JP2012147772A - Recombinant plasmid vector and method for producing protein by using the same - Google Patents
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Abstract
Description
本発明は、組換えタンパク質を発現させるための新規なベクター、およびそれを用いて宿主を形質転換して得られる形質転換体により、タンパク質を製造する方法に関する。 The present invention relates to a novel vector for expressing a recombinant protein and a method for producing a protein using a transformant obtained by transforming a host using the vector.
遺伝子工学的手法を用いて製造された組換えタンパク質は、医薬、農薬、研究試薬等に数多く用いられている。組換えタンパク質を製造するために用いる宿主としては主に、細菌、酵母、糸状菌、動物細胞などが用いられる。なかでも、大腸菌Escherichia coli(以下、本明細書では単に大腸菌とする)は組換えタンパク質を製造するための宿主として代表的に用いられており、研究例も豊富である。しかしながら、ヒト等の異種生物に由来した組換えタンパク質を大腸菌の細胞質内で発現させようとすると、しばしば、前記組換えタンパク質が不活性型の封入体として発現することがある。封入体として発現した不活性型タンパク質を活性型タンパク質に変換するには、リフォールディング工程を経る必要があり、作業が非常に煩雑となる。 Many recombinant proteins produced using genetic engineering techniques are used in medicines, agricultural chemicals, research reagents and the like. Bacteria, yeast, filamentous fungi, animal cells and the like are mainly used as hosts for producing recombinant proteins. Among them, Escherichia coli Escherichia coli (hereinafter simply referred to as E. coli in the present specification) is typically used as a host for producing a recombinant protein, and there are many research examples. However, when a recombinant protein derived from a heterologous organism such as a human is to be expressed in the cytoplasm of E. coli, the recombinant protein is often expressed as an inactive inclusion body. In order to convert an inactive protein expressed as an inclusion body into an active protein, it is necessary to go through a refolding step, and the work becomes very complicated.
細胞質内で封入体として発現する組換えタンパク質であっても、ペリプラズムであれば可溶性の活性型タンパク質として発現する場合がある(非特許文献1)。特に製造対象の組換えタンパク質がジスルフィド結合を有している場合、酸化的環境であり、かつジスルフィド結合形成に関与するタンパク質が存在するペリプラズムにおいて、前記タンパク質にジスルフィド結合が形成されることで、活性型タンパク質として発現する傾向がある。 Even a recombinant protein expressed as inclusion bodies in the cytoplasm may be expressed as a soluble active protein in the periplasm (Non-patent Document 1). In particular, when the recombinant protein to be produced has a disulfide bond, it is active by forming a disulfide bond in the periplasm where there is a protein involved in disulfide bond formation in an oxidative environment. It tends to be expressed as a type protein.
組換えタンパク質をペリプラズムに分泌発現させるためには、組換えタンパク質を、そのN末端側に、ペリプラズムへの分泌発現を促進させるシグナルペプチドを付加した状態で発現させる必要がある。なお、前記シグナルペプチドは、組換えタンパク質がペリプラズムへ分泌発現される際、シグナルペプチダーゼにより、組換えタンパク質から切除されるため、最終的には前記シグナルペプチドのない、組換えタンパク質が得られる。しかしながら、ペリプラズムに分泌発現させる方法を用いた場合、活性型組換えタンパク質の製造効率が低いという問題がある。 In order to secrete and express the recombinant protein in the periplasm, it is necessary to express the recombinant protein in a state in which a signal peptide that promotes secretory expression to the periplasm is added to the N-terminal side. Since the signal peptide is excised from the recombinant protein by signal peptidase when the recombinant protein is secreted and expressed into the periplasm, a recombinant protein without the signal peptide is finally obtained. However, when a method for secretory expression in the periplasm is used, there is a problem that the production efficiency of the active recombinant protein is low.
宿主のペリプラズムへ分泌発現させる方法を用いて組換えタンパク質を製造する際、その効率を改善する方法として、ジスルフィド結合形成に関係するDsbタンパク質と共発現させる方法(特許文献1)、グルタチオンレダクターゼと共発現させる方法(特許文献2)、分子シャペロンと共発現させる方法(特許文献3)等が報告されている。しかしながら、いずれの方法も共発現系の構築や共発現条件の最適化など、煩雑な操作を必要とした。 When a recombinant protein is produced using a method for secretory expression to the periplasm of the host, methods for improving its efficiency include co-expression with a Dsb protein related to disulfide bond formation (Patent Document 1), co-expression with glutathione reductase. Methods for expression (Patent Document 2), methods for co-expression with molecular chaperones (Patent Document 3), and the like have been reported. However, each method requires complicated operations such as construction of a co-expression system and optimization of co-expression conditions.
そこで本発明は、組換えタンパク質を宿主において高効率で分泌発現可能な新規なベクター、およびそれを用いて得られる形質転換体により組換えタンパク質を高効率に製造する方法を提供することにある。 Therefore, the present invention is to provide a novel vector capable of secreting and expressing a recombinant protein in a host with high efficiency, and a method for producing a recombinant protein with high efficiency using a transformant obtained by using the vector.
本発明者らは前記課題を解決すべく鋭意検討した結果、ペリプラズムにタンパク質を分泌させるためのシグナルペプチドをコードするオリゴヌクレオチドを含むベクターに、さらに新規なオリゴヌクレオチドを挿入することで、組換えタンパク質を宿主において高効率に分泌させることができることを見出し、本発明を完成させるに至った。 As a result of intensive studies to solve the above-mentioned problems, the present inventors have further inserted a novel oligonucleotide into a vector containing an oligonucleotide encoding a signal peptide for secreting the protein into the periplasm, whereby a recombinant protein is obtained. Has been found to be secreted with high efficiency in the host, and the present invention has been completed.
すなわち本発明は、以下の態様を包含する:
(1)配列番号1から6のいずれかに記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドと、ペリプラズムにタンパク質を分泌させるシグナルペプチドをコードするオリゴヌクレオチドとを含む、ヒト由来タンパク質を発現させるためのベクター。
That is, the present invention includes the following embodiments:
(1) A vector for expressing a human-derived protein comprising an oligonucleotide having the base sequence described in any one of SEQ ID NOs: 1 to 6 and an oligonucleotide encoding a signal peptide that causes the periplasm to secrete the protein.
(2)ペリプラズムにタンパク質を分泌させるシグナルペプチドが、配列番号7から9のいずれかに記載のアミノ酸配列からなるオリゴペプチドである、(1)に記載のベクター。 (2) The vector according to (1), wherein the signal peptide that causes the periplasm to secrete a protein is an oligopeptide consisting of the amino acid sequence of any one of SEQ ID NOs: 7 to 9.
(3)ヒト由来タンパク質をコードするポリヌクレオチドを挿入した(1)または(2)に記載のベクターを用いて宿主を形質転換して得られる、ヒト由来タンパク質を発現可能な形質転換体。 (3) A transformant capable of expressing a human-derived protein, obtained by transforming a host using the vector according to (1) or (2) into which a polynucleotide encoding a human-derived protein is inserted.
(4)宿主が大腸菌である、(3)に記載の形質転換体。 (4) The transformant according to (3), wherein the host is Escherichia coli.
(5)ヒト由来タンパク質がヒトFc結合性タンパク質である、(3)または(4)に記載の形質転換体。 (5) The transformant according to (3) or (4), wherein the human-derived protein is a human Fc-binding protein.
(6)ヒト由来タンパク質がヒトエリスロポエチン結合性タンパク質である、(3)または(4)に記載の形質転換体。 (6) The transformant according to (3) or (4), wherein the human-derived protein is a human erythropoietin-binding protein.
(7)(3)または(4)に記載の形質転換体を培養する工程を含む、ヒト由来タンパク質の製造方法。 (7) A method for producing a human-derived protein, comprising a step of culturing the transformant according to (3) or (4).
(8)(5)に記載の形質転換体を培養する工程を含む、ヒトFc結合性タンパク質の製造方法。 (8) A method for producing a human Fc-binding protein, comprising a step of culturing the transformant according to (5).
(9)(6)に記載の形質転換体を培養する工程を含む、ヒトエリスロポエチン結合性タンパク質の製造方法。 (9) A method for producing a human erythropoietin-binding protein, comprising a step of culturing the transformant according to (6).
以下、本発明について詳細に説明する。 Hereinafter, the present invention will be described in detail.
本発明のベクターは、配列番号1(5’−CTTTAAGAACGAGATATACAT−3’)に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、配列番号2(5’−CTTTAAGAAGGAGACAT−3’)に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、配列番号3(5’−CTTTAAGAAGGAGATATAAATACAT−3’)に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、配列番号4(5’−CTTTAAGAAGGAGATATACATAATACAT−3’)に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、配列番号5(5’−CTTTAAGAAGGAGATATACATAATAATACAT−3’)に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、配列番号6(5’−CTTTAAGAACGAGATATACATAATACAT−3’)に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドのうちのいずれかと、ペリプラズムにタンパク質を分泌させるシグナルペプチドをコードするオリゴヌクレオチドと、を含んでいることを特徴としている。なお、本願出願前に公開されていたDNA配列データベース(URL:http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi、アクセス日:2010年10月22日)を用いて、先行技術を調査したところ、配列番号1から6のいずれかに記載の塩基配列とペリプラズムにタンパク質を分泌させるシグナルペプチドをコードするオリゴヌクレオチドとを含むベクターは開示されておらず、本発明のベクターは新規なベクターであることを確認している。 The vector of the present invention includes an oligonucleotide consisting of the base sequence described in SEQ ID NO: 1 (5′-CTTTAAGAACGGAATATAC-3 ′), an oligonucleotide consisting of the base sequence described in SEQ ID NO: 2 (5′-CTTTAAGAAGAGAGACAT-3 ′), An oligonucleotide consisting of the base sequence set forth in SEQ ID NO: 3 (5′-CTTTAAGAGAGAGATAATAATACAT-3 ′), an oligonucleotide consisting of the base sequence set forth in SEQ ID NO: 4 (5′-CTTTAAGAAGGAGATATACATAATACAT-3 ′), SEQ ID NO: 5 (5 ′ -Oligonucleotide having the base sequence described in CTTTAAGAAGGAGATACATAATAATACAT-3 '), SEQ ID NO: 6 (5'-CTTTAAGAAACGAGATAT) And any of the oligonucleotide consisting of the nucleotide sequence of CATAATACAT-3 '), is characterized in that it contains an oligonucleotide encoding a signal peptide to secrete proteins into the periplasm, the. It should be noted that prior art was used by using a DNA sequence database (URL: http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi, access date: October 22, 2010) that was disclosed before the filing of the present application. As a result, a vector containing the nucleotide sequence of any one of SEQ ID NOS: 1 to 6 and an oligonucleotide encoding a signal peptide that secretes the protein into the periplasm has not been disclosed, and the vector of the present invention is novel. Confirm that it is a vector.
本発明のベクターに含まれる、配列番号1から6のいずれかに記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド(オリゴヌクレオチドA)と、ペリプラズムにタンパク質を分泌させるシグナルペプチドをコードするオリゴヌクレオチド(オリゴヌクレオチドB)は、オリゴヌクレオチドAの3’末端側にオリゴヌクレオチドBを直接付加する形で含んでいると好ましい。また、オリゴヌクレオチドBの3’末端側直後に制限酵素サイトを設け、発現させるヒト由来タンパク質をコードするポリヌクレオチドを前記サイトに挿入できるようにするとより好ましい。 The oligonucleotide (oligonucleotide A) comprising the base sequence described in any one of SEQ ID NOS: 1 to 6 and the oligonucleotide (oligonucleotide B) encoding a signal peptide that secretes the protein to the periplasm contained in the vector of the present invention Preferably contains oligonucleotide B directly added to the 3 ′ end of oligonucleotide A. More preferably, a restriction enzyme site is provided immediately after the 3 'end of the oligonucleotide B so that a polynucleotide encoding a human-derived protein to be expressed can be inserted into the site.
本発明のベクターに含まれる、配列番号1から6に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドは、いずれもその3’末端側にある、ヒト由来タンパク質をコードするポリヌクレオチドの発現の翻訳効率を制御する機能を有するオリゴヌクレオチドである。なお、配列番号1から6に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドのうち、どのオリゴヌクレオチドを選択するかにより、ヒト由来タンパク質をコードするポリヌクレオチドの発現の翻訳効率は変化する。例えば、宿主が大腸菌の場合、翻訳効率が高い順に、配列番号3、配列番号2、配列番号4、配列番号1、配列番号5、配列番号6となる(参考例参照)。配列番号1から6に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドのうち、どのオリゴヌクレオチドを選択するかについては、発現させるヒト由来タンパク質をコードするポリヌクレオチドの発現の翻訳効率や、前記タンパク質を発現させるための宿主を考慮し、適宜選択すればよい。 All of the oligonucleotides comprising the nucleotide sequences set forth in SEQ ID NOs: 1 to 6 contained in the vector of the present invention control the translation efficiency of the expression of the polynucleotide encoding the human-derived protein on the 3 ′ end side thereof. It is an oligonucleotide having a function. The translation efficiency of the expression of the polynucleotide encoding the human-derived protein varies depending on which oligonucleotide is selected from the oligonucleotides having the base sequences described in SEQ ID NOs: 1 to 6. For example, when the host is Escherichia coli, they are SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 5, and SEQ ID NO: 6 in descending order of translation efficiency (see Reference Example). Among the oligonucleotides consisting of the nucleotide sequences set forth in SEQ ID NOs: 1 to 6, which oligonucleotide is selected depends on the translation efficiency of the expression of the polynucleotide encoding the human-derived protein to be expressed and the expression of the protein May be selected as appropriate in consideration of the host.
本発明のベクターは、配列番号1から6のいずれかに記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドとペリプラズムにタンパク質を分泌させるためのオリゴヌクレオチドとを少なくも含んでいればよいが、前記2つのオリゴヌクレオチドの他に、転写開始に必要なプロモーターの機能を有するポリヌクレオチド、転写終結に必要なターミネーターの機能を有するポリヌクレオチド、複製起点の機能を有するポリヌクレオチド、抗生物質耐性遺伝子等の選択マーカーの機能を有するポリヌクレオチド、複数の制限酵素サイトを有したマルチクローニングサイトを構成するポリヌクレオチド等を、さらに含んでいると好ましい。 The vector of the present invention may contain at least an oligonucleotide having the nucleotide sequence set forth in any one of SEQ ID NOs: 1 to 6 and an oligonucleotide for secreting the protein into the periplasm. In addition, a polynucleotide having a promoter function necessary for transcription initiation, a polynucleotide having a terminator function necessary for transcription termination, a polynucleotide having a replication origin function, and a function of a selection marker such as an antibiotic resistance gene. It is preferable that the polynucleotide further comprises a polynucleotide having a multiple cloning site having a plurality of restriction enzyme sites, and the like.
本発明のベクターは、例えば、前述した、プロモーター、ターミネーター、複製起点、選択マーカー、マルチクローニングサイト等の機能を有するポリヌクレオチドを含む、市販のベクターの適切な箇所に、配列番号1から6のいずれかに記載の塩基配列からなるポリヌクレオチド、およびペリプラズムにタンパク質を分泌させるシグナルペプチドをコードするオリゴヌクレオチドを、遺伝子工学的手法を用いて挿入することで作製できる。前記市販のベクターは、形質転換する宿主に好ましいベクターを適宜選択すればよく、宿主が大腸菌の場合は、pUC、pET、pBBR、pBluescript、pTrc99aなどのプラスミドベクターが例示できる。本発明のベクターを作製する具体的な方法の一例として、配列番号1から6のいずれかに記載の塩基配列からなるポリヌクレオチドの3’末端側にペリプラズムにタンパク質を分泌させるシグナルペプチドをコードするオリゴヌクレオチドを直接結合したオリゴヌクレオチドを、PCR法で作製し、前記作製したオリゴヌクレオチドを市販の制限酵素やライゲーション試薬等を用いて、市販のベクター中の適切な位置(例えばプロモーターとターミネーターとの間)に挿入する方法があげられる。 The vector of the present invention may be any one of SEQ ID NOS: 1 to 6 at an appropriate location of a commercially available vector including the polynucleotide having the functions of the promoter, terminator, origin of replication, selection marker, multicloning site and the like described above. The polynucleotide comprising the nucleotide sequence described above and an oligonucleotide encoding a signal peptide that causes the periplasm to secrete a protein can be prepared by insertion using a genetic engineering technique. The commercially available vector may be appropriately selected as a preferred vector for the host to be transformed. When the host is Escherichia coli, plasmid vectors such as pUC, pET, pBBR, pBluescript, and pTrc99a can be exemplified. As an example of a specific method for producing the vector of the present invention, an oligo encoding a signal peptide that secretes a protein to the periplasm at the 3 ′ end side of a polynucleotide comprising the nucleotide sequence of any one of SEQ ID NOs: 1 to 6 An oligonucleotide to which nucleotides are directly bound is prepared by a PCR method, and the prepared oligonucleotide is used at a suitable position in a commercially available vector (for example, between a promoter and a terminator) using a commercially available restriction enzyme or a ligation reagent. The method of inserting in is mentioned.
本発明のベクターに含まれる、ペリプラズムにタンパク質を分泌させるシグナルペプチドは、組換えタンパク質を発現させる宿主により適宜選択すればよい。組換えタンパク質を製造するための宿主として大腸菌を用いる場合、大腸菌のペリプラズム分泌経路としてSecYEG複合体を介した分泌経路とツインアルギニン輸送(Tat)系を介した分泌経路が知られている(非特許文献1)ことから、前記経路を利用するシグナルペプチドを用いると好ましい。具体的には、PelBシグナルペプチド(MKYLLPTAAAGLLLLAAQPAMA:UniProt No.P0C1C1の1番目から22番目までの領域、配列番号7)、MalEシグナルペプチド(MKIKTGARILALSALTTMMFSASALA:UniProt No.P0AEX9の1番目から26番目までの領域、配列番号8)、TorTシグナルペプチド(MRVLLFLLLSLFMLPAFS:UniProt No.P38683の1番目から18番目の領域、配列番号9)があげられる。
The signal peptide contained in the vector of the present invention that causes the periplasm to secrete the protein may be appropriately selected depending on the host that expresses the recombinant protein. When Escherichia coli is used as a host for producing a recombinant protein, a secretory pathway via a SecYEG complex and a secretory pathway via a twin arginine transport (Tat) system are known as periplasmic secretory pathways of E. coli (non-patented). From the literature 1), it is preferable to use a signal peptide that utilizes the above pathway. Specifically, a PelB signal peptide (MKYLLPTAAAGLLLLLAAQPAMA: UniProt No. P0C1C1 from the first to the 22nd region, SEQ ID NO: 7), a MalE signal peptide (MKIKTGARILALSALTMMFSASALA: UniProt No. P0AEX9 from the first to the 26th region). SEQ ID NO: 8), TorT signal peptide (MRVLLFLLLSLFMLPFAS: UniProt No. P38683,
本発明のベクターを用いて組換えタンパク質を製造するには、本発明のベクターに含まれる、ペリプラズムにタンパク質を分泌させるシグナルペプチドをコードするオリゴヌクレオチドの3’末端側に直接、または任意のリンカーペプチドをコードするオリゴヌクレオチドを介して、組換えタンパク質をコードするポリヌクレオチド(組換えタンパク遺伝子)を挿入し、前記遺伝子を挿入したベクターを用いて宿主を形質転換して得られる形質転換体を、培養して製造すればよい。 In order to produce a recombinant protein using the vector of the present invention, any linker peptide can be used directly on the 3 ′ end side of an oligonucleotide encoding a signal peptide that causes the periplasm to secrete the protein contained in the vector of the present invention. A transformant obtained by inserting a polynucleotide (recombinant protein gene) encoding a recombinant protein through a oligonucleotide encoding the gene and transforming the host using the vector into which the gene has been inserted is cultured. Can be manufactured.
