシド間結合、末端基、複合基、またはヒドロキシル基である。R基のうちで、R3-7の少なくとも1つは、Hではなく、及び/またはR1及びR2の少なくとも1つは、HまたはOHではない。2’-修飾フラノシル糖部分では、R1及びR2の少なくとも1つは、HまたはOHではなく、R3-7はそれぞれ、HまたはH以外の置換基から独立して選択される。4’-修飾フラノシル糖部分では、R5は、Hではなく、R1-4,6,7はそれぞれ、H及びH以外の置換基から独立して選択され、フラノシル環のそれぞれの位置についても同様である。立体化学は、別段の記載がない限り、規定されない。
によって示され、式中、Bは、核酸塩基であり、L1及びL2はそれぞれ、独立して、ヌクレオシド間結合、末端基、複合基、またはヒドロキシル基である。R1は、HまたはOH以外の置換基である。立体化学は、示されるように規定される。
によって示され、式中、Bは、核酸塩基であり、L1及びL2はそれぞれ、独立して、ヌクレオシド間結合、末端基、複合基、またはヒドロキシル基である。R5は、H以外の置換基である。立体化学は、示されるように規定される。
によって示され、式中、Bは、核酸塩基であり、L1及びL2はそれぞれ、独立して、ヌクレオシド間結合、末端基、複合基、またはヒドロキシル基である。R6またはR7は、H以外の置換基である。立体化学は、示されるように規定される。
によって示され、式中、Bは、核酸塩基であり、L1及びL2はそれぞれ、独立して、ヌクレオシド間結合、末端基、複合基、またはヒドロキシル基である。R1-5はそれぞれ、H及びH以外の置換基から独立して選択される。R1-5のすべてがそれぞれHである
ならば、糖部分は、非置換2’-デオキシフラノシル糖部分である。立体化学は、別段の記載がない限り、規定されない。
によって示され、式中、Bは、核酸塩基であり、L1及びL2はそれぞれ、独立して、ヌクレオシド間結合、末端基、複合基、またはヒドロキシル基である。R3は、H以外の置換基である。立体化学は、示されるように規定される。
によって示され、式中、Bは、核酸塩基であり、L1及びL2はそれぞれ、独立して、ヌクレオシド間結合、末端基、複合基、またはヒドロキシル基である。R4またはR5は、H以外の置換基である。立体化学は、示されるように規定される。
によって示され、式中、Bは、核酸塩基であり、L1及びL2はそれぞれ、独立して、ヌクレオシド間結合、末端基、複合基、またはヒドロキシル基である。立体化学は、示されるように規定される。α-L-リボシルヌクレオチド及びβ-D-キシロシルヌクレオチドの合成は、Gaubert,et al.,Tetehedron 2006,62:2278-2294によって記載されている。DNAヌクレオシド及びRNAヌクレオシドの追加の異性体は、Vester,et.al.,“Chemically modified oligonucleotides with efficient RNase H response,”Bioorg.Med.Chem.Letters,2008,18:2296-2300によって記載されている。
追加の糖代替物は、式:
を有するTHP化合物を含むものであり、
式中、上記修飾THPヌクレオシドのそれぞれについて独立して、
Bxは、核酸塩基部分であり、
T3及びT4はそれぞれ、独立して、修飾THPヌクレオシドをオリゴヌクレオチドの残部に連結するヌクレオシド間結合であり、あるいはT3及びT4の一方は、修飾THPヌクレオシドをオリゴヌクレオチドの残部に連結するヌクレオシド間結合であり、T3及びT4のもう一方は、H、ヒドロキシル保護基、連結された複合基、または5’末端基もしくは3’末端基であり、
q1、q2、q3、q4、q5、q6、及びq7はそれぞれ、独立して、H、C1-C6アルキル、置換C1-C6アルキル、C2-C6アルケニル、置換C2-C6アルケニル、C2-C6アルキニル、または置換C2-C6アルキニルであり、
R1及びR2はそれぞれ、水素、ハロゲン、置換または非置換のアルコキシ、NJ1J2、SJ1、N3、OC(=X)J1、OC(=X)NJ1J2、NJ3C(=X)NJ1J2、及びCN(Xは、O、S、またはNJ1であり、J1、J2、及びJ3はそれぞれ、独立して、HまたはC1-C6アルキルである)のうちから独立して選択される。
を含む糖代替物を意味する。ある特定の実施形態では、モルホリノは、例えば、上記のモルホリノ構造にさまざまな置換基を付加するか、または上記のモルホリノ構造からさまざまな置換基を改変することによって、修飾され得る。そのような糖代替物は、「修飾モルホリノ」と本明細書で称される。ある特定の実施形態では、ヌクレオシド間結合を含めて、全ヌクレオチドがモルホリノ残基によって置き換えられ、当該モルホリノ残基は、以下に示される構造を有し、式中、Bxは、ヘテロ環式塩基部分である。
et al.,WO2011/133876に記載のヌクレオシド及びオリゴヌクレオチドが挙げられる。
によって示される構造を含み、
式中、Bxは、ヘテロ環式塩基部分を示す。
の1つによって示される構造を含み、
式中、Xは、OまたはSであり、Bxは、ヘテロ環式塩基部分を示す。
RNase H response,”Bioorg.Med.Chem.Letters,2008,18:2296-2300の図1に記載のものであり、当該文献は、参照によって本明細書に組み込まれる。ある特定の実施形態では、DNA模倣体ヌクレオシドは、
から選択される式を有し、
式中、Bxは、ヘテロ環式塩基部分であり、L1及びL2はそれぞれ、独立して、修飾THPヌクレオシドをオリゴヌクレオチドの残部に連結するヌクレオシド間結合であり、あるいはL1及びL2の一方は、修飾ヌクレオシドをオリゴヌクレオチドの残部に連結するヌクレオシド間結合であり、L1及びL2のもう一方は、H、ヒドロキシル保護基、連結された複合基、または5’末端基もしくは3’末端基である。ある特定の実施形態では、DNA模倣体は、α,β-拘束核酸(CAN)、2’,4’-炭素環式-LNA、または2’,4’-炭素環式-ENAである。ある特定の実施形態では、DNA模倣体は、4’-C-ヒドロキシメチル-2’-デオキシリボシル、3’-C-ヒドロキシメチル-2’-デオキシリボシル、3’-C-ヒドロキシメチル-アラビノシル、3’-C-2’-O-アラビノシル、3’-C-メチレン-延長型-キシロシル、3’-C-2’-O-ピペラジノ-アラビノシルのうちから選択される糖部分を有する。ある特定の実施形態では、DNA模倣体は、2’-メチルリボシル、2’-S-メチルリボシル、2’-アミノリボシル、2’-NH(CH2)-リボシル、2’-NH(CH2)2-リボシル、2’-CH2-F-リボシル、2’-CHF2-リボシル、2’-CF3-リボシル、2’=CF2リボシル、2’-エチルリボシル、2’-アルケニルリボシル、2’-アルキニルリボシル、2’-O-4’-C-メチレンリボシル、2’-シアノアラビノシル、2’-クロロアラビノシル、2’-フルオロアラビノシル、2’-ブロモアラビノシル、2’-アジドアラビノシル、2’-メトキシアラビノシル、及び2’-アラビノシルのうちから選択される糖部分を有する。ある特定の実施形態では、DNA模倣体は、4’-メチル-修飾デオキシフラノシル、4’-F-デオキシフラノシル、4’-OMe-デオキシフラノシルから選択される糖部分を有する。ある特定の実施形態では、DNA模倣体は、5’-メチル-2’-β-D-デオキシリボシル、5’-エチル-2’-β-D-デオキシリボシル、5’-アリル-2’-β-D-デオキシリボシル、2’-フルオロ-β-D-アラビノフラノシルのうちから選択される糖部分を有する。ある特定の実施形態では、DNA模倣体は、B型ヌクレオチドとしてPCT/US00/267929の32~33ページに列挙されており、当該文献は、その全体が参照によって本明細書に組み込まれる。
ある特定の実施形態では、修飾核酸塩基は、5-置換ピリミジン、6-アザピリミジン、アルキル置換ピリミジンまたはアルキニル置換ピリミジン、アルキル置換プリン、ならびにN-2置換プリン、N-6置換プリン、及びO-6置換プリンから選択される。ある特定の実施形態では、修飾核酸塩基は、2-アミノプロピルアデニン、5-ヒドロキシメチルシトシン、キサンチン、ヒポキサンチン、2-アミノアデニン、6-N-メチルグアニン、6-N-メチルアデニン、2-プロピルアデニン、2-チオウラシル、2-チオチミン、及び2-チオシトシン、5-プロピニル(-C≡C-CH3)ウラシル、5-プロピニルシトシン、6-アゾウラシル、6-アゾシトシン、6-アゾチミン、5-リボシルウラシル(シュードウラシル)、4-チオウラシル、8-ハロプリン、8-アミノプリン、8-チオールプリン、8-チオアルキルプリン、8-ヒドロキシルプリン、8-アザプリン、及び他の8-置換プリン、5-ハロ、具体的には、5-ブロモ、5-トリフルオロメチル、5-ハロウラシル、及び5-ハロシトシン、7-メチルグアニン、7-メチルアデニン、2-F-アデニン、2-アミノアデニン、7-デアザグアニン、7-デアザアデニン、3-デアザグアニン、3-デアザアデニン、6-N-ベンゾイルアデニン、2-N-イソブチリルグアニン、4-N-ベンゾイルシトシン、4-N-ベンゾイルウラシル、5-メチル4-N-ベンゾイルシトシン、5-メチル4-N-ベンゾイルウラシル、ユニバーサル塩基、疎水性塩基、多様な対形成が可能な塩基(promiscuous base)、サイズ拡張型塩基、ならびにフッ素化塩基から選択される。追加の修飾核酸塩基には、三環式ピリミジンが含まれ、こうした三環式ピリミジンは、1,3-ジアザフェノキサジン-2-オン、1,3-ジアザフェノチアジン-2-オン、及び9-(2-アミノエトキシ)-1,3-ジアザフェノキサジン-2-オン(G-クランプ)などである。修飾核酸塩基には、プリン塩基またはピリミジン塩基が他のヘテロ環(例えば、7-デアザ-アデニン、7-デアザグアノシン、2-アミノピリジン、及び2-ピリドン)で置き換えられたものも含まれ得る。追加の核酸塩基には、Merigan et al.,U.S.3,687,808に開示のもの、The Concise Encyclopedia Of Polymer Science And Engineering,Kroschwitz,J.I.,Ed.,John Wiley & Sons,1990,858-859に開示のもの、Englisch et al.,Angewandte Chemie,International Edition,1991,30,613に開示のもの、Sanghvi,Y.S.,Chapter 15,Antisense Research and Applications,Crooke,S.T.and Lebleu,B.,Eds.,CRC Press,1993,273-288に開示のもの、及びChapters 6 and 15,Antisense Drug Technology,Crooke S.T.,Ed.,CRC Press,2008,163-166 and 442-443に開示のものが含まれる。ある特定の実施形態では、修飾ヌクレオシドは、2つの核酸塩基を有する双頭型ヌクレオシドを含む。そのような化合物は、Sorinaset al.,J.Org.Chem,2014 79:8020-8030に詳述されている。
et al.,U.S.4,845,205、Spielvogel et al.,U.S.5,130,302、Rogers et al.,U.S.5,134,066、Bischofberger et al.,U.S.5,175,273、Urdea et al.,U.S.5,367,066、Benner et al.,U.S.5,432,272、Matteucci et al.,U.S.5,434,257、Gmeiner et al.,U.S.5,457,187、Cook et
al.,U.S.5,459,255、Froehler et al.,U.S.5,484,908、Matteucci et al.,U.S.5,502,177、Hawkins et al.,U.S.5,525,711、Haralambidis
et al.,U.S.5,552,540、Cook et al.,U.S.5,587,469、Froehler et al.,U.S.5,594,121、Switzer et al.,U.S.5,596,091、Cook et al.,U.S.5,614,617、Froehler et al.,U.S.5,645,985、Cook et al.,U.S.5,681,941、Cook et al.,U.S.5,811,534、Cook et al.,U.S.5,750,692、Cook et al.,U.S.5,948,903、Cook et al.,U.S.5,587,470、Cook et al.,U.S.5,457,191、Matteucci et al.,U.S.5,763,588、Froehler et al.,U.S.5,830,653、Cook et al.,U.S.5,808,027、Cook et al.,6,166,199、及びMatteucci et al.,U.S.6,005,096が含まれる。
ある特定の実施形態では、1つまたは複数の修飾ヌクレオシド間結合を有する本明細書に記載の化合物は、望ましい特性(例えば、細胞内への取り込みの増進、標的核酸に対する親和性の増進、及びヌクレアーゼ存在下での安定性の向上など)を有するため、ホスホジエステルヌクレオシド間結合のみを有する化合物に勝って選択される。
