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JP2022545585A - 新規の抗ｃｄ３９抗体 - Google Patents

新規の抗ｃｄ３９抗体 Download PDF

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JP2022545585A
JP2022545585A JP2020572398A JP2020572398A JP2022545585A JP 2022545585 A JP2022545585 A JP 2022545585A JP 2020572398 A JP2020572398 A JP 2020572398A JP 2020572398 A JP2020572398 A JP 2020572398A JP 2022545585 A JP2022545585 A JP 2022545585A
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スン，メイリン
シン，ロウメイ
シュー，ダン
シ，ユーフェイ
チャオ，ジンフェン
ドゥ，チンリン
ウー，チーハオ
ガオ，ルイ
アーチ，ロバート・エイチ
ルー，ホンタオ
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エルピサイエンス（スーチョウ）・バイオファーマ，リミテッド
エルピサイエンス・バイオファーマ，リミテッド
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Abstract

本開示は、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片、これらをコードする単離されたポリヌクレオチド、これらを含む医薬組成物、およびそれらの使用を提供する。

Description

[001]本開示は一般に、新規の抗ＣＤ３９抗体に関する。
[002]ＣＤ３９は、エクト－ヌクレオシドトリホスフェートジホスホヒドロラーゼ１（ＥＮＴＰＤアーゼ１）としても知られている、ＡＴＰまたはＡＤＰをＡＭＰに変換する内在性膜タンパク質であり、次いでＣＤ７３がＡＭＰを脱ホスホリル化してアデノシンに変換する。アデノシンは強力な免疫抑制剤であり、ＣＤ４、ＣＤ８Ｔ細胞、およびナチュラルキラー（ＮＫ）細胞の表面においてアデノシン受容体（たとえばＡ２Ａ受容体）に結合し、Ｔ細胞およびＮＫ細胞の応答を阻害して、それにより免疫系を抑制する。アデノシンはまた、マクロファージおよび樹状細胞の上のＡ２ＡおよびＡ２Ｂ受容体に結合し、ファゴサイトーシスおよび抗原提示を阻害し、ＶＥＧＦ、ＴＧＦｂ、およびＩＬ－６等の腫瘍促進因子の分泌を増加させる。ＣＤ３９およびＣＤ７３の酵素活性は、ＡＤＰおよびＡＴＰのＡＭＰへの変換、ならびにＡＭＰのアデノシンへの変換のそれぞれを通して免疫細胞に送達されるプリン作動性シグナルの持続期間、規模、および化学的性質の調整に重要な役割を果たしている（Ｌｕｃａ Ａｎｔｏｎｉｏｌｉ ｅｔ ａｌ．，Ｔｒｅｎｄｓ Ｍｏｌ Ｍｅｄ．２０１３ Ｊｕｎ；１９（６）：３５５－３６７）。ＣＤ３９およびＣＤ７３によって媒介されるアデノシンレベルの増加は免疫抑制性環境を生成し、それによりがんの発生および進行が促進される。
[003]新規の抗ＣＤ３９抗体へのニーズが依然としてある。
[004]本開示を通して、冠詞「ａ」、「ａｎ」、および「ｔｈｅ」は、本明細書において、その冠詞の文法的目的物の１つまたはそれ超（即ち、少なくとも１つ）を意味するために用いられる。例として、「抗体」は１つの抗体または２つ以上の抗体を意味する。
[005]１つの観点では、本開示は、ヒトＣＤ３９に特異的に結合することができる抗体またはその抗原結合性断片であって、ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含む重鎖可変領域ならびに／またはＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域を含み、
ａ）ＨＣＤＲ１が、ＮＹＧＭＮ（配列番号１）、ＫＹＷＭＮ（配列番号２）、ＮＹＷＭＮ（配列番号３）、ＤＴＦＬＨ（配列番号４）、ＤＹＮＭＹ（配列番号５）、ＤＴＹＶＨ（配列番号６）からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
ｂ）ＨＣＤＲ２が、ＬＩＮＴＹＴＧＥＰＴＹＡＤＤＦＫＤ（配列番号７）、ＥＩＲＬＫＳＮＫＹＧＴＨＹＡＥＳＶＫＧ（配列番号８）、ＱＩＲＬＮＰＤＮＹＡＴＨＸ１ＡＥＳＶＫＧ（配列番号９）、Ｘ５８ＩＤＰＡＸ５９Ｘ６０ＮＩＫＹＤＰＫＦＱＧ（配列番号１５１）、ＦＩＤＰＹＮＧＹＴＳＹＮＱＫＦＫＧ（配列番号１１）、ＲＩＤＰＡＩＤＮＳＫＹＤＰＫＦＱＧ（配列番号１２）からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
ｃ）ＨＣＤＲ３が、ＫＧＩＹＹＤＹＶＷＦＦＤＶ（配列番号１３）、ＱＬＤＬＹＷＦＦＤＶ（配列番号１４）、ＨＧＸ２ＲＧＦＡＹ（配列番号１５）、ＳＰＹＹＹＧＳＧＹＲＩＦＤＶ（配列番号１６）、ＩＹＧＹＤＤＡＹＹＦＤＹ（配列番号１７）、ＹＹＣＡＬＹＤＧＹＮＶＹＡＭＤＹ（配列番号１８）からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
ｄ）ＬＣＤＲ１が、ＫＡＳＱＤＩＮＲＹＩＡ（配列番号１９）、ＲＡＳＱＳＩＳＤＹＬＨ（配列番号２０）、ＫＳＳＱＳＬＬＤＳＤＧＲＴＨＬＮ（配列番号２１）、ＳＡＦＳＳＶＮＹＭＨ（配列番号２２）、ＳＡＴＳＳＶＳＹＭＨ（配列番号２３）、ＲＳＳＫＮＬＬＨＳＮＧＩＴＹＬＹ（配列番号２４）からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
ｅ）ＬＣＤＲ２が、ＹＴＳＴＬＬＰ（配列番号２５）、ＹＡＳＱＳＩＳ（配列番号２６）、ＬＶＳＫＬＤＳ（配列番号２７）、ＴＴＳＮＬＡＳ（配列番号２８）、ＳＴＳＮＬＡＳ（配列番号２９）、ＲＡＳＴＬＡＳ（配列番号３０）からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
ｆ）ＬＣＤＲ３が、ＬＱＹＳＮＬＬＴ（配列番号３１）、ＱＮＧＨＳＬＰＬＴ（配列番号３２）、ＷＱＧＴＬＦＰＷＴ（配列番号３３）、ＱＱＲＳＴＹＰＦＴ（配列番号３４）、ＱＱＲＩＴＹＰＦＴ（配列番号３５）、ＡＱＬＬＥＬＰＨＴ（配列番号３６）からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
Ｘ１がＹまたはＦであり、Ｘ２がＳまたはＴであり、Ｘ５８がＲまたはＫであり、Ｘ５９がＮ、Ｇ、Ｓ、またはＱであり、Ｘ６０がＧ、Ａ、またはＤである、抗体またはその抗原結合性断片を提供する。
[006]一部の実施形態では、ＨＣＤＲ１は配列番号３のアミノ酸配列を含み、かつ／またはＨＣＤＲ２は配列番号９のアミノ酸配列を含み、かつ／またはＨＣＤＲ３は配列番号１５のアミノ酸配列を含み、かつ／またはＬＣＤＲ１は配列番号２１のアミノ酸配列を含み、かつ／またはＬＣＤＲ２は配列番号２７のアミノ酸配列を含み、かつ／またはＬＣＤＲ３は配列番号３３のアミノ酸配列を含み、Ｘ１およびＸ２は上で定義した通りである。
[007]一部の実施形態では、ＨＣＤＲ１は配列番号３のアミノ酸配列を含み、かつ／またはＨＣＤＲ２は配列番号３７および配列番号３８からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、かつ／またはＨＣＤＲ３は配列番号４０および配列番号４１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、かつ／またはＬＣＤＲ１は配列番号２１のアミノ酸配列を含み、かつ／またはＬＣＤＲ２は配列番号２７のアミノ酸配列を含み、かつ／またはＬＣＤＲ３は配列番号３３のアミノ酸配列を含む。
[008]一部の実施形態では、ＨＣＤＲ１は配列番号４のアミノ酸配列を含み、かつ／またはＨＣＤＲ２は配列番号１５１のアミノ酸配列を含み、かつ／またはＨＣＤＲ３は配列番号１６のアミノ酸配列を含み、かつ／またはＬＣＤＲ１は配列番号２２のアミノ酸配列を含み、かつ／またはＬＣＤＲ２は配列番号２８のアミノ酸配列を含み、かつ／またはＬＣＤＲ３は配列番号３４のアミノ酸配列を含み、Ｘ５８、Ｘ５９、およびＸ６０は上で定義した通りである。
[009]一部の実施形態では、本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片の重鎖可変領域は、
ａ）配列番号１の配列を含むＨＣＤＲ１、配列番号７の配列を含むＨＣＤＲ２、および配列番号１３の配列を含むＨＣＤＲ３、または
ｂ）配列番号２の配列を含むＨＣＤＲ１、配列番号８の配列を含むＨＣＤＲ２、および配列番号１４の配列を含むＨＣＤＲ３、または
ｃ）配列番号３の配列を含むＨＣＤＲ１、配列番号３７の配列を含むＨＣＤＲ２、および配列番号４０の配列を含むＨＣＤＲ３、または
ｄ）配列番号３の配列を含むＨＣＤＲ１、配列番号３８の配列を含むＨＣＤＲ２、および配列番号４１の配列を含むＨＣＤＲ３、または
ｅ）配列番号４の配列を含むＨＣＤＲ１、配列番号１０の配列を含むＨＣＤＲ２、および配列番号１６の配列を含むＨＣＤＲ３、または
ｆ）配列番号４の配列を含むＨＣＤＲ１、配列番号１３４、１３５、１３６、１３７、１３８、および１３９からなる群から選択される配列を含むＨＣＤＲ２、ならびに配列番号１６の配列を含むＨＣＤＲ３、または
ｇ）配列番号５の配列を含むＨＣＤＲ１、配列番号１１の配列を含むＨＣＤＲ２、および配列番号１７の配列を含むＨＣＤＲ３、または
ｈ）配列番号６の配列を含むＨＣＤＲ１、配列番号１２の配列を含むＨＣＤＲ２、および配列番号１８の配列を含むＨＣＤＲ３
を含む。
[0010]一部の実施形態では、本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片の軽鎖可変領域は、
ａ）配列番号１９の配列を含むＬＣＤＲ１、配列番号２５の配列を含むＬＣＤＲ２、および配列番号３１の配列を含むＬＣＤＲ３、または
ｂ）配列番号２０の配列を含むＬＣＤＲ１、配列番号２６の配列を含むＬＣＤＲ２、および配列番号３２の配列を含むＬＣＤＲ３、または
ｃ）配列番号２１の配列を含むＬＣＤＲ１、配列番号２７の配列を含むＬＣＤＲ２、および配列番号３３の配列を含むＬＣＤＲ３、または
ｄ）配列番号２２の配列を含むＬＣＤＲ１、配列番号２８の配列を含むＬＣＤＲ２、および配列番号３４の配列を含むＬＣＤＲ３、または
ｅ）配列番号２３の配列を含むＬＣＤＲ１、配列番号２９の配列を含むＬＣＤＲ２、および配列番号３５の配列を含むＬＣＤＲ３、または
ｆ）配列番号２４の配列を含むＬＣＤＲ１、配列番号３０の配列を含むＬＣＤＲ２、および配列番号３６の配列を含むＬＣＤＲ３
を含む。
[0011]一部の実施形態では、本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片において、
（ａ）ＨＣＤＲ１は配列番号１の配列を含み、ＨＣＤＲ２は配列番号７の配列を含み、ＨＣＤＲ３は配列番号１３の配列を含み、ＬＣＤＲ１は配列番号１９の配列を含み、ＬＣＤＲ２は配列番号２５の配列を含み、ＬＣＤＲ３は配列番号３１の配列を含み、または
（ｂ）ＨＣＤＲ１は配列番号２の配列を含み、ＨＣＤＲ２は配列番号８の配列を含み、ＨＣＤＲ３は配列番号１４の配列を含み、ＬＣＤＲ１は配列番号２０の配列を含み、ＬＣＤＲ２は配列番号２６の配列を含み、ＬＣＤＲ３は配列番号３２の配列を含み、または
（ｃ）ＨＣＤＲ１は配列番号３の配列を含み、ＨＣＤＲ２は配列番号３７の配列を含み、ＨＣＤＲ３は配列番号４０の配列を含み、ＬＣＤＲ１は配列番号２１の配列を含み、ＬＣＤＲ２は配列番号２７の配列を含み、ＬＣＤＲ３は配列番号３３の配列を含み、または
（ｄ）ＨＣＤＲ１は配列番号３の配列を含み、ＨＣＤＲ２は配列番号３８の配列を含み、ＨＣＤＲ３は配列番号４１の配列を含み、ＬＣＤＲ１は配列番号２１の配列を含み、ＬＣＤＲ２は配列番号２７の配列を含み、ＬＣＤＲ３は配列番号３３の配列を含み、または
（ｅ）ＨＣＤＲ１は配列番号４の配列を含み、ＨＣＤＲ２は配列番号１０の配列を含み、ＨＣＤＲ３は配列番号１６の配列を含み、ＬＣＤＲ１は配列番号２２の配列を含み、ＬＣＤＲ２は配列番号２８の配列を含み、ＬＣＤＲ３は配列番号３４の配列を含み、または
（ｆ）ＨＣＤＲ１は配列番号４の配列を含み、ＨＣＤＲ２は配列番号１３４、１３５、１３６、１３７、１３８、および１３９からなる群から選択される配列を含み、ＨＣＤＲ３は配列番号１６の配列を含み、ＬＣＤＲ１は配列番号２２の配列を含み、ＬＣＤＲ２は配列番号２８の配列を含み、ＬＣＤＲ３は配列番号３４の配列を含み、または
（ｇ）ＨＣＤＲ１は配列番号５の配列を含み、ＨＣＤＲ２は配列番号１１の配列を含み、ＨＣＤＲ３は配列番号１７の配列を含み、ＬＣＤＲ１は配列番号２３の配列を含み、ＬＣＤＲ２は配列番号２９の配列を含み、ＬＣＤＲ３は配列番号３５の配列を含み、または
（ｈ）ＨＣＤＲ１は配列番号６の配列を含み、ＨＣＤＲ２は配列番号１２の配列を含み、ＨＣＤＲ３は配列番号１８の配列を含み、ＬＣＤＲ１は配列番号２４の配列を含み、ＬＣＤＲ２は配列番号３０の配列を含み、ＬＣＤＲ３は配列番号３６の配列を含む。
[0012]一部の実施形態では、本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片は、重鎖ＨＦＲ１、ＨＦＲ２、ＨＦＲ３、およびＨＦＲ４のうち１つもしくは複数、ならびに／または軽鎖ＬＦＲ１、ＬＦＲ２、ＬＦＲ３、およびＬＦＲ４のうち１つもしくは複数をさらに含み、
（ａ）ＨＦＲ１はＸ１９ＶＱＬＶＸ２０ＳＧＸ２１Ｘ２２Ｘ２３Ｘ２４ＫＰＧＸ２５ＳＸ２６Ｘ２７Ｘ２８ＳＣＸ２９ＡＳＧＸ３０Ｘ３１Ｘ３２Ｘ３３（配列番号７６）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、
（ｂ）ＨＦＲ２はＷＶＸ３４ＱＸ３５ＰＧＸ３６Ｘ３７ＬＥＷＸ３８Ｘ３９（配列番号７７）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、
（ｃ）ＨＦＲ３配列はＸ４０Ｘ４１ＴＸ４２Ｘ４３Ｘ４４ＤＸ４５ＳＸ４６Ｘ４７ＴＸ４８ＹＸ４９Ｘ５０Ｘ５１Ｘ５２ＳＬＸ５３Ｘ５４ＥＤＴＡＶＹＹＣＸ５５Ｘ５６（配列番号７８）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、
（ｄ）ＨＦＲ４はＷＧＱＧＴＸ５７ＶＴＶＳＳ（配列番号１２６）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、
（ｅ）ＬＦＲ１はＸ３ＩＶＸ４ＴＱＳＰＡＴＬＸ５Ｘ６ＳＰＧＥＲＸ７ＴＸ８Ｘ９Ｃ（配列番号８０）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、
（ｆ）ＬＦＲ２はＷＹＱＱＫＰＧＱＸ１０ＰＸ１１ＬＬＩＹ（配列番号８１）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、
（ｇ）ＬＦＲ３はＧＸ１２ＰＸ１３ＲＦＳＧＳＧＳＧＴＸ１４Ｘ１５ＴＬＴＩＳＳＸ１６ＥＰＥＤＦＡＶＹＸ１７Ｃ（配列番号８２）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、
（ｈ）ＬＦＲ４はＦＧＸ１８ＧＴＫＬＥＩＫ（配列番号１５２）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、
Ｘ３はＥまたはＱであり、Ｘ４はＬまたはＭであり、Ｘ５はＳまたはＴであり、Ｘ６はＬ、Ｖ、またはＡであり、Ｘ７はＡまたはＶであり、Ｘ８はＬまたはＩであり、Ｘ９はＳまたはＴであり、Ｘ１０はＡまたはＳであり、Ｘ１１はＲまたはＫであり、Ｘ１２はＩまたはＶであり、Ｘ１３はＡまたはＴであり、Ｘ１４はＤまたはＳであり、Ｘ１５はＦまたはＹであり、Ｘ１６はＬ、Ｍ、またはＶであり、Ｘ１７はＹまたはＦであり、Ｘ１８はＧまたはＱであり、Ｘ１９はＱまたはＥであり、Ｘ２０はＥまたはＱであり、Ｘ２１はＧまたはＡであり、Ｘ２２はＧまたはＥであり、Ｘ２３はＬまたはＶであり、Ｘ２４はＶまたはＫであり、Ｘ２５はＧまたはＡであり、Ｘ２６はＬ、Ｍ、またはＶであり、Ｘ２７はＲまたはＫであり、Ｘ２８はＶまたはＬであり、Ｘ２９はＡまたはＫであり、Ｘ３０はＦまたはＹであり、Ｘ３１はＮまたはＴであり、Ｘ３２はＦまたはＬであり、Ｘ３３はＳまたはＫであり、Ｘ３４はＲまたはＫであり、Ｘ３５はＡまたはＳであり、Ｘ３６はＫまたはＱであり、Ｘ３７はＲまたはＧであり、Ｘ３８はＭ、Ｉ、またはＶであり、Ｘ３９はＧまたはＡであり、Ｘ４０はＲまたはＫであり、Ｘ４１はＶ、Ａ、またはＦであり、Ｘ４２はＩまたはＬであり、Ｘ４３はＳまたはＴであり、Ｘ４４はＲまたはＡであり、Ｘ４５はＤまたはＴであり、Ｘ４６はＫ、Ａ、またはＳであり、Ｘ４７はＳまたはＮであり、Ｘ４８はＬ、Ｖ、またはＡであり、Ｘ４９はＭまたはＬであり、Ｘ５０はＱまたはＥであり、Ｘ５１はＭまたはＬであり、Ｘ５２はＳ、Ｉ、またはＮであり、Ｘ５３はＲまたはＫであり、Ｘ５４はＳまたはＴであり、Ｘ５５はＡまたはＴであり、Ｘ５６はＲ、Ｎ、またはＴであり、Ｘ５７はＴまたはＬである。
[0013]一部の実施形態では、ＨＦＲ１はＥＶＱＬＶＥＳＧＧＧＬＶＫＰＧＧＳＸ６１ＲＬＳＣＡＡＳＧＦＴＦＳ（配列番号１５４）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、ＨＦＲ２はＷＶＲＱＸ６２ＰＧＫＧＬＥＷＶＸ６３（配列番号１５５）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、ＨＦＲ３はＲＦＴＩＳＲＤＤＳＫＮＴＸ６４ＹＬＱＭＮＳＬＫＴＥＤＴＡＶＹＹＣＴＴ（配列番号１５６）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、ＨＦＲ４はＷＧＱＧＴＴＶＴＶＳＳ（配列番号７９）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、ＬＦＲ１はＥＩＶＸ６５ＴＱＳＰＡＴＬＳＸ６６ＳＰＧＥＲＸ６７ＴＬＳＣ（配列番号１５７）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、ＬＦＲ２はＷＹＱＱＫＰＧＱＸ６８ＰＲＬＬＩＹ（配列番号１５８）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、ＬＦＲ３はＧＩＰＡＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＴＩＳＳＸ６９ＥＰＥＤＦＡＶＹＸ７０Ｃ（配列番号１５９）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、ＬＦＲ４はＦＧＧＧＴＫＬＥＩＫ（配列番号１５３）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、Ｘ６１はＬまたはＭであり、Ｘ６２はＡまたはＳであり、Ｘ６３はＧまたはＡであり、Ｘ６４はＬまたはＶであり、Ｘ６５はＬまたはＭであり、Ｘ６６はＬまたはＶであり、Ｘ６７はＡまたはＶであり、Ｘ６８はＡまたはＳであり、Ｘ６９はＬまたはＶであり、Ｘ７０はＹまたはＦである。
[0014]一部の実施形態では、ＨＦＲ１はＸ７１ＶＱＬＶＱＳＧＡＥＶＫＫＰＧＡＳＶＫＸ７２ＳＣＫＡＳＧＹＸ７３ＬＫ（配列番号１６０）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、ＨＦＲ２はＷＶＸ７４ＱＡＰＧＱＸ７５ＬＥＷＸ７６Ｇ（配列番号１６１）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、ＨＦＲ３はＸ７７Ｘ７８ＴＸ７９ＴＸ８０ＤＴＳＸ８１Ｘ８２ＴＡＹＸ８３ＥＬＸ８４ＳＬＲＳＥＤＴＡＶＹＹＣＡＸ８５（配列番号１４９）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、ＨＦＲ４はＷＧＱＧＴＸ５７ＶＴＶＳＳ（配列番号１２６）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、ＬＦＲ１はＸ８６ＩＶＬＴＱＳＰＡＴＬＸ８７Ｘ８８ＳＰＧＥＲＸ８９ＴＸ９０Ｘ９１Ｃ（配列番号１５０）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、ＬＦＲ２はＷＹＱＱＫＰＧＱＸ１０ＰＸ１１ＬＬＩＹ（配列番号８１）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、ＬＦＲ３はＧＸ９２ＰＸ９３ＲＦＳＧＳＧＳＧＴＸ９４Ｘ９５ＴＬＴＩＳＳＸ９６ＥＰＥＤＦＡＶＹＹＣ（配列番号１４８）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、ＬＦＲ４はＦＧＱＧＴＫＬＥＩＫ（配列番号８３）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、Ｘ１０、Ｘ１１、およびＸ５７は上で定義した通りであり、Ｘ７１はＱまたはＥであり、Ｘ７２はＶまたはＬであり、Ｘ７３はＮまたはＴであり、Ｘ７４はＲまたはＫであり、Ｘ７５はＲまたはＧであり、Ｘ７６はＭまたはＩであり、Ｘ７７はＲまたはＫであり、Ｘ７８はＶまたはＡであり、Ｘ７９はＩまたはＬであり、Ｘ８０はＲまたはＡであり、Ｘ８１はＡまたはＳであり、Ｘ８２はＳまたはＮであり、Ｘ８３はＭまたはＬであり、Ｘ８４はＳまたはＩであり、Ｘ８５はＲまたはＮであり、Ｘ８６はＥまたはＱであり、Ｘ８７はＳまたはＴであり、Ｘ８８はＬまたはＡであり、Ｘ８９はＡまたはＶであり、Ｘ９０はＬまたはＩであり、Ｘ９１はＳまたはＴであり、Ｘ９２はＩまたはであり、Ｘ９３はＡまたはＴであり、Ｘ９４はＤまたはＳであり、Ｘ９５はＦまたはＹであり、Ｘ９６はＬまたはＭである。
[0015]一部の実施形態では、ＨＦＲ１は配列番号８４～８６、１１５、１１９～１２０、および１３１からなる群から選択される配列を含み、ＨＦＲ２は配列番号８７～９０および１２１～１２３からなる群から選択される配列を含み、ＨＦＲ３は配列番号９１～９７、１１６～１１７、および１２４～１２５からなる群から選択される配列を含み、ＨＦＲ４は配列番号７９および１１８からなる群から選択される配列を含み、ＬＦＲ１は配列番号９８～１０３および１２７～１２９からなる群から選択される配列を含み、ＬＦＲ２は配列番号１０４、１０５、および１３０からなる群から選択される配列を含み、ＬＦＲ３は配列番号１０６～１１０および１３２～１３３からなる群から選択される配列を含み、ＬＦＲ４は配列番号８３および１５３からなる群から選択される配列を含む。
[0016]一部の実施形態では、本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片は、配列番号６０、６２、６４、６６、１４０、１４１、１４２、１４６、１４７、３９からなる群から選択される配列、および少なくとも８０％の配列同一性を有ししかもヒトＣＤ３９に対する特異的結合親和性を保持しているその相同配列を含む重鎖可変領域、ならびに配列番号６１、６３、６５、６７、１４３、１４４、１４５、１１１、１１２、６３からなる群から選択される配列、および少なくとも８０％の配列同一性を有ししかもヒトＣＤ３９に対する特異的結合親和性を保持しているその相同配列を含む軽鎖可変領域を含む。
[0017]一部の実施形態では、本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片は、配列番号６８、７０、７２、７４からなる群から選択される配列、および少なくとも８０％の配列同一性を有ししかもヒトＣＤ３９に対する特異的結合親和性を保持しているその相同配列を含む重鎖可変領域、ならびに配列番号６９、７１、７３、７５からなる群から選択される配列、および少なくとも８０％の配列同一性を有ししかもヒトＣＤ３９に対する特異的結合親和性を保持しているその相同配列を含む軽鎖可変領域を含む。
[0018]一部の実施形態では、本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片は、
（１）配列番号４２の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号５１の配列を含む軽鎖可変領域、または
（２）配列番号４３の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号５２の配列を含む軽鎖可変領域、または
（３）配列番号４４の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号５３の配列を含む軽鎖可変領域、または
（４）配列番号４５の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号５４の配列を含む軽鎖可変領域、または
（５）配列番号４７の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号５６の配列を含む軽鎖可変領域、または
（６）配列番号４９の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号５８の配列を含む軽鎖可変領域、または
（７）配列番号５０の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号５９の配列を含む軽鎖可変領域、または
（８）配列番号６０の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６１の配列を含む軽鎖可変領域、または
（９）配列番号６２の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６１の配列を含む軽鎖可変領域、または
（１０）配列番号６４の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６１の配列を含む軽鎖可変領域、または
（１１）配列番号６６の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６１の配列を含む軽鎖可変領域、または
（１２）配列番号６０の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６３の配列を含む軽鎖可変領域、または
（１３）配列番号６２の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６３の配列を含む軽鎖可変領域、または
（１４）配列番号６４の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６３の配列を含む軽鎖可変領域、または
（１５）配列番号６６の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６３の配列を含む軽鎖可変領域、または
（１６）配列番号６０の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６５の配列を含む軽鎖可変領域、または
（１７）配列番号６２の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６５の配列を含む軽鎖可変領域、または
（１８）配列番号６４の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６５の配列を含む軽鎖可変領域、または
（１９）配列番号６６の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６５の配列を含む軽鎖可変領域、または
（２０）配列番号６０の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６７の配列を含む軽鎖可変領域、または
（２１）配列番号６２の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６７の配列を含む軽鎖可変領域、または
（２２）配列番号６４の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６７の配列を含む軽鎖可変領域、または
（２３）配列番号６６の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６７の配列を含む軽鎖可変領域、または
（２４）配列番号１４０の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６１の配列を含む軽鎖可変領域、または
（２５）配列番号１４１の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６１の配列を含む軽鎖可変領域、または
（２６）配列番号１４２の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６１の配列を含む軽鎖可変領域、または
（２７）配列番号６０の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号１４３の配列を含む軽鎖可変領域、または
（２８）配列番号１４０の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号１４３の配列を含む軽鎖可変領域、または
（２９）配列番号１４１の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号１４３の配列を含む軽鎖可変領域、または
（３０）配列番号１４２の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号１４３の配列を含む軽鎖可変領域、または
（３１）配列番号６０の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号１４４の配列を含む軽鎖可変領域、または
（３２）配列番号１４０の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号１４４の配列を含む軽鎖可変領域、または
（３３）配列番号１４１の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号１４４の配列を含む軽鎖可変領域、または
（３４）配列番号１４２の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号１４４の配列を含む軽鎖可変領域、または
（３５）配列番号６０の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号１４５の配列を含む軽鎖可変領域、または
（３６）配列番号１４０の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号１４５の配列を含む軽鎖可変領域、または
（３７）配列番号１４１の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号１４５の配列を含む軽鎖可変領域、または
（３８）配列番号１４２の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号１４５の配列を含む軽鎖可変領域、または
（３９）配列番号１４６の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号１１１の配列を含む軽鎖可変領域、または
（４０）配列番号１４６の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号１１２の配列を含む軽鎖可変領域、または
（４１）配列番号１４７の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号１１１の配列を含む軽鎖可変領域、または
（４２）配列番号３９の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６３の配列を含む軽鎖可変領域、または
（４３）配列番号６８の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６９の配列を含む軽鎖可変領域、または
（４４）配列番号７０の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６９の配列を含む軽鎖可変領域、または
（４５）配列番号７２の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６９の配列を含む軽鎖可変領域、または
（４６）配列番号７４の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６９の配列を含む軽鎖可変領域、または
（４７）配列番号６８の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号７１の配列を含む軽鎖可変領域、または
（４８）配列番号７０の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号７１の配列を含む軽鎖可変領域、または
（４９）配列番号７２の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号７１の配列を含む軽鎖可変領域、または
（５０）配列番号７４の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号７１の配列を含む軽鎖可変領域、または
（５１）配列番号６８の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号７３の配列を含む軽鎖可変領域、または
（５２）配列番号７０の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号７３の配列を含む軽鎖可変領域、または
（５３）配列番号７２の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号７３の配列を含む軽鎖可変領域、または
（５４）配列番号７４の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号７３の配列を含む軽鎖可変領域、または
（５５）配列番号６８の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号７５の配列を含む軽鎖可変領域、または
（５６）配列番号７０の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号７５の配列を含む軽鎖可変領域、または
（５７）配列番号７２の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号７５の配列を含む軽鎖可変領域、または
（５８）配列番号７４の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号７５の配列を含む軽鎖可変領域
を含む。
[0019]一部の実施形態では、本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片は、１つまたは複数のアミノ酸残基の置換または修飾をさらに含み、しかもヒトＣＤ３９に対する特異的結合親和性を保持している。一部の実施形態では、置換または修飾のうち少なくとも１つは、重鎖可変領域または軽鎖可変領域のＣＤＲ配列の１つもしくは複数の中、および／または非ＣＤＲ配列の１つもしくは複数の中にある。一部の実施形態では、置換の少なくとも１つは保存的置換である。
[0020]一部の実施形態では、本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片は、Ｆｃ領域、任意選択でヒト免疫グロブリン（Ｉｇ）のＦｃ領域、または任意選択でヒトＩｇＧのＦｃ領域をさらに含む。一部の実施形態では、Ｆｃ領域はヒトＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１、ＩｇＡ２、またはＩｇＭに由来する。一部の実施形態では、Ｆｃ領域はヒトＩｇＧ１またはＩｇＧ４に由来する。一部の実施形態では、ヒトＩｇＧ１またはＩｇＧ４に由来するＦｃ領域は低減されたエフェクター機能を有する。一部の実施形態では、ヒトＩｇＧ１に由来するＦｃ領域はＬ２３４Ａおよび／またはＬ２３５Ａの変異を含む。一部の実施形態では、ヒトＩｇＧ４に由来するＦｃ領域は任意選択で低減されたエフェクター機能を有する。一部の実施形態では、ヒトＩｇＧ４に由来するＦｃ領域はＳ２２８Ｐの変異、ならびに／またはＬ２３５Ｅの変異、ならびに／またはＦ２３４ＡおよびＬ２３５Ａの変異を含む。
[0021]一部の実施形態では、本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片は、ヒト化されている。一部の実施形態では、本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片は、モノクローナル抗体、二重特異的抗体、多重特異的抗体、組換え抗体、キメラ抗体、標識抗体、二価抗体、抗イディオタイプ抗体、または融合タンパク質である。
[0022]一部の実施形態では、本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片は、ダイアボディ、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆｄ、Ｆｖ断片、ジスルフィド安定化Ｆｖ断片（ｄｓＦｖ）、（ｄｓＦｖ）２、二重特異的ｄｓＦｖ（ｄｓＦｖ－ｄｓＦｖ’）、ジスルフィド安定化ダイアボディ（ｄｓダイアボディ）、単鎖抗体分子（ｓｃＦｖ）、ｓｃＦｖダイマー（二価ダイアボディ）、多重特異的抗体、ラクダ化単鎖ドメイン抗体、ナノボディ、ドメイン抗体、または二価ドメイン抗体である。
[0023]一部の実施形態では、本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片は、ＦＡＣＳ（蛍光活性化細胞ソーティング）アッセイによって測定して１０－８Ｍ以下のＥＣ５０でヒトＣＤ３９に特異的に結合することができる。
[0024]一部の実施形態では、本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片は、
ａ）ＦＡＣＳアッセイによって測定してヒトＣＤ３９に特異的に結合するが、マウスＣＤ３９に特異的に結合しない、
ｂ）ＦＡＣＳアッセイによって測定して１０－８Ｍ以下のＥＣ５０でカニクイザルＣＤ３９に特異的に結合する、
ｃ）Ｂｉａｃｏｒｅアッセイによって測定して１０－７Ｍ以下（たとえば５×１０－８Ｍ以下、３×１０－８Ｍ以下、２×１０－８Ｍ以下、１×１０－８Ｍ以下、または８×１０－９Ｍ以下）のＫＤ値でヒトＣＤ３９に特異的に結合する、
ｄ）Ｏｃｔｅｔアッセイによって測定して１０－８Ｍ以下（たとえば８×１０－９Ｍ以下、５×１０－９Ｍ以下、４×１０－９Ｍ以下、３×１０－９Ｍ以下、１×１０－９Ｍ以下、または９×１０－１０Ｍ以下）のＫＤ値でヒトＣＤ３９に特異的に結合する、
ｅ）ＡＴＰアーゼ活性アッセイによって測定して５０ｎＭ以下（たとえば１ｎＭ以下、５ｎＭ以下、１０ｎＭ以下、または３０ｎＭ以下）のＩＣ５０でＣＤ３９発現細胞中のＡＴＰアーゼ活性を阻害する、
ｆ）ＦＡＣＳアッセイによるＣＤ８０、ＣＤ８６、および／またはＣＤ４０の発現の解析によって測定して５０ｎＭ以下（たとえば４０ｎＭ以下、３０ｎＭ以下、２０ｎＭ以下、１０ｎＭ以下、５ｎＭ以下、３ｎＭ以下、２ｎＭ以下、１ｎＭ以下、０．５ｎＭ以下、または０．２ｎＭ以下）の濃度でＡＴＰ媒介単球活性化を増強することができる、
ｇ）ＩＬ－２の分泌、ＩＦＮ－γの分泌、ＣＤ４＋またはＣＤ８＋のＴ細胞の増殖によって測定して２５ｎＭ以下の濃度で末梢血単核球細胞（ＰＢＭＣ）中のＡＴＰ媒介Ｔ細胞活性化を増強することができる、
ｈ）ＦＡＣＳアッセイによるＣＤ８３の発現の解析によって、またはＴ細胞の増殖を促進する活性化樹状細胞（ＤＣ）の能力によって、または混合リンパ球反応（ＭＬＲ）アッセイにおけるＩＦＮ－γの産生を促進する活性化ＤＣの能力によって測定して、２５ｎＭ以下（または１０ｎＭ以下、または５ｎＭ以下、または１ｎＭ以下、または０．５ｎＭ以下、または０．２ｎＭ以下）の濃度で、ＡＴＰ媒介ＤＣ活性化を増強することができる、
ｉ）ＦＡＣＳアッセイによって測定して１ｎＭ以下（たとえば０．１ｎＭ以下、０．０１ｎＭ以下）の濃度で（ＡＴＰから加水分解される）アデノシンによって誘導されるＣＤ４＋Ｔ細胞の増殖の阻害をブロックすることができる、
ｊ）ＮＫ細胞またはマクロファージ細胞に依存する様式で腫瘍の成長を阻害することができる、
ｋ）Ｔ細胞の増殖、ＣＤ２５＋細胞、および生細胞集団によって測定して、ｅＡＴＰによって阻害されたヒトＣＤ８＋Ｔ細胞の増殖を反転させることができる、および
