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Memoire Fael Moudoumi - MP 090722
Memoire Fael Moudoumi - MP 090722
Memoire Fael Moudoumi - MP 090722
Département de
Biologie
N° d’ordre : /Biologie/FS
Mémoire de Master 1
Biologie Cellulaire et Physiologie,
Option Physiopathologie Moléculaire (PPM)
Prévalence de l’infection sensible et multi-résistante a
Mycobacterium tuberculosis chez les sujets a risque
vivant en zone rurale dans la province de l’ogooue-lolo
(population carcérale et patients reçus en consultation au
Centre de Traitement Ambulatoire à Koula-Moutou) en
2022
Présenté par :
I
Signature :
II
Dédicace
Je dédie ce travail à mes disparus,
Ma Mère NYROUBIONGA SUZANE, l’objectif n’a pas changé, de là où tu es, tu seras
fière ;
Mon oncle et mentor Monsieur MBANA LUC, tes conseils continuent de me guider ;
Mon ORCHADE, mon éclipse, mon orchidée… Tu es apparue un instant et tu as apporté
de la magie, du rêve et de l’espoir dans ma vie. Malgré la distance, je t’aime ma fille !
Je tiens aussi à remercier ma famille, sans vous, mes pères et mes mères, mes frères et mes
sœurs, je n’aurais eu ni la force, ni les moyens d’arriver jusqu’ici.
III
Remerciements
– Grand merci au docteur MONGO DELIS Arnaud, médecin chef du CTA de Koula-
Moutou, pour sa patience et chacun de ses enseignements. C’est à vous que nous
devons le bon déroulement de cette étude.
IV
Abréviation
ANTITUBERCULEUX:
E Ethambutol
H Isoniazide
R Rifampicine
RIF Rifampicine
Z Pyrazinamide
V
Liste de figures
Figure 1. Incidence de la tuberculose pour 100000 habitants en 2018...................................................4
VI
Liste des tableaux
Tableau 1. Associations à doses fixes (ADF) de qualité garantie........................................................11
Tableau 4: Répartition des cas de TB chez les sujet reçus en consultation selon le sexe.....................24
Tableau 5: Répartition des cas selon les tranches d'âges au sein des groupes de populations.............24
VII
Sommaire
Déclaration sur l’honneur........................................................................................................................I
Dédicace.................................................................................................................................................II
Remerciements.....................................................................................................................................III
Abréviation............................................................................................................................................IV
Liste de figures.......................................................................................................................................V
Liste des tableaux..................................................................................................................................VI
Sommaire.............................................................................................................................................VII
Résumé..................................................................................................................................................IX
Abstract..................................................................................................................................................X
I. Introduction.........................................................................................................................................1
Objectif général..............................................................................................................................3
Objectifs spécifiques.......................................................................................................................3
I.3 GENERALITES.................................................................................................................................4
I.3.1 Tuberculose............................................................................................................................4
1. Epidémiologie.....................................................................................................................4
2. Mycobacterium tuberculosis..............................................................................................5
3. Mode de transmission........................................................................................................6
4. Physiopathologie de la tuberculose....................................................................................6
5. Types de tuberculose..........................................................................................................9
6. Coïnfection TB/VIH...........................................................................................................10
7. Traitement de la TB sensible.............................................................................................10
8. Diagnostique de la tuberculose........................................................................................11
I.3.2 Tuberculose multirésistante (TB-MR)...................................................................................14
I.3.3 Populations vulnérable à la TB..............................................................................................16
II. Matériel et Méthodes......................................................................................................................18
II.1.1 Site d’étude.........................................................................................................................18
II.1.2 Type d’étude........................................................................................................................18
II.1.3 Population d’étude..............................................................................................................18
II.2.1 Déroulement de l’étude......................................................................................................18
II.2.1.1 Prélèvement.................................................................................................................18
II.2.1.2 Diagnostic.....................................................................................................................19
II.2.2 Considération éthique.........................................................................................................21
VIII
II.2.3 Analyse statistique...............................................................................................................21
III. RESULTATS.......................................................................................................................................22
III.1. Données sociodémographiques...............................................................................................22
II.2. Prévalence de la tuberculose sensible et multi-résistante........................................................24
IV. DISCUSSION..............................................................................................................................25
Conclusion et perspectives...................................................................................................................27
Bibliographie........................................................................................................................................28
IX
Résumé
La tuberculose est une maladie infectieuse transmissible et non immunisante, avec des
signes cliniques variables dont l’incidence a été réduite par l’utilisation des antibiotiques à
partir des années 1950. La découverte de bacilles multi-résistants responsables de la
tuberculose multi-résistante constitue un véritable problème de santé publique surtout dans les
pays en voie de développement comme le Gabon et notamment dans les zones rurales. D’où
cette étude transversale, à but descriptif visant à renseigner sur la prévalence de la TB
sensible et multi-résistante chez les sujets à risque vivant en zone rurale dans le département
de la Lolo-Bouenguidi dans l’Ogooué-Lolo.
