JP7054399B2 - 分析系におけるプロセス中に試料同一性を追跡するための方法 - Google Patents
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Description
分析系におけるプロセス中に試料同一性を追跡するための開示する方法の態様は、独立クレームの特徴を有する。単独の方式で、またはいずれの任意の組み合わせで実現可能である、本発明のさらなる態様を、従属クレームに開示する。
-試料を提供し、
-異なる化学物質の組成物を、質量分析計の検出レベルより高い濃度で、試料に添加し、
-試料を組成物とともに、分析系によってプロセシングし、
-試料の単数および/または複数の構成要素を、質量分析計によって検出し、そして測定し、
-異なる化学物質の組成物または組成物の部分を、質量分析計によって検出し、そして測定し、
-化学物質の組成物に相当する物質検出シグナルを含む、質量分析計の物質検出シグナルパターンの検出に基づいて、試料を同定する
工程を含む。
「臨床診断系」は、本明細書において、in vitro診断のための試料の分析に特化した実験室自動化装置を指す。臨床診断系は、必要にしたがって、そして/または望ましい実験室ワークフローにしたがって、異なる構造を有してもよい。複数の装置および/またはモジュールを一緒にカップリングすることによって、さらなる構造を得ることも可能である。「モジュール」は、特化された機能を有する臨床診断系全体よりも典型的にはより小さいサイズの作業セルである。この機能は、分析機能であってもよいが、また、分析前または分析後の機能であってもよく、あるいは、これは、分析前機能、分析機能、または分析後機能のいずれかに対する補助的機能であってもよい。特に、モジュールは、例えば1つまたはそれより多い分析前工程および/または分析工程および/または分析後工程を実行することによって、試料プロセシングワークフローの特化されたタスクを実行するための1つまたはそれより多い他のモジュールと協働するように設定されていてもよい。特に、臨床診断系は、特定のタイプの分析、例えば臨床化学、免疫化学、凝固、血液学、液体クロマトグラフィ分離、質量分析等のために最適化された、それぞれのワークフローを実行するように設計された、1つまたはそれより多い分析装置を含んでももよい。したがって、臨床診断系は、それぞれのワークフローと共に、1つの分析装置またはこうした分析装置のいずれかの組み合わせを含んでももよく、ここで、分析前モジュールおよび/または分析後モジュールが個々の分析装置にカップリングされるか、または複数の分析装置によって共有されていてもよい。あるいは、分析前機能および/または分析後機能を、分析装置中に組み込まれたユニットによって実行してもよい。臨床診断系は、機能ユニット、例えば、試料および/または試薬および/または系の液体をピペッティングしそして/またはポンピングしそして/または混合するための液体取り扱いユニット、およびまたソートし、貯蔵し、輸送し、同定し、分離し、検出するための機能ユニットを含んでもよい。
このため、分析系は、試料の自動化調製のための試料調製ステーションを含んでもよい。「試料調製ステーション」は、試料中の干渉マトリックス構成要素を除去するかまたは少なくとも減少させ、そして/または試料中の関心対象の分析物を濃縮することを目的とした、一連の試料プロセシング工程を実行するように設計された1つまたはそれより多い分析装置または分析装置中のユニットとカップリングされた分析前モジュールである。こうしたプロセシング工程には、連続して、平行して、または交互の方式で、単数または複数の試料に対して実行する以下のプロセシング操作の任意の1つまたはそれより多くが含まれてもよい:液体のピペッティング(吸引および/または分配)、液体のポンピング、試薬との混合、特定の温度でのインキュベーション、加熱または冷却、遠心分離、分離、濾過、ふるい、乾燥、洗浄、再懸濁、アリコット、トランスファー、貯蔵等。
化学物質の極性は、化学物質の同重性オリゴマーまたは同位体の混合物を用いることによって適応させてもよい。したがって、用いる化学物質は、試料プロセシングおよびクロマトグラフィ中、関心対象の分析物と、ほとんど同一の振る舞いを示す。それによって、試料の同一性は、明白に検出されうる。
化学物質の極性は、化学物質のオリゴマーまたは誘導体の混合物を用いることによって適応させてもよい。したがって、極性は、かなり単純な方式で適応させうる。
化学物質は、(極性)n-(親油性)m、式中、(極性)が極性分子基を示し、(親油性)が親油性分子基を示し、そしてn、mが0より大きい整数である、の構造を有する単量体ブロックより形成されることも可能である。したがって、単量体は同一の分子量を有するように設計されてもよく(同重性構築ブロック)、それによってオリゴマーサブユニットの全体の分子量は、同重性オリゴマー主鎖を生成する比n/mとは独立に、一定である。
化学物質は:ペプチド、ペプチドの誘導体、ペプチド核酸、オリゴヌクレオチド、およびオリゴマーからなる群より選択される少なくとも1つの要素であることも可能である。したがって、うまく取り扱い可能である物質を用いることも可能である。