ｌ）ＥＬＩＳＡアッセイによって測定して５０ｎＭ以下（または１２．５ｎＭ以下、または３．１３ｎＭ以下、または０．７８ｎＭ以下、または０．２ｎＭ以下、または０．０４９ｎＭ以下、または０．０１２ｎＭ以下、または０．００３ｎＭ以下、または０．０００８ｎＭ以下）の濃度で、ＬＰＳ刺激によって誘導されたヒトマクロファージのＩＬ１βの放出を増強することができる、
からなる群から選択される１つまたは複数の特性を有する。
[0025]別の態様では、本開示は、ヒトＣＤ３９との結合について本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片と競合する抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片を提供する。一部の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片は、ヒトＣＤ３９との結合について配列番号４３の配列を含む重鎖可変領域および配列番号５２の配列を含む軽鎖可変領域を含む抗体と競合する。一部の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片は、ヒトＣＤ３９との結合について配列番号４４の配列を含む重鎖可変領域および配列番号５３の配列を含む軽鎖可変領域を含む抗体と競合するか、または配列番号４５の配列を含む重鎖可変領域および配列番号５４の配列を含む軽鎖可変領域を含む抗体と競合する。一部の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片は、ヒトＣＤ３９との結合について配列番号４７の配列を含む重鎖可変領域および配列番号５６の配列を含む軽鎖可変領域を含む抗体と競合する。
[0026]別の態様では、本開示は、ＣＤ３９のエピトープと特異的に結合する抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片であって、エピトープが、Ｑ９６、Ｎ９９、Ｅ１４３、Ｒ１４７、Ｒ１３８、Ｍ１３９、Ｅ１４２、Ｋ５、Ｅ１００、Ｄ１０７、Ｖ８１、Ｅ８２、Ｒ１１１、およびＶ１１５からなる群から選択される１つまたは複数の残基を含む、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片を提供する。
[0027]一部の実施形態では、エピトープは、Ｑ９６、Ｎ９９、Ｅ１４３、およびＲ１４７からなる群から選択される１つまたは複数の残基を含む。一部の実施形態では、エピトープは、Ｒ１３８、Ｍ１３９、およびＥ１４２からなる群から選択される１つまたは複数の残基を含む。一部の実施形態では、エピトープは、Ｋ５、Ｅ１００、およびＤ１０７からなる群から選択される１つまたは複数の残基を含む。一部の実施形態では、エピトープは、Ｖ８１、Ｅ８２、Ｒ１１１、およびＶ１１５からなる群から選択される１つまたは複数の残基を含む。一部の実施形態では、ＣＤ３９はヒトＣＤ３９である。一部の実施形態では、ＣＤ３９は配列番号１６２のアミノ酸配列を含むヒトＣＤ３９である。
[0028]一部の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片は、抗体９－８Ｂ、抗体Ｔ８９５、および抗体Ｉ３９４のいずれでもなく、抗体９－８Ｂは配列番号４６の配列を含む重鎖可変領域および配列番号４８の配列を含む軽鎖可変領域を含み、抗体Ｔ８９５は配列番号５５の配列を含む重鎖可変領域および配列番号５７の配列を含む軽鎖可変領域を含み、抗体Ｉ３９４は配列番号１１３の配列を含む重鎖可変領域および配列番号１１４の配列を含む軽鎖可変領域を含む。
[0029]一部の実施形態では、本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片は、二重特異的である。一部の実施形態では、本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片は、ＣＤ３９以外の第２の抗原またはＣＤ３９の上の第２のエピトープと特異的に結合することができる。ある特定の実施形態では、第２の抗原は、ＴＧＦベータ、ＣＤ７３、ＰＤ１、ＰＤＬ１、４－１ＢＢ、ＣＴＬＡ４、ＴＩＧＩＴ、ＧＩＴＡ、ＶＩＳＴＡ、ＴＩＧＩＴ、Ｂ７－Ｈ３、Ｂ７－Ｈ４、Ｂ７－Ｈ５、ＣＤ１１２Ｒ、Ｓｉｇｌｅｃ－１５、ＬＡＧ３、およびＴＩＭ－３からなる群から選択される。
[0030]一部の実施形態では、本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片は、１つまたは複数のコンジュゲート部分に連結されている。一部の実施形態では、コンジュゲート部分はクリアランス修飾剤、化学療法剤、毒素、放射性同位体、ランタニド、発光標識、蛍光標識、酵素基質標識、ＤＮＡアルキル化剤、トポイソメラーゼ阻害剤、チューブリンバインダー、またはその他の抗がん薬物を含む。
[0031]別の態様では、本開示は、本開示の抗体またはその抗原結合性断片および１つまたは複数の薬学的に許容される担体を含む医薬組成物を提供する。
[0032]別の態様では、本開示は、本開示の抗体またはその抗原結合性断片をコードする単離されたポリヌクレオチドを提供する。
[0033]別の態様では、本開示は、本開示の単離されたポリヌクレオチドを含むベクターを提供する。
[0034]別の態様では、本開示は、本開示のベクターを含む宿主細胞を提供する。
[0035]別の態様では、本開示は、本開示の抗体もしくはその抗原結合性断片および／または医薬組成物、ならびに第２の治療剤を含むキットを提供する。
[0036]別の態様では、本開示は、本開示のベクターが発現される条件下で本開示の宿主細胞を培養するステップを含む、本開示の抗体またはその抗原結合性断片を発現する方法を提供する。
[0037]別の態様では、本開示は、治療有効量の本開示の抗体もしくはその抗原結合性断片、および／または本開示の医薬組成物を対象に投与するステップを含む、対象におけるＣＤ３９関連の疾患、障害、または状態を処置し、防止し、または軽減する方法を提供する。
[0038]別の態様では、本開示は、治療有効量の本開示の抗体もしくはその抗原結合性断片、および／または本開示の医薬組成物を対象に投与するステップを含む、対象におけるＣＤ３９のＡＴＰアーゼ活性を低減させることによって処置可能な疾患を処置し、防止し、または軽減する方法を提供する。
[0039]別の態様では、本開示は、治療有効量の本開示の抗体もしくはその抗原結合性断片、および／または本開示の医薬組成物を対象に投与するステップを含む、対象におけるＴ細胞、単球、マクロファージ、樹状細胞、抗原提示細胞、ＮＫおよび／またはＢ細胞の活性のアデノシン媒介阻害に関連する疾患を処置し、防止し、または軽減する方法を提供する。
[0040]一部の実施形態では、疾患、障害、または状態はがんである。一部の実施形態では、がんは肛門がん、虫垂がん、星状細胞腫、基底細胞癌、胆嚢がん、胃がん、肺がん、気管支がん、骨がん、肝胆管がん、膵がん、乳がん、肝がん、卵巣がん、精巣がん、腎がん、腎盂尿管がん、唾液腺がん、小腸がん、尿道がん、膀胱がん、頭頚部がん、脊椎がん、脳がん、頸がん、子宮がん、子宮内膜がん、結腸がん、結腸直腸がん、直腸がん、肛門がん、食道がん、胃腸管がん、皮膚がん、前立腺がん、下垂体がん、膣がん、甲状腺がん、咽喉がん、膠芽細胞腫、黒色腫、骨髄異形成症候群、肉腫、奇形腫、慢性リンパ球性白血病（ＣＬＬ）、慢性骨髄性白血病（ＣＭＬ）、急性リンパ球性白血病（ＡＬＬ）、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、多発性骨髄腫、ＴまたはＢ細胞リンパ腫、ＧＩ器官間質腫、軟組織腫瘍、肝細胞癌、および腺癌である。一部の実施形態では、がんは白血病、リンパ腫、膀胱がん、神経膠腫、膠芽細胞腫、卵巣がん、黒色腫、前立腺がん、甲状腺がん、食道がん、または乳がんである。一部の実施形態では、対象は、任意選択で非がん細胞または非免疫抑制細胞において通常見られるレベルより有意に高いレベルで、ＣＤ３９を発現しているがん細胞または腫瘍浸潤性免疫細胞もしくは免疫抑制細胞を有すると同定されている。ＣＤ３９を発現している免疫抑制細胞の例には、骨髄細胞に由来する抑制細胞（ＭＤＳＣ）または制御性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ）が含まれる。
[0041]一部の実施形態では、疾患、障害、または状態は、自己免疫疾患または感染である。一部の実施形態では、自己免疫疾患は免疫性血小板減少症、全身性強皮症、硬化症、成人呼吸窮迫症候群、湿疹、喘息、シェーグレン症候群、アジソン病、巨細胞性動脈炎、免疫複合体性腎炎、免疫性血小板減少性紫斑病、自己免疫性血小板減少症、セリアック病、乾癬、皮膚炎、結腸炎、または全身性エリテマトーデスである。一部の実施形態では、感染はウイルス感染または細菌感染である。一部の実施形態では、感染はＨＩＶ感染、ＨＢＶ感染、ＨＣＶ感染、炎症性腸疾患、またはクローン病である。
[0042]一部の実施形態では、対象はヒトである。一部の実施形態では、投与は経口、経鼻、静脈内、皮下、舌下、または筋肉内の投与である。一部の実施形態では、方法は治療有効量の第２の治療剤を投与するステップをさらに含む。一部の実施形態では、第２の治療剤は化学療法剤、抗がん薬、放射線療法剤、免疫療法剤、抗血管新生剤、標的療法剤、細胞療法剤、遺伝子療法剤、ホルモン療法剤、抗ウイルス剤、抗生剤、鎮痛剤、抗酸化剤、金属キレート剤、およびサイトカインからなる群から選択される。
[0043]別の態様では、本開示は、ＣＤ３９陽性細胞を本開示の抗体もしくはその抗原結合性断片および／または本開示の医薬組成物に曝露するステップを含む、ＣＤ３９陽性細胞におけるＣＤ３９の活性を調節する方法を提供する。一部の実施形態では、細胞は免疫細胞である。
[0044]別の態様では、本開示は、試料を本開示の抗体もしくはその抗原結合性断片および／または本開示の医薬組成物と接触させるステップ、ならびに試料中におけるＣＤ３９の存在または量を決定するステップを含む、試料中におけるＣＤ３９の存在または量を検出する方法を提供する。
[0045]別の態様では、本開示は、ａ）対象から得た試料を本開示の抗体もしくはその抗原結合性断片および／または本開示の医薬組成物と接触させるステップ、ｂ）試料中のＣＤ３９の存在または量を決定するステップ、ならびにｃ）ＣＤ３９の存在または量を、対象におけるＣＤ３９関連の疾患、障害、またはステータスの存在または状態と相関させるステップを含む、対象におけるＣＤ３９関連の疾患、障害、または状態を診断する方法を提供する。
[0046]別の態様では、本開示は、対象におけるＣＤ３９関連の疾患、障害、または状態を処置し、防止し、または軽減するための医薬の製造における、本開示の抗体もしくはその抗原結合性断片および／または本開示の医薬組成物の使用を提供する。
[0047]別の態様では、本開示は、対象におけるＣＤ３９関連の疾患、障害、または状態を診断するための診断試薬の製造における、本開示の抗体もしくはその抗原結合性断片および／または本開示の医薬組成物の使用を提供する。
[0048]別の態様では、本開示は、ＣＤ３９の検出に有用な、本開示の抗体もしくはその抗原結合性断片および／または本開示の医薬組成物を含むキットを提供する。
[0049]図１は、抗ＣＤ３９モノクローナル抗体ｍＡＢ２１およびｍＡｂ２３によるＡＴＰ媒介増強Ｔ細胞増殖を示す。 [0050]図２は、抗ＣＤ３９キメラ抗体ｃ１４、ｃ１９、ｃ２１、およびｃ２３によるＴ細胞増殖のＡＴＰ媒介抑制の封鎖を示す。ｈＩｇＧ４はヒトＩｇＧ４アイソタイプ対照抗体を意味する。 [0051]図３は、樹状細胞（ＤＣ）上のＣＤ３９の発現レベルを示す。 [0052]図４Ａは、ＦＡＣＳを用いるＣＤ８６の発現によって測定した抗ＣＤ３９キメラ抗体ｃ１４、ｃ１９、ｃ２１、およびｃ２３によるＡＴＰ媒介ＤＣ活性化を示す。 図４Ｂは、ＦＡＣＳを用いるＣＤ８３の発現によって測定した抗ＣＤ３９キメラ抗体ｃ１４、ｃ１９、ｃ２１、およびｃ２３によるＡＴＰ媒介ＤＣ活性化を示す。 図４Ｃは、ＦＡＣＳを用いるＨＬＡ－ＤＲの発現によって測定した抗ＣＤ３９キメラ抗体ｃ１４、ｃ１９、ｃ２１、およびｃ２３によるＡＴＰ媒介ＤＣ活性化を示す。 [0053]図５は、ＭＯＬＰ－８細胞（ヒト多発性骨髄腫細胞株）を接種したマウスにおいて抗ＣＤ３９キメラ抗体ｃ２３－ｈＩｇＧ４およびｃ２３－ｈＩｇＧ１で処置した後の腫瘍の成長を示す。 [0054]図６Ａは、ヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５のＥＮＴＰＤ１（即ちＣＤ３９）、ＥＮＴＰＤ２（即ちＣＤ３９Ｌ１）、ＥＮＴＰＤ３（即ちＣＤ３９Ｌ３）、ＥＮＴＰＤ５（即ちＣＤ３９Ｌ４）、およびＥＮＴＰＤ６（即ちＣＤ３９Ｌ２）タンパク質それぞれに対する結合特性を示す。図６Ｂは、陰性対照ｈＩｇＧ４のＥＮＴＰＤ１（即ちＣＤ３９）、ＥＮＴＰＤ２（即ちＣＤ３９Ｌ１）、ＥＮＴＰＤ３（即ちＣＤ３９Ｌ３）、ＥＮＴＰＤ５（即ちＣＤ３９Ｌ４）、およびＥＮＴＰＤ６（即ちＣＤ３９Ｌ２）タンパク質それぞれに対する結合を示す。 [0055]図７Ａおよび７Ｂは、ＦＡＣＳによるｃ２３ヒト化抗体のＭＯＬＰ－８細胞との結合活性を示す。 [0056]図８は、ｃ２３ヒト化抗体（酵母ディスプレイによって得られた）のＭＯＬＰ－８細胞との結合活性を示す。 [0057]図９Ａおよび９Ｂは、ＦＡＣＳによるｃ２３ヒト化抗体のＳＫ－ＭＥＬ－２８細胞におけるＡＴＰアーゼ阻害を示す。 [0058]図１０Ａ～１０Ｃは、ＦＡＣＳによるｃ１４ヒト化抗体のＭＯＬＰ－８細胞との結合活性を示す。 図１０Ａ～１０Ｃは、ＦＡＣＳによるｃ１４ヒト化抗体のＭＯＬＰ－８細胞との結合活性を示す。 図１０Ａ～１０Ｃは、ＦＡＣＳによるｃ１４ヒト化抗体のＭＯＬＰ－８細胞との結合活性を示す。 [0059]図１１Ａは、ＩＬ－２によって測定したヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５によるＰＭＢＣ中のＡＴＰ媒介Ｔ細胞活性化を示す。 図１１Ｂは、ＩＦＮ－γによって測定したヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５によるＰＭＢＣ中のＡＴＰ媒介Ｔ細胞活性化を示す。 図１１Ｃは、ＣＤ４＋Ｔ細胞増殖によって測定したヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５によるＰＭＢＣ中のＡＴＰ媒介Ｔ細胞活性化を示す。 図１１Ｄは、ＣＤ８＋Ｔ細胞増殖によって測定したヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５によるＰＭＢＣ中のＡＴＰ媒介Ｔ細胞活性化を示す。 [0060]図１２Ａは、ＦＡＣＳによるヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５およびｈｕ１４．Ｈ１Ｌ１のＳＫ－ＭＥＬ－５細胞との結合活性を示す。 図１２Ｂは、ＦＡＣＳによるヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５およびｈｕ１４．Ｈ１Ｌ１のＳＫ－ＭＥＬ－２８細胞との結合活性を示す。 図１２Ｃは、ＦＡＣＳによるヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５およびｈｕ１４．Ｈ１Ｌ１のＭＯＬＰ－８細胞との結合活性を示す。 図１２Ｄは、ＦＡＣＳによるヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５およびｈｕ１４．Ｈ１Ｌ１のＣＨＯＫ１－ｃｙｎｏＣＤ３９細胞との結合活性を示す。 図１２Ｅは、ＦＡＣＳによるヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５およびｈｕ１４．Ｈ１Ｌ１のＣＨＯＫ１－ｍＣＤ３９細胞との結合活性を示す。 [0061]図１３Ａは、ＳＫ－ＭＥＬ－５におけるヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５およびｈｕ１４．Ｈ１Ｌ１によるＡＴＰアーゼ阻害活性を示す。図１３Ｂは、ＭＯＬＰ－８におけるヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５およびｈｕ１４．Ｈ１Ｌ１によるＡＴＰアーゼ阻害活性を示す。 [0062]図１４Ａは、ＣＤ８０の発現によって測定した抗ＣＤ３９ヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５によるＡＴＰ媒介単球活性化を示す。 図１４Ｂは、ＣＤ８６の発現によって測定した抗ＣＤ３９ヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５によるＡＴＰ媒介単球活性化を示す。 図１４Ｃは、ＣＤ４０の発現によって測定した抗ＣＤ３９ヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５によるＡＴＰ媒介単球活性化を示す。 [0063]図１５Ａは、ＣＤ８３の発現によって測定してヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５がＡＴＰ媒介ＤＣ活性化を増加させることを示す。 図１５Ｂは、増強されたＴ細胞の増殖によって測定してヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５がＡＴＰ媒介ＤＣ活性化を増加させることを示す。 図１５Ｃは、Ｔ細胞の活性化によって測定してヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５がＡＴＰ媒介ＤＣ活性化を増加させることを示す。 [0064]図１６は、ＭＯＬＰ－８異種移植マウスにおけるヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５およびｈｕ１４．Ｈ１Ｌ１による腫瘍成長阻害を示す。 [0065]図１７は、ＮＫが枯渇したＭＯＬＰ－８異種移植マウスにおける抗ＣＤ３９ヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５の腫瘍成長阻害を示す。 [0066]図１８は、マクロファージが枯渇したＭＯＬＰ－８異種移植マウスにおける抗ＣＤ３９ヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５の腫瘍成長阻害を示す。 [0067]図１９Ａは、ヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５およびｈｕ１４．Ｈ１Ｌ１と参照抗体とのエピトープビニングの結果を示す。 図１９Ｂは、試験した抗体のエピトープ分類を示す。 [0068]図２０は、ＬＰＳ刺激によって誘導されたヒトマクロファージのＩＬ１β放出に対する抗ＣＤ３９ヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５の効果を示す。 [0069]図２１は、ＰＢＭＣ養子マウスにおける異なる用量（０．０３ｍｇ／ｋｇ、０．３ｍｇ／ｋｇ、３ｍｇ／ｋｇ、１０ｍｇ／ｋｇ、３０ｍｇ／ｋｇ）のヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５の腫瘍成長阻害を示す。 [0070]図２２は、ヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５、キメラ抗体ｃ３４およびｃ３５、ならびに参照抗体Ｔ８９５、Ｉ３９４、および９－８Ｂのエピトープマッピングの結果を示す。 [0071]図２３Ａは、Ｔ細胞の増殖によって測定したヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５によって反転された細胞外ＡＴＰ阻害ＣＤ８＋Ｔ細胞の増殖を示す。 図２３Ｂは、ＣＤ２５＋細胞によって測定したヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５によって反転された細胞外ＡＴＰ阻害ＣＤ８＋Ｔ細胞の増殖を示す。 図２３Ｃは、生細胞集団によって測定したヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５によって反転された細胞外ＡＴＰ阻害ＣＤ８＋Ｔ細胞の増殖を示す。
[0072]以下の本開示の記述は、本開示の種々の実施形態を説明することを意図しているのみである。したがって、議論する特定の改変は本開示の範囲を限定するものと解釈すべきではない。本開示の範囲から逸脱することなしに種々の等価物、変更、および改変ができることは、当業者には明らかであり、そのような等価の実施形態が本明細書に含まれるべきことが理解される。出版物、特許、および特許出願を含む本明細書で引用した全ての参照文献は、参照により全体として本明細書に組み込まれる。
[0073]定義
[0074]本明細書で用いる用語「抗体」は、特定の抗原に結合する任意の免疫グロブリン、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、多価抗体、二価抗体、一価抗体、多重特異的抗体、または二重特異的抗体を含む。天然のインタクトな抗体は２つの重（Ｈ）鎖および２つの軽（Ｌ）鎖を含む。哺乳動物の重鎖はアルファ、デルタ、イプシロン、ガンマ、およびミューに分類され、それぞれの重鎖は可変領域（ＶＨ）ならびに第１、第２、第３、および任意選択で第４の定常領域（それぞれＣＨ１、ＣＨ２、ＣＨ３、ＣＨ４）からなる。哺乳動物の軽鎖はλまたはκと分類され、それぞれの軽鎖は可変領域（ＶＬ）および定常領域からなる。抗体は「Ｙ」の形状を有し、Ｙの軸はジスルフィド結合を介して互いに結合した２つの重鎖の第２および第３の定常領域からなる。Ｙのそれぞれのアームは、１本の軽鎖の可変および定常領域に結合した１本の重鎖の可変領域および第１の定常領域を含む。軽鎖および重鎖の可変領域は抗原の結合に関与している。両方の鎖の可変領域は一般に、相補性決定領域（ＣＤＲ）（ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む軽鎖ＣＤＲ、ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含む重鎖ＣＤＲ）と呼ばれる３つの高度に可変性のループを含む。本明細書で開示する抗体および抗原結合性断片のＣＤＲの境界は、Ｋａｂａｔ、ＩＭＧＴ、Ｃｈｏｔｈｉａ、またはＡｌ－Ｌａｚｉｋａｎｉの規則によって定義され、または同定されてよい（Ａｌ－Ｌａｚｉｋａｎｉ，Ｂ．，Ｃｈｏｔｈｉａ，Ｃ．，Ｌｅｓｋ，Ａ．Ｍ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，２７３（４），９２７（１９９７）；Ｃｈｏｔｈｉａ，Ｃ．ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ．Ｄｅｃ ５；１８６（３）：６５１－６３（１９８５）；Ｃｈｏｔｈｉａ，Ｃ．ａｎｄ Ｌｅｓｋ，Ａ．Ｍ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，１９６，９０１（１９８７）；Ｃｈｏｔｈｉａ，Ｃ．ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ．Ｄｅｃ ２１－２８；３４２（６２５２）：８７７－８３（１９８９）；Ｋａｂａｔ Ｅ．Ａ．ｅｔ ａｌ．，Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｏｆ ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ Ｉｎｔｅｒｅｓｔ，５ｔｈ Ｅｄ．Ｐｕｂｌｉｃ Ｈｅａｌｔｈ Ｓｅｒｖｉｃｅ，Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｓ ｏｆ Ｈｅａｌｔｈ，Ｂｅｔｈｅｓｄａ，Ｍｄ．（１９９１）；Ｍａｒｉｅ－Ｐａｕｌｅ Ｌｅｆｒａｎｃ ｅｔ ａｌ．，Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔａｌ ａｎｄ Ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，２７：５５－７７（２００３）；Ｍａｒｉｅ－Ｐａｕｌｅ Ｌｅｆｒａｎｃ ｅｔ ａｌ．，Ｉｍｍｕｎｏｍｅ Ｒｅｓｅａｒｃｈ，１（３），（２００５）；Ｍａｒｉｅ－Ｐａｕｌｅ Ｌｅｆｒａｎｃ，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ ｏｆ Ｂ ｃｅｌｌｓ（ｓｅｃｏｎｄ ｅｄｉｔｉｏｎ），ｃｈａｐｔｅｒ ２６，４８１－５１４，（２０１５））。３つのＣＤＲは、ＣＤＲよりも高度に保存され、高度に可変性のループを支持するスキャフォールドを形成するフレームワーク領域（ＦＲ）（ＬＦＲ１、ＬＦＲ２、ＬＦＲ３、およびＬＦＲ４を含む軽鎖ＦＲ、ならびにＨＦＲ１、ＨＦＲ２、ＨＦＲ３、およびＨＦＲ４を含む重鎖ＦＲ）として知られる隣接する区間の間に挿入されている。重鎖および軽鎖の定常領域は抗原結合には関与しないが、種々のエフェクター機能を呈する。抗体は、その重鎖の定常領域のアミノ酸配列に基づいてクラスに割り付けられる。抗体の５つの主なクラスまたはアイソタイプはＩｇＡ、ＩｇＤ、ＩｇＥ、ＩｇＧ、およびＩｇＭであり、これらはそれぞれアルファ、デルタ、イプシロン、ガンマ、およびミュー重鎖の存在によって特徴付けられる。主な抗体クラスのいくつかは、ＩｇＧ１（ガンマ１重鎖）、ＩｇＧ２（ガンマ２重鎖）、ＩｇＧ３（ガンマ３重鎖）、ＩｇＧ４（ガンマ４重鎖）、ＩｇＡ１（アルファ１重鎖）、またはＩｇＡ２（アルファ２重鎖）等のサブクラスに分割される。
[0075]ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗体はその任意の抗原結合性断片を包含する。本明細書で用いる用語「抗原結合性断片」は、１つまたは複数のＣＤＲを含む抗体の一部から形成された抗体断片、または抗原に結合するが、インタクトな天然の抗体構造を含まない任意の他の抗体断片を意味する。抗原結合性断片の例には、限定なく、ダイアボディ、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆｖ断片、ジスルフィド安定化Ｆｖ断片（ｄｓＦｖ）、（ｄｓＦｖ）２、二重特異的ｄｓＦｖ（ｄｓＦｖ－ｄｓＦｖ’）、ジスルフィド安定化ダイアボディ（ｄｓダイアボディ）、単鎖抗体分子（ｓｃＦｖ）、ｓｃＦｖダイマー（二価ダイアボディ）、二重特異的抗体、多重特異的抗体、ラクダ化単鎖ドメイン抗体、ナノボディ、ドメイン抗体、または二価ドメイン抗体が含まれる。抗原結合性断片は、親抗体が結合する同じ抗原に結合することができる。
[0076]「Ｆａｂ」は、抗体に関して、ジスルフィド結合によって単一の重鎖の可変領域および第１の定常領域に結合した単一の軽鎖（可変領域と定常領域の両方）からなる抗体の部分を意味する。
[0077]「Ｆａｂ’」は、ヒンジ領域の一部を含むＦａｂ断片を意味する。
[0078]「Ｆ（ａｂ’）２」は、Ｆａｂ’のダイマーを意味する。
[0079]「Ｆｃ」は、抗体（たとえばＩｇＧ、ＩｇＡ、またはＩｇＤアイソタイプ）に関して、ジスルフィド結合を介して第２の重鎖の第２および第３の定常ドメインに結合した第１の重鎖の第２および第３の定常ドメインからなる抗体の部分を意味する。ＩｇＭおよびＩｇＥアイソタイプの抗体に関するＦｃは、第４の定常ドメインをさらに含む。抗体のＦｃ部分は、抗体依存性細胞媒介細胞毒性（ＡＤＣＣ）および補体依存性細胞毒性（ＣＤＣ）等の種々のエフェクター機能に関与しているが、抗原結合には機能しない。
[0080]「Ｆｖ」は、抗体に関して、完全な抗原結合部位を担う抗体の最小断片を意味する。Ｆｖ断片は、単一の重鎖の可変領域に結合した単一の軽鎖の可変領域からなる。
[0081]「単鎖Ｆｖ抗体」または「ｓｃＦｖ」は、直接またはペプチドリンカー配列を介して相互に連結された軽鎖可変領域および重鎖可変領域からなる操作された抗体を意味する（Ｈｕｓｔｏｎ ＪＳ ｅｔ ａｌ．Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ，８５：５８７９（１９８８））。
[0082]「単鎖Ｆｖ－Ｆｃ抗体」または「ｓｃＦｖ－Ｆｃ」は、抗体のＦｃ領域に連結されたｓｃＦｖからなる操作された抗体を意味する。
[0083]「ラクダ化単鎖ドメイン抗体」、「重鎖抗体」、または「ＨＣＡｂ」は、２つのＶＨドメインを含み、軽鎖を含まない抗体を意味する（Ｒｉｅｃｈｍａｎｎ Ｌ．ａｎｄ Ｍｕｙｌｄｅｒｍａｎｓ Ｓ．，Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｍｅｔｈｏｄｓ．Ｄｅｃ １０；２３１（１－２）：２５－３８（１９９９）；Ｍｕｙｌｄｅｒｍａｎｓ Ｓ．，Ｊ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．Ｊｕｎ；７４（４）：２７７－３０２（２００１）；ＷＯ９４／０４６７８；ＷＯ９４／２５５９１；米国特許第６，００５，０７９号）。重鎖抗体はもともとラクダ科（ラクダ、ヒトコブラクダ、およびリャマ）に由来する。ラクダ化抗体は軽鎖を有しないが、真正の抗原結合能力を有する（Ｈａｍｅｒｓ－Ｃａｓｔｅｒｍａｎ Ｃ．ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ．Ｊｕｎ ３；３６３（６４２８）：４４６－８（１９９３）；Ｎｇｕｙｅｎ ＶＫ．ｅｔ ａｌ．Ｉｍｍｕｎｏｇｅｎｅｔｉｃｓ．Ａｐｒ；５４（１）：３９－４７（２００２）；Ｎｇｕｙｅｎ ＶＫ．ｅｔ ａｌ．Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ．Ｍａｙ；１０９（１）：９３－１０１（２００３））。重鎖抗体の可変ドメイン（ＶＨＨドメイン）は、適応免疫応答によって生成される既知の最小の抗原結合単位を表す（Ｋｏｃｈ－Ｎｏｌｔｅ Ｆ．ｅｔ ａｌ．，ＦＡＳＥＢ Ｊ．Ｎｏｖ；２１（１３）：３４９０－８．Ｅｐｕｂ ２００７ Ｊｕｎ １５（２００７））。
[0084]「ナノボディ」は、重鎖抗体のＶＨＨドメインおよび２つの定常ドメイン、ＣＨ２およびＣＨ３からなる抗体断片を意味する。
[0085]「ダイアボディ」または「ｄＡｂ」には、２つの抗原結合部位を有する小さな抗体断片が含まれ、断片は同じポリペプチド鎖の中でＶＬドメインに連結されたＶＨドメインを含む（ＶＨ－ＶＬまたはＶＬ－ＶＨ）（たとえばＨｏｌｌｉｇｅｒ Ｐ．ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ．Ｊｕｌ １５；９０（１４）：６４４４－８（１９９３）；ＥＰ４０４０９７；ＷＯ９３／１１１６１を参照）。同じ鎖の中の２つのドメインの間での対形成を可能にするには短すぎるリンカーを用いることによって、ドメインは別の鎖の相補的なドメインと対を形成することを強制され、それにより２つの抗原結合部位が創出される。抗原結合部位は同じまたは異なる抗原（またはエピトープ）を標的とし得る。ある特定の実施形態では、「二重特異的ｄｓダイアボディ」は、２つの異なる抗原（またはエピトープ）を標的とするダイアボディである。
[0086]「ドメイン抗体」は、重鎖の可変領域または軽鎖の可変領域のみを含む抗体断片を意味する。ある例では、２つ以上のＶＨドメインがペプチドリンカーと共有結合的に接合されて、二価または多価のドメイン抗体が創出される。二価ドメイン抗体の２つのＶＨドメインは、同じまたは異なる抗原を標的とし得る。
[0087]本明細書で用いる用語「価」は、所与の分子の中の特定した数の抗原結合部位の存在を意味する。用語「一価」は、ただ一つの単一の抗原結合部位を有する抗体または抗原結合性断片を意味し、用語「多価」は、複数の抗原結合部位を有する抗体または抗原結合性断片を意味する。したがって、用語「二価」、「四価」、および「六価」は、抗原結合性分子の中のそれぞれ２つの結合部位、４つの結合部位、および６つの結合部位の存在を示す。一部の実施形態では、抗体またはその抗原結合性断片は二価である。
[0088]本明細書で用いる場合、「二重特異的」抗体は、２つの異なるモノクローナル抗体に由来する断片を有し、２つの異なるエピトープに結合することができる人工の抗体を意味する。２つのエピトープは同じ抗原の上に存在してもよく、または２つの異なる抗原の上に存在してもよい。
[0089]ある特定の実施形態では、「ｓｃＦｖダイマー」は、別のＶＨ－ＶＬ部分と二量化した（ペプチドリンカーによって二量化された）ＶＨ－ＶＬを含む二価ダイアボディまたは二重特異的ｓｃＦｖ（ＢｓＦｖ）であり、それにより１つの部分のＶＨが他の部分のＶＬと協調して、同じ抗原（またはエピトープ）または異なる抗原（またはエピトープ）を標的とすることができる２つの結合部位を形成する。他の実施形態では、「ｓｃＦｖダイマー」は、（ペプチドリンカーによって連結された）ＶＬ１－ＶＨ２と会合した（これもペプチドリンカーによって連結した）ＶＨ１－ＶＬ２を含む二重特異的ダイアボディであり、それによりＶＨ１とＶＬ１が協調し、ＶＨ２とＶＬ２が協調して、それぞれの協調した対が異なる抗原特異性を有する。
[0090]「ｄｓＦｖ」は、単一の軽鎖の可変領域と単一の重鎖の可変領域との間の連結がジスルフィド結合であるジスルフィド安定化Ｆｖ断片を意味する。一部の実施形態では、「（ｄｓＦｖ）２」または「（ｄｓＦｖ－ｄｓＦｖ’）」は、３つのペプチド鎖、即ちペプチドリンカー（たとえば長い可撓性リンカー）によって連結され、ジスルフィド架橋を介してそれぞれ２つのＶＬ部分に結合した２つのＶＨ部分を含む。一部の実施形態では、ｄｓＦｖ－ｄｓＦｖ’は、ジスルフィドで対を形成したそれぞれの重鎖および軽鎖が異なる抗原特異性を有する二重特異的である。
[0091]本明細書で用いる用語「キメラ」は、１つの種に由来する重鎖および／または軽鎖の一部と、異なる種に由来する重鎖および／または軽鎖の残りとを有する抗体または抗原結合性断片を意味する。説明的な例では、キメラ抗体はヒトに由来する定常領域と、マウス等の非ヒト動物に由来する可変領域とを含んでよい。一部の実施形態では、非ヒト動物は哺乳動物、たとえばマウス、ラット、ウサギ、ヤギ、ヒツジ、モルモット、またはハムスターである。
[0092]本明細書で用いる用語「ヒト化」は、抗体または抗原結合性断片が非ヒト動物に由来するＣＤＲ、ヒトに由来するＦＲ領域、および適用される場合にはヒトに由来する定常領域を含むことを意味する。
[0093]本明細書で用いる用語「親和性」は、免疫グロブリン分子（即ち抗体）またはその断片と抗原との間の非共有結合相互作用の強さを意味する。
[0094]本明細書で用いる用語「特異的結合」または「特異的に結合する」は、たとえば抗体と抗原のような２つの分子の間の非ランダム結合反応を意味する。特異的結合は、たとえば抗原と抗原結合性分子との間の結合が平衡に達したときのＫＤ値、即ち解離速度と会合速度との比（ｋｏｆｆ／ｋｏｎ）によって表される結合親和性において特徴付けることができる。ＫＤは、それだけに限らないが、表面プラスモン共鳴法、Ｏｃｔｅｔ法、ミクロスケールサーモフォレーシス法、ＨＰＬＣ－ＭＳ法、およびＦＡＣＳアッセイ法を含む当技術分野で既知の任意の従来法を用いて決定してよい。１０－６Ｍ以下（たとえば５×１０－７Ｍ以下、２×１０－７Ｍ以下、１０－７Ｍ以下、５×１０－８Ｍ以下、２×１０－８Ｍ以下、１０－８Ｍ以下、５×１０－９Ｍ以下、４×１０－９Ｍ以下、３×１０－９Ｍ以下、２×１０－９Ｍ以下、または１０－９Ｍ以下）のＫＤ値は、抗体またはその抗原結合性断片とＣＤ３９（たとえばヒトＣＤ３９）との間の特異的結合を示し得る。
[0095]本明細書で用いる「ヒトＣＤ３９との結合について競合する」能力は、第１の抗体または抗原結合性断片の、ヒトＣＤ３９と第２の抗ＣＤ３９抗体との間の結合相互作用を何らかの検出可能な程度で阻害する能力を意味する。ある特定の実施形態では、ヒトＣＤ３９との結合について競合する抗体または抗原結合性断片は、ヒトＣＤ３９と第２の抗ヒトＣＤ３９抗体との間の結合相互作用を少なくとも８５％、または少なくとも９０％阻害する。ある特定の実施形態では、この阻害は９５％より大きく、または９９％より大きくてよい。
[0077]本明細書で用いる用語「エピトープ」は、それに抗体が結合する抗原の上の特定の原子またはアミノ酸の群を意味する。２つの抗体が抗原に対して競合的結合を示せば、それらは抗原の中の同じまたは密接に関連したエピトープに結合し得る。エピトープは線状またはコンフォメーション状（即ち、隔たれたアミノ酸残基を含む）であってよい。たとえば、抗体または抗原結合性断片が参照抗体の抗原への結合を少なくとも８５％、または少なくとも９０％、または少なくとも９５％ブロックすれば、その抗体または抗原結合性断片は、参照抗体と同じ／密接に関連したエピトープと結合するとみなしてよい。
[0078]本明細書で用いる用語「アミノ酸」は、それぞれのアミノ酸に特有の側鎖とともにアミン（－ＮＨ２）およびカルボキシル（－ＣＯＯＨ）官能基を含む有機化合物を意味する。本開示においてアミノ酸の名称は標準的な１文字または３文字のコードとして表すこともでき、それらを以下に要約する。
Figure 2022545585000002
[0079]アミノ酸配列に関する「保存的置換」は、アミノ酸残基を、同様の物理化学的特性を有する側鎖を有する異なるアミノ酸残基で置き換えることを意味する。たとえば、保存的置換は、疎水性側鎖を有するアミノ酸残基（たとえばＭｅｔ、Ａｌａ、Ｖａｌ、Ｌｅｕ、およびＩｌｅ）の間で、中性親水性側鎖を有するアミノ酸残基（たとえばＣｙｓ、Ｓｅｒ、Ｔｈｒ、Ａｓｎ、およびＧｌｎ）の間で、酸性側鎖を有するアミノ酸残基（たとえばＡｓｐ、Ｇｌｕ）の間で、塩基性側鎖を有するアミノ酸残基（たとえばＨｉｓ、Ｌｙｓ、およびＡｒｇ）の間で、または芳香族側鎖を有するアミノ酸残基（たとえばＴｒｐ、Ｔｙｒ、およびＰｈｅ）の間で行うことができる。当技術分野で既知のように、保存的置換は通常、タンパク質のコンフォメーション構造において顕著な変化を生じず、したがってタンパク質の生物学的活性を保持することができる。
[0080]本明細書で用いる用語「相同」は、最適に整列させたときに別の配列と少なくとも６０％（たとえば少なくとも６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％）の配列同一性を有する核酸配列（またはその相補的ストランド）またはアミノ酸配列を意味する。
[0081]アミノ酸配列（または核酸配列）に関する「配列同一性パーセント（％）」は、配列を整列させ、必要な場合には同一のアミノ酸（または核酸）の数が最大になるようにギャップを導入した後の、参照配列におけるアミノ酸（または核酸）残基と同一である候補配列におけるアミノ酸（または核酸）残基のパーセンテージとして定義される。換言すれば、アミノ酸配列（または核酸配列）の配列同一性パーセント（％）は、比較する参照配列に関して同一であるアミノ酸残基（または塩基）の数を、候補配列または参照配列のどちらか短い方におけるアミノ酸残基（または塩基）の全数で除することによって計算することができる。アミノ酸残基の保存的置換は、同一の残基とみなしてもよく、みなさなくてもよい。アミノ酸（または核酸）の配列同一性パーセントを計算するための整列は、たとえばＢＬＡＳＴＮ、ＢＬＡＳＴｐ（Ｕ．Ｓ．Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ（ＮＣＢＩ）のウェブサイトから入手可能、Ａｌｔｓｃｈｕｌ Ｓ．Ｆ．ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，２１５：４０３－４１０（１９９０）；Ｓｔｅｐｈｅｎ Ｆ．ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．，２５：３３８９－３４０２（１９９７）も参照されたい）、ＣｌｕｓｔａｌＷ２（Ｅｕｒｏｐｅａｎ Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅのウェブサイトから入手可能、Ｈｉｇｇｉｎｓ Ｄ．Ｇ．ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，２６６：３８３－４０２（１９９６）；Ｌａｒｋｉｎ Ｍ．Ａ．ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ（Ｏｘｆｏｒｄ，Ｅｎｇｌａｎｄ），２３（２１）：２９４７－８（２００７）も参照されたい）、およびＡＬＩＧＮまたはＭｅｇａｌｉｇｎ（ＤＮＡＳＴＡＲ）ソフトウェア等の公衆利用可能なツールを用いて達成することができる。当業者であれば、ツールによって提供されるデフォルトパラメーターを用いてもよく、またはたとえば好適なアルゴリズムを選択することによって整列のために適切なパラメーターをカスタマイズしてもよい。
[0082]本明細書で用いる「エフェクター機能」は、抗体のＦｃ領域の、Ｃ１複合体およびＦｃ受容体等のそのエフェクターへの結合に帰せられる生物学的活性を意味する。例示的なエフェクター機能には、抗体とＣ１複合体上のＣ１ｑとの相互作用によって媒介される補体依存性細胞毒性（ＣＤＣ）、抗体のＦｃ領域のエフェクター細胞上のＦｃ受容体への結合によって媒介される抗体依存性細胞媒介細胞毒性（ＡＤＣＣ）、およびファゴサイトーシスが含まれる。エフェクター機能は、Ｆｃ受容体結合アッセイ、Ｃ１ｑ結合アッセイ、および細胞溶解アッセイ等の種々のアッセイを用いて評価することができる。
