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JP6518199B2 - Ｍｉｃａおよびｍｉｃｂタンパク質に対する抗体 - Google Patents

Ｍｉｃａおよびｍｉｃｂタンパク質に対する抗体 Download PDF

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Description

関連出願に対するクロスリファレンス
[0001]本出願は、２０１４年２月１５日出願の米国仮出願第６１／９４０，３７２号および２０１３年３月１５日出願の米国仮出願第６１／８０１，３２９号の恩典を請求する。各引用優先出願の内容は、その全体が本明細書に援用される。
配列表、表またはコンピュータプログラムに対する言及
[0002]配列表の公式コピーは、ＥＦＳ−Ｗｅｂを通じ、ファイル名「ＮＢＩ−００１＿ＳＴ２５．ｔｘｔ」、生成日２０１４年３月１５日、および９４ｋｂのサイズで、ＡＳＣＩＩフォーマットテキストファイルとして、明細書とともに提出される。ＥＦＳ−Ｗｅｂを通じて提出された配列表は明細書の一部であり、そしてその全体が本明細書に援用される。
技術分野
[0003]本開示は、抗体、該抗体を生成するための免疫原、ならびに診断および治療のために該抗体を用いる方法に関する。
[0004]世界全体の癌の率は、より多くの人が高齢まで生存し、そして先進国で庶民の生活様式が変化するに連れて、上昇し続けると予測される。したがって、癌は、最新の、そしてより効率的なターゲティング癌医薬を用いてさえも、ヒトの罹患率および死亡率の主な原因のままである。免疫療法治療の多くに関して予測されてきているように、新規療法戦略、特に防御免疫を一貫して提供するかまたは刺激することが可能であるものに関する、連続する必要性がある。
[0005]癌免疫療法は、体の免疫系を刺激して腫瘍と闘うように設計される。局所免疫療法は、罹患領域内に治療薬を注射し、それによって免疫細胞の補充、ロバストな炎症およびその結果の腫瘍収縮を引き起こす。全身性免疫療法は、やはり腫瘍を収縮させることが可能な剤、例えばタンパク質、インターフェロンアルファを投与することによって、全身を治療する。免疫療法はまた、全免疫系を刺激することによって、全体の癌と戦う能力を改善する場合、非特異的であると見なされうるし、そして治療が、免疫系に癌細胞を破壊するよう指示する場合、ターゲティングと見なされうる。これらの療法は、比較的未成熟であるが、抗体をヒトの体に導入して、そして癌細胞増殖の阻害を生じている治療で成功を収めてきている。最新の抗体免疫療法薬剤の例は、免疫細胞上のＣＴＬＡ４表面タンパク質をターゲティングし、それによって免疫系上の特異的制御ブレーキに干渉して、そして腫瘍細胞に向かう全身性免疫攻撃を改善するイピリムマブ（Ｙｅｒｖｏｙ（登録商標））である。
[0006]免疫系および形質転換癌性細胞の間の相互作用を取り巻く大きな疑問は、非正常腫瘍細胞が、腫瘍細胞を破壊しようと待ち構えている、見かけ上正常でそして損なわれていない（ｉｎｔａｃｔ）免疫防御系に直面して、どのように検出を回避し、そして生き延びることが可能であるかである。生得的免疫監視系、およびストレスを受けそして形質転換された細胞とのその相互作用に関して、かなりの量の研究によって、中程度から進行した癌が存在する場合、免疫系のこの特定のアームが抑制されていると示唆されている。これは、大部分、局所および全身性の両方で、免疫監視系を中和する明確な目的を持つ、腫瘍細胞からのデコイ分子の放出によって達成される。実際、多くのウイルスがこれらの防御系に干渉し、そしてこうして感染周期中に免疫検出を回避する機構を発展させてきている。癌およびウイルス感染に対する療法を考慮する際、疾患または病原体が扇動する免疫系の抑制を克服することが望ましい。
[0007]本開示は、循環可溶性ＭＩＣＡ（ｓＭＩＣＡ）および／または可溶性ＭＩＣＢ（ｓＭＩＣＢ）タンパク質レベルを低下させるための組成物および方法であって、免疫監視に対するｓＭＩＣタンパク質の免疫抑制効果を制限し、それによって疾患細胞に対する免疫反応を増進させることによって、療法的に有益な効果を有しうる前記組成物および方法を提供する。本明細書の組成物は、ｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢに特異的に結合可能であるが、全長ＭＩＣタンパク質または細胞膜に結合したＭＩＣタンパク質型には特異的に結合しない、結合剤、特に抗体に関する。いくつかの態様において、抗体は、ＭＩＣＡおよび／またはＭＩＣＢタンパク質の潜在性（ｃｒｙｐｔｉｃ）エピトープと称される、免疫学的に隠れたまたは潜在性の領域に特異的に結合し、ここで、これらのｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢ外部ドメインが細胞膜から放出されるかまたは脱落すると、潜在性エピトープが現れる。
[0008]一般的に、いくつかの態様において、結合剤は、わずかな自己免疫疾患誘導活性を有してもよい。いくつかの態様において、結合剤は、ＭＩＣＡおよび／またはＭＩＣＢのその同族（ｃｏｇｎａｔｅ）受容体ＮＫＧ２Ｄへの結合に対する、わずかなアンタゴニスト性活性を有してもよい。
[0009]いくつかの態様において、結合剤は、ＭＩＣＡおよび／またはＭＩＣＢタンパク質のアルファ−３ドメインに特異的に結合可能であるが、全長ＭＩＣタンパク質または細胞膜に結合したＭＩＣタンパク質型に特異的に結合しない。いくつかの態様において、結合剤は、ＭＩＣＡおよび／またはＭＩＣＢタンパク質のアルファ−３ドメイン上の潜在性エピトープに特異的に結合可能であり、ここで抗体が結合する潜在性エピトープは、ＭＩＣＡまたはＭＩＣＢの
アミノ酸残基１９０〜２２９；
アミノ酸残基１９０〜２３８；
アミノ酸残基２１７〜２３８；
アミノ酸残基２４３〜２５６；
アミノ酸残基２４３〜２７４；または
アミノ酸残基２４３〜２９６／２９７
によって定義されるアルファ−３ドメイン内にあり、ここで、アミノ酸位は、それぞれ、ＭＩＣＡ＊００１アレルのプロセシングされた成熟ＭＩＣＡタンパク質に、そしてＭＩＣＢ＊００１アレルのプロセシングされた成熟ＭＩＣＢタンパク質に関する。
[0010]いくつかの態様において、結合剤は、ＭＩＣＡのアルファ−３ドメイン上の潜在性エピトープに特異的に結合可能であり、ここで、潜在性エピトープは：
１９０＿ＲＳＥＡＳＥＧ＿１９６（配列番号３８）；
２１７＿ＲＱＤＧＶ＿２２１（配列番号３９）；
２３４＿ＬＰＤＧＮ＿２３８（配列番号４０）；および
２５１＿ＱＧＥＥＱＲ＿２５６（配列番号４１）
より選択されるアミノ酸配列内にあり、ここでアミノ酸位は、ＭＩＣＡ＊００１アレルのプロセシングされた成熟ＭＩＣＡタンパク質に関して定義される。
[0011]いくつかの態様において、結合剤は、ＭＩＣＢのアルファ−３ドメイン上の潜在性エピトープに特異的に結合可能であり、ここで、潜在性エピトープは：
１９０＿ＣＳＥＶＳＥＧ＿１９６（配列番号４３）；
２１７＿ＲＱＤＧＶ＿２２１（配列番号４４）；
２３４＿ＬＰＤＧＮ＿２３８（配列番号４５）；および
２５０＿ＲＱＧＥＥＱＲ＿２５６（配列番号４６）
より選択されるアミノ酸配列内にあり、ここでアミノ酸位は、ＭＩＣＢ＊００１アレルのプロセシングされた成熟ＭＩＣＢタンパク質に関して定義される。
[0012]いくつかの態様において、結合剤は：
（ａ）〜ＸＡ１−Ｓ−ＸＡ３−ＸＡ４−Ｓ−Ｅ−Ｇ〜（配列番号４７）、
式中、ＸＡ１はＲおよびＣより選択され；ＸＡ３はＥおよびＫより選択され；そしてＸＡ４はＡおよびＶより選択される；
（ｂ）〜Ｒ−Ｑ−Ｄ−Ｇ−ＸＢ５〜（配列番号４８）、
式中、ＸＢ５はＶおよびＬより選択される；
（ｃ）〜ＸＤ１−ＸＤ２−Ｇ−Ｅ−Ｅ−Ｑ−ＸＤ７〜（配列番号４９）、
式中、ＸＤ１はＣまたはＲより選択され；ＸＤ２はＱ、ＲおよびＥより選択され；そしてＸＤ７はＲ、ＳおよびＫより選択される；または
（ｄ）〜Ｌ−Ｐ−Ｄ−Ｇ−Ｎ〜（配列番号５０）
によって定義される配列内のエピトープに特異的に結合可能である。
[0013]いくつかの態様において、結合剤は、抗体を含み、ここで、抗体は、ポリクローナル、モノクローナル、キメラ、ヒト化、または全長ヒト抗体であることも可能である。いくつかの態様において、結合剤は、抗体断片または一本鎖抗体を含むことも可能である。いくつかの態様において、抗体は二重特異性または多重特異性抗体であることも可能である。
[0014]いくつかの態様において、抗体は、配列番号２３の軽鎖可変領域アミノ酸配列および配列番号２７の重鎖可変領域アミノ酸配列中の、少なくとも１、２、３、４、５または６すべてのＣＤＲを含む。いくつかの態様において、抗体は：アミノ酸配列ＲＡＳＫＳＶＳＴＳＧＹＳＹＭＨ（配列番号８３）を含むＣＤＲ Ｌ１；アミノ酸配列ＲＡＳＮＬＥＳ（配列番号８４）を含むＣＤＲ Ｌ２；アミノ酸配列ＱＨＳＲＥＬＰＬＴ（配列番号８５）を含むＣＤＲ Ｌ３；アミノ酸配列ＤＹＳＶＨ（配列番号８９）、ＧＹＴＦＴＤＹ（配列番号９５）、またはＧＹＴＦＴＤＹＳＶＨ（配列番号９９）を含むＣＤＲ Ｈ１；アミノ酸配列ＷＩＮＴＥＴＧＥＰＴＹＡＤＤＦＫＧ（配列番号９０）、ＮＴＥＴＧ（配列番号９６）、またはＷＩＮＴＥＴＧＥＰ（配列番号１００）を含むＣＤＲ Ｈ２；およびアミノ酸配列ＡＧＧＮＡＦＡＹ（配列番号９１）を含むＣＤＲ Ｈ３より選択される、少なくとも１、２、３、４、５または６すべてのＣＤＲを含む。
[0015]いくつかの態様において、抗体は、配列番号３１の軽鎖可変領域アミノ酸配列および配列番号３５の重鎖可変領域アミノ酸配列中の、少なくとも１、２、３、４、５または６すべてのＣＤＲを含む。いくつかの態様において、抗体は：アミノ酸配列ＲＳＳＫＳＬＬＱＳＮＧＮＴＦＬＹ（配列番号８６）を含むＣＤＲ Ｌ１；アミノ酸配列ＲＭＳＮＬＡＳ（配列番号８７）を含むＣＤＲ Ｌ２；アミノ酸配列ＭＱＨＬＥＹＰＦＴ（配列番号８８）を含むＣＤＲ Ｌ３；アミノ酸配列ＮＹＧＭＮ（配列番号９２）、ＧＹＴＦＴＮＹ（配列番号９７）、またはＧＹＴＦＴＮＹＧＭＮ（配列番号１０１）を含むＣＤＲ Ｈ１；アミノ酸配列ＷＩＮＴＮＴＧＥＰＴＹＡＥＥＦＫＧ（配列番号９３）、ＮＴＮＴＧ（配列番号９８）、またはＷＩＮＴＮＴＧＥＰ（配列番号１０２）を含むＣＤＲ Ｈ２；およびアミノ酸配列ＳＧＧＳＳＰＦＡＹ（配列番号９４）を含むＣＤＲ Ｈ３より選択される、少なくとも１、２、３、４、５または６すべてのＣＤＲを含む。
[0016]いくつかの態様において、抗体は、配列番号２３のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域ＶＬおよび配列番号２７のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域ＶＨを含む。
[0017]いくつかの態様において、抗体は、配列番号３１のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域ＶＬおよび配列番号３５のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域ＶＨを含む。
[0018]別の側面において、本開示は、ｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢに、特にアルファ−３ドメイン中の潜在性エピトープに、特異的に結合する抗体を調製するための免疫原を提供する。いくつかの態様において、免疫原をキャリアーとカップリングさせて、そして本開示の結合剤を調製するための適切なアジュバントとの組成物として調製してもよい。
[0019]別の側面において、本開示は、アルファ−３ドメイン中の潜在性エピトープに特異的に結合する抗体に関するスクリーニング法、ならびに該抗体を調製する方法を提供する。
[0020]本開示の結合剤を多様な診断および療法使用に適用してもよい。いくつかの態様において、結合剤、例えば本開示の抗体を診断アッセイに用いて、生物学的試料、特にｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢの上昇したレベルによって特徴付けられる疾患または障害が推測されるか、または該疾患または障害と診断された被験体から得られる試料において、ｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢの存在を決定することも可能である。
[0021]別の側面において、結合剤を療法適用に用いてもよい。いくつかの態様において、本開示の抗体剤の有効量を、必要がある被験体に投与することによって、ｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢのレベルを減少させる方法で、該抗体を用いてもよい。いくつかの態様において、抗体剤を用いて、ｓＭＩＣタンパク質の上昇したレベルによって特徴付けられる疾患または障害に罹患した被験体を治療してもよい。これらの療法適用において、本明細書開示の結合剤を、療法的有効量で、ｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢの上昇したレベルによって特徴付けられる疾患または障害に罹患した被験体に投与してもよい。
[0022]いくつかの態様において、療法を用いて、ｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢの上昇したレベルと関連する多様な障害、例えばＭＩＣ＋腫瘍またはＭＩＣ＋ウイルス感染を治療することも可能である。いくつかの態様において、ＭＩＣ＋腫瘍は、上皮細胞腫瘍または血液学的悪性腫瘍を含む。いくつかの態様において、腫瘍は、限定されるわけではないが、肺、乳房、胃、結腸、卵巣、腎細胞、前立腺癌腫、肝細胞癌腫、および黒色腫を含む、多様なタイプの上皮腫瘍を含むことも可能である。いくつかの態様において、ＭＩＣ＋血液学的悪性腫瘍は、急性リンパ芽球性白血病（ＡＬＬ）、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）、慢性リンパ球性白血病（ＣＬＬ）、慢性骨髄性白血病（ＣＭＬ）、急性単球性白血病（ＡＭｏｌ）；リンパ腫、例えばホジキンリンパ腫、および非ホジキンリンパ腫；ならびに多発性骨髄腫より選択されることも可能である。療法抗体を特定のウイルス感染、例えば呼吸器合胞体ウイルス（ＲＳＶ）および１型ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ−１）感染に適用してもよい。
[0023]いくつかの態様において、以下の詳細な説明にさらに記載するように、療法適用を、化学療法剤；生物学的剤、例えば他の療法抗体；および癌ワクチンとの組み合わせを含めて、ｓＭＩＣ＋レベル上昇と関連する特定の障害を治療するために用いられる他の療法剤と組み合わせて、用いてもよい。
[0024]図１Ａおよび図１Ｂは、それぞれ、全長ヒトＭＩＣＡポリペプチドに対応する例示的なアミノ酸配列（アレル＊００１：ＮＣＢＩ寄託番号ＮＰ＿０００２３８．１）（配列番号１）、および全長ヒトＭＩＣＢポリペプチドに対応する例示的なアミノ酸配列（アレル＊００１：ＵｎｉＰｒｏｔＫＢ寄託番号Ｑ２９９８０．１）（配列番号２）を示す。[0025]図１Ｃおよび図１Ｄは、それぞれ、ＭＩＣＡ＊００１アレルのＭＩＣＡタンパク質の細胞外アルファ−３ドメインのアミノ酸配列、アミノ酸残基２０５〜２９７（配列番号３）；およびＭＩＣＢ＊００１アレルのＭＩＣＢタンパク質の細胞外アルファ−３ドメインのアミノ酸配列、アミノ酸残基２０５〜２９７（配列番号４）を示す。アミノ酸番号付けは、プロセシングされないＭＩＣＡおよびＭＩＣＢタンパク質に基づく。プロセシングされた成熟ＭＩＣＡ＊００１およびＭＩＣＢ＊００１に基づくアミノ酸番号付けは、ＭＩＣＡのアミノ酸残基１８２〜２７４およびＭＩＣＢのアミノ酸残基１８２〜２７４に対応する。 [0026]図２は、ヒトＭＩＣＡ ｃＤＮＡに対応する例示的なヌクレオチド配列（アレル＊００１：ＮＣＢＩ寄託番号ＮＭ＿０００２４７．２）（配列番号５）を示す。コード領域を下線で示す。 [0027]図３は、ヒトＭＩＣＢ ｃＤＮＡに対応する例示的なヌクレオチド配列（アレル＊００１：ＧｅｎＢａｎｋ寄託番号Ｘ９１６２５．１）（配列番号６）を示す。コード領域を下線で示す。 [0027]図３は、ヒトＭＩＣＢ ｃＤＮＡに対応する例示的なヌクレオチド配列（アレル＊００１：ＧｅｎＢａｎｋ寄託番号Ｘ９１６２５．１）（配列番号６）を示す。コード領域を下線で示す。 [0028]図４は、推定上の可溶性ＭＩＣＡポリペプチドの例示的なアミノ酸配列を示す（Ａ−配列番号７；Ｂ−配列番号８；Ｃ−配列番号９；Ｄ−配列番号１０；Ｅ−配列番号１１；Ｆ−配列番号１２；Ｇ−配列番号１３；Ｈ−配列番号１４）。 [0028]図４は、推定上の可溶性ＭＩＣＡポリペプチドの例示的なアミノ酸配列を示す（Ａ−配列番号７；Ｂ−配列番号８；Ｃ−配列番号９；Ｄ−配列番号１０；Ｅ−配列番号１１；Ｆ−配列番号１２；Ｇ−配列番号１３；Ｈ−配列番号１４）。 [0029]図５は、推定上の可溶性ＭＩＣＢポリペプチドの例示的なアミノ酸配列を示す（Ａ−配列番号１５；Ｂ−配列番号１６；Ｃ−配列番号１７；Ｄ−配列番号１８；Ｅ−配列番号１９；Ｆ−配列番号２０；Ｇ−配列番号２１）。 [0029]図５は、推定上の可溶性ＭＩＣＢポリペプチドの例示的なアミノ酸配列を示す（Ａ−配列番号１５；Ｂ−配列番号１６；Ｃ−配列番号１７；Ｄ−配列番号１８；Ｅ−配列番号１９；Ｆ−配列番号２０；Ｇ−配列番号２１）。 [0030]図６は、抗体ＩＦ５の軽鎖可変領域および重鎖可変領域のアミノ酸およびヌクレオチド配列を示す。Ａ−シグナル配列（斜字）、可変領域（太字、下線）および定常領域の部分（無印）を含む、抗体ＩＦ５の軽鎖可変領域のアミノ酸配列（配列番号２２）。Ｂ−軽鎖可変領域のみのアミノ酸配列、Ｋａｂａｔに基づいて示されるＣＤＲを示す（配列番号２３）。Ｃ−上のＡに示すシグナル配列および軽鎖可変領域をコードするヌクレオチド配列（配列番号２４）。Ｄ−抗体ＩＦ５の軽鎖可変領域のみをコードするヌクレオチド配列（配列番号２５）。Ｅ−シグナル配列（斜字）、可変領域（太字、下線）および定常領域の部分（無印）を含む、抗体ＩＦ５の重鎖可変領域のアミノ酸配列（配列番号２６）。Ｆ−重鎖可変領域のみのアミノ酸配列、Ｋａｂａｔに基づいて示されるＣＤＲを示す（配列番号２７）。Ｇ−上のＥに示すシグナル配列および軽鎖可変領域をコードするヌクレオチド配列（配列番号２８）。Ｈ−抗体ＩＦ５の重鎖可変領域のみをコードするヌクレオチド配列（配列番号２９）。 [0030]図６は、抗体ＩＦ５の軽鎖可変領域および重鎖可変領域のアミノ酸およびヌクレオチド配列を示す。Ａ−シグナル配列（斜字）、可変領域（太字、下線）および定常領域の部分（無印）を含む、抗体ＩＦ５の軽鎖可変領域のアミノ酸配列（配列番号２２）。Ｂ−軽鎖可変領域のみのアミノ酸配列、Ｋａｂａｔに基づいて示されるＣＤＲを示す（配列番号２３）。Ｃ−上のＡに示すシグナル配列および軽鎖可変領域をコードするヌクレオチド配列（配列番号２４）。Ｄ−抗体ＩＦ５の軽鎖可変領域のみをコードするヌクレオチド配列（配列番号２５）。Ｅ−シグナル配列（斜字）、可変領域（太字、下線）および定常領域の部分（無印）を含む、抗体ＩＦ５の重鎖可変領域のアミノ酸配列（配列番号２６）。Ｆ−重鎖可変領域のみのアミノ酸配列、Ｋａｂａｔに基づいて示されるＣＤＲを示す（配列番号２７）。Ｇ−上のＥに示すシグナル配列および軽鎖可変領域をコードするヌクレオチド配列（配列番号２８）。Ｈ−抗体ＩＦ５の重鎖可変領域のみをコードするヌクレオチド配列（配列番号２９）。 [0031]図７は、抗体８Ｃ７の軽鎖可変領域および重鎖可変領域のアミノ酸およびヌクレオチド配列を示す。Ａ−シグナル配列（斜字）、可変領域（太字、下線）および定常領域の部分（無印）を含む、抗体８Ｃ７の軽鎖可変領域のアミノ酸配列（配列番号３０）。Ｂ−軽鎖可変領域のみのアミノ酸配列、Ｋａｂａｔに基づいて示されるＣＤＲを示す（配列番号３１）。Ｃ−上のＡに示すシグナル配列および軽鎖可変領域をコードするヌクレオチド配列（配列番号３２）。Ｄ−抗体８Ｃ７の軽鎖可変領域のみをコードするヌクレオチド配列（配列番号３３）。Ｅ−シグナル配列（斜字）、可変領域（太字、下線）および定常領域の部分（無印）を含む、抗体８Ｃ７の重鎖可変領域のアミノ酸配列（配列番号３４）。Ｆ−重鎖可変領域のみのアミノ酸配列、Ｋａｂａｔに基づいて示されるＣＤＲを示す（配列番号３５）。Ｇ−上のＥに示すシグナル配列および軽鎖可変領域をコードするヌクレオチド配列（配列番号３６）。Ｈ−抗体８Ｃ７の重鎖可変領域のみをコードするヌクレオチド配列（配列番号３７）。 [0031]図７は、抗体８Ｃ７の軽鎖可変領域および重鎖可変領域のアミノ酸およびヌクレオチド配列を示す。Ａ−シグナル配列（斜字）、可変領域（太字、下線）および定常領域の部分（無印）を含む、抗体８Ｃ７の軽鎖可変領域のアミノ酸配列（配列番号３０）。Ｂ−軽鎖可変領域のみのアミノ酸配列、Ｋａｂａｔに基づいて示されるＣＤＲを示す（配列番号３１）。Ｃ−上のＡに示すシグナル配列および軽鎖可変領域をコードするヌクレオチド配列（配列番号３２）。Ｄ−抗体８Ｃ７の軽鎖可変領域のみをコードするヌクレオチド配列（配列番号３３）。Ｅ−シグナル配列（斜字）、可変領域（太字、下線）および定常領域の部分（無印）を含む、抗体８Ｃ７の重鎖可変領域のアミノ酸配列（配列番号３４）。Ｆ−重鎖可変領域のみのアミノ酸配列、Ｋａｂａｔに基づいて示されるＣＤＲを示す（配列番号３５）。Ｇ−上のＥに示すシグナル配列および軽鎖可変領域をコードするヌクレオチド配列（配列番号３６）。Ｈ−抗体８Ｃ７の重鎖可変領域のみをコードするヌクレオチド配列（配列番号３７）。 [0032]図８は、ヒト可変重鎖コンセンサスフレームワークおよびヒト可変軽鎖コンセンサスフレームワーク：ヒトＶＨサブグループＩコンセンサスフレームワークからＫａｂａｔ ＣＤＲを除いたもの（配列番号１０３）；ヒトＶＨサブグループＩＩコンセンサスフレームワークからＫａｂａｔ ＣＤＲを除いたもの（配列番号１０４）；ヒトＶＨサブグループＩＩＩコンセンサスフレームワークからＫａｂａｔ ＣＤＲを除いたもの（配列番号１０５）；ヒトＶＨサブグループＶＩＩコンセンサスフレームワークからＫａｂａｔ ＣＤＲを除いたもの（配列番号１０６）；ヒトＶＬサブグループＩコンセンサスフレームワークからＫａｂａｔ ＣＤＲを除いたもの（配列番号１０７）；ヒトＶＬサブグループＩＩコンセンサスフレームワークからＫａｂａｔ ＣＤＲを除いたもの（配列番号１０８）；ヒトＶＬサブグループＩＩＩコンセンサスフレームワークからＫａｂａｔ ＣＤＲを除いたもの（配列番号１０９）；およびヒトＶＬサブグループＩＶコンセンサスフレームワークからＫａｂａｔ ＣＤＲを除いたもの（配列番号１１０）のアミノ酸配列を示す。 [0033]図９は、細胞表面上にＭＩＣタンパク質を発現する、熱処理ＨＣＴ１１６結腸癌腫細胞に結合する抗体のＦＡＣＳ分析の結果を示す。Ａ−アルファ−３サブドメインに結合する抗体（ＩｇＧ２アイソタイプ）を用いた陽性対照。Ｂ−アルファ−１＋アルファ−２サブドメインに結合する抗体（ＩｇＧ１アイソタイプ）を用いた陽性対照。Ｃ−抗体クローン１Ｆ５の結合。Ｄ−抗体クローン８Ｃ７の結合。ＡおよびＢは、アルファ−３またはアルファ１＋２サブドメインに結合する対照抗体がまた、熱処理ＨＣＴ１１６結腸癌腫細胞にもまた結合することを示す（ピークは、１０２黄色蛍光軸近傍）。Ｃは、１Ｆ５が、熱処理ＨＣＴ１１６結腸癌腫細胞に結合しないことを示す（未結合抗体ピークは、１０１黄色蛍光軸近傍）。同様に、Ｄは、抗体８Ｃ７が、熱処理ＨＣＴ１１６結腸癌腫細胞に結合しないことを示す（未結合抗体ピーク、１０１黄色蛍光軸近傍）。 [0033]図９は、細胞表面上にＭＩＣタンパク質を発現する、熱処理ＨＣＴ１１６結腸癌腫細胞に結合する抗体のＦＡＣＳ分析の結果を示す。Ａ−アルファ−３サブドメインに結合する抗体（ＩｇＧ２アイソタイプ）を用いた陽性対照。Ｂ−アルファ−１＋アルファ−２サブドメインに結合する抗体（ＩｇＧ１アイソタイプ）を用いた陽性対照。Ｃ−抗体クローン１Ｆ５の結合。Ｄ−抗体クローン８Ｃ７の結合。ＡおよびＢは、アルファ−３またはアルファ１＋２サブドメインに結合する対照抗体がまた、熱処理ＨＣＴ１１６結腸癌腫細胞にもまた結合することを示す（ピークは、１０２黄色蛍光軸近傍）。Ｃは、１Ｆ５が、熱処理ＨＣＴ１１６結腸癌腫細胞に結合しないことを示す（未結合抗体ピークは、１０１黄色蛍光軸近傍）。同様に、Ｄは、抗体８Ｃ７が、熱処理ＨＣＴ１１６結腸癌腫細胞に結合しないことを示す（未結合抗体ピーク、１０１黄色蛍光軸近傍）。
[0034]本開示は、ＭＨＣクラスＩ鎖関連遺伝子Ａタンパク質（ＭＩＣＡ）および／またはＭＨＣクラスＩ鎖関連遺伝子Ｂタンパク質（ＭＩＣＢ）の可溶性型を特異的に認識する結合剤、特に抗体、可溶性ＭＩＣＡ（ｓＭＩＣＡ）および／または可溶性ＭＩＣＢ（ｓＭＩＣＢ）の上昇したレベルの存在によって特徴付けられる疾患を治療するためのこうした結合剤の使用、ならびに可溶性ＭＩＣタンパク質の存在を検出するための診断試薬としての使用を提供する。
[0035]本発明の多様な態様をさらに記載する前に、本開示は、記載する特定の態様に限定されず、これはこうしたものがもちろん、多様でありうるためであることを理解すべきである。また、本明細書で用いる専門用語が、特定の態様のみを記載する目的のためであり、そして限定することを意図されないことも理解すべきである。
[0036]本明細書および付随する請求項で使用する際、単数形「ａ」、「ａｎ」、および「ｔｈｅ」には、文脈が明らかに別に示さない限り、複数形を含むことにもまた留意すべきである。さらに、請求項は、いかなる場合による要素も排除するよう起草されうることに留意すべきである。こうしたものとして、本文書は、請求項要素の記述と関連する「単独の」、「唯一」等のこうした排他的用語の使用、あるいは「負の」限定の使用に関して、先行詞として働くよう意図される。
[0037]さらに、「または」の使用は、別に示さない限り「および／または」を意味する。同様に、「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｅ、ｃｏｍｐｒｉｓｅｓ、ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ、ｉｎｃｌｕｄｅ、ｉｎｃｌｕｄｅｓ、およびｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」は交換可能であり、そして限定することを意図されない。多様な態様の説明が、用語「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」を用いる場合、当業者は、いくつかの特定の例において、態様が、別に、用語「から本質的になる」または「からなる」を用いて記載可能であることを理解するであろう。
[0038]ある範囲の値を提供する場合、文脈が別に明らかに示さない限り、下限の単位の十分の一まで、その範囲の上限および下限の間の、および言及される範囲の任意の他の言及されるかまたは介在する値である各介在値が、本発明内に含まれることが理解される。これらのより小さい範囲の上限および下限は、独立に、より小さい範囲に含まれることも可能であるし、そしてまた、言及される範囲中の任意の特に排除される限界次第で、本発明内に含まれることも可能である。言及される範囲が限界の一方または両方を含む場合、これらの含まれる限界のいずれかまたは両方を排除する範囲もまた、本発明に含まれる。
[0039]本明細書に記載するものと類似のまたは同等のいかなる方法および材料もまた、本発明の実施または試験において使用可能であるが、ここで、好ましい方法および材料を記載する。本開示を読めば当業者には明らかであるように、本明細書に記載しそして例示する個々の態様は各々、本発明の範囲または精神から逸脱することなく、他のいくつかの態様のいずれかの特徴と、容易に分離されるかまたは組み合わされることも可能な、別個の構成要素および特徴を有する。いくつかの態様において、本明細書に列挙する方法を、理論的に可能である、列挙する事象の任意の順序で、ならびに事象の列挙する順序で、行うことも可能である。
[0040]本開示において、本明細書の遺伝子コードアミノ酸に関して用いる略語は、慣用的であり、そして以下の通りである：
Figure 0006518199
[0041]三文字略語を用いる場合、「Ｌ」または「Ｄ」が特に先行しない限り、あるいは略語を用いる文脈から明らかでない限り、アミノ酸は、α−炭素（Ｃα）に関するＬ−またはＤ−立体配置いずれであってもよい。例えば、「Ａｌａ」はα−炭素に関する立体配置を特定することなくアラニンを示し、「Ｄ−Ａｌａ」および「Ｌ−Ａｌａ」は、それぞれ、Ｄ−アラニンおよびＬ−アラニンを示す。一文字略語を用いる場合、大文字はα−炭素に関してＬ−立体配置のアミノ酸を示し、そして小文字は、α−炭素に関してＤ−立体配置のアミノ酸を示す。例えば、「Ａ」はＬ−アラニンを示し、そして「ａ」はＤ−アラニンを示す。ポリペプチドおよびペプチド配列を一連の一文字または三文字略語（あるいはその混合物）として示す際、配列は、一般的な慣用にしたがって、Ｎ→Ｃの方向に示される。
[0042]遺伝的にコードされるヌクレオシドに関して用いる略語は慣用的であり、そして以下の通りである：アデノシン（Ａ）；グアノシン（Ｇ）；シチジン（Ｃ）；チミジン（Ｔ）；およびウリジン（Ｕ）。特に示さない限り、略語ヌクレオチドは、リボヌクレオシドまたは２’−デオキシリボヌクレオシドのいずれかであることも可能である。ヌクレオシドは、個々のものとして、または凝集体として、リボヌクレオシドまたは２’−デオキシリボヌクレオシドいずれかと明記されうる。個々のものとして明記される場合、一文字略語には「ｄ」または「ｒ」のいずれかが先行し、ここで、「ｄ」は、ヌクレオシドが２’−デオキシリボヌクレオシドであることを示し、そして「ｒ」は、ヌクレオシドがリボヌクレオシドであることを示す。例えば「ｄＡ」は、２’−デオキシリボアデノシンを示し、そして「ｒＡ」はリボアデノシンを示す。凝集体として明記される場合、特定の核酸またはポリヌクレオチドが、ＲＮＡ分子またはＤＮＡ分子のいずれかとして同定される。ヌクレオチドは、各リン酸を示す「ｐ」を付加することによって、ならびにリン酸が糖の３’位または５’位に付着するかどうかによって略される。したがって、５’−ヌクレオチドは「ｐＮ」と略され、そして３’−ヌクレオチドは「Ｎｐ」として略され、ここで「Ｎ」はＡ、Ｇ、Ｃ、ＴまたはＵを示す。核酸配列を一連の一文字略語として示す場合、配列は、一般的な慣用にしたがって、５’→３’方向で提示され、そしてリン酸は示されない。
[0043]別に定義しない限り、本明細書で用いるすべての技術的および科学的用語は、一般の当業者に一般的に理解されるのと同じ意味を有する。したがって、以下の用語は、以下の意味を有すると意図される。
[0044]本明細書において、用語「抗体」は、最も広い意味で用いられ、そして免疫グロブリンまたはその断片を指し、そして抗体の抗原結合断片または領域を含む任意のこうしたポリペプチドを含む。認識された免疫グロブリン遺伝子には、カッパ、ラムダ、アルファ、ガンマ、デルタ、イプシロンおよびミュー定常領域遺伝子、ならびに無数の免疫グロブリン可変領域遺伝子が含まれる。軽鎖は、カッパまたはラムダのいずれかとして分類される。重鎖は、ガンマ、ミュー、アルファ、デルタ、またはイプシロンとして分類され、これは次に、それぞれ、免疫グロブリンクラス、ＩｇＧ、ＩｇＭ、ＩｇＡ、ＩｇＤおよびＩｇＥを定義する。免疫グロブリンクラスはまた、ＩｇＧサブクラスＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、およびＩｇＧ４；ならびにＩｇＡサブクラスＩｇＡ１およびＩｇＡ２とさらに分類されうる。該用語には、限定されるわけではないが、ポリクローナル、モノクローナル、単一特異性、多重特異性（例えば二重特異性抗体）、天然、ヒト化、ヒト、キメラ、合成、組換え、ハイブリッド、突然変異、移植、抗体断片（例えば全長抗体の部分、一般的にその抗原結合または可変領域、例えばＦａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、およびＦｖ断片）、および望ましい生物学的活性を示す限り、ｉｎ ｖｉｔｒｏ生成抗体が含まれる。該用語にはまた、可変重鎖および可変軽鎖がともに連結されて（直接またはペプチドリンカーを通じて）、連続ポリペプチドを形成する、一本鎖抗体、例えば一本鎖Ｆｖ（ｓＦｖまたはｓｃＦｖ）抗体も含まれる。
[0045]本明細書において、用語「単離」は、天然状態からの変化、すなわち元来の環境から変化しそして／または除去されることを指す。例えば、天然に生物中に存在するポリヌクレオチドまたはポリペプチド（例えば抗体）は、「単離」されておらず、天然状態で同時に存在する物質から人為的作用によって分離された際、同じポリヌクレオチドまたはポリペプチドは、「単離」されている。したがって、「単離抗体」は、天然環境の構成要素から分離され、そして／または回収されているものである。
[0046]本明細書において、用語「精製抗体」は、抗体が、例えば還元または非還元条件下のＳＤＳ−ＰＡＧＥを用いた決定によって、調製物中の他の混入物質（例えば他のタンパク質）と比較した際、重量にして、少なくとも８０％またはそれより多く、少なくとも８５％またはそれより多く、少なくとも９０％またはそれより多く、少なくとも９５％またはそれより多い、抗体調製物を指す。
[0047]本明細書において、用語「細胞外ドメイン」および「外部ドメイン」は、膜結合したタンパク質に関して用いた際、交換可能に用いられ、そして細胞の脂質二重層の細胞外側で曝露されるタンパク質の部分を指す。いくつかの態様において、ＭＩＣＡの細胞外ドメインは、プロセシングされない全長ＭＩＣＡタンパク質のほぼ２４〜ほぼ２９９のアミノ酸残基由来であり、ここで、アミノ酸番号付けは、ＭＩＣＡ＊００１アレルのＭＩＣＡタンパク質に基づく。いくつかの態様において、ＭＩＣＢの細胞外ドメインは、プロセシングされない全長ＭＩＣＢタンパク質のほぼ２４〜ほぼ２９９のアミノ酸残基由来であり、ここで、アミノ酸番号付けは、ＭＩＣＢ＊００１アレルのＭＩＣＢタンパク質に基づく。ＭＩＣＡおよびＭＩＣＢの細胞外ドメインを定義するポリペプチド領域が、おおよそのものであり、そしていくつかの態様において、ほぼアミノ酸残基３０７まで伸張することも可能であることが理解されるべきである。ＭＩＣＡ＊００１アレルの例示的なプロセシングされない全長ＭＩＣＡタンパク質を図１Ａ（配列番号１）に示し、そしてＭＩＣＢ＊００１アレルの例示的なプロセシングされない全長ＭＩＣＢタンパク質を図１Ｂ（配列番号２）に示す。
[0048]本明細書において、用語「特異的に結合する」は、任意の結合剤、例えば抗体の背景において、抗原またはエピトープに、例えば高いアフィニティで特異的に結合し、そして他の関連しない抗原またはエピトープに有意には結合しない結合剤を指す。
[0049]本明細書において、用途「機能的」は、そのタイプの天然に存在する分子の天然の生物学的活性、または例えばリガンド分子に結合する能力によって判断されるような任意の特定の望ましい活性のいずれかを所持する分子の型を指す。「機能的」ポリペプチドの例には、抗原結合領域を通じて、抗原に特異的に結合する抗体が含まれる。
[0050]本明細書において、用語「ナチュラルキラー群２Ｄ」、「ＮＫＧ２Ｄ」および「ＮＫＧ２Ｄ受容体」は、多様なタイプの免疫細胞、特にＮＫ細胞、ＣＤ８＋ Ｔ細胞（例えばγδ ＣＤ８＋ Ｔ細胞およびαβ ＣＤ８＋ Ｔ細胞）およびいくつかのＣＤ４＋ Ｔ細胞上に見られる活性化細胞表面分子を指す。ＮＫＧ２Ｄはまた、キラー細胞レクチン様受容体、サブファミリーＣ、メンバー４、またはＫＬＲＣ４とも称される、用語「ＮＫＧ２Ｄ」および「ＮＫＧ２Ｄ受容体」には、ヒトＮＫＧ２Ｄ受容体の変異体、アイソフォーム、および種相同体が含まれる（例えばＤｉｅｆｅｎｂａｃｈら， ２００２， Ｎａｔ Ｉｍｍｕｎｏｌ． ３（１２）：１１４２−９に記載されるアイソフォームを参照されたい）。ＮＫＧ２Ｄは、細胞外Ｃ型（すなわちＣａ２＋結合）レクチン様ドメインを含むが、Ｃａ２＋結合部位を欠く、ＩＩ型膜貫通タンパク質である。これは、アダプタータンパク質、例えば、ＤＡＰ１０またはＤＡＰ１２とヘテロ二量体を形成可能であり、そしてＭＩＣＡ、ＭＩＣＢ、ＵＬＢＰ１、ＵＬＢＰ２、ＵＬＢＰ３、ＵＬＢＰ４、ＵＬＢＰ５、およびＵＬＢＰ６を含むタンパク質リガンドを認識する。本明細書において、ＮＫＧ２Ｄに帰因する任意の活性、例えば細胞活性化、抗体による認識等はまた、ＮＫＧ２Ｄ包含複合体、例えばＮＫＧ２Ｄ−ＤＡＰ１０またはＮＫＧ２Ｄ−ＤＡＰ１２ヘテロ二量体を指すことも可能である。ＮＫＧ２Ｄ所持免疫エフェクター細胞、例えばＮＫ細胞と、ＮＫＧ２Ｄリガンド、例えばＭＩＣＡまたはＭＩＣＢを発現する、ストレスを受けた細胞または疾患細胞との相互作用は、ストレスを受けた細胞／疾患細胞に対する細胞免疫反応を増進させる。
[0051]本明細書において、用語「ＭＩＣＡ」は、ＭＨＣクラスＩ鎖関連遺伝子Ａタンパク質（ＭＩＣＡ）を指し、ヒトＭＩＣＡの変異体、アイソフォーム、および種相同体が含まれる。ＨＬＡクラスＩタンパク質とは異なり、ＭＩＣＡタンパク質は、β２ミクログロブリンと会合しない。ＭＩＣＡ発現は、ストレス誘導性であり、そしてＭＩＣＡは、ナチュラルキラー細胞（ＮＫ）受容体ＮＫＧ２Ｄのリガンドとして働く。ＭＩＣＡタンパク質は、３つの細胞外Ｉｇ様ドメイン、すなわちアルファ−１、アルファ−２およびアルファ−３、膜貫通ドメイン、ならびに細胞内ドメインを含む。該タンパク質は、胃上皮、内皮細胞および線維芽細胞の細胞において、ならびに角化細胞および単球の細胞質において発現される。ＭＩＣＡの例示的な配列は、本開示の図１Ａ（配列番号１）に提示するＮＣＢＩ寄託番号ＮＰ＿０００２３８．１（アレルＭＩＣＡ＊００１）、およびＮＰ＿００１１７０９９０．１（アレルＭＩＣＡ＊００８．０１）として入手可能である。他の例示的なＭＩＣＡ配列は、本明細書に援用される米国特許公報２０１１０３１１５６１に見出されうる。
[0052]本明細書において、用語「ＭＩＣＢ」は、ＭＨＣクラスＩ鎖関連遺伝子Ｂタンパク質（ＭＩＣＢ）を指し、ヒトＭＩＣＢの変異体、アイソフォーム、および種相同体が含まれる。ＨＬＡクラスＩタンパク質とは異なり、ＭＩＣＢタンパク質は、β２ミクログロブリンと会合しない。ＭＩＣＢ発現は、ストレス誘導性であり、そしてＭＩＣＢは、ナチュラルキラー細胞（ＮＫ）受容体ＮＫＧ２Ｄのリガンドとして働く。ＭＩＣＢは、ＭＩＣＡに約８４％配列同一性を有する。ＭＩＣＢタンパク質は、３つの細胞外Ｉｇ様ドメイン、すなわちアルファ−１、アルファ−２およびアルファ−３、膜貫通ドメイン、ならびに細胞内ドメインを含む。該タンパク質は、胃上皮、内皮細胞および線維芽細胞の細胞において、ならびに角化細胞および単球の細胞質において発現される。ＭＩＣＢの例示的な配列は、本開示の図１Ｂ（配列番号２）に提示するＵｎｉＰｒｏｔＫＢ寄託番号Ｑ２９９８０．１として入手可能である。他の例示的なＭＩＣＢ配列は、本明細書に援用される米国特許公報２０１１０３１１５６１に見出されうる。