別段の指定がない限り、本明細書に記載の修飾オリゴヌクレオチドのキラルヌクレオシド間結合は、立体ランダムであるか、または特定の立体化学的配置を有し得る。
には、シロキサン(ジアルキルシロキサン)、カルボン酸エステル、カルボキサミド、スルフィド、スルホン酸エステル、及びスルホン酸アミド、を含む非イオン性結合が含まれる(例えば、Carbohydrate Modifications in Antisense Research;Y.S.Sanghvi and P.D.Cook,Eds.,ACS Symposium Series 580;Chapters 3
and 4,40-65を参照のこと)。追加の中性ヌクレオシド間結合には、N構成要素部分、O構成要素部分、S構成要素部分、及びCH2構成要素部分の組み合わせを含む非イオン性結合が含まれる。
によって示され、
式中、Bは、核酸塩基であり、L1は、ヌクレオシド間結合、末端基、複合基、またはヒドロキシル基であり、L2は、ヌクレオシド間結合である。立体化学は、別段の記載がない限り、規定されない。
トレオース核酸
(TNA)
ある特定の実施形態では、本明細書に記載のオリゴマー化合物は、オリゴヌクレオチドを含むか、またはオリゴヌクレオチドからなる。オリゴヌクレオチドは、モチーフを有し得、こうしたモチーフは、例えば、糖部分、核酸塩基、及び/またはヌクレオシド間結合の非修飾及び/または修飾のパターンである。ある特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、修飾糖を含む1つまたは複数の修飾ヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、修飾核酸塩基を含む1つまたは複数の修飾ヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、1つまたは複数の修飾ヌクレオシド間結合を含む。そのような実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの糖部分、核酸塩基、及び/またはヌクレオシド間結合の修飾、非修飾、及び修飾差異によってパターンまたはモチーフが規定される。ある特定の実施形態では、糖部分、核酸塩基、及びヌクレオシド間結合のパターンまたはモチーフはそれぞれ、互いに独立している。したがって、修飾オリゴヌクレオチドは、その糖モチーフ、核酸塩基モチーフ、及び/またはヌクレオシド間結合モチーフによって説明され得る(本明細書で使用されるように、核酸塩基モチーフは、核酸塩基の配列とは無関係に核酸塩基に対する修飾を説明するものである)。
ある特定の実施形態では、本明細書に記載のオリゴマー化合物は、オリゴヌクレオチドを含むか、またはオリゴヌクレオチドからなる。ある特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドまたはその領域に沿って規定のパターンまたは糖モチーフ
で配置された1つまたは複数の型の修飾糖部分及び/または非修飾糖部分を含む。ある特定の場合では、そのような糖モチーフは、限定されないが、本明細書で論じられる糖修飾のいずれかを含む。
MOEギャップマーは、eeeee-d(10)-eeeeeまたはe(5)-d(10)-e(5)という表記によって示され得、表記中、「e」はそれぞれ、2’-MOE-β-D-リボフラノシル糖部分を示し、「d」はそれぞれ、2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を示す。
ある特定の実施形態では、本明細書に記載のオリゴマー化合物は、オリゴヌクレオチドを含むか、またはオリゴヌクレオチドからなる。ある特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドまたはその領域に沿って規定のパターンまたはモチーフで配置された修飾核酸塩基及び/または非修飾核酸塩基を含む。ある特定の実施形態では、核酸塩基はそれぞれ、修飾される。ある特定の実施形態では、核酸塩基はいずれも、修飾されない。ある特定の実施形態では、プリンまたはピリミジンはそれぞれ、修飾される。ある特定の実施形態では、アデニンはそれぞれ、修飾される。ある特定の実施形態では、グアニンはそれぞれ、修飾される。ある特定の実施形態では、チミンはそれぞれ、修飾される。ある特定の実施形態では、ウラシルはそれぞれ、修飾される。ある特定の実施形態では、シトシンはそれぞれ、修飾される。ある特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドにおけるシトシン核酸塩基のいくつかまたはすべてが、5-メチルシトシンである。
ある特定の実施形態では、本明細書に記載のオリゴマー化合物は、オリゴヌクレオチドを含むか、またはオリゴヌクレオチドからなる。ある特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドまたはその領域に沿って規定のパターンまたはモチーフで配置された修飾ヌクレオシド間結合及び/または非修飾ヌクレオシド間結合を含む。ある特定の実施形態では、ヌクレオシド間結合はそれぞれ、ホスホジエステルヌクレオシド間結合(P=O)である。ある特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドのヌクレオシド間結合はそれぞれ、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合(P=S)である。ある特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドのヌクレオシド間結合はそれぞれ、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合及びホスホジエステルヌクレオシド間結合から独立して選択される。ある特定の実施形態では、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合はそれぞれ、立体ランダムなホスホロチオエート、(Sp)ホスホロチオエート、及び(Rp)ホスホロチオエートから独立して選択される。ある特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの中央領域内のヌクレオシド間結合はすべて、修飾される。ある特定のそのような実施形態では、5’領域及び3’領域におけるヌクレオシド間結合のいくつかまたはすべてが、非修飾リン酸結合である。ある特定の実施形態では、末端のヌクレオシド間結合は、修飾される。ある特定の実施形態では、ヌクレオシド間結合モチーフは、5’領域及び3’領域の少なくとも1つに少なくとも1つのホスホジエステルヌクレオシド間結合を含み
、当該少なくとも1つのホスホジエステル結合は、末端のヌクレオシド間結合ではなく、残りのヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である。ある特定のそのような実施形態では、ホスホロチオエート結合はすべて、立体ランダムである。ある特定の実施形態では、5’領域及び3’領域におけるホスホロチオエート結合はすべて、(Sp)ホスホロチオエートであり、中央領域は、少なくとも1つのSp,Sp,Rpモチーフを含む。ある特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの集団は、そのようなヌクレオシド間結合モチーフを含む修飾オリゴヌクレオチドが富化される。
しながらホスホロチオエートヌクレオシド間結合の数を減らすことが望ましい。ある特定の実施形態では、ヌクレアーゼ抵抗性を保持しながらホスホジエステルヌクレオシド間結合の数を増やすことが望ましい。
ある特定の実施形態では、本明細書に記載のオリゴマー化合物は、修飾オリゴヌクレオチドを含むか、または修飾オリゴヌクレオチドからなる。ある特定の実施形態では、上記の修飾(糖、核酸塩基、ヌクレオシド間結合)は、修飾オリゴヌクレオチドに組み込まれる。ある特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、その修飾、モチーフ、及び全長によって特徴付けられる。ある特定の実施形態では、そのようなパラメーターはそれぞれ、互いに独立している。したがって、別段の指定がない限り、修飾オリゴヌクレオチドのヌクレオシド間結合はそれぞれ、修飾されることも修飾されないこともあり得、糖部分の修飾パターンに従うことも従わないこともあり得る。同様に、そのような修飾オリゴヌクレオチドは、糖修飾のパターンとは無関係に1つまたは複数の修飾核酸塩基を含み得る。さらに、ある特定の場合では、修飾オリゴヌクレオチドは、全長または全範囲と、2つ以上の領域(例えば、特定の糖修飾を有するヌクレオシドの領域)の長さまたは長さ範囲と、によって説明され、そのような状況では、特定の範囲を逸脱する全長を有するオリゴヌクレオチドが結果的に生じる数をそれぞれの範囲には選択することが可能であり得る。そのような状況では、両方の要素が満たされなくてはならない。例えば、ある特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、15~20個の連結ヌクレオシドからなり、A、B、及びCという3つの領域またはセグメントからなる糖モチーフを有し、領域AまたはセグメントAは、特定の糖部分を有する2~6つの連結ヌクレオシドからなり、領域BまたはセグメントBは、特定の糖部分を有する6~10個の連結ヌクレオシドからなり、領域CまたはセグメントCは、特定の糖部分を有する2~6つの連結ヌクレオシドからなる。そのような実施形態には、A及びCがそれぞれ、6つの連結ヌクレオシドからなり、Bが、10個の連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドは含まれない。この理由は、(ヌクレオシドのこうした数は、A、B、及びCに対する要件には収まるものとして許容されるものの)そのようなオリゴヌクレオチドの全長は22であり、この22という数は、修飾オリゴヌクレオチドの全長の上限である20を超えていることによるものである。別段の指定がない限り、オリゴヌクレオチド配列では修飾核酸塩基である5-メチルシトシンが必然的に「C」であること以外は、修飾はすべて、核酸塩基配列とは無関係である。ある特定の実施形態では、DNA配列におけるTを含むDNAヌクレオシドまたはDNA様ヌクレオシドが、2’-OMe修飾糖部分を含むヌクレオシドを含めて、RNA様ヌクレオシドで置き換えられるとき、核酸塩基Tは、核酸塩基Uで置き換えられる。こうした化合物はそれぞれ、同一のRNAを標的とする。
、14~18個、14~19個、14~20個、14~21個、14~22個、14~23個、14~24個、14~25個、14~26個、14~27個、14~28個、14~29個、14~30個、15~16個、15~17個、15~18個、15~19個、15~20個、15~21個、15~22個、15~23個、15~24個、15~25個、15~26個、15~27個、15~28個、15~29個、15~30個、16~17個、16~18個、16~19個、16~20個、16~21個、16~22個、16~23個、16~24個、16~25個、16~26個、16~27個、16~28個、16~29個、16~30個、17~18個、17~19個、17~20個、17~21個、17~22個、17~23個、17~24個、17~25個、17~26個、17~27個、17~28個、17~29個、17~30個、18~19個、18~20個、18~21個、18~22個、18~23個、18~24個、18~25個、18~26個、18~27個、18~28個、18~29個、18~30個、19~20個、19~21個、19~22個、19~23個、19~24個、19~25個、19~26個、19~29個、19~28個、19~29個、19~30個、20~21個、20~22個、20~23個、20~24個、20~25個、20~26個、20~27個、20~28個、20~29個、20~30個、21~22個、21~23個、21~24個、21~25個、21~26個、21~27個、21~28個、21~29個、21~30個、22~23個、22~24個、22~25個、22~26個、22~27個、22~28個、22~29個、22~30個、23~24個、23~25個、23~26個、23~27個、23~28個、23~29個、23~30個、24~25個、24~26個、24~27個、24~28個、24~29個、24~30個、25~26個、25~27個、25~28個、25~29個、25~30個、26~27個、26~28個、26~29個、26~30個、27~28個、27~29個、27~30個、28~29個、28~30個、または29~30個の連結ヌクレオシドからなる。
ある特定の実施形態では、本明細書に記載のオリゴマー化合物は、オリゴヌクレオチド(修飾を有するか、または修飾を有さないもの)と、任意選択の1つまたは複数の複合基及び/または末端基と、を含むか、あるいはこれらからなる。複合基は、1つまたは複数の複合部分と、複合部分をオリゴヌクレオチドに連結する複合リンカーと、からなる。複合基は、オリゴヌクレオチドのいずれかの末端もしくは両末端、及び/または任意の内部位置に対して付加され得る。ある特定の実施形態では、複合基は、修飾オリゴヌクレオチドのヌクレオシドの2’位に付加される。ある特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドのいずれかの末端または両末端に付加される複合基は、末端基である。ある特定のそのような実施形態では、複合基または末端基は、オリゴヌクレオチドの3’末端及び/または5’末端に付加される。ある特定のそのような実施形態では、複合基(または末端基)は、オリゴヌクレオチドの3’末端に付加される。ある特定の実施形態では、複合基は、オリゴヌクレオチドの3’末端付近に付加される。ある特定の実施形態では、複合基(または末端基)は、オリゴヌクレオチドの5’末端に付加される。ある特定の実施形態では、複合基は、オリゴヌクレオチドの5’末端付近に付加される。
、修飾ヌクレオシドまたは非修飾ヌクレオシド、及び独立して修飾されるか、または修飾されない2つ以上のヌクレオシドが挙げられる。
ある特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、1つまたは複数の複合基に共有結合で付加される。ある特定の実施形態では、複合基は、付加対象のオリゴヌクレオチドの1つまたは複数の特性を改変し、こうした特性には、限定されないが、薬力学、薬物動態、安定性、結合、吸収、組織内分布、細胞内分布、細胞内への取り込み、電荷、及びクリアランスが含まれる。ある特定の実施形態では、複合基は、付加対象のオリゴヌクレオチドに対して新たな特性を付与し、こうした複合基は、例えば、オリゴヌクレオチドの検出を可能にするフルオロフォアまたはレポーター基である。
複合部分には、限定されないが、インターカレーター、レポーター分子、ポリアミン、ポリアミド、ペプチド、糖質(例えば、GalNAc)、ビタミン部分、ポリエチレングリコール、チオエーテル、ポリエーテル、コレステロール、チオコレステロール、コール酸部分、葉酸、脂質、リン脂質、ビオチン、フェナジン、フェナントリジン、アントラキノン、アダマンタン、アクリジン、フルオレセイン、ローダミン、クマリン、フルオロフォア、及び色素が含まれる。
複合部分は、複合リンカーを介してオリゴヌクレオチドに付加される。ある特定のオリゴマー化合物では、複合リンカーは、単一化学結合である(すなわち、複合部分は、単結合を通じて複合リンカーを介してオリゴヌクレオチドに付加される)。ある特定の実施形態では、複合リンカーは、鎖構造(ヒドロカルビル鎖など)、または反復単位(エチレングリコール単位、ヌクレオシド単位、もしくはアミノ酸単位など)のオリゴマーを含む。
含む。ある特定の実施形態では、リンカー-ヌクレオシドは、修飾されない。ある特定の実施形態では、リンカー-ヌクレオシドは、プリン、置換プリン、ピリミジン、または置換ピリミジンから選択される任意選択で保護されるヘテロ環式塩基を含む。ある特定の実施形態では、切断可能部分は、ウラシル、チミン、シトシン、4-N-ベンゾイルシトシン、5-メチルシトシン、4-N-ベンゾイル-5-メチルシトシン、アデニン、6-N-ベンゾイルアデニン、グアニン、及び2-N-イソブチリルグアニンから選択されるヌクレオシドである。リンカー-ヌクレオシドは、標的組織に到達後にオリゴマー化合物から切断されることが典型的には望ましい。したがって、リンカー-ヌクレオシドは、典型的には、互いに連結され、切断可能な結合を介してオリゴマー化合物の残部に連結される。ある特定の実施形態では、そのような切断可能な結合は、ホスホジエステル結合である。
ある特定の実施形態では、複合基は、細胞標的化複合部分を含む。ある特定の実施形態では、複合基は、一般式:
を有し、
式中、nは、1~約3であり、nが1であるとき、mは0であり、nが2以上であるときmは1であり、jは、1または0であり、kは、1または0である。
Chem,2011,19,2494-2500、Kornilova et al.,Analyt Biochem,2012,425,43-46、Pujol et al.,Angew Chemie Int Ed Engl,2012,51,7445-7448、Biessen et al.,J Med Chem,1995,38,1846-1852、Sliedregt et al.,J Med Chem,1999,42,609-618、Rensen et al.,J Med Chem,2004,47,5798-5808、Rensen et al.,Arterioscler Thromb Vasc Biol,2006,26,169-175、van Rossenberg et al.,Gene Ther,2004,11,457-464、Sato et al.,J Am Chem Soc,2004,126,14013-14022、Lee et al.,J Org Chem,2012,77,7564-7571、Biessen et al.,FASEB J,2000,14,1784-1792、Rajur et al.,Bioconjug Chem,1997,8,935-940、Duff et al.,Methods Enzymol,2000,313,297-321、Maier et al.,Bioconjug Chem,2003,14,18-29、Jayaprakash et al.,Org Lett,2010,12,5410-5413、Manoharan,Antisense Nucleic Acid Drug Dev,2002,12,103-128、Merwin et al.,Bioconjug Chem,1994,5,612-620、Tomiya et al.,Bioorg Med Chem,2013,21,5275-5281、国際出願WO1998/013381、同WO2011/038356、同WO1997/046098、同WO2008/098788、同WO2004/101619、同WO2012/037254、同WO2011/120053、同WO2011/100131、同WO2011/163121、同WO2012/177947、同WO2013/033230、同WO2013/075035、同WO2012/083185、同WO2012/083046、同WO2009/082607、同WO2009/134487、同WO2010/144740、同WO2010/148013、同WO1997/020563、同WO2010/088537、同WO2002/043771、同WO2010/129709、同WO2012
/068187、同WO2009/126933、同WO2004/024757、同WO2010/054406、同WO2012/089352、同WO2012/089602、同WO2013/166121、同WO2013/165816、米国特許4,751,219、同8,552,163、同6,908,903、同7,262,177、同5,994,517、同6,300,319、同8,106,022、同7,491,805、同7,491,805、同7,582,744、同8,137,695、同6,383,812、同6,525,031、同6,660,720、同7,723,509、同8,541,548、同8,344,125、同8,313,772、同8,349,308、同8,450,467、同8,501,930、同8,158,601、同7,262,177、同6,906,182、同6,620,916、同8,435,491、同8,404,862、同7,851,615、公開された米国特許出願公開US2011/0097264、同US2011/0097265、同US2013/0004427、同US2005/0164235、同US2006/0148740、同US2008/0281044、同US2010/0240730、同US2003/0119724、同US2006/0183886、同US2008/0206869、同US2011/0269814、同US2009/0286973、同US2011/0207799、同US2012/0136042、同US2012/0165393、同US2008/0281041、同US2009/0203135、同US2012/0035115、同US2012/0095075、同US2012/0101148、同US2012/0128760、同US2012/0157509、同US2012/0230938、同US2013/0109817、同US2013/0121954、同US2013/0178512、同US2013/0236968、同US2011/0123520、同US2003/0077829、同US2008/0108801、及び同US2009/0203132。
本明細書に記載のオリゴマー化合物は、医薬組成物を調製するための医薬的に許容可能な活性物質または不活性物質と混合され得る。医薬組成物を製剤化するための組成物及び方法は、いくつかの基準に依存するものであり、こうした基準には、限定されないが、投与経路、疾患の程度、または投与用量が含まれる。
希釈剤もしくは担体及び/または医薬組成物が注射に適するようになる追加成分、とオリゴマー化合物を組み合わせることによって医薬組成物において利用できる。ある特定の実施形態では、医薬的に許容可能な希釈剤は、リン酸緩衝生理食塩水である。したがって、1つの実施形態では、標的核酸に相補的なオリゴマー化合物及び医薬的に許容可能な希釈剤を含む医薬組成物が、本明細書に記載の方法において利用される。ある特定の実施形態では、医薬的に許容可能な希釈剤は、リン酸緩衝生理食塩水である。ある特定の実施形態では、オリゴマー化合物は、本明細書で提供される修飾オリゴヌクレオチドを含むか、または本明細書で提供される修飾オリゴヌクレオチドからなる。
ある特定の実施形態では、本明細書に記載のオリゴマー化合物は、修飾オリゴヌクレオチドを含むか、または修飾オリゴヌクレオチドからなる。ある特定のそのような実施形態では、本明細書に記載のオリゴマー化合物は、標的核酸にハイブリダイゼーションする能力を有することで、少なくとも1つのアンチセンス活性を生じさせる。ある特定の実施形態では、本明細書に記載の化合物は、1つまたは複数の標的核酸に選択的に影響を与える。そのような化合物は、1つまたは複数の標的核酸にハイブリダイゼーションすることで、1つまたは複数の所望のアンチセンス活性を生じさせる核酸塩基配列であって、1つもしくは複数の非標的核酸にハイブリダイゼーションしないか、または望ましくないアンチセンス活性を顕著に生じさせる様式では1つもしくは複数の非標的核酸にハイブリダイゼーションしない核酸塩基配列を含む。
コードされるタンパク質の量の変化、核酸もしくはタンパク質のスプライスバリアントの比率の変化、及び/または細胞もしくは動物の表現型変化、が観測または検出される。
化合物が使用可能な治療剤となるためには、治療的に適切な用量において当該化合物が安全でなくてはならない。いくつかの機序の1つまたは複数に起因してオリゴヌクレオチドの毒性が生じ得ることが明らかになっている。例えば、オリゴヌクレオチドによっては、意図されないRNA(または「オフターゲットRNA」)にハイブリダイゼーションにすることで、当該オフターゲットRNA及び当該オフターゲットRNAによってコードされるタンパク質を減少させる。そのような意図されないタンパク質減少は、結果として毒性を招き得る。本明細書に開示のデータは、ある特定のタンパク質にオリゴヌクレオチドが結合した後、オリゴヌクレオチド/タンパク質複合体が細胞内に局在化することで毒性が生じ得ることを実証するものである。他の毒性機序が寄与する可能性もある。当然ながら、オリゴヌクレオチドが治療における使用に適した薬物となるためには、毒性の形態または機序はすべて、許容可能なように低くなくてはならない。
ドは、中央領域の位置3または位置4に存在する。ある特定の場合では、3-10-3cEtギャップマーの中央領域の位置3または位置4に対して、5’-アルキルβ-D-デオキシリボシル糖部分を含むヌクレオシドを組み込むと、さまざまな配列にわたって、インビトロでは細胞毒性及びアポトーシスが減少し、インビボでは肝毒性が減少する一方で、アンチセンス活性に対する影響は、生じるとすれば、穏やかなものである。ある特定の実施形態では、中央領域の位置2~3または位置3~4のヌクレオシド間に安全性増強ヌクレオシド間結合を組み込むと、毒性を低減することができる。ある特定の実施形態では、中央領域の位置2~4のヌクレオシドを連結する安全性増強結合の1つまたは複数は、中性結合である。ある特定の実施形態では、中央領域の位置2~4のヌクレオシドを連結する安全性増強結合の1つまたは複数は、2’-5’ヌクレオシド間結合である。本発明は、ヌクレオシドに対する修飾及びヌクレオシド間結合に対する修飾を含めて、中央領域の位置2、位置3、または位置4に導入される任意の化学修飾に及ぶものである。ある特定の実施形態では、そのような修飾は、カスパーゼ3/7アッセイによって測定すると、インビトロの毒性を低減し(中央領域の位置2、位置3、もしくは位置4に安全性増強ヌクレオシドを含まない修飾オリゴヌクレオチドとの比較、もしくは中央領域の位置2~3もしくは位置3~4の間に安全性増強ヌクレオシド間結合を含まない修飾オリゴヌクレオチドとの比較)、及び/またはALTもしくはASTによって測定すると、インビボの肝毒性を低減し、及び/またはFOBスコアによって測定するか、もしくはグリア炎症のマーカー(Aif1及びGFAP)の蓄積によって測定すると、インビボの神経毒性を低減する。