-少なくとも1つのプロセッサを含むコンピュータまたはコンピュータネットワークであって、該プロセッサが、本明細書に記載する態様の1つにしたがって方法を実行するために適応されている、前記コンピュータまたはコンピュータネットワーク、
-コンピュータロード可能データ構造であって、該データ構造がコンピュータ上で実行される間、本明細書に記載する態様の1つにしたがって方法を実行するために適応されている、前記データ構造、
-コンピュータプログラムがコンピュータ上で実行される間、本明細書に記載する態様の1つにしたがって該プログラムが方法を実行するために適応されている、コンピュータスクリプト、
-コンピュータプログラムがコンピュータまたはコンピュータネットワーク上で実行される間、本明細書に記載する態様の1つにしたがって方法を実行するための、プログラム手段を含むコンピュータプログラム、
-先行する態様にしたがったプログラム手段を含むコンピュータプログラムであって、プログラム手段がコンピュータに読み取り可能な記憶媒体上に記憶されている、前記コンピュータプログラム、
-記憶媒体であって、データ構造が該記憶媒体上に記憶され、そして該データ構造が、コンピュータまたはコンピュータネットワークの主記憶および/または作業記憶内にロードされた後、本明細書に記載する態様の1つにしたがった方法を実行するために適応されている、前記記憶媒体、および
-プログラムコード手段を有するコンピュータプログラム製品であって、該プログラムコード手段がコンピュータまたはコンピュータネットワーク上で実行される場合、本明細書に記載する態様の1つにしたがった方法を実行するために、プログラムコード手段が記憶媒体上に記憶されることが可能であるかまたは記憶されている、前記コンピュータプログラム製品
を開示する。
態様1:分析系におけるプロセス中に試料同一性を追跡するための方法であって、分析系が液体クロマトグラフおよび質量分析計を含み、該方法が:
-試料を提供し、
-異なる化学物質の組成物を、質量分析計の検出レベルより高い濃度で、試料に添加し、
-試料を組成物とともに、分析系によってプロセシングし、
-試料の単数および/または複数の構成要素を、質量分析計によって検出し、そして測定し、
-異なる化学物質の組成物または組成物の部分を、質量分析計によって検出し、そして測定し、
-化学物質の組成物に相当する物質検出シグナルを含む、質量分析計の物質検出シグナルパターンの検出に基づいて、試料を同定する
工程を含む、前記方法。
態様3:液体クロマトグラフの固定相上に化学物質が保持されるのを防止するように、化学物質が設計されている、態様1または2記載の方法。
態様6:分子量が、化学物質の相同体、誘導体または同位体標識を用いることによって適応されている、態様3または4記載の方法。
態様8:各オリゴマー構成要素が、分子量コーディングのための標識基を有し、該標識基が損なわれずに測定されるか、または質量分析プロセス中に放出され、そして質量分析計によって測定される、態様7記載の方法。
態様11:化学物質が、(極性)n-(親油性)m、式中、(極性)が極性分子基を示し、(親油性)が親油性分子基を示し、そしてn、mが0より大きい整数である、の構造を有する単量体ブロックより形成される、態様10記載の方法。
態様15:化学物質が同一の分子量を有する、態様1~14のいずれか一項記載の方法。
0.5mgの重量のそれぞれの物質を計量し、そして10%(v/v)酢酸を含有する水1mlで希釈することによって、物質を個々に調製した。こうして調製した試料を、Vydac 218TP C18カラム(5μm、2.1x150mm)を装備したHPLC系(Waters Aquity)に注入した。以下の溶媒を用いて、ポンプを勾配モードに維持した。
溶媒B:アセトニトリル+0.1%ギ酸(v/v)
以下の勾配を適用した:
0分(98%A)、15分(35%A)、17分(0%A)、25分(0%A)、25.1分(98%A)、30分(98%A)。
102 液体クロマトグラフ
104 質量分析計
106 試料調製ステーション
108 試料
110 液体クロマトグラフィ分離ステーション
112 液体クロマトグラフィチャネル
114 試料調製/液体クロマトグラフィインターフェース
116 液体クロマトグラフィ/質量分析計インターフェース
118 イオン化源
120 イオン移動度モジュール
122 コントローラー
124 バルブスイッチング
126 ESI源
128 APCI源
130 組成物
132 化学物質
134 標識基
136 極性分子基
138 親油性分子基
140 同重性オリゴマー基
142 分子量コーディング基
144 時間
146 保持シグナル
148 例1に関するクロマトグラフィ分離の結果
150 例2に関するクロマトグラフィ分離の結果
152 例3に関するクロマトグラフィ分離の結果
154 例4に関するクロマトグラフィ分離の結果
156 例1に関するシグナルピーク
