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JP7236273B2 - Clec9a結合物質 - Google Patents

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Description

関連出願の相互参照
本出願は、2016年2月5日に出願された米国特許仮出願第62/291,769号;2016年5月13日に出願された同第62/335,880号;2016年10月24日に出願された同第62/411,805号;2016年2月5日に出願された同第62/291,772号;2016年2月5日に出願された同第62/291,774号;2016年5月13日に出願された同第62/335,965号;2016年2月5日に出願された同第62/291,776号;2016年5月13日に出願された同第62/335,968号;2016年5月13日に出願された同第62/335,979号;同第2016年5月13日に出願された同第62/336,030号;2016年6月23日に出願された同第62/353,607号;および2016年2月5日に出願された同第62/291,779号の利益を主張する。これら全ての特許の内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
発明の分野
本発明は、一部は、Clec9Aを結合する結合物質ならびに治療薬および診断薬としてのそれらの使用に関する。
電子申請したテキストファイルの説明
本明細書と共に電子申請された次記のテキストファイルの内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる:配列リストのコンピュータ可読形式コピー(ファイル名:ORN-012PC_Sequence_listing;記録日付:2017年2月1日;ファイルサイズ:281KB)。
樹状細胞(DC)は、一次免疫応答を誘導する能力を備えた抗原提示細胞(APC)であり、種々の免疫の状況で重要な役割を果たす。活性化樹状細胞は、追加の免疫細胞、例えば、マクロファージ、好酸球、ナチュラルキラー細胞、およびナチュラルキラーT細胞などのT細胞などをリクルートできる。樹状細胞はまた、抗原を捕捉し、樹状細胞の表面上に提示して、T細胞(例えば、細胞傷害性T細胞(CTL))を活性化する。
癌治療における大きな進展にもかかわらず、癌は全世界的に、死亡の主要な原因の1つとして残されたままである。効果的な治療を設計する上での障害には、癌の免疫回避が含まれ、そこで癌細胞は破滅をもたらす免疫、ならびに放射線療法および化学療法などの多くの従来の癌治療の毒性を回避し、このことは患者の治療に耐える能力に影響を与え、および/または治療の効果に影響を与える。
癌が免疫検出および破壊を回避する1つの機序は、樹状細胞(DC)のリクルートおよび活性化を妨げることにより、樹状細胞の機能を無能にすることによる。したがって、腫瘍回避を効果的に逸脱させかつ、例えば、樹状細胞により媒介される抗腫瘍免疫を強化できる免疫療法薬に対する必要性が残されている。
多発性硬化症(MS)は、中枢神経系の自己免疫疾患であり、自己免疫および神経変性の両方の特徴を有する。最も多い型のMSは、再発寛解型多発性硬化症(RRMS)であり、神経学的症状の反復発症を臨床的な特徴とする。世界中で、230万人を越える人がMSに罹患しており、米国だけで40万人がこの病気に罹っている。
MSに対する現在の薬理学的処置は、疾患修飾治療(DMT)を含み、身体の免疫系を緩和するまたは抑える。MS用の現在の薬理学的物質の多くは、不完全な効力、副作用および医療リスクにより制限される。これらの処置は、疾患の神経学的再発を中程度に減らし、いくつかの事例では、神経障害の進行を不完全に遅らせることが示されている。したがって、改善されたMS処置に対する差し迫った必要性も残されている。
種々の態様では、本発明は、Clec9Aに特異的に結合する少なくとも1つのターゲティング部分を有するClec9A結合物質に関する。種々の実施形態では、これらのClec9A結合物質は、Clec9Aに結合するが、Clec9Aを機能的に調節しない(例えば、部分的にまたは完全に中和しない)。したがって、種々の実施形態では、本発明のClec9A結合物質は、例えば、Clec9A発現細胞を目的の部位に直接または間接的にリクルートし同時になおClec9A発現細胞をClec9Aを介してシグナル伝達させることにおいて使用される(すなわち、Clec9A結合物質の結合は、目的の部位でのClec9Aシグナル伝達を低減せず排除しない)。ある実施形態では、ターゲティング部分は単一ドメイン抗体(VHHまたはナノボディ)である。種々の実施形態では、Clec9A結合物質は、シグナル伝達物質、例えば、限定されないが、活性を弱めるように改変され得るインターフェロン、インターロイキン、および腫瘍壊死因子をさらに含む。種々の実施形態では、Clec9A結合物質は、目的とする他の標的(例えば、抗原、受容体)に結合する追加のターゲティング部分を含む。ある実施形態では、目的とする他の標的(例えば、抗原、受容体)は、腫瘍細胞上に存在する。別の実施形態では、目的とする他の標的(例えば、抗原、受容体)は、免疫細胞上に存在する。いくつかの実施形態では、本発明のClec9A結合物質は、免疫細胞、(例えば、樹状細胞)を、作用の部位(例えば、非限定的例であるが、腫瘍微小環境など)に直接的にまたは間接的にリクルートし得る。いくつかの実施形態では、本発明のClec9A結合物質は、樹状細胞による抗原(例えば、腫瘍抗原)の提示を促進する。
種々の実施形態では、本発明のClec9A結合物質は、癌、感染症、免疫異常、ならびに他の疾患および障害などの種々の疾患または障害の処置に使用され、かつ本発明は、処置の様々な方法を包含する。
図1のパネルAは、マウスClec9Aに特異的な6種のVHHの、Clec9Aを遺伝子導入したCHO細胞への結合を示すヒストグラムである。 図1のパネルBは、マウスClec9Aに特異的な6種のVHHの、Clec9Aを遺伝子導入したCHO細胞への結合を示すヒストグラムである。 図1のパネルCは、マウスClec9Aに特異的な6種のVHHの、Clec9Aを遺伝子導入したCHO細胞への結合を示すヒストグラムである。 図1のパネルDは、マウスClec9Aに特異的な6種のVHHの、Clec9Aを遺伝子導入したCHO細胞への結合を示すヒストグラムである。 図1のパネルEは、マウスClec9Aに特異的な6種のVHHの、Clec9Aを遺伝子導入したCHO細胞への結合を示すヒストグラムである。 図1のパネルFは、マウスClec9Aに特異的な6種のVHHの、Clec9Aを遺伝子導入したCHO細胞への結合を示すヒストグラムである。 図2パネルAは、改変ヒトインターフェロンとのマウスClec9Aに特異的なVHHの融合体(Q124R変異体、「Clec9Aを標的とするAcTaferon」)の投与が、腫瘍サイズの減少をもたらしたことを示す(折れ線の最後の時点で上から下へ:PBS、「非標的化AcTaferon」(すなわち、無関係の標的-hcD20に対するターゲティング部分に融合された改変ヒトインターフェロン(Q124R変異体)、「Clec9Aを標的とするAcTaferon」-改変ヒトインターフェロン(Q124R変異体)とのマウスClec9Aに特異的なVHHの融合体、および「WT mIFN」(すなわち、非改変マウスインターフェロン))。 図2パネルBは、改変ヒトインターフェロン(Q124R変異体)とのマウスClec9Aに特異的なVHHの融合体の投与が、それぞれ体重減少または血液毒性を生じなかったことを示す(パネルBでは、折れ線の最後の時点で上から下へ:非標化AcTaferon、PBS、Clec9Aを標的とするAcTaferon、およびWT mIFN、パネルCの全てのグラフでは、ヒストグラムの左から右へ:未処置マウス、PBS、mIFN WT、非標的化AcTaferon、およびClec9Aを標的とするAcTaferon)。 図2パネルCは、改変ヒトインターフェロン(Q124R変異体)とのマウスClec9Aに特異的なVHHの融合体の投与が、それぞれ体重減少または血液毒性を生じなかったことを示す(パネルBでは、折れ線の最後の時点で上から下へ:非標化AcTaferon、PBS、Clec9Aを標的とするAcTaferon、およびWT mIFN、パネルCの全てのグラフでは、ヒストグラムの左から右へ:未処置マウス、PBS、mIFN WT、非標的化AcTaferon、およびClec9Aを標的とするAcTaferon)。 図3は、ヒトClec9Aに特異的な27種の異なるVHHのヌクレオチド配列を示す。ギャップは、配列を整列するために導入された。図3の配列は、下記実施例2に示すようにして、シーケンス識別子に割り付けられる。 図4は、ヒトClec9Aに特異的な27種の異なるVHHのアミノ酸配列を示す。示される相補性決定領域(CDR1、CDR2およびCDR3)は、Kabatに従って決定される。ギャップは、配列を整列するために導入された。上記27種の異なるVHHは、11個の異なる群に属する(図5参照)。同じ群に属するVHHは極めて類似しており、それらのアミノ酸配列は、それらが体細胞超変異から生じるまたは同じB細胞から生じるクローン的に関連したB細胞由来であるが、ライブラリー構築中にRTおよび/またはPCRエラーにより多様化したことを示唆している。同じ群に属するVHHは同じエピトープを認識するが、それらの他の特性(例えば、親和性、効力、安定性、発現量、など)は異なる可能性がある。図4の配列は、下記実施例2に示すようにして、シーケンス識別子に割り付けられる。 図5は、27種のVHHが11個の異なる群に属することを示す。群5および7のメンバーは、マウスおよびヒトClec9Aの両方に結合する。 図6は、腫瘍壊死因子(TNF)と組み合わせた、改変ヒトインターフェロンアルファ2に融合されたマウスClec9Aに特異的なVHHを含むキメラタンパク質(Q124R変異体、「Acta-Clec9A」)の抗腫瘍能力を示す。パネルAは、キメラタンパク質とTNFを用いた併用療法が強力な抗腫瘍活性を示し、38日目まで(または投与後23日目まで)腫瘍の再発がなかったことを示す。 図6は、腫瘍壊死因子(TNF)と組み合わせた、改変ヒトインターフェロンアルファ2に融合されたマウスClec9Aに特異的なVHHを含むキメラタンパク質(Q124R変異体、「Acta-Clec9A」)の抗腫瘍能力を示す。パネルBは、併用療法が耐容性良好であり、野生型IFNまたはTNFと組み合わされた野生型IFNに比べて、血小板減少症などの重大な血液毒性がなかったことを示す。 図7は、改変ヒトインターフェロンアルファ2(Q124R変異体)に融合したマウスClec9Aに特異的なVHHのキメラと抗PD-L1抗体との(「Clec9A-AcTaferon+抗PD-L1」)組み合わせ効果を、PBS(ネガティブコントロール)、改変ヒトインターフェロンアルファ2に融合したマウスClec9Aに特異的なVHHのキメラ単独(Q124R変異体、「Clec9A-AcTaferon」)、および抗PD-L1抗体単独(「抗PD-L1」)と比べて示す。 図8は、改変ヒトインターフェロンアルファ2(Q124R)に融合し、および抗PD-L1 VHHにも融合したマウスClec9Aに特異的なVHHのキメラと、ドキソルビシンとの(「Clec9A-Q124R-PD-L1+doxo」)組み合わせ効果を、改変ヒトインターフェロンアルファ2(「Q124R」)に融合しかつ抗PD-L1VHHに融合したマウスClec9Aに特異的なVHHのキメラ(「Clec9A-Q124R-PD-L1」)、ドキソルビシン(「doxo」)、およびPBS(ネガティブコントロール)に比べて示す。 図9は、改変ヒトインターフェロンアルファ2に融合したマウスClec9Aに特異的なVHH(Q124R変異体、「Actakine」)の投与に応答した、マウスにおけるT細胞増殖の実質的誘導を示す。 図10、パネルAは、実施例7に記載の種々の処置(種々の融合体を含む)に対する同じく実施例7で記載の平均臨床スコアを示す。 図10、パネルBは、実施例7に記載の種々の処置(種々の融合体を含む)に対する同じく実施例7で記載の平均体重を示す。 図11は、種々の処置に対する累積臨床スコアを示す。ヒストグラムは左から右へ次の順である:PBS(ネガティブコントロール)、抗CD20とQ124R変異を有するヒトIFNとの融合体(「Q-CD20」)、抗CD8とQ124R変異を有するヒトIFNとの融合体(Q-CD8)、抗Clec9AとQ124R変異を有するヒトIFNとの融合体(Q-Clec9A)、抗Bcll10とQ124R変異を有するヒトIFNとの融合体(「Q-Bcll10」)、および示したように2種の用量での野生型IFN。Q124Rは、マウスでの使用に好適するヒトIFN変異体である(すなわち、これは、マウスで機能するヒト変異体IFNである)。Nat.Comm.2014;5:3016.doi:10.1038/ncomms 4016を参照されたい。この文献の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。 図12は、上記図11で示した処置での種々の副作用を示す(パネルB~Fに対し、左から右へ同じヒストグラムの順序)。 図12は、上記図11で示した処置での種々の副作用を示す(パネルB~Fに対し、左から右へ同じヒストグラムの順序)。 図12は、上記図11で示した処置での種々の副作用を示す(パネルB~Fに対し、左から右へ同じヒストグラムの順序)。 図12は、上記図11で示した処置での種々の副作用を示す(パネルB~Fに対し、左から右へ同じヒストグラムの順序)。 図12は、上記図11で示した処置での種々の副作用を示す(パネルB~Fに対し、左から右へ同じヒストグラムの順序)。 図12は、上記図11で示した処置での種々の副作用を示す(パネルB~Fに対し、左から右へ同じヒストグラムの順序)。 図13は、ヒト樹状細胞pSTAT1シグナル伝達アッセイを示す。調査したキメラは、抗ヒトClec9A VHH/ヒトIFN R149Aおよび抗ヒトClec9A VHH/ヒトIFN R33A/E120Rであった。物質の2種の用量:100ng/mlおよび500ng/mlを調査した。PBSはコントロールであり、データはpSTAT1樹状細胞のパーセンテージの倍率変化として表される(データは、3回のデータセットの平均である)。 図14は、抗ヒトClec9a VHH/抗ヒトPD-L1 VHH/ヒトIFN-R149A二重特異的キメラのヒト化マウスにおけるヒト腫瘍(RL)増殖に対する抗腫瘍効果を示す。X軸上の18日目に対して、調査構築物は、上から下へ下記の通り:PBS(コントロール);抗ヒトClec9a VHH/抗ヒトPD-L1 VHH/ヒトIFN-R149A二重特異的キメラ;および抗ヒトClec9a VHH/抗ヒトPD-L1VHH/ヒトIFN-R149A二重特異的キメラ+FMS様チロシンキナーゼ3リガンド(FLT3L)。
本発明は、一部は、Clec9Aを認識しそれに結合する物質(例えば、非限定的例であるが、VHHなどの抗体)の発見に基づいている。いくつかの実施形態では、本発明のClec9A結合物質は、1つまたは複数のターゲティング部分および/または1種または複数のシグナル伝達物質とのキメラまたは融合タンパク質の一部である。いくつかの実施形態では、これらのClec9A結合物質は、Clec9Aに結合するが、Clec9Aを機能的に調節しない。
いくつかの実施形態では、これらのClec9A結合物質は、免疫細胞を結合し治療作用の必要な部位(例えば、腫瘍または腫瘍微小環境)へ直接的にまたは間接的にリクルートし得る。いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質は、効果的な抗腫瘍免疫応答を誘発するため腫瘍抗原提示を強化する。
いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質は、腫瘍抗原提示を調節する。いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質は、免疫応答を調節して自己免疫を回避するか低減させる。いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質は、免疫抑制をもたらす。いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質は、患者においてTregの、CD8+ T細胞および/またはCD4+ T細胞に対する比率を高める。いくつかの実施形態では、本発明の方法は、患者中の自己反応性T細胞の低減に関する。
本発明は、Clec9A結合物質を含む医薬組成物および、癌、自己免疫疾患、および/または神経変性疾患を含む、種々の疾患の処置におけるそれらの使用を提供する。
Clec9A結合物質
種々の実施形態では、本発明のClec9A結合物質は、Clec9Aに特異的に結合できるタンパク質ベースの物質である。種々の実施形態では、本発明のClec9A結合物質は、Clec9Aの機能的な調節(例えば、部分的または完全な中和)を行わずに特異的にClec9Aに結合できるタンパク質ベースの物質である。Clec9Aは、死細胞由来の物質の取込とプロセッシングに特化された樹状細胞のサブセット(すなわち、BDCA+樹状細胞)の表面上で発現される5群C型レクチン様受容体(CTLR)である。Clec9Aは、細胞膜が損傷を受けた場合に現れる、有核細胞および無核細胞内の保存された成分を認識する。Clec9Aは、グリコシル化されたダイマーとして細胞表面で発現され、エンドサイトーシスを媒介できるが、食作用は媒介できない。Clec9Aは、Sykキナーゼをリクルートし炎症促進性サイトカイン産生を誘導できる細胞質免疫受容体チロシンベース活性化モチーフを有する(Huysamen et al.(2008),JBC,283:16693-701を参照)。
種々の実施形態では、本発明のClec9A結合物質は、Clec9A上に存在するエピトープを認識する抗原認識ドメインを有するターゲティング部分を含む。ある実施形態では、抗原認識ドメインは、Clec9A上に存在する1個または複数の線形エピトープを認識する。本明細書で使用される場合、線形エピトープは、Clec9A上に存在するアミノ酸の任意の連続配列を指す。別の実施形態では、抗原認識ドメインは、Clec9A上に存在する1個または複数の立体構造エピトープを認識する。本明細書で使用される場合、立体構造エピトープは、抗原認識ドメインにより認識され得る特徴および/または形状および/または三次構造を備えた3次元表面を形成する1個または複数のアミノ酸の部分(これは不連続であってよい)を指す。
種々の実施形態では、本発明のClec9A結合物質は、ヒトClec9Aの完全長型および/または成熟型および/またはアイソフォームおよび/またはスプライスバリアントおよび/またはフラグメントおよび/または任意の他の天然のまたは合成の類似体、バリアント、または変異体に結合し得る。種々の実施形態では、本発明のClec9A結合物質は、モノマー、ダイマー、ヘテロダイマー、マルチマーおよび会合型を含む任意の型のヒトClec9Aに結合し得る。ある実施形態では、Clec9A結合物質は、モノマー型のClec9Aに結合する。別の実施形態では、Clec9A結合物質は、ダイマー型のClec9Aに結合する。さらなる実施形態では、Clec9A結合物質は、グリコシル化型のClec9Aに結合し、これはモノマーであってもダイマーであってもよい。
ある実施形態では、本発明のClec9A結合物質は、ヒトClec9A上に存在する1個または複数のエピトープを認識する抗原認識ドメインを有するターゲティング部分を含む。ある実施形態では、ヒトClec9Aは、下記のアミノ酸配列を含む:
MHEEEIYTSLQWDSPAPDTYQKCLSSNKCSGACCLVMVISCVFCMGLLTASIFLGVKLLQVSTIAMQQQEKLIQQERALLNFTEWKRSCALQMKYCQAFMQNSLSSAHNSSPCPNNWIQNRESCYYVSEIWSIWHTSQENCLKEGSTLLQIESKEEMDFITGSLRKIKGSYDYWVGLSQDGHSGRWLWQDGSSPSPGLLPAERSQSANQVCGYVKSNSLLSSNCSTWKYFICEKYALRSSV(配列番号1)。
種々の実施形態では、本発明のClec9A結合物質は、特異的結合ができるターゲティング部分を含む。種々の実施形態では、Clec9A結合物質は、抗体またはその誘導体などの抗原認識ドメインを有するターゲティング部分を含む。ある実施形態では、Clec9A結合物質は、抗体であるターゲティング部分を含む。種々の実施形態では、抗体は、2つの重鎖および2つの軽鎖を含む完全長マルチマータンパク質である。それぞれの重鎖は、1つの可変領域(例えば、V)および少なくとも3つの定常領域(例えば、CH、CHおよびCH)を含み、それぞれの軽鎖は、1つの可変領域(V)および1つの定常領域(C)を含む。可変領域は抗体の特異性を決定する。それぞれの可変領域は、4つの比較的保存されたフレームワーク領域(FR)が隣接する、相補性決定領域(CDR)としても知られる、3つの高頻度可変領域を含む。3つのCDRは、CDR1、CDR2、およびCDR3と呼ばれ、抗体の結合特異性に寄与する。いくつかの実施形態では、抗体はキメラ抗体である。いくつかの実施形態では、抗体はヒト化抗体である。
いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質は、特定の抗体誘導体または抗体フォーマットであるターゲティング部分を含む。いくつかの実施形態では、本発明のClec9A結合物質は、次のターゲティング部分を含む:単一ドメイン抗体、組み換え型の重鎖のみで構成される抗体(重鎖抗体)(VHH)、単鎖抗体(scFv)、サメの重鎖のみで構成される抗体(VNAR)、マイクロタンパク質(システインノットタンパク質、ノッチン)、DARPin;テトラネクチン;アフィボディ;アフィマー、トランスボディ;アンチカリン;アドネクチン;アフィリン;ミクロボディ;ペプチドアプタマー;alterase;プラスチック抗体;フィロマー;ストラドボディ;マキシボディ;エビボディ;フィノマー;アルマジロリピートタンパク質(armadillo repeat protein);クニッツドメイン、アビマー、アトリマー、プロボディ、イムノボディ、トリオマブ、トロイボディ、ペプボディ、ワクシボディ、ユニボディ;デュオボディ、Fv、Fab、Fab’、F(ab’)、ペプチド模倣分子、または合成分子。これらは、その全内容が参照により本明細書に組み込まれる、米国特許第7,417,130号、米国特許出願公開第2004/132094号、米国特許第5,831,012号、米国特許出願公開第2004/023334号、米国特許第7,250,297号、米国特許第6,818,418号、米国特許出願公開第2004/209243号、米国特許第7,838,629号、米国特許第7,186,524号、米国特許第6,004,746号、米国特許第5,475,096号、米国特許出願公開第2004/146938号、米国特許出願公開第2004/157209号、米国特許第6,994,982号、米国特許第6,794,144号、米国特許出願公開第2010/239633号、米国特許第7,803,907号、米国特許出願公開第2010/119446号、および/または米国特許第7,166,697号に記載されている。Storz MAbs.2011 May-Jun;3(3):310-317、も参照されたい。
いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質は、VHHなどの、単一ドメイン抗体であるターゲティング部分を含む。VHHは、例えば、ラクダ類、サメなどのVHH抗体を産生する生物から誘導されるか、またはVHHは設計されたVHHであってもよい。VHHは、天然起源の重鎖抗体の特有の構造および機能特性を含む、抗体由来の治療用タンパク質である。VHH技術は、軽鎖を欠くラクダ類由来の完全に機能的な抗体に基づいている。これらの重鎖抗体は、単一可変ドメイン(VH)および2つの定常ドメイン(CH2およびCH3)を含む。VHHは、NANOBODIESの登録商標で市販されている。ある実施形態では、Clec9A結合物質はVHHを含む。
いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質は、4つの「フレームワーク領域」またはFRおよび3つの「相補性決定領域」またはCDRを有する単一アミノ酸鎖を含むVHHであるターゲティング部分を含む。本明細書で使用される場合、「フレームワーク領域」または「FR」は、CDRの間に位置する可変ドメイン中の領域を指す。本明細書で使用される場合、「相補性決定領域」または「CDR」は、抗原性標的に特異的に結合できるアミノ酸配列を含むVHH中の可変領域を指す。
種々の実施形態では、Clec9A結合物質は、少なくとも1つのCDR1、CDR2、および/またはCDR3配列を含む可変ドメインを有するVHHを含む。種々の実施形態では、Clec9A結合物質は、少なくとも1つのFR1、FR2、FR3、および/またはFR4配列を含む可変領域を有するVHHを含む。
代表的実施形態では、CDR1配列は、下記から選択される:
GSISSINVMG(配列番号2);
GSFSSINVMG(配列番号3);
GSISSINIMG(配列番号4);
GSISSINIMG(配列番号5);
VSIFSINAMG(配列番号6);
GSIFSLNAMG(配列番号7);
GRTISNYDMA(配列番号8);
GRTFTTSLMQ(配列番号9);
ERNLRIYDMA(配列番号10);
ERNLRSYDMA(配列番号11);
GLTFSNYHMG(配列番号12);
GLTFSSYHMG(配列番号13);
GLTFSRYHMG(配列番号14);
GLTLSSYYIA(配列番号15);
GLTFSSYYTG(配列番号16);
GLTLSSYHMG(配列番号17);
GRTSSPYVTG(配列番号18);
GFTFSGYVMS(配列番号19);
GFTFSGYVMT(配列番号20);または
GFTFSGYLMS(配列番号21)。
代表的実施形態では、CDR2配列は、下記から選択される:
RITNLGLPNYADWLKD(配列番号22);
RITNLGLPNYADSVTG(配列番号23);
RITNIGLPNYADSVKG(配列番号24);
RITNLGLPNYADSVEG(配列番号25);
AITSGGRVVYSDSVKG(配列番号26);
AITSGGRTAYADSVKG(配列番号27);
HITSDGRIVYADPVKG(配列番号28);
RISGSGDRTDYADSVKG(配列番号29);
SITWSTGNTHYADSVKG(配列番号30);
VISSSGDSTHYSDFVKG(配列番号31);
VITSSGDSTHYSDFVKG(配列番号32);
QITWSDASIYYAGSVKG(配列番号33);
QITWSDTSIYYAGSVKG(配列番号34);
QITWSDGTTYYPGSVKG(配列番号35);
QIRWSDDSTYYPGSVKG(配列番号36);
QISWSDDSTYYADSVKG(配列番号37);
TVSWGGVTYYADSVKG(配列番号38);
SIGSGGGYPSYTDSVEG(配列番号39);
SIGSGGGYPSYTGSVEG(配列番号40);
HIGSGGGYPSYTDSVQG(配列番号41);
HIGSGGGHATYTDSVEG(配列番号42);または
TIGSGGGITSYADSVKG(配列番号43)。
代表的実施形態では、CDR3配列は、下記から選択される:
VALSAEY(配列番号44);
VALKAEY(配列番号45);
VGLKAEY(配列番号46);
KTKSAVLFGGMDY(配列番号47);
YIRGEDY(配列番号48);
KHYASNY(配列番号49);
QDFGSPSF(配列番号50);
QDFRSPDF(配列番号51);
QIFGSPNF(配列番号52);
LAIHGDY(配列番号53);
NQIRQWP(配列番号54);
NSIRQWP(配列番号55);
NAIRQWP(配列番号56);
RKVGGPDY(配列番号57);
NTFGNVY(配列番号58);
LGR;または
VIK。
代表的実施形態では、Clec9A結合物質は、配列番号2、配列番号22、および配列番号44を含む。
代表的実施形態では、Clec9A結合物質は、配列番号3、配列番号23、および配列番号45を含む。
代表的実施形態では、Clec9A結合物質は、配列番号4、配列番号24、および配列番号45を含む。
代表的実施形態では、Clec9A結合物質は、配列番号2、配列番号25、および配列番号46を含む。
代表的実施形態では、Clec9A結合物質は、配列番号5、配列番号26、および配列番号47を含む。
代表的実施形態では、Clec9A結合物質は、配列番号6、配列番号27、および配列番号48を含む。
代表的実施形態では、Clec9A結合物質は、配列番号7、配列番号28、および配列番号49を含む。
代表的実施形態では、Clec9A結合物質は、配列番号8、配列番号29、および配列番号50を含む。
代表的実施形態では、Clec9A結合物質は、配列番号8、配列番号29、および配列番号51を含む。
代表的実施形態では、Clec9A結合物質は、配列番号8、配列番号29、および配列番号52を含む。
代表的実施形態では、Clec9A結合物質は、配列番号9、配列番号30、および配列番号53を含む。
代表的実施形態では、Clec9A結合物質は、配列番号10、配列番号31、および配列番号54を含む。
代表的実施形態では、Clec9A結合物質は、配列番号10、配列番号31、および配列番号55を含む。
代表的実施形態では、Clec9A結合物質は、配列番号11、配列番号32、および配列番号56を含む。
代表的実施形態では、Clec9A結合物質は、配列番号12、配列番号33、および配列番号57を含む。
代表的実施形態では、Clec9A結合物質は、配列番号13、配列番号34、および配列番号57を含む。
代表的実施形態では、Clec9A結合物質は、配列番号14、配列番号35、および配列番号57を含む。
代表的実施形態では、Clec9A結合物質は、配列番号15、配列番号36、および配列番号57を含む。
代表的実施形態では、Clec9A結合物質は、配列番号16、配列番号37、および配列番号57を含む。
代表的実施形態では、Clec9A結合物質は、配列番号17、配列番号37、および配列番号57を含む。
代表的実施形態では、Clec9A結合物質は、配列番号18、配列番号38、および配列番号58を含む。
代表的実施形態では、Clec9A結合物質は、配列番号19、配列番号39、およびLGRを含む。
代表的実施形態では、Clec9A結合物質は、配列番号19、配列番号40、およびLGRを含む。
代表的実施形態では、Clec9A結合物質は、配列番号19、配列番号41、およびLGRを含む。
代表的実施形態では、Clec9A結合物質は、配列番号20、配列番号42、およびLGRを含む。
代表的実施形態では、Clec9A結合物質は、配列番号21、配列番号43、およびVIKを含む。
種々の代表的実施形態では、Clec9A結合物質は、下記の配列から選択されるアミノ酸配列を含む:
R2CHCL8
QVQLVESGGGLVHPGGSLRLSCAASGSISSINVMGWYRQAPGKERELVARITNLGLPNYADWLKDRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCYLVALSAEYWGQGTQVTVSS(配列番号59);
R1CHCL50
QVQLVESGGGLVHPGGSLRLSCAASGSFSSINVMGWYRQAPGKERELVARITNLGLPNYADSVTGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCYLVALKAEYWGQGTQVTVSS(配列番号60);
R1CHCL21
QVQLVESGGGLVHRGGSLRLSCAASGSISSINIMGWYRQAPGKERELVARITNIGLPNYADSVKGRFTISRDNAKSTVYLQMNSLNAEDTAVYYCYLVALKAEYWGQGTQVTVSS(配列番号61);
R2CHCL87
QVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGSISSINVMGWYRQAPGKERELVARITNLGLPNYADSVEGRFTISRDKDENTVYLEMNTLKPEDTAVYYCYLVGLKAEYWGQGTQVTVSS(配列番号62);
R2CHCL24
QVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGSSDSINAMGWYRQAPGKERELVAAITSGGRVVYSDSVKGRGTISRDNAKNTVYLQIASLKPEDTAVYYCNVKTKSAVLFGGMDYWGKGTQVTVSS(配列番号63);
R2CHCL38
QVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASVSIFSINAMGWYRQAPGKERELVAAITSGGRTAYADSVKGRFTISRDNSKNTVYLQMDSLKPEDTDVYYCKAYIRGEDYWGKGTQVTVSS(配列番号64);
R1CHCL16
DVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGSIFSLNAMGWYRQAPGKERELVAHITSDGRIVYADPVKGRFTISRVDGKNMVTLQMNSLKPEDTAVYYCNAKHYASNYWGQGTQVTVSS(配列番号65);
R2CHCL10
QVQLVESGGGSVQAGGSLRLSCAASGRTISNYDMAWSRQAPGKEREFVARISGSGDRTDYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAIYYCQIQDFGSPSFSGQGTQVTVSS(配列番号66);
R1CHCL34
DVQLVESGGGSVQAGGSLRLSCAASGRTISNYDMAWSRQAPGKEREFVARISGSGDRTDYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAIYYCQIQDFRSPDFWSQGTQVTVSS(配列番号67);
R1CHCL82
QVQLVESGGESVQAGGSLRLSCAASGRTISNYDMAWSRQAPGKEREFVARISGSGDRTDYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAIYNCQTQIFGSPNFSGQGTQVTVSS(配列番号68);
R2CHCL3
QVQLVESGGGLVQAGDSLRLSCAASGRTFTTSLMQWHRQAPGKEREFVASITWSTGNTHYADSVKGRFTISRDNARNTVYLQMNSLKPEDTAIYTCRVLAIHGDYWGQGTQVTVSS(配列番号69);
R2CHCL69
DVQLVESGGGLVQAGDSLRLSCAASERNLRIYDMAWYRQAPGKEREYVAVISSSGDSTHYSDFVKGRFTISRDNAKNTVSLQMDSLKPEDTAFYYCNVNQIRQWPWGQGTQVTVSS(配列番号70);
R1CHCL56
QVQLVESGGGLVQAGDSLRLSCAASERNLRIYDMAWYRQAPGKEREYVAVISSSGDSTHYSDFVKGRFTISRDNAKNTVSLQMDSLKPEDTAFYYCNVNSIRQWPWGQGTQVTVSS(配列番号71);
R2CHCL32
QVQLVESGGGLVQAGDSLRLSCTASERNLRSYDMAWWRQAPGKEREYVAVITSSGDSTHYSDFVKGRFTISRDNAKNTVSLQMDSLKPEDTASYYCNVNAIRQWPWGQGTQVTVSS(配列番号72);
R2CHCL49
DVQLVESGGGSVQAGGSLRLSCAISGLTFSNYHMGWYRQAPGREREFVAQITWSDASIYYAGSVKGRFTISRDNVKNIVYLQIDNLKPEDTAIYYCDARKVGGPDYWGQGTQVTVSS(配列番号73);
R2CHCL53
QVQLVESGGGLVQAGGSLTLSCAISGLTFSSYHMGWYRQAPGREREFVAQITWSDTSIYYAGSVKGRFTISRDNVKNIVYLQIDNLKPEDTAIYYCDARKVGGPDYWGQGTQVTVSS(配列番号74);
R2CHCL22
DVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAISGLTFSRYHMGWYRQAPGREREFVAQITWSDGTTYYPGSVKGRFTISRDNARNTVYLQIDNLKPEDTAIYYCDARKVGGPDYWGQGTQVTVSS(配列番号75);
R2CHCL25
QVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCATSGLTLSSYYIAWYRQAPGREREFVAQIRWSDDSTYYPGSVKGRFTISRDNARNTVYLRMDNLKPEDTARYYCDARKVGGPDYWGQGTQVTVSS(配列番号76);
R2CHCL18
DVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCATSGLTFSSYYTGWYRQAPGREREFVAQISWSDDSTYYADSVKGRFTISRDNARNTVYLQMNNLKPGDTAIYYCDARKVGGPDYWGQGTQVTVSS(配列番号77);
R1CHCL23
DVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCATSGLTLSSYHMGWYRQAPGREREFVAQISWSDDSTYYADSVKGRFTISRDNARNTVYLQMNNLKPEDTAIYYCDARKVGGPDYWGQGTQVTVSS(配列番号78);
R1CHCL27
DVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGRTSSPYVTGWYRQTPGKEREPVATVSWGGVTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNALKPEDTAIYYCNVNTFGNVYWGQGTQVTVSS(配列番号79);
R2CHCL13
QVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSGYVMSWVRQAPGKGLEWVASIGSGGGYPSYTDSVEGRFTISRDNAKNTLYLLMDNLKPDDTAVYYCEMLGRRGQGTQVTVSS(配列番号80);
R2CHCL14
QVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSGYVMSWVRQAPGKGLEWVASIGSGGGYPSYTDSVEGRFTISRDNAKNTLYLQMNNLKPDDTAVYYCEMLGRRGQGTQVTVSS(配列番号81);
R2CHCL42
QVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSGYVMSWVRQAPGKGLEWVASIGSGGGYPSYTGSVEGRFTISRDNAKNTLYLLMNNLKPDDTAVYYCEMLGRRGQGTQVTVSS(配列番号82);
R2CHCL41
QVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSGYVMSWVRQAPGKGLEWVAHIGSGGGYPSYTDSVQGRFTISRDNAKNTLYLQMNNLKPEDTAVYYCEMLGRRGQGTQVTVSS(配列番号83);
R2CHCL94
QVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSGYVMTWVRQAPGKGLEWVAHIGSGGGHATYTDSVEGRFTISRDNAKNTLYLQMNNLKAEDTAVYYCEFLGRRGQGTQVTVSS(配列番号84);または
R2CHCL27
QVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSGYLMSWVRQAPGKGLEWVATIGSGGGITSYADSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMNNLKHEDTAVYYCETVIKRGQGTQVTVSS(配列番号85)。
種々の実施形態では、本発明は、本明細書に記載の本発明のClec9A結合物質の任意の天然のまたは合成の類似体、変異体、バリアント、アレル、同族体およびオーソログ(本明細書では、ひとまとめにして「類似体」と呼ぶ)の使用を意図する。種々の実施形態では、Clec9A結合物質のアミノ酸配列は、アミノ酸類似体、アミノ酸誘導体、またはその他の非古典的アミノ酸をさらに含む。
種々の実施形態では、Clec9A結合物質は、本明細書で開示の配列のいずれか1つに少なくとも60%同一である配列を含むターゲティング部分を含む。例えば、Clec9A結合物質は、本明細書で開示の配列のいずれかに少なくとも約60%、少なくとも約61%、少なくとも約62%、少なくとも約63%、少なくとも約64%、少なくとも約65%、少なくとも約66%、少なくとも約67%、少なくとも約68%、少なくとも約69%、少なくとも約70%、少なくとも約71%、少なくとも約72%、少なくとも約73%、少なくとも約74%、少なくとも約75%、少なくとも約76%、少なくとも約77%、少なくとも約78%、少なくとも約79%、少なくとも約80%、少なくとも約81%、少なくとも約82%、少なくとも約83%、少なくとも約84%、少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、または100%同一(例えば、本明細書で開示の配列のいずれか1つに約60%、または約61%、または約62%、または約63%、または約64%、または約65%、または約66%、または約67%、または約68%、または約69%、または約70%、または約71%、または約72%、または約73%、または約74%、または約75%、または約76%、または約77%、または約78%、または約79%、または約80%、または約81%、または約82%、または約83%、または約84%、または約85%、または約86%、または約87%、または約88%、または約89%、または約90%、または約91%、または約92%、または約93%、または約94%、または約95%、または約96%、または約97%、または約98%、約99%または約100%の配列同一性)である配列を含むターゲティング部分を含み得る。
種々の実施形態では、Clec9A結合物質は、本明細書で開示の配列のいずれか1つに関して1個または複数のアミノ酸変異を有するアミノ酸配列を含むターゲティング部分を含む。種々の実施形態では、Clec9A結合物質は、本明細書で開示の配列のいずれか1つに関して1個、または2個、または3個、または4個、または5個、または6個、または7個、または8個、または9個、または10個、または15個、または20個のアミノ酸変異を有するアミノ酸配列を含むターゲティング部分を含む。いくつかの実施形態では、1個または複数のアミノ酸変異は、置換、挿入、欠失、および切り詰めから独立に選択され得る。
いくつかの実施形態では、アミノ酸変異は、アミノ酸置換であり、保存的および/または非保存的置換を含み得る。
「保存的置換」は、例えば、関与するアミノ酸残基の極性、電荷、サイズ、溶解度、疎水性、親水性、および/または両親媒特性の類似性に基づいて行われ得る。20種の天然アミノ酸は、次の6つの標準的アミノ酸群に分類できる:(1)疎水性:Met、Ala、Val、Leu、Ile;(2)中性親水性:Cys、Ser、Thr;Asn、Gln;(3)酸性:Asp、Glu;(4)塩基性:His、Lys、Arg;(5)鎖配向に影響を与える残基:Gly、Pro;および(6)芳香族:Trp、Tyr、Phe。
本明細書で使用される場合、「保存的置換」は、あるアミノ酸の、上記6つの標準的アミノ酸群の同じ群内に記載の別のアミノ酸による交換として定義される。例えば、AspのGluによる交換は、そのように改変されたポリペプチド中で1つの負電荷を保持する。さらに、グリシンおよびプロリンは、それらのαヘリックスを破壊する能力に基づいて相互に置換され得る。
本明細書で使用される場合、「非保存的置換」は、あるアミノ酸の、上記6つの標準的アミノ酸群(1)~(6)の異なる群に記載の別のアミノ酸による交換として定義される。
種々の実施形態では、置換は非古典的アミノ酸も含んでよい。代表的非古典的アミノ酸としては、限定されないが、セレノシステイン、ピロールリジン、N-ホルミルメチオニンβ-アラニン、GABAおよびδ-アミノレブリン酸、4-アミノ安息香酸(PABA)、共通アミノ酸のD-異性体、2,4-ジアミノ酪酸、α-アミノイソ酪酸、4-アミノ酪酸、Abu、2-アミノ酪酸、γ-Abu、ε-Ahx、6-アミノヘキサン酸、Aib、2-アミノイソ酪酸、3-アミノプロピオン酸、オルニチン、ノルロイシン、ノルバリン、ヒドロキシプロリン、サルコシン、シトルリン、ホモシトルリン、システイン酸、t-ブチルグリシン、t-ブチルアラニン、フェニルグリシン、シクロヘキシルアラニン、β-アラニン、フルオロアミノ酸、βメチルアミノ酸などのデザイナーアミノ酸、C α-メチルアミノ酸、N α-メチルアミノ酸、およびアミノ酸類似体一般が挙げられる。
種々の実施形態では、アミノ酸変異は、ターゲティング部分のCDR(例えば、CDR1、CDR2またはCDR3領域)中であってよい。別の実施形態では、アミノ酸変化は、ターゲティング部分のフレームワーク領域(FR)(例えば、FR1、FR2、FR3、またはFR4領域)中であってよい。
アミノ酸配列の改変は、任意の当該技術分野において周知の技術、例えば、部位特異的変異誘発またはPCRベース変異誘発を用いて実現され得る。このような技術は、例えば、Sambrook et al.,Molecular Cloning:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Press,Plainview,N.Y.,1989 and Ausubel et al.,Current Protocols in Molecular Biology,John Wiley & Sons,New York,N.Y.,1989に記載されている。
種々の実施形態では、変異は、Clec9Aに特異的に結合する本発明のClec9A結合物質の能力を実質的に低下させない。種々の実施形態では、変異は、Clec9Aに特異的に結合する本発明のClec9A結合物質の能力を実質的に低下させず、かつClec9Aを機能的に調節する(例えば、部分的にまたは完全に中和する)こともない。
種々の実施形態では、ヒトClec9Aの完全長および/または成熟型および/またはアイソフォームおよび/またはスプライスバリアントおよび/またはフラグメントおよび/またはモノマーおよび/またはダイマー型および/または任意の他の天然のまたは合成の類似体、バリアント、または変異体(モノマー、ダイマー型を含む)に対する本発明のClec9A結合物質の結合親和性は、平衡解離定数(K)により特徴付けられ得る。種々の実施形態では、Clec9A結合物質は、ヒトClec9Aの完全長および/または成熟型および/またはアイソフォームおよび/またはスプライスバリアントおよび/またはフラグメントおよび/または任意の他の天然のまたは合成の類似体、バリアント、または変異体(モノマーおよび/またはダイマー型を含む)に約1uM、約900nM、約800nM、約700nM、約600nM、約500nM、約400nM、約300nM、約200nM、約100nM、約90nM、約80nM、約70nM、約60nM、約50nM、約40nM、約30nM、約20nM、約10nM、または約5nM、または約1nM未満のKで結合するターゲティング部分を含む。
種々の実施形態では、Clec9A結合物質は、目的の抗原、すなわち、Clec9Aを結合するが機能的に調節(例えば、部分的にまたは完全に中和)しないターゲティング部分を含む。例えば、種々の実施形態では、Clec9A結合物質のターゲティング部分は、単に抗原を標的とするが、抗原が有する生物学的作用を実質的に機能的に調節(例えば、部分的にまたは完全に阻害するまたは中和する)しない。種々の実施形態では、Clec9A結合物質のターゲティング部分は、その生物活性にとって重要な抗原部位(例えば、抗原の活性部位)から物理的に離れたエピトープを結合する。
顕著な機能調節のないこのような結合は、本発明のClec9A結合物質がエフェクター抗原を介して必要な部位に活性免疫細胞を直接的にまたは間接的にリクルートするのに用いられる方法を含む、本発明の種々の実施形態で使用される。例えば、種々の実施形態では、本発明のClec9A結合物質は、腫瘍を縮小させるまたは取り除く方法において、腫瘍細胞にClec9Aを介して直接的または間接的に樹状細胞をリクルートするために使用され得る(例えば、Clec9A結合物質は、抗Clec9A抗原認識ドメインを有するターゲティング部分および腫瘍抗原または受容体に対する認識ドメイン(例えば、抗原認識ドメイン)を有するターゲティング部分を含み得る)。このような実施形態では、樹状細胞を直接的または間接的にリクルートするがClec9A活性を機能的に調節または中和しないことが望ましい。これらの実施形態では、Clec9Aシグナル伝達は、腫瘍を縮小させるまたは取り除く作用の重要な部分である。
いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質は、樹状細胞による抗原提示を強化する。例えば、種々の実施形態では、本発明のClec9A結合物質は、腫瘍細胞にClec9Aを介して樹状細胞を直接または間接的にリクルートし、そこで腫瘍抗原が次いで取り込まれ、かつ強力な体液性および細胞傷害性T細胞応答の誘導のために、樹状細胞上に提示される。
他の実施形態では(例えば、自己免疫または神経変性疾患の処置に関連して)、Clec9A結合物質は、目的の抗原、すなわち、Clec9Aを結合し中和するターゲティング部分を含む。例えば、種々の実施形態では、本発明の方法は、例えば免疫応答を低減させるために、Clec9Aのシグナル伝達または発現を阻害または低減し得る。
本発明のClec9A結合物質を含む治療薬
シグナル伝達物質とのキメラおよび融合体
種々の実施形態では、本発明のClec9A結合物質は、1種または複数のシグナル伝達物質とのキメラまたは融合体の一部である。したがって、本発明は、例えば、Clec9Aに対するターゲティング部分および1種または複数のシグナル伝達物質を含むキメラまたは融合タンパク質を提供する。
種々の実施形態では、シグナル伝達物質は、1個または複数のその受容体に対する低減された親和性または活性を有するように改変され、それによりキメラまたは融合タンパク質の活性(アゴニズムまたはアンタゴニズムを含む)の減弱化を可能とし、および/または非特異的シグナル伝達または望ましくない隔離を防止する。種々の実施形態では、シグナル伝達物質はその野生型の形態で拮抗的であり、そのアンタゴニスト活性を弱める1個または複数の変異を有する。種々の実施形態では、シグナル伝達物質は、1個または複数の変異に起因して拮抗的であり、例えば、作動性シグナル伝達物質は拮抗的シグナル伝達物質に変換され、このような変換されたシグナル伝達物質は、場合により、そのアンタゴニスト活性を弱める1個または複数の変異も有する(例えば、その全内容が参照により本明細書に組み込まれる、国際公開第2015/007520号に記載のように)。
したがって、種々の実施形態では、シグナル伝達物質は、1個または複数の変異を有する改変された(例えば、変異した)型のシグナル伝達物質である。種々の実施形態では、改変(例えば、変異)は、改変シグナル伝達物質が、非改変型または非変異型、すなわち野生型形態のシグナル伝達物質に比べて(例えば、野生型形態対改変または変異形態で同じシグナル伝達物質を比較して)、低減された結合親和性、低減された内在性活性、および低減された特定の生物活性の1種または複数などの1種または複数の弱められた活性を有することを可能にする。いくつかの実施形態では、結合または親和性を弱めるまたは低減する変異は、結合または活性を実質的に低下または除去する変異を含む。いくつかの実施形態では、結合または親和性を弱めるまたは低減する変異は、結合または活性を実質的に低下または除去する変異とは異なる。結果として、種々の実施形態では、変異は、シグナル伝達物質が、非変異型、すなわち、野生型シグナル伝達物質に比べて(例えば、野生型形態対改変(例えば、変異)形態で同じシグナル伝達物質を比較して)向上した安全性、例えば、低減された全身性毒性、低減された副作用、および低減されたオフターゲット効果を有することを可能にする。
本明細書に記載のように、物質は、1個または複数の改変、例えば、変異により、向上した安全性を有し得る。種々の実施形態では、向上した安全性は、本キメラタンパク質ガより低い毒性(例えば、全身性毒性および/または組織/器官関連毒性);および/または低減されたまたは実質的に除去された副作用;および/または高められた耐容性、低減されたまたは実質的に除去された有害事象;および/または低減されたまたは実質的に除去された;および/または拡大された治療濃度域をもたらすことを意味する。
種々の実施形態では、シグナル伝達物質は、1個または複数のその受容体に対する結合親和性または活性を低減する1個または複数の変異を有するように改変される。いくつかの実施形態では、シグナル伝達物質は、受容体に対する結合親和性または活性を実質的に低減または除去する1個または複数の変異を有するように改変される。いくつかの実施形態では、野生型シグナル伝達物質により与えられる活性は、受容体に対するアゴニズム(例えば、治療の部位での細胞効果の活性化)である。例えば、野生型シグナル伝達物質は、その受容体を活性化し得る。このような実施形態では、変異は、受容体に対する低減されたまたは除去された活性化作用を有するように改変されたシグナル伝達物質をもたらす。例えば、変異は、標的細胞に低減された活性化シグナルを送るように改変されたシグナル伝達物質をもたらし得る、または活性化シグナルが除去され得る。いくつかの実施形態では、野生型シグナル伝達物質により与えられる作用は、受容体に対するアンタゴニズム(例えば、治療の部位での細胞効果の遮断または抑制)である。例えば、野生型シグナル伝達物質は、受容体をアンタゴナイズするまたは阻害し得る。これらの実施形態では、変異は、受容体に対するを低減されたまたは除去されたアンタゴナイズ活性を有するように改変されたシグナル伝達物質をもたらす。例えば、変異は、標的細胞に低減された阻害シグナルを送るように改変されたシグナル伝達物質をもたらし得る、または阻害シグナルが除去され得る。種々の実施形態では、シグナル伝達物質は、1個または複数の変異に起因して拮抗的であり、例えば、作動性シグナル伝達物質は拮抗的シグナル伝達物質に変換され(例えば、その全内容が参照により本明細書に組み込まれる、国際公開第2015/007520号に記載のように)かつ、このような変換されたシグナル伝達物質は、場合により、1個または複数のその受容体に対するその結合親和性または活性を低減する、または1個または複数のその受容体に対し結合親和性または活性を実質的に低減または除去する1個または複数の変異も有する。
いくつかの実施形態では、受容体に対し低減された親和性または活性は、本明細書に記載の1つまたは複数のターゲティング部分(例えば、Clec9Aに対するターゲティング部分または本明細書に記載のいずれか他のターゲティング部分)との結合により回復可能である。他の実施形態では、受容体に対し低減された親和性または活性は、1つまたは複数のターゲティング部分の活性により実質的に回復可能でない。
種々の実施形態では、本発明のキメラタンパク質は、それらのシグナル伝達物質が受容体に対する結合親和性または活性を弱めるまたは除去する変異を有するという理由で、オフターゲット効果を低減させる。種々の実施形態では、副作用におけるこの低減は、例えば、野生型シグナル伝達物質と比べてが観察される。種々の実施形態では、シグナル伝達物質は、標的細胞に対し活性である。理由は、ターゲティング部分(単数または複数)が、実質的な活性化に必要とされる欠損した/不十分な結合(例えば、限定されないが、および/または結合力)を補償するためである。種々の実施形態では、改変シグナル伝達物質は、治療作用部位への途中では実質的に不活性であり、特異的に標的とされる細胞型に対してその効果を実質的に有し、このことは望ましくない副作用を大きく低減する。
いくつかの実施形態では、シグナル伝達物質は、1つの受容体(すなわち、治療受容体)に対する結合または親和性を弱めるまたは低減させる1個または複数の変異および第2の受容体に対する結合または活性を実質的に低減または除去する1個または複数の変異を含み得る。このような実施形態では、これらの変異は、同じまたは異なる位置にあってよい(すなわち、同じ変異または複数の変異)。いくつかの実施形態では、1つの受容体に対し結合および/または活性を低減する変異(単数または複数)は、別の受容体に対し実質的に低減または除去する変異(単数または複数)とは異なる。いくつかの実施形態では、1つの受容体に対し結合および/または活性を低減する変異(単数または複数)は、別の受容体に対し実質的に低減または除去する変異(単数または複数)と同じである。いくつかの実施形態では、本キメラタンパク質は、治療受容体に対し結合および/または活性を弱めしたがってより制御された狙い通りの治療効果(例えば、野生型シグナル伝達物質に比較して)を可能にする変異および、別の受容体に対する結合および/または活性を実質的に低減または除去ししたがって副作用を低減する(例えば、野生型シグナル伝達物質に比べて)変異の両方を有する改変シグナル伝達物質を有する。
いくつかの実施形態では、結合または活性の実質的な低減または除去は、ターゲティング部分(Clec9Aに対するターゲティング部分または本明細書に記載の任意のその他のターゲティング部分)を用いて実質的に回復可能ではない。いくつかの実施形態では、結合または活性の実質的な低減または除去は、ターゲティング部分を用いて回復可能である。種々の実施形態では、第2の受容体に対する結合または活性の実質的な低減または除去は、他の受容体により媒介される有害作用も防止し得る。あるいは、または加えて、他の受容体に対する結合または活性の実質的な低減または除去は、治療作用の部位から離れて治療キメラタンパク質の低減されたまたは排除された隔離があるので、治療効果を改善させる。例えば、いくつかの実施形態では、これは、他の受容体での損失を補償する高用量の本キメラタンパク質の必要性をなくす。用量を低減するこのような能力は、副作用のより低い可能性をさらにもたらす。
種々の実施形態では、改変シグナル伝達物質は、シグナル伝達物質が、1個または複数のその受容体に対し、低減された、実質的に低減された、または除去された親和性、例えば、結合(例えば、K)および/または活性化(例えば、改変シグナル伝達物質がその受容体のアゴニストである場合、例えば、Kおよび/またはEC50として測定可能な)および/または阻害(例えば、改変シグナル伝達物質がその受容体のアンタゴニストである場合、例えば、Kおよび/またはIC50として測定可能な)を有するようにさせる1個または複数の変異を含む。種々の実施形態では、免疫調節薬の受容体に対する低減された親和性は、活性の減弱化(アゴニズムまたはアンタゴニズムを含む)を可能にする。このような実施形態では、改変シグナル伝達物質は、野生型シグナル伝達物質に比較して、約1%、または約3%、約5%、約10%、約15%、約20%、約25%、約30%、約35%、約40%、約45%、約50%、約60%、約65%、約70%、約75%、約80%、約85%、約90%、約95%、または約10%~20%、約20%~40%、約50%、約40%~60%、約60%~80%、約80%~100%の受容体に対する親和性を有する。いくつかの実施形態では、結合親和性は、野生型シグナル伝達物質に比べて、少なくとも約2倍低い、約3倍低い、約4倍低い、約5倍低い、約6倍低い、約7倍低い、約8倍低い、約9倍低い、少なくとも約10倍低い、少なくとも約15倍低い、少なくとも約20倍低い、少なくとも約25倍低い、少なくとも約30倍低い、少なくとも約35倍低い、少なくとも約40倍低い、少なくとも約45倍低い、少なくとも約50倍低い、少なくとも約100倍低い、少なくとも約150倍低い、または約10~50倍低い、約50~100倍低い、約100~150倍低い、約150~200倍低い、または200倍超低い。
