RU2822660C1 - Microorganisms producing l-valine, and method of producing l-valine using same - Google Patents
Microorganisms producing l-valine, and method of producing l-valine using same Download PDFInfo
- Publication number
- RU2822660C1 RU2822660C1 RU2023105034A RU2023105034A RU2822660C1 RU 2822660 C1 RU2822660 C1 RU 2822660C1 RU 2023105034 A RU2023105034 A RU 2023105034A RU 2023105034 A RU2023105034 A RU 2023105034A RU 2822660 C1 RU2822660 C1 RU 2822660C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- ala
- gly
- leu
- asp
- glu
- Prior art date
Links
- KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N L-valine Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N 0.000 title claims abstract description 150
- 244000005700 microbiome Species 0.000 title claims abstract description 99
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 33
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims abstract description 159
- 229960004295 valine Drugs 0.000 claims abstract description 90
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 claims abstract description 44
- LCTONWCANYUPML-UHFFFAOYSA-M Pyruvate Chemical compound CC(=O)C([O-])=O LCTONWCANYUPML-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims abstract description 36
- 101710088194 Dehydrogenase Proteins 0.000 claims abstract description 34
- 108700016168 Dihydroxy-acid dehydratases Proteins 0.000 claims abstract description 34
- 108010030844 2-methylcitrate synthase Proteins 0.000 claims abstract description 31
- 108010071536 Citrate (Si)-synthase Proteins 0.000 claims abstract description 31
- 102000006732 Citrate synthase Human genes 0.000 claims abstract description 28
- 108010037084 valine-pyruvate transaminase Proteins 0.000 claims abstract description 26
- 101150043028 ilvD gene Proteins 0.000 claims description 27
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims description 26
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 claims description 25
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 claims description 24
- 241000186226 Corynebacterium glutamicum Species 0.000 claims description 20
- 101150015189 aceE gene Proteins 0.000 claims description 18
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 16
- 241000186216 Corynebacterium Species 0.000 claims description 15
- 101150106096 gltA gene Proteins 0.000 claims description 13
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 claims description 4
- 101150065474 avtA gene Proteins 0.000 claims description 4
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 claims description 4
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 claims description 3
- 229960003767 alanine Drugs 0.000 claims description 3
- AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N L-threonine Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N 0.000 claims description 2
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 claims description 2
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 claims description 2
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 229960002898 threonine Drugs 0.000 claims description 2
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract description 3
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 89
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 69
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 66
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 58
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 56
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 56
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 51
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 51
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 49
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 44
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 41
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 39
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 39
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 39
- KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N Valine Natural products CC(C)C(N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 33
- 239000004474 valine Substances 0.000 description 33
- 229940076788 pyruvate Drugs 0.000 description 30
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 29
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 26
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 25
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 description 24
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 description 22
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 description 22
- 230000000379 polymerizing effect Effects 0.000 description 22
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 22
- 101150105723 ilvD1 gene Proteins 0.000 description 21
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 17
- 108010050848 glycylleucine Proteins 0.000 description 17
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 17
- 230000002238 attenuated effect Effects 0.000 description 16
- 108010057821 leucylproline Proteins 0.000 description 15
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 15
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 15
- 108010047857 aspartylglycine Proteins 0.000 description 14
- 108091081024 Start codon Proteins 0.000 description 13
- 108010038633 aspartylglutamate Proteins 0.000 description 13
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 13
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 13
- VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N glycyl-DL-alpha-alanine Natural products OC(=O)C(C)NC(=O)CN VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 13
- 108010093581 aspartyl-proline Proteins 0.000 description 12
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 12
- 108010034529 leucyl-lysine Proteins 0.000 description 12
- 102000003960 Ligases Human genes 0.000 description 11
- 108090000364 Ligases Proteins 0.000 description 11
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 description 11
- 238000000137 annealing Methods 0.000 description 11
- 108010013835 arginine glutamate Proteins 0.000 description 11
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 241000807905 Corynebacterium glutamicum ATCC 14067 Species 0.000 description 10
- 101100493587 Escherichia coli (strain K12) avtA gene Proteins 0.000 description 10
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 10
- 101150042350 gltA2 gene Proteins 0.000 description 10
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 9
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 9
- 108010049041 glutamylalanine Proteins 0.000 description 9
- DTNUIAJCPRMNBT-WHFBIAKZSA-N Asp-Gly-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(O)=O DTNUIAJCPRMNBT-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 8
- CUPSDFQZTVVTSK-GUBZILKMSA-N Glu-Lys-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O CUPSDFQZTVVTSK-GUBZILKMSA-N 0.000 description 8
- DXVOKNVIKORTHQ-GUBZILKMSA-N Glu-Pro-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O DXVOKNVIKORTHQ-GUBZILKMSA-N 0.000 description 8
- RLFSBAPJTYKSLG-WHFBIAKZSA-N Gly-Ala-Asp Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O RLFSBAPJTYKSLG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 8
- XTQFHTHIAKKCTM-YFKPBYRVSA-N Gly-Glu-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O XTQFHTHIAKKCTM-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 8
- SGLXGEDPYJPGIQ-ACRUOGEOSA-N His-Phe-Phe Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC2=CC=CC=C2)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC3=CN=CN3)N SGLXGEDPYJPGIQ-ACRUOGEOSA-N 0.000 description 8
- BQSLGJHIAGOZCD-CIUDSAMLSA-N Leu-Ala-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O BQSLGJHIAGOZCD-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 8
- XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N N-alpha-L-glutamyl-L-phenylalanine Natural products OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- LCTONWCANYUPML-UHFFFAOYSA-N Pyruvic acid Chemical compound CC(=O)C(O)=O LCTONWCANYUPML-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- QGXCWPNQVCYJEL-NUMRIWBASA-N Thr-Asn-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O QGXCWPNQVCYJEL-NUMRIWBASA-N 0.000 description 8
- KOSRFJWDECSPRO-UHFFFAOYSA-N alpha-L-glutamyl-L-glutamic acid Natural products OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(CCC(O)=O)C(O)=O KOSRFJWDECSPRO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 108010068380 arginylarginine Proteins 0.000 description 8
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 8
- 108010009297 diglycyl-histidine Proteins 0.000 description 8
- 108010055341 glutamyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 8
- XKUKSGPZAADMRA-UHFFFAOYSA-N glycyl-glycyl-glycine Chemical compound NCC(=O)NCC(=O)NCC(O)=O XKUKSGPZAADMRA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 108010037850 glycylvaline Proteins 0.000 description 8
- 108010044311 leucyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 8
- 108010056582 methionylglutamic acid Proteins 0.000 description 8
- 108010053725 prolylvaline Proteins 0.000 description 8
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 8
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 8
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 8
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- XMPXVJIDADUOQB-RCOVLWMOSA-N Gly-Gly-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)CNC(=O)C[NH3+] XMPXVJIDADUOQB-RCOVLWMOSA-N 0.000 description 7
- JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N H-Gly-Phe-OH Natural products NCC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 108010005233 alanylglutamic acid Proteins 0.000 description 7
- 108010070944 alanylhistidine Proteins 0.000 description 7
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 7
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 7
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 7
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 7
- 108010061238 threonyl-glycine Proteins 0.000 description 7
- QHKABHOOEWYVLI-UHFFFAOYSA-N 3-methyl-2-oxobutanoic acid Chemical compound CC(C)C(=O)C(O)=O QHKABHOOEWYVLI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- BEMGNWZECGIJOI-WDSKDSINSA-N Ala-Gly-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O BEMGNWZECGIJOI-WDSKDSINSA-N 0.000 description 6
- SBHUBSDEZQFJHJ-CIUDSAMLSA-N Asp-Asp-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O SBHUBSDEZQFJHJ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 6
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 6
- PVBBEKPHARMPHX-DCAQKATOSA-N Glu-Gln-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O PVBBEKPHARMPHX-DCAQKATOSA-N 0.000 description 6
- AUTNXSQEVVHSJK-YVNDNENWSA-N Glu-Glu-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O AUTNXSQEVVHSJK-YVNDNENWSA-N 0.000 description 6
- VWHGTYCRDRBSFI-ZETCQYMHSA-N Leu-Gly-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O VWHGTYCRDRBSFI-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 6
- AIOWVDNPESPXRB-YTWAJWBKSA-N Pro-Thr-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@@H]2CCCN2)O AIOWVDNPESPXRB-YTWAJWBKSA-N 0.000 description 6
- KDGARKCAKHBEDB-NKWVEPMBSA-N Ser-Gly-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)CNC(=O)[C@H](CO)N)C(=O)O KDGARKCAKHBEDB-NKWVEPMBSA-N 0.000 description 6
- RVMNUBQWPVOUKH-HEIBUPTGSA-N Thr-Ser-Thr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O RVMNUBQWPVOUKH-HEIBUPTGSA-N 0.000 description 6
- 108010036413 histidylglycine Proteins 0.000 description 6
- 230000006801 homologous recombination Effects 0.000 description 6
- 238000002744 homologous recombination Methods 0.000 description 6
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 6
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 6
- 229930027917 kanamycin Natural products 0.000 description 6
- SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N kanamycin Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CN)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N 0.000 description 6
- 229960000318 kanamycin Drugs 0.000 description 6
- 229930182823 kanamycin A Natural products 0.000 description 6
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 6
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 6
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 6
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 6
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 6
- 108010020532 tyrosyl-proline Proteins 0.000 description 6
- BUANFPRKJKJSRR-ACZMJKKPSA-N Ala-Ala-Gln Chemical compound C[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C([O-])=O)CCC(N)=O BUANFPRKJKJSRR-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 5
- MNZHHDPWDWQJCQ-YUMQZZPRSA-N Ala-Leu-Gly Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O MNZHHDPWDWQJCQ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 5
- AAWLEICNDUHIJM-MBLNEYKQSA-N Ala-Thr-His Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C)N)O AAWLEICNDUHIJM-MBLNEYKQSA-N 0.000 description 5
- QXHVOUSPVAWEMX-ZLUOBGJFSA-N Asp-Asp-Ser Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O QXHVOUSPVAWEMX-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 5
- QGZSAHIZRQHCEQ-QWRGUYRKSA-N Gly-Asp-Tyr Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 QGZSAHIZRQHCEQ-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 5
- YCKPUHHMCFSUMD-IUKAMOBKSA-N Ile-Thr-Asp Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N YCKPUHHMCFSUMD-IUKAMOBKSA-N 0.000 description 5
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 5
- DLFAACQHIRSQGG-CIUDSAMLSA-N Leu-Asp-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O DLFAACQHIRSQGG-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 5
- VPKIQULSKFVCSM-SRVKXCTJSA-N Leu-Gln-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O VPKIQULSKFVCSM-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 5
- DZQMXBALGUHGJT-GUBZILKMSA-N Leu-Glu-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O DZQMXBALGUHGJT-GUBZILKMSA-N 0.000 description 5
- KWUKZRFFKPLUPE-HJGDQZAQSA-N Lys-Asp-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O KWUKZRFFKPLUPE-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 5
- AJHCSUXXECOXOY-UHFFFAOYSA-N N-glycyl-L-tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)CN)C(O)=O)=CNC2=C1 AJHCSUXXECOXOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- FRKBNXCFJBPJOL-GUBZILKMSA-N Pro-Glu-Glu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O FRKBNXCFJBPJOL-GUBZILKMSA-N 0.000 description 5
- 108010087924 alanylproline Proteins 0.000 description 5
- 108010068265 aspartyltyrosine Proteins 0.000 description 5
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 description 5
- XBGGUPMXALFZOT-UHFFFAOYSA-N glycyl-L-tyrosine hemihydrate Natural products NCC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 XBGGUPMXALFZOT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 108010089804 glycyl-threonine Proteins 0.000 description 5
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 5
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 5
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 5
- 108010018625 phenylalanylarginine Proteins 0.000 description 5
- 230000004952 protein activity Effects 0.000 description 5
- 102200151424 rs5198 Human genes 0.000 description 5
- 108010026333 seryl-proline Proteins 0.000 description 5
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 description 5
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 5
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 5
- YLTKNGYYPIWKHZ-ACZMJKKPSA-N Ala-Ala-Glu Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O YLTKNGYYPIWKHZ-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 4
- CXRCVCURMBFFOL-FXQIFTODSA-N Ala-Ala-Pro Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O CXRCVCURMBFFOL-FXQIFTODSA-N 0.000 description 4
- SDMAQFGBPOJFOM-GUBZILKMSA-N Ala-Arg-Arg Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](NC(=O)[C@@H](N)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O SDMAQFGBPOJFOM-GUBZILKMSA-N 0.000 description 4
- JAMAWBXXKFGFGX-KZVJFYERSA-N Ala-Arg-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O JAMAWBXXKFGFGX-KZVJFYERSA-N 0.000 description 4
- STACJSVFHSEZJV-GHCJXIJMSA-N Ala-Asn-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O STACJSVFHSEZJV-GHCJXIJMSA-N 0.000 description 4
- BLGHHPHXVJWCNK-GUBZILKMSA-N Ala-Gln-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O BLGHHPHXVJWCNK-GUBZILKMSA-N 0.000 description 4
- OBVSBEYOMDWLRJ-BFHQHQDPSA-N Ala-Gly-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](C)N OBVSBEYOMDWLRJ-BFHQHQDPSA-N 0.000 description 4
- QQACQIHVWCVBBR-GVARAGBVSA-N Ala-Ile-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O QQACQIHVWCVBBR-GVARAGBVSA-N 0.000 description 4
- HHRAXZAYZFFRAM-CIUDSAMLSA-N Ala-Leu-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O HHRAXZAYZFFRAM-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 4
- LDLSENBXQNDTPB-DCAQKATOSA-N Ala-Lys-Arg Chemical compound NCCCC[C@H](NC(=O)[C@@H](N)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N LDLSENBXQNDTPB-DCAQKATOSA-N 0.000 description 4
- PMQXMXAASGFUDX-SRVKXCTJSA-N Ala-Lys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](C)N)CCCCN PMQXMXAASGFUDX-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 4
- OMDNCNKNEGFOMM-BQBZGAKWSA-N Ala-Met-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)NCC(O)=O OMDNCNKNEGFOMM-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 4
- ZBLQIYPCUWZSRZ-QEJZJMRPSA-N Ala-Phe-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](C)N)CC1=CC=CC=C1 ZBLQIYPCUWZSRZ-QEJZJMRPSA-N 0.000 description 4
- IORKCNUBHNIMKY-CIUDSAMLSA-N Ala-Pro-Glu Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O IORKCNUBHNIMKY-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 4
- DYXOFPBJBAHWFY-JBDRJPRFSA-N Ala-Ser-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](C)N DYXOFPBJBAHWFY-JBDRJPRFSA-N 0.000 description 4
- KTXKIYXZQFWJKB-VZFHVOOUSA-N Ala-Thr-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O KTXKIYXZQFWJKB-VZFHVOOUSA-N 0.000 description 4
- IETUUAHKCHOQHP-KZVJFYERSA-N Ala-Thr-Val Chemical compound CC(C)[C@H](NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](C)N)[C@@H](C)O)C(O)=O IETUUAHKCHOQHP-KZVJFYERSA-N 0.000 description 4
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N Ammonia Chemical compound N QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- DFCIPNHFKOQAME-FXQIFTODSA-N Arg-Ala-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O DFCIPNHFKOQAME-FXQIFTODSA-N 0.000 description 4
- SBVJJNJLFWSJOV-UBHSHLNASA-N Arg-Ala-Phe Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 SBVJJNJLFWSJOV-UBHSHLNASA-N 0.000 description 4
- GIVATXIGCXFQQA-FXQIFTODSA-N Arg-Ala-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N GIVATXIGCXFQQA-FXQIFTODSA-N 0.000 description 4
- MAISCYVJLBBRNU-DCAQKATOSA-N Arg-Asn-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N MAISCYVJLBBRNU-DCAQKATOSA-N 0.000 description 4
- GHNDBBVSWOWYII-LPEHRKFASA-N Arg-Asn-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)C(=O)O GHNDBBVSWOWYII-LPEHRKFASA-N 0.000 description 4
- SQKPKIJVWHAWNF-DCAQKATOSA-N Arg-Asp-Lys Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O SQKPKIJVWHAWNF-DCAQKATOSA-N 0.000 description 4
- RKRSYHCNPFGMTA-CIUDSAMLSA-N Arg-Glu-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O RKRSYHCNPFGMTA-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 4
- MZRBYBIQTIKERR-GUBZILKMSA-N Arg-Glu-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O MZRBYBIQTIKERR-GUBZILKMSA-N 0.000 description 4
- CYXCAHZVPFREJD-LURJTMIESA-N Arg-Gly-Gly Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O CYXCAHZVPFREJD-LURJTMIESA-N 0.000 description 4
- OQCWXQJLCDPRHV-UWVGGRQHSA-N Arg-Gly-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O OQCWXQJLCDPRHV-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 4
- PHHRSPBBQUFULD-UWVGGRQHSA-N Arg-Gly-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N PHHRSPBBQUFULD-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 4
- PAPSMOYMQDWIOR-AVGNSLFASA-N Arg-Lys-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O PAPSMOYMQDWIOR-AVGNSLFASA-N 0.000 description 4
- BSYKSCBTTQKOJG-GUBZILKMSA-N Arg-Pro-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O BSYKSCBTTQKOJG-GUBZILKMSA-N 0.000 description 4
- OQPAZKMGCWPERI-GUBZILKMSA-N Arg-Ser-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O OQPAZKMGCWPERI-GUBZILKMSA-N 0.000 description 4
- UZSQXCMNUPKLCC-FJXKBIBVSA-N Arg-Thr-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(O)=O UZSQXCMNUPKLCC-FJXKBIBVSA-N 0.000 description 4
- UVTGNSWSRSCPLP-UHFFFAOYSA-N Arg-Tyr Natural products NC(CCNC(=N)N)C(=O)NC(Cc1ccc(O)cc1)C(=O)O UVTGNSWSRSCPLP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- GXMSVVBIAMWMKO-BQBZGAKWSA-N Asn-Arg-Gly Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)NCC(O)=O)CCCN=C(N)N GXMSVVBIAMWMKO-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 4
- HLTLEIXYIJDFOY-ZLUOBGJFSA-N Asn-Cys-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O HLTLEIXYIJDFOY-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 4
- BXUHCIXDSWRSBS-CIUDSAMLSA-N Asn-Leu-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O BXUHCIXDSWRSBS-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 4
- FHETWELNCBMRMG-HJGDQZAQSA-N Asn-Leu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O FHETWELNCBMRMG-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 4
- RAUPFUCUDBQYHE-AVGNSLFASA-N Asn-Phe-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O RAUPFUCUDBQYHE-AVGNSLFASA-N 0.000 description 4
- GFGUPLIETCNQGF-DCAQKATOSA-N Asn-Pro-His Chemical compound C1C[C@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC(=O)N)N)C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O GFGUPLIETCNQGF-DCAQKATOSA-N 0.000 description 4
- PUUPMDXIHCOPJU-HJGDQZAQSA-N Asn-Thr-Lys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N)O PUUPMDXIHCOPJU-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 4
- AMGQTNHANMRPOE-LKXGYXEUSA-N Asn-Thr-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O AMGQTNHANMRPOE-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 4
- XEDQMTWEYFBOIK-ACZMJKKPSA-N Asp-Ala-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O XEDQMTWEYFBOIK-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 4
- PMEHKVHZQKJACS-PEFMBERDSA-N Asp-Gln-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O PMEHKVHZQKJACS-PEFMBERDSA-N 0.000 description 4
- WBDWQKRLTVCDSY-WHFBIAKZSA-N Asp-Gly-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O WBDWQKRLTVCDSY-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 4
- VIRHEUMYXXLCBF-WDSKDSINSA-N Asp-Gly-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O VIRHEUMYXXLCBF-WDSKDSINSA-N 0.000 description 4
- POTCZYQVVNXUIG-BQBZGAKWSA-N Asp-Gly-Pro Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O POTCZYQVVNXUIG-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 4
- OGTCOKZFOJIZFG-CIUDSAMLSA-N Asp-His-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O OGTCOKZFOJIZFG-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 4
- UBPMOJLRVMGTOQ-GARJFASQSA-N Asp-His-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CN=CN2)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)C(=O)O UBPMOJLRVMGTOQ-GARJFASQSA-N 0.000 description 4
- PAYPSKIBMDHZPI-CIUDSAMLSA-N Asp-Leu-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O PAYPSKIBMDHZPI-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 4
- GKWFMNNNYZHJHV-SRVKXCTJSA-N Asp-Lys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O GKWFMNNNYZHJHV-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 4
- KOWYNSKRPUWSFG-IHPCNDPISA-N Asp-Phe-Trp Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC2=CNC3=CC=CC=C32)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N KOWYNSKRPUWSFG-IHPCNDPISA-N 0.000 description 4
- BWJZSLQJNBSUPM-FXQIFTODSA-N Asp-Pro-Asn Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O BWJZSLQJNBSUPM-FXQIFTODSA-N 0.000 description 4
- DRCOAZZDQRCGGP-GHCJXIJMSA-N Asp-Ser-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O DRCOAZZDQRCGGP-GHCJXIJMSA-N 0.000 description 4
- OZBXOELNJBSJOA-UBHSHLNASA-N Asp-Ser-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N OZBXOELNJBSJOA-UBHSHLNASA-N 0.000 description 4
- AWPWHMVCSISSQK-QWRGUYRKSA-N Asp-Tyr-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)NCC(O)=O AWPWHMVCSISSQK-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 4
- 241000588722 Escherichia Species 0.000 description 4
- INKFLNZBTSNFON-CIUDSAMLSA-N Gln-Ala-Arg Chemical compound NC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O INKFLNZBTSNFON-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 4
- MLZRSFQRBDNJON-GUBZILKMSA-N Gln-Ala-Lys Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N MLZRSFQRBDNJON-GUBZILKMSA-N 0.000 description 4
- XOKGKOQWADCLFQ-GARJFASQSA-N Gln-Arg-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N)C(=O)O XOKGKOQWADCLFQ-GARJFASQSA-N 0.000 description 4
- WQWMZOIPXWSZNE-WDSKDSINSA-N Gln-Asp-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O WQWMZOIPXWSZNE-WDSKDSINSA-N 0.000 description 4
- XJKAKYXMFHUIHT-AUTRQRHGSA-N Gln-Glu-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N XJKAKYXMFHUIHT-AUTRQRHGSA-N 0.000 description 4
- HDUDGCZEOZEFOA-KBIXCLLPSA-N Gln-Ile-Ala Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](C)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N HDUDGCZEOZEFOA-KBIXCLLPSA-N 0.000 description 4
- TWTWUBHEWQPMQW-ZPFDUUQYSA-N Gln-Ile-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O TWTWUBHEWQPMQW-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 4
- FNAJNWPDTIXYJN-CIUDSAMLSA-N Gln-Pro-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O FNAJNWPDTIXYJN-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 4
- UTKUTMJSWKKHEM-WDSKDSINSA-N Glu-Ala-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O UTKUTMJSWKKHEM-WDSKDSINSA-N 0.000 description 4
- IRDASPPCLZIERZ-XHNCKOQMSA-N Glu-Ala-Pro Chemical compound C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N IRDASPPCLZIERZ-XHNCKOQMSA-N 0.000 description 4
- WOMUDRVDJMHTCV-DCAQKATOSA-N Glu-Arg-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O WOMUDRVDJMHTCV-DCAQKATOSA-N 0.000 description 4
- RDPOETHPAQEGDP-ACZMJKKPSA-N Glu-Asp-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O RDPOETHPAQEGDP-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 4
- KASDBWKLWJKTLJ-GUBZILKMSA-N Glu-Glu-Met Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O KASDBWKLWJKTLJ-GUBZILKMSA-N 0.000 description 4
- WRNAXCVRSBBKGS-BQBZGAKWSA-N Glu-Gly-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O WRNAXCVRSBBKGS-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 4
- LRPXYSGPOBVBEH-IUCAKERBSA-N Glu-Gly-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O LRPXYSGPOBVBEH-IUCAKERBSA-N 0.000 description 4
- IRXNJYPKBVERCW-DCAQKATOSA-N Glu-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O IRXNJYPKBVERCW-DCAQKATOSA-N 0.000 description 4
- MWMJCGBSIORNCD-AVGNSLFASA-N Glu-Leu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O MWMJCGBSIORNCD-AVGNSLFASA-N 0.000 description 4
- SJJHXJDSNQJMMW-SRVKXCTJSA-N Glu-Lys-Arg Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O SJJHXJDSNQJMMW-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 4
- CBWKURKPYSLMJV-SOUVJXGZSA-N Glu-Phe-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=CC=C2)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)C(=O)O CBWKURKPYSLMJV-SOUVJXGZSA-N 0.000 description 4
- VJVAQZYGLMJPTK-QEJZJMRPSA-N Glu-Trp-Asp Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N VJVAQZYGLMJPTK-QEJZJMRPSA-N 0.000 description 4
- MIWJDJAMMKHUAR-ZVZYQTTQSA-N Glu-Trp-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N MIWJDJAMMKHUAR-ZVZYQTTQSA-N 0.000 description 4
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 4
- UGVQELHRNUDMAA-BYPYZUCNSA-N Gly-Ala-Gly Chemical compound [NH3+]CC(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC([O-])=O UGVQELHRNUDMAA-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 4
- XUDLUKYPXQDCRX-BQBZGAKWSA-N Gly-Arg-Asn Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O XUDLUKYPXQDCRX-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 4
- CLODWIOAKCSBAN-BQBZGAKWSA-N Gly-Arg-Asp Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](NC(=O)CN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O CLODWIOAKCSBAN-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 4
- OVSKVOOUFAKODB-UWVGGRQHSA-N Gly-Arg-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CCCN=C(N)N OVSKVOOUFAKODB-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 4
- DTPOVRRYXPJJAZ-FJXKBIBVSA-N Gly-Arg-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CCCN=C(N)N DTPOVRRYXPJJAZ-FJXKBIBVSA-N 0.000 description 4