L’âge moyen au sein de la population carcérale était de 32,86 ± 9.85 ans et la tranche
d’âge la plus représentée est celle de 30 à 40 ans. Chez les sujets reçus en consultation, l’âge
moyen était de 38 ± 15 ans et les plus de 40 ans étaient les plus représentés. L’analyse
statistique a montré une différence significative entre la prévalence de la TB en milieu
carcérale et chez les sujets reçus en consultation (p-value = 0.0003301) et l’Odds-ratio
(0.051) a laissé penser que le milieu carcéral est moins exposé à la tuberculose que le milieu
hospitalier. Enfin, l’âge a constitué un facteur pouvant influence la prévalence de tuberculose
en milieu carcérale (p-value = 0.05) mais pas en dehors (p-value = 0.1207)
X
Abstract
Tuberculosis is a transmissible and non-immunizing infectious disease, with variable
clinical signs, the incidence of which has been reduced by the use of antibiotics since the
1950s. The discovery of multi-resistant bacilli responsible for multi-resistant tuberculosis
constitutes a real public health problem especially in developing countries like Gabon and
especially in rural areas. Hence this cross-sectional study, with a descriptive purpose, aimed at
providing information on the prevalence of susceptible and multi-resistant TB in subjects at
risk living in rural areas in the department of Lolo-Bouenguidi in Ogooué-Lolo.
The study population (198 subjects) was made up of two groups of people, the prison
population of this department (112 subjects) and the patients seen in consultation at the
Koula-Moutou CTA and presenting clinical suspicions of a Mycobacterium infection.
tuberculosis (86 subjects). The diagnosis of tuberculosis of these subjects was carried out
using geneXpert technology during the period from January 1, 2022 to February 28, 2022.
The average age within the prison population was 32.86 ± 9.85 years and the most
represented age group is that of 30 to 40 years. Among the subjects seen in consultation, the
mean age was 38 ± 15 years and the over 40s were the most represented. The statistical
analysis showed a significant difference between the prevalence of TB in the prison
environment and in the subjects received in consultation (p-value = 0.0003301) and the Odds-
ratio (0.051) suggested that the prison environment is less exposed to tuberculosis than the
hospital setting. Finally, age was a factor that could influence the prevalence of tuberculosis
in prison (p-value = 0.05) but not outside (p-value = 0.1207).
Ultimately, this study shows that the health monitoring granted to the prison
population shows satisfactory and encouraging signs. The subjects received in consultation
should be the subject of special attention from the public authorities, particularly with regard
to the multi-drug resistance of tuberculosis.
XI
I. Introduction
La tuberculose est un maladie infectieuse et contagieuse causé par les bactéries du
complexe Mycobacterium tuberculosis (MTB). Avec environ 1,5 million de personne morte
de la tuberculose en 2020, cette pandémie demeure un problème de santé publique (WHO,
2021).
Bien que la tuberculose soit une maladie que l’on peut soigner et guérir (WHO, 2021),
la découverte de souche multi résistante de MTB responsable de la tuberculose multirésistante
(TB-MR) inquiète. La TB-MR est une forme de la maladie due à un bacille ne réagissant pas
à l’isoniazide et à la rifampicine, les deux médicaments antituberculeux de première intention
les plus efficaces. En 2020, environ un demi-million de cas ont été diagnostiqué TB-MR
positif dans le monde (WHO, 2021). Dans la région Afrique de l’OMS la tuberculose multi
résistante a un taux d’incidence inférieur ou égal à 2 % chez les nouveaux cas de tuberculose
et un taux compris entre 10 % et 13 % chez les cas déjà traités. Le Kenya, l’Ouganda et le
Zimbabwe ont finalisé des enquêtes nationales sur la prévalence de la tuberculose qui, d’une
manière générale, ont mis en évidence une incidence de la tuberculose au moins deux fois
plus élevée que les estimations précédentes.(régional de l'Afrique, 2018)
Ces populations sensibles devraient donc susciter plus d’intérêt, cependant la majorité
des articles parle beaucoup plus de tuberculose au sein de la population générale et des
personnes vivant avec le VIH, essentiellement dans les villes de Libreville et Franceville.
