칼슘결합성 미토콘드리아 운반단백질 Aralar1

Calcium-binding mitochondrial carrier protein Aralar1
SLC25A12
사용 가능한 구조
PDBOrtholog 검색: PDBe RCSB
식별자
별칭SLC25A12, AGC1, ARALAR, 용질 캐리어 패밀리 25 멤버 12, EIE39, DE39
외부 IDOMIM: 603667 MGI: 1926080 HomoloGene: 48235 GeneCard: SLC25A12
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈

8604

78830

앙상블

ENSG00000115840

없음

유니프로트

O75746

Q8BH59

RefSeq(mRNA)

NM_003705

NM_172436

RefSeq(단백질)

NP_003696

NP_766024

장소(UCSC)Chr 2: 171.78 ~172 Mb없음
PubMed 검색[2][3]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

칼슘결합성 미토콘드리아 운반단백질 Aralar1은 SLC25A12 [4][5][6][7]유전자에 의해 인체 내에서 암호화되는 단백질이다.아랄은 미토콘드리아 내막에 위치한 일체형 막 단백질이다.항촉매제로서의 그것의 주요 기능은 하나의 칼슘 이온의 결합에 의존하여 미토콘드리아 아스파르트산염과 함께 세포질 글루탐산염의 내부 미토콘드리아 막을 가로질러 운반하는 것이다.이 유전자의 돌연변이는 중추신경계의 전역적 근수 감소, 난치성 발작, 신경 발달 [8][9]장애로 증상인 조기 유아 간질 뇌증 39(EIEE39)를 유발한다. 뇌전증이 유전자는 [10][11]자폐증과 관련이 있다.

구조.

SLC25A12 유전자는 염색체 2의 q팔 위치 31.1에 위치하며 110,[7]902개의 염기쌍에 걸쳐 있다.이 유전자는 아미노산 [12][13]678개로 구성된 74.8kDa 단백질을 생성한다.코드 단백질인 아랄라1은 미토콘드리아 [8][9]내막에 위치한 다통로 막 단백질이다.이 단백질의 N 말단 절반은 3개의 표준 EF-핸드 칼슘 결합 도메인과 함께 2개의 불완전한 EF-핸드 도메인을 포함합니다. 단백질의 이 부분은 칼슘을 시험관 내에서 결합합니다.아랄라의 C 말단 절반은 SLC25A11, SLC25A5, SLC25A1을 포함한 미토콘드리아 용질담체군의 다른 구성원과 28~29%의 동일성을 공유하며, 미토콘드리아 용질담체군의 [14][15]다른 구성원과 마찬가지로 6개의 추정막 통과 도메인을 가진다.

기능.

SLC25A12, Aralar1에 의해 코드된 단백질은 미토콘드리아 내막을 가로질러 세포질 글루탐산염과 미토콘드리아 아스파르트산염의 칼슘 의존적인 교환을 촉진하는 미토콘드리아 칼슘 결합 운반체이다.아랄은 높은 친화력으로 하나의 칼슘 이온에 결합합니다.칼슘 결합 시 EF-핸드 함유 조절 N-말단 도메인은 C-말단 도메인에 결합하여 기판이 캐리어 도메인을 통해 전위할 수 있는 전정을 엽니다.칼슘이 없는 경우 링커루프 도메인은 전정을 닫아 기판이 캐리어 [16]도메인에 들어가는 것을 방해할 수 있습니다.말산아스파르트산NADH셔틀의 멤버로서 아랄라는 세포질 환원 당량을 세포질에서 미토콘드리아 [17]매트릭스로의 전달에도 관여한다.아랄라는 SLC25A13에 의해 코드된 단백질과 함께 TIMM8A/TIMM13 착체의 기질인 칼슘결합 아스파르트산/글루탐산담체이다.

임상적 의의

아랄라1의 과잉발현은 미토콘드리아 대사를 증가시키고 췌장세포에서 [18]인슐린 분비를 증가시킨다.아랄은 심장과 골격근 세포에서 3.2kb와 2.9kb의 mRNA 전사체로 표현되며 뇌와 신장 [14][15]세포에서는 더 적은 양으로 표현된다.

간질성 뇌증

SLC25A12 유전자의 돌연변이는 난치성 발작, 신경 발달 장애 및 나쁜 예후를 특징으로 하는 조기 유아 간질 뇌증 39(EIEE39)를 일으킨다.발작이 시작되기 전에는 발작이 정상이며, 그 이후에는 인지 및 운동 지연이 뚜렷해집니다.EIEE39는 중추신경계의 전지구적 근수 감소로 특징지어지며, 회백질은 비교적 영향을 받지 않는 것으로 보인다.유전은 상염색체 [8][9]열성이야

자폐증

SLC25A12 유전자의 인트론 3과 16의 2 SNP는 [10]자폐증과 관련될 수 있다.전전두엽 피질의 Brodmann's Area(BA) 46에서 SLC25A12는 자폐인의 뉴런에서 더욱 강하게 발현된다.SLC25A12 과잉발현은 자폐증 [11]환자의 태아 발달 동안 뇌의 특정 하위 영역에서 신경 네트워크를 수정할 수 있다.

상호 작용

아랄은 36개의 다른 단백질 [19]외에 SCO1, ATF2, COX14, COA3와 상호작용을 한다.