[0083]「単離された」物質は、天然の状態から人の手によって改変されている。「単離された」組成物または物質が天然に生じるならば、それはその元の環境から変化しもしくは除去されているか、またはその両方である。たとえば、生きている動物の中に天然に存在するポリヌクレオチドまたはポリペプチドは「単離されて」いないが、同じポリヌクレオチドまたはポリペプチドは、その天然の状態において共存する物質から十分に分離されて実質的に純粋な状態で存在するならば、「単離されて」いる。「単離された核酸配列」は、単離された核酸分子の配列を意味する。ある特定の実施形態では、「単離された抗体またはその抗原結合性断片」は、電気泳動法（ＳＤＳ－ＰＡＧＥ、等電点電気泳動、キャピラリ電気泳動等）またはクロマトグラフィー法（イオン交換クロマトグラフィーまたは逆相ＨＰＬＣ）によって決定して少なくとも６０％、７０％、７５％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％の純度を有する抗体またはその抗原結合性断片を意味する。
[0084]本明細書で用いる用語「ベクター」は、その中に遺伝要素が作動可能に挿入され、その遺伝要素の発現が生じて、それにより、その遺伝要素によってコードされるタンパク質、ＲＮＡ、またはＤＮＡが産生され、またはその遺伝要素が複製されるビヒクルを意味する。ベクターは、宿主細胞をトランスフォーム、トランスデュース、またはトランスフェクトして、それが宿主細胞の中に運搬する遺伝要素の発現を生じさせるために用い得る。ベクターの例には、プラスミド、ファージミド、コスミド、酵母人工染色体（ＹＡＣ）、細菌人工染色体（ＢＡＣ）、またはＰ１由来人工染色体（ＰＡＣ）等の人工染色体、ラムダファージまたはＭ１３ファージ等のバクテリオファージ、および動物ウイルスが含まれる。ベクターは、プロモーター配列、転写開始配列、エンハンサー配列、選択可能な要素、およびレポーター遺伝子等の発現を制御するための種々の要素を含んでよい。さらに、ベクターは複製の起点を含んでよい。ベクターは、ウイルス粒子、リポソーム、またはタンパク質コーティングを含むがこれらに限定されない、ベクターの細胞内への進入を補助する物質を含んでもよい。ベクターは発現ベクターまたはクローニングベクターであってよい。本開示は、抗体またはその抗原結合性断片をコードする本明細書で提供される核酸配列、核酸配列に作動可能に連結された少なくとも１つのプロモーター（たとえばＳＶ４０、ＣＭＶ、ＥＦ－１α）、および少なくとも１つの選択マーカーを含むベクター（たとえば発現ベクター）を提供する。
[0085]本明細書で用いる語句「宿主細胞」は、その中に外来のポリヌクレオチドおよび／またはベクターを導入することができ、またはこれらが導入された細胞を意味する。
[0086]用語「対象」は、ヒトおよび非ヒト動物を含む。非ヒト動物は、全ての脊椎動物、たとえば哺乳動物および非ヒト霊長類、マウス、ラット、ネコ、ウサギ、ヒツジ、イヌ、雌ウシ、ニワトリ、両生類、および爬虫類等の非哺乳動物を含む。注記した場合を除いて、用語「患者」または「対象」は、本明細書では相互交換可能に用いられる。
[0087]用語「抗腫瘍活性」は、腫瘍細胞の増殖、生存性、または転移活性の低減を意味する。たとえば、抗腫瘍活性は、治療のない対照と比較して、治療中に生じる異常な細胞の増殖速度の低下、または腫瘍のサイズの安定性もしくは低減、あるいは治療による長期生存によって示すことができる。そのような活性は、異種移植モデル、同種移植モデル、マウス乳腺腫瘍ウイルス（ＭＭＴＶ）モデル、および抗腫瘍活性を検討するための当技術分野で既知のその他のモデルを含むがこれらに限らない許容されたｉｎ ｖｉｔｒｏまたはｉｎ ｖｉｖｏの腫瘍モデルを用いて評価することができる。
[0088]本明細書で用いる疾患、障害、もしくは状態を「処置すること」またはそれらの「処置」は、疾患、障害、もしくは状態を防止しまたは軽減すること、疾患、障害、もしくは状態の発症または発生速度を遅くすること、疾患、障害、もしくは状態を発生させるリスクを低減すること、疾患、障害、もしくは状態に関連する症状の発生を防止しまたは遅延させること、疾患、障害、もしくは状態に関連する症状を低減しまたは終止させること、疾患、障害、もしくは状態を完全にまたは部分的に寛解させること、疾患、障害、もしくは状態を治癒させること、またはそれらのいくつかの組合せを含む。
[0089]用語「診断」、「診断する」、または「診断すること」は、ＣＤ３９関連疾患の同定のような、病的な状態、疾患、または状態の同定を意味し、または特定の処置レジメンによって恩恵を受ける可能性のあるＣＤ３９関連疾患を有する対象の同定を意味する。一部の実施形態では、診断はＣＤ３９の異常な量または活性の同定を含む。一部の実施形態では、診断は対象におけるがんまたは自己免疫疾患の同定を意味する。
[0090]本明細書で用いる場合、用語「生物学的試料」または「試料」は、目的の対象から得られまたは由来し、たとえば物理的、生化学的、化学的、および／または生理学的特徴に基づいて特徴付けおよび／または同定される、細胞および／またはその他の分子実体を含む生物学的組成物を意味する。生物学的試料は、当業者には既知の任意の方法によって得られる対象の細胞、組織、臓器、および／または生物学的流体を含むが、これらに限定されない。一部の実施形態では、生物学的試料は流体試料である。一部の実施形態では、流体試料は全血、血漿、血清、粘液（鼻漏および痰を含む）、腹水、胸膜液、胸水、唾液、尿、滑液、脳脊髄液（ＣＳＦ）、胸腔穿刺液、腹部の液、腹水、または心嚢液である。一部の実施形態では、生物学的試料は対象の心臓、肝臓、脾臓、肺、腎臓、皮膚、または血管から得られる組織または細胞である。
[0091]本明細書で用いる「ＣＤ３９」は、ＥＮＴＰＤ１またはＥＮＴＰＤアーゼ１としても知られている、ＡＴＰをＡＭＰに変換する内在性膜タンパク質を意味する。構造的には、これは２つの膜貫通ドメイン、小さな細胞質ドメイン、および大きな細胞外疎水性ドメインによって特徴付けられる。ある特定の実施形態では、ＣＤ３９はヒトＣＤ３９である。本明細書で用いるＣＤ３９は、マウスおよびとりわけカニクイザル等のその他の動物種からであってよい。ヒトＣＤ３９タンパク質の例示的な配列は、ＮＣＢＩ Ｒｅｆ Ｓｅｑ Ｎｏ．ＮＰ＿００１７６７．３に開示されている。Ｍｕｓ ｍｕｓｃｕｌｕｓ（マウス）ＣＤ３９タンパク質の例示的な配列はＮＣＢＩ Ｒｅｆ Ｓｅｑ Ｎｏ．ＮＰ＿０３３９７８．１に開示されている。カニクイザル（サル）ＣＤ３９タンパク質の例示的な配列はＮＣＢＩ Ｒｅｆ Ｓｅｑ Ｎｏ．ＸＰ＿０１５３１１９４５．１に開示されている。
[0092]ＣＤ３９に加えて、ＥＮＴＰＤアーゼファミリーは、ＥＮＴＰＤアーゼ２、３、４、５、６、７、および８（ＥＮＴＰＤ２、３、４、５、６、７、および８としても知られており、本開示では相互交換可能に用いる）を含む他のいくつかのメンバーをも含む。ＥＮＴＰＤアーゼのうち４つは、細胞外に面する触媒部位を有する典型的な細胞表面局在酵素（ＥＮＴＰＤアーゼ１、２、３、８）である。ＥＮＴＰＤアーゼ５および６は細胞内局在化を呈し、非相同発現の後で分泌を受ける。ＥＮＴＰＤアーゼ４および７は完全に細胞内局在化しており、細胞質オルガネラの管腔に面している。一部の実施形態では、本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片はＣＤ３９（即ちＥＮＴＰＤアーゼ１）に特異的に結合するが、他のファミリーメンバー、たとえばＥＮＴＰＤアーゼ２、３、５、または６には結合しない。
[0093]用語「抗ＣＤ３９抗体」は、ＣＤ３９（たとえばヒトまたはサルのＣＤ３９）に特異的に結合することができる抗体を意味する。用語「抗ヒトＣＤ３９抗体」は、ヒトＣＤ３９に特異的に結合することができる抗体を意味する。
[0094]本明細書で用いる「ＣＤ３９関連」の疾患、障害、または状態は、ＣＤ３９の増加したまたは減少した発現または活性によって惹起され、悪化され、またはその他に関連する任意の疾患または状態を意味する。一部の実施形態では、ＣＤ３９関連の疾患、障害、または状態は、たとえば自己免疫疾患等の免疫関連障害である。一部の実施形態では、ＣＤ３９関連の疾患、障害、または状態は、たとえばがん等の過剰な細胞の増殖に関連する障害である。ある特定の実施形態では、ＣＤ３９関連の疾患または状態は、ＣＤ３９および／またはＥＮＴＰＤ１、２、３、４、５、６、７、または８遺伝子等のＣＤ３９関連遺伝子の発現または過発現において特徴付けられる。
[0095]用語「薬学的に許容される」は、指定した担体、ビヒクル、希釈剤、賦形剤、および／または塩が一般に、その製剤を構成する他の成分と化学的におよび／または物理的に適合性があり、その受容者に生理学的に適合性があることを示す。
[0096]本明細書で用いる用語「ＣＤ３９陽性細胞」は、細胞の表面にＣＤ３９を発現する細胞（たとえば食細胞）を意味する。
[0097]抗ＣＤ３９抗体
[0098]本開示は、抗ＣＤ３９抗体およびその抗原結合性断片を提供する。本明細書で提供される抗ＣＤ３９抗体および抗原結合性断片は、ＣＤ３９に特異的に結合することができる。
[0099]ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗体およびその抗原結合性断片は、Ｂｉａｃｏｒｅアッセイによって１０－７Ｍ以下、８×１０－８Ｍ以下、５×１０－８Ｍ以下、２×１０－８Ｍ以下、８×１０－９Ｍ以下、５×１０－９Ｍ以下、２×１０－９Ｍ以下、１０－９Ｍ以下、８×１０－１０Ｍ以下、７×１０－１０Ｍ以下、または６×１０－１０Ｍ以下のＫＤ値で、ヒトＣＤ３９に特異的に結合する。Ｂｉａｃｏｒｅアッセイは表面プラスモン共鳴技術に基づいている。たとえばＭｕｒｐｈｙ，Ｍ．ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒｅｎｔ ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ ｐｒｏｔｅｉｎ ｓｃｉｅｎｃｅ，Ｃｈａｐｔｅｒ １９，ｕｎｉｔ １９．１４，２００６を参照されたい。ある特定の実施形態では、ＫＤ値は本開示の実施例５．１に記載した方法によって測定される。ある特定の実施形態では、ＫＤ値は約２５℃、または約３７℃で測定される。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗体およびその抗原結合性断片は、２５℃で測定して、３７℃で測定したＫＤ値と同程度の、たとえば３７℃で測定したＫＤ値の約８０％～約１５０％、約９０％～約１３０％、または約９０％～約１２０％、約９０％～約１１０％のＫＤ値を有する。
[00100]ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗体およびその抗原結合性断片は、Ｏｃｔｅｔアッセイによって１０－８Ｍ以下、８×１０－９Ｍ以下、５×１０－９Ｍ以下、４×１０－９Ｍ以下、３×１０－９Ｍ以下、２×１０－９Ｍ以下、１×１０－９Ｍ以下、９×１０－１０Ｍ以下、８×１０－１０Ｍ以下、７×１０－１０Ｍ以下、または６×１０－１０Ｍ以下のＫＤ値で、ヒトＣＤ３９に特異的に結合する。Ｏｃｔｅｔアッセイは、生物層干渉分光技術に基づいている。たとえばＡｂｄｉｃｈｅ，Ｙａｓｍｉｎａ Ｎ．，ｅｔ ａｌ．Ａｎａｌｙｔｉｃａｌ ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ３８６．２（２００９）：１７２－１８０およびＳｕｎ Ｙ Ｓ．，Ｉｎｓｔｒｕｍｅｎｔａｔｉｏｎ Ｓｃｉｅｎｃｅ ＆ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，２０１４，４２（２）：１０９－１２７を参照されたい。ある特定の実施形態では、ＫＤ値は本開示の実施例５．１に記載した方法によって測定される。
[00101]本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片のヒトＣＤ３９への結合は、「５０％効果濃度」（ＥＣ５０）値によっても表すことができる。ＥＣ５０値は、その最大の結合の５０％が観察される抗体の濃度を意味する。ＥＣ５０値は当技術分野で既知の結合アッセイ、たとえば酵素連結免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）等の直接または間接結合アッセイ、ＦＡＣＳアッセイ、およびその他の結合アッセイによって測定することができる。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗体およびその抗原結合性断片は、ＦＡＣＳ（蛍光活性化細胞ソーティング）アッセイによって測定して、１０－７Ｍ以下、８×１０－８Ｍ以下、５×１０－８Ｍ以下、２×１０－８Ｍ以下、１０－８Ｍ以下、８×１０－９Ｍ以下、５×１０－９Ｍ以下、２×１０－９Ｍ以下、１０－９Ｍ以下、８×１０－１０Ｍ以下、７×１０－１０Ｍ以下、または６×１０－１０Ｍ以下のＥＣ５０（即ち５０％結合濃度）で、ヒトＣＤ３９に特異的に結合する。ある特定の実施形態では、結合はＥＬＩＳＡまたはＦＡＣＳアッセイによって測定される。
[00102]一部の実施形態では、本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片は、ヒトＣＤ３９（即ちＥＮＴＰＤアーゼ１）に特異的に結合する。一部の実施形態では、本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片は、ＥＮＴＰＤアーゼファミリーの他のメンバーには結合しない。一部の実施形態では、本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片は、たとえばＥＬＩＳＡアッセイによって測定して、ヒトＣＤ３９に特異的に結合するが、ＥＮＴＰＤアーゼ２、３、５、６には特異的に結合しない。
[00103]ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗体およびその抗原結合性断片は、たとえばＦＡＣＳアッセイによって測定して、ヒトＣＤ３９に特異的に結合するが、マウスＣＤ３９には特異的に結合しない。
[00104]ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗体およびその抗原結合性断片は、ＦＡＣＳアッセイによって１０－７Ｍ以下、８×１０－８Ｍ以下、５×１０－８Ｍ以下、２×１０－８Ｍ以下、１０－８Ｍ以下、８×１０－９Ｍ以下、５×１０－９Ｍ以下、２×１０－９Ｍ以下、１０－９Ｍ以下、８×１０－１０Ｍ以下、７×１０－１０Ｍ以下、または６×１０－１０Ｍ以下のＥＣ５０で、カニクイザルＣＤ３９に特異的に結合する。
[00105]ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗体およびその抗原結合性断片は、ＡＴＰアーゼ活性アッセイによって測定して５０ｎＭ以下、４０ｎＭ以下、３０ｎＭ以下、２０ｎＭ以下、１０ｎＭ以下、８ｎＭ以下、５ｎＭ以下、３ｎＭ以下、１ｎＭ以下、０．９ｎＭ以下、０．８ｎＭ以下、０．７ｎＭ以下、０．６ｎＭ以下、０．５ｎＭ以下、０．４ｎＭ以下、０．３ｎＭ以下、０．２ｎＭ以下、０．１ｎＭ以下、０．０９ｎＭ以下、０．０８ｎＭ以下、０．０７ｎＭ以下、０．０６ｎＭ以下、または０．０５ｎＭ以下のＩＣ５０で、ＣＤ３９発現細胞中のＡＴＰアーゼ活性を阻害する。ＡＴＰアーゼ活性アッセイは当技術分野で既知の任意の方法を用いて、たとえばＡＴＰアーゼ活性の結果として放出されるリン酸塩の比色検出によって決定することができる。ある特定の実施形態では、ＡＴＰアーゼ活性は、本開示の実施例３．３に記載した方法によって決定される。
[00106]ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗体およびその抗原結合性断片は、ＣＤ８０、ＣＤ８６、および／またはＣＤ４０の上方制御が単球の活性化を示すＦＡＣＳアッセイによるＣＤ８０、ＣＤ８６、および／またはＣＤ４０の発現の解析によって測定して、５０ｎＭ以下（たとえば４０ｎＭ以下、３０ｎＭ以下、２０ｎＭ以下、１０ｎＭ以下、５ｎＭ以下、３ｎＭ以下、２ｎＭ以下、１ｎＭ以下、０．５ｎＭ以下、または０．２ｎＭ以下）の濃度で、ＡＴＰ媒介単球活性化を増強することができる。ＡＴＰ媒介単球の活性は当技術分野で既知の方法を用いて、たとえば本開示の実施例５．５に記載の方法によって決定することができる。
[00107]ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗体およびその抗原結合性断片は、ＩＬ－２の分泌、またはＩＦＮ－γの分泌、またはＣＤ４＋もしくはＣＤ８＋のＴ細胞の増殖によって測定して、たとえば本開示の実施例５．５に記載の方法によって、２５ｎＭ以下、２０ｎＭ以下、１５ｎＭ以下、１０ｎＭ以下、９ｎＭ以下、８ｎＭ以下、７ｎＭ以下、６ｎＭ以下、５ｎＭ以下、４ｎＭ以下、３ｎＭ以下、２ｎＭ以下、または１ｎＭ以下の濃度で、ＰＢＭＣ中のＡＴＰ媒介Ｔ細胞活性化を増強することができる。
[00108]ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗体およびその抗原結合性断片は、ＦＡＣＳアッセイによるＣＤ８３の発現の解析によって測定して、２５ｎＭ以下（または１０ｎＭ以下、または５ｎＭ以下、または１ｎＭ以下、または０．５ｎＭ以下）の濃度で、ＡＴＰ媒介樹状細胞（ＤＣ）活性化を増強することができる。
[00109]ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗体およびその抗原結合性断片は、Ｔ細胞の増殖を促進する活性化ＤＣの能力によって測定して、２５ｎＭ以下（または１０ｎＭ以下、または５ｎＭ以下、または１ｎＭ以下、または０．５ｎＭ以下）の濃度で、ＡＴＰ媒介ＤＣ活性化を増強することができる。
[00110]本明細書で提供される抗体およびその抗原結合性断片は、混合リンパ球反応（ＭＬＲ）アッセイにおけるＩＦＮ－γの産生を促進する活性化ＤＣの能力によって測定して、２５ｎＭ以下（または１０ｎＭ以下、または５ｎＭ以下、または１ｎＭ以下、または０．５ｎＭ以下）の濃度で、ＡＴＰ媒介ＤＣ活性化を増強することができる。
[00111]ＡＴＰ媒介ＤＣ成熟の活性は、当技術分野で既知の方法、たとえば本開示の実施例５．５に記載の方法を用いて決定することができる。
[00112]ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗体およびその抗原結合性断片は、ＦＡＣＳアッセイによって測定して１ｎＭ以下（たとえば０．１ｎＭ以下、０．０１ｎＭ以下）の濃度で、（ＡＴＰから加水分解される）アデノシンによって誘導されるＣＤ４＋Ｔ細胞の増殖の阻害をブロックすることができる。Ｔ細胞の増殖は、当技術分野で既知の方法、たとえば本開示の実施例３．４に記載の方法を用いて決定することができる。
[00113]ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗体およびその抗原結合性断片は、ＮＫ細胞またはマクロファージ細胞に依存する様式で哺乳動物における腫瘍の成長を阻害することができる。
[00114]ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗体およびその抗原結合性断片は、Ｔ細胞の増殖、ＣＤ２５＋細胞、および生細胞集団によって測定して、ｅＡＴＰによって阻害されたヒトＣＤ８＋Ｔ細胞の増殖を反転させることができる。Ｔ細胞の増殖の％、ＣＤ２５＋細胞の％、および生細胞の％は、当技術分野で既知の方法、たとえば本開示の実施例３．４に記載の方法を用いて決定することができる。
[00115]ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗体およびその抗原結合性断片は、ＥＬＩＳＡアッセイによって測定して、５０ｎＭ以下（または１２．５ｎＭ以下、または３．１３ｎＭ以下、または０．７８ｎＭ以下、または０．２ｎＭ以下、または０．０４９ｎＭ以下、または０．０１２ｎＭ以下、または０．００３ｎＭ以下、または０．０００８ｎＭ以下）の濃度で、ＬＰＳ刺激によって誘導されたヒトマクロファージのＩＬ１βの放出を増強することができる。マクロファージのＩＬ１β放出は、当技術分野で既知の方法、たとえば本開示の実施例５．５．４に記載の方法を用いて決定することができる。
[00116]実例となる抗ＣＤ３９抗体
[00117]ある特定の実施形態では、本開示は、ＮＹＧＭＮ（配列番号１）、ＫＹＷＭＮ（配列番号２）、ＮＹＷＭＮ（配列番号３）、ＤＴＦＬＨ（配列番号４）、ＤＹＮＭＹ（配列番号５）、ＤＴＹＶＨ（配列番号６）、ＬＩＮＴＹＴＧＥＰＴＹＡＤＤＦＫＤ（配列番号７）、ＥＩＲＬＫＳＮＫＹＧＴＨＹＡＥＳＶＫＧ（配列番号８）、ＱＩＲＬＮＰＤＮＹＡＴＨＸ１ＡＥＳＶＫＧ（配列番号９）、Ｘ５８ＩＤＰＡＸ５９Ｘ６０ＮＩＫＹＤＰＫＦＱＧ（配列番号１５１）、ＦＩＤＰＹＮＧＹＴＳＹＮＱＫＦＫＧ（配列番号１１）、ＲＩＤＰＡＩＤＮＳＫＹＤＰＫＦＱＧ（配列番号１２）、ＫＧＩＹＹＤＹＶＷＦＦＤＶ（配列番号１３）、ＱＬＤＬＹＷＦＦＤＶ（配列番号１４）、ＨＧＸ２ＲＧＦＡＹ（配列番号１５）、ＳＰＹＹＹＧＳＧＹＲＩＦＤＶ（配列番号１６）、ＩＹＧＹＤＤＡＹＹＦＤＹ（配列番号１７）、ＹＹＣＡＬＹＤＧＹＮＶＹＡＭＤＹ（配列番号１８）、ＫＡＳＱＤＩＮＲＹＩＡ（配列番号１９）、ＲＡＳＱＳＩＳＤＹＬＨ（配列番号２０）、ＫＳＳＱＳＬＬＤＳＤＧＲＴＨＬＮ（配列番号２１）、ＳＡＦＳＳＶＮＹＭＨ（配列番号２２）、ＳＡＴＳＳＶＳＹＭＨ（配列番号２３）、ＲＳＳＫＮＬＬＨＳＮＧＩＴＹＬＹ（配列番号２４）、ＹＴＳＴＬＬＰ（配列番号２５）、ＹＡＳＱＳＩＳ（配列番号２６）、ＬＶＳＫＬＤＳ（配列番号２７）、ＴＴＳＮＬＡＳ（配列番号２８）、ＳＴＳＮＬＡＳ（配列番号２９）、ＲＡＳＴＬＡＳ（配列番号３０）、ＬＱＹＳＮＬＬＴ（配列番号３１）、ＱＮＧＨＳＬＰＬＴ（配列番号３２）、ＷＱＧＴＬＦＰＷＴ（配列番号３３）、ＱＱＲＳＴＹＰＦＴ（配列番号３４）、ＱＱＲＩＴＹＰＦＴ（配列番号３５）、およびＡＱＬＬＥＬＰＨＴ（配列番号３６）からなる群から選択される配列を含む１つまたは複数の（たとえば１、２、３、４、５、または６つの）ＣＤＲを含む抗ＣＤ３９抗体（たとえば抗ヒトＣＤ３９抗体）およびその抗原結合性断片を提供し、ここでＸ１はＹまたはＦであり、Ｘ２はＳまたはＴであり、Ｘ５８はＲまたはＫであり、Ｘ５９はＮ、Ｇ、Ｓ、またはＱであり、Ｘ６０はＧ、Ａ、またはＤである。ある特定の実施形態では、本開示は、配列番号１～９、１１～３６、および１５１のいずれかの１つ、２つ、もしくは３つ以下のアミノ酸残基の置換を有する抗体およびその抗原結合性断片をさらに包含する。
[00118]本明細書で用いる抗体「ｍＡｂ１３」は、配列番号４２の配列を有する重鎖可変領域および配列番号５１の配列を有する軽鎖可変領域を含むモノクローナル抗体を意味する。
[00119]本明細書で用いる抗体「ｍＡｂ１４」は、配列番号４３の配列を有する重鎖可変領域および配列番号５２の配列を有する軽鎖可変領域を含むモノクローナル抗体を意味する。
[00120]本明細書で用いる抗体「ｍＡｂ１９」は、配列番号４４の配列を有する重鎖可変領域および配列番号５３の配列を有する軽鎖可変領域を含むモノクローナル抗体を意味する。
[00121]本明細書で用いる抗体「ｍＡｂ２１」は、配列番号４５の配列を有する重鎖可変領域および配列番号５４の配列を有する軽鎖可変領域を含むモノクローナル抗体を意味する。
[00122]本明細書で用いる抗体「ｍＡｂ２３」は、配列番号４７の配列を有する重鎖可変領域および配列番号５６の配列を有する軽鎖可変領域を含むモノクローナル抗体を意味する。
[00123]本明細書で用いる抗体「ｍＡｂ３４」は、配列番号４９の配列を有する重鎖可変領域および配列番号５８の配列を有する軽鎖可変領域を含むモノクローナル抗体を意味する。
[00124]本明細書で用いる抗体「ｍＡｂ３５」は、配列番号５０の配列を有する重鎖可変領域および配列番号５９の配列を有する軽鎖可変領域を含むモノクローナル抗体を意味する。
[00125]ある特定の実施形態では、本開示は、抗体ｍＡｂ１３、ｍＡｂ１４、ｍＡｂ１９、ｍＡｂ２１、ｍＡｂ２３、ｍＡｂ３４、またはｍＡｂ３５の１つまたは複数の（たとえば１、２、３、４、５、または６つの）ＣＤＲ配列を含む抗ＣＤ３９抗体およびその抗原結合性断片を提供する。
[00126]ある特定の実施形態では、本開示は、配列番号１～６からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むＨＣＤＲ１、配列番号７～９、１１～１２、および１５１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むＨＣＤＲ２、および配列番号１３～１８からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むＨＣＤＲ３、ならびに／または配列番号１９～２４からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むＬＣＤＲ１、配列番号２５～３０からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むＬＣＤＲ２、および配列番号３１～３６からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むＬＣＤＲ３を含む抗ＣＤ３９抗体およびその抗原結合性断片を提供する。
[00127]ある特定の実施形態では、本開示は、配列番号１の配列を含むＨＣＤＲ１、配列番号７の配列を含むＨＣＤＲ２、配列番号１３の配列を含むＨＣＤＲ３、ならびに／または配列番号１９の配列を含むＬＣＤＲ１、配列番号２５の配列を含むＬＣＤＲ２、および配列番号３１の配列を含むＬＣＤＲ３を含む抗ＣＤ３９抗体およびその抗原結合性断片を提供する。
[00128]ある特定の実施形態では、本開示は、配列番号２の配列を含むＨＣＤＲ１、配列番号８の配列を含むＨＣＤＲ２、配列番号１４の配列を含むＨＣＤＲ３、ならびに／または配列番号２０の配列を含むＬＣＤＲ１、配列番号２６の配列を含むＬＣＤＲ２、および配列番号３２の配列を含むＬＣＤＲ３を含む、抗ＣＤ３９抗体およびその抗原結合性断片を提供する。
[00129]ある特定の実施形態では、本開示は、配列番号３の配列を含むＨＣＤＲ１、配列番号３７の配列を含むＨＣＤＲ２、配列番号４０の配列を含むＨＣＤＲ３、ならびに／または配列番号２１の配列を含むＬＣＤＲ１、配列番号２７の配列を含むＬＣＤＲ２、および配列番号３３の配列を含むＬＣＤＲ３を含む、抗ＣＤ３９抗体およびその抗原結合性断片を提供する。
[00130]ある特定の実施形態では、本開示は、配列番号３の配列を含むＨＣＤＲ１、配列番号３８の配列を含むＨＣＤＲ２、配列番号４１の配列を含むＨＣＤＲ３、ならびに／または配列番号２１の配列を含むＬＣＤＲ１、配列番号２７の配列を含むＬＣＤＲ２、および配列番号３３の配列を含むＬＣＤＲ３を含む、抗ＣＤ３９抗体およびその抗原結合性断片を提供する。
[00131]ある特定の実施形態では、本開示は、配列番号４の配列を含むＨＣＤＲ１、配列番号１０の配列を含むＨＣＤＲ２、配列番号１６の配列を含むＨＣＤＲ３、ならびに／または配列番号２２の配列を含むＬＣＤＲ１、配列番号２８の配列を含むＬＣＤＲ２、および配列番号３４の配列を含むＬＣＤＲ３を含む、抗ＣＤ３９抗体およびその抗原結合性断片を提供する。
[00132]ある特定の実施形態では、本開示は、配列番号５の配列を含むＨＣＤＲ１、配列番号１１の配列を含むＨＣＤＲ２、配列番号１７の配列を含むＨＣＤＲ３、ならびに／または配列番号２３の配列を含むＬＣＤＲ１、配列番号２９の配列を含むＬＣＤＲ２、および配列番号３５の配列を含むＬＣＤＲ３を含む、抗ＣＤ３９抗体およびその抗原結合性断片を提供する。
[00133]ある特定の実施形態では、本開示は、配列番号６の配列を含むＨＣＤＲ１、配列番号１２の配列を含むＨＣＤＲ２、配列番号１８の配列を含むＨＣＤＲ３、ならびに／または配列番号２４の配列を含むＬＣＤＲ１、配列番号３０の配列を含むＬＣＤＲ２、および配列番号３６の配列を含むＬＣＤＲ３を含む、抗ＣＤ３９抗体およびその抗原結合性断片を提供する。
[00134]下の表１は、抗体ｍＡｂ１３、ｍＡｂ１４、ｍＡｂ１９、ｍＡｂ２１、ｍＡｂ２３、ｍＡｂ３４、およびｍＡｂ３５のＣＤＲアミノ酸配列を示す。ＣＤＲの境界はＫａｂａｔの規則によって定義し、または同定した。下の表２は、抗体ｍＡｂ１３、ｍＡｂ１４、ｍＡｂ１９、ｍＡｂ２１、ｍＡｂ２３、ｍＡｂ３４、およびｍＡｂ３５の重鎖および軽鎖の可変領域のアミノ酸配列を示す。
Figure 2022545585000003
Figure 2022545585000004
Figure 2022545585000005
[00135]抗体ｍＡｂ１３、ｍＡｂ１４、ｍＡｂ１９、ｍＡｂ２１、ｍＡｂ２３、ｍＡｂ３４、およびｍＡｂ３５のそれぞれがＣＤ３９に結合することができ、抗原結合特異性が一次的にＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３領域によって提供されることを考えれば、抗体ｍＡｂ１３、ｍＡｂ１４、ｍＡｂ１９、ｍＡｂ２１、ｍＡｂ２３、ｍＡｂ３４、およびｍＡｂ３５のＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３の配列、ならびにＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３の配列は「混合および整合されて」（即ち異なる抗体のＣＤＲは混合および整合されるが、それぞれの抗体はＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３、ならびにＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含まなくてはならない）、本開示の抗ＣＤ３９結合分子を創出することができる。そのような「混合および整合された」抗体のＣＤ３９結合は、上記および実施例に記載した結合アッセイを用いて試験することができる。好ましくは、ＶＨ ＣＤＲ配列が混合および整合される場合には、特定のＶＨ配列からのＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、および／またはＨＣＤＲ３配列は、構造的に同様のＣＤＲ配列で置き換えられる。同様に、ＶＬ ＣＤＲ配列が混合および整合される場合には、特定のＶＬ配列からのＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、および／またはＬＣＤＲ３配列は、好ましくは構造的に同様のＣＤＲ配列で置き換えられる。たとえば、抗体ｍＡｂ１３およびｍＡｂ１９のＨＣＤＲ１はいくつかの構造的同様性を共有しており、したがって混合および整合させやすい。モノクローナル抗体ｍＡｂ１３、ｍＡｂ１４、ｍＡｂ１９、ｍＡｂ２１、ｍＡｂ２３、ｍＡｂ３４、およびｍＡｂ３５について１つまたは複数のＶＨおよび／またはＶＬ ＣＤＲ配列を本明細書で開示したＣＤＲ配列からの構造的に同様の配列で置換することによって新規のＶＨおよびＶＬ配列が創出され得ることは、当業者には容易に明白になる。
[00136]ＣＤＲは抗原結合に関与していることが知られている。しかし、６つのＣＤＲの全てが不可欠または不変ではないことが見出されている。換言すれば、ＣＤ３９への特異的な結合親和性を実質的に保持しながら抗ＣＤ３９抗体ｍＡｂ１３、ｍＡｂ１４、ｍＡｂ１９、ｍＡｂ２１、ｍＡｂ２３、ｍＡｂ３４、およびｍＡｂ３５における１つまたは複数のＣＤＲを置き換え、変更、または修飾することが可能である。
[00137]ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗体およびその抗原結合性断片は、その抗体およびその抗原結合性断片がＣＤ３９に特異的に結合することができる限り、好適なフレームワーク領域（ＦＲ）配列を含む。上の表１で提供したＣＤＲ配列はマウス抗体から得られるが、これらは組換え手法等の当技術分野で既知の好適な方法を用いてとりわけマウス、ヒト、ラット、ウサギ等の任意の好適な種の任意の好適なＦＲ配列にグラフトすることができる。
[00138]ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗体およびその抗原結合性断片は、ヒト化される。ヒト化抗体またはその抗原結合性断片は、ヒトにおけるその低減した免疫原性において望ましい。ヒト化抗体は、非ヒトＣＤＲ配列がヒトまたは実質的にヒトのＦＲ配列にグラフトされているので、その可変領域においてキメラである。抗体または抗原結合性断片のヒト化は本質的に、非ヒト（マウス等）ＣＤＲ遺伝子をヒト免疫グロブリン遺伝子中の対応するヒトＣＤＲ遺伝子で置換することによって実施することができる（たとえばＪｏｎｅｓ ｅｔ ａｌ．（１９８６）Ｎａｔｕｒｅ ３２１：５２２－５２５；Ｒｉｅｃｈｍａｎｎ ｅｔ ａｌ．（１９８８）Ｎａｔｕｒｅ ３３２：３２３－３２７；Ｖｅｒｈｏｅｙｅｎ ｅｔ ａｌ．（１９８８）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２３９：１５３４－１５３６）を参照されたい）。
[00139]この目的を達成するために、当技術分野で既知の方法を用いて好適なヒト重鎖および軽鎖の可変ドメインを選択することができる。説明的な例では、「ベストフィット」アプローチを用いることができ、ここでは非ヒト（たとえばげっ歯類）抗体の可変ドメイン配列が既知のヒト可変ドメイン配列に対してスクリーニングまたはＢＬＡＳＴ処理され、非ヒトクエリー配列に最も近いヒト配列が同定され、非ヒトＣＤＲ配列をグラフトするためのヒトスキャフォールドとして用いられる（たとえばＳｉｍｓ ｅｔ ａｌ．，（１９９３）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１５１：２２９６；Ｃｈｏｔｈｉａ ｅｔ ａｌ．（１９８７）Ｊ．Ｍｏｔ．Ｂｉｏｌ．１９６：９０１を参照されたい）。あるいは、非ヒトＣＤＲのグラフト化のために、全てのヒト抗体のコンセンサス配列に由来するフレームワークを用いてもよい（たとえばＣａｒｔｅｒ ｅｔ ａｌ．（１９９２）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８９：４２８５；Ｐｒｅｓｔａ ｅｔ ａｌ．（１９９３）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１５１：２６２３を参照されたい）。
[00140]一部の実施形態では、本開示はそれぞれｈｕ１４．Ｈ１Ｌ１、ｈｕ１４．Ｈ２Ｌ１、ｈｕ１４．Ｈ３Ｌ１、ｈｕ１４．Ｈ４Ｌ１、ｈｕ１４．Ｈ１Ｌ２、ｈｕ１４．Ｈ２Ｌ２、ｈｕ１４．Ｈ３Ｌ２、ｈｕ１４．Ｈ４Ｌ２、ｈｕ１４．Ｈ１Ｌ３、ｈｕ１４．Ｈ２Ｌ３、ｈｕ１４．Ｈ３Ｌ３、ｈｕ１４．Ｈ４Ｌ３、ｈｕ１４．Ｈ１Ｌ４、ｈｕ１４．Ｈ２Ｌ４、ｈｕ１４．Ｈ３Ｌ４、およびｈｕ１４．Ｈ４Ｌ４と表記されるｃ１４の１６種のヒト化抗体を提供する。ｃ１４のそれぞれのヒト化抗体の重鎖および軽鎖の可変領域の配列番号を実施例５．１の表１６に示す。ｃ１４の１６種のヒト化抗体のそれぞれは、配列番号２の配列を含むＨＣＤＲ１、配列番号８の配列を含むＨＣＤＲ２、配列番号１４の配列を含むＨＣＤＲ３、配列番号２０の配列を含むＬＣＤＲ１、配列番号２６の配列を含むＬＣＤＲ２、および配列番号３２の配列を含むＬＣＤＲ３を含む。ＣＤＲの境界はＫａｂａｔの規則によって定義し、または同定した。
[00141]一部の実施形態では、本開示はそれぞれｈｕ２３．Ｈ１Ｌ１、ｈｕ２３．Ｈ２Ｌ１、ｈｕ２３．Ｈ３Ｌ１、ｈｕ２３．Ｈ４Ｌ１、ｈｕ２３．Ｈ１Ｌ２、ｈｕ２３．Ｈ２Ｌ２、ｈｕ２３．Ｈ３Ｌ２、ｈｕ２３．Ｈ４Ｌ２、ｈｕ２３．Ｈ１Ｌ３、ｈｕ２３．Ｈ２Ｌ３、ｈｕ２３．Ｈ３Ｌ３、ｈｕ２３．Ｈ４Ｌ３、ｈｕ２３．Ｈ１Ｌ４、ｈｕ２３．Ｈ２Ｌ４、ｈｕ２３．Ｈ３Ｌ４、ｈｕ２３．Ｈ４Ｌ４、ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ１、ｈｕ２３．Ｈ６Ｌ１、ｈｕ２３．Ｈ７Ｌ１、ｈｕ２３．Ｈ１Ｌ５、ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５、ｈｕ２３．Ｈ６Ｌ５、ｈｕ２３．Ｈ７Ｌ５、ｈｕ２３．Ｈ１Ｌ６、ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ６、ｈｕ２３．Ｈ６Ｌ６、ｈｕ２３．Ｈ７Ｌ６、ｈｕ２３．Ｈ１Ｌ７、ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ７、ｈｕ２３．Ｈ６Ｌ７、およびｈｕ２３．Ｈ７Ｌ７と表記されるｃ２３の３１種のヒト化抗体を提供する。ｃ２３のそれぞれのヒト化抗体の重鎖および軽鎖の可変領域の配列番号を実施例５．１の表１３および表１４に示す。上の抗体ｃ２３についての３１種のヒト化抗体のそれぞれは、配列番号４の配列を含むＨＣＤＲ１、配列番号１０の配列を含むＨＣＤＲ２、配列番号１６の配列を含むＨＣＤＲ３、配列番号２２の配列を含むＬＣＤＲ１、配列番号２８の配列を含むＬＣＤＲ２、および配列番号３４の配列を含むＬＣＤＲ３を含む。ＣＤＲの境界はＫａｂａｔの規則によって定義し、または同定した。
[00142]一部の実施形態では、本開示は、ＨＣＤＲ２のアミノ酸配列が異なることを除いてｃ２３と同じＣＤＲを有する６種のヒト化抗体をも提供する。一部の実施形態では、これらのｃ２３のバリアント（ｃ２３’）のヒト化抗体のＨＣＤＲ２のアミノ酸配列は、Ｘ５８ＩＤＰＡＸ５９Ｘ６０ＮＩＫＹＤＰＫＦＱＧ（配列番号１５１）のアミノ酸配列を含み、ここでＸ５８はＲまたはＫであり、Ｘ５９はＮ、Ｇ、Ｓ、またはＱであり、Ｘ６０はＧ、Ａ、またはＤである。一部の実施形態では、これらのｃ２３のバリアント（ｃ２３’）のヒト化抗体のＨＣＤＲ２のアミノ酸配列は、ＲＩＤＰＡＧＧＮＩＫＹＤＰＫＦＱＧ（配列番号１３４）、ＲＩＤＰＡＳＧＮＩＫＹＤＰＫＦＱＧ（配列番号１３５）、ＲＩＤＰＡＱＧＮＩＫＹＤＰＫＦＱＧ（配列番号１３６）、ＲＩＤＰＡＮＡＮＩＫＹＤＰＫＦＱＧ（配列番号１３７）、ＲＩＤＰＡＮＤＮＩＫＹＤＰＫＦＱＧ（配列番号１３８）、およびＫＩＤＰＡＮＧＮＩＫＹＤＰＫＦＱＧ（配列番号１３９）からなる群から選択される配列を含む。ＣＤＲの境界はＫａｂａｔの規則によって定義し、または同定した。
[00143]一部の実施形態では、本開示は、ｈｕ２３．２０１、ｈｕ２３．２０３、ｈｕ２３．２０７、およびｈｕ２３．２１１と表記される、酵母ディスプレイによるｃ２３バリアントに対する４種のヒト化抗体をも提供する。ヒト化抗体ｈｕ２３．２０１、ｈｕ２３．２０３、ｈｕ２３．２０７、およびｈｕ２３．２１１の重鎖可変領域および軽鎖可変領域を実施例５．１の表１５に示す。４種のヒト化抗体ｈｕ２３．２０１、ｈｕ２３．２０３、ｈｕ２３．２０７、およびｈｕ２３．２１１のそれぞれは、配列番号４の配列を含むＨＣＤＲ１、配列番号１０の配列を含むＨＣＤＲ２、配列番号１６の配列を含むＨＣＤＲ３、配列番号２２の配列を含むＬＣＤＲ１、配列番号２８の配列を含むＬＣＤＲ２、および配列番号３４の配列を含むＬＣＤＲ３を含む。ＣＤＲの境界はＫａｂａｔの規則によって定義し、または同定した。
[00144]下の表３は、ヒト化ｃ１４重鎖可変領域の４つのバリアント（即ちｈｕ１４．ＶＨ＿１、ｈｕ１４．ＶＨ＿２、ｈｕ１４．ＶＨ＿３、およびｈｕ１４．ＶＨ＿４）およびヒト化ｃ１４軽鎖可変領域の４つのバリアント（即ちｈｕ１４．ＶＬ＿１、ｈｕ１４．ＶＬ＿２、ｈｕ１４．ＶＬ＿３、およびｈｕ１４．ＶＬ＿４）を示す。下の表４は、ヒト化ｃ１４の重鎖および軽鎖の可変領域についてのＦＲのアミノ酸配列を示す。下の表５は、それぞれｈｕ１４．Ｈ１Ｌ１、ｈｕ１４．Ｈ２Ｌ１、ｈｕ１４．Ｈ３Ｌ１、ｈｕ１４．Ｈ４Ｌ１、ｈｕ１４．Ｈ１Ｌ２、ｈｕ１４．Ｈ２Ｌ２、ｈｕ１４．Ｈ３Ｌ２、ｈｕ１４．Ｈ４Ｌ２、ｈｕ１４．Ｈ１Ｌ３、ｈｕ１４．Ｈ２Ｌ３、ｈｕ１４．Ｈ３Ｌ３、ｈｕ１４．Ｈ４Ｌ３、ｈｕ１４．Ｈ１Ｌ４、ｈｕ１４．Ｈ２Ｌ４、ｈｕ１４．Ｈ３Ｌ４、ｈｕ１４．Ｈ４Ｌ４と表記されるキメラ抗体ｃ１４についての１６種のヒト化抗体のそれぞれの重鎖および軽鎖のＦＲアミノ酸配列を示す。これら１６種のヒト化抗体の重鎖可変領域および軽鎖可変領域を実施例５．１の表１６に示す。
Figure 2022545585000006
Figure 2022545585000007
Figure 2022545585000008