D’où l’importance de cette étude visant à évaluer la Prévalence et les résistances de
l’infection au MTB au sein de la population carcérale à Koula-Moutou dans le département de
la Lolo Bouenguidi, chef-lieu de la province de l’Ogooué Lolo au centre-est du Gabon.
1
– La première partie, dite partie introductive, comprend la problématique, les objectifs
poursuivis, ainsi que les généralités sur la tuberculose sensible et multi résistante.
– La seconde partie décrit le matériel ainsi que la méthode diagnostique utilisée pour le
diagnostic de la tuberculose et l’identification des formes résistantes. Elle fait aussi
une description du site et des structures au seins desquelles ont eu lieu cette étude.
– La troisième partie expose les résultats obtenus
– La quatrième discute les résultats obtenus
– La dernière partie permet de conclure et de donner les perspectives de ce travail.
–
2
Objectif général
Objectifs spécifiques
3
I.3 GENERALITES
I.3.1 Tuberculose
1. Epidémiologie
La tuberculose demeure un problème de santé mondial car elle touche tous les pays et
toute les tranches d’âge. En effet, selon l’OMS, près de 10 millions de personnes ont
développées une tuberculose dans le monde en 2020, parmi lesquelles, environ 5.5 millions
d’hommes, 3.3 millions de femmes et 1.1 millions d’enfants. L’incidence de la tuberculose est
très hétérogène selon les pays. Ainsi, environ 98 % des cas de tuberculose signalés sont
enregistrés au seins des pays à revenu faible et intermédiaire avec près de deux tiers des cas
concentrés dans huit pays, avec l’Inde en tête, la Chine en seconde position, puis l’Indonésie,
les Philippines, le Pakistan, le Nigéria, le Bangladesh et l’Afrique du Sud (WHO, 2021).
Le Gabon, avec environ 5179 cas détectés en 2013 dont 1930 cas de tuberculose
pulmonaire (TBP) à microscopie positive confirmés bactériologiquement, 2099 cas de TBP
cliniquement diagnostiqués, 529 cas de tuberculose extra pulmonaire (TB-EP) et un taux
d’incidence de la tuberculose de 423 cas par 100000 habitants, constitue une zone de haut
fardeau de tuberculose (TB) avec environ 50% des cas détectés regroupé à Libreville. Bien
qu’ici aussi toute les tranche d’âge soient touchées, une prédominance de la TB au sein de la
4
population jeune et active âgée de 15 à 44 ans est observée (Dr Marguerite Massinga Loembé
et al 2014).
2. Mycobacterium tuberculosis
5
3. Mode de transmission
Les MTB se transmettent d’un individu à un autre essentiellement par voie aérienne.
En effet, lorsqu’une personne atteinte d’une TB des voies respiratoire, TB pulmonaire ou
laryngée, tousse, crier, éternuer ou manifeste une quelconque autre manœuvre expiratoire
énergique qui arrache des sécrétions respiratoires, celle-ci généré des aérosols infectants
porteuse de bactéries de Mycobacterium dans l’environnement. La durée de suspension dans
l’aire de ces aérosols encore appelées gouttelettes de pflugge est fonction de leur diamètre (Dr
Florence ADER, journée nationale de l’infectiologie 2014).