- BULIVUZUDBHKKZ-WDSKDSINSA-N Gly-Gln-Asn Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O BULIVUZUDBHKKZ-WDSKDSINSA-N 0.000 description 4
- FIQQRCFQXGLOSZ-WDSKDSINSA-N Gly-Glu-Asp Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O FIQQRCFQXGLOSZ-WDSKDSINSA-N 0.000 description 4
- ORXZVPZCPMKHNR-IUCAKERBSA-N Gly-His-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CNC=N1 ORXZVPZCPMKHNR-IUCAKERBSA-N 0.000 description 4
- DGKBSGNCMCLDSL-BYULHYEWSA-N Gly-Ile-Asn Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)CN DGKBSGNCMCLDSL-BYULHYEWSA-N 0.000 description 4
- HMHRTKOWRUPPNU-RCOVLWMOSA-N Gly-Ile-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(O)=O HMHRTKOWRUPPNU-RCOVLWMOSA-N 0.000 description 4
- BHPQOIPBLYJNAW-NGZCFLSTSA-N Gly-Ile-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)CN BHPQOIPBLYJNAW-NGZCFLSTSA-N 0.000 description 4
- YTSVAIMKVLZUDU-YUMQZZPRSA-N Gly-Leu-Asp Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O YTSVAIMKVLZUDU-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 4
- UHPAZODVFFYEEL-QWRGUYRKSA-N Gly-Leu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)CN UHPAZODVFFYEEL-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 4
- FHQRLHFYVZAQHU-IUCAKERBSA-N Gly-Lys-Gln Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O FHQRLHFYVZAQHU-IUCAKERBSA-N 0.000 description 4
- FXLVSYVJDPCIHH-STQMWFEESA-N Gly-Phe-Arg Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O FXLVSYVJDPCIHH-STQMWFEESA-N 0.000 description 4
- YYXJFBMCOUSYSF-RYUDHWBXSA-N Gly-Phe-Gln Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O YYXJFBMCOUSYSF-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 4
- IGOYNRWLWHWAQO-JTQLQIEISA-N Gly-Phe-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CC=CC=C1 IGOYNRWLWHWAQO-JTQLQIEISA-N 0.000 description 4
- OCPPBNKYGYSLOE-IUCAKERBSA-N Gly-Pro-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CN OCPPBNKYGYSLOE-IUCAKERBSA-N 0.000 description 4
- HQSKKSLNLSTONK-JTQLQIEISA-N Gly-Tyr-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CC=C(O)C=C1 HQSKKSLNLSTONK-JTQLQIEISA-N 0.000 description 4
- RIYIFUFFFBIOEU-KBPBESRZSA-N Gly-Tyr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CC=C(O)C=C1 RIYIFUFFFBIOEU-KBPBESRZSA-N 0.000 description 4
- SYOJVRNQCXYEOV-XVKPBYJWSA-N Gly-Val-Glu Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O SYOJVRNQCXYEOV-XVKPBYJWSA-N 0.000 description 4
- RYAOJUMWLWUGNW-QMMMGPOBSA-N Gly-Val-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC(O)=O RYAOJUMWLWUGNW-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 4
- DZMVESFTHXSSPZ-XVYDVKMFSA-N His-Ala-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DZMVESFTHXSSPZ-XVYDVKMFSA-N 0.000 description 4
- TVQGUFGDVODUIF-LSJOCFKGSA-N His-Arg-Ala Chemical compound C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)N TVQGUFGDVODUIF-LSJOCFKGSA-N 0.000 description 4
- LBHOVGUGOBINDL-KKUMJFAQSA-N His-Asp-Tyr Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CN=CN2)N)O LBHOVGUGOBINDL-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 4
- QAMFAYSMNZBNCA-UWVGGRQHSA-N His-Gly-Met Chemical compound CSCC[C@H](NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)Cc1cnc[nH]1)C(O)=O QAMFAYSMNZBNCA-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 4
- XKIYNCLILDLGRS-QWRGUYRKSA-N His-Lys-Gly Chemical compound NCCCC[C@@H](C(=O)NCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 XKIYNCLILDLGRS-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 4
- QCBYAHHNOHBXIH-UWVGGRQHSA-N His-Pro-Gly Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)NCC(O)=O)C1=CN=CN1 QCBYAHHNOHBXIH-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 4
- XVZJRZQIHJMUBG-TUBUOCAGSA-N His-Thr-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)N XVZJRZQIHJMUBG-TUBUOCAGSA-N 0.000 description 4
- CMPHFUWXKBPNRS-WDSOQIARSA-N His-Val-Trp Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(O)=O)C1=CNC=N1 CMPHFUWXKBPNRS-WDSOQIARSA-N 0.000 description 4
- 108700039609 IRW peptide Proteins 0.000 description 4
- LJKDGRWXYUTRSH-YVNDNENWSA-N Ile-Gln-Gln Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)N LJKDGRWXYUTRSH-YVNDNENWSA-N 0.000 description 4
- DVRDRICMWUSCBN-UKJIMTQDSA-N Ile-Gln-Val Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)O)N DVRDRICMWUSCBN-UKJIMTQDSA-N 0.000 description 4
- RIVKTKFVWXRNSJ-GRLWGSQLSA-N Ile-Ile-Gln Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)N RIVKTKFVWXRNSJ-GRLWGSQLSA-N 0.000 description 4
- KLBVGHCGHUNHEA-BJDJZHNGSA-N Ile-Leu-Ala Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)O)N KLBVGHCGHUNHEA-BJDJZHNGSA-N 0.000 description 4
- UDBPXJNOEWDBDF-XUXIUFHCSA-N Ile-Lys-Val Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)O)N UDBPXJNOEWDBDF-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 4
- RVNOXPZHMUWCLW-GMOBBJLQSA-N Ile-Met-Asn Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N RVNOXPZHMUWCLW-GMOBBJLQSA-N 0.000 description 4
- SNHYFFQZRFIRHO-CYDGBPFRSA-N Ile-Met-Val Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)O)N SNHYFFQZRFIRHO-CYDGBPFRSA-N 0.000 description 4
- VZSDQFZFTCVEGF-ZEWNOJEFSA-N Ile-Phe-Tyr Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](Cc1ccccc1)C(=O)N[C@@H](Cc1ccc(O)cc1)C(O)=O VZSDQFZFTCVEGF-ZEWNOJEFSA-N 0.000 description 4
- IVXJIMGDOYRLQU-XUXIUFHCSA-N Ile-Pro-Leu Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O IVXJIMGDOYRLQU-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 4
- RQJUKVXWAKJDBW-SVSWQMSJSA-N Ile-Ser-Thr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)O)N RQJUKVXWAKJDBW-SVSWQMSJSA-N 0.000 description 4
- GVEODXUBBFDBPW-MGHWNKPDSA-N Ile-Tyr-Leu Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 GVEODXUBBFDBPW-MGHWNKPDSA-N 0.000 description 4
- ZGKVPOSSTGHJAF-HJPIBITLSA-N Ile-Tyr-Ser Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N ZGKVPOSSTGHJAF-HJPIBITLSA-N 0.000 description 4
- PMGDADKJMCOXHX-UHFFFAOYSA-N L-Arginyl-L-glutamin-acetat Natural products NC(=N)NCCCC(N)C(=O)NC(CCC(N)=O)C(O)=O PMGDADKJMCOXHX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- LJHGALIOHLRRQN-DCAQKATOSA-N Leu-Ala-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N LJHGALIOHLRRQN-DCAQKATOSA-N 0.000 description 4
- BOFAFKVZQUMTID-AVGNSLFASA-N Leu-Gln-His Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)N BOFAFKVZQUMTID-AVGNSLFASA-N 0.000 description 4
- ZFNLIDNJUWNIJL-WDCWCFNPSA-N Leu-Glu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O ZFNLIDNJUWNIJL-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 4
- VBZOAGIPCULURB-QWRGUYRKSA-N Leu-Gly-His Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)N VBZOAGIPCULURB-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 4
- KXODZBLFVFSLAI-AVGNSLFASA-N Leu-His-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C)CC1=CN=CN1 KXODZBLFVFSLAI-AVGNSLFASA-N 0.000 description 4
- ZRHDPZAAWLXXIR-SRVKXCTJSA-N Leu-Lys-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O ZRHDPZAAWLXXIR-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 4
- DDVHDMSBLRAKNV-IHRRRGAJSA-N Leu-Met-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O DDVHDMSBLRAKNV-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 4
- RRVCZCNFXIFGRA-DCAQKATOSA-N Leu-Pro-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O RRVCZCNFXIFGRA-DCAQKATOSA-N 0.000 description 4
- QWWPYKKLXWOITQ-VOAKCMCISA-N Leu-Thr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C QWWPYKKLXWOITQ-VOAKCMCISA-N 0.000 description 4
- VJGQRELPQWNURN-JYJNAYRXSA-N Leu-Tyr-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O VJGQRELPQWNURN-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 4
- AIMGJYMCTAABEN-GVXVVHGQSA-N Leu-Val-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O AIMGJYMCTAABEN-GVXVVHGQSA-N 0.000 description 4
- WQWZXKWOEVSGQM-DCAQKATOSA-N Lys-Ala-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN WQWZXKWOEVSGQM-DCAQKATOSA-N 0.000 description 4
- FLCMXEFCTLXBTL-DCAQKATOSA-N Lys-Asp-Arg Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)N FLCMXEFCTLXBTL-DCAQKATOSA-N 0.000 description 4
- HEWWNLVEWBJBKA-WDCWCFNPSA-N Lys-Gln-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN HEWWNLVEWBJBKA-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 4
- FHIAJWBDZVHLAH-YUMQZZPRSA-N Lys-Gly-Ser Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O FHIAJWBDZVHLAH-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 4
- XREQQOATSMMAJP-MGHWNKPDSA-N Lys-Ile-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O XREQQOATSMMAJP-MGHWNKPDSA-N 0.000 description 4
- XIZQPFCRXLUNMK-BZSNNMDCSA-N Lys-Leu-Phe Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N XIZQPFCRXLUNMK-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 4
- AZOFEHCPMBRNFD-BZSNNMDCSA-N Lys-Phe-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 AZOFEHCPMBRNFD-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 4
- YTJFXEDRUOQGSP-DCAQKATOSA-N Lys-Pro-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YTJFXEDRUOQGSP-DCAQKATOSA-N 0.000 description 4
- NQOQDINRVQCAKD-ULQDDVLXSA-N Lys-Tyr-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N NQOQDINRVQCAKD-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 4
- VHGIWFGJIHTASW-FXQIFTODSA-N Met-Ala-Asp Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O VHGIWFGJIHTASW-FXQIFTODSA-N 0.000 description 4
- GODBLDDYHFTUAH-CIUDSAMLSA-N Met-Asp-Glu Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O GODBLDDYHFTUAH-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 4
- FJVJLMZUIGMFFU-BQBZGAKWSA-N Met-Asp-Gly Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O FJVJLMZUIGMFFU-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 4
- IECZNARPMKQGJC-XIRDDKMYSA-N Met-Gln-Trp Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)O)N IECZNARPMKQGJC-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 4
- MYAPQOBHGWJZOM-UWVGGRQHSA-N Met-Gly-Leu Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C MYAPQOBHGWJZOM-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 4
- KYXDADPHSNFWQX-VEVYYDQMSA-N Met-Thr-Asp Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O KYXDADPHSNFWQX-VEVYYDQMSA-N 0.000 description 4
- CULGJGUDIJATIP-STQMWFEESA-N Met-Tyr-Gly Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)NCC(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 CULGJGUDIJATIP-STQMWFEESA-N 0.000 description 4
- SITLTJHOQZFJGG-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-valine Natural products CC(C)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O SITLTJHOQZFJGG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- PESQCPHRXOFIPX-UHFFFAOYSA-N N-L-methionyl-L-tyrosine Natural products CSCCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 PESQCPHRXOFIPX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- KZNQNBZMBZJQJO-UHFFFAOYSA-N N-glycyl-L-proline Natural products NCC(=O)N1CCCC1C(O)=O KZNQNBZMBZJQJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 108010002311 N-glycylglutamic acid Proteins 0.000 description 4
- HXSUFWQYLPKEHF-IHRRRGAJSA-N Phe-Asn-Arg Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)N HXSUFWQYLPKEHF-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 4
- KIEPQOIQHFKQLK-PCBIJLKTSA-N Phe-Asn-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O KIEPQOIQHFKQLK-PCBIJLKTSA-N 0.000 description 4
- LLGTYVHITPVGKR-RYUDHWBXSA-N Phe-Gln-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)NCC(O)=O LLGTYVHITPVGKR-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 4
- APJPXSFJBMMOLW-KBPBESRZSA-N Phe-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 APJPXSFJBMMOLW-KBPBESRZSA-N 0.000 description 4
- DNAXXTQSTKOHFO-QEJZJMRPSA-N Phe-Lys-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 DNAXXTQSTKOHFO-QEJZJMRPSA-N 0.000 description 4
- OXKJSGGTHFMGDT-UFYCRDLUSA-N Phe-Phe-Arg Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 OXKJSGGTHFMGDT-UFYCRDLUSA-N 0.000 description 4
- MMJJFXWMCMJMQA-STQMWFEESA-N Phe-Pro-Gly Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)NCC(O)=O)C1=CC=CC=C1 MMJJFXWMCMJMQA-STQMWFEESA-N 0.000 description 4
- XDMMOISUAHXXFD-SRVKXCTJSA-N Phe-Ser-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O XDMMOISUAHXXFD-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 4
- MWQXFDIQXIXPMS-UNQGMJICSA-N Phe-Val-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)N)O MWQXFDIQXIXPMS-UNQGMJICSA-N 0.000 description 4
- APZNYJFGVAGFCF-JYJNAYRXSA-N Phe-Val-Val Chemical compound CC(C)[C@H](NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)Cc1ccccc1)C(C)C)C(O)=O APZNYJFGVAGFCF-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 4
- ZSKJPKFTPQCPIH-RCWTZXSCSA-N Pro-Arg-Thr Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O ZSKJPKFTPQCPIH-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 4
- VJLJGKQAOQJXJG-CIUDSAMLSA-N Pro-Asp-Glu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O VJLJGKQAOQJXJG-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 4
- PULPZRAHVFBVTO-DCAQKATOSA-N Pro-Glu-Arg Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O PULPZRAHVFBVTO-DCAQKATOSA-N 0.000 description 4
- WVOXLKUUVCCCSU-ZPFDUUQYSA-N Pro-Glu-Ile Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O WVOXLKUUVCCCSU-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 4
- LXVLKXPFIDDHJG-CIUDSAMLSA-N Pro-Glu-Ser Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O LXVLKXPFIDDHJG-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 4
- UIMCLYYSUCIUJM-UWVGGRQHSA-N Pro-Gly-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H]1CCCN1 UIMCLYYSUCIUJM-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 4
- FEVDNIBDCRKMER-IUCAKERBSA-N Pro-Gly-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H]1CCCN1 FEVDNIBDCRKMER-IUCAKERBSA-N 0.000 description 4
- YTWNSIDWAFSEEI-RWMBFGLXSA-N Pro-His-Pro Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)N3CCC[C@@H]3C(=O)O YTWNSIDWAFSEEI-RWMBFGLXSA-N 0.000 description 4
- LNOWDSPAYBWJOR-PEDHHIEDSA-N Pro-Ile-Ile Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O LNOWDSPAYBWJOR-PEDHHIEDSA-N 0.000 description 4
- CGSOWZUPLOKYOR-AVGNSLFASA-N Pro-Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H]1NCCC1 CGSOWZUPLOKYOR-AVGNSLFASA-N 0.000 description 4
- QAAYIXYLEMRULP-SRVKXCTJSA-N Pro-Pro-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H]1NCCC1 QAAYIXYLEMRULP-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 4
- UGDMQJSXSSZUKL-IHRRRGAJSA-N Pro-Ser-Tyr Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC2=CC=C(C=C2)O)C(=O)O UGDMQJSXSSZUKL-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 4
- FDMCIBSQRKFSTJ-RHYQMDGZSA-N Pro-Thr-Leu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O FDMCIBSQRKFSTJ-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 4
- RMJZWERKFFNNNS-XGEHTFHBSA-N Pro-Thr-Ser Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O RMJZWERKFFNNNS-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 4
- CXGLFEOYCJFKPR-RCWTZXSCSA-N Pro-Thr-Val Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O CXGLFEOYCJFKPR-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 4
- YHUBAXGAAYULJY-ULQDDVLXSA-N Pro-Tyr-Leu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O YHUBAXGAAYULJY-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 4
- QDDJNKWPTJHROJ-UFYCRDLUSA-N Pro-Tyr-Tyr Chemical compound C([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H]1NCCC1)C1=CC=C(O)C=C1 QDDJNKWPTJHROJ-UFYCRDLUSA-N 0.000 description 4
- VAIZFHMTBFYJIA-ACZMJKKPSA-N Ser-Asp-Gln Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(N)=O VAIZFHMTBFYJIA-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 4
- OLIJLNWFEQEFDM-SRVKXCTJSA-N Ser-Asp-Phe Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 OLIJLNWFEQEFDM-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 4
- HJEBZBMOTCQYDN-ACZMJKKPSA-N Ser-Glu-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O HJEBZBMOTCQYDN-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 4
- DOSZISJPMCYEHT-NAKRPEOUSA-N Ser-Ile-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O DOSZISJPMCYEHT-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 4
- NLOAIFSWUUFQFR-CIUDSAMLSA-N Ser-Leu-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O NLOAIFSWUUFQFR-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 4
- UGGWCAFQPKANMW-FXQIFTODSA-N Ser-Met-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O UGGWCAFQPKANMW-FXQIFTODSA-N 0.000 description 4
- HEYZPTCCEIWHRO-IHRRRGAJSA-N Ser-Met-Phe Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 HEYZPTCCEIWHRO-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 4
- KZPRPBLHYMZIMH-MXAVVETBSA-N Ser-Phe-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O KZPRPBLHYMZIMH-MXAVVETBSA-N 0.000 description 4
- CKDXFSPMIDSMGV-GUBZILKMSA-N Ser-Pro-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O CKDXFSPMIDSMGV-GUBZILKMSA-N 0.000 description 4
- WUXCHQZLUHBSDJ-LKXGYXEUSA-N Ser-Thr-Asp Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O WUXCHQZLUHBSDJ-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 4
- PIQRHJQWEPWFJG-UWJYBYFXSA-N Ser-Tyr-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O PIQRHJQWEPWFJG-UWJYBYFXSA-N 0.000 description 4
- FGBLCMLXHRPVOF-IHRRRGAJSA-N Ser-Tyr-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O FGBLCMLXHRPVOF-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 4
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- RKDFEMGVMMYYNG-WDCWCFNPSA-N Thr-Gln-Leu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O RKDFEMGVMMYYNG-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 4
- FDALPRWYVKJCLL-PMVVWTBXSA-N Thr-His-Gly Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)NCC(O)=O FDALPRWYVKJCLL-PMVVWTBXSA-N 0.000 description 4
- YJCVECXVYHZOBK-KNZXXDILSA-N Thr-Ile-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)N YJCVECXVYHZOBK-KNZXXDILSA-N 0.000 description 4
- VRUFCJZQDACGLH-UVOCVTCTSA-N Thr-Leu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O VRUFCJZQDACGLH-UVOCVTCTSA-N 0.000 description 4
- XZUBGOYOGDRYFC-XGEHTFHBSA-N Thr-Ser-Met Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O XZUBGOYOGDRYFC-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 4
- PJCYRZVSACOYSN-ZJDVBMNYSA-N Thr-Thr-Met Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O PJCYRZVSACOYSN-ZJDVBMNYSA-N 0.000 description 4
- BZTSQFWJNJYZSX-JRQIVUDYSA-N Thr-Tyr-Asp Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O BZTSQFWJNJYZSX-JRQIVUDYSA-N 0.000 description 4
- BKVICMPZWRNWOC-RHYQMDGZSA-N Thr-Val-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)O BKVICMPZWRNWOC-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 4
- MNYNCKZAEIAONY-XGEHTFHBSA-N Thr-Val-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O MNYNCKZAEIAONY-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 4
- RNFZZCMCRDFNAE-WFBYXXMGSA-N Trp-Asn-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O RNFZZCMCRDFNAE-WFBYXXMGSA-N 0.000 description 4
- GQHAIUPYZPTADF-FDARSICLSA-N Trp-Ile-Arg Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O)=CNC2=C1 GQHAIUPYZPTADF-FDARSICLSA-N 0.000 description 4
- NWQCKAPDGQMZQN-IHPCNDPISA-N Trp-Lys-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O NWQCKAPDGQMZQN-IHPCNDPISA-N 0.000 description 4
- NESIQDDPEFTWAH-BPUTZDHNSA-N Trp-Met-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O NESIQDDPEFTWAH-BPUTZDHNSA-N 0.000 description 4
- HIZDHWHVOLUGOX-BPUTZDHNSA-N Trp-Ser-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O HIZDHWHVOLUGOX-BPUTZDHNSA-N 0.000 description 4
- XKTWZYNTLXITCY-QRTARXTBSA-N Trp-Val-Asn Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O)=CNC2=C1 XKTWZYNTLXITCY-QRTARXTBSA-N 0.000 description 4
- VCXWRWYFJLXITF-AUTRQRHGSA-N Tyr-Ala-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 VCXWRWYFJLXITF-AUTRQRHGSA-N 0.000 description 4
- DLZKEQQWXODGGZ-KWQFWETISA-N Tyr-Ala-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 DLZKEQQWXODGGZ-KWQFWETISA-N 0.000 description 4
- WTXQBCCKXIKKHB-JYJNAYRXSA-N Tyr-Arg-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O WTXQBCCKXIKKHB-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 4
- PEVVXUGSAKEPEN-AVGNSLFASA-N Tyr-Asn-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O PEVVXUGSAKEPEN-AVGNSLFASA-N 0.000 description 4
- NRFTYDWKWGJLAR-MELADBBJSA-N Tyr-Asp-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)N)C(=O)O NRFTYDWKWGJLAR-MELADBBJSA-N 0.000 description 4
- MPKPIWFFDWVJGC-IRIUXVKKSA-N Tyr-Gln-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)N)O MPKPIWFFDWVJGC-IRIUXVKKSA-N 0.000 description 4
- BXPOOVDVGWEXDU-WZLNRYEVSA-N Tyr-Ile-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O BXPOOVDVGWEXDU-WZLNRYEVSA-N 0.000 description 4
- KSCVLGXNQXKUAR-JYJNAYRXSA-N Tyr-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O KSCVLGXNQXKUAR-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 4
- WOAQYWUEUYMVGK-ULQDDVLXSA-N Tyr-Lys-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O WOAQYWUEUYMVGK-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 4
- RWOKVQUCENPXGE-IHRRRGAJSA-N Tyr-Ser-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O RWOKVQUCENPXGE-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 4
- RGJZPXFZIUUQDN-BPNCWPANSA-N Tyr-Val-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O RGJZPXFZIUUQDN-BPNCWPANSA-N 0.000 description 4
- AEOFMCAKYIQQFY-YDHLFZDLSA-N Tyr-Val-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 AEOFMCAKYIQQFY-YDHLFZDLSA-N 0.000 description 4
- OBKOPLHSRDATFO-XHSDSOJGSA-N Tyr-Val-Pro Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)N OBKOPLHSRDATFO-XHSDSOJGSA-N 0.000 description 4
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N Urea Chemical compound NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- KKHRWGYHBZORMQ-NHCYSSNCSA-N Val-Arg-Glu Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N KKHRWGYHBZORMQ-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 4
- COYSIHFOCOMGCF-WPRPVWTQSA-N Val-Arg-Gly Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)NCC(O)=O)CCCN=C(N)N COYSIHFOCOMGCF-WPRPVWTQSA-N 0.000 description 4
- COYSIHFOCOMGCF-UHFFFAOYSA-N Val-Arg-Gly Natural products CC(C)C(N)C(=O)NC(C(=O)NCC(O)=O)CCCN=C(N)N COYSIHFOCOMGCF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- CVIXTAITYJQMPE-LAEOZQHASA-N Val-Glu-Asn Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O CVIXTAITYJQMPE-LAEOZQHASA-N 0.000 description 4
- PIFJAFRUVWZRKR-QMMMGPOBSA-N Val-Gly-Gly Chemical compound CC(C)[C@H]([NH3+])C(=O)NCC(=O)NCC([O-])=O PIFJAFRUVWZRKR-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 4
- MDYSKHBSPXUOPV-JSGCOSHPSA-N Val-Gly-Phe Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)N MDYSKHBSPXUOPV-JSGCOSHPSA-N 0.000 description 4
- BZWUSZGQOILYEU-STECZYCISA-N Val-Ile-Tyr Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 BZWUSZGQOILYEU-STECZYCISA-N 0.000 description 4
- VHIZXDZMTDVFGX-DCAQKATOSA-N Val-Ser-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](C(C)C)N VHIZXDZMTDVFGX-DCAQKATOSA-N 0.000 description 4
- NZYNRRGJJVSSTJ-GUBZILKMSA-N Val-Ser-Val Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O NZYNRRGJJVSSTJ-GUBZILKMSA-N 0.000 description 4
- QHSSPPHOHJSTML-HOCLYGCPSA-N Val-Trp-Gly Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)NCC(=O)O)N QHSSPPHOHJSTML-HOCLYGCPSA-N 0.000 description 4
- 108010076324 alanyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 4
- 108010086434 alanyl-seryl-glycine Proteins 0.000 description 4
- 108010044940 alanylglutamine Proteins 0.000 description 4
- 108010070783 alanyltyrosine Proteins 0.000 description 4
- 108010050025 alpha-glutamyltryptophan Proteins 0.000 description 4
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 4
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 4
- 108010008355 arginyl-glutamine Proteins 0.000 description 4
- 108010009111 arginyl-glycyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 4
- 108010059459 arginyl-threonyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 4
- 108010060035 arginylproline Proteins 0.000 description 4
- 238000012136 culture method Methods 0.000 description 4
- 108010054812 diprotin A Proteins 0.000 description 4
- 230000008030 elimination Effects 0.000 description 4
- 238000003379 elimination reaction Methods 0.000 description 4
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 4
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 4
- 108010078144 glutaminyl-glycine Proteins 0.000 description 4
- 108010008237 glutamyl-valyl-glycine Proteins 0.000 description 4
- 108010067216 glycyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 4
- 108010045126 glycyl-tyrosyl-glycine Proteins 0.000 description 4
- 108010081551 glycylphenylalanine Proteins 0.000 description 4
- 108010077515 glycylproline Proteins 0.000 description 4
- 108010084389 glycyltryptophan Proteins 0.000 description 4
- 108010087823 glycyltyrosine Proteins 0.000 description 4
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 4
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 4
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 4
- 108010073472 leucyl-prolyl-proline Proteins 0.000 description 4
- 108010057952 lysyl-phenylalanyl-lysine Proteins 0.000 description 4
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 4
- 108010063431 methionyl-aspartyl-glycine Proteins 0.000 description 4
- 235000013379 molasses Nutrition 0.000 description 4
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 4
- 108010073025 phenylalanylphenylalanine Proteins 0.000 description 4
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 4
- 229940107700 pyruvic acid Drugs 0.000 description 4
- 108010071207 serylmethionine Proteins 0.000 description 4
- 108700004896 tripeptide FEG Proteins 0.000 description 4
- 108010005834 tyrosyl-alanyl-glycine Proteins 0.000 description 4
- 108010015385 valyl-prolyl-proline Proteins 0.000 description 4
- 108010009962 valyltyrosine Proteins 0.000 description 4
- CTMXBOCTJPQVDZ-UHFFFAOYSA-N 2,2-dihydroxy-3-methylbutanoic acid Chemical compound CC(C)C(O)(O)C(O)=O CTMXBOCTJPQVDZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- FDQYIRHBVVUTJF-ZETCQYMHSA-N His-Gly-Gly Chemical compound [O-]C(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@@H]([NH3+])CC1=CN=CN1 FDQYIRHBVVUTJF-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 3
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 description 3
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 3
- ZRLUISBDKUWAIZ-CIUDSAMLSA-N Leu-Ala-Asp Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O ZRLUISBDKUWAIZ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 3
- ILJREDZFPHTUIE-GUBZILKMSA-N Leu-Asp-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O ILJREDZFPHTUIE-GUBZILKMSA-N 0.000 description 3
- APFJUBGRZGMQFF-QWRGUYRKSA-N Leu-Gly-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN APFJUBGRZGMQFF-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 3
- HGAJNEWOUHDUMZ-SRVKXCTJSA-N Met-Leu-Glu Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O HGAJNEWOUHDUMZ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 3
- YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-leucine Natural products CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108010079364 N-glycylalanine Proteins 0.000 description 3
- OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N Phosphorus Chemical compound [P] OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- KWYUFKZDYYNOTN-UHFFFAOYSA-M Potassium hydroxide Chemical compound [OH-].[K+] KWYUFKZDYYNOTN-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- SLLKXDSRVAOREO-KZVJFYERSA-N Val-Ala-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O SLLKXDSRVAOREO-KZVJFYERSA-N 0.000 description 3
- 240000008042 Zea mays Species 0.000 description 3
- 235000005824 Zea mays ssp. parviglumis Nutrition 0.000 description 3
- 235000002017 Zea mays subsp mays Nutrition 0.000 description 3
- 108010011559 alanylphenylalanine Proteins 0.000 description 3
- 108010062796 arginyllysine Proteins 0.000 description 3
- 150000005693 branched-chain amino acids Chemical class 0.000 description 3
- 238000004422 calculation algorithm Methods 0.000 description 3
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N citric acid Chemical compound OC(=O)CC(O)(C(O)=O)CC(O)=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 235000005822 corn Nutrition 0.000 description 3
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 description 3
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 description 3
- 108010063718 gamma-glutamylaspartic acid Proteins 0.000 description 3
- 239000007789 gas Substances 0.000 description 3
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 description 3
- 229960002989 glutamic acid Drugs 0.000 description 3
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 description 3
- 101150060643 ilvN gene Proteins 0.000 description 3
- 229960003136 leucine Drugs 0.000 description 3
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 3
- 229960004452 methionine Drugs 0.000 description 3
