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WO2023100829A1 - プロテアーゼ分解性マスク抗体 - Google Patents

プロテアーゼ分解性マスク抗体 Download PDF

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WO2023100829A1
WO2023100829A1 PCT/JP2022/043846 JP2022043846W WO2023100829A1 WO 2023100829 A1 WO2023100829 A1 WO 2023100829A1 JP 2022043846 W JP2022043846 W JP 2022043846W WO 2023100829 A1 WO2023100829 A1 WO 2023100829A1
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antibody
peptide
amino acid
acid sequence
target antigen
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翔太 工藤
幹広 石塚
玲子 亀井
智子 寺内
和徳 佐伯
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第一三共株式会社
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Definitions

  • the present invention relates to protease-degrading masked antibodies that are activated by the action of proteases.
  • Antibodies have very high recognition specificity and binding activity for antigens, that is, target molecules, and various molecules such as low-molecular-weight compounds, peptides, and proteins can be antigens.
  • antibody drugs are highly productive and stable in vivo, and are being developed for various diseases such as cancer, immune diseases, and infectious diseases.
  • ADC Antibody Drug Conjugate
  • TCE T-Cell Engaging
  • a mask antibody is known as a modified antibody that specifically acts on tumor tissue by using the properties of the tumor microenvironment (enhanced protease activity in tumor tissue, etc.). Since masked antibodies have suppressed binding activity in normal tissues, they are expected to be highly safe antibody drugs with low toxicity to normal tissues via target molecules (Non-Patent Document 2).
  • a masked antibody is composed of an antibody body, a masking domain that inhibits antibody binding, and a cleavable linker that connects the antibody and the masking domain and can be cleaved by a protease (Patent Document 1).
  • Non-Patent Document 3 Known masking domains include mimotope peptides that bind to complementarity determining regions (CDRs) of antibodies, and coiled-coil domains that do not directly interact with antibodies.
  • the cleavable linker is equipped with substrates for extracellular proteases such as matrix metalloprotease (MMP) and urokinase-type plasminogen activator (uPA), whose activity is enhanced in tumor tissue, and activates tumor tissue-selective antibodies.
  • MMP matrix metalloprotease
  • uPA urokinase-type plasminogen activator
  • Non-Patent Document 4 For example, previous studies using a masked anti-EGFR antibody (Cetuximab) showed activation of the masked antibody in tumor tissue, reduced skin exposure to EGFR, extended blood half-life, improved safety, etc. reported (Non-Patent Document 4). In addition, masking technology has been applied to various biologics molecules such as bispecific antibodies and cytokines (Patent Documents 3 and 4).
  • Masked antibodies are activated by proteases located extracellularly (membrane type, secretory type). It is known that the activities of various extracellular proteases such as matrix metalloprotease (MMP), urokinase-type plasminogen activator (uPA), matriptase (MT-SP1) and cathepsin (CTS) are enhanced in tumor tissues. (Non-Patent Document 5). In addition, it has been reported that legumain (LGMN), which is known to be localized in intracellular lysosomes, exists extracellularly in the tumor environment (Non-Patent Document 6).
  • MMP matrix metalloprotease
  • uPA urokinase-type plasminogen activator
  • MT-SP1 matriptase
  • CTS cathepsin
  • proteases are extracellularly secreted from cancer cells and stromal cells that exist around cancer cells, and are involved in various processes such as survival, proliferation, invasion, and metastasis of cancer cells. . Masked antibodies are activated by these extracellular proteases and act selectively on tumor tissue.
  • Protein-degrading proteases are also present in the cell (cytoplasm), and like the ubiquitin-proteasome system and the autophagy-lysosome system, they are involved in various biological processes such as amino acid metabolism, signal transduction, immunity, and apoptosis. . In addition, it has been reported that cytoplasmic protease leaks out of the cell following cell death or damage to the cell membrane (Non-Patent Document 7).
  • the present inventors have conducted intensive research to solve the above problems, and found that proteases that degrade proteins are present in the cytoplasm, and use of intracytoplasmic proteases that leak from tumor cells following cell death or damage to the cell membrane. As a result, the present invention was completed by improving the mask antibody.
  • the present invention includes the following inventions.
  • the molecule of [1] characterized in that after the second peptide is cleaved by a protease localized in the cytoplasm, it has a higher binding affinity to the target antigen than before cleavage. .
  • [3] The molecule of [1] or [2], wherein the second peptide of the [c] portion further comprises an amino acid sequence that is cleaved by an extracellular protease.
  • [4] The molecule of any one of [1] to [3], wherein the first peptide, the second peptide, and the portion that binds to the target antigen are linked in that order.
  • [5] The molecule of any one of [1] to [4], wherein the portion that binds to the target antigen is a polypeptide consisting of an amino acid sequence not included in the first peptide and the second peptide.
  • [6] The molecule according to any one of [1] to [5], which consists of a polypeptide.
  • the first peptide, the second peptide, and the portion that binds to the target antigen in that order, or the portion that binds to the target antigen, the second peptide, and the first peptide in that order. becomes the molecule of [6].
  • Any one selected from the group consisting of the first peptide, the second peptide and the portion that binds to the target antigen is bound to one or both of the other two via a linker, [1 ] to any one molecule of [7].
  • the molecule according to any one of [1] to [8], wherein the protease localized in the cytoplasm leaks out of the cell due to cell death or damage to the cell membrane.
  • the protease localized in the cytoplasm is selected from calpain, caspase and tripeptidyl peptidase, preferably the calpain is calpain 1 or calpain 2, and the caspase is caspase 1, caspase 8, caspase 3 or caspase-7 and the tripeptidyl peptidase is tripeptidyl peptidase-1 or tripeptidyl peptidase-2.
  • the extracellular protease is selected from the group consisting of matrix metalloprotease, urokinase-type plasminogen activator, matriptase, legumain and cathepsin, and the matrix metalloprotease is preferably MMP1, MMP2, MMP3, MMP7, MMP9, MMP12 and any one of [3] to [14], wherein one or more of MMP14 and preferably one or more of cathepsin B, cathepsin D, cathepsin S and cathepsin L Molecule as described.
  • the amino acid sequence cleaved by the protease localized in the cytoplasm, or in the cytoplasm and an amino acid sequence cleaved by the extracellular protease, preferably an amino acid sequence cleaved by the extracellular protease, localized in the cytoplasm The molecule according to any one of [1] to [15], which is arranged in the order of the amino acid sequences cleaved by the protease.
  • [20] [d] part is an antibody or antigen-binding fragment thereof that is not a target antigen-binding part, a peptide comprising an amino acid sequence not contained in the first peptide and the second peptide, a cytokine, a toxin, a radioisotope, a labeling molecule,
  • the molecule of [19] which is one or more selected from the group consisting of photosensitizers, immunostimulants, antitumor compounds, drugs, payloads, and polymers.
  • the antitumor compound is a camptothecin derivative or a pyrrolobenzodiazepine derivative, preferably the camptothecin derivative is N-[(1S,9S)-9-Ethyl-5-fluoro-9-hydroxy-4-methyl-10 , 13-dioxo-2,3,9,10,13,15-hexahydro-1H,12H-benzo[de]pyrano[3′,4′:6,7]indolizino[1,2-b]quinolin-1 -yl]-2-hydroxyacetamide, the molecule of [20]. [22] The molecule of [20], wherein the immunostimulatory substance is a cyclic dinucleotide derivative.
  • a method for identifying a peptide that binds to a complementarity determining region (CDR) contained in an antibody or an antigen-binding fragment of an antibody comprising the following steps (i) and (ii): (i) contacting the CDRs with a peptide library containing repeating sequences of aromatic amino acids and Pro; and (ii) recovering peptides that bind to the CDRs.
  • CDR complementarity determining region
  • [28] A step of preparing a peptide comprising the amino acid sequence contained in the first peptide and/or the amino acid sequence contained in the second peptide by recombination, in vitro translation, chemical synthesis or peptide synthesis, [1]- A method for producing the molecule of any one of [23]. [29] A molecule that binds to a target antigen obtained by the method of [28].
  • a molecule that binds to a target antigen obtained by the method of [30].
  • [32] A pharmaceutical composition comprising a molecule of any one of [1] to [23], [27], [29] and [31], a salt thereof, or a hydrate thereof. [33] The pharmaceutical composition of [32], which is an anticancer agent.
  • [34] A peptide library containing repeating sequences of aromatic amino acids and Pro. [35] Repeated sequences of aromatic amino acids and Pro form a ZPZP motif [Z represents an aromatic amino acid that is histidine (His), phenylalanine (Phe), tyrosine (Tyr), or tryptophan (Trp); The peptide library of [34], which represents proline].
  • This specification includes the disclosure content of Japanese Patent Application No. 2021-194701, which is the basis of priority of this application.
  • masked antibodies are activated by the action of proteases in the tumor environment, and by improving their tumor specificity, they exhibit excellent effects as antitumor agents.
  • FIG. 1 shows the concept of the invention.
  • A The format of masked antibodies activatable by extracellular and intracellular proteases is shown as an example.
  • a masking domain (lattice) that binds to the variable region of the antibody (white) is fused to the variable region of the antibody heavy chain with a cleaved linker.
  • the linker contains an extracellular protease substrate sequence (shaded) and an intracellular protease substrate sequence (black).
  • the variable region of the antibody is fused to the constant region (horizontal line).
  • B shows the activation of masked antibodies using intracellular proteases.
  • FIG. 2 shows the results of ELISA evaluation of the interaction between the known anti-TROP2 antibody HT1-11 described in WO2015/098099 and the human TROP2 antigen. HT1-11 bound to the antigen in a concentration-dependent manner.
  • FIG. 3 shows the output/input ratio when the degree of enrichment of peptide binders after panning against anti-TROP2 antibody HT1-11 was evaluated by pull-down experiments.
  • FIG. 4-1 shows the results of ELISA evaluation of the interaction between the scFv-type anti-TROP2 antibody and the human TROP2 antigen. The binding activity was evaluated under MMP non-addition conditions (solid line) and MMP1 addition conditions (dotted line).
  • (A) HT1-11-scFv-HL showed similar binding activity regardless of MMP addition conditions.
  • FIG. 4-2 shows the results of ELISA evaluation of the interaction between the scFv-type anti-TROP2 antibody and the human TROP2 antigen.
  • the binding activity was evaluated under MMP non-addition conditions (solid line) and MMP1 addition conditions (dotted line).
  • C MHT1001 showed stronger binding activity under MMP1 addition conditions than under MMP1 non-addition conditions.
  • MHT1002 showed stronger binding activity under MMP1 addition conditions than under MMP1 non-addition conditions.
  • FIG. 5-1 shows the results of evaluating the interaction between an IgG-type anti-TROP2 mask antibody and a human TROP2 antigen by ELISA.
  • FIG. 5-2 shows the results of an ELISA evaluation of the interaction between an IgG-type anti-TROP2 mask antibody and a human TROP2 antigen. The binding activity was evaluated under protease-free conditions (solid line) and protease-added conditions (dotted line).
  • C MHT1008 showed similar binding activity regardless of MMP addition conditions.
  • FIG. 6 shows the results of an ELISA evaluation of the interaction between an anti-TROP2 mask antibody loaded with a CAPN substrate and a human TROP2 antigen.
  • A MHT3002 showed stronger binding activity under uPA- or CAPN1-added conditions than under protease-free conditions.
  • MHT3201 showed stronger binding activity only under CAPN1-added conditions than under protease-free conditions.
  • B MHT1713 showed stronger binding activity under various MMP-added conditions than under MMP-free conditions.
  • MHT3202 showed the same binding activity as MMP non-addition condition under any conditions.
  • FIG. 7-1 shows the results of an ELISA evaluation of the interaction between an anti-TROP2 mask antibody loaded with a uPA substrate or a CAPN substrate and a human TROP2 antigen. Binding activity was evaluated under protease-free conditions (solid line), uPA-added conditions (dotted line), and CAPN1-added conditions (dashed line).
  • A MHT3423 showed stronger binding activity only under uPA-added conditions than under protease-free conditions.
  • (B) MHT3201 showed stronger binding activity only under CAPN1-added conditions than under protease-free conditions.
  • FIG. 7-2 shows the results of an ELISA evaluation of the interaction between an anti-TROP2 mask antibody loaded with a uPA substrate or a CAPN substrate and a human TROP2 antigen. Binding activity was evaluated under protease-free conditions (solid line), uPA-added conditions (dotted line), and CAPN1-added conditions (dashed line).
  • C MHT3202 showed stronger binding activity under uPA and CAPN1 addition conditions than under protease non-addition conditions.
  • (D) MHT3203 showed stronger binding activity under uPA and CAPN1 addition conditions than under protease non-addition conditions.
  • FIG. 8 shows the N297 sugar chain of the sugar chain-modified antibody (MSG1-type sugar chain (WO2019/065964) in which an azide group is introduced to the sialic acid at the non-reducing end).
  • Figure 9 shows MHT1008-PBD-ADC (square), MHT3423- in a mouse model transplanted with (A) TROP2-positive human lung mucinous epidermoid carcinoma cell line NCI-H292 or (B) TROP2-positive human pharyngeal carcinoma cell line FaDu.
  • FIG. 10 shows the results of ELISA evaluation of the interaction between the known anti-CD98 antibody hM23H1L1 described in WO2015/146132 and the human CD98 antigen. hM23H1L1 bound to the antigen in a concentration-dependent manner.
  • FIG. 11 shows (A) the type of peptide library and (B) the output/input ratio when the enrichment degree of peptide binders after panning against the anti-CD98 antibody hM23H1L1 was evaluated by pull-down experiments. The value was higher for hM23H1L1 than for human serum-derived IgG (IgG mixture), suggesting concentration of peptides that specifically bind to hM23H1L1.
  • FIG. 12-1 shows the results of evaluating the interaction between an IgG-type anti-CD98 mask antibody and a human CD98 antigen by ELISA. The binding activity was evaluated under protease-free conditions (solid line) and protease-added conditions (dotted line).
  • FIG. 12-2 shows the results of evaluating the interaction between the IgG-type anti-CD98 mask antibody and the human CD98 antigen by ELISA. The binding activity was evaluated under protease-free conditions (solid line) and protease-added conditions (dotted line).
  • C MhM1013 showed stronger binding activity under MMP1 addition conditions than under MMP1 non-addition conditions.
  • Figure 13 shows (A) the results of evaluating the binding activity to the human CD98 antigen of hM23-M1 in which a point mutation was introduced into the CDR1 in the hM23H1L1 heavy chain variable region by SPR (Surface plasma resonance), and (B) the results of MhM1013.
  • 2 shows the results of evaluating the binding activity of mutated MhM1013-M1 to human CD98 antigen by ELISA.
  • MhM1013-M1 (gray) showed a masking effect equal to or greater than that of MhM1013 (black).
  • FIG. 14-1 shows the results of an ELISA evaluation of the interaction between an anti-CD98 mask antibody loaded with a cleavable linker with a different protease substrate and the human CD98 antigen. Binding activity was evaluated under protease-free conditions (solid line), uPA or MMP9-added conditions (dotted line), and CAPN1-added conditions (dashed line).
  • A MhM1018-M1 showed similar binding activity under any condition.
  • FIG. 14-2 shows the results of an ELISA evaluation of the interaction between an anti-CD98 mask antibody loaded with a cleavable linker with a different protease substrate and the human CD98 antigen. Binding activity was evaluated under protease-free conditions (solid line), uPA or MMP9-added conditions (dotted line), and CAPN1-added conditions (broken line).
  • C MhM1020-M1 showed stronger binding activity only under CAPN1-added conditions than under protease-free conditions.
  • D MhM1021-M1 showed stronger binding activity under uPA and CAPN1 addition conditions than under protease non-addition conditions.
  • FIG. 14-3 shows the results of an ELISA evaluation of the interaction between an anti-CD98 mask antibody loaded with a cleavable linker with a different protease substrate and the human CD98 antigen. Binding activity was evaluated under protease-free conditions (solid line), uPA or MMP9-added conditions (dotted line), and CAPN1-added conditions (dashed line).
  • E MhM1018-M1 had slightly improved binding activity under MMP9 addition conditions, but exhibited similar binding activity under other conditions.
  • 14-4 shows the results of an ELISA evaluation of the interaction between an anti-CD98 mask antibody loaded with a cleavable linker with a different protease substrate and the human CD98 antigen. Binding activity was evaluated under protease-free conditions (solid line), uPA or MMP9-added conditions (dotted line), and CAPN1-added conditions (dashed line). (G) MhM1023-M1 showed stronger binding activity under MMP9- and CAPN1-added conditions than under protease-free conditions.
  • Figure 16 shows (A) the results of evaluating the interaction between the known anti-EGFR antibody Cetuximab and human EGFR by ELISA, and (B) the interaction between the known anti-GPRC5D antibody C3022 described in WO2018/147245 and the human GPRC5D antigen. are evaluated by ELISA. The antibody bound to the antigen in a concentration-dependent manner.
  • FIG. 17 shows the output/input ratio when the enrichment of peptide binders after panning against (A) anti-EGFR antibody Cetuximab or (B) anti-GPRC5D antibody C3022 was evaluated by pull-down experiments. The target antibody value was higher than that of human serum-derived IgG (IgG mixture), suggesting the concentration of target antibody-specific peptides.
  • Figure 18 shows both uPA substrate and CAPN substrate loaded (A) results of evaluation of the interaction between anti-EGFR mask antibody and human EGFR antigen by ELISA, or (B) interaction between anti-GPRC5D mask antibody and human GPRC5D antigen. are evaluated by ELISA. Binding activity was evaluated under protease-free conditions (solid line), uPA-added conditions (dotted line), and CAPN1-added conditions (dashed line). The masked antibody showed stronger binding activity under uPA and CAPN1 addition conditions than under protease non-addition conditions.
  • Figure 19 shows (A) MhM1018-M1-DXd-ADC ( square), MhM1019-M1-DXd-ADC (black square), MhM1020-M1-DXd-ADC (upward black triangle), MhM1021-M1-DXd-ADC (black circle), Vehicle (ABS) (circle) and (B) MhM1018-M1-DXd-ADC (square), MhM1022-M1-DXd-ADC (black square), MhM1020-M1-DXd-ADC (upward black triangle), MhM1023-M1-DXd-ADC (black circle), Vehicle (ABS ) (circles) show anti-tumor activity.
  • FIG. 22 shows the results of an ELISA evaluation of the interaction between an anti-TROP2 mask antibody loaded with a uPA substrate and a CAPN substrate and a human TROP2 antigen. Binding activity was evaluated under protease-free conditions (solid line), uPA-added conditions (dotted line), and CAPN1-added conditions (dashed line). (A) MHT3203 showed stronger binding activity under uPA and CAPN1 addition conditions than under protease non-addition conditions.
  • FIG. 24 shows the binding activity of anti-TROP2 masked antibodies loaded with cleavable linkers with different protease substrates reacted with buffer (hatched), CAPN1 (black), CAPN2 (grey) and uPA (white). The value of binding intensity when reacted with uPA is indicated as 100%.
  • Figure 25 shows MHT3203-PBD-ADC (squares), MHT5082- in mouse models transplanted with (A) TROP2-positive human lung mucinous epidermoid carcinoma cell line NCI-H292 or (B) TROP2-positive human pharyngeal carcinoma cell line FaDu.
  • PBD-ADC black square
  • MHT5085-PBD-ADC upward black triangle
  • MHT5086-PBD-ADC black circle
  • MHT5093-PBD-ADC black diamond
  • MHT5094-PBD-ADC downward black triangle
  • HT1-11 Full-length H chain amino acid sequence (SEQ ID NO: 1) HT1-11 full-length L chain amino acid sequence (SEQ ID NO: 2) MHT1001 full-length amino acid sequence (SEQ ID NO: 3) MHT1002 full-length amino acid sequence (SEQ ID NO: 4) HT1-11-scFv-HL full-length amino acid sequence (SEQ ID NO: 5) HT1-11-scFv-LH full-length amino acid sequence (SEQ ID NO: 6) MHT1007 full-length H chain amino acid sequence (SEQ ID NO: 7) MHT1008 H chain full-length amino acid sequence (SEQ ID NO: 8) MHT1009 full-length H chain amino acid sequence (SEQ ID NO: 9) MHT3002 full-length H chain amino acid sequence (SEQ ID NO: 10) human CAPN1 full-length amino acid sequence (SEQ ID NO: 11) Amino acid sequence of novel CAPN substrate (SEQ ID NO: 12) MHT3201 full-length H chain amino acid sequence (
  • DXd means "N-[(1S,9S)-9-Ethyl-5-fluoro-9-hydroxy-4-methyl-10,13-dioxo-2,3,9,10, 13,15-hexahydro-1H,12H-benzo[de]pyrano[3′,4′:6,7]indolizino[1,2-b]quinolin-1-yl]-2-hydroxyacetamide”.
  • PBD in the present invention means "pyrrolobenzodiazepine”.
  • a “mimotope” means a "peptide that binds to the complementarity determining region (CDR) of an antibody".
  • the amino acid sequence of the mimotope has the characteristic that it does not necessarily match the amino acid sequence (epitope) of the antigen recognized by the antibody (Molecular Immunology.; 23(7):709-715 (1986)).
  • antibody is used to mean an immunoglobulin having a constant region and a variable region. Antibodies are not particularly limited, whether they are naturally occurring immunoglobulins or partially or wholly synthetically produced immunoglobulins.
  • the basic four-chain antibody structure consists of two identical light chains (L chains) and two identical heavy chains (H chains).
  • a light chain is attached to a heavy chain by one covalent disulfide bond.
  • the two heavy chains are held together by one or more disulfide bonds depending on the heavy chain isotype.
  • Each light and heavy chain has regularly spaced intrachain disulfide bonds.
  • Heavy and light chains have a constant region with very high amino acid sequence similarity and a variable region with low amino acid sequence similarity.
  • Light chains have at the amino terminus a variable region (VL) followed by a constant region (CL).
  • the heavy chain has at the amino terminus a variable region (VH) followed by three constant regions (CH1/CH2/CH3).
  • VL and VH are paired and CL is aligned with the first constant region (CH1) of the heavy chain.
  • VL and VH pair to form a single antigen-binding site.
  • the constant region of the antibody of the present invention is not particularly limited, but the constant region of a human antibody is preferably used as the antibody of the present invention for treating or preventing human diseases.
  • Heavy chain constant regions of human antibodies include, for example, C ⁇ 1, C ⁇ 2, C ⁇ 3, C ⁇ 4, C ⁇ , C ⁇ , C ⁇ 1, C ⁇ 2, and C ⁇ .
  • Light chain constant regions of human antibodies include, for example, C ⁇ and C ⁇ .
  • a Fab consists of a heavy chain VH followed by CH1, and a light chain VL followed by CL.
  • VH and VL contain complementarity determining regions (CDRs).
  • CDRs complementarity determining regions
  • Fc (also referred to as Fc region) is the carboxyl-terminal region of the heavy chain constant region, comprising CH2 and CH3, and is a dimer.
  • the Fc of the present invention may be a natural (wild-type) sequence Fc or a mutant Fc in which the natural sequence is mutated (referred to as "mutant Fc").
  • a preferred Fc region is a variant Fc, more preferably a set of Fc's capable of forming heterodimers.
  • a combination of Fc (i) contained in the first polypeptide and Fc (ii) contained in the second polypeptide, which will be described later, can be mentioned. dimer formation), it is not limited to them.
  • the variant Fc disclosed in WO2013/063702, modified Fc region contained in a heteromultimer having improved stability (including heterodimeric Fc region), disclosed in WO96/27011, Fc comprising the CH3 region of an immunoglobulin derived from an IgG antibody having "protrusions" and "cavities” contained in heterologous multimers, one or more amino acid residues to charged amino acids disclosed in WO2009/089004 Fc containing CH3 domains contained in heterodimers that are electrostatically favored by replacement, heterologous using conformational and/or pI (isoelectric point) mutations as disclosed in WO 2014/110601 Heterodimeric Fc region contained in the dimer, comprising a CH3 domain containing modifications that eliminate or reduce binding to protein A disclosed in WO2010/151792, heterodimeric Fc etc. are exemplified but not limited to these.
  • variable region consists of regions of extreme variability, called hypervariable regions (HVR), and relatively invariant regions, called framework regions (FR), separated by these regions.
  • HVR hypervariable regions
  • FR framework regions
  • Natural heavy and light chain variable regions comprise four FRs joined by three hypervariable regions, each chain's hypervariable region being held in close proximity with the other chain's hypervariable region by the FRs; It contributes to the formation of the antigen-binding site of antibodies.
  • CDRs Complementarity Determining Regions
  • Complementarity-determining regions also called hypervariable regions
  • CDRH1, CDRH2, and CDRH3 from the amino terminal side of the heavy chain amino acid sequence
  • the light chain complementarity determining region is denoted as light chain amino acid sequence.
  • CDRL1, CDRL2 and CDRL3 are designated from the amino terminal side of the sequence.
  • FR is the part other than the CDRs of the variable region.
  • a variable region generally has four FRs, FR1, FR2, FR3 and FR4.
  • the CDRs and FRs contained in the heavy and light chains are, from amino-terminus to carboxyl-terminus, FRH1-CDRH1-FRH2-CDRH2-FRH3-CDRH3-FRH4 and FRL1-CDRL1-FRL2-CDRL2-FRL3-CDRL3- FRL4, and so on.
  • CDRs and FRs can also be determined by various definitions known in the art, such as Kabat, Chothia, AbM, contact, etc., in addition to IMGT.
  • the "site" to which an antibody binds that is, the "site” recognized by an antibody means a partial peptide or partial conformation on an antigen that is bound or recognized by an antibody.
  • mutant antibody refers to an amino acid that is substituted, deleted, or added (addition includes insertion) (hereinafter collectively referred to as "mutation") in the amino acid sequence of the original antibody.
  • the number of mutated amino acids in such mutated antibodies is 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 12, 15, 20, 25, 30, 40 or 50.
  • Such mutant antibodies are also included in the "antibody” of the present invention.
  • “several” in “one or several” refers to 2 to 10.
  • the term “molecule” refers to the above-described antibody, a molecule containing an antigen-binding fragment of an antibody, and a multispecific molecule formed from an antibody or a plurality of antigen-binding fragments derived therefrom.
  • a carries B means "A contains B” or "B is bound, added or fused to A”.
  • an "antibody loaded with a substrate” can be interpreted as an “antibody comprising a substrate,” a “substrate-bound antibody,” a “substrate-attached antibody,” or a “substrate-fused antibody.”
  • the present invention is a molecule that binds to a target antigen, wherein the molecule specifically binds to said target antigen in a particular environment.
  • a specific environment refers to the environment in a specific tissue, such as the cancer microenvironment.
  • a cancer microenvironment refers to an environment within a cancer tissue, for example, an environment in which proteases are present.
  • the target antigen-binding molecule of the present invention comprises a target antigen-binding portion, a first peptide that recognizes the target antigen-binding site contained in the portion, and an amino acid sequence that is cleaved by a protease localized in the cytoplasm. It contains two peptides, linked in order of the first peptide, the second peptide and the target antigen-binding portion.
  • a portion that binds to a target antigen is also referred to as a moiety that binds to a target antigen.
  • the target antigen-binding portion is sometimes referred to as the [a] portion, the first peptide as the [b] portion, and the second peptide as the [c] portion.
  • the portion that binds to the target antigen is preferably a polypeptide.
  • the portion binds to the target antigen by antibody-antigen reaction or protein (eg, receptor)-ligand binding.
  • the portion that binds to the target antigen is more preferably an antibody or an antigen-binding fragment of an antibody that binds to the target antigen via an antibody-antigen reaction.
  • Antibodies of the present invention include non-human animal-derived antibodies (non-human animal antibodies), human antibodies, chimerized antibodies (also referred to as "chimeric antibodies"), humanized antibodies, etc., preferably human antibodies. Alternatively, humanized antibodies can be used.
  • the scope of the antibodies of the present invention also includes antibody variants (“variant antibodies” described below). For example, the scope of human antibodies includes human variant antibodies, and the scope of humanized antibodies includes human Also included are mutated antibodies.
  • non-human animal antibodies include antibodies derived from vertebrates such as mammals and birds.
  • Antibodies derived from mammals include antibodies derived from rodents such as mouse antibodies and rat antibodies, and antibodies derived from camels.
  • Examples of antibodies derived from birds include chicken antibodies.
  • chimerized antibodies include, but are not limited to, antibodies formed by combining variable regions derived from non-human animal antibodies and human antibody (human immunoglobulin) constant regions.
  • Humanized antibodies include those in which the CDRs in the variable regions of non-human animal antibodies are grafted into human antibodies (variable regions of human immunoglobulins), and in addition to the CDRs, the sequences of the framework regions of non-human animal antibodies are also partly human antibodies. and those in which one or more amino acids from any of these non-human animal antibodies are replaced with human amino acids, and the like, but are not limited thereto.
  • Antibodies can be produced by various known methods. As well-known methods, it can be produced by a method using a hybridoma, a cell immunization method, or the like, and can be produced by a genetic recombination technique. Also known is a method for obtaining phage-display-derived human antibodies selected from a human antibody library. For example, a phage display method can be used in which variable regions of human antibodies are expressed as scFv on the surface of phages and phages that bind to the antigen are selected. By analyzing the genes of phages selected for binding antigen, the DNA sequences encoding the variable regions of human antibodies that bind antigen can be determined.
  • a human antibody can be obtained by constructing an expression vector having the sequence and introducing it into an appropriate host for expression (WO92/01047, WO92 /20791, WO93/06213, WO93/11236, WO93/19172, WO95/01438, WO95/15388, Annu. Rev. Immunol (1994) 12, 433-455).
  • human antibodies are obtained by a method using human antibody-producing mice having human genomic DNA fragments containing human antibody heavy chain and light chain genes (Tomizuka, K. et al., Nature Genetics (1997) 16, p. 133). Kuroiwa, Y. et al., Nuc.
  • constant regions of human therapeutic or prophylactic antibodies those of human antibodies are preferably used.
  • heavy chain constant regions of human antibodies include C ⁇ 1, C ⁇ 2, C ⁇ 3, C ⁇ 4, C ⁇ , C ⁇ , C ⁇ 1, C ⁇ 2, and C ⁇ .
  • Light chain constant regions of human antibodies include, for example, C ⁇ and C ⁇ .
  • An antigen-binding fragment of an antibody means a partial fragment of an antibody composed of a heavy chain variable region and a light chain variable region and having antigen-binding activity.
  • Antigen-binding fragments of antibodies include, but are not limited to, antigen-binding fragments such as Fab, F(ab') 2 , scFv, Fab', Fv, and single-domain antibody (sdAb). not a thing Antigen-binding fragments of such antibodies include those obtained by treating full-length antibody proteins with enzymes such as papain and pepsin, as well as recombinant proteins produced in appropriate host cells using recombinant genes. There may be.
  • Variants of antibodies or antigen-binding fragments thereof preferably have reduced susceptibility to protein degradation or oxidation, maintenance, improvement, reduction, or change in biological activity or function. Suppression, improvement or regulation of antigen-binding ability, conferment of physicochemical or functional properties, or the like can be achieved. Proteins are known to change their function and activity by changing specific amino acid side chains on their surface. Examples include deamidation of asparagine side chains and Isomerization etc. are included. Alternative amino acid substitutions to prevent such amino acid side chain changes are also included within the scope of the variants of the present invention.
  • variants of the present invention include antibodies or antigen-binding fragments thereof having amino acid sequences in which conservative amino acid substitutions are made in the amino acid sequence of antibodies or antigen-binding fragments thereof.
  • Conservative amino acid substitutions are substitutions that occur within a group of amino acids that are related in their amino acid side chains.
  • Modified Antibodies or Binding Fragments, Conjugates The present invention provides modified antibodies or binding fragments thereof.
  • a modified antibody of the present invention or a binding fragment thereof means a product obtained by chemically or biologically modifying the antibody of the present invention or a binding fragment thereof.
  • Chemical modifications include attachment of chemical moieties to the amino acid backbone, chemical modifications of N-linked or O-linked carbohydrate chains, and the like.
  • Biological modifications include post-translational modifications (e.g., N- or O-linkage glycosylation, glycosylation remodeling, amino- or carboxyl-terminal region processing, deamidation, aspartic acid isomerization, oxidation of methionine), and those with a methionine residue added to the amino terminus by expression using a prokaryotic host cell.
  • post-translational modifications e.g., N- or O-linkage glycosylation, glycosylation remodeling, amino- or carboxyl-terminal region processing, deamidation, aspartic acid isomerization, oxidation of methionine
  • those with a methionine residue added to the amino terminus by expression using a prokaryotic host cell.
  • those labeled to enable detection or isolation of the antibody or antigen of the present invention such as enzyme labels, fluorescent labels, and affinity labels.
  • modifications of the antibody of the present invention or binding fragment thereof can improve the stability and blood retention of the original antibody of the present invention
  • Examples of chemical moieties included in chemical modifications include water-soluble polymers such as polyethylene glycol (PEG), ethylene glycol/propylene glycol copolymer, carboxymethylcellulose, dextran, and polyvinyl alcohol.
  • biological modifications include those modified by enzymatic or cell treatments, fusions to which other peptides such as tags are added by genetic recombination, and endogenous or exogenous glycosylation enzymes. and those prepared by using cells expressing as a host.
  • Such modifications may be made at any position or desired position in the antibody or binding fragment thereof, and the same or two or more different modifications may be made at one or more positions.
  • deletion of these heavy chain sequences or modification of the heavy or light chain sequences does not significantly affect the antigen-binding ability and effector functions of antibodies (such as complement activation and antibody-dependent cytotoxicity). Does not affect, preferably does not affect significantly.
  • the present invention also includes the deleted or modified antibody.
  • a deletion in which one or two amino acids are deleted at the heavy chain carboxyl terminus Journal of Chromatography A; 705; 129-134 (1995)
  • two amino acid residues of glycine and lysine at the heavy chain carboxyl terminus are deleted.
  • the two or more chains are heavy chains selected from the group consisting of full-length and truncated forms described above. Any one of these may be used, or any two of them may be used in combination.
  • the amount ratio or molecular number ratio of each deletion can be affected by the type and culture conditions of cultured mammalian cells that produce the antibody of the present invention. at least one of, preferably both of, one, two or several amino acid residues at the carboxyl terminus are deleted.
  • the antibody of the present invention or an antigen-binding fragment thereof may contain one or more derived from an expression vector and/or a signal sequence, etc. Even if one amino acid is added to the amino terminus and/or the carboxyl terminus (and some or all of them are modified as described above), the desired antigen-binding activity of the antibody of the present invention is maintained. Included within the scope of modifications or modifications of antigen-binding fragments thereof, molecules comprising such modifications of antibodies or antigen-binding fragments are also encompassed within the scope of the molecules of the present invention.
  • the term "antibody or its binding fragment” also includes “modified antibody or its antigen-binding fragment”.
  • the "antibody or antigen-binding fragment thereof” included in the molecules, multispecific molecules, bispecific molecules, etc. of the present invention includes such "modified antibody or antigen-binding fragment thereof” in its meaning. .
  • a target antigen refers to a molecule associated with a specific disease.
  • a molecule associated with a specific disease refers to a molecule that is expressed or whose expression is enhanced in abnormal cells that appear in the disease when suffering from the disease of the antigen or molecule that is the cause of the disease. .
  • the abnormal cells are preferably tumor cells or stromal cells, and the target antigen is a tumor antigen for tumor cells and a molecule expressed on stromal cells for stromal cells.
  • Tumor antigens are antigens expressed on tumor cells or antigens expressed on tumor cells in which normal cells have become cancerous. , damage tumor cells, or cause tumor cell death (apoptosis or necrosis).
  • anti-CD98 antibodies JP 2017-114763, WO 2007/114496, WO 2008/017828, WO 2009/043922, WO 2009/090553, JP 2012-092068, WO 2011/118804 and WO 2013/0783 as an antibody against the tumor antigen
  • WO2008/144891, WO2011/145744, WO2011/155579, WO2013 /077458, WO2003/074566, WO2011/068845, WO2013/068946, US7999083 and WO2015/098099 panitumumab, nimotuzumab, cetuximab, ametumumab ( SY-101), SYN-004, SCT-200
  • anti-EGFR antibodies such as tomuzotuximab, GC-1118, GR-1401, depatuxizumab (ABT-806), serclutamab, AMG595
  • FAP fibroblast activation protein
  • the portion that binds to the target antigen preferably comprises an amino acid sequence that is not contained in the first peptide and the second peptide, more preferably a polypeptide consisting of said amino acid sequence.
  • the target antigen and the portion that binds to the target antigen may be an antigen and an antibody that binds to the antigen or an antigen-binding fragment of an antibody, but is not limited to a combination thereof, and is not limited to a ligand and a ligand that binds to the ligand.
  • a receptor or vice versa
  • a cytokine and a receptor to which the cytokine binds can be exemplified.
  • molecules other than antibodies and the like include non-immunoglobulin proteins that bind to target antigens, nucleic acid molecules such as nucleic acid aptamers, and low-molecular-weight compounds.
  • the first peptide that recognizes the target antigen binding site contained in the portion that binds to the target antigen is the target antigen binding site By recognizing , it is a peptide that masks the site and renders the portion that binds to the target antigen unable to bind to the target antigen, makes it difficult to bind, or inhibits or interferes with the binding.
  • the portion that binds to the target antigen is an antibody or an antigen-binding fragment of an antibody (hereinafter referred to as "an antibody or the like")
  • the first peptide is a peptide that binds to the antigen-binding region of the antibody or the like.
  • Antigen-binding regions of antibodies and the like exist in variable regions of antibodies and the like, particularly in complementarity determining regions (CDRs).
  • Antibodies and the like bind to an epitope (antigenic determinant) of an antigen, so the first peptide is a peptide that mimics the epitope.
  • a peptide mimicking an epitope of an antigen is called a mimotope, and in the present invention, the first peptide is preferably a mimotope that binds to a CDR.
  • a mimotope is a peptide consisting of 6 to 30, preferably 10 to 20, more preferably 13 to 17 and particularly preferably 15 amino acids.
  • mimotopes are included in the portion that binds to the target antigen by preparing various display libraries (phage display, ribosome display, nucleic acid display, bacterial display, etc.) consisting of the above number of amino acids and screening by panning.
  • a phage particle displaying a peptide that recognizes the target antigen-binding site is selected, and DNA encoding the mimotope and its nucleotide sequence can be obtained from the phage particle and produced.
  • Whether the peptide is a mimotope (binds to the CDR of the antibody) can be confirmed, for example, by crystallizing a mask antibody or a complex of the antibody and the peptide and performing X-ray crystal structure analysis.
  • the peptide binds to the antigen (competitively) with the antibody, it is strongly suggested that the peptide is a mimotope that binds to the CDR of the antibody (see Example 4).
  • the portion that binds to the target antigen may be a molecule other than an antibody or an antigen-binding fragment of an antibody (hereinafter referred to as "antibody etc.”).
  • antibody an antigen-binding fragment of an antibody
  • the target antigen is a cytokine
  • a peptide recognizing the cytokine binding site contained in the receptor to which the cytokine binds, respectively. can be exemplified.
  • the first peptide is a peptide that recognizes the target antigen site contained in the protein, and if the portion that binds to the target antigen is a nucleic acid molecule, the first peptide is It is a peptide that recognizes the target antigen site contained in the nucleic acid molecule, and when the portion that binds to the target antigen is a low-molecular compound, the first peptide is a peptide that recognizes the target antigen site contained in the low-molecular-weight compound.
  • Second Peptide [c] Portion
  • the second peptide containing an amino acid sequence cleaved by a protease localized in the cytoplasm is a substrate for the protease localized in the cytoplasm and contains an amino acid sequence cleaved by the protease.
  • the protease recognizes and cleaves the amino acid sequence contained in the second peptide.
  • "protease localized in the cytoplasm” is also referred to as “intracellular protease”, and the two terms are interchangeable.
  • the second peptide is also called "cleavable linker".
  • the second peptide preferably further serves as a substrate for an extracellular protease and has an amino acid sequence that is cleaved by the protease (also referred to simply as a "substrate".
  • a substrate that is cleaved by a certain protease is "the protease substrate.” Also called.) including.
  • the amino acid sequence that serves as a substrate for the intracellular protease can be called the first cleavage amino acid sequence
  • the amino acid sequence that serves as the substrate for the extracellular protease can be called the second cleavage amino acid sequence.
  • the second peptide contains the first cleavage amino acid sequence and the second cleavage amino acid sequence, and the second peptide combines the first cleavage amino acid sequence and the second cleavage amino acid sequence as protease cleavage sequences. Also called match.
  • Intracellular proteases are also called “intracellular-acting proteases”. After being expressed in cells, they act inside cells without being secreted outside the cells, and are involved in cell apoptosis. Examples of intracellular proteases include cytosolic cysteine proteases such as caspase, calpain (also referred to as “CAPN”), and tripeptidyl peptidase.
  • cytosolic cysteine proteases such as caspase, calpain (also referred to as “CAPN”), and tripeptidyl peptidase.
  • Calpain has isoforms such as CAPN1 ( ⁇ -calpain), CAPN2 (m-calpain), CAPN3, CAPN4, CAPN5, CAPN6, CAPN7, CAPN8, CAPN9, CAPN10, CAPN11, CAPN12, CAPN13, CAPN14, CAPN15, CAPN16, and CAPN17
  • any isoform can be used, preferably CAPN1 (calpain 1) or CAPN2 (calpain 2).
  • Tripeptidyl peptidase has isoforms such as tripeptidyl peptidase 1 and tripeptidyl peptidase 2.
  • any isoform can be used, and tripeptidyl peptidase 2 is preferably used.
  • the first cleavage amino acid sequence in the second peptide is not particularly limited as long as it is an amino acid sequence that serves as a substrate for the above intracellular protease, that is, as long as it is an amino acid sequence that the protease recognizes and cleaves.
  • an amino acid sequence recognized by human CAPN1 and serving as its substrate also referred to as "CAPN1 substrate” or "CAPN substrate”
  • PLFAAP as a CAPN substrate
  • PLFAAP FIG. 30, SEQ ID NO: 12
  • Extracellular proteases are also called “extracellular-acting proteases", are expressed with a signal sequence, are secreted outside the cell, and act outside the cell. Extracellular proteases include urokinase-type plasminogen activator (u-PA), matrix metalloprotease (MMP), plasmin, cathepsin, matriptase, legumain and the like.