[0053]本明細書において、用語「可溶性ＭＩＣＡ」または「ｓＭＩＣＡ」は、アルファ−１、アルファ−２、およびアルファ−３ドメインを含有するが、細胞に付着または係留されておらず、そしてしたがって細胞外に存在する、ＭＩＣＡタンパク質を指す。一般的に、可溶性ＭＩＣＡは、鎖膜貫通ドメインを欠く。いくつかの態様において、ｓＭＩＣＡは、ＮＫＧ２Ｄ受容体への結合において機能性である。本明細書において、ｓＭＩＣＡは、タンパク質分解により細胞から放出される型を含み、こうした型は、タンパク質分解プロセスの非特異性のため、多様でありうる。例示的なｓＭＩＣＡは、図１Ａ（配列番号１）に提示するプロセシングされていない全長ＭＩＣＡのほぼ２４〜ほぼ２９７のアミノ酸残基を含有するポリペプチドを含む。また、推定上の可溶性ＭＩＣＡタンパク質の例示的なアミノ酸配列を、図４（配列番号７〜１４）に示す。
[0054]本明細書において、用語「可溶性ＭＩＣＢ」または「ｓＭＩＣＢ」は、ＭＩＣＢタンパク質のアルファ−１、アルファ−２、およびアルファ−３ドメインを含有するが、細胞に付着または係留されておらず、そしてしたがって細胞外に存在する、ＭＩＣＢタンパク質を指す。一般的に、可溶性ＭＩＣＢは、鎖膜貫通ドメインを欠く。本明細書において、ｓＭＩＣＢは、タンパク質分解により細胞から放出される型を含み、こうした型は、タンパク質分解プロセスの非特異性のため、多様でありうる。例示的なｓＭＩＣＢは、図１Ｂ（配列番号２）に提示するプロセシングされていない全長ＭＩＣＢのほぼ２４〜ほぼ２９７のアミノ酸残基を含有するポリペプチドを含む。また、推定上の可溶性ＭＩＣＢタンパク質の例示的なアミノ酸配列を、図５（配列番号１５〜２１）に示す。
[0055]本明細書において、用語「脱落性（ｓｈｅｄｄｉｎｇ）」または「脱落した（ｓｈｅｄ）」は、ＮＫＧ２Ｄリガンド、例えばＭＩＣＡおよびＭＩＣＢに関して、ＮＫＧ２Ｄリガンドを発現する細胞の細胞表面から、ＮＫＧ２Ｄリガンドの可溶性細胞外ドメイン断片の放出を指す。こうした脱落は、細胞表面ＮＫＧ２Ｄリガンドのタンパク質分解的切断によって引き起こされ、細胞表面からの細胞外ドメイン断片の放出を生じることも可能である。いくつかの態様において、可溶性細胞外ドメインまたはその断片は、別の転写物によってコードされてもよい。
[0056]本明細書において、用語「全長ＭＩＣ」は、アルファ−１、アルファ−２、およびアルファ−３ドメイン；膜貫通ドメイン；ならびに細胞内ドメインを含有するＭＩＣタンパク質を指す。「プロセシングされていない全長ＭＩＣタンパク質」は、翻訳後にプロセシングされていないＭＩＣタンパク質を指す一方、「全長成熟ＭＩＣタンパク質」または「プロセシングされた全長ＭＩＣタンパク質」は、ＭＩＣタンパク質のプロセシングされた型、例えばリーダーペプチドが除去されているＭＩＣタンパク質を指す。プロセシングされていない全長、およびプロセシングされた全長成熟タンパク質は、多型の存在のため、長さが多様でありうる。いくつかの態様において、プロセシングされていない全体の長さ（リーダー配列を含有する）は、ＭＩＣＡに関しては約３３２〜約３８８アミノ酸の範囲である可能性があり、そしていくつかの態様において、ＭＩＣＢに関しては約３８３アミノ酸である。いくつかの態様において、プロセシングされていない全長ＭＩＣタンパク質は、約３３２〜約３８８アミノ酸の範囲である可能性がある。プロセシングされたＭＩＣタンパク質（リーダー配列が除去されている）は、ＭＩＣＡに関しては約３０９〜約３６５アミノ酸の範囲である可能性があり、そしてＭＩＣＢに関しては約３６０アミノ酸である。例示的なプロセシングされていない全長ＭＩＣタンパク質を、ＭＩＣＡに関して図１Ａ（配列番号１）に示し、そしてＭＩＣＢに関して図１Ｂ（配列番号２）に示す。他の例示的な全長ＭＩＣＡおよびＭＩＣＢ配列は、本明細書に援用される米国特許公報２０１１０３１１５６１および国際特許公報ＷＯ２０１３１１７６４７に見出されうる。
[0057]本明細書において、用語「膜結合型」は、タンパク質またはポリペプチドの背景において、少なくとも膜貫通ドメインまたは他の膜付着ドメインに付着した細胞外ドメインまたはその一部を含有するタンパク質またはポリペプチドを指す。膜結合型には、細胞内ドメインが含まれてもまたは含まれなくてもよい。
[0058]本明細書において、用語、ＭＩＣタンパク質（例えばＭＩＣＡおよびＭＩＣＢ）の「アルファ−１ドメイン」は、ＭＩＣＡおよびＭＩＣＢタンパク質の細胞外ドメイン上のアミノ末端近位Ｉｇ様領域（すなわちＧ様ドメイン）を指す（例えば、本明細書に援用される、ＦｒｉｇｏｕｌおよびＬｅｆｒａｎｃ， ２００５， Ｒｅｃｅｎｔ Ｒｅｓ Ｄｅｖｅｌ Ｈｕｍａｎ Ｇｅｎｅｔ． ３：９５−１４５を参照されたい）。ＭＩＣＡの例示的なアルファ−１ドメインは、ＭＩＣＡ＊００１アレルのプロセシングされていないＭＩＣＡタンパク質のほぼ２４〜ほぼ１０８のアミノ酸残基を含有する。ＭＩＣＢの例示的なアルファ−１ドメインは、ＭＩＣＢ＊００１アレルのプロセシングされていないＭＩＣＢタンパク質のほぼ２４〜ほぼ１０８のアミノ酸残基を含有する。
[0059]本明細書において、用語、ＭＩＣタンパク質（例えばＭＩＣＡおよびＭＩＣＢ）の「アルファ−２ドメイン」は、ＭＩＣＡおよびＭＩＣＢタンパク質の細胞外ドメイン上の第二のＩｇ様領域（すなわちＧ様ドメイン）を指す（例えば、本明細書に援用される、ＦｒｉｇｏｕｌおよびＬｅｆｒａｎｃ， ２００５， Ｒｅｃｅｎｔ Ｒｅｓ Ｄｅｖｅｌ Ｈｕｍａｎ Ｇｅｎｅｔ． ３：９５−１４５を参照されたい）。ＭＩＣＡの例示的なアルファ−２ドメインは、ＭＩＣＡ＊００１アレルのプロセシングされていないＭＩＣＡタンパク質のほぼ１０９〜ほぼ２０１のアミノ酸残基を含有する。ＭＩＣＢの例示的なアルファ−２ドメインは、ＭＩＣＢ＊００１アレルのプロセシングされていないＭＩＣＢタンパク質のほぼ１０９〜ほぼ２０１のアミノ酸残基を含有する。
[0060]本明細書において、用語、ＭＩＣタンパク質（例えばＭＩＣＡおよびＭＩＣＢ）の「アルファ−３ドメイン」は、ＭＩＣＡおよびＭＩＣＢタンパク質の細胞外ドメイン上の、Ｃ様領域とも称される膜貫通近位領域を指す（例えば、本明細書に援用される、ＦｒｉｇｏｕｌおよびＬｅｆｒａｎｃ， ２００５， Ｒｅｃｅｎｔ Ｒｅｓ Ｄｅｖｅｌ Ｈｕｍａｎ Ｇｅｎｅｔ． ３：９５−１４５を参照されたい）。いくつかの態様において、アルファ−３ドメインは、アルファ−３ドメイン中の２つのシステイン残基間に形成されるジスルフィド結合を含有する。ＭＩＣＡの例示的なアルファ−３ドメインは、ＭＩＣＡ＊００１アレルのプロセシングされていないＭＩＣＡタンパク質のほぼ２０５〜ほぼ２９６またはほぼ２０５〜ほぼ２９７のアミノ酸残基を含有する。ＭＩＣＢタンパク質の例示的なアルファ−３ドメインは、ＭＩＣＢ＊００１アレルのプロセシングされていないＭＩＣＢタンパク質のほぼ２０５〜ほぼ２９６またはほぼ２０５〜ほぼ２９７のアミノ酸残基を含有する。
[0061]本明細書において、用語「わずかな自己免疫疾患誘導性」は、病原性自己免疫反応誘導活性の欠如を指す。
[0062]本明細書において、用語「抗原」は、特定の抗体に結合可能な物質、例えば特定のペプチドまたはタンパク質を指す。
[0063]本明細書において、用語「エピトープ」または「抗原決定基」は、特定の抗体によって認識され、そして特異的に結合されることが可能な抗原の部分を指す。抗原がポリペプチドである場合、エピトープは、連続アミノ酸および／またはタンパク質の三次フォールディングによって並ぶ非連続アミノ酸から形成可能である。直鎖エピトープは、アミノ酸直鎖配列上の連続アミノ酸から形成されるエピトープである。直鎖エピトープは、典型的には、タンパク質変性の際に保持される。コンホメーションまたは構造エピトープは、連続しておらず、そしてしたがって、例えば二次、三次および／または四次構造を通じて、分子のフォールディングによって互いに近接するようになる、アミノ酸の直鎖配列の別個の部分で構成される。コンホメーションまたは構造エピトープは、典型的には、タンパク質変性に際して失われる。いくつかの態様において、エピトープは、ユニークな空間的コンホメーションの、少なくとも３、そしてより一般的には、少なくとも５または８〜１０アミノ酸を含むことも可能である。したがって、本明細書に用いられるようなエピトープは、抗体が定義されるエピトープの部分にのみ結合する定義されるエピトープを含む。タンパク質上のエピトープの位置をマッピングし、そして性質決定するための多くの方法が当該技術分野に知られ、これには、抗体−抗原複合体の結晶構造の解析、競合アッセイ、遺伝子断片発現アッセイ、突然変異アッセイ、および合成ペプチドに基づくアッセイが含まれ、例えば、Ｕｓｉｎｇ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ： Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ中， 第１１章， ＨａｒｌｏｗおよびＬａｎｅ監修， Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ， ニューヨーク州コールドスプリングハーバー（１９９９）に記載される通りである。
[0064]本明細書において、用語「潜在性（ｃｒｙｐｔｉｃ）エピトープ」は、天然構造内では、結合剤による認識のために曝露されておらず、潜在性エピトープを曝露する天然構造の破壊があった場合に認識可能であるエピトープを指す。タンパク質の背景において、潜在性エピトープは、天然タンパク質内では、認識のために曝露されておらず、天然タンパク質構造の破壊があった場合に、または天然タンパク質からエピトープが分離された場合に、認識可能であるタンパク質配列を指す。天然構造において、曝露されていないか、または部分的にしか曝露されていない配列は、潜在的な潜在性エピトープである。エピトープが曝露されていない場合、または部分的にしか曝露されていない場合、分子の内部内に包埋されている可能性がある。候補潜在性エピトープはまた、例えば、天然タンパク質の三次元構造を調べることによっても同定可能である。いくつかの態様において、潜在性エピトープを曝露させることが可能な構造破壊には、変性およびタンパク質分解が含まれる。天然タンパク質からの潜在性エピトープの分離は、タンパク質分解、エピトープを含有するタンパク質断片の合成、または膜、例えば細胞表面膜からの天然タンパク質の細胞外部分の放出によって起こることも可能である。
[0065]本明細書において、用語「多型性」または「多型」は、遺伝子またはその一部の２またはそれより多い型の出現を指す。少なくとも２つの異なる型、すなわち２つの異なるヌクレオチド配列がある遺伝子の部分を、「遺伝子の多型領域」と称する。多型領域は、異なるアレルにおいてその同一性が異なる、単一ヌクレオチドであることも可能である。多型領域はまた、長さ数ヌクレオチドであることも可能である。多型タンパク質は、コードする遺伝子配列中の多型による、タンパク質の２またはそれより多い型の出現を指す。
[0066]本明細書において、用語「アレル」は、ＤＮＡの遺伝子配列に沿って、塩基対の特定の配列のセグメントによって占められる位である、遺伝子座の特定の遺伝子配列を指す。
[0067]本明細書において、用語「タンパク質」、「ポリペプチド」、または「ペプチド」は、長さまたは翻訳後修飾（例えばグリコシル化、リン酸化、脂質化、ミリスチル化、ユビキチン化等）に関わらず、アミド結合によって共有結合される、少なくとも２つのアミノ酸のポリマーを示す。この定義内に含まれるのは、Ｄ−およびＬ−アミノ酸、ならびにＤ−およびＬ−アミノ酸の混合物である。ポリペプチド配列は、本明細書において、慣用的なＮ末端からＣ末端の配向で示される。
[0068]本明細書において、用語「ポリヌクレオチド」および「核酸」は、交換可能に用いられ、そしてともに共有結合された２またはそれより多いヌクレオシドを指す。ポリヌクレオチドは、完全にリボヌクレオシドで構成されるもの（すなわちＲＮＡ）、完全に２’デオキシリボヌクレオチドで構成されるもの（すなわちＤＮＡ）、またはリボおよび２’デオキシリボヌクレオシドの混合物であってもよい。ヌクレオシドは、典型的には、糖−リン酸連結（糖−リン酸主鎖）でともに連結されるが、ポリヌクレオチドには、１またはそれより多い非標準的連結が含まれてもよい。こうした非標準的連結の限定されない例には、ホスホロアミデート、ホスホロチオエート、およびアミドが含まれる（例えば、Ｅｃｋｓｔｅｉｎ， Ｆ．， Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ ａｎｄ Ａｎａｌｏｇｕｅｓ： Ａ Ｐｒａｃｔｉｃａｌ Ａｐｐｒｏａｃｈ， Ｏｘｆｏｒｄ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｐｒｅｓｓ （１９９２）を参照されたい）。
[0069]本明細書において、用語「機能可能であるように連結された」または「機能可能であるように関連する」は、２またはそれより多いポリヌクレオチド配列が、その通常の機能を可能にするように配置されている状況を指す。例えば、プロモーターがコード配列の発現を制御可能であるならば、該プロモーターは該コード配列に機能可能であるように連結されている。また他の制御配列、例えばエンハンサー、リボソーム結合または進入部位、終結シグナル、ポリアデニル化配列、およびシグナル配列を機能可能であるように連結して、転写または翻訳におけるその適切な機能を可能にする。
[0070]本明細書において、用語「アミノ酸位」および「アミノ酸残基」は、交換可能に用いられ、ポリペプチド鎖中のアミノ酸の位を指す。いくつかの態様において、アミノ酸残基は、「ＸＮ」として表すことも可能であり、ここでＸはアミノ酸残基を示し、そしてＮはポリペプチド鎖中のその位を示す。２またはそれより多い変動、例えば多型が同じアミノ酸位で生じる場合、変動は、多型を分離する「／」で示されることも可能である。特定の残基位で、１アミノ酸残基の別のアミノ酸残基での置換は、ＸＮＹと示されることも可能であり、ここでＸは元来のアミノ酸を示し、Ｎはポリペプチド鎖中の位を示し、そしてＹは交換または置換アミノ酸を示す。より大きなポリペプチドまたはタンパク質に関してポリペプチドまたはペプチド部分を記載するように該用語を用いる場合、言及される最初の数字は、ポリペプチドまたはペプチドが開始する位（すなわちアミノ末端）を示し、そして第二の言及される数字は、ポリペプチドまたはペプチドが終わる位（すなわちカルボキシ末端）を指す。例えば、プロセシングされた全長ＭＩＣＡのアミノ酸位１９０〜１９６由来のペプチドは、アミノ末端がプロセシングされた全長ＭＩＣＡタンパク質の１９０位であり、そしてカルボキシ末端が１９６位であるペプチドを指す。
[0071]本明細書において、用語「ポリクローナル」抗体は、同じまたは異なる抗原上のいくつかの異なる特異的抗原決定基に結合するかまたはこれと反応することが可能な、異なる抗体分子の組成物を指す。ポリクローナル抗体はまた、「モノクローナル抗体のカクテル」と見なすことも可能である。ポリクローナル抗体は、任意の起源、例えばキメラ、ヒト化、または完全ヒトであることも可能である。
[0072]本明細書において、用語「モノクローナル抗体」は、実質的に均質な抗体集団から得られる抗体を指し、すなわち、集団を構成する個々の抗体は、少量で存在しうる、ありうる天然存在突然変異を除いて同一である。各モノクローナル抗体は、抗原上の単一の決定基に対して向けられる。モノクローナル抗体は、非常に特異的である。例えば、本開示にしたがって用いられるモノクローナル抗体は、Ｋｏｈｌｅｒら， １９７５， Ｎａｔｕｒｅ ２５６：４９５−７に記載されるハイブリドーマ法によって作製可能であるし、または組換えＤＮＡ法によって作製可能である。モノクローナル抗体はまた、例えばファージ抗体ライブラリーから単離されることも可能である。
[0073]本明細書において、用語「キメラ抗体」は、少なくとも２つの異なる供給源由来の構成要素で構成される抗体を指す。キメラ抗体は、別の分子、例えば第二の種に由来する抗体部分に融合した、第一の種に由来する抗体部分を含んでもよい。いくつかの態様において、キメラ抗体は、ヒト由来の抗体部分に融合した、非ヒト動物、例えばマウスまたはラット由来の抗体部分を含む。いくつかの態様において、キメラ抗体は、ヒト由来の抗体の定常領域に融合した、非ヒト動物由来の抗体の可変領域のすべてまたは部分を含む。
[0074]本明細書において、用語「ヒト化抗体」は、ヒトフレームワーク配列上に移植された、ドナー抗体結合特異性、例えばドナー抗体、例えばマウスモノクローナル抗体のＣＤＲ領域を含む抗体を指す。「ヒト化抗体」は、典型的には、ドナー抗体と同じエピトープに結合する。
[0075]本明細書において、用語「全長ヒト抗体」または「ヒト抗体」は、ヒト免疫グロブリンタンパク質配列のみを含む抗体を指す。全長ヒト抗体は、マウスにおいて、マウス細胞において、またはマウス細胞由来のハイブリドーマにおいて産生された際、ネズミ炭水化物鎖を含有する可能性もある。
[0076]本明細書において、用語「抗体断片」または「抗原結合部分」は、全長抗体の部分、一般的には、その抗原結合または可変ドメインを指す。抗体断片の例には、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、およびＦｖ断片；ディアボディ；直鎖抗体；一本鎖抗体；ならびに２またはそれより多い異なる抗原に結合する抗体断片から形成される多重特異性抗体が含まれる。増加した結合化学量論または多様な結合価（２、３または４）を含有する抗体断片のいくつかの例には、トリアボディ、三価抗体およびトリマーボディ、テトラボディ、ｔａｎｄＡｂ（登録商標）、ジ−ディアボディおよび（ｓｃ（Ｆｖ）２）２分子が含まれ、そしてすべて、可溶性抗原に対して、高アフィニティおよびアビディティで結合する結合剤として使用可能である（例えばＣｕｅｓｔａら， ２０１０， Ｔｒｅｎｄｓ Ｂｉｏｔｅｃｈ． ２８：３５５−６２）。
[0077]本明細書において、用語「一本鎖Ｆｖ」または「ｓＦｖ」抗体断片は、抗体のＶＨおよびＶＬドメインを含み、ここでこれらのドメインは、単一ポリペプチド鎖中に提示される。一般的に、Ｆｖポリペプチドは、ＶＨおよびＶＬドメイン間にポリペプチドリンカーをさらに含み、該リンカーは、ｓＦｖが抗原結合に望ましい構造を形成することを可能にする。ｓＦｖの概説に関しては、Ｐｌｕｃｋｔｈｕｎ Ｔｈｅ Ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ ｏｆ Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ中， Ｖｏｌ． １１３， ｐｐ． ２６９−３１５， ＲｏｓｅｎｂｕｒｇおよびＭｏｏｒｅ監修， Ｓｐｒｉｎｇｅｒ−Ｖｅｒｌａｇ， ニューヨーク（１９９４）を参照されたい。
[0078]本明細書において、用語「ディアボディ」は、２つの抗原結合部位を持つ小さい抗体断片を指し、これは、同じポリペプチド鎖中で軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）に連結された重鎖可変ドメイン（ＶＨ）を含む（ＶＨ−ＶＬ）。同じ鎖上の２つのドメイン間での対形成を可能にするには短いリンカーを用いることによって、ドメインは、別の鎖の相補ドメインと対形成することを強いられ、そして２つの抗原結合部位を生成する。
[0079]本明細書において、用語「抗原結合ドメイン」または「抗原結合部分」は、抗原の一部またはすべてに特異的に結合し、そして相補的である、抗原結合分子の領域または部分を指す。いくつかの態様において、抗原結合ドメインは、特に抗原が大きい場合、抗原の特定の部分（例えばエピトープ）にのみ結合可能である。抗原結合ドメインは、１またはそれより多い抗体可変領域、特に抗体軽鎖可変領域（ＶＬ）および抗体重鎖可変領域（ＶＨ）、ならびに特にＶＨおよびＶＬ鎖各々の上の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含むことも可能である。
[0080]本明細書において、用語「可変領域」および「可変ドメイン」は、交換可能に用いられ、抗体間で配列において大規模に異なり、そして特定の抗体各々に結合および特異性特性を与えるポリペプチド領域を指す。抗体重鎖中の可変領域は「ＶＨ」と称され、一方、抗体軽鎖中の可変領域は「ＶＬ」と称される。配列中の主要可変性は、一般的に、ＶＬ領域およびＶＨ領域各々において、「超可変領域」または「ＣＤＲ」と称される可変ドメインの３つの領域中に位置し、そして抗原結合部位を形成する。可変ドメインのより保存された部分は、フレームワーク領域と称される。
[0081]本明細書において、用語「相補性決定領域」または「ＣＤＲ」は、交換可能に用いられて、重鎖および軽鎖ポリペプチドの可変領域内に見られる非連続抗原結合領域を指す。いくつかの態様において、ＣＤＲはまた、「超可変領域」とも記載される。一般的に、天然存在抗体は、６つのＣＤＲを含み、３つはＶＨ中（ＣＤＲ Ｈ１またはＨ１；ＣＤＲ Ｈ２またはＨ２；およびＣＤＲ Ｈ３またはＨ３と称される）、そして３つはＶＬ中（ＣＤＲ Ｌ１またはＬ１；ＣＤＲ Ｌ２またはＬ２；およびＣＤＲ Ｌ３またはＬ３と称される）にある。ＣＤＲドメインは、多様なアプローチを用いて描写されてきており、そして異なるアプローチによって定義されるＣＤＲが本明細書に含まれることが理解されるものとする。ＣＤＲを定義するための「Ｋａｂａｔ」アプローチは、配列可変性を用い、そして最も一般的に用いられる（Ｋａｂａｔら， １９９１， “Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｏｆ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ Ｉｎｔｅｒｅｓｔ， 第５版” ＮＩＨ １：６８８−９６）。「Ｃｈｏｔｈｉａ」は、構造ループの位置を用いる（ＣｈｏｔｈｉａおよびＬｅｓｋ， １９８７， Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ． １９６：９０１−１７）。「ＡｂＭ」によって定義されるＣＤＲは、ＫａｂａｔおよびＣｈｏｔｈｉａの間の妥協であり、そしてＯｘｆｏｒｄ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ＡｂＭ抗体モデリングソフトウェアを用いて描写される（Ｍａｒｔｉｎら， １９８９， Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ． ８６：９２６８を参照されたい；また、ワールドワイドウェブｗｗｗ．ｂｉｏｉｎｆ−ｏｒｇ．ｕｋ／ａｂｓも参照されたい）。「Ｃｏｎｔａｃｔ」ＣＤＲ描写は、既知の抗体−抗原結晶構造の分析に基づく（例えば、ＭａｃＣａｌｌｕｍら， １９９６， Ｊ． Ｍｏｌ． Ｂｉｏｌ． ２６２， ７３２−４５を参照されたい）。これらの方法によって描写されるＣＤＲには、典型的には、互いに比較した際、アミノ酸残基の重複またはサブセットが含まれる。一般的に、各アプローチを用いてＣＤＲを定義する残基は、以下の通りである：
Figure 0006518199
[0082]特定のＣＤＲを含む正確な残基数は、ＣＤＲの配列およびサイズに応じて多様であることが理解されるものとし、そして当業者は、抗体の可変領域のアミノ酸配列が与えられれば、どの残基が特定のＣＤＲを構成するかをルーチンに決定可能である。
[0083]上記のＫａｂａｔはまた、任意の抗体に適用可能な可変ドメイン配列に関する番号付け系も定義した。当業者は、「Ｋａｂａｔ番号付け」のこの系を、任意の可変ドメイン配列に割り当てることも可能である。したがって、別に明記しない限り、抗体または抗原結合断片における特定のアミノ酸残基の番号への言及は、Ｋａｂａｔ番号付け系にしたがう。いくつかの態様において、可変領域およびＣＤＲに関連する配列（例えば配列番号２３、２６、３１、３５、および８３〜１０２）は、Ｋａｂａｔ番号付け系にしたがって番号付けされないが、一般の当業者は、こうした配列がＫａｂａｔ番号付け系に変換可能であることを認識するであろう。
[0084]本明細書において、用語「フレームワーク領域」または「ＦＲ領域」は、可変領域の一部であるが、ＣＤＲの一部ではないアミノ酸残基を指す（例えばＫａｂａｔ、ＣｈｏｔｈｉａまたはＡｂＭ定義を用いる）。抗体の可変領域は、一般的に、４つのＦＲ領域：ＦＲ１、ＦＲ２、ＦＲ３およびＦＲ４を含有する。したがって、ＶＬ領域中のＦＲ領域は、以下の配列：ＦＲＬ１−ＣＤＲ Ｌ１−ＦＲＬ２−ＣＤＲ Ｌ２−ＦＲＬ３−ＣＤＲ Ｌ３−ＦＲＬ４中に現れ、一方、ＶＨ領域中のＦＲ領域は、以下の配列： ＦＲ１Ｈ−ＣＤＲ Ｈ１−ＦＲＨ２−ＣＤＲ Ｈ２−ＦＲＨ３−ＣＤＲ Ｈ３−ＦＲＨ４中に現れる。
[0085]本明細書において、用語「ヒトコンセンサスフレームワーク」は、ヒト免疫グロブリンＶＬまたはＶＨフレームワーク配列の選択において、最も一般的に存在するアミノ酸残基に相当するフレームワークを指す。一般的に、ヒト免疫グロブリンＶＬまたはＶＨ配列の選択は、可変ドメイン配列のサブグループからである。いくつかの態様において、サブグループ配列は、Ｋａｂａｔら、上記に提示されるサブグループである。いくつかの態様において、ＶＬに関して、サブグループは、Ｋａｂａｔら、上記に記載されるサブグループ・カッパである。いくつかの態様において、ＶＨに関して、サブグループは、Ｋａｂａｔら、上記に記載されるサブグループＩＩＩである。
[0086]本明細書において、用語「定常領域」または「定常ドメイン」は、可変領域とは異なる免疫グロブリン軽鎖または重鎖の領域を指す。重鎖の定常ドメインは、一般的に：ＣＨ１ドメイン、ヒンジ（例えば、上部、中央、および／または下部ヒンジ領域）、ＣＨ２ドメイン、およびＣＨ３ドメインの少なくとも１つを含む。例えば、本明細書に記載する抗体は、ＣＨ１ドメインを含むポリペプチド；ＣＨ１ドメイン、ヒンジドメインの少なくとも一部、およびＣＨ２ドメインを含むポリペプチド；ＣＨ１ドメインおよびＣＨ３ドメインを含むポリペプチド；ＣＨ１ドメイン、ヒンジドメインの少なくとも一部、およびＣＨ３ドメインを含むポリペプチド、またはＣＨ１ドメイン、ヒンジドメインの少なくとも一部、ＣＨ２ドメイン、およびＣＨ３ドメインを含むポリペプチドを含むことも可能である。いくつかの態様において、ポリペプチドは、ＣＨ３ドメインを含むポリペプチド鎖を含む。軽鎖定常ドメインは、ＣＬと称され、そしていくつかの態様において、カッパまたはラムダ定常領域であることも可能である。しかし、一般の当業者によって、これらの定常ドメイン（例えば重鎖または軽鎖）は、天然存在免疫グロブリン分子とはアミノ酸配列が多様であるように、修飾されていることも可能であることが理解されるであろう。
[0087]本明細書において、用語「Ｆｃ領域」または「Ｆｃ部分」は、免疫グロブリン重鎖のＣ末端領域を指す。Ｆｃ領域は、天然配列Ｆｃ領域または非天然存在変異体Ｆｃ領域であってもよい。一般的に、免疫グロブリンのＦｃ領域は、定常ドメインＣＨ２およびＣＨ３を含む。Ｆｃ領域の境界は多様であることが可能であるが、いくつかの態様において、ヒトＩｇＧ重鎖Ｆｃ領域は、そのＣ２２６位のアミノ酸残基から、またはＰ２３０から、カルボキシ末端に渡るように定義されることも可能である。いくつかの態様において、ヒトＩｇＧ Ｆｃ領域の「ＣＨ２ドメイン」はまた、「Ｃγ２」と示され、通常、ほぼアミノ酸残基２３１〜ほぼアミノ酸残基３４０に渡る。いくつかの態様において、Ｎ連結炭水化物鎖は、損なわれていない（ｉｎｔａｃｔ）天然ＩｇＧ分子の２つのＣＨ２ドメイン間に挿入される。いくつかの態様において、ヒトＩｇＧ Ｆｃ領域のＣＨ３ドメインは、ＣＨ２ドメインよりＣ末端の残基を含み、例えばＦｃ領域のほぼアミノ酸残基３４１からほぼアミノ酸残基４４７である。「機能性Ｆｃ領域」は、天然配列Ｆｃ領域の「エフェクター機能」を所持する。例示的なＦｃ「エフェクター機能」には、とりわけ、Ｃｌｑ結合；補体依存性細胞傷害性（ＣＤＣ）；Ｆｃ受容体結合；抗体依存性細胞仲介性細胞傷害性（ＡＤＣＣ）；食作用；細胞表面受容体の下方制御（例えばＬＴ受容体）等が含まれる。こうしたエフェクター機能は、一般的に、Ｆｃ領域が結合ドメイン（例えば抗体可変ドメイン）と組み合わせられることを必要とし、そして当該技術分野に知られる多様なアッセイを用いて評価可能である。
[0088]本明細書において、用語「結合アフィニティ」は、リガンドおよびその結合パートナーの間の非共有相互作用の総計の強度を指す。いくつかの態様において、結合アフィニティは、リガンドおよび結合パートナーの間の一対一相互作用を反映する本質的なアフィニティである。アフィニティは、一般的に、平衡会合（ＫＡ）または解離定数（ＫＤ）に関して表され、これは次に、解離（ｋｏｆｆ）および会合速度定数（ｋｏｎ）の反比である。
[0089]本明細書において、用語「配列同一性パーセント（％）」および「配列相同性の割合」は、本明細書において交換可能に用いられ、ポリヌクレオチドまたはポリペプチド間の比較を指し、そして比較ウィンドウに渡る最適に整列された配列を比較することによって決定され、ここで比較ウィンドウ中のポリヌクレオチドまたはポリペプチド配列の部分は、２つの配列の最適な整列のため、参照配列に比較した際にギャップを含むことも可能である。割合は、同一核酸塩基またはアミノ酸残基が両方の配列で生じる位の数を決定して、マッチした位の数を得て、マッチした位の数を比較ウィンドウ中の位の総数で割り、そして結果に１００を乗じて、配列同一性の割合を得ることによって計算可能である。あるいは、割合は、同一核酸塩基またはアミノ酸残基のいずれかが、両方の配列で生じるか、あるいは核酸塩基またはアミノ酸残基を、ギャップを含めて整列させて、マッチした位の数を得て、マッチした位の数を比較ウィンドウ中の位の総数で割り、そして結果に１００を乗じて、配列同一性の割合を得ることによって計算可能である。当業者は、２つの配列を整列させるために利用可能な多くの確立されたアルゴリズムがあることを認識する。比較のための配列の最適な整列は、例えばＳｍｉｔｈおよびＷａｔｅｒｍａｎ， １９８１， Ａｄｖ Ａｐｐｌ Ｍａｔｈ． ２：４８２の局所相同アルゴリズムによって、ＮｅｅｄｌｅｍａｎおよびＷｕｎｓｃｈ， １９７０， Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ． ４８：４４３の相同性整列アルゴリズムによって、ＰｅａｒｓｏｎおよびＬｉｐｍａｎ， １９８８， Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ． ８５：２４４４−８の類似性に関する検索法によって、これらのアルゴリズムのコンピュータ化実装（例えば、ＢＬＡＳＴ、ＡＬＩＧＮ、ＧＡＰ、ＢＥＳＴＦＩＴ、ＦＡＳＴＡ、およびＴＦＡＳＴＡ；例えばＭｏｕｎｔ， Ｄ．Ｗ．， Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ： Ｓｅｑｕｅｎｃｅ ａｎｄ Ｇｅｎｏｍｅ Ａｎａｌｙｓｉｓ， 第２版， Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ， ニューヨーク州コールドスプリングハーバー（２０１３））によって、実行可能である。
[0090]配列同一性パーセントおよび配列類似性パーセントを決定するために適したアルゴリズムの例は、公的に利用可能なＢＬＡＳＴおよびＢＬＡＳＴ ２．０、ＦＡＳＴＤＢ、またはＡＬＩＧＮアルゴリズムである（例えばＮＣＢＩ： Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ）。当業者は、配列を整列させるために適したパラメータを決定可能である。例えば、ＢＬＡＳＴＮプログラム（ヌクレオチド配列に関して）は、１１のワード長（Ｗ）、１０の期待値（Ｅ）、Ｍ＝５、Ｎ＝−４、および両方の鎖の比較をデフォルトとして使用可能である。ＢＬＡＳＴＰを用いたアミノ酸配列の比較は、３のワード長（Ｗ）、１０の期待値（Ｅ）、およびＢＬＯＳＵＭ６２スコアリングマトリックス（ＨｅｎｉｋｏｆｆおよびＨｅｎｉｋｏｆｆ， １９８９， Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ． ８９：１０９１５−９を参照されたい）をデフォルトとして使用可能である。
[0091]本明細書において、用語「アミノ酸置換」は、ポリペプチド中の１つのアミノ酸の別のアミノ酸での置換を指す。「保存的アミノ酸置換」は、類似の側鎖を有する残基の交換可能性を指し、そしてしたがって、典型的には、ポリペプチド中のアミノ酸の、アミノ酸の同じまたは類似の定義されるクラス内のアミノ酸での置換を伴う。例えば、そして限定なしに、脂肪族側鎖を含むアミノ酸は、別の脂肪族アミノ酸、例えばアラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、およびメチオニンで置換可能であり；ヒドロキシル側鎖を持つアミノ酸は、ヒドロキシル側鎖を持つ別のアミノ酸、例えばセリンおよびスレオニンで置換され；芳香族側鎖を有するアミノ酸は、芳香族側鎖を有する別のアミノ酸、例えばフェニルアラニン、チロシン、トリプトファン、およびヒスチジンで置換され；塩基性側鎖を持つアミノ酸は、塩基性側鎖を持つ別のアミノ酸、例えば、リジン、アルギニン、およびヒスチジンで置換され；酸性側鎖を持つアミノ酸は、酸性側鎖を持つ別のアミノ酸、例えばアスパラギン酸またはグルタミン酸で置換され；そして疎水性または親水性アミノ酸は、それぞれ、別の疎水性または親水性アミノ酸で置換される。
[0092]本明細書において、用語「アミノ酸挿入」は、あらかじめ決定されたアミノ酸配列内への少なくとも１つのアミノ酸の取り込みを指す。挿入は、１または２のアミノ酸残基の挿入からなることも可能である；が、約３〜約５、あるいは最大約１０またはそれより多いアミノ酸残基のより大きな挿入が本明細書に意図される。
[0093]本明細書において、用語「アミノ酸欠失」は、あらかじめ決定されたアミノ酸配列からの１またはそれより多いアミノ酸残基の除去を指す。欠失は、１または２のアミノ酸残基の除去からなることも可能である；が、約３〜約５、あるいは最大約１０またはそれより多いアミノ酸残基のより大きな欠失が本明細書に意図される。
[0094]本明細書において、用語「免疫原」は、場合によって被験体に投与されることが可能であり、免疫学的反応を誘導する部分を指す。
[0095]本明細書において、用語「サブ配列」は、それぞれ、核酸またはポリペプチドのより長い配列の部分を構成する、核酸またはポリペプチドの配列を指す。
[0096]本明細書において、用語「アジュバント」は、限定されるわけではないが、抗原に対する免疫反応を増加させるかまたは多様にするアジュバントを含めて、組成物の免疫学的作用を補助するかまたは修飾する、任意の物質を指す。
[0097]本明細書において、用語「融合タンパク質」および「融合ポリペプチド」は、２またはそれより多い異種ポリペプチド由来のアミノ酸配列を含むポリペプチドを指す。融合タンパク質を形成するポリペプチドは、典型的には、Ｃ末端からＮ末端に連結されるが、また、Ｃ末端からＣ末端に、Ｎ末端からＮ末端に、またはＮ末端からＣ末端に連結されてもよい。融合タンパク質のポリペプチドは、いかなる順序であってもよい。
[0098]本明細書において、用語「候補」は、スクリーニングの背景において、望ましい特性、例えば定義されるエピトープへの結合に関して考慮されるかまたは試験される抗体を指す。
[0099]本明細書において、用語「同定する」は、特性の存在または非存在に関して調べることを指す。プロセスには、多様な特性を測定するかまたは検出することが含まれることも可能であり、エピトープへの結合または結合の欠如が含まれる。
[0100]本明細書において、用語「生物学的試料」は、患者または被験体から採取された任意の生物学的材料を指す。こうした試料には、組織試料および体液試料が含まれる。「体液試料」には、とりわけ、患者の血液、血漿、血清、尿、脳脊髄液、リンパ、滑液、胆汁、精液、および唾液が含まれる。試料にはまた、生検試料、全細胞、または細胞溶解物が含まれることも可能である。
[0101]本明細書において、用語「被験体」は、限定されるわけではないが、ヒト、非ヒト霊長類、および非霊長類、例えばヤギ、ウマ、およびウシを含む、哺乳動物を指す。いくつかの態様において、用語「被験体」および「患者」は、本明細書においてヒトに関して交換可能に用いられる。
[0102]本明細書において、用語「異常」または「異常性」は、こうした疾患または障害に罹患していない生物において観察されるレベルまたは状態とは統計的に異なるレベルまたは状態を指し、そしてシグナルの過剰な量、強度または期間、あるいはシグナルの不十分な量、強度または期間のいずれかとして特徴付けられることも可能である。異常性は、細胞機能、生存性または分化状態の異常として実現することも可能である。異常な相互作用レベルはまた、正常レベルよりも多いまたは少ないことも可能であり、そして生物の正常な能力または機能を損なうことも可能である。
[0103]本明細書において、用語「上昇した」は、疾患または障害の背景において、疾患または障害の発生と統計的に有意な相関を有する、物質または分子、例えば疾患マーカーまたは指標の、正常よりも高いレベルを指す。レベルを適切な対照、例えば疾患を持たない健康な被験体に比較して、疾患の存在のシグナルとなるレベルを決定することも可能である。
[0104]本明細書において、用語「癌」および「癌性」は、細胞集団が、制御されない細胞増殖によって特徴付けられる哺乳動物における生理学的状態を指すかまたは記載する。癌の例には、限定されるわけではないが、癌腫、リンパ腫、芽腫、肉腫、および白血病が含まれる。こうした癌のより特定の例には、扁平上皮癌、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、肺腺癌、肺扁平上皮癌、腹膜癌、肝細胞癌、胃腸癌、膵臓癌、神経膠芽腫、子宮頸癌、卵巣癌、肝臓癌、膀胱癌、肝細胞腫、乳癌、結腸癌、結腸直腸癌、子宮内膜または子宮癌、唾液腺癌、腎臓癌、肝臓癌、前立腺癌、外陰癌、甲状腺癌、肝癌腫、ならびに多様なタイプの頭頸部癌が含まれる。
[0105]本明細書において、用語「増殖性障害」および「増殖性疾患」は、異常な細胞増殖、例えば癌と関連する障害を指す。
[0106]本明細書において、用語「腫瘍」および「新生物」は、良性（非癌性）または悪性（癌性）いずれかの、前癌性病変を含む、過剰な細胞成長または増殖から生じる任意の組織塊を指す。
[0107]本明細書において、用語「ＭＩＣＡ＋疾患または障害」は、疾患または障害の発生と相関する、ＭＩＣＡタンパク質またはその一部、例えばｓＭＩＣＡの上昇したレベルを示す疾患または障害を指す。
[0108]本明細書において、用語「ＭＩＣＢ＋疾患または障害」は、疾患または障害の発生と相関する、ＭＩＣＢタンパク質またはその一部、例えばｓＭＩＣＢの上昇したレベルを示す疾患または障害を指す。
[0109]本明細書において、用語「ＭＩＣ＋上皮腫瘍」は、ＭＩＣタンパク質またはその一部、例えばｓＭＩＣＡの上昇したレベルによって特徴付けられる腫瘍または新生物を指し、ここで、腫瘍または新生物は、こうした障害を同定するために当該技術分野に知られる臨床的標準と一致して、上皮起源である組織または細胞から生じる。
[0110]本明細書において、用語「ＭＩＣ＋血液学的悪性腫瘍」は、ＭＩＣタンパク質またはその一部、例えばｓＭＩＣＡおよびｓＭＩＣＢの上昇したレベルによって特徴付けられるリンパ系または骨髄系の細胞の増殖性障害を指す。リンパ系障害には、急性リンパ球性白血病および慢性リンパ増殖性障害（例えばリンパ腫、骨髄腫、および慢性リンパ性白血病）が含まれる。リンパ腫には、ホジキン病および非ホジキンリンパ腫、前駆体Ｔ細胞白血病／リンパ腫、濾胞性リンパ腫、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、マントル細胞リンパ腫、ＭＡＬＴリンパ腫、バーキットリンパ腫、Ｂ細胞慢性リンパ球性白血病／リンパ腫、特定不能の（ｎｏｔ−ｏｔｈｅｒｗｉｓｅ−ｓｐｅｃｉｆｉｅｄ）末梢Ｔ細胞リンパ腫、および菌状息肉症が含まれる。慢性リンパ性白血病には、Ｔ細胞慢性リンパ性白血病およびＢ細胞慢性リンパ性白血病が含まれる。骨髄性障害には、慢性骨髄性障害および急性骨髄性白血病が含まれる。慢性骨髄性障害には、慢性骨髄増殖性障害および骨髄異形成障害が含まれる。慢性骨髄増殖性障害には、血管新生性骨髄化生、本態性血小板血症、慢性骨髄性白血病、真性多血症、および非典型的骨髄増殖性障害が含まれる。非典型的骨髄増殖性障害には、非典型的ＣＭＬ、慢性好中球性白血病、マスト細胞病、および慢性好酸球性白血病が含まれる。
[0111]本明細書において、用語「ＭＩＣ＋ウイルス感染」は、ＭＩＣタンパク質またはその一部、例えばｓＭＩＣＡおよびｓＭＩＣＢの上昇したレベルによって特徴付けられるウイルス感染を指す。
[0112]本明細書において、用語「治療」または「治療すること」は、しばしば患者とも呼ばれる、哺乳動物、例えばヒトの状態における有益な変化を生じるよう意図されるプロセスを指す。有益な変化には、例えば、１またはそれより多い機能回復；症状の減少；重症度の減少；疾患、障害または状態の進行の制限または遅延、または防止；あるいは患者の状態、疾患または障害の悪化の制限または遅延が含まれる。疾患または障害の背景において、「療法」、「治療」または「治療可能」は、療法が疾患または障害に対して、望ましい薬理学的および／または生理学的影響を達成する療法を意味する。影響は、疾患／障害またはその症状を完全にまたは部分的に防止する観点から、予防的であることも可能であるし、ならびに／あるいは疾患／障害、および／または疾患障害に帰因しうる不都合な影響の部分的なまたは完全な治癒の観点から、療法性であることも可能である。該用語には：（ａ）疾患に対する素因を有しうるが、いまだに該疾患を有するとは診断されていない被験体において、疾患を発生しないように防止し；（ｂ）疾患を阻害し、すなわちその発展を抑止し；あるいは（ｃ）疾患を軽減させる、すなわち疾患の寛解または退縮を引き起こす工程が含まれる。療法剤を、疾患または障害の開始前に、開始中にまたは開始後に投与してもよい。進行しつつある疾患の治療であって、患者の望ましくない臨床的症状を安定化させるかまたは減少させる前記治療が特に興味深い。こうした治療は、罹患した組織中の機能の完全な喪失の前に望ましく行われる。
[0113]本明細書において、用語「療法的有効用量」または「療法的有効量」は、必要がある哺乳動物への投与に際して、望ましい活性を生じるために十分な、生物学的化合物を含む化合物または薬学的組成物の量を指す。本明細書において、抗体を含む薬学的組成物に関して、用語「療法的有効量／用量」は、哺乳動物への投与に際して、有効な反応を生じるために十分である抗体またはその薬学的組成物の量／用量を指す。
[0114]本明細書において、用語「薬学的に許容されうる」は、一般的に安全であり、非毒性であり、そして生物学的にまたは別の意味で望ましくないものではない化合物または組成物を指し、そしてこれには、ヒト薬学的および獣医学的使用のために許容されうる化合物または組成物が含まれる。化合物または組成物は、監督機関によって認可されるかまたは認可されうるものであることも可能であり、あるいは米国薬局方または他のヒトを含む動物における使用に関して一般的に認識される薬局方に列挙されるものであることも可能である。
[0115]本明細書において、用語「薬学的に許容されうる賦形剤、キャリアーまたはアジュバント」は、少なくとも１つの療法剤（例えば本開示の抗体）と一緒に、被験体に投与可能であり、そして剤の療法量を送達するために十分な用量で投与された際に、その薬理学的活性を破壊せず、そして一般的に安全であり、非毒性であり、そして生物学的にまたは別の意味でのいずれでも望ましくないものではない賦形剤、キャリアーまたはアジュバントを指す。
[0116]本明細書において、用語「単一療法」は、単回用量で投与されるか、または長期に渡って数回の用量で投与されるかいずれかの、１つの療法的有効化合物の送達に基づく治療措置を指す。
[0117]本明細書において、用語「併用療法」は、示す療法効果を達成するために、少なくとも２つの別個の療法の提供を伴う療法措置を指す。例えば、併用療法は、２またはそれより多い別個の活性成分、例えば抗体および化学療法剤、または第一のターゲットに対して向けられる抗体および第二のターゲットに対して向けられる第二の抗体の投与を伴うことも可能である。あるいは、併用療法は、単独のまたは別の治療、例えば放射線療法および／または手術の送達を伴う、抗体および／または１またはそれより多い他の療法剤の投与を伴うことも可能である。２またはそれより多い別個の活性成分の投与の背景において、活性成分を同じ組成物の一部として、または異なる組成物として、投与することも可能であることが理解される。別個の組成物として投与する際、すべて特定の内容物が必要とするように、そして主治医または担当介護者によって決定されるように、異なる活性成分を含む組成物を、同時にまたは異なる時点で、同じまたは異なる経路によって、同じまたは異なる投薬措置を用いて、投与してもよい。
[0118]本明細書において、用語「免疫刺激剤」または「免疫活性化剤」は、例えば免疫刺激剤の非存在下での免疫反応に比較した際、免疫反応を増進させる剤、例えば化合物または組成物を指す。
[0119]本明細書において、用語「ワクチン」は、免疫系反応を誘導するためにヒトまたは動物に投与可能な化合物または組成物を指し；この免疫系反応は、抗体の産生を生じるか、または特定の細胞、特に抗原提示細胞および免疫系エフェクター細胞、例えばＴリンパ球およびＢリンパ球の活性化を生じることも可能である。ワクチン組成物は、予防目的のためのそして／または療法目的のための組成物であることも可能である。こうしたものとして、「癌ワクチン」は、癌に対する免疫反応を誘発する化合物または組成物を指す。免疫反応は、広い範囲の癌に対するまたは特定の癌に対するものであってもよい。
[0120]本明細書において、１つの側面において、本開示は、ＭＨＣクラスＩ鎖関連遺伝子Ａタンパク質（ＭＩＣＡ）および／またはＭＨＣクラスＩ鎖関連遺伝子Ｂタンパク質（ＭＩＣＢ）の可溶性型に特異的に結合する結合剤、特に抗体を提供する。ＭＩＣＡおよびＭＩＣＢタンパク質は、ＭＨＣクラスＩ関連鎖（ＭＩＣ）ファミリーおよび関連ＵＬ−１６結合タンパク質のメンバーであり（Ｌｅｅｌａｙｕｗａｔら， １９９４， Ｉｍｍｕｎｏｇｅｎｅｔｉｃｓ ４０：３３９−５１； Ｂａｈｒａｍ， １９９４， Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ． ９１：６２５９−６３； Ｆｏｄｉｌら， １９９６， Ｉｍｍｕｎｏｇｅｎｅｔｉｃｓ ４４：３５１−７； Ｇｒｏｈら， １９９９， Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ． ９６：６８７９−８４； Ｂａｕｅｒら， １９９９， Ｓｃｉｅｎｃｅ ２８５（５４２８）：７２７−９）、そしてＮＫ、ＮＫＴならびにαβおよびγδ両方のＣＤ８＋ Ｔ細胞を含む、免疫エフェクター細胞上のＣ型レクチン様活性化受容体、ナチュラルキラー群２Ｄ（ＮＫＧ２Ｄ）に結合するリガンドとして作用する。相同性分析によって、ＭＩＣリガンドは、齧歯類ファミリーを除く大部分の哺乳動物において非常に保存されており、そしてＭＨＣクラスＩタンパク質に弱く関連することが示される。非常に関連するＭＩＣＡおよびＭＩＣＢ糖タンパク質は、アミノ酸配列レベルで約８４％同一である（Ｂａｈｒａｍら， １９９４， Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ． ９１：６２５９−６２６３； Ｂａｈｒａｍ， １９９６， Ｉｍｍｕｎｏｇｅｎｅｔｉｃｓ ４４：８０−８１； ＢａｈｒａｍおよびＳｐｉｅｓ．， １９９６， Ｉｍｍｕｎｏｇｅｎｅｔｉｃｓ ４３：２３０−２３３）。ＭＩＣＡおよびＭＩＣＢタンパク質は、ストレス誘導性であり、そしてＭＨＣクラスＩ分子に類似である；が、これらはベータ−２−ミクログロブリンと会合せず、またはペプチドと結合しない。
[0121]ＭＩＣタンパク質は、通常、腸上皮において、角化細胞、単球および内皮細胞上で、低レベルで発現されるが、ストレスを受けた、形質転換された、またはいくつかのウイルス感染した細胞において、より高いレベルに誘導される（Ｇｒｏｈら， １９９９， Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ． ９６：６８７９−８４； Ｂａｕｅｒら， １９９９， Ｓｃｉｅｎｃｅ ２８５（５４２８）：７２７−９； Ｚｗｉｒｎｅｒら， １９９８， Ｉｍｍｕｎｏｇｅｎｅｔｉｃｓ ４７：１３９−４１）。ＮＫＧ２Ｄ所持免疫エフェクター細胞と、細胞表面上にＭＩＣリガンドを発現する、ストレスを受けた細胞または疾患細胞の相互作用は、ストレスを受けた細胞／疾患細胞に対する細胞性免疫反応を生じ、最終的にＭＩＣ発現細胞の死で終わる。ＮＫＧ２Ｄ受容体所持免疫細胞へのＭＩＣリガンドの結合は、天然Ｔ細胞の活性化を刺激し、そして適切なＴＣＲ連結の非存在下での細胞傷害性さえ誘導可能である。ヒトにおいて、ＮＫＧ２Ｄ受容体は、ＤＡＰ１０とともに共刺激分子として機能し、ホスファチジルイノシトールキナーゼ（ＰＩ３Ｋ）経路を通じて、細胞内部にリガンド結合シグナルを伝える。
[0122]ＮＫＧ２Ｄリガンドの発現は、多くのタイプの腫瘍において報告されてきており、そして熱ショックプロモーター要素の刺激から生じる遺伝子発現、ならびに環境傷害または癌に関連するゲノム不安定性レベルの増加から生じるＤＮＡ損傷の細胞内検出の結果と考えられる。癌患者において、アルファ−１、−２、および−３ドメインを含む細胞外ドメインは、プロテアーゼ作用によって血液内に頻繁に脱落し、そしてエフェクター免疫細胞上の意図される受容体、ＮＫＧ２Ｄの下方調節（受容体内在化）を生じる（例えば、Ｇｒｏｈら， ２００２， Ｎａｔｕｒｅ ４１９：７３４−８を参照されたい）。ある個体では、ＭＩＣＡ糖タンパク質は、細胞内で産生され、これはルーチンに細胞表面膜結合となるように運命づけられず、その代わりエクソソーム内に取り込まれ、そして細胞の外側に放出されて、ここで免疫細胞上のＮＫＧ２Ｄ受容体との相互作用が起こる（Ａｓｈｉｒｕら， ２０１０， Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ． ７０：４８１−９）。研究によって、これらの腫瘍由来可溶性ＭＩＣＡおよびＭＩＣＢリガンド（ｓＭＩＣＡおよびｓＭＩＣＢ）は、腫瘍細胞表面から脱落し、デコイ分子のように機能し、そしてＮＫ、ＮＫＴおよび多様なＣＤ８＋ Ｔ細胞などの免疫エフェクター細胞上のＮＫＧ２Ｄ受容体の下方調節を導くことが示唆される。ｓＭＩＣＡおよびｓＭＩＣＢの形成は、タンパク質ジスルフィドイソメラーゼＥＲｐ５の関与を必要とし、該酵素は、一過性混合ジスルフィド複合体を形成して、膜結合したＭＩＣＡおよびＭＩＣＢのタンパク質分解的切断を可能にするようである（Ｋａｉｓｅｒら， ２００７， Ｎａｔｕｒｅ ４４７（７１４３）：４８２−６）。ｓＭＩＣＡおよびｓＭＩＣＢの形成は、その天然の役割が形質転換した細胞を探し、そしてこれを破壊することである、生得的防御系のエフェクターが、これらのデコイＭＩＣリガンド分子の免疫抑制作用によって停止される、異常な状況を導く。この機構を通じて、腫瘍細胞は、免疫系から隠れることも可能であり、そして変わらずに増殖し続けることが可能である。さらなる考慮として、持続性ＮＫＧ２Ｄリガンド発現および脱落は、癌患者において、通常はまれな免疫抑制性ＮＫＧ２Ｄ＋ ＣＤ４＋ Ｔ細胞の増殖を促進し、そしてこれは、ｓＭＩＣＡの血清濃度と直接相関し、それによって、Ｔ細胞増殖のＮＫＧ２Ｄ共刺激を可能にする（例えば、Ｇｒｏｈら， ２００６， Ｎａｔ Ｉｍｍｕｎｏｌ． ７：７５５−６２を参照されたい）。
[0123]ｓＭＩＣＡおよびｓＭＩＣＢの不都合な作用は、健康な個体に比較した際、進行した癌患者の血液における、可溶性ＭＩＣ免疫デコイ分子（ｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢ）の有意に上昇したレベルの存在によって裏付けられる（Ｇｒｏｈら， ２００２， Ｎａｔｕｒｅ ４１９：７３４−８； Ｓａｌｉｈら， ２００２， Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ． １６９：４０９８−１０２）。これらの高レベルは、癌の臨床段階および劣った臨床的転帰の両方に直接相関するようである（Ｄｏｕｂｒｏｖｉｎａら， ２００３， Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ． １７１：６８９１−９； Ｗｕら， ２００４， Ｊ Ｃｌｉｎ Ｉｎｖｅｓｔ． １１４：５６０−８； Ｈｏｌｄｅｎｒｅｉｄｅｒら， ２００６， Ｉｎｔｌ Ｊ Ｃａｎｃｅｒ １１８：６８４−７）。また、ｉｎ ｖｉｔｒｏ実験によって、組換えまたは腫瘍細胞由来ｓＭＩＣタンパク質の添加が、エフェクター免疫細胞、例えばＮＫおよびＴ細胞上のＮＫＧ２Ｄ受容体レベルを減少させることも可能であり、そしてこの効果が受容体結合との干渉を通じて、可溶性リガンドに対する中和抗体によって遮断可能であることもまた示されてきている（Ｇｒｏｈら， ２００２， Ｎａｔｕｒｅ ４１９：７３４−８）。したがって、全身性および腫瘍浸潤エフェクター細胞上両方のＮＫＧ２Ｄ発現の減少は、ｓＭＩＣ＋患者において、腫瘍に対する免疫反応を制限しうる。しかし、前述の特異的中和齧歯類抗体が（ヒト化されていても）、ヒト療法剤として有用でありうる可能性は非常に低く、これはこれらが細胞結合性ＭＩＣリガンドにもまた結合し、そしてしたがって正常条件下で、内因性ＭＩＣリガンドを発現する特定の細胞に対する望ましくない免疫反応を生じうるためである。
[0124]ウイルス感染におけるｓＭＩＣＡおよびｓＭＩＣＢの関与は、呼吸上皮細胞における呼吸器合胞体ウイルス（ＲＳＶ）感染が、ＭＩＣＡの細胞表面発現およびｓＭＩＣＡの循環レベルの上方制御を導くことを示す観察から得られる（Ｚｄｒｅｎｇｈｅａら， ２０１２， Ｅｕｒ Ｒｅｓｐｉｒ Ｊ． ３９：７１２−２０）。この例において、より高いレベルのｓＭＩＣＡは、ウイルスのクリアランスを損ない、そして潜在的に感染延長を補助しうる。再び、ＮＫ細胞は、提唱される免疫監視系において、形質転換細胞の検出に機能するのと同様に、ＲＳＶ感染に対する免疫系の反応において、重要な細胞傷害性の役割を果たすことが知られる。ｓＭＩＣが誘導するエフェクター免疫細胞上のＮＫＧ２Ｄ受容体の下方調節を通じた、ＮＫ細胞機能の抑制は、免疫検出を回避するウイルス反応、または細胞感染中にひとたび抗ウイルス・ガンマインターフェロンが放出された際に、感染していない傍観者細胞の細胞質溶解を減少させるための細胞安全性機構のいずれかに相当する可能性もある。ウイルスに対する適切な免疫反応の発展、およびその結果のＲＳＶ感染において起こることが知られるＮＫ細胞機能の損失の間の繊細なバランスを考慮すると、過剰なｓＭＩＣＡは、望ましい全体の抗ウイルス反応において有益ではないことが推測可能である。これらのＲＳＶ感染中にｓＭＩＣＡレベルを減少させる試みは、したがって、長期のウイルス感染がしばしば、呼吸管裏打ちに対する深刻な打撃、および治療が困難な二次的細菌感染の結果として死さえ生じる、特に非常に若い、および高齢の患者において、特に是認される。可溶性ＮＫＧ２Ｄリガンドの放出はまた、１型ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ−１）（Ｎｏｌｔｉｎｇら， ２０１０， Ｖｉｒｏｌｏｇｙ ４０６：１２−２０）または肝細胞癌（ＨＣＣ）の開始を生じるＢ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）でのヒトのウイルス感染においても記載されてきている。Ｍａｔｕｓａｌｉら， ２０１３， ＦＡＳＥＢ Ｊ． ２７（６）：２４４０−５０は、ＨＩＶ−１感染リンパ球から脱落するＮＫＧ２Ｄリガンドが、ＮＫおよびＣＤ８＋ Ｔ細胞において、ＮＫＧ２Ｄ下方制御を誘導し、そしてウイルス感染細胞に対する免疫反応の抑制を導くことを報告した。ｓＭＩＣＡ、ｓＭＩＣＢおよびｓＵＬＢＰ２レベルは、すべて、ｉｎ ｖｉｔｒｏ ＨＩＶ−１感染ＣＤ４＋ Ｔ細胞の培地中で上昇した。さらに、ＨＩＶ−１慢性感染患者は、非ウイルス血症性の高活性抗レトロウイルス剤療法（ＨＡＡＲＴ）治療患者に比較して、７倍高いレベルのｓＭＩＣＡを所持し、そしてｓＵＬＢＰ２に関して同様の傾向が見られたが、ｓＭＩＣＢに関しては見られなかった。本開示に概略する結合剤および方法による、ＨＩＶ−１感染における可溶性ＮＫＧ２Ｄリガンドレベルの減少は、ＮＫＧ２Ｄ細胞表面レベルを増加させ、そしてそれによってＨＩＶ−１感染の免疫監視およびＮＫ制御における全体の改善を提供することによって、ＮＫ細胞の細胞傷害性機能を改善するように働きうる。また、Ｋｕｍａｒら， ２０１２， ＰＬＯＳ Ｏｎｅ ７：１−６ Ｅ４４７４３は、ＨＢＶ誘導性ＨＣＣ症例において、ｓＭＩＣＡの有意な上昇を見出した。実際、上昇したレベルのｓＭＩＣＡを有するＨＢＶ＋ ＨＣＣ患者は、正常レベルのものよりも有意により劣った生存度を示しており、これはおそらく、より高いｓＭＩＣＡレベルが、ＨＢＶ感染細胞に対する免疫監視系の不活性化を引き起こしたためであろう。再び、循環ｓＭＩＣリガンドにおける減少は、慢性ウイルス感染に対する改善された免疫反応性と一致する。
[0125]免疫監視における役割を考慮すると、ＭＩＣＡおよびＭＩＣＢならびに同族受容体ＮＫＧ２Ｄは、ＭＩＣＡおよびＭＩＣＢと関連する多様な疾患、例えば癌および自己免疫疾患を治療するための療法剤の開発のためのターゲットであった。例えば、特許公報ＷＯ ９８／０１９１６７は、細胞ストレスが制御するヒトＭＩＣクラス１遺伝子、ならびにＧＶＨＤおよび癌を含む特定の疾患状態の治療を記載する。特許公報ＷＯ ０３／０８９６１６、ＵＳ２００５０２３３３９１、ＵＳ２０１００３１６６５０；および米国特許第７，７７１，７１８号は、癌および自己免疫疾患または状態の診断、予後、および治療のマーカーとしての、可溶性ＭＩＣポリペプチドを記載する。特許公報米国特許第７，６６６，４１７号およびＷＯ ２００６／０２４３６７は自己免疫疾患を治療するためのＮＫＧ２Ｄ受容体／ＮＫＧ２Ｄリガンド相互作用遮断剤を記載する。特許公報ＷＯ ２００８／０３６９８１および米国特許第７，９５９，９１６号は、抗ＭＩＣＡ抗体の使用、および例えばＥＲｐ５抗体によるまたはＥＲｐ５発現の調節による、ＥＲｐ５（タンパク質ジスルフィドイソメラーゼ）の調節を通じた、ＭＩＣＡ関連障害の治療法を記載する。米国特許第８，１８２，８０９号もまた、抗ＭＩＣＡ抗体の使用によりＭＩＣ脱落（例えば可溶性ＭＩＣＡの形成）を阻害することによって、癌を治療するための方法を記載する。
[0126]本開示は、ＭＩＣＡおよび／またはＭＩＣＢの細胞外（すなわち外部ドメイン）上のエピトープに対して向けられる結合剤、特に抗体を提供し、ここで、該エピトープは、細胞外ドメインが、損なわれていないＭＩＣタンパク質から分離された際、結合に関して利用可能になる。したがって、該抗体は、損なわれていないまたは細胞結合型ＭＩＣＡおよび／またはＭＩＣＢタンパク質から、脱落したｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢタンパク質を区別するはずである。結合剤は、ＭＩＣタンパク質の可溶性型に関して特異的であるため、ｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢの中和性および／または駆動性（ｉｎｓｔｉｇａｔｉｎｇ）クリアランスに対する療法アプローチとして使用可能であり、それによって、とりわけ、癌およびウイルス感染を含む、特定のタイプの疾患において、細胞から放出されるｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢの、例えば免疫抑制特性の有害な効果を軽減することも可能である。
[0127]したがって、いくつかの態様において、本明細書の結合剤は、ＭＩＣＡの細胞外ドメインに特異的に結合するが、全長ＭＩＣＡまたはＭＩＣＡの膜結合型の細胞外ドメインに特異的に結合しない抗体に対して向けられる。いくつかの態様において、本明細書の結合剤は、ＭＩＣＢの細胞外ドメインに特異的に結合するが、全長ＭＩＣＢまたはＭＩＣＢの膜結合型の細胞外ドメインに特異的に結合しない抗体に対して向けられる。例示的な全長ＭＩＣＡタンパク質を図１Ａ（配列番号１）に提示し、ＭＩＣＡの細胞外ドメインは、図１Ａの配列のほぼ２４〜ほぼ２９７、そして残基３０７までのアミノ酸残基によって示される。例示的な全長ＭＩＣＢタンパク質を図１Ｂ（配列番号２）に提示し、ＭＩＣＢの細胞外ドメインは、図１Ｂの配列のほぼ２４〜ほぼ２９７、そして残基３０７までのアミノ酸残基によって示される。いくつかの態様において、本明細書の抗体は、単離された抗体を含む。
[0128]いくつかの態様において、抗体は、ＭＩＣＡの可溶性型（ｓＭＩＣＡ）に特異的に結合し、ここで抗体は、天然存在全長ＭＩＣＡまたはＭＩＣＡの膜結合型の細胞外ドメインに特異的に結合しない。
[0129]いくつかの態様において、抗体は、ＭＩＣＢの可溶性型（ｓＭＩＣＢ）に特異的に結合し、ここで抗体は、天然存在全長ＭＩＣＢまたはＭＩＣＢの膜結合型の細胞外ドメインに特異的に結合しない。
[0130]ＭＩＣＡおよび／またはＭＩＣＢの可溶性型は、膜貫通ドメインおよび細胞質テールを欠くが、３つの細胞外ドメイン：アルファ−１、アルファ−２およびアルファ−３ドメインを保持する一部切除（ｔｒｕｎｃａｔｅｄ）タンパク質である。多様なタイプの腫瘍において見られうるＭＩＣタンパク質の可溶性型は、可溶性型を生じるプロセスのため、可変カルボキシ末端を有しうる。理論によって束縛されることなく、天然存在可溶性型は、ジスルフィドイソメラーゼである、ＥＲｐ５、ＰＤＩＡ６またはＰ５ともまた称される小胞体タンパク質５の作用から生じるようであり、該酵素は、ＭＩＣＡまたはＭＩＣＢタンパク質と複合体を形成し、そしてアルファ−３ドメインのジスルフィド結合を還元する。可溶性ＭＩＣタンパク質は、細胞膜近傍でのタンパク質分解的切断後に放出される。これらの一部切除は、特定のタンパク質分解認識部位で生じるのではなく（例えば、Ｗａｎｇら， ２００９， Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｂｉｏｐｈｙｓ Ｒｅｓ Ｃｏｍｍ． ３８７：４７６−８１）、膜貫通セクションの上流、およびＭＩＣＡの報告される保存されたＮ２３８−Ｔ２３４またはＭＩＣの相同性配列でのＥＲｐ５結合部位の下流の、アルファ−３ドメイン配列内で、ランダムな様式で起こるようである。
[0131]本開示は、アルファ−３ドメイン上の、そして特に、細胞膜にごく近接したアルファ−３ドメインのセクションのいくつかのエピトープを同定し、該エピトープは、ＭＩＣタンパク質のタンパク質分解的プロセシングによって曝露され、そしてこれに対して、抗体は、ＭＩＣタンパク質の可溶性型（またはＭＩＣタンパク質の細胞外ドメイン）を、ＭＩＣＡおよび／またはＭＩＣＢの損なわれていないまたは膜結合型から区別して結合することが可能である。したがって、いくつかの態様において、抗体は、ＭＩＣＡのアルファ−３ドメインに特異的に結合するが、天然存在全長ＭＩＣＡまたはＭＩＣＡの膜結合型の細胞外ドメインには特異的に結合しない。いくつかの態様において、抗体は、ＭＩＣＡのアルファ−３ドメイン上の潜在性エピトープに特異的に結合するが、天然存在全長ＭＩＣＡまたはＭＩＣＡの膜結合型の細胞外ドメインには特異的に結合しない。いくつかの態様において、抗体は、ＭＩＣＢのアルファ−３ドメインに特異的に結合するが、天然存在全長ＭＩＣＢまたはＭＩＣＢの膜結合型の細胞外ドメインには特異的に結合しない。いくつかの態様において、抗体は、ＭＩＣＢのアルファ−３ドメイン上の潜在性（ｃｒｙｐｔｉｃ）エピトープに特異的に結合するが、天然存在全長ＭＩＣＢまたはＭＩＣＢの膜結合型の細胞外ドメインには特異的に結合しない。
[0132]いくつかの態様において、本開示の抗体は、被験体に投与された際、わずかな自己免疫疾患誘導活性を有する。理論によって束縛されることなく、アルファ−１またはアルファ−２ドメインに、あるいはＭＩＣＡ（またはＭＩＣＢ）タンパク質が細胞に付着している際、免疫系によって通常「認識される」可能性があるアルファ−３ドメインの部分に対して結合する抗体は、例えば腸上皮において、恒常的に発現されるＭＩＣＡが不適切にターゲティングされた療法抗体によって結合され、そしてしたがって、その部位で、望ましくない免疫反応、特に自己免疫反応を導く状況を生じうる。
[0133]いくつかの態様において、本開示の抗体は、ＭＩＣタンパク質のその同族受容体ＮＫＧ２Ｄへの結合に対するわずかなアンタゴニスト活性を有する。アルファ−３ドメイン上の潜在性エピトープに特異的に結合する本明細書の抗体は、細胞表面上に存在するＭＩＣＡおよび／またはＭＩＣＢに結合する可能性が低い。したがって、抗体は、ＭＩＣＡおよび／またはＭＩＣＢタンパク質とＮＫＧ２Ｄ受容体の相互作用にわずかな影響を有するはずである。さらに、アルファ−３ドメインは、受容体と典型的に相互作用するであろう領域からは遠い、膜貫通ドメインに近位の領域に位置する。
[0134]いくつかの態様において、本明細書に意図するような免疫反応増進にはまた、１またはそれより多い以下も含まれる：Ｔ細胞、ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞、ナチュラルキラーＴ（ＮＫＴ）細胞、γδ Ｔ細胞、αβ Ｔ細胞、およびＢ細胞機能の上方制御。いくつかの態様において、Ｔ細胞、ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞、ナチュラルキラーＴ（ＮＫＴ）細胞、γδ Ｔ細胞、αβ Ｔ細胞、およびＢ細胞機能の１またはそれより多くの上方制御には、癌進行を阻害するかまたはウイルス感染を阻害することが可能な活性の増進および／または授与も含まれる。
[0135]いくつかの態様において、本開示の抗体は、ｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢの非変性または天然存在型に特異的に結合する。療法的に有用な抗体は、天然存在ターゲット分子、この場合、ｓＭＩＣＡおよびｓＭＩＣＢに特異的に結合するであろう。こうした抗体は、潜在性エピトープを含有するが、また、エピトープが常在する三次元構造も保持するポリペプチド抗原を用いることによって得られうる。以下にさらに論じるように、アルファ−３ドメインまたはアルファ−３ドメインの多様な下位構造（例えばループ）を含有するポリペプチド免疫原を用いて、そして次いで、定義される潜在性エピトープを用いて候補抗体をスクリーニングすると、ｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢの非変性または天然存在型に特異的に結合する抗体を同定することが可能になるであろう。
[0136]いくつかの態様において、抗体が結合する潜在性エピトープは、ＭＩＣＡタンパク質のアミノ酸残基１８７〜２９６、または１８７〜２９７、特にアミノ酸残基１８７〜２７４、より具体的にはアミノ酸残基１９０〜２５６由来のアミノ酸配列によって定義されるＭＩＣＡのアルファ−３ドメイン内にあり、ここで、アミノ酸番号付けは、ＭＩＣＡ＊００１アレルのプロセシングされたＭＩＣＡタンパク質に基づく。ＭＩＣＡの細胞外領域上のアルファ−３ドメインに関する例示的な配列を図１Ｃ（配列番号３）に示す。いくつかの態様において、抗体が結合する潜在性エピトープは、ＭＩＣＢタンパク質のアミノ酸残基１８７〜２９６、または１８７〜２９７、特にアミノ酸残基１８７〜２７４、より具体的にはアミノ酸残基１９０〜２５６由来のアミノ酸配列によって定義されるＭＩＣＢのアルファ−３ドメイン内にあり、ここで、アミノ酸番号付けは、ＭＩＣＢ＊００１アレルのプロセシングされたＭＩＣＢタンパク質に基づく。ＭＩＣＢの細胞外領域上のアルファ−３ドメインに関する例示的な配列を図１Ｄ（配列番号４）に示す。以下にさらに記載するように、ＭＩＣＡおよびＭＩＣＢの多様な多型中に潜在性エピトープを含有する同等の領域および対応するアミノ酸配列は、本開示に記載する例示的なＭＩＣＡおよびＭＩＣＢタンパク質および配列を考慮して、例えばアミノ酸配列を比較することによって、同定可能である。配列整列は、本明細書に記載するように、既知のコンピュータプログラム、例えば、ＢＬＡＳＴ、ＦＡＳＴＤＢ、ＣｌｕｓｔａｌＷ、およびＬＡＬＩＧＮを用いて、好適に決定可能である（例えば、Ａｌｔｓｃｈｕｌら， １９９０， Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ． ２１５（３）：４０３−１０； Ｂｒｕｔｌａｇら， １９９０， Ｃｏｍｐ Ａｐｐ Ｂｉｏｓｃｉ． ６：２３７−４５； ＳｍｉｔｈおよびＷａｔｅｒｍａｎ， １９８１， Ａｄｖ Ａｐｐｌ Ｍａｔｈ． ２：４８２−９を参照されたい）。例示的なアミノ酸配列整列は、以下のパラメータを用いてＦＡＳＴＤＢを用い、実行可能である：マトリックス＝ＰＡＭ ０、ｋ−タプル＝２、ミスマッチペナルティ＝１、連結ペナルティ＝２０、ランダム化群の長さ＝０、カットオフスコア＝１、ウインドウサイズ＝配列の長さ、ギャップペナルティ＝５、ギャップサイズペナルティ＝０．０５、ウィンドウサイズ＝５００または対象アミノ酸配列の長さのいずれか短い方。あるいは、デフォルトパラメータを用いたＢＬＡＳＴを用い、配列整列を実行してもよい。
[0137]いくつかの態様において、抗体が結合する潜在性エピトープは、アルファ−３ドメインのサブ配列内にあり、サブ配列は、ＭＩＣＡまたはＭＩＣＢの：
アミノ酸残基１９０〜２２９；
アミノ酸残基１９０〜２３８；
アミノ酸残基２１７〜２３８；
アミノ酸残基２４３〜２５６；
アミノ酸残基２４３〜２７４；および
アミノ酸残基２４３〜２９６／２９７
より選択され、ここでアミノ酸番号付けは上記の通りである。
[0138]いくつかの態様において、アルファ−３ドメイン内の潜在性エピトープは、ＭＩＣＡの：
アミノ酸残基１９０〜１９６；
アミノ酸残基２１７〜２２１；
アミノ酸残基２３４〜２３８
アミノ酸残基２５０〜２５６；および
アミノ酸残基２５１〜２５６
より選択される配列領域を含み、ヒト集団に存在する任意のＭＩＣＡアレル中の対応する領域、例えば本明細書に援用される、Ｒｏｂｉｎｓｏｎら， ２００３， “ＩＭＧＴ／ＨＬＡ ａｎｄ ＩＭＧＴ／ＭＨＣ： Ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｄａｔａｂａｓｅｓ ｆｏｒ ｔｈｅ ｓｔｕｄｙ ｏｆ ｔｈｅ ｍａｊｏｒ ｈｉｓｔｏｃｏｍｐａｔｉｂｉｌｉｔｙ ｃｏｍｐｌｅｘ”， Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ． ３１：３１１−３１４およびＡｎｔｈｏｎｙ Ｎｏｌａｎ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅワールドワイドウェブサイトｗｗｗ．ａｎｔｈｏｎｙｎｏｌａｎ．ｏｒｇ．ｕｋ／ＨＩＧ／ｄａｔａ．ｈｔｍｌにおいて入手可能な、同定されるＭＩＣＡアレルが含まれる。したがって、本明細書に記載するＭＩＣＡ潜在性エピトープのあらゆる態様に関して、ＭＩＣＡ＊００１、ＭＩＣＡ＊００２：０１、ＭＩＣＡ＊００２：０２、ＭＩＣＡ＊００２：０３、ＭＩＣＡ＊００２：０４、ＭＩＣＡ＊００４、ＭＩＣＡ＊００５、ＭＩＣＡ＊００６、ＭＩＣＡ＊００７：０１、ＭＩＣＡ＊００７：０２、ＭＩＣＡ＊００７：０３、ＭＩＣＡ＊００７：０４、ＭＩＣＡ＊００７：０５、ＭＩＣＡ＊００７：０６、ＭＩＣＡ＊００８：０１：０１、ＭＩＣＡ＊００８：０１：０２、ＭＩＣＡ＊００８：０２、ＭＩＣＡ＊００８：０３、ＭＩＣＡ＊００８：０４、ＭＩＣＡ＊００８：０５、ＭＩＣＡ＊００９：０１、ＭＩＣＡ＊００９：０２、ＭＩＣＡ＊０１０：０１、ＭＩＣＡ＊０１０：０２、ＭＩＣＡ＊０１１、ＭＩＣＡ＊０１２：０１、ＭＩＣＡ＊０１２：０２、ＭＩＣＡ＊０１２：０３、ＭＩＣＡ＊０１２：０４、ＭＩＣＡ＊０１３、ＭＩＣＡ＊０１４、ＭＩＣＡ＊０１５、ＭＩＣＡ＊０１６、ＭＩＣＡ＊０１７、ＭＩＣＡ＊０１８：０１、ＭＩＣＡ＊０１８：０２、ＭＩＣＡ＊０１９、ＭＩＣＡ＊０２０、ＭＩＣＡ＊０２２、ＭＩＣＡ＊０２３、ＭＩＣＡ＊０２４、ＭＩＣＡ＊０２５、ＭＩＣＡ＊０２６、ＭＩＣＡ＊０２７、ＭＩＣＡ＊０２８、ＭＩＣＡ＊０２９、ＭＩＣＡ＊０３０、ＭＩＣＡ＊０３１、ＭＩＣＡ＊０３２、ＭＩＣＡ＊０３３、ＭＩＣＡ＊０３４、ＭＩＣＡ＊０３５、ＭＩＣＡ＊０３６、ＭＩＣＡ＊０３７、ＭＩＣＡ＊０３８、ＭＩＣＡ＊０３９、ＭＩＣＡ＊０４０、ＭＩＣＡ＊０４１、ＭＩＣＡ＊０４２、ＭＩＣＡ＊０４３、ＭＩＣＡ＊０４４、ＭＩＣＡ＊０４５、ＭＩＣＡ＊０４６、ＭＩＣＡ＊０４７、ＭＩＣＡ＊０４８、ＭＩＣＡ＊０４９、ＭＩＣＡ＊０５０、ＭＩＣＡ＊０５１、ＭＩＣＡ＊０５２、ＭＩＣＡ＊０５３、ＭＩＣＡ＊０５４、ＭＩＣＡ＊０５５、ＭＩＣＡ＊０５６、ＭＩＣＡ＊０５７、ＭＩＣＡ＊０５８、ＭＩＣＡ＊０５９、ＭＩＣＡ＊０６０、ＭＩＣＡ＊０６１、ＭＩＣＡ＊０６２、ＭＩＣＡ＊０６４Ｎ、ＭＩＣＡ＊０６５、ＭＩＣＡ＊０６６、ＭＩＣＡ＊０６７、ＭＩＣＡ＊０６８、ＭＩＣＡ＊０６９、ＭＩＣＡ＊０７０、ＭＩＣＡ＊０７２、ＭＩＣＡ＊０７３、ＭＩＣＡ＊０７４、ＭＩＣＡ＊０７５、ＭＩＣＡ＊０７６、およびＭＩＣＡ＊０７７より選択されるヒトＭＩＣＡアレル変異体を含む、ＭＩＣＡアレル変異体のあらゆる１つに関して、同等のエピトープもまた記載されることが理解されるものとする。
[0139]いくつかの態様において、アルファ−３ドメイン内の潜在性エピトープは、ＭＩＣＢの：
アミノ酸残基１９０〜１９６；
アミノ酸残基２１７〜２２１；
アミノ酸残基２３４〜２３８；および
アミノ酸残基２５０〜２５６
より選択される配列領域を含み、ヒト集団に存在する任意のＭＩＣＢアレル中の領域、例えば本明細書に援用される、Ｒｏｂｉｎｓｏｎら， ２００３， “ＩＭＧＴ／ＨＬＡ ａｎｄ ＩＭＧＴ／ＭＨＣ： Ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｄａｔａｂａｓｅｓ ｆｏｒ ｔｈｅ ｓｔｕｄｙ ｏｆ ｔｈｅ ｍａｊｏｒ ｈｉｓｔｏｃｏｍｐａｔｉｂｉｌｉｔｙ ｃｏｍｐｌｅｘ”， Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ． ３１：３１１−３１４およびＡｎｔｈｏｎｙ Ｎｏｌａｎ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅワールドワイドウェブサイトｗｗｗ．ａｎｔｈｏｎｙｎｏｌａｎ．ｏｒｇ．ｕｋ／ＨＩＧ／ｄａｔａ．ｈｔｍｌにおいて入手可能な、同定されるＭＩＣＢアレルが含まれる。したがって、本明細書に記載するＭＩＣＢ潜在性エピトープのあらゆる態様に関して、ＭＩＣＢ＊００１、ＭＩＣＢ＊００２：０１：０１、ＭＩＣＢ＊００２：０１：０２、ＭＩＣＢ＊００３、ＭＩＣＢ＊００４：０１：０１、ＭＩＣＢ＊００４：０１：０２、ＭＩＣＢ＊００５：０１、ＭＩＣＢ＊００５：０２：０１、ＭＩＣＢ＊００５：０２：０２、ＭＩＣＢ＊００５：０２：０３、ＭＩＣＢ＊００５：０２：０４、ＭＩＣＢ＊００５：０３、ＭＩＣＢ＊００５：０４、ＭＩＣＢ＊００５：０５、ＭＩＣＢ＊００５：０６、ＭＩＣＢ＊００５：０７、ＭＩＣＢ＊００５：０８、ＭＩＣＢ＊００６、ＭＩＣＢ＊００７、ＭＩＣＢ＊００８、ＭＩＣＢ＊００９Ｎ、ＭＩＣＢ＊０１０、ＭＩＣＢ＊０１１、ＭＩＣＢ＊０１２、ＭＩＣＢ＊０１３、ＭＩＣＢ＊０１４、ＭＩＣＢ＊０１５、ＭＩＣＢ＊０１６、ＭＩＣＢ＊０１８、ＭＩＣＢ＊０１９、ＭＩＣＢ＊０２０、ＭＩＣＢ＊０２１Ｎ、ＭＩＣＢ ＊０２２； ＭＩＣＢ＊０２３、ＭＩＣＢ＊０２４、ＭＩＣＢ＊０２５、ＭＩＣＢ＊０２６、ＭＩＣＢ＊０２７、ＭＩＣＢ＊０２８、およびＭＩＣＢ＊０２９より選択されるヒトＭＩＣＢアレル変異体を含む、ＭＩＣＢアレル変異体のあらゆる１つに関して、同等のエピトープもまた記載されることが理解されるものとする。
[0140]いくつかの態様において、抗体は、配列：
１９０＿ＲＳＥＡＳＥＧ＿１９６、アルファ−３ドメインの最下部に位置する（配列番号３８）；
２１７＿ＲＱＤＧＶ＿２２１、アルファ−３ドメインの下部に位置する（配列番号３９）；
２３４＿ＬＰＤＧＮ＿２３８、アルファ−３ドメインの最上部近傍に位置する（配列番号４０）；
２５１＿ＱＧＥＥＱＲ＿２５６、アルファ−３ドメインの最下部に位置する（配列番号４１）；または
２５１＿ＲＧＥＥＱＲ＿２５６、アルファ−３ドメインの最下部に位置する（配列番号４２）
によって定義されるエピトープに特異的に結合し、ここでアミノ酸位は、ＭＩＣＡ＊００１アレルのプロセシングされた成熟ＭＩＣＡタンパク質に関して定義される。
[0141]ＭＩＣＡに関して上記の特異的抗原性部位すべては、ＭＩＣＡに関して知られる異なるアレルの大部分の内部で保存され、そしてしたがって、抗体は、ヒト集団において生じる多型ＭＩＣＡタンパク質のすべてではないとしても有意な大部分を特異的に認識することも可能である。
[0142]いくつかの態様において、抗体は、アルファ−３ドメインの最下部に位置するＲ１９０、Ｓ１９１、Ｅ１９２、Ａ１９３、Ｓ１９４、Ｅ１９５、およびＧ１９６より選択される、１またはそれより多いアミノ酸残基を含むエピトープに結合し、ここで、アミノ酸位は、ＭＩＣＡ＊００１アレルのプロセシングされた成熟ＭＩＣＡタンパク質に関して定義される。いくつかの態様において、エピトープは、アルファ−３ドメイン中の１、２、３またはそれより多い、あるいは１、２、３、４またはそれより多い前述のアミノ酸残基を含む。
[0143]いくつかの態様において、抗体は、アルファ−３ドメインの下部に位置するＲ２１７、Ｑ２１８、Ｄ２１９、Ｇ２２０、およびＶ２２１より選択される、１またはそれより多いアミノ酸残基を含むエピトープに結合し、ここで、アミノ酸位は、ＭＩＣＡ＊００１アレルのプロセシングされた成熟ＭＩＣＡタンパク質に関して定義される。いくつかの態様において、エピトープは、アルファ−３ドメイン中の１、２、３またはそれより多い、あるいは１、２、３、４またはそれより多い前述のアミノ酸残基を含む。
[0144]いくつかの態様において、抗体は、アルファ−３ドメインの最下部に位置するＱ２５１／Ｒ２５１、Ｇ２５２、Ｅ２５３、Ｅ２５４、Ｑ２５５、およびＲ２５６より選択される、１またはそれより多いアミノ酸残基を含むエピトープに結合し、ここで、アミノ酸位は、ＭＩＣＡ＊００１アレルのプロセシングされた成熟ＭＩＣＡタンパク質に関して定義される。いくつかの態様において、エピトープは、アルファ−３ドメイン中の１、２、３またはそれより多い、あるいは１、２、３、４またはそれより多い前述のアミノ酸残基を含む。
[0145]いくつかの態様において、抗体は、アルファ−３ドメインの最上部近傍に位置するＬ２３４、Ｐ２３５、Ｄ２３６、Ｇ２３７、およびＮ２３８より選択される、１またはそれより多いアミノ酸残基を含むエピトープに結合し、ここで、アミノ酸位は、ＭＩＣＡ＊００１アレルのプロセシングされた成熟ＭＩＣＡタンパク質に関して定義される。いくつかの態様において、エピトープは、アルファ−３ドメイン中の１、２、３またはそれより多い、あるいは１、２、３、４またはそれより多い前述のアミノ酸残基を含む。
[0146]上述の高い度合いの保存に対する１つの例外は、ＭＩＣＡアミノ酸２５１位周囲の予測されるエピトープに関し、ここで残基は、ＭＩＣＡ＊００１アレルにおいてグルタミン（Ｑ）であり、そして他のＭＩＣＡアレルでは、アミノ酸アルギニン（Ｒ）の実質的な存在がある。したがって、いくつかの態様において、抗体は：
２５１＿ＲＧＥＥＱＲ＿２５６、アルファ−３ドメインの最下部に位置する（配列番号４２）
によって定義されるエピトープに特異的に結合し、ここで、アミノ酸残基番号付けは、ＭＩＣＡ＊００１アレルのプロセシングされた成熟ＭＩＣＡタンパク質に関する。このエピトープは、限定されるわけではないが、ＭＩＣＡアレル＊００５； ＊００８：０１：０１； ＊００８：０１：０２； ＊００８：０２； ＊００８：０３； ＊００８：０４； ＊００８：０５； ＊０１０：０１； ＊０１０：０２； ＊０１３； ＊０１６； ＊０１９； ＊０２２； ＊０２７； ＊０３３； ＊０３５； ＊０３７； ＊０３９； ＊０４２； ＊０４８； ＊０５３； ＊０５４； ＊０５６； ＊０５８； ＊０６２； ＊０６５； ＊０６９； ＊０７０； ＊０７３および＊０７６に見られる（例えば、Ｒｏｂｉｎｓｏｎら、上記；およびＡｎｔｈｏｎｙ Ｎｏｌａｎ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅウェブサイト、ｗｗｗ．ａｎｔｈｏｎｙｎｏｌａｎ．ｏｒｇ．ｕｋ／ＨＩＧ／ｄａｔａ．ｈｔｍｌを参照されたい）。
[0147]いくつかの態様において、抗体は、配列：
１９０＿ＣＳＥＶＳＥＧ＿１９６、アルファ−３ドメインの最下部に位置する（配列番号４３）；
２１７＿ＲＱＤＧＶ＿２２１、アルファ−３ドメインの下部に位置する（配列番号４４）；
２３４＿ＬＰＤＧＮ＿２３８、アルファ−３ドメインの最上部近傍に位置する（配列番号４５）；または
２５０＿ＲＱＧＥＥＱＲ＿２５６、アルファ−３ドメインの最下部に位置する（配列番号４６）
によって定義されるＭＩＣＢのエピトープに特異的に結合し、ここでアミノ酸位は、ＭＩＣＢ＊００１アレルのプロセシングされたＭＩＣＢタンパク質に関して定義される。
[0148]ＭＩＣＡ同様、ＭＩＣＢに関して上記の抗原性部位は、ＭＩＣＢのアルファ−３ドメインに関して知られる異なるアレルの大部分の内部で保存されるため、抗体は、ヒト集団において生じる多型ＭＩＣＢタンパク質のすべてではないとしても有意な大部分を特異的に認識することも可能である。
[0149]いくつかの態様において、抗体は、アルファ−３ドメインの最下部に位置するＣ１９０、Ｓ１９１、Ｅ１９２、Ｖ１９３、Ｓ１９４、Ｅ１９５、およびＧ１９６より選択される、１またはそれより多いアミノ酸残基を含むエピトープに結合し、ここで、アミノ酸位は、ＭＩＣＢ＊００１アレルのプロセシングされた成熟ＭＩＣＢタンパク質に関して定義される。いくつかの態様において、エピトープは、アルファ−３ドメイン中の１、２、３またはそれより多い、あるいは１、２、３、４またはそれより多い前述のアミノ酸残基を含む。
[0150]いくつかの態様において、抗体は、アルファ−３ドメインの下部に位置するＲ２１７、Ｑ２１８、Ｄ２１９、Ｇ２２０、およびＶ２２１より選択される、１またはそれより多いアミノ酸残基を含むエピトープに結合し、ここで、アミノ酸位は、ＭＩＣＢ＊００１アレルのプロセシングされた成熟ＭＩＣＢタンパク質に関して定義される。いくつかの態様において、エピトープは、アルファ−３ドメイン中の１、２、３またはそれより多い、あるいは１、２、３、４またはそれより多い前述のアミノ酸残基を含む。
[0151]いくつかの態様において、抗体は、アルファ−３ドメインの最下部に位置するＲ２５０、Ｑ２５１、Ｇ２５２、Ｅ２５３、Ｅ２５４、Ｑ２５５、およびＲ２５６より選択される、１またはそれより多いアミノ酸残基を含むエピトープに結合し、ここで、アミノ酸位は、ＭＩＣＢ＊００１アレルのプロセシングされた成熟ＭＩＣＢタンパク質に関して定義される。いくつかの態様において、エピトープは、アルファ−３ドメイン中の１、２、３またはそれより多い、あるいは１、２、３、４またはそれより多い前述のアミノ酸残基を含む。
[0152]いくつかの態様において、抗体は、アルファ−３ドメインの最上部近傍に位置するＬ２３４、Ｐ２３５、Ｄ２３６、Ｇ２３７、およびＮ２３８より選択される、１またはそれより多いアミノ酸残基を含むエピトープに結合し、ここで、アミノ酸位は、ＭＩＣＢ＊００１アレルのプロセシングされた成熟ＭＩＣＢタンパク質に関して定義される。いくつかの態様において、エピトープは、アルファ−３ドメイン中の１、２、３またはそれより多い、あるいは１、２、３、４またはそれより多い前述のアミノ酸残基を含む。
[0153]いくつかの態様において、抗体が結合するアルファ−３ドメインのエピトープは：
（ａ）〜ＸＡ１−Ｓ−ＸＡ３−ＸＡ４−Ｓ−Ｅ−Ｇ〜（配列番号４７）、
式中、ＸＡ１はＲおよびＣより選択され；ＸＡ３はＥおよびＫより選択され；そしてＸＡ４はＡおよびＶより選択される；
（ｂ）〜Ｒ−Ｑ−Ｄ−Ｇ−ＸＢ５〜（配列番号４８）、
式中、ＸＢ５はＶおよびＬより選択される；
（ｃ）〜ＸＤ１−ＸＤ２−Ｇ−Ｅ−Ｅ−Ｑ−ＸＤ７〜（配列番号４９）、
式中、ＸＤ１はＣまたはＲより選択され；ＸＤ２はＱ、Ｒ、およびＥより選択され；そしてＸＤ７はＲ、Ｓ、およびＫより選択される；または
（ｄ）〜Ｌ−Ｐ−Ｄ−Ｇ−Ｎ〜（配列番号５０）
によって定義されるアミノ酸配列内にある。
[0154]したがって、いくつかの態様において、抗体は、上に定義するアミノ酸配列内のアルファ−３ドメインのエピトープに特異的に結合する。いくつかの態様において、抗体は、アミノ酸配列：
（ａ）〜ＸＡ１−Ｓ−ＸＡ３−ＸＡ４−Ｓ−Ｅ−Ｇ〜（配列番号４７）、
式中、ＸＡ１はＲおよびＣより選択され；ＸＡ３はＥおよびＫより選択され；そしてＸＡ４はＡおよびＶより選択される
内のエピトープに特異的に結合する。
[0155]いくつかの態様において、抗体は、アミノ酸配列：
（ｂ）〜Ｒ−Ｑ−Ｄ−Ｇ−ＸＢ５〜（配列番号４８）、
式中、ＸＢ５はＶおよびＬより選択される
内のエピトープに特異的に結合する。
[0156]いくつかの態様において、抗体は、アミノ酸配列：
（ｃ）〜ＸＤ１−ＸＤ２−Ｇ−Ｅ−Ｅ−Ｑ−ＸＤ７〜（配列番号４９）、
式中、ＸＤ１はＣまたはＲより選択され；ＸＤ２はＱ、Ｒ、およびＥより選択され；そしてＸＤ７はＲ、Ｓ、およびＫより選択される
内のエピトープに特異的に結合する。
[0157]いくつかの態様において、抗体は、アミノ酸配列：
（ｄ）〜Ｌ−Ｐ−Ｄ−Ｇ−Ｎ〜（配列番号５０）
内のエピトープに特異的に結合する。
[0158]いくつかの態様において、任意のエピトープは、アミノ末端および／またはカルボキシ末端に、さらなる１、２、３、４、または５アミノ酸を含有することも可能であり、ここで、さらなるアミノ酸は、記載する定義する領域または定義するアミノ酸配列周囲の、天然存在ＭＩＣＡまたはＭＩＣＢアミノ酸配列上に見られるものであることも可能である。
[0159]いくつかの態様において、さらなる潜在性エピトープは、ＭＩＣＡまたはＭＩＣＢの細胞外ドメインのＸ線結晶構造中のアルファ−３ドメインを調べることによって同定可能である（例えば、Ｌｉら， １９９９， Ｉｍｍｕｎｉｔｙ １０：５７７−８４； Ｌｉら， ２００１， Ｎａｔｕｒｅ Ｉｍｍｕｎｏｌ． ２（５）：４４３−５１； Ｈｏｌｍｅｓら， ２００２， Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ． １６９： １３９５−４００；およびタンパク質データバンク（ＰＤＢ） ＭＩＣＡに関する１ＨＹＲおよびＭＩＣＢに関する１ＪＥ６のＸ線結晶構造）。免疫系から隠れた、予測される抗原性部位と一致するいくつかのループ構造は、開放された／脱落したＭＩＣタンパク質（ｓＭＩＣＡおよびｓＭＩＣＢ）中で曝露されている可能性があり、上述のエピトープを含み、そしてしたがって、潜在性エピトープに結合する抗体を生成するために有用である。これらのアミノ酸配列モチーフは、二次構造予測から（例えば、ＣｈｏｕおよびＦａｓｍａｎ， １９７８， Ａｎｎ Ｒｅｖ Ｂｉｏｃｈｅｍ． ４７：２５１−７６）、ならびに三次元Ｘ線結晶構造（単数または複数）の綿密な検査から、そしてより具体的には、一次配列、表面アクセス可能性、および潜在的なＢ細胞エピトープと一致するβ−ターン特性の組み合わせを評価することによって、決定可能である。さらに、３Ｄ構造（例えば結晶構造）からこれらの潜在的エピトープを同定するために使用可能な多様な予測法には、とりわけ、Ｈａｓｔｅら， ２００６， Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｓｃｉ． １５：２５５８−６７； Ｋｒｉｎｇｅｌｕｍら， ２０１２， ＰＬＯＳ Ｃｏｍｐｕｔａｔｉｏｎａｌ Ｂｉｏｌ． ８（１２）：ｅ１００２８２９； Ｋｕｒｏｄａら， ２０１２， Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｎｇ Ｄｅｓ Ｓｅｌ． ２５（１０）：５０７−５２１；およびＳｏｇａら， ２０１０， Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｎｇ Ｄｅｓ Ｓｅｌ． ２３（６）：４４１−８に記載されるものが含まれ；すべての刊行物は本明細書に援用される。
[0160]アミノ酸残基２２４〜２２９（アミノ酸番号付けは、ＭＩＣＡ＊００１アレルのＭＩＣＡタンパク質に基づく）の分析によって、この領域が潜在性部位として働きうることが示唆されたが、国際特許公報ＷＯ２０１３１１７６４７に記載される研究は、この配列が潜在性エピトープを含まない可能性があることを示す。ＷＯ２０１３１１７６４７において、抗体の一次スクリーニングは、ＭＩＣＡの多様なアレルによってコードされるＭＩＣＡタンパク質を発現している細胞株を用いており、そしてこうして成熟全長ＭＩＣＡタンパク質の細胞外ドメインに結合する抗体を同定した。したがって、潜在性エピトープの範囲から特に排除されるのは、アミノ酸残基２２４〜２３２によって定義されるアルファ−３ドメイン、ならびに本明細書に援用されるＷＯ２０１３１１７６４７に定義される任意の他の特定の領域である。本開示の範囲から排除される特定の抗体には、９Ｃ１０、１２Ａ１０、１９Ｅ９、１８ Ｅ８、１０Ｆ３、１５Ｆ９、６Ｅ４、２０Ｃ６、１０Ａ７、１６Ａ８、および１４Ｂ４、特に抗体１５Ｆ９、１６Ａ８および１４Ｂ４と称されるモノクローナル抗体、ならびにＷＯ２０１３１１７６４７に記載されるような対応するＣＤＲ配列を含む抗体が含まれる。１５Ｆ９の一次エピトープには、残基Ｒ６、Ｎ８、Ｅ９７、Ｈ９９、Ｅ１００、Ｄ１０１、Ｎ１０２、Ｓ１０３、Ｔ１ ０４、Ｒ１０５、Ｅ１１５、Ｌ１７８、Ｒ１７９およびＲ１８０が含まれる。１６Ａ８の一次エピトープにはＭＩＣＡの残基Ｗ２３０、Ｄ２３２、Ｔ２２７、Ｑ２２８、Ｑ２２９、Ｓ２２４、Ｈ２２５およびＤ２２６が含まれる。１４Ｂ４の一次エピトープには、Ｔ２２７、Ｑ２２８、Ｑ２２９が含まれ、そしてしたがって１６Ａ８と重複する。
[0161]いくつかの態様において、本開示の範囲から、やはり特異的に排除されるのは、参照ＭＩＣＡ＊００１アレル中の配列２３８＿ＮＧＴＹＱＴ＿２４３（配列番号５１）、および参照ＭＩＣＢ＊００１アレル中の同じまたは類似のアミノ酸配列によって定義されるエピトープに結合する抗体である。この配列は、ジスルフィドイソメラーゼＥＲｐ５と相互作用するＭＩＣタンパク質中の領域を定義し、そして膜結合型ＭＩＣをタンパク質分解的にプロセシングして、可溶性ＭＩＣタンパク質を生じるために必要であると考えられる。ＮＧＴＹＱＴ（配列番号５１）エピトープに特異的に結合する抗体は、ＭＩＣタンパク質およびＥＲｐ５の相互作用を阻害し、それによって可溶性ＭＩＣタンパク質の産生を阻害する（例えば、米国特許第８，１８２，８０９号を参照されたい）。抗体が結合するために、エピトープは、膜結合したＭＩＣタンパク質において、溶液環境に曝露されなければならず、そしてしたがって、本明細書に記載するように潜在性エピトープと見なされない。
[0162]いくつかの態様において、本開示の範囲からやはり排除されるのは、米国特許第７，７７１，７１８号およびＷＯ０３０８９６１６に開示されるような、２Ｃ１０、６Ｄ４、６Ｇ６、および３Ｈ５と称されるモノクローナル抗体、ならびに対応するＣＤＲ配列を含む抗体である。モノクローナル抗体２Ｃ１０、６Ｄ４、６Ｇ６および３Ｈ５は、免疫原として全長ＭＩＣＡタンパク質を発現している細胞を用いて生成された。
[0163]本開示の範囲からさらに排除されるものには、Ｈｕｅら， ２００３， Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ． １７１：１９０９−１９１７およびＨｕｅ Ｓら， ２００４， Ｉｍｍｕｎｉｔｙ ２１：３６７−３７７に記載されるような、ＳＲ９９、ＳＲ１０４およびＳＲ１１６と称されるモノクローナル抗体、ならびに対応するＣＤＲ配列を含む抗体が含まれる。ＳＲ９９、ＳＲ１０４およびＳＲ１１６抗体は、細胞表面上に発現されたＭＩＣＡタンパク質への結合に関して選択され、そしてしたがって、これは、本明細書に特に記載される潜在性エピトープを含む、潜在性エピトープに結合する抗体を同定しないはずの選択であった。
[0164]本明細書の態様において、適切な特性を持つ単離された抗体は、ポリクローナル、モノクローナル、非ヒト、キメラ、ヒト化、または完全ヒト抗体であることも可能である。抗体は、単一特異性（すなわち単一エピトープに結合する−一価）、あるいは二重特異性および三重特異性抗体を含めて、多重特異性（すなわち単一エピトープより多くに結合する−多価）であってもよい（例えば、本明細書に援用される、Ｓｈａｒｋｅｙら， ２０１０， Ｃａｎｃｅｒ Ｂｉｏｔｈｅｒ Ｒａｄｉｏｐｈａｒｍ． ２５（１）：１−１２）；米国特許公報２００８００６９８２０を参照されたい）。いくつかの態様において、抗体は、小分子の二価および二重特異性抗体断片である、一本鎖抗体またはディアボディであってもよい。いくつかの態様において、抗体は、非ヒト抗体、例えばヤギ、ウマ、ウシ、ニワトリ、ラクダ、ラマ、ウサギ、ラット、またはマウスから調製されてもよいし、あるいは非ヒト抗体に基づくキメラまたはヒト化抗体であってもよい。
[0165]いくつかの態様において、本開示の抗体は、約１０４〜約１０１２ Ｍ−１、約１０５〜約１０１２ Ｍ−１、約１０６〜約１０１２ Ｍ−１、約１０７〜約１０１２ Ｍ−１、約１０８〜約１０１２ Ｍ−１、約１０７〜約１０１１ Ｍ−１、約１０８〜約１０１１ Ｍ−１、約１０７〜約１０１０ Ｍ−１、または約１０８〜約１０１０ Ｍ−１の範囲の、ｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢタンパク質、またはそのアルファ−３ドメインに関するアフィニティ（ＫＡ＝平衡会合定数、または会合速度定数ｋｏｎ／解離速度定数ｋｏｆｆの比）によって特徴付けられる。いくつかの態様において、結合剤は、少なくとも約１ｘ１０７ Ｍ−１またはそれより高い、少なくとも約１ｘ１０８ Ｍ−１またはそれより高い、少なくとも約１ｘ１０９ Ｍ−１またはそれより高い、少なくとも約１ｘ１０１０ Ｍ−１またはそれより高い、少なくとも約１ｘ１０１１ Ｍ−１またはそれより高い、あるいは少なくとも約１ｘ１０１２ Ｍ−１またはそれより高いＫＡを有する。いくつかの態様において、抗体は、本明細書記載の抗体１Ｆ５または抗体８Ｃ７のＫＡを有する。いくつかの態様において、抗体は、約１ｘ１０９ Ｍ−１〜約１ｘ１０１０ Ｍ−１またはそれより高いＫＡを有する（例えば抗体１Ｆ５のアフィニティ）。いくつかの態様において、抗体は、約１ｘ１０８ Ｍ−１〜約１ｘ１０９ Ｍ−１またはそれより高いＫＡを有する（例えば抗体８Ｃ７のアフィニティ）。
[0166]いくつかの態様において、本開示の抗体は、約１０−４〜約１０−１２ Ｍ、約１０−５〜約１０−１２ Ｍ、約１０−６〜約１０−１２ Ｍ、約１０−７〜約１０−１２ Ｍ、約１０−８〜約１０−１２ Ｍ、約１０−７〜約１０−１１ Ｍ、約１０−８〜約１０−１１ Ｍ、約１０−７〜約１０−１０ Ｍ、または約１０−８〜約１０−１０ Ｍの範囲の、ｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢタンパク質、またはそのアルファ−３ドメインに関する平衡解離定数（ＫＤ＝平衡解離定数、または解離速度定数ｋｏｆｆ／会合速度定数ｋｏｎの比）によって特徴付けられる。いくつかの態様において、結合剤は、約１ｘ１０−７ Ｍまたはそれより低い、約１ｘ１０−８ Ｍまたはそれより低い、約１ｘ１０−９ Ｍまたはそれより低い、約１ｘ１０−１０ Ｍまたはそれより低い、約１ｘ１０−１１ Ｍまたはそれより低い、あるいは約１ｘ１０−１２ Ｍまたはそれより低いＫＡを有する。いくつかの態様において、抗体は、本明細書記載の抗体１Ｆ５または抗体８Ｃ７のＫＤを有する。いくつかの態様において、抗体は、約１ｘ１０−９ Ｍ〜約１ｘ１０−１０ Ｍまたはそれより低いＫＤを有する（抗体１Ｆ５）。いくつかの態様において、抗体は、約５ｘ１０−９ Ｍ〜約１ｘ１０−１０ Ｍまたはそれより低いＫＤを有する（抗体８Ｃ７）。
[0167]いくつかの態様において、抗体は、約１０３〜約１０９ Ｍ−１ｓ−１またはそれより大きい、約１０４〜約１０９ Ｍ−１ｓ−１またはそれより大きい、約１０５〜約１０９ Ｍ−１ｓ−１またはそれより大きい、約１０６〜約１０９ Ｍ−１ｓ−１またはそれより大きい、約１０７〜約１０９ Ｍ−１ｓ−１またはそれより大きい、約１０４〜約１０８ Ｍ−１ｓ−１またはそれより大きい、あるいは約１０５〜約１０８ Ｍ−１ｓ−１またはそれより大きい範囲の、ｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢタンパク質、またはそのアルファ−３ドメインに関するｋｏｎ会合速度定数によって特徴付けられる。いくつかの態様において、結合剤は、少なくとも約１ｘ１０３ Ｍ−１ｓ−１またはそれより大きい，少なくとも約１ｘ１０４ Ｍ−１ｓ−１またはそれより大きい，少なくとも約１ｘ１０５ Ｍ−１ｓ−１またはそれより大きい，少なくとも約１ｘ１０６ Ｍ−１ｓ−１またはそれより大きい，少なくとも約１ｘ１０７ Ｍ−１ｓ−１またはそれより大きい，少なくとも約１ｘ１０８ Ｍ−１ｓ−１またはそれより大きい、あるいは少なくとも約１ｘ１０９ Ｍ−１ｓ−１またはそれより大きい、ｋｏｎ会合速度定数を有する。いくつかの態様において、抗体は、本明細書に記載する抗体１Ｆ５または抗体８Ｃ７の特徴的なＭＩＣＡに関するｋｏｎ会合定数を有する。
[0168]いくつかの態様において、本開示の抗体は、約１０−３〜約１０−１０ ｓ−１またはそれ未満の、約１０−４〜約１０−１０ ｓ−１またはそれ未満の、約１０−５〜約１０−１０ ｓ−１またはそれ未満の、約１０−６〜約１０−１０ ｓ−１またはそれ未満の、約１０−７〜約１０−１０ ｓ−１またはそれ未満の、約１０−５〜約１０−９ ｓ−１またはそれ未満の、約１０−６〜約１０−９ ｓ−１またはそれ未満の、約１０−５〜約１０−８ ｓ−１またはそれ未満の、あるいは約１０−６〜約１０−８ ｓ−１またはそれ未満の、ｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢタンパク質、またはそのアルファ−３ドメインに関するｋｏｆｆ解離速度定数によって特徴付けられる。いくつかの態様において、結合剤は、約１０−３ ｓ−１またはそれ未満の、約１０−４ ｓ−１またはそれ未満の、約１０−５ ｓ−１またはそれ未満の、約１０−６ ｓ−１またはそれ未満の、約１０−７ ｓ−１またはそれ未満の、約１０−８ ｓ−１またはそれ未満の、約１０−９ ｓ−１またはそれ未満の、あるいは約１０−１０ ｓ−１またはそれ未満の、ｋｏｆｆ解離速度定数を有する。いくつかの態様において、抗体は、本明細書記載の抗体１Ｆ５または抗体８Ｃ７の特徴的なＭＩＣＡに関するｋｏｆｆ解離速度定数を有する。
[0169]いくつかの態様において、ＫＡまたはＫＤ、ならびにｋｏｎおよびｋｏｆｆ速度定数は、本明細書に援用される、Ｐｏｐｏｖら， １９９６， Ｍｏｌ Ｉｍｍｕｎｏｌ． ３３：４９３−５０２；およびＫａｒｌｓｓｏｎら， １９９１， Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ． Ｍｅｔｈｏｄｓ １４５：２２９−４０に記載されるような、ＢＩＡｃｏｒｅＴＭ ＳＰＲ分析デバイスでの分析によるなどして、表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）スクリーニングによって決定可能である。いくつかの態様において、ＫＡまたはＫＤ、ならびにｋｏｎおよびｋｏｆｆ速度定数は２つの表面から反射される白色光の干渉パターンに基づき（例えば、ＲｉｃｈおよびＭｙｓｚｋａ， ２００７， Ａｎａｌ Ｂｉｏｃｈｅｍ． ３６１：１−６； Ｆｒａｎｓｓｏｎら， ２０１０， Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ． ３９８（２）：２１４−３１を参照されたい）、そしてＯｃｔｅｔ ＲＥＤ９６（ＦｏｒｔｅＢｉｏ、米国カリフォルニア州メンロパーク）として商業的に入手可能である、Ｂｉｏ−Ｌａｙｅｒインターフェロメトリー（ＢＬＩ）によって決定可能である。アフィニティおよび動力学的パラメータを決定するための他の方法には、平衡透析およびグロブリン沈降が含まれる（例えば、Ａｚｉｍｚａｄｅｈら， １９９０， Ｊ Ｍｏｌ Ｒｅｃｏｇｎｉｔ． ３（３）：１０８−１６を参照されたい）。
[0170]いくつかの態様において、抗体は、本明細書および実施例に記載する、抗体１Ｆ５または抗体８Ｃ７の抗原結合特性を含む。これらの抗体は、ＭＩＣＡのアルファ−３ドメインに特異的に結合するが、細胞において発現される膜結合型ＭＩＣＡには結合しない。したがって、いくつかの態様において、抗体は：
Figure 0006518199
を含む軽鎖可変領域アミノ酸配列中のＣＤＲ Ｌ１、ＣＤＲ Ｌ２、およびＣＤＲ Ｌ３、ならびに：
Figure 0006518199
を含む重鎖可変領域アミノ酸配列中のＣＤＲ Ｈ１、ＣＤＲ Ｈ２およびＣＤＲ Ｈ３を含む。
[0171]いくつかの態様において、抗体は：
Figure 0006518199
を含む軽鎖可変領域アミノ酸配列中のＣＤＲ Ｌ１、ＣＤＲ Ｌ２、およびＣＤＲ Ｌ３、ならびに：
Figure 0006518199
を含む重鎖可変領域アミノ酸配列中のＣＤＲ Ｈ１、ＣＤＲ Ｈ２およびＣＤＲ Ｈ３を含む。
[0172]当該技術分野に理解されるように、そして本明細書に記載するように、抗体のＣＤＲ領域を描写するアミノ酸位／境界は、背景および当該技術分野に知られる多様な定義に応じて、多様でありうる。可変領域内のいくつかの位は、その位が一組の基準の下ではＣＤＲ領域内にある一方、異なる組の基準の下ではＣＤＲ領域外にあるようである点で、ハイブリッドＣＤＲとして見られうる。いくつかの態様において、前述の可変軽鎖および可変重鎖中のＣＤＲは、本明細書に記載されるようなＫａｂａｔ、Ｃｈｏｔｈｉａ、またはＡｂＭスキームを用いて描写され、特にＫａｂａｔ番号付け系に基づいて描写される。いくつかの態様において、例示的なＣＤＲを表Ｉに示す。
[0173]表Ｉ
Figure 0006518199
[0174]上述のＣＤＲ配列は、Ｋａｂａｔ、Ｃｈｏｔｈｉａ、およびＡｂＭアプローチを用いて定義されてきているが、「Ｃｏｎｔａｃｔ」アプローチ、ＩＭＧＴアプローチ（Ｌｅｆｒａｎｃら， ２００３） Ｄｅｖ Ｃｏｍｐ Ｉｍｍｕｎｏｌ． ２７：５５−７７）およびＰａｒａｔｏｍｅなどの計算プログラム（Ｋｕｎｉｋら， ２０１２， Ｎｕｃｌ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ． Ｗ５２１−４； ｗｗｗ．ｏｆｒａｎｌａｂ．ｏｒｇ／ｐａｒａｔｏｍｅ／）を含む、他の方法もまた使用可能であることが理解されるものとする。
[0175]いくつかの態様において、抗体は、配列番号２３のアミノ酸配列の軽鎖可変領域および配列番号２７のアミノ酸配列の重鎖可変領域中の少なくとも１、２、３、４、５または６すべてのＣＤＲを含む。いくつかの態様において、抗体は：アミノ酸配列ＲＡＳＫＳＶＳＴＳＧＹＳＹＭＨ（配列番号８３）を含むＣＤＲ Ｌ１；アミノ酸配列ＲＡＳＮＬＥＳ（配列番号８４）を含むＣＤＲ Ｌ２；アミノ酸配列ＱＨＳＲＥＬＰＬＴ（配列番号８５）を含むＣＤＲ Ｌ３；アミノ酸配列ＤＹＳＶＨ（配列番号８９）、ＧＹＴＦＴＤＹ（配列番号９５）またはＧＹＴＦＴＤＹＳＶＨ（配列番号９９）を含むＣＤＲ Ｈ１；アミノ酸配列ＷＩＮＴＥＴＧＥＰＴＹＡＤＤＦＫＧ（配列番号９０）、ＮＴＥＴＧ（配列番号９６）またはＷＩＮＴＥＴＧＥＰ（配列番号１００）を含むＣＤＲ Ｈ２；およびアミノ酸配列ＡＧＧＮＡＦＡＹ（配列番号９１）を含むＣＤＲ Ｈ３より選択される、少なくとも１、２、３、４、５または６すべてのＣＤＲを含む。
[0176]いくつかの態様において、抗体は、配列番号３１のアミノ酸配列の軽鎖可変領域および配列番号３５のアミノ酸配列の重鎖可変領域中の少なくとも１、２、３、４、５または６すべてのＣＤＲを含む。いくつかの態様において、抗体は：アミノ酸配列ＲＳＳＫＳＬＬＱＳＮＧＮＴＦＬＹ（配列番号８６）を含むＣＤＲ Ｌ１；アミノ酸配列ＲＭＳＮＬＡＳ（配列番号８７）を含むＣＤＲ Ｌ２；アミノ酸配列ＭＱＨＬＥＹＰＦＴ（配列番号８８）を含むＣＤＲ Ｌ３；アミノ酸配列ＮＹＧＭＮ（配列番号９２）、ＧＹＴＦＴＮＹ（配列番号９７）またはＧＹＴＦＴＮＹＧＭＮ（配列番号１０１）を含むＣＤＲ Ｈ１；アミノ酸配列ＷＩＮＴＮＴＧＥＰＴＹＡＥＥＦＫＧ（配列番号９３）、ＮＴＮＴＧ（配列番号９８）またはＷＩＮＴＮＴＧＥＰ（配列番号１０２）を含むＣＤＲ Ｈ２；およびアミノ酸配列ＳＧＧＳＳＰＦＡＹ（配列番号９４）を含むＣＤＲ Ｈ３より選択される、少なくとも１、２、３、４、５または６すべてのＣＤＲを含む。
[0177]いくつかの態様において、抗体は、アミノ酸配列ＲＡＳＫＳＶＳＴＳＧＹＳＹＭＨ（配列番号８３）を含むＣＤＲ Ｌ１；アミノ酸配列ＲＡＳＮＬＥＳ（配列番号８４）を含むＣＤＲ Ｌ２；アミノ酸配列ＱＨＳＲＥＬＰＬＴ（配列番号８５）を含むＣＤＲ Ｌ３；アミノ酸配列ＤＹＳＶＨ（配列番号８９）、ＧＹＴＦＴＤＹ（配列番号９５）またはＧＹＴＦＴＤＹＳＶＨ（配列番号９９）を含むＣＤＲ Ｈ１；アミノ酸配列ＷＩＮＴＥＴＧＥＰＴＹＡＤＤＦＫＧ（配列番号９０）、ＮＴＥＴＧ（配列番号９６）、またはＷＩＮＴＥＴＧＥＰ（配列番号１００）を含むＣＤＲ Ｈ２；およびアミノ酸配列ＡＧＧＮＡＦＡＹ（配列番号９１）を含むＣＤＲ Ｈ３を含む。
[0178]いくつかの態様において、抗体は、アミノ酸配列ＲＡＳＫＳＶＳＴＳＧＹＳＹＭＨ（配列番号８３）を含むＣＤＲ Ｌ１；アミノ酸配列ＲＡＳＮＬＥＳ（配列番号８４）を含むＣＤＲ Ｌ２；アミノ酸配列ＱＨＳＲＥＬＰＬＴ（配列番号８５）を含むＣＤＲ Ｌ３；アミノ酸配列ＤＹＳＶＨ（配列番号８９）を含むＣＤＲ Ｈ１；アミノ酸配列ＷＩＮＴＥＴＧＥＰＴＹＡＤＤＦＫＧ（配列番号９０）を含むＣＤＲ Ｈ２；およびアミノ酸配列ＡＧＧＮＡＦＡＹ（配列番号９１）を含むＣＤＲ Ｈ３を含む。
[0179]いくつかの態様において、抗体は、アミノ酸配列ＲＳＳＫＳＬＬＱＳＮＧＮＴＦＬＹ（配列番号８６）を含むＣＤＲ Ｌ１；アミノ酸配列ＲＭＳＮＬＡＳ（配列番号８７）を含むＣＤＲ Ｌ２；アミノ酸配列ＭＱＨＬＥＹＰＦＴ（配列番号８８）を含むＣＤＲ Ｌ３；アミノ酸配列ＮＹＧＭＮ（配列番号９２）、ＧＹＴＦＴＮＹ（配列番号９７）、またはＧＹＴＦＴＮＹＧＭＮ（配列番号１０１）を含むＣＤＲ Ｈ１；アミノ酸配列ＷＩＮＴＮＴＧＥＰＴＹＡＥＥＦＫＧ（配列番号９３）、ＮＴＮＴＧ（配列番号９８）、またはＷＩＮＴＮＴＧＥＰ（配列番号１０２）を含むＣＤＲ Ｈ２；およびアミノ酸配列ＳＧＧＳＳＰＦＡＹ（配列番号９４）を含むＣＤＲ Ｈ３を含む。
[0180]いくつかの態様において、抗体は、アミノ酸配列ＲＳＳＫＳＬＬＱＳＮＧＮＴＦＬＹ（配列番号８６）を含むＣＤＲ Ｌ１；アミノ酸配列ＲＭＳＮＬＡＳ（配列番号８７）を含むＣＤＲ Ｌ２；アミノ酸配列ＭＱＨＬＥＹＰＦＴ（配列番号８８）を含むＣＤＲ Ｌ３；アミノ酸配列ＮＹＧＭＮ（配列番号９２）を含むＣＤＲ Ｈ１；アミノ酸配列ＷＩＮＴＮＴＧＥＰＴＹＡＥＥＦＫＧ（配列番号９３）を含むＣＤＲ Ｈ２；およびアミノ酸配列ＳＧＧＳＳＰＦＡＹ（配列番号９４）を含むＣＤＲ Ｈ３を含む。
[0181]いくつかの態様において、１またはそれより多いＣＤＲを含有する上述の任意の態様に関して、ＣＤＲ配列は、抗体が、適切な機能特性、例えばＭＩＣＡおよび／またはＭＩＣＢのアルファ３ドメインまたはその潜在性エピトープに特異的に結合する特性を保持する限り、１またはそれより多いアミノ酸置換、欠失、および／または挿入を有してもよい。いくつかの態様において、ＣＤＲ配列は、少なくとも１、２、３、４、５またはそれより多いアミノ酸置換、欠失、および／または挿入を有する。いくつかの態様において、ＣＤＲがアミノ酸置換を有する場合、置換は保存的置換を含む。
[0182]いくつかの態様において、抗体は、配列番号２３のアミノ酸配列に対して、少なくとも８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％またはそれより高い配列同一性を有する、軽鎖可変領域ＶＬを含む。
[0183]いくつかの態様において、抗体は、配列番号３１のアミノ酸配列に対して、少なくとも８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％またはそれより高い配列同一性を有する、軽鎖可変領域ＶＬを含む。
[0184]いくつかの態様において、抗体は、配列番号２７のアミノ酸配列に対して、少なくとも８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％またはそれより高い配列同一性を有する、重鎖可変領域ＶＨを含む。
[0185]いくつかの態様において、抗体は、配列番号３５のアミノ酸配列に対して、少なくとも８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％またはそれより高い配列同一性を有する、重鎖可変領域ＶＨを含む。
[0186]いくつかの態様において、抗体は、配列番号２３のアミノ酸配列に対して、少なくとも８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％またはそれより高い配列同一性を有する、軽鎖可変領域ＶＬ、および配列番号２７のアミノ酸配列に対して、少なくとも８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％またはそれより高い配列同一性を有する、重鎖可変領域ＶＨを含む。
[0187]いくつかの態様において、抗体は、配列番号３１のアミノ酸配列に対して、少なくとも８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％またはそれより高い配列同一性を有する、軽鎖可変領域ＶＬ、および配列番号３５のアミノ酸配列に対して、少なくとも８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％またはそれより高い配列同一性を有する、重鎖可変領域ＶＨを含む。
[0188]いくつかの態様において、軽鎖可変領域に対するアミノ酸配列同一性の定義されるレベルを持つ抗体は、配列番号２３または配列番号３１のＶＬ参照配列に比較した際、１またはそれより多いアミノ酸置換、欠失および／または挿入を有する。いくつかの態様において、抗体は、軽鎖可変領域参照配列に比較して、１、２、３、４、５またはそれより多いアミノ酸置換、欠失および／または挿入を有する。いくつかの態様において、アミノ酸置換の背景において、置換は保存的アミノ酸置換を含む。特に、いくつかの態様において、保存的置換は、軽鎖可変領域参照配列のフレームワーク領域（非ＣＤＲ領域：ＦＲＬ１、ＦＲＬ２、ＦＲＬ３およびＦＲＬ４）上に存在する。
[0189]いくつかの態様において、重鎖可変領域に対するアミノ酸配列同一性の定義されるレベルを持つ抗体は、配列番号２７または配列番号３５のＶＨ参照配列に比較した際、１またはそれより多いアミノ酸置換、欠失および／または挿入を有する。いくつかの態様において、抗体は、重鎖可変領域参照配列に比較して、１、２、３、４、５またはそれより多いアミノ酸置換、欠失および／または挿入を有する。いくつかの態様において、アミノ酸置換の背景において、置換は保存的アミノ酸置換を含む。特に、いくつかの態様において、保存的置換は、重鎖可変領域参照配列のフレームワーク領域（非ＣＤＲ領域：ＦＲＨ１、ＦＲＨ２、ＦＲＨ３およびＦＲＨ４）上に存在する。
[0190]いくつかの態様において、抗体は、配列番号２３のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域ＶＬ、および配列番号２７のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域ＶＨを含む。
[0191]いくつかの態様において、抗体は、配列番号３１のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域ＶＬ、および配列番号３５のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域ＶＨを含む。
[0192]いくつかの態様において、任意の明記される抗原結合ドメインを持つ抗体は、ｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢ、またはそのアルファ−３ドメインへの結合において抗原結合ドメインの機能特性が維持される限り、任意の適切なフレームワーク可変領域配列を含むことも可能である。いくつかの態様において、フレームワーク配列は、齧歯類可変軽鎖および重鎖フレームワーク配列、特にマウスフレームワーク配列のものである。いくつかの態様において、抗体のフレームワーク配列は、ヒト重鎖コンセンサスフレームワーク配列のものである。ＶＨコンセンサスフレームワーク配列の例には：ヒトＶＨ下位群Ｉコンセンサスフレームワーク（配列番号１０３）；ヒトＶＨ下位群ＩＩコンセンサスフレームワーク（配列番号１０４）；ヒトＶＨ下位群ＩＩＩコンセンサスフレームワーク（配列番号１０５）；およびヒトＶＨ下位群ＶＩＩコンセンサスフレームワーク（配列番号１０６）が含まれる（図８）。いくつかの態様において、抗体のフレームワーク配列は、ヒトκ１軽鎖コンセンサスフレームワーク配列を含む。ＶＬコンセンサスフレームワーク配列の例には：ヒトＶＬカッパ下位群Ｉコンセンサスフレームワーク（配列番号１０７）；ヒトＶＬカッパ下位群ＩＩコンセンサスフレームワーク（配列番号１０８）；ヒトＶＬカッパ下位群ＩＩＩコンセンサスフレームワーク（配列番号１０９）；およびヒトＶＬカッパ下位群ＩＶコンセンサスフレームワーク（配列番号１１０）が含まれる（図８）。
[0193]いくつかの態様において、任意の明記される抗原結合ドメインを持つ抗体は、任意の起源の軽鎖および／または重鎖上の定常ドメインを有することも可能である。定常ドメインは、齧歯類、霊長類、または他の哺乳動物のものであることも可能である。いくつかの態様において、定常ドメインはヒト起源のものである。したがって、いくつかの態様において、上記の任意の明記される抗原結合ドメインを持つ抗体は、ヒト定常領域、例えばヒト軽鎖定常領域ＣＬおよび／またはヒト重鎖定常領域を有してもよい。いくつかの態様において、ヒト軽鎖定常領域ＣＬは、ヒトカッパまたはヒトラムダ定常領域を含む。いくつかの態様において、ヒト重鎖定常領域は、以下の少なくとも１つまたはすべてを含む：ヒトＣＨ１、ヒトヒンジ、ヒトＣＨ２およびヒトＣＨ３ドメイン。いくつかの態様において、重鎖定常領域はＦｃ部分を含み、ここでＦｃ部分はヒトＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４またはＩｇＭアイソタイプである。
[0194]いくつかの態様において、抗体は、アミノ酸配列ＲＡＳＫＳＶＳＴＳＧＹＳＹＭＨ（配列番号８３）を含むＣＤＲ Ｌ１；アミノ酸配列ＲＡＳＮＬＥＳ（配列番号８４）を含むＣＤＲ Ｌ２；アミノ酸配列ＱＨＳＲＥＬＰＬＴ（配列番号８５）を含むＣＤＲ Ｌ３；アミノ酸配列ＤＹＳＶＨ（配列番号８９）、ＧＹＴＦＴＤＹ（配列番号９５）またはＧＹＴＦＴＤＹＳＶＨ（配列番号９９）を含むＣＤＲ Ｈ１；アミノ酸配列ＷＩＮＴＥＴＧＥＰＴＹＡＤＤＦＫＧ（配列番号９０）、ＮＴＥＴＧ（配列番号９６）またはＷＩＮＴＥＴＧＥＰ（配列番号１００）を含むＣＤＲ Ｈ２；およびアミノ酸配列ＡＧＧＮＡＦＡＹ（配列番号９１）を含むＣＤＲ Ｈ３より選択される、少なくとも１、２、３、４、５または６すべてのＣＤＲ；ならびにヒトカッパまたはラムダのヒト軽鎖定常領域；および／またはヒト重鎖定常領域、特に：ヒトＣＨ１、ヒトヒンジ、ヒトＣＨ２およびヒトＣＨ３ドメインの少なくとも１つまたはすべてを含むヒト重鎖定常領域を含む。こうした態様において、抗体は、可変領域中のヒトフレームワーク配列を含むことも可能である。いくつかの態様において、重鎖定常領域はＦｃ部分を含み、ここでＦｃ部分はヒトＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４またはＩｇＭアイソタイプである。
[0195]いくつかの態様において、抗体は、アミノ酸配列ＲＳＳＫＳＬＬＱＳＮＧＮＴＦＬＹ（配列番号８６）を含むＣＤＲ Ｌ１；アミノ酸配列ＲＭＳＮＬＡＳ（配列番号８７）を含むＣＤＲ Ｌ２；アミノ酸配列ＭＱＨＬＥＹＰＦＴ（配列番号８８）を含むＣＤＲ Ｌ３；アミノ酸配列ＮＹＧＭＮ（配列番号９２）、ＧＹＴＦＴＮＹ（配列番号９７）、またはＧＹＴＦＴＮＹＧＭＮ（配列番号１０１）を含むＣＤＲ Ｈ１；アミノ酸配列ＷＩＮＴＮＴＧＥＰＴＹＡＥＥＦＫＧ（配列番号９３）、ＮＴＮＴＧ（配列番号９８）またはＷＩＮＴＮＴＧＥＰ（配列番号１０２）を含むＣＤＲ Ｈ２；およびアミノ酸配列ＳＧＧＳＳＰＦＡＹ（配列番号９４）を含むＣＤＲ Ｈ３より選択される、少なくとも１、２、３、４、５または６すべてのＣＤＲ；ならびにヒトカッパまたはラムダのヒト軽鎖定常領域（ＣＬ）；および／またはヒト重鎖定常領域、特に：ヒトＣＨ１、ヒトヒンジ、ヒトＣＨ２およびヒトＣＨ３ドメインの少なくとも１つまたはすべてを含むヒト重鎖定常領域を含む。こうした態様において、抗体は、可変領域中のヒトフレームワーク配列を含むことも可能である。いくつかの態様において、重鎖定常領域はＦｃ部分を含み、ここでＦｃ部分はヒトＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４またはＩｇＭアイソタイプである。
[0196]いくつかの態様において、抗体は、配列番号２３のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域ＶＬ；配列番号２７のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域ＶＨ；ヒトカッパまたはラムダのヒト軽鎖定常（ＣＬ）領域；ならびにヒト重鎖定常領域、特に、ヒトＣＨ１、ヒトヒンジ、ヒトＣＨ２およびヒトＣＨ３ドメインを含むヒト重鎖定常領域を含む。いくつかの態様において、重鎖定常領域はＦｃ部分を含み、ここでＦｃ部分はヒトＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４またはＩｇＭアイソタイプである。
[0197]いくつかの態様において、抗体は、配列番号３１のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域ＶＬ；配列番号３５のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域ＶＨ；ヒトカッパまたはラムダのヒト軽鎖定常（ＣＬ）領域、ならびにヒト重鎖定常領域、特に：ヒトＣＨ１、ヒトヒンジ、ヒトＣＨ２およびヒトＣＨ３ドメインを含むヒト重鎖定常領域を含む。いくつかの態様において、重鎖定常領域はＦｃ部分を含み、ここでＦｃ部分はヒトＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４またはＩｇＭアイソタイプである。
[0198]いくつかの態様において、本開示の抗体は、抗体１Ｆ５の抗原結合ドメインを含む抗体、または抗体８Ｃ７の抗原結合ドメインを含む抗体と、ｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢ、またはそのアルファ−３ドメインへの結合に関して競合する、抗体または抗原結合断片を含む。いくつかの態様において、本開示の抗体は：配列番号２３のＶＬ領域および配列番号２７のＶＨ領域を含む抗体と、ＭＩＣＡおよび／またはＭＩＣＢへの結合に関して競合する。いくつかの態様において、本開示の抗体は：配列番号３１のＶＬ領域および配列番号３５のＶＨ領域を含む抗体と、ｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢ、またはそのアルファ−３ドメインへの結合に関して競合する。抗体間の競合は、関心対象の抗体または候補抗体が、共通の抗原、例えばＭＩＣＡのアルファ−３ドメインまたはアルファ−３ドメイン中の潜在性エピトープに対する参照抗体の特異的結合を阻害するアッセイによって決定可能である。多くのタイプの競合結合アッセイが知られ、例えば固相直接または間接的ラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）、固相直接または間接的酵素イムノアッセイ（ＥＩＡ）、サンドイッチ競合アッセイ；固相直接ビオチン−アビジンＥＩＡ；固相直接標識アッセイ、および固相直接標識サンドイッチアッセイが含まれる。
[0199]いくつかの態様において、ＭＩＣＡおよびＭＩＣＢの間の高いアミノ酸配列類似性を考慮して、本明細書に提示する抗体は、ｓＭＩＣＡおよびｓＭＩＣＢタンパク質と交差反応し、そして特に、ｓＭＩＣＡのアルファ−３ドメインおよびｓＭＩＣＢタンパク質のアルファ−３ドメインと交差反応する。すなわち、いくつかの態様において、抗体は、ｓＭＩＣＡタンパク質およびｓＭＩＣＢタンパク質に特異的に結合することが可能である。上述のように、これらの抗体は、全長ＭＩＣＡおよび全長ＭＩＣＢ、あるいはＭＩＣＡの膜結合型およびＭＩＣＢの膜結合型の細胞外ドメインに特異的に結合しない。いくつかの態様において、交差反応性抗体は、ＭＩＣＡおよびＭＩＣＢタンパク質上の共通のエピトープ（例えば潜在性エピトープ）に結合する。ＭＩＣＡおよびＭＩＣＢの間で共通である例示的なエピトープには：ＭＩＣＡおよびＭＩＣＢのアルファ−３ドメインの下部に位置する２１７＿ＲＱＤＧＶ＿２２１（配列番号３９および配列番号４４）；ＭＩＣＡおよびＭＩＣＢのアルファ−３ドメインの最上部近傍に位置する２３４＿ＬＰＤＧＮ＿２３８（配列番号４０および配列番号４５）；ならびにアルファ−３ドメインの最下部に位置するＭＩＣＡの２５１＿ＱＧＥＥＱＲ＿２５６（配列番号４１）およびＭＩＣＢの２５０＿ＲＱＧＥＥＱＲ＿２５６（配列番号４６）の間の共通の配列が含まれる。
[0200]いくつかの態様において、抗体は、３またはそれより多い結合部位を含有する多量体抗体、例えばＩｇＭアイソタイプまたは合成生成多量体抗体を含む。ＩｇＭ抗体は、一般的に、二価結合ユニットを４、５、または６ユニット有し、すなわち四量体、五量体および／または六量体に組み立てられた２つの重鎖および２つの軽鎖を含む。ＩｇＭ抗体は、Ｊ鎖を有してもまたは持たなくてもよい。Ｊ鎖を含まないＩｇＭの発現は、主に六量体を形成し、一方、Ｊ鎖を含むＩｇＭの発現は、主に五量体を形成する。多量体抗体は、部分的に多数の抗原結合部位から生じる高いアビディティのため、ｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢへの効率的な結合を促進するであろう。いくつかの態様において、ＩｇＭ抗体は、免疫した動物からＩｇＭ抗体を単離することによって、ＩｇＭアイソタイプ抗体を発現しているモノクローナル抗体産生細胞株（例えばハイブリドーマ細胞株等）を単離することによって、あるいはＪ鎖を含むまたは含まないＩｇＭ抗体またはＩｇＭ可変重鎖および可変軽鎖をコードする核酸での適切な細胞株（例えばＣＨＯ、ＣＯＳ、３Ｔ３、ＰＣ１２、ＢＨＫ、Ｖｅｒｏ、Ｃ６神経膠腫、およびＨｅＬａ）のトランスフェクション／形質転換によって、得られうる（例えばＡｚｕｍａら， ２００７， Ｃｌｉｎ Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ． １３：２７４５−５０； Ｍａｄｅｒら， ２０１３， Ａｄｖａｎｃｅｓ ｉｎ Ｂｉｏｓｃｉ Ｂｉｏｔｅｃｈ． ４：３８−４３；米国特許第７，７０９，６１５号を参照されたい）。いくつかの態様において、最初に単離されたＩｇＧ抗体を、適切な細胞株における発現によって、ＩｇＭアイソタイプにクラススイッチングすることも可能である。例えば、Ｋｕｎｅｒｔら， ２００４， ＡＩＤＳ Ｒｅｓ Ｈｕｍ Ｒｅｔｒｏｖｉｒｕｓｅｓ， ２０：７５５−６２およびＷｏｌｂａｎｋら， ２００３， Ｊ Ｖｉｒｏｌ． ７７：４０９５−１０３は、ＩｇＧモノクローナル抗体のＩｇＭアイソタイプへのスイッチングを記載する。いくつかの態様において、多量体抗体として産生される一本鎖抗体または抗体断片を用いて、多量体抗体を生成してもよい（例えば、Ｐｏｗｅｒら， ２００３， Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ． ２０７：３３５−５０； Ｇａｉｌら， １９９９， ＦＥＢＳ Ｌｅｔｔ． ４５３（１−２）：１６４−８を参照されたい）。当該技術分野に知られる技術、例えばゲル濾過クロマトグラフィ、イオン交換クロマトグラフィ（例えばヒドロキシアパタイト）、およびアフィニティクロマトグラフィによって、ＩｇＭまたは一本鎖多量体抗体を精製してもよい（例えば、Ｖａｌａｓｅｋら， ２０１１， ＢｉｏＰｒｏｃｅｓｓ Ｉｎｔ’ｌ． ９（１１）：２８−３７； Ｇａｇｎｏｎら， ２００８， ＢｉｏＰｈａｒｍ Ｉｎｔ’ｌ． Ｓ２６−Ｓ３６を参照されたい）。いくつかの態様において、多量体抗体は、５０％またはそれより多い六量体、６０％またはそれより多い五量体、あるいは特に８０％またはそれより多い五量体または六量体ＩｇＭ分子を含んでもよい。いくつかの態様において、ＩｇＭまたは多量体抗体は、上述の抗体結合ドメインを含み、抗体１Ｆ５または８Ｃ７のＣＤＲまたは可変領域の多様な組み合わせが含まれる。
[0201]いくつかの態様において、結合剤は、全長抗体の部分を含む、本開示の抗体の断片であることも可能であり、そしてこれには、抗原結合性または可変領域が含まれる。例示的な抗体断片には、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、およびＦｖ断片が含まれる。パパインでのタンパク質分解的消化は、２つの同一の抗原結合断片、Ｆａｂ’断片を生じ、各々、単一の抗原結合部位を含む。ペプシンでのタンパク質分解的消化は、抗原を架橋することが可能な２つの抗原結合断片、および残ったｐＦｃ’断片を有する、Ｆ（ａｂ’）２断片を生じる。断片の他のタイプには、ディアボディ、直鎖抗体、一本鎖抗体、および抗体断片から形成される多重特異性抗体が含まれることも可能である。抗体断片は、望ましい結合特性、例えばＭＩＣＡおよび／またはＭＩＣＢのアルファ−３ドメインにおける潜在性エピトープへの特異的結合を保持する点で、機能性である。
[0202]いくつかの態様において、本明細書の抗体を、多様な標識で標識してもよく、これには、レポーター分子および検出可能標識、例えばフルオロフォア、生物発光部分、発光部分、酵素、放射標識、および補欠分子族が含まれる。例示的な酵素には、とりわけ、西洋ワサビ（ｈｏｒｓｅｒａｄｉｓｈ）ペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、β−ガラクトシダーゼ、およびアセチルコリンエステラーゼが含まれる。例示的な補欠分子族には、とりわけ、ストレプトアビジン／ビオチンおよびジゴキシゲニンが含まれる。例示的なフルオロフォアには、とりわけ、フルオレセイン、イソチオシアン酸フルオレセイン、ローダミン、ジクロロトリアジニルアミン・フルオレセイン、塩化ダンシル、テキサスレッドおよびフィコエリトリンが含まれる。例示的な発光標識には、ルミナールが含まれる。例示的な生物発光標識には、ルシフェラーゼ、ルシフェリン、およびエクオリンが含まれる。例示的な放射標識には、とりわけ、１２５Ｉ、１３１Ｉ、３５Ｓ、２１１Ａｔ、９０Ｙ、１８６Ｒｅ、１８８Ｒｅ、１４Ｃ、２２５Ａｃ、２１２Ｂｉ、２２７Ａｃ、１９４Ｏｓ、２２３Ｒａ、１４９Ｔｂ、および３Ｈが含まれる。
[0203]いくつかの態様において、本開示の抗体を、エフェクター部分にコンジュゲート化してもよい。エフェクター部分には、とりわけ、抗新生物剤、薬剤、毒素、生物学的活性タンパク質、他の抗体または抗体断片、合成または天然存在ポリマー、核酸（例えばＤＮＡおよびＲＮＡ）、キレート金属、およびナノ粒子が含まれる。例えば、抗ｓＭＩＣＡまたは抗ｓＭＩＣＢ抗体を、エフェクター部分、例えば細胞傷害性剤、放射性核種または所定の生物学的反応を修飾する薬剤部分にコンジュゲート化してもよい。エフェクター部分は、タンパク質またはポリペプチドであってもよく、例えばそして限定なしに、毒素（例えばアブリン、リシンＡ、シュードモナス属（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ）外毒素、またはジフテリア毒素）、血栓剤または抗血管形成剤（例えばアンギオスタチンまたはエンドスタチン）、あるいはサイトカインまたは増殖因子などの生物学的反応修飾剤（例えば、インターロイキン−Ｉ（ＩＬ−Ｉ）、インターロイキン−２（ＩＬ−２）、インターロイキン−６（ＩＬ−６）、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）、顆粒球コロニー刺激因子（Ｇ−ＣＳＦ）、または神経増殖因子（ＮＧＦ）であってもよい。
[0204]いくつかの態様において、エフェクター部分は、細胞毒または細胞傷害剤であってもよい。例示的な細胞毒および細胞傷害剤には、タキソール、クロラムブシル、サイトカラシンＢ、グラミシジンＤ、エチジウムブロミド、エメチン、マイトマイシン、エトポシド、テニポシド、ビンクリスチン、ビンブラスチン、コルヒチン、ドキソルビシン、ダウノルビシン、ジヒドロキシアントラセンジオン、ミトキサントロン、ミトラマイシン、アクチノマイシンＤ、Ｉ−メルファラン、ピューロマイシン、およびその類似体または相同体が含まれる。
[0205]こうしたエフェクター部分を抗体にコンジュゲート化する技術が当該技術分野に周知である（Ｈｅｌｌｓｔｒｏｍら， Ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖｅｒｙ， 第２版， Ｒｏｂｉｎｓｏｎら監修， ｐｐ． ６２３−５３ （１９８７）； Ｔｈｏｒｐｅら， １９８２， Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｒｅｖ． ６２：１１９−５８； Ｄｕｂｏｗｃｈｉｋら， １９９９， Ｐｈａｒｍａｃｏｌ Ｔｈｅｒ． ８３：６７−１２３）；および“Ａｎｔｉｂｏｄｙ−Ｄｒｕｇ Ｃｏｎｊｕｇａｔｅｓ ａｎｄ Ｉｍｍｕｎｏｔｏｘｉｎｓ： Ｆｒｏｍ Ｐｒｅ−Ｃｌｉｎｉｃａｌ Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ｔｏ Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ，” Ｃａｎｃｅｒ Ｄｒｕｇ Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ ａｎｄ Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ中， Ｇａｉｌ Ｌｅｗｉｓ Ｐｈｉｌｌｉｐｓ監修， Ｓｐｒｉｎｇｅｒ Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒ （２０１２）を参照されたい）。
[0206]いくつかの態様において、本開示の抗体をポリエチレングリコール（ＰＥＧ）部分に付着させてもよい。いくつかの態様において、抗体は抗体断片である。ＰＥＧ部分を、抗体または抗体断片中に位置する任意の利用可能なアミノ酸側鎖または末端アミノ酸官能基、例えば任意の未結合（ｆｒｅｅ）アミノ、イミノ、チオール、ヒドロキシルまたはカルボキシル基を通じて、付着させてもよい。こうしたアミノ酸は、抗体または抗体断片中に天然に存在してもよいし、あるいは組換えＤＮＡ法を用いて、抗体または断片内に設計されてもよい。多数の部位を用いて、２またはそれより多いＰＥＧ分子を付着させてもよい。ＰＥＧ部分を、抗体または断片中に位置する少なくとも１つのシステイン残基のチオール基を通じて、共有結合させてもよい。チオール基を付着点として用いる場合、適切に活性化されたエフェクター部分（例えばマレイミドおよびシステイン誘導体などのチオール選択的誘導体）を用いてもよい（例えば、Ｐｏｌｙ（ｅｔｈｙｌｅｎｅｇｌｙｃｏｌ） Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ａｎｄ Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ， Ｍｉｌｔｏｎ ＨａｒｒｉｓおよびＳ． Ｚａｌｉｐｓｋｙ監修， Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｃｈｅｍｉｃａｌ Ｓｏｃｉｅｔｙ， ワシントンＤ．Ｃ．（１９９７）； Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇａｔｉｏｎ Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｃｏｕｐｌｉｎｇ Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ ｆｏｒ ｔｈｅ Ｂｉｏｍｅｄｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ， Ｍ． ＡｓｌａｍおよびＡ． Ｄｅｎｔ監修， Ｇｒｏｖｅ Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ， ニューヨーク， １９９８；ならびにＣｈａｐｍａｎ， ２００２， Ａｄｖ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖ Ｒｅｖ． ５４：５３１−４５を参照されたい）。
[0207]いくつかの態様において、以下にさらに記載するように、上昇したレベルのＭＩＣタンパク質と関連する疾患または障害を治療するための薬学的組成物として、抗体を調製してもよい。したがって、いくつかの態様において、提供するのは、ＭＩＣＡおよび／またはＭＩＣＢタンパク質の潜在性エピトープ、特にアルファ−３ドメインの潜在性エピトープに特異的に結合する、２またはそれより多い抗体の組み合わせを含む、単離抗体；および抗体調製物と適合する、薬学的に許容されうる賦形剤、キャリアー、またはビヒクルを含む薬学的組成物である。望ましい度合いの純度を有する抗体を、例えば緩衝剤、安定剤、保存剤、等張化剤、非イオン性界面活性剤、酸化防止剤、および他の種々の添加物を含む、当該技術分野において典型的に使用される、場合による薬学的に許容されうるキャリアー、賦形剤または安定剤（これらはすべて本明細書において、「キャリアー」と称される）と混合することによって、凍結乾燥配合物として、または水性溶液として貯蔵するために、抗体の療法配合物を調製してもよい（例えば、本明細書に援用される、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ： Ｔｈｅ Ｓｃｉｅｎｃｅ ａｎｄ Ｐｒａｃｔｉｃｅ ｏｆ Ｐｈａｒｍａｃｙ， 第１９版， 第１巻および２巻， Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｐｒｅｓｓ （２０１２）；ならびにＦｏｒｍｕｌａｔｉｏｎ ａｎｄ Ｐｒｏｃｅｓｓ Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ Ｓｔｒａｔｅｇｉｅｓ ｆｏｒ Ｍａｎｕｆａｃｔｕｒｉｎｇ Ｂｉｏｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ， Ｊａｍｅｅｌ， Ｆ．およびＨｅｒｓｈｅｎｓｏｎ， Ｓ．監修 Ｗｉｌｅｙ （２０１０）を参照されたい）。こうした添加物は、使用する投薬量および濃度で、レシピエントに対して非毒性である。
[0208]緩衝剤は、生理学的条件に近づける範囲においてｐＨを維持するよう補助する。本開示の結合剤とともに使用するために適した緩衝剤には、有機および無機酸およびその塩の両方が含まれ、例えばクエン酸緩衝剤、コハク酸緩衝剤、酒石酸緩衝剤、フマル酸緩衝剤、グルコン酸緩衝剤、シュウ酸緩衝剤、乳酸緩衝剤、および酢酸緩衝剤が含まれる。さらに、リン酸緩衝剤、ヒスチジン緩衝剤およびトリメチルアミン塩、例えばＴｒｉｓを用いてもよい。
[0209]いくつかの態様において、キャリアーは、微生物増殖を遅延させる保存剤を含み、そして０．２％〜１％（ｗ／ｖ）の範囲の量で存在可能である。抗体調製物とともに使用するために適した保存剤には、フェノール、ベンジルアルコール、メタ−クレゾール、メチルパラベン、プロピルパラベン、オクタデシルジメチルベンジルアンモニウムクロリド、ハロゲン化ベンザルコニウム（例えば塩化物、臭化物、およびヨウ化物）、塩化ヘキサメトニウム、およびアルキルパラベン、例えばメチルまたはプロピルパラベン、カテコール、レゾルシノール、シクロヘキサノール、および３−ペンタノールが含まれる。
[0210]いくつかの態様において、キャリアーは、液体組成物の等張性を確実にするため、時に「安定剤」と称される等張化剤を含み、この例には、多価糖アルコール、例えば三価またはより高次の糖アルコール、例えばグリセリン、エリスリトール、アラビトール、キシリトール、ソルビトールおよびマンニトールが含まれる。安定剤は、広いカテゴリーの賦形剤を指し、これは、機能において、充填剤から、療法剤を可溶化するかあるいは変性または容器壁への付着の防止を補助する、添加剤までの範囲であることも可能である。例示的な安定剤は、多価糖アルコール（上記）；アミノ酸、例えばアルギニン、リジン、グリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アラニン、オルニチン、Ｌ−ロイシン、２−フェニルアラニン、グルタミン、スレオニン等；有機糖または糖アルコール、例えばラクトース、トレハロース、スタキオース、マンニトール、ソルビトール、キシリトール、リビトール、ミオ−イノシトール、ガラクチトール、グリセロール等、イノシトールなどのシクリトールも含む；ポリエチレングリコール；アミノ酸ポリマー；イオウ含有還元剤、例えば尿素、グルタチオン、チオクト酸、チオグリコール酸ナトリウム、チオグリセロール、モノチオグリセロールおよびチオ硫酸ナトリウム；低分子量ポリペプチド（例えば１０残基またはそれより少ないペプチド）；タンパク質、例えばヒト血清アルブミン、ウシ血清アルブミン、ゼラチンまたは免疫グロブリン；親水性ポリマー、例えばポリビニルピロリドン；単糖、例えばキシロース、マンノース、フルクトース、グルコース；二糖、例えばラクトース、マルトース、スクロース、および三糖、例えばラフィノース；ならびに多糖、例えばデキストランであってもよい。いくつかの態様において、安定剤は、重量活性タンパク質部分あたり、０．１〜１０，０００重量の範囲で存在することも可能である。
[0211]時に「湿潤剤」と称される、非イオン性表面活性剤または界面活性剤を添加して、療法剤の可溶化を補助し、そして攪拌誘導性凝集に対して療法タンパク質を保護することも可能であり、該剤はまた、タンパク質の変性を引き起こすことなく、配合物が表面剪断ストレスに曝露されることを可能にする。適切な非イオン性界面活性剤には、ポリソルベート（２０、８０等）、ポロキサマー（１８４、１８８等）、プルロニックポリオール、およびポリオキシエチレンソルビタンモノエーテル（ＴＷＥＥＮ（登録商標）−２０、ＴＷＥＥＮ（登録商標）−８０等）が含まれる。いくつかの態様において、非イオン性界面活性剤は、約０．０５ｍｇ／ｍＬ〜約１．０ｍｇ／ｍＬの範囲で、例えば約０．０７ｍｇ／ｍＬ〜約０．２ｍｇ／ｍＬの範囲で存在することも可能である。
[0212]さらなる種々の賦形剤には、増量剤（例えばデンプン）、キレート剤（例えばＥＤＴＡ）、酸化防止剤（例えばアスコルビン酸、メチオニン、ビタミンＥ）、および共溶媒が含まれる。
[0213]必要に応じて、上に列挙される成分の１つまたは組み合わせを含む、適切な溶媒中に、必要な量の抗体を取り込んだ後、滅菌、例えば微量濾過することによって、無菌注射可能溶液を調製することも可能である。一般的に、基本的分散媒体、ならびに上に列挙され、そして当該技術分野に知られるもののうち必要な他の成分を含有する、無菌ビヒクル内に、活性化合物を取り込むことによって、分散物を調製する。無菌注射可能溶液を調製するための無菌粉末の場合、好ましい調製法は、活性成分に加えて、あらかじめ滅菌濾過されたその溶液に由来する、任意のさらなる望ましい成分の粉末を生じる、真空乾燥およびフリーズドライ（凍結乾燥）である。
[0214]いくつかの態様において、化合物を、迅速な放出から保護するキャリアーとともに、抗体を調製してもよく、これは例えば、移植物および微量被包送達系（ｍｉｃｒｏｅｎｃａｐｓｕｌａｔｅｄ ｄｅｌｉｖｅｒｙ ｓｙｓｔｅｍ）を含む、徐放配合物である。生物分解性、生物適合性ポリマーを用いてもよく、これには例えば、酢酸エチレンビニル、ポリ無水物、ポリグリコール酸、コラーゲン、ポリ（オルトエステル）、およびポリ乳酸がある。こうした配合物の調製のための多くの方法は、特許されるかまたは当業者に一般的に知られる(例えば、Ｓｕｓｔａｉｎｅｄ ａｎｄ Ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ Ｒｅｌｅａｓｅ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖｅｒｙ Ｓｙｓｔｅｍｓ， Ｊ． Ｒ． Ｒｏｂｉｎｓｏｎ監修， Ｍａｒｃｅｌ Ｄｅｋｋｅｒ， Ｉｎｃ．， Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ （１９７８）を参照されたい）。
[0215]混合、可溶化、安定化、および凍結乾燥して、薬学的組成物を調製する多様な方法は、抗体療法剤に適用可能な標準的慣用的技術を用いるであろう（例えば、Ｗａｎｇら， ２００７， Ｊ Ｐｈａｒｍ Ｓｃｉ． ９６（１）：１−２６； Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ： Ｔｈｅ Ｓｃｉｅｎｃｅ ａｎｄ Ｐｒａｃｔｉｃｅ ｏｆ Ｐｈａｒｍａｃｙ， 第１９版， 第１巻および２巻， Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｐｒｅｓｓ （２０１２）；ならびにＦｏｒｍｕｌａｔｉｏｎ ａｎｄ Ｐｒｏｃｅｓｓ Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ Ｓｔｒａｔｅｇｉｅｓ ｆｏｒ Ｍａｎｕｆａｃｔｕｒｉｎｇ Ｂｉｏｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ， ＪａｍｅｅｌおよびＨｅｒｓｈｅｎｓｏｎ監修， Ｗｉｌｅｙ （２０１０）を参照されたい）。
[0216]当業者に利用可能な多様な技術によって、本開示の結合剤を調製することも可能である。ポリクローナル抗体の調製は、当業者に周知の慣用法、例えば、本明細書に援用される、Ｇｒｅｅｎら， “Ｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎ ｏｆ Ｐｏｌｙｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｓｅｒａ，” ：Ｉｍｍｕｎｏｃｈｅｍｉｃａｌ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ中， Ｍａｎｓｏｎ監修， Ｈｕｍａｎａ Ｐｒｅｓｓ （１９９２）； Ｃｏｌｉｇａｎら， “Ｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎ ｏｆ Ｐｏｌｙｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｓｅｒａ ｉｎ Ｒａｂｂｉｔｓ， Ｒａｔｓ Ｍｉｃｅ ａｎｄ Ｈａｍｓｔｅｒｓ，” ：Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ中， Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ， Ｉｎｃ． （１９９２）を使用することも可能である。
[0217]モノクローナル抗体の調製はまた、当該技術分野に知られる慣用技術、例えば、本明細書に援用される、ＫｏｈｌｅｒおよびＭｉｌｓｔｅｉｎ， １９７５， Ｎａｔｕｒｅ ２５６（５５１７）：４９５−７； Ｃｏｌｉｇａｎら、上記、セクション２．５．１−２．６．７； Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ， Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ， Ｉｎｃ． （１９９２）；ならびにＡｎｔｉｂｏｄｉｅｓ： Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ， ＨａｒｌｏｗおよびＬａｎｅ監修， Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｐｒｅｓｓ， ニューヨーク（１９８８）； Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ： Ｍｅｔｈｏｄｓ ａｎｄ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ．， Ｖｏｌ． ３７８， Ａｌｂｉｔａｒ Ｍ．監修， Ｈｕｍａｎａ Ｐｒｅｓｓ （２００７）を用いることも可能である。モノクローナル抗体は、「抗原」を投与し、そして続いて、抗体を作製するＢ細胞を単離することによって、最も頻繁にはマウスにおいて生成される。次いで、Ｂ細胞を、同じ種の別の安定な細胞タイプに融合させて、「ハイブリドーマ」を生成することによって、Ｂ細胞を不死化する。個々のＢ細胞は、１つの特異的抗体（すなわちクローン性に単一特異的である）を作製し、これは、その一次アミノ酸配列および根底にある遺伝子配列によって定義される。また、用語「ヘテロハイブリドーマ」および「ヘテロ骨髄腫」は、２つの異なる種由来のリンパ球および骨髄腫の融合によって不死化されたリンパ球細胞株を指す。多様なよく確立された技術によって、ハイブリドーマ培養から、モノクローナル抗体を単離し、そして精製することも可能である。こうした単離技術には、プロテイン−Ａセファロースでのアフィニティクロマトグラフィ、サイズ排除クロマトグラフィ、およびイオン交換クロマトグラフィが含まれる（例えば、Ｃｏｌｉｇａｎら、上記、セクション２．７．１−２．７．１２およびセクション２．９．１−２．９．３； Ｂａｒｎｅｓら， Ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｏｆ Ｉｍｍｕｎｏｇｌｏｂｕｌｉｎ Ｇ （ＩｇＧ）， Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｍｏｌ． Ｂｉｏｌ．中， Ｖｏｌ． １０， ７９−１０４ページ， Ｈｕｍａｎａ Ｐｒｅｓｓ （１９９２）を参照されたい）。抗体を調製するための例示的な方法を実施例に記載する。
[0218]いくつかの態様において、ＤＮＡ、ペプチド、またはタンパク質に由来する免疫原を用いて、モノクローナル抗体の生成を達成することも可能である。例えばマウスまたはウサギ、あるいは適切な抗体反応を生じる動物いずれかを免疫することによって、ハイブリドーマを生成する。いくつかの態様において、動物内に、抗原をコードする核酸、またはタンパク質抗原、例えばＭＩＣＡ／ＭＩＣＢまたはその断片（例えばアルファ−３ドメイン）、あるいはＭＩＣＡ／ＭＩＣＢまたはその免疫原性断片をコードする核酸を導入することによって、免疫を行う。当業者は、特定のエピトープが、その天然環境から除去された際に、動物において、より免疫原性であることを認識するであろう。したがって、キーホールリンペット（ｋｅｙｈｏｌｅ ｌｉｍｐｅｔ）ヘモシアニンなどのキャリアーにコンジュゲートした抗原のエピトープに対応するペプチドは、ペプチドのみまたは見出される天然タンパク質の一部である場合のエピトープのいずれかに対するよりも、より強い抗体反応を誘発しうる。こうした変型および他の免疫スキームが当業者に知られ、本開示の免疫法に含まれる。
[0219]非ヒト免疫グロブリン、例えばラットまたはマウス抗体由来の可変配列、ならびにいくつかの態様において、典型的にはヒト免疫グロブリンテンプレートから選択されるヒト免疫グロブリン定常領域を有する抗体である、キメラ抗体もまた、慣用的技術によって調製可能である。１つの方法は、可変領域をコードする非ヒト遺伝子および定常領域をコードするヒト遺伝子をクローニングして、そして組み換え技術を用いてこれらを組み換えて、キメラ遺伝子を形成することである。適切な細胞における発現は、キメラタンパク質をコードするｍＲＮＡを生じる。別のプロセスは、相同組換えを用いることであり、ここで、齧歯類またはマウスハイブリドーマ細胞株を、対応する齧歯類免疫グロブリン定常領域遺伝子に相同な配列が隣接する、ヒト定常領域遺伝子でトランスフェクションする。低い頻度で、トランスフェクションＤＮＡは、齧歯類遺伝子と組換えを起こし、ヒト免疫グロブリン定常領域遺伝子配列の挿入を生じる。キメラ抗体を生じるための多様な方法が、すべて本明細書にその全体が援用される、Ｍｏｒｒｉｓｏｎら， １９８４， Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ． ８１：６８５１−５； Ｍｏｒｒｉｓｏｎら， １９８５， Ｓｃｉｅｎｃｅ ２２９（４７１９）：１２０２−７； Ｎｅｕｂｅｒｇｅｒら， １９８５， Ｎａｔｕｒｅ ３１４：２６８−７１； Ｏｉら， １９８６， ＢｉｏＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓ ４：２１４−２１； Ｇｉｌｌｉｅｓら， １９８５， Ｉｍｍｕｎｏｌ． Ｍｅｔｈｏｄｓ １２５：１９１−２０２；米国特許第５，８０７，７１５号；米国特許第４，８１６，５６７号；および米国特許第４，８１６３９７号に記載される。
[0220]いくつかの態様において、本明細書の抗体をヒト化抗体として調製してもよく、これは、非ヒト免疫グロブリン由来の最小配列を含有するキメラ免疫グロブリン、免疫グロブリン鎖またはその断片（例えばＦｖ、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２または抗体の他のターゲット結合サブドメイン）である。一般的には、ヒト化抗体は、少なくとも１つ、そして典型的には２つの可変ドメインの実質的にすべてを含み、ここでＣＤＲ領域のすべてまたは実質的にすべてが非ヒト免疫グロブリンのものに対応し、そしてフレームワーク領域のすべてまたは実質的にすべてがヒト免疫グロブリン配列のものである。ヒト化抗体はまた、免疫グロブリン定常領域、典型的にはヒト免疫グロブリンコンセンサス配列の少なくとも一部またはすべてを含むことも可能である。抗体ヒト化の方法は、当該技術分野に知られ、そして例えば、すべてその全体が本明細書に援用される、Ｒｉｅｃｈｍａｎｎら， １９８８， Ｎａｔｕｒｅ ３３２：３２３−７；米国特許第５，２２５，５３９号；米国特許第５，５３０，１０１号；米国特許第５，５８５，０８９号；米国特許第５，５６５，３３２号；米国特許第５，６９３，７６１号；米国特許第５，６９３，７６２号；および米国特許第６，１８０，３７０号；ＰＣＴ公報ＷＯ ９１／０９９６７； Ｐａｄｌａｎ， １９９１， Ｍｏｌ Ｉｍｍｕｎｏｌ． ２８：４８９−９８； Ｓｔｕｄｎｉｃｋａら， １９９４， Ｐｒｏｔ Ｅｎｇ． ７：８０５−１４；ならびにＲｏｇｕｓｋａら， １９９４， Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ． ９１：９６９−７３に記載される。
[0221]完全ヒト抗体は、宿主動物系でなく、ヒト免疫系の部分を所持する、トランスジェニックまたは染色体導入（ｔｒａｎｓ−ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｉｃ）動物を用いて、生成可能である。これらのトランスジェニックおよび染色体導入動物には、ＨｕＭＡｂマウスおよびＫＭマウスと称されるマウスが含まれる。ＨｕＭＡｂマウスＴＭ（Ｍｅｄａｒｅｘ， Ｉｎｃ．）は、非再編成ヒト重鎖（ミューおよびガンマ）およびカッパ軽鎖免疫グロブリン配列をコードするヒト免疫グロブリン遺伝子ミニ遺伝子座を、内因性ミューおよびカッパ鎖遺伝子座を不活性化させるターゲティング突然変異とともに含有する（例えば、Ｌｏｎｂｅｒｇら， １９９４， Ｎａｔｕｒｅ ３６８（６４７４）：８５６−９）。したがって、マウスは、マウスＩｇＭまたはカッパの発現減少を示し、そして免疫に反応して、導入されたヒト重鎖および軽鎖導入遺伝子が、クラススイッチングおよび体細胞突然変異を経て、高アフィニティヒトＩｇＧカッパ・モノクローナル抗体を生成する（Ｌｏｎｂｅｒｇ， Ｎ．， １９９４， Ｈａｎｄｂｏｏｋ ｏｆ Ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔａｌ Ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ １１３：４９−１０１； Ｌｏｎｂｅｒｇ， Ｎ．およびＨｕｓｚａｒ， Ｄ．， １９９５， Ｉｎｔｅｒｎ Ｒｅｖ Ｉｍｍｕｎｏ１． １３：６５−９３；ならびにＨａｒｄｉｎｇ， Ｆ．およびＬｏｎｂｅｒｇ， Ｎ．， １９９５， Ａｎｎ ＮＹ Ａｃａｄ Ｓｃｉ． ７６４：５３６−４６）。ＨｕＭＡｂマウスの調製および使用、ならびにこうしたマウスによって所持されるゲノム修飾は、すべてその全内容が本明細書に援用される、Ｔｕａｉｌｌｏｎら， １９９４， Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ． １５２：２９１２−２０； Ｔａｙｌｏｒら， １９９４， Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ ６：５７９−９１； Ｆｉｓｈｗｉｌｄら， １９９６， Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈ． １４：８４５−５１；米国特許第５，５４５，８０６号；米国特許第５，５６９，８２５号；米国特許第５，６２５，１２６号；米国特許第５，６３３，４２５号；米国特許第５，７８９，６５０号；米国特許第５，８７７，３９７号；米国特許第５，６６１，０１６号；米国特許第５，８１４，３１８号；米国特許第５，８７４，２９９号；米国特許第５，７７０，４２９号；米国特許第５，５４５，８０７号；ならびにＰＣＴ公報ＷＯ ９２１０３９１８、ＷＯ ９３／１２２２７、ＷＯ ９４／２５５８５、ＷＯ ９７１１３８５２、ＷＯ ９８／２４８８４； ＷＯ ９９／４５９６２；および ＷＯ ０１／１４４２４にさらに記載される。ＸｅｎｏｍｏｕｓｅＴＭ（Ａｂｇｅｎｉｘ， Ｉｎｃ．）と称される別のトランスジェニック系を使用してもよく、これは、すべて本明細書に援用される、Ｇｒｅｅｎ， ＬＬ．， １９９９， Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｍｅｔｈｏｄｓ， ２３１（１−２）：１１−２３；米国特許第５，９３９，５９８号；米国特許第６，０７５，１８１号；米国特許第６，１１４，５９８号；米国特許第６，１５０，５８４号および米国特許第６，１６２，９６３号に記載される。
[0222]いくつかの態様において、エピトープに特異的に結合するヒト抗体は、導入遺伝子および導入染色体上にヒト免疫グロブリン配列を所持するマウス、例えばＷＯ ０２／０４３４７８に記載されるように、ヒト重鎖導入遺伝子およびヒト軽鎖導入染色体を所持するマウスを用いて作製可能である。いくつかの態様において、ヒト免疫グロブリン遺伝子を発現するウサギ系を用いて、完全ヒト抗体を生成することも可能である（Ｒａｄｅｒら， ２０００， Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ． ２７５（１８）：１３６６８−７６）。
