El documento describe la extracción de ADN de bazo. Se explica que el bazo es una buena fuente debido a su alta relación núcleo/citoplasma. La extracción involucra homogeneizar el tejido en una solución reguladora para proteger el ADN, seguido de centrifugación y precipitación selectiva del ADN con alcohol etílico, obteniendo un precipitado blanco de fibras de ADN.
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El documento describe la extracción de ADN de bazo. Se explica que el bazo es una buena fuente debido a su alta relación núcleo/citoplasma. La extracción involucra homogeneizar el tejido en una solución reguladora para proteger el ADN, seguido de centrifugación y precipitación selectiva del ADN con alcohol etílico, obteniendo un precipitado blanco de fibras de ADN.
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Introducción
Los ácidos nucleicos son las
biomoléculas portadoras de la información genética. Tienen una estructura polimérica, lineal, cuyos monómeros son los nucleótidos. El grado de polimerización puede llegar a ser altísimo, con moléculas constituidas por centenares de millones de nucleótidos en una sola estructura covalente. De la misma manera que las proteínas son polímeros lineales aperiódicos de aminoácidos, los ácidos nucleicos lo son de nucleótidos. La aperiodicidad de la secuencia de nucleótidos implica la existencia de información. De hecho, sabemos que los ácidos nucleicos constituyen el depósito de información de todas las secuencias de aminoácidos de todas las proteínas de la célula. Existe una correlación entre ambas secuencias, lo que se expresa diciendo que ácidos nucleicos y proteínas son colineares; la descripción de esta correlación es lo que llamamos Código Genético, establecido de forma que a una secuencia de tres nucleótidos en un ácido nucleico corresponde un aminoácido en una proteína. La función de los ácidos nucleicos no se reduce, por otra parte, a contener la información necesaria para la síntesis de las proteínas celulares. Hay secuencias regulatorias que controlan la expresión de las diferentes unidades genéticas, por sí mismas o a su vez controladas por otras moléculas (hormonas, factores de crecimiento, señales químicas en general); hay asimismo ácidos nucleicos implicados en la transmisión y procesado de la información genética; hay también ácidos nucleicos con funciones catalíticas (ribosimas). La estructura química de los ácidos nucleicos es tan uniforme como la de las proteínas, o incluso más. Para tener una idea aproximada, veamos en primer lugar un polinucleótido (no se representan los átomos de hidrógeno). Podemos apreciar los distintos residuos (nucleótidos) de la cadena mediante el siguiente mando: Vamos ahora a una visión más cercana de este estructura: El espinazo de la misma está constituída por ortofosfatos esterificados cada uno simultáneamente a dos pentosas: se trata del enlace fosfodiéster, característico de los ácidos nucleicos (de la misma manera que el enlace peptídico lo es de las proteínas). Por lo tanto, el continuo covalente de un ácido nucleico es el esqueleto pentosa- fosfato-pentosa-fosfato-... Unidas a cada pentosa a través de un enlace glicosídico aparecen las bases nitrogenadas: que como puede apreciarse, no forman parte del continuo covalente del polinucleótido. Sin embargo, su papel es fundamental; son las portadoras de la información genética. El monómero de los ácidos nucleicos es, por lo tanto, el nucleótido: formado por un fosfato: esterificado a una pentosa: que a su vez está unida por un enlace beta-glicosídico a una base nitrogenada
OBTENCIÓN DEL DNA DE BAZO
