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JP7148580B2 - 特定の組成を有する遺伝子により改変されたt細胞製剤 - Google Patents

特定の組成を有する遺伝子により改変されたt細胞製剤 Download PDF

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JP7148580B2
JP7148580B2 JP2020155429A JP2020155429A JP7148580B2 JP 7148580 B2 JP7148580 B2 JP 7148580B2 JP 2020155429 A JP2020155429 A JP 2020155429A JP 2020155429 A JP2020155429 A JP 2020155429A JP 7148580 B2 JP7148580 B2 JP 7148580B2
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Description

関連出願の相互参照
本願は、2014年4月10日に出願された米国仮特許出願61/977,751号、2014年4月30日に出願された米国仮特許出願61/986,479号、2014年10月2日に出願された米国仮特許出願62/058,973号、2014年12月5日に出願された米国仮特許出願62/088,363号、2014年12月9日に出願された米国仮特許出願62/089,730号、および2014年12月11日に出願された米国仮特許出願62/090,845号に係る優先権を主張するものである。前記出願の開示は、参照によりその全体が明示的に本明細書に組み込まれる。
配列表に関する情報
本願は電子形式の配列表とともに出願されたものである。この配列表は、SCRI-090WO_SEQUENCE_LISTING.TXTのファイル名で2015年3月23日に作成された2.92kbのファイルとして提供されたものである。この電子形式の配列表に記載された情報は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
本発明の態様は、キメラ抗原受容体を含む遺伝子改変T細胞を製造するためのアプローチに関する。本発明により開示される方法は、T細胞の混合集団からCD4および/またはCD8T細胞を選択かつ/または単離することに関し、選択かつ/または単離されたCD4および/またはCD8T細胞は、次いで、該細胞の生存、移植および/または増殖を補助しかつ細胞表面受容体(CD62L、CD28、および/またはCD27など)の維持を向上する1つ以上のサイトカインの存在下での単離培養において、活性化され、遺伝子改変され、かつ増殖される。
同種造血幹細胞移植(HSCT)を行った後に急性リンパ芽球性白血病(ALL)が再発する場合がある。したがって、HSCTのようなアプローチは有効ではないと考えている人も多い。腫瘍細胞または悪性B細胞の表面上に存在する分子に特異的なキメラ抗原受容体(CAR)を発現するように遺伝子導入により改変されたヒトTリンパ球を養子免疫細胞移入すれば、様々な進行性がんおよび進行性悪性腫瘍を効果的に治療できる可能性がある。しかしながら、長時間持続する有効な治療法を提供するためには、患者への移入後に高い生存率および増殖率を示すキメラ抗原受容体保有T細胞を投与することが望ましい。さらに、治療に使用するこのようなT細胞は、移植に適合していることが望ましい。当技術分野における多大な努力にもかかわらず、さらなる有効な細胞療法が依然として必要とされている。
本明細書に記載の本発明の態様は、ヒトを治療するための、キメラ抗原受容体を含む遺伝子改変T細胞を製造する方法を包含する。本発明の別の実施形態は、T細胞の混合集団からの、たとえば胸腺細胞に由来するT細胞、遺伝子改変された前駆細胞(望ましくはiPS細胞)に由来するT細胞などの、CD4および/またはCD8発現T細胞の選択、濃縮および/または単離を利用した方法を包含する。選択、濃縮または単離されたCD4および/またはCD8発現T細胞は、次いで、活性化され、遺伝子改変され、増殖されるが、この活性化、遺伝子改変および増殖は、1つ以上のサイトカインの存在下での分離培養、濃縮培養または単離培養において行うことが好ましい。該1つ以上のサイトカインは、たとえば前記T細胞によって産生されうる任意のサイトカインや培地中に存在しうる任意のサイトカインなどに加えて、前記T細胞に外因的に提供することができる。該1つ以上のサイトカインは、前記T細胞の生存、移植および/または増殖を補助、促進または誘導するか、前記T細胞の生存、移植および/または増殖に寄与する。さらに、該1つ以上のサイトカインは、CD62L、CD28および/またはCD27などの細胞表面受容体の維持を補助、促進または誘導するか、該受容体の維持に寄与することが好ましい。本発明は、さらに、がんを治療、抑制、緩和または排除する方法であって、がんの治療、抑制、緩和または排除を必要とする対象に、1つ以上の前記遺伝子改変T細胞、または本明細書に記載に従って製造された遺伝子改変T細胞を含む1つ以上の組成物を投与することを含む方法を包含する。
本明細書に記載の本発明の態様のいくつかは、キメラ抗原受容体を有する遺伝子改変T細胞の製造方法に関する。
いくつかのアプローチでは、上記の方法は、
T細胞の混合集団から、胸腺細胞に由来するT細胞、遺伝子改変された前駆細胞(望ましくはiPS細胞)に由来するT細胞などの、CD8発現T細胞集団および/またはCD4発現T細胞集団を分離、単離または濃縮して、該T細胞が分離、単離また濃縮された集団を作製すること、
前記分離、単離または濃縮されたT細胞集団を刺激して、刺激されたCD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を作製すること、
前記刺激されたCD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を、細胞表面選択マーカーをコードするマーカー配列とキメラ抗原受容体とをコードするベクターで形質導入して、形質導入されたCD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を作製すること、
たとえば該細胞によって産生されうる任意のサイトカインまたは培地中に存在していてもよい任意のサイトカインに加えて、外因性であってもよい少なくとも1つのサイトカインと、前記形質導入されたCD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団とを接触させて、前記形質導入されたサイトカイン刺激性CD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を作製すること、
前記サイトカイン刺激性形質導入CD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を前記マーカー配列による選択によって濃縮して、分離、濃縮または単離されたサイトカイン刺激性形質導入CD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を作製すること、ならびに
前記分離、濃縮または単離されたサイトカイン刺激性形質導入CD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を少なくとも2日増殖させて、キメラ抗原受容体を有する遺伝子改変T細胞を得ること
によって実施する。
いくつかの実施形態においては、前記CD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞は、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、14日、15日、16日、17日、18日、19日もしくは20日にわたって、これらの時間以上にわたって、またはこれらの時間点のいずれか2つによって定義される時間範囲にある任意の時間にわたって増殖させることによって、キメラ抗原受容体を有する前記遺伝子改変T細胞を得ることができる。いくつかの実施形態においては、T細胞の混合集団からの前記CD8T細胞集団および/またはCD4T細胞集団の前記分離または濃縮は、CD8および/またはCD4上に存在するエピトープを有するT細胞を親和性により選択することによって行う。いくつかの実施形態においては、T細胞の混合集団からの前記CD8T細胞集団および/またはCD4T細胞集団の前記分離または濃縮は、フローサイトメトリーによって行う。いくつかの実施形態においては、T細胞の混合集団からの前記CD8T細胞集団および/またはCD4T細胞集団の前記分離または濃縮は、免疫磁気選択によって行う。いくつかの実施形態においては、前記遺伝子改変CD8T細胞および/またはCD4T細胞は、少なくとも1つの受容体を含み、該少なくとも1つの受容体が、移植適合性を向上、誘導または増強するか、移植適合性に寄与する。いくつかの実施形態においては、前記少なくとも1つの受容体は、CD45 RA、CD45 RO、CCR7、CD25、CD127、CD57、CD137、CD27、CD28および/またはCD62Lである。いくつかの実施形態においては、前記少なくとも1つの受容体は、CD27、CD28および/またはCD62Lである。いくつかの実施形態においては、前記単離されたT細胞集団の刺激は、前記CD8および/またはCD4T細胞と、ビーズまたは粒子などの、抗体を結合させた支持体とを接触させることによって行う。いくつかの実施形態においては、前記抗体を結合させた支持体は、抗TCR抗体、抗CD2抗体、抗CD3抗体、抗CD4抗体および/または抗CD28抗体を含む。いくつかの実施形態においては、前記抗体を結合させた支持体は、抗CD3抗体および/または抗CD28抗体を含む。いくつかの実施形態においては、前記ベクターは、リーダー配列をコードする第1の配列、リガンド結合ドメインをコードする第2の配列、シグナル伝達ドメインをコードする第3の配列、および選択マーカーをコードする第4の配列をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記ベクターは、スペーサーをコードする配列をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーはIgG4のヒンジ領域を含む。いくつかの実施形態においては、前記ベクターはウイルスベクターである。いくつかの実施形態においては、前記ウイルスベクターは、シミアンウイルス40、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス(AAV)、レンチウイルスまたはレトロウイルスに由来する。いくつかの実施形態においては、前記ウイルスベクターは、組換えアデノウイルスベクター、組換えアデノ随伴ウイルスベクター、組換えレンチウイルスベクターまたは組換えレトロウイルスベクターである。いくつかの実施形態においては、前記ウイルスベクターは、レンチウイルスベクターである。いくつかの実施形態においては、前記マーカー配列は、末端切断型上皮成長因子受容体(EGFRt)をコードする。いくつかの実施形態においては、前記少なくとも1つのサイトカインは、GM-CSF、IL-7、IL-12、IL-15、IL-18、IL-2および/またはIL-21を含む。いくつかの実施形態においては、前記少なくとも1つのサイトカインは、IL-7、IL-15および/またはIL-21を含み、0.1ng/mL、0.2ng/mL、0.3ng/mL、0.4ng/mL、0.5ng/mL、0.6ng/mL、0.7ng/mL、0.8ng/mL、0.9ng/mLもしくは1.0ng/mL、もしくはこれらの量のいずれか2つによって定義される範囲にある量、および/または10U/mL、20U/mL、30U/mL、40U/mL、50U/mL、60U/mL、70U/mL、80U/mL、90U/mLまたは100U/mL、もしくはこれらの量のいずれか2つによって定義される範囲にある量で提供することができる。いくつかの実施形態においては、前記少なくとも1つのサイトカインは、IL-2、IL-15および/またはIL-21を含み、0.5ng/mLおよび/または50U/mLの量で提供される。いくつかの実施形態においては、前記接触を、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、14日、15日、16日、17日、18日、19日もしくは20日にわたって、またはこれらの値のいずれか2つによって定義される範囲にある期間にわたって行う。いくつかの実施形態においては、前記方法は、単離、精製、濃縮または分離されたCD4細胞を使用し、CD8細胞の非存在下、CD8細胞が実質的に除去された条件下、またはCD8細胞よりも該CD4細胞が多く含まれるように濃縮された条件下において実施する。いくつかの実施形態においては、前記方法は、単離、精製、濃縮または分離されたCD8細胞を使用し、CD4細胞の非存在下、CD4細胞が実質的に除去された条件下、またはCD4細胞よりも該CD8細胞が多く含まれるように濃縮された条件下において実施する。いくつかの実施形態においては、少なくとも1日、たとえば、1日、2日間、3日間、4日間、5日間、6日間、7日間、8日間、9日間、10日間、11日間、12日間、13日間、14日間、15日間、16日間、17日間、18日間、19日間もしくは20日間にわたって、またはこれらの期間のいずれか2つによって定義される範囲にある期間にわたって、前記CD4発現T細胞を増殖させる。いくつかの実施形態においては、少なくとも1日、たとえば、1日、2日間、3日間、4日間、5日間、6日間、7日間、8日間、9日間、10日間、11日間、12日間、13日間、14日間、15日間、16日間、17日間、18日間、19日間もしくは20日間にわたって、またはこれらの期間のいずれか2つによって定義される範囲にある期間にわたって、前記CD8T細胞を増殖させる。いくつかの実施形態においては、前記方法は、ビーズまたは粒子などの、前記抗体を結合させた支持体を除去することをさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記キメラ抗原受容体の前記リガンド結合ドメインは、抗体またはその結合部分を含む。いくつかの実施形態においては、前記キメラ抗原受容体の前記リガンド結合ドメインは、一本鎖可変フラグメント(scFv)またはその結合部分を含む。いくつかの実施形態においては、前記キメラ抗原受容体の前記リガンド結合ドメインは、FMC63またはその結合部分を含む。いくつかの実施形態においては、前記キメラ抗原受容体の前記リガンド結合ドメインは、CD19に特異的である。いくつかの実施形態においては、前記方法は、前記遺伝子改変CD8および/またはCD4T細胞を凍結保存することをさらに含む。
いくつかの実施形態においては、T細胞の混合集団からの、胸腺細胞に由来するT細胞、遺伝子改変された前駆細胞(望ましくはiPS細胞)に由来するT細胞などの、CD8発現T細胞集団および/またはCD4発現T細胞集団の前記分離、濃縮または単離は、CD8および/またはCD4上に存在するエピトープを有するT細胞を親和性により選択することによって行う。いくつかの実施形態においては、T細胞の混合集団からの、CD8発現T細胞集団および/またはCD4発現T細胞集団の前記分離、濃縮または単離は、フローサイトメトリーによって行う。いくつかの実施形態においては、T細胞の混合集団からの、CD8発現T細胞集団および/またはCD4発現T細胞集団の前記分離、濃縮または単離は、免疫磁気選択によって行う。いくつかの実施形態においては、前記遺伝子改変CD8発現T細胞および/または前記遺伝子改変CD4発現T細胞は、少なくとも1つの受容体を含み、該少なくとも1つの受容体は、移植適合性を向上または誘導するか、移植適合性に寄与する。いくつかの実施形態においては、移植適合性を向上または誘導するか、移植適合性に寄与する前記少なくとも1つの受容体は、CD45 RA、CD45 RO、CCR7、CD25、CD127、CD57、CD137、CD27、CD28および/またはCD62Lである。いくつかの好ましい実施形態において、移植適合性を向上または誘導するか、移植適合性に寄与する前記少なくとも1つの受容体は、CD27、CD28および/またはCD62Lである。いくつかの実施形態においては、前記単離、濃縮または分離されたT細胞集団の前記刺激は、前記CD8および/またはCD4発現T細胞と、ビーズまたは粒子などの、抗体を結合させた支持体とを接触させることによって行う。前記実施形態のいくつかにおいては、前記抗体を結合させた支持体は、抗TCR抗体、抗CD2抗体、抗CD3抗体、抗CD4抗体および/または抗CD28抗体を含む。
いくつかの好ましい実施形態において、前記抗体を結合させた支持体は、抗CD3抗体および/または抗CD28抗体を含む。
前記実施形態の多くにおいては、前記ベクターは、リーダー配列をコードする第1の配列、リガンド結合ドメインをコードする第2の配列、シグナル伝達ドメインをコードする第3の配列、および選択マーカー配列をコードする第4の配列をさらに含む。前記実施形態のいくつかにおいては、前記ベクターは、スペーサーをコードする配列をさらに含み、いくつかの実施形態においては、該スペーサーはIgG4のヒンジ領域を含んでいてもよい。前記実施形態の多くにおいては、前記ベクターはウイルスベクターまたはミニサークル(minicircle)である。
前記実施形態の多くにおいては、前記ウイルスベクターは、シミアンウイルス40、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス(AAV)、レンチウイルスまたはレトロウイルスに由来する。いくつかの実施形態においては、前記ウイルスベクターは、組換えアデノウイルスベクター、組換えアデノ随伴ウイルスベクター、組換えレンチウイルスベクターまたは組換えレトロウイルスベクターである。前記ウイルスベクターは、レンチウイルスベクターであることが好ましい。前記実施形態の多くにおいては、前記マーカー配列は、末端切断型上皮成長因子受容体(EGFRt)をコードする。前記実施形態の多くにおいて使用される前記少なくとも1つのサイトカインは、GM-CSF、IL-7、IL-12、IL-15、IL-18、IL-2および/またはIL-21を含み、該サイトカインは、たとえば前記T細胞によって産生されうる任意のサイトカインまたは培地中に存在しうる任意のサイトカインに加えて、外部から前記T細胞に供給されたものであってもよい。
望ましい実施形態では、前記少なくとも1つのサイトカインはIL-7、IL-15および/またはIL-21を含む。前記実施形態の多くにおいては、前記少なくとも1つのサイトカインはIL-2、IL-15および/またはIL-21を含む。好ましい実施形態においては、前記接触を、少なくとも1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、14日、15日、16日、17日、18日、19日もしくは20日にわたって、またはこれらの時間点のいずれか2つによって定義される範囲にある期間にわたって行う。前記実施形態の多くにおいては、前記方法は、CD8発現T細胞の非存在下、またはT細胞集団が分離も濃縮も単離もされていない天然集団と比較してCD8発現T細胞が低減された条件下において、胸腺細胞に由来するT細胞、遺伝子改変された前駆細胞(望ましくはiPS細胞)に由来するT細胞などの、単離、分離または濃縮されたCD4発現T細胞集団を使用して行う。前記実施形態の多くにおいては、前記方法は、CD4発現T細胞の非存在下、またはT細胞集団が分離も濃縮も単離もされていない天然集団と比較してCD4発現T細胞が低減された条件下において、胸腺細胞に由来するT細胞、遺伝子改変された前駆細胞(望ましくはiPS細胞)に由来するT細胞などの、単離、分離または濃縮されたCD8発現T細胞集団を使用して行う。前記実施形態の多くにおいては、少なくとも1日、たとえば、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、14日、15日、16日、17日、18日、19日もしくは20日にわたって、またはこれらの時間点のいずれか2つによって定義される時間範囲にある任意の時間にわたって、前記CD4発現T細胞を増殖させる。前記実施形態の多くにおいては、少なくとも1日、たとえば、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、14日、15日、16日、17日、18日、19日もしくは20日にわたって、またはこれらの時間点のいずれか2つによって定義される時間範囲にある任意の時間にわたって、前記CD8発現T細胞を増殖させる。
前記実施形態の多くにおいては、前記方法は、ビーズまたは粒子などの、抗体を結合させた前記支持体を除去することをさらに含む。前記実施形態の多くにおいては、前記キメラ抗原受容体の前記リガンド結合ドメインは、抗体またはその結合部分を含む。前記実施形態の多くにおいては、前記キメラ抗原受容体の前記リガンド結合ドメインは、一本鎖可変フラグメント(scFv)またはその結合部分を含む。前記実施形態の多くにおいては、前記キメラ抗原受容体の前記リガンド結合ドメインは、FMC63またはその結合部分を含み、これらは米国特許第7,446,179号に従って得ることができる(この文献は参照によりその全体が明示的に本明細書に組み込まれる)。前記実施形態の多くにおいては、前記キメラ抗原受容体の前記リガンド結合ドメインは、CD19に特異的である。前記実施形態の多くにおいては、前記方法は、前記遺伝子改変CD8および/またはCD4T細胞を凍結保存することをさらに含む。
本発明のさらなる態様は、遺伝子改変T細胞集団であって、
たとえば胸腺細胞や遺伝子改変された前駆細胞などに由来し、濃縮された状態、たとえば、CD8T細胞およびCD4発現T細胞が含まれないように濃縮された状態、CD8T細胞およびCD4発現T細胞が存在しない状態、またはCD8T細胞およびCD4発現T細胞から単離された状態などで、親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4発現T細胞を含み、
前記親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4T発現細胞が、刺激されたCD2受容体、CD3受容体、CD4受容体および/またはCD28受容体を有していること、
前記濃縮されたまたは親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4発現T細胞が、キメラ抗原受容体をコードする遺伝子と細胞表面選択マーカーをコードする遺伝子とをさらに含むこと、ならびに
前記濃縮されたまたは親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4発現T細胞が、少なくとも1つのサイトカインで再刺激されており、該少なくとも1つのサイトカインが、たとえば該T細胞によって産生されうる任意のサイトカインまたは培地中に存在しうる任意のサイトカインなどに加えて、外部から前記T細胞に供給されたものであってもよく、前記再刺激が、たとえば、少なくとも1日、たとえば、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、14日、15日、16日、17日、18日、19日もしくは20日にわたって、またはこれらの時間点のいずれか2つによって定義される時間範囲にある任意の時間にわたって、前記T細胞と、外部から加えた前記サイトカインと接触させることによって行うこと
を特徴とする遺伝子改変T細胞集団に関する。
いくつかの実施形態においては、親和性により選択された前記複数のCD8および/またはCD4発現T細胞は、少なくとも1つの受容体をさらに含み、該少なくとも1つの受容体は、移植適合性を向上または誘導するか、移植適合性に寄与する。いくつかの実施形態においては、移植適合性を向上、誘導または改善するか、移植適合性に寄与する前記少なくとも1つの受容体は、CD45 RA、CD45 RO、CCR7、CD25、CD127、CD57、CD137、CD27、CD28および/またはCD62Lである。いくつかの実施形態においては、移植適合性を向上、誘導または改善するか、移植適合性に寄与する前記少なくとも1つの受容体は、CD27、CD28および/またはCD62Lである。いくつかの実施形態においては、前記親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4発現T細胞は、リーダー配列をコードする第1の配列、リガンド結合ドメインをコードする第2の配列、シグナル伝達ドメインをコードする第3の配列および選択マーカー配列をコードする第4の配列を有するベクターをさらに含む。
いくつかの実施形態は遺伝子改変T細胞集団に関する。
いくつかの実施形態では、前記遺伝子改変T細胞集団は、
親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4T細胞を含み、CD8および/もしくはCD4T細胞を含んでいないか、CD8および/もしくはCD4T細胞が実質的に除去されているか、またはCD8および/もしくはCD4T細胞よりも前記CD8および/またはCD4T細胞が多く含まれるように濃縮されていること、
前記親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4T細胞が、刺激されたCD2受容体、CD3受容体、CD4受容体および/またはCD28受容体を有していること、
前記親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4T細胞が、キメラ抗原受容体と細胞表面選択マーカーとをコードする遺伝子をさらに含むこと、ならびに
前記親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4T細胞が、少なくとも1つのサイトカインで再刺激されていること
を特徴とする。
いくつかの実施形態においては、前記親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4T細胞は、少なくとも1つの受容体をさらに含み、該少なくとも1つの受容体は、移植適合性を向上、増強または改善するか、移植適合性に寄与する。いくつかの実施形態においては、移植適合性を向上、増強または改善するか、移植適合性に寄与する前記少なくとも1つの受容体は、CD45 RA、CD45 RO、CCR7、CD25、CD127、CD57、CD137、CD27、CD28および/またはCD62Lである。いくつかの実施形態においては、移植適合性を向上、増強または改善するか、移植適合性に寄与する前記少なくとも1つの受容体は、CD27、CD28および/またはCD62Lである。いくつかの実施形態においては、前記親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4T細胞は、リーダー配列をコードする第1の配列、リガンド結合ドメインをコードする第2の配列、シグナル伝達ドメインをコードする第3の配列および選択マーカーをコードする第4の配列を有するベクターをさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記ベクターは、スペーサーをコードする配列をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーはIgG4のヒンジ領域を含む。いくつかの実施形態においては、前記ベクターはウイルスベクターである。いくつかの実施形態においては、前記ウイルスベクターは、シミアンウイルス40、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス(AAV)、レンチウイルスまたはレトロウイルスに由来する。いくつかの実施形態においては、前記ウイルスベクターは、組換えアデノウイルスベクター、組換えアデノ随伴ウイルスベクター、組換えレンチウイルスベクターまたは組換えレトロウイルスベクターである。いくつかの実施形態においては、前記ウイルスベクターは、レンチウイルスベクターである。いくつかの実施形態においては、前記細胞表面選択マーカーは、末端切断型上皮成長因子受容体(EGFRt)をコードする。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは、抗体またはその結合部分を含む。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは、一本鎖可変フラグメント(scFv)またはその結合部分を含む。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは、FMC63またはその結合部分を含む。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは、CD19に特異的である。いくつかの実施形態においては、前記集団は、単離、精製、分離または濃縮されたCD8T細胞を含み、CD4T細胞を含んでいないか、CD4T細胞が実質的に除去されているか、CD4T細胞よりも該CD8T細胞が多く含まれるように濃縮されている。いくつかの実施形態においては、前記集団は、単離、精製、分離または濃縮されたCD4T細胞を含み、CD8T細胞を含んでいないか、CD8T細胞が実質的に除去されているか、CD8T細胞よりも該CD4T細胞が多く含まれるように濃縮されている。いくつかの実施形態においては、前記T細胞はT細胞前駆細胞である。いくつかの実施形態においては、前記T細胞前駆細胞は造血幹細胞である。いくつかの実施形態においては、前記ベクターは、スペーサーをコードする配列をさらに含み、該スペーサーは、たとえば、IgG4のヒンジ領域を含むスペーサーである。いくつかの実施形態においては、前記ベクターはウイルスベクターである。いくつかの実施形態においては、前記ウイルスベクターは、シミアンウイルス40、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス(AAV)、レンチウイルスまたはレトロウイルスに由来する。いくつかの実施形態においては、前記ウイルスベクターは、組換えアデノウイルスベクター、組換えアデノ随伴ウイルスベクター、組換えレンチウイルスベクターまたは組換えレトロウイルスベクターである。いくつかの実施形態においては、前記ウイルスベクターは、レンチウイルスベクターまたはミニサークル(minicircle)である。いくつかの実施形態においては、前記細胞表面選択マーカーは、末端切断型上皮成長因子受容体(EGFRt)をコードする。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは、抗体またはその結合部分を含む。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは、一本鎖可変フラグメント(scFv)またはその結合部分を含む。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは、FMC63またはその結合部分を含み、これらは米国特許第7,446,179号に従って得ることができる(この文献は参照によりその全体が明示的に本明細書に組み込まれる)。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは、CD19に特異的である。いくつかの実施形態においては、胸腺細胞に由来するT細胞、遺伝子改変された前駆細胞に由来するT細胞などの、前記遺伝子改変T細胞集団は、単離されたCD8発現T細胞を含み、CD4発現T細胞を含んでいないか、T細胞集団が分離も濃縮も単離もされていない天然集団と比較してCD4発現T細胞が低減されている。いくつかの実施形態においては、胸腺細胞に由来するT細胞、遺伝子改変された前駆細胞に由来するT細胞などの、前記遺伝子改変T細胞集団は、単離されたCD4発現T細胞を含み、CD8発現T細胞を含んでいないか、T細胞集団が分離も濃縮も単離もされていない天然集団と比較してCD8発現T細胞が低減されている。
本発明のさらなる態様は、ヒトを治療するための組成物または組み合わせ製剤であって、医薬品添加剤と、少なくとも1つの前記遺伝子改変T細胞集団とを含む組成物または組み合わせ製剤に関する。いくつかの実施形態においては、前記組成物または組み合わせ製剤は、遺伝子改変CD8発現T細胞集団を含む。いくつかの実施形態においては、前記組成物または組み合わせ製剤は、遺伝子改変CD4発現T細胞集団を含む。いくつかの実施形態においては、前記組成物または組み合わせ製剤は、前記遺伝子改変CD8発現T細胞集団と、前記遺伝子改変CD4発現T細胞集団とを、1:1、1:2、1:3、1:4、1:5、1:6、1:7、1:8、1:9、1:10、2:1、3:1、4:1、5:1、6:1、7:1、8:1、9:1もしくは10:1の比率、もしくはこれらの比率のいずれか2つによって定義される範囲にある比率で混合集団中に含むか、またはこれらの比率のいずれかで共投与するものである。
本発明の別の態様は、疾患の治療、抑制または緩和を必要とする対象において、該疾患を治療、抑制または緩和する方法であって、少なくとも1つの前記組成物または前記組み合わせ製剤を前記対象に投与することを含む方法に関する。いくつかの実施形態では、前記方法は、CD8発現T細胞を投与する前に、胸腺細胞に由来するT細胞、遺伝子改変された前駆細胞に由来するT細胞などのCD4発現T細胞を含む組成物または組み合わせ製剤を投与することを含み、別の実施形態においては、CD4発現T細胞を投与する前に、胸腺細胞に由来するT細胞、遺伝子改変された前駆細胞に由来するT細胞などのCD8発現細胞を投与する。実施形態の多くにおいて、前記対象は、抗がん療法を受ける対象として同定または選択されている。前記方法の実施形態の多くにおいては、前記方法は、疾患の抑制を測定または評価することをさらに含む。前記方法の実施形態の多くにおいては、前記方法は、前記組成物または組み合わせ製剤の投与前、投与中または投与後に、前記対象に別の抗がん療法を提供することをさらに含む。
前記方法の実施形態の多くにおいては、養子細胞移入によって組成物または組み合わせ製剤を前記対象に投与する。いくつかの実施形態においては、前記対象を別の形態の抗がん療法で処置した後に、組成物または組み合わせ製剤を該対象に投与する。前記方法の実施形態の多くにおいては、前記対象は白血病患者である。前記方法の実施形態の多くにおいては、前記対象は、再発性かつ/または化学療法抵抗性のCD19小児急性リンパ芽球性白血病(ALL)を有する。前記方法の実施形態の多くにおいては、前記対象は、再発性かつ/または化学療法抵抗性のCD19急性リンパ芽球性白血病(ALL)を有する。前記方法の実施形態の多くにおいては、前記対象は自己免疫疾患患者である。前記方法の実施形態の多くにおいては、前記対象はHSCT後の再発を有する。
したがって、本発明の態様のいくつかは以下に関する。
1.キメラ抗原受容体を有する遺伝子改変T細胞を製造する方法であって、
T細胞の混合集団から、胸腺細胞に由来するT細胞、遺伝子改変された前駆細胞(望ましくはiPS細胞)に由来するT細胞などの、CD8発現T細胞集団および/またはCD4発現T細胞集団を分離または濃縮して、該T細胞が分離または濃縮された集団を作製すること、
前記分離または濃縮されたT細胞集団を刺激して、刺激されたCD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団を作製すること、
前記刺激されたCD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団を、細胞表面選択マーカーをコードするマーカー配列とキメラ抗原受容体とをコードするベクターで形質導入して、形質導入されたCD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団を作製すること、
たとえば該細胞によって産生されうる任意のサイトカインまたは培地中に存在しうる任意のサイトカインに加えて、外部から供給されたものであってもよい少なくとも1つのサイトカインと、前記形質導入されたCD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団とを、たとえば、1日、2日間、3日間、4日間、5日間、6日間、7日間、8日間、9日間、10日間、11日間、12日間、13日間、14日間、15日間、16日間、17日間、18日間、19日間もしくは20日間にわたって、またはこれらの期間のいずれか2つによって定義される範囲にある期間にわたって接触させて、サイトカイン刺激性形質導入CD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団を作製すること、
前記サイトカイン刺激性形質導入CD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団を前記マーカー配列による選択によって濃縮し、濃縮されたサイトカイン刺激性形質導入CD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団を作製すること、ならびに
前記濃縮されたサイトカイン刺激性形質導入CD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団を少なくとも1日、たとえば、1日、2日間、3日間、4日間、5日間、6日間、7日間、8日間、9日間、10日間、11日間、12日間、13日間、14日間、15日間、16日間、17日間、18日間、19日間もしくは20日間にわたって、またはこれらの期間のいずれか2つによって定義される範囲にある期間にわたって増殖させて、キメラ抗原受容体を有する遺伝子改変T細胞を得ること
を含む方法。
2.T細胞の混合集団からの前記CD8T細胞集団および/またはCD4T細胞集団の分離または濃縮が、CD8および/またはCD4上に存在するエピトープを有するT細胞を親和性により選択することによって行われる、前記1に記載の方法。
3.T細胞の混合集団からの前記CD8T細胞集団および/またはCD4T細胞集団の分離または濃縮が、フローサイトメトリーによって行われる、前記1または2に記載の方法。
4.T細胞の混合集団からの前記CD8T細胞集団および/またはCD4T細胞集団の分離または濃縮が、免疫磁気選択によって行われる、前記1または2に記載の方法。
5.前記遺伝子改変CD8T細胞および/またはCD4T細胞が、少なくとも1つの受容体を含み、該少なくとも1つの受容体が、移植適合性を向上、誘導または増強するか、移植適合性に寄与する、前記1~4のいずれか一項に記載の方法。
6.前記少なくとも1つの受容体が、CD45 RA、CD45 RO、CCR7、CD25、CD127、CD57、CD137、CD27、CD28および/またはCD62Lである、前記5に記載の方法。
7.前記少なくとも1つの受容体が、CD27、CD28および/またはCD62Lである、前記5または6に記載の方法。
8.前記単離されたT細胞集団の刺激が、前記CD8および/またはCD4T細胞と、ビーズまたは粒子などの、抗体を結合させた支持体とを接触させることによって行われる、前記1~7のいずれか一項に記載の方法。