ある特定の実施形態では、本明細書に記載の化合物は、標的核酸に相補的な領域を含むオリゴヌクレオチドを含むか、または当該オリゴヌクレオチドからなる。ある特定の実施形態では、標的核酸は、内在性RNA分子である。ある特定の実施形態では、標的核酸は、タンパク質をコードする。ある特定のそのような実施形態では、標的核酸は、イントロン領域、エクソン領域、及び非翻訳領域を含めて、mRNA及びpre-mRNAから選択される。ある特定の実施形態では、標的RNAは、mRNAである。ある特定の実施形態では、標的核酸は、pre-mRNAである。ある特定の実施形態では、pre-mRNA及び対応mRNAは共に、単一化合物の標的核酸である。ある特定のそのような実施形態では、標的領域は、その全体が標的pre-mRNAのイントロン内に含まれる。ある特定の実施形態では、標的領域は、イントロン/エクソン接合部にまたがる。ある特定の実施形態では、標的領域の少なくとも50%が、イントロン内に含まれる。
ある特定の実施形態では、本明細書のオリゴマー化合物は、ギャップマーの中央領域に1つまたは複数の改変ヌクレオチドを含むギャップマーを含む。そのようなオリゴマー化合物はそれぞれ、1つまたは複数の改変ヌクレオチドをギャップマーの中央領域に含まないこと以外は第1のオリゴマー化合物と同一である対応親オリゴマー化合物を有する。そのような親オリゴマー化合物の例、及び改変ヌクレオチドを含まないこと以外は同一のその対応オリゴマー化合物の例は、実施例1の表1及び表2、ならびに実施例セクションを通じて見られる。実施例1では、558807は、親オリゴヌクレオチドである。ある特定の実施形態では、親オリゴマー化合物の中央領域は、ホスホジエステルヌクレオシド間
結合及び/またはホスホロチオエートヌクレオシド間結合、非修飾核酸塩基及び/または5-メチルシトシン、ならびに非修飾2’β-D-デオキシリボシル糖部分、のみを含む。
本出願に添付される配列表は、必要に応じてそれぞれの配列を「RNA」または「DNA」のいずれかとして特定するものであるが、実際には、そうした配列は、化学修飾の任
意の組み合わせで修飾され得る。修飾オリゴヌクレオチドを説明するためになされる「RNA」または「DNA」としてのそのような指定は、ある特定の場合では、任意であることを当業者なら容易に理解するであろう。例えば、2’-OH糖部分及びチミン核酸塩基を含むヌクレオシドを含むオリゴヌクレオチドは、RNA糖を有するDNA、またはDNA核酸塩基を有するRNAとして説明され得る。
CXCL12に相補的な修飾オリゴヌクレオチドのインビトロの活性及びインビボの肝毒性に対する位置特異的な2’-修飾の効果
修飾オリゴヌクレオチドを合成し、それぞれkkk-x-d(9)-kkk、kkk-d-x-d(8)-kkk、kkk-dd-x-d(7)-kkk、またはkkk-d(3)-x-d(6)-kkkという糖モチーフを持たせた。これらの式中、「x」は、以下の表に示される修飾を有する糖部分を示し、「k」は、cEtを示し、「d」は、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を示す。これらの修飾オリゴヌクレオチドを、中央領域に改変ヌクレオチドを含まないこと以外は同一の修飾オリゴヌクレオチド(5’領域及び3’領域のそれぞれに3つのcEtヌクレオシドを有し、中央領域に10個のDNAヌクレオシドを有する3-10-3cEtギャップマー)と比較した。ヌクレオシド間結合はそれぞれ、ホスホロチオエートである。以下の表中の化合物は、マウスのCXCL12(GENBANK NT_039353.7の69430515~69445350の区間の配列)(配列番号1)に対して位置6877~6892において100%相補的である。
レオチドを用いて約20,000個のマウス3T3-L1細胞の電気穿孔を実施した。mRNAを収集し、RT-qPCRによって分析した。CXCL12のmRNAは、プライマープローブセットRTS2605(フォワード配列CCAGAGCCAACGTCAAGCAT(配列番号9)、リバース配列:CAGCCGTGCAACAATCTGAA(配列番号10)、プローブ配列:TGAAAATCCTCAACACTCCAAACTGTGCC(配列番号11))を用いて検出し、RAPTORのmRNAは、プライマープローブセットRTS3420(フォワード配列GCCCTCAGAAAGCTCTGGAA(配列番号12)、リバース配列:TAGGGTCGAGGCTCTGCTTGT(配列番号13)、プローブ配列:CCATCGGTGCAAACCTACAGAAGCAGTATG(配列番号14))を用いて検出した。RAPTORは、毒性の指標となり得るセンチネル遺伝子であり、このことは、US20160160280に記載されており、当該文献は、参照によって本明細書に組み込まれる。
いて正規化してあり、PBSで処理した対照マウスに対して示される。
CXCL12に相補的な修飾オリゴヌクレオチドのインビトロの活性及びインビボの肝毒性に対する位置特異的な5’-修飾の効果。
5’-メチル修飾、5’-アリル修飾、及び5’-エチル修飾をさまざまな位置に含む修飾オリゴヌクレオチドを合成した。5’-メチル類似体及び5’-アリル類似体の合成手順は、WO2013022967に詳述されている。5’-エチル類似体の合成手順は、実施例39において本明細書で以下に詳述される。これらの修飾オリゴヌクレオチドを、中央領域に修飾ヌクレオシドを含まないこと以外は同一の修飾オリゴヌクレオチド(5’領域及び3’領域のそれぞれに3つのcEtヌクレオシドを含み、中央領域に10個の非修飾DNA核酸塩基を含む3-10-3cEt修飾オリゴヌクレオチド)と比較した。以下の表中の化合物は、マウスのCXCL12(GENBANK NT_039353.7の69430515~69445350の区間の配列)(配列番号1)に対して位置6
877~6892において100%相補的である。
インビトロの活性試験ならびにインビボの活性試験及び毒性試験は、実施例1に記載のものと本質的に同様に実施した。インビボの毒性試験については、修飾オリゴヌクレオチド当たり1匹のBALB/Cマウスに対して修飾オリゴヌクレオチドを皮下注射によって150mg/kgで投与し、72時間後に当該BALB/Cマウスを屠殺した。以下の表中のインビボの活性試験については、群当たり2匹のBALB/Cマウスに対して修飾オリゴヌクレオチドを1.8mg/kg、5.5mg/kg、16.7mg/kg、50m
g/kgの用量で皮下投与し、72時間後に当該BALB/Cマウスを屠殺した。558807については、用量を高めると急性毒性が生じたため、1.8mg/kg、5.5mg/kg、及び16.7mg/kgの用量のみで用量反応の試験を実施した。組織を収集し、肝臓のmRNAを単離し、上記のプライマープローブセットRTS2605を用いてRT-qPCRによってCXCL12のレベルを測定した。
**この実験では試験していない。558807での処理が150mg/kgで行われるマウスは、典型的には、処理後72時間以内に死亡する。
第XI因子に相補的な修飾オリゴヌクレオチドのインビトロの活性及びインビボの肝毒性に対する位置特異的な2’-修飾の効果
改変ヌクレオチドを中央領域の位置1~3に含む修飾オリゴヌクレオチドを、以下の表に示されるように合成した。これらの修飾オリゴヌクレオチドを、中央領域に改変ヌクレオチドを含まないこと以外は同一の修飾オリゴヌクレオチド(5’領域及び3’領域のそれぞれに3つのcEtヌクレオシドを含み、中央領域に10個の非修飾DNAヌクレオシドを含む3-10-3cEtギャップマー)と比較した。ヌクレオシド間結合はそれぞれ、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である。以下の表中の化合物は、マウスの第XI因子(GENBANK NT_039460.6の6086000~6111000の区間の配列)の相補配列(配列番号2)に対して位置11699~11714において100%相補的である。
インビトロの毒性試験については、27nM、80nM、250nM、740nM、2,222nM、6,667nM、または20,000nMの修飾オリゴヌクレオチドを用いて3T3-L1細胞の電気穿孔を実施し、実施例1に記載のようにRT-qPCRによってRaptorのレベルを測定した。
第XI因子に相補的な修飾オリゴヌクレオチドのインビボの活性及び肝毒性に対する位置特異的な2’-修飾及び5’-修飾の効果
以下の表に示されるように2’修飾または5’修飾を有する修飾オリゴヌクレオチドを合成した。これらの修飾オリゴヌクレオチドを、中央領域に修飾ヌクレオシドを含まないこと以外は同一の修飾オリゴヌクレオチド(5’領域及び3’領域のそれぞれに3つのcEtヌクレオシドを含み、中央領域に10個の非修飾DNA核酸塩基を含む3-10-3cEt修飾オリゴヌクレオチド)と比較した。以下の表中の化合物は、マウスの第XI因子(GENBANK NT_039460.6の6086000~6111000の区間の配列の相補配列)(配列番号2)に対して位置11699~11714において100%相補的である。
以下のインビボの活性試験及び毒性試験については、群当たり2匹のBALB/Cマウスに対して、修飾オリゴヌクレオチドを皮下注射によって33mg/kgまたは100mg/kgで投与し、72時間後に当該BALB/Cマウスを屠殺した。FXIの発現レベルは、プライマープローブセットRTS2898(フォワード配列:ACATGACAGGCGCGATCTCT(配列番号78)、リバース配列:TCTAGGTTCACGTACACATCTTTGC(配列番号79)、プローブ配列:TTCCTTCAAGCAATGCCCTCAGCAAT(配列番号80))を使用してRT-qPCRによって測定した。ALTの血漿中レベルは、自動臨床化学分析装置を使用して測定した。ALTの
上昇は、急性肝毒性の指標である。
PTENに相補的な修飾オリゴヌクレオチドのインビトロの活性及びインビボの肝毒性に対する位置特異的な2’-修飾の効果
以下の表に示されるように2’修飾を有する修飾オリゴヌクレオチドを合成した。これらの修飾オリゴヌクレオチドを、中央領域に修飾ヌクレオシドを含まないこと以外は同一の修飾オリゴヌクレオチド(5’領域及び3’領域のそれぞれに3つのcEtヌクレオシドを含み、中央領域に10個の非修飾DNA核酸塩基を含む3-10-3cEt修飾オリゴヌクレオチド)と比較した。以下の表中の化合物は、マウスのPTEN(GENBANK NC_000085.6の32755001~32829000の区間の配列)(配列番号3)に対して位置2635~2650において100%相補的である。
SOD1に相補的な修飾オリゴヌクレオチドのインビトロの活性及びインビボの肝毒性に対する位置特異的な2’-修飾の効果
以下の表に示されるように2’修飾を有する修飾オリゴヌクレオチドを合成した。これらの修飾オリゴヌクレオチドを、中央領域に修飾ヌクレオシドを含まないこと以外は同一の修飾オリゴヌクレオチド(5’領域及び3’領域のそれぞれに3つのcEtヌクレオシドを含み、中央領域に10個の非修飾DNA核酸塩基を含む3-10-3cEt修飾オリゴヌクレオチド)と比較した。以下の表中の化合物は、マウスのSOD1(GENBANK NT_039625.7の24924000~24933000の区間の配列)(配列番号4)に対して位置5685~5880において100%相補的である。
て測定した。ALTの上昇は、急性肝毒性の指標である。
SRB1に相補的な修飾オリゴヌクレオチドのインビトロの活性及びインビボの肝毒性に対する位置特異的な2’-修飾の効果
以下の表に示されるように2’修飾を有する修飾オリゴヌクレオチドを合成した。これらの修飾オリゴヌクレオチドを、中央領域に修飾ヌクレオシドを含まないこと以外は同一の修飾オリゴヌクレオチド(5’領域及び3’領域のそれぞれに3つのcEtヌクレオシドを含み、中央領域に10個の非修飾DNAヌクレオシドを含む3-10-3cEt修飾オリゴヌクレオチド)と比較した。ヌクレオシド間結合はそれぞれ、ホスホロチオエートである。以下の表中の化合物は、マウスSRB1(GENBANK NT_039313.7の566000~632000の区間の配列)の相補配列(配列番号5)に対して位置64840~64855において100%相補的である。
CXCL12に相補的な修飾オリゴヌクレオチドの及び第XI因子に相補的な修飾オリゴヌクレオチドのインビトロの活性及びインビボの肝毒性に対するイノシン置換の効果
CXCL12に相補的な修飾オリゴヌクレオチドのインビトロの活性及びインビボの肝
毒性に対する位置特異的な核酸塩基置換の効果
さまざまな位置に核酸塩基修飾を含む修飾オリゴヌクレオチドを合成した。これらの修飾オリゴヌクレオチドを、中央領域に修飾ヌクレオシドを含まないこと以外は同一の修飾オリゴヌクレオチド(5’領域及び3’領域のそれぞれに3つのcEtヌクレオシドを含み、中央領域に10個の非修飾DNA核酸塩基を含む3-10-3cEt修飾オリゴヌクレオチド)と比較した。以下の表中の化合物は、マウスのCXCL12(GENBANK
NT_039353.7の69430515~69445350の区間の配列)(配列番号1)に対して位置6877~6892において100%相補的である。
核酸塩基修飾:
CXCL12に相補的な修飾オリゴヌクレオチドのインビトロの活性及びインビボの肝毒性に対する位置特異的なモルホリノの効果
さまざまな位置にモルホリノを含む修飾オリゴヌクレオチドを合成した。これらの修飾オリゴヌクレオチドを、中央領域に修飾ヌクレオシドを含まないこと以外は同一の修飾オリゴヌクレオチド(5’領域及び3’領域のそれぞれに3つのcEtヌクレオシドを含み、中央領域に10個の非修飾DNA核酸塩基を含む3-10-3cEt修飾オリゴヌクレオチド)と比較した。以下の表中の化合物は、マウスのCXCL12(GENBANK NT_039353.7の69430515~69445350の区間の配列)(配列番号1)に対して位置6877~6892において100%相補的である。モルホリノ残基は、ヌクレオシド間結合を含めて全ヌクレオチドを置き換えるものであり、以下に示される構造を有する。
