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JP2009191020A - 有機化合物合成装置および有機化合物合成方法 - Google Patents

有機化合物合成装置および有機化合物合成方法 Download PDF

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Abstract

【課題】有機化合物の配列パターンの変更に即座に対応可能で、合成される有機化合物の均一性にも優れ、小型化を図ることが可能な有機化合物合成装置および有機化合物合成方法を提供する。
【解決手段】本発明によれば、1種または2種以上の重合可能な繰り返し単位を含む有機化合物を合成する有機化合物合成装置において、有機化合物の合成に要する化合物を含む反応液、および、加熱によりプロトンが発生する熱酸発生剤を含む反応液が供給される有機化合物合成用基板10と、熱酸発生剤を含む反応液を加熱する熱源が設けられ、有機化合物合成用基板の所定箇所を選択的に加熱する基板加熱部20と、を設けた。
【選択図】図1C

Description

本発明は、半導体製造装置などに設けられる有機化合物合成装置および有機化合物合成方法に関する。
生体物質であるDNA(DeoxyriboNucleic Acid:デオキシリボ核酸)を用いた診断において、DNAを基板上に配列したチップを用いる方法が、個々の人間の違いに対応したオーダーメイド医療実現に必須のものとして研究され、実用化されつつある。
DNAチップは、基板の上に配列の異なるDNAのセグメントをスポット状に並べたものである。DNAチップの作製方法として、予めスポットの種類分だけのDNAを合成しておき、合成しておいたDNAをインクジェット方式で基板上に並べていく方法と、基板上で核酸をつなげて合成していく方法の2種類が考えられている。
基板上で核酸をつなげて合成していく方法は、四つの塩基に応じた材料だけで、任意の配列のDNAを直接基板上に合成できる点で優れており、光リソグラフィに用いられる方法やインクジェット方式を用いて基板上にDNAのパターン形成を行うことが可能である(例えば、特許文献1〜4を参照。)。この基板上で核酸をつなげて合成していく方法は、以下のような手順で行われる。
まず、基板上に所定のリンカーを介して保護基を形成する。この保護基は、光または酸に対して反応し、リンカーから離脱する。その結果、末端に水素原子を有するリンカーの端部が現れる。ここに、保護基が導入された塩基を反応させると、塩基のイソプロピル(iPr)基を有した部分がリンカーの端部につながる。再び、新たな塩基をつなぎたい場所に光を照射したり酸を供給したりすると、保護基がはずれ、保護基が導入された塩基を反応させると、新たな塩基が保護基のはずれた部位につながっていく。このような工程を繰り返すことで任意の塩基配列を形成することができ、DNAチップを製造することができる。
このようにして製造されたDNAチップで遺伝子診断を行う場合には、例えば検体で発現している遺伝子により合成されたmRNA(メッセンジャーRNA)からcDNA(相補的DNA)を得て、このcDNAに蛍光標識等の検出に必要な信号を得ることができるものを付加する。DNAチップにこの試料を加えると、DNAチップ上の配列と合うcDNAのみが所定の塩基配列の部分に結合する。蛍光標識からの蛍光を検出することで、DNAチップ上のDNAと試料中のcDNAが結合した部分を検出することができ、検体中でどのような遺伝子が発現しているかを知ることができる。これによって、病気の診断を行うことができる。また、遺伝子をいくつかの断片に分けて同様の操作をすることで、遺伝子の違いを検出することも可能である。
米国特許第6372483号明細書 米国特許第6420180号明細書 米国特許第6600031号明細書 米国特許第6375903号明細書
ここで、基板上のどの場所にどのようなDNAの配列を合成するかは、光の照射や酸の供給を行う位置やスポッティングを決めることで決定することができる。基板上での光照射パターンは、半導体集積回路を作製する場合に使用するガラスマスクを用いるのが主流である。しかしながら、このガラスマスクを用いる方法は、同じものを大量に生産する場合には良いが、パターン変更に即座に対応することが困難であるという問題がある。
パターン変更に対応する方法として、ディスプレイ用に開発されたマイクロマシンミラーや液晶を用いたものが考案されている。しかしながら、ガラスマスクと同様に投影系の光学系を用いているために、装置の小型化には限界があった。
また、レーザのスキャンまたは光ファイバを用いた光学系も提案されているが、実用性を考慮した装置は考えられていない。また、ガラスマスクを用いた方法は、スポット内での化学物質の均一性が優れているものの、他の方法では、化学物質の均一性に問題がある。
また、インクジェット方式では、スポッティングの回ごとの位置合わせに精密さが要求されること、乾燥時のムラなどで各DNA区画の均一性がとりにくい、等の欠点を有していた。
そこで、本発明は、このような問題に鑑みてなされたもので、その目的は、有機化合物の配列パターンの変更に即座に対応可能で、合成される有機化合物の均一性にも優れ、小型化を図ることが可能な、新規かつ改良された有機化合物合成装置および有機化合物合成方法を提供することにある。
上記課題を解決するために、本発明のある観点によれば、1種または2種以上の重合可能な繰り返し単位を含む有機化合物を合成する有機化合物合成装置であって、前記有機化合物の合成に要する化合物を含む反応液、および、加熱によりプロトンが発生する熱酸発生剤を含む反応液が供給される有機化合物合成用基板と、前記熱酸発生剤を含む反応液を加熱する熱源が設けられ、前記有機化合物合成用基板の所定箇所を選択的に加熱する基板加熱部と、を備える有機化合物合成装置が提供される。
前記基板加熱部は、電熱ヒーターがアレイ状に配設されたサーマルヘッドであってもよい。
前記基板加熱部は、所定波長の光を射出する光照射装置を前記熱源として含み、前記所定波長の光を利用して前記熱酸発生剤を含む反応液を加熱するようにしてもよい。
前記有機化合物合成用基板には、前記有機化合物の合成に要する化合物を含む反応液、および、前記熱酸発生剤を含む反応液を保持する溝部がマトリクス状に形成されていてもよい。
所定波長の光が有するエネルギーを熱に変換する熱発生基板が、前記有機化合物合成用基板に対して離隔して配置され、前記光照射装置から前記熱発生基板に向かって前記所定波長の光が射出されてもよい。
前記熱発生基板と前記有機化合物合成用基板との間の空隙に、前記有機化合物の合成に要する化合物を含む反応液、および、前記熱酸発生剤を含む反応液が保持されてもよい。
前記有機化合物の合成に要する化合物を含む反応液は、アミダイト試薬であってもよい。
上記課題を解決するために、本発明の別の観点によれば、1種または2種以上の重合可能な繰り返し単位を含む有機化合物の合成に要する化合物を含む反応液、および、加熱によりプロトンが発生する熱酸発生剤を含む反応液が供給される有機化合物合成用基板と、前記熱酸発生剤を含む反応液を加熱する熱源が設けられ、前記有機化合物合成用基板の所定箇所を選択的に加熱する基板加熱部と、を備える有機化合物合成装置を用いて前記有機化合物を合成する有機化合物合成方法であって、前記有機化合物合成用基板に対して、前記熱酸発生剤を含む反応液が供給されるステップと、前記有機化合物合成用基板を、前記基板加熱部により加熱するステップと、加熱された前記有機化合物合成用基板に対して、前記有機化合物の合成に要する化合物を含む反応液を供給するステップと、を含む有機化合物合成方法が提供される。
本発明に係る有機化合物合成装置は、有機化合物の配列パターンの変更に即座に対応可能で、合成される有機化合物の均一性にも優れ、小型化を図ることが可能である。
以下に添付図面を参照しながら、本発明の好適な実施の形態について詳細に説明する。なお、本明細書及び図面において、実質的に同一の機能構成を有する構成要素については、同一の符号を付することにより重複説明を省略する。
本発明に係る有機化合物合成装置は、上述したように、1または2以上の繰り返し単位を含む有機化合物を合成する装置である。この装置により合成される有機化合物としては、例えば、核酸(DNA、RNAなど)またはタンパク質などの生体高分子化合物や、生体以外の通常の高分子化合物(ポリマー、オリゴマー)等がある。DNAやRNAなどの核酸の場合には、4種類の塩基(A、T、G、C)が繰り返し単位となり、タンパク質の場合には、種々のアミノ酸が繰り返し単位となり、通常の高分子化合物の場合には、モノマーが繰り返し単位となる。
以下、本発明の第1の実施形態および第2の実施形態に係る有機化合物合成装置として、アレイ状に配置されたDNAを合成するためのDNAアレイ合成装置を例に挙げて説明する。
(第1の実施形態)
<有機化合物合成装置の構成について>
まず、図1A〜図1Cを参照しながら、本発明の第1の実施形態に係る有機化合物合成装置の構成について、詳細に説明する。図1Aは、本実施形態に係る有機化合物合成装置の有機化合物合成用基板を説明するための平面図であり、図1Bは、本実施形態に係る有機化合物合成装置の基板加熱部を説明するための説明図であり、図1Cは、本実施形態に係る有機化合物合成装置を説明するための断面図である。
本実施形態に係る有機化合物合成装置は、有機化合物合成用基板10と、基板加熱部20と、を主に備える。
有機化合物合成用基板10は、例えば図1Aに示したように、ベース基板11と、区画13と、を備える。
ベース基板11は、アルミなどの金属、ガラス、プラスチック等を材料として使用することが可能である。ベース基板11の材質は、有機化合物の反応条件に応じて決定する。例えば、本実施形態に係る有機化合物合成装置では、反応中で酸やアルカリを使用するため、耐溶剤性に優れる基板を使用することが好ましい。また、光を照射して反応を誘起する場合には、用いる光の波長範囲を透過させる基板を用いることが好ましい。
このベース基板11上に、縦横に複数の区画13が形成される。各区画13は、任意の大きさに形成することが可能であるが、例えば、1つの区画13を、数十μm程度の大きさに形成してもよい。
図1Aでは,区画13の形状は、略円形状となっているが、この形状に限定されるわけではなく、略楕円形状であっても、略四角形状や略五角形状などの多角形状であってもよい。また、図1Aでは、区画13は、ベース基板11上に縦4行、横6列で形成されているが、上記の行、列の数に限定されるわけではない。なお、区画13の形状を略円形状とすることで、合成される有機化合物の均一性をより高くすることができる。
基板加熱部20は、例えば図1Bに示したように、電熱ヒーター21がアレイ状に配置されたサーマルヘッド23を備える。サーマルヘッド23に配設される電熱ヒーター23として、例えば、数十μmの細かさで局所的に熱を加えることができるものを用いることが可能である。また、サーマルヘッド23に配設される電熱ヒーター21の個数は、例えば有機化合物合成用基板10の区画13の行数と同じ個数以上とすることが好ましい。複数の電熱ヒーター21は、個別に電源のON・OFFが可能であり、それぞれの電熱ヒーター21の電源を制御することで、加熱を行う区画13を選択することが可能である。
なお、本実施形態に係る基板加熱部20に用いられるサーマルヘッド23として、プリンタに使用されているものを利用することが可能である。
図1Cは、有機化合物合成用基板10を図1AのA−A切断線で切断した場合の断面図である。図1Cには、基板加熱部20もあわせて図示している。
本実施形態に係る有機化合物合成用基板10の区画13は、平坦であってもよく、図1Cに示したように、溝部15が設けられていてもよい。区画13に溝部15を設けることで、溝部15にて合成された有機化合物と、サーマルヘッド23との接触を防止することが可能となる。
図1Cに示したように、有機化合物合成用基板10上には、温度上昇によりプロトンまたは酸が発生する熱酸発生剤(TAG)を含む反応液4が供給される。熱酸発生剤として、公知の物質を使用することが可能であるが、例えば、ヨードニウム塩、スルホニウム塩、ホスホニウム塩、ジアゾニウム塩等のオニウム塩を用いることが可能である。なかでも、SbF イオンやPF イオンを対イオン(カウンターイオン)とするスルホニウム塩等を用いることが好ましい。この熱酸発生剤を含む反応液4は、流体であってもよく、ゲル状であってもよい。
また、熱酸発生剤を含む反応液4中には、有機化合物の合成に要する化合物が更に含まれていてもよいが、有機化合物合成用基板10上に供給されているのが望ましい。
基板加熱部20のサーマルヘッド23は、有機化合物合成用基板10に供給された熱酸発生剤を含む反応液4の上方を、有機化合物合成用基板10の一端から他端まで時間とともに移動する。サーマルヘッド23は、移動している間に間欠的に所望の位置で電熱ヒーター23が発熱し、熱酸発生剤を含む反応液4を加熱する。熱酸発生剤が加熱されるとプロトンが発生し、サーマルヘッド23により加熱された区画13には、液性が酸性である酸性領域19が形成される。この酸性領域19において有機化合物を合成するための化学反応が進行し、所望の有機化合物が生成されることとなる。
例えば、有機化合物の合成に要する化合物を含む反応液が、熱酸発生剤を含む反応液とは別に供給される場合には、熱酸発生剤を含む反応液4がサーマルヘッド23によって加熱され酸性領域5が形成された後に、熱酸発生剤を含む反応液4を除去し、有機化合物の合成に要する化合物を含む反応液を供給する。これにより、所望の有機化合物を合成することが可能である。なお、各反応液の供給は、同一の槽内で行ってもよく、反応液ごとに異なる槽内で行ってもよい。また、各反応液の供給を異なる槽内で行う場合には、搬送系を用いて操作を自動化してもよい。
また、有機化合物の合成に要する化合物が、熱酸発生剤を含む反応液4に含有されている場合には、サーマルヘッド23による加熱によって形成された酸性領域5において、反応液4中に含まれる化合物が反応を起こし、所望の化合物が合成される。
なお、図1Bおよび図1Cでは、サーマルヘッド23の下端は平坦面になっているが、サーマルヘッド23の下端を、丸みを帯びた形状にすると、有機化合物合成用基板10に供給された各種反応液を乱すことが少なくなるため、より好ましい。
<有機化合物合成装置の動作について>
続いて、図2を参照しながら、本実施形態に係る有機化合物合成装置の動作について、詳細に説明する。図2は、本実施形態に係る有機化合物合成装置の動作について、DNAの合成を例にとって説明する説明図である。この場合には、上記の1種または2種以上の重合可能な繰り返し単位が、4種類の塩基アデニン(A)、チミン(T)、グアニン(G)、シトシン(C)に対応する。
図2(A)に示したように、本実施形態に係る有機化合物合成用基板10の区画13には、リンカー1を介して、保護基3を有する塩基(チミン)2が形成されている。この有機化合物合成用基板10に対して、熱酸発生剤を含む反応液4が供給される。サーマルヘッド23により熱酸発生剤を含む反応液4が加熱されると、加熱された箇所に酸性領域5が形成され、発生した酸(プロトン)により、保護基3が塩基2からはずれ、反応可能な塩基6が生成する(図2(B))。
ここで、図2(C)に示したように、有機化合物合成用基板10から熱酸発生剤を含む反応液4が除去され、所望の塩基(図2(C)に示した例では、保護基3を有するアデニン)8を含む反応液であるアミダイト溶液7が供給されると、保護基3がはずれ反応可能となっている塩基6と、保護基3を有する塩基8とが反応し、DNAの伸張が生じる。また、サーマルヘッド23により加熱が行われなかった区画13については、区画13上に導入されている塩基2に保護基3があるため、DNAの伸張は生じない。このようにして、図2(D)に示したように、1塩基だけ伸張したDNAが生成される。
続いて、有機化合物合成用基板10を洗浄液で洗浄した後、伸張したい塩基を含む溶液を変更しながら図2(A)〜図2(D)の操作を繰り返すことで、所望の塩基配列を有するDNAを有機化合物合成用基板10上に合成することが可能である。
(第1変形例)
続いて、図3を参照しながら、本実施形態に係る有機化合物合成装置の第1変形例について、詳細に説明する。図3は、本実施形態に係る有機化合物合成装置の第1変形例を説明するための説明図である。
本発明の第1の実施形態に係る有機化合物合成装置は、基板加熱部20が有機化合物合成用基板10を直接加熱するものであったが、本変形例に係る有機化合物合成装置は、基板加熱部20が有機化合物合成用基板10を直接加熱しないようにしたものである。本変形例に係る有機化合物合成装置は、熱により変性しやすいタンパク質等を合成する場合に、有効である。
本変形例に係る有機化合物合成装置は、図3に示したように、有機化合物合成用基板10と、熱酸発生剤を含む反応液を供給する反応液供給装置31と、ドラム32と、サーマルヘッド33と、転写ドラム34と、クリーナー35と、搬送装置36と、反応装置37と、洗浄装置38と、を主に備える。
有機化合物合成用基板10は、本発明の第1の実施形態に係る有機化合物合成用基板10と同様の構成を有し、ほぼ同一の効果を奏するため、詳細な説明は省略する。
反応液供給装置31は、熱酸発生剤を含む反応液をドラム32に対して供給する供給装置である。この反応液供給装置31は、例えば、スプレー型の装置であってもよく、ローラー型の装置であってもよく、スポイト型の装置であってもよい。
サーマルヘッド33は、ドラム32上の熱酸発生剤を含む反応液の所望の箇所を加熱する。このサーマルヘッド33として、本発明の第1の実施形態に係るサーマルヘッド23と同様のものを使用することが可能である。また、サーマルヘッド33は、本変形例に係る有機化合物合成装置に複数個設けられていてもよい。
転写ドラム34は、ドラム32上に存在する、所望の箇所が加熱された熱酸発生剤を含む反応液を、有機化合物合成用基板10へ転写する。この転写ドラム34を用いずに、ドラム32から有機化合物合成用基板10へ直接反応液を転写してもよいが、転写ドラム34を用いることで、有機化合物合成用基板10への転写性を向上させることができる。
クリーナー35は、所望の箇所が加熱された熱酸発生剤を含む反応液が転写ドラム34または有機化合物合成用基板10に転写された後のドラム32を、清掃して初期状態に戻す機能を果たす。クリーナー35は、例えば、ブレード方式のものであってもよいし、ローラー方式のものであってもよい。また、プリンタで使用されるスクレーパーを使用してもよく、酸中和剤を用いた洗浄を行う装置であってもよい。また、図3では、クリーナー35は、ドラム32用に設けられているが、必要に応じて、転写ドラム34用のものを設けてもよい。
反応装置37は、搬送装置36によって搬送されてきた有機化合物合成用基板10に、合成反応に要する反応試薬等を供給し、合成反応を進行させる装置である。この反応装置37は、有機化合物合成用基板10に、合成に要する化合物等を含む反応液を塗布するものであってもよく、合成に要する化合物等を含む反応液が入った槽であってもよい。また、反応に必要な試薬の性質や種類等に応じて、適宜複数の反応装置37を設けることも可能である。
また、図3では、反応装置37が1つだけ装備されている場合について示しているが、本変形例に係る有機化合物合成装置では、2つ以上の反応装置37が設けられていてもよい。例えば,DNAを合成する場合には、アデニン(A)、シトシン(C)、グアニン(G)、チミン(T)の4種の塩基に対応する4つの反応装置37を設けてもよく、n種類の繰り返し単位からなるn成分系のコポリマーを合成する際には、n個の反応装置37を設けてもよい。
洗浄装置38は、有機化合物合成用基板10から、余剰の反応液や未反応物等を除去するために用いられる。未反応物の除去に際しては、有機化合物合成用基板10を、未反応物の除去に用いられる薬品の入った槽に浸すようにしてもよい。
搬送装置36に配設された有機化合物合成用基板10は、転写ドラム34、反応装置37および洗浄装置38の間を往復することで、層を重ねるように、有機化合物合成用基板10上に化合物が合成されていく。
なお、有機化合物合成装置に備えられる反応液供給装置31、ドラム32、サーマルヘッド33、転写ドラム34、クリーナー35および搬送装置36については、図3に示したような配置に限定されるわけでなく、適宜配置の変更をすることが可能である。
(第2の実施形態)
<有機化合物合成装置の構成について>
続いて、図4Aおよび図4Bを参照しながら、本発明の第2の実施形態に係る有機化合物合成装置について、詳細に説明する。図4Aは、本実施形態に係る有機化合物合成装置を説明するための断面図であり、図4Bは、本実施形態に係る有機化合物合成装置の基板加熱部を説明するための説明図である。
図4Aに示したように、本実施形態に係る有機化合物合成装置は、有機化合物合成用基板10を含む反応容器40と、基板加熱部である光照射装置50と、を主に備える。
反応容器40は、有機化合物合成用基板10と、有機化合物合成用基板10の一方の面に対して離隔して配置される熱発生基板41と、熱発生基板41の一方の面(本実施形態においては、有機化合物合成用基板10側の面)を、有機化合物合成用基板10を内包するように覆うとともに、有機化合物合成用基板10との間に所定の空間を有して配置される基板43と、を備える。
熱発生基板41および基板43と、有機化合物合成用基板10との間に位置する空隙部は、有機化合物の合成に用いられる各種の反応液を保持する反応液保持部45として機能する。
また、基板43には、2つの貫通孔が設けられており、一方が反応液注入口47として用いられ、他方が反応液排出口49として用いられる。有機化合物の合成に用いられる各種の反応液は、反応液注入口47から導入され、反応液保持部45を通って、反応液排出口49から排出される。このように、本実施形態に係る反応容器40においては、反応液注入口47→反応液保持部45→反応液排出口49という反応液の流路が形成されている。かかる反応容器40の具体的な構造としては、例えば、基板上に溝を掘り込むことにより形成される、いわゆるマイクロ流体構造が代表的なものとして使用される。
本実施形態に係る有機化合物合成用基板10は、本発明の第1の実施形態に係る有機化合物合成用基板10と同様の構成を有し、ほぼ同一の効果を奏するため、詳細な説明は省略する。
熱発生基板41は、後述する光照射装置50から射出された光を吸収して熱に変換する基板である。この熱発生基板41として、例えば、石英ガラス上にモリブデン(Mo)薄膜を蒸着したものを用いることが可能である。モリブデン薄膜が蒸着された側の面を有機化合物合成用基板10側に向けて配設することで、発生した熱を効率よく反応液の加熱に利用することができる。
本実施形態に係る有機化合物合成装置の基板加熱部である光照射装置50は、複数の光源51を有し、光源51から、反応容器40の反応液保持部45に保持された反応液(熱酸発生剤を含む反応液)に向けて光を射出する。このように、光照射装置50の光源51から、反応容器40の反応液保持部45に保持された反応液に光を照射することにより、有機化合物合成用基板10を含む反応容器40と光照射装置50とにより構成される化学反応系に対して、空間分布を持った光化学反応を起こさせることができる。
本実施形態に係る光照射装置50は、例えば図4Aおよび図4Bに示したように、光源アレイ基板55上にアレイ状に配置された複数の光源51と、ロッドレンズ53がアレイ状に配列されたロッドレンズアレイと、を主に備える。
本実施形態に係る複数の光源51は、アレイ状に1列に配置されているが、必ずしもアレイ状に配置されている必要はなく、また、光源51の配列の数も1列には限られず、有機化合物合成用基板10の大きさや有機化合物合成用基板10上に形成される光照射のパターン等により適宜変更することができる。さらに、光源51の個数も有機化合物合成用基板10の大きさや有機化合物合成用基板10上に形成される光照射のパターン等により適宜選択することができる。
光源51としては、例えば、半導体を用いた光学素子を使用することができるが、このような光学素子としては、例えば、発光ダイオードや半導体レーザなどを使用できる。発光波長の選択に当たっては、所望の発光波長を選択することが可能であるが、例えば、近赤外領域や赤外領域の波長を用いることが好ましい。
また、光源51として発光ダイオードを使用した場合には、発光ダイオードのピッチ(隣り合う発光ダイオード間の間隔)を20μm程度とし、ロッドレンズ53の焦点距離を4mm程度とすることができる。さらに、光源51として発光ダイオードを用いることにより、従来使用されていたUVランプ等と比べ、100〜1000倍程度高い輝度を得ることができるため、有機化合物の反応に要する時間を短縮することができる。
なお、発光ダイオードアレイを使用すると、従来のUVランプやレーザ等を用いる場合と比べて焦点距離を短くすることができるので、有機化合物合成用基板10を含む反応容器40と光照射装置50との距離を短くすることができる。これにより、有機化合物合成装置全体の大きさを小型化することが可能となる。
ロッドレンズ53は、光源51から照射された光を集光して所望の焦点位置に調整する集光レンズの一例である。本実施形態においては、光源51から射出された光が、熱発生基板41のモリブデン薄膜部分に集光されるように、ロッドレンズ53により焦点位置が調整される。
本実施形態においては、ロッドレンズ53は、アレイ状に1列に配置されているが、必ずしもアレイ状に配置されている必要はなく、千鳥配置となるように配置されてもよい。また、光源51の場合と同様に、ロッドレンズ53の配置の仕方や個数も特に限定されない。
また、本実施形態に係る有機化合物合成装置は、光照射装置50を反応容器40に対して相対移動させる移動機構(図示せず)を有している。この移動機構は、例えば、光照射装置50を、光源51のアレイの軸方向と垂直な方向に、有機化合物合成用基板10と平行に水平移動させるように構成することができる。ただし、光照射装置50の相対移動の方向については、上記の場合には限られず、例えば、有機化合物合成用基板10の対角線方向でもよく、あるいは、光照射装置50が有機化合物合成用基板10の辺方向に沿って往復しながら相対移動するように構成してもよい。
このように、光照射装置50が有機化合物合成用基板10に対して相対移動しながら光源51の光照射を時間的・空間的にオンオフして、熱酸発生剤から酸を発生させたい所望の位置に選択的に光を照射することで、酸性領域5が生成される位置の空間パターンを有機化合物合成用基板10上に形成することができる。
このような方法により酸性領域5が生成される位置の空間パターン(光照射のパターン)を形成することにより、光照射の空間パターン(酸性領域5が生成される位置の空間パターン)を変更したい場合には、光照射装置50を相対移動させる際に、光源51からの光照射のオンオフのタイミングを制御するだけで、容易にパターン変更に対応することができる。
ここで、本実施形態においては、光源51およびロッドレンズ53がアレイ状に配置された構造を有する光照射装置50を用いて、この光照射装置50をアレイの軸と垂直な方向に有機化合物合成用基板10に対して相対移動させることにより、有機化合物合成用基板10上に酸性領域5が生成される位置の空間パターンを形成している。このようにして上記空間パターンを形成することにより、光照射装置50を有機化合物合成用基板10に対して相対移動させるだけで、所望の位置に正確に光を照射することが可能となり化学物質の均一性を向上できるとともに、高速に空間パターンを形成することができる。
なお、本発明の第1の実施形態に係る有機化合物合成用基板10と、本実施形態に係る光照射装置50とを用いて有機化合物を合成する場合には、熱酸発生剤を含む反応液4の中に、更に、光照射装置50から射出される光を吸収して熱を発生させる化合物や、ナノ粒子を添加することが好ましい。熱酸発生剤を含む反応液4に上述のような物質を添加することで、光照射装置50から射出される光が有するエネルギーを、効率よく熱に変換することが可能となる。なお、この場合、熱発生基板41は使用する必要がない。