本発明のベクターを用いて製造する組換えタンパク質は、ヒト由来タンパク質のように従来の発現方法では活性型タンパク質としての発現が困難または発現量が少ないタンパク質に対して適用すると、本発明の効果を発揮できる点で好ましい。また、本発明のベクターを用いて製造する組換えタンパク質は、その由来する生物(例えば、ヒト)において細胞外に分泌発現されるタンパク質、または発現後にタンパク質の構造の一部分が細胞外に露出するタンパク質が、宿主のペリプラズムにおいて活性型タンパク質としての発現が期待できる点で好ましい。 When the recombinant protein produced using the vector of the present invention is applied to a protein that is difficult to express as an active protein by conventional expression methods, such as a human-derived protein, or has a low expression level, the effect of the present invention can be obtained. It is preferable in that it can be exhibited. In addition, the recombinant protein produced using the vector of the present invention is a protein that is secreted and expressed extracellularly in the organism from which it is derived (for example, human), or a protein in which a part of the protein structure is exposed outside the cell after expression. However, it is preferable in that expression as an active protein can be expected in the periplasm of the host.
本発明のベクターを用いて製造するヒト由来タンパク質の一例として、インシュリン、インターフェロン、インターロイキン、抗体、エリスロポエチン、成長ホルモン、およびそれらの受容体のタンパク質等があげられる。なお、本発明のベクターを用いて製造するヒト由来タンパク質は、前記タンパク質の完全体であってもよいし、前記タンパク質の機能に重要な部分のみから構成されるタンパク質であってもよいし、さらに前記タンパク質を構成するアミノ酸残基の一つ以上が欠失および/または挿入および/または置換されていてもよい。本発明のベクターを用いて製造するヒト由来タンパク質の好ましい一例である、ヒトFc結合性タンパク質の場合、該タンパク質は、ヒトFc結合性タンパク質の一つであるヒトFcγRIの全領域(UniProt No.P12314、配列番号76)であってもよく、ヒトFcγRIの一部領域(例えば、配列番号76に記載のアミノ酸配列のうち、16番目のグルタミンから289番目のバリンまでのアミノ酸からなるタンパク質)であってもよく、ヒトFcγRIの全領域または一部領域のアミノ酸のうちの一つ以上が欠失および/または挿入および/または置換されたヒトFcγRIであってもよい。また、本発明のベクターを用いて製造するヒト由来タンパク質の別の好ましい一例である、ヒトエリスロポエチン結合性タンパク質の場合、該タンパク質は、ヒトエリスロポエチン受容体の全領域(UniProt No.P19235)であってもよく、ヒトエリスロポエチン受容体の一部領域(例えば、配列番号77)であってもよく、ヒトエリスロポエチン受容体の全領域または一部領域のアミノ酸のうち一つ以上が欠失および/または挿入および/または置換されたものであってもよい。なお、本発明のベクターを用いて製造するヒト由来タンパク質に、簡便な精製や定量を容易にするためのタグ配列を付加してもよい。前記タグ配列の一例として、ポリヒスチジンタグやc−mycタグといった遺伝子工学で多用されるオリゴペプチドがあげられる。 Examples of human-derived proteins produced using the vector of the present invention include insulin, interferon, interleukin, antibody, erythropoietin, growth hormone, and their receptor proteins. The human-derived protein produced using the vector of the present invention may be a complete protein, a protein composed of only a part important for the function of the protein, or One or more amino acid residues constituting the protein may be deleted and / or inserted and / or substituted. In the case of a human Fc-binding protein, which is a preferred example of a human-derived protein produced using the vector of the present invention, the protein is the entire region of human FcγRI, which is one of human Fc-binding proteins (UniProt No. P12314). Or a partial region of human FcγRI (for example, a protein consisting of amino acids from the 16th glutamine to the 289th valine in the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 76) Alternatively, it may be human FcγRI in which one or more amino acids in the whole region or a partial region of human FcγRI are deleted and / or inserted and / or substituted. In the case of a human erythropoietin-binding protein, which is another preferred example of a human-derived protein produced using the vector of the present invention, the protein is the entire region of human erythropoietin receptor (UniProt No. P19235). Or a partial region of the human erythropoietin receptor (eg, SEQ ID NO: 77), wherein one or more amino acids of the entire region or a partial region of the human erythropoietin receptor are deleted and / or inserted and It may be substituted. A tag sequence for facilitating simple purification and quantification may be added to the human-derived protein produced using the vector of the present invention. Examples of the tag sequence include oligopeptides frequently used in genetic engineering, such as polyhistidine tags and c-myc tags.
本発明のベクターに挿入する、ヒト由来タンパク質をコードするポリヌクレオチドを作製する方法としては、
(I)ヒト由来タンパク質のアミノ酸配列から塩基配列に変換し、前記塩基配列を含むポリヌクレオチドを人工的に合成して作製する方法や、
(II)ヒト由来タンパク質の全体または部分配列を含むポリヌクレオチドを直接人工的に、またはヒト由来タンパク質のcDNAなどからPCR法といったDNA増幅法を用いて調製し、調製した前記ポリヌクレオチドを適当な方法で連結し作製する方法、
を例示することができる。なお、アミノ酸配列から塩基配列に変換する際は、形質転換させる宿主におけるコドンの使用頻度を考慮して変換するのが好ましい。一例として、宿主が大腸菌の場合は、アルギニン(Arg)ではAGA/AGG/CGG/CGAが、イソロイシン(Ile)ではATAが、ロイシン(Leu)ではCTAが、グリシン(Gly)ではGGAが、プロリン(Pro)ではCCCが、それぞれ使用頻度が少ないため(いわゆるレアコドンであるため)、それらのコドンを避けるように変換すればよい。コドンの使用頻度の解析は公的データベース(例えば、かずさDNA研究所のホームページにあるCodon Usage Databaseなど)を利用することによっても可能である。
As a method for producing a polynucleotide encoding a human-derived protein to be inserted into the vector of the present invention,
(I) a method of converting a human-derived protein from an amino acid sequence to a base sequence, artificially synthesizing a polynucleotide containing the base sequence,
(II) A polynucleotide containing a whole or partial sequence of a human-derived protein is prepared directly or artificially or from a cDNA or the like of a human-derived protein using a DNA amplification method such as a PCR method, and the prepared polynucleotide is subjected to an appropriate method. The method of connecting and making with
Can be illustrated. In addition, when converting from an amino acid sequence to a base sequence, it is preferable to convert in consideration of the codon usage frequency in the host to be transformed. For example, when the host is E. coli, AGA / AGG / CGG / CGA for arginine (Arg), ATA for isoleucine (Ile), CTA for leucine (Leu), GGA for glycine (Gly), proline ( In Pro), since CCC is used less frequently (because it is a so-called rare codon), it may be converted so as to avoid those codons. Analysis of codon usage frequency can also be performed by using a public database (for example, Codon Usage Database on the website of Kazusa DNA Research Institute).
本発明のベクターに、ヒト由来タンパク質をコードするポリヌクレオチドを挿入したベクターを用いて形質転換させる宿主としては、前記ヒト由来タンパク質の発現に適した宿主を適宜選択すればよく、COS細胞やCHO細胞に代表される動物細胞、バチルス属(ブレビバチルス属細菌やパエニバチルス属細菌のような広義のバチルス属細菌も含む)や大腸菌に代表される細菌、サッカロマイセス属、ピキア属、シゾサッカロマイセス属に代表される酵母、麹菌に代表される糸状菌が例示できるが、取扱いの簡便な大腸菌を宿主とするのが好ましい。なお、宿主を大腸菌とした場合、BL21(DE3)株、JM109株、HB101株といった遺伝子型が明らかとなっている株が特に好ましい。 As a host to be transformed using a vector in which a polynucleotide encoding a human-derived protein is inserted into the vector of the present invention, a host suitable for the expression of the human-derived protein may be appropriately selected. COS cells and CHO cells Animal cells represented by genus Bacillus (including bacteria of the broad genus such as Brevibacillus genus and Paenibacillus genus) and bacteria typified by E. coli, Saccharomyces genus, Pichia genus and Schizosaccharomyces genus Yeast, and filamentous fungi typified by koji molds are preferable, but it is preferable to use E. coli which is easy to handle as a host. When the host is Escherichia coli, strains with known genotypes such as BL21 (DE3) strain, JM109 strain, and HB101 strain are particularly preferred.
本発明のベクターにヒト由来タンパク質をコードするポリヌクレオチドを挿入したベクターを用いて宿主を形質転換させる方法としては、遺伝子組換え技術において慣用されている方法に準じて実施すればよく、具体的には塩化カルシウム法、エレクトロポレーション法等を例示することができる。これにより、前記ヒト由来タンパク質を発現可能な形質転換体(以下、単に本発明の形質転換体とする)が得られる。 A method for transforming a host using a vector in which a polynucleotide encoding a human-derived protein is inserted into the vector of the present invention may be carried out according to a method commonly used in gene recombination techniques. Can be exemplified by the calcium chloride method, the electroporation method and the like. Thereby, a transformant capable of expressing the human-derived protein (hereinafter simply referred to as the transformant of the present invention) is obtained.
本発明の形質転換体は、当該技術分野で周知であり、かつ、選択した宿主細胞の培養に適した培地で増殖させればよい。一例として宿主が大腸菌の場合は、好ましい培地の一例として、必要な栄養源を補ったLB(ルリア−ベルターニ)培地があげられる。本発明のベクターに抗生物質耐性遺伝子等の選択マーカーの機能を有するポリヌクレオチドが挿入されている場合は、前記選択マーカーに対応する薬剤を培地に添加した状態で培養すると、本発明の形質転換体を選択的に増殖できるため好ましい。例えば、形質転換に用いた本発明のベクターが、選択マーカーとしてカナマイシン耐性遺伝子を挿入していた場合、培地にカナマイシンを添加することで、本発明の形質転換体を選択的に増殖させることができる。なお、培地には、炭素、窒素および無機塩供給源の他に、適当な栄養源を加えてもよい。さらに、所望により、グルタチオン、システイン、シスタミン、チオグリコレート、及びジチオスレイトールからなる群から選択される一種類以上の還元剤を含んでもよい。また、培地にはグリシンといった、宿主から培養液へのタンパク質漏出を促す試薬を加えてもよい。 The transformant of the present invention is well known in the art and may be grown in a medium suitable for culturing selected host cells. As an example, when the host is Escherichia coli, an example of a preferable medium is an LB (Luria-Bertani) medium supplemented with necessary nutrient sources. When a polynucleotide having a function of a selectable marker such as an antibiotic resistance gene is inserted into the vector of the present invention, the transformant of the present invention is obtained by culturing in a state where a drug corresponding to the selectable marker is added to the medium. Is preferable because it can be selectively proliferated. For example, when the vector of the present invention used for transformation has a kanamycin resistance gene inserted as a selection marker, the transformant of the present invention can be selectively grown by adding kanamycin to the medium. . In addition to carbon, nitrogen and inorganic salt sources, an appropriate nutrient source may be added to the medium. Further, if desired, it may contain one or more reducing agents selected from the group consisting of glutathione, cysteine, cystamine, thioglycolate, and dithiothreitol. Further, a reagent such as glycine that promotes protein leakage from the host to the culture solution may be added to the medium.
本発明の形質転換体の培養温度および培地のpHについても、形質転換に用いた宿主に好ましい条件で行なえばよい。一例として宿主が大腸菌の場合、培養温度は10℃から40℃の範囲が好ましいが、特に形質転換体を増殖させるには30℃から38℃の範囲がより好ましく、形質転換体から組換えタンパク質を発現させるには15℃から25℃の範囲がより好ましい。また、培地のpHはpH6.5からpH7.5の範囲が好ましく、pH6.8からpH7.2の範囲がさらに好ましい。 The culture temperature and the pH of the medium of the transformant of the present invention may be determined under conditions preferable for the host used for transformation. For example, when the host is Escherichia coli, the culture temperature is preferably in the range of 10 ° C. to 40 ° C., but in particular, the range of 30 ° C. to 38 ° C. is more preferable for growing the transformant. A range of 15 ° C. to 25 ° C. is more preferable for expression. The pH of the medium is preferably in the range of pH 6.5 to pH 7.5, and more preferably in the range of pH 6.8 to pH 7.2.
本発明の形質転換体を作製するときに用いる宿主が好気性生物または通性嫌気性生物である場合、培養液に通気する必要があるが、その方法としては、宿主が細菌の場合、綿栓等の通気性のある栓をしたバッフル付三角フラスコを培養容器に用い、培養中、当該容器を振とうすることで培養液に通気を行なう方法が例示できる。 When the host used for producing the transformant of the present invention is an aerobic organism or a facultative anaerobic organism, it is necessary to aerate the culture solution. As the method, when the host is a bacterium, a cotton plug is used. An example is a method of using a baffled conical flask with a breathable stopper such as a culture container and shaking the container during the culture to vent the culture solution.
本発明のベクターに、誘導可能なプロモーターの機能を有するポリヌクレオチドを含んでいる場合は、前記プロモーターによりヒト由来タンパク質を効率的に発現できるような条件下で誘導をかけ、培養するのが好ましい。一例として、本発明のベクターに、lacプロモーターやtrcプロモーターを含んでいる場合は、IPTG(isopropyl−β−D−thiogalactopyranoside)を培地に添加することで誘導をかけ、培養すればよい。具体的には、培養液の濁度(Optical Density at 600nm、OD600)を測定し、約0.5から1.0となったときに、適当量のIPTGを添加後、引き続き培養することで、ヒト由来タンパク質の発現を誘導することができる。IPTGの添加濃度は0.005mMから1.0mMの範囲から適宜選択すればよいが、0.01mMから0.05mMの範囲が好ましい。IPTG誘導に関する種々の条件は当該技術分野において周知の条件で行なえばよい。 When the vector of the present invention contains a polynucleotide having a function of an inducible promoter, it is preferable to induce and culture under conditions that allow efficient expression of a human-derived protein by the promoter. As an example, when the lac promoter or trc promoter is included in the vector of the present invention, induction may be performed by adding IPTG (isopropyl-β-D-thiogalactopyroside) to the medium. Specifically, the turbidity (Optical Density at 600 nm, OD 600 ) of the culture solution is measured, and when it becomes about 0.5 to 1.0, an appropriate amount of IPTG is added and then cultured. The expression of human-derived protein can be induced. The addition concentration of IPTG may be appropriately selected from the range of 0.005 mM to 1.0 mM, but is preferably in the range of 0.01 mM to 0.05 mM. Various conditions relating to the IPTG induction may be performed under conditions well known in the art.
本発明の形質転換体の培養液からヒト由来タンパク質を回収するには、発現の形態によって一般的な抽出方法を適宜選択して用いればよい。例えばヒト由来タンパク質が宿主細胞のペリプラズムに発現する場合には、遠心分離操作により宿主細胞を集めた後、酵素や界面活性剤等を添加し、超音波破砕処理により宿主細胞を破砕して、当該組換えタンパク質を抽出すればよい。一方、ヒト由来タンパク質が細胞のペリプラズムから培養上清に漏出する場合は、宿主細胞を遠心分離操作によって分離し、得られる培養上清から当該ヒト由来タンパク質を抽出すればよい。 In order to recover the human-derived protein from the culture broth of the transformant of the present invention, a general extraction method may be appropriately selected and used depending on the form of expression. For example, when a human-derived protein is expressed in the periplasm of a host cell, the host cell is collected by centrifugation, and then an enzyme or a surfactant is added, and the host cell is crushed by ultrasonic crushing treatment. What is necessary is just to extract a recombinant protein. On the other hand, when human-derived protein leaks from the cell periplasm into the culture supernatant, the host cell may be separated by centrifugation, and the human-derived protein may be extracted from the resulting culture supernatant.
前記タンパク質抽出物からヒト由来タンパク質を分離・精製するには、当該技術分野において公知の方法を用いればよい。一例として、液体クロマトグラフィーを用いた分離・精製があげられる。液体クロマトグラフィーとしては、イオン交換クロマトグラフィー、疎水性相互作用クロマトグラフィー、ゲルろ過クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィーなどがあげられる。これらのクロマトグラフィーを組み合わせて精製操作を行なうことによって、ヒト由来タンパク質を高純度に調製することができる。 In order to separate and purify human-derived protein from the protein extract, a method known in the art may be used. An example is separation / purification using liquid chromatography. Examples of liquid chromatography include ion exchange chromatography, hydrophobic interaction chromatography, gel filtration chromatography, affinity chromatography and the like. A human-derived protein can be prepared with high purity by performing a purification operation by combining these chromatographies.
本発明のベクターは、新規なオリゴヌクレオチドである配列番号1から6のいずれかに記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドと、ペリプラズムにタンパク質を分泌させるためのオリゴヌクレオチドと、を含んでいることを特徴としている。本発明のベクターは、ヒト由来タンパク質といった、従来の発現方法では活性型タンパク質としての発現が困難または発現量が少ないタンパク質であっても、前記タンパク質を効率的に発現させることができる。 The vector of the present invention comprises a novel oligonucleotide comprising the nucleotide sequence of any one of SEQ ID NOs: 1 to 6 and an oligonucleotide for allowing the periplasm to secrete a protein. It is said. The vector of the present invention can efficiently express a protein such as a human-derived protein even if the protein is difficult to express as an active protein by a conventional expression method or has a low expression level.
以下、実施例および比較例に基づいて本発明を具体的に説明するが、本発明はこれらに限定されるものではない。なお、参考例は本発明を構成するものではない。 EXAMPLES Hereinafter, although this invention is demonstrated concretely based on an Example and a comparative example, this invention is not limited to these. The reference example does not constitute the present invention.
実施例1
配列番号4に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含むヒトFc結合性タンパク質発現ベクター、および前記ベクターにより得られる形質転換体を以下の方法で作製した。
(1)ペリプラズムにタンパク質を分泌させるためのシグナルペプチドとして、MalEシグナルペプチド(配列番号8)を選択し、下記に示す二段階PCRにより、前記シグナルペプチドをコードするポリヌクレオチドを作製した。
(1−1)一段階目のPCRを、表1の反応液組成のもと、98℃で10秒間の第一ステップ、55℃で5秒間の第二ステップ、72℃で1分間の第三ステップを1サイクルとした反応を5サイクル行なった後、4℃に冷却することで行なった。なお、オリゴヌクレオチドは、配列番号10(5’−TATACATATGAAAATAAAAACAGGTGCACGCATCC−3’)に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、配列番号11(5’−GCATTAACGACGATGATGTTTTCCGCCTCGGCTCTCGCC−3’)に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、配列番号12(5’−ATCGTCGTTAATGCGGATAATGCGAGGATGCGTGCACCTG−3’)に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、および配列番号13(5’−TTGTCCCATGGCTTCTTCGATTTTGGCGAGAGCCG−3’)に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを用いた。
Example 1
A human Fc-binding protein expression vector containing an oligonucleotide having the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 4 and a transformant obtained from the vector were prepared by the following method.
(1) A MalE signal peptide (SEQ ID NO: 8) was selected as a signal peptide for causing the periplasm to secrete proteins, and a polynucleotide encoding the signal peptide was prepared by the following two-step PCR.
(1-1) Based on the reaction solution composition shown in Table 1, the first stage PCR was carried out at 98 ° C. for 10 seconds for the first step, 55 ° C. for 5 seconds for the second step, and 72 ° C. for 1 minute for the third time. The reaction with one step as one cycle was performed by 5 cycles and then cooled to 4 ° C. The oligonucleotide is an oligonucleotide composed of the base sequence described in SEQ ID NO: 10 (5′-TATACATATGAAAATAAAAACAGGGTGCACCGCATCC-3 ′), an oligonucleotide composed of the base sequence described in SEQ ID NO: 11 (5′-GCATTAACGACGATGATGTTTTCCGCCTCGGCTCTCGCCC-3 ′), An oligonucleotide consisting of the base sequence described in SEQ ID NO: 12 (5′-ATCGTCGTTAATGCGGATAATGCCGAGGATGCGTGCCACCTG-3 ′) and an oligonucleotide consisting of the base sequence described in SEQ ID NO: 13 (5′-TTGTCCCATGGCTTCTCTCGATTTGGCGAGAGCCG-3 ′).
