Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
MTA3
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| MTA3, metastasis associated 1 family member 3 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 609050 MGI: 2151172 HomoloGene: 14282 GeneCards: MTA3
|
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • sequence-specific DNA binding • DNA binding • zinc ion binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • histone deacetylase activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0032403 protein-containing complex binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001106 transcription corepressor activity • histone deacetylase binding
|
---|
Клітинна компонента |
• внутрішньоклітинна мембранна органела • клітинне ядро • нуклеоплазма • цитоплазма • NuRD complex
|
---|
Біологічний процес |
• GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • histone deacetylation • positive regulation of cell population proliferation • positive regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of nucleic acid-templated transcription
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 2: 42.49 – 42.76 Mb
| Хр. 17: 84.01 – 84.13 Mb
|
---|
PubMed search |
[1]
| [2] |
---|
Вікідані |
|
MTA3 (англ. Metastasis associated 1 family member 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 594 амінокислот, а молекулярна маса — 67 504[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAANMYRVGD | | YVYFENSSSN | | PYLIRRIEEL | | NKTASGNVEA | | KVVCFYRRRD |
ISNTLIMLAD | | KHAKEIEEES | | ETTVEADLTD | | KQKHQLKHRE | | LFLSRQYESL |
PATHIRGKCS | | VALLNETESV | | LSYLDKEDTF | | FYSLVYDPSL | | KTLLADKGEI |
RVGPRYQADI | | PEMLLEGESD | | EREQSKLEVK | | VWDPNSPLTD | | RQIDQFLVVA |
RAVGTFARAL | | DCSSSVRQPS | | LHMSAAAASR | | DITLFHAMDT | | LYRHSYDLSS |
AISVLVPLGG | | PVLCRDEMEE | | WSASEASLFE | | EALEKYGKDF | | NDIRQDFLPW |
KSLTSIIEYY | | YMWKTTDRYV | | QQKRLKAAEA | | ESKLKQVYIP | | TYSKPNPNQI |
STSNGKPGAV | | NGAVGTTFQP | | QNPLLGRACE | | SCYATQSHQW | | YSWGPPNMQC |
RLCAICWLYW | | KKYGGLKMPT | | QSEEEKLSPS | | PTTEDPRVRS | | HVSRQAMQGM |
PVRNTGSPKS | | AVKTRQAFFL | | HTTYFTKFAR | | QVCKNTLRLR | | QAARRPFVAI |
NYAAIRAEYA | | DRHAELSGSP | | LKSKSTRKPL | | ACIIGYLEIH | | PAKKPNVIRS |
TPSLQTPTTK | | RMLTTPNHTS | | LSILGKRNYS | | HHNGLDELTC | | CVSD |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.
Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | |
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|