[00145]下の表６は、ヒト化ｃ２３重鎖可変領域の７つのバリアント（即ちｈｕ２３．ＶＨ＿１、ｈｕ２３．ＶＨ＿２、ｈｕ２３．ＶＨ＿３、ｈｕ２３．ＶＨ＿４、ｈｕ２３．ＶＨ＿５、ｈｕ２３．ＶＨ＿６、およびｈｕ２３．ＶＨ＿７）およびヒト化ｃ２３軽鎖可変領域の７つのバリアント（即ちｈｕ２３．ＶＬ＿１、ｈｕ２３．ＶＬ＿２、ｈｕ２３．ＶＬ＿３、ｈｕ２３．ＶＬ＿４、ｈｕ２３．ＶＬ＿５、ｈｕ２３．ＶＬ＿６、およびｈｕ２３．ＶＬ＿７）を示す。下の表７に、酵母ディスプレイによって得られたキメラ抗体ｃ２３についての４種のヒト化抗体の重鎖および軽鎖の可変領域のアミノ酸配列を示す。下の表８に、ｃ２３の３５種のヒト化抗体のＦＲアミノ酸配列を示す。下の表９に、ｃ２３の３５種のヒト化抗体のそれぞれの重鎖および軽鎖についてのＦＲアミノ酸配列を示す。
Figure 2022545585000009
Figure 2022545585000010
Figure 2022545585000011
Figure 2022545585000012
Figure 2022545585000013
Figure 2022545585000014
[00146]ある特定の実施形態では、本明細書で提供されるヒト化抗体またはその抗原結合性断片は、非ヒトであるＣＤＲ配列を除いて、実質的に全てのヒト配列からなっている。一部の実施形態では、可変領域ＦＲおよび存在する場合には定常領域は、完全にまたは実質的にヒト免疫グロブリン配列からのものである。ヒトＦＲ配列およびヒト定常領域配列は異なるヒト免疫グロブリン遺伝子由来でよく、たとえばＦＲ配列は１つのヒト抗体由来であり、定常領域は別のヒト抗体に由来する。一部の実施形態では、ヒト化抗体またはその抗原結合性断片は、ヒト重鎖ＨＦＲ１～４、および／または軽鎖ＬＦＲ１～４を含む。
[00147]一部の実施形態では、ヒトに由来するＦＲ領域は、それが由来する元のヒト免疫グロブリンと同じアミノ酸配列を含んでよい。一部の実施形態では、ヒトＦＲの１つまたは複数のアミノ酸残基は、親の非ヒト抗体からの対応する残基で置換される。これは、ある特定の実施形態ではヒト化抗体またはその断片を非ヒト親抗体の構造に密接に近似させ、それによって結合特性を最適化（たとえば結合親和性を増大）させるために望ましい。ある特定の実施形態では、本明細書で提供されるヒト化抗体またはその抗原結合性断片は、ヒトＦＲ配列のそれぞれにおいて１０、９、８、７、６、５、４、３、２、もしくは１個以下のアミノ酸残基の置換、または重鎖もしくは軽鎖の可変ドメインの全てのＦＲ配列において１０、９、８、７、６、５、４、３、２、もしくは１個以下のアミノ酸残基の置換を含む。一部の実施形態では、アミノ酸残基におけるそのような変化は、重鎖ＦＲ領域にのみ、軽鎖ＦＲ領域にのみ、または両方の鎖に存在し得る。ある特定の実施形態では、ヒトＦＲ配列の１つまたは複数のアミノ酸はランダムに変異して結合親和性を増大させる。ある特定の実施形態では、ヒトＦＲ配列の１つまたは複数のアミノ酸は親の非ヒト抗体の対応するアミノ酸に復帰変異して結合親和性を増大させる。
[00148]ある特定の実施形態では、本開示は、Ｘ１９ＶＱＬＶＸ２０ＳＧＸ２１Ｘ２２Ｘ２３Ｘ２４ＫＰＧＸ２５ＳＸ２６Ｘ２７Ｘ２８ＳＣＸ２９ＡＳＧＸ３０Ｘ３１Ｘ３２Ｘ３３（配列番号７６）の配列またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含む重鎖ＨＦＲ１、ＷＶＸ３４ＱＸ３５ＰＧＸ３６Ｘ３７ＬＥＷＸ３８Ｘ３９（配列番号７７）の配列またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含む重鎖ＨＦＲ２、Ｘ４０Ｘ４１ＴＸ４２Ｘ４３Ｘ４４ＤＸ４５ＳＸ４６Ｘ４７ＴＸ４８ＹＸ４９Ｘ５０Ｘ５１Ｘ５２ＳＬＸ５３Ｘ５４ＥＤＴＡＶＹＹＣＸ５５Ｘ５６（配列番号７８）の配列またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含む重鎖ＨＦＲ３、およびＷＧＱＧＴＸ５７ＶＴＶＳＳ（配列番号１２６）の配列またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含む重鎖ＨＦＲ４を含む、ヒト化抗ＣＤ３９抗体およびその抗原結合性断片をも提供し、ここでＸ１９はＱまたはＥであり、Ｘ２０はＥまたはＱであり、Ｘ２１はＧまたはＡであり、Ｘ２２はＧまたはＥであり、Ｘ２３はＬまたはＶであり、Ｘ２４はＶまたはＫであり、Ｘ２５はＧまたはＡであり、Ｘ２６はＬ、Ｍ、またはＶであり、Ｘ２７はＲまたはＫであり、Ｘ２８はＶまたはＬであり、Ｘ２９はＡまたはＫであり、Ｘ３０はＦまたはＹであり、Ｘ３１はＮまたはＴであり、Ｘ３２はＦまたはＬであり、Ｘ３３はＳまたはＫであり、Ｘ３４はＲまたはＫであり、Ｘ３５はＡまたはＳであり、Ｘ３６はＫまたはＱであり、Ｘ３７はＲまたはＧであり、Ｘ３８はＭ、Ｉ、またはＶであり、Ｘ３９はＧまたはＡであり、Ｘ４０はＲまたはＫであり、Ｘ４１はＶ、Ａ、またはＦであり、Ｘ４２はＩまたはＬであり、Ｘ４３はＳまたはＴであり、Ｘ４４はＲまたはＡであり、Ｘ４５はＤまたはＴであり、Ｘ４６はＫ、Ａ、またはＳであり、Ｘ４７はＳまたはＮであり、Ｘ４８はＬ、Ｖ、またはＡであり、Ｘ４９はＭまたはＬであり、Ｘ５０はＱまたはＥであり、Ｘ５１はＭまたはＬであり、Ｘ５２はＳ、Ｉ、またはＮであり、Ｘ５３はＲまたはＫであり、Ｘ５４はＳまたはＴであり、Ｘ５５はＡまたはＴであり、Ｘ５６はＲ、Ｎ、またはＴであり、Ｘ５７はＴまたはＬである。
[00149]ある特定の実施形態では、本開示は、Ｘ３ＩＶＸ４ＴＱＳＰＡＴＬＸ５Ｘ６ＳＰＧＥＲＸ７ＴＸ８Ｘ９Ｃ（配列番号８０）の配列またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含む軽鎖ＬＦＲ１、ＷＹＱＱＫＰＧＱＸ１０ＰＸ１１ＬＬＩＹ（配列番号８１）の配列またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含む軽鎖ＬＦＲ２、ＧＸ１２ＰＸ１３ＲＦＳＧＳＧＳＧＴＸ１４Ｘ１５ＴＬＴＩＳＳＸ１６ＥＰＥＤＦＡＶＹＸ１７Ｃ（配列番号８２）の配列またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含む軽鎖ＬＦＲ３、およびＦＧＸ１８ＧＴＫＬＥＩＫ（配列番号１５２）の配列またはその少なくとも８０％の相同配列を含む軽鎖ＬＦＲ４を含む、ヒト化抗ＣＤ３９抗体およびその抗原結合性断片をも提供し、ここでＸ３はＥまたはＱであり、Ｘ４はＬまたはＭであり、Ｘ５はＳまたはＴであり、Ｘ６はＬ、Ｖ、またはＡであり、Ｘ７はＡまたはＶであり、Ｘ８はＬまたはＩであり、Ｘ９はＳまたはＴであり、Ｘ１０はＡまたはＳであり、Ｘ１１はＲまたはＫであり、Ｘ１２はＩまたはＶであり、Ｘ１３はＡまたはＴであり、Ｘ１４はＤまたはＳであり、Ｘ１５はＦまたはＹであり、Ｘ１６はＬ、Ｍ、またはＶであり、Ｘ１７はＹまたはＦであり、Ｘ１８はＧまたはＱである。
[00150]ある特定の実施形態では、本開示は、ＥＶＱＬＶＥＳＧＧＧＬＶＫＰＧＧＳＸ６１ＲＬＳＣＡＡＳＧＦＴＦＳ（配列番号１５４）の配列またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含む重鎖ＨＦＲ１、ＷＶＲＱＸ６２ＰＧＫＧＬＥＷＶＸ６３（配列番号１５５）の配列またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含む重鎖ＨＦＲ２、ＲＦＴＩＳＲＤＤＳＫＮＴＸ６４ＹＬＱＭＮＳＬＫＴＥＤＴＡＶＹＹＣＴＴ（配列番号１５６）の配列またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含む重鎖ＨＦＲ３、ＷＧＱＧＴＴＶＴＶＳＳ（配列番号７９）の配列またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含む重鎖ＨＦＲ４を含む、ヒト化抗ＣＤ３９抗体およびその抗原結合性断片をも提供し、ここでＸ６１はＬまたはＭであり、Ｘ６２はＡまたはＳであり、Ｘ６３はＧまたはＡであり、Ｘ６４はＬまたはＶである。
[00151]ある特定の実施形態では、本開示は、ＥＩＶＸ６５ＴＱＳＰＡＴＬＳＸ６６ＳＰＧＥＲＸ６７ＴＬＳＣ（配列番号１５７）またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含む軽鎖ＬＦＲ１、ＷＹＱＱＫＰＧＱＸ６８ＰＲＬＬＩＹ（配列番号１５８）の配列またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含む軽鎖ＬＦＲ２、ＧＩＰＡＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＴＩＳＳＸ６９ＥＰＥＤＦＡＶＹＸ７０Ｃ（配列番号１５９）の配列またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含む軽鎖ＬＦＲ３、およびＦＧＧＧＴＫＬＥＩＫ（配列番号１５３）またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含む軽鎖ＬＦＲ４を含む、ヒト化抗ＣＤ３９抗体およびその抗原結合性断片をも提供し、ここでＸ６５はＬまたはＭであり、Ｘ６６はＬまたはＶであり、Ｘ６７はＡまたはＶであり、Ｘ６８はＡまたはＳであり、Ｘ６９はＬまたはＶであり、Ｘ７０はＹまたはＦである。
[00152]ある特定の実施形態では、本開示は、Ｘ７１ＶＱＬＶＱＳＧＡＥＶＫＫＰＧＡＳＶＫＸ７２ＳＣＫＡＳＧＹＸ７３ＬＫ（配列番号１６０）の配列またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含む重鎖ＨＦＲ１、ＷＶＸ７４ＱＡＰＧＱＸ７５ＬＥＷＸ７６Ｇ（配列番号１６１）の配列またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含む重鎖ＨＦＲ２、Ｘ７７Ｘ７８ＴＸ７９ＴＸ８０ＤＴＳＸ８１Ｘ８２ＴＡＹＸ８３ＥＬＸ８４ＳＬＲＳＥＤＴＡＶＹＹＣＡＸ８５（配列番号１４９）の配列またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含む重鎖ＨＦＲ３、ＷＧＱＧＴＸ５７ＶＴＶＳＳ（配列番号１２６）またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含む重鎖ＨＦＲ４を含む、ヒト化抗ＣＤ３９抗体およびその抗原結合性断片をも提供し、ここでＸ５７は上で定義した通りであり、Ｘ７１はＱまたはＥであり、Ｘ７２はＶまたはＬであり、Ｘ７３はＮまたはＴであり、Ｘ７４はＲまたはＫであり、Ｘ７５はＲまたはＧであり、Ｘ７６はＭまたはＩであり、Ｘ７７はＲまたはＫであり、Ｘ７８はＶまたはＡであり、Ｘ７９はＩまたはＬであり、Ｘ８０はＲまたはＡであり、Ｘ８１はＡまたはＳであり、Ｘ８２はＳまたはＮであり、Ｘ８３はＭまたはＬであり、Ｘ８４はＳまたはＩであり、Ｘ８５はＲまたはＮである。
[00153]ある特定の実施形態では、本開示は、Ｘ８６ＩＶＬＴＱＳＰＡＴＬＸ８７Ｘ８８ＳＰＧＥＲＸ８９ＴＸ９０Ｘ９１Ｃ（配列番号１５０）の配列またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含む軽鎖ＬＦＲ１、ＷＹＱＱＫＰＧＱＸ１０ＰＸ１１ＬＬＩＹ（配列番号８１）の配列またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含む軽鎖ＬＦＲ２、ＧＸ９２ＰＸ９３ＲＦＳＧＳＧＳＧＴＸ９４Ｘ９５ＴＬＴＩＳＳＸ９６ＥＰＥＤＦＡＶＹＹＣ（配列番号１４８）の配列またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含む軽鎖ＬＦＲ３、およびＦＧＱＧＴＫＬＥＩＫ（配列番号８３）の配列またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含む軽鎖ＬＦＲ４を含む、ヒト化抗ＣＤ３９抗体およびその抗原結合性断片をも提供し、ここでＸ１０およびＸ１１は上で定義した通りであり、Ｘ８６はＥまたはＱであり、Ｘ８７はＳまたはＴであり、Ｘ８８はＬまたはＡであり、Ｘ８９はＡまたはＶであり、Ｘ９０はＬまたはＩであり、Ｘ９１はＳまたはＴであり、Ｘ９２はＩまたはＶであり、Ｘ９３はＡまたはＴであり、Ｘ９４はＤまたはＳであり、Ｘ９５はＦまたはＹであり、Ｘ９６はＬまたはＭである。
[00154]ある特定の実施形態では、本開示は、配列番号８４～８６、１１５、１１９～１２０、および１３１からなる群から選択される配列を含む重鎖ＨＦＲ１、配列番号８７～９０および１２１～１２３の配列を含む重鎖ＨＦＲ２、配列番号９１～９７、１１６～１１７、および１２４～１２５からなる群から選択される配列を含む重鎖ＨＦＲ３、および配列番号７９および１１８からなる群から選択される配列を含む重鎖ＨＦＲ４、ならびに／または配列番号９８～１０３および１２７～１２９からなる群からの配列を含む軽鎖ＬＦＲ１、配列番号１０４、１０５、および１３０からなる群から選択される配列を含む軽鎖ＬＦＲ２、配列番号１０６～１１０および１３２～１３３からなる群から選択される配列を含む軽鎖ＬＦＲ３、および配列番号８３および１５３からなる群から選択される配列を含む軽鎖ＬＦＲ４を含む、ヒト化抗ＣＤ３９抗体およびその抗原結合性断片をも提供する。
[00155]ある特定の実施形態では、本開示は、ｈｕ１４．ＶＨ＿１（配列番号６８）、ｈｕ１４．ＶＨ＿２（配列番号７０）、ｈｕ１４．ＶＨ＿３（配列番号７２）、ｈｕ１４．ＶＨ＿４（配列番号７４）、ｈｕ２３．ＶＨ＿１（配列番号６０）、ｈｕ２３．ＶＨ＿２（配列番号６２）、ｈｕ２３．ＶＨ＿３（配列番号６４）、ｈｕ２３．ＶＨ＿４（配列番号６６）、ｈｕ２３．ＶＨ＿５（配列番号１４０）、ｈｕ２３．ＶＨ＿６（配列番号１４１）、ｈｕ２３．ＶＨ＿７（配列番号１４２）、ｈｕ２３．２０１Ｈ（配列番号１４６）、ｈｕ２３．２０７Ｈ（配列番号１４７）、およびｈｕ２３．２１１Ｈ（配列番号３９）からなる群から選択される重鎖可変領域に含まれるＨＦＲ１、ＨＦＲ２、ＨＦＲ３、および／またはＨＦＲ４配列を含む、ヒト化抗ＣＤ３９およびその抗原結合性断片をも提供する。
[00156]ある特定の実施形態では、本開示は、ｈｕ１４．ＶＬ＿１（配列番号６９）、ｈｕ１４．ＶＬ＿２（配列番号７１）、ｈｕ１４．ＶＬ＿３（配列番号７３）、ｈｕ１４．ＶＬ＿４（配列番号７５）、ｈｕ２３．ＶＬ＿１（配列番号６１）、ｈｕ２３．ＶＬ＿２（配列番号６３）、ｈｕ２３．ＶＬ＿３（配列番号６５）、ｈｕ２３．ＶＬ＿４（配列番号６７）、ｈｕ２３．ＶＬ＿５（配列番号１４３）、ｈｕ２３．ＶＬ＿６（配列番号１４４）、ｈｕ２３．ＶＬ＿７（配列番号１４５）、ｈｕ２３．２０１Ｌ（配列番号１１１）、ｈｕ２３．２０３Ｌ（配列番号１１２）、およびｈｕ２３．２１１Ｌ（配列番号６３）からなる群から選択される軽鎖可変領域に含まれるＬＦＲ１、ＬＦＲ２、ＬＦＲ３、および／またはＬＦＲ４配列を含む、ヒト化抗ＣＤ３９およびその抗原結合性断片をも提供する。
[00157]ある特定の実施形態では、本明細書で提供されるヒト化抗ＣＤ３９抗体およびその抗原結合性断片は、配列番号３９、６０、６２、６４、６６、６８、７０、７２、７４、１４０、１４１、１４２、１４６、１４７からなる群から選択される重鎖可変ドメイン配列、ならびに／または配列番号６１、６３、６５、６７、６９、７１、７３、７５、１１１、１１２、１４３、１４４、および１４５からなる群から選択される軽鎖可変ドメイン配列を含む。
[00158]本開示は、
１）ｈｕ１４．ＶＨ＿１（配列番号６８）の重鎖可変領域およびｈｕ１４．ＶＬ＿１（配列番号６９）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ１４．Ｈ１Ｌ１」、
２）ｈｕ１４．ＶＨ＿２（配列番号７０）の重鎖可変領域およびｈｕ１４．ＶＬ＿１（配列番号６９）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ１４．Ｈ２Ｌ１」、
３）ｈｕ１４．ＶＨ＿３（配列番号７２）の重鎖可変領域およびｈｕ１４．ＶＬ＿１（配列番号６９）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ１４．Ｈ３Ｌ１」、
４）ｈｕ１４．ＶＨ＿４（配列番号７４）の重鎖可変領域およびｈｕ１４．ＶＬ＿１（配列番号６９）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ１４．Ｈ４Ｌ１」、
５）ｈｕ１４．ＶＨ＿１（配列番号６８）の重鎖可変領域およびｈｕ１４．ＶＬ＿２（配列番号７１）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ１４．Ｈ１Ｌ２」、
６）ｈｕ１４．ＶＨ＿２（配列番号７０）の重鎖可変領域およびｈｕ１４．ＶＬ＿２（配列番号７１）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ１４．Ｈ２Ｌ２」、
７）ｈｕ１４．ＶＨ＿３（配列番号７２）の重鎖可変領域およびｈｕ１４．ＶＬ＿２（配列番号７１）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ１４．Ｈ３Ｌ２」、
８）ｈｕ１４．ＶＨ＿４（配列番号７４）の重鎖可変領域およびｈｕ１４．ＶＬ＿２（配列番号７１）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ１４．Ｈ４Ｌ２」、
９）ｈｕ１４．ＶＨ＿１（配列番号６８）の重鎖可変領域およびｈｕ１４．ＶＬ＿３（配列番号７３）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ１４．Ｈ１Ｌ３」、
１０）ｈｕ１４．ＶＨ＿２（配列番号７０）の重鎖可変領域およびｈｕ１４．ＶＬ＿３（配列番号７３）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ１４．Ｈ２Ｌ３」、
１１）ｈｕ１４．ＶＨ＿３（配列番号７２）の重鎖可変領域およびｈｕ１４．ＶＬ＿３（配列番号７３）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ１４．Ｈ３Ｌ３」、
１２）ｈｕ１４．ＶＨ＿４（配列番号７４）の重鎖可変領域およびｈｕ１４．ＶＬ＿３（配列番号７３）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ１４．Ｈ４Ｌ３」、
１３）ｈｕ１４．ＶＨ＿１（配列番号６８）の重鎖可変領域およびｈｕ１４．ＶＬ＿４（配列番号７５）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ１４．Ｈ１Ｌ４」、
１４）ｈｕ１４．ＶＨ＿２（配列番号７０）の重鎖可変領域およびｈｕ１４．ＶＬ＿４（配列番号７５）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ１４．Ｈ２Ｌ４」、
１５）ｈｕ１４．ＶＨ＿３（配列番号７２）の重鎖可変領域およびｈｕ１４．ＶＬ＿４（配列番号７５）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ１４．Ｈ３Ｌ４」、ならびに
１６）ｈｕ１４．ＶＨ＿４（配列番号７４）の重鎖可変領域およびｈｕ１４．ＶＬ＿４（配列番号７５）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ１４．Ｈ４Ｌ４」
を含むキメラ抗体ｃ１４の例示的なヒト化抗体をも提供する。
[00159]本開示は、
１）ｈｕ２３．ＶＨ＿１（配列番号６０）の重鎖可変領域およびｈｕ２３．ＶＬ＿１（配列番号６１）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ２３．Ｈ１Ｌ１」、
２）ｈｕ２３．ＶＨ＿２（配列番号６２）の重鎖可変領域およびｈｕ２３．ＶＬ＿１（配列番号６１）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ２３．Ｈ２Ｌ１」、
３）ｈｕ２３．ＶＨ＿３（配列番号６４）の重鎖可変領域およびｈｕ２３．ＶＬ＿１（配列番号６１）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ２３．Ｈ３Ｌ１」、
４）ｈｕ２３．ＶＨ＿４（配列番号６６）の重鎖可変領域およびｈｕ２３．ＶＬ＿１（配列番号６１）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ２３．Ｈ４Ｌ１」、
５）ｈｕ２３．ＶＨ＿１（配列番号６０）の重鎖可変領域およびｈｕ２３．ＶＬ＿２（配列番号６３）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ２３．Ｈ１Ｌ２」、
６）ｈｕ２３．ＶＨ＿２（配列番号６２）の重鎖可変領域およびｈｕ２３．ＶＬ＿２（配列番号６３）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ２３．Ｈ２Ｌ２」、
７）ｈｕ２３．ＶＨ＿３（配列番号６４）の重鎖可変領域およびｈｕ２３．ＶＬ＿２（配列番号６３）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ２３．Ｈ３Ｌ２」、
８）ｈｕ２３．ＶＨ＿４（配列番号６６）の重鎖可変領域およびｈｕ２３．ＶＬ＿２（配列番号６３）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ２３．Ｈ４Ｌ２」、
９）ｈｕ２３．ＶＨ＿１（配列番号６０）の重鎖可変領域およびｈｕ２３．ＶＬ＿３（配列番号６５）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ２３．Ｈ１Ｌ３」、
１０）ｈｕ２３．ＶＨ＿２（配列番号６２）の重鎖可変領域およびｈｕ２３．ＶＬ＿３（配列番号６５）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ２３．Ｈ２Ｌ３」、
１１）ｈｕ２３．ＶＨ＿３（配列番号６４）の重鎖可変領域およびｈｕ２３．ＶＬ＿３（配列番号６５）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ２３．Ｈ３Ｌ３」、
１２）ｈｕ２３．ＶＨ＿４（配列番号６６）の重鎖可変領域およびｈｕ２３．ＶＬ＿３（配列番号６５）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ２３．Ｈ４Ｌ３」、
１３）ｈｕ２３．ＶＨ＿１（配列番号６０）の重鎖可変領域およびｈｕ２３．ＶＬ＿４（配列番号６７）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ２３．Ｈ１Ｌ４」、
１４）ｈｕ２３．ＶＨ＿２（配列番号６２）の重鎖可変領域およびｈｕ２３．ＶＬ＿４（配列番号６７）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ２３．Ｈ２Ｌ４」、
１５）ｈｕ２３．ＶＨ＿３（配列番号６４）の重鎖可変領域およびｈｕ２３．ＶＬ＿４（配列番号６７）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ２３．Ｈ３Ｌ４」、
１６）ｈｕ２３．ＶＨ＿４（配列番号６６）の重鎖可変領域およびｈｕ２３．ＶＬ＿４（配列番号６７）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ２３．Ｈ４Ｌ４」、
１７）ｈｕ２３．ＶＨ＿５（配列番号１４０）の重鎖可変領域およびｈｕ２３．ＶＬ＿１（配列番号６１）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ１」、
１８）ｈｕ２３．ＶＨ＿６（配列番号１４１）の重鎖可変領域およびｈｕ２３．ＶＬ＿１（配列番号６１）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ２３．Ｈ６Ｌ１」、
１９）ｈｕ２３．ＶＨ＿７（配列番号１４２）の重鎖可変領域およびｈｕ２３．ＶＬ＿１（配列番号６１）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ２３．Ｈ７Ｌ１」、
２０）ｈｕ２３．ＶＨ＿１（配列番号６０）の重鎖可変領域およびｈｕ２３．ＶＬ＿５（配列番号１４３）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ２３．Ｈ１Ｌ５」、
２１）ｈｕ２３．ＶＨ＿５（配列番号１４０）の重鎖可変領域およびｈｕ２３．ＶＬ＿５（配列番号１４３）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５」、
２２）ｈｕ２３．ＶＨ＿６（配列番号１４１）の重鎖可変領域およびｈｕ２３．ＶＬ＿５（配列番号１４３）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ２３．Ｈ６Ｌ５」、
２３）ｈｕ２３．ＶＨ＿７（配列番号１４２）の重鎖可変領域およびｈｕ２３．ＶＬ＿５（配列番号１４３）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ２３．Ｈ７Ｌ５」、
２４）ｈｕ２３．ＶＨ＿１（配列番号６０）の重鎖可変領域およびｈｕ２３．ＶＬ＿６（配列番号１４４）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ２３．Ｈ１Ｌ６」、
２５）ｈｕ２３．ＶＨ＿５（配列番号１４０）の重鎖可変領域およびｈｕ２３．ＶＬ＿６（配列番号１４４）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ６」、
２６）ｈｕ２３．ＶＨ＿６（配列番号１４１）の重鎖可変領域およびｈｕ２３．ＶＬ＿６（配列番号１４４）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ２３．Ｈ６Ｌ６」、
２７）ｈｕ２３．ＶＨ＿７（配列番号１４２）の重鎖可変領域およびｈｕ２３．ＶＬ＿６（配列番号１４４）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ２３．Ｈ７Ｌ６」、
２８）ｈｕ２３．ＶＨ＿１（配列番号６０）の重鎖可変領域およびｈｕ２３．ＶＬ＿７（配列番号１４５）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ２３．Ｈ１Ｌ７」、
２９）ｈｕ２３．ＶＨ＿５（配列番号１４０）の重鎖可変領域およびｈｕ２３．ＶＬ＿７（配列番号１４５）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ７」、
３０）ｈｕ２３．ＶＨ＿６（配列番号１４１）の重鎖可変領域およびｈｕ２３．ＶＬ＿７（配列番号１４５）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ２３．Ｈ６Ｌ７」、
３１）ｈｕ２３．ＶＨ＿７（配列番号１４２）の重鎖可変領域およびｈｕ２３．ＶＬ＿７（配列番号１４５）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ２３．Ｈ７Ｌ７」、
３２）ｈｕ２３．２０１Ｈ（配列番号１４６）の重鎖可変領域およびｈｕ２３．２０１Ｌ（配列番号１１１）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ２３．２０１」、
３３）ｈｕ２３．２０１Ｈ（配列番号１４６）の重鎖可変領域およびｈｕ２３．２０３Ｌ（配列番号１１２）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ２３．２０３」、
３４）ｈｕ２３．２０７Ｈ（配列番号１４７）の重鎖可変領域およびｈｕ２３．２０１Ｌ（配列番号１１１）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ２３．２０７」、ならびに
３５）ｈｕ２３．２１１Ｈ（配列番号３９）の重鎖可変領域およびｈｕ２３．２１１Ｌ（配列番号６３）の軽鎖可変領域を含む「ｈｕ２３．２１１」
を含むキメラ抗体ｃ２３の例示的なヒト化抗体をも提供する。
[00160]これらの例示的なヒト化抗ＣＤ３９抗体はＣＤ３９に対する特異的な結合能力または親和性を保持しており、その観点において親のマウス抗体ｍＡｂ１４またはｍＡｂ２３と少なくとも同程度またはそれより優れていた。
[00161]一部の実施形態では、本明細書で提供される抗ＣＤ３９抗体および抗原結合性断片は、重鎖可変ドメインの全てもしくは一部、および／または軽鎖可変ドメインの全てもしくは一部を含む。一実施形態では、本明細書で提供される抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片は、本明細書で提供される重鎖可変ドメインの全てまたは一部からなる単鎖ドメイン抗体である。そのような単鎖ドメイン抗体のさらなる情報は当技術分野で利用可能である（たとえば米国特許第６，２４８，５１６号を参照されたい）。
[00162]ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片は、免疫グロブリン（Ｉｇ）の定常領域をさらに含み、これは任意選択で重鎖および／または軽鎖の定常領域をさらに含む。ある特定の実施形態では、重鎖定常領域はＣＨ１、ヒンジ、および／またはＣＨ２－ＣＨ３領域（または任意選択でＣＨ２－ＣＨ３－ＣＨ４領域）を含む。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片は、ヒトＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１、ＩｇＡ２、またはＩｇＭの重鎖定常領域を含む。ある特定の実施形態では、軽鎖定常領域はＣκまたはＣλを含む。本明細書で提供される抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片の定常領域は、野生型の定常領域の配列と同一であってもよく、１つまたは複数の変異において異なってもよい。
[00163]ある特定の実施形態では、重鎖定常領域はＦｃ領域を含む。Ｆｃ領域は、抗体依存性細胞性細胞毒性（ＡＤＣＣ）および抗体の補体依存性細胞毒性（ＣＤＣ）等のエフェクター機能を媒介することが知られている。異なるＩｇアイソタイプのＦｃ領域はエフェクター機能を誘導する異なる能力を有する。たとえば、ＩｇＧ１およびＩｇＧ３のＦｃ領域は、ＩｇＧ２およびＩｇＧ４のＦｃ領域より効果的にＡＤＣＣとＣＤＣの両方を誘導することが認識されている。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗ＣＤ３９抗体およびその抗原結合性断片は、ＡＤＣＣまたはＣＤＣを誘導することができるＩｇＧ１またはＩｇＧ３アイソタイプのＦｃ領域を含み、あるいはエフェクター機能が低減しまたは枯渇したＩｇＧ４もしくはＩｇＧ２アイソタイプの定常領域を含む。一部の実施形態では、ヒトＩｇＧ１に由来するＦｃ領域は低減したエフェクター機能を有する。一部の実施形態では、ヒトＩｇＧ１に由来するＦｃ領域はＬ２３４Ａおよび／またはＬ２３５Ａの変異を含む。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片は、野生型のヒトＩｇＧ４ Ｆｃ領域またはその他の野生型のヒトＩｇＧ４の対立遺伝子を含む。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片は、Ｓ２２８Ｐの変異および／もしくはＬ２３５Ｅの変異、ならびに／またはＦ２３４ＡおよびＬ２３５Ａの変異を含むヒトＩｇＧ４ Ｆｃ領域を含む。一部の実施形態では、ヒトＩｇＧ４に由来するＦｃ領域はＳ２２８Ｐの変異ならびに／またはＦ２３４ＡおよびＬ２３５Ａの変異を含む。
[00164]ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片は、診断用および／または治療用に提供するために十分なヒトＣＤ３９に対する特異的結合親和性を有する。
[00165]本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片は、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、ヒト化抗体、キメラ抗体、組換え抗体、二重特異的抗体、多重特異的抗体、標識抗体、二価抗体、抗イディオタイプ抗体、または融合タンパク質であってよい。組換え抗体は、動物体内でなくｉｎ ｖｉｔｒｏで組換え法を用いて調製された抗体である。
[00166]ある特定の実施形態では、本開示は、ＣＤ３９との結合について本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片と競合する、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片を提供する。ある特定の実施形態では、本開示は、ヒトＣＤ３９との結合について配列番号４３の配列を含む重鎖可変領域および配列番号５２の配列を含む軽鎖可変領域を含む抗体と競合する、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片を提供する。ある特定の実施形態では、本開示は、ヒトＣＤ３９との結合について配列番号４４の配列を含む重鎖可変領域および配列番号５３の配列を含む軽鎖可変領域を含む抗体と競合する、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片を提供する。ある特定の実施形態では、本開示は、ヒトＣＤ３９との結合について配列番号４５の配列を含む重鎖可変領域および配列番号５４の配列を含む軽鎖可変領域を含む抗体と競合するか、またはヒトＣＤ３９との結合について配列番号４７の配列を含む重鎖可変領域および配列番号５６の配列を含む軽鎖可変領域を含む抗体と競合する、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片を提供する。
[0096]一部の実施形態では、本開示は、ＣＤ３９のエピトープと特異的に結合する抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片を提供し、ここでエピトープはＱ９６、Ｎ９９、Ｅ１４３、Ｒ１４７、Ｒ１３８、Ｍ１３９、Ｅ１４２、Ｋ５、Ｅ１００、Ｄ１０７、Ｖ８１、Ｅ８２、Ｒ１１１、およびＶ１１５からなる群から選択される１つまたは複数の残基を含む。
[00167]一部の実施形態では、エピトープはＱ９６、Ｎ９９、Ｅ１４３、およびＲ１４７からなる群から選択される１つまたは複数の残基を含む。一部の実施形態では、エピトープは残基Ｑ９６、Ｎ９９、Ｅ１４３、およびＲ１４７の全てを含む。
[00168]一部の実施形態では、エピトープはＲ１３８、Ｍ１３９、およびＥ１４２からなる群から選択される１つまたは複数の残基を含む。一部の実施形態では、エピトープは残基Ｒ１３８、Ｍ１３９、およびＥ１４２の全てを含む。
[00169]一部の実施形態では、エピトープはＫ５、Ｅ１００、およびＤ１０７からなる群から選択される１つまたは複数の残基を含む。一部の実施形態では、エピトープは残基Ｋ５、Ｅ１００、およびＤ１０７の全てを含む。
[00170]一部の実施形態では、エピトープはＶ８１、Ｅ８２、Ｒ１１１、およびＶ１１５からなる群から選択される１つまたは複数の残基を含む。一部の実施形態では、エピトープは残基Ｖ８１、Ｅ８２、Ｒ１１１、およびＶ１１５の全てを含む。
[00171]一部の実施形態では、ＣＤ３９はヒトＣＤ３９である。一部の実施形態では、ＣＤ３９は配列番号１６２のアミノ酸配列を含むヒトＣＤ３９である。
[00172]一部の実施形態では、本明細書で提供される抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片は、抗体９－８Ｂ、抗体Ｔ８９５、および抗体Ｉ３９４のいずれでもない。
[00173]本明細書で用いる「９－８Ｂ」は、配列番号４６のアミノ酸配列を有する重鎖可変領域および配列番号４８のアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合性断片を意味する。
[00174]本明細書で用いる「Ｔ８９５」は、配列番号５５のアミノ酸配列を有する重鎖可変領域および配列番号５７のアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合性断片を意味する。
[00175]本明細書で用いる「Ｉ３９４」は、配列番号１１３のアミノ酸配列を有する重鎖可変領域および配列番号１１４のアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域を含む抗体またはその抗原結合性断片を意味する。
[00176]抗体バリアント
[00177]本明細書で提供される抗体およびその抗原結合性断片は、本明細書で提供される抗体配列の種々のバリアントをも包含する。
[00178]ある特定の実施形態では、抗体バリアントは、上の表１で提供したＣＤＲ配列の１つもしくは複数、上の表４、表５、表８、および表９で提供した重鎖可変領域もしくは軽鎖可変領域の非ＣＤＲ配列の１つもしくは複数、ならびに／または定常領域（たとえばＦｃ領域）における１つまたは複数の修飾または置換を含む。そのようなバリアントはＣＤ３９に対するそれらの親抗体の結合特異性を保持しているが、修飾または置換によって与えられる１つまたは複数の望ましい特性を有する。たとえば、抗体バリアントは、改善された抗原結合親和性、改善されたグリコシル化パターン、低減されたグリコシル化のリスク、低減された脱アミノ化、低減されまたは枯渇したエフェクター機能、改善されたＦｃＲｎ受容体結合、増大した薬物動態学的半減期、ｐＨ感受性、および／またはコンジュゲート化に対する適合性（たとえば導入された１つまたは複数のシステイン残基）を有し得る。
[00179]当技術分野で既知の方法、たとえば「アラニンスキャニング変異生成」を用いて親抗体配列をスクリーニングして、修飾しまたは置換するために好適なまたは好ましい残基を同定してよい（たとえばCunningham and Wells (1989) Science，244:1081-1085を参照されたい）。簡単には、標的の残基（たとえばＡｒｇ、Ａｓｐ、Ｈｉｓ、Ｌｙｓ、およびＧｌｕ等の荷電残基）を同定し、中性または陰荷電のアミノ酸（たとえばアラニンまたはポリアラニン）で置き換えることができ、修飾された抗体を産生して目的の特性についてスクリーニングする。特定のアミノ酸の位置における置換によって目的の機能の変化が実証されれば、その位置を修飾または置換のための可能性のある残基として同定することができる。可能性のある残基は、異なる種類の残基（たとえばシステイン残基、陽荷電残基等）で置換することによってさらに評価してよい。
[00180]親和性バリアント
[00181]抗体の親和性バリアントは、上の表１で提供した１つもしくは複数のＣＤＲ配列、上の表４、表５、表８、および表９で提供した１つもしくは複数のＦＲ配列、または上の表２、表３、表６、および表７で提供した重鎖または軽鎖の可変領域配列における修飾または置換を含んでよい。ＣＤＲ領域は可変領域において２つのＦＲ領域に隣接していることが当技術分野で公知であるので、ＦＲ配列は、上の表１におけるＣＤＲ配列および上の表２、表３、表６、および表７における可変領域配列に基づいて当業者によって容易に同定することができる。親和性バリアントはＣＤ３９に対する親抗体の特異的結合親和性を保持し、または親抗体よりも改善されたＣＤ３９特異的結合親和性さえも有する。ある特定の実施形態では、ＣＤＲ配列、ＦＲ配列、または可変領域配列における置換の少なくとも１つ（または全て）は、保存的置換を含む。
[00182]当業者であれば、上の表１で提供したＣＤＲ配列、ならびに上の表２、表３、表６、および表７で提供した可変領域配列において、１つまたは複数のアミノ酸残基が置換され、しかも得られる抗体もしくは抗原結合性断片がまだＣＤ３９に対する結合親和性もしくは結合容量を保持し、または改善された結合親和性もしくは容量さえも有することが理解される。この目的を達成するために、当技術分野で既知の種々の方法を用いることができる。たとえば、ファージディスプレイ技術を用いて抗体バリアント（ＦａｂまたはｓｃＦｖバリアント等）のライブラリーを生成して発現させ、次いでヒトＣＤ３９への結合親和性についてスクリーニングすることができる。別の例として、コンピューターソフトウェアを用いて抗体のヒトＣＤ３９への結合を仮想的に模擬し、結合界面を形成する抗体上のアミノ酸残基を同定することができる。そのような残基は、結合親和性の低減を防止するために置換において避けるか、またはより強い結合を提供するために置換の標的としてもよい。
[00183]ある特定の実施形態では、本明細書で提供されるヒト化抗体またはその抗原結合性断片は、ＣＤＲ配列の１つもしくは複数において、および／またはＦＲ配列の１つもしくは複数において、１つまたは複数のアミノ酸残基の置換を含む。ある特定の実施形態では、親和性バリアントは、ＣＤＲ配列中および／またはＦＲ配列中、合計で２０、１５、１０、９、８、７、６、５、４、３、２、または１以下の置換を含む。