Figure 3. Vitesse de chute des aérosols (Dr Florence ADER, journée nationale de l’infectiologie 2014)
4. Physiopathologie de la tuberculose
6
a. Réaction de l’organisme en réponse à l’infection de MTB
7
Figure 4: Immunopathologie de Mycobacterium tuberculosis (M. HAOUES et al 2014)
b. Tuberculose latente
c. Tuberculose active
La tuberculose active est une infection caractérisée par la manifestation clinique des
symptômes de la tuberculose. Elle est due à la persistance de la multiplication
mycobactérienne en dépit des barrières immunologiques mises en place par l’organisme pour
stopper ou contrôler la croissance bactérienne intra et extracellulaire. La TBA peut survenir à
8
partir d’une TB latente réactivée en raison de l’incapacité de l’organisme à maintenir le
granulome en place ou simplement à partir d’une infection ou réinfection ressente suite à une
forte exposition au MTB. Plusieurs facteurs augmentent le risque de développer une TB
active au cours des deux premières années qui suivent l'infection. Ces facteurs sont :
l’existence de facteurs induisant une immunodépression, l’existence de lésions pulmonaires
préalables, l'intensité et de la durée de l'exposition
5. Types de tuberculose
On distingue en fonction de l’organe colonisé différents types de tuberculose
notamment : la tuberculose pulmonaire (TBP), la tuberculose extra pulmonaire (TBEP) et
tuberculose disséminée ou miliaire.
6. Coïnfection TB/VIH
7. Traitement de la TB sensible
La tuberculose est une maladie que l’on peut soigner et guérir (WHO, 2021),
cependant une association de plusieurs médicaments antibactériens selon des schémas
thérapeutique adapté par l’OMS est nécessaire pour traiter la maladie et éviter l’apparition de
résistances. Ainsi, on distingue 5 groupes de médicament antituberculeux classés en fonction
de leur efficacité, de leur utilisation et de leur classe. Toutefois, selon le Programme de pré
qualification de l'OMS, les médicaments appartenant au même groupe ne sont pas similaires
10
en termes d’efficacité, mécanisme d'action, profil d'effets indésirables ou innocuité. Les
médicaments antituberculeux de première ligne (H, R, Z, E et la streptomycine) sont
considérés comme les médicaments du Groupe 1, à l'exception de la streptomycine qui
appartient au Groupe 2. Les médicaments des Groupes 2 à 5 (sauf la streptomycine), sont
généralement réservés aux TB pharmaco-résistantes et sont des médicaments antituberculeux
de deuxième ligne.
Tableau 1. Associations à doses fixes (ADF) de qualité garantie (Falzon et al., 2011)
Le schéma de traitement standard pour une TB-P est de six mois et comprend 2 mois
de quadrithérapie comprenant la rifampicine (R), l’isoniazide (H), l’éthambutol (E) et la
pyrazinamide (Z) puis quatre mois de bithérapie de rifampicine et isoniazide chez l’adulte.
Aussi bien pour la prévention des personnes vivant avec le VIH diagnostiqué négatif à la TB
que pour le traitement de la TBL, les patients sont mis sous traitement de six à neuf mois de
monothérapie d’isoniazide ou 3 mois de bithérapie d’isoniazide et de rifampicine. Un autre
moyen de prévention est celui du vaccin BCG contre la TB qui contient des souches vivantes
et atténuées de Mycobacterium bovis dérivées par Calmette et Guérin en 1921
8. Diagnostique de la tuberculose
11
ont donc été élaboré, aussi bien des tests immunologique et moléculaire que des tests
d’identification directe des bacilles tuberculeux, notamment :
a. Examen microscopique
Le deuxième, directement réalisé sur les urines d’un patient présentant des signes
suspicieux de la tuberculose, permet la détection de lipoarabinomannane, un composant
12
majeur de la paroi des bactéries. Cependant bien que très accessible, il présente une très faible
spécificité.
Ils correspondent à une amplification multiplex d’ADN couplée à une hybridation sur
bandelettes et sont utilisées pour l’identification des mycobactéries et de la résistance aux
antibiotiques. Dans les pays à forte incidence de tuberculose ultrarésistante, le test
GenoType® MTBDRsl permet à partir de culture de détecter la résistance aux
fluoroquinolones, à l’éthambutol, à l’amikacine et à la capréomycine avec une sensibilité
variant de 77,3 à 92,3% (Drobniewski et al., 2013, Slim-Saidi et al., 2015)
Le test Xpert MTB/RIF est un test moléculaire unitaire qui permet la détection dans
les prélèvements cliniques des fragments d’ADN du génome des mycobactéries du complexe
tuberculosis et leur éventuelle résistance à la rifampicine en deux heures. Il s’agit d’un test
semi-quantitatif car il indique lorsque l’infection est faible, moyenne ou grave. Automatisé, il
réalise en temps réel, dans une seule cartouche, les différentes étapes d’extraction,
purification, amplification d’ADN, hybridation des sondes et détection multiplex de PCR à la
demande. L’amplification génique cible la région de 81 paires de base du gène rpoB, qui code
la sous-unité de l’ARN polymérase et qui héberge les principales mutations responsables de la
résistance à la rifampicine. La technique Xpert MTB/RIF fournit une évaluation rapide et
fiable de la charge bactérienne au-dessus d’un seuil de 100 bactéries par échantillon (van Zyl-
Smit et al., 2011). Cela permet notamment d’optimiser le diagnostic en cas de forte suspicion
de TB chez des patient à frotti négatif. Néanmoins, Cette technique reste moins sensible que
13
la culture et l’obtention d’un résultat négatif ne permet pas toujours d’exclure une
tuberculose.