キメラタンパク質が1つの受容体に対し結合を低減しかつ第2の受容体に対し結合を実質的に低減または除去する変異を有するいくつかの実施形態では、1つの受容体に対する改変シグナル伝達物質の結合親和性の減弱または低減は、他の受容体に対する親和性の実質的な低減または除去より小さい。いくつかの実施形態では、1つの受容体に対する改変シグナル伝達物質の結合親和性の減弱または低減は、他の受容体に対する親和性の実質的低減または除去よりも、約1%、または約3%、約5%、約10%、約15%、約20%、約25%、約30%、約35%、約40%、約45%、約50%、約60%、約65%、約70%、約75%、約80%、約85%、約90%、または約95%だけ小さい。種々の実施形態では、実質的な低減または除去は、減弱または低減よりも大きい結合親和性および/または活性の低減を指す。
種々の実施形態では、改変シグナル伝達物質は、例えば、野生型シグナル伝達物質に比べて、シグナル伝達物質の内在性活性を、約75%、または約70%、または約60%、または約50%、または約40%、または約30%、または約25%、または約20%、または約10%、または約5%、または約3%、または約1%に低減する1個または複数の変異を含む。
いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、シグナル伝達物質が、その(それらの)受容体(単一または複数)に対するターゲティング部分(単一または複数)の結合親和性より低い、その受容体に対する低下された親和性を有するようにさせる1個または複数の変異を含む。いくつかの実施形態では、この結合親和性の差異は、同じ細胞上のシグナル伝達物質/受容体とターゲティング部分/受容体との間に存在する。いくつかの実施形態では、この結合親和性の差異は、シグナル伝達物質、例えば、変異シグナル伝達物質が、局在化された狙い通りの効果を有し、かつ野生型シグナル伝達物質で観察される副作用の根底にあるオフターゲット効果を最小化するのを可能にする。いくつかの実施形態では、この結合親和性は、少なくとも約2倍、または少なくとも約5倍、または少なくとも約10倍、または少なくとも約15倍低い、または少なくとも約25倍、または少なくとも約50倍低い、または少なくとも約100倍、または少なくとも約150倍低い。
受容体結合活性は、当該技術分野において既知の方法を使用して測定され得る。例えば、親和性および/または結合活性は、スキャッチャードプロット分析および結合データのコンピューターフィッティング(例えば、Scatchard,1949)によりまたはBrechtら(1993)により記載のように、フロースルー条件下で反射型干渉分光法により評価され得る。これらの文献の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。
種々の実施形態では、シグナル伝達物質は、免疫調節薬、例えば、インターロイキン、インターフェロン、および腫瘍壊死因子の1種または複数である。
いくつかの実施形態では、シグナル伝達物質は、インターロイキンまたは改変インターロイキンであり、例えば、IL1;IL2;IL3;IL4;IL5;IL6;IL7;IL8;IL9;IL10;IL11;IL12;IL13;IL14;IL15;IL16;IL17;IL18;IL19;IL20;IL21;IL22;IL23;IL24;IL25;IL26;IL27;IL28;IL29;IL30;IL31;IL32;IL33;IL35;IL36またはそのフラグメント、バリアント、類似体、またはファミリーメンバーを含む。インターロイキンは、リンパ球、単球、およびマクロファージにより合成される多機能サイトカイン群である。既知の機能は、免疫細胞(例えば、ヘルパーT細胞、B細胞、好酸球、およびリンパ球)の増殖の刺激、好中球およびTリンパ球の遊走作用、および/またはインターフェロンの阻害を含む。インターロイキン活性は、当該技術分野において既知のアッセイを使用して測定できる(Matthews et al.,in Lymphokines and Interferons:A Practical Approach,Clemens et al.,eds,IRL Press,Washington,D.C.1987,pp.221-225;and Orencole & Dinarello(1989)Cytokine 1,14-20)。
いくつかの実施形態では、シグナル伝達物質は、インターフェロンまたはインターフェロンI、II、およびIII型などの改変型のインターフェロンである。インターフェロンの例としては、例えば、インターフェロンα-1、2、4、5、6、7、8、10、13、14、16、17、および21、インターフェロンβおよびインターフェロンγ、インターフェロンκ、インターフェロンε、インターフェロンτ、およびインターフェロンωが挙げられる。
いくつかの実施形態では、シグナル伝達物質は、腫瘍壊死因子(TNF)または腫瘍壊死因子(TNF)の改変型またはTNFファミリーのタンパク質であり、限定されないが、TNFα、TNFβ、LTβ、CD40L、CD27L、CD30L、FASL、4-1BBL、OX40L、およびTRAILを含む。
本明細書に記載の野生型シグナル伝達物質のアミノ酸配列は、当該技術分野において周知である。したがって、種々の実施形態では、改変シグナル伝達物質は、本明細書に記載のシグナル伝達物質の既知の野生型アミノ酸配列との少なくとも約60%、または少なくとも約61%、または少なくとも約62%、または少なくとも約63%、または少なくとも約64%、または少なくとも約65%、または少なくとも約66%、または少なくとも約67%、または少なくとも約68%、または少なくとも約69%、または少なくとも約70%、または少なくとも約71%、または少なくとも約72%、または少なくとも約73%、または少なくとも約74%、または少なくとも約75%、または少なくとも約76%、または少なくとも約77%、または少なくとも約78%、または少なくとも約79%、または少なくとも約80%、または少なくとも約81%、または少なくとも約82%、または少なくとも約83%、または少なくとも約84%、または少なくとも約85%、または少なくとも約86%、または少なくとも約87%、または少なくとも約88%、または少なくとも約89%、または少なくとも約90%、または少なくとも約91%、または少なくとも約92%、または少なくとも約93%、または少なくとも約94%、または少なくとも約95%、または少なくとも約96%、または少なくとも約97%、または少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性(例えば、約60%、または約61%、または約62%、または約63%、または約64%、または約65%、または約66%、または約67%、または約68%、または約69%、または約70%、または約71%、または約72%、または約73%、または約74%、または約75%、または約76%、または約77%、または約78%、または約79%、または約80%、または約81%、または約82%、または約83%、または約84%、または約85%、または約86%、または約87%、または約88%、または約89%、または約90%、または約91%、または約92%、または約93%、または約94%、または約95%、または約96%、または約97%、または約98%、または約99%の配列同一性)を有するアミノ酸配列を含む。
種々の実施形態では、改変シグナル伝達物質は、本明細書に記載のシグナル伝達物質のいずれかのアミノ酸配列との少なくとも約60%、または少なくとも約61%、または少なくとも約62%、または少なくとも約63%、または少なくとも約64%、または少なくとも約65%、または少なくとも約66%、または少なくとも約67%、または少なくとも約68%、または少なくとも約69%、または少なくとも約70%、または少なくとも約71%、または少なくとも約72%、または少なくとも約73%、または少なくとも約74%、または少なくとも約75%、または少なくとも約76%、または少なくとも約77%、または少なくとも約78%、または少なくとも約79%、または少なくとも約80%、または少なくとも約81%、または少なくとも約82%、または少なくとも約83%、または少なくとも約84%、または少なくとも約85%、または少なくとも約86%、または少なくとも約87%、または少なくとも約88%、または少なくとも約89%、または少なくとも約90%、または少なくとも約91%、または少なくとも約92%、または少なくとも約93%、または少なくとも約94%、または少なくとも約95%、または少なくとも約96%、または少なくとも約97%、または少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性(例えば、約60%、または約61%、または約62%、または約63%、または約64%、または約65%、または約66%、または約67%、または約68%、または約69%、または約70%、または約71%、または約72%、または約73%、または約74%、または約75%、または約76%、または約77%、または約78%、または約79%、または約80%、または約81%、または約82%、または約83%、または約84%、または約85%、または約86%、または約87%、または約88%、または約89%、または約90%、または約91%、または約92%、または約93%、または約94%、または約95%、または約96%、または約97%、または約98%、または約99%の配列同一性)を有するアミノ酸配列を含む。
種々の実施形態では、改変シグナル伝達物質は、1個または複数のアミノ酸変異を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、1個または複数のアミノ酸変異は、置換、挿入、欠失、および切り詰めから独立に選択され得る。いくつかの実施形態では、アミノ酸変異はアミノ酸置換であり、本明細書の他の場所で記載のように、保存的置換および/または非保存的置換を含み得る。
種々の実施形態では、本明細書の他の場所で記載のように、置換は非古典的アミノ酸も含んでよい。
本明細書に記載のように、改変シグナル伝達物質は、1個または複数の受容体に対し親和性および/または活性に影響を与える変異を有する。任意のシグナル伝達物質の受容体は、本明細書に記載のように当技術分野において既知である。
受容体に対し低減された親和性および/または活性(例えば、アゴニスト活性)をもたらす変異の例は、国際公開第2013/10779号(例えば、インターフェロンに関して)、国際公開第2015/007542号(例えば、インターロイキンに関して)、および国際公開第2015/007903号(例えば、TNFに関して)で見出され、これらのそれぞれの全内容は参照により本明細書に組み込まれる。受容体に対し親和性および/または活性(例えば、アゴニスト活性)を低減する変異の例は、国際公開第2015/007520号で見出され、この全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はインターフェロンαである。このような実施形態では、改変IFNα物質は、IFNα/β受容体(IFNAR)、すなわち、IFNAR1および/またはIFNAR2鎖に対し、低減された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変IFNα物質は、IFNα/β受容体(IFNAR)、すなわち、IFNAR1および/またはIFNAR2鎖に対し、実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。変異型のインターフェロンαは、当業者に既知である。ある例示的実施形態では、改変シグナル伝達物質は、下記のアミノ酸配列を有するアレル型のIFNα2aである:
IFNα2a:
CDLPQTHSLGSRRTLMLLAQMRKISLFSCLKDRHDFGFPQEEFGNQFQKAETIPVLHEMIQQIFNLFSTKDSSAAWDETLLDKFYTELYQQLNDLEACVIQGVGVTETPLMKEDSILAVRKYFQRITLYLKEKKYSPCAWEVVRAEIMRSFSLSTNLQESLRSKE(配列番号86)。
ある例示的実施形態では、改変シグナル伝達物質は、下記のアミノ酸配列(これはアミノ酸位置23でIFNα2aと異なる)を有するアレル型のIFNα2bである:
IFNα2b
CDLPQTHSLGSRRTLMLLAQMRRISLFSCLKDRHDFGFPQEEFGNQFQKAETIPVLHEMIQQIFNLFSTKDSSAAWDETLLDKFYTELYQQLNDLEACVIQGVGVTETPLMKEDSILAVRKYFQRITLYLKEKKYSPCAWEVVRAEIMRSFSLSTNLQESLRSKE(配列番号87)。
いくつかの実施形態では、上記IFNα2変異体(IFNα2aまたはIFNα2b)は、位置144~154、例えば、アミノ酸位置148、149および/または153にて、1個または複数のアミノ酸で変異される。いくつかの実施形態では、IFNα2変異体は、L153A、R149A、およびM148Aから選択される1個または複数の変異を含む。このような変異体は、例えば、国際公開第2013/107791号およびPiehlerら、(2000)J.Biol.Chem,275:40425-33に記載され、これらの全内容は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、IFNα2変異体は、IFNAR1に対する低減された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、IFNα2変異体は、国際公開第2010/030671号に記載のように、F64A、N65A、T69A、L80A、Y85A、およびY89Aから選択される1個または複数の変異を含み、この特許の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、IFNα2変異体は、国際公開第2008/124086号に記載のように、K133A、R144A、R149A、およびL153Aから選択される1個または複数の変異を含み、この特許の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、IFNα2変異体は、国際公開第2015/007520号および国際公開第2010/030671号に記載のように、R120EおよびR120E/K121Eから選択される1個または複数の変異を含み、これらの特許の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。このような実施形態では、前記IFNα2変異体は、野生型IFNα活性2をアンタゴナイズする。このような実施形態では、上記変異体IFNα2はIFNAR1に対する低減された親和性および/または活性を有するが、IFNAR2に対する活性は保持される。
いくつかの実施形態では、ヒトIFNα2変異体は、(1)R120EおよびR120E/K121Eから選択される1個または複数の変異(理論に束縛されることを望むものではないが、これらはアンタゴニスト効果を作り出す)、および(2)K133A、R144A、R149A、およびL153Aから選択される1個または複数の変異(理論に束縛されることを望むものではないが、これらは、例えば、IFNAR2に対する減弱化効果を可能にする)を含む。ある実施形態では、ヒトIFNα2変異体は、R120EおよびL153Aを含む。
いくつかの実施形態では、ヒトIFNα2変異体は、国際公開第2013/059885号に開示のように、L15A、A19W、R22A、R23A、L26A、F27A、L30A、L30V、K31A、D32A、R33K、R33A、R33Q、H34A、D35A、Q40A、D114R、L117A、R120A、R125A、K134A、R144A、A145G、A145M、M148A、R149A、S152A、L153A、およびN156Aから選択される1個または複数の変異を含み、この特許の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、ヒトIFNα2変異体は、国際公開第2013/059885号で開示のように、変異H57Y、E58N、Q61S、および/またはL30Aを含む。いくつかの実施形態では、ヒトIFNα2変異体は、国際公開第2013/059885号で開示のように、変異H57Y、E58N、Q61S、および/またはR33Aを含む。いくつかの実施形態では、ヒトIFNα2変異体は、国際公開第2013/059885号で開示のように、変異H57Y、E58N、Q61S、および/またはM148Aを含む。いくつかの実施形態では、ヒトIFNα2変異体は、国際公開第2013/059885号で開示のように、変異H57Y、E58N、Q61S、および/またはL153Aを含む。いくつかの実施形態では、ヒトIFNα2変異体は、国際公開第2013/059885号で開示のように、変異N65A、L80A、Y85A、および/またはY89Aを含む。いくつかの実施形態では、ヒトIFNα2変異体は、国際公開第2013/059885号で開示のように、変異N65A、L80A、Y85A、Y89A、および/またはD114Aを含む。
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はインターフェロンβである。このような実施形態では、改変インターフェロンβ物質は、IFNα/β受容体(IFNAR)、すなわち、IFNAR1および/またはIFNAR2鎖に対し、低減された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変IFNβ物質は、IFNα/β受容体(IFNAR)、すなわち、IFNAR1および/またはIFNAR2鎖に対し、実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はインターフェロンγである。このような実施形態では、改変インターフェロンγ物質は、インターフェロンガンマ受容体(IFNGR)、すなわち、IFNGR1および/またはIFNGR2鎖に対し、低減された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変インターフェロンγ物質は、インターフェロンガンマ受容体(IFNGR)、すなわち、IFNGR1および/またはIFNGR2鎖に対し、実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はTNFαである。TNFは、細胞増殖、分化、アポトーシス、腫瘍形成、ウイルス複製、自己免疫、免疫細胞機能および輸送、炎症、ならびに敗血性ショックの調節を含む、多くの多様な機能を有する多面的サイトカインである。それは、標的細胞上の2つの別々の膜受容体:TNFR1(p55)およびTNFR2(p75)に結合する。TNFR1は非常に広範な発現パターンを示すが、TNFR2はリンパ球、Treg、内皮細胞、特定のニューロン、ミクログリア、心筋細胞および間葉系幹細胞の特定の集団上で選択的に発現される。全く別々の生物学的経路が受容体活性化に応答して活性化されるが、若干の重なり合いも存在する。一般原則として、理論に束縛されることを望むものではないが、TNFR1シグナル伝達はアポトーシス(細胞死)の誘導に関連し、TNFR2シグナル伝達は細胞生存シグナルの活性化に関連する(例えば、NFκB経路の活性化)。TNFの投与は、全身的毒性であり、これは主にTNFR1の関与のためである。しかし、TNFR2の活性化もまた多様な作用に関連し、かつTNFR1と同様に、TNF系治療薬の開発においては、TNFターゲティングおよび活性に対する制御が重要であることに留意されたい。
いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、TNFR1および/またはTNFR2に対する低減された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、TNFR1および/またはTNFR2に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。TNFR1はほとんどの組織で発現され、かつ細胞死シグナル伝達に関与するが、対照的に、TNFR2は細胞生存シグナルに関与する。したがって癌の処置法に関する実施形態では、改変シグナル伝達物質は、TNFR1に対する低減された親和性および/または活性および/またはTNFR2に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。これらの実施形態では、キメラタンパク質は、アポトーシスが望ましい細胞、例えば腫瘍細胞または腫瘍血管内皮細胞に標的され得る。例えば、神経変性障害の処置のためのニューロン新生における、細胞生存を促進する方法に関する実施形態では、改変シグナル伝達物質は、TNFR2に対する低減された親和性および/または活性および/またはTNFR1に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。言い方を変えれば、本キメラタンパク質は、いくつかの実施形態では、死シグナルまたは生存シグナルのどちらかを優先できる改変TNFα物質を含む。
いくつかの実施形態では、キメラタンパク質は、TNFR1に対する低減された親和性および/または活性および/またはTNFR2に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する改変TNFを有する。このようなキメラは、いくつかの実施形態では、野生型TNFおよび/またはTNFR1に対する低減された親和性および/または活性をもたらす変異(単一または複数)のみを有するキメラに比べて、より強力なアポトーシスの誘導因子である。このようなキメラは、いくつかの実施形態では、腫瘍細胞死または腫瘍血管内皮細胞死の誘導に使用される(例えば、癌の処置において)。また、いくつかの実施形態では、これらのキメラは、例えば、TNFR2を介してTreg細胞の活性化を回避または低減し、したがってin vivoでTNFR1介在性抗腫瘍活性をさらに支持する。
いくつかの実施形態では、キメラタンパク質は、TNFR2に対する低減された親和性および/または活性および/またはTNFR1に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する改変TNFを有する。このようなキメラは、いくつかの実施形態では、いくつかの細胞型での細胞生存のより強力な活性化因子であり、これは種々の疾患における具体的治療目的であり得、限定されないが、ニューロン新生の刺激を含む。さらに、このようなTNFR2選択キメラはまた、自己免疫疾患(例えば、クローン病、糖尿病、MS、大腸炎など、および本明細書に記載の多くの他の疾患)の処置において有用である。いくつかの実施形態では、キメラは自己反応性T細胞に標的される。いくつかの実施形態では、キメラは、Treg活性化および細胞傷害性T細胞の間接的抑制を促進する。
いくつかの実施形態では、キメラタンパク質は、例えば、TNFR2の活性化および/またはTNFR1の回避により自己反応性T細胞の死をもたらす(例えば、TNFR2に対する低減された親和性および/または活性および/またはTNFR1に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する改変TNF)。理論に束縛されることを望むものではないが、これらの自己反応性T細胞は、例えばNFκB経路活性/シグナル伝達の変化により変更されたそれらのアポトーシス/生存シグナルを有する。
いくつかの実施形態では、TNFR2ベースキメラは、種々の自己免疫疾患、特に、心臓疾患、脱髄性および神経変性障害、および感染症を含む、疾患における追加の治療用途を有する。
ある実施形態では、野生型TNFαは、下記のアミノ酸配列を有する:
TNFα
VRSSSRTPSDKPVAHVVANPQAEGQLQWLNRRANALLANGVELRDNQLVVPSEGLYLIYSQVLFKGQGCPSTHVLLTHTISRIAVSYQTKVNLLSAIKSPCQRETPEGAEAKPWYEPIYLGGVFQLEKGDRLSAEINRPDYLDFAESGQVYFGIIAL(配列番号88)。
このような実施形態では、改変TNFα物質は、1つまたは複数のアミノ酸位置29、31、32、84、85、86、87、88、89、145、146および147に変異を有し、これは低減された受容体結合親和性を有する改変TNFαをもたらす。例えば、米国特許第7,993,636号を参照されたい。この特許の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、改変TNFα部分は、全内容が参照により本明細書に組み込まれる、国際公開第2015/007903号に記載のように、1つまたは複数のアミノ酸位置R32、N34、Q67、H73、L75、T77、S86、Y87、V91、I97、T105、P106、A109、P113、Y115、E127、N137、D143、およびA145に変異を有する(ジェンバンク受入番号BAG70306、バージョンBAG70306.1 Gl:197692685、ヒトTNF配列に従ってナンバリング)。いくつかの実施形態では、改変TNFα部分は、R32G、N34G、Q67G、H73G、L75G、L75A、L75S、T77A、S86G、Y87Q、Y87L、Y87A、Y87F、V91G、V91A、I97A、I97Q、I97S、T105G、P106G、A109Y、P113G、Y115G、Y115A、E127G、N137G、D143N、A145GおよびA145Tから選択される置換変異を有する。ある実施形態では、TNFα部分は、Y87Q、Y87L、Y87A、およびY87Fから選択される変異を有する。別の実施形態では、TNFα部分は、I97A、I97Q、およびI97Sから選択される変異を有する。さらなる実施形態では、TNFα部分は、Y115AおよびY115Gから選択される変異を有する。
いくつかの実施形態では、改変TNFα物質は、国際公開第2008/124086号に記載のように、N39Y、S147Y、およびY87Hから選択される1個または複数の変異を含み、この特許の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、改変ヒトTNFα部分は、国際出願第PCT/IB2016/001668号に記載の受容体選択性をもたらし、この特許の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、TNFに対する変異は、TNFR1選択的である。いくつかの実施形態では、TNFR1選択的であるTNFに対する変異は、1つまたは複数の位置R32、S86、およびE146にある。いくつかの実施形態では、TNFR1選択的であるTNFに対する変異は、R32W、S86T、およびE146Kの1個または複数である。いくつかの実施形態では、TNFR1選択的であるTNFに対する変異は、R32W、S32W/S86T、R32W/E146KおよびE146Kの1個または複数である。いくつかの実施形態では、TNFに対する変異は、TNFR2選択的である。いくつかの実施形態では、TNFR2選択的であるTNFに対する変異は、1個または複数の位置A145、E146、およびS147にある。いくつかの実施形態では、TNFR2選択的であるTNFに対する変異は、A145T、A145R、E146D、およびS147Dの1個または複数である。いくつかの実施形態では、TNFR2選択的であるTNFに対する変異は、A145R、A145T/S147D、およびA145T/E146D/S147Dの1個または複数である。
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はTNFβである。TNFβは、ホモトリマーまたはLTβ(LTα1β2)とヘテロトリマーを形成できる。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、TNFR1および/またはTNFR2および/またはヘルペスウイルス侵入メディエーター(HEVM)および/またはLTβRに対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。
ある実施形態では、野生型TNFβは、下記のアミノ酸配列を有する:
TNFβ
LPGVGLTPSAAQTARQHPKMHLAHSNLKPAAHLIGDPSKQNSLLWRANTDRAFLQDGFSLSNNSLLVPTSGIYFVYSQVVFSGKAYSPKATSSPLYLAHEVQLFSSQYPFHVPLLSSQKMVYPGLQEPWLHSMYHGAAFQLTQGDQLSTHTDGIPHLVLSPSTVFFGAFAL(配列番号89)。
このような実施形態では、改変TNFβ物質は、1つまたは複数のアミノ酸位置106~113に変異を含み得、これはTNFR2に対する低減された受容体結合親和性を有する改変TNFβをもたらす。ある実施形態では、改変シグナル伝達物質は、アミノ酸位置106~113に1個または複数の置換変異を有する。例示的実施形態では、置換変異は、Q107E、Q107D、S106E、S106D、Q107R、Q107N、Q107E/S106E、Q107E/S106D、Q107D/S106E、およびQ107D/S106Dから選択される。別の実施形態では、改変シグナル伝達物質は、位置106~113に、約1~約3個のアミノ酸の挿入を有する。
いくつかの実施形態では、改変物質は、国際公開第2015/007903号に記載のように、単鎖トリマー型であってよいTNFファミリーメンバー(例えば、TNFα、TNFβ)であり、この特許の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、改変物質は、TNFファミリーメンバー(例えば、TNFα、TNFβ)であり、これはTNFR1に対し、低減された親和性および/または活性、すなわちアンタゴニスト活性(例えば、天然のアンタゴニスト活性または1個または複数の変異の結果としてのアンタゴニスト活性、例えば、その全内容が参照により本明細書に組み込まれる、国際公開第2015/007520号を参照)を有する。これらの実施形態では、改変物質は、TNFファミリーメンバー(例えば、TNFα、TNFβ)であり、これもまた、場合により、TNFR2に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変物質は、TNFファミリーメンバー(例えば、TNFα、TNFβ)であり、これはTNFR2に対し、低減された親和性および/または活性、すなわちアンタゴニスト活性(例えば、天然のアンタゴニスト活性または1個または複数の変異の結果としてのアンタゴニスト活性、例えば、その全内容が参照により本明細書に組み込まれる、国際公開第2015/007520号を参照)を有する。これらの実施形態では、改変物質は、TNFファミリーメンバー(例えば、TNFα、TNFβ)であり、これもまた、場合により、TNFR1に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。このような実施形態の構築物は、例えば、細胞特異的な様式でTNF応答を抑制する方法で使用される。いくつかの実施形態では、アンタゴニストTNFファミリーメンバー(例えば、TNFα、TNFβ)は、国際公開第2015/007903号に記載のように、単鎖トリマー型である。
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はTRAILである。いくつかの実施形態では、改変TRAIL物質は、DR4(TRAIL-RI)および/またはDR5(TRAIL-RII)および/またはDcR1および/またはDcR2に対して、低減された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変TRAIL物質は、DR4(TRAIL-RI)および/またはDR5(TRAIL-RII)および/またはDcR1および/またはDcR2に対して、低減された親和性および/または活性を有する。
ある実施形態では、野生型TRAILは、下記のアミノ酸配列を有する:
TRAIL
MAMMEVQGGPSLGQTCVLIVIFTVLLQSLCVAVTYVYFTNELKQMQDKYSKSGIACFLKEDDSYWDPNDEESMNSPCWQVKWQLRQLVRKMILRTSEETISTVQEKQQNISPLVRERGPQRVAAHITGTRGRSNTLSSPNSKNEKALGRKINSWESSRSGHSFLSNLHLRNGELVIHEKGFYYIYSQTYFRFQEEIKENTKNDKQMVQYIYKYTSYPDPILLMKSARNSCWSKDAEYGLYSIYQGGIFELKENDRIFVSVTNEHLIDMDHEASFFGAFLVG(配列番号90)。
このような実施形態では、改変TRAIL物質は、アミノ酸位置T127~R132、E144~R149、E155~H161、Y189~Y209、T214~1220,K224~A226、W231、E236~L239、E249~K251、T261~H264およびH270~E271に変異を含み得る(ジェンバンク受入番号NP_003801、バージョン10NP_003801.1、Gl:4507593、ヒト配列に基づいてナンバリング;上記参照)。
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はインターロイキンである。ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はIL1である。ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はIL1αまたはIL1βである。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL1R1および/またはIL1RAcPに対する低減された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL1R1および/またはIL1RAcPに対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL1R2に対する低減された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL1R2に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。例えば、いくつかの実施形態では、本改変IL1物質は、IL1R2に対する相互作用を回避し、したがって治療薬に対するデコイおよび/またはシンクとしてのその機能を実質的に低減する。
ある実施形態では、野生型IL1βは、下記のアミノ酸配列を有する:
IL1β(成熟型、野生型)
APVRSLNCTLRDSQQKSLVMSGPYELKALHLQGQDMEQQVVFSMSFVQGEESNDKIPVALGLKEKNLYLSCVLKDDKPTLQLESVDPKNYPKKKMEKRFVFNKIEINNKLEFESAQFPNWYISTSQAENMPVFLGGTKGGQDITDFTMQFVSS(配列番号91)。
IL1は、炎症促進性のサイトカインであり、重要な免疫系制御因子である。それは、CD4 T細胞応答の強力な活性化因子であり、Th17細胞の比率ならびにIFNγおよびIL4産生細胞の増殖を増大させる。IL1はまたCD8 T細胞の強力な制御因子であり、抗原特異的CD8 T細胞増殖、分化、周辺部への移動および記憶を強化する。IL1受容体は、IL1R1およびIL1R2を含む。IL1R1への結合およびIL1R1を介するシグナル伝達は、IL1がその生物学的(および病理学的)作用の多くを媒介する機序を構成する。IL1R2はデコイ受容体として機能し得、それによりIL1R1を介する相互作用およびシグナル伝達のためのIL1の利用可能性を減らす。
いくつかの実施形態では、改変IL1は、IL1R1に対する低減された親和性および/または活性(例えば、アゴニスト活性)を有する。いくつかの実施形態では、改変IL1は、IL1R2に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。このような実施形態では、回復可能なIL1/IL1R1シグナル伝達ならびにILR2に対する治療用キメラの損失の防止およびその結果として必要とされるIL1投与量の削減(例えば、野生型またはILR1に対する減弱化変異のみを有するキメラに比べて)がある。このような構築物は、例えば、免疫系を刺激して抗癌応答を開始することを含む、例えば、癌を処置する方法で使用される。
いくつかの実施形態では、改変IL1は、IL1R1に対し、低減された親和性および/または活性(例えば、アンタゴニスト活性、例えば、天然のアンタゴニスト活性または1個または複数の変異の結果としてのアンタゴニスト活性、例えば、その全内容が参照により本明細書に組み込まれる、国際公開第2015/007520号を参照)を有する。いくつかの実施形態では、改変IL1は、IL1R2に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。このような実施形態では、回復可能でないIL1/IL1R1シグナル伝達ならびにILR2に対する治療用キメラの損失の防止およびその結果として必要とされるIL1投与量の削減(例えば、野生型またはILR1に対する減弱化変異のみを有するキメラに比べて)がある。このような構築物は、例えば、免疫系を抑制することを含む、例えば、自己免疫疾患を処置する方法で使用される。
このような実施形態では、改変シグナル伝達物質は、アミノ酸52~54の欠失を有し、これはI型IL1Rに対して低減された結合親和性および低減された生物活性を有する改変ヒトIL1βを産生する。例えば、その全内容が参照により本明細書に組み込まれる、国際公開第1994/000491号を参照されたい。いくつかの実施形態では、改変ヒトIL1βは、A117G/P118G、R120X、L122A、T125G/L126G、R127G、Q130X、Q131G、K132A、S137G/Q138Y、L145G、H146X、L145A/L147A、Q148X、Q148G/Q150G、Q150G/D151A、M152G、F162A、F162A/Q164E、F166A、Q164E/E167K、N169G/D170G、I172A、V174A、K208E、K209X、K209A/K210A、K219X、E221X、E221S/N224A、N224S/K225S、E244K、N245Qから選択される1個または複数の置換変異(Xはアミノ酸の任意の変化、例えば、非保存的変化であり得る)を有し、これらは、例えば、全内容が参照により本明細書に組み込まれる、国際公開第2015/007542号および国際公開第2015/007536号に記載のように、IL1Rに対し低減された結合を示す(ジェンバンク受入番号NP_000567、バージョンNP-000567.1、Gl:10835145、ヒトIL1β配列に基づいてナンバリング)。いくつかの実施形態では、改変ヒトIL1βは、R120A、R120G、Q130A、Q130W、H146A、H146G、H146E、H146N、H146R、Q148E、Q148G、Q148L、K209A、K209D、K219S、K219Q、E221SおよびE221Kから選択される1個または複数の変異を有し得る。ある実施形態では、改変ヒトIL1βは、変異Q131GおよびQ148Gを含む。ある実施形態では、改変ヒトIL1βは、変異Q148GおよびK208Eを含む。ある実施形態では、改変ヒトIL1βは、変異R120GおよびQ131Gを含む。ある実施形態では、改変ヒトIL1βは、変異R120GおよびH146Aを含む。ある実施形態では、改変ヒトIL1βは、変異R120GおよびH146Nを含む。ある実施形態では、改変ヒトIL1βは、変異R120GおよびH146Rを含む。ある実施形態では、改変ヒトIL1βは、変異R120GおよびH146Eを含む。ある実施形態では、改変ヒトIL1βは、変異R120GおよびH146Gを含む。ある実施形態では、改変ヒトIL1βは、変異R120GおよびK208Eを含む。ある実施形態では、改変ヒトIL1βは、変異R120G、F162A、およびQ164Eを含む。
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はIL2である。このような実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL2Rαおよび/またはIL2Rβおよび/またはIL2Rγに対する低減された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL2Rβおよび/またはIL2Rγに対する低減された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL2Rαに対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。このような実施形態は、例えば、改変IL2がIL2Rβおよび/またはIL2Rγに対するアゴニストである場合、癌の処置に適切であり得る。例えば、本構築物は、IL2受容体βおよびγを有するCD8 T細胞(抗腫瘍効果を与えることができる)の減弱化された活性化を優先し、IL2受容体α、β、およびγを有するTreg(免疫抑制効果、腫瘍促進効果を与えることができる)を優先しない。さらに、いくつかの実施形態では、IL2RαよりもIL2Rβおよび/またはIL2Rγに対する選択性は、肺水腫などのIL2副作用を回避する。また、IL2ベースキメラは、例えば、改変IL2が、IL2Rβおよび/またはIL2Rγに対して拮抗的(例えば、天然のアンタゴニスト活性または1個または複数の変異の結果としてのアンタゴニスト活性、例えば、その全内容が参照により本明細書に組み込まれる、国際公開第2015/007520号を参照)である場合、疾患(例えば、自己免疫疾患)の処置に有用である。例えば、本構築物は、IL2受容体βおよびγを有するCD8 T細胞の抑制の減弱化(したがって、免疫応答を抑制する)を優先し、IL2受容体α、β、およびγを有するTregを優先しない。あるいは、いくつかの実施形態では、IL2を有するキメラは、Tregの活性化、したがって免疫抑制を優先し、CD8 T細胞の活性化を優先しない。例えば、これらの構築物は、疾患または免疫抑制から恩恵を受けると思われる疾患、例えば、自己免疫疾患の処置で使用される。
いくつかの実施形態では、キメラタンパク質は、CD8 T細胞に向けられた本明細書に記載のターゲティング部分ならびにIL2Rβおよび/またはIL2Rγに対する低減された親和性および/または活性および/またはIL2Rαに対し実質的に低減されたまたは除去された親和性および/または活性を有する改変IL2物質を有する。いくつかの実施形態では、これらの構築物は、標的とされるCD8 T細胞活性をもたらし、通常、Treg細胞に対して不活性である(または実質的に低減された活性を有する)。いくつかの実施形態では、このような構築物は、野生型IL2に比べて、高められた免疫刺激効果を有する(理論に束縛されることを望むものではないが、Tregを刺激しないことにより)一方で、IL2に関連する全身毒性を除去または低減する。
ある実施形態では、野生型IL2は、下記のアミノ酸配列を有する:
IL2(成熟型、野生型)
APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTFKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号92)。
このような実施形態では、改変ヒトIL2物質は1個または複数の変異を、アミノ酸L72(L72G、L72A、L72S、L72T、L72Q、L72E、L72N、L72D、L72R、またはL72K)、F42(F42A、F42G、F42S、F42T、F42Q、F42E、F42N、F42D、F42R、またはF42K)およびY45(Y45A、Y45G、Y45S、Y45T、Y45Q、Y45E、Y45N、Y45D、Y45RまたはY45K)で有する。理論に束縛されることを望むものではないが、これらの改変IL2物質は、野性型IL2と比べて、高親和性のIL2受容体に対する低減された親和性を有し、中間の親和性のIL2受容体に対する親和性を維持すると考えられている。例えば、米国特許出願公開第2012/0244112号を参照されたい。この特許の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はIL3である。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL3受容体に対する低減された親和性および/または活性を有し、IL3受容体は共通のベータ(ベータcまたはCD131)サブユニットと対になった特有のアルファ鎖を有するヘテロダイマーである。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL3受容体に対して実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有し、IL3受容体は共通のベータ(ベータcまたはCD131)サブユニットと対になった特有のアルファ鎖を有するヘテロダイマーである。
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はIL4である。このような実施形態では、改変シグナル伝達物質は、1型および/または2型IL4受容体に対する低減された親和性および/または活性を有する。このような実施形態では、改変シグナル伝達物質は、1型および/または2型IL4受容体に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。1型IL4受容体は、共通のγ鎖を有するIL4Rαサブユニットから構成され、IL4を特異的に結合する。2型IL4受容体は、IL13Rα1として知られる異なるサブユニットに結合されるIL4Rαサブユニットを含む。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、2型IL4受容体に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。
ある実施形態では、野生型IL4は、下記のアミノ酸配列を有する:
IL4(成熟型、野生型)
HKCDITLQEIIKTLNSLTEQKTLCTELTVTDIFAASKNTTEKETFCRAATVLRQFYSHHEKDTRCLGATAQQFHRHKQLIRFLKRLDRNLWGLAGLNSCPVKEANQSTLENFLERLKTIMREKYSKCSS(配列番号93)。
このような実施形態では、改変IL4物質は1個または複数の変異を、アミノ酸R121(R121A、R121D、R121E、R121F、R121H、R121I、R121K、R121N、R121P、R121T、R121W)、E122(E122F)、Y124(Y124A、Y124Q、Y124R、Y124S、Y124T)およびS125(S125A)で有する。理論に束縛されることを望むものではないが、これらの改変IL4物質は、I型受容体により媒介される活性を維持しているが、他の受容体により媒介される生物活性を顕著に低減すると考えられている。例えば、米国特許第6,433,157号を参照されたい。この特許の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はIL6である。IL6は、リガンド結合IL6R鎖(CD126)およびシグナル伝達成分gp130を含む細胞表面I型サイトカイン受容体複合体を介して信号を伝達する。IL6はまた、IL6Rの細胞外の部分である、可溶性型のIL6R(sIL6R)にも結合し得る。sIL6R/IL6複合体は、神経突起の成長およびニューロンの生存に関与し得、したがって、再ミエリン化による神経再生において重要であり得る。したがって、いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL6R/gp130および/またはsIL6Rに対する低減された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL6R/gp130および/またはsIL6Rに対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。
ある実施形態では、野生型IL6は、下記のアミノ酸配列を有する:
IL6(成熟型、野生型)
APVPPGEDSKDVAAPHRQPLTSSERIDKQIRYILDGISALRKETCNKSNMCESSKEALAENNLNLPKMAEKDGCFQSGFNEETCLVKIITGLLEFEVYLEYLQNRFESSEEQARAVQMSTKVLIQFLQKKAKNLDAITTPDPTTNASLTTKLQAQNQWLQDMTTHLILRSFKEFLQSSLRALRQM(配列番号94)。
このような実施形態では、改変シグナル伝達物質は、アミノ酸58、160、163、171または177で1個または複数の変異を有する。理論に束縛されることを望むものではないが、これらの改変IL6物質は、IL6Rαに対し低減された結合親和性および低減された生物活性を示すと考えられている。例えば、国際公開第97/10338号を参照されたい。この特許の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はIL10である。このような実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL10受容体1およびIL10受容体2に対する低減された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL10受容体1およびIL10受容体2に対する除去されたまたは実質的に低減された親和性および/または活性を有する。
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はIL11である。このような実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL11Rαおよび/またはIL11Rβおよび/またはgp130に対する低減された親和性および/または活性を有する。このような実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL11Rαおよび/またはIL11Rβおよび/またはgp130に対する除去されたまたは実質的に低減された親和性および/または活性を有する。
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はIL12である。このような実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL12Rβ1および/またはIL12Rβ2に対する低減された親和性および/または活性を有する。このような実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL12Rβ1および/またはIL12Rβ2に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はIL13である。このような実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL4受容体(IL4Rα)およびIL13Rα1に対する低減された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL4受容体(IL4Rα)またはIL13Rα1に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。
ある実施形態では、野生型IL13は、下記のアミノ酸配列を有する:
IL13(成熟型、野生型)
SPGPVPPSTALRELIEELVNITQNQKAPLCNGSMVWSINLTAGMYCAALESLINVSGCSAIEKTQRMLSGFCPHKVSAGQFSSLHVRDTKIEVAQFVKDLLLHLKKLFREGRFN(配列番号95)。
このような実施形態では、改変IL13物質は、アミノ酸13、16、17、66、69、99、102、104、105、106、107、108、109、112、113および114で1個または複数の変異を有する。理論に束縛されることを望むものではないが、これらの改変IL13物質は、低減された生物活性を示すと考えられている。例えば、国際公開第2002/018422号を参照されたい。この特許の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はIL18である。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL18Rαおよび/またはIL18Rβに対する低減された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL18Rαおよび/またはIL18Rβに対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、シグナル伝達に必要なTIRドメインを欠くIL18RαのアイソフォームであるIL18Rα2型に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。
ある実施形態では、野生型IL18は、下記のアミノ酸配列を有する:
IL18(野生型)
MAAEPVEDNCINFVAMKFIDNTLYFIAEDDENLESDYFGKLESKLSVIRNLNDQVLFIDQGNRPLFEDMTDSDCRDNAPRTIFIISMYKDSQPRGMAVTISVKCEKISTLSCENKIISFKEMNPPDNIKDTKSDIIFFQRSVPGHDNKMQFESSSYEGYFLACEKERDLFKLILKKEDELGDRSIMFTVQNEDL(配列番号96)。
このような実施形態では、改変IL18物質は、全内容が参照により本明細書に組み込まれる、国際公開第2015/007542号に記載のように、Y37~K44、R49~Q54、D59~R63、E67~C74、R80、M87~A97、N127~K129、Q139~M149、K165~K171、R183およびQ190~N191から選択されるアミノ酸またはアミノ酸領域に1個または複数の変異を含み得る(ジェンバンク受入番号AAV38697、バージョンAAV38697.1、Gl:54696650、ヒトIL18配列に基づいてナンバリング)。
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はIL33である。このような実施形態では、改変シグナル伝達物質は、ST2受容体1およびIL1RAcPに対する低減された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、ST2受容体およびIL1RAcPに対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。
ある実施形態では、野生型IL33は、下記のアミノ酸配列を有する:
MKPKMKYSTNKISTAKWKNTASKALCFKLGKSQQKAKEVCPMYFMKLRSGLMIKKEACYFRRETTKRPSLKTGRKHKRHLVLAACQQQSTVECFAFGISGVQKYTRALHDSSITGISPITEYLASLSTYNDQSITFALEDESYEIYVEDLKKDEKKDKVLLSYYESQHPSNESGDGVDGKMLMVTLSPTKDFWLHANNKEHSVELHKCEKPLPDQAFFVLHNMHSNCVSFECKTDPGVFIGVKDNHLALIKVDSSENLCTENILFKLSET(配列番号97)。
このような実施形態では、改変IL33物質は、全内容が参照により本明細書に組み込まれる、国際公開第2015/007542号に記載のように、I113~Y122、S127~E139、E144~D157、Y163~M183、E200、Q215、L220~C227およびT260~E269から選択されるアミノ酸またはアミノ酸領域に1個または複数の変異を含み得る(ジェンバンク受入番号NP_254274、バージョンNP_254274.1、Gl:15559209、ヒト配列に基づいてナンバリング)。
一実施形態では、本キメラタンパク質は、本明細書に記載のいずれかの改変または変異シグナル伝達物質と共に、(i)Clec9Aに対するターゲティング部分および(ii)腫瘍細胞に向けられたターゲティング部分を有する。ある実施形態では、本キメラタンパク質は、樹状細胞上のClec9Aに向けられたターゲティング部分および腫瘍細胞上のPD-L1またはPD-L2に向けられた第2ターゲティング部分を有する。
一実施形態では、本キメラタンパク質は、本明細書に記載のいずれかの改変または変異インターフェロンと共に、(i)Clec9Aに対するターゲティング部分および(ii)チェックポイント阻害剤マーカーに向けられたターゲティング部分を有する。ある実施形態では、本キメラタンパク質は、樹状細胞上のClec9Aに向けられたターゲティング部分およびPD-1向けられた第2ターゲティング部分を有する。
種々の実施形態では、シグナル伝達物質は毒素または毒性酵素である。いくつかの実施形態では、毒素または毒性酵素は、植物および細菌から誘導される。毒素または毒性酵素の例としては、ジフテリア毒素、シュードモナス毒素、炭疽病毒素、リシンおよびサポリンなどのリボソーム不活化タンパク質(RIP)、モデシン、アブリン、ゲロニン、およびヤマゴボウ抗ウイルスタンパク質が挙げられるが、これらに限定されない。追加の毒素は、Mathew et al.,(2009)Cancer Sci 100(8):1359-65、に開示のものを含み、この文献の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。このような実施形態では、本発明のキメラタンパク質は、細胞型特異的な様式で細胞死を誘導するのに利用され得る。このような実施形態では、毒素は改変され、例えば、変異導入されて、本明細書で他のシグナル伝達物質に関し記載されるように、弱められた効果のために毒素の親和性および/または活性を低減させ得る。
シグナル伝達物質との多重特異的キメラおよび融合体
種々の実施形態では、本発明のClec9A結合物質は、本明細書に記載の1種または複数のシグナル伝達物質および/または1つまたは複数の追加のターゲティング部分とのキメラまたは融合体の一部である。したがって、本発明は、例えば、1種または複数のシグナル伝達物質およびClec9Aに対するターゲティング部分および/または1つまたは複数の追加のターゲティング部分を含むキメラまたは融合タンパク質を提供する。したがって、種々の実施形態では、用語の「Clec9A結合物質」は、このような1種または複数のシグナル伝達物質および/または1つまたは複数の追加のターゲティング部分とのキメラまたは融合タンパク質を包含する。
種々の実施形態では、本発明のキメラタンパク質は、2個の異なる細胞(例えば、シナプスを作るために)または同じ細胞(例えば、より高濃度のシグナル伝達物質効果を得るために)を標的とするターゲティング部分を有する。
種々の実施形態では、本発明のClec9A結合物質は、多重特異的であり、すなわち、Clec9A結合物質は、2つ以上の標的(例えば、抗原、または受容体、またはエピトープ)を認識し結合する認識ドメイン(例えば、抗原認識ドメイン)を有する2つ以上のターゲティング部分を含む。このような実施形態では、本発明のClec9A結合物質は、同じ抗原上または異なる抗原上または異なる受容体上の2個以上のエピトープを認識し結合する認識ドメインを有する2つ以上のターゲティング部分を含み得る。種々の実施形態では、このような多重特異的Clec9A結合物質は、向上した結合力および/または改善された選択性などの有利な性質を示す。ある実施形態では、本発明のClec9A結合物質は、2つのターゲティング部分を含み、かつ二重特異性であり、すなわち、同じ抗原上または異なる抗原上または異なる受容体上の2個のエピトープを結合し認識する。したがって、種々の実施形態では、用語「Clec9A結合物質」は、2つ以上のターゲティング部分を含むこのような多重特異的Clec9A結合物質を包含する。