(1−2)二段階目のPCRを、表2の反応液組成のもと、98℃で10秒間の第一ステップ、55℃で5秒間の第二ステップ、72℃で1分間の第三ステップを1サイクルとした反応を30サイクル行なった後、4℃に冷却することで行なった。なお、鋳型としては一段階目のPCR産物を用い、PCRプライマーとしては配列番号10に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドおよび配列番号13に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを用いた。 (1-2) Based on the reaction solution composition shown in Table 2, the second-stage PCR was performed at 98 ° C for 10 seconds for the first step, 55 ° C for 5 seconds for the second step, and 72 ° C for 1 minute for the third time. The reaction with one step as one cycle was performed by cooling to 4 ° C. after 30 cycles. The first-stage PCR product was used as the template, and the oligonucleotide consisting of the base sequence shown in SEQ ID NO: 10 and the oligonucleotide consisting of the base sequence shown in SEQ ID NO: 13 were used as the PCR primers.
(2)二段階PCRにより作製した、MalEシグナルペプチドをコードするポリヌクレオチドを、制限酵素NdeIとNcoIで消化後、あらかじめ制限酵素NdeIとNcoIで消化したpET−26b(+)プラスミドベクター(Novagen社)にライゲーションし、これを用いて塩化カルシウム法により大腸菌BL21(DE3)株(Novagen社)を形質転換した。
(3)得られた形質転換体を50μg/mLのカナマイシンを添加したLB培地で培養後、菌体からプラスミドを抽出し、このプラスミドをプラスミドベクターpETMalEとした。プラスミドベクターpETMalEの概要とその作製工程を図1に示す。
(4)鋳型としてプラスミドベクターpETMalE(図1)を、PCRプライマーとして配列番号14(5’−AGTAGTAGGTTGAGGCCGTTGAG−3’)に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドおよび配列番号15(5’−TTTTCATATGTATTATGTATATCTCCTTCTTAAA−3’)に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを、それぞれ用いて、表2の反応組成のもと、98℃で10秒間の第一ステップ、55℃で5秒間の第二ステップ、72℃で1分間の第三ステップを1サイクルとした反応を30サイクル行なった後、4℃に冷却することでPCRを行なった。
(5)(4)のPCR産物を制限酵素SphIとNdeIで消化後、あらかじめ制限酵素SphIとNdeIで消化したpETMalEにライゲーションし、これを用いて大腸菌BL21(DE3)株を形質転換した。
(6)(5)の形質転換体を培養後、プラスミドを抽出し、このプラスミドをプラスミドベクターpETMalE−p7とした。プラスミドベクターpETMalE−p7には、配列番号4に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドと、MalEシグナルペプチド(配列番号8)をコードするオリゴヌクレオチドと、を含んでいる。プラスミドベクターpETMalE−p7の概要とその作製工程を図1に示す。また、プラスミドベクターpETMalE−p7(図1)のうち、制限酵素BglII認識サイトからBpu1102I認識サイトまでのポリヌクレオチドの塩基配列を配列番号16に示す。なお、配列番号16に記載の塩基配列のうち、88番目から115番目までのヌクレオチドが配列番号4に相当し、116番目から193番目までのヌクレオチドがMalEシグナルペプチド(配列番号8)をコードするオリゴヌクレオチドに相当する。
(7)下記の方法により組換えプラスミドベクターpETMalEFcR−p7およびその形質転換体を作製した。
(7−1)特開2008−245580号公報(特許文献4)に開示の方法に従い、コドンを大腸菌型に変換したヒトFcγRIをコードするポリヌクレオチドを含むプラスミドベクターpECFcRを作製した。
(7−2)鋳型としてプラスミドベクターpECFcRを、PCRプライマーとして配列番号17(5’−TCAGCCATGGGACAAGTAGATACCACCAAAGCTGTGATTA−3’)に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドと配列番号18(5’−CCAAGCTTAATGATGATGATGATGATGGACCGGGGTCGGCAGTTGAAGACCCAG−3’)に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを、それぞれ用いて、表2の反応液組成のもと、98℃で10秒間の第一ステップ、55℃で5秒間の第二ステップ、72℃で1分間の第三ステップを1サイクルとした反応を30サイクル行なった後、4℃に冷却することでPCRを行ない、C末端側にポリヒスチジンタグを付加した、ヒトFcγRIの細胞外領域(配列番号76に記載のアミノ酸配列のうち、16番目のグルタミンから289番目のバリンまでの領域)を含むポリペプチドをコードする塩基配列を含む、ポリヌクレオチドを作製した。
(7−3)(7−2)で得られたポリヌクレオチドを制限酵素NcoIとHindIIIで消化後、あらかじめ制限酵素NcoIとHindIIIで消化したプラスミドベクターpETMalE−p7(図1)にライゲーションすることで、プラスミドベクターpETMalEFcR−p7を作製した。プラスミドベクターpETMalEFcR−p7の概要とその作製工程を図2に示す。
(8)プラスミドベクターpETMalEFcR−p7(図2)を用いて大腸菌BL21(DE3)株を塩化カルシウム法により形質転換し、pETMalEFcR−p7の形質転換体を作製した。
(2) A pET-26b (+) plasmid vector (Novagen) prepared by two-step PCR and digested with restriction enzymes NdeI and NcoI and then digested with restriction enzymes NdeI and NcoI in advance. The Escherichia coli BL21 (DE3) strain (Novagen) was transformed by using the calcium chloride method.
(3) The obtained transformant was cultured in an LB medium supplemented with 50 μg / mL kanamycin, and then a plasmid was extracted from the cells, and this plasmid was designated as a plasmid vector pETmalE. An outline of the plasmid vector pETmalE and its production process are shown in FIG.
(4) The plasmid vector pETmalE (FIG. 1) as a template, the oligonucleotide consisting of the base sequence described in SEQ ID NO: 14 (5′-AGTAGTAGGTTGAGGCCGTTGAG-3 ′) as the PCR primer and SEQ ID NO: 15 (5′-TTTTCATATGTTATTGTTATCTCCTTTCTTAAA-3 ′ ) Using the oligonucleotides having the base sequences described in Table 2 under the reaction composition shown in Table 2, the first step at 98 ° C. for 10 seconds, the second step at 55 ° C. for 5 seconds, and the second step at 72 ° C. for 1 minute. After performing 30 cycles of the reaction with the third step of 1 cycle, PCR was performed by cooling to 4 ° C.
(5) After the PCR product of (4) was digested with restriction enzymes SphI and NdeI, it was ligated to pETMalE previously digested with restriction enzymes SphI and NdeI, and this was used to transform E. coli BL21 (DE3) strain.
(6) After culturing the transformant of (5), a plasmid was extracted, and this plasmid was designated as a plasmid vector pETmalE-p7. The plasmid vector pETMalE-p7 contains an oligonucleotide having the base sequence described in SEQ ID NO: 4 and an oligonucleotide encoding the MalE signal peptide (SEQ ID NO: 8). An outline of the plasmid vector pETMalE-p7 and its production process are shown in FIG. In addition, the base sequence of the polynucleotide from the restriction enzyme BglII recognition site to the Bpu1102I recognition site in the plasmid vector pETmalE-p7 (FIG. 1) is shown in SEQ ID NO: 16. Of the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 16, the 88th to 115th nucleotides correspond to SEQ ID NO: 4, and the 116th to 193rd nucleotides are oligos encoding the MalE signal peptide (SEQ ID NO: 8). Corresponds to nucleotide.
(7) A recombinant plasmid vector pETMalEFcR-p7 and its transformant were prepared by the following method.
(7-1) A plasmid vector pECFcR containing a polynucleotide encoding human FcγRI whose codon was converted to E. coli was prepared according to the method disclosed in Japanese Patent Application Laid-Open No. 2008-245580 (Patent Document 4).
(7-2) A plasmid vector pECFcR as a template, an oligonucleotide consisting of a base sequence described in SEQ ID NO: 17 (5′-TCAGCCATGGGACAAGTAGATACACCACCAAGCTGTGATTA-3 ′) as a PCR primer and SEQ ID NO: 18 (5′-CCAAGCTTAATGATGATGATGGATGGATGGAGCGGGTGTGGAGGG Each of the oligonucleotides consisting of the described base sequences was used for the first step at 98 ° C. for 10 seconds, the second step at 55 ° C. for 5 seconds, and the second step at 72 ° C. for 1 minute under the reaction solution composition shown in Table 2. 30 cycles of the reaction with the third step as one cycle, followed by PCR by cooling to 4 ° C. and adding a polyhistidine tag to the C-terminal side, human Fc A polynucleotide containing a base sequence encoding a polypeptide containing the extracellular region of γRI (the region from the 16th glutamine to the 289th valine in the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 76) was prepared.
(7-3) After digesting the polynucleotide obtained in (7-2) with restriction enzymes NcoI and HindIII, ligation to the plasmid vector pETmalE-p7 (FIG. 1) previously digested with restriction enzymes NcoI and HindIII, Plasmid vector pETmalEFcR-p7 was constructed. FIG. 2 shows an outline of the plasmid vector pETmalEFcR-p7 and its production process.
(8) Escherichia coli BL21 (DE3) strain was transformed by the calcium chloride method using the plasmid vector pETmalEFcR-p7 (FIG. 2) to prepare a transformant of pETmalEFcR-p7.
プラスミドベクターpETMalEFcR−p7により発現される組換えタンパク質は、ヒトFcγRIの細胞外領域からなる抗体結合性タンパク質であり、以降、本明細書では当該タンパク質をrhFcγRIと略記する。プラスミドベクターpETMalEFcR−p7(図2)には、5’末端側から、配列番号4に記載の塩基配列からなるポリヌクレオチド、MalEシグナルペプチド(配列番号8)をコードするオリゴヌクレオチド、rhFcγRIをコードするポリヌクレオチド、ポリヒスチジンタグをコードするオリゴヌクレオチドの順に配置されている。プラスミドベクターpETMalEFcR−p7(図2)のうち、制限酵素BglII認識サイトからHindIII認識サイトまでの塩基配列を、配列番号19に示す。なお、配列番号19に記載の塩基配列のうち、88番目から115番目までのヌクレオチドが配列番号4に相当し、116番目から193番目までのヌクレオチドがMalEシグナルペプチド(配列番号8)をコードするオリゴヌクレオチドに相当し、215番目から1036番目までのヌクレオチドがrhFcγRI(配列番号76に記載のアミノ酸配列のうち、16番目のグルタミンから289番目のバリンまでの領域)をコードするオリゴヌクレオチドに相当し、1037番目から1054番目のヌクレオチドがポリヒスチジンタグをコードするオリゴヌクレオチドに相当する。 The recombinant protein expressed by the plasmid vector pETMalEFcR-p7 is an antibody-binding protein consisting of the extracellular region of human FcγRI. Hereinafter, this protein is abbreviated as rhFcγRI. The plasmid vector pETMalEFcR-p7 (FIG. 2) includes, from the 5 ′ end side, a polynucleotide comprising the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 4, an oligonucleotide encoding the MalE signal peptide (SEQ ID NO: 8), and a polynucleotide encoding rhFcγRI. The nucleotides and the oligonucleotides encoding the polyhistidine tags are arranged in this order. The nucleotide sequence from the restriction enzyme BglII recognition site to the HindIII recognition site in the plasmid vector pETMalEFcR-p7 (FIG. 2) is shown in SEQ ID NO: 19. Of the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 19, the 88th to 115th nucleotides correspond to SEQ ID NO: 4, and the 116th to 193rd nucleotides encode an MalE signal peptide (SEQ ID NO: 8). The nucleotides corresponding to nucleotides 215 to 1036 correspond to oligonucleotides encoding rhFcγRI (the region from the 16th glutamine to the 289th valine in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 76). The 1054th nucleotide corresponds to the oligonucleotide encoding the polyhistidine tag.
実施例2
配列番号1に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含むヒトFc結合性タンパク質発現ベクター、および前記ベクターにより得られる形質転換体を以下の方法で作製した。
(1)鋳型として実施例1で作製したプラスミドベクターpETMalE−p7(図1)を、PCRプライマーとして配列番号14に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドおよび配列番号21(5’−ATTTTCATATGTATATCTCGTTCTTAAA−3’)に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを、それぞれ用いて、表2の反応液組成のもと、98℃で10秒間の第一ステップ、55℃で5秒間の第二ステップ、72℃で1分間の第三ステップを1サイクルとした反応を30サイクル行なった後、4℃に冷却することでPCRを行なった。
(2)PCR産物を制限酵素SphIとNdeIで消化後、あらかじめ制限酵素SphIとNdeIで消化した組換えプラスミドベクターpETMalEFcR−p7(図2)にライゲーションすることで、プラスミドベクターpETMalEFcR−rbsを作製した。プラスミドベクターpETMalEFcR−rbsは、プラスミドベクターpETMalEFcR−p7(図2)に含まれる配列番号4に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドの部分を、配列番号1に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドに置換した構造である。
(3)プラスミドベクターpETMalEFcR−rbsを用いて、塩化カルシウム法により大腸菌BL21(DE3)株を形質転換し、pETMalEFcR−rbsの形質転換体を作製した。
Example 2
A human Fc-binding protein expression vector containing an oligonucleotide having the base sequence set forth in SEQ ID NO: 1 and a transformant obtained from the vector were prepared by the following method.
(1) The plasmid vector pETMalE-p7 (FIG. 1) prepared in Example 1 as a template was used as an oligonucleotide consisting of the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 14 as a PCR primer and SEQ ID NO: 21 (5′-ATTTTCATATTATATCTCGTTCTAAA-3 ′) Each of the oligonucleotides consisting of the base sequences described in Table 1 was used, under the reaction solution composition shown in Table 2, for the first step at 98 ° C for 10 seconds, the second step at 55 ° C for 5 seconds, and 72 ° C for 1 minute. After performing 30 cycles of the reaction with the third step of 1 cycle, PCR was performed by cooling to 4 ° C.
(2) The PCR product was digested with restriction enzymes SphI and NdeI, and then ligated to a recombinant plasmid vector pETmalEFcR-p7 (FIG. 2) previously digested with restriction enzymes SphI and NdeI to prepare plasmid vector pETmalEFcR-rbs. In the plasmid vector pETmalEFcR-rbs, the oligonucleotide part consisting of the base sequence shown in SEQ ID NO: 4 contained in the plasmid vector pETmalEFcR-p7 (FIG. 2) was replaced with the oligonucleotide consisting of the base sequence shown in SEQ ID NO: 1. It is a structure.
(3) Escherichia coli BL21 (DE3) strain was transformed by the calcium chloride method using the plasmid vector pETmalEFcR-rbs to prepare a transformant of pETmalEFcR-rbs.
実施例3
配列番号2に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含むヒトFc結合性タンパク質発現ベクター、および前記ベクターにより得られる形質転換体を以下の方法で作製した。
(1)PCRプライマーとして、配列番号14に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドおよび配列番号22(5’−ATATACATATGTCTCCTTCTTAAAGTT−3’)に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを用いたほかは、実施例2と同様の方法により、プラスミドベクターpETMalEFcR−m4を作製した。プラスミドベクターpETMalEFcR−m4は、プラスミドベクターpETMalEFcR−p7(図2)に含まれる配列番号4に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドの部分を、配列番号2に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドに置換した構造である。
(2)プラスミドベクターpETMalEFcR−m4を用いて、塩化カルシウム法により大腸菌BL21(DE3)株を形質転換し、pETMalEFcR−m4形質転換体を作製した。
Example 3
A human Fc-binding protein expression vector containing an oligonucleotide having the base sequence set forth in SEQ ID NO: 2 and a transformant obtained from the vector were prepared by the following method.
(1) Example 2 except that an oligonucleotide consisting of the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 14 and an oligonucleotide consisting of the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 22 (5′-ATATACATAGTCCTCTCTTTAAAAGTT-3 ′) were used as PCR primers. A plasmid vector pETmalEFcR-m4 was prepared in the same manner as described above. In the plasmid vector pETmalEFcR-m4, the part of the oligonucleotide consisting of the base sequence described in SEQ ID NO: 4 contained in the plasmid vector pETmalEFcR-p7 (FIG. 2) was replaced with the oligonucleotide consisting of the base sequence described in SEQ ID NO: 2. It is a structure.
(2) Escherichia coli BL21 (DE3) strain was transformed with the plasmid vector pETmalEFcR-m4 by the calcium chloride method to prepare a pETmalEFcR-m4 transformant.
実施例4
配列番号3に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含むヒトFc結合性タンパク質発現ベクター、および前記ベクターにより得られる形質転換体を以下の方法で作製した。(1)PCRプライマーとして、配列番号14に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドおよび配列番号23(5’−TTTTACATATGTATTTATATCTCCTTCTTAA−3’)に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを用いたほかは、実施例2と同様の方法により、プラスミドベクターpETMalEFcR−p4を作製した。プラスミドベクターpETMalEFcR−p4は、プラスミドベクターpETMalEFcR−p7(図2)に含まれる配列番号4に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドの部分を、配列番号3に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドに置換した構造である。
(2)プラスミドベクターpETMalEFcR−p4を用いて、塩化カルシウム法により大腸菌BL21(DE3)株を形質転換し、pETMalEFcR−p4形質転換体を作製した。
Example 4
A human Fc-binding protein expression vector containing an oligonucleotide having the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 3 and a transformant obtained from the vector were prepared by the following method. (1) Example 2 except that an oligonucleotide having the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 14 and an oligonucleotide having the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 23 (5′-TTTTATACATGTATTTATACTCCCTTCTTAA-3 ′) were used as PCR primers. The plasmid vector pETMalEFcR-p4 was prepared by the same method as described above. In the plasmid vector pETMalEFcR-p4, the oligonucleotide part consisting of the base sequence described in SEQ ID NO: 4 contained in the plasmid vector pETMalEFcR-p7 (FIG. 2) was replaced with the oligonucleotide consisting of the base sequence described in SEQ ID NO: 3. It is a structure.
(2) Escherichia coli BL21 (DE3) strain was transformed by the calcium chloride method using the plasmid vector pETmalEFcR-p4 to prepare a pETmalEFcR-p4 transformant.
実施例5
配列番号5に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含むヒトFc結合性タンパク質発現ベクター、および前記ベクターにより得られる形質転換体を以下の方法で作製した。(1)PCRプライマーとして、配列番号14に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドおよび配列番号24(5’−TTTTCATATGTATTATTATGTATATCTCCTTCTTA−3’)に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを用いたほかは、実施例2と同様の方法により、プラスミドベクターpETMalEFcR−p10を作製した。プラスミドベクターpETMalEFcR−p10は、プラスミドベクターpETMalEFcR−p7(図2)に含まれる配列番号4に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドの部分を、配列番号5に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドに置換した構造である。
(2)プラスミドベクターpETMalEFcR−p10を用いて、大腸菌BL21(DE3)株を塩化カルシウム法により形質転換し、pETMalEFcR−p10形質転換体を作製した。
Example 5
A human Fc-binding protein expression vector containing an oligonucleotide having the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 5 and a transformant obtained from the vector were prepared by the following method. (1) Example 2 except that an oligonucleotide having the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 14 and an oligonucleotide having the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 24 (5′-TTTTCATATGTATTATTTAGTTATCTCTCTCTCTA-3 ′) were used as PCR primers. A plasmid vector pETMalEFcR-p10 was prepared in the same manner as described above. In the plasmid vector pETmalEFcR-p10, the oligonucleotide part consisting of the base sequence described in SEQ ID NO: 4 contained in the plasmid vector pETmalAlFcR-p7 (FIG. 2) was replaced with the oligonucleotide consisting of the base sequence described in SEQ ID NO: 5. It is a structure.
(2) Escherichia coli BL21 (DE3) strain was transformed by the calcium chloride method using the plasmid vector pETmalEFcR-p10 to prepare a pETmalEFcR-p10 transformant.