9.前記抗体を結合させた支持体が、抗TCR抗体、抗CD2抗体、抗CD3抗体、抗CD4抗体および/または抗CD28抗体を含む、前記8に記載の方法。
10.前記抗体を結合させた支持体が、抗CD3抗体および/または抗CD28抗体を含む、前記8または9に記載の方法。
11.前記ベクターが、リーダー配列をコードする第1の配列、リガンド結合ドメインをコードする第2の配列、シグナル伝達ドメインをコードする第3の配列、および選択マーカーをコードする第4の配列をさらに含む、前記1~10のいずれか一項に記載の方法。
12.前記ベクターが、スペーサーをコードする配列をさらに含む、前記1~11のいずれか一項に記載の方法。
13.前記スペーサーがIgG4のヒンジ領域を含む、前記12に記載の方法。
14.前記ベクターがウイルスベクターである、前記1~13のいずれか一項に記載の方法。
15.前記ウイルスベクターが、シミアンウイルス40、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス(AAV)、レンチウイルスまたはレトロウイルスに由来する、前記14に記載の方法。
16.前記ウイルスベクターが、組換えアデノウイルスベクター、組換えアデノ随伴ウイルスベクター、組換えレンチウイルスベクターまたは組換えレトロウイルスベクターである、前記14または15に記載の方法。
17.前記ウイルスベクターが、レンチウイルスベクターである、前記14~16のいずれか一項に記載の方法。
18.前記マーカー配列が、末端切断型上皮成長因子受容体(EGFRt)をコードする、前記1~17のいずれか一項に記載の方法。
19.前記少なくとも1つのサイトカインが、GM-CSF、IL-7、IL-12、IL-15、IL-18、IL-2および/またはIL-21を含む、前記1~18のいずれか一項に記載の方法。
20.前記少なくとも1つのサイトカインが、IL-7、IL-15および/またはIL-21を含み、0.1ng/mL、0.2ng/mL、0.3ng/mL、0.4ng/mL、0.5ng/mL、0.6ng/mL、0.7ng/mL、0.8ng/mL、0.9ng/mLもしくは1.0ng/mL、もしくはこれらの量のいずれか2つによって定義される範囲にある量、および/または10U/mL、20U/mL、30U/mL、40U/mL、50U/mL、60U/mL、70U/mL、80U/mL、90U/mLまたは100U/mL、もしくはこれらの量のいずれか2つによって定義される範囲にある量で提供することができる、前記1~19のいずれか一項に記載の方法。
21.前記少なくとも1つのサイトカインが、IL-2、IL-15および/またはIL-21を含み、0.5ng/mLおよび/または50U/mLの量で提供される、前記1~19のいずれか一項に記載の方法。
22.前記接触を、1日、2日間、3日間、4日間、5日間、6日間、7日間、8日間、9日間、10日間、11日間、12日間、13日間、14日間、15日間、16日間、17日間、18日間、19日間もしくは20日間にわたって、またはこれらの値のいずれか2つによって定義される範囲にある期間にわたって行う、前記1~21のいずれか一項に記載の方法。
23.単離、精製、濃縮または分離されたCD4細胞を使用し、CD8細胞の非存在下、CD8細胞が実質的に除去された条件下、またはCD8細胞よりも前記CD4細胞が多く含まれるように濃縮された条件下において実施される、前記1~20および22のいずれか一項に記載の方法。
24.単離、精製、濃縮または分離されたCD8細胞を使用し、CD4細胞の非存在下、CD4細胞が実質的に除去された条件下、またはCD4細胞よりも前記CD8細胞が多く含まれるように濃縮された条件下において実施される、前記1~19、21および22のいずれか一項に記載の方法。
25.少なくとも1日、たとえば、1日、2日間、3日間、4日間、5日間、6日間、7日間、8日間、9日間、10日間、11日間、12日間、13日間、14日間、15日間、16日間、17日間、18日間、19日間もしくは20日間にわたって、またはこれらの期間のいずれか2つによって定義される範囲にある期間にわたって、前記CD4発現T細胞を増殖させる、前記1~20、22および23のいずれか一項に記載の方法。
26.少なくとも1日、たとえば、1日、2日間、3日間、4日間、5日間、6日間、7日間、8日間、9日間、10日間、11日間、12日間、13日間、14日間、15日間、16日間、17日間、18日間、19日間もしくは20日間にわたって、またはこれらの期間のいずれか2つによって定義される範囲にある期間にわたって、前記CD8T細胞を増殖させる、前記1~19、21、22および24のいずれか一項に記載の方法。
27.ビーズまたは粒子などの、前記抗体を結合させた支持体を除去することをさらに含む、前記8~26のいずれか一項に記載の方法。
28.前記キメラ抗原受容体の前記リガンド結合ドメインが、抗体またはその結合部分を含む、前記1~27のいずれか一項に記載の方法。
29.前記キメラ抗原受容体の前記リガンド結合ドメインが、一本鎖可変フラグメント(scFv)またはその結合部分を含む、前記1~28のいずれか一項に記載の方法。
30.前記キメラ抗原受容体の前記リガンド結合ドメインが、FMC63またはその結合部分を含む、前記1~29のいずれか一項に記載の方法。
31.前記キメラ抗原受容体の前記リガンド結合ドメインが、CD19に特異的である、前記1~30のいずれか一項に記載の方法。
32.前記遺伝子改変CD8および/またはCD4T細胞を凍結保存することをさらに含む、前記1~31のいずれか一項に記載の方法。
33.遺伝子改変T細胞集団であって、
親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4T細胞を含み、CD8および/もしくはCD4T細胞を含んでいないか、CD8および/もしくはCD4T細胞が実質的に除去されているか、またはCD8および/もしくはCD4T細胞よりも前記CD8および/またはCD4T細胞が多く含まれるように濃縮されていること、
前記親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4T細胞が、刺激されたCD2受容体、CD3受容体、CD4受容体および/またはCD28受容体を有していること、
前記親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4T細胞が、キメラ抗原受容体と細胞表面選択マーカーとをコードする遺伝子をさらに含むこと、ならびに
前記親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4T細胞が、少なくとも1つのサイトカインで再刺激されていること
を特徴とする遺伝子改変T細胞集団。
34.前記親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4T細胞が、少なくとも1つの受容体をさらに含み、該少なくとも1つの受容体が、移植適合性を向上、増強または改善するか、移植適合性に寄与する、前記33に記載の遺伝子改変T細胞集団。
35.移植適合性を向上、増強または改善するか、移植適合性に寄与する前記少なくとも1つの受容体が、CD45 RA、CD45 RO、CCR7、CD25、CD127、CD57、CD137、CD27、CD28および/またはCD62Lである、前記33または34に記載の遺伝子改変T細胞集団。
36.移植適合性を向上、増強または改善するか、移植適合性に寄与する前記少なくとも1つの受容体が、CD27、CD28および/またはCD62Lである、前記34または35に記載の遺伝子改変T細胞集団。
37.前記親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4T細胞が、リーダー配列をコードする第1の配列、リガンド結合ドメインをコードする第2の配列、シグナル伝達ドメインをコードする第3の配列および選択マーカーをコードする第4の配列を有するベクターをさらに含む、前記33~36のいずれか一項に記載の遺伝子改変T細胞集団。
38.前記ベクターが、スペーサーをコードする配列をさらに含む、前記37に記載の遺伝子改変T細胞集団。
39.前記スペーサーがIgG4のヒンジ領域を含む、前記38に記載の遺伝子改変T細胞集団。
40.前記ベクターがウイルスベクターである、前記33~39のいずれか一項に記載の遺伝子改変T細胞集団。
41.前記ウイルスベクターが、シミアンウイルス40、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス(AAV)、レンチウイルスまたはレトロウイルスに由来する、前記40に記載の遺伝子改変T細胞集団。
42.前記ウイルスベクターが、組換えアデノウイルスベクター、組換えアデノ随伴ウイルスベクター、組換えレンチウイルスベクターまたは組換えレトロウイルスベクターである、前記40または41に記載の遺伝子改変T細胞集団。
43.前記ウイルスベクターが、レンチウイルスベクターである、前記40~42のいずれか一項に記載の遺伝子改変T細胞集団。
44.前記細胞表面選択マーカーが、末端切断型上皮成長因子受容体(EGFRt)をコードする、前記33~43のいずれか一項に記載の遺伝子改変T細胞集団。
45.前記リガンド結合ドメインが、抗体またはその結合部分を含む、前記37~44のいずれか一項に記載の遺伝子改変T細胞集団。
46.前記リガンド結合ドメインが、一本鎖可変フラグメント(scFv)またはその結合部分を含む、前記37~45のいずれか一項に記載の遺伝子改変T細胞集団。
47.前記リガンド結合ドメインが、FMC63またはその結合部分を含む、前記37~46のいずれか一項に記載の遺伝子改変T細胞集団。
48.前記リガンド結合ドメインが、CD19に特異的である、前記37~47のいずれか一項に記載の遺伝子改変T細胞集団。
49.前記集団が、単離、精製、分離または濃縮されたCD8T細胞を含み、CD4T細胞を含んでいないか、CD4T細胞が実質的に除去されているか、CD4T細胞よりも前記CD8T細胞が多く含まれるように濃縮されている、前記33~48のいずれか一項に記載の遺伝子改変T細胞集団。
50.前記集団が、単離、精製、分離または濃縮されたCD4T細胞を含み、CD8T細胞を含んでいないか、CD8T細胞が実質的に除去されているか、CD8T細胞よりも前記CD4T細胞が多く含まれるように濃縮されている、前記33~48のいずれか一項に記載の遺伝子改変T細胞集団。
51.ヒトを治療するための組成物または組み合わせ製剤であって、医薬品添加剤と、前記33~50のいずれか一項または複数項に記載の少なくとも1つの遺伝子改変T細胞集団とを含む組成物または組み合わせ製剤。
52.前記49に記載の遺伝子改変T細胞集団を含む、前記51に記載の組成物または組み合わせ製剤。
53.前記50に記載の遺伝子改変T細胞集団を含む、前記47に記載の組成物または組み合わせ製剤。
54.前記49に記載の遺伝子改変T細胞集団と、前記50に記載の遺伝子改変T細胞集団とを含み、これらのT細胞集団が1:1の比率で混合されているかまたは共投与される、前記47に記載の組成物または組み合わせ製剤。
55.疾患の治療、抑制または緩和を必要とする対象において、該疾患を治療、抑制または緩和する方法であって、前記51~54のいずれか一項または複数項に記載の少なくとも1つの組成物または組み合わせ製剤を前記対象に投与することを含む方法。
56.前記52に記載の組成物または組み合わせ製剤を投与することを含む、前記55に記載の方法。
57.前記53に記載の組成物または組み合わせ製剤を投与することを含む、前記55に記載の方法。
58.前記53に記載の組成物または組み合わせ製剤を投与することを含む、前記56に記載の方法。
59.前記52に記載の組成物または組み合わせ製剤を投与することを含む、前記57に記載の方法。
60.たとえば前記CD4発現T細胞を投与する前に前記CD8発現T細胞を投与することなどによって前記54に記載の組成物または組み合わせ製剤の投与を行うことを含み、該CD8発現T細胞の投与が、たとえば、前記CD4T細胞の投与の1分前、2分前、3分前、4分前、5分前、6分前、7分前、8分前、9分前、10分前、20分前、30分前、40分前、50分前もしくは60分前、またはこれらの時間のいずれか2つによって定義される範囲にある期間に行われる、前記55に記載の方法。
61.前記対象が、抗がん療法を受ける対象として同定または選択されている、前記55~60のいずれか一項または複数項に記載の方法。
62.疾患の抑制を測定または評価することをさらに含む、前記55~61のいずれか一項または複数項に記載の方法。
63.前記51~54のいずれか一項または複数項に記載の組成物または組み合わせ製剤の投与前、投与中または投与後に、前記対象に別の抗がん療法を提供することをさらに含む、前記55~62のいずれか一項または複数項に記載の方法。
64.前記51~54のいずれか一項または複数項に記載の組成物または組み合わせ製剤を養子細胞移入によって前記対象に投与する、前記55~63のいずれか一項または複数項に記載の方法。
65.前記対象を別の形態の抗がん療法で処置した後に、前記51~54のいずれか一項または複数項に記載の組成物または組み合わせ製剤を該対象に投与する、前記55~64のいずれか一項または複数項に記載の方法。
66.前記対象を別の形態の抗がん療法で処置した後に、前記51~54のいずれか一項または複数項に記載の組成物または組み合わせ製剤を該対象に投与する、前記55~65のいずれか一項または複数項に記載の方法。
67.前記対象が白血病患者である、前記55~66のいずれか一項または複数項に記載の方法。
68.前記対象が、再発性かつ/または化学療法抵抗性のCD19小児急性リンパ芽球性白血病(ALL)を有する、前記55~67のいずれか一項または複数項に記載の方法。
69.前記対象が、再発性かつ/または化学療法抵抗性のCD19急性リンパ芽球性白血病(ALL)を有する、前記55~68のいずれか一項または複数項に記載の方法。
70.前記対象が自己免疫疾患患者である、前記55~69のいずれか一項または複数項に記載の方法。
71.前記対象がHSCT後の再発を有する、前記55~70のいずれか一項または複数項に記載の方法。
図1Aは、抗CD19CAR保有T細胞の養子細胞移入後の11名の患者における該抗CD19CAR保有T細胞の0日目から65日目までの絶対数を示す。図1Bは、3種の投与量で治療した後の抗CD19CAR保有T細胞の絶対数を示す。
図2Aは、抗CD19CAR保有T細胞の養子細胞移入後の患者の末梢血における該抗CD19CAR保有T細胞の0日から65日目までの持続性を示す。図2Bは、3種の投与量で治療した後の抗CD19CAR保有T細胞の持続性を示す。
図3Aは、抗CD19CAR保有T細胞の養子細胞移入後の患者の骨髄における該抗CD19CAR保有T細胞の0日から65日目までの持続性を示す。図3Bは、3種の投与量で治療した後の患者の骨髄における抗CD19CAR保有T細胞の持続性を示す。
3種の投与量で治療した後の患者Xにおける急性リンパ芽球性白血病(ALL)の発症率を示す。
前記試験で使用した患者特性を示した表を示す。
疾患および投与量に関連した、CNS中リンパ腫の発症を示す。図中、2つの棒グラフは、抗CD19CAR保有T細胞を含む治療を受けた患者の数および3種の投与量による治療を受けた後の患者の疾患の重症度を示す。
グレード4の脳症を有するALL患者の異常MRI所見を示す。最初のパネルは、抗CD19CAR保有T細胞を用いた治療後の結果を示す。
抗CD19CAR保有T細胞による治療後の急性皮膚移植片対宿主病(GVHD)を示す。パネルAに示すとおり、S03は、CAR T細胞移植の17日後にグレード2の急性皮膚GVHDを新たに発症した。パネルBでは、皮膚生検により、皮膚局在T細胞のうちEGFRtを示したのは9%に過ぎず、循環しているT細胞では79%がEGFRtを示したことが明らかになった。これと同時に、パネルCでは、末梢血中T細胞の大多数がCARであることが示された。この対象を、1mg/kgのプレドニゾンで2週間治療したところ、GVHDが6週間かけて漸減し、消散した。プレドニゾン治療を行っても、この対象の体内では引き続きCART細胞が持続している。
抗CD19CAR保有T細胞を用いた治療後に微少残存病変(MRD)のマーカーとしてIgまたはTCRを示した患者をまとめた表を示す。
抗CD19CAR T細胞の同種造血幹細胞移植後の患者プロファイルを示す表である。
抗CD19CAR T細胞の造血幹細胞移植(HSCT)後に末梢血およびCSFから単離された細胞のFACS散乱分析を示す。
3種の投与量で抗CD19CAR T細胞の造血幹細胞を移植した後の腫瘍量と奏効の比較を示す。
3種の投与量の造血幹細胞移植後の患者の寛解持続期間を示す。
2種の投与量で抗CD19CAR T細胞の造血幹細胞を移植後した後の7日目の腫瘍量と奏効の比較を示す。
3種の投与量で抗CD19CAR T細胞の造血幹細胞を移植した後の患者におけるCAR/EGFRtT細胞の持続性のおよび持続期間を示す。
3種の投与量で抗CD19CAR T細胞の造血幹細胞を移植した後のB細胞形成不全の持続期間を示す。
3種の投与量で抗CD19CAR T細胞の造血幹細胞を移植した後の患者のCRSのプロファイルを示す。
遺伝子改変T細胞の製造を示す2つのフローチャートを示す。図に示したように、初期の増殖方法では、バルク処理を即座に開始しない場合もあった。Ficoll処理は、成分分離血の一部を常に使用して行った。バルク培養を開始しない場合は、Ficollにより分離された細胞を凍結保存した。
キメラ抗原受容体を有する遺伝子改変T細胞の種々の製造方法を比較したフローチャートを示す。
培養開始時において様々な濃度の細胞を用いた細胞増殖における最初の比較を示す。図に示したように、PD0064はPD0063ドナーであるが、PD0063ドナー由来の濃縮CD8発現T細胞を用いて、開始時のT25フラスコにおける培養開始時の細胞密度を試験した。この実験では、2種の細胞密度を試験したが、実験中に早期に細胞培養物の量を増加させた場合、いずれの細胞密度でも高い生存能および増殖が示された。
細胞増殖の開始時における比較を示す。これは、本発明で使用された改良された製造方法に移行した際に使用した実用スケールのデータであった。
CD4発現T細胞およびCD8発現T細胞の増殖についての試験に使用したサイトカインのカクテルのバリエーションを表したフローチャートを示す。
図23A~Fは、CD4発現T細胞およびCD8発現T細胞の増殖中に試験したサイトカインの比較を示す。
図24A~Fは、CD4発現T細胞およびCD8発現T細胞の増殖において試験したサイトカインの比較を示す。
図25A~Bは、細胞増殖についてサイトカインを比較した結果を示す。新たなCD4およびCD8ドナー(PD0057)を使用して試験を行ったこと以外は、PD0051での実験と同様にしてPD0059ドナー試料のサイトカイン実験を行った。
初期の増殖方法と、様々なサイトカイン混合物を試験した実験に基づく本発明の増殖方法とを示すフローチャートを示す。
図27は、試料PD0080、PD084およびPD0085の増殖を比較した結果を示す。これらの実験は「早期増殖」法の反復試験であった。
遺伝子改変細胞を製造するためにPD0044を評価した試験を示す。最初のスケールアップを行うため、選択後に凍結保存された細胞から得たPLAT-02(第I相および第II相試験)「事前評価済み(pre-qual)」細胞を使用した。
PLAT-02「Qual run#1」のスケールアップ実験において遺伝子改変細胞を製造するためにPD0046を評価した試験を示す。
遺伝子改変細胞を製造するためにPD0063を評価した試験を示す。PLAT-02「Qual run#2」またはこのスケールアップ実験において行った。増殖曲線は、2つのV-197細胞バッグから得た総細胞数(TNC)を合わせて示す。次いで、ビーズ除去およびEGFRt濃縮を、CD4発現T細胞は14日目(D+14)に行い、CD8発現T細胞は15日目(D+15)に行った。CD8発現T細胞をIL-2(50U/mL)/IL-15(0.5ng/mL)の存在下で増殖させ、CD4発現T細胞はIL-7(5ng/mL)/IL-15(0.5ng/mL)の存在下で増殖させた。ビーズ除去およびEGFRt濃縮を、CD4発現T細胞は12日目に行い、CD8発現T細胞は13日目に行った。
図31A~Bは、サイトカインの存在下で増殖させたときのバルクPBMC培養物の細胞の増殖を示す。図に示したように、CD4発現T細胞(●)をIL-2およびIL-15の存在下で増殖させた。CD8発現T細胞(■)をIL-7およびIL-15の存在下で増殖させた。
図32A~Bは、サイトカイン混合物の存在下における濃縮CD8発現T細胞および濃縮CD4発現T細胞の増殖を示す。試料PD0044に示したように、IL-2およびIL-15の存在下で濃縮CD8発現T細胞を増殖させた。試料PD0044では、IL-7およびIL-15の存在下で濃縮CD4発現T細胞を20日間にわたって増殖させた。
図18のフローチャートに示した早期増殖方法を用いた、濃縮CD4発現T細胞および濃縮CD8発現T細胞の増殖を示す。試料14602-S01、試料14602-S02および試料14602-S03/14602-S03-02中の細胞を用いた実験を示す。
図18のフローチャートに示した早期増殖方法を用いた、濃縮CD4発現T細胞および濃縮CD8発現T細胞の増殖を示す。試料14602-S04/14602-S04-02、試料14602-S05、試料14602-S06および試料14602-S06-2/14602-S06-04中の細胞を用いた実験を示す。
図18のフローチャートに示した「早期増殖法」を用いた、濃縮CD4発現T細胞および濃縮CD8発現T細胞の増殖を示す。試料14602-S07、14602-S08、および14602-S09中の細胞を用いた実験を示す。
試料14602-S10、試料14602-S11、試料14602-S12、および試料14602-S13中の細胞の増殖を示す。
試料14602-S14、試料14602-S15、および試料14602-S16中の細胞の増殖を示す。
濃縮CD4発現T細胞および濃縮CD8発現T細胞が細胞増殖の後でも選択された表現型を発現していたことを示す。
図39A~Bは、試料PD00044およびPD00046から得た細胞を注射したマウスの生存を示す。PD00046細胞は、移植適合性マーカー(CD27、CD28、CD127、およびCD62L)を発現することが認められた。
PD0044細胞バッチおよびPD0046細胞バッチから得た細胞で処置したマウスにおける平均腫瘍進行を示す。
移植適合性を有するように製造されたT細胞で処置したマウスにおける腫瘍進行を試験するための実験のセットアップを示す。
試料PD0051および試料PD00055から得たCD4発現T細胞とCD8発現T細胞との動物への投与日における比較、ならびにサイトカイン増殖条件を示す。
PBS、PD0051(通常増殖細胞)およびPD00055(サイトカインの組み合わせの存在下で増殖させた細胞)で処置した3つのマウス群の比較を示す。
EGFRtCARマーカーの検出によるマウス末梢血におけるT細胞の持続性を示す。
インビトロにおいて様々なサイトカイン条件下で増殖させた細胞をインビボで抗原と繰り返し遭遇させた場合に殺傷能力に違いが見られるかどうかを評価するための、3つのマウス群を用いた試験の実験のセットアップを示す。
PD0051またはPD0055で処置したマウスの治療後0日目から120日目までの腫瘍進行を示す。
抗原に繰り返し曝露させることによって刺激したPD0051細胞およびPD0055細胞を示す。
JME13-29において「通常の増殖方法で得た細胞」とサイトカインの組み合わせでパルスしたT細胞とをRaji腫瘍細胞で繰り返し刺激した場合の比較を示す。
PLAT-01(第I相臨床試験)およびPLAT-02(第I相および第II相臨床試験)と同じ条件下またはこれらの「間」のプロトコルで増殖させた細胞間でインビボにおける殺傷能力に違いが見られるかどうかを評価するため実験のセットアップを示す。
CD8発現T細胞およびCD4発現T細胞由来の細胞製剤およびそのEGFRtレベルを示す表を示す。
特定濃度の用量漸増法においてT細胞で処置した後の平均腫瘍進行を示す。
T細胞治療を受けた投与群内におけるPLATの比較を示す。
図53A~Eは、同等の用量濃度のPLAT-1.00製剤、PLAT-1.33製剤、PLAT-1.67製剤およびPLAT-2.00製剤から得たT細胞の比較を示す。これらの図は個々の動物の腫瘍進行を示す。用量漸増法における各折れ線グラフの起点では、各PLAT群の様々な用量がまとまって示されているが、用量が増加するにつれて別々に分かれていく。
PLAT-1.00製剤、PLAT-1.33製剤、PLAT-1.67製剤およびPLAT-2.00製剤から得たT細胞で処置したマウスの用量漸増法による生存率を示す。これらの図は、細胞治療を受けた投与群内におけるPLATの比較を示す。
生存曲線によるPLATの比較を示す。これらの図は、特定用量でのT細胞治療後の平均腫瘍進行を示す。
通常の増殖方法でT細胞を増殖させた場合またはサイトカインの存在下で増殖させた場合のT細胞治療に応答したマウスの生存率を示す。この図では、T細胞治療後にマウスが異種移植片対宿主病を発症したかどうかも示されている。
通常の増殖方法でT細胞を増殖させた場合またはサイトカインの存在下で増殖させた場合のT細胞治療に応答したマウスの生存率を示す。この図では、T細胞治療後にマウスが異種移植片対宿主病を発症したかどうかも示されている。
図58A~Cは、通常の増殖方法でT細胞を増殖させた場合またはサイトカインの存在下で増殖させた場合のT細胞治療に応答したマウスの生存率を示す。これら図では、T細胞治療後にマウスが異種移植片対宿主病を発症したかどうかも示されている。
図59A~Hは、通常の増殖方法でT細胞を増殖させた場合またはサイトカインの存在下で増殖させた場合のT細胞治療に応答したマウスの生存率を示す。これら図では、T細胞治療後にマウスが異種移植片対宿主病を発症したかどうかも示されている。
図60A~Dは、通常の増殖方法でT細胞を増殖させた場合またはサイトカインの存在下で増殖させた場合のT細胞治療に応答したマウスの生存率を示す。これら図では、T細胞治療後にマウスが異種移植片対宿主病を発症したかどうかも示されている。
T細胞治療後の51日目および90日目におけるJME14-03 N群を示した表を示す。
下記の用語の定義は、本明細書に記載の実施形態のいくつかの理解を容易にするために提供される。
本明細書に記載の「1つの(aまたはan)」は、1または1以上を意味しうる。
本明細書に記載の「核酸」または「核酸分子」は、ポリヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチドを指し、たとえば、デオキシリボ核酸(DNA)またはリボ核酸(RNA)、オリゴヌクレオチド、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)により作製されたフラグメント、ならびにライゲーション、切断、エンドヌクレアーゼ作用、エキソヌクレアーゼ作用および合成のいずれかにより作製されたフラグメントなどが挙げられる。核酸分子は、天然のヌクレオチドモノマー(DNAおよびRNAなど)、または天然に存在するヌクレオチドの類似体(たとえば、天然に存在するヌクレオチドのエナンチオマー)からなるモノマー、またはこれらの組み合わせから構成されうる。改変ヌクレオチドは、糖部分および/またはピリミジン塩基部分もしくはプリン塩基部分に改変を有していてもよい。糖部分の改変としては、たとえば、ハロゲン、アルキル基、アミンおよびアジド基による1つ以上のヒドロキシル基の置換が挙げられ、あるいは、糖部分はエーテル化またはエステル化されてもよい。さらに、糖部分全体が、立体構造的に類似の構造や電子的に類似の構造と置換されていてもよく、このような構造として、たとえば、アザ糖および炭素環式糖類似体が挙げられる。改変された塩基部分としては、アルキル化プリンおよびアルキル化ピリミジン、アシル化プリンおよびアシル化ピリミジン、ならびにその他の公知の複素環置換が挙げられる。核酸モノマーは、ホスホジエステル結合またはこれと似た結合により連結することができる。ホスホジエステル結合と似た結合としては、ホスホロチオエート結合、ホスホロジチオエート結合、ホスホロセレノエート結合、ホスホロジセレノエート結合、ホスホロアニロチオエート(phosphoroanilothioate)結合、ホスホロアニリデート(phosphoranilidate)結合、ホスホロアミデート結合などが挙げられる。「核酸分子」は、いわゆる「ペプチド核酸」も包含し、これは、天然の核酸塩基または改変された核酸塩基が付加されたポリアミド骨格を含む。核酸は、一本鎖であっても二本鎖であってもよい。
本明細書に記載の「遺伝子改変」は、遺伝子工学技術を利用して改変した遺伝子物質(たとえば核酸など)を使用して、細菌、T細胞、細菌細胞、真核細胞、昆虫、植物哺乳動物などの生物や細胞を改変する方法をいう。たとえば、DNAなどの核酸を宿主ゲノムに挿入することができ、これは、分子クローニング法を用いて単離した目的の遺伝子物質を複製してDNA配列を作製するか、あるいは目的のDNAを合成し、次いで得られたこの構築物を宿主生物に挿入することによって行うことができる。遺伝子は、ヌクレアーゼを用いて除去または「ノックアウト」することもできる。遺伝子ターゲティングは、相同組換えにより内在性遺伝子を改変する別の技術であり、遺伝子欠失、エクソンの除去、遺伝子の付加または点突然変異導入を行うために使用されうる。
本明細書では、形質導入による遺伝子改変について述べられている。「形質導入」とは、ベクターを介してDNAやRNAなどの遺伝子物質を細胞に導入する方法をいう。一般的な技術ではウイルスベクター、エレクトロポレーション、および細胞透過性を高める化学試薬を用いる。DNAは、ウイルスまたはウイルスベクターを介して導入することができる。本明細書に記載されているように、免疫CD4T細胞および/またはCD8T細胞を改変するための方法が提供される。治療用遺伝子の高発現を達成するため、かつ/または細胞表面上のキメラ抗原受容体の発現量を増加させるために、たとえば、キメラ抗原受容体をコードする遺伝子物質をT細胞に形質導入することができる。T細胞は、ウイルスを用いて遺伝子改変することができる。遺伝子治療に一般に使用されるウイルスは、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス(AAV)、レトロウイルスおよびレンチウイルスである。
キメラ抗原受容体をコードする核酸の送達のための組換え感染性ウイルス粒子を利用した様々な形質導入技術が開発されてきた。このような形質導入技術は、Tリンパ球を形質導入するためのアプローチとして現時点では好ましい。本明細書に記載されているように、形質導入に使用されるウイルスベクターとしては、シミアンウイルス40、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス(AAV)、レンチウイルスベクター、およびレトロウイルスに由来するウイルスベクターが挙げられる。このように、遺伝子導入方法および発現方法としては様々なものが存在するが、このような方法は、哺乳類細胞に遺伝物質を導入して発現させることを本質的な機能とする。前記形質導入技術のいくつかは、造血細胞またはリンパ球に形質導入することを目的として使用することができ、このような形質導入技術としては、リン酸カルシウムトランスフェクション、プロトプラスト融合、エレクトロポレーション、組換えアデノウイルスによる感染、アデノ随伴ウイルスによる感染、レンチウイルスによる感染、およびレトロウイルスベクターによる感染が挙げられる。初代Tリンパ球の形質導入は、エレクトロポレーションおよびレトロウイルスまたはレンチウイルスの感染によって成功を収めている。したがって、レトロウイルスベクターおよびレンチウイルスベクターを使用することによって、真核細胞への遺伝子導入を非常に効率的に行うことができる。レトロウイルスベクターおよびレンチウイルスベクターを使用することによって、T細胞への遺伝子導入を非常に効率的に行うことができる。さらに、レトロウイルスまたはレンチウイルスの組み込みは制御下で行うことができ、細胞1個あたり1コピーまたは数コピーの新しい遺伝情報を安定して組み込むことができる。
「発現ベクター」または本明細書に記載のベクターは、宿主細胞において発現される遺伝子をコードする核酸分子である。通常、発現ベクターは、転写プロモーター、遺伝子および転写ターミネーターを含む。遺伝子発現は、通常、プロモーターの制御下に置かれ、プロモーターの制御下に置かれた遺伝子はプロモーターに「作動可能に連結されている」と言われる。同様に、調節因子がコアプロモーターの活性を調節する場合、調節因子とコアプロモーターは作動可能に連結されている。
いくつかの実施形態においては、キメラ抗原受容体を有する遺伝子改変T細胞の製造方法であって、
該遺伝子改変T細胞が、たとえば、胸腺細胞に由来するT細胞、遺伝子改変された前駆細胞に由来するT細胞などであり、
該方法が、
T細胞の混合集団から、CD8発現T細胞集団および/またはCD4発現T細胞集団を分離、単離または濃縮して、該T細胞が単離、分離または濃縮された集団を作製すること、
前記単離、分離または濃縮されたT細胞集団を刺激して、刺激されたCD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を作製すること、
前記刺激されたCD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を、細胞表面選択マーカーをコードするマーカー配列とキメラ抗原受容体とをコードするベクターで形質導入して、形質導入されたCD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を作製すること、
前記形質導入されたCD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団と、少なくとも1つのサイトカインとを、少なくとも1日、たとえば1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、14日、15日、16日、17日、18日、19日もしくは20日にわたって、またはこれらの時間点のいずれか2つによって定義される時間範囲にある任意の時間にわたって接触させて、サイトカイン刺激性形質導入CD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を作製すること、
前記サイトカイン刺激性形質導入CD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を前記マーカー配列によりコードされる前記マーカーによる選択によって濃縮、分離または単離して、濃縮、分離、または単離されたサイトカイン刺激性形質導入CD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を作製すること、ならびに
前記濃縮、分離または単離されたサイトカイン刺激性形質導入CD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を少なくとも1日、たとえば、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、14日、15日、16日、17日、18日、19日もしくは20日にわたって、またはこれらの時間点のいずれか2つによって定義される時間範囲にある任意の時間にわたって増殖させて、キメラ抗原受容体を有する遺伝子改変T細胞を得ること
を含む方法が提供される。
前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記ベクターはウイルスベクターである。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記ウイルスベクターは、シミアンウイルス40、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス(AAV)、レンチウイルスまたはレトロウイルスに由来する。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記ウイルスベクターは、組換えアデノウイルスベクター、組換えアデノ随伴ウイルスベクター、組換えレンチウイルスベクターまたは組換えレトロウイルスベクターである。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記ウイルスベクターは、レンチウイルスベクターである。
「5’非翻訳領域(5’UTR)」としても知られる「リーダー配列」は、開始コドンの上流に位置するmRNA領域であり、mRNA転写産物の翻訳制御にとって重要である。キメラ抗原受容体を有する遺伝子改変T細胞の製造方法の実施形態のいくつかにおいては、前記キメラ抗原受容体をコードするベクターは、リーダー配列をコードする配列を含む。
本明細書に記載の「リガンド」とは、別の分子や生体分子とともに複合体を形成して、シグナル誘発などの生物学的作用を引き起こすことが可能な小分子である。リガンドの結合は、分子間力によって行われ、たとえばイオン結合、水素結合、およびファンデルワールス相互作用によって行われうる。リガンドが受容体タンパク質に結合することによって、三次元構造が変化し、その機能的状態が決定されうる。
リガンドとしては、たとえば、基質、タンパク質、小分子、阻害因子、活性化因子および神経伝達物質が挙げられるが、これらに限定されない。リガンドの結合強度は、結合親和性とも呼ばれ、直接的相互作用および解離作用によって決定されうる。リガンドは、「リガンド結合ドメイン」による結合を受ける。「リガンド結合ドメイン」は、特異的リガンドと結合する可能な構造における保存配列を意味しうる。リガンド結合ドメインは、1つまたは複数のリガンドに特異的な特異的タンパク質ドメインでありうるが、これに限定されない。
「特異的」または「特異性」は、結合パートナーに対するリガンドの特性、あるいはリガンドに対する結合パートナーの特性を指すことができ、結合に特異的な相補的形状、電荷性および疎水性が挙げられる。結合に関与する特異性としては、立体特異性、領域選択性、および化学選択性が挙げられる。
「共刺激ドメイン」としても知られている「シグナル伝達ドメイン」は、タンパク質または受容体タンパク質の細胞内ドメインすなわち細胞質ドメインであり、細胞内部と相互作用して、シグナルを中継することにより機能する。細胞の細胞内部分に属するこのようなタンパク質部分は「エンドドメイン(endodomain)」とも称される。上記の相互作用は、エフェクター分子またはエフェクタータンパク質との特異的なタンパク質-タンパク質相互作用またはタンパク質-リガンド相互作用を介した細胞内ドメインによる伝達によって起こりうり、次いでシグナル連鎖に沿ってシグナルをその目的地へと送ることができる。