種々の実施形態では、本発明の多重特異的Clec9A結合物質は、それぞれのターゲティング部分が本明細書に記載の抗体または抗体誘導体である2つ以上のターゲティング部分を含む。ある実施形態では、本発明の多重特異的Clec9A結合物質は、Clec9Aに対する抗原認識ドメインを含む少なくとも1種のVHHおよび腫瘍抗原および/または免疫細胞マーカーに対する抗原認識ドメインを含む1種の抗体または抗体誘導体を含む。
種々の実施形態では、本多重特異的Clec9A結合物質は、異なる抗原または受容体を標的とする2つ以上のターゲティング部分を有し、1つのターゲティング部分は、その抗原または受容体に対し減弱化され得、例えば、ターゲティング部分はその抗原または受容体を低親和性または結合力で結合する(例えば、他のターゲティング部分がその抗原または受容体に対して有する親和性または結合力より低い親和性または結合力で、を含み、例えば結合親和性の間の差異は、約10倍、または25倍、または50倍、または100倍、または300倍、または500倍、または1000倍、または5000倍であってよく;例えばより低い親和性または結合力のターゲティング部分は中~高nMまたは低~中μMの範囲Kでその抗原または受容体を結合し一方でより高い親和性または結合力のターゲティング部分は中~高pMまたは低~中nMの範囲のKでその抗原または受容体を結合し得る)。例えば、いくつかの実施形態では、本多重特異的Clec9A結合物質は、無差別の抗原または受容体に向けられた減弱化ターゲティング部分を含み、これは目的の細胞への標的化を改善し(例えば、他のターゲティング部分を介して)かつ治療用として標的にされないものを含む、複数細胞型間にまたがる効果を防止し得る(例えば、これらの実施形態で与えられるものより高い親和性で無差別な抗原または受容体を結合することによる)。
本発明の多重特異的Clec9A結合物質は、当該技術分野において既知の方法を使用して構築し得る。例えば、米国特許第9,067,991号、米国特許出願公開第20110262348号および国際公開第2004/041862号を参照されたい。これらの特許の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、2つ以上のターゲティング部分を含む本発明の多重特異的Clec9A結合物質は、例えば、全内容が参照により本明細書に組み込まれる、Blattler et al.,Biochemistry 24,1517-1524および欧州特許第294703号に記載のように有機誘導体化試薬とアミノ酸残基を反応させることにより、化学架橋により構築し得る。別の例示的実施形態では、2つ以上のターゲティング部分を含む多重特異的Clec9A結合物質は、遺伝的融合、すなわち、個別のターゲティング部分のポリペプチドを含む単一ポリペプチドを構築することにより、構築される。例えば、Clec9Aに対する抗原認識ドメインを有する第1のVHHおよび、例えば、腫瘍抗原またはチェックポイント阻害剤に対する抗原認識ドメインを有する第2の抗体または抗体誘導体をコードする、単一ポリペプチド構築物を形成し得る。二価または多価性のVHHポリペプチド構築物を産生する方法は、国際公開第96/34103号に開示され、この特許の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。さらなる例示的実施形態では、本発明の多重特異的Clec9A結合物質は、リンカーを用いることにより構築し得る。例えば、Clec9Aに対する抗原認識ドメインを有する第1のVHHのカルボキシ末端を、例えば、腫瘍抗原またはチェックポイント阻害剤に対する抗原認識ドメインを有する第2の抗体または抗体誘導体のアミノ末端に連結し得る(または逆もまた同様)。使用し得るリンカーの例は、本明細書に記載される。いくつかの実施形態では、本発明の多重特異的Clec9A結合物質の成分は、リンカーの使用なしに、相互に直接連結される。
種々の実施形態では、本発明の多重特異的Clec9A結合物質は、Clec9Aおよび1個または複数の免疫細胞上に見出される1個または複数の抗原を認識し、それらに結合し、免疫細胞は巨核球、血小板、赤血球、マスト細胞、好塩基球、好中球、好酸球、単球、マクロファージ、ナチュラルキラー細胞、Tリンパ球(例えば、細胞傷害性Tリンパ球、ヘルパーT細胞、ナチュラルキラーT細胞)、Bリンパ球、プラズマ細胞、樹状細胞、またはこれらのサブセットを含み得るが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、CLEC9A結合物質は、目的の抗原に特異的に結合し、1つまたは複数の免疫細胞を効果的に直接または間接的にリクルートする。
種々の実施形態では、本発明の多重特異的Clec9A結合物質は、Clec9Aおよび腫瘍細胞上に見出される1個または複数の抗原を認識し、それらに結合する。これらの実施形態では、本発明のClec9A結合物質は、腫瘍細胞にまたは腫瘍微小環境に免疫細胞を直接的にまたは間接的にリクルートし得る。いくつかの実施形態では、本発明のClec9A結合物質は、作用部位(例えば、非限定的例であるが、腫瘍微小環境など)に、
免疫細胞、例えば、樹状細胞を直接的にまたは間接的にリクルートし得る。いくつかの実施形態では、本発明のClec9A結合物質は、強力な体液性および細胞傷害性T細胞応答の誘導のために、樹状細胞による抗原の提示(例えば、腫瘍抗原の提示)を促進する。
いくつかの実施形態では、本発明のClec9A結合物質は、腫瘍の免疫攻撃に有利なように、免疫細胞のバランスを変化させることを含む、方法で使用できる、または用途が見つかる。例えば、本発明のClec9A結合物質は、臨床的に重要な部位での免疫細胞の比率を、腫瘍を死滅させるおよび/または抑制できる細胞(例えば、T細胞、細胞傷害性Tリンパ球、ヘルパーT細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞、ナチュラルキラーナチュラルキラーT(NKT)細胞、抗腫瘍マクロファージ(例えば、M1マクロファージ)、B細胞、および樹状細胞に有利なように、ならびに腫瘍を保護する細胞(例えば、骨髄由来サプレッサー細胞(MDSC)、制御性T細胞(Treg);腫瘍関連好中球(TAN)、M2マクロファージ、腫瘍関連マクロファージ(TAM)、またはこれらのサブセット)に不利なように変化させることができる。いくつかの実施形態では、本発明のClec9A結合物質は、エフェクターT細胞の制御性T細胞に対する比率を高めることができる。
いくつかの実施形態では、本発明の多重特異的Clec9A結合物質は、腫瘍細胞関連標的(例えば、抗原または受容体)に特異的に結合する認識ドメインを有するターゲティング部分を含む。いくつかの実施形態では、ターゲティング部分は、腫瘍細胞を直接または間接的にリクルートする。例えば、いくつかの実施形態では、腫瘍細胞のリクルートは、腫瘍細胞を死滅させることができるおよび/または抑制できる1個または複数のエフェクター細胞(例えば、本明細書に記載の免疫細胞)に対するものである。
腫瘍細胞、または癌細胞は、身体の器官およびシステムの正常な機能動作を妨害する、細胞または組織の無制御な増殖および/または細胞生存の異常な増大および/またはアポトーシスの抑制の異常な増大を指す。例えば、腫瘍細胞は、良性および悪性の癌、ポリープ、過形成、ならびに休眠腫瘍または微小転移を含む。腫瘍細胞の例としては、基底細胞癌、胆道癌;膀胱癌;骨癌;脳および中枢神経系癌;乳癌;腹膜の癌;子宮頸癌;絨毛癌;結腸および直腸癌;結合組織癌;消化器系の癌;子宮内膜癌;食道癌;眼癌;頭頸部の癌;胃癌(胃腸癌を含む);神経膠芽腫;肝癌;ヘパトーマ;上皮内腫瘍;腎臓癌または腎臓癌(kidney or renal cancer);喉頭癌;白血病;肝臓癌;肺癌(例えば、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、肺腺癌、および肺扁平上皮癌);黒色腫;骨髄腫;神経芽腫;口腔癌(唇、舌状、舌、口内、および咽頭);卵巣癌;膵臓癌;前立腺癌;網膜芽細胞腫;横紋筋肉腫;直腸癌;呼吸器系癌;唾液腺癌腫;肉腫;皮膚癌;扁平上皮細胞癌;胃癌;精巣癌;甲状腺癌;子宮または子宮内膜癌;泌尿器系の癌;外陰癌;ホジキンリンパ腫および非ホジキンリンパ腫、ならびにB細胞リンパ腫を含むリンパ腫(低悪性度/濾胞性非ホジキンリンパ腫(NHL)を含む);小リンパ球性(SL)NHL;中悪性度/濾胞性NHL;中悪性度びまん性NHL;高悪性度免疫芽細胞NHL;高悪性度リンパ芽球性NHL;高悪性度小型非切れ込み核細胞性NHL;巨大腫瘤病変NHL;マントル細胞リンパ腫;エイズ関連リンパ腫;およびワルデンシュトレームマクログロブリン血症;慢性リンパ性白血病(CLL);急性リンパ性白血病(ALL);毛様細胞性白血病;慢性骨髄芽球性白血病;ならびにその他の癌腫および肉腫;および移植後リンパ増殖性疾患(PTLD)、ならびに母斑症、浮腫(例えば、脳腫瘍に関連するもの)、およびメグズ症候群と関連する異常血管増殖の細胞が挙げられるが、これらに限定されない。
腫瘍細胞または癌細胞としては、癌腫、例えば、種々のサブタイプ(例えば、腺癌、基底細胞癌、扁平上皮細胞癌、および移行性上皮癌を含む)、肉腫(例えば、骨および軟組織を含む)、白血病(例えば、急性骨髄性、急性リンパ芽球性、慢性骨髄性、慢性リンパ球性、およびヘアリー細胞を含む)、リンパ腫および骨髄腫(例えば、ホジキンおよび非ホジキンリンパ腫、軽鎖型、非分泌型MGUS、および形質細胞腫を含む)、および中枢神経系癌(例えば、脳腫瘍(例えば、神経膠腫(例えば、星状細胞腫、乏突起細胞腫および上衣腫)、髄膜腫、下垂体腺腫、および神経腫)、および脊髄腫瘍(例えば、髄膜腫および神経線維腫))も挙げられるが、これらに限定されない。
腫瘍抗原の例としては、MART-1/Melan-A、gp100、ジペプチジルペプチダーゼIV(DPPIV)、アデノシンデアミナーゼ結合タンパク質(ADAbp)、シクロフィリンb、結腸直腸関連性抗原(CRC)-0017-1A/GA733、癌胎児抗原(CEA)およびその免疫原性エピトープCAP-1およびCAP-2、etv6、aml1、前立腺特異抗原(PSA)およびその免疫原性エピトープPSA-1、PSA-2、およびPSA-3、前立腺特異的膜抗原(PSMA)、T細胞受容体/CD3-ゼータ鎖、MAGEファミリーの腫瘍抗原(例えば、MAGE-A1、MAGE-A2、MAGE-A3、MAGE-A4、MAGE-A5、MAGE-A6、MAGE-A7、MAGE-A8、MAGE-A9、MAGE-A10、MAGE-A11、MAGE-A12、MAGE-Xp2(MAGE-B2)、MAGE-Xp3(MAGE-B3)、MAGE-Xp4(MAGE-B4)、MAGE-C1、MAGE-C2、MAGE-C3、MAGE-C4、MAGE-C5)、GAGEファミリーの腫瘍抗原(例えば、GAGE-1、GAGE-2、GAGE-3、GAGE-4、GAGE-5、GAGE-6、GAGE-7、GAGE-8、GAGE-9)、BAGE、RAGE、LAGE-1、NAG、GnT-V、MUM-1、CDK4、チロシナーゼ、p53、MUCファミリー、HER2/neu、p21ras、RCAS1、α-フェトプロテイン、E-カドヘリン、α-カテニン、β-カテニンおよびγ-カテニン、p120ctn、gp100 Pmel117、PRAME、NY-ESO-1、cdc27、大腸腺腫症タンパク質(APC)、フォドリン、コネキシン37、Ig-イディオタイプ、p15、gp75、GM2およびGD2ガングリオシド、ヒトパピローマウイルスタンパク質などのウイルス産物、Smadファミリーの腫瘍抗原、lmp-1、NA、EBV-コード化核内抗原(EBNA)-1、脳グリコーゲンホスホリラーゼ、SSX-1、SSX-2(HOM-MEL-40)、SSX-1、SSX-4、SSX-5、SCP-1 CT-7、c-erbB-2、CD19、CD20、CD22、CD30、CD33、CD37、CD56、CD70、CD74、CD138、AGS16、MUC1、GPNMB、Ep-CAM、PD-L1、PD-L2、PMSA、およびBCMA(TNFRSF17)が挙げられるが、これらに限定されない。種々の実施形態では、CLEC9A結合物質は、1個または複数のこれらの腫瘍抗原を結合するターゲティング部分を含む。
いくつかの実施形態では、本多重特異的Clec9A結合物質は、Clec9Aならびに腫瘍細胞上の抗原を認識し、それに結合する。いくつかの実施形態では、多重特異的Clec9A結合物質は、腫瘍細胞にまたは腫瘍微小環境へ樹状細胞を直接的にまたは間接的にリクルートする。
いくつかの実施形態では、本発明の多重特異的Clec9A結合物質は、T細胞関連標的(例えば、抗原または受容体)に特異的に結合する認識ドメインを有するターゲティング部分を含む。いくつかの実施形態では、ターゲティング部分は、直接または間接的にT細胞をリクルートする。ある実施形態では、抗原認識ドメインは、エフェクターT細胞に特異的に結合する。いくつかの実施形態では、抗原認識ドメインは、エフェクターT細胞を、例えば、いくつかの実施形態では、治療部位(例えば、1個または複数の疾患細胞または治療効果を得るために調節されるべき細胞を有する部位)に直接または間接的にリクルートする。エフェクターT細胞の例には、細胞傷害性T細胞(例えば、αβTCR、CD3、CD8、CD45RO);CD4 エフェクターT細胞(例えば、αβTCR、CD3、CD4、CCR7、CD62Lhi、IL7R/CD127);CD8 エフェクターメモリーT細胞(例えば、CD62Llow、CD44、TCR、CD3、IL7R/CD127、IL15R、CCR7low);セントラルメモリーT細胞(例えば、CCR7、CD62L、CD27;またはCCR7hi、CD44、CD62Lhi、TCR、CD3、IL7R/CD127、IL15R);CD62L エフェクターT細胞;早期エフェクターメモリーT細胞(CD27 CD62L)および後期エフェクターメモリーT細胞(CD27 CD62L)(それぞれ、TemEおよびTemL)を含むCD8 エフェクターメモリーT細胞(TEM);CD127()CD25(low/)エフェクターT細胞;CD127()CD25()エフェクターT細胞;CD8幹細胞メモリーエフェクター細胞(TSCM)(例えば、CD44(low)CD62L(high)CD122(high)sca());TH1エフェクターT細胞(例えば、CXCR3、CXCR6およびCCR5;またはαβTCR、CD3、CD4、IL12R、IFNγR、CXCR3)、TH2エフェクターT細胞(例えば、CCR3、CCR4およびCCR8;またはαβTCR、CD3、CD4、IL4R、IL33R、CCR4、IL17RB、CRTH2);TH9エフェクターT細胞(例えば、αβTCR、CD3、CD4);TH17エフェクターT細胞(例えば、αβTCR、CD3、CD4、IL23R、CCR6、IL1R);CD4CD45ROCCR7 エフェクターT細胞、ICOS エフェクターT細胞;CD4CD45ROCCR7()エフェクターT細胞;およびIL2、IL4および/またはIFN-γを分泌するエフェクターT細胞が挙げられる。
目的とするT細胞抗原の例としては、例えば、下記が挙げられる(該当する場合には、細胞外ドメインも含む):CD8、CD3、SLAMF4、IL2Rα、4-1BB/TNFRSF9、IL2Rβ、ALCAM、B7-1、IL4R、B7-H3、BLAME/SLAMFS、CEACAM1、IL6R、CCR3、IL7Rα、CCR4、CXCRl/ILSRA、CCR5、CCR6、IL10Rα、CCR7、IL10Rβ、CCRS、IL12Rβ1、CCR9、IL12Rβ2、CD2、IL13Rα1、IL13、CD3、CD4、ILT2/CDS5j、ILT3/CDS5k、ILT4/CDS5d、ILT5/CDS5a、lutegrin α4/CD49d、CDS、インテグリンαE/CD103、CD6、インテグリンαM/CD11b、CDS、インテグリンαX/CD11c、インテグリンβ2/CDlS、KIR/CD15S、CD27/TNFRSF7、KIR2DL1、CD2S、KIR2DL3、CD30/TNFRSFS、KIR2DL4/CD15Sd、CD31/PECAM-1、KIR2DS4、CD40リガンド/TNFSF5、LAG-3、CD43、LAIR1、CD45、LAIR2、CDS3、ロイコトリエンB4-R1、CDS4/SLAMF5、NCAM-L1、CD94、NKG2A、CD97、NKG2C、CD229/SLAMF3、NKG2D、CD2F-10/SLAMF9、NT-4、CD69、NTB-A/SLAMF6、共通γ鎖/IL2Rγ、オステオポンチン、CRACC/SLAMF7、PD-1、CRTAM、PSGL-1、CTLA-4、RANK/TNFRSF11A、CX3CR1、CX3CL1、L-セレクチン、CXCR3、SIRPβ1、CXCR4、SLAM、CXCR6、TCCR/WSX-1、DNAM-1、サイモポエチン、EMMPRIN/CD147、TIM-1、EphB6、TIM-2、Fas/TNFRSF6、TIM-3、Fasリガンド/TNFSF6、TIM-4、FcγRIII/CD16、TIM-6、TNFR1/TNFRSF1A、グラニュライシン、TNFRIII/TNFRSF1B、TRAILRl/TNFRSFlOA、ICAM-1/CD54、TRAILR2/TNFRSF10B、ICAM-2/CD102、TRAILR3/TNFRSF10C、IFN-γR1、TRAILR4/TNFRSF10D、IFN-γR2、TSLP、IL1R1およびTSLPR。種々の実施形態では、CLEC9A結合物質は、1個または複数のこれらの例示T細胞抗原を結合するターゲティング部分を含む。
非限定的例であるが、種々の実施形態では、本キメラタンパク質は、T細胞上に発現されるチェックポイントマーカー、例えば、PD-1、CD28、CTLA4、ICOS、BTLA、KIR、LAG3、CD137、OX40、Cd27、CD40L、TIM3、およびA2aRの1個または複数に向けられたターゲティング部分を有する。
いくつかの実施形態では、本発明の多重特異的Clec9A結合物質は、B細胞と関連する標的(例えば、抗原または受容体)に特異的に結合する認識ドメインを有するターゲティング部分を含む。いくつかの実施形態では、ターゲティング部分は、B細胞を、例えば、いくつかの実施形態では、治療部位(例えば、1個または複数の疾患細胞または治療効果を得るために調節されるべき細胞を有する部位)へ直接または間接的にリクルートする。目的のB細胞抗原の例としては、例えば、CD10、CD19、CD20、CD21、CD22、CD23、CD24、CD37、CD38、CD39、CD40、CD72、CD73、CD74、CDw75、CDw76、CD77、CD78、CD79a/b、CD80、CD81、CD82、CD83、CD84、CD85、CD86、CD89、CD98、CD126、CD127、CDw130、CD138、CDw150、およびB細胞成熟抗原(BCMA)が挙げられる。種々の実施形態では、Clec9A結合物質は、1個または複数のこれらの例示B細胞抗原を結合するターゲティング部分を含む。
いくつかの実施形態では、本発明の多重特異的Clec9A結合物質は、ナチュラルキラー細胞と関連する標的(例えば、抗原または受容体)に特異的に結合する認識ドメインを有するターゲティング部分を含む。いくつかの実施形態では、ターゲティング部分は、ナチュラルキラー細胞を、例えば、いくつかの実施形態では、治療部位(例えば、1個または複数の疾患細胞または治療効果を得るために調節されるべき細胞を有する部位)へ直接または間接的にリクルートする。目的のナチュラルキラー細胞抗原の例としては、例えば、TIGIT、2B4/SLAMF4、KIR2DS4、CD155/PVR、KIR3DL1、CD94、LMIR1/CD300A、CD69、LMIR2/CD300c、CRACC/SLAMF7、LMIR3/CD300LF、Kir1alpha、DNAM-1、LMIR5/CD300LB、Fc-イプシロンRII、LMIR6/CD300LE、Fc-γRl/CD64、MICA、Fc-γRIIB/CD32b、MICB、Fc-γRIIC/CD32c、MULT-1、Fc-γRIIA/CD32a、Nectin-2/CD112、Fc-γRIII/CD16、NKG2A、FcRH1/IRTA5、NKG2C、FcRH2/IRTA4、NKG2D、FcRH4/IRTA1、NKp30、FcRH5/IRTA2、NKp44、Fc-受容体様3/CD16-2、NKp46/NCR1、NKp80/KLRF1、NTB-A/SLAMF6、Rae-1、Rae-1α、Rae-1β、Rae-1δ、H60、Rae-1ε、ILT2/CD85j、Rae-1γ、ILT3/CD85k、TREM-1、ILT4/CD85d、TREM-2、ILT5/CD85a、TREM-3、KIR/CD158、TREML1/TLT-1、KIR2DL1、ULBP-1、KIR2DL3、ULBP-2、KIR2DL4/CD158dおよびULBP-3が挙げられる。種々の実施形態では、CLEC9A結合物質は、1個または複数のこれらの例示NK細胞抗原を結合するターゲティング部分を含む。
いくつかの実施形態では、本発明の多重特異的Clec9A結合物質は、マクロファージ/単球と関連する標的(例えば、抗原または受容体)に特異的に結合する認識ドメインを有するターゲティング部分を含む。いくつかの実施形態では、ターゲティング部分は、マクロファージ/単球を、例えば、いくつかの実施形態では、治療部位(例えば、1個または複数の疾患細胞または治療効果を得るために調節されるべき細胞を有する部位)へ直接または間接的にリクルートする。目的のマクロファージ/単球抗原の例としては、例えば、SIRP1a、B7-1/CD80、ILT4/CD85d、B7-H1、ILT5/CD85a、共通β鎖、インテグリンα4/CD49d、BLAME/SLAMF8、インテグリンαX/CDllc、CCL6/C10、インテグリンβ2/CD18、CD155/PVR、インテグリンβ3/CD61、CD31/PECAM-1、Latexin、CD36/SR-B3、ロイコトリエンB4R1、CD40/TNFRSF5、LIMPIIISR-B2、CD43、LMIR1/CD300A、CD45、LMIR2/CD300c、CD68、LMIR3/CD300LF、CD84/SLAMF5、LMIR5/CD300LB、CD97、LMIR6/CD300LE、CD163、LRP-1、CD2F-10/SLAMF9、MARCO、CRACC/SLAMF7、MD-1、ECF-L、MD-2、EMMPRIN/CD147、MGL2、エンドグリン/CD105、Osteoactivin/GPNMB、Fc-γRI/CD64、オステオポンチン、Fc-γRIIB/CD32b、PD-L2、Fc-γRIIC/CD32c、Siglec-3/CD33、Fc-γRIIA/CD32a、SIGNR1/CD209、Fc-γRIII/CD16、SLAM、GM-CSFRα、TCCR/WSX-1、ICAM-2/CD102、TLR3、IFN-γRl、TLR4、IFN-gannnaR2、TREM-l、IL-lRII、TREM-2、ILT2/CD85j、TREM-3、ILT3/CD85k、TREML1/TLT-1、2B4/SLAMF 4、IL10Rα、ALCAM、IL10Rβ、アミノペプチダーゼN/ANPEP、ILT2/CD85j、共通β鎖、ILT3/CD85k、ClqR1/CD93、ILT4/CD85d、CCR1、ILT5/CD85a、CCR2、CD206、インテグリンα4/CD49d、CCR5、インテグリンαM/CDll b、CCR8、インテグリンαX/CDllc、CD155/PVR、インテグリンβ2/CD18、CD14、インテグリンβ3/CD61、CD36/SR-B3、LAIR1、CD43、LAIR2、CD45、ロイコトリエンB4-R1、CD68、LIMPIIISR-B2、CD84/SLAMF5、LMIR1/CD300A、CD97、LMIR2/CD300c、CD163、LMIR3/CD300LF、凝固因子III/組織因子、LMIR5/CD300LB、CX3CR1、CX3CL1、LMIR6/CD300LE、CXCR4、LRP-1、CXCR6、M-CSF R、DEP-1/CD148、MD-1、DNAM-1、MD-2、EMMPRIN/CD147、MMR、エンドグリン/CD105、NCAM-L1、Fc-γRI/CD64、PSGL-1、Fc-γRIIIICD16、RP105、G-CSF R、L-セレクチン、GM-CSFRα、Siglec-3/CD33、HVEM/TNFRSF14、SLAM、ICAM-1/CD54、TCCR/WSX-1、ICAM-2/CD102、TREM-l、IL6R、TREM-2、CXCRl/IL8RA、TREM-3およびTREMLl/TLT-1が挙げられる。種々の実施形態では、CLEC9A結合物質は、1個または複数のこれらの例示マクロファージ/単球抗原を結合するターゲティング部分を含む。
いくつかの実施形態では、本発明の多重特異的Clec9A結合物質は、樹状細胞と関連する標的(例えば、抗原または受容体)に特異的に結合する認識ドメインを有するターゲティング部分を含む。いくつかの実施形態では、ターゲティング部分は、樹状細胞を、例えば、いくつかの実施形態では、治療部位(例えば、1個または複数の疾患細胞または治療効果を得るために調節されるべき細胞を有する部位)へ直接または間接的にリクルートする。目的の樹状細胞抗原の例としては、例えば、CLEC9A、XCR1、RANK、CD36/SRB3、LOX-1/SR-E1、CD68、MARCO、CD163、SR-A1/MSR、CD5L、SREC-1、CL-Pl/COLEC12、SREC-II、LIMPIIISRB2、RP105、TLR4、TLR1、TLR5、TLR2、TLR6、TLR3、TLR9、4-IBBリガンド/TNFSF9、IL12/IL23p40、4-Amino-1、8-ナフタルイミド、ILT2/CD85j、CCL21/6Ckine、ILT3/CD85k、8-oxo-dG、ILT4/CD85d、8D6A、ILT5/CD85a、A2B5、lutegrin α4/CD49d、Aag、インテグリンβ2/CD18、AMICA、Langerin、B7-2/CD86、ロイコトリエンB4 Rl、B7-H3、LMIR1/CD300A、BLAME/SLAMF8、LMIR2/CD300c、ClqR1/CD93、LMIR3/CD300LF、CCR6、LMIR5/CD300LBCCR7、LMIR6/CD300LE、CD40/TNFRSF5、MAG/Siglec-4-a、CD43、MCAM、CD45、MD-1、CD68、MD-2、CD83、MDL-1/CLEC5A、CD84/SLAMF5、MMR、CD97、NCAMLl、CD2F-10/SLAMF9、Osteoactivin GPNMB、Chern23、PD-L2、CLEC-1、RP105、CLEC-2、CLEC-8、シグレック-2/CD22、CRACC/SLAMF7、シグレック-3/CD33、DC-SIGN、DEC205、シグレック-5、DC-SIGNR/CD299、シグレック-6、DCAR、シグレック-7、DCIR/CLEC4A、シグレック-9、DEC-205、シグレック-10、Dectin-1/CLEC7A、シグレック-F、Dectin-2/CLEC6A、SIGNR1/CD209、DEP-1/CD148、SIGNR4、DLEC、SLAM、EMMPRIN/CD147、TCCR/WSX-1、Fc-γR1/CD64、TLR3、Fc-γRIIB/CD32b、TREM-1、Fc-γRIIC/CD32c、TREM-2、Fc-γRIIA/CD32a、TREM-3、Fc-γRIII/CD16、TREML1/TLT-1、ICAM-2/CD102、およびバニロイドR1が挙げられる。種々の実施形態では、CLEC9A結合物質は、1個または複数のこれらの例示DC抗原を結合するターゲティング部分を含む。
いくつかの実施形態では、本発明の多重特異的Clec9A結合物質は、限定されないが、巨核球、血小板、赤血球、マスト細胞、好塩基球、好中球、好酸球、またはこれらのサブセットから選択される免疫細胞と関連する標的(例えば、抗原または受容体)に特異的に結合する認識ドメインを有するターゲティング部分を含む。いくつかの実施形態では、抗原認識ドメインは、巨核球、血小板、赤血球、マスト細胞、好塩基球、好中球、好酸球、またはこれらのサブセットを、例えば、いくつかの実施形態では、治療部位(例えば、1個または複数の疾患細胞または治療効果を得るために調節されるべき細胞を有する部位)へ直接または間接的にリクルートする。
いくつかの実施形態では、本発明の多重特異的Clec9A結合物質は、巨核球および/または血小板と関連する標的(例えば、抗原または受容体)に特異的に結合する認識ドメインを有するターゲティング部分を含む。巨核球および/または血小板抗原の例としては、例えば、GPIIb/IIIa、GPIb、vWF、PF4、およびTSPが挙げられる。種々の実施形態では、CLEC9A結合物質は、1個または複数のこれらの例示的な巨核球および/または血小板抗原を結合するターゲティング部分を含む。
いくつかの実施形態では、本発明の多重特異的Clec9A結合物質は、赤血球と関連する標的(例えば、抗原または受容体)に特異的に結合する認識ドメインを有するターゲティング部分を含む。目的の赤血球抗原の例としては、例えば、CD34、CD36、CD38、CD41a(血小板糖タンパク質IIb/IIIa)、CD41b(GPIIb)、CD71(トランスフェリン受容体)、CD105、グリコホリンA、グリコホリンC、c-kit、HLA-DR、H2(MHC-II)、およびRh抗原が挙げられる。種々の実施形態では、CLEC9A結合物質は、1個または複数のこれらの例示的な赤血球抗原を結合するターゲティング部分を含む。
いくつかの実施形態では、本発明の多重特異的Clec9A結合物質は、マスト細胞と関連する標的(例えば、抗原または受容体)に特異的に結合する認識ドメインを有するターゲティング部分を含む。目的のマスト細胞抗原の例としては、例えば、SCFR/CD117、FcεRI、CD2、CD25、CD35、CD88、CD203c、C5R1、CMAl、FCERlA、FCER2、TPSABlが挙げられる。種々の実施形態では、CLEC9A結合物質は、1個または複数のこれらの例示的なマスト細胞抗原を結合するターゲティング部分を含む。
いくつかの実施形態では、本発明の多重特異的Clec9A結合物質は、好塩基球と関連する標的(例えば、抗原または受容体)に特異的に結合する認識ドメインを有するターゲティング部分を含む。目的の好塩基球抗原の例としては、例えば、FcεRI、CD203c、CD123、CD13、CD107a、CD107b、およびCD164が挙げられる。種々の実施形態では、CLEC9A結合物質は、1個または複数のこれらの好塩基球抗原を結合するターゲティング部分を含む。
いくつかの実施形態では、本発明の多重特異的Clec9A結合物質は、好中球と関連する標的(例えば、抗原または受容体)に特異的に結合する認識ドメインを有するターゲティング部分を含む。目的の好中球抗原の例としては、例えば、7D5、CD10/CALLA、CD13、CD16(FcRIII)、CD18タンパク質(LFA-1、CR3、およびp150、95)、CD45、CD67、およびCD177が挙げられる。種々の実施形態では、CLEC9A結合物質は、1個または複数のこれらの好中球抗原を結合するターゲティング部分を含む。
いくつかの実施形態では、本発明の多重特異的Clec9A結合物質は、好酸球と関連する標的(例えば、抗原または受容体)に特異的に結合する認識ドメインを有するターゲティング部分を含む。目的の好酸球抗原の例としては、例えば、CD35、CD44およびCD69が挙げられる。種々の実施形態では、CLEC9A結合物質は、1個または複数のこれらの好酸球抗原を結合するターゲティング部分を含む。
種々の実施形態では、本発明の多重特異的Clec9A結合物質は、当業者に既知の適切な抗原または細胞表面マーカーに特異的に結合する認識ドメインを有するターゲティング部分を含む。いくつかの実施形態では、抗原または細胞表面マーカーは、組織特異的マーカーである。組織特異的マーカーの例としては、ACE、CD14、CD34、CDH5、ENG、ICAM2、MCAM、NOS3、PECAMl、PROCR、SELE、SELP、TEK、THBD、VCAMl、VWFなどの内皮細胞表面マーカー;ACTA2、MYHlO、MYHl 1、MYH9、MYOCDなどの平滑筋細胞表面マーカー;ALCAM、CD34、COLlAl、COL1A2、COL3A1、FAP、PH-4などの線維芽細胞(間質)細胞表面マーカー;CDlD、K6IRS2、KRTlO、KRT13、KRT17、KRT18、KRT19、KRT4、KRT5、KRT8、MUCl、TACSTDlなどの上皮細胞表面マーカー;CD13、TFNA、アルファ-v ベータ-3(αVβ3)、E-セレクチンなどの新生血管マーカー;およびADIPOQ、FABP4、およびRETNなどの脂肪細胞表面マーカーが挙げられるが、これらに限定されない。種々の実施形態では、CLEC9A結合物質は、1個または複数のこれらの抗原を結合するターゲティング部分を含む。種々の実施形態では、キメラタンパク質のターゲティング部分は、これらの抗原を有する1個または複数の細胞を結合する。
種々の実施形態では、本発明の多重特異的Clec9A結合物質は、チェックポイントマーカー、例えば、PD-1/PD-L1またはPD-L2、CD28/CD80またはCD86、CTLA4/CD80またはCD86、ICOS/ICOSLまたはB7RP1、BTLA/HVEM、KIR、LAG3、CD137/CD137L、OX40/OX40L、CD27、CD40L、TIM3/Gal9、およびA2aRの1個または複数に向けられた1つまたは複数のターゲティング部分を有する。いくつかの実施形態では、本発明の多重特異的Clec9A結合物質は、CTLA-4、PD-L1、PD-L2、およびPD-1の1種から選択されるチェックポイント阻害剤マーカーに対する抗体または抗体フォーマット、例えば、VHHを含み得る。
非限定的例であるが、種々の実施形態では、本多重特異的Clec9A結合物質は、(i)T細胞上に発現したチェックポイントマーカー、例えば、PD-1、CD28、CTLA4、ICOS、BTLA、KIR、LAG3、CD137、OX40、Cd27、CD40L、TIM3、およびA2aRの1個または複数に向けられたターゲティング部分を有し、および(ii)ターゲティング部分は、本明細書に記載のいずれかの改変(例えば、変異)シグナル伝達物質と共に、腫瘍細胞に向けられる。
種々の実施形態では、本多重特異的Clec9A結合物質は、PD-1に向けられた1つまたは複数のターゲティング部分を有する。いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質は、PD-1ポリペプチドを選択的に結合する1つまたは複数のターゲティング部分を有する。いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質は、PD-1ポリペプチドを選択的に結合する、抗体、抗体誘導体もしくはフォーマット、ペプチドもしくはポリペプチド、または融合タンパク質の1種または複数を含む。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、抗PD-1抗体ペムブロリズマブ(別名MK-3475、キイトルーダ)、またはそのフラグメントを含む。ペムブロリズマブおよび他のヒト化抗PD-1抗体は、Hamid,et al.(2013)New England Journal of Medicine 369(2):134-44,US 8,354,509、および国際公開第2009/114335号に開示され、これらの文献の全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のためのペムブロリズマブまたはその抗原結合フラグメントは、下記のアミノ酸配列を含む重鎖:
QVQLVQSGVEVKKPGASVKVSCKASGYTFTNYYMYWVRQAPGQGLEWMGGINPSNGGTNF NEKFKNRVTLTTDSSTTTAYMELKSLQFDDTAVYYCARRDYRFDMGFDYWGQGTTVTVSS ASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSS GLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPPCPAPEFLGGPSV FLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTY RVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTK NQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEG NVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK(配列番号:98);
および/または下記のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む:
EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCRASKGVSTSGYSYLHWYQQKPGQAPRLLIYLASYLES GVPARFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYCQHSRDLPLTFGGGTKVEIKRTVAAPSVF IFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLS STLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号99)。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、抗PD-1抗体、ニボルバム(別名BMS-936558、MDX-1106、ONO-4538、オプジーボ)、またはそのフラグメントを含む。PD-1に特異的に結合するニボルバム(クローン5C4)および他のヒトモノクローナル抗体は、米国特許第8,008,449号および国際公開第2006/121168号に開示され、これらの特許の全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、ニボルバムまたはその抗原結合フラグメントは、下記のアミノ酸配列を含む重鎖:
QVQLVESGGG VVQPGRSLRL DCKASGITFS
NSGMHWVRQA PGKGLEWVAV IWYDGSKRYY
ADSVKGRFTI SRDNSKNTLF LQMNSLRAED
TAVYYCATND DYWGQGTLVT VSSASTKGPS
VFPLAPCSRS TSESTAALGC LVKDYFPEPV
TVSWNSGALT SGVHTFPAVL QSSGLYSLSS
VVTVPSSSLG TKTYTCNVDH KPSNTKVDKR
VESKYGPPCP PCPAPEFLGG PSVFLFPPKP
KDTLMISRTP EVTCVVVDVS QEDPEVQFNW
YVDGVEVHNA KTKPREEQFN STYRVVSVLT
VLHQDWLNGK EYKCKVSNKG LPSSIEKTIS
KAKGQPREPQ VYTLPPSQEE MTKNQVSLTC
LVKGFYPSDI AVEWESNGQP ENNYKTTPPV
LDSDGSFFLY SRLTVDKSRW QEGNVFSCSV
MHEALHNHYT QKSLSLSLGK(配列番号100);
および/または下記のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む:
EIVLTQSPAT LSLSPGERAT LSCRASQSVS
SYLAWYQQKP GQAPRLLIYD ASNRATGIPA
RFSGSGSGTD FTLTISSLEP EDFAVYYCQQ
SSNWPRTFGQ GTKVEIKRTV AAPSVFIFPP
SDEQLKSGTA SVVCLLNNFY PREAKVQWKV
DNALQSGNSQ ESVTEQDSKD STYSLSSTLT
LSKADYEKHK VYACEVTHQG LSSPVTKSFN
RGEC(配列番号101)。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、抗PD-1抗体ピディリズマブ(別名CT-011、hBATまたはhBAT-1)、またはそのフラグメントを含む。ピディリズマブおよびその他のヒト化抗PD-Iヒトモノクローナル抗体は、米国特許出願公開第2008/0025980号および国際公開第2009/101611号に開示され、これらの特許の全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のための抗PD-1抗体またはその抗原結合フラグメントは、米国特許出願公開第2008/0025980号の配列番号15~18から選択される下記のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含み:
米国特許出願公開第2008/0025980号の配列番号15(配列番号102):
EIVLTQSPSSLSASVGDRVTITCSARSSVSYMHWYQQKPGKAPKLLIYRTSNLASGVPSR FSGSGSGTDFTLTINSLQPEDFATYYCQQRSSFPLTFGGGTKLEIK;
米国特許出願公開第2008/0025980号の配列番号16(配列番号103):
EIVLTQSPSSLSASVGDRVTITCSARSSVSYMHWFQQKPGKAPKLWIYRTSNLASGVPSR FSGSGSGTDYTLTINSLQPEDFATYYCQQRSSFPLTFGGGTKLEIK;
米国特許出願公開第2008/0025980号の配列番号17(配列番号104):
EIVLTQSPSSLSASVGDRVTITCSARSSVSYMHWFQQKPGKAPKLWIYRTSNLASGVPSR FSGSGSGTDYCLTINSLQPEDFATYYCQQRSSFPLTFGGGTKLEIK;
米国特許出願公開第2008/0025980号の配列番号18(配列番号105):
EIVLTQSPSSLSASVGDRVTITCSARSSVSYMHWFQQKPGKAPKLWIYRTSNLASGVPSR FSGSGSGTSYCLTINSLQPEDFATYYCQQRSSFPLTFGGGTKLEIK;
および/または、米国特許出願公開第2008/0025980号の配列番号20~24から選択される下記のアミノ酸配列を含む重鎖を含む:
米国特許出願公開第2008/0025980号の配列番号20(配列番号106):
QVQLVQSGSELKKPGASVKISCKASGYSFSNYGMNWVRQAPGQGLQWMGWINTDSGESTY AEEFKGRFVFSLDTSVSTAYLQITSLTAEDTGMYFCAKVGYDALDYWGQGTLVTVSS;
米国特許出願公開第2008/0025980号の配列番号21(配列番号107):
QVQLVQSGSELKKPGASVKISCKASGYTFTNYGMNWVRQAPGQGLQWMGWINTDSGESTY AEEFKGRFVFSLDTSVSTAYLQITSLTAEDTGMYFCAKVGYDALDYWGQGTLVTVSS;
米国特許出願公開第2008/0025980号の配列番号22(配列番号108):
QVQLVQSGSELKKPGASVKISCKASGYTFTNYGMNWVRQAPGQGLQWMGWINTDSGESTY AEEFKGRFVFSLDTSVNTAYLQITSLTAEDTGMYFCVRVGYDALDYWGQGTLVTVSS;
米国特許出願公開第2008/0025980号の配列番号23(配列番号109):
QIQLVQSGSELKKPGASVKISCKASGYTFTNYGMNWVRQAPGQGLQWMGWINTDSGESTY AEEFKGRFVFSLDTSVNTAYLQITSLTAEDTGMYFCVRVGYDALDYWGQGTLVTVSS;
米国特許出願公開第2008/0025980号の配列番号24(配列番号110):
QIQLVQSGSELKKPGASVKISCKASGYTFTNYGMNWVKQAPGQGLKWMGWINTDSGESTY AEEFKGRFAFSLDTSVNTAYLQITSLNAEDTGMYFCVRVGYDALDYWGQGTLVTVSS。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、米国特許出願公開第2008/0025980号の配列番号18を含む軽鎖および米国特許出願公開第2008/0025980号の配列番号22を含む重鎖を含む。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、AMP-514(別名MEDI-0680)を含む。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、pd-l2-Fc融合タンパク質AMP-224を含み、これは国際公開第2010/027827号および同第2011/066342号に開示され、これらの特許の全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。このような実施形態では、ターゲティング部分は、下記の国際公開第2010/027827号の配列番号4(配列番号111)を含むターゲティングドメイン:
LFTVTVPKELYIIEHGSNVTLECNFDTGSHVNLGAITASLQKVENDTSPHRERATLLEEQ LPLGKASFHIPQVQVRDEGQYQCIIIYGVAWDYKYLTLKVKASYRKINTHILKVPETDEV ELTCQATGYPLAEVSWPNVSVPANTSHSRTPEGLYQVTSVLRLKPPPGRNFSCVFWNTHV RELTLASIDLQSQMEPRTHPTWLLHIFIPFCIIAFIFIATVIALRKQLCQKLYSSKDTTK RPVTTTKREVNSAI
および/または下記の国際公開第2010/027827号の配列番号83(配列番号112)を含むB7-DC融合タンパク質を含み得る:
MIFLLLMLSLELQLHQIAALFTVTVPKELYIIEHGSNVTLECNFDTGSHVNLGAITASLQ KVENDTSPHRERATLLEEQLPLGKASFHIPQVQVRDEGQYQCIIIYGVAWDYKYLTLKVK ASYRKINTHILKVPETDEVELTCQATGYPLAEVSWPNVSVPANTSHSRTPEGLYQVTSVL RLKPPPGRNFSCVFWNTHVRELTLASIDLQSQMEPRTHPTWEPKSCDKTHTCPPCPAPEL LGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREE QYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPS RDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDK SRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、ペプチドAUNP12または米国特許出願公開第2011/0318373号または米国特許第8,907,053号に開示のいずれかの他のペプチドを含む。例えば、ターゲティング部分は、AUNP12(すなわち、米国特許出願公開第2011/0318373号の化合物8または配列番号49)を含み得、これは、下記配列番号113の配列を有する:
SNTSESFK(SNTSESF)FRVTQLAPKAQIKE-NH2
Figure 0007236273000001
ある実施形態では、ターゲティング部分は、米国特許出願公開第2014/0044738号に開示のように、抗PD-1抗体1E3またはそのフラグメントを含み、この特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のための1E3またはその抗原結合フラグメントは、下記のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域:
EVQLQQSGPV LVKPGASVKM SCKASGYTFT
DYYMNWVKQS HGKSLEWIGN INPYNGGTTY
NQKFKGKATL TVDKSSRTAY MEINSLTSED
SAVYYCARGR IYDGSLDYWG QGTALTVSS(配列番号114);
および/または下記のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む:
DIQMTQFPSS LCASQGGKVT VTCKASQDIN
NYMAWYQHKP GKGPRLLIHY TSTLLSGIPS
RFSGSGSGRD YSFSISNLEP EDIATYYCLQ
YDNLWTFGGG TKLEIK(配列番号115)。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、米国特許出願公開第2014/0044738号に開示のように、抗PD-1抗体1E8またはそのフラグメントを含み、この特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のための1E8またはその抗原結合フラグメントは、下記のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域:
QVQLQQSGAE LAKPGASVRL SCKASGYTFT
NYWMHWVKQR PGQGLEWIGH INPSSGFTTY
NQNFKDKATL TADKSSNTAY MQLSSLTYED
SAVYFCARED YDVDYWGQGT TLTVSS(配列番号116);
および/または下記のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む:
DIVMTQSQKF MSTSVGDRVS VTCKASQSVD
TNVAWYQQKP GQSPKALIFS ASYRYSGVPD
RFTGSGSGTD FTLTINSVQS EDLAEYFCQQ
YNSYPYTFGS GTKLEIK(配列番号117)。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、米国特許出願公開第2014/0044738号に開示のように、抗PD-1抗体1H3またはそのフラグメントを含み、この特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のための1H3またはその抗原結合フラグメントは、下記のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域:
EVQLVESGGG LVKPGGSLKL SCAASGFTFS
DYGMHWVRQA PEKGLEWVAY ISSGSYTIYY
TDTVKGRFTI SRDNAKNTLF LQMTSLRSED
TAMYYCARRG YGSFYEYYFD YWGQGTTLTV
SS(配列番号118);
および/または下記のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む:
QIVLTQSPAL MSASPGEKVT MTCSASSSVS
YMYWYQQKPR SSPKPWIYLT SNLASGVPAR
FSGSGSGTSY SLTISSMEAE DAATYYCQQW
SSNPFTFGSG TKLEIK(配列番号119)。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、例えば、米国特許第8,907,065号および国際公開第2008/071447号に開示のように、PD-1抗体に向けられたVHHを含み、これらの特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、PD-1に対するVHHは、米国特許第8,907,065号の配列番号347~351を含む:
米国特許第8,907,065号の配列番号347(配列番号120):
EVQLVESGGGLVQAGKSLRLSCAASGSIFSIHAMGWFRQAPGKEREFVAA ITWSGGITYYEDSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAIYYCAADR AESSWYDYWGQGTQVTVSS;
米国特許第8,907,065号の配列番号348(配列番号121):
EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAV ITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAIYYCAGDK HQSSWYDYWGQGTQVTVSS;
米国特許第8,907,065号の配列番号349(配列番号122):
EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGSISSIHAMGWFRQAPGKEREFVAA ITWSGGITYYADSLKGRFTISRDNAKNTGYLQMNSLKPEDTAIYYCAADR AQSSWYDYWGQGTQVTVSS;
米国特許第8,907,065号の配列番号350(配列番号123):
EVQLVESGGGLVQAGGSLGLSCAASGSIFSINAMAWFRQAPGKEREFVAL ISWSGGSTYYEDSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAIYYCAADR VDSNWYDYWGQGTQVTVSS;
米国特許第8,907,065号の配列番号351(配列番号124):
EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGRAFSSGTMGWFRRAPGKEREFVA SIPWSGGRIYYADSVKGRFTISRDNAQNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCAVK ERSTGWDFASWGQCTQVTVSS。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、米国特許出願公開第2011/0271358号および国際公開第2010/036959号に開示のように、いずれか1種の抗PD-1抗体またはそのフラグメントを含み、これらの特許の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のための抗体またはその抗原結合フラグメントは、米国特許出願公開第2011/0271358号の下記の配列番号25~29から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖:
米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号25(配列番号125):
QVQLVQSGAELKQPGASVKMSCKASGYSFTSSWIHWVKQAPGQGLEWIGYIYPSTGFTEY NQKFKDRATLTADKSTSTAYMELSSLRSEDSAVYYCARWRDSSGYHAMDYWGQGTSVTVS S;
米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号26(配列番号126):
QVQLVQSGAEVKQPGASVKMSCKASGYSFTSSWIHWVKQAPGQGLEWIGYIYPSTGFTEY NQKFKDRATLTADKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYY3/d10CARWRDSSGYHAMDYWGQGTSVTVS S;
米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号27(配列番号127):
QVQLVQSGHEVKQPGASVKMSCKASGYSFTSSWIHWVKQAPGQGLEWIGYIYPSTGFTEY NQKFKDRATLTADKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARWRDSSGYHAMDYWGQGTLVTVS S;
米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号28(配列番号128):
QVQLVQSGHEVKQPGASVKMSCKASGYSFTSSWIHWVRQAPGQGLEWIGYIYPSTGFTEY NQKFKDRATLTADKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARWRDSSGYHAMDYWGQGTLVTVS S;
米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号29(配列番号129):
QVQLVQSGHEVKQPGASVKVSCKASGYSFTSSWIHWVRQAPGQGLEWIGYIYPSTGFTEY NQKFKDRATITADKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARWRDSSGYHAMDYWGQGTLVTVS S;
および/または、米国特許出願公開第2011/0271358号の下記の配列番号30~33から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖を含む:
米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号30(配列番号130):
DIVLTQSPASLTLSPGQRLTISCRASQSVSTSGYSYMHWYQQKPDQSPKLLIKFGSNLES GIPARFSGSGSGTDFTLTISSLEEEDFATYYCQHSWEIPYTFGQGTKLEIK;
米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号31(配列番号131):
DIVLTQSPATLSLSPGQRLTISCRASQSVSTSGYSYMHWYQQKPDQSPKLLIKFGSNLES GIPARFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFATYYCQHSWEIPYTFGQGTKLEIK;
米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号32(配列番号132):
EIVLTQSPATLSLSPGQRLTISCRASQSVSTSGYSYMHWYQQKPDQSPKLLIKFGSNLES GIPARFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFATYYCQHSWEIPYTFGQGTKLEIK;
米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号33(配列番号133):
DIVLTQSPATLSLSPGQRLTISCRASQSVSTSGYSYMHWYQQKPDQSPKLLIKFGSNLES GIPARFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYCQHSWEIPYTFGQGTKLEIK。
種々の実施形態では、本多重特異的Clec9A結合物質は、TSR-042(Tesaro,Inc.)、REGN2810(Regeneron Pharmaceuticals,Inc.)、PDR001(Novartis Pharmaceuticals)、およびBGB-A317(BeiGene Ltd.)から選択されるPD-1に対する1種または複数の抗体、またはその抗体フラグメントを含む。
ある実施形態では、Clec9A結合物質は、下記配列番号134などの、PD-1に向けられたターゲティング部分を含む:
EVQLVESGGGLVQAGKSLRLSCAASGSIFSIHAMGWFRQAPGKEREFVAAITWSGGITYYEDSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAIYYCAADRAESSWYDYWGQGTQVTVSS。
