ARNTL

ARNTL
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4H10
Ідентифікатори
Символи	ARNTL, BMAL1, BMAL1c, JAP3, MOP3, PASD3, TIC, bHLHe5, aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like
Зовнішні ІД	OMIM: 602550 MGI: 1096381 HomoloGene: 910 GeneCards: ARNTL
Пов'язані генетичні захворювання
	шизофренія
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • Hsp90 protein binding; • protein dimerization activity; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • aryl hydrocarbon receptor binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding; • transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding; • core promoter sequence-specific DNA binding; • bHLH transcription factor binding; • sequence-specific DNA binding; • protein heterodimerization activity; • E-box binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • PML body; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • transcription regulator complex; • нуклеоплазма; • клітинне ядро; • ядерні тільця; • chromatoid body;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • ритмічний процес; • transcription, DNA-templated; • regulation of hair cycle; • transcription by RNA polymerase II; • Сперматогенез; • циркадний ритм; • negative regulation of TOR signaling; • circadian regulation of gene expression; • GO:1903362 regulation of protein catabolic process; • positive regulation of circadian rhythm; • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; • negative regulation of fat cell differentiation; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • regulation of neurogenesis; • regulation of insulin secretion; • regulation of cell cycle; • response to redox state; • maternal process involved in parturition; • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway; • oxidative stress-induced premature senescence; • regulation of type B pancreatic cell development; • negative regulation of glucocorticoid receptor signaling pathway; • regulation of cellular senescence; • positive regulation of skeletal muscle cell differentiation; • positive regulation of protein acetylation; • negative regulation of cold-induced thermogenesis; • protein import into nucleus;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	406
	11865
	ENSG00000133794
	ENSMUSG00000055116
	O00327
	Q9WTL8
NM_001030272; NM_001030273; NM_001178; NM_001297719; NM_001297722;
	NM_001297724
	NM_001243048; NM_007489; NM_001357070; NM_001368412; NM_001374642
NP_001025443; NP_001025444; NP_001169; NP_001284648; NP_001284651;
	NP_001284653; NP_001338733; NP_001338734; NP_001338735; NP_001338736; NP_001338737; NP_001338738; NP_001338739; NP_001338740; NP_001338741; NP_001338742; NP_001338743; NP_001338744; NP_001338745; NP_001338746; NP_001338747; NP_001338748; NP_001338749; NP_001338750; NP_001338751; NP_001338752; NP_001338753
	NP_001229977; NP_031515; NP_001343999; NP_001355341; NP_001361571
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ARNTL (англ. Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 626 амінокислот, а молекулярна маса — 68 762^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MADQRMDISS	TISDFMSPGP	TDLLSSSLGT	SGVDCNRKRK	GSSTDYQESM
DTDKDDPHGR	LEYTEHQGRI	KNAREAHSQI	EKRRRDKMNS	FIDELASLVP
TCNAMSRKLD	KLTVLRMAVQ	HMKTLRGATN	PYTEANYKPT	FLSDDELKHL
ILRAADGFLF	VVGCDRGKIL	FVSESVFKIL	NYSQNDLIGQ	SLFDYLHPKD
IAKVKEQLSS	SDTAPRERLI	DAKTGLPVKT	DITPGPSRLC	SGARRSFFCR
MKCNRPSVKV	EDKDFPSTCS	KKKADRKSFC	TIHSTGYLKS	WPPTKMGLDE
DNEPDNEGCN	LSCLVAIGRL	HSHVVPQPVN	GEIRVKSMEY	VSRHAIDGKF
VFVDQRATAI	LAYLPQELLG	TSCYEYFHQD	DIGHLAECHR	QVLQTREKIT
TNCYKFKIKD	GSFITLRSRW	FSFMNPWTKE	VEYIVSTNTV	VLANVLEGGD
PTFPQLTASP	HSMDSMLPSG	EGGPKRTHPT	VPGIPGGTRA	GAGKIGRMIA
EEIMEIHRIR	GSSPSSCGSS	PLNITSTPPP	DASSPGGKKI	LNGGTPDIPS
SGLLSGQAQE	NPGYPYSDSS	SILGENPHIG	IDMIDNDQGS	SSPSNDEAAM
AVIMSLLEAD	AGLGGPVDFS	DLPWPL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Ikeda M., Nomura M. (1997). cDNA cloning and tissue-specific expression of a novel basic helix-loop-helix/PAS protein (BMAL1) and identification of alternatively spliced variants with alternative translation initiation site usage. Biochem. Biophys. Res. Commun. 233: 258—264. PMID 9144434 DOI:10.1006/bbrc.1997.6371
Hogenesch J.B., Gu Y.Z., Jain S., Bradfield C.A. (1998). The basic-helix-loop-helix-PAS orphan MOP3 forms transcriptionally active complexes with circadian and hypoxia factors. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 5474—5479. PMID 9576906 DOI:10.1073/pnas.95.10.5474
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Rutter J., Reick M., Wu L.C., McKnight S.L. (2001). Regulation of clock and NPAS2 DNA binding by the redox state of NAD cofactors. Science. 293: 510—514. PMID 11441146 DOI:10.1126/science.1060698
Richards J., Gumz M.L. (2013). Mechanism of the circadian clock in physiology. Am. J. Physiol. 304: R1053—R1064. PMID 23576606 DOI:10.1152/ajpregu.00066.2013
Eckel-Mahan K., Sassone-Corsi P. (2013). Metabolism and the circadian clock converge. Physiol. Rev. 93: 107—135. PMID 23303907 DOI:10.1152/physrev.00016.2012

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з ARNTL переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:701 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O00327 (англ.) . Архів оригіналу за 13 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з ARNTL переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:701 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, O00327 (англ.) . Архів оригіналу за 13 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

ARNTL

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук