ES2853327T3 - Tratamiento combinado para la dermatitis atópica - Google Patents
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Abstract
Composición que comprende un primer y un segundo compuesto, donde dicho primer compuesto es un corticosteroide y dicho segundo compuesto comprende al menos un dominio de unión a la pared celular que se une específicamente a la pared celular de peptidoglicano de una célula bacteriana, preferiblemente una célula bacteriana gram positiva y donde dicho segundo compuesto es un polipéptido que tiene al menos un 80 % de identidad con la SEQ ID NO: 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30, 32, 34, 36, 38, 40, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 60, 62, 64, 66, 68, 70, 72, 76, 78, 80, 82, 84, 86, 88, 90, 92, 94, 98 o 100; y/o dicho dominio de unión a la pared celular tiene al menos un 80 % de identidad con cualquiera de las SEQ ID NO: 4, 6 u 8; y/o donde dicho uno o más dominios activos enzimáticos tiene al menos un 80 % de identidad con cualquiera de las SEQ ID NO: 10, 12, 14, 16, 18, 98 o 100.
Description
DESCRIPCIÓN
Tratamiento combinado para la dermatitis atópica
Campo de la invención
[0001] La invención se refiere al campo de la medicina, específicamente al campo del tratamiento de la dermatitis o el eccema, aún más específicamente al campo del tratamiento de la dermatitis atópica. La invención se refiere a una nueva composición y un nuevo kit de partes, donde ambos comprenden un compuesto antiinflamatorio y un compuesto específicamente dirigido contra una célula bacteriana, preferiblemente una célula bacteriana gram positiva. La invención se refiere además a dicha composición para uso médico, preferiblemente para tratar a un individuo que sufre de eccema.
Antecedentes de la invención
[0002] El eccema es una condición común de la piel caracterizada por una piel roja y pruriginosa y pequeñas ampollas también conocidas en la técnica como erupción cutánea o erupción o dermatitis. No hay cura para el eccema, pero hay muchos tratamientos, que varían desde dietas especiales a emolientes y pomadas inmunosupresoras, como por ejemplo una pomada de corticosteroides. Mientras que los corticosteroides, tales como la hidrocortisona o el propionato de clobetasol (administración tópica, oral o intradérmica), provocan normalmente mejoras, pueden tener también efectos secundarios. Se piensa que el uso prolongado de corticosteroides tópicos aumenta el riesgo de efectos secundarios, el más común de los cuales es que la piel se vuelve fina y frágil (atrofia). A causa de esto, si se usa en la cara u otra piel delicada, debería usarse un esteroide de baja potencia o aplicarse con menos frecuencia. Adicionalmente, los esteroides de alta potencia usados sobre áreas grandes, o bajo oclusión, se pueden absorber hacia el cuerpo, causando la supresión del eje hipotalámicohipofisario-adrenal (supresión del eje HHA).
[0003] Debido a la barrera cutánea perjudicada en la dermatitis atópica, el resultado puede ser un aumento en las infecciones cutáneas con bacterias como Staphylococcus aureus u hongos. Para casos más graves, los dermatólogos también pueden prescribir antibióticos convencionales tópicos u orales tales como penicilina, estreptomicina y cloranfenicol. Los antibióticos evitan la infección que puede resultar de una barrera cutánea perjudicada tal como una piel agrietada. La colonización o infección de S. aureus es la causa más común de una mayor gravedad del eccema. La eficacia de los tratamientos con antibióticos varía de persona a persona. Las desventajas bien conocidas de los antibióticos convencionales son la inespecificidad, es decir, también matan a las bacterias no patógenas y/o beneficiosas, y el riesgo de desarrollar resistencia, no solo por las células bacterianas diana sino posiblemente también por otras bacterias patógenas. Además, el tratamiento con antibióticos sistémicos convencionales puede interactuar con otros fármacos, incluidas las píldoras anticonceptivas. Determinados antibióticos no se pueden combinar con el uso de alcohol. Por consiguiente, hay una necesidad de un tratamiento mejorado del eccema.
Descripción de la invención
[0004] La invención está definida por el objeto de las reivindicaciones en la presente.
[0005] En un primer aspecto, se describe una nueva composición que comprende un primer y un segundo compuesto, donde dicho primer compuesto es un compuesto antiinflamatorio y dicho segundo compuesto es un compuesto específicamente dirigido contra una célula bacteriana, preferiblemente una célula bacteriana gram positiva. Preferiblemente, dicha célula bacteriana gram positiva es un Staphylococcus, más preferiblemente un Staphylococcus aureus. Preferiblemente, dicha composición es un medicamento preferiblemente para usar en el tratamiento del eccema, más preferiblemente para usar en el tratamiento de la dermatitis atópica, como se detalla adicionalmente en la presente. El estado de la técnica para tratar el eccema es usar agentes inmunosupresores como corticosteroides y, si está indicado, antibióticos tópicos o sistémicos. Se describe una composición nueva que comprende tanto un compuesto antiinflamatorio como un compuesto específicamente dirigido contra una célula bacteriana, preferiblemente una célula bacteriana gram positiva, preferiblemente un Staphylococcus aureus, que combate la mayoría, si no todas, de las desventajas de usar o un régimen de dosificación eficaz de un corticosteroide y/o un antibiótico convencional solo o en combinación y proporciona una sinergia inesperada. En comparación con el uso de un agente inmunosupresor solo como un corticosteroide solo, una composición descrita reduce el riesgo y/o es más eficaz combatiendo infecciones relacionadas con el eccema y/o inducidas por corticosteroides inducidas por una célula bacteriana, tal como una célula bacteriana gram positiva, preferiblemente Staphylococcus aureus. Además, en comparación con el uso de un corticosteroide solo, una composición descrita puede ser tan eficaz como el uso de un corticosteroide solo a la vez que se hace uso de una dosis inferior y/o un régimen más corto de administración, dando como resultado un tiempo de exposición más corto del corticosteroide,
reduciendo así posibles efectos secundarios como el riesgo de atrofia de la piel, la supresión del eje hipotalámicohipofisario-adrenal (supresión del eje HHA) y/o una (mayor) infección de la piel.
[0006] En comparación con el uso de un corticosteroide en combinación con antibióticos convencionales y/o antibióticos convencionales solo, la composición descrita selectiva y específicamente se dirige contra una célula bacteriana, preferiblemente una célula bacteriana gram positiva, preferiblemente un Staphylococcus, más preferiblemente un Staphylococcus aureus, sin afectar a la microflora comensal y/o beneficiosa circundante. Además, el riesgo de desarrollar resistencia contra antibióticos se disminuye o al menos se reduce, ya que se utilizan cantidades más bajas de antibióticos o incluso ningún antibiótico en absoluto.
[0007] Un agente que específicamente se dirige contra una célula bacteriana gram positiva es preferiblemente un agente que muestra al menos 2, 5, 10, 50 o 100 veces mayor actividad lítica hacia una célula bacteriana gram positiva en comparación con una célula bacteriana gram negativa. Preferiblemente, un agente que específicamente se dirige contra una célula bacteriana gram positiva es un agente que no afecta a una célula bacteriana gram negativa en una concentración que es efectiva en el lisado de una célula bacteriana gram positiva. Un agente que específicamente se dirige contra una célula bacteriana de Staphylococcus es preferiblemente un agente que muestra al menos 2, 5, 10, 50 o 100 veces mayor actividad lítica hacia una célula bacteriana de Staphylococcus en comparación con una célula bacteriana que no es de Staphylococcus. Preferiblemente, un agente que específicamente se dirige contra una célula bacteriana de Staphylococcus es un agente que no afecta a una célula bacteriana que no es de Staphylococcus en una concentración que sea eficaz en el lisado de una célula bacteriana de Staphylococcus. Un agente que específicamente se dirige contra una célula bacteriana de Staphylococcus aureus es preferiblemente un agente que muestra al menos 2, 5, 10, 50 o 100 veces mayor actividad lítica hacia una célula bacteriana de Staphylococcus aureus en comparación con una célula bacteriana que no es de Staphylococcus aureus. Preferiblemente, un agente que específicamente se dirige contra una célula bacteriana de Staphylococcus aureus es un agente que no afecta a una célula bacteriana que no es de Staphylococcus aureus en una concentración que sea eficaz en el lisado de una célula bacteriana de Staphylococcus aureus. La actividad lítica se evalúa preferiblemente como se ejemplifica en la presente.
[0008] También se describe una composición que comprende un primer y un segundo compuesto, donde dicho primer compuesto es un compuesto antiinflamatorio y dicho segundo compuesto es un compuesto específicamente dirigido contra una célula bacteriana, preferiblemente una célula bacteriana gram positiva, y donde dicho segundo compuesto comprende al menos un dominio de unión a la pared celular que se une específicamente a la pared celular de peptidoglicano de dicha célula bacteriana, preferiblemente una célula bacteriana gram positiva. Un dominio de unión a la pared celular descrito se define como un elemento, preferiblemente un polipéptido dentro de dicho segundo compuesto, que dirige dicho segundo compuesto a la pared bacteriana de una célula bacteriana.
[0009] Un dominio de unión a la pared celular descrito puede ser cualquier dominio de unión a la pared celular conocido por la persona experta en la técnica. Preferiblemente, un dominio de unión a la pared celular descrito es un elemento, preferiblemente un polipéptido dentro de dicho segundo compuesto, que dirige dicho segundo compuesto a la pared celular de peptidoglicano de una célula bacteriana grampositiva, preferiblemente la pared celular de peptidoglicano de una célula bacteriana de Staphylococcus, más preferiblemente la pared celular de peptidoglicano de una célula bacteriana de Staphylococcus aureus.
[0010] También se describe una composición que comprende un primer y un segundo compuesto, donde dicho primer compuesto es un compuesto antiinflamatorio y dicho segundo compuesto es un compuesto específicamente dirigido contra una célula bacteriana, preferiblemente una célula bacteriana gram positiva, y donde dicho segundo compuesto comprende al menos un dominio de unión a la pared celular que se une específicamente a la pared celular de peptidoglicano de Staphylococcus, más preferiblemente, un Staphylococcus aureus.
[0011] La unión de un dominio a la pared celular de peptidoglicano de géneros de Staphylococcus puede evaluarse usando ensayos bien conocidos por la persona experta en la materia. En una forma de realización preferida, una técnica inmunohistoquímica y/o una técnica de fusión de genes que dan como resultado construcciones marcadas se usan para evaluar la unión específica de compuestos tales como péptidos, polipéptidos, proteínas o bacteriófagos a la pared celular de peptidoglicano de géneros de Staphylococcus. Métodos de cuantificación de señales usados en las técnicas inmunohistoquímicas o de fusión mencionadas anteriormente se conocen en la técnica.
[0012] En una forma de realización, la unión a la pared celular de peptidoglicano de Staphylococcus se cuantifica usando una construcción de fusión fluorescente que comprende un dominio de la pared celular de interés. Tal ensayo de unión a la pared celular está descrito en detalle por Loessner et al (Molecular Microbiology 2002, 44(2): 335-349). En este ensayo, una solución que comprende dicha construcción de fusión fluorescente o un control negativo, preferiblemente proteína verde fluorescente (GFP), se somete a células de Staphylococcus, preferiblemente células de S. aureus, más preferiblemente S. aureus BB255, durante un período de tiempo
indicado donde después las células se sedimentan por centrifugación junto con las construcciones de fusión fluorescentes unidas. La señal fluorescente de las células de Staphylococcus expuestas a una construcción de fusión fluorescente sustraída por la señal de fluorescencia de las células de Staphylococcus expuestas a un control negativo, preferiblemente GFP, es una medida de la unión celular como se entiende en esta divulgación. Preferiblemente, se dice que un dominio descrito se une a la pared celular de peptidoglicano de géneros de Staphylococcus cuando, usando este ensayo, se detecta un aumento en la señal fluorescente de las células sedimentadas sobre el control negativo tal y como se define en la presente. También se describe un dominio de unión a la pared celular que muestra una unión tal y como se define en la presente de al menos 50, 60, 70, 80, 90 o 100, 150 o 200 % de unión a la pared celular de peptidoglicano de endolisina de bacteriófago 02638a de S. aureus (endolisina Ply2638 definida por la SEQ ID NO: 2) codificada preferiblemente por la SEQ ID NO:1. Preferiblemente, una construcción de fusión como la representada por la SEQ ID NO: 95 y codificada por la SEQ ID NO: 96 sirve como un control positivo en este ensayo. Un resumen de todas las secuencias incluidas y sus SEQ ID NO se da en la tabla 2.
[0013] También se describe una composición que comprende un primer y un segundo compuesto, donde dicho primer compuesto es un compuesto antiinflamatorio y dicho segundo compuesto es un compuesto específicamente dirigido contra una célula bacteriana, preferiblemente una célula bacteriana gram positiva, y donde dicho segundo compuesto comprende al menos un dominio de unión a la pared celular que se origina o es un homólogo de una endolisina de fago de Staphylococcus, preferiblemente dicha endolisina de fago de Staphylococcus se selecciona de entre, pero no se limita a, endolisina de bacteriófago 02638a de S. aureus, endolisina de bacteriófago 011 de S. aureus, endolisina de bacteriófago OTwort de S. aureus, S. haemolyticus JCSC1435, endolisina de fago K de S. aureus, endolisina de fago WMY de S. warneri, endolisina de fago NM3 de S. aureus y endolisina de 80alfa de S. aureus.
[0014] También se prefiere un dominio de unión a la pared celular que se origina o es un homólogo de lisostafina de S. simulans (representada por la SEQ ID NO: 76, codificada preferiblemente por la SEQ ID NO: 75). Un homólogo conocido de lisostafina de S. simulans que tiene propiedades de unión a la pared celular es la enzima ALE-1 de S. capitis.
[0015] Preferiblemente, dicho dominio de unión a la pared celular tiene al menos un 80 % de identidad con cualquiera de las SEQ ID NO: 4, 6 u 8 y/o donde dicho uno o más dominios activos enzimáticos tiene al menos un 80 % de identidad con cualquiera de las SEQ ID NO: 10, 12, 14, 16, 18, 98 o 100. También se describe un dominio de unión a la pared celular que tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con el dominio de unión a la pared celular de lisostafina de S. simulans definida en la presente por la SEQ ID NO: 4 y codificada preferiblemente por la SEQ ID NO: 3. También se prefiere un dominio de unión a la pared celular aislado a partir de una endolisina de bacteriófago de Staphylococcus nativa. También se describe un dominio de unión a la pared celular que tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con el dominio de unión a la pared celular de la endolisina de bacteriófago 02638a de S. aureus definida en la presente por la SEQ ID NO: 6 y codificada preferiblemente por la SEQ ID NO: 5. También se describe un dominio de unión a la pared celular aislado a partir de una endolisina de fago phiNM3 de Staphylococcus aureus nativa. Preferiblemente, un dominio de unión a la pared celular descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con el dominio de unión a la pared celular de la endolisina de fago phiNM3 de S. aureus definida en la presente por la SEQ ID NO: 8 y codificada preferiblemente por la SEQ ID NO: 7.
[0016] También se describe una composición que comprende un primer y un segundo compuesto, donde dicho primer compuesto es un compuesto antiinflamatorio y dicho segundo compuesto es un compuesto específicamente dirigido contra una célula bacteriana, preferiblemente una célula bacteriana gram positiva, donde dicho segundo compuesto comprende uno o más dominios activos enzimáticos que muestran especificidad de enlace diana. 'Un dominio activo enzimático' se define en la presente como un dominio con actividad lítica, exhibiendo preferiblemente actividad de peptidoglicano hidrolasa. La actividad lítica se puede evaluar por métodos bien conocidos por la persona experta en la técnica. En una forma de realización, la actividad lítica se evalúa espectrofotométricamente midiendo la caída en la turbidez de suspensiones celulares de sustrato. La turbidez se evalúa midiendo la densidad óptica a una longitud de onda de 595 nm, típicamente un cultivo es turbio cuando muestra una densidad óptica de al menos 0,3 OD a una longitud de onda de 595 nm. Preferiblemente, la actividad lítica se evalúa espectrofotométricamente midiendo la caída en la turbidez de una suspensión de S. aureus, donde la turbidez se cuantifica midiendo la OD595 espectrofotométricamente (Libra S22, Biochrom). Más preferiblemente, 200 nM de polipéptido que comprende un dominio activo enzimático como se identifica en la presente se incuba junto con una suspensión de S. aureus con una OD595 inicial de 1 ± 0,05, evaluada espectrofotométricamente (Libra S22, Biochrom), en tampón PBS a pH 7,4, 120 mM de cloruro sódico durante 30 min a 37°C. La caída en la turbidez se calcula sustrayendo la OD595 después de 30 min de incubación de la OD595 antes de los 30 min de incubación. Se dirá que un polipéptido que comprende un dominio activo enzimático como se identifica en la presente tiene actividad lítica si, cuando se usa este ensayo, se detecta una caída en la turbidez de al menos un 10, 20, 30, 40, 50 o 60 %. Preferiblemente, se detecta una caída en la turbidez de al menos un 70 %.
Preferiblemente, un polipéptido que comprende un dominio activo enzimático muestra una actividad lítica de al menos un 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150 o 200 % o más de una actividad lítica de endolisina de bacteriófago 02638a de S. aureus (endolisina Ply2638 identificada por la SEQ ID NO: 2) codificada preferiblemente por la SEQ ID NO: 1.
[0017] También se describe una composición que comprende un primer y un segundo compuesto, donde dicho primer compuesto es un compuesto antiinflamatorio y dicho segundo compuesto es un compuesto específicamente dirigido contra una célula bacteriana, preferiblemente una célula bacteriana gram positiva, donde dicho segundo compuesto comprende uno o más dominios activos enzimáticos que muestran una especificidad de enlace diana, y donde dicho enlace diana es un enlace esencial en una capa de peptidoglicano de dicha célula bacteriana, preferiblemente una célula bacteriana gram positiva. Un enlace esencial en una capa de peptidoglicano de una célula bacteriana, preferiblemente una célula bacteriana grampositiva, se define en la presente como un enlace dentro de dicho peptidoglicano que es esencial para que dicho peptidoglicano proporcione dicha forma de célula bacteriana y una resistencia de estructura rígida al choque osmótico. Preferiblemente, dicho enlace esencial en una capa de peptidoglicano de una célula bacteriana grampositiva es un enlace entre una D-alanina del péptido corto y una glicina del péptido de puente cruzado (definido en la presente también como un enlace entre una alanina N-terminal y una glicina), un enlace en un puente cruzado de pentaglicina (definido en la presente también como un enlace glicil-glicil de puente de pentaglicina, un enlace entre un N-acetilmuramil y una L-alanina o un enlace entre una N-acetilmuramina y una N-acetilglucosamina o entre una N-acetilglucosamina y una N-acetilmuramina. Otros enlaces esenciales preferidos en una capa de peptidoglicano de una célula bacteriana grampositiva son un enlace en un péptido corto gamma-glutamil, un enlace entre un ácido L-alanil-iso-D-glutámico en un péptido corto y un enlace entre un ácido iso-D-glutámico-L-lisina en un péptido corto.
[0018] La mayoría de endolisinas de bacteriófago de Staphylococcus nativas que muestran actividad de peptidoglicano hidrolasa consisten en un dominio de unión a la pared celular (CBD) C-terminal, un dominio de N-acetilmuramil-L-alanina amidasa central, y un dominio de endopeptidasa alanil-glicil N-terminal con homología a amidohidrolasa/peptidasa dependiente de cisteína e histidina (ChA p ) o, en el caso de Ply2638, de un dominio de glicil-glicina endopeptidasa N-terminal con homología a peptidasa_M23, donde los últimos tres dominios muestran actividad de peptidoglicano hidrolasa, cada uno con distinta especificidad de enlace diana y generalmente denominados en la presente como dominios enzimáticamente activos. Preferiblemente, dicho uno o más dominios activos enzimáticos se seleccionan de entre o son una permutación de un dominio del grupo consistente en un dominio de amidohidrolasa/peptidasa dependiente de cisteína e histidina, un dominio de endopeptidasa, un dominio de amidasa y un dominio de glicosilhidrolasa. Dicho dominio de glicosilhidrolasa puede ser un dominio de muramidasa o un dominio de glicosaminidasa.
[0019] Preferiblemente, dicho dominio CHAP escinde un enlace entre un alanil N-terminal y un glicil dentro de una capa de peptidoglicano. Más preferiblemente, dicho dominio CHAP escinde específicamente un enlace entre un alanil N-terminal y un glicil dentro de una capa de peptidoglicano. Preferiblemente, dicho dominio de endopeptidasa escinde el enlace glicil-glicil de puente de pentaglicina dentro de una capa de peptidoglicano. Más preferiblemente, dicho dominio de endopeptidasa escinde específicamente el enlace glicil-glicil de puente de pentaglicina dentro de una capa de peptidoglicano. Preferiblemente, dicho dominio de amidasa escinde un enlace entre un N-acetilmuramil central y una L-alanina dentro de una capa de peptidoglicano. Más preferiblemente, dicho dominio de amidasa escinde específicamente un enlace entre un N-acetilmuramil central y una L-alanina dentro de una capa de peptidoglicano. Preferiblemente, dicho dominio de murimidasa escinde un enlace entre una N-acetilmuramina y una N-acetilglucosamina dentro de una capa de peptidoglicano. Más preferiblemente, dicho dominio de murimidasa escinde específicamente un enlace entre una N-acetilmuramina y una N-acetilglucosamina dentro de una capa de peptidoglicano. Preferiblemente, dicho dominio de glucosaminidasa escinde un enlace entre una N-acetilglucosamina y una N-acetilmuramina dentro de una capa de peptidoglicano. Más preferiblemente, dicho dominio de glucosaminidasa escinde específicamente un enlace entre una N-acetilglucosamina y una N-acetilmuramina dentro de una capa de peptidoglicano. Preferiblemente dicha capa de peptidoglicano es de una célula bacteriana, preferiblemente una célula bacteriana gram positiva, más preferiblemente de un Staphylococcus, más preferiblemente de un Staphylococcus aureus. Preferiblemente, la escisión de un enlace por un dominio activo enzimático tal y como se define en la presente es específica si dicho enlace se hidroliza al menos 2, 5, 10, 50 o 100 veces de manera más eficiente con dicho dominio activo enzimático en comparación con la hidrólisis de cualquier otro enlace tal y como se ha definido en la presente anteriormente con dicho dominio activo enzimático.
[0020] Preferiblemente, un dominio CHAP se origina del fago K de Staphylococcus, el fago Twort de Staphylococcus y/o el bacteriófago phi 11 de S. aureus. Preferiblemente, un dominio CHAP es un dominio que tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 10, 12 o 98 y/o está codificado preferiblemente por la SEQ ID NO: 9 u 11. Preferiblemente, un dominio de endopeptidasa se origina del bacteriófago 02638a de S. aureus y/o S. simulans. Preferiblemente, un dominio de endopeptidasa tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 14 o 16 y/o está codificado preferiblemente por la SEQ ID NO: 13 o 15. Preferiblemente, un dominio de amidasa se origina del bacteriófago 02638a de S. aureus o el bacteriófago
phi 11 de S. aureus. Preferiblemente un dominio de amidasa tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 18 o 100 y/o está codificado preferiblemente por la SEQ ID NO: 17 o 99.
[0021] También se describe una composición que comprende un primer y un segundo compuesto, donde dicho primer compuesto es un compuesto antiinflamatorio y dicho segundo compuesto es un compuesto específicamente dirigido contra una célula bacteriana, preferiblemente una célula bacteriana gram positiva, donde dicho segundo compuesto es un bacteriófago de origen natural o mutante, una endolisina de origen natural o un polipéptido mutante.
[0022] Un bacteriófago de origen natural puede ser cualquier bacteriófago específicamente dirigido contra, y que infecta, una célula bacteriana, preferiblemente una célula bacteriana, preferiblemente un Staphylococcus, más preferiblemente un Staphylococcus aureus. Preferiblemente, un bacteriófago de origen natural se selecciona de entre, pero no se limita a, un grupo consistente en el bacteriófago 02638a de S. aureus, el bacteriófago 011 de S. aureus, el bacteriófago OTwort de S. aureus, S. haemolyticus JCSC1435, el fago K de S. aureus, el fago WMY de S. warneri, el fago NM3 de S. aureus y el 80alfa de S. aureus. Dicha endolisina de origen natural se puede sintetizar y/o purificar. Un bacteriófago puede ser un bacteriófago mutante, quimérico y/o recombinante. La persona experta en la técnica puede construir un bacteriófago colocando mutaciones en el genoma y/o eliminando y/o insertando secuencias codificantes o partes de las mismas en el genoma usando métodos conocidos en la técnica. Una endolisina de origen natural puede ser cualquier endolisina de tipo salvaje o nativa que muestre actividad de peptidoglicano hidrolasa. Se prefiere una endolisina de fago de Staphylococcus, preferiblemente dicha endolisina de fago de Staphylococcus se selecciona de entre, pero no se limita a, el grupo consistente en endolisina de bacteriófago 02638a de S. aureus, endolisina de bacteriófago 011 de S. aureus, endolisina de bacteriófago OTwort de S. aureus, S. haemolyticus JCSC1435, endolisina de fago K de S. aureus, endolisina de fago WMY de S. warneri, endolisina de fago n M3 de S. aureus y endolisina de 80alfa de S. aureus. También se prefiere lisostafina de S. simulans y/o un homólogo de lisostafina de S. simulans tal como la enzima ALE-1 de S. capitis. La mayoría de las endolisinas de bacteriófago de Staphylococcus nativas que muestran actividad de peptidoglicano hidrolasa consisten en un dominio de unión a la pared celular (CBD) C-terminal, un dominio de N-acetilmuramil-L-alanina amidasa central y un dominio de alanil-glicil endopeptidasa N-terminal con homología a CHAP o, en el caso de Ply2638, de un dominio de endopeptidasa N-terminal con homología a peptidasa_M23, donde los últimos tres dominios muestran actividad de peptidoglicano hidrolasa, cada uno con distinta especificidad de enlace diana y generalmente denominados en la presente como dominios enzimáticamente activos.