- 235000006109 methionine Nutrition 0.000 description 3
- 230000002018 overexpression Effects 0.000 description 3
- 229910052698 phosphorus Inorganic materials 0.000 description 3
- 239000011574 phosphorus Substances 0.000 description 3
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 3
- 238000011160 research Methods 0.000 description 3
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 3
- 230000003827 upregulation Effects 0.000 description 3
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000003313 weakening effect Effects 0.000 description 3
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 2
- 108020003589 5' Untranslated Regions Proteins 0.000 description 2
- SVBXIUDNTRTKHE-CIUDSAMLSA-N Ala-Arg-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O SVBXIUDNTRTKHE-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- ZEXDYVGDZJBRMO-ACZMJKKPSA-N Ala-Asn-Gln Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)N ZEXDYVGDZJBRMO-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- NHCPCLJZRSIDHS-ZLUOBGJFSA-N Ala-Asp-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O NHCPCLJZRSIDHS-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 2
- LGFCAXJBAZESCF-ACZMJKKPSA-N Ala-Gln-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O LGFCAXJBAZESCF-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- GRPHQEMIFDPKOE-HGNGGELXSA-N Ala-His-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O GRPHQEMIFDPKOE-HGNGGELXSA-N 0.000 description 2
- DVJSJDDYCYSMFR-ZKWXMUAHSA-N Ala-Ile-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(O)=O DVJSJDDYCYSMFR-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 2
- RZZMZYZXNJRPOJ-BJDJZHNGSA-N Ala-Ile-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C)N RZZMZYZXNJRPOJ-BJDJZHNGSA-N 0.000 description 2
- LNNSWWRRYJLGNI-NAKRPEOUSA-N Ala-Ile-Val Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O LNNSWWRRYJLGNI-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 2
- OEVCHROQUIVQFZ-YTLHQDLWSA-N Ala-Thr-Ala Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O OEVCHROQUIVQFZ-YTLHQDLWSA-N 0.000 description 2
- NLXLAEXVIDQMFP-UHFFFAOYSA-N Ammonia chloride Chemical compound [NH4+].[Cl-] NLXLAEXVIDQMFP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JSHVMZANPXCDTL-GMOBBJLQSA-N Arg-Asp-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O JSHVMZANPXCDTL-GMOBBJLQSA-N 0.000 description 2
- LMPKCSXZJSXBBL-NHCYSSNCSA-N Arg-Gln-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O LMPKCSXZJSXBBL-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 2
- NMRHDSAOIURTNT-RWMBFGLXSA-N Arg-Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N NMRHDSAOIURTNT-RWMBFGLXSA-N 0.000 description 2
- CLICCYPMVFGUOF-IHRRRGAJSA-N Arg-Lys-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O CLICCYPMVFGUOF-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- XYOVHPDDWCEUDY-CIUDSAMLSA-N Asn-Ala-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O XYOVHPDDWCEUDY-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- JJGRJMKUOYXZRA-LPEHRKFASA-N Asn-Arg-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N)C(=O)O JJGRJMKUOYXZRA-LPEHRKFASA-N 0.000 description 2
- AYZAWXAPBAYCHO-CIUDSAMLSA-N Asn-Asn-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N AYZAWXAPBAYCHO-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- BHQQRVARKXWXPP-ACZMJKKPSA-N Asn-Asp-Glu Chemical compound C(CC(=O)O)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N BHQQRVARKXWXPP-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- SPIPSJXLZVTXJL-ZLUOBGJFSA-N Asn-Cys-Ser Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SPIPSJXLZVTXJL-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 2
- UBKOVSLDWIHYSY-ACZMJKKPSA-N Asn-Glu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O UBKOVSLDWIHYSY-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- GQRDIVQPSMPQME-ZPFDUUQYSA-N Asn-Ile-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O GQRDIVQPSMPQME-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 2
- HZZIFFOVHLWGCS-KKUMJFAQSA-N Asn-Phe-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O HZZIFFOVHLWGCS-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- SKQTXVZTCGSRJS-SRVKXCTJSA-N Asn-Tyr-Asp Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N)O SKQTXVZTCGSRJS-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- HPNDBHLITCHRSO-WHFBIAKZSA-N Asp-Ala-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O HPNDBHLITCHRSO-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- UQBGYPFHWFZMCD-ZLUOBGJFSA-N Asp-Asn-Asn Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O UQBGYPFHWFZMCD-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 2
- JDHOJQJMWBKHDB-CIUDSAMLSA-N Asp-Asn-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N JDHOJQJMWBKHDB-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- PDECQIHABNQRHN-GUBZILKMSA-N Asp-Glu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O PDECQIHABNQRHN-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- KTTCQQNRRLCIBC-GHCJXIJMSA-N Asp-Ile-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O KTTCQQNRRLCIBC-GHCJXIJMSA-N 0.000 description 2
- NHSDEZURHWEZPN-SXTJYALSSA-N Asp-Ile-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N NHSDEZURHWEZPN-SXTJYALSSA-N 0.000 description 2
- YFSLJHLQOALGSY-ZPFDUUQYSA-N Asp-Ile-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N YFSLJHLQOALGSY-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 2
- JNNVNVRBYUJYGS-CIUDSAMLSA-N Asp-Leu-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O JNNVNVRBYUJYGS-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- JUWISGAGWSDGDH-KKUMJFAQSA-N Asp-Phe-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JUWISGAGWSDGDH-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- NONWUQAWAANERO-BZSNNMDCSA-N Asp-Phe-Tyr Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](CC(O)=O)N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 NONWUQAWAANERO-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 2
- HICVMZCGVFKTPM-BQBZGAKWSA-N Asp-Pro-Gly Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(O)=O HICVMZCGVFKTPM-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- MVRGBQGZSDJBSM-GMOBBJLQSA-N Asp-Pro-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](CC(=O)O)N MVRGBQGZSDJBSM-GMOBBJLQSA-N 0.000 description 2
- SQIARYGNVQWOSB-BZSNNMDCSA-N Asp-Tyr-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O SQIARYGNVQWOSB-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 2
- VTYYLEPIZMXCLO-UHFFFAOYSA-L Calcium carbonate Chemical compound [Ca+2].[O-]C([O-])=O VTYYLEPIZMXCLO-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- CURLTUGMZLYLDI-UHFFFAOYSA-N Carbon dioxide Chemical compound O=C=O CURLTUGMZLYLDI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- VZRAXPGTUNDIDK-GUBZILKMSA-N Gln-Leu-Asn Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N VZRAXPGTUNDIDK-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- MXOODARRORARSU-ACZMJKKPSA-N Glu-Ala-Ser Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N MXOODARRORARSU-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- NCWOMXABNYEPLY-NRPADANISA-N Glu-Ala-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O NCWOMXABNYEPLY-NRPADANISA-N 0.000 description 2
- AKJRHDMTEJXTPV-ACZMJKKPSA-N Glu-Asn-Ala Chemical compound C[C@H](NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O)C(O)=O AKJRHDMTEJXTPV-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- GPSHCSTUYOQPAI-JHEQGTHGSA-N Glu-Thr-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(O)=O GPSHCSTUYOQPAI-JHEQGTHGSA-N 0.000 description 2
- QXUPRMQJDWJDFR-NRPADANISA-N Glu-Val-Ser Chemical compound CC(C)[C@H](NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O QXUPRMQJDWJDFR-NRPADANISA-N 0.000 description 2
- PYTZFYUXZZHOAD-WHFBIAKZSA-N Gly-Ala-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)CN PYTZFYUXZZHOAD-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- CIMULJZTTOBOPN-WHFBIAKZSA-N Gly-Asn-Asn Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O CIMULJZTTOBOPN-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- YYPFZVIXAVDHIK-IUCAKERBSA-N Gly-Glu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)CN YYPFZVIXAVDHIK-IUCAKERBSA-N 0.000 description 2
- UFPXDFOYHVEIPI-BYPYZUCNSA-N Gly-Gly-Asp Chemical compound NCC(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O UFPXDFOYHVEIPI-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 2
- GDOZQTNZPCUARW-YFKPBYRVSA-N Gly-Gly-Glu Chemical compound NCC(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O GDOZQTNZPCUARW-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 2
- XPJBQTCXPJNIFE-ZETCQYMHSA-N Gly-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)CN XPJBQTCXPJNIFE-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 2
- BUEFQXUHTUZXHR-LURJTMIESA-N Gly-Gly-Pro zwitterion Chemical compound NCC(=O)NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O BUEFQXUHTUZXHR-LURJTMIESA-N 0.000 description 2
- SWQALSGKVLYKDT-UHFFFAOYSA-N Gly-Ile-Ala Natural products NCC(=O)NC(C(C)CC)C(=O)NC(C)C(O)=O SWQALSGKVLYKDT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- LCRDMSSAKLTKBU-ZDLURKLDSA-N Gly-Ser-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)CN LCRDMSSAKLTKBU-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 2
- LYZYGGWCBLBDMC-QWHCGFSZSA-N Gly-Tyr-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)NC(=O)CN)C(=O)O LYZYGGWCBLBDMC-QWHCGFSZSA-N 0.000 description 2
- GJHWILMUOANXTG-WPRPVWTQSA-N Gly-Val-Arg Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O GJHWILMUOANXTG-WPRPVWTQSA-N 0.000 description 2
- KSOBNUBCYHGUKH-UWVGGRQHSA-N Gly-Val-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)CN KSOBNUBCYHGUKH-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- IGBBXBFSLKRHJB-BZSNNMDCSA-N His-Lys-Phe Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CN=CN1 IGBBXBFSLKRHJB-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 2
- CCUSLCQWVMWTIS-IXOXFDKPSA-N His-Thr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O CCUSLCQWVMWTIS-IXOXFDKPSA-N 0.000 description 2
- FRDFAWHTPDKRHG-ULQDDVLXSA-N His-Tyr-Arg Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O)C1=CN=CN1 FRDFAWHTPDKRHG-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 2
- ISQOVWDWRUONJH-YESZJQIVSA-N His-Tyr-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)NC(=O)[C@H](CC3=CN=CN3)N)C(=O)O ISQOVWDWRUONJH-YESZJQIVSA-N 0.000 description 2
- LVQDUPQUJZWKSU-PYJNHQTQSA-N Ile-Arg-His Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)N LVQDUPQUJZWKSU-PYJNHQTQSA-N 0.000 description 2
- NKRJALPCDNXULF-BYULHYEWSA-N Ile-Asp-Gly Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O NKRJALPCDNXULF-BYULHYEWSA-N 0.000 description 2
- LBRCLQMZAHRTLV-ZKWXMUAHSA-N Ile-Gly-Ser Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O LBRCLQMZAHRTLV-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 2
- PKGGWLOLRLOPGK-XUXIUFHCSA-N Ile-Leu-Arg Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N PKGGWLOLRLOPGK-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 2
- JHNJNTMTZHEDLJ-NAKRPEOUSA-N Ile-Ser-Arg Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O JHNJNTMTZHEDLJ-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 2
- WXLYNEHOGRYNFU-URLPEUOOSA-N Ile-Thr-Phe Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)N WXLYNEHOGRYNFU-URLPEUOOSA-N 0.000 description 2
- DGTOKVBDZXJHNZ-WZLNRYEVSA-N Ile-Thr-Tyr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)O)N DGTOKVBDZXJHNZ-WZLNRYEVSA-N 0.000 description 2
- HQLSBZFLOUHQJK-STECZYCISA-N Ile-Tyr-Arg Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)N HQLSBZFLOUHQJK-STECZYCISA-N 0.000 description 2
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 description 2
- 229930182844 L-isoleucine Natural products 0.000 description 2
- 239000004395 L-leucine Substances 0.000 description 2
- 235000019454 L-leucine Nutrition 0.000 description 2
- KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N L-lysine Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 2
- UCOCBWDBHCUPQP-DCAQKATOSA-N Leu-Arg-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O UCOCBWDBHCUPQP-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- WGNOPSQMIQERPK-UHFFFAOYSA-N Leu-Asn-Pro Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(CC(=O)N)C(=O)N1CCCC1C(=O)O WGNOPSQMIQERPK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- DLCOFDAHNMMQPP-SRVKXCTJSA-N Leu-Asp-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O DLCOFDAHNMMQPP-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- IWTBYNQNAPECCS-AVGNSLFASA-N Leu-Glu-His Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 IWTBYNQNAPECCS-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- USLNHQZCDQJBOV-ZPFDUUQYSA-N Leu-Ile-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O USLNHQZCDQJBOV-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 2
- IRNSXVOWSXSULE-DCAQKATOSA-N Lys-Ala-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN IRNSXVOWSXSULE-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- WGLAORUKDGRINI-WDCWCFNPSA-N Lys-Glu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O WGLAORUKDGRINI-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 2
- VUTWYNQUSJWBHO-BZSNNMDCSA-N Lys-Leu-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O VUTWYNQUSJWBHO-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 2
- NYTDJEZBAAFLLG-IHRRRGAJSA-N Lys-Val-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O NYTDJEZBAAFLLG-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 2
- CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L Magnesium sulfate Chemical compound [Mg+2].[O-][S+2]([O-])([O-])[O-] CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- DBXMFHGGHMXYHY-DCAQKATOSA-N Met-Leu-Ser Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DBXMFHGGHMXYHY-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- UNPGTBHYKJOCCZ-DCAQKATOSA-N Met-Lys-Ala Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O UNPGTBHYKJOCCZ-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- HAQLBBVZAGMESV-IHRRRGAJSA-N Met-Lys-Lys Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O HAQLBBVZAGMESV-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- CNTNPWWHFWAZGA-JYJNAYRXSA-N Met-Met-Phe Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 CNTNPWWHFWAZGA-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 2
- FBLBCGLSRXBANI-KKUMJFAQSA-N Met-Phe-Glu Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N FBLBCGLSRXBANI-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- HUURTRNKPBHHKZ-JYJNAYRXSA-N Met-Phe-Val Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 HUURTRNKPBHHKZ-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 2
- DFPAKSUCGFBDDF-UHFFFAOYSA-N Nicotinamide Chemical compound NC(=O)C1=CC=CN=C1 DFPAKSUCGFBDDF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 2
- XXAOSEUPEMQJOF-KKUMJFAQSA-N Phe-Glu-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 XXAOSEUPEMQJOF-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- XEXSSIBQYNKFBX-KBPBESRZSA-N Phe-Gly-His Chemical compound C([C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC=1N=CNC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 XEXSSIBQYNKFBX-KBPBESRZSA-N 0.000 description 2
- YOFKMVUAZGPFCF-IHRRRGAJSA-N Phe-Met-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O YOFKMVUAZGPFCF-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- MGLBSROLWAWCKN-FCLVOEFKSA-N Phe-Phe-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O MGLBSROLWAWCKN-FCLVOEFKSA-N 0.000 description 2
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N Phosphoric acid Chemical compound OP(O)(O)=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- NHDVNAKDACFHPX-GUBZILKMSA-N Pro-Arg-Ala Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O NHDVNAKDACFHPX-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- IHCXPSYCHXFXKT-DCAQKATOSA-N Pro-Arg-Glu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O IHCXPSYCHXFXKT-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- AHXPYZRZRMQOAU-QXEWZRGKSA-N Pro-Asn-Val Chemical compound CC(C)[C@H](NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1)C(O)=O AHXPYZRZRMQOAU-QXEWZRGKSA-N 0.000 description 2
- CJZTUKSFZUSNCC-FXQIFTODSA-N Pro-Asp-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 CJZTUKSFZUSNCC-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- UUHXBJHVTVGSKM-BQBZGAKWSA-N Pro-Gly-Asn Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O UUHXBJHVTVGSKM-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- QUBVFEANYYWBTM-VEVYYDQMSA-N Pro-Thr-Asp Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O QUBVFEANYYWBTM-VEVYYDQMSA-N 0.000 description 2
- SFTZTYBXIXLRGQ-JBDRJPRFSA-N Ser-Ile-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O SFTZTYBXIXLRGQ-JBDRJPRFSA-N 0.000 description 2
- KCNSGAMPBPYUAI-CIUDSAMLSA-N Ser-Leu-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O KCNSGAMPBPYUAI-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- IAORETPTUDBBGV-CIUDSAMLSA-N Ser-Leu-Cys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N IAORETPTUDBBGV-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- VGQVAVQWKJLIRM-FXQIFTODSA-N Ser-Ser-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O VGQVAVQWKJLIRM-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- ZKOKTQPHFMRSJP-YJRXYDGGSA-N Ser-Thr-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O ZKOKTQPHFMRSJP-YJRXYDGGSA-N 0.000 description 2
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N Sulfuric acid Chemical compound OS(O)(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KBLYJPQSNGTDIU-LOKLDPHHSA-N Thr-Glu-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N)O KBLYJPQSNGTDIU-LOKLDPHHSA-N 0.000 description 2
- ONNSECRQFSTMCC-XKBZYTNZSA-N Thr-Glu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O ONNSECRQFSTMCC-XKBZYTNZSA-N 0.000 description 2
- QQWNRERCGGZOKG-WEDXCCLWSA-N Thr-Gly-Leu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O QQWNRERCGGZOKG-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 2
- DJDSEDOKJTZBAR-ZDLURKLDSA-N Thr-Gly-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DJDSEDOKJTZBAR-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 2
- KZURUCDWKDEAFZ-XVSYOHENSA-N Thr-Phe-Asn Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N)O KZURUCDWKDEAFZ-XVSYOHENSA-N 0.000 description 2
- YYXIWHBHTARPOG-HJXMPXNTSA-N Trp-Ile-Ala Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](C)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)N YYXIWHBHTARPOG-HJXMPXNTSA-N 0.000 description 2
- AKXBNSZMYAOGLS-STQMWFEESA-N Tyr-Arg-Gly Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(=O)NCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 AKXBNSZMYAOGLS-STQMWFEESA-N 0.000 description 2
- NGALWFGCOMHUSN-AVGNSLFASA-N Tyr-Gln-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O NGALWFGCOMHUSN-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- IMXAAEFAIBRCQF-SIUGBPQLSA-N Tyr-Glu-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)N IMXAAEFAIBRCQF-SIUGBPQLSA-N 0.000 description 2
- KZOZXAYPVKKDIO-UFYCRDLUSA-N Tyr-Met-Tyr Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 KZOZXAYPVKKDIO-UFYCRDLUSA-N 0.000 description 2
- ZZDYJFVIKVSUFA-WLTAIBSBSA-N Tyr-Thr-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(O)=O ZZDYJFVIKVSUFA-WLTAIBSBSA-N 0.000 description 2
- RVGVIWNHABGIFH-IHRRRGAJSA-N Tyr-Val-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O RVGVIWNHABGIFH-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- XPYNXORPPVTVQK-SRVKXCTJSA-N Val-Arg-Met Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)O)N XPYNXORPPVTVQK-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- HHSILIQTHXABKM-YDHLFZDLSA-N Val-Asp-Phe Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](Cc1ccccc1)C(O)=O HHSILIQTHXABKM-YDHLFZDLSA-N 0.000 description 2
- LYERIXUFCYVFFX-GVXVVHGQSA-N Val-Leu-Glu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N LYERIXUFCYVFFX-GVXVVHGQSA-N 0.000 description 2
- ZZGPVSZDZQRJQY-ULQDDVLXSA-N Val-Leu-Phe Chemical compound CC(C)C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)C(C)C)C(=O)N[C@@H](Cc1ccccc1)C(O)=O ZZGPVSZDZQRJQY-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 2
- RLVTVHSDKHBFQP-ULQDDVLXSA-N Val-Tyr-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)C(C)C)CC1=CC=C(O)C=C1 RLVTVHSDKHBFQP-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 2
- NLNCNKIVJPEFBC-DLOVCJGASA-N Val-Val-Glu Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O NLNCNKIVJPEFBC-DLOVCJGASA-N 0.000 description 2
- 108010081404 acein-2 Proteins 0.000 description 2
- ZSLZBFCDCINBPY-ZSJPKINUSA-N acetyl-CoA Chemical compound O[C@@H]1[C@H](OP(O)(O)=O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OCC(C)(C)[C@@H](O)C(=O)NCCC(=O)NCCSC(=O)C)O[C@H]1N1C2=NC=NC(N)=C2N=C1 ZSLZBFCDCINBPY-ZSJPKINUSA-N 0.000 description 2
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 2
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 2
- 108010041407 alanylaspartic acid Proteins 0.000 description 2
- 229910021529 ammonia Inorganic materials 0.000 description 2
- 108010031045 aspartyl-glycyl-aspartyl-alanine Proteins 0.000 description 2
- 108010069205 aspartyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 2
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical compound [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000006696 biosynthetic metabolic pathway Effects 0.000 description 2
- 229940041514 candida albicans extract Drugs 0.000 description 2
- 239000004202 carbamide Substances 0.000 description 2
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 2
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 description 2
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 2
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 2
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 2
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 2
- 239000007857 degradation product Substances 0.000 description 2
- 239000012153 distilled water Substances 0.000 description 2
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 235000004554 glutamine Nutrition 0.000 description 2
- 229960002743 glutamine Drugs 0.000 description 2
- 108010079547 glutamylmethionine Proteins 0.000 description 2
- 108010051307 glycyl-glycyl-proline Proteins 0.000 description 2
- 108010082286 glycyl-seryl-alanine Proteins 0.000 description 2
- 108010040030 histidinoalanine Proteins 0.000 description 2
- 108010028295 histidylhistidine Proteins 0.000 description 2
- 108010025306 histidylleucine Proteins 0.000 description 2
- 101150077793 ilvH gene Proteins 0.000 description 2
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 2
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 2
- 150000002484 inorganic compounds Chemical class 0.000 description 2
- 229910010272 inorganic material Inorganic materials 0.000 description 2
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 2
- 108010078274 isoleucylvaline Proteins 0.000 description 2
- JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N lactic acid Chemical compound CC(O)C(O)=O JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 2
- 235000018977 lysine Nutrition 0.000 description 2
- 229960003646 lysine Drugs 0.000 description 2
- 108010012988 lysyl-glutamyl-aspartyl-glycine Proteins 0.000 description 2
- -1 malt extract Substances 0.000 description 2
- 235000013372 meat Nutrition 0.000 description 2
- 239000002207 metabolite Substances 0.000 description 2
- 102000035118 modified proteins Human genes 0.000 description 2
- 108091005573 modified proteins Proteins 0.000 description 2
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 2
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 2
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 2
- 239000001301 oxygen Substances 0.000 description 2
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 description 2
- 108010051242 phenylalanylserine Proteins 0.000 description 2
- 230000008569 process Effects 0.000 description 2
- 239000000047 product Substances 0.000 description 2
- 239000013587 production medium Substances 0.000 description 2
- 108010079317 prolyl-tyrosine Proteins 0.000 description 2
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 2
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 2
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 2
- 230000005030 transcription termination Effects 0.000 description 2
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 2
- 108010037335 tyrosyl-prolyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 2
- 108010003137 tyrosyltyrosine Proteins 0.000 description 2
- 108010073969 valyllysine Proteins 0.000 description 2
- 239000011782 vitamin Substances 0.000 description 2
- 235000013343 vitamin Nutrition 0.000 description 2
- 229940088594 vitamin Drugs 0.000 description 2
- 229930003231 vitamin Natural products 0.000 description 2
- 239000012138 yeast extract Substances 0.000 description 2
- MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N (2S)-2-Amino-3-hydroxypropansäure Chemical compound OC[C@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- NMDWGEGFJUBKLB-YFKPBYRVSA-N (2S)-2-hydroxy-2-methyl-3-oxobutanoic acid Chemical compound CC(=O)[C@](C)(O)C(O)=O NMDWGEGFJUBKLB-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- BITYXLXUCSKTJS-ZETCQYMHSA-N (2S)-2-isopropylmalic acid Chemical compound CC(C)[C@](O)(C(O)=O)CC(O)=O BITYXLXUCSKTJS-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 1
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 1
- OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 100676-05-9 Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OCC1C(O)C(O)C(O)C(OC2C(OC(O)C(O)C2O)CO)O1 OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PAWQVTBBRAZDMG-UHFFFAOYSA-N 2-(3-bromo-2-fluorophenyl)acetic acid Chemical compound OC(=O)CC1=CC=CC(Br)=C1F PAWQVTBBRAZDMG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PPINMSZPTPRQQB-NHCYSSNCSA-N 2-[[(2s)-1-[(2s)-2-[[(2s)-2-amino-3-methylbutanoyl]amino]propanoyl]pyrrolidine-2-carbonyl]amino]acetic acid Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(O)=O PPINMSZPTPRQQB-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- WTLNOANVTIKPEE-UHFFFAOYSA-N 2-acetyloxypropanoic acid Chemical compound OC(=O)C(C)OC(C)=O WTLNOANVTIKPEE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- TYEYBOSBBBHJIV-UHFFFAOYSA-N 2-oxobutanoic acid Chemical compound CCC(=O)C(O)=O TYEYBOSBBBHJIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YLZOPXRUQYQQID-UHFFFAOYSA-N 3-(2,4,6,7-tetrahydrotriazolo[4,5-c]pyridin-5-yl)-1-[4-[2-[[3-(trifluoromethoxy)phenyl]methylamino]pyrimidin-5-yl]piperazin-1-yl]propan-1-one Chemical compound N1N=NC=2CN(CCC=21)CCC(=O)N1CCN(CC1)C=1C=NC(=NC=1)NCC1=CC(=CC=C1)OC(F)(F)F YLZOPXRUQYQQID-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RNQHMTFBUSSBJQ-WHFBIAKZSA-N 3-isopropylmalic acid Chemical compound CC(C)[C@H](C(O)=O)[C@H](O)C(O)=O RNQHMTFBUSSBJQ-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- BKAJNAXTPSGJCU-UHFFFAOYSA-N 4-methyl-2-oxopentanoic acid Chemical compound CC(C)CC(=O)C(O)=O BKAJNAXTPSGJCU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DEXFNLNNUZKHNO-UHFFFAOYSA-N 6-[3-[4-[2-(2,3-dihydro-1H-inden-2-ylamino)pyrimidin-5-yl]piperidin-1-yl]-3-oxopropyl]-3H-1,3-benzoxazol-2-one Chemical compound C1C(CC2=CC=CC=C12)NC1=NC=C(C=N1)C1CCN(CC1)C(CCC1=CC2=C(NC(O2)=O)C=C1)=O DEXFNLNNUZKHNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010000700 Acetolactate synthase Proteins 0.000 description 1
- 241000251468 Actinopterygii Species 0.000 description 1
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 1
- HHGYNJRJIINWAK-FXQIFTODSA-N Ala-Ala-Arg Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N HHGYNJRJIINWAK-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- RLMISHABBKUNFO-WHFBIAKZSA-N Ala-Ala-Gly Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O RLMISHABBKUNFO-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- WMYJZJRILUVVRG-WDSKDSINSA-N Ala-Gly-Gln Chemical compound C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(N)=O WMYJZJRILUVVRG-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- VGPWRRFOPXVGOH-BYPYZUCNSA-N Ala-Gly-Gly Chemical compound C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O VGPWRRFOPXVGOH-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- SMCGQGDVTPFXKB-XPUUQOCRSA-N Ala-Gly-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](C)N SMCGQGDVTPFXKB-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 1
- LTSBJNNXPBBNDT-HGNGGELXSA-N Ala-His-Gln Chemical compound N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)O LTSBJNNXPBBNDT-HGNGGELXSA-N 0.000 description 1
- OKEWAFFWMHBGPT-XPUUQOCRSA-N Ala-His-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)C)CC1=CN=CN1 OKEWAFFWMHBGPT-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 1