[0223]他の態様において、ヒト免疫グロブリン遺伝子のライブラリーをスクリーニングするため、ファージディスプレイ法を用いて、完全ヒトモノクローナル抗体を調製することも可能である。ヒト抗体を単離するためのこうしたファージディスプレイ法は、当該技術分野に確立され、そして例えばＨｕｍａｎ Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ｍｅｔｈｏｄｓ ａｎｄ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ， Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ．， Ｖｏｌ． １０６０， Ｓｔｅｉｎｉｔｚ， Ｍ．監修， Ｈｕｍａｎａ Ｐｒｅｓｓ （２０１３）； ＭａｒｋｓおよびＢｒａｄｂｕｒｙ， ２００４， Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ．， ２４８：１６１−７６； Ｐａｎｓｒｉら， ＢＭＣ Ｂｉｏｔｅｃｈ．， ９：６−２２； Ｒａｄｅｒ， Ｃ．， ２０１２， Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ．， ９０１：５３−７９；米国特許第５，２２３，４０９号；米国特許第５，４０３，４８４号；米国特許第５，５７１，６９８号；米国特許第５，４２７，９０８号；米国特許第５，５８０，７１７号；米国特許第５，９６９，１０８号；米国特許第６，１７２，１９７号；米国特許第５，８８５，７９３号；米国特許第６，５２１，４０４号；米国特許第６，５４４，７３１号；米国特許第６，５５５，３１３号；米国特許第６，５８２，９１５号および米国特許第６，５９３，０８１号に記載される。
[0224]免疫グロブリンの可変重鎖および可変軽鎖の融合タンパク質である一本鎖抗体を、ファージディスプレイ法によって調製することも可能であり、この場合、抗原結合ドメインは、単一ポリペプチドとして発現され、そして特異的結合活性に関してスクリーニングされる。あるいは、細胞、典型的には所望の抗体を発現しているハイブリドーマ細胞株から重鎖および軽鎖をクローニングすることによって、一本鎖抗体を調製することも可能である。一般的に、典型的には、長さ１０〜２５アミノ酸のリンカーペプチドを用いて、重鎖および軽鎖を連結する。リンカーは、グリシン、セリン、および／またはスレオニンリッチであって、一本鎖抗体に柔軟性および可溶性を与えることも可能である。一本鎖抗体を生成するための特異的方法は、例えば、すべて本明細書に援用される、Ｌｏｆｆｌｅｒら， ２０００， Ｂｌｏｏｄ ９５（６）：２０９８−１０３； ＷｏｒｎおよびＰｌｕｃｋｔｈｕｎ， ２００１， Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ． ３０５， ９８９−１０１０； Ｐｌｕｃｋｔｈｕｎ， Ｔｈｅ Ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ ｏｆ Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ中， Ｖｏｌ． １１３， ｐｐ． ２６９−３１５， ＲｏｓｅｎｂｕｒｇおよびＭｏｏｒｅ監修， Ｓｐｒｉｎｇｅｒ−Ｖｅｒｌａｇ， ニューヨーク（１９９４）；米国特許第５，８４０，３０１号；米国特許第５，８４４，０９３号；および米国特許第５，８９２，０２０号に記載される。
[0225]抗体断片作製はまた、当該技術分野に周知である（例えば、本明細書に援用される、Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ： Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ， ＨａｒｌｏｗおよびＬａｎｅ監修， Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ， ニューヨーク（１９８８）を参照されたい）。抗体のタンパク質分解的加水分解によって、または断片をコードするＤＮＡの大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）における発現によって、抗体断片を調製してもよい。全抗体のペプシンまたはパパイン消化によって、抗体断片を産生してもよい。例えば、ペプシンで抗体を酵素的に切断して、Ｆ（ａｂ’）２を意味する５Ｓ断片を提供することによって、抗体断片を産生してもよい。チオール還元剤、および場合によってジスルフィド連結の切断から生じるスルフィドリル基のためのブロッキング基を用いて、この断片をさらに切断して、３．５Ｓ Ｆａｂ’一価断片を産生してもよい。あるいは、ペプシンを用いた酵素切断は、２つの一価Ｆａｂ’断片およびＦｃ断片を直接生じる。
[0226]開示の抗体を調製するための態様において、組換えＤＮＡ、オリゴヌクレオチド合成、組織培養、およびトランスフェクション（例えばエレクトロポレーション、リポフェクション等）のための標準技術を用いてもよい。製造者の明記にしたがって、または当該技術分野において、一般的に達成されるように、または本明細書に記載するように、酵素反応および精製技術を行ってもよい。一般的に、当該技術分野に周知の慣用法にしたがって、そして本明細書全体で引用されそして論じられる多様な一般的なそしてより特異的な参考文献に記載されるように、前述の技術および方法を行ってもよい（例えば、ＳａｍｂｒｏｏｋおよびＲｕｓｓｅｌｌ， Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ： Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ， 第３版， Ｖｏｌ． １−３， Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ， Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ， ニューヨーク（２００１）； Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ： Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ， Ｇｒｅｅｎｆｉｅｌｄ， Ｅ．Ａ．監修， Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ， ニューヨーク（２０１２）；ならびにＣｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ， Ｃｏｌｉｇａｎら監修， Ｗｉｌｅｙ （１９９９）， ２０１３年まで改訂を参照されたい）。
[0227]いくつかの態様において、単離された抗体をさらに：（１）ローリー法を用いて決定されるようなタンパク質重量によって測定可能であるように；（２）スピニングカップシーケンサーを用いることによる、Ｎ末端または内部アミノ酸配列の少なくとも１５残基を得るために十分な度合いまで；または（３）クーマシーブルーまたは好ましくは銀染色を用いた還元または非還元条件下でのＳＤＳ−ＰＡＧＥによって均一であるまで、精製することも可能である。抗体を精製するため、多様な技術が使用可能であり、例えばクロマトグラフィ（例えばアフィニティクロマトグラフィ：プロテインＡ、ペプチドエピトープ等；イオン交換クロマトグラフィ；分子篩など）、高性能液体クロマトグラフィ、示差溶解度等によってもよい（例えば、Ｆｉｓｈｅｒ， Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ， Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ Ａｎｄ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ中， ＷｏｒｋおよびＢｕｒｄｏｎ監修， Ｅｌｓｅｖｉｅｒ （１９８０）； Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ： Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ， Ｇｒｅｅｎｆｉｅｌｄ， Ｅ．Ａ．監修， Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ， ニューヨーク（２０１２）を参照されたい）。精製抗体は、前述の方法によって決定した際、重量８５％またはそれより高く、９０％またはそれより高く、９５％またはそれより高く、あるいは少なくとも９９％であることも可能である。
[0228]別の側面において、本明細書に提供するのは、本開示の抗体または抗原結合領域をコードするポリヌクレオチドである。特に、ポリヌクレオチドは単離ポリヌクレオチドである。ポリヌクレオチドは、機能可能であるように、関心対象のポリペプチドを発現可能な組換えポリヌクレオチドを生成するよう遺伝子発現を制御する、１またはそれより多い異種制御配列に連結されることも可能である。適切なポリペプチドまたはタンパク質をコードする異種ポリヌクレオチドを含有する発現構築物を、適切な宿主細胞内に導入して、対応するポリペプチドを発現させてもよい。
[0229]いくつかの態様において、ポリヌクレオチドは、配列番号２３のアミノ酸配列に対して、少なくとも８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％またはそれより高い配列同一性を有する、軽鎖可変領域ＶＬをコードする。いくつかの態様において、ポリヌクレオチドは、配列番号２７のアミノ酸配列に対して、少なくとも８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％またはそれより高い配列同一性を有する、重鎖可変領域ＶＨをコードする。
[0230]いくつかの態様において、ポリヌクレオチドは、配列番号３１のアミノ酸配列に対して、少なくとも８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％またはそれより高い配列同一性を有する、軽鎖可変領域ＶＬをコードする。いくつかの態様において、ポリヌクレオチドは、配列番号３５のアミノ酸配列に対して、少なくとも８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％またはそれより高い配列同一性を有する、重鎖可変領域ＶＨをコードする。
[0231]いくつかの態様において、ポリヌクレオチドは、配列番号２３のアミノ酸配列を含む、軽鎖可変領域ＶＬをコードする。いくつかの態様において、ポリヌクレオチドは、配列番号２７のアミノ酸配列を含む、重鎖可変領域ＶＨをコードする。いくつかの態様において、ポリヌクレオチドは、配列番号３１のアミノ酸配列を含む、軽鎖可変領域ＶＬをコードする。いくつかの態様において、ポリヌクレオチドは、配列番号３５のアミノ酸配列を含む、重鎖可変領域ＶＨをコードする。
[0232]いくつかの態様において、ポリヌクレオチドは：配列番号８３のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｌ１；配列配列番号８４のアミノ酸を含むＣＤＲ Ｌ２；配列番号８５のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｌ３；配列番号８９のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｈ１；配列番号９５のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｈ１；配列番号９９のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｈ１；配列番号９０のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｈ２；配列番号９６のアミノ酸配列を含むＣＤＲＨ２；配列番号１００のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｈ２；および配列番号９１のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｈ３より選択される１またはそれより多いＣＤＲをコードする。
[0233]いくつかの態様において、ポリヌクレオチドは：配列番号８６のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｌ１；配列番号８７のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｌ２；配列番号８８のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｌ３；配列番号９２のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｈ１；配列番号９７のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｈ１；配列番号１０１のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｈ１；配列番号９３のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｈ２；配列番号９８のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｈ２；配列番号１０２のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｈ２；および配列番号９４のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｈ３より選択される１またはそれより多いＣＤＲをコードする。
[0234]いくつかの態様において、ポリヌクレオチドは、配列番号２３のアミノ酸配列の軽鎖可変領域および配列番号２７のアミノ酸配列の重鎖可変領域中の、少なくとも１、２、３、４、５または６すべてのＣＤＲをコードする。いくつかの態様において、ポリヌクレオチドは：配列番号８３のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｌ１；配列番号８４のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｌ２；配列番号８５のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｌ３；配列番号８９、配列番号９５、または配列番号９９のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｈ１；配列番号９０、配列番号９６、または配列番号１００のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｈ２；および配列番号９１のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｈ３の、少なくとも１、２、３、４、５または６すべてのＣＤＲをコードする。
[0235]いくつかの態様において、ポリヌクレオチドは：配列番号３１のアミノ酸配列の軽鎖可変領域および配列番号３５のアミノ酸配列の重鎖可変領域中の、少なくとも１、２、３、４、５または６すべてのＣＤＲをコードする。いくつかの態様において、ポリヌクレオチドは、配列番号８６のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｌ１；配列番号８７のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｌ２；配列番号８８のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｌ３；配列番号９２、配列番号９７、または配列番号１０１のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｈ１；配列番号９３、配列番号９８、または配列番号１０２のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｈ２；および配列番号９４のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｈ３の、少なくとも１、２、３、４、５または６すべてのＣＤＲをコードする。
[0236]当業者には明らかであろうように、タンパク質配列がわかると、多様なアミノ酸に対応するすべてのありうるコドンがわかるため、対象タンパク質配列をコードすることが可能なポリヌクレオチドすべての説明が提供される。ありうるコドン選択に基づいて、組み合わせを選択することによって、前述のポリペプチドをコードする非常に多数の核酸が作製可能であり、そしてこうしたすべての変動は、本明細書に記載するポリペプチドに関して、具体的に開示されると見なされるものとする。
[0237]いくつかの態様において、ポリヌクレオチドは、ヌクレオチドレベルで：（ａ）配列番号２５の参照ポリヌクレオチド配列に対して、少なくとも約８０％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、もしくは９９％またはそれより高い配列同一性を有し、そして配列番号２３のポリペプチドをコードし、あるいは（ｂ）配列番号２４の参照ポリヌクレオチド配列に対して、少なくとも約８０％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、もしくは９９％またはそれより高い配列同一性を有し、そして配列番号２２の残基１〜１３２を含むポリペプチドをコードする。いくつかの態様において、ポリヌクレオチドは、ヌクレオチドレベルで：（ａ）配列番号２９の参照ポリヌクレオチド配列に対して、少なくとも約８０％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、もしくは９９％またはそれより高い配列同一性を有し、そして配列番号２７のポリペプチドをコードし、あるいは（ｂ）配列番号２８の参照ポリヌクレオチド配列に対して、少なくとも約８０％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、もしくは９９％またはそれより高い配列同一性を有し、そして配列番号２６の残基１〜１３６を含むポリペプチドをコードする。いくつかの態様において、ポリヌクレオチドは、ヌクレオチドレベルで：（ａ）配列番号３３の参照ポリヌクレオチド配列に対して、少なくとも約８０％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、もしくは９９％またはそれより高い配列同一性を有し、そして配列番号３１のポリペプチドをコードし、あるいは（ｂ）配列番号３２の参照ポリヌクレオチド配列に対して、少なくとも約８０％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、もしくは９９％またはそれより高い配列同一性を有し、そして配列番号３０の残基１〜１３３を含むポリペプチドをコードする。いくつかの態様において、ポリヌクレオチドは、ヌクレオチドレベルで：（ａ）配列番号３７の参照ポリヌクレオチド配列に対して、少なくとも約８０％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、もしくは９９％またはそれより高い配列同一性を有し、そして配列番号３５のポリペプチドをコードし、あるいは（ｂ）配列番号３６の参照ポリヌクレオチド配列に対して、少なくとも約８０％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、もしくは９９％またはそれより高い配列同一性を有し、そして配列番号３４の残基１〜１３７を含むポリペプチドをコードする。
[0238]いくつかの態様において、本明細書のポリヌクレオチドを、多様な方式で操作して、コードされるポリペプチドの発現を提供してもよい。いくつかの態様において、ポリヌクレオチドは、ポリヌクレオチドおよび／または対応するポリペプチドの発現のための、とりわけ、転写プロモーター、リーダー配列、転写エンハンサー、リボソーム結合または進入部位、終結配列、およびポリアデニル化配列を含む、制御配列に機能可能であるように連結されている。発現ベクターに応じて、ベクター内への挿入前に、単離ポリヌクレオチドを操作することが望ましいかまたは必要でありうる。組換えＤＮＡ法を利用して、ポリヌクレオチドおよび核酸配列を修飾するための技術が、当該技術分野に周知である。ガイダンスは、Ｓａｍｂｒｏｏｋら， Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ： Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ， 第３版， Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ， ニューヨーク（２００１）；およびＣｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ， Ａｕｓｕｂｅｌ． Ｆ．監修， Ｇｒｅｅｎｅ Ｐｕｂ． Ａｓｓｏｃｉａｔｅｓ （１９９８）， ２０１３年まで改訂に提供される。
[0239]いくつかの態様において、ポリヌクレオチドは、発現ベクターの一部であることも可能であり、ここでベクターおよびポリヌクレオチドには、ポリヌクレオチドの発現および／またはコードされるポリペプチドの発現を制御するための１またはそれより多い機能可能であるように連結された制御配列が含まれる。組換え発現ベクターは、組換えＤＮＡ法に好適に供されうる、そしてポリヌクレオチド配列の発現を達成可能である、任意のベクター（例えばプラスミドまたはウイルス）であってもよい。ベクターの選択は、典型的には、ベクターを導入しようとする宿主細胞とベクターの適合可能性に応じるであろう。ベクターは直鎖であってもまたは閉じた環状プラスミドであってもよい。例示的な発現ベクターには、とりわけ、Ｔ７またはＴ７ｌａｃプロモーターに基づくベクター（ｐＡＣＹ：Ｎｏｖａｇｅｎ；ｐＥＴ）；バキュロウイルスプロモーターに基づくベクター（例えばｐＢＡＣ）；Ｅｆｌ−αおよびＨＴＬＶプロモーターに基づくベクター（例えばｐＦＵＳＥ２；Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ、米国カリフォルニア州）；ＣＭＶエンハンサーおよびヒトフェリチン軽鎖遺伝子プロモーターに基づくベクター（例えばｐＦＵＳＥ；Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ、米国カリフォルニア州）；ＣＭＶプロモーターに基づくベクター（例えばｐＦＬＡＧ：Ｓｉｇｍａ、米国）；およびジヒドロ葉酸レダクターゼプロモーターに基づくベクター（例えばｐＥＡＳＥ：Ａｍｇｅｎ、米国）が含まれる。多様なベクターを、関心対象の一過性または安定発現に用いてもよい。
[0240]別の側面において、ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを、宿主細胞におけるポリペプチドの発現のため、１またはそれより多い制御配列に機能可能であるように連結する。ポリペプチドを発現する際に使用するための宿主細胞は、当該技術分野に周知であり、そして限定されるわけではないが、これには、細菌細胞、例えば大腸菌、酵母細胞；昆虫細胞、例えばショウジョウバエ属（Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａ）Ｓ２およびスポドプテラ属（Ｓｐｏｄｏｐｔｅｒａ）Ｓｆ９細胞；動物細胞、例えばチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）、アフリカミドリザル（Ａｆｒｉｃａｎ Ｇｒｅｅｎ Ｍｏｎｋｅｙ）腎臓（ＣＯＳ）、ベビーハムスター腎臓（ＢＨＫ）、マウス骨髄腫（例えばＮＳ０およびＳｐ２／０）、およびヒト胚性腎臓（ＨＥＫ）；ならびに植物細胞が含まれる。上述の宿主細胞のための適切な培地および増殖条件は、当該技術分野に周知である。いくつかの態様において、宿主細胞および発現ベクターを用いて、関心対象のポリペプチドを発現させる。
[0241]いくつかの態様において、本明細書記載の発現ベクターおよびポリヌクレオチドを含む宿主細胞を、適切な培地中で、そしてコードされるポリペプチド、例えば配列番号２３、配列番号２７、配列番号３１、および／または配列番号３５を含むポリペプチドの発現に適した培養条件下で培養する。いくつかの態様において、発現ベクターとともにｉｎ ｖｉｔｒｏ発現系を用いて、ポリペプチドを発現させてもよい。ｉｎ ｖｉｔｒｏ発現系には、大腸菌、ウサギ網状赤血球、小麦胚芽、昆虫細胞、およびヒト細胞に基づくものが含まれる。宿主細胞でまたはｉｎ ｖｉｔｒｏで発現するのであっても、発現されたポリペプチドを、以下にさらに記載するように、単離するかまたは精製することも可能である。
[0242]別の側面において、本開示の抗体を調製するため、ＭＩＣポリペプチドおよびエピトープは、抗体の産生を誘発するための免疫原の一部であることも可能である。したがって、いくつかの態様において、本開示は、本明細書に記載する抗体を調製するための免疫原を提供する。いくつかの態様において、免疫原は、ＭＩＣＡまたはＭＩＣＢタンパク質のアルファ−３ドメイン内のペプチドを含む。本明細書に示すように、アルファ−３ドメインの免疫原は、ＭＩＣＡ＊００１アレルの全長ＭＩＣＡ、またはＭＩＣＢ＊００１アレルの全長ＭＩＣＢタンパク質のアミノ酸残基２０５〜２９７由来のポリペプチド領域を含むことも可能である。いくつかの態様において、細胞外ドメインまたはアルファ−３ドメインを免疫原として用いる場合、エピトープ配列を含有するペプチドを用いるアフィニティ技術によって、潜在性エピトープに特異的に結合する抗体を調製してもよい。あるいは、モノクローナル抗体を調製するため、エピトープ（例えば潜在性）配列を含有するペプチドを用いて、特異的結合に関して抗体をスクリーニングすることも可能である。
[0243]いくつかの態様において、免疫原は、ＭＩＣＡまたはＭＩＣＢのアルファ−３ドメインの潜在性エピトープ、例えば上述のＭＩＣＡまたはＭＩＣＢのアミノ酸残基１８７〜２９７、特にアミノ酸残基１８７〜２７４、より具体的にはアミノ酸残基１９０〜２５６内の潜在性エピトープを含む。一般的に、ＭＩＣタンパク質の天然存在細胞外ドメインに存在する三次元構造を保持するポリペプチドまたはペプチド、例えばｓＭＩＣＡおよびｓＭＩＣＢを選択する。
[0244]いくつかの態様において、免疫原はアルファ−３ドメインのサブ配列内のペプチドを含み、ここで、サブ配列は、本明細書記載のＭＩＣＡまたはＭＩＣＢの：
アミノ酸残基１９０〜２２９；
アミノ酸残基１９０〜２３８；
アミノ酸残基２１７〜２３８；
アミノ酸残基２４３〜２５６；
アミノ酸残基２４３〜２７４；または
アミノ酸残基２４３〜２９６／２９７
より選択され、ここで、アミノ酸位は、それぞれ、ＭＩＣＡ＊００１アレルのＭＩＣＡタンパク質およびＭＩＣＢ＊００１アレルのＭＩＣＢタンパク質に関して定義される。
[0245]いくつかの態様において、免疫原は、ＭＩＣＡ（アミノ酸番号付けは＊００１アレルに基づく）の：
アミノ酸残基１９０〜１９６；
アミノ酸残基２１７〜２２１；
アミノ酸残基２３４〜２３８
アミノ酸残基２５０〜２５６；および
アミノ酸残基２５１〜２５６
より選択される配列を含むアルファ−３ドメイン内のペプチドを含み、ヒト集団に存在する任意のＭＩＣＡアレル中の対応する領域、例えば本明細書に援用される、Ｒｏｂｉｎｓｏｎら， ２００３， “ＩＭＧＴ／ＨＬＡ ａｎｄ ＩＭＧＴ／ＭＨＣ： Ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｄａｔａｂａｓｅｓ ｆｏｒ ｔｈｅ ｓｔｕｄｙ ｏｆ ｔｈｅ ｍａｊｏｒ ｈｉｓｔｏｃｏｍｐａｔｉｂｉｌｉｔｙ ｃｏｍｐｌｅｘ”， Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ． ３１：３１１−３１４およびＡｎｔｈｏｎｙ Ｎｏｌａｎ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅワールドワイドウェブサイトｗｗｗ．ａｎｔｈｏｎｙｎｏｌａｎ．ｏｒｇ．ｕｋ／ＨＩＧ／ｄａｔａ．ｈｔｍｌにおいて入手可能な、同定されるＭＩＣＡアレルが含まれる。
[0246]いくつかの態様において、免疫原は、ＭＩＣＢ（アミノ酸番号付けは＊００１アレルに基づく）の：
アミノ酸残基１９０〜１９６；
アミノ酸残基２１７〜２２１；
アミノ酸残基２３４〜２３８；および
アミノ酸残基２５０〜２５６
より選択される配列を含むアルファ−３ドメイン内のペプチドを含み、ヒト集団に存在する任意のＭＩＣＢアレル中の領域、例えば本明細書に援用される、Ｒｏｂｉｎｓｏｎら， ２００３， “ＩＭＧＴ／ＨＬＡ ａｎｄ ＩＭＧＴ／ＭＨＣ： Ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｄａｔａｂａｓｅｓ ｆｏｒ ｔｈｅ ｓｔｕｄｙ ｏｆ ｔｈｅ ｍａｊｏｒ ｈｉｓｔｏｃｏｍｐａｔｉｂｉｌｉｔｙ ｃｏｍｐｌｅｘ”， Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ． ３１：３１１−３１４およびＡｎｔｈｏｎｙ Ｎｏｌａｎ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅワールドワイドウェブサイトｗｗｗ．ａｎｔｈｏｎｙｎｏｌａｎ．ｏｒｇ．ｕｋ／ＨＩＧ／ｄａｔａ．ｈｔｍｌにおいて入手可能な、同定されるＭＩＣＡアレルが含まれる。
[0247]いくつかの態様において、免疫原はペプチドを含み、ここでペプチドは、配列：
１９０＿ＲＳＥＡＳＥＧ＿１９６、アルファ−３ドメインの最下部に位置する（配列番号３８）；
２１７＿ＲＱＤＧＶ＿２２１、アルファ−３ドメインの下部に位置する（配列番号３９）；
２３４＿ＬＰＤＧＮ＿２３８、アルファ−３ドメインの最上部近傍に位置する（配列番号４０）；または
２５１＿ＱＧＥＥＱＲ＿２５６、アルファ−３ドメインの最下部に位置する（配列番号４１）
を含み、ここで、アミノ酸位は、ＭＩＣＡ＊００１アレルのＭＩＣＡタンパク質に関して定義される。
[0248]いくつかの態様において、免疫原はペプチドを含み、ペプチドは、配列：
２５１＿ＲＧＥＥＱＲ＿２５６、アルファ−３ドメインの最下部に位置する（配列番号４２）
を含み、ここで、アミノ酸残基番号付けは、ＭＩＣＡ＊００１アレルのＭＩＣＡタンパク質に関するものである。上述のように、このエピトープは、限定されるわけではないが、ＭＩＣＡアレル＊００５； ＊００８：０１：０１； ＊００８：０１：０２； ＊００８：０２； ＊００８：０３； ＊００８：０４； ＊００８：０５； ＊０１０：０１； ＊０１０：０２； ＊０１３； ＊０１６； ＊０１９； ＊０２２； ＊０２７； ＊０３３； ＊０３５； ＊０３７； ＊０３９； ＊０４２； ＊０４８； ＊０５３； ＊０５４； ＊０５６； ＊０５８； ＊０６２； ＊０６９； ＊０７０； ＊０７３および＊０７６に見られる。
[0249]いくつかの態様において、免疫原はペプチドを含み、ここでペプチドは、配列：
１９０＿ＣＳＥＶＳＥＧ＿１９６、アルファ−３ドメインの最下部に位置する（配列番号４３）；
２１７＿ＲＱＤＧＶ＿２２１、アルファ−３ドメインの下部に位置する（配列番号４４）；
２３４＿ＬＰＤＧＮ＿２３８、アルファ−３ドメインの最上部近傍に位置する（配列番号４５）；または
２５０＿ＲＱＧＥＥＱＲ＿２５６、アルファ−３ドメインの最下部に位置する（配列番号４６）
を含み、ここで、アミノ酸位は、ＭＩＣＢ＊００１アレルのＭＩＣＢタンパク質に関して定義される。
[0250]いくつかの態様において、免疫原はペプチドを含み、ここでペプチドは、アミノ酸配列：
（ａ）〜ＸＡ１−Ｓ−ＸＡ３−ＸＡ４−Ｓ−Ｅ−Ｇ〜（配列番号４７）、
式中、ＸＡ１はＲおよびＣより選択され；ＸＡ３はＥおよびＫより選択され；そしてＸＡ４はＡおよびＶより選択される；
（ｂ）〜Ｒ−Ｑ−Ｄ−Ｇ−ＸＢ５〜（配列番号４８）、
式中、ＸＢ５はＶおよびＬより選択される；
（ｃ）〜ＸＤ１−ＸＤ２−Ｇ−Ｅ−Ｅ−Ｑ−ＸＤ７〜（配列番号４９）、
式中、ＸＤ１はＣまたはＲより選択され；ＸＤ２はＱ、ＲおよびＥより選択され；そしてＸＤ７はＲ、ＳおよびＫより選択される；または
（ｄ）〜Ｌ−Ｐ−Ｄ−Ｇ−Ｎ〜（配列番号５０）
を含む。
[0251]いくつかの態様において、上述の特異的配列は、アミノおよび／またはカルボキシ末端に付随するさらなるアミノ酸を有することも可能であり、ここで、さらなるアミノ酸は、定義される領域を取り巻く天然存在ＭＩＣＡまたはＭＩＣＢアミノ酸配列または定義されるアミノ酸配列上に見られるものであることも可能である。いくつかの態様において、ペプチド免疫原は、特定の免疫原ペプチド配列のアミノ末端および／またはカルボキシ末端に、さらなる１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５、３０、３５、４０、４５、５０アミノ酸を有することも可能である。
[0252]いくつかの態様において、ＭＩＣＡのアルファ−３ドメイン中の潜在性エピトープに結合する抗体を生成するための例示的な免疫原は：
Figure 0006518199
より選択されるペプチドを含み、ここでアミノ酸番号付けは、ＭＩＣＡ＊００１アレルのプロセシングされた成熟ＭＩＣＡタンパク質に基づく。
[0253]いくつかの態様において、ＭＩＣＢのアルファ−３ドメイン中の潜在性エピトープに結合する抗体を生成するための例示的な免疫原は：
Figure 0006518199
より選択されるペプチドを含み、ここでアミノ酸番号付けは、ＭＩＣＢ＊００１アレルのプロセシングされた成熟ＭＩＣＢタンパク質に基づく。
[0254]いくつかの態様において、本明細書記載の免疫原ペプチドは、付随するさらなるアミノ酸を有することも可能であり、ここで該アミノ酸は、ＭＩＣＡまたはＭＩＣＢ上に存在する天然存在アミノ酸配列の一部ではなく、例えばペプチドの免疫原性を増加させ；そして／またはペプチドを免疫原性キャリアーにカップリングするための官能基、例えばアミノ基、イミノ基、システイン基、またはカルボキシ基を提供するためのものである。付随させることが可能な他の異種配列には、とりわけ、精製配列（例えばＨｉｓタグ）；切断配列（例えばプロテアーゼ認識配列）；およびエピトープタグ（例えばｃ−ｍｙｃ、ＧＦＰ、赤血球凝集素等）が含まれる。異種配列は、アミノ末端および／またはカルボキシ末端の、１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５、３０、３５、４０、４５、５０またはそれより多いアミノ酸であることも可能である。
[0255]いくつかの態様において、潜在性エピトープを含有するペプチドを、例えば化学合成または組換え技術によって、融合タンパク質として調製してもよい。特に有用なのは、定義するエピトープを含有する付着したペプチドの免疫原性を増加させる融合タンパク質である。いくつかの態様において、頭尾配置など、上述のエピトープを定義するペプチドの１またはそれより多くをともに連結して、ペプチドの融合を生じることも可能である。いくつかの態様において、リンカー、例えばグリシン、セリン、および／またはスレオニン含有リンカーを用いて、ペプチドを連結して、融合構築物にある程度の構造柔軟性を提供することも可能である。これらの融合ペプチドは、化学合成によって調製可能であり、またはリンカーを含みまたは含まず、融合ペプチドを発現するように設計された核酸構築物を用いた組換え法によって調製可能である。いくつかの態様において、ペプチドを環状化して、免疫原特性を促進してもよい。
[0256]いくつかの態様において、ペプチドを融合タンパク質として産生してもよく、ここで融合は、ペプチドエピトープに対する強い体液性反応を誘発可能なＴ細胞エピトープへのものである。これらのＴ細胞エピトープは、ときにＴヘルパー細胞（Ｔｈ）エピトープと称され、共通の構造特徴を含む約１５〜３０アミノ酸の配列を含む（例えば、すべて本明細書に援用される、Ｃｅａｓｅら， １９８７， Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ． ８４：４２４９−５３；米国特許第５，７５９，５５１号および米国特許公報２００３００２７９７９を参照されたい）。いくつかの病原体由来Ｔヘルパー細胞エピトープが含まれ、とりわけＦＦＬＬＴＲＩＬＴＩＰＱＳＬＤ（配列番号６２）； ＫＫＬＲＲＬＬＹＭＩＹＭＳＧＬＡＶＲＶＨＶＳＫＥＥＱＹ（配列番号６３）； ＫＫＱＹＩＫＡＮＳＫＦＩＧＩＴＥＬ（配列番号６４）； ＫＫＦＮＮＦＴＶＳＦＷＬＲＶＰＫＶＳＡＳＨＬ（配列番号６５）； ＹＭＳＧＬＡＶＲＶＨＶＳＫＥＥ（配列番号６６）； ＹＤＰＮＹＬＲＴＤＳＤＫＤＲＦＬＱＴＭＶＫＬＦＮＲＩＫ（配列番号６７）； ＧＡＹＡＲＣＰＮＧＴＲＡＬＴＶＡＥＬＲＧＮＡＥＬ（配列番号６８）； ＬＳＥＩＫＧＶＩＶＨＲＬＥＧＶ（配列番号６９）； ＧＩＬＥＳＲＧＩＫＡＲＩＴＨＶＤＴＥＳＹ（配列番号７０）； ＷＶＲＤＩＩＤＤＦＴＮＥＳＳＱＫＴ（配列番号７１）；およびＤＶＳＴＩＶＰＹＩＧＰＡＬＮＨＶ（配列番号７２）が含まれる。他のこうしたＴｈエピトープが当該技術分野に記載され、例えば本明細書に援用される米国特許公報２００３００２７９７９に記載される。
[0257]いくつかの態様において、ペプチドは、ペプチドに免疫原性を与えるかまたはその免疫原性を増加させるために適したキャリアーにカップリングされる。適切なキャリアーには、とりわけ、破傷風トキソイド、ジフテリア・トキソイド、キーホールリンペットヘモシアニン（ＫＬＨ）、ロコガイ（Ｃｏｎｃｈｏｌｅｐａｓ ｃｏｎｃｈｏｌｅｐａｓ）ヘモシアニン、およびカチオン化ウシ血清アルブミン（ｃＢＳＡ）が含まれる。
[0258]いくつかの態様において、上記免疫原を、例えばアジュバントとともに、免疫原組成物として調製してもよい。適切なアジュバントには、とりわけ、典型的には、ミネラルオイル、乳化剤、および死菌マイコバクテリウム、例えば結核菌（Ｍｉｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）で構成される、完全フロイントアジュバント（ＣＦＡ）が含まれる。水性抗原溶液をこれらの構成要素と混合して、油中水エマルジョンを生成する。いくつかの態様において、アジュバントは、ＣＦＡと類似であるが細菌構成要素を含まない、不完全フロイントアジュバント（ＩＦＡ）である。使用可能な他のアジュバントには、とりわけ、ＣＦＡで観察されるアジュバント活性を生じる、マイコバクテリウム細胞壁複合体の最小単位である、ムラミルペプチド（ＭＤＰ）（例えば、Ｃｈｅｄｉｄら， １９７８， Ｐｒｏｇ Ａｌｌｅｒｇｙ ２５：６３−１０５； Ｂｙａｒｓら， １９８７， Ｖａｃｃｉｎｅ ５：２２３−８； Ｃｈｅｄｉｄら， Ｉｎｆｅｃｔ Ｉｍｍｕｎ． ３５：４１７−２４； Ｇｉｓｌｅｒら， Ｉｍｍｕｎｏｍｏｄｕｌａｔｉｏｎｓ ｏｆ Ｍｉｃｒｏｂｉａｌ Ｐｒｏｄｕｃｔｓ ａｎｄ Ｒｅｌａｔｅｄ Ｓｙｎｔｈｅｔｉｃ Ｃｏｍｐｏｕｎｄｓ， Ｙ． ＹａｍａｍｕｒａおよびＳ． Ｋｏｔａｎｉ監修， １６７ページ， Ｅｘｃｅｒｐｔａ Ｍｅｄｉｃａ， Ａｍｓｔｅｒｄａｍ （１９８１）；ならびにＥｌｌｏｕｚら， １９７４， Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｂｉｏｐｈｙｓ Ｒｅｓ Ｃｏｍｍｕｎ． ５９：１３１７−２５）；非常に免疫原性であり、スクアレン、モノオレイン酸ポリオキシエチレンソルビタン（ＴｗｅｅｎＴＭ ８０）およびトリオレイン酸ソルビタンのミクロン未満の水中油エマルジョンであるＭＦ５９（例えば、Ｏｔｔら， “ＭＦ５９−Ｄｅｓｉｇｎ ａｎｄ Ｅｖａｌｕａｔｉｏｎ ｏｆ ａ Ｓａｆｅ ａｎｄ Ｐｏｔｅｎｔ Ａｄｊｕｖａｎｔ ｆｏｒ Ｈｕｍａｎ Ｖａｃｃｉｎｅｓ” Ｖａｃｃｉｎｅ Ｄｅｓｉｇｎ： Ｔｈｅ Ｓｕｂｕｎｉｔ ａｎｄ Ａｄｊｕｖａｎｔ Ａｐｐｒｏａｃｈ中， Ｐｏｗｅｌｌ， Ｍ． Ｆ．およびＮｅｗｍａｎ， Ｍ． Ｊ．監修， ｐｇ． ２７７−９６， Ｐｌｅｎｕｍ Ｐｒｅｓｓ， ニューヨーク（１９９５）を参照されたい）；ならびに脂肪酸置換の度合いおよび位置が多様である、ＭＰＬＴＭ、一連の４’−モノホスホリル脂質Ａ種、ＡＳ０４およびＡＳ０２が含まれる。