実施例6
配列番号6に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含むヒトFc結合性タンパク質発現ベクター、および前記ベクターにより得られる形質転換体を以下の方法で作製した。
(1)PCRプライマーとして、配列番号14に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドおよび配列番号25(5’−TTTTCATATGTATTATGTATATCTCGTTCTTAAA−3’)に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを用いたほかは、実施例2と同様の方法により、プラスミドベクターpETMalEFcR−rbsp7を作製した。プラスミドベクターpETMalEFcR−rbsp7は、プラスミドベクターpETMalEFcR−p7(図2)に含まれる配列番号4に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドの部分を、配列番号6に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドに置換した構造である。
(2)プラスミドベクターpETMalEFcR−rbsp7を用いて、塩化カルシウム法により大腸菌BL21(DE3)株を形質転換し、pETMalEFcR−rbsp7の形質転換体を作製した。
Example 6
A human Fc-binding protein expression vector containing an oligonucleotide having the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 6 and a transformant obtained from the vector were prepared by the following method.
(1) Example 2 except that the oligonucleotide having the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 14 and the oligonucleotide having the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 25 (5′-TTTTCATATGTATTATGTATATCTCGTTTCTTAAA-3 ′) were used as PCR primers. The plasmid vector pETMalEFcR-rbsp7 was prepared by the same method as described above. In the plasmid vector pETmalEFcR-rbsp7, the oligonucleotide part consisting of the base sequence described in SEQ ID NO: 4 contained in the plasmid vector pETmalAlFcR-p7 (FIG. 2) was replaced with the oligonucleotide consisting of the base sequence described in SEQ ID NO: 6. It is a structure.
(2) Escherichia coli BL21 (DE3) strain was transformed by the calcium chloride method using the plasmid vector pETmalEFcR-rbsp7 to prepare a transformant of pETmalEFcR-rbsp7.
実施例7
実施例1から実施例6で作製した各形質転換体を用いて、rhFcγRIを発現させ、その量を評価した。
(1)実施例1で作製したpETMalEFcR−p7形質転換体、実施例2で作製したpETMalEFcR−rbs形質転換体、実施例3で作製したpETMalEFcR−m4形質転換体、実施例4で作製したpETMalEFcR−p4形質転換体、実施例5で作製したpETMalEFcR−p10形質転換体、および実施例6で作製したpETMalEFcR−rbsp7形質転換体、それぞれに対して、下記の方法により各形質転換体の培養および発現の誘導を行なった。
(1−1)各形質転換体を50μg/mLのカナマイシンを含むLB培地に接種し、37℃で一晩振とう培養し、前培養液とした。
(1−2)新たに50μg/mLのカナマイシンを含むLB培地に、前培養液を接種し37℃で振とう培養した。
(1−3)培養液の濁度(OD600)の値が約0.5になったところで、培養温度を20℃にして30分培養後、IPTGを終濃度0.01mMとなるように培養液に添加することで発現の誘導を行ない、引き続き20℃で22時間振とう培養した。
(1−4)培養後、遠心操作により得られた各形質転換体の菌体から、BugBuster protein extraction Kit(Novagen社製)を用いて可溶性タンパク質抽出液を調製した。
(2)可溶性タンパク質抽出液中のrhFcγRIのタンパク質量を下記に示すELISA(Enzyme−Linked Immunosorbent Assay)法により評価した。
(2−1)96穴マイクロプレートのウェルに、抗体であるガンマグロブリン(化学及血清療法研究所製)を濃度1μg/wellで固定し(4℃、18時間)、StartingBlock Blocking Buffers(PIERCE社製)によりブロッキングした。
(2−2)ブロッキング後、(1−4)で調製した可溶性タンパク質抽出液を段階希釈し、ELISA反応に供した(30℃、2時間)。
(2−3)続いて0.2%(w/v)のTween 20と150mMのNaClを含むTris−HCl緩衝液(pH8.0)で洗浄後、Horseradish Peroxidase 抗His−Tag抗体試薬(BETHYL社製)を添加し、30℃で2時間反応した。
(2−4)反応後、(2−3)で使用した緩衝液で洗浄を行ない、TMB Peroxidase Substrate(KPL社製)を添加し、450nmの吸光度を測定した。
(2−5)既知濃度のrhFcγRI市販品(Recombinant Human FcγRI/CD64;R&D systems社製)を基準とし、測定吸光度から可溶性タンパク質抽出液中のrhFcγRIのタンパク質濃度を算出することで、培養液あたりのrhFcγRIの発現量を算出した。
Example 7
Using each transformant prepared in Example 1 to Example 6, rhFcγRI was expressed and the amount thereof was evaluated.
(1) pETmalEFcR-p7 transformant prepared in Example 1, pETmalEFcR-rbs transform prepared in Example 2, pETmalEFcR-m4 transformant prepared in Example 3, pETmalEFcR- prepared in Example 4 For the p4 transformant, the pETMalEFcR-p10 transformant prepared in Example 5, and the pETmalEFcR-rbsp7 transformant prepared in Example 6, respectively, the culture and expression of each transformant were carried out by the following method. Guidance was performed.
(1-1) Each transformant was inoculated into an LB medium containing 50 μg / mL kanamycin and cultured with shaking at 37 ° C. overnight to prepare a preculture solution.
(1-2) A LB medium newly containing 50 μg / mL kanamycin was inoculated with the preculture and cultured at 37 ° C. with shaking.
(1-3) When the value of the turbidity (OD 600 ) of the culture solution becomes about 0.5, after culturing for 30 minutes at a culture temperature of 20 ° C., IPTG is cultured to a final concentration of 0.01 mM. Expression was induced by adding to the solution, followed by shaking culture at 20 ° C. for 22 hours.
(1-4) After cultivation, a soluble protein extract was prepared from the cells of each transformant obtained by centrifugation using BugBuster protein extraction Kit (manufactured by Novagen).
(2) The amount of rhFcγRI protein in the soluble protein extract was evaluated by the ELISA (Enzyme-Linked Immunosorbent Assay) method shown below.
(2-1) An antibody gamma globulin (manufactured by Chemo-Serum Therapy Laboratories) was fixed at a concentration of 1 μg / well (4 ° C., 18 hours) in a well of a 96-well microplate, and Starting Block Blocking Buffers (manufactured by PIERCE) ).
(2-2) After blocking, the soluble protein extract prepared in (1-4) was serially diluted and subjected to an ELISA reaction (30 ° C., 2 hours).
(2-3) Subsequently, after washing with Tris-HCl buffer (pH 8.0) containing 0.2% (w / v) Tween 20 and 150 mM NaCl, Horseradish Peroxidase anti-His-Tag antibody reagent (BETHYL) Made) and reacted at 30 ° C. for 2 hours.
(2-4) After the reaction, washing was performed with the buffer used in (2-3), TMB Peroxidase Substrate (manufactured by KPL) was added, and the absorbance at 450 nm was measured.
(2-5) Based on a commercially available rhFcγRI product having a known concentration (Recombinant Human FcγRI / CD64; manufactured by R & D systems), by calculating the protein concentration of rhFcγRI in the soluble protein extract from the measured absorbance, The expression level of rhFcγRI was calculated.
n=4で測定を行なった結果、各形質転換体による培養液あたりのrhFcγRIの発現量は、多い順に、pETMalEFcR−p10形質転換体(実施例5/配列番号5:823±158μg/L)、pETMalEFcR−rbsp7形質転換体(実施例6/配列番号6:700±89μg/L)、pETMalEFcR−rbs形質転換体(実施例2/配列番号1:539±50μg/L)、pETMalEFcR−m4形質転換体(実施例3/配列番号2:490±65μg/L)、pETMalEFcR−p7形質転換体(実施例1/配列番号4:466±23μg/L)、pETMalEFcR−p4形質転換体(実施例4/配列番号3:410±84μg/L)、であった。実施例1から実施例6で作製した形質転換体のうち、実施例5で作製したpETMalEFcR−p10形質転換体が、特に効率よくrhFcγRIを発現できることがわかる。 As a result of measuring at n = 4, the expression amount of rhFcγRI per culture solution by each transformant was, in descending order, pETmalEFcR-p10 transformant (Example 5 / SEQ ID NO: 5: 823 ± 158 μg / L), pETmalEFcR-rbsp7 transformant (Example 6 / SEQ ID NO: 6: 700 ± 89 μg / L), pETmalEFcR-rbs transformant (Example 2 / SEQ ID NO: 539 ± 50 μg / L), pETMalEFcR-m4 transformant (Example 3 / SEQ ID NO: 490 ± 65 μg / L), pETMalEFcR-p7 transformant (Example 1 / SEQ ID NO: 466 ± 23 μg / L), pETMalEFcR-p4 transformant (Example 4 / sequence) No. 3: 410 ± 84 μg / L). Of the transformants prepared in Example 1 to Example 6, it can be seen that the pETMalEFcR-p10 transformant prepared in Example 5 can express rhFcγRI particularly efficiently.
比較例1
実施例1で作製したプラスミドベクターpETMalEFcR−p7に含まれる配列番号4に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドの部分を、配列番号26に記載の塩基配列からなるプラスミドベクターpET−26b(+)由来の既存のオリゴヌクレオチド(5’−CTTTAAGAAGGAGATATACAT−3’)に置換した構造である、プラスミドベクターpETMalEFcR、および前記ベクターにより得られる形質転換体を、下記の方法により作製した。
(1)実施例1で作製した組換えプラスミドベクターpETMalEFcR−p7(図2)を制限酵素NdeIとHindIIIで消化することで、配列番号20に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含むポリヌクレオチド断片を作製した。なお、配列番号20に記載のアミノ酸配列のうち、1番目のメチオニンから26番目までのアラニンまでがMalEシグナルペプチド(配列番号8)に相当し、34番目のグルタミンから307番目のバリンまでがrhFcγRI(配列番号76に記載のアミノ酸配列のうち、16番目のグルタミンから289番目のバリンまでの領域)に相当し、308番目から313番目のヒスチジンがポリヒスチジンタグに相当する。
(2)(1)で作製した断片を、あらかじめ制限酵素NdeIとHindIIIで消化したpET−26b(+)プラスミドベクターにライゲーションすることで、プラスミドベクターpETMalEFcRを作製した。
(3)プラスミドベクターpETMalEFcRを用いて、塩化カルシウム法により大腸菌BL21(DE3)株を形質転換し、pETMalEFcR形質転換体を作製した。
(4)pETMalEFcR形質転換体を用いて、実施例7と同様の方法で、rhFcγRIの発現および発現量の評価を行なった。
Comparative Example 1
The oligonucleotide part consisting of the base sequence shown in SEQ ID NO: 4 contained in the plasmid vector pETMalEFcR-p7 prepared in Example 1 was derived from the plasmid vector pET-26b (+) consisting of the base sequence shown in SEQ ID NO: 26. Plasmid vector pETmalEFcR, which is a structure substituted with an existing oligonucleotide (5′-CTTTAAGAAGGGAATATAC-3 ′), and a transformant obtained from the vector were prepared by the following method.
(1) By digesting the recombinant plasmid vector pETMalEFcR-p7 (FIG. 2) prepared in Example 1 with restriction enzymes NdeI and HindIII, a polynucleotide encoding a polypeptide consisting of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 20 is obtained. Polynucleotide fragments containing were made. In the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 20, the first methionine to the 26th alanine correspond to the MalE signal peptide (SEQ ID NO: 8), and the 34th glutamine to the 307th valine correspond to rhFcγRI ( In the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 76, it corresponds to the region from the 16th glutamine to the 289th valine), and the 308th to 313th histidines correspond to the polyhistidine tag.
(2) The fragment prepared in (1) was ligated to the pET-26b (+) plasmid vector previously digested with restriction enzymes NdeI and HindIII, thereby preparing a plasmid vector pETmalEFcR.
(3) Escherichia coli BL21 (DE3) strain was transformed with the plasmid vector pETmalEFcR by the calcium chloride method to prepare a pETmalEFcR transformant.
(4) Using the pETMalEFcR transformant, rhFcγRI expression and expression level were evaluated in the same manner as in Example 7.
n=4で測定を行なった結果、pETMalEFcR形質転換体による培養液あたりのrhFcγRI発現量は293±10μg/Lであり、前記発現量は、実施例1から実施例6で作製した、本発明のベクターを用いて得られた形質転換体によるrhFcγRIの発現量に比べて少なかった。すなわち、rhFcγRIを発現可能な形質転換体において、配列番号1から6のいずれかに記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含むプラスミドベクターで形質転換して得られた形質転換体(実施例1から実施例6で作製した形質転換体)は、配列番号1から6に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含まないプラスミドベクター(pETMalEFcR)で形質転換して得られた形質転換体(本比較例で作製した形質転換体)と比較し、より高効率にrhFcγRIを発現させることができることがわかる。 As a result of measurement at n = 4, rhFcγRI expression level per culture solution by the pETmalEFcR transformant was 293 ± 10 μg / L, and the expression level of the present invention prepared in Examples 1 to 6 was The expression level of rhFcγRI by the transformant obtained using the vector was small. That is, in a transformant capable of expressing rhFcγRI, a transformant obtained by transforming with a plasmid vector containing the oligonucleotide having the nucleotide sequence set forth in any one of SEQ ID NOs: 1 to 6 (from Example 1) The transformant prepared in Example 6) is a transformant obtained by transforming with a plasmid vector (pETmalEFcR) that does not contain the oligonucleotide consisting of the nucleotide sequences set forth in SEQ ID NOS: 1 to 6 (prepared in this comparative example) It can be seen that rhFcγRI can be expressed with higher efficiency than the above-mentioned transformants.
実施例8
配列番号4に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含むヒトFc結合性タンパク質発現ベクター、および前記ベクターにより得られる形質転換体を以下の方法で作製した。
(1)ペリプラズムにタンパク質を分泌させるシグナルペプチドとして、PelBシグナルペプチド(配列番号7)を選択し、下記に示す二段階PCRにより、前記シグナルペプチドをコードする塩基配列を含むポリヌクレオチドを作製した。
(1−1)一段階目のPCRを、表1の反応液組成のもと、98℃で10秒間の第一ステップ、55℃で5秒間の第二ステップ、72℃で1分間の第三ステップを1サイクルとした反応を5サイクル行なった後、4℃に冷却することで行なった。なお、オリゴヌクレオチドとして、配列番号27(5’−TATACATATGAAATACCTATTGCCTACGGCAGCCGCT−3’)に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、配列番号28(5’−ATTGTTATTACTCGCTGCCCAACCAGCGATGGCC−3’)に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、配列番号29(5’−GCAGCGAGTAATAACAATCCAGCGGCTGCCGTAGGCA−3’)に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、および配列番号30(5’−TTTGGTGGTATCTACTTGGGCCATCGCTGGT−3’)に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを用いた。
(1−2)二段階目のPCRを、表2の反応液組成のもと、98℃で10秒間の第一ステップ、55℃で5秒間の第二ステップ、72℃で1分間の第三ステップを1サイクルとした反応を30サイクル行なった後、4℃に冷却することで行ない、PelBシグナルペプチドをコードするポリヌクレオチドを作製した。なお、鋳型としては一段階目のPCR産物を用い、PCRプライマーとしては配列番号27に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドおよび配列番号30に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを用いた。
(2)鋳型として実施例1で作製したプラスミドベクターpECFcR(図2)を、PCRプライマーとして配列番号31(5’−CAAGTAGATACCACCAAAGCTGTGATTACGCTGCAACCACCGT−3’)に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドおよび配列番号18に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを、それぞれ用い、表2の反応液組成のもと、98℃で10秒間の第一ステップ、55℃で5秒間の第二ステップ、72℃で1分間の第三ステップを1サイクルとした反応を30サイクル行なった後、4℃に冷却するPCRを行なうことで、C末端側にポリヒスチジンタグを付加したrhFcγRIをコードするポリヌクレオチドを作製した。
(3)(2)で作製したC末端側にポリヒスチジンタグを付加したrhFcγRIをコードするポリヌクレオチドと、(1)で作製したPelBシグナルペプチドをコードするポリヌクレオチドとを下記に示す二段階PCRで連結した。
(3−1)一段階目のPCRを、前記二つのポリヌクレオチドを用いて、表3の反応液組成のもと、98℃で10秒間の第一ステップ、55℃で5秒間の第二ステップ、72℃で1分間の第三ステップを1サイクルとした反応を5サイクル行なった後、4℃に冷却することで行なった。
Example 8
A human Fc-binding protein expression vector containing an oligonucleotide having the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 4 and a transformant obtained from the vector were prepared by the following method.
(1) A PelB signal peptide (SEQ ID NO: 7) was selected as a signal peptide that causes the periplasm to secrete a protein, and a polynucleotide containing a base sequence encoding the signal peptide was prepared by the following two-step PCR.
(1-1) Based on the reaction solution composition shown in Table 1, the first stage PCR was carried out at 98 ° C. for 10 seconds for the first step, 55 ° C. for 5 seconds for the second step, and 72 ° C. for 1 minute for the third time. The reaction with one step as one cycle was performed by 5 cycles and then cooled to 4 ° C. In addition, as an oligonucleotide, an oligonucleotide having a base sequence described in SEQ ID NO: 27 (5′-TATACATATGAAATACCTATTGCCCTACGGCAGCCCCT-3 ′), an oligonucleotide having a base sequence described in SEQ ID NO: 28 (5′-ATTGTTATTACTCGCTGCCCCAACCAGCGATGGCC-3 ′), An oligonucleotide consisting of the base sequence described in SEQ ID NO: 29 (5′-GCAGCGGATAATAACAATCCAGCGGCTGCCCGTAGGCA-3 ′) and an oligonucleotide consisting of the base sequence described in SEQ ID NO: 30 (5′-TTTGGGTGATCTACTTGGGCCCATCGCTGGGT-3 ′) were used.
(1-2) Based on the reaction solution composition shown in Table 2, the second-stage PCR was performed at 98 ° C for 10 seconds for the first step, 55 ° C for 5 seconds for the second step, and 72 ° C for 1 minute for the third time. After performing 30 cycles of reaction with one step as a step, the reaction was performed by cooling to 4 ° C. to prepare a polynucleotide encoding the PelB signal peptide. The first-stage PCR product was used as the template, and the oligonucleotide consisting of the base sequence shown in SEQ ID NO: 27 and the oligonucleotide consisting of the base sequence shown in SEQ ID NO: 30 were used as the PCR primers.
(2) The plasmid vector pECFcR (FIG. 2) prepared in Example 1 as a template and the oligonucleotide consisting of the base sequence described in SEQ ID NO: 31 (5′-CAAGTAGATACCACCCAAAGCTGTGATTACGCTGCAACCACCGT-3 ′) as a PCR primer Each of the oligonucleotides consisting of the base sequences was used, under the reaction solution composition shown in Table 2, for the first step at 98 ° C. for 10 seconds, the second step at 55 ° C. for 5 seconds, and the third step at 72 ° C. for 1 minute. After performing 30 cycles of the reaction with one step, a polynucleotide encoding rhFcγRI with a polyhistidine tag added to the C-terminal side was prepared by cooling to 4 ° C.
(3) The polynucleotide encoding rhFcγRI added with a polyhistidine tag on the C-terminal side prepared in (2) and the polynucleotide encoding the PelB signal peptide prepared in (1) by the two-step PCR shown below Connected.
(3-1) The first step of PCR was performed using the two polynucleotides and the first step at 98 ° C. for 10 seconds and the second step at 55 ° C. for 5 seconds based on the reaction solution composition shown in Table 3. The reaction was carried out by 5 cycles of a third step of 1 minute at 72 ° C., followed by cooling to 4 ° C.