h. Radiographie
La radiographie pulmonaire est un outil d’aide au diagnostic qui permet l’observation
des lésions induites par la TB. Cette caractéristique fait de la radiographie un outil
d’évaluation de l’efficacité du traitement anti-TB. Elle peut aider au dépistage de la TBP mais
n'apporte aucun diagnostic étiologique et ne peut pas non plus détecter l'infection latente
(Emane, 2016).
La tuberculose multi résistante est une forme de tuberculose due à des bacilles ne
réagissant aux deux médicaments de première intention les plus efficaces, la rifampicine et
l’isoniazide (Zellweger, 2011)
Entre 2018 et 2019, quelques progrès ont été réalisés dans le dépistage, la détection et
le traitement de la TB-MR. À l’échelle mondiale en 2019, Au total, 206 030 cas de
TB-MR/TB-RR ont été détectés et notifiés en 2019, soit une augmentation de 10% par rapport
aux 186 833 cas enregistrés en 2018 (mondiale de la Santé, 2020).
Au Gabon, La TB-MR est un défi majeur pour le pays, le nombre de cas diagnostiqués
étant sans cesse croissant depuis 2015 (Kombila et al., 2021).
L’échec thérapeutique est caractérisé par la persistance de la symptomatologie
clinique, parfois par l’apparition de formes multifocales, l’aggravation de l’image
radiologique et surtout la persistance de BAAR à l’examen microscopique des crachats
(Mounguengui et al., 2011). La TB-MR peut être le résultat de résistance intrinsèque ou de
14
résistance extrinsèque. La résistance intrinsèque ou naturelle fait référence à la résistance qui
n'est pas causée par une altération génétique, tandis que la résistance extrinsèque ou acquise
est due à une mutation des gènes codant pour des cibles de médicaments ou d'enzymes
activant des médicaments, en réponse à la pression de sélection des antibiotiques tuberculeux
(Culyba et al., 2015, Lina)
Les mécanismes de résistance aux médicaments mis en place par les bacilles multi
résistants sont essentiellement (figure 7):
Figure 6: Mécanismes de résistance aux médicaments chez Mycobacterium tuberculosis.(Singh et al., 2020)
15
En dépit des résistances, la TB-MR peut être soigner et guérie avec des médicaments
de deuxième intention (WHO, 2021). Le traitement devrait comprendre au moins quatre ou
cinq médicaments potentiellement efficaces (généralement des médicaments de deuxième)
dont un injectable et une quinolone et devrait se poursuivre pendant 18 mois au moins. Le
médicament injectable peut être supprimé après six mois de traitement ou quatre mois après la
négativation des cultures. Les effets indésirables du traitement de la tuberculose
multirésistante sont fréquents et peuvent parfois nécessiter l’adjonction de traitements
complémentaires ou le changement de régime thérapeutique (Zellweger, 2011).
Le risque d'évolution d’une TBL vers une TB active est largement supérieur à celui de
la population générale au sein de certains groupes. Pour ces populations à risque parmi
lesquelles les personnes vivant avec le VIH, Les contacts familiaux de patients atteints de TB
pulmonaire (TBP) confirmé en particulier les enfants de moins de 5 ans, le personnel de santé
et les personnes privées de liberté ou vivant en vase clos, les avantages du traitement en
prévention de la TB active l'emportent sur les risques (mondiale de la Santé, 2021).
– Les personnes vivant avec le VIH
L'épuisement progressif et le dysfonctionnement des lymphocytes T CD4 à la suite
d'une infection par le VIH conduit à un affaiblissement de la réponse immunitaire dirigée
contre Mycobacterium tuberculosis (Bizzell et al., 2018). Cependant même pour les personnes
vivant avec le VIH, l’infection n’est pas systématique et dépend en grande majorité de
l’observance du traitement antirétroviral et de du degré d’exposition à Mycobacterium
tuberculosis.
