ES2258955T3 - Acetilhidrolasa del factor activador de plaquetas. - Google Patents
Acetilhidrolasa del factor activador de plaquetas.Info
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Abstract
Una composición terapéutica que comprende un polipéptido PAF-AH y un diluyente o vehículo fisiológicamente aceptable y, opcionalmente, otro agente anti-inflamatorio, donde el polipéptido PAF-AH es: (i) un polipéptido PAF-AH, purificado y aislado, constituido esencialmente por la secuencia de aminoácidos de PAF-AH de plasma humano representada en SEC ID NO: 8; o (ii) la variante de un polipéptido PAF-AH, purificado y aislado, constituido esencialmente por los aminoácidos 42 a 441 de SEC ID NO: 8, donde la variante es una variante de sustitución de aminoácidos que tiene una sustitución de aminoácido en la secuencia de SEC ID NO: 8 elegida entre: (a) S108A (b) D338A (c) H395A (d) H399A (e) C67S (f) C334S; o (g) C407S
Description
Acetilhidrolasa del factor activador de
plaquetas.
La presente invención se refiere en general a la
acetilhidrolasa del factor activador de plaquetas y, más
específicamente, a nuevos polinucleótidos purificados y aislados que
codifican la acetilhidrolasa del factor activador de plaquetas del
plasma humano, a los productos de acetilhidrolasa del factor
activador de plaquetas codificados por los polinucleótidos, a
materiales y métodos para la producción recombinante de productos de
acetilhidrolasa del factor activador de plaquetas y a anticuerpos
específicos para la acetilhidrolasa del factor activador de
plaquetas.
El factor activador de plaquetas (PAF) es un
fosfolípido biológicamente activo sintetizado por diversos tipos de
células. In vivo y a concentraciones normales de 10^{-10} a
10^{-9} M, el PAF activa las células diana tales como plaquetas y
neutrófilos, uniéndose a receptores específicos de la superficie
celular acoplados a la proteína G [Venable y colaboradores, J. Lipid
Res., 34; 691-701 (1993)]. El PAF tiene la
estructura
1-Q-alquil-2-acetil-sn-glicero-3-fosfocolina.
Para una óptima actividad biológica, la posición sn-1 del
esqueleto de glicerol del PAF debe estar en un enlace éter con un
alcohol graso y la posición sn-3 debe tener un grupo
fosfocolina de cabeza.
El PAF funciona en procesos fisiológicos
normales (p. ej. inflamación, hemostasia y parto) e interviene en
las respuestas inflamatorias patológicas (p. ej. asma, anafilaxia,
choque séptico y artritis) [Venable y colaboradores, véase más
arriba, y Lindsberg y colaboradores, Ann. Neurol., 30:
117-129 (1991)]. La probabilidad de la intervención
del PAF en respuestas patológicas ha generado intentos de modular
la actividad del PAF y el mayor centro de atención de tales intentos
ha sido el desarrollo de antagonistas de la actividad del PAF, los
cuales interfieren con la unión del PAF a los receptores
superficiales celulares. Véase, p. ej. Heuer y colaboradores, Clin.
Exp. Allergy, 22: 980-983 (1992).
La síntesis y secreción del PAF, así como su
degradación y eliminación parecen estar estrechamente controlados,
hasta el grado de que las acciones inflamatorias patológicas del PAF
son el resultado del fracaso de los mecanismos de regulación del
PAF que dan lugar a una producción excesiva, a una producción
inadecuada o a la falta de degradación. Un medio alternativo de
modular la actividad del PAF comprendería imitar o aumentar el
proceso natural a través del cual se produce la resolución de la
inflamación. Se ha comunicado que los macrófagos [Stafforini y
colaboradores, J. Biol. Chem., 26(17):
9682-9687 (1990)], los hepatocitos y la línea
celular del hepatoma humano HepG2 [Satoh y colaboradores, J. Clin.
Invest., 87: 476-481 (1991) y Tarbet y
colaboradores, J. Biol. Chem., 266(25):
16667-16673 (1991)] liberan una actividad
enzimática, la PAF acetilhidrolasa (PAF-AH), que
inactiva el PAF. Además de inactivar el PAF, la
PAF-AH inactiva también los fosfolípidos
oxidativamente fragmentados, tales como productos de la cascada del
ácido araquidónico que median la inflamación. Véase Stremler y
colaboradores, J. Biol. Chem., 266(17):
11095-11103 (1991). La inactivación del PAF por la
PAF-AH tiene lugar principalmente por hidrólisis del
grupo acetilo sn-2 del PAF y la PAF-AH
metaboliza los fosfolípidos oxidativamente fragmentados eliminando
los grupos acilo sn-2. Se han identificado dos tipos de
PAF-AH: las formas citoplásmicas, halladas en
diversos tipos de células y tejidos, tales como las células
endoteliales y eritrocitos, y una forma extracelular hallada en el
plasma y suero. La PAG-AH plasmática no hidroliza
fosfolípidos intactos, excepto el PAF, y esta especificidad de
sustrato permite que la enzima circule in vivo en un estado
plenamente activo sin efectos adversos. La PAF-AH
plasmática parece explicar toda la degradación de PAF en la sangre
humana ex vivo [Stafforini y colaboradores, J. Biol. Chem.,
269(9): 4223-4230 (1987)].
En tanto que las formas citoplásmica y
plasmática de la PAF-AH parecen tener la misma
especificidad de sustrato, la PAF-AH plasmática
posee características bioquímicas que la distinguen dé la
PAF-AH citoplásmica y de otras lipasas
caracterizadas. De manera específica, la PAF-AH
plasmática se asocia con partículas de lipoproteína, es inhibida
por el fluorofosfato de diisopropilo, no resulta afectada por los
iones de calcio, es relativamente insensible a la proteolisis y
tiene un peso molecular aparente de 43.000 daltons. Véase Stafforini
y colaboradores (1987), más arriba. El mismo artículo de Stafforini
y colaboradores describe el procedimiento para la purificación
parcial de la PAF-AH a partir del plasma humano y
la composición de aminoácidos del material plasmático obtenido por
el uso de dicho procedimiento. La PAF-AH
citoplásmica ha sido purificada a partir de eritrocitos, como se
informa en Stafforini y colaboradores, J. Biol. Chem.,
268(6): 3857-3865 (1993) y en el artículo se
describen también diez residuos amino-terminales de
PAF-AH citoplásmica. Hattori y colaboradores, J.
Biol. Chem., 268(25): 18748-18753 (1993)
describen la purificación de PAF-AH citoplásmica a
partir de cerebro bovino. Posteriormente a la presentación de esta
solicitud de patente, la secuencia de nucleótidos de la
PAF-AH citoplásmica de cerebro bovino se publicó en
Hattori y colaboradores, J. Biol. Chem.- 269(237):
23150-23155 (1994). Hasta la fecha, no se ha
publicado ninguna secuencia de nucleótidos para la forma plasmática
de la PAF-AH.
La producción recombinante de
PAF-AH permitiría utilizar PAF-AH
exógena para imitar o aumentar los procesos normales de resolución
de la inflamación in vivo. La administración de
PAF-AH proporcionaría una ventaja fisiológica sobre
la administración de antagonistas de los receptores de PAF, puesto
que la PAF-AH es un producto encontrado normalmente
en el plasma. Es más, debido a que los antagonistas de receptores de
PAF, que están estructuralmente relacionados con el PAF, inhiben la
actividad de la PAF-AH nativa, se impediría el
metabolismo deseable del PAF y de los fosfolípidos oxidativamente
fragmentados. Así, la inhibición de la actividad de
PAF-AH por los antagonistas de receptores de PAF
contrarresta el bloqueo competitivo del receptor de PAF por parte de
los antagonistas. Véase Stremler y colaboradores, más arriba.
Además, en las localizaciones de la inflamación aguda, p. ej. la
liberación de oxidantes da como resultado una inactivación de la
enzima PAF-AH nativa, lo que, a su vez, da como
resultado niveles locales elevados de PAF y compuestos semejantes
al PAF, los cuales competirían con cualquier antagonista de
receptores de PAF administrados de forma exógena, por la fijación a
los receptores de PAF. Por el contrario, el tratamiento con
PAF-AH recombinante aumentaría la actividad de la
PAF-AH endógena y compensaría cualquier enzima
endógena inactivada.
Por consiguiente, existe en la técnica la
necesidad de identificar y aislar secuencias de polinucleótidos que
codifiquen PAF-AH plasmática humana, desarrollar
materiales y métodos útiles para la producción recombinante de
PAF-AH y generar reactivos para la detección de
PAF-AH en plasma.
La presente invención proporciona nuevos
polinucleótidos purificados y aislados (es decir, cadenas sentido y
antisentido de ADN y ARN) que codifican PAF-AH
plasmática humana, o fragmentos enzimáticamente activos de la misma.
Las secuencias preferidas de ADN de la invención incluyen
secuencias de ADN genómico y de ADNc, así como secuencias de ADN
químicamente sintetizadas de forma total o parcial. La invención
contempla la secuencia de ADN que codifica PAF-AH
representada en la SEC ID NO: 7 y las secuencias de ADN que
hibridan con la cadena no codificante del mismo bajo condiciones
convencionales estrictas o que podrían hibridar, excepto por la
redundancia del código genético. La invención también contempla las
réplicas biológicas (es decir, copias de secuencias aisladas de ADN
obtenidas in vivo o in vitro) de secuencias de ADN de
la invención. También se proporcionan las construcciones
recombinantes de replicación autónoma, tales como vectores de ADN de
plásmidos y de virus que incorporan secuencias de
PAF-AH y, en especial, los vectores en los que el
ADN que codifica PAF-AH está operativamente unido a
una secuencia de ADN de control de la expresión endógena o exógena,
así como un terminador de transcripción.
De acuerdo con otro aspecto de la invención,
células hospedantes procariotas o eucariotas se transforman de
manera estable con secuencias de ADN de la invención de forma tal
que permiten la expresión de la PAF-AH deseada. Las
células hospedantes que expresan productos de PAF-AH
pueden servir para diversos propósitos útiles. Tales células
representan una valiosa fuente de inmunógeno para el desarrollo de
anticuerpos específicamente inmunorreactivos con
PAF-AH. Las células hospedantes de la invención son
particularmente útiles en métodos para la producción a gran escala
de PAF-AH en los que las células se cultivan en
medio adecuados de cultivo y se aíslan los productos polipeptídicos
deseados a partir de las células o del medio en el que se han
cultivado las células por, por ejemplo, purificación por
inmunoafinidad.
Un método no inmunológico contemplado por la
invención para purificar la enzima PAF-AH, a partir
del plasma incluye las etapas siguientes: (a) aislar partículas de
lipoproteínas de baja densidad; (b) solubilizar dichas partículas
de lipoproteínas de baja densidad en un tampón que comprende CHAPS
10 mM para obtener una primera solución de la enzima
PAF-AH; (c) aplicar dicha primera solución de enzima
PAF-AH a una columna de intercambio aniónico DEAE;
(d) lavar dicha columna de intercambio aniónico DEAE utilizando un
tampón de pH aprox. 7,5 y que comprende CHAPS 1 mM; (e) eluir la
enzima PAF-AH de dicha columna de intercambio
aniónico DEAE en fracciones, usando tampones de pH aprox. 7,5 que
comprenden un gradiente de NaCl 0 a 0,5 M; (f) reunir las fracciones
eluidas de dicha columna de intercambio aniónico DEAE que posee
actividad enzimática PAF-AH; (g) ajustar dichas
fracciones activas reunidas de la citada columna de intercambio
aniónico DEAE a CHAPS 10 mM para generar una segunda solución de
enzima PAF-AH; (h) aplicar dicha segunda solución de
enzima PAF-AH a una columna de afinidad de ligando
de tinción azul; (i) eluir la enzima PAF-AH de dicha
columna de afinidad de ligando de tinción azul utilizando un tampón
que comprende CHAPS 10 mM y una sal caotrópica; (j) aplicar el
eluato de dicha columna de afinidad de ligando de tinción azul a una
columna de afinidad de ligando de Cu; (k) eluir la enzima
PAF-AH a partir de dicha columna de afinidad de
ligando de Cu utilizando un tampón que comprende CHAPS 10 mM e
imidazol; (1) someter el eluato de dicha columna de afinidad de
ligando de Cu a SDS-PAGE; y (m) aislar la enzima
PAF-AH de aproximadamente 44 KDa a partir del gel
de SDS-poliacrilamida. Preferentemente, el tampón de
la etapa (b) es Tris-HCl 25 mM, CHAPS 10 mM, pH
7,5; el tampón de la etapa (d) es Tris-HCl 25 nM,
CHAPS 1 mM; la columna de la etapa (h) es una columna de Blue
Sepharose Fast Flow; el tampón de a etapa (i) es
Tris-HCl 25 mM, CHAPS 10 mM, KSCN 0,5 M, pH 7,5; la
columna de la etapa (j) es una columna de Cu Chelating Sepharose; y
el tampón de la etapa (k) es Tris-HCl 25 mM, CHAPS
10 mM, NaCl 0,5 M, imidazol 50 mM a un pH en el intervalo de aprox.
7,5-8,0.
Un método contemplado por la invención para
purificar PAF-AH enzimáticamente activa, a partir
de células E. coli productoras de PAF-AH
incluye las etapas de: (a) preparar un sobrenadante de
centrifugación de E. coli lisados productores de enzima
PAF-AH; (b) aplicar dicho sobrenadante de
centrifugación a una columna de afinidad de ligando de tinción
azul; (c) eluir la enzima PAF-AH a partir de dicha
columna de afinidad de ligando de tinción azul utilizando un tampón
que comprende CHAPS 10 mM y una sal caotrópica; (d) aplicar dicho
eluato de dicha columna de afinidad de ligando de tinción azul a
una columna de afinidad de ligando de Cu; y (e) eluir la enzima
PAF-AH a partir de dicha columna de afinidad de
ligando dé Cu utilizando un tampón que comprende CHAPS 10 mM e
imidazol. Preferentemente, la columna de la etapa (b) es una
columna Blue Sepharose Fast Flow; el tampón de la etapa (c) es
Tris-HCl 25 mM, CHAPS 10 mM, KSCN 0,5 M, pH 7,5; la
columna de la etapa (d) es una columna Cu Chelating Sepharose; y el
tampón de la etapa (e) es Tris-HCl 25 mM, CHAPS 10
mM, NaCl 0,5 M, imidazol 100 mM, pH 7,5.
Otro método contemplado por la invención para
purificar PAF-AH enzimáticamente activa, a partir de
células E. coli productoras de PAF-AH incluye
las etapas de: (a) preparar un sobrenadante de centrifugación de
E. coli lisados productores de enzima de
PAF-AH; (b) diluir dicho sobrenadante de
centrifugación en un tampón de bajo pH que comprende CHAPS 10 mM;
(c) aplicar dicho sobrenadante de centrifugación diluido a una
columna de intercambio catiónica equilibrada a aprox. pH 7,5; (d)
eluir la enzima PAF-AH de dicha columna de
intercambio catiónico una sal 1 M; (e) elevar el pH de dicho eluato
de dicha columna de intercambio catiónico y ajustar la
concentración de sal de dicho eluato a aprox. sal 0,5 M; (f)
aplicar dicho eluato ajustado de dicha columna de intercambio
catiónico a una columna de afinidad de ligando de tinción azul; (g)
eluir la enzima PAF-AH de dicha columna de afinidad
de ligando de tinción azul utilizando un tampón que comprende una
sal aprox. 2 M a aprox. 3 M; y (h) dializar dicho eluato de dicha
columna de afinidad de ligando de tinción azul utilizando un tampón
que comprende aprox. 0,1% de Tween. Preferentemente, el tampón de
la etapa (b) es MES 25 mM, CHAPS 10 mM, EDTA 1 mM, pH 4,9; la
columna de la etapa (c) es una columna S Sepharose equilibrada en
MES 25 mM, CHAPS 10 mM, EDTA 1 mM, NaCl 50 mM, pH 5,5;
PAF-AH se eluye en la etapa (d) usando NaCl 1 mM;
el pH del eluato en la etapa (e) se ajusta a pH 7,5 utilizando una
base Tris 2M; la columna de la etapa (f) es una columna de
sefarosa; el tampón de la etapa (g) es Tris 25 mM, CHAPS 10 mM,
NaCl 3 M, EDTA 1 mM, pH 7,5; y el tampón de la etapa (h) es Tris 25
mM, NaCl 0,5 M, Tween 80 al 0,1%, pH 7,5.
Los productos de PAF-AH se
pueden obtener como aislados de fuentes celulares naturales o pueden
estar sintetizados químicamente, pero preferentemente se producen
por procedimientos recombinantes en los que intervienen células
hospedantes procariotas o eucariotas de la invención. Se contemplan
los productos de PAF-AH que tienen parte o toda la
secuencia de aminoácidos representada en la SEC ID NO: 8. Cabe
esperar que el uso de células hospedantes de mamíferos proporcione
modificaciones post-traduccionales (p. ej.
miristolación, glicosilación, truncamiento, lipidación y
fosforilaciónide tirosina, serina o treonina) que pueden ser
necesarias para conferir una óptima actividad biológica sobre los
productos de expresión recombinante de la invención. Los productos
de PAF-AH de la invención pueden ser polipéptidos
de longitud completa, fragmentos o variantes. Las variantes pueden
comprender análogos de PAF-AH en los que se elimina
o sustituye uno o más de los aminoácidos especificados (es decir,
codificados de forma natural), o en los que se añade uno o más
aminoácidos no especificados: (I) sin pérdida de una o más de las
actividades enzimáticas o características inmunológicas específicas
de PAF-AH; o (2) con incapacitación específica de
una actividad biológica particular de PAF-AH. Para
la modulación de su actividad se pueden utilizar proteínas u otras
moléculas que se unen a PAF-AH.
La presente invención comprende, además,
anticuerpos (p. ej. anticuerpos monoclonales o policlonales,
anticuerpos de cadena simple, anticuerpos quiméricos, anticuerpos
injertados en CDR y similares) y otras proteínas de unión
específicas para la PAF-AH. Proteínas de unión que
ilustran específicamente la invención son los anticuerpos
monoclonales producidos por hibridomas 90G11D y 90F2D depositados en
la American Type Culture Collection (ATCC), 12301 Parkdawn Drive,
Rockville, MD 20852 el 30 de septiembre de 1994 y con números de
acceso HB 11724 y HB 11725, respectivamente. Se pueden identificar
proteínas u otras moléculas (p. ej. lípidos o pequeñas moléculas)
que se unen específicamente a PAF-AH utilizando
PAF-AH aislada de plasma, PAF-AH
recombinante, variantes de PAF-AH o células que
expresan tales productos. Por su parte, las proteínas de unión son
útiles en composiciones para la inmunización, así como para la
purificación de PAF-AH, siendo de utilidad además
para la detección o cuantificación de PAF-AH en
muestras de fluidos y tejidos mediante procedimientos inmunológicos
conocidos. Se contemplan también anticuerpos
anti-idiotípicos específicos para anticuerpos
específicos para PAF-AH.
El valor científico de la información aportada
por las descripciones de las secuencias de ADN y aminoácidos de la
presente invención es evidente. Tal como una serie de ejemplos, el
conocimiento de la secuencia de un ADNc para PAF-AH
hace posible el aislamiento por hibridación ADN/ADN de secuencias
de ADN genómico que codifican PAF-AH y especifican
secuencias de regulación del control de expresión de
PAF-AH tales como promotores, operadores y
similares. Cabe esperar que los procedimientos de hibridación de
ADN/ADN llevados a cabo con secuencias de ADN de la invención bajo
condiciones convencionales estrictas del estado de la técnica
permitan igualmente el aislamiento de ADNs que codifiquen variantes
alélicas de PAF-AH, otras proteínas estructuralmente
relacionadas que compartan una o más de las propiedades bioquímicas
y/o inmunológicas de PAF-AH y proteínas de especies
no humanas homólogas a PAF-AH. La información sobre
la secuencia de ADN que ofrece la presente invención permite
asimismo el desarrollo, por estrategias de recombinación homóloga o
"knockout" [véase p. ej. Kapecchi, Science, 244:
1288-1292 (1989)], de roedores que no expresan una
enzima PAF-AH funcional o que expresan una variante
de la enzima PAF-AH. Los polinucleótidos de la
invención, una vez adecuadamente marcados, son útiles en ensayos de
hibridación para detectar la capacidad de las células para
sintetizar PAF-AH. Los polinucleótidos de la
invención pueden representar, asimismo, la base para métodos de
diagnóstico de utilidad en la identificación de
alteración(es) genética(s) en el locus de
PAF-AH subyacente(s) a uno o varios estados
patológicos. La invención pone a punto igualmente polinucleótidos
antisentido.importantes para regular la expresión de
PAF-AH en aquellas células que normalmente la
expresan.
Se contempla la administración de preparaciones
de PAF-AH de la invención a mamíferos, especialmente
humanos, con el fin de mejorar afecciones inflamatorias
patológicas. Basándose en la intervención del PAF en estados
inflamatorios patológicos, la administración de
PAF-AH está indicada, p. ej. en el tratamiento del
asma [Miwa y colaboradores, J. Clin. Invest.,
82:1983-1991 (1988); Hsieh y colaboradores, J.
Allergy Clin. Immunol., 91: 650-657 (1993); y
Yamashita y colaboradores, Allergy, 49: 60-63
(1994)], anafilaxia [Venable y colaboradores, más arriba], choque
[Venable y colaboradores, más arriba], lesiones de reperfusión e
isquemia del sistema nervioso central [Lindsberg y colaboradores,
(1991), más arriba], artritis inducida por antígenos [Zarco y
colaboradores, Clin. Exp. Immunol., 88:318-323
(1992)], aterogénesis [Handley y colaboradores, Drug Dev. Res.,
7:361-375 (1986)], enfermedad de Crohn [Denizot y
colaboradores, Digestive Diseases and Sciences, 37(3):
432-437 (1992)], necrosis intestinal
isquémica/enterocolitis necrotizante [Denizot y colaboradores, más
arriba y Caplan y colaboradores, Acta Paediatr., Suppl. 396:
11-17 (1994)], colitis ulcerativa [Denizot y
colaboradores, más arriba], ataque isquémico [Satoh y colaboradores
Stroke, 23: 1090-1092 (1992)], lesión cerebral
isquémica [Lindsberg y colaboradores, Stroke, 21:
1452-1457 (1990) y Lindsberg y colaboradores
(1991), más arriba], lupus eritematoso sistémico [Matsuzaki y
colaboradores, Clinica Chimica Acta, 210: 139-144
(1992)], pancreatitis aguda [Kald y colaboradores, Pancreas,
8(4): 440-442 (1993)], septicemia [Kald y
colaboradores, más arriba], glomerulonefritis
post-estreptocócica aguda [Mezzano y colaboradores,
J. Am. Soc. Nephrol., 4: 235-242 (1993)], edema
pulmonar resultante del tratamiento con IL-2
[Rabinovici y colaboradores, J. Clin. Invest., 89:
1669-1673 (1992)], inflamación alérgica [Watanabe y
colaboradores, Br. J. Pharmacol., 111: 123-130
(1994)], insuficiencia renal isquémica [Grino y colaboradores,
Annals of Internal Medicine, 121(5): 345-347
(1994)], parto prematuro [Hoffman y colaboradores, Am. J. Obstr.
Gynecol., 162(2): 525-528 (1990) y Maki y
colaboradores, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 85:
728-732 (1988)]y síndrome de distrés respiratorio
del adulto [Rabinovici y colaboradores, J. Appl. Physiol.,
74(4): 1791-1802 (1993); Matsumoto y
colaboradores, Clin. Exp. Pharmacol. Physiol. 19:
509-515 (1992); y Rodríguez-Roisin y
colaboradores, J. Clin. Invest., 93: 188-194
(1994).
En el estado de la técnica se han descrito
modelos animales para muchos de los estados patológicos
anteriormente mencionados. Por ejemplo, en el Ejemplo 16 se describe
un modelo animal de ratón para asma, rinitis y eccema; un modelo de
conejo para la artritis aparece en Zarco y colaboradores, más
arriba; modelos de rata para necrosis intestinal
isquémica/enterocolitis necrotizante se describen en Furukawa y
colaboradores, Ped. Res. 34(2): 237-241
(1993) y Caplan y colaboradores, más arriba; en Lindsberg y
colaboradores (1990) más arriba, se describe un modelo de conejo
para la embolia cerebral; en Matsuzaki y colaboradores, más arriba,
se describe un modelo de ratón para el lupus; en Kald y
colaboradores, más arriba, se describe un modelo de rata para la
pancreatitis aguda; en Rabinovici y colaboradores, más arriba, se
describe un modelo de rata para el edema pulmonar resultante del
tratamiento con IL-2; en Watanabe y colaboradores,
más arriba, se describe un modelo de rata de inflamación alérgica;
en Watson y colaboradores, Transplantation, 56(4):
1047-1049 (1993) se describe un modelo canino de
aloinjerto renal; y en Rabinovici y colaboradores, más arriba, se
describe un modelo de rata del síndrome de distrés respiratorio del
adulto.
De forma específica, se contemplan composiciones
de PAF-AH de la invención para utilizar en métodos
de tratamiento de mamíferos susceptibles o que sufren estados
patológicos mediados por el PAF, que comprenden la administración de
PAF-AH de la invención al mamífero en cantidad
suficiente para suplementar la actividad de PAF-AH
endógena e inactivar las cantidades patológicas de PAF en el
mamífero.
Las composiciones terapéuticas contempladas por
la invención incluyen PAF-AH de la invención y un
diluyente o vehículo fisiológicamente aceptable, pudiendo incluir
también otros agentes con un efecto antiinflamatorio. Las
cantidades de dosificación indicadas serían suficientes para
suplementar la actividad de PAF-AH endógena e
INACtivar las cantidades patológicas de PAF. En relación con las
consideraciones generales de dosificación, véase Remington's
Pharmaceutical Sciences, 18ª edición, Mack Publishing Co., Eastbn,
PA (1990). Las dosificaciones variarán entre aprox. 0,1 hasta aprox.
1000 \mug de PAF-AH/kg de peso corporal. Las
composiciones terapéuticas de la invención se pueden administrar
por diversas vías, dependiendo del estado patológico a tratar. Por
ejemplo, la administración puede ser intravenosa, subcutánea, oral,
por supositorio y/o por vía pulmonar.
Para afecciones pulmonares, la administración de
PAF-AH por vía pulmonar está especialmente indicada.
Se contempla el uso en la administración pulmonar de una amplia gama
de dispositivos, incluidos, p. ej. nebulizadores, inhaladores de
dosis medidas e inhaladores de polvo, que son convencionales en la
técnica. El suministro de diversas proteínas a los pulmones y al
sistema circulatorio por inhalación de formulaciones en aerosol ha
sido descrito por Adjei y colaboradores, Pharm. Res., 7(6):
565-569 (1990) (acetato de leuprolida); Braquet y
colaboradores, J. Cardio. Pharm., 13 (sup. 5): pág.
143-146 (1989) (endotelina-1);
Hubbard y colaboradores, Annals of Internal Medicine, 111(3),
206-212 (1989)
(\alpha1-antitripsina); Smith y colaboradores, J.
Clin. Invest., 84: 1145-1146 (1989) (inhibidor de
la \alpha-l-proteinasa); Debs y
colaboradores, J. Immunol., 140:3482-3488 (1993)
(interferón gamma recombinante y factor alfa de necrosis tumoral);
Tratado de Cooperación de Patentes (PCT) Publicación Internacional
n° WO 94/20069, publicado el 15 de septiembre de 1994 (factor
recombinante pegilado estimulante de colonias de granulocitos).
Otros muchos aspectos y ventajas de la invención
resultarán evidentes de la siguiente descripción detallada de la
misma, que hace referencia a los dibujos, en los que:
Fig. 1: fotografía de una membrana PVDF que
contiene PAF-AH purificada de plasma humano;
Fig. 2: gráfico que muestra la actividad
enzimática de la PAF-AH recombinante de plasma
humano;
Fig. 3: dibujo esquemático que representa
fragmentos de PAF-AH recombinante y su actividad
catalítica;
Fig. 4: gráfico de barras que muestra el bloqueo
del edema de la pata de la rata inducido por PAF mediante
PAF-AH recombinante de la invención administrada
localmente;
Fig. 5: gráfico de barras que ilustra el bloqueo
del edema de la pata de la rata inducido por PAF mediante
PAF-AH administrada por vía intravenosa;
Fig. 6: gráfico de barras que muestra que la
PAF-AH bloquea el edema inducido por PAF, pero no
el edema inducido por zimosano-A;
Figs. 7A y 7B: presentan resultados de respuesta
a la dosis de la actividad antiinflamatoria de
PAF-AH en el edema de la pata de la rata;
Figs. 8A y 8B: presentan resultados que indican
la eficacia in vivo de una sola dosis de
PAF-AH en el tiempo;
Fig. 9: gráfico de líneas que representa la
farmacocinética de PAF-AH en la circulación de la
rata; y
Fig. 10: gráfico de barras que muestra los
efectos antiinflamatorios de PAF-AH en comparación
con los efectos menores de los antagonistas del PAF en el edema de
la pata de la rata.
Los siguientes ejemplos ilustran la invención.
El Ejemplo 1 expone un nuevo método para la purificación de
PAF-AH a partir de plasma humano. El Ejemplo 2
describe la microsecuenciación de aminoácidos de la
PAF-AH purificada de plasma humano. La clonación de
un ADNc de longitud total que codifica PAF-AH de
plasma humano se describe en el Ejemplo 3. En el Ejemplo 4 se
describe una variante de unión putativa del gen de la
PAF-AH de plasma humano. En el Ejemplo 5 se describe
la clonación de secuencias genómicas que codifican
PAF-AH de plasma humano. El Ejemplo 6 describe la
clonación de ADNc canino, murino, de roedor y macaco homólogos al
ADNc de la PAF-AH de plasma humano. El Ejemplo 7
presenta los resultados de un ensayo que pone de manifiesto la
actividad enzimática de la PAF-AH recombinante
expresada temporalmente en células COS 7. El Ejemplo 8 describe la
expresión de PAF-AH humana en E. coli y S.
cerevisiae. El Ejemplo 9 presenta un protocolo para la
purificación de PAF-AH recombinante a partir de
E. coli y ensayos que confirman la actividad enzimática. El
Ejemplo 10 describe diversos productos de PAF-AH
recombinante, incluidos análogos por sustitución de aminoácidos y
productos amino y carboxitruncados. En el Ejemplo 11 se presentan
los resultados del ensayo Northern blot para la expresión de ARN de
PAF-AH de plasma humano en diversos tejidos y
líneas celulares, mientras que en el Ejemplo 12 se exponen los
resultados de la hibridación in situ. El Ejemplo 13 describe
el desarrollo de anticuerpos monoclonales específicos para la
PAF-AH de plasma humano. Los Ejemplos 14, 15 y 16
describen, respectivamente, el efecto terapéutico in vivo de
la administración de productos de PAF-AH
recombinante de la invención sobre la inflamación aguda, la
pleuresía y el asma en la rata. El Ejempló 17 presenta los
resultados de inmunoensayos de suero de pacientes humanos que
muestran un déficit de actividad de PAF-AH y
describe la identificación de una lesión genética en los pacientes
que es aparentemente responsable de dicho déficit.
Se purificó PAF-AH a partir de
plasma humano para proporcionar el material para la secuenciación de
aminoácidos.
Inicialmente, se precipitaron partículas de
lipoproteínas de baja densidad (LDL) en plasma con fosfotungstato,
se solubilizaron en Tween 20 al 0,1% y se sometieron a cromatografía
en una columna de DEAE (Pharmacia, Uppsala, Suecia) de acuerdo con
el método de Stafforini y colaboradores, (1987), véase más arriba,
pero la falta de constancia en la elución de PAF-AH
de la columna de DEAE requirió una segunda evaluación de la
solubilización y de las condiciones de purificación posteriores.
El Tween 20, el CHAPS (Pierce Chemical Co.,
Rockford, IL) y el octil glucósido se evaluaron por centrifugación
y cromatografía de exclusión molecular con respecto a su capacidad
de solubilizar las partículas de LDL. CHAPS proporcionó un 25% más
de recuperación de actividad solubilizada que Tween 20 y un 300%
más de recuperación que el octil glucósido. El precipitado de LDL
solubilizado con CHAPS 10 mM después se fraccionó en una columna de
DEAE Sepharose Fast Flow Column (una columna de intercambio
aniónico; Pharmacia) con tampón que contenía CHAPS 1 mM para
proporcionar un conjunto grande de PAF-AH
parcialmente purificada ("el conjunto de DEAE") para la
evaluación de más columnas.
El conjunto de DEAE se usó como material de
partida para ensayar una diversidad de columnas cromatográficas con
respecto a su utilidad en la purificación adicional de la
actividad PAF-AH. Las columnas ensayadas incluyeron:
Blue Sepharose Fast Flow (Pharmacia), una columna de afinidad de
ligando de colorante; S-Sepharose Fast Flow
(Pharmacia), una columna de intercambio catiónico; Cu Chelating
Sepharose (Pharmacia), una columna de afinidad de ligando metálico;
Fractogel S (EM Separations, Gibbstown, NJ), una columna de
intercambio catiónico; y Sephacryl-200 (Pharmacia),
una columna de exclusión molecular. Todos estos procedimientos
cromatográficos produjeron niveles bajos e insatisfactorios de
purificación cuando se hicieron funcionar en CHAPS 1 mM. La
posterior cromatografía de exclusión molecular en Sephacryl
S-200 en CHAPS 1 mM generó una fracción
enzimáticamente activa que eluyó en un amplio intervalo de tamaños
en lugar de en el tamaño aproximado a 44 kDa esperado. En conjunto,
estos resultados indicaron que las proteínas LDL se agregaban en
solución.
Por lo tanto, se evaluaron diferentes muestras
de LDL por cromatografía de exclusión molecular analítica con
respecto a la agregación de la actividad PAF-AH. Se
analizaron muestras procedentes del conjunto de DEAE y del
precipitado de LDL recién solubilizado en Superose 12 (Pharmacia)
equilibrada en tampón con CHAPS 1 mM. Las dos muestras se eluyeron
en un intervalo muy amplio de pesos moleculares, eluyendo la mayor
parte de la actividad por encima de 150 kDa. Cuando las muestras se
analizaron posteriormente en Superose 12 equilibrada con CHAPS 10
mM, la mayor parte de la actividad eluyó a aproximadamente 44 kDa,
como era de esperar para la actividad PAF-AH. Sin
embargo, las muestras contenían parte de la actividad
PAF-AH en la región de alto peso molecular
correspondiente a los agregados.