[0023] Un polipéptido mutante como el descrito puede ser un polipéptido sintetizado químicamente o un polipéptido recombinante o adaptado producido in vitro. Una construcción adaptada se define en la presente como un polinucleótido que comprende secuencias de nucleótidos heterólogas. Como se utiliza en este caso, el término secuencia heteróloga o polinucleótido heterólogo es uno que no se encuentra de manera natural operativamente enlazado como secuencia adyacente de dicha primera secuencia de nucleótidos. Como se utiliza en este caso, el término heterólogo puede significar recombinante. Recombinante se refiere a una entidad genética distinta de la generalmente encontrada en la naturaleza. Aplicado a una secuencia de nucleótidos o molécula de ácido nucleico, esto significa que dicha secuencia de nucleótidos o molécula de ácido nucleico es el producto de varias combinaciones de pasos de clonación, restricción y/o ligamiento, y otros procedimientos que dan como resultado la producción de una construcción que es distinta de una secuencia o molécula encontrada en la naturaleza. Preferiblemente, un polipéptido mutante descrito comprende al menos un dominio activo enzimático y un dominio de unión celular tal y como se define en la presente.
[0024] Una endolisina o polipéptido mutante descrita puede estar en una forma purificada o puede estar comprendida dentro de una composición cruda, preferiblemente de origen biológico, tal como un lisado bacteriano, lisado de levadura, lisado fúngico, fracción sonicada o fijada. Alternativamente, dicha endolisina o polipéptido mutante puede ser una endolisina o polipéptido químicamente sintetizada o un polipéptido recombinante producido in vitro.
[0025] Una endolisina o polipéptido mutante descrita preferiblemente comprende o consiste en al menos un dominio activo enzimático y al menos un dominio de unión celular y opcionalmente una etiqueta para facilitar la purificación. Preferiblemente, dicha etiqueta se selecciona de entre, pero no se limita a, el grupo consistente en una etiqueta FLAG, una etiqueta poli(His), una etiqueta HA y una etiqueta myc. Más preferiblemente dicha etiqueta es una etiqueta 6xHis. Aún más preferiblemente, dicha etiqueta es una etiqueta 6xHis N-terminal (indicada en la presente como HXa) idéntica a la SEQ ID NO: 74 y codificada preferiblemente por la SEQ ID NO: 73).
[0026] Preferiblemente, un dominio de unión a la pared celular descrito se sitúa en el lado C-terminal del dominio activo enzimático dentro de dicha endolisina de origen natural o un polipéptido mutante. Preferiblemente, dicho polipéptido de origen natural o mutante comprende al menos dos o más dominios activos enzimáticos con distintas especificidades de enlace diana, ya que las distintas especificidades de enlace diana confieren efectos sinérgicos. También se describe una composición que comprende al menos dos compuestos distintos dirigidos contra una
célula bacteriana, preferiblemente una célula bacteriana gram positiva, preferiblemente un Staphylococcus, más preferiblemente un Staphylococcus aureus. Preferiblemente dichos al menos dos compuestos distintos son endolisina de origen natural, que son opcionalmente sintetizados. Preferiblemente dichos al menos dos compuestos distintos son polipéptidos recombinantes, donde cada uno comprende un dominio activo enzimático distinto y/o una multiplicidad diferente de al menos dos dominios activos enzimáticos distintos tal y como se define en la presente a continuación.
[0027] También se describe una composición que comprende un primer y un segundo compuesto, donde dicho primer compuesto es un compuesto antiinflamatorio y dicho segundo compuesto es un compuesto específicamente dirigido contra una célula bacteriana, preferiblemente una célula bacteriana gram positiva, donde dicho segundo compuesto es un polipéptido recombinante que comprende una multiplicidad de dicho uno o más dominios activos enzimáticos que muestran especificidad de enlace diana. La "multiplicidad" debe entenderse como un número de copias y puede ser cualquier número entero que varía de 1 a 20, preferiblemente de 1 a 10, más preferiblemente de 1 a 3, más preferiblemente dicha multiplicidad es 2, es decir, un duplicado. Los polipéptidos que comprenden una multiplicidad de dominios activos enzimáticos muestran una actividad lítica superior en comparación con los polipéptidos que comprenden un único dominio activo enzimático.
[0028] Preferiblemente, dicho segundo compuesto es un polipéptido que comprende y/o consiste en un dominio activo enzimático, uno de unión a la pared celular y opcionalmente una etiqueta para facilitar la purificación tal y como se define en la presente, preferiblemente dicho dominio activo enzimático es un dominio de amidohidrolasa/peptidasa dependiente de cisteína e histidina, un dominio de endopeptidasa o un dominio de amidasa, y preferiblemente el polipéptido comprende una multiplicidad de dicho dominio activo enzimático, preferiblemente dicha multiplicidad es 2, es decir, un duplicado. Más preferiblemente dicho polipéptido comprende y/o consiste en un dominio de amidasa duplicado y un dominio de unión a la pared celular y opcionalmente una etiqueta para facilitar la purificación tal y como se define en la presente, preferiblemente dicha amidasa es de endolisina de bacteriófago 02638a de S. aureus y dicho dominio de unión a la pared celular es de lisostafina de S. simulans. Más preferiblemente dicho polipéptido comprende y/o consiste en un dominio de endopeptidasa duplicado y un dominio de unión a la pared celular y opcionalmente una etiqueta para facilitar la purificación tal y como se define en la presente, preferiblemente dicho dominio de endopeptidasa es un dominio de peptidasa_M23 de lisostafina de S. simulans y dicho dominio de unión a la pared celular es de lisostafina de S. simulans.
[0029] Preferiblemente, dicho segundo compuesto es un polipéptido que tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30, 32, 34, 36, 38, 40, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 60, 62, 64, 66, 68, 70, 72, 76, 78, 80, 82, 84, 86, 88, 90, 92, 94, 98 o 100 y/o está codificado por un polinucleótido con al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con cualquiera de las SEQ ID NO: 1, 3, 5, 7, 9, 11, 13, 15, 17, 19, 21,23, 25, 27, 29, 31,33, 35, 37, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 59, 61, 63, 65, 67, 69, 71, 75, 77, 79, 81, 83, 85, 87, 89, 91, 93, 97 o 99. Preferiblemente, dicho polipéptido tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 28, 34, 46, 52, 58 o 70, más preferiblemente, dicho polipéptido tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 28, 46, 52 o 70, aún más preferiblemente, dicho polipéptido tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 46 o 70, más preferiblemente dicho polipéptido tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 70.
[0030] También se describe una composición que comprende un primer y un segundo compuesto, donde dicho primer compuesto es un compuesto antiinflamatorio y dicho segundo compuesto es un compuesto específicamente dirigido contra una célula bacteriana, preferiblemente una célula bacteriana gram positiva, donde dicho primer compuesto se selecciona del grupo que consiste en un corticosteroide, un inhibidor de calcineurina, un compuesto inmunoterapéutico, un IFN-gamma humano recombinante, un probiótico microbiano, un modulador de citocina, un bloqueador de reclutamiento de células inflamatorias y un inhibidor de la activación de células T. Los inhibidores de calcineurina preferidos son FK506, tacrolimus y pimecrolimus. Un compuesto inmunoterapéutico preferido es omalizumab, un anticuerpo monoclonal IgG1 humanizado contra IgE que reconoce y oculta un epítopo en la región CH3 de IgE responsable de la unión a FcsR de alta afinidad en mastocitos y basófilos. Los moduladores de citocina preferidos son un receptor soluble de IL-4, un anticuerpo monoclonal anti-IL-5 y un inhibidor de TNF. Los bloqueantes del reclutamiento de células inflamatorias preferidos son un antagonista de receptor de quimiocinas y un inhibidor de CLA. Los inhibidores de la activación de células T preferidos son alefacept y efalizumab. Los corticosteroides que se pueden usar incluyen, pero de forma no limitativa, dipropionato de betametasona, acetónido de fluocinolona, valerato de betametasona, acetónido de triamcinolona, propionato de clobetasol, desoximetasona, diacetato de diflorasona, amcinonida, flurandrenolida, valerato de hidrocortisona, butirato de hidrocortisona, desonida, hidrocortisona y acetato de metilprednisolona. Un compuesto antiinflamatorio preferido adicional es dapsona, que tiene tanto propiedades antimicrobianas como antiinflamatorias.
[0031] En todas las formas de realización, el segundo compuesto específicamente dirigido contra una célula bacteriana, preferiblemente una célula bacteriana gram positiva, puede estar comprendida por una combinación de una fuente de un primer dominio activo enzimático y una fuente de un segundo dominio activo enzimático, donde dichos primer y segundo dominios activos enzimáticos muestran distintas especificidades de enlace diana y están comprendidos en un primer y segundo polipéptido distinto, es decir, dicho primer dominio activo enzimático está comprendido en un primer polipéptido y dicho segundo dominio enzimático está comprendido en un segundo polipéptido, donde dichos primer y segundo polipéptidos tienen cada uno una secuencia de aminoácidos distinta. Además, el segundo compuesto descrito conforme puede estar comprendido por una combinación de una fuente de un primer dominio activo enzimático, una fuente de un segundo dominio activo enzimático y una fuente de un tercer dominio activo enzimático, donde dichos primer, segundo y tercer dominios activos enzimáticos muestran distintas especificidades de enlace diana y están comprendidos en un primer, segundo y tercer polipéptido distintos, es decir, dicho primer dominio activo enzimático está comprendido en un primer polipéptido, dicho segundo dominio enzimático está comprendido en un segundo polipéptido y dicho tercer dominio enzimático está comprendido en un tercer polipéptido, donde dichos polipéptidos primero, segundo y tercero tienen cada uno una secuencia de aminoácidos distinta. Además, el segundo compuesto descrito puede estar comprendido por una combinación de una fuente de un primer dominio activo enzimático, una fuente de un segundo dominio activo enzimático, una fuente de un tercer dominio activo enzimático y una fuente de un dominio activo enzimático adicional, donde dichos dominios activos enzimáticos primero, segundo, tercero y adicional muestran distintas especificidades de enlace diana y están comprendidos en un polipéptido primero, segundo, tercero y adicional distinto, es decir, dicho primer dominio activo enzimático está comprendido en un primer polipéptido, dicho segundo dominio enzimático está comprendido en un segundo polipéptido, dicho tercer dominio enzimático está comprendido en un tercer polipéptido y dicho dominio activo enzimático adicional está comprendido en un polipéptido adicional, donde dichos polipéptidos primero, segundo, tercero y adicional tienen cada uno una secuencia de aminoácidos distinta. Un dominio activo enzimático adicional se entiende en la presente como un dominio activo enzimático cuarto, quinto, sexto, séptimo, octavo, noveno, décimo o más, preferiblemente un cuarto dominio activo enzimático. Un polipéptido adicional se entiende en la presente como un polipéptido cuarto, quinto, sexto, séptimo, octavo, noveno, décimo o más, preferiblemente un cuarto polipéptido.
[0032] Los inventores sorprendentemente descubrieron, para el segundo compuesto descrito, que la aplicación simultánea de dos o más dominios enzimáticamente activos con distintas especificidades de enlace diana confiere efectos sinérgicos. Sorprendentemente, esto no solo funciona cuando los dominios enzimáticamente activos con especificidades diferentes se sitúan en la misma molécula que en las endolisinas de Staphylococcus nativas, sino que también funciona cuando los dominios enzimáticamente activos con especificidades diferentes se separan en polipéptidos distintos.
[0033] El beneficio de tener distintos dominios activos enzimáticos situados en polipéptidos individuales separados es que los polipéptidos resultantes son más pequeños, por lo que pueden producirse más fácilmente. Además, estos polipéptidos más pequeños tienen mejores propiedades de difusión en ambientes específicos y pueden ser más resistentes a la degradación y presentar una mayor termoestabilidad. Otra ventaja es que los distintos dominios activos enzimáticos independientes situados en distintas moléculas de polipéptido separadas se pueden mezclar y agrupar en composiciones variables, en una proporción que es más adecuada para hidrolizar las células diana bacterianas específicas. El segundo compuesto descrito compuesto por una combinación como la descrita en este caso se puede suplementar y/o complementar mediante el uso de prácticamente cualquier dominio activo enzimático funcional con prácticamente cualquier especificidad de enlace diana a partir de muchos orígenes diferentes, incluyendo lisinas de fago, bacteriocinas, autolisinas o cualquier otra enzima lítica de la pared celular.
[0034] En el contexto del segundo compuesto descrito, 'una combinación' significa que se contemplan y abarcan una fuente de un primer dominio activo enzimático y una fuente de un segundo dominio activo enzimático. Además, en el contexto del segundo compuesto descrito, 'una combinación' significa que se contemplan y abarcan una fuente de un primer dominio activo enzimático, una fuente de un segundo dominio activo enzimático y opcionalmente una fuente de un tercer dominio activo enzimático y/o uno adicional. Cada fuente puede estar junto con o presente junto con o combinada junto con o físicamente en contacto con la otra fuente formando una composición única. Cada fuente puede alternativamente estar comprendida dentro de una composición distinta. Sin embargo, la divulgación proporciona la idea de que ambas fuentes de un primer y un segundo dominio activo enzimático son necesarias preferiblemente o se usan para obtener un efecto de la presente invención tal y como se define en la presente. Si cada fuente no está presente en una misma composición única, cada fuente y/o cada composición distinta que comprende una fuente de una combinación que abarca el segundo compuesto descrito se puede usar secuencial o simultáneamente.
[0035] 'Una fuente de un primer dominio activo enzimático', 'una fuente de un segundo dominio activo enzimático', 'una fuente de un tercer dominio activo enzimático' y 'una fuente de un dominio activo enzimático adicional' comprende preferiblemente una fuente a base de proteínas, es decir, un polipéptido, una proteína, productos de digestión de una proteína y/o un fragmento de una proteína o de productos de digestión, o una fuente que no es a base de proteína, es decir, un ácido nucleico que codifica una proteína o péptido derivado o fragmento de proteína.
A continuación definimos fuentes preferidas de un primer dominio activo enzimático, una fuente de un segundo dominio activo enzimático, una fuente de un tercer dominio activo enzimático y una fuente de un dominio activo enzimático adicional que están abarcadas por la divulgación. Cuando el segundo compuesto descrito se refiere a una combinación de una fuente de un primer dominio activo enzimático, una fuente de un segundo dominio activo enzimático y opcionalmente una fuente de un tercer dominio activo enzimático y/o uno adicional, cada una de las fuentes de un primer dominio activo enzimático definidas en la presente se puede combinar con cada una de las fuentes de un segundo y opcionalmente un tercer dominio activo enzimático y/o uno adicional definidas en la presente. También se describe el uso de una combinación de una fuente de un primer dominio activo enzimático que es a base de proteínas con una fuente de un segundo y opcionalmente un tercer dominio activo enzimático y/o uno adicional que no son a base de proteínas, y viceversa.
[0036] 'Comprendido/a(s) en distintos polipéptidos' se refiere en la presente a que cualquiera de dichos dominios activos enzimáticos primero, segundo y opcionalmente tercero y/o adicional está comprendido en un polipéptido que es distinto del polipéptido en el que está comprendido cualquiera de los otros dichos dominios activos enzimáticos primero, segundo y opcionalmente tercero y/o adicional.
[0037] En todas las formas de realización, un polipéptido puede ser un polipéptido natural o un polipéptido aislado, preferiblemente un polipéptido aislado. Un ácido nucleico puede ser un ácido nucleico natural o un ácido nucleico aislado, preferiblemente un ácido nucleico aislado. Una construcción de ácido nucleico puede ser una construcción natural o una aislada, preferiblemente una construcción de ácido nucleico aislada.
[0038] Preferiblemente, un primer, un segundo y opcionalmente un tercer dominio activo enzimático y/o uno adicional que abarcan juntos el segundo compuesto descrito es un dominio seleccionado del grupo que consiste en un dominio de amidohidrolasa/peptidasa dependiente de cisteína e histidina (CHAP), un dominio de endopeptidasa, y un dominio de amidasa; todos preferiblemente como se describe previamente en la presente.
[0039] Preferiblemente, un polipéptido primero, segundo, tercero y/o adicional que abarcan juntos el segundo compuesto descrito comprende una multiplicidad diferente de un dominio activo enzimático primero, segundo, tercero y/o adicional como se describe. Una "multiplicidad" se define en la presente como un número de copias. Una "multiplicidad diferente" se define en la presente como una multiplicidad o número de copias de un dominio activo enzimático específico descrito, es decir, un dominio activo enzimático primero, segundo, tercero o adicional tal y como se define en la presente, comprendido dentro de un polipéptido específico descrito, es decir, un polipéptido primero, segundo, tercero o adicional tal y como se define en la presente, que es diferente de una multiplicidad o número de copias de ese mismo dominio activo enzimático dentro de otro polipéptido de la combinación que abarca el segundo compuesto descrito. Por ejemplo, una combinación que abarca el segundo compuesto comprende un primer polipéptido que comprende un número específico de copias de un primer dominio activo enzimático, y un segundo polipéptido que comprende un número diferente de copias de dicho primer dominio activo enzimático. Además, dicho primer polipéptido de dicha combinación ejemplificada que abarca el segundo compuesto puede comprender además un número específico de copias del segundo dominio activo enzimático, que es diferente del número de copias de dicho segundo dominio activo enzimático comprendido en dicho segundo polipéptido de dicha combinación. Además, cualquier polipéptido adicional de dicha combinación ejemplificada que abarca el segundo compuesto puede comprender un número de copias de un dominio activo enzimático adicional, que es diferente del número de copias de dicho dominio activo enzimático adicional comprendido en dichos primer y segundo polipéptidos de dicha combinación. Aunque una combinación de polipéptidos distintos donde cada uno comprende un único dominio activo enzimático distinto mostró actividad lítica sinérgica en comparación con la actividad lítica de cada polipéptido por separado, los presentes inventores descubrieron sorprendentemente que los polipéptidos que comprenden una multiplicidad de dominios activos enzimáticos muestran una actividad lítica superior en comparación con los polipéptidos que comprenden un único dominio activo enzimático.
[0040] Además, una combinación de dominios enzimáticos distintos en polipéptidos distintos donde al menos uno de dichos polipéptidos distintos comprende una multiplicidad de dominios activos enzimáticos fue superior a una combinación donde todos los dichos polipéptidos distintos comprenden un único dominio activo enzimático distinto. Además, una combinación que abarca el segundo compuesto, donde un polipéptido primero, segundo, tercero y/o adicional comprenden una multiplicidad de un dominio activo enzimático primero, segundo, tercero y/o adicional, respectivamente, fue superior a una combinación que abarca el segundo compuesto, donde dichos polipéptidos primero, segundo, tercero y/o adicional comprenden una única copia de dichos dominios activos enzimáticos primero, segundo, tercero y/o adicional, respectivamente, y preferiblemente donde dicha multiplicidad, tal y como se define en la presente, es 2, es decir, un duplicado. En una forma de realización preferida, el efecto sinérgico de una combinación que abarca el segundo compuesto descrito, donde un polipéptido primero, segundo, tercero y/o adicional comprenden una multiplicidad de un dominio activo enzimático primero, segundo, tercero y/o adicional, respectivamente, fue superior a una combinación que abarca el segundo compuesto, donde dichos polipéptidos primero, segundo, tercero y adicional comprenden una única copia de dichos dominios activos enzimáticos primero, segundo, tercero y adicional, respectivamente, y preferiblemente donde dicha multiplicidad, tal y como se define en la presente a continuación, es 2, es decir, un duplicado.
[0041] Preferiblemente, un primer y/o segundo polipéptido de una combinación que abarca el segundo compuesto, comprende una multiplicidad diferente de un primer y/o segundo dominio activo enzimático descrito. La multiplicidad de dicho primer y segundo dominio se define, como previamente en la presente, como un número de copias, indicado preferiblemente por k, l, n y p, de dicho primer y segundo dominio indicado de la siguiente manera:
k indica el número de copias de dicho primer dominio activo enzimático en dicho primer polipéptido; l indica el número de copias de dicho segundo dominio activo enzimático en dicho primer polipéptido; n indica el número de copias de dicho primer dominio activo enzimático en dicho segundo polipéptido; p indica el número de copias de dicho segundo dominio activo enzimático en dicho segundo polipéptido;
y donde k y p son números enteros independientes de 1-10, 1-9, 1-8, 1-7, 1-6, 1-5, 1-4, 1-3, o preferiblemente 1-2, y l y n son números enteros independientes de 0-10, 0-9, 0-8, 0-7, 0-6, 0-5, 0-4, 0-3, o preferiblemente 0-2, y donde k es un número entero diferente de n y/o l es un número entero diferente de p, más preferiblemente k y p son 2 y l y n son 0.
[0042] Preferiblemente, un primer, segundo y tercer polipéptido que abarcan el segundo compuesto descrito comprenden una multiplicidad diferente de un primer, segundo y tercer dominio activo enzimático descrito.
[0043] La multiplicidad de dichos primer, segundo y tercer dominios se define, como previamente en la presente, como un número de copias, indicado preferiblemente por k, l, m, n, p, q, r, s y t, de dichos primer, segundo y tercer dominios indicado de la siguiente manera:
k indica el número de copias de dicho primer dominio activo enzimático en dicho primer polipéptido; l indica el número de copias de dicho segundo dominio activo enzimático en dicho primer polipéptido; m indica el número de copias de dicho tercer dominio activo enzimático en dicho primer polipéptido; n indica el número de copias de dicho primer dominio activo enzimático en dicho segundo polipéptido; p indica el número de copias de dicho segundo dominio activo enzimático en dicho segundo polipéptido; q indica el número de copias de dicho tercer dominio activo enzimático en dicho segundo polipéptido; r indica el número de copias de dicho primer dominio activo enzimático en dicho tercer polipéptido; s indica el número de copias de dicho segundo dominio activo enzimático en dicho tercer polipéptido; t indica el número de copias de dicho tercer dominio activo enzimático en dicho tercer polipéptido;
y donde k, p y t son números enteros independientes de 1-10, 1-9, 1-8, 1-7, 1-6, 1-5, 1-4, 1-3, o preferiblemente 1-2, y l, m, n, q, r y s son números enteros independientes de 0-10, 0-9, 0-8, 0-7, 0-6, 0-5, 0-4, 0-3, o preferiblemente 0-2, y donde k es un número entero diferente de n y/o r, y/o l es un número entero diferente de p y/o s, y/o t es un número entero diferente de m o q, más preferiblemente k, p y t son 2 y l, m, n, q, r y s son 0.
[0044] Preferiblemente, un polipéptido primero, segundo, tercero y adicional que abarcan el segundo compuesto descrito comprenden una multiplicidad diferente de un dominio activo enzimático primero, segundo, tercero y adicional descrito. La multiplicidad de dicho dominio activo enzimático adicional en vista de dichos primer, segundo y tercer dominios activos enzimáticos debe interpretarse en la presente de una manera análoga a como se ha definido en la presente anteriormente para un primer, segundo y tercer dominio activo enzimático.
[0045] Preferiblemente un polipéptido primero, segundo, tercero o adicional que abarcan el segundo compuesto descrito tiene una longitud de al menos 140, 150, 160, 170, 180, 190, 200, 210, 220, 230, 240, 250, 260, 270, 280, 290, 300, 310, 320 o 330 aminoácidos y/o una longitud de como máximo 850, 800, 750, 700, 650, 600, 550, 500, 490, 480, 470, 460, 450, 440, 430, 420, 410, 400, 390, 380 o 370 aminoácidos. Más preferiblemente, un primer, segundo o tercer polipéptido que abarcan el segundo compuesto descrito tiene una longitud de 140-850, 140-800, 140-750, 140-700, 140-650, 140-600, 140-550 140-500, 140-490, 140-480, 140-470, 140-460, 140-450, 140-440, 140-430, 140-420, 140-410, 140-400, 140-390, 140-380, 140-370, 150-850, 160-850, 170-850, 180-850, 190-850, 200-850, 210-850, 220-850, 230-850, 240-850, 250-850, 260-850, 270-850, 280-850, 290-850, 300-850, 310-850, 320-850 o 330-850 aminoácidos.
[0046] Preferiblemente un primer y segundo polipéptido que abarcan el segundo compuesto descrito tiene cada uno una longitud de al menos 140, 150, 160, 170, 180, 190, 200, 210, 220, 230, 240, 250, 260, 270, 280, 290, 300, 310, 320 o 330 aminoácidos y/o una longitud de como máximo 800, 850, 700, 650, 600, 550, 500, 490, 480, 470, 460, 450, 440, 430, 420, 410, 400, 390, 380 o 370 aminoácidos. Más preferiblemente, un primer y segundo polipéptido descrito tiene cada uno una longitud de 140-850, 140-800, 140-750, 140-700, 140-650, 140-600, 140 550 140-500, 140-490, 140-480, 140-470, 140-460, 140-450, 140-440, 140-430, 140-420, 140-410, 140-400, 140 390, 140-380, 140-370, 150-850, 160-850, 170-850, 180-850, 190-850, 200-850, 210-850, 220-850, 230-850, 240 850, 250-850, 260-850, 270-850, 280-850, 290-850, 300-850, 310-850, 320-850 o 330-850 aminoácidos.
[0047] Preferiblemente un primer, segundo y tercer polipéptido que abarcan el segundo compuesto descrito tiene cada uno una longitud de al menos 140, 150, 160, 170, 180, 190, 200, 210, 220, 230, 240, 250, 260, 270, 280, 290, 300, 310, 320 o 330 aminoácidos y/o una longitud de como máximo 800, 850, 700, 650, 600, 550, 500, 490, 480, 470, 460, 450, 440, 430, 420, 410, 400, 390, 380 o 370 aminoácidos. Más preferiblemente, un primer, segundo y tercer polipéptido que abarcan el segundo compuesto descrito tiene cada uno una longitud de 140-850, 140-800, 140-750, 140-700, 140-650, 140-600, 140-550 140-500, 140-490, 140-480, 140-470, 140-460, 140-450, 140-440, 140-430, 140-420, 140-410, 140-400, 140-390, 140-380, 140-370, 150-850, 160-850, 170-850, 180-850, 190-850, 200-850, 210-850, 220-850, 230-850, 240-850, 250-850, 260-850, 270-850, 280-850, 290-850, 300-850, 310-850, 320-850 o 330-850 aminoácidos.
[0048] Preferiblemente un polipéptido primero, segundo, tercero y adicional que abarcan el segundo compuesto descrito tiene cada uno una longitud de al menos 140, 150, 160, 170, 180, 190, 200, 210, 220, 230, 240, 250, 260, 270, 280, 290, 300, 310, 320 o 330 aminoácidos y/o una longitud de como máximo 800, 850, 700, 650, 600, 550, 500, 490, 480, 470, 460, 450, 440, 430, 420, 410, 400, 390, 380 o 370 aminoácidos. Más preferiblemente, un polipéptido primero, segundo, tercero y adicional que abarcan el segundo compuesto descrito tiene cada uno una longitud de 140-850, 140-800, 140-750, 140-700, 140-650, 140-600, 140-550 140-500, 140-490, 140-480, 140 470, 140-460, 140-450, 140-440, 140-430, 140-420, 140-410, 140-400, 140-390, 140-380, 140-370, 150-850, 160 850, 170-850, 180-850, 190-850, 200-850, 210-850, 220-850, 230-850, 240-850, 250-850, 260-850, 270-850, 280 850, 290-850, 300-850, 310-850, 320-850 o 330-850 aminoácidos.
[0049] Una forma de realización proporciona una combinación de una fuente de un primer y un segundo dominio activo enzimático que abarcan el segundo compuesto descrito, donde dichos dominios activos enzimáticos primero y segundo están comprendidos en distintos polipéptidos primero y segundo descritos, donde dicho primer polipéptido está libre de dicho segundo dominio activo enzimático y dicho segundo polipéptido está libre de dicho primer dominio activo enzimático. Además, se proporciona una combinación descrita, donde l y n son 0.
[0050] Otra forma de realización proporciona una combinación de una fuente de un primer, segundo y tercer dominio activo enzimático que abarcan el segundo compuesto descrito, donde dichos primer, segundo y tercer dominios activos enzimáticos están comprendidos en polipéptidos primero, segundo y tercero distintos, donde dicho primer polipéptido está libre de dicho segundo y tercer dominio activo enzimático, dicho segundo polipéptido está libre de dicho primer y tercer dominio activo enzimático, y dicho tercer polipéptido está libre de dicho primer y segundo dominio activo enzimático. Además, se proporciona una combinación descrita, donde l, m, n, q, r y s son 0. También se describe una combinación que abarca el segundo compuesto según la presente invención, donde 1, m, n, q, r y s son 0 y k, p y t son 2.
[0051] Otra forma de realización proporciona una combinación de una fuente de un dominio activo enzimático primero, segundo, tercero y adicional que abarcan el segundo compuesto descrito, donde dichos dominios activos enzimáticos primero, segundo, tercero y adicional están comprendidos en un polipéptido primero, segundo, tercero y adicional distintos, respectivamente, donde
preferiblemente dicho primer polipéptido está libre de dichos dominios activos enzimáticos segundo, tercero y adicional;
preferiblemente dicho segundo polipéptido está libre de dichos dominios activos enzimáticos primero, tercero y adicional;
preferiblemente dicho tercer polipéptido está libre de dichos dominios activos enzimáticos primero, segundo y adicional; y,
preferiblemente dicho polipéptido adicional está libre de dichos dominios activos enzimáticos primero, segundo y tercero.
[0052] Preferiblemente dichos dominios activos enzimáticos primero, segundo, tercero y adicional están comprendidos dentro de dicho polipéptido primero, segundo, tercero y adicional, respectivamente, por duplicado, es decir, donde la multiplicidad como se identifica en la presente es 2. También se abarca una combinación que abarca el segundo compuesto descrito, donde un primer, segundo y/o tercer polipéptido descrito no están libres de un primer, segundo y/o tercer dominio activo enzimático descrito, pero dicho primer, segundo y/o tercer polipéptido difieren en la multiplicidad de dicho primer, segundo y/o tercer dominio activo enzimático. Además, se abarca una combinación que abarca el segundo compuesto descrito, donde al menos uno de entre k, l, m, n, p, q, r, s o t es 2 y donde cualquiera de los otros k, l, m, n, p, q, r, s y/o t es 1 o 0.
[0053] Se prefiere una combinación que abarca el segundo compuesto descrito, donde un polipéptido primero, segundo, tercero y/o adicional es un polipéptido que tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con un polipéptido seleccionado del grupo que consiste en la SEQ ID NO: 26, 28, 30, 32, 34, 36, 38, 40, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 60, 62, 64, 66, 68, 70, 72, 76, 78, 80, 82, 84, 86, 88, 90, 92, 94, 98 o 100.
[0054] En el contexto de la divulgación, se prevén varias combinaciones preferidas, no limitativas, que abarcan el segundo compuesto descrito, que se enumeran aquí a continuación.
[0055] Se prefiere una combinación de una fuente de un primer dominio activo enzimático y un segundo dominio activo enzimático, donde dichos dominios activos enzimáticos primero y segundo están comprendidos en distintos polipéptidos primero y segundo, y donde dicho primer dominio activo enzimático es un dominio de amidohidrolasa/peptidasa dependiente de cisteína e histidina y dicho segundo dominio activo enzimático es un dominio de endopeptidasa o donde dicho primer dominio activo enzimático es un dominio de amidohidrolasa/peptidasa dependiente de cisteína e histidina y dicho segundo dominio activo enzimático es un dominio de amidasa o donde dicho primer dominio activo enzimático es un dominio de endopeptidasa y dicho segundo dominio activo enzimático es un dominio de amidasa, donde dichos distintos primero y segundo comprende cada uno además un dominio de unión a la pared celular, y donde cada uno de dichos polipéptidos distintos primero y segundo comprende una multiplicidad de dicho primer o segundo dominio activo enzimático, preferiblemente dicha multiplicidad es 2, es decir, un duplicado.
[0056] También se prefiere una combinación de una fuente de un primer y segundo dominio activo enzimático, donde dichos dominios activos enzimáticos primero y segundo están comprendidos en distintos polipéptidos primero y segundo, y donde dicho primer dominio enzimático es un dominio de amidohidrolasa/peptidasa dependiente de histidina y dicho segundo dominio activo enzimático es un dominio de endopeptidasa o dicho primer dominio activo enzimático es un dominio de amidohidrolasa/peptidasa dependiente de cisteína e histidina y dicho segundo dominio activo enzimático es un dominio de amidasa o dicho primer dominio activo enzimático es un dominio de endopeptidasa y dicho segundo dominio activo enzimático es un dominio de amidasa, y donde dicho primer y segundo polipéptido además comprende cada uno un dominio de unión a la pared celular.
[0057] También se prefiere una combinación de una fuente de un primer dominio activo enzimático y un segundo dominio activo enzimático, donde dichos dominios activos enzimáticos primero y segundo están comprendidos en distintos polipéptidos primero y segundo, y donde dicho primer dominio activo enzimático es un dominio de amidohidrolasa/peptidasa dependiente de cisteína e histidina y dicho segundo dominio activo enzimático es un dominio de endopeptidasa, y donde dicha combinación comprende además una fuente de un tercer dominio activo enzimático comprendido en un tercer polipéptido distinto, donde dicho tercer dominio activo enzimático es un dominio de amidasa y dichos polipéptidos primero, segundo y tercero distintos comprenden cada uno además un dominio de unión a la pared celular, y donde cada uno de dichos polipéptidos primero, segundo y tercero distintos comprende una multiplicidad de dicho primer, segundo o tercer dominio activo enzimático, preferiblemente dicha multiplicidad es 2, es decir, un duplicado.
[0058] También se prefiere una combinación de una fuente de un primer, segundo y tercer dominio activo enzimático, donde dichos dominios activos enzimáticos primero, segundo y tercero están comprendidos en distintos polipéptidos primero, segundo y tercero, y donde dicho primer dominio enzimático es un dominio de amidohidrolasa/peptidasa dependiente de histidina, dicho segundo dominio activo enzimático es un dominio de endopeptidasa y dicho tercer dominio activo enzimático es un dominio de amidasa, y donde dichos polipéptidos primero, segundo y tercero además comprenden cada uno un dominio de unión a la pared celular.
[0059] También se prefiere una combinación donde un primer dominio activo enzimático descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 10 y un segundo dominio activo enzimático descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 16.
[0060] También se prefiere una combinación donde un primer dominio activo enzimático descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 10 y un segundo dominio activo enzimático descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 18.
[0061] También se prefiere una combinación donde un primer activo enzimático descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 16 y un segundo dominio activo enzimático descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 18.
[0062] También se prefiere una combinación donde un primer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 34 y un segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 46.
[0063] También se prefiere una combinación donde un primer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 34 y un segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 28.
[0064] También se prefiere una combinación donde un primer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 46 y un segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 28.
[0065] También se prefiere una combinación donde un primer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 58 y un segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 70.
[0066] También se prefiere una combinación donde un primer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 58 y un segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 52.
[0067] Más preferida es una combinación donde un primer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 70 y un segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 52.
[0068] También se prefiere una combinación donde un primer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 58 y un segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 46.
[0069] También se prefiere una combinación donde un primer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 58 y un segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 28.
[0070] También se prefiere una combinación donde un primer polipéptido según la presente invención tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 70 y un segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 34.
[0071] Más preferida es una combinación donde un primer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 70 y un segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 28.
[0072] También se prefiere una combinación donde un primer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 52 y un segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 34.
[0073] También se prefiere una combinación donde un primer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 52 y un segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 46.
[0074] También se prefiere una combinación donde un primer dominio activo enzimático descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 10, un segundo dominio activo enzimático descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 16 y un tercer dominio activo enzimático descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 18.
[0075] También se prefiere una combinación donde un primer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 34, un segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 46 y un tercer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 28.
[0076] También se prefiere una combinación donde un primer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 32, un segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 44 y un tercer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 26.
[0077] También se prefiere una combinación donde un primer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 34, un segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 46 y un tercer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 26.
[0078] También se prefiere una combinación donde un primer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 36, un segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 48 y un tercer polipéptido según la presente invención tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 30.
[0079] También se prefiere una combinación donde un primer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 32, un segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 46 y un tercer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 26.
[0080] También se prefiere una combinación donde un primer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 34, un segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 44 y un tercer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 26.
[0081] También se prefiere una combinación donde un primer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 32, un segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 44 y un tercer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 28.
[0082] También se prefiere una combinación donde un primer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 32, un segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 46 y un tercer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 28.
[0083] También se prefiere una combinación donde un primer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 34, un segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 44 y un tercer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 28.
[0084] También se prefiere una combinación donde un primer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 58, un segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 70 y un tercer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 52.
[0085] También se prefiere una combinación donde un primer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 58, un segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 70 y un tercer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 50.
[0086] También se prefiere una combinación donde un primer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 56, un segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 68 y un tercer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 50.
[0087] También se prefiere una combinación donde un primer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 60, un segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 72 y un descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 54.
[0088] También se prefiere una combinación donde un primer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 56, un segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 70 y un tercer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 50.
[0089] También se prefiere una combinación donde un primer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 58, un segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 68 y un tercer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 50.
[0090] También se prefiere una combinación donde un primer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 56, un segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 68 y un tercer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 52.
[0091] También se prefiere una combinación donde un primer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 65, un segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 70 y un tercer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 52.
[0092] También se prefiere una combinación donde un primer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 58, un segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 68 y un tercer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 52.
[0093] También se prefiere una combinación donde un primer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 58, un segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 70 y un tercer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 28.
[0094] También se prefiere una combinación donde un primer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 34, un segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 70 y un tercer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 52.
[0095] También se prefiere una combinación donde un primer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 58, un
segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 46 y un tercer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 52.
[0096] También se prefiere una combinación donde un primer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 34, un segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 46 y un tercer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 52.
[0097] También se prefiere una combinación donde un primer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 58, un segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 46 y un tercer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 28.
[0098] También se prefiere una combinación donde un primer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 34, un segundo polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81,82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91,92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 70 y un tercer polipéptido descrito tiene al menos un 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99 o 100 % de identidad con la SEQ ID NO: 28.
[0099] Debe entenderse que una combinación como se describe en este caso que abarca el segundo compuesto descrito incluye mezclas de una fuente de un primer, una fuente de un segundo y opcionalmente una fuente de un tercer dominio activo enzimático y/o uno adicional acorde en proporciones variables. Preferiblemente, tal combinación comprende una fuente de un primer y una fuente de un segundo dominio activo enzimático descrito, donde dichos primer y segundo dominio activo enzimático están presentes en cantidades equimolares. También se prefiere una combinación que comprende una fuente de un primer, una fuente de un segundo y una fuente de un tercer dominio activo enzimático descrito, donde dichos primer, segundo y tercer dominios activos enzimáticos están presentes en cantidades equimolares. También se prefiere una combinación que comprende una fuente de un primer, una fuente de un segundo, una fuente de un tercer y una fuente de un dominio activo enzimático adicional descrito, donde dichos dominios activos enzimáticos primero, segundo, tercero y adicional están presentes en cantidades equimolares.
[0100] En un segundo aspecto, se describe un kit de partes que comprende:
a) un primer frasco con una primera composición que comprende un primer compuesto tal y como se define en el primer aspecto; y,
b) un segundo frasco con una segunda composición que comprende un segundo compuesto tal y como se define en el primer aspecto; y opcionalmente,
c) instrucciones de uso, que comprenden preferiblemente un régimen de dosificación.
Preferiblemente, dicho kit de partes, más específicamente dicha primera y segunda composición de dicho kit de partes, es para el uso como un medicamento, preferiblemente para usar en el tratamiento del eccema, más preferiblemente para usar en el tratamiento de la dermatitis atópica, como se detalla adicionalmente en la presente. Un régimen de dosificación debe entenderse en la presente como una instrucción para la administración a un individuo que la necesita, preferiblemente una instrucción que indica una vía de administración, frecuencia de administración y dosificación de administración, y opcionalmente una instrucción para la mezcla de dichos compuestos primero y segundo justo antes de la administración, según sea necesario para el tratamiento, preferiblemente necesario para el tratamiento del eccema, más preferiblemente para el tratamiento de la dermatitis atópica. Vías, frecuencias y dosificaciones de administración preferidas se detallan adicionalmente en la presente. En una forma de realización, dicha primera composición según un segundo aspecto y/o dicha segunda composición según un segundo aspecto se administra por separado, preferiblemente como parte de un régimen de tratamiento general. En una forma de realización alternativa, dicha primera composición según un segundo aspecto y dicha segunda composición según un segundo aspecto se almacenan por separado, y se mezclan justo antes de la administración. Preferiblemente, "justo antes de" debe entenderse en la presente como menos de 120, 60, 30, 15, 5, 4, 3, 2 o 1 minutos antes de la administración, preferiblemente menos de 5 minutos antes de la administración.
[0101] Dicho primer y dicho segundo frasco puede ser cualquier frasco, botella, tubo, ampolla, contenedor, matraz o similar, adecuado para el almacenamiento de dicha primera y segunda composición tal y como se define en la presente, respectivamente. Preferiblemente dicho primer y/o segundo frasco tiene un volumen de entre 0,1 y 500 ml, preferiblemente entre 1 y 100 ml, más preferiblemente de aproximadamente 5, 10, 50 o 100 ml.
[0102] En un tercer aspecto, se describe un método de tratamiento que comprende la administración de una composición según el primer aspecto y/o la administración secuencial o simultánea de un primer y un segundo compuesto de un kit de partes según el segundo aspecto.
[0103] Preferiblemente, dicho método de tratamiento es un método para prevenir, retrasar y/o curar una enfermedad infecciosa, tal como, pero no limitada a, una infección cutánea, mastitis, neumonía, meningitis, endocarditis, síndrome del shock tóxico (SST), sepsis, septicemia, bacteriemia u osteomielitis. Preferiblemente, dicha infección cutánea se selecciona del grupo de acné, rosácea, granos, impétigo, diviesos, forúnculos, celulitis, foliculitis, psoriasis, carbuncos, síndrome de la piel escaldada y abscesos. Preferiblemente, dicho método de tratamiento es un método para prevenir, retrasar y/o curar el eccema tal como la dermatitis atópica, el eccema de contacto alérgico, el eccema de contacto, el eccema dishidrótico, la neurodermatitis, el eccema numular, el eccema seborreico, la dermatitis por estasis, preferiblemente la dermatitis atópica. Preferiblemente, dicho método de tratamiento es el tratamiento local de una infección cutánea y/o eccema como se identifica en la presente, más preferiblemente dermatitis atópica.
[0104] Se abarca una composición según el primer aspecto y/o un kit de partes según el segundo aspecto, para el uso como un medicamento. Preferiblemente, dicha composición según el primer aspecto y/o dicho kit de partes según el segundo aspecto es para prevenir, retrasar y/o curar una enfermedad infecciosa, tal como, pero no limitada a, una infección cutánea, mastitis, neumonía, meningitis, endocarditis, síndrome del shock tóxico (SST), sepsis, septicemia, bacteriemia u osteomielitis. Preferiblemente, dicha infección cutánea se selecciona del grupo de acné, rosácea, granos, impétigo, diviesos, forúnculos, celulitis, foliculitis, psoriasis, carbuncos, síndrome de la piel escaldada y abscesos. Preferiblemente, dicha composición según el primer aspecto y/o dicho kit de partes según el segundo aspecto es para usar en la prevención, el retraso y/o la curación del eccema tal como la dermatitis atópica, el eccema de contacto alérgico, el eccema de contacto, el eccema dishidrótico, la neurodermatitis, el eccema numular, el eccema seborreico, la dermatitis por estasis, preferiblemente la dermatitis atópica.
[0105] También se abarca el uso de una composición según el primer aspecto y/o un kit de partes según el segundo aspecto para la producción de un medicamento. Preferiblemente, dicho medicamento es para prevenir, retrasar y/o curar una enfermedad infecciosa, tal como, pero no limitada a, una infección cutánea, mastitis, neumonía, meningitis, endocarditis, síndrome del shock tóxico (SST), sepsis, septicemia, bacteriemia u osteomielitis. Preferiblemente, dicha infección cutánea se selecciona del grupo de acné, rosácea, granos, impétigo, diviesos, forúnculos, celulitis, foliculitis, psoriasis, carbuncos, síndrome de la piel escaldada y abscesos. Preferiblemente, dicho medicamento es un medicamento para prevenir, retrasar y/o curar el eccema tal como la dermatitis atópica, el eccema de contacto alérgico, el eccema de contacto, el eccema dishidrótico, la neurodermatitis, el eccema numular, el eccema seborreico, la dermatitis por estasis, preferiblemente la dermatitis atópica.
[0106] Preferiblemente, dicha composición según el primer aspecto, una primera composición de un kit de partes según el segundo aspecto y/o una segunda composición de un kit de partes según el segundo aspecto y/o medicamento tal y como se define en la presente es una formulación tópica entendida en la presente como una formulación, incluyendo una formulación microencapsulada, que sea adecuada para la administración tópica y puede estar en forma de una crema, pomada, solución, polvo, espray, aerosol, cápsula, sólido o gel, y/o puede estar unida a una superficie sólida, por ejemplo por inmovilización con ligandos de afinidad o a través de interacciones iónicas/hidrofóbicas e inmovilización covalente.
[0107] Una composición según el primer aspecto y/o una primera y/o segunda composición de un kit de partes según el segundo aspecto también puede formar parte de un gel de ducha, jabón, barra de aplicación o cosmético.
[0108] Una composición según el primer aspecto y/o una segunda composición de un kit de partes según el segundo aspecto y/o una mezcla resultante de mezclar dicha primera y segunda composición de un kit de partes según el segundo aspecto justo antes de la administración como se ha indicado anteriormente en la presente, se dice preferiblemente que es activa, funcional o terapéuticamente activa cuando reduce la cantidad de células bacterianas, preferiblemente células bacterianas gram positivas, más preferiblemente la cantidad de células bacterianas de Staphylococcus, más preferiblemente la cantidad de células bacterianas de Staphylococcus aureus, presentes en un paciente o en una célula de dicho paciente o en una línea celular o en un sistema in vitro sin células y preferiblemente significa que un 99 %, 90 %, 80 %, 70 %, 60 %, 50 %, 40 %, 30 %, 20 %, 10 %, 5 % o menos de la cantidad inicial de dichas células bacterianas sigue siendo detectable. Más preferiblemente, ninguna célula bacteriana, preferiblemente ninguna célula bacteriana gram positiva, más preferiblemente ninguna célula bacteriana de Staphylococcus, más preferiblemente ninguna célula bacteriana de Staphylococcus aureus, es detectable. En este párrafo, la expresión "cantidad de células bacterianas" significa preferiblemente células bacterianas viables. Se pueden detectar estafilococos de todos los géneros usando técnicas estándar conocidas por la persona especialista tales como técnicas inmunohistoquímicas que usan anticuerpos específicos de Staphylococcus, pruebas de coagulasa en tubo que detectan la estafilocoagulasa o "coagulasa libre", detección de proteínas de superficie como el factor de aglutinación (prueba de la coagulasa en portaobjetos) y/o la proteína A (pruebas de látex comerciales). Se pueden detectar estafilococos viables usando técnicas estándar conocidas
por la persona especialista tales como técnicas microbiológicas de cultivo bacteriano y/o reacción en cadena de la polimerasa de transcripción inversa cuantitativa en tiempo real para analizar para el ARNm bacteriano. Una reducción en la cantidad de células bacterianas se evalúa preferiblemente en un tejido o en una célula de un individuo o un paciente por comparación con la cantidad presente en dicho individuo o paciente antes del tratamiento con dicha composición o polipéptido descritos. Alternativamente, la comparación se puede hacer con un tejido o una célula de dicho individuo o paciente que no ha sido aún tratado con dicha composición o polipéptido en el caso de que el tratamiento sea local.
[0109] Preferiblemente una composición según el primer aspecto y/o una segunda composición de un kit de partes del segundo aspecto, y/o una mezcla resultante de mezclar la primera y la segunda composición del kit de parte del segundo aspecto de la invención justo antes de la administración como se ha identificado en la presente antes comprende una cantidad de un segundo compuesto tal y como se define en la presente que se activa terapéuticamente como se ha identificado anteriormente en la presente. Preferiblemente, dicha composición es para la administración tópica a un individuo que la necesita, preferiblemente a un paciente que sufre de eccema, y comprende dicho segundo compuesto en una cantidad eficaz, preferiblemente una concentración del 0,001-10 % en peso de la composición total. Dependiendo de la actividad específica del segundo compuesto, la cantidad eficaz puede ser tan baja como aproximadamente unos pocos microgramos/ml, tal como aproximadamente 1,2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 microgramos/ml a aproximadamente varios miligramos/ml, tal como aproximadamente 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9,10 miligramos/ml.
[0110] Preferiblemente una composición según el primer aspecto y/o una primera composición de un kit de partes del segundo aspecto, y/o una mezcla resultante que resulta de mezclar la primera y la segunda composición del kit de parte del segundo aspecto justo antes de la administración como se ha identificado en la presente antes es una composición para la aplicación tópica para el tratamiento del eccema que comprende un compuesto antiinflamatorio, seleccionado de, pero no limitado a, un corticosteroide, un inhibidor de calcineurina, un compuesto inmunoterapéutico, un IFN-gamma humano recombinante, un probiótico microbiano, un modulador de citocinas, un bloqueador del reclutamiento de células inflamatorias, un inhibidor de la activación de células T, o una combinación de estos. Preferiblemente, dicha composición es para la administración tópica a un individuo que la necesita, preferiblemente a un paciente que sufre de eccema, y comprende dicho compuesto antiinflamatorio en una cantidad eficaz, preferiblemente en el rango del 0,01 al 10 % en peso de la composición total, preferiblemente en el rango del 0,05 al 5 %, más preferiblemente en un rango del 0,05 al 2,5 %, aún más preferiblemente en un rango del 0,1 al 1 %.
[0111] Preferiblemente una composición según el primer aspecto y/o una primera composición de un kit de partes del segundo aspecto, y/o una mezcla resultante que resulta de mezclar la primera y la segunda composición del kit de parte del segundo aspecto justo antes de la administración como se ha identificado en la presente antes es una composición para la aplicación tópica para el tratamiento del eccema que comprende un corticosteroide en el rango del 0,05 al 5 % en peso de la composición total, preferiblemente en un rango del 0,05 al 2,5 %, más preferiblemente en un rango del 0,1 al 1 %, aún más preferiblemente que comprende aproximadamente un 0,05 % de propionato de clobetasol, aproximadamente un 0,05 % de propionato de halobetasol, aproximadamente un 0,1 % de fluocinonida, aproximadamente un 0,05 % de diacetato de diflorasona, aproximadamente un 0,1 % de furoato de mometasona, aproximadamente un 0,1 % de halcinonida, aproximadamente un 0,25 % de desoximetasona, aproximadamente un 0,05 % de fluocinonida, aproximadamente un 0,05 % de desoximetasona, aproximadamente un 0,1 % de pivalato de clocortolona, aproximadamente un 0,1 % de furoato de mometasona, aproximadamente un 0,1 % de acetónido de triamcinolona, aproximadamente un 0,1 % de valerato de betametasona, aproximadamente un 0,025 % de acetónido de fluocinolona, aproximadamente un 0,05 % de propionato de fluticasona, aproximadamente un 0,1 % de prednicarbato, aproximadamente un 0,1 % de probutato de hidrocortisona, aproximadamente un 0,1 % de acetónido de triamcinolona, aproximadamente un 0,05 % de dipropionato de alclometasona, aproximadamente un 0,05 % de desonida, aproximadamente un 0,025 % de acetónido de triamcinolona, aproximadamente un 0,1 % de butirato de hidrocortisona, aproximadamente un 0,01 % de acetónido de fluocinolona, aproximadamente un 1 % de acetato de hidrocortisona, aproximadamente un 2 % de hidrocortisona, aproximadamente un 2,5 % de hidrocortisona y/o un 0,5-1 % de hidrocortisona. Aproximadamente se define en la presente como un valor menos o más el 10 % del valor indicado.