「シグナル伝達ドメイン」あるいは「共刺激ドメイン」は、たとえばTCR/CD3複合体のCD3ζ鎖によって提供される一次シグナルに加えて、たとえば、免疫応答、活性化、増殖、分化、サイトカイン分泌、細胞溶解活性、パーフォリン活性および/またはグランザイム活性などのT細胞応答を媒介するシグナルをT細胞に提供するシグナル伝達部分を指すこともできる。シグナル伝達ドメインあるいは共刺激ドメインは、CD27、CD28、4-1BB、OX40、CD30、CD40、ICOS、リンパ球機能関連抗原-1(LFA-1)、CD2、CD7、LIGHT、NKG2C、B7-H3などの分子全体、および/またはCD83と特異的に結合するリガンド全体、またはこれらの分子やリガンドの一部を含んでいてもよいが、これらに限定されない。
「選択マーカー配列」は、人為的な選択のための特性を付与するために、ベクターまたは細胞に導入される遺伝子である。選択マーカー配列すなわちマーカー配列は、スクリーニング可能なマーカーであってもよく、このようなマーカー配列を使用することによって、研究者が望ましい細胞と望ましくない細胞とを識別すること、または特定の種類の細胞を濃縮することが可能となる。キメラ抗原受容体を有する遺伝子改変T細胞の製造方法の実施形態のいくつかにおいては、マーカー配列を含むキメラ抗原受容体をコードするベクターが提供され、前記マーカー配列は細胞表面選択マーカーをコードする。
いくつかの実施形態においては、キメラ抗原受容体を有する遺伝子改変T細胞の製造方法であって、
T細胞の混合集団から、胸腺細胞に由来するT細胞、遺伝子改変された前駆細胞(望ましくはiPS細胞)に由来するT細胞などの、CD8発現T細胞集団および/またはCD4発現T細胞集団を分離、単離または濃縮して、該T細胞が単離、分離または濃縮された集団を作製すること、
前記単離、分離または濃縮されたT細胞集団を刺激して、刺激されたCD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を作製すること、
前記刺激されたCD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を、細胞表面選択マーカーをコードするマーカー配列とキメラ抗原受容体とをコードするベクターで形質導入して、形質導入されたCD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を作製すること、
たとえば該T細胞によって産生される任意のサイトカインまたは培地中に存在しうる任意のサイトカインに加えて、外部から供給されたものであることが好ましい少なくとも1つのサイトカインと、前記形質導入されたCD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団とを、少なくとも1日、たとえば、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、14日、15日、16日、17日、18日、19日もしくは20日にわたって、またはこれらの時間点のいずれか2つによって定義される時間範囲にある任意の時間にわたって接触させて、サイトカイン刺激性形質導入CD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を作製すること、
前記サイトカイン刺激性形質導入CD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を前記マーカー配列によりコードされる前記マーカーによる選択によって分離、濃縮または単離して、濃縮、分離、または単離されたサイトカイン刺激性形質導入CD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を作製すること、ならびに
前記濃縮、分離または単離されたサイトカイン刺激性形質導入CD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を少なくとも1日、たとえば、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、14日、15日、16日、17日、18日、19日もしくは20日にわたって、またはこれらの時間点のいずれか2つによって定義される時間範囲にある任意の時間にわたって増殖させて、キメラ抗原受容体を有する遺伝子改変T細胞を得ること
を含む方法が提供される。
前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記ベクターは、リーダー配列をコードする第1の配列、リガンド結合ドメインをコードする第2の配列、シグナル伝達ドメインをコードする第3の配列、および選択マーカー配列をコードする第4の配列をさらに含む。
前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記ベクターは、スペーサーをコードする配列をさらに含む。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記スペーサーはIgG4のヒンジ領域を含む。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記ベクターはウイルスベクターである。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記ウイルスベクターは、シミアンウイルス40、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス(AAV)、レンチウイルスまたはレトロウイルスに由来する。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記ウイルスベクターは、組換えアデノウイルスベクター、組換えアデノ随伴ウイルスベクター、組換えレンチウイルスベクターまたは組換えレトロウイルスベクターである。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記ウイルスベクターは、レンチウイルスベクターである。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記マーカー配列は、末端切断型上皮成長因子受容体(EGFRt)をコードする。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記キメラ抗原受容体の前記リガンド結合ドメインは、抗体またはその結合部分を含む。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記キメラ抗原受容体の前記リガンド結合ドメインは、一本鎖可変フラグメント(scFv)またはその結合部分を含む。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記キメラ抗原受容体の前記リガンド結合ドメインは、FMC63またはその結合部分を含む。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記キメラ抗原受容体の前記リガンド結合ドメインは、CD19に特異的である。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記ベクターは、マーカー配列をコードする配列を含む。前記実施形態のいくつかにおいては、前記マーカー配列は末端切断型上皮成長因子受容体(EGFRt)である。
本明細書に記載の「コドン最適化」は、タンパク質の発現効率を最大化できることが知られているコドンへと、特定のコドンを変更する設計工程を指す。いくつかの実施形態においては、ヒトにおける発現を目的としたコドンの最適化が述べられており、コドンの最適化は、ヒトにおけるmRNAおよびタンパク質の収率の増加に最適化された合成遺伝子転写産物を作製するための、当業者に公知のアルゴリズムを使用することによって実施できる。ヒトにおけるコドン最適化のためのアルゴリズムを含んだプログラムは容易に入手可能である。このようなプログラムとしては、たとえば、OptimumGeneTMアルゴリズムまたはGeneGPS(登録商標)アルゴリズムが挙げられる。さらに、ヒトに対してコドンが最適化された配列は、たとえば、Integrated DNA Technologies社から入手できる。
いくつかの実施形態においては、キメラ抗原受容体を有する遺伝子改変T細胞の製造方法であって、
T細胞の混合集団から、胸腺細胞に由来するT細胞、遺伝子改変された前駆細胞(望ましくはiPS細胞)に由来するT細胞などの、CD8発現T細胞集団および/またはCD4発現T細胞集団を分離、単離または濃縮して、該T細胞が単離、分離または濃縮された集団を作製すること、
前記単離、分離または濃縮されたT細胞集団を刺激して、刺激されたCD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を作製すること、
前記刺激されたCD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を、細胞表面選択マーカーをコードするマーカー配列とキメラ抗原受容体とをコードするベクターで形質導入して、形質導入されたCD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を作製すること、
たとえば該T細胞によって産生される任意のサイトカインまたは培地中に存在しうる任意のサイトカインに加えて、外部から供給されたものであることが好ましい少なくとも1つのサイトカインと、前記形質導入されたCD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団とを、少なくとも1日、たとえば、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、14日、15日、16日、17日、18日、19日もしくは20日にわたって、またはこれらの時間点のいずれか2つによって定義される時間範囲にある任意の時間にわたって接触させて、サイトカイン刺激性形質導入CD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を作製すること、
前記サイトカイン刺激性形質導入CD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を前記マーカー配列によりコードされる前記マーカーによる選択によって濃縮、単離または分離して、濃縮、単離または分離されたサイトカイン刺激性形質導入CD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を作製すること、ならびに
前記濃縮、分離または単離されたサイトカイン刺激性形質導入CD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を少なくとも1日、たとえば、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、14日、15日、16日、17日、18日、19日もしくは20日にわたって、またはこれらの時間点のいずれか2つによって定義される時間範囲にある任意の時間にわたって増殖させて、キメラ抗原受容体を有する遺伝子改変T細胞を得ること
を含む方法が提供される。
前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記ベクターは、リーダー配列をコードする第1の配列、リガンド結合ドメインをコードする第2の配列、シグナル伝達ドメインをコードする第3の配列、および選択マーカー配列をコードする第4の配列をさらに含む。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記ベクターの配列は、ヒトにおける発現を目的としてコドン最適化されている。いくつかの実施形態においては、前記ベクターの配列は、特にヒト細胞におけるタンパク質の発現が最大となる選択されたコドンを有するように最適化されており、このように選択されたコドンによって、T細胞におけるタンパク質またはCARの濃度を増加させることができる。
最適化することによって、ポリヌクレオチドの二次構造の形成を低下させることもできる。前記方法の実施形態のいくつかのにおいては、ベクター内の配列を最適化することによって、総GC/AT比を低下させることもできる。コドンの最適化を厳密に行うと、望ましくない二次構造が形成されたり、GC含量が高くなって二次構造が形成されるという望ましくない結果になったりする場合がある。したがって、二次構造は転写効率に影響を与える。コドン使用の最適化を行った後にGeneOptimizerなどのプログラムを使用することによって、二次構造の形成を回避したり、GC含量を最適化したりすることができる。このようなさらなるプログラムは、最初のコドン最適化を行った後にさらに最適化を実施したり、トラブルシューティングを行うために使用することができ、それによって、1回目の最適化の後で起こりうる二次構造の形成を制限することができる。最適化のための他のプログラムも容易に入手可能である。前記方法の実施形態のいくつかにおいて、ベクターは、二次構造の形成を回避できるように最適化された配列、および/または総GC/AT比が低下するように最適化された配列、および/またはヒトにおける発現を目的として最適化された配列を含む。
マーカードメインは、本明細書に記載の実施形態に重要な要素を提供することもできる。細胞表面上のマーカードメインの利用することによって、形質導入T細胞の投与または存在に伴う毒性といった有害事象が起こった際に形質導入リンパ球を除去することが可能となる。たとえば、EGFRtマーカー配列の場合、EGFRに対する完全長抗体を利用して、EGFRを発現する細胞に該抗体を結合させ、これらの細胞を抗体依存性細胞傷害(ADCC)により殺傷することができる。いくつかの実施形態においては、マーカードメインに特異的な抗体を、放射性核種または毒素などの細胞傷害薬に結合させることができ、このようにして、インビボで形質導入細胞を除去または殺傷することができる治療薬が得られる。いくつかの実施形態において、マーカー配列は、濃縮および細胞選択のために提供される。本明細書に記載の典型的な実施形態においては、EGFRtマーカー配列を使用して精製および濃縮を行い、EGFRtマーカーに対する免疫磁気選択を実施することができる。
本明細書に記載の「スペーサー」は、特定の長さを有するポリペプチド鎖を意味することができ、スペーサーの長さは、10アミノ酸長、11アミノ酸長、12アミノ酸長、13アミノ酸長、14アミノ酸長、15アミノ酸長、16アミノ酸長、17アミノ酸長、18アミノ酸長、19アミノ酸長、20アミノ酸長、21アミノ酸長、22アミノ酸長、23アミノ酸長、24アミノ酸長、25アミノ酸長、26アミノ酸長、27アミノ酸長、28アミノ酸長、29アミノ酸長、30アミノ酸長、31アミノ酸長、32アミノ酸長、33アミノ酸長、34アミノ酸長、35アミノ酸長、36アミノ酸長、37アミノ酸長、38アミノ酸長、39アミノ酸長、40アミノ酸長、41アミノ酸長、42アミノ酸長、43アミノ酸長、44アミノ酸長、45アミノ酸長、46アミノ酸長、47アミノ酸長、48アミノ酸長、49アミノ酸長、50アミノ酸長、51アミノ酸長、52アミノ酸長、53アミノ酸長、54アミノ酸長、55アミノ酸長、56アミノ酸長、57アミノ酸長、58アミノ酸長、59アミノ酸長、60アミノ酸長、61アミノ酸長、62アミノ酸長、63アミノ酸長、64アミノ酸長、65アミノ酸長、66アミノ酸長、67アミノ酸長、68アミノ酸長、69アミノ酸長、70アミノ酸長、71アミノ酸長、72アミノ酸長、73アミノ酸長、74アミノ酸長、75アミノ酸長、76アミノ酸長、77アミノ酸長、78アミノ酸長、79アミノ酸長、80アミノ酸長、81アミノ酸長、82アミノ酸長、83アミノ酸長、84アミノ酸長、85アミノ酸長、86アミノ酸長、87アミノ酸長、88アミノ酸長、89アミノ酸長、90アミノ酸長、91アミノ酸長、92アミノ酸長、93アミノ酸長、94アミノ酸長、95アミノ酸長、96アミノ酸長、97アミノ酸長、98アミノ酸長、99アミノ酸長、100アミノ酸長、101アミノ酸長、102アミノ酸長、103アミノ酸長、104アミノ酸長、105アミノ酸長、106アミノ酸長、107アミノ酸長、108アミノ酸長、109アミノ酸長、110アミノ酸長、111アミノ酸長、112アミノ酸長、113アミノ酸長、114アミノ酸長、115アミノ酸長、116アミノ酸長、117アミノ酸長、118アミノ酸長、119アミノ酸長、120アミノ酸長、121アミノ酸長、122アミノ酸長、123アミノ酸長、124アミノ酸長、125アミノ酸長、126アミノ酸長、127アミノ酸長、128アミノ酸長、129アミノ酸長、130アミノ酸長、131アミノ酸長、132アミノ酸長、133アミノ酸長、134アミノ酸長、135アミノ酸長、136アミノ酸長、137アミノ酸長、138アミノ酸長、139アミノ酸長、140アミノ酸長、141アミノ酸長、142アミノ酸長、143アミノ酸長、144アミノ酸長、145アミノ酸長、146アミノ酸長、147アミノ酸長、148アミノ酸長、149アミノ酸長、150アミノ酸長、151アミノ酸長、152アミノ酸長、153アミノ酸長、154アミノ酸長、155アミノ酸長、156アミノ酸長、157アミノ酸長、158アミノ酸長、159アミノ酸長、160アミノ酸長、161アミノ酸長、162アミノ酸長、163アミノ酸長、164アミノ酸長、165アミノ酸長、166アミノ酸長、167アミノ酸長、168アミノ酸長、169アミノ酸長、170アミノ酸長、171アミノ酸長、172アミノ酸長、173アミノ酸長、174アミノ酸長、175アミノ酸長、176アミノ酸長、177アミノ酸長、178アミノ酸長、179アミノ酸長、180アミノ酸長、181アミノ酸長、182アミノ酸長、183アミノ酸長、184アミノ酸長、185アミノ酸長、186アミノ酸長、187アミノ酸長、188アミノ酸長、189アミノ酸長、190アミノ酸長、191アミノ酸長、192アミノ酸長、193アミノ酸長、194アミノ酸長、195アミノ酸長、196アミノ酸長、197アミノ酸長、198アミノ酸長、199アミノ酸長、200アミノ酸長、201アミノ酸長、202アミノ酸長、203アミノ酸長、204アミノ酸長、205アミノ酸長、206アミノ酸長、207アミノ酸長、208アミノ酸長、209アミノ酸長、210アミノ酸長、211アミノ酸長、212アミノ酸長、213アミノ酸長、214アミノ酸長、215アミノ酸長、216アミノ酸長、217アミノ酸長、218アミノ酸長、219アミノ酸長、220アミノ酸長、221アミノ酸長、222アミノ酸長、223アミノ酸長、224アミノ酸長、225アミノ酸長、226アミノ酸長、227アミノ酸長、228アミノ酸長、229アミノ酸長、230アミノ酸長、231アミノ酸長、232アミノ酸長、233アミノ酸長、234アミノ酸長、235アミノ酸長、236アミノ酸長、237アミノ酸長、238アミノ酸長、239アミノ酸長または240アミノ酸長の範囲にあってもよく、これらの長さのいずれか2つによって定義される範囲にある長さであってもよい。スペーサーは20種のアミノ酸のうち任意のものを含むことができ、たとえば、キメラ抗原受容体において望ましい長さのポリペプチド鎖を形成するために任意の順序で任意のアミノ酸を含んでいてもよく、前記20種のアミノ酸としては、アルギニン、ヒスチジン、リシン、アスパラギン酸、グルタミン酸、セリン、トレオニン、アスパラギン、グルタミン、システイン、グリシン、プロリン、アラニン、バリン、イソロイシン、メチオニン、フェニルアラニン、チロシン、および/またはトリプトファンが挙げられる。スペーサー配列は、scFVとキメラ抗原受容体の膜貫通ドメインとの間に位置するリンカーであってもよい。キメラ抗原受容体を有する遺伝子改変T細胞の製造方法の実施形態のいくつかにおいては、前記ベクターは、スペーサーをコードする配列をさらに含む。前記方法の実施形態のいくつかにおいて、スペーサーは、特定の長さの配列を含み、該配列の長さは、10アミノ酸長、11アミノ酸長、12アミノ酸長、13アミノ酸長、14アミノ酸長、15アミノ酸長、16アミノ酸長、17アミノ酸長、18アミノ酸長、19アミノ酸長、20アミノ酸長、21アミノ酸長、22アミノ酸長、23アミノ酸長、24アミノ酸長、25アミノ酸長、26アミノ酸長、27アミノ酸長、28アミノ酸長、29アミノ酸長、30アミノ酸長、31アミノ酸長、32アミノ酸長、33アミノ酸長、34アミノ酸長、35アミノ酸長、36アミノ酸長、37アミノ酸長、38アミノ酸長、39アミノ酸長、40アミノ酸長、41アミノ酸長、42アミノ酸長、43アミノ酸長、44アミノ酸長、45アミノ酸長、46アミノ酸長、47アミノ酸長、48アミノ酸長、49アミノ酸長、50アミノ酸長、51アミノ酸長、52アミノ酸長、53アミノ酸長、54アミノ酸長、55アミノ酸長、56アミノ酸長、57アミノ酸長、58アミノ酸長、59アミノ酸長、60アミノ酸長、61アミノ酸長、62アミノ酸長、63アミノ酸長、64アミノ酸長、65アミノ酸長、66アミノ酸長、67アミノ酸長、68アミノ酸長、69アミノ酸長、70アミノ酸長、71アミノ酸長、72アミノ酸長、73アミノ酸長、74アミノ酸長、75アミノ酸長、76アミノ酸長、77アミノ酸長、78アミノ酸長、79アミノ酸長、80アミノ酸長、81アミノ酸長、82アミノ酸長、83アミノ酸長、84アミノ酸長、85アミノ酸長、86アミノ酸長、87アミノ酸長、88アミノ酸長、89アミノ酸長、90アミノ酸長、91アミノ酸長、92アミノ酸長、93アミノ酸長、94アミノ酸長、95アミノ酸長、96アミノ酸長、97アミノ酸長、98アミノ酸長、99アミノ酸長、100アミノ酸長、101アミノ酸長、102アミノ酸長、103アミノ酸長、104アミノ酸長、105アミノ酸長、106アミノ酸長、107アミノ酸長、108アミノ酸長、109アミノ酸長、110アミノ酸長、111アミノ酸長、112アミノ酸長、113アミノ酸長、114アミノ酸長、115アミノ酸長、116アミノ酸長、117アミノ酸長、118アミノ酸長、119アミノ酸長、120アミノ酸長、121アミノ酸長、122アミノ酸長、123アミノ酸長、124アミノ酸長、125アミノ酸長、126アミノ酸長、127アミノ酸長、128アミノ酸長、129アミノ酸長、130アミノ酸長、131アミノ酸長、132アミノ酸長、133アミノ酸長、134アミノ酸長、135アミノ酸長、136アミノ酸長、137アミノ酸長、138アミノ酸長、139アミノ酸長、140アミノ酸長、141アミノ酸長、142アミノ酸長、143アミノ酸長、144アミノ酸長、145アミノ酸長、146アミノ酸長、147アミノ酸長、148アミノ酸長、149アミノ酸長、150アミノ酸長、151アミノ酸長、152アミノ酸長、153アミノ酸長、154アミノ酸長、155アミノ酸長、156アミノ酸長、157アミノ酸長、158アミノ酸長、159アミノ酸長、160アミノ酸長、161アミノ酸長、162アミノ酸長、163アミノ酸長、164アミノ酸長、165アミノ酸長、166アミノ酸長、167アミノ酸長、168アミノ酸長、169アミノ酸長、170アミノ酸長、171アミノ酸長、172アミノ酸長、173アミノ酸長、174アミノ酸長、175アミノ酸長、176アミノ酸長、177アミノ酸長、178アミノ酸長、179アミノ酸長、180アミノ酸長、181アミノ酸長、182アミノ酸長、183アミノ酸長、184アミノ酸長、185アミノ酸長、186アミノ酸長、187アミノ酸長、188アミノ酸長、189アミノ酸長、190アミノ酸長、191アミノ酸長、192アミノ酸長、193アミノ酸長、194アミノ酸長、195アミノ酸長、196アミノ酸長、197アミノ酸長、198アミノ酸長、199アミノ酸長、200アミノ酸長、201アミノ酸長、202アミノ酸長、203アミノ酸長、204アミノ酸長、205アミノ酸長、206アミノ酸長、207アミノ酸長、208アミノ酸長、209アミノ酸長、210アミノ酸長、211アミノ酸長、212アミノ酸長、213アミノ酸長、214アミノ酸長、215アミノ酸長、216アミノ酸長、217アミノ酸長、218アミノ酸長、219アミノ酸長、220アミノ酸長、221アミノ酸長、222アミノ酸長、223アミノ酸長、224アミノ酸長、225アミノ酸長、226アミノ酸長、227アミノ酸長、228アミノ酸長、229アミノ酸長、230アミノ酸長、231アミノ酸長、232アミノ酸長、233アミノ酸長、234アミノ酸長、235アミノ酸長、236アミノ酸長、237アミノ酸長、238アミノ酸長、239アミノ酸長もしくは240アミノ酸長、またはこれらの長さのいずれか2つによって定義される範囲にある長さである。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、スペーサーは、scFVとキメラ抗原受容体の膜貫通領域との間に位置する。
本明細書に記載の「IgG4のヒンジ領域」は、IgG4抗体の重鎖と軽鎖の間に存在するポリペプチドドメインを指す。
いくつかの実施形態においては、キメラ抗原受容体を有する遺伝子改変T細胞の製造方法であって、
T細胞の混合集団から、胸腺細胞に由来するT細胞、遺伝子改変された前駆細胞(望ましくはiPS細胞)に由来するT細胞などの、CD8発現T細胞集団および/またはCD4発現T細胞集団を分離、濃縮または単離して、該T細胞が単離、分離または濃縮された集団を作製すること、
前記単離、分離または濃縮されたT細胞集団を刺激して、刺激されたCD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を作製すること、
前記刺激されたCD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を、細胞表面選択マーカーをコードするマーカー配列とキメラ抗原受容体とをコードするベクターで形質導入して、形質導入されたCD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を作製すること、
たとえば該T細胞によって産生される任意のサイトカインまたは培地中に存在しうる任意のサイトカインに加えて、外部から供給されたものであることが好ましい少なくとも1つのサイトカインと、前記形質導入されたCD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団とを、少なくとも1日、たとえば、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、14日、15日、16日、17日、18日、19日もしくは20日にわたって、またはこれらの時間点のいずれか2つによって定義される時間範囲にある任意の時間にわたって接触させて、サイトカイン刺激性形質導入CD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を作製すること、
前記サイトカイン刺激性形質導入CD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を前記マーカー配列によりコードされる前記マーカーによる選択によって濃縮して、濃縮、分離、または単離されたサイトカイン刺激性形質導入CD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を作製すること、ならびに
前記濃縮されたサイトカイン刺激性形質導入CD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を少なくとも1日、たとえば、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、14日、15日、16日、17日、18日、19日もしくは20日にわたって、またはこれらの時間点のいずれか2つによって定義される時間範囲にある任意の時間にわたって増殖させて、キメラ抗原受容体を有する遺伝子改変T細胞を得ること
を含む方法が提供される。
前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記ベクターは、リーダー配列をコードする第1の配列、リガンド結合ドメインをコードする第2の配列、シグナル伝達ドメインをコードする第3の配列、および選択マーカーをコードする第4の配列をさらに含む。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記ベクターは、スペーサーをコードする配列をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーはヒト抗体のヒンジ領域を含む。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記スペーサーはIgG4のヒンジ領域を含む。いくつかの実施形態においては、前記IgG4ヒンジ領域は改変されたIgG4ヒンジ領域である。本明細書に記載の「改変されたIgG4ヒンジ領域」は、配列番号1(配列番号1;ESKYGPPCPPCP)、配列番号2(配列番号2;YGPPCPPCP)、配列番号3(配列番号3;KYGPPCPPCP)または配列番号4(配列番号4;EVVKYGPPCPPCP)で表されるヒンジ領域のアミノ酸配列と少なくとも90%、92%、95%もしくは100%の配列同一性、またはこれらのパーセンテージのいずれか2つによって定義される範囲にある配列同一性を有しうるヒンジ領域を指してもよい。上述のように、これらの配列のいずれか1つまたは複数の配列は、ヒトにおける発現を目的としてコドン最適化することができ、二次構造の除去またはGC/AT比の低減を目的として最適化することができ、かつ少なくとも2つのアイソタイプ遺伝子から作製されたコンセンサス配列であってもよい。
「膜貫通ドメイン」は、細胞の二重層に存在する疎水性タンパク質領域であり、生体膜に埋め込まれるタンパク質をつなぎ止める役割を果たす。膜貫通ドメインのトポロジーは、膜貫通型のαヘリックスであってもよいが、これに限定されない。キメラ抗原受容体を有する遺伝子改変T細胞の製造方法の実施形態のいくつかにおいては、前記ベクターは、膜貫通ドメインをコードする配列を含む。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記膜貫通ドメインは、10アミノ酸長、11アミノ酸長、12アミノ酸長、13アミノ酸長、14アミノ酸長、15アミノ酸長、16アミノ酸長、17アミノ酸長、18アミノ酸長、19アミノ酸長、20アミノ酸長、21アミノ酸長、22アミノ酸長、23アミノ酸長、24アミノ酸長、25アミノ酸長、26アミノ酸長、27アミノ酸長もしくは28アミノ酸長、またはこれらの長さのいずれか2つによって定義される範囲にある長さのCD28膜貫通配列またはそのフラグメントを含む。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記CD28膜貫通配列またはそのフラグメントは、28アミノ酸長を含む。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記膜貫通ドメインは、配列番号5(配列番号5;MFWVLVVVGGVLACYSLLVTVAFIIFWV)で表される配列を含む。
「共刺激ドメイン」としても知られている「シグナル伝達ドメイン」は、タンパク質または受容体タンパク質の細胞内ドメインすなわち細胞質ドメインであり、細胞内部と相互作用して、シグナルを中継することにより機能する。細胞の細胞内部分に属するこのようなタンパク質部分は「エンドドメイン(endodomain)」とも称される。上記の相互作用は、エフェクター分子またはエフェクタータンパク質との特異的なタンパク質-タンパク質相互作用またはタンパク質-リガンド相互作用を介した細胞内ドメインによる伝達によって起こりうり、次いでシグナル連鎖に沿ってシグナルをその目的地へと送ることができる。「シグナル伝達ドメイン」あるいは「共刺激ドメイン」は、たとえばTCR/CD3複合体のCD3ζ鎖によって提供される一次シグナルに加えて、たとえば、免疫応答、活性化、増殖、分化、サイトカイン分泌、細胞溶解活性、パーフォリン活性および/またはグランザイム活性などのT細胞応答を媒介するシグナルをT細胞に提供するシグナル伝達部分を指すこともできる。シグナル伝達ドメインあるいは共刺激ドメインは、CD27、CD28、4-1BB、OX40、CD30、CD40、ICOS、リンパ球機能関連抗原-1(LFA-1)、CD2、CD7、LIGHT、NKG2C、および/もしくはB7-H3の分子全体、および/もしくはCD83と特異的に結合するリガンド全体、またはこれらの分子やリガンドの一部を含んでいてもよいが、これらに限定されない。
キメラ抗原受容体を有する遺伝子改変T細胞の製造方法の実施形態のいくつかにおいては、前記キメラ抗原受容体をコードするベクターは、共刺激ドメインをコードする配列をさらに含み、該共刺激ドメインは、別の細胞内メディエーターと相互作用して細胞応答を媒介する細胞内シグナル伝達ドメインであり、該細胞応答としては、免疫応答、活性化、増殖、分化、サイトカイン分泌、細胞溶解活性、パーフォリン活性および/またはグランザイム活性などが挙げられる。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記ベクターは、シグナル伝達ドメインをコードする配列を含む。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記シグナル伝達ドメインは、4-1BBドメインおよび/またはCD3ζドメインを含む。いくつかの実施形態においては、前記4-1BBドメインは、配列番号6(配列番号6;KRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCEL)で表される配列を含む。いくつかの実施形態においては、前記CD3ζドメインは、配列番号7(配列番号7;RVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR)で表される配列を含む。
本明細書に記載の「キメラ抗原受容体」(CAR)は、キメラT細胞受容体としても知られており、人工のT細胞受容体または遺伝子改変受容体を指し、エフェクター免疫細胞に所望の特異性を移植することができる。このような受容体を使用することによって、モノクローナル抗体またはその結合部分の特異性をT細胞に移植することができ、たとえば、レトロウイルスベクターを利用して、CARのコード配列をレシピエント細胞に移入することよって前記移植を達成することができる。CARの構造は、CD3ζ膜貫通ドメインおよび細胞内ドメインに融合された、モノクローナル抗体由来の一本鎖可変フラグメント(scFv)を含んでいてもよい。このような分子は、scFvによる標的の認識に応答してζシグナルの伝達を誘導する。
いくつかの実施形態においては、キメラ抗原受容体を有する遺伝子改変T細胞の製造方法であって、
T細胞の混合集団から、胸腺細胞に由来するT細胞、遺伝子改変された前駆細胞(望ましくはiPS細胞)に由来するT細胞などの、CD8発現T細胞集団および/またはCD4発現T細胞集団を分離、単離または濃縮して、該T細胞が単離、分離または濃縮された集団を作製すること、
前記単離、分離または濃縮されたT細胞集団を刺激して、刺激されたCD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を作製すること、
前記刺激されたCD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を、細胞表面選択マーカーをコードするマーカー配列とキメラ抗原受容体とをコードするベクターで形質導入して、形質導入されたCD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を作製すること、
前記形質導入されたCD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団と、少なくとも1つのサイトカインとを、たとえば少なくとも1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、14日、15日、16日、17日、18日、19日もしくは20日にわたって、またはこれらの時間点のいずれか2つによって定義される時間範囲にある任意の時間にわたって接触させて、サイトカイン刺激性形質導入CD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を作製すること、
前記サイトカイン刺激性形質導入CD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を前記マーカー配列によりコードされる前記マーカーによる選択によって濃縮、分離または単離して、濃縮、分離、または単離されたサイトカイン刺激性形質導入CD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を作製すること、ならびに
前記濃縮、分離または単離されたサイトカイン刺激性形質導入CD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を少なくとも1日、たとえば、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、14日、15日、16日、17日、18日、19日もしくは20日にわたって、またはこれらの時間点のいずれか2つによって定義される時間範囲にある任意の時間にわたって増殖させて、キメラ抗原受容体を有する遺伝子改変T細胞を得ること
を含む方法が提供される。
前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記キメラ抗原受容体はCD19に特異的である。
前記人工T細胞受容体すなわちCARは、「養子細胞移入」と呼ばれる技術を使用して、がんまたはウイルス感染症の治療法として使用できる。T細胞を患者から採取し、がん細胞、ウイルスまたはウイルス感染細胞に提示される分子に特異的な受容体を発現するように該T細胞を改変する。この遺伝子改変T細胞は、がん細胞もしくはウイルス感染細胞を認識してこれらを殺傷する能力またはウイルスの排除を促進できる能力を有し、このようにして作製された遺伝子改変T細胞を前記患者に再度導入する。いくつかの実施形態においては、疾患の治療、抑制または緩和を必要とする対象において該疾患を治療、抑制または緩和する方法が提供される。
いくつかの態様では、前記方法は、少なくとも1つの組成物または組み合わせ製剤を投与することを含むことができ、
該少なくとも1つの組成物または組み合わせ製剤は、遺伝子改変T細胞集団を含み、
該遺伝子改変T細胞集団が、親和性により選択された複数のCD8および/もしくはCD4発現T細胞を含み、CD8および/もしくはCD4発現T細胞を含んでいないか、CD8および/もしくはCD4発現T細胞が含まれないように濃縮されているか、CD8および/もしくはCD4発現T細胞から実質的に分離されているか、またはCD8および/もしくはCD4発現T細胞から実質的に単離されていること、
前記親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4T発現細胞が、刺激されたCD2受容体、CD3受容体、CD4受容体および/またはCD28受容体を有していること、