  • u-PA urokinase-type plasminogen activator
  • MMP matrix metalloprotease
  • plasmin cathepsin
  • matriptase legumain and the like.
  • MMPs are MMP1, MMP2, MMP3, MMP7, MMP8, MMP9, MMP10, MMP11, MMP12, MMP13, MMP14, MMP15, MMP16, MMP17, MMP18, MMP19, MMP20, MMP21, MMP23A, MMP23B, MMP24, MMP25, MMP26, MMP27 , MMP28, etc., any isoform can be used in the present invention.
  • Cathepsins include cathepsin A, cathepsin B, cathepsin C, cathepsin D, cathepsin E, cathepsin F, cathepsin G, cathepsin H, cathepsin K, cathepsin L1, cathepsin L2, cathepsin O, cathepsin S, cathepsin W, cathepsin X/Z.
  • any isoform can be used in the present invention.
  • the second cleaving amino acid sequence in the second peptide is not particularly limited as long as it is an amino acid sequence that serves as a substrate for the extracellular protease, that is, as long as it is an amino acid sequence that the protease recognizes and cleaves.
  • the amino acid sequence recognized by human uPA and serving as its substrate is SGRSANAILE (SEQ ID NO: 36, FIG. 61), SGRSANA (SEQ ID NO: 37, FIG. 61) as the uPA substrate. and SGRSA (SEQ ID NO: 38, FIG.
  • MMP1 substrate an amino acid sequence that is recognized by human MMP1 and serves as its substrate.
  • MMP substrate an amino acid sequence that is recognized by human MMP1 and serves as its substrate.
  • No. 39, FIG. 61) and PLGLWA SEQ ID NO: 40, FIG. 61
  • an amino acid sequence that human MMP9 recognizes and serves as its substrate also referred to as “MMP9 substrate”.
  • SEQ ID NO: 41, FIG. 61 can be cited as suitable examples.
  • the order is not limited, but for example, the first peptide
  • the first peptide In a molecule that binds to a target antigen that is linked in the order of a second peptide and a portion that binds to the target antigen, the first peptide contains a second cleavage amino acid sequence that is a substrate for an extracellular protease, and the target-binding portion contains In a molecule that binds to a target antigen that may include a first cleavage amino acid sequence that is a substrate for an intracellular protease and that is linked in the order of a first peptide, a second peptide, and a portion that binds to the target antigen, the first The peptide side may contain a first cleavage amino acid sequence that is a substrate for an intracellular protea
  • an amino acid sequence that is cleaved by a suitable extracellular protease uPA (uPA substrate) or by an MMP is located amino-terminal to the amino acid sequence to be cleaved by the preferred intracellular protease, CAPN (CAPN substrate). Therefore, in the molecule that binds to the target antigen, the first peptide, the second cleaved amino acid sequence, the first cleaved amino acid sequence, and the target antigen-binding portion may preferably be linked in this order.
  • the cleaved amino acid sequence, the second cleaved amino acid sequence, and the target antigen-binding portion may be linked in this order, but more preferably, the first peptide, the second cleaved amino acid sequence, the first cleaved amino acid sequence, and the target antigen-binding portion. Arranged in order, more preferably arranged in order of the first peptide, the uPA substrate or MMP substrate, the CAPN substrate, and the target antigen-binding portion.
  • the second truncated amino acid sequence may be included in the molecule that binds to the target antigen of the present invention. It may be contained in other than two peptides, for example, it may be contained in a third peptide inserted between the end of the first peptide, the second peptide and the target antigen-binding portion.
  • the first peptide, the second peptide, and the target antigen-binding portion may be bound to a linker (a portion that connects two things, preferably an amino acid sequence or a peptide consisting of the amino acid sequence). That is, any one of the first peptide, the second peptide and the target antigen-binding portion may be linked to one or both of the other two via a linker.
  • the linker is a peptide consisting of 1-30, preferably 2-20, more preferably 2-10 amino acids.
  • the portion that binds to the first peptide or the second peptide may be either the heavy chain or the light chain of the antibody, or an antigen-binding fragment thereof;
  • any of their amino termini, carboxyl termini, sites other than termini, or moieties (sugar chains, polymers, etc.) that modify them may be used.
  • Target antigen-binding molecule comprises a target antigen-binding portion ([a] portion), a first peptide ([b] portion), and a second peptide ([c] portion) comprising an amino acid sequence that is cleaved by a protease localized in the cytoplasm, preferably present in a state in which they are directly or indirectly linked, and the first The peptide masks the target antigen binding site by binding to the target antigen binding site in the moiety that binds the target antigen. As a result, the target antigen binding site is unable or difficult to bind the target antigen.
  • first truncated amino acid sequence, shaded part in FIG. 1A is a molecule that is a linked peptide, and the first peptide indicated by the grid pattern in FIG. 1A binds to the antigen-binding site of the antibody, masked.
  • the first peptide can recognize and bind to the target antigen-binding site, but when the second peptide is cleaved and the first peptide exists alone, it binds and dissociates depending on physicochemical conditions, so it does not bind permanently. It is considered that it is not possible to For example, in the molecule that binds to the target antigen of the present invention, the first peptide binds to the portion that binds to the target antigen via the second peptide.
  • the first peptide adopts a conformation such that the position is located near the target antigen-binding site contained in the portion that binds to the target antigen, and the first peptide is in the target antigen-binding site under equilibrium conditions unless the conformation of the molecule is changed. It can be assumed to have a mechanism of action such as being largely masked, but such mechanism is not limited thereto.
  • the first peptide dissociates from the molecule that binds to the target antigen, and the first peptide continues to bind to the target antigen-binding site.
  • the target antigen-binding site contained in the target antigen-binding portion becomes capable of binding to the target antigen, and has a higher binding affinity to the target antigen than before cleavage. It is thought that it will have
  • the molecule that binds to the target antigen of the present invention can bind to the target antigen with higher affinity in an environment in which the protease is present than in an environment in which the protease is not present.
  • the intracellular protease utilized in the present invention may preferably be a protease that is more highly expressed, present in greater abundance, or has a higher catalytic activity in abnormal cells than in normal cells. .
  • the total activity of the intracellular protease is increased in an environment where abnormal cells are present, and the second peptide (the first cleavage amino acid sequence of) is more likely to be cleaved.
  • Intracellular proteases are normally not secreted outside the cell, but when the cell is destroyed due to cell death or damage to the cell membrane, they can leak out and act outside the cell.
  • the action of the intracellular protease cleaves the amino acid sequence that is the substrate for the intracellular protease in the second peptide, resulting in binding to the target antigen. It can be speculated that the first peptide that recognizes and masks the target antibody binding site contained in the portion dissociates, allowing the portion that binds the target antigen to bind the target antigen with higher affinity.
  • the target antigen in the present invention is not particularly limited as long as it is an antigen associated with a specific disease. is an antigen.
  • the amino acid sequence serving as a substrate for intracellular protease in the second peptide in the molecule that binds to the target antigen of the present invention is cleaved by the action of intracellular protease leaked from the abnormal cell, thereby binding to the target antigen. It is believed that the moiety binds with higher affinity to the target antigen of the aberrant cells, promotes the induction of cell death in the aberrant cells, and eliminates disease caused by the aberrant cells to a greater extent.
  • the action of the extracellular protease extracellularly secreted from the abnormal cell or its surrounding cells causes is cleaved, the first peptide that recognizes and masks the target antibody binding site of the portion that binds to the target antigen is dissociated, and the target antigen-binding portion is targeted with higher affinity It can bind to antigen.
  • the amino acid sequence serving as a substrate for the intracellular protease in the second peptide in the molecule that binds to the target antigen of the present invention is cleaved by the action of the intracellular protease leaked from the abnormal cell, and binds to the target antigen. It is believed that the portion binds to the target antigen of abnormal cells and kills the abnormal cells, thereby eliminating the cause of disease caused by abnormal cells to a higher degree.
  • the second peptide when the molecule that binds to the target antigen of the present invention, for example, the second peptide, contains an amino acid sequence that serves as a substrate for the extracellular protease (second cleavage amino acid sequence) in addition to the intracellular protease, the extracellular protease and the intracellular protease, the amino acid sequence serving as a substrate for the extracellular protease and the amino acid sequence serving as a substrate for the intracellular protease are sequentially cleaved, and the first peptide binds to and masks the target antibody binding site of the target antigen binding portion. It is speculated that as the is dissociated, the target antigen-binding portion becomes more likely to bind to the target antigen, increasing the binding affinity of the target antigen-binding molecules of the invention for the target antigen.
  • the extracellular protease present in the tumor environment near the tumor tissue causes the extracellular protease in the second peptide to
  • the substrate amino acid sequence is cleaved by the action of extracellular protease, the first peptide masking the target antigen binding site is dissociated, and the portion of the molecule that binds to the target antigen is transferred to tumor cells with higher affinity. It binds to target antigens and promotes cell death induction of tumor cells. As a result, tumor cells are destroyed, intracellular proteases leak out of the cells, and the intracellular proteases are supplied to the tumor environment.
  • the amino acid sequence serving as a substrate for intracellular protease in the second peptide is cleaved by the action of intracellular protease leaked from the tumor cells.
  • the first peptide masking the target antigen binding site which remains uncut only by the action of the extracellular protease, is dissociated.
  • the binding affinity for the target antigen of the molecule that binds the target antigen is much higher than before cleavage, and the portion that binds the target antigen binds with higher affinity to the target antigen of the tumor cell. .
  • the tumor can then be treated by inducing cell death of the tumor cells.
  • the second peptide is cleaved by the action of both the extracellular protease and the intracellular protease, and the first peptide that recognizes and binds to the target antigen-binding site contained in the portion that binds to the target antigen, and masks the target antigen. Dissociation from the binding site allows the molecule that binds the target antigen to bind tightly to the target antigen. Cleavage of the second peptide occurs partially with only an extracellular protease or only with an intracellular protease, but the action of both proteases cleaves more of the second peptide and dissociates the first peptide from the target antigen binding site. can.
  • the molecule that binds to the target antigen of the present invention can exert its effect mainly through the mechanism as described above, but such mechanism is not limited thereto, and by other mechanisms or in combination with other mechanisms. At the same time, the effect may be exhibited.
  • Molecules that bind to target antigens of the present invention may further comprise other moieties.
  • another portion is also referred to as "[d] portion".
  • the [d] portion binds to the target antigen binding portion of said molecule.
  • the [d] portion is an antibody or antigen-binding fragment thereof that is not the target antigen-binding portion, a peptide containing an amino acid sequence not included in the first peptide and the second peptide, a cytokine, a toxin, a radioisotope, a labeling molecule, and a photosensitive It consists of one or more compounds selected from the group consisting of substances (photosensitizers: also referred to as “photosensitizers”), immunostimulatory substances, antitumor compounds, drugs, payloads and polymers.
  • photosensitizers also referred to as “photosensitizers”
  • the peptide containing an amino acid sequence not included in the first peptide and the second peptide includes antibodies, antigen-binding fragments of antibodies, naturally occurring non-immunoglobulin proteins, artificially created proteins, receptors Proteins or ligand-binding fragments thereof, ligand proteins, proteins that regulate blood dynamics (e.g., antibody Fc, albumin), etc.
  • Antibodies include antibodies that are not molecules that bind to the target antigen, molecules that bind to the target antigen, Cytokines include antibodies that bind to sites other than target-binding sites, antibodies that function as multispecific molecules (e.g., bispecific antibodies) by binding to molecules that bind to target antigens, and interleukins.
  • Interferons Interferons, chemokines, colony-stimulating factors, tumor necrosis factors, growth factors, etc.; 131 I, 211 AT, 89 Sr and the like; fluorescent substances such as FITC and PE, enzymes such as HRP and AP, and biotin as labeling molecules; and phthalocyanine derivatives, chlorin derivatives and bacteriochlorin derivatives as photosensitizers.
  • immunostimulatory substances as polymers, natural or artificial sugar chains, synthetic resins, polyethylene glycol, etc., as antitumor compounds, topoisomerase inhibitors, mitotic inhibitors, cells
  • Antitumor agents such as mitotic inhibitors, microtubule polymerization/depolymerization inhibitors, glucocorticoid receptor modulators, DNA binding agents, alkylating agents, radioisotopes, siRNA, antibodies or antigen-binding fragments thereof, etc. , the aforementioned immunostimulatory substances and cytokines, and the antitumor compounds, drugs, payloads, etc. contained in the ADCs described below, but are not limited thereto.
  • the molecule that binds to the target antigen of the present invention may consist of a polypeptide, and when the [d] portion is a compound other than a polypeptide, A molecule that does may consist of a [d] portion and a polypeptide.
  • the [d] portion may be linked to a molecule that binds to the target antigen of the present invention with a linker.
  • the molecule that binds to the target antigen is an antibody or an antigen-binding portion thereof (such as an antibody)
  • the molecule that binds to the target antigen containing the [d] portion It can be called an ADC (Antibody-Drug Conjugate).
  • ADCs are described in [Methods Mol Biol. (2013) 1045:1-27; Nature Biotechnology (2005) 23, p. 1137-1146, etc.
  • the antitumor compound is not particularly limited as long as it is a substance that can exert a pharmacological effect by binding with an antibody or the like, and emtansine (4 -( ⁇ 3-[(3- ⁇ [(1S)-2- ⁇ [(1S,2R,3S,5S,6S,16E,18E,20R,21S)-11-chloro-21-hydroxy-12,20 -dimethoxy 2,5,9,16-tetramethyl-8,23-dioxo-4,24-dioxa-9,22-diazatetracyclo[19.3.1.110,14.03,5]hexacosa- 10,12,14(26),16,18-pentaen-6-yl]oxy ⁇ -1-methyl-2-oxoethyl]methylamino ⁇ -3-oxopropyl)sulfanyl]-2,5-dioxopyrrolidine- 1-yl ⁇ methyl)cyclohexylcarbonyl group
  • topoisomerase I inhibitors such as camptothecin derivatives, preferably irinotecan and its active metabolite SN-38 (eg EP 137145A1, US4604463A), exatecan (eg EP 495432A1, US5637770A), exatecan derivatives (eg, WO2014/057687), and the like.
  • a suitable exatecan derivative is N-[(1S,9S)-9-Ethyl-5-fluoro-9-hydroxy-4-methyl-10,13-dioxo-2,3,9,10,13,15-hexahydro -1H,12H-benzo[de]pyrano[3′,4′:6,7]indolizino[1,2-b]quinolin-1-yl]-2-hydroxyacetamide (e.g., WO2014/057687, WO2014/061277, WO2015/146132, WO2020/100954, WO2015/098099) can be exemplified.
  • antitumor compounds include pyrrolobenzodiazepine derivatives (for example, 6804, WO2015/095124, WO2015/052322, WO2015 /052534, WO2016/115191, WO2015/052321, WO2015/031693, WO2011/130613), and suitable pyrrobenzodiazepine derivatives include (11a'S)-7'-methoxy-8'-[(5 - ⁇ [(11aS)-7-methoxy-2-(4-methoxyphenyl)-5-oxo-5,10,11,11a-tetrahydro-1H-pyrrolo[2,1-c][1,4]benzodiazepine -8-yl]oxy ⁇ pentyl)oxy]-1′,11a′-dihydro-5′H-spiro[cyclopropane-1,2′-pyrrolo[2,1-c][1,4]benzodiazepine]- 5′-one, (11a′S)-7′-me
  • Drugs include STING agonists (eg WO2021/202984, WO2020/229982, WO2020/050406, WO2021/177438), TLR7/8 agonists or TLR8 agonists (eg WO2018/009916, WO2019/084060) Immunostimulatory substances such as It's okay. Cyclic dinucleotide derivatives can be exemplified as suitable STING agonists.
  • Cyclic dinucleotide derivatives include (5R,7R,8R,12aR,14R,15R,15aS,16R)-15,16-dihydroxy-7-[1-(2-hydroxyethyl)-6-oxo-1,6 -dihydro-9H-purin-9-yl]-2,10-bis(sulfanyl)-14-(6,7,8,9-tetrahydro-2H-2,3,5,6-tetraazabenzo[cd] Azulen-2-yl)octahydro-2H,10H,12H-5,8-methano-2 ⁇ 5 ,10 ⁇ 5 -furo[3,2-l][1,3,6,9,11,2,10]penta Oxadiphosphacyclotetradecine-2,10-dione, (5R,7R,8R,12aR,14R,15R,15aR,16R)-15-fluoro-16-hydroxy-7-[1-(2-hydroxyethyl) -6
  • the [d] portion binds to the target antigen binding portion.
  • the target antigen-binding portion is an antibody or antigen-binding fragment thereof
  • the [d] portion can be bound to the antibody or antigen-binding fragment thereof by known methods.
  • Techniques have been developed to homogenize carbohydrate chains in the production of therapeutic or prophylactic antibodies or glycoprotein molecules comprising Fc regions thereof.
  • Enzymatic transglycosylation is known as a method for homogenizing sugar chains added to glycoproteins. This is a multistep process consisting of cleavage of a sugar chain (hydrolysis reaction) and condensation of another sugar chain (transglycosylation reaction) in an in vitro environment.
  • a group of enzyme family called endo- ⁇ -N-acetylglucosaminidase (ENGase) is used especially for conversion of N-glycans.
  • the characteristics of this enzyme are required to be 1) the ability to hydrolyze complex-type sugar chains as substrate specificity, and 2) the ability to perform transglycosylation to a specific structure.
  • an oxazoline method in which a sugar chain whose reducing end is activated using a single ENGase, for example, a sugar chain whose reducing end is oxazolated, is transferred to a GlcNAc (N-acetylglucosamine) acceptor;
  • GlcNAc N-acetylglucosamine
  • a one-pot method is known in which a sugar chain whose reducing end is not activated is directly transferred to a GlcNAc acceptor using an ENGase of WO2022/050300 and WO2018/003983.
  • transglycosylation by these methods is used to bind the [d] portion of an antitumor compound, drug, payload, etc.
  • the target antigen-binding molecule comprising the [d] portion is , can be used for photodynamic therapy (PDT), and the molecule can be called an ADP (Antibody-Directed Phototherapy) molecule.
  • PDT photodynamic therapy
  • ADP Antibody-Directed Phototherapy
  • the photosensitizer is not particularly limited as long as it is a substance that can exert a pharmacological effect by irradiating the site where the antibody or the like is bound with light.
  • [(2S,3S)-7-carboxy-3-(2-carboxyethyl)-17-ethenyl-12-ethyl-2,8,13,18-tetramethyl-2,3,23,24-tetrahydroporphyrin- 5-yl]acetyl]amino]butanedioic acid e.g. US Patent No. 5633275, US Patent No. RE37180
  • IR700 IRDye® 700DX
  • WO2013/009475 WO2004/038378, WO2015/187677 , WO2017/031363, WO2017/031367, WO2018/156815, WO2019/232478, WO202020/5623
  • 2,4-difluoro-N-methyl-3-[10,15,20-tris[2,6-difluoro-3 -(methylsulfamoyl)phenyl]-2,3,12,13,22,24-hexahydroporphyrin-5-yl]benzenesulfonamide eg, WO2016/151458, and the like.
  • the cleavage linker (second peptide) contained in the molecule that binds to the target antigen is cleaved, and the active ingredient (for example, drug) contained in the molecule that binds to the target antigen is released. Effective.
  • a peptide library may be constructed by a known method.
  • peptide libraries for various displays such as ribosomes composed of completely random amino acids may be constructed, and peptides having high affinity for the CDRs may be selected.
  • a peptide library (ZPZP lib) for various displays having a repeating motif of aromatic amino acids and Pro (ZPZP motif) near the center may be constructed, and peptides having a high affinity for the CDR may be selected.
  • Z represents an aromatic amino acid such as histidine (His), phenylalanine (Phe), tyrosine (Tyr) or tryptophan (Trp), and P represents proline.
  • a mimotope contained in the first peptide can also be identified by the above method.
  • Antibody CDR loops are rich in aromatic amino acids. Since aromatic amino acids tend to interact with each other, it is preferred that the aromatic amino acid is present near the center of the peptide.
  • the present invention also includes peptide libraries for various displays for identifying peptides that bind to the first peptide obtained by the above method, mimotopes, and other molecules other than antibodies (cytokines, etc.).
  • a molecule that binds to a target antigen of the present invention the peptide comprising the amino acid sequence contained in the first peptide and/or the amino acid sequence contained in the second peptide, It can be prepared by recombination, in vitro translation, chemical synthesis, peptide synthesis and the like.
  • a polynucleotide comprising a nucleotide sequence encoding an amino acid sequence comprised in a target antigen-binding portion and, optionally, an amino acid sequence comprised in a first peptide and/or an amino acid sequence comprised in a second peptide.
  • a molecule that binds to the target antigen of the present invention can be produced by introducing it into a cell, culturing the cell, and recovering the polypeptide that binds to the target antigen from the culture.
  • a polynucleotide comprising a nucleotide sequence encoding the amino acid sequence contained in the target antigen-binding portion and, optionally, the amino acid sequence contained in the first peptide and/or the amino acid sequence contained in the second peptide, respectively
  • the peptide-encoding DNA may be ligated and further operably linked to elements such as promoters, enhancers, polyadenylation signals and the like.
  • “functionally linked” means linked so that the elements perform their functions.
  • the vector may contain DNA encoding a signal peptide that facilitates secretion of the molecule that binds the target antigen from the host cell, in which case the DNA encoding the signal peptide and the molecule that binds the target antigen
  • the DNA is ligated in-frame. By removing the signal peptide after the molecule that binds to the target antigen is produced, the molecule that binds to the target antigen can be obtained as a mature protein.
  • the expression vector is not particularly limited as long as it is replicable in hosts such as animal cells, bacteria, yeast, etc. Examples include known plasmids, phages, and the like. Examples of vectors used for construction of expression vectors include pcDNATM (ThermoFisher Scientific), Flexi (registered trademark) vector (Promega), pUC19, pUEX2 (Amersham), pGEX-4T, and pKK233-2. (manufactured by Pharmacia), pMAM-neo (manufactured by Clontech) and the like. As host cells, prokaryotic cells such as E.
  • coli and Bacillus subtilis and eukaryotic cells such as yeast and animal cells can be used, but eukaryotic cells are preferably used.
  • animal cells human embryonic kidney cell line HEK293 cells, Chinese hamster ovary (CHO) cells, and the like may be used.
  • An expression vector may be introduced into a host cell by a known method to transform the host cell. Examples include electroporation, calcium phosphate precipitation, DEAE-dextran transfection, and the like.
  • the antibodies produced can be purified using separation and purification methods commonly used for proteins. For example, affinity chromatography, other chromatography, filter, ultrafiltration, salting out, dialysis, etc. may be appropriately selected and combined.
  • Molecules that Bind to Target Antigens of the Present Invention can be used as abnormal cells. It can be used as a prophylactic or therapeutic drug for diseases caused by.
  • the molecules that bind to the target antigen of the present invention can be used as anticancer agents.
  • the anticancer agent is for one or more selected from carcinoma, sarcoma, lymphoma, leukemia, myeloma, germinoma, brain tumor, carcinoid, neuroblastoma, retinoblastoma, and nephroblastoma.
  • carcinoma renal cancer, melanoma, squamous cell carcinoma, basal cell carcinoma, conjunctival cancer, oral cavity cancer, laryngeal cancer, pharyngeal cancer, thyroid cancer, lung cancer, breast cancer , esophageal cancer, gastric cancer, duodenal cancer, small intestine cancer, colon cancer, rectal cancer, appendix cancer, anal cancer, liver cancer, gallbladder cancer, bile duct cancer, pancreatic cancer, adrenal cancer , bladder cancer, prostate cancer, uterine cancer, vaginal cancer, and the like.
  • Myxoid fibrosarcoma malignant peripheral schwannoma, retroperitoneal sarcoma, synovial sarcoma, uterine sarcoma, gastrointestinal stromal tumor, leiomyosarcoma, epithelioid sarcoma, etc.
  • NK cell lymphoma Hodgkin's lymphoma, etc.; leukemia, myelogenous leukemia, lymphocytic leukemia, myeloproliferative disease, myelodysplastic syndrome; myeloma, multiple myeloma;
  • Cell tumors include testicular cancer and ovarian cancer, and brain tumors include glioma and meningioma.
  • the antitumor agent of the present invention can contain a therapeutically effective amount of the molecule that binds to the target antigen of the present invention and a pharmaceutically acceptable carrier, diluent, solubilizer, emulsifier, preservative, adjuvant, and the like.
  • a pharmaceutically acceptable carrier diluent, solubilizer, emulsifier, preservative, adjuvant, and the like.
  • "Pharmaceutically acceptable carriers” and the like can be appropriately selected from a wide range depending on the type of target disease and the mode of administration of the drug.
  • the method of administering the antitumor agent of the present invention can be selected as appropriate, and for example, injection administration can be used, such as local injection, intraperitoneal administration, selective intravenous injection, intravenous injection, subcutaneous injection, and organ perfusate injection. can be adopted.
  • Injectable solutions can also be formulated with carriers comprising saline solutions, glucose solutions, mixtures of saline and glucose solutions, various buffers, and the like. It may also be formulated in powder form and mixed with the liquid carrier at the time of use to prepare an injection solution.
  • oral liquids powders, pills, capsules, tablets and the like can be applied.
  • oral liquid preparations water, sugars such as sucrose, sorbitol, fructose, glycols such as polyethylene glycol, sesame oil, soybean oil, etc. are used as oral liquid preparations such as suspensions and syrups. It can be produced using oils, preservatives such as alkyl p-hydroxybenzoates, flavors such as strawberry flavor and peppermint, and the like.
  • Powders, pills, capsules and tablets contain excipients such as lactose, glucose, sucrose and mannitol, disintegrants such as starch and sodium alginate, lubricants such as magnesium stearate and talc, and polyvinyl alcohol. , a binder such as hydroxypropyl cellulose and gelatin, a surfactant such as fatty acid ester, a plasticizer such as glycerin, and the like. Because of their ease of administration, tablets and capsules represent the preferred unit dosage forms for the compositions of this invention. Solid manufacturing carriers are used in the manufacture of tablets and capsules.
  • the amount of the molecule that binds to the target antigen of the present invention which is effective for treatment, varies depending on the nature of the condition to be treated, the age and condition of the patient, and may be finally determined by the doctor. For example, it is 0.0001 mg to 100 mg per 1 kg body weight at a time.
  • a given dosage may be administered once every 1 to 180 days, or it may be administered in divided doses of two, three, four or more times per day at appropriate intervals.
  • a molecule or the like that binds to a target antigen of the present invention can be used as a prophylactic or therapeutic drug for diseases caused by abnormal cells, even in combination with other drugs.
  • the molecule or the like that binds to the target antigen of the present invention has or is likely to have a disease caused by abnormal cells before administration of another drug, at the same time as another drug, or after administration of another drug. It can be administered to a person.
  • a combination formulation preparation containing both of them
  • a single drug preparation containing only one of them
  • Example 1 Preparation of anti-TROP2 antibody HT1-11 1)-1 Expression and purification of anti-TROP2 antibody HT1-11 Heavy chain of known anti-TROP2 antibody described in WO2015/098099 (Fig. 26, SEQ ID NO: 1)
  • a mammalian cell expression vector having a backbone of pcDNA3.3 (Thermo Fisher Scientific) in which DNA encoding the light chain (FIG. 27, SEQ ID NO: 2) was cloned was introduced into Expi293F cells for transient expression. Antibody molecules were purified from the culture supernatant. Expi293F cells (Thermo Fisher Scientific) were subcultured and cultured according to the manual.
  • the Expi293F cell culture medium in the exponential growth phase was diluted with Expi293 Expression medium (Thermo Fisher Scientific) to 2.5 ⁇ 10 6 cells/mL, and the heavy chain and the heavy chain were added to Opti-Pro SFM medium (Thermo Fisher Scientific).
  • An expression vector for each light chain and Polyethyleneimine (Polyscience) were added and reacted, followed by addition to Expi293F cells. Shaking culture was performed at 135 rpm for 5 days in a 37° C., 8% CO 2 incubator.
  • MabSelectSuRe (Cytiva) equilibrated with PBS pH 7.4 was added to the culture supernatant after centrifugation to adsorb target antibody molecules.
  • the adsorbed components were eluted with an acetate buffer of pH 3.5.
  • the eluted fraction was neutralized with a Tris buffer of pH 9.0, and buffer-substituted with 25 mM Histidine, 5 (w/v)% sorbitor, pH 6.0 using an ultrafiltration membrane. After concentration as necessary, it was applied to a gel filtration column Superdex 200 Increase (Cytiva) pre-equilibrated with 25 mM Histidine, 300 mM NaCl, 5 (w/v)% sorbitor, pH 5.5 to collect the monomer fraction.
  • SDS-polyacrylamide electrophoresis SDS-PAGE
  • SEC analytical size exclusion chromatography
  • the C-terminal Avi tag sequence was biotinylated.
  • 50 ⁇ L of the antibody of Example 1)-1 whose concentration was adjusted with ELISA buffer was added and shaken at room temperature for 30 minutes.
  • 50 ⁇ L of horseradish peroxidase (HRP)-labeled anti-human IgG antibody (Jackson Immuno Research Laboratories) diluted 2500-fold with ELISA buffer was added and shaken at room temperature for 30 minutes.
  • HRP horseradish peroxidase
  • Example 2 Enrichment of mimotope peptides that bind to anti-TROP2 antibody HT1-11 A peptide library for ribosome display consisting of 15 completely random amino acids (Linear 15mer lib) was constructed and Peptides capable of binding to HT1-11 were enriched. First, human serum-derived IgG (Sigma-Aldrich) or HT1-11 biotinylated with EZ-Link NHS-PEG4-Bioin (Thermo Fisher Scientific) was immobilized to Dynabeads Streptavidin M-280 (Thermo Fisher Scientific).
  • RD Phase A ribosome displaying a peptide
  • Human serum-derived IgG-conjugated beads Unbound RD was recovered using a magnet stand (DynaMag-2, Thermo Fisher Scientific) and reacted with HT1-11-bound beads. RD that did not bind to HT1-11 was removed by washing using a magnetic stand, and mRNA was purified from RD that bound to HT1-11. RD was then prepared again by RT-PCR and in vitro translation. This panning operation was performed three times.
  • mRNA was translated in vitro to prepare RD, which was reacted with biotinylated HT1-11 or Dynabeads Streptavidin M-280 on which human serum-derived IgG was immobilized (input amount: 6 ⁇ 10 11 ). After removing unbound RD by washing using a magnetic stand, mRNA was recovered from the bound RD, and the recovered amount (output) was quantitatively evaluated by RT-qPCR. As shown in FIG. 3, 2624-fold more mRNA was recovered under the HT1-11 immobilized condition than under the human serum IgG immobilized condition. This result suggested an enrichment of peptides that specifically bind to HT1-11.
  • Example 3 Screening for mimotope peptides that bind to anti-TROP2 antibody 3)-1
  • pelB signal sequence, DNA fragment, MMP cleavage linker including known MMP substrates (Journal of Controlled Release.; 161: 804-812 (2012).): amino acid numbers 41 to 41 of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 3 and Figure 28 60), HT1-11 scFv (in the order of VH-VL or in the order of VL-VH), FLAG tag, and His tag are translated in this order.
  • E. coli XL-1 Blue (Agilent Technologies) was transformed. E. coli was cultured in the presence of IPTG (Isopropyl- ⁇ -D-thiogalactopyranoside) (Sigma-Aldrich), and the culture supernatant containing the peptide-fused scFv was collected.
  • IPTG Isopropyl- ⁇ -D-thiogalactopyranoside
  • Bound scFv was detected with HRP-labeled anti-FLAG antibody (Sigma-Aldrich) diluted 5000-fold with ELISA buffer. The same operation was also performed under MMP1 non-addition conditions, and clones exhibiting a large binding strength ratio (MMP1 addition condition/MMP1 non-addition condition) were selected as positive clones. After purifying the expression vector of the positive clone, the sequence of the translation region was analyzed by a method known to those skilled in the art, and MHT1001 (FIG. 28, SEQ ID NO: 3) and MHT1002 (FIG. 29, SEQ ID NO: 4) were obtained as unique clones.
  • the binding activity to human TROP2 antigen was evaluated by ELISA in the same manner as in Example 3)-2 under MMP1 addition conditions and MMP1 non-addition conditions.
  • the antibody was adjusted to 1 ⁇ M with MMP buffer, MMP1 was added to a final concentration of 1 ⁇ M or 0 ⁇ M, and reacted at 37° C. for 15 minutes.
  • Antibodies adjusted in concentration with ELISA buffer were then added to each well.
  • HT1-11-scFv-HL and HT1-11-scFv-LH not fused with a mimotope peptide were irrespective of the addition of MMP1. It showed similar binding activity.
  • MHT1001 and MHT1002 fused with a mimotope peptide exhibited stronger binding activity under MMP1 addition conditions than under MMP1 non-addition conditions, and the binding EC 50 ratios (MMP1 non-addition conditions/MMP1 addition conditions) were 7.5. 9 and 4.3 (Fig. 4-2 (C), Fig. 4-2 (D)).
  • Example 4 Preparation of anti-TROP2 masked antibody and evaluation of its binding activity
  • Anti-TROP2 masked antibody MHT1007 (Table 1, Figure 32, SEQ ID NO: 7) was constructed.
  • MHT1008 (Table 1, FIG.
  • the heavy chain expression vector of each antibody was combined with the light chain expression vector of HT1-11, each mask antibody was purified from the culture supernatant of Expi293F cells in the same manner as in Example 1)-1, and the protein concentration was determined.
  • the prepared mask antibodies were named MHT1007, MHT1008, and MHT1009 corresponding to the names of the heavy chain expression vectors (Table 1).
  • the binding activity to the human TROP2 antigen was evaluated by ELISA in the same manner as in Examples 1)-2 and 3)-2, except for the parts described below, under protease addition and non-addition conditions.
  • protease addition conditions a final concentration of 300 nM of MMP1 or activated human uPA (Accession number: P00749) was added to 3 ⁇ M of the antibody, and after reaction at 37° C., the concentration of the antibody was adjusted with an ELISA buffer, and the antibody was used as the human TROP2 antigen. were added to the fixed wells.
  • HT1-11 not fused with a mimotope peptide exhibited the same binding activity under MMP1-added conditions as it did under MMP1-free conditions.
  • the binding activity of MHT1007 fused with a mimotope peptide was lower than that of HT1-11, demonstrating a masking effect similar to that of scFv.
  • it exhibited stronger binding activity under MMP1 addition conditions than under MMP1 non-addition conditions, and the binding EC 50 ratio (MMP1 non-addition conditions/MMP1 addition conditions) was 104 (FIG. 5-1(B)).
  • MHT1008 loaded with an uncleavable linker
  • the binding activity was reduced even under MMP1-added conditions as well as under non-added conditions (FIG. 5-2(C)).
  • MHT1009 loaded with a uPA cleavage linker exhibited stronger binding activity under uPA addition conditions than under uPA non-addition conditions, and the binding EC50 ratio (uPA non-addition conditions/uPA addition conditions) was 83 (Fig. 5- 2(D)). From the above results, it was shown that the mimotope obtained in Example 3 functions as a masking domain not only in the scFv state but also in the IgG state, and that the cleavage linker sequence can be modified while maintaining the masking effect.
  • the Fab region of MHT1007 containing a mask peptide and an MMP cleavage linker is prepared by a method known to those skilled in the art, and crystals of the Fab region are obtained. Chemical analysis and X-ray crystallographic analysis were performed. The results showed that the peptide bound to the CDR regions of HT1-11 (data not shown). It was also confirmed by SPR that the chemically synthesized mask peptide binds to HT1-11 competitively with the TROP2 antigen (data not shown).
  • Example 5 Selection of calpain (CAPN) cleavage sequence using anti-TROP2 mask antibody 5)-1 Modification of CAPN cleavage sequence It has been suggested that CAPN, which is localized in the cytoplasm, leaks out of the cell upon cell death. (Non-Patent Document 7).
  • Non-Patent Document 7 By combining the substrate sequence of CAPN, an intracellular protease, with the substrate sequence of uPA, an extracellular protease, we will verify whether the binding activity of the masked antibody can be improved compared to the case where only the uPA substrate is loaded. To this end, we designed a suitable CAPN substrate sequence.
  • a known CAPN substrate (Biochimica et Biophysica Acta.; 1794(10):1505-1509 (2009).) consisting of the amino acid sequence PLFAAR (SEQ ID NO: 10, amino acid numbers 47-52 in Figure 35) was inserted into the cleaved linker.
  • Mounted anti-TROP2 masked antibody MHT3002 (Table 1, FIG. 35, SEQ ID NO: 10) was prepared and tested against the human TROP2 antigen under protease addition and non-addition conditions in the same manner as in Example 4, except for the parts described below. Binding activity was assessed by ELISA.
  • the binding activity of MHT3002 was improved under uPA and CAPN1 addition conditions, indicating that MHT3002 was activated by both proteases.
  • uPA is known to cleave immediately after Arg.
  • a novel CAPN substrate (PLFAAP (FIG. 37, SEQ ID NO: 12)) was designed by changing R to P in the CAPN substrate sequence (PLFAAR) with the aim of obtaining a CAPN substrate that is not cleaved by uPA.
  • Anti-TROP2 masked antibody MHT3201 (Table 1, Figure 38, SEQ ID NO: 13) with this sequence in the cleavable linker was prepared and assessed for sensitivity to uPA and CAPN1 by ELISA as described above.
  • the binding activity of the anti-TROP2 mask antibody MHT3201 was improved only under CAPN1 addition conditions, and uPA did not activate it.
  • MHT1713 (Table 1, Figure 40, SEQ ID NO: 15), human MMP1 (accession number: P03956), human MMP2 (accession number: P08253), human MMP3 (accession number: P08254), human MMP7 (Accession number: P09237), human MMP9 (Accession number: P14780), human MMP12 (Accession number: P39900), human MMP14 (Accession number: P50281), the parts described below Except for , it was evaluated by ELISA in the same manner as in Example 5)-1. Antibodies were diluted to 20 nM with MMP buffer, each of the above proteases was added to 50 nM, reacted at 37° C., and then added to wells on which human TROP2 antigen was immobilized.
  • Example 6 Preparation of anti-TROP2 mask antibody subjected to ADC conversion and evaluation of binding activity MHT3423 (Table 1, FIG. 41, SEQ ID NO: 16) loaded with only uPA substrate, loaded with only CAPN substrate, for the purpose of verifying whether the binding activity of the mask antibody can be improved compared to loading MHT3201 loaded with both uPA and CAPN substrates, MHT3202 loaded with both uPA and CAPN substrates, and a known uPA substrate partial sequence (Journal of Biological Chemistry.; 272(33):20456-20462 (1997).) loaded with both CAPN substrates MHT3203 (Table 1, Figure 42, SEQ ID NO: 17) was designed.
  • Each antibody was prepared in the same manner as in Example 1)-1, and the binding activity to the human TROP2 antigen was measured by ELISA in the same manner as in Example 4 under protease addition and non-addition conditions, except for the portions described below. evaluated.
  • protease addition conditions the antibody was diluted to 2000 nM with MMP buffer, 200 nM uPA or CAPN1 was added, reacted at 37° C., and the antibody whose concentration was adjusted with MMP buffer was added to the wells in which the human TROP2 antigen was immobilized.
  • Antibodies prepared in MMP buffer were also added to each well in the same manner as in the condition where protease was not added.
  • Example 7 Preparation of Antibody-Drug Conjugates
  • the drug linker for preparation of antibody-drug conjugates is N-[6-(2,5-dioxo-2,5-dihydro-1H-pyrrole-1- yl)hexanoyl]glycylglycyl-L-phenylalanyl-N-[(2- ⁇ [(1S,9S)-9-ethyl-5-fluoro-9-hydroxy-4-methyl-10,13-dioxo-2, 3,9,10,13,15-hexahydro-1H,12H-benzo[de]pyrano[3′,4′:6,7]indolizino[1,2-b]quinolin-1-yl]amino ⁇ -2 -oxoethoxy)methyl]glycinamide (Example 58 Step 8 WO2014/057687, hereinafter referred to as "linker 1”) and N-[4-(11,12-didehydro
  • Buffer exchange of antibody C-1 Buffer exchange to phosphate buffer (50 mM, pH 6.0) containing NaCl (50 mM) and EDTA (5 mM) (hereinafter referred to as PBS6.0/EDTA) NAP- 25 column (Cat. No. 17085202, Cytiva, NAP-25 Columns Sephadex, hereinafter referred to as NAP-25) according to the method specified by the manufacturer, a phosphate buffer containing NaCl (50 mM) and EDTA (5 mM) (50 mM, pH 6.0) (hereinafter referred to as PBS6.0/EDTA).
  • PB6.0 Buffer Exchange with Phosphate Buffer (50 mM, pH 6.0) (hereinafter referred to as PB6.0)
  • PB6.0 Buffer Exchange with Phosphate Buffer (50 mM, pH 6.0)
  • PB6.0 was added to the aqueous antibody solution and concentrated using Common Procedure A. After performing this operation several times, the concentration was measured (common operation B) and adjusted to 10 mg/mL using PB6.0.
  • ⁇ DL,280 is the measured molar extinction coefficient (280 nm) of the compound in which the linker 1 is reacted with mercaptoethanol or N-acetylcysteine and the maleimide group is converted to succinimide thioether, and the measured molar extinction coefficient (280 nm) of the linker 2 )It was used.
  • HPLC analysis HPLC analysis was performed under the following measurement conditions.
  • HPLC system Agilent 1290 HPLC system (Agilent Technologies) ⁇ Detector: UV absorbance meter (measurement wavelength: 280 nm)
  • Mobile phase A 0.10 (w / v) % trifluoroacetic acid (TFA), 15 (w / v) % 2-propanol aqueous solution -
  • Mobile phase B 0.075 (w / v) % TFA, 15 ( w/v) % 2-propanol, acetonitrile solution
  • the peak area value is corrected according to the following formula using the molar extinction coefficients of the light chain, heavy chain and drug linker, depending on the number of drug linker bonds.
  • the molar extinction coefficient (280 nm) of the light chain and heavy chain in each antibody is determined by a known calculation method (Protein Science, 1995, vol.4, 2411-2423), amino acids of the light chain and heavy chain of each antibody Values deduced from sequences were used (see Table 2 below).
  • the average number of drug bound per antibody molecule in the F-3-4 antibody-drug conjugate was calculated according to the following formula.