Cuando se desea purificar una sustancia se deben seleccionar las células o tejidos que se van a utilizar como materia prima. En el caso del DNA esta selección es en especial importante porque el contenido de DNA es pequeño en la mayor parte de las células. La celula ideal será aquella que tenga una relación núcleo/citoplasma alta, como en los linfocitos y células del tumor ascítico de Ehrlich. Sin embargo, no es fácil obtener este tipo de células por lo que frecuentemente se usan órganos típicamente linfoides como el timo y el bazo. El primer paso en la extracción del DNA es la homogeneización del tejido. Este paso puede degradar en parte la molécula del DNA si no se toman las precauciones necesarias, la solución reguladora es de citrato 0.01M y NaCl 0.14M, a pH de 7.2 a 7.4; la fuerza iónica de esta solución hace insoluble a la desoxirribONUCLEOPROTEINA. Si se centrifuga este homogeneizado, en el residuo quedaran los restos celulares y las desoxirribonucleoproteinas insolubles. En el sobrenadante se encuentran compuestos solubles como la mayor parte de los ácidos ribonucleicos. Al homogeneizar el tejido se liberan las enzimas de los lisosomas, entre ellas la DNAasa, la cual hidroliza el DNA. Se sabe que el Mg es indispensable para la actividad de esta enzima; si en la solución existe citrato, este se une al Mg e impide la acción de la DNAasa. Otra forma de evitar la acción hidrolitíca de la enzima es trabajar a temperaturas bajas (0°C a 2°C). El siguiente paso en la purificación está basado en que las desoxirribonucleoproteinas y el DNA son solubles en soluciones salinas concentradas, mientras que la mayor parte de las proteínas precipitan en estas condiciones. Si el residuo se suspende en solución de NaCl 2.6M y se centrifuga, el residuo insoluble estará formado fundamentalmente por proteínas, mientras que el DNA permanecerá en solución. Este DNA se puede precipitar selectivamente por la adición selectiva de 2 volúmenes de alcohol etílico al 95% formándose un precipitado blanco fibroso, el cual se puede recoger por rotación de un agitador de vidrio con pequeños salientes. EXPERIMENTO 1 La muestra de bazo se coloca en un mortero, previamente enfriado y se secciona lo más finamente posible con una tijera. Se colocan 450 ml de la solución reguladora de citrato 0.01 M – NaCl 0.14M, a pH de 7.2 fría, en una licuadora cuyo vaso haya sido previamente enfriado. Se hace funcionar la licuadora a baja velocidad y se van añadiendo los trozos de bazo de todos los equipos. Esperando a que se homogeneicé completamente el primero antes de añadir el segundo y así sucesivamente. Una vez terminada la adición, continúe homogeneizando por 30 – 60 segundos más. Utilizando la centrifuga automática refrigerada, se coloca el homogeneizado en tubos de centrifuga apropiados teniendo cuidado de tarar perfectamente los tubos opuestos. ¡PRECAUCION! (CONSULTE A SU MAESTRO) Se centrifuga por 15 minutos a 5000 rpm. El sobrenadante se desecha. El residuo insoluble se lava en el mismo tubo en 15ml de citrato 0.01M NaCl 0.14M, pH 7.2 agitando hasta volver a re suspender con ayuda de una varilla de vidrio, si es necesario. Se vuelve a centrifugar a 5000 rpm por 5 minutos y si sobrenadante se desecha. La solución salina sobrenadante se coloca en un vaso de precipitados y se añaden lentamente dos volúmenes de alcohol etílico al 95%, procurando que la fase alcohólica quede en la parte superior. Se deberá observar la formación de un precipitado blanco, denso, en la interfase. Utilizando un agitador con pequeños saliente, agite esta mezcla lentamente procurando enrollar sobre el agitador las fibras del DNA precipitadas. 1) Explique por qué se utilizo bazo como materia prima y no otro órgano cualquiera Es un órgano que contiene células que contienen una relación núcleo/citoplasma alta, como en los linfocitos y células del tumor ascítico de Ehrlich. 2) ¿Seria conveniente utilizar solución reguladora de fosfatos para la extracción del DNA? ¿Por qué? Si, por que el fosfato hace que la solución se mantenga en un estado de equilibrio. 3) ¿Por qué es conveniente trabajar durante toda la extracción a baja temperatura? Para evitar la acción hidrolitíca de la enzima
Esta imagen nos muestra el DNA
precipitado en el alcohol etílico 95%
Con el agitador enrollamos las
fibras del DNA INSTITUTO POLITECNICO NACIONAL ESCUELA SUPERIOR DE MEDICINA INTEGRANTES: ARETIA PEREZ TREIZY RUBI BASURTO HERNANDEZ JUAN CARLOS GOMEZ MOSQUEDA KARLA PATRICIA TORRES PERALTA ALEJANDRA GRUPO 2CM7 EQUIPO: 1 LABORATORIO DE BIOQUIMICA I PRACTICA 11 ACIDOS NUCLEICOS