Otras muestras eluyeron la actividad
PAF-AH exclusivamente en un intervalo aproximado a
44 kDa cuando se ensayaron posteriormente por exclusión molecular.
Estas muestras eran un precipitado de LDL solubilizado en CHAPS 10
mM en presencia de NaCl 0,5 M y un conjunto de DEAE reciente que
se ajustó en CHAPS 10 mM después de la elución desde la columna de
DEAE. Estos datos indican que se requiere una concentración de
CHAPS de al menos 10 mM para mantener PAF-AH sin
agregación. El aumento de la concentración de CHAPS de 1 mM a 10 mM
después de la cromatografía en DEAE, pero antes de las posteriores
etapas cromatográficas, produjo diferencias notables en la
purificación. Por ejemplo, el grado de purificación de
PAF-AH en S-Sepharose Fast Flow
aumento de 2 veces a 10 veces. La actividad PAF-AH
se unió a la columna Blue Sepharose Fast Flow irreversiblemente en
CHAPS 1 mM, pero la columna proporcionó el máximo nivel de
purificación en CHAPS 10 mM. La cromatografía en DEAE no mejoró con
la adición previa de CHAPS 10 mM.
La cromatografía en Cu Chelating Sepharose
después de la columna Blue Sepharose Fast Flow concentró la
actividad PAF-AH 15 veces. Esto también determinó
que la actividad PAF-AH podía recuperarse de un gel
de SDS-poliacrilamida reducido, siempre que las
muestras no hirvieran. La actividad del material eluido de la
columna Cu Chelating Sepharose cuando se sometió a electroforesis en
gel de SDS-poliacrilamida coincidió con una banda
proteica principal cuando el gel se tiñó con plata.
Por lo tanto, el nuevo protocolo utilizado para
purificar PAF-AH para la secuenciación de
aminoácidos comprendía las siguientes etapas, que se realizaron a
4°C. Se dividió plasma humano en alícuotas de 900 ml en frascos
Nal-gene de 1 litro y se ajustaron a pH 8,6. Después
se precipitaron las partículas de LDL añadiendo 90 ml de
fosfotungstato sódico al 3,85% seguido de 23 ml de MgCl_{2} 2 M.
El plasma después se centrifugó durante 15 minutos a 3600 g. Los
sedimentos se resuspendieron en 800 ml de citrato sódico al 0,2%.
Lis partículas de LDL se precipitaron de nuevo añadiendo 10 g de
NaCl y 24 ml de MgCl_{2} 2 M. Las partículas de LDL se
sedimentaron por centrifugación durante 15 minutos a 3600 g. Este
lavado se repitió dos veces. Los sedimentos después se congelaron a
-20°C. Las partículas de LDL procedentes de 5 l de plasma se
resuspendieron en 5 1 de tampón A (Tris-HCl 25 mM,
CHAPS 10 mM, pH 7,5) y se agitaron durante una noche. Las
partículas de LDL solubilizadas se centrifugaron a 3600 g durante
1,5 h. Se combinaron los sobrenadantes y se filtraron con papel de
filtro Whatman 113 para eliminar todos los sólidos que quedaran.
El sobrenadante de LDL solubilizadas se introdujo en una columna
DEAE Sepharose Fast Flow (11 cm x 10 cm; volumen de resina 1 l; 80
ml/minuto) equilibrada en tampón B (Tris-HCl 25 mM;
CHAPS 1 mM, pH 7,5). La columna se lavó con tampón B hasta que la
absorbancia volvió al nivel inicial. La proteína se eluyó con 8 1 de
un gradiente de NaCl de 0-0,5 M y se recogieron
fracciones de 480 ml. Esta etapa era necesaria para conseguir la
unión a la columna Blue Sepharose Fast Flow posterior. En las
fracciones se ensayó la actividad acetilhidrolasa esencialmente por
el método descrito en el Ejemplo 4.
Se reunieron las fracciones activas y se añadió
suficiente CHAPS para que el conjunto tuviera una concentración de
CHAPS aproximadamente 10 mM. El conjunto de DEAE se introdujo
durante una noche, a un caudal de 4 ml/minuto, en una columna Blue
Sepharose Fast Flow (5 cm x 10 cm; volumen del lecho 200 m)
equilibrada en tampón A que contenía NaCl 0,5 M. La columna se lavó
con el tampón de equilibrio a un caudal de 16 ml/minuto hasta que la
absorbancia volvió al nivel inicial. La actividad
PAF-AH se eluyó por etapas con tampón A que
contenía KSCN (una sal caotrópica) 0,5 M a un caudal de 16
ml/minuto y se recogió en fracciones de 50 ml. Esta etapa produjo
una purificación más de 1000 veces mayor. Se reunieron las
fracciones activas y el conjunto se ajustó a pH 8,0 con
Tris-HCl 1 M, pH 8, 0. El conjunto activo procedente
de la cromatografía con Blue Sepharose Fast Flow se introdujo en
una columna Cu Chelating Sepharose (2,5 cm x 2 cm; volumen del
lecho 10 ml; caudal 4 ml/minuto) equilibrada en tampón C
[Tris-HCl 25 mM, CHAPS 10 mM, NaCl 0,5 M, pH 8,0
(también se trabajó a pH 7,5)] y la columna se lavó con 50 ml de
tampón-C. La actividad PAF-AH se
eluyó con 100 ml de imidazol 50 mM en tampón C y se recogió en
fracciones de 10 ml. Se reunieron las fracciones que contenían las
fracciones de PAF-AH y se dializaron frente a
tampón A. Además de proporcionar una concentración 15 veces mayor
de la actividad PAF-AH, la columna Cu Chelating
Sepharose proporcionó poca purificación. El conjunto de Cu
Chelating Sepharose se redujo en DTT 50 mM durante 15 minutos a 37°C
y se introdujo en un gel de poliacrilamida al 7,5%, de 0'75 mm. Las
porciones de gel se cortaron cada 0,5 cm y se pusieron en tubos de
microcentrífuga desechables que contenían 200 \mul de
Tris-HCl 25 mM, CHAPS 10 mM y NaCl 150 mM. Las
porciones se trituraron y se dejaron en incubación durante una noche
a 4°C. Depués, en el sobrenadante de cada porción de gel se ensayó
la actividad PAF-AH para determinar qué banda
proteinica de la SDS-PAGE contenía la actividad
PAF-AH. La actividad PAF-AH se
encontró en una banda de aprox. 44 kDa. La proteína de un gel
duplicado se electrotransfirió a una membrana PVDF
(Immobilon-P, Millipore) y se tiñó con Azul de
Coomassie. En la Figura 1 se presenta una fotografía de la membrana
PVDF.
Como se presenta en la Tabla I, mostrada a
continuación, se purificaron aprox. 200 \mug de
PAF-AH 2 x 10^{6} veces más a partir de 5 1 de
plasma humano. En comparación, en Stafforino y colaboradores,
(1987), véase más arriba, se describe una purificación de la
actividad PAF-AH 3 x 10^{4} veces mayor.
Muestra | Vol | Acti- | Acti- | Conc. | Acti- | % de Recup. | Factor de | ||
ml | vidad | vidad | de | vidad | de | multiplicación | |||
(cpm x | total | prot. | Espec. | Actividad | de la | ||||
10^{6}) | (cpm x | mg/cm | cpm x | Etapa | Purificación | ||||
10^{6}) | 10^{6} | Acum. | Etapa | Acum. | |||||
Plasma | 5000 | 23 | 116 | 62 | 0,37 | 100 | 100 | 1 | 1 |
LDL | 4500 | 22 | 97 | 1,76 | 12 | 84 | 84 | 33 | 33 |
DEAE | 4200 | 49 | 207 | 1,08 | 46 | 212 | 178 | 3,7 | 124 |
Blue | 165 | 881 | 14 | 0,02 | 54200 | 70 | 126 | 1190 | 1,5 x 10^{5} |
Cu | 12 | 12700 | 152 | 0,15 | 82200 | 104 | 131 | 1,5 | 2,2 x 10^{5} |
SDS-PAGE | - - - | - - - | - - - | - - - | - - - | - - - | - - - | \sim 10 | 2,2 x 10^{6} |
En resumen, las siguientes etapas fueron únicas
y críticas para la purificación satisfactoria de
PAF-AH plasmática para la microsecuenciación: (1)
solubilización y cromatografía en CHAPS 10 mM, (2) cromatografía en
una columna de afinidad de ligando azul tal como Blue Sepharose
Fast Flow, (3) cromatografía en una columna de afinidad de ligando
de Cu tal como Cu Chelating Sepharose, y (4) elución de
PAF-AH de SDS-PAGE.
Para la secuenciación de aminoácidos, la banda
proteica de aprox. 44 kDa de la membrana PVDF que contenía
PAF-AH descrita en el ejemplo 1 se escindió y
secuenció usando un secuenciador de proteínas Applied Biosystems
473A. El análisis de la secuencia N-terminal. de la
banda proteica de \sim44 kDa correspondiente a la actividad
PAF-AH indicó que la banda contenía dos secuencias
principales y dos secuencias minoritarias. La relación de las dos
secuencias principales era de 1:1 y, por lo tanto, eran difíciles
de interpretar los datos de secuencia.
Para distinguir las secuencias de las dos
proteínas principales que se habían resuelto en el gel de SDS, se
cortó por la mitad una membrana PVDF duplicada que contenía la
banda de aprox. 44 kDa, de forma que la parte superior y la parte
inferior de la membrana se sometieron a la secuenciación por
separado.
La secuencia N-terminal obtenida
para la mitad inferior de la membrana fue:
SEC ID NO: 1
F K D L G E E N F K A L V L I A F
Una investigación de la base de datos de
proteínas reveló que esta secuencia era un fragmento de la alúmina
de suero humano. También se secuenció la mitad superior de la misma
membrana PVDF y la secuencia de aminoácidos
N-terminal determinada fue:
SEC ID NO: 2
I Q V L M A A A S F G Q T K I P
Esta secuencia no corresponde a ninguna proteína
de la base de datos investigada y era diferente de la secuencia de
aminoácidos N-terminal:
SEC ID NO: 3
M K P L V V F V L G G
que se había identificado como la
PAF-AH citoplásmica de eritrocitos en Stafforini y
colaboradores (1993), véase más arriba. La nueva secuencia (SEC ID
NO: 2) se utilizó para la clonación de ADNc de
PAF-AH de plasma humano como se describe más
adelante en el Ejemplo 3.
Se aisló un clon de longitud completa que
codificaba el PAF-AH de plasma humano a partir de
una biblioteca de ADNc de macrófagos.
Se recogió ARN Poli A^{+} a partir de
macrófagos derivados de monocitos de sangre periférica. Se generó un
ADNc de extremos romos, de doble cadena, usando el equipo
Invitrogen Copy (San Diego, CA) y se unieron adaptadores BstXI al
ADNc antes de la inserción en el vector de expresión de mamíferos
pRc/CMV (Invitrogen). Los plásmidos resultantes se introdujeron en
la cepa XL-1 Blue de E. coli por
electroporación. Las bacterias transformadas se cultivaron a una
densidad de aproximadamente 3000 colonias por placa de agarosa en un
total de aprox. 978 placas. El ADN plasmídico preparado por separado
a partir de cada placa se mantuvo en conjuntos individuales y
también. se combinó en conjuntos mayores que representaban 300.000
clones cada uno.
La biblioteca de macrófagos se seleccionó
mediante la reacción en cadena de la polimerasa utilizando un
cebador de PCR oligonucleotídico de sentido contrario, degenerado,
basado en la nueva secuencia de aminoácidos
N-terminal descrita en el Ejemplo 2. La secuencia
del cebador se indica más adelante en la nomenclatura de la IUPAC,
siendo "I" una inosina.
SEC ID NO: 4
5'ACATGAATTCGIATCYTTIGTYTGICCRAA3'
Se usaron las tablas de elección de codones de
Wada y colaboradores, Nuc. Acids. Res., 19S:
1981-1986 (1991) para seleccionar los nucleótidos
en la tercera posición de cada codón del cebador. El cebador se usó
en combinación con un cebador específico para las secuencias
promotoras SP6 o T7, flanqueando estas dos secuencias el sitio de
clonación de pRc/CMV, para seleccionar los conjuntos de bibliotecas
de macrófagos de 300.000 clones. Todas las reacciones de PCR
contenían 100 ng de ADNc molde, 1 \mug de cada cebador, 0,125 mM
de cada dNTP, Tris-HCl 10 mM pH 8, 4, MgCl_{2} 50
mM y 2,5 unidades de Taq Poimerasa. Una etapa de desnaturalización
inicial a 94°C durante 4 minutos se continuó por 30 ciclos de
amplificación de 1 minuto a 94°C, 1 minuto a 60°C y 2 minutos a
72°C. El producto de PCR resultante se clonó en pBluescript
SK^{-} (Stratagene, La Jolla, CA) y su secuencia de nucleótidos
se determinó por el método de terminación de cadena didesoxi. El
producto de PCR contenía la secuencia prevista por la nueva
secuencia peptídica y corresponde a los nucleótidos 1 a 331 de la
SEC ID NO: 7.
Después se diseñaron los cebadores de PCR
indicados a continuación, que son específicos para el fragmento de
PCR clonado descrito anteriormente, para identificar un clon de
longitud completa.
Cebador con sentido (SEC ID NO: 5)
5'TATTTCTAGAAGTGTGGTGGAACTCGCTGG3'
Cebador con sentido opuesto (SEC ID NO: 6)
5' CGATGAATTCAGCTTGCAGCAGCCATCAGTAC3'
Se realizaron las reacciones de PCR utilizando
los cebadores como se ha descrito anteriormente para seleccionar
primero los conjuntos de ADNc de 300.000 clones y después la
subserie apropiada de los conjuntos más pequeños de 3000 clones.
Después se usaron 3 conjuntos de 3000 clones que produjeron un
producto de PCR del tamaño esperado para transformar las
bacterias.
El ADN de las bacterias transformadas
posteriormente se seleccionó por hibridación usando el fragmento de
PCR clonado original como sonda. Las colonias se transfirieron a
nitrocelulosa y se pre-hibridaron e hibridaron en un
50% de formamida, cloruro sódico 0,75 M, citrato sódico 0,075 M,
fosfato sódico 0,05 M pH 6,5, 1% de polivinil pirrolidina, 1% de
Ficoll, 1% de albúmina de suero bovino y 50 ng/ml de ADN de esperma
de salmón sonicado. La sonda de hibridación se marcó mediante cebado
con hexámeros aleatorios. Después de la hibridación durante una
noche a 42°C, las manchas de transferencia se lavaron
minuciosamente en cloruro sódico 0,03 M, citrato sódico 3 mM y 0,1%
de SDS a 42°C. Se determinó la secuencia de nucleótidos de 10
clones que hibridaron. Uno de los clones, el clon sAH
406-3, contenía la secuencia prevista por la
secuencia peptídica original de la actividad PAF-AH
purificada a partir de plasma humano. En las SEC ID NOs: 7 y 8 se
indican, respectivamente, la secuencia de ADN y la secuencia de
aminoácidos deducida de la PAF-AH de plasma
humano.
El clon
sAH-406-3 contiene un inserto de
1,52 kb con una fase de lectura abierta que codifica una proteína
prevista de 441 aminoácidos. En el extremo amino, un fragmento
relativamente hidrófobo de 41 restos precede al aminoácido
N-terminal (la isoleucina en la posición 42 de la
SEC ID NO: 8) identificado por microsecuenciación de proteínas.
Por lo tanto, la proteína codificada puede tener una secuencia señal
J1arga o una secuencia señal más un péptido adicional que se
escinde para producir la enzima funcional madura. La presencia de
una secuencia señal es una característica de las proteínas de
secreción. Además, la proteína codificada por el clon sAH
406-3 incluye el motivo consenso GxSxG (aminoácidos
271-275 de la SEC ID NO: 8) que se cree que
contiene la serina del sitio activo de todas las lipasas de
mamífero, lipasas microbianas y proteasas de serina conocidas.
Véase Chapus y colaboradores, Biochimie, 70:
1223-1224 (1988) y Brenner, Nature, 334;
528-530 (1988).
La Tabla 2 que se presenta a continuación es una
comparación de la composición de aminoácidos de la
PAF-AH de plasma humano de la invención, prevista a
partir de la SEC ID NO: 8, y la composición de aminoácidos del
material supuestamente purificado descrito por Stafforini y
colaboradores, (1987), véase más arriba.
Clon sAH 406-3 | Stafforini y colaboradores | |
Ala | 26 | 24 |
Asp y Asn | 48 | 37 |
Cys | 5 | 14 |
Glu y Gln | 36 | 42 |
Phe | 22 | 12 |
Gly | 29 | 58 |
His | 13 | 24 |
Ile | 31 | 17 |
Lys | 26 | 50 |
Leu | 40 | 26 |
Met | 10 | 7 |
Pro | 15 | 11 |
Arg | 18 | 16 |
Ser | 27 | 36 |
Thr | 20 | 15 |
Val | 13 | 14 |
Trp | 7 | No determinado |
Tyr | 14 | 13 |
La composición de aminoácidos de la forma madura
de la PAF-AH de plasma humano de la invención y la
composición de aminoácidos del material previamente purificado que
supuestamente era la PAF-AH de plasma humano son
claramente distintas.
Cuando se intentó alinear las secuencias de
núcleotidos de Hattori y colaboradores, véase más arriba, y las
secuencias de aminoácidos deducidas de PAF-AH
citoplásmica de cerebro bovino con las secuencias de nucleótidos y
de aminoácidos de la PAF-AH de plasma humano de la
invención, no se observaron parecidos estructurales significativos
en las secuencias.
Se detectó una supuesta variante de unión del
gen de PAF-AH humano cuando se realizó una PCR en
ADNc de PBMC de macrófagos y estimulado usando cebadores que
hibridaban con la región 5' no traducida (nucleótidos 31 a 52 de la
SEC ID NO: 7) y la región que incluía el codón de terminación de
la traducción en el extremo 3' del ADNc de PAF-AH
(núcleotidos 1465 a 1487 de la SEC ID NO: 7). Las reacciones de PCR
produjeron dos bandas en un gel, correspondiendo una al tamaño
esperado de ADNc de PAF-AH del Ejemplo 3 y siendo la
otra aproximadamente 100 bp más corta. La secuenciación de las dos
bandas reveló que la banda mayor era el ADNc de
PAF-AH del Ejemplo 3, mientras que la banda más
corta carecía del exon 2 (Ejemplo 5 mostrado más adelante) de la
secuencia de PAF-AH que codifica las supuestas
secuencias señal y pro-péptido de la
PAF-AH en plasma. En el clon más corto estaban
presentes la tríada catalítica prevista y todas las cisteínas, por
lo tanto, es probable que la actividad bioquímica de la proteína
codificada por el clon corresponda a la de la enzima plasmática.
También se aislaron secuencias genómicas de la
PAF-AH de plasma humano. La estructura del gen de
PAF-AH se determinó aislando clones del fago lambda
y del fago P1 que contenían ADN genómico y humano por hibridación de
ADN en condiciones muy rigurosas. Los fragmentos de los clones de
los fagos se subclonaron y secuenciaron usando cebadores diseñados
para templar el clon de ADNc
sAH-406-3 a intervalos regulares a
lo largo de toda su longitud. Además, se usaron nuevos cebadores de
secuenciación diseñados para templar las regiones dd intrones que
flanqueaban los exones, para secuenciar los límites
exon-intrón con la intención de confirmar las
secuencias. Los límites exon/intrón se definieron como los puntos en
los que divergían las secuencias genómicas y de ADNc. Estos análisis
revelaron que el gen de PAF-AH humano comprende 12
exones.
Los exones 1, 2, 3, 4, 5, 6 y parte del 7 se
aislaron a partir de una biblioteca placentaria fetal masculina
construida en lambda FIX (Stratagene). Las placas del fago se
transfirieron sobre nitrocelulosa y se prehibridaron e hibridaron
en un 50% de formamida, cloruro sódico 0,75 M, citrato sódico 75
mM, fosfato sódico 50 mM (pH 6,5), 1% de polivinil pirrolidina, 1%
de Ficoll, 1% de albúmina de suero bovino y 50 ng/ml de ADN de
esperma de salmón sonicado. La sonda de hibridación usada para
identificar un clon del fago que contenía los exones
2-6 y parte del 7 constaba del clon de ADNc entero
sAH 406-3. Se identificó un clon que contenía el
exon 1 usando un fragmento derivado del extremo 5' del clon de ADNc
(nucleótidos 1 a 312 de la SEC ID NO: 7). Las dos sondas se
marcaron con ^{32}P por cebado aleatorio con hexámeros. Después
de una hibridación durante una noche a 42°C, las manchas de
transferencia se lavaron minuciosamente en cloruro sódico 30 mM,
citrato sódico 3 mM y 0,1% de SDS a 42°C. En las SEC ID NOs: 9, 10,
11, 12, 13 y 14 se indican, respectivamente, las secuencias de ADN
de los exones 1, 2, 3, 4, 5 y 6 junto con las secuencias parciales
de los intrones circundantes.
El resto del exon 7, así como los exones 8, 9,
10, 11 y 12 se subclonaron a partir de un clon P1 aislado de una
biblioteca genómica humana de P1. Las placas del fago P1 se
transfirieron sobre nitrocelulosa y se
pre-hibridaron e hibridaron en cloruro sódico 0,75
M, fosfato sódico 50 mM, (pH 7,4), EDTA 5 mM, polivinil pirrolidina
al 1%, Ficoll al 1%, albúmina de suero bovino al 1%, 0,5% de SDS y
0,1 mg/ml de ADN humano total. La sonda de hibridación, marcada con
^{32}P por cebado aleatorio con hexámeros, constaba de un
fragmento EcoR1 de 2,6 kb del ADN genómico derivado del extremo 3'
de un clon lambda aislado anteriormente. Este fragmento contenía el
exon 6 y la parte del exon 7 presente en el clon del fago. Después
de una hibridación durante una noche a 65°C, las manchas de
transferencia se lavaron como se ha descrito anteriormente. En las
SEC ID NOs: 15, 16, 17, 18, 19 y 20 se indican, respectivamente,
las secuencias de ADN de los exones 7, 8, 9, 10, 11 y 12 junto con
la secuencia parcial de los intrones circundantes.
Se aislaron clones de ADNc de la
PAF-AH plasmática de longitud completa a partir de
bibliotecas de ADNc de bazo de ratón y canino y se aisló un clon
parcial de roedor a partir de una biblioteca de ADNc de timo de
rata. Los clones se identificaron por hibridación de baja
rigurosidad (las condiciones de hibridación fueron las mismas que
se han descrito para los exones 1 a-6 en el Ejemplo
5 anterior, con la excepción de que se usó un 20% de formamida en
lugar de un 50% de formamida). Como sonda se usó un fragmento
HindIII de 1 kb del clon de ADNc de PAF-AH
sAH-406-3 (nucleótidos 309 a 1322
de la SEC ID NO: 7). Además, se aisló un clon parcial de mono a
partir de ADNc de cerebro de macaco por PCR usando los cebadores
basados en los nucleótidos 285 a 303 y 851 a 867 de la SEC ID NO: 7.
Las secuencias de nucleótidos y de aminoácidos deducida de los
clones de ADNc de ratón, perro, rata y macaco se indican en las SEC
ID NOs: 21, 22, 23 y 24, respectivamente.
Una comparación de las secuencias de aminoácidos
deducidas de los clones de ADNc con el clon de ADNc humano produce
los valores de identidad de -aminoácidos en porcentaje indicados en
la Tabla 3 mostrada a continuación.
\vskip1.000000\baselineskip
\dotable{\tabskip\tabcolsep#\hfil\+\hfil#\hfil\+\hfil#\hfil\+\hfil#\hfil\+\hfil#\hfil\+\hfil#\hfil\+\hfil#\hfil\tabskip0ptplus1fil\dddarstrut\cr}{ \+ \hskip2cm \+ Humano \+ \hskip2cm \+ Perro \+ \hskip2cm \+ Ratón \cr \+\+\+\+\+\+\cr Perro \+ \+ 80\+\+\+\+\cr Ratón \+ \+ 66 \+ \+ 64\+\+\cr Mono \+ \+ 92 \+ \+ 82 \+ \+ 69\cr Rata \+ \+ 74 \+ \+ 69 \+ \+ 82\cr}
Para determinar si el clon de ADNc de
PAF-AH plasmática humana
sAH-406-3 (Ejemplo 3) codifica una
proteína que tiene actividad PAF-AH, se expresó de
forma transitoria la construcción de expresión pRc/CMV en células
COS 7. Tres días después de la transfección por el método de DEAE
Dextrano, en el medio de células COS se ensayó la actividad
PAF-AH.
Las células se sembraron a una densidad de
300.000 células por placa de cultivo de tejidos de 60 mm. Al día
siguiente, las células se incubaron en DMEM que contenía 0,5 mg/ml
de DEAE dextrano, cloroquina 0,1 mM y 5-10 \mug de
ADN plasmídico durante 2 horas. Las células después se trataron con
DMSO al 10% en solución salina tamponada con fosfato durante 1
minuto, se lavaron. con medio y se incubaron en DMEM que contenía
un 10% de suero de ternero fetal previamente tratado con diisopropil
fluorofosfato (DFP) para inactivar la PAF-AH de
suero bovino endógeno. Después de tres días de incubación, en los
medios de las células transfectadas se ensayó la actividad
PAF-AH. Los ensayos se realizaron en presencia y
ausencia de EDTA 10 mM o DFP 1 mM para determinar si la enzima
recombinante era independiente del calcio y se inhibía por el
inhibidor esterasa de serina DFP como se ha descrito previamente
para la PAF-AH plasmática por Stafforini y
colaboradores (1987), véase más arriba. Los controles negativos
incluyeron células transfectadas con pRc/CMV que carecían del
inserto o que tenían el inserto sAH 406-3 en la
orientación inversa.
La actividad PAF-AH presente en
los sobrenadantes de los transfectantes se determinó por el método
de Stafforini y colaboradores (1990), véase más arriba, con las
siguientes modificaciones. En resumen, la actividad
PAF-AH se determinó midiendo la hidrólisis de
^{3}H-acetato a partir de
[acetil-^{3}H]PAF (New England Nuclear,
Boston, MA). El ^{3}H-acetato libre acuoso se
separó del sustrato marcado por cromatografía en columna de fase
inversa sobre cartuchos de gel de octadecilsílice (Baker Research
Products, Phillipsburg, PA). Los ensayos se realizaron usando 10
\mul del sobrenadante de los transfectantes en tampón HEPES 0,1 M,
pH 7,2, en un volumen de reacción de 50 \mul. Se usó un total de
50 pmoles de sustrato por reacción con una relación de PAF marcado:
frío de 1:5. Las reacciones se incubaron durante 30 minutos a 37°C
y se interrumpieron mediante la adición de 40 \mul de ácido
acético 10 M. La solución después se lavó a través de los cartuchos
de gel de octadecilsílice, que después se aclararon con acetato
sódico 0,1 M. El eluato acuoso de cada muestra se recogió y se
contó en un contador de centelleo líquido durante un minuto. La
actividad enzimática se expresó en cuentas por minuto.
Como se muestra en la Figura 2, los medíos de
células transfectadas con sAH-406-3
contenían actividad PAF-AH a niveles 4 veces
mayores que el nivel de fondo. Esta actividad no se vio afectada por
la presencia de EDTA, pero se anuló por la presencia de DFP 1 mM.
Estas observaciones demuestran que el clon
sAH-406-3 codifica una actividad
consistente con la enzima plasmática humana
PAF-AH.
Se usó la PCR para generar un fragmento
codificante de proteínas de ADNc de la PAF-AH
plasmática humana a partir del clon
sAH-406-3, que era muy susceptible a
la subclonaión en un vector de expresión de E. coli. El
segmento sublonado comenzaba en el extremo 5' del gen humano con el
codón que codifica Ile_{42} (SEC ID NO: 8), el resto
N-terminal de la enzima purificada a partir de
plasma humano. El resto del gen hasta el codón de terminación
nativo se incluyó en la construcción. El cebador de PCR 5' con
sentido utilizado fue:
SEC ID NO: 25
5'TATTCTAGAATTATGATACAAGTATTAATGGCTGCTGCAAG
3'
y contenía un sitio de clonación XbaI así como
un codón de iniciación de la traducción (subrayado). El cebador 3'
con sentido opuesto utilizado fue:
SEC ID NO: 26
5'ATTGATATCCTAATTGTATTTCTCTATTCCTG3'
e incluía el codón de terminación de sAH
406-3 y contenía un sitio de clonación EcoRV. Las
reacciones de PCR se realizaron esencialmente como se describe en el
Ejemplo 3. El producto de PCR resultante se digirió con XbaI y
EcoRV y se subclonó en un vector pBR322 que contenía el promotor
Trp [deBoer y colaboradores, PNAS, 80:21-25 (1983)]
inmediatamente cadena arriba del sitio de clonación. La cepa
XL-1 Blue de E. coli se transformó con la
construcción de expresión y se cultivó en caldo L que contenía 100
\mug/ml de carbenicilina. Los transformantes de los cultivos de
una noche se sedimentaron y resuspendieron en tampón de lisis que
contenía Tris-HCl 50 mM, pH 7,5, NaCl 50 mM, CHAPS
10 mM, EDTA 1 mM, 100 \mug/ml de lisozima y 0,05 unidades
inhibidoras de tripsina (TIU)/ml de Aprotinina. Después de una
incubación de 1 hora en hielo y sonicación durante 2 minutos, los
lisados se ensayaron con respecto a la actividad
PAF-AH por el método descrito en el Ejemplo 4. Las
células E. coli transformadas con la construcción de
expresión (denominada trp AH) generaron un producto con actividad
PAF-AH. Véase la Tabla 6 del Ejemplo 9.
También se utilizaron construcciones que
incluían tres promotores adicionales, el promotor tacII (deBoer,
véase más arriba), el promotor B de arabinosa (ara) de Salmonella
typhimurium [Holrwitz y colaboradores, Gene, 14:
309-319 (1981)] y el promotor del bacteriófago T7,
para dirigir la expresión de las secuencias de
PAF-AH humana en E. coli. Las construcciones
que comprendían el promotor Trp (pUC trp AH), el promotor tacII
(pUC tac AH) y el promotor araB (pUC ara AH) se montaron en el
plásmido pUC19 (New England Biolabs, MA), mientras que la
construcción que comprendía el promotor de T7 (pET AH) se montó en
el plásmido pET15B (Novagen, Madison, WI). Una construcción que
contenía un promotor híbrido, pHAB/PH, que constaba del promotor
araB fusionado a los sitios de unión a ribosomas de la región del
promotor de T7 también se montó en pET15B. Todas las construcciones
de E. coli producían actividad PAF-AH dentro
de un intervalo de 20 a 50 U/ml/DO_{600}. Esta actividad
correspondía a una masa de proteína recombinante total de 1% de la
proteína celular total.
La PAF-AH humana recombinanté
también se ha expresado en Sacharomyces cerevisiae. Se usó
el promotor ADH2 de levadura para dirigir la expresión de
rPAF-AH y produjo 7 U/ml/DO_{600} (Tabla 4
mostrada a continuación).
Construcción | Cepa | Actividad Enzimática (U/ml/DO) | |
pUC tac AH | tac | E. coli W3110 | 30 |
pUC trp AH | trp | E. coli W3110 | 40 |
pUC ara AH | araB | E. coli W3110 | 20 |
pET AH | T7 | E. coli BL21 (DE3) | 50 |
(Novagen) | |||
pHAB/PH | araB/T7 | E. coli XL-1 | 34 |
pYep ADH2 AH | ADH2 | Levadura BJ2.28 | 7 |
También se evaluaron varias construcciones de
expresión de E. coli que producían PAF-AH con
el extremo amino extendido. El extremo N-terminal
de la PAF-AH plasmática natural se identificó como
Ile_{42} por secuenciación de aminoácidos (Ejemplo 2). Sin
embargo, la secuencia inmediatamente cadena arriba de Ile_{92} no
corresponde a los aminoácidos encontrados en los sitios de escisión
de la secuencia señal [es decir, no se sigue la "regla
-3-1-", ya que la lisina no se encuentra en la
posición -1; véase von Heijne, Nuc. Acids. Res.,
14:4683-4690 (1986)]. Presumiblemente, el sistema
de secreción celular reconoce una secuencia señal más clásica
(M_{1} - A_{17}) y después produce una escisión
endoproteolítica. La secuencia codificante entera para
PAF-AH que comenzaba en la metionina de iniciación
(nucleótidos 162 a 1487 de la SEC ID NO: 7) se modificó por
ingeniería genética para la expresión en E. coli usando el
promotor de trp. Como se muestra en la Tabla 5, con esta
construcción se obtuvo PAF-AH activa, pero la
expresión estuvo a aproximadamente un quinto del nivel de la
construcción original que comenzaba en Ile_{42}. Otra
construcción de expresión, que comenzaba en Valla (nucleótidos 213
a 1487 de la SEC ID NO: 7), produjo PAF-AH activa a
aproximadamente un tercio del nivel de la construcción original.
Estos resultados sugieren que las extensiones amino terminales no
son críticas o necesarias para la actividad de la
PAF-AH recombinante producida en E. coli.
Actividad PAF-AH (U/ml/DO_{600}) | ||
Construcción | Lisado | Medio |
pUC trp AH | 177,7 | 0,030 |
pUC trp AH Met_{1} | 3,1 | 0,003 |
pUC trp AH Val_{18} | 54,6 | 0,033 |
Se purificó PAF-AH plasmática
humana recombinante (comenzando en Ile_{42}) expresada en E.
coli en una sola banda de SDS-PAGE teñida con
Coomassie por diversos métodos, y se ensayó con respecto a las
actividades presentadas por la enzima PAF-AH
nativa.
El primer procedimiento de purificación
utilizado es similar al descrito en el Ejemplo 1 para la
PAF-AH nativa. Las siguientes etapas se realizaron
a 4°C. Se lisaron sedimentos de 50 ml de E. coli que producía
PAF-AH (transformada con la construcción de
expresión trp AH) como se describe en el Ejemplo 8. Los sólidos se
retiraron por centrifugación a 10.000 g durante 20 minutos. El
sobrenadante se introdujo a un caudal de 0,8 ml/minuto en una
columna Blue Sepharose Fast Flow (2,5 cm x 4 cm; volumen del lecho
20 ml) equilibrada en tampón D (Tris-HCl 25 mM,
CHAPS 10 mM, NaCl 0,5 M, pH 7,5). La columna se lavó con 100 ml de
tampón D y se eluyó con 100 ml de tampón A que contenía KSCN 0,5 M
a 3,2 ml/minuto. Se introdujo una fracción activa de 15 ml en una
columna Cu Chelating Sepharose de 1 ml equilibrada en tampón D. La
columna se lavó con 5 ml de tampón D y después se eluyó con 5 ml de
tampón D que contenía imidazol 100 mM produciéndose el flujo por
gravedad. Las fracciones que contenían la actividad
PAF-AH se analizaron por
SDS-PAGE.
Los resultados de la purificación se muestran en
la Tabla 6, en la que una unidad equivale al número de \mumoles
de hidrólisis de PAF por hora. El producto de purificación obtenido
a 4°C aparecía en SDS-PAGE como una sola banda
intensa por debajo del marcador de 43 kDa, con alguna tinción
difusa directamente por encima y por debajo de este marcador. El
material recombinante es significativamente más puro y presenta más
actividad específica en comparación con las preparaciones de
PAF-AH plasmática como se describe en el Ejemplo
1.
Muestra | Vol | Acti- | Act. | Conc. | Act. | % Recup. | Factor de | ||
ml | vidad | Total | Prot | Específ. | actividad | multiplic. | |||
uds/ | uds x | mg/ml | uds/mg | Etapa | de la | ||||
ml | 10^{3} | Acum. | Purificación | ||||||
Etapa | |||||||||
Acum. | |||||||||
Lisado | 4,5 | 989 | 4451 | 15,6 | 63 | 100 | 100 | 1 | 1 |
Blue | 15 | 64 | 960 | 0,07 | 914 | 22 | 22 | 14,4 | 14,4 |
Cu | 1 | 2128 | 2128 | 0,55 | 3869 | 220 | 48 | 4,2 | 61 |
Cuando se realizó el mismo protocolo de
purificación a temperatura ambiente, además de la banda por debajo
del marcador de 43 kDa, aparecía un grupo de bandas por debajo del
marcador de 29 kDa correlacionadas con la actividad
PAF-AH de las porciones de gel ensayadas. Estas
bandas de menor peso molecular pueden ser fragmentos proteolíticos
de PAF-AH que retienen la actividad enzimática.
También se realizó un procedimiento de
purificación diferente a temperatura ambiente. Se resuspendieron
sedimentos (100 g) de células E. coli que producían
PAF-AH (transformadas con la construcción de
expresión pUC trp AH) en 200 ml de tampón de lisis (Tris 25 mM,
CHAPS 20 mM, NaCl 50 mM, EDTA 1 mM, 50 \mug/ml de benzamidina, pH
7,5) y se lisaron pasándolos tres veces a través de un
microfluidizador a 15.000 psi. Los sólidos se retiraron por
centrifugación a 14.300 x g durante 1 hora. El sobrenadante se
diluyó 10 veces en tampón de dilución [MES 25 mM (ácido
2-[N-morfolino]etanosulfónico), CHAPS 10 mM,
EDTA 1 mM, pH 4,9] y se introdujo a un caudal de 25 ml/minuto en
una Columna S Sepharose Fast Flow (200 ml) (una columna de
intercambio catiónico) equilibrada en Tampón E (MES 25 mM, CHAPS 10
mM, EDTA 1 mM, NaCl 50 mM, pH 5,5). La columna se lavó con 1 litro
de Tampón E, se eluyó con NaCl 1 M y el eluato se recogió en
fracciones de 50 ml que se ajustaron a pH 7,5 con 0,5 ml de base
Tris 2 M. Las fracciones que contenían la actividad
PAF-AH se reunieron y ajustaron a NaCl 0,05 M. El
conjunto de S se introdujo a un caudal de 1 ml/minuto en una columna
Blue Sepharose Fast Flow (2,5 cm x 4 cm; 20 ml) equilibrada en
Tampón F (Tris 25 mM, CHAPS 10 mM, NaCl 0,5 M, EDTA 1 mM, pH 7,5).
La columna se lavó con 100 ml de Tampón F y se eluyó con 100 ml de
Tampón F que contenía NaCl 3 M a un caudal de 4 ml/minuto. Después
se repitió la etapa de cromatografía en Blue Sepharose Fast Flow
para reducir los niveles de endotoxinas de la muestra.
Las fracciones que contenían la actividad
PAF-AH se reunieron y dializaron frente a Tampón G
(Tris 25 mM, pH 7,5, NaCl 0,5 M, Tween 80 al 0,1% y EDTA 1 mM).
Los resultados de la purificación se muestran en
la Tabla 7, en la que una unidad equivale al número de pinoles de
hidrólisis de PAF por hora.
\vskip1.000000\baselineskip
Muestra | Vol | Acti- | Act. | Conc. | Act. | % Recup. | Veces de | ||
ml | vidad | Total | Prot | Específ. | actividad | purificación | |||
uds/ | uds x | mg/ml | uds/mg | Etapa | Etapa | ||||
ml | 10^{3} | Acum. | Acum. | ||||||
Lisado | 200 | 5640 | 1128 | 57,46 | 98 | 100 | 100 | 1 | 1 |
S | 111 | 5742 | 637 | 3,69 | 1557 | 57 | 56 | 16 | 16 |
Blue | 100 | 3944 | 394 | 0,84 | 4676 | 35 | 62 | 3 | 48 |
El producto de purificación obtenido apareció en
la SDS-PAGE como una sola banda intensa por debajo
del marcador de 43 kDa con alguna tinción difusa directamente por
encima y por debajo del marcador. El material recombinante es
significativamente más puro y presenta una actividad específica
mayor en comparación con las preparaciones de PAF-AH
plasmática como se describe en el Ejemplo 1.
Otro procedimiento de purificación contemplado
por la presente invención implica las siguientes etapas de lisis
celular, clarificación y primera columna. Las células se diluyen 1:1
en tampón de lisis (Tris 25 mM, pH 7,5, NaCl 150 mM, Tween 80 y
EDTA 2 mM). La lisis se realiza en un microfluidizador enfriado a
15.000-20.000 psi con tres fases del material para
producir > 99% de rotura celular. El lisado se diluye a 1:20 en
tampón de dilución (Tris 25 mM, pH 8,5, EDTA 1 mM) y se aplica a
una columna rellena de medio de cromatografía
Q-Sepharose Big Bead (Pharmacia) equilibrado en
Tris 25 mM, pH 8,5, EDTA 1 mM, y 0,015% de Tween 80. El eluato se
diluyd a 1:10 en MES 25 mM pH 5,5, sulfato amónico 1,2 M y EDTA 1
mM y se aplica a medio de cromatografía de Butyl Sepharose
(Pharmacia) equilibrado en el mismo tampón. La actividad
PAF-AH se eluye en MES 25 mM, pH 5,5, 0,1% de Tween
80 y EDTA 1 mM.
La propiedad más destacada del PAF
acetilhidrolasa es su notable especificidad por sustratos con un
resto corto en la posición sn-2 del sustrato. Esto
distingue la especificidad estricta del PAF acetilhidrolasa de otras
formas de PLA_{2}. Así pues, para determinar si la
PAF-AH recombinante degrada los fosfolípidos con
ácidos grasos de cadena larga en la posición sn-2,
se ensayó la hidrólisis de
1-palmitoil-2-araquidonoil-sn-glicero-3-fosfocolina
(araquidonoilPC), ya que éste es el sustrato preferido para una
forma bien caracterizada de PLA_{2}. Como se prevé por los
estudios previos con la PAF-AH nativa, este
fosfolípido no se hidrolizó cuando se incubó con
PAF-AH recombinante. En otros experimentos, se
incluyó araquidonoilPC en un ensayo convencional de hidrólisis de
PAF a concentraciones que variaban de 0 a 125 \muM para
determinar si inhibía la hidrólisis de PAF por
PAF-AH recombinante. No hubo inhibición de la
hidrólisis de PAF incluso a la mayor concentración de
PAF-AH, que era 5 veces mayor que la concentración
de PAF. Así pues, la PAF-AH recombinante presenta la
misma selectividad de sustrato que la enzima nativa; no se
reconocen los sustratos de cadena larga. Además, la enzima
PAF-AH recombinante degrada rápidamente un
fosfolípido oxidado (glutaroilPC) que había sufrido escisión
oxidativa del ácido graso sn-2. La
PAF-AH plasmática nativa tiene otras diversas
propiedades que la distinguen de otras fosfolipasas, que incluyen
la independencia de calcio y la resistencia a compuestos que
modifican los grupos sulfhidrilo o rompen enlaces disulfuro.
Tanto la enzima PAF-AH
plasmática recombinante como la nativa son sensibles a DFP, lo que
indica que una serina constituye parte de sus sitios activos. Una
característica poco habitual del PAF acetilhidrolasa plasmático
nativo es que está muy asociado con lipoproteínas circulantes, y su
eficacia catalítica está influenciada por el medio lipoproteico.
Cuando la PAF-AH recombinante de la invención se
incubó con plasma humano (previamente tratado con DFP para anular la
actividad enzimática endógena), se asoció con lipoproteínas de baja
y de alta densidad de la misma manera que la actividad nativa. Este
resultado es significativo, porque existen indicios sustanciales de
que la modificación de las lipoproteínas de baja densidad es
esencial para la deposición de colesterol observada en los
ateromas, y de que la oxidación de los lípidos es un factor de
iniciación de este proceso. La PAF-AH protege a las
lipoproteínas de baja densidad de la modificación en condiciones
oxidantes in vitro y puede tener un papel similar in
vivo. Así pues, la administración de PAF-AH
está indicada para la supresión de la oxidación de las
lipoproteínas en placas ateroscleróticas así como para resolver una
inflamación.
Todos estos resultados confirman que el clon de
ADNc sAH 406-3 codifica una proteína con las
actividades de la PAF acetilhidrolasa de plasma humano.
Se expresaron en E. coli otros diversos
productos de PAF-AH recombinante. Los productos
incluían análogos de PAF-AH que tenían mutaciones de
un solo aminoácido y fragmentos de PAF-AH.
La PAF-AH es una lipasa porque
hidroliza el fosfolípido PAF. Aunque no gxiste ninguna analogía
evidente entre PAF-AH y otras lipasas
caracterizadas, se han encontrado residuos conservados en
comparaciones de lipasas caracterizadas estructuralmente. Se ha
identificado una serina como miembro del sitio activo. La serina,
junto con un resto de aspartato y un resto de histidina, forman una
tríada catalítica que representa el sitio activo de la lipasa. Los
tres restos no están adyacentes en la secuencia primaria de la
proteína, pero ciertos estudios estructurales han demostrado que
los tres restos están adyacentes en el espacio tridimensional. Las
comparaciones de las estructuras de las lipasas de mamífero sugieren
que el resto Asp generalmente está a una distancia de veinte
aminoácidos en posición C-terminal con respecto a la
serina del sitio activo. Además, la histidina generalmente está a
una distancia de 109 a 111 aminoácidos en posición
C-terminal con respecto a la serina del sitio
activo.
Mediante mutagénesis de localización dirigida y
PCR, se modificaron codones individuales de la secuencia
codificante de la PAF-AH humana para codificar
restos de alanina y se expresaron en E. coli. Como se
muestra en la Tabla 8 mostrada a continuación, en la que, por
ejemplo, la abreviatura "S108A" indica que el resto de serina
en posición 273 se cambió por una alanina, las mutaciones puntuales
de Ser_{273}, Asp_{296} o His_{351} destruyen completamente
la actividad PAF-AH. Las distancias entre los
restos de sitios activos es similar para PAF-AH (de
Ser a Asp, 23 aminoácidos; de Ser a His, 78 aminoácidos) y otras
lipasas. Estos experimentos demuestran que la Ser_{273}, el
Asp_{296} y la His_{351} son restos críticos para la actividad
y que, por lo tanto, son candidatos probables de restos de tríadas
catalíticas. Las cisteínas a menudo son críticas para la integridad
funcional de las proteínas a causa de su capacidad de formar
enlaces disulfuro. La enzima PAF-AH plasmática
contiene cinco cisteínas. Para determinar si alguna de las cinco es
crítica para la actividad enzimática, cada cisteína se mutó
individualmente a una serina y los mutantes resultantes se
expresaron en E. coli. Como se muestra a continuación en la
Tabla 8, se obtuvo una pérdida significativa pero no total de
actividad PAF-AH por la conversión de Cys_{229} o
Cys_{291} en serina. Por lo tanto, estas cisteínas parecen ser
necesarias para la actividad PAF-AH completa. Otras
mutaciones puntuales tuvieron un efecto pequeño o nulo sobre la
actividad catalítica de PAF-AH. En la Tabla 8,
"++++" representa la actividad PAF-AH de tipo
silvestre de aproximadamente 40-60 U/ml/DO_{600},
"+++" representa una actividad de aproximadamente
20-40 U/ml/DO_{600}, "++" representa una
actividad de aproximadamente 10-20 U/ml/DO_{600},
"+" representa una actividad de 1-10
U/ml/DO_{600} y "-" indica una actividad < 1
U/ml/DO_{600}.
\vskip1.000000\baselineskip
\dotable{\tabskip\tabcolsep\hfil#\hfil\+\hfil#\hfil\+\hfil#\hfil\tabskip0ptplus1fil\dddarstrut\cr}{ Mutación \+ \hskip4cm \+ Actividad PAF-AH \cr \+\+\cr Tipo silvestre \+ \+ ++++\cr S108A \+ \+ ++++\cr S273A \+ \+ -\cr D296A \+ \+ -\cr D338A \+ \+ ++++\cr H351A \+ \+ -\cr H395A, H399A \+ \+ ++++\cr C67S \+ \+ +++\cr C229S \+ \+ +\cr C291S \+ \+ +\cr C334S \+ \+ ++++\cr C407S \+ \+ +++\cr}
Se prepararon deleciones
C-terminales digiriendo el extremo 3' de la
secuencia codificante de PAF-AH con la exonucleasa
III durante diversos periodos de tiempo y después uniendo la
secuencia codificante acortada al ADN plasmídico que codificaba
codones stop en las tres fases de lectura. Se caracterizaron tres
construcciones de deleción diferentes por análisis de la secuencia
de ADN, expresión de proteínas y actividad PAF-AH.
La eliminación de veintiún a treinta aminoácidos
C-terminales redujo en gran medida la actividad
catalítica y la eliminación de cincuenta y dos restos destruyó
completamente la actividad. Véase la Figura 3.
Se realizaron deleciones similares en el extremo
amino terminal de PAF-AH. Se prepararon fusiones de
PAF-AH con tiorredoxina de E. coli en el
extremo N-terminal para facilitar un alto nivel de
expresión constante de actividad PAF-AH [LaVallie y
colaboradores, Bio/technology, 11: 187-193 (1993)].
La eliminación de diecinueve aminoácidos del extremo
N-terminal procesado de forma natural (Ile_{2})
destruyó completamente la actividad enzimática en la proteína de
fusión. Véase la Figura 3.
Se realizó un análisis preliminar de los modelos
de expresión de ARNm de PAF-AH de plasma humano en
tejidos humanos por hibridación de transferencia de Northern.
El ARN se preparó a partir de corteza cerebral
humana, corazón, riñón, placenta, timo y amígdalas usando ARN Stat
60 (Tel-Test "B", Friendswood, TX). Además, se
preparó ARN a partir de la línea de células de tipo precursor
hematopoyético humano, THP-1 (ATCC TIB 202), que se
indujo para diferenciar un fenotipo de tipo macrófago usando el
éster de forbol miristilacetato de forbol (PMA). El ARN tisular y
el ARN preparado a partir de la línea de células
THP-1 premielocítica antes y de 1 a 3 días después
de la inducción se sometieron a electroforesis a través de un gel
de agarosa y formaldehído al 1,2% y posteriormente se transfirieron
a una membrana de nitrocelulosa. El ADNc de PAF-AH
de plasma humano de longitud completa, sAH 406-3, se
tiñó mediante cebado aleatorio y se hibridó con la membrana en
condiciones idénticas a las descritas en el Ejemplo 3 para la
selección de la biblioteca. Los resultados iniciales indican que la
sonda de PAF-AH hibridaba con una banda de 1,8 kb
presente en el ARN del timo, de las amígdalas y, en un menor grado,
en el ARN placentario.
También se examinó la expresión del ARN de
PAF-AH en monocitos aislados a partir de sangre
humana y durante su diferenciación espontánea en macrófagos en
cultivo. En los monocitos recientes se detectó poco o nada de ARN,
pero la expresión se indujo y mantuvo durante la diferenciación en
macrófagos. Hubo una acumulación concomitante de actividad
PAF-AH en el medio de cultivo de las células en
diferenciación. La expresión del transcrito de
PAF-AH en plasma humano también se observó en el
ARN de las células THP-1 en el día 1, pero no 3 días
después de la inducción. Las células THP-1 no
expresaban ARNm para PAF-AH en el estado basal.
La expresión de PAF-AH en
tejidos humanos y de ratón se examinó por hibridación in
situ.
Se obtuvieron tejidos humanos del National
Disease Research Interchange y la Cooperative Human Tissue Network.
El cerebro y la médula espinal de ratones normales, y las médulas
espinales de ratones con EAE de fase 3 se extrajeron a partir de
ratones S/JLJ. Los embriones de ratones S/JLJ normales se
extrajeron de once a dieciocho días después de la
fertilización.
Las secciones tisulares se pusieron en
criomoldes Tissue Tek II (Miles Laboratories, Inc., Naperville, IL)
con una pequeña cantidad de compuesto OCT (Miles, Inc., Elkhart,
IN). Se centraron en el criomolde, el criomolde se rellenó con
compuesto OCT, después se puso en un recipiente con
2-metilbutano
[C_{2}H_{5}CH(CH_{3})_{2}, Aldrich Chemical
Company, Inc., Milwaukee, WI] y el recipiente se puso en nitrógeno
líquido. Una vez congelados el tejido y el compuesto OTO en el
criomolde, los bloques se almacenaron a -80°C hasta que se
seccionaron. Los bloques de tejido se seccionaron con espesores de 6
\mum, se adhirieron a portaobjetos recubiertos con Vectabond
(Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA), se almacenaron a
-70°C, se pusieron a 50°C durante aproximadamente 5 minutos para
calentarlos y eliminar la condensación, y después se fijaron en
paraformaldehído al 4% durante 20 minutos a 4°C, se deshidrataron
(70%, 95%, 100% de etanol) durante 1 minuto a 4°C en cada grado, y
después se dejaron secar al aire durante 30 minutos a temperatura
ambiente. Las secciones se desnaturalizaron durante 2 minutos a
70°C en formamida al 70% (2X SSC, se aclararon dos veces en 2X SSC,
se deshidrataron y después se secaron al aire durante 30 minutos.
Los tejidos se hibridaron in situ con ARNm de una sola
cadena radiomarcado generado a partir de ADN derivado de un
fragmento HindIII interno de 1 kb del gen PAF-AH
(nucleótidos 308 a 1323 de la SEC ID NO: 7) mediante incorporación
de ^{35}S-UTP en la transcripción de ARN in
vitro (AMER-sham).
Las sondas se usaron a longitudes variables de
250-500 pb. La hibridación se realizó durante una
noche (12-16 horas) a 50°C; al tampón de hibridación
se añadieron las ribosondas marcadas con ^{35}S (6 x 10^{5}
cpm/sección), ARNt (0,5 \mug/sección) y agua tratada con
dietilpirocarbonato (depc) para llevarlo a una concentración final
de 50% de formamida, NaCl 0,3 M, Tris 20 mM, pH 7,5, 10% de sulfato
de extrano, 1X de solución de Denhardt, ditiotreitol (DTT) 100 mM y
EDTA 5 mM. Después de la hibridación, las secciones se lavaron
durante 1 hora a temperatura ambiente en 4X SSC/DTT 10 mM, después
durante 40 minutos a 60°C en 50% de formamida/1X SSC/DTT 10 mM, 30
minutos a temperatura ambiente en 2X SSC, y 30 minutos a temperatura
ambiente en 0,1X SSC. Las secciones se deshidrataron, se secaron al
aire durante 2 horas, se revistieron con emulsión fotográfica Kodak
NTB2 y se secaron al aire durante 2 horas, se revelaron (después
del almacenamiento a 4°C en la oscuridad completa) y se tiñeron con
hematoxilina/eosina como colorantes de contraste.
Cerebelo. Tanto en el cerebro de ratón como en
el cerebro humano, se observó una señal fuerte en la capa de células
de Purkinje del cerebelo, así como en los cuerpos de las células
neuronales individuales del núcleo dentado (uno de los cuatro
núcleos profundos del cerebelo). Además, se observó una señal en
las células individuales de las capas granular y molecular de la
materia gris.
Hipocampo. En la sección de hipocampo humano,
las células individuales presentes a lo largo de toda la sección,
que parecen ser cuerpos de células neuronales, mostraron señales
fuertes.
Tallo Cerebral. Tanto en las secciones de tallo
cerebral humano como en las de ratón, se observó una señal fuerte
en las células individuales de la materia gris.
Corteza. En las secciones de corteza humana
tomadas de las cortezas cerebral, occipital y temporal, y en las
secciones de cerebro entero de ratón, las células individuales
presentes a lo largo de toda la corteza mostraron señales fuertes.
No parece haber diferenciación en el modelo de expresión en las
diferentes capas de la corteza. Estos resultados de hibridación
in situ son diferentes de los resultados para la corteza
cerebral obtenidos por transferencia de Northern. Probablemente, la
diferencia se debe a la mayor sensibilidad de la hibridación in
situ en comparación con la de la Transferencia de Northern.
Pituitaria. Se observó una señal algo más débil
en células individuales dispersas del pars distalis de la sección de
tejido humano.
Tanto el colon normal como el colon con la
enfermedad de Crohn presentaron señales en las agregaciones
linfáticas presentes en la mucosa de las secciones, siendo el nivel
de señal ligeramente mayor en la sección del paciente con la
enfermedad de Crohn. El colon con la enfermedad de Crohn también
tenía una señal fuerte en la lámina propia. Análogamente, se observó
un alto nivel de señal en una sección enferma del apéndice,
mientras que el apéndice normal presentaba una señal menor pero
detectable. Las secciones procedentes de un paciente con colitis
ulcerosa no mostraron ninguna señal evidente ni en las agregaciones
linfáticas ni en la lámina propia.
Se observaron señales fuertes en grupos
dispersos de células individuales dentro de los centros germinales
de las amígdalas y dentro del timo.
Se observó una señal fuerte en la sección de
ganglio linfático tomada a partir de un donante normal, mientras
que se observó una señal algo débil en los ganglios linfáticos de la
sección de un donante con choque séptico.
Tanto el intestino delgado normal como el
intestino delgado con la enfermedad de Crohn tuvieron señales
débiles en las placas de Peyer y la lámina propia en las secciones,
siendo la señal ligeramente mayor en el tejido enfermo.
No se observó señal en ninguno de los tejidos de
bazo (secciones normales y de abscesos esplénicos) ni de pulmón
(secciones normales y de enfisema).
Tanto en las médulas espinales de ratones
normales como en las médulas espinales de ratones con EAE de fase 3,
hubo una señal fuerte en la materia gris de la médula espinal,
siendo la expresión ligeramente mayor en la médula espinal de los
ratones con EAE de fase 3. En la médula espinal de los ratones con
EAE de fase 3, las células de la materia blanca y los manguitos
perivasculares, probablemente macrófagos y/u otros leucocitos
infiltrantes, mostraron señales que estaban ausentes en la médula
espinal normal.
En el embrión de 11 días fue evidente una señal
en el sistema nervioso central en el cuarto ventrículo, que
permaneció a lo largo de todo el periodo de tiempo hasta que se
desarrolló el cerebelo y el tallo cerebral. Según maduraban los
embriones, la señal se hizo evidente en el sistema nervioso central
en la médula espinal (día 12), en la corteza primaria y en ganglio
de Gasser (día 14) y en la hipófisis (día 16). Se observó una señal
en el sistema nervioso periférico (desde el día 14 ó 15) o en los
nervios que salían de la médula espinal y, en el día 17, apareció
una señal fuerte alrededor de los filamentos del embrión. También
se observó expresión en el hígado y pulmón en el día 14, en el
intestino (desde el día 15) y en la porción posterior de la
boca/garganta (desde el día 16). En el día 18, el modelo de
expresión se había diferenciado en señales en la corteza,
metencéfalo (cerebelo y tallo cerebral), nervios que dejan la
región lumbar de la médula espinal, la porción posterior de la
boca/garganta, el hígado, el riñón y una posible señal débil en el
pulmón y el intestino.
La expresión del ARNm de PAF-AH
en las amígdalas, timo, ganglios linfáticos, placas de Peyer,
apéndice y agregados linfáticos de colon es coherente con las
conclusiones de que la fuente predominante probable in vivo
de PAF-AH es el macrófago, porque todos estos
tejidos tienen altas poblaciones de macrófagos que sirven como
células fagocíticas y procesadoras de antígenos.
La expresión de la PAF-AH en
tejidos inflamados sería coherente con la hipótesis de que un papel
de los macrófagos derivados de monocitos es resolver la inflamación.
Sería de esperar que la PAF-AH inactivara el PAF y
los fosfolípidos pro-inflamatorios, regulando así
negativamente la cascada inflamatoria de acontecimientos iniciados
por estos mediadores.
El PAF se ha detectado en tejido cerebral entero
y se secreta por las células de los gránulos cerebelares de rata
en cultivo. Ciertos experimentos in vitro e in vivo
han demostrado que PAF se une a un receptor específico de los
tejidos neurales e induce cambios funcionales y fenotípicos tales
como movilización de calcio, regulación positiva de genes
activadores de la transcripción y diferenciación de la línea de
células precursoras neurales, PC12. Estas observaciones sugirieron
un papel fisiológico para PAF en el cerebro y, de forma coherente
con esto, ciertos experimentos recientes que usan cultivos de
secciones tisulares del hipocampo y análogos y antagonistas de PAF,
han implicado al PAF como un mensajero retrógado importante en la
potenciación del hipocampo a largo plazo. Por lo tanto, además de
su efecto patológico en la inflamación, el PAF parece participar en
el proceso de señalización neuronal rutinario. La expresión del
PAF-AH extracelular en el cerebro puede servir para
regular la duración y magnitud de la señalización mediada por
PAF.
Se generaron anticuerpos monoclonales
específicos para la PAF-AH de plasma humano
recombinante usando PAF-AH producida por E.
coli como inmunógeno.
El ratón n° 1342 se inyectó en el día 0, en el
día 19 y en el día 40 con PAF-AH recombinante. Para
el refuerzo de prefusión, se inyectó al ratón el inmunógeno en PBS.
Cuatro días después el ratón se sacrificó, se extrajo su bazo de
forma estéril y se puso en 10 ml de RPMI 1640 sin suero. Se formó
una suspensión de una sola célula triturando el bazo entre los
extremos deslustrados de dos portaobjetos de microscopio de vidrio
sumergidos en RPMI 1640 sin suero, suplementado con
L-glutamina 2 mM, piruvato sódico 1 mM, 100
unidades/ml de penicilina y 100 \mug/ml de estreptomicina (RPMI)
(Gibco, Canadá). La suspensión celular se filtró a través de un
tamiz de células Nitex de malla 70 estéril (Becton Dickinson,
Parsippany, New Jersey) y se lavó dos veces por centrifugación a 200
g durante 5 minutos, resuspendiendo el sedimento en 20 ml de RPMI
sin suero. Los timocitos tomados a partir de tres ratones Balb/c
sobre los que no se había experimentado previamente, se prepararon
de una forma similar. Las células de mieloma NS-1,
mantenidas en fase logarítmica en RPMI con un 11% de suero bovino
fetal (FBS) (Hyclone Laboratories, Inc., Logan, Utah) durante tres
días antes de la fusión, se centrifugaron a 200 g durante 5 minutos
y el sedimento se lavó dos veces como se describe en el párrafo
anterior.
Se reunieron 1 x 10^{8} células de bazo con
2,0 x 10^{7} células NS-1, se centrifugaron y el
sobrenadante se aspiró. El sedimento celular se desprendió tapando
el tubo y añadiendo 1 ml de PEG 1500 (50% en HEPES 75 mM, pH 8,0)
(Boehringer Mannheim) a 37°C, con agitación durante 1 minuto,
seguido de la adición de 7 ml de RPMI sin suero durante 7 minutos.
Se añadieron 8 ml más de RPMI y las células se centrifugaron a 200
g durante 10 minutos. Después de desechar el sobrenadante, el
sedimento se resuspendió en 200 ml de RPMI que contenía un 15% de
FBS, hipoxantina sódica 100 \muM, aminopterina 0,4 \muM,
timidina 16 \muM (HAT) (Gibco), 25 uds/ml de
I:L-6 (Boehringer Mannheim) y 1,5 x 10^{6}
timocitos/ml y se cultivó en placas de cultivo de tejidos de 96
pocillos de fondo plano Corning (Corning, Corning N.Y.).
En los días 2, 4 y 6, después de la fusión, se
retiraron 100 \mul de los pocillos de las placas de fusión y se
reemplazaron con medio nuevo. En e], día 8, la fusión se investigó
por ELISA, ensayando la presencia de unión de IgG de ratón a la
PAF-AH recombinante. Se recubrieron placas Immulon
4 (Dynatech, Cambridge, MA) durante 2 horas a 37°C con 100
ng/pocillo de PAF-AH recombinante diluida en TRIS
25 mM, pH 7,5. La solución de recubrimiento se aspiró, se añadieron
200 \mul/pocillo de solución bloqueante [gelatina de piel de
pescado al 0,5% (Sigma) diluida en CMF-PBS] y la
mezcla se incubó durante 30 minutos a 37°C. Las placas se lavaron
tres veces con PBS con Tween 20 al 0,05% (PBST) y se añadieron 50
\mul de sobrenadante de cultivo. Después de la incubación a 37°C
durante 30 minutos y del lavado como se ha indicado anteriormente,
se añadieron 50 \mul de IgG(fc) anti-ratón
de cabra conjugada con peroxidasa de rábano picante (Jackson
ImmunoResearch, West Grove, Pennsylvania) diluida a 1:3500 en PBST.
Las placas se incubaron como se ha indicado anteriormente, se
lavaron cuatro veces con PBST y se añadieron 100 \mu1 de
sustrato, que constaba de 1 mg/ml de
o-fenilendiamina (Sigma) y 0,1 \mul/ml de
H_{2}O_{2} al 30% en Citrato 100 mM, pH 4,5. La reacción
coloreada se interrumpió en 5 minutos con la adición de 50 \mul de
H_{2}SO_{4} al 15%. La A_{490} se leyó en un lector de placas
(Dynatech).
Los pocillos de fusión seleccionados se clonaron
dos veces por dilución en placas de 96 pocillos y se evaluó
visualmente el número de colonias/pocillo tras 5 días. Los
hibridomas clonados fueron 90D1E, 90E3A, 90E6C, 90G11D (ATCC HB
11724) y 90F2D (ATCC HB 11725).
Los anticuerpos monoclonales producidos por los
hibridomas se isotipificaron usando el sistema Isostrip (Boehringer
Mannheim, Indianapolis, IN). Los resultados demostraron que todos
los anticuerpos monoclonales producidos por los hibridomas a partir
de la fusión 90 fueron IgG_{1}.
Se llevaron a cabo estudios experimentales para
evaluar los efectos terapéuticos in vivo de
PAF-AH recombinante de la invención sobre la
inflamación aguda, utilizando un modelo de edema de pata de la rata
[Henriques y colaboradores, Br. J. Pharmacol., 106:
579-582 (1992)]. Los resultados de estos estudios
demostraron que la PAF-AH bloquea el edema inducido
por PAF. Se realizaron estudios paralelos para comparar la eficacia
de PAF-AH con dos antagonistas comercialmente
disponibles del PAF.
Se lisaron en un microfluidizador células E.
coli transformadas con el vector de expresión de
PAF-AH puc trp AH, se retiraron los sólidos por
centrifugación y los sobrenadantes celulares se introdujeron en una
columna de S-Sepharose (Pharmacia). La columna se
lavó exhaustivamente con tampón formado por NaCl 50 mM, CHAPS 10
mM, MES 25 mM y EDTA 1 mM, pH 5,5. La PAF-AH se
eluyó mediante un aumento de la concentración de NaCl en el tampón
a 1 M. A continuación, se utilizó cromatografía de afinidad con una
columna Blue Sepharose (Pharmacia) como etapa adicional de la
purificación. Antes de cargar la preparación de
PAF-AH en la columna Blue Sepharose, la muestra se
diluyó 1:2 para reducir la concentración de NaCl a 0,5M y el pH se
ajustó a 7,5. Después de lavar exhaustivamente la columna Blue
Sepharose con tampón formado por NaCl 0,5M, Tris 25 mM, CHAPS 10 mM
y EDTA 1 mM, pH 7,5, la PAF-AH se eluyó
incrementando la concentración de NaCl a 3,0M.
La pureza de la PAF-AH aislada
de esta manera fue en general del 95% según la evaluación por
SDS-PAGE, con actividad en el intervalo de
5000-10.000 U/ml. Los controles adicionales de
calidad realizados en cada preparación de PAF-AH
incluyeron la determinación de niveles de endotoxina y actividad
hemolítica en eritrocitos de rata recién obtenidos. Un tampón que
contenía Tris 25 mM, CHAPS 10 mM, NaCl 0,5M, pH 7,5 actuó como
medio de almacenamiento de la enzima, así como vehículo para la
administración. Las dosificaciones utilizadas en los experimentos se
basaron en ensayos de actividad enzimática llevados a cabo
inmediatamente antes de los experimentos.
En todos los ensayos se utilizaron ratas Long
Evans hembras de seis a ocho semanas de edad (Charles River,
Wilmington, MA), de 180-220 gramos de peso. Antes de
las manipulaciones experimentales, los animales fueron anestesia-
dos con una mezcla de los anestésicos Ketaset (Fort Dodge
Laboratories, Fort Dodge, IA), Rompun (Miles, Shawnee Mission, KS) y
Ace Promazine (Aveco, Fort Dodge, IA), administrada por vía
subcutánea a una dosis de aproximadamente 2,5 mg de Jetaset, 1,6 g
de Rompun, 0,2 mg de Ace Promazine por animal y dosis. El edema se
indujo en la pata mediante la administración de PAF o zimosan, de
la forma siguiente. Se utilizó PAF recién preparado (Sigma No
P-1402) para cada experimento a partir de una
solución madre de 19,1 mM almacenada en clorbformo/metanol (9:1) a
-20°C. Los volúmenes requeridos se secaron bajo N_{2}, se
diluyeron 1:1000 en un tampón que contenía NaCl 150 mM, Tris 10 mM,
pH 7,5 y BSA al 0,25%, y se sonicaron durante 5 minutos. Los
animales recibieron 50 \mul de PAF (dosis final de 0,96 nmoles)
por vía subcutánea entre las almohadillas de la pata trasera y el
edema se evaluó después de 1 hora y nuevamente después de 2 horas
en algunos experimentos. Se preparó Zymosan A (Sigma No.
A-8800) para cada experimento en forma de una
suspensión de 10 mg/ml en PBS. Los animales recibieron 50 \mul de
zymosan (dosis final 500 \mug) por vía subcutánea entre las
almohadillas de la pata trasera y el edema se evaluó después de 2
horas.
El edema se cuantificó midiendo el volumen de la
pata inmediatamente antes de la administración de PAF o zymosan y
en un momento indicado posterior a la inducción con PAF o zymosan.
El edema se expresa como el incremento del volumen de la pata en
milímetros. Se realizaron mediciones de desplazamiento del volumen
en los animales anestesiados utilizando un pletismómetro (UGO
Basile, modelo n° 7150) que mide el volumen de agua desplazado por
la pata sumergida. Con el fin de asegurar que la inmersión de la
pata era comparable de un momento a otro de medición, las patas
traseras se marcaron con tinta indeleble en el punto en que la
línea de pelo se une con el talón. Las mediciones repetidas de la
misma pata utilizando esta técnica indican que la precisión se
encontraba dentro del 5%.
La PAF-AH se inyectó de forma
local entre las almohadillas de la pata, o de forma sistemática por
inyección IV en la vena caudal. Para la administración local, las
ratas recibieron 100 \mul de PAF-AH
(4000-6000 U/ml) administrados por vía subcutánea
entre las almohadillas de la pata trasera derecha. La pata izquierda
sirvió como control mediante la administración de 100 \mul de
vehículo (solución salina tamponada). Para la administración
sistémica de PAF-AH, las ratas recibieron las
unidades indicadas de PAF-AH en 300 \mul de
vehículo, administrados por vía IV en la vena caudal. Los controles
recibieron el volumen apropiado de vehículo IV en la vena
caudal.
Se inyectaron a las ratas (N=4) 100 \mul de
PAF-AH (4000-6000 U/ml) por vía
subcutánea entre las almohadillas de la pata derecha. En la pata
izquierda se inyectaron 100 \mul de vehículo (solución salina
tamponada). En otras cuatro ratas se inyectó solamente el vehículo.
Todas las ratas fueron estimuladas inmediatamente con PAF a través
de una inyección subcutánea en la pata y los volúmenes de las patas
se evaluaron 1 hora después de la inyección. La Figura 4, en la que
el edema se expresa como un incremento medio del volumen de la pata
(ml) \pm SEM para cada grupo de tratamiento, ilustra que el edema
de pata inducido por PAF se bloquea por la administración local de
PAF-AH. El grupo que recibió tratamiento local de
PAF-AH antes de la estimulación con PAF mostró una
inflamación reducida comparada con el grupo con inyección de
control. Se observó un incremento del volumen de la pata de 0,08 ml
\pm 0,08 (SEM) en el grupo de PAF-AH, frente a
0,63 \pm 0,14 (SEM) en los controles tratados con vehículo. El
aumento del volumen de la pata fue resultado directo de la inyección
de PAF, puesto que los animales en los que se inyectó únicamente el
vehículo no exhibieron incremento alguno del volumen de la
pata.
Se pretrataron ratas (N=4 por grupo) por vía IV
con PAF-AH (2000 U en 300 pl de vehículo) o vehículo
solo, 15 minutos antes de la estimulación con PAF. El edema se
evaluó 1 y 2 horas después de la estimulación con PAF. La Figura 5,
en la que el edema se expresa como incremento medio en volumen (ml)
\pm SEM para cada grupo de tratamiento, ilustra que la
administración IV de PAF-AH bloqueó el edema de pata
inducido por PAF tanto una como dos horas después del estímulo. El
grupo que recibió 2000 U de PAF-AH administradas
por vía IV mostró una reducción de la inflamación durante el ciclo
de dos horas. El incremento medio en el grupo tratado con
PAF-AH a las dos horas fue de 0,10 ml \pm 0,08
(SEM), frente a 0,56 ml \pm 0,11 para los controles tratados con
vehículo.
Se pretrataron ratas (N=4 por grupo) por vía IV
con PAF-AH (2000 U en 300 \mul de vehículo) o
vehículo solo. Quince minutos después del pretratamiento, los grupos
recibieron PAF o zymosan A y se evaluó el volumen de la pata
después de 1 y 2 horas, respectivamente. Tal como se muestra en la
Figura 6, en la que el edema se expresa como incremento medio de
volumen (ml) \pm SEM para cada grupo de tratamiento, la
administración sistémica de PAF-AH (2000 U) fue
eficaz en reducir el edema de la pata inducido por PAF, pero
fracasó en el bloqueo del edema inducido por zymosan. Se registró
un incremento medio de volumen de 0,08 \pm 0,02 en el grupo
tratado con PAF-AH frente a 0,49 \pm 0,03 para el
grupo de control.
En dos experimentos separados, se pretrataron
grupos de ratas (N=3 a 4 por grupo) por vía IV con diluciones
seriadas de PAF-AH o vehículo de control en un
volumen de 300 \mul, 15 minutos antes de la estimulación con PAF.
Ambas patas fueron estimuladas con PAF (como se ha descrito
anteriormente) y el edema se evaluó después de 1 hora. La Figura 7,
en la que el edema se expresa como el incremento medio en volumen
(ml) \pm SEM para cada grupo de tratamiento, ilustra el aumento
de protección contra el edema inducido por PAF en ratas inyectadas
con dosis crecientes de PAF-AH. En los
experimentos, la DI_{50} de PAF-AH administrada
por vía IV resultó ser de entre 40 y 80 U por rata.
En dos experimentos separados, se pretrataron
dos grupos de ratas (N=3 a 4 por grupo) por vía IV con
PAF-AH (2000 U en 300 \mul de vehículo) o
vehículo solo. Tras la administración, los grupos recibieron PAF en
puntos de tiempo que oscilaban desde 15 minutos hasta 47 horas
después de la administración de PAF-AH. A
continuación, se evaluó el edema 1 hora después de la estimulación
con PAF. Tal como se muestra en la Figura 8, en la que el edema se
expresa como el incremento medio en volumen (ml) \pm SEM para
cada grupo de tratamiento, la administración de 2000 U de
PAF-AH protege a las ratas contra el edema inducido
por PAF durante al menos 24 horas.
Cuatro ratas recibieron 2000 U de
PAF-AH por inyección IV en 300 \mul de volumen.
Se recogió el plasma en diversos momentos y se almacenó a 4°C,
determinándose las concentraciones de PAF-AH por
ELISA, utilizando un ensayo de captura de doble mAb. En resumen, el
anticuerpo monoclonal 90G11D (Ejemplo 13) se diluyó en tampón
carbonato 50 mM a pH 9,6 a 100 ng/ml y se inmovilizó sobre placas
ELISA Immulon 4 durante una noche a 4°C. Después de un lavado
exhaustivo con PBS que contenía Tween 20 al 0,05%, las placas se
bloquearon durante una hora a temperatura ambiente con 0,5% de
gelatina de piel de pescado (Sigma) diluida en PBS. Las muestras de
suero, diluidas en PBS con CHAPS 15 mM se añadieron por duplicado a
la placa lavada de ELISA y se incubaron durante 1 hora a temperatura
ambiente. Después del lavado, se añadió un conjugado de biotina de
anticuerpo monoclonal 90F2D (Ejemplo 13) a los pocillos a una
concentración de 5 \mug/ml diluido en PBS y se incubó durante 1
hora a temperatura ambiente. Después del lavado, se añadieron 50
\mul de una dilución 1:1000 de ExtraAvidin (Sigma) a los pocillos
y se incubaron durante 1 hora a temperatura ambiente. Después del
lavado, los pocillos se revelaron utilizando OPD como sustrato y se
cuantificaron. Después se calculó la actividad enzimática se
calculó de una curva patrón. La Figura 9, en la que los puntos de
datos representan medias \pm SEM, demuestra que los niveles en
plasma al cabo de una hora se aproximaron a la concentración
prevista basada en el volumen de plasma de 5-6 ml
para ratas de 180-200 gramos, media = 374 U/ml \pm
58,2. Después de una hora, los niveles en plasma disminuyeron de
manera constante, alcanzando una concentración media en plasma de
19,3 U/ml \pm 3,4 a las 24 horas, que sigue siendo
considerablemente superior a los niveles endógenos de
PAF-AH en la rata, que son de aproximadamente 4
U/ml según se determina por ensayos enzimáticos.
Se pretrataron grupos de ratas (N=4 por grupo)
con uno de los tres antiinflamatorios potenciales: el antagonista
de PAF CV3988 (Biomol n° L-103), administrado por
vía IP (2 mg en 200 \mul de EtOH), el antagonista de PAF
Alprazolam (Sigma n° A-8800), administrado por vía
IP (2 mg en 200 \mul de EtOH), o PAF-AH (2000 U),
administrada por vía IV. Las ratas de control recibieron
inyecciones de 300 \mul de volumen de vehículo por vía IV. Los
antagonistas del PAF se administraron por vía IP porque estaban
solubilizados en etanol. Las ratas inyectadas con CV3988 o
Alprazolam fueron estimuladas con PAF 30 minutos después de la
administración de los antagonistas del PAF, para permitir que éstos
penetraran en la circulación, en tanto que las ratas tratadas con
PAF-AH y el vehículo recibieron el estímulo de PAF
15 minutos después de la administración de la enzima. Las ratas que
recibieron la inyección de enzima PAF-AH exhibieron
una reducción del edema inducido por PAF mayor que la conferida por
los antagonistas establecidos del PAF CV3988 y Alprazolam. Véase la
Figura 10, en la que el edema se expresa como el incremento medio de
volumen (ml) \pm SEM para cada grupo de tratamiento.
En resumen, la PAF-AH es eficaz
para bloquear el edema mediado por el PAF in vivo. La
administración de PAF-AH puede ser local o
sistémica por inyección IV. En estudios de dosificación, las
inyecciones IV en el intervalo de 160-2000 U/rata
demostraron reducir de forma llamativa la inflamación mediada por
PAF, mientras que la dosificación de DI50 parece estar en el
intervalo de 40-80 U/rata. Los cálculos basados en
el volumen en plasma para ratas de 180-200 gramos
predicen que una concentración plasmática en el intervalo de
25-40 U/ml debería bloquear el edema inducido por
PAF. Estas predicciones vienen confirmadas por estudios
farmacocinéticos preliminares. Se ha demostrado que una dosificación
de 2000 U de PAF-AH es eficaz en bloquear el edema
mediado por PAF durante un mínimo de 24 horas. A las 24 horas
después de la administración de PAF-AH, las
concentraciones en plasma de la enzima demostraron ser de
aproximadamente 25 U/ml. Se ha observado que la
PAF-AH bloquea el edema inducido por PAF de forma
más eficaz que los dos antagonistas de PAF ensayados.
En su conjunto, estos resultados demuestran que
la PAF-AH bloquea eficazmente la inflamación
inducida por PAF, pudiendo ser de valor terapéutico en enfermedades
en las que el PAF es el principal mediador.
Se ensayó la PAF-AH recombinante
de la invención en un segundo modelo in vivo, la pleuresía
inducida por PAF. Se había demostrado anteriormente que el PAF
producía filtración vascular cuando se introducía en el espacio
pleural [Henriques y colaboradores, más arriba]. En la vena caudal
de ratas hembras (Charles River, 180-200 g) se
inyectaron 200 \mul de colorante azul de Evans al 1% en 0,9% con
300 \mul de PAF-AH recombinante (1500
\mumol/ml/hora, preparada como se ha descrito en el Ejemplo 14),
o con un volumen equivalente de tampón de control. Quince minutos
más tarde, las ratas recibieron una inyección de 100 \mul de PAF
(2,0 nmol) en el espacio pleural. Una hora después del estímulo con
PAF, las ratas fueron sacrificadas y se recogió el fluido pleural
lavando la cavidad con 3 ml de solución salina de tampón fosfato
heparinizada. Se determinó el grado de filtración vascular por la
cantidad de colorante azul de Evans presente en el espacio pleural,
que se cuantificó por absorbancia a 620 nm. Las ratas pretratadas
con PAF-AH demostraron tener una filtración vascular
muy inferior a la de los animales de control (representando más de
un 80% de reducción de la inflamación).
Los anteriores resultados avalan el tratamiento
de sujetos que sufren pleuresía con la enzima PAF-AH
recombinante de la invención.
La eficacia de la enzima PAF-AH
recombinante de la invención también se analizó en un modelo de
acumulación de eosinófilos inducida por antígenos. La acumulación
de eosinófilos en lás vías respiratorias es característica de las
respuestas inmunes de fase tardía que se producen en el asma, la
rinitis y el eccema. Se sensibilizaron ratones BALB/c (Charles
River) mediante dos inyecciones intraperitoneales consistentes en 1
\mug de ovalbúmina (OVA) en 4 mg de hidróxido de aluminio (Imject
alum, Pierce Laboratories, Rockford, IL), administradas en un
intervalo de 2 semanas. Catorce días después de la segunda
inmunización, los ratones sensibilizados fueron estimulados con OVA
en aerosol o con solución salina como control.
Antes de la estimulación, los ratones fueron
distribuidos aleatoriamente en cuatro grupos, con cuatro
ratones/grupo. Los ratones de los grupos 1 y 3 fueron pretratados
con 140 de tampón de control, formado por Tris 25 mM, NaCl 0,5M,
EDTA 1 mM y Tween 80 al 0,1%, administrado por inyección
intravenosa. Los ratones de los grupos 2 y 4 fueron pretratados con
750 unidades de PAF-AH (actividad de 5.500
unidades/mi, administrada en 140 \mul de tampón
PAF-AH). Treinta minutos después de la
administración de PAF-AH o tampón, los ratones de
los grupos 1 y 2 fueron expuestos a PBS en aerosol, según se
describe más adelante, mientras que los ratones1de los grupos 3 y 4
se expusieron a OVA en aerosol. Veinticuatro horas más tarde, los
ratones fueron tratados por segunda vez con 140 \mul de tampón
(grupos 1 y 3) o 750 unidades de PAF-AH en 140
\mul de tampón (grupos 2 y 4), administrados por inyección
intravenosa.
intravenosa.
La infiltración de eosinófilos de la tráquea se
indujo en los ratones sensibilizados exponiendo a los animales a
OVA en aerosol. Los ratones sensibilizados se situaron en tubos de
centrifugación cónicos de 50 ml (Corning) y se les forzó a respirar
OVA en aerosol (50 mg/mi) disuelta en solución salina al 0,9%
durante 20 minutos, utilizando un nebulizador (Modelo 646,
DeVilbiss Corp., Sormerset, PA). Los ratones de control fueron
tratados de forma similar, excepto que en él nebulizador se utilizó
solución salina al 0,9%. Cuarenta y ocho horas después de la
exposición a OVA o solución salina en aerosol, los ratones fueron
sacrificados y se extrajeron las tráqueas. Las tráqueas de cada
grupo se incluyeron en OCT y se almacenaron a -70°C hasta que se
cortaron las secciones.
Para evaluar la infiltración de eosinófilos en
la tráquea, se tiñeron secciones de tejido de los cuatro grupos de
ratones con solución Luna y solución de hematoxilinaeosina o con
peroxidasa. Se cortaron doce secciones de 6 \mum de espesor de
cada grupo de ratones, numerándolas en consecuencia. Las secciones
de número impar se tiñeron con tinción Luna de la forma siguiente.
Los cortes se fijaron en formal-alcohol durante 5
minutos a temperatura ambiente, se lavaron tres veces con agua del
grifo durante 2 minutos a temperatura ambiente y se volvieron a
lavar con dos cambios de H_{2}O destilada durante 1 minuto a
temperatura ambiente. Los cortes de tejido se tiñeron con tinción
Luna 5 minutos a temperatura ambiente (la tinción Luna está formada
por 90 ml de hematoxilina de hierro de Weigert y 10 ml de Escarlata
de Biebrich al 1%). Las secciones teñidas se sumergieron en alcohol
ácido al 1% seis veces, se lavaron con agua del grifo durante 1
minuto a temperatura ambiente, se sumergieron en solución de
carbonato de litio al 0,5% cinco veces y se lavaron con agua
corriente durante 2 minutos a temperatura ambiente. Los cortes se
deshidrataron con etanol al 70%-95%-100% durante 1 minuto en cada
uno, a temperatura ambiente y se enjuagaron a continuación en dos
cambios de xileno durante 1 minuto a temperatura ambiente y se
montaron en Cytoseal 60.
Para la tinción de peroxidasa, los cortes con
números pares se fijaron en acetona a 4°C durante 10 minutos y se
dejaron secar al aire. Se añadieron 200 \mul de solución de DAB a
cada corte y se dejó reposar durante 5 minutos a temperatura
ambiente. Las secciones se lavaron con agua del grifo durante 5
minutos a temperatura ambiente y se aplicaron 2 gotas de ácido
ósmico al 1% a cada sección durante 3-5 segundos.