Toutefois, pour les personnes vivant avec le VIH non infectés à la TB, même pour
ceux qui ont une bonne observance des antirétroviraux et un taux de CD4 élevé, un traitement
de six à neuf mois de monothérapie d’isoniazide ou 3 mois de bithérapie d’isoniazide et de
rifampicine est prescrit à titre préventif (Group, 2015).
– Les contacts familiaux de personnes atteints de TBP confirmé
Un contact familial est une personne qui a partagé le même espace de vie fermé que le
cas index pendant une ou plusieurs nuits ou pendant des périodes fréquentes ou prolongées de
la journée au cours des 3 derniers mois (Organization, 2019).
16
Les enfants de moins de 5ans en raison de leur jeune âge, ils sont généralement très
proche de leur parent. Cette proximité accentue les risques de contamination par le complexe
Mycobacterium tuberculosis.
– Le personnel de santé
Des études menées dans certains pays africains et dans d’autres parties du monde ont
démontré que le personnel hospitalier court un risque plus important d’infections à
Mycobacterium tuberculosis et de maladie tuberculeuse que la population générale (Laraqui C
et al., 2001). En effet, l’exposition au flux constant de malades au sein des structures de santé
expose les employés des établissements de soins et des hôpitaux qui peuvent contracter la
tuberculose.
– La population carcérale
L’incidence de la tuberculose en milieu carcéral est plus élevée qu’en milieu libre en
raison des conditions de vie des détenus. En France par exemple la prévalence du VIH en
milieux carcéral est six fois plus élevée qu’en milieu libre ce qui augmente les risque
d’infection à la tubercule (Harcouët, 2010).
Au Gabon comme un peu partout en Afrique, la promiscuité en milieu carcéral
favorise la propagation de la TB et de la TB-MR du fait du surpeuplement, de la mauvaise
ventilation et de l’accès limité aux soins médicaux. Cette situation expose ainsi les détenus, le
personnel et les visiteurs à la TB (Fond, 2014).
17
II. Matériel et Méthodes
II.1.1 Site d’étude
L’étude a été menée sur les personnes vivant en détention à la prison centrale de
II.2.1.1 Prélèvement
18
pénitentiaire a procédé à la collecte et au transport des nouveaux échantillons jusqu’au CTA
de Koula-Moutou.
– Expectorations
Elles ont été recueillies tôt le matin avant que le patient ne se soit brosser ou rincer la
bouche et avant de manger, suivant ces différentes étapes :
Pour débuter, il faut se munir d’un flacon stérile étiqueté au nom du patient fourni par le
personnel soignant, s’éloigner des autres et recueillir les expectorations dans une zone aérée
sans toucher l’intérieur du flacon ou du bouchon. Pour ce faire, inspirer profondément, retenir
son souffle quelques secondes, tousser avec force jusqu’à produire des expectorations, cracher
dans le flacon jusqu’à ce que le fond du flacon soit couvert de mucosités, Fermer le flacon
pour éviter les fuites, noter la date de prélèvement et placer le flacon dans un sachet et Se
laver les mains une fois le prélèvement fini.
– Tubages gastriques
Ils ont été réalisés tôt le matin chez des sujets hospitalisés, à jeun avant toute forme de
mouvements, par le médecin équipé d’un stéthoscope, de gants et d’un masque de protection
grâce à l’utilisation d’une sonde nasogastrique et d’une seringue. Le liquide gastrique prélevé
a par la suite été recueilli dans un flacon stérile étiqueté au nom du patient.
II.2.1.2 Diagnostic
19
l’automate GeneXpert. Ce qui permet de détecter rapidement la présence de MTB et
d’éventuelles résistances.
Le diagnostic d’un échantillon nécessite un traitement préalable avec un réactif
(Réactif Sample Reagen) permettant l’extraction de l’ADN et son transfert dans une cartouche
identifiée par un code barre.
