JP5360960B2 - 組換え植物における目的遺伝子産物の高生産方法 - Google Patents
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Description
[1]以下の(a)〜(c)のいずれかのDNAからなる、ターミネーター。
(a)配列番号3で示される塩基配列からなるDNA
(b)配列番号2の塩基番号1から、塩基番号450〜550のいずれかまでの塩基配列からなり、かつ、ノパリン合成酵素遺伝子ターミネーターと比較して、その上流に連結された遺伝子の発現産物量を増加させるターミネーター機能を有するDNA
(c)前記(a)又は(b)のDNAの塩基配列において1若しくは数個の塩基が欠失、置換若しくは付加された塩基配列からなり、かつ、ノパリン合成酵素遺伝子ターミネーターと比較して、その上流に連結された遺伝子の発現産物量を増加させるターミネーター機能を有するDNA
[2]プロモーター及び遺伝子挿入部位の下流に連結された上記[1]に記載のターミネーターを含む、発現ベクター。
[3]プロモーターが植物プロモーターである、上記[2]に記載の発現ベクター。
[4]プロモーターがカリフラワーモザイクウイルス35Sプロモーターである、上記[2]に記載の発現ベクター。
[5]遺伝子挿入部位に挿入された遺伝子をさらに含む、上記[2]〜[4]に記載の発現ベクター。
[6]遺伝子の下流に連結された上記[1]に記載のターミネーターを含む、DNA構築物。
[7]前記ターミネーターが、プロモーター及びその制御下に配置された遺伝子の下流に連結されている、上記[6]に記載のDNA構築物。
[8]プロモーターが植物プロモーターである、上記[7]に記載のDNA構築物。
[9]プロモーターがカリフラワーモザイクウイルス35Sプロモーターである、上記[7]に記載のDNA構築物。
[10]上記[2]〜[5]に記載の発現ベクター又は上記[7]〜[9]に記載のDNA構築物を含む、形質転換体。
[11]形質転換植物である、上記[10]に記載の形質転換体。
[12]上記[5]に記載の発現ベクター、又は上記[7]〜[9]に記載のDNA構築物を植物細胞に導入することを特徴とする、植物において前記遺伝子の遺伝子産物を組換え生産させる方法。
1.本発明に係るミラクリン遺伝子ターミネーターとその取得
本発明は、ミラクリンタンパク質をコードする遺伝子(ミラクリン遺伝子)のターミネーター領域内の配列を含むDNA断片が、ターミネーター機能として、転写終結機能と共に、その制御下にある遺伝子から発現される遺伝子産物の生産量を効果的に向上させる発現量調節的な機能を有するという驚くべき知見に基づくものである。
(a)配列番号3で示される塩基配列からなるDNA。この配列番号3で示される塩基配列は、ミラクルフルーツ(Richadella dulcifica)からミラクリン遺伝子のターミネーター領域として単離されたDNA断片の塩基配列(配列番号2)中の、塩基番号1から塩基番号507までの塩基配列に相当する。
(b)配列番号2の塩基番号1から始まり、塩基番号450〜550のいずれかまで(より好ましくは、塩基番号480〜530のいずれかまで、さらに好ましくは塩基番号500〜510のいずれかまで)の塩基配列からなり、かつ、ノパリン合成酵素遺伝子ターミネーター(Tnos)と比較して、その上流に連結された遺伝子の発現産物量を増加させるターミネーター機能を有するDNA。
(c)前記(a)又は(b)のDNAの塩基配列において1若しくは複数個(2〜40個、好ましくは数個(2〜9個))の塩基が欠失、置換若しくは付加された塩基配列からなり、かつ、ノパリン合成酵素遺伝子ターミネーター(Tnos)と比較して、その上流に連結された遺伝子の発現産物量を増加させるターミネーター機能を有するDNA。
本発明は、本発明に係るミラクリン遺伝子ターミネーターを組み込んだベクターも提供する。本発明に係るミラクリン遺伝子ターミネーターは、任意の組換えベクター中にクローニングすることにより容易に複製可能な形態とすることができる。
以上のようにして得られる本発明に係る発現ベクター又はDNA構築物を導入した形質転換細胞又は形質転換植物は、目的の遺伝子の遺伝子産物(mRNA、rRNA等のRNA、又はタンパク質)を効率よく生産し、好ましくは蓄積することができる。本発明に係る発現ベクター又はDNA構築物を導入した形質転換細胞又は形質転換植物は、特に、プロモーターとその制御下にある目的の遺伝子の下流にノパリン合成酵素遺伝子ターミネーターを連結させたDNA構築物又はそれを含む発現ベクターを導入した形質転換植物における遺伝子発現と比較して、目的の遺伝子の遺伝子産物をより高生産することができる。この形質転換細胞又は形質転換植物においては、例えば目的の遺伝子から発現される遺伝子産物が酵素である場合には、その酵素活性を測定することによって当該遺伝子の発現産物量を測定することができる。