  • Drug average binding number (L0 peak area ratio x0 + L1 peak area ratio x1 + H0 peak area ratio x0 + H1 peak area ratio x1 + H2 peak area ratio x2 + H3 peak area ratio x3)/100 x2
  • Step 1 Antibody-Drug Conjugate (1)
  • Antibody Reduction MhM1018-M1 prepared in Example 13 was adjusted to 10 mg/mL in PBS 6.0/EDTA using Common Procedures B and C-1. This solution (1.45 mL) was added with 1 M dipotassium hydrogen phosphate aqueous solution (Nacalai Tesque, Inc.; 0.0218 mL) and 10 mM TCEP (Tokyo Chemical Industry Co., Ltd.) aqueous solution (0.0581 mL; .0 eq.) was added. Incubation at 37° C. for 2 hours reduced the interchain disulfide bonds of the antibody.
  • Step 1 Antibody-Drug Conjugate (2) Using 1.50 mL of MhM1019-M1 prepared in Example 13 (using 1.66 mL mg ⁇ 1 cm ⁇ 1 as an extinction coefficient at 280 nm), the title antibody-drug was prepared in the same manner as in Example 7)-1 Step 1. A conjugate "MhM1019-M1-DXd-ADC" was obtained.
  • Step 1 Antibody-Drug Conjugate (3) Using 1.44 mL of MhM1020-M1 prepared in Example 13 (using 1.66 mL mg ⁇ 1 cm ⁇ 1 as an extinction coefficient at 280 nm), the title antibody-drug was prepared in the same manner as in Example 7)-1 Step 1. A conjugate "MhM1020-M1-DXd-ADC" was obtained.
  • Step 1 Antibody-Drug Conjugate (4) Using 1.43 mL of MhM1021-M1 prepared in Example 13 (using 1.66 mL mg ⁇ 1 cm ⁇ 1 as an extinction coefficient at 280 nm), the title antibody-drug was prepared in the same manner as in Example 7)-1 step 1. A conjugate "MhM1021-M1-DXd-ADC" was obtained.
  • Step 1 Antibody-Drug Conjugate (5) Using 1.51 mL of MhM1022-M1 prepared in Example 13 (using 1.66 mL mg ⁇ 1 cm ⁇ 1 as an extinction coefficient at 280 nm), the title antibody-drug was prepared in the same manner as in Example 7)-1 Step 1. A conjugate "MhM1022-M1-DXd-ADC" was obtained.
  • Step 1 Antibody-Drug Conjugate (6)
  • the title antibody- A drug conjugate "MhM1023-M1-DXd-ADC" was obtained.
  • the N297 sugar chain of the above sugar chain-modified antibody shows a MSG1-type sugar chain (WO2019/065964) in which an azide group is introduced to the non-reducing terminal sialic acid (Fig. 8).
  • Step 1 Preparation of (Fucal,6) GlucNAc-MHT3423 antibody
  • the MHT3423 antibody solution prepared in Example 6 was buffered in a phosphate buffer solution (50 mM, pH 6.0) (hereinafter PB6.0) according to Common Procedure C-2. exchanged and adjusted to 19.4 mg/mL (1.15 mL). 0.0148 mL of EndoS solution (PBS, 7.52 mg/mL) was added to this solution and incubated at 37° C. for 2 hours. After confirming that the sugar chain was cleaved using an Agilent 2100 bioanalyzer, purification was performed using a GST and Protein A column (AKTA). The target fraction was substituted with PB6.0 to obtain (Fucal,6)GlucNAc-MHT3423 antibody (19.3 mg/mL, 0.995 mL).
  • PB6.0 phosphate buffer solution
  • AKTA Protein A column
  • Step 2 Preparation of sugar chain-modified MHT3423 antibody To the (Fucal, 6) GlucNAc-MHT3423 antibody (PB6.0) (19.3 mg/mL, 0.995 mL) obtained in Step 1 above, sugar chain oxazoline (3aR ,5R,6S,7R,7aR)-3a,6,7,7a-Tetrahydro-7-hydroxy-5-(hydroxymethyl)-2-methyl-5H-pyrano[3,2-d]oxazol-6-yl O -[N5-acetyl-N1-[2-[2-[2-(2-azidoethoxy)ethoxy]ethoxy]ethyl]- ⁇ -neuraminemidosyl]-(2 ⁇ 6)-O- ⁇ -D-galactopyranosyl-(1 ⁇ 4) -O-2-(acetylamino)-2-deoxy- ⁇ -D-glucopyranosyl-(1 ⁇ 2)-O- ⁇ -D-mann
  • Step 3 Conjugation of Antibody and Drug Linker
  • sugar chain-modified MHT3423 (ABS) (9.99 mg/mL, 0.500 mL) obtained in Step 2 above
  • 1,2-propanediol (0.5 mL) was added at room temperature.
  • 480 mL a 10 mM dimethylsulfoxide solution of linker 2 (0.0197 mL; 6 equivalents per antibody molecule) was added, and the mixture was reacted at room temperature for 48 hours using a tube rotator (MTR-103, AS ONE Corporation). .
  • the N297 sugar chain of the above sugar chain-modified antibody shows a MSG1-type sugar chain (WO2019/065964) in which an azide group is introduced to the non-reducing terminal sialic acid (Fig. 8).
  • Step 1 Preparation of (Fuc ⁇ 1,6)GlcNAc-MHT3201 Antibody
  • the MHT3201 antibody solution prepared in Example 6 was buffer-exchanged with PB6.0, ca. Prepared to 20.2 mg/mL (1.43 mL).
  • a (Fuc ⁇ 1,6)GlcNAc-MHT3201 antibody solution (PB6.0) (19.4 mg/mL, 1.27 mL) was obtained by performing the same operation as in Example 7)-7 Step 1 above.
  • Step 2 Preparation of sugar chain-modified MHT3201 Using the (Fuc ⁇ 1,6)GlcNAc-MHT3201 antibody solution (PB6.0) (19.4 mg/mL, 1.27 mL) obtained in Step 1 above, Example 7) A sugar chain-modified MHT3201 antibody (ABS) (9.96 mg/mL, 1.72 mL) was obtained by performing the same operation as in step 2-7.
  • Step 3 Conjugation of antibody and drug linker Using the sugar chain-modified MHT3201 (ABS) (9.96 mg/mL, 0.500 mL) obtained in step 2 above, the MHT3201-PBD-ADC solution was prepared in the same manner as in Example 7)-7 step 3. 2.50 mL of (ABS) was obtained. Characteristic evaluation: Using common operations E and F, the following characteristic values were obtained.
  • Antibody concentration 1.41 mg/mL
  • Antibody yield 3.52 mg (71%)
  • the N297 sugar chain of the above sugar chain-modified antibody shows a MSG1-type sugar chain (WO2019/065964) in which an azide group is introduced to the non-reducing terminal sialic acid (Fig. 8).
  • Step 1 Preparation of (Fuc ⁇ 1,6)GlcNAc-MHT3202 Antibody
  • the MHT3202 antibody solution prepared in Example 6 was buffer-exchanged with PB6.0, ca. Prepared to 19.8 mg/mL (1.12 mL).
  • a (Fuc ⁇ 1,6)GlcNAc-MHT3202 antibody solution (PB6.0) (20.5 mg/mL, 0.959 mL) was obtained by performing the same operation as in Example 7)-7 Step 1 above.
  • Step 2 Preparation of sugar chain-modified MHT3202 antibody )-7
  • Step 3 Conjugation of antibody and drug linker Using the sugar chain-modified MHT3202 (ABS) (9.93 mg/mL, 0.500 mL) obtained in step 2 above, the same procedure as in Example 7)-7 step 3 was performed to obtain MHT3202-PBD. - Obtained 2.50 mL of ADC solution (ABS). Characteristic evaluation: Using common operations E and F, the following characteristic values were obtained.
  • Antibody concentration 1.51 mg/mL, Antibody yield: 3.77 mg (76%), Average drug binding number per antibody molecule (n): 1.8
  • the N297 sugar chain of the above sugar chain-modified antibody shows a MSG1-type sugar chain (WO2019/065964) in which an azide group is introduced to the non-reducing terminal sialic acid (Fig. 8).
  • Step 1 Preparation of (Fuc ⁇ 1,6)GlcNAc-MHT3203 antibody
  • the MHT3203 antibody solution prepared in Example 6 was buffer-exchanged with PB6.0, ca. Prepared to 19.1 mg/mL (1.29 mL).
  • a (Fuc ⁇ 1,6)GlcNAc-MHT3203 antibody solution (PB6.0) (19.8 mg/mL, 0.969 mL) was obtained by performing the same operation as in Example 7)-7 Step 1 above.
  • Step 2 Preparation of sugar chain-modified MHT3203 antibody )-7
  • Step 3 Conjugation of Antibody and Drug Linker Same as Example 7)-7 Step 3 using the sugar chain-modified MHT3203 (ABS) (9.77 mg/mL, 0.500 mL) obtained in Step 2 above. 2.50 mL of MHT3203-PBD-ADC solution (ABS) was obtained by performing the operation. Characteristic evaluation: Using common operations E and F, the following characteristic values were obtained.
  • Antibody concentration 1.49 mg/mL, Antibody yield: 3.73 mg (76%), Average number of drug binding per antibody molecule (n): 1.8
  • the N297 sugar chain of the above sugar chain-modified antibody shows a MSG1-type sugar chain (WO2019/065964) in which an azide group is introduced to the non-reducing terminal sialic acid (Fig. 8).
  • Step 1 Preparation of (Fuc ⁇ 1,6)GlcNAc-MHT1008 antibody
  • the MHT1008 antibody solution prepared in Example 4 was buffer-exchanged with PB6.0, ca. Prepared to 16.6 mg/mL (0.880 mL).
  • a (Fuc ⁇ 1,6)GlcNAc-MHT1008 antibody solution (PB6.0) (16.8 mg/mL, 0.800 mL) was obtained by performing the same operation as in Example 7)-7 Step 1 above.
  • Step 2 Preparation of sugar chain-modified MHT1008 antibody Using the 16.8 mg/mL (Fuc ⁇ 1,6) GlcNAc-MHT1008 antibody solution (PB6.0) (0.800 mL) obtained in Step 1 above, Example 7) A sugar chain-modified MHT1008 antibody (ABS) (11.4 mg/mL, 1.00 mL) was obtained by performing the same operation as in -7 step 2.
  • Step 3 Conjugation of antibody and drug linker Using the sugar chain-modified MHT1008 antibody (ABS) (11.4 mg/mL, 0.450 mL) obtained in step 2 above, Example 7)-7 step 3 and By performing the same operation, 2.50 mL of MHT1008-PBD-ADC solution (ABS) was obtained.
  • ABS sugar chain-modified MHT1008 antibody
  • the N297 sugar chain of the above sugar chain-modified antibody shows a MSG1-type sugar chain (WO2019/065964) in which an azide group is introduced to the non-reducing terminal sialic acid (Fig. 8).
  • Step 1 Preparation of (Fuc ⁇ 1,6)GlcNAc-MHT3219 antibody
  • the MHT3219 antibody solution prepared in Example 21 was buffer-exchanged with PB6.0, ca. Prepared to 15.0 mg/mL (1.70 mL).
  • a (Fuc ⁇ 1,6)GlcNAc-MHT3219 antibody solution (PB6.0) (17.9 mg/mL, 1.30 mL) was obtained by performing the same operation as in Example 7)-7 Step 1 above.
  • Step 2 Preparation of sugar chain-modified MHT3219 antibody Using the 17.9 mg/mL (Fuc ⁇ 1,6) GlcNAc-MHT3219 antibody solution (PB6.0) (1.30 mL) obtained in Step 1 above, Example 7) A sugar chain-modified MHT3219 antibody (ABS) (9.90 mg/mL, 2.10 mL) was obtained by performing the same operation as in -7 step 2.
  • Step 3 Conjugation of Antibody and Drug Linker Same as Example 7)-7 Step 3 using the sugar chain-modified MHT3219 antibody (ABS) (9.90 mg/mL, 0.50 mL) obtained in Step 2 above. 3.50 mL of MHT3219-PBD-ADC solution (ABS) was obtained by performing the operation.
  • ABS sugar chain-modified MHT3219 antibody
  • the N297 sugar chain of the above sugar chain-modified antibody shows a MSG1-type sugar chain (WO2019/065964) in which an azide group is introduced to the non-reducing terminal sialic acid (Fig. 8).
  • Step 1 Preparation of (Fuc ⁇ 1,6)GlcNAc-MHT5082 antibody
  • the MHT5082 antibody solution prepared in Example 22 was buffer-exchanged with PB6.0, ca. Prepared to 15.8 mg/mL (1.50 mL).
  • a (Fuc ⁇ 1,6)GlcNAc-MHT5082 antibody solution (PB6.0) (12.5 mg/mL, 1.4 mL) was obtained by performing the same operation as in Example 7)-7 Step 1 above.
  • Step 2 Preparation of sugar chain-modified MHT5082 antibody Using the 12.5 mg/mL (Fuc ⁇ 1,6) GlcNAc-MHT5082 antibody solution (PB6.0) (1.40 mL) obtained in Step 1 above, Example 7) A sugar chain-modified MHT5082 antibody (ABS) (9.10 mg/mL, 1.20 mL) was obtained by performing the same operation as in step 2-7.
  • Step 3 Conjugation of Antibody and Drug Linker Using the sugar chain-modified MHT5082 antibody (ABS) (9.10 mg/mL, 0.60 mL) obtained in Step 2 above, the same as in Example 7)-7 Step 3. 3.0 mL of MHT5082-PBD-ADC solution (ABS) was obtained by performing the operation.
  • ABS sugar chain-modified MHT5082 antibody
  • the N297 sugar chain of the above sugar chain-modified antibody shows a MSG1-type sugar chain (WO2019/065964) in which an azide group is introduced to the non-reducing terminal sialic acid (Fig. 8).
  • Step 1 Preparation of (Fuc ⁇ 1,6)GlcNAc-MHT5085 antibody
  • the MHT5085 antibody solution prepared in Example 22 was buffer-exchanged with PB6.0, ca. Prepared to 15.3 mg/mL (1.50 mL).
  • a (Fuc ⁇ 1,6)GlcNAc-MHT5085 antibody solution (PB6.0) (11.0 mg/mL, 1.40 mL) was obtained by performing the same operation as in Example 7)-7 Step 1 above.
  • Step 2 Preparation of sugar chain-modified MHT5085 antibody Using the 11.0 mg/mL (Fuc ⁇ 1,6) GlcNAc-MHT5085 antibody solution (PB6.0) (1.40 mL) obtained in Step 1 above, Example 7) A sugar chain-modified MHT5085 antibody (ABS) (9.20 mg/mL, 1.20 mL) was obtained by performing the same operation as in step 2-7.
  • Step 3 Conjugation of Antibody and Drug Linker Using the sugar chain-modified MHT5085 antibody (ABS) (9.20 mg/mL, 0.60 mL) obtained in Step 2 above, the same as in Example 7)-7 Step 3.
  • MHT5085-PBD-ADC solution (ABS) was obtained by performing the operation.
  • the N297 sugar chain of the above sugar chain-modified antibody shows a MSG1-type sugar chain (WO2019/065964) in which an azide group is introduced to the non-reducing terminal sialic acid (Fig. 8).
  • Step 1 Preparation of (Fuc ⁇ 1,6)GlcNAc-MHT5086 Antibody
  • the MHT5086 antibody solution prepared in Example 22 was buffer-exchanged with PB6.0, ca. Prepared to 15.7 mg/mL (1.50 mL).
  • a (Fuc ⁇ 1,6)GlcNAc-MHT5086 antibody solution (PB6.0) (15.0 mg/mL, 1.20 mL) was obtained by performing the same operation as in Example 7)-7 Step 1 above.
  • Step 2 Preparation of sugar chain-modified MHT5086 antibody Using the 15.0 mg/mL (Fuc ⁇ 1,6) GlcNAc-MHT5086 antibody solution (PB6.0) (1.20 mL) obtained in Step 1 above, Example 7) A sugar chain-modified MHT5086 antibody (ABS) (10.5 mg/mL, 1.20 mL) was obtained by performing the same operation as in step 2-7.
  • Step 3 Conjugation of Antibody and Drug Linker Using the sugar chain-modified MHT5086 antibody (ABS) (10.5 mg/mL, 0.60 mL) obtained in Step 2 above, the same as in Example 7)-7 Step 3.
  • MHT5086-PBD-ADC solution (ABS) was obtained by performing the operation.
  • the N297 sugar chain of the above sugar chain-modified antibody shows a MSG1-type sugar chain (WO2019/065964) in which an azide group is introduced to the non-reducing terminal sialic acid (Fig. 8).
  • Step 1 Preparation of (Fuc ⁇ 1,6)GlcNAc-MHT5093 antibody
  • the MHT5093 antibody solution prepared in Example 22 was buffer-exchanged with PB6.0, ca. Prepared to 13.4 mg/mL (1.50 mL).
  • a (Fuc ⁇ 1,6)GlcNAc-MHT5093 antibody solution (PB6.0) (15.3 mg/mL, 1.10 mL) was obtained by performing the same operation as in Example 7)-7 Step 1 above.
  • Step 2 Preparation of sugar chain-modified MHT5093 antibody Using the 15.3 mg/mL (Fuc ⁇ 1,6) GlcNAc-MHT5093 antibody solution (PB6.0) (1.10 mL) obtained in Step 1 above, Example 7) A sugar chain-modified MHT5093 antibody (ABS) (10.9 mg/mL, 1.20 mL) was obtained by performing the same operation as in step 2-7.
  • Step 3 Conjugation of Antibody and Drug Linker Using the sugar chain-modified MHT5093 antibody (ABS) (10.9 mg/mL, 0.60 mL) obtained in Step 2 above, the same as in Example 7)-7 Step 3.
  • MHT5093-PBD-ADC solution (ABS) was obtained by performing the operation.
  • the N297 sugar chain of the above sugar chain-modified antibody shows a MSG1-type sugar chain (WO2019/065964) in which an azide group is introduced to the non-reducing terminal sialic acid (Fig. 8).
  • Step 1 Preparation of (Fuc ⁇ 1,6)GlcNAc-MHT5094 Antibody
  • the MHT5094 antibody solution prepared in Example 22 was buffer-exchanged with PB6.0, ca. Prepared to 13.9 mg/mL (1.50 mL).
  • a (Fuc ⁇ 1,6)GlcNAc-MHT5094 antibody solution (PB6.0) (15.8 mg/mL, 1.10 mL) was obtained by performing the same operation as in Example 7)-7 Step 1 above.
  • Step 2 Preparation of sugar chain-modified MHT5094 antibody Using the 15.8 mg/mL (Fuc ⁇ 1,6) GlcNAc-MHT5094 antibody solution (PB6.0) (1.10 mL) obtained in Step 1 above, Example 7) A sugar chain-modified MHT5094 antibody (ABS) (9.10 mg/mL, 1.20 mL) was obtained by performing the same operation as in -7 step 2.
  • Step 3 Conjugation of Antibody and Drug Linker Using the sugar chain-modified MHT5094 antibody (ABS) (9.10 mg/mL, 0.60 mL) obtained in Step 2 above, the same as in Example 7)-7 Step 3.
  • MHT5094-PBD-ADC solution (ABS) was obtained by performing the operation.
  • the N297 sugar chain of the above sugar chain-modified antibody shows a MSG1-type sugar chain (WO2019/065964) in which an azide group is introduced to the non-reducing terminal sialic acid (Fig. 8).
  • Step 1 Preparation of (Fuc ⁇ 1,6)GlcNAc-MHT5095 antibody
  • the MHT5095 antibody solution prepared in Example 22 was buffer-exchanged with PB6.0, ca. Prepared to 12.4 mg/mL (1.50 mL).
  • a (Fuc ⁇ 1,6)GlcNAc-MHT5095 antibody solution (PB6.0) (15.6 mg/mL, 1.10 mL) was obtained by performing the same operation as in Example 7)-7 Step 1 above.
  • Step 2 Preparation of sugar chain-modified MHT5095 antibody Using the 15.6 mg/mL (Fuc ⁇ 1,6) GlcNAc-MHT5095 antibody solution (PB6.0) (1.10 mL) obtained in Step 1 above, Example 7) A sugar chain-modified MHT5095 antibody (ABS) (10.5 mg/mL, 1.20 mL) was obtained by performing the same operation as in step 2-7.
  • Step 3 Conjugation of Antibody and Drug Linker Using the sugar chain-modified MHT5095 antibody (ABS) (10.5 mg/mL, 0.60 mL) obtained in Step 2 above, the same as in Example 7)-7 Step 3.
  • MHT5095-PBD-ADC solution (ABS) was obtained by performing the operation.
  • Example 8 In vivo efficacy test of anti-TROP2 masked antibody-drug conjugate The anti-tumor effect of the antibody-drug conjugate was evaluated using an animal model in which cells of a TROP2-positive human tumor cell line were transplanted into immunodeficient mice. bottom. 4- to 5-week-old BALB/c nude mice (CAnN.Cg-Foxn1[nu]/CrlCrlj[Foxn1nu/Foxn1nu], Charles River Laboratories Japan, Inc.) were conditioned for 3 days or more under SPF conditions before use in experiments.
  • mice were fed sterile chow (FR-2, Funabashi Farms Co., Ltd.) and were given sterile tap water (prepared with 5-15 ppm sodium hypochlorite solution).
  • the major axis and minor axis of the transplanted tumor were measured with an electronic digital caliper (CD-15CX, Mitutoyo Corp.) twice a week, and the tumor volume was calculated according to the following formula.
  • Tumor volume (mm 3 ) 1/2 x major axis (mm) x [minor axis (mm)] 2
  • ABS buffer (10 mM-Acetate Buffer, 5 (w/v)% Sorbitol, pH 5.5) (NACALAI) and administered to the tail vein at a liquid volume of 10 mL/kg. Also, as a control group (vehicle group), an ABS buffer was similarly administered. Six mice per group were used for the experiment.
  • TROP2-positive human lung mucinous epidermoid carcinoma cell line NCI-H292 was suspended in physiological saline, 5 ⁇ 10 6 cells were subcutaneously transplanted into the right flank of female nude mice (Day 0), and randomized on Day 11. Grouping was performed. On the day of grouping, the five antibody-drug conjugates prepared in Example 7 (the clone names are MHT1008-PBD-ADC, MHT3423-PBD-ADC, MHT3201-PBD-ADC, MHT3202-PBD-ADC, MHT3203- PBD-ADC) was administered via the tail vein at a dose of 0.4 mg/kg. The results are shown in FIG. 9(A). The horizontal axis indicates the number of days, the vertical axis indicates the tumor volume, and the error range indicates the SE value.
  • MHT3202-PBD-ADC and MHT3203-PBD-ADC loaded with both uPA and CAPN substrates are stronger antitumor than MHT3423-PBD-ADC loaded with uPA substrate only and MHT3201-PBD-ADC loaded with CAPN substrate only It worked.
  • a TROP2-positive human pharyngeal cancer cell line FaDu was suspended in physiological saline, and 3 ⁇ 10 6 cells were subcutaneously transplanted into the right flanks of female nude mice (Day 0), and randomly grouped on Day 10.
  • the five antibody-drug conjugates prepared in Example 7 (the clone names are MHT1008-PBD-ADC, MHT3423-PBD-ADC, MHT3201-PBD-ADC, MHT3202-PBD-ADC, MHT3203- PBD-ADC) was administered via the tail vein at a dose of 0.4 mg/kg.
  • the results are shown in FIG. 9(B).
  • the horizontal axis indicates the number of days
  • the vertical axis indicates the tumor volume
  • the error range indicates the SE value.
  • MHT3202-PBD-ADC and MHT3203-PBD-ADC loaded with both uPA and CAPN substrates are stronger antitumor than MHT3423-PBD-ADC loaded with uPA substrate only and MHT3201-PBD-ADC loaded with CAPN substrate only It worked.
  • Example 9 Evaluation of binding activity of anti-CD98 antibody hM23H1L1 was prepared in the same manner as in Example 1)-1, and the binding activity to human CD98 antigen was evaluated by ELISA.
  • Example 10 Enrichment of mimotope peptides that bind to anti-CD98 antibody hM23H1L1 Peptide library (Linear 15mer lib) composed of completely random 15 amino acids or repeating motifs of aromatic amino acids and Pro near the center A peptide library (ZPZP lib) for ribosome display was constructed, and peptides capable of binding to hM23H1L1 were enriched (Fig. 11(A)).
  • Dynabeads Streptavidin M-280 (Thermo Fisher Scientific) and Dynabeads Streptavidin M-280 (Thermo Fisher Scientific) on which human serum-derived IgG (Sigma-Aldrich) biotinylated with EZ-Link NHS-PEG4-Bioin (Thermo Fisher Scientific) was immobilized.
  • beads protein RD was added to A (Thermo Fisher Scientific) and reacted with human serum-derived IgG and protein A. Unbound RD was recovered using a magnet stand (DynaMag-2, Thermo Fisher Scientific) and then reacted with Dynabeads Protein A bound with hM23H1L1.
  • RD that did not bind to hM23H1L1 was removed by washing using a magnetic stand, and mRNA was purified from RD that bound to hM23H1L1. RD was then prepared again by RT-PCR and in vitro translation. This panning operation was performed three times.
  • mRNA was translated in vitro to prepare RD, which was reacted with Dynabeads Protein A on which hM23H1L1 or human serum-derived IgG was immobilized (input amount: 6 ⁇ 10 11 ). After removing unbound RD by washing using a magnetic stand, mRNA was recovered from the bound RD, and the recovered amount (output) was quantitatively evaluated by RT-qPCR. As shown in FIG. 11(B), with respect to both the Linear 15mer lib and the ZPZP lib peptide library, under the hM23H1L1-immobilized condition, about 200 times more mRNA was recovered than under the human serum IgG-immobilized condition. was done. This result suggested an enrichment of peptides that specifically bind to hM23H1L1.
  • Example 11 Preparation of anti-CD98 mask antibody and evaluation of binding activity
  • random peptides derived from panning were fused to anti-CD98 scFv, and mimotope peptides capable of inhibiting anti-CD98 antibody binding were selected.
  • Anti-CD98 masked antibodies MhM1008 (Table 3, Figure 45, SEQ ID NO: 20), MhM1013 (Table 3 , FIG. 46, SEQ ID NO: 21) was constructed by a method known to those skilled in the art, and the light chain expression vector of each antibody was combined with the heavy chain expression vector of hM23H1L1.
  • the mask antibody was purified from the culture supernatant of , and the protein concentration was determined.
  • the prepared mask antibodies were named MhM1008 and MhM1013 corresponding to the names of the light chain expression vectors (Table 3).
  • the binding activity to the human CD98 antigen was evaluated by ELISA in the same manner as in Examples 4 and 9 under MMP1 addition and non-addition conditions.
  • MMP1 addition conditions 500 nM MMP1 was added to 3 ⁇ M antibody, and after reaction at 37° C., the antibody whose concentration was adjusted with ELISA buffer was added to the wells to which human CD98 antigen had been immobilized.
  • Antibodies prepared in ELISA buffer were added to each well in the same way under the protease-free condition.
  • hM23H1L1 not fused with a mimotope peptide bound to human CD98 antigen in a concentration-dependent manner under MMP1-added conditions.
  • MhM1008 and MhM1013 fused with a mimotope peptide exhibited binding activity similar to that of hM23H1L1 under MMP1-added conditions.
  • the binding activities of MhM1008 and MhM1013 in MMP1 non-addition conditions are each lower than the binding activity in MMP1 addition conditions, showing a masking effect (FIG. 12-1 (B), FIG. 12-2 (C)).
  • the EC50 ratios for MhM1008 and MhM1013 binding were 132 and 326, respectively.
  • a Fab region of MhM1013 containing a mask peptide and an MMP cleavage linker is prepared by a method known to those skilled in the art, and crystals of the Fab region are obtained. Chemical analysis and X-ray crystallographic analysis were performed. The results showed that the peptide bound to the CDR regions of hM23H1L1 (data not shown).
  • CD98 antigen was measured as an analyte.
  • Anti-Human IgG (Fc) antibody Human antibody Capture kit, Cytiva
  • Sensor Chip CM5 Chip CM5 (Cytiva) according to the kit instructions.
  • HBS-EP+ Cytiva
  • CD98 antigen diluted with HBS-EP + were used as analytes, and each sample was run at a flow rate.
  • the K D was calculated by multi-cycle kinetics analysis by adding 30 ⁇ L/min for 90 seconds and measuring the dissociation for 250 seconds.As shown in FIG. were 0.58 nM and 10.3 nM, respectively.
  • MhM1013 and MhM1013-M1 fused with a mimotope peptide exhibited stronger binding activity under MMP1 addition conditions than under MMP1 non-addition conditions.
  • the EC 50 ratios for MhM1013 and MhM1013-M1 binding were 239 and 552, respectively.
  • Example 13 Preparation of anti-CD98 antibody subjected to ADC and evaluation of binding activity
  • the substrate sequence of CAPN, an intracellular protease, and the substrate sequence of uPA, an extracellular protease By combining the substrate sequence of CAPN, an intracellular protease, and the substrate sequence of uPA, an extracellular protease, only the uPA substrate was obtained.
  • various masked antibodies composed of the heavy chain of the anti-CD98 antibody hM23-M1 and the light chain with different linker sequences were prepared. (Table 3).
  • MhM1018-M1 loaded with no protease substrate (Table 3, Figure 49, SEQ ID NO: 24), M1019-M1 loaded with uPA substrate only (Table 3, Figure 50, SEQ ID NO: 25), M1020 loaded with CAPN substrate only -M1 (Table 3, Figure 51, SEQ ID NO: 26), M1021-M1 (Table 3, Figure 52, SEQ ID NO: 27) loaded with both uPA and CAPN substrates, a known MMP9 substrate composed of PLGLAG (Biopolymers.
  • MhM1018-M1 showed similar binding activity under enzyme-free and uPA- or CAPN1-added conditions (Fig. 14-1 (A)).
  • the binding activity of MhM1019-M1 was improved under the uPA-added condition, but not under the CAPN1-added condition, as compared with the enzyme-free condition (FIG. 14-1(B)).
  • the binding activity of MhM1020-M1 was improved only under CAPN1 addition conditions (Fig. 14-2(C)).
  • the binding activity of MhM1021-M1 loaded with both uPA and CAPN substrates was improved under both uPA and CAPN1 addition conditions (Fig. 14-2(D)).
  • MhM1018-M1 showed similar binding activity under the enzyme-free condition and MMP9- or CAPN1-added condition, but the binding activity was slightly improved under the MMP9-added condition (FIG. 14-3(E)).
  • the binding activity of MhM1022-M1 was improved under the MMP9-added condition, and slightly improved under the CAPN1-added condition as compared to the enzyme-free condition (Fig. 14-3 (F)).
  • the binding activity of MhM1023-M1 loaded with both MMP9 substrate and CAPN substrate was improved under both MMP9 addition conditions and CAPN1 addition conditions (FIG. 14-4 (G)).
  • Example 14 In Vivo Efficacy Test of Anti-CD98 Masked Antibody-Drug Conjugate
  • the anti-tumor effect of the antibody-drug conjugate was evaluated using an animal model in which cells of a CD98-positive human tumor cell line were transplanted into immunodeficient mice. bottom. 4- to 5-week-old BALB/c nude mice (CAnN.Cg-Foxn1[nu]/CrlCrlj[Foxn1nu/Foxn1nu], Charles River Laboratories Japan, Inc.) were conditioned for 3 days or more under SPF conditions before use in experiments.
  • mice were fed sterile chow (FR-2, Funabashi Farms Co., Ltd.) and were given sterile tap water (prepared with 5-15 ppm sodium hypochlorite solution).
  • the major axis and minor axis of the transplanted tumor were measured with an electronic digital caliper (CD-15CX, Mitutoyo Corp.) twice a week, and the tumor volume was calculated according to the following formula.
  • Tumor volume (mm 3 ) 1/2 x major axis (mm) x [minor axis (mm)] 2
  • ABS buffer (10 mM-Acetate Buffer, 5 (w/v)% Sorbitol, pH 5.5) (NACALAI) and administered to the tail vein at a liquid volume of 10 mL/kg. Also, as a control group (vehicle group), an ABS buffer was similarly administered. Six mice per group were used for the experiment.
  • a CD98-positive human pharyngeal cancer cell line FaDu (ATCC) was suspended in physiological saline, and 3 ⁇ 10 6 cells were subcutaneously transplanted into the right flanks of female nude mice (Day 0), and randomly grouped on Day 10.
  • the four antibody-drug conjugates prepared in Example 7 (the clone names are MhM1018-M1-DXd-ADC, MhM1020-M1-DXd-ADC, MhM1022-M1-DXd-ADC, MhM1023- M1-DXd-ADC) was administered via the tail vein at a dose of 1 mg/kg.
  • the results are shown in FIG.
  • the horizontal axis indicates the number of days
  • the vertical axis indicates the tumor volume
  • the error range indicates the SE value.
  • MhM1023-M1-DXd-ADC loaded with both MMP9 substrate and CAPN substrate is more potent antitumor than MhM1022-M1-DXd-ADC loaded with MMP9 substrate only and MhM1020-M1-DXd-ADC loaded with CAPN substrate only It worked.
  • Example 15 Preparation and binding activity evaluation of anti-EGFR antibody and anti-GPRC5D antibody 15)-1
  • Preparation and binding activity evaluation of anti-EGFR antibody Known anti-EGFR antibody Cetuximab Table 4, heavy chain sequence (Fig. 55, SEQ ID NO 30), the light chain sequence (FIG. 56, SEQ ID NO: 31)) was prepared in the same manner as in Example 1)-1, and the binding activity to human EGFR was evaluated by ELISA.
  • Human EGFR-Fc human EGFR (accession number: P00533) extracellular domain and human IgG1 Fc region (accession The fusion protein of number: P01857) was purified by a method known to those skilled in the art.) was added in 50 ⁇ L portions and immobilized overnight at 4°C. After washing with PBS (ELISA buffer) containing 0.05 (w/v)% Tween-20 (Bio-Rad), blocking was performed with Blocker Casein (Thermo Fisher Scientific). After washing with ELISA buffer, 50 ⁇ L of Cetuximab prepared with MMP buffer was added and shaken at room temperature for 30 minutes.
  • PBS ELISA buffer
  • Blocker Casein Blocker Casein
  • HRP horseradish peroxidase
  • IgG antibody Jackson Immuno Research Laboratories
  • HRP horseradish peroxidase
  • ELISA buffer 50 ⁇ L of horseradish peroxidase (HRP)-labeled anti-human IgG antibody (Jackson Immuno Research Laboratories) diluted 2500-fold with ELISA buffer was added and shaken at room temperature for 30 minutes.
  • SuperSignal Pico ELISA chemiluminescent substrate (Thermo Fisher Scientific) was added, and chemiluminescence after 10 minutes was measured with a plate reader.
  • Figure 16(A) Cetuximab bound to the human EGFR antigen in a concentration-dependent manner.
  • HRP horseradish peroxidase
  • IgG antibody Jackson Immuno Research Laboratories
  • Example 16 Enrichment of mimotope peptides for anti-EGFR antibody Cetuximab and anti-GPRC5D antibody C3022 16)-1
  • Enrichment of mimotope peptides for Cetuximab Peptide library for ribosome display consisting of 15 completely random amino acids (Linear 15mer lib) was used to enrich peptides capable of binding to Cetuximab.
  • RD was added to Dynabeads Protein A (Thermo Fisher Scientific) and Dynabeads Protein A (Thermo Fisher Scientific) to which human serum-derived IgG (Sigma-Aldrich) was immobilized, and Protein A and human It was reacted with serum-derived IgG.
  • Unbound RD was recovered using a magnet stand (DynaMag-2, Thermo Fisher Scientific) and then reacted with Dynabeads Protein A to which Cetuximab was bound. RD that did not bind to Cetuximab was removed by washing using a magnetic stand, and mRNA was purified from RD that bound to Cetuximab. RD was then prepared again by RT-PCR and in vitro translation. This panning operation was performed four times.
  • mRNA was translated in vitro to prepare RD, which was reacted with Dynabeads Protein A on which Cetuximab or human serum-derived IgG was immobilized (input amount: 6 ⁇ 10 11 ). After removing unbound RD by washing using a magnetic stand, mRNA was recovered from the bound RD, and the recovered amount (output) was quantitatively evaluated by RT-qPCR. As shown in FIG. 17(A), 276-fold more mRNA was recovered under the Cetuximab-immobilized condition than under the human serum IgG-immobilized condition. The results indicated an enrichment of peptides that specifically bind to Cetuximab.
  • RD that did not bind to C3022 was removed by washing using a magnetic stand, and mRNA was purified from RD that bound to C3022. RD was then prepared again by RT-PCR and in vitro translation. This panning operation was performed three times.
  • mRNA was translated in vitro to prepare RD, which was reacted with Dynabeads Protein A on which C3022 or human serum-derived IgG was immobilized (input amount: 6 ⁇ 10 11 ). After removing unbound RD by washing using a magnetic stand, mRNA was recovered from the bound RD, and the recovered amount (output) was quantitatively evaluated by RT-qPCR. As shown in FIG. 17(B), 503-fold more mRNA was recovered under the conditions in which C3022 was immobilized as compared to the conditions in which human serum IgG was immobilized. The results indicated an enrichment of peptides that specifically bind to C3022.
  • Example 17 Application versatility of cleavage linkers loaded with uPA and CAPN substrates A mimotope peptide capable of inhibiting the binding of the anti-GPRC5D antibody was selected in the same manner as in Example 3.
  • mimotopes were selected in the IgG state rather than in the scFv state.
  • the DNA fragment encoding the random peptide portion was purified after restriction enzyme digestion and isolated from the secretory signal sequence, DNA fragment, MMP-cleaved linker (SEQ ID NO: 64: FIG. 75), Cetuximab (heavy or light chain). The DNA fragment was inserted into a mammalian cell expression vector so that it would be translated in the following order.
  • Cetuximab in which a peptide and an MMP-cleavage linker were fused to the N-terminus of the heavy or light chain, was expressed in Expi293F cells, and mimotope peptides capable of inhibiting Cetuximab binding were selected in the same manner as in Example 3.
  • Anti-EGFR masked antibody MCE-2105 (Table 4, Figure 59, SEQ ID NO: 34) loaded with a mimotope identified by screening was used to confirm that cleavable linkers containing uPA and CAPN substrates can be universally applied to masked antibodies. and an anti-GPRC5D masked antibody MC3-9003 (Table 4, Figure 60, SEQ ID NO:35) was designed. Except for the parts described below, preparation was performed in the same manner as in Example 1)-1, and antigen binding was evaluated by ELISA in the same manner as in Example 15.
  • MCE-2105 showed improved binding activity under uPA and CAPN1 addition conditions compared to enzyme non-addition conditions (Fig. 18(A)).
  • MC3-9003 also showed improved binding activity under the condition of adding uPA and CAPN1 compared to the condition of adding no enzyme (FIG. 18(B)).
  • Example 18 In vivo efficacy test of anti-CD98 masked antibody-drug conjugate The anti-tumor effect of the antibody-drug conjugate was evaluated using an animal model in which cells of a CD98-positive human tumor cell line were transplanted into immunodeficient mice. bottom. 4- to 5-week-old BALB/c nude mice (CAnN.Cg-Foxn1[nu]/CrlCrlj[Foxn1nu/Foxn1nu], Charles River Laboratories Japan, Inc.) were conditioned for 3 days or more under SPF conditions before use in experiments.
  • mice were fed sterile chow (FR-2, Funabashi Farms Co., Ltd.) and were given sterile tap water (prepared with 5-15 ppm sodium hypochlorite solution).
  • the major axis and minor axis of the transplanted tumor were measured with an electronic digital caliper (CD-15CX, Mitutoyo Corp.) twice a week, and the tumor volume was calculated according to the following formula.
  • Tumor volume (mm 3 ) 1/2 x major axis (mm) x [minor axis (mm)] 2
  • ABS buffer (10 mM-Acetate Buffer, 5 (w/v)% Sorbitol, pH 5.5) (NACALAI) and administered to the tail vein at a liquid volume of 10 mL/kg. Also, as a control group (vehicle group), an ABS buffer was similarly administered. Six mice per group were used for the experiment.
  • CD98-positive lung squamous cell carcinoma cell line EBC-1 (JCRB) was suspended in physiological saline/50% Matrigel, 1 ⁇ 10 6 cells were subcutaneously transplanted to the right flank of female nude mice (Day 0), and randomized on Day 10. grouping was carried out. On the day of grouping, the four antibody-drug conjugates prepared in Example 7 (the clone names are MhM1018-M1-DXd-ADC, MhM1019-M1-DXd-ADC, MhM1020-M1-DXd-ADC, MhM1021- M1-DXd-ADC) was administered via the tail vein at a dose of 3 mg/kg. The results are shown in FIG. 19(A). The horizontal axis indicates the number of days, the vertical axis indicates the tumor volume, and the error range indicates the SE value.
  • MhM1021-M1-DXd-ADC loaded with both uPA and CAPN substrates is more potent anti-tumor than MhM1019-M1-DXd-ADC loaded with uPA substrate alone and MhM1020-M1-DXd-ADC loaded with CAPN substrate alone It worked.
  • EBC-1 was suspended in physiological saline/50% Matrigel, and 1 ⁇ 10 6 cells were subcutaneously transplanted to the right flank of female nude mice (Day 0), and randomly grouped on Day 9.
  • the four antibody-drug conjugates prepared in Example 7 (the clone names are MhM1018-M1-DXd-ADC, MhM1020-M1-DXd-ADC, MhM1022-M1-DXd-ADC, MhM1023-
  • FIG. 19(B) shows the results of intravenous administration of 1 mg/kg of M1-DXd-ADC) to the tail vein.
  • MhM1023-M1-DXd-ADC loaded with both MMP9 substrate and CAPN substrate is more potent antitumor than MhM1022-M1-DXd-ADC loaded with MMP9 substrate only and MhM1020-M1-DXd-ADC loaded with CAPN substrate only It worked.
  • Example 19 Activation of anti-TROP2 mask antibody by intracellular CAPN 19)-1
  • E-MEM medium containing 10% fetal bovine serum (Hyclone).
  • the cultured FaDu was collected by trypsinization, washed with PBS, and suspended in 1 mL of Lysis Buffer (25 mM Tris-HCl (pH 7.5), 1 mM EDTA) per 1.0 ⁇ 10 7 cells. After sonication, it was centrifuged at 13000 rpm and 4° C. for 15 minutes.