「 」를 참조해 주세요.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000115840 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  3. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ del Arco A, Satrústegui J (September 1998). "Molecular cloning of Aralar, a new member of the mitochondrial carrier superfamily that binds calcium and is present in human muscle and brain". The Journal of Biological Chemistry. 273 (36): 23327–34. doi:10.1074/jbc.273.36.23327. PMID 9722566.
  5. ^ Crackower MA, Sinasac DS, Lee JR, Herbrick JA, Tsui LC, Scherer SW (Apr 2000). "Assignment of the SLC25A12 gene coding for the human calcium-binding mitochondrial solute carrier protein aralar to human chromosome 2q24". Cytogenetics and Cell Genetics. 87 (3–4): 197–8. doi:10.1159/000015465. PMID 10702666. S2CID 28029151.
  6. ^ Palmieri L, Pardo B, Lasorsa FM, del Arco A, Kobayashi K, Iijima M, Runswick MJ, Walker JE, Saheki T, Satrústegui J, Palmieri F (September 2001). "Citrin and aralar1 are Ca(2+)-stimulated aspartate/glutamate transporters in mitochondria". The EMBO Journal. 20 (18): 5060–9. doi:10.1093/emboj/20.18.5060. PMC 125626. PMID 11566871.
  7. ^ a b "Entrez Gene: SLC25A12 solute carrier family 25 (mitochondrial carrier, Aralar), member 12".Public Domain이 문서에는 퍼블릭 도메인에 있는 이 소스로부터의 텍스트가 포함되어 있습니다.
  8. ^ a b c "SLC25A12 - Calcium-binding mitochondrial carrier protein Aralar1 - Homo sapiens (Human) - SLC25A12 gene & protein". www.uniprot.org. Retrieved 2018-08-22. 이 문서에는 CC BY 4.0 라이센스로 제공되는 텍스트가 포함되어 있습니다.
  9. ^ a b c "UniProt: the universal protein knowledgebase". Nucleic Acids Research. 45 (D1): D158–D169. January 2017. doi:10.1093/nar/gkw1099. PMC 5210571. PMID 27899622.
  10. ^ a b Segurado R, Conroy J, Meally E, Fitzgerald M, Gill M, Gallagher L (November 2005). "Confirmation of association between autism and the mitochondrial aspartate/glutamate carrier SLC25A12 gene on chromosome 2q31". The American Journal of Psychiatry. 162 (11): 2182–4. doi:10.1176/appi.ajp.162.11.2182. hdl:2262/34993. PMID 16263864.
  11. ^ a b Lepagnol-Bestel AM, Maussion G, Boda B, Cardona A, Iwayama Y, Delezoide AL, Moalic JM, Muller D, Dean B, Yoshikawa T, Gorwood P, Buxbaum JD, Ramoz N, Simonneau M (April 2008). "SLC25A12 expression is associated with neurite outgrowth and is upregulated in the prefrontal cortex of autistic subjects". Molecular Psychiatry. 13 (4): 385–97. doi:10.1038/sj.mp.4002120. PMID 18180767.
  12. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J, Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (October 2013). "Integration of cardiac proteome biology and medicine by a specialized knowledgebase". Circulation Research. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161/CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID 23965338.
  13. ^ "SLC25A12 - Calcium-binding mitochondrial carrier protein Aralar1". Cardiac Organellar Protein Atlas Knowledgebase (COPaKB). Archived from the original on 2018-08-25. Retrieved 2018-08-24.
  14. ^ a b del Arco A, Satrústegui J (September 1998). "Molecular cloning of Aralar, a new member of the mitochondrial carrier superfamily that binds calcium and is present in human muscle and brain". The Journal of Biological Chemistry. 273 (36): 23327–34. doi:10.1074/jbc.273.36.23327. PMID 9722566.
  15. ^ a b 온라인 Mendelian Inheritance in Man, OMIM®. John Hopkins University, Baltimore, MD. MIM 번호: {603667}: {08/01/2016}. 월드 와이드 웹 URL: https://omim.org/
  16. ^ Thangaratnarajah C, Ruprecht JJ, Kunji ER (November 2014). "Calcium-induced conformational changes of the regulatory domain of human mitochondrial aspartate/glutamate carriers". Nature Communications. 5: 5491. Bibcode:2014NatCo...5.5491T. doi:10.1038/ncomms6491. PMC 4250520. PMID 25410934.
  17. ^ Jalil MA, Begum L, Contreras L, Pardo B, Iijima M, Li MX, Ramos M, Marmol P, Horiuchi M, Shimotsu K, Nakagawa S, Okubo A, Sameshima M, Isashiki Y, Del Arco A, Kobayashi K, Satrústegui J, Saheki T (September 2005). "Reduced N-acetylaspartate levels in mice lacking aralar, a brain- and muscle-type mitochondrial aspartate-glutamate carrier". The Journal of Biological Chemistry. 280 (35): 31333–9. doi:10.1074/jbc.M505286200. PMID 15987682.
  18. ^ Rubi B, del Arco A, Bartley C, Satrustegui J, Maechler P (December 2004). "The malate-aspartate NADH shuttle member Aralar1 determines glucose metabolic fate, mitochondrial activity, and insulin secretion in beta cells". The Journal of Biological Chemistry. 279 (53): 55659–66. doi:10.1074/jbc.M409303200. PMID 15494407.
  19. ^ IntAct. "SLC25A12 interactions". www.ebi.ac.uk. Retrieved 2018-08-23.

추가 정보

이 기사에는 미국 국립 의학 도서관(미국 국립 의학 도서관)의 공공 도메인 텍스트가 포함되어 있습니다.