Las secciones se lavaron con agua corriente durante 5 minutos a
temperatura ambiente y se tiñeron con hematoxilina de Mayers como
colorante de contraste a 25°C a temperatura ambiente. A
continuación, los cortes se lavaron con agua corriente durante 5
minutos y se deshidrataron a través de etanol al 70%-95%-100% 1
minuto en cada uno a temperatura ambiente. Las secciones se
enjuagaron a través de dos cambios de xileno durante 1 minuto cada
uno a temperatura ambiente y se montaron en Cytoseal 60.
Se evaluó el número de eosinófilos en el tejido
submucoso de la tráquea. Se observó que las tráqueas de los ratones
de los grupos 1 y 2 tenían escasos eosinófilos dispersos a
travésldel tejido submucoso. Tal como se esperaba, las tráqueas de
los ratones del grupo 3, que fueron pretratados con tampón y
expuestos a OVA nebulizada, mostraron tener grandes cantidades de
eosinófilos en el tejido submucoso. Por el contrario, las tráqueas
de los ratones del grupo 4, pretratados con PAF-AH
y expuestos a OVA nebulizada, tenían muy pocos eosinófilos en el
tejido submucoso, comparable al registrado en los dos grupos de
control, es decir, los grupos 1 y 2.
Por consiguiente, está indicado el tratamiento
terapéutico con PAF-AH de pacientes con respuestas
inmunes de fase tardía que comprenden la acumulación de eosinófilos
en las vías respiratorias, tal como ocurre en el asma, la rinitis y
el eccema.
Aproximadamente un cuatro por ciento de la
población japonesa presenta niveles bajos o indetectables de
actividad PAF-AH en su plasma. Este déficit se ha
correlacionado con graves síntomas respiratorios en niños asmáticos
[Miwa y colaboradores, J. Clin. Invest., 82:
1983-1991 (1988)], que parecen haber heredado el
déficit de manera autosómica recesiva.
Para determinar si el déficit es consecuencia de
una enzima inactiva pero presente, o de una incapacidad para
sintetizar PAF-AH, se analizó plasma de múltiples
pacientes con déficit de actividad PAF-AH tanto con
respecto a la actividad PAF-AH (por el método
descrito en el Ejemplo 10 para transfectantes) como con respecto a
la presencia de PAF-AH utilizando los anticuerpos
monoclonales 90G11D y 90F2D (Ejemplo 13) en un ELISA de sandwich de
la forma siguiente. Se recubrieron placas Immulon 4 de fondo plano
(Dynatech, Chantilly, VA) con 100 ng/pocillo de anticuerpo
monoclonal 90G11D y se almacenaron durante una noche. Las placas se
bloquearon durante 1 hora a temperatura ambiente con gelatina de
piel de pescado al 0,5% (Sigma) diluida en CMF-PBS
y a continuación se lavaron tres veces. El plasma del paciente se
diluyó en PBS que contenía CHAPS 15 mM y se añadió a cada pocillo de
las placas (50 \mul/pocillo). Las placas se incubaron durante 1
hora a temperatura ambiente y se lavaron cuatro veces. Se añadieron
50 \mul de 5 \mug/ml de anticuerpo monoclonal 90F2D,
biotinilado por métodos convencionales y diluido en PBST, a cada
pocillo y las placas se incubaron durante 1 hora a temperatura
ambiente y a continuación se lavaron tres veces. Seguidamente, se
añadieron 50 \mul de ExtraAvidin (Sigma) diluidos 1/1000 en
CMF-PBST a cada pocillo y las placas se incubaron
durante 1 hora a temperatura ambiente antes de su revela-
do.
do.
Se observó una correlación directa entre la
actividad PAF-AH y los niveles de enzima. La
ausencia de actividad en el suero de un paciente se reflejó en la
ausencia de enzima detectable. De igual forma, las muestras de
plasma con la mitad de la actividad normal contenían la mitad de
los niveles normales de PAF-AH. Estas observaciones
sugirieron que el déficit de actividad PAF-AH se
debía a una incapacidad para sintetizar la enzima o era debida a una
enzima inactiva que no reconocían los anticuerpos monoclonales.
Otros experimentos revelaron que el déficit se
debía a una lesión genética en el gen de la PAF-AH
de plasma humano. Se aisló ADN genómico de individuos con déficit de
PAF-AH, utilizándolo como molde para reacciones PCR
con cebadores específicos del gen de la PAF-AH.
Inicialmente se amplificó y se secuenció cada uno de los exones de
la secuencia codificante de un individuo. Se observó un único cambio
de nucleótido dentro del exón 9 (un cambio de G a T en la posición
996 de la SEC ID n° 7). El cambio de nucleótido da como resultado
una sustitución de aminoácido de valina por una fenilalanina en la
posición 279 de la secuencia de PAF-AH (V279F). El
exón 9 se amplificó a partir de ADN genómico de once pacientes
adicionales con déficit de PAF-AH, que presentaron
la misma mutación puntual.
Para analizar si esta mutación invalidaba la
enzima, se generó una construcción de expresión de E. coli
que contenía la mutación, mediante métodos similares a los descritos
en el Ejemplo 10. Al introducirla en E. coli, la construcción
de expresión no generó actividad PAF-AH, mientras
que una construcción de control, exenta de la mutación, fue
totalmente activa. Esta sustitución de aminoácido da presuntamente
como resultado una modificación estructural que determina el
déficit observado de actividad y la falta de inmunorreactividad con
los anticuerpos contra PAF-AH de la invención.
Por consiguiente, se pueden utilizar anticuerpos
específicos contra la PAF-AH de la invención en
métodos de diagnóstico para detectar niveles anormales de
PAF-AH en suero (los niveles normales son de
alrededor de 1 a 5 U/ml) y para realizar un seguimiento de la
evolución del tratamiento de estados patológicos con
PAF-AH. Es más, la identificación de una lesión
genética en el gen de PAF-AH permite la
investigación genética del déficit de PAF-AH
exhibido por los pacientes japoneses. La mutación provoca la
obtención de un sitio de endonucleasa de restricción (Mae II) que
permite así el análisis a través del método sencillo de Polimorfismo
de Longitud de Fragmentos de Restricción (RFLP) para diferenciar
entre alelos activos y mutantes. Véase Lenin, pág.
136-141 en Genes V, Oxford University Press, Nueva
York, Nueva York (1994).
La investigación del ADN genómico de doce
pacientes con déficit de PAF-AH se llevó a cabo por
digestión del ADN con Mae II, transferencia de Southern e
hibridación con una sonda del exón 9 (nucleótidos
1-396 de la SEC ID NO: 17). Se encontró que todos
los pacientes tenían RPLP coherentes con el alelo mutante.
Otras características de la invención son las
indicadas a continuación:
1. Método para el tratamiento de un mamífero
susceptible de padecer o que padece una afección patológica mediada
por PAF, que comprende la administración de PAF-AH
a dicho mamífero en una cantidad suficiente para suplementar la
actividad PAF-AH endógena e inactivar cantidades
patológicas de PAF en dicho mamífero.
2. Método para el tratamiento de un mamífero
susceptible de padecer o que padece pleuresía, que comprende la
administración de PAF-AH a dicho mamífero en una
cantidad suficiente para suplementar la actividad
PAF-AH endógena e inactivar cantidades patológicas
de PAF en dicho mamífero.
3. Método para el tratamiento de un mamífero
susceptible de padecer o que padece asma, que comprende la
administración de PAF-AH a dicho mamífero en una
cantidad suficiente para suplementar la actividad
PAF-AH endógena e inactivar cantidades patológicas
de PAF en dicho mamífero.
4. Método para el tratamiento de un mamífero
susceptible de padecer o que padece rinitis, que comprende la
administración de PAF-AH a dicho mamífero en una
cantidad suficiente para suplementar la actividad
PAF-AH endógena e inactivar cantidades patológicas
de PAF en dicho mamífero.
5. Método para el tratamiento de un mamífero
susceptible de padecer o que padece eccema, que comprende la
administración de PAF-AH a dicho mamífero en una
cantidad suficiente para suplementar la actividad
PAF-AH endógena e inactivar cantidades patológicas
de PAF en dicho mamífero.
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SOLICITANTE: ICOS Corporation
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TÍTULO DE LA INVENCIÓN: Acetilhidrolasa del factor activador de plaquetas
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- NÚMERO DE SECUENCIAS: 26
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- DIRECCIÓN DE CORRESPONDENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESTINATARIO: Forrester & Böhmert
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: Franz-Joseph Strasse 38
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: D - 80801 Munich
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- PAIS: Alemania
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- FORMA LEGIBLE POR ORDENADOR:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TIPO DE MEDIO: Disco flexible
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- ORDENADOR: IBM PC compatible
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- SOFTWARE: Patentin Release 1.0, Versión N° 1.25
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- DATOS DE LA SOLICITUD ACTUAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD:
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN: 6 octubre 1994
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASIFICACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- DATOS DE LA SOLICITUD ANTERIOR:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD: US 08/113.803
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN: 06-OCT-1993
\vskip0.800000\baselineskip
- (viii)
- INFORMACIÓN DEL MANDATARIO/AGENTE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: Richardson, Kate
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- NÚMERO DE REFERENCIA/EXPEDIENTE: FB5444A
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- INFORMACIÓN DE TELECOMUNICACIÓN:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TELÉFONO: 089 384 07 20
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TELEFAX: 089 34 70 10
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 1:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 17 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 1:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Phe Lys Asp Leu Gly Glu Glu Asn Phe Lys Ala
Leu Val Leu Ile Ala}
\sac{Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO:2:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 16 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 2:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ile Gln Val Leu Met Ala Ala Ala Ser Phe Gly
Gln Thr Lys Ile Pro}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 3:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 11 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 3:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Met Lys Pro Leu Val Val Phe Val Leu Gly
Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 4:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 32 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICAS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: Sitio-modificado
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: grupo (13, 21, 27)
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- OTRA INFORMACIÓN: /nota = "el nucleótido en cada una de estas posiciones es una inosina."
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 4:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipACATGAATTC GGNATCYTTG NGTYTGNCCR AA
\hfill32
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 5:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 30 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 5:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTATTTCTAGA AGTGTGGTGG AACTCGCTGG
\hfill30
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 6:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 32 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 6:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCGATGAATTC AGCTTGCAGC AGCCATCAGT AC
\hfill32
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 7:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1520 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICAS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDSLOCALIZACIÓN: 162..1484
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 7:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 8:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 441 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 8:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 9:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 504 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICAS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: exon
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 185..311
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 9:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 10:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 417 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICAS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: exon
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 145..287
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 10:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 11:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 498 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICAS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: exon
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 251..372
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 11:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 12:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 433 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICAS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: exon
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 130..274
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 12:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 13:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 486 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICAS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: exon
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 164..257
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 13:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 14:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 363 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICAS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: exon
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 113..181
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 14:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip0.3cm10
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 15:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 441 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICAS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: exon
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 68..191
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 15:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 16:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 577 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICAS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: exon
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 245..358
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 16:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 17:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 396 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICAS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: exon
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 108..199
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 17:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 18:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 519 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICAS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: exon
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 181..351
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 18:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 19:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 569 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICAS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: exon
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 156..304
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 19:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 20:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 469 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICAS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: exon
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 137..253
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 20:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 21:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1494 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICAS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 117..1436
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 21:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 22:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2191 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICAS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 92..1423
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 22:
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 23:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 517 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICAS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 2..514
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 23:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 24:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 580 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICAS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1..580
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 24:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 25:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 41 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 25:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTATTCTAGAA TTATGATACA AGTATTAATG GCTGCTGCAA G
\hfill41
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID NO: 26:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 32 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID NO: 26:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipATTGATATCC TAATTGTATT TCTCTATTCC TG
\hfill32
Claims (8)
1. Una composición terapéutica que comprende un
polipéptido PAF-AH y un diluyente o vehículo
fisiológicamente aceptable y, opcionalmente, otro agente
anti-inflamatorio, donde el polipéptido
PAF-AH es:
(i) un polipéptido PAF-AH,
purificado y aislado, constituido esencialmente por la secuencia de
aminoácidos de PAF-AH de plasma humano representada
en SEC ID NO: 8; o
(ii) la variante de un polipéptido
PAF-AH, purificado y aislado, constituido
esencialmente por los aminoácidos 42 a 441 de SEC ID NO: 8, donde
la variante es una variante de sustitución de aminoácidos que tiene
una sustitución de aminoácido en la secuencia de SEC ID NO: 8
elegida entre:
- (a)
- S108A
- (b)
- D338A
- (c)
- H395A
- (d)
- H399A
- (e)
- C67S
- (f)
- C334S; o
- (g)
- C407S
2. Polipéptido PAF-AH que se
utiliza para mejorar estados inflamatorios patológicos o para
tratar la pleuresía, el asma, la rinitis, el eccema, la septicemia
o el parto prematuro en un mamífero, especialmente para el
tratamiento de un mamífero susceptible de padecer o que padece una
afección patológica mediada por PAF, mediante la administración de
dicho polipéptido PAF-AH a dicho mamífero en una
cantidad suficiente para suplementar la actividad
PAF-AH endógena e inactivar cantidades patológicas
de PAF en dicho mamífero, donde el polipéptido
PAF-AH es:
(i) un polipéptido PAF-AH,
purificado y aislado, constituido esencialmente por la secuencia de
aminoácidos de PAF-AH de plasma humano representada
en SEC ID NO: 8; o
(ii) la variante de un polipéptido
PAF-AH, purificado y aislado, constituido
esencialmente por los aminoácidos 42 a 441 de SEC ID NO: 8, donde
la variante es una variante de sustitución de aminoácidos que tiene
una sustitución de aminoácido en la secuencia de SEC ID NO: 8
elegida entre:
- (a)
- S108A
- (b)
- D338A
- (c)
- H395A
- (d)
- H399A
- (e)
- C67S
- (f)
- C334S; o
- (g)
- C407S
3. Polipéptido PAF-AH,
purificado y aislado, constituido esencialmente por los aminoácidos
42 a 441 de SEC ID NO: 8, que se utiliza en el tratamiento de la
septicemia o el parto prematuro.
4. Utilización de un polipéptido
PAF-AH para la fabricación de un medicamento para el
tratamiento de un mamífero susceptible de padecer o que padece una
afección patológica mediada por PAF, mediante la administración de
dicho polipéptido PAF-AH a dicho mamífero en una
cantidad suficiente para suplementar la actividad
PAF-AH endógena e inactivar cantidades patológicas
de PAF en dicho mamífero, donde el polipéptido
PAF-AH es:
(i) un polipéptido PAF-AH,
purificado y aislado, constituido esencialmente por la secuencia de
aminoácidos de PAF-AH de plasma humano representada
en SEC ID NO: 8; o
(ii) la variante de un polipéptido
PAF-AH, purificado y aislado, constituido
esencialmente por los aminoácidos 42 a 441 de SEC ID NO: 8, donde la
variante es una variante de sustitución de aminoácidos que tiene
una sustitución de aminoácido en la secuencia de SEC ID NO: 8
elegida entre:
- (a)
- S108A
- (b)
- D338A
- (c)
- H395A
- (d)
- H399A
- (e)
- C67S
- (f)
- C334S; o
- (g)
- C407S
5. Utilización de un polipéptido
PAF-AH para la fabricación de un medicamento para el
tratamiento de la pleuresía, el asma, la rinitis, el eccema, la
septicemia o el parto prematuro en un mamífero, donde el
polipéptido PAF-AH es:
(i) un polipéptido PAF-AH,
purificado y aislado, constituido esencialmente por la secuencia de
aminoácidos de PAF-AH de plasma humano representada
en SEC ID NO: 8; o
(ii) la variante de un polipéptido
PAF-AH, purificado y aislado, constituido
esencialmente por los aminoácidos 42 a 441 de SEC ID NO: 8, donde
la variante es una variante de sustitución de aminoácidos que tiene
una sustitución de aminoácido en la secuencia de SEC ID NO: 8
elegida entre:
- (a)
- S108A
- (b)
- D338A
- (c)
- H395A
- (d)
- H399A
- (e)
- C67S
- (f)
- C334S; o
- (g)
- C407S
6. Utilización de un polipéptido
PAF-AH, purificado y aislado, constituido
esencialmente por los aminoácidos 42 a 441 de SEC ID NO: 8 para la
fabricación de un medicamento para el tratamiento de la septicemia
o el parto prematuro en un mamífero.
7. Utilización según la reivindicación 5 o 6,
donde el citado polipéptido PAF-AH es una cantidad
suficiente para suplementar la actividad PAF-AH
endógena e inactivar cantidades patológicas de PAF en dicho
mamífero.
8. Método para realizar la exploración genética
tendente a descubrir la presencia o ausencia de una lesión genética
en un gen de PAF-AH de plasma humano de la muestra
de un sujeto, que comprende las siguientes etapas:
(a) aislar por lo menos parte del ADN del gen de
PAF-AH de plasma humano de dicha muestra de sujeto;
y
(b) comparar el ADN de (a) con el ADN de SEC ID
NO; 7, donde toda diferencia indica la presencia de una lesión
genética en al ADN de la muestra del sujeto.
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