種々の実施形態では、本多重特異的Clec9A結合物質は、PD-L1に向けられた1つまたは複数のターゲティング部分を有する。いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質は、PD-L1ポリペプチドを選択的に結合する1つまたは複数のターゲティング部分を有する。いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質は、PD-L1ポリペプチドを選択的に結合する、抗体、抗体誘導体もしくはフォーマット、ペプチドもしくはポリペプチド、または融合タンパク質の1種または複数を含む。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、抗PD-L1抗体MEDI4736(別名デュルバルマブ)、またはそのフラグメントを含む。MEDI4736は、PD-L1に対し選択的であり、PD-1およびCD80受容体に対するPD-L1の結合を阻止する。本明細書で提供される方法での使用のためのMEDI4736およびその抗原結合フラグメントは、重鎖および軽鎖または重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含む。MEDI4736の配列は、国際公開第2016/06272号に開示され、この特許の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のためのMEDI4736またはその抗原結合フラグメントは、下記のアミノ酸配列を含む重鎖:
EVQLVESGGG LVQPGGSLRL SCAASGFTFS
RYWMSWVRQA PGKGLEWVAN IKQDGSEKYY
VDSVKGRFTI SRDNAKNSLY LQMNSLRAED
TAVYYCAREG GWFGELAFDY WGQGTLVTVS
SASTKGPSVF PLAPSSKSTS GGTAALGCLV
KDYFPEPVTV SWNSGALTSG VHTFPAVLQS
SGLYSLSSVV TVPSSSLGTQ TYICNVNHKP
SNTKVDKRVE PKSCDKTHTC PPCPAPEFEG
GPSVFLFPPK PKDTLMISRT PEVTCVVVDV
SHEDPEVKFN WYVDGVEVHN AKTKPREEQY
NSTYRVVSVL TVLHQDWLNG KEYKCKVSNK
ALPASIEKTI SKAKGQPREP QVYTLPPSRE
EMTKNQVSLT CLVKGFYPSD IAVEWESNGQ
PENNYKTTPP VLDSDGSFFL YSKLTVDKSR
WQQGNVFSCS VMHEALHNHY TQKSLSLSPG
K(配列番号135);
および/または下記のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む:
EIVLTQSPGT LSLSPGERAT LSCRASQRVS
SSYLAWYQQK PGQAPRLLIY DASSRATGIP
DRFSGSGSGT DFTLTISRLE PEDFAVYYCQ
QYGSLPWTFG QGTKVEIKRT VAAPSVFIFP
PSDEQLKSGT ASVVCLLNNF YPREAKVQWK
VDNALQSGNS QESVTEQDSK DSTYSLSSTL
TLSKADYEKH KVYACEVTHQ GLSSPVTKSF
NRGEC(配列番号136)。
例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のためのMEDI4736またはその抗原結合フラグメントは、下記の国際公開第2016/06272号の配列番号4(配列番号137)のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域:
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSRYWMSWVRQAPGKGLEWVANIKQDGSEKYY VDSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAREGGWFGELAFDYWGQGTLVTVS S;
および/または下記の国際公開第2016/06272号の配列番号3(配列番号138)のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む:
EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSCRASQRVSSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYDASSRATGIP DRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQYGSLPWTFGQGTKVEIK。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、抗PD-L1抗体アテゾリズマブ(別名MPDL3280A、RG7446)、またはそのフラグメントを含む。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のためのアテゾリズマブまたはその抗原結合フラグメントは、下記のアミノ酸配列を含む重鎖:
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSDSWIHWVRQAPGKGLEWVAWISPYGGSTYYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCARRHWPGGFDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号139);
および/または下記のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む:
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVSTAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYLYHPATFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号140)。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、抗PD-L1抗体アベルマブ(別名MSB0010718C)、またはそのフラグメントを含む。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のためのアベルマブまたはその抗原結合フラグメントは、下記のアミノ酸配列を含む重鎖:
EVQLLESGGG LVQPGGSLRL SCAASGFTFS
SYIMMWVRQA PGKGLEWVSS IYPSGGITFY
ADTVKGRFTI SRDNSKNTLY LQMNSLRAED
TAVYYCARIK LGTVTTVDYW GQGTLVTVSS
ASTKGPSVFP LAPSSKSTSG GTAALGCLVK
DYFPEPVTVS WNSGALTSGV HTFPAVLQSS
GLYSLSSVVT VPSSSLGTQT YICNVNHKPS
NTKVDKKVEP KSCDKTHTCP PCPAPELLGG
PSVFLFPPKP KDTLMISRTP EVTCVVVDVS
HEDPEVKFNW YVDGVEVHNA KTKPREEQYN
STYRVVSVLT VLHQDWLNGK EYKCKVSNKA
LPAPIEKTIS KAKGQPREPQ VYTLPPSRDE
LTKNQVSLTC LVKGFYPSDI AVEWESNGQP
ENNYKTTPPV LDSDGSFFLY SKLTVDKSRW
QQGNVFSCSV MHEALHNHYT QKSLSLSPGK
(配列番号141);
および/または下記のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む:
QSALTQPASV SGSPGQSITI SCTGTSSDVG
GYNYVSWYQQ HPGKAPKLMI YDVSNRPSGV
SNRFSGSKSG NTASLTISGL QAEDEADYYC
SSYTSSSTRV FGTGTKVTVL GQPKANPTVT
LFPPSSEELQ ANKATLVCLI SDFYPGAVTV
AWKADGSPVK AGVETTKPSK QSNNKYAASS
YLSLTPEQWK SHRSYSCQVT HEGSTVEKTV
APTECS(配列番号142)。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、米国特許出願公開第2013/0309250号および国際公開第2007/005874号に開示のように、抗PD-L1抗体BMS-936559(別名12A4、MDX-1105)、またはそのフラグメントを含み、これら特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のためのBMS-936559またはその抗原結合フラグメントは、下記のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域:
QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKTSGDTFSTYAISWVRQAPGQGLEWMGGIIPIFGKAHY AQKFQGRVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYFCARKFHFVSGSPFGMDVWGQGTTVT VSS(配列番号143);
および/または下記のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む:
EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYDASNRATGIPA RFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYCQQRSNWPTFGQGTKVEIK(配列番号144)。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、米国特許出願公開第2013/0309250号および国際公開第2007/005874号に開示のように、抗PD-L1抗体3G10、またはそのフラグメントを含み、これら特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のための3G10またはその抗原結合フラグメントは、下記のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域:
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTDYGFSWVRQAPGQGLEWMGWITAYNGNTNY AQKLQGRVTMTTDTSTSTVYMELRSLRSDDTAVYYCARDYFYGMDVWGQGTTVTVSS(配列番号145);
および/または下記のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む:
EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLVWYQQKPGQAPRLLIYDASNRATGIPA RFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYCQQRSNWPRTFGQGTKVEIK(配列番号146)。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、米国特許出願公開第2013/0309250号および国際公開第2007/005874号に開示のように、抗PD-L1抗体10A5、またはそのフラグメントを含み、これら特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のための10A5またはその抗原結合フラグメントは、下記のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域:
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYDVHWVRQAPGQRLEWMGWLHADTGITKF SQKFQGRVTITRDTSASTAYMELSSLRSEDTAVYYCARERIQLWFDYWGQGTLVTVSS(配列番号147);
および/または下記のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む:
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQGISSWLAWYQQKPEKAPKSLIYAASSLQSGVPS RFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYNSYPYTFGQGTKLEIK(配列番号148)。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、米国特許出願公開第2013/0309250号および国際公開第2007/005874号に開示のように、抗PD-L1抗体5F8、またはそのフラグメントを含み、これら特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のための5F8またはその抗原結合フラグメントは、下記のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域:
QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKVSGGIFSTYAINWVRQAPGQGLEWMGGIIPIFGTANH AQKFQGRVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARDQGIAAALFDYWGQGTLVTVSS(配列番号149);
および/または下記のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む:
EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSCRASQSVSSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYGASSRATGIP DRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQYGSSPWTFGQGTKVEIK(配列番号150)。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、米国特許出願公開第2013/0309250号および国際公開第2007/005874号に開示のように、抗PD-L1抗体10H10、またはそのフラグメントを含み、これら特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のための10H10またはその抗原結合フラグメントは、下記のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域:
EVQLVESGGGLVQPGRSLRLSCAVSGFTFDDYVVHWVRQAPGKGLEWVSGISGNSGNIGY ADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTALYYCAVPFDYWGQGTLVTVSS(配列番号151);
および/または下記のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む:
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQGISSWLAWYQQKPEKAPKSLIYAASSLQSGVPS RFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYNSYPYTFGQGTKLEIK(配列番号152)。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、米国特許出願公開第2013/0309250号および国際公開第2007/005874号に開示のように、抗PD-L1抗体1B12、またはそのフラグメントを含み、これら特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のための1B12またはその抗原結合フラグメントは、下記のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域:
QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKTSGDTFSSYAISWVRQAPGQGLEWMGGIIPIFGRAHY
AQKFQGRVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYFCARKFHFVSGSPFGMDVWGQGTTVT VSS(配列番号153);
および/または下記のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む:
EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYDASNRATGIPA RFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYCQQRSNWPTFGQGTKVEIK(配列番号154)。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、米国特許出願公開第2013/0309250号および国際公開第2007/005874号に開示のように、抗PD-L1抗体7H1、またはそのフラグメントを含み、これら特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のための7H1またはその抗原結合フラグメントは、下記のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域:
QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKTSGGTFSSYAISWVRQAPGQGLEWMGGIIPIFGKAHY AQKFQGRVTITADESTTTAYMELSSLRSEDTAVYYCARKYDYVSGSPFGMDVWGQGTTVT VSS(配列番号155);
および/または下記のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む:
EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYDASNRATGIPA RFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYCQQRSNWPTFGQGTKVEIK(配列番号156)。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、米国特許出願公開第2013/0309250号および国際公開第2007/005874号に開示のように、抗PD-L1抗体11E6、またはそのフラグメントを含み、これら特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のための11E6またはその抗原結合フラグメントは、下記のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域:
QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGGTFSSYAINWVRQAPGQGLEWMGGIIPIFGSANY AQKFQDRVTITADESTSAAYMELSSLRSEDTAVYYCARDSSGWSRYYMDVWGQGTTVTVS S(配列番号157);
および/または下記のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む:
EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSCRASQSVSSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYGASSRATGIP DRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQYGSSPFGGGTKVEIK(配列番号158)。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、米国特許出願公開第2013/0309250号および国際公開第2007/005874号に開示のように、抗PD-L1抗体12B7、またはそのフラグメントを含み、これら特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のための12B7またはその抗原結合フラグメントは、下記のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域:
QVQLVQSGAEVKEPGSSVKVSCKASGGTFNSYAISWVRQAPGQGLEWMGGIIPLFGIAHY AQKFQGRVTITADESTNTAYMDLSSLRSEDTAVYYCARKYSYVSGSPFGMDVWGQGTTVT VSS(配列番号159);
および/または下記のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む:
EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYDASNRATGIPA RFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYCQQRSNWPTFGQGTRLEIK(配列番号160)。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、米国特許出願公開第2013/0309250号および国際公開第2007/005874号に開示のように、抗PD-L1抗体13G4、またはそのフラグメントを含み、これら特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のための13G4またはその抗原結合フラグメントは、下記のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域:
EVQLVESGGGLVQPGRSLRLSCAASGITFDDYGMHWVRQAPGKGLEWVSGISWNRGRIEY ADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTALYYCAKGRFRYFDWFLDYWGQGTLVTVS S(配列番号161);
および/または下記のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む:
AIQLTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQGISSALAWYQQKPGKAPKLLIYDASSLESGVPS RFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQFNSYPFTFGPGTKVDIK(配列番号162)。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、米国特許出願公開第2014/0044738号に開示のように、抗PD-L1抗体1E12、またはそのフラグメントを含み、この特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のための1E12またはその抗原結合フラグメントは、下記のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域:
EVKLQESGPS LVKPSQTLSL TCSVTGYSIT
SDYWNWIRKF PGNKLEYVGY ISYTGSTYYN
PSLKSRISIT RDTSKNQYYL QLNSVTSEDT
ATYYCARYGG WLSPFDYWGQ GTTLTVSS(配列番号163);
および/または下記のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む:
DIVMTQSHKL MSTSVGDRVS ITCKASQDVG
TAVAWYQQKP GQSPKLLIYW ASTRHTGVPD
RFTGSGSGTD FTLTISNVQS EDLADYFCQQ
DSSYPLTFGA GTKVELK(配列番号164)。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、米国特許出願公開第2014/0044738号に開示のように、抗PD-L1抗体1F4、またはそのフラグメントを含み、この特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のための1F4またはその抗原結合フラグメントは、下記のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域:
EVQLQESGPG LVAPSQSLSI TCTVSGFSLT
TYSINWIRQP PGKGLEWLGV MWAGGGTNSN
SVLKSRLIIS KDNSKSQVFL KMNSLQTDDT
ARYYCARYYG NSPYYAIDYW GQGTSVTVSS
(配列番号165);
および/または下記のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む:
DIVTTQSHKL MSTSVGDRVS ITCKASQDVG
TAVAWYQQKP GQSPKLLIYW ASTRHTGVPD
RFTGSGSGTD FTLTISNVQS EDLADYFCQQ
DSSYPLTFGA GTKVELK(配列番号166)。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、米国特許出願公開第2014/0044738号に開示のように、抗PD-L1抗体2G11、またはそのフラグメントを含み、この特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のための2G11またはその抗原結合フラグメントは、下記のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域:
EVKLQESGPS LVKPSQTLSL TCSVTGYSII
SDYWNWIRKF PGNKLEYLGY ISYTGSTYYN
PSLKSRISIT RDTSKNQYYL QLNSVTTEDT
ATYYCARRGG WLLPFDYWGQ GTTLTVSS
(配列番号167);
および/または下記のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む:
DIVMTQSPSS LAVSVGEKVS MGCKSSQSLL
YSSNQKNSLA WYQQKPGQSP KLLIDWASTR
ESGVPDRFTG SGSGTDFTLT ISSVKAEDLA
VYYCQQYYGY PLTFGAGTKL ELK(配列番号168)。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、米国特許出願公開第2014/0044738号に開示のように、抗PD-L1抗体3B6、またはそのフラグメントを含み、この特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のための3B6またはその抗原結合フラグメントは、下記のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域:
EVKLQESGPS LVKPGASVKL SCKASGYTFT
SYDINWVKQR PGQGLEWIGW IFPRDNNTKY
NENFKGKATL TVDTSSTTAY MELHSLTSED
SAVYFCTKEN WVGDFDYWGQ GTTLTLSS(配列番号169);
および/または下記のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む:
DIVMTQSPAI MSASPGEKVT MTCSASSSIR
YMHWYQQKPG TSPKRWISDT SKLTSGVPAR
FSGSGSGTSY ALTISSMEAE DAATYYCHQR
SSYPWTFGGG TKLEIK(配列番号170)。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、米国特許出願公開第2014/0044738号および国際公開第2012/145493号に開示のように、抗PD-L1抗体3D10、またはそのフラグメントを含み、これらの特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のための3D10またはその抗原結合フラグメントは、下記のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域:
EVQLQQSGPD LVTPGASVRI SCQASGYTFP
DYYMNWVKQS HGKSLEWIGD IDPNYGGTTY
NQKFKGKAIL TVDRSSSTAY MELRSLTSED
SAVYYCARGA LTDWGQGTSL TVSS(配列番号171);
および/または下記のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む:
QIVLSQSPAI LSASPGEKVT MTCRASSSVS
YIYWFQQKPG SSPKPWIYAT FNLASGVPAR
FSGSGSGTSY SLTISRVETE DAATYYCQQW
SNNPLTFGAG TKLELK(配列番号172)。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、米国特許出願公開第2011/0271358号および国際公開第2010/036959号に開示のいずれか1種の抗PD-L1抗体を含み、これらの特許の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のための抗体またはその抗原結合フラグメントは、米国特許出願公開第2011/0271358号の下記の配列番号34~38から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖:
米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号34(配列番号173):
EVQLVQSGPELKKPGASVKMSCKASGYTFTSYVMHWVKQAPGQRLEWIGYVNPFNDGTKY NEMFKGRATLTSDKSTSTAYMELSSLRSEDSAVYYCARQAWGYPWGQGTLVTVSS;
米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号35(配列番号174):
EVQLVQSGAEVKKPGASVKMSCKASGYTFTSYVMHWVKQAPGQRLEWIGYVNPFNDGTKY NEMFKGRATLTSDKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARQAWGYPWGQGTLVTVSS;
米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号36(配列番号175):
EVQLVQSGAEVKKPGASVKMSCKASGYTFTSYVMHWVRQAPGQRLEWIGYVNPFNDGTKY NEMFKGRATLTSDKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARQAWGYPWGQGTLVTVSS;
米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号37(配列番号176):
EVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYVMHWVRQAPGQRLEWIGYVNPFNDGTKY NEMFKGRATLTSDKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARQAWGYPWGQGTLVTVSS;
米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号38(配列番号177):
EVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYVMHWVRQAPGQRLEWIGYVNPFNDGTKY NEMFKGRATITSDKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARQAWGYPWGQGTLVTVSS;
および/または、米国特許出願公開第2011/0271358号の下記の配列番号39~42から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖を含む:
米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号39(配列番号178):
DIVLTQSPASLALSPGERATLSCRATESVEYYGTSLVQWYQQKPGQPPKLLIYAASSVDS GVPSRFSGSGSGTDFTLTINSLEEEDAAMYFCQQSRRVPYTFGQGTKLEIK;
米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号40(配列番号179):
DIVLTQSPATLSLSPGERATLSCRATESVEYYGTSLVQWYQQKPGQPPKLLIYAASSVDS GVPSRFSGSGSGTDFTLTINSLEAEDAAMYFCQQSRRVPYTFGQGTKLEIK;
米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号41(配列番号180):
EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCRATESVEYYGTSLVQWYQQKPGQPPKLLIYAASSVDS GVPSRFSGSGSGTDFTLTINSLEAEDAAMYFCQQSRRVPYTFGQGTKLEIK;
米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号42(配列番号181):
DIVLTQSPATLSLSPGERATLSCRATESVEYYGTSLVQWYQQKPGQPPKLLIYAASSVDS GVPSRFSGSGSGTDFTLTINSLEAEDAATYFCQQSRRVPYTFGQGTKLEIK。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、国際公開第2011/066389号、米国特許第8,779,108号、および米国特許出願公開第2014/0356353号に開示のように、抗PD-L1抗体2.7A4、またはそのフラグメントを含み、これらの特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のための2.7A4またはその抗原結合フラグメントは、下記のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域:
国際公開第2011/066389号の配列番号2(配列番号182):
EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSTYSMNWVRQAPGKGLEWVSSISSSGDYIYY ADSVKGRFTISRDNAKNSLFLQMNSLKAEDTAVYYCARDLVTSMVAFDYWGQGTLVTVSS;
および/または下記のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む:
国際公開第2011/066389号の配列番号7(配列番号183):
SYELTQPPSVSVSPGQAARITCSGDALPQKYVFWYQQKSGQAPVLVIYEDSKRPSGIPER FSGSSSGTMATLTISGAQVEDEADYYCYSTDRSGNHRVFGGGTRLTVL。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、国際公開第2011/066389号、米国特許第8,779,108号、および米国特許出願公開第2014/0356353号に開示のように、抗PD-L1抗体2.9D10、またはそのフラグメントを含み、これらの特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のための2.9D10またはその抗原結合フラグメントは、下記のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域:
国際公開第2011/066389号の配列番号12(配列番号184):
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYWMSWVRQAPGKGLEWVANIKQDGGEQYY VDSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARDWNYGYYDMDVWGQGTTVTVSS;
および/または下記のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む:
国際公開第2011/066389号の配列番号17(配列番号185):
EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSCRASQSVSSNYLAWFQQKPGQAPRLLIFGTSSRATGIP DRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQYGSSIFTFGPGTKVDIK。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、国際公開第2011/066389号、米国特許第8,779,108号、および米国特許出願公開第2014/0356353号に開示のように、抗PD-L1抗体2.14H9、またはそのフラグメントを含み、これらの特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のための2.14H9またはその抗原結合フラグメントは、下記のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域:
国際公開第2011/066389号の配列番号22(配列番号186):
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSRYWMSWVRQAPGKGLEWVANIKQDGSEKYY VDSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAREGGWFGELAFDYWGQGTLVTVS S;
および/または下記のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む:
国際公開第2011/066389号の配列番号27(配列番号187):
EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSCRASQRVSSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYDASSRATGIP DRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQYGSLPWTFGQGTEVEIK。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、国際公開第2011/066389号、米国特許第8,779,108号、および米国特許出願公開第2014/0356353号に開示のように、抗PD-L1抗体2.20A8、またはそのフラグメントを含み、これらの特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のための2.20A8またはその抗原結合フラグメントは、下記のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域:
国際公開第2011/066389号の配列番号32(配列番号188):
EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSNYAMSWVRQAPGKGLEWVSAIRGSGGSTYY ADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKDLHYDSSGYLDYWGQGTLVTVS S;
および/または下記のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む:
国際公開第2011/066389号の配列番号37(配列番号189):
DIQMTQSPSSVSASVGDRVTITCRASQGIRSWLAWYQQKPGKAPKLLIYAISRLQSGVPS RFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQANSFPLTFGGGTKVEIK。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、国際公開第2011/066389号、米国特許第8,779,108号、および米国特許出願公開第2014/0356353号に開示のように、抗PD-L1抗体3.15G8、またはそのフラグメントを含み、これらの特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のための3.15G8またはその抗原結合フラグメントは、下記のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域:
国際公開第2011/066389号の配列番号42(配列番号190):
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYWMSWVRQAPGKGLEWVANIKQDGGEKYY VDSVKGRFTISRDNAKNSLFLQMNSLRAEDTAVYYCARVQLYSDYFDYWGQGTLVTVSS;
および/または下記のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む:
国際公開第2011/066389号の配列番号47(配列番号191):
DIQMTQSPSSVSASVGDRVTITCRASQGISSWLAWYQQKSGKAPKLLIYAASGLQSGVPS RFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDLATYYCQQSHSLPPTFGQGTKVEIK。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、国際公開第2011/066389号、米国特許第8,779,108号、および米国特許出願公開第2014/0356353号に開示のように、抗PD-L1抗体3.18G1、またはそのフラグメントを含む。これらの特許の全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のための3.18G1またはその抗原結合フラグメントは、下記のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域:
国際公開第2011/066389号の配列番号52(配列番号192):
EVQLLESGGDLVQPGGSLRLSCAASGFTFNSYAMSWVRQAPGKGLEWVSTISGSGGFTFS ADSVKGRFTISRDNSKNTLFLQMNSLRVEDSAVYSCAKVLVGFNNGCWDYWGQGTLVTVS S;
および/または下記のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む:
国際公開第2011/066389号の配列番号57(配列番号193):
SYVLTQPPSVSVAPGQTARITCGGNNIGSKSVHWYQQKPGQAPVLVVYDDSDRPSGIPER FSGSNSGNTATLTISRVEAGDEADYYCQVWDSSNDHVVFGGGTKLTVL。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、国際公開第2011/066389号、米国特許第8,779,108号、および米国特許出願公開第2014/0356353号、および米国特許出願公開第2014/0356353号に開示のように、抗PD-L1抗体2.7A4OPT、またはそのフラグメントを含み、これらの特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のための2.7A4OPTまたはその抗原結合フラグメントは、下記のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域:
国際公開第2011/066389号の配列番号62(配列番号194):
EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSTYSMNWVRQAPGKGLEWVSSISSSGDYIYY ADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARDLVTSMVAFDYWGQGTLVTVSS;
および/または下記のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む:
国際公開第2011/066389号の配列番号67(配列番号195):
SYELTQPPSVSVSPGQTARITCSGDALPQKYVFWYQQKSGQAPVLVIYEDSKRPSGIPER FSGSSSGTMATLTISGAQVEDEADYYCYSTDRSGNHRVFGGGTKLTVL。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、国際公開第2011/066389号、米国特許第8,779,108号、および米国特許出願公開第2014/0356353号に開示のように、抗PD-L1抗体2.14H9OPT、またはそのフラグメントを含み、これらの特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のための2.14H9OPTまたはその抗原結合フラグメントは、下記のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域:
国際公開第2011/066389号の配列番号72(配列番号196):
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSRYWMSWVRQAPGKGLEWVANIKQDGSEKYY VDSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAREGGWFGELAFDYWGQGTLVTVS S;
および/または下記のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む:
国際公開第2011/066389号の配列番号77(配列番号197):
EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSCRASQRVSSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYDASSRATGIP DRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQYGSLPWTFGQGTKVEIK。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、国際公開第2016/061142号に開示されるいずれか1種の抗PD-L1抗体を含み、この特許の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のための抗体またはその抗原結合フラグメントは、国際公開第2016/061142号の下記の配列番号18、30、38、46、50、54、62、70、および78から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖:
国際公開第2016/061142号の配列番号18(配列番号198):
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYWMYWVRQATGQGLEWMGRIDPNSGSTKY NEKFKNRFTISRDDSKNTAYLQMNSLKTEDTAVYYCARDYRKGLYAMDYWGQGTTVTVSS;
国際公開第2016/061142号の配列番号30(配列番号199):
EVQLVQSGAEVKKPGATVKISCKVSGYTFTSYWMYWVRQATGQGLEWMGRIDPNSGSTKY NEKFKNRVTITADKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARDYRKGLYAMDYWGQGTTVTVSS;
国際公開第2016/061142号の配列番号38(配列番号200):
EVQLVQSGAEVKKPGESLRISCKGSGYTFTSYWMYWVRQAPGQGLEWMGRIDPNSGSTKY NEKFKNRVTISVDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCARDYRKGLYAMDYWGQGTTVTVSS;
国際公開第2016/061142号の配列番号46(配列番号201):
EVQLVQSGAEVKKPGATVKISCKVSGYTFTSYWMYWIRQSPSRGLEWLGRIDPNSGSTKY NEKFKNRLTISKDTSKNQVVLTMTNMDPVDTATYYCARDYRKGLYAMDYWGQGTTVTVSS;
国際公開第2016/061142号の配列番号50(配列番号202):
EVQLVQSGAEVKKPGESLRISCKGSGYTFTSYWMYWIRQPPGKGLEWIGRIDPNSGSTKY NEKFKNRVTITADKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARDYRKGLYAMDYWGQGTTVTVSS;
国際公開第2016/061142号の配列番号54(配列番号203):
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYWMYWIRQSPSRGLEWLGRIDPNSGSTKY NEKFKNRFTISRDDSKNTAYLQMNSLKTEDTAVYYCARDYRKGLYAMDYWGQGTTVTVSS;
国際公開第2016/061142号の配列番号62(配列番号204):
EVQLVQSGAEVKKPGESLRISCKGSGYTFTSYWMYWVRQARGQRLEWIGRIDPNSGSTKY NEKFKNRLTISKDTSKNQVVLTMTNMDPVDTATYYCARDYRKGLYAMDYWGQGTTVTVSS;
国際公開第2016/061142号の配列番号70(配列番号205):
QITLKESGPTLVKPTQTLTLTCTFSGYTFTSYWMYWVRQAPGKGLEWVSRIDPNSGSTKY NEKFKNRVTITADKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARDYRKGLYAMDYWGQGTTVTVSS;
国際公開第2016/061142号の配列番号78(配列番号206):
EVQLVQSGAEVKKPGATVKISCKVSGYTFTSYWMYWVRQARGQRLEWIGRIDPNSGSTKY NEKFKNRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARDYRKGLYAMDYWGQGTTVTVSS;
および/または、国際公開第2016/061142号の下記の配列番号22、26、34、42、58、66、74、82、および86から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖を含む:
国際公開第2016/061142号の配列番号22(配列番号207):
DIVMTQTPLSLPVTPGEPASISCKASQDVGTAVAWYLQKPGQSPQLLIYWASTRHTGIPA RFSGSGSGTEFTLTISSLQSEDFAVYYCQQYNSYPLTFGQGTKVEIK;
国際公開第2016/061142号の配列番号26(配列番号208):
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQDVGTAVAWYLQKPGQSPQLLIYWASTRHTGVPS RFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYNSYPLTFGQGTKVEIK;
国際公開第2016/061142号の配列番号34(配列番号209):
EIVLTQSPDFQSVTPKEKVTITCKASQDVGTAVAWYLQKPGQSPQLLIYWASTRHTGVPD RFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCQQYNSYPLTFGQGTKVEIK;
国際公開第2016/061142号の配列番号42(配列番号210):
EIVLTQSPDFQSVTPKEKVTITCKASQDVGTAVAWYLQKPGQSPQLLIYWASTRHTGVPS RFSGSGSGTDFTFTISSLQPEDIATYYCQQYNSYPLTFGQGTKVEIK.
国際公開第2016/061142号の配列番号58(配列番号211):
EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCKASQDVGTAVAWYLQKPGQSPQLLIYWASTRHTGIPP RFSGSGYGTDFTLTINNIESEDAAYYFCQQYNSYPLTFGQGTKVEIK;
国際公開第2016/061142号の配列番号66(配列番号212):
DVVMTQSPLSLPVTLGQPASISCKASQDVGTAVAWYQQKPGQAPRLLIYWASTRHTGVPS RFSGSGSGTEFTLTISSLQPDDFATYYCQQYNSYPLTFGQGTKVEIK;
国際公開第2016/061142号の配列番号74(配列番号213):
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQDVGTAVAWYQQKPGQAPRLLIYWASTRHTGVPS RFSGSGSGTDFTFTISSLQPEDIATYYCQQYNSYPLTFGQGTKVEIK;
国際公開第2016/061142号の配列番号82(配列番号214):
AIQLTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQDVGTAVAWYLQKPGQSPQLLIYWASTRHTGVPS RFSGSGSGTDFTFTISSLEAEDAATYYCQQYNSYPLTFGQGTKVEIK;
国際公開第2016/061142号の配列番号86(配列番号215):
EIVLTQSPDFQSVTPKEKVTITCKASQDVGTAVAWYQQKPGQAPRLLIYWASTRHTGVPS RFSGSGSGTEFTLTISSLQPDDFATYYCQQYNSYPLTFGQGTKVEIK。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、国際公開第2016/022630号に開示されるいずれか1種の抗PD-L1抗体を含み、この特許の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のための抗体またはその抗原結合フラグメントは、国際公開第2016/022630号の下記の配列番号2、6、10、14、18、22、26、30、34、38、42、および46から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖:
国際公開第2016/022630号の配列番号2(配列番号216):
EVKLVESGGGLVKPGGSLKLSCAASGFIFRSYGMSWVRQTPEKRLEWVASISSGGSTYYP DSVKGRFTISRDNARNILYLQMSSLRSEDTAMYDCARGYDSGFAYWGQGTLVTVSE;
国際公開第2016/022630号の配列番号6(配列番号217):
EVKLVESGGGLVKPGGSLKLSCAASGFTFRSYGMSWVRQTPEKRLEWVASISSGGTTYYP DSVKGRFIISRDNARNILYLQMSSLRSEDTAMYYCAKGYDSGFAYWGQGTLVIVSA;
国際公開第2016/022630号の配列番号10(配列番号218):
QVQLKQSGPGLVQPSQSLSITCTVSGFSLTTYGVHWVRQSPGKGLEWLGVIWRGVTTDYN AAFMSRLTITKDNSKSQVFFKMNSLQANDTAIYYCARLGFYAMDYWGQGTSVTVSS;
国際公開第2016/022630号の配列番号14(配列番号219):
QVQLKQSGPGLVQPSQSLSITCTVSGFSLTSYGVHWVRQSPGKGLEWLGVIWSGGVTDYN AAFISRLSISKDNSKSQVFFKMNSLQANDTAIYYCARLGFYAMDYWGQGTSVTVSS;
国際公開第2016/022630号の配列番号18(配列番号220):
EVKLFESGGGLVQPGGSLKLSCVASGFDFSTYWMHWVRQAPGQGLEWIGQINPDSTTINY APSLKDRFIISRDNAKNTLFLQMSKVRSEDTALYYCAKPGDYGYDFDCWGQGTTLTVSS;
国際公開第2016/022630号の配列番号22(配列番号221):
EVQLQESGPSLVKPSQTLSLTCSVTGDSITSGYWNWIRKFPGNKLEYMGYISYSGSTYYN PSLKSRISITRDTSKNQYYLQLNSVTTEDTATYYCARSLLWFSTGFAYWGQGTLVTVSA;
国際公開第2016/022630号の配列番号26(配列番号222):
QVQLKQSGPGLVQPSQSLSITCTVSGFSLTSYGVHWVRQSPGKGLEWLGVIWSGGITDYN AAFKSRLSISKDNSKSQVFFKMNSLQANDTAIYFCARLGFYAMDYWGQGTSVTVSS;
国際公開第2016/022630号の配列番号30(配列番号223):
EVKLVESGGGLVKPGGSLKLSCAASGFTFRSYGMSWARQIPEKRLEWVASISSGGTTYYL GSVQGRFTISRDNARNILYLQMSSLRSEDTAMYYCARGYDAGFAYWGQGTLVSVSE;
国際公開第2016/022630号の配列番号34(配列番号224):
EVQLQESGPSLVKPSQTLSLTCSVTGDSITSGYWTWIRKFPGNKLEYMGYISYTGSTYYN PSLKSRISISRDTSKSQYYLQLNSVTTEDTATYYCARQRDWLGFAYWGQGTLVTVSA;
国際公開第2016/022630号の配列番号38(配列番号225):
EEKLVESGGGLVKPGGSLKLSCAASGFSFSSYGMSWVRQTPEKRLEWVASISSGGSIYYP DSVKGRFTISRDNARNILYLQMSSLRSEDTAMYYCARGYDAGFAFWGQGTLVTASA;