- YHKANGMVQWRMAP-DCAQKATOSA-N Ala-Leu-Arg Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N YHKANGMVQWRMAP-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- UWIQWPWWZUHBAO-ZLIFDBKOSA-N Ala-Leu-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](C)N)CC(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 UWIQWPWWZUHBAO-ZLIFDBKOSA-N 0.000 description 1
- MDNAVFBZPROEHO-DCAQKATOSA-N Ala-Lys-Val Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O MDNAVFBZPROEHO-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- RAAWHFXHAACDFT-FXQIFTODSA-N Ala-Met-Asn Chemical compound CSCC[C@H](NC(=O)[C@H](C)N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O RAAWHFXHAACDFT-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- DEWWPUNXRNGMQN-LPEHRKFASA-N Ala-Met-Pro Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N DEWWPUNXRNGMQN-LPEHRKFASA-N 0.000 description 1
- CNQAFFMNJIQYGX-DRZSPHRISA-N Ala-Phe-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)C)CC1=CC=CC=C1 CNQAFFMNJIQYGX-DRZSPHRISA-N 0.000 description 1
- CYBJZLQSUJEMAS-LFSVMHDDSA-N Ala-Phe-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)NC(=O)[C@H](C)N)O CYBJZLQSUJEMAS-LFSVMHDDSA-N 0.000 description 1
- IPZQNYYAYVRKKK-FXQIFTODSA-N Ala-Pro-Ala Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O IPZQNYYAYVRKKK-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- VQAVBBCZFQAAED-FXQIFTODSA-N Ala-Pro-Asn Chemical compound C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N VQAVBBCZFQAAED-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- HOVPGJUNRLMIOZ-CIUDSAMLSA-N Ala-Ser-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](C)N HOVPGJUNRLMIOZ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- MMLHRUJLOUSRJX-CIUDSAMLSA-N Ala-Ser-Lys Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN MMLHRUJLOUSRJX-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- CREYEAPXISDKSB-FQPOAREZSA-N Ala-Thr-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O CREYEAPXISDKSB-FQPOAREZSA-N 0.000 description 1
- AENHOIXXHKNIQL-AUTRQRHGSA-N Ala-Tyr-Ala Chemical compound [O-]C(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H]([NH3+])C)CC1=CC=C(O)C=C1 AENHOIXXHKNIQL-AUTRQRHGSA-N 0.000 description 1
- MTDDMSUUXNQMKK-BPNCWPANSA-N Ala-Tyr-Arg Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)N MTDDMSUUXNQMKK-BPNCWPANSA-N 0.000 description 1
- JPOQZCHGOTWRTM-FQPOAREZSA-N Ala-Tyr-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O JPOQZCHGOTWRTM-FQPOAREZSA-N 0.000 description 1
- LYILPUNCKACNGF-NAKRPEOUSA-N Ala-Val-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](C)N LYILPUNCKACNGF-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N Alpha-Lactose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)O[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N 0.000 description 1
- USFZMSVCRYTOJT-UHFFFAOYSA-N Ammonium acetate Chemical compound N.CC(O)=O USFZMSVCRYTOJT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000005695 Ammonium acetate Substances 0.000 description 1
- ATRRKUHOCOJYRX-UHFFFAOYSA-N Ammonium bicarbonate Chemical compound [NH4+].OC([O-])=O ATRRKUHOCOJYRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VHUUQVKOLVNVRT-UHFFFAOYSA-N Ammonium hydroxide Chemical compound [NH4+].[OH-] VHUUQVKOLVNVRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004254 Ammonium phosphate Substances 0.000 description 1
- 108020005544 Antisense RNA Proteins 0.000 description 1
- 101100533902 Arabidopsis thaliana SPL13A gene Proteins 0.000 description 1
- 101100533904 Arabidopsis thaliana SPL13B gene Proteins 0.000 description 1
- YYOVLDPHIJAOSY-DCAQKATOSA-N Arg-Ala-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N YYOVLDPHIJAOSY-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- OTOXOKCIIQLMFH-KZVJFYERSA-N Arg-Ala-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N OTOXOKCIIQLMFH-KZVJFYERSA-N 0.000 description 1
- XPSGESXVBSQZPL-SRVKXCTJSA-N Arg-Arg-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O XPSGESXVBSQZPL-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- BIOCIVSVEDFKDJ-GUBZILKMSA-N Arg-Arg-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O BIOCIVSVEDFKDJ-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- DCGLNNVKIZXQOJ-FXQIFTODSA-N Arg-Asn-Ala Chemical compound C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N DCGLNNVKIZXQOJ-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- DPXDVGDLWJYZBH-GUBZILKMSA-N Arg-Asn-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O DPXDVGDLWJYZBH-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- DGFGDPVSDQPANQ-XGEHTFHBSA-N Arg-Cys-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)O DGFGDPVSDQPANQ-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- PBSOQGZLPFVXPU-YUMQZZPRSA-N Arg-Glu-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O PBSOQGZLPFVXPU-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- OHYQKYUTLIPFOX-ZPFDUUQYSA-N Arg-Glu-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O OHYQKYUTLIPFOX-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 1
- YVTHEZNOKSAWRW-DCAQKATOSA-N Arg-Lys-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O YVTHEZNOKSAWRW-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- BNYNOWJESJJIOI-XUXIUFHCSA-N Arg-Lys-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N BNYNOWJESJJIOI-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 1
- ZPWMEWYQBWSGAO-ZJDVBMNYSA-N Arg-Thr-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O ZPWMEWYQBWSGAO-ZJDVBMNYSA-N 0.000 description 1
- PJOPLXOCKACMLK-KKUMJFAQSA-N Arg-Tyr-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O PJOPLXOCKACMLK-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- CNBIWSCSSCAINS-UFYCRDLUSA-N Arg-Tyr-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O CNBIWSCSSCAINS-UFYCRDLUSA-N 0.000 description 1
- XEOXPCNONWHHSW-AVGNSLFASA-N Arg-Val-His Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N XEOXPCNONWHHSW-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 1
- NXVGBGZQQFDUTM-XVYDVKMFSA-N Asn-Ala-His Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N NXVGBGZQQFDUTM-XVYDVKMFSA-N 0.000 description 1
- CMLGVVWQQHUXOZ-GHCJXIJMSA-N Asn-Ala-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O CMLGVVWQQHUXOZ-GHCJXIJMSA-N 0.000 description 1
- ORXCYAFUCSTQGY-FXQIFTODSA-N Asn-Ala-Met Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N ORXCYAFUCSTQGY-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- CQMQJWRCRQSBAF-BPUTZDHNSA-N Asn-Arg-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N CQMQJWRCRQSBAF-BPUTZDHNSA-N 0.000 description 1
- KXEGPPNPXOKKHK-ZLUOBGJFSA-N Asn-Asp-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O KXEGPPNPXOKKHK-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- UGXVKHRDGLYFKR-CIUDSAMLSA-N Asn-Asp-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O UGXVKHRDGLYFKR-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- IICZCLFBILYRCU-WHFBIAKZSA-N Asn-Gly-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O IICZCLFBILYRCU-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- BKFXFUPYETWGGA-XVSYOHENSA-N Asn-Phe-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O BKFXFUPYETWGGA-XVSYOHENSA-N 0.000 description 1
- HCZQKHSRYHCPSD-IUKAMOBKSA-N Asn-Thr-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O HCZQKHSRYHCPSD-IUKAMOBKSA-N 0.000 description 1
- ZAESWDKAMDVHLL-RCOVLWMOSA-N Asn-Val-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC(O)=O ZAESWDKAMDVHLL-RCOVLWMOSA-N 0.000 description 1
- RDRMWJBLOSRRAW-BYULHYEWSA-N Asp-Asn-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O RDRMWJBLOSRRAW-BYULHYEWSA-N 0.000 description 1
- XAJRHVUUVUPFQL-ACZMJKKPSA-N Asp-Glu-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O XAJRHVUUVUPFQL-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- GHODABZPVZMWCE-FXQIFTODSA-N Asp-Glu-Glu Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O GHODABZPVZMWCE-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- DGKCOYGQLNWNCJ-ACZMJKKPSA-N Asp-Glu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DGKCOYGQLNWNCJ-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- PSLSTUMPZILTAH-BYULHYEWSA-N Asp-Gly-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O PSLSTUMPZILTAH-BYULHYEWSA-N 0.000 description 1
- KYQNAIMCTRZLNP-QSFUFRPTSA-N Asp-Ile-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O KYQNAIMCTRZLNP-QSFUFRPTSA-N 0.000 description 1
- LBOVBQONZJRWPV-YUMQZZPRSA-N Asp-Lys-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(O)=O LBOVBQONZJRWPV-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- KESWRFKUZRUTAH-FXQIFTODSA-N Asp-Pro-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O KESWRFKUZRUTAH-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- KBJVTFWQWXCYCQ-IUKAMOBKSA-N Asp-Thr-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O KBJVTFWQWXCYCQ-IUKAMOBKSA-N 0.000 description 1
- ZQFZEBRNAMXXJV-KKUMJFAQSA-N Asp-Tyr-His Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)O ZQFZEBRNAMXXJV-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- WAEDSQFVZJUHLI-BYULHYEWSA-N Asp-Val-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O WAEDSQFVZJUHLI-BYULHYEWSA-N 0.000 description 1
- XQFLFQWOBXPMHW-NHCYSSNCSA-N Asp-Val-His Chemical compound N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)O XQFLFQWOBXPMHW-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- QOJJMJKTMKNFEF-ZKWXMUAHSA-N Asp-Val-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O QOJJMJKTMKNFEF-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010088278 Branched-chain-amino-acid transaminase Proteins 0.000 description 1
- 241000186146 Brevibacterium Species 0.000 description 1
- UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L Calcium chloride Chemical compound [Cl-].[Cl-].[Ca+2] UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K Citrate Chemical compound [O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- YMBAVNPKBWHDAW-CIUDSAMLSA-N Cys-Asp-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N YMBAVNPKBWHDAW-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N D-Glucitol Natural products OC[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N D-Mannitol Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N 0.000 description 1
- QNAYBMKLOCPYGJ-UHFFFAOYSA-N D-alpha-Ala Natural products CC([NH3+])C([O-])=O QNAYBMKLOCPYGJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N D-glucitol Chemical compound OC[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N 0.000 description 1
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 1
- 206010059866 Drug resistance Diseases 0.000 description 1
- 241000588914 Enterobacter Species 0.000 description 1
- 241000588698 Erwinia Species 0.000 description 1
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 1
- 241000701959 Escherichia virus Lambda Species 0.000 description 1
- 229930091371 Fructose Natural products 0.000 description 1
- 239000005715 Fructose Substances 0.000 description 1
- RFSUNEUAIZKAJO-ARQDHWQXSA-N Fructose Chemical compound OC[C@H]1O[C@](O)(CO)[C@@H](O)[C@@H]1O RFSUNEUAIZKAJO-ARQDHWQXSA-N 0.000 description 1
- 206010064571 Gene mutation Diseases 0.000 description 1
- MQJDLNRXBOELJW-KKUMJFAQSA-N Gln-Pro-Phe Chemical compound N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](Cc1ccccc1)C(O)=O MQJDLNRXBOELJW-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- FITIQFSXXBKFFM-NRPADANISA-N Gln-Val-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O FITIQFSXXBKFFM-NRPADANISA-N 0.000 description 1
- FHPXTPQBODWBIY-CIUDSAMLSA-N Glu-Ala-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O FHPXTPQBODWBIY-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- ATRHMOJQJWPVBQ-DRZSPHRISA-N Glu-Ala-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O ATRHMOJQJWPVBQ-DRZSPHRISA-N 0.000 description 1
- YYOBUPFZLKQUAX-FXQIFTODSA-N Glu-Asn-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O YYOBUPFZLKQUAX-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- ZOXBSICWUDAOHX-GUBZILKMSA-N Glu-Asn-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O ZOXBSICWUDAOHX-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- CGOHAEBMDSEKFB-FXQIFTODSA-N Glu-Glu-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O CGOHAEBMDSEKFB-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- SJPMNHCEWPTRBR-BQBZGAKWSA-N Glu-Glu-Gly Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O SJPMNHCEWPTRBR-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- QYPKJXSMLMREKF-BPUTZDHNSA-N Glu-Glu-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N QYPKJXSMLMREKF-BPUTZDHNSA-N 0.000 description 1
- OGNJZUXUTPQVBR-BQBZGAKWSA-N Glu-Gly-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O OGNJZUXUTPQVBR-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- GGJOGFJIPPGNRK-JSGCOSHPSA-N Glu-Gly-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(O)=O)N)C(O)=O)=CNC2=C1 GGJOGFJIPPGNRK-JSGCOSHPSA-N 0.000 description 1
- HILMIYALTUQTRC-XVKPBYJWSA-N Glu-Gly-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O HILMIYALTUQTRC-XVKPBYJWSA-N 0.000 description 1
- ZWABFSSWTSAMQN-KBIXCLLPSA-N Glu-Ile-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O ZWABFSSWTSAMQN-KBIXCLLPSA-N 0.000 description 1
- WNRZUESNGGDCJX-JYJNAYRXSA-N Glu-Leu-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O WNRZUESNGGDCJX-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- UGSVSNXPJJDJKL-SDDRHHMPSA-N Glu-Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N UGSVSNXPJJDJKL-SDDRHHMPSA-N 0.000 description 1
- FBEJIDRSQCGFJI-GUBZILKMSA-N Glu-Leu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O FBEJIDRSQCGFJI-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- JJSVALISDCNFCU-SZMVWBNQSA-N Glu-Leu-Trp Chemical compound CC(C)C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](Cc1c[nH]c2ccccc12)C(O)=O JJSVALISDCNFCU-SZMVWBNQSA-N 0.000 description 1
- GJBUAAAIZSRCDC-GVXVVHGQSA-N Glu-Leu-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O GJBUAAAIZSRCDC-GVXVVHGQSA-N 0.000 description 1
- CBEUFCJRFNZMCU-SRVKXCTJSA-N Glu-Met-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O CBEUFCJRFNZMCU-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- TWYSSILQABLLME-HJGDQZAQSA-N Glu-Thr-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O TWYSSILQABLLME-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- FVGOGEGGQLNZGH-DZKIICNBSA-N Glu-Val-Phe Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 FVGOGEGGQLNZGH-DZKIICNBSA-N 0.000 description 1
- PUUYVMYCMIWHFE-BQBZGAKWSA-N Gly-Ala-Arg Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N PUUYVMYCMIWHFE-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- MFVQGXGQRIXBPK-WDSKDSINSA-N Gly-Ala-Glu Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O MFVQGXGQRIXBPK-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- QXPRJQPCFXMCIY-NKWVEPMBSA-N Gly-Ala-Pro Chemical compound C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)CN QXPRJQPCFXMCIY-NKWVEPMBSA-N 0.000 description 1
- KRRMJKMGWWXWDW-STQMWFEESA-N Gly-Arg-Phe Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](NC(=O)CN)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 KRRMJKMGWWXWDW-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- VXKCPBPQEKKERH-IUCAKERBSA-N Gly-Arg-Pro Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](NC(=O)CN)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O VXKCPBPQEKKERH-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- KKBWDNZXYLGJEY-UHFFFAOYSA-N Gly-Arg-Pro Natural products NCC(=O)NC(CCNC(=N)N)C(=O)N1CCCC1C(=O)O KKBWDNZXYLGJEY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SOEATRRYCIPEHA-BQBZGAKWSA-N Gly-Glu-Glu Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O SOEATRRYCIPEHA-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- LHRXAHLCRMQBGJ-RYUDHWBXSA-N Gly-Glu-Phe Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)CN LHRXAHLCRMQBGJ-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- KAJAOGBVWCYGHZ-JTQLQIEISA-N Gly-Gly-Phe Chemical compound [NH3+]CC(=O)NCC(=O)N[C@H](C([O-])=O)CC1=CC=CC=C1 KAJAOGBVWCYGHZ-JTQLQIEISA-N 0.000 description 1
- OLPPXYMMIARYAL-QMMMGPOBSA-N Gly-Gly-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)CN OLPPXYMMIARYAL-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- ALOBJFDJTMQQPW-ONGXEEELSA-N Gly-His-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)NC(=O)CN ALOBJFDJTMQQPW-ONGXEEELSA-N 0.000 description 1
- SWQALSGKVLYKDT-ZKWXMUAHSA-N Gly-Ile-Ala Chemical compound NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O SWQALSGKVLYKDT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- CCBIBMKQNXHNIN-ZETCQYMHSA-N Gly-Leu-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O CCBIBMKQNXHNIN-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 1
- LRQXRHGQEVWGPV-NHCYSSNCSA-N Gly-Leu-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)CN LRQXRHGQEVWGPV-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- VBOBNHSVQKKTOT-YUMQZZPRSA-N Gly-Lys-Ala Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O VBOBNHSVQKKTOT-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- WDEHMRNSGHVNOH-VHSXEESVSA-N Gly-Lys-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)CN)C(=O)O WDEHMRNSGHVNOH-VHSXEESVSA-N 0.000 description 1
- IFHJOBKVXBESRE-YUMQZZPRSA-N Gly-Met-Gln Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)CN IFHJOBKVXBESRE-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- QGDOOCIPHSSADO-STQMWFEESA-N Gly-Met-Phe Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O QGDOOCIPHSSADO-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- GGLIDLCEPDHEJO-BQBZGAKWSA-N Gly-Pro-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CN GGLIDLCEPDHEJO-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- HFPVRZWORNJRRC-UWVGGRQHSA-N Gly-Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CN HFPVRZWORNJRRC-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- HAOUOFNNJJLVNS-BQBZGAKWSA-N Gly-Pro-Ser Chemical compound NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O HAOUOFNNJJLVNS-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- SOEGEPHNZOISMT-BYPYZUCNSA-N Gly-Ser-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O SOEGEPHNZOISMT-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- WCORRBXVISTKQL-WHFBIAKZSA-N Gly-Ser-Ser Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O WCORRBXVISTKQL-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- XHVONGZZVUUORG-WEDXCCLWSA-N Gly-Thr-Lys Chemical compound NCC(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN XHVONGZZVUUORG-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 1
- GBYYQVBXFVDJPJ-WLTAIBSBSA-N Gly-Tyr-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)NC(=O)CN)O GBYYQVBXFVDJPJ-WLTAIBSBSA-N 0.000 description 1
- ZVXMEWXHFBYJPI-LSJOCFKGSA-N Gly-Val-Ile Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O ZVXMEWXHFBYJPI-LSJOCFKGSA-N 0.000 description 1
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 1
- RVKIPWVMZANZLI-UHFFFAOYSA-N H-Lys-Trp-OH Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)C(N)CCCCN)C(O)=O)=CNC2=C1 RVKIPWVMZANZLI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BIAKMWKJMQLZOJ-ZKWXMUAHSA-N His-Ala-Ala Chemical compound C[C@H](NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)Cc1cnc[nH]1)C(O)=O BIAKMWKJMQLZOJ-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- HTZKFIYQMHJWSQ-INTQDDNPSA-N His-Ala-Pro Chemical compound C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CN=CN2)N HTZKFIYQMHJWSQ-INTQDDNPSA-N 0.000 description 1
- QZAFGJNKLMNDEM-DCAQKATOSA-N His-Asn-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 QZAFGJNKLMNDEM-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- RNMNYMDTESKEAJ-KKUMJFAQSA-N His-Leu-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 RNMNYMDTESKEAJ-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- MVZASEMJYJPJSI-IHPCNDPISA-N His-Lys-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CC3=CN=CN3)N MVZASEMJYJPJSI-IHPCNDPISA-N 0.000 description 1
- SYPULFZAGBBIOM-GVXVVHGQSA-N His-Val-Glu Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)N SYPULFZAGBBIOM-GVXVVHGQSA-N 0.000 description 1
- XGBVLRJLHUVCNK-DCAQKATOSA-N His-Val-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XGBVLRJLHUVCNK-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- 108090001042 Hydro-Lyases Proteins 0.000 description 1
- 102000004867 Hydro-Lyases Human genes 0.000 description 1
- UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N Hydrogen Chemical compound [H][H] UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VSZALHITQINTGC-GHCJXIJMSA-N Ile-Ala-Asp Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N VSZALHITQINTGC-GHCJXIJMSA-N 0.000 description 1
- RWIKBYVJQAJYDP-BJDJZHNGSA-N Ile-Ala-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN RWIKBYVJQAJYDP-BJDJZHNGSA-N 0.000 description 1
- MKWSZEHGHSLNPF-NAKRPEOUSA-N Ile-Ala-Val Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)O)N MKWSZEHGHSLNPF-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 1
- WECYRWOMWSCWNX-XUXIUFHCSA-N Ile-Arg-Leu Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O WECYRWOMWSCWNX-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 1
- LLZLRXBTOOFODM-QSFUFRPTSA-N Ile-Asp-Val Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)O)N LLZLRXBTOOFODM-QSFUFRPTSA-N 0.000 description 1
- PHIXPNQDGGILMP-YVNDNENWSA-N Ile-Glu-Glu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N PHIXPNQDGGILMP-YVNDNENWSA-N 0.000 description 1
- IGJWJGIHUFQANP-LAEOZQHASA-N Ile-Gly-Gln Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)N IGJWJGIHUFQANP-LAEOZQHASA-N 0.000 description 1
- PWDSHAAAFXISLE-SXTJYALSSA-N Ile-Ile-Asp Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O PWDSHAAAFXISLE-SXTJYALSSA-N 0.000 description 1
- HUORUFRRJHELPD-MNXVOIDGSA-N Ile-Leu-Glu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N HUORUFRRJHELPD-MNXVOIDGSA-N 0.000 description 1
- GVNNAHIRSDRIII-AJNGGQMLSA-N Ile-Lys-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N GVNNAHIRSDRIII-AJNGGQMLSA-N 0.000 description 1
- IITVUURPOYGCTD-NAKRPEOUSA-N Ile-Pro-Ala Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O IITVUURPOYGCTD-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 1
- YKZAMJXNJUWFIK-JBDRJPRFSA-N Ile-Ser-Ala Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)O)N YKZAMJXNJUWFIK-JBDRJPRFSA-N 0.000 description 1
- JODPUDMBQBIWCK-GHCJXIJMSA-N Ile-Ser-Asn Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O JODPUDMBQBIWCK-GHCJXIJMSA-N 0.000 description 1
- CNMOKANDJMLAIF-CIQUZCHMSA-N Ile-Thr-Ala Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O CNMOKANDJMLAIF-CIQUZCHMSA-N 0.000 description 1
- ANTFEOSJMAUGIB-KNZXXDILSA-N Ile-Thr-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N ANTFEOSJMAUGIB-KNZXXDILSA-N 0.000 description 1
- JZBVBOKASHNXAD-NAKRPEOUSA-N Ile-Val-Ser Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N JZBVBOKASHNXAD-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 1
- APQYGMBHIVXFML-OSUNSFLBSA-N Ile-Val-Thr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)O)N APQYGMBHIVXFML-OSUNSFLBSA-N 0.000 description 1
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical compound C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 description 1
- 108010065920 Insulin Lispro Proteins 0.000 description 1
- 229910021578 Iron(III) chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- 108010000200 Ketol-acid reductoisomerase Proteins 0.000 description 1
- QNAYBMKLOCPYGJ-UWTATZPHSA-N L-Alanine Natural products C[C@@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-UWTATZPHSA-N 0.000 description 1
- XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N L-Cysteine Chemical compound SC[C@H](N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N L-Proline Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P L-argininium(2+) Chemical compound NC(=[NH2+])NCCC[C@H]([NH3+])C(O)=O ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P 0.000 description 1
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N L-histidine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- KFKWRHQBZQICHA-STQMWFEESA-N L-leucyl-L-phenylalanine Natural products CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 KFKWRHQBZQICHA-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- 125000003580 L-valyl group Chemical group [H]N([H])[C@]([H])(C(=O)[*])C(C([H])([H])[H])(C([H])([H])[H])[H] 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N Lactose Natural products OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)C(O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N 0.000 description 1
- 241000880493 Leptailurus serval Species 0.000 description 1
- XBBKIIGCUMBKCO-JXUBOQSCSA-N Leu-Ala-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O XBBKIIGCUMBKCO-JXUBOQSCSA-N 0.000 description 1
- IGUOAYLTQJLPPD-DCAQKATOSA-N Leu-Asn-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N IGUOAYLTQJLPPD-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- JKGHDYGZRDWHGA-SRVKXCTJSA-N Leu-Asn-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O JKGHDYGZRDWHGA-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- POJPZSMTTMLSTG-SRVKXCTJSA-N Leu-Asn-Lys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N POJPZSMTTMLSTG-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- BPANDPNDMJHFEV-CIUDSAMLSA-N Leu-Asp-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O BPANDPNDMJHFEV-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- XVSJMWYYLHPDKY-DCAQKATOSA-N Leu-Asp-Met Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O XVSJMWYYLHPDKY-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- NFHJQETXTSDZSI-DCAQKATOSA-N Leu-Cys-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O NFHJQETXTSDZSI-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- RVVBWTWPNFDYBE-SRVKXCTJSA-N Leu-Glu-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O RVVBWTWPNFDYBE-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- KGCLIYGPQXUNLO-IUCAKERBSA-N Leu-Gly-Glu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O KGCLIYGPQXUNLO-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- XQXGNBFMAXWIGI-MXAVVETBSA-N Leu-His-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C)CC1=CN=CN1 XQXGNBFMAXWIGI-MXAVVETBSA-N 0.000 description 1
- QJXHMYMRGDOHRU-NHCYSSNCSA-N Leu-Ile-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(O)=O QJXHMYMRGDOHRU-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- HRTRLSRYZZKPCO-BJDJZHNGSA-N Leu-Ile-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O HRTRLSRYZZKPCO-BJDJZHNGSA-N 0.000 description 1
- FLNPJLDPGMLWAU-UWVGGRQHSA-N Leu-Met-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](CCSC)NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C FLNPJLDPGMLWAU-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- QMKFDEUJGYNFMC-AVGNSLFASA-N Leu-Pro-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O QMKFDEUJGYNFMC-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- VULJUQZPSOASBZ-SRVKXCTJSA-N Leu-Pro-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O VULJUQZPSOASBZ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- MVHXGBZUJLWZOH-BJDJZHNGSA-N Leu-Ser-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O MVHXGBZUJLWZOH-BJDJZHNGSA-N 0.000 description 1
- XOWMDXHFSBCAKQ-SRVKXCTJSA-N Leu-Ser-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C XOWMDXHFSBCAKQ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- AMSSKPUHBUQBOQ-SRVKXCTJSA-N Leu-Ser-Lys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N AMSSKPUHBUQBOQ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- LFSQWRSVPNKJGP-WDCWCFNPSA-N Leu-Thr-Glu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O LFSQWRSVPNKJGP-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 1
- DAYQSYGBCUKVKT-VOAKCMCISA-N Leu-Thr-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O DAYQSYGBCUKVKT-VOAKCMCISA-N 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LZWNAOIMTLNMDW-NHCYSSNCSA-N Lys-Asn-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CCCCN)N LZWNAOIMTLNMDW-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- ZAWOJFFMBANLGE-CIUDSAMLSA-N Lys-Cys-Ala Chemical compound C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CCCCN)N ZAWOJFFMBANLGE-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- SKRGVGLIRUGANF-AVGNSLFASA-N Lys-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O SKRGVGLIRUGANF-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- URGPVYGVWLIRGT-DCAQKATOSA-N Lys-Met-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O URGPVYGVWLIRGT-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- LUTDBHBIHHREDC-IHRRRGAJSA-N Lys-Pro-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O LUTDBHBIHHREDC-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- RIPJMCFGQHGHNP-RHYQMDGZSA-N Lys-Val-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](CCCCN)N)O RIPJMCFGQHGHNP-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N Maltose Natural products O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)OC(O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N 0.000 description 1