[00184]ある特定の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片は、上の表１に列挙したＣＤＲと少なくとも８０％（たとえば少なくとも８５％、８８％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％）の配列同一性を有する１つ、２つ、または３つのＣＤＲ配列を含み、しかもその親抗体と同様またはそれより高いレベルでさえＣＤ３９に対する特異的結合親和性を保持している。
[00185]ある特定の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片は、上の表２、表３、表６、および表７に列挙した可変領域配列と少なくとも８０％（たとえば少なくとも８５％、８８％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％）の配列同一性を有する１つまたは複数の可変領域配列を含み、しかもその親抗体と同様またはそれより高いレベルでさえＣＤ３９に対する特異的結合親和性を保持している。一部の実施形態では、上の表２、表３、表６、および表７に列挙した可変領域配列において全部で１～１０個のアミノ酸が置換され、挿入され、または欠失している。一部の実施形態では、置換、挿入、または欠失は、ＣＤＲの外（たとえばＦＲの中）の領域で起こる。
[00186]グリコシル化バリアント
[00187]本明細書で提供される抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片は、抗体またはその抗原結合性断片のグリコシル化の程度を増加しまたは減少することによって得られるグリコシル化バリアントをも包含する。
[00188]抗体またはその抗原結合性断片は、グリコシル化部位を導入しまたは除去する１つまたは複数の修飾を含んでよい。グリコシル化部位は、炭水化物部分（たとえばオリゴ糖構造）を結合することができる側鎖を有するアミノ酸残基である。抗体のグリコシル化は、典型的にはＮ連結またはＯ連結である。Ｎ連結は、アスパラギン残基、たとえばアスパラギン－Ｘ－セリンおよびアスパラギン－Ｘ－スレオニン等のトリペプチド配列においてＸがプロリンを除く任意のアミノ酸である、アスパラギン残基の側鎖への炭水化物部分の結合を意味する。Ｏ連結グリコシル化は、糖、Ｎ－アセチルガラクトサミン、ガラクトース、またはキシロースのうちの１つの、ヒドロキシアミノ酸、最も一般的にはセリンまたはスレオニンへの結合を意味する。天然のグリコシル化部位の除去は、たとえば配列中に存在する上記のトリペプチド配列（Ｎ連結グリコシル化部位について）またはセリンもしくはスレオニン残基（Ｏ連結グリコシル化部位について）の１つが置換されるようにアミノ酸配列を改変することによって、便利に達成することができる。そのようなトリペプチド配列またはセリンもしくはスレオニン残基を導入することによって、新たなグリコシル化部位を同様に創出することができる。
[00189]ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗ＣＤ３９抗体および抗原結合性断片は、１つまたは複数の脱アミド化部位を除去するために、Ｎ５５、Ｇ５６、およびＮ２３９からなる群から選択される位置に１つまたは複数の変異を含む。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗ＣＤ３９抗体および抗原結合性断片は、Ｎ５５の変異（たとえばＮ５５Ｇ、Ｎ５５Ｓ、またはＮ５５Ｑ）、および／またはＧ５６の変異（たとえばＧ５６Ａ、Ｇ５６Ｄ）、および／またはＮ２９７の変異（たとえばＮ２９７Ａ、Ｎ２９７Ｑ、またはＮ２９７Ｇ）を含む。これらの変異を試験し、本明細書で提供される抗体の結合親和性に悪影響を与えないと考えられる。
[00190]システイン操作されたバリアント
[00191]本明細書で提供される抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片は、導入された１つまたは複数の遊離のシステインアミノ酸残基を含む、システイン操作されたバリアントをも包含する。
[00192]遊離のシステイン残基は、ジスルフィド架橋の部分ではない残基である。システイン操作されたバリアントは、操作されたシステインの部位で、たとえばマレイミドまたはハロアセチルによって、たとえば細胞毒性および／またはイメージング化合物、標識、またはとりわけ放射性同位体とコンジュゲートするために有用である。抗体またはその抗原結合性断片を操作して遊離のシステイン残基を導入する方法は当技術分野で既知であり、たとえばＷＯ２００６／０３４４８８を参照されたい。
[00193]Ｆｃバリアント
[00194]本明細書で提供される抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片は、たとえばＡＤＣＣおよびＣＤＣ等の改変されたエフェクター機能を提供するために、Ｆｃ領域および／またはヒンジ領域に１つまたは複数のアミノ酸残基の修飾または置換を含むＦｃバリアントをも包含する。抗体操作によってＡＤＣＣ活性を改変する方法は当技術分野において記載されており、たとえばＳｈｉｅｌｄｓ ＲＬ．ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ．２００１．２７６（９）：６５９１－６０４；Ｉｄｕｓｏｇｉｅ ＥＥ．ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ．２０００．１６４（８）：４１７８－８４；Ｓｔｅｕｒｅｒ Ｗ．ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ．１９９５，１５５（３）：１１６５－ ７４；Ｉｄｕｓｏｇｉｅ ＥＥ．ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ．２００１，１６６（４）：２５７１－５；Ｌａｚａｒ ＧＡ．ｅｔ ａｌ．，ＰＮＡＳ，２００６，１０３（１１）：４００５－４０１０；Ｒｙａｎ ＭＣ．ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌ．Ｃａｎｃｅｒ Ｔｈｅｒ．，２００７，６：３００９－３０１８；Ｒｉｃｈａｒｄｓ ＪＯ，．ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌ Ｃａｎｃｅｒ Ｔｈｅｒ．２００８，７（８）：２５１７－２７；Ｓｈｉｅｌｄｓ Ｒ．Ｌ．ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ，２００２，２７７：２６７３３－２６７４０；Ｓｈｉｎｋａｗａ Ｔ．ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ，２００３，２７８：３４６６－３４７３を参照されたい。
[00195]本明細書で提供される抗体または抗原結合性断片のＣＤＣ活性は、たとえばＣ１ｑ結合および／またはＣＤＣを改善しまたは減退させることによって改変することもできる（たとえばＷＯ９９／５１６４２；Ｄｕｎｃａｎ ＆ Ｗｉｎｔｅｒ Ｎａｔｕｒｅ ３２２：７３８－４０（１９８８）；米国特許第５，６４８，２６０号;米国特許第５，６２４，８２１号;ならびにＦｅ領域バリアントの他の例に関してはＷＯ９４／２９３５１を参照されたい）。Ｆｃ領域のアミノ酸残基３２９、３３１、および３２２から選択される１つまたは複数のアミノ酸を異なるアミノ酸残基で置き換えて、Ｃ１ｑの結合および／または低減されもしくは消失された補体依存性細胞毒性（ＣＤＣ）を改変することができる（たとえばＩｄｕｓｏｇｉｅらによる米国特許第６，１９４，５５１号を参照されたい）。１つまたは複数のアミノ酸置換を導入して、抗体の補体を固定する能力を改変することもできる（ＢｏｄｍｅｒらによるＰＣＴ公開ＷＯ ９４／２９３５１を参照されたい）。
[00196]ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片は低減したエフェクター機能を有し、ＩｇＧ１において２３４、２３５、２３７、２３８、２６８、２９７、３０９、３３０、および３３１からなる群から選択される位置に１つまたは複数のアミノ酸置換を含む。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片はＩｇＧ１アイソタイプのものであり、Ｎ２９７Ａ、Ｎ２９７Ｑ、Ｎ２９７Ｇ、Ｌ２３５Ｅ、Ｌ２３４Ａ、Ｌ２３５Ａ、Ｌ２３４Ｆ、Ｌ２３５Ｅ、Ｐ３３１Ｓからなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸の置換、またはそれらの任意の組合せを含む。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片はＩｇＧ１アイソタイプのものであり、Ｌ２３４ＡおよびＬ２３５Ａの変異を含む。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片はＩｇＧ２アイソタイプのものであり、Ｈ２６８Ｑ、Ｖ３０９Ｌ、Ａ３３０Ｓ、Ｐ３３１Ｓ、Ｖ２３４Ａ、Ｇ２３７Ａ、Ｐ２３８Ｓ、Ｈ２６８Ａからなる群から選択される１つまたは複数のアミノ酸の置換、またはそれらの任意の組合せ（たとえばＨ２６８Ｑ／Ｖ３０９Ｌ／Ａ３３０Ｓ／Ｐ３３１Ｓ、Ｖ２３４Ａ／Ｇ２３７Ａ／Ｐ２３８Ｓ／Ｈ２６８Ａ／Ｖ３０９Ｌ／Ａ３３０Ｓ／Ｐ３３１Ｓ）を含む。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片はＩｇＧ４アイソタイプのものであり、Ｓ２２８Ｐ、Ｎ２９７Ａ、Ｎ２９７Ｑ、Ｎ２９７Ｇ、Ｌ２３５Ｅ、Ｆ２３４Ａ、Ｌ２３５Ａからなる群から選択される１つまたは複数のアミノ酸の置換、またはそれらの任意の組合せを含む。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片はＩｇＧ２／ＩｇＧ４交差アイソタイプのものである。ＩｇＧ２／ＩｇＧ４交差アイソタイプの例はＲｏｔｈｅｒ ＲＰ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ ２５：１２５６－１２６４（２００７）に記載されている。
[00197]ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗ＣＤ３９抗体およびその抗原結合性断片はＩｇＧ４アイソタイプのものであり、２２８、２３４、および２３５の１つまたは複数の点に１つまたは複数のアミノ酸の置換を含む。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗ＣＤ３９抗体および抗原結合性断片はＩｇＧ４アイソタイプのものであり、Ｆｃ領域にＳ２２８Ｐの変異ならびに／またはＬ２３５Ｅの変異ならびに／またはＦ２３４ＡおよびＬ２３５Ａの変異を含む。
[00198]ある特定の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片は、新生児Ｆｃ受容体（ＦｃＲｎ）へのｐＨ依存性結合を改善する１つまたは複数のアミノ酸の置換を含む。そのようなバリアントは酸性ｐＨでＦｃＲｎに結合してこれをリソソーム内での分解から逃れさせ、次いで転座して細胞外に放出されることを可能にするので、延長された薬物動態学的半減期を有することができる。抗体またはその抗原結合性断片を操作してＦｃＲｎとの結合親和性を改善する方法は当技術分野で公知であり、たとえばＶａｕｇｈｎ，Ｄ．ｅｔ ａｌ．，Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ，６（１）：６３－７３，１９９８；Ｋｏｎｔｅｒｍａｎｎ，Ｒ．ｅｔ ａｌ．，Ａｎｔｉｂｏｄｙ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ，Ｖｏｌｕｍｅ １，Ｃｈａｐｔｅｒ ２７：Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ ｏｆ ｔｈｅ Ｆｃ ｒｅｇｉｏｎ ｆｏｒ ｉｍｐｒｏｖｅｄ ＰＫ，ｐｕｂｌｉｓｈｅｄ ｂｙ Ｓｐｒｉｎｇｅｒ，２０１０；Ｙｅｕｎｇ，Ｙ．ｅｔ ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓｅａｒｃｈ，７０：３２６９－３２７７（２０１０）；ａｎｄ Ｈｉｎｔｏｎ，Ｐ．ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，１７６：３４６－３５６（２００６）を参照されたい。
[00199]ある特定の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片は、Ｆｃ領域の界面においてヘテロ二量化を容易にしおよび／または促進する１つまたは複数のアミノ酸の置換を含む。これらの修飾は、第１のＦｃポリペプチドへの突出部の導入および第２のＦｃポリペプチドへの空洞の導入を含み、突出部が空洞の中に位置して第１および第２のＦｃポリペプチドの相互作用が促進され、ヘテロ二量体または複合体が形成される。これらの修飾を有する抗体を生成する方法は、たとえば米国特許第５，７３１，１６８号に記載されているように当技術分野で既知である。
[00200]抗原結合性断片
[00201]抗ＣＤ３９抗原結合性断片も、本明細書で提供される。種々の型の抗原結合性断片が当技術分野で既知であり、たとえばそのＣＤＲが上の表１に示され、可変配列が表２、表３、表６、および表７に示される、例示的な抗体ならびにその種々のバリアント（親和性バリアント、グリコシル化バリアント、Ｆｃバリアント、システイン操作されたバリアント、その他）を含む本明細書で提供される抗ＣＤ３９抗体に基づいて開発することができる。
[00202]ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗ＣＤ３９抗原結合性断片は、ダイアボディ、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆｄ、Ｆｖ断片、ジスルフィド安定化Ｆｖ断片（ｄｓＦｖ）、（ｄｓＦｖ）２、二重特異的ｄｓＦｖ（ｄｓＦｖ－ｄｓＦｖ’）、ジスルフィド安定化ダイアボディ（ｄｓダイアボディ）、単鎖抗体分子（ｓｃＦｖ）、ｓｃＦｖダイマー（二価ダイアボディ）、多重特異的抗体、ラクダ化単鎖ドメイン抗体、ナノボディ、ドメイン抗体、および二価ドメイン抗体である。
[00203]そのような抗原結合性断片の産生のために種々の手法を用いることができる。実例的な方法には、インタクトな抗体の酵素消化（たとえばＭｏｒｉｍｏｔｏ ｅｔ ａｌ．，Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｂｉｏｃｈｅｍｉｃａｌ ａｎｄ Ｂｉｏｐｈｙｓｉｃａｌ Ｍｅｔｈｏｄｓ ２４：１０７－１１７（１９９２）；およびＢｒｅｎｎａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２２９：８１（１９８５）を参照されたい）、E.coli等の宿主細胞による組換え発現（たとえばＦａｂ、Ｆｖ、およびＳｃＦｖ抗体断片のため）、上で論じたファージディスプレイライブラリーからのスクリーニング（たとえばＳｃＦｖのため）、およびＦ（ａｂ’）２断片を形成するための２つのＦａｂ’－ＳＨ断片の化学的カップリング（Ｃａｒｔｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ １０：１６３－１６７（１９９２））が含まれる。抗体断片の産生のためのその他の手法は、当業者には明らかになる。
[00204]ある特定の実施形態では、抗原結合性断片はｓｃＦｖである。ｓｃＦｖの生成は、たとえばＷＯ ９３／１６１８５；米国特許第５，５７１，８９４号および第５，５８７，４５８号に記載されている。ＳｃＦｖはアミノまたはカルボキシル末端でエフェクタータンパク質と融合して、融合タンパク質を提供することができる（たとえばＡｎｔｉｂｏｄｙ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ，Ｂｏｒｒｅｂａｅｃｋ編を参照されたい）。
[00205]ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片は、二価、四価、六価、または多価である。二価を超えるいずれの分子も多価と考えられ、たとえば三価、四価、六価等を包含する。
[00206]二価分子は、２つの結合部位がいずれも同じ抗原または同じエピトープへの結合について特異的であれば、単一特異的である。これは、ある特定の実施形態では、抗原またはエピトープに対して一価の対応物よりも強い結合を提供する。同様に、多価分子も単一特異的であり得る。ある特定の実施形態では、二価または多価の抗原結合性部分において、結合部位の第１の価および結合部位の第２の価は構造的に同一である（即ち、同じ配列を有する）か、または構造的に異なる（即ち、同じ特異性であるが異なる配列を有する）。
[00207]二価も、２つの結合部位が異なる抗原またはエピトープに特異的であれば、二重特異的であり得る。これは多価分子にもあてはまる。たとえば、三価分子は、２つの結合部位が第１の抗原（またはエピトープ）に対して単一特異的で、第３の結合部位が第２の抗原（またはエピトープ）に対して特異的であれば、二重特異的であり得る。
[00208]二重特異的抗体
[00209]ある特定の実施形態では、抗ＣＤ抗体またはその抗原結合性断片は、二重特異的である。ある特定の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片は、前記ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片とは異なる結合特異性を有する第２の機能性部分にさらに連結されている。
[00210]ある特定の実施形態では、本明細書で提供される二重特異的抗体またはその抗原結合性断片は、ＣＤ３９以外の第２の抗原、またはＣＤ３９の上の第２のエピトープに特異的に結合することができる。ある特定の実施形態では、第２の抗原は、ＴＧＦベータ、ＣＤ７３、ＰＤ１、ＰＤＬ１、４－１ＢＢ、ＣＴＬＡ４、ＴＩＧＩＴ、ＧＩＴＡ、ＶＩＳＴＡ、ＴＩＧＩＴ、Ｂ７－Ｈ３、Ｂ７－Ｈ４、Ｂ７－Ｈ５、ＣＤ１１２Ｒ、Ｓｉｇｌｅｃ－１５、ＬＡＧ３、およびＴＩＭ－３からなる群から選択される。
[00211]コンジュゲート
[00212]一部の実施形態では、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片は、１つまたは複数のコンジュゲート部分をさらに含む。コンジュゲート部分は、抗体またはその抗原結合性断片に連結することができる。コンジュゲート部分は、抗体またはその抗原結合性断片に結合することができる部分である。種々のコンジュゲート部分が本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片に連結され得ることが意図されている（たとえば「Ｃｏｎｊｕｇａｔｅ Ｖａｃｃｉｎｅｓ」，Ｃｏｎｔｒｉｂｕｔｉｏｎｓ ｔｏ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ ａｎｄ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，Ｊ．Ｍ．Ｃｒｕｓｅ ａｎｄ Ｒ．Ｅ．Ｌｅｗｉｓ，Ｊｒ．（ｅｄｓ．），Ｃａｒｇｅｒ Ｐｒｅｓｓ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，（１９８９）を参照されたい）。これらのコンジュゲート部分は、とりわけ共有結合、親和性結合、インターカレーション、配位結合、複合体化、会合、ブレンド、または付加によって、抗体またはその抗原結合性断片に連結され得る。一部の実施形態では、抗体またはその抗原結合性断片は、リンカーを介して１つまたは複数のコンジュゲートに連結することができる。
[00213]ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片は、エピトープ結合部分の外に、１つまたは複数のコンジュゲート部分への結合に利用できる特定の部位を含むように操作してよい。たとえば、そのような部位は、コンジュゲート部分への共有結合リンケージを容易にする１つまたは複数の反応性アミノ酸残基、たとえばシステインまたはヒスチジン残基を含んでよい。
[00214]ある特定の実施形態では、抗体またはその抗原結合性断片は、コンジュゲート部分に間接的に、または別のコンジュゲート部分を通して連結されてもよい。たとえば、本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片をビオチンにコンジュゲートさせ、次いでアビジンにコンジュゲートした第２のコンジュゲートに間接的にコンジュゲートしてよい。一部の実施形態では、コンジュゲート部分は、クリアランス修飾剤（たとえば半減期を延長させるＰＥＧ等のポリマー）、化学療法剤、毒素、放射性同位体、ランタニド、検出可能な標識（たとえば発光標識、蛍光標識、酵素基質標識）、ＤＮＡアルキル化剤、トポイソメラーゼ阻害剤、チューブリンバインダー、精製部分、またはその他の抗がん薬物を含む。
[00215]「毒素」は、細胞に有害なまたは細胞に損傷を与えもしくはこれを殺す任意の薬剤であり得る。毒素の例には、タキソール、サイトカラシンＢ、グラミシジンＤ、エチジウムブロミド、エメチン、マイトマイシン、エトポシド、テノポシド、ビンクリスチン、ＭＭＡＥ、ＭＭＡＦ、ＤＭ１、ビンブラスチン、コルヒチン、ドキソルビシン、ダウノルビシン、ジヒドロキシアンスラシンジオン、ミトキサントロン、ミスラマイシン、アクチノマイシンＤ、１－デヒドロテストステロン、グルココルチコイド、プロカイン、テトラカイン、リドカイン、プロプラノロール、プロマイシンおよびそのアナログ、抗代謝物（たとえばメトトレキサート、６－メルカプトプリン、６－チオグアニン、シタラビン、５－フルオロウラシルデカルバジン）、アルキル化剤（たとえばメクロレタミン、チオエパクロラムブシル、メルファラン、カルムスチン（ＢＳＮＵ）およびロムスチン（ＣＣＮＵ）、シクロホスファミド、ブスルファン、ジブロモマニトール、ストレプトゾトシン、マイトマイシンＣ、およびｃｉｓ－ジクロロジアミン白金（ＩＩ）（ＤＤＰ）シスプラチン、アンスラサイクリン類（たとえばダウノルビシン（以前はダウノマイシン）およびドキソルビシン）、抗生剤（たとえばダクチノマイシン（以前はアクチノマイシン）、ブレオマイシン、ミスラマイシンおよびアンスラマイシン（ＡＭＣ））、抗有糸分裂剤（たとえばビンクリスチンおよびビンブラスチン）、トポイソメラーゼ阻害剤、ならびにチューブリンバインダーが限定なく含まれる。
[00216]検出可能な標識の例には、蛍光標識（たとえばフルオレセイン、ローダミン、ダンシル、フィコエリスリン、またはテキサスレッド）、酵素基質標識（たとえばセイヨウワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、ルセリフェラーゼ類、グルコアミラーゼ、リゾチーム、サッカライドオキシダーゼ類、またはβ－Ｄ－ガラクトシダーゼ）、放射性同位体（たとえば１２３Ｉ、１２４Ｉ、１２５Ｉ、１３１Ｉ、３５Ｓ、３Ｈ、１１１Ｉｎ、１１２Ｉｎ、１４Ｃ、６４Ｃｕ、６７Ｃｕ、８６Ｙ、８８Ｙ、９０Ｙ、１７７Ｌｕ、２１１Ａｔ、１８６Ｒｅ、１８８Ｒｅ、１５３Ｓｍ、２１２Ｂｉ、および３２Ｐ、その他のランタニド）、発光標識、色素体部分、ジゴキシゲニン、ビオチン／アビジン、ＤＮＡ分子、または検出用の金が含まれてよい。
[00217]ある特定の実施形態では、コンジュゲート部分は、抗体の半減期を延長することを補助するクリアランス修飾剤であり得る。説明的な例には、水溶性ポリマー、たとえばＰＥＧ、カルボキシメチルセルロース、デキストラン、ポリビニルアルコール、ポリビニルピロリドン、エチレングリコール／プロピレングリコールのコポリマー、その他が含まれる。ポリマーは任意の分子量のものであってよく、分枝しても分枝しなくてもよい。抗体に結合されるポリマーの数は変動し、２つ以上のポリマーが結合される場合にはこれらは同じ分子または異なる分子であり得る。
[00218]ある特定の実施形態では、コンジュゲート部分は磁気ビーズ等の精製部分であり得る。
[00219]ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片は、コンジュゲートのための基礎として用いられる。
[00220]ポリヌクレオチドおよび組換え方法
[00221]本開示は、本明細書で提供される抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片をコードする単離されたポリヌクレオチドを提供する。本明細書で用いる用語「核酸」または「ポリヌクレオチド」は、一本鎖または二本鎖の形態のデオキシリボ核酸（ＤＮＡ）またはリボ核酸（ＲＮＡ）およびそのポリマーを意味する。他に指示しなければ、特定のポリヌクレオチド配列は、その保存的に修飾されたバリアント（たとえば縮重コドン置換）、対立遺伝子、オルソログ、ＳＮＰ、および相補的配列をも黙示的に包含し、ならびに明白に示された配列を包含する。具体的には、縮重コドン置換は、その中の１つまたは複数の選択された（または全ての）コドンの第３の位置が混合された塩基および／またはデオキシイノシン残基で置換された配列を生成することによって達成され得る（Ｂａｔｚｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄ Ｒｅｓ．１９：５０８１（１９９１）；Ｏｈｔｓｕｋａ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６０：２６０５－２６０８（１９８５）；およびＲｏｓｓｏｌｉｎｉ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ．Ｐｒｏｂｅｓ ８：９１－９８（１９９４）を参照されたい）。
[00222]モノクローナル抗体をコードするＤＮＡは、従来の手順を用いて（たとえば抗体の重鎖および軽鎖をコードする遺伝子に特異的に結合することができるオリゴヌクレオチドプローブを用いることによって）容易に単離され、シーケンシングされる。コードするＤＮＡは、合成法によって得てもよい。
[00223]抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片をコードする単離されたポリヌクレオチドは、当技術分野で既知の組換え手法を用いて、さらなるクローニング（ＤＮＡの増幅）または発現のためにベクターに挿入することができる。多くのベクターが利用可能である。ベクター成分には一般に、それだけに限らないが、以下の１つまたは複数が含まれる。シグナル配列、複製の起源、１つまたは複数のマーカー遺伝子、エンハンサー要素、プロモーター（たとえばＳＶ４０、ＣＭＶ、ＥＦ－１α）、および転写終止配列。
[00224]本開示は、本明細書で提供される単離されたポリヌクレオチドを含むベクターを提供する。ある特定の実施形態では、本明細書で提供されるポリヌクレオチドは、抗体またはその抗原結合性断片、核酸配列に作動可能に連結された少なくとも１つのプロモーター（たとえばＳＶ４０、ＣＭＶ、ＥＦ－１α）、および少なくとも１つの選択マーカーをコードする。ベクターの例には、それだけに限らないが、レトロウイルス（レンチウイルスを含む）、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、ヘルペスウイルス（たとえばヘルペスシンプレックスウイルス）、ポックスウイルス、バキュロウイルス、パピローマウイルス、パポバウイルス（たとえばＳＶ４０）、ラムダファージ、およびＭ１３ファージ、プラスミドｐｃＤＮＡ３．３、ｐＭＤ１８－Ｔ、ｐＯｐｔｉｖｅｃ、ｐＣＭＶ、ｐＥＧＦＰ、ｐＩＲＥＳ、ｐＱＤ－Ｈｙｇ－ＧＳｅｕ、ｐＡＬＴＥＲ、ｐＢＡＤ、ｐｃＤＮＡ、ｐＣａｌ、ｐＬ、ｐＥＴ、ｐＧＥＭＥＸ、ｐＧＥＸ、ｐＣＩ、ｐＥＧＦＴ、ｐＳＶ２、ｐＦＵＳＥ、ｐＶＩＴＲＯ、ｐＶＩＶＯ、ｐＭＡＬ、ｐＭＯＮＯ、ｐＳＥＬＥＣＴ、ｐＵＮＯ、ｐＤＵＯ、Ｐｓｇ５Ｌ、ｐＢＡＢＥ、ｐＷＰＸＬ、ｐＢＩ、ｐ１５ＴＶ－Ｌ、ｐＰｒｏ１８、ｐＴＤ、ｐＲＳ１０、ｐＬｅｘＡ、ｐＡＣＴ２．２、ｐＣＭＶ－ＳＣＲＩＰＴ．ＲＴＭ．、ｐＣＤＭ８、ｐＣＤＮＡ１．１／ａｍｐ、ｐｃＤＮＡ３．１、ｐＲｃ／ＲＳＶ、ＰＣＲ２．１、ｐＥＦ－１、ｐＦＢ、ｐＳＧ５、ｐＸＴ１、ｐＣＤＥＦ３、ｐＳＶＳＰＯＲＴ、ｐＥＦ－Ｂｏｓ等が含まれる。
[00225]抗体またはその抗原結合性断片をコードするポリヌクレオチド配列を含むベクターを、クローニングまたは遺伝子発現のために宿主細胞に導入することができる。本明細書におけるベクター中でのクローニングまたはＤＮＡ発現に適した宿主細胞は、原核細胞、酵母、または上述の高等な真核細胞である。この目的に適した原核細胞には、グラム陰性またはグラム陽性の生命体等の真正細菌、たとえばエシェリキア属、たとえば大腸菌等の腸内細菌科、エンテロバクター属、エルウィニア属、クレブシエラ属、プロテウス属、サルモネラ属、たとえばＳａｌｍｏｎｅｌｌａ ｔｙｐｈｉｍｕｒｉｕｍ、セラチア属、たとえばＳｅｒｒａｔｉａ ｍａｒｃｅｓｃａｎｓ、およびシゲラ属、ならびにＢ．ｓｕｂｔｉｌｉｓおよびＢ．ｌｉｃｈｅｎｉｆｏｒｍｉｓ等のバチルス属、Ｐ．ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ等のシュードモナス属、ならびにストレプトミセス属が含まれる。
[00226]原核細胞に加えて、糸状菌または酵母等の真核微生物は、抗ＣＤ３９抗体コーディングベクターのための好適なクローニングまたは発現用の宿主である。低級真核宿主微生物の中で、Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅまたは一般的な製パン用酵母が最も一般に使用されている。しかし、Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｐｏｍｂｅ、たとえばＫ．ｌａｃｔｉｓ、Ｋ．ｆｒａｇｉｌｉｓ（ＡＴＣＣ １２，４２４）、Ｋ．ｂｕｌｇａｒｉｃｕｓ（ＡＴＣＣ １６，０４５）、Ｋ．ｗｉｃｋｅｒａｍｉｉ（ＡＴＣＣ ２４，１７８）、Ｋ．ｗａｌｔｉｉ（ＡＴＣＣ ５６，５００）、Ｋ．ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａｒｕｍ（ＡＴＣＣ ３６，９０６）、Ｋ．ｔｈｅｒｍｏｔｏｌｅｒａｎｓ、およびＫ．ｍａｒｘｉａｎｕｓ等のクルイベロミセス宿主、ヤロウィア（ＥＰ ４０２，２２６）、Ｐｉｃｈｉａ ｐａｓｔｏｒｉｓ（ＥＰ １８３，０７０）、カンジダ、Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｒｅｅｓｉａ（ＥＰ ２４４，２３４）、Ｎｅｕｒｏｓｐｏｒａ ｃｒａｓｓａ、Ｓｃｈｗａｎｎｉｏｍｙｃｅｓ ｏｃｃｉｄｅｎｔａｌｉｓ等のシュワニオミセス、およびたとえばＮｅｕｒｏｓｐｏｒａ、Ｐｅｎｉｃｉｌｌｉｕｍ、Ｔｏｌｙｐｏｃｌａｄｉｕｍ等の糸状菌、ならびにＡ．ｎｉｄｕｌａｎｓおよびＡ．ｎｉｇｅｒ等のアスペルギルス属の宿主等の他の多数の属、種、および株が一般に利用可能であり、本明細書で有用である。
[00227]本明細書で提供されるグリコシル化抗体またはその抗原結合性断片の発現のために好適な宿主細胞は、多細胞生命体に由来する。無脊椎動物の細胞の例には、植物および昆虫の細胞が含まれる。多数のバキュロウイルス株およびバリアント、ならびにＳｐｏｄｏｐｔｅｒａ ｆｒｕｇｉｐｅｒｄａ（毛虫）、Ａｅｄｅｓ ａｅｇｙｐｔｉ（蚊）、Ａｅｄｅｓ ａｌｂｏｐｉｃｔｕｓ（蚊）、Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａ ｍｅｌａｎｏｇａｓｔｅｒ（ミバエ）、およびＢｏｍｂｙｘ ｍｏｒｉ等の宿主からの対応する許容される昆虫宿主細胞が同定されている。トランスフェクションのための種々のウイルス株、たとえばＡｕｔｏｇｒａｐｈａ ｃａｌｉｆｏｒｎｉｃａ ＮＰＶのＬ－１バリアントおよびＢｏｍｂｙｘ ｍｏｒｉ ＮＰＶのＢｍ－５株は公に利用可能であり、そのようなウイルスは本発明に従って本明細書のウイルスとして、特にＳｐｏｄｏｐｔｅｒａ ｆｒｕｇｉｐｅｒｄａ細胞のトランスフェクションのために用いてよい。木綿、トウモロコシ、ジャガイモ、大豆、ペチュニア、トマト、およびタバコの植物細胞培養も宿主として利用することができる。
[00228]しかし、関心は脊椎動物細胞において最大であり、培養における脊椎動物細胞の増殖（組織培養）が通常の手順になっている。有用な哺乳動物宿主細胞株の例には、ＳＶ４０でトランスフォームされたサル腎ＣＶ１株（ＣＯＳ－７、ＡＴＣＣ ＣＲＬ １６５１）、ヒト胚腎株（懸濁培養における増殖のためにサブクローニングした２９３または２９３細胞、Ｇｒａｈａｍ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｇｅｎ Ｖｉｒｏｌ．３６：５９（１９７７））、ベビーハムスター腎細胞（ＢＨＫ、ＡＴＣＣ ＣＣＬ １０）、チャイニーズハムスター卵巣細胞／－ＤＨＦＲ（ＣＨＯ、Ｕｒｌａｕｂ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ７７：４２１６（１９８０））、マウスセルトリ細胞（ＴＭ４、Ｍａｔｈｅｒ，Ｂｉｏｌ．Ｒｅｐｒｏｄ．２３：２４３－２５１（１９８０））、サル腎細胞（ＣＶ１ ＡＴＣＣ ＣＣＬ ７０）、アフリカミドリザル腎細胞（ＶＥＲＯ－７６、ＡＴＣＣ ＣＲＬ－１５８７）、ヒト子宮頚癌細胞（ＨＥＬＡ、ＡＴＣＣ ＣＣＬ ２）、イヌ腎細胞（ＭＤＣＫ、ＡＴＣＣ ＣＣＬ ３４）、バッファローラット肝細胞（ＢＲＬ ３Ａ、ＡＴＣＣ ＣＲＬ １４４２）、ヒト肺細胞（Ｗ１３８、ＡＴＣＣ ＣＣＬ ７５）、ヒト肝細胞（Ｈｅｐ Ｇ２、ＨＢ ８０６５）、マウス乳腺腫瘍（ＭＭＴ ０６０５６２、ＡＴＣＣ ＣＣＬ５１）、ＴＲＩ細胞(Ｍａｔｈｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ａｎｎａｌｓ Ｎ．Ｙ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．３８３：４４－６８（１９８２）)、ＭＲＣ５細胞、ＦＳ４細胞、ならびにヒト肝細胞がん株（Ｈｅｐ Ｇ２）がある。一部の実施形態では、宿主細胞は、ＣＨＯ、ＢＨＫ、ＮＳ０、２９３等の哺乳動物培養細胞株、およびそれらの誘導体である。
[00229]宿主細胞は、抗ＣＤ３９抗体の産生のための上記の発現またはクローニング用のベクターによってトランスフォームされ、プロモーターの誘導、トランスフォーマントの選択、または所望の配列をコードする遺伝子の増幅のために適するように修飾された従来の栄養培地中で培養される。別の実施形態では、抗体は当技術分野で既知の相同組換えによって産生してよい。ある特定の実施形態では、宿主細胞は、本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片を産生することができる。
[00230]本開示はまた、本開示のベクターが発現される条件下で、本開示で提供される宿主細胞を培養するステップを含む、本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片を発現する方法を提供する。本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片を産生するために用いる宿主細胞は、種々の培地中で培養してよい。ＨａｍのＦ１０（Ｓｉｇｍａ）、Ｍｉｎｉｍａｌ Ｅｓｓｅｎｔｉａｌ Ｍｅｄｉｕｍ（ＭＥＭ）（Ｓｉｇｍａ）、ＲＰＭＩ－１６４０（Ｓｉｇｍａ）、およびＤｕｌｂｅｃｃｏのＭｏｄｉｆｉｅｄ Ｅａｇｌｅ’ｓ Ｍｅｄｉｕｍ（ＤＭＥＭ）（Ｓｉｇｍａ）等の市販の培地は、宿主細胞を培養するために好適である。さらに、Ｈａｍ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚ．５８：４４（１９７９）、Ｂａｒｎｅｓ ｅｔ ａｌ．，Ａｎａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．１０２：２５５（１９８０）、米国特許第４，７６７，７０４号、第４，６５７，８６６号、第４，９２７，７６２号、第４，５６０，６５５号、もしくは第５，１２２，４６９号、ＷＯ ９０／０３４３０、ＷＯ ８７／００１９５、または米国特許Ｒｅ．３０，９８５に記載された培地のいずれも、宿主細胞の培養培地として用いてよい。これらの培地のいずれにも、ホルモンおよび／またはその他の成長因子（インスリン、トランスフェリン、または上皮細胞成長殖因子等）、塩（塩化ナトリウム、カルシウム、マグネシウム、およびリン酸塩）、緩衝剤（ＨＥＰＥＳ等）、ヌクレオチド（アデノシンおよびチミジン等）、抗生剤（ＧＥＮＴＡＭＹＣＩＮ（商標）薬物等）、微量元素（通常マイクロモル範囲の最終濃度で存在する無機化合物として定義される）、およびグルコースもしくは当量のエネルギー源を必要に応じて補ってよい。当業者に既知の他の任意の必要な補助物も、適切な濃度で含んでよい。温度、ｐＨ、その他の培養条件は、発現のために選択した宿主細胞とともに既に用いられたものであり、当業者には明白になる。
[00231]組換え手法を用いる場合には、抗体は細胞内で、細胞膜周辺腔で、産生され、または培地中に直接分泌することができる。抗体が細胞内で産生される場合には、第１のステップとして、宿主細胞または溶解した断片の粒子状のデブリは、たとえば遠心分離または限外濾過によって除去される。Ｃａｒｔｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ １０：１６３－１６７（１９９２）は、大腸菌の細胞膜周辺腔に分泌される抗体を単離する手順を記載している。簡単には、酢酸ナトリウム（ｐＨ３．５）、ＥＤＴＡ、およびフェニルメチルスルホニルフルオリド（ＰＭＳＦ）の存在下に約３０分かけて細胞ペーストを解凍する。細胞デブリは遠心分離によって除去することができる。抗体が培地中に分泌される場合には、そのような発現システムからの上清を、一般に市販のタンパク質濃縮フィルター、たとえばＡｍｉｃｏｎまたはＭｉｌｌｉｐｏｒｅのＰｅｌｌｉｃｏｎ限外濾過ユニットを用いてまず濃縮する。タンパク質分解を阻害するためにＰＭＳＦ等のプロテアーゼ阻害剤を前記ステップのいずれにも含ませ、外来の夾雑物の増殖を防止するために抗生剤を含ませてよい。
[00232]細胞から調製した抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片は、たとえばヒドロキシアパタイトクロマトグラフィー、ゲル電気泳動、透析、ＤＥＡＥセルロースイオン交換クロマトグラフィー、硫酸アンモニウム沈降、塩析、およびアフィニティクロマトグラフィーを用いて精製することができ、アフィニティクロマトグラフィーが好ましい精製手法である。
[00233]ある特定の実施形態では、固相に固定化されたプロテインＡが、抗体およびその抗原結合性断片の免疫アフィニティ精製のために用いられる。アフィニティリガンドとしてのプロテインＡの好適性は、抗体中に存在する任意の免疫グロブリンのＦｃドメインの種およびアイソタイプによる。プロテインＡは、ヒトガンマ１、ガンマ２、またはガンマ４の重鎖に基づく抗体を精製するために用いることができる（Ｌｉｎｄｍａｒｋ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈ．６２：１－１３（１９８３））。全てのマウスアイソタイプおよびヒトガンマ３についてはプロテインＧが推奨される（Ｇｕｓｓ ｅｔ ａｌ．，ＥＭＢＯ Ｊ．５：１５６７ １５７５（１９８６））。アフィニティリガンドが結合するマトリックスはアガロースであることが最も多いが、他のマトリックスも利用可能である。制御された細孔ガラスまたはポリ（スチレンジビニル）ベンゼン等の機械的に安定なマトリックスは、アガロースによって達成されるよりも速い流量および短い処理時間を可能にする。抗体がＣＨ３ドメインを含む場合には、Ｂａｋｅｒｂｏｎｄ ＡＢＸ（商標）樹脂（Ｊ．Ｔ．Ｂａｋｅｒ，Ｐｈｉｌｌｉｐｓｂｕｒｇ，Ｎ．Ｊ．）が精製に有用である。イオン交換カラム上の分別、エタノール沈降、逆相ＨＰＬＣ、シリカ上のクロマトグラフィー、ヘパリンＳＥＰＨＡＲＯＳＥ（商標）上のクロマトグラフィー、アニオンまたはカチオン交換樹脂（ポリアスパラギン酸カラム等）上のクロマトグラフィー、クロマトフォーカシング、ＳＤＳ－ＰＡＧＥ、および硫酸アンモニウム沈降等のタンパク質精製のための他の手法も、回収すべき抗体に応じて利用可能である。
[00234]任意の予備的な精製ステップに続いて、目的の抗体および夾雑物を含む混合物を、約２．５～４．５のｐＨで溶出緩衝液を用い、好ましくは低い塩濃度（たとえば約０～０．２５Ｍの塩）で実施する低ｐＨ疎水性相互作用クロマトグラフィーに供してよい。
[00235]医薬組成物
[00236]本開示は、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片および１つもしくは複数の薬学的に許容される担体を含む医薬組成物をさらに提供する。