前記親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4発現T細胞が、キメラ抗原受容体と細胞表面選択マーカーとをコードする遺伝子をさらに含むこと、ならびに
前記親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4発現T細胞が、たとえば少なくとも1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、14日、15日、16日、17日、18日、19日もしくは20日にわたって、またはこれらの時間点のいずれか2つによって定義される時間範囲にある任意の時間にわたって、少なくとも1つのサイトカインで再刺激されていること
を特徴とする。
いくつかの実施形態においては、前記少なくとも1つの組成物または組み合わせ製剤を、養子細胞移入によって前記対象に投与する。
本明細書に記載の「抗体」は、免疫系で機能する形質細胞により産生され、細菌やウイルスなどの外来物を特定しそれを中和する役割を果たす大きなY字型タンパク質を指す。抗体タンパク質は4つのポリペプチド鎖、すなわち、ジスルフィド結合により連結された同一の重鎖2本と同一の軽鎖2本とを含むことができる。それぞれの重鎖および軽鎖は、免疫グロブリンドメインと呼ばれる構造ドメインから構成される。これらのドメインは70~110個のアミノ酸を含むことができ、そのサイズおよび機能に従って様々なカテゴリーに分類される。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは抗体フラグメントであり、望ましくはその結合部分である。いくつかの実施形態においては、CAR上に存在する前記抗体フラグメントまたはその結合部分はCD19に特異的である。
「一本鎖可変フラグメント」、すなわちscFVは、短いリンカーペプチドで連結された免疫グロブリン重鎖可変領域(VH)および軽鎖可変領域(VL)を含む融合タンパク質である。本発明を何ら限定するものではないが、前記リンカーは、フレキシビリティを達成するためグリシンを含んでいてもよく、溶解性を達成するため親水性アミノ酸(たとえばセリンまたはトレオニン)を含んでいてもよい。前記リンカーは、VHのN末端とVLのC末端とを連結することができ、あるいはVHのC末端とVLのN末端とを連結することもできる。いくつかの実施形態において、CAR上に存在するリガンド結合ドメインは、一本鎖可変フラグメント(scFV)である。いくつかの実施形態において、CAR上に存在する前記scFVドメインは、腫瘍細胞上に存在するCD19に特異的である。
「FMC63」は、CD19特異的モノクローナル抗体である。CD19は、白血球の表面上に存在するタンパク質であり、Bリンパ球の抗原受容体と会合して抗原受容体依存性刺激の閾値を低下させることができる。CD19は、濾胞樹状細胞およびB細胞に発現される。CD19は、Bリンパ芽球へと発達する過程において最も初期に見られるB系細胞の段階から見られるが、形質細胞に成熟すると失われる。CD19は、CD21およびCD81と一緒になってB細胞補助受容体として主に作用する。CD19の細胞内尾部は活性化されるとリン酸化され、リン酸化されたCD19にSrcファミリーキナーゼが結合し、PI-3キナーゼが動員される。T細胞の場合と同様に、いくつかのB細胞表面分子が抗原受容体を形成し、Bリンパ球上で複合体を形成する。
CD19の突然変異は、抗体産生の減少を特徴とする重症免疫不全症候群と関連している。たとえば、CD19の発現異常は、急性骨髄性白血病における単球系マーカーである。CD19はB細胞の特徴のひとつであるため、このタンパク質を用いることによって、B細胞から生じるがん、特にB細胞リンパ腫を診断することができる。2011年以来、CD19を標的とする治療について臨床試験が始められている。現在開発中の実験的抗CD19薬のほとんどは、CD19の存在を利用して治療をB細胞がんに特異的に指向させることにより作用する。また、CD19は、MYC腫瘍性タンパク質の濃度を安定化させることによって、B細胞がんの成長の助長に積極的な役割を果たしていることが徐々にわかってきている。したがって、CD19およびその下流のシグナル伝達は、治療標的として有望でありうる。
いくつかの実施形態においては、キメラ抗原受容体を有する遺伝子改変T細胞の製造方法であって、
T細胞の混合集団から、胸腺細胞に由来するT細胞、遺伝子改変された前駆細胞(望ましくはiPS細胞)に由来するT細胞などの、CD8発現T細胞集団および/またはCD4発現T細胞集団を分離、濃縮、単離または精製して、該T細胞が単離、分離、濃縮または精製された集団を作製すること、
前記単離、分離、濃縮または精製されたT細胞集団を刺激して、刺激されたCD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を作製すること、
前記刺激されたCD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を、細胞表面選択マーカーをコードするマーカー配列とキメラ抗原受容体とをコードするベクターで形質導入して、形質導入されたCD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を作製すること、
前記形質導入されたCD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団と、少なくとも1つのサイトカインとを、たとえば少なくとも1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、14日、15日、16日、17日、18日、19日もしくは20日にわたって、またはこれらの時間点のいずれか2つによって定義される時間範囲にある任意の時間にわたって接触させて、サイトカイン刺激性形質導入CD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を作製すること、
前記サイトカイン刺激性形質導入CD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を前記マーカーによる選択によって濃縮して、濃縮されたサイトカイン刺激性形質導入CD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を作製すること、ならびに
前記濃縮されたサイトカイン刺激性形質導入CD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を少なくとも1日、たとえば、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、14日、15日、16日、17日、18日、19日もしくは20日にわたって、またはこれらの時間点のいずれか2つによって定義される時間範囲にある任意の時間にわたって増殖させて、キメラ抗原受容体を有する遺伝子改変T細胞を得ること
を含む方法が提供される。
前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記ベクターは、リーダー配列をコードする第1の配列、リガンド結合ドメインをコードする第2の配列、シグナル伝達ドメインをコードする第3の配列、および選択マーカー配列をコードする第4の配列をさらに含む。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記ベクターは、スペーサーをコードする配列をさらに含む。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記キメラ抗原受容体の前記リガンド結合ドメインは、抗体またはその結合部分を含む。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記キメラ抗原受容体の前記リガンド結合ドメインは、一本鎖可変フラグメント(scFv)またはその結合部分を含む。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記キメラ抗原受容体の前記リガンド結合ドメインは、FMC63またはその結合部分を含む。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記キメラ抗原受容体の前記リガンド結合ドメインは、CD19に特異的である。
本明細書に記載されているT細胞の「精製」とは、治療用T細胞についての研究または治療用T細胞の製造方法に使用するために、高度に精製された機能性T細胞を単離することをいう。本明細書に記載されているT細胞の「単離」またはT細胞の「分離」は、たとえば間接的パニングなどの技術を用いることにより、不均一な細胞集団または他の成分から所望のT細胞、T細胞集団または亜集団を単離または分離する操作をいう。この方法では、プラスチック表面やポリカーボネート表面、ビーズ、粒子、プレートまたはウェルなどの支持体に結合させた抗体に対する細胞の結合能を利用して、細胞を単離、分離または選択することができる。細胞は、特定の細胞表面マーカーに基づいて結合することができる。場合によっては、所望のT細胞集団を「濃縮」するが、これは、濃縮を行った後の所望のT細胞集団の細胞数が、このT細胞が由来する天然集団における細胞数よりも多いことを意味する。
遺伝子改変T細胞の製造方法の実施形態のいくつかにおいて、前記CD8発現T細胞集団および/またはCD4発現T細胞集団は、CD8特異的抗体および/またはCD4特異的抗体を使用することによって、望ましくない成分から単離、濃縮、精製または分離される。前記方法の実施形態のいくつかにおいて、前記CD8発現T細胞集団および/またはCD4発現T細胞集団は、フローサイトメトリーを使用することによって、単離、濃縮または精製される。いくつかの実施形態において、前記CD8発現T細胞集団および/またはCD4発現T細胞集団は、免疫磁気選択を使用することによって、単離、濃縮、精製または分離される。前記方法の実施形態のいくつかにおいて、前記CD8発現T細胞集団および/またはCD4発現T細胞集団は、抗CD45 RA抗体、抗CD45 RO抗体、抗CCR7抗体、抗CD25抗体、抗CD127抗体、抗CD57抗体、抗CD137抗体、抗CD27抗体、抗CD28抗体、抗CD8抗体、抗CD4抗体または抗CD62L抗体を使用することによって、単離、濃縮、精製または分離される。前記方法の実施形態のいくつかにおいて、前記CD8発現T細胞集団および/またはCD4発現T細胞集団は、抗CD27抗体、抗CD28抗体および/または抗CD62L抗体を使用することによって、単離、濃縮、精製または分離される。いくつかの実施形態において、前記方法は、単離、濃縮または分離されたCD4発現T細胞を使用し、該単離、濃縮または精製に使用したT細胞混合集団中に含まれていたCD8発現細胞の非存在下、またはCD8発現細胞よりもCD4発現T細胞が多く存在する条件下で実施される。いくつかの実施形態において、前記方法は、単離、濃縮または分離されたCD8発現T細胞を使用し、該単離、濃縮または精製に使用したT細胞混合集団中に含まれていたCD4発現細胞の非存在下、またはCD4発現細胞よりもCD8発現T細胞が多く存在する条件下で実施される。
T細胞の「刺激」すなわち「活性化」は、該T細胞の生存能および免疫機能を維持したまま、シグナル伝達応答(たとえば増殖)などの応答を開始するようにT細胞を誘導する方法を指す。たとえば、TCR/CD3およびCD8に対して同時にシグナルが伝達されると、ヒトT細胞の生理的活性化および増殖が誘起されうる。適切な刺激を与えると、T細胞はインビトロで広範囲に増殖しうる。
いくつかの実施形態においては、キメラ抗原受容体を有する遺伝子改変T細胞の製造方法であって、
T細胞の混合集団から、胸腺細胞に由来するT細胞、遺伝子改変された前駆細胞(望ましくはiPS細胞)に由来するT細胞などの、CD8発現T細胞集団および/またはCD4発現T細胞集団を単離、分離、濃縮または精製して、該T細胞が単離、分離、精製または濃縮された集団を作製すること、
前記単離、分離、精製または濃縮されたT細胞集団を刺激して、刺激されたCD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を作製すること、
前記刺激されたCD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を、細胞表面選択マーカーをコードするマーカー配列とキメラ抗原受容体とをコードするベクターで形質導入して、形質導入されたCD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を作製すること、
前記形質導入されたCD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団と、少なくとも1つのサイトカインとを、たとえば少なくとも1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、14日、15日、16日、17日、18日、19日もしくは20日にわたって、またはこれらの時間点のいずれか2つによって定義される時間範囲にある任意の時間にわたって接触させて、サイトカイン刺激性形質導入CD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を作製すること、
前記サイトカイン刺激性形質導入CD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を前記マーカー配列によりコードされる前記マーカーによる選択によって濃縮、分離または単離して、濃縮されたサイトカイン刺激性形質導入CD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団を作製すること、ならびに
前記濃縮、単離または分離されたサイトカイン刺激性形質導入CD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団を少なくとも1日、たとえば、少なくとも1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、14日、15日、16日、17日、18日、19日もしくは20日にわたって、またはこれらの時間点のいずれか2つによって定義される時間範囲にある任意の時間にわたって増殖させて、キメラ抗原受容体を有する遺伝子改変T細胞を得ること
を含む方法が提供される。
いくつかの実施形態においては、前記刺激は、ビーズまたは粒子などの、抗体を結合させた支持体を使用して行われる。いくつかの実施形態においては、前記刺激は、抗TCR抗体、抗CD2抗体、抗CD3抗体、抗CD4抗体および/または抗CD28抗体を含む、抗体を結合させた支持体を使用して行われる。いくつかの実施形態においては、前記刺激は、抗CD3抗体および/または抗CD28抗体を含む、抗体を結合させた支持体を使用して行われる。いくつかの実施形態においては、前記方法は、ビーズまたは粒子などの、前記抗体を結合させた支持体を除去することをさらに含む。
本明細書において「T細胞」または「Tリンパ球」は、どのような哺乳動物から得られたものであってもよいが、サルやヒトなどの霊長類、イヌ、ネコ、ウマなどの愛玩動物、またはヒツジ、ヤギ、ウシなどの家畜であることが好ましい。いくつかの実施形態において、T細胞はレシピエント対象と同種異系(同種であるが異なるドナーに由来するもの)である。いくつかの実施形態においては、T細胞は自己由来である(ドナーとレシピエントは同じである)。いくつかの実施形態において、T細胞は同質遺伝子型である(ドナーとレシピエントは異なるが、一卵性双生児である)。
本明細書を通して同じ意味で使用される「CD8発現T細胞」または「CD8T細胞」は、TC、細胞傷害性Tリンパ球、CTL、Tキラー細胞、細胞溶解性T細胞またはキラーT細胞としても知られている。本明細書に記載されているように、CD8T細胞は、がん細胞、ウイルス感染細胞、または損傷した細胞を殺傷することができるTリンパ球である。CD8T細胞は、特定の抗原を認識できるT細胞受容体(TCR)を発現する。CD8T細胞は、細胞表面にCD8を発現する。CD8発現T細胞は、数種類のサイトカインを産生する能力を有するが、CD8T細胞により産生されるサイトカインの量は、移植適合性を向上または改善したり、移植適合性に寄与したり、移植適合性を誘導するような濃度ではない。
本明細書を通して同じ意味で使用される「CD4発現T細胞」または「CD4T細胞」は、ヘルパーT細胞としても知られており、免疫系および適応免疫系において重要な役割を果たしている。CD4T細胞は、T細胞サイトカインを放出することにより他の免疫細胞の活性を補助する役割も果たす。CD4T細胞は、免疫応答を補助し、抑制し、または調節する。CD4T細胞は、B細胞抗体のクラススイッチ、細胞傷害性T細胞の活性化および増殖、ならびにマクロファージなどの食細胞の殺菌活性の最大化において不可欠である。CD4発現T細胞は、数種類のサイトカインを産生する能力を有するが、CD4T細胞により産生されるサイトカインの量は、移植適合性を向上または改善したり、移植適合性に寄与したり、移植適合性を誘導するような濃度ではない。
成熟T細胞は、表面タンパク質であるCD4を発現し、CD4T細胞と呼ばれる。CD4T細胞は、一般に、免疫系においてヘルパーT細胞として機能することが運命づけられているものとして扱われる。たとえば、抗原提示細胞がクラスII MHC上で抗原を発現する場合、CD4細胞は細胞間相互作用(たとえばCD40とCD40L)の組み合わせおよびサイトカインを介して抗原提示細胞を補助する。しかしながら、稀に例外があり、たとえば、制御性T細胞、ナチュラルキラー細胞、および細胞傷害性T細胞のサブグループはCD4を発現する。これらのCD4発現T細胞グループは、いずれもヘルパーT細胞とは見なされない。
本明細書に記載の「セントラルメモリー」T細胞(または「TCM」)は、抗原を経験したCTLであり、ナイーブ細胞と比較して、その表面上にCD62LまたはCCR-7、およびCD45ROを発現するが、CD45RAを発現していないか、CD45RAの発現が低下しているCTLを指す。いくつかの実施形態において、セントラルメモリー細胞は、ナイーブ細胞と比較して、CD62L、CCR7、CD28、CD127、CD45RO、および/もしくはCD95の発現が陽性であり、かつCD54RAの発現が低下している。
本明細書に記載の「エフェクターメモリー」T細胞(または「TEM」)は、抗原を経験したT細胞であり、セントラルメモリー細胞と比較して、その表面上にCD62Lを発現していないか、CD62Lの発現が低下しており、ナイーブ細胞と比較して、CD45RAを発現していないか、CD45RAの発現が低下しているT細胞を指す。いくつかの実施形態において、エフェクターメモリー細胞は、ナイーブ細胞またはセントラルメモリー細胞と比較して、CD62Lおよび/またはCCR7の発現が陰性であり、CD28および/またはCD45RAの発現が陽性であっても陰性であってもよい。
本明細書に記載の「ナイーブ」T細胞は、抗原を経験していないTリンパ球であり、セントラルメモリー細胞またはエフェクターメモリー細胞と比較して、CD62Lおよび/もしくはCD45RAを発現しており、かつ/またはCD45ROを発現していないTリンパ球を指す。いくつかの実施形態において、ナイーブCD8Tリンパ球は、ナイーブT細胞の表現型マーカーの発現によって特徴付けられ、ナイーブT細胞の表現型マーカーとしては、CD62L、CCR7、CD28、CD127、および/またはCD45RAが挙げられる。
本明細書に記載の「エフェクター」T細胞または「T」T細胞は、抗原を経験した細胞傷害性Tリンパ球であり、セントラルメモリー細胞またはナイーブT細胞と比較して、CD62L、CCR7、および/もしくはCD28を発現していないか、またはCD62L、CCR7、および/もしくはCD28の発現が低下しており、かつグランザイムB陽性および/またはパーフォリンに陽性であるTリンパ球を指す。
本明細書に記載の「移植適合性」は、細胞が養子細胞移入により体内(たとえば血流)に入った後に該細胞が成長および増殖する能力を指す。細胞の定着は、通常、移入後2~4週間以内に起こりうる。細胞の定着は、特定の細胞について血中細胞数を定期的に確認することによってモニタリングすることができる。いくつかの実施形態においては、対象おける疾患を治療、抑制または緩和する前記方法であって、本明細書に記載の遺伝子改変T細胞を含む組成物または組み合わせ製剤を投与することを含む方法が提供される。いくつかの実施形態では、前記方法は、キメラ抗原受容体を発現する遺伝子改変T細胞の血球算定、たとえば、移入した前記T細胞に関連するマーカーの存在または不在の同定などによって、前記対象をモニタリングすることをさらに含むことができる。
移植適合性が改善されたT細胞は、T細胞免疫の生成および長期維持を可能にする特定の細胞表面マーカーを有しうる。T細胞の活性化および生存に関与するタンパク質がいくつか知られている。CD28は、T細胞上に発現されるタンパク質であり、T細胞の活性化および生存に必要とされる共刺激シグナルを提供する。CD27は、T細胞免疫の生成および長期維持に必要とされる。CD27は、CD70リガンドに結合し、B細胞の活性化および免疫グロブリンの合成の制御において重要な役割を果たしている。CD62Lとしても知られているL-セレクチンは、リンパ球上に見られる細胞接着分子である。L-セレクチンは、リンパ球またはT細胞が高内皮細静脈を通って二次リンパ組織へ入るための「ホーミング受容体」として機能する。内皮細胞上に存在するリガンドは、L-セレクチンを発現するリンパ球に結合し、血液中のリンパ球の交通を減速させることによって、リンパ球の二次リンパ器官への移動を容易とする。前記キメラ抗原受容体を有する遺伝子改変T細胞の製造方法の実施形態のいくつかにおいては、前記T細胞は、少なくとも1つの受容体を含み、該少なくとも1つの受容体は、移植適合性を向上、誘導または改善するか、移植適合性に寄与する。いくつかの実施形態においては、前記少なくとも1つの受容体は、CD45 RA、CD45 RO、CCR7、CD25、CD127、CD57、CD137、CD27、CD28および/またはCD62Lである。いくつかの実施形態においては、前記少なくとも1つの受容体は、CD27、CD28および/またはCD62Lである。本明細書に記載の実施形態のいくつかにおいては、ベクターの形態の遺伝物質を形質導入することによってCD4およびCD8発現T細胞が遺伝子改変され、その結果得られた遺伝子改変CD4およびCD8発現T細胞が、特異的なキメラ抗原受容体を発現することを特徴とする方法が提供される。前記遺伝子改変CD4およびCD8T細胞の実施形態のいくつかにおいては、該遺伝子改変CD4およびCD8T細胞は、移植適合性の向上または増強を目的としてさらに改変される。
本明細書に記載の「サイトカイン」は、細胞のシグナル伝達に重要な小さいタンパク質(5~25kDa)をいう。サイトカインは、細胞により放出され、他の細胞や、時にはサイトカインを放出した細胞自体(たとえばT細胞など)の挙動に影響を及ぼす。サイトカインとしては、たとえば、ケモカイン、インターフェロン、インターロイキン、リンホカインおよび腫瘍壊死因子が挙げられる。サイトカインは様々な細胞によって産生され、このような細胞としては、たとえば、マクロファージ、Bリンパ球、Tリンパ球、およびマスト細胞など免疫細胞、ならびに内皮細胞、線維芽細胞、および様々な間質細胞が挙げられる。
サイトカインは、受容体を介して作用することができる。サイトカインは、液性免疫応答と細胞性免疫応答との間のバランスを調節することができ、さらに特定の細胞集団の成熟、増殖、および応答性を調節することができるため、免疫系において重要である。サイトカインの中には、複雑な方法で他のサイトカインの作用を増強または抑制するものもある。サイトカインとしては、たとえば、アシル化刺激タンパク質、アディポカイン、アルブインターフェロン、CCL1、CCL11、CCL12、CCL13、CCL14、CCL15、CCL16、CCL17、CCL18、CCL19、CCL2、CCL20、CCL21、CCL22、CCL23、CCL24、CCL25、CCL26、CCL27、CCL28、CCL3、CCL5、CCL6、CCL7、CCL8、CCL9、ケモカイン、コロニー刺激因子、CX3CL1、CX3CR1、CXCL1、CXCL10、CXCL11、CXCL13、CXCL14、CXCL15、CXCL16、CXCL17、CXCL2、CXCL3、CXCL5、CXCL6、CXCL7、CXCL9、エリスロポエチン、Gc-MAF、顆粒球コロニー刺激因子、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子、肝細胞増殖因子、サイトカインIL-10ファミリー、サイトカインIL-17ファミリー、IL1A、IL1B、インフラマソーム、Interferome、インターフェロン、インターフェロンβ1a、インターフェロンβ1b、インターフェロンγ、I型インターフェロン、II型インターフェロン、III型インターフェロン、インターロイキン、インターロイキン1ファミリー、インターロイキン1受容体アンタゴニスト、インターロイキン10、インターロイキン12、インターロイキン12サブユニットβ、インターロイキン13、インターロイキン15、インターロイキン16、インターロイキン2、インターロイキン23、インターロイキン23サブユニットα、インターロイキン34、インターロイキン35、インターロイキン6、インターロイキン7、インターロイキン8、インターロイキン36、白血病抑制因子、白血球促進因子、リンホカイン、リンフォトキシン、リンフォトキシンα、リンフォトキシンβ、マクロファージコロニー刺激因子、マクロファージ炎症タンパク質、マクロファージ活性化因子、モノカイン、マイオカイン、マイオネクチン(Myonectin)、ニコチンアミドホスホリボシルトランスフェラーゼ、オンコスタチンM、オプレルベキン、血小板第4因子、炎症性サイトカイン、プロメガポエチン、RANKL、間質細胞由来因子1、タリモジーン・ラハーパレプベック、腫瘍壊死因子α、腫瘍壊死因子、XCL1、XCL2、GM-CSF、および/またはXCR1を挙げることができるが、これらに限定されない。前記遺伝子改変T細胞の製造方法の実施形態のいくつかにおいては、形質導入されたCD8発現T細胞および/またはCD4発現T細胞の集団と、少なくとも1つのサイトカインとを接触させて、サイトカイン刺激性形質導入CD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団を作製する。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、使用される前記少なくとも1つのサイトカインは、GM-CSF、IL-7、IL-12、IL-15、IL-18、IL-2および/またはIL-21を含む。いくつかの実施形態において、サイトカインとの接触時間は、少なくとも1日、たとえば、少なくとも1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、14日、15日、16日、17日、18日、19日もしくは20日、またはこれらの時間点のいずれか2つによって定義される時間範囲にある任意の時間である。
本明細書に記載の「インターロイキン」すなわちILは、免疫系が大きく依存しているサイトカインである。本発明において使用することができるインターロイキンとしては、たとえば、IL-1、IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-7、IL-8/CXCL8、IL-9、IL-10、IL-11、IL-12、IL-13、IL-14、IL-15、IL-16、IL-17、IL-18、IL-19、IL-20、IL-21、IL-22、IL-23、IL-24、IL-25、IL-26、IL-27、IL-28、IL-29、IL-30、IL-31、IL-32、IL-33、IL-34、IL-35、および/またはIL-36が挙げられる。T細胞をインターロイキンと接触させることによって、細胞の移植適合性を向上、補助、誘導、または改善する効果が得られることがある。IL-1は、たとえばT細胞の成熟および増殖において機能することができる。IL-2は、たとえばT細胞応答の増大および分化を刺激することができる。IL-3は、たとえば骨髄性前駆細胞の分化および増殖を促進することができる。IL-4は、たとえば増殖および分化を促進することができる。IL-7は、たとえばB細胞、T細胞、およびNK細胞の生存、発達、およびホメオスタシスに関与するリンパ球前駆細胞の分化および増殖を促進することができる。IL-15は、たとえばナチュラルキラー細胞の産生を誘導することができる。IL-21は、たとえばCD8T細胞の活性化および増殖を補助刺激し、NK細胞傷害性を増大させ、CD40媒介性のB細胞増殖、分化およびアイソタイプスイッチングを増強し、かつTh17細胞の分化を促進する。
いくつかの実施形態においては、遺伝子改変T細胞の製造方法であって、
T細胞の混合集団から、胸腺細胞に由来するT細胞、遺伝子改変された前駆細胞(望ましくはiPS細胞)に由来するT細胞などの、CD8T細胞集団および/またはCD4T細胞集団を精製、分離、濃縮または単離して、該T細胞が単離、分離、濃縮または精製された集団を作製すること、
前記単離、分離、濃縮または精製されたT細胞集団を刺激して、刺激されたCD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団を作製すること、
前記刺激されたCD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団を、細胞表面選択マーカーをコードするマーカー配列とキメラ抗原受容体とをコードするベクターで形質導入して、形質導入されたCD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団を作製すること、
形質導入されたCD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団と、少なくとも1つのサイトカインとを接触させて、サイトカイン刺激性形質導入CD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団を作製すること、
前記サイトカイン刺激性形質導入CD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団を前記マーカー配列によりコードされる前記マーカーによる選択によって濃縮、単離または分離して、濃縮、単離または分離されたサイトカイン刺激性形質導入CD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団を作製すること、ならびに
前記濃縮、単離または分離されたサイトカイン刺激性形質導入CD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団を少なくとも1日、たとえば、少なくとも1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、14日、15日、16日、17日、18日、19日もしくは20日にわたって、またはこれらの時間点のいずれか2つによって定義される時間範囲にある任意の時間にわたって増殖させて、キメラ抗原受容体を有する遺伝子改変T細胞を得ること
を含む方法が提供される。
いくつかの実施形態においては、前記少なくとも1つのサイトカインは、GM-CSF、IL-7、IL-12、IL-18、IL-15、IL-2および/またはIL-21を含む。いくつか実施形態では、前記少なくとも1つのサイトカインはIL-7、IL-15および/またはIL-21を含む。いくつかの実施形態では、前記少なくとも1つのサイトカインはIL-2、IL-15および/またはIL-21を含む。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記サイトカインとの接触を、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、14日、15日、16日、17日、18日、19日もしくは20日にわたって、またはこれらの時間点のいずれか2つによって定義される範囲にある期間にわたって行う。いくつかの実施形態では、前記少なくとも1つのサイトカインを添加することによって、移植適合性が向上、増強、促進または誘導される。いくつかの実施形態においては、前記濃縮されたCD4発現T細胞を、5ng/mLの組換えヒトIL-7(rhIL-7)および/または0.5ng/mLの組換えヒトIL-15(rhIL-15)と接触させることによって、たとえば該細胞を増殖させる。いくつかの実施形態においては、前記濃縮されたCD8発現T細胞を、50U/mLの組換えヒトIL-2(rhIL-2)および/または0.5ng/mLの組換えヒトIL-15(rhIL-15)と接触させることによって、たとえば該細胞を増殖させる。さらなる実施形態では、0.1ng/mL、0.2ng/mL、0.3ng/mL、0.4ng/mL、0.5ng/mL、0.6ng/mL、0.7ng/mL、0.8ng/mL、0.9ng/mLもしくは1.0ng/mLのrhIL-7、もしくはこれらの量のいずれか2つによって定義される範囲にある量のrhIL-7および/または0.1ng/mL、0.2ng/mL、0.3ng/mL、0.4ng/mL、0.5ng/mL、0.6ng/mL、0.7ng/mL、0.8ng/mL、0.9ng/mLもしくは1.0ng/mLのrhIL-15、もしくはこれらの量のいずれか2つによって定義される範囲にある量のrhIL-15と、前記濃縮されたCD4発現T細胞とを接触させることによって、たとえば該細胞を増殖させる。さらなる実施形態では、10U/mL、20U/mL、30U/mL、40U/mL、50U/mL、60U/mL、70U/mL、80U/mL、90U/mLもしくは100U/mLのrhIL-2、もしくはこれらの量のいずれか2つによって定義される範囲にある量のrhIL-2、および/または0.1ng/mL、0.2ng/mL、0.3ng/mL、0.4ng/mL、0.5ng/mL、0.6ng/mL、0.7ng/mL、0.8ng/mL、0.9ng/mLもしくは1.0ng/mLのrhIL-7、および/または0.1ng/mL、0.2ng/mL、0.3ng/mL、0.4ng/mL、0.5ng/mL、0.6ng/mL、0.7ng/mL、0.8ng/mL、0.9ng/mLもしくは1.0ng/mLのrhIL-15、もしくはこれらの量のいずれか2つによって定義される範囲にある量のrhIL-15と、前記濃縮されたCD8発現T細胞とを接触させることによって、たとえば該細胞を増殖させる。いくつかの実施形態においては、前記複数のサイトカインは、前記の量でT細胞に共投与されるが、たとえば、混合物として、または短時間にそれぞれを順次添加することによってT細胞に共投与される。あるいは、別の実施形態では、前記複数のサイトカインを別個にT細胞と接触させるが、たとえば、1~10分間または1~10時間の間隔を空けて別個にT細胞と接触させる。
本明細書において、混合物中の特定の細胞種の量について述べる際に使用される「濃縮された」および「除去された」という用語は、細胞の混合物中において「濃縮された」細胞種の数を増加させる方法もしくは工程で細胞混合物を処理すること、または細胞の混合物中の「除去された」細胞の数を低減させる方法もしくは工程で細胞混合物を処理することを指す。したがって、濃縮工程に付された細胞の由来に応じて、混合物または組成物において、「濃縮された」細胞は(細胞数で)全体の60%、70%、80%、90%、95%もしくは99%以上を占めていてもよく、またはこれらの値のいずれか2つによって定義される範囲にある任意の値であってもよく、かつ「除去された」細胞は(細胞数で)全体の40%、30%、20%、10%、5%もしくは1%以下を占めていてもよく、またはこれらの値のいずれか2つによって定義される範囲にある任意の値であってもよい。前記遺伝子改変T細胞の製造方法の実施形態のいくつかにおいては、親和性により細胞表面マーカーを選択することによって、サイトカイン刺激性形質導入CD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団を濃縮することも可能であり、この結果、濃縮されたサイトカイン刺激性形質導入CD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団を作製することができる。
「細胞を増殖させること」すなわち「増殖」は、細胞を増殖、増加、成長および繁殖させる工程を指す。たとえば、CD8T細胞およびCD4T細胞の培養は、通常、Tリンパ球の成長および増殖に適した条件下でインキュベートすることによって行うことができる。前記キメラ抗原受容体を有する遺伝子改変T細胞の製造方法の実施形態のいくつかにおいては、前記CD4発現T細胞を少なくとも1日増殖させ、20日間増殖させてもよく、たとえば、1日、2日間、3日間、4日間、5日間、6日間、7日間、8日間、9日間、10日間、11日間、12日間、13日間、14日間、15日間、16日間、17日間、18日間、19日間もしくは20日間にわたって、またはこれらの期間のいずれか2つによって定義される範囲にある期間にわたって増殖させる。前記キメラ抗原受容体を有する遺伝子改変T細胞の製造方法の実施形態のいくつかにおいては、前記CD8発現T細胞を少なくとも1日増殖させ、20日間増殖させてもよく、たとえば、1日、2日間、3日間、4日間、5日間、6日間、7日間、8日間、9日間、10日間、11日間、12日間、13日間、14日間、15日間、16日間、17日間、18日間、19日間もしくは20日間にわたって、またはこれらの期間のいずれか2つによって定義される範囲にある期間にわたって増殖させる。
本明細書に記載の「親和性による選択」は、特異的な分子または目的の細胞の選択を可能とする結合親和性薬物と、特異的な分子もしくは選択可能な細胞表面マーカー、またはこれらの分子やマーカー上に存在するエピトープとを結合させることによって、該特異的な分子または該細胞表面マーカーを有する細胞を選択することを指す。親和性による選択は、たとえば抗体、標識抗体、レクチン、アプタマーおよび/またはペプチドによって行うことができる。前記遺伝子改変T細胞の製造方法の実施形態のいくつかにおいては、T細胞の混合集団からの前記CD8T細胞集団および/またはCD4T細胞集団の前記分離は、CD8および/またはCD4上に存在するエピトープを有するT細胞を親和性により選択することによって行う。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、抗CD8抗体もしくは抗CD4抗体またはその結合部分を使用して、目的の細胞を選択する。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、T細胞の混合集団からの前記CD8T細胞集団および/またはCD4T細胞集団の前記分離は、フローサイトメトリーによって行う。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、T細胞の混合集団からの前記CD8T細胞集団および/またはCD4T細胞集団の前記分離は、免疫磁気選択によって行う。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記抗CD8抗体または抗CD4抗体は、たとえば不活性ビーズまたは不活性粒子などの固相支持体に結合される。