[0112] Una composición según el primer aspecto, una primera composición de un kit de partes según el segundo aspecto y/o una segunda composición de un kit de partes según el segundo aspecto y/o un medicamento tal y como se define en la presente puede estar en forma líquida, sólida o semilíquida o semisólida, preferiblemente comprende además un portador, excipiente y/o estabilizador farmacéutico aceptable. Ejemplos de portadores, excipientes y estabilizadores farmacéuticamente aceptables incluyen, pero de forma no limitativa, tampones tales como fosfato, citrato y otros ácidos orgánicos; antioxidantes, incluyendo el ácido ascórbico; polipéptidos de bajo peso molecular; proteínas, tales como albúmina de suero y gelatina; polímeros hidrófilos tal como la polivinilpirrolidona; aminoácidos tales como glicina, glutamina, asparagina, arginina o lisina; monosacáridos, disacáridos y otros carbohidratos incluyendo la glucosa, la manosa o dextrinas; agentes quelantes tales como el EDTA; polialcoholes tales como el manitol o el sorbitol; contraiones formadores de sales tales como el sodio; y/o
tensioactivos no iónicos tales como el polisorbato (TWEEN™), el polietilenglicol (PEG) y poloxámeros (PLURONICS™); y espesantes poliméricos tales como agentes gelificantes hidrófilos e hidroalcohólicos usados con frecuencia en las industrias cosmética y farmacéutica, preferiblemente un agente gelificante comprende entre aproximadamente el 0,2 % y aproximadamente el 4% en peso de la composición. Una composición según el primer aspecto, una primera composición de un kit de partes según el segundo aspecto y/o una segunda composición de un kit de partes según el segundo aspecto y/o un medicamento tal y como se define en la presente pueden incluir también un lubricante, un agente humectante, un edulcorante, un agente aromatizante, un emulsionante, un agente de suspensión, un protector solar tal como, pero no limitado a, dióxido de titanio o cinamato de metilo, y/o un conservante, además de los ingredientes anteriores, preferiblemente un conservante está presente a aproximadamente de un 0,05 % a un 0,5 % en peso de la composición total. Una composición según el primer aspecto, una primera composición de un kit de partes según el segundo aspecto y/o una segunda composición de un kit de partes según el segundo aspecto y/o un medicamento tal y como se define en la presente pueden incluir también un portador, que se conocen en la técnica (tal como un carbohidrato y un polialcohol), para ayudar en la exposición de la piel a un medicamento.
[0113] Preferiblemente, una composición según el primer aspecto, una primera composición de un kit de partes según el segundo aspecto y/o una segunda composición de un kit de partes según el segundo aspecto y/o un medicamento tal y como se define en la presente comprende además una sustancia activa adicional. Una sustancia activa adicional puede ser cualquiera de entre, pero no se limita a, un agente antiinflamatorio; un agente antibiótico estándar o convencional tal como, pero no limitado a, penicilina, penicilinas sintéticas, bacitracina, meticilina, cefalosporina, polimixina, cefaclor, Cefadroxil, nafato de cefamandol, cefazolina, cefixima, cefmetazol, cefonicid, cefoperazona, ceforanida, cefotanme, cefotaxima, cefotetán, cefoxitina, cefpodoxima proxetilo, ceftazidima, ceftizoxima, ceftriaxona, cefriaxona moxalactamo, cefuroxima, cefalexina, cefalosporina C, sal sódica de cefalosporina C, cefalotina, sal sódica de cefalotina, cefapirina, cefradina, cefuroxima axetilo, dihidratocefalotina, moxalactamo, mafato de loracarbef y/o agentes quelantes; un antifúngico, tal como, pero no limitado a, nitrato de oxiconazol, ciclopirox olamina, cetoconazol, nitrato de miconazol y nitrato de butoconazol; un antiandrógeno, tal como, pero no limitado a, flutamida y/o finasterida; un agente anestésico local, tal como, pero no limitado a, tetracaína, clorhidrato de tetracaína, lidocaína, clorhidrato de lidocaína, diclonina, clorhidrato de diclonina, clorhidrato de dimetisoquina, dibucaína, clorhidrato de dibucaína, picrato de butambeno y/o clorhidrato de pramoxina; y dapsona, que tiene tanto propiedades antimicrobianas como antiinflamatorias. Los porcentajes en peso preferidos de los agentes antimicrobianos son del 0,1 % al 10 % en peso de la composición total. Los porcentajes en peso preferidos para los anestésicos locales son del 0,025 % al 5 % en peso de la composición total.
[0114] Una composición según el primer aspecto, una primera composición según un segundo aspecto y/o una segunda composición según un segundo aspecto y/o medicamento tal y como se define en la presente se puede usar para tratar animales, incluidos los seres humanos, que sufran de cualquiera de las enfermedades infecciosas y/o eccema como se ha identificado en la presente anteriormente, preferiblemente de dermatitis atópica.
[0115] Una vía preferida de administración de dicha composición y/o dicho medicamento es cualquier vía adecuada de administración que se pueda usar para administrar dicha composición según el primer aspecto, dicha primera composición según un segundo aspecto y/o dicha segunda composición según un segundo aspecto y/o medicamento tal y como se define en la presente, incluyendo pero de forma no limitativa: oral, aerosol u otro dispositivo para administrar a los pulmones, espray nasal, intravenosa, intramuscular, intraperitoneal, intratecal, vaginal, rectal, tópica, punción lumbar, intratecal y aplicación directa al cerebro y/o las meninges. Preferiblemente, dicha composición según el primer aspecto, dicha primera composición según un segundo aspecto y/o dicha segunda composición según un segundo aspecto y/o medicamento tal y como se define en la presente se administran por vía tópica, preferiblemente en el lado de la infección y/o lesión y/o, en el caso de un eccema, preferiblemente en el lado de la erupción cutánea.
[0116] Una frecuencia de administración preferida de dicha composición y/o dicho medicamento es una o dos veces al día, preferiblemente en el área de la piel afectada por la enfermedad o el lado de la lesión conocido en la técnica como el lado de la erupción. Preferiblemente dicho tratamiento se continúa tanto tiempo como sea necesario para que desaparezca la erupción. Preferiblemente dicho tratamiento se continúa durante 2 a 3 días, durante 7 a 10 días y/o durante 2 a 3 semanas. Preferiblemente una cantidad total de composición para la aplicación tópica se administra como se ha identificado en la presente, dando como resultado una aplicación total de aproximadamente 1 gramo de corticosteroide a la persona que lo necesite.
[0117] Una dosis de administración preferida de dicha composición y/o dicho medicamento es una dosis con una cantidad total eficaz de dichos compuestos primero y segundo que da como resultado la prevención, el retraso y/o la curación de una enfermedad infecciosa y/o eccema como se ha identificado anteriormente en la presente, preferiblemente eccema, más preferiblemente dermatitis atópica.
Definiciones
[0118] "Identidad de secuencia" o "identidad" en el contexto de una secuencia de aminoácidos o de ácido nucleico se define en la presente como una relación entre dos o más secuencias de aminoácidos (péptido, polipéptido o proteína) o dos o más secuencias de ácido nucleico (nucleótido, polinucleótido), determinada comparando las secuencias. En la técnica, "identidad" significa también el grado de relación de las secuencias entre secuencias de aminoácidos o nucleótidos, según el caso, determinado por la coincidencia entre las cadenas de tales secuencias. En la presente, identidad de secuencia con una secuencia particular significa preferiblemente identidad de secuencia a lo largo de toda la longitud de dicha secuencia de polipéptido o polinucleótido particular. La información de secuencia como se proporciona en la presente no debería interpretarse tan limitadamente como para requerir la inclusión de bases erróneamente identificadas. La persona experta es capaz de identificar tales bases erróneamente identificadas y sabe cómo corregir tales errores. La "similitud" entre dos secuencias de aminoácidos se determina comparando la secuencia de aminoácidos y sus sustitutos de aminoácidos conservados de un péptido o polipéptido con la secuencia de un segundo péptido o polipéptido. En una forma de realización preferida, la identidad o la similitud se calcula a lo largo de toda la SEQ ID NO como se identifica en la presente. La "identidad" y la "similitud" se pueden calcular fácilmente por métodos conocidos, incluidos pero no limitados a aquellos descritos en Computational Molecular Biology, Lesk, A. M., ed., Oxford University Press, New York, 1988; Biocomputing: Informatics and Genome Projects, Smith, D. W., ed., Academic Press, New York, 1993; Computer Analysis of Sequence Data, Part I, Griffin, A. M., y Griffin, H. G., eds., Humana Press, New Jersey, 1994; Sequence Analysis in Molecular Biology, von Heine, G., Academic Press, 1987; y Sequence Analysis Primer, Gribskov, M. y Devereux, J., eds., M Stockton Press, New York, 1991; y Carillo, H., and Lipman, D., SIAM J. Applied Math., 48:1073 (1988).
[0119] Los métodos preferidos para determinar la identidad están diseñados para dar la coincidencia más grande entre las secuencias evaluadas. Los métodos para determinar la identidad y la similitud están codificados en programas informáticos públicamente disponibles. Los métodos de programas informáticos preferidos para determinar la identidad y la similitud entre dos secuencias incluyen, por ejemplo, el paquete del programa GCG (Devereux, J., et al., Nucleic Acids Research 12 (1): 387 (1984)), BestFit, BlAs t P, BlAs t N y FASTA (Altschul, S. F. et al., J. Mol. Biol. 215:403-410 (1990). El programa BLAST X está disponible públicamente de Nc Bi y otras fuentes (BLAST Manual, Altschul, S., et al., NCBI NLM NIH Bethesda, MD 20894; Altschul, S., et al., J. Mol. Biol.
215:403-410 (1990). El bien conocido algoritmo de Smith Waterman también se puede usar para determinar la identidad.
[0120] Los parámetros preferidos para la comparación de secuencias de polipéptidos incluyen los siguientes: Algoritmo: Needleman y Wunsch, J. Mol. Biol. 48:443-453 (1970); matriz de comparación: BLOSSUM62 de Hentikoff y Hentikoff, Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 89:10915-10919 (1992); penalización por espacio: 12; y penalización por longitud del espacio: 4. Un programa útil con estos parámetros está disponible públicamente como el programa "Ogap" del Genetics Computer Group, ubicado en Madison, WI. Los parámetros anteriormente mencionados son los parámetros por defecto para comparaciones de aminoácidos (junto con la no penalización de los espacios finales).
[0121] Los parámetros preferidos para la comparación de ácidos nucleicos incluyen los siguientes: Algoritmo: Needleman y Wunsch, J. Mol. Biol.48:443-453 (1970); matriz de comparación: coincidencias = 10; discrepancias = 0; penalización por espacio: 50; penalización por longitud del espacio: 3. Disponible como el programa Gap del Genetics Computer Group, ubicado en Madison, Wisconsin. Arriba se dan los parámetros por defecto para las comparaciones de ácidos nucleicos.
[0122] Opcionalmente, al determinar el grado de similitud de los aminoácidos, la persona experta también puede tener en cuenta las sustituciones de aminoácidos denominadas "conservadoras", como estará claro para la persona experta. Las sustituciones de aminoácidos conservadoras se refieren a la intercambiabilidad de residuos que tienen cadenas laterales similares. Por ejemplo, un grupo de aminoácidos que tienen cadenas laterales alifáticas es glicina, alanina, valina, leucina e isoleucina; un grupo de aminoácidos que tienen cadenas laterales hidroxilo-alifáticas es serina y treonina; un grupo de aminoácidos que tienen cadenas laterales que contienen amida es asparagina y glutamina; un grupo de aminoácidos que tienen cadenas laterales aromáticas es fenilalanina, tirosina y triptófano; un grupo de aminoácidos que tienen cadenas laterales básicas es lisina, arginina e histidina; y un grupo de aminoácidos que tienen cadenas laterales con azufre es cisteína y metionina. Los grupos preferidos de sustituciones de aminoácidos conservadoras son: valina-leucina-isoleucina, fenilalanina-tirosina, lisina-arginina, alanina-valina y asparagina-glutamina. Las variantes de sustitución de la secuencia de aminoácidos descritas en la presente son aquellas donde se ha eliminado al menos un residuo en las secuencias descritas y se ha insertado en su posición un residuo diferente. Preferiblemente, el cambio de aminoácido es conservador. Las sustituciones conservadoras preferidas para cada uno de los aminoácidos de origen natural son los siguientes: Ala a ser; Arg a lys; Asn a gln o his; Asp a glu; Cys a ser o ala; Gln a asn; Glu a asp; Gly a pro; His a asn o gln; Ile a leu o val; Leu a ile o val; Lys a arg; gln o glu; Met a leu o ile; Phe a met, leu o tyr; Ser a thr; Thr a ser; Trp a tyr; Tyr a trp o phe; y Val a ile o leu.
[0123] Un polinucleótido está representado por una secuencia de nucleótidos. Un polipéptido está representado por una secuencia de aminoácidos. Una construcción de ácido nucleico se define como un polinucleótido que se aísla de un gen de origen natural o que se ha modificado para que contenga segmentos de polinucleótidos que se combinan o se superponen de una manera que, de otro modo, no existiría en la naturaleza. Opcionalmente, un polinucleótido presente en una construcción de ácido nucleico está operativamente enlazado a una o más secuencias de control, que dirigen la producción o la expresión de dicho péptido o polipéptido en una célula o en un sujeto.
[0124] Como se utiliza en este caso, el término "secuencia heteróloga" o "ácido nucleico heterólogo" es una que no se encuentra de manera natural operativamente enlazada como secuencia adyacente de dicha primera secuencia de nucleótidos. Como se utiliza en este caso, el término "heterólogo" puede significar "recombinante". "Recombinante" se refiere a una entidad genética distinta de la que se encuentra generalmente en la naturaleza. Cuando se aplica a una secuencia de nucleótidos o molécula de ácido nucleico, esto significa que dicha secuencia de nucleótidos o molécula de ácido nucleico es el producto de varias combinaciones de pasos de clonación, restricción y/o ligamiento, y otros procedimientos que dan como resultado la producción de una construcción que es distinta de una secuencia o molécula encontrada en la naturaleza.