CXCL12に相補的な修飾オリゴヌクレオチド、第XI因子に相補的な修飾オリゴヌクレオチド、PTENに相補的な修飾オリゴヌクレオチド、及びSOD-1に相補的な修飾オリゴヌクレオチドのインビトロの活性及びインビボの毒性に対する位置特異的なMOPの効果
ホスホロチオエート結合の代わりにMOP中性骨格結合を特定の位置に有する修飾オリ
ゴヌクレオチドを合成した。これらの修飾オリゴヌクレオチドを、中央領域に改変ヌクレオチドを含まないこと以外は同一の修飾オリゴヌクレオチド(5’領域及び3’領域のそれぞれに3つのcEtヌクレオシドを含み、中央領域に10個の非修飾DNAヌクレオシドを含み、全体を通じてホスホロチオエート結合を含む3-10-3cEt修飾オリゴヌクレオチド)と比較した。以下の表中の化合物は、上記の配列を有するマウスのCXCL12、第XI因子、PTEN、またはSOD-1に100%相補的である。
」という下付き文字は、cEtを示す。「s」という下付き文字は、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を示す。「m」という上付き文字が前に付くCは、5-メチルシトシンを示す。「x」という下付き文字は、MOPヌクレオシド間結合またはメトキシプロピルヌクレオシド間結合を示す。ヌクレオシド間結合の位置は、当該結合の5’末端上のヌクレオシドの位置として指定される。
**値は、2回の独立した実験の平均値を示す。
クレオチドを用いてb.END細胞の電気穿孔を実施し、プライマープローブセットMm04207341_m1(ThermoFisher)を使用してRT-qPCRによってP21のレベルを測定した。
2’-修飾と組み合わせたときの位置特異的なMOPの効果
2’-FANA修飾糖部分または2’-OMe修飾糖部分と組み合わせて、ホスホロチオエート結合の代わりにMOP中性骨格結合を特定の位置に有する修飾オリゴヌクレオチドを合成した。これらの修飾オリゴヌクレオチドを、中央領域に修飾ヌクレオシドを含まないこと以外は同一の修飾オリゴヌクレオチド(5’領域及び3’領域のそれぞれに3つのcEtヌクレオシドを含み、中央領域に10個の非修飾DNAヌクレオシドを含み、全体を通じてホスホロチオエート結合を含む3-10-3cEt修飾オリゴヌクレオチド)と比較した。以下の表中の化合物は、上記の配列を有するマウスのCXCL12またはSOD1に100%相補的である。
3’-HPPO-GalNAcは、以下の構造を指し、式中、リン酸基は、3’ヌクレオシドの3’-酸素原子に付加される:
/Cマウスを屠殺した。1匹の動物には、対照として生理食塩水を注射投与した。ALTの血漿中レベルは、自動臨床化学分析装置を使用して測定した。ALTの上昇は、急性肝毒性の指標である。カスパーゼアッセイは、実施例8に記載のようにインビトロで実施した。
さまざまな配列を有する修飾オリゴヌクレオチドのインビトロの活性及び毒性に対する位置特異的な2’-OMeの効果
以下の表に示されるように修飾オリゴヌクレオチドを合成した。これらの化合物は、kkk-d(10)-kkkまたはkkk-d-m-d(8)-kkkという糖モチーフを有し、式中、「k」は、cEtを示し、「d」は、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を示し、「m」は、2’-OMe-β-D-リボフラノシル糖部分を示す。親オリゴヌクレオチドkkk-d(10)-kkkの位置5(5’末端から数えた位置)にTを有する配列については、kkk-d-m-d(8)-kkkは、当該位置に2’-OMe修飾Uを含む。親オリゴヌクレオチドkkk-d(10)-kkkの位置5(5’末端から数えた位置)にmCを有する配列については、kkk-d-m-d(8)-kkkは、5-Me基を有さない2’-OMe修飾Cを当該位置に含む。
さまざまな配列を有する修飾オリゴヌクレオチドのインビトロ及びインビボの活性及び毒性に対する位置特異的な2’-OMeの用量反応
インビボのオンターゲット活性及び毒性を、上の実施例13に記載の化合物の一部について測定した。群当たり2匹の雄性BALB/cマウスに対して、以下の表に示されるように、修飾オリゴヌクレオチドを皮下注射によって1.85mg/kg、5.55mg/kg、16.67mg/kg、50mg/kg、または150mg/kgで1回投与した。1週間後にマウスを屠殺し、肝臓からmRNAを単離し、上の表30に記載のプライマープローブセットを使用してRT-qPCRによって測定した。Gadd45a、P21、及びTnfrsf10bのmRNAレベルは、実施例1に記載のように分析した。結果は、Ribogreenを用いて正規化してあり、PBSで処理した動物に正規化したものが報告される。ALTの血漿中レベルは、自動臨床化学分析装置を使用して測定した。ALTの上昇は、急性肝毒性の指標である。治療指数は、インビボED50によって最大非毒性用量を割った比として計算した。最大非毒性用量は、PBSで処理したマウスと比較したときのALT値の上昇が5x(典型的には150IU/L)未満にとどまる最高用量である。
核小体へのp54nrbの局在化に対する修飾オリゴヌクレオチドの効果
HeLa細胞に対する上記の選択された修飾ヌクレオチドの効果を顕微鏡法によって試験した。lipofectamine2000によって200nMの修飾オリゴヌクレオチドをHeLa細胞に2時間トランスフェクトした後、mP54抗体(Santa Cruz Biotech,sc-376865)によって細胞タンパク質p54nrbを染色し、細胞の核の染色にはDAPIを使用した。核小体にp54nrbが存在する細胞の数、及び細胞の総数を画像中で数えた。ALTのデータは、上の実施例13に上記のように示した。
さまざまな配列を有する修飾オリゴヌクレオチドのインビトロの活性及び毒性に対する位置特異的な2’-OMeの効果
lll-d(10)-lll及びlll-d-m-d(8)-lllという糖モチーフを有する修飾オリゴヌクレオチドを合成した。これらの式中、「l」は、β-D-架橋型核酸(β-D-LNA)を示し、「d」は、2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を示し、「m」は、2’-OMe-β-D-リボフラノシル糖部分を示す。ヌクレオシド間結合はそれぞれ、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である。親オリゴヌクレオチドlll-d(10)-lllの位置5(5’末端から数えた位置)にTを有する配列については、lll-d-m-d(8)-lllは、当該位置に2’-OMe修飾Uを含む。親オリゴヌクレオチドlll-d(10)-lllの位置5(5’末端から数えた位置)にmCを有する配列については、lll-d-m-d(8)-lllは、5-Me基を含まない2’-OMe修飾Cを当該位置に含む。
CPT1Aに相補的な修飾オリゴヌクレオチドのインビトロの活性及びインビボの肝毒性に対する位置特異的な2’-修飾の効果
以下の表に示されるように修飾オリゴヌクレオチドを合成した。これらの修飾オリゴヌクレオチドを、中央領域に改変ヌクレオチドを含まないこと以外は同一の修飾オリゴヌクレオチド(5’領域及び3’領域のそれぞれに2’-MOE-β-D-リボフラノシル糖部分をそれぞれが含む5つのヌクレオシドを含み、中央領域に10個の非修飾DNAヌクレオシドを含む5-10-5MOE修飾オリゴヌクレオチド)と比較した。ヌクレオシド間結合はそれぞれ、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である。以下の表中の化合物は、マウスのCPT1A(GENBANK NC_000085.6の3319001~3389000の区間の配列)(配列番号6)に対して位置49870~49889において100%相補的である。ある特定の場合では、位置5にTを含む修飾オリゴヌクレオチドは、位置5に2’-OMeUを含む修飾オリゴヌクレオチドと比較される。
ブセットRTS40014(フォワード配列:AGATCAATCGGACCCTAGACA(配列番号75)、リバース配列:CAGCACCTTCAGCGAGTA(配列番号76)、プローブ配列:AAGAGGACGCCACTCACGATGTTC(配列番号77))を使用して検出し、P21及びTnfrsf10bのmRNAは、実施例1に記載のように検出した。
第XI因子に相補的な修飾オリゴヌクレオチドにおける2’-OMe修飾の効果
以下の表に示されるように修飾オリゴヌクレオチドを合成した。これらの化合物は、kkk-d(10)-kkk(「親」)またはkkk-d-m-d(8)-kkkという糖モチーフを有し、式中、「k」は、cEtを示し、「d」は、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を示し、「m」は、2’-OMe-リボフラノシル糖部分を示す。親オリゴヌクレオチドkkk-d(10)-kkkの位置5(5’末端から数えた位置)にTを有する配列については、kkk-d-m-d(8)-kkkは、当該位置に2’-OMe修飾Uを含む。オリゴヌクレオチドkkk-d(10)-kkkの位置5(5’末端から数えた位置)にmCを有する配列については、kkk-d-m-d(8)-kkkは、5-Me基を含まない2’-OMe修飾Cを当該位置に含む。ヌクレオシド間結合はそれぞれ、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である。
HDAC2に相補的な修飾オリゴヌクレオチドの毒性に対する2’-OMeの組み込みの効果
以下の表に示されるように修飾オリゴヌクレオチドを合成した。これらの化合物は、kkk-d(10)-kkk(「親」)またはkkk-d-m-d(8)-kkkという糖モチーフを有し、式中、「k」は、cEtを示し、「d」は、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を示し、「m」は、2’-OMe-β-D-リボフラノシル糖部分を示す。親オリゴヌクレオチドkkk-d(10)-kkkの位置5(5’末端から数えた位置)にTを有する配列については、kkk-d-m-d(8)-kkkは、当該位置に2’-OMe修飾Uを含む。オリゴヌクレオチドkkk-d(10)-kkkの位置5(5’末端から数えた位置)にmCを有する配列については、kkk-d-m-d(8)-kkkは、5-Me基を含まない2’-OMe修飾Cを当該位置に含む。ヌクレオシド間結合はそれぞれ、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である。
表48b HDAC2に相補的な修飾オリゴヌクレオチドのインビボの活性及び毒性
さまざまな位置への2’-OMeの組み込み
修飾オリゴヌクレオチドを合成し、それぞれkkk-m-d(9)-kkk、kkk-d-m-d(8)-kkk、kkk-dd-m-d(7)-kkk、またはkkk-d(3)-m-d(6)-kkkという糖モチーフを持たせた。これらの式中、「m」は、2’-OMe-β-D-リボフラノシル糖部分を示し、「k」は、cEtを示し、「d」は、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を示す。ある特定の場合では、2’-デオキシTは、2’-OMeUによって置き換えられる。これらの修飾オリゴヌクレオチドを、中央領域に改変ヌクレオチドを含まないこと以外は同一の修飾オリゴヌクレオチド(5’領域及び3’領域のそれぞれに3つのcEtヌクレオシドを含み、中央領域に10個の非修飾DNAヌクレオシドを含む3-10-3cEt修飾オリゴヌクレオチド)と比較した。ヌクレオシド間結合はそれぞれ、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である。以下の表中の化合物は、マウスのCXCL12(GENBANK NT_039353.7の69430515~69445350の区間の配列)(配列番号1)に対して位置6877~6892において100%相補的である。
M、80nM、250nM、740nM、2,222nM、6,667nM、または20,000nMの修飾オリゴヌクレオチドを電気穿孔によって3T3-L1細胞にトランスフェクトし、上の実施例1に記載のようにRT-qPCRによってp21のレベルを測定した。カスパーゼアッセイは、3T3-L1細胞において上の実施例8に記載のように実施した。HeLa細胞におけるp54nrbの局在化は、実施例15に記載のように定量化した。
ヌクレオシドの立体化学的異性体
2’-デオキシフラノシル糖の1’位、3’位、及び5’位における立体化学的配置がさまざまな修飾ヌクレオチドを含む修飾オリゴヌクレオチドを合成した。β-L-DNA含有ヌクレオチドを合成するためのアミダイトは市販されており(ChemGenes)、α-L dTホスホロアミダイトの合成とβ-L dTホスホロアミダイトの合成との両方が報告されている(Morvan,Biochem and Biophys Research Comm,172(2):537-543,1990)。改変ヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドの中央領域内に含めた。
Bは、任意の核酸塩基であり、L1及びL2は、ヌクレオシド間結合である。
ヌクレオシドの立体化学的異性体
さまざまな位置にβ-L-DNAヌクレオチド(上の実施例21に記載のもの)を含む修飾オリゴヌクレオチドを合成した。これらの修飾オリゴヌクレオチドを、上の実施例1の表1に記載の化合物558807と比較した。化合物558807は、すべてのシトシンヌクレオシドが5-メチルシトシンを含んでおり、以下の表に記載の化合物1215458~1215460も同様である。表54における化合物はそれぞれ、3つの連結cEtヌクレオシドからそれぞれがなる5’ウィング及び3’ウィングと、改変ヌクレオチドの他に、2’-β-D-デオキシリボシル糖部分をそれぞれが含むヌクレオシドを示されるように含む中央領域と、を含む。ヌクレオシド間結合はそれぞれ、ホスホジエステルヌクレオシド間結合である。以下の表中の化合物1244441~1244447は、当該化合物の中央領域に非メチル化シトシンを含む。以下の表中の化合物は、マウスのCXCL12(GENBANK NT_039353.7の69430515~69445350の区間の配列)(配列番号1)に対して位置6877~6892において100%相補的である。
ヌクレオシドの立体化学的異性体
さまざまな位置にα-D-DNAヌクレオチド(以下を参照のこと)を含む修飾オリゴヌクレオチドを合成した。これらの修飾オリゴヌクレオチドを、中央領域に改変ヌクレオチドを含まないこと以外は同一の修飾オリゴヌクレオチドと比較した。表54における化合物はそれぞれ、3つの連結cEtヌクレオシドからそれぞれがなる5’ウィング及び3’ウィングと、改変ヌクレオチドの他に、2’-β-D-デオキシリボシル糖部分をそれぞれが含むヌクレオシドを示されるように含む中央領域と、を含む。ヌクレオシド間結合はそれぞれ、ホスホジエステルヌクレオシド間結合である。以下の表中の化合物は、マウスのCXCL12(GENBANK NT_039353.7の69430515~69445350の区間の配列)(配列番号1)に対して位置6877~6892において100%相補的である。
4’-メチル及びキシロDNA
4’-メチル修飾糖部分または2’-デオキシ-β-D-キシロフラノシル(2’デオキシ-β-D-XNA)糖部分を有する改変ヌクレオチドをさまざまな位置に含む修飾オリゴヌクレオチドを合成した(以下の表58を参照のこと)。2’デオキシ-β-D-XNAヌクレオシドを含むオリゴヌクレオチドの合成は、以前に報告されている(Wang,et.al.,Biochemistry,56(29):3725-3732,2017)。4’-メチル修飾ヌクレオシドを含むオリゴヌクレオチドの合成は、以前に報告されている(例えば、Detmer et.al.,European J.Org.Chem,1837-1846,2003)。表58における化合物はそれぞれ、3つの連結cEtヌクレオシドからそれぞれがなる5’ウィング及び3’ウィングと、改変ヌクレオチドの他に、2’-β-D-デオキシリボシル糖部分をそれぞれが含むヌクレオシドを示されるように含む中央領域と、を含む。ヌクレオシド間結合はそれぞれ、ホスホジエステルヌクレオシド間結合である。これらの化合物を、中央領域の位置2に2’-OMe修飾糖部分を含む化合物(上の実施例1に記載の936053)と比較した。以下の表中の化合物は、マウスのCXCL12(GENBANK NT_039353.7の69430515~69445350の区間の配列)(配列番号1)に対して位置6877~6892において100%相補的である。
顕微鏡法
HeLa細胞に対する上の実施例に記載の選択された修飾ヌクレオチドの効果を顕微鏡法によって試験した。lipofectamine2000によって200nMの修飾オリゴヌクレオチドをHeLa細胞に2時間トランスフェクトした後、mP54抗体(Santa Cruz Biotech,sc-376865)によって細胞タンパク質p54nrbを染色し、細胞の核の染色にはDAPIを使用した。
**820685は、464917と同じ配列を有し、kkk-m(10)-kkkという糖モチーフを有する。
蛍光標識化修飾オリゴヌクレオチドでの核小体へのp54nrbの誤った局在化
上の表に記載の修飾オリゴヌクレオチドを、ホスホロチオエートリンカーを介して3’末端または5’末端でCy3またはFAMに結合させることで、フルオロフォアを含む複合基を含む化合物を生成させ、蛍光標識化修飾オリゴヌクレオチドを得た。200nMの蛍光標識化修飾オリゴヌクレオチドをHeLa細胞と共に2時間インキュベートし、蛍光顕微鏡法によって細胞を画像化した。mP54抗体(Santa Cruz Biotech,sc-376865)によって細胞タンパク質p54nrbを染色し、細胞の核の染色にはDAPIを使用した。以下の表に報告される実験については、画像を定性的に解析し、(-)のスコア(核小体へのp54nrbの誤った局在化が観測されなかったことを示す)、または(+)のスコア(いくつかの細胞では核小体へのp54nrbの誤った局在化が観測されたことを示す)、または(++)(ほとんどもしくはすべての細胞において核小体へのp54nrbの誤った局在化が観測されたことを示す)を割り当てた。
LNA含有修飾オリゴヌクレオチドのインビボ及びインビトロの毒性
以下の表中の修飾オリゴヌクレオチドは、5’末端及び3’末端にLNAヌクレオシドを有し、中央領域にDNAヌクレオシドを有する3-10-3糖モチーフを有する。
SOD1に相補的な修飾オリゴヌクレオチドの全体的なタンパク質結合性
HeLaの核可溶化液における全体的なタンパク質結合性について、上の実施例に記載の修飾オリゴヌクレオチドを評価した。ビオチン結合型修飾オリゴヌクレオチド791136(5’-ビオチン-TEG、kkk-d(10)-kkkという糖モチーフ、及び464917と同じ配列(GTCTGTGCATCTCTCC(配列番号22))を有する)を用いて細胞タンパク質を捕捉し、上の実施例6に記載の508031、895154、895155、及び895156の濃度を増加させて溶出させた。溶出したタンパク質をSDS-PAGEのゲル上で泳動させた。図1を参照のこと。化合物508031及び化合物895154について、化合物895155及び化合物895156と比較して全体的なタンパク質結合性の増加が観測された。
FXIに相補的な修飾オリゴヌクレオチドの全体的なタンパク質結合性
HeLaの核可溶化液における全体的なタンパク質結合性について、上の実施例に記載の修飾オリゴヌクレオチドを評価した。ビオチン結合型修飾オリゴヌクレオチド791136(5’-ビオチン-TEG、kkk-d(10)-kkkという糖モチーフ、及び464917と同じ配列(GTCTGTGCATCTCTCC(配列番号22))を有する)を用いて細胞タンパク質を捕捉し、上の実施例4及び実施例25に記載の464917、465977、483706、及び820685の濃度を増加させて溶出させた。溶出したタンパク質をSDS-PAGEのゲル上で泳動させた。図2Aを参照のこと。化合物464917及び化合物465977について、化合物483706及び化合物820685と比較して全体的なタンパク質結合性の増加が観測された。一連のウエスタンブロットを実施することで、SSBP1、NCL1、PCNA、p54nrb、RNaseH1、及びPSFを検出した。結果は、図2Bに示される。
MOP結合と関連する全体的なタンパク質結合性、活性、及び毒性
細胞における全体的なタンパク質結合性について修飾オリゴヌクレオチドを評価した。ビオチン結合型修飾オリゴヌクレオチド592590(5’-ビオチン-TEG、kkk-d(10)-kkkという糖モチーフ、及びGCTAGCCTCTGGATTTという配列(配列番号115)を有する)を用いて細胞タンパク質を捕捉し、以下の表に記載の修飾オリゴヌクレオチドで溶出させた。溶出したタンパク質をSDS-PAGEのゲル上で泳動させ、可視化した。毒性が減少した化合物について、558807と比較してタンパク質結合性の減少が観測され、このことは、特に、化合物766654、化合物766655、及び化合物766666について観測された。図4を参照のこと。
上の実施例に記載の修飾オリゴヌクレオチドの自己構造についてTmを決定した。以下の表中の化合物は、CXCL12に相補的であり、配列番号18~21に対応する配列を有する。GAUAAUGUGAGAACAUGCCUという配列(配列番号116)を有する20マーのRNAと上の実施例に記載の修飾オリゴヌクレオチドとが複合体を形成した二本鎖についてもTmを決定した。
修飾オリゴヌクレオチドの5’領域及び3’領域における2’-修飾
さまざまな糖修飾モチーフを含む修飾オリゴヌクレオチドを以下の表に示されるように合成した。以下の表中の化合物は、マウスのCXCL12(GENBANK NT_039353.7の69430515~69445350の区間の配列)(配列番号1)に対して位置6877~6892(16マー)または位置6875~6894(20マー)において100%相補的である。
修飾オリゴヌクレオチドでのb.END細胞の処理の効果
以下の表に報告されるインビトロ試験については、3.125nM、6.25nM、12.5nM、25nM、または50nMの修飾オリゴヌクレオチド464917(肝毒性)または修飾オリゴヌクレオチド549148(非毒性)を用いてb.END.3細胞の電気穿孔を実施した。549148は、GGCTACTACGCCGTCAという配列(配列番号118)を有する3-10-3cEt修飾オリゴヌクレオチドであり、この配列は、既知のマウス遺伝子のいずれにも相補的ではない。p21及びGadd45aのmRNAの発現レベルは、0時間後、1時間後、2時間後、4時間後、及び6時間後に、実施例1に記載のようにRT-qPCRによって測定した。
さまざまな細胞株における核小体へのp54nrbの非局在化
細胞を20,000個細胞/ウェルで播種し、Lipofectamine2,000を用いて60nMの修飾オリゴヌクレオチド791143(3’末端にCy3標識を有する化合物464917)を当該細胞にトランスフェクトした。トランスフェクトから6時間後に細胞を可視化した。
修飾オリゴヌクレオチドの毒性に対するRNaseH1の枯渇の効果
HeLa細胞を150,000個細胞/ウェルで播種し、ルシフェラーゼを標的とする対照siRNA、またはRNaseH1を標的とするsiRNA(ThermoFish
erから供給されるs48357もしくはs48358)を、Lipofectamine RNAiMAXを使用して最終濃度3nMで当該HeLa細胞に48時間トランスフェクトした。修飾オリゴヌクレオチド464917及び修飾オリゴヌクレオチド549148を自然取り込みによって細胞に導入した。549148は、GGCTACTACGCCGTCAという配列(配列番号118)を有する3-10-3cEt修飾オリゴヌクレオチドであり、この配列は、既知のマウス遺伝子のいずれにも相補的ではない。共焦点顕微鏡法を使用することで、上の実施例15に記載のようにp54nrbの局在化を可視化した。
修飾オリゴヌクレオチドのタンパク質結合性
細胞におけるタンパク質結合性について、上の実施例に記載の修飾オリゴヌクレオチドを評価した。ビオチン結合型修飾オリゴヌクレオチド791136を用いて細胞タンパク質を捕捉した。791136は、5’-ビオチン-TEG、kkk-d(10)-kkkという糖モチーフ、完全なホスホロチオエート骨格、及び464917と同じ配列(GTCTGTGCATCTCTCC(配列番号22))を有する。タンパク質は、464917または549148の濃度を増加させて溶出させた。溶出したタンパク質をSDS-PAGEのゲル上で泳動させ、p54nrb、FUS、RNaseH1、SSBP1、Ku70、PSPC1、SND1、FUBP、NCL1、及びKu80についてウエスタンブ
ロットによって分析した。以下の表には、バンド強度が示される:-(バンドなし)、+(バンド強度が低い)、++(バンド強度が中程度である)、+++(バンド強度が高い)。図5Aを参照のこと。
修飾ヌクレオシド間結合を含む修飾オリゴヌクレオチドのインビトロの活性及び毒性
本明細書の実施例1に記載の対照オリゴヌクレオチド558807に基づいて修飾オリゴヌクレオチドを設計し、標準的な手順を使用して当該修飾オリゴヌクレオチドを合成した。修飾ヌクレオシド間結合(1つまたは2つ)を、以下に示されるようにオリゴヌクレオチドの中央領域内のさまざまな位置に配置した。得られた修飾オリゴヌクレオチドがCXCL12(ケモカインリガンド12)及びRaptorの発現レベルを抑制する能力を試験した。修飾オリゴヌクレオチドの効力を評価し、対照オリゴヌクレオチドと比較した。
度で達成されるCXCL12またはRaptorのmRNA発現抑制パーセントに対してオリゴヌクレオチドの濃度をプロットすることによって計算した。IC50は、対照と比較したときにCXCL12のmRNA発現の50%抑制が達成されるオリゴヌクレオチド濃度を示す。結果は、以下の表に示される。
558807に基づいて修飾オリゴヌクレオチドを設計した。修飾オリゴヌクレオチドはそれぞれ、以下に示されるように、(5’ウィングにおける3つのcEt修飾ヌクレオシドを含めずに)5’-ギャップ接合部から数えて3番目のヌクレオシドと4番目のヌクレオシドとの間に配置された修飾ヌクレオシド間結合を有する。修飾オリゴヌクレオチドはそれぞれ、以下に示されるように、3’末端でHPPO-GalNAc複合基と結合している。インビボのCXCL12(ケモカインリガンド12)のmRNA発現レベルの低減についてオリゴヌクレオチドを評価した。それぞれの用量に対するトランスアミナーゼレベル(ALT及びAST)も測定した。