  • the supernatant was recovered, the protein concentration was measured, and DTT was added to the supernatant to a final concentration of 1 mM.
  • the DTT-added supernatant was stored at -80°C until use and used as a cell lysate containing intracellular CAPN.
  • Cellulisate was used after adjusting the protein concentration to a final concentration of 0.01 ⁇ g/mL, and adding calcium chloride to a final concentration of 2 mM under calcium chloride addition conditions.
  • the antibody was diluted with MilliQ to a final concentration of 20 nM and added.
  • PD150606 was added to the calcium chloride-added cell lysate to a final concentration of 100 ⁇ M.
  • the reaction was performed in a 96-well V-bottom plate (Greiner) in a reaction system of 75 ⁇ L and allowed to react at 37°C for 1 hour. As a control, the reaction was performed using Lysis Buffer instead of cell lysate.
  • the binding activity of the antibody was evaluated by ELISA in the same manner as in Example 1)-1.
  • the anti-TROP2 masked antibody MHT3203 loaded with both the uPA substrate and the CAPN substrate increased its binding activity to the human TROP2 antigen by reacting it with cell lysate to which calcium chloride was added.
  • MHT1903 Table 5, FIG. 62, SEQ ID NO: 42
  • the CAPN inhibitor PD150606 inhibited the increase in the binding activity of MHT3203 to the human TROP2 antigen by cell lysate to which calcium chloride was added.
  • Example 20 Activation of anti-TROP2 masked antibody by two types of enzymes Using anti-TROP2 masked antibody MHT3202 loaded with both uPA substrate and CAPN substrate, the type of enzyme reacted with the masked antibody and the activated mask were analyzed. The binding activity relationship of the antibodies was analyzed. Antibodies were adjusted to 1000 nM in MMP buffer and 20 nM uPA and 100 nM CAPN1 were added alone or simultaneously. After reaction at 37° C. for 30 minutes, binding to human TROP2 antigen was evaluated by ELISA in the same manner as in Example 1)-1. The binding activity was evaluated 3 times, and after calculating the mean value and SD value of the binding activity, the significant difference was evaluated by t-test (significance level 1%).
  • the binding activity of MHT3202 was further improved in the conditions in which both enzymes were added simultaneously compared to the conditions in which uPA or CAPN1 was added alone (p ⁇ 0.01).
  • the reaction with two types of enzymes, an extracellular protease and an intracellular protease can improve the binding activity of the mask antibody compared to the reaction with each individual protease.
  • masked antibodies that can be activated by two enzymes, an extracellular protease and an intracellular protease may have stronger binding activity in the tumor environment than masked antibodies that can be activated by a single protease. was done.
  • Example 21 Alignment study of uPA and CAPN substrates using anti-TROP2 mask antibody 21)-1 Activation of mask antibody by uPA and CAPN1
  • Anti-TROP2 mask antibody MHT3203 loaded with both uPA substrate and CAPN substrate, and MHT3219 (Table 5, FIG. 63, SEQ ID NO: 43) in which the positions of the uPA substrate and the CAPN substrate in the cleavage linker were exchanged was prepared in the same manner as in Example 1-1), and activation of the mask antibody by uPA and CAPN1 was performed. It was evaluated by ELISA as in Example 6.
  • MHT3203 was activated by uPA and CAPN1, respectively (Fig. 22(A)), and MHT3219 was also activated by uPA and CAPN1, like MHT3203 (Fig. 22(B)).
  • Anti-tumor effect of anti-TROP2 masked antibody-drug conjugate was performed in the same manner as in Example 8.
  • TROP2-positive human lung mucinous epidermoid carcinoma cell line NCI-H292 ATCC
  • 5 ⁇ 10 6 cells were subcutaneously transplanted to the right flank of female nude mice (Day 0), and randomized on Day 12. Grouping was performed.
  • two types of antibody-drug conjugates prepared in Example 7 (the clone names are MHT3219-PBD-ADC and MHT3203-PBD-ADC) were administered to the tail vein at a dose of 0.4 mg/kg. .
  • FIG. 23(A) The results are shown in FIG. 23(A).
  • the horizontal axis indicates the number of days, the vertical axis indicates the tumor volume, and the error range indicates the SE value.
  • MHT3203-PBD-ADC loaded with both the uPA substrate and the CAPN substrate exhibited a stronger antitumor effect than MHT3219-PBD-ADC with the rearranged substrates. Therefore, it was shown that a cleavable linker in which the uPA substrate is positioned more amino-terminal than the CAPN substrate is more suitable than a cleavable linker in which the uPA substrate is positioned vice versa.
  • the horizontal axis indicates the number of days
  • the vertical axis indicates the tumor volume
  • the error range indicates the SE value.
  • MHT3203, and MHT1903 loaded with uPA substrate only were prepared in the same manner as in Example 1-1), and activation by uPA, CAPN1, and CAPN2 (accession number: P17655) was performed except for the part described below. , and evaluated by ELISA in the same manner as in Example 5)-1.
  • Antibodies were diluted to 20 nM with MMP buffer, 50 nM uPA, 100 nM CAPN1, or 100 nM CAPN2 were added, reacted at 37° C., and then added to wells to which human TROP2 antigen had been immobilized. The protease susceptibility of each clone was compared with the binding activity when reacted with uPA as 100%.
  • the binding activity of MHT1903 was improved under uPA addition conditions, but not under CAPN1 or CAPN2 addition conditions.
  • the binding activity of the anti-TROP2 masked antibody loaded with both uPA and CAPN substrates was improved under uPA and CAPN (CAPN1 or CAPN2) addition conditions.
  • Example 23 In vivo efficacy of PBD-ADC loaded with different CAPN substrate sequences 23)-1 Anti-tumor effect of anti-TROP2 antibody-drug conjugate (1) Antitumor effect evaluation of the antibody-drug conjugate was performed in the same manner as in Example 8. TROP2-positive human lung mucinous epidermoid carcinoma cell line NCI-H292 (ATCC) was suspended in physiological saline, 5 ⁇ 10 6 cells were subcutaneously transplanted to the right flank of female nude mice (Day0), and randomized on Day10. Grouping was performed.
  • TROP2-positive human lung mucinous epidermoid carcinoma cell line NCI-H292 ATCC
  • Example 7 On the day of grouping, seven antibody-drug conjugates prepared in Example 7 (the clone names are MHT3203-PBD-ADC, MHT5082-PBD-ADC, MHT5085-PBD-ADC, MHT5086-PBD-ADC, MHT5093- PBD-ADC, MHT5094-PBD-ADC, MHT5095-PBD-ADC) were administered via the tail vein at a dose of 0.4 mg/kg. The results are shown in FIG. 25(A). The horizontal axis indicates the number of days, the vertical axis indicates the tumor volume, and the error range indicates the SE value.
  • Example 7 On the day of grouping, seven antibody-drug conjugates prepared in Example 7 (the clone names are MHT3203-PBD-ADC, MHT5082-PBD-ADC, MHT5085-PBD-ADC, MHT5086-PBD-ADC, MHT5093- PBD-ADC, MHT5094-PBD-ADC, MHT5095-PBD-ADC) were administered via the tail vein at a dose of 0.4 mg/kg. The results are shown in FIG. 25(B). The horizontal axis indicates the number of days, the vertical axis indicates the tumor volume, and the error range indicates the SE value.
  • the improved mask antibody of the present invention can be used for treatment of various cancers.
  • SEQ ID NO: 1 heavy chain amino acid sequence of anti-TROP2 antibody
  • SEQ ID NO: 2 light chain amino acid sequence of anti-TROP2 antibody
  • SEQ ID NO: 3 amino acid sequence of MHT1001
  • SEQ ID NO: 4 Amino acid sequence of MHT1002
  • SEQ ID NO: 5 amino acid sequence of HT1-11-scFv-HL
  • SEQ ID NO: 6 amino acid sequence of HT1-11-scFv-LH
  • SEQ ID NO: 7 heavy chain amino acid sequence of MHT1007
  • SEQ ID NO: 8 heavy chain amino acid sequence of MHT1008
  • SEQ ID NO: 9 heavy chain amino acid sequence of MHT1009
  • SEQ ID NO: 10 heavy chain amino acid sequence of MHT3002
  • SEQ ID NO: 12 amino acid sequence of novel
  • SEQ ID NO: 37 Amino acid sequence recognized by human uPA and serving as its substrate
  • SEQ ID NO: 38 Amino acid sequence recognized by human uPA and serving as its substrate
  • SEQ ID NO: 39 Amino acid sequence recognized by human MMP1 and serving as its substrate
  • SEQ ID NO: 40 Amino acid sequence recognized by human MMP1 and serving as its substrate
  • SEQ ID NO: 41 Amino acid sequence recognized by human MMP9 and serving as its substrate
  • SEQ ID NO: 42 heavy chain amino acid sequence of MHT1903
  • SEQ ID NO: 43 heavy chain amino acid sequence of MHT3219
  • SEQ ID NO: 44 amino acid sequence of novel CAPN substrate
  • SEQ ID NO: 45 amino acid sequence of novel CAPN substrate
  • SEQ ID NO: 46 amino acid sequence of novel CAPN substrate
  • SEQ ID NO: 47 amino acid sequence of novel CAPN substrate
  • SEQ ID NO: 48 amino acid sequence of novel CAPN substrate
  • SEQ ID NO: 49 amino acid sequence of novel CAPN substrate
  • SEQ ID NO: 50 amino acid sequence of novel CAPN substrate
  • SEQ ID NO: 52 amino acid sequence of novel CAPN substrate
  • SEQ ID NO: 53 amino acid sequence of novel CAPN substrate
  • SEQ ID NO:54 heavy chain amino acid sequence of MHT5082

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Abstract

新規なマスク抗体を提供すること。 標的抗原に結合する部分、該部分に含まれる該標的抗原結合部位を認識する第1ペプチド、及び、プロテアーゼにより切断されるアミノ酸配列を含む第2ペプチドを含んでなり、該第2ペプチドが該プロテアーゼにより切断された後には、該切断前と比較して、該標的抗原に対しより高い結合親和性を有することを特徴とする、該標的抗原に結合する分子。

Description

プロテアーゼ分解性マスク抗体
 本発明は、プロテアーゼの作用により活性化されるプロテアーゼ分解性マスク抗体に関する。
 抗体は抗原すなわち標的分子への認識特異性や結合活性が非常に高く、低分子化合物、ペプチド、蛋白質など多様な分子が抗原になり得る。また、抗体医薬品は生産性や生体内での安定性も高く、癌、免疫疾患、感染症など様々な疾患を対象に開発が進められている。近年では、より薬効の優れた抗体医薬品として、細胞毒性のある薬剤を抗体に結合させたAntibody Drug Conjugate(ADC)や、標的細胞と細胞傷害性T細胞を架橋し、標的細胞を攻撃可能な二重特異性抗体(T-Cell Engaging(TCE))などの研究開発が進められている。ADCやTCEなどは強力な抗腫瘍活性を示す一方で、標的分子が正常組織に発現する場合、標的分子を介した正常組織への毒性が課題となっている(非特許文献1)。
 腫瘍微小環境の性質(腫瘍組織におけるプロテアーゼ活性の亢進など)を利用し、腫瘍組織で特異的に作用する改変抗体としてマスク抗体が知られている。マスク抗体は、正常組織中での結合活性が抑制されているため、標的分子を介した正常組織への毒性が低く、安全性の高い抗体医薬品として期待されている(非特許文献2)。マスク抗体は、抗体本体、抗体の結合を阻害するマスキングドメイン、抗体とマスキングドメインをつなぎプロテアーゼにより切断可能な切断リンカーから構成される(特許文献1)。マスキングドメインとしては、抗体の相補性決定領域(CDR:Complemetarity determining region)に結合するミモトープペプチドの他、抗体とは直接相互作用しないコイルドコイルドメインなどが知られている(非特許文献3)。また切断リンカーには、マトリクスメタロプロテアーゼ(MMP)やウロキナーゼ型プラスミノゲンアクチベータ(uPA)など、腫瘍組織で活性が亢進している細胞外プロテアーゼの基質が搭載され、腫瘍組織選択的な抗体の活性化を可能にしている(特許文献2)。例えば、抗EGFR抗体(Cetuximab)をマスク化した先行研究では、腫瘍組織におけるマスク抗体の活性化や、EGFRが発現する皮膚への暴露量低下、血中半減期の延長、安全性の改善などが報告されている(非特許文献4)。その他、二重特異性抗体やサイトカインなど多様なバイオロジクス分子に対してマスク化技術が適用されている(特許文献3、4)。
 マスク抗体は細胞外(膜型、分泌型)に局在するプロテアーゼによって活性化される。腫瘍組織ではマトリクスメタロプロテアーゼ(MMP)やウロキナーゼ型プラスミノゲンアクチベータ(uPA)の他、マトリプターゼ(MT-SP1)やカテプシン(CTS)など様々な細胞外プロテアーゼの活性が亢進していることが知られている(非特許文献5)。また、細胞内のリソソームに局在が知られているレグメイン(LGMN)は、腫瘍環境中では細胞外に存在していることが報告されている(非特許文献6)。これらプロテアーゼはがん細胞や、がん細胞周辺に存在する間質細胞から細胞外へ分泌され、がん細胞の生存、増殖、浸潤、転移など様々なプロセスに関与していることが分かっている。マスク抗体は、細胞外に存在するこれらのプロテアーゼによって活性化され、腫瘍組織選択的に作用している。
 蛋白質を分解するプロテアーゼは細胞内(細胞質)にも存在し、ユビキチン・プロテアソーム系やオートファジー・リソソーム系と同様に、アミノ酸の代謝、シグナル伝達、免疫、アポトーシスなど様々な生物プロセスに関与している。また、細胞質内のプロテアーゼは、細胞死や細胞膜へのダメージに伴い、細胞外に漏出することが報告されている(非特許文献7)。
国際公開WO2009/025846号 国際公開WO2010/081173号 国際公開WO2016/014974号 国際公開WO2020/069398号
Nature Review Drug Discovery.;17:197-223(2018). Expert Opin Biol Ther.;14(8):1049-53(2014). ACS Cent. Sci.;7:724-38(2021). Sci Transl Med.;5(207):1-10(2013). Annual Review of Cancer Biology.;2:353-76(2018). Scientific Reports.;5(16599):1-9(2015). Anal Biochem.;366(2):197-206(2007).
 従来のマスク抗体より優れた性能を有するマスク抗体を提供する。
 本発明者らは、上記課題を解決するために鋭意研究を行い、蛋白質を分解するプロテアーゼが細胞質内に存在し、細胞死や細胞膜へのダメージに伴って腫瘍細胞から漏出する細胞質内プロテアーゼを利用して、マスク抗体を改良することにより、本発明を完成した。
 すなわち、本発明は以下の発明を包含する。
[1] 下記[a]部分、[b]部分及び[c]部分を含んでなり、標的抗原に結合する分子:
[a]部分 標的抗原に結合する部分;
[b]部分 [a]部分に含まれる標的抗原結合部位を認識する第1ペプチド;
[c]部分 細胞質内に局在するプロテアーゼにより切断されるアミノ酸配列を含む第2ペプチド。
[2] 第2ペプチドが細胞質内に局在するプロテアーゼにより切断された後には、切断前と比較して、標的抗原に対しより高い結合親和性を有することを特徴とする、[1]の分子。
[3] [c]部分の第2ペプチドが、さらに、細胞外プロテアーゼにより切断されるアミノ酸配列を含む、[1]又は[2]の分子。
[4] 第1ペプチド、第2ペプチド、標的抗原に結合する部分の順に連結してなる、[1]~[3]のいずれかの分子。
[5] 標的抗原に結合する部分が、第1ペプチド及び第2ペプチドには含まれないアミノ酸配列からなるポリペプチドである、[1]~[4]のいずれかの分子。
[6] ポリペプチドからなる、[1]~[5]のいずれかの分子。
[7] アミノ末端からカルボキシル末端に向かって、第1ペプチド、第2ペプチド、標的抗原に結合する部分の順、又は、標的抗原に結合する部分、第2ペプチド、第1ペプチドの順に結合してなる、[6]の分子。
[8] 第1ペプチド、第2ペプチド及び標的抗原に結合する部分からなる群より選択されるいずれか1つが、他の2つのうち1つ又は両方とリンカーを介して結合している、[1]~[7]のいずれか1つの分子。
[9] 該細胞質内に局在するプロテアーゼが、細胞死や細胞膜へのダメージにより、細胞外に漏出することを特徴とする、[1]~[8]のいずれかの分子。
[10] 該細胞質内に局在するプロテアーゼが、カルパイン、カスパーゼ及びトリぺプチジルペプチダーゼから選択され、好適には、カルパインがカルパイン1又はカルパイン2であり、カスパーゼが、カスパーゼ1、カスパーゼ8、カスパーゼ3又はカスパーゼ7であり、トリぺプチジルペプチダーゼがトリぺプチジルペプチダーゼ1又はトリぺプチジルペプチダーゼ2である、[1]~[9]のいずれか1つの分子。
[11] 該細胞質内に局在するプロテアーゼが、カルシウム依存性又はカルシウム要求性である、[1]~[10]のいずれか1つに記載の分子。
[12]  該細胞質内に局在するプロテアーゼが、カルパイン1又はカルパイン2である、[1]~[11]のいずれか1つの分子。
[13] 該細胞外プロテアーゼが、正常な組織に比して、異常な組織においてより高発現しているか、より多量に存在するか又はより触媒活性が高いことを特徴とする、[3]~[12]のいずれかの分子。
[14] 該異常な組織が、腫瘍組織及び/又は間質組織である、[13]の分子。
[15] 該細胞外プロテアーゼが、マトリックスメタロプロテアーゼ、ウロキナーゼ型プラスミノゲンアクチベータ、マトリプターゼ、レグマイン及びカテプシンよりなる群から選択され、マトリックスメタロプロテアーゼは好適にはMMP1、MMP2、MMP3、MMP7、MMP9、MMP12及びMMP14の1つ又は2つ以上であり、カテプシンは好適にはカテプシンB、カテプシンD、カテプシンS及びカテプシンLの1つ又は2つ以上である、[3]~[14]のいずれか1つに記載の分子。
[16] 第2ペプチドにおいて、アミノ末端からカルボキシル末端に向かって、該細胞外プロテアーゼにより切断されるアミノ酸配列、該細胞質内に局在するプロテアーゼにより切断されるアミノ酸配列の順、又は、該細胞質内に局在するプロテアーゼにより切断されるアミノ酸配列、該細胞外プロテアーゼにより切断されるアミノ酸配列の順に配置されてなり、好適には、該細胞外プロテアーゼにより切断されるアミノ酸配列、該細胞質内に局在するプロテアーゼにより切断されるアミノ酸配列の順に配置されてなる、[1]~[15]のいずれか1つに記載の分子。
[17] 該細胞質内に局在するプロテアーゼにより切断されるアミノ酸配列が、配列番号12、44~53のいずれか1つ又は2つ以上を含む、[1]~[16]のいずれか1つに記載の分子。
[18] 標的抗原が腫瘍抗原である、[1]~[17]のいずれか1つの分子。
[19] 標的抗原に結合する部分に、他の部分である[d]部分が結合してなり、[d]部分が第1ペプチド及び第2ペプチドを含まない、[1]~[18]のいずれか1つの分子。
[20] [d]部分が、標的抗原結合部分ではない抗体若しくはその抗原結合断片、第1ペプチド及び第2ペプチドに含まれないアミノ酸配列を含むペプチド、サイトカイン、毒素、放射性同位元素、標識分子、光感受性物質、免疫賦活化物質、抗腫瘍性化合物、薬物、ペイロード、並びにポリマーからなる群より選択される1つ又は2つ以上である、[19]の分子。
[21] 抗腫瘍性化合物が、カンプトテシン誘導体又はpyrrolobenzodiazepine誘導体であり、好適には、カンプトテシン誘導体がN-[(1S,9S)-9-Ethyl-5-fluoro-9-hydroxy-4-methyl-10,13-dioxo-2,3,9,10,13,15-hexahydro-1H,12H-benzo[de]pyrano[3',4':6,7]indolizino[1,2-b]quinolin-1-yl]-2-hydroxyacetamideである、[20]の分子。
[22] 免疫賦活化物質が環状ジヌクレオチド誘導体である、[20]の分子。
[23] ポリペプチドからなるか、又は[d]部分及びポリペプチドからなる、[19]~[22]のいずれか1つの分子。
[24] 下記工程(i)及び(ii)を含む、抗体又は抗体の抗原結合断片に含まれる相補性決定領域(CDR)に結合するペプチドを同定する方法:
(i)芳香族性アミノ酸とProの繰返し配列を含むペプチドライブラリーを該CDRに接触させる工程;及び
(ii)該CDRに結合するペプチドを回収する工程。
[25] 芳香族性アミノ酸とProの繰返し配列がZPZPモチーフ[Zは、ヒスチジン(His)、フェニルアラニン(Phe)、チロシン(Tyr)、トリプトファン(Trp)のいずれかの芳香族アミノ酸を表し、Pはプロリンを表す]である、[24]の方法。
[26] 該ペプチドを組換え、インビトロ翻訳、化学合成又はペプチド合成により調製する工程をさらに含む、[24]又は[25]の方法。
[27] 該CDRが[1]記載の標的抗原結合部分に含まれ、第1ペプチドが[26]に記載の方法により得られる、標的抗原に結合する分子。
[28] 第1ペプチドに含まれるアミノ酸配列及び/又は第2ペプチドに含まれるアミノ酸配列を含んでなるペプチドを組換え、インビトロ翻訳、化学合成又はペプチド合成により調製する工程を含む、[1]~[23]のいずれか1つの分子の製造方法。
[29] [28]の方法により得られる、標的抗原に結合する分子。
[30] 下記(iii)記載の工程を含む、[6]、[7]又は[23]記載の分子の製造方法:
(iii)標的抗原結合部分に含まれるアミノ酸配列、並びに、任意で(optionally)、第1ペプチドに含まれるアミノ酸配列、及び/又は、第2ペプチドに含まれるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列を含んでなるポリヌクレオチドを細胞に導入し、該細胞を培養し、該培養物から該標的抗原に結合するポリペプチドを回収する工程。
[31] [30]の方法により得られる、標的抗原に結合する分子。
[32] [1]~[23]、[27]、[29]及び[31]のいずれか1つの分子、その塩又はそれらの水和物を含む、医薬組成物。
[33] 抗がん剤である、[32]の医薬組成物。
[34] 芳香族性アミノ酸とProの繰返し配列を含むペプチドライブラリー。
[35] 芳香族性アミノ酸とProの繰返し配列がZPZPモチーフ[Zは、ヒスチジン(His)、フェニルアラニン(Phe)、チロシン(Tyr)、トリプトファン(Trp)のいずれかの芳香族アミノ酸を表し、Pはプロリンを表す]である、[34]のペプチドライブラリー。
 本明細書は本願の優先権の基礎となる日本国特許出願番号2021-194701号の開示内容を包含する。
 本発明によれば、マスク抗体は、腫瘍環境中のプロテアーゼの作用により活性化され、腫瘍特異性が向上することにより、抗腫瘍剤として優れた効果を発揮する。
図1は、本発明のコンセプトを示している。(A)細胞外プロテアーゼおよび細胞内プロテアーゼで活性化可能なマスク抗体のフォーマットを一例として示す。抗体の可変領域(白)に結合するマスキングドメイン(格子)が切断リンカーで抗体重鎖の可変領域に融合されている。リンカーには細胞外プロテアーゼの基質配列(灰塗り)と細胞内プロテアーゼの基質配列(黒塗り)が含まれている。抗体の可変領域は定常領域(横線)に融合している。(B)細胞内プロテアーゼを利用したマスク抗体の活性化を示している。(1)-(4)は細胞外プロテアーゼにより活性化したマスク抗体の作用で細胞死が誘導されること、死細胞から細胞内プロテアーゼが細胞外へ漏出すること、細胞内プロテアーゼによりマスク抗体が活性化されること、細胞内プロテアーゼにより活性化したマスク抗体が殺細胞活性を示すこと、をそれぞれ示している。 図2は、WO2015/098099号に記載の公知の抗TROP2抗体HT1-11とヒトTROP2抗原の相互作用をELISAで評価した結果を示している。HT1-11は濃度依存的に抗原に結合した。 図3は、抗TROP2抗体HT1-11に対するパニング後のペプチドバインダーの濃縮度合いをプルダウン実験で評価した際のoutput/input比を示している。ヒト血清由来IgG(IgG mixture)よりもHT1-11で値が高く、HT1-11特異的に結合するペプチドの濃縮が示唆された。 図4-1は、scFv型の抗TROP2抗体とヒトTROP2抗原の相互作用をELISAで評価した結果を示している。結合活性はMMP非添加条件(実線)およびMMP1添加条件(点線)で評価した。(A)HT1-11-scFv-HLはMMP添加条件に関わらず同様の結合活性を示した。(B)HT1-11-scFv-LHはMMP添加条件に関わらず同様の結合活性を示した。 図4-2は、scFv型の抗TROP2抗体とヒトTROP2抗原の相互作用をELISAで評価した結果を示している。結合活性はMMP非添加条件(実線)およびMMP1添加条件(点線)で評価した。(C)MHT1001はMMP1添加条件においてMMP1非添加条件よりも強い結合活性を示した。(D)MHT1002はMMP1添加条件においてMMP1非添加条件よりも強い結合活性を示した。 図5-1は、IgG型の抗TROP2マスク抗体とヒトTROP2抗原の相互作用をELISAで評価した結果を示している。結合活性はプロテアーゼ非添加条件(実線)およびプロテアーゼ添加条件(点線)で評価した。(A)HT1-11はMMP添加条件に関わらず同様の結合活性を示した。(B)MHT1007はMMP1添加条件においてMMP1非添加条件よりも強い結合活性を示した。 図5-2は、IgG型の抗TROP2マスク抗体とヒトTROP2抗原の相互作用をELISAで評価した結果を示している。結合活性はプロテアーゼ非添加条件(実線)およびプロテアーゼ添加条件(点線)で評価した。(C)MHT1008はMMP添加条件に関わらず同様の結合活性を示した。(D)MHT1009はuPA添加条件においてuPA非添加条件よりも強い結合活性を示した。 図6は、CAPN基質を搭載した抗TROP2マスク抗体とヒトTROP2抗原の相互作用をELISAで評価した結果を示している。(A)MHT3002はuPAまたはCAPN1添加条件において、プロテアーゼ非添加条件よりも強い結合活性を示した。MHT3201はCAPN1添加条件においてのみプロテアーゼ非添加条件よりも強い結合活性を示した。(B)MHT1713は各種MMP添加条件においてMMP非添加条件よりも強い結合活性を示した。MHT3202はいずれの条件においてもMMP非添加条件と同様の結合活性を示した。 図7-1は、uPA基質やCAPN基質を搭載した抗TROP2マスク抗体とヒトTROP2抗原の相互作用をELISAで評価した結果を示している。結合活性はプロテアーゼ非添加条件(実線)、uPA添加条件(点線)および、CAPN1添加条件(破線)で評価した。(A)MHT3423はuPA添加条件においてのみプロテアーゼ非添加条件よりも強い結合活性を示した。(B)MHT3201はCAPN1添加条件においてのみプロテアーゼ非添加条件よりも強い結合活性を示した。 図7-2は、uPA基質やCAPN基質を搭載した抗TROP2マスク抗体とヒトTROP2抗原の相互作用をELISAで評価した結果を示している。結合活性はプロテアーゼ非添加条件(実線)、uPA添加条件(点線)および、CAPN1添加条件(破線)で評価した。(C)MHT3202はuPAおよびCAPN1添加条件においてプロテアーゼ非添加条件よりも強い結合活性を示した。(D)MHT3203はuPAおよびCAPN1添加条件においてプロテアーゼ非添加条件よりも強い結合活性を示した。 図8は、糖鎖改変抗体のN297糖鎖(非還元末端のシアル酸にアジド基を導入したMSG1型糖鎖(WO2019/065964号))を示している。 図9は、(A)TROP2陽性ヒト肺粘液性類表皮癌細胞株NCI-H292または(B)TROP2陽性ヒト咽頭癌細胞株FaDuを移植したマウスモデルにおけるMHT1008-PBD-ADC(四角)、MHT3423-PBD-ADC(黒四角)、MHT3201-PBD-ADC(上向き黒三角)、MHT3202-PBD-ADC(黒丸)、MHT3203-PBD-ADC(黒ひし形)、Vehicle(ABS)(丸)の抗腫瘍活性を示している。図中のエラーバーは標準誤差(n=6)を示す。 図10は、WO2015/146132号に記載の公知の抗CD98抗体hM23H1L1とヒトCD98抗原の相互作用をELISAで評価した結果を示している。hM23H1L1は濃度依存的に抗原に結合した。 図11は、(A)ペプチドライブラリーの種類および、(B)抗CD98抗体hM23H1L1に対するパニング後のペプチドバインダーの濃縮度合いをプルダウン実験で評価した際のoutput/input比を示している。ヒト血清由来IgG(IgG mixture)よりもhM23H1L1で値が高く、hM23H1L1特異的に結合するペプチドの濃縮が示唆された。 図12-1は、IgG型の抗CD98マスク抗体とヒトCD98抗原の相互作用をELISAで評価した結果を示している。結合活性はプロテアーゼ非添加条件(実線)およびプロテアーゼ添加条件(点線)で評価した。(A)hM23H1L1はMMP1添加条件においても濃度依存的な結合活性を示した。(B)MhM1008はMMP1添加条件においてMMP1非添加条件よりも強い結合活性を示した。 図12-2は、IgG型の抗CD98マスク抗体とヒトCD98抗原の相互作用をELISAで評価した結果を示している。結合活性はプロテアーゼ非添加条件(実線)およびプロテアーゼ添加条件(点線)で評価した。(C)MhM1013はMMP1添加条件においてMMP1非添加条件よりも強い結合活性を示した。 図13は、(A)hM23H1L1重鎖可変領域内のCDR1に点変異を導入したhM23-M1のヒトCD98抗原に対する結合活性をSPR(Surface plasmon resonance)で評価した結果および、(B)MhM1013に上記変異を導入したMhM1013-M1のヒトCD98抗原に対する結合活性をELISAで評価した結果を示している。MhM1013-M1(灰色)はMhM1013(黒色)と同等以上のマスク効果を示した。 図14-1は、プロテアーゼ基質の異なる切断リンカーを搭載した抗CD98マスク抗体とヒトCD98抗原の相互作用をELISAで評価した結果を示している。結合活性はプロテアーゼ非添加条件(実線)、uPAまたはMMP9添加条件(点線)および、CAPN1添加条件(破線)で評価した。(A)MhM1018-M1はいずれの条件においても同様の結合活性を示した。(B)MhM1019-M1はuPA添加条件においてのみプロテアーゼ非添加条件よりも強い結合活性を示した。 図14-2は、プロテアーゼ基質の異なる切断リンカーを搭載した抗CD98マスク抗体とヒトCD98抗原の相互作用をELISAで評価した結果を示している。結合活性はプロテアーゼ非添加条件(実線)、uPAまたはMMP9添加条件(点線)および、CAPN1添加条件(破線)で評価した。(C)MhM1020-M1はCAPN1添加条件においてのみプロテアーゼ非添加条件よりも強い結合活性を示した。(D)MhM1021-M1はuPAおよびCAPN1添加条件においてプロテアーゼ非添加条件よりも強い結合活性を示した。 図14-3は、プロテアーゼ基質の異なる切断リンカーを搭載した抗CD98マスク抗体とヒトCD98抗原の相互作用をELISAで評価した結果を示している。結合活性はプロテアーゼ非添加条件(実線)、uPAまたはMMP9添加条件(点線)および、CAPN1添加条件(破線)で評価した。(E)MhM1018-M1はMMP9添加条件でわずかに結合活性が向上したが、その他の条件では同様の結合活性を示した。(F)MhM1022-M1はMMP9添加条件においてプロテアーゼ非添加条件よりも強い結合活性を示した。CAPN1添加条件においてもわずかに結合活性が向上した。 図14-4は、プロテアーゼ基質の異なる切断リンカーを搭載した抗CD98マスク抗体とヒトCD98抗原の相互作用をELISAで評価した結果を示している。結合活性はプロテアーゼ非添加条件(実線)、uPAまたはMMP9添加条件(点線)および、CAPN1添加条件(破線)で評価した。(G)MhM1023-M1はMMP9およびCAPN1添加条件においてプロテアーゼ非添加条件よりも強い結合活性を示した。 図15は、CD98陽性ヒト咽頭癌細胞株FaDuを移植したマウスモデルにおけるMhM1018-M1-DXd-ADC(四角)、MhM1022-M1-DXd-ADC(黒四角)、MhM1020-M1-DXd-ADC(上向き黒三角)、MhM1023-M1-DXd-ADC(黒丸)、Vehicle(ABS)(丸)の抗腫瘍活性を示している。図中のエラーバーは標準誤差(n=6)を示す。 図16は、(A)公知の抗EGFR抗体CetuximabとヒトEGFRの相互作用をELISAで評価した結果および、(B)WO2018/147245号に記載の公知の抗GPRC5D抗体C3022とヒトGPRC5D抗原の相互作用をELISAで評価した結果をそれぞれ示している。抗体は濃度依存的に抗原に結合した。 図17は、(A)抗EGFR抗体Cetuximabまたは、(B)抗GPRC5D抗体C3022に対するパニング後のペプチドバインダーの濃縮度合いをプルダウン実験で評価した際のoutput/input比を示している。ヒト血清由来IgG(IgG mixture)よりも標的抗体で値が高く、標的抗体特異的なペプチドの濃縮が示唆された。 図18は、uPA基質とCAPN基質の両方を搭載した(A)抗EGFRマスク抗体とヒトEGFR抗原の相互作用をELISAで評価した結果または、(B)抗GPRC5Dマスク抗体とヒトGPRC5D抗原の相互作用をELISAで評価した結果をそれぞれ示している。結合活性はプロテアーゼ非添加条件(実線)、uPA添加条件(点線)および、CAPN1添加条件(破線)で評価した。マスク抗体はuPAおよびCAPN1添加条件においてプロテアーゼ非添加条件よりも強い結合活性を示した。 図19は、CD98陽性ヒト肺扁平上皮癌細胞株EBC-1を移植したマウスモデル((A)用量3mg/kg、(B)用量1mg/kg)における(A)MhM1018-M1-DXd-ADC(四角)、MhM1019-M1-DXd-ADC(黒四角)、MhM1020-M1-DXd-ADC(上向き黒三角)、MhM1021-M1-DXd-ADC(黒丸)、Vehicle(ABS)(丸)および(B)MhM1018-M1-DXd-ADC(四角)、MhM1022-M1-DXd-ADC(黒四角)、MhM1020-M1-DXd-ADC(上向き黒三角)、MhM1023-M1-DXd-ADC(黒丸)、Vehicle(ABS)(丸)の抗腫瘍活性を示している。図中のエラーバーは標準誤差(n=6)を示す。 図20は、抗TROP2マスク抗体MHT3203またはMHT1903の(A)塩化カルシウムを含むセルライセート(黒色)、塩化カルシウムを含まないセルライセート(灰色)、ライセートを含まないバッファー(斜線)と反応させた際の結合活性、および(B)塩化カルシウムを含むセルライセート(黒色)、塩化カルシウムとCAPN阻害剤PD150606を含むセルライセート(灰色)、ライセートを含まないバッファー(斜線)と反応させた際の結合活性をそれぞれ示している。図中のエラーバーは標準偏差(n=3)を示す。また、バッファー条件は平均値(n=2)を示す。 図21は、1種類のプロテアーゼまたは2種類のプロテアーゼと反応させた際の抗TROP2マスク抗体MHT3202の結合活性を示している。図中のエラーバーは標準偏差(n=3)、**は有意差(有意水準1%)を示す。 図22は、uPA基質とCAPN基質を搭載した抗TROP2マスク抗体とヒトTROP2抗原の相互作用をELISAで評価した結果を示している。結合活性はプロテアーゼ非添加条件(実線)、uPA添加条件(点線)および、CAPN1添加条件(破線)で評価した。(A)MHT3203はuPAおよびCAPN1添加条件においてプロテアーゼ非添加条件よりも強い結合活性を示した。(B)MHT3219はuPAおよびCAPN1添加条件においてプロテアーゼ非添加条件よりも強い結合活性を示した。 図23は、(A)TROP2陽性ヒト肺粘液性類表皮癌細胞株NCI-H292または(B)TROP2陽性ヒト咽頭癌細胞株FaDuを移植したマウスモデルにおけるMHT3203-PBD-ADC(四角)および、MHT3219-PBD-ADC(黒四角)、Vehicle(ABS)(丸)の抗腫瘍活性を示している。図中のエラーバーは標準誤差(n=6)を示す。 図24は、プロテアーゼ基質の異なる切断リンカーを搭載した抗TROP2マスク抗体をバッファー(斜線)、CAPN1(黒色)、CAPN2(灰色)、uPA(白色)と反応させた際の結合活性を示している。結合活性(Binding Intensity)はuPAと反応させた際の値を100%として表示している。 図25は、(A)TROP2陽性ヒト肺粘液性類表皮癌細胞株NCI-H292または(B)TROP2陽性ヒト咽頭癌細胞株FaDuを移植したマウスモデルにおけるMHT3203-PBD-ADC(四角)、MHT5082-PBD-ADC(黒四角)、MHT5085-PBD-ADC(上向き黒三角)、MHT5086-PBD-ADC(黒丸)、MHT5093-PBD-ADC(黒ひし形)、MHT5094-PBD-ADC(下向き黒三角)、MHT5095-PBD-ADC(ひし形)、Vehicle(ABS)(丸)の抗腫瘍活性を示している。図中のエラーバーは標準誤差(n=5又は6)を示す。 HT1-11 H鎖全長のアミノ酸配列(配列番号1) HT1-11 L鎖全長のアミノ酸配列(配列番号2) MHT1001全長のアミノ酸配列(配列番号3) MHT1002全長のアミノ酸配列(配列番号4) HT1-11-scFv-HL全長のアミノ酸配列(配列番号5) HT1-11-scFv-LH全長のアミノ酸配列(配列番号6) MHT1007 H鎖全長のアミノ酸配列(配列番号7) MHT1008 H鎖全長のアミノ酸配列(配列番号8) MHT1009 H鎖全長のアミノ酸配列(配列番号9) MHT3002 H鎖全長のアミノ酸配列(配列番号10) human CAPN1全長のアミノ酸配列(配列番号11) 新規CAPN基質のアミノ酸配列(配列番号12) MHT3201 H鎖全長のアミノ酸配列(配列番号13) MHT3202 H鎖全長のアミノ酸配列(配列番号14) MHT1713 H鎖全長のアミノ酸配列(配列番号15) MHT3423 H鎖全長のアミノ酸配列(配列番号16) MHT3203 H鎖全長のアミノ酸配列(配列番号17) hM23H1L1 H鎖全長のアミノ酸配列(配列番号18) hM23H1L1 L鎖全長のアミノ酸配列(配列番号19) MhM1008 L鎖全長のアミノ酸配列(配列番号20) MhM1013 L鎖全長のアミノ酸配列(配列番号21) hM23-M1 H鎖全長のアミノ酸配列(配列番号22) hM23-M1 L鎖全長のアミノ酸配列(配列番号23) MhM1018-M1 L鎖全長のアミノ酸配列(配列番号24) MhM1019-M1 L鎖全長のアミノ酸配列(配列番号25) MhM1020-M1 L鎖全長のアミノ酸配列(配列番号26) MhM1021-M1 L鎖全長のアミノ酸配列(配列番号27) MhM1022-M1 L鎖全長のアミノ酸配列(配列番号28) MhM1023-M1 L鎖全長のアミノ酸配列(配列番号29) Cetuximab H鎖全長のアミノ酸配列(配列番号30) Cetuximab L鎖全長のアミノ酸配列(配列番号31) C3022 H鎖全長のアミノ酸配列(配列番号32) C3022 L鎖全長のアミノ酸配列(配列番号33) MCE-2105 L鎖全長のアミノ酸配列(配列番号34) MC3-9003 H鎖全長のアミノ酸配列(配列番号35) ヒトuPAが認識し、その基質となるアミノ酸配列及びヒトMMP1またはヒトMMP9が認識し、その基質となるアミノ酸配列(配列番号36~41) MHT1903のH鎖全長のアミノ酸配列(配列番号42) MHT3219のH鎖全長のアミノ酸配列(配列番号43) 新規CAPN基質のアミノ酸配列(配列番号44~53) MHT5082のH鎖全長のアミノ酸配列(配列番号54) MHT5084のH鎖全長のアミノ酸配列(配列番号55) MHT5085のH鎖全長のアミノ酸配列(配列番号56) MHT5086のH鎖全長のアミノ酸配列(配列番号57) MHT5090のH鎖全長のアミノ酸配列(配列番号58) MHT5091のH鎖全長のアミノ酸配列(配列番号59) MHT5092のH鎖全長のアミノ酸配列(配列番号60) MHT5093のH鎖全長のアミノ酸配列(配列番号61) MHT5094のH鎖全長のアミノ酸配列(配列番号62) MHT5095のH鎖全長のアミノ酸配列(配列番号63) MMPリンカーのアミノ酸配列(配列番号64)