国際公開第2016/022630号の配列番号42(配列番号226):
QITLKESGPTLVKPTQTLTLTCTVSGFSLSTYGVHWIRQPPGKALEWLGVIWRGVTTDYN AAFMSRLTITKDNSKNQVVLTMNNMDPVDTATYYCARLGFYAMDYWGQGTLVTVSS;
国際公開第2016/022630号の配列番号46(配列番号227):
EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFIFRSYGMSWVRQAPGKGLEWVASISSGGSTYYP DSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYDCARGYDSGFAYWGQGTLVTVSS;
および/または、国際公開第2016/022630号の下記の配列番号4、8、12、16、20、24、28、32、36、40、44、および48から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖を含む:
国際公開第2016/022630号の配列番号4(配列番号228):
DIVLTQSPASLAVSLGQRATISCRASQSVSTSSSSFMHWYQQKPGQPPKLLIKYASNLES GVPARFSGSGSGTDFTLNIHPVEEEDTATYYCQHSWEIPYTFGGGTKLEIKR;
国際公開第2016/022630号の配列番号8(配列番号229):
DIVLTQSPPSLAVSLGQRATISCRASQSVSTSSSSYMHWYQQKPGQPPKLLIKYASNLES GVPARFSGSGSGTDFTLNIHPVEEEDTATYYCQHSWEIPYTFGGGTKLEIK;
国際公開第2016/022630号の配列番号12(配列番号230):
SIVMTQTPKFLLVSAGDRVTITCKASQSVSNDVAWYQQKPGQSPKLLIYYAANRYTGVPD RFTGSGYGTDFTFTISIVQAEDLAVYFCQQDYTSPYTFGGGTKLEIK;
国際公開第2016/022630号の配列番号16(配列番号231):
SIVMTQTPKFLLVSAGDRVTITCKASQSVSNDVGWYQQKPGQSPKLLIYYASNRYSGVPD RFTGSGYGTDFTFTISTVQAEDLAVYFCQQDYTSPYTFGGGTKLEIK;
国際公開第2016/022630号の配列番号20(配列番号232):
DVLMTQTPLYLPVSLGDQASISCRSSQIIVHSNANTYLEWFLQKPGQSPKLLIYKVSNRF SGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDLGVYYCFQGSHVPYTFGGGTKLEIK;
国際公開第2016/022630号の配列番号24(配列番号233):
QIVLTQSPAIMSASPGEKVTLTCSASSSVSSSYLYWNQQKPGSSPKVWIYNTSNLASGVP ARFSGSGSGTSYSLTISSMEAEDAASYFCHQWRSYPPTLGAGTKLELK;
国際公開第2016/022630号の配列番号28(配列番号234):
QIVLTQSPAIMSASPGEKVTMTCSANSSVSYMHWYQQKSGTSPKRWIYDTSKLASGVPAR FSGSGSGTSYSLTISSMGAEDAATYYCQQWSSNPWTFGGGTKLEIK;
国際公開第2016/022630号の配列番号32(配列番号235):
DIVLTQSPASLAVSLGQRATISCRASQSVSTSSYSYMHWYQQKPGQPPKLLIKYASNLES GVPARFSGSGSGTDFTLNIHPVEEEDTATYYCQNSWEIPYTFGGGTKLEIK;
国際公開第2016/022630号の配列番号36(配列番号236):
DIVMTQTPSSLAVSLGEKVTMSCKSSQSLLYSSNQKNSLAWYQQKPGQSPKLLIYWASNR ESGVPDRFTGSSSGTDFTLTISSVKAEDLAVYYCQQYYSYPLTFGAGTKLELK;
国際公開第2016/022630号の配列番号40(配列番号237):
DIVLTQSPASLAVSLGQRATISCRASQSVSTSSYSYVHWYQQKPGQPPKLLIKYASNLES GVPARFSGSGSGTDFTLNIHPVEEEDTATYYCQHSWEIPYTFGGGTKLEIK;
国際公開第2016/022630号の配列番号44(配列番号238):
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQSVSNDVAWYQQKPGKAPKLLIYYAANRYTGVPD RFSGSGYGTDFTFTISSLQPEDIATYFCQQDYTSPYTFGQGTKLEIK;
国際公開第2016/022630号の配列番号48(配列番号239):
DIVLTQSPASLAVSPGQRATITCRASQSVSTSSSSFMHWYQQKPGQPPKLLIKYASNLES GVPARFSGSGSGTDFTLTINPVEANDTANYYCQHSWEIPYTFGQGTKLEIK。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、国際公開第2015/112900号に開示されるいずれか1種の抗PD-L1抗体を含み、この特許の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のための抗体またはその抗原結合フラグメントは、国際公開第2015/112900号の下記の配列番号38、50、82、および86から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖:
国際公開第2015/112900号の配列番号38(配列番号240):
EVQLVQSGAEVKKPGESLRISCKGSGYTFTTYWMHWVRQATGQGLEWMGNIYPGTGGSNF DEKFKNRVTITADKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCTRWTTGTGAYWGQGTTVTVSS;
国際公開第2015/112900号の配列番号50(配列番号241):
EVQLVQSGAEVKKPGESLRISCKGSGYTFTTYWMHWIRQSPSRGLEWLGNIYPGTGGSNF DEKFKNRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCTRWTTGTGAYWGQGTTVTVSS;
国際公開第2015/112900号の配列番号82(配列番号242):
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTTYWMHWIRQSPSRGLEWLGNIYPGTGGSNF DEKFKNRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCTRWTTGTGAYWGQGTTVTVSS;
国際公開第2015/112900号の配列番号86(配列番号243):
EVQLVQSGAEVKKPGESLRISCKGSGYTFTTYWMHWVRQAPGQGLEWMGNIYPGTGGSNF DEKFKNRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCTRWTTGTGAYWGQGTTVTVSS;
および/または、国際公開第2015/112900号の下記の配列番号42、46、54、58、62、66、70、74、および78から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖を含む:
国際公開第2015/112900号の配列番号42(配列番号244):
EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCKSSQSLLDSGNQKNFLTWYQQKPGQAPRLLIYWASTR ESGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPDDFATYYCQNDYSYPYTFGQGTKVEIK;
国際公開第2015/112900号の配列番号46(配列番号245):
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKSSQSLLDSGNQKNFLTWYQQKPGQAPRLLIYWASTR ESGIPPRFSGSGYGTDFTLTINNIESEDAAYYFCQNDYSYPYTFGQGTKVEIK;
国際公開第2015/112900号の配列番号54(配列番号246):
EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCKSSQSLLDSGNQKNFLTWYQQKPGKAPKLLIYWASTR ESGVPSRFSGSGSGTDFTFTISSLQPEDIATYYCQNDYSYPYTFGQGTKVEIK;
国際公開第2015/112900号の配列番号58(配列番号247):
DIVMTQTPLSLPVTPGEPASISCKSSQSLLDSGNQKNFLTWYQQKPGQAPRLLIYWASTR ESGVPSRFSGSGSGTDFTFTISSLEAEDAATYYCQNDYSYPYTFGQGTKVEIK;
国際公開第2015/112900号の配列番号62(配列番号248):
EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCKSSQSLLDSGNQKNFLTWYQQKPGKAPKLLIYWASTR ESGVPSRFSGSGSGTDFTFTISSLEAEDAATYYCQNDYSYPYTFGQGTKVEIK;
国際公開第2015/112900号の配列番号66(配列番号249):
EIVLTQSPDFQSVTPKEKVTITCKSSQSLLDSGNQKNFLTWYQQKPGQAPRLLIYWASTR ESGVPSRFSGSGSGTDFTFTISSLEAEDAATYYCQNDYSYPYTFGQGTKVEIK;
国際公開第2015/112900号の配列番号70(配列番号250):
EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCKSSQSLLDSGNQKNFLTWYQQKPGQAPRLLIYWASTR ESGVPSRFSGSGSGTDFTFTISSLEAEDAATYYCQNDYSYPYTFGQGTKVEIK;
国際公開第2015/112900号の配列番号74(配列番号251):
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKSSQSLLDSGNQKNFLTWYLQKPGQSPQLLIYWASTR ESGVPSRFSGSGSGTDFTFTISSLEAEDAATYYCQNDYSYPYTFGQGTKVEIK;
国際公開第2015/112900号の配列番号78(配列番号252):
DVVMTQSPLSLPVTLGQPASISCKSSQSLLDSGNQKNFLTWYQQKPGKAPKLLIYWASTR ESGVPSRFSGSGSGTDFTFTISSLEAEDAATYYCQNDYSYPYTFGQGTKVEIK。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、国際公開第2010/077634号および米国特許第8,217,149号に開示されるいずれか1種の抗PD-L1抗体を含み、これらの特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のための抗PD-L1またはその抗原結合フラグメントは、下記のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域:
国際公開第2010/077634号の配列番号20(配列番号253):
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSDSWIHWVRQAPGKGLEWVAWISPYGGSTYY ADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCARRHWPGGFDYWGQGTLVTVSA;
および/または下記のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む:
国際公開第2010/077634号の配列番号21(配列番号254)
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVSTAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPS RFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYLYHPATFGQGTKVEIKR。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、米国特許出願公開第20120039906号に開示されるように、CNCM受託番号CNCM I-4122、CNCM I-4080およびCNCM I-4081で入手可能なハイブリドーマから得られるいずれか1種の抗PD-L1抗体を含み、これらの特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、例えば、米国特許第8,907,065号および国際公開第2008/071447号に開示のように、PD-L1抗体に向けられたVHHを含み、これらの特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、PD-L1に対するVHHは、米国特許第8,907,065号の下記の配列番号394~399を含む:
米国特許第8,907,065号の配列番号394(配列番号255):
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTLDYYAIGWFRQAPGKEREWASS ISSSDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVFLQMNSLKPEDTAVYSCAASQ APITIATMMKPFYDYWGQGTQVTVSS;
米国特許第8,907,065号の配列番号395(配列番号256):
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTLDYYAKCWFRQAPGKEREWVSC ISSSDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYFCAARH GGPLTVEYFFDYWGQGTQVTVSS;
米国特許第8,907,065号の配列番号396(配列番号257):
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFDYYAIGWFRQAPGKAREGVSC ISGGDNSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATGG WKYCSGYDPEYIYWGQGTQVTVSS;
米国特許第8,907,065号の配列番号397(配列番号258):
EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGSTFSQYDVGWYRQAPGKQRELVA FSSSGGRTIYPDSVKGRFTFSRDNTKNTVYLQMTSLKPEDTAVYYCKIDW YLNSYWGQGTQVTVSS;
米国特許第8,907,065号の配列番号398(配列番号259):
EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGVDASNSAMGWYRQAPGKQREWVAR ITGGGLIAYTDSVKGRFTISRDNAKSTVYLQMNSLEPEDTAVYYCNTINS RDGWGQGTQVTVSS;
米国特許第8,907,065号の配列番号399(配列番号260):
EVQLVESGGGLVQAGGSLTISCAASGITFSDSIVSWYRRARGKQREWVAG ISNGGTTKYAESVLGRFTISRDNAKNNVYLQMNGLNPEDTAVYLCKVRQY WGQGTQVTVSS。
ある実施形態では、Clec9A結合物質は、下記の配列番号261などの、PDL-1に向けられたターゲティング部分を含む:
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTLDYYAKCWFRQAPGKEREWVSCISSSDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYFCAARHGGPLTVEYFFDYWGQGTQVTVSS
種々の実施形態では、本多重特異的Clec9A結合物質は、PD-L2に向けられた1つまたは複数のターゲティング部分を有する。いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質は、PD-L2ポリペプチドを選択的に結合する1つまたは複数のターゲティング部分を有する。いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質は、PD-L2ポリペプチドを選択的に結合する、抗体、抗体誘導体もしくはフォーマット、ペプチドもしくはポリペプチド、または融合タンパク質の1種または複数を含む。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、例えば、米国特許第8,907,065号および国際公開第2008/071447号に開示のように、PD-L2抗体に向けられたVHHを含み、これらの特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、PD-1に対するVHHは、米国特許第8,907,065号の下記の配列番号449~455を含む:
米国特許第8,907,065号の配列番号449(配列番号262):
EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASESTVLINAMGWYRQAPGKQRELVAS
ISSGGSTNYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCNADVY PQDYGLGYVEGKVYYGHDYWGTGTLVTVSS;
米国特許第8,907,065号の配列番号450(配列番号263):
EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGSTFSNYVSNYAMGWGRQAPGTQ RELVASISNGDTTNYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYY CFEHQVAGLTWGQGTQVTVSS;
米国特許第8,907,065号の配列番号451(配列番号264):
EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCVASGXALKIXVMGWYRQAPGKQRELV AAITSGGRTNYSDSVKGRFTISGDNAXNTVYLQMNSLKSEDTAVYYCRE WNSGYPPVDYWGQGTQVTVSS;
米国特許第8,907,065号の配列番号452(配列番号265):
EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGRTFSSGTMGWFRRAPGKEREFV ASIPWSGGRTYYADSVKDRFTISRDNAQNTVFLQMNSLKPEDTAVYYCAF KERSTGWDFASWGQGIQVTVSS;
米国特許第8,907,065号の配列番号453(配列番号266):
EVQLVESGGGLVQTGGSLRLSCAASGFTLDYYGIGWFRQAPGKEREGVS FISGSDGSTYYAESVKGRFTISRDKAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCAAD PWGPPSIATMTSYEYKHWGQGTQVTVSS;
米国特許第8,907,065号の配列番号454(配列番号267):
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSTYTMIWLRRAPGKGFEWV STIDKDGNTNYVDSVKGRFAVSRDNTKNTLYLQMNSLKPEDTAMYYCTK HGSSARGQGTRVTVSS;
米国特許第8,907,065号の配列番号455(配列番号268):
EVQLVESGGGLVEPGGSLRLSCVASGFTFSSYDMSWVRQAPGKGLE WVSTINSGGGITYRGSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMNSLKPEDTAVYY CENGGSSYRRGQGTQVTVSS。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、米国特許出願公開第2011/0271358号および国際公開第2010/036959号に開示のいずれか1種の抗PD-L2抗体を含み、これらの特許の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のための抗体またはその抗原結合フラグメントは、米国特許出願公開第2011/0271358号の下記の配列番号43~47から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖:
米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号43(配列番号269):
QVQLVQSGAELKKPGASVKMSCKASGYTFTGYTMHWVKQAPGQGLEWIGYINPRSGYTEY NQKFKDRTTLTADKSTSTAYMELSSLRSEDSAVYYCARPWFAYWGQGTLVTVSS;
米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号44(配列番号270):
QVQLVQSGAEVKKPGASVKMSCKASGYTFTGYTMHWVKQAPGQGLEWIGYINPRSGYTEY NQKFKDRTTLTADKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARPWFAYWGQGTLVTVSS;
米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号45(配列番号271):
QVQLVQSGAEVKKPGASVKMSCKASGYTFTGYTMHWVRQAPGQGLEWIGYINPRSGYTEY NQKFKDRTTLTADKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARPWFAYWGQGTLVTVSS;
米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号46(配列番号272):
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTGYTMHWVRQAPGQGLEWIGYINPRSGYTEY NQKFKDRTTLTADKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARPWFAYWGQGTLVTVSS;
米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号47(配列番号273):
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTGYTMHWVRQAPGQGLEWIGYINPRSGYTEY NQKFKDRTTITADKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARPWFAYWGQGTLVTVSS;
および/または、米国特許出願公開第2011/0271358号の下記の配列番号48~51から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖を含む:
米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号48(配列番号274):
DIVMTQSPASLTVTPGEKVTITCKSSQSLLNSGNQKNYLTWYQQKPGQPPKLLIYWASTR ESGVPDRFTGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCQNDYSYPLTFGQGTKLEIK;
米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号49(配列番号275):
DIVMTQSPASLSVTPGEKVTITCKSSQSLLNSGNQKNYLTWYQQKPGQPPKLLIYWASTR ESGVPDRFTGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCQNDYSYPLTFGQGTKLEIK;
米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号50(配列番号276):
DIVMTQSPAFLSVTPGEKVTITCKSSQSLLNSGNQKNYLTWYQQKPGQPPKLLIYWASTR ESGVPDRFTGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCQNDYSYPLTFGQGTKLEIK;
米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号51(配列番号277):
DIVMTQSPAFLSVTPGEKVTITCKSSQSLLNSGNQKNYLTWYQQKPGQPPKLLIYWASTR ESGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCQNDYSYPLTFGQGTKLEIK。
種々の実施形態では、本発明のターゲティング部分は、PD-1、PD-L1、および/またはPD-L2を標的とする配列、または本明細書で開示の配列のいずれかに少なくとも約60%、少なくとも約61%、少なくとも約62%、少なくとも約63%、少なくとも約64%、少なくとも約65%、少なくとも約66%、少なくとも約67%、少なくとも約68%、少なくとも約69%、少なくとも約70%、少なくとも約71%、少なくとも約72%、少なくとも約73%、少なくとも約74%、少なくとも約75%、少なくとも約76%、少なくとも約77%、少なくとも約78%、少なくとも約79%、少なくとも約80%、少なくとも約81%、少なくとも約82%、少なくとも約83%、少なくとも約84%、少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、または100%同一(例えば、本明細書で開示の配列のいずれかと約60%、または約61%、または約62%、または約63%、または約64%、または約65%、または約66%、または約67%、または約68%、または約69%、または約70%、または約71%、または約72%、または約73%、または約74%、または約75%、または約76%、または約77%、または約78%、または約79%、または約80%、または約81%、または約82%、または約83%、または約84%、または約85%、または約86%、または約87%、または約88%、または約89%、または約90%、または約91%、または約92%、または約93%、または約94%、または約95%、または約96%、または約97%、または約98%、約99%または約100%の配列同一性)である、本明細書に記載のいずれかの他の標的を含み得る。
種々の実施形態では、本発明のターゲティング部分は、本明細書で開示のPD-1、PD-L1、および/またはPD-L2を標的とする重鎖、軽鎖、重鎖可変領域、軽鎖可変領域、相補性決定領域(CDR)、およびフレームワーク領域配列の任意の組み合わせを含み得る。
PD-1、PD-L1および/またはPD-L2を選択的に結合するまたは標的とする追加の抗体、抗体誘導体またはフォーマット、ポリペプチドまたは融合タンパク質は、国際公開第2011/066389号、米国特許出願公開第2008/0025980号、米国特許出願公開第2013/0034559号、米国特許第8,779,108号、米国特許出願公開第2014/0356353号、米国特許第8,609,089号、米国特許出願公開第2010/028330号、米国特許出願公開第2012/0114649号、国際公開第2010/027827号、国際公開第2011/066342号、米国特許第8,907,065号、国際公開第2016/062722号、国際公開第2009/101611号、国際公開第2010/027827号、国際公開第2011/066342号、国際公開第2007/005874号、国際公開第2001/014556号、米国特許出願公開第2011/0271358号、国際公開第2010/036959号、国際公開第2010/077634号、米国特許第8,217,149号、米国特許出願公開第2012/0039906号、国際公開第2012/145493号、米国特許出願公開第2011/0318373号、米国特許第8,779,108号、米国特許出願公開第2014/0044738号、国際公開第2009/089149号、国際公開第2007/00587号、国際公開第2016/061142号、国際公開第2016/02263号、国際公開第2010/077634号、および国際公開第2015/112900で開示され、これらの特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。
種々の実施形態では、本発明の多重特異的Clec9A結合物質は、例えば樹状細胞上のXCR1に向けられた1つまたは複数のターゲティング部分を有する。例えば、ターゲティング部分は、いくつかの実施形態ではXCL1の全部もしくは一部またはXCR1を機能的に調節しない(例えば中和しない)抗XCR1物質を含む。
種々の実施形態では、多重特異的Clec9A結合物質は、非細胞構造の一部である標的(例えば、抗原、受容体)に特異的に結合する認識ドメインを有するターゲティング部分を有する。いくつかの実施形態では、抗原または受容体は、無傷の細胞または細胞構造の不可欠な構成要素ではない。いくつかの実施形態では、抗原または受容体は、細胞外の抗原または受容体である。いくつかの実施形態では、標的は、非タンパク質性の非細胞マーカーであり、これらは、限定されないが、例えば、壊死腫瘍細胞から放出されたDNA、などのDNAまたはRNAを含む、核酸またはコレステロールなどの細胞外沈着物を含む。
いくつかの実施形態では、目的の標的(例えば、抗原、受容体)は、ストローマもしくは細胞外マトリックス(ECM)の非細胞成分またはそれと関連するマーカーの一部である。本明細書で使用される場合、ストローマは、組織または器官の連結および支持フレームワークを指す。ストローマは、細胞外マトリックス(ECM)および細胞外分子と共に線維芽細胞/筋線維芽細胞/膠細胞、上皮、脂肪、免疫、血管、平滑筋、および免疫細胞などの細胞の寄せ集めを含み得る。種々の実施形態では、目的の標的(例えば、抗原、受容体)は、細胞外マトリックスおよび細胞外分子などのストローマの非細胞成分の一部である。本明細書で使用される場合、ECMは、全ての組織および器官内に存在する非細胞成分を指す。ECMは、限定されないが、タンパク質、糖タンパク質、プロテオグリカン、および多糖類を含む生化学的に別々の成分の多数の集まりからなる。ECMのこれらの成分は通常、隣接する細胞により産生され、エキソサイトーシスによりECM中に分泌される。分泌されると、ECM成分は多くの場合、集合して、巨大分子の複合体ネットワークを形成する。種々の実施形態では、本発明のキメラタンパク質は、ECMの任意の成分上に位置する標的(例えば、抗原または受容体または非タンパク質分子)を認識するターゲティング部分を含む。ECMの成分の例としては、限定されないが、プロテオグリカン、非プロテオグリカン多糖類、繊維および他のECMタンパク質またはECM非タンパク質、例えば、多糖類および/または脂質、またはECM関連分子(例えば、タンパク質または非タンパク質、例えば、多糖類、核酸および/または脂質)が挙げられる。
いくつかの実施形態では、ターゲティング部分は、ECMプロテオグリカン上の標的(例えば、抗原、受容体)を認識する。プロテオグリカンはグリコシル化タンパク質である。塩基性のプロテオグリカン単位は、1個または複数の共有結合グリコサミノグリカン(GAG)鎖を有するコアタンパク質を含む。プロテオグリカンは、正電荷のナトリウムイオン(Na+)を引き付ける正味負電荷を有し、これは浸透を介して水を引き付け、ECMおよび常在性細胞を水和した状態に保持する。プロテオグリカンはまた、ECM内の成長因子を捕捉し貯蔵し得る。本発明のキメラタンパク質により標的とされ得るプロテオグリカンの例としては、ヘパラン硫酸、コンドロイチン硫酸、およびケラタン硫酸が挙げられるが、これらに限定されない。ある実施形態では、ターゲティング部分は、ヒアルロン酸などの非プロテオグリカン多糖類上の標的(例えば、抗原、受容体)を認識する。
いくつかの実施形態では、ターゲティング部分は、ECM繊維上の標的(例えば、抗原、受容体)を認識する。ECM繊維は、コラーゲン繊維およびエラスチン繊維を含む。いくつかの実施形態では、ターゲティング部分は、コラーゲンまたはコラーゲン繊維上の1個または複数のエピトープを認識する。コラーゲンは、ECM中で最も豊富なタンパク質である。コラーゲンはECM中に線維性タンパク質として存在し、常在性細胞に対し構造支持を与える。1つまたは複数の実施形態では、ターゲティング部分は、限定されないが、線維性コラーゲン(I、II、III、V、XI型)、FACITコラーゲン(IX、XII、XIV型)、短鎖コラーゲン(VIII、X型)、基底膜コラーゲン(IV型)、および/またはVI、VII、またはXIII型コラーゲンを含む、ECM内に存在する様々な種類のコラーゲンを認識し、これに結合する。エラスチン繊維は組織に弾性を与え、それらが必要に応じ伸縮し、その後それらの元の状態に戻ることを可能にする。いくつかの実施形態では、ターゲティング部分は、エラスチンまたはエラスチン繊維上の1個または複数のエピトープを認識する。
いくつかの実施形態では、ターゲティング部分は、限定されないが、テネイシン、フィブロネクチン、フィブリン、ラミニン、またはナイドジェン/エンタクチンを含む、1種または複数のECMタンパク質を認識する。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、テネイシンを認識し、これに結合する。テネイシン(TN)ファミリーの糖タンパク質は、少なくとも4種のメンバー、テネイシン-C、テネイシン-R、テネイシン-X、およびテネイシン-Wを含む。テネイシンタンパク質の一次構造は、同じ連続する配列で順序づけられるいくつかの共通のモチーフ:アミノ末端7個の反復、上皮増殖因子(EGF)様反復、フィブロネクチンIII型ドメイン反復、およびカルボキシル末端フィブリノーゲン様球状ドメインを含む。それぞれのタンパク質メンバーは、EGF様およびフィブロネクチンIII型反復の数および性質における典型的な変動と関連付けられる。アイソフォームバリアントもまた、特にテネイシン-Cに関して存在する。27種を超えるテネイシン-Cのスプライスバリアントおよび/またはアイソフォームが知られている。特定の実施形態では、ターゲティング部分は、テネイシン-CA1を認識し、これに結合する。同様に、テネイシン-Rはまた、種々のスプライスバリアントおよびアイソフォームを有する。テネイシン-Rは通常、ダイマーまたはトリマーとして存在する。テネイシン-Xは、テネイシンファミリーの最大メンバーであり、トリマーとして存在することが知られている。テネイシン-Wは、トリマーとして存在する。いくつかの実施形態では、ターゲティング部分は、テネイシンタンパク質上の1個または複数のエピトープを認識する。いくつかの実施形態では、ターゲティング部分は、モノマーおよび/またはダイマーおよび/またはトリマーおよび/またはヘキサマー型のテネイシンタンパク質を認識する。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、フィブロネクチンを認識し、これに結合する。フィブロネクチンは、細胞をECM中のコラーゲン繊維と連結する糖タンパク質であり、細胞がECM中を移動することを可能にする。インテグリンへの結合時に、フィブロネクチンは折り畳みをほどいて機能的ダイマーを形成する。いくつかの実施形態では、ターゲティング部分は、モノマーおよび/またはダイマー型のフィブロネクチンを認識する。いくつかの実施形態では、ターゲティング部分は、フィブロネクチン上の1個または複数のエピトープを認識する。例示的実施形態では、ターゲティング部分は、フィブロネクチン細胞外ドメインA(EDA)またはフィブロネクチン細胞外ドメインB(EDB)を認識する。EDAレベルの上昇は、乾癬、関節リウマチ、糖尿病、および癌を含む種々の疾患および障害に関連する。いくつかの実施形態では、ターゲティング部分は、EDAアイソフォームを含むフィブロネクチンを認識し、キメラタンパク質を癌細胞を含む疾患細胞に向けるのに使用し得る。いくつかの実施形態では、ターゲティング部分は、EDBアイソフォームを含むフィブロネクチンを認識する。種々の実施形態では、このようなターゲティング部分は、キメラタンパク質を腫瘍新生血管を含む腫瘍細胞に向けるのに使用し得る。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、フィブリンを認識し、これに結合する。フィブリンは、ECMのマトリックスネットワーク中に見出されることが多い、もう1つのタンパク質物質である。フィブリンは、フィブリンを重合させるフィブリノーゲンに対するプロテアーゼトロンビンの作用により形成される。いくつかの実施形態では、ターゲティング部分は、フィブリン上の1個または複数のエピトープを認識する。いくつかの実施形態では、ターゲティング部分は、モノマーならびに重合型のフィブリンを認識する。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、ラミニンを認識し、これに結合する。ラミニンは、基底膜の主要成分であり、これは細胞および器官のためのタンパク質ネットワーク基盤である。ラミニンは、α鎖、β鎖、およびγ鎖を含むヘテロトリマータンパク質である。いくつかの実施形態では、ターゲティング部分は、ラミニン上の1個または複数のエピトープを認識する。いくつかの実施形態では、ターゲティング部分は、モノマー、ダイマーならびにトリマー型のラミニンを認識する。
ある実施形態では、ターゲティング部分は、ナイドジェンまたはエンタクチンを認識し、これらに結合する。ナイドジェン/エンタクチンは、高度に保存された硫酸化糖タンパク質ファミリーである。それらは基底膜の主要構造的成分をなし、基底膜中でラミニンとコラーゲンIVネットワークを連結するように機能する。このファミリーのメンバーは、ナイドジェン-1およびナイドジェン-2を含む。種々の実施形態では、ターゲティング部分は、ナイドジェン-1および/またはナイドジェン-2上のエピトープを認識する。
種々の実施形態では、ターゲティング部分は、本明細書に記載のいずれかの標的(例えば、ECMタンパク質)上に存在するエピトープを認識する抗原認識ドメインを含む。ある実施形態では、抗原認識ドメインは、タンパク質上に存在する1個または複数の線形エピトープを認識する。本明細書で使用される場合、線形エピトープは、タンパク質上に存在するアミノ酸の任意の連続配列を意味する。別の実施形態では、抗原認識ドメインは、タンパク質上に存在する1個または複数の立体構造エピトープを認識する。本明細書で使用される場合、立体構造エピトープは、抗原認識ドメインにより認識できる特徴および/または形状および/または三次構造を備えた3次元表面を形成する1個または複数のアミノ酸の部分(これは不連続であってよい)を指す。
種々の実施形態では、ターゲティング部分は、本明細書に記載のいずれかの標的(例えば、ECMタンパク質)の完全長型および/または成熟型および/またはアイソフォームおよび/またはスプライスバリアントおよび/またはフラグメントおよび/または任意の他の天然または合成の類似体、バリアント、または変異体に結合し得る。種々の実施形態では、ターゲティング部分は、モノマー、ダイマー、トリマー、テトラマー、ヘテロダイマー、マルチマーおよび会合型を含む、本明細書に記載の任意の型のタンパク質に結合し得る。種々の実施形態では、ターゲティング部分は、グリコシル化および/またはリン酸化型などの、本明細書に記載の任意の翻訳後修飾型のタンパク質に結合し得る。
種々の実施形態では、ターゲティング部分は、DNAなどの細胞外分子を認識する抗原認識ドメインを含む。いくつかの実施形態では、ターゲティング部分は、DNAを認識する抗原認識ドメインを含む。ある実施形態では、DNAは、壊死細胞またはアポトーシス腫瘍細胞または他の疾患細胞から細胞外間隙中に脱落する。
種々の実施形態では、ターゲティング部分は、アテローム斑と関連する1種または複数の非細胞構造を認識する抗原認識ドメインを含む。2つのタイプのアテローム斑が知られている。線維-脂質(線維-脂肪)斑(fibro-lipid(fibro-fatty)plaque)は、動脈の内膜の下の脂質を取り込んだ(lipid-laden)細胞の蓄積を特徴とする。内皮の下には、アテローム性のプラークコアを覆う繊維状キャップが存在する。コアは、増大した組織コレステロールおよびコレステロールエステル含量、フィブリン、プロテオグリカン、コラーゲン、エラスチン、ならびに壊死細胞片を有する脂質を取り込んだ細胞(マクロファージおよび平滑筋細胞)を含む。進行型プラークでは、プラークの中心コアは通常、細胞外のコレステロール沈着物(死細胞から放出される)を含み、これは空の針状間隙を有するコレステロール結晶の領域を形成する。プラークの周辺部には、より若い泡沫状細胞および毛細血管がある。繊維状プラークはまた、動脈壁内の内膜下にも局在し、壁の肥厚化および増殖、および時には、筋層の若干の萎縮を伴う内腔の飛び飛びに局在化した狭小化をもたらす。繊維状プラークは、コラーゲン繊維(エオシン好性)、カルシウムの沈殿物(ヘマトキシリン好性)および脂質を取り込んだ細胞を含む。いくつかの実施形態では、ターゲティング部分は、フィブリン、プロテオグリカン、コラーゲン、エラスチン、壊死細胞片、およびカルシウムまたは他の鉱物沈着物または沈殿物などのこれらのプラークの1種または複数の非細胞成分を認識し、これに結合する。いくつかの実施形態では、壊死細胞片は、核酸、例えば、死細胞から放出されるDNAまたはRNAである。
種々の実施形態では、ターゲティング部分は、神経変性疾患と関連する脳プラーク中で見つかる1種または複数の非細胞構造を認識する抗原認識ドメインを含む。いくつかの実施形態では、ターゲティング部分は、アルツハイマー病の患者の脳中で見つかるアミロイド斑中に局在する1種または複数の非細胞構造を認識し、これに結合する。例えば、ターゲティング部分は、ペプチドアミロイドベータを認識し、これに結合する。ペプチドアミロイドベータは、アミロイド斑の主要な成分である。いくつかの実施形態では、ターゲティング部分は、ハンチントン病の患者で見つかる脳プラーク中にある1種または複数の非細胞構造を認識し、これに結合する。種々の実施形態では、ターゲティング部分は、レヴィー小体認知症および封入体筋炎などの他の神経変性疾患または筋骨格疾病と関連するプラークで見つかる1種または複数の非細胞構造を認識し、これに結合する。
リンカーおよび官能基
種々の実施形態では、Clec9A結合物質は、1つまたは複数の官能基、残基、または部分を含み得る。種々の実施形態では、1つまたは複数の官能基、残基、または部分は、本明細書に記載のいずれかのシグナル伝達物質またはターゲティング部分に結合されるか、または遺伝的に融合される。いくつかの実施形態では、このような官能基、残基または部分は、本発明のClec9A結合物質に1つまたは複数の望ましい特性または官能基を付与する。このような官能基およびそれらをClec9A結合物質に導入する技術の例は、当技術分野において既知であり、例えば、Remington’s Pharmaceutical Sciences,16th ed.,Mack Publishing Co.,Easton,Pa.(1980)を参照されたい。
種々の実施形態では、Clec9A結合物質は、別の物質と複合化および/または融合されて、半減期を延長するか、または別の方法で薬力学的および薬物動態学的特性を改善し得る。いくつかの実施形態では、CD8結合物質は、PEG、XTEN(例えば、rPEGとして)、ポリシアル酸(POLYXEN)、アルブミン(例えば、ヒト血清アルブミンまたはHAS)、エラスチン様タンパク質(ELP)、PAS、HAP、GLK、CTP、トランスフェリンなどの1種または複数と融合または複合化され得る。いくつかの実施形態では、CD8結合物質は、抗体またはFcフラグメントなどの抗体フラグメントと融合または複合化され得る。例えば、キメラタンパク質は、ヒト免疫グロブリン(Ig)GのFcドメインのN-末端またはC末端に融合され得る。種々の実施形態では、それぞれ個々のキメラタンパク質は、BioDrugs(2015)29:215-239に記載の1種または複数の物質に融合され、この文献の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、官能基、残基、または部分は、好適な薬学的に許容可能なポリマー、例えばポリ(エチレングリコール)(PEG)またはその誘導体(例えば、メトキシポリ(エチレングリコール)またはmPEG)を含む。いくつかの実施形態では、PEG部分の結合は、半減期を伸ばし、および/またはClec9A結合タンパク質の免疫原性を低減する。通常、抗体および抗体フラグメント(限定されないが、VHHなどの単一ドメイン抗体を含む)に対し当該技術分野で用いられるペグ化などの、任意の好適な形態のペグ化が用いられる;例えば、Chapman,Nat.Biotechnol.,54,531-545(2002);VeroneseおよびHarrisによる、Adv.Drug Deliv.Rev.54,453-456(2003),HarrisおよびChessによる、Nat.Rev.Drug.Discov.,2,(2003)ならびに国際公開第04/060965号を参照されたい。これらの文献の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。タンパク質のペグ化のための種々の試薬も、例えば、Nektar Therapeutics,USAから市販されている。いくつかの実施形態では、特に、システイン残基を介した部位特異的なペグ化が使用される(例えば、その全内容が参照により本明細書に組み込まれる、Yang et al.,Protein Engineering,16,10,761-770(2003)を参照されたい)。例えば、このために、PEGは本発明のClec9A結合物質中の天然のシステイン残基に結合され得る。いくつかの実施形態では、本発明のClec9A結合物質は、PEGの結合のための1個または複数のシステイン残基を適切に導入するように修飾されるか、またはPEGの結合のための1個または複数のシステイン残基を含むアミノ酸配列が、当該技術分野において既知の技術を使用してClec9A結合物質のアミノ末端および/またはカルボキシ末端に融合され得る。
いくつかの実施形態では、官能基、残基、または部分は、N結合型またはO結合型グリコシル化を含む。いくつかの実施形態では、N結合型またはO結合型グリコシル化は、翻訳時修飾および/または翻訳後修飾の一部として導入される。
いくつかの実施形態では、官能基、残基、または部分は、1個または複数の検出可能なラベルまたはその他のシグナル生成基または部分を含む。好適なラベルおよびそれらの結合、使用および検出のための技術は、当技術分野において既知であり、限定されないが、蛍光標識(例えば、フルオレセイン、イソチオシアネート、ローダミン、フィコエリトリン、フィコシアニン、アロフィコシアニン、o-フタルアルデヒド、ならびにフルオレサミンおよび蛍光金属、例えば、Euまたはランタニド系列の他の金属)、リン光標識、化学発光ラベルまたは生物発光ラベル(例えば、ルミノール、イソルミノール、セロマティックアクリジニウム・エステル、イミダゾール、アクリジニウム塩、オキサレートエステル、ジオキセタンまたはGFPおよびその類似体)、放射性同位体、金属、金属キレートもしくは金属カチオンまたはインビボ、インビトロまたはインサイツ診断および画像処理での使用に特に適している他の金属もしくは金属カチオン、ならびに発色団および酵素(例えば、リンゴ酸脱水素酵素、ブドウ球菌ヌクレアーゼ、デルタ-V-ステロイドイソメラーゼ、酵母アルコール脱水素酵素、アルファグリセロリン酸脱水素酵素、トリオースリン酸イソメラーゼ、ビオチンアビジンペルオキシダーゼ、西洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリフォスファターゼ、アスパラギナーゼ、グルコースオキシダーゼ、ベータガラクトシダーゼ、リボヌクレアーゼ、ウレアーゼ、カタラーゼ、グルコース-VI-リン酸脱水素酵素、グルコアミラーゼおよびアセチルコリンエステラーゼ)を含む。他の好適なラベルとしては、NMRまたはESR分光法を用いて検出できる部分が挙げられる。このように標識される本発明のVHHおよびポリペプチドは、特定の標識の選択により、例えば、インビトロ、インビボまたはインサイツアッセイ(ELISA、RIAおよびEIAおよび他の「サンドイッチ法」などのそれ自体公知のイムノアッセイを含む)ならびにインビボ診断および画像処理の目的に使用し得る。
いくつかの実施形態では、官能基、残基、または部分は、Clec9A結合物質に結合または遺伝的に融合されるタグを含む。いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質は、単一タグまたは複数タグを含み得る。タグは例えば、Clec9Aまたは腫瘍抗原などの目的のいずれか他の抗原へのClec9A結合物質の結合を阻害または妨害しない、ペプチド、糖、またはDNA分子である。種々の実施形態では、タグは、少なくとも約:3~5個のアミノ酸長、5~8個のアミノ酸長、8~12個のアミノ酸長、12~15個のアミノ酸長、または15~20個のアミノ酸長である。タグの例は、例えば、米国特許出願公開第2013/0058962号に記載されている。いくつかの実施形態では、タグは、グルタチオン-S-トランスフェラーゼ(GST)およびヒスチジン(His)タグなどの親和性タグである。ある実施形態では、Clec9A結合物質はHisタグを含む。
いくつかの実施形態では、官能基、残基、または部分は、例えば、1種の金属または金属カチオンをキレートするためのキレート化基を含む。好適なキレート化基は、例えば、限定されないが、ジエチレントリアミン五酢酸(DTPA)またはエチレンジアミン四酢酸(EDTA)を含む。
いくつかの実施形態では、官能基、残基、または部分は、ビオチン-(ストレプト)アビジン結合対などの、特異的結合対の片方の部分である官能基を含む。このような官能基を使って、本発明のClec9A結合物質を、結合対のもう一方の半分に結合される別のタンパク質、ポリペプチドまたは化学化合物に、すなわち、結合対の形成を介して、連結し得る。例えば、本発明のClec9A結合物質をビオチンに複合化し、アビジンまたはストレプトアビジンに複合化された別のタンパク質、ポリペプチド、化合物または担体に連結し得る。例えば、検出可能なシグナル生成物質がアビジンまたはストレプトアビジンに複合化される診断システムにおいて、このような結合Clec9A結合物質を、例えば、レポーターとして用い得る。このような結合対を、例えば、医薬品目的に好適する担体を含む、担体へClec9A結合物質を結合するのにも使用し得る。1つの非限定的例は、Cao and Suresh,Journal of Drug Targeting,8,4,257(2000)に記載されたリポソーム製剤である。このような結合対を、本発明のClec9A結合物質に治療活性薬剤を連結するのにも使用し得る。
いくつかの実施形態では、本発明のClec9A結合物質は、必要に応じ、1個または複数のリンカーを含む。いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質は、それぞれの結合領域および/またはターゲティング部分を連結するリンカーを含む。いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質は、それぞれのシグナル伝達物質およびターゲティング部分を連結する(または2つ以上のターゲティング部分の場合、シグナル伝達物質をターゲティング部分の1つに連結する)リンカーを含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、本明細書に記載される種々の官能基、残基、または部分をClec9A結合物質に連結するのに利用し得る。いくつかの実施形態では、リンカーは、結合領域および結合タンパク質の安定性、配向、結合、中和、および/または排出特性に影響を与えない、またはそれらを低下させない単一アミノ酸または複数のアミノ酸である。種々の実施形態では、リンカーは、ペプチド、タンパク質、糖、または核酸から選択される。
いくつかの実施形態では、本発明のClec9A結合物質は、ターゲティング部分とシグナル伝達物質とを連結するリンカーを含む。いくつかの実施形態では、本キメラタンパク質は、シグナル伝達物質内にリンカーを含む(例えば、単鎖TNFの場合には、それは2つのリンカーを含みトリマーを生じることができる)。
本発明は、種々のリンカー配列の使用を意図する。種々の実施形態では、リンカーは、天然のマルチドメインタンパク質から誘導され得るか、または、例えば、Chichili et al.,(2013),Protein Sci.22(2):153-167;Chen et al.,(2013),Adv Drug Deliv Rev.65(10):1357-1369に記載されている経験的リンカーであり、これらの文献の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、リンカーは、リンカー設計データベースおよびその全内容が参照により本明細書に組み込まれる、Chen et al.,(2013),Adv Drug Deliv Rev.65(10):1357-1369 and Crasto et al.,(2000),Protein Eng.13(5):309-312に記載のものなどのコンピュータープログラムを用いて設計され得る。種々の実施形態では、リンカーは機能性であり得る。例えば、限定されないが、リンカーは、折り畳みおよび/または安定性を改善するように、発現を改善するように、薬物動態学を改善するように、および/または本発明のClec9A結合物質の生物活性を改善するように機能し得る。
いくつかの実施形態では、リンカーはポリペプチドである。いくつかの実施形態では、リンカーは約100アミノ酸長未満である。例えば、リンカーは、約100、約95、約90、約85、約80、約75、約70、約65、約60、約55、約50、約45、約40、約35、約30、約25、約20、約19、約18、約17、約16、約15、約14、約13、約12、約11、約10、約9、約8、約7、約6、約5、約4、約3、または約2アミノ酸長未満であり得る。いくつかの実施形態では、リンカーはポリペプチドである。いくつかの実施形態では、リンカーは約100アミノ酸長超である。例えば、リンカーは、約100、約95、約90、約85、約80、約75、約70、約65、約60、約55、約50、約45、約40、約35、約30、約25、約20、約19、約18、約17、約16、約15、約14、約13、約12、約11、約10、約9、約8、約7、約6、約5、約4、約3、または約2アミノ酸長超であり得る。いくつかの実施形態では、リンカーはフレキシブルである。別の実施形態では、リンカー は剛性である。
いくつかの実施形態では、リンカーの長さは、ターゲティング部分とシグナル伝達物質のそれらの受容体への効果的結合を可能にする。例えば、いくつかの実施形態では、リンカーの長さは、1つのターゲティング部分とシグナル伝達物質の同じ細胞上の受容体への効果的な結合、ならびに他のターゲティング部分の別の細胞への効果的な結合を可能にする。細胞対の例は、本明細書の他の場所で提供される。
いくつかの実施形態では、リンカーの長さは、少なくとも、同じ細胞上の1つのターゲティング部分およびシグナル伝達物質の受容体への結合部位の間の最短距離に等しい。いくつかの実施形態では、リンカーの長さは、同じ細胞上の1つのターゲティング部分およびシグナル伝達物質の受容体への結合部位の間の最短距離の、少なくとも2倍、または3倍、または4倍、または5倍、または10倍、または20倍、または25倍、または50倍、または100倍、または、それを超える。
いくつかの実施形態では、あるリンカーは2つのターゲティング部分を相互に連結し、このリンカーは短い長さを有し、また、あるリンカーはターゲティング部分とシグナル伝達物質を連結し、このリンカーは2つのターゲティング部分を連結するリンカーより長い。例えば、2つのターゲティング部分を連結するリンカーと、ターゲティング部分とシグナル伝達物質とを連結するリンカーとの間のアミノ酸長さの差異は、約100、約95、約90、約85、約80、約75、約70、約65、約60、約55、約50、約45、約40、約35、約30、約25、約20、約19、約18、約17、約16、約15、約14、約13、約12、約11、約10、約9、約8、約7、約6、約5、約4、約3、または約2アミノ酸であり得る。いくつかの実施形態では、リンカーはフレキシブルである。別の実施形態では、リンカーは剛性である。
種々の実施形態では、リンカーは、グリシンおよびセリン残基から実質的に構成される(例えば、約30%、または約40%、または約50%、または約60%、または約70%、または約80%、または約90%、または約95%、または約97%のグリシンとセリン)。例えば、いくつかの実施形態では、リンカーは(GlySer)であり、式中、nは、約1~約8、例えば、1、2、3、4、5、6、7、または8である。ある実施形態では、リンカー配列は、GGSGGSGGGGSGGGGS(配列番号278)である。追加のリンカーの例としては、限定されないが、次記の配列を有するリンカーが挙げられる:LE、GGGGS(配列番号279)、(GGGGS)(n=1~4)(配列番号280)、(Gly)(配列番号281)、(Gly)(配列番号282)、(EAAAK)(n=1~3)(配列番号283)、A(EAAAK)A(n=2~5)(配列番号284)、AEAAAKEAAAKA(配列番号285)、A(EAAAK)ALEA(EAAAK)A(配列番号286)、PAPAP(配列番号287)、KESGSVSSEQLAQFRSLD(配列番号288)、EGKSSGSGSESKST(配列番号289)、GSAGSAAGSGEF(配列番号290)、および(XP)、Xは、任意のアミノ酸、例えば、Ala、Lys、またはGluを示す。種々の実施形態では、リンカーはGGSである。