本明細書に記載の「T細胞前駆細胞」は、胸腺へと遊走して、T細胞前駆細胞となり得るリンパ球前駆細胞を指し、T細胞前駆細胞はT細胞受容体を発現しない。すべてのT細胞は、骨髄中の造血幹細胞に由来する。造血幹細胞由来の造血前駆細胞(リンパ球系前駆細胞)は胸腺に移行し、細胞分裂により増殖し、未熟な胸腺細胞の大集団を作り出す。最も初期の胸腺細胞はCD4もCD8も発現せず、したがって、ダブルネガティブ(CD4CD8)細胞に分類される。これらは成長により発達し、ダブルポジティブ胸腺細胞(CD4CD8)となり、最終的にシングルポジティブ(CD4CD8またはCD4CD8)胸腺細胞に成熟して、その後、胸腺から末梢組織に放出される。胸腺細胞の約98%は、胸腺での発達過程においてポジティブ選択およびネガティブ選択により選抜されずに死滅し、残りの2%が生存して胸腺を去り、成熟した免疫担当T細胞になる。
T細胞前駆細胞は、ダブルネガティブ(DN)段階においては主に機能的β鎖を産生し、ダブルポジティブ(DP)段階では主に機能的α鎖を産生し、その結果、最終的に機能性αβ T細胞受容体を産生する。4つのDN段階(DN1、DN2、DN3およびDN4)を経て胸腺細胞が発達するに従って、T細胞はインバリアントα鎖を発現するが、β鎖の遺伝子は再編成される。再編成されたβ鎖がインバリアントα鎖と対を為すことに成功した場合、β鎖の再編成を止めるシグナルが産生され(さらに、もう一方のアレルが抑制され)、細胞の増殖が起こる。これらのシグナルが産生されるには、この前駆TCRが細胞表面上に発現されていなければならないが、これらのシグナル自体は前駆TCRに結合するリガンドに依存する。このように発達した胸腺細胞はその後、CD4およびCD8の両方を発現し、α鎖が選択されるダブルポジティブ(DP)段階を経る。再編成β鎖がシグナル伝達を全くもたらさない場合(たとえば、インバリアントα鎖との対合ができなかった結果)、この細胞は無視され(シグナル伝達を受けることなく)、死滅すると考えられている。
本明細書に記載の「造血幹細胞」または「HSC」は、骨髄系細胞に分化しうる前駆細胞であり、該骨髄系細胞としては、たとえば、マクロファージ、単球、マクロファージ、好中球、好塩基球、好酸球、赤血球、巨核球/血小板、樹状細胞およびリンパ系細胞(たとえば、T細胞、B細胞、NK細胞など)が挙げられる。HSCは3種の幹細胞が存在する異種細胞集団であり、これらの幹細胞は血液中のリンパ系子孫細胞と骨髄系子孫細胞との比(L/M)により識別される。
「凍結保存」は、損傷を受けやすい細胞、組織全体、または物質を零下温度に冷却することにより保存する方法である。目的の細胞、組織、または物質に損傷を与えうる酵素的活性または化学的活性はどのようなものでも低温で効果的に阻止される。凍結保存方法は、凍結過程での氷の形成によるさらなる損傷を起こすことなく低温に到達させるための方法である。慣用の凍結保存では、凍結する材料を凍害防御剤と呼ばれる特定の分子でコーティングすることによって行われてきた。凍害防御剤の多くは固有の毒性があるため、新たな方法が絶えず研究されている。凍結保存方法は当業者には公知である。キメラ抗原受容体を有する遺伝子改変T細胞の製造方法の実施形態のいくつかにおいては、該方法は、遺伝子改変T細胞を凍結保存することをさらに含んでもよい。
いくつかの実施形態では、遺伝子改変T細胞集団であって、
たとえば、胸腺細胞や遺伝子改変された前駆細胞(望ましくはiPS細胞)などに由来し、親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4発現T細胞を含み、CD8T細胞およびCD4発現T細胞を含んでいないか、CD8T細胞およびCD4発現T細胞よりも前記CD8および/またはCD4発現T細胞が多く含まれるように濃縮されているか、またはCD8T細胞およびCD4発現T細胞から単離されていること、
前記親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4T細胞が、刺激されたCD2受容体、CD3受容体、CD4受容体および/またはCD28受容体を有していること、
前記親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4T細胞が、キメラ抗原受容体と細胞表面選択マーカーとをコードする遺伝子をさらに含むこと、ならびに
前記親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4発現T細胞が、たとえば少なくとも1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、14日、15日、16日、17日、18日、19日もしくは20日にわたって、またはこれらの時間点のいずれか2つによって定義される時間範囲にある任意の時間にわたって、少なくとも1つのサイトカインで再刺激されていること
を特徴とする遺伝子改変T細胞集団が提供される。
いくつかの実施形態においては、前記選択されたCD8および/またはCD4T細胞は、本発明により提供される方法によって製造される。いくつかの実施形態においては、前記少なくとも1つのサイトカインは、GM-CSF、IL-7、IL-12、IL-15、IL-18、IL-2および/またはIL-21を含む。いくつか実施形態では、前記少なくとも1つのサイトカインはIL-7、IL-15および/またはIL-21を含む。いくつかの実施形態では、前記少なくとも1つのサイトカインはIL-2、IL-15および/またはIL-21を含む。前記遺伝子改変T細胞集団の実施形態のいくつかにおいては、前記親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4T細胞は、少なくとも1つの受容体をさらに含み、該少なくとも1つの受容体は、移植適合性を向上、誘導または増強するか、移植適合性に寄与する。いくつかの実施形態においては、移植適合性を向上、増強または誘導するか、移植適合性に寄与する前記少なくとも1つの受容体は、CD45 RA、CD45 RO、CCR7、CD25、CD127、CD57、CD137、CD27、CD28および/またはCD62Lである。いくつかの実施形態においては、移植適合性を向上、増強または誘導するか、移植適合性に寄与する前記少なくとも1つの受容体は、CD27、CD28および/またはCD62Lである。いくつかの実施形態においては、前記親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4発現T細胞は、リーダー配列をコードする第1の配列、リガンド結合ドメインをコードする第2の配列、シグナル伝達ドメインをコードする第3の配列および選択マーカーをコードする第4の配列を有するベクターをさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記ベクターは、スペーサーをコードする配列をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーはIgG4のヒンジ領域を含む。いくつかの実施形態においては、前記ベクターはウイルスベクターである。いくつかの実施形態においては、前記ウイルスベクターは、シミアンウイルス40、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス(AAV)、レンチウイルスまたはレトロウイルスに由来する。いくつかの実施形態においては、前記ウイルスベクターは、組換えアデノウイルスベクター、組換えアデノ随伴ウイルスベクター、組換えレンチウイルスベクターまたは組換えレトロウイルスベクターである。いくつかの実施形態においては、前記ウイルスベクターは、レンチウイルスベクターである。いくつかの実施形態においては、前記細胞表面選択マーカーは、末端切断型上皮成長因子受容体(EGFRt)をコードする。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは、抗体またはその結合部分を含む。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは、一本鎖可変フラグメント(scFv)またはその結合部分を含む。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは、FMC63またはその結合部分を含む。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは、CD19に特異的である。いくつかの実施形態においては、前記集団は、単離または濃縮されたCD8発現T細胞を含み、CD4T細胞を含んでいないか、CD4T細胞よりも該CD8T細胞が多く含まれるように濃縮されているか、CD4T細胞が実質的に除去されている。いくつかの実施形態においては、前記集団は、単離または濃縮されたCD4T細胞を含み、CD8T細胞を含んでいないか、CD8T細胞よりも該CD4T細胞が多く含まれるように濃縮されているか、CD8T細胞が実質的に除去されている。
いくつかの実施形態では、養子細胞免疫療法組成物は疾患またはがんの治療に有用である。いくつかの実施形態においては、ヒトを治療するための組成物または組み合わせ製剤であって、本明細書に記載に従って製造または入手されるT細胞または遺伝子改変T細胞集団に関する実施形態のいずれか1つまたは複数に記載の、少なくとも1つの遺伝子改変T細胞集団と医薬品添加剤とを含む組成物または組み合わせ製剤が提供される。ヒトを治療するための前記組成物または組み合わせ製剤の実施形態のいくつかにおいては、該組成物または組み合わせ製剤は、胸腺細胞に由来するT細胞、遺伝子改変された前駆細胞(望ましくはiPS細胞)に由来するT細胞などの、遺伝子改変T細胞集団を含み、該集団は、単離されたCD8T細胞を含み、CD4T細胞を含んでいないか、CD4T細胞よりも該CD8T細胞が多く含まれるように濃縮されているか、CD4T細胞が実質的に除去されている。ヒトを治療するための前記組成物または組み合わせ製剤の実施形態のいくつかにおいては、該組成物または組み合わせ製剤は、胸腺細胞に由来するT細胞、遺伝子改変された前駆細胞(望ましくはiPS細胞)に由来するT細胞などの、遺伝子改変T細胞集団を含み、該集団は、単離されたCD4T細胞を含み、CD8T細胞を含んでいないか、CD8T細胞よりも該CD4T細胞が多く含まれるように濃縮されているか、CD8T細胞が実質的に除去されている。ヒトを治療するための前記組成物または組み合わせ製剤の実施形態のいくつかにおいては、該組成物または組み合わせ製剤は、単離されたCD8T細胞と単離されたCD4T細胞とを1:1の比率で含み、前記単離されたCD8T細胞は、CD4T細胞を含んでいないか、CD4T細胞よりも該CD8T細胞が多く含まれるように濃縮されているか、またはCD4T細胞が実質的に除去されており、前記単離されたCD4T細胞は、CD8T細胞を含んでいないか、CD8T細胞よりも該CD4T細胞が多く含まれるように濃縮されているか、CD8T細胞が実質的に除去されている。いくつかの実施形態においては、前記遺伝子改変CD4T細胞集団と前記遺伝子改変CD8T細胞集団は、1:1、1:2、1:3、1:4、1:5、1:6、1:7、1:8、1:9もしくは1:10またはこれらの比率のいずれか2つによって定義される範囲にある比率で混合されて、これらの投与を必要とする対象に投与されるか、あるいは別々の製剤としてこれらの比率のいずれかで該対照に共投与される。いくつかの実施形態においては、前記遺伝子改変CD8T細胞集団と前記遺伝子改変CD4T細胞集団は、1:1、1:2、1:3、1:4、1:5、1:6、1:7、1:8、1:9もしくは1:10またはこれらの比率のいずれか2つによって定義される範囲にある比率で混合されて、これらの投与を必要とする対象に投与されるか、あるいは別々の製剤としてこれらの比率のいずれかで該対照に共投与される。
本明細書に記載の「医薬品添加剤」または医薬品ビヒクルは、溶媒として使用される担体または不活性媒質を意味することができ、この溶媒中において治療用有効成分すなわちT細胞を製剤化し、かつ/または投与する。ビヒクルとしては、ポリマーミセル、リポソーム、リポタンパク質ベースの担体、ナノ粒子担体、デンドリマー、および/または当業者に公知の他のT細胞用ビヒクルを挙げることができる。理想的なビヒクルまたは添加剤としては、非毒性、生体適合性、非免疫原性かつ生物分解性のものが挙げられ、宿主の防御機構による認識を回避することができるものが挙げられる。
いくつかの実施形態においては、ヒトを治療するための組成物または組み合わせ製剤であって、本発明の実施形態のいずれかに記載の少なくとも1つの遺伝子改変T細胞集団と医薬品添加剤とを含む組成物または組み合わせ製剤が提供される。いくつかの実施形態では、前記添加剤は医薬品ビヒクルである。いくつかの実施形態では、前記医薬品ビヒクル中に医薬組成物を含む。
急性リンパ芽球性白血病(ALL)、すなわち急性リンパ性白血病は、リンパ芽球としても知られるがん性の未成熟白血球の過剰産生を特徴とする白血球のがんである。ALL患者では、リンパ芽球が骨髄で過剰産生されて継続的に増加し、その結果、骨髄における赤血球、白血球、血小板などの正常細胞の産生が阻害され、さらに、リンパ芽球が他の臓器に拡散することによって、損傷が起こり死に至る。ALLは、小児期に最も多く見られ、発症率のピークは2~5歳と高齢期である。
ALLの症状は機能性血液細胞の産生の低減を示すが、これは、通常であれば新しい機能性血液細胞を産生するのに使用される骨髄の供給源がALLによって消耗するためである。症状としては、発熱、感染症のリスク増大、出血傾向の増加、貧血、頻脈、疲労、および頭痛が挙げられる。初回治療後に疾患が完全に寛解したが、その後に再発した小児の50~70%および成人の40~50%は、2回目の完全寛解に至ることができる。初回寛解後の再発に対する治療としては、標準的化学療法もしくは実験的薬物の使用が挙げられ、さらに積極的な治療としては幹細胞移植などが挙げられる。初回寛解後の再発に対する治療としては、標準的化学療法もしくは実験的薬物の使用が挙げられ、さらに積極的な治療としては幹細胞移植などが挙げられる。しかしながら、急性骨髄性白血病やALLなどの白血病では、同種造血幹細胞移植(HSCT)ではなく自家移植を使用することによって死亡率を低減させることよりも、がん再発の可能性の増大および治療関連死亡率の上昇の方が懸念されることがあるため、同種異系移植による治療の方が急性骨髄性白血病やALLなどの白血病では好ましい場合がある。したがって、白血病、骨髄性白血病、およびALLの治療のために細胞を改善する方法が必要とされている。
いくつかの実施形態においては、がん(たとえばALL)などの疾患の治療、抑制または緩和を必要とする対象において、該疾患を治療、抑制または緩和する方法であって、
本発明の実施形態のいずれか1つまたは複数に記載の少なくとも1つの組成物または組み合わせ製剤を前記対象に投与することを含み、
前記組成物または組み合わせ製剤が、キメラ抗原受容体を有する遺伝子改変のT細胞を含むこと、
該T細胞が、サイトカイン刺激性形質導入CD8T細胞および/またはCD4T細胞であること
を特徴とする方法が提供される。
前記方法の実施形態のいくつかでは、前記方法は、組成物または組み合わせ製剤を投与することを含み、該組成物または組み合わせ製剤は、遺伝子改変T細胞集団を含み、該遺伝子改変T細胞集団は、単離されたCD8T細胞を含み、CD4T細胞を含んでいないか、CD4T細胞よりも該CD8T細胞が多く含まれるように濃縮されているか、CD4T細胞が実質的に除去されている。前記方法の実施形態のいくつかでは、前記方法は、組成物または組み合わせ製剤を投与することを含み、該組成物または組み合わせ製剤は、遺伝子改変T細胞集団を含み、該遺伝子改変T細胞集団は、単離されたCD4T細胞を含み、CD8T細胞を含んでいないか、CD8T細胞よりも該CD4T細胞が多く含まれるように濃縮されているか、CD8T細胞が実質的に除去されている。いくつかの実施形態では、前記方法は、組成物または組み合わせ製剤を投与することをさらに含み、該組成物または組み合わせ製剤は、遺伝子改変T細胞集団を含み、該遺伝子改変T細胞集団は、単離されたCD4T細胞を含み、CD8T細胞を含んでいないか、CD8T細胞よりも該CD4T細胞が多く含まれるように濃縮されているか、CD8T細胞が実質的に除去されている。前記方法の実施形態のいくつかでは、前記方法は、組成物または組み合わせ製剤を投与することをさらに含み、該組成物または組み合わせ製剤は、遺伝子改変T細胞集団を含み、該遺伝子改変T細胞集団は、単離されたCD8T細胞を含み、CD4T細胞を含んでいないか、CD4T細胞よりも該CD8T細胞が多く含まれるように濃縮されているか、CD4T細胞が実質的に除去されている。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記方法は、前記組成物または組み合わせ製剤を投与することをさらに含み、該組成物または組み合わせ製剤は、単離されたCD8T細胞と単離されたCD4T細胞とを1:1の比率で含み、前記単離されたCD8T細胞は、CD4T細胞を含んでいないか、CD4T細胞よりも該CD8T細胞が多く含まれるように濃縮されているか、またはCD4T細胞が実質的に除去されており、前記単離されたCD4T細胞は、CD8T細胞を含んでいないか、CD8T細胞よりも該CD4T細胞が多く含まれるように濃縮されているか、CD8T細胞が実質的に除去されている。いくつかの実施形態においては、前記遺伝子改変CD4T細胞集団と前記遺伝子改変CD8T細胞集団は、1:1、1:2、1:3、1:4、1:5、1:6、1:7、1:8、1:9もしくは1:10またはこれらの比率のいずれか2つによって定義される範囲にある比率で混合されて、これらの投与を必要とする対象に投与されるか、あるいは別々の製剤としてこれらの比率のいずれかで該対照に共投与される。いくつかの実施形態においては、前記遺伝子改変CD8T細胞集団と前記遺伝子改変CD4T細胞集団は、1:1、1:2、1:3、1:4、1:5、1:6、1:7、1:8、1:9もしくは1:10またはこれらの比率のいずれか2つによって定義される範囲にある比率で混合されて、これらの投与を必要とする対象に投与されるか、あるいは別々の製剤としてこれらの比率のいずれかで該対照に共投与される。いくつかの実施形態において、前記対象は、抗がん療法を受ける対象として同定または選択されている。いくつかの実施形態において、前記方法は、疾患の抑制を測定または評価することをさらに含む。いくつかの実施形態において、前記方法は、本発明の実施形態のいずれか1つまたは複数に記載の組成物または組み合わせ製剤の投与前、投与中または投与後に、前記対象に別の抗がん療法を提供することをさらに含む。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、本発明の実施形態のいずれか1つまたは複数に記載の組成物または組み合わせ製剤を養子細胞移入によって前記対象に投与する。いくつかの実施形態においては、前記対象を別の形態の抗がん療法で処置した後に、本発明の実施形態のいずれか1つまたは複数に記載の組成物または組み合わせ製剤を該対象に投与する。いくつかの実施形態においては、前記対象を別の形態の抗がん療法で処置した後に、本発明の実施形態のいずれか1つまたは複数に記載の組成物または組み合わせ製剤を該対象に投与する。いくつかの実施形態では、前記対象は白血病患者である。いくつかの実施形態では、前記対象は、再発性かつ/または抵抗性のCD19小児急性リンパ芽球性白血病(ALL)を有する。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記対象は、再発性かつ/または化学療法抵抗性のCD19急性リンパ芽球性白血病(ALL)を有する。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記対象は自己免疫疾患患者である。前記方法の実施形態のいくつかにおいては、前記対象はHSCT後の再発を有する。
さらなる実施形態
ベクター、細胞および細胞の形質導入方法
本明細書に記載の組成物は、胸腺細胞に由来するT細胞、遺伝子改変された前駆細胞(望ましくはiPS細胞)に由来するT細胞などの、CD4および/またはCD8発現Tリンパ球を提供する。Tリンパ球は、公知の技術によって回収することができ、フローサイトメトリーおよび/または免疫磁気選択のような、抗体との親和性結合などの公知の技術によって濃縮または除去することができる。濃縮工程および/または除去工程を行った後、公知の技術によって所望のTリンパ球をインビトロで増殖させることができる(このような公知技術としては、たとえばRiddellらに付与された米国特許第6,040,177号に記載の技術が挙げられるが、これに限定されない(この文献は参照によりその全体が明示的に本明細書に援用される))。いくつかの実施形態では、前記T細胞は自己由来T細胞であり、すなわち、前記T細胞が送達される患者から得られたものである。いくつかの実施形態においては、前記T細胞はT細胞前駆細胞である。いくつかの実施形態においては、前記T細胞前駆細胞は造血幹細胞(HSC)である。
たとえば、所望のT細胞集団またはT細胞亜集団の増殖は、増殖前のTリンパ球集団をインビトロにおいて培地に添加すること、非分裂末梢血単核細胞(PBMC)などのフィーダー細胞を該培地に添加すること(たとえば、添加後の細胞集団が、増殖培養される最初の集団中の各Tリンパ球1個あたり、少なくとも5個、10個、20個、または40個またはそれ以上のPBMCフィーダー細胞を含むような比率で加える)、および該培地を(たとえばT細胞数の増加に十分な時間にわたって)インキュベートすることによって行うことができる。前記非分裂フィーダー細胞は、γ線が照射されたPBMCフィーダー細胞を含んでいてもよい。いくつかの実施形態においては、細胞分裂を防ぐため、3000rad、3200rad、3300rad、3400rad、3500rad、もしくは3600rad、またはこれらの放射線量(rad)のいずれか2つによって定義される範囲にある放射線量(rad)のγ線を前記PBMCに照射する。培地にT細胞またはフィーダー細胞を添加する順序は必要に応じて入れ替えてもよい。Tリンパ球の増殖に適した条件下で培養物をインキュベートすることができる。ヒトTリンパ球を増殖させるための温度としては、たとえば、通常、少なくとも25℃、好ましくは少なくとも30℃、より好ましくは37℃であり、またはこれらの温度のいずれか2つによって定義される範囲にある任意の温度である。
増殖させたTリンパ球としては、ヒト腫瘍または病原体上に存在する抗原に特異的であってもよく、かつキメラ抗原受容体を発現するCD8+細胞傷害性Tリンパ球(CTL)およびCD4+ヘルパーTリンパ球が挙げられる。
一実施形態において、前記増殖方法または増殖は、EBVで形質転換された非分裂リンパ芽球様細胞(LCL)をフィーダー細胞として加えることをさらに含んでもよい。LCLには、6000rad、7000rad、8000rad、9000radもしくは10,000radの範囲のγ線を照射してもよく、またはこれらの放射線量(rad)のいずれか2つにより定義される範囲にある放射線量(rad)のγ線を照射してもよい。前記LCLフィーダー細胞は任意の適切な量で提供することができ、たとえば、LCLフィーダー細胞と増殖開始時のTリンパ球との比は少なくとも10:1であってもよい。
別の一実施形態では、前記増殖方法または増殖は、(たとえば、少なくとも0.5ng/mlの濃度で)抗CD3抗体および/または抗CD28抗体を培地に加えることをさらに含んでもよい。別の一実施形態では、キメラ抗原受容体を有する遺伝子改変T細胞の製造方法は、IL-2、IL-15および/またはIL-21を培地に加えることをさらに含んでもよい(IL-2の濃度は、たとえば、少なくとも10単位/mLである)。別の一実施形態では、キメラ抗原受容体を有する遺伝子改変T細胞の製造方法は、IL-7、IL-15および/またはIL-21を培地に加えることをさらに含んでもよい(IL-2の濃度は、たとえば、少なくとも10単位/mLである)。Tリンパ球を単離し、増殖を行う前または増殖を行った後に、細胞傷害性Tリンパ球およびヘルパーTリンパ球をそれぞれ、ナイーブT細胞亜集団、メモリーT細胞亜集団、およびエフェクターT細胞亜集団にソートすることができる。
CD8細胞は、標準的な方法を用いることによって得ることもできる。いくつかの実施形態において、CD8細胞は、ナイーブCD8細胞、セントラルメモリーCD8細胞、およびエフェクターメモリーCD8細胞それぞれと関連する細胞表面抗原を同定することによって、ナイーブ細胞、セントラルメモリー細胞、およびエフェクターメモリー細胞にさらにソートされる。いくつかの実施形態において、メモリーT細胞は、CD8末梢血リンパ球由来のCD62LサブセットおよびCD62Lサブセットの両方に存在する。PBMCは、抗CD8抗体および抗CD62L抗体で染色した後に、CD62LCD8画分およびCD62LCD8画分にソートされる。いくつかの実施形態において、セントラルメモリーTCMの表現型マーカーの発現は、CD45RO、CD62L、CCR7、CD28、CD3、および/またはCD127を含み、かつ/またはグランザイムBおよび/もしくはCD45RAは陰性であるか、低発現を示す。いくつかの実施形態において、セントラルメモリーT細胞は、CD28、CD27、CD45RO、CD62L、および/またはCD8のT細胞である。いくつかの実施形態において、ナイーブCD8Tリンパ球は、ナイーブT細胞の表現型マーカーの発現によって特徴付けられ、ナイーブT細胞の表現型マーカーとしては、CD62L、CCR7、CD27、CD28、CD3、CD127、および/またはCD45RAが挙げられる。
細胞または細胞集団が特定の細胞表面マーカーについて陽性であるかどうか、または特定の細胞表面マーカーを発現しているかどうかは、該表面マーカーに特異的な抗体およびアイソタイプを一致させたコントロール抗体を使用したフローサイトメトリーによって判定することができる。細胞集団において特定のマーカーが陰性であることは、アイソタイプコントロールと比べて特異的抗体と強く結合する細胞集団が見られないことを指し、これは、前記マーカーの発現が欠如していることを示す。細胞集団において特定のマーカーが陽性であることは、アイソタイプコントロールと比べて特異的抗体と均一に結合する細胞集団が見られることを指し、これは、前記マーカーが発現していることを示す。いくつかの実施形態において、1つ以上のマーカーの発現の減少は、対照の細胞集団と比較して、平均蛍光強度の低下が1 log10であること、および/またはマーカーを発現する細胞のパーセンテージが細胞全体の少なくとも20%に低下すること、細胞全体の少なくとも25%に低下すること、細胞全体の少なくとも30%に低下すること、細胞全体の少なくとも35%に低下すること、細胞全体の少なくとも40%に低下すること、細胞全体の少なくとも45%に低下すること、細胞全体の少なくとも50%に低下すること、細胞全体の少なくとも55%に低下すること、細胞全体の少なくとも60%に低下すること、細胞全体の少なくとも65%に低下すること、細胞全体の少なくとも70%に低下すること、細胞全体の少なくとも75%に低下すること、細胞全体の少なくとも80%に低下すること、細胞全体の少なくとも85%に低下すること、細胞全体の少なくとも90%に低下すること、細胞全体の少なくとも95%に低下すること、もしくは細胞全体の少なくとも100%に低下すること、もしくはこれらの値のいずれか2つによって定義される範囲にある任意のパーセンテージに低下することを指す。いくつかの実施形態において、細胞集団が1つ以上のマーカーについて陽性であることは、対照の細胞集団と比較して、マーカーを発現する細胞のパーセンテージが細胞全体の少なくとも50%であること、細胞全体の少なくとも55%であること、細胞全体の少なくとも60%であること、細胞全体の少なくとも65%であること、細胞全体の少なくとも70%であること、細胞全体の少なくとも75%であること、細胞全体の少なくとも80%であること、細胞全体の少なくとも85%であること、細胞全体の少なくとも90%であること、細胞全体の少なくとも95%であること、もしくは細胞全体の少なくとも100%であること、またはこれらの値のいずれか2つによって定義される範囲にある任意のパーセンテージであることを指す。
CD4ヘルパーT細胞は、細胞表面抗原を有する細胞集団を同定することによって、ナイーブ細胞、セントラルメモリー細胞、およびエフェクター細胞にソートされる。CD4リンパ球は、標準的な方法によって得ることができる。いくつかの実施形態において、ナイーブCD4Tリンパ球は、CD45RO、CD45RA、CD62L、CD27、CD28、および/またはCD4のT細胞である。いくつかの実施形態において、セントラルメモリーCD4細胞は、CD62Lおよび/またはCD45ROである。いくつかの実施形態において、エフェクターCD4細胞は、CD62Lおよび/またはCD45ROである。いくつかの実施形態において、エフェクターCD4細胞はCD28、CD27および/またはCD62Lである。
いくつかの実施形態において、抗原特異的なCD4集団およびCD8集団は、ナイーブTリンパ球または抗原特異的Tリンパ球を抗原で刺激することによって得ることができる。たとえば、サイトメガロウイルス抗原に対して特異的なT細胞株またはT細胞クローンは、サイトメガロウイルス抗原に感染した対象からT細胞を単離し、インビトロにおいてサイトメガロウイルス抗原で該細胞を刺激することによって作製することができる。
ナイーブT細胞を使用することもできる。T細胞応答を誘導するための標的として使用する、腫瘍細胞に由来する抗原の数は特に限定されない。いくつかの実施形態において、本発明の養子細胞免疫療法組成物は、固形腫瘍、血液悪性腫瘍、乳がん、または黒色腫を含む疾患または障害の治療に有用である。
Tリンパ球集団の改変
いくつかの実施形態においては、本発明の開示による免疫療法に使用する前記T細胞に機能性遺伝子を導入することが望ましい場合がある。たとえば、単一の遺伝子または複数の遺伝子をT細胞に導入することによって、体内に移入された該T細胞の生存能および/または機能を向上することができ、それによって治療法の有効性を改善することができる。あるいは、上記単一または複数の遺伝子を導入することによって、遺伝子マーカーを提供することができ、この遺伝子マーカーを利用することによって、インビボにおける生存T細胞および/または移行T細胞の選択および/または評価が可能となる。あるいは、上記単一または複数の遺伝子をT細胞に導入することによって、たとえば、インビボにおいてネガティブセレクションにより除去されるように該T細胞を改変することができ、それによって免疫療法の安全性を改善することができる。この方法は、Lupton S. D. et al., Mol. and Cell Biol., 11:6 (1991); およびRiddell et al., Human Gene Therapy 3:319-338 (1992)に記載されている。さらに、LuptonらによるPCT/US91/08442およびPCT/US94/05601も参照されたいが、これらの文献では、ドミナントポジティブ型の選択マーカーとネガティブ選択マーカーとを融合させた選択可能な二機能性融合遺伝子の使用について述べられている(これらの文献は参照によってその全体が本明細書に明示的に組み込まれる)。このような二機能性融合遺伝子の使用は、公知の技術(たとえば、Riddellらに付与された米国特許第6,040,177号の14~17段落を参照されたい(この文献は参照によってその全体が本明細書に明示的に組み込まれる))、または本明細書の記載を元に当業者によって容易に理解されうる上記技術の変法によって実施することができる。いくつかの実施形態においては、前記T細胞はT細胞前駆細胞である。いくつかの実施形態においては、前記T細胞前駆細胞は、造血幹細胞(HSC)である。
いくつかの実施形態においては、本明細書に記載されているように、T細胞はキメラ受容体で改変される。いくつかの実施形態において、前記T細胞は、処置を受ける対象から得られ、別の実施形態においては、前記リンパ球は同種異系のヒトドナー、好ましくは健常ヒトドナーから得られる。いくつかの実施形態においては、前記T細胞はT細胞前駆細胞である。いくつかの実施形態においては、前記T細胞前駆細胞は造血幹細胞(HSC)である。
いくつかの実施形態において、キメラ受容体は、本明細書に記載されているように、細胞上の表面分子と特異的に結合するリガンド結合ドメイン、ポリペプチドスペーサー領域、膜貫通ドメイン、および細胞内シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態において、前記リガンド結合ドメインは、モノクローナル抗体(mAb)の重鎖可変領域(VH)および軽鎖可変領域(VL)に由来する一本鎖抗体フラグメント(scFv)である。CD28共刺激ドメインおよび/または4-1BB共刺激ドメインをCD3ζ鎖に融合することによって、前記キメラ受容体を介して共刺激シグナルを提供することもできる。キメラ受容体は、HLAとは無関係に細胞表面分子に特異的である。したがって、HLAによる制限や腫瘍細胞におけるHLAの低レベル発現などの、TCRによる認識に関連する制限事項には縛られない。
いくつかの実施形態において、CD4Tリンパ球集団およびCD8Tリンパ球集団のそれぞれに導入されるキメラ受容体は同じでも異なっていてもよい。いくつかの実施形態においては、これらの細胞集団のそれぞれに導入されるキメラ受容体のリガンド結合ドメインは、細胞上の同じリガンドに特異的に結合する。前記細胞シグナル伝達モジュールもそれぞれ異なっていてもよい。いくつかの実施形態においては、前記CD8細胞傷害性T細胞の前記細胞内シグナル伝達ドメインは、前記CD4ヘルパーT細胞の前記細胞内シグナル伝達ドメインと同一のものである。別の実施形態では、前記CD8細胞傷害性T細胞の前記細胞内シグナル伝達ドメインは、前記CD4ヘルパーT細胞の前記細胞内シグナル伝達ドメインと異なるものである。いくつかの実施形態においては、抗CD19 CARを1つのリンパ球集団に導入し、EGFR特異的CARを別のリンパ球集団に導入する。
いくつかの実施形態において、CD4Tリンパ球またはCD8 Tリンパ球はそれぞれ、本明細書に記載の形質導入の前に、ナイーブ細胞、セントラルメモリー細胞、エフェクターメモリー細胞またはエフェクター細胞にソートする。いくつかの実施形態において、CD4Tリンパ球またはCD8 Tリンパ球はそれぞれ、形質導入を行った後に、ナイーブ細胞、セントラルメモリー細胞、エフェクターメモリー細胞またはエフェクター細胞にソートする。
遺伝子送達のための組換え感染性ウイルス粒子を利用した様々な形質導入技術が開発されてきた。このような形質導入技術は、本明細書に記載のTリンパ球を形質導入するためのアプローチとして現時点では好ましい。この形質導入技術に通常使用されるウイルスベクターとしては、シミアンウイルス40、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス(AAV)、レンチウイルスベクター、およびレトロウイルスに由来するウイルスベクターが挙げられる。このように、遺伝子導入方法および発現方法としては様々なものが存在するが、このような方法は、哺乳類細胞に遺伝物質を導入して発現させることを本質的な機能とする。前記形質導入技術のいくつかは、造血細胞またはリンパ球に形質導入することを目的として使用され、このような形質導入技術としては、リン酸カルシウムトランスフェクション、プロトプラスト融合、エレクトロポレーション、組換えアデノウイルスによる感染、アデノ随伴ウイルスによる感染、およびレトロウイルスベクターによる感染が挙げられる。
初代Tリンパ球の形質導入は、エレクトロポレーションおよびレトロウイルスまたはレンチウイルスの感染によって成功を収めている。
レトロウイルスベクターおよびレンチウイルスベクターを使用することによって、真核細胞への遺伝子導入を非常に効率的に行うことができる。さらに、レトロウイルスまたはレンチウイルスの組み込みは制御下で行うことができ、細胞1個あたり1コピーまたは数コピーの新しい遺伝情報を安定して組み込むことができる。
いくつかの実施形態においては、ネガティブ選択可能な表現型を有する細胞のインビトロでの選択を可能にするポジティブマーカーをT細胞に導入すると有用である場合がある。このポジティブ選択可能なマーカーは、導入された宿主細胞において、該遺伝子を持つ細胞のポジティブ選択を可能にする表現型を優位に発現する遺伝子であってもよい。このような遺伝子は当技術分野において公知であり、具体的には、ハイグロマイシンBに対する耐性を与えるハイグロマイシンBホスホトランスフェラーゼ遺伝子(hph)、抗生物質であるG418に対する耐性をコードするTn5由来のアミノグリコシドホスホトランスフェラーゼ遺伝子(neoまたはaph)、ジヒドロ葉酸還元酵素(DHFR)遺伝子、アデノシンデアミナーゼ遺伝子(ADA)、および多剤耐性(MDR)遺伝子などが挙げられる。
いくつかの実施形態では、ポジティブマーカーは、細胞を選択するための末端切断型EGFRタンパク質である。
Tリンパ球に形質を導入するため、当技術分野において公知の様々な方法を使用することができる。いくつかの実施形態においては、レンチウイルスベクターを用いて形質導入を行う。いくつかの実施形態においては、キメラ受容体をコードする発現ベクターを使用して、CD4細胞およびCD8細胞をそれぞれ別々に改変し、所定の集団を形成することができる。いくつかの実施形態においては、これらの細胞は、次いで、前述したナイーブ細胞の亜集団、セントラルメモリー細胞の亜集団、およびエフェクター細胞の亜集団のそれぞれに固有の細胞表面抗原でソートすることによって、これらの亜集団にソートされる。
いくつかの実施形態においては、抗原または腫瘍標的に応答して増殖するCD4細胞およびCD8細胞が選択される。たとえば、抗原または腫瘍標的で刺激した場合に、偽物形質導入細胞よりも、活発に増殖するCD4細胞またはCD8形質導入細胞が選択される。いくつかの実施形態においては、抗原を有する細胞に対して細胞傷害性を示すCD4細胞およびCD8細胞が選択される。いくつかの実施形態においては、CD4細胞は、CD8細胞よりも低い細胞傷害性を示すと予想される。
別の一実施形態においては、特定の種類のがんについて確立されたインビボ動物モデルにおいて、細胞を殺傷する能力を発揮する形質導入リンパ球(たとえばCD8セントラルメモリー細胞)が選択される。そのような動物モデルは当業者に知られており、この動物モデルにヒトは包含されない。本明細書に記載されているように、リンパ球に形質導入されたキメラ受容体構築物は、インビトロで活性化され、細胞を殺傷する能力を付与したとしても、そのキメラ受容体構築物のすべてが、インビボにおいて腫瘍細胞を殺傷する能力を付与するとは限らない。