(3−2)二段階目のPCRを、鋳型として一段階目のPCR産物を、PCRプライマーとして配列番号27に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドおよび配列番号18に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを、それぞれ用いて、表2の反応液組成のもと、98℃で10秒間の第一ステップ、55℃で5秒間の第二ステップ、72℃で1分間の第三ステップを1サイクルとした反応を30サイクル行なった後、4℃に冷却することで行なった。
この二段階PCRにより、PelBシグナルペプチド、rhFcγRIおよびポリヒスチジンタグからなる一連のポリペプチド(配列番号33)をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド(配列番号32)を作製した。なお、配列番号33に記載のアミノ酸配列のうち、1番目のメチオニンから22番目までのアラニンまでがPelBシグナルペプチド(配列番号7)に相当し、23番目のグルタミンから296番目のバリンまでがrhFcγRI(配列番号76に記載のアミノ酸配列のうち、16番目のグルタミンから289番目のバリンまでの領域)に相当し、297番目から302番目までのヒスチジンがポリヒスチジンタグに相当する。
(4)(3)で作製した配列番号32に記載の塩基配列からなるポリヌクレオチドを制限酵素NdeIとHindIIIで消化後、あらかじめ制限酵素NdeIとHindIIIで消化した実施例1で作製したプラスミドベクターpETMalE−p7(図2)にライゲーションすることで、プラスミドベクターpETPelBFcR−p7を作製した。プラスミドベクターpETPelBFcR−p7には、5’末端側から、配列番号4に記載の塩基配列からなるポリヌクレオチド、PelBシグナルペプチド(配列番号7)をコードするオリゴヌクレオチド、rhFcγRIをコードするポリヌクレオチド、ポリヒスチジンタグをコードするオリゴヌクレオチドの順に配置されている。
(5)プラスミドベクターpETPelBFcR−p7を用いて、塩化カルシウム法により大腸菌BL21(DE3)株を形質転換することで、pETPelBFcR−p7形質転換体を作製した。
(3-2) The second-stage PCR, the first-stage PCR product as a template, and the oligonucleotide consisting of the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 27 and the oligonucleotide consisting of the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 18 as PCR primers , Respectively, based on the reaction solution composition in Table 2, one cycle of 98 ° C. for 10 seconds first step, 55 ° C. for 5 seconds second step, 72 ° C. for 1
By this two-step PCR, a polynucleotide (SEQ ID NO: 32) containing a base sequence encoding a series of polypeptides (SEQ ID NO: 33) consisting of a PelB signal peptide, rhFcγRI and a polyhistidine tag was prepared. Of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 33, the first methionine to the 22nd alanine correspond to the PelB signal peptide (SEQ ID NO: 7), and the 23rd glutamine to the 296th valine correspond to rhFcγRI ( In the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 76, the region from the 16th glutamine to the 289th valine) corresponds to the histidine from the 297th to the 302nd, and corresponds to the polyhistidine tag.
(4) The plasmid vector pETMalE− prepared in Example 1 was digested with the restriction enzymes NdeI and HindIII and then digested with the restriction enzymes NdeI and HindIII in advance. The plasmid vector pETPelBFcR-p7 was prepared by ligation to p7 (FIG. 2). The plasmid vector pETPelBFcR-p7 includes, from the 5 ′ end, a polynucleotide consisting of the base sequence described in SEQ ID NO: 4, an oligonucleotide encoding the PelB signal peptide (SEQ ID NO: 7), a polynucleotide encoding rhFcγRI, and a polyhistidine The oligonucleotides encoding the tags are arranged in this order.
(5) A pETPelBFcR-p7 transformant was prepared by transforming E. coli BL21 (DE3) strain by the calcium chloride method using the plasmid vector pETPelBFcR-p7.
pETPelBFcR−p7形質転換体を用いて、実施例7と同様の方法により活性型rhFcγRIを発現させ、その発現量を評価した。n=3で測定を行なった結果、pETPelBFcR−p7形質転換体による培養液あたりの活性型rhFcγRIの発現量は292±36μg/Lであった。 Using the pETPelBFcR-p7 transformant, active rhFcγRI was expressed by the same method as in Example 7, and the expression level was evaluated. As a result of measurement at n = 3, the expression level of active rhFcγRI per culture solution by the pETPelBFcR-p7 transformant was 292 ± 36 μg / L.
比較例2
実施例8で作製したプラスミドベクターpETPelBFcR−p7に含まれる配列番号4に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドの部分を、配列番号26に記載の塩基配列からなるプラスミドベクターpET−26b(+)由来の既存のオリゴヌクレオチド(5’−CTTTAAGAAGGAGATATACAT−3’)に置換した構造である、プラスミドベクターpETPelBFcR、および前記ベクターにより得られる形質転換体を、下記の方法により作製した。
(1)実施例8で作製した、配列番号32に記載の塩基配列からなるポリヌクレオチドを制限酵素NdeIとHindIIIで消化後、あらかじめ制限酵素NdeIとHindIIIで消化したpET−26b(+)プラスミドベクターにライゲーションすることで、プラスミドベクターpETPelBFcRを作製した。
(2)プラスミドベクターpETPelBFcRを用いて、塩化カルシウム法により大腸菌BL21(DE3)株を形質転換し、pETPelBFcR形質転換体を作製した。
このpETPelBFcRの形質転換体を用いて、実施例7と同様の方法によりrhFcγRIを発現させ、その発現量を評価した。n=3で測定を行なった結果、pETPelBFcR形質転換体による培養液あたりのrhFcγRIの発現量は48±3μg/Lであり、前記発現量は、実施例8で作製した、本発明のベクターを用いて得られた形質転換体によるrhFcγRIの発現量に比べて少なかった。すなわち、rhFcγRIを発現可能な形質転換体において、配列番号4に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含むプラスミドベクター(pETPelBFcR−p7)で形質転換して得られた形質転換体(実施例8で作製した形質転換体)は、配列番号4に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含まないプラスミドベクター(pETPelBFcR)で形質転換して得られた形質転換体(本比較例で作製した形質転換体)と比較し、より高効率にrhFcγRIを発現させることができることがわかる。
Comparative Example 2
The oligonucleotide part consisting of the base sequence shown in SEQ ID NO: 4 contained in the plasmid vector pETPelBFcR-p7 prepared in Example 8 was derived from the plasmid vector pET-26b (+) consisting of the base sequence shown in SEQ ID NO: 26. Plasmid vector pETPelBFcR, which is a structure substituted with an existing oligonucleotide (5′-CTTTAAGAAGGAGAATACAT-3 ′), and a transformant obtained from the vector were prepared by the following method.
(1) The pET-26b (+) plasmid vector prepared in Example 8 was digested with the restriction enzymes NdeI and HindIII and then previously digested with the restriction enzymes NdeI and HindIII. Ligation produced a plasmid vector pETPelBFcR.
(2) Escherichia coli BL21 (DE3) strain was transformed by the calcium chloride method using the plasmid vector pETPelBFcR to prepare a pETPelBFcR transformant.
Using this pETPelBFcR transformant, rhFcγRI was expressed in the same manner as in Example 7, and the expression level was evaluated. As a result of measurement at n = 3, the expression level of rhFcγRI per culture solution by the pETPelBFcR transformant was 48 ± 3 μg / L, and the expression level was determined using the vector of the present invention prepared in Example 8. The amount of rhFcγRI expressed by the transformant thus obtained was small. That is, in a transformant capable of expressing rhFcγRI, a transformant obtained by transforming with a plasmid vector (pETPelBFcR-p7) containing an oligonucleotide having the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 4 (produced in Example 8) A transformant obtained by transforming with a plasmid vector (pETPelBFcR) that does not contain an oligonucleotide having the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 4 (the transformant prepared in this Comparative Example) and Comparison shows that rhFcγRI can be expressed with higher efficiency.
実施例9
配列番号4に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含むヒトFc結合性タンパク質発現ベクター、および前記ベクターにより得られる形質転換体を以下の方法で作製した。
(1)ペリプラズムにタンパク質を分泌させるシグナルペプチドとして、TorTシグナルペプチド(配列番号9)を選択し、以下に示す二段階PCRにより、TorTシグナルペプチドをコードする塩基配列を含むポリヌクレオチドを作製した。
(1−1)一段階目のPCRを、表1の反応液組成のもと、98℃で10秒間の第一ステップ、55℃で5秒間の第二ステップ、72℃で1分間の第三ステップを1サイクルとした反応を5サイクル行なった後、4℃に冷却することで行なった。なお、オリゴヌクレオチドとして、配列番号34(5’−TATACATATGCGCGTACTGCTATTTTTAC−3’)に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、配列番号35(5’−TTCTTTCCCTTTTCATGTTGCCGGCATTTTCG−3’)に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、配列番号36(5’−TGAAAAGGGAAAGAAGTAAAAATAGCAGTACG−3’)に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド、および配列番号37(5’−TTTGGTGGTATCTACTTGCGAAAATGCCGGCAACA−3’)に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを用いた。
(1−2)二段階目のPCRを、表2の反応液組成のもと、98℃で10秒間の第一ステップ、55℃で5秒間の第二ステップ、72℃で1分間の第三ステップを1サイクルとした反応を30サイクル行なった後、4℃に冷却することで行ない、TorTシグナルペプチドをコードするポリヌクレオチドを作製した。なお、鋳型としては一段階目のPCR産物を用い、PCRプライマーとしては配列番号34に記載の配列からなるオリゴヌクレオチドおよび配列番号37に記載の配列からなるオリゴヌクレオチドを用いた。
(2)TorTシグナルペプチドをコードするポリヌクレオチドと、実施例8で作製したC末端にポリヒスチジンタグを付加したrhFcγRIをコードするポリヌクレオチドを下記に示す二段階PCRで連結した。
(3−1)一段階目のPCRを、前記二つのポリヌクレオチドを用いて、表3の反応液組成のもと、98℃で10秒間の第一ステップ、55℃で5秒間の第二ステップ、72℃で1分間の第三ステップを1サイクルとした反応を5サイクル行なった後、4℃に冷却することで行なった。
(3−2)二段階目のPCRを、鋳型として一段階目のPCR産物を、PCRプライマーとして配列番号34に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドおよび配列番号18に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを、それぞれ用いて、表2の反応液組成のもと、98℃で10秒間の第一ステップ、55℃で5秒間の第二ステップ、72℃で1分間の第三ステップを1サイクルとした反応を30サイクル行なった後、4℃に冷却することで行なった。
この二段階PCRにより、TorTシグナルペプチド、rhFcγRIおよびHisタグペプチドからなる一連のポリペプチド(配列番号39)をコードする塩基配列を含むポリヌクレオチド(配列番号38)を作製した。なお、配列番号39に記載のアミノ酸配列のうち、1番目のメチオニンから18番目までのセリンまでがTorTシグナルペプチド(配列番号9)に相当し、19番目のグルタミンから292番目のバリンまでがrhFcγRI(配列番号76に記載のアミノ酸配列のうち、16番目のグルタミンから289番目のバリンまでの領域)に相当し、293番目から298番目までのヒスチジンがポリヒスチジンタグに相当する。
(4)(3)で作製した配列番号38に記載の塩基配列からなるポリヌクレオチドを制限酵素NdeIとHindIIIで消化後、あらかじめ制限酵素NdeIとHindIIIで消化した実施例1で作製したプラスミドベクターpETMalE−p7(図2)にライゲーションすることで、プラスミドベクターpETTorTFcR−p7を作製した。プラスミドベクターpETTorTFcR−p7には、5’末端側から、配列番号4に記載の塩基配列からなるポリヌクレオチド、TorTシグナルペプチド(配列番号9)をコードするオリゴヌクレオチド、rhFcγRIをコードするポリヌクレオチド、Hisタグペプチドをコードするオリゴヌクレオチドの順に配置されている。
(5)組換えプラスミドベクターpETTorTFcR−p7を用いて、塩化カルシウム法により大腸菌BL21(DE3)を形質転換し、pETTorTFcR−p7形質転換体を作製した。
(6)pETTorTFcR−p7形質転換体を用いて、実施例7と同様の方法によりrhFcγRIを発現させ、その発現量を評価した。n=3で測定を行なった結果、pETTorTFcR−p7の形質転換体による培養液あたりのrhFcγRIの発現量は320±61μg/Lであった。
Example 9
A human Fc-binding protein expression vector containing an oligonucleotide having the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 4 and a transformant obtained from the vector were prepared by the following method.
(1) A TorT signal peptide (SEQ ID NO: 9) was selected as a signal peptide that causes the periplasm to secrete a protein, and a polynucleotide containing a base sequence encoding the TorT signal peptide was prepared by the following two-step PCR.
(1-1) Based on the reaction solution composition shown in Table 1, the first stage PCR was carried out at 98 ° C. for 10 seconds for the first step, 55 ° C. for 5 seconds for the second step, and 72 ° C. for 1 minute for the third time. The reaction with one step as one cycle was performed by 5 cycles and then cooled to 4 ° C. In addition, as an oligonucleotide, an oligonucleotide consisting of the base sequence described in SEQ ID NO: 34 (5′-TATACATGCCGCGTACGCCTTTTTTAC-3 ′), an oligonucleotide consisting of the base sequence described in SEQ ID NO: 35 (5′-TTCTTTCCCTTTTCATGTTTGCCGGCATTTTCG-3 ′), An oligonucleotide consisting of the base sequence described in SEQ ID NO: 36 (5′-TGAAAAGGAGAAGAAGTAAAAAATAGCAGTACG-3 ′) and an oligonucleotide consisting of the base sequence described in SEQ ID NO: 37 (5′-TTTGGTGGTATCACTTGCGAAAATGCCGGCAACA-3 ′) were used.
(1-2) Based on the reaction solution composition shown in Table 2, the second-stage PCR was performed at 98 ° C for 10 seconds for the first step, 55 ° C for 5 seconds for the second step, and 72 ° C for 1 minute for the third time. After performing 30 cycles of reaction with one step as a step, the reaction was performed by cooling to 4 ° C. to prepare a polynucleotide encoding a TorT signal peptide. The first-stage PCR product was used as a template, and the oligonucleotide consisting of the sequence shown in SEQ ID NO: 34 and the oligonucleotide consisting of the sequence shown in SEQ ID NO: 37 were used as PCR primers.
(2) The polynucleotide encoding the TorT signal peptide and the polynucleotide encoding rhFcγRI with a polyhistidine tag added to the C-terminus prepared in Example 8 were ligated by the two-step PCR shown below.
(3-1) The first step of PCR was performed using the two polynucleotides and the first step at 98 ° C. for 10 seconds and the second step at 55 ° C. for 5 seconds based on the reaction solution composition shown in Table 3. The reaction was carried out by 5 cycles of a third step of 1 minute at 72 ° C., followed by cooling to 4 ° C.
(3-2) The second-stage PCR, the first-stage PCR product as a template, and the oligonucleotide consisting of the base sequence set forth in SEQ ID NO: 34 and the oligonucleotide consisting of the base sequence set forth in SEQ ID NO: 18 as a PCR primer , Respectively, based on the reaction solution composition in Table 2, one cycle of 98 ° C. for 10 seconds first step, 55 ° C. for 5 seconds second step, 72 ° C. for 1
By this two-step PCR, a polynucleotide (SEQ ID NO: 38) containing a base sequence encoding a series of polypeptides (SEQ ID NO: 39) consisting of a TorT signal peptide, rhFcγRI and His tag peptide was prepared. Of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 39, the first methionine to the 18th serine correspond to the TorT signal peptide (SEQ ID NO: 9), and the 19th glutamine to the 292nd valine correspond to rhFcγRI ( In the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 76, the region from the 16th glutamine to the 289th valine) corresponds to the histidine from the 293th to the 298th, and corresponds to the polyhistidine tag.
(4) The plasmid vector pETmalE- produced in Example 1 was prepared by digesting the polynucleotide comprising the base sequence described in SEQ ID NO: 38 prepared in (3) with restriction enzymes NdeI and HindIII and then digesting with restriction enzymes NdeI and HindIII in advance. The plasmid vector pETTorTFcR-p7 was prepared by ligation to p7 (FIG. 2). The plasmid vector pETTorTFcR-p7 includes, from the 5 ′ end, a polynucleotide consisting of the base sequence described in SEQ ID NO: 4, an oligonucleotide encoding the TorT signal peptide (SEQ ID NO: 9), a polynucleotide encoding rhFcγRI, and a His tag Arranged in the order of oligonucleotides encoding peptides.
(5) Escherichia coli BL21 (DE3) was transformed by the calcium chloride method using the recombinant plasmid vector pETTorTFcR-p7 to prepare a pETTorTFcR-p7 transformant.
(6) rhFcγRI was expressed by the same method as in Example 7 using the pETTorTFcR-p7 transformant, and the expression level was evaluated. As a result of the measurement at n = 3, the expression level of rhFcγRI per culture solution by the transformant of pETTorTFcR-p7 was 320 ± 61 μg / L.
比較例3
実施例9で作製したプラスミドベクターpETTorTFcR−p7に含まれる配列番号4に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドの部分を、配列番号26に記載の塩基配列からなるプラスミドベクターpET−26b(+)由来の既存のオリゴヌクレオチド(5’−CTTTAAGAAGGAGATATACAT−3’)に置換した構造である、プラスミドベクターpETTorTFcR、および前記ベクターにより得られる形質転換体を、下記の方法により作製した。
(6)実施例9で作製した配列番号38に記載の塩基配列からなるポリヌクレオチドを、制限酵素NdeIとHindIIIで消化後、あらかじめ制限酵素NdeIとHindIIIで消化したpET−26b(+)プラスミドベクターにライゲーションすることで、プラスミドベクターpETTorTFcRを作製した。
(7)プラスミドベクターpETTorTFcRを用いて、大腸菌BL21(DE3)を形質転換し、pETTorTFcR形質転換体を作製した。
pETTorTFcR形質転換体を用いて、実施例7と同様の方法によりrhFcγRIを発現させ、その発現量を評価した。n=3で測定を行なった結果、pETTorTFcR形質転換体による培養液あたりの活性型rhFcγRIの発現量は13±1μg/Lであった。前記発現量は、実施例9で作製した、本発明のベクターを用いて得られた形質転換体によるrhFcγRIの発現量に比べて少なかった。すなわち、rhFcγRIを発現可能な形質転換体において、配列番号4に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含むプラスミドベクター(pETTorTFcR−p7)で形質転換して得られた形質転換体(実施例9で作製した形質転換体)は、配列番号4に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含まないプラスミドベクター(pETTorTFcR)で形質転換して得られた形質転換体(本比較例で作製した形質転換体)と比較し、より高効率にrhFcγRIを発現させることができることがわかる。
Comparative Example 3
The oligonucleotide part consisting of the base sequence set forth in SEQ ID NO: 4 contained in the plasmid vector pETTorTFcR-p7 prepared in Example 9 was derived from the plasmid vector pET-26b (+) consisting of the base sequence set forth in SEQ ID NO: 26. Plasmid vector pETTorTFcR, which is a structure substituted with an existing oligonucleotide (5′-CTTTAAGAAGGAGATACATA-3 ′), and a transformant obtained from the vector were prepared by the following method.
(6) The pET-26b (+) plasmid vector digested with the restriction enzymes NdeI and HindIII and then digested with the restriction enzymes NdeI and HindIII in advance, was prepared by digesting the polynucleotide comprising the base sequence set forth in SEQ ID NO: 38 prepared in Example 9. Ligation produced a plasmid vector pETTorTFcR.
(7) Escherichia coli BL21 (DE3) was transformed with the plasmid vector pETTorTFcR to prepare a pETTorTFcR transformant.
Using the pETTorTFcR transformant, rhFcγRI was expressed by the same method as in Example 7, and the expression level was evaluated. As a result of the measurement at n = 3, the expression level of active rhFcγRI per culture solution by the pETTorTFcR transformant was 13 ± 1 μg / L. The expression level was lower than the expression level of rhFcγRI by the transformant prepared in Example 9 and obtained using the vector of the present invention. That is, in a transformant capable of expressing rhFcγRI, a transformant obtained by transforming with a plasmid vector (pETTorTFcR-p7) containing an oligonucleotide having the base sequence described in SEQ ID NO: 4 (prepared in Example 9) A transformant obtained by transforming with a plasmid vector (pETTorTFcR) that does not contain an oligonucleotide having the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 4 (the transformant prepared in this Comparative Example) and Comparison shows that rhFcγRI can be expressed with higher efficiency.