Elle est identifiée par un code barre et est essentiellement constituée d’un tube
réactionnel, un corps de valve et des chambres de traitement dans lesquelles on retrouve :
- Le tampon de PCR
- Les amorces spécifiques fluoromarquées
- ADN polymérase
- CQ internes (amorces et cellulaires)
Déroulement du test
Noter le numéro d’identification de l’échantillon sur chaque cartouche Xpert MTB/RIF Puis
ouvrir avec précaution le couvercle du récipient et mélanger 1mL d’échantillon et 2mL de
réactif, dans un autre récipient identifier au nom du patient, le fermer et agiter énergiquement
10 à 20 fois. Incuber l’échantillon pendant 15 minutes à température ambiante. Ouvrir le
couvercle de la cartouche et à l’aide d’une pipette de transfert fournie, aspirer l’échantillon
liquéfié. Transférer l’échantillon dans la chambre pour échantillon de la cartouche de test
Xpert MTB/RIF et bien fermer le couvercle de la cartouche et enfin, scanner le code bar,
renseigner sur l’identité du patient et introduire la cartouche dans GeneXpert pour analyse.
20
Figure 8: Transfert du mélange échantillon-réactif Sample Reagen dans la cartouche MTB/RIF
Les résultats étaient obtenus au bout de 2h. Le test est considéré négatif lorsque MTB
not detected s’affiche comme résultat. Lorsqu’une tuberculose sensible (TBS) est détecté le
résultat est MTB detected, RIF not detected. Lorsqu’une TB-MR est détecté, le résultat est
MTB detected, RIF detected la RIF. Les indication LOW, MEDIUM et HIGHT indique le
degré d’infection.
21
III. RESULTATS
Cette étude s’est étendue sur une période de deux mois allant du 1 er janvier 2022 au 28
février 2022. L’ensemble des résultats obtenus sont regroupés en deux principaux points à
savoir, les données sociodémographiques et les données biologiques décrivant la prévalence
de la tuberculose sensible et multi-résistante.
43%
57%
Sur les 198 sujets ayant pris part à cette étude, 56.57% sont des personnes privées de
liberté et 43.43%, sont des sujets reçus en consultation. L’âge moyen global est de 35.22 ans
± 12.68ans. L’âge minimum est de 15 ans, l’âge maximum est de 82 ans et le sex-ratio de
7.25 dans la population globale.
22
Femme
27%
Homme
73%
Femme Homme
La population reçue en consultation était constituée à 73% des hommes avec un sex-
ratio de 2.74, tandis que la population carcérale est constituée à 99.11% des hommes.
Tableau 2. Répartition de l’âge au sein de la population carcérale et des sujets reçus en consultation au CTA en
février 2022.
Tranche d’âge
<30 [30-40] >40 Total
Population carcérale 40 (36%) 54 (48%) 18 (16%) 112
Sujets reçus en consultation 28 (33%) 26 (30%) 32 (37%) 86
Total 68 (34%) 80 (40%) 50 (25%) 198
Dans la population carcérale, la tranche d’âge la plus représentée est celle allant de 30
à 40 ans (48%) suivant des moins de 30 ans (36%) et des plus de 40 ans (16%) et l’âge moyen
est de 32,86 ± 9.85 ans. Chez les sujets reçus en consultation par contre, les plus de 40 ans
sont les plus représenté (37%) suivi des moins de 30 ans (33%) et des 30 à 40 ans (30%) avec
un âge moyen de 38 ± 15 ans.
23
II.2. Prévalence de la tuberculose sensible et multi-résistante
TB+
Population d'étude TB- Total général
TB-MR TBS
Consultation 73(84.88%) 2(2.33%) 11(12.79%) 86
111(99.11%
Population carcérale ) 1(0.89%) 112
Total général 184(93%) 2(1%) 12(6%) 198
Tableau 4: Répartition des cas de TB chez les sujet reçus en consultation selon le sexe
16% des hommes reçus en consultation sont positif à la TB. p-value>0.500 ; Odds-
ratio : 0.795.
Tableau 5: Répartition des cas selon les tranches d'âges au sein des groupes de populations
Dans la population carcérale, un seul sujet de plus de 40 ans était TB+. Chez les sujets
reçus en consultation, les moins de 30 ans sont les plus atteints avec 7 sujet TB+ soit 8%.
24
IV. DISCUSSION
Cette étude transversale a été mené dans l’optique d’évaluer la prévalence de TB
sensible et multi-résistante dans la population carcérale de la ville de Koula-Moutou dans le
département de la Lolo Bouenguidi et chez les sujets reçus en consultation au CTA de Koula-
Moutou de janvier à février 2022.