- 240000003183 Manihot esculenta Species 0.000 description 1
- 235000016735 Manihot esculenta subsp esculenta Nutrition 0.000 description 1
- 229930195725 Mannitol Natural products 0.000 description 1
- UYAKZHGIPRCGPF-CIUDSAMLSA-N Met-Glu-Ala Chemical compound C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CCSC)N UYAKZHGIPRCGPF-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- MTBVQFFQMXHCPC-CIUDSAMLSA-N Met-Glu-Asp Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O MTBVQFFQMXHCPC-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- HZLSUXCMSIBCRV-RVMXOQNASA-N Met-Ile-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCSC)N HZLSUXCMSIBCRV-RVMXOQNASA-N 0.000 description 1
- UROWNMBTQGGTHB-DCAQKATOSA-N Met-Leu-Asp Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O UROWNMBTQGGTHB-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- YLBUMXYVQCHBPR-ULQDDVLXSA-N Met-Leu-Tyr Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 YLBUMXYVQCHBPR-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- IRVONVRHHJXWTK-RWMBFGLXSA-N Met-Lys-Pro Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N IRVONVRHHJXWTK-RWMBFGLXSA-N 0.000 description 1
- GFDBWMDLBKCLQH-IHRRRGAJSA-N Met-Phe-Cys Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N GFDBWMDLBKCLQH-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- FIZZULTXMVEIAA-IHRRRGAJSA-N Met-Ser-Phe Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 FIZZULTXMVEIAA-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- CIIJWIAORKTXAH-FJXKBIBVSA-N Met-Thr-Gly Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(O)=O CIIJWIAORKTXAH-FJXKBIBVSA-N 0.000 description 1
- MFDDVIJCQYOOES-GUBZILKMSA-N Met-Val-Cys Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCSC)N MFDDVIJCQYOOES-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- 108010087066 N2-tryptophyllysine Proteins 0.000 description 1
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 1
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 1
- 240000007594 Oryza sativa Species 0.000 description 1
- 235000007164 Oryza sativa Nutrition 0.000 description 1
- 101100070556 Oryza sativa subsp. japonica HSFA4D gene Proteins 0.000 description 1
- 101100043227 Oryza sativa subsp. japonica SPL13 gene Proteins 0.000 description 1
- 239000001888 Peptone Substances 0.000 description 1
- 108010080698 Peptones Proteins 0.000 description 1
- HTKNPQZCMLBOTQ-XVSYOHENSA-N Phe-Asn-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)N)O HTKNPQZCMLBOTQ-XVSYOHENSA-N 0.000 description 1
- IDUCUXTUHHIQIP-SOUVJXGZSA-N Phe-Gln-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC2=CC=CC=C2)N)C(=O)O IDUCUXTUHHIQIP-SOUVJXGZSA-N 0.000 description 1
- PSKRILMFHNIUAO-JYJNAYRXSA-N Phe-Glu-Lys Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N PSKRILMFHNIUAO-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- VZFPYFRVHMSSNA-JURCDPSOSA-N Phe-Ile-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)CC)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 VZFPYFRVHMSSNA-JURCDPSOSA-N 0.000 description 1
- LRBSWBVUCLLRLU-BZSNNMDCSA-N Phe-Leu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)Cc1ccccc1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O LRBSWBVUCLLRLU-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- IPFXYNKCXYGSSV-KKUMJFAQSA-N Phe-Ser-Lys Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N IPFXYNKCXYGSSV-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- VIIRRNQMMIHYHQ-XHSDSOJGSA-N Phe-Val-Pro Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CC=CC=C2)N VIIRRNQMMIHYHQ-XHSDSOJGSA-N 0.000 description 1
- SGCZFWSQERRKBD-BQBZGAKWSA-N Pro-Asp-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 SGCZFWSQERRKBD-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- NOXSEHJOXCWRHK-DCAQKATOSA-N Pro-Cys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 NOXSEHJOXCWRHK-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- LHALYDBUDCWMDY-CIUDSAMLSA-N Pro-Glu-Ala Chemical compound C[C@H](NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1)C(O)=O LHALYDBUDCWMDY-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- XQPHBAKJJJZOBX-SRVKXCTJSA-N Pro-Lys-Glu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O XQPHBAKJJJZOBX-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- KWMZPPWYBVZIER-XGEHTFHBSA-N Pro-Ser-Thr Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O KWMZPPWYBVZIER-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- KIDXAAQVMNLJFQ-KZVJFYERSA-N Pro-Thr-Ala Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](NC(=O)[C@@H]1CCCN1)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O KIDXAAQVMNLJFQ-KZVJFYERSA-N 0.000 description 1
- DCHQYSOGURGJST-FJXKBIBVSA-N Pro-Thr-Gly Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(O)=O DCHQYSOGURGJST-FJXKBIBVSA-N 0.000 description 1
- GNFHQWNCSSPOBT-ULQDDVLXSA-N Pro-Trp-Gln Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CC2=CNC3=CC=CC=C32)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O GNFHQWNCSSPOBT-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- ZAUHSLVPDLNTRZ-QXEWZRGKSA-N Pro-Val-Asn Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O ZAUHSLVPDLNTRZ-QXEWZRGKSA-N 0.000 description 1
- ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N Proline Natural products OC(=O)C1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000588768 Providencia Species 0.000 description 1
- 101150099282 SPL7 gene Proteins 0.000 description 1
- 240000000111 Saccharum officinarum Species 0.000 description 1
- 235000007201 Saccharum officinarum Nutrition 0.000 description 1
- BTKUIVBNGBFTTP-WHFBIAKZSA-N Ser-Ala-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O BTKUIVBNGBFTTP-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- YQHZVYJAGWMHES-ZLUOBGJFSA-N Ser-Ala-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YQHZVYJAGWMHES-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- TYYBJUYSTWJHGO-ZKWXMUAHSA-N Ser-Asn-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O TYYBJUYSTWJHGO-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- MOVJSUIKUNCVMG-ZLUOBGJFSA-N Ser-Cys-Ser Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N)O MOVJSUIKUNCVMG-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- ZOHGLPQGEHSLPD-FXQIFTODSA-N Ser-Gln-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O ZOHGLPQGEHSLPD-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- QKQDTEYDEIJPNK-GUBZILKMSA-N Ser-Glu-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO QKQDTEYDEIJPNK-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- YMTLKLXDFCSCNX-BYPYZUCNSA-N Ser-Gly-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O YMTLKLXDFCSCNX-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- WSTIOCFMWXNOCX-YUMQZZPRSA-N Ser-Gly-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CO)N WSTIOCFMWXNOCX-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- XNCUYZKGQOCOQH-YUMQZZPRSA-N Ser-Leu-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O XNCUYZKGQOCOQH-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- KCGIREHVWRXNDH-GARJFASQSA-N Ser-Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N KCGIREHVWRXNDH-GARJFASQSA-N 0.000 description 1
- PMCMLDNPAZUYGI-DCAQKATOSA-N Ser-Lys-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O PMCMLDNPAZUYGI-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- AMRRYKHCILPAKD-FXQIFTODSA-N Ser-Met-Asn Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N AMRRYKHCILPAKD-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- SRSPTFBENMJHMR-WHFBIAKZSA-N Ser-Ser-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O SRSPTFBENMJHMR-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- RXUOAOOZIWABBW-XGEHTFHBSA-N Ser-Thr-Arg Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N RXUOAOOZIWABBW-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- KKKVOZNCLALMPV-XKBZYTNZSA-N Ser-Thr-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O KKKVOZNCLALMPV-XKBZYTNZSA-N 0.000 description 1
- BEBVVQPDSHHWQL-NRPADANISA-N Ser-Val-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O BEBVVQPDSHHWQL-NRPADANISA-N 0.000 description 1
- MFQMZDPAZRZAPV-NAKRPEOUSA-N Ser-Val-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](CO)N MFQMZDPAZRZAPV-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 1
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000607720 Serratia Species 0.000 description 1
- 235000019764 Soybean Meal Nutrition 0.000 description 1
- 108010073771 Soybean Proteins Proteins 0.000 description 1
- 229920002472 Starch Polymers 0.000 description 1
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 1
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 1
- DFTCYYILCSQGIZ-GCJQMDKQSA-N Thr-Ala-Asn Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O DFTCYYILCSQGIZ-GCJQMDKQSA-N 0.000 description 1
- DDPVJPIGACCMEH-XQXXSGGOSA-N Thr-Ala-Gln Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O DDPVJPIGACCMEH-XQXXSGGOSA-N 0.000 description 1
- LXWZOMSOUAMOIA-JIOCBJNQSA-N Thr-Asn-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N)O LXWZOMSOUAMOIA-JIOCBJNQSA-N 0.000 description 1
- NLSNVZAREYQMGR-HJGDQZAQSA-N Thr-Asp-Leu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O NLSNVZAREYQMGR-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- LYGKYFKSZTUXGZ-ZDLURKLDSA-N Thr-Cys-Gly Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)NCC(O)=O LYGKYFKSZTUXGZ-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 1
- ZBKDBZUTTXINIX-RWRJDSDZSA-N Thr-Ile-Gln Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O ZBKDBZUTTXINIX-RWRJDSDZSA-N 0.000 description 1
- RRRRCRYTLZVCEN-HJGDQZAQSA-N Thr-Leu-Asp Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O RRRRCRYTLZVCEN-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- MGJLBZFUXUGMML-VOAKCMCISA-N Thr-Lys-Lys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N)O MGJLBZFUXUGMML-VOAKCMCISA-N 0.000 description 1
- WVVOFCVMHAXGLE-LFSVMHDDSA-N Thr-Phe-Ala Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O WVVOFCVMHAXGLE-LFSVMHDDSA-N 0.000 description 1
- MXDOAJQRJBMGMO-FJXKBIBVSA-N Thr-Pro-Gly Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(O)=O MXDOAJQRJBMGMO-FJXKBIBVSA-N 0.000 description 1
- FWTFAZKJORVTIR-VZFHVOOUSA-N Thr-Ser-Ala Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O FWTFAZKJORVTIR-VZFHVOOUSA-N 0.000 description 1
- NQQMWWVVGIXUOX-SVSWQMSJSA-N Thr-Ser-Ile Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O NQQMWWVVGIXUOX-SVSWQMSJSA-N 0.000 description 1
- VBMOVTMNHWPZJR-SUSMZKCASA-N Thr-Thr-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O VBMOVTMNHWPZJR-SUSMZKCASA-N 0.000 description 1
- AKHDFZHUPGVFEJ-YEPSODPASA-N Thr-Val-Gly Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC(O)=O AKHDFZHUPGVFEJ-YEPSODPASA-N 0.000 description 1
- ICNFHVUVCNWUAB-SZMVWBNQSA-N Trp-Arg-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)N ICNFHVUVCNWUAB-SZMVWBNQSA-N 0.000 description 1
- DVAAUUVLDFKTAQ-VHWLVUOQSA-N Trp-Asp-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)N DVAAUUVLDFKTAQ-VHWLVUOQSA-N 0.000 description 1
- KVMZNMYZCKORIG-UBHSHLNASA-N Trp-Cys-Asp Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N KVMZNMYZCKORIG-UBHSHLNASA-N 0.000 description 1
- LDMUNXDDIDAPJH-VMBFOHBNSA-N Trp-Ile-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)N LDMUNXDDIDAPJH-VMBFOHBNSA-N 0.000 description 1
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AKFLVKKWVZMFOT-IHRRRGAJSA-N Tyr-Arg-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O AKFLVKKWVZMFOT-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- MVYRJYISVJWKSX-KBPBESRZSA-N Tyr-His-Gly Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)NCC(=O)O)N)O MVYRJYISVJWKSX-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- BJCILVZEZRDIDR-PMVMPFDFSA-N Tyr-Leu-Trp Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 BJCILVZEZRDIDR-PMVMPFDFSA-N 0.000 description 1
- KHUVIWRRFMPVHD-JYJNAYRXSA-N Tyr-Met-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O KHUVIWRRFMPVHD-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- NVZVJIUDICCMHZ-BZSNNMDCSA-N Tyr-Phe-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O NVZVJIUDICCMHZ-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- CDBXVDXSLPLFMD-BPNCWPANSA-N Tyr-Pro-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 CDBXVDXSLPLFMD-BPNCWPANSA-N 0.000 description 1
- RIVVDNTUSRVTQT-IRIUXVKKSA-N Tyr-Thr-Gln Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)N)O RIVVDNTUSRVTQT-IRIUXVKKSA-N 0.000 description 1
- LTFLDDDGWOVIHY-NAKRPEOUSA-N Val-Ala-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C(C)C)N LTFLDDDGWOVIHY-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 1
- ZLFHAAGHGQBQQN-GUBZILKMSA-N Val-Ala-Pro Natural products CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O ZLFHAAGHGQBQQN-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- AZSHAZJLOZQYAY-FXQIFTODSA-N Val-Ala-Ser Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O AZSHAZJLOZQYAY-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- JLFKWDAZBRYCGX-ZKWXMUAHSA-N Val-Asn-Ser Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N JLFKWDAZBRYCGX-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- QHDXUYOYTPWCSK-RCOVLWMOSA-N Val-Asp-Gly Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)NCC(=O)O)N QHDXUYOYTPWCSK-RCOVLWMOSA-N 0.000 description 1
- BMGOFDMKDVVGJG-NHCYSSNCSA-N Val-Asp-Lys Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N BMGOFDMKDVVGJG-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- KZKMBGXCNLPYKD-YEPSODPASA-N Val-Gly-Thr Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O KZKMBGXCNLPYKD-YEPSODPASA-N 0.000 description 1
- OPGWZDIYEYJVRX-AVGNSLFASA-N Val-His-Arg Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)N OPGWZDIYEYJVRX-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- HQYVQDRYODWONX-DCAQKATOSA-N Val-His-Ser Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N HQYVQDRYODWONX-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- SDUBQHUJJWQTEU-XUXIUFHCSA-N Val-Ile-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N SDUBQHUJJWQTEU-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 1
- OTJMMKPMLUNTQT-AVGNSLFASA-N Val-Leu-Arg Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N OTJMMKPMLUNTQT-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- OFQGGTGZTOTLGH-NHCYSSNCSA-N Val-Met-Gln Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)N OFQGGTGZTOTLGH-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- ZXYPHBKIZLAQTL-QXEWZRGKSA-N Val-Pro-Asp Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N ZXYPHBKIZLAQTL-QXEWZRGKSA-N 0.000 description 1
- GBIUHAYJGWVNLN-UHFFFAOYSA-N Val-Ser-Pro Natural products CC(C)C(N)C(=O)NC(CO)C(=O)N1CCCC1C(O)=O GBIUHAYJGWVNLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OFTXTCGQJXTNQS-XGEHTFHBSA-N Val-Thr-Ser Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O OFTXTCGQJXTNQS-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- JVGDAEKKZKKZFO-RCWTZXSCSA-N Val-Val-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O JVGDAEKKZKKZFO-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 1
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 1
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 1
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 1
- 238000005377 adsorption chromatography Methods 0.000 description 1
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 1
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 1
- 108010045350 alanyl-tyrosyl-alanine Proteins 0.000 description 1
- 108010047495 alanylglycine Proteins 0.000 description 1
- 229910000147 aluminium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019257 ammonium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 229940043376 ammonium acetate Drugs 0.000 description 1
- 239000001099 ammonium carbonate Substances 0.000 description 1
- 235000012501 ammonium carbonate Nutrition 0.000 description 1
- 235000019270 ammonium chloride Nutrition 0.000 description 1
- 239000000908 ammonium hydroxide Substances 0.000 description 1
- 229910000148 ammonium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019289 ammonium phosphates Nutrition 0.000 description 1
- BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N ammonium sulfate Chemical compound N.N.OS(O)(=O)=O BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052921 ammonium sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011130 ammonium sulphate Nutrition 0.000 description 1
- 239000002518 antifoaming agent Substances 0.000 description 1
- 239000000074 antisense oligonucleotide Substances 0.000 description 1
- 238000012230 antisense oligonucleotides Methods 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960003121 arginine Drugs 0.000 description 1
- 235000009697 arginine Nutrition 0.000 description 1
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 description 1
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 description 1
- 108010077245 asparaginyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 229960005261 aspartic acid Drugs 0.000 description 1
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 description 1
- 108010040443 aspartyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 1
- 238000012365 batch cultivation Methods 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 1
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-QUYVBRFLSA-N beta-maltose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QUYVBRFLSA-N 0.000 description 1
- 238000010364 biochemical engineering Methods 0.000 description 1
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 1
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 1
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 1
- FAPWYRCQGJNNSJ-UBKPKTQASA-L calcium D-pantothenic acid Chemical compound [Ca+2].OCC(C)(C)[C@@H](O)C(=O)NCCC([O-])=O.OCC(C)(C)[C@@H](O)C(=O)NCCC([O-])=O FAPWYRCQGJNNSJ-UBKPKTQASA-L 0.000 description 1
- 229910000019 calcium carbonate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000010216 calcium carbonate Nutrition 0.000 description 1
- 239000001110 calcium chloride Substances 0.000 description 1
- 229910001628 calcium chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- 229960002079 calcium pantothenate Drugs 0.000 description 1
- 239000001569 carbon dioxide Substances 0.000 description 1
- 229910002092 carbon dioxide Inorganic materials 0.000 description 1
- 108010079058 casein hydrolysate Proteins 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 238000007385 chemical modification Methods 0.000 description 1
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 1
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 1
- 239000003184 complementary RNA Substances 0.000 description 1
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 1
- 238000004590 computer program Methods 0.000 description 1
- 239000013601 cosmid vector Substances 0.000 description 1
- 229960002433 cysteine Drugs 0.000 description 1
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 1
- 229940127089 cytotoxic agent Drugs 0.000 description 1
- 239000002254 cytotoxic agent Substances 0.000 description 1
- 231100000599 cytotoxic agent Toxicity 0.000 description 1
- 238000000502 dialysis Methods 0.000 description 1
- MNNHAPBLZZVQHP-UHFFFAOYSA-N diammonium hydrogen phosphate Chemical compound [NH4+].[NH4+].OP([O-])([O-])=O MNNHAPBLZZVQHP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000014113 dietary fatty acids Nutrition 0.000 description 1
- ZPWVASYFFYYZEW-UHFFFAOYSA-L dipotassium hydrogen phosphate Chemical compound [K+].[K+].OP([O-])([O-])=O ZPWVASYFFYYZEW-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 229910000396 dipotassium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019797 dipotassium phosphate Nutrition 0.000 description 1
- 230000003828 downregulation Effects 0.000 description 1
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 1
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 229930195729 fatty acid Natural products 0.000 description 1
- 239000000194 fatty acid Substances 0.000 description 1
- 230000002349 favourable effect Effects 0.000 description 1
- 239000011790 ferrous sulphate Substances 0.000 description 1
- 235000003891 ferrous sulphate Nutrition 0.000 description 1
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 1
- 239000012467 final product Substances 0.000 description 1
- 239000006260 foam Substances 0.000 description 1
- 238000010230 functional analysis Methods 0.000 description 1
- 238000002523 gelfiltration Methods 0.000 description 1
- 238000012239 gene modification Methods 0.000 description 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 1
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 1
- 230000005017 genetic modification Effects 0.000 description 1
- 235000013617 genetically modified food Nutrition 0.000 description 1
- 229960002449 glycine Drugs 0.000 description 1
- 108010019832 glycyl-asparaginyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010026364 glycyl-glycyl-leucine Proteins 0.000 description 1
- 108010078326 glycyl-glycyl-valine Proteins 0.000 description 1
- 108010023364 glycyl-histidyl-arginine Proteins 0.000 description 1
- 108010038983 glycyl-histidyl-lysine Proteins 0.000 description 1
- 108010050475 glycyl-leucyl-tyrosine Proteins 0.000 description 1
- 108010077435 glycyl-phenylalanyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010015792 glycyllysine Proteins 0.000 description 1
- 239000003102 growth factor Substances 0.000 description 1
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960002885 histidine Drugs 0.000 description 1
- 235000014304 histidine Nutrition 0.000 description 1
- 108010092114 histidylphenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010018006 histidylserine Proteins 0.000 description 1
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 1
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 description 1
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000001976 improved effect Effects 0.000 description 1
- 238000009776 industrial production Methods 0.000 description 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 1
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 1
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 1
- 238000004255 ion exchange chromatography Methods 0.000 description 1
- RBTARNINKXHZNM-UHFFFAOYSA-K iron trichloride Chemical compound Cl[Fe](Cl)Cl RBTARNINKXHZNM-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- BAUYGSIQEAFULO-UHFFFAOYSA-L iron(2+) sulfate (anhydrous) Chemical compound [Fe+2].[O-]S([O-])(=O)=O BAUYGSIQEAFULO-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 229910000359 iron(II) sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 229950003188 isovaleryl diethylamide Drugs 0.000 description 1
- 239000004310 lactic acid Substances 0.000 description 1
- 235000014655 lactic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000008101 lactose Substances 0.000 description 1
- 108010044056 leucyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 1
- 108010003700 lysyl aspartic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010009298 lysylglutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 229910052943 magnesium sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019341 magnesium sulphate Nutrition 0.000 description 1
- 239000002075 main ingredient Substances 0.000 description 1
- 229940099596 manganese sulfate Drugs 0.000 description 1
- 239000011702 manganese sulphate Substances 0.000 description 1
- 235000007079 manganese sulphate Nutrition 0.000 description 1
- SQQMAOCOWKFBNP-UHFFFAOYSA-L manganese(II) sulfate Chemical compound [Mn+2].[O-]S([O-])(=O)=O SQQMAOCOWKFBNP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 239000000594 mannitol Substances 0.000 description 1
- 235000010355 mannitol Nutrition 0.000 description 1
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 1
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 1
- 108010022588 methionyl-lysyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 1
- 238000009629 microbiological culture Methods 0.000 description 1
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 1
- 239000002808 molecular sieve Substances 0.000 description 1
- 229910000402 monopotassium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019796 monopotassium phosphate Nutrition 0.000 description 1
- 229960003966 nicotinamide Drugs 0.000 description 1
- 235000005152 nicotinamide Nutrition 0.000 description 1
- 239000011570 nicotinamide Substances 0.000 description 1
- 235000021048 nutrient requirements Nutrition 0.000 description 1
- 238000005457 optimization Methods 0.000 description 1
- 150000007524 organic acids Chemical class 0.000 description 1
- 235000005985 organic acids Nutrition 0.000 description 1
- 125000001477 organic nitrogen group Chemical group 0.000 description 1
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 1
- 235000019319 peptone Nutrition 0.000 description 1
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960005190 phenylalanine Drugs 0.000 description 1
- 108010084572 phenylalanyl-valine Proteins 0.000 description 1
- PJNZPQUBCPKICU-UHFFFAOYSA-N phosphoric acid;potassium Chemical compound [K].OP(O)(O)=O PJNZPQUBCPKICU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 1
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 1
- 229920000151 polyglycol Polymers 0.000 description 1
- 239000010695 polyglycol Substances 0.000 description 1
- 230000001323 posttranslational effect Effects 0.000 description 1
- 230000001376 precipitating effect Effects 0.000 description 1
- 229960002429 proline Drugs 0.000 description 1
- 235000013930 proline Nutrition 0.000 description 1
- 108010025826 prolyl-leucyl-arginine Proteins 0.000 description 1
- 108010029020 prolylglycine Proteins 0.000 description 1
- 108010015796 prolylisoleucine Proteins 0.000 description 1
- 230000003362 replicative effect Effects 0.000 description 1
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 1
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 description 1
- 210000003705 ribosome Anatomy 0.000 description 1
- 235000009566 rice Nutrition 0.000 description 1
- 238000005185 salting out Methods 0.000 description 1
- 229960001153 serine Drugs 0.000 description 1
- 235000004400 serine Nutrition 0.000 description 1
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 1
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 description 1
- URGAHOPLAPQHLN-UHFFFAOYSA-N sodium aluminosilicate Chemical compound [Na+].[Al+3].[O-][Si]([O-])=O.[O-][Si]([O-])=O URGAHOPLAPQHLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000000600 sorbitol Substances 0.000 description 1
- 229940001941 soy protein Drugs 0.000 description 1
- 239000004455 soybean meal Substances 0.000 description 1
- 239000008107 starch Substances 0.000 description 1
- 235000019698 starch Nutrition 0.000 description 1
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 1
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 1
- 150000005846 sugar alcohols Chemical class 0.000 description 1
- 150000008163 sugars Chemical class 0.000 description 1
- 230000002195 synergetic effect Effects 0.000 description 1
- 229960003495 thiamine Drugs 0.000 description 1
- DPJRMOMPQZCRJU-UHFFFAOYSA-M thiamine hydrochloride Chemical compound Cl.[Cl-].CC1=C(CCO)SC=[N+]1CC1=CN=C(C)N=C1N DPJRMOMPQZCRJU-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 235000019190 thiamine hydrochloride Nutrition 0.000 description 1
- 239000011747 thiamine hydrochloride Substances 0.000 description 1
- 235000008521 threonine Nutrition 0.000 description 1
- 108010031491 threonyl-lysyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 238000011426 transformation method Methods 0.000 description 1
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 1
- 238000011282 treatment Methods 0.000 description 1
- 229960004799 tryptophan Drugs 0.000 description 1
- 229960004441 tyrosine Drugs 0.000 description 1
- 235000002374 tyrosine Nutrition 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000000108 ultra-filtration Methods 0.000 description 1
- 241001515965 unidentified phage Species 0.000 description 1
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 1
- 125000002114 valyl group Chemical group 0.000 description 1
- 108010072644 valyl-alanyl-prolyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 150000003722 vitamin derivatives Chemical class 0.000 description 1
Abstract
Description
Область изобретенияField of invention
Описание настоящего изобретения относится к микроорганизму, продуцирующему L-валин, и способу получения L-валина с использованием этого микроорганизма.The present invention relates to a microorganism that produces L-valine and a method for producing L-valine using this microorganism.
Предшествующий уровень техникиPrior Art
L-Валин, представляющий собой аминокислоту с разветвленной цепью, биосинтезируется в микроорганизмах, начиная с пировиноградной кислоты через ацетомолочную кислоту, дигидроксиизовалериановую кислоту и кетоизовалериановую кислоту. Эти промежуточные метаболиты образуются в реакции, катализируемой синтазой ацетогидроксикислоты, изомероредуктазой ацетогидроксикислоты, дегидратазой ацетогидроксикислоты и трансаминазой В. Тем не менее, эти ферменты также вовлечены в биосинтез L-изолейцина, начинающийся с кетомасляной кислоты и пировиноградной кислота, и L-лейцин также биосинтезируется с промежуточного метаболита, представляющего собой кетоизовалериановую кислоту, через 2-изопропиляблочную кислоту, 3-изопропиляблочную кислоту и кетоизокапроновую кислоту. Таким образом, поскольку ферменты, используемые в путях биосинтеза аминокислот с разветвленной цепью, т.е. L-валин, L-изолейцин и L-лейцин, идентичны, известно, что промышленное получение одного типа аминокислоты с разветвленной цепью посредством ферментации затруднительно. Кроме того, ингибирование по механизму обратной связи осуществляется со стороны конечного продукта L-валина или его производных, что затрудняет промышленное массовое производство L-валина.L-Valine, which is a branched chain amino acid, is biosynthesized in microorganisms starting with pyruvic acid through acetolactic acid, dihydroxyisovaleric acid and ketoisovaleric acid. These intermediate metabolites are formed in a reaction catalyzed by acetohydroxy acid synthase, acetohydroxy acid isomeroreductase, acetohydroxy acid dehydratase and transaminase B. However, these enzymes are also involved in the biosynthesis of L-isoleucine, starting with ketobutyric acid and pyruvic acid, and L-leucine is also biosynthesized from the intermediate metabolite, which is ketoisovaleric acid, through 2-isopropyl malic acid, 3-isopropyl malic acid and ketoisocaproic acid. Thus, since the enzymes used in the biosynthetic pathways of branched chain amino acids, i.e. L-valine, L-isoleucine and L-leucine are identical; it is known that industrial production of one type of branched chain amino acid through fermentation is difficult. In addition, feedback inhibition occurs on the part of the final product L-valine or its derivatives, which makes industrial mass production of L-valine difficult.
Тем не менее, до настоящего времени проводились исследования способа получения валина путем ингибирования по механизму обратной связи (Патент США №10457919), но не было никаких исследований увеличения способности продуцировать валин путем комбинации ферментов, обладающих усиленной или уменьшенной активностью, в соответствии с описанием настоящего изобретения.However, to date, studies have been conducted on the method of producing valine by feedback inhibition (US Patent No. 10457919), but there have been no studies on increasing the ability to produce valine by combining enzymes with increased or decreased activity, in accordance with the description of the present invention .
Описание изобретенияDescription of the invention
Техническая проблемаTechnical problem
Соответственно, авторы настоящего изобретения провели непрерывное исследование эффективного способа получения L-валина, и в качестве результата подтвердили то, что микроорганизм, обладающий усиленной активностью дегидратазы дигидроксикислоты; уменьшенной активностью трансаминазы С; ослабленной активностью пируватдегидрогеназы; уменьшенной активностью цитратсинтазы; или их комбинацией, обладает превосходной способностью продуцировать L-валин по сравнению с микроорганизмом дикого типа, таким образом, завершая настоящее изобретение.Accordingly, the inventors of the present invention have conducted continuous research on an effective method for producing L-valine, and as a result, it has been confirmed that a microorganism having enhanced dihydroxy acid dehydratase activity; decreased transaminase C activity; weakened activity of pyruvate dehydrogenase; decreased citrate synthase activity; or a combination thereof, has superior ability to produce L-valine compared to the wild type microorganism, thus completing the present invention.
Техническое решениеTechnical solution
Одна из задач описания настоящего изобретения заключается в том, чтобы предложить микроорганизм, продуцирующий L-валин, обладающий усиленной активностью дегидратазы дигидроксикислоты; и любой одной или более чем одной из комбинаций, выбранных из (1)-(3) ниже:One of the objects of the present invention is to provide an L-valine producing microorganism having enhanced dihydroxy acid dehydratase activity; and any one or more than one of the combinations selected from (1)-(3) below:
(1) уменьшенной активностью трансаминазы С;(1) decreased transaminase C activity;
(2) ослабленной активностью пируватдегидрогеназы;(2) weakened pyruvate dehydrogenase activity;
(3) уменьшенной активностью цитратсинтазы.(3) reduced citrate synthase activity.
Еще одна задача описания настоящего изобретения заключается в том, чтобы предложить способ получения L-валина, включающий выращивание микроорганизма.Another object of the present invention is to provide a method for producing L-valine, comprising growing a microorganism.
Благоприятные действияFavorable Actions
При выращивании микроорганизма, продуцирующего L-валин, в соответствии с описанием настоящего изобретения, L-валин может продуцироваться с высоким выходом. Соответственно, можно ожидать эффектов удобства получения и уменьшения стоимости получения с точки зрения промышленного аспекта.By growing the L-valine-producing microorganism according to the description of the present invention, L-valine can be produced in high yield. Accordingly, the effects of convenience of obtaining and reducing cost of obtaining from an industrial aspect can be expected.
Подробное описание предпочтительных воплощенийDetailed Description of Preferred Embodiments
Далее, описание настоящего изобретения будет описано подробно.Next, a description of the present invention will be described in detail.
В то же самое время, каждое описание и раскрытые здесь воплощения могут применяться здесь в различных описаниях и воплощениях в отношении общих свойств. То есть, все комбинации различных компонентов, раскрытых здесь, включены в объем описания настоящего изобретения. Кроме того, объем описания настоящего изобретения не должен ограничиваться приведенным ниже конкретным описанием.At the same time, each description and embodiment disclosed herein may be applied in different descriptions and embodiments herein with respect to the general properties. That is, all combinations of the various components disclosed herein are included within the scope of the present invention. Moreover, the scope of the description of the present invention should not be limited to the specific description below.
Дополнительно, специалисты в данной области техники могут быть способны понять или подтвердить с использованием исключительно обычного экспериментального пути множество эквивалентов конкретных аспектов описанного здесь изобретения. Кроме того, также предполагается, что эти эквиваленты включены в описание настоящего изобретения.Additionally, those skilled in the art may be able to understand or confirm, using purely conventional experimental means, many equivalents to specific aspects of the invention described herein. Moreover, it is also intended that these equivalents be included in the description of the present invention.
В одном из аспектов описания настоящего изобретения предложен микроорганизм, продуцирующий L-валин, обладающий усиленной активностью дегидратазы дигидроксикислоты; и любой одной или более чем одной из комбинаций, выбранных из (1)-(3) ниже:In one aspect of the present invention there is provided a microorganism that produces L-valine having enhanced dihydroxy acid dehydratase activity; and any one or more than one of the combinations selected from (1)-(3) below:
(1) уменьшенной активностью трансаминазы С;(1) decreased transaminase C activity;
(2) ослабленной активностью пируватдегидрогеназы; и(2) weakened pyruvate dehydrogenase activity; And
(3) уменьшенной активностью цитратсинтазы.(3) reduced citrate synthase activity.
В одном из воплощений микроорганизм, продуцирующий валин, может представлять собой микроорганизм, обладающий усиленной активностью дегидратазы дигидроксикислоты и уменьшенной активностью трансаминазы С.In one embodiment, the valine-producing microorganism may be a microorganism having increased dihydroxy acid dehydratase activity and decreased transaminase C activity.
В еще одном воплощении микроорганизм, продуцирующий валин, может представлять собой микроорганизм, обладающий усиленной активностью дегидратазы дигидроксикислоты и ослабленной активностью пируватдегидрогеназы.In yet another embodiment, the valine-producing microorganism may be a microorganism having enhanced dihydroxy acid dehydratase activity and reduced pyruvate dehydrogenase activity.
В еще одном воплощении микроорганизм, продуцирующий валин, может представлять собой микроорганизм, обладающий усиленной активностью дегидратазы дигидроксикислоты и уменьшенной активностью цитратсинтазы.In yet another embodiment, the valine-producing microorganism may be a microorganism having enhanced dihydroxy acid dehydratase activity and reduced citrate synthase activity.
В еще одном воплощении микроорганизм, продуцирующий валин, может представлять собой микроорганизм, обладающий усиленной активностью дегидратазы дигидроксикислоты и уменьшенной активностью цитратсинтазы, и дополнительно обладающий уменьшенной активностью трансаминазы С или ослабленной активностью пируватдегидрогеназы, но не ограничивается им.In yet another embodiment, the valine-producing microorganism may be a microorganism having enhanced dihydroxy acid dehydratase activity and reduced citrate synthase activity, and further having reduced transaminase C activity or reduced pyruvate dehydrogenase activity.
Используемый здесь термин «дегидратаза дигидроксикислоты» представляет собой фермент, вовлеченный в синтез кетоизовалерата, представляющего собой предшественник валина, в пути биосинтеза L-валина, начиная с пирувата через ацетолактат, дигидроксиизовалерат в кетоизовалерат. В описании настоящего изобретения можно способствовать получению L-валина путем усиления активности дегидратазы дигидроксикислоты, и, таким образом, увеличения синтеза кетоизовалерата.As used herein, the term "dihydroxy acid dehydratase" is an enzyme involved in the synthesis of the valine precursor ketoisovalerate in the L-valine biosynthetic pathway, starting from pyruvate through acetolactate, dihydroxyisovalerate to ketoisovalerate. In the present invention, it is possible to promote the production of L-valine by enhancing the activity of dihydroxy acid dehydratase, and thus increasing the synthesis of ketoisovalerate.
Используемый здесь термин «трансаминаза С» представляет собой фермент, вовлеченный в путь синтеза L-аланина из пирувата.As used herein, the term "transaminase C" is an enzyme involved in the pathway for the synthesis of L-alanine from pyruvate.
Используемый здесь термин «пируватдегидрогеназа» представляет собой фермент, вовлеченный в синтез ацетил-соА из пировиноградной кислоты.As used herein, the term "pyruvate dehydrogenase" is an enzyme involved in the synthesis of acetyl-coA from pyruvic acid.
Используемый здесь термин «цитратсинтаза» представляет собой фермент, синтезирующий цитрат из ацетил-соА.As used herein, the term “citrate synthase” is an enzyme that synthesizes citrate from acetyl-coA.
Использованный здесь термин «усиление» означает то, что активность белка увеличивается по сравнению с его эндогенной активностью. Усиление может быть использовано взаимозаменяемо с терминами, такими как активация, повышающая регуляция, сверхэкспрессия, увеличение и т.п. В частности, активация, усиление, повышающая регуляция, сверхэкспрессия и увеличение могут включать оба случая, при которых демонстрируется активность, которая исходно не обнаруживалась, или активность усиливается по сравнению с эндогенной активностью или активностью перед модификацией. «Эндогенная активность» относится к активности конкретного полипептида, исходно присутствующей в родительском штамме перед трансформацией, или не модифицированном микроорганизме, когда свойство изменяют путем генетической модификации, вызванной природными или искусственными факторами, и может быть использована взаимозаменяемо с «активностью перед модификацией». «Усиление», «повышающая регуляция», «сверхэкспрессия» или «увеличение» активности полипептида по сравнению с его эндогенной активностью означает то, что активность и/или концентрация (уровень экспрессии) полипептида усиливается по сравнению с конкретным полипептидом, исходно присутствующим в родительском штамме перед трансформацией или в немодифицированном микроорганизме.As used herein, the term "amplification" means that the activity of the protein is increased relative to its endogenous activity. Enhancement can be used interchangeably with terms such as activation, up-regulation, overexpression, increase, and the like. In particular, activation, amplification, up-regulation, overexpression and amplification can include both cases in which activity is demonstrated that was not initially detected, or activity is enhanced relative to endogenous activity or activity before modification. "Endogenous activity" refers to the activity of a particular polypeptide initially present in the parent strain before transformation, or in an unmodified microorganism when the property is altered by genetic modification caused by natural or artificial factors, and can be used interchangeably with "activity before modification". “Amplification,” “upregulation,” “overexpression,” or “increase” in the activity of a polypeptide relative to its endogenous activity means that the activity and/or concentration (level of expression) of the polypeptide is increased relative to the particular polypeptide originally present in the parent strain before transformation or in an unmodified microorganism.
Усиление может быть достигнуто путем введения чужеродного полипептида или путем усиления активности и/или увеличения концентрации (уровня экспрессии) эндогенного полипептида. Усилена ли активность дегидратазы дигидроксикислоты или не усилена можно подтвердить путем увеличения уровня полипептида, уровня экспрессии или количества продукта, экскретируемого из полипептида.Enhancement can be achieved by introducing a foreign polypeptide or by enhancing the activity and/or increasing the concentration (expression level) of an endogenous polypeptide. Whether the dihydroxy acid dehydratase activity is enhanced or not can be confirmed by increasing the level of the polypeptide, the level of expression, or the amount of product excreted from the polypeptide.
Усиление активности регулятора дегидратазы дигидроксикислоты может быть достигнуто путем применения различных способов, хорошо известных в области техники, и эти способы не ограничены при условии, что они усиливают активность полипептида-мишени по равнению с активностью микроорганизма перед модификацией. В частности, может быть использована генетическая инженерия и/или белковая инженерия, хорошо известные специалистам в данной области техники, которые представляют собой обычные для молекулярной биологии способы, но способ не ограничен ими (например, Sitnicka et al. Functional Analysis of Genes. Advances in Cell Biology. 2010, Vol. 2. 1-16, Sambrook et al. Molecular Cloning 2012 и т.п.).Enhancing the activity of the dihydroxy acid dehydratase regulator can be achieved by using various methods well known in the art, and these methods are not limited provided that they enhance the activity of the target polypeptide equal to the activity of the microorganism before modification. In particular, genetic engineering and/or protein engineering may be used, well known to those skilled in the art, which are methods conventional in molecular biology, but the method is not limited to them (for example, Sitnicka et al. Functional Analysis of Genes. Advances in Cell Biology. 2010, Vol. 2. 1-16, Sambrook et al.
В частности, усиление активности дегидратазы дигидроксикислоты в соответствии с описанием настоящего изобретения может быть достигнуто путем:In particular, enhancing the activity of dihydroxy acid dehydratase in accordance with the description of the present invention can be achieved by:
1) увеличения числа копий полинуклеотида, кодирующего полипептид, в клетках;1) increasing the number of copies of the polynucleotide encoding the polypeptide in cells;
2) замены последовательности, регулирующей экспрессию гена, кодирующего полипептид, в хромосоме на последовательность, обладающую более сильной активностью;2) replacing the sequence that regulates the expression of the gene encoding the polypeptide in the chromosome with a sequence that has stronger activity;
3) модификации нуклеотидной последовательности, кодирующей стартовый кодон или 5'-UTR генного транскрипта, кодирующего полипептид;3) modification of the nucleotide sequence encoding the start codon or 5'-UTR of the gene transcript encoding the polypeptide;
4) модификации аминокислотной последовательности полипептида, таким образом, что активность полипептида усиливается;4) modification of the amino acid sequence of the polypeptide, such that the activity of the polypeptide is enhanced;
5) модификации полинуклеотидной последовательности, кодирующей полипептид, таким образом, что активность полипептида усиливается (например, путем модификации полинуклеотидной последовательности гена полипептида для кодирования полипептида, модифицированного таким образом, чтобы усилить активность полипептида);5) modifying a polynucleotide sequence encoding a polypeptide such that the activity of the polypeptide is enhanced (eg, by modifying the polynucleotide sequence of a polypeptide gene to encode a polypeptide modified so as to enhance the activity of the polypeptide);
6) введения чужеродного полипептида, демонстрирующего активность полипептида, или кодирующего его чужеродного полинуклеотида;6) introduction of a foreign polypeptide demonstrating the activity of the polypeptide, or a foreign polynucleotide encoding it;
7) оптимизации кодона полинуклеотида, кодирующего полипептид;7) optimization of the codon of the polynucleotide encoding the polypeptide;
8) анализа третичной структуры полипептида и, таким образом, выбора и модификации экспонируемого сайта или его химической модификации; или8) analysis of the tertiary structure of the polypeptide and, thus, selection and modification of the exposed site or its chemical modification; or
9) комбинации двух или более чем двух, выбранных из (1)-(8) выше, но не ограничиваясь этим.9) combinations of two or more than two selected from, but not limited to, (1)-(8) above.
Конкретнее,More specifically,
1) Способ увеличения числа копий полинуклеотида в клетке, кодирующего полипептид, может быть достигнуто путем введения вектора, который функционально связан с полинуклеотидом, кодирующим полипептид, и способен реплицироваться и функционировать независимо от клетки-хозяина в клетке-хозяине. В качестве альтернативы, этот способ может быть достигнут путем введения одной копии или двух копий полинуклеотидов, кодирующих полипептид, в хромосому клетки-хозяина. Введение в хромосому может быть осуществлено путем введения вектора, способного встраивать полинуклеотид в хромосому клетки-хозяина, в клетку-хозяина, но не ограничиваясь этим. Вектор является таким, как описано выше.1) A method of increasing the copy number of a polynucleotide in a cell encoding a polypeptide can be achieved by introducing a vector that is operably linked to the polynucleotide encoding the polypeptide and is capable of replicating and functioning independently of a host cell in a host cell. Alternatively, this method can be achieved by introducing one copy or two copies of polynucleotides encoding the polypeptide into the host cell chromosome. Introduction into a chromosome can be accomplished by introducing, but not limited to, a vector capable of inserting a polynucleotide into the chromosome of a host cell into the host cell. The vector is as described above.
2) Способ замены области, регулирующей экспрессию (или последовательности, регулирующей экспрессию) гена, кодирующего полипептид, в хромосоме, на последовательность, обладающую сильной активностью, может быть достигнуто, например, путем индукции модификации в последовательности путем делеции, вставки, не консервативной или консервативной замены, или путем любой их комбинации для дополнительного усиления активности области, регулирующей экспрессию, или путем замены последовательности на последовательность, обладающую более сильной активностью. Область, регулирующая экспрессию, может включать без ограничения промотор, операторную последовательность, последовательность, кодирующую сайт связывания с рибосомой, последовательность, регулирующую терминацию транскрипции или трансляции и т.п. В одном из примеров способ может включать замену исходного промотора на сильный промотор, но не ограничиваться этим.2) A method of replacing the expression control region (or expression control sequence) of a gene encoding a polypeptide in a chromosome with a sequence having strong activity can be achieved, for example, by inducing a modification in the sequence by deletion, insertion, non-conservative or conservative substitution, or any combination thereof, to further enhance the activity of the expression regulatory region, or by replacing the sequence with a sequence having stronger activity. The expression regulating region may include, but is not limited to, a promoter, an operator sequence, a sequence encoding a ribosome binding site, a sequence regulating transcription or translation termination, and the like. In one example, the method may include, but is not limited to, replacing the original promoter with a strong promoter.
Примеры известного сильного промотора могут включать промоторы CJ1-CJ7 (патент США № US 7662943 В2), промотор lac, промотор trp, промотор trc, промотор tac, промотор PR фага лямбда, промотор PL, промотор tet, промотор gapA, промотор SPL7, промотор SPL13(sm3) (патент США № US 10584338 В2), промотор 02 (патент США №US 10273491 В2), промотор tkt и промотор уссА, но не ограничиваются этим.Examples of a known strong promoter may include the CJ1-CJ7 promoters (US Patent No. US 7,662,943 B2), the lac promoter, the trp promoter, the trc promoter, the tac promoter, the lambda phage PR promoter, the PL promoter, the tet promoter, the gapA promoter, the SPL7 promoter, the SPL13 promoter (sm3) (US Patent No. US 10584338 B2), promoter 02 (US Patent No. US 10273491 B2), tkt promoter and uscA promoter, but are not limited to.
3) Способ модификации нуклеотидной последовательности, кодирующей стартовый кодон или 5'-UTR генного транскрипта, кодирующего полипептид, может быть достигнут, например, путем замены нуклеотидной последовательности на нуклеотидную последовательность, кодирующую другой стартовый кодон, обладающий более высоким уровнем экспрессии полипептида, чем эндогенный стартовый кодон, но не ограничивается этим.3) A method for modifying a nucleotide sequence encoding a start codon or the 5'-UTR of a gene transcript encoding a polypeptide can be achieved, for example, by replacing the nucleotide sequence with a nucleotide sequence encoding another start codon having a higher level of expression of the polypeptide than the endogenous start codon, but is not limited to this.
4) и 5) Способы модификации аминокислотной последовательности или полинуклеотидной последовательности могут быть достигнуты путем индукции модификации в последовательности путем делеции, вставки, не консервативной или консервативной замены аминокислотной последовательности полипептида или полинуклеотидной последовательности, кодирующей полипептид, или путем любой их комбинации для усиления активности полипептида или путем замены последовательности на аминокислотную последовательность или полинуклеотидную последовательность, модифицированную таким образом, чтобы усилить активность, но не ограничиваются этим. Используемый здесь вектор может дополнительно включать маркер для отбора для подтверждения встраивания в хромосому. Маркер для отбора является таким как описано выше.4) and 5) Methods of modifying an amino acid sequence or a polynucleotide sequence can be achieved by inducing a modification in the sequence by deletion, insertion, non-conservative or conservative substitution of an amino acid sequence of a polypeptide or a polynucleotide sequence encoding a polypeptide, or any combination thereof to enhance the activity of the polypeptide or by replacing the sequence with, but not limited to, an amino acid sequence or a polynucleotide sequence modified so as to enhance activity. The vector used herein may further include a selection marker to confirm chromosomal integration. The selection marker is as described above.
6) Способ введения чужеродного полинуклеотида, демонстрирующего активностью полипептида может быть достигнут путем введения в клетку чужеродного полинуклеотида, кодирующего полипептид, который демонстрирует активность, идентичную/похожую на активность полипептида. Чужеродный полинуклеотид может быть использован без ограничения независимо от его происхождения или последовательности при условии, что он демонстрирует активность, идентичную/похожую на активность полипептида. Введение может быть осуществлено специалистами в данной области техники путем подходящего выбора способа трансформации, известного в области техники, и экспрессия введенного полинуклеотида в клетке-хозяине обеспечивает продукцию полипептида, таким образом, увеличивая его активность.6) The method of introducing a foreign polynucleotide exhibiting the activity of a polypeptide can be achieved by introducing into a cell a foreign polynucleotide encoding a polypeptide that exhibits activity identical/similar to that of the polypeptide. The foreign polynucleotide may be used without limitation regardless of its origin or sequence, provided that it exhibits activity identical/similar to that of the polypeptide. Administration can be accomplished by those skilled in the art by appropriate selection of a transformation method known in the art, and expression of the introduced polynucleotide in a host cell causes production of the polypeptide, thereby increasing its activity.
7) Способ оптимизации кодона полинуклеотида, кодирующего полипептид, может быть достигнут путем оптимизации кодона эндогенного полинуклеотида для увеличения транскрипции или трансляции в клетке-хозяине, или путем оптимизации его кодонов таким образом, чтобы дать возможность для достижения оптимизированной транскрипции и трансляции чужеродного полинуклеотида в клетке-хозяине.7) A method for optimizing the codon of a polynucleotide encoding a polypeptide can be achieved by optimizing the codon of an endogenous polynucleotide to enhance transcription or translation in a host cell, or by optimizing its codons so as to enable optimized transcription and translation of a foreign polynucleotide to be achieved in a cell. owner.
Кроме того, 8) способ анализа третичной структуры полипептида и, таким образом, отбора и модификации экспонируемого сайта или его химической модификации может быть достигнут, например, путем сравнения информации о последовательности анализируемого полипептида с базой данных, в которой хранится информация о последовательностях известных белков, для определения кандидатов белков-матриц в соответствии со степенью сходства последовательности, и, таким образом, подтверждения структуры, основанной на информации, таким образом, отбора и трансформации или модификации экспонируемого сайту, который предполагается модифицировать или химически модифицировать.In addition, 8) a method for analyzing the tertiary structure of a polypeptide and thus selecting and modifying the exposed site or chemically modifying it can be achieved, for example, by comparing the sequence information of the analyzed polypeptide with a database that stores sequence information of known proteins, to identify candidate template proteins according to the degree of sequence similarity, and thus confirm the structure based on the information, thereby selecting and transforming or modifying the exposed site that is intended to be modified or chemically modified.
Вектор в соответствии с описанием настоящего изобретения представляет собой молекулу ДНК, используемую в качестве посредника для искусственного переноса чужеродного генетического материала в другие клетки, и может включать конструкцию ДНК, содержащую нуклеотидную последовательность полинуклеотида, кодирующего полипептид-мишень, функционально связанный с подходящей областью, регулирующей экспрессию (последовательностью, регулирующей экспрессию), таким образом, что она способна экспрессировать полипептид-мишень в подходящей клетке-хозяине. Область, регулирующая экспрессию, может включать промотор, способный инициировать транскрипцию, любую операторную последовательность для регулирования транскрипции, последовательность, кодирующую подходящий сайт связывания мРНК с рибосомой, и последовательность, регулирующую терминацию транскрипции и трансляцию. После трансформации в подходящую клетку-хозяин вектор может реплицироваться или функционировать независимо от генома хозяина или может быть встроен в ее геном.A vector as described herein is a DNA molecule used as an intermediary for the artificial transfer of foreign genetic material into other cells, and may include a DNA construct containing the nucleotide sequence of a polynucleotide encoding a target polypeptide operably linked to a suitable expression regulatory region (expression control sequence) such that it is capable of expressing the target polypeptide in a suitable host cell. The expression regulatory region may include a promoter capable of initiating transcription, any operator sequence for regulating transcription, a sequence encoding a suitable mRNA ribosome binding site, and a sequence regulating transcription termination and translation. Once transformed into a suitable host cell, the vector can replicate or function independently of the host genome or can be integrated into its genome.
Вектор, используемый в описании настоящего изобретения, не ограничен конкретным образом, и может быть использован любой вектор, известный в области техники. Примеры обычно используемого вектора могут включать природные или рекомбинантные плазмиды, космиды, вирусы и бактериофаги. Например в качестве фагового вектора или космидного вектора могут быть использованы pWE15, М13, MBL3, MBL4, IXII, ASHII, APII, t10, t11, Charon4A и Charon21A и т.п., и в качестве плазмидного вектора могут быть использованы векторы на основе pDZ, pBR, pUC, pBluescriptII, pGEM, pTZ, pCL, pET и т.п. В частности, могут быть использованы векторы pDZ, pDC, pDCM2, pACYC177, pACYC184, pCL, pECCG117, pUC19, pBR322, pMW118, pCC1BAC и т.п.The vector used in the description of the present invention is not particularly limited, and any vector known in the art can be used. Examples of commonly used vectors may include natural or recombinant plasmids, cosmids, viruses and bacteriophages. For example, pWE15, M13, MBL3, MBL4, IXII, ASHII, APII, t10, t11, Charon4A and Charon21A, etc. can be used as a phage vector or cosmid vector, and pDZ-based vectors can be used as a plasmid vector , pBR, pUC, pBluescriptII, pGEM, pTZ, pCL, pET, etc. In particular, the vectors pDZ, pDC, pDCM2, pACYC177, pACYC184, pCL, pECCG117, pUC19, pBR322, pMW118, pCC1BAC and the like can be used.