参考例
本例は、単に、配列番号1から6に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドの、大腸菌を宿主としたときの翻訳効率の高さを評価したものであり、本発明を構成するものではない。
Reference Example This example merely evaluates the high translational efficiency of an oligonucleotide having the base sequences described in SEQ ID NOs: 1 to 6 when Escherichia coli is used as a host, and does not constitute the present invention. Absent.
配列番号1から6および26に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドをヒト由来タンパク質以外タンパク質をコードするポリヌクレオチドの5’末端側に隣接させることによる、前記ポリヌクレオチドの発現の翻訳効率への影響を評価した。本例ではポリヌクレオチドとして、緑色蛍光タンパク質(Green Fluorescent Protein、GFP)遺伝子を用いた。GFPは大腸菌宿主の細胞質内で活性型として良好に発現することが知られている。
(1)DNAworks法(Nucleic Acids Res.,30,e43,2002:非特許文献2)により大腸菌型コドンからなるGFPをコードするポリヌクレオチド(GFP遺伝子)を設計した。
(2)(1)で設計したGFP遺伝子を作製するために、配列番号40から73に記載の配列からなる、合計34種類のオリゴヌクレオチドを合成した。
(3)(2)で合成したオリゴヌクレオチドから、下記に示す二段階PCRにより、GFP遺伝子を含むポリヌクレオチドを作製した。
(3−1)一段階目のPCRを、表4の反応液組成のもと、94℃で5分間の熱処理、引き続き94℃で30秒間の第一ステップ、65℃で30秒間の第二ステップ、72℃で1分間の第三ステップを1サイクルとした反応を25サイクル行ない、72℃で7分間保持後、4℃に冷却することで行なった。なお、表4に記載のDNAミックスは、配列番号40から73に記載の配列からなる各合成オリゴヌクレオチド(計34種類)の溶液(濃度:50pmol/μL)をそれぞれ一定量採取し、混合した溶液を指す。
Effect of the expression of the polynucleotide on the translation efficiency by making the oligonucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NOs: 1 to 6 and 26 adjacent to the 5 ′ end of the polynucleotide encoding a protein other than a human-derived protein evaluated. In this example, a green fluorescent protein (GFP) gene was used as the polynucleotide. GFP is known to be well expressed as an active form in the cytoplasm of an E. coli host.
(1) A polynucleotide (GFP gene) encoding GFP comprising an E. coli type codon was designed by the DNAworks method (Nucleic Acids Res., 30, e43, 2002: Non-Patent Document 2).
(2) In order to produce the GFP gene designed in (1), a total of 34 types of oligonucleotides comprising the sequences described in SEQ ID NOs: 40 to 73 were synthesized.
(3) A polynucleotide containing a GFP gene was prepared from the oligonucleotide synthesized in (2) by the following two-step PCR.
(3-1) First-stage PCR was carried out at 94 ° C. for 5 minutes, followed by a first step at 94 ° C. for 30 seconds, and a second step at 65 ° C. for 30 seconds under the composition of the reaction solution in Table 4. The reaction was carried out for 25 cycles, with the third step at 72 ° C. for 1 minute taken as one cycle, held at 72 ° C. for 7 minutes, and then cooled to 4 ° C. The DNA mix shown in Table 4 was obtained by collecting a fixed amount of each of the synthetic oligonucleotides (34 types in total) consisting of the sequences shown in SEQ ID NOs: 40 to 73 (concentration: 50 pmol / μL) and mixing them. Point to.
(3−2)第二段階目のPCRを、表5の反応液組成のもと、94℃で5分間の熱処理、引き続き94℃で30秒間の第一ステップ、60℃で30秒間の第二ステップ、72℃で1分間の第三ステップを1サイクルとした反応を25サイクル行ない、72℃で7分間保持後、4℃に冷却することで行なった。なお、鋳型としては一段階目のPCR反応液を用い、PCRプライマーとしては配列番号40(5’−GCTCATATGAGCAAGGGCGAAGAGCTGTTCACCGGCG−3’)に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドおよび配列番号73(5’−GAAAAGCTTTTCCAGACCCGCCTTATACAGTTCATCCATGCC−3’)に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを用いた。この二段階PCRにより、GFP遺伝子を含むポリヌクレオチドを作製した。 (3-2) The second-stage PCR was performed by heat treatment at 94 ° C. for 5 minutes, followed by the first step at 94 ° C. for 30 seconds, and the second step at 60 ° C. for 30 seconds based on the reaction solution composition shown in Table 5. Step, 25 cycles of the reaction in which the third step of 1 minute at 72 ° C. was performed for 1 cycle was carried out by holding at 72 ° C. for 7 minutes and then cooling to 4 ° C. The first-stage PCR reaction solution was used as a template, and the PCR primer was an oligonucleotide consisting of the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 40 (5′-GCCTATATGAGCAAGGGGCGAAGAGCTGTTCACCGGCG-3 ′) and SEQ ID NO: 73 (5′-GAAAAGCTTTTCCAACCCCGCCTTATACGCTTTCATCATCAT An oligonucleotide having the base sequence described in 3 ′) was used. By this two-step PCR, a polynucleotide containing the GFP gene was prepared.
(4)配列番号1から6および26に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドのうちのいずれかと、GFP遺伝子とを含むプラスミドベクター、および前記ベクターによる形質転換体の作製を以下の方法により行なった。
(4−1)(3)で作製したGFP遺伝子を含むポリヌクレオチドを、制限酵素NdeIとHindIIIで消化後、あらかじめ制限酵素NdeIとHindIIIで消化した実施例1で作製したプラスミドベクターpETMalEFcR−p7(図2)にライゲーションすることで、プラスミドベクターpETGFP−p7を作製した。プラスミドベクターpETGFP−p7の概要とその作製工程を図3に示す。
(4−2)組換えプラスミドベクターpETGFP−p7を用いて、大腸菌BL21(DE3)を形質転換し、pETGFP−p7形質転換体を作製した。プラスミドベクターpETGFP−p7(図3)には、C末端側にポリヒスチジンタグが付加されたGFP遺伝子(配列番号75)が含まれ、配列番号4に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドの3’末端に前記GFP遺伝子が連続するよう配置した。プラスミドベクターpETGFP−p7中の、制限酵素BglII認識サイトからBpu1102I認識サイトまでの塩基配列を配列番号74に示す。配列番号74に記載の塩基配列からなるポリヌクレオチドには、C末端側にHisタグペプチドが付加されたGFP遺伝子(配列番号75)と、その5’末端側に配列番号4に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドと、が含まれている。
(4−3)前述したGFP遺伝子を含むポリヌクレオチド(配列番号74)を制限酵素NdeIとHindIIIで消化後、あらかじめ制限酵素NdeIとHindIIIで消化した実施例2で作製したプラスミドベクターpETMalEFcR−rbsにライゲーションすることで、プラスミドベクターpETGFP−rbsを作製した。プラスミドベクターpETGFP−rbsは、pETGFP−p7に含まれる配列番号4に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドの部分を、配列番号1に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドに置換した構造である。その後、プラスミドベクターpETGFP−rbsを用いて、大腸菌BL21(DE3)株を形質転換し、pETGFP−rbs形質転換体を作製した。
(4−4)前述したGFP遺伝子を含むポリヌクレオチド(配列番号74)を制限酵素NdeIとHindIIIで消化後、あらかじめ制限酵素NdeIとHindIIIで消化した実施例3で作製したプラスミドベクターpETMalEFcR−m4にライゲーションすることで、プラスミドベクターpETGFP−m4を作製した。プラスミドベクターpETGFP−m4は、pETGFP−p7に含まれる配列番号4に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドの部分を、配列番号2に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドに置換した構造である。その後、プラスミドベクターpETGFP−m4を用いて、大腸菌BL21(DE3)株を形質転換し、pETGFP−m4形質転換体を作製した。
(4−5)前述したGFP遺伝子を含むポリヌクレオチド(配列番号74)を制限酵素NdeIとHindIIIで消化後、あらかじめ制限酵素NdeIとHindIIIで消化した実施例4で作製したプラスミドベクターpETMalEFcR−p4にライゲーションすることで、プラスミドベクターpETGFP−p4を作製した。プラスミドベクターpETGFP−p4は、pETGFP−p7に含まれる配列番号4に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドの部分を、配列番号3に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドに置換した構造である。その後、プラスミドベクターpETGFP−p4を用いて、大腸菌BL21(DE3)株を形質転換し、pETGFP−p4形質転換体を作製した。
(4−6)前述したGFP遺伝子を含むポリヌクレオチド(配列番号74)を制限酵素NdeIとHindIIIで消化後、あらかじめ制限酵素NdeIとHindIIIで消化した実施例5で作製したプラスミドベクターpETMalEFcR−p10にライゲーションすることで、プラスミドベクターpETGFP−p10を作製した。プラスミドベクターpETGFP−p10は、pETGFP−p7に含まれる配列番号4に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドの部分を、配列番号5に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドに置換した構造である。その後、プラスミドベクターpETGFP−p10を用いて、大腸菌BL21(DE3)株を形質転換し、pETGFP−p10形質転換体を作製した。
(4−7)前述したGFP遺伝子を含むポリヌクレオチド(配列番号74)を制限酵素NdeIとHindIIIで消化後、あらかじめ制限酵素NdeIとHindIIIで消化した実施例6で作製したプラスミドベクターpETMalEFcR−rbsp7にライゲーションすることで、プラスミドベクターpETGFP−rbsp7を作製した。プラスミドベクターpETGFP−rbsp7は、pETGFP−p7に含まれる配列番号4に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドの部分を、配列番号6に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドに置換した構造である。その後、プラスミドベクターpETGFP−rbsp7を用いて、大腸菌BL21(DE3)株を形質転換し、pETGFP−rbsp7形質転換体を作製した。
(4−8)前述したGFP遺伝子を含むポリヌクレオチド(配列番号74)を制限酵素NdeIとHindIIIで消化後、あらかじめ制限酵素NdeIとHindIIIで消化した比較例1で作製したプラスミドベクターpETMalEFcRにライゲーションすることで、プラスミドベクターpETGFPを作製した。プラスミドベクターpETGFPは、pETGFP−p7に含まれる配列番号4に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドの部分を、配列番号26に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドに置換した構造である。その後、プラスミドベクターpETGFPを用いて、大腸菌BL21(DE3)株を形質転換し、pETGFP形質転換体を作製した。
(5)配列番号1から6および26に記載の塩基配列からなるポリヌクレオチドが、3’末端に隣接するGFP遺伝子の発現の翻訳効率に与える影響を評価した。図4には該翻訳効率の評価方法の概略図を示す。GFP発現量が翻訳効率を反映するように、転写効率はpETシステム(Novagen社製)を利用し、培養液へのIPTGの添加量により制御した。発現されるGFPのタンパク量と蛍光強度には相関があることから(Scholz,O.ら,Eur.J.Biochem.,267,1565−1570,2000、非特許文献3)、GFPの蛍光強度によりGFPの発現量(翻訳効率)を評価した。
(5−1)作製したpETGFP形質転換体、pETGFP−rbs形質転換体、pETGFP−m4形質転換体、pETGFP−p4形質転換体、pETGFP−p7形質転換体、pETGFP−p10形質転換体、およびpETGFP−rbsp7形質転換体を50μg/mLのカナマイシンを含むLB培地に接種し、37℃で一晩振とう培養することで前培養液を得た。
(5−2)96穴ディープウェルプレートの各ウェルに、50μg/mLのカナマイシンを含むLB培地800μLを入れ、各形質転換体の前培養液を20μL接種した。これをBioshaker M・BR−022UP(TAITEC社製)を用いて、37℃で1.5時間、1000rpmで振とう培養した。
(5−3)培養開始から1.5時間後に温度を20℃に変えて、1000rpmで30分間振とう培養後、IPTGを添加して発現の誘導を行なった。IPTGの添加は、培養液の終濃度で0.01mM、0.05mMまたは0.1mMとなるように、IPTG濃縮液(50μg/mLのカナマイシンを含むLB培地に溶解)を各80μLずつ添加することで行なった。
(5−4)IPTG添加後、20℃、1000rpmでさらに22時間、振とう培養した。なお、ブランク試験として、IPTG濃縮液の代わりに50μg/mLのカナマイシンを含むLB培地80μLを添加して、20℃、1000rpmでさらに22時間、振とう培養する試験を行なっている。
(5−5)誘導開始から22時間後に各条件の培養液を採取し、0.85%のNaCl溶液で3倍希釈後、96穴プレートに1ウェルあたり100μL入れ、蛍光マイクロプレートリーダー(InfiniteM200,TECAN社製)を用いて、培養液の濁度(OD600)と培養液のGFP蛍光強度(励起波長:488nm、蛍光波長:530nm)をn=3で測定した。
(4) A plasmid vector containing any one of the oligonucleotides having the base sequences described in SEQ ID NOs: 1 to 6 and 26 and the GFP gene, and a transformant using the vector were prepared by the following method.
(4-1) The plasmid vector pETMalEFcR-p7 prepared in Example 1 prepared by digesting the polynucleotide containing the GFP gene prepared in (3) with restriction enzymes NdeI and HindIII and then digesting with restriction enzymes NdeI and HindIII in advance (FIG. The plasmid vector pETGFP-p7 was produced by ligation to 2). The outline of the plasmid vector pETGFP-p7 and its production process are shown in FIG.
(4-2) Escherichia coli BL21 (DE3) was transformed with the recombinant plasmid vector pETGFP-p7 to prepare a pETGFP-p7 transformant. The plasmid vector pETGFP-p7 (FIG. 3) includes the GFP gene (SEQ ID NO: 75) with a polyhistidine tag added to the C-terminal side, and the 3 ′ end of the oligonucleotide consisting of the base sequence set forth in SEQ ID NO: 4. The GFP gene was arranged in a continuous manner. SEQ ID NO: 74 shows the base sequence from the restriction enzyme BglII recognition site to the Bpu1102I recognition site in the plasmid vector pETGFP-p7. The polynucleotide consisting of the base sequence set forth in SEQ ID NO: 74 includes a GFP gene (SEQ ID NO: 75) with a His tag peptide added to the C-terminal side, and a base sequence set forth in SEQ ID NO: 4 on the 5 ′ end side. And an oligonucleotide.
(4-3) Ligation to the plasmid vector pETmalEFcR-rbs prepared in Example 2 in which the polynucleotide (SEQ ID NO: 74) containing the GFP gene described above was digested with restriction enzymes NdeI and HindIII and then digested with restriction enzymes NdeI and HindIII in advance. Thus, plasmid vector pETGFP-rbs was prepared. The plasmid vector pETGFP-rbs has a structure in which the oligonucleotide part consisting of the base sequence shown in SEQ ID NO: 4 contained in pETGFP-p7 is replaced with the oligonucleotide consisting of the base sequence shown in SEQ ID NO: 1. Thereafter, Escherichia coli BL21 (DE3) strain was transformed with the plasmid vector pETGFP-rbs to prepare a pETGFP-rbs transformant.
(4-4) Ligation to the plasmid vector pETmalEFcR-m4 prepared in Example 3 previously digested with the restriction enzymes NdeI and HindIII after digesting the polynucleotide containing the GFP gene (SEQ ID NO: 74) with the restriction enzymes NdeI and HindIII. Thus, plasmid vector pETGFP-m4 was prepared. The plasmid vector pETGFP-m4 has a structure in which the oligonucleotide part consisting of the base sequence shown in SEQ ID NO: 4 contained in pETGFP-p7 is replaced with the oligonucleotide consisting of the base sequence shown in SEQ ID NO: 2. Thereafter, Escherichia coli BL21 (DE3) strain was transformed with the plasmid vector pETGFP-m4 to prepare a pETGFP-m4 transformant.
(4-5) Ligation to the plasmid vector pETmalEFcR-p4 prepared in Example 4 which was previously digested with the restriction enzymes NdeI and HindIII after the polynucleotide containing the GFP gene (SEQ ID NO: 74) was digested with the restriction enzymes NdeI and HindIII. Thus, a plasmid vector pETGFP-p4 was prepared. The plasmid vector pETGFP-p4 has a structure in which the oligonucleotide part consisting of the base sequence shown in SEQ ID NO: 4 contained in pETGFP-p7 is replaced with the oligonucleotide consisting of the base sequence shown in SEQ ID NO: 3. Thereafter, Escherichia coli BL21 (DE3) strain was transformed with the plasmid vector pETGFP-p4 to prepare a pETGFP-p4 transformant.
(4-6) Ligation to the plasmid vector pETmalEFcR-p10 prepared in Example 5 which was previously digested with the restriction enzymes NdeI and HindIII and then previously digested with the restriction enzymes NdeI and HindIII. Thus, a plasmid vector pETGFP-p10 was produced. The plasmid vector pETGFP-p10 has a structure in which the oligonucleotide part consisting of the base sequence shown in SEQ ID NO: 4 contained in pETGFP-p7 is replaced with the oligonucleotide consisting of the base sequence shown in SEQ ID NO: 5. Thereafter, Escherichia coli BL21 (DE3) strain was transformed with the plasmid vector pETGFP-p10 to prepare a pETGFP-p10 transformant.
(4-7) Ligation to the plasmid vector pETmalEFcR-rbsp7 prepared in Example 6 previously digested with the restriction enzymes NdeI and HindIII after the polynucleotide containing the GFP gene (SEQ ID NO: 74) was digested with the restriction enzymes NdeI and HindIII. Thus, a plasmid vector pETGFP-rbsp7 was produced. The plasmid vector pETGFP-rbsp7 has a structure in which the oligonucleotide part consisting of the base sequence shown in SEQ ID NO: 4 contained in pETGFP-p7 is replaced with the oligonucleotide consisting of the base sequence shown in SEQ ID NO: 6. Then, Escherichia coli BL21 (DE3) strain was transformed with the plasmid vector pETGFP-rbsp7 to prepare a pETGFP-rbsp7 transformant.
(4-8) Ligation to the plasmid vector pETmalEFcR prepared in Comparative Example 1 previously digested with the restriction enzymes NdeI and HindIII and then previously digested with the restriction enzymes NdeI and HindIII after the polynucleotide containing the GFP gene (SEQ ID NO: 74) is digested with the restriction enzymes NdeI and HindIII. Thus, plasmid vector pETGFP was prepared. The plasmid vector pETGFP has a structure in which the oligonucleotide part consisting of the base sequence shown in SEQ ID NO: 4 contained in pETGFP-p7 is replaced with the oligonucleotide consisting of the base sequence shown in SEQ ID NO: 26. Thereafter, Escherichia coli BL21 (DE3) strain was transformed with the plasmid vector pETGFP to prepare a pETGFP transformant.
(5) The influence of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequences described in SEQ ID NOs: 1 to 6 and 26 on the translation efficiency of the expression of the GFP gene adjacent to the 3 ′ end was evaluated. FIG. 4 shows a schematic diagram of the method for evaluating the translation efficiency. The transcription efficiency was controlled by the amount of IPTG added to the culture solution using the pET system (manufactured by Novagen) so that the expression level of GFP reflects the translation efficiency. Since there is a correlation between the amount of GFP protein expressed and the fluorescence intensity (Scholz, O. et al., Eur. J. Biochem., 267, 1565-1570, 2000, Non-Patent Document 3), it depends on the fluorescence intensity of GFP. The expression level (translation efficiency) of GFP was evaluated.
(5-1) The prepared pETGFP transformant, pETGFP-rbs transformant, pETGFP-m4 transformant, pETGFP-p4 transformant, pETGFP-p7 transformant, pETGFP-p10 transformant, and pETGFP- The rbsp7 transformant was inoculated into an LB medium containing 50 μg / mL kanamycin and cultured overnight at 37 ° C. with shaking to obtain a preculture solution.
(5-2) 800 μL of LB medium containing 50 μg / mL kanamycin was placed in each well of a 96-well deep well plate, and 20 μL of the preculture solution of each transformant was inoculated. This was cultured with shaking at 1000 rpm at 37 ° C. for 1.5 hours using Bioshaker M · BR-022UP (manufactured by TAITEC).