158 例2に関するシグナルピーク
160 例3に関するシグナルピーク
162 例4に関するシグナルピーク
164 分子質量
166 分子質量パーセンテージ
168 例1に関する分子質量分布
170 例2に関する分子質量分布
172 例3に関する分子質量分布
174 例4に関する分子質量分布
176 例1に関するシグナルピーク
178 例2に関するシグナルピーク
180 例3に関するシグナルピーク
182 例4に関するシグナルピーク
Claims (15)
- 分析系(112)におけるプロセス中に試料同一性を追跡するための方法であって、分析系(112)が液体クロマトグラフ(102)および質量分析計(104)を含み、該方法が:
-試料(108)を提供し、
-異なる化学物質(132)の組成物(130)を、質量分析計(104)の検出レベルより高い濃度で、試料(108)に添加し、
-試料(108)を組成物(130)とともに、分析系(112)によってプロセシングし、
-試料(108)の単数および/または複数の構成要素を、質量分析計(104)によって検出し、そして測定し、
-異なる化学物質(132)の組成物(130)または組成物(130)の部分を、質量分析計(104)によって検出し、そして測定し、
-化学物質(132)の組成物(130)に相当する物質検出シグナルを含む、質量分析計(104)の物質検出シグナルパターンの検出に基づいて、試料(108)を同定する
工程を含む、前記方法。 - 異なる化学物質(132)の組成物(130)を、試料(108)の調製前、調製中または調製後に、試料(108)に添加する、請求項1記載の方法。
- 液体クロマトグラフ(102)の固定相上に化学物質(132)が保持されるのを防止するように、化学物質(132)が設計されている、請求項1または2記載の方法。
- 化学物質(132)が液体クロマトグラフ(102)の固定相上に保持されるのを防止するように、化学物質(132)の極性および分子量が液体クロマトグラフ(102)の固定相に対して適応されている、請求項3記載の方法。
- 化学物質(132)の極性が、化学物質(132)の同重性オリゴマーまたは同位体の混合物を用いることによって適応されている、請求項4記載の方法。
- 分子量が、化学物質(132)の相同体、誘導体または同位体標識を用いることによって適応されている、請求項3または4記載の方法。
- 化学物質(132)の極性が、化学物質(132)のオリゴマーまたは誘導体の混合物を用いることによって適応されている、請求項4記載の方法。
- 各オリゴマー構成要素が、分子量コーディングのための標識基(134)を有し、該標識基が損なわれずに(intact)測定されるか、または質量分析プロセス中に放出され、そして質量分析計(104)によって測定される、請求項7記載の方法。
- 試料(108)が、関心対象の少なくとも1つの分析物を含み、化学物質(132)が化学同位体であり、そして/または関心対象の分析物と類似の極性を有する、請求項1~8のいずれか一項記載の方法。
- 化学物質(132)が極性分子基(136)および親油性分子基(138)を含む、請求項1~9のいずれか一項記載の方法。
- 化学物質(132)が、(極性)n-(親油性)m、式中、(極性)が極性分子基(136)を示し、(親油性)が親油性分子基(140)を示し、そしてn、mが0より大きい整数である、の構造を有する単量体ブロックより形成される、請求項10記載の方法。
- 化学物質(132)が、ランダムに重合する単量体構築ブロック、n*(極性)およびm*(親油性)、式中、(極性)が極性分子基(136)を示し、(親油性)が親油性分子基(138)を示し、そしてn、mが0より大きい整数である、より形成される、請求項10記載の方法。
- 請求項1から12のいずれか一項記載の方法であって、液体クロマトグラフ(102)が、複数の液体クロマトグラフィチャネル(112)を含む液体クロマトグラフィ分離ステーション(110)を含み、該方法がさらに、複数の試料(108)を提供し、異なる化学物質(132)の組成物(130)を複数の試料(108)各々に添加し、ここで複数の試料(108)に添加する組成物(130)は互いに異なる、複数の試料(108)を化学物質(132)の組成物(130)とともに、分析系(112)によってプロセシングし、そして化学物質(132)の異なる組成物(130)に相当する物質検出シグナルを含む、質量分析計(104)の物質検出シグナルパターンの検出に基づいて、複数の試料(108)各々を同定する工程を含む、前記方法。
- 組成物(130)の数が、液体クロマトグラフィチャネル(112)の数に対応する、請求項13記載の方法。
- 各化学物質(132)が、同重性オリゴマー基(140)および少なくとも1つの分子量コーディング基(142)を含み、ここで異なる化学物質(132)の同重性オリゴマー基(140)および分子量コーディング基(142)は互いに異なる、請求項1~14のいずれか一項記載の方法。
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