 以下、本発明を詳細に説明する。
1.定義
 本発明において「DXd」とは、「N-[(1S,9S)-9-Ethyl-5-fluoro-9-hydroxy-4-methyl-10,13-dioxo-2,3,9,10,13,15-hexahydro-1H,12H-benzo[de]pyrano[3’,4’:6,7]indolizino[1,2-b]quinolin-1-yl]-2-hydroxyacetamide」を意味する。
 本発明において「PBD」とは、「pyrrolobenzodiazepine」を意味する。
 本発明において「ミモトープ」とは、「抗体の相補性決定領域(CDR:Complemetarity determining region)に結合するペプチド」を意味する。ミモトープのアミノ酸配列は抗体が認識する抗原のアミノ酸配列(エピトープ)とは必ずしも一致しない特徴をもつ(Molecular Immunology.;23(7):709-715(1986))。 
 本発明において、「抗体」は、定常領域と可変領域とを有する免疫グロブリンの意味で用いる。抗体は、天然のものであるか、又は、部分的若しくは完全合成により製造された免疫グロブリンであるかは特に限定されない。
 基本的な4鎖抗体の構造は、2つの同一な軽鎖(L鎖)、及び、2つの同一な重鎖(H鎖)から構成される。軽鎖は1つの共有ジスルフィド結合により重鎖に結合する。2つの重鎖は、重鎖のアイソタイプに応じて1つ又は複数のジスルフィド結合により互いに結合している。それぞれの軽鎖、重鎖は規則的な間隔を持つ鎖内ジスルフィド結合を持つ。重鎖と軽鎖には、アミノ酸配列が非常に高い類似性を示す定常領域とアミノ酸配列の類似性が低い可変領域とが存在する。軽鎖は、定常領域(CL)が続く可変領域(VL)をアミノ末端に有する。重鎖は3つの定常領域(CH1/CH2/CH3)が続く可変領域(VH)をアミノ末端に有する。VLとVHは対となり、CLは重鎖の第一定常領域(CH1)と並んでいる。VLとVHは対となって、単一の抗原結合部位を形成する。
 本発明の抗体の定常領域としては、特に限定されるものではないが、ヒトの疾患を治療又は予防するための本発明の抗体としては、好適にはヒト抗体の定常領域が使用される。ヒト抗体の重鎖定常領域としては、例えば、Cγ1、Cγ2、Cγ3、Cγ4、Cμ、Cδ、Cα1、Cα2、Cε等を挙げることができる。ヒト抗体の軽鎖定常領域としては、例えば、Cκ、Cλ等を挙げることができる。
 Fabは、重鎖のVHとそれに続くCH1、及び、軽鎖のVLとそれに続くCLからなる。VHとVLは、相補性決定領域(CDR)を含む。VHとCH1及びVLとCLの間にはリンカー又は連結部が在ってもよい。
 Fc(Fc領域ともいう)は、重鎖の定常領域のカルボキシル末端領域であって、CH2とCH3を含み、二量体である。本発明のFcは、天然(野生型)の配列のFcであっても、天然の配列に変異がなされた変異型のFc(「変異型Fc」という)であってもよく、本発明の多重特異性分子及び二重特異性分子において、好適なFc領域は変異型Fcであり、より好適にはヘテロ2量体を形成し得る1組のFcである。1組のFcとしては、後述の、第1ポリペプチドに含まれるFc(i)及び第2ポリペプチドに含まれるFc(ii)の組合せをあげることができるが、1組のFcが会合(ヘテロ2量体形成)することができれば、それらに限定されるものではない。
 変異型Fcとしては、WO2013/063702号に開示される、向上した安定性を有するヘテロ多量体に含まれる改変Fc領域(ヘテロ二量体Fc領域を含む)、WO96/27011号に開示される、異種多量体に含まれる、「突起」及び「空隙」を有するIgG抗体から誘導されるイムノグロブリンのCH3領域を含むFc、WO2009/089004号に開示される、1以上のアミノ酸残基を荷電アミノ酸に置換することで静電的に有利であるヘテロ二量体に含まれるCH3ドメインを含むFc、WO2014/110601号に開示される、立体構造変異及び/又はpI(等電点)変異を用いた異種二量体に含まれる異種二量体Fc領域、WO2010/151792号に開示される、プロテインAへの結合を無くすか又は減少させる改変を含むCH3ドメインを含む、ヘテロ二量体のFc等が例示されるが、これらに限定されるものではない。
 可変領域は、超可変領域(HVR:hypervariable region)と称される極度の可変性を有する領域と、その領域により分離されたフレームワーク領域(FR:Framework region)と呼ばれる比較的不変の領域からなる。天然の重鎖と軽鎖の可変領域は、3つの超可変領域により接続される4つのFRを含み、各鎖の超可変領域はFRにより他の鎖の超可変領域とともに極近傍に保持され、抗体の抗原結合部位の形成に寄与している。
 抗体分子の重鎖及び軽鎖にはそれぞれ3箇所の相補性決定領域(CDR:Complemetarity determining region)があることが知られている。相補性決定領域は、超可変領域とも呼ばれ、抗体の重鎖及び軽鎖の可変領域内にあって、一次構造の変異性が特に高い部位であり、重鎖及び軽鎖のポリペプチド鎖の一次構造上において、通常、それぞれ3ヶ所に分離している。本発明においては、抗体の相補性決定領域について、重鎖の相補性決定領域を重鎖アミノ酸配列のアミノ末端側からCDRH1、CDRH2、CDRH3と表記し、軽鎖の相補性決定領域を軽鎖アミノ酸配列のアミノ末端側からCDRL1、CDRL2、CDRL3と表記する。これらの部位は立体構造の上で相互に近接し、結合する抗原に対する特異性を決定している。
 本発明において、CDRの位置と長さは、IMGTの定義(Developmental and Comparative Immunology 27(2003) 55-77)により決定した。
 FRは、可変領域のCDR以外の部分である。可変領域は、一般にFR1、FR2、FR3、FR4の4つのFRを持つ。
 重鎖並びに軽鎖に含まれるCDRとFRは、アミノ末端からカルボキシル末端に向かって、FRH1-CDRH1-FRH2-CDRH2-FRH3-CDRH3-FRH4、並びに、FRL1-CDRL1-FRL2-CDRL2-FRL3-CDRL3-FRL4、の順にそれぞれ配置される。
 CDRとFRの位置は、当技術分野で周知の様々な定義、例えば、IMGT以外にも、Kabat、Chothia、AbM、contact等の定義により決定することもできる。
 本発明において、抗体が結合する「部位」、すなわち抗体が認識する「部位」とは、抗体が結合又は認識する抗原上の部分ペプチド又は部分高次構造を意味する。
 本発明においては、かかる部位のことをエピトープ、抗体の結合部位とも呼ぶ。本発明において、「変異抗体」とは、元の抗体が有するアミノ酸配列においてアミノ酸が置換、欠失、付加(付加には挿入が含まれる)(以下、「変異」と総称する)してなるアミノ酸配列を有し、且つ本発明の標的とする抗原に結合するポリペプチドを意味する。かかる変異抗体における変異アミノ酸の数は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、15、20、25、30、40又は50個である。かかる変異抗体も本発明の「抗体」に包含される。
 本発明において、「1又は数個」における「数個」とは、2~10個を指す。
 本発明において、「分子」は、上述の抗体、抗体の抗原結合断片を含む分子であり、さらに抗体又はそれらに由来する複数の抗原結合断片より形成された多重特異的である分子を含む。
 本発明において「AがBを搭載する」とは「AがBを含む」又は「AにBが結合、付加もしくは融合している」ことを意味する。例えば、「基質を搭載する抗体」は、「基質を含む抗体」、「基質が結合した抗体」、「基質が付加した抗体」又は「基質が融合した抗体」と解することができる。
2.標的抗原に結合する分子
 本発明は、標的抗原に結合する分子であって、特定の環境で前記標的抗原に特異的に結合する分子である。
 特定の環境とは、特定の組織における環境をいい、例えば、癌微小環境が挙げられる。癌微小環境とは、癌組織内における環境をいい、例えば、プロテアーゼが存在する環境である。
 本発明の標的抗原に結合する分子は、標的抗原に結合する部分、該部分に含まれる標的抗原結合部位を認識する第1ペプチド及び細胞質内に局在するプロテアーゼにより切断されるアミノ酸配列を含む第2ペプチドを含み、第1ペプチド、第2ペプチド及び標的抗原結合部分の順に連結している。標的抗原に結合する部分を標的抗原結合部分(a moiety that binds to a target antigen)ともいう。本発明において、標的抗原結合部分を[a]部分、第1ペプチドを[b]部分、第2ペプチドを[c]部分と呼ぶことがある。
 標的抗原に結合する部分は、好ましくは、ポリペプチドである。該部分は、抗体抗原反応又はタンパク質(例えば、受容体)-リガンド結合により、標的抗原に結合する。標的抗原に結合する部分は、より好ましくは、抗体抗原反応により標的抗原に結合する抗体又は抗体の抗原結合断片である。
 抗体
 本発明の抗体としては、非ヒト動物由来の抗体(非ヒト動物抗体)、ヒト抗体、キメラ化抗体(「キメラ抗体」ともいう)、ヒト化抗体などを挙げることができ、好ましくはヒト抗体又はヒト化抗体を用いることができる。本発明の抗体の範囲には、抗体の変異体(後述の「変異抗体」)も含まれ、例えば、ヒト抗体の範囲には、ヒト変異抗体も含まれ、ヒト化抗体の範囲には、ヒト化変異抗体も含まれる。
 非ヒト動物抗体としては、哺乳類、鳥類等の脊椎動物に由来する抗体などを挙げることができる。哺乳類由来の抗体としては、マウス抗体、ラット抗体などのげっ歯類、又はラクダ由来の抗体などを挙げることができる。鳥類由来の抗体としては、ニワトリ抗体等を挙げることができる。
 キメラ化抗体としては、非ヒト動物抗体由来の可変領域とヒト抗体(ヒト免疫グロブリン)定常領域とを結合してなる抗体などを挙げることができるが、それらに限定されるものではない。
 ヒト化抗体としては、非ヒト動物抗体の可変領域中のCDRをヒト抗体(ヒト免疫グロブリンの可変領域)に移植したもの、CDRに加え非ヒト動物抗体のフレームワーク領域の配列も一部ヒト抗体に移植したもの、それらのいずれかの非ヒト動物抗体由来の1つ又は2つ以上のアミノ酸をヒト型のアミノ酸で置換したものなどを挙げることができるが、それらに限定されるものではない。
 抗体は、公知の種々の方法で作製することができる。公知の方法として、ハイブリドーマを用いる方法や細胞免疫法等により作製し、遺伝子組換えの手法により作製することができる。また、ヒト抗体ライブラリーより選別したファージディスプレイ由来のヒト抗体を取得する方法も知られている。例えば、ヒト抗体の可変領域をscFvとしてファージ表面に発現させて、抗原に結合するファージを選択するファージディスプレイ法を用いることができる。抗原に結合することで選択されたファージの遺伝子を解析することによって、抗原に結合するヒト抗体の可変領域をコードするDNA配列を決定することができる。抗原に結合するscFvのDNA配列が明らかになれば、当該配列を有する発現ベクターを作製し、適当な宿主に導入して発現させることによりヒト抗体を取得することができる(WO92/01047号、WO92/20791号、WO93/06213号、WO93/11236号、WO93/19172号、WO95/01438号、WO95/15388号、Annu.Rev.Immunol(1994)12,433-455)。また、ヒト抗体は、ヒト抗体の重鎖と軽鎖の遺伝子を含むヒトゲノムDNA断片を有するヒト抗体産生マウスを用いた方法(Tomizuka,K.et al.,Nature Genetics(1997)16,p.133-143,; Kuroiwa,Y.et.al.,Nuc.Acids Res.(1998)26,p.3447-3448;Yoshida, H.et.al.,Animal Cell Technology:Basic and Applied Aspects vol.10,p.69-73(Kitagawa, Y.,Matuda,T.and Iijima,S.eds.),Kluwer Academic Publishers,1999.;Tomizuka,K.et.al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA(2000)97,p.722-727等を参照。)によっても取得することができるが、それらに限定されない。ヒト治療用又は予防用抗体の定常領域としては、好適には、ヒト抗体のものが使用される。ヒト抗体の重鎖定常領域としては、例えば、Cγ1、Cγ2、Cγ3、Cγ4、Cμ、Cδ、Cα1、Cα2、Cε等をあげることができる。ヒト抗体の軽鎖定常領域としては、例えば、Cκ、Cλ等をあげることができる。
 抗体の抗原結合断片とは、重鎖可変領域及び軽鎖可変領域から構成される、抗原との結合活性を有する抗体の部分断片を意味する。抗体の抗原結合断片としては、例えば、Fab、F(ab’)、scFv、Fab’、Fv、single-domain antibody(sdAb)等の抗原結合断片を挙げることができるが、それらに限定されるものではない。かかる抗体の抗原結合断片は、抗体蛋白質の全長分子をパパイン、ペプシン等の酵素で処理することによって得られたものに加え、組換え遺伝子を用いて適当な宿主細胞において産生された組換え蛋白質であってもよい。
抗体又はその結合断片の変異体
 本発明の抗体又はその抗原結合断片の変異体には、好適には、蛋白質の分解若しくは酸化に対する感受性の低下、生物活性や機能の維持、改善若しくは低下や変化の抑制、抗原結合能の改善若しくは調節、又は理化学的性質若しくは機能的性質の付与等がなされ得る。蛋白質は、その表面にある特定のアミノ酸側鎖が変化して当該蛋白質の機能や活性が変化することが知られ、そのような例には、アスパラギン側鎖の脱アミド化、アスパラギン酸側鎖の異性化等が含まれる。そのようなアミノ酸側鎖の変化を防ぐために別のアミノ酸に置き換えたものも、本発明の変異体の範囲に含まれる。
 本発明の変異体の例として、抗体又はその抗原結合断片の有するアミノ酸配列において保存的アミノ酸置換されてなるアミノ酸配列を有する抗体又はその抗原結合断片を挙げることができる。保存的アミノ酸置換とは、アミノ酸側鎖に関連のあるアミノ酸グループ内で生じる置換である。
 好適なアミノ酸グループは、以下の通りである:酸性グループ=アスパラギン酸、グルタミン酸;塩基性グループ=リジン、アルギニン、ヒスチジン;非極性グループ=アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン、トリプトファン;及び非帯電極性ファミリー=グリシン、アスパラギン、グルタミン、システイン、セリン、スレオニン、チロシン。他の好適なアミノ酸グループは次のとおりである:脂肪族ヒドロキシグループ=セリン及びスレオニン;アミド含有グループ=アスパラギン及びグルタミン;脂肪族グループ=アラニン、バリン、ロイシン及びイソロイシン;並びに芳香族グループ=フェニルアラニン、トリプトファン及びチロシン。かかる変異抗体におけるアミノ酸置換は、元の抗体が有する抗原結合活性を低下させない範囲で行うのが好ましい。
抗体又はその結合断片の修飾体、複合体
 本発明は、抗体又はその結合断片の修飾体を提供する。本発明の抗体又はその結合断片の修飾体とは、本発明の抗体又はその結合断片に化学的又は生物学的な修飾が施されてなるものを意味する。化学的な修飾体には、アミノ酸骨格への化学部分の結合、N-結合又はO-結合炭水化物鎖の化学修飾体等が含まれる。生物学的な修飾体には、翻訳後修飾(例えば、N-結合又はO-結合への糖鎖付加、糖鎖リモデリング、アミノ末端領域又はカルボキシル末端領域のプロセッシング、脱アミド化、アスパラギン酸の異性化、メチオニンの酸化)されたもの、原核生物宿主細胞を用いて発現させることによりアミノ末端にメチオニン残基が付加したもの等が含まれる。また、本発明の抗体又は抗原の検出又は単離を可能にするために標識されたもの、例えば、酵素標識体、蛍光標識体、アフィニティー標識体もかかる修飾物の意味に含まれる。このような本発明の抗体又はその結合断片の修飾物は、元の本発明の抗体又はその結合断片の安定性及び血中滞留性の改善、抗原性の低減、かかる抗体又は抗原の検出又は単離等に有用である。
 化学的修飾体に含まれる化学部分としては、ポリエチレングリコール(PEG)、エチレングリコール/プロピレングリコールコポリマー、カルボキシメチルセルロース、デキストラン、ポリビニルアルコール等の水溶性ポリマーを例示することができる。
 生物学的な修飾物としては、酵素処理や細胞処理等により修飾が施されたもの、遺伝子組換えによりタグ等他のペプチドが付加された融合体、並びに内因性又は外来性の糖鎖修飾酵素を発現する細胞を宿主として調製されたもの等を挙げることができる。
 かかる修飾は、抗体又はその結合断片における任意の位置に、又は所望の位置において施されてもよく、1つ又は2つ以上の位置に同一又は2種以上の異なる修飾がなされてもよい。
 しかし、これらの重鎖配列の欠失、あるいは、重鎖又は軽鎖配列の修飾は、抗体の抗原結合能及びエフェクター機能(補体の活性化や抗体依存性細胞傷害作用など)には、あまり影響を及ぼさず、好適には、有意に影響を及ぼさない。
 従って、本発明には当該欠失又は修飾を受けた抗体も含まれる。例えば、重鎖カルボキシル末端において1又は2つのアミノ酸が欠失した欠失体(Journal of Chromatography A;705;129-134(1995))、重鎖カルボキシル末端のグリシン、リジンの2アミノ酸残基が欠失し、新たにカルボキシル末端に位置するプロリン残基がアミド化された当該欠失体(Analytical Biochemistry,360:75-83(2007))、抗体の重鎖又は軽鎖のアミノ末端のグルタミン又はグルタミン酸残基がピログルタミル化修飾された抗体(WO2013/147153号)等を挙げることができる(それらをまとめて「欠失体」と呼ぶ)。ただし、抗原結合能及びエフェクター機能が保たれている限り、本発明に係る抗体の重鎖及び軽鎖のカルボキシル末端の欠失体は上記の種類に限定されない。本発明に係る抗体が2本以上の鎖(例えば重鎖)を含む場合、当該2本以上の鎖(例えば重鎖)は、完全長及び上記の欠失体からなる群から選択される重鎖のいずれか一種であっても良いし、いずれか二種を組合せたものであっても良い。各欠失体の量比又は分子数比は本発明に係る抗体を産生する哺乳類培養細胞の種類及び培養条件に影響を受け得るが、本発明に係る抗体の主成分としては2本の重鎖の少なくとも片方、好ましくは双方でカルボキシル末端の1つ、2つ又は数個のアミノ酸残基が欠失している場合を挙げることができる。
 さらに、本発明の抗体又はその抗原結合断片(本発明の分子、多重特異的分子、二重特異的分子等に含まれるもの等)に、発現ベクター及び/又はシグナル配列等に由来する1乃至数個のアミノ酸がアミノ末端及び/又はカルボキシル末端に付加され(且つその一部又は全部が前記のように修飾され)ていても、所望の抗原結合活性が維持されていれば、本発明の抗体の修飾体又はその抗原結合断片の修飾体の範囲に包含され、そのような抗体又は抗原結合断片の修飾体を含む分子も本発明の分子の範囲に包含される。
 本発明において「抗体又はその結合断片」は「抗体又はその抗原結合断片の修飾体」もその意味に含むものである。また、本発明の分子、多重特異的な分子、二重特異的な分子等に含まれる「抗体又はその抗原結合断片」はかかる「抗体又はその抗原結合断片の修飾体」もその意味に含むものである。
 また、本発明の抗体に結合している糖鎖修飾を調節すること(グリコシル化、脱フコース化等)によって、抗体依存性細胞傷害活性を増強することが可能である。抗体の糖鎖修飾の調節技術としては、国際特許公開WO99/54342号、WO00/61739号、WO02/31140号等が知られているが、これらに限定されるものではない。
標的抗原に結合する部分:[a]部分
 標的抗原とは、特定の疾患に関連した分子をいう。特定の疾患に関連した分子とは、該疾患の原因となっている抗原や分子の疾患に罹患した場合に、該疾患において出現する異常細胞において、発現するか、又は発現が亢進する分子をいう。該分子に上記の標的抗原に結合する部分が結合することにより、異常細胞を攻撃し、疾患の症状を軽減し、又は疾患を治療し得る分子をいう。前記異常細胞は、好ましくは腫瘍細胞や間質細胞であり、標的抗原は、腫瘍細胞については、腫瘍抗原であり、間質細胞については、間質細胞上に発現している分子である。間質細胞は、腫瘍細胞と相互作用を行い、がんの増殖及び進行に大きな役割を果たす。腫瘍抗原は、腫瘍細胞に発現している抗原又は正常細胞ががん化した腫瘍細胞に発現する抗原であり、上記の標的抗原に結合する部分が腫瘍抗原に結合することにより、腫瘍細胞の増殖を阻害し、腫瘍細胞を傷害し、又は腫瘍細胞を死滅(アポトーシス又はネクローシス)させる。
 腫瘍抗原として、CD98、TROP2、EGFR、GPRC5D、CD33、CD37、DR5、EPHA2、FGFR2、FGFR4、FOLR1、VEGF、CD20、CD22、CD70、PD-L1、CTLA-4、CD166、CD71、CD47、CDH6、CD147、Mesothelin、A33、CanAg、G250、MUC1、GPNMB、Integrin、Tenascin-C、CLDN6、DLL-3、SLC44A4等が挙げられる。
 また、上記腫瘍抗原に対する抗体として、抗CD98抗体(特開2017-114763、WO2007/114496、WO2008/017828、WO2009/043922、WO2009/090553、特開2012-092068、WO2011/118804及びWO2013/078377等に記載されている。)、抗TROP2抗体(Linnenbach A J他 Proc. Natl. Acad. Sci. 86巻(1号), pp27-31(1989)、WO2008/144891、WO2011/145744、WO2011/155579、WO2013/077458、WO2003/074566、WO2011/068845、WO2013/068946、US7999083及びWO2015/098099等に記載されている。)、panitumumab、nimotuzumab、cetuximab、ametumumab(SY-101)、SYN-004、SCT-200、tomuzotuximab、GC-1118、GR-1401、depatuxizumab(ABT-806)、Serclutamab、AMG595及びmatuzumab等の抗EGFR抗体、抗GPRC5D抗体(WO2018/147245及びWO2016/090329等に記載されている。)等が挙げられる。本発明の標的抗原に結合する部分は、こられの抗体に由来するか又は含んでよい。
 間質細胞に発現している分子として、例えば、FAP(fibroblast activation protein)等が挙げられる。
 標的抗原に結合する部分は、好適には、第1ペプチド及び第2ペプチドには含まれないアミノ酸配列を含んでなり、より好適には該アミノ酸配列からなるポリペプチドである。
 標的抗原及び該標的抗原に結合する部分は、抗原及び該抗原に結合する抗体又は抗体の抗原結合断片であってもよいが、その組み合わせに限定されるものではなく、リガンド及び該リガンドに結合する受容体(又はその逆)、サイトカイン及び該サイトカインが結合する受容体(又はその逆)を例示することができる。また、抗体等以外の分子として、標的抗原に結合する非免疫グロブリンタンパク質、核酸アプタマー等の核酸分子、低分子化合物も例示することができる。
 第1ペプチド:[b]部分
 標的抗原に結合する部分([a]部分)に含まれる該標的抗原結合部位を認識する第1ペプチドは、標的抗原に結合する部分に含まれる該標的抗原結合部位を認識することにより、該部位をマスクし、標的抗原に結合する部分が標的抗原に結合できなくする、結合し難くする、又は、結合するのを阻害もしくは妨害するペプチドである。標的抗原に結合する部分が抗体又は抗体の抗原結合断片(以下「抗体等」という。)である場合、第1ペプチドは抗体等の抗原との結合領域に結合するペプチドである。抗体等の抗原との結合領域は、抗体等の可変領域、特に相補性決定領域(CDR)に存在する。抗体等は抗原のエピトープ(抗原決定基)と結合するので、第1ペプチドはエピトープを模倣したペプチドである。抗原のエピトープを模倣(mimic)したペプチドをミモトープ(Mimotope)といい、本発明において、前記第1ペプチドは、好ましくはCDRに結合するミモトープである。ミモトープは、6~30個、好ましくは10~20個、さらに好ましくは13~17個、特に好ましくは15個のアミノ酸からなるペプチドである。ミモトープは、例えば、上記のアミノ酸数からなる各種ディスプレイ(ファージディスプレイ、リボソームディスプレイ、核酸ディスプレイ、細菌ディスプレイ等)・ライブラリーを作製し、パニングによりスクリーニングを行うことにより、標的抗原に結合する部分に含まれる該標的抗原結合部位を認識するペプチドを提示するファージ粒子を選別し、該ファージ粒子からミモトープをコードするDNA及びそのヌクレオチド配列を得て製造することができる。ペプチドがミモトープであること(抗体のCDRに結合していること)は、例えば、マスク抗体、又は抗体と当該ペプチドの複合体を結晶化して、X線結晶構造解析を行うことにより確認できる。また、ペプチドが抗体に対し抗原と(競合的に)結合することをSPR等により確認できれば、当該ペプチドは当該抗体のCDRに結合するミモトープであることが強く示唆される(実施例4参照)。
 前述の通り、標的抗原に結合する部分は、抗体又は抗体の抗原結合断片(以下「抗体等」という。)以外の分子であってもよく、ミモトープ以外の第1ペプチドとして、標的抗原がリガンドの場合、該リガンドが結合する受容体に含まれる該リガンド結合部位を認識するペプチドを、標的抗原がサイトカインの場合、該サイトカインが結合する受容体に含まれる該サイトカイン結合部位を認識するペプチドを、それぞれ例示することができる。標的抗原に結合する部分が非免疫グロブリンタンパク質の場合、第1ペプチドは該タンパク質に含まれる該標的抗原部位を認識するペプチドであり、標的抗原に結合する部分が核酸分子の場合、第1ペプチドは該核酸分子に含まれる該標的抗原部位を認識するペプチドであり、標的抗原に結合する部分が低分子化合物の場合、第1ペプチドは該低分子化合物に含まれる該標的抗原部位を認識するペプチドである。
第2ペプチド:[c]部分
 細胞質内に局在するプロテアーゼにより切断されるアミノ酸配列を含む第2ペプチドは、細胞質内に局在するプロテアーゼの基質となり、該プロテアーゼにより切断されるアミノ酸配列を含む。該プロテアーゼは、第2ペプチドに含まれるアミノ酸配列を認識して切断する。本発明においては「細胞質内に局在するプロテアーゼ」を「細胞内プロテアーゼ」とも呼び、2つの用語は互換性がある。第2ペプチドを「切断リンカー」とも呼ぶ。
 本発明において、第2ペプチドは、好適には、さらに細胞外プロテアーゼの基質となり、該プロテアーゼにより切断されるアミノ酸配列(単に「基質」ともいう。あるプロテアーゼにより切断される基質を「当該プロテアーゼ基質」ともいう。)を含む。この場合、細胞内プロテアーゼの基質となるアミノ酸配列を第1切断アミノ酸配列と呼び、細胞外プロテアーゼの基質となるアミノ酸配列を第2切断アミノ酸配列と呼ぶことができる。本発明においては、第2ペプチドに、第1切断アミノ酸配列と第2切断アミノ酸配列を含ませることを、第2ペプチドにおいて、プロテアーゼ切断配列として、第1切断アミノ酸配列と第2切断アミノ酸配列を組合わせるともいう。
 細胞内プロテアーゼは、「細胞内作用型プロテアーゼ」ともいい、細胞内で発現した後、細胞外に分泌されることなく、細胞内で作用し、細胞のアポトーシスに関連する。細胞内プロテアーゼとして、細胞質性システインプロテアーゼであるカスパーゼ、カルパイン(「CAPN」ともいう。)、トリぺプチジルペプチダーゼ等が挙げられる。カルパインは、CAPN1(μ-カルパイン)、CAPN2(m-カルパイン)、CAPN3、CAPN4、CAPN5、CAPN6、CAPN7、CAPN8、CAPN9、CAPN10、CAPN11、CAPN12、CAPN13、CAPN14、CAPN15、CAPN16、CAPN17等のアイソフォームが存在するが、本発明においては、いずれのアイソフォームも利用することができ、好ましくは、CAPN1(カルパイン1)又はCAPN2(カルパイン2)を利用する。トリペプチジルペプチダーゼは、トリペプチジルペプチダーゼ1、トリペプチジルペプチダーゼ2等のアイソフォームが存在するが、本発明においては、いずれのアイソフォームも利用することができ、好ましくは、トリペプチジルペプチダーゼ2を利用する。従って、第2ペプチド中の第1切断アミノ酸配列としては、上記の細胞内プロテアーゼの基質となるアミノ酸配列であれば、すなわち、該プロテアーゼが認識し、切断するアミノ酸配列であれば特に限定されないが、好ましくは、ヒトCAPN1が認識し、その基質となるアミノ酸配列(「CAPN1基質」又は「CAPN基質」ともいう)を、CAPN基質としては、PLFAAP(図30、配列番号12)を、それぞれ好適な例としてあげることができる。
 細胞外プロテアーゼは、「細胞外作用型プロテアーゼ」ともいい、シグナル配列を有した状態で発現され、細胞外へ分泌され、細胞外で作用する。細胞外プロテアーゼとして、ウロキナーゼ型プラスミノゲンアクチベータ(u-PA)、マトリクスメタロプロテアーゼ(MMP)、プラスミン、カテプシン、マトリプターゼ、レグメイン等が挙げられる。MMPは、MMP1、MMP2、MMP3、MMP7、MMP8、MMP9、MMP10、MMP11、MMP12、MMP13、MMP14、MMP15、MMP16、MMP17、MMP18、MMP19、MMP20、MMP21、MMP23A、MMP23B、MMP24、MMP25、MMP26、MMP27、MMP28等のアイソフォームが存在するが、本発明においては、いずれのアイソフォームも利用することができる。カテプシンとしては、カテプシンA、カテプシンB、カテプシンC、カテプシンD、カテプシンE、カテプシンF、カテプシンG、カテプシンH、カテプシンK、カテプシンL1、カテプシンL2、カテプシンO、カテプシンS、カテプシンW、カテプシンX/Z等のアイソフォームが存在するが、本発明においてはいずれのアイソフォームも利用することができる。従って、第2ペプチド中の第2切断アミノ酸配列としては、上記の細胞外プロテアーゼの基質となるアミノ酸配列であれば、すなわち、該プロテアーゼが認識し、切断するアミノ酸配列であれば特に限定されないが、好ましくは、ヒトuPAが認識し、その基質となるアミノ酸配列(「uPA基質」ともいう。)を、uPA基質としては、SGRSANAILE(配列番号36、図61)、SGRSANA(配列番号37、図61)及びSGRSA(配列番号38、図61)を、また、ヒトMMP1が認識し、その基質となるアミノ酸配列(「MMP1基質」又は「MMP基質」ともいう。)を、MMP1基質としては、VLVPMAMMAS(配列番号39、図61)及びPLGLWA(配列番号40、図61)を、さらに、ヒトMMP9が認識し、その基質となるアミノ酸配列(「MMP9基質」ともいう。)を、MMP9基質としては、PLGLAG(配列番号41、図61)を、それぞれ好適な例としてあげることができる。
 第2ペプチドに、細胞内プロテアーゼの基質である第1切断アミノ酸配列と細胞外プロテアーゼの基質である第2切断アミノ酸配列の両方が含まれる場合、その順序は限定されないが、例えば、第1ペプチド、第2ペプチド、標的抗原に結合する部分の順に連結している標的抗原に結合する分子において、第1ペプチド側に細胞外プロテアーゼの基質である第2切断アミノ酸配列が含まれ、標的結合部分側に細胞内プロテアーゼの基質である第1切断アミノ酸配列が含まれていてもよく、第1ペプチド、第2ペプチド、標的抗原に結合する部分の順に連結している標的抗原に結合する分子において、第1ペプチド側に細胞内プロテアーゼの基質である第1切断アミノ酸配列が含まれ、標的結合部分側に細胞外プロテアーゼの基質である第2切断アミノ酸配列が含まれていてもよいが、好適には、アミノ末端かカルボキシル末端に向かって、第2切断アミノ酸配列、第1切断アミノ酸配列の順に配置され、より好適には、好適な細胞外プロテアーゼであるuPAにより切断されるアミノ酸配列(uPA基質)又はMMPにより切断されるアミノ酸配列(MMP基質)が好適な細胞内プロテアーゼであるCAPNにより切断されるアミノ酸配列(CAPN基質)よりアミノ末端側に配置されてなる。従って、標的抗原に結合する分子においては、好適には、第1ペプチド、第2切断アミノ酸配列、第1切断アミノ酸配列、標的抗原結合部分の順に連結していてもよく、第1ペプチド、第1切断アミノ酸配列、第2切断アミノ酸配列、標的抗原結合部分の順に連結していてもよいが、より好適には、第1ペプチド、第2切断アミノ酸配列、第1切断アミノ酸配列、標的抗原結合部分の順に配置され、より一層好適には、第1ペプチド、uPA基質又はMMP基質、CAPN基質、標的抗原結合部分の順に配置されてなる。
 前数段落は、専ら第2切断アミノ酸配列が第2ペプチドに含まれる場合について記載しているが、第2切断アミノ酸配列は、本発明の標的抗原に結合する分子に含まれていれば、第2ペプチド以外に含まれてもよく、例えば、第1ペプチドの末端、第2ペプチドと標的抗原結合部分の間に挿入された第3のペプチドに含まれてもよい。
 第1ペプチド、第2ペプチド及び標的抗原結合部分はリンカー(2つのものをつなぐ部分であり、好適には、アミノ酸配列又は該アミノ酸配列からなるペプチドである。)と結合していてもよい。すなわち、第1ペプチド、第2ペプチド及び標的抗原結合部分のいずれか1つが、他の2つのうち1つ又は両方とリンカーを介して結合していてもよい。ここで、リンカーは、アミノ酸1~30個、好ましくは2~20個、より好ましくは2~10個からなるペプチドである。標的抗原結合部分が抗体又はその抗原結合断片である場合、当該部分のうち第1ペプチド又は第2ペプチドに結合するのは該抗体の重鎖若しくは軽鎖又はそれらの抗原結合断片のいずれでもよく、またそれらのアミノ末端、カルボキシル末端、末端以外の部位、又はそれらを修飾する部分(糖鎖、ポリマー等)のいずれでもよい。
標的抗原に結合する分子
 本発明の標的抗原に結合する分子は、標的抗原に結合する部分([a]部分)、該部分に含まれる該標的抗原結合部位を認識する第1ペプチド([b]部分)、及び、細胞質内に局在するプロテアーゼにより切断されるアミノ酸配列を含む第2ペプチド([c]部分)を含み、好ましくはそれらが直接又は間接的に連結した状態で存在し、第1ペプチドが、標的抗原に結合する部分中の標的抗原結合部位に結合することにより、該標的抗原結合部位をマスクする。この結果、該標的抗原結合部位は、標的抗原に結合することができないか又は結合し難い。図1Aは、標的抗原に結合する部分が2価の抗体(IgG)であり、第2ペプチドが細胞外プロテアーゼ用基質(第2切断アミノ酸配列、図1Aの灰塗り部分)及び細胞内プロテアーゼ用基質(第1切断アミノ酸配列、図1Aの黒塗り部分)が連結したペプチドである分子であり、図1Aの格子柄で示された第1ペプチドが抗体の抗原との結合部位に結合し該部位をマスクしている。第1ペプチドは、標的抗原結合部位を認識し結合し得るが、第2ペプチドが切断され、第1ペプチド単独で存在する場合、物理化学的条件により、結合、解離するので、永続的に結合していることはできないと考えられる。例えば、本発明の標的抗原に結合する分子においては、第1ペプチドは、第2ペプチドを介して標的抗原に結合する部分に結合しているので、標的抗原に結合する分子は、第1ペプチドの位置が標的抗原に結合する部分に含まれる該標的抗原結合部位の近傍に位置するようなコンフォメーションをとり、第1ペプチドは、分子のコンフォメーションが変化しない限り、平衡条件では標的抗原結合部位の大部分がマスクされているといった作用機序をとると想定することができるが、かかる機序はそれに限定されない。
 プロテアーゼにより、第2ペプチドに含まれるプロテアーゼの基質となるアミノ酸配列が切断されると、第1ペプチドが標的抗原に結合する分子から解離し、第1ペプチドは、標的抗原結合部位に結合し続けることはできなくなり、この結果、標的抗原に結合する部分に含まれる該標的抗原結合部位が標的抗原に結合し得るようになり、切断前と比較して、該標的抗原に対しより高い結合親和性を有するようになると考えられる。
 すなわち、本発明の標的抗原に結合する分子は、プロテアーゼが存在する環境下で、該プロテアーゼが存在しない環境下に比して、標的抗原により高い親和性をもって結合し得るようになる。
 本発明において利用する細胞内プロテアーゼは、好ましくは、正常な細胞に比して、異常な細胞においてより高発現しているか、より多量に存在するか又はより触媒活性が高いプロテアーゼであってもよい。そのような好適な細胞内プロテアーゼの場合、異常な細胞が存在する環境下において該細胞内プロテアーゼの総活性が多くなり、第2ぺプチド(の第1切断アミノ酸配列)が切断されやすくなる。
 細胞内プロテアーゼは、通常では、細胞外に分泌されないが、細胞死や細胞膜の傷害により細胞が壊れると、細胞外に漏出し、細胞外で作用し得る。本発明の標的抗原に結合する分子は、細胞内プロテアーゼが細胞外に漏出した場合、細胞内プロテアーゼの作用により、第2ペプチド中の細胞内プロテアーゼの基質となるアミノ酸配列が切断され、標的抗原結合部分に含まれる標的抗体結合部位を認識してマスクする第1ペプチドが解離し、標的抗原に結合する部分がより高い親和性をもって標的抗原に結合し得るようになると推測され得る。
 上記のように、本発明における標的抗原は、特定の疾患に関連した抗原であれば特に限定されないが、好ましくは腫瘍細胞及び/又は間質細胞等の異常細胞に存在し、異常の原因となる抗原である。
 本発明の標的抗原に結合する分子中の第2ペプチド中の細胞内プロテアーゼの基質となるアミノ酸配列が、異常な細胞から漏出した細胞内プロテアーゼの作用により切断されることにより、標的抗原に結合する部分がより高い親和性をもって異常な細胞の標的抗原に結合し、異常な細胞への細胞死誘導を促進し、異常細胞による疾患の原因をより高度に除去すると考えられる。