[実施例1]ミラクリン遺伝子の転写調節領域(プロモーター領域及びターミネーター領域)の単離
(1)DNAの抽出
ミラクルフルーツ(Richadella dulcifica)の葉からCTAB法にてゲノムDNAの抽出を行った。乳鉢に5gのミラクルフルーツの葉を入れ、液体窒素を加えて完全にすりつぶし、50mLのチューブに移した。これに10mLの3% CTAB 溶液(100mM Tris-HCl pH8.0、20mM EDTA、1.4M NaCl、3%[w/v] CTAB)を加え混和した後、65℃で30分間保温した。10mLのクロロフォルム/イソアミルアルコール(24:1)を加え、5分間穏やかに攪拌して、遠心分離(10,000回転、20分、室温)を行った。上層の水層を新しいチューブに回収し、同様にクロロフォルム/イソアミルアルコール(24:1)抽出を行い、水層を回収した。次に10mLの冷イソプロピルアルコールを加え、穏やかに転倒混和し、糸状に析出したゲノムDNAを滅菌したガラス棒で巻き取り、5mLの70%冷エタノールを入れたチューブに移して5分間洗浄した。ゲノムDNAが巻きついたガラス棒を引き上げ、ゲノムDNAを乾燥させ、1mLのRNaseA (10μg/mL)に入れ37℃で2時間処理した。1mLのフェノール/クロロフォルム/イソアミルアルコール(25:24:1)を加え、5分間穏やかに撹拌して遠心分離(10,000回転、20分、室温)し、上層の水層を新しいチューブに移した。1mLのイソプロピルアルコールを加え、穏やかに転倒混和し、糸状に析出してきたゲノムDNAをガラス棒で巻き取った。これを5mLの70%エタノールを入れたチューブに移して5分間洗浄後、ガラス棒ごとゲノムDNAを引き上げて乾燥し、0.4mLの滅菌水に溶解した。単離したゲノムDNAは50倍希釈して、分光光度計で濃度を測定した(O.D.260=50μg/mL)。
次に、上記(1)で単離したミラクルフルーツ由来ゲノムDNAを用いて、アダプター付きDNAライブラリーを作製した。
このため、まずアダプターの作製を行った。アダプターはADL(48mer:5'-GTA ATA CGA CTC ACT ATA GGG CAC GCG TGG TCG ACG GCC CGG GCT GGT-3'(配列番号4))とADS(8mer:5'-ACC AGC CC-NH2-3')とを6:1の比率(112.7μg:18.6μg)で混合し、65℃で5分、37℃で10分アニールさせることにより作製した(75.9μl;100 pmol/μl)。
ミラクリン遺伝子のプロモーター領域及びターミネーター領域のクローニングは、ゲノムウォーキングのための改良型PCR法(Siebert et al., Nucl Acids Res (1995) 23, p.1087-1088)により行った。このPCRには、アダプター特異的プライマーAP1:5'-CCA TCC TAA TAC GAC TCA CTA TAG GGC-3'(配列番号5)、AP2:5'-CTA TAG GGC ACG CGT GGT-3'(配列番号6)およびミラクリン遺伝子特異的プライマーF1/458:5'-ACC CAG GTC CCG AAA CCA TTA GTA GCT-3'(配列番号7)、F2/551:5'-GTT CCT GCA AAG TAA AAT GCG GAG ATG-3'(配列番号8)、R1/248:5'-ACA ACT CTG GGT GGA CAA ACG AAG CTG CCG TT-3'(配列番号9)、R1/139:5'-GGA GTT TCT CTC CGT CTA TGT CAA GAA CCG GAT TG-3'(配列番号10)、R2/101:5'-GCC GAA TCC GCT GCA CTA AGC AGT GGT TT-3'(配列番号11)の7つのプライマーを下記の通りに組み合わせて用いた。なおミラクリン遺伝子の上流領域(5'側)の単離にはプライマーR1又はR2を、下流領域(3'側)の単離にはプライマーF1又はF2を用いた。ミラクリン遺伝子特異的プライマーは、既知のミラクリン遺伝子の塩基配列(非特許文献6)に基づいて設計した。
