CBX5(유전자)

CBX5 (gene)
CBX5
Protein CBX5 PDB 3FDT.png
사용 가능한 구조
PDBOrtholog 검색: PDBe RCSB
식별자
에일리어스CBX5, HEL25, HP1, HP1A, chromobox 5
외부 IDOMIM: 604478 MGI: 109372 HomoloGene: 7257 GeneCard: CBX5
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈

23468

12419

앙상블

ENSG000094916

ENSMUSG00000009575

유니프로트

P45973

Q61686

RefSeq(mRNA)

NM_012117
NM_001127321
NM_001127322

NM_001076789
NM_001110216
NM_007626
NM_001358950

RefSeq(단백질)

NP_001120793
NP_001120794
NP_036249

NP_001070257
NP_001103686
NP_031652
NP_001345879

장소(UCSC)Chr 12: 54.23 ~54.28 MbChr 15: 103.1 ~103.15 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

크로모박스 단백질 호몰로그 5는 CBX5 [5][6]유전자에 의해 인체 내에서 암호화되는 단백질이다.이것은 헤테로크로마틴 계열의 고도로 보존된 비히스톤 단백질 부분이다.단백질 자체는 일반적으로 HP1α라고 불린다.[citation needed]헤테로크로마틴 단백질-1(HP1)은 후생유전 [7]억제로 이어지는 메틸화 리신 잔기에 작용하는 N말단 도메인을 가진다.이 단백질의 C 말단은 호모다이머라이징을 담당할 뿐만 아니라 다양한 크로마틴 관련 비히스톤 [8]단백질과의 상호작용을 담당하는 크로모 섀도우 도메인(CSD)을 가지고 있다.

구조.

HP1α는 길이가 [7][8]6엑손으로 이루어진 191개의 아미노산이다.상기 단백질은 N말단 크로모도메인(CD)과 C말단 크로모사도메인(CSD)의 2개의 도메인을 포함한다.CD는 위치 9(H3K9)에서 메틸화된 리신 잔기를 통해 히스톤 3과 결합하는 반면, C 말단 CSD는 다른 다양한 크로마틴 관련, 비히스톤 [8]관련 단백질과 호모다이머화 및 상호작용한다.이들 2개의 도메인을 접속하는 것이 힌지 [9]영역입니다.

크로모도메인

일단 번역되면, 크로모도메인은 3개의 β-시트와 1개의 α-나선으로 구성된 구상 형태를 띠게 된다.β-시트는 카르복시 말단 [9]세그먼트에서 나선에 대해 채워집니다.β 시트의 전하가 음성이므로 DNA 결합 모티브로서 DNA에 결합하는 것이 어렵다.대신 HP1α는 단백질 상호작용 [8]모티브로서 히스톤에 결합한다.메틸화 H3K9에 대한 CD에 대한 특이적 결합은 "소수성 상자"라고 불리는 세 개의 소수성 측쇄에 의해 매개된다.HP1의 다른 사이트는 인접한 히스톤의 H3 꼬리와 상호작용하여 히스톤의 유연한 N 말단 꼬리에 구조를 제공한다.인접한 H3 히스톤은 번역 후 [9]꼬리를 수정함으로써 HP1 바인딩에 영향을 줄 수 있습니다.

크로모샤도 도메인

CSD는 CD와 매우 유사합니다.또한 3개의 β-시트를 포함하는 구상 구조를 가지지만 [9]CD에 있는 1개가 아닌 2개의 α-헬리스를 가진다.CSD는 체외에서 쉽게 균질화되고 그 결과 PxVxL, V는 프롤린, L은 류신, x는 아미노산 [8]등 특정 컨센서스 서열을 가진 HP1 관련 단백질을 수용할 수 있는 홈을 형성한다.

작용 메커니즘

HP1α는 주로 CD와 메틸 H3K9 [10]마크 사이의 상호작용에 따라 달라지는 유전자 소음기 역할을 한다.CD의 소수성 상자는 메틸화 리신 잔기에 적합한 환경을 제공합니다.유전자 침묵이 어떻게 이루어지는지에 대한 정확한 메커니즘은 알려지지 않았지만, 실험 데이터는 생물학적 고분자가 헤테로크로마틴 영역 안팎에서 빠르게 교환되는 것을 결론지었다.이것은 HP1이 헤테로크로마틴을 함께 고정시키는 접착제 역할을 하는 것이 아니라, 오히려 유전자 억제로 이어지는 닫힌 복합체나 유전자 활성화와 함께 열린 에크로마틴 구조를 만들기 위해 다양한 방식으로 상호작용하는 경쟁적인 분자들이 있다는 것을 암시한다.HP1 농도는 메틸화 H3K9 잔류물이 존재하는 염색체 영역에서 더 높고 정적이며, 염색체에 폐쇄적이고 유전자 억제된 헤테로크로마틴 [9]구조를 제공한다.또한 H3 리신이 메틸화 될수록 HP1의 친화력이 높아지는 것으로 나타났다.즉, 트리메틸화 리신 잔기는 디메틸화 잔기보다 HP1에 더 강하게 결합하며, 모노메틸화 잔기보다 더 잘 결합한다.

국소화 구동 계수는 현재 [9]알려져 있지 않습니다.

진화적 보존

HP1α는 매우 진화적으로 보존된 단백질로 효모의 일종인 시조당류 폼브와 같은 종에 존재하며,[9] 인간에 이르기까지 존재한다.N 말단 크로모도메인과 C 말단 크로모샤도 도메인은 힌지 영역보다 훨씬 보존된 것으로 보인다(약 50-70% 아미노산 유사도). (드로소필라 HP1 호몰로그와 [9]약 25-30% 유사도).

상호 작용

CBX5(gene)는, 다음과 상호 작용하고 있는 것을 나타내고 있습니다.

「 」를 참조해 주세요.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG000094916 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG00000009575 - 앙상블, 2017년 5월
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추가 정보

외부 링크