[0125] "Operativamente enlazado/a" se define en la presente como una configuración donde una secuencia de control se coloca apropiadamente en una posición con respecto a la secuencia de nucleótidos codificante del polipéptido descrita en la presente de manera que la secuencia de control dirige la producción/expresión del péptido o polipéptido descrito en la presente en una célula y/o en un sujeto.
[0126] "Operativamente enlazado/a" también se puede usar para definir una configuración donde una secuencia se coloca apropiadamente en una posición con respecto a otra secuencia codificante de un dominio funcional de manera que se codifica un polipéptido quimérico en una célula y/o en un sujeto.
Se entenderá que la expresión incluye cualquier paso implicado en la producción del péptido o el polipéptido incluyendo, pero de forma no limitativa, la transcripción, la modificación postranscripcional, la traducción, la modificación postraduccional y la secreción. Opcionalmente, un promotor representado por una secuencia de nucleótidos presente en una construcción de ácido nucleico está operativamente enlazado a otra secuencia de nucleótidos que codifica un péptido o polipéptido como se identifica en la presente.
[0127] El término "transformación" se refiere a un cambio genético permanente o transitorio inducido en una célula después de la incorporación de ADN nuevo (es decir, ADN exógeno a la célula). Cuando la célula es una célula bacteriana, como se pretende en la presente, el término normalmente se refiere a un vector extracromosómico de replicación autónoma que alberga una resistencia a antibiótico seleccionable.
[0128] Un vector de expresión puede ser cualquier vector que se pueda someter convenientemente a procedimientos de ADN recombinante y pueda provocar la expresión de una secuencia de nucleótidos que codifica un polipéptido descrito en una célula y/o en un sujeto. Como se utiliza en este caso, el término "promotor" se refiere a un fragmento de ácido nucleico que funciona para controlar la transcripción de uno o más genes o ácidos nucleicos, situados aguas arriba con respecto a la dirección de la transcripción del sitio de iniciación de la transcripción del gen. Se refiere al sitio de unión identificado por la presencia de un sitio de unión para una ARN-polimerasa dependiente del ADN, sitios de iniciación de la transcripción y cualquier otra secuencia de ADN, incluyendo, pero de forma no limitativa, sitios de unión de factores de transcripción, sitios de unión a proteínas represoras y activadoras, y cualquier otra secuencia de nucleótidos conocida por una persona experta en la técnica por actuar directa o indirectamente para regular la cantidad de transcripción del promotor. En la presente, un promotor preferiblemente termina en el nucleótido -1 del sitio de inicio de la transcripción (SIT).
[0129] "Polipéptido" como se utiliza en este caso se refiere a cualquier péptido, oligopéptido, polipéptido, producto génico, producto de expresión o proteína. Un polipéptido está compuesto de aminoácidos consecutivos. El término "polipéptido" abarca moléculas de origen natural o sintéticas.
[0130] El término "secuencias de control" se define en la presente para incluir todos los componentes que son necesarios o ventajosos para la expresión de un polipéptido. Cada secuencia de control puede ser nativa o foránea a la secuencia de ácido nucleico que codifica el polipéptido. Tales secuencias de control incluyen, pero de forma no limitativa, un líder, secuencias de iniciación de la traducción óptimas (como se describe en Kozak, 1991, J. Biol. Chem. 266:19867-19870), una secuencia de poliadenilación, una secuencia propeptídica, una secuencia prepropeptídica, un promotor, una secuencia señal y un terminador de la transcripción. Como mínimo, las secuencias de control incluyen un promotor y señales de parada transcripcional y traduccional.
[0131] Las secuencias de control pueden proporcionarse con conectores con el fin de introducir sitios de restricción específicos que faciliten el ligamiento de las secuencias de control con la región codificante de la secuencia de ácido nucleico que codifica un polipéptido.
[0132] La secuencia de control puede ser una secuencia promotora apropiada, una secuencia de ácido nucleico, que es reconocida por una célula huésped para la expresión de la secuencia de ácido nucleico. La secuencia promotora contiene secuencias de control transcripcional, que median la expresión del polipéptido. El promotor puede ser cualquier secuencia de ácido nucleico que muestre actividad transcripcional en la célula, incluyendo promotores mutantes, truncados e híbridos, y se puede obtener de genes que codifican polipéptidos extracelulares o intracelulares homólogos o heterólogos a la célula.
[0133] La secuencia de control también puede ser una secuencia terminadora de la transcripción adecuada, una secuencia reconocida por una célula huésped para terminar la transcripción. La secuencia terminadora está operativamente enlazada al extremo 3' de la secuencia de ácido nucleico que codifica el polipéptido. Cualquier terminador, que sea funcional en la célula, se puede usar en este caso.
[0134] La secuencia de control también puede ser una secuencia líder adecuada, una región no traducida de un ARNm que es importante para la traducción por la célula huésped. La secuencia líder está operativamente enlazada al extremo 5' de la secuencia de ácido nucleico que codifica el polipéptido. Cualquier secuencia líder, que sea funcional en la célula, se puede usar en este caso.
[0135] La secuencia de control también puede ser una secuencia de poliadenilación, una secuencia que está operativamente enlazada al extremo 3' de la secuencia de ácido nucleico y que, cuando se transcribe, es reconocida por la célula huésped como una señal para añadir residuos de poliadenosina al ARNm transcrito. Cualquier secuencia de poliadenilación, que sea funcional en la célula, se puede usar en este caso.
[0136] En este documento y en sus reivindicaciones, el verbo "comprender" y sus conjugaciones se usan en su sentido no limitativo para significar que los artículos que van después de la palabra están incluidos, pero los artículos no específicamente mencionados no están excluidos. Además el verbo "consistir" se puede sustituir por "consistir esencialmente en", lo que quiere decir que un producto o una composición o una molécula de ácido nucleico o un péptido o polipéptido de una construcción de ácido nucleico o vector o célula tal y como se define en la presente puede comprender componente(s) adicional(es) a aquellos específicamente identificados; donde dicho(s) componente(s) adicional(es) no altera(n) la característica única. Además, la referencia a un elemento por el artículo indefinido "un" o "una" no excluye la posibilidad de que más de uno de los elementos esté presente, a menos que el contexto requiera claramente que haya uno y solo uno de los elementos. El artículo indefinido "un" o "una" significa así normalmente "al menos uno/a".
[0137] Los ejemplos siguientes se ofrecen con fines ilustrativos solo y no pretenden limitar el alcance de la invención de ninguna manera.
Ejemplos
Uso de corticosteroides y un compuesto dirigido específicamente contra S. aureus (Staphefekt™)
[0138] En varias formas de dermatitis, se utilizan ciclos de terapia tópica de corticosteroides para suprimir los síntomas de la inflamación local. Sin embargo, los corticosteroides no tratan la causa subyacente de la inflamación, y se sabe que los síntomas vuelven con el tiempo. Se hipotetizó que un segundo compuesto sería eficaz en combinación con un tratamiento con corticosteroides. Se usó un segundo compuesto específicamente dirigido contra S. aureus. El compuesto Staphefekt™ (Gladskin™) se obtuvo de Micreos Human Health B.V., Países Bajos. Ya que Staphefekt™ erradica el S. aureus como un factor etiológico de la inflamación local, se especuló que durante el tratamiento con Staphefekt™ se necesitarían menos corticosteroides para aliviar los síntomas.
[0139] Para estudiar el uso de corticosteroides durante el tratamiento de Staphefekt™, se supervisó el uso de corticosteroides y el alivio de los síntomas en ocho pacientes, de los cuales el tratamiento de varios tipos de dermatitis con Staphefekt™ fue guiado y observado por un médico (tabla 1). En los seis casos donde se encontró S. aureus, los síntomas disminuyeron durante el tratamiento con Staphefekt™, y los pacientes informaron de una menor necesidad de corticosteroides anamnésicamente. En un paciente con eccema constitucional grave, la carga de la presencia de S. aureus era alta y los síntomas disminuyeron solo moderadamente con Staphefek™, por lo que necesitó el uso sin cambios de corticosteroides y, finalmente, incluso la inmunosupresión con Neoral. En un caso donde no se encontró S. aureus, Staphefekt™ no tuvo ningún efecto en los síntomas y el uso de corticosteroides permaneció sin cambios.
[0140] El uso de corticosteroides no se abandonó completamente en los pacientes tratados con éxito, especialmente con la recurrencia de síntomas después de cesar el uso de Staphefekt™. Esto sugiere que un alivio rápido de los síntomas en la fase de inflamación local se consigue mejor mediante la combinación de la terapia sintomática con corticosteroides con la erradicación de la presencia etiológica de S. aureus por Staphefekt™.
[0141] La necesidad reducida de corticosteroides observada en los comentarios de los consumidores, cuestionarios y el presente estudio de Staphefekt™ guiado por médicos indica claramente que una dosis inferior o un ciclo más corto de corticosteroides sería eficaz en una terapia combinada con un segundo compuesto, en este caso Staphefekt™.
Tabla 1. Casos de Staphefekt™ guiados por médicos.
género indicación de sitio Presencia de alivio de los uso de corticosteroides durante el (edad) tratamiento S. aureus síntomas tratamiento
hombre eccema cuello/ moderado uso sin cambios de corticosteroides, (22) cara Neoral debido a recidiva
hombre eccema cara - sí menor necesidad
(32)
mujer eccema brazo, sí no necesario
(16) rodilla
mujer dermatitis perioral sí menor necesidad hasta recidiva (19) perioral
mujer eccema brazo - no sin cambios
(16)
hombre dermatitis de manos ++ sí menor necesidad
(28) contacto
hombre dermatitis de manos sí no necesario
(57) contacto
mujer eccema brazo sí menor necesidad
(30)
Tabla 2 : Tabla resumen de SEQ ID NO
Claims (11)
1. Composición que comprende un primer y un segundo compuesto, donde dicho primer compuesto es un corticosteroide y dicho segundo compuesto comprende al menos un dominio de unión a la pared celular que se une específicamente a la pared celular de peptidoglicano de una célula bacteriana, preferiblemente una célula bacteriana gram positiva y donde dicho segundo compuesto es un polipéptido que tiene al menos un 80 % de identidad con la SEQ ID NO: 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30, 32, 34, 36, 38, 40, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 60, 62, 64, 66, 68, 70, 72, 76, 78, 80, 82, 84, 86, 88, 90, 92, 94, 98 o 100; y/o dicho dominio de unión a la pared celular tiene al menos un 80 % de identidad con cualquiera de las SEQ ID NO: 4, 6 u 8; y/o donde dicho uno o más dominios activos enzimáticos tiene al menos un 80 % de identidad con cualquiera de las SEQ ID NO: 10, 12, 14, 16, 18, 98 o 100.
2. Kit de partes que comprende:
a) un primer frasco con una primera composición que comprende un primer compuesto como se define en la reivindicación 1; y
b) un segundo frasco con una segunda composición que comprende un segundo compuesto como se define en la reivindicación 1; y, opcionalmente,
c) instrucciones de uso, que comprenden preferiblemente un régimen de dosificación.
3. Composición según la reivindicación 1 para usar en un método de tratamiento, que comprende la administración secuencial o simultánea de dichos compuestos primero y segundo.
4. Composición para el uso según la reivindicación 3, para usar en la prevención, el retraso y/o la curación de la dermatitis o el eccema.
5. Composición y/o kit de partes según cualquiera de las reivindicaciones precedentes, donde dicho segundo compuesto comprende uno o más dominios activos enzimáticos que muestran especificidad de enlace diana.
6. Composición y/o kit de partes según la reivindicación 5, donde dicho enlace diana es un enlace esencial en una capa de peptidoglicano de dicha célula bacteriana, preferiblemente una célula bacteriana gram positiva.
7. Composición y/o kit de partes según la reivindicación 5 y/o 6, donde dicho uno o más dominios activos enzimáticos se selecciona o es una combinación de un dominio del grupo consistente en un dominio de amidohidrolasa/peptidasa dependiente de cisteína e histidina, un dominio de endopeptidasa, un dominio de amidasa y un dominio de glicosilhidrolasa.
8. Composición y/o kit de partes según cualquiera de las reivindicaciones precedentes, donde dicha célula bacteriana, preferiblemente una célula bacteriana gram positiva es un Staphylococcus.
9. Composición y/o kit de partes según la reivindicación 8, donde dicho dominio de unión a la pared celular se origina o es un homólogo de una endolisina de fago de Staphylococcus y/o una lisostafina de S. simulans y/o una bacteriocina ALE-1 de S. capitis.
10. Composición y/o kit de partes según cualquiera de las reivindicaciones precedentes, donde dicho segundo compuesto es un bacteriófago de origen natural o mutante, una endolisina de origen natural o un polipéptido mutante.
11. Composición y/o kit de partes según cualquiera de las reivindicaciones 8-10, donde dicho segundo compuesto es un polipéptido recombinante que comprende una multiplicidad de dichos uno o más dominios activos enzimáticos que muestran especificidad de enlace diana.
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