 第2ペプチド中に細胞内プロテアーゼの他に細胞外プロテアーゼの基質となるアミノ酸配列が存在する場合、異常細胞又はその周辺の細胞から細胞外に分泌された細胞外プロテアーゼの作用により、第2ペプチド中の細胞外プロテアーゼの基質となるアミノ酸配列が切断され、標的抗原に結合する部分の標的抗体結合部位を認識してマスクする第1ペプチドが解離し、標的抗原結合部分がより一層高い親和性をもって標的抗原に結合することができる。本発明の標的抗原に結合する分子中の第2ペプチド中の細胞外プロテアーゼの基質となるアミノ酸配列が、異常な細胞から漏出した細胞外プロテアーゼの作用により切断された場合に、標的抗原に結合する部分がより一層高い親和性をもって異常な細胞の標的抗原に結合し、異常な細胞の細胞死(アポトーシス)の誘導をさらに促進すれば、細胞が破壊され、細胞から細胞内プロテアーゼが細胞外に漏出すると推測される。また、細胞膜に傷害を来した細胞、例えば、腫瘍組織内で細胞膜が破壊または壊死(ネクローシス)した細胞から細胞内プロテアーゼが細胞外に漏出する。その結果、本発明の標的抗原に結合する分子中の第2ペプチド中の細胞内プロテアーゼの基質となるアミノ酸配列が、異常な細胞から漏出した細胞内プロテアーゼの作用により切断され、標的抗原に結合する部分が異常な細胞の標的抗原に結合し、異常な細胞を死滅させる等により、異常細胞による疾患の原因をより一層高度に除去すると考えられる。すなわち、本発明の標的抗原に結合する分子中、例えば、第2ペプチド中に細胞内プロテアーゼの他に細胞外プロテアーゼの基質となるアミノ酸配列(第2切断アミノ酸配列)が存在する場合、細胞外プロテアーゼ及び細胞内プロテアーゼの両方により、順次細胞外プロテアーゼの基質となるアミノ酸配列及び細胞内プロテアーゼの基質となるアミノ酸配列が切断され、標的抗原結合部分の標的抗体結合部位に結合してマスクする第1ペプチドが解離するにつれて、標的抗原結合部分が標的抗原に結合し易くなり、本発明の標的抗原に結合する分子の標的抗原に対する結合親和性が高まると推測される。
 例えば、腫瘍細胞を標的とする場合、本発明の標的抗原に結合する分子が腫瘍組織に到達すると、腫瘍組織近傍の腫瘍環境中に存在する細胞外プロテアーゼにより、第2ペプチド中の細胞外プロテアーゼの基質となるアミノ酸配列が、細胞外プロテアーゼの作用により切断され、標的抗原結合部位をマスクしている第1ペプチドが解離し、分子中の標的抗原に結合する部分がより高い親和性をもって腫瘍細胞の標的抗原に結合し、腫瘍細胞の細胞死誘導を促進する。その結果、腫瘍細胞が破壊され、細胞内から細胞内プロテアーゼが細胞外に漏出し、腫瘍環境中に細胞内プロテアーゼが供給される。次いで、第2ペプチド中の細胞内プロテアーゼの基質となるアミノ酸配列が、腫瘍細胞から漏出した細胞内プロテアーゼの作用により切断される。細胞外プロテアーゼの作用のみでは切断されないで残っていた標的抗原結合部位をマスクしている第1ペプチドが解離する。その結果、標的抗原に結合する分子の標的抗原に対する結合親和性が、切断前に比してより一層高くなり、標的抗原に結合する部分がより一層高い親和性をもって腫瘍細胞の標的抗原に結合する。その後、腫瘍細胞の細胞死を誘導し、腫瘍を治療することができる。すなわち、細胞外プロテアーゼと細胞内プロテアーゼの両方の作用により、第2ペプチドが切断され、標的抗原に結合する部分に含まれる標的抗原結合部位を認識し結合しマスクしていた第1ペプチドが標的抗原結合部位から解離することにより、標的抗原に結合する分子が標的抗原に強く結合するようになる。第2ペプチドの切断は、細胞外プロテアーゼのみ、又は細胞内プロテアーゼのみでも部分的に起こるが、両プロテアーゼの作用により、より多くの第2ペプチドが切断され、第1ペプチドが標的抗原結合部位から解離し得る。本発明の標的抗原に結合する分子は、主として上述の様な機序によりその効果を発揮し得ると推測され得るが、かかる機序はそれに限定されず、他のメカニズムにより、又は他のメカニズムと併せて、その効果を発揮してもよい。
他の部分
 本発明の標的抗原に結合する分子は、さらに他の部分を含んでいてもよい。本発明においては、かかる他の部分のことを「[d]部分」ともいう。[d]部分は、前記分子の標的抗原結合部分に結合する。[d]部分は、該標的抗原結合部分ではない抗体若しくはその抗原結合断片、第1ペプチド及び第2ペプチドに含まれないアミノ酸配列を含むペプチド、サイトカイン、毒素、放射性同位元素、標識分子、光感受性物質(photosensitizer:「光増感剤」ともいう)、免疫賦活化物質、抗腫瘍性化合物、薬物、ペイロード並びにポリマーからなる群より選択される1つ又は2つ以上の化合物からなる。
 ここで、第1ペプチド及び第2ペプチドに含まれないアミノ酸配列を含むペプチドとしては、抗体、抗体の抗原結合断片、天然に存在する非免疫グロブリン性タンパク質、人工的に創出されたタンパク質、受容体タンパク質又はそのリガンド結合断片、リガンドタンパク質、血中動態を調節するタンパク(例えば、抗体のFc、アルブミン)等、抗体としては、標的抗原に結合する分子ではない抗体、標的抗原に結合する分子中の標的結合標的部位以外の部位に結合する抗体、標的抗原に結合する分子と結合することにより多重特異性分子(例えば、二重特異性抗体)として機能する抗体等を、サイトカインとしては、インターロイキン、インターフェロン、ケモカイン、コロニー刺激因子、腫瘍壊死因子、増殖因子等を、毒素としては、シアノトキシン、ヘモトキシン、ネクロトキシン、神経毒、細胞毒素等の生物毒素、環境毒素等を、放射性同位元素としては、131I、211AT、89Sr等を、標識分子としては、FITC、PE等の蛍光物質、HRP、AP等の酵素、ビオチン等を、光感受性物質としては、フタロシアニン誘導体、クロリン誘導体、バクテリオクロリン誘導体等を、免疫賦活化物質としては、アジュバント等を、ポリマーとしては、天然又は人工糖鎖、合成樹脂、ポリエチレングリコール等を、抗腫瘍性化合物としては、トポイソメラーゼ阻害剤、有糸分裂阻害剤、細胞分裂阻害剤、微小管重合/脱重合阻害剤、グルココルチコイド受容体調節剤、DNA結合剤、アルキル化剤、放射性同位元素、siRNA、抗体又はその抗原結合断片等を、薬物としては、抗腫瘍剤、前述の免疫賦活化物質及びサイトカイン、下に述べるADCに含まれる抗腫瘍性化合物、薬物、ペイロード等をそれぞれ例示することができるが、それらに限定されるものではない。
 [d]部分がポリペプチドである場合、本発明の標的抗原に結合する分子はポリぺプチドからなってよく、[d]部分がポリペプチド以外の化合物である場合、本発明の標的抗原に結合する分子は[d]部分及びポリぺプチドからなり得る。
 [d]部分は、本発明の標的抗原に結合する分子とリンカーで連結されていてもよい。
 [d]部分が抗腫瘍性化合物、薬物又はペイロードであり、標的抗原に結合する分子が抗体又はその抗原結合部分(抗体等)である場合、[d]部分を含む標的抗原に結合する分子をADC(Antibody-Drug Conjugate;抗体-薬物複合体)ということができる。ADCについては、[Methods Mol Biol.(2013)1045:1-27;Nature Biotechnology(2005)23,p.1137-1146等に記載されている。抗腫瘍性化合物としては、抗体等が結合することにより薬理学的な効果を奏し得る物質であれば特に限定されず、抗腫瘍剤である場合に使用し得る抗腫瘍性化合物として、エムタンシン(4-({3-[(3-{[(1S)-2-{[(1S,2R,3S,5S,6S,16E,18E,20R,21S)-11-クロロ-21-ヒドロキシ-12,20-ジメトキシ2,5,9,16-テトラメチル-8,23-ジオキソ-4,24-ジオキサ-9,22-ジアザテトラシクロ[19.3.1.110,14.03,5]ヘキサコサ-10,12,14(26),16,18-ペンタエン-6-イル]オキシ}-1-メチル-2-オキソエチル]メチルアミノ}-3-オキソプロピル)スルファニル]-2,5-ジオキソピロリジン-1-イル}メチル)シクロヘキシルカルボニル基)(例えば、WO2001/000244、WO2001/000245)、トポイソメラーゼ阻害剤(例えば、Liang,X.他、Eur.J.Med.Chem.171巻、2019年、129-168頁)、好適には、トポイソメラーゼI阻害剤、例えば、カンプトテシン誘導体、好適には、イリノテカン及びその活性代謝産物であるSN-38(例えば、EP 137145A1、US4604463A、)、エキサテカン(例えば、EP 495432A1、US5637770A)、エキサテカン誘導体(例えば、WO2014/057687)等をあげることができる。好適なエキサテカン誘導体として、N-[(1S,9S)-9-Ethyl-5-fluoro-9-hydroxy-4-methyl-10,13-dioxo-2,3,9,10,13,15-hexahydro-1H,12H-benzo[de]pyrano[3',4':6,7]indolizino[1,2-b]quinolin-1-yl]-2-hydroxyacetamide(例えば、WO2014/057687、WO2014/061277、WO2015/146132、WO2020/100954、WO2015/098099)を例示することができる。他の抗腫瘍性化合物として、pyrrolobenzodiazepine誘導体(例えば、WO2019/065964、WO2013/173496、WO2014/130879、WO2017/004330、WO2017/004025、WO2017/020972、WO2016/036804、WO2015/095124、WO2015/052322、WO2015/052534、WO2016/115191、WO2015/052321、WO2015/031693、WO2011/130613)も例示することができ、好適なpyrrolobenzodiazepine誘導体としては、(11a’S)-7’-メトキシ-8’-[(5-{[(11aS)-7-メトキシ-2-(4-メトキシフェニル)-5-オキソ-5,10,11,11a-テトラヒドロ-1H-ピロロ[2,1-c][1,4]ベンゾジアゼピン-8-イル]オキシ}ペンチル)オキシ]-1’,11a’-ジヒドロ-5’H-スピロ[シクロプロパン-1,2’-ピロロ[2,1-c][1,4]ベンゾジアゼピン]-5’-オン、(11a’S)-7’-メトキシ-8’-[(5-{[(11a’S)-7’-メトキシ-5’-オキソ-5’,11a’-ジヒドロ-1’H-スピロ[シクロプロパン-1,2’-ピロロ[2,1-c][1,4]ベンゾジアゼピン]-8’-イル]オキシ}ペンチル)オキシ]-1’,10’,11’,11a’-テトラヒドロ-5’H-スピロ[シクロプロパン-1,2’-ピロロ[2,1-c][1,4]ベンゾジアゼピン]-5’-オン、(11a’S,11a’’’’S)-8’,8’’-[1,5-ペンタンジイルビス(オキシ)]ビス(7’-メトキシ-1’,11a’-ジヒドロ-5’H-スピロ[シクロプロパン-1,2’-ピロロ[2,1-c][1,4]ベンゾジアゼピン]-5’-オン)及び(11a’S)-7’-メトキシ-8’-(3-{[(11aS)-7-メトキシ-2-(4-メトキシフェニル)-5-オキソ-5,10,11,11a-テトラヒドロ-1H-ピロロ[2,1-c][1,4]ベンゾジアゼピン-8-イル]オキシ}プロポキシ)-1’,11a’-ジヒドロ-5’H-スピロ[シクロプロパン-1,2’-ピロロ[2,1-c][1,4]ベンゾジアゼピン]-5’-オン等(WO2019/065964)を例示することができる。薬物としては、STINGアゴニスト(例えば、WO2021/202984、WO2020/229982、WO2020/050406、WO2021/177438)、TLR7/8アゴニスト又はTLR8アゴニスト(例えば、WO2018/009916、WO2019/084060)等の免疫賦活化物質でもよい。好適なSTINGアゴニストとしては、環状ジヌクレオチド誘導体を例示することができる。環状ジヌクレオチド誘導体としては、(5R,7R,8R,12aR,14R,15R,15aS,16R)-15,16-ジヒドロキシ-7-[1-(2-ヒドロキシエチル)-6-オキソ-1,6-ジヒドロ-9H-プリン-9-イル]-2,10-ビス(スルファニル)-14-(6,7,8,9-テトラヒドロ-2H-2,3,5,6-テトラアザベンゾ[cd]アズレン-2-イル)オクタヒドロ-2H,10H,12H-5,8-メタノ-2λ,10λ-フロ[3,2-l][1,3,6,9,11,2,10]ペンタオキサジホスファシクロテトラデシン-2,10-ジオン、(5R,7R,8R,12aR,14R,15R,15aR,16R)-15-フルオロ-16-ヒドロキシ-7-[1-(2-ヒドロキシエチル)-6-オキソ-1,6-ジヒドロ-9H-プリン-9-イル]-2,10-ビス(スルファニル)-14-(6,7,8,9-テトラヒドロ-2H-2,3,5,6-テトラアザベンゾ[cd]アズレン-2-イル)オクタヒドロ-2H,10H,12H-5,8-メタノ-2λ,10λ-フロ[3,2-l][1,3,6,9,11,2,10]ペンタオキサジホスファシクロテトラデシン-2,10-ジオン、(5R,7R,8R,12aR,14R,15R,15aR,16R)-7-[1-(2-アミノエチル)-6-オキソ-1,6-ジヒドロ-9H-プリン-9-イル]-14-(8,9-ジヒドロ-6-チア-2,3,5-トリアザベンゾ[cd]アズレン-2(7H)-イル)-15-フルオロ-16-ヒドロキシ-2,10-ビス(スルファニル)オクタヒドロ-2H,10H,12H-5,8-メタノ-2λ,10λ-フロ[3,2-l][1,3,6,9,11,2,10]ペンタオキサジホスファシクロテトラデシン-2,10-ジオン、N-(2-{9-[(5R,7R,8R,12aR,14R,15R,15aR,16R)-14-(8,9-ジヒドロ-6-チア-2,3,5-トリアザベンゾ[cd]アズレン-2(7H)-イル)-15-フルオロ-16-ヒドロキシ-2,10-ジオキソ-2,10-ビス(スルファニル)オクタヒドロ-2H,10H,12H-5,8-メタノ-2λ,10λ-フロ[3,2-l][1,3,6,9,11,2,10]ペンタオキサジホスファシクロテトラデシン-7-イル]-6-オキソ-6,9-ジヒドロ-1H-プリン-1-イル}エチル)-2-ヒドロキシアセトアミドを例示することができる(WO2021/177438)。本発明において、[d]部分は標的抗原結合部分に結合する。標的抗原結合部分が抗体又はその抗原結合断片である場合、[d]部分は、公知の方法により抗体又はその抗原結合断片に結合させることができる。治療又は予防用の抗体又はそのFc領域を含む糖タンパク質分子の製造において、糖鎖を均一化させる技術が開発されている。糖タンパク質に付加する糖鎖を均一にする方法として、酵素を使った糖鎖転移反応が知られている。これは、in vitro環境での糖鎖の切断(加水分解反応)と別の糖鎖の縮合(糖鎖転移反応)からなる、多段階プロセスである。特にN型糖鎖の変換を目的とする場合、エンド-β-N-アセチルグルコサミニダーゼ(ENGase)と呼ばれる一群の酵素ファミリーが用いられる。この酵素の特性として、1)基質特異性として複合型糖鎖に対する加水分解反応を行う能力を持つこと、及び、2)特定の構造に対する糖鎖転移反応を行う能力を持つことが要求される。糖鎖転移反応では、単独のENGaseを用いて還元末端が活性化された糖鎖である、例えば還元末端をオキサゾリン化した糖鎖をGlcNAc(N-アセチルグルコサミン)アクセプターに転移するオキサゾリン法と、2種類のENGaseを使用して還元末端が活性化されていない糖鎖をGlcNAcアクセプターに直接転移するワンポット法が知られている(WO2022/050300、WO2018/003983)。本発明において、抗腫瘍性化合物、薬物、ペイロード等の[d]部分を抗体又はその抗原結合断片に直接又はリンカー等を介して結合させるために、例えば、それらの方法による糖鎖転移反応を使用することができる。[d]部分が光感受性物質であり、標的抗原に結合する部分が抗体又はその抗原結合部分(抗体等)であるか又はそれらを含む場合、[d]部分を含む標的抗原に結合する分子は、光線力学的療法(Photodynamic Therapy;PDT)に用いることができ、当該分子はADP(Antibody-Directed Phototherapy)分子ということができる。ADP分子については、Antibodies(2013)2,p.270-305等に記載されている。光感受性物質としては、抗体等が結合した部位に光照射することで薬理学的な効果を奏し得る物質であれば特に限定されず、光感受性物質として、(2S)-2-[[2-[(2S,3S)-7-カルボキシ-3-(2-カルボキシエチル)-17-エテニル-12-エチル-2,8,13,18-テトラメチル-2,3,23,24-テトラヒドロポルフィリン-5-イル]アセチル]アミノ]ブタン二酸(例えば、米国特許第5633275号、米国特許第RE37180号)、IR700(IRDye(登録商標)700DX)(例えば、WO2013/009475、WO2004/038378、WO2015/187677、WO2017/031363、WO2017/031367、WO2018/156815、WO2019/232478、WO202020/5623)、2,4-ジフルオロ-N-メチル-3-[10,15,20-トリス[2,6-ジフルオロ-3-(メチルスルファモイル)フェニル]-2,3,12,13,22,24-ヘキサヒドロポルフィリン-5-イル]ベンゼンスルホンアミド(例えば、WO2016/151458)等を例示することができる。
 標的抗原を有する細胞を含む組織又はその近傍において、標的抗原に結合する分子に含まれる切断リンカー(第2ペプチド)が切断され、標的抗原に結合する分子に含まれる有効成分(例えば、薬物)が効果を発揮する。
3.標的抗原に結合する分子の製造方法
(1)第1ペプチドに含まれるミモトープの同定方法
 任意の抗体又はその抗原結合断片に含まれる相補性決定領域(CDR)に結合するペプチドを、ペプチドライブラリーを利用して同定することができる。ペプチドライブラリーは公知の方法で構築すればよい。例えば、完全ランダムなアミノ酸から構成されるリボソーム等の各種ディスプレイ用のペプチドライブラリーを構築し、前記CDRに親和性の大きいペプチドを選択すればよい。また、中央付近に芳香族性アミノ酸とProの繰り返しモチーフ(ZPZPモチーフ)をもつ各種ディスプレイ用のペプチドライブラリー(ZPZP lib)を構築し、前記CDRに親和性の大きいペプチドを選択すればよい。ここで、Zはヒスチジン(His)、フェニルアラニン(Phe)、チロシン(Tyr)、トリプトファン(Trp)のいずれかの芳香族アミノ酸を表し、Pはプロリンを表す。
 第1ペプチドに含まれるミモトープも上記方法で同定することができる。
 抗体のCDRループは、芳香族アミノ酸が多く含まれる。芳香族アミノ酸同士は相互作用しやすいため、ペプチドの中央付近に芳香族アミノ酸が存在していることが好ましい。
 本発明は、上記方法により得られた第1ペプチドや、ミモトープその他抗体以外の分子(サイトカイン等)に結合するペプチドを同定するための各種ディスプレイ用のペプチドライブラリーをも包含する。
(2)標的抗原に結合する分子の製造方法
 本発明の標的抗原に結合する分子であり、第1ペプチドに含まれるアミノ酸配列及び/又は第2ペプチドに含まれるアミノ酸配列を含んでなるペプチドは、組換え、インビトロ翻訳、化学合成、ペプチド合成等により調製することができる。
 例えば、標的抗原結合部分に含まれるアミノ酸配列、並びに、任意で、第1ペプチドに含まれるアミノ酸配列、及び/又は、第2ペプチドに含まれるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列を含んでなるポリヌクレオチドを細胞に導入し、該細胞を培養し、該培養物から該標的抗原に結合するポリペプチドを回収することにより、本発明の標的抗原に結合する分子を製造することができる。
 標的抗原結合部分に含まれるアミノ酸配列、並びに、任意で、第1ペプチドに含まれるアミノ酸配列、及び/又は、第2ペプチドに含まれるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列を含んでなるポリヌクレオチドは、それぞれのペプチドをコードするDNAを連結し、さらに、プロモータ、エンハンサー、ポリアデニル化シグナル等のエレメントと機能的に連結してもよい。ここで機能的に連結とは、エレメントがその機能を果たすように連結することをいう。これらのDNAを発現ベクターに挿入し、宿主細胞を該ベクターで形質転換し、該宿主細胞を培養して産生させ、回収すればよい。該ベクターは宿主細胞からの標的抗原に結合する分子の分泌を促進するシグナルペプチドをコードするDNAを含んでいてもよい、この場合、シグナルペプチドをコードするDNAと標的抗原に結合する分子をコードするDNAをインフレームで連結しておく。標的抗原に結合する分子が産生された後にシグナルペプチドを除去することにより、標的抗原に結合する分子を成熟タンパク質として得ることができる。
 発現ベクターは、動物細胞、細菌、酵母等の宿主中で複製可能なものであれば特に限定されず、例えば、公知のプラスミド、ファージ等が挙げられる。発現ベクターの構築に用いられるベクターとしては、例えば、pcDNA(商標)(ThermoFisher Scientific社)、Flexi(登録商標)ベクター(プロメガ社)、pUC19、pUEX2(アマシャム社製)、pGEX-4T、pKK233-2(ファルマシア社製)、pMAM-neo(クロンテック社製)等が挙げられる。宿主細胞としては、大腸菌、枯草菌等の原核細胞も酵母、動物細胞等の真核細胞も用いることができるが、真核細胞を用いることが好ましい。例えば、動物細胞として、ヒト胎児腎細胞株であるHEK293細胞、チャイニーズ・ハムスター・卵巣(CHO)細胞等を用いればよい。発現ベクターは公知の方法で宿主細胞に導入し、宿主細胞を形質転換すればよい。例えば、エレクトロポレーション法、リン酸カルシウム沈殿法、DEAE-デキストラントランスフェクション法等が挙げられる。産生された抗体は、通常のタンパク質で使用されている分離、精製方法を使用して精製することができる。例えば、アフィニティー・クロマトグラフィー、その他のクロマトグラフィー、フィルター、限外濾過、塩析、透析等を適宜選択し、組合せればよい。
4.本発明の標的抗原に結合する分子の利用
 本発明の標的抗原に結合する分子、その塩又はそれらの水和物(以下「本発明の標的抗原に結合する分子等」という。)は、異常細胞に起因する疾患の予防又は治療薬として用いることができる。
 異常細胞が腫瘍細胞である場合、本発明の標的抗原に結合する分子は、抗がん剤として用いることができる。
 該抗がん剤は、がん腫、肉腫、リンパ腫、白血病、骨髄腫、胚細胞腫、脳腫瘍、カルチノイド、神経芽腫、網膜芽細胞腫、腎芽腫から選択される一種又は複数種に対して使用することができる。具体的には、がん腫では、腎がん、メラノーマ、有棘細胞がん、基底細胞がん、結膜がん、口腔がん、喉頭がん、咽頭がん、甲状腺がん、肺がん、乳がん、食道がん、胃がん、十二指腸がん、小腸がん、大腸がん、直腸がん、虫垂がん、肛門がん、肝がん、胆嚢がん、胆管がん、膵がん、副腎がん、膀胱がん、前立腺がん、子宮がん、膣がんなどが挙げられ、肉腫では、脂肪肉腫、血管肉腫、軟骨肉腫、横紋筋肉腫、ユーイング肉腫、骨肉腫、未分化多型肉腫、粘液型線維肉腫、悪性末梢性神経鞘腫、後腹膜肉腫、滑膜肉腫、子宮肉腫、消化管間質腫瘍、平滑筋肉腫、類上皮肉腫などが挙げられ、リンパ腫では、B細胞リンパ腫、T・NK細胞リンパ腫、ホジキンリンパ腫などが挙げられ、白血病では、骨髄性白血病、リンパ性白血病、骨髄増殖性疾患、骨髄異形成症候群などが挙げられ、骨髄腫では、多発性骨髄腫などが挙げられ、胚細胞腫では、精巣がん、卵巣がんなどが挙げられ、脳腫瘍では、神経膠腫、髄膜腫などが挙げられる。
 本発明の抗腫瘍剤は、治療に有効量の本発明の標的抗原に結合する分子と薬学上許容可能な担体、希釈剤、可溶化剤、乳化剤、保存剤、補助剤等を含めることができる。「薬学上許容可能な担体」等は、対象疾患の種類や薬剤の投与形態に応じて広い範囲から適宜選択することができる。本発明の抗腫瘍剤の投与方法は適宜選択することができるが、例えば注射投与することができ、局所注入、腹腔内投与、選択的静脈内注入、静脈注射、皮下注射、臓器灌流液注入等を採用することができる。また、注射用の溶液は、塩溶液、グルコース溶液、又は塩水とグルコース溶液の混合物、各種の緩衝液等からなる担体を用いて製剤化することができる。また粉末状態で製剤化し、使用時に前記液体担体と混合して注射液を調整するようにしてもよい。 
 他の投与方法についても、製剤の開発と共に適宜選択することができる。例えば経口投与の場合には、経口液剤や散剤、丸剤、カプセル剤及び錠剤等を適用することができる。経口液剤の場合には、懸濁剤及びシロップ剤等のような経口液体調整物として、水、シュークロース、ソルビトール、フラクト-ス等の糖類、ポリエチレングリコール等のグリコール類、ごま油、大豆油等の油類、アルキルパラヒドロキシベンゾエート等の防腐剤、ストロベリー・フレーバー、ペパーミント等のフレーバー類等を使用して製造することができる。散剤、丸剤、カプセル剤及び錠剤は、ラクト-ス、グルコース、シュークロース、マンニトール等の賦形剤、デンプン、アルギニン酸ソーダ等の崩壊剤、マグネシウムステアレート、タルク等の滑沢剤、ポリビニルアルコール、ヒドロキシプロピルセルロース、ゼラチン等の結合剤、脂肪酸エステル等の表面活性剤、グリセリン等の可塑剤等を用いて製剤化することができる。錠剤及びカプセル剤は、投与が容易であるという点において、この発明の組成物における好ましい単位投与形態である。錠剤やカプセル剤を製造する際には、固体の製造担体が用いられる。
 治療に用いるに有効な本発明の標的抗原に結合する分子等の量は、治療する病状の性質、患者の年齢や状態により変更され、最終的には医師が決めればよい。例えば、1回体重1kg当たり0.0001mg~100mgである。所定の投与量は1~180日に1回投与してもよいし、1日当たり2回、3回、4回又はそれ以上の分割投与とし適当な間隔で投与してもよい。
 本発明の標的抗原に結合する分子等は、他の薬剤と組み合わせても、異常細胞に起因する疾患の予防薬又は治療薬として用いられ得る。本発明の標的抗原に結合する分子等は、他の薬剤を投与する前に、他の薬剤と同時に、又は、他の薬剤を投与した後に、異常細胞に起因する疾患しているか又はそのおそれのある者等に投与され得る。本発明の標的抗原に結合する分子等を他の薬剤の同時に投与する場合、それらの配合剤(それら両方を含む製剤)及び各単剤(それぞれ一方だけを含む製剤)のいずれでもよい。
 以下、実施例において本発明をさらに詳細に説明するが、本発明はこれらに限定されない。
 なお、下記実施例において遺伝子操作に関する各操作は特に明示がない限り、「モレキュラークローニング(Molecular Cloning)」(Sambrook,J.,Fritsch,E.F.及びManiatis,T.著,Cold SpringHarbor Laboratory Pressより1989年発行)に記載の方法及びその他の当業者が使用する実験書に記載の方法により行うか、又は、市販の試薬やキットを用いる場合には市販品の指示書に従って行った。遺伝子やベクター構築のために必要なプライマーは、必要に応じて合成委託(株式会社FASMAC、およびThermo Fisher Scientific社)した。
(実施例1) 抗TROP2抗体HT1-11の調製
1)-1 抗TROP2抗体HT1-11の発現・精製
 WO2015/098099号に記載の公知の抗TROP2抗体の重鎖(図26、配列番号1)または軽鎖(図27、配列番号2)をコードするDNAがクローニングされたpcDNA3.3(Thermo Fisher Scientific社)を骨格とした哺乳動物細胞用発現ベクターをExpi293F細胞に導入し、一過性発現させた培養上清より抗体分子を精製した。Expi293F細胞(Thermo Fisher Scientific社)はマニュアルに従い、継代、培養を行った。対数増殖期にあるExpi293F細胞培養液を2.5×10 cells/mLになるようExpi293 Expression medium(Thermo Fisher Scientific社)で希釈し、Opti-Pro SFM培地(Thermo Fisher Scientific社)に重鎖、軽鎖それぞれの発現ベクターとPolyethyleneimine(Polyscience社)を加えて反応後、Expi293F細胞へ添加した。37℃、8%COインキュベーターで5日間、135rpmで振とう培養した。遠心分離後の培養上清に対してPBS pH7.4で平衡化したMabSelectSuRe(Cytiva社)を添加し、目的の抗体分子を吸着させた。非吸着成分をPBSで除去した後、pH3.5の酢酸バッファーで吸着成分を溶出した。溶出画分はpH9.0のTrisバッファーでpHを中性に調製し、限外ろ過膜を用いて25mM Histidine、5(w/v)% Sorbitor、pH6.0にバッファー置換した。必要に応じて濃縮後、予め25mM Histidine、300mM NaCl、5(w/v)% Sorbitor、pH5.5で平衡化したゲルろ過カラムSuperdex 200 Increase(Cytiva社)に供し、モノマー画分を回収した。精製サンプルは、SDS-ポリアクリルアミド電気泳動(SDS-PAGE)と分析用サイズ排除クロマトグラフィー(SEC)に供し、モノマー純度を評価した。精製抗体の濃度は、分光光度計の280nmの吸光度と、PACE法で算出した吸光係数を用いて当業者公知の方法で決定した(Protein Science.;4(11):2411-2423(1995))。
1)-2 ELISAによる抗TROP2抗体HT1-11と抗TROP2抗原の結合活性評価
 96ウェルMaxi-sorp plate(Black、Nunc社)にPBSで1μg/mLに希釈したNeutrAvidin(Thermo Fisher Scientific社)を50μLずつ添加し、4℃で一晩固相化した。Tween-20(Bio-Rad社)を0.05(w/v)%含むPBS(ELISAバッファー)で洗浄後、Blocker Casein(Thermo Fisher Scientific社)でブロッキングした。ELISAバッファーで洗浄後、PBSで1μg/mLに希釈したビオチン化ヒトTROP2抗原(アクセション番号:P09758。細胞外ドメインを当業者公知の手法で精製後、C末端Aviタグ配列をビオチン化した。)を50μLずつ添加して30分室温で振とうした。ELISAバッファーで洗浄後、ELISAバッファーで濃度調整した実施例1)-1の抗体を50μLずつ添加して30分室温で振とうした。ELISAバッファーで洗浄後、ELISAバッファーで2500倍に希釈したHorseradish peroxidase(HRP)標識抗ヒトIgG抗体(Jackson Immuno Research Laboratories社)を50μL添加し、30分室温で振とうした。ELISAバッファーで洗浄後、SuperSignal Pico ELISA Chemiluminescent substrate(Thermo Fisher Scientific社)を添加し、10分後の化学発光をプレートリーダーで測定した。図2に示すように、HT1-11は濃度依存的にヒトTROP2抗原に結合した。
(実施例2) 抗TROP2抗体HT1-11に結合するミモトープペプチドの濃縮
 完全ランダムな15アミノ酸から構成されるリボソームディスプレイ用のペプチドライブラリー(Linear 15mer lib)を構築し、当業者公知の方法でHT1-11へ結合可能なペプチドを濃縮した。最初に、EZ-Link NHS-PEG4-Bioin(Thermo Fisher Scientific社)でビオチン化したヒト血清由来IgG(Sigma-Aldrich社)またはHT1-11をDynabeads Streptavidin M-280(Thermo Fisher Scientific社)に固相化し、ペプチドを提示しているリボソーム(ribosome displaying peptide:以下「RD」という。)をヒト血清由来IgG結合ビーズと反応させた。結合しなかったRDをマグネットスタンド(DynaMag‐2、Thermo Fisher Scientific社)を用いて回収後、HT1-11結合ビーズと反応させた。マグネットスタンドを用いた洗浄操作によりHT1-11に結合しなかったRDを除去し、HT1-11に結合したRDからmRNAを精製した。その後、RT-PCRおよびインビトロ翻訳によりRDを再度調製した。このパニング操作を3回実施した。
 パニング3ラウンド後のmRNAをインビトロ翻訳しRDを調製後、ビオチン化したHT1-11またはヒト血清由来IgGが固相化されたDynabeads Streptavidin M-280とそれぞれ反応させた(インプット量:6×1011)。マグネットスタンドを用いた洗浄操作により結合しなかったRDを除去後、結合したRDからmRNAを回収し、RT-qPCRにより回収量(アウトプット)を定量評価した。図3に示すように、HT1-11を固相した条件では、ヒト血清IgGを固相した条件と比較して2624倍多くmRNAが回収された。この結果から、HT1-11に特異的に結合するペプチドの濃縮が示唆された。
(実施例3) 抗TROP2抗体に結合するミモトープペプチドのスクリーニング
3)-1 パニング由来のペプチドを融合したHT1-11 scFvの調製
 パニング3ラウンド後のDNAフラグメントに制限酵素を添加し、ランダムペプチド部分をコードするDNAフラグメントを当業者公知の方法で精製した。pelBシグナル配列、DNAフラグメント、MMP切断リンカー(公知のMMP基質含む(Journal of Controlled Release.;161:804-812(2012).):配列番号3及び図28に示されるアミノ酸配列のアミノ酸番号41~60)、HT1-11 scFv(VH-VLの順または、VL-VHの順)、FLAGタグ、Hisタグの順で翻訳されるように、当業者公知の方法でDNAフラグメントを大腸菌発現ベクターにライゲーションし、大腸菌XL-1 Blue(Agilent Technologies社)を形質転換した。IPTG(Isopropyl-β-D-thiogalactopyranoside)(Sigma-Aldrich社)存在下で大腸菌を培養し、ペプチド融合scFvを含む培養上清を回収した。
3)-2 ミモトープペプチドの取得
 実施例1)-2と同様の方法でヒトTROP2抗原に対する結合活性をELISAで評価した。ペプチド融合scFvを含む培養上清は、2mMの塩化カルシウムを含むTBS(MMPバッファー)で10倍希釈し、100nMの活性型ヒトMMP1(アクセション番号:P03956)と37℃で15分反応させ、MMP切断リンカーを切断した。その後、ヒトTROP2抗原を固相化したプレートに50μLずつ添加した。結合したscFvはELISAバッファーで5000倍に希釈したHRP標識抗FLAG抗体(Sigma-Aldrich社)で検出した。また、MMP1非添加条件でも同様の操作を行い、結合強度比(MMP1添加条件/MMP1非添加条件)が大きい値を示すクローンを陽性クローンとして選抜した。陽性クローンの発現ベクターを精製後、当業者公知の方法で翻訳領域の配列を解析し、ユニーククローンとしてMHT1001(図28、配列番号3)およびMHT1002(図29、配列番号4)を得た。
3)-3 陽性クローンの結合活性評価
 HT1-11―scFv-HL(図30、配列番号5)、HT1-11-scFv-LH(図31、配列番号6)および実施例3)-2で同定した陽性クローンMHT1001、MHT1002を大腸菌XL-1 Blueで発現させ、培養上清よりNi Sepharose excel(Cytiva社)で精製し、TBSに置換した。精製抗体の濃度は、分光光度計の280nmの吸光度と、PACE法で算出した吸光係数を用いて当業者公知の方法で決定した(Protein Science.;4(11):2411-2423(1995))。精製サンプルを用いて実施例3)-2と同様の方法でMMP1添加条件、MMP1非添加条件におけるヒトTROP2抗原に対する結合活性をELISAで評価した。MMPバッファーで抗体を1μMに調製し、終濃度1μMまたは0μMになるようMMP1を添加し、37℃で15分反応させた。その後、ELISAバッファーで濃度調整した抗体を各ウェルに添加した。
 図4-1(A)、図4-1(B)に示すように、ミモトープペプチドを融合していないHT1-11-scFv-HLおよびHT1-11-scFv-LHはMMP1の添加に寄らず同様の結合活性を示した。また、ミモトープペプチドを融合したMHT1001およびMHT1002は、MMP1添加条件においてMMP1非添加条件よりも強い結合活性を示しており、結合のEC50比(MMP1非添加条件/MMP1添加条件)はそれぞれ7.9、4.3だった(図4-2(C)、図4-2(D))。
(実施例4) 抗TROP2マスク抗体の調製・結合活性評価
 当業者公知の手法で、MHT1001のミモトープペプチドおよびMMP切断リンカー(実施例3)-1参照)を融合した抗TROP2マスク抗体MHT1007(表1、図32、配列番号7)の重鎖発現ベクターを構築した。同様に、MMP切断リンカーの部分をプロテアーゼで切断できない非切断リンカーに改変したMHT1008(表1、図33、配列番号8)およびuPAの切断リンカー(公知のuPA基質含む(Journal of Biological Chemistry.;272(33):20456-20462(1997).):図34及び配列番号9で示されるアミノ酸配列のアミノ酸番号36~55)に改変したMHT1009(表1、図34、配列番号9)の重鎖発現ベクターをそれぞれ構築した。各抗体の重鎖発現ベクターをHT1-11の軽鎖発現ベクターを組合せ、実施例1)-1と同様の方法でExpi293F細胞の培養上清より各マスク抗体を精製し、蛋白質濃度を決定した。調製したマスク抗体は重鎖発現ベクター名と対応させ、MHT1007、MHT1008、MHT1009と命名した(表1)。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000001
 以下に記載する部分を除き、実施例1)-2、実施例3)-2と同様の方法でプロテアーゼ添加条件、非添加条件におけるヒトTROP2抗原に対する結合活性をELISAで評価した。プロテアーゼ添加条件では、3μMの抗体に対して終濃度300nMのMMP1または、活性型ヒトuPA(アクセション番号:P00749)を添加し、37℃で反応後、ELISAバッファーで濃度調整した抗体をヒトTROP2抗原の固定されたウェルに添加した。
 図5-1(A)に示すように、ミモトープペプチドを融合していないHT1-11はMMP1添加条件においても非添加条件と同様の結合活性を示した。また、プロテアーゼ非添加条件において、ミモトープペプチドを融合したMHT1007の結合活性はHT1-11よりも低下しており、scFv時と同様にマスク効果が示された。また、MMP1添加条件においてMMP1非添加条件よりも強い結合活性を示しており、結合のEC50比(MMP1非添加条件/MMP1添加条件)は104だった(図5-1(B))。非切断リンカーを搭載したMHT1008では、MMP1添加条件でも非添加条件と同様に結合活性が低下していた(図5-2(C))。uPA切断リンカーを搭載したMHT1009では、uPA添加条件においてuPA非添加条件よりも強い結合活性を示しており、結合のEC50比(uPA非添加条件/uPA添加条件)は83だった(図5-2(D))。上記結果から、実施例3で取得したミモトープはscFvの状態だけでなくIgGの状態でもマスキングドメインとして機能すること、切断リンカー配列はマスク効果を維持した状態で改変可能であることが示された。
 取得したペプチドがミモトープであることを確認するために、マスクペプチドとMMP切断リンカー(実施例3)-1参照)を含むMHT1007のFab領域を当業者公知の方法で調製し、当該Fab領域の結晶化およびX線結晶構造解析を行った。その結果、該ペプチドはHT1-11のCDR領域に結合していることが示された(データ示さず)。また、化学合成したマスクペプチドがTROP2抗原と競合的にHT1-11に結合することをSPRで確認した(データ示さず)。
(実施例5) 抗TROP2マスク抗体を利用したカルパイン(CAPN)切断配列の選定
5)-1 CAPN切断配列の改変
 細胞質に局在するCAPNは、細胞死に伴い細胞外へ漏出することが示唆されている(非特許文献7)。細胞内プロテアーゼであるCAPNの基質配列と、細胞外プロテアーゼであるuPAの基質配列を組合せることで、uPA基質のみを搭載した場合と比較して、マスク抗体の結合活性を向上させられるか検証するために、適切なCAPNの基質配列を設計した。アミノ酸配列PLFAAR(配列番号10、図35のアミノ酸番号47~52)で構成される公知のCAPN基質(Biochimica et Biophysica Acta.;1794(10):1505-1509(2009).)を切断リンカー内に搭載した抗TROP2マスク抗体MHT3002(表1、図35、配列番号10)を調製し、以下に記載する部分を除き、実施例4と同様の方法でプロテアーゼ添加条件、非添加条件におけるヒトTROP2抗原に対する結合活性をELISAで評価した。MMPバッファーでマスク抗体を10nMに希釈後、200nMのuPAまたはCAPN1(Novus Biologicals社(図36、配列番号11))を添加し、37℃で反応後、ヒトTROP2抗原の固定されたウェルに添加した。
 図6(A)に示すように、uPAおよびCAPN1添加条件においてMHT3002の結合活性は向上しており、MHT3002は両プロテアーゼで活性化されることが示された。
 uPAはArgの直後を切断することが知られている。uPAでの切断されないCAPN基質の取得を目的に、CAPN基質配列(PLFAAR)のRをPに改変した新規CAPN基質(PLFAAP(図37、配列番号12))を設計した。この配列を切断リンカーに搭載した抗TROP2マスク抗体MHT3201(表1、図38、配列番号13)を調製し、上記方法でuPAおよびCAPN1に対する感受性をELISAで評価した。
 図6(A)に示すように、抗TROP2マスク抗体MHT3201の結合活性はCAPN1添加条件においてのみ向上しており、uPAによる活性化は生じなかった。
5)-2 新規CAPN基質(PLFAAP)のMMPに対する反応性
 公知のuPA基質(Journal of Biological Chemistry.;272(33):20456-20462(1997).)と新規CAPN基質(PLFAAP)の両方を切断リンカー内に搭載したMHT3202(表1、図39、配列番号14)と、上記uPA基質とPLGLWAで構成される公知のMMP基質(Biopolymers.;40(4):399-416(1996).)を搭載したMHT1713(表1、図40、配列番号15)を調製し、ヒトMMP1(アクセション番号:P03956)、ヒトMMP2(アクセション番号:P08253)、ヒトMMP3(アクセション番号:P08254)、ヒトMMP7(アクセション番号:P09237)、ヒトMMP9(アクセション番号:P14780)、ヒトMMP12(アクセション番号:P39900)、ヒトMMP14(アクセション番号:P50281)で活性化されるかどうか、以下に記載する部分を除き、実施例5)-1と同様にELISAで評価した。MMPバッファーで抗体を20nMに希釈し、50nMになるよう上記プロテアーゼをそれぞれ添加し、37℃で反応後、ヒトTROP2抗原の固定されたウェルに添加した。
 図6(B)に示すように、MMP添加条件でMHT1713の結合活性は向上したが、MMP添加条件でもMHT3202の結合活性は向上しなかった。以上の結果から、新規CAPN基質(PLFAAP)は上記MMPでは切断されないことが示された。
(実施例6) ADC化に供される抗TROP2マスク抗体の調製・結合活性評価
 細胞内プロテアーゼであるCAPNの基質配列と、細胞外プロテアーゼであるuPAの基質配列を組合せることで、uPA基質のみを搭載した場合と比較して、マスク抗体の結合活性を向上させられるか検証することを目的に、uPA基質のみを搭載したMHT3423(表1、図41、配列番号16)、CAPN基質のみを搭載したMHT3201、uPAとCAPN基質の両方を搭載したMHT3202および、公知のuPA基質の部分配列(Journal of Biological Chemistry.;272(33):20456-20462(1997).)とCAPN基質の両方を搭載したMHT3203(表1、図42、配列番号17)を設計した。実施例1)-1と同様の方法で各抗体を調製し、以下に記載する部分を除き、実施例4と同様の方法でプロテアーゼ添加条件、非添加条件におけるヒトTROP2抗原に対する結合活性をELISAで評価した。プロテアーゼ添加条件では、MMPバッファーで抗体を2000nMに希釈後、200nMのuPAまたはCAPN1を添加し、37℃で反応後、MMPバッファーで濃度調整した抗体をヒトTROP2抗原の固定されたウェルに添加した。プロテアーゼ非添加条件でも同様に、MMPバッファーで調製した抗体を各ウェルに添加した。
 図7-1(A)に示すように、酵素非添加条件と比較してuPA添加条件でMHT3423の結合活性が向上し、CAPN1添加条件では結合活性が向上しなかった。同様に、MHT3201の結合活性はCAPN1添加条件でのみ向上した(図7-1(B))。uPA基質とCAPN基質の両方を搭載したMHT3202およびMHT3203の結合活性はuPA添加条件とCAPN1添加条件の両方で向上した(図7-2(C)、図7-2(D))。以上の結果から、設計したマスク抗体が目的のプロテアーゼ感受性をもつことが示された。
(実施例7) 抗体-薬物コンジュゲートの製造