В одном из примеров полинуклеотид, кодирующий желаемый полипептид, может быть встроен в хромосому с использованием вектора для внутриклеточного встраивания хромосом. Встраивание полинуклеотида в хромосому может быть произведено без ограничения при помощи любого способа, известного в области техники, например, при помощи гомологичной рекомбинации. Вектор может дополнительно включать селективный маркер для подтверждения встраивания в хромосому. Селективный маркер предназначен для отбора клеток, трансформированных вектором, то есть для подтверждения того, что встроена желаемая молекула нуклеиновой кислоты, и могут быть использованы маркеры, обеспечивающие селективные фенотипы, такие как резистентность к лекарственным средствам, потребность в питательных веществах, резистентность к цитотоксическим агентам и экспрессия поверхностных полипептидов. При обработке селективным агентом только клетки, экспрессирующие селективные маркеры, могут выжить или демонстрировать другие фенотипы в среде, и, таким образом, могут быть отобраны трансформированные клетки.In one example, a polynucleotide encoding a desired polypeptide can be inserted into a chromosome using an intracellular chromosome insertion vector. The insertion of a polynucleotide into a chromosome can be carried out without limitation using any method known in the art, for example, using homologous recombination. The vector may further include a selectable marker to confirm chromosomal integration. The selectable marker is intended to select cells transformed with the vector, that is, to confirm that the desired nucleic acid molecule has been inserted, and markers can be used to provide selective phenotypes such as drug resistance, nutrient requirements, resistance to cytotoxic agents and expression of surface polypeptides. When treated with a selection agent, only cells expressing the selectable markers can survive or exhibit other phenotypes in the environment, and thus transformed cells can be selected.
Использованный здесь термин «трансформация» относится к введению вектора, содержащего полинуклеотид, кодирующий полипептид-мишень, в клетку-хозяина или микроорганизм таким образом, чтобы полипептид, кодируемый полинуклеотидом, мог экспрессироваться в клетке-хозяине. Трансформированный полинуклеотид может быть представлен в форме, встроенной в хромосому клетки-хозяина, или в форме, расположенной за пределами хромосомы, при условии, что полипептид экспрессируется в клетке-хозяине. При условии, что трансформируемый полинуклеотид может экспрессироваться в клетке-хозяине, не важно, интегрируется ли трансформированный полинуклеотид в хромосому клетки-хозяина или располагается экстрахромосомно, и могут быть включены оба случая. Кроме того, полинуклеотид может включать ДНК и/или РНК, кодирующую полипептид-мишень. Полинуклеотид может быть введен в любой форме при условии, что он может быть введен в клетку-хозяина и экспрессироваться в ней. Например, полинуклеотид может быть введен в клетку-хозяина в форме экспрессирующейся кассеты, которая представляет собой генетическую конструкцию, включающую все элементы, необходимые для ее автономной экспрессии. Как правило, экспрессирующаяся кассета может включать промотор, функционально связанный с полинуклеотидом, сигнал терминации транскрипции, сайт связывания с рибосомой и сигнал терминации трансляции. Экспрессирующаяся кассета может находиться в форме самореплицирующегося экспрессирующегося вектора. Кроме того, полинуклеотид может быть введен в клетку-хозяина в своей исходной форме и функционально связан с последовательностью, необходимой для экспрессии в клетке-хозяине, но не ограничиваться этим.As used herein, the term “transformation” refers to the introduction of a vector containing a polynucleotide encoding a target polypeptide into a host cell or microorganism such that the polypeptide encoded by the polynucleotide can be expressed in the host cell. The transformed polynucleotide may be present in a form integrated into the chromosome of the host cell, or in a form located outside the chromosome, provided that the polypeptide is expressed in the host cell. As long as the transformed polynucleotide can be expressed in the host cell, it does not matter whether the transformed polynucleotide is integrated into the chromosome of the host cell or located extrachromosomally, and both cases can be included. In addition, the polynucleotide may include DNA and/or RNA encoding the target polypeptide. The polynucleotide can be introduced in any form, provided that it can be introduced into and expressed in a host cell. For example, the polynucleotide can be introduced into a host cell in the form of an expression cassette, which is a genetic construct that includes all elements necessary for its autonomous expression. Typically, the expression cassette may include a promoter operably linked to the polynucleotide, a transcription termination signal, a ribosome binding site, and a translation termination signal. The expression cassette may be in the form of a self-replicating expression vector. In addition, the polynucleotide may be introduced into a host cell in its original form and is operably linked to, but is not limited to, a sequence required for expression in the host cell.
Кроме того, использованный здесь термин «функционально связанный» означает то, что последовательность гена функционально связана с промоторной последовательностью, которая инициирует и опосредует транскрипцию полинуклеотида, кодирующего белок-мишень в соответствии с описанием настоящего изобретения.Additionally, as used herein, the term “operably linked” means that the gene sequence is operably linked to a promoter sequence that initiates and mediates transcription of a polynucleotide encoding a target protein as described herein.
Такое усиление белковой активности может означать то, что усиливается активность соответствующего белка, которой он исходно не обладает, или его активность или концентрация в общем увеличена на 1%, 10%, 25%, 50%, 75%, 100%, 150%, 200%, 300%, 400% или 500%, и максимально на 1000% или 2000% или более, основываясь на активности или концентрации белка дикого типа или исходного микробного штамма, но не ограничена ими.Such an increase in protein activity may mean that the activity of the corresponding protein is enhanced, which it does not initially possess, or its activity or concentration is generally increased by 1%, 10%, 25%, 50%, 75%, 100%, 150%, 200%, 300%, 400% or 500%, and a maximum of 1000% or 2000% or more, based on, but not limited to, the activity or concentration of the wild type protein or the original microbial strain.
В частности, усиление активности дегидратазы дигидроксикислоты может означать то, что активность дегидратазы дигидроксикислоты у микроорганизма усилена по сравнению с активностью у микроорганизма дикого типа, микроорганизма до модификации или микроорганизма, имеющего не модифицированный белок, таким образом, увеличивая синтез кетоизовалерата, который является предшественником L-валина, из дигидроксиизовалерата, приводя в результате к увеличению продукции L-валина.In particular, increased dihydroxy acid dehydratase activity may mean that the dihydroxy acid dehydratase activity of the microorganism is enhanced relative to that of a wild-type microorganism, a pre-modified microorganism, or a microorganism having an unmodified protein, thereby increasing the synthesis of ketoisovalerate, which is a precursor to L- valine, from dihydroxyisovalerate, resulting in increased production of L-valine.
Используемый здесь термин «уменьшение» представляет собой всеобъемлющую концепцию, включающую случай, при котором активность белка, представленного у микроорганизма в его естественном состоянии или до модификации, ослаблена или устранена (удалена), т.е. по сравнению с эндогенной активностью или одной копией гена, кодирующего белок в клетке, и может означать то, что активность составляет 0% или более до 100% или менее.As used herein, the term "reduction" is a comprehensive concept that includes the event in which the activity of a protein present in a microorganism in its natural state or before modification is weakened or eliminated (removed), i.e. compared to endogenous activity or one copy of a gene encoding a protein in a cell, and can mean that the activity is 0% or more to 100% or less.
Такое «уменьшение активности» белка означает то, что активность самого белка устранена или реализуется действие меньше чем его исходная функция, но конкретно не ограничена этим. То есть, уменьшение активности в частности включает как «устранение активности», так и «ослабление активности».Such "downregulation" of a protein means that the activity of the protein itself is eliminated or does less than its original function, but is not specifically limited to this. That is, activity reduction specifically includes both “elimination of activity” and “attenuation of activity.”
«Устранение активности» может означать то, что фермент или белок не экспрессируется совсем по сравнению с природным штаммом дикого типа, представляющего собой родительский штамм или штамм, имеющий не модифицированный белок, или его активность не обнаруживается даже тогда, когда фермент или белок экспрессируется.“Elimination of activity” may mean that the enzyme or protein is not expressed at all compared to a natural wild-type strain, which is the parent strain or a strain having an unmodified protein, or its activity is not detectable even when the enzyme or protein is expressed.
В описании настоящего изобретения устранение активности может быть достигнуто путем применения различных способов, хорошо известных в области техники. Примеры этих способов включают: 1) устранение фрагмента или всего гена, кодирующего белок; 2) модификацию последовательности гена, кодирующего белок, таким образом то, что активность белка устранена или ослаблена; 3) введение антисмыслового олигонуклеотида (например, антисмысловой РНК), который комплементарно связывается с транскриптом гена, кодирующего белок; 4) добавление последовательности, комплементарной последовательности Шайна-Дальгарно (SD) относительно переднего конца последовательности SD гена, кодирующего белок, с образованием вторичной структуры, таким образом, ингибируя рибосомальное прикрепление; 5) инженерия путем обратной транкрипции (RTE), при которой добавляют промотор, который должен обратимо транскрибироваться, по 3' концу открытой рамки считывания (ORF) последовательности гена, кодирующей белок; или их комбинацию, но конкретно не ограничены этим.In the present invention, elimination of activity can be achieved by using various methods well known in the art. Examples of these methods include: 1) elimination of a fragment or entire gene encoding a protein; 2) modification of the sequence of the gene encoding the protein, such that the activity of the protein is eliminated or weakened; 3) introduction of an antisense oligonucleotide (for example, antisense RNA), which complementarily binds to the transcript of the gene encoding the protein; 4) adding a sequence complementary to the Shine-Dalgarno (SD) sequence to the upstream end of the SD sequence of the protein-coding gene to form a secondary structure, thereby inhibiting ribosomal attachment; 5) reverse transcription engineering (RTE), in which a promoter, which is to be reversibly transcribed, is added at the 3' end of the open reading frame (ORF) of the protein-coding gene sequence; or a combination thereof, but is not specifically limited thereto.
Дополнительно, «ослабление активности» может означать то, что реализуется действие, меньшее чем исходная функция, и может быть достигнуто при помощи способов, включающих: устранение части гена, кодирующего белок, на хромосоме; замена гена, кодирующего белок на хромосоме, на мутантный ген, таким образом, что активность белка уменьшается; введение мутации в регулирующую экспрессию последовательность гена, кодирующего белок на хромосоме; замена регулирующей экспрессию последовательности гена, кодирующего белок, на последовательность, обладающую слабой активностью (например, замена промотора гена на промотор, который слабее чем эндогенный промотор) и т.п., но не ограничивающихся ими, и без ограничения могут быть использованы известные способы ослабления активности.Additionally, "attenuation" may mean that an effect less than the original function is achieved and can be achieved by methods including: eliminating a portion of a protein-encoding gene on a chromosome; replacement of a gene encoding a protein on a chromosome with a mutant gene, such that the activity of the protein is reduced; introducing a mutation into the expression-regulating sequence of a gene encoding a protein on the chromosome; replacement of the expression-regulating sequence of a gene encoding a protein with a sequence having weak activity (for example, replacement of a gene promoter with a promoter that is weaker than the endogenous promoter), etc., but not limited to them, and known methods of weakening can be used without limitation activity.
Такое уменьшение активности белка может означать то, что активность соответствующего белка устранена или его активность или концентрация в общем уменьшена на 0%, 1%, 5%, 10%, 15%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 98%, 99% относительно активности или концентрации в белке дикого типа или исходном штамме микроба, но не ограничиваться этим.Such a decrease in protein activity may mean that the activity of the corresponding protein is eliminated or its activity or concentration is generally reduced by 0%, 1%, 5%, 10%, 15%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60 %, 70%, 80%, 90%, 95%, 98%, 99% relative to, but not limited to, the activity or concentration in the wild-type protein or parent strain of the microbe.
В частности, активность трансаминазы С у микроорганизма может быть уменьшена по сравнению с активностью природного штамма дикого типа, родительского штамма до мутации или штамма, имеющего не модифицированный белок. В одном из воплощений микроорганизм может не обладать активностью белка трансаминазы С вследствие делеции гена трансаминазы С или может обладать ослабленной активностью, поскольку последовательность, кодирующая стартовый кодон гена трансаминазы С, модифицирована до GTG, таким образом, уменьшая экспрессию белка трансаминазы С.In particular, the transaminase C activity of a microorganism may be reduced compared to the activity of a natural wild-type strain, a parental strain before mutation, or a strain having an unmodified protein. In one embodiment, the microorganism may lack transaminase C protein activity due to deletion of the transaminase C gene, or may have reduced activity because the sequence encoding the start codon of the transaminase C gene is modified to GTG, thereby reducing the expression of transaminase C protein.
Дополнительно, в частности, активность пируватдегидрогеназы у микроорганизма может быть уменьшена по сравнению с активностью природного штамма дикого типа, родительского штамма до мутации или штамма, имеющего не модифицированный белок. В одном из воплощений микроорганизм может не обладать активностью белка пируватдегидрогеназы вследствие делеции гена пируватдегидрогеназы или может обладать ослабленной активностью, поскольку последовательность, кодирующая стартовый кодон гена пируватдегидрогеназы, модифицирована до GTG, таким образом, уменьшая экспрессию белка пируватдегидрогеназы. В еще одном воплощении, поскольку последовательность гена пируватдегидрогеназы мутирована у микроорганизма, микроорганизм может экспрессировать мутант пируватдегидрогеназы, обладающий ослабленной активностью по сравнению с активностью белка дикого типа, при котором аминокислота, соответствующая 432ому или 435ому положению от N-конца аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 3 заменена на другую аминокислоту. В частности, мутант пируватдегидрогеназы, обладающий ослабленной активностью по сравнению с активностью белка дикого типа, может включать последовательность SEQ ID NO: 5 или SEQ ID NO: 6, но не ограничен ими.Additionally, in particular, the activity of pyruvate dehydrogenase in a microorganism may be reduced compared to the activity of a natural wild-type strain, a parental strain before mutation, or a strain having an unmodified protein. In one embodiment, the microorganism may lack pyruvate dehydrogenase protein activity due to deletion of the pyruvate dehydrogenase gene, or may have reduced activity because the sequence encoding the start codon of the pyruvate dehydrogenase gene is modified to GTG, thereby reducing pyruvate dehydrogenase protein expression. In yet another embodiment, because the pyruvate dehydrogenase gene sequence is mutated in a microorganism, the microorganism may express a pyruvate dehydrogenase mutant having reduced activity compared to that of the wild-type protein, in which the amino acid corresponding to the 432nd or 435th position from the N-terminus of the amino acid sequence SEQ ID NO : 3 replaced with another amino acid. In particular, a mutant of pyruvate dehydrogenase having reduced activity compared to that of the wild-type protein may include, but is not limited to, SEQ ID NO: 5 or SEQ ID NO: 6.
Кроме того, в частности, активность цитратсинтазы у микроорганизма может быть уменьшена по сравнению с активностью природного штамма дикого типа, родительского штамма до мутации или штамма, имеющего не модифицированный белок. В одном из воплощений микроорганизм может не обладать активностью белка цитратсинтазы вследствие делеции гена цитратсинтазы или может обладать ослабленной активностью, поскольку последовательность, кодирующая стартовый кодон гена цитратсинтазы, модифицирована до GTG, таким образом, уменьшая экспрессию белка цитратсинтазы. В еще одном воплощении, поскольку последовательность гена цитратсинтазы мутирована у микроорганизма, микроорганизм может экспрессировать мутант цитратсинтазы, обладающий уменьшенной активностью по сравнению с активностью белка дикого типа, при котором аминокислота, соответствующая 241ому или 312ому положению от N-конца аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 4 заменена на другую аминокислоту. В частности, мутант цитратсинтазы, обладающий уменьшенной активностью по сравнению с активностью белка дикого типа, может включать последовательность SEQ ID NO: 7 или SEQ ID NO: 8, но не ограничен ими.In addition, in particular, the activity of citrate synthase in a microorganism may be reduced compared to the activity of a natural wild-type strain, a parental strain before mutation, or a strain having an unmodified protein. In one embodiment, the microorganism may lack citrate synthase protein activity due to deletion of the citrate synthase gene, or may have reduced activity because the sequence encoding the start codon of the citrate synthase gene is modified to GTG, thereby reducing expression of the citrate synthase protein. In yet another embodiment, because the citrate synthase gene sequence is mutated in a microorganism, the microorganism may express a mutant citrate synthase having reduced activity compared to that of the wild-type protein, in which the amino acid corresponding to position 241 or 312 from the N-terminus of the amino acid sequence SEQ ID NO : 4 replaced with another amino acid. In particular, a citrate synthase mutant having reduced activity compared to that of the wild-type protein may include, but is not limited to, SEQ ID NO: 7 or SEQ ID NO: 8.
Выражение «замена на другую аминокислоту» не ограничено при условии, что аминокислота до замены заменяется на другую аминокислоту. В частности, она может быть заменена на любую аминокислоту, выбранную из лизина, гистидина, глутаминовой кислоты, аспарагиновой кислоты, глицина, аланина, валина, лейцина, изолейцина, метионина, фенилаланина, триптофана, пролина, серина, треонина, цистеина, тирозина, аспарагина, аргинина и глутамина.The expression "replacement with another amino acid" is not limited, provided that the amino acid before the substitution is replaced with another amino acid. In particular, it may be replaced by any amino acid selected from lysine, histidine, glutamic acid, aspartic acid, glycine, alanine, valine, leucine, isoleucine, methionine, phenylalanine, tryptophan, proline, serine, threonine, cysteine, tyrosine, asparagine , arginine and glutamine.
Конкретнее, пируватдегидрогеназа, обладающая ослабленной активностью, может представлять собой пируватдегидрогеназу, в которой аминокислота, соответствующая 432ому или 435ому положению от N-конца аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 3 заменена на не полярную аминокислоту.More specifically, the pyruvate dehydrogenase having reduced activity may be a pyruvate dehydrogenase in which the amino acid corresponding to the 432nd or 435th position from the N-terminus of the amino acid sequence SEQ ID NO: 3 is replaced by a non-polar amino acid.
Дополнительно, конкретнее, цитратсинтаза, обладающая уменьшенной активностью, может представлять собой цитратеинтазу, в которой аминокислота, соответствующая 241ому или 312ому положению от N-конца аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 4 заменена на полярную или не полярную аминокислоту.Additionally, more specifically, the citrate synthase having reduced activity may be a citrate synthase in which the amino acid corresponding to position 241 or 312 from the N-terminus of the amino acid sequence SEQ ID NO: 4 is replaced by a polar or non-polar amino acid.
Использованный здесь термин «соответствующий» относится к аминокислотному остатку в положении, указанном в белке или пептиде, или аминокислотному остатку, который похож на, идентичен или гомологичен остатку, указанному в белке или пептиде. Использованная здесь «соответствующая область» как правило относится к похожей или соответствующей позиции в родственном белке или референсном белке.As used herein, the term “corresponding” refers to an amino acid residue at a position specified in a protein or peptide, or an amino acid residue that is similar, identical or homologous to a residue specified in a protein or peptide. As used herein, “corresponding region” generally refers to a similar or corresponding position in a related protein or reference protein.
В описании настоящего изобретения может быть использована специфическая нумерация положений аминокислотных остатков в используемом здесь белке. Например, возможно перенумеровать положения аминокислотных остатков в белке в соответствии с описанием настоящего изобретения в соответствующие положения путем выравнивания последовательности белка в соответствии с описанием настоящего изобретения с желаемым белком, с которым производится сравнение.In describing the present invention, specific numbering of amino acid residue positions in the protein used herein may be used. For example, it is possible to renumber the positions of amino acid residues in a protein as described herein to corresponding positions by aligning the sequence of the protein as described herein with the desired protein being compared.
Использованный здесь термин «гомология» или «идентичность» относится к степени сходства между двумя данными аминокислотными последовательностями или нуклеотидными последовательностями, и она может быть выражена в процентах. Часто термины «гомология» и «идентичность» можно использовать взаимозаменяемо друг с другом.As used herein, the term “homology” or “identity” refers to the degree of similarity between two given amino acid sequences or nucleotide sequences, and can be expressed as a percentage. Often the terms homology and identity can be used interchangeably with each other.
Гомологию или идентичность последовательности консервативных полинуклеотидов или полипептидов можно определить путем стандартного алгоритма выравнивания, и вместе с ним можно использовать штраф за пропуск в последовательности, установленный в используемой программе. По существу, гомологичные или идентичные последовательности как правило могут гибридизоваться с полными последовательностями или частью последовательностей в умеренно строгих или очень строгих условиях. Понятно то, что также включена гибридизация с полинуклеотидами, содержащими общий кодон или вырожденные кодоны в гибридизируемых полинуклеотидах.The homology or sequence identity of conserved polynucleotides or polypeptides can be determined by a standard alignment algorithm and can be coupled with a sequence gap penalty set in the program being used. Substantially homologous or identical sequences can generally hybridize to entire sequences or portions of sequences under moderately stringent or very stringent conditions. It is understood that hybridization with polynucleotides containing a common codon or degenerate codons in the polynucleotides being hybridized is also included.
Имеют ли любые две полинуклеотидные или полипептидные последовательности гомологию, сходство или идентичность может быть, например, определено с использованием известного компьютерного алгоритма, такого как программа «FASTA» (Pearson et al., (1988) [Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85]: 2444) с использованием параметров по умолчанию. Альтернативно, они могут быть определены с использованием алгоритма Нидлмана-Вунша (Needleman and Wunsch, 1970, J. Mol. Biol. 48:443-453), который осуществляют с использованием программы Needleman пакета EMBOSS (EMBOSS: The European Molecular Biology Open Software Suite, Rice et al., 2000, Trends Genet. 16:276 277) (предпочтительно, версия 5.0.0 или более поздняя) (программный пакет GCG (Devereux, J. et al., Nucleic Acids Research 12:387 (1984)), BLASTP, BLASTN, FASTA (Atschul, S. F. et al., J MOLEC BIOL 215:403 (1990); Guide to Huge Computers, Martin J. Bishop, ed., Academic Press, San Diego, 1994, и CARILLO et al. (1988) SIAM J Applied Math 48:1073). Например, гомология, сходство или идентичность могут быть определены с использованием BLAST или ClustalW Национального Центра Биотехнологической Информации (NCBI).Whether any two polynucleotide or polypeptide sequences have homology, similarity or identity can, for example, be determined using a known computer algorithm such as the FASTA program (Pearson et al., (1988) [Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85]: 2444) using default parameters. Alternatively, they can be determined using the Needleman-Wunsch algorithm (Needleman and Wunsch, 1970, J. Mol. Biol. 48:443-453), which is carried out using the Needleman program of the EMBOSS package (EMBOSS: The European Molecular Biology Open Software Suite , Rice et al., 2000, Trends Genet. 16:276 277) (preferably version 5.0.0 or later) (GCG software package (Devereux, J. et al., Nucleic Acids Research 12:387 (1984)) , BLASTP, BLASTN, FASTA (Atschul, S. F. et al., J MOLEC BIOL 215:403 (1990); Guide to Huge Computers, Martin J. Bishop, ed., Academic Press, San Diego, 1994, and CARILLO et al. (1988) SIAM J Applied Math 48:1073). For example, homology, similarity, or identity can be determined using BLAST or National Center for Biotechnology Information (NCBI) ClustalW.
Гомологию, сходство или идентичность между полинуклеотидами или полипептидами можно определить, например, путем сравнения информации о последовательностях с помощью, например, компьютерной программы GAP, такой как Needleman et al., (1970), J Mol Biol. 48:443, как раскрыто в Smith and Waterman, Adv. Appl. Math (1981) 2:482. В общем, программа GAP определяет гомологию, сходство или идентичность путем деления количества выровненных одинаковых символов (т.е. нуклеотидов или аминокислот) на общее количество символов в более короткой из двух последовательностей. Параметры по умолчанию для программы GAP могут включать: (1) матрицу двоичного сравнения (содержащую величину 1 в случае идентичности и 0 в случае не идентичности) и взвешенную матрицу сравнения в соответствии с Gribskov, et al. (1986), Nucl. Acids Res. 14:6745, как описано в Schwartz and Dayhoff, eds., Atlas Of Protein Sequence and Structure, National Biomedical Research Foundation, pp. 353-358 (1979) (или матрица замен EDNAFULL (версия EMBOSS NCBI NUC4.4); (2) штраф 3,0 за каждый пропуск и дополнительно штраф 0,10 за каждый символ в каждом пропуске (или штраф за внесение пропуска 10 и штраф за удлинение пропуска 0,5) и (3) отсутствие штрафа за концевые пропуски.Homology, similarity or identity between polynucleotides or polypeptides can be determined, for example, by comparing sequence information using, for example, a GAP computer program such as Needleman et al., (1970), J Mol Biol. 48:443, as disclosed in Smith and Waterman, Adv. Appl. Math (1981) 2:482. In general, the GAP program determines homology, similarity, or identity by dividing the number of aligned identical characters (i.e., nucleotides or amino acids) by the total number of characters in the shorter of the two sequences. Default parameters for the GAP program may include: (1) a binary comparison matrix (containing a value of 1 if identical and 0 if not identical) and a weighted comparison matrix according to Gribskov, et al. (1986), Nucl. Acids Res. 14:6745, as described in Schwartz and Dayhoff, eds., Atlas Of Protein Sequence and Structure, National Biomedical Research Foundation, pp. 353-358 (1979) (or EDNAFULL substitution matrix (EMBOSS NCBI NUC4.4 version); (2) a penalty of 3.0 for each omission and an additional penalty of 0.10 for each character in each omission (or a penalty of 10 and penalty for extending skips 0.5) and (3) no penalty for end skips.
Используемый здесь термин «вариант» относится к белку, имеющему одну или более чем одну аминокислоту, отличающуюся от описанной последовательности путем консервативных замен и/или модификаций, таким образом, что функции или свойства белка сохраняются. Варианты отличаются от последовательностей, идентифицированных путем замены, делеции или вставки нескольких аминокислот. Такие варианты как правило могут быть идентифицированы путем модификации одной или более чем одной из вышеприведенных аминокислотных последовательностей белка и путем оценки свойств модифицированного белка. То есть, способность вариантов может быть усилена, не изменена или уменьшена по сравнению с нативным белком. Другие варианты могут включать варианты, в которых фрагмент удален из N-и/или С-конца зрелого белка. Термин «вариант» может быть использован взаимозаменяемо с терминами, такими как модификация, модифицированный белок, модифицированный полипептид, мутант, мутеин, дивергент, вариант и т.п., при условии, что термины используют для обозначения вариации, но термины не ограничены ими. Для задачи описания настоящего изобретения вариант может представлять собой варианты, в которых активность белка уменьшена или ослаблена по сравнению с активностью природного белка дикого типа или не модифицированного белка, но не ограничен ими.As used herein, the term “variant” refers to a protein having one or more amino acids that differ from the described sequence by conservative substitutions and/or modifications such that the functions or properties of the protein are retained. Variants differ from sequences identified by substitution, deletion, or insertion of multiple amino acids. Such variants can generally be identified by modifying one or more of the above amino acid sequences of the protein and by evaluating the properties of the modified protein. That is, the ability of the variants may be enhanced, unchanged, or reduced compared to the native protein. Other variants may include variants in which the fragment is removed from the N- and/or C-terminus of the mature protein. The term “variant” may be used interchangeably with terms such as modification, modified protein, modified polypeptide, mutant, mutein, divergent, variant, and the like, provided that the terms are used to denote variation, but the terms are not limited to them. For the purpose of describing the present invention, a variant may be, but is not limited to, variants in which the activity of the protein is reduced or weakened compared to the activity of the naturally occurring wild-type or unmodified protein.
Используемый здесь термин «консервативная замена» относится к замене аминокислоты на другую аминокислоту, обладающую похожими структурными и/или химическими свойствами. Такая аминокислотная замена как правило может происходить на основе сходства полярности, заряда (основной, кислотный), растворимости, гидрофобности, гидрофильности и/или амфипатической природы остатка.As used herein, the term “conservative substitution” refers to the replacement of an amino acid with another amino acid having similar structural and/or chemical properties. Such an amino acid substitution can generally occur on the basis of similarity in polarity, charge (basic, acidic), solubility, hydrophobicity, hydrophilicity and/or amphipathic nature of the residue.