[00237]本明細書で開示する医薬組成物における使用のための薬学的に許容される担体には、たとえば薬学的に許容される液体、ゲル、もしくは固体の担体、水性ビヒクル、非水性ビヒクル、抗微生物剤、等張剤、緩衝剤、抗酸化剤、麻酔剤、懸濁／分散剤、隔離剤もしくはキレート化剤、希釈剤、アジュバント、賦形剤、または非毒性補助物質、当技術分野で既知の他の成分、またはそれらの種々の組合せが含まれ得る。
[00238]好適な成分には、たとえば抗酸化剤、充填材、結合剤、崩壊剤、緩衝剤、保存剤、滑剤、香味剤、増粘剤、着色剤、乳化剤、または糖およびシクロデキストリン等の安定剤が含まれ得る。好適な抗酸化剤には、たとえばメチオニン、アスコルビン酸、ＥＤＴＡ、チオ硫酸ナトリウム、白金、カタラーゼ、クエン酸、システイン、チオグリセロール、チオグリコール酸、チオソルビトール、ブチル化ヒドロキシアニソール、ブチル化ヒドロキシトルエン、および／またはプロピルガレートが含まれ得る。本明細書で開示したように、本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片およびコンジュゲートを含む組成物におけるメチオニン等の１つもしくは複数の抗酸化剤の含有により、抗体またはその抗原結合性断片の酸化が低減される。この酸化の低減によって結合親和性の喪失が防止されまたは低減され、それにより抗体の安定性が改善され、保存期間が最大化される。したがって、ある特定の実施形態では、本明細書で開示した１つもしくは複数の抗体またはその抗原結合性断片およびメチオニン等の１つもしくは複数の抗酸化剤を含む医薬組成物が提供される。抗体または抗原結合性断片をメチオニン等の１つもしくは複数の抗酸化剤と混合することによって、本明細書で提供される抗体または抗原結合性断片の酸化を防止し、保存期間を延長し、および／または効率を改善する方法がさらに提供される。
[00239]さらに説明すると、薬学的に許容される担体には、たとえば注射用塩化ナトリウム、リンゲル注射液、等張デキストロース注射液、注射用滅菌水、もしくはデキストロースおよびラクテート化リンゲル注射液等の水性ビヒクル、植物由来の固定化油、綿実油、コーン油、ゴマ油、またはピーナツ油等の非水性ビヒクル、静細菌性または静真菌性の濃度の抗微生物剤、塩化ナトリウムもしくはデキストロース等の等張剤、リン酸塩もしくはクエン酸塩等の緩衝剤、重硫酸ナトリウム等の抗酸化剤、プロカイン塩酸塩等の局所麻酔剤、カルボキシメチルセルロースナトリウム、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、もしくはポリビニルピロリドン等の懸濁分散剤、Ｐｏｌｙｓｏｒｂａｔｅ８０（ＴＷＥＥＮ－８０）等の乳化剤、ＥＤＴＡ（エチレンジアミン四酢酸）もしくはＥＧＴＡ（エチレングリコール四酢酸）等の隔離剤もしくはキレート化剤、エチルアルコール、ポリエチレングリコール、プロピレングリコール、水酸化ナトリウム、塩酸、クエン酸、または乳酸が含まれ得る。多数回投与用容器中の医薬組成物には、フェノール類もしくはクレゾール類、水銀化合物、ベンジルアルコール、クロロブタノール、メチルおよびプロピルｐ－ヒドロキシ安息香酸エステル、チメロサール、塩化ベンザルコニウム、および塩化ベンゼトニウムを含む、担体として利用される抗微生物剤を添加してよい。好適な賦形剤には、たとえば水、食塩液、デキストロース、グリセロール、またはエタノールが含まれ得る。好適な非毒性補助物質には、たとえば湿潤もしくは乳化剤、ｐＨ緩衝剤、安定剤、溶解促進剤、または酢酸ナトリウム、ソルビタンモノラウレート、トリエタノールアミンオレエート、もしくはシクロデキストリン等の薬剤が含まれ得る。
[00240]医薬組成物は、液体溶液、懸濁液、エマルジョン、ピル、カプセル、錠剤、持続放出製剤、または粉末であり得る。経口製剤には、医薬グレードのマンニトール、ラクトース、デンプン、ステアリン酸マグネシウム、ポリビニルピロリドン、サッカリンナトリウム、セルロース、炭酸マグネシウム等の標準的な担体が含まれ得る。
[00241]ある特定の実施形態では、医薬組成物は注射可能な組成物に製剤化される。注射可能な医薬組成物は、たとえば液体溶液、懸濁液、エマルジョン、を生成するために好適な液体溶液、懸濁液、エマルジョン、または固体形態等の任意の従来の形態で調製してよい。注射用の調製物には、即時注射可能な無菌かつ／または非発熱性の溶液、皮下注射用錠剤を含む使用直前に溶媒と即時混合できる凍結乾燥粉末等の無菌の乾燥した可溶性製品、即時注射可能な無菌の懸濁液、使用直前にビヒクルと即時混合できる無菌の乾燥した不溶性製品、ならびに無菌かつ／または非発熱性のエマルジョンが含まれ得る。溶液は水性または非水性であってよい。
[00242]ある特定の実施形態では、単位用量の調製物がアンプル、バイアル、または針付きシリンジの中に包装される。非経口投与のための全ての調製物は、当技術分野で知られており実践されているように、無菌かつ非発熱性であるべきである。
[00243]ある特定の実施形態では、無菌の凍結乾燥された粉末は、本明細書で開示した抗体または抗原結合性断片を好適な溶媒に溶解することによって調製される。溶媒は、粉末または粉末から調製される再構成された溶液の安定性またはその他の薬理学的要素を改善する賦形剤を含んでよい。用い得る賦形剤には、それだけに限らないが、水、デキストロース、ソルビタール、フルクトース、コーンシラップ、キシリトール、グリセリン、グルコース、スクロース、またはその他の好適な薬剤が含まれる。溶媒は、一実施形態ではほぼ中性のｐＨで、クエン酸塩、リン酸ナトリウムもしくはカリウム、またはその他の当業者には既知のそのような緩衝剤等の緩衝剤を含んでよい。引き続く溶液の無菌濾過およびそれに続く当業者には既知の標準的条件下における凍結乾燥によって、望ましい製剤が提供される。一実施形態では、得られる溶液は凍結乾燥のためのバイアルに分注される。各バイアルは、抗ＣＤ３９抗体もしくはその抗原結合性断片、またはその組成物の単一用量または多回用量を含み得る。用量または用量の組に必要な量より少量（たとえば約１０％）多くバイアルを過剰充填することは、正確な試料取り出しおよび正確な投与を容易にするために許容される。凍結乾燥された粉末は、約４℃～室温等の適切な条件下で保存することができる。
[00244]凍結乾燥された粉末を注射用水で再構成することによって、非経口投与における使用のための製剤が提供される。一実施形態では、再構成のために、無菌かつ／もしくは非発熱性の水またはその他の好適な液体担体を、凍結乾燥された粉末に添加する。正確な量は与えられる選択した療法に依存し、実験的に決定することができる。
[00245]キット
[00246]ある特定の実施形態では、本開示は、本明細書で提供される抗体もしくはその抗原結合性断片、ならびに／または本明細書で提供される医薬組成物を含むキットを提供する。ある特定の実施形態では、本開示は、本明細書で提供される抗体もしくはその抗原結合性断片、ならびに第２の治療剤を含むキットを提供する。ある特定の実施形態では、第２の治療剤は、化学療法剤、抗がん薬物、放射線療法、免疫療法剤、抗血管形成剤、標的療法、細胞療法、遺伝子療法、ホルモン療法、抗ウイルス剤、抗生剤、鎮痛剤、抗酸化剤、金属キレート化剤、およびサイトカインからなる群から選択される。
[00247]そのようなキットは、当業者には容易に明白になるように、所望であればたとえば１つもしくは複数の薬学的に許容される担体を含む容器、追加の容器、その他の種々の従来の医薬キット成分の１つまた複数をさらに含み得る。投与すべき成分の量を示す、挿入物またはラベルとしての説明書、投与のためのガイドライン、および／または成分を混合するためのガイドラインも、キットに含ませることができる。
[00248]使用の方法
[00249]本開示は、治療有効量の本明細書で提供される抗体もしくはその抗原結合性断片、および／または本明細書で提供される医薬組成物を対象に投与するステップを含む、対象におけるＣＤ３９関連の疾患、障害、または状態を処置する方法をも提供する。ある特定の実施形態では、対象はヒトである。
[00250]一部の実施形態では、ＣＤ３９関連の疾患、障害、または状態は、ＣＤ３９の発現または過発現によって特徴付けられる。
[00251]ある特定の実施形態では、ＣＤ３９関連の疾患、障害、または状態は、がんである。ある特定の実施形態では、がんはＣＤ３９を発現しているがんである。本明細書で用いる「ＣＤ３９を発現している」がんは、がん細胞、腫瘍浸潤性免疫細胞もしくは免疫抑制細胞の中でＣＤ３９タンパク質を発現していること、またはがん細胞、腫瘍浸潤性免疫細胞もしくは免疫抑制細胞の中で正常細胞において予想されるよりも有意に高いレベルでＣＤ３９を発現していることにおいて特徴付けられるがんを意味する。対象からの試験生物学的試料の中のＣＤ３９の存在および／または量を決定するために、種々の方法を用いることができる。たとえば、試験生物学的試料を、発現されたＣＤ３９タンパク質に結合し、これを検出する抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片に曝露することができる。あるいは、ｑＰＣＲ、逆転写酵素ＰＣＲ、マイクロアレイ、ＳＡＧＥ、ＦＩＳＨ、その他の方法を用いて、核酸発現レベルでＣＤ３９を検出することもできる。一部の実施形態では、試験試料はがん細胞もしくは組織、または腫瘍浸潤性免疫細胞に由来する。参照試料は、健常もしくは非疾患個体から得られた対照試料、または試験試料を得た同じ個体からの健常もしくは非疾患試料であり得る。たとえば、参照試料は、試験試料（たとえば腫瘍）に隣接したまたはその付近の非疾患試料であり得る。
[00252]ある特定の実施形態では、がんは肛門がん、虫垂がん、星状細胞腫、基底細胞癌、胆嚢がん、胃がん、肺がん、気管支がん、骨がん、肝胆管がん、膵がん、乳がん、肝がん、卵巣がん、精巣がん、腎がん、腎盂尿管がん、唾液腺がん、小腸がん、尿道がん、膀胱がん、頭頚部がん、脊椎がん、脳がん、頸がん、子宮がん、子宮内膜がん、結腸がん、結腸直腸がん、直腸がん、肛門がん、食道がん、胃腸管がん、皮膚がん、前立腺がん、下垂体がん、膣がん、甲状腺がん、咽喉がん、膠芽細胞腫、黒色腫、骨髄異形成症候群、肉腫、奇形腫、慢性リンパ球性白血病（ＣＬＬ）、慢性骨髄性白血病（ＣＭＬ）、急性リンパ球性白血病（ＡＬＬ）、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、多発性骨髄腫、ＴまたはＢ細胞リンパ腫、ＧＩ器官間質腫、軟組織腫瘍、肝細胞癌、および腺癌からなる群から選択される。ある特定の実施形態では、がんは白血病、リンパ腫、膀胱がん、神経膠腫、膠芽細胞腫、卵巣がん、黒色腫、前立腺がん、甲状腺がん、食道がん、または乳がんである。
[00253]一部の実施形態では、対象は、任意選択で非がん細胞または非免疫抑制細胞において通常見られるレベルより有意に高いレベルで、ＣＤ３９を発現しているがん細胞または腫瘍浸潤性免疫細胞もしくは免疫抑制細胞を有すると同定されている。
[00254]一部の実施形態では、疾患、障害、または状態は、自己免疫疾患または感染である。一部の実施形態では、自己免疫疾患は免疫性血小板減少症、全身性強皮症、硬化症、成人呼吸窮迫症候群、湿疹、喘息、シェーグレン症候群、アジソン病、巨細胞性動脈炎、免疫複合体性腎炎、免疫性血小板減少性紫斑病、自己免疫性血小板減少症、セリアック病、乾癬、皮膚炎、結腸炎、または全身性エリテマトーデスである。一部の実施形態では、感染はウイルス感染または細菌感染である。一部の実施形態では、感染はＨＩＶ感染、ＨＢＶ感染、ＨＣＶ感染、炎症性腸疾患、またはクローン病である。
[00255]別の態様では、治療有効量の本明細書で提供される抗体もしくはその抗原結合性断片、および／または本明細書で提供される医薬組成物を、疾患、障害、または状態の処置を必要とする対象に投与するステップを含む、ＣＤ３９の活性を調節することによる恩恵を受ける対象における疾患、障害、または状態を処置する方法が提供される。ある特定の実施形態では、疾患、障害、または状態は、上で定義したＣＤ３９に関連する疾患、障害、または状態である。
[00256]本明細書で提供される抗体または抗原結合性断片の治療有効量は、たとえば体重、年齢、過去の病歴、現在の投薬、対象の健康状態および交差反応の可能性、アレルギー、感受性、および有害な副反応、ならびに投与経路および疾患発生の程度等の当技術分野で既知の種々の因子に依存する。用量は、これらのおよびその他の状況または要求によって指示されるように、当事者（たとえば医師または獣医師）によって比例的に低減されまたは増加されてよい。
[00257]一部の実施形態では、本明細書で提供される抗体または抗原結合性断片は、約０．０１ｍｇ／ｋｇ～約１００ｍｇ／ｋｇの治療有効用量で投与してよい。ある特定の実施形態では、投与用量は処置の経過にわたって変化してよい。たとえばある特定の実施形態では、初期の投与用量は引き続く投与用量より高くてよい。ある特定の実施形態では、投与用量は対象の反応に応じて処置の経過にわたって変動してよい。
[00258]投薬レジメンは、最適の所望の応答（たとえば治療応答）が提供されるように調整してよい。たとえば、単一用量を投与してもよく、いくつかに分割した用量を経時的に投与してもよい。
[00259]本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片は、当技術分野で既知の任意の経路、たとえば非経口（たとえば皮下、腹腔内、静脈内注入を含む静脈内、筋肉内、または皮内注射）または非－非経口（たとえば経口、鼻内、眼内、舌下腺、直腸、または局所）経路によって投与してよい。
[00260]一部の実施形態では、本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片は、単独で、または治療有効量の第２の治療剤と組み合わせて、投与してよい。たとえば、本明細書で開示する抗体またはその抗原結合性断片は、第２の治療剤、たとえば化学療法剤、抗がん薬、放射線療法剤、免疫療法剤、抗血管新生剤、標的療法剤、細胞療法剤、遺伝子療法剤、ホルモン療法剤、抗ウイルス剤、抗生剤、鎮痛剤、抗酸化剤、金属キレート剤、およびサイトカインと組み合わせて投与してよい。
[00261]本明細書で用いる用語「免疫療法」は、免疫系を刺激してがん等の疾患と闘わせるか、一般的な方法で免疫系を強化する療法の型を意味する。免疫療法の例には、チェックポイント調節剤、養子細胞移植、サイトカイン、腫瘍溶解性ウイルス、および治療用ワクチンが限定なく含まれる。
[00262]「標的療法」は、がんに関連する特定の分子、たとえばがん細胞には存在するが正常な細胞には存在しない、もしくはがん細胞でより豊富に存在する特定のタンパク質、またはがんの成長および生存に寄与するがん微小環境における標的分子に作用する療法の型である。標的療法は治療剤を腫瘍に標的させ、それにより正常組織を治療剤の影響から救う。
[00263]これらの実施形態のあるものでは、１つもしくは複数の追加の治療剤と組み合わせて投与される本明細書で提供される抗体もしくはその抗原結合性断片は、その１つもしくは複数の追加の治療剤と同時に投与してよく、またこれらの実施形態のあるものでは、抗体もしくはその抗原結合性断片および追加の治療剤は、同じ医薬組成物の部分として投与してよい。しかし、別の治療剤と「組み合わせて」投与される抗体もしくはその抗原結合性断片は、その薬剤と同時にもしくは同じ組成物中で投与されなくてもよい。別の薬剤の前にもしくはその後に投与される抗体もしくはその抗原結合性断片は、その抗体もしくは抗原結合性断片および第２の薬剤が異なる経路を介して投与されたとしても、その語句が本明細書で使用されれば、その薬剤と「組み合わせて」投与されたと考えられる。可能な場合には、本明細書で開示した抗体もしくはその抗原結合性断片と組み合わせて投与された追加の治療剤は、その追加の治療剤の製品情報シートに列挙されたスケジュールに従って、またはＰｈｙｓｉｃｉａｎｓ’ Ｄｅｓｋ Ｒｅｆｅｒｅｎｃｅ ２００３（Ｐｈｙｓｉｃｉａｎｓ’ Ｄｅｓｋ Ｒｅｆｅｒｅｎｃｅ，５７版；Ｍｅｄｉｃａｌ Ｅｃｏｎｏｍｉｃｓ Ｃｏｍｐａｎｙ；ＩＳＢＮ：１５６３６３４４５７；５７版（２００２年１１月）もしくは当技術分野で公知のプロトコルに従って、投与される。
[00264]本開示は、ＣＤ３９陽性細胞を本明細書で提供される抗体またはその抗原結合性断片に曝露するステップを含む、ＣＤ３９陽性細胞におけるＣＤ３９の活性を調節する方法をさらに提供する。一部の実施形態では、ＣＤ３９陽性細胞は免疫細胞である。
[00265]別の態様では、本開示は、試料を本明細書で提供される抗体もしくはその抗原結合性断片、および／または本明細書で提供される医薬組成物と接触させるステップ、ならびに試料中のＣＤ３９の存在または量を決定するステップを含む、試料中のＣＤ３９の存在または量を検出する方法を提供する。
[00266]別の態様では、本開示は、ａ）対象から得た試料を本明細書で提供される抗体もしくはその抗原結合性断片および／または本明細書で提供される医薬組成物と接触させるステップ、ｂ）試料中のＣＤ３９の存在または量を決定するステップ、ならびにｃ）ＣＤ３９の存在または量を対象におけるＣＤ３９関連の疾患、障害、またはステータスの存在または状態と相関させるステップを含む、対象におけるＣＤ３９関連の疾患、障害、または状態を診断する方法を提供する。
[00267]別の態様では、本開示は、ＣＤ３９関連の疾患、障害、または状態の検出に有用な、任意選択で検出可能な部分とコンジュゲートした、本明細書で提供される抗体もしくはその抗原結合性断片、および／または本明細書で提供される医薬組成物を含むキットを提供する。キットは、使用説明書をさらに含んでよい。
[00268]別の態様では、本開示は、対象におけるＣＤ３９関連の疾患、障害、または状態を処置し、防止し、または軽減するための医薬の製造における、ならびにＣＤ３９関連の疾患、障害、または状態を診断するための診断試薬の製造における、本明細書で提供される抗体もしくはその抗原結合性断片および／または本明細書で提供される医薬組成物の使用をも提供する。
[00269]別の態様では、本開示は、治療有効量の本明細書で提供される抗体もしくはその抗原結合性断片、および／または本明細書で提供される医薬組成物を対象に投与するステップを含む、対象におけるＣＤ３９のＡＴＰアーゼ活性を低減させることによって処置可能な疾患を処置し、防止し、または軽減する方法を提供する。たとえば、ＣＤ３９を発現しているがん細胞、腫瘍浸潤性免疫細胞、免疫抑制細胞のＡＴＰアーゼ活性を低減させるために、本明細書で提供される抗体もしくはその抗原結合性断片を投与してよい。一部の実施形態では、対象はヒトである。一部の実施形態では、対象はがん、自己免疫疾患、および感染症からなる群から選択される疾患、障害、または状態を有する。
[00270]別の態様では、本開示は、治療有効量の本明細書で提供される抗体もしくはその抗原結合性断片、および／または本明細書で提供される医薬組成物を対象に投与するステップを含む、対象におけるＴ細胞、単球、マクロファージ、ＤＣ、ＡＰＣ、ＮＫおよび／またはＢ細胞の活性のアデノシン媒介阻害に関連する疾患を処置し、防止し、または軽減する方法を提供する。
[00271]以下の実施例は、特許請求する発明をより良く説明するために提供され、本発明の範囲を限定するものと解釈すべきではない。以下に記載する全ての特定の組成物、材料、および方法は全体としてまたは部分的に、本発明の範囲に含まれる。これらの特定の組成物、材料、および方法は本発明を限定することを意図しておらず、本発明の範囲に含まれる特定の実施形態を説明するのみである。当業者であれば、発明の能力を行使することなく、また本発明の範囲から逸脱せずに、等価の組成物、材料、および方法を開発することができる。本発明の境界内に留まりつつ、本明細書に記載した手順の中で多くの変形を行うことができることが理解されよう。そのような変形が本発明の範囲に含まれることは、本発明者らの意図である。
実施例１．材料の生成
[00272]１．１．参照抗体の生成
[00273]抗ＣＤ３９参照抗体は、公開された配列に基づいて生成した。抗体９－８Ｂは特許出願ＷＯ ２０１６／０７３８４５Ａ１に開示されており、その重鎖および軽鎖の可変領域の配列はそれぞれ配列番号４６および４８として本明細書に含まれている。抗体Ｔ８９５は抗体３１８９５として特許出願ＷＯ ２０１９／０２７９３５Ａ１に開示されており、その重鎖および軽鎖の可変領域の配列はそれぞれ配列番号５５および５７として本明細書に含まれている。抗体Ｉ３９４は特許出願ＷＯ ２０１８／１６７２６７Ａ１に開示されており、その重鎖および軽鎖の可変領域の配列はそれぞれ配列番号１１３および１１４として本明細書に含まれている。抗体９－８Ｂ、Ｔ８９５、およびＩ３９４の重鎖および軽鎖の可変領域を下の表１０に示す。参照抗体をコードするＤＮＡをＥｘｐｉ２９３細胞（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）中でクローニングし、発現させた。細胞培養培地を収集して遠心分離し、細胞ペレットを除去した。回収した上清をプロテインＡアフィニティクロマトグラフィー（ＭａｂｓｅｌｅｃｔＳｕｒｅ、ＧＥ Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）で精製して、参照抗体調製物を得た。
Figure 2022545585000015
[00274]１．２．ヒト、カニクイザル、およびマウスのＣＤ３９安定発現細胞株の生成
[00275]それぞれ全長のヒトＣＤ３９（ＮＰ＿００１７６７．３）、カニクイザルＣＤ３９（ＸＰ＿０１５３１１９４４．１）、およびマウスＣＤ３９（ＮＰ＿０３３９７８．１）をコードするＤＮＡ配列を発現ベクター中にクローニングし、続いてＨＥＫ２９３細胞中でトランスフェクトし発現させた。それぞれヒトＣＤ３９、カニクイザルＣＤ３９、およびマウスＣＤ３９を発現しているトランスフェクトされた細胞を選択培地中で培養した。ヒトＣＤ３９、カニクイザルＣＤ３９、またはマウスＣＤ３９を安定的に発現している単一細胞クローンを限界希釈法によって単離した。続いて細胞を、抗ヒトＣＤ３９抗体（ＢＤ、Ｃａｔ＃５５５４６４）、抗カニクイザルＣＤ３９（９－８Ｂ）、抗マウスＣＤ３９（Ｂｉｏｌｅｇｅｎｄ、Ｃａｔ＃１４３８１０）を用いるＦＡＣＳによってスクリーニングした。
[00276]同様にして、ヒトＣＤ３９、カニクイザルＣＤ３９、およびマウスＣＤ３９発現プラスミドでトランスフェクトしたＣＨＯＫ１細胞（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）を選択培地中で培養した。ヒトＣＤ３９、カニクイザルＣＤ３９、またはマウスＣＤ３９を安定的に発現している単一細胞クローンを限界希釈法によって単離し、続いて抗ヒトＣＤ３９抗体、抗カニクイザルＣＤ３９抗体、または抗マウスＣＤ３９抗体を用いるＦＡＣＳによってスクリーニングした。
[00277]安定な細胞株をそれぞれＨＥＫ２９３－ｈＣＤ３９、ＨＥＫ２９３－ｃｙｎｏＣＤ３９、ＨＥＫ２９３－ｍＣＤ３９、ＣＨＯＫ１－ｈＣＤ３９、ＣＨＯＫ１－ｃｙｎｏＣＤ３９、およびＣＨＯＫ１－ｍＣＤ３９と表記した。これらの全ては高い発現およびＡＴＰアーゼ活性を示した。
[00278]１．３．組換えタンパク質の生成
[00279]ヒトＣＤ３９の細胞外ドメイン（ＥＣＤ）をコードするＤＮＡ配列を発現ベクター中にクローニングし、ＨＥＫ２９３細胞中にトランスフェクトして、組換えＥＣＤタンパク質を発現させた。
実施例２．抗体の生成
[00280]２．１．免疫ならびにハイブリドーマの生成およびスクリーニング
[00281]ＣＤ３９に対する抗体を生成するため、Ｂａｌｂ／ｃおよびＳＪＬ／Ｊマウス（ＳＬＡＣ）を、組換え発現させたヒトＣＤ３９抗原もしくはその断片、または全長のヒトＣＤ３９をコードするＤＮＡ、および／またはヒトＣＤ３９を発現する細胞で免疫した。免疫プロトコルの経過にわたって、尾静脈または後眼窩での採血によって得られた血漿または血清試料によって免疫応答をモニターした。抗ＣＤ３９抗体の十分なタイターを有するマウスを融合に用いた。免疫したマウスの脾細胞および／またはリンパ節細胞を単離し、マウスミエローマ細胞株（ＳＰ２／０）に融合させた。得られたハイブリドーマを、ヒトＣＤ３９ ＥＣＤ組換えタンパク質を用いるＥＬＩＳＡアッセイによって、またはヒトＣＤ３９を安定的に発現しているＣＨＯＫ１－ｈＣＤ３９細胞を用いるＡｃｕｍｅｎアッセイ（ＴＴＰ Ｌａｂｔｅｃｈ）によって、ＣＤ３９特異的抗体の産生についてスクリーニングした。ｈＣＤ３９に特異的なハイブリドーマクローンをＦＡＣＳおよび酵素活性ブロッキングアッセイによって確認し、サブクローニングして安定なハイブリドーマクローンを得た。１～２回のサブクローニングの後、抗体の産生のためにハイブリドーマモノクローンを増殖させ、ストックとして凍結した。
[00282]抗体を分泌するハイブリドーマを限界希釈法によってサブクローニングした。安定なサブクローンをｉｎ ｖｉｔｒｏで培養し、特徴付けのために組織培養培地中で抗体を生成させた。１～２回のサブクローニングの後、抗体の産生のためにハイブリドーマモノクローンを増殖させた。
[00283]約１４日間の培養の後、ハイブリドーマ細胞培養培地を収集してプロテインＡアフィニティクロマトグラフィー（ＧＥ）によって精製した。ハイブリドーマ抗体クローンをそれぞれｍＡｂ１３、ｍＡｂ１４、Ａｂ１９、ｍＡｂ２１、ｍＡｂ２３、ｍＡｂ３４、およびｍＡｂ３５と表記した。
実施例３．抗体の特徴付け
[00284]３．１．抗体
[00285]ハイブリドーマ抗体クローンｍＡｂ１３、ｍＡｂ１４、Ａｂ１９、ｍＡｂ２１、ｍＡｂ２３、ｍＡｂ３４、およびｍＡｂ３５を、以下に記載するように一連の結合および機能性アッセイにおいて特徴付けた。
[00286]３．２．ヒトＣＤ３９、カニクイザルＣＤ３９、およびマウスＣＤ３９に対する結合親和性
[00287]ＦＡＣＳを用いて、天然に（ＳＫ－ＭＥＬ－２８）もしくは組換えによって（ＣＨＯＫ１－ｈＣＤ３９、ＣＨＯＫ１－ｃｙｎｏＣＤ３９、およびＣＨＯＫ１－ｍＣＤ３９）ＣＤ３９を発現している細胞株、または陰性対照としてＣＤ３９発現を欠く細胞（ＣＨＯＫ１－ｂｌａｎｋ）への抗体の結合を決定した。
[00288]ＣＨＯＫ１－ｈＣＤ３９、ＣＨＯＫ１－ｃＣＤ３９、ＣＨＯＫ１－ｍＣＤ３９、およびＣＨＯＫ１－ｂｌａｎｋ細胞を、ＡＴＣＣの手順に従って培養培地中で維持した。細胞を収集し、細胞密度３×１０６個／ｍｌでブロッキング緩衝液中に再懸濁した。細胞を１００μｌ／ウェル（３×１０５個／ウェル）で９６ウェルのＦＡＣＳプレートに移し、プレートを遠心分離し、ＦＡＣＳ緩衝液（ＰＢＳ、１％ ＦＢＳ、０．０５％ Ｔｗｅｅｎ－２０）で２回洗浄した。抗ＣＤ３９抗体の４倍段階希釈をＦＡＣＳ緩衝液中で３０μｇ／ｍｌから始めて調製した。参照抗体９－８Ｂおよびマウス／ヒト対照ＩｇＧを、それぞれ陽性および陰性の対照として用いた。細胞を１００μＬ／ウェル希釈抗体中で再懸濁し、プレートを４℃で６０分インキュベートした。プレートをＦＡＣＳ緩衝液で洗浄し、Ａｌｅｘａ－Ｆｌｕｏｒ（登録商標）４８８ラベル二次抗体（ＦＡＣＳ緩衝液中１：１０００）を各ウェルに加えて、４℃で３０分インキュベートした。プレートをＦＡＣＳ緩衝液で洗浄し、細胞を１００μＬ／ウェルのＰＢＳで再懸濁した。次いで細胞をＦＡＣＳＶｅｒｓｅ（商標）で解析し、平均蛍光強度を決定した。抗体濃度の範囲を試験することによって、ＣＤ３９発現細胞について完全結合曲線を生成した。Ｐｒｉｓｍソフトウェアを用いて、各抗体について見かけの親和性を決定した。
[00289]同様に、ヒトＣＤ３９発現細胞ＳＫ－ＭＥＬ－５、ＳＫ－ＭＥＬ－２８、またはＭＯＬＰ－８を勾配濃度の抗ＣＤ３９抗体とともに４℃で３０分インキュベートした。ＦＡＣＳ緩衝液を用いて細胞を３回洗浄し、次いで蛍光標識二次抗体（ヤギ抗マウスＩｇＧまたはヤギ抗ヒトＩｇＧ）と４℃で３０分インキュベートした。細胞を３回洗浄し、次いでＦＡＣＳ緩衝液中に再懸濁して、ＢＤ Ｃｅｌｅｓｔａでフローサイトメトリー解析によって解析した。データはＧｒａｐｈＰａｄ Ｐｒｉｓｍ８．０２を用いてプロットし、解析した。
[00290]精製された７種のハイブリドーマ抗体の結合親和性を、既知の抗ＣＤ３９抗体９－８Ｂと比較して表１１に要約する。全てのハイブリドーマ抗体は用量依存的にヒトおよびカニクイザルのＣＤ３９に結合したが、ＦＡＣＳ研究においていずれもマウスＣＤ３９を認識しなかった。
Figure 2022545585000016
[00291]３．３．ＡＴＰアーゼ阻害の検出
[00292]ＣＤ３９発現細胞、ＳＫ－ＭＥＬ－５およびＭＯＬＰ－８をＰＢＳ緩衝液で洗浄し、抗体の勾配とともに３７℃で３０分インキュベートした。５０ｍＭのＡＴＰを各ウェルに加え、細胞とともに１６時間インキュベートした。上清を収集し、ＡＴＰの分解によるオルソリン酸塩産物をＭａｌａｃｈｉｔｅ Ｇｒｅｅｎ Ｐｈｏｓｐｈａｔｅ Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ Ｋｉｔ（Ｒ＆Ｄ ｓｙｓｔｅｍｓ、カタログ＃ＤＹ９９６）により、製造者のマニュアルに従って測定した。アイソタイプおよび／または９－８Ｂを対照として用いた。データはＧｒａｐｈＰａｄ Ｐｒｉｓｍ８．０２を用いてプロットし、解析した。ＥＣ５０はこのアッセイにおいてシグナルの５０％に達する表示した抗体の濃度である。
[00293]表１１に要約したように、精製した７種のハイブリドーマ抗体の全てが、参照抗体９－８Ｂと比較して良好なＡＴＰアーゼ阻害活性を有していた。
[00294]３．４．ＡＴＰ媒介Ｔ細胞増殖抑制アッセイ
[00295]ＣＳＦＥで標識し、抗ＣＤ３および抗ＣＤ２８で刺激したヒトＴ細胞を、ＡＴＰの存在下で抗ＣＤ３９抗体またはアイソタイプ対照とともにインキュベートした。Ｔ細胞の増殖はＣＳＦＥ希釈によるＦＡＣＳで解析した。ｍＩｇＧ２ａをアイソタイプ対照として用いた。
[00296]選択した抗ＣＤ３９抗体ｍＡｂ２１およびｍＡｂ２３のＴ細胞増殖活性を図１に示し、表１１に要約した。ＥＣ５０はこのアッセイにおいてシグナルの５０％に達する表示した抗体の濃度である。両方の抗体が用量依存的にＴ細胞の増殖を増強した。即ち、両方の抗体がＴ細胞の増殖に対するＡＴＰ媒介阻害をブロックした。
[00297]３．５．エピトープビニング
[00298]Ａｌｅｘ４８８標識キットを用いて抗ＣＤ３９抗体を標識し、一連の濃度で希釈して、ＣＨＯＫ１－ｈＣＤ３９細胞と混合し、ＦＡＣＳを用いて結合のＥＣ５０を試験した。非標識抗体の標識抗体に対するブロッキング効率を試験した。簡単には、単核ＣＨＯＫ１－ｈＣＤ３９細胞を２×１０６個／ｍｌに調製して５０μｌ／ウェルで９６ウェルプレートに播種し、最終体積１００μｌまで抗体勾配と混合し、等量のＡｌｅｘ４８８標識抗体をＥＣ８０の２倍の濃度で加えた。９６ウェルプレートを４℃で１時間インキュベートし、遠心沈殿して、２００μｌのＦＡＣＳ緩衝液で３回洗浄した。ＦＡＣＳｃｅｌｅｓｔａマシンでＦＡＣＳ解析を実施し、データをＦｌｏｗｊｏソフトウェアで解析した。ブロッキング率を計算し、非競合ウェル（Ａｌｅｘ４８８標識抗体のみ）と比較して８０％を超える競合率を有する抗体を１つのエピトープ群に割り付けた。
[00299]競合の結果を表１２に示す。競合の結果に基づいて、表１１に示すように、４種の抗ＣＤ３９ハイブリドーマ抗体（ｍＡｂ１４、ｍＡｂ１９、ｍＡｂ２１、ｍＡｂ２３）を４つの異なるエピトープ群に分類することができる。具体的には、抗ＣＤ３９抗体ｍＡｂ１９とｍＡｂ２１は高度に類似したエピトープについて競合し、表１１に示すようにエピトープ群Ｉに分類される。ｍＡｂ１４は試験した他のいずれの抗体とも競合せず、表１１に示すようにエピトープ群ＩＶに分類された。ｍＡｂ２３はｍＡｂ１９およびｍＡｂ２１と交差競合を示し、表１１のエピトープ群ＩＩに分類された。
Figure 2022545585000017
[00300]３．６．ハイブリドーマのシーケンシング
[00301]モノクローナルハイブリドーマ細胞からＲＮＡを単離し、市販のキットを用いてｃＤＮＡに逆転写した。次いでｃＤＮＡを鋳型として用い、Ｍｏｕｓｅ Ｉｇ－Ｐｒｉｍｅｒ Ｓｅｔ（Ｎｏｖａｇｅｎ）のプライマーで重鎖および軽鎖の可変領域を増幅した。正しいサイズのＰＣＲ産物を収集して精製し、好適なプラスミドベクターでライゲートした。ライゲーション産物をＤＨ５αコンピテント細胞にトランスフォームした。クローンを選択し、挿入された断片をＤＮＡシーケンシングによって解析した。
[00302]ハイブリドーマ抗体の可変領域配列を本明細書の表２に提供する。
実施例４．キメラ抗体の生成および特徴付け
[00303]４．１．キメラ抗体の生成および産生
[00304]選択した４種のハイブリドーマ抗体（ｍＡｂ１４、ｍＡｂ１９、ｍＡｂ２１、およびｍＡｂ２３）の可変領域をコードするＤＮＡを合成し、前もってヒトＩｇＧ定常遺伝子を含ませた発現ベクターにサブクローニングした。組換えタンパク質の発現のためにベクターを哺乳動物細胞にトランスフェクトし、発現させた抗体をプロテインＡアフィニティカラムで精製した。得られたキメラ抗体を本明細書ではｃ１４、ｃ１９、ｃ２１、およびｃ２３と称し、ここで接頭辞「ｃ」は「キメラ」を示し、数字はハイブリドーマ抗体のクローンを示す。たとえば数「１４」はハイブリドーマ抗体ｍＡｂ１４からであることを示す。
[00305]４．２．キメラ抗体の特徴付け
[00306]精製された４種のキメラ抗体を、Ｔ細胞の増殖に対するＡＴＰ媒介抑制をブロックする活性について試験した（実施例３．４に記載した方法と同様）。図２に示すように、抗ＣＤ３９キメラ抗体ｃ１４、ｃ１９、ｃ２１、およびｃ２３は用量依存的に（１００ｎＭ、１０ｎＭ、１ｎＭ、０．１ｎＭ、０．０１ｎＭ、および０．００１ｎＭの範囲の濃度で）ＣＤ４＋Ｔ細胞の増殖に対する抑制をブロックした。ＣＦＳＥ－ＣＤ４＋ＴおよびｈＩｇＧ４をそれぞれＡＴＰ媒介Ｔ細胞増殖の陽性および陰性の対照として用いた。
[00307]精製された４種のキメラ抗体を、ＡＴＰ誘導樹状細胞（ＤＣ）活性化およびＡＴＰの存在下の成熟を増強する能力についてさらに試験した。ＡＴＰは、単球に由来する樹状細胞の上のＰ２Ｙ１１受容体の刺激を通してＤＣの成熟を誘導する。
[00308]簡単には、健常ヒト血液からヒト単球を単離し、ＧＭ－ＣＳＦおよびＩＬ－４の存在下で６日間、ＭｏＤＣに分化させた。次いで分化したＭｏＤＣを異なる用量の４種の抗ＣＤ３９キメラ抗体と、ＡＴＰの存在下でさらに２４時間、処置した。次いでＤＣの成熟をＦＡＣＳアッセイでＣＤ８６、ＣＤ８３、およびＨＬＡ－ＤＲの発現を解析することによって評価した。
[00309]図３に、ＦＡＣＳによるＤＣ表面上のＣＤ３９のレベルを示した。図４Ａ～図４Ｃには、それぞれ抗体処置後のＣＤ８６（図４Ａ）、ＣＤ８３（図４Ｂ）、およびＨＬＡ－ＤＲ（図４Ｃ）の発現を示した。ＡＴＰ誘導ＤＣ成熟は、ビヒクル処置と比較して増加したＣＤ８６、ＣＤ８３、およびＨＬＡ－ＤＲの発現によって示された。４種の抗ＣＤ３９抗体ｃ１４、ｃ１９、ｃ２１、およびｃ２３の全ては、ＡＴＰ誘導ＤＣ成熟の増強に対して顕著な効果を示した。
[00310]キメラ抗体を、抗腫瘍活性についてｉｎ ｖｉｖｏでも試験した。ＮＯＤ－ＳＣＩＤマウスの右後側腹領域に、腫瘍発生のためのマトリゲル（１：１）と混合した０．１ｍｌのＰＢＳ中の腫瘍細胞（１０×１０６個）を皮下接種した。平均腫瘍サイズがほぼ８０ｍｍ３に達した時にマウスをランダムに群別した。処置はランダム化と同じ日に３０ｍｇ／ｋｇで開始し、毎週２回投与した。腫瘍体積はランダム化の後、週２回、キャリパーを用いて二次元で測定し、式：Ｖ＝（Ｌ×Ｗ×Ｗ）／２を用いて体積をｍｍ３で表した。ここでＶは腫瘍体積、Ｌは腫瘍の長さ（最長の腫瘍寸法）、Ｗは腫瘍の幅（Ｌに直角な最長の腫瘍寸法）である。投薬ならびに腫瘍および体重の測定は層流キャビネット内で行った。データはＧｒａｐｈｐａｄ Ｐｒｉｓｍによる双方向ＡＮＯＶＡを用いて解析した。
[00311]キメラ抗ＣＤ３９抗体ｃ２３の腫瘍成長結果を図５に示した。ｃ２３のヒトＩｇＧ１アイソタイプとＩｇＧ４アイソタイプの両方が得られ、試験した。ｃ２３－ｈＩｇＧ４とｃ２３－ｈＩｇＧ１の両方のキメラ抗体はビヒクル群と比較して抗腫瘍効率を示し、ｃ２３－ｈＩｇＧ４とｃ２３－ｈＩｇＧ１の間に有意差は同定されなかった。
実施例５．抗体のヒト化および親和性成熟
[00312]５．１．ヒト化
[00313]キメラ抗体ｃ２３およびｃ１４をヒト化のためのクローンとして選択した。抗体配列をヒト生殖細胞配列と整列させて最適フィットモデルを同定した。元のマウス抗体配列との相同性に基づき、ヒト化のための鋳型として最良整合したヒト生殖細胞配列を選択した。次いでマウス抗体配列からのＣＤＲを、抗体の上部および中央のコア構造を維持するための残基とともに鋳型にグラフトした。最適化された変異をフレームワーク領域に導入して、ヒト化重鎖可変領域のバリアントおよびヒト化軽鎖可変領域のバリアントを生成し、これらを混合して整合させ、多重ヒト化抗体クローンを提供した。グラフトおよび変異の後、ヒト化抗体はヒトＣＤ３９発現細胞に同様の結合親和性を保持していた。ヒト化抗体を、ＣＤ３９ ＡＴＰアーゼ阻害アッセイおよびｉｎ ｖｉｔｒｏの免疫細胞活性化アッセイによってさらに評価した。ヒト化抗体のいくつかについてはｉｎ ｖｉｖｏ研究も行った。
[00314]ｃ２３について全部で３１種のヒト化抗体クローンが得られ、ヒト化ｃ２３重鎖可変領域の７種のバリアント（即ちｈｕ２３．ＶＨ＿１、ｈｕ２３．ＶＨ＿２、ｈｕ２３．ＶＨ＿３、ｈｕ２３．ＶＨ＿４、ｈｕ２３．ＶＨ＿５、ｈｕ２３．ＶＨ＿６、およびｈｕ２３．ＶＨ＿７）ならびにヒト化ｃ２３軽鎖可変領域の７種のバリアント（即ちｈｕ２３．ＶＬ＿１、ｈｕ２３．ＶＬ＿２、ｈｕ２３．ＶＬ＿３、ｈｕ２３．ＶＬ＿４、ｈｕ２３．ＶＬ＿５、ｈｕ２３．ＶＬ＿６、およびｈｕ２３．ＶＬ＿７）を混合し、整合させた。３１種のヒト化抗体クローンを上の表９ならびに下の表１３、表１４、および表１５に示すようにｈｕ２３．Ｈ１Ｌ１、ｈｕ２３．Ｈ１Ｌ２等と表記した。ここで接頭辞「ｈｕ」は「ヒト化」を示し、接尾辞、たとえば「Ｈ１Ｌ１」はｈｕ２３．ＶＨ＿１バリアントおよびｈｕ２３．ＶＬ＿１バリアントの可変領域を有するｃ２３ヒト化抗体クローンの一連番号を表す。
Figure 2022545585000018
Figure 2022545585000019
Figure 2022545585000020
[00315]同様に、ｃ１４について全部で１６種のヒト化抗体が得られ、ヒト化ｃ１４重鎖可変領域の４つのバリアント（即ちｈｕ１４．ＶＨ＿１、ｈｕ１４．ＶＨ＿２、ｈｕ１４．ＶＨ＿３、およびｈｕ１４．ＶＨ＿４）ならびにヒト化ｃ１４軽鎖可変領域の４つのバリアント（即ちｈｕ１４．ＶＬ＿１、ｈｕ１４．ＶＬ＿２、ｈｕ１４．ＶＬ＿３、およびｈｕ１４．ＶＬ＿４）を混合し、整合させた。１６種のヒト化抗体クローンを同じ表象によって下の表１６に示すようにｈｕ１４．Ｈ１Ｌ１、ｈｕ１４．Ｈ１Ｌ２等と表記した。
Figure 2022545585000021
[00316]ｃ２３について酵母ディスプレイによっていくつかのヒト化抗体クローンも得た。簡単には、マウス重鎖および軽鎖の配列をヒト抗体配列の社内のデータベースと整列させた。重鎖および軽鎖のＣＤＲグラフト化のため、それぞれ最大の相同性を有する鋳型であるＩＧＨＶ１－３＊０１およびＩＧＫＶ３－１１＊０１を選択した。復帰変異は酵母ディスプレイを用いる高スループット法によって同定した。具体的には、ＣＤＲのコンフォメーションに寄与する位置（Ｖｅｒｎｉｅｒゾーン残基）を同定し、ＤＮＡ合成の間に鋳型およびマウス残基の両方をそれぞれの位置に組み込むことによって復帰変異のライブラリーを創出した。ヒトＣＤ３９タンパク質へのトップバインダーのシーケンシングによって最終の候補を同定した。酵母ディスプレイを介して得られたｃ２３についてのヒト化抗体をｈｕ２３．２０１（配列番号１４６／１１１のＶＨ／ＶＬを有する）、ｈｕ２３．２０３（配列番号１４６／１１２のＶＨ／ＶＬを有する）、ｈｕ２３．２０７（配列番号１４７／１１１のＶＨ／ＶＬを有する）、およびｈｕ２３．２１１（配列番号３９／６３のＶＨ／ＶＬを有する）と表記する。
[00317]表１３、表１４、表１５、および表１６のヒト化抗体を組換えで産生して結合親和性について試験し、これらがヒトＣＤ３９への特異的結合を保持できることが示された。比較的高い親和性を有するヒト化抗体を、ＣＤ３９ブロッキングアッセイおよびｉｎ ｖｉｔｒｏ免疫細胞活性化アッセイを含む機能性アッセイにおいてさらに評価した。
[00318]特に、ヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５、ｈｕ２３．２０１、ｈｕ１４．Ｈ１Ｌ１、ならびに参照抗体Ｉ３９４およびＴ８９５を、Ｂｉａｃｏｒｅ（ＧＥ）を用いてヒトＣＤ３９に対する結合親和性について特徴付けた。簡単には、Ｈｕｍａｎ Ａｎｔｉｂｏｄｙ Ｃａｐｕｔｕｒｅ Ｋｉｔ（ＧＥ）を用いて試験すべき抗体をＣＭ５チップ（ＧＥ）に捕捉した。６×Ｈｉｓタグ付けしたヒトＣＤ３９の抗原を多重用量のため段階希釈し、３０μｌ／分で１８０秒、注入した。解離のため緩衝液流量を４００秒、保った。チップの再生のため３ＭのＭｇＣｌ２を用いた。会合および解離の曲線は１：１結合モデルに合致し、それぞれの抗体についてＫａ／Ｋｄ／ＫＤ値を計算した。試験した抗体の親和性データを下の表１７に要約する。