本開示は、組成物においてCD4T細胞とCD8T細胞の組み合わせを使用することを包含する。一実施形態において、キメラ受容体により形質導入されたCD4細胞の組み合わせは、同じリガンドに特異的である形質導入キメラ受容体発現CD8細胞と組み合わせてもよく、あるいは異なる腫瘍リガンドに特異的であるCD8T細胞と組み合わせてもよい。別の実施形態においては、形質導入キメラ受容体発現CD8細胞は、腫瘍上に発現された別のリガンドに特異的な形質導入キメラ受容体発現CD4細胞と組み合わせる。さらに別の実施形態においては、キメラ受容体で改変されたCD4細胞とCD8細胞とを組み合わせる。いくつかの実施形態においては、CD8細胞とCD4細胞は、様々な比率で組み合わせることができ、たとえば、CD8とCD4とを1:1の比率で組み合わせることができ、CD8とCD4とを10:1の比率で組み合わせることができ、CD8とCD4とを100:1の比率で組み合わせることができ、またはこれらの比率のいずれか2つによって定義される範囲にある任意の別の比率でCD8とCD4とを組み合わせることができる。いくつかの実施形態においては、組み合わされた細胞集団は、インビトロおよび/またはインビボにおいて細胞増殖を試験し、細胞の増殖が見られる細胞比率を選択する。
本明細書に記載されているように、本開示では、CD4T細胞およびCD8T細胞をさらに亜集団に分離することを包含し、たとえば、ナイーブ細胞集団、セントラルメモリー細胞集団およびエフェクターメモリー細胞集団などに分離される。本明細書に記載のように、いくつかの実施形態において、ナイーブCD4細胞は、CD45RO、CD45RA、CD62L、CD28、 CD27、および/またはCD4T細胞である。いくつかの実施形態において、セントラルメモリーCD4細胞は、CD62Lおよび/またはCD45ROである。いくつかの実施形態において、エフェクターCD4細胞は、CD62Lおよび/またはCD45ROである。これらの集団はそれぞれ別個にキメラ受容体で改変することができる。いくつかの実施形態において、セントラルメモリーCD4細胞は、CD62L、CD28および/またはCD27である。
形質導入を行った後および/またはキメラ受容体を有する細胞を選択した後、得られた各細胞集団は、ヒト対象中への少なくとも1回の注入に十分な数に達するまでインビトロにおいて増殖させることが好ましく、少なくとも1回の注入に十分な細胞数としては、典型的には、約10細胞/kg~10細胞/kgが挙げられる。いくつかの実施形態においては、前記形質導入細胞は、抗原を有する細胞、抗CD3、抗CD28、IL-2、IL-7、IL-15、および/もしくはIL-21、ならびに/またはそれらの組み合わせの存在下で培養される。いくつかの実施形態においては、ビーズまたは粒子などの抗体結合支持体の存在下で前記T細胞を刺激する。いくつかの実施形態においては、抗TCR抗体、抗CD2抗体、抗CD3抗体、抗CD4抗体、および/または抗CD28抗体を含む抗体結合支持体で前記T細胞を刺激する。いくつかの実施形態においては、抗CD3抗体および/または抗CD28抗体を含む抗体結合支持体で前記T細胞を刺激する。
CD4細胞の亜集団とCD8細胞の亜集団とを組み合わせてもよい。特定の一実施形態においては、改変されたナイーブCD4細胞またはセントラルメモリーCD4細胞と、改変されたセントラルメモリーCD8T細胞とを組み合わせることによって、抗原を有する細胞(たとえば細胞表面上にCD19を有するB細胞)に対して相乗的な細胞傷害性効果を提供する。
組成物
本発明の開示は、本明細書に記載の遺伝子改変Tリンパ球製剤を含む養子細胞免疫療法組成物を提供する。
いくつかの実施形態においては、前記Tリンパ球製剤は、キメラ受容体を有するCD4T細胞を含み、該キメラ受容体は、本明細書に記載されているように、前記疾患または障害に関連するリガンドに特異的な細胞外抗体可変ドメイン、カスタマイズ可能なスペーサー領域、膜貫通ドメイン、およびT細胞受容体またはその他の受容体の細胞内シグナル伝達ドメインを含む。別の実施形態においては、養子細胞免疫療法組成物は、細胞性免疫応答を提供可能な、キメラ受容体により改変された腫瘍特異的なCD8細胞傷害性Tリンパ球製剤をさらに含み、前記細胞傷害性Tリンパ球製剤は、キメラ受容体を有するCD8T細胞を含み、該キメラ受容体は、本明細書に記載されているように、前記疾患または障害に関連するリガンドに特異的な細胞外一本鎖抗体、カスタマイズ可能なスペーサー領域、膜貫通ドメイン、およびT細胞受容体の細胞内シグナル伝達ドメインを含む。
いくつかの実施形態においては、養子細胞免疫療法組成物は、キメラ受容体により改変された腫瘍特異的なCD8細胞傷害性Tリンパ球製剤、抗原反応性のキメラ受容体で改変されたナイーブCD4Tヘルパー細胞、および薬学的に許容される担体を含み、前記細胞傷害性Tリンパ球製剤が、細胞性免疫応答を提供し、かつキメラ受容体を有するCD8T細胞を含み、該キメラ受容体が、前記疾患または障害に関連するリガンドに特異的な細胞外一本鎖抗体、カスタマイズ可能なスペーサー領域、膜貫通ドメイン、およびT細胞受容体の細胞内シグナル伝達ドメインを含むこと、ならびに前記ナイーブCD4Tヘルパー細胞が、CD45ROCD62Lおよび/またはCD4T細胞に由来することを特徴とする。
別の実施形態においては、養子細胞免疫療法組成物は、抗原特異的CD8細胞傷害性Tリンパ球製剤と抗原反応性のキメラ受容体で改変されたナイーブCD4Tヘルパー細胞との組み合わせを含み、前記CD8細胞傷害性Tリンパ球製剤が、患者由来であり、細胞性免疫応答を提供すること、前記ナイーブCD4Tヘルパー細胞が、CD8Tリンパ球による免疫応答を増強すること、ならびに前記ヘルパーTリンパ球製剤が、キメラ受容体を有するCD4T細胞を含み、該キメラ受容体が、前記疾患または障害に関連する抗原に特異的な細胞外抗体可変ドメイン、カスタマイズ可能なスペーサー領域、膜貫通ドメイン、およびT細胞受容体の細胞内シグナル伝達ドメイン含むことを特徴とする。
さらに別の一実施形態において、養子細胞免疫療法組成物は、抗原反応性キメラ受容体により改変したナイーブCD4Tヘルパー細胞含み、該ヘルパーTリンパ球製剤が、前記CD8Tリンパ球による免疫応答を増強し、キメラ受容体を有するCD4T細胞を含み、該キメラ受容体が、疾患または障害に関連するリガンドに特異的な細胞外抗体可変ドメイン、カスタマイズ可能なスペーサー領域、膜貫通ドメイン、およびT細胞受容体の細胞内シグナル伝達ドメインを含むことを特徴とする。
いくつかの実施形態においては、前記CD4Tヘルパーリンパ球は、ナイーブCD4T細胞、セントラルメモリーCD4T細胞、エフェクターメモリーCD4T細胞およびバルクCD4T細胞からなる群から選択される。いくつかの実施形態においては、前記CD4ヘルパーリンパ球は、ナイーブCD4T細胞であり、該ナイーブCD4T細胞は、CD45RO、CD45RA、CD62L、CD28、CD27および/またはCD4を含む。いくつかの実施形態においては、前記細胞傷害性CD8Tリンパ球は、ナイーブCD8T細胞、セントラルメモリーCD8T細胞、エフェクターメモリーCD8T細胞およびバルクCD8T細胞からなる群から選択される。いくつかの実施形態においては、前記CD8細胞傷害性Tリンパ球は、セントラルメモリーT細胞であり、該セントラルメモリーT細胞は、該セントラルメモリーT細胞は、CD45RO、CD62L、CD27、CD28および/またはCD8を含む。さらに別の実施形態では、前記CD8細胞傷害性Tリンパ球はセントラルメモリーT細胞であり、前記CD4ヘルパーTリンパ球はナイーブCD4T細胞またはセントラルメモリーCD4T細胞である。
本発明の開示は、養子免疫療法組成物の製造方法、および、疾患または障害を有する対象において細胞免疫療法を行うための、該組成物の使用、または疾患または障害を有する対象において組成物を使用して細胞免疫療法を行う方法を提供する。前記キメラ受容体により改変されたT細胞の増殖および持続性は、前記疾患または障害の動物モデルを使用し、前記細胞を投与し、移入された細胞の持続能力および/または増殖能力を算出することによって、測定することができる。別の実施形態において、増殖および活性化は、抗原を有する細胞を使用して複数回にわたって活性化することによって、インビトロで試験することができる。
いくつかの実施形態においては、前記組成物の製造方法は、改変されたナイーブCD4Tヘルパー細胞を得ることを含み、前記改変されたヘルパーTリンパ球製剤が、キメラ受容体を有するCD4T細胞を含み、該キメラ受容体が、本明細書に記載されているように、腫瘍細胞の表面分子に特異的なリガンド結合ドメイン、カスタマイズされたスペーサードメイン、膜貫通ドメイン、および細胞内シグナル伝達ドメインを含むことを特徴とする。
別の一実施形態においては、前記方法は、改変されたCD8細胞傷害性T細胞を得ることをさらに含み、前記改変された細胞傷害性Tリンパ球製剤が、キメラ受容体を有するCD8細胞を含み、該キメラ受容体が、本明細書に記載されているように、腫瘍細胞の表面分子に特異的なリガンド結合ドメイン、カスタマイズされたスペーサードメイン、膜貫通ドメイン、および細胞内シグナル伝達ドメインを含むことを特徴とする。
別の一実施形態においては、前記方法は、改変されたCD8細胞傷害性T細胞を得ることを含み、前記改変された細胞傷害性Tリンパ球製剤が、キメラ受容体を有するCD8T細胞を含み、該キメラ受容体が、本明細書に記載されているように、腫瘍細胞の表面分子に特異的なリガンド結合ドメイン、カスタマイズされたスペーサードメイン、膜貫通ドメイン、および細胞内シグナル伝達ドメインを含むことを特徴とし、該方法は、前記改変されたCD8細胞傷害性T細胞とCD4ヘルパー細胞リンパ球製剤とを組み合わせることをさらに含む。
キメラ受容体で改変されたCD4細胞およびCD8細胞の調製は、上記および実施例で説明したとおりである。抗原特異的Tリンパ球は、疾患または障害を有する患者から得ることができ、また、抗原の存在下、インビトロにおいてTリンパ球を刺激することによっても調製することができる。抗原特異性によって選択されなかったCD4Tリンパ球亜集団およびCD8Tリンパ球亜集団も本明細書に記載の方法で単離することができ、前記製造方法に組み込むことができる。いくつかの実施形態においては、このような細胞集団の組み合わせは、細胞表面マーカーの均一性、すなわち少なくとも2世代にわたり増殖する能力を評価して、均一な細胞分化状態を有するかどうかを確認することができる。品質管理は、前記標的リガンドを発現する細胞株とキメラ受容体により改変されたT細胞とを共培養し、当技術分野で公知の細胞傷害アッセイ、増殖アッセイまたはサイトカイン産生アッセイを使用して、該キメラ受容体により改変されたT細胞が該細胞株を認識するかどうかを確認することによって実施することができる。前記キメラ受容体により改変されたT細胞の細胞分化状態および細胞表面マーカーは、フローサイトメトリーによって測定することができる。いくつかの実施形態において、前記CD8細胞の前記マーカーおよび細胞分化状態は、CD3、CD8、CD62L、CD28、CD27、CD69、CD25、PD-1、CTLA-4、CD45ROおよび/またはCD45RAを含む。いくつかの実施形態において、前記CD4細胞の前記マーカーおよび細胞分化状態は、CD3、CD4、CD62L、CD28、CD27、CD69、CD25、PD-1およびCTLA-4、CD45ROおよび/またはCD45RAを含む。いくつかの実施形態において、前記マーカーは、CD45 RA、CD45 RO、CCR7、CD25、CD127、CD57、CD137、CD27、CD28および/またはCD62Lを含む。いくつかの実施形態において、前記マーカーはCD27、CD28および/またはCD62Lを含む。
いくつかの実施形態は、がん(たとえばALL)などの疾患の治療、抑制または緩和を必要とする対象において、該疾患を治療、抑制または緩和するアプローチに関し、このようなアプローチには、がんの進行および/もしくは転移を抑制するもしくは遅延させる方法、体内に存在する腫瘍細胞またはがん細胞を抑制または低減する方法、ならびに/またはCD19発現細胞を含む標的集団の抑制もしくは低減を必要とする患者において、該標的集団を抑制または低減する方法が含まれる。これらの方法は、細胞性免疫応答を提供する遺伝子改変細胞傷害性Tリンパ球製剤を上記の処置を必要とする対象または患者に投与することを含み、該細胞傷害性Tリンパ球製剤はキメラ受容体を有するCD8T細胞を含み、該キメラ受容体が、リガンド結合ドメインをコードするポリヌクレオチド、ポリペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチド、膜貫通ドメインをコードするポリヌクレオチドおよび1つ以上の細胞内シグナル伝達ドメインをコードするポリヌクレオチドを含むこと、前記リガンドが、腫瘍持異抗原、またはリンパ球による認識および/もしくは排除を媒介するのに適切な標的細胞集団に発現しているその他の分子(たとえばCD19)であること、前記ポリペプチドスペーサーがカスタマイズされた長さを有すること、前記スペーサーによって、T細胞の増殖、および/またはサイトカイン産生が対照キメラ受容体よりも増強されることを特徴とする。
また、本発明の開示は、がん(たとえばALL)などの疾患または障害を有する対象において細胞免疫療法を行う方法であって、本明細書に記載のキメラ受容体を発現するリンパ球を含む組成物を投与することを含む方法を提供する。別の実施形態では、前記方法は、遺伝子改変細胞傷害性Tリンパ球製剤と遺伝子改変ヘルパーTリンパ球製剤とを前記対象に投与することを含み、前記細胞傷害性Tリンパ球製剤が、細胞性免疫応答を提供し、かつキメラ受容体を有するCD8T細胞を含み、該キメラ受容体が、本明細書に記載されているように、細胞の表面分子に特異的なリガンド結合ドメイン、カスタマイズされたスペーサードメイン、膜貫通ドメイン、および細胞内シグナル伝達ドメインを含むこと、前記ヘルパーTリンパ球製剤が、直接認識を誘導するとともに、前記細胞傷害性Tリンパ球の細胞性免疫応答を媒介する能力を増強し、かつキメラ受容体を有するCD4T細胞を含み、該キメラ受容体が、本明細書に記載されているように、細胞の表面分子に特異的なリガンド結合ドメイン、カスタマイズされたスペーサードメイン、膜貫通ドメイン、および細胞内シグナル伝達ドメインを含むことを特徴とする。
本発明の開示の範囲を何ら限定するものではないが、インビボで持続し増殖することができるキメラ受容体改変T細胞集団を投与前に選択することによって、T細胞の用量を低減することができ、かつ治療活性をより均一なものとすることができると考えられる。いくつかの実施形態では、T細胞の用量を少なくとも10%、20%、30%、またはそれ以上低減することができる。T細胞の用量を低減することは、腫瘍崩壊症候群およびサイトカインストームのリスクの低減に有益だと考えられる。
別の一実施形態では、疾患または障害を有する対象において細胞免疫療法を行う方法は、遺伝子改変ヘルパーTリンパ球製剤を前記対象に投与することを含み、前記改変されたヘルパーTリンパ球製剤が、キメラ受容体を有するCD4T細胞を含み、該キメラ受容体が、本明細書に記載されているように、腫瘍細胞の表面分子に特異的なリガンド結合ドメイン、カスタマイズされたスペーサードメイン、膜貫通ドメイン、および細胞内シグナル伝達ドメインを含むことを特徴とする。いくつかの実施形態においては、前記方法は、遺伝子改変細胞傷害性Tリンパ球製剤を前記対象に投与することをさらに含み、前記改変された細胞傷害性Tリンパ球製剤が、キメラ受容体を有するCD4細胞を含み、該キメラ受容体が、本明細書に記載されているように、腫瘍細胞の表面分子に特異的なリガンド結合ドメイン、カスタマイズされたスペーサードメイン、膜貫通ドメイン、および細胞内シグナル伝達ドメインを含むことを特徴とする。
別の一実施形態は、疾患または障害を有する対象において細胞免疫療法を行う方法であって、前記対象の生体試料を分析して、前記疾患または障害に関連する標的分子(たとえばCD19)の存在を検出すること、および本明細書に記載の養子免疫療法組成物を投与することを含み、前記キメラ受容体が、前記標的分子(CD19)に特異的に結合することを特徴とする方法に関する。
いくつかの実施形態においては、前記CD4Tヘルパーリンパ球は、前記キメラ受容体の導入前に、ナイーブCD4T細胞、セントラルメモリーCD4T細胞、エフェクターメモリーCD4T細胞およびバルクCD4T細胞からなる群から選択される。特定の一実施形態では、前記CD4ヘルパーリンパ球は、ナイーブCD4T細胞であり、該ナイーブCD4T細胞は、CD45RO、CD45RA、CD28、CD27、CD62Lおよび/またはCD4を含む。さらに別の実施形態においては、前記細胞傷害性CD8Tリンパ球は、前記キメラ受容体の導入前に、ナイーブCD8T細胞、セントラルメモリーCD8T細胞、エフェクターメモリーCD8T細胞およびバルクCD8T細胞からなる群から選択される。特定の一実施形態では、前記CD8細胞傷害性Tリンパ球は、セントラルメモリーT細胞であり、該セントラルメモリーT細胞は、該セントラルメモリーT細胞は、CD45RO、CD62L、CD28、CD28および/またはCD8を含む。特定の一実施形態においては、前記CD8細胞傷害性Tリンパ球はセントラルメモリーT細胞であり、前記CD4ヘルパーTリンパ球はナイーブCD4T細胞である。
いくつかの実施形態においては、前記CD8T細胞およびCD4T細胞はいずれも、細胞表面分子に特異的に結合する抗体重鎖ドメインを含むキメラ受容体で遺伝子改変されている。別の実施形態においては、前記CD8細胞傷害性T細胞の前記細胞内シグナル伝達ドメインは、前記CD4ヘルパーT細胞の前記細胞内シグナル伝達ドメインと同一のものである。さらに別の実施形態では、前記CD8細胞傷害性T細胞の前記細胞内シグナル伝達ドメインは、前記CD4ヘルパーT細胞の前記細胞内シグナル伝達ドメインと異なるものである。
本明細書に記載の実施形態が適用されうる対象としては、ヒト、サルや類人猿などの他の霊長類、イヌ、ネコ、ウマなどの愛玩動物、ブタ、ヤギ、ヒツジ、ウシなどの家畜などが挙げられる。対象は雄性でも雌性でもよく、任意の適切な年齢であってもよく、たとえば、幼児、幼年者、若年者、成人、および高齢者の対象が挙げられる。本発明の方法は、たとえば、CD19担持するがんまたは細胞の治療に有用である。
前述のように製造された細胞は、本発明の開示を踏まえ、当業者であれば容易に理解できる公知の技術またはその変法に従って、養子免疫療法のための方法および組成物において使用することができる。
いくつかの実施形態において、前記細胞の製剤化は、まず該細胞を培地から回収し、次いで該細胞を洗浄し、投与に適した培地および容器システム(「薬学的に許容され得る」担体)中において該細胞を治療有効量まで濃縮することによって行われる。適切な注入用培地は、任意の等張性培地製剤であってもよく、典型的には、生理食塩水、Normosol R(アボット)もしくはPlasma-Lyte A(バクスター)、5%デキストロース水溶液、または乳酸リンゲル液を使用することができる。注入用培地にはウシ胎児血清を添加してもよい。次いで、細胞をサイトカインで処理することにより、サイトカインで刺激していないCD8T細胞集団および/またはCD4T細胞集団と比べて、移植適合性が増強または改善されたサイトカイン刺激性形質導入CD8T細胞集団および/またはCD4T細胞集団を得る。改善された所望の移植適合性を示す細胞を作製するため、T細胞の増殖中に前記サイトカインをインビトロで添加することが望ましい。したがって、分離されたCD4T細胞およびCD8T細胞は、遺伝子改変T細胞の増殖中にサイトカインを添加することによって刺激される。いくつかの実施形態においては、前記CD4T細胞は、少なくとも1つのサイトカインで刺激され、該少なくとも1つのサイトカインは、ILー7、IL-15、および/またはIL-21を含む。いくつかの実施形態において、前記CD8T細胞は、少なくとも1つのサイトカインで刺激され、該少なくとも1つのサイトカインは、IL-2、IL-15、および/またはIL-21を含む。
組成物中の細胞の治療有効量または抑制有効量とは、少なくとも2つの細胞サブセット(たとえば、CD8セントラルメモリーT細胞の1つのサブセットとCD4ヘルパーT細胞の1つのサブセット)の量を指し、より典型的には、10個を超えかつ10個以下の細胞であり、または10個以下または10個以下の細胞であり、たとえば、10個または10個であってもよく、1010個を超える数の細胞であってもよく、これら2つの値のいずれかによって定義される範囲にある任意の他の値で表される細胞数であってもよい。細胞の数は、前記組成物の最終的な用途や、該組成物に含まれる細胞種などによって決定される。たとえば、特定の抗原に特異的な細胞が所望される場合、前記集団を占める該細胞の割合は70%を超え、一般的には、80%を超え、85%を超え、かつ/または前記集団全体の90~95%を占める。本明細書に記載の用途において、前記細胞の量は通常1L以下であり、500ml以下であってもよく、さらには250ml以下もしくは100ml以下であってもよく、これらの値のいずれか2つによって定義される範囲にある任意の他の値で表される量であってもよい。したがって、前記所望の細胞の密度は、典型的には、10細胞/mlよりも大きく、通常10細胞/mlよりも大きく、通常10細胞/ml以上である。臨床用途に適したこのような数の免疫細胞は、複数の注入に分割して投与してもよく、その累積投与量は10個、10個、10個、10個、1010個、もしくは1011個の細胞、もしくはこれらの細胞数以上の細胞、またはこれらの2つの値のいずれかによって定義される範囲にある任意の他の細胞数に相当する。
いくつかの実施形態において、本発明のリンパ球は、個体に免疫を付与するために使用することができる。「免疫」は、病原体の感染に対する応答またはリンパ球反応の標的となる腫瘍に対する応答に伴う1つ以上の身体症状を軽減することを意味する。前記細胞の投与量は、通常、病原体に対する免疫を備える正常個体の体内に存在する量の範囲内である。したがって、細胞は、通常、注入によって投与され、1回の注入あたり2個以上から少なくとも10個~3×1010個までの範囲の数の細胞が投与され、少なくとも10個~10個の細胞を注入することが好ましい。前記T細胞は、単回の注入によって、または特定の期間における複数回の注入によって投与することができる。しかしながら、個体によって反応性が異なると考えられるため、注入する細胞の種類および細胞の量、ならびに注入の回数および複数回の注入を実施する期間は主治医によって決定され、日常的な検査によっても決定することができる。十分な量のTリンパ球(細胞傷害性Tリンパ球および/またはヘルパーTリンパ球を含む)の作製は、本明細書に例示したような、本発明による迅速な増殖方法を用いて容易に行うことができる。たとえば、Riddellらに付与された米国特許第6,040,177号の第17段落を参照されたい(この文献は参照によりその全体が明示的に本明細書に組み込まれるさらなる)。
いくつかの実施形態においては、本明細書に記載の組成物は、静脈内投与、腹腔内投与、腫瘍内投与、骨髄内投与、リンパ節内投与、かつ/または脳脊髄液内投与される。
いくつかの実施形態において、本明細書に記載の組成物は、化学療法剤および/または免疫抑制剤とともに投与される。別の一実施形態においては、まず、本発明の免疫細胞以外の免疫細胞を抑制または殺傷する化学療法剤を患者に投与してから、本明細書に記載の組成物を投与する。場合によっては、化学療法を完全に省いてもよい。
ALL患者への投与
治験参加者から得られた成分分離血からCD4T細胞サブセットおよびCD8T細胞サブセットを免疫磁気的に単離した。抗CD3×CD28ビーズでの刺激後、選択および追跡のための自殺構築物EGFRtとFMC63scFv:IgG4hinge:CD28tm:4-1BB:ζCARとを共発現させるSINレンチウイルスベクターでT細胞株に形質導入を行った。組換えヒトサイトカインを用いて形質導入細胞を10~20日間培養して臨床使用に適した数まで増殖させ、培養期間中に該形質導入細胞のEGFRt免疫磁気ポジティブセレクションを行った。リンパ球を除去するための化学療法を行った後、直ちに、凍結保存しておいたCD4/EGFRtT細胞製剤およびCD8/EGFRtT細胞製剤を解凍し、所定のプロトコルに規定された投与量レベル(投与量レベル1=0.5×10個/kg;投与量レベル2=1×10個/kg;投与量レベル3=5×10個/kg)にてEGFRtCD4T細胞とEGFRtCD8T細胞とが1:1の割合で患者に投与されるように、臨床現場にて前記製剤を注入した。いくつかの実験においては、前記濃縮されたCD4発現T細胞を、5ng/mLの組換えヒトIL-7(rhIL-7)および/または0.5ng/mLの組換えヒトIL-15(rhIL-15)と接触させることによって、たとえば該細胞を増殖させた。また、いくつかの実験においては、前記濃縮されたCD8発現T細胞を、50U/mLの組換えヒトIL-2(rhIL-2)および/または0.5ng/mLの組換えヒトIL-15(rhIL-15)と接触させることによって、たとえば該細胞を増殖させた。
登録された対象(n=16)は、輸液用として精製され、投与計画に適合した細胞製剤の投与を受けた。13名の対象(男性6名、HSCTから3年経過)は、実験の前に様々な投与量レベル(0.5×10/kg~5×10/kgの範囲)で治療を既に受けていた。本発明の輸液は、グレード2を超える有害事象(DMSOに関連したグレード3のアナフィラキシー)は1件に過ぎず、該輸液の忍容性は良好であった。13名の対象のうち12名は、92%のORR(全奏効率)を示した。13名の対象のうち11名は、MRD陰性のCR(完全奏効)に達した(85%)。疾病負荷が高かった対象は、MRD陰性骨髄を持つ対象と比べて高いピークPB CAR T細胞レベルを有していた(62.7%対19.6%)。骨髄(n=12)、末梢血(n=12)およびCSFにおけるCAR T細胞の増殖による蓄積を観察した。T細胞移植片が消失した5名の対象における平均持続期間は63日であった(42~150日の範囲)。
応答性を示した12名の対象はいずれも、顕著な症状として発熱および低血圧を伴うある程度のサイトカイン放出症候群(CRS)を発症した。2名の対象S02およびS09は、重症サイトカイン放出症候群(sCRS)に対する免疫調節治療を必要とした(2名に対しトシリズマブを投与し、1名にはさらにデキサメタゾンの追加した)。これらの患者13名のうちの4名は、脳症を発症した(2名がグレード1、1名がグレード3、1名がグレード4)。グレード4の脳症は、DLT(用量制限毒性)であり、発作を伴い、PRESに類似した異常なMRI所見を示した。MRI所見は治療後9週間までに正常化したが、この対象は、最終評価の時点で、治療から6か月にわたって発作を起こし続けた。
上述したとおり、調製・精製されたCD4:CD8 CD19CAR/EGFRt+T細胞の輸液をkg体重当たりの規定量で投与したところ、HSCT後に再発が起こした小児および若年成人ALL患者において、MRD陰性のCR(完全奏効)が良好な割合で見られた。したがって、16名の登録患者の各々からドナー由来の製剤を作製することが可能である。評価可能な13名の患者について予測される毒性としては、ICU入院率が約30%であるCRS、および重症度が軽症から重症の範囲に及ぶ脳症が挙げられる。MRDの陰性応答は、すべての投与量レベルで見られたが、早期のデータからは投与量を増加すると持続性も向上することが示唆された。
1名の患者は、T細胞による治療後に急性GVHDを発症したが、予備的評価では、CAR T細胞がこの応答を媒介したわけではないことが示唆された。興味深いことに、プレドニゾンはT細胞移植片の持続性に影響を及ぼさなかった。したがって、CD28マーカー、CD27マーカー、およびCD62Lマーカーを維持していた細胞は、所定のサイトカイン混合物で処理されなかったため移植適合性に寄与する前記マーカーを欠いていた細胞よりも高い持続性を示した。本発明の治療法では、これらのマーカーを維持するT細胞が使用されている。
図18に、キメラ抗原受容体を含む本遺伝子改変T細胞の製造に使用される製造方法の工程の進行を表したフローチャートを示す。図示したとおり、この本発明の製造方法はFicoll処理を含まないが、初期の実験的製法ではFicoll処理工程を含んでいた。図19のフローチャートで示すように、初期培養において細胞濃度を変化させた試験も行った。また、細胞をサイトカインの存在下で増殖させた(図20)。
図20に示すように、ドナー試料PD0064:PD0063由来のCD8濃縮T細胞を用いて、開始時のT25フラスコにおける出発試料中の細胞密度を試験した。いずれの細胞(PD0064、PD0063に由来)も通常のPLAT-02培養条件、すなわちIL-2(50U/mL)+IL-15(0.5ng/mL)で試験した。Tx日における細胞の増殖を試験するため、ドナー試料PD0080由来の細胞を培地およびサイトカインに加え、最終細胞濃度0.7×10個/mLまで増殖させた(「早期増殖」)。本明細書において「Tx」とは、ビーズで刺激した日を0日目(Day+0)と定義したとき、1日目(Day+1)を指す。PD0063 CD8細胞を、濃縮出発材料として使用した。PD0064:PD0063由来CD8濃縮細胞の場合と同じサイトカイン条件を用いた。この実験では2つの細胞密度を試験しており、サイトカインの存在下で細胞培養物の量を早期に増加させた場合に、いずれの細胞密度の細胞も高い生存能および増殖を示した。ここで「量の増加」とは、Tx後に最初に供給した培地/サイトカインの添加量を「早期増殖」条件において増加させたことをいい、これによって「早期増殖」条件での培養中に細胞密度が減少する。
図21に、細胞試料PD104およびPD0116の増殖、ならびに実験条件下での細胞増殖の比較を示す。PD0104:PD0063由来のCD8濃縮細胞およびCD4濃縮細胞を用いて前記と同様にして実験を再度行い、Tx日における0.7×10個/mLまでの細胞の増殖を試験した(「早期増殖」)。このとき、添加したサイトカインおよびその濃度は、CD8T細胞については、IL-2(50U/mL)+IL-15(0.5ng/mL)とし、CD4T細胞については、IL-7(5ng/mL)+IL-15(0.5ng/mL)とした。増殖および生存能は劇的に増加した。これらの細胞が示した曲線は、増殖/ビーズ除去/選択/凍結保存のタイミングに関しては臨床製剤で見られるものと類似している。
前記のPD0116:PD0046由来のCD8濃縮T細胞およびCD4濃縮T細胞を用いて実験を再度行い、Tx日における0.7×10個/mLまでの細胞の増殖を試験した(「早期増殖」)。通常のPLAT-02培養条件、すなわち、CD8細胞にはIL-2(50U/mL)+IL-15(0.5ng/mL)を使用し、CD4細胞にはIL-7(5ng/mL)+IL-15(0.5ng/mL)を使用した。PD116は、V-197バッグ中において180×10個から開始し、磁気濃縮およびスピノキュレーションを輸液パック中で行った。図示したとおり、これらの条件において、増殖および生存能は劇的に増加した。これらの細胞が示した曲線は、増殖、ビーズ除去、選択、およびT細胞の凍結保存のタイミングに関しては臨床製剤で見られるものと類似している。
また、PD0116:PD0046由来のCD8濃縮細胞およびCD4濃縮細胞に培地およびサイトカインを添加して実験を再度行い、Tx日における最終量0.7×10個/mLまでの細胞の増殖を試験した(「早期増殖」)。通常のPLAT-02培養条件、すなわち、CD8細胞にはIL-2(50U/mL)+IL-15(0.5ng/mL)を添加し、CD4細胞にはIL-7(5ng/mL)+IL-15(0.5ng/mL)を添加した。PD116は、V-197バッグ中において180×10個から開始し、磁気濃縮およびスピノキュレーションを輸液パック中で行った。これは、改良した製造方法に移行にした際に使用された実用スケールのデータであった。図21に示すとおり、増殖の拡大は、CD4細胞よりもCD8細胞の方が大きかった。CD4細胞およびCD8細胞に対して使用したサイトカイン、ならびに使用したサイトカインの組み合わせのバリエーションを図22のフローチャートに示す。
様々なサイトカイン条件についても、ドナー由来の前記CD8細胞および前記CD4細胞で試験した。図23のパネルA~Fに示すとおり、PD0047およびPD0040由来の試料を、IL2/IL15、IL7/IL15、IL2/IL7/IL15、IL2でパルス後IL7/IL15、IL2のみ、IL2でパルス後IL7/IL21およびIL2/IL15で処理した。この実験には、IL-2単独(パルス)とともに5日間インキュベーションし、次いでIL-7/IL-21を加え、これらのサイトカインを除去することなく残りの培養を続けた実験、ならびにIL-2単独(パルス)とともに5日間インキュベーションし、次いでIL-7/IL-21およびIL2/IL15を加え、これらのサイトカインを除去することなく残りの培養を続けた実験を含んでいた。PD0040:PD0038由来のCD8濃縮T細胞を用いて、様々なサイトカインカクテルについて試験した。各条件におけるサイトカインの濃度は、IL-2(50U/mL)、IL-7(5ng/mL)、IL-15(0.5ng/mL)であった。条件#4は、IL-2で5日間パルスし、次いでIL-7/IL-15を加え、これらのサイトカインを除去することなく残りの培養を続けた。増殖倍率および総細胞数(TNC)は小規模実験から外挿した。この実験で使用したIL-2/IL-15の組み合わせが最も優れた増殖を示した。この試験では、IL-2/IL-15の組み合わせが最も優れた増殖をもたらすことが立証された。
図に示したように、前記PD0047:PD0038由来のCD8濃縮細胞を用いて、様々なサイトカインカクテルを試験した。最終濃度を10U/mLとした「低用量」のIL-2を用いて、同じサイトカインカクテルを試験した。様々な組み合わせで使用された各サイトカインの濃度は、図中の凡例に記載のとおりIL-2(50U/mL)および(10U/mL)、IL-7(5ng/mL)、IL-15(0.5ng/mL)、IL-21(5ng/mL)であった。パルス条件は、IL-2で5日間パルスし、次いでIL-7/IL-21を加え、これらのサイトカインを除去することなく残りの培養を続けた。増殖倍率および総細胞数(TNC)は小規模実験から外挿する。IL-2/IL-15の組み合わせは、最も優れた増殖を示し、以降の実験に使用した。「通常」の用量のIL-2が最も優れた増殖を示した。パネルAは、PD0047細胞のインキュベーションによって15日目(D15)に得られた結果、ならびに様々なサイトカインによる増殖の比較、および様々なサイトカイン条件下(CD3、CD62L、CD3/CD62L/CD45RO、CD28、CD45RA/CD4RO、CD45RA/CD45RO_およびCD45RA/CD45RO)でのインキュベーション後の陽性細胞のパーセンテージを示す。
パネルBは、PD0047細胞のインキュベーションによって21日目(D21)に得られた結果、ならびに様々なサイトカインによる増殖の比較および上記で示した条件下での陽性細胞のパーセンテージを示す。パネルCは、PD0040 D21および様々なサイトカインによる増殖の比較を示し、総細胞数は22日間の培養増殖後に調べたものである。パネルDは、PD0040 D21および様々なサイトカインによる増殖の比較を示し、図に示したように、CD3細胞の増殖を22日間の培養増殖後に調べたものである。パネルEは、PD0047および様々なサイトカインによる増殖の比較を示し、総細胞数を22日間の培養増殖後に調べたものである。パネルFは、PD0047および様々なサイトカインによる増殖の比較を示し、図に示したように、CD3細胞の増殖を22日間の培養増殖後に調べたものである。上記と同様にして、PD0040:PD0038由来のCD8濃縮細胞を用いて、様々なサイトカインカクテルを試験した。各条件におけるサイトカインの濃度は、IL-2(50U/mL)、IL-7(5ng/mL)、IL-15(0.5ng/mL)であった。条件#4は、IL-2で5日間パルスし、次いでIL-7/IL-15を加え、これらのサイトカインを除去することなく残りの培養を続けた。増殖倍率および総細胞数(TNC)は小規模実験から外挿した。IL-2/IL-15の組み合わせは、最も優れた増殖を示し、以降の実験に使用した。さらに、PD0047:PD0038由来のCD8濃縮細胞を用いて、様々なサイトカインカクテルを試験した。最終濃度を10U/mLとした「低用量」のIL-2を用いて、同じサイトカインカクテルを試験した。各条件におけるサイトカインの濃度は、図中の凡例に記載のとおりIL-2(50U/mL)および(10U/mL)、IL-7(5ng/mL)、IL-15(0.5ng/mL)、IL-21(5ng/mL)であった。パルス条件は、IL-2で5日間パルスし、次いでIL-7/IL-21を加え、これらのサイトカインを除去することなく残りの培養を続けた。次いで、増殖倍率および総細胞数(TNC)を小規模実験から外挿した。この試験で使用したIL-2/IL-15のサイトカインの組み合わせが、最も優れた増殖を示した。「通常」用量のIL-2でも最も優れた増殖が示された。特定の表現型の増殖を分析するためにフローサイトメトリーを利用することができ、本明細書におけるさらなる実験で示されている。
図24に、サイトカインの様々な組み合わせについて試験した一連の実験から得られた結果を示す。2名のドナー由来のPD0051:CD8細胞を用いて、IL-2(50U/mL)およびIL-15(0.5ng/mL)を用いた「通常」のサイトカイン条件を試験した。パルス条件は、IL-2で5日間パルスした後、IL-7(5ng/mL)およびIL-21(5ng/mL)を加え、これらのサイトカインを除去することなく残りの培養を続けた。図示した増殖倍率および総細胞数(TNC)は、30×10個の細胞で開始したスケールアップ実験から得られたものである。ここで使用したIL-2/IL-15の組み合わせが最も優れた増殖を示したが、IL-2でパルスした後、IL-7/IL-21に切り替えた培養物でも増殖が見られた。増殖倍率は、PD0047で使用したパルス条件におけるものと類似していた。