L’âge moyen au sein de la population carcérale est de 32,86 ± 9.85 ans et la tranche
d’âge la plus représentée est celle de 30 à 40 ans. Ces données sont supérieures à ceux décrit à
la maison centrale d’arrêt pour homme de Bamako où l’âge moyen était de 28 ans et la
tranche d’âge la plus représenté était celle allant de 18 à 30 ans (Toloba, 2018). Chez les
sujets reçus en consultation, l’âge moyen était de 38 ± 15 ans. Cela est légèrement supérieure
à celui obtenu à Lambaréné au Gabon (Adegbite et al., 2020).
25
Koula-Moutou. Toutefois, il aurait été bénéfique d’évaluer la prévalence de l’infection latente
au sein de cette population qui pourrait constituer des niches de réplication pour les bactéries
du complexe MTB. En revanche, sur les 86 sujets reçus en consultation ayant pris part à
l’étude, 12.79% ont été diagnostiqué positif à la TBS et 2,33% sont TB-MR positif. Ces
résultats sont légèrement supérieur à ceux décrit à Bangui ou la prévalence hospitalière toute
formes était de 10,99% (Tékpa, 2019) Cela pourrait s’expliquer par le faible échantillonnage
de la population hospitalière au sein de cette étude, mais aussi par le fait que les sujets de cette
cohorte ne se rendent en consultation que lorsqu’ils manifestent des symptômes persistant de
la TB et cela après avoir usé de l’automédication comme le décrit une étude sur les
connaissances, les attitudes et les pratiques de la population sénégalaise sur la tuberculose
(LEYE, 2020). Enfin, l’Odds-ratio (0.051) laisse penser que le milieu carcéral est moins
exposé à la tuberculose que le milieu hospitalier.
Les hommes reçus en consultation sont les plus touchés par la TB tout forme En effet,
dans cette étude, 16% des cas de TB sont des hommes. Cela est en accord avec ce décrit dans
la littérature et pourrait se justifier par, la prédominance des hommes dans l’échantillonnage,
le faible échantillonnage mais aussi pas les habitudes sociétales des hommes tel que le
tabagisme ou la fréquentation des bars et boites de nuit. Cependant, cette différence reste non
significative (p-value>0.500).
100% des cas de tuberculose détecté en milieu carcéral ont un âge supérieur à 40 ans
contrairement à ce décrit dans les maisons d’arrêt en Ile de France où environ 80% des cas de
TB avaient un âge inférieur à 40 ans (Cochet, 2005). Chez les sujets reçus en consultation par
contre, 53.8% des cas de TB ont un âge inférieur à 30 ans. Cela est semblable à ce décrit à
Brazzaville où la tuberculose était plus représentative chez les jeunes de moins de 30 ans
(Régis, 2020). Il semblerait que l’âge constitue un facteur qui influence la prévalence de
tuberculose en milieu carcérale (p-value = 0.05) mais pas en dehors (p-value = 0.1207).
Notamment en raison de l’efficacité du système l’immunité qui s’amoindri avec l’âge mais
aussi à cause de l’insouciance qui caractérise les jeunes et les expose davantage à la TB.
Cependant il aurait été bénéfique d’évaluer l’impact d’autre facteurs tel que le niveau
connaissance de la maladie ainsi que le tabagisme
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Conclusion et perspectives
En définitive, cette étude a montré que la prévalence de la tuberculose sensible en
milieu carcérale est significativement plus faible que celle enregistrée chez les sujets reçus en
consultation. Preuve que le suivi sanitaire accordé à la population carcérale montre des signes
satisfaisants et encourageants. Cependant, les sujets reçus en consultation devraient être
l’objet d’une attention particulière de la part des pouvoirs publics notamment concernant la
multi-résistance de la tuberculose
Pour la suite de cette étude, il serait intéressant d’évaluer non seulement la prévalence
de toute les formes de tuberculose au sein de la population carcérale mais aussi d’évaluer la
prévalence de la tuberculose latente au sein de cet environnement. D’étendre l’étude au
personnel de santé qui constitue aussi une population très exposée aux bactéries du complexe
Mycobacterium tuberculosis, de déterminer en ce qui concerne la TB-MR le type de souche
résistante c’est-à-dire intrinsèque ou extrinsèque. Mais aussi de procéder à l’identification de
l’espèce de bacille tuberculeux prédominante au sein de cette localité.
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