Кроме того, вариант также может включать делецию или добавление аминокислот, которые обладают минимальным влиянием на свойства и вторичную структуру полипептида. Например, полипептид может быть конъюгирован с сигнальной (или лидерной) последовательностью по N-концу, вовлеченной в перенос белков котрансляционно или посттрансляционно. Кроме того, полипептид также может быть конъюгирован с другой последовательностью или линкером для идентификации, очистки или синтеза полипептида.In addition, the variant may also include deletion or addition of amino acids that have minimal effect on the properties and secondary structure of the polypeptide. For example, the polypeptide may be conjugated to a signal (or leader) sequence at the N-terminus involved in co-translational or post-translational protein transfer. In addition, the polypeptide may also be conjugated to another sequence or linker to identify, purify, or synthesize the polypeptide.
Используемый здесь термин «микроорганизм, продуцирующий L-валин», относится к микроорганизму, способному продуцировать избыточное количество L-валина из источника углерода в среде по сравнению с микроорганизмом дикого типа или не модифицированным микроорганизмом. Кроме того, микроорганизм, продуцирующий L-валин, может представлять собой рекомбинантный микроорганизм. В частности, микроорганизм не ограничен конкретно его типом при условии, что он может продуцировать L-валин, и может представлять собой микроорганизм рода Enterobacter, рода Escherichia, рода Erwinia, рода Serratia, рода Providencia, рода Corynebacterium и рода Brevibacterium. Конкретнее, он может представлять собой микроорганизм рода Corynebacterium или рода Escherichia.As used herein, the term “L-valine-producing microorganism” refers to a microorganism capable of producing an excess amount of L-valine from a carbon source in the medium compared to a wild-type microorganism or an unmodified microorganism. In addition, the L-valine-producing microorganism may be a recombinant microorganism. In particular, the microorganism is not particularly limited to its type as long as it can produce L-valine, and may be a microorganism of the Enterobacter genus, Escherichia genus, Erwinia genus, Serratia genus, Providencia genus, Corynebacterium genus and Brevibacterium genus. More specifically, it may be a microorganism of the genus Corynebacterium or the genus Escherichia.
Еще конкретнее, микроорганизм рода Escherichia может представлять собой Escherichia coli, и микроорганизм рода Corynebacterium может представлять собой Corynebacterium glutamicum, и может быть включен любой микроорганизм рода Corynebacterium или рода Escherichia, способный увеличивать продукцию L-валина, в который введена усиленная активность дегидратазы дигидроксикислоты; и любая одна или более чем одна из комбинаций, выбранных из уменьшенной активности трансаминазы С; уменьшенной активности пируватдегидрогеназы; или уменьшенной активности цитратсинтазы.More specifically, the microorganism of the genus Escherichia may be Escherichia coli, and the microorganism of the genus Corynebacterium may be Corynebacterium glutamicum, and any microorganism of the genus Corynebacterium or the genus Escherichia capable of increasing the production of L-valine into which enhanced dihydroxy acid dehydratase activity is introduced can be included; and any one or more combinations selected from reduced transaminase C activity; decreased pyruvate dehydrogenase activity; or decreased citrate synthase activity.
Родительский штамм микроорганизма, продуцирующего L-валин, который модифицирован таким образом, что обладает усиленной активностью дегидратазы дигидроксикислоты; и любой одной или более чем одной из комбинаций, выбранных из (1)-(3) ниже:A parent strain of an L-valine-producing microorganism that has been modified to have enhanced dihydroxy acid dehydratase activity; and any one or more than one of the combinations selected from (1)-(3) below:
(1) уменьшенной активностью трансаминазы С;(1) decreased transaminase C activity;
(2) ослабленной активностью пируватдегидрогеназы; и(2) weakened pyruvate dehydrogenase activity; And
(3) уменьшенной активностью цитратсинтазы, не ограничен конкретным образом при условии, что он представляет собой микроорганизм, продуцирующий L-валин.(3) reduced citrate synthase activity, is not particularly limited provided that it is an L-valine producing microorganism.
Микроорганизм, продуцирующий L-валин, сам может представлять природный микроорганизм или микроорганизм, обладающий улучшенной способностью продуцировать L-валин путем встраивания гена, связанного с механизмом внешней продукции L-валина, или усилением или уменьшением (ослаблением или подавлением) активности эндогенного гена.The L-valine producing microorganism may itself be a naturally occurring microorganism or a microorganism having an improved ability to produce L-valine by insertion of a gene associated with an extrinsic L-valine production mechanism or by enhancing or decreasing (weakening or suppressing) the activity of an endogenous gene.
В одном из воплощений микроорганизм может представлять собой микроорганизм, продуцирующий L-валин, обладающий усиленной активностью дегидратазы дигидроксикислоты по сравнению со штаммом дикого типа или родительским штаммом до мутации, и уменьшенной активностью трансаминазы С по сравнению со штаммом дикого типа или родительским штаммом до мутации. В частности, дегидратаза дигидроксикислоты может кодироваться геном ilvD, и трансаминаза С может кодироваться геном avtA. Гены могут быть получены из Corynebacterium glutamicum, но не ограничены ими.In one embodiment, the microorganism may be an L-valine-producing microorganism having increased dihydroxy acid dehydratase activity compared to the wild-type strain or pre-mutation parent strain, and reduced transaminase C activity compared to the wild-type or pre-mutation parent strain. In particular, dihydroxy acid dehydratase may be encoded by the ilvD gene, and transaminase C may be encoded by the avtA gene. The genes may be derived from, but are not limited to, Corynebacterium glutamicum.
В еще одном воплощении микроорганизм может представлять собой микроорганизм, продуцирующий L-валин, обладающий усиленной активностью дегидратазы дигидроксикислоты по сравнению со штаммом дикого типа или родительским штаммом до мутации, и ослабленной активностью пируватдегидрогеназы по сравнению со штаммом дикого типа или родительским штаммом до мутации. В частности, дегидратаза дигидроксикислоты может кодироваться геном ilvD, и пируватдегидрогеназа может кодироваться геном асеЕ. Гены могут быть получены из Corynebacterium glutamicum, но не ограничены ими.In yet another embodiment, the microorganism may be an L-valine-producing microorganism having enhanced dihydroxy acid dehydratase activity compared to the wild-type strain or pre-mutation parent strain, and reduced pyruvate dehydrogenase activity compared to the wild-type strain or pre-mutation parent strain. In particular, dihydroxy acid dehydratase may be encoded by the ilvD gene, and pyruvate dehydrogenase may be encoded by the aceE gene. The genes may be derived from, but are not limited to, Corynebacterium glutamicum.
В еще одном воплощении микроорганизм может представлять собой микроорганизм, продуцирующий L-валин, обладающий усиленной активностью дегидратазы дигидроксикислоты по сравнению со штаммом дикого типа или родительским штаммом до мутации и уменьшенной активностью цитратсинтазы по сравнению со штаммом дикого типа или родительским штаммом до мутации. В частности, дегидратаза дигидроксикислоты может кодироваться геном ilvD, и цитратсинтаза может кодироваться геном gltA. Гены могут быть получены из Corynebacterium glutamicum, но не ограничены ими.In yet another embodiment, the microorganism may be an L-valine-producing microorganism having enhanced dihydroxy acid dehydratase activity compared to the wild-type strain or pre-mutation parent strain and reduced citrate synthase activity compared to the wild-type strain or pre-mutation parent strain. In particular, dihydroxy acid dehydratase may be encoded by the ilvD gene, and citrate synthase may be encoded by the gltA gene. The genes may be derived from, but are not limited to, Corynebacterium glutamicum.
Дополнительно к вышеприведенному микроорганизму он может представлять собой микроорганизм, продуцирующий L-валин, у которого активность трансаминазы С уменьшена или активность пируватдегидрогеназы уменьшена по сравнению со штаммом дикого типа или родительским штаммом до мутации, или может представлять собой микроорганизм, продуцирующий L-валин, у которого активность трансаминазы С уменьшена и активность пируватдегидрогеназы уменьшена по сравнению со штаммом дикого типа или родительским штаммом до мутации.In addition to the above microorganism, it may be an L-valine-producing microorganism in which transaminase C activity is reduced or pyruvate dehydrogenase activity is reduced compared with the wild-type strain or the parent strain before the mutation, or may be an L-valine-producing microorganism in which transaminase C activity is reduced and pyruvate dehydrogenase activity is reduced compared to the wild type strain or the parental strain before the mutation.
В еще одном аспекте описания настоящего изобретения предложен способ получения L-валина, включающий: культивирование микроорганизма, продуцирующего L-валин, который отличается усиленной активностью дегидратазы дигидроксикислоты; и любой одной или более чем одной из комбинаций, выбранных из (1)-(3) ниже:In yet another aspect of the present invention, there is provided a method for producing L-valine, comprising: cultivating an L-valine producing microorganism that has enhanced dihydroxy acid dehydratase activity; and any one or more than one of the combinations selected from (1)-(3) below:
(1) уменьшенной активностью трансаминазы С;(1) decreased transaminase C activity;
(2) ослабленной активностью пируватдегидрогеназы; и(2) weakened pyruvate dehydrogenase activity; And
(3) уменьшенной активностью цитратсинтазы.(3) reduced citrate synthase activity.
«L-валин» в соответствии с описанием настоящего изобретения может включать не только сам L-валин, а также и его соль."L-valine" as used herein may include not only L-valine itself, but also a salt thereof.
Использованный здесь термин «культивирование» означает, что микроорганизм выращивают в надлежащим образом контролируемых условиях окружающей среды. Процесс культивирования в соответствии с описанием настоящего изобретения может быть осуществлен в подходящей культуральной среде и условиях выращивания, известных в области техники. Такой процесс культивирования может быть легко скорректирован для применения специалистом в данной области техники в соответствии с выбранным штаммом. В частности, выращивание может представлять собой периодическое выращивание, непрерывное выращивание и выращивание подпитываемой культуры, но не ограничиваться этим.As used herein, the term "culture" means that the microorganism is grown under appropriately controlled environmental conditions. The cultivation process in accordance with the description of the present invention can be carried out in a suitable culture medium and growth conditions known in the art. Such a cultivation process can be easily adjusted for use by one skilled in the art according to the strain selected. In particular, the cultivation may be, but is not limited to, batch cultivation, continuous cultivation, and fed-culture cultivation.
Использованный здесь термин «среда» относится к смеси веществ, которая содержит в качестве основного ингредиента питательные вещества, требующиеся для культивирования микроорганизма, и она обеспечивает питательные вещества и факторы роста, а также воду, которые необходимы для жизнедеятельности и роста. В частности, среда и другие условия культивирования, используемые для культивирования микроорганизма в соответствии с описанием настоящего изобретения, могут представлять собой любую среду, используемую для обычного культивирования микроорганизмов без какого-либо конкретного ограничения. Тем не менее, микроорганизм в соответствии с описанием настоящего изобретения может быть выращен в аэробных условиях в обычной среде, содержащей подходящий источник углерода, источник азота, источник фосфора, неорганическое соединение, аминокислоту и/или витамин, при корректировании температуры, рН и т.п.As used herein, the term "medium" refers to a mixture of substances that contains as a main ingredient the nutrients required for the cultivation of a microorganism, and it provides nutrients and growth factors, as well as water, which are necessary for life and growth. In particular, the medium and other culture conditions used for culturing the microorganism in accordance with the description of the present invention may be any medium used for conventional cultivation of microorganisms without any particular limitation. However, the microorganism in accordance with the description of the present invention can be grown under aerobic conditions in a conventional environment containing a suitable carbon source, nitrogen source, phosphorus source, inorganic compound, amino acid and/or vitamin, with adjustments in temperature, pH, and the like. .
В описании настоящего изобретения источник углерода может включать углеводы, такие как глюкоза, сахароза, лактоза, фруктоза, мальтоза и т.п.; сахарные спирты, такие как маннит, сорбит и т.п.; органические кислоты, такие как пировиноградная кислота, молочная кислота, лимонная кислота и т.п.; аминокислоты, такие как глутаминовая кислота, метионин, лизин и т.п. Кроме того, источник углерода может включать природные органические питательных вещества, такие как гидролизат крахмала, мелассы, сырые мелассы, рисовые отруби, маниок, выжимки сахарного тростника и жидкий кукурузный экстракт и т.п. В частности, могут быть использованы углеводы, такие как глюкоза и стерилизованные предварительно обработанные мелассы (т.е. мелассы, преобразованные в редуцированные сахара), и, кроме того, различные другие источники углерода в подходящем количестве могут быть использованы без ограничения. Эти источники углерода могут быть использованы сами по себе или в комбинации двух или более чем двух из них, но не ограничиваться этим.In the present invention, the carbon source may include carbohydrates such as glucose, sucrose, lactose, fructose, maltose and the like; sugar alcohols such as mannitol, sorbitol and the like; organic acids such as pyruvic acid, lactic acid, citric acid and the like; amino acids such as glutamic acid, methionine, lysine, etc. In addition, the carbon source may include natural organic nutrients such as starch hydrolyzate, molasses, raw molasses, rice bran, cassava, sugar cane pomace and liquid corn extract, and the like. In particular, carbohydrates such as glucose and sterilized pre-processed molasses (ie molasses converted to reduced sugars) can be used, and in addition, various other carbon sources in suitable amounts can be used without limitation. These carbon sources may be used alone or in combination of two or more of them, but are not limited to this.
Источник азота может включать источники неорганического азота, такие как аммиак, сульфат аммония, хлорид аммония, ацетат аммония, фосфат аммония, карбонат аммония, нитрат аммония и т.п.; аминокислоты, такие как глутаминовая кислота, метионин, глютамин и т.п.; и источники органического азота, такие как пептон, NZ-амин, мясной экстракт, дрожжевой экстракт, солодовый экстракт, жидкий кукурузный экстракт, гидролизат казеина, рыба или продукты ее деградации, обезжиренный соевый жмых или продукт его деградации и т.п. Эти источники азота могут быть использованы сами по себе или в комбинации двух или более чем двух из них, но не ограничиваться этим.The nitrogen source may include inorganic nitrogen sources such as ammonia, ammonium sulfate, ammonium chloride, ammonium acetate, ammonium phosphate, ammonium carbonate, ammonium nitrate and the like; amino acids such as glutamic acid, methionine, glutamine and the like; and organic nitrogen sources such as peptone, NZ-amine, meat extract, yeast extract, malt extract, liquid corn extract, casein hydrolysate, fish or its degradation products, defatted soybean meal or its degradation product, and the like. These nitrogen sources may be used alone or in combination of two or more of them, but are not limited to this.
Источник фосфора может включать первичный кислый фосфат калия, гидрофосфат калия или соответствующие содержащие натрий соли. Примеры неорганических соединений могут включать хлорид натрия, хлорид кальция, хлорид железа, сульфат магния, сульфат железа, сульфат марганца, карбонат кальция и т.д. Кроме того, могут быть включены аминокислоты, витамины и/или соответствующие предшественники. Эти компоненты или предшественники могут быть добавлены к среде партиями или непрерывным образом, но эти источники фосфора не ограничиваются этим.The phosphorus source may include potassium dihydrogen phosphate, potassium hydrogen phosphate, or appropriate sodium containing salts. Examples of inorganic compounds may include sodium chloride, calcium chloride, ferric chloride, magnesium sulfate, ferrous sulfate, manganese sulfate, calcium carbonate, etc. In addition, amino acids, vitamins and/or appropriate precursors may be included. These components or precursors may be added to the medium in batches or in a continuous manner, but these phosphorus sources are not limited to this.
В описании настоящего изобретения рН среды может быть скорректирован путем добавления соединения, такого как гидроксид аммония, гидроксид калия, аммиак, фосфорная кислота, серная кислота и т.п., подходящим образом во время культивирования микроорганизма. Кроме того, во время культивирования образование пены может быть предотвращено путем использования пеногасителя, такого как сложный эфир полигликоля и жирной кислоты. Кроме того, кислород или содержащий кислород газ могут быть введены в среду для поддержания в среде аэробных условий; или азот, водород или углекислый газ могут быть введены для поддержания анаэробных и микроаэробных условий без нагнетания в нее газа, но газ не ограничен ими.In the present invention, the pH of the medium can be adjusted by adding a compound such as ammonium hydroxide, potassium hydroxide, ammonia, phosphoric acid, sulfuric acid and the like, as appropriate during the cultivation of the microorganism. In addition, during culture, foam formation can be prevented by using an antifoaming agent such as a polyglycol fatty acid ester. In addition, oxygen or an oxygen-containing gas may be introduced into the medium to maintain aerobic conditions in the medium; or nitrogen, hydrogen or carbon dioxide may be introduced to maintain anaerobic and microaerobic conditions without forcing gas into it, but the gas is not limited to them.
Температура среды может находиться в диапазоне от 20°С до 45°С, в частности, от 30°С до 37°С, но не ограничиваться этим. Культивирование может осуществляться до получения желательного продуцируемого количества полезных веществ, в частности, в течение приблизительно от 10 до 100 часов, но не ограничиваться этим.The ambient temperature may be in the range of 20°C to 45°C, in particular, but not limited to 30°C to 37°C. Cultivation may be carried out until the desired amount of nutrients produced is obtained, particularly for, but not limited to, about 10 to 100 hours.
L-валин, продуцирумый путем выращивания в соответствии с описанием настоящего изобретения, может быть высвобожден в среду или оставаться в клетках.L-valine produced by cultivation in accordance with the description of the present invention can be released into the medium or remain in the cells.
Способ получения L-валина в соответствии с описанием настоящего изобретения дополнительно может включать стадию приготовления микроорганизма в соответствии с описанием настоящего изобретения, стадию приготовления среды для культивирования штамма или их комбинацию (независимо от последовательности, в любой последовательности), например, до стадии выращивания.The method for producing L-valine in accordance with the description of the present invention may further include the step of preparing a microorganism in accordance with the description of the present invention, the step of preparing a medium for culturing the strain, or a combination thereof (regardless of the sequence, in any sequence), for example, before the growth step.
Способ получения L-валина в соответствии с описанием настоящего изобретения дополнительно может включать стадию выделения L-валина из культуральной среды (среды, в которой осуществлялось выращивание) или микроорганизма в соответствии с описанием настоящего изобретения. Стадия выделения может быть дополнительно включена после стадии культивирования.The method for producing L-valine as described herein may further include the step of isolating L-valine from a culture medium or microorganism as described herein. An isolation step may further be included after the culture step.
На стадии выделения желаемый L-валин может быть собран с использованием способа культивирования микроорганизма в соответствии с описанием настоящего изобретения, например, с использованием подходящего способа, известного в области техники, в соответствии с периодическим способом культивирования, непрерывным способом культивирования или культивированием с подпиткой. Например, могут быть использованы способы, такие как центрифугирование, фильтрование, обработка агентом, осаждающим белок (способ высаливания), экстракция, ультразвуковое разрушение, ультрафильтрация, диализ, различные виды хроматографий, такие как хроматография на молекулярных ситах (гель-фильтрация), адсорбционная хроматография, ионообменная хроматография и аффинная хроматография и т.п., HPLC (высокоэффективная жидкостная хроматография) или их комбинация, и желаемый L-валин может быть выделен из культурной среды или микроорганизма с использованием подходящих способов, известных в области техники.In the isolation step, the desired L-valine can be collected using a microorganism culture method as described in the present invention, for example, using a suitable method known in the art according to a batch culture method, a continuous culture method or a fed-batch culture method. For example, methods such as centrifugation, filtration, treatment with a protein precipitating agent (salting-out method), extraction, ultrasonic disruption, ultrafiltration, dialysis, various types of chromatography such as molecular sieve chromatography (gel filtration), adsorption chromatography can be used. , ion exchange chromatography and affinity chromatography, etc., HPLC (high performance liquid chromatography) or a combination thereof, and the desired L-valine can be isolated from the culture medium or microorganism using suitable methods known in the art.
Кроме того, способ получения L-валина в соответствии с описанием настоящего изобретения дополнительно может включать стадию очистки, которая может быть осуществлена с использованием подходящего способа, известного в области техники. В одном из примеров, когда способ получения L-валина в соответствии с описанием настоящего изобретения включает как стадию выделения, так и стадию очистки, тогда стадия выделения и стадия очистки могут быть осуществлены непрерывно или с перерывами независимо от последовательности, или могут быть осуществлены одновременно, или могут быть объединены в одну стадию, но способ не ограничивается этим.In addition, the method for producing L-valine in accordance with the description of the present invention may further include a purification step, which can be carried out using a suitable method known in the art. In one example, when the method for producing L-valine in accordance with the description of the present invention includes both an isolation step and a purification step, then the isolation step and the purification step can be carried out continuously or intermittently regardless of the sequence, or can be carried out simultaneously, or may be combined into one step, but the method is not limited to this.
В способе в соответствии с описанием настоящего изобретения полинуклеотид, вектор, микроорганизм, L-валин и т.п. являются такими, как описано в других аспектах выше.In the method according to the description of the present invention, a polynucleotide, vector, microorganism, L-valine, etc. are as described in other aspects above.
В еще одном аспекте описания настоящего изобретения предложен способ увеличения способности продуцировать L-валин, включающий введение модификации в микроорганизм, которая характеризуется усиленной активностью дегидратазы дигидроксикислоты; и любой одной или более чем одной из комбинаций, выбранных из (1)-(3) ниже:In yet another aspect of the present invention, there is provided a method of increasing the ability to produce L-valine, comprising introducing a modification into a microorganism that is characterized by enhanced dihydroxy acid dehydratase activity; and any one or more than one of the combinations selected from (1)-(3) below:
(1) уменьшенной активностью трансаминазы С;(1) decreased transaminase C activity;
(2) ослабленной активностью пируватдегидрогеназы; и(2) weakened pyruvate dehydrogenase activity; And
(3) уменьшенной активностью цитратсинтазы.(3) reduced citrate synthase activity.
В еще одном аспекте описания настоящего изобретения предложено применение микроорганизма, обладающего усиленной активностью дегидратазы дигидроксикислоты; и любой одной или более чем одной из комбинаций, выбранных из (1)-(3) ниже:Another aspect of the present invention provides the use of a microorganism having enhanced dihydroxy acid dehydratase activity; and any one or more of the combinations selected from (1)-(3) below:
(1) уменьшенной активностью трансаминазы С;(1) decreased transaminase C activity;
(2) ослабленной активностью пируватдегидрогеназы; и(2) weakened pyruvate dehydrogenase activity; And
(3) уменьшенной активностью цитратсинтазы, при получении L-валина.(3) reduced citrate synthase activity when producing L-valine.
Способ осуществления изобретенияMethod for carrying out the invention
Далее описание настоящего изобретения будет описано более подробно со ссылкой на следующие примеры. Тем не менее, эти примеры представляют собой всего лишь предпочтительные примеры, приведенные для иллюстративных задач, и, таким образом, не предполагается, что объем описания настоящего изобретения ограничен этими примерами.Hereinafter, the present invention will be described in more detail with reference to the following examples. However, these examples are merely preferred examples given for illustrative purposes, and thus it is not intended that the scope of the description of the present invention be limited to these examples.
Пример 1: Конструирование штамма, основанного на получении валила, и его оценкаExample 1: Construction of a Valyl-derived strain and its evaluation
Один из типов мутаций [ilvN(A42V); Biotechnology and Bioprocess Engineering, June 2014, Volume 19, Issue 3, pp 456-467] вводили в штаммы дикого типа Corynebacterium glutamicum АТСС14067 и АТСС13869 для создания штамма, обладающего усиленной способностью продуцировать L-валин.One type of mutation [ilvN(A42V); Biotechnology and Bioprocess Engineering, June 2014, Volume 19, Issue 3, pp 456-467] were introduced into wild-type Corynebacterium glutamicum strains ATCC14067 and ATCC13869 to create a strain with enhanced ability to produce L-valine.
В частности, геномную ДНК штамма дикого типа Corynebacterium glutamicum АТСС 14067 экстрагировали с использованием мининабора для экстракции всей ДНК G-spin Total DNA (intron, № по каталогу 17045) в соответствии с протоколом, приведенным в наборе. ПЦР (полимеразную цепную реакцию) осуществляли с использованием пары праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 9 и 10 и пары праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 11 и 12, основанных на геномной ДНК в качестве матрицы с получением фрагмента гена 537 п.о., соответственно. Условия ПЦР были следующими: денатурация при 94°С в течение 5 минут и затем 25 циклов денатурации при 94°С в течение 30 секунд; отжиг при 55°С в течение 30 секунд и полимеризация при 72°С в течение 60 секунд, а затем полимеризация при 72°С в течение 7 минут.Specifically, genomic DNA from wild-type Corynebacterium glutamicum strain ATCC 14067 was extracted using the G-spin Total DNA Mini Kit (intron, cat. no. 17045) according to the protocol provided in the kit. PCR (polymerase chain reaction) was carried out using a pair of primers in accordance with SEQ ID NO: 9 and 10 and a pair of primers in accordance with SEQ ID NO: 11 and 12, based on genomic DNA as a template to obtain a 537 bp gene fragment ., respectively. PCR conditions were as follows: denaturation at 94°C for 5 minutes and then 25 cycles of denaturation at 94°C for 30 seconds; annealing at 55°C for 30 seconds and polymerizing at 72°C for 60 seconds, and then polymerizing at 72°C for 7 minutes.
ПЦР с перекрывающимися праймерами осуществляли на основе двух фрагментов, полученных выше, в качестве матрицы с использованием пары праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 9 и 12 с получением продукта ПЦР длиной 1044 п. о. (далее названного как «фрагмент 2 с введенной мутацией»).PCR with overlapping primers was carried out based on the two fragments obtained above as a template using the primer pair according to SEQ ID NO: 9 and 12 to obtain a PCR product of 1044 bp in length. (hereinafter referred to as “fragment 2 with introduced mutation”).
Полученный таким образом фрагмент 2 с введенной мутацией обрабатывали ферментом рестрикции XbaI (New England Biolabs, Beverly, MaA) и затем лигировали в вектор pDZ, который был обработан тем же самым ферментом рестрикции, с использованием лигазы Т4 (New England Biolabs, Beverly, MA) для конструирования вектора, содержащего фрагмент 2 с введенной мутацией. Вектор для введения мутации A42V в ген ilvN назван pDZ-ilvN(A42V).The thus obtained fragment 2 with the introduced mutation was treated with the restriction enzyme XbaI (New England Biolabs, Beverly, MA) and then ligated into the pDZ vector, which had been treated with the same restriction enzyme, using T4 ligase (New England Biolabs, Beverly, MA) to construct a vector containing fragment 2 with the introduced mutation. The vector for introducing the A42V mutation into the ilvN gene is named pDZ-ilvN(A42V).
Затем pDZ-ilvN(A42V) трансформировали в каждый из штаммов дикого типа Corynebacterium glutamicum АТСС14067 и АТСС13869 для индукции гомологичной рекомбинации в хромосоме (van der Rest et al., Appl Microbiol Biotechnol 52:541-545, 1999). Штаммы, в который был введен вектор в хромосому, путем рекомбинации гомологичных последовательностей отбирали в среде, содержащей 25 мг/л канамицина.pDZ-ilvN(A42V) was then transformed into each of the wild-type Corynebacterium glutamicum strains ATCC14067 and ATCC13869 to induce homologous recombination in the chromosome (van der Rest et al., Appl Microbiol Biotechnol 52:541-545, 1999). Strains into which the vector was introduced into the chromosome were selected by recombination of homologous sequences in a medium containing 25 mg/l kanamycin.
Затем фрагменты гена амплифицировали на основании трансформантов Corynebacterium glutamicum, отобранных выше при помощи ПЦР с использованием пары праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 18