PD0055では、PD0051で評価したものと同じサイトカイン条件を試験したが、CD4ドナー細胞(上記と同じドナーPD0038に由来)を用いた。この実験のサイトカイン条件は、IL-7(5ng/mL)およびIL-15(0.5ng/mL)であった。パルス条件は、IL-2で5日間パルスした後、IL-7(5ng/mL)およびIL-21(5ng/mL)を加え、これらのサイトカインを除去することなく残りの培養を続けた。増殖倍率および総細胞数(TNC)は、30×10個の細胞で開始したスケールアップ実験から得られたものである。ここで使用したIL-7/IL-15の組み合わせは、通常の増殖を示したが、IL-2でパルスした後、IL-7/IL-21に切り替えた培養物ではそれよりも良好な増殖が見られた。パネルAは、15日目(D15)のPD0051、ならびに様々なサイトカインによる増殖の比較、およびドナー対ドナーのサイトカイン比較における陽性細胞のパーセンテージ(EGFRt、EGFRt/CD4、EGFRt/CD8、CD3、CD3/CD4、CD3/CD4/CD8、CD3/CD8、CD62L、CD3/CD8、CD62L、CD3/CD28、CD27、CD127、CD45RA/CD45RO、CD45RA/CD45RO_/CD45RO_/CD45RA、CD62/CD28)を示す。パネルBは、17日目(D17)のPD0055、ならびに様々なサイトカインによる増殖の比較および陽性細胞のパーセンテージを示す。パネルCは、PD0051の増殖曲線および様々なサイトカインによる増殖の比較を示し、総細胞数は20日間の培養増殖後に調べたものである。パネルDは、PD0051および様々なサイトカインによる増殖の比較を示し、図に示したように、このCD3細胞の増殖は20日間の培養増殖後に調べたものである。パネルCおよびDは、PD0051の増殖曲線(全細胞およびCD3細胞)を示し、培養期間20日間にわたって所定の様々なサイトカインとともに細胞をインキュベートしたときの増殖を比較したものである。パネルEおよびFは、所定の様々なサイトカインとともにインキュベートしたときの、培養増殖の17日目の所定の時点におけるドナーPD0055の増殖曲線(全細胞およびCD3細胞)を示す。
図25に、様々なサイトカインの組み合わせが細胞増殖に及ぼす影響について評価したサイトカイン実験を示す。新たなCD4およびCD8ドナー(PD0057)を使用して試験を行ったこと以外は、PD0051での実験と同様にして試料PD0059のサイトカイン実験を行った。CD4にはIL-7(5ng/mL)およびIL-15(0.5ng/mL)を使用し、CD8にはIL-2(50U/mL)およびIL-15(0.5ng/mL)を使用した「通常」のサイトカイン条件で試験を実施した。パルス条件は、IL-2で5日間パルスした後、IL-7(5ng/mL)およびIL-21(5ng/mL)を加え、これらのサイトカインを除去することなく残りの培養を続けた。増殖倍率および総細胞数(TNC)は、30×10個の細胞で開始したスケールアップ実験から得られたものである。この試験においては「通常」のサイトカインの組み合わせで増殖が見られ、IL-2でパルスした後、IL-7/IL-21に切り替えた培養では良好な増殖が見られた。
別のCD4およびCD8ドナー(PD0063)を使用して実験を行ったこと以外は、PD0051と同様にしてPD0078のサイトカイン試験を実施した。CD4にはIL-7(5ng/mL)およびIL-15(0.5ng/mL)を使用し、CD8にはIL-2(50U/mL)およびIL-15(0.5ng/mL)を使用した「通常」のサイトカイン条件と、IL-2のみを使用した条件とを比較することによってこの試験を実施した。いずれの培養も14日目(D14)までは通常の増殖レベルを示し、次いで培養物においてEGFRt細胞を選択した。CD8細胞を選択後、生存能および増殖の回復は認められなかった。パネルAには、細胞を解凍した後の陽性細胞のパーセンテージを示す。パネルBは、PD0059を使用したPLAT-02条件下でのサイトカインの比較を示す。パネルCは、PD0059を使用したPLAT-02条件下でのサイトカインの比較およびCD3細胞の増殖を示す。パネルDは、PD0078の増殖曲線を示す。パネルDは、PD0078の増殖曲線およびCD3細胞の増殖を示す。
図26は、初期の増殖方法、および実験に基づいて改良された(すなわち「本発明」の)細胞増殖方法を示す2つのフローチャートである。後者を以降の実験に使用した。
図27に、PD0080、PD0084、およびPD0085由来の試料の増殖曲線、ならびにこれら3つ試料の比較を示す。これらの3つの実験は、「早期増殖」法の反復実験であった。これらの実験においては、前記の標準的なサイトカイン条件、すなわち、CD8T細胞にはIL-2(50U/mL)+IL-15(0.5ng/mL)を使用し、CD4T細胞にはIL-7(5ng/mL)+IL-15(0.5ng/mL)を使用した。PD0080では、PD0063 CD8T細胞を用いて、2種の開始密度を二連で試験した。二連で試験した細胞培養物の一方では、形質導入を行った日に3時間インキュベートすることによって、約0.7×10個/mLまで細胞が増加した。PD0084では、2種のさらなるCD8ドナーT細胞を使用して、早期増殖の効果について評価した。30×10個の細胞での開始条件を各ドナーの対照として使用し、60×10個の細胞密度での開始を早期増殖の試験条件として使用した。PD0085では、CD4T細胞を用いたこと以外はPD0084と同様にして試験を実施して、早期増殖を評価した。この実験でも、30×10個の開始時細胞密度を「通常」の対照条件として使用し、60×10個の開始時細胞密度を試験条件として使用した。
図28に示すように、PD0038の出発材料は、選択されたCD4T細胞およびCD8T細胞を含んでいた。増殖曲線は、プールした細胞を含む2つのV-197バッグから得た総細胞数(TNC)を示す。早い段階から、凍結保存前にCD4とCD8とを50:50の比率でプールした製剤とすることが計画されていた。フロー分析データは、プール製剤の解凍後を示す。ビーズ除去およびEGFRt濃縮を、CD4は14日目(D+14)に行い、CD8は15日目(D+15)に行った。CD8T細胞はIL-2(50U/mL)/IL-15(0.5ng/mL)の存在下で増殖させ、CD4T細胞はIL-7(5ng/mL)/IL-15(0.5ng/mL)の存在下で増殖させた。この方法の変法として、各細胞を別々の製剤として凍結保存し、解凍後に50:50の製剤を調製し、注入を行った。
図29に、PD0046の増殖曲線を示す。増殖曲線は、プールした細胞を含む2つのV-197バッグから得た総細胞数(TNC)を示す。早い段階から、凍結保存前にCD4とCD8とを50:50の比率でプールした製剤とすることが計画されていた。フロー分析データは、プール製剤の解凍後を示す。次いで、ビーズ除去およびEGFRt濃縮を、CD4T細胞は14日目(D+14)に行い、CD8T細胞は15日目(D+15)に行った。CD8+T細胞はIL-2(50U/mL)/IL-15(0.5ng/mL)の存在下で増殖させ、CD4+T細胞はIL-7(5ng/mL)/IL-15(0.5ng/mL)の存在下で増殖させた。しかしながら、ドナー細胞の解凍が不適切であったため、この製剤では良好な結果は得られなかった。10%HAを添加して解凍を行ったところ、細胞は大幅に改善された試験結果を示した。
図30に、PD0063の増殖曲線を示す。増殖曲線は、プールした細胞を含む2つのV-197バッグから得た総細胞数(TNC)を示す。次いで、ビーズ除去およびEGFRt濃縮を、CD4は14日目(D+14)に行い、CD8は15日目(D+15)に行った。CD8細胞はIL-2(50U/mL)/IL-15(0.5ng/mL)の存在下で増殖させ、CD4細胞はIL-7(5ng/mL)/IL-15(0.5ng/mL)の存在下で増殖させた。次いで、ビーズ除去およびEGFRt濃縮を行った。
図31に、サイトカインの存在下で増殖させたときのバルクPBMC培養物の細胞の増殖を示す。図に示したように、IL-2およびIL-15の存在下でCD4細胞(●)を増殖させた。IL-7およびIL-15の存在下でCD8細胞(■)を増殖させた。図31Aおよび図31Bそれぞれの下方のパネル(表現型の比較)は、様々な条件でのインキュベーション後に、図に示したマーカーを細胞表面に発現した細胞の総パーセンテージを示しており、いずれの実験でも、CD62L、CD28、CD27、CD45RAなどの移植適合性を示すマーカーを発現する細胞が得られた。IL-2/IL-15の存在下においてCD8濃縮培養物を培養すること、およびIL-7/IL-15の存在下においてCD4濃縮培養物を培養することによって、いずれの培養物でも活発な増殖およびメモリー表現型の強い発現が見られた。
図32に、サイトカイン混合物の存在下における濃縮CD8細胞および濃縮CD4細胞の増殖を示す。試料PD0044に示したように、IL-2およびIL-15の存在下で濃縮CD8T細胞を増殖させた(上のパネル)。試料PD0044では、IL-7およびIL-15の存在下で濃縮CD4T細胞を20日間にわたって増殖させた。図に示したように、CD4T細胞とCD8T細胞とのプールは、CD3、CD4、CD8、CD62L、CD28、CD27、CD45RA、およびCD45ROを発現した。また、試料14602-S14についても試験した(図32B参照)。図に示したように、IL-2/IL-15の存在下においてCD8濃縮培養物を培養すること、およびIL-7/IL-15の存在下においてCD4濃縮培養物を培養することによって、いずれの培養物でも活発な増殖およびメモリー表現型の強い発現が見られた。重要なことに、この実験で得られたデータならびに図31および図32に示したデータから、CD4T細胞およびCD8T細胞は、様々なサイトカインの組み合わせの存在下で最適な増殖を示したことが示され、CD4T細胞はこの試験においてIL-7およびIL-15の存在下で最もよく増殖し、CD8T細胞はこの試験においてサイトカインIL-2およびIL-15の存在下で最もよく増殖した。それぞれの細胞に最適なサイトカインの組み合わせを用いて培養したことによって、細胞増殖後に特定の表現型を有する細胞が得られ、これらの細胞は、CD45RA、CD62L、CD28、およびCD27の表面マーカーを発現した。このことは、養子免疫細胞移入したときに移植適合性が向上または改善することを示す。
図33に、改変前のPLAT-02細胞増殖方法(臨床試験の第I相および第II相)を用いた場合の14602-S01~14602-S06の試料を示す。これらの細胞は、凍結保存前にEGFRt陽性を示していた。これらの細胞の生存能について試験した。下の表に示したように、14602-S03 CD8細胞および14602-S03-CD8細胞は、CD3、CD62L、CD27、CD127、CD45RA/CD45RO、またはCD45RAを発現しなかった。
図34に、CD4T細胞およびCD8T細胞の両方を含む細胞製剤14602-S04および14602-S04-02について試験した結果を示す。「早期増殖」法を用いて細胞を培地中で増殖させた。これらの細胞を凍結保存前にEGFRtの発現について試験したところ陽性であった。
図35に、試料14602-S07、14602-S08、および14602-S09から得た細胞を示す。これらのCD4細胞およびCD8細胞を、早期増殖法を用いて増殖させた。14602-S07 CD4細胞および14602-S07 CD8細胞について表に示したように、上のパネルは、CD3、CD62L、CD27、CD27、CD127、CD45RAなどの様々なマーカーを発現する細胞の様々な時点でのパーセンテージを示す。下のパネルに示した試料14602-S08 CD4濃縮T細胞およびCD8濃縮T細胞は、培養10日後において生存能を維持していたい。
図36に、14602-S10バッチ試料、14602-S11バッチ試料、14602-S12バッチ試料、および14602-S13バッチ試料から得た細胞を生存能について試験した結果を示す。添付した表に示したように、前記細胞はいずれも凍結保存前にEGFRtを発現していた。これらの細胞の生存能について、少なくとも12日間の細胞培養において試験した。
図37に、14602-S14バッチ試料、14602-S15バッチ試料および14602-S16バッチ試料から得た細胞を生存能について試験した結果を示す。添付した表に示したように、前記細胞はいずれも凍結保存前にEGFRtを発現していた。これらの細胞の生存能について、少なくとも12日間の細胞培養において試験した。
図38に示したように、14602試料から濃縮されたCD4T細胞およびCD8T細胞は、CD3、CD62L、CD28、CD127、CD45RA/CD45RO、CD45RA、およびCD45ROについて陽性であった。これらマーカーは、特定のサイトカインの組み合わせで処理されたCD4細胞およびCD8細胞が、高い移植適合性を有したことを示す特異的マーカーである。
図39に、腫瘍接種後にT細胞を投与したマウスから得た結果(生存、腫瘍進行)を示す。図に示したように、試料PD0046由来の細胞を様々な濃度で注射したマウスは投与後80日間の生存したことから、これらの細胞が改善または向上された高い移植適合性を有していたことが示された。試料PD00044は、40日目に生存率(%)が低下し、改善または向上された高い移植適合性を有していなかった(図39B)。
図40に、PD0044細胞バッチおよびPD0046細胞バッチから得た細胞で処置したマウスにおける平均腫瘍進行を示す。これらのグラフに示したように、CD4T細胞およびCD8T細胞に好適なサイトカイン混合物(CD4T細胞にはIL-7/IL-15が好適であり、CD8T細胞にはIL-2/IL-15が好適である)の存在下で当初から培養することによって得られたPD0046バッチ由来のCD8T細胞およびCD4T細胞をマウスに投与した場合、マウスにおける腫瘍進行は低減された。対照としてビヒクルを用いた場合の細胞は、PD0044およびPD0046によるどちらの試験においても腫瘍の進行を阻止することはできなかった。下のパネルに示したとおり、PD0044試料から得た細胞で処置したマウスでは腫瘍の進行が増大し、特に最低濃度のT細胞で処置した場合に大幅に増大した。腫瘍の進行は、ビヒクルを用いた対照と比べると低下していた。
さらなる試験として、1群あたり5匹のマウスを含む3つのマウス群を試験した。A群のマウスは、プラセボとしてリン酸緩衝生理食塩水(PBS)を使用して処置した。B群では、Zrx-014で形質導入されたEGFRtCD4とEGFRtCD8とを1:1の比率で含む「通常の」増殖方法で得た細胞を使用した。使用したこれらの細胞は、PD0055#1群(ドナーPD0038 CD4に5ng/mL IL-7および0.5ng/mLIL-15を添加、EGFRt75.9%においてS1D14)およびPD0051#1群(ドナーPD0038 CD8に50U/mL IL-2および0.5ng/mL IL-15を添加、EGFRt76.8%においてS1D21)から得た。C群は、Zrx-014で形質導入されたEGFRtCD4とEGFRtCD8とを1:1の比率で含む、サイトカイン処理で「パルスした」細胞を使用した。PD0055#2(ドナーPD0038 CD4を50U/mL IL-2で5日間パルス後、5ng/mL IL-7および5ng/mL IL-21を添加、EGFRt81.2%においてS1D11)およびPD0051#2(ドナーPD0038 CD8を50U/mL IL-2で5日間パルス後、5ng/mL IL-7および5ng/mL IL-21を添加、EGFRt89.5%においてS1D21)から得た。
図42に、JME13-25においてマウスへの注射に使用された解凍後の細胞(PD0051およびPD00055細胞)のFACS解析を示す。図に示したように、これらの細胞試料は、EGFRtを発現するCD8T細胞およびCD4T細胞を有していた。
図43に、A群、B群およびC群からなる3つのマウス群を示す。プラセボとしてのPBSで処置した群(A群)、B群(PD00051「通常増殖細胞」で処置)およびC群(PD00055、サイトカインの組み合わせでパルスした細胞で処置)を含んでいた。図に示したように、プラセボで処置したA群のマウスは、20日目に腫瘍の進行が目視で確認された。PD0051(通常増殖細胞)で処置したB群マウスは、2匹のマウスにおいて腫瘍の進行が大幅に増大していることが示されている。C群のマウスでは、PD00055で処置したマウスは、わずかな腫瘍進行しか示さず、したがって、治療に使用する前に前記サイトカインの混合物で処理された細胞は、他の細胞よりも高い移植適合性を有することが示された。
図44に、3日間の投与後のマウスにおけるCAR発現T細胞の持続性を示す。図に示したように、CARを発現するCD4T細胞およびCD8T細胞は、通常の増殖方法により増殖させた細胞よりも高い持続性を有していた。
CAR発現T細胞によるT細胞治療後の腫瘍進行を調べた実験を行った後、インビトロにおいて様々なサイトカイン条件下で増殖させた細胞をインビボで抗原と繰り返し遭遇させた場合に殺傷能力に違いが見られるかどうかを評価するために実験を行った(図45)。この実験では、1群あたり3匹のマウスを含む3つのマウス群を使用した。A群のマウスはプラセボ(PBS)で処置した。B群は、「通常の増殖方法」により増殖させた細胞で処置した。(「通常」の増殖方法により増殖させたEGFRtCD4とEGFRtCD8とを1:1の比率で使用し、これらの細胞をZrx-014で形質導入した。PD0055#1(ドナーPD0038 CD4に5ng/mL IL-7および0.5ng/mLIL-15を添加、EGFRt+75.9%においてS1D14)およびPD0051#1(ドナーPD0038 CD8に50U/mL IL-2および0.5ng/mL IL-15を添加、EGFRt+76.8%においてS1D21)から得た。)(図18)C群は、増殖中にサイトカインでパルスした細胞で処置した。(「パルスした」EGFRtCD4とEGFRtCD8とを1:1の比率で使用し、Zrx-014で形質導入した。PD0055#2(ドナーPD0038 CD4を50U/mL IL-2で5日間パルス後、5ng/mL IL-7および5ng/mL IL-21を添加、EGFRt+81.2%においてS1D11)およびPD0051#2(ドナーPD0038 CD8を50U/mL IL-2で5日間パルス後、5ng/mL IL-7および5ng/mL IL-21を添加、EGFRt+89.5%においてS1D21)から得た。)
図46に示すように、A群のマウスはPBS注射後20日目までに死亡した。「通常の増殖方法」により増殖させた細胞で処置したB群のマウスでは、120日目までに1匹のマウスにおいて腫瘍の進行が見られた。これに対して、サイトカインの存在下で増殖させた細胞で処置したマウスでは、120日目まで腫瘍は見られなかった。したがって、これらのデータから、CD4およびCD8に特異的なサイトカインの混合物で処理された細胞は、マウスにおける移植定着率が高く、生存率も高かったことが示された。さらに、これらの細胞は、腫瘍進行をより効率的に阻止した。
図47に示したように、腫瘍接種後にPD0051細胞またはPD0055細胞で処置したマウスは、100%の生存率を示した。しかしながら、腫瘍の進行は、PD0055細胞を用いて処置した場合に減少することが示された。
図48に示したように、プラセボ、「通常の増殖」方法で増殖させたT細胞、およびサイトカインの組み合わせでパルスしたT細胞で処置したマウスにおいて平均腫瘍進行を調べた。実験の0日目では、マウスに腫瘍を接種し、6日目に腫瘍を画像化した。次いで、7日目にT細胞またはプラセボを投与した。次いで、腫瘍接種を14日目および21日目に再度行った。
28日目、35日目、49日目、63日目、78日目、92日目、105日目、および120日目にマウスの腫瘍の進行について調べ、その際、腫瘍の画像を撮影した。マウスの群で示されたように、腫瘍の進行は、サイトカインでパルスした細胞で処置したマウスでは減少しており、このことから、サイトカインでパルスした細胞は、サイトカインを用いない通常の条件下で増殖させた細胞よりも改善または向上された高い移植適合性を有することが示された。
図49に示したように、PLAT-01およびPLAT-02と同じ条件下またはこれらの「間」のプロトコルで増殖させた細胞間でインビボにおける殺傷能力に違いが見られるかどうかを評価するために実験をセットアップした。この実験では、1群あたり5匹のマウスを含む17個の群を用いて、前記細胞を腫瘍接種後のマウスの処置において試験した。図49の表に示したように、これらの群には、製剤条件1つにつき1回用量の細胞(1.25×10個、2.5×10個、5×10個、10×10個)を投与した。細胞の解凍、カウント、マウスへの注射は同じ日に行った。図50に、2種の増殖方法により得られた異なる細胞製剤におけるCD4細胞数およびCD8細胞数、ならびにこれらの細胞におけるEGFRt量を示す。
図51に示したように、17個のマウス群に腫瘍を接種し、次いで通常増殖方法により増殖させたT細胞またはサイトカインの組み合わせでパルスしたT細胞を用量漸増法により投与することによって処置した。グラフに示したように、高濃度のPLAT-1.00細胞を投与したマウスは、腫瘍進行の低下を呈した。また、PLAT-2.00を投与したマウスは、高濃度の細胞を投与した25日後に腫瘍進行の低下を示した。これに対して、PLAT-1.33を投与したマウスでは、細胞濃度とは関係なく腫瘍進行の増加を示したことから、PLAT-1.33細胞の移植適合性が低いか、あるいは移植適合性が低減したことが示された。PLAT-1.67細胞を投与したマウスでは、最高投与濃度の細胞で処置した場合に腫瘍進行の低下を呈した。しかしながら、図50で示したように、PLAT-1.33細胞はEGFRt細胞数が低かったことから、細胞表面上のCARの発現量の低下を示している可能性があった。
図51に、PD104細胞製剤とPD116細胞製剤の増殖開始時の比較を示す。このPD0104製剤については、PD0063 CD8およびCD4濃縮細胞を用いて実験を再度行い、Tx日における0.7×10個/mLまでの細胞増殖を試験した(「早期増殖」)。通常のPLAT-02培養条件においては、CD8細胞にはIL-2(50U/mL)+IL-15(0.5ng/mL)を使用し、CD4T細胞にはIL-7(5ng/mL)+IL-15(0.5ng/mL)を使用した。増殖および生存能は劇的に増加した。これらの細胞が示した曲線は、増殖/ビーズ除去/選択/凍結保存のタイミングに関しては臨床製剤で見られるものと類似している。
図52に示したように、PLAT-1.00細胞製剤、PLAT-1.33細胞製剤、PLAT-1.67細胞製剤、およびPLAT-2.00細胞製剤を用いた用量漸増法によりマウスを処置した。これらのグラフすべてで示したように、最低濃度の細胞は、腫瘍進行の治療において有効性が最も低かった。これに対して、移植適合性が最も高かった細胞は、高濃度のPLAT-1.00およびPLAT-2.00であった。
図53に示した細胞はいずれも1.25×10個の濃度では有効性が最も低かった。PLAT-1.00細胞が、腫瘍進行の抑制において最も有効であることが示され、これによって、PLAT-1.00細胞は他の群よりも優れた移植適合性、改善された移植適合性もしくは向上された移植適合性を有していたこと、およびサイトカインによる処理によってもPLAT-1.00細胞の移植適合性は向上、改善または増強されたことが示された。5×10個の濃度で示されたように、マウスの処置に使用した他の群の細胞と比べて、腫瘍の進行は25日目に阻止された。
図54に示したように、1用量あたり2.5×10個~10×10個の細胞用量で処置した場合にマウスはさらに高い生存率を示した。しかしながら、PLAT-1.00製剤の細胞で処置したマウスの生存率はさらに延長されていたことから、PLAT-1.00製剤群のT細胞は、さらに活発であり、改善または向上されたさらに高い移植適合性を示したことが示された。
図55に示したように、マウスの生存率は、細胞の用量濃度に依存していた。いずれの細胞においても、最低用量のT細胞で処置した場合、マウスの生存率は低下した。しかしながら、上述のとおり、PLAT-1.00製剤の細胞で処置したマウスの生存率はさらに延長されていたことから、PLAT-1.00製剤群のT細胞は、さらに活発であり、改善された移植適合性を有していたことが示された。
さらなる実施形態
いくつかの実施形態においては、キメラ抗原受容体を有する遺伝子改変T細胞の製造方法であって、
T細胞の混合集団から、胸腺細胞に由来するT細胞、遺伝子改変された前駆細胞(望ましくはiPS細胞)に由来するT細胞などの、CD8T細胞集団および/またはCD4T細胞集団を分離、単離または濃縮して、該T細胞が単離された集団を作製すること、
得られた前記T細胞集団を刺激して、刺激されたCD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団を作製すること、
前記刺激されたCD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団を、細胞表面選択マーカーをコードするマーカー配列とキメラ抗原受容体とをコードするベクターで形質導入して、形質導入されたCD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団を作製すること、
形質導入されたCD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団と、少なくとも1つのサイトカインとを接触させて、サイトカイン刺激性形質導入CD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団を作製すること、
前記サイトカイン刺激性形質導入CD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団を前記マーカー配列による選択によって濃縮して、濃縮されたサイトカイン刺激性形質導入CD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団を作製すること、ならびに
前記濃縮されたサイトカイン刺激性形質導入CD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団を少なくとも1日増殖させて、キメラ抗原受容体を有する遺伝子改変T細胞を得ること
を含む方法が提供される。
いくつかの実施形態においては、T細胞の混合集団からの前記CD8T細胞集団および/またはCD4T細胞集団の前記分離は、CD8および/またはCD4上に存在するエピトープを有するT細胞を親和性により選択することによって行う。いくつかの実施形態においては、T細胞の混合集団からの前記CD8T細胞集団および/またはCD4T細胞集団の前記分離は、フローサイトメトリーによって行う。いくつかの実施形態においては、T細胞の混合集団からの前記CD8T細胞集団および/またはCD4T細胞集団の前記分離は、免疫磁気選択によって行う。いくつかの実施形態においては、前記遺伝子改変CD8T細胞および/または前記遺伝子改変CD4T細胞は、少なくとも1つの受容体を含み、該少なくとも1つの受容体は、移植適合性を向上する。いくつかの実施形態においては、前記少なくとも1つの受容体は、CD45 RA、CD45 RO、CCR7、CD25、CD127、CD57、CD137、CD27、CD28および/またはCD62Lである。いくつかの実施形態においては、前記少なくとも1つの受容体は、CD27、CD28および/またはCD62Lである。いくつかの実施形態においては、前記単離されたT細胞集団の刺激は、前記CD8および/またはCD4T細胞と、ビーズまたは粒子などの、抗体を結合させた支持体とを接触させることによって行う。いくつかの実施形態においては、前記抗体を結合させた支持体は、抗TCR抗体、抗CD2抗体、抗CD3抗体、抗CD4抗体および/または抗CD28抗体を含む。いくつかの実施形態においては、前記抗体を結合させた支持体は、抗CD3抗体および/または抗CD28抗体を含む。いくつかの実施形態においては、前記ベクターは、リーダー配列をコードする第1の配列、リガンド結合ドメインをコードする第2の配列、シグナル伝達ドメインをコードする第3の配列、および選択マーカー配列をコードする第4の配列をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記ベクターは、スペーサーをコードする配列をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーはIgG4のヒンジ領域を含む。いくつかの実施形態においては、前記ベクターはウイルスベクターである。いくつかの実施形態においては、前記ウイルスベクターは、シミアンウイルス40、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス(AAV)、レンチウイルスまたはレトロウイルスに由来する。いくつかの実施形態においては、前記ウイルスベクターは、組換えアデノウイルスベクター、組換えアデノ随伴ウイルスベクター、組換えレンチウイルスベクターまたは組換えレトロウイルスベクターである。いくつかの実施形態においては、前記ウイルスベクターは、レンチウイルスベクターである。いくつかの実施形態においては、前記マーカー配列は、末端切断型上皮成長因子受容体(EGFRt)をコードする。いくつかの実施形態においては、前記少なくとも1つのサイトカインは、GM-CSF、IL-7、IL-12、IL-15、IL-18、IL-2および/またはIL-21を含む。いくつか実施形態では、前記少なくとも1つのサイトカインはIL-7、IL-15および/またはIL-21を含む。いくつかの実施形態では、前記少なくとも1つのサイトカインはIL-2、IL-15および/またはIL-21を含む。いくつかの実施形態においては、前記接触を、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、14日、15日、16日、17日、18日、19日もしくは20日にわたって、またはこれらの値のいずれか2つによって定義される範囲にある期間にわたって行う。いくつかの実施形態では、前記方法は、単離されたCD4細胞を使用して、CD8細胞の非存在下において行われる。いくつかの実施形態では、前記方法は、単離したCD8細胞を使用して、CD4細胞の非存在下またはCD4細胞よりも該CD8細胞が多く含まれるように濃縮された条件下において実施する。いくつかの実施形態においては、前記CD4発現T細胞を少なくとも1日増殖させ、20日間増殖させてもよく、たとえば、1日、2日間、3日間、4日間、5日間、6日間、7日間、8日間、9日間、10日間、11日間、12日間、13日間、14日間、15日間、16日間、17日間、18日間、19日間もしくは20日間にわたって、またはこれらの期間のいずれか2つによって定義される範囲にある期間にわたって増殖させる。いくつかの実施形態においては、前記CD8発現T細胞を少なくとも1日増殖させ、20日間増殖させてもよく、たとえば、1日、2日間、3日間、4日間、5日間、6日間、7日間、8日間、9日間、10日間、11日間、12日間、13日間、14日間、15日間、16日間、17日間、18日間、19日間もしくは20日間にわたって、またはこれらの期間のいずれか2つによって定義される範囲にある期間にわたって増殖させる。いくつかの実施形態においては、前記方法は、ビーズまたは粒子などの、前記抗体を結合させた支持体を除去することをさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記キメラ抗原受容体の前記リガンド結合ドメインは、抗体またはその結合部分を含む。いくつかの実施形態においては、前記キメラ抗原受容体の前記リガンド結合ドメインは、一本鎖可変フラグメント(scFv)またはその結合部分を含む。いくつかの実施形態においては、前記キメラ抗原受容体の前記リガンド結合ドメインは、FMC63またはその結合部分を含む。いくつかの実施形態においては、前記キメラ抗原受容体の前記リガンド結合ドメインは、CD19に特異的である。いくつかの実施形態においては、前記方法は、前記遺伝子改変CD8および/またはCD4T細胞を凍結保存することをさらに含む。
いくつかの実施形態では、遺伝子改変T細胞集団であって、
該遺伝子改変T細胞集団が、親和性により選択された複数のCD8および/もしくはCD4T細胞を含み、CD8および/もしくはCD4T細胞を含んでいないか、CD8および/もしくはCD4T細胞よりも該CD8および/もしくはCD4T細胞が多く含まれるように濃縮されているか、またはCD8および/もしくはCD4T細胞から単離されていること、
前記親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4T細胞が、刺激されたCD2受容体、CD3受容体、CD4受容体および/またはCD28受容体を有していること、
前記親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4T細胞が、キメラ抗原受容体と細胞表面選択マーカーとをコードする遺伝子をさらに含むこと、ならびに
前記親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4T細胞が、少なくとも1つのサイトカインで再刺激されていることを特徴とする遺伝子改変T細胞集団が提供される。
いくつかの実施形態においては、前記少なくとも1つのサイトカインは、GM-CSF、IL-7、IL-12、IL-18、IL-15、IL-2および/またはIL-21を含む。いくつか実施形態では、前記少なくとも1つのサイトカインはIL-7、IL-15および/またはIL-21を含む。いくつかの実施形態では、前記少なくとも1つのサイトカインはIL-2、IL-15および/またはIL-21を含む。いくつかの実施形態においては、前記親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4T細胞は、少なくとも1つの受容体をさらに含み、該少なくとも1つの受容体は、移植適合性を向上、誘導または増強するか、移植適合性に寄与する。いくつかの実施形態においては、移植適合性を向上、誘導または増強するか、移植適合性に寄与する前記少なくとも1つの受容体は、CD45 RA、CD45 RO、CCR7、CD25、CD127、CD57、CD137、CD27、CD28および/またはCD62Lである。いくつかの実施形態においては、移植適合性を向上、誘導または増強するか、移植適合性に寄与する前記少なくとも1つの受容体は、CD27、CD28および/またはCD62Lである。いくつかの実施形態においては、前記親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4T細胞は、リーダー配列をコードする第1の配列、リガンド結合ドメインをコードする第2の配列、シグナル伝達ドメインをコードする第3の配列および選択マーカー配列をコードする第4の配列を有するベクターをさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記ベクターは、スペーサーをコードする配列をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーはIgG4のヒンジ領域を含む。いくつかの実施形態においては、前記ベクターはウイルスベクターである。いくつかの実施形態においては、前記ウイルスベクターは、シミアンウイルス40、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス(AAV)、レンチウイルスまたはレトロウイルスに由来する。いくつかの実施形態においては、前記ウイルスベクターは、組換えアデノウイルスベクター、組換えアデノ随伴ウイルスベクター、組換えレンチウイルスベクターまたは組換えレトロウイルスベクターである。いくつかの実施形態においては、前記ウイルスベクターは、レンチウイルスベクターである。いくつかの実施形態においては、前記細胞表面選択マーカーは、末端切断型上皮成長因子受容体(EGFRt)をコードする。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは、抗体またはその結合部分を含む。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは、一本鎖可変フラグメント(scFv)またはその結合部分を含む。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは、FMC63またはその結合部分を含む。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは、CD19に特異的である。いくつかの実施形態においては、前記集団は、単離されたCD4T細胞を含み、CD8T細胞を含んでいないか、CD8T細胞よりも該CD4T細胞が多く含まれるように濃縮されている。いくつかの実施形態においては、前記集団は、単離されたCD8T細胞を含み、CD4T細胞を含んでいないか、CD4T細胞よりも該CD8T細胞が多く含まれるように濃縮されている。
いくつかの実施形態においては、ヒトを治療するための組成物または組み合わせ製剤であって、少なくとも1つの遺伝子改変T細胞集団と医薬品添加剤とを含む組成物または組み合わせ製剤が提供される。
いくつかの実施形態においては、前記少なくとも1つの遺伝子改変T細胞集団は、
親和性により選択された複数のCD8および/もしくはCD4T細胞を含み、CD8および/もしくはCD4T細胞を含んでいないか、CD8および/もしくはCD4T細胞よりも該CD8および/もしくはCD4T細胞が多く含まれるように濃縮されているか、またはCD8および/もしくはCD4T細胞から単離されていること、
前記親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4T細胞が、刺激されたCD2受容体、CD3受容体、CD4受容体および/またはCD28受容体を有していること、
前記親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4T細胞が、キメラ抗原受容体と細胞表面選択マーカーとをコードする遺伝子をさらに含むこと、ならびに
前記親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4T細胞が、少なくとも1つのサイトカインで再刺激されていることを特徴とする。