 抗体―薬物コンジュゲートを製造するための薬物リンカーは、N-[6-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)ヘキサノイル]グリシルグリシル-L-フェニルアラニル-N-[(2-{[(1S,9S)-9-エチル-5-フルオロ-9-ヒドロキシ-4-メチル-10,13-ジオキソ-2,3,9,10,13,15-ヘキサヒドロ-1H,12H-ベンゾ[de]ピラノ[3’,4’:6,7]インドリジノ[1,2-b]キノリン-1-イル]アミノ}-2-オキソエトキシ)メチル]グリシンアミド(実施例58 工程8 WO2014/057687号、以下「リンカー1」と称する)および、N-[4-(11,12-ジデヒドロジベンゾ[b,f]アゾシン-5(6H)-イル)-4-オキソブタノイル]グリシルグリシル-L-バリル-N-{4-[({[(11’S,11a’S)-11’-ヒドロキシ-7’-メトキシ-8’-[(5-{[(11aS)-7-メトキシ-2-(4-メトキシフェニル)-5-オキソ-5,10,11,11a-テトラヒドロ-1H-ピロロ[2,1-c][1,4]ベンゾジアゼピン-8-イル]オキシ}ペンチル)オキシ]-5’-オキソ-11’,11a’-ジヒドロ-1’H-スピロ[シクロプロパン-1,2’-ピロロ[2,1-c][1,4]ベンゾジアゼピン]-10’(5’H)-イル]カルボニル}オキシ)メチル]フェニル}-L-アラニンアミド(実施例2-1 WO2020/196474号、以下「リンカー2」と称する)を使用した。
抗体-薬物コンジュゲートの製造および同定に使用する共通操作
共通操作A:抗体および抗体-薬物コンジュゲート水溶液の濃縮
 Amicon Ultra(50,000 MWCO,Millipore Corporation)および遠心機Allegra X-15R Centrifuge(Beckman Coulter)(SX4750A)にて濃縮した(4000g)。
共通操作B:抗体の濃度測定
 UV測定器(Nanodrop 1000,Thermo Fisher Scientific Inc.)を用いて、メーカー規定の方法に従い測定を使用した。
共通操作C:抗体のバッファー交換
C-1:NaCl(50mM)及びEDTA(5mM)を含むリン酸バッファー(50mM,pH6.0)(以下PBS6.0/EDTAと称する。)へのバッファー交換
 NAP-25カラム(Cat.No.17085202,Cytiva,NAP-25 Columns Sephadex、以下NAP-25と称する)を用いてメーカー規定の方法に従い、NaCl(50mM)及びEDTA(5mM)を含むリン酸バッファー(50mM,pH6.0)(以下PBS6.0/EDTAと称する。)にて平衡化させた。このNAP-25カラム一本につき、抗体水溶液2.5mLをのせたのち、PBS6.0/EDTA3.5mLで溶出させた画分(3.5mL)を分取した。この画分を共通操作A、Bにて濃縮、濃度測定を行ったのちに、PBS6.0/EDTAを用いて10mg/mLに調整した。
C-2:リン酸バッファー(50mM, pH6.0)(以下、PB6.0と称する)へのバッファー交換
 抗体水溶液にPB6.0を加え共通操作Aを用いて濃縮した。この操作を数回行った後、濃度測定(共通操作B)を行い、PB6.0を用いて10mg/mLに調整した。
共通操作D:抗体-薬物コンジュゲートの精製
 NAP-25を用いてメーカー規定操作に従い、抗体画分を溶出させた。カラムの平衡化および溶出溶液に5(w/v)%Sorbitol―10mM 酢酸バッファー(以下、ABSと称する)を使用し、
共通操作E:抗体-薬物コンジュゲートにおける抗体濃度の測定
 抗体-薬物コンジュゲートの濃度C’(mg/mL)は、ランベルト・ベールの法則、吸光度A280=モル吸光係数ε280(L・mol-1・cm-1)×モル濃度C(mol・L-1)×セル光路長l(cm)より導ける式(I)で算出した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000002
 C’(mg/mL)の算出に使用した各値は以下によって得た。
・吸光度A280:抗体-薬物コンジュゲート水溶液の280nmUV吸光度の実測値
 Lamba25(PerkinElmer)にて計測
・モル質量MW(g・mol-1):抗体のアミノ酸配列からより求められる抗体分子量の計算推定値(抗体-薬物コンジュゲートのモル質量の近似値として使用)。
・光路長l(cm):1cm
・抗体薬物コンジュゲートのモル吸光係数ε280:下記の式(II)より算出
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000003
   εAb,280:280nmにおける抗体のモル吸光係数
   εDL,280:280nmにおける薬物リンカーのモル吸光係数
   薬物結合数:共通操作Fにて算出(下記参照)
   εAb,280は抗体のアミノ酸配列から、既知の計算方法(Protein Science, 1995, vol.4, 2411-2423)で算出した値を使用した(下記表2参照)。
 εDL,280はリンカー1ではメルカプトエタノール又はN-アセチルシステインで反応させ、マレイミド基をサクシニイミドチオエーテルに変換した化合物の実測のモル吸光係数(280nm)、リンカー2では実測のモル吸光係数(280nm)を使用した。
共通操作F:抗体-薬物コンジュゲートにおける抗体一分子あたりの薬物平均結合数の測定
 抗体-薬物コンジュゲートにおける抗体一分子あたりの薬物平均結合数は、reversed-phase chromatography(RPC)を用いて測定した。
F-1.サンプル調製(抗体分子間ジスルフィドの還元)
 抗体-薬物コンジュゲート溶液(約1mg/mL、60μL)にジチオトレイトール(DTT)水溶液(100mM、15μL)を添加した後、混合物を37℃で30分インキュベートし、軽鎖及び重鎖間のジスルフィド結合を切断した。
F-2.HPLC分析
 HPLC分析は下記の測定条件にて行った。
・HPLCシステム:Agilent1290HPLCシステム(Agilent Technologies)
・検出器:紫外吸光度計(測定波長:280nm)
・カラム:ACQUITY UPLC BEH Phenyl(2.1×50mm、1.7μm、130Å;Waters、P/N186002884)
・カラム温度:75℃
・移動相A:0.10(w/v)%トリフルオロ酢酸(TFA)、15(w/v)%2-プロパノール水溶液
・移動相B:0.075(w/v)%TFA、15(w/v)%2-プロパノール、アセトニトリル溶液
・グラジエントプログラム:(min,B%):(0,14)-(15,36)-(17,80)-(17.01,14)-(25,14)
・サンプル注入量:10μL
F-3.データ解析
F-3-1 薬物の結合していない抗体の軽鎖(L0)及び重鎖(H0)に対して、薬物の結合した軽鎖(薬物がi個結合した軽鎖:Li)及び重鎖(薬物がi個結合した重鎖:Hi)は、結合した薬物の数に比例して疎水性が増し保持時間が大きくなることから、L0、L0及びH0との保持時間比較により検出ピークをL0、L1、H0、H1、H2、H3のいずれかに割り当てることができる。
F-3-2 薬物リンカーにUV吸収があるため、薬物リンカーの結合数に応じて、軽鎖、重鎖及び薬物リンカーのモル吸光係数を用いて下式に従ってピーク面積値の補正を行う。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000004
 ここで、各抗体における軽鎖及び重鎖のモル吸光係数(280nm)は、既知の計算方法(Protein Science, 1995, vol.4, 2411-2423)によって、各抗体の軽鎖及び重鎖のアミノ酸配列から推定される値を使用した(下記表2参照)。
F-3-3 ピーク面積補正値合計に対する各鎖ピーク面積比(%)を下式に従って計算した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-I000005
F-3-4 抗体-薬物コンジュゲートにおける抗体一分子あたりの薬物平均結合数を、下式に従って計算した。
 薬物平均結合数=(L0ピーク面積比x0+L1ピーク面積比x1+H0ピーク面積比x0+H1ピーク面積比x1+H2ピーク面積比x2+H3ピーク面積比x3)/100x2
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000006
7)-1 MhM1018-M1-DXd-ADCの合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000007
工程1:抗体-薬物コンジュゲート(1)
 抗体の還元:実施例13にて作製したMhM1018-M1を、共通操作B及びC-1を用いて、PBS6.0/EDTAにて10mg/mLに調製した。本溶液(1.45mL)に1Mリン酸水素二カリウム水溶液(Nacalai Tesque,Inc.;0.0218mL)及び、10mM TCEP(東京化成工業株式会社)水溶液(0.0581mL;抗体一分子に対して6.0当量)を加えた。37℃で2時間インキュベートすることによって、抗体内鎖間部のジスルフィド結合を還元した。
 抗体と薬物リンカーのコンジュゲーション:上記溶液を15℃で10分間インキュベートした。次いでリンカー1の10mM ジメチルスルホキシド溶液(0.0969mL;抗体一分子に対して10当量)を加え、15℃で1時間インキュベートし、薬物リンカーを抗体へ結合させた。次に、100mM NAC(Sigma-Aldrich Co.LLC)水溶液(0.0097mL;抗体一分子に対して10当量)を加え撹拌後、さらに室温にて20分間静置し、薬物リンカーの反応を停止させた。
 精製:上記溶液を、共通操作Dによる精製を行い、標記抗体-薬物コンジュゲート「MhM1018-M1-DXd-ADC」を含有する溶液を7mL得た。
 特性評価:共通操作E及びFを使用して、下記の特性値を得た。
抗体濃度:1.75mg/mL,抗体収量:12.27mg(83%)
抗体一分子あたりの薬物平均結合数(n):7.4。
7)-2 MhM1019-M1-DXd-ADCの合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000008
工程1:抗体-薬物コンジュゲート(2)
 実施例13にて作製したMhM1019-M1(280nm吸光係数として1.66mLmg-1cm-1を使用)を1.50mL用いて、実施例7)-1工程1と同様の方法により、標記抗体-薬物コンジュゲート「MhM1019-M1-DXd-ADC」を得た。
 特性評価:共通操作E及びFを使用して、下記の特性値を得た。
 抗体濃度:1.85mg/mL,抗体収量:12.94mg(87%)抗体一分子あたりの薬物平均結合数(n):7.3。
7)-3 MhM1020-M1-DXd-ADCの合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000009
工程1:抗体-薬物コンジュゲート(3)
 実施例13にて作製したMhM1020-M1(280nm吸光係数として1.66mLmg-1cm-1を使用)を1.44mL用いて、実施例7)-1工程1と同様の方法により、標記抗体-薬物コンジュゲート「MhM1020-M1-DXd-ADC」を得た。
 特性評価:共通操作E及びFを使用して、下記の特性値を得た。
 抗体濃度:1.40mg/mL,抗体収量:9.79mg(67%),抗体一分子あたりの薬物平均結合数(n):7.7。
7)-4 MhM1021-M1-DXd-ADCの合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000010
工程1:抗体-薬物コンジュゲート(4)
 実施例13にて作製したMhM1021-M1(280nm吸光係数として1.66mLmg-1cm-1を使用)を1.43mL用いて、実施例7)-1工程1と同様の方法により、標記抗体-薬物コンジュゲート「MhM1021-M1-DXd-ADC」を得た。
 特性評価:共通操作E及びFを使用して、下記の特性値を得た。
 抗体濃度:1.44mg/mL,抗体収量:10.10mg(69%)、抗体一分子あたりの薬物平均結合数(n):7.8。
7)-5 MhM1022-M1-DXd-ADCの合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000011
工程1:抗体-薬物コンジュゲート(5)
 実施例13にて作製したMhM1022-M1(280nm吸光係数として1.66mLmg-1cm-1を使用)を1.51mL用いて、実施例7)-1工程1と同様の方法により、標記抗体-薬物コンジュゲート「MhM1022-M1-DXd-ADC」を得た。
 特性評価:共通操作E及びFを使用して、下記の特性値を得た。
抗体濃度:1.52mg/mL,抗体収量:10.62mg(69%)、抗体一分子あたりの薬物平均結合数(n):7.7。
7)-6 MhM1023-M1-DXd-ADCの合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000012
工程1:抗体-薬物コンジュゲート(6)
 実施例13にて作製したMhM1023-M1(280nm吸光係数として1.66mLmg-1cm-1を使用)を1.36mL用いて、実施例7)-1工程1と同様の方法により、標記抗体-薬物コンジュゲート「MhM1023-M1-DXd-ADC」を得た。
 特性評価:共通操作E及びFを使用して、下記の特性値を得た。
 抗体濃度:1.76mg/mL,抗体収量:12.32mg(89%),抗体一分子あたりの薬物平均結合数(n):7.8。
7)-7 MHT3423-PBD-ADCの合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000013
i ) EndoS酵素
ii ) EndoS(D233Q/Q303L)酵素,糖鎖オキサゾリン
 上記糖鎖改変抗体のN297糖鎖は、非還元末端のシアル酸にアジド基を導入したMSG1型糖鎖(WO2019/065964号)を示す(図8)。
工程1:(Fuca1,6)GlucNAc-MHT3423抗体の調製
 実施例6で調製したMHT3423抗体溶液を、共通操作C-2に従いリン酸緩衝溶液(50mM,pH6.0)(以下PB6.0)にバッファー交換し、19.4mg/mL(1.15mL)に調製した。この溶液にEndoS溶液(PBS、7.52mg/mL)を0.0148mL加え、37℃で2時間インキュベートした。Agilent 2100 バイオアナライザを用いて糖鎖が切断されたことを確認した後、GSTおよびProteinAカラム(AKTA)で精製した。目的物のフラクションをPB6.0に置換し、(Fuca1,6)GlucNAc-MHT3423抗体(19.3mg/mL,0.995mL)を得た。
工程2:糖鎖改変MHT3423抗体の調製
 上記工程1にて得られた(Fuca1,6)GlucNAc-MHT3423抗体(PB6.0)(19.3mg/mL,0.995mL) に、糖鎖オキサゾリン(3aR,5R,6S,7R,7aR)-3a,6,7,7a-Tetrahydro-7-hydroxy-5-(hydroxymethyl)-2-methyl-5H-pyrano[3,2-d]oxazol-6-yl O-[N5-acetyl-N1-[2-[2-[2-(2-azidoethoxy)ethoxy]ethoxy]ethyl]-α-neuraminamidosyl]-(2→6)-O-β-D-galactopyranosyl-(1→4)-O-2-(acetylamino)-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl-(1→2)-O-α-D-mannopyranosyl-(1→3)-O-[O-β-D-galactopyranosyl-(1→4)-O-2-(acetylamino)-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl-(1→2)-α-D-mannopyranosyl-(1→6)]-β-D-mannopyranoside (WO2019/065964号 実施例56、以下[N3-PEG(3)]-MSG1-Ox)(図8)溶液(PB6.0)(50.0mg/mL,0.0578mL)と、GST-EndoS D233Q/Q303L溶液(WO2017/010559号)(PBS)(4.80mg/mL,0.0800mL)を加え、30℃で3時間インキュベートした。Agilent 2100 バイオアナライザで糖鎖の転移を確認後、GSTおよびCHTカラム(AKTA)にて精製した。目的物を含むフラクションを 10mM酢酸緩衝溶液,5(w/v)%ソルビトールpH5.5(以下ABS)に置換し、糖鎖改変MHT3423抗体(9.99mg/mL,1.56mL)を得た。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000014
iii ) リンカー2
工程3:抗体と薬物リンカーのコンジュゲーション
 上記工程2にて得られた糖鎖改変MHT3423(ABS)(9.99mg/mL,0.500mL)に、室温にて1,2-プロパンジオール(0.480mL)、リンカー2の10mMジメチルスルホキシド溶液(0.0197mL;抗体1分子に対して6当量)を加え、チューブローテーター(MTR-103、アズワン株式会社)を用いて、室温にて48時間反応させた。
精製操作:上記溶液を共通操作Dで2回精製し、MHT3423-PBD-ADC溶液溶液を2.50mL得た。
特性評価:共通操作E,Fを用いて下記の特性値を得た。
抗体濃度:1.59mg/mL,抗体収量:3.97mg(79%),抗体一分子あたりの薬物平均結合数(n):1.8
7)-8 MHT3201-PBD-ADCの合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000015
i)EndoS酵素
ii)EndoS(D233Q/Q303L)酵素,糖鎖オキサゾリン
 上記糖鎖改変抗体のN297糖鎖は、非還元末端のシアル酸にアジド基を導入したMSG1型糖鎖(WO2019/065964号)を示す(図8)。
工程1:(Fucα1,6)GlcNAc-MHT3201抗体の調製
 実施例6で調製したMHT3201抗体溶液をPB6.0でバッファー交換し、ca.20.2mg/mL(1.43mL)に調製した。上記実施例7)-7工程1と同様の操作を行い、(Fucα1,6)GlcNAc-MHT3201抗体溶液(PB6.0)(19.4mg/mL,1.27mL)を得た。
工程2:糖鎖改変MHT3201の調製
 上記工程1で得られた(Fucα1,6)GlcNAc-MHT3201抗体溶液(PB6.0) (19.4mg/mL,1.27mL)を用いて、実施例7)-7工程2と同様の操作を行うことによって、糖鎖改変MHT3201抗体(ABS)(9.96 mg/mL, 1.72mL)を得た。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000016
iii ) リンカー2
工程3:抗体と薬物リンカーのコンジュゲーション 
 上記工程2で得られた糖鎖改変MHT3201 (ABS)(9.96 mg/mL,0.500mL)を用いて、実施例7)-7工程3と同様の操作によりMHT3201-PBD-ADC溶液溶液(ABS)を2.50mL得た。
特性評価:共通操作E,Fを用いて下記の特性値を得た。
 抗体濃度:1.41mg/mL,抗体収量:3.52mg(71%),抗体一分子あたりの薬物平均結合数(n):1.9
7)-9 MHT3202-PBD-ADCの合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000017
i)EndoS酵素
ii)EndoS(D233Q/Q303L)酵素,糖鎖オキサゾリン
 上記糖鎖改変抗体のN297糖鎖は、非還元末端のシアル酸にアジド基を導入したMSG1型糖鎖(WO2019/065964号)を示す(図8)。
工程1:(Fucα1,6)GlcNAc-MHT3202抗体の調製
 実施例6で調製したMHT3202抗体溶液をPB6.0でバッファー交換し、ca.19.8mg/mL(1.12mL)に調製した。上記実施例7)-7工程1と同様の操作を行い、(Fucα1,6)GlcNAc-MHT3202抗体溶液(PB6.0)(20.5mg/mL、0.959mL)を得た。
工程2:糖鎖改変MHT3202抗体の調製
 上記工程1で得られた(Fucα1,6)GlcNAc-MHT3202抗体溶液(PB6.0)(20.5mg/mL、0.959mL)を用いて、実施例7)-7工程2と同様の操作を行うことによって、糖鎖改変MHT3202抗体(ABS)(9.93 mg/mL,1.74mL)を得た。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000018
iii ) リンカー2
工程3:抗体と薬物リンカーのコンジュゲーション 
 上記工程2で得られた糖鎖改変MHT3202(ABS)(9.93 mg/mL,0.500mL)を用いて、実施例7)-7工程3と同様の操作を行うことによって、MHT3202-PBD-ADC溶液(ABS)を2.50mL得た。
特性評価:共通操作E,Fを用いて下記の特性値を得た。
 抗体濃度:1.51mg/mL,抗体収量:3.77mg(76%),抗体一分子あたりの薬物平均結合数(n):1.8
7)-10 MHT3203-PBD-ADCの合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000019
i)EndoS酵素
ii)EndoS(D233Q/Q303L)酵素,糖鎖オキサゾリン
 上記糖鎖改変抗体のN297糖鎖は、非還元末端のシアル酸にアジド基を導入したMSG1型糖鎖(WO2019/065964号)を示す(図8)。
工程1:(Fucα1,6)GlcNAc-MHT3203抗体の調製
 実施例6で調製したMHT3203抗体溶液をPB6.0でバッファー交換し、ca.19.1mg/mL(1.29mL)に調製した。上記実施例7)-7工程1と同様の操作を行い、(Fucα1,6)GlcNAc-MHT3203抗体溶液(PB6.0)(19.8mg/mL、0.969mL)を得た。
工程2:糖鎖改変MHT3203抗体の調製
 上記工程1で得られた(Fucα1,6)GlcNAc-MHT3203抗体溶液(PB6.0)(19.8mg/mL、0.969mL)を用いて、実施例7)-7工程2と同様の操作を行うことによって、糖鎖改変MHT3203抗体(PB6.0)(9.77 mg/mL, 1.77mL)を得た。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000020
iii ) リンカー2
工程3:抗体と薬物リンカーのコンジュゲーション
 上記工程2で得られた糖鎖改変MHT3203(ABS)(9.77 mg/mL,0.500mL)を用いて、実施例7)-7工程3と同様の操作を行うことによって、MHT3203-PBD-ADCの溶液(ABS)を2.50mL得た。
特性評価:共通操作E,Fを用いて下記の特性値を得た。
 抗体濃度:1.49mg/mL,抗体収量:3.73mg(76%),抗体一分子あたりの薬物平均結合数(n):1.8
7)-11 MHT1008-PBD-ADCの合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000021
i)EndoS酵素
ii)EndoS(D233Q/Q303L)酵素,糖鎖オキサゾリン
 上記糖鎖改変抗体のN297糖鎖は、非還元末端のシアル酸にアジド基を導入したMSG1型糖鎖(WO2019/065964号)を示す(図8)。
工程1:(Fucα1,6)GlcNAc-MHT1008抗体の調製
 実施例4で調製したMHT1008抗体溶液をPB6.0でバッファー交換し、ca.16.6mg/mL(0.880mL)に調製した。上記実施例7)-7工程1と同様の操作を行い、(Fucα1,6)GlcNAc-MHT1008抗体溶液(PB6.0)(16.8mg/mL、0.800mL)を得た。
工程2:糖鎖改変MHT1008抗体の調製
 上記工程1で得られた16.8mg/mL(Fucα1,6)GlcNAc-MHT1008抗体溶液(PB6.0)(0.800mL)を用いて、実施例7)-7工程2と同様の操作を行うことによって、糖鎖改変MHT1008抗体(ABS)(11.4 mg/mL, 1.00mL)を得た。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000022
iii ) リンカー2
工程3:抗体と薬物リンカーのコンジュゲーション
 上記工程2で得られた糖鎖改変MHT1008抗体(ABS)(11.4 mg/mL, 0.450mL)を用いて、実施例7)-7工程3と同様の操作を行うことによって、MHT1008-PBD-ADCの溶液(ABS)を2.50mL得た。
特性評価:共通操作E,Fを用いて下記の特性値を得た。
 抗体濃度:1.55mg/mL,抗体収量:3.87mg(77%),抗体一分子あたりの薬物平均結合数(n):1.9
7)-12 MHT3219-PBD-ADCの合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000023
i)EndoS酵素
ii)EndoS(D233Q/Q303L)酵素,糖鎖オキサゾリン
 上記糖鎖改変抗体のN297糖鎖は、非還元末端のシアル酸にアジド基を導入したMSG1型糖鎖(WO2019/065964号)を示す(図8)。
工程1:(Fucα1,6)GlcNAc-MHT3219抗体の調製
 実施例21で調製したMHT3219抗体溶液をPB6.0でバッファー交換し、ca.15.0mg/mL(1.70mL)に調製した。上記実施例7)-7工程1と同様の操作を行い、(Fucα1,6)GlcNAc-MHT3219抗体溶液(PB6.0)(17.9mg/mL、1.30mL)を得た。
工程2:糖鎖改変MHT3219抗体の調製
 上記工程1で得られた17.9mg/mL(Fucα1,6)GlcNAc-MHT3219抗体溶液(PB6.0)(1.30mL)を用いて、実施例7)-7工程2と同様の操作を行うことによって、糖鎖改変MHT3219抗体(ABS)(9.90mg/mL,2.10mL)を得た。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000024
iii ) リンカー2
工程3:抗体と薬物リンカーのコンジュゲーション
 上記工程2で得られた糖鎖改変MHT3219抗体(ABS)(9.90mg/mL, 0.50mL)を用いて、実施例7)-7工程3と同様の操作を行うことによって、MHT3219-PBD-ADCの溶液(ABS)を3.50mL得た。
特性評価:共通操作E,Fを用いて下記の特性値を得た。
 抗体濃度:0.90mg/mL,抗体収量:3.13mg(63%),抗体一分子あたりの薬物平均結合数(n):1.9
7)-13 MHT5082-PBD-ADCの合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000025
i)EndoS酵素
ii)EndoS(D233Q/Q303L)酵素,糖鎖オキサゾリン
 上記糖鎖改変抗体のN297糖鎖は、非還元末端のシアル酸にアジド基を導入したMSG1型糖鎖(WO2019/065964号)を示す(図8)。
工程1:(Fucα1,6)GlcNAc-MHT5082抗体の調製
 実施例22で調製したMHT5082抗体溶液をPB6.0でバッファー交換し、ca.15.8mg/mL(1.50mL)に調製した。上記実施例7)-7工程1と同様の操作を行い、(Fucα1,6)GlcNAc-MHT5082抗体溶液(PB6.0)(12.5mg/mL、1.4mL)を得た。
工程2:糖鎖改変MHT5082抗体の調製
 上記工程1で得られた12.5mg/mL(Fucα1,6)GlcNAc-MHT5082抗体溶液(PB6.0)(1.40mL)を用いて、実施例7)-7工程2と同様の操作を行うことによって、糖鎖改変MHT5082抗体(ABS)(9.10mg/mL,1.20 mL)を得た。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000026
iii ) リンカー2
工程3:抗体と薬物リンカーのコンジュゲーション
 上記工程2で得られた糖鎖改変MHT5082抗体(ABS)(9.10mg/mL,0.60mL)を用いて、実施例7)-7工程3と同様の操作を行うことによって、MHT5082-PBD-ADCの溶液(ABS)を3.0mL得た。
特性評価:共通操作E,Fを用いて下記の特性値を得た。
 抗体濃度:0.57mg/mL,抗体収量:2.00mg(37%),抗体一分子あたりの薬物平均結合数(n):1.8
7)-14 MHT5085-PBD-ADCの合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000027
i)EndoS酵素
ii)EndoS(D233Q/Q303L)酵素,糖鎖オキサゾリン
 上記糖鎖改変抗体のN297糖鎖は、非還元末端のシアル酸にアジド基を導入したMSG1型糖鎖(WO2019/065964号)を示す(図8)。
工程1:(Fucα1,6)GlcNAc-MHT5085抗体の調製
 実施例22で調製したMHT5085抗体溶液をPB6.0でバッファー交換し、ca.15.3mg/mL(1.50mL)に調製した。上記実施例7)-7工程1と同様の操作を行い、(Fucα1,6)GlcNAc-MHT5085抗体溶液(PB6.0)(11.0mg/mL、1.40mL)を得た。
工程2:糖鎖改変MHT5085抗体の調製
 上記工程1で得られた11.0mg/mL(Fucα1,6)GlcNAc-MHT5085抗体溶液(PB6.0)(1.40mL)を用いて、実施例7)-7工程2と同様の操作を行うことによって、糖鎖改変MHT5085抗体(ABS)(9.20mg/mL,1.20mL)を得た。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000028
iii ) リンカー2
工程3:抗体と薬物リンカーのコンジュゲーション
 上記工程2で得られた糖鎖改変MHT5085抗体(ABS)(9.20mg/mL,0.60mL)を用いて、実施例7)-7工程3と同様の操作を行うことによって、MHT5085-PBD-ADCの溶液(ABS)を3.50mL得た。
特性評価:共通操作E,Fを用いて下記の特性値を得た。
 抗体濃度:1.38mg/mL,抗体収量:4.90mg(89%),抗体一分子あたりの薬物平均結合数(n):1.8
7)-15 MHT5086-PBD-ADCの合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000029
i)EndoS酵素
ii)EndoS(D233Q/Q303L)酵素,糖鎖オキサゾリン
 上記糖鎖改変抗体のN297糖鎖は、非還元末端のシアル酸にアジド基を導入したMSG1型糖鎖(WO2019/065964号)を示す(図8)。
工程1:(Fucα1,6)GlcNAc-MHT5086抗体の調製
 実施例22で調製したMHT5086抗体溶液をPB6.0でバッファー交換し、ca.15.7mg/mL(1.50mL)に調製した。上記実施例7)-7工程1と同様の操作を行い、(Fucα1,6)GlcNAc-MHT5086抗体溶液(PB6.0)(15.0mg/mL、1.20mL)を得た。
工程2:糖鎖改変MHT5086抗体の調製
 上記工程1で得られた15.0mg/mL(Fucα1,6)GlcNAc-MHT5086抗体溶液(PB6.0)(1.20mL)を用いて、実施例7)-7工程2と同様の操作を行うことによって、糖鎖改変MHT5086抗体(ABS)(10.5mg/mL,1.20mL)を得た。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000030
iii ) リンカー2
工程3:抗体と薬物リンカーのコンジュゲーション
 上記工程2で得られた糖鎖改変MHT5086抗体(ABS)(10.5mg/mL,0.60mL)を用いて、実施例7)-7工程3と同様の操作を行うことによって、MHT5086-PBD-ADCの溶液(ABS)を3.50mL得た。
特性評価:共通操作E,Fを用いて下記の特性値を得た。
 抗体濃度:1.55mg/mL,抗体収量:5.11mg(81%),抗体一分子あたりの薬物平均結合数(n):1.8
7)-16 MHT5093-PBD-ADCの合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000031
i)EndoS酵素
ii)EndoS(D233Q/Q303L)酵素,糖鎖オキサゾリン
 上記糖鎖改変抗体のN297糖鎖は、非還元末端のシアル酸にアジド基を導入したMSG1型糖鎖(WO2019/065964号)を示す(図8)。
工程1:(Fucα1,6)GlcNAc-MHT5093抗体の調製
 実施例22で調製したMHT5093抗体溶液をPB6.0でバッファー交換し、ca.13.4mg/mL(1.50mL)に調製した。上記実施例7)-7工程1と同様の操作を行い、(Fucα1,6)GlcNAc-MHT5093抗体溶液(PB6.0)(15.3mg/mL、1.10mL)を得た。
工程2:糖鎖改変MHT5093抗体の調製
 上記工程1で得られた15.3mg/mL(Fucα1,6)GlcNAc-MHT5093抗体溶液(PB6.0)(1.10mL)を用いて、実施例7)-7工程2と同様の操作を行うことによって、糖鎖改変MHT5093抗体(ABS)(10.9mg/mL,1.20mL)を得た。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000032
iii ) リンカー2
工程3:抗体と薬物リンカーのコンジュゲーション
 上記工程2で得られた糖鎖改変MHT5093抗体(ABS)(10.9mg/mL,0.60mL)を用いて、実施例7)-7工程3と同様の操作を行うことによって、MHT5093-PBD-ADCの溶液(ABS)を3.50mL得た。
特性評価:共通操作E,Fを用いて下記の特性値を得た。
 抗体濃度:1.56mg/mL,抗体収量:5.32mg(81%),抗体一分子あたりの薬物平均結合数(n):1.9
7)-17 MHT5094-PBD-ADCの合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000033
i)EndoS酵素
ii)EndoS(D233Q/Q303L)酵素,糖鎖オキサゾリン
 上記糖鎖改変抗体のN297糖鎖は、非還元末端のシアル酸にアジド基を導入したMSG1型糖鎖(WO2019/065964号)を示す(図8)。
工程1:(Fucα1,6)GlcNAc-MHT5094抗体の調製
 実施例22で調製したMHT5094抗体溶液をPB6.0でバッファー交換し、ca.13.9mg/mL(1.50mL)に調製した。上記実施例7)-7工程1と同様の操作を行い、(Fucα1,6)GlcNAc-MHT5094抗体溶液(PB6.0)(15.8mg/mL、1.10mL)を得た。
工程2:糖鎖改変MHT5094抗体の調製
 上記工程1で得られた15.8mg/mL(Fucα1,6)GlcNAc-MHT5094抗体溶液(PB6.0)(1.10mL)を用いて、実施例7)-7工程2と同様の操作を行うことによって、糖鎖改変MHT5094抗体(ABS)(9.10mg/mL,1.20mL)を得た。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000034
iii ) リンカー2
工程3:抗体と薬物リンカーのコンジュゲーション
 上記工程2で得られた糖鎖改変MHT5094抗体(ABS)(9.10mg/mL,0.60mL)を用いて、実施例7)-7工程3と同様の操作を行うことによって、MHT5094-PBD-ADCの溶液(ABS)を3.50mL得た。
特性評価:共通操作E,Fを用いて下記の特性値を得た。
 抗体濃度:1.37mg/mL,抗体収量:4.41mg(81%),抗体一分子あたりの薬物平均結合数(n):1.9
7)-18 MHT5095-PBD-ADCの合成
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000035
i)EndoS酵素
ii)EndoS(D233Q/Q303L)酵素,糖鎖オキサゾリン
 上記糖鎖改変抗体のN297糖鎖は、非還元末端のシアル酸にアジド基を導入したMSG1型糖鎖(WO2019/065964号)を示す(図8)。
工程1:(Fucα1,6)GlcNAc-MHT5095抗体の調製
 実施例22で調製したMHT5095抗体溶液をPB6.0でバッファー交換し、ca.12.4mg/mL(1.50mL)に調製した。上記実施例7)-7工程1と同様の操作を行い、(Fucα1,6)GlcNAc-MHT5095抗体溶液(PB6.0)(15.6mg/mL、1.10mL)を得た。
工程2:糖鎖改変MHT5095抗体の調製
 上記工程1で得られた15.6mg/mL(Fucα1,6)GlcNAc-MHT5095抗体溶液(PB6.0)(1.10mL)を用いて、実施例7)-7工程2と同様の操作を行うことによって、糖鎖改変MHT5095抗体(ABS)(10.5mg/mL,1.20mL)を得た。
Figure JPOXMLDOC01-appb-C000036
iii ) リンカー2
工程3:抗体と薬物リンカーのコンジュゲーション
 上記工程2で得られた糖鎖改変MHT5095抗体(ABS)(10.5mg/mL,0.60mL)を用いて、実施例7)-7工程3と同様の操作を行うことによって、MHT5095-PBD-ADCの溶液(ABS)を3.50mL得た。
特性評価:共通操作E,Fを用いて下記の特性値を得た。
 抗体濃度:1.52mg/mL,抗体収量:5.18mg(82%),抗体一分子あたりの薬物平均結合数(n):1.9
(実施例8) 抗TROP2マスク抗体-薬物コンジュゲートのin vivo薬効試験
 抗体-薬物コンジュゲートの抗腫瘍効果は、TROP2陽性ヒト腫瘍細胞株の細胞を免疫不全マウスに移植した動物モデルを用いて評価した。4-5週齢のBALB/c ヌードマウス(CAnN.Cg-Foxn1[nu]/CrlCrlj[Foxn1nu/Foxn1nu]、日本チャールス・リバー)を実験使用前にSPF条件化で3日間以上馴化した。マウスには滅菌した固形飼料(FR-2,Funabashi Farms Co.,Ltd)を給餌し、滅菌した水道水(5-15ppm次亜塩素酸ナトリウム溶液を添加して調製)を与えた。移植した腫瘍の長径及び短径を電子式デジタルノギス(CD-15CX,Mitutoyo Corp.)で1週間に2回測定し、以下に示す計算式により腫瘍体積を算出した。
腫瘍体積(mm)=1/2×長径(mm)×[短径(mm)]
 抗体-薬物コンジュゲートは全てABSバッファー(10mM-Acetate Buffer, 5(w/v)% Sorbitol, pH5.5)(NACALAI)で希釈し、10mL/kgの液量を尾静脈内投与した。また、コントロール群(Vehicle群)としてABSバッファーを同様に投与した。1群あたり6匹のマウスを実験に用いた。
8)-1 抗腫瘍効果(1)
 TROP2陽性ヒト肺粘液性類表皮癌細胞株NCI-H292(ATCC)を生理食塩水に懸濁、5×10cellsを雌ヌードマウスの右側腹部に皮下移植し(Day0)、Day11に無作為に群分けを実施した。群分け実施日に、実施例7で作製した抗体-薬物コンジュゲート5種(クローン名は、MHT1008-PBD-ADC、MHT3423-PBD-ADC、MHT3201-PBD-ADC、MHT3202-PBD-ADC、MHT3203-PBD-ADC)を0.4mg/kgの用量で尾静脈内投与した。結果を図9(A)に示す。横軸は日数、縦軸は腫瘍体積、誤差範囲はSE値を示す。
 uPA基質とCAPN基質の両方を搭載したMHT3202-PBD-ADC及びMHT3203-PBD-ADCはuPA基質のみを搭載したMHT3423-PBD-ADC及びCAPN基質のみを搭載したMHT3201-PBD-ADCよりも強い抗腫瘍効果を発揮した。
8)-2 抗腫瘍効果(2)
 TROP2陽性ヒト咽頭癌細胞株FaDu(ATCC)を生理食塩水に懸濁、3×10cellsを雌ヌードマウスの右側腹部に皮下移植し(Day0)、Day10に無作為に群分けを実施した。群分け実施日に、実施例7で作製した抗体-薬物コンジュゲート5種(クローン名は、MHT1008-PBD-ADC、MHT3423-PBD-ADC、MHT3201-PBD-ADC、MHT3202-PBD-ADC、MHT3203-PBD-ADC)を0.4mg/kgの用量で尾静脈内投与した。結果を図9(B)に示す。横軸は日数、縦軸は腫瘍体積、誤差範囲はSE値を示す。
 uPA基質とCAPN基質の両方を搭載したMHT3202-PBD-ADC及びMHT3203-PBD-ADCはuPA基質のみを搭載したMHT3423-PBD-ADC及びCAPN基質のみを搭載したMHT3201-PBD-ADCよりも強い抗腫瘍効果を発揮した。
(実施例9) 抗CD98抗体hM23H1L1の結合活性評価
 WO2015/146132号に記載の公知の抗CD98抗体hM23H1L1(重鎖配列(図43、配列番号18)、軽鎖配列(図44、配列番号19))を実施例1)-1と同様の方法で調製し、ヒトCD98抗原に対する結合活性をELISAで評価した。
 96ウェルMaxi-sorp plate(Black、Nunc社)にPBSで1μg/mLに希釈したNeutrAvidin(Thermo Fisher Scientific社)を50μLずつ添加し、4℃で一晩固相化した。Tween-20(バイオ・ラッド社)を0.05(w/v)%含むPBS(ELISAバッファー)で3回洗浄後、Blocker Casein(Thermo Fisher Scientific社)でブロッキングした。ELISAバッファーで洗浄後、PBSで1μg/mLに希釈したビオチン化ヒトCD98抗原(アクセション番号:P08195。細胞外ドメインを当業者公知の手法で精製後、EZ-Link NHS-PEG4-Bioin(Thermo Fisher Scientific社)でビオチン化した。)を50μLずつ添加して30分室温で振とうした。ELISAバッファーで洗浄後、ELISAバッファーで調製した抗CD98抗体hM23H1L1を50μLずつ添加して30分室温で振とうした。ELISAバッファーで洗浄後、ELISAバッファーで2500倍に希釈したHorseradish peroxidase(HRP)標識抗ヒトIgG抗体(Jackson Immuno Research Laboratories社)を50μL添加し、30分室温で振とうした。ELISAバッファーで洗浄後、SuperSignal Pico ELISA Chemiluminescent substrate(Thermo Fisher Scientific社)を添加し、10分後の化学発光をプレートリーダーで測定した。図10に示すように、hM23H1L1は濃度依存的にヒトCD98抗原に結合した。
(実施例10) 抗CD98抗体hM23H1L1に結合するミモトープペプチドの濃縮
 完全ランダムな15アミノ酸から構成されるペプチドライブラリー(Linear 15mer lib)または、中央付近に芳香族性アミノ酸とProの繰り返しモチーフをもつリボソームディスプレイ用のペプチドライブラリー(ZPZP lib)を構築し、hM23H1L1へ結合可能なペプチドを濃縮した(図11(A))。最初に、EZ-Link NHS-PEG4-Bioin(Thermo Fisher Scientific社)でビオチン化したヒト血清由来IgG(Sigma-Aldrich社)を固相化したDynabeads Streptavidin M-280(Thermo Fisher Scientific社)およびDynabeads Protein A(Thermo Fisher Scientific社)に対してRDを添加し、ヒト血清由来IgGやProtein Aと反応させた。結合しなかったRDをマグネットスタンド(DynaMag‐2、Thermo Fisher Scientific社)を用いて回収後、hM23H1L1を結合させたDynabeads Protein Aと反応させた。マグネットスタンドを用いた洗浄操作によりhM23H1L1に結合しなかったRDを除去し、hM23H1L1に結合したRDからmRNAを精製た。その後、RT-PCRおよびインビトロ翻訳によりRDを再度調製した。このパニング操作を3回実施した。
 パニング3ラウンド後のmRNAをインビトロ翻訳してRDを調製後、hM23H1L1またはヒト血清由来IgGが固相化されたDynabeads Protein Aとそれぞれ反応させた(インプット量:6×1011)。マグネットスタンドを用いた洗浄操作により結合しなかったRDを除去後、結合したRDからmRNAを回収し、RT-qPCRにより、回収量(アウトプット)を定量評価した。図11(B)に示すように、Linear 15mer libおよびZPZP libの両ペプチドライブラリーに関して、hM23H1L1を固相した条件では、ヒト血清IgGを固相した条件と比較して約200倍多くmRNAが回収された。この結果から、hM23H1L1に特異的に結合するペプチドの濃縮が示唆された。
(実施例11) 抗CD98マスク抗体の調製・結合活性評価