(1)ベクターの改変
単離したミラクリン遺伝子のプロモーター領域及びターミネーター領域をそれぞれ植物発現用に慣用されているバイナリーベクターpBI121中にクローニングするため、まず、pBI121のプロモーター配列中のクローニングサイトにXhoIとKpnI部位を付加する改変を行った。HindIII、XhoI、及びKpnI認識配列(大文字の配列部分)を付加したプライマーpBI121-F-HXK:5'-TTT AAG CTT CTC GAG GGT ACC gca tgc ctg cag gtc-3'(配列番号12)と、XbaI認識部位(大文字の配列部分)を付加したプライマーpBI121-R-X:5'-TTT TCT AGA gtc ccc cgt gtt ctc tcc-3'(配列番号13)を用いて、pBI121(TOYOBO;Chen et al.,Mol Breed (2003) 11, p.287-293;GenBankアクセッション番号AF485783)を鋳型としてPCRを行い、増幅断片をpGEM(R)-T Easy Vector System I (Promega) のプロトコルに従いクローニングし、塩基配列の決定を行った。次いで、得られた増幅断片とベクターpBI121をそれぞれHindIIIとXbaIで処理し、pBI121中の35Sプロモーター配列を増幅断片で置換することにより、XhoIとKpnI部位が付加された35Sプロモーター配列を有するように改変された植物発現ベクターを作製した。この改変ベクターをpBI121HXKと名付けた。
上記でクローニングしたプロモーター領域由来の異なるサイズのプロモーター配列を導入したベクターを作製した。まず、実施例1でクローニングしたプロモーター領域のDNA断片を鋳型とし、3'側プライマーとしてXbaI-T-MIR(5'-TTT TCT AGA TGT TGT AGA GAC TAT AGG GCT-3';配列番号14)を、5'側プライマーとして以下の各プライマーを組み合わせてPCRを行った。PCRのサイクル条件は、2224bpのミラクリン遺伝子プロモーター配列増幅のために94℃で30秒(変性)、50℃で25秒(アニーリング)、続いて68℃で150秒(伸長反応)を1サイクルとして、計35サイクルで実施した。また、1512bpおよび1012bpのミラクリン遺伝子プロモーター配列増幅のためには、PCRのサイクル条件は、94℃で30秒(変性)、55℃で25秒、続いて68℃で90秒(伸長反応)を1サイクルとして、計35サイクルで実施した。さらに、PCRのサイクル条件は、510bpのミラクリン遺伝子プロモーター配列増幅のためには、94℃で30秒(変性)、55℃で25秒、続いて68℃で40秒(伸長反応)を1サイクルとして、計35サイクルで実施した。なお各プライマー名に付記した増幅サイズは、プライマーXbaI-T-MIRと組み合わせたPCRで増幅することができる本願のプロモーター領域内の配列(プロモーター配列)のサイズであり、これはXbaI-T-MIR中のXbaI部位の配列を含まない。
1) プライマーP-1/F(増幅サイズ:2224bp):
5'-TTT CTC GAG GAT ATC ATT ATA ATA GTG TGT-3'(配列番号15)
2) プライマーP-4/F(増幅サイズ:1512bp):
5'-TTT CTC GAG TTA CCA AAC GCT CAA AAA TAA CAG-3'(配列番号16)
3) プライマーP-7/F(増幅サイズ:1012bp):
5'-TTT CTC GAG TGA CTT AGG ACT TTA ATT TCA CTA-3'(配列番号17)
4) プライマーP-10/F(増幅サイズ:510bp):
5'-TTT CTC GAG ACT TGG GTT AGT TTG GGT-3'(配列番号18)。
それぞれの増幅サイズ(2224bp、1512bp、1012bp、510bp)のPCR産物を、pGEM(R)-T Easy Vector System I(Promega)のプロトコルに従ってクローニングし、塩基配列を確認した。