いくつかの実施形態においては、前記少なくとも1つのサイトカインは、GM-CSF、IL-7、IL-12、IL-15、IL-18、IL-2および/またはIL-21を含む。いくつか実施形態では、前記少なくとも1つのサイトカインはIL-7、IL-15および/またはIL-21を含む。いくつかの実施形態では、前記少なくとも1つのサイトカインはIL-2、IL-15および/またはIL-21を含む。いくつかの実施形態においては、前記親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4T細胞は、少なくとも1つの受容体をさらに含み、該少なくとも1つの受容体は、移植適合性を向上、誘導または増強するか、移植適合性に寄与する。いくつかの実施形態においては、移植適合性を向上、誘導または増強するか、移植適合性に寄与する前記少なくとも1つの受容体は、CD45 RA、CD45 RO、CCR7、CD25、CD127、CD57、CD137、CD27、CD28および/またはCD62Lである。いくつかの実施形態においては、移植適合性を向上、誘導または増強するか、移植適合性に寄与する前記少なくとも1つの受容体は、CD27、CD28および/またはCD62Lである。いくつかの実施形態においては、前記親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4T細胞は、リーダー配列をコードする第1の配列、リガンド結合ドメインをコードする第2の配列、シグナル伝達ドメインをコードする第3の配列および選択マーカー配列をコードする第4の配列を有するベクターをさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記ベクターは、スペーサーをコードする配列をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーはIgG4のヒンジ領域を含む。いくつかの実施形態においては、前記ベクターはウイルスベクターである。いくつかの実施形態においては、前記ウイルスベクターは、シミアンウイルス40、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス(AAV)、レンチウイルスまたはレトロウイルスに由来する。いくつかの実施形態においては、前記ウイルスベクターは、組換えアデノウイルスベクター、組換えアデノ随伴ウイルスベクター、組換えレンチウイルスベクターまたは組換えレトロウイルスベクターである。いくつかの実施形態においては、前記ウイルスベクターは、レンチウイルスベクターである。いくつかの実施形態においては、前記細胞表面選択マーカーは、末端切断型上皮成長因子受容体(EGFRt)をコードする。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは、抗体またはその結合部分を含む。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは、一本鎖可変フラグメント(scFv)またはその結合部分を含む。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは、FMC63またはその結合部分を含む。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは、CD19に特異的である。いくつかの実施形態においては、前記少なくとも1つの集団は、単離されたCD4T細胞を含み、CD8T細胞を含んでいないか、CD8T細胞よりも該CD4T細胞が多く含まれるように濃縮されている。いくつかの実施形態においては、前記少なくとも1つの集団は、単離されたCD8T細胞を含み、CD4T細胞を含んでいないか、CD4T細胞よりも該CD8T細胞が多く含まれるように濃縮されている。いくつかの実施形態においては、前記組成物または組み合わせ製剤は、前記遺伝子改変T細胞集団を含み、該遺伝子改変T細胞集団は、単離されたCD8T細胞を含み、CD4T細胞を含んでいないか、CD4T細胞よりも該CD8T細胞が多く含まれるように濃縮されている。いくつかの実施形態においては、前記組成物または組み合わせ製剤は、前記遺伝子改変T細胞集団を含み、該遺伝子改変T細胞集団は、単離されたCD4T細胞を含み、CD8T細胞を含んでいないか、CD8T細胞よりも該CD4T細胞が多く含まれるように濃縮されている。いくつかの実施形態においては、前記集団は、単離されたCD8T細胞と単離されたCD4T細胞とを含み、これらT細胞が1:1の比率で混合されているかまたは共投与され、該単離されたCD8T細胞は、CD4T細胞を含んでいないか、CD4T細胞よりも該CD8T細胞が多く含まれるように濃縮されており、該単離されたCD4T細胞は、CD8T細胞を含んでいないか、CD8T細胞よりも該CD4T細胞が多く含まれるように濃縮されている。
いくつかの実施形態においては、疾患の治療、抑制または緩和を必要とする対象において該疾患を治療、抑制または緩和する方法であって、少なくとも1つの組成物または組み合わせ製剤を前記対象に投与することを含む方法が提供される。いくつかの実施形態においては、前記少なくとも1つの組成物または組み合わせ製剤は、少なくとも1つの遺伝子改変T細胞集団と医薬品添加剤とを含む。
いくつかの実施形態においては、前記少なくとも1つの遺伝子改変T細胞集団は、
親和性により選択された複数のCD8および/もしくはCD4T細胞を含み、CD8および/もしくはCD4T細胞を含んでいないか、CD8および/もしくはCD4T細胞よりも該CD8および/もしくはCD4T細胞が多く含まれるように濃縮されているか、またはCD8および/もしくはCD4T細胞から単離されていること、
前記親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4T細胞が、刺激されたCD2受容体、CD3受容体、CD4受容体および/またはCD28受容体を有していること、
前記親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4T細胞が、キメラ抗原受容体と細胞表面選択マーカーとをコードする遺伝子をさらに含むこと、ならびに
前記親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4T細胞が、少なくとも1つのサイトカインで再刺激されていることを特徴とする。
いくつかの実施形態においては、前記少なくとも1つのサイトカインは、GM-CSF、IL-7、IL-12、IL-15、IL-18、IL-2および/またはIL-21を含む。いくつか実施形態では、前記少なくとも1つのサイトカインはIL-7、IL-15および/またはIL-21を含む。いくつかの実施形態では、前記少なくとも1つのサイトカインはIL-2、IL-15および/またはIL-21を含む。いくつかの実施形態においては、前記親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4T細胞は、少なくとも1つの受容体をさらに含み、該少なくとも1つの受容体は、移植適合性を向上する。いくつかの実施形態においては、移植適合性を向上、誘導または増強するか、移植適合性に寄与する前記少なくとも1つの受容体は、CD45 RA、CD45 RO、CCR7、CD25、CD127、CD57、CD137、CD27、CD28および/またはCD62Lである。いくつかの実施形態においては、移植適合性を向上、誘導または増強するか、移植適合性に寄与する前記少なくとも1つの受容体は、CD27、CD28および/またはCD62Lである。いくつかの実施形態においては、前記親和性により選択された複数のCD8および/またはCD4T細胞は、リーダー配列をコードする第1の配列、リガンド結合ドメインをコードする第2の配列、シグナル伝達ドメインをコードする第3の配列および選択マーカー配列をコードする第4の配列を有するベクターをさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記ベクターは、スペーサーをコードする配列をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記スペーサーはIgG4のヒンジ領域を含む。いくつかの実施形態においては、前記ベクターはウイルスベクターである。いくつかの実施形態においては、前記ウイルスベクターは、シミアンウイルス40、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス(AAV)、レンチウイルスまたはレトロウイルスに由来する。いくつかの実施形態においては、前記ウイルスベクターは、組換えアデノウイルスベクター、組換えアデノ随伴ウイルスベクター、組換えレンチウイルスベクターまたは組換えレトロウイルスベクターである。いくつかの実施形態においては、前記ウイルスベクターは、レンチウイルスベクターである。いくつかの実施形態においては、前記細胞表面選択マーカーは、末端切断型上皮成長因子受容体(EGFRt)をコードする。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは、抗体またはその結合部分を含む。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは、一本鎖可変フラグメント(scFv)またはその結合部分を含む。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは、FMC63またはその結合部分を含む。いくつかの実施形態においては、前記リガンド結合ドメインは、CD19に特異的である。いくつかの実施形態においては、前記少なくとも1つの集団は、単離されたCD4T細胞を含み、CD8T細胞を含んでいないか、CD8T細胞よりも該CD4T細胞が多く含まれるように濃縮されている。いくつかの実施形態においては、前記少なくとも1つの集団は、単離されたCD8T細胞を含み、CD4T細胞を含んでいないか、CD4T細胞よりも該CD8T細胞が多く含まれるように濃縮されている。いくつかの実施形態においては、前記組成物または組み合わせ製剤は、前記遺伝子改変T細胞集団を含み、該遺伝子改変T細胞集団は、単離されたCD8T細胞を含み、CD4T細胞を含んでいないか、CD4T細胞よりも該CD8T細胞が多く含まれるように濃縮されている。いくつかの実施形態においては、前記組成物または組み合わせ製剤は、前記遺伝子改変T細胞集団を含み、該遺伝子改変T細胞集団は、単離されたCD4T細胞を含み、CD8T細胞を含んでいないか、CD8T細胞よりも該CD4T細胞が多く含まれるように濃縮されている。いくつかの実施形態においては、前記集団は、単離されたCD8T細胞と単離されたCD4T細胞とを含み、これらT細胞が1:1の比率で混合されているかまたは共投与され、該単離されたCD8T細胞は、CD4T細胞を含んでいないか、CD4T細胞よりも該CD8T細胞が多く含まれるように濃縮されており、該単離されたCD4T細胞は、CD8T細胞を含んでいないか、CD8T細胞よりも該CD4T細胞が多く含まれるように濃縮されている。いくつかの実施形態では、前記方法は、前記組成物または組み合わせ製剤を投与することを含み、該組成物または組み合わせ製剤は少なくとも1つの集団を含み、該少なくとも1つの集団は、単離されたCD4T細胞を含み、CD8T細胞を含んでいないか、CD8T細胞よりもCD4T細胞が多く含まれるように濃縮されている。いくつかの実施形態では、前記方法は、前記組成物または組み合わせ製剤を投与することを含み、該組成物または組み合わせ製剤は少なくとも1つの集団を含み、該少なくとも1つの集団は、単離されたCD8T細胞を含み、CD4T細胞を含んでいないか、CD4T細胞よりもCD8T細胞が多く含まれるように濃縮されている。いくつかの実施形態では、前記方法は、前記組成物または組み合わせ製剤を投与することを含み、該組成物または組み合わせ製剤は少なくとも1つの集団を含み、該少なくとも1つの集団は、単離されたCD4T細胞と単離されたCD8T細胞とを含み、これらのT細胞が1:1の比率で混合されているかまたは共投与され、該単離されたCD4T細胞は、CD8T細胞を含んでいないか、CD8T細胞よりも該CD4T細胞が多く含まれるように濃縮されており、該単離されたCD8T細胞は、CD4T細胞を含んでいないか、CD4T細胞よりも該CD8T細胞が多く含まれるように濃縮されている。いくつかの実施形態では、前記方法は、前記組成物または組み合わせ製剤を投与することをさらに含み、該組成物または組み合わせ製剤は少なくとも1つの集団を含み、該少なくとも1つの集団は、単離されたCD8T細胞を含み、CD4T細胞を含んでいないか、CD4T細胞よりも該CD8T細胞が多く含まれるように濃縮されている。いくつかの実施形態では、前記方法は、前記組成物または組み合わせ製剤を投与することをさらに含み、該組成物または組み合わせ製剤は少なくとも1つの集団を含み、該少なくとも1つの集団は、単離されたCD4T細胞を含み、CD8T細胞を含んでいないか、CD8T細胞よりも該CD4T細胞が多く含まれるように濃縮されている。いくつかの実施形態において、前記対象は、抗がん療法を受ける対象として同定または選択されている。いくつかの実施形態において、前記方法は、疾患の抑制を測定または評価することをさらに含む。いくつかの実施形態において、前記方法は、前記組成物または組み合わせ製剤の投与前、投与中または投与後に、前記対象に別の抗がん療法を提供することをさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記組成物または組み合わせ製剤を、養子細胞移入によって前記対象に投与する。いくつかの実施形態においては、前記対象を別の形態の抗がん療法で処置した後に、前記組成物または組み合わせ製剤を該対象に投与する。いくつかの実施形態においては、前記対象を別の形態の抗がん療法で処置した後に、前記組成物または組み合わせ製剤を該対象に投与する。いくつかの実施形態では、前記対象は白血病患者である。いくつかの実施形態では、前記対象は、再発性かつ/または化学療法抵抗性のCD19小児急性リンパ芽球性白血病(ALL)を有する。いくつかの実施形態では、前記対象は、再発性かつ/または化学療法抵抗性のCD19急性リンパ芽球性白血病(ALL)を有する。いくつかの実施形態においては、前記対象は自己免疫疾患患者である。いくつかの実施形態においては、前記対象はHSCT後の再発を有する。
本明細書における実質的に複数形および/または単数形の用語の使用に関して、当業者であれば、本明細書の文脈および/または本明細書に記載の用途を踏まえて、複数個のものを単数のものであると解釈することができ、かつ/または単数のものを複数個のものであると解釈することができる。本発明を明確なものとするため、単数から複数または複数から単数へのさまざまな置き換えが本明細書において記載されている。
当業者であれば、通常、本明細書に記載の用語、特に、添付の請求項(たとえば、添付の請求項の本体部)において使用されている用語は「オープンエンドな」用語であることを理解するであろう(たとえば、「含んでいる(including)」という用語は、「含んでいるが、これらに限定されない」と解釈されるべきであり、「有する(having)」という用語は、「少なくとも有する」と解釈されるべきであり、「含む(includes)」という用語は「含むが、これらに限定されない」と解釈されるべきである)。さらに、当業者であれば、特定の数について請求項に記載する場合、その記載の意図も請求項に明確に記載すべきであり、特定数が記載されない場合はその意図を記載する必要はないことを理解するであろう。分かりやすく説明をすれば、たとえば、後述の特許請求の範囲では、請求項を記載するために、「少なくとも1つ」や「1つ以上」といった前置きが記載されている場合がある。しかしながら、このような前置きが使用されているからといって、不定冠詞「1つ(aまたはan)」で記載された特定の請求項を、1つのみの要素を含む実施形態に限定すべきではなく、たとえ同じ請求項内に「1つ以上」または「少なくとも1つ」といった前置きと「1つ(aまたはan)」といった不定冠詞とが含まれていたとしても、1つのみの要素を含む実施形態に限定すべきではない(たとえば、「1つ(aおよび/またはan)」は、通常、「少なくとも1つ」または「1つ以上」を意味すると解釈されるべきである)。これは、請求項の記載において定冠詞が使用された場合でも同じである。さらに、請求項に特定の数が明確に記載されていたとしても、当業者であれば、通常、「少なくとも」記載されたその数であるということを理解するであろう(たとえば、修飾語を伴わない「2つ」という記載は、「少なくとも」2つまたは「2つ以上」を意味する)。さらに、たとえば「A、BおよびCのうち少なくとも1つ」などの頻用される語句を使用する場合、通常、そのような文構造は、当業者がその語句を通常理解する意味で記載されている(たとえば、「A、BおよびCのうち少なくとも1つを有するシステム」は、Aのみを有するシステム、Bのみを有するシステム、Cのみを有するシステム、AとBの両方を有するシステム、AとCの両方を有するシステム、BとCの両方を有するシステム、ならびに/またはA、BおよびCのすべてを有するシステムなどを包含するが、これらに限定されない)。「A、BまたはCのうち少なくとも1つ」などの頻用される語句が使用される場合、通常、そのような文構造は、当業者がその語句を通常理解する意味で記載されている(たとえば、「A、BまたはCのうち少なくとも1つを有するシステム」は、Aのみを有するシステム、Bのみを有するシステム、Cのみを有するシステム、AとBの両方を有するシステム、AとCの両方を有するシステム、BとCの両方を有するシステム、ならびに/またはA、BおよびCのすべてを有するシステムなどを包含するが、これらに限定されない)。さらに、当業者であれば、2つ以上の選択肢を表すための選言的用語および/または選言的語句は、明細書、特許請求の範囲または図面のいずれにおいても、列記された用語のうちの1つ、列記された用語のいずれか、または列記された用語の両方を含む場合があると理解すべきであると理解するであろう。たとえば、「AまたはB」という表現は、「AまたはB」または「AおよびB」を示す場合を包含する。
さらなる実施形態
いくつかの実施形態においては、T細胞の混合集団からの、胸腺細胞に由来するT細胞、遺伝子改変された前駆細胞(望ましくはiPS細胞)に由来するT細胞などの、CD8発現T細胞集団および/またはCD4発現T細胞集団の前記分離、濃縮または単離は、CD8および/またはCD4上に存在するエピトープを有するT細胞を親和性により選択することによって行う。いくつかの実施形態においては、T細胞の混合集団からの、CD8発現T細胞集団および/またはCD4発現T細胞集団の前記分離、濃縮または単離は、フローサイトメトリーによって行う。いくつかの実施形態においては、T細胞の混合集団からの、CD8発現T細胞集団および/またはCD4発現T細胞集団の前記分離、濃縮または単離は、免疫磁気選択によって行う。いくつかの実施形態においては、前記遺伝子改変CD8発現T細胞および/または前記遺伝子改変CD4発現T細胞は、少なくとも1つの受容体を含み、該少なくとも1つの受容体は、移植適合性を向上または誘導するか、移植適合性に寄与する。いくつかの実施形態においては、移植適合性を向上または誘導するか、移植適合性に寄与する前記少なくとも1つの受容体は、CD45 RA、CD45 RO、CCR7、CD25、CD127、CD57、CD137、CD27、CD28および/またはCD62Lである。いくつかの好ましい実施形態において、移植適合性を向上または誘導するか、移植適合性に寄与する前記少なくとも1つの受容体は、CD27、CD28および/またはCD62Lである。いくつかの実施形態においては、前記単離、濃縮または分離されたT細胞集団の前記刺激は、前記CD8および/またはCD4発現T細胞と、ビーズまたは粒子などの、抗体を結合させた支持体とを接触させることによって行う。前記実施形態のいくつかにおいては、前記抗体を結合させた支持体は、抗TCR抗体、抗CD2抗体、抗CD3抗体、抗CD4抗体および/または抗CD28抗体を含む。いくつかの好ましい実施形態において、前記抗体を結合させた支持体は、抗CD3抗体および/または抗CD28抗体を含む。
前記実施形態の多くにおいては、前記ベクターは、リーダー配列をコードする第1の配列、リガンド結合ドメインをコードする第2の配列、シグナル伝達ドメインをコードする第3の配列、および選択マーカー配列をコードする第4の配列をさらに含む。前記実施形態のいくつかにおいては、前記ベクターは、スペーサーをコードする配列をさらに含み、いくつかの実施形態においては、該スペーサーはIgG4のヒンジ領域を含んでいてもよい。前記実施形態の多くにおいては、前記ベクターはウイルスベクターまたはミニサークル(minicircle)である。
前記実施形態の多くにおいては、前記ウイルスベクターは、シミアンウイルス40、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス(AAV)、レンチウイルスまたはレトロウイルスに由来する。いくつかの実施形態においては、前記ウイルスベクターは、組換えアデノウイルスベクター、組換えアデノ随伴ウイルスベクター、組換えレンチウイルスベクターまたは組換えレトロウイルスベクターである。前記ウイルスベクターは、レンチウイルスベクターであることが好ましい。前記実施形態の多くにおいては、前記マーカー配列は、末端切断型上皮成長因子受容体(EGFRt)をコードする。前記実施形態の多くにおいて使用される前記少なくとも1つのサイトカインは、GM-CSF、IL-7、IL-12、IL-15、L-18、IL-15、IL-2および/またはIL-21を含み、該サイトカインは、たとえば前記T細胞によって産生されうる任意のサイトカインまたは培地中に存在しうる任意のサイトカインに加えて、外部から前記T細胞に供給されたものであってもよい。
望ましい実施形態では、前記少なくとも1つのサイトカインはIL-7、IL-15および/またはIL-21を含む。前記実施形態の多くにおいては、前記少なくとも1つのサイトカインはIL-2、IL-15および/またはIL-21を含む。望ましい実施形態においては、前記少なくとも1つのサイトカインは、IL-21および別のサイトカインを含み、かつ/またはIL-7および少なくとも1つの別のサイトカインを含み、かつ/またはIL-15および少なくとも1つの別のサイトカインを含み、たとえば、IL-21およびIL-15を含むか、IL-21およびIL-7を含むか、IL-15およびIL-7を含むか、IL-2およびIL-15を含むか、IL-7およびIL-15を含む。好ましい実施形態においては、前記接触を、少なくとも1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、14日、15日、16日、17日、18日、19日もしくは20日にわたって、またはこれらの時間点のいずれか2つによって定義される範囲にある期間にわたって行う。前記実施形態の多くにおいては、前記方法は、CD8発現T細胞の非存在下、またはT細胞集団が分離も濃縮も単離もされていない天然集団と比較してCD8発現T細胞が低減された条件下において、胸腺細胞に由来するT細胞、遺伝子改変された前駆細胞(望ましくはiPS細胞)に由来するT細胞などの、単離、分離または濃縮されたCD4発現T細胞集団を使用して行う。前記実施形態の多くにおいては、前記方法は、CD4発現T細胞の非存在下、またはT細胞集団が分離も濃縮も単離もされていない天然集団と比較してCD4発現T細胞が低減された条件下において、胸腺細胞に由来するT細胞、遺伝子改変された前駆細胞(望ましくはiPS細胞)に由来するT細胞などの、単離、分離または濃縮されたCD8発現T細胞集団を使用して行う。前記実施形態の多くにおいては、少なくとも1日、たとえば、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、14日、15日、16日、17日、18日、19日もしくは20日にわたって、またはこれらの時間点のいずれか2つによって定義される時間範囲にある任意の時間にわたって、前記CD4発現T細胞を増殖させる。前記実施形態の多くにおいては、少なくとも1日、たとえば、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、14日、15日、16日、17日、18日、19日もしくは20日にわたって、またはこれらの時間点のいずれか2つによって定義される時間範囲にある任意の時間にわたって、前記CD8発現T細胞を増殖させる。
いくつかの実施形態においては、キメラ抗原受容体を有する遺伝子改変T細胞の製造方法であって、
T細胞の混合集団から、胸腺細胞に由来するT細胞、遺伝子改変された前駆細胞(iPS細胞であってもよい)に由来するT細胞などの、CD8発現T細胞集団および/またはCD4発現T細胞集団を分離または濃縮して、該T細胞が分離または濃縮された集団を作製すること、
前記分離または濃縮されたT細胞集団を刺激して、刺激されたCD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団を作製すること、
前記刺激されたCD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団を、キメラ抗原受容体をコードするベクターで形質導入して、形質導入されたCD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団を作製すること、
前記形質導入されたCD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団と、外部から供給された少なくとも1つのサイトカインとを、1日、2日間、3日間、4日間、5日間、6日間、7日間、8日間、9日間、10日間、11日間、12日間、13日間、14日間、15日間、16日間、17日間、18日間、19日間もしくは20日間にわたって、またはこれらの期間のいずれか2つによって定義される範囲にある期間にわたって接触させて、サイトカイン刺激性形質導入CD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団を作製することを含み、
これらの工程によって、キメラ抗原受容体を有する前記遺伝子改変のT細胞を得ることを特徴とする方法が提供される。
いくつかの実施形態においては、前記方法は、前記サイトカイン刺激性形質導入CD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団をマーカーによる選択によって濃縮して、濃縮されたサイトカイン刺激性形質導入CD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団を作製することを含む。いくつかの実施形態では、前記マーカーは前記ベクターによってコードされ、前記マーカーは細胞表面マーカーであってもよい。いくつかの実施形態では、前記方法は、前記濃縮されたサイトカイン刺激性形質導入CD8T細胞および/またはCD4T細胞の集団を少なくとも1日、たとえば、1日、2日間、3日間、4日間、5日間、6日間、7日間、8日間、9日間、10日間、11日間、12日間、13日間、14日間、15日間、16日間、17日間、18日間、19日間もしくは20日間にわたって、またはこれらの期間のいずれか2つによって定義される範囲にある期間にわたって増殖させることをさらに含む。
いくつかの実施形態においては、遺伝子改変T細胞の製造方法であって、
CD4T細胞が濃縮されたT細胞組成物中の細胞に、組換えタンパク質をコードするベクターを導入すること、および
前記CD4T細胞が濃縮されたT細胞組成物中の前記細胞を、IL-7およびIL-15を含むサイトカインとともにインキュベートすることを含み、かつ/または
CD8T細胞が濃縮されたT細胞組成物中の細胞に、組換えタンパク質をコードするベクターを導入すること、および
前記CD8T細胞が濃縮されたT細胞組成物中の前記細胞を、IL-2およびIL-15を含むサイトカインとともにインキュベートすることを含み、
これらの工程によって、形質導入されたCD4濃縮集団および/または形質導入されたCD8濃縮集団を作製することを特徴とする方法が提供される。
いくつかの実施形態においては、前記形質導入されたCD4濃縮集団は、サイトカインの組み合わせの代わりにIL-2を単独で使用すること以外は前記方法と同じである別の方法で調製された対照としての形質導入CD4細胞濃縮集団よりも、CD62L、CD27および/またはCD28の表面発現レベルが高く、かつ/または対象に投与した後の移植適合性の指標、増殖および/または持続性が、対照としての前記形質導入CD4細胞濃縮集団よりも向上している。いくつかの実施形態においては、前記形質導入されたCD8濃縮集団は、サイトカインの組み合わせの代わりにIL-2を単独で使用すること以外は前記方法と同じである別の方法で調製された対照としての形質導入CD8細胞濃縮集団よりも、CD62L、CD27および/またはCD28の表面発現レベルが高く、かつ/または対象に投与した後の移植適合性の指標、増殖および/または持続性が、対照としての前記形質導入CD8細胞濃縮集団よりも向上している。
いくつかの実施形態においては、遺伝子改変T細胞の製造方法であって、
CD4T細胞が濃縮されたT細胞組成物中の細胞に、組換えタンパク質をコードするベクターを導入すること、および
前記CD4T細胞が濃縮されたT細胞組成物中の前記細胞を、第1のサイトカインの組み合わせとともにインキュベートすること、ならびに
CD8T細胞が濃縮されたT細胞組成物中の細胞に、組換えタンパク質をコードするベクターを導入すること、および
前記CD8T細胞が濃縮されたT細胞組成物中の前記細胞を、前記第1のサイトカインの組み合わせとは異なる第2のサイトカインの組み合わせとともにインキュベートすることを含み、
これらの工程によって、形質導入されたCD4濃縮集団および形質導入されたCD8濃縮集団を作製することを特徴とする方法が提供される。
いくつかの実施形態においては、前記形質導入されたCD4濃縮集団は、第1のサイトカインの組み合わせと第2のサイトカインの組み合わせとが同一のものであること以外は前記方法と同じである別の方法で調製された対照としての形質導入CD4細胞濃縮集団よりも、CD62L、CD27および/またはCD28の表面発現レベルが高く、かつ/または対象に投与した後の移植適合性の指標、増殖および/または持続性が、対照としての前記形質導入CD4細胞濃縮集団よりも向上している。いくつかの実施形態においては、前記形質導入されたCD8濃縮集団は、第1のサイトカインの組み合わせと第2のサイトカインの組み合わせとが同一のものであること以外は前記方法と同じである別の方法で調製された対照としての形質導入CD8細胞濃縮集団よりも、CD62L、CD27および/またはCD28の表面発現レベルが高く、かつ/または対象に投与した後の移植適合性の指標、増殖および/または持続性が、対照としての前記形質導入CD8細胞濃縮集団よりも向上している。いくつかの実施形態においては、前記第1の組み合わせはIL-7およびIL-15を含み、前記第2の組み合わせはIL-2およびIL-15を含む。いくつかの実施形態においては、前記単一または複数のサイトカインの組み合わせは、形質導入の開始に続けて添加され、形質導入を開始した日に添加してもよい。いくつかの実施形態においては、IL-2の濃度は50U/mLまたは約50U/mLであり、IL-15が使用可能な場合、その濃度は0.5ng/mLまたは約0.5ng/mLであり、かつ/またはIL-7が使用可能な場合、その濃度は5ng/mLまたは約5ng/mLである。いくつかの実施形態においては、前記CD4濃縮組成物および/または前記CD8濃縮組成物への前記サイトカインの組み合わせの添加は、インキュベートされる前記細胞が含まれる前記組成物の量を増加させて、細胞密度を低下させることを含む。いくつかの実施形態においては、移植適合性の前記指標は、前記組成物中の細胞のパーセンテージ、またはCD62L、CD27、および/またはCD28からなる群から選択される細胞表面マーカーの、前記集団の細胞表面における総発現レベルを含む。いくつかの実施形態においては、移植適合性の前記指標は、投与後の対象における持続性を含む。いくつかの実施形態では、前記細胞は前記対象に由来する。いくつかの実施形態においては、形質導入されたCD8および/またはCD4細胞は、この細胞が由来する対象に注射投与後、少なくとも30日間もしくは60日間または少なくとも約30日間もしくは約60日間にわたって持続する。いくつかの実施形態では、前記組換えタンパク質はキメラ抗原受容体である。いくつかの実施形態においては、前記方法は、前記形質導入を行う前に、CD4発現細胞が多く含まれるようにT細胞組成物を濃縮してから、上述のように形質導入を行い、前記CD4T細胞が濃縮されたT細胞組成物を作製することをさらに含み、かつ/またはCD8発現細胞が多く含まれるようにT細胞組成物を濃縮してから、上述のように形質導入を行い、前記CD8T細胞が濃縮されたT細胞組成物を作製することをさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記方法は前記遺伝子改変細胞を凍結保存することをさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記方法は、前記遺伝子改変細胞を対象に投与することをさらに含み、かつ前記投与の前に、前記形質導入されたCD4濃縮組成物と前記形質導入されたCD8濃縮組成物とをプールすることをさらに含んでもよい。
いくつかの実施形態においては、この「さらなる実施形態」の章において述べた先の段落に記載した、前記方法の実施形態のいずれかによって細胞または組成物が製造される。いくつかの実施形態においては、先の段落に記載した、前記方法の実施形態または前記組成物の実施形態のいずれかによって製造された前記細胞を投与する方法も考えられる。いくつかの実施形態においては、前記細胞または組成物を対象に投与する。いくつかの実施形態においては、前記投与は、前記細胞が由来する対象に対して行われる。
いくつかの実施形態においては、養子細胞療法を行う方法であって、
(a)刺激条件下およびIL-15およびIL-7の存在下においてCD4濃縮T細胞組成物をインキュベートして、増殖させたCD4組成物を作製すること、
(b)前記工程とは別に、刺激条件下およびIL-15およびIL-2の存在下においてCD8濃縮T細胞組成物をインキュベートして、増殖させたCD8組成物を作製すること、ならびに
(c)前記増殖させたCD4集団および前記増殖させたCD8集団を対象に投与すること(これらの集団を同時に投与してもよい)を含む方法が提供される。
いくつかの実施形態においては、前記CD4集団およびCD8集団は、前記対象から得られたものである。いくつかの実施形態においては、前記1つ以上のサイトカインまたはサイトカインの組み合わせは、CD21をさらに含む。いくつかの実施形態においては、前記CD4濃縮集団に含まれるCD4細胞は、少なくとも全体の70%、80%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%を占め、もしくは前記CD4濃縮集団中のT細胞の総数の少なくとも70%、80%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%を占め、かつ/または前記CD8濃縮集団に含まれるCD8細胞は、少なくとも全体の70%、80%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%を占め、もしくは前記CD8濃縮集団中のT細胞の総数の少なくとも70%、80%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%を占める。
さらに、本開示の構成要素または態様がマーカッシュ形式で記載されている場合、当業者であれば、マーカッシュ形式で記載された個々のメンバーまたはメンバーのサブグループについても記載されていると理解するであろう。

Claims (22)

  1. キメラ抗原受容体(CAR)を含み、改善された移植適合性を有するT細胞集団を製造する方法であって、
    (a)CARを含む、濃縮されたCD4T細胞および/またはCD8T細胞のT細胞集団を得ること
    (b)外部から供給されたIL-2に、前記T細胞集団を接触させること;ならびに
    (c)外部から供給されたIL-7およびIL-21の組み合わせに、前記T細胞集団を接触させることを含み
    (b)を(c)の前に行うことにより改善された移植適合性を有するT細胞集団を製造する、方法。
  2. CD8T細胞が濃縮されたT細胞集団である、請求項1に記載の方法。
  3. IL-2、IL-7またはIL-21の濃度が20U/mL以上70U/mL以下、または0.1ng/mL以上1.0ng/mL以下である、請求項1または2に記載の方法。
  4. IL-2、IL-7またはIL-21の濃度が30U/mL以上70U/mL以下、または0.3ng/mL以上0.7ng/mL以下である、請求項1~のいずれか一項に記載の方法。
  5. IL-2の濃度が約50U/mLである、請求項1~のいずれか一項に記載の方法。
  6. (a)が、親和性により選択することによってT細胞の混合集団からのCD8T細胞集団および/またはCD4T細胞集団を分離または濃縮することを含む、請求項1~のいずれか一項に記載の方法。
  7. 親和性により選択することが、フローサイトメトリーまたは免疫磁気選択を含む、請求項に記載の方法。
  8. 前記T細胞集団が、CD45 RA、CD45 RO、CCR7、CD25、CD127、CD57、CD137、CD27、CD28およびCD62Lからなる群から選択される少なくとも1つの受容体を含む、請求項1~のいずれか一項に記載の方法。
  9. (a)が、抗体を結合させた支持体と、前記T細胞集団とを接触させることによって前記T細胞集団を刺激することをさらに含み、前記抗体を結合させた支持体が、抗TCR抗体もしくはそのTCR結合フラグメント、抗CD2抗体もしくはそのCD2結合フラグメント、抗CD3抗体もしくはそのCD3結合フラグメント、抗CD4抗体もしくはそのCD4結合フラグメント、および抗CD28抗体もしくはそのCD28結合フラグメントからなる群から選択される抗体または抗原結合フラグメントを含む、請求項1~のいずれか一項に記載の方法。
  10. ARを含む前記T細胞の集団、CARをコードするベクターをT細胞集団に形質導入することによって得られる、請求項1~のいずれか一項に記載の方法。
  11. 前記ベクターが、シミアンウイルス40、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス(AAV)、レンチウイルスおよびレトロウイルスからなる群から選択されるウイルスベクターである、請求項10に記載の方法。
  12. 前記IL-2、IL-7またはIL-21が組換えサイトカインを含む、請求項1~11のいずれか一項に記載の方法。
  13. (b)および(c)が、1日から20日間の範囲にある期間にわたって接触させる、および/または少なくとも1日、もしくは1日から20日間の範囲にある期間にわたって前記T細胞集団を増殖させる(d)
    をさらに含む、請求項1~12のいずれか一項に記載の方法。
  14. 前記T細胞集団が、T細胞前駆細胞および/または造血幹細胞(HSC)を含む、請求項1~13のいずれか一項に記載の方法。
  15. 請求項1~14のいずれか一項に記載の方法によって製造されたT細胞集団と、医薬品添加剤とを含む医薬組成物。
  16. CD8T細胞が濃縮された第1のT細胞集団およびCD4T細胞が濃縮された第2のT細胞集団を含み、前記第1のT細胞集団および第2のT細胞集団が1:1の比率で混合されている、請求項15に記載の医薬組成物。
  17. 対象のがんを治療、抑制または緩和するために使用される、請求項15または16に記載の医薬組成物。
  18. 前記がんがCD19を発現し、CARがCD19に特異的に結合することができる、請求項17に記載の医薬組成物。
  19. 別の抗がん療法と組み合わせて前記対象に投与される、請求項17または18に記載の医薬組成物。
  20. 前記がんが白血病を含む、請求項17~19のいずれか一項に記載の医薬組成物。
  21. 前記白血病が、再発性かつ/または化学療法抵抗性のCD19小児急性リンパ芽球性白血病(ALL)を含む、請求項20に記載の医薬組成物。
  22. 前記対象が、造血幹細胞移植(HSCT)後の再発を有する、請求項17~21のいずれか一項に記載の医薬組成物。
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