Figure 2022545585000022
[00319]さらに、Ｏｃｔｅｔアッセイ（Ｃｒｅａｔｉｖｅ Ｂｉｏｌａｂｓ）を用いて製造者のマニュアルに従い、ヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５およびｈｕ１４．Ｈ１Ｌ２、ならびに参照抗体Ｉ３９４、Ｔ８９５、および９－８Ｂを、ヒトＣＤ３９に対する結合親和性について特徴付けた。簡単には、抗体をセンサーにカプリングし、次いでセンサーをＣＤ３９の勾配に浸漬した（開始時２００ｎＭ、２倍希釈により全体で８用量）。これらの結合応答をリアルタイムで測定した。結果は全体的に合致した。試験した抗体の親和性データを下の表１８に要約する。
Figure 2022545585000023
[00320]さらに、ｃ２３抗体のヒト化抗体クローン（たとえばｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５）のＨＣＤＲ２において、脱アミド化を受けやすい１つのＮＧモチーフ（Ｎ５５Ｇ５６）が同定された。脱アミド化部位を除去するため、Ｎ５５またはＧ５６に様々な変異を導入し、Ｎ５５およびＧ５６はそれぞれ種々の残基に変異させることができ、しかもヒトＣＤ３９への特異的結合を保持することが見出された。たとえば、Ｎ５５をＧ、Ｓ、またはＱによって一点のみ置き換えると、抗体結合親和性は保持され、かつヒトＣＤ３９への結合には不利な影響がないことが見出された。同様に、Ｇ５６をＡまたはＤで置き換えると、変異抗体もヒトＣＤ３９への特異的結合および結合親和性を保持していた。その他の変異も同様に効果があると予想された。
[00321]５．２．結合特異性の検出
[00322]精製されたヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５のＥＮＴＰＤアーゼファミリーメンバーに対する結合特異性をＥＬＩＳＡアッセイによって検出した。簡単には、ＥＮＴＰＤ１（即ちＣＤ３９）およびＥＮＴＰＤ２／３／５／６タンパク質を９６ウェルのＥＬＩＳＡプレートに４℃で一夜コートした。翌日ＥＬＩＳＡプレートを洗浄し、ブロッキング緩衝液（ＰＢＳ中１％ＢＳＡおよび０．０５％ Ｔｗｅｅｎ２０）２００μｌ／ウェルで２時間ブロッキングした。次いでｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５の勾配を２連にしてウェルに入れ、抗ｈＩｇＧ－ＨＲＰで染色した。プレートの洗浄後、プレートをＴＭＢ基質で発色させ、２Ｎ ＨＣｌで停止した。プレートリーダーを用いてＯＤ４５０を記録し、Ｇｒａｐｈｐａｄ Ｐｒｉｓｍによってプロットした。ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５の結合特異特性を図６に示す。図６Ａより、ヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５はヒトＣＤ３９に特異的に結合するが、ＥＮＴＰＤ２／３／５／６タンパク質のいずれにも結合しないことが分かる。図６Ｂは、陰性対照ｈＩｇＧ４がＥＮＴＰＤ１／２／３／５／６タンパク質のいずれにも結合しないことを示している。
[00323]５．３．ヒト化抗体の特徴付け
[00324]ｃ２３のヒト化抗体の結合親和性をＦＡＣＳにより、実施例３．２に記載したものと同様の方法を用いて決定した。良好な結合親和性を示すｃ２３ヒト化抗体クローンを下の表１９および表２０に列挙し、また図７Ａ、図７Ｂ、および図８にも示す。ＥＣ５０はこのアッセイにおいてシグナルの５０％に達する表示した抗体の濃度である。
Figure 2022545585000024
Figure 2022545585000025
[00325]選択したｃ２３のヒト化抗体を、ＡＴＰアーゼ阻害アッセイで（実施例３．３に記載したように）ＳＫ－ＭＥＬ－２８細胞について試験した。表示した抗体の阻害プロットを図９Ａおよび図９Ｂに示し、表２１に要約する。さらなるバリデーションのためにｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５およびｈｕ２３．２０１を選択した。
Figure 2022545585000026
[00326]ｃ１４のヒト化抗体の結合親和性をＦＡＣＳにより、ヒトＣＤ３９を発現するＭＯＬＰ－８細胞を用い、実施例３．２に記載したものと同様の方法を用いて決定した。
[00327]良好な結合親和性を示すｃ１４のヒト化抗体クローンを図１０Ａ、図１０Ｂ、および図１０Ｃに示した。ＥＣ５０は表２２に要約した。
Figure 2022545585000027
[00328]５．４．エピトープビニング
[00329]選択したヒト化抗体を競合結合について試験した（実施例３．５に記載した方法）。ヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５およびｈｕ１４．Ｈ１Ｌ１と参照抗体のエピトープビニングの結果を図１９Ａに示した。
[00330]競合の結果（図１９Ａに示す）に基づいて、２種のヒト化抗ＣＤ３９抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５およびｈｕ１４．Ｈ１Ｌ１が２つの異なるエピトープ群に分類できた（図１９Ｂを参照）。具体的には、抗ＣＤ３９抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５は高度に類似したエピトープについて参照抗体Ｉ３９４、Ｔ８９５、および９－８Ｂと競合し、エピトープ群Ｉに分類された。ｈｕ１４．Ｈ１Ｌ１、ｃ３４、およびｃ３５はＴ８９５と部分的に競合する他には試験した他のいずれの抗体とも競合せず、エピトープ群ＩＩに分類された。
[00331]５．５．最適化されたヒト化抗体の特徴付け
[00332]５．５．１ ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５によるＣＤ３９の封鎖は、細胞外ＡＴＰ（ｅＡＴＰ）の存在下でヒトＴ細胞の増殖を改善した。
[00333]抗ＣＤ３抗体および抗ＣＤ２８抗体で刺激したヒトＰＢＭＣを、ＡＴＰの存在下で、それぞれ２５ｎＭのヒト化抗ＣＤ３９抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５およびビヒクルとともにインキュベートした。それぞれＩＬ－２およびＩＦＮ－γの分泌の検出のために細胞培養上清を回収した。ＣＤ４＋Ｔ細胞およびＣＤ８＋Ｔ細胞の増殖を５日目にＦＡＣＳによりＣｅｌｌ Ｔｒａｃｅ Ｖｉｏｌｅｔ染料希釈によって解析した。
[00334]図１１Ａ～図１１Ｄに示すように、ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５は濃度２５ｎＭでＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔ細胞の増殖を有意に増強し、それらのＩＬ－２およびＩＦＮ－γの産生を活性化させた。図１１Ａ、図１１Ｂ、および図１１Ｄに示すように、ＰＢＭＣでのＴ細胞の活性化の増強において、ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５はＩ３９４よりも有意に高い活性を示した。
[00335]ヒトＣＤ８＋Ｔ細胞も健常ドナーのＰＢＭＣから単離し、次いで細胞増殖染料で標識し、抗ＣＤ３抗体および抗ＣＤ２８抗体で活性化し、異なる用量のヒト化抗ＣＤ３９抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５または参照抗体Ｉ３９４で全処置期間を５日として処置し、ＣＤ３９封鎖処置の開始後３日目に２００μＭのＡＴＰを細胞に加えた。５日目にフローサイトメトリーを用いてＣＤ８＋Ｔ細胞の増殖％、ＣＤ２５＋細胞の％、および生細胞の％を解析した。
[00336]図２３Ａ～図２３Ｃに示すように、ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５は、ｅＡＴＰによって阻害されたヒトＣＤ８＋Ｔ細胞の増殖を顕著に反転させた。
[00337]ヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５およびｈｕ１４．Ｈ１Ｌ１の結合親和性を、様々な細胞についてＦＡＣＳにより、実施例３．２に記載したものと同様の方法に従って試験した。
[00338]図１２Ａ～図１２Ｅに、ＳＫ－ＭＥＬ－５（図１２Ａ）、ＳＫ－ＭＥＬ－２８（図１２Ｂ）、ＭＯＬＰ－８（図１２Ｃ）、ＣＨＯＫ１－ｃｙｎｏＣＤ３９（図１２Ｄ）、およびＣＨＯＫ１－ｍＣＤ３９（図１２Ｅ）に対する抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５およびｈｕ１４．Ｈ１Ｌ１の結合親和性をそれぞれ示す。参照抗体Ｔ８９５およびＩ３９４を対照抗体として並行して試験した。図１２に示し、表２３に要約するように、抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５およびｈｕ１４．Ｈ１Ｌ１の両方は用量依存的にかつナノモル未満もしくはナノモルのレベルのＥＣ５０による類似した親和性で、ヒトおよびカニクイザルのＣＤ３９発現細胞に結合した。これらの抗体のいずれもＦＡＣＳ研究でマウスＣＤ３９を認識しなかった。それぞれの抗体について細胞の間で異なる最大シグナル（平均蛍光強度、ＭＦＩ）は、それらの発現レベルの相違によると考えられる。
Figure 2022545585000028
[00339]図１３に、ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５が参照抗体Ｔ８９５およびＩ３９４と同様にＳＫ－ＭＥＬ－５（図１３Ａ）またはＭＯＬＰ－８（図１３Ｂ）細胞におけるＣＤ３９ ＡＴＰアーゼ活性をブロックしたことを示す（実施例３．３に記載した方法）。結果は表２４に要約した。
[00340]ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５はＳＫ－ＭＥＬ－５細胞で７０ｐＭ、ＭＯＬＰ－８細胞で３３０ｐＭの酵素ブロッキングＩＣ５０を示し、参照抗体Ｔ８９５およびＩ３９４と同様またはこれらよりやや良好であった。しかし、ｈｕ１４．Ｈ１Ｌ１は両方の細胞において飽和ブロッキングに達することができず、９－８Ｂはこのアッセイでは非ブロッカーとして同定された。
Figure 2022545585000029
[00341]５．５．２ ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５によるＣＤ３９の封鎖は、ＡＴＰ媒介単球活性化を増強した。
[00342]ヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５を、ＡＴＰ媒介単球活性化アッセイでも試験した。ＡＴＰ媒介炎症促進活性は、単球を含む多種の免疫細胞型の機能の制御において重要な役割を有する。ＣＤ３９の封鎖がＡＴＰ媒介単球活性化を増強できるか否かを評価するため、健常ヒト血液からヒト単球を精製し、次いでＡＴＰの存在下で、０．２ｎＭ～１００ｎＭの範囲の種々の濃度で抗ＣＤ３９抗体とインキュベートした。ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５は０．２ｎＭ、即ち試験した最低の濃度で、単球活性化の誘導に効果的であることが示された。単球活性化はＦＡＣＳアッセイにより、ＣＤ８０（図１４Ａ）、ＣＤ８６（図１４Ｂ）、およびＣＤ４０（図１４Ｃ）の発現を解析することによって評価した（ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５の濃度は５０ｎＭである）。参照の抗ＣＤ３９抗体Ｉ３９４およびＴ８９５を対照として用い、ｈＩｇＧ４をアイソタイプ対照として用いた。
[00343]結果を図１４に示す。ＡＴＰ単独による刺激はＣＤ８０およびＣＤ８６の上方制御された発現を示し、単球の活性化が示された。抗ＣＤ３９ヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５は、参照抗体Ｉ３９４による増強と同程度のレベルでのＣＤ８０、ＣＤ８６、およびＣＤ４０の上方制御によって実証されるように、ＡＴＰ媒介単球活性化をさらに増強した。参照抗体Ｔ８９５はＡＴＰ誘導活性化単球に対して顕著な効果を示さなかった。
[00344]５．５．３ ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５によるＣＤ３９の封鎖は、ＡＴＰ媒介ＤＣ活性化を増強した。
[00345]選択したヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５を、ＡＴＰ媒介ＤＣ活性化アッセイにおいても試験した（実施例４．２に記載した同様の方法に従って）。簡単には、ＦＡＣＳアッセイによってＣＤ８３の発現を解析することによってＤＣの成熟を評価した。ＡＴＰは、ＣＤ８３の増加した発現を示すことによって、ＤＣの成熟を誘導した（図１５Ａ）。ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５は０．２ｎＭという低いレベルから開始して用量依存的にＣＤ８３の発現を増加させ、０．６ｎＭの抗体レベルでＣＤ８３の発現を顕著に増加させた。これは参照抗体Ｔ８９５およびＩ３９４のいずれよりも強力である。
[00346]Ｔ細胞の活性化に対するＡＴＰ媒介ＤＣ活性化の結果的な効果をさらに評価するために、ＡＴＰ活性化ＤＣを洗浄し、次いで混合リンパ球反応（ＭＬＲ）のために同種Ｔ細胞とインキュベートした。Ｔ細胞の増殖（図１５Ｂ）および活性化Ｔ細胞からのＩＦＮ－γの産生を解析した（図１５Ｃ）。
[00347]参照抗体Ｉ３９４およびＴ８９５比較して、抗ＣＤ３９抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５はＡＴＰ誘導ＤＣ成熟の増強に対して用量依存的かつ顕著な効果を示した。参照Ｉ３９４は同様であったがやや弱い活性を示した。一方Ｔ８９５の効果は極めて軽度であった。一貫して、図１５Ｂおよび図１５Ｃに示すように、抗ＣＤ３９ブロッキング抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５によって増強されたＡＴＰ媒介ＭｏＤＣ成熟により、より高いＴ細胞の増殖およびＭＬＲアッセイにおけるＩＦＮ－γの産生がもたらされた。
[00348]５．５．４ ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５によるＣＤ３９の封鎖は、ＬＰＳ刺激によって誘導されたヒトマクロファージのＩＬ１βの放出を促進した。
[00349]健常ヒトＰＢＭＣからヒトＣＤ１４＋Ｔ細胞を単離し、次いで富化したＣＤ１４＋単球を２×１０６個／ウェルの密度で６ウェルのプレートに播種し、１００ｎｇ／ｍＬのヒトＧＭ－ＣＳＦと６日間培養して、Ｍ１様マクロファージを生成した。ｉｎ ｖｉｔｒｏで分化させたマクロファージを、増加する用量のｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５または参照抗体Ｉ３９４と１時間処置し、続いて１０ｎｇ／ｍＬのＬＰＳで３時間刺激し、８００μＭのＡＴＰを２時間加えた。細胞培養上清中のＩＬ－１βをＥＬＩＳＡによって定量した。
[00350]結果を図２０に示す。アステリスクはそれぞれの条件の間の有意差を示す。図２０に示すように、ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５はＬＰＳ刺激によって誘導されたヒトマクロファージのＩＬ１βの放出を顕著に促進し、ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５はＬＰＳ刺激によって誘導されたヒトマクロファージのＩＬ１βの放出の促進において参照抗体Ｉ３９４より有意に高い活性を示した。
[00351]５．６．ｉｎ ｖｉｖｏ研究
[00352]ヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５およびｈｕ１４．Ｈ１Ｌ１の効果をＭＯＬＰ－８異種移植マウスについて実施例４．２に記載した方法に従って決定した。
[00353]結果を図１６に示す。抗ＣＤ３９抗体の全ては、ビヒクル群と比較して腫瘍の成長を阻害した。Ｉ３９４について観察された効率は、ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５およびｈｕ１４．Ｈ１Ｌ１を含む他の抗体よりもやや弱かった。
[00354]ヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５の抗腫瘍効率も、ｉｎ ｖｉｖｏでＰＢＭＣ養子動物モデル（ＮＣＧマウス、ＭＯＬＰ－８細胞を５Ｍ／マウスで接種）において実施例４．２に記載した方法に従って異なる用量（０．０３ｍｇ／ｋｇ、０．３ｍｇ／ｋｇ、３ｍｇ／ｋｇ、１０ｍｇ／ｋｇ、３０ｍｇ／ｋｇ、ｉ．ｐ．、ＢＩＷ×６用量）の範囲で試験することによって試験した。
[00355]結果を図２１に示す。図２１に示すように、ヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５は試験した全ての用量で強力に腫瘍の成長を阻害した。
[00356]抗ＣＤ３９抗体の抗腫瘍効率がＮＫ細胞またはマクロファージ細胞のいずれに依存しているかも判定した。抗アシアロ－ＧＭ１のＮＫ枯渇処置を腹腔内２０μｌ／マウスで７日目に開始し、５日ごとに１回行った。クロドロネートリポソームのマクロファージ枯渇処置も静脈内２００μｌ／マウスで７日目および９日目に開始し、毎週１回行った。血液試料解析データにより、単核食細胞またはＮＫが試薬によって顕著に除去されたことが実証された。
[00357]ＮＫ（図１７）またはマクロファージ（図１８）細胞が枯渇したモデルにおいてｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５の腫瘍成長阻害効果は消失され、抗ＣＤ３９抗体の抗腫瘍効果がＮＫ細胞およびマクロファージに依存していることが示唆された。
[00358]具体的には、図１７に示すように、抗アシアロ－ＧＭ１はビヒクルと比較して遅い段階で腫瘍成長をやや増強した。ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５で処置した群と比較して、これを抗アシアロ－ＧＭ１と組み合わせることによって、ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５の腫瘍成長阻害効率は完全に消失された。図１８に示すように、クロドロネートリポソームはビヒクルと比較して腫瘍成長に影響がなかった。しかし、クロドロネートリポソーム処置によってｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５の腫瘍成長阻害効率は完全に消失された。
実施例６．エピトープマッピング
[00359]抗ＣＤ３９抗体のエピトープを定義するため、ＣＤ３９変異体を設計し、ヒトＣＤ３９の表面上で分子表面に露出したアミノ酸の置換によって定義した。下の表２５に示すように、変異体をＣ末端ＥＧＦＰ配列と融合した発現ベクター中にクローニングし、ＨＥＫ－２９３Ｆ細胞にトランスフェクトした。標的したアミノ酸変異を、ＵｎｉＰｒｏｔＫＢ－Ｐ４９９６１（ＥＮＴＰ１＿ＨＵＭＡＮ）の番号付けを用いて示す。これはヒトＣＤ３９の野生型アミノ酸配列であり、本明細書で配列番号１６２として示す。たとえば、Ｖ７７Ｇは配列番号１６２の７７位のバリンがグリシンによって置き換えられていることを意味する。
Figure 2022545585000030
Figure 2022545585000031
[00360]簡単には、ヒトＣＤ３９変異体を遺伝子合成によって生成し、次いで発現ベクターｐＣＭＶ３－ＧＦＰＳｐａｒｋの中にクローニングした。バリデートした変異配列を含むベクターを調製し、ＨＥＫ２９３Ｆ細胞にトランスフェクトした。トランスフェクションの３日後、トランスジーンの発現についてＥＧＦＰを試験するため、細胞を収集した。生成した２０種の変異体について用量範囲の抗体（１００ｎＭから開始、３倍希釈、１１点）を試験し、ＦＡＣＳにより、ＡｌｅｘＦｌｕｏｒ６４７標識抗ｈＩｇＧによって染色した。抗体結合は、ＡｌｅｘＦｌｕｏｒ６４７の強度をＧＦＰの強度で除して導き出される相対結合として記述した。結果を図２２に示す。
[00361]図２２に示すように、ヒト化抗体ｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５は変異体ＫＷ２７－６およびＫＷ２７－２０への結合性を失っていたが、他の変異体には結合性を失っていなかった。変異体ＫＷ２７－６は残基Ｑ９６、Ｎ９９、Ｅ１４３、およびＲ１４７にアミノ酸置換を含み、変異体の残基の１つもしくは複数、または全てがｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５のコアエピトープに重要であることを示している。変異体ＫＷ２７－２０は残基Ｒ１３８、Ｍ１３９、およびＥ１４２にアミノ酸置換を含み、変異体の残基の１つもしくは複数、または全てがまたｈｕ２３．Ｈ５Ｌ５のコアエピトープに重要であることを示している。
[00362]図２２に示すように、キメラ抗体ｃ３４は変異体ＫＷ２７－１６への結合性を失っていたが、他のいずれの変異体にも結合性を失っていなかった。変異体ＫＷ２７－１６は残基Ｋ５、Ｅ１００、およびＤ１０７にアミノ酸置換を含み、変異体の残基の１つもしくは複数、または全てがｃ３４のコアエピトープに重要であることを示している。
[00363]図２２に示すように、キメラ抗体ｃ３５は変異体ＫＷ２７－２への結合性を失っていたが、他のいずれの変異体にも結合性を失っていなかった。変異体ＫＷ２７－２は残基Ｖ８１、Ｅ８２、Ｒ１１１、およびＶ１１５にアミノ酸置換を含み、変異体の残基の１つもしくは複数、または全てがｃ３５のコアエピトープに重要であることを示している。
[00364]図２２に示すように、参照抗体Ｔ８９５は変異体ＫＷ２７－２０への結合性を失っていたが、他のいずれの変異体にも結合性を失っていなかった。変異体ＫＷ２７－２０は残基Ｒ１３８、Ｍ１３９、およびＥ１４２にアミノ酸置換を含み、変異体の残基の１つもしくは複数、または全てがＴ８９５のコアエピトープに重要であることを示している。
[00365]図２２に示すように、参照抗体Ｉ３９４は変異体ＫＷ２７－６およびＫＷ２７－２０への結合性を失っていたが、他の変異体には結合性を失っていなかった。変異体ＫＷ２７－６は残基Ｑ９６、Ｎ９９、Ｅ１４３、およびＲ１４７にアミノ酸置換を含み、変異体の残基の１つもしくは複数、または全てがＩ３９４のコアエピトープに重要であることを示している。変異体ＫＷ２７－２０は残基Ｒ１３８、Ｍ１３９、およびＥ１４２にアミノ酸置換を含み、変異体の残基の１つもしくは複数、または全てがＩ３９４のコアエピトープに重要であることを示している。
[00366]図２２に示すように、参照抗体９－８Ｂは変異体ＫＷ２７－６への結合性を失っていたが、他のいずれの変異体にも結合性を失っていなかった。変異体ＫＷ２７－６は残基Ｑ９６、Ｎ９９、Ｅ１４３、およびＲ１４７にアミノ酸置換を含み、変異体の残基の１つもしくは複数、または全てが９－８Ｂのコアエピトープに重要であることを示している。

Claims (66)

  1. ヒトＣＤ３９に特異的に結合することができる抗体またはその抗原結合性断片であって、ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、およびＨＣＤＲ３を含む重鎖可変領域ならびに／またはＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域を含み、
    ａ）前記ＨＣＤＲ１が、ＮＹＧＭＮ（配列番号１）、ＫＹＷＭＮ（配列番号２）、ＮＹＷＭＮ（配列番号３）、ＤＴＦＬＨ（配列番号４）、ＤＹＮＭＹ（配列番号５）、ＤＴＹＶＨ（配列番号６）からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
    ｂ）前記ＨＣＤＲ２が、ＬＩＮＴＹＴＧＥＰＴＹＡＤＤＦＫＤ（配列番号７）、ＥＩＲＬＫＳＮＫＹＧＴＨＹＡＥＳＶＫＧ（配列番号８）、ＱＩＲＬＮＰＤＮＹＡＴＨＸ１ＡＥＳＶＫＧ（配列番号９）、Ｘ５８ＩＤＰＡＸ５９Ｘ６０ＮＩＫＹＤＰＫＦＱＧ（配列番号１５１）、ＦＩＤＰＹＮＧＹＴＳＹＮＱＫＦＫＧ（配列番号１１）、ＲＩＤＰＡＩＤＮＳＫＹＤＰＫＦＱＧ（配列番号１２）からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
    ｃ）前記ＨＣＤＲ３が、ＫＧＩＹＹＤＹＶＷＦＦＤＶ（配列番号１３）、ＱＬＤＬＹＷＦＦＤＶ（配列番号１４）、ＨＧＸ２ＲＧＦＡＹ（配列番号１５）、ＳＰＹＹＹＧＳＧＹＲＩＦＤＶ（配列番号１６）、ＩＹＧＹＤＤＡＹＹＦＤＹ（配列番号１７）、ＹＹＣＡＬＹＤＧＹＮＶＹＡＭＤＹ（配列番号１８）からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
    ｄ）前記ＬＣＤＲ１が、ＫＡＳＱＤＩＮＲＹＩＡ（配列番号１９）、ＲＡＳＱＳＩＳＤＹＬＨ（配列番号２０）、ＫＳＳＱＳＬＬＤＳＤＧＲＴＨＬＮ（配列番号２１）、ＳＡＦＳＳＶＮＹＭＨ（配列番号２２）、ＳＡＴＳＳＶＳＹＭＨ（配列番号２３）、ＲＳＳＫＮＬＬＨＳＮＧＩＴＹＬＹ（配列番号２４）からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
    ｅ）前記ＬＣＤＲ２が、ＹＴＳＴＬＬＰ（配列番号２５）、ＹＡＳＱＳＩＳ（配列番号２６）、ＬＶＳＫＬＤＳ（配列番号２７）、ＴＴＳＮＬＡＳ（配列番号２８）、ＳＴＳＮＬＡＳ（配列番号２９）、ＲＡＳＴＬＡＳ（配列番号３０）からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
    ｆ）前記ＬＣＤＲ３が、ＬＱＹＳＮＬＬＴ（配列番号３１）、ＱＮＧＨＳＬＰＬＴ（配列番号３２）、ＷＱＧＴＬＦＰＷＴ（配列番号３３）、ＱＱＲＳＴＹＰＦＴ（配列番号３４）、ＱＱＲＩＴＹＰＦＴ（配列番号３５）、ＡＱＬＬＥＬＰＨＴ（配列番号３６）からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、
    Ｘ１がＹまたはＦであり、Ｘ２がＳまたはＴであり、Ｘ５８がＲまたはＫであり、Ｘ５９がＮ、Ｇ、Ｓ、またはＱであり、Ｘ６０がＧ、Ａ、またはＤである、抗体またはその抗原結合性断片。
  2. ａ）前記ＨＣＤＲ１が配列番号３のアミノ酸配列を含み、かつ/または
    ｂ）前記ＨＣＤＲ２が配列番号９のアミノ酸配列を含み、かつ/または
    ｃ）前記ＨＣＤＲ３が配列番号１５のアミノ酸配列を含み、かつ/または
    ｄ）前記ＬＣＤＲ１が配列番号２１のアミノ酸配列を含み、かつ／または
    ｅ）前記ＬＣＤＲ２が配列番号２７のアミノ酸配列を含み、かつ／または
    ｆ）前記ＬＣＤＲ３が配列番号３３のアミノ酸配列を含み、
    Ｘ１およびＸ２が請求項１に定義した通りである、請求項１に記載の抗体またはその抗原結合性断片。
  3. 前記ＨＣＤＲ２が配列番号３７および配列番号３８からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、かつ／または
    前記ＨＣＤＲ３が配列番号４０および配列番号４１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項２に記載の抗体またはその抗原結合性断片。
  4. ａ）前記ＨＣＤＲ１が配列番号４のアミノ酸配列を含み、かつ/または
    ｂ）前記ＨＣＤＲ２が配列番号１５１のアミノ酸配列を含み、かつ/または
    ｃ）前記ＨＣＤＲ３が配列番号１６のアミノ酸配列を含み、かつ/または
    ｄ）前記ＬＣＤＲ１が配列番号２２のアミノ酸配列を含み、かつ／または
    ｅ）前記ＬＣＤＲ２が配列番号２８のアミノ酸配列を含み、かつ／または
    ｆ）前記ＬＣＤＲ３が配列番号３４のアミノ酸配列を含み、
    Ｘ５８、Ｘ５９およびＸ６０が請求項１に定義した通りである、請求項１に記載の抗体またはその抗原結合性断片。
  5. 前記重鎖可変領域が
    ａ）配列番号１の配列を含むＨＣＤＲ１、配列番号７の配列を含むＨＣＤＲ２、および配列番号１３の配列を含むＨＣＤＲ３、または
    ｂ）配列番号２の配列を含むＨＣＤＲ１、配列番号８の配列を含むＨＣＤＲ２、および配列番号１４の配列を含むＨＣＤＲ３、または
    ｃ）配列番号３の配列を含むＨＣＤＲ１、配列番号３７の配列を含むＨＣＤＲ２、および配列番号４０の配列を含むＨＣＤＲ３、または
    ｄ）配列番号３の配列を含むＨＣＤＲ１、配列番号３８の配列を含むＨＣＤＲ２、および配列番号４１の配列を含むＨＣＤＲ３、または
    ｅ）配列番号４の配列を含むＨＣＤＲ１、配列番号１０の配列を含むＨＣＤＲ２、および配列番号１６の配列を含むＨＣＤＲ３、または
    ｆ）配列番号４の配列を含むＨＣＤＲ１、配列番号１３４、１３５、１３６、１３７、１３８、および１３９からなる群から選択される配列を含むＨＣＤＲ２、ならびに配列番号１６の配列を含むＨＣＤＲ３、または
    ｇ）配列番号５の配列を含むＨＣＤＲ１、配列番号１１の配列を含むＨＣＤＲ２、および配列番号１７の配列を含むＨＣＤＲ３、または
    ｈ）配列番号６の配列を含むＨＣＤＲ１、配列番号１２の配列を含むＨＣＤＲ２、および配列番号１８の配列を含むＨＣＤＲ３
    を含む、請求項１から４のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合性断片。
  6. 前記軽鎖可変領域が、
    ａ）配列番号１９の配列を含むＬＣＤＲ１、配列番号２５の配列を含むＬＣＤＲ２、および配列番号３１の配列を含むＬＣＤＲ３、または
    ｂ）配列番号２０の配列を含むＬＣＤＲ１、配列番号２６の配列を含むＬＣＤＲ２、および配列番号３２の配列を含むＬＣＤＲ３、または
    ｃ）配列番号２１の配列を含むＬＣＤＲ１、配列番号２７の配列を含むＬＣＤＲ２、および配列番号３３の配列を含むＬＣＤＲ３、または
    ｄ）配列番号２２の配列を含むＬＣＤＲ１、配列番号２８の配列を含むＬＣＤＲ２、および配列番号３４の配列を含むＬＣＤＲ３、または
    ｅ）配列番号２３の配列を含むＬＣＤＲ１、配列番号２９の配列を含むＬＣＤＲ２、および配列番号３５の配列を含むＬＣＤＲ３、または
    ｆ）配列番号２４の配列を含むＬＣＤＲ１、配列番号３０の配列を含むＬＣＤＲ２、および配列番号３６の配列を含むＬＣＤＲ３
    を含む、請求項１から５のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合性断片。
  7. ａ）前記ＨＣＤＲ１が配列番号１の配列を含み、前記ＨＣＤＲ２が配列番号７の配列を含み、前記ＨＣＤＲ３が配列番号１３の配列を含み、前記ＬＣＤＲ１が配列番号１９の配列を含み、前記ＬＣＤＲ２が配列番号２５の配列を含み、前記ＬＣＤＲ３が配列番号３１の配列を含むか、または
    ｂ）前記ＨＣＤＲ１が配列番号２の配列を含み、前記ＨＣＤＲ２が配列番号８の配列を含み、前記ＨＣＤＲ３が配列番号１４の配列を含み、前記ＬＣＤＲ１が配列番号２０の配列を含み、前記ＬＣＤＲ２が配列番号２６の配列を含み、前記ＬＣＤＲ３が配列番号３２の配列を含むか、または
    ｃ）前記ＨＣＤＲ１が配列番号３の配列を含み、前記ＨＣＤＲ２が配列番号３７の配列を含み、前記ＨＣＤＲ３が配列番号４０の配列を含み、前記ＬＣＤＲ１が配列番号２１の配列を含み、前記ＬＣＤＲ２が配列番号２７の配列を含み、前記ＬＣＤＲ３が配列番号３３の配列を含むか、または
    ｄ）前記ＨＣＤＲ１が配列番号３の配列を含み、前記ＨＣＤＲ２が配列番号３８の配列を含み、前記ＨＣＤＲ３が配列番号４１の配列を含み、前記ＬＣＤＲ１が配列番号２１の配列を含み、前記ＬＣＤＲ２が配列番号２７の配列を含み、前記ＬＣＤＲ３が配列番号３３の配列を含むか、または
    ｅ）前記ＨＣＤＲ１が配列番号４の配列を含み、前記ＨＣＤＲ２が配列番号１０の配列を含み、前記ＨＣＤＲ３が配列番号１６の配列を含み、前記ＬＣＤＲ１が配列番号２２の配列を含み、前記ＬＣＤＲ２が配列番号２８の配列を含み、前記ＬＣＤＲ３が配列番号３４の配列を含むか、または
    ｆ）前記ＨＣＤＲ１が配列番号４の配列を含み、前記ＨＣＤＲ２が配列番号１３４、１３５、１３６、１３７、１３８、および１３９からなる群から選択される配列を含み、前記ＨＣＤＲ３が配列番号１６の配列を含み、前記ＬＣＤＲ１が配列番号２２の配列を含み、前記ＬＣＤＲ２が配列番号２８の配列を含み、前記ＬＣＤＲ３が配列番号３４の配列を含むか、または
    ｇ）前記ＨＣＤＲ１が配列番号５の配列を含み、前記ＨＣＤＲ２が配列番号１１の配列を含み、前記ＨＣＤＲ３が配列番号１７の配列を含み、前記ＬＣＤＲ１が配列番号２３の配列を含み、前記ＬＣＤＲ２が配列番号２９の配列を含み、前記ＬＣＤＲ３が配列番号３５の配列を含むか、または
    ｈ）前記ＨＣＤＲ１が配列番号６の配列を含み、前記ＨＣＤＲ２が配列番号１２の配列を含み、前記ＨＣＤＲ３が配列番号１８の配列を含み、前記ＬＣＤＲ１が配列番号２４の配列を含み、前記ＬＣＤＲ２が配列番号３０の配列を含み、前記ＬＣＤＲ３が配列番号３６の配列を含む、請求項１から６のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合性断片。
  8. 重鎖ＨＦＲ１、ＨＦＲ２、ＨＦＲ３、およびＨＦＲ４のうち１つもしくは複数、ならびに／または軽鎖ＬＦＲ１、ＬＦＲ２、ＬＦＲ３、およびＬＦＲ４のうち１つもしくは複数をさらに含み、
    ａ）前記ＨＦＲ１がＸ１９ＶＱＬＶＸ２０ＳＧＸ２１Ｘ２２Ｘ２３Ｘ２４ＫＰＧＸ２５ＳＸ２６Ｘ２７Ｘ２８ＳＣＸ２９ＡＳＧＸ３０Ｘ３１Ｘ３２Ｘ３３（配列番号７６）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、
    ｂ）前記ＨＦＲ２がＷＶＸ３４ＱＸ３５ＰＧＸ３６Ｘ３７ＬＥＷＸ３８Ｘ３９（配列番号７７）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、
    ｃ）前記ＨＦＲ３配列がＸ４０Ｘ４１ＴＸ４２Ｘ４３Ｘ４４ＤＸ４５ＳＸ４６Ｘ４７ＴＸ４８ＹＸ４９Ｘ５０Ｘ５１Ｘ５２ＳＬＸ５３Ｘ５４ＥＤＴＡＶＹＹＣＸ５５Ｘ５６（配列番号７８）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、
    ｄ）前記ＨＦＲ４がＷＧＱＧＴＸ５７ＶＴＶＳＳ（配列番号１２６）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、
    ｅ）前記ＬＦＲ１がＸ３ＩＶＸ４ＴＱＳＰＡＴＬＸ５Ｘ６ＳＰＧＥＲＸ７ＴＸ８Ｘ９Ｃ（配列番号８０）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、
    ｆ）前記ＬＦＲ２がＷＹＱＱＫＰＧＱＸ１０ＰＸ１１ＬＬＩＹ（配列番号８１）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、
    ｇ）前記ＬＦＲ３がＧＸ１２ＰＸ１３ＲＦＳＧＳＧＳＧＴＸ１４Ｘ１５ＴＬＴＩＳＳＸ１６ＥＰＥＤＦＡＶＹＸ１７Ｃ（配列番号８２）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、
    ｈ）前記ＬＦＲ４がＦＧＸ１８ＧＴＫＬＥＩＫ（配列番号１５２）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、
    Ｘ３がＥまたはＱであり、Ｘ４がＬまたはＭであり、Ｘ５がＳまたはＴであり、Ｘ６がＬ、Ｖ、またはＡであり、Ｘ７がＡまたはＶであり、Ｘ８がＬまたはＩであり、Ｘ９がＳまたはＴであり、Ｘ１０がＡまたはＳであり、Ｘ１１がＲまたはＫであり、Ｘ１２がＩまたはＶであり、Ｘ１３がＡまたはＴであり、Ｘ１４がＤまたはＳであり、Ｘ１５がＦまたはＹであり、Ｘ１６がＬ、Ｍ、またはＶであり、Ｘ１７がＹまたはＦであり、Ｘ１８がＧまたはＱであり、Ｘ１９がＱまたはＥであり、Ｘ２０がＥまたはＱであり、Ｘ２１がＧまたはＡであり、Ｘ２２がＧまたはＥであり、Ｘ２３がＬまたはＶであり、Ｘ２４がＶまたはＫであり、Ｘ２５がＧまたはＡであり、Ｘ２６がＬ、Ｍ、またはＶであり、Ｘ２７がＲまたはＫであり、Ｘ２８がＶまたはＬであり、Ｘ２９がＡまたはＫであり、Ｘ３０がＦまたはＹであり、Ｘ３１がＮまたはＴであり、Ｘ３２がＦまたはＬであり、Ｘ３３がＳまたはＫであり、Ｘ３４がＲまたはＫであり、Ｘ３５がＡまたはＳであり、Ｘ３６がＫまたはＱであり、Ｘ３７がＲまたはＧであり、Ｘ３８がＭ、Ｉ、またはＶであり、Ｘ３９がＧまたはＡであり、Ｘ４０がＲまたはＫであり、Ｘ４１がＶ、Ａ、またはＦであり、Ｘ４２がＩまたはＬであり、Ｘ４３がＳまたはＴであり、Ｘ４４がＲまたはＡであり、Ｘ４５がＤまたはＴであり、Ｘ４６がＫ、Ａ、またはＳであり、Ｘ４７がＳまたはＮであり、Ｘ４８がＬ、Ｖ、またはＡであり、Ｘ４９がＭまたはＬであり、Ｘ５０がＱまたはＥであり、Ｘ５１がＭまたはＬであり、Ｘ５２がＳ、Ｉ、またはＮであり、Ｘ５３がＲまたはＫであり、Ｘ５４がＳまたはＴであり、Ｘ５５がＡまたはＴであり、Ｘ５６がＲ、Ｎ、またはＴであり、Ｘ５７がＴまたはＬである、請求項１から７のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合性断片。
  9. ａ）前記ＨＦＲ１がＥＶＱＬＶＥＳＧＧＧＬＶＫＰＧＧＳＸ６１ＲＬＳＣＡＡＳＧＦＴＦＳ（配列番号１５４）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、
    ｂ）前記ＨＦＲ２がＷＶＲＱＸ６２ＰＧＫＧＬＥＷＶＸ６３（配列番号１５５）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、
    ｃ）前記ＨＦＲ３がＲＦＴＩＳＲＤＤＳＫＮＴＸ６４ＹＬＱＭＮＳＬＫＴＥＤＴＡＶＹＹＣＴＴ（配列番号１５６）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、
    ｄ）前記ＨＦＲ４がＷＧＱＧＴＴＶＴＶＳＳ（配列番号７９）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、
    ｅ）前記ＬＦＲ１がＥＩＶＸ６５ＴＱＳＰＡＴＬＳＸ６６ＳＰＧＥＲＸ６７ＴＬＳＣ（配列番号１５７）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、
    ｆ）前記ＬＦＲ２がＷＹＱＱＫＰＧＱＸ６８ＰＲＬＬＩＹ（配列番号１５８）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、
    ｇ）前記ＬＦＲ３がＧＩＰＡＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＴＩＳＳＸ６９ＥＰＥＤＦＡＶＹＸ７０Ｃ（配列番号１５９）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、
    ｈ）前記ＬＦＲ４がＦＧＧＧＴＫＬＥＩＫ（配列番号１５３）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、
    Ｘ６１がＬまたはＭであり、Ｘ６２がＡまたはＳであり、Ｘ６３がＧまたはＡであり、Ｘ６４がＬまたはＶであり、Ｘ６５がＬまたはＭであり、Ｘ６６がＬまたはＶであり、Ｘ６７がＡまたはＶであり、Ｘ６８がＡまたはＳであり、Ｘ６９がＬまたはＶであり、Ｘ７０がＹまたはＦである、請求項８に記載の抗体またはその抗原結合性断片。
  10. ａ）前記ＨＦＲ１がＸ７１ＶＱＬＶＱＳＧＡＥＶＫＫＰＧＡＳＶＫＸ７２ＳＣＫＡＳＧＹＸ７３ＬＫ（配列番号１６０）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、
    ｂ）前記ＨＦＲ２がＷＶＸ７４ＱＡＰＧＱＸ７５ＬＥＷＸ７６Ｇ（配列番号１６１）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、
    ｃ）前記ＨＦＲ３がＸ７７Ｘ７８ＴＸ７９ＴＸ８０ＤＴＳＸ８１Ｘ８２ＴＡＹＸ８３ＥＬＸ８４ＳＬＲＳＥＤＴＡＶＹＹＣＡＸ８５（配列番号１４９）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、
    ｄ）前記ＨＦＲ４がＷＧＱＧＴＸ５７ＶＴＶＳＳ（配列番号１２６）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、
    ｅ）前記ＬＦＲ１がＸ８６ＩＶＬＴＱＳＰＡＴＬＸ８７Ｘ８８ＳＰＧＥＲＸ８９ＴＸ９０Ｘ９１Ｃ（配列番号１５０）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、
    ｆ）前記ＬＦＲ２がＷＹＱＱＫＰＧＱＸ１０ＰＸ１１ＬＬＩＹ（配列番号８１）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、
    ｇ）前記ＬＦＲ３がＧＸ９２ＰＸ９３ＲＦＳＧＳＧＳＧＴＸ９４Ｘ９５ＴＬＴＩＳＳＸ９６ＥＰＥＤＦＡＶＹＹＣ（配列番号１４８）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、
    ｈ）前記ＬＦＲ４がＦＧＱＧＴＫＬＥＩＫ（配列番号８３）の配列、またはその少なくとも８０％の配列同一性のある相同配列を含み、
    Ｘ１０、Ｘ１１、およびＸ５７が請求項８に定義した通りであり、Ｘ７１がＱまたはＥであり、Ｘ７２がＶまたはＬであり、Ｘ７３がＮまたはＴであり、Ｘ７４がＲまたはＫであり、Ｘ７５がＲまたはＧであり、Ｘ７６がＭまたはＩであり、Ｘ７７がＲまたはＫであり、Ｘ７８がＶまたはＡであり、Ｘ７９がＩまたはＬであり、Ｘ８０がＲまたはＡであり、Ｘ８１がＡまたはＳであり、Ｘ８２がＳまたはＮであり、Ｘ８３がＭまたはＬであり、Ｘ８４がＳまたはＩであり、Ｘ８５がＲまたはＮであり、Ｘ８６がＥまたはＱであり、Ｘ８７がＳまたはＴであり、Ｘ８８がＬまたはＡであり、Ｘ８９がＡまたはＶであり、Ｘ９０がＬまたはＩであり、Ｘ９１がＳまたはＴであり、Ｘ９２がＩまたはであり、Ｘ９３がＡまたはＴであり、Ｘ９４がＤまたはＳであり、Ｘ９５がＦまたはＹであり、Ｘ９６がＬまたはＭである、請求項８に記載の抗体またはその抗原結合性断片。
  11. 前記ＨＦＲ１が配列番号８４～８６、１１５、１１９～１２０、および１３１からなる群から選択される配列を含み、
    前記ＨＦＲ２が配列番号８７～９０、および１２１～１２３からなる群から選択される配列を含み、
    前記ＨＦＲ３が配列番号９１～９７、１１６～１１７、および１２４～１２５からなる群から選択される配列を含み、
    前記ＨＦＲ４が配列番号７９および１１８からなる群から選択される配列を含み、
    前記ＬＦＲ１が配列番号９８～１０３、および１２７～１２９からなる群から選択される配列を含み、
    前記ＬＦＲ２が配列番号１０４、１０５、および１３０からなる群から選択される配列を含み、
    前記ＬＦＲ３が配列番号１０６～１１０、および１３２～１３３からなる群から選択される配列を含み、
    前記ＬＦＲ４が配列番号８３および１５３からなる群から選択される配列を含む、請求項７または８に記載の抗体またはその抗原結合性断片。
  12. 配列番号６０、６２、６４、６６、１４０、１４１、１４２、１４６、１４７、３９からなる群から選択される配列、および少なくとも８０％の配列同一性を有ししかもヒトＣＤ３９に対する特異的結合親和性を保持しているその相同配列を含む重鎖可変領域、ならびに
    配列番号６１、６３、６５、６７、１４３、１４４、１４５、１１１、１１２、６３からなる群から選択される配列、および少なくとも８０％の配列同一性を有ししかもヒトＣＤ３９に対する特異的結合親和性を保持しているその相同配列を含む軽鎖可変領域
    を含む、請求項１から１１のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合性断片。
  13. 配列番号６８、７０、７２、７４からなる群から選択される配列、および少なくとも８０％の配列同一性を有ししかもヒトＣＤ３９に対する特異的結合親和性を保持しているその相同配列を含む重鎖可変領域、ならびに
    配列番号６９、７１、７３、７５からなる群から選択される配列、および少なくとも８０％の配列同一性を有ししかもヒトＣＤ３９に対する特異的結合親和性を保持しているその相同配列を含む軽鎖可変領域
    を含む、請求項１から１１のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合性断片。
  14. ａ）配列番号４２の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号５１の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｂ）配列番号４３の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号５２の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｃ）配列番号４４の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号５３の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｄ）配列番号４５の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号５４の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｅ）配列番号４７の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号５６の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｆ）配列番号４９の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号５８の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｇ）配列番号５０の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号５９の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｈ）配列番号６０の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６３の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｉ）配列番号６２の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６３の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｊ）配列番号６４の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６３の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｋ）配列番号６６の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６３の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｌ）配列番号６０の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６５の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｍ）配列番号６２の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６５の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｎ）配列番号６４の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６５の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｏ）配列番号６６の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６５の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｐ）配列番号６０の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６７の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｑ）配列番号６２の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６７の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｒ）配列番号６４の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６７の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｓ）配列番号６６の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６７の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｔ）配列番号１４０の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６１の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｕ）配列番号１４１の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６１の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｖ）配列番号１４２の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６１の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｗ）配列番号１４０の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号１４３の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｘ）配列番号１４１の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号１４３の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｙ）配列番号１４２の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号１４３の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｚ）配列番号１４０の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号１４４の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ａａ）配列番号１４１の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号１４４の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｂｂ）配列番号１４２の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号１４４の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｃｃ）配列番号１４０の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号１４５の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｄｄ）配列番号１４１の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号１４５の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｅｅ）配列番号１４２の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号１４５の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｆｆ）配列番号１４６の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号１１１の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｇｇ）配列番号１４６の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号１１２の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｈｈ）配列番号１４７の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号１１１の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｉｉ）配列番号３９の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６３の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｊｊ）配列番号６８の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６９の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｋｋ）配列番号７０の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６９の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｌｌ）配列番号７２の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６９の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｍｍ）配列番号７４の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号６９の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｎｎ）配列番号６８の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号７１の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｏｏ）配列番号７０の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号７１の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｐｐ）配列番号７２の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号７１の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｑｑ）配列番号７４の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号７１の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｒｒ）配列番号６８の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号７３の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｓｓ）配列番号７０の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号７３の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｔｔ）配列番号７２の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号７３の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｕｕ）配列番号７４の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号７３の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｖｖ）配列番号６８の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号７５の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｗｗ）配列番号７０の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号７５の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｘｘ）配列番号７２の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号７５の配列を含む軽鎖可変領域、または
    ｙｙ）配列番号７４の配列を含む重鎖可変領域、および配列番号７５の配列を含む軽鎖可変領域
    を含む、請求項１から１３のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合性断片。
  15. １つまたは複数のアミノ酸残基の置換または修飾をさらに含み、しかもヒトＣＤ３９に対する特異的結合親和性を保持している、請求項１から１４のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合性断片。
  16. 前記置換または修飾のうち少なくとも１つが前記重鎖可変領域または軽鎖可変領域の前記ＣＤＲ配列の１つもしくは複数の中、および／または前記非ＣＤＲ配列の１つもしくは複数の中にある、請求項１５に記載の抗体またはその抗原結合性断片。
  17. Ｆｃ領域、任意選択でヒト免疫グロブリン（Ｉｇ）のＦｃ領域、または任意選択でヒトＩｇＧのＦｃ領域をさらに含む、請求項１から１６のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合性断片。
  18. 前記Ｆｃ領域がヒトＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１、ＩｇＡ２、またはＩｇＭに由来する、請求項１７に記載の抗体またはその抗原結合性断片。
  19. ヒトＩｇＧ１に由来する前記Ｆｃ領域がＬ２３４ＡおよびＬ２３５Ａの変異を含む、請求項１８に記載の抗体またはその抗原結合性断片。
  20. ヒト化されている、請求項１から１９のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合性断片。
  21. モノクローナル抗体、二重特異的抗体、多重特異的抗体、組換え抗体、キメラ抗体、標識抗体、二価抗体、抗イディオタイプ抗体、または融合タンパク質である、請求項１から２０のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合性断片。
  22. ダイアボディ、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆｄ、Ｆｖ断片、ジスルフィド安定化Ｆｖ断片（ｄｓＦｖ）、（ｄｓＦｖ）２、二重特異的ｄｓＦｖ（ｄｓＦｖ－ｄｓＦｖ’）、ジスルフィド安定化ダイアボディ（ｄｓダイアボディ）、単鎖抗体分子（ｓｃＦｖ）、ｓｃＦｖダイマー（二価ダイアボディ）、多重特異的抗体、ラクダ化単一ドメイン抗体、ナノボディ、ドメイン抗体、または二価ドメイン抗体である、請求項１から２１のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合性断片。
  23. ＦＡＣＳアッセイによって測定して１０－８Ｍ以下のＥＣ５０でヒトＣＤ３９に特異的に結合することができる、請求項１から２２のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合性断片。
  24. ａ）ＦＡＣＳアッセイによって測定してヒトＣＤ３９に特異的に結合するが、マウスＣＤ３９に特異的に結合しない、
    ｂ）ＦＡＣＳアッセイによって測定して１０－８Ｍ以下のＥＣ５０でカニクイザルＣＤ３９に特異的に結合する、
    ｃ）Ｂｉａｃｏｒｅアッセイによって測定して１０－７Ｍ以下（たとえば５×１０－８Ｍ以下、３×１０－８Ｍ以下、２×１０－８Ｍ以下、１×１０－８Ｍ以下、または８×１０－９Ｍ以下）のＫＤ値でヒトＣＤ３９に特異的に結合する、
    ｄ）Ｏｃｔｅｔアッセイによって測定して１０－８Ｍ以下（たとえば８×１０－９Ｍ以下、５×１０－９Ｍ以下、４×１０－９Ｍ以下、３×１０－９Ｍ以下、１×１０－９Ｍ以下、または９×１０－１０Ｍ以下）のＫＤ値でヒトＣＤ３９に特異的に結合する、
    ｅ）ＡＴＰアーゼ活性アッセイによって測定して５０ｎＭ以下（たとえば１ｎＭ以下、５ｎＭ以下、１０ｎＭ以下、または３０ｎＭ以下）のＩＣ５０でＣＤ３９発現細胞中のＡＴＰアーゼ活性を阻害する、
    ｆ）ＦＡＣＳアッセイによるＣＤ８０、ＣＤ８６、および／またはＣＤ４０の発現の解析によって測定して１０ｎＭ以下（たとえば５ｎＭ以下、３ｎＭ以下、２ｎＭ以下、１ｎＭ以下、０．５ｎＭ以下、または０．２ｎＭ以下）の濃度でＡＴＰ媒介単球活性化を増強することができる、
    ｇ）ＩＬ－２の分泌、ＩＦＮ－γの分泌、ＣＤ４＋またはＣＤ８＋のＴ細胞の増殖によって測定して２５ｎＭ以下の濃度でＰＢＭＣ中のＡＴＰ媒介Ｔ細胞活性化を増強することができる、
    ｈ）ＦＡＣＳアッセイによるＣＤ８３の発現の解析によって、またはＴ細胞の増殖を促進する活性化樹状細胞（ＤＣ）の能力によって、または混合リンパ球反応（ＭＬＲ）アッセイにおけるＩＦＮ－γの産生を促進する活性化ＤＣの能力によって測定して、２５ｎＭ以下（または１０ｎＭ以下、または５ｎＭ以下、または１ｎＭ以下、または０．５ｎＭ以下）の濃度でＡＴＰ媒介ＤＣ活性化を増強することができる、
    ｉ）ＦＡＣＳアッセイによって測定して１ｎＭ以下（たとえば０．１ｎＭ以下、０．０１ｎＭ以下）の濃度でアデノシン（ＡＴＰから加水分解される）によって誘導されるＣＤ４＋Ｔ細胞の増殖の阻害をブロックすることができる、
    ｊ）哺乳動物のＮＫ細胞またはマクロファージ細胞に依存する様式で腫瘍の成長を阻害することができる、
    ｋ）Ｔ細胞の増殖、ＣＤ２５＋細胞、および生細胞集団によって測定して、ｅＡＴＰによって阻害されたヒトＣＤ８＋Ｔ細胞の増殖を反転させることができる、および
    ｌ）ＥＬＩＳＡアッセイによって測定して５０ｎＭ以下（または１２．５ｎＭ以下、または３．１３ｎＭ以下、または０．７８ｎＭ以下、または０．２ｎＭ以下、または０．０４９ｎＭ以下、または０．０１２ｎＭ以下、または０．００３ｎＭ以下、または０．０００８ｎＭ以下）の濃度で、ＬＰＳ刺激によって誘導されたヒトマクロファージのＩＬ１βの放出を増強することができる、
    からなる群から選択される１つまたは複数の特性を有する、請求項１から２３のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合性断片。
  25. ヒトＣＤ３９との結合について請求項１から２４のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合性断片と競合する、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片。
  26. ヒトＣＤ３９との結合について配列番号４３の配列を含む重鎖可変領域および配列番号５２の配列を含む軽鎖可変領域を含む抗体と競合する、請求項２５に記載の抗体またはその抗原結合性断片。
  27. ヒトＣＤ３９との結合について配列番号４４の配列を含む重鎖可変領域および配列番号５３の配列を含む軽鎖可変領域を含む抗体と競合するか、または配列番号４５の配列を含む重鎖可変領域および配列番号５４の配列を含む軽鎖可変領域を含む抗体と競合する、請求項２５に記載の抗体またはその抗原結合性断片。
  28. ヒトＣＤ３９との結合について配列番号４７の配列を含む重鎖可変領域および配列番号５６の配列を含む軽鎖可変領域を含む抗体と競合する、請求項２５に記載の抗体またはその抗原結合性断片。
  29. ＣＤ３９のエピトープと特異的に結合する抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片であって、前記エピトープが、Ｑ９６、Ｎ９９、Ｅ１４３、Ｒ１４７、Ｒ１３８、Ｍ１３９、Ｅ１４２、Ｋ５、Ｅ１００、Ｄ１０７、Ｖ８１、Ｅ８２、Ｒ１１１、およびＶ１１５からなる群から選択される１つまたは複数の残基を含む、抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片。
  30. 前記エピトープがＱ９６、Ｎ９９、Ｅ１４３、およびＲ１４７からなる群から選択される１つまたは複数の残基を含む、請求項１から２９のいずれか一項に記載の抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片。
  31. 前記エピトープがＲ１３８、Ｍ１３９、およびＥ１４２からなる群から選択される１つまたは複数の残基を含む、請求項１から２９のいずれか一項に記載の抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片。
  32. 前記エピトープがＫ５、Ｅ１００、およびＤ１０７からなる群から選択される１つまたは複数の残基を含む、請求項１から２９のいずれか一項に記載の抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片。
  33. 前記エピトープがＶ８１、Ｅ８２、Ｒ１１１、およびＶ１１５からなる群から選択される１つまたは複数の残基を含む、請求項１から２９のいずれか一項に記載の抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片。
  34. 前記ＣＤ３９が配列番号１６２のアミノ酸配列を含むヒトＣＤ３９である、請求項１から３３のいずれか一項に記載の抗ＣＤ３９抗体またはその抗原結合性断片。
  35. 抗体９－８Ｂ、抗体Ｔ８９５、および抗体Ｉ３９４のいずれでもなく、
    抗体９－８Ｂが配列番号４６の配列を含む重鎖可変領域および配列番号４８の配列を含む軽鎖可変領域を含み、
    抗体Ｔ８９５が配列番号５５の配列を含む重鎖可変領域および配列番号５７の配列を含む軽鎖可変領域を含み、
    抗体Ｉ３９４が配列番号１１３の配列を含む重鎖可変領域および配列番号１１４の配列を含む軽鎖可変領域を含む、請求項２８から３４のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合性断片。
  36. 二重特異的である、請求項１から３５のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合性断片。
  37. ＣＤ３９以外の第２の抗原またはＣＤ３９上の第２のエピトープと特異的に結合することができる、請求項３６に記載の抗体またはその抗原結合性断片。
  38. １つまたは複数のコンジュゲート部分に連結された、請求項１から３７のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合性断片。
  39. 前記コンジュゲート部分がクリアランス修飾剤、化学療法剤、毒素、放射性同位体、ランタニド、発光標識、蛍光標識、酵素基質標識、ＤＮＡアルキル化剤、トポイソメラーゼ阻害剤、チューブリンバインダー、精製部分、またはその他の抗がん薬物を含む、請求項３８に記載の抗体またはその抗原結合性断片。
  40. 請求項１から３９のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合性断片および１つまたは複数の薬学的に許容される担体を含む医薬組成物。
  41. 請求項１から３９のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合性断片をコードする単離されたポリヌクレオチド。
  42. 請求項４１に記載の単離されたポリヌクレオチドを含むベクター。
  43. 請求項４２に記載のベクターを含む宿主細胞。
  44. 請求項１から３９のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合性断片、および／または請求項４０に記載の医薬組成物、ならびに第２の治療剤を含むキット。
  45. 請求項４２に記載のベクターが発現される条件下で請求項４３に記載の宿主細胞を培養するステップを含む、請求項１から３９のいずれか一項に記載の抗体またはその抗原結合性断片を発現する方法。
  46. 治療有効量の請求項１から３９のいずれか一項に記載の抗体もしくはその抗原結合性断片、および／または請求項４０に記載の医薬組成物を対象に投与するステップを含む、前記対象におけるＣＤ３９関連の疾患、障害、または状態を処置し、防止し、または軽減する方法。
  47. 治療有効量の請求項１から３９のいずれか一項に記載の抗体もしくはその抗原結合性断片、および／または請求項４０に記載の医薬組成物を対象に投与するステップを含む、前記対象におけるＣＤ３９のＡＴＰアーゼ活性を低減させることによって処置可能な疾患を処置し、防止し、または軽減する方法。
  48. 治療有効量の請求項１から３９のいずれか一項に記載の抗体もしくはその抗原結合性断片、および／または請求項４０に記載の医薬組成物を対象に投与するステップを含む、前記対象におけるＴ、単球、マクロファージ、ＤＣ、ＡＰＣ、ＮＫ、および／またはＢ細胞の活性のアデノシン媒介阻害に関連する疾患を処置し、防止し、または軽減する方法。
  49. 前記疾患、障害、または状態ががんである、請求項４６から４８のいずれか一項に記載の方法。
  50. 前記がんが肛門がん、虫垂がん、星状細胞腫、基底細胞癌、胆嚢がん、胃がん、肺がん、気管支がん、骨がん、肝胆管がん、膵がん、乳がん、肝がん、卵巣がん、精巣がん、腎がん、腎盂尿管がん、唾液腺がん、小腸がん、尿道がん、膀胱がん、頭頚部がん、脊椎がん、脳がん、頸がん、子宮がん、子宮内膜がん、結腸がん、結腸直腸がん、直腸がん、食道がん、胃腸管がん、皮膚がん、前立腺がん、下垂体がん、膣がん、甲状腺がん、咽喉がん、膠芽細胞腫、黒色腫、骨髄異形成症候群、肉腫、奇形腫、慢性リンパ球性白血病（ＣＬＬ）、慢性骨髄性白血病（ＣＭＬ）、急性リンパ球性白血病（ＡＬＬ）、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、多発性骨髄腫、ＴもしくはＢ細胞リンパ腫、ＧＩ器官間質腫、軟組織腫瘍、肝細胞癌、腺癌である、請求項４９に記載の方法。
  51. 前記がんが白血病、リンパ腫、膀胱がん、神経膠腫、膠芽細胞腫、卵巣がん、黒色腫、前立腺がん、甲状腺がん、食道がん、または乳がんである、請求項４９に記載の方法。
  52. 前記対象が、任意選択で非がん細胞または非免疫抑制細胞において通常見られるレベルより有意に高いレベルで、ＣＤ３９を発現しているがん細胞または腫瘍浸潤性免疫細胞もしくは免疫抑制細胞を有すると同定されている、請求項４６から５１のいずれか一項に記載の方法。
  53. 前記疾患、障害、または状態が自己免疫疾患または感染である、請求項４６から４８のいずれか一項に記載の方法。
  54. 前記自己免疫疾患が免疫性血小板減少症、全身性強皮症、硬化症、成人呼吸窮迫症候群、湿疹、喘息、シェーグレン症候群、アジソン病、巨細胞性動脈炎、免疫複合体性腎炎、免疫性血小板減少性紫斑病、自己免疫性血小板減少症、セリアック病、乾癬、皮膚炎、結腸炎、または全身性エリテマトーデスである、請求項５３に記載の方法。
  55. 前記感染がＨＩＶ感染、ＨＢＶ感染、ＨＣＶ感染、炎症性腸疾患、またはクローン病である、請求項５３に記載の方法。
  56. 前記対象がヒトである、請求項４６から５５のいずれか一項に記載の方法。
  57. 前記投与が経口、経鼻、静脈内、皮下、舌下、または筋肉内投与を介する、請求項４６から５６のいずれか一項に記載の方法。
  58. 治療有効量の第２の治療剤を投与するステップをさらに含む、請求項４６から５７のいずれか一項に記載の方法。
  59. 前記第２の治療剤が化学療法剤、抗がん薬、放射線療法剤、免疫療法剤、抗血管新生剤、標的療法剤、細胞療法剤、遺伝子療法剤、ホルモン療法剤、抗ウイルス剤、抗生剤、鎮痛剤、抗酸化剤、金属キレート剤、およびサイトカインからなる群から選択される、請求項５８に記載の方法。
  60. ＣＤ３９陽性細胞を請求項１から３９のいずれか一項に記載の抗体もしくはその抗原結合性断片および／または請求項４０に記載の医薬組成物に曝露するステップを含む、前記ＣＤ３９陽性細胞におけるＣＤ３９の活性を調節する方法。
  61. 前記細胞が免疫細胞である、請求項６０に記載の方法。
  62. 試料を請求項１から３９のいずれか一項に記載の抗体もしくはその抗原結合性断片および／または請求項４０に記載の医薬組成物と接触させるステップ、ならびに前記試料中におけるＣＤ３９の存在または量を決定するステップを含む、前記試料中におけるＣＤ３９の存在または量を検出する方法。
  63. ａ）対象から得た試料を請求項１から３９のいずれか一項に記載の抗体もしくはその抗原結合性断片および／または請求項４０に記載の医薬組成物と接触させるステップ、ｂ）前記試料中のＣＤ３９の存在または量を決定するステップ、ならびにｃ）ＣＤ３９の存在または量を前記対象におけるＣＤ３９関連の疾患、障害、または状態の存在またはステータスと相関させるステップを含む、前記対象におけるＣＤ３９関連の疾患、障害、または状態を診断する方法。
  64. 対象におけるＣＤ３９関連の疾患、障害、または状態を処置し、防止し、または軽減するための医薬の製造における、請求項１から３９のいずれか一項に記載の抗体もしくはその抗原結合性断片および／または請求項４０に記載の医薬組成物の使用。
  65. 対象におけるＣＤ３９関連の疾患、障害、または状態を診断するための診断試薬の製造における、請求項１から３９のいずれか一項に記載の抗体もしくはその抗原結合性断片および／または請求項４０に記載の医薬組成物の使用。
  66. ＣＤ３９の検出に有用な、請求項１から３９のいずれか一項に記載の抗体もしくはその抗原結合性断片および／または請求項４０に記載の医薬組成物を含むキット。
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Families Citing this family (14)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
AU2018312251A1 (en) 2017-07-31 2020-02-20 Trishula Therapeutics, Inc. Anti-CD39 antibodies, compositions comprising anti-CD39 antibodies and methods of using anti-CD39 antibodies
KR20230113752A (ko) * 2020-11-27 2023-08-01 엘피사이언스 (쑤저우) 바이오파마, 엘티디. Cd39 및 tgf베타를 표적화하는 신규 접합체 분자
CN114773473B (zh) * 2021-05-12 2023-02-24 杭州邦顺制药有限公司 抗cd39抗体及其制备方法和用途
EP4137516A1 (en) * 2021-08-20 2023-02-22 Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf Antigen-binding polypeptides against cd39
WO2023138643A1 (zh) * 2022-01-24 2023-07-27 上海华奥泰生物药业股份有限公司 Cd39抗原结合蛋白及其应用
TW202340243A (zh) 2022-03-03 2023-10-16 美商阿克思生物科學有限公司 抗ｃｄ３９抗體及其用途
AU2023252914A1 (en) 2022-04-13 2024-10-17 Arcus Biosciences, Inc. Combination therapy for treating trop-2 expressing cancers
WO2023236968A1 (zh) * 2022-06-08 2023-12-14 上海华奥泰生物药业股份有限公司 Cd39/cd73双特异性抗原结合蛋白及其用途
WO2024030956A2 (en) * 2022-08-03 2024-02-08 Mozart Therapeutics, Inc. Cd39-specific binding agents and methods of using the same
CN117866090A (zh) * 2022-10-10 2024-04-12 三生国健药业（上海）股份有限公司 结合人cd39的抗体或其抗原结合片段、其制备方法及用途
WO2024109585A1 (zh) * 2022-11-23 2024-05-30 广东菲鹏制药股份有限公司 抗cd39抗体及其应用
WO2024115935A1 (en) * 2022-11-29 2024-06-06 Inserm Methods for the treatment of b-cell lymphoma using cd39 inhibitors
WO2024115966A2 (en) 2022-12-01 2024-06-06 Innate Pharma Compositions and methods for neoadjuvant treatment in cancer
CN118243802B (zh) * 2022-12-23 2024-09-24 北京东方百泰生物科技股份有限公司 一种抗Siglec-15单克隆抗体电荷异质性的检测方法

Family Cites Families (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DK2238170T3 (en) * 2008-01-31 2017-02-27 Inserm - Inst Nat De La Santé Et De La Rech Médicale ANTIBODIES AGAINST HUMAN CD39 AND ITS USE FOR INHIBITING ACTIVITY OF T-REGULATORY CELLS
TR201802772T4 (tr) * 2010-11-17 2018-03-21 Chugai Pharmaceutical Co Ltd Kan pıhtılaşma faktörü VIII in işlevi için alternatif işleve sahip multi-spesifik antijen bağlayıcı molekül.
US8790651B2 (en) * 2011-07-21 2014-07-29 Zoetis Llc Interleukin-31 monoclonal antibody
EP3215538A4 (en) * 2014-11-07 2018-07-04 Igenica Biotherapeutics, Inc. Anti-cd39 antibodies and uses thereof
KR102569813B1 (ko) * 2014-11-21 2023-08-24 브리스톨-마이어스 스큅 컴퍼니 Cd73에 대항한 항체 및 그의 용도
AU2016359790A1 (en) * 2015-11-23 2018-06-21 Innate Pharma CD39 vascular isoform targeting agents
WO2017157948A1 (en) * 2016-03-14 2017-09-21 Innate Pharma Anti-cd39 antibodies
WO2018065552A1 (en) * 2016-10-06 2018-04-12 Innate Pharma Anti-cd39 antibodies
KR102584011B1 (ko) * 2017-03-16 2023-09-27 이나뜨 파르마 에스.에이. 암 치료를 위한 조성물 및 방법
JP7274469B2 (ja) * 2017-10-06 2023-05-16 イナート・ファルマ・ソシエテ・アノニム Ｃｄ３９／ｃｄ７３軸によるｔ細胞活性の回復

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