(5-3) After 1.5 hours from the start of the culture, the temperature was changed to 20 ° C., and after shaking culture at 1000 rpm for 30 minutes, IPTG was added to induce expression. IPTG is added by adding 80 μL each of IPTG concentrate (dissolved in LB medium containing 50 μg / mL kanamycin) so that the final concentration of the culture solution is 0.01 mM, 0.05 mM, or 0.1 mM. It was done in.
(5-4) After addition of IPTG, the cells were further cultured with shaking at 20 ° C. and 1000 rpm for 22 hours. As a blank test, 80 μL of LB medium containing 50 μg / mL kanamycin is added instead of the IPTG concentrate, and the test is further performed by shaking culture at 20 ° C. and 1000 rpm for 22 hours.
(5-5) After 22 hours from the start of induction, the culture medium of each condition was collected, diluted 3-fold with 0.85% NaCl solution, put into a 96-well plate, 100 μL per well, and a fluorescent microplate reader (Infinite M200, The turbidity (OD 600 ) of the culture solution and the GFP fluorescence intensity (excitation wavelength: 488 nm, fluorescence wavelength: 530 nm) of the culture solution were measured using n = 3.
誘導開始から22時間後の培養液濁度あたりのGFP蛍光強度を図5に示す。図5に示すように、終濃度0.01mM、0.05mM、0.1mM、いずれのIPTG濃度で誘導させても、pETGFP形質転換体が培養液濁度あたりのGFP蛍光強度が強く、続いてpETGFP−p4形質転換体、pETGFP−m4形質転換体、pETGFP−p7形質転換体、pETGFP−p10形質転換体、pETGFP−rbs形質転換体、pETGFP−rbsp7形質転換体の順に、培養液濁度あたりのGFP蛍光強度が強い傾向が認められた。 FIG. 5 shows the GFP fluorescence intensity per turbidity of the culture medium 22 hours after the start of induction. As shown in FIG. 5, the pETGFP transformant has a strong GFP fluorescence intensity per culture turbidity regardless of the IPTG concentration of 0.01 mM, 0.05 mM, or 0.1 mM. pETGFP-p4 transformant, pETGFP-m4 transformant, pETGFP-p7 transformant, pETGFP-p10 transformant, pETGFP-rbs transformant, and pETGFP-rbsp7 transformant in this order. A tendency of strong GFP fluorescence intensity was observed.
図5の結果から、pET−26b(+)プラスミドベクター由来の既存の塩基配列(配列番号26)のポリヌクレオチドが、その3’末端に隣接するGFP遺伝子の発現の翻訳効率を高く制御する一方、配列番号1から6に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドは、配列番号26に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドに比べ、いずれもGFP遺伝子の発現の翻訳効率が低いことがわかる。なお翻訳効率の高さは、高い順に、配列番号3、配列番号2、配列番号4、配列番号1、配列番号5、配列番号6であった。 From the result of FIG. 5, while the polynucleotide of the existing base sequence (SEQ ID NO: 26) derived from the pET-26b (+) plasmid vector controls the translation efficiency of the expression of the GFP gene adjacent to its 3 ′ end, It can be seen that all of the oligonucleotides consisting of the base sequences set forth in SEQ ID NOs: 1 to 6 have lower translation efficiency of the expression of the GFP gene than the oligonucleotide consisting of the base sequence set forth in SEQ ID NO: 26. In addition, the high translation efficiency was SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 5, and SEQ ID NO: 6 in descending order.
実施例10
配列番号4に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含むヒトエリスロポエチン結合性タンパク質発現ベクター、および前記ベクターにより得られる形質転換体を以下の方法で作製した。
(1)C末端側にポリヒスチジンタグを付加したヒトエリスロポエチン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチドの合成を以下に示す二段階PCRによって行なった。
(1−1)一段階目のPCRを、鋳型としてEPOR cDNA(Human)(OriGene Technologies社製、カタログ番号:SC125440)を、PCRプライマーとして配列番号78(5’−CAGGATCCCCCGGGAGAGCTCCGCCGCCTAACCTC−3’)に記載の制限酵素SacI認識配列を配した塩基配列からなるオリゴヌクレオチドおよび配列番号79(5’−TTATCTAGATTAATGATGATGATGATGATGGTCCAGGTCGCTAGG−3’)に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを、それぞれ用いて、表2の反応組成のもと、98℃で10秒間の第一ステップ、55℃で5秒間の第二ステップ、72℃で44秒間の第三ステップを1サイクルとした反応を30サイクル行なった。このPCR産物をEPOR1とした。
(1−2)二段階目のPCRを、鋳型としてEPOR1を、PCRプライマーとして配列番号78に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドおよび配列番号80(5’−TTATCTAGACCTAGGTTAATGATGATGATGATGATG−3’)に記載の制限酵素XbaI認識配列を含む塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを、それぞれ用いて、表2の反応組成のもと、98℃で10秒間の第一ステップ、55℃で5秒間の第二ステップ、72℃で44秒間の第三ステップを1サイクルとした反応を30サイクル行なった。このPCR産物をEPOR2とした。
(2)EPOR2を、制限酵素SacIとXbaIで消化後、制限酵素SacIとXbaIで消化したプラスミドベクターpUC19(GenBank No.L09137)にライゲーションし、それを用いて大腸菌JM109株を形質転換した。
(3)得られた形質転換体を培養後、定法に従って、C末端側にポリヒスチジンタグを付加したヒトエリスロポエチン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチドを含むプラスミドベクターpUC−EPORを調製した。プラスミドベクターpUC−EPORの概要とその作製工程を図6に示す。
(4)鋳型としてプラスミドベクターpUC−EPOR(図6)を、PCRプライマーとして配列番号81(5’−CGGTCATGAAAGCTCCGCCGCCTAACCTTCCGGAC−3’)に記載の制限酵素BspHI認識配列を含む塩基配列からなるオリゴヌクレオチドおよび配列番号82(5’−GAGCGGATAACAATTTCACACAGG−3’)に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを、それぞれ用いて、表2の反応組成に従い、98℃で10秒間の第一ステップ、55℃で5秒間の第二ステップ、72℃で44秒間の第三ステップを1サイクルとした反応を30サイクル行なった後、4℃に冷却することでPCRを行なった。このPCR産物をEPOR3とした。
(5)EPOR3を、制限酵素BspHI(消化後に制限酵素NcoI消化断片と結合可能な突出末端を形成)とHindIIIで消化後、あらかじめ制限酵素NcoIとHindIIIで消化した実施例1に記載のプラスミドベクターpETMalE−p7(図1)にライゲーションし、それを用いて大腸菌JM109株を形質転換した。
(6)得られた形質転換体を培養後、定法に従いプラスミドベクターpETMalE−p7−Eを調製した。プラスミドベクターpETMalE−p7−Eの概要とその作製工程を図7に示した。
(7)鋳型としてプラスミドベクターpUC−EPOR(図6)を、PCRプライマーとして配列番号83(5’−TCCGCTAGCGCTCTCGCCGCTCCGCCGCCTAACCT−3’)に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドおよび配列番号82に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを、それぞれ用いて、表2の反応組成に従い、98℃で10秒間の第一ステップ、55℃で5秒間の第二ステップ、72℃で44秒間の第三ステップを1サイクルとした反応を30サイクル行なった。このPCR産物をEPOR4とした。
(8)鋳型として実施例1に記載のプラスミドベクターpETMalE−p7(図1)を、PCRプライマーとして配列番号84(5’−CCCTCTAGAAATAATTTTGTTTAAC−3’)に記載の制限酵素XbaI認識配列を含む塩基配列からなるオリゴヌクレオチドおよび配列番号85(5’−GGCGAGAGCGCTAGCGGAAAACATCATC−3’)に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを、それぞれ用いて、表2の反応組成に従い、98℃で10秒間の第一ステップ、55℃で5秒間の第二ステップ、72℃で44秒間の第三ステップを1サイクルとした反応を30サイクル行なった。このPCR産物をPCRMalEとした。
(9)PCRを用いて、PCRMalEとEPOR4の連結を行なった。鋳型としてEPOR4およびPCRMalEの混合液を、PCRプライマーとして配列番号84に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドおよび配列番号82に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを、それぞれ用いて、表2の反応組成に従い、98℃で10秒間の第一ステップ、55℃で5秒間の第二ステップ、72℃で44秒間の第三ステップを1サイクルとした反応を30サイクル行なった。このPCR産物をPCRMalE−EPORとした。
(10)PCRMalE−EPORを制限酵素XbaIで消化後、制限酵素XbaIで消化しアルカリホスファターゼで脱リン酸化処理したプラスミドベクターpETMalE−p7−E(図7)にライゲーションし、配列番号4に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含むヒトエリスロポエチン結合性タンパク質発現ベクターであるプラスミドベクターpETMalE−p7−EPORを作製した。
(11)プラスミドベクターpETMalE−p7−EPORを用いて、大腸菌BL21(DE3)株を形質転換し、pETMalE−p7−EPOR形質転換体を作製した。プラスミドベクターpETMalE−p7−EPORの概要とその作製工程を図8に示す。
Example 10
A human erythropoietin-binding protein expression vector containing an oligonucleotide having the base sequence set forth in SEQ ID NO: 4 and a transformant obtained from the vector were prepared by the following method.
(1) Synthesis of a polynucleotide encoding a human erythropoietin-binding protein with a polyhistidine tag added to the C-terminal side was performed by the two-step PCR shown below.
(1-1) The first-stage PCR is performed using EPOR cDNA (Human) (manufactured by OriGene Technologies, catalog number: SC125440) as a template and PCR primer described in SEQ ID NO: 78 (5′-CAGGATCCCCCCGGGAGAGCTCCCGCGCCCTAACCTC-3 ′) An oligonucleotide consisting of a base sequence with a restriction enzyme SacI recognition sequence and an oligonucleotide consisting of the base sequence set forth in SEQ ID NO: 79 (5′-TTATCTAGATTTAATGATGGATGATGATGATGGTCCAGGTCGCTAGGG-3 ′) were used respectively under the reaction composition in Table 2. , A reaction consisting of a first step at 98 ° C. for 10 seconds, a second step at 55 ° C. for 5 seconds, and a third step at 72 ° C. for 44 seconds. 0 cycles were carried out. This PCR product was named EPOR1.
(1-2) Second-stage PCR is performed using EPOR1 as a template, an oligonucleotide having a nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 78 as a PCR primer, and a restriction enzyme set forth in SEQ ID NO: 80 (5′-TTATCTAGACCTAGGTTAATGATGATGATGATGATG-3 ′) Oligonucleotides comprising a base sequence containing an XbaI recognition sequence were used, respectively, under the reaction composition shown in Table 2 for the first step at 98 ° C. for 10 seconds, the second step at 55 ° C. for 5 seconds, The reaction was repeated 30 cycles with the third step of seconds as one cycle. This PCR product was named EPOR2.
(2) EPOR2 was digested with restriction enzymes SacI and XbaI, ligated to plasmid vector pUC19 (GenBank No. L09137) digested with restriction enzymes SacI and XbaI, and E. coli strain JM109 was transformed with it.
(3) After culturing the obtained transformant, a plasmid vector pUC-EPOR containing a polynucleotide encoding a human erythropoietin-binding protein having a polyhistidine tag added to the C-terminal side was prepared according to a conventional method. An outline of the plasmid vector pUC-EPOR and its production process are shown in FIG.
(4) An oligonucleotide consisting of a plasmid vector pUC-EPOR (FIG. 6) as a template and a nucleotide sequence containing the restriction enzyme BspHI recognition sequence described in SEQ ID NO: 81 (5′-CGGTCATGAAAGCTCCGCCGCCTAACCTCTCCGAC-3 ′) as a PCR primer and SEQ ID NO: 82 (5′-GAGCGGAATAACAATTTCACACAGGG-3 ′) was used, respectively, in accordance with the reaction composition of Table 2, according to the reaction composition of Table 2, the first step at 98 ° C. for 10 seconds and the second step at 55 ° C. for 5 seconds. PCR was carried out by performing 30 cycles of the step, which was a cycle of the third step of 44 seconds at 72 ° C., followed by cooling to 4 ° C. This PCR product was named EPOR3.
(5) The plasmid vector pETmalE described in Example 1 was digested with restriction enzymes NcoI and HindIII in advance after digesting EPOR3 with restriction enzyme BspHI (forms a protruding end capable of binding to a restriction enzyme NcoI digested fragment after digestion) and HindIII. -Ligated to p7 (Fig. 1) and used to transform E. coli JM109 strain.
(6) After culturing the obtained transformant, a plasmid vector pETmalE-p7-E was prepared according to a conventional method. An outline of the plasmid vector pETmalE-p7-E and its production process are shown in FIG.
(7) From a plasmid vector pUC-EPOR (FIG. 6) as a template, an oligonucleotide having the base sequence described in SEQ ID NO: 83 (5′-TCCGCTAGCGCTCTGCCGCCTCCCGCCGCCTAACCT-3 ′) as a PCR primer, and a base sequence described in SEQ ID NO: 82 Each oligonucleotide was used in accordance with the reaction composition of Table 2, and the first step at 98 ° C. for 10 seconds, the second step at 55 ° C. for 5 seconds, and the third step at 72 ° C. for 44 seconds was defined as one cycle. The reaction was performed for 30 cycles. This PCR product was named EPOR4.
(8) From the nucleotide sequence containing the restriction enzyme XbaI recognition sequence described in SEQ ID NO: 84 (5′-CCCTCTGAAAATATTTTGTTTAC-3 ′) as a PCR primer using the plasmid vector pETmalE-p7 (FIG. 1) described in Example 1 as a template. And the oligonucleotide having the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 85 (5′-GGCGGAGACGCGTAGCGGAAAAACATCATC-3 ′), respectively, in accordance with the reaction composition of Table 2, the first step at 98 ° C. for 10 seconds, 55 ° C. The reaction was carried out 30 cycles with the second step for 5 seconds and the third step for 44 seconds at 72 ° C. as one cycle. This PCR product was designated as PCRMalE.
(9) PCRMalE and EPOR4 were linked using PCR. Using a mixture of EPOR4 and PCRMalE as a template, and an oligonucleotide consisting of the base sequence set forth in SEQ ID NO: 84 and an oligonucleotide consisting of the base sequence set forth in SEQ ID NO: 82 as PCR primers, respectively, according to the reaction composition of Table 2. , 30 cycles of the reaction were performed with a first step at 98 ° C. for 10 seconds, a second step at 55 ° C. for 5 seconds, and a third step at 72 ° C. for 44 seconds as one cycle. This PCR product was designated as PCRMalE-EPOR.
(10) PCRMalE-EPOR is digested with restriction enzyme XbaI, then ligated to plasmid vector pETmalE-p7-E (FIG. 7) digested with restriction enzyme XbaI and dephosphorylated with alkaline phosphatase (FIG. 7), and the base described in SEQ ID NO: 4 A plasmid vector pETmalE-p7-EPOR, which is a human erythropoietin-binding protein expression vector containing an oligonucleotide consisting of a sequence, was prepared.
(11) Escherichia coli BL21 (DE3) strain was transformed using plasmid vector pETmalE-p7-EPOR to prepare a pETmalE-p7-EPOR transformant. FIG. 8 shows an outline of the plasmid vector pETmalE-p7-EPOR and its production process.
プラスミドベクターpETMalE−p7−EPOR(図8)には、5’末端側から、配列番号4に記載の塩基配列からなるポリヌクレオチド、MalEシグナルペプチド(配列番号8)をコードするオリゴヌクレオチド、ヒトエリスロポエチン結合性タンパク質(配列番号77)をコードするポリヌクレオチド、ポリヒスチジンタグをコードするオリゴヌクレオチドの順に配置されている。プラスミドベクターpETMalE−p7−EPOR(図8)のうち、制限酵素BglII認識サイトからHindIII認識サイトまでの塩基配列を、配列番号86に示す。なお、配列番号86に記載の塩基配列のうち、88番目から115番目までのヌクレオチドが配列番号4に相当し、116番目から193番目までのヌクレオチドがMalEシグナルペプチド(配列番号8)をコードするオリゴヌクレオチドに相当し、194番目から868番目までのヌクレオチドがヒトエリスロポエチン結合性タンパク質(配列番号77)をコードするオリゴヌクレオチドに相当し、869番目から886番目のヌクレオチドがポリヒスチジンタグをコードするオリゴヌクレオチドに相当する。配列番号87には配列番号86に記載の塩基配列のうち、116番目から886番目までのヌクレオチドからの翻訳により得られるポリペプチドのアミノ酸配列を示す。 In the plasmid vector pETmalE-p7-EPOR (FIG. 8), from the 5 ′ end side, a polynucleotide comprising the nucleotide sequence described in SEQ ID NO: 4, an oligonucleotide encoding the MalE signal peptide (SEQ ID NO: 8), and human erythropoietin binding The polynucleotide encoding the sex protein (SEQ ID NO: 77) and the oligonucleotide encoding the polyhistidine tag are arranged in this order. Of the plasmid vector pETmalE-p7-EPOR (FIG. 8), the base sequence from the restriction enzyme BglII recognition site to the HindIII recognition site is shown in SEQ ID NO: 86. Of the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 86, nucleotides from 88th to 115th correspond to SEQ ID NO: 4, and nucleotides from 116th to 193rd encode an MalE signal peptide (SEQ ID NO: 8). The nucleotides from 194th to 868th correspond to the oligonucleotide encoding human erythropoietin-binding protein (SEQ ID NO: 77), and the 869th to 886th nucleotides correspond to the oligonucleotide encoding the polyhistidine tag. Equivalent to. SEQ ID NO: 87 shows the amino acid sequence of the polypeptide obtained by translation from the 116th to 886th nucleotides of the base sequence set forth in SEQ ID NO: 86.
実施例11
配列番号1に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含むヒトエリスロポエチン結合性タンパク質発現ベクター、および前記ベクターにより得られる形質転換体を以下の方法で作製した。
(1)実施例10で作製したpETMalE−p7−EPOR(図8)を制限酵素NdeIとHindIIIで消化後、ヒトエリスロポエチン結合性タンパク質(配列番号77)をコードするオリゴヌクレオチドを含むポリヌクレオチド断片を、あらかじめ制限酵素NdeIとHindIIIで消化した、実施例2で作製したプラスミドベクターpETMalEFcR−rbsにライゲーションし、プラスミドベクターpETMalE−rbs−EPORを作製した。プラスミドベクターpETMalE−rbs−EPORは、プラスミドベクターpETMalE−p7−EPOR(図8)に含まれる配列番号4に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドの部分を、配列番号1に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドに置換した構造である。
(2)プラスミドベクターpETMalE−rbs−EPORを用いて、大腸菌BL21(DE3)株を形質転換し、pETMalE−rbs−EPOR形質転換体を作製した。
Example 11
A human erythropoietin-binding protein expression vector containing an oligonucleotide having the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 1 and a transformant obtained from the vector were prepared by the following method.
(1) After digesting pETmalE-p7-EPOR (FIG. 8) prepared in Example 10 with restriction enzymes NdeI and HindIII, a polynucleotide fragment containing an oligonucleotide encoding a human erythropoietin-binding protein (SEQ ID NO: 77) is obtained. The plasmid vector pETMalE-rbs-EPOR was ligated to the plasmid vector pETMalEFcR-rbs prepared in Example 2 previously digested with restriction enzymes NdeI and HindIII. The plasmid vector pETMalE-rbs-EPOR is a portion of the oligonucleotide consisting of the base sequence described in SEQ ID NO: 4 contained in the plasmid vector pETmalE-p7-EPOR (FIG. 8). It is a structure substituted with nucleotides.
(2) Escherichia coli BL21 (DE3) strain was transformed with the plasmid vector pETmalE-rbs-EPOR to prepare a pETmalE-rbs-EPOR transformant.
実施例12
配列番号2に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含むヒトエリスロポエチン結合性タンパク質発現ベクター、および前記ベクターにより得られる形質転換体を以下の方法で作製した。
(1)実施例10で作製したpETMalE−p7−EPOR(図8)を制限酵素NdeIとHindIIIで消化後、ヒトエリスロポエチン結合性タンパク質(配列番号77)をコードするオリゴヌクレオチドを含むポリヌクレオチド断片を、あらかじめ制限酵素NdeIとHindIIIで消化した、実施例3で作製したプラスミドベクターpETMalEFcR−m4にライゲーションし、プラスミドベクターpETMalE−m4−EPORを作製した。プラスミドベクターpETMalE−m4−EPORは、プラスミドベクターpETMalE−p7−EPOR(図8)に含まれる配列番号4に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドの部分を、配列番号2に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドに置換した構造である。
(2)プラスミドベクターpETMalE−m4−EPORを用いて、大腸菌BL21(DE3)を形質転換し、pETMalE−m4−EPOR形質転換体を作製した。
Example 12
A human erythropoietin-binding protein expression vector containing an oligonucleotide having the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 2 and a transformant obtained from the vector were prepared by the following method.
(1) After digesting pETmalE-p7-EPOR (FIG. 8) prepared in Example 10 with restriction enzymes NdeI and HindIII, a polynucleotide fragment containing an oligonucleotide encoding a human erythropoietin-binding protein (SEQ ID NO: 77) is obtained. The plasmid vector pETmalE-m4-EPOR was prepared by ligation to the plasmid vector pETmalEFcR-m4 prepared in Example 3 previously digested with restriction enzymes NdeI and HindIII. The plasmid vector pETmalE-m4-EPOR is a portion of the oligonucleotide consisting of the base sequence described in SEQ ID NO: 4 contained in the plasmid vector pETmalE-p7-EPOR (FIG. 8). It is a structure substituted with nucleotides.
(2) Escherichia coli BL21 (DE3) was transformed with the plasmid vector pETmalE-m4-EPOR to prepare a pETmalE-m4-EPOR transformant.
実施例13
配列番号3に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含むヒトエリスロポエチン結合性タンパク質発現ベクター、および前記ベクターにより得られる形質転換体を以下の方法で作製した。
(1)実施例10で作製したpETMalE−p7−EPOR(図8)を制限酵素NdeIとHindIIIで消化後、ヒトエリスロポエチン結合性タンパク質(配列番号77)をコードするオリゴヌクレオチドを含むポリヌクレオチド断片を、あらかじめ制限酵素NdeIとHindIIIで消化した、実施例4で作製したプラスミドベクターpETMalEFcR−p4にライゲーションし、プラスミドベクターpETMalE−p4−EPORを作製した。プラスミドベクターpETMalE−p4−EPORは、プラスミドベクターpETMalE−p7−EPOR(図8)に含まれる配列番号4に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドの部分を、配列番号3に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドに置換した構造である。
(2)プラスミドベクターpETMalE−p4−EPORを用いて、大腸菌BL21(DE3)株を形質転換し、pETMalE−p4−EPOR形質転換体を作製した。
Example 13
A human erythropoietin-binding protein expression vector containing an oligonucleotide having the base sequence set forth in SEQ ID NO: 3 and a transformant obtained from the vector were prepared by the following method.
(1) After digesting pETmalE-p7-EPOR (FIG. 8) prepared in Example 10 with restriction enzymes NdeI and HindIII, a polynucleotide fragment containing an oligonucleotide encoding a human erythropoietin-binding protein (SEQ ID NO: 77) is obtained. The plasmid vector pETMalE-p4-EPOR was prepared by ligation to the plasmid vector pETMalEFcR-p4 prepared in Example 4 previously digested with restriction enzymes NdeI and HindIII. The plasmid vector pETmalE-p4-EPOR is a portion of the oligonucleotide consisting of the base sequence described in SEQ ID NO: 4 contained in the plasmid vector pETmalE-p7-EPOR (FIG. 8), and the oligo consisting of the base sequence described in SEQ ID NO: 3. It is a structure substituted with nucleotides.
(2) Escherichia coli BL21 (DE3) strain was transformed with the plasmid vector pETmalE-p4-EPOR to prepare a pETmalE-p4-EPOR transformant.
実施例14
配列番号5に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含むヒトエリスロポエチン結合性タンパク質発現ベクター、および前記ベクターにより得られる形質転換体を以下の方法で作製した。
(1)実施例10で作製したpETMalE−p7−EPORを制限酵素NdeIとHindIIIで消化後、ヒトエリスロポエチン結合性タンパク質(配列番号77)をコードするオリゴヌクレオチドを含むポリヌクレオチド断片を、あらかじめ制限酵素NdeIとHindIIIで消化した、実施例5で作製したプラスミドベクターpETMalEFcR−p10にライゲーションし、プラスミドベクターpETMalE−p10−EPORを作製した。プラスミドベクターpETMalE−p10−EPORは、プラスミドベクターpETMalE−p7−EPOR(図8)に含まれる配列番号4に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドの部分を、配列番号5に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドに置換した構造である。
(2)プラスミドベクターpETMalE−p10−EPORを用いて、大腸菌BL21(DE3)株を形質転換し、pETMalE−p10−EPOR形質転換体を作製した。
Example 14
A human erythropoietin-binding protein expression vector containing an oligonucleotide having the base sequence set forth in SEQ ID NO: 5 and a transformant obtained from the vector were prepared by the following method.
(1) After digesting pETMalE-p7-EPOR prepared in Example 10 with restriction enzymes NdeI and HindIII, a polynucleotide fragment containing an oligonucleotide encoding a human erythropoietin-binding protein (SEQ ID NO: 77) is preliminarily obtained by restriction enzyme NdeI. And ligated to the plasmid vector pETMalEFcR-p10 prepared in Example 5 digested with HindIII to prepare a plasmid vector pETmalE-p10-EPOR. The plasmid vector pETmalE-p10-EPOR is a portion of the oligonucleotide consisting of the base sequence shown in SEQ ID NO: 4 contained in the plasmid vector pETmalE-p7-EPOR (FIG. 8), and the oligo consisting of the base sequence shown in SEQ ID NO: 5. It is a structure substituted with nucleotides.
(2) Escherichia coli BL21 (DE3) strain was transformed with the plasmid vector pETmalE-p10-EPOR to prepare a pETmalE-p10-EPOR transformant.
実施例15
配列番号6に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含むヒトエリスロポエチン結合性タンパク質発現ベクター、および前記ベクターにより得られる形質転換体を以下の方法で作製した。
(1)実施例10で作製したpETMalE−p7−EPOR(図8)を制限酵素NdeIとHindIIIで消化後、ヒトエリスロポエチン結合性タンパク質(配列番号77)をコードするオリゴヌクレオチドを含むポリヌクレオチド断片を、あらかじめ制限酵素NdeIとHindIIIで消化した、実施例6で作製したプラスミドベクターpETMalEFcR−rbsp7にライゲーションし、プラスミドベクターpETMalE−rbsp7−EPORを作製した。プラスミドベクターpETMalE−rbsp7−EPORは、プラスミドベクターpETMalE−p7−EPORに含まれる配列番号4に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドの部分を、配列番号6に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドに置換した構造である。
(2)プラスミドベクターpETMalE−rbsp7−EPORを用いて、大腸菌BL21(DE3)株を形質転換し、pETMalE−rbsp7−EPOR形質転換体を作製した。
Example 15
A human erythropoietin-binding protein expression vector containing an oligonucleotide having the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 6 and a transformant obtained from the vector were prepared by the following method.
(1) After digesting pETmalE-p7-EPOR (FIG. 8) prepared in Example 10 with restriction enzymes NdeI and HindIII, a polynucleotide fragment containing an oligonucleotide encoding a human erythropoietin-binding protein (SEQ ID NO: 77) is obtained. The plasmid vector pETMalE-rbsp7-EPOR was prepared by ligation to the plasmid vector pETMalEFcR-rbsp7 prepared in Example 6 previously digested with restriction enzymes NdeI and HindIII. In the plasmid vector pETmalE-rbsp7-EPOR, the oligonucleotide part consisting of the base sequence described in SEQ ID NO: 4 contained in the plasmid vector pETmalE-p7-EPOR was replaced with the oligonucleotide consisting of the base sequence described in SEQ ID NO: 6. It is a structure.
(2) Escherichia coli BL21 (DE3) strain was transformed with the plasmid vector pETmalE-rbsp7-EPOR to prepare a pETmalE-rbsp7-EPOR transformant.
比較例4
配列番号26に記載の塩基配列からなるプラスミドベクターpET−26b(+)由来の既存のオリゴヌクレオチド(5’−CTTTAAGAAGGAGATATACAT−3’)を含むヒトエリスロポエチン結合性タンパク質発現ベクター、および前記ベクターにより得られる形質転換体を以下の方法で作製した。
(1)実施例10で作製したプラスミドベクターpETMalE−p7−EPOR(図8)を制限酵素NdeIとHindIIIで消化後、ヒトエリスロポエチン結合性タンパク質(配列番号77)をコードするオリゴヌクレオチドを含むポリヌクレオチド断片を、あらかじめ制限酵素NdeIとHindIIIで消化したpET−26b(+)プラスミドベクターにライゲーションし、プラスミドベクターpETMalE−EPORを作製した。プラスミドベクターpETMalE−EPORは、プラスミドベクターpETMalE−p7−EPOR(図8)に含まれる配列番号4に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドの部分を、配列番号26に記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドに置換した構造である。
(2)プラスミドベクターpETMalE−EPORを用いて、大腸菌BL21(DE3)株を形質転換し、pETMalE−EPOR形質転換体を作製した。
Comparative Example 4
A human erythropoietin-binding protein expression vector containing an existing oligonucleotide (5′-CTTTAAGAAGGAGAATATAC-3 ′) derived from a plasmid vector pET-26b (+) having the base sequence set forth in SEQ ID NO: 26, and a trait obtained by the vector A converter was prepared by the following method.
(1) A polynucleotide fragment containing an oligonucleotide encoding a human erythropoietin-binding protein (SEQ ID NO: 77) after digesting the plasmid vector pETMalE-p7-EPOR (FIG. 8) prepared in Example 10 with restriction enzymes NdeI and HindIII Was ligated to a pET-26b (+) plasmid vector previously digested with restriction enzymes NdeI and HindIII to prepare a plasmid vector pETmalE-EPOR. The plasmid vector pETMalE-EPOR is a portion of the oligonucleotide consisting of the base sequence described in SEQ ID NO: 4 contained in the plasmid vector pETmalE-p7-EPOR (FIG. 8) into the oligonucleotide consisting of the base sequence described in SEQ ID NO: 26. It is a substituted structure.
(2) Escherichia coli BL21 (DE3) strain was transformed with the plasmid vector pETmalE-EPOR to prepare a pETmalE-EPOR transformant.
実施例16
実施例10から15および比較例4で作製した各形質転換体を用いて、ヒトエリスロポエチン結合性タンパク質を発現させ、その量を評価した。
(1)実施例10で作製したpETMalE−p7−EPOR形質転換体、実施例11で作製したpETMalE−rbs−EPOR形質転換体、実施例12で作製したpETMalE−m4−EPOR形質転換体、実施例13で作製したpETMalE−p4−EPOR形質転換体、実施例14で作製したpETMalE−p10−EPOR形質転換体、実施例15で作製したpETMalE−rbsp7−EPOR形質転換体、および比較例4で作製したpETMalE−EPOR形質転換体を、それぞれ50μg/mLのカナマイシンを含むLB培地に接種し、37℃で一晩振とう培養し、前培養液とした。
(2)新たに50μg/mLのカナマイシンを含むLB培地に、(1)の培養液をそれぞれ接種し37℃で振とう培養した。
(3)培養液の濁度(OD600)の値が約0.5になったところで培養温度を37℃から20℃に変更し、さらに30分培養後、IPTGを終濃度0.01mMとなるように培養液に添加することでヒトエリスロポエチン結合性タンパク質の発現誘導を行ない、引き続き20℃で22時間振とう培養した。
(4)培養液を遠心操作することで得られた、各形質転換体の菌体から、BugBuster protein extraction Kit(Novagen社製)を用いて可溶性タンパク質抽出画分を調製した。
(5)可溶性タンパク質抽出画分中のヒトエリスロポエチン結合性タンパク質のタンパク質量を下記に示すELISA法により測定した。
(5−1)96穴マイクロプレートのウェルに、50mMのTris−HCl緩衝液(pH8.0)を用いて希釈した抗エリスロポエチン受容体抗体(Monoclonal Anti−human Epo R Antibody)(R&D Systems社製、カタログ番号MAB3071)を濃度0.1μg/wellで固定し(4℃、18時間)、0.5%(w/v)のウシ血清アルブミン(BSA)を含むTBS緩衝液(20mMのTris−HCl、137mMのNaCl、2.68mMのKCl、pH7.5)によりブロッキングした。
(5−2)ブロッキング後、(4)で調製した可溶性タンパク質抽出画分を0.5%BSAを含むTBS緩衝液で段階希釈し、ELISA反応に供した(30℃、2時間)。
(5−3)0.2%(w/v)のTween 20と150mMのNaClを含むTris−HCl緩衝液(pH7.5)で洗浄後、Horseradish Peroxidase 抗His−Tag抗体試薬(BETHYL社製)を添加し、30℃で2時間反応させた。
(5−4)反応後、(5−3)で使用した緩衝液で洗浄を行ない、TMB Peroxidase Substrate(KPL社製)を添加し、450nmの吸光度を測定した。
(5−5)既知濃度のヒトエリスロポエチン結合性タンパク質(Recombinant Human EPO Receptor/EPOR)(Sino Biological社製、カタログ番号10707−H08H)を基準とし、測定吸光度から可溶性タンパク質抽出画分中のヒトエリスロポエチン結合性タンパク質のタンパク質濃度を算出することで、培養液あたりのヒトエリスロポエチン結合性タンパク質の発現量を算出した。
Example 16
Using each transformant prepared in Examples 10 to 15 and Comparative Example 4, human erythropoietin-binding protein was expressed and the amount thereof was evaluated.
(1) pETmalE-p7-EPOR transformant prepared in Example 10, pETmalE-rbs-EPOR transformant prepared in Example 11, pETmalE-m4-EPOR transformant prepared in Example 12, Example PETMalE-p4-EPOR transformant prepared in Example 13, pETMalE-p10-EPOR transformant prepared in Example 14, pETmalE-rbsp7-EPOR transformant prepared in Example 15, and Comparative Example 4 The pETmalE-EPOR transformant was inoculated into LB medium containing 50 μg / mL of kanamycin, respectively, and cultured with shaking at 37 ° C. overnight to prepare a preculture solution.
(2) The culture solution of (1) was inoculated into LB medium newly containing 50 μg / mL kanamycin, and cultured at 37 ° C. with shaking.
(3) When the turbidity value (OD 600 ) of the culture solution becomes about 0.5, the culture temperature is changed from 37 ° C. to 20 ° C., and after further incubation for 30 minutes, the IPTG becomes a final concentration of 0.01 mM. Thus, the expression of human erythropoietin-binding protein was induced by adding to the culture solution as described above, followed by shaking culture at 20 ° C. for 22 hours.
(4) A soluble protein extract fraction was prepared from the cells of each transformant obtained by centrifuging the culture solution using BugBuster protein extraction Kit (manufactured by Novagen).
(5) The amount of human erythropoietin-binding protein in the soluble protein extract fraction was measured by the ELISA method shown below.
(5-1) Anti-erythropoietin receptor antibody diluted with 50 mM Tris-HCl buffer (pH 8.0) (Monoclonal Anti-human EPO R Antibody) (manufactured by R & D Systems, Inc.) Catalog number MAB3071) was fixed at a concentration of 0.1 μg / well (4 ° C., 18 hours), and TBS buffer (20 mM Tris-HCl, 0.5% (w / v) bovine serum albumin (BSA) was added. It was blocked with 137 mM NaCl, 2.68 mM KCl, pH 7.5).
(5-2) After blocking, the soluble protein extract fraction prepared in (4) was serially diluted with a TBS buffer containing 0.5% BSA and subjected to an ELISA reaction (30 ° C., 2 hours).
(5-3) After washing with Tris-HCl buffer (pH 7.5) containing 0.2% (w / v) Tween 20 and 150 mM NaCl, Horseradish Peroxidase Anti-His-Tag Antibody Reagent (manufactured by BETHYL) And reacted at 30 ° C. for 2 hours.
(5-4) After the reaction, washing was performed with the buffer used in (5-3), TMB Peroxidase Substrate (manufactured by KPL) was added, and the absorbance at 450 nm was measured.
(5-5) Human erythropoietin-binding protein in a soluble protein extract fraction based on measured absorbance based on a known concentration of human erythropoietin-binding protein (Recombinant Human EPO Receptor / EPOR) (manufactured by Sino Biological, catalog number 10707-H08H) The expression level of the human erythropoietin-binding protein per culture solution was calculated by calculating the protein concentration of the sex protein.
各形質転換体による培養液あたりのヒトエリスロポエチン結合性タンパク質の発現量は、pETMalE−p10−EPOR形質転換体(実施例14/配列番号5:2.07±0.33mg/L)、pETMalE−p7−EPOR形質転換体(実施例10/配列番号4:1.22±0.09mg/L)、pETMalE−p4−EPOR形質転換体(実施例13/配列番号3:0.97±0.01mg/L)、pETMalE−rbsp7−EPOR形質転換体(実施例15/配列番号6:0.89±0.15mg/L)、pETMalE−rbs−EPOR形質転換体(実施例11/配列番号1:0.65±0.11mg/L)、pETMalE−m4−EPOR形質転換体(実施例12/配列番号2:0.32±0.01mg/L)、pETMalE−EPOR形質転換体(比較例4/配列番号26:0.17±0.01mg/L)であった。この結果から、プラスミドベクターpET−26b(+)由来の配列番号26に記載の塩基配列からなる既存のオリゴヌクレオチドを含むヒトエリスロポエチン結合性タンパク質発現ベクターを用いるより、本発明の配列番号1から6のいずれかに記載の塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを含むヒトエリスロポエチン結合性タンパク質発現ベクターを用いる方が、ヒトエリスロポエチン結合性タンパク質を大量に調製できることが判明した。なお、実施例10から実施例15で作製した形質転換体のうち、実施例14で作製したpETMalE−p10−EPOR形質転換体が、特に効率よくヒトエリスロポエチン結合性タンパク質を発現できることがわかる。 The expression level of human erythropoietin-binding protein per culture solution by each transformant was pETmalE-p10-EPOR transformant (Example 14 / SEQ ID NO: 5: 2.07 ± 0.33 mg / L), pETmalE-p7. -EPOR transformant (Example 10 / SEQ ID NO: 4: 1.22 ± 0.09 mg / L), pETmalE-p4-EPOR transformant (Example 13 / SEQ ID NO: 3: 0.97 ± 0.01 mg / L) L), pETmalE-rbsp7-EPOR transformant (Example 15 / SEQ ID NO: 6: 0.89 ± 0.15 mg / L), pETmalE-rbs-EPOR transformant (Example 11 / SEQ ID NO: 1: 0. 65 ± 0.11 mg / L), pETmalE-m4-EPOR transformant (Example 12 / SEQ ID NO: 0.32 ± 0.01 mg / L), pE MalE-EPOR transformants (Comparative Example 4 / SEQ ID NO 26: 0.17 ± 0.01mg / L) was. From this result, it was found that the human erythropoietin-binding protein expression vector containing the existing oligonucleotide consisting of the base sequence described in SEQ ID NO: 26 derived from the plasmid vector pET-26b (+) was used. It has been found that a human erythropoietin-binding protein can be prepared in a larger amount by using a human erythropoietin-binding protein expression vector containing an oligonucleotide having any one of the nucleotide sequences described above. In addition, it turns out that the pETMalE-p10-EPOR transformant produced in Example 14 can express human erythropoietin binding protein especially efficiently among the transformants produced in Example 10 to Example 15.
Claims (9)
Priority Applications (1)
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