507bpのミラクリン遺伝子ターミネーター配列の増幅のために、プライマーEcoRI-T-2:5'-TTT GAA TTC CTA CAA CGT TAC GAA ACG-3'(配列番号19)と、プライマーSacI-P-MIR:5'-TTT GAG CTC TTG GGT TTG GGG GTG GTT TTT CCA-3'(配列番号20)を、一方、1085bpのターミネーター配列の増幅のためにプライマーEcoRI-T-5:5'-TTT GAA TTC GTC GCT GAA TAA AGG-3'(配列番号21)と、プライマーSacI-P-MIR:5'-TTT GAG CTC TTG GGT TTG GGG GTG GTT TTT CCA-3'(配列番号20)を、それぞれ組み合わせて、実施例1でクローニングしたターミネーター領域のDNA断片を鋳型としてPCRを行った。PCRのサイクル条件は、507bpのミラクリン遺伝子ターミネーター配列増幅のために94℃で30秒(変性)、55℃で25秒(アニーリング)、続いて68℃で40秒(伸長反応)を1サイクルとして、計35サイクルで実施した。また1085bpのミラクリン遺伝子ターミネーター配列増幅のためには、PCRのサイクル条件は、94℃で30秒(変性)、50℃で25秒、続いて68℃で80秒(伸長反応)を1サイクルとして、計35サイクルで実施した。得られたPCR産物は、GEMR-T Easy Vector System I(Promega)のプロトコルに従ってクローニングし、塩基配列の確認を行った。クローニングした507bpと1085bpのターミネーター配列のDNA断片を、上記で作製したベクターpBI121HXKのSacIとEcoRIの間に導入し(すなわちノパリン合成酵素遺伝子ターミネーター配列(Tnos)を置換し)、それぞれ、pBI121HXK/T0.5、pBI121HXK/T1.1と名付けた。この2つのベクターpBI121HXK/T0.5、pBI121HXK/T1.1及びpBI121HXKベクター(対照)のXhoIとXbaI部位に、さらに、上記(2)でクローニングした異なるサイズのミラクリン遺伝子プロモーター配列をそれぞれ導入し、植物発現ベクターを作製した。
1) P2.2/T1.1:
ミラクリン遺伝子プロモーター配列(2224bp;P2.2と称する;配列番号1の塩基番号1〜2224)の下流に、β-グルクロニダーゼ(GUS)遺伝子、次いでミラクリン遺伝子ターミネーター配列(1085bp;T1.1と称する;配列番号2の塩基番号1〜1085)が連結されている。
ミラクリン遺伝子プロモーター配列(2224bp;P2.2と称する;配列番号1の塩基番号1〜2224)の下流に、GUS遺伝子、次いでノパリン合成酵素遺伝子ターミネーター(Tnos)が連結されている。
ミラクリン遺伝子プロモーター配列(2224bp;P2.2と称する;配列番号1の塩基番号1〜2224)の下流に、GUS遺伝子、次いでミラクリン遺伝子ターミネーター配列(507bp;T0.5と称する;配列番号2の塩基番号1〜507)が連結されている。
ミラクリン遺伝子プロモーター配列(1512bp;P1.5と称する;配列番号1の塩基番号713〜2224)の下流に、GUS遺伝子、次いでミラクリン遺伝子ターミネーター配列(1085bp;T1.1と称する;配列番号2の塩基番号1〜1085)が連結されている。
ミラクリン遺伝子プロモーター配列(1012bp;P1.0と称する;配列番号1の塩基番号1213〜2224)の下流に、GUS遺伝子、次いでミラクリン遺伝子ターミネーター配列(1085bp;T1.1と称する;配列番号2の塩基番号1〜1085)が連結されている。
ミラクリン遺伝子プロモーター配列(510bp;P0.5と称する;配列番号1の塩基番号1715〜2224)の下流に、GUS遺伝子、次いでミラクリン遺伝子ターミネーター配列(1085bp;T1.1と称する;配列番号2の塩基番号1〜1085)が連結されている。
カリフラワーモザイクウイルス35Sプロモーターの下流に、GUS遺伝子、次いでミラクリン遺伝子ターミネーター配列(1085bp;T1.1と称する;配列番号2の塩基番号1〜1085)が連結されている。
カリフラワーモザイクウイルス35Sプロモーターの下流に、GUS遺伝子、次いでミラクリン遺伝子ターミネーター配列(507bp;T0.5と称する;配列番号3;配列番号2の塩基番号1〜507に相当する)が連結されている。
ベクターpBI121HXK中に含まれる核酸構築物(対照用)。カリフラワーモザイクウイルス(CaMV)35Sプロモーター(以下、35Sプロモーターと称する)の下流に、GUS遺伝子、次いでノパリン合成酵素遺伝子ターミネーター(Tnos)が連結されている。
トマト(Solanum lycopersicum)の形質転換は、実施例2で作製した植物発現ベクターを各々導入したアグロバクテリウムC58C1RifR株を用いて、Sun et al.(Plant Cell Physiol., (2006) 47, p.426-431)の方法に従って以下の手順で行った。まず、無菌播種したトマト子葉を、葉脈に垂直に切断し一枚の子葉から2切片を作った。葉切片をアグロバクテリウム懸濁液(MS培地に100μMのアセトシリンゴンと、40μMのメルカプトルエタノールを加えたものを使用)に浸し、10分間感染させた後、懸濁液を除き、共存培地(MS培地、3%ショ糖、0.3%ゲルライト、1.5mg/lゼアチン、pH 5.8)に葉の表が下になるように並べた。シャーレをアルミホイルで完全に包み、25℃の培養室で3〜4日共存培養を行った。その後、選抜培地(MS培地、3%ショ糖、0.3%ゲルライト、1.5mg/lゼアチン、100mg/l カナマイシン、pH5.8)に葉の表が上になるように移し替え、2〜3週間毎に新しい選抜培地に移しながら、25℃、16時間日長で培養した。子葉片からカルスが形成されたら、シュートの生長を速めるためゼアチンの濃度を1mg/Lに下げた。カルスから葉が出てきたら、子葉切片部分から切り落とし、それを新しい培地に移した。伸長したシュートの葉は、根元で切り取り、発根培地(1/2 MS培地、1.5%ショ糖、0.3%ゲルライト、50mg/l カナマイシン)に移した。発根培地で2週間以内に発根した個体を形質転換体の候補として選抜し、順化した。
配列番号2:ミラクリン遺伝子のターミネーター領域
配列番号3:ミラクリン遺伝子のターミネーターT0.5
配列番号4:アダプターADL
配列番号5:プライマーAP1
配列番号6:プライマーAP2
配列番号7:プライマーF1/458
配列番号8:プライマーF2/551
配列番号9:プライマーR1/248
配列番号10:プライマーR1/139
配列番号11:プライマーR2/101
配列番号12:プライマーpBI121-F-HXK、塩基番号1〜21はHindIII、XhoI及びKpnI部位
配列番号13:プライマーpBI121-R-HXK、塩基番号1〜9はXbaI部位
配列番号14:プロモーター・プライマーXbaI-T-MIR
配列番号15:プライマーP-1/F
配列番号16:プライマーP-4/F
配列番号17:プライマーP-7/F
配列番号18:プライマーP-10/F
配列番号19:プライマー EcoRI-T-2
配列番号20:ターミネーター・プライマーSacI-P-MIR
配列番号21:プライマー EcoRI-T-5
Claims (12)
- 以下の(a)〜(c)のいずれかのDNAからなる、ターミネーター。
(a)配列番号3で示される塩基配列からなるDNA
(b)配列番号2の塩基番号1から、塩基番号450〜550のいずれかまでの塩基配列からなり、かつ、ノパリン合成酵素遺伝子ターミネーターと比較して、その上流に連結された遺伝子の発現産物量を増加させるターミネーター機能を有するDNA
(c)前記(a)又は(b)のDNAの塩基配列において1若しくは数個の塩基が欠失、置換若しくは付加された塩基配列からなり、かつ、ノパリン合成酵素遺伝子ターミネーターと比較して、その上流に連結された遺伝子の発現産物量を増加させるターミネーター機能を有するDNA - プロモーター及び遺伝子挿入部位の下流に連結された請求項1に記載のターミネーターを含む、発現ベクター。
- プロモーターが植物プロモーターである、請求項2に記載の発現ベクター。
- プロモーターがカリフラワーモザイクウイルス35Sプロモーターである、請求項2に記載の発現ベクター。
- 遺伝子挿入部位に挿入された遺伝子をさらに含む、請求項2〜4のいずれか1項に記載の発現ベクター。
- 遺伝子の下流に連結された請求項1に記載のターミネーターを含む、DNA構築物。
- 前記ターミネーターが、プロモーター及びその制御下に配置された遺伝子の下流に連結されている、請求項6に記載のDNA構築物。
- プロモーターが植物プロモーターである、請求項7に記載のDNA構築物。
- プロモーターがカリフラワーモザイクウイルス35Sプロモーターである、請求項7に記載のDNA構築物。
- 請求項2〜5のいずれか1項に記載の発現ベクター又は請求項7〜9のいずれか1項に記載のDNA構築物を含む、形質転換体。
- 形質転換植物である、請求項10に記載の形質転換体。
- 請求項5に記載の発現ベクター、又は請求項7〜9のいずれか1項に記載のDNA構築物を植物細胞に導入することを特徴とする、植物において前記遺伝子の遺伝子産物を組換え生産させる方法。
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