 実施例3と同様にパニング由来のランダムペプチドを抗CD98 scFvに融合し、抗CD98抗体の結合を阻害可能なミモトープペプチドを選抜した。Linear 15mer libおよびZPZP libからそれぞれ選抜したミモトープペプチドおよびMMP切断リンカー(実施例3)-1参照)を融合した抗CD98マスク抗体MhM1008(表3、図45、配列番号20)、MhM1013(表3、図46,配列番号21)の発現ベクターを当業者公知の方法で構築し、各抗体の軽鎖発現ベクターをhM23H1L1の重鎖発現ベクターと組合せ実施例1)-1と同様の方法でExpi293F細胞の培養上清よりマスク抗体を精製し、蛋白質濃度を決定した。調製したマスク抗体は軽鎖発現ベクター名と対応させ、MhM1008、MhM1013と命名した(表3)。
 以下に記載する部分を除き、実施例4、実施例9と同様の方法でMMP1添加条件、非添加条件におけるヒトCD98抗原に対する結合活性をELISAで評価した。プロテアーゼ添加条件では、3μMの抗体に対して500nMのMMP1を添加し、37℃で反応後、ELISAバッファーで濃度調整した抗体をヒトCD98抗原の固定されたウェルに添加した。プロテアーゼ非添加条件でも同様に、ELISAバッファーで調製した抗体を各ウェルに添加した。
 図12-1(A)に示すように、ミモトープペプチドを融合していないhM23H1L1はMMP1添加条件において濃度依存的にヒトCD98抗原に結合した。また、ミモトープペプチドを融合したMhM1008およびMhM1013は、MMP1添加条件においてhM23H1L1と同様の結合活性を示した。その一方で、MMP1非添加条件におけるMhM1008およびMhM1013の結合活性は、MMP1添加条件における結合活性よりもそれぞれ低下しており、マスク効果が示された(図12-1(B)、図12-2(C))。MhM1008およびMhM1013の結合のEC50比(MMP1非添加条件/MMP1添加条件)はそれぞれ132、326だった。
 取得したペプチドがミモトープであることを確認するために、マスクペプチドとMMP切断リンカー(実施例3)-1参照)を含むMhM1013のFab領域を当業者公知の方法で調製し、当該Fab領域の結晶化およびX線結晶構造解析を行った。その結果、該ペプチドはhM23H1L1のCDR領域に結合していることが示された(データ示さず)。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000037
(実施例12) 異なる親和性を有する抗CD98抗体のマスキング効果
12)-1 抗CD98マスク抗体の結合親和性評価
 Biacore T200を用い、固定化した抗Human IgG(Fc)抗体へ抗CD98抗体(hM23H1L1または、H鎖CDR1に点変異を導入したhM23-M1(表3、重鎖配列(図47、配列番号22)、軽鎖配列(図48、配列番号23))をリガンドとして捕捉(キャプチャー)し、CD98抗原をアナライトとして測定した。抗Human IgG(Fc)抗体(Human antibody Capture kit、Cytiva社)はSensor Chip CM5(Cytiva社)へ、キット説明書に従い固定化させた。HBS-EP+(Cytiva社)で2μg/mLに希釈した評価する各抗CD98抗体を5μL/minで60秒間接触させて固定化した。その後、HBS-EP+で希釈した複数濃度のCD98抗原をアナライトとして各サンプルを流速30μL/minで90秒間添加し、250秒間乖離を測定するマルチサイクルカイネティクス解析によりKを算出した。図13(A)に示すように、hM23H1L1およびhM23-M1の結合親和性(K)はそれぞれ0.58nM、10.3nMだった。
12)-2 抗CD98マスク抗体のマスキング効果評価
 MhM1013および、hM23-M1の重鎖とMhM1013の軽鎖をもつMhM1013-M1(表3)を調製し、以下に記載する部分を除き、実施例11と同様の方法でMMP1添加条件、非添加条件におけるヒトCD98抗原に対する結合活性をELISAで評価した。プロテアーゼ添加条件では、2μMの抗体に対して200nMのMMP1を添加し、37℃で反応後、MMPバッファーで濃度調整した抗体をヒトCD98抗原の固定されたウェルに添加した。プロテアーゼ非添加条件でも同様に、MMPバッファーで調製した抗体を各ウェルに添加した。
 図13(B)に示すように、ミモトープペプチドを融合したMhM1013およびMhM1013-M1は、MMP1添加条件でMMP1非添加条件よりも強い結合活性を示した。MhM1013およびMhM1013-M1の結合のEC50比(MMP1非添加条件/MMP1添加条件)はそれぞれ239、552だった。
(実施例13) ADC化に供される抗CD98抗体の調製・結合活性評価
 細胞内プロテアーゼであるCAPNの基質配列と、細胞外プロテアーゼであるuPAの基質配列を組合せることで、uPA基質のみを搭載した場合と比較して、マスク抗体の結合活性を向上させられるか検証することを目的に、抗CD98抗体hM23-M1の重鎖とリンカー配列の異なる軽鎖で構成される各種マスク抗体を調製した(表3)。プロテアーゼ基質を搭載していないMhM1018-M1(表3、図49、配列番号24)、uPA基質のみを搭載したM1019-M1(表3、図50、配列番号25)、CAPN基質のみを搭載したM1020-M1(表3、図51、配列番号26)、uPAとCAPN基質の両方を搭載したM1021-M1(表3、図52、配列番号27)、PLGLAGで構成される公知のMMP9基質(Biopolymers.;40(4):399-416(1996).)のみを搭載したM1022-M1(表3、図53、配列番号28)および、MMP9とCAPN基質の両方を搭載したM1023-M1(表3、図54、配列番号29)に関して、以下に記載する部分を除き、実施例6、実施例11と同様の方法でプロテアーゼ添加条件、非添加条件におけるヒトCD98抗原に対する結合活性をELISAで評価した。MMPバッファーで抗体を2000nMに希釈後、200nMのuPAまたはCAPN1またはMMP9を添加し、37℃で反応後、MMPバッファー濃度調整した抗体をヒトCD98抗原の固定されたウェルに添加した。プロテアーゼ非添加条件でも同様に、MMPバッファーで調製した抗体を各ウェルに添加した。
 MhM1018-M1は酵素非添加条件およびuPAまたはCAPN1添加条件で同様の結合活性を示した(図14-1(A))。MhM1019-M1は酵素非添加条件と比較しuPA添加条件で結合活性が向上し、CAPN1添加条件では結合活性が向上しなかった(図14-1(B))。同様に、MhM1020-M1の結合活性はCAPN1添加条件でのみ向上した(図14-2(C))。uPA基質とCAPN基質の両方を搭載したMhM1021-M1の結合活性はuPA添加条件とCAPN1添加条件の両方で向上した(図14-2(D))。MhM1018-M1は酵素非添加条件およびMMP9またはCAPN1添加条件で同様の結合活性を示したが、MMP9添加条件でわずかに結合活性が向上した(図14-3(E))。MhM1022-M1は酵素非添加条件と比較しMMP9添加条件で結合活性が向上し、CAPN1添加条件でもわすかに結合活性が向上した(図14-3(F))。MMP9基質とCAPN基質の両方を搭載したMhM1023-M1の結合活性はMMP9添加条件とCAPN1添加条件の両方で向上した(図14-4(G))。以上の結果から、設計したマスク抗体が目的のプロテアーゼ感受性をもつことが示された。
(実施例14) 抗CD98マスク抗体-薬物コンジュゲートのin vivo薬効試験
 抗体-薬物コンジュゲートの抗腫瘍効果は、CD98陽性ヒト腫瘍細胞株の細胞を免疫不全マウスに移植した動物モデルを用いて評価した。4-5週齢のBALB/c ヌードマウス(CAnN.Cg-Foxn1[nu]/CrlCrlj[Foxn1nu/Foxn1nu]、日本チャールス・リバー)を実験使用前にSPF条件化で3日間以上馴化した。マウスには滅菌した固形飼料(FR-2,Funabashi Farms Co.,Ltd)を給餌し、滅菌した水道水(5-15ppm次亜塩素酸ナトリウム溶液を添加して調製)を与えた。移植した腫瘍の長径及び短径を電子式デジタルノギス(CD-15CX,Mitutoyo Corp.)で1週間に2回測定し、以下に示す計算式により腫瘍体積を算出した。
腫瘍体積(mm)=1/2×長径(mm)×[短径(mm)]
 抗体-薬物コンジュゲートは全てABSバッファー(10mM-Acetate Buffer, 5(w/v)% Sorbitol, pH5.5)(NACALAI)で希釈し、10mL/kgの液量を尾静脈内投与した。また、コントロール群(Vehicle群)としてABSバッファーを同様に投与した。1群あたり6匹のマウスを実験に用いた。
 CD98陽性ヒト咽頭癌細胞株FaDu(ATCC)を生理食塩水に懸濁、3×10cellsを雌ヌードマウスの右側腹部に皮下移植し(Day0)、Day10に無作為に群分けを実施した。群分け実施日に、実施例7で作製した抗体-薬物コンジュゲート4種(クローン名は、MhM1018-M1-DXd-ADC、MhM1020-M1-DXd-ADC、MhM1022-M1-DXd-ADC、MhM1023-M1-DXd-ADC)を1mg/kgの用量で尾静脈内投与した。結果を図15に示す。横軸は日数、縦軸は腫瘍体積、誤差範囲はSE値を示す。
 MMP9基質とCAPN基質の両方を搭載したMhM1023-M1-DXd-ADCはMMP9基質のみを搭載したMhM1022-M1-DXd-ADC及びCAPN基質のみを搭載したMhM1020-M1-DXd-ADCよりも強い抗腫瘍効果を発揮した。
(実施例15) 抗EGFR抗体、抗GPRC5D抗体の調製・結合活性評価
15)-1 抗EGFR抗体の調製・結合活性評価
 公知の抗EGFR抗体Cetuximab(表4、重鎖配列(図55、配列番号30)、軽鎖配列(図56、配列番号31))を実施例1)-1と同様に調製し、ヒトEGFRに対する結合活性をELISAで評価した。
 96ウェルMaxi-sorp plate(Black、Nunc社)にPBSで0.2μg/mLに希釈したヒトEGFR-Fc(ヒトEGFR(アクセション番号:P00533)の細胞外ドメインと、ヒトIgG1 Fc領域(アクセション番号:P01857)の融合蛋白質を当業者公知の方法で精製した。)を50μLずつ添加し、4℃で一晩固相化した。Tween-20(バイオ・ラッド社)を0.05(w/v)%含むPBS(ELISAバッファー)で洗浄後、Blocker Casein(Thermo Fisher Scientific社)でブロッキングした。ELISAバッファーで洗浄後、MMPバッファーで調製したCetuximabを50μLずつ添加して30分室温で振とうした。ELISAバッファーで洗浄後、ELISAバッファーで2500倍に希釈したHorseradish peroxidase(HRP)標識抗ヒトIgG抗体(Jackson Immuno Research Laboratories社)を50μL添加し、30分室温で振とうした。ELISAバッファーで洗浄後、SuperSignal Pico ELISA Chemiluminescent substrate(Thermo Fisher Scientific社)を添加し、10分後の化学発光をプレートリーダーで測定した。図16(A)に示すように、Cetuximabは濃度依存的にヒトEGFR抗原に結合した。
15)-2 抗GPRC5D抗体の調製・結合活性評価
 WO2018/147245号に記載の公知の抗GPRC5D抗体C3022(表4、重鎖配列(図57、配列番号32)、軽鎖配列(図58、配列番号33))を実施例1)-1と同様に調製し、ヒトGPRC5D抗原に対する結合活性をELISAで評価した。
 96ウェルMaxi-sorp plate(Black、Nunc社)にPBSで1μg/mLに希釈したNeutrAvidin(Thermo Fisher Scientific社)を50μLずつ添加し、4℃で一晩固相化した。Tween-20(バイオ・ラッド社)を0.05(w/v)%含むPBS(ELISAバッファー)で洗浄後、Blocker Casein(Thermo Fisher Scientific社)でブロッキングした。ELISAバッファーで洗浄後、PBSで1μg/mLに希釈したビオチン化ヒトGPRC5Dアミノ末端ペプチド(MYKDCIESTGDYFLLCDAEGPWGIILE-K(Biotin)-NH(ペプチド研究所))を50μLずつ添加して30分室温で振とうした。ELISAバッファーで洗浄後、MMPバッファーで調製した抗体を50μLずつ添加して30分室温で振とうした。ELISAバッファーで洗浄後、ELISAバッファーで2500倍に希釈したHorseradish peroxidase(HRP)標識抗ヒトIgG抗体(Jackson Immuno Research Laboratories社)を50μL添加し、30分室温で振とうした。ELISAバッファーで洗浄後、SuperSignal Pico ELISA Chemiluminescent substrate(Thermo Fisher Scientific社)を添加し、10分後の化学発光をプレートリーダーで測定した。図16(B)に示すように、C3022は濃度依存的にヒトGPRC5D抗原に結合した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000038
(実施例16) 抗EGFR抗体Cetuximabおよび抗GPRC5D抗体C3022に対するミモトープペプチドの濃縮
16)-1 Cetuximabに対するミモトープペプチドの濃縮
 完全ランダムな15アミノ酸から構成されるリボソームディスプレイ用のペプチドライブラリー(Linear 15mer lib)を用いて、Cetuximabへ結合可能なペプチドを濃縮した。最初に、Dynabeads Protein A(Thermo Fisher Scientific社)および、ヒト血清由来IgG(Sigma-Aldrich社)を固相化したDynabeads Protein A(Thermo Fisher Scientific社)に対してRDを添加し、Protein Aやヒト血清由来IgGと反応させた。結合しなかったRDをマグネットスタンド(DynaMag‐2、Thermo Fisher Scientific社)を用いて回収後、Cetuximabを結合させたDynabeads Protein Aと反応させた。マグネットスタンドを用いた洗浄操作によりCetuximabに結合しなかったRDを除去し、Cetuximabに結合したRDからmRNAを精製した。その後、RT-PCRおよびインビトロ翻訳によりRDを再度調製した。このパニング操作を4回実施した。
 パニング4ラウンド後のmRNAをインビトロ翻訳しRDを調製後、Cetuximabまたはヒト血清由来IgGが固相化されたDynabeads Protein Aとそれぞれ反応させた(インプット量:6×1011)。マグネットスタンドを用いた洗浄操作により結合しなかったRDを除去後、結合したRDからmRNAを回収し、RT-qPCRにより、回収量(アウトプット)を定量評価した。図17(A)に示すように、Cetuximabを固相した条件では、ヒト血清IgGを固相した条件と比較して276倍多くmRNAが回収された。この結果から、Cetuximabに特異的に結合するペプチドの濃縮が示された。
16)-2 抗GPRC5D抗体C3022に対するミモトープペプチドの濃縮
 完全ランダムな15アミノ酸から構成されるリボソームディスプレイ用のペプチドライブラリー(Linear 15mer lib)を用いて、C3022へ結合可能なペプチドを濃縮した。最初に、Dynabeads Protein A(Thermo Fisher Scientific社)および、ヒト血清由来IgG(Sigma-Aldrich社)を固相化したDynabeads Protein A(Thermo Fisher Scientific社)に対してRDを添加し、Protein Aやヒト血清由来IgGと反応させた。結合しなかったRDをマグネットスタンド(DynaMag‐2、Thermo Fisher Scientific社)を用いて回収後、C3022を結合させたDynabeads Protein Aと反応させた。マグネットスタンドを用いた洗浄操作によりC3022に結合しなかったRDを除去し、C3022に結合したRDからmRNAを精製した。その後、RT-PCRおよびインビトロ翻訳によりRDを再度調製した。このパニング操作を3回実施した。
 パニング3ラウンド後のmRNAをインビトロ翻訳しRDを調製後、C3022またはヒト血清由来IgGが固相化されたDynabeads Protein Aとそれぞれ反応させた(インプット量:6×1011)。マグネットスタンドを用いた洗浄操作により結合しなかったRDを除去後、結合したRDからmRNAを回収し、RT-qPCRにより、回収量(アウトプット)を定量評価した。図17(B)に示すように、C3022を固相した条件では、ヒト血清IgGを固相した条件と比較して503倍多くmRNAが回収された。この結果から、C3022に特異的に結合するペプチドの濃縮が示された。
(実施例17)uPA基質とCAPN基質を搭載した切断リンカーの適用汎用性 
 実施例3と同様の方法で抗GPRC5D抗体の結合を阻害可能なミモトープペプチドを選抜した。抗EGFR抗体Cetuximabに関しては、scFvの状態でなくIgGの状態でミモトープを選抜した。実施例3と同様に、ランダムペプチド部分をコードするDNAフラグメントを制限酵素消化後に精製し、分泌シグナル配列、DNAフラグメント、MMP切断リンカー(配列番号64:図75)、Cetuximab(重鎖または軽鎖)の順で翻訳されるように、DNAフラグメントを哺乳動物細胞発現用ベクターに挿入した。ペプチドおよびMMP切断リンカーが重鎖または軽鎖のN末端に融合したCetuximabはExpi293F細胞で発現させ、実施例3と同様の方法でCetuximabの結合を阻害可能なミモトープペプチドを選抜した。
 uPA基質とCAPN基質を含む切断リンカーが汎用的にマスク抗体に適用できることを確認するために、スクリーニングより同定したミモトープを搭載した抗EGFRマスク抗体MCE-2105(表4、図59、配列番号34)および、抗GPRC5Dマスク抗体MC3-9003(表4、図60、配列番号35)を設計した。以下に記載する部分を除き、実施例1)-1と同様に調製し、実施例15と同様に、ELISAで抗原への結合を評価した。MMPバッファーで抗体を2000nMに希釈後、200nMのuPAまたはCAPN1を添加し、37℃で反応後、MMPバッファーで濃度調整しヒトEGFR抗原またはヒトGPRC5D抗原の固定されたウェルに添加した。
 MCE-2105は酵素非添加条件と比較しuPAおよびCAPN1添加条件で結合活性が向上した(図18(A))。同様に、MC3-9003も酵素非添加条件と比較しuPAおよびCAPN1添加条件で結合活性が向上した(図18(B))。これらの結果から、uPA基質とCAPN基質を含む切断リンカーが汎用的にマスク抗体に適用できることが示された。
(実施例18)抗CD98マスク抗体-薬物コンジュゲートのin vivo薬効試験
 抗体-薬物コンジュゲートの抗腫瘍効果は、CD98陽性ヒト腫瘍細胞株の細胞を免疫不全マウスに移植した動物モデルを用いて評価した。4-5週齢のBALB/c ヌードマウス(CAnN.Cg-Foxn1[nu]/CrlCrlj[Foxn1nu/Foxn1nu]、日本チャールス・リバー)を実験使用前にSPF条件化で3日間以上馴化した。マウスには滅菌した固形飼料(FR-2,Funabashi Farms Co.,Ltd)を給餌し、滅菌した水道水(5-15ppm次亜塩素酸ナトリウム溶液を添加して調製)を与えた。移植した腫瘍の長径及び短径を電子式デジタルノギス(CD-15CX,Mitutoyo Corp.)で1週間に2回測定し、以下に示す計算式により腫瘍体積を算出した。
腫瘍体積(mm)=1/2×長径(mm)×[短径(mm)]
 抗体-薬物コンジュゲートは全てABSバッファー(10mM-Acetate Buffer, 5(w/v)% Sorbitol, pH5.5)(NACALAI)で希釈し、10mL/kgの液量を尾静脈内投与した。また、コントロール群(Vehicle群)としてABSバッファーを同様に投与した。1群あたり6匹のマウスを実験に用いた。
18)-1 抗腫瘍効果(1)
 CD98陽性肺扁平上皮癌細胞株EBC-1(JCRB)を生理食塩水/50%Matrigelに懸濁、1×10cellsを雌ヌードマウスの右側腹部に皮下移植し(Day0)、Day10に無作為に群分けを実施した。群分け実施日に、実施例7で作製した抗体-薬物コンジュゲート4種(クローン名は、MhM1018-M1-DXd-ADC、MhM1019-M1-DXd-ADC、MhM1020-M1-DXd-ADC、MhM1021-M1-DXd-ADC)を3mg/kgの用量で尾静脈内投与した。結果を図19(A)に示す。横軸は日数、縦軸は腫瘍体積、誤差範囲はSE値を示す。
 uPA基質とCAPN基質の両方を搭載したMhM1021-M1-DXd-ADCはuPA基質のみを搭載したMhM1019-M1-DXd-ADC及びCAPN基質のみを搭載したMhM1020-M1-DXd-ADCよりも強い抗腫瘍効果を発揮した。
18)-2 抗腫瘍効果(2)
 同様にEBC-1を生理食塩水/50%Matrigelに懸濁、1×10cellsを雌ヌードマウスの右側腹部に皮下移植し(Day0)、Day9に無作為に群分けを実施した。群分け実施日に、実施例7で作製した抗体-薬物コンジュゲート4種(クローン名は、MhM1018-M1-DXd-ADC、MhM1020-M1-DXd-ADC、MhM1022-M1-DXd-ADC、MhM1023-M1-DXd-ADC)を1mg/kgの用量で尾静脈内投与した結果を図19(B)に示す。
 MMP9基質とCAPN基質の両方を搭載したMhM1023-M1-DXd-ADCはMMP9基質のみを搭載したMhM1022-M1-DXd-ADC及びCAPN基質のみを搭載したMhM1020-M1-DXd-ADCよりも強い抗腫瘍効果を発揮した。
(実施例19) 細胞内CAPNによる抗TROP2マスク抗体の活性化
19)-1 セルライセートの調製
 ヒト頭頸部癌株FaDu(ATCC)を、10%のウシ胎児血清(Hyclone)を含むE-MEM medium(Wako:以下、E-MEM培地)で培養した。培養したFaDuをトリプシン処理で回収し、PBSで洗浄後、1.0×10細胞あたり1mLのLysis Buffer(25mM Tris-HCl (pH 7.5), 1mM EDTA)で懸濁した。超音波破砕を行った後、13000rpm、4℃で15分間遠心した。遠心後の上清を回収し、タンパク質濃度を測定するとともに、上清に終濃度が1mMとなるようにDTTを添加した。DTT添加済みの上清は使用時まで-80℃で保存し、細胞内CAPNを含むセルライセートとして使用した。
19)-2 セルライセートと反応させた抗TROP2マスク抗体の結合活性
 CAPNの活性化に必要な塩化カルシウム添加条件、および塩化カルシウム非添加条件のセルライセートとCAPN基質を搭載した抗TROP2マスク抗体を反応させ、ヒトTROP2抗原に対する結合活性をELISAで評価した。セルライセート中のCAPNによるマスク抗体活性化を確認する目的で、CAPN特異的阻害剤PD150606(Proc Natl Acad Sci USA.;93(13):6687-6692(1996))を用いた阻害実験も行った。セルライセートはタンパク質濃度が終濃度0.01μg/mLとなるように調整し、塩化カルシウム添加条件では終濃度2mMとなるように塩化カルシウムを添加して使用した。抗体は終濃度20nMとなるようにMilliQで希釈して添加した。阻害実験では塩化カルシウム添加セルライセートにPD150606を終濃度100μMとなるように加えた。反応は96ウェルV底plate(Greiner社)内で75μLの反応系で行い、37℃で1時間反応させた。比較対照には、セルライセートの代わりにLysis Bufferを用いて反応を行った。
 抗体の結合活性は実施例1)-1と同様にELISAで評価した。図20(A)に示すように、uPA基質とCAPN基質の両方を搭載した抗TROP2マスク抗体MHT3203は塩化カルシウムを添加したセルライセートと反応させることで、ヒトTROP2抗原への結合活性が上昇した。一方で、uPA基質のみを搭載したMHT1903(表5、図62、配列番号42)では結合活性の上昇はみられなかった。また、図20(B)に示すように、塩化カルシウムを添加したセルライセートによるMHT3203のヒトTROP2抗原への結合活性の上昇は、CAPN阻害剤PD150606によって阻害された。これらの結果から、CAPN基質を搭載した抗TROP2マスク抗体MHT3203は細胞内のCAPNによって活性化されることが示された。
(実施例20)2種類の酵素による抗TROP2マスク抗体の活性化
 uPA基質とCAPN基質の両方を搭載した抗TROP2マスク抗体MHT3202を用いて、マスク抗体と反応させる酵素の種類と、活性化したマスク抗体の結合活性の関係を解析した。抗体をMMPバッファーで1000nMに調製し、20nMのuPAと100nMのCAPN1をそれぞれ単独または同時に添加した。37℃で30分反応させた後に、実施例1)-1と同様にELISAでヒトTROP2抗原への結合を評価した。結合活性は3回評価し、結合活性の平均値とSD値を算出後、t検定(有意水準1%)により有意差を評価した。
 図21に示すように、uPAまたはCAPN1を単独で加えた条件と比較して、両方の酵素を同時に加えた条件では、MHT3202の結合活性がさらに向上した(p<0.01)。この結果から、細胞外プロテアーゼと細胞内プロテアーゼの2種の酵素と反応させる場合の方が、それぞれ単独のプロテアーゼと反応させる場合よりマスク抗体の結合活性を向上できることが示された。同様に、細胞外プロテアーゼと細胞内プロテアーゼの2種の酵素で活性化可能なマスク抗体は、それぞれ単独のプロテアーゼで活性化可能なマスク抗体よりも腫瘍環境中での結合活性が強い可能性が示唆された。
(実施例21)抗TROP2マスク抗体を利用したuPA基質とCAPN基質の配置検討
21)-1 uPAとCAPN1によるマスク抗体の活性化
 uPA基質とCAPN基質の両方を搭載した抗TROP2マスク抗体MHT3203および、切断リンカー中のuPA基質とCAPN基質の配置を入れ替えたMHT3219(表5、図63、配列番号43)を実施例1-1)と同様に調製し、uPAおよびCAPN1によるマスク抗体の活性化を実施例6と同様にELISAで評価した。
 MHT3203はuPAとCAPN1でそれぞれ活性化され(図22(A))、MHT3219もMHT3203と同様にuPAとCAPN1で活性化された(図22(B))。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000039
21)-2 抗TROP2マスク抗体-薬物コンジュゲートの抗腫瘍効果(1)
 抗体-薬物コンジュゲートの抗腫瘍効果評価は実施例8と同様に実施した。TROP2陽性ヒト肺粘液性類表皮癌細胞株NCI-H292(ATCC)を生理食塩水に懸濁、5×10cellsを雌ヌードマウスの右側腹部に皮下移植し(Day0)、Day12に無作為に群分けを実施した。群分け実施日に、実施例7で作製した抗体-薬物コンジュゲート2種(クローン名は、MHT3219-PBD-ADC、MHT3203-PBD-ADC)を0.4mg/kgの用量で尾静脈内投与した。結果を図23(A)に示す。横軸は日数、縦軸は腫瘍体積、誤差範囲はSE値を示す。
 uPA基質とCAPN基質の両方を搭載したMHT3203-PBD-ADCは基質の配置を入れ替えたMHT3219-PBD-ADCよりも強い抗腫瘍効果を発揮した。よって、uPA基質がCAPN基質よりアミノ末端側に配置されてなる切断リンカーは、その逆に配置されてなる切断リンカーよりも好適であることが示された。
21)-3 抗TROP2抗体-薬物コンジュゲートの抗腫瘍効果(2)
 TROP2陽性ヒト咽頭癌細胞株FaDu(ATCC)を生理食塩水に懸濁、3×10cellsを雌ヌードマウスの右側腹部に皮下移植し(Day0)、Day12に無作為に群分けを実施した。群分け実施日に、実施例7で作製した抗体-薬物コンジュゲート2種(クローン名は、MHT3219-PBD-ADC、MHT3203-PBD-ADC)を0.4mg/kgの用量で尾静脈内投与した。結果を図23(B)に示す。横軸は日数、縦軸は腫瘍体積、誤差範囲はSE値を示す。
 uPA基質とCAPN基質の両方を搭載したMHT3203-PBD-ADCは基質の配置を入れ替えたMHT3219-PBD-ADCよりも強い抗腫瘍効果を発揮した。
(実施例22)CAPN基質配列の検討
 uPA基質とCAPN基質の両方を搭載した抗TROP2マスク抗体MHT5082(表5、図65、配列番号54)、MHT5084(表5、図66、配列番号55)、MHT5085(表5、図67、配列番号56)、MHT5086(表5、図68、配列番号57)、MHT5090(表5、図69、配列番号58)、MHT5091(表5、図70、配列番号59)、MHT5092(表5、図71、配列番号60)、MHT5093(表5、図72、配列番号61)、MHT5094(表5、図73、配列番号62)、MHT5095(表5、図74、配列番号63)、MHT3203および、uPA基質のみを搭載したMHT1903を実施例1-1)と同様に調製し、uPA、CAPN1、CAPN2(アクセション番号:P17655)による活性化を以下に記載する部分を除き、実施例5)-1と同様にELISAで評価した。MMPバッファーで抗体を20nMに希釈し、50nMのuPAまたは、100nMのCAPN1または、100nMのCAPN2をそれぞれ添加し、37℃で反応後、ヒトTROP2抗原の固定されたウェルに添加した。uPAと反応させた際の結合活性を100%として各クローンのプロテアーゼ感受性を比較した。
 図24に示すように、MHT1903の結合活性はuPA添加条件で向上したが、CAPN1またはCAPN2添加条件では向上しなかった。その一方で、uPA基質とCAPN基質の両方を搭載した抗TROP2マスク抗体の結合活性はuPA添加条件およびCAPN(CAPN1またはCAPN2)添加条件で向上した。
(実施例23)異なるCAPN基質配列を搭載したPBD-ADCのin vivo薬効
23)-1 抗TROP2抗体-薬物コンジュゲートの抗腫瘍効果(1)
 抗体-薬物コンジュゲートの抗腫瘍効果評価は実施例8と同様に実施した。TROP2陽性ヒト肺粘液性類表皮癌細胞株NCI-H292(ATCC)を生理食塩水に懸濁、5×10cellsを雌ヌードマウスの右側腹部に皮下移植し(Day0)、Day10に無作為に群分けを実施した。群分け実施日に、実施例7で作製した抗体-薬物コンジュゲート7種(クローン名は、MHT3203-PBD-ADC、MHT5082-PBD-ADC、MHT5085-PBD-ADC、MHT5086-PBD-ADC、MHT5093-PBD-ADC、MHT5094-PBD-ADC、MHT5095-PBD-ADC)を0.4mg/kgの用量で尾静脈内投与した。結果を図25(A)に示す。横軸は日数、縦軸は腫瘍体積、誤差範囲はSE値を示す。
 uPA基質とCAPN基質の両方を搭載したMHT3203-PBD-ADCと同様にMHT5082-PBD-ADC、MHT5085-PBD-ADC、MHT5086-PBD-ADC、MHT5093-PBD-ADC、MHT5094-PBD-ADC、MHT5095-PBD-ADCも強い抗腫瘍効果を発揮した。
23)-2 抗TROP2抗体-薬物コンジュゲートの抗腫瘍効果(2)
 TROP2陽性ヒト咽頭癌細胞株FaDu(ATCC)を生理食塩水に懸濁、3×10cellsを雌ヌードマウスの右側腹部に皮下移植し(Day0)、Day13に無作為に群分けを実施した。群分け実施日に、実施例7で作製した抗体-薬物コンジュゲート7種(クローン名は、MHT3203-PBD-ADC、MHT5082-PBD-ADC、MHT5085-PBD-ADC、MHT5086-PBD-ADC、MHT5093-PBD-ADC、MHT5094-PBD-ADC、MHT5095-PBD-ADC)を0.4mg/kgの用量で尾静脈内投与した。結果を図25(B)に示す。横軸は日数、縦軸は腫瘍体積、誤差範囲はSE値を示す。
 uPA基質とCAPN基質の両方を搭載したMHT3203-PBD-ADCと同様にMHT5082-PBD-ADC、MHT5085-PBD-ADC、MHT5086-PBD-ADC、MHT5093-PBD-ADC、MHT5094-PBD-ADC、MHT5095-PBD-ADCも強い抗腫瘍効果を発揮した。
 本発明の改良型マスク抗体は各種がんの治療に使用することができる。
配列番号1:抗TROP2抗体の重鎖アミノ酸配列(図26)
配列番号2:抗TROP2抗体の軽鎖アミノ酸配列(図27)
配列番号3:MHT1001のアミノ酸配列(図28)
配列番号4:MHT1002のアミノ酸配列(図29)
配列番号5:HT1-11―scFv-HLのアミノ酸配列(図30)
配列番号6:HT1-11-scFv-LHのアミノ酸配列(図31)
配列番号7:MHT1007の重鎖アミノ酸配列(図32)
配列番号8:MHT1008の重鎖アミノ酸配列(図33)
配列番号9:MHT1009の重鎖アミノ酸配列(図34)
配列番号10:MHT3002の重鎖アミノ酸配列(図35)
配列番号11:CAPN1のアミノ酸配列(図36)
配列番号12:新規CAPN基質のアミノ酸配列(図37)
配列番号13:MHT3201の重鎖アミノ酸配列(図38)
配列番号14:MHT3202の重鎖アミノ酸配列(図39)
配列番号15:MHT1713の重鎖アミノ酸配列(図40)
配列番号16:HMT3423の重鎖アミノ酸配列(図41)
配列番号17:MHT3203の重鎖アミノ酸配列(図42)
配列番号18:抗CD98抗体hM23H1L1の重鎖アミノ酸配列(図43)
配列番号19:抗CD98抗体hM23H1L1の軽鎖アミノ酸配列(図44)
配列番号20:MhM1008の軽鎖アミノ酸配列(図45)
配列番号21:MhM1013の軽鎖アミノ酸配列(図46)
配列番号22:hM23-M1の重鎖アミノ酸配列(図47)
配列番号23:hM23-M1の軽鎖アミノ酸配列(図48)
配列番号24:MhM1018の軽鎖アミノ酸配列(図49)
配列番号25:MhM1019の軽鎖アミノ酸配列(図50)
配列番号26:MhM1020の軽鎖アミノ酸配列(図51)
配列番号27:MhM1021の軽鎖アミノ酸配列(図52)
配列番号28:MhM1022の軽鎖アミノ酸配列(図53)
配列番号29:MhM1023の軽鎖アミノ酸配列(図54)
配列番号30:抗EGFR抗体cetuximabの重鎖アミノ酸配列(図55)
配列番号31:抗EGFR抗体cetuximabの軽鎖アミノ酸配列(図56)
配列番号32:抗GPRC5D抗体C3022の重鎖アミノ酸配列(図57)
配列番号33:抗GPRC5D抗体C3022の軽鎖アミノ酸配列(図58)
配列番号34:MCE-2105の軽鎖アミノ酸配列(図59)
配列番号35:MC3-9003の重鎖アミノ酸配列(図60)
配列番号36:ヒトuPAが認識し、その基質となるアミノ酸配列(図61)
配列番号37:ヒトuPAが認識し、その基質となるアミノ酸配列(図61)
配列番号38:ヒトuPAが認識し、その基質となるアミノ酸配列(図61)
配列番号39:ヒトMMP1が認識し、その基質となるアミノ酸配列(図61)
配列番号40:ヒトMMP1が認識し、その基質となるアミノ酸配列(図61)
配列番号41:ヒトMMP9が認識し、その基質となるアミノ酸配列(図61)
配列番号42:MHT1903の重鎖アミノ酸配列(図62)
配列番号43:MHT3219の重鎖アミノ酸配列(図63)
配列番号44:新規CAPN基質のアミノ酸配列(図64)
配列番号45:新規CAPN基質のアミノ酸配列(図64)
配列番号46:新規CAPN基質のアミノ酸配列(図64)
配列番号47:新規CAPN基質のアミノ酸配列(図64)
配列番号48:新規CAPN基質のアミノ酸配列(図64)
配列番号49:新規CAPN基質のアミノ酸配列(図64)
配列番号50:新規CAPN基質のアミノ酸配列(図64)
配列番号51:新規CAPN基質のアミノ酸配列(図64)
配列番号52:新規CAPN基質のアミノ酸配列(図64)
配列番号53:新規CAPN基質のアミノ酸配列(図64)
配列番号54:MHT5082の重鎖アミノ酸配列(図65)
配列番号55:MHT5084の重鎖アミノ酸配列(図66)
配列番号56:MHT5085の重鎖アミノ酸配列(図67)
配列番号57:MHT5086の重鎖アミノ酸配列(図68)
配列番号58:MHT5090の重鎖アミノ酸配列(図69)
配列番号59:MHT5091の重鎖アミノ酸配列(図70)
配列番号60:MHT5092の重鎖アミノ酸配列(図71)
配列番号61:MHT5093の重鎖アミノ酸配列(図72)
配列番号62:MHT5094の重鎖アミノ酸配列(図73)
配列番号63:MHT5095の重鎖アミノ酸配列(図74)
配列番号64:MMPリンカーのアミノ酸配列(図75)
 本明細書で引用した全ての刊行物、特許及び特許出願はそのまま引用により本明細書に組み入れられるものとする。

Claims (35)

  1.  下記[a]部分、[b]部分及び[c]部分を含んでなり標的抗原に結合する分子:
    [a]部分 標的抗原に結合する部分;
    [b]部分 [a]部分に含まれる標的抗原結合部位を認識する第1ペプチド;
    [c]部分 細胞質内に局在するプロテアーゼにより切断されるアミノ酸配列を含む第2ペプチド。
  2.  第2ペプチドが細胞質内に局在するプロテアーゼにより切断された後には、切断前と比較して、標的抗原に対しより高い結合親和性を有することを特徴とする、請求項1記載の分子。
  3.  [c]部分の第2ペプチドが、さらに、細胞外プロテアーゼにより切断されるアミノ酸配列を含む、請求項1又は2に記載の分子。
  4.  第1ペプチド、第2ペプチド、標的抗原に結合する部分の順に連結してなる、請求項1~3のいずれか1つに記載の分子。
  5.  標的抗原に結合する部分が、第1ペプチド及び第2ペプチドには含まれないアミノ酸配列からなるポリペプチドである、請求項1~4のいずれか1つに記載の分子。
  6.  ポリペプチドからなる、請求項1~5のいずれか1つに記載の分子。
  7.  アミノ末端からカルボキシル末端に向かって、第1ペプチド、第2ペプチド、標的抗原に結合する部分の順、又は、標的抗原に結合する部分、第2ペプチド、第1ペプチドの順に結合してなる、請求項6記載の分子。
  8.  第1ペプチド、第2ペプチド及び標的抗原に結合する部分からなる群より選択されるいずれか1つが、他の2つのうち1つ又は両方とリンカーを介して結合している、請求項1~7のいずれか1つに記載の分子。
  9.  該細胞質内に局在するプロテアーゼが、細胞死や細胞膜へのダメージにより、細胞外に漏出することを特徴とする、請求項1~8のいずれか1つに記載の分子。
  10.  該細胞質内に局在するプロテアーゼが、カルパイン、カスパーゼ及びトリぺプチジルペプチダーゼから選択され、好適には、カルパインがカルパイン1又はカルパイン2であり、カスパーゼが、カスパーゼ1、カスパーゼ8、カスパーゼ3又はカスパーゼ7であり、トリぺプチジルペプチダーゼがトリぺプチジルペプチダーゼ1又はトリぺプチジルペプチダーゼ2である、請求項1~9のいずれか1つに記載の分子。
  11.  該細胞質内に局在するプロテアーゼが、カルシウム依存性又はカルシウム要求性である、請求項1~10のいずれか1つに記載の分子。
  12.  該細胞質内に局在するプロテアーゼが、カルパイン1又はカルパイン2である、請求項1~11のいずれか1つに記載の分子。
  13.  該細胞外プロテアーゼが、正常な組織に比して、異常な組織においてより高発現しているか、より多量に存在するか又はより触媒活性が高いことを特徴とする、請求項3~12のいずれか1つに記載の分子。
  14.  該異常な組織が、腫瘍組織及び/又は間質組織である、請求項13に記載の分子。
  15.  該細胞外プロテアーゼが、マトリックスメタロプロテアーゼ、ウロキナーゼ型プラスミノゲンアクチベータ、マトリプターゼ、レグマイン及びカテプシンよりなる群から選択され、マトリックスメタロプロテアーゼは好適にはMMP1、MMP2、MMP3、MMP7、MMP9、MMP12及びMMP14の1つ又は2つ以上であり、カテプシンは好適にはカテプシンB、カテプシンD、カテプシンS及びカテプシンLの1つ又は2つ以上である、請求項3~14のいずれか1つに記載の分子。
  16.  第2ペプチドにおいて、アミノ末端からカルボキシル末端に向かって、該細胞外プロテアーゼにより切断されるアミノ酸配列、該細胞質内に局在するプロテアーゼにより切断されるアミノ酸配列の順、又は、該細胞質内に局在するプロテアーゼにより切断されるアミノ酸配列、該細胞外プロテアーゼにより切断されるアミノ酸配列の順に配置されてなり、好適には、該細胞外プロテアーゼにより切断されるアミノ酸配列、該細胞質内に局在するプロテアーゼにより切断されるアミノ酸配列の順に配置されてなる、請求項1~15のいずれか1つに記載の分子。
  17.  該該細胞質内に局在するプロテアーゼにより切断されるアミノ酸配列が、配列番号12、37~46のいずれか1つ又は2つ以上を含む、請求項1~16のいずれか1つに記載の分子。
  18.  標的抗原が腫瘍抗原である、請求項1~17のいずれか1つに記載の分子。
  19.  標的抗原に結合する部分に、他の部分である[d]部分が結合してなり、[d]部分が第1ペプチド及び第2ペプチドを含まない、請求項1~18のいずれか1つに記載の分子。
  20.  [d]部分が、標的抗原結合部分ではない抗体若しくはその抗原結合断片、第1ペプチド及び第2ペプチドに含まれないアミノ酸配列を含むペプチド、サイトカイン、毒素、放射性同位元素、標識分子、光感受性物質、免疫賦活化物質、抗腫瘍性化合物、薬物、ペイロード、並びにポリマーからなる群より選択される1つ又は2つ以上である、請求項19記載の分子。
  21.  抗腫瘍性化合物が、カンプトテシン誘導体又はもしくはpyrrolobenzodiazepine誘導体であり、好適には、カンプトテシン誘導体がN-[(1S,9S)-9-Ethyl-5-fluoro-9-hydroxy-4-methyl-10,13-dioxo-2,3,9,10,13,15-hexahydro-1H,12H-benzo[de]pyrano[3',4':6,7]indolizino[1,2-b]quinolin-1-yl]-2-hydroxyacetamideである、請求項20記載の分子。
  22.  免疫賦活化物質が環状ジヌクレオチド誘導体である請求項20記載の分子。
  23.  ポリペプチドからなるか、又は[d]部分及びポリペプチドからなる、請求項19~22のいずれか1つに記載の分子。
  24.  下記工程(i)及び(ii)を含む、抗体又は抗体の抗原結合断片に含まれる相補性決定領域(CDR)に結合するペプチドを同定する方法:
    (i)芳香族性アミノ酸とProの繰返し配列を含むペプチドライブラリーを該CDRに接触させる工程;及び
    (ii)該CDRに結合するペプチドを回収する工程。
  25.  芳香族性アミノ酸とProの繰返し配列がZPZPモチーフ[Zは、ヒスチジン(His)、フェニルアラニン(Phe)、チロシン(Tyr)、トリプトファン(Trp)のいずれかの芳香族アミノ酸を表し、Pはプロリンを表す]である、請求項24記載の方法。
  26.  該ペプチドを組換え、化学合成又はペプチド合成により調製する工程をさらに含む、請求項24又は25に記載の方法。
  27.  該CDRが請求項1記載の標的抗原結合部分に含まれ、第1ペプチドが請求項26に記載の方法により得られる、標的抗原に結合する分子。
  28.  第1ペプチドに含まれるアミノ酸配列及び/又は第2ペプチドに含まれるアミノ酸配列を含んでなるペプチドを組換え、インビトロ翻訳、化学合成又はペプチド合成により調製する工程を含む、請求項1~23のいずれか1つに記載の分子の製造方法。
  29.  請求項28記載の方法により得られる、標的抗原に結合する分子。
  30.  下記(iii)記載の工程を含む、請求項6、7又は23記載の分子の製造方法:
    (iii)標的抗原結合部分に含まれるアミノ酸配列、並びに、任意で(optionally)、第1ペプチドに含まれるアミノ酸配列、及び/又は、第2ペプチドに含まれるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列を含んでなるポリヌクレオチドを細胞に導入し、該細胞を培養し、該培養物から該標的抗原に結合するポリペプチドを回収する工程。
  31.  請求項30記載の方法により得られる、標的抗原に結合する分子。
  32.  請求項1~23、27、29及び31のいずれか1つに記載の分子、その塩又はそれらの水和物を含む、医薬組成物。
  33.  抗がん剤である、請求項32記載の医薬組成物。
  34.  芳香族性アミノ酸とProの繰返し配列を含むペプチドライブラリー。
  35.  芳香族性アミノ酸とProの繰返し配列がZPZPモチーフ[Zは、ヒスチジン(His)、フェニルアラニン(Phe)、チロシン(Tyr)、トリプトファン(Trp)のいずれかの芳香族アミノ酸を表し、Pはプロリンを表す]である、請求項34記載のペプチドライブラリー。
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