いくつかの実施形態では、リンカーは抗体(例えば、IgG、IgA、IgD、およびIgE、サブクラス(例えば、IgG1、IgG2、IgG3、およびIgG4、ならびにIgA1およびIgA2)を含む)のヒンジ部である。種々の実施形態では、リンカーは抗体(例えば、IgG、IgA、IgD、およびIgE、サブクラス(例えば、IgG1、IgG2、IgG3、およびIgG4、ならびにIgA1およびIgA2)を含む)のヒンジ部である。IgG、IgA、IgD、およびIgEクラス抗体で見つかるヒンジ部は、フレキシブルスペーサーとして機能し、Fab部が空間中で自由に動くことを可能にする。定常領域と対照的に、ヒンジドメインは、構造上多様で、免疫グロブリンクラスおよびサブクラス中の配列および長さの両方で変動する。例えば、ヒンジ部の長さおよび可撓性は、IgGサブクラス内で変動する。IgG1のヒンジ部は、アミノ酸216~231を包含し、それは自由にフレキシブルであるため、Fabフラグメントがそれらの対称軸の周りで回転でき、2つの重鎖間ジスルフィド架橋の内の最初の位置を中心とする球内で移動できる。IgG2は、IgG1より短いヒンジを有し、12個のアミノ酸残基と4個のジスルフィド架橋を有する。IgG2のヒンジ部は、グリシン残基を欠き、比較的短く、また、追加の重鎖間ジスルフィド架橋により安定化される剛性のポリプロリン二重らせんを含む。これらの特性は、IgG2分子の可撓性を制限する。IgG3は、その特有の伸びたヒンジ部(IgG1ヒンジの約4倍の長さ)により他のサブクラスとは異なり、62個のアミノ酸(21個のプロリンと11個のシステインを含む)を含み、柔軟でないポリプロリン二重らせんを形成する。IgG3では、FabフラグメントはFcフラグメントから比較的遠くに離れており、分子により大きな可撓性を与える。IgG3の伸びたヒンジはまた、その他のサブクラスに比べて、これが高分子量である原因である。IgG4のヒンジ部はIgG1より短く、その可撓性はIgG1とIgG2との中間である。ヒンジ部の可撓性は、次の順に低下すると報告されている:IgG3>IgG1>IgG4>IgG2。
結晶学的調査によれば、免疫グロブリンヒンジ部は、機能的に次の3つの領域にさらに細分できる:上部ヒンジ部、コアヒンジ部、および下部ヒンジ部。Shin et al.,1992 Immunological Reviews 130:87を参照されたい。上部ヒンジ部は、CH1残基カルボキシル末端~運動を制限するヒンジ中の最初のアミノ酸、通常は2つの重鎖間の鎖間ジスルフィド結合を形成する最初のシステイン残基のアミノ酸を含む。上部ヒンジ部の長さは、抗体のセグメントの可撓性と相関する。コアヒンジ部は重鎖間ジスルフィド架橋を含み、下部ヒンジ部はCH2ドメインのアミノ末端に繋がり、かつCH2中の残基を含む(同上文献)。野性型ヒトIgG1のコアヒンジ部は配列Cys-Pro-Pro-Cysを含み、これは、ジスルフィド結合形成により二量体化されると、環状オクタペプチドを生成し、これが旋回軸として機能することにより、可撓性を付与すると考えられている。種々の実施形態では、本リンカーは、任意の抗体(例えば、IgG、IgA、IgD、およびIgE、サブクラス(例えば、IgG1、IgG2、IgG3、およびIgG4、ならびにIgA1およびIgA2)を含む)の1個、または2個、または3個の上部ヒンジ部、コアヒンジ部および下部ヒンジ部を含む。ヒンジ部はまた、1つまたは複数のグリコシル化部位も含み得、これは、多くの構造上異なるタイプの炭水化物付着部位を含む。例えば、IgA1は、ヒンジ部の17アミノ酸セグメント内に5つのグリコシル化部位を含み、腸内プロテアーゼに対するヒンジ部ポリペプチドの耐性を付与し、これは、分泌性免疫グロブリンにとって、有利な性質であると考えられる。種々の実施形態では、本発明のリンカーは、1つまたは複数のグリコシル化部位を含む。種々の実施形態では、リンカーは、ヒトIgG4抗体のヒンジ-CH2-CH3ドメインである。
必要に応じ、本発明のClec9A結合物質は抗体Fc領域に連結されてよく、C2およびC3ドメインの片方または両方、および場合によりヒンジ部を含む。例えば、単一ヌクレオチド配列としてFc領域に連結された本発明のClec9A結合物質をコードするベクターを用いて、このようなポリペプチドを調製できる。
いくつかの実施形態では、リンカーはPEGなどの合成リンカーである。
種々の実施形態では、リンカーは機能性であり得る。例えば、限定されないが、リンカーは、折り畳みおよび/または安定性を改善するように、発現を改善するように、薬物動態学を改善するように、および/または本発明のClec9A結合物質の生物活性を改善するように機能し得る。別の例では、リンカーは、Clec9A結合物質を特定の細胞型または部位に向けるように機能し得る。
Clec9A結合物質の改変と産生
種々の実施形態では、Clec9A結合物質は、VHHであるターゲティング部分を含む。種々の実施形態では、VHHは、特定の生物源または特定の調製法に限定されない。例えば、VHHは通常、次記により得ることができる:(1)天然の重鎖抗体のVHドメインを単離することにより;(2)天然のVHドメインをコードするヌクレオチド配列の発現により;(3)天然のVHドメインの「ヒト化」によりまたはこのようなヒト化VHドメインをコードする核酸の発現により;(4)ヒト由来などの哺乳動物種由来などの任意の動物種由来の天然のVHドメインの「ラクダ化」により、またはこのようなラクダ化VHドメインをコードする核酸の発現により;(5)当該技術分野で記載される「ドメイン抗体」または「Dab」の「ラクダ化」により、またはこのようなラクダ化VHドメインをコードする核酸の発現により;(6)当該技術分野において既知のタンパク質、ポリペプチドまたは他のアミノ酸配列を調製するための合成技術または半合成技術を用いることにより;(7)当該技術分野において既知の核酸合成技術を用いてVHHをコードする核酸を調製すること、それに続く、こうして得られた核酸の発現により;および/または(8)前述の1つまたは複数の任意の組み合わせにより。
ある実施形態では、Clec9A結合物質は、ヒトClec9Aに向けられた天然の重鎖抗体のVHドメインに対応するVHHを含む。いくつかの実施形態では、このようなVH配列は通常、ラクダ科の動物種をClec9A分子で適切に免疫する(すなわち、Clec9Aに対する免疫応答および/またはClec9Aに対する重鎖抗体を生じるように)ことにより、ラクダ科の動物から好適な生物試料(例えば、血液試料、またはB細胞の任意の試料)を得ることにより、および任意の好適な既知の技術を用いて、試料から出発して、Clec9Aに対するVH配列を生成することにより、生成または得ることができる。いくつかの実施形態では、Clec9Aに対する天然のVHドメインは、、例えば、当技術分野で既知の1種または複数のスクリーニング技術を使って、Clec9Aまたはその少なくとも1つの部分、フラグメント、抗原決定基またはエピトープを用いてこのようなライブラリーをスクリーニングすることにより、ラクダ科の動物VHH配列の未処理ライブラリーから得ることができる。このようなライブラリーおよび技術は、例えば、国際公開第99/37681号、国際公開第01/90190号、国際公開第03/025020号、および国際公開第03/035694号に記載され、これらの特許の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、例えば、その全内容はが参照により本明細書に組み込まれる、国際公開第00/43507号に記載の、ランダム変異誘発および/またはCDRシャッフリングなどの技術により未処理VHライブラリーから得られるVHライブラリーなどの、未処理VHライブラリー由来の改善された合成または半合成ライブラリーを使用し得る。いくつかの実施形態では、Clec9Aに対するVH配列を得るための別の技術は、重鎖抗体を発現できる遺伝子導入哺乳動物を適切に免疫すること(すなわち、Clec9Aに対する免疫応答および/またはClec9Aに対する重鎖抗体を生じるように)、遺伝子導入哺乳動物から好適な生物試料(例えば、血液試料、またはB細胞の任意の試料)を得ること、およびその後、任意の好適な既知の技術を用いて、試料から出発してClec9Aに対するVH配列を生成することを含む。例えば、この目的のために、国際公開第02/085945号および国際公開第04/049794号(これらの特許の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる)に記載の重鎖抗体発現マウスおよびさらなる方法および技術を使用できる。
ある実施形態では、Clec9A結合物質は、「ヒト化され」ている、すなわち、天然のVH配列(および特に、フレームワーク配列中の)のアミノ酸配列の1個または複数のアミノ酸残基を、ヒト由来の従来の4鎖抗体由来のVHドメイン中の対応する位置(単一または複数)にある1個または複数のアミノ酸残基で置換することによる、VHHを含む。これは、当該技術分野において既知の技術を使用して実施できる。いくつかの実施形態では、可能なヒト化置換またはヒト化置換の組み合わせは、当該技術分野において既知の方法により、例えば、VHHの配列と天然のヒトVHドメインの配列との間の比較により決定し得る。いくつかの実施形態では、ヒト化置換は、得られるヒト化VHHが有利な機能特性をなお保持するように選択される。通常、ヒト化の結果として、本発明のVHHは、より「ヒト様」になり得るが、対応する天然のVHドメインと比較して、低減された免疫原性などの好ましい特性を依然として保持している。種々の実施形態では、本発明のヒト化VHHは、当該技術分野において既知の任意の好適な方法で得ることができ、したがって出発材料として天然のVHドメインを含むポリペプチドを用いて得たポリペプチドに厳密に限定されない。
ある実施形態では、Clec9A結合物質は、「ラクダ化され」ている、すなわち、従来の4鎖抗体由来の天然のVHドメインのアミノ酸配列の1個または複数のアミノ酸残基を、ラクダ科の動物の重鎖抗体のVHドメイン中の対応する位置(単一または複数)にある1個または複数のアミノ酸残基で置換することによる、VHHを含む。いくつかの実施形態では、このような「ラクダ化」置換は、VH-VLインターフェースを形成するおよび/または、そこに存在するアミノ酸位置で、および/またはいわゆるラクダ科の顕著な特徴の残基の位置で挿入される(例えば、その全内容が参照により本明細書に組み込まれる、国際公開第94/04678号を参照)。いくつかの実施形態では、ラクダ化VHHを生成するまたは設計するための出発材料または出発点として用いられるVH配列は、哺乳動物由来のVH配列、例えば、VH3配列などの、ヒトのVH配列である。種々の実施形態では、ラクダ化VHHは、当該技術分野において既知の任意の好適な方法で得ることができ(すなわち、上記(1)~(8)で示されるような)、したがって、出発材料として天然のVHドメインを含むポリペプチドを用いて得たポリペプチドに厳密に限定されない。
種々の実施形態では、「ヒト化」および「ラクダ化」の両方は、天然のVHドメインまたはVHドメインをコードするヌクレオチド配列をそれぞれ用意すること、および次に、当該技術分野において既知の方法で、ヌクレオチド配列中の1個または複数のコドンを新規ヌクレオチド配列がそれぞれ「ヒト化」または「ラクダ化」VHHをコードするように変更することにより実施できる。この核酸は、その後、本発明の目的のVHHを得るように、当該技術分野において既知の方法で発現されてよい。あるいは、天然のVHドメインまたはVHドメインそれぞれのアミノ酸配列に基づいて、目的の本発明のヒト化またはラクダ化VHHのそれぞれのアミノ酸配列を設計し、その後、当該技術分野において既知のペプチド合成技術を用いて、新規に合成できる。また、天然のVHドメインまたはVHドメインそれぞれのアミノ酸配列またはヌクレオチド配列に基づいて、目的のヒト化またはラクダ化VHHのそれぞれをコードするヌクレオチド配列を設計し、次に当該技術分野において既知の核酸合成技術を用いて新規に合成でき、その後、こうして得られた核酸を、本発明の目的のVHHが得られるように、当該技術分野において既知の方法で発現させることができる。天然のVH配列またはVH配列から出発して、本発明のVHHおよび/またはそれをコードする核酸を得るための他の好適な方法および技術は、当技術分野において既知であり、例えば、1個または複数の天然のVH配列(1個または複数のFR配列および/またはCDR配列など)の1個または複数の部分、1個または複数の天然のVH配列(1個または複数のFR配列またはCDR配列など)の1個または複数の部分、および/または1個または複数の合成または半合成配列を、本発明のVHHまたはそれをコードするヌクレオチド配列もしくは核酸をもたらすように、好適な方法で組み合わせることを含み得る。
本発明のClec9A結合物質を産生するための方法は、本明細書に記載される。例えば、本発明のClec9A結合物質をコードするDNA配列は、当該技術分野において既知の方法を使用して化学的に合成できる。合成DNA配列は、例えば、発現制御配列を含む他の適切なヌクレオチド配列に連結されて、目的のClec9A結合物質をコードする遺伝子発現構築物を産生できる。したがって、種々の実施形態では、本発明は、本発明のClec9A結合物質をコードするヌクレオチド配列を含む単離核酸を提供する。
本発明のClec9A結合物質をコードする核酸は、発現ベクター中に組み込まれ(連結され)てよく、このベクターは、遺伝子導入、形質転換、または形質導入技術により宿主細胞中に導入されてよい。例えば、本発明のClec9A結合物質をコードする核酸は、レトロウイルス形質導入により宿主細胞中に導入されてよい。宿主細胞の例は、大腸菌細胞、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞、ヒト胎児腎臓293(HEK293)細胞、ヒーラ細胞、仔ハムスター腎(BHK)細胞、サル腎培養細胞(COS)、またはヒト肝細胞癌細胞(例えば、Hep G2)、および骨髄腫細胞である。形質転換宿主細胞は、宿主細胞が本発明のClec9A結合物質をコードする遺伝子を発現するのを可能にする条件下で増殖されてよい。したがって、種々の実施形態では、本発明は、本発明のClec9A結合物質をコードする核酸を含む発現ベクターを提供する。種々の実施形態では、本発明は、このような発現ベクターを含む宿主細胞をさらに提供する。
特定の発現および精製条件は、用いた発現系に応じて変化するであろう。例えば、遺伝子が大腸菌中で発現される場合、遺伝子は最初に、操作された遺伝子を細菌プロモーター、例えば、TrpまたはTac、および原核生物シグナル配列の下流に配置することにより発現ベクター中に挿入される。別の例では、操作された遺伝子が真核生物宿主細胞、例えば、CHO細胞中で発現される場合、遺伝子は最初に、例えば、好適な真核生物プロモーター、分泌シグナル、転写促進因子、および種々のイントロンを含む発現ベクター中に挿入される。遺伝子構築物は、遺伝子導入、形質転換、または形質導入技術を用いて宿主細胞中に導入できる。
本発明のClec9A結合物質は、タンパク質の発現を許容する条件下で、Clec9A結合物質をコードする発現ベクターで形質導入された宿主細胞を増殖させることにより産生できる。発現後、タンパク質を収集し、例えば、グルタチオン-S-トランスフェラーゼ(GST)およびヒスチジン(His)などの親和性タグまたはクロマトグラフィーによる当該技術分野において周知の技術を用いて精製できる。ある実施形態では、Clec9A結合物質はHisタグを含む。ある実施形態では、Clec9A結合物質はHisタグおよびHisタグの切断を可能にするタンパク分解部位を含む。
したがって、種々の実施形態では、本発明は、本発明のClec9A結合物質をコードする核酸を提供する。種々の実施形態では、本発明は、本発明のClec9A結合物質をコードする核酸を含む宿主細胞を提供する。
種々の実施形態では、本明細書に記載されるClec9A結合物質を改変するおよび産生する方法は、2つ以上のターゲティング部分および/またはシグナル伝達物質を含む任意の多重特異的結合物質またはキメラの改変および産生に容易に適応できる。例えば、方法は、チェックポイント阻害剤抗原に対するターゲティング部分を含む多重特異的Clec9A結合物質の産生に適応され得る。
薬学的に許容可能な塩および賦形剤
本明細書で記載のClec9A結合物質(および/またはいずれか他の治療薬)は、充分に塩基性の官能基を有してよく、これは無機もしくは有機酸、またはカルボキシル基と反応でき、これは無機または有機塩基と反応でき、薬学的に許容可能な塩を形成する。薬学的に許容可能な酸付加塩は、当該技術分野でよく知られているように、薬学的に許容可能な酸から形成される。このような塩は、例えば、Journal of Pharmaceutical Science,66,2-19(1977およびThe Handbook of Pharmaceutical Salts;Properties,Selection,and Use.P.H.Stahl and C.G.Wermuth(eds.),Verlag,Zurich(Switzerland)2002、に挙げられた薬学的に許容可能な塩を含み、これらの文献は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
薬学的に許容可能な塩としては、限定されないが、硫酸塩、クエン酸塩、酢酸塩、シュウ酸塩、塩化物、臭化物、ヨウ化物、硝酸塩、重硫酸塩、ホスフェート、酸性リン酸塩、イソニコチン酸塩、乳酸塩、サリチル酸塩、酸性クエン酸塩、酒石酸塩、オレイン酸塩、タンニン酸塩、パントテン酸塩、酒石酸水素塩、アスコルビン酸塩、コハク酸塩、マレイン酸塩、ゲンチシン酸塩、フマル酸塩、グルコン酸塩、グルカロン酸塩、サッカリン酸塩、ギ酸塩、安息香酸塩、グルタミン酸塩、メタンスルホン酸塩、エタンスルホン酸塩、ベンゼンスルホン酸塩、p-トルエンスルホン酸塩、樟脳スルホン酸塩、パモ酸塩、フェニル酢酸塩、トリフルオロ酢酸塩、アクリル酸塩、クロロ安息香酸塩、ジニトロ安息香酸塩、ヒドロキシ安息香酸塩、メトキシ安息香酸塩、メチル安息香酸塩、o-アセトキシ安息香酸塩、ナフタレン-2-安息香酸塩、イソ酪酸塩、フェニル酪酸塩、α-ヒドロキシ酪酸塩、ブチン-1,4-ジカルボキシレート、ヘキシン-1,4-ジカルボキシレート、カプリン酸塩、カプリル酸塩、ケイ皮酸塩、グリコール酸塩、ヘプタン酸塩、ヒプル酸塩、リンゴ酸塩、ヒドロキシマレイン酸塩、マロン酸塩、マンデル酸塩、メシル酸塩、ニコチン酸塩、フタル酸塩、テラフタル酸塩、プロピオール酸塩、プロピオン酸塩、フェニルプロピオン酸塩、セバシン酸塩、スベリン酸塩、p-ブロモベンゼンスルホン酸塩、クロロベンゼンスルホン酸塩、エチルスルホン酸塩、2-ヒドロキシエチルスルホン酸塩、メチルスルホン酸塩、ナフタレン-1-スルホン酸塩、ナフタレン-2-スルホン酸塩、ナフタレン-1,5-スルホン酸塩、キシレンスルホン酸塩、および酒石酸塩が挙げられる。
「薬学的に許容可能な塩」という用語はまた、カルボン酸官能基などの酸性官能基、および塩基を有する本発明の組成物の塩を指す。適切な塩基は、限定されないが、ナトリウム、カリウム、およびリチウムなどのアルカリ金属の水酸化物;カルシウムおよびマグネシウムなどのアルカリ土類金属の水酸化物;アルミニウムおよび亜鉛などのその他の金属の水酸化物;アンモニア、および非置換またはヒドロキシ置換のモノ-、ジ-、またはトリ-アルキルアミン、ジシクロヘキシルアミンなどの有機アミン;トリブチルアミン;ピリジン;N-メチル、N-エチルアミン;ジエチルアミン;トリエチルアミン;モノ-、ビス-、またはトリス-(2-ヒドロキシエチル)アミン、2-ヒドロキシ-tert-ブチルアミン、またはトリス-(ヒドロキシメチル)メチルアミンなどのモノ-、ビス-、またはトリス-(2-OH-低級アルキルアミン)、N,N-ジメチル-N-(2-ヒドロキシエチル)アミンまたはトリ-(2-ヒドロキシエチル)アミンなどのN,N-ジ-低級アルキル-N-(ヒドロキシル-低級アルキル)-アミン;N-メチル-D-グルカミン;およびアルギニン、リシンなどのアミノ酸などを含む。
いくつかの実施形態では、本明細書で記載の組成物は、薬学的に許容可能な塩の形態である。
医薬組成物および製剤
種々の実施形態では、本発明は、本明細書で記載のClec9A結合物質(および/またはいずれか他の治療薬)および薬学的に許容可能な担体または賦形剤を含む医薬組成物に関する。いくつかの実施形態では、本発明は、本発明のClec9A結合物質を含む医薬組成物に関する。別の実施形態では、本発明は、本明細書に記載のいずれか他の治療薬を含む医薬組成物に関する。さらなる実施形態では、本発明は、本発明のClec9A結合物質と本明細書に記載のいずれか他の治療薬との組み合わせを含む医薬組成物に関する。本明細書で記載のいずれの医薬組成物も、薬学的に許容可能な担体またはビークルを含む組成物の成分として、対象に投与できる。このような組成物は必要に応じ、適切な投与用の形態を与えるように、適切な量の薬学的に許容可能な賦形剤を含んでよい。
種々の実施形態では、医薬賦形剤は、ピーナッツオイル、大豆油、ミネラルオイル、ゴマ油などの石油、動物、植物、または人工起源のものを含む、水および油などの液体であってよい。医薬賦形剤は、例えば、食塩水、アカシアゴム、ゼラチン、デンプンペースト、滑石、ケラチン、コロイド状シリカ、尿素などであってよい。さらに、助材、安定化剤、増粘化剤、潤滑剤、および着色料を使用できる。一実施形態では、薬学的に許容可能な賦形剤は、対象に投与される場合、無菌である。本明細書で記載のいずれかの薬剤が静脈内に投与される場合、水は有用な賦形剤である。生理食塩水および水性デキストロースならびにグリセリン溶液はまた、液体賦形剤として、特に注射可能溶液に用いることができる。適切な医薬賦形剤としては、デンプン、グルコース、ラクトース、ショ糖、ゼラチン、麦芽、米、小麦粉、シリカゲル、ステアリン酸ナトリウム、グリセリンモノステアレート、滑石、塩化ナトリウム、乾燥脱脂乳、グリセリン、プロピレン、グリコール、水、エタノールなども挙げられる。本明細書で記載のいずれの薬剤も、必要に応じ、少量の湿潤剤もしくは乳化剤、またはpH緩衝剤を含んでよい。適切な医薬賦形剤の他の例は、Remington’s Pharmaceutical Sciences 1447-1676(Alfonso R.Gennaro eds.,19th ed.1995)に記載され、この文献は参照により本明細書に組み込まれる。
本発明は、種々の製剤中に記載医薬組成物(および/または追加の治療薬)を含む。本明細書で記載のいずれの本発明の医薬組成物(および/または追加の治療薬)も、液剤、懸濁剤、乳濁液、点滴剤、錠剤、丸薬、ペレット、カプセル剤、液体含有カプセル剤、ゼラチンカプセル剤、散剤、徐放製剤、坐剤、乳剤、エアロゾル、噴霧剤、懸濁剤、凍結乾燥散剤、凍結懸濁剤、乾燥散剤、または使用に適する他の任意の形態をとってよい。一実施形態では、組成物はカプセルの形態である。別の実施形態では、組成物は錠剤の形態である。さらに別の実施形態では、医薬組成物は、軟質ゲルカプセルの形態で処方される。さらなる実施形態では、医薬組成物は、ゼラチンカプセルの形態で処方される。さらに別の実施形態では、医薬組成物は、液剤として処方される。
必要に応じて、本発明の医薬組成物(および/または追加の薬剤)は、可溶化剤も含んでよい。また、薬剤は当技術分野において既知の適切なビークルまたはデリバリー装置を使って送達できる。本明細書で概要を述べた併用療法剤は、単一の送達ビークルまたはデリバリー装置で共送達することができる。
本発明の医薬組成物(および/または追加の薬剤)を含む製剤は単位剤形として好都合に提供でき、薬学の分野でよく知られたいずれかの方法により調製され得る。このような方法は通常、治療薬を担体と会合させるステップを含み、担体は1種または複数の補助成分を構成する。通常、製剤は、治療薬を液体担体、微粉化固相担体、または両方と均一にかつ完全に会合させること、およびその後、必要に応じ、生成物を所望の製剤の剤形に成形すること(例えば、湿式または乾式造粒、散剤ブレンド、など、続いて、当該技術分野で既知の従来の方法を使って錠剤化)により調製される。
種々の実施形態では、本明細書で記載のいずれの医薬組成物(および/または追加の薬剤)も、本明細書で記載の投与方法に適合された組成物として、ルーチン手順に従って処方される。
投与経路は、例えば、経口、皮内、筋肉内、腹腔内、静脈内、皮下、鼻腔内、硬膜外、舌下、鼻腔内、脳内、膣内、経皮、直腸内、吸入、または局所を含む。投与は局所的でも全身性でもよい。いくつかの実施形態では、投与は、経口により行われる。別の実施形態では、投与は非経口の注射による。投与方法は、開業医の自由裁量に任すことができ、病状の部位にある程度依存する。大抵の場合、投与は血流中への本明細書で記載のいずれかの薬剤の放出を生じる。
一実施形態では、本明細書で記載のClec9A結合物質は、経口投与に適合された組成物として、常法に従って処方される。経口送達用の組成物は、例えば、錠剤、トローチ剤、水性または油性懸濁剤、粒剤、散剤、乳剤、カプセル剤、シロップ剤、またはエリキシル剤の形態であってよい。経口投与される組成物は、薬学的に美味な製剤を提供するために、1種または複数種の薬剤、例えば、ラクトース、アスパルテームまたはサッカリンなどの甘味料;ペパーミント、冬緑油、またはチェリー油などの調味料;着色料;および保存剤を含んでよい。さらに、タブレットまたは丸薬形態では、組成物をコートして消化管での崩壊および吸収を遅らせ、長期間にわたる持続作用を提供できる。本明細書に記載のいずれかのClec9A結合物質を運ぶ浸透圧的に活性な物質を取り囲む選択的透過性膜も、経口投与組成物として好適である。これらの後者のプラットフォームでは、カプセルの周りの環境からの液体が運搬化合物により吸収され、この化合物は膨潤して開口部を介し薬剤または薬剤組成物を追い出す。これらの送達プラットフォームは、即時放出製剤の急上昇プロファイルとは対照的に、実質的に0次の送達プロファイルを提供できる。グリセロールモノステアレートまたはグリセロールステアレートなどの時間遅延物質も使用できる。経口組成物は、標準的な賦形剤、例えば、マンニトール、ラクトース、デンプン、ステアリン酸マグネシウム、ナトリウムサッカリン、セルロース、および炭酸マグネシウムを含んでよい。一実施形態では、賦形剤は医薬品グレードである。懸濁剤は、活性化合物に加えて、例えば、エトキシ化イソステアリルアルコール、ポリオキシエチレンソルビトールおよびソルビタンエステル、微結晶セルロース、アルミニウムメタヒドロオキシド、ベントナイト、寒天、トラガントなど、およびこれらの混合物などの沈殿防止剤を含んでよい。
非経口投与(例えば、静脈内、筋肉内、腹腔内、皮下および関節内注射および注入)に好適な剤形は、例えば、液剤、懸濁剤、分散剤、乳剤、などを含む。それらは、無菌の固相組成物(例えば、凍結乾燥組成物)の形態で製造されてもよく、これは使用直前に無菌の注射可能媒体中に溶解または懸濁し得る。それらは、例えば、当該技術分野において既知の懸濁剤または分散剤を含み得る。非経口的投与に好適な製剤成分としては、注射用の水、食塩水溶液、不揮発性油、ポリエチレングリコール、グリセリン、プロピレングリコール、またはその他の合成溶媒などの無菌希釈剤;ベンジルアルコールまたはメチルパラベンなどの抗菌剤;アスコルビン酸もしくは亜硫酸水素ナトリウムなどの酸化防止剤;EDTAなどのキレート化剤;アセテート、シトレート、またはホスフェートなどの緩衝剤;および塩化ナトリウムまたはデキストロースなどの浸透圧調節剤が挙げられる。
静脈内投与の場合、好適なキャリアとしては、生理食塩水、静菌性水、クレモフォアELTM(BASF,Parsippany,NJ)またはリン酸緩衝生理食塩水(PBS)が挙げられる。担体は、製造および貯蔵条件下で安定でなければならず、微生物に対し保護されなければならない。担体は、例えば、水、エタノール、ポリオール(例えば、グリセロール、プロピレングリコール、および液体ポリエチレングリコール)、および好適なこれらの混合物を含む、溶媒または分散媒であってよい。
本明細書にて提供される組成物は、単独でまたは他の好適な成分と組み合わせて、吸入により投与されるエーロゾル製剤(すなわち、「噴霧化」製剤)に作製されてよい。エーロゾル製剤は、ジクロロジフルオロメタン、プロパン、窒素などの許容され得る加圧化噴射剤中に置かれてよい。
本明細書で記載のいずれの本発明の医薬組成物(および/または追加の薬剤)も、当業者に既知の制御放出によりまたは徐放手段または送達装置により投与可能である。例としては、米国特許第3,845,770号;同第3,916,899号;同第3,536,809号;同第3,598,123号;同第4,008,719号、同第5,674,533号、同第5,059,595号、同第5,591,767号、同第5,120,548号、同第5,073,543号、同第5,639,476号、同第5,354,556号、および同第5,733,556号に記載のものが挙げられるが、これらに限定されない。これらの特許のそれぞれは参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。このような剤形は、例えば、ヒドロプロピルセルロース、ヒドロプロピルメチルセルロース、ポリビニルピロリドン、その他のポリマーマトリクス、ゲル、浸透膜、浸透系、多層被膜、微粒子、リポソーム、マイクロスフェア、またはこれらの組み合わせを用いて1つまたは複数の有効成分の制御放出または徐放を提供して様々な割合での所望の放出プロファイルを提供するために有用である。本明細書に記載されるものを含む、当業者に既知の適切な制御放出または徐放製剤は、本明細書で記載の薬剤の有効成分との使用のために容易に選択できる。本発明はこのように、限定されないが、制御放出または徐放に適合された錠剤、カプセル、ジェルカプセルおよびカプレットなどの経口投与に好適な単位剤形を提供する。
有効成分の制御放出または徐放は、限定されないが、pH変化、温度変化、適切な波長の光による刺激、酵素の濃度もしくは利用可能性、水の濃度または利用可能性、または他の生理学的条件または化合物を含む、種々の条件により刺激されてよい。
別の実施形態では、徐放系が、処置される標的領域の近傍に配置されてよく、したがって全身用量の一部のみを必要とする(例えば、Goodson,in Medical Applications of Controlled Release,supra,vol.2,pp.115-138(1984)を参照)。Langer,1990,Science 249:1527-1533、中の概説で考察される他の放出制御系を使用し得る。
医薬製剤は好ましくは無菌である。無菌化は、例えば、無菌濾過膜を介する濾過により達成される。組成物が凍結乾燥される場合、凍結乾燥および再構成の前またはその後でフィルター滅菌を行うことができる。
投与および投与量
本発明により投与されるClec9A結合物質および/または本明細書に記載のいずれかの治療薬の実際の用量は、特定の剤形および投与方法に応じて変わるであろうということは理解されよう。当業者なら、Clec9A結合物質の作用を変え得る多くの要因(例えば、体重、性別、食事、投与時期、投与経路、排出速度、対象の状態、薬剤の組み合わせ、遺伝的素因および反応感度)を考慮に入れることができる。投与は、最大耐量の範囲内で連続的にまたは1種または複数の別々の用量で実施できる。与えられた一連の条件に対する最適投与速度は、従来の用量投与試験を使って、当業者により確認できる。
いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質および/または本明細書に記載のいずれかの治療薬の好適な投与量は、対象の体重の約0.01mg/kg~約10g/kg、対象の体重の約0.01mg/kg~約1g/kg、対象の体重の約0.01mg/kg~約100mg/kg、対象の体重の約0.01mg/kg~約10mg/kgの範囲であり、例えば、約0.01mg/kg、約0.02mg/kg、約0.03mg/kg、約0.04mg/kg、約0.05mg/kg、約0.06mg/kg、約0.07mg/kg、約0.08mg/kg、約0.09mg/kg、約0.1mg/kg、約0.2mg/kg、約0.3mg/kg、約0.4mg/kg、約0.5mg/kg、約0.6mg/kg、約0.7mg/kg、約0.8mg/kg、約0.9mg/kg、約1mg/kg、約1.1mg/kg、約1.2mg/kg、約1.3mg/kg、約1.4mg/kg、約1.5mg/kg、約1.6mg/kg、約1.7mg/kg、約1.8mg/kg、1.9mg/kg、約2mg/kg、約3mg/kg、約4mg/kg、約5mg/kg、約6mg/kg、約7mg/kg、約8mg/kg、約9mg/kg、約10mg/kg体重、約100mg/kg体重、約1g/kg体重、約10g/kg体重(これらの間の全ての値および範囲を含む)である。
Clec9A結合物質および/または本明細書に記載のいずれかの治療薬の個々の用量は、例えば、単位剤形当たり約0.01mg~約100g、約0.01mg~約75g、約0.01mg~約50g、約0.01mg~約25g、約0.01mg~約10g、約0.01mg~約7.5g、約0.01mg~約5g、約0.01mg~約2.5g、約0.01mg~約1g、約0.01mg~約100mg、約0.1mg~約100mg、約0.1mg~約90mg、約0.1mg~約80mg、約0.1mg~約70mg、約0.1mg~約60mg、約0.1mg~約50mg、約0.1mg~約40mgの有効成分、約0.1mg~約30mg、約0.1mg~約20mg、約0.1mg~約10mg、約0.1mg~約5mg、約0.1mg~約3mg、約0.1mg~約1mg、または単位剤形当たり約5mg~約80mgを含む単位剤形として投与できる。例えば、単位剤形は、約0.01mg、約0.02mg、約0.03mg、約0.04mg、約0.05mg、約0.06mg、約0.07mg、約0.08mg、約0.09mg、約0.1mg、約0.2mg、約0.3mg、約0.4mg、約0.5mg、約0.6mg、約0.7mg、約0.8mg、約0.9mg、約1mg、約2mg、約3mg、約4mg、約5mg、約6mg、約7mg、約8mg、約9mg約10mg、約15mg、約20mg、約25mg、約30mg、約35mg、約40mg、約45mg、約50mg、約55mg、約60mg、約65mg、約70mg、約75mg、約80mg、約85mg、約90mg、約95mg、約100mg、約200mg、約500mg、約1g、約2.5g、約5g、約10g、約25g、約50g、約75g、約100g(これらの間の全ての値および範囲を含む)であってよい。
一実施形態では、Clec9A結合物質および/または本明細書に記載のいずれかの治療薬は、毎日約0.01mg~約100g、毎日約0.01mg~約75g、毎日約0.01mg~約50g、毎日約0.01mg~約25g、毎日約0.01mg~約10g、毎日約0.01mg~約7.5g、毎日約0.01mg~約5g、毎日約0.01mg~約2.5g、毎日約0.01mg~約1g、毎日約0.01mg~約100mg、毎日約0.1mg~約100mg、毎日約0.1mg~約95mg、毎日約0.1mg~約90mg、毎日約0.1mg~約85mg、毎日約0.1mg~約80mg、毎日約0.1mg~約75mg、毎日約0.1mg~約70mg、毎日約0.1mg~約65mg、毎日約0.1mg~約60mg、毎日約0.1mg~約55mg、毎日約0.1mg~約50mg、毎日約0.1mg~約45mg、毎日約0.1mg~約40mg、毎日約0.1mg~約35mg、毎日約0.1mg~約30mg、毎日約0.1mg~約25mg、毎日約0.1mg~約20mg、毎日約0.1mg~約15mg、毎日約0.1mg~約10mg、毎日約0.1mg~約5mg、毎日約0.1mg~約3mg、毎日約0.1mg~約1mg、または毎日約5mg~約80mgの量で投与される。種々の実施形態では、Clec9A結合物質は、約0.01mg、約0.02mg、約0.03mg、約0.04mg、約0.05mg、約0.06mg、約0.07mg、約0.08mg、約0.09mg、約0.1mg、約0.2mg、約0.3mg、約0.4mg、約0.5mg、約0.6mg、約0.7mg、約0.8mg、約0.9mg、約1mg、約2mg、約3mg、約4mg、約5mg、約6mg、約7mg、約8mg、約9mg約10mg、約15mg、約20mg、約25mg、約30mg、約35mg、約40mg、約45mg、約50mg、約55mg、約60mg、約65mg、約70mg、約75mg、約80mg、約85mg、約90mg、約95mg、約100mg、約200mg、約500mg、約1g、約2.5g、約5g、約7.5g、約10g、約25g、約50g、約75g、約100g(これらの間の全ての値および範囲を含む)の1日量で投与される。
本発明の特定の実施形態では、Clec9A結合物質および/または本明細書に記載のいずれかの治療薬を含む医薬組成物は、例えば、1日2回以上(例えば、毎日約2回、約3回、約4回、約5回、約6回、約7回、約8回、約9回、または約10回)、1日約1回、約1日おき、約3日おき、週約1回、2週毎に約1回、毎月約1回、2ヶ月毎に約1回、3ヶ月毎に約1回、6ヶ月毎に約1回、または毎年約1回投与されてよい。
併用療法および追加の治療薬
種々の実施形態では、本発明の医薬組成物は、追加の治療薬(単一または複数)と併せて共投与される。共投与は、同時または順次であってよい。
一実施形態では、追加の治療薬および本発明のClec9A結合物質は、対象に同時に投与される。本明細書で使用される場合、用語「同時に」は、追加の治療薬およびClec9A結合物質が約60分以下、例えば約30分以下、約20分以下、約10分以下、約5分以下、または約1分以下の時間間隔で投与されることを意味する。追加の治療薬およびClec9A結合物質の投与は、単一製剤(例えば、追加の治療薬およびClec9A結合物質を含む製剤)のまたは別々の製剤(例えば、追加の治療薬を含む第1の製剤およびClec9A結合物質を含む第2の製剤)の同時の投与により行われてよい。
共投与は、それらの投与のタイミングが、追加の治療薬およびClec9A結合物質の薬理学的活性が時がたてば重なりあい、それにより組み合わされた治療効果が発揮されるような場合には、治療薬が同時に投与される必要はない。例えば、追加の治療薬およびClec9A結合物質は、順次に投与できる。本明細書で使用される場合、用語「順次に」は、追加の治療薬およびClec9A結合物質が約60分を超える時間間隔で投与されることを意味する。例えば、追加の治療薬とClec9A結合物質との逐次投与の間の時間は、約60分を超えて、約2時間を超えて、約5時間を超えて、約10時間を超えて、約1日を超えて、約2日を超えて、約3日を超えて、約1週間を超えて、約2週間を超えて、または約1ヶ月を越えて離れていてよい。最適投与時間は、投与される追加の治療薬およびClec9A結合物質の代謝、排泄速度、および/または薬力学的活性に依存するであろう。追加の治療薬またはClec9A結合物質のいずれかを、最初に投与してよい。
共投与はまた、治療薬が同じ投与経路により対象に投与される必要はない。むしろ、それぞれの治療薬は、任意の適切な経路、例えば、非経口または経口(non-parenterally)で投与できる。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のClec9A結合物質は、別の治療薬と共投与されると、相乗的に作用する。このような実施形態では、Clec9A結合物質および追加の治療薬は、治療薬が単剤療法で使用される場合に採用される用量よりも低い用量で投与され得る。
いくつかの実施形態では、本発明は、追加の治療薬としての化学療法剤に関する。例えば、限定されないが、本発明のClec9A結合物質と化学療法剤のこのような組み合わせは、本明細書の別の場所で記載のように、癌の処置で使用される。化学療法剤の例としては、アルキル化剤、例えば、チオテパ、CYTOXAN(シクロホスファミド);スルホン酸アルキル、例えば、ブスルファン、インプロスルファンおよびピポスルファン;アジリジン、例えば、ベンゾドーパ,カルボコン、メツレドーパ、およびウレドーパ;エチレンイミン、メチラメラミン例えば、アルトレタミン、トリエチルエネメラミン、トリエチレンネフォスフォラミド、トリエチレンチオフォスフォラミドおよび、トリメチロールメラミン;アセトゲニン(例えば、ブラタシン、ブラタチノン);カントテシン(合成類似剤トポテカンを含む);ブリオスタチン;カリスタチン(cally statin);CC-1065(アドゼレシン、カルゼルシンおよびビゼレシン合成類似体を含む);クリプトフィシン(例えば、クリプトフィシン1、クリプトフィシン8など);ドラスタチン;デュオカルマイシン(合成類似薬KW-2189およびCB1-TM1を含む);エレウテロビン;パンクラチスタチン;サルコディクチン;スポンギスタチン;ナイトロジェンマスタード、例えば、クロラムブシル、クロルナファジン、クロロホスファミド、エストラムスチン、イホスファミド、メクロレタミン、酸化メクロルエタミン塩酸塩、メルファラン、ノベンビチン、フェネステリン、プレドニムスチン、トロホスファミド、ウラシルマスタード、ニトロソウレア、例えば、カルムスチン、クロロゾトシン、フォテムスチン、ロムスチン、ニムスチンおよびラニムスチン(ranimnustine);抗生物質、例えば、エンジイン抗生物質(カリチアマイシン、特にカリチアマイシンガンマIIとカリチアマイシンオメガII(Agnew,Chem.Intl.Ed.Engl.,33:183-186(1994)を参照);ダイネマイシン、ダイネマイシンAを含む;ビスフォスフォネート、例えば、クロドロネート;エスペラマイシン;ならびに、ネオカルジノスタチン発色団および関連色素タンパク質エンジイン抗生物質発色団)、アクラシノマイシン、アクチノマイシン、オースラマイシン、アザセリン、ブレオマイシン、カクチノマイシン、カラビシン、カルミノマイシン(caminomycin)、カルジノフィリン、クロモマイシン(chromomycinis)、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、デトルビシン、6-ジアゾ-5-オキソ-L-ノルロイシン、アドリアマイシン(ドキソルビシン)(モルフォリノドキソルビシン、シアノモルフォリノドキソルビシン、2-ピロリノドキソルビシンおよびデオキシドキソルビシンを含む)、エピルビシン、エソルビシン、イダルビシン、マルセロマイシン、マイトマイシン(例えば、マイトマイシンC)、ミコフェノール酸、ノガラマイシン、オリボマイシン、ペプロマイシン、ポトフィロマイシン、ピューロマイシン、クエラマイシン、ロドルビシン、ストレプトニグリン、ストレプトゾシン、チュベルシジン、ウベニメックス、ジノスタチン、ゾルビシン;代謝拮抗薬、例えば、メトトレキセートおよび5-フルオロウラシル(5-FU);葉酸の類似体、例えば、デノプテリン、メトトレキセート、プテロプテリン、トリメトレキサート;プリン類似体、例えば、フルダラビン、6-メルカプトプリン、チアミプリン、チオグアニン;ピリミジン類似体、例えば、アンシタビン、アザシチジン、6-アザウリジン、カルモフール、シタラビン、ジデオキシウリジン、ドキシフルリジン、エノシタビン、フロクスウリジン;アンドロゲン、例えば、カルステロン、プロピオン酸ドロモスタノロン、エピチオスタノール、メピチオスタン、テストラクトン;抗副腎物質、例えば、アミノグルテチミド(minoglutethimide)、ミトタン、トリロスタン;葉酸補充液、例えば、フロリン酸(frolinic acid);アセグラトン;アルドホスファミドグリコシド;アミノレブリン酸;エニルウラシル;アムサクリン;ベストラブシル;ビサントレン;エダトラキセート(edatraxate);デメコルチン;ジアジクオン;エルフォルミチン(elformithine);エリプチニウムアセテート;エポチロン;エトグルシド;ガリウムニトレート;ヒドロキシ尿素;レンチナン;ロニダミン(lonidainine);メイタンシノイド、例えば、メイタンシンおよびアンサマイトシン;ミトグアゾン;ミトキサントロン;モピダモール;ニトラエリン;ペントスタチン;フェナメット;ピラルビシン;ロソキサントロン;ポドフィリン酸;2-エチルヒドラジド;プロカルバジン;PSK多糖複合体(JHS Natural Products,Eugene,Oreg.);ラゾキサン;リゾキシン;シゾフィラン;スピロゲルマニウム;テヌアゾン酸;2,2’,2”-トリクロロトリエチルアミン;トリコテセン(例えば、T2毒、ベラクリンA、ロリジンA、およびアングイディン);ウレタン;ビンデシン;ダカルバジン;マンノムスチン;ミトブロニトール;ミトラクトール;ピポブロマン;ガシトシン;アラビノシド(アラ-C);シクロホスファミド;チオテパ;タキソイド、例えば、タキソールパクリタキセル(Bristol-Myers Squibb Oncology,Princeton,N.J.)、アブラキサンクレモフォアフリー、アルブミン処理ナノ粒子形成パクリタキセル(American Pharmaceutical Partners,Schaumberg,111.)、タキソテールドキセタキセル(Rhone-Poulenc Rorer,Antony,France);クロランブシル;ジェムザール(ゲムシタビン);6-チオグアニン;メルカプトプリン;メトトレキセート;白金類似体、例えば、シスプラチン、オキサリプラチンおよびカルボプラチン;ビンブラスチン;白金;エトポシド(VP-16);イホスファミド;ミトキサントロン;ビンクリスチン;ナベルビン(ビノレルビン);ノバントロン;テニポシド;エダトレキセート;ダウノマイシン;アミノプテリン;ゼローダ;イバンドロネート;イリノテカン(キャンプトサー,CPT-11)(イリノテカンと5-FUおよびロイコボリンの治療法を含む);トポイソメラーゼ阻害剤RFS2000;ヂルルオロメチルオルニチン(DMFO);レチノイド、例えば、レチノイン酸;カペシタビン;コンブレタスタチン;ロイコボリン(LV);オキサリプラチン、オキサリプラチン治療法(FOLFOX)を含む;ラパチニブ(Tykerb);PKC-α、Raf、H-Ras、EGFRの阻害剤(例えば、エルロチニブ(Tarceva))および細胞増殖を抑制するVEGF-Aならびに上述のいずれかの薬剤の薬学的に許容可能な塩、酸または誘導体、が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、処置の方法は、放射線の使用をさらに含んでよい。さらに、処置の方法は、光線力学的治療の使用をさらに含んでよい。
したがって、いくつかの実施形態では、本発明は、Clec9A結合物質および化学療法剤を用いる併用療法に関する。いくつかの実施形態では、本発明は、化学療法剤での処置を受けている患者に対するClec9A結合物質の投与に関する。いくつかの実施形態では、化学療法剤は、DNA挿入剤、例えば、限定されないが、ドキソルビシン、シスプラチン、ダウノルビシン、およびエピルビシンである。ある実施形態では、DNA挿入剤は、ドキソルビシンである。
例示的実施形態では、Clec9A結合物質は、ドキソルビシンと共投与されると、相乗的に作用する。例示的実施形態では、Clec9A結合物質は、腫瘍または癌の処置での使用において、ドキソルビシンと共投与されると相乗的に作用する。例えば、Clec9A結合物質とドキソルビシンとの共投与は、相乗的に作用して、腫瘍または癌を低減または除去し得、または腫瘍または癌の増殖および/または進行および/または転移を遅らせ得る。例示的実施形態では、Clec9A結合物質とドキソルビシンの組み合わせは、単剤療法において単独で使用される物質に比べて、改善された安全性プロファイルを示し得る。例示的実施形態では、Clec9A結合物質およびドキソルビシンは、その物質が単剤療法で使用される場合に採用される用量よりも低い用量で投与され得る。いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質は、変異IFNαなどの変異インターフェロンを含む。例示的実施形態では、変異IFNαは、M148A、R149A、およびL153Aなど、配列番号86または配列番号87に関連して位置148、149、および153で1個または複数の変異を含む。
いくつかの実施形態では、本発明は、1種または複数の免疫調節薬、例えば、限定されないが、免疫チェックポイントを調節する物質との併用療法に関する。種々の実施形態では、免疫調節薬は、PD-1、PD-L1、およびPD-L2の1個または複数を標的とする。種々の実施形態では、免疫調節薬は、PD-1阻害剤である。種々の実施形態では、免疫調節薬は、PD-1、PD-L1、およびPD-L2の1個または複数に特異的な抗体である。例えば、いくつかの実施形態では、免疫調節薬は、限定されないが、ニボルバム(ONO-4538/BMS-936558、MDX1106、オプジーボ、BRISTOL MYERS SQUIBB)、ペムブロリズマブ(キイトルーダ、MERCK)、ピディリズマブ(CT-011,CURE TECH)、MK-3475(MERCK)、BMS936559(BRISTOL MYERS SQUIBB)、MPDL328OA(ROCHE)などの抗体である。いくつかの実施形態では、免疫調節薬は、CD137またはCD137Lの1つまたは複数を標的とする。種々の実施形態では、免疫調節薬は、CD137またはCD137Lの1つまたは複数に特異的な抗体である。例えば、いくつかの実施形態では、免疫調節薬は、限定されないが、ウレルマブ(BMS-663513および抗4-1BB抗体としても知られる)などの抗体である。いくつかの実施形態では、本キメラタンパク質は、固形腫瘍および/またはB細胞非ホジキンリンパ腫および/または頭頸部癌および/または多発性骨髄腫の処置のために、ウレルマブ(と必要に応じ、ニボルバム、リリルマブ、およびウレルマブの1種または複数)と組み合わされる。いくつかの実施形態では、免疫調節薬は、CTLA-4、AP2M1、CD80、CD86、SHP-2、およびPPP2R5Aの1種または複数を標的とする物質である。種々の実施形態では、免疫調節薬は、CTLA-4、AP2M1、CD80、CD86、SHP-2、およびPPP2R5Aの1種または複数に特異的な抗体である。例えば、いくつかの実施形態では、免疫調節薬は、限定されないが、イピリムマブ(MDX-010、MDX-101、ヤーボイ、BMS)および/またはトレメリムマブ(Pfizer)などの抗体である。いくつかの実施形態では、本キメラタンパク質は、黒色腫、前立腺癌、および肺癌の1種または複数の処置のために、イピリムマブ(と必要に応じ、バビツキシマブ)と組み合わされる。種々の実施形態では、免疫調節薬は、CD20を標的とする。種々の実施形態では、免疫調節薬は、CD20に特異的な抗体である。例えば、いくつかの実施形態では、免疫調節薬は、限定されないが、オファツムマブ(GENMAB)、オビヌツズマブ(GAZYVA)、、AME-133v(APPLIED MOLECULAR EVOLUTION)、オクレリズマブ(GENENTECH)、TRU-015(TRUBION/EMERGENT)、ベルツズマブ(IMMU-106)などの抗体である。
いくつかの実施形態では、本発明は、Clec9A結合物質およびチェックポイント阻害剤を用いる併用療法に関する。いくつかの実施形態では、本発明は、チェックポイント阻害剤での処置を受けている患者に対するClec9A結合物質の投与に関する。いくつかの実施形態では、チェックポイント阻害剤は、PD-1、PD-L1、PD-L2、およびCTLA-4(本明細書に記載の抗PD-1、抗PD-L1、抗PD-L2、および抗CTLA-4物質のいずれかを含む)の1種または複数を標的とする物質である。いくつかの実施形態では、チェックポイント阻害剤は、ニボルバム(ONO-4538/BMS-936558、MDX1106、オプジーボ、BRISTOL MYERS SQUIBB)、ペムブロリズマブ(キイトルーダ、MERCK)、ピディリズマブ(CT-011,CURE TECH)、MK-3475(MERCK)、BMS936559(BRISTOL MYERS SQUIBB)、MPDL328OA(ROCHE)、イピリムマブ(MDX-010、MDX-101、ヤーボイ、BMS)およびトレメリムマブ(Pfizer)の1種または複数である。ある実施形態では、チェックポイント阻害剤はPD-L1に対する抗体である。
例示的実施形態では、Clec9A結合物質は、抗PD-L1抗体と共投与されると、相乗的に作用する。例示的実施形態では、Clec9A結合物質は、腫瘍または癌の処置での使用において、抗PD-L1抗体と共投与されると相乗的に作用する。例えば、Clec9A結合物質と抗PD-L1抗体との共投与は、相乗的に作用して、腫瘍または癌を低減または除去し得、または腫瘍または癌の増殖および/または進行および/または転移を遅らせ得る。いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質と抗PD-L1抗体の組み合わせは、単剤療法において単独で使用される物質に比べて、改善された安全性プロファイルを示し得る。いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質および抗PD-L1抗体は、その物質が単剤療法で使用される場合に採用される用量よりも低い用量で投与され得る。いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質は、変異IFNαなどの変異インターフェロンを含む。例示的実施形態では、変異IFNαは、M148A、R149A、およびL153Aなど、配列番号86または配列番号87に関連して位置148、149、および153で1個または複数の変異を含む。
いくつかの実施形態では、本発明は、Clec9A結合物質および免疫抑制剤を用いる併用療法に関する。いくつかの実施形態では、本発明は、免疫抑制剤での処置を受けている患者に対するClec9A結合物質の投与に関する。ある実施形態では、免疫抑制剤は、TNFである。
例示的実施形態では、Clec9A結合物質は、TNFと共投与されると、相乗的に作用する。例示的実施形態では、Clec9A結合物質は、腫瘍または癌の処置での使用において、TNFと共投与されると相乗的に作用する。例えば、Clec9A結合物質とTNFとの共投与は、相乗的に作用して、腫瘍または癌を低減または除去し得、または腫瘍または癌の増殖および/または進行および/または転移を遅らせ得る。いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質とTNFの組み合わせは、単剤療法において単独で使用される物質に比べて、改善された安全性プロファイルを示し得る。いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質およびTNFは、その物質が単剤療法で使用される場合に採用される用量よりも低い用量で投与され得る。いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質は、変異IFNαなどの変異インターフェロンを含む。例示的実施形態では、変異IFNαは、M148A、R149A、およびL153Aなど、配列番号86または配列番号87に関連して位置148、149、および153で1個または複数の変異を含む。
いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質は、キメラ抗原受容体(CAR)T細胞療法と組み合わせて使用されると、相乗的に作用する。例示的実施形態では、Clec9A結合物質は、腫瘍または癌の処置において、CAR T細胞療法と組み合わせて使用されると相乗的に作用する。例示的実施形態では、Clec9A結合物質は、血液系腫瘍の処置において、CAR T細胞療法と組み合わせて使用されると相乗的に作用する。ある実施形態では、Clec9A結合物質は、固形腫瘍の処置において、CAR T細胞療法と組み合わせて使用されると相乗的に作用する。例えば、Clec9A結合物質とCAR T細胞との使用は、相乗的に作用して、腫瘍または癌を低減または除去し得、または腫瘍または癌の増殖および/または進行および/または転移を遅らせ得る。種々の実施形態では、本発明のClec9A結合物質は、CAR T細胞分裂を誘導する。種々の実施形態では、本発明のClec9A結合物質は、CAR T細胞増殖を誘導する。種々の実施形態では、本発明のClec9A結合物質は、CAR T細胞増のアナジーを防止する。
種々の実施形態では、CAR T細胞療法は、抗原(例えば、腫瘍抗原)、例えば、限定されないが、炭酸脱水酵素IX(CAIX)、5T4、CD19、CD20、CD22、CD30、CD33、CD38、CD47、CS1、CD138、Lewis-Y、L1-CAM、MUC16、ROR-1、IL13Rα2、gp100、前立腺幹細胞抗原(PSCA)、前立腺特異的膜抗原(PSMA)、B細胞成熟抗原(BCMA)、ヒトパピローマタイプ16 E6(HPV-16 E6)、CD171、葉酸受容体アルファ(FRα)、GD2、ヒト上皮成長因子受容体2(HER2)、メソテリン、EGFRvIII、線維芽細胞活性化タンパク質(FAP)、癌胎児抗原(CEA)、および血管内皮細胞増殖因子受容体2(VEGF2)、ならびに当該技術分野において周知の他の腫瘍抗原を標的とするCAR T細胞を含む。追加の腫瘍抗原の例としては、MART-1/Melan-A、gp100、ジペプチジルペプチダーゼIV(DPPIV)、アデノシンデアミナーゼ結合タンパク質(ADAbp)、シクロフィリンb、結腸直腸関連性抗原(CRC)-0017-1A/GA733、癌胎児抗原(CEA)およびその免疫原性エピトープCAP-1およびCAP-2、etv6、aml1、前立腺特異抗原(PSA)およびその免疫原性エピトープPSA-1、PSA-2、およびPSA-3、T細胞受容体/CD3-ゼータ鎖、MAGEファミリーの腫瘍抗原(例えば、MAGE-A1、MAGE-A2、MAGE-A3、MAGE-A4、MAGE-A5、MAGE-A6、MAGE-A7、MAGE-A8、MAGE-A9、MAGE-A10、MAGE-A11、MAGE-A12、MAGE-Xp2(MAGE-B2)、MAGE-Xp3(MAGE-B3)、MAGE-Xp4(MAGE-B4)、MAGE-C1、MAGE-C2、MAGE-C3、MAGE-C4、MAGE-C5)、GAGEファミリーの腫瘍抗原(例えば、GAGE-1、GAGE-2、GAGE-3、GAGE-4、GAGE-5、GAGE-6、GAGE-7、GAGE-8、GAGE-9)、BAGE、RAGE、LAGE-1、NAG、GnT-V、MUM-1、CDK4、チロシナーゼ、p53、MUCファミリー、HER2/neu、p21ras、RCAS1、α-フェトプロテイン、E-カドヘリン、α-カテニン、β-カテニンおよびγ-カテニン、p120ctn、gp100 Pmel117、PRAME、NY-ESO-1、cdc27、大腸腺腫症タンパク質(APC)、フォドリン、コネキシン37、Ig-イディオタイプ、p15、gp75、GM2およびGD2ガングリオシド、ヒトパピローマウイルスタンパク質などのウイルス産物、Smadファミリーの腫瘍抗原、lmp-1、NA、EBV-コード化核内抗原(EBNA)-1、脳グリコーゲンホスホリラーゼ、SSX-1、SSX-2(HOM-MEL-40)、SSX-1、SSX-4、SSX-5、SCP-1 CT-7、c-erbB-2、CD19、CD33、CD37、CD56、CD70、CD74、CD138、AGS16、MUC1、GPNMB、Ep-CAM、PD-L1、およびPD-L2が挙げられるが、これらに限定されない。
例示的CAR T細胞療法としては、JCAR014(Juno Therapeutics)、JCAR015(Juno Therapeutics)、JCAR017(Juno Therapeutics)、JCAR018(Juno Therapeutics)、JCAR020(Juno Therapeutics)、JCAR023(Juno Therapeutics)、JCAR024(Juno Therapeutics)、CTL019(Novartis)、KTE-C19(Kite Pharma)、BPX-401(Bellicum Pharmaceuticals)、BPX-501(Bellicum Pharmaceuticals)、BPX-601(Bellicum Pharmaceuticals)、bb2121(Bluebird Bio)、CD-19 Sleeping Beauty(眠れる森の美女)細胞(Ziopharm Oncology)、UCART19(Cellectis)、UCART123(Cellectis)、UCART38(Cellectis)、UCARTCS1(Cellectis)、OXB-302(Oxford BioMedica、MB-101(Mustang Bio)およびInnovative Cellular Therapeuticsにより開発されたCAR T細胞が挙げられるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質は、限定されないが、3-インターフェロン、酢酸グラチラマー、T-インターフェロン、IFNβ2(米国特許出願公開第2002/0025304号)、スピロゲルマニウム(例えば、N-(3-ジメチルアミノプロピル-2-アザ-8,8-ジメチル-8-ゲルマスピロ[4:5]デカン、N-(3-ジメチルアミノプロピル-2-アザ-8,8-ジエチル-8-ゲルマスピロ[4:5]デカン、N-(3-ジメチルアミノプロピル-2-アザ-8,8-ジプロピル-8-ゲルマスピロ[4:5]デカン、およびN-(3-ジメチルアミノプロピル-2-アザ-8,8-ジブチル-8-ゲルマスピロ[4:5]デカン)、ビタミンD類似体(例えば、1,25(OH)2D3、(例えば、米国特許第5,716,946号を参照))、プロスタグランジン(例えば、ラタノプロスト、ブリモニジン、PGE1、PGE2およびPGE3、例えば、米国特許出願公開第2002/0004525号を参照)、テトラサイクリンと誘導体(例えば、ミノサイクリンおよびドキシサイクリン、例えば、米国特許出願公開第2002/0022608号を参照)、VLA-4結合抗体(例えば、米国特許出願公開第2009/0202527号を参照)、副腎皮質刺激ホルモン、副腎皮質ステロイド、プレドニゾン、メチルプレドニソン、2-クロロデオキシアデノシン、ミトキサントロン、スルファサラジン、メトトレキセート、アザチオプリン、シクロホスファミド、シクロスポリン、フマレート、抗CD20抗体(例えば、リツキシマブ)、および チザニジン塩酸塩を含むMS治療薬の1種または複数と組み合わせて多発性硬化症(MS)を処置する方法で使用される。
いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質は、MSの1つまたは複数の症状または副作用を処置する1種または複数の治療薬と組み合わせて使用される。このような薬剤としては、アマンタジン、バクロフェン、パパベリン、メクリジン、ヒドロキシジン、スルファメトキサゾール、シプロフロキサシン、ドクセート、ペモリン、ダントロレン、デスモプレシン、デキサメタゾン、トルテロジン、フェニトイン(phenyloin)、オキシブチニン、ビサコジル、ベンラファキシン、アミトリプチリン、メテナミン、クロナゼパム、イソニアジド、バルデナフィル、ニトロフラントイン、車前子親水性粘漿薬、アルプロスタジル、ガバペンチン、ノルトリプチリン、パロキセチン、プロパンテリンブロミド、モダフィニル、フルオキセチン、フェナゾピリジン、メチルプレドニゾロン、カルバマゼピン、イミプラミン、ジアゼパム、シルデナフィル、ブプロピオン、およびセルトラリンが挙げられるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質は、1種または複数の本明細書に記載の疾患修飾治療薬(DMT)(例えば、表Aの物質)と組み合わせて多発性硬化症を処置する方法で使用される。いくつかの実施形態では、本発明は、1種または複数の開示結合物質を含まない1個または複数の本明細書に記載のDMT(例えば、下表に挙げた物質)の使用と比べて、改善された治療効果を提供する。ある実施形態では、Clec9A結合物質と1種または複数のDMTの組み合わせは、相乗的治療効果をもたらす。
Figure 0007236273000002
Figure 0007236273000003
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MS疾患進行は、疾患進行の最初期段階で、最も激しく、最も多くの損害を与える得る。したがって、例えば、コストと副作用緩和を考慮した多くの償還方針および医療業務とは逆に、例えば、いわゆる二次治療として、最も強力なDMTを用いて処置を開始することが患者の長期疾患状態にとって最も有益である可能性がある。いくつかの実施形態では、患者は二次治療と組み合わせたClec9A結合物質の投与計画により処置される。このような組み合わせを用いて、1種または複数の二次治療の副作用プロファイルを低減する。いくつかの実施形態では、この組み合わせを用いて、1種または複数の二次治療の投与頻度用量を低減する。例えば、組み合わせの場合、上記表に列挙された物質の用量を、約50%、または約40%、または約30%、または約25%低減し得、および/または投与頻度を通常の半分、または通常の1/3に、または例えば、毎日から隔日もしくは毎週に、隔日から毎週もしくは2週毎に、毎週から2週毎もしくは毎月に、等々減らし得る。したがって、いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質は、より都合のよい治療計画を可能にすることにより、患者のアドヒアランスを高める。さらに、いくつかのDMTは示唆される生涯投与量限度を有し、例えばミトキサントロンについては生涯累積投与量は140mg/m、または2、3年の治療に厳密に制限されるべきである。いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質の補充は、このDMTのより低い用量またはより少ない頻度の投与を可能にすることにより、患者がミトキサントロンを利用する機会を維持する。
いくつかの実施形態では、患者は、1種または複数のDMTでの処置を受けていない未処置の患者であり、Clec9A結合物質が二次治療の副作用を和らげるために使用される。したがって、未処置患者は、疾患の発生時に、二次治療の長期間の効果から利益を得られる。いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質は、二次治療の使用の前のエントリー治療として使用される。例えば、Clec9A結合物質が、最初の約3ヶ月の処置期間投与されて疾患を安定化させ、その後患者は二次薬剤の維持療法に移行され得る。
未処置患者は、1種または複数のDMTを受け、かつおそらく失敗した患者に比べて、治療に応答する可能性が大きいと一般に考えられる。いくつかの実施形態では、Clec9a結合物質は、1種または複数のDMTを受け、かつおそらく失敗した患者に使用される。例えば、いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質は、1種または複数のDMTを受け、かつおそらく失敗した患者の治療効果を高め、これらの患者が未処置患者のように応答することを可能にし得る。
いくつかの実施形態では、患者は1種または複数のDMTを受けたことがあるか受けているが、十分に応答していない。例えば、患者は1種または複数のDMTに対し、不応性であるか、または不十分に応答し得る。いくつかの実施形態では、患者は、(AUBAGIO(GENZYME));テリフルノミド(AUBAGIO(GENZYME));インターフェロンβ1a(AVONEX(BIOGEN IDEC);インターフェロンβ1b(BETASERON(BAYER HEALTHCARE PHARMACEUTICALS,INC.);酢酸グラチラマー(COPAXONE(TEVA NEUROSCIENCE);インターフェロンβ1b(EXTAVIA(NOVARTIS PHARMACEUTICALS CORP.);フィンゴリモド(GILENYA(NOVARTIS PHARMACEUTICALS CORP.);アレムツズマブ(LEMTRADA(GENZYME);ミトキサントロン(NOVANTRONE(EMD SERONO);ペグ化インターフェロンβ1a(PLEGRIDY(BIOGEN IDEC);インターフェロンβ1a(REBIF(EMD SERONO,INC.);フマル酸ジメチル(BG-12)(TECFIDERA(BIOGEN IDEC);およびナタリズマブ(TYSABRI(BIOGEN IDEC)の内の1種または複数に対し、不応性であるか、または不十分に応答する。いくつかの実施形態では、1種または複数の開示結合物質は、患者における1種または複数のDMTの治療効果をもたらし、したがってDMTに対する非応答性を低減または除去する。例えば、これは、より高い用量または頻度での1種または複数のDMTを用いる治療から患者を免れさせ得る。
より攻撃的な疾患の患者では、1つの手法は、誘導治療モデルであり、この場合、強力な効力があるが強い安全性の懸念のある治療を最初に投与し、続いて、維持療法を行う。このようなモデルの例は、アレムツズマブによる最初の処置に続く、IFNβ、GA、またはBG-12による処置を含む。いくつかの実施形態では、1種または複数の開示結合物質を用いて、療法を維持療法に切り替える必要性をなくす。いくつかの実施形態では、1種または複数の開示結合物質を、二次治療を含む、1種または複数のDMTに対する維持療法として用いる。いくつかの実施形態では、1種または複数の開示結合物質を、例えば、一次治療などの、誘導療法での最初の治療として用い、維持療法として別のDMTが続く。
いくつかの実施形態では、1種または複数の開示結合物質は、約3ヶ月の初期処置期間の間投与されて疾患を安定させ、その後患者を一次治療薬による維持療法に移行し得る。
種々の実施形態では、1種または複数の開示結合物質を用いて、限定されないが、本明細書で開示のいずれかの物質を含む、DMTの1種または複数の副作用を低減する。例えば、1個または複数の開示結合物質は、1種または複数のDMTの用量節約を可能にしかつ、したがって、より少ない副作用をもたらす投与計画において使用され得る。例えば、いくつかの実施形態では、1種または複数の開示結合物質は、AUBAGIOまたは関連物質の1種または複数の副作用を低減させ得る。この副作用は、毛髪菲薄化、下痢、インフルエンザ、悪心、肝臓検査異常および手または足の異常な痺れまたは刺痛(知覚異常)、白血球のレベル(感染症のリスクを増大させる可能性がある);血圧の増大;および重篤な肝障害を含み得る。いくつかの実施形態では、1種または複数の開示結合物質は、注射後のインフルエンザ様症状、うつ、軽度の貧血、肝障害、アレルギー反応、および心臓障害を含むAVONEXまたは関連物質の1種または複数の副作用を低減し得る。いくつかの実施形態では、1種または複数の開示結合物質は、注射後のインフルエンザ様症状、注射部位反応、アレルギー反応、うつ、肝障害、および低白血球数を含むBETASERONまたは関連物質の1種または複数の副作用を低減し得る。いくつかの実施形態では、1種または複数の開示結合物質は、注射部位反応、血管拡張(血管の拡張);胸部痛;不安症、胸部痛、動悸、息切れ、および顔面紅潮を含む注射直後の反応を含むCOPAXONEまたは関連物質の1種または複数の副作用を低減し得る。いくつかの実施形態では、1種または複数の開示結合物質は、注射後のインフルエンザ様症状、注射部位反応、アレルギー反応、うつ、肝障害、および低白血球数を含むEXTAVIAまたは関連物質の1種または複数の副作用を低減し得る。いくつかの実施形態では、1種または複数の開示結合物質は、頭痛、インフルエンザ、下痢、背部痛、肝臓酵素上昇、咳、最初の投与後の遅い心拍数、感染症、および眼の膨潤を含むGILENYAまたは関連物質の1種または複数の副作用を低減し得る。いくつかの実施形態では、1種または複数の開示結合物質は、発疹、頭痛、発熱、鼻詰まり、悪心、尿路感染症、疲労、不眠、上気道感染症、じん麻疹、そう痒、甲状腺障害、真菌感染、関節、四肢および背中の痛み、下痢、嘔吐、顔面紅潮、および輸注反応(悪心、じん麻疹、そう痒、不眠、悪寒、顔面紅潮、疲労、息切れ、味覚の変化、消化障害、眩暈、疼痛を含む)を含むLEMTRADAまたは関連物質の1種または複数の副作用を低減し得る。いくつかの実施形態では、1種または複数の開示結合物質は、投与の24時間後の緑色尿;感染症、骨髄抑制(疲労、紫斑、低血液細胞数)、悪心、毛髪菲薄化、膀胱感染症、口のびらん、および深刻な肝障害および心臓障害を含むノバントロンまたは関連物質の1種または複数の副作用を低減し得る。いくつかの実施形態では、1種または複数の開示結合物質は、注射後のインフルエンザ様症状、注射部位反応、うつ、軽度の貧血、肝障害、アレルギー反応、および心臓障害を含むPLEGRIDYまたは関連物質の1種または複数の副作用を低減し得る。いくつかの実施形態では、1種または複数の開示結合物質は、注射後のインフルエンザ様症状、注射部位反応、うつ、アレルギー反応、および低赤血球数または低白血球数を含むREBIFまたは関連物質の1種または複数の副作用を低減し得る。いくつかの実施形態では、1種または複数の開示結合物質は、顔面紅潮(熱またはそう痒の感覚、皮膚の紅潮)、消化管障害(悪心、下痢、腹痛)、発疹、尿中タンパク、肝酵素の上昇;および血中のリンパ球(白血球)数の減少を含むTECFIDERAまたは関連物質の1種または複数の副作用を低減し得る。いくつかの実施形態では、1種または複数の開示結合物質は、頭痛、疲労、尿路感染症、うつ、気道感染症、関節痛、胃もたれ、腹部不快感、下痢、腟炎、腕または脚部痛、発疹、輸注の2時間以内のアレルギー性反応または過敏症反応(眩暈、発熱、発疹、そう痒、悪心、顔面紅潮、低血圧、呼吸困難、胸部痛)を含むTYSABRIまたは関連物質の1種または複数の副作用を低減し得る。
いくつかの実施形態では、本発明は、国際公開第2013/10779号、国際公開第2015/007536号、国際公開第2015/007520号、国際公開第2015/007542号、および国際公開第2015/007903号に記載の1種または複数のキメラ物質との併用療法に関する。これらの特許の内容は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
限定されないが、感染症適用を含む、いくつかの実施形態では、本発明は、追加の治療薬としての抗感染薬に関する。いくつかの実施形態では、抗感染薬は抗ウイルス薬であり、限定されないが、アバカビル、アシクロビル、アデホビル、アンプレナビル、アタザナビル、シドフォヴィル、ダルナビル、デラビルジン、ジダノシン、ドコサノール、エファビレンツ、エルビテグラビル、エムトリシタビン、エンフビルチド、エトラビリン、ファムシクロビル、およびホスカルネットを含む。いくつかの実施形態では、治療薬は抗菌剤であり、限定されないが、セファロスポリン系抗生物質(セファレキシン、セフロキシム、セファドロキシル、セファゾリン、セファロチン、セファクロール、セファマンドール、セフォキシチン、セフプロジル、およびセフトビプロール);フルオロキノロン系抗生物質(シプロ、レヴァキン、フロキシン、テクイン、アベロックスおよびノルフロックス);テトラサイクリン系抗生物質(テトラサイクリン、ミノサイクリン、オキシテトラサイクリン、およびドキシサイクリン);ペニシリン系抗生物質(アモキシシリン、アンピシリン、ペニシリンV、ジクロキサシリン、カルベニシリン、バンコマイシン、およびメチシリン);モノバクタム系抗生物質(アズトレオナム);およびカルバペネム系抗生物質(エルタペネム、ドリペネム、イミペネム/シラスタチン、およびメロペネム)を含む。いくつかの実施形態では、抗感染薬は、抗マラリア薬(例えば、クロロキン、キニーネ、メフロキン、プリマキン、ドキシサイクリン、アーテメータ/ルメファントリン、アトバクオン/プログアニルおよびスルファドキシン/ピリメタミン)、メトロニダゾール、チニダゾール、イベルメクチン、パモ酸ピランテル、およびアルベンダゾールを含む。
限定されないが、自己免疫疾患適用を含むいくつかの実施形態では、追加の治療薬は、免疫抑制剤である。いくつかの実施形態では、免疫抑制剤は、ステロイド性抗炎症剤または非ステロイド性抗炎症剤(NSAIDS)などの抗炎症剤である。ステロイド,特に副腎皮質ホルモン剤およびそれらの合成類似体は当該技術分野においてよく知られている。本発明で有用な副腎皮質ステロイドの例としては、ヒドロキシルトリアムシノロン、α-メチルデキサメタゾン、β-メチルβ-メタゾン、ベクロメタゾンジプロピオネート、β-メタゾンベンゾエート、β-メタゾンジプロピオネート、β-メタゾンバレレート、クロベタゾールバレレート、デソニド、デソキシメタゾン、デキサメタゾン、ジフロラソンジアセテート、ジフルコルトロンバレレート、フルアドレノロン、フルクロロロンアセトニド、フルメタゾンピバレート、フルオシノロンアセトニド、フルオシノニド、フルコルチンブチルエステル、フルオコルトロン、フルプレドニデン(フルプレドニリデン)アセテート、フルランドレノロン、ハルシノニド、ヒドロコルチゾンアセテート、ヒドロコルチゾンブチレート、メチルプレドニゾロン、トリアムシノロンアセトニド、コルチゾン、コルトドキソン、フルセトニド、フルドロコルチゾン、ジフルオロゾンジアセテート、フルラドレノロンアセトニド、メドリゾン、アムシナフェル、アムシナフィド、ベタメタゾンおよびその残りのエステル、クロロプレドニソン、クロコルテロン、クレシノロン、ジクロリゾン、ジフルプレドネート、フルクロロニド、フルニソリド、フルオロメタロン、フルペロロン、フルプレドニソロン、ヒドロコルチゾン、メプレドニゾン、パラメタゾン、プレドニゾロン、プレドニゾン、ベクロメタゾンジプロピオネートが挙げられるが、これらに限定されない。本発明で使用してよい(NSAIDS)としては、限定されないが、サリチル酸、アセチルサリチル酸、サリチル酸メチル、グリコールサリチレート、サリチルアミド、ベンジル-2,5-ジアセトキシ安息香酸、イブプロフェン、スリンダク(fulindac)、ナプロキセン、ケトプロフェン、エトフェナメート、フェニルブタゾン、およびインドメタシンが挙げられる。いくつかの実施形態では、免疫抑制剤は、アルキル化剤、代謝拮抗物質(例えば、アザチオプリン、メトトレキセート)、細胞傷害性抗生物質、抗体(バシリキシマブ、ダクリズマブ、およびムロモナブ)、抗イムノフィリン剤(例えば、シクロスポリン、タクロリムス、シロリムス)、インターフェロン、オピオイド、TNF結合タンパク質、ミコフェノレート、および小分子生物学的製剤(例えば、フィンゴリモド、ミリオシン)などの細胞分裂阻害薬であってよい。追加の抗炎症剤は、例えば、米国特許第4,537,776号に記載され、この特許の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、本明細書で記載のClec9A結合物質は、修飾されている誘導体、すなわち、共有結合が組成物の活性を妨げないような組成物への任意のタイプの分子の共有結合により修飾されている誘導体を含む。例えば、限定するものではないが、誘導体は、特に、グリコシル化、脂質化、アセチル化、ペグ化、リン酸化、アミド化、既知の保護/ブロック基による誘導体化、タンパク質切断、細胞リガンドまたはその他のタンパク質への結合、などにより修飾されている組成物を含む。多くの化学修飾のいずれかを、限定されないが、特異的切断、アセチル化、ホルミル化、ツニカマイシンの代謝合成などを含む、既知の技術により行うことができる。
さらに他の実施形態では、本明細書に記載のClec9A結合物質は、例示的実施形態で、毒素、化学療法剤、放射性同位元素、およびアポトーシスまたは細胞死を引き起こす物質を含む細胞傷害薬をさらに含む。このような物質は、本明細書に記載の組成物に複合化され得る。
本明細書で記載のClec9A結合物質はしたがって翻訳後修飾されて、化学リンカーなどのエフェクター部分、例えば蛍光染料、酵素、基質、生物発光物質、放射性物質、および化学発光部分などの検出可能な部分、または、例えばストレプトアビジン、アビジン、ビオチン、細胞毒、細胞傷害性薬、および放射性物質などの機能的部分を付加し得る。
細胞傷害薬の例としては、メトトレキセート、アミノプテリン、6-メルカプトプリン、6-チオグアニン、シタラビン、5-フルオロウラシルデカルバジン;アルキル化剤(例えば、メクロレタミン、チオテパ、クロラムブシル(thioepa chlorambucil)、メルファラン、カルムスチン(BSNU)、マイトマイシンC、ロムスチン(CCNU)、1-メチルニトロソウレア、シクロホスファミド(cyclothosphamide)、メクロレタミン、ブスルファン、ジブロモマンニトール、ストレプトゾトシン、マイトマイシンC、シス-ジクロロジアミン白金(II)(DDP)シスプラチンおよびカルボプラチン(パラプラチン));アントラサイクリン(ダウノルビシン(以前のダウノマイシン)およびドキソルビシン(アドリアマイシン)、デトルビシン、カルミノマイシン、イダルビシン、エピルビシン、ミトキサントロンおよびビサントレンを含む);抗生物質(ダクチノマイシン(アクチノマイシンD)、ブレオマイシン、カリチアマイシン、ミトラマイシン、およびアントラマイシン(AMC)を含む);および有糸分裂阻害薬(antimytotic agent)(例えば、ビンカアルカロイドビンカアルカロイド、ビンクリスチンおよびビンブラスチン)が挙げられるが、これらに限定されない。他の細胞傷害薬としては、パクリタキセル(タキソール)、リシン、緑膿菌外毒素、ゲムシタビン、サイトカラシンB、グラミシジンD、臭化エチジウム、エメチン、エトポシド、テノポシド、コルヒチン、ジヒドロキシアントラシンジオン,1-デヒドロテストステロン、グルココルチコイド、プロカイン、テトラカイン、リドカイン、プロプラノロール、ピューロマイシン、プロカルバジン、ヒドロキシ尿素、アスパラギナーゼ、副腎皮質ステロイド、ミトタン(mytotane)(O,P’-(DDD))、インターフェロン、およびこれらの細胞傷害薬の混合物が挙げられる。
さらなる細胞傷害薬としては、化学療法剤、例えば、カルボプラチン、シスプラチン、パクリタキセル、ゲムシタビン、カリチアマイシン、ドキソルビシン、5-フルオロウラシル、マイトマイシンC、アクチノマイシンD、シクロホスファミド、ビンクリスチン、ブレオマイシン、VEGFアンタゴニスト、EGFRアンタゴニスト、プラチン、タキソール、イリノテカン、5-フルオロウラシル、ゲムシタビン(gemcytabine)、ロイコボリン、ステロイド類、シクロホスファミド、メルファラン、ビンカアルカロイド(例えば、ビンブラスチン、ビンクリスチン、ビンデシンおよびビノレルビン)、ムスチン、チロシンキナーゼ阻害剤、放射線療法、性ホルモン拮抗薬、選択的アンドロゲン受容体調節薬、選択的エストロゲン受容体調節薬、PDGFアンタゴニスト、TNFアンタゴニスト、IL-1アンタゴニスト、インターロイキン(例えば、IL-12またはIL-2)、IL-12Rアンタゴニスト、毒素複合化モノクローナル抗体、腫瘍抗原特異的モノクローナル抗体、アービタックス、アバスチン、ペルツズマブ、抗CD20抗体、リツキサン、オクレリズマブ、オファツムマブ、DXL625、ハーセプチン(登録商標)、またはこれらの任意の組み合わせが挙げられるが、これらに限定されない。リシン、ジフテリア毒素およびシュードモナス毒素などの植物および細菌由来の毒性酵素は、治療薬(例えば、抗体)と複合化されて、細胞型特異的殺作用剤を生成し得る(Youle,et al.,Proc.Nat’l Acad.Sci.USA 77:5483(1980);Gilliland,et al.,Proc.Nat’l Acad.Sci.USA 77:4539(1980);Krolick,et al.,Proc.Nat’l Acad.Sci.USA 77:5419(1980))。
他の細胞傷害薬としては、Goldenbergによる米国特許第6.653,104号に記載される細胞傷害性リボヌクレアーゼが挙げられる。本発明の実施形態はまた、放射性免疫複合体に関し、複合体形成剤を使用してまたは使用せずに、アルファまたはベータ粒子を放出する放射性核種がClec9A結合物質に安定に結合される。このような放射性核種は、リン-32、スカンジウム-47、銅-67、ガリウム-67、イットリウム-88、イットリウム-90、ヨウ素-125、ヨウ素-131、サマリウム-153、ルテチウム-177、レニウム-186またはレニウム-188などのベータエミッター、およびアスタチン-211、鉛-212、ビスマス-212、ビスマス-213またはアクチニウム-225などのアルファエミッターを含む。
検出可能な部分の例としては、西洋ワサビペルオキシダーゼ、アセチルコリンエステラーゼ、アルカリフォスファターゼ、ベータガラクトシダーゼおよびルシフェラーゼが挙げられるが、これらに限定されない。蛍光材料のさらなる例としては、ローダミン、フルオレセイン、フルオレセインイソチオシアネート、ウンベリフェロン、ジクロロトリアジニルアミン、フィコエリトリンおよびダンシルクロリドが挙げられるが、これらに限定されない。化学発光部分のさらなる例としては、ルミノールが挙げられるが、これに限定されない。生物発光材料のさらなる例としては、ルシフェリンおよびエクオリンが挙げられるが、これらに限定されない。放射性材料のさらなる例としては、ヨウ素-125、炭素-14、硫黄-35、トリチウムおよびリン-32が挙げられるが、これらに限定されない。
処置方法
本明細書に記載の方法および組成物は、限定されないが、癌、感染症、免疫異常、および炎症性疾患または状態を含む、種々の疾患および障害を処置する用途がある。
さらに、本発明の物質は、限定されないが、癌、感染症、免疫異常、炎症性疾患または状態、および自己免疫疾患を含む、種々の疾患および障害の処置、または処置用の薬物の製造に使用し得る。
いくつかの実施形態では、本発明は、癌の処置、または癌の患者に関する。本明細書で使用される場合、癌は、身体の器官およびシステムの正常な機能動作を妨害し得る何らかの制御されない細胞増殖を指し、原発性および転移性の腫瘍の両方を含む。原発性腫瘍またはそれらの元の位置から移動し重要な器官に播種する癌は、罹患した器官の機能劣化により対象の死を最終的にもたらす可能性がある。転移は、原発腫瘍部位とは異なる、癌細胞または一群の癌細胞であり、原発腫瘍から身体の他の部位への癌細胞の転移から生ずる。転移は、最終的に対象の死に繋がる場合がある。例えば、癌は、良性および悪性の癌、ポリープ、過形成、ならびに休眠腫瘍または微小転移を含み得る。
処置され得る癌の例としては、基底細胞癌、胆道癌;膀胱癌;骨癌;脳および中枢神経系癌;乳癌;腹膜の癌;子宮頸癌;絨毛癌;結腸および直腸癌;結合組織癌;消化器系の癌;子宮内膜癌;食道癌;眼癌;頭頸部の癌;胃癌(胃腸癌を含む);神経膠芽腫;肝癌;ヘパトーマ;上皮内腫瘍;腎臓癌または腎臓癌(kidney or renal cancer);喉頭癌;白血病;肝臓癌;肺癌(例えば、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、肺腺癌、および肺扁平上皮癌);黒色腫;骨髄腫;神経芽腫;口腔癌(唇、舌状、舌、口内、および咽頭);卵巣癌;膵臓癌;前立腺癌;網膜芽細胞腫;横紋筋肉腫;直腸癌;呼吸器系癌;唾液腺癌腫;肉腫;皮膚癌;扁平上皮細胞癌;胃癌;精巣癌;甲状腺癌;子宮または子宮内膜癌;泌尿器系の癌;外陰癌;ホジキンリンパ腫および非ホジキンリンパ腫、ならびにB細胞リンパ腫を含むリンパ腫(低悪性度/濾胞性非ホジキンリンパ腫(NHL)を含む);小リンパ球性(SL)NHL;中悪性度/濾胞性NHL;中悪性度びまん性NHL;高悪性度免疫芽細胞NHL;高悪性度リンパ芽球性NHL;高悪性度小型非切れ込み核細胞性NHL;巨大腫瘤病変NHL;マントル細胞リンパ腫;エイズ関連リンパ腫;およびワルデンシュトレームマクログロブリン血症;慢性リンパ性白血病(CLL);急性リンパ性白血病(ALL);急性骨髄性白血病(AML);毛様細胞性白血病;慢性骨髄芽球性白血病;ならびに他の癌腫および肉腫;および移植後リンパ増殖性疾患(PTLD)、ならびに母斑症、浮腫(例えば、脳腫瘍に関連するもの)、およびメグズ症候群に関連する異常血管増殖が挙げられるが、これらに限定されない。
種々の実施形態では、本発明は、癌の処置のための改変シグナル伝達物質をさらに含むキメラの一部であるClec9A結合物質を提供する。いくつかの実施形態では、本発明のClec9A結合物質は、腫瘍を大きく低減および/または除去する。いくつかの実施形態では、本発明のClec9A結合物質は、化学療法剤、チェックポイント阻害剤、および免疫抑制剤などの他の抗癌剤と併せて対象に投与されると、腫瘍を大きく低減および/または除去する。種々の実施形態では、Clec9A結合物質と他の抗癌剤の組み合わせは、腫瘍サイズを相乗的に低減するおよび/または腫瘍細胞を除去する。
種々の実施形態では、本発明は、1つまたは複数のターゲティング部分および1種または複数の改変シグナル伝達物質を含むキメラの一部であるClec9A結合物質を用いる癌併用療法に関する。したがって、本発明は、例えば、Clec9Aに対するターゲティング部分および1種または複数のシグナル伝達物質を含むキメラタンパク質または融合タンパク質ならびに抗癌剤と組み合わせたその使用を提供する。
例えば、種々の実施形態では、本発明は、限定されないが、本明細書に記載のClec9A結合物質と、ヒトインターフェロンアルファ2を含むIFNアルファなどの変異ヒトインターフェロンを含む改変シグナル伝達物質とのキメラを含む癌の併用療法剤に関する。
他の実施形態では、本発明のClec9A結合物質は、複数のターゲティング部分を含みしたがって二重特異性または三重特異性フォーマットで存在するキメラの一部である。例えば、種々の実施形態では、本発明は、Clec9A結合物質と、本明細書に記載のチェックポイント阻害剤結合物質(例えば、抗PD-L1、抗PD-1、抗PD-L2、または抗CTLA)、および限定されないが、ヒトインターフェロンアルファ2を含むIFNアルファなどの変異ヒトインターフェロンを含む改変シグナル伝達物質と、を含む癌のための併用療法剤に関する。
種々の実施形態では、シグナル伝達物質は、1個または複数のその受容体に対する低減された親和性または活性を有するように改変され、それはキメラタンパク質の活性(アゴニズムまたはアンタゴニズムを含む)の減弱化を可能にし、および/または非特異的シグナル伝達または望ましくない隔離を防止する。いくつかの実施形態では、受容体に対し低減された親和性または活性は、本明細書に記載の1つまたは複数のターゲティング部分の結合により回復可能である。
いくつかの実施形態では、本発明は、微生物感染症および/または慢性感染症の処置、またはそれらの感染症を罹患している患者に関する。感染症の例としては、HIV/AIDS、結核、骨髄炎、B型肝炎、C型肝炎、エプスタイン・バールウイルスまたはパルボウイルス感染症、T細胞白血病ウイルス感染症、細菌過剰症候群、真菌または寄生虫感染症が挙げられるが、これらに限定されない。
種々の実施形態では、本発明の組成物は、炎症、急性炎症、慢性炎症、呼吸器疾患、アテローム性動脈硬化症、再狭窄、喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、敗血性ショック、関節リウマチ、炎症性腸疾患、炎症性骨盤疾患、痛み、眼の炎症性疾患、セリアック病、リー症候群、グリセロールキナーゼ欠損症、家族性好酸球増加症(FE)、常染色体劣性遺伝性脊髄小脳変性症、炎症性喉頭疾患;結核、慢性胆嚢炎、気管支拡張症、珪肺症および他の塵肺症などの1種または複数の炎症性疾患または状態を処置するまたは予防するために使用される。
種々の実施形態では、本発明は、自己免疫疾患および/または神経変性疾患を処置する用途を有する。
種々の実施形態では、本発明の組成物は、1種または複数の望ましくないCTL活性を特徴とする状態、および/または高レベルの細胞死を特徴とする状態を処置するまたは予防するために使用される。例えば、種々の実施形態では、本発明の組成物は、1種または複数の無制御または過敏性の免疫応答に関連する状態を処置するまたは予防するために使用される。
種々の実施形態では、本発明の組成物は、MS、糖尿病、ループス、セリアック病、クローン病、潰瘍性大腸炎、ギラン・バレー症候群、強皮症、グッドパスチャー症候群、ウェゲナー肉芽腫症、自己免疫性てんかん、ラスムッセン脳炎、原発性硬化性胆管炎、硬化性胆管炎、自己免疫性肝炎、アジソン病、橋本甲状腺炎、線維筋痛症、メニエール症候群(Menier’s syndrome)、移植拒絶反応(例えば、移植片拒絶の防止)、悪性貧血、関節リウマチ、全身性エリテマトーデス、皮膚筋炎、シェーグレン症候群、紅斑性狼瘡、重症筋無力症、ライター症候群、グレーブス病、および他の自己免疫疾患などの、1種または複数の自己免疫疾患および/または神経変性疾患または状態を処置するまたは予防するために使用される。
種々の実施形態では、本発明は、自己免疫疾患および/または神経変性疾患を処置するまたは予防するために用いられる。いくつかの実施形態では、自己免疫疾患および/または神経変性疾患は、MS(限定されないが、本明細書に記載のサブタイプを含む)、アルツハイマー病(限定されないが、早期発症型アルツハイマー病、遅発性アルツハイマー病、および家族性アルツハイマー病(FAD)を含む)、パーキンソン病およびパーキンソニズム(限定されないが、特発性パーキンソン病、脳血管性パーキンソニズム、薬剤誘発性パーキンソニズム、レヴィー小体型痴呆、遺伝性パーキンソン病、若年性パーキンソン病を含む)、ハンチントン病、筋萎縮性側索硬化症(ALS、限定されないが、突発性ALS、家族性ALS、西太平洋ALS、若年性ALS、平山病(Hirayama disease))から選択される。
種々の実施形態では、本発明は、MSの処置または予防するために用いられる。種々の実施形態では、本明細書に記載のClec9a結合物質は、複数のMS症状を除去または低減するために用いられる。本明細書に記載の組成物および方法で予防または処置できる多発性硬化症に関連する症状の例は、視神経炎、複視、眼振、眼球運動測定異常、核間性眼筋麻痺、運動眼閃および音眼閃、求心性瞳孔障害、不全麻痺、単不全麻痺、不全対麻痺、不全片麻痺、四肢不全麻痺、麻痺、対麻痺、半身麻痺、四肢麻痺、四肢不全麻痺(quadriplegia)、痙縮、構音障害、筋萎縮症、痙攣、筋痙攣、筋緊張低下、クローヌス、間代性筋痙攣、ミオキミア、不隠脚症候群、下垂足、反射機能不全、錯感覚、麻酔、神経痛、神経障害性および神経性疼痛、レルミット徴候、固有受容機能不全、三叉神経痛、運動失調、企図振戦、測定異常、前庭性運動失調、めまい、発語運動失調、ジストニア、拮抗運動反復障害、頻尿、膀胱痙性、弛緩性膀胱、排尿筋・括約筋筋失症、勃起不全、無オルガスム症、不感症、便秘、便意切迫、便失禁、うつ、認知障害、認知症、気分変動、情緒不安定、多幸感、双極症候群、不安症、失語症、言語障害、疲労、ウートホフ徴候、胃食道逆流症、および就眠障害を含む。本明細書に記載の1種または複数の物質により、対象におけるこれらの症状の1種または複数の緩和または改善を実現できる。
種々の実施形態では、本明細書に記載のClec9A結合物質は、最初のエピソードからなる症候群(clinically isolated syndrome)(CIS)を処置または予防するために用いられる。最初のエピソードからなる症候群(CIS)は、視神経炎、脳幹症状、および部分的な脊髄炎などの、MSと合致する単一症状の発作である。第2の臨床的発作を経験するCISの患者は通常、臨床的に確実な多発性硬化症(CDMS)であると見なされる。CISおよびMRI病変を有する患者の80%超がMSを発病し、約20%は自己限定プロセスを有する。MSに適合する単一の臨床的発作を経験する患者は、臨床的に確実な多発性硬化症の発作の前に、多発性硬化症に合致する少なくとも1つの病変を有し得る。種々の実施形態では、本明細書中に記載するClec9a結合物質は、CISが、例えばRRMSを含むMSに進行しないよう、CISの処置に使用される。
種々の実施形態では、本明細書に記載のClec9A結合物質は、radiologically isolated syndrome(RIS)を処置または予防するために用いられる。RISでは、偶然の画像診察所見が、臨床的徴候または症状の非存在下の炎症性脱髄を示唆する。種々の実施形態では、Clec9A結合物質は、RISが、例えば、RRMSを含むMSに進行しないよう、RISの処置に使用される。
種々の実施形態では、本明細書に記載のClec9A結合物質は、良性多発性硬化症;再発寛解型多発性硬化症(RRMS);二次性進行型多発性硬化症(SPMS);進行性再発型多発性硬化症(PRMS);および一次性進行型多発性硬化症(PPMS)の1種または複数を処置するために用いられる。
良性多発性硬化症は、レトロスペクティブな診断であり、1~2回の増悪と完全な回復、継続しない能力障害および最初の発症後10~15年の間の無疾患進行を特徴とする。しかし、良性多発性硬化症は、他の型の多発性硬化症に進行する可能性がある。種々の実施形態では、Clec9a結合物質は、良性多発性硬化症がMSに進行しないように良性多発性硬化症の処置に使用される。
RRMSに罹患している患者は、散発性増悪または再発、ならびに寛解期間を経験する。病変および軸索喪失の証拠は、RRMSの患者のMRIで見える場合も見えない場合もある。種々の実施形態では、本明細書に記載のClec9a結合物質は、RRMSを処置するために使用される。いくつかの実施形態では、RRMSは、RRMSの患者;SPMSの患者で再発が重畳している患者;およびCISの患者で、その後のMRIスキャンでMcDonald基準に従い病変の多発を示す患者を含む。本明細書で「再発」、「確定再発」、または「臨床的確定再発(clinically defined relapse)」として使用してもよい臨床的再発は、1種または複数の新しい神経学的異常の出現または1種または複数の以前に観察された神経学的異常の再出現である。臨床状態のこの変化は、少なくとも48時間持続しなければならず、少なくとも30日間の比較的安定なまたは改善されている神経学的状態が直前になければならない。いくつかの実施形態では、対象の症状に、以前の評価に比べて総合障害度評価尺度(EDSS)スコアでの少なくとも1.00または7つのFSの2以上のスコアでの1グレードまたはFSの1つのスコアの2グレードの増加に一致する、観察される客観的な神経学的変化が付随する場合、あるイベントは再発としてカウントされる。
SPMSは、RRMSから進化し得る。SPMSに罹患している患者は、再発を有し、寛解中の回復の減少した程度、RRMS患者より頻度が低い寛解およびより顕著な神経障害を有する。脳梁、正中中枢および脊髄の萎縮のマーカーである脳室拡大が、SPMSの患者のMRIで認められる。種々の実施形態では、本明細書に記載のClec9a結合物質は、RRMSがSPMSに進行しないようRRMSを処置するために使用される。
PPMSは、明確な発作または寛解なしに増大する神経障害の着実な進行を特徴とする。脳病変、びまん性脊髄損傷および軸索喪失の証拠が、PPMSの患者のMRIで明白である。PPMSは急性増悪の期間を有し、一方で、寛解することなく増大する神経障害の過程に沿って進行する。病変は、PRMSを罹患している患者のMRIで明らかである。種々の実施形態では、本明細書に記載のClec9A結合物質は、RRMSおよび/またはSPMSがPPMSに進行しないようにそれらを処置するために使用される。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のClec9A結合物質は、再発型のMSの処置の方法で使用される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のClec9A結合物質は、身体障害の蓄積を遅らせおよび/または臨床的増悪の頻度を低減させるために再発型のMSの処置の方法で使用され、かつ、任意に、最初の臨床的発症を経験しかつMSに合致するMRIの特徴を有する患者に対して使用される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のClec9a結合物質は、神経障害および/または臨床的増悪の頻度を低減するために、悪化する再発寛解型MS、進行再発型MSまたは二次性進行型MSの処置の方法で使用される。いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質は、再発の頻度および/または重症度を低減する。
いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質は、1回、または2回、または3回、または4回、または5回、または6回、または7回、または8回、または9回、または10回以上の疾患修飾治療(DMT)に対し不適切な応答のあった患者における再発型のMSの処置の方法で使用される。
種々の実施形態では、対象の症状は、EDSS、または再発の頻度の減少、または持続性進行までの時間の増加、または高頻度の連続的MRI調査における磁気共鳴画像(MRI)挙動の改善によりなど、定量的に評価され、患者の処置前後の状態測定値を比較し得る。成功した処置では、患者の状態は改善されるであろう(例えば、EDSS測定スコアまたは再発の頻度が減少する、または持続性進行までの時間が増加する、またはMRIスキャンが病状の低下を示す)。
いくつかの実施形態では、患者は、例えば、Clec9a結合物質を受ける前、その間またはその後で、例えば、応答性の指標について評価され得る。種々の臨床的または他の処置の有効性の指標、例えば、EDSSスコア;MRIスキャン;再発数、比率、または重症度;多発性硬化症機能評価(MSFC);多発性硬化症の生活の質質問票(MSQLI);連続聞き取り加算検査(PASAT);符号数字モダリティー検査(SDMT);25フィートの歩行試験;9ホールペグ試験;低コントラスト視力;修正疲労重症度スケール;総合障害度評価スコア(EDSS);多発性硬化症機能評価(MSFC);ベックうつ病質問票;および7/24空間認知検査を使用できる。種々の実施形態では、Clec9A結合物質は、これらの尺度の1つまたは複数で改善をもたらす。さらに、患者は、投与計画中の様々な時間でモニターされ得る。いくつかの実施形態では、Clec9a結合物質は、空間的、時間的McDonald播種により評価される、疾患の改善をもたらす。例えば、空間的播種に関しては、病変イメージング、例えば、実例として、Barkhof-TintoreのMRI基準、を使用してよく、ガドリニウム強調病変または9 T2高信号病変;少なくとも1つのテント下病変;少なくとも1つの傍骨性病変;少なくとも約3個の脳室周囲病変;および脊髄病変を含む。時間的播種に関しても、MRIを使用でき;例えば、最初の臨床的イベント後3ヶ月以上で実施された脳のMRIスキャンが新しいガドリニウム強調病変を示す場合、これは新規CNS炎症性のイベントを示す可能性があり、理由は、MSのガドリニウム強調期間は通常、6週間未満であるためである。ガドリニウム強調病変はないが新しいT2病変が存在する場合(最初のイベントの時のMRIを仮定して)、新しいT2病変またはガドリニウム強調病変を実証する3ヶ月後の反復MRイメージングが必要となり得る。
いくつかの実施形態では、疾患効果は、Lavery,et al.Multiple Sclerosis International,Vol 2014(2014),Article ID262350に記載されるいずれかの尺度を用いて評価され、この文献の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質は、(a)EDSSでの1.0ポイントの劣化として定義される身体障害の悪化の防止、(b)再発までの時間の増加、(c)ガドリニウム強調病変の数および/または体積の低減または安定化、(d)低下した年間再発率、(e)増加した再発持続時間およびNRSスコアによる重症度、(f)MRIで測定される疾患活動性の低下(新規のまたは拡大する病変の年率)、(g)1年間、または2年間でのより低い再発平均数、(h)3ヶ月でのEDSSで測定される持続性の疾患進行、(i)CDMSへの移行の防止、(j)新規のまたは増進するT2病変がない、またはわずか、(k)高信号T2病変体積の最小限の変化、(l)McDonald定義のMSまでの延長された時間、(m)12週でのEDSSの持続性悪化により測定される身体障害の進行の防止、(n)96週での再発までの時間の短縮、および(o)脳萎縮(例えば、ベースラインからの%変化)の低減または安定化、の1つまたは複数をもたらす。
一実施形態では、Clec9A結合物質が投与され、処置の投与前の再発率に比べて(例えば、12ヶ月、または12ヶ月未満、例えば、約10ヶ月、または約8ヶ月、または約4ヶ月、または約2ヶ月、またはそれ未満の月数の間の投与後の発生率と比較して)、または以前の再発後の3~24ヶ月(例えば、6~8ヶ月、例えば、12ヶ月)に測定した場合、処置の開始前と比べて、低下された再発率(例えば、少なくとも、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80またはそれを超える再発率の低下)を効果的に生ずる。
一実施形態では、Clec9A結合物質が投与され、前処理状態からのEDSSスコアの増加の防止を効果的にもたらす。Kurtzke総合障害度評価尺度(EDSS)は、多発性硬化症での身体障害を定量化する方法である。EDSSは、MSの人をより低い区分にまとめた以前の障害度評価尺度と置き換わった。EDSSは、身体障害を8つの機能障害度(FS)で定量化し、神経学者が機能別障害度スコア(FSS)をこれらのそれぞれに割り付けるのを可能にする。機能障害度は:錐体路機能、小脳機能、脳幹機能、感覚機能、膀胱直腸機能、視覚機能および脳機能である。
一実施形態では、Clec9A結合物質が投与され、Clec9a結合物質の投与後のEDSSスコアに比較して(例えば、12ヶ月または12ヶ月未満に対し、例えば、10、8、4またはそれ未満の月数に対し、または処置開始以前に対し)低減されたEDSSスコア(例えば、少なくとも3ヶ月、6ヶ月、1年、またはそれより長くにわたり、例えば、1、1.5、2、2.5、3ポイント以上の低減)を効果的にもたらす。
一実施形態では、Clec9A結合物質が投与され、12ヶ月または12ヶ月未満の、例えば、10、8、4ヶ月またはそれ未満の月数の間のClec9A結合物質の投与後の、または処置開始以前の新しい病変の数に比べて、低減された新しい病変全体の数または任意の1つの型の新しい病変の数(例えば、少なくとも10%、20%、30%、40%の低減)を効果的にもたらすさ。
一実施形態では、Clec9A結合物質が投与され、12ヶ月または12ヶ月未満の、例えば、10、8、4ヶ月またはそれ未満の月数の間のClec9a結合物質の投与後の、または処置開始以前の病変の数に比べて、低減された病変全体の数または任意の1つの型の病変の数の低減(例えば、少なくとも10%、20%、30%、40%の低減)を効果的にもたらす。
一実施形態では、Clec9A結合物質が投与され、12ヶ月または12ヶ月未満、例えば、10、8、4ヶ月またはそれ未満の月数の間のClec9a結合物質の投与後の、または処置開始以前の新しい病変の出現比率に比べて、低減された新しい病変全体の数またはいずれか1つの型の新しい病変の数の出現比率(例えば、少なくとも10%、20%、30%、40%の比率の低減)を効果的にもたらす。
一実施形態では、Clec9A結合物質が投与され、12ヶ月または12ヶ月未満、例えば、10、8、4ヶ月またはそれ未満の月数の間のClec9a結合物質の投与後の、または処置開始以前の病変面積の増加に比べて、低減された病変面積全体またはいずれか1つの型の病変面積(例えば、少なくとも10%、20%、30%、40%の低減)を効果的にもたらす。
一実施形態では、Clec9A結合物質が投与され、12ヶ月または12ヶ月未満、例えば、10、8、4ヶ月またはそれ未満の月数の間のClec9a結合物質の投与後の、または処置開始以前の視神経炎の発生率または症状に比べて、低減された視神経炎の発生率または症状(例えば、視力の改善)を効果的にもたらす。
種々の実施形態では、本発明の方法は、ヒト対象の処置で有用である。いくつかの実施形態では、ヒトは小児科のヒトである。他の実施形態では、ヒトは成人のヒトである。他の実施形態では、ヒトは老人のヒトである。他の実施形態では、ヒトは患者と呼ばれることもある。いくつかの実施形態では、ヒトは女性である。いくつかの実施形態では、ヒトは男性である。
特定の実施形態では、ヒトは、約1~約18ヶ月、約18~約36ヶ月、約1~約5才、約5~約10才、約10~約15才、約15~約20才、約20~約25才、約25~約30才、約30~約35才、約35~約40才、約40~約45才、約45~約50才、約50~約55才、約55~約60才、約60~約65才、約65~約70才、約70~約75才、約75~約80才、約80~約85才、約85~約90才、約90~約95才または約95~約100才の範囲の年齢である。種々の実施形態では、ヒトは30才を超える年齢である。
免疫調節
いくつかの実施形態では、本発明の組成物は、免疫調節ができる、または免疫調節の方法で使用される。例えば、種々の実施形態では、本発明の処置の方法は、本明細書に記載の免疫調節を含み得る。いくつかの実施形態では、免疫調節は、樹状細胞(DC)との関連で、改変IFNシグナル伝達を含む、IFNシグナル伝達を含む。
種々の実施形態では、多重特異的Clec9a結合物質が提供される。いくつかの実施形態では、このような多重特異的Clec9a結合物質は、Clec9Aおよび1個または複数の免疫細胞上で見出される1個または複数の抗原を認識しそれらに結合する。免疫細胞は、巨核球、血小板、赤血球、マスト細胞、好塩基球、好中球、好酸球、単球、マクロファージ、ナチュラルキラー細胞、Tリンパ球(例えば、細胞傷害性Tリンパ球、ヘルパーT細胞)、Bリンパ球、プラズマ細胞、樹状細胞、またはこれらのサブセットを含み得るが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質は、目的の抗原に特異的に結合し、1つまたは複数の免疫細胞を効果的に、直接または間接的にリクルートする。
いくつかの実施形態では、Clec9a結合物質は、目的の抗原に特異的に結合し、1個または複数の免疫細胞を効果的に、直接または間接的にリクルートして、免疫抑制効果を生じさせる。例えば、Clec9a結合物質は免疫抑制性免疫細胞を直接的または間接的にリクルートする。いくつかの実施形態では、免疫抑制性免疫細胞は、制御性T細胞(または、本明細書で使用される場合、免疫系を調節し、自己免疫疾患を抑制し、自己抗原に対する寛容を維持し、抗腫瘍免疫応答を妨害するT細胞の亜集団を指す「Treg」)である。他の免疫抑制性免疫細胞としては、骨髄系サプレッサー細胞(または、本明細書で使用される場合、それらの骨髄起源、未成熟状態、およびT細胞応答を強力に抑制する能力により規定される、不均一細胞集団を指す「MSC」);腫瘍関連好中球(または、本明細書で使用される場合、免疫応答を抑制できる好中球サブセットを指す「TAN」);腫瘍関連マクロファージ(または、本明細書で使用される場合、免疫応答を低減させ得るマクロファージのサブセットを指す「TAM」)、M2マクロファージ、および/または腫瘍誘導マスト細胞(本明細書で使用される場合、骨髄由来の長寿命不均一細胞集団のサブセットを指す)が挙げられる。また、免疫抑制性免疫細胞は、Th2細胞およびTh17細胞を含む。さらに、免疫抑制性免疫細胞は、免疫細胞、例えば、1種または複数のチェックポイント阻害性受容体(例えば、無制御免疫応答を防止または抑制する免疫細胞上で発現される、CTLA-4、B7-H3、B7-H4、TIM-3を含む、受容体)を発現する、CD4+および/またはCD8+ T細胞を含む。Stagg,J.et.al.,Immunotherapeutic approach in triple-negative breast cancer.Ther Adv Med Oncol.(2013)5(3):169-181)を参照されたい。
いくつかの実施形態では、Clec9a結合物質は、制御性T細胞(Treg)増殖を刺激する。Treg細胞は、Foxp3(Forkhead box p3)転写因子の発現を特徴とする。大部分のTreg細胞はCD4+およびCD25+であり、ヘルパーT細胞のサブセットと見なすことができるが、小さい集団はCD8+の場合がある。したがって、本発明の方法により調節される免疫応答は、Treg細胞の、場合により抗原に応答した、増殖誘導を含み得る。したがって、方法は、対象に抗原を含む組成物を投与することを含み得、この場合、抗原はClec9Aに対する親和性を有する結合物質と組み合わせられる。抗原はTreg細胞の増殖を促進するアジュバントと共に投与されてよい。
この方法が特異的抗原に応答してTregの増殖と分化を伴う限り、それは免疫応答を刺激する方法であると見なすことができる。しかし、Tregが抗原に対する免疫系の他の細胞の応答を他の方法で、例えば、それらの活性を阻害または抑制することで調節できることを考慮すれば、全体としての免疫系に対する効果は、その抗原に対する応答を調節する(例えば、抑制または阻害する)ことであり得る。したがって、本発明のこの態様の方法は等しく、抗原に対する免疫応答を調節(例えば、阻害または抑制)する方法と呼ぶことができる。
いくつかの実施形態では、方法は、その抗原に対する既存の免疫または進行中の免疫応答を有する対象においてであっても、特定の抗原に対する望ましくない免疫応答を治療的にまたは予防的に阻害または抑制する。これは、例えば、自己免疫疾患の処置で特に有用であり得る。
ある種の条件下では、Clec9Aを発現する抗原提示細胞に抗原を標的することにより、特定の抗原に対して対象を寛容化することも可能である。したがって、本発明は、対象において抗原に対する寛容を誘導するための方法を提供し、方法は、抗原を含む組成物を対象に投与することを含み、この場合、抗原はClec9Aに対する親和性を有する結合物質と組み合わせられ、その抗原はアジュバントの非存在下で投与される。この状況において、寛容は通常、免疫細胞の枯渇を伴い、その枯渇がなければ、この免疫細胞はその抗原に応答できる、またはこのような免疫細胞中での抗原に対する応答性の持続性低減を誘導できるはずである。
それに対し対象が望ましくない免疫応答を示す、または生じる危険性のある抗原に対して、Treg応答を高めることは特に望ましいであろう。例えば、それは、自己免疫疾患においてそれに対し免疫応答が起こる自己抗原であり得る。潜在的に重要な病因して特定の抗原が特定されている自己免疫疾患の例としては、多発性硬化症(ミエリン塩基性タンパク質)、インスリン依存性糖尿病(グルタミン酸デカルボキシラーゼ)、インスリン耐性糖尿病(インスリン受容体)、セリアック病(グリアジン)、水疱性類天疱瘡(コラーゲンXVII型)、自己免疫性貧血(Rhタンパク質)、自己免疫性血小板減少症(GpIIb/IIIa)、重症筋無力症(myasthenia gravis)(アセチルコリン受容体)、グレーブス病(甲状腺刺激ホルモン受容体)、グッドパスチャー病などの糸球体腎炎(アルファ3(IV)NC1コラーゲン)、および悪性貧血(内因子)が挙げられる。あるいは、標的抗原は、宿主組織にまた損害をもたらす応答を刺激する外来性抗原であってよい。例えば、急性リウマチ熱は、心筋細胞抗原と交差反応する連鎖球菌抗原に対する抗体応答により引き起こされる。したがって、これらの抗原、またはその特定のフラグメントまたはエピトープは、本発明での使用のために好適な抗原であり得る。
いくつかの実施形態では、本発明の物質、またはこれらの物質を用いる方法は、例えば、そのリガンドへのClec9A結合を低減するまたは抑制することにより、Clec9Aシグナル伝達を破壊する(例えば、Clec9Aの中和を介して)。いくつかの自己免疫疾患は、異常な高レベルの細胞死を特徴とし、これらの細胞と関連する自己抗原に対する免疫応答がこれらの状態の発症に寄与すると考えられる。Clec9Aアンタゴニストをしたがって使用して、死細胞または瀕死細胞(例えば、免疫原性細胞死に曝されている細胞)中で曝露されるリガンドへのClec9Aの結合を防ぎ、それにより、これらの抗原に対する免疫応答の刺激を抑制または防止し得る。
種々の実施形態では、本発明の物質、またはこれらの物質を用いる方法は、自己反応性T細胞を低減または抑制する。いくつかの実施形態では、多重特異的Clec9a結合物質は、キメラの場合には任意にインターフェロンシグナル伝達を介して、この免疫抑制をもたらす。いくつかの実施形態では、多重特異的Clec9a結合物質は、PD-L1またはPD-L2シグナル伝達および/または発現を刺激し、これは自己反応性T細胞を抑制し得る。いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質は、キメラの場合には任意にインターフェロンシグナル伝達を介して、この免疫抑制をもたらす。いくつかの実施形態では、Clec9A結合物質は、PD-L1またはPD-L2シグナル伝達および/または発現を刺激し、これは自己反応性T細胞を抑制し得る。
種々の実施形態では、本発明の方法は、制御性T細胞対エフェクターT細胞の比率を、例えば、自己免疫疾患を処置するために、免疫抑制に有利なように調整することを含む。例えば、本発明の方法は、いくつかの実施形態では、1種または複数の細胞傷害性T細胞;エフェクターメモリーT細胞;セントラルメモリーT細胞;CD8 幹細胞メモリーエフェクター細胞;TH1エフェクターT細胞;TH2エフェクターT細胞pTH9エフェクターT細胞;TH17エフェクターT細胞を低減および/または抑制する。例えば、本発明の方法は、いくつかの実施形態では、1種または複数のCD4CD25FOXP3制御性T細胞、CD4CD25制御性T細胞、CD4CD25制御性T細胞、CD4CD25high制御性T細胞、TIM-3PD-1制御性T細胞、リンパ球活性化遺伝子-3(LAG-3)制御性T細胞、CTLA-4/CD152制御性T細胞、ニューロピリン-1(Nrp-1)制御性T細胞、CCR4CCR8制御性T細胞、CD62L(L-セレクチン)制御性T細胞、CD45RBlow制御性T細胞、CD127low制御性T細胞、LRRC32/GARP制御性T細胞、CD39制御性T細胞、GITR制御性T細胞、LAP制御性T細胞、1B11制御性T細胞、BTLA制御性T細胞、1型制御性T細胞(Tr1細胞)、Tヘルパー3型(Th3)細胞、ナチュラルキラーT細胞表現型の制御性細胞(NKTreg)、CD8制御性T細胞、CD8CD28制御性T細胞および/またはIL-10、IL-35、TGF-β、TNF-α、ガレクチン-1、IFN-γおよび/またはMCP1分泌制御性T細胞を増加させる、および/または刺激する。
いくつかの実施形態では、本発明の方法は、免疫刺激シグナルより免疫抑制シグナルを優先する。いくつかの実施形態では、本発明の方法は、免疫活性化シグナルまたは共刺激シグナルを逆転または抑制することを可能にする。いくつかの実施形態では、本発明の方法は、免疫抑制シグナルを提供することを可能にする。例えば、いくつかの実施形態では、本発明の物質および方法は、免疫刺激シグナルの効果を低減し、免疫刺激シグナルは、限定されないが、4-1BB、OX-40、HVEM、GITR、CD27、CD28、CD30、CD40、ICOSリガンド;OX-40リガンド、LIGHT(CD258)、GITRリガンド、CD70、B7-1、B7-2、CD30リガンド、CD40リガンド、ICOS、ICOSリガンド、CD137リガンドおよびTL1Aの1種または複数である。さらに、いくつかの実施形態では、本発明の物質および方法は、免疫抑制シグナルの効果を高め、これらのシグナルは、限定されないが、CTLA-4、PD-L1、PD-L2、PD-1、BTLA、HVEM、TIM3、GAL9、LAG3、VISTA、KIR、2B4、CD160(BY55とも呼ばれる)、CGEN-15049、CHK1およびCHK2キナーゼ、A2aR、CEACAM(例えば、CEACAM-1、CEACAM-3および/またはCEACAM-5)、および種々のB-7ファミリーリガンド(限定されないが、B7-1、B7-2、B7-DC、B7-H1、B7-H2、B7-H3、B7-H4、B7-H5、B7-H6およびB7-H7を含む)の1種または複数である。
キット
本発明はまた、本明細書に記載のいずれかのClec9A結合物質の投与(例えば追加の治療薬を含み、または含まず)のためのキットを提供する。キットは、本明細書に記載の少なくとも1種の本発明の医薬組成物を含む、材料または成分の集合体である。したがって、いくつかの実施形態では、キットは、本明細書に記載の少なくとも1種の医薬組成物を含む。
キットを構成する成分の明確な性質は、その意図される目的に依存する。一実施形態では、キットは、ヒト対象用を処置する目的のために構成される。
使用説明書をキット中に含めてもよい。使用説明書は通常、癌を処置するなどの、望まれる治療結果を達成するためにキットの成分を使用する際に採用すべき技術を説明する、明確な表現を含む。必要に応じ、キットは、他の有用な成分、例えば、希釈剤、緩衝剤、薬学的に許容可能な担体、シリンジ、カテーテル、塗布具、ピペット操作または測定用ツール、包帯材料または当業者なら容易に気付くような他の有用な備品一式も含む。
キットに組込まれる材料および成分は、それらの操作性および有用性を維持する任意の便利で適切な方法で保管され開業医に提供され得る。例えば、成分は、室温、冷蔵温度、または凍結温度で提供できる。成分は通常、適切な梱包材料に収容される。種々の実施形態では、梱包材料は、よく知られた方法、好ましくは無菌の、混入物のない環境を与える方法で構築される。梱包材料は、内容物および/またはキットの目的および/またはその成分を表示する外部ラベルを有してよい。
定義
本明細書で使用される場合、「a」、「an」、または「the」は、1つ(1種)または1つ(1種)を超えるを意味し得る。
さらに、参照数値表示に関連して使われる用語の「約」は、参照数値表示±参照数値表示の最大10%を意味する。例えば、用語の「約50」は、45~55の範囲を含む。
「有効量」という用語は、医学的使用に関連して使用される場合、目的の疾患の測定できる処置、予防、または発病速度の低下を与えるのに効果的である量である。
本明細書で使用される場合、物質または刺激の存在下で、このような調節の非存在に比べて、活性および/または効果の出力値がかなりの量、例えば、少なくとも約10%、少なくとも約20%、少なくとも約30%、少なくとも約40%、少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、またはそれを超えて、少なくとも最大約100%(約100%を含む)低減されるとき、何かが「減少し」ている。当業者により理解されるように、いくつかの実施形態では、活性は低下し、かついくつかの下流の出力値は低下するが、他のものは増加し得る。
逆に、物質または刺激の存在下で、このような物質または刺激の非存在に比べて、活性および/または効果の出力値がかなりの量、例えば、少なくとも約10%、少なくとも約20%、少なくとも約30%、少なくとも約40%、少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、またはそれを超えて、最大少なくとも約100%(約100%を含む)またはそれを超えて、少なくとも約2倍、少なくとも約3倍、少なくとも約4倍、少なくとも約5倍、少なくとも約6倍、少なくとも約7倍、少なくとも約8倍、少なくとも約9倍、少なくとも約10倍、少なくとも約50倍、少なくとも約100倍増加する場合、活性は「高く」なる。
本明細書において参照される場合、全ての組成物に関するパーセンテージは、特に指定がない限り、総組成物の重量による。本明細書で使用する場合、「含む(include)」という単語とその変形物は、非限定であると意図され、それにより、リスト中の項目の記載は、この技術の組成物および方法に有用である可能性を同様に有する他の類似項目の除外を意図するものではない。同様に、用語の「can」および「may」およびその変形物は、非限定であると意図され、それにより、ある実施形態が特定の要素または特徴を含むことが「できる(can)」または含んでも「よい(may)」という記載は、これらの要素または特徴を含まないこの技術のその他の実施形態を排除するものではない。
including、containing、またはhavingなどの用語の同義語としてのオープンエンド用語の「含む(comprising)」を本明細書で使用して本発明を記載および請求するが、本発明、またはその実施形態は、「からなる(consisting of)」または「から本質的になる(consisting essentially of)」などの代替用語を使って、代わって記載できる。
本明細書で使用される場合、用語の「好ましい」および「好ましくは」は、特定の状況下で、特定の利点をもたらす本技術の実施形態を指す。しかしながら、同じまたは他の環境下で、他の実施形態も好ましい場合がある。さらに、1つまたは複数の好ましい実施形態の記載は、他の実施形態が有用でないことを示すものではなく、また、本技術の範囲から他の実施形態を排除することを意図するものではない。
治療効果の達成に必要な本明細書で記載の組成物の量は、特定目的のための従来の手順に従って経験的に決定されてよい。一般に、治療目的のために治療薬を投与する場合、治療薬は薬理学的有効量で投与される。「薬理学的有効量」、「薬理学的有効用量」、「治療有効量」、または「有効量」は、特に障害または疾患を処置するために、望ましい生理的効果を生み出すのに十分な量または望ましい結果を達成できる量を意味する。本明細書で使用される場合、有効量は、例えば、障害または疾患の症状の進展を遅らせる、障害または疾患の症状の経過を変える(例えば、疾患の症状の進展を遅らせる)、障害または疾患の1つまたは複数の症状または発症を減らすまたはなくす、および障害または疾患の症状を逆転させるのに十分な量を含んでよい。治療効果はまた、改善が実現されるかどうかにかかわらず、根底にある疾患または障害の進行を止めるまたは遅らせることも含む。
有効量、毒性、および治療効果は、例えば、細胞培養または実験動物によりLD50(集団の約50%に対する致死用量)およびED50(集団の約50%での治療的有効量)を測定するための標準的薬学的手順により決定できる。投与量は、用いられる剤形および利用される投与経路に応じて変化し得る。毒性と治療効果との間の用量比率は、治療指数であり、比率LD50/ED50として表すことができる。いくつかの実施形態では、大きな治療指数を示す組成物および方法が好ましい。治療有効量は最初に、例えば、細胞培養アッセイを含む、インビトロアッセイから推測できる。また、用量は、細胞培養または適切な動物モデルで決定したIC50などの循環血漿中濃度を達成するように動物モデルで処方できる。記載の組成物の血漿中のレベルは、例えば、高速液体クロマトグラフィーにより測定できる。いずれかの特定の投与量の効果は、適切なバイオアッセイによりモニターできる。投与量は医師により決定されてよく、必要に応じて、観察された処置の効果に適合するように調節できる。
特定の実施形態では、効果は、少なくとも約10%、少なくとも約20%、少なくとも約30%、少なくとも約50%、少なくとも約70%、または少なくとも約90%の定量可能な変化をもたらすであろう。いくつかの実施形態では、効果は、約10%、約20%、約30%、約50%、約70%、またはさらに約90%以上の定量可能な変化をもたらすであろう。治療効果はまた、改善が実現されるかどうかにかかわらず、根底にある疾患または障害の進行を止めるまたは遅らせることも含む。
本明細書で使用される場合、「処置方法」は、本明細書に記載の疾患または障害の処置のための組成物および/または本明細書に記載の疾患または障害の処置のための薬剤の製造での使用および/または複数使用のための組成物に等しく適用可能である。
実施例
用語の「AcTaferon」は、インターフェロンベースキメラに言及するために本明細書で使われることがある。
下記の実施例では、特に断りのない限り、IFN対する変異は、ヒトIFNα2(配列番号86)に対するものである。
Q124R変異体は、マウスモデル中でインビボアッセイできる、減弱化ヒトIFNアルファ2変異体を代表するものである。特に、Q124Rは、マウスでの使用に好適なヒトIFN変異である(すなわち、これは、マウスで機能するヒト変異体IFNである)。Nat.Comm.2014;5:3016.doi:10.1038/ncomms 4016を参照されたい。この文献の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。
R33A/E120R変異体は、非機能性である(およびコントロールとして使用される)ヒトIFNアルファ2変異体を代表するものである。
これらの例で用いられる抗ヒトPD-L1 VHHは、配列番号256である。
抗Bcll10 VHHは、コントロールとしてこれらの実施例で使用される(無関係の抗原を標的とする、すなわち、「非標的化」)。
実施例1.マウスClec9A特異的VHHの構築と評価
抗原特異的VHHの単離
VHHライブラリーを3回の連続パニングラウンドに供し、マウスClec9Aを発現する安定に遺伝子導入されたCHO-K1細胞で実施した。抗原特異的ファージの濃縮を、パニング後に遺伝子導入された細胞から溶出されたファージミド粒子の数(出力)をパニングに使用したファージミド粒子の数(入力)と比較することにより、各パニングラウンド後に評価した。ファージ出力は、第1ラウンドの出力と比較して、第2および第3ラウンドで、それぞれ約50倍および30倍増加した。入力ファージは、常に約1011個であり、第1ラウンドからの出力は約10個のファージ粒子であり、第1ラウンドで標的特異的ファージが既に濃縮されたことを示唆している。合計で285個のコロニー(第1および第2ラウンドからそれぞれ95個と190個)を無作為に選択し、それらの粗製周辺質抽出物(可溶性VHHを含む)を、親CHO-K1細胞と比較して、遺伝子導入したCHO-K1に対する特異的結合について細胞ELISAにより分析した。これらのコロニーのいずれも細胞ELISAで陽性を示さず、ELISAがこの場合には十分に感受性でないか、または抗原がELISAでの細胞固定に影響されるかのいずれかを示唆する。我々はしたがって、抗原特異的VHHの特定のためFACSに切り替えた。ここで我々は、第1および第2パニングラウンドからの190個(各ラウンドから95個)の無作為選択コロニーを配列決定し、その後、CDR3配列に基づいてVHHを分類した。これらの実験により、7種の異なるCDR3群に属する28種の異なるVHHが特定された。下表1は、28種の異なる抗マウスClec9A VHH遺伝子を表す28個のクローンの説明である。抗マウスClec9A VHH配列を含む組換えファージミドpHEN4を収容する大腸菌TG1を生成し、-80℃で保存した。ベクターpHEN4は、アンピシリン耐性をコードする。
Figure 0007236273000007
VHHを含む粗製ペリプラズム抽出物を用いて、各群の代表物(単一または複数)を、マウスClec9Aで遺伝子導入されたCHO-K1細胞を用いて、マウスClec9Aに対する特異性についてFACSにより分析した。親の非遺伝子導入CHO-K1細胞は、ネガティブコントロールとしての役割を果たした。マウスClec9Aに対するそれらの特異性について試験した代表的VHHは以下の通り:R1MCL3、R1MCL7、R1MCL9、R1MCL12、R1MCL13、R1MCL33、R1MCL71、R1MCL95、R2MCL15、R2MCL18、R2MCL20、R2MCL28、R2MCL36、R2MCL41、R2MCL43、R2MCL47、R2MCL57、R2MCL74、R2MCL86、R2MCL93。試験した全ての代表物は、マウスClec9Aで遺伝子導入されたCHO-K1細胞に対し陽性であり、全28VHHがマウスClec9Aに特異的に結合したことを示す。次に、マウスClec9AまたはヒトClec9Aで遺伝子導入されたCHO-K1細胞を用いて、各群の代表物のマウスおよびヒトClec9Aに対する特異性についてFACSにより分析した。ここでまた、親の非遺伝子導入CHO-K1細胞が、ネガティブコントロールとしての役割を果たした。異種間反応性について試験した代表的VHHは以下の通り:R1MCL3、R1MCL7、R1MCL9、R1MCL12、R1MCL33、R2MCL18、R2MCL43。これらのVHHのいずれも、ヒトClec9Aに対する何らの特異的結合を示さず、これらのVHHがマウスClec9Aに対する固有のエピトープを認識することを示唆する。
VHHの発現および精製
VHH遺伝子をpHEN4からpHEN6cベクターに再クローニングした。具体的には、VHH遺伝子を、テンプレートとしてVHH遺伝子を含む組換えpHEN4ならびにプライマーA6Eおよび38を用いるPCRにより増幅した。プライマーA6Eおよび38は、それぞれ、フレームワーク1およびフレームワーク4プライマーであった。プライマー配列は以下の通り:
・プライマーA6E(5’ GAT GTG CAG CTG CAG GAG TCT GGR GGA GG 3’)(配列番号291)。
・プライマー38(5’ GGA CTA GTG CGG CCG CTG GAG ACG GTG ACC TGG GT 3’)(配列番号292)。
・ユニバーサル逆方向プライマー(5’ TCA CAC AGG AAA CAG CTA TGA C 3’)(配列番号293)。
・ユニバーサル順方向プライマー(5’ CGC CAG GGT TTT CCC AGT CAC GAC 3’)(配列番号294)。
Rは、AまたはGを表す。
増幅プロトコルは、約30サイクルのPCRを含み、それぞれのサイクルは、94℃で30秒、55℃で30秒および72℃で45秒、その後、PCRの最後に72℃で10分間の伸長反応を含んだ。約400bpのフラグメントが増幅された。本明細書に記載のプロトコルを用いて産生された全ての得られたVHHは、次記の配列で始まる:QVQLQESGGG(配列番号295)。
PCR産物を精製し(例えば、QiagenのQiaquick PCR精製キットにより)、PstIで一晩消化した。精製PCR産物をBstEIIで(またはFermentasのEco91Iで)一晩消化した。消化に用いた温度は様々であった。例えば、BstEIIによる消化は、酵素の供給業者に応じて、50℃または60℃で実施した。
ライゲーションのために、PCR産物を精製した。pHEN6cベクターをPstIで3時間消化し、上述のように精製した後、BstEIIで2~3時間消化した。あるいは、消化をFermentasのEco91Iを用いて実施した。消化ベクターを1%アガロースゲルで泳動し、ベクターバンドをゲルから切り出し、精製した(例えば、QiagenのQiaquickゲル抽出キットにより)。PCRフラグメントをその後ベクターに連結した。
エレクトロコンピテントWK6細胞を連結反応で形質転換し、LB/寒天/アンピシリン(100μg/ml)/グルコース(1%)プレートを用いて形質転換体を選択した。陽性クローンを、ユニバーサル逆方向およびユニバーサル順方向プライマーを用いるPCRによりスクリーニングした。挿入断片が存在した場合には、約550bpのフラグメントが増幅された。クローンの同一性を確認するために、それぞれのVHH当たり少なくとも2種のクローンを、ユニバーサル逆方向プライマーを用いて配列決定した。抗原結合能を、ELISAまたは任意の他の適切なアッセイにより再試験した。
上記プロトコルに続き、pHEN6cベクター中にクローン化したVHH遺伝子を生成した。これは、N-末端にPelBシグナル配列およびC-末端にHisテイルを含んだ。PelBリーダー配列はVHHを大腸菌のペリプラズム空間に向け、HisタグはVHHの精製と検出に使用された(例えば、ELISA、ウェスタンブロット、などで)。
VHHの発現および精製を実施した。具体的には、1日目に、10~20mlのLB+アンピシリン(100μg/ml)+グルコース(1%)に、新たに形質転換したWK6コロニーを接種した。この前培養液を37℃で一晩、200~250rpmで振盪しながらインキュベートした。2日目に、VHH発現用にTB培地を用いた。TB培地は、リッター当たり:2.3gのKHPO、16.4gのKHPO・3HO、12gのトリプトン(Duchefa Biochemie)、24gの酵母(Duchefa Biochemie)、および4mlの100%グリセロール(Duchefa Biochemie)を含んだ。
1リットルのバッフル付振とうフラスコを、330mlのTBで満たし、オートクレーブ処理した。KHPOおよびKHPO・3HOは、オートクレーブ処理しなかった。その代わりに、KHPOおよびKHPO・3HOを調製し、フィルター滅菌した後、既にオートクレーブ処理された残りの培地に加えた。約1mlの前培養液を、100μgのアンピシリン、330mlの、2mMのMgClおよび0.1%のグルコースを補充したTBに加えた後、37℃で振盪(200~250rpm)しながら、0.6~0.9のOD600に達するまで増殖させた。IPTG(1mMの最終濃度)を加えて、VHH発現を誘導した。この培養液を28℃で振盪しながら一晩(約16~18時間)インキュベートした。一晩誘導後のOD600は通常、25~30であった。クローン当たり少なくとも1リットルの培養液(3つのボトル)を、平均収量1~15mg/lで調製した。
大腸菌のペリプラズムからのVHHの抽出を3日目に実施した。使用した溶液は、次を含んだ:TES:0.2M トリス pH8.0、0.5mM EDTA、0.5Mショ糖、およびTES/4:水中4倍希釈TES。
一晩の誘導培養液を8000rpmで8分間遠心分離した。1リットルの培養液からの細胞ペレットを、上下のピペッティングにより12mlのTES中に再懸濁し、氷上で1時間震盪した。用いた各12mlのTES当たり、約18mlのTES/4を加え、氷上で追加の1時間振盪しながらインキュベートし、続いて4℃にて8000rpmで30分間遠心分離した。ペリプラズム空間から抽出されたタンパク質を含む上清を、新しいファルコンチューブに移した。
VHHをその後、次の溶液を使用するIMACにより精製した:HIS-select(Sigma)、PBS、および50mMの酢酸ナトリウムpH4.6。
HIS-selectをPBSで平衡化した。具体的には、1リットルの培養液からのペリプラズム抽出物当たり、1mlのレジン(約2mlのHis-select溶液)を50mlのファルコンチューブに加えた。PBSも加えて、最終体積の50mlにし、混合した。遠心分離を2000rpmで2分間行い、上清を廃棄した。上述のように、レジンをPBSで2回洗浄した。ペリプラズム抽出物をレジンに加え、緩やかに振盪しながら室温で30分~1時間インキュベートした。試料を、底部にフィルターを備えたPD-10カラム(GE Healthcare、カタログ番号17-0435-01)に加え、50~100mlのPBS(使用した1mlのレジン当たり、50~100mlのPBS)で洗浄した。溶出を3回実施し、各回に使用した1mlのレジン当たり、1mlのPBS/0.5Mのイミダゾールを用いた(溶出を効率化するために、ビーズを再懸濁し、カラムの低部を閉止して、4℃で一晩放置した)。透析を、PBSに対し4℃で一晩実施(カットオフ3500ダルトン)して、イミダゾールを除去した。効率的な透析のために、透析緩衝液(PBS)を2、3回交換した。あるいは、イミダゾールを用いる溶出の代わりに、結合VHHを10mlの50mM 酢酸ナトリウムpH4.6で溶出し得る。50mMの酢酸ナトリウムpH4.6をVHHの溶出に使用した場合、溶出されたVHHをすぐに1MのトリスpH8.0で中和し、透析の必要はなかった。
タンパク質の量を、溶出した試料のOD280測定により推定した。各クローンの消光率を、ExPASyプロテオミクスサーバーでの一次構造分析に基づいて、protParamツールにより測定した。VHHのさらなる精製は、異なる方法で達成できるであろう。例えば、試料を、Superdex 75 16/60へのロード用の適切な体積が得られるまで(最大4ml)4℃にて2000rpmでの遠心分離(Vivaspin 5000MWカットオフ、Vivascience)により濃縮し得る。濃縮試料を、PBSで平衡化したSuperdex 75 16/60カラムにロードした。ピーク画分をプールし、定量化のためにOD280測定を実施した。一般に、1ml/分で稼働した場合、VHHは85~95分後に溶出した。濃縮VHH試料の分割量を、約1mg/mlの濃度にて-20℃で貯蔵した。
VHHの機能分析
VHHをClec9Aに対する結合について試験した。図1は、Clec9Aを安定に発現するCHO細胞への種々のVHHの結合を示す。全ての実験で、VHHを以下の通り標識した:
Figure 0007236273000008
腫瘍処置におけるVHHの活性を特徴付ける実験を実施した。図2の実験では、雌C57BL/6Jマウスに、50μlのPBS中の6x10個のB16Bl6-mCD20細胞を皮下注射した。7日後、病変周囲(=腫瘍端部の皮下)の処置を開始した。WT mIFNを8x10の用量で注射し、同時に、5500IUのキメラタンパク質を注射した。処置を、腫瘍細胞接種後8、9、10、11、12、14、16および17日目に与えた。コントロールマウスに100μlのPBSを注射した。デジタルノギスを用いて腫瘍増殖をモニターした。プロットは、腫瘍サイズの平均±SEM(n=5)(図2パネルA)および体重変化(図2パネルB)である。最後の処置(18日目)後1日目に、EDTA血液を、Hemavet 950FS Analyzer(Drew Scientific)を用いる血液学的パラメーターの分析(図2パネルC)のために尾静脈から集めた。
図2パネルAに示すように、Clec9Aに対するVHHの投与は、腫瘍サイズを効果的に縮小した。図2、パネルBおよびCは、それぞれ、VHHによる処置が体重減少または血液毒性を生じなかったことを示す。重要なことに、パネルBおよびCは、野生型インターフェロンに対しキメラの改善された安全性パラメーター(体重、血球数パラメーター)を示す。
実施例2.ヒトClec9A特異的VHHの構築と評価
抗原特異的VHHの単離
VHHライブラリーを2回の連続パニングラウンドに供し、ヒトClec9Aを発現する安定に遺伝子導入されたCHO-K1細胞で実施した。抗原特異的ファージの濃縮を、パニング後に遺伝子導入された細胞から溶出されたファージミド粒子の数(出力)を、パニングに使用したファージミド粒子の数(入力)と比較することにより、各パニングラウンド後に評価した。ファージ出力は、第1ラウンドの出力と比較して、第2ラウンドで約10倍増加した。入力ファージは、約1011個であり、第1ラウンドからの出力は約2x10個のファージ粒子であった。ラウンドからの95個のコロニーを無作為に選択し、それらの粗製周辺質抽出物(可溶性VHHを含む)を、親CHO-K1細胞と比較して、遺伝子導入したCHO-K1に対する特異的結合について細胞ELISAにより分析した。これらのコロニーのいずれも細胞ELISAで陽性を示さず、ELISAがこの場合には十分に感受性でなかったか、または抗原がELISAでの細胞固定に影響されたかのいずれかを示唆する。FACS分析をしたがって、抗原特異的VHHの特定のために使用した。ここで、第1および第2パニングラウンドから190個の無作為に選択したコロニー(各ラウンドから95個)を配列決定し、その後、VHHをCDR3配列に基づいて群に分類した。これらの実験により、11種の異なる群に属する27種の異なるVHHが特定された(図5)。27種の抗ヒトClec9A VHHのヌクレオチドおよびアミノ酸配列を、それぞれ配列番号3および配列番号4に示す。下表2は、27種の異なる抗ヒトClec9A VHH遺伝子を表す27個のクローンの説明である。抗ヒトClec9A VHH配列を含む組換えファージミドpHEN4を収容する大腸菌TG1を生成し、-80℃で保存した。ベクターpHEN4は、アンピシリン耐性をコードする。
Figure 0007236273000009
VHHを含む粗製ペリプラズム抽出物を用いて、各群の代表物(単一または複数)を、マウスClec9AまたはヒトClec9Aで遺伝子導入されたCHO-K1細胞を用いて、ヒトおよびマウスClec9Aに対する特異性についてFACSにより分析した。親の非遺伝子導入CHO-K1細胞は、ネガティブコントロールとしての役割を果たした。試験した代表的VHHは以下の通り:R1CHCL16、R1CHCL27、R1CHCL34、R1CHCL50、R2CHCL3、R2CHCL10、R2CHCL13、R2CHCL24、R2CHCL25、R2CHCL27、R2CHCL32、R2CHCL38、R2CHCL49、R2CHCL69およびR2CHCL87。試験した全ての代表物は、ヒトClec9Aで遺伝子導入されたCHO-K1細胞に対し陽性であり、全27VHHがヒトClec9Aに特異的に結合したことを示す。さらに、群5由来のVHH R2CHCL10はまた、FACSで、マウスClec9Aとも強く反応した。群5由来のVHH R1CHCL34もまた、マウスClec9Aと反応したが、極めて弱い反応であった。群5由来のVHH R1CHCL82は、FACSで試験されなかった。さらに、群7由来のVHH R2CHCL32は、FACSで、マウスClec9Aと弱く反応した。他の群7の2つのメンバー(VHH R1CHCL56およびR2CHCL69)は、FACSで試験されなかった。
VHHの発現および精製
VHH遺伝子をpHEN4からpHEN6cベクターに再クローニングした。具体的には、VHH遺伝子を、テンプレートとしてVHH遺伝子を含む組換えpHEN4ならびにプライマーA6Eおよび38を用いるPCRにより増幅した。プライマーA6Eおよび38は、それぞれ、フレームワーク1およびフレームワーク4プライマーであった。プライマー配列は以下の通り:
・プライマーA6E(5’ GAT GTG CAG CTG CAG GAG TCT GGR GGA GG 3’)(配列番号291)。
・プライマー38(5’ GGA CTA GTG CGG CCG CTG GAG ACG GTG ACC TGG GT 3’)(配列番号292)。
・ユニバーサル逆方向プライマー(5’ TCA CAC AGG AAA CAG CTA TGA C 3’)(配列番号293)。
・ユニバーサル順方向プライマー(5’ CGC CAG GGT TTT CCC AGT CAC GAC 3’)(配列番号294)。
Rは、AまたはGを表す。
増幅プロトコルは、約30サイクルのPCRを含み、それぞれのサイクルは、94℃で30秒、55℃で30秒および72℃で45秒、その後、PCRの最後に72℃で10分間の伸長反応を含んだ。約400bpのフラグメントが増幅された。
PCR産物を精製し(例えば、QiagenのQiaquick PCR精製キットにより)、PstIで一晩消化した。精製PCR産物をBstEIIで(またはFermentasのEco91Iで)一晩消化した。消化に用いた温度は様々であった。例えば、BstEIIによる消化は、酵素の供給業者に応じて、50℃または60℃で実施した。
ライゲーションのために、PCR産物を精製した。pHEN6cベクターをPstIで3時間消化し、上述のように精製した後、BstEIIで2~3時間消化した。あるいは、消化をFermentasのEco91Iを用いて実施した。消化ベクターを1%アガロースゲルで泳動し、ベクターバンドをゲルから切り出し、精製した(例えば、QiagenのQiaquickゲル抽出キットにより)。PCRフラグメントをその後ベクターに連結した。
エレクトロコンピテントWK6細胞を連結反応で形質転換し、LB/寒天/アンピシリン(100μg/ml)/グルコース(1%)プレートを用いて形質転換体を選択した。陽性クローンを、ユニバーサル逆方向およびユニバーサル順方向プライマーを用いるPCRによりスクリーニングした。挿入断片が存在した場合には、約550bpのフラグメントが増幅された。クローンの同一性を確認するために、それぞれのVHH当たり少なくとも2種のクローンを、ユニバーサル逆方向プライマーを用いて配列決定した。抗原結合能を、ELISAまたは任意の他の適切なアッセイにより再試験した。
上記プロトコルに続き、pHEN6cベクター中にクローン化したVHH遺伝子を生成した。これは、N-末端にPelBシグナル配列およびC-末端にHisテイルを含んだ。PelBリーダー配列はVHHを大腸菌のペリプラズム空間に向け、HisタグはVHHの精製と検出に使用された(例えば、ELISA、ウェスタンブロット、などで)。
VHHの発現および精製を実施した。具体的には、1日目に、10~20mlのLB+アンピシリン(100μg/ml)+グルコース(1%)に、新たに形質転換したWK6コロニーを接種した。この前培養液を37℃で一晩、200~250rpmで振盪しながらインキュベートした。2日目に、VHH発現用にTB培地を用いた。TB培地は、リッター当たり:2.3gのKHPO、16.4gのKHPO・3HO、12gのトリプトン(Duchefa Biochemie)、24gの酵母(Duchefa Biochemie)、および4mlの100%グリセロール(Duchefa Biochemie)を含んだ。
1リットルのバッフル付振とうフラスコを、330mlのTBで満たし、オートクレーブ処理した。KHPOおよびKHPO・3HOは、オートクレーブ処理しなかった。その代わりに、KHPOおよびKHPO・3HOを調製し、フィルター滅菌した後、既にオートクレーブ処理された残りの培地に加えた。約1mlの前培養液を、100μgのアンピシリン、330mlの、2mMのMgClおよび0.1%のグルコースを補充したTBに加えた後、37℃で振盪(200~250rpm)しながら、0.6~0.9のOD600に達するまで増殖させた。IPTG(1mMの最終濃度)を加えて、VHH発現を誘導した。この培養液を28℃で振盪しながら一晩(約16~18時間)インキュベートした。一晩誘導後のOD600は通常、25~30であった。クローン当たり少なくとも1リットルの培養液(3つのボトル)を、平均収量1~15mg/lで調製した。
大腸菌のペリプラズムからのVHHの抽出を3日目に実施した。使用した溶液は、次を含んだ:TES:0.2M トリス pH8.0、0.5mM EDTA、0.5Mショ糖、およびTES/4:水中4倍希釈TES。
一晩の誘導培養液を8000rpmで8分間遠心分離した。1リットルの培養液からの細胞ペレットを、上下のピペッティングにより12mlのTES中に再懸濁し、氷上で1時間震盪した。用いた各12mlのTES当たり、約18mlのTES/4を加え、氷上で追加の1時間振盪しながらインキュベートし、続いて4℃にて8000rpmで30分間遠心分離した。ペリプラズム空間から抽出されたタンパク質を含む上清を、新しいファルコンチューブに移した。
VHHをその後、次の溶液を使用するIMACにより精製した:HIS-select(Sigma)、PBS、および50mMの酢酸ナトリウムpH4.6。
HIS-selectをPBSで平衡化した。具体的には、1リットルの培養液からのペリプラズム抽出物当たり、1mlのレジン(約2mlのHis-select溶液)を50mlのファルコンチューブに加えた。PBSも加えて、最終体積の50mlにし、混合した。遠心分離を2000rpmで2分間行い、上清を廃棄した。上述のように、レジンをPBSで2回洗浄した。ペリプラズム抽出物をレジンに加え、緩やかに振盪しながら室温で30分~1時間インキュベートした。試料を、底部にフィルターを備えたPD-10カラム(GE Healthcare、カタログ番号17-0435-01)に加え、50~100mlのPBS(使用した1mlのレジン当たり、50~100mlのPBS)で洗浄した。溶出を3回実施し、各回に使用した1mlのレジン当たり、1mlのPBS/0.5Mのイミダゾールを用いた(溶出を効率化するために、ビーズを再懸濁し、カラムの低部を閉止して、4℃で一晩放置した)。透析を、PBSに対し4℃で一晩実施(カットオフ3500ダルトン)して、イミダゾールを除去した。効率的な透析のために、透析緩衝液(PBS)を2、3回交換した。あるいは、イミダゾールを用いる溶出の代わりに、結合VHHを10mlの50mM 酢酸ナトリウムpH4.6で溶出し得る。50mMの酢酸ナトリウムpH4.6をVHHの溶出に使用した場合、溶出されたVHHをすぐに1MのトリスpH8.0で中和し、透析の必要はなかった。
タンパク質の量を、溶出した試料のOD280測定により推定した。各クローンの消光率を、ExPASyプロテオミクスサーバーでの一次構造分析に基づいて、protParamツールにより測定した。VHHのさらなる精製は、異なる方法で達成できるであろう。例えば、試料を、Superdex 75 16/60へのロード用の適切な体積が得られるまで(最大4ml)4℃にて2000rpmでの遠心分離(Vivaspin 5000MWカットオフ、Vivascience)により濃縮し得る。濃縮試料を、PBSで平衡化したSuperdex 75 16/60カラムにロードした。ピーク画分をプールし、定量化のためにOD280測定を実施した。一般に、1ml/分で稼働した場合、VHHは85~95分後に溶出した。濃縮VHH試料の分割量を、約1mg/mlの濃度にて-20℃で貯蔵した。
図3および図4の配列は、下表に示すように、配列識別子に割り付けられる。さらに、精製後に、抗ヒトClec9A VHHの結合特性を、Clec9Aで遺伝子導入されたHEK-293T細胞への結合により評価し、下表に示す。簡単に説明すると、HEK293T細胞に、標準的リン酸カルシウム法を用いてヒトClec9A発現プラスミドを遺伝子導入した。遺伝子導入の2日後に、細胞をFACS緩衝液(2%FBSおよび0.5mMのEDTAを補充したPBS)中に再懸濁し、系列希釈VHH(1000ng/ml;1/3)と4℃で2時間インキュベートした。非結合VHHをFACS緩衝液で洗い流した。試料をFITC結合抗His Abで4℃にてさらに45分間染色し、FACSCalibur(BD Biosciences)およびCellQuest Pro Version 4.0.2ソフトウェア(BD Biosciences)で分析した。
Figure 0007236273000010
実施例3.Clec9Aキメラおよび腫瘍壊死因子を用いる併用療法
マウスClec9A特異的VHHおよび腫瘍壊死因子(TNF)を用いる併用療法の抗腫瘍効果を試験した。マウスにB16(マウス黒色腫細胞株)を皮下に接種して、腫瘍を誘導した。マウスの病変周囲(=腫瘍端部の皮下)をその後、TNF含有または非含有で、改変ヒトインターフェロンアルファ2と融合されたマウスClec9A特異的キメラClec9A VHH(Q124R変異体、「AcTa Clec9A」)を用いて処置した。コントロールマウスをPBSまたはキメラClec9A VHH単独またはTNF単独のいずれかで処置した。腫瘍増殖を、デジタルノギスを用いてモニターした。EDTA血液もまた、Hemavet 950FS Analyzer(Drew Scientific)を用いる血液学的パラメーターの分析のために尾静脈から集めた。
図6パネルAに示すように、キメラClec9A VHHおよびTNFを用いる併用治療は、いずれかの物質単独での処置に比べて、強力な抗腫瘍効果を誘発し38日目まで腫瘍再発が認められなかった。図6パネルBは、併用療法が耐容性良好であり、野生型IFN単独または野生型IFNとTNFでの処置に比べて、血液毒性を誘導しなかったことを示す。これらのデータは全体で、キメラClec9A VHHおよびTNFを用いる併用療法の相乗的効果を示唆する。
Q124R変異体は、マウスモデル中でインビボアッセイできる、減弱化ヒトIFNアルファ2変異体を代表するものである。特に、Q124Rは、マウスでの使用に好適なヒトIFN変異である(すなわち、これは、マウスで機能するヒト変異体IFNである)。Nat.Comm.2014;5:3016.doi:10.1038/ncomms 4016を参照されたい。この文献の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。
実施例4.Clec9Aキメラおよび抗PD-L1抗体を用いる併用療法
図7は、改変ヒトIFNアルファ2(Q124R変異体)に融合されたマウスClec9A特異的VHHのキメラと、抗PD-L1抗体の組み合わせ(「Clec9A-AcTaferon+抗PD-L1」)の効果を、PBS(ネガティブコントロール)、改変ヒトIFNに融合されたマウスClec9A特異的VHHのキメラ(Q124R変異体、「Clec9A-AcTaferon」)単独、および抗PD-L1抗体(「抗PD-L1」)単独と比べて示す。
図7のインビボ実験により示されるように、改変ヒトIFNに融合されたClec9Aのキメラと、抗PD-L1抗体の組み合わせは、腫瘍進行に対し相乗効果をもたらす。特に、併用治療は、均衡状態をもたらしたのみでなく、腫瘍収縮ももたらした。これは、例えば、抗PD-L1抗体単独との比較において、この抗体で単独処置されたマウスが実験の終わりに腫瘍増殖を示していたので、特に注目に値する。
Q124R変異体は、マウスモデルでインビボアッセイできる、減弱化ヒトIFNアルファ2変異体を代表するものである。特に、Q124Rは、マウスでの使用に好適なヒトIFN変異である(すなわち、これは、マウスで機能するヒト変異体IFNである)。Nat.Comm.2014;5:3016.doi:10.1038/ncomms 4016を参照されたい。この文献の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。
実施例5.Clec9Aキメラおよび化学療法剤を用いる併用療法
図8は、改変ヒトIFN(Q124R)に融合され、および抗PD-L1 VHHに融合されたマウスClec9A特異的VHHのキメラと、ドキソルビシンとの組み合わせ(「Clec9A-Q124R-PD-L1+doxo」)の効果を、改変ヒトIFN(「Q124R」)に融合され、および抗PD-L1VHH(“Clec9A-Q124R-PD-L1)に融合されたマウスClec9A特異的VHHのキメラ、ドキソルビシン(「doxo」)、およびPBS(ネガティブコントロール)に比べて、示す。
図8のインビボ実験により示されるように、改変ヒトインターフェロン(Q124R)に融合されかつ抗PD-L1 VHHに融合されたマウスClec9A特異的VHHのキメラと、ドキソルビシンの組み合わせは、腫瘍進行に対し相乗効果をもたらす。重要なことに、併用療法群中の6匹のマウスのうち5匹が完全な腫瘍縮小を示した。
Q124R変異体は、マウスモデルでインビボアッセイできる、減弱化ヒトIFNアルファ2変異体を代表するものである。特に、Q124Rは、マウスでの使用に好適なヒトIFN変異である(すなわち、これは、マウスで機能するヒト変異体IFNである)。Nat.Comm.2014;5:3016.doi:10.1038/ncomms 4016を参照されたい。この文献の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。
実施例6.マウスClec9AキメラによるT細胞増殖の刺激
キメラ抗原受容体(CAR)T細胞療法は、CAR T細胞に対する免疫抑制作用を課す、極めて過酷な固形腫瘍の腫瘍微小環境により損なわれることが多い。例えば、種々の免疫抑制サイトカイン、調節モジュレーター、および共抑制受容体が、CAR T細胞のアナジーを誘導できる腫瘍微小環境中に存在する。CAR T細胞療法の有効性を高める1つの機序は、腫瘍微小環境内で分裂および増殖するようにT細胞を誘導する必要がある。
改変ヒトIFN(Q124R)に融合されたマウスClec9A特異的VHHがインビボでCAR T細胞の増殖を誘導し得るがどうかを評価する実験を実施した。具体的には、腫瘍細胞上に存在するメラノサイト分化抗原gp100を認識するカルボキシフルオレスセインスクシンイミジルエステル(CFSE)標識T細胞受容体遺伝子導入CD8+ T細胞(pmel-1)を、B16メラノーマ腫瘍担持マウスに養子導入した。マウスをその後、PBS(コントロール)または改変ヒトIFN(Q124R)に融合されたマウスClec9A特異的VHHで処置した。T細胞増殖を、FACS分析を使って腫瘍流入領域リンパ節中に存在するCFSE標識T細胞の量を求めることにより評価した。
図9に示すように、VHHでマウスを処置することは、PBSでの処置に比べて、T細胞の分裂および増殖を大きく誘導した。理論に束縛されることを意図するものではないが、T細胞の分裂および増殖は樹状細胞活性化を経由して媒介されたと考えられる。これらの結果は全体で、IFNに融合されたClec9A特異的VHHの使用がCAR T細胞療法を相乗的に高めることを示す。
実施例7.ヒトClec9Aに特異的なVHHは、実験的自己免疫性脳脊髄炎(EAE)モデルで効果的である。
本実施例は、ヒト多発性硬化症(MS)を模倣するEAEマウスモデルにおける、マウスClec9A特異的VHHの治療効果を示す。手短に言えば、Clec9A-IFNQ124Rの融合体で処置された5匹のマウスのうち4匹は、MS症状を全く発症しなかった。単回処置マウスは、病気になったが、すぐに回復した。疾患発症を抑制した、高用量の野生型IFNで処置された5匹のマウスのうち3匹は、死亡した。低用量の野生型IFNで処置されたマウスは体重減を示した。これは、実際に体重が増加した、Clec9A-IFNQ124RAcTaferon(すなわち、融合タンパク質)処置動物とは著しい対照をなす。
図10~12について、種々のAcTaferonを使用した。この状況下では、これらは減弱化インターフェロンを指し、すなわち、5000IUでBcII10、mCD20、CD8、またはClec9Aに対するVHHを含んだ種々のターゲティングドメインに連結されたhIFN Q124R(「Q」)を指す。比較のために、野生型インターフェロンを用いた(上述のように、5000IUまたは1,000,000IUのいずれかでの「WT mIFN」)。PBS緩衝液は、モックコントロール(すなわち、ネガティブコントロール)である。
この調査に対する処置スケジュールは以下の通り:
・d0=sc注射MOG+CFA/mtb、+ip PT
・d2=ip PT
・d7=毎日の処置ipの開始、および
臨床スコアリングは次の通りであった:
0~1 マウスが頸部で掴まれた場合、様々な程度の水平より低い尾
1.5 尾挙上不全(全く垂直)であるが尾にまだわずかな張力がある
2 完全に尾挙上不全
2.5 +閉じた後肢(足指はもはや広がらない)
3 +よたよた歩き(しかしまだ両後肢を使用)
3.5 歩行時にもはや片方の後肢を使用しない
4 両後肢を使用しない
4.5 +裏返して置かれてももはやひっくり返ることができない
5 瀕死
6 死亡
図10パネルAには、0日目に、雄C57BL/6Jマウス(8週齢)を、ミエリン特異的ペプチド(マウスオリゴデンドロサイト糖タンパク質アミノ酸35-55 MEVGWYRSPFSRVVHLYRNGK(配列番号296)、1mg/ml)およびフロイント完全アジュバント(5mg/ml)の2x100μlのエマルジョンでs.c免疫し、続いて、50ngの百日咳毒素のi.p.注射を行った。2日目に、第2の百日咳毒素用量をi.p.接種した。7日目に開始して、マウスを、BcII10(すなわち、無関係の標的、したがって非標的化コントロール)、mCD8、mCD20またはmClec9A(n=4であるmCD8を標的とするAcTaferonを除いて、n=5)のいずれかに結合するVHHに連結された5000IUのAcTaferonで毎日処置(i.p.)した。ポジティブコントロールとして、非標的化野生型mIFN(BcII10VHHに連結)を5,000IUまたは1,000,000IUのいずれかで注射した。コントロールマウスは、PBS処置を受けた。マウスを、進行性不全麻痺および運動麻痺に関し毎日スコア付けた。0~2のスコアを減少した尾張力の異なる度合いに対し与え、スコア2を完全に麻痺した尾に対し;スコア3は後肢脱力および対麻痺開始に対し;スコア4は完全対麻痺に対し;スコア5は四肢麻痺に対し(この段階でマウスを安楽死させる必要がある)およびスコア6はマウスが死んだ場合に与えた。注目すべきは、マウスが1未満のスコアで突然に死亡した場合、それらの死亡は処置の毒性に帰された。これらのマウスは、平均臨床スコアの計算に含まれなかった(これは、高用量の野生型IFNで処置したマウスの場合のみであった)。図10パネルBは、体重の変化を示す。体重も毎日測定した。平均体重は、死亡マウスのものも含めて計算した。
図11は、処置後10日目~28日目の平均(±S.E.M)累積臨床スコアを示す。運動麻痺の最初の徴候は、13日目から認められる(n=5、mCD8標的化AcTaferonについてはn=4)。図12は、種々のAcTaferonによる毎日の処置の毒性副作用の評価を示す。示されるのは、実験の過程での死亡率(パネルA)および25日目の白血球数である。具体的には、EDTA処理血液を最後の処置の3時間後にマウスの尾静脈から収集し、リンパ球(パネルB)、単球(パネルC)、好中球(パネルD)、血小板(パネルE)、および赤血球(パネルF)を、HEMAVET950FS血液学的分析計(Drew Scientific)を用いて計数した。プロットは、平均±S.E.M(n=5、mCD8標的化AcTaferonについてはn=4、野生型mIFN 1,000,000IUについてはn=2)である。
実施例8.抗ヒトClec9A VHHキメラにより誘導される樹状細胞シグナル伝達
樹状細胞pSTATシグナル伝達アッセイを行った。調査したキメラは、抗ヒトClec9A VHH/ヒトIFN R149Aおよび抗ヒトClec9A VHH/ヒトIFN R33A/E120Rであった。物質の2種の用量:100ng/mlおよび500ng/mlを調査した。
この実施例で使用した抗ヒトClec9A VHHはR2CHCL24(配列番号63)であった。
簡単に説明すると、ヒトPBMCを健康なドナー由来の血液から単離した。約120mlの血液をヘパリンコートチューブ(12個のチューブ)を用いて各ドナーから収集した。血液を室温で保持し、すぐに処理した。簡単に説明すると、血液をDPBSで1:1に希釈し、25mlを15mlのリンパ球H上に静かに層状に配置した。遠心分離後、単核細胞環を集め、細胞をDPBS(PBSダルベッコリン酸緩衝食塩水、Wisent、カタログ番号311-425-LL)で3回洗浄し、計数した。樹状細胞を、製造業者の説明書に従い、PBS中の系統特異的モノクローナル抗体および磁気粒子(STEMCELL Technologiesカタログ番号19251)の懸濁液の組み合わせを含む「DC濃縮キット」を用いてPBMC集団から濃縮した。
樹状細胞(DC)を供試品およびコントロール(PBS)の存在下または非存在下で15分間刺激し、単離DC細胞集団(Lin-(CD14/CD16/CD20/CD56/CD3)/HLA-DR+)中のリン酸化STAT1(pSTAT1、特にpY701-STAT1)の量を、フローサイトメトリーにより測定した。刺激後、細胞を固定(BD Cytofix fixation buffer,BD Bioscience、カタログ番号554655)した後、Perm緩衝液II(BD PhosFlow Perm Buffer,BD Bioscience、カタログ番号558052)で透過処理した。細胞をその後、ホスホSTAT1およびDC表面マーカー(Lin-/HLA-DR+)について染色した(下表参照)。細胞内および表面の染色の両方を同時に実施した。フローサイトメトリーおよびデータ取得を、DPBSによる細胞洗浄後に実施した。
Figure 0007236273000011
図13は、pSTAT樹状細胞のパーセンテージの倍率変化として表したデータを示す。
この調査は、その活性が細胞ターゲティング時に回復可能であるIFNシグナル伝達物質(IFN R149A)を含むヒトCLEC9A抗原ターゲティング構築物が、ヒト樹状細胞中でIFNシグナル伝達(pSTAT1誘導により測定される)を促進することを明確に示す。対照的に、その活性が回復可能でないIFNシグナル伝達物質(IFN R33A/E120R)を組み込むCLEC9Aターゲティング構築物では、IFNシグナル伝達活性化は観察されない。したがって、CLEC9Aマウスを標的とする同等のIFN融合体構築物について観察されるように、CLEC9A抗原に向けたターゲティング部分を用いるIFNのヒト樹状細胞への標的化は、顕著なIFNシグナル伝達のトリガーをもたらす。
実施例9.ヒト抗腫瘍効果のモデル化
この実施例で使用した抗ヒトClec9A VHHはR2CHCL24(配列番号63)であった。
ヒト臍帯血の選択
幹細胞は、実験中用いた腫瘍細胞によるHLA-A2の発現と、HLA型が適合した。このために、HLA-A2陽性臍帯血のみを選択して、CD34幹細胞精製を進めた。細胞をHLA-A2-FITC(BD Pharmingen)またはHLA-ABC-PE(BD Pharmingen)で染色した。後者はポジティブコントロールである。試料をAttune Nxt Acoustic Focusing Cytometer(Life Technologies)で取得した。
ヒト臍帯血からのCD34幹細胞の精製
ヒト臍帯血由来の生存単核細胞を、Fycoll(Lymphoprep,Stemcell technologies)勾配分離を用いて単離した後、直接CD34前駆細胞単離キット(Miltenyi)を用いてCD34単離を行った。ヒトCD3-PE(BD Phamringen)/ヒトCD34-APC(BD Pharmingen)を用いるフローサイトメトリー染色を使って、単離幹細胞の純度を評価した。試料をAttune Nxt Acoustic Focusing Cytometer(Life Technologies)で取得した。注入した細胞の純度は95~98%に達した。
ヒト化マウスの生成
新生児NSGマウス(1~2日齢)を、100CGyで亜致死量照射し、その後、10個のCD34ヒト幹細胞を肝内に送達した。細胞移入の6週後、末梢血を、ヒトおよびマウスCD45(両方共BD)細胞の両方の存在について分析して、生着の効果を解析した。試料を、LSRフローサイトメーター(BD)で取得し、FACS Divaソフトウェア(BD)で解析した。
キメラの抗腫瘍能力を、担腫瘍ヒト化マウスモデルで評価した。新生児NSGマウス(1~2日齢)を、100CGyで亜致死量照射し、その後、10個のCD34ヒト幹細胞(HLA-A2陽性臍帯血由来)を肝内に送達した。幹細胞移入の13週後、マウスに2.5x10個のヒトRL濾胞性リンパ腫細胞をs.c.接種した。マウスを、腫瘍接種後6日目に開始して毎日、30μlのFlt3Lタンパク質でi.p.処置した。毎日の病変周囲キメラ送達(30μg)を、触知できる腫瘍に到達した、腫瘍接種後の10日目に開始した。抗ヒトClec9aVHH/抗ヒトPD-L1 VHH/ヒトIFN-R149A二重特異的キメラによる処置は、腫瘍増殖の安定化をもたし、これは、PBSの注入と対照的に、Flt3L注入と組み合わされるとさらに顕著であった。グラフは、腫瘍増殖を平均値±SEMとして示す。
したがって、抗ヒトClec9a VHH/抗ヒトPD-L1 VHH/ヒトIFN-R149A二重特異的キメラは、ヒト化マウス(再構成ヒト免疫系を有するマウス)におけるヒト腫瘍(RL)増殖に対する明確な抗腫瘍効果を示した。図14を参照されたい。
等価物
本発明をその特定の実施形態と関連付けて説明してきたが、その実施形態はさらに修正が可能であり、本出願は、一般的に、本発明の原理に従った本発明の任意の変形、使用、または改変を包含することが意図され、本発明が属する技術内の既知のまたは日常的な実施の範囲に入る、および上に示されるおよび以下の添付の請求項の範囲に入る本質的な特徴に該当し得る本開示からの乖離を含むものと理解されよう。
当業者は、本明細書で具体的に記載された特定の実施形態に対する多数の等価物を、ルーチン実験のみを用いて認識し、確認できるであろう。このような等価物は、次の請求項の範囲内に包含されることが意図されている。
参照による組み込み
本明細書で引用されている全ての特許および刊行物は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
本明細書で考察された出版物は、単に本出願の出願日に先行してそれらが開示されているという理由で提供されている。本明細書のいずれも、本発明が、先行発明の理由でこのような出版物に先行する権利がないことを容認すると解釈されるべきではない。
本明細書で使用されている全ての見出しは、単に構成上の理由によるものであり、どんな形にせよ、本開示を限定することを意図するものではない。任意の個別のセクションの内容は、等しく全てのセクションに適用することができる。
参考文献
以下の参考文献は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
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Claims (15)

  1. (a)C型レクチンドメインファミリー9メンバーA(Clec9A)を認識しかつそれに結合する認識ドメインを含むターゲティング部分であって、単一ドメイン抗体である、ターゲティング部分と
    (b)改変シグナル伝達物質であって、配列番号86または配列番号87から選択される配列と少なくとも98%の配列同一性を有し、かつ配列番号86または配列番号87に関連してR149、L153およびM148の位置で1個または複数の変異を有する、アミノ酸配列を含むヒトインターフェロンアルファ2(IFNα2)である、改変シグナル伝達物質と
    を含むキメラタンパク質であって、
    変異ヒトIFNα2が、野生型ヒトIFNα2と比較して低減された親和性または活性を有し、前記変異ヒトIFNα2の低減された親和性または活性が、前記ターゲティング部分への結合により回復可能であり、
    前記ターゲティング部分および改変ヒトIFNα2が、1個または複数のリンカーで連結される、キメラタンパク質。
  2. 1種または複数の追加のターゲティング部分をさらに含む、請求項1に記載のキメラタンパク質。
  3. 前記1種または複数の追加のターゲティング部分が、完全長抗体、単一ドメイン抗体、組換え重鎖のみで構成される抗体(VHH)、単鎖抗体(scFv)、サメ重鎖のみで構成される抗体(VNAR)、Fv、Fab、Fab’、またはF(ab’)を含む認識ドメインを含む、請求項2に記載のキメラタンパク質。
  4. 前記認識ドメインが、VHH、またはヒト化VHHを含む、請求項1~3のいずれか1項に記載のキメラタンパク質。
  5. 前記1個または複数の変異が、配列番号86または配列番号87に関連してL153A、R149A、およびM148Aである、請求項1~4のいずれか1項に記載のキメラタンパク質。
  6. 前記ターゲティング部分が、下記:
    配列番号2のアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号22のアミノ酸配列からなるCDR2、および配列番号44のアミノ酸配列からなるCDR3;
    配列番号3のアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号23のアミノ酸配列からなるCDR2、および配列番号45のアミノ酸配列からなるCDR3;
    配列番号4のアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号24のアミノ酸配列からなるCDR2、および配列番号45のアミノ酸配列からなるCDR3;
    配列番号2のアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号25のアミノ酸配列からなるCDR2、および配列番号46のアミノ酸配列からなるCDR3;
    配列番号5のアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号26のアミノ酸配列からなるCDR2、および配列番号47のアミノ酸配列からなるCDR3;
    GSSDSINAMGのアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号26のアミノ酸配列からなるCDR2、および配列番号47のアミノ酸配列からなるCDR3。
    配列番号6のアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号27のアミノ酸配列からなるCDR2、および配列番号48のアミノ酸配列からなるCDR3;
    配列番号7のアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号28のアミノ酸配列からなるCDR2、および配列番号49のアミノ酸配列からなるCDR3;
    配列番号8のアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号29のアミノ酸配列からなるCDR2、および配列番号50のアミノ酸配列からなるCDR3;
    配列番号8のアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号29のアミノ酸配列からなるCDR2、および配列番号51のアミノ酸配列からなるCDR3;
    配列番号8のアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号29のアミノ酸配列からなるCDR2、および配列番号52のアミノ酸配列からなるCDR3;
    配列番号9のアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号30のアミノ酸配列からなるCDR2、および配列番号53のアミノ酸配列からなるCDR3;
    配列番号10のアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号31のアミノ酸配列からなるCDR2、および配列番号54のアミノ酸配列からなるCDR3;
    配列番号10のアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号31のアミノ酸配列からなるCDR2、および配列番号55のアミノ酸配列からなるCDR3;
    配列番号11のアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号32のアミノ酸配列からなるCDR2、および配列番号56のアミノ酸配列からなるCDR3;
    配列番号12のアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号33のアミノ酸配列からなるCDR2、および配列番号57のアミノ酸配列からなるCDR3;
    配列番号13のアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号34のアミノ酸配列からなるCDR2、および配列番号57のアミノ酸配列からなるCDR3;
    配列番号14のアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号35のアミノ酸配列からなるCDR2、および配列番号57のアミノ酸配列からなるCDR3;
    配列番号15のアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号36のアミノ酸配列からなるCDR2、および配列番号57のアミノ酸配列からなるCDR3;
    配列番号16のアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号37のアミノ酸配列からなるCDR2、および配列番号57のアミノ酸配列からなるCDR3;
    配列番号17のアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号37のアミノ酸配列からなるCDR2、および配列番号57のアミノ酸配列からなるCDR3;
    配列番号18のアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号38のアミノ酸配列からなるCDR2、および配列番号58のアミノ酸配列からなるCDR3;
    配列番号19のアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号39のアミノ酸配列からなるCDR2、およびLGRのアミノ酸配列からなるCDR3;
    配列番号19のアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号40のアミノ酸配列からなるCDR2、およびLGRのアミノ酸配列からなるCDR3;
    配列番号19のアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号41のアミノ酸配列からなるCDR2、およびLGRのアミノ酸配列からなるCDR3;
    配列番号20のアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号42のアミノ酸配列からなるCDR2、およびLGRのアミノ酸配列からなるCDR3;ならびに
    配列番号21のアミノ酸配列からなるCDR1、配列番号43のアミノ酸配列からなるCDR2、およびVIKのアミノ酸配列からなるCDR3
    の1つまたは複数を含む、請求項1~5のいずれか1項に記載のキメラタンパク質。
  7. 前記変異が、配列番号86または配列番号87に関連してR149Aである、請求項5に記載のキメラタンパク質。
  8. 前記変異が、配列番号86または配列番号87に関連してL153Aである、請求項5に記載のキメラタンパク質。
  9. 前記変異が、配列番号86または配列番号87に関連してM148Aである、請求項5に記載のキメラタンパク質。
  10. 1種または複数のシグナル伝達物質を含む、請求項1~9のいずれか1項に記載のキメラタンパク質。
  11. 前記1種または複数のシグナル伝達物質が、インターフェロン、インターロイキン、腫瘍壊死因子およびその改変型である、請求項10に記載のキメラタンパク質。
  12. 前記ターゲティング部分が、配列番号59、60、62、63、66、および75から選択される配列と少なくとも95%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項に記載のキメラタンパク質。
  13. 前記ターゲティング部分が、配列番号60と少なくとも95%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項12に記載のキメラタンパク質。
  14. 癌を処置するまたは予防するための医薬品の調製のための、請求項1~13のいずれか1項に記載のキメラタンパク質の使用。
  15. 請求項1~13のいずれか1項に記載のキメラタンパク質および適切な賦形剤を含む、医薬組成物。
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