[0259]いくつかの態様において、抗体反応を誘発するために十分な条件下で、任意の望ましい免疫原で動物を免疫し；そして抗体を単離することによって、本開示の抗体を調製することも可能である。
[0260]いくつかの態様において、所望の結合特性に関して、例えばｓＭＩＣタンパク質に結合するが、アルファ−３ドメインおよび膜貫通ドメインを含むＭＩＣポリペプチド（例えば全長ＭＩＣタンパク質）、あるいは膜結合型ＭＩＣＡまたはＭＩＣＢに結合しない特性に関して、生成した抗体をスクリーニングすることも可能である。したがって、いくつかの態様において、本開示の抗体に関するスクリーニング法は：
（ａ）抗体がｓＭＩＣＡまたはｓＭＩＣＢと相互作用するために適した条件下で、ｓＭＩＣＡまたはｓＭＩＣＢと候補抗体を接触させ：
（ｂ）アルファ−３ドメインおよび膜貫通ドメインを含むＭＩＣＡまたはＭＩＣＢポリペプチド、あるいは膜結合型ＭＩＣＡまたはＭＩＣＢと抗体を接触させ；そして
（ｃ）抗体がｓＭＩＣＡまたはｓＭＩＣＢに特異的に結合するが、アルファ−３ドメインおよび膜貫通ドメインを含むＭＩＣＡまたはＭＩＣＢポリペプチド、あるいは膜結合型ＭＩＣＡまたはＭＩＣＢに特異的に結合しないかどうかを決定する
工程を含むことも可能である。
[0261]いくつかの態様において、本開示の抗体に関してスクリーニングする方法は：
（ａ）アルファ−３ドメイン上の潜在性エピトープが抗体と相互作用することが可能な条件下で、ＭＩＣＡまたはＭＩＣＢのアルファ−３ドメインを含むポリペプチドと候補抗体を接触させ：
（ｂ）アルファ−３ドメインおよび膜貫通ドメインを含むＭＩＣＡまたはＭＩＣＢポリペプチド、あるいは膜結合型ＭＩＣＡまたはＭＩＣＢと候補抗体を接触させ；そして
（ｃ）抗体がＭＩＣＡまたはＭＩＣＢのアルファ−３ドメインに特異的に結合するが、アルファ−３ドメインおよび膜貫通ドメインを含むＭＩＣＡまたはＭＩＣＢポリペプチド、あるいは膜結合型ＭＩＣＡまたはＭＩＣＢに特異的に結合しないかどうかを決定する
工程を含むことも可能である。
[0262]いくつかの態様において、本開示の抗体に関してスクリーニングする方法は：
（ａ）潜在性エピトープが抗体と相互作用することが可能な条件下で、ＭＩＣＡのアルファ−３ドメイン上の潜在性エピトープと候補抗体を接触させ：
（ｂ）アルファ−３ドメインおよび膜貫通ドメインを含むＭＩＣＡまたはＭＩＣＢポリペプチド、あるいは膜結合型ＭＩＣＡまたはＭＩＣＢと候補抗体を接触させ；そして
（ｃ）抗体がＭＩＣＡの潜在性エピトープに特異的に結合するが、アルファ−３ドメインおよび膜貫通ドメインを含むＭＩＣＡまたはＭＩＣＢポリペプチド、あるいは膜結合型ＭＩＣＡまたはＭＩＣＢに特異的に結合しないかどうかを決定する
工程を含むことも可能である。
[0263]いくつかの態様において、本開示の抗体に関してスクリーニングする方法は：
（ａ）潜在性エピトープが抗体と相互作用することが可能な条件下で、ＭＩＣＢのアルファ−３ドメイン上の潜在性エピトープと候補抗体を接触させ：
（ｂ）アルファ−３ドメインおよび膜貫通ドメインを含むＭＩＣＡまたはＭＩＣＢポリペプチド、あるいは膜結合型ＭＩＣＡまたはＭＩＣＢと候補抗体を接触させ；そして
（ｃ）抗体がＭＩＣＢの潜在性エピトープに特異的に結合するが、アルファ−３ドメインおよび膜貫通ドメインを含むＭＩＣＡまたはＭＩＣＢポリペプチド、あるいは膜結合型ＭＩＣＡまたはＭＩＣＢに特異的に結合しないかどうかを決定する
工程を含むことも可能である。
[0264]スクリーニング法のいくつかの態様において、アルファ−３ドメインおよび膜貫通ドメインを含むＭＩＣＡまたはＭＩＣＢポリペプチドは、プロセシングされないまたはプロセシングされた全長型いずれかの、それぞれ、全長ＭＩＣＡまたは全長ＭＩＣＢタンパク質であることも可能である。
[0265]いくつかの態様において、特異的潜在性ペプチドを含む、本明細書記載のポリペプチドはいずれも、抗体をスクリーニングするために使用可能である。いくつかの態様において、スクリーニングに用いる潜在性ペプチドは、ＭＩＣＡまたはＭＩＣＢタンパク質の：
アミノ酸残基１９０〜２２９；
アミノ酸残基１９０〜２３８；
アミノ酸残基２１７〜２３８；
アミノ酸残基２４３〜２５６；
アミノ酸残基２４３〜２７４；または
アミノ酸残基２４３〜２９６／２９７
によって示される配列を含むことも可能であり、ここで、アミノ酸位は、それぞれ、ＭＩＣＡ＊００１アレルのＭＩＣＡタンパク質またはＭＩＣＢ＊００１アレルのＭＩＣＢタンパク質に関して定義される。
[0266]いくつかの態様において、スクリーニングに用いる潜在性ペプチドは、配列：
１９０＿ＲＳＥＡＳＥＧ＿１９６、アルファ−３ドメインの最下部に位置する（配列番号３８）；
２１７＿ＲＱＤＧＶ＿２２１、アルファ−３ドメインの下部に位置する（配列番号３９）；
２３４＿ＬＰＤＧＮ＿２３８、アルファ−３ドメインの最上部近傍に位置する（配列番号４０）；
２５１＿ＱＧＥＥＱＲ＿２５６、アルファ−３ドメインの最下部に位置する（配列番号４１）；または
２５１＿ＲＧＥＥＱＲ＿２５６、アルファ−３ドメインの最下部に位置する（配列番号４２）
を含んでもよく、ここで、アミノ酸位は、ＭＩＣＡ＊００１アレルのＭＩＣＡタンパク質に関して定義される。
[0267]いくつかの態様において、スクリーニングに用いる潜在性ペプチドは、配列：
１９０＿ＣＳＥＶＳＥＧ＿１９６、アルファ−３ドメインの最下部に位置する（配列番号４３）；
２１７＿ＲＱＤＧＶ＿２２１、アルファ−３ドメインの下部に位置する（配列番号４４）；
２３４＿ＬＰＤＧＮ＿２３８、アルファ−３ドメインの最上部近傍に位置する（配列番号４５）；または
２５０＿ＲＱＧＥＥＱＲ＿２５６、アルファ−３ドメインの最下部に位置する（配列番号４６）
を含んでもよく、ここで、アミノ酸位は、ＭＩＣＢ＊００１アレルのＭＩＣＢタンパク質に関して定義される。
[0268]いくつかの態様において、スクリーニングに用いるペプチドは、配列：
（ａ）〜ＸＡ１−Ｓ−ＸＡ３−ＸＡ４−Ｓ−Ｅ−Ｇ〜（配列番号４７）、
式中、ＸＡ１はＲおよびＣより選択され；ＸＡ３はＥおよびＫより選択され；そしてＸＡ４はＡおよびＶより選択される；
（ｂ）〜Ｒ−Ｑ−Ｄ−Ｇ−ＸＢ５〜（配列番号４８）、
式中、ＸＢ５はＶおよびＬより選択される；
（ｃ）〜ＸＤ１−ＸＤ２−Ｇ−Ｅ−Ｅ−Ｑ−ＸＤ７〜（配列番号４９）、
式中、ＸＤ１はＣまたはＲより選択され；ＸＤ２はＱ、ＲおよびＥより選択され；そしてＸＤ７はＲ、ＳおよびＫより選択される；または
（ｄ）〜Ｌ−Ｐ−Ｄ−Ｇ−Ｎ〜（配列番号５０）
を含んでもよい。
[0269]スクリーニング法のいくつかの態様において、わずかな自己免疫疾患誘導活性に関して、候補抗体を評価する。いくつかの態様において、同族受容体ＮＫＧ２Ｄに対するＭＩＣタンパク質の結合に対するわずかなアンタゴニスト性活性に関して、候補抗体を評価する。
[0270]スクリーニングに適した条件は、慣用的なスクリーニング法において使用するものであってもよく、例えば水性緩衝溶液中、抗体と細胞またはポリペプチドをインキュベーションした後、数回洗浄してもよい。いくつかの態様において、エピトープを含有するペプチドまたはＭＩＣタンパク質発現細胞を固体表面、例えば膜またはプレート上に固定して、これを次いで候補抗体と接触させる。非特異的に結合した抗体を、非特異的競合剤、例えば適切なブロッキング剤を含有する溶液で洗い流してもよい。例示的な接触条件は、３０分〜４時間の間、氷上または４℃でのインキュベーションを含むことも可能である。あるいは、室温または３７℃で接触工程を実行することも可能であり、そしてこれは、いくつかの場合、好ましい可能性もある。さらに、ブロッキング剤などの適切な試薬、例えばウシ血清アルブミン、非イオン性界面活性剤（例えばＮＰ４０、Ｔｒｉｔｏｎ Ｘ１００、Ｔｗｅｅｎ２０等）、または他の適切なブロッキング剤（例えば脱脂乳）を用いて、非特異的結合を減少させることも可能である。スクリーニング法の目的に応じて、当業者によって、接触条件を変化させ、そして適応させることも可能であることが認識されるであろう。例えば、インキュベーション温度を増加させる場合、例えば室温にした場合、ターゲット実体の異なるサブセットに対する結合剤を同定する可能性が増加しうる。条件に対するこうした適応は当業者の範囲内である。
[0271]いくつかの態様において、潜在性エピトープを含有するペプチドへの候補抗体の特異的結合を、表面プラズモン共鳴（例えばＢｉａｃｏｒｅ系）またはＢｉｏ−Ｌａｙｅｒインターフェロメトリー（ＢＬＩ）によって決定することも可能である。表面プラズモン共鳴に関しては、抗体をセンサーチップ上に固定し、そして定義されるエピトープを含有するペプチドにチップを曝露することも可能である。ペプチドへの抗体の結合特性は、抗体とペプチドの相互作用に際して、回折の局所指標の変化によって直接測定可能である。あるいは、ペプチドをセンサーチップに結合させて、そしてチップを候補抗体に曝露してもよい（例えば、本明細書に援用される、Ｒｉｃｈ， Ｒ．Ｌ．およびＭｙｓｚｋａ， Ｄ．Ｇ．， ２００７， Ａｎａｌ Ｂｉｏｃｈｅｍ． ３６１（１）：１−６；ならびにＰｏｐｅら， ２００９， Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｍｅｔｈ． ３４１（１−２）：８６−９６を参照されたい）。ＢＬＩに関しては、ペプチド抗原（または抗体）をバイオセンサー（例えば光ファイバープローブ）に結合させ、そしてバイオセンサーを、抗体（またはペプチド抗原）を含有する溶液と接触させる。バイオセンサーチップを白色光で照射し、そして干渉パターンの変化を測定して、結合を検出する。いくつかの態様において、表面プラズモン共鳴またはＢＬＩに加えて、１またはそれより多い他の既知の方法、例えばＥＬＩＳＡ、ＦＡＣＳ、またはウェスタンブロッティングを用いて、適切な抗体結合潜在能力および抗体の抗原部位特異性を決定することも可能である。
[0272]別の側面において、開示の抗体を多様な診断適用に適用してもよい。いくつかの態様において、抗体を用いて、生物学的試料、例えばＭＩＣタンパク質レベル上昇によって特徴付けられる疾患、例えば上皮癌、血液学的悪性腫瘍、および自己免疫疾患と推測されるかまたは診断されている患者から得たものにおいて、ｓＭＩＣタンパク質の存在および／またはレベルを検出することも可能である。いくつかの態様において、ｓＭＩＣＡを検出する方法は：
（ａ）生物学的試料を、ｓＭＩＣＡに特異的に結合する本開示の任意の抗体と接触させ；そして
（ｂ）抗体の特異的結合を決定するかまたは測定して、試料におけるｓＭＩＣＡのレベルを決定する
工程を含むことも可能である。
[0273]いくつかの態様において、ｓＭＩＣＢを検出する方法は：
（ａ）生物学的試料を、ｓＭＩＣＢに特異的に結合する本開示の任意の抗体と接触させ；そして
（ｂ）抗体の特異的結合を決定するかまたは測定して、試料におけるｓＭＩＣＢのレベルを決定する
工程を含むことも可能である。
[0274]診断法のいくつかの態様において、抗体は、ｓＭＩＣＡおよびｓＭＩＣＢの両方に特異的に結合する交差反応性抗体であることも可能である。生物学的試料がｓＭＩＣレベル上昇によって特徴付けられる疾患または障害と推測されるかまたは診断される患者由来である場合、検出されるｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢレベルを標準に比較してもよく、標準レベルは、疾患または障害を伴わない複数の被験体における、ｓＭＩＣタンパク質レベルの統計的平均である。本明細書に記載されるように、検出されるｓＭＩＣレベルは、標準レベルからの統計的に有意な相違がある場合、異常である。いくつかの態様において、被験体を、疾患または障害と診断される前、疾患または障害の診断に続いて、療法剤での治療前、および療法剤での治療に続いてを含めて、長期に渡って、ｓＭＩＣレベルに関して調べることも可能である。診断法を単独で、あるいは特定の疾患または障害に関する診断として用いられる他の方法およびマーカーと組み合わせて、用いてもよい。
[0275]診断法において、生物学的試料は、細胞試料、組織試料および体液試料を含めて、分析のため被験体から採取される任意の適切な試料であることも可能である。いくつかの態様において、体液試料には、血液、血漿、血清、尿、脳脊髄液、リンパ、滑液、胆汁、精液、唾液、涙、および眼房水または硝子体液が含まれる。いくつかの態様において、組織試料には、臓器生検、固形腫瘍、保存組織、全細胞、および細胞溶解物が含まれる。生物学的試料は、特定の試料に適した、当該技術分野に知られる方法によって調製可能であり、そしてこれには、とりわけ、抗体との反応前の、機械的手段、凍結への曝露（例えば液体窒素）、あるいは化学薬品、例えば界面活性剤、酸、または塩基への曝露による破壊が含まれる。ｓＭＩＣタンパク質の存在および／またはレベルを検出するためのアッセイには当該技術分野において典型的に用いられるものが含まれ、とりわけ、免疫組織化学、競合的およびサンドイッチアッセイ、および立体阻害アッセイが含まれる。
[0276]抗体の特異的結合（例えば抗体−ｓＭＩＣタンパク質複合体）を検出する工程は、受容体分子または検出可能標識、例えば蛍光標識、検出可能酵素、または検出可能コンジュゲート系を含有する抗体の使用に頼ることも可能である。いくつかの態様において、抗体の特異的結合は、二次検出剤、例えば一次抗体に特異的に結合する別の抗体に頼ることも可能である。二次抗体をレポーター分子、検出可能標識、または検出可能コンジュゲートで標識してもよい。
[0277]いくつかの態様において、本明細書の診断法を用いて、上昇したＭＩＣ＋レベルによって特徴付けられる疾患または障害を有すると推測される被験体の生物学的試料において、ｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢのレベルを検出することも可能であり、これは、疾患の存在および／または疾患の進行の指標を提供しうる。
[0278]いくつかの態様において、診断法を用いて、上昇したＭＩＣ＋レベルによって特徴付けられる疾患または障害を有するとすでに診断されている被験体の生物学的試料において、ｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢのレベルを検出することも可能であり、これは、疾患の存在および／または疾患の進行の確認を提供しうる。
[0279]いくつかの態様において、診断法を用いて、治療を経た被験体におけるｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢのレベルを検出して、療法剤および／または療法措置の有効性、ならびに／あるいはｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢのレベルの変化に基づいて、疾患再発の可能性を決定することも可能である。
[0280]上述のように、多様な疾患が、上昇したまたは異常なｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢのレベルと関連する。ＭＩＣＡおよびＭＩＣＢならびにそのＮＫＧ２Ｄ所持免疫エフェクター細胞との相互作用は、最終的にＭＩＣ＋細胞の死を生じる、ストレスを受けた細胞または疾患細胞の免疫監視に関与するが、可溶性ＭＩＣタンパク質の存在は、ＮＫＧ２Ｄ受容体レベルを下方制御し、典型的には適格性の免疫系に直面しても、ＭＩＣ＋腫瘍が生存することを可能にする。本明細書に論じるように、高レベルのｓＭＩＣＡおよびｓＭＩＣＢは、癌患者の血液中で同定されているが、「正常」個体では見られず、そしてこれは癌病期の重症度と正に相関してきている(Ｓａｌｉｈら， ２００２， Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ． １６９：４０９８−１０２； Ｄｏｕｂｒｏｖｉｎａら， ２００３， Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ． １７１：６８９１−９； Ｗｕら， ２００４， Ｊ Ｃｌｉｎ Ｉｎｖｅｓｔ． １１４：５６０−８；およびＨｏｌｄｅｎｒｅｉｄｅｒ， ２００６， Ｉｎｔｌ Ｊ Ｃａｎｃｅｒ １１８：６８４−７)。
[0281]したがって、いくつかの態様において、ｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢが細胞（膜）から脱落したかまたは放出された際に、選択的および特異的に結合するよう設計されるかまたは選択された療法抗体は、ｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢの有害な影響を中和するための基盤を提供する。ＭＩＣタンパク質の脱落型に選択的に結合する抗体を用いる利点は、抗体が、細胞表面上に発現されるＭＩＣタンパク質に結合する可能性が低く、それによって、免疫エフェクター細胞の不適切な活性化による病的な自己免疫反応の可能性が減少することである。同様に、ＮＫＧ２Ｄ受容体への、疾患細胞上に発現されるＭＩＣＡおよび／またはＭＩＣＢの結合レベルに対して、抗体の有意なアンタゴニスト活性が存在しないため、ＭＩＣ発現腫瘍細胞の免疫が仲介する破壊が保持されうる。したがって、こうした治療（すなわち減少）が必要な被験体において、ｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢのレベルを減少させる方法において、本開示の抗体を用いることが可能であり、ここで、該方法は：
本明細書記載の抗ｓＭＩＣＡおよび／または抗ｓＭＩＣＢ抗体の療法的有効量を、必要な被験体に投与する
工程を含む。
[0282]一般的に、治療すべき被験体は、上昇したレベルのｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢを有し、ここでそのレベルは、疾患または障害の存在に関連する。用語「上昇した」、あるいは「より高い」または「より大きい」を含むその文法的同等物は、疾患または障害の指標である分子（例えばｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢ）のレベルに関する場合、疾患を持たない集団（例えば健康な被験体）における分子レベルに比較した際、統計的に有意な方式で、疾患または障害を持つ集団においてより高い分子の量を指す。いくつかの態様において、疾患集団におけるｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢの量は、疾患または障害を持たない対象集団における同じ分子の量よりも、少なくとも１０％大きく、少なくとも２５％大きく、少なくとも５０％大きく、少なくとも７５％大きく、そして／または少なくとも９０％大きい。
[0283]ｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢレベルが上昇する、多様な疾患が同定されてきている。こうした疾患には、上皮細胞腫瘍または癌、および血液学的悪性腫瘍が含まれる。したがって、いくつかの態様において、治療される被験体は、ＭＩＣ＋腫瘍または癌、あるいはＭＩＣ＋血液学的悪性腫瘍に罹患している。いくつかの態様において、治療すべきＭＩＣ＋腫瘍または癌は、脳癌、リンパ癌、肝臓癌、胃癌、精巣癌、子宮頸癌、卵巣癌、膣癌および外陰癌、白血病、黒色腫、扁平上皮癌、悪性中皮腫癌、口腔癌、頭頸部癌、咽喉癌、胸腺癌、胃腸間質腫瘍（ＧＩＳＴ）癌、鼻咽頭癌、食道癌、結腸癌、肛門癌、乳癌、肺癌、前立腺癌、陰茎癌、膀胱癌、膵臓癌、神経芽腫、神経膠腫、肝細胞癌、および腎癌より選択されうる。より具体的には、限定されるわけではないが、肺、乳房、胃、結腸、卵巣、腎細胞、前立腺癌腫および黒色腫を含む、上皮腫瘍の多様なタイプを伴う癌で使用することが意図される。したがって、いくつかの態様において、本開示の抗体を用いて、ＭＩＣ＋腫瘍または癌に罹患した被験体を治療するために使用可能であり、該方法は：
本明細書記載の抗体の療法的有効量を、ＭＩＣ＋腫瘍または癌に罹患した被験体に投与する
工程を含む。
[0284]いくつかの態様において、治療すべきＭＩＣ＋血液学的悪性腫瘍は、急性リンパ芽球性白血病（ＡＬＬ）、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）、慢性リンパ球性白血病（ＣＬＬ）、慢性骨髄性白血病（ＣＭＬ）、急性単球性白血病（ＡＭｏｌ）、リンパ腫（例えばホジキンリンパ腫および非ホジキンリンパ腫）、および多発性骨髄腫より選択されうる。したがって、いくつかの態様において、本開示の抗体を用いて、ＭＩＣ＋血液学的悪性腫瘍に罹患した被験体を治療することも可能であり、該方法は：
本明細書記載の抗体の療法的有効量を、ＭＩＣ＋血液学的悪性腫瘍に罹患した被験体に投与する
工程を含む。
[0285]上記疾患に加えて、ｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢのレベル上昇は、特定のウイルス感染中に起こる。上に論じるように、ウイルス感染中に存在するｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢのより高いレベルは、ｓＭＩＣタンパク質による免疫反応の抑制によって、感染を延長させ、そして／またはその重症度を増加させるようである。したがって、上昇したレベルのｓＭＩＣ＋タンパク質によって特徴付けられるウイルス感染を伴う被験体を治療する方法は：
本開示の抗体の療法的有効量を、ｓＭＩＣ＋タンパク質の上昇したレベルによって特徴付けられるウイルス疾患に罹患した被験体に投与する
工程を含むことも可能である。
[0286]ｓＭＩＣタンパク質レベル上昇を示す例示的なウイルス感染には、とりわけ、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、呼吸器合胞体ウイルス（ＲＳＶ）、ヒトサイトメガロウイルス（ＨＣＭＶ）、Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）、およびヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）での感染が含まれる。したがって、いくつかの態様において、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、呼吸器合胞体ウイルス（ＲＳＶ）、ヒトサイトメガロウイルス（ＨＣＭＶ）、Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）、またはヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ；例えばＨＩＶ−１、ＨＩＶ−２）に感染した被験体を治療する方法は：
本開示の抗体の療法的有効量を、ＨＢＶ、ＲＳＶ、ＨＣＭＶ、ＨＣＶまたはＨＩＶ−１に感染した被験体に投与する
工程を含むことも可能である。
[0287]いくつかの態様において、本明細書の治療法のいずれに関しても、例示的な抗体は、配列番号２３のアミノ酸配列の軽鎖可変領域および配列番号２７のアミノ酸配列の重鎖可変領域中の少なくとも１、２、３、４、５または６すべてのＣＤＲを含むことも可能である。いくつかの態様において、療法治療において使用するための抗体は：配列番号８３のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｌ１；配列番号８４のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｌ２；配列番号８５のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｌ３；配列番号８９、配列番号９５、または配列番号９９のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｈ１；配列番号９０、配列番号９６、または配列番号１００のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｈ２；および配列番号９１のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｈ３より選択される、少なくとも１、２、３、４、５または６すべてのＣＤＲを含むことも可能である。
[0288]いくつかの態様において、療法治療において使用するための抗体は、配列番号３１のアミノ酸配列の軽鎖可変領域および配列番号３５のアミノ酸配列の重鎖可変領域中の少なくとも１、２、３、４、５または６すべてのＣＤＲを含む。いくつかの態様において、療法治療において使用するための抗体は：配列番号８６のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｌ１；配列配列番号８７のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｌ２；配列番号８８のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｌ３；配列番号９２、配列番号９７、または配列番号１０１のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｈ１；配列番号９３、配列番号９８、または配列番号１０２のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｈ２；および配列番号９４のアミノ酸配列を含むＣＤＲ Ｈ３より選択される、少なくとも１、２、３、４、５または６すべてのＣＤＲを含むことも可能である。
[0289]いくつかの態様において、療法治療において使用するための抗体は、配列番号２３のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域ＶＬおよび配列番号２７のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域ＶＨを含む。
[0290]いくつかの態様において、療法治療において使用するための抗体は、配列番号３１のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域ＶＬおよび配列番号３５のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域ＶＨを含む。
[0291]いくつかの態様において、本明細書に開示する方法は、一般的に、免疫反応を生成するために、予防剤として、または免疫反応刺激療法剤として有用である。本明細書に開示する方法を、広い範囲の哺乳動物に適用することも可能であり、これにはとりわけ、ヒト、非ヒト霊長類（例えばチンパンジー、サル等）、または非霊長類（例えばウマ、ウシ、ブタ、ヒツジ、シカ、エルク、ヤギ、イヌ、ネコ、ウサギ、ラット、およびマウス）が含まれる。一般的に、被験体または患者は、好ましくはヒトである。特定の態様において、ヒトは小児科患者である。他の態様において、ヒトは成人患者である。いくつかの態様において、被験体は、類人猿（例えばゴリラ、チンパンジー、またはオランウータン）または家畜化哺乳動物（例えばイヌ、ネコ、ヒツジ、ウシ、またはウマ）である。
[0292]本明細書記載の任意の組成物、特に薬学的組成物を、投与が適切な場合は、宿主の体に投与することも可能である。抗体は、限定なしに、哺乳動物の関節、鼻粘膜、血液、肺、腸、筋肉組織、皮膚、または腹腔に送達可能である。さらに、静脈内、腹腔内、筋内、皮下、筋内、直腸内、膣内、クモ膜下腔内、気管内、皮内、または経皮注射によって、経口または鼻投与によって、吸入によって、あるいは長期にわたる漸次灌流によって、組成物を投与することも可能である。さらなる例において、組成物のエアロゾル調製物を、吸入によって宿主に投与することも可能である。任意の所定の症例における最も適切な投与経路は、特定の抗体、被験体、疾患の性質および重症度、ならびに被験体の身体状態に応じるであろう。
[0293]投与される投薬量は、とりわけ、投与経路；配合物の性質；被験体の疾病の性質；被験体の大きさ、体重、表面積、年齢、および性別；投与されている他の薬剤；ならびに主治医の判断に応じる。適切な投薬量は、０．０００１〜１００ｍｇ／ｋｇ体重の範囲であることも可能である。投与される投薬量の広い変動は、利用可能な多様な抗体組成物および多様な投与経路の異なる有効性を考慮して、予期されるものである。当該技術分野によく理解されるように、最適化のための標準的経験的ルーチンを用いて、これらの投薬レベルの変動を調整することも可能である。いくつかの態様において、本明細書記載の徴候の治療のため、本開示の抗体の有効用量は、約０．００１〜約７５ｍｇ／ｋｇ体重；０．００５〜約５０ｍｇ／ｋｇ体重；約０．０１〜約３０ｍｇ／ｋｇ体重；または約０．０１〜約５ｍｇ／ｋｇ体重の範囲であることも可能である。いくつかの態様において、投薬量は、約０．００１ｍｇ／ｋｇ体重；約０．０１ｍｇ／ｋｇ体重；約０．３ｍｇ／ｋｇ体重；約１ｍｇ／ｋｇ体重；約３ｍｇ／ｋｇ体重；約５ｍｇ／ｋｇ体重または約１０ｍｇ／ｋｇ体重であるか、あるいは単回（例えばボーラス）投与あたり、１〜１０ｍｇ／ｋｇ体重の範囲内であることも可能である。
[0294]投薬措置は、最適な望ましい反応（例えば療法反応、管理可能な毒性または副作用等）を提供するために調整される。例えば、単回ボーラスを投与してもよく、数回に分けた用量を長期に渡って投与してもよく、あるいは療法状況によって必要とされるように、用量を比例的に減少させるかまたは増加させてもよい。本明細書に提供する任意の組成物を用いた治療期間は、必要に応じて、最短１日から無期限までの任意の期間であってもよい。投与は、単回ボーラスまたは反復投与、例えば１日、２日、３日、５日、１週間、２週間、３週間、１ヶ月、５週間、６週間、７週間、２ヶ月、３ヶ月、またはそれより長くてもよい。反復投与は、同じ用量でもまたは異なる用量でもよい。例えば、定義される投薬措置を、疾患を治療する（例えば疾患を排除する、寛解を引き起こす、または疾患進行を止める）ために必要に応じて、ある期間、例えば２週間〜６週間、３ヶ月〜１または２年、６ヶ月〜３または４年、８ヶ月〜１８ヶ月等の期間続ける。いくつかの態様において、最初の治療は、２週間から２ヶ月の定義される投薬措置、その後、維持投薬措置であってもよく、ここで、維持投薬は、最初の治療と同じかまたはそれよりも低い用量であってもよく、疾患または障害を治療するために必要に応じて反復してもよく、例えば２週間ごと、１ヶ月ごと、２ヶ月ごと、または４ヶ月ごと、あるいは医師によって決定されるような必要に応じた維持治療を行ってもよい。
[0295]いくつかの態様において、抗体を単一療法として用いてもよいし、そして単回用量として、または長期に渡って数回の用量で投与してもよい。いくつかの態様において、抗体を誘導療法として投与してもよく、すなわち最初は疾患の治療に用いる一連の療法手段で、その後、抗体での維持療法として投与してもよい。
[0296]いくつかの態様において、ｓＭＩＣタンパク質の上昇したレベルによって特徴付けられる疾患または障害を治療するために適した他の療法剤と組み合わせて、抗体を投与してもよい。併用療法において、本開示の抗体および１またはそれより多い併用療法剤を併用して（例えば同時に）、連続して、一緒に、または別個に投与してもよい。
[0297]いくつかの態様において、本開示の抗体を、腫瘍、癌または自己免疫疾患を治療するために用いられる化学療法剤と組み合わせて用いる。化学療法剤には、とりわけ、細胞傷害剤、代謝拮抗剤（例えば葉酸アンタゴニスト、プリン類似体、ピリミジン類似体等）、トポイソメラーゼ阻害剤（例えばカンプトテシン誘導体、アントラセンジオン、アントラサイクリン、エピポドフィロトキシン、キノリンアルカロイド等）、抗微小管剤（例えばタキサン、ビンカアルカロイド）、タンパク質合成阻害剤（例えばセファロタキシン、カンプトテシン誘導体、キノリンアルカロイド）、アルキル化剤（例えばスルホン酸アルキル、エチレンイミン、ナイトロジェンマスタード、ニトロソ尿素、白金誘導体、トリアゼン等）、アルカロイド、テルペノイド、およびキナーゼ阻害剤が含まれてもよい。増殖性障害、例えば癌および腫瘍を治療するために典型的に用いられる例示的な化学療法剤には、例えば、そして限定なしに、アファチニブ、アフレセルチブ、アレクチニブ、アリセルチブ、アルボシジブ、アモナフィド、アムバチニブ、アキシチニブ、アザシチジン、アザチオプリン、バフェチニブ、バラセルチブ、ベンダムスチン、ブレオマイシン、ボスチニブ、ボルテゾミブ、ブスルファン、カボザンチニブ、カンプトテシン、カネルチニブ、カペシタビン、カバジタキセル、カルボプラチン、カルムスチン、セニセルチブ、セリチニブ、クロラムブシル、シスプラチン、クラドリビン、クロフォラビン、クレノラニブ、クリゾチニブ、シクロホスファミド、シタラビン、ダブラフェニブ、ダカルバジン、ダコミチニブ、ダクチノマイシン、ダヌセルチブ、ダサチニブ、ダウノルビシン、デシタビン、ジナシクリブ、ドセタキセル、ドビチニブ、ドキソルビシン、エピルビシン、エピチニブ、メシル酸エリブリン、エロロチニブ、エチリノテカン、エトポシド、エベロリムス、エキセメスタン、フロクスウリジン、フルダラビン、フルオロウラシル、ゲフィチニブ、ゲムシタビン、ヒドロキシ尿素、イブルチニブ、イコチニブ、イダルビシン、イホスファミド、イマチニブ、イメテルスタット、イパタセルチブ、イリノテカン、イキサベピロン、ラパチニブ、レナリドミド、レスタウルチニブ、ロムスチン、ルシタニブ、マシチニブ、メルファラン、メルカプトプリン、メトトレキセート、ミドスタウリン、マイトマイシン、ミトキサントロン、ムブリチニブ、ネララビン、ネラチニブ、ニロチニブ、ニンテダニブ、オマセタキシン・メペスクシネート、オランチニブ、オキサリプラチン、パクリタキセル、パルボシクリブ、パリホスファミド・トリス、パゾパニブ、ペリチニブ、ペメトレキセド、ペントスタチン、プリカマイシン、ポナチニブ、ポジオチニブ、プララトレキセート、プロカルバジン、キザルチニブ、ラルチトレキセド、レゴラフェニブ、ルキソリチニブ、セリシクリブ、ソラフェニブ、ストレプトゾシン、スルファチニブ、スニチニブ、タモキシフェン、タンデュチニブ、テモゾロミド、テムシロリムス、テニポシド、テリアチニブ、チオグアニン、チオテパ、トポテカン、バルルビシン、バンデタニブ、ベムラフェニブ（ゼルボラフ（登録商標））、ビンクリスチン、ビンブラスチン、ビノレルビン、ビンデシン等が含まれる。いくつかの態様において、被験体の免疫反応に不都合に影響を及ぼさない化学療法剤を選択してもよい。
[0298]いくつかの態様において、抗体を、腫瘍、癌または自己免疫疾患を治療するために用いられる生物薬剤と組み合わせて用いてもよい。本明細書の抗体と組み合わせて使用可能な例示的な生物薬剤の例には、とりわけ、抗ＢＡＦＦ（例えばベリムマブ）；抗ＣＣＲ４（例えばモガムリズマブ）；抗ＣＤ１９／ＣＤ３（例えばブリナツモマブ）；抗ＣＤ２０（例えばオビヌツズマブ、リツキシマブ、イブリツモマブ・チウキセタン、オファツムマブ、トシツモマブ）；抗ＣＤ２２（例えばモキセツモマブ・パスドトクス）；抗ＣＤ３０（例えばブレンツキシマブ・ベドチン）；抗ＣＤ３３（例えばゲムツズマブ）；抗ＣＤ３７（例えばオトレルツズマブ）；抗ＣＤ３８（例えばダラツムマブ）；抗ＣＤ５２（例えばアレムツズマブ）；抗ＣＤ５６（例えばロルボツズマブ・メルタンシン）；抗ＣＤ７４（例えばミラツズマブ）；抗ＣＤ１０５；抗ＣＤ２４８（ＴＥＭ１）（例えばオンツキシズマブ）；抗ＣＴＬＡ４（例えばトレメリムマブ、イピリムマブ）；抗ＥＧＦＬ７（例えばパルサツズマブ）；抗ＥＧＦＲ（ＨＥＲ１／ＥＲＢＢ１）（例えばパニツムマブ、ニモツズマブ、ネシツムマブ、セツキシマブ、イムガツズマブ、フツキシマブ）；抗ＦＺＤ７（例えばバンチクツマブ）；抗ＨＥＲ２（ＥＲＢＢ２／ｎｅｕ）（例えばマルゲツキシマブ、ペルツズマブ、アド−トラスツズマブ・エムタンシン、トラスツズマブ）；抗ＨＥＲ３（ＥＲＢＢ３）；抗ＨＧＦ（例えばリロツムマブ、フィクラツズマブ）；抗ＩＧＦ−１Ｒ（例えばガニツマブ、フィジツムマブ、シクスツムマブ、ダロツズマブ）；抗ＩＧＦ−２Ｒ；抗ＫＩＲ（例えばリリルマブ、オナルツズマブ）；抗ＭＭＰ９；抗ＰＤ−１（例えばニボルマブ、ピジリズマブ、ラムブロリズマブ）；抗ＰＤ−Ｌ１；抗ＰＤＧＦＲα（例えばラムシルマブ、トベツマブ）；抗ＰＤ−Ｌ２；抗ＰＩＧＦ（例えばジブ−アフリベルセプト）；抗ＲＡＮＫＬ（例えばデノスマブ）；抗ＴＮＦＲＳＦ９（ＣＤ１３７／４−１ＢＢ）（例えばウレルマブ）；抗ＴＲＡＩＬ−Ｒ１／ＤＲ４、Ｒ２／Ｄ５（例えばデュラネルミン）；抗ＴＲＡＩＬ−Ｒ１／Ｄ４（例えばマパツムマブ）；抗ＴＲＡＩＬ−Ｒ２／Ｄ５（例えばコナツムマブ、レキサツムマブ、アポマブ）；抗ＶＥＧＦＡ（例えばベバシズマブ、ジブ−アフリベルセプト）；抗ＶＥＧＦＢ（例えばジブ−アフリベルセプト）；および抗ＶＥＧＦＲ２（例えばラムシルマブ）が含まれる。
[0299]特に、本明細書記載の抗体を、免疫系を活性化する、例えば刺激する療法剤と組み合わせて用いてもよい。いくつかの態様において、これらは、免疫系を正に活性化させる剤、または免疫活性の下方制御を阻害する剤を含んでもよい。免疫活性化または免疫刺激剤は、小分子化合物、抗体、アンチセンス化合物、遺伝子療法等であることも可能である。療法免疫活性化剤のための多様な生物学的ターゲットには、例えば、そして限定なしに、ＣＴＬＡ−４、ＫＩＲ（キラー細胞免疫グロブリン様受容体）、ＰＤ−１、ＰＤ−Ｌ１、ＰＤ−Ｌ２、ＣＤ１３７、ＣＤ２２７、ＩＬ−１５受容体、ＩＬ−６、ＩＬ−６受容体、ＴＧＦ−β１、ＴＧＦ−β２、ＴＧＦ−β３、およびアポリポタンパク質Ｊ（クラステリン）が含まれる。いくつかの態様において、免疫系活性化剤には、療法ターゲットに対して向けられる抗体または他の結合剤、例えば抗ＣＴＬＡ４、抗ＰＤ−１、抗ＰＤ−Ｌ１、抗ＰＤ−Ｌ２、抗ＣＤ１３７、抗ＴＧＦ−β１、抗ＴＧＦ−β２、抗ＴＧＦ−β３、および抗アポリポタンパク質Ｊ（クラステリン）が含まれる。例示的な免疫活性化剤には、とりわけ、イピリムマブ、トレメリムマブ（Ｒｉｂａｓら， ２０１３， Ｊ Ｃｌｉｎ Ｏｎｃｏｌ． ３１：６１６−２２）、ニボルマブ（Ｗｏｌｃｈｏｋら， ２０１３， Ｎ Ｅｎｇｌ Ｊ Ｍｅｄ． ３６９：１２２−３３）、ＢＭＳ−９３６５５９（ＭＤＸ−１１０５： Ｂｒａｈｍｅｒら， ２０１２， Ｎ Ｅｎｇｌ Ｊ Ｍｅｄ． ３６６：２４５５−６５）、ＭＥＤＩ４７３６（抗ＰＤ−Ｌ１）、ＭＰＤＬ３２８０Ａ（抗ＰＤＬ−１）、ラムブロリズマブ（Ｈａｍｉｄら， ２０１３， Ｎ Ｅｎｇｌ Ｊ Ｍｅｄ． ３６９：１３４−４４）、ピジリズマブ（抗ＰＤ−１； Ｂｅｒｇｅｒ Ｒら ２００８， Ｃｌｉｎ Ｃａｎ Ｒｅｓ． １４：３０４４−５１）、ＡＭＰ−２２４（ＰＤ−Ｌ２−Ｉｇ）、ラムブロリズマブ、ウレルマブ（ＬｉおよびＬｉｕ， ２０１３， Ｃｌｉｎ Ｐｈａｒｍ： Ａｄｖａｎｃｅｓ ＆ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎ ５（Ｓｕｐｐｌ １）：４７−５３）、ＰＦ−０５０８２５６６（Ｆｉｓｈｅｒら， ２０１２， Ｃａｎｃ Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ． ６１：１７２１−３３）、ＡＬＴ−８０３（ＩＬ−１５アゴニスト； Ｘｕら， ２０１３， Ｃａｎｃ Ｒｅｓ． ７３：３０７５−８６； Ｚｈｕら， ２００９， Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ． １８３：３５９８−６０７）、ＡＢ−１６Ｂ５（抗クラステリン）、ピルフェニドン（Ｎｏｂｌｅら， ２０１１， Ｌａｎｃｅｔ ３７７：１７６０−９）、フレソリムマブ（Ｔｒａｃｈｔｍａｎら， Ｋｉｄｎｅｙ Ｉｎｔ． ７９：１２３６−４３）、スルチキシマブ、およびトシリズマブが含まれる。
[0300]いくつかの態様において、抗体と組み合わせて使用するための免疫活性化剤は、免疫反応を刺激するサイトカインまたはケモカインを含んでもよい。例示的なサイトカインおよびケモカインには、とりわけ、ＩＬ−２、ＩＬ−７、ＩＬ−１２、ＩＬ−１５、ＩＬ−２１、ＧＭ−ＣＳＦ、ＩＦＮ−α、およびＣＣＬ−２１が含まれる。いくつかの態様において、免疫刺激性サイトカインおよびケモカインをｅｘ ｖｉｖｏで用いて、免疫細胞、特に治療しようとする被験体または患者から得られる免疫細胞を治療することも可能である。
[0301]いくつかの態様において、本明細書記載の抗体を、癌ワクチンで活性化された抗原提示細胞（例えば樹状細胞）を含む、癌ワクチンと組み合わせて用いてもよい。例示的な癌ワクチンには、とりわけ、前立腺酸性ホスファターゼ（例えばプロベンジ（登録商標））；ｇｐ−９６−Ｉｇ（例えばＨＳ−４１０）； ＰＡＮＶＡＣ； ＨＥＲ２／ｎｅｕ（例えばネリペピムト−Ｓ、ＡＶＸ９０１）； ＤＣＶａｘ（Ｒ）−Ｌ；リンドペピムト； ＩＭＡ９５０（多重腫瘍関連ペプチド）；腫瘍由来熱ショックタンパク質ｇｐ９６（ビテスペン）；生存ペプチド（例えばＩＳＡ−５１： ＵＳ特許公報２０１１００９１４８９）； ＥＧＦＲｖＩＩＩ−ＮＹ−ＥＳＯ−１（例えばＡＤＵ−６２３）； ＣＤ−１３３；葉酸結合タンパク質ワクチンＥ３９およびＪ６５； ＨＬＡ−Ａ２腫瘍抗原ペプチド；癌胎児性抗原（ＣＥＡ）；普遍的腫瘍抗原癌胎児性抗原／未成熟ラミニン受容体タンパク質（ＯＦＡ／ｉＬＲＰ）；ママグロビン−Ａ； ｂｉ−ｓｈＲＮＡフューリン； ＨＬＡ−Ａ＊２４０２制限エピトープペプチドＣＤＣＡ１、ＵＲＬＣ１０、ＫＩＦ２０Ａ、ＤＥＰＤＣ１およびＭＰＨＯＳＰＨ１；高グリコシル化（ｈｙｐｅｒｇｌｏｃｏｓｙｌａｔｅｄ）ＭＵＣ１（例えばＯＮＴ−１０）；ポリ−ＩＣＬＣ；ヒト・テロメラーゼ逆転写酵素（例えば、ｈＴＥＲＴ、ＵＶ１、ＧＶ１００１）； ＨＰＶ Ｐ１６ ３７−６３−ペプチド； ＨＰＶ−１６−Ｅ７（例えばＡＤＸ１１−００１）、ｐＮＧＶＬ４ａ−Ｓｉｇ；帯状疱疹（Ｈｅｒｐｅｓ Ｚｏｓｔｅｒ）ワクチンＧＳＫ１４３７１７３Ａ； ＮＹ−ＥＳＯ−１抗原；白血病関連抗原ＷＴ１； ｂｃｒ−ａｂｌ ｐ２１０−ｂ３ａ２ブレイクポイント誘導性ペンタペプチドＣＭＬＶＡＸ１００；ＧＭ−ＣＳＦを伴う肺癌細胞（例えばＧＶＡＸ）；ウィルムス腫瘍遺伝子（ＷＴ１）ペプチド（例えばＯＣＶ−５０１）；ヒトＭＵＣ１抗原（例えばＬ−ＢＬＰ２５）； ＭＵＣ１ペプチド、テセモチド； ＨＬＡ−Ａ＊０２０１制限エピトープペプチドＵＲＬＣ１０、ＶＥＧＦＲ１および／またはＶＥＧＦＲ２ ９ＵＲＬＣ１０；癌精巣抗原（例えばＵＲＬＣ１０、ＣＤＣＡ１、ＫＩＦ２０Ａ、ＭＡＧＥ−Ｃ１、ＭＡＧＥ−Ａ３／６等）；オートファゴソーム濃縮ワクチン、ドリブル、Ｌ５２３Ｓタンパク質； ＲＮＡｃｔｉｖｅ由来肺癌ワクチンＣＶ９２０２； ＣＳＦ−４７０ワクチン；黒色腫抗原ＭＡＧＥ−３．Ａ１；黒色腫抗原ＮＡ１７．Ａ２；黒色腫抗原ＩＭＰ３２１；黒色腫抗原ＬＡＧ−３； ＩＢＢＬ抗原（例えばＡ２／４−１ＢＢＬ）黒色腫ワクチン； ＭＡＲＴ−１； ｇｐ１００（例えばｇ２０９−２Ｍ、Ｇ２８０−９Ｖ）； ＫＲＮ７０００； ＰＶＸ−４１０； ＰＲＯＳＴＶＡＣ；ペプチド、ピロＥＨＷＳＹＧＬＲＰＧ（ＰＥＰ２２３）；前立腺性特異的抗原；およびＰＳＭＡ抗原（例えばＢＰＸ−２０１）が含まれる。
[0302]いくつかの態様において、抗体と組み合わせて用いられる癌ワクチンは、腫瘍細胞または腫瘍細胞溶解物であってもよく、ここでワクチンには、腫瘍細胞または腫瘍細胞溶解物で活性化された抗原提示細胞（例えば樹状細胞）が含まれる。ワクチンとして有用な、例示的な腫瘍細胞および対応する腫瘍細胞溶解物には、とりわけ、膀胱癌細胞、神経膠芽腫細胞、乳癌細胞、子宮頸癌細胞、リンパ腫細胞、腎臓癌細胞、白血病細胞、肺癌細胞、黒色腫細胞、多発性骨髄腫細胞、非ホジキンリンパ腫、膵臓癌細胞、および前立腺癌細胞が含まれる。
[0303]いくつかの態様において、抗体を、上昇したｓＭＩＣリガンドの存在によって特徴付けられるウイルス感染、例えばＢ型肝炎ウイルス、呼吸器合胞体ウイルス、ヒトサイトメガロウイルス、Ｃ型肝炎ウイルス、およびヒト免疫不全ウイルスでの感染を治療するために用いられる抗ウイルス薬剤と組み合わせて用いてもよい。Ｂ型肝炎ウイルスを治療するための薬剤には、とりわけ、インターフェロン（例えばインターフェロン・アルファ−２ｂまたはＰＥＧ化インターフェロン）、ラミブジン、アデホビル・ジピボキシル、エンテカビル、テルビブジン、およびテノホビルが含まれる。呼吸器合胞体ウイルスを治療するための薬剤には、とりわけ、ＲＳＶ過免疫グロブリン；パリビズマブ；ベンズイミダゾールＢＭＳ−４３３７７１、ＴＭＣ３５３１２１およびＪＮＪ−２４０８０６８；リバビリン；およびアンチセンス・ホスホロジアミデート・モルホリノオリゴマー（概説、ＯｌｓｚｅｗｓｋａおよびＯｐｅｎｓｈａｗ， ２００９， Ｅｘｐｅｒｔ Ｏｐｉｎ Ｅｍｅｒｇ Ｄｒｕｇｓ １４（２）： ２０７−１７を参照されたい）。Ｃ型肝炎ウイルスを治療するための薬剤には、とりわけ、インターフェロン（例えばインターフェロン・アルファ−２ｂまたはＰＥＧ化インターフェロン）、ボセプレビル、テラプレビル、リバビリン、シメプレビル、ソホスブビル、ダクラタスビルおよびその組み合わせが含まれる。ヒト免疫不全ウイルスを治療するための薬剤には、とりわけ、エファビレンツ、エムトリシタビン、テノホビル・ジソプロキシル・フマレート、リルピビリン、コビシスタット、ラミブジン、ジドブジン、アバカビル、ザルシタビン、スタブジン、ネビラピン、エトラビリン、デラビルジン、チプラナビル、インジナビル、メシル酸サキナビル、ロピナビル、リトナビル、ダルナビル、硫酸アタザナビル、メシル酸ネルフィナビル、マラビロック、ラルテグラビル、エンフビルチド、およびその組み合わせが含まれる。
[0304]併用療法のいくつかの態様において、本明細書記載の抗体を、他の療法剤の投与の前に、それと同時に、またはそれに続いて用いてもよい。いくつかの態様において、本開示の抗体および併用療法剤を、同じ日に、例えば同じ受診日に、連続して患者に投与してもよい。連続投与は、１、２、３、４、５、６、７または８時間、またはそれより長い時間離れて行ってもよい。いくつかの態様において、本開示の抗体および併用療法剤を、異なる日に、別個に投与してもよく、例えば、抗体および併用療法剤を、１日、２日、または３日、１週間、２週間または一月間隔で投与してもよい。本開示の抗体および他の療法剤の組み合わせのための他の治療措置は、本明細書のガイダンスを考慮して、当業者に明らかであろう。
[0305]別の側面において、本開示は、本明細書記載の抗体および方法を実施するために有用な材料を含有する製造物品およびキットを提供する。いくつかの態様において、物品は、本開示の抗体を含む容器を含んでもよい。適切な容器には、とりわけ、瓶、バイアル、バッグ、およびシリンジが含まれる。容器は多様な材料、例えばプラスチックまたはガラスで製造されてもよい。いくつかの態様において、容器は、無菌アクセスポート、例えば皮下注射針を挿入するための栓または膜を有してもよい。
[0306]いくつかの態様において、物品にはまた、抗体と組み合わせて用いられる材料、例えば無菌水または無菌緩衝液、例えば使用のために組成物を再構成するためのものを含有する、少なくとも第二の容器も含まれてもよい。いくつかの態様において、第二の容器または第三の容器は、本開示の抗体組成物と組み合わせて使用するための、化学療法剤または生物学的剤を含む、さらなる療法剤を含んでもよい。
[0307]いくつかの態様において、物品は、１またはそれより多い疾患状態を治療するために用いられる組成物を記載する、ラベルまたは添付文書を含む。物品にはまた、適切な電子媒体、例えば光ディスクおよびスタティックＲＡＭチップ上に組成物の説明書または説明および使用説明書も含んでもよい。
[0308]製造物品は、容器、添付文書、および／または電子媒体を含むキットの形で提供されてもよい。これは、商品流通および使用者のために望ましい他の材料、例えば他の緩衝剤、希釈剤、フィルター、針およびシリンジをさらに含んでもよい。
[0309]本発明をここで一般的に記載してきたが、本発明は、例示のためにのみ提供され、そして明記しない限り、本発明を限定することを意図されない、以下の実施例を参照することによってより容易に理解されるであろう。
実施例１：ＭＩＣＡのアルファ−３ドメインに対するモノクローナル抗体の生成に関連する方法
[0310]バキュロウイルス発現による、細胞外アルファ−３ドメインＭＩＣＡ免疫原の産生。抗体産生のための免疫原として、ＭＩＣＡの細胞外アルファ−３ドメインを調製するため、バキュロウイルスタンパク質発現系を用いて、発現されたＭＩＣＡ上に適切なタンパク質グリコシル化を生成した。プロセシングされたＭＩＣＡタンパク質（例えば図４−１）のアミノ酸残基１８２〜２７４である、ＭＩＣＡのアルファ−３ドメインの残基２０５〜２９７（図１Ｃ：配列番号３）をコードするＧｅｎＢａｎｋ ＭＩＣＡ配列ＮＰ＿０００２３８．１（図１）に対応する組換えアルファ−３ドメインＭＩＣＡ ｃＤＮＡ（アレル００１）を、バキュロウイルストランスファーベクター内にさらにサブクローニングするための慣用的な制限酵素部位と一緒に合成的に生成し、そして次いで、適切なＤＮＡクローニングベクター内に連結した。バキュロウイルストランスファーベクターは、精製のため、６つのＣ末端ヒスチジン残基タグを含有した。精製タグおよび切断部位を持つ例示的なＭＩＣＡペプチド免疫原もまた、以下から選択可能であり、ここでＭＩＣＡ配列を下線で示す：
Figure 0006518199
[0311]サブクローン中のＭＩＣＡおよびさらなるＤＮＡ配列の両方を確認する際、バキュロウイルス発現系を用いて、２つのＤＮＡ構成要素を大腸菌細菌において組み換えて、組換えウイルスＤＮＡを含有するバクミド構築物を生成した。正しい配列を持つ組換えバクミドクローンを用いて、Ｓｆ９昆虫細胞内にトランスフェクションすることによって、組換えバキュロウイルスを産生した。
[0312]組換えタンパク質を産生するため、Ｓｆ９細胞を血清不含培地、例えばＳＦ−９００（Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）中で、組換えウイルスに感染させ、そして感染４日後または５日後に細胞を採取した。感染細胞からＭＩＣＡアルファ−３ドメインポリペプチドを精製するため、細胞を溶解し、短時間遠心分離して上清を収集し、そして次いで、Ｎｉ２＋キレートを用いて、アフィニティクロマトグラフィに供した。クロマトグラフィ前に試料緩衝液に８Ｍ尿素を添加することによって、タンパク質回収を改善した。炭酸緩衝液に対する透析を用いて、尿素を除去した。また、純粋なタンパク質を遠心分離フィルター（Ａｍｉｃｏｎ）によって濃縮して、より安定なタンパク質調製を達成してもよい。
[0313]別の態様において、類似の戦略を取って、マウスの免疫において用いられる組換えタンパク質として、ＭＩＣＢ由来のアルファ−３ドメインを調製してもよい（配列を図１Ｄ：配列番号４に提示する）。精製タグおよび切断部位を含む、例示的なＭＩＣＢペプチド免疫原はまた、以下から選択可能であり、ここでＭＩＣＢ配列を下線で示す：
Figure 0006518199
[0314]モノクローナル抗体生成および一次スクリーニング。アルファ−３ドメインＭＩＣＡ免疫原を水溶液（約０．５ｍｇ／ｍｌ）中で調製し、そして２週間の期間に渡って５回、ＲａｐｉｄＰｒｉｍｅＴＭ法（ＩｍｍｕｎｏＰｒｅｃｉｓｅ、カナダ・ブリティッシュコロンビア州）を用いて免疫適合マウス内に注射した。免疫後、免疫マウスのリンパ組織由来のリンパ球を取り除き、そしてリンパ球を化学的に、限定されるわけではないが、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）またはＰＥＧ誘導体を用いて、不死化のためにネズミＳＰ２／Ｏ骨髄腫細胞に融合させた。抗体を産生可能なクローン性Ｂ−細胞／骨髄腫融合ハイブリドーマ細胞を選択するため、融合させた細胞をメチルセルロース含有半固形ＨＡＴ薬剤選択培地中で増殖させた。ハイブリドーマクローンの一次スクリーニングは、ＥＬＩＳＡによって、組換え抗原（ＭＩＣＡのアルファ−３ドメイン）に結合する能力に関して、抗体含有上清を伴った。一次スクリーニングは、総数９４８のアッセイしたハイブリドーマクローンから１４６のヒットを生じ（１５％）、一方、アイソタイプ決定アッセイは、特異的抗体タイプに関して、９８／１４６クローン（６７％）を同定し、これは９４８の最初のクローンの１０％に同等であった。
[0315]間接的ＥＬＩＳＡを用いた二次スクリーニング。いくつかの二次間接的ＥＬＩＳＡスクリーニングを行って、さらなる分析に関して、高品質のハイブリドーマクローンを選択するよう補助した。（ａ）試験アルファ−３ドメインＭＩＣＡタンパク質；（ｂ）潜在的なＨｉｓタグ結合抗体を排除するため、ＭＩＣタンパク質に関連がないＨｉｓタグ化タンパク質；（ｃ）ヒトＭＩＣＡ由来の組換え大腸菌産生外部ドメインタンパク質（完全アルファ−３サブドメインを含むが、Ｈｉｓ−タグを含まないもの）（Ｂｉｏ Ｂａｓｉｃ、カナダ・マーカム）；および（ｄ）ヒトＭＩＣＢ由来の組換え大腸菌産生外部ドメイン（完全アルファ−３サブドメインを含むが、Ｈｉｓ−タグを含まないもの）（Ｂｉｏ Ｂａｓｉｃ、カナダ・マーカム）への結合に関して、ハイブリドーマ上清が含有する抗体をアッセイした。
[0316]上記タンパク質を、炭酸緩衝液（ｐＨ９．６）中、ウェルあたり０．１〜０．２μｇの範囲の濃度で、ＥＬＩＳＡプレートに一晩、４℃で結合させた。次いで、プレートを脱脂粉乳／ＰＢＳ ｐＨ７．４でブロッキングし、洗浄し、そして次いで、一次抗体（１００μｌのハイブリドーマ上清）で、または陽性対照ＭＩＣネズミモノクローナル抗体（ＢＡＭＯ３、ＭＩＣアルファ−３特異的ＩｇＧ２ａ ｍＡｂ；およびＢＡＭＯ１、ＭＩＣアルファ１＋２特異的ＩｇＧ１ ｍＡｂ；どちらもＭＢＬ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ、米国マサチューセッツ州）で、またはアイソタイプマッチング陰性対照抗体で１時間処理した。洗浄後、ウェルを二次ヤギ抗マウスＩｇＧ／ＩｇＭ（Ｈ＋Ｌ）−ＨＲＰコンジュゲート化抗体で１時間処理した。洗浄したウェルに、ＨＲＰ基質、テトラメチルベンジジン（ＴＭＢ）を添加し、そして暗所で５分間発色させた。１Ｍ ＨＣｌを添加することによって反応を停止し、そしてプレートを４５０ｎｍで読み取った。
[0317]これらのＥＬＩＳＡ実験は、Ｈｉｓ−タグ化タンパク質と非常に弱く反応する少量のハイブリドーマ上清しか生じず、生成された抗体がターゲット、すなわちＭＩＣＡに特異的であることが示唆された。本発明者らはまた、試験したハイブリドーマの多くが、アルファ−３ターゲットＭＩＣＡタンパク質ならびに細菌産生ＭＩＣＡおよび／またはＭＩＣＢタンパク質両方に強く結合する抗体を生じ、多様な結合可能性を持つ異なるクローンの収集を可能にすることも決定した。特に興味深いのは、ターゲットＭＩＣＡアルファ−３ドメイン組換えタンパク質ならびにＭＩＣＡおよびＭＩＣＢ組換え外部ドメインタンパク質に結合可能な、クローン１Ｆ５および８Ｃ７を含む抗体を産生するクローンであった。ＥＬＩＳＡ実験もまた、遡及的に、対照ＭＩＣ抗体ＢＡＭＯ３（ＭＩＣアルファ−３特異的）が、組換えアルファ−３ ＭＩＣＡターゲットタンパク質に対する間接的ＥＬＩＳＡによって強いシグナルを産生することが可能であるが、ＢＡＭＯ１（ＭＩＣアルファ１＋２特異的）はそうではないことも示し、試験アルファ−３ドメイン抗原が、実際に、バキュロウイルス系において正しく発現されていたことを確認した。
[0318]フローサイトメトリーアッセイを用いた二次スクリーニング。二次スクリーニングは同じ抗体含有上清を用いて、間接的ＥＬＩＳＡによって、これらが、ＭＩＣＡまたはＭＩＣＢタンパク質の細胞外領域（アルファ−１、−２、および−３ドメイン）に結合する能力に関して、そしてフローサイトメトリー分析によって、ＭＩＣ発現熱ショック処理ＨＣＴ１１６結腸癌細胞の細胞表面上のＭＩＣタンパク質に結合する能力がないことに関して、試験した。
[0319]細胞結合ＭＩＣタンパク質への結合に関してアッセイするため、ＭＩＣ発現熱ショック処理ＨＣＴ１１６結腸癌細胞を４２℃で６０分間熱処理し、そして次いで、３７℃で２２時間回復させた。回復に際して、生存度試験を、トリプシン処理後の細胞に対して行い、そして９７％の生存度レベルが決定された。次いで、まずＣｌｅａｒ ＢａｃｋＴＭヒトＦｃ受容体ブロッキング試薬（ＭＢＬ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ、米国マサチューセッツ州）で短期間ブロッキングし、そして次いで、以下：（ａ）試験ハイブリドーマ上清；（ｂ）アルファ−１に加えてアルファ−２ ＭＩＣサブドメインのみに、またはアルファ−３ ＭＩＣサブドメインのみのいずれかに結合可能な陽性対照ネズミ抗体（上述のＢＡＭＯ１およびＢＡＭＯ３ ｍＡｂ：ＭＢＬ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ、米国マサチューセッツ州）、あるいは（ｃ）陽性対照抗体とアイソタイプマッチした陰性対照ネズミ抗体（ＩｇＧ１抗ヒトトランスフェリン抗体およびＩｇＧ２ａ−抗マス（ｔｒｏｕｔ）Ｉｇ）の１つより選択される一次抗体で処理することによって、熱処理ＨＣＴ１１６細胞を調製した。インキュベーションおよび徹底的な洗浄後、細胞をフィコエリトリン（ＰＥ）コンジュゲート化ヤギ抗マウス二次抗体（Ｊａｃｋｓｏｎ Ｉｍｍｕｎｏ Ｒｅｓｅａｒｃｈ、米国ペンシルバニア州）で処理した。次いで、細胞をＢＤ ＣｙｔｏｆｉｘＴＭ（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ、米国カリフォルニア州）で固定し、保存緩衝剤中で再懸濁し、そして次いで、ＧｕａｖａＦｌｏｗ ＦＡＣＳ装置上でフローサイトメトリーに供した。
[0320]細胞表面への強い結合は、両方の陽性対照抗体（アルファ−１＋２特異的、またはアルファ−３特異的）で検出されたが、陰性対照抗体（未提示）、またはＥＬＩＳＡアッセイ形式で、ＭＩＣＡアルファ−３サブドメイン組換えタンパク質に結合すると以前決定されている抗体のハイブリドーマ試験上清ではいずれも、結合は観察されなかった。特に、ハイブリドーマクローン１Ｆ５（ＩｇＧ１）および８Ｃ７（ＩｇＧ１）由来の抗体は、ＨＣＴ１１６細胞上の細胞表面発現ＭＩＣタンパク質に結合不能であった（図９）。これらの２つのハイブリドーマクローン１Ｆ５および８Ｃ７をさらに性質決定した。
実施例２：１Ｆ５および８Ｃ７抗体の性質決定
[0321]結合アフィニティの分析。Ｐａｌｌ ＦｏｒｔｅＢｉｏ Ｏｃｔｅｔ ＲＥＤ９６装置（Ｐａｌｌ ＦｏｒｔｅＢｉｏ、米国カリフォルニア州）を用いて、Ｂｉｏ−Ｌａｙｅｒインターフェロメトリー（ＢＬＩ）によって、抗原および抗体の間の生体分子相互作用を直接測定した。試験ＭＩＣＡモノクローナル抗体１Ｆ５および８Ｃ７、ならびに、先にＥＬＩＳＡによって決定されるように、そのうちの１つがアルファ−３ ＭＩＣＡサブドメイン抗原（陽性対照）に結合可能であり、そしてそのうちの一方が結合不能である（陰性対照、他のＭＩＣＡドメインに結合する）２つの対照抗体に関して、リアルタイム動力学的分析を行った。Ｏｃｔｅｔ ＲＥＤ９６装置は、Ｂｉｏ−Ｌａｙｅｒインターフェロメトリーの原理の元に作動し、これは、分子相互作用および複合体形成を測定する標識不含技術である。技術の重要な構成要素は、光学バイオセンサーであり、そのチップを試験ウェルの液体に浸し、そして次いで、これを用いて、光波間の干渉パターンをアッセイする。ここで、リガンド（モノクローナル抗体）は、先に結合した抗マウスＩｇＧによる捕捉を通じてバイオセンサー表面に局在し、一方、分析物生体分子（抗原）は、溶液中に維持される。リガンドおよび分析物間の結合反応を測定し、そしてリアルタイムで報告した。会合および解離動力学の両方を監視し、そしてＫＤ値を計算した。このモデルは、リガンド対分析物の１：１相互作用を仮定した。
[0322]ｐＨ７．４で、陽性対照ＭＩＣＡ抗体に関するアフィニティ定数ＫＤは、約６．０７ｘ１０−９Ｍであった。緊密に結合しない陰性対照ＭＩＣＡ抗体は、約９．６ｘ１０−６ＭのＫＤを有した。２つのＭＩＣＡモノクローナル抗体に関して、クローン１Ｆ５由来の抗体は、約７．８３ｘ１０−１０Ｍの測定されるＫＤを有し、一方、クローン８Ｃ７由来の抗体は、約６．８１ｘ１０−０９Ｍの測定されるＫＤを有した。
[0323]抗原結合ドメインの配列決定。ハイブリドーマ細胞を界面活性剤含有緩衝剤で溶解し、そして標準法によってｍＲＮＡを単離した。５’ＲＡＣＥ（ＲＬＭ−ＲＡＣＥ）、ならびにマウス免疫グロブリン重鎖（ＩｇＧ１）および軽鎖（カッパ）可変領域配列を増幅する遺伝子特異的逆プライマーを用いて、ＲＴ−ＰＣＲを行った。ゲル電気泳動によって反応混合物を分離し、そして特異的ＰＣＲバンドをゲル切除した。精製ＰＣＲ産物をｐＣＲ−Ｂｌｕｎｔ ＩＩ−ＴＯＰＯベクター内にクローニングし、そして構築物を大腸菌内に形質転換した。各鎖の２３のコロニーを摘み取り、そして配列決定前に、増幅された領域の存在に関して、ＰＣＲスクリーニングした。各鎖のＰＣＲ陽性クローン（約８〜１０）を配列決定した。ＢＬＡＳＴによってＤＮＡ配列を分析して、マウス抗体配列に対する相同性を確認した。抗体１Ｆ５の可変領域の配列を図６（Ａ〜Ｈ）に示す。抗体８Ｃ７の可変領域の配列を図７（Ａ〜Ｈ）に示す。
[0324]本発明の特定の態様の前述の説明は、例示および説明の目的のために提示してきている。これらは、包括的であることも、または開示する正確な型に本発明を限定することも意図されず、そして多くの修飾および変動が、上記解説を考慮して可能である。
[0325]本明細書に引用するすべての特許、特許出願、刊行物、および参考文献は、各個々の刊行物または特許出願が、具体的に、そして個々に、本明細書に援用されると示されるのと同じ度合いまで、本明細書に明らかに援用される。
本発明は、非限定的に以下の態様を含む。
［態様１］
（ａ）ＭＩＣＡの細胞外ドメインに特異的に結合するが、全長ＭＩＣＡまたはＭＩＣＡの膜結合型の細胞外ドメインに特異的に結合しない；または
（ｂ）ＭＩＣＢの細胞外ドメインに特異的に結合するが、全長ＭＩＣＢまたはＭＩＣＢの膜結合型の細胞外ドメインに特異的に結合しない
単離抗体。
［態様２］
アルファ−３ドメインを含むＭＩＣＡの可溶性細胞外ドメイン（ｓＭＩＣＡ）に特異的に結合し、そして全長ＭＩＣＡまたはＭＩＣＡの膜結合型の細胞外ドメインに特異的に結合しない、態様１の単離抗体。
［態様３］
アルファ−３ドメインを含むＭＩＣＢの可溶性細胞外ドメイン（ｓＭＩＣＢ）に特異的に結合し、そして全長ＭＩＣＢまたはＭＩＣＢの膜結合型の細胞外ドメインに特異的に結合しない、態様１の単離抗体。
［態様４］
被験体に投与した際、わずかな自己免疫疾患誘導活性を有する、態様２または３の単離抗体。
［態様５］
ｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢの受容体ＮＫＧ２Ｄへの結合に対するわずかなアンタゴニスト活性を有する、態様２または３の単離抗体。
［態様６］
ＭＩＣＡのアルファ−３ドメイン上の潜在性（ｃｒｙｐｔｉｃ）エピトープに特異的に結合する、態様１〜５のいずれか一項の単離抗体。
［態様７］
ＭＩＣＡのアルファ−３ドメインがＭＩＣＡ ＊ ００１アレルのプロセシングされないＭＩＣＡタンパク質のアミノ酸残基２０５〜２９７由来のアミノ酸配列を含む、態様６の単離抗体。
［態様８］
ＭＩＣＢのアルファ−３ドメイン上の潜在性エピトープに特異的に結合する、態様１〜５のいずれか一項の単離抗体。
［態様９］
ＭＩＣＢのアルファ−３ドメインがＭＩＣＢ ＊ ００１アレルのプロセシングされないＭＩＣＢタンパク質のアミノ酸残基２０５〜２９７由来のアミノ酸配列を含む、態様８の単離抗体。
［態様１０］
潜在性エピトープが、ＭＩＣＡのアミノ酸残基１９０〜２５６内にある、態様７の単離抗体。
［態様１１］
ＭＩＣＡの潜在性エピトープが：
（ａ）アミノ酸残基１９０〜１９６；
（ｂ）アミノ酸残基２１７〜２２１；
（ｃ）アミノ酸残基２５０〜２５６；
（ｄ）アミノ酸残基２５１〜２５６；または
（ｅ）アミノ酸残基２３４〜２３８
内の配列を含む、態様１０の単離抗体。
［態様１２］
配列：
１９０＿ＲＳＥＡＳＥＧ＿１９６（配列番号３８）；
２１７＿ＲＱＤＧＶ＿２２１（配列番号３９）；
２３４＿ＬＰＤＧＮ＿２３８（配列番号４０）
２５１＿ＱＧＥＥＱＲ＿２５６（配列番号４１）；または
２５１＿ＲＧＥＥＱＲ＿２５６（配列番号４２）
内のエピトープに特異的に結合する、態様１１の単離抗体。
［態様１３］
潜在性エピトープが、ＭＩＣＢのアミノ酸残基１９０〜２５６内のアミノ酸配列を含む、態様９の単離抗体。
［態様１４］
ＭＩＣＢの潜在性エピトープが：
（ａ）アミノ酸１９０〜１９６；
（ｂ）アミノ酸２１７〜２２１；
（ｃ）アミノ酸２５０〜２５６；または
（ｄ）アミノ酸２３４〜２３８
内の配列を含む、態様１３の単離抗体。
［態様１５］
配列：
１９０＿ＣＳＥＶＳＥＧ＿１９６（配列番号４３）；
２１７＿ＲＱＤＧＶ＿２２１（配列番号４４）；
２３４＿ＬＰＤＧＮ＿２３８（配列番号４５）；または
２５０＿ＲＱＧＥＥＱＲ＿２５６（配列番号４６）
内のエピトープに特異的に結合する、態様１４の単離抗体。
［態様１６］
配列：
（ａ）〜Ｘ Ａ１ −Ｓ−Ｘ Ａ３ −Ｘ Ａ４ −Ｓ−Ｅ−Ｇ〜（配列番号４７）、
式中、Ｘ Ａ１ はＲおよびＣより選択され；Ｘ Ａ３ はＥおよびＫより選択され；そしてＸ Ａ４ はＡおよびＶより選択される；
（ｂ）〜Ｒ−Ｑ−Ｄ−Ｇ−Ｘ Ｂ５ 〜（配列番号４８）、
式中、Ｘ Ｂ５ はＶおよびＬより選択される；
（ｃ）〜Ｘ Ｄ１ −Ｘ Ｄ２ −Ｇ−Ｅ−Ｅ−Ｑ−Ｘ Ｄ７ 〜（配列番号４９）、
式中、Ｘ Ｄ１ はＣまたはＲより選択され；Ｘ Ｄ２ はＱ、ＲおよびＥより選択され；そしてＸ Ｄ７ はＲ、ＳおよびＫより選択される；
（ｄ）〜Ｌ−Ｐ−Ｄ−Ｇ−Ｎ〜（配列番号５０）
内のエピトープに特異的に結合する、態様１１または１４の単離抗体。
［態様１７］
ポリクローナル抗体を含む、態様１〜１６のいずれか一項の単離抗体。
［態様１８］
配列番号２３の軽鎖可変領域アミノ酸配列中のＣＤＲ、および配列番号２７の重鎖可変領域アミノ酸配列中のＣＤＲを含む、態様１の単離抗体。
［態様１９］
アミノ酸配列ＲＡＳＫＳＶＳＴＳＧＹＳＹＭＨ（配列番号８３）を含むＣＤＲ Ｌ１；アミノ酸配列ＲＡＳＮＬＥＳ（配列番号８４）を含むＣＤＲ Ｌ２；アミノ酸配列ＱＨＳＲＥＬＰＬＴ（配列番号８５）を含むＣＤＲ Ｌ３；アミノ酸配列ＤＹＳＶＨ（配列番号８９）、ＧＹＴＦＴＤＹ（配列番号９５）、またはＧＹＴＦＴＤＹＳＶＨ（配列番号９９）を含むＣＤＲ Ｈ１；アミノ酸配列ＷＩＮＴＥＴＧＥＰＴＹＡＤＤＦＫＧ（配列番号９０）、ＮＴＥＴＧ（配列番号９６）、またはＷＩＮＴＥＴＧＥＰ（配列番号１００）を含むＣＤＲ Ｈ２；およびアミノ酸配列ＡＧＧＮＡＦＡＹ（配列番号９１）を含むＣＤＲ Ｈ３を含む、態様１８の単離抗体。
［態様２０］
配列番号２３のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域ＶＬ、および配列番号２７のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域ＶＨを含む、態様１の単離抗体。
［態様２１］
配列番号３１の軽鎖可変領域アミノ酸配列中のＣＤＲ、および配列番号３５の重鎖可変領域アミノ酸配列中のＣＤＲを含む、態様１の単離抗体。
［態様２２］
アミノ酸配列ＲＳＳＫＳＬＬＱＳＮＧＮＴＦＬＹ（配列番号８６）を含むＣＤＲ Ｌ１；アミノ酸配列ＲＭＳＮＬＡＳ（配列番号８７）を含むＣＤＲ Ｌ２；アミノ酸配列ＭＱＨＬＥＹＰＦＴ（配列番号８８）を含むＣＤＲ Ｌ３；アミノ酸配列ＮＹＧＭＮ（配列番号９２）、ＧＹＴＦＴＮＹ（配列番号９７）、またはＧＹＴＦＴＮＹＧＭＮ（配列番号１０１）を含むＣＤＲ Ｈ１；アミノ酸配列ＷＩＮＴＮＴＧＥＰＴＹＡＥＥＦＫＧ（配列番号９３）、ＮＴＮＴＧ（配列番号９８）、またはＷＩＮＴＮＴＧＥＰ（配列番号１０２）を含むＣＤＲ Ｈ２；およびアミノ酸配列ＳＧＧＳＳＰＦＡＹ（配列番号９４）を含むＣＤＲ Ｈ３を含む、態様２１の単離抗体。
［態様２３］
配列番号３１のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域ＶＬ、および配列番号３５のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域ＶＨを含む、態様１の単離抗体。
［態様２４］
モノクローナル抗体を含む、態様１〜１６および１８〜２３のいずれか一項の単離抗体。
［態様２５］
キメラ抗体を含む、態様１〜２４のいずれか一項の単離抗体。
［態様２６］
ヒト化抗体を含む、態様１〜２５のいずれか一項の単離抗体。
［態様２７］
全長ヒト抗体を含む、態様１〜２４のいずれか一項の単離抗体。
［態様２８］
抗体断片を含む、態様１〜２５のいずれか一項の単離抗体。
［態様２９］
精製抗体を含む、態様１〜２８のいずれか一項の単離抗体。
［態様３０］
検出可能標識で標識されている、態様１〜２９のいずれか一項の抗体。
［態様３１］
態様１〜２９のいずれか一項の単離抗体、および薬学的に許容されうるキャリアーを含む、薬学的組成物。
［態様３２］
ｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢのレベルを減少させる方法であって、必要とする被験体に、態様１〜２９のいずれか一項の抗体の有効量を投与することによる、前記方法。
［態様３３］
上昇したレベルのｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢによって特徴付けられる疾患または障害を有する被験体を治療する方法であって、態様１〜２９のいずれか一項の抗体の療法的有効量を投与する工程を含む、前記方法。
［態様３４］
疾患または障害が、ＭＩＣ ＋ 上皮細胞腫瘍、あるいはｓＭＩＣＡまたはｓＭＩＣＢ上昇によって特徴付けられる造血悪性腫瘍より選択される、態様３３の方法。
［態様３５］
上皮細胞腫瘍が、肺、乳房、胃、結腸、卵巣、腎細胞、または前立腺癌腫、あるいは黒色腫を含む、態様３４の方法。
［態様３６］
造血悪性腫瘍が、急性リンパ芽球性白血病（ＡＬＬ）、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）、慢性リンパ球性白血病（ＣＬＬ）、慢性骨髄性白血病（ＣＭＬ）、急性単球性白血病（ＡＭｏｌ）；リンパ腫、例えばホジキンリンパ腫、および非ホジキンリンパ腫；または多発性骨髄腫を含む、態様３４の方法。
［態様３７］
ｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢレベル上昇によって特徴付けられるウイルス感染に罹患した被験体を治療する方法であって、必要な被験体に、態様１〜２９のいずれか一項の抗体の療法的有効量を投与する工程を含む、前記方法。
［態様３８］
ウイルス感染が、呼吸器合胞体ウイルス（ＲＳＶ）または１型ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ−１）での感染である、態様３７の方法。

Claims (27)

  1. （ａ）ＭＩＣＡの細胞外ドメインに特異的に結合するが、ＭＩＣＡの膜結合型の細胞外ドメインに特異的に結合しない；または
    （ｂ）ＭＩＣＢの細胞外ドメインに特異的に結合するが、ＭＩＣＢの膜結合型の細胞外ドメインに特異的に結合しない
    単離抗体。
  2. アルファ−３ドメインを含むＭＩＣＢの可溶性細胞外ドメイン（ｓＭＩＣＢ）に特異的に結合し、そしてＭＩＣＢの膜結合型の細胞外ドメインに特異的に結合しない、請求項１の単離抗体。
  3. ＭＩＣＢのアルファ−３ドメイン上のエピトープに特異的に結合する、請求項２の単離抗体。
  4. ｓＭＩＣＢアルファ−３ドメインのアミノ酸残基２４３−２７４内のエピトープに特異的に結合する、請求項３の単離抗体。
  5. アルファ−３ドメインを含むＭＩＣＡの可溶性細胞外ドメイン（ｓＭＩＣＡ）に特異的に結合し、そしてＭＩＣＡの膜結合型の細胞外ドメインに特異的に結合しない、請求項１の単離抗体。
  6. ＭＩＣＡのアルファ−３ドメイン上のエピトープに特異的に結合する、請求項５の単離抗体。
  7. ｓＭＩＣＡアルファ−３ドメインのアミノ酸残基２４３−２７４内のエピトープに特異的に結合する、請求項６の単離抗体。
  8. ポリクローナル抗体を含む、請求項１〜７のいずれか一項の単離抗体。
  9. 配列番号２３の軽鎖可変領域アミノ酸配列中のＣＤＲ Ｌ１、ＣＤＲ Ｌ２、およびＣＤＲ Ｌ３、並びに、配列番号２７の重鎖可変領域アミノ酸配列中のＣＤＲ Ｈ１、ＣＤＲ Ｈ２、およびＣＤＲ Ｈ３を含む、請求項１の単離抗体。
  10. アミノ酸配列ＲＡＳＫＳＶＳＴＳＧＹＳＹＭＨ（配列番号８３）を含むＣＤＲ Ｌ１；アミノ酸配列ＲＡＳＮＬＥＳ（配列番号８４）を含むＣＤＲ Ｌ２；アミノ酸配列ＱＨＳＲＥＬＰＬＴ（配列番号８５）を含むＣＤＲ Ｌ３；アミノ酸配列ＤＹＳＶＨ（配列番号８９）、ＧＹＴＦＴＤＹ（配列番号９５）、またはＧＹＴＦＴＤＹＳＶＨ（配列番号９９）を含むＣＤＲ Ｈ１；アミノ酸配列ＷＩＮＴＥＴＧＥＰＴＹＡＤＤＦＫＧ（配列番号９０）、ＮＴＥＴＧ（配列番号９６）、またはＷＩＮＴＥＴＧＥＰ（配列番号１００）を含むＣＤＲ Ｈ２；およびアミノ酸配列ＡＧＧＮＡＦＡＹ（配列番号９１）を含むＣＤＲ Ｈ３を含む、請求項９の単離抗体。
  11. 配列番号２３のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域ＶＬ、および配列番号２７のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域ＶＨを含む、請求項１の単離抗体。
  12. 配列番号３１の軽鎖可変領域アミノ酸配列中のＣＤＲ Ｌ１、ＣＤＲ Ｌ２、およびＣＤＲ Ｌ３、並びに、配列番号３５の重鎖可変領域アミノ酸配列中のＣＤＲ Ｈ１、ＣＤＲ Ｈ２、およびＣＤＲ Ｈ３を含む、請求項１の単離抗体。
  13. アミノ酸配列ＲＳＳＫＳＬＬＱＳＮＧＮＴＦＬＹ（配列番号８６）を含むＣＤＲ Ｌ１；アミノ酸配列ＲＭＳＮＬＡＳ（配列番号８７）を含むＣＤＲ Ｌ２；アミノ酸配列ＭＱＨＬＥＹＰＦＴ（配列番号８８）を含むＣＤＲ Ｌ３；アミノ酸配列ＮＹＧＭＮ（配列番号９２）、ＧＹＴＦＴＮＹ（配列番号９７）、またはＧＹＴＦＴＮＹＧＭＮ（配列番号１０１）を含むＣＤＲ Ｈ１；アミノ酸配列ＷＩＮＴＮＴＧＥＰＴＹＡＥＥＦＫＧ（配列番号９３）、ＮＴＮＴＧ（配列番号９８）、またはＷＩＮＴＮＴＧＥＰ（配列番号１０２）を含むＣＤＲ Ｈ２；およびアミノ酸配列ＳＧＧＳＳＰＦＡＹ（配列番号９４）を含むＣＤＲ Ｈ３を含む、請求項１２の単離抗体。
  14. 配列番号３１のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域ＶＬ、および配列番号３５のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域ＶＨを含む、請求項１の単離抗体。
  15. 配列番号２３のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域ＶＬおよび配列番号２７のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域ＶＨを有する抗体によって結合されるエピトープへのの結合に関して競合する、請求項１〜７のいずれか一項の単離抗体。
  16. 配列番号３１のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域ＶＬおよび配列番号３５のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域ＶＨを有する抗体によって結合されるエピトープへのの結合に関して競合する、請求項１〜７のいずれか一項の単離抗体。
  17. モノクローナル抗体を含む、請求項１〜７および９〜１６のいずれか一項の単離抗体。
  18. キメラ抗体を含む、請求項１〜１７のいずれか一項の単離抗体。
  19. ヒト化抗体を含む、請求項１〜１７のいずれか一項の単離抗体。
  20. 全長ヒト抗体を含む、請求項１〜１７のいずれか一項の単離抗体。
  21. 抗体断片を含む、請求項１〜１７のいずれか一項の単離抗体。
  22. 請求項１〜２１のいずれか一項の単離抗体、および薬学的に許容されうるキャリアーを含む、薬学的組成物。
  23. 被験体中のｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢの上昇したレベルを減少させるために使用される、請求項２２の薬学的組成物。
  24. 上昇したレベルのｓＭＩＣＡおよび／またはｓＭＩＣＢによって特徴付けられる疾患または障害を治療するために使用される、請求項２２の薬学的組成物。
  25. 疾患または障害が、ＭＩＣ ＋ 癌、あるいはｓＭＩＣＡまたはｓＭＩＣＢ上昇によって特徴付けられる造血悪性腫瘍より選択される、請求項２４の薬学的組成物。
  26. 癌が、肺癌、乳癌、胃癌、結腸癌、卵巣癌、腎癌、または前立腺癌、あるいは黒色腫を含む、請求項２５の薬学的組成物。
  27. 造血悪性腫瘍が、急性リンパ芽球性白血病（ＡＬＬ）、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）、慢性リンパ球性白血病（ＣＬＬ）、慢性骨髄性白血病（ＣＭＬ）、急性単球性白血病（ＡＭｏｌ）；リンパ腫、例えばホジキンリンパ腫、および非ホジキンリンパ腫；または多発性骨髄腫を含む、請求項２５の薬学的組成物。
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