2mg/kg、1.85mg/kg、または5.56mg/kgの修飾オリゴヌクレオチド用量でマウスに注射した。それぞれの処理群は、3匹の動物からなる群とした。投与から72時間後にマウスを屠殺し、さらなる分析に向けて臓器及び血漿を収集した。
ンを示す。「x」という下付き文字は、「結合修飾x」列に示される修飾ヌクレオシド間結合を示す。これらの結合は、上及び以下に示される。
**独立した実験において決定された値であり、当該値は、比較のために示される。ALTは、修飾オリゴヌクレオチドを5.56mg/kgとしたときのものである。
以下の表に記載の修飾オリゴヌクレオチドをHeLa細胞にトランスフェクトした。トランスフェクトの0時間後、0.5時間後、1時間後、2時間後、4時間後、及び6時間後の時点で、細胞を溶解し、mRNAを単離し、RT-qPCRによって分析した。プライマープローブセットHTS3934(フォワード配列:TGGAGACTCTCAGGGTCGAAA(配列番号122)、リバース配列:GGCGTTTGGAGTGGTAGAAATC(配列番号123)、プローブ配列:CGGCGGCAGACCAGCATGAC(配列番号124))を使用してヒトのp21のmRNAを検出すると共に、プライマープローブセットHS00169255_m1(ThermoFisher))を使用してヒトのGadd45aのmRNAを検出した。結果は、非処理細胞に正規化されたものである。
修飾オリゴヌクレオチド464917のインビボの毒性の経時変化
投与群当たり9匹のBALB/Cマウスに対して修飾オリゴヌクレオチド464917を11mg/kg、33mg/kg、または100mg/kgで皮下投与した。それぞれの群に由来するマウスを、投与後24時間時点で3匹屠殺し、投与後48時間時点で3匹屠殺し、投与後72時間の時点で最後の3匹を屠殺した。mRNAを単離し、実施例1に記載のように分析した。血漿中のALT値は、臨床化学分析装置を使用して取得した。
インビボの核小体へのp54nrbの非局在化
化合物959265は、5’末端でCy3に結合し、3’末端でHPPO-GalNAcに結合した化合物464917である。Balb/cマウスに対して959265を皮下注射によって15mg/kgで投与した。修飾オリゴヌクレオチドの投与から40時間後に肝細胞を単離及び精製し、共焦点ディッシュに播種し、6~7時間保持した。6~7時間後、ホルムアルデヒドで細胞を固定化し、p54nrbに対する免疫蛍光染色を実施してp54nrbを染色した。上記のようにRT-qPCRによってFXI及びp21のレベルを検出した。
Balb/cマウスに対して464917または549148を皮下注射によって100mg/kgで投与した。修飾オリゴヌクレオチドの投与から16時間後に肝細胞を単離及び精製し、共焦点ディッシュに播種し、1~2時間保持した。1~2時間後、ホルムアルデヒドで細胞を固定化し、p54nrbに対する免疫蛍光染色を実施してp54nrbを染色した。
MOP中性結合を含む化合物のインビボの活性及び毒性
6週齢のBALB/Cマウス(Charles Riverから購入)に対して、以下に示される修飾オリゴヌクレオチドを0.2mg/kg、0.6mg/kg、1.8mg/kg、5.4mg/kg、もしくは50mg/kgの用量で1回皮下注射するか、または対照として生理食塩水を1回皮下注射した。化合物855156については、0.2mg/kg、0.6mg/kg、1.8mg/kg、5.4mg/kg、または15mg/kgの修飾オリゴヌクレオチド用量でマウスに注射した。それぞれの処理群は、3匹の動物からなる群とした。投与から72時間後にマウスを屠殺し、さらなる分析に向けて臓器及び血漿を収集した。
Balb/cマウスにおけるインビボの毒性について修飾オリゴヌクレオチドを試験した。
修飾オリゴヌクレオチド464932または修飾オリゴヌクレオチド464917のインビボの毒性及び活性の経時変化
上の実施例45に記載の修飾オリゴヌクレオチド464932、または上の実施例4に記載の修飾オリゴヌクレオチド464917を33mg/kgでBALB/Cマウスに皮下投与した。それぞれの投与群に由来するマウスを、それぞれの指定時点で3匹屠殺し、mRNAを単離し、実施例1に記載のように分析した。血漿中のALT値は、臨床化学分析装置を使用して取得し、生理食塩水で処理した動物に正規化した。
修飾オリゴヌクレオチド558807または修飾オリゴヌクレオチド558765のインビボの毒性及び活性の経時変化
修飾オリゴヌクレオチド558765は、完全なホスホロチオエート骨格、及びAmCATmCTTmCAGATmCATTという配列(配列番号144)を有する3-10-3cEtギャップマーである。修飾オリゴヌクレオチド558807または修飾オリゴヌクレオチド558765を51mg/kgでBALB/Cマウスに皮下投与した。それぞれの投与群に由来するマウスを、それぞれの指定時点で3匹屠殺し、mRNAを単離し、実施例1に記載のように分析した。血漿中のALT値は、臨床化学分析装置を使用して取得し、生理食塩水で処理した動物に正規化した。
2’-OMe修飾ヌクレオシドを中央領域に組み込むことによるインビボの毒性の改善
BALB/cマウスに対して、558807を1.8mg/kg、5.5mg/kg、16.7mg/kg、もしくは50mg/kgで投与するか、または936053を1.8mg/kg、5.5mg/kg、16.7mg/kg、50mg/kg、100mg/
kg、200mg/kg、もしくは300mg/kgで投与し、72時間後に当該BALB/cマウスを屠殺した。臨床化学分析装置を用いてALTの血漿中レベルを測定すると共に、mRNAを単離し、実施例1に記載のように分析した。治療指数(TI)は、ED50によって最大非毒性用量を割ったものとして計算した。化合物936053は、化合物の5’末端から数えると位置5または中央領域の位置2に2’-OMe基が存在することのみが化合物558807と異なる。
FXIを標的とする修飾オリゴヌクレオチドの毒性の改善
修飾オリゴヌクレオチドを皮下注射によって1.8mg/kg、5.5mg/kg、16.7mg/kg、50mg/kg、または150mg/kgでBALB/cマウスに投与した。それぞれの群には3匹のマウスを含めた。4匹のマウスの群には、対照としてPBSを投与した。臨床化学分析装置を用いてALTの血漿中レベルを測定すると共に、mRNAを単離し、実施例1に記載のように分析した。修飾オリゴヌクレオチドは、実施例18に記載のものである。化合物のペアはそれぞれ、以下の表において互いに隣り合わせで示されており、kkk-d(10)-kkkというモチーフを有する化合物(464xxx)と、kkk-d-m-d(8)-kkkというモチーフを有する同じ配列の化合物(1133xxx)と、を示す。元の配列の位置5がTの場合、このヌクレオシドは、kkk-d-m-d(8)-kkk配列では2’-OMeUである。
HDAC2を標的とする修飾オリゴヌクレオチドの毒性の改善
修飾オリゴヌクレオチドを皮下注射によって1.8mg/kg、5.5mg/kg、16.7mg/kg、50mg/kg、または150mg/kgでBALB/cマウスに投与した。それぞれの群には3匹のマウスを含めた。4匹のマウスの群には、対照としてPBSを投与した。臨床化学分析装置を用いてALTの血漿中レベルを測定すると共に、mRNAを単離し、実施例1に記載のように分析した。修飾オリゴヌクレオチドは、実施例19に記載のものである。化合物のペアはそれぞれ、以下の表において互いに隣り合わせで示されており、kkk-d(10)-kkkというモチーフを有する化合物(546xxx)と、kkk-d-m-d(8)-kkkというモチーフを有する同じ配列の化合物(1133xxx)と、を示す。元の配列の位置5がTの場合、このヌクレオシドは、kkk-d-m-d(8)-kkk配列では2’-OMeUである。
修飾オリゴヌクレオチドの毒性の改善
Balb/cマウスにおけるインビボの毒性について修飾オリゴヌクレオチドを試験した。化合物865060は、kkk-d(10)-kkkkというモチーフを有し、化合物865061は、kkkk-d(10)-kkkというモチーフを有する。化合物1269430及び化合物1269431は、中央領域の2番目の位置に2’-OMe修飾糖部分を含むこと以外は、それぞれ865060及び865061と同一の化合物である。
修飾オリゴヌクレオチドの長期毒性の改善
Balb/cマウスにおけるインビボの毒性について修飾オリゴヌクレオチドを試験した。修飾オリゴヌクレオチドを1週間に1回の投与頻度で50mg/kgでマウスに6週間投与し、自動臨床化学分析装置を使用してALTを測定した。以下の表中の化合物は、実施例13に記載のものである。化合物のペアはそれぞれ、kkk-d(10)-kkkという糖モチーフを有するオリゴヌクレオチド(上)と、kkk-d-m-d(8)-kkkという糖モチーフを有する同じ配列のオリゴヌクレオチド(下)と、を示す。
546118に基づいて修飾オリゴヌクレオチドを設計した。修飾オリゴヌクレオチドはそれぞれ、3’末端でTHA-GalNAc複合基と結合している。THA-GalNacは、以下の構造:
を指し、式中、リン酸基は、3’ヌクレオシドの3’-酸素原子に付加される。
上の実施例19に記載の546110に基づいて修飾オリゴヌクレオチドを設計した。修飾オリゴヌクレオチドはそれぞれ、上の実施例53に記載のように、3’末端でTHA-GalNAc複合基と結合している。インビボのHDAC2のmRNA発現レベルの低減についてオリゴヌクレオチドを評価した。P21及びTnfrsf10bのmRNAレベルも測定した。それぞれの用量に対するトランスアミナーゼレベル(ALT及びAST)も測定した。
に示される修飾オリゴヌクレオチドを0.016mg/kg、0.08mg/kg、0.40mg/kg、2.0mg/kg、もしくは50mg/kgの用量で1回皮下注射するか、または対照として生理食塩水を1回皮下注射した。それぞれの処理群は、3匹の動物からなる群とした。投与から72時間後にマウスを屠殺し、さらなる分析に向けて臓器及び血漿を収集した。
上の実施例13に記載のように、747149に基づいて修飾オリゴヌクレオチドを設計した。修飾オリゴヌクレオチドはそれぞれ、上の実施例53に記載のように、3’末端でTHA-GalNAc複合基と結合している。インビボのFBO1AのmRNA発現レベルの低減についてオリゴヌクレオチドを評価した。P21及びTnfrsf10bのmRNAレベルも測定した。それぞれの用量に対するトランスアミナーゼレベル(ALT及びAST)も測定した。
上の実施例18に記載のように、464924に基づいて修飾オリゴヌクレオチドを設計した。修飾オリゴヌクレオチドはそれぞれ、上の実施例53に記載のように、3’末端でTHA-GalNAc複合基と結合している。インビボのFXIのmRNA発現レベルの低減についてオリゴヌクレオチドを評価した。P21及びTnfrsf10bのmRNAレベルも測定した。それぞれの用量に対するトランスアミナーゼレベル(ALT及びAST)も測定した。
5’-アルキル修飾のインビボの導入
中央領域に5’-アルキル修飾ヌクレオシドを含む修飾オリゴヌクレオチドを合成した。
キラルホスホロチオエート結合を有するヌクレオシド
キラル制御されたホスホロチオエート結合を中央領域に含む修飾オリゴヌクレオチドを合成した。以下の表中の化合物は、マウスのCXCL12(GENBANK NT_039353.7の69430515~69445350の区間の配列)(配列番号1)に対して位置6877~6892において100%相補的である。化合物はそれぞれ、kkk-d(10)-kkkという糖モチーフを有し、式中、「k」はそれぞれ、2’-拘束エチル修飾糖部分を示し、「d」はそれぞれ、2’-デオキシ糖部分を示す。ヌクレオシド間結合1、ヌクレオシド間結合2、ヌクレオシド間結合3、ヌクレオシド間結合14、及びヌクレオシド間結合15は、立体ランダムなホスホロチオエート結合である。ヌクレオシド間結合4~13は、以下の表に示される立体化学を有し、式中、「s」という下付き文字は、立体ランダムなホスホロチオエートヌクレオシド間結合を示し、「r」という下付き文字は、(Rp)配置を有するホスホロチオエートヌクレオシド間結合を示し、「q」という下付き文字は、(Sp)配置を有するホスホロチオエートヌクレオシド間結合を示す。
ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を示す。
キラルホスホロチオエート結合及び3’-GalNAcを有するヌクレオシド
キラル制御されたホスホロチオエート結合を中央領域に含むと共に、3’-THA-GalNAcを含む修飾オリゴヌクレオチドを合成した。以下の表中の化合物は、マウスのCXCL12(GENBANK NT_039353.7の69430515~69445350の区間の配列)(配列番号1)に対して位置6877~6892において100%相補的である。化合物はそれぞれ、kkk-d(10)-kkkという糖モチーフを有し、式中、「k」はそれぞれ、2’-拘束エチル修飾糖部分を示し、「d」はそれぞれ、2’-デオキシ糖部分を示す。ヌクレオシド間結合1、ヌクレオシド間結合2、ヌクレオシド間結合3、ヌクレオシド間結合14、及びヌクレオシド間結合15は、立体ランダムなホスホロチオエート結合である。ヌクレオシド間結合4~13は、以下の表に示される立体化学を有し、式中、「s」という下付き文字は、立体ランダムなホスホロチオエートヌクレオシド間結合を示し、「r」という下付き文字は、(Rp)配置を有するホスホロチオエートヌクレオシド間結合を示し、「q」という下付き文字は、(Sp)配置を有するホスホロチオエートヌクレオシド間結合を示す。
THA-GalNAcは、分子の3’末端に存在する以下の構造:
を指し、式中、リン酸基は、3’ヌクレオシドの3’-酸素原子に付加される。
含有するヌクレオシド間結合の2つがキラルリン酸結合であり、その他は立体ランダムなホスホロチオエートであるオリゴヌクレオチド
キラル制御されたホスホロチオエート結合を中央領域の2つの位置に含む修飾オリゴヌクレオチドを合成した。以下の表中の化合物は、マウスのCXCL12(GENBANK
NT_039353.7の69430515~69445350の区間の配列)(配列番号1)に対して位置6877~6892において100%相補的である。1273959~1273967の範囲の識別子を有する化合物はそれぞれ、kkk-d(10)-kkkという糖モチーフを有し、式中、「k」はそれぞれ、2’-拘束エチル修飾糖部分を示し、「d」はそれぞれ、2’-デオキシ糖部分を示す。1276491~1276497の範囲の識別子を有する化合物はそれぞれ、kkk-d-m-d(8)-kkkという糖モチーフを有し、式中、「k」はそれぞれ、cEtを示し、「d」はそれぞれ、ヌクレオシドが非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を含むことを示し、「m」はそれぞれ、ヌクレオシドが2’-Oメチル修飾糖部分を含むことを示す。ヌクレオシド間結合は、以下の表に示されるとおりであり、式中、「s」という下付き文字は、立体ランダムなホスホロチオエートヌクレオシド間結合を示し、「r」という下付き文字は、(Rp)配置を有するホスホロチオエートヌクレオシド間結合を示し、「q」という下付き文字は、(Sp)配置を有するホスホロチオエートヌクレオシド間結合を示す。化合物はそれぞれ、「Rp/Sp」単位を含み、この「Rp/Sp」単位は、5’→3’の向きで、(Rp)配置を有するヌクレオシド間結合の後に、(Sp)配置を有するヌクレオシド間結合を含む。
化合物546108、化合物546118、化合物465178、及び化合物694804(それぞれ実施例18、実施例18、実施例19、及び実施例13に記載のもの)に基づいて修飾オリゴヌクレオチドを設計した。親オリゴヌクレオチドkkk-d(10)-kkkの位置5(5’末端から数えた位置)にTを有する配列については、kkk-d-m-d(8)-kkkは、当該位置に2’-OMe修飾Uを含む。親オリゴヌクレオチドkkk-d(10)-kkkの位置5(5’末端から数えた位置)にmCを有する配列については、kkk-d-m-d(8)-kkkは、5-メチル基を含まない2’-OMe修飾Cを当該位置に含む。修飾オリゴヌクレオチドはそれぞれ、3’末端でTHA-GalNAc複合基と結合している。単回用量での72時間後のインビボの毒性についてオリゴヌクレオチドを評価した。
HDAC2に相補的な修飾オリゴヌクレオチドの遅発性毒性に対する2’-OMe組み込みの効果
以下の表に示されるように2’修飾を有する修飾オリゴヌクレオチドを合成した。これらの化合物は、kkk-d(10)-kkk(「親」)またはkkk-d-m-d(8)-kkkという糖モチーフを有し、式中、「k」は、cEtを示し、「d」は、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を示し、「m」は、2’-OMe-β-D-リボフラノシル糖部分を示す。親オリゴヌクレオチドkkk-d(10)-kkkの位置5(5’末端から数えた位置)にTを有する配列については、kkk-d-m-d(8)-kkkは、当該位置に2’-OMe修飾Uを含む。親オリゴヌクレオチドkkk-d(10)-kkkの位置5(5’末端から数えた位置)にmCを有する配列については、kkk-d-m-d(8)-kkkは、5-メチル基を含まない2’-OMe修飾Cを当該位置に含む。以下の表中の修飾オリゴヌクレオチドは、表中の化学表記によって示されるように、soossssssssssosまたはsoosossssssssosという混在型骨格モチーフを有し、式中、「s」はそれぞれ、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を示し、「o」はそれぞれ、ホスホジエステルヌクレオシド間結合を示す。
5)マウスが持ち上げられた後になんらかの動作を示したか、(6)尾部の圧迫にマウスが反応したか、(7)呼吸が規則的であったか、である。これら7つの基準のそれぞれについて、基準を満たす場合は0のサブスコアをマウスに与え、基準を見たさない場合は1のサブスコアをマウスに与えた。7つの基準をすべて評価した後、それぞれのマウスについてFOBスコアを合計し、それぞれの処理群内で平均化した。結果は、以下の表に示される。
さまざまな位置への2’-OMeの組み込みの効果
以下の表に示されるように、2’修飾を有する修飾オリゴヌクレオチドを合成した。これらの化合物は、kkk-d-m-d(8)-kkk、kkk-d(8)-m-d-kkk、またはkkk-mm-d(8)-kkkという糖モチーフを有し、式中、「k」は、cEtを示し、「d」は、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を示し、「m」は、2’-OMe-β-D-リボフラノシル糖部分を示す。親配列が2’-OMe-修飾位置にTを有するものについては、修飾配列は、当該位置に2’-OMe修飾Uを含む。親配列が2’-OMe-修飾位置にmCを有するものについては、修飾配列は、5-メチル基を含まない2’-OMe修飾Cを当該位置に含む。
中央領域に11個のヌクレオシドを有する修飾オリゴヌクレオチドへの2’-OMeの組み込みの効果
以下の表に示されるように、2’修飾を有する修飾オリゴヌクレオチドを合成した。これらの化合物は、kkk-d(11)-kkk、kkk-d-m-d(9)-kkk、またはkkk-dd-m-d(8)-kkkという糖モチーフを有し、式中、「k」は、cEtを示し、「d」は、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を示し、「m」は、2’-OMe-β-D-リボフラノシル修飾糖部分を示す。親配列が2’-OMe-修飾位置にTを有するものについては、修飾配列は、当該位置に2’-OMe修飾Uを含む。
示す。
腎毒性に対する修飾オリゴヌクレオチドへの2’-OMeの組み込みの効果
以下の表に示されるように修飾オリゴヌクレオチドを合成した。これらの化合物は、kkk-d(10)-kkkまたはkkk-d-m-d(8)-kkkという糖モチーフを有し、式中、「k」は、cEtを示し、「d」は、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を示し、「m」は、2’-OMe-β-D-リボフラノシル糖部分を示す。
中央領域の位置2及び位置3の化学がさまざまなヌクレオシド
中央領域の位置2に改変ヌクレオチドを含む修飾オリゴヌクレオチドを合成した。以下の表中の化合物は、マウスのFXIに100%相補的である。オリゴヌクレオチドの配列は、以下の表に示されるように、GTTATTGTGGTTGGCG(配列番号81)、GTTAUTGTGGTTGGCG(配列番号133)、またはGTTATUGTGGTTGGCG(配列番号154)である。これらの化合物は、kkk-d-Z-d(8)-kkkまたはkkk-dd-Z-d(7)-kkkという糖モチーフを有し、式中、「k」は、cEtを示し、「d」は、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を示し、「Z」は、ヌクレオチドが以下の表139に示されるように修飾を含むこと示す。
中央領域の位置2及び位置3の化学特性がさまざまなヌクレオシド
中央領域に2’-5’ヌクレオシド間結合を有する修飾オリゴヌクレオチドを、以下の表に示されるように合成した。「k」は、cEtを示し、「d」は、非修飾2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を示し、「25s」は、2’-5’ヌクレオシド間結合を示す。2’-5’ヌクレオシド間結合の例は、以下に示される:
Claims (15)
- 14~16個の連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドが、5’領域、中央領域、及び3’領域を有し、
前記5’領域が、4’-2’架橋型の二環式糖部分をそれぞれが含む1~3つの連結ヌクレオシドからなり、
前記3’領域が、4’-2’架橋型の二環式糖部分をそれぞれが含む1~3つの連結ヌクレオシドからなり、
前記中央領域が、9~10個の連結ヌクレオシドからなり、前記中央領域が、下記の式:
(Nd)(Nx)(Nd)n
を有し、式中、Nxが、2’-OMe-β-D-リボフラノシル糖部分を含むヌクレオシドであり、Ndがそれぞれ、2’-β-D-デオキシリボシル糖部分を含むヌクレオシドであり、
nが、7または8である前記オリゴマー化合物。 - 前記5’領域が、3つのヌクレオシドからなる、請求項1に記載のオリゴマー化合物。
- 前記3’領域が、3つのヌクレオシドからなる、請求項1または請求項2に記載のオリゴマー化合物。
- 前記5’領域のそれぞれのヌクレオシドの4’-2’架橋型の二環式糖部分がそれぞれ、cEt、LNA、及びENAから独立して選択される、請求項1~3のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
- 前記3’領域のそれぞれのヌクレオシドの4’-2’架橋型の二環式糖部分がそれぞれ、cEt、LNA、及びENAから独立して選択される、請求項1~4のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
- 前記3’領域及び前記5’領域のそれぞれのヌクレオシドの4’-2’架橋型の二環式糖部分がそれぞれ、cEtである、請求項1~5のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
- 前記修飾オリゴヌクレオチドのそれぞれのヌクレオシドの核酸塩基がそれぞれ、チミン、ウラシル、グアニン、シトシン、5-メチルシトシン、及びアデニンのうちから独立して選択される、請求項1~6のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
- ヌクレオシド間結合がそれぞれ、ホスホジエステルヌクレオシド間結合及びホスホロチオエートヌクレオシド間結合のうちから独立して選択される、請求項1~7のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
- 前記中央領域内のヌクレオシド間結合の1つが、メトキシプロピルヌクレオシド間結合であり、前記修飾オリゴヌクレオチドにおける残りのヌクレオシド間結合がそれぞれ、ホスホジエステルヌクレオシド間結合及びホスホロチオエートヌクレオシド間結合のうちから独立して選択される、請求項1~8のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
- 前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、標的RNAに対して少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、または100%相補的である、請求項1~9のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
- 前記標的RNAが、標的mRNAまたは標的pre-mRNAである、請求項10に記載のオリゴマー化合物。
- 前記標的RNAが、マウス、ラット、サル、またはヒトのPTEN、SRB-1、MYD11、HTT、SOD1、またはアルファ-シヌクレインのmRNAではない、請求項10に記載のオリゴマー化合物。
- 請求項10~12のいずれかに記載のオリゴマー化合物であって、
前記標的RNAが、肝臓において発現する;および/または
前記標的RNAが、中枢神経系において発現する;および/または
前記標的RNAが、がん細胞において発現する;および/または
前記標的RNAが、筋細胞において発現する、
前記オリゴマー化合物。 - 前記標的RNAが、MeCP2のRNA、DUX4のRNA、HDAC2のRNA、APPのRNA、アタキシン1のRNA、アタキシン2のRNA、アタキシン3のRNA、アタキシン6のRNA、アタキシン7のRNA、C9ORF72のRNA、UBE3AのRNA、プリオンのRNA、PMP22のRNA、タウのRNA、LRRK2のRNA、LINGO2のRNA、GYS1のRNA、KCNT1のRNA、IRF8のRNA、プログラニュリンのRNA、またはGFAPのRNAから選択される、請求項10~13のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
- 前記標的RNAの発現を調節することが、障害または状態の治療と関連する、請求項10~14のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
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