上述の光を救出して熱を発生させる化合物として、例えば、波長700nm以上の領域(好ましくは、750nm〜1200nmの領域)の光を高効率に吸収することが可能な染料または顔料を挙げることが可能である。
このような染料の例として、例えば、アゾ染料、金属錯塩アゾ染料、ピラゾロンアゾ染料、ナフトキノン染料、アントラキノン染料、フタロシアニン染料、カルボニウム染料、キノンイミン染料、メチン染料、シアニン染料、スクワリリウム色素、ピリリウム塩、金属チオレート錯体等の染料を挙げることができる。また、上述のような顔料の例として、例えば、不溶性アゾ顔料、アゾレーキ顔料、縮合アゾ顔料、キレートアゾ顔料、フタロシナニン系顔料、アントラキノン系顔料、ペリレンおよびペリノン系顔料、チオインジゴ系顔料、キナクリドン系顔料、ジオキサジン系顔料、イソインドリノン系顔料、キノフタロン系顔料、染付けレーキ顔料、アジン顔料、ニトロソ顔料、ニトロ顔料、天然顔料、蛍光顔料、無機顔料、カーボンブラック等を挙げることができる。
<有機化合物合成装置の動作について>
光源51から射出された光は、熱発生基板41によって吸収され、熱発生基板41は、光源51から射出された光が有するエネルギーに応じて熱を発生する。発生した熱によって反応液保持部45に保持されている熱酸発生剤を含む反応液が加熱され、酸(プロトン)が発生し、酸性領域5が生成されることとなる。本実施形態に係る有機化合物合成装置は、このようにして生成された酸を利用して、有機化合物の合成を行う。酸を利用した有機化合物の合成反応の詳細については、図2に示した場合と同様であるため、詳細な説明は省略する。
以下に、本発明の第1の実施形態および第2の実施形態に係るDNAの合成方法について、使用可能な試薬の例を示しながら、さらに具体的に説明する。
DNAの合成化学は、現在も開発が続いており、様々な方法がある。通常使用されている方法は、Phosphoramideを用いた4−ステップ法である。本実施形態に係る有機化合物合成装置では、従来の4−ステップ法において酸(TCA)を供給する代わりに、熱により酸(プロトン)を発生する熱酸発生剤を供給する。本実施形態に係るDNAの合成法の詳細は、以下の通りである。
まず、ガラス系ベース基板11の表面に形成された区画13に設けられたリンカーに、保護基として5’−dimethoxytrityl基が導入された2’−deoxynucleosideを固定する。塩基をリンカーに固定する方法は、従来の方法を用いることが可能である。なお、ベース基板11として、ガラス系基板だけでなく、例えばポリスチレン基板を用いることも可能である。
プロトン供給材(PGA:Photogenerated Acid)としては、上述したように、任意の熱酸発生剤(TAG)を利用することが可能である。この熱酸発生剤の一例として、例えば、レジスト材料に多く使用されている、SbF 系スルホニウム塩や、PF 系スルホニウム塩を挙げることができる。
また、光吸収を利用して熱を発生させる場合には、例えば、アゾ染料、金属錯塩アゾ染料、ピラゾロンアゾ染料、ナフトキノン染料、アントラキノン染料、フタロシアニン染料、カルボニウム染料、キノンイミン染料、メチン染料、シアニン染料、スクワリリウム色素、ピリリウム塩、金属チオレート錯体等の染料や、不溶性アゾ顔料、アゾレーキ顔料、縮合アゾ顔料、キレートアゾ顔料、フタロシナニン系顔料、アントラキノン系顔料、ペリレンおよびペリノン系顔料、チオインジゴ系顔料、キナクリドン系顔料、ジオキサジン系顔料、イソインドリノン系顔料、キノフタロン系顔料、染付けレーキ顔料、アジン顔料、ニトロソ顔料、ニトロ顔料、天然顔料、蛍光顔料、無機顔料、カーボンブラック等の顔料を使用することができる。
次に、アセトニトリル(CHCN)、ジクロロメタン(CHCl)による洗浄の後、テトラゾール/CHCN溶液中でDNAの伸張反応を行う。
伸張反応を行った後、再びCHCNで洗浄し,無水酢酸/ルチジン(lutidine)/テトラヒドロフラン(THF)とN−メチルイミダゾール(N−methylimidazole)/THFとの混合溶液でキャッピングを行う。次いで、洗浄した後、I/THF/ピリジン(pyridine)/HOで酸化をする。このように、洗浄、キャッピング、洗浄で1サイクルが終了する。
このように、本発明の各実施形態に係る有機化合物合成装置を用いることにより、任意の有機化合物が配列された化合物チップを作製可能であり、印刷機と同様の利点を有した、小型で高速な有機化合物合成装置を実現することが可能である。
さらに、熱源として、プリンタまたは通信用に開発されたサーマルヘッドや、化合物半導体LEDや半導体レーザが使用可能であり、有機化合物合成装置の製造におけるコストを削減することが可能である。
以上、添付図面を参照しながら本発明の好適な実施形態について説明したが、本発明はかかる例に限定されないことは言うまでもない。当業者であれば、特許請求の範囲に記載された範疇内において、各種の変更例または修正例に想到し得ることは明らかであり、それらについても当然に本発明の技術的範囲に属するものと了解される。
例えば、上述した実施形態においては、目的とする有機化合物としてDNAを例にとって説明を行ったが、目的とする有機化合物がタンパク質や通常の高分子化合物である場合であっても同様に合成を行うことが可能である。
本発明の第1の実施形態に係る有機化合物合成装置の有機化合物合成用基板を説明するための平面図である。 同実施形態に係る有機化合物合成装置の基板加熱部を説明するための説明図である。 同実施形態に係る有機化合物合成装置を説明するための断面図である。 同実施形態に係る有機化合物合成装置の動作について、DNAの合成を例にとって説明する説明図である。 同実施形態に係る有機化合物合成装置の第1変形例について説明するための説明図である。 本発明の第2の実施形態に係る有機化合物合成装置を説明するための断面図である。 同実施形態に係る有機化合物合成装置の基板加熱部を説明するための説明図である。
符号の説明
10 有機化合物合成用基板
11 ベース基板
13 区画
15 溝部
20 基板加熱部
21 電熱ヒーター
23,33 サーマルヘッド
31 反応液供給装置
32 ドラム
34 転写ドラム
35 クリーナー
36 搬送装置
37 反応装置
38 洗浄装置
40 反応容器
41 熱発生基板
43 基板
45 反応液保持部
47 反応液注入口
49 反応液排出口
50 光照射装置
51 光源
53 ロッドレンズ
55 光源アレイ基板

Claims (8)

  1. 1種または2種以上の重合可能な繰り返し単位を含む有機化合物を合成する有機化合物合成装置であって、
    前記有機化合物の合成に要する化合物を含む反応液、および、加熱によりプロトンが発生する熱酸発生剤を含む反応液が供給される有機化合物合成用基板と、
    前記熱酸発生剤を含む反応液を加熱する熱源が設けられ、前記有機化合物合成用基板の所定箇所を選択的に加熱する基板加熱部と、
    を備えることを特徴とする、有機化合物合成装置。
  2. 前記基板加熱部は、電熱ヒーターがアレイ状に配設されたサーマルヘッドである
    ことを特徴とする、請求項1に記載の有機化合物合成装置。
  3. 前記基板加熱部は、所定波長の光を射出する光照射装置を前記熱源として含み、
    前記所定波長の光を利用して前記熱酸発生剤を含む反応液を加熱する
    ことを特徴とする、請求項1に記載の有機化合物合成装置。
  4. 前記有機化合物合成用基板には、
    前記有機化合物の合成に要する化合物を含む反応液、および、前記熱酸発生剤を含む反応液を保持する溝部がマトリクス状に形成される
    ことを特徴とする、請求項1に記載の有機化合物合成装置。
  5. 所定波長の光が有するエネルギーを熱に変換する熱発生基板が、前記有機化合物合成用基板に対して離隔して配置され、
    前記光照射装置から前記熱発生基板に向かって前記所定波長の光が射出される
    ことを特徴とする、請求項3に記載の有機化合物合成装置。
  6. 前記熱発生基板と前記有機化合物合成用基板との間の空隙に、前記有機化合物の合成に要する化合物を含む反応液、および、前記熱酸発生剤を含む反応液が保持される
    ことを特徴とする、請求項5に記載の有機化合物合成装置。
  7. 前記有機化合物の合成に要する化合物を含む反応液は、アミダイト試薬である
    ことを特徴とする、請求項1に記載の有機化合物合成装置。
  8. 1種または2種以上の重合可能な繰り返し単位を含む有機化合物の合成に要する化合物を含む反応液、および、加熱によりプロトンが発生する熱酸発生剤を含む反応液が供給される有機化合物合成用基板と、前記熱酸発生剤を含む反応液を加熱する熱源が設けられ、前記有機化合物合成用基板の所定箇所を選択的に加熱する基板加熱部と、を備える有機化合物合成装置を用いて前記有機化合物を合成する有機化合物合成方法であって、
    前記有機化合物合成用基板に対して、前記熱酸発生剤を含む反応液が供給されるステップと、
    前記有機化合物合成用基板を、前記基板加熱部により加熱するステップと、
    加熱された前記有機化合物合成用基板に対して、前記有機化合物の合成に要する化合物を含む反応液を供給するステップと、
    を含むことを特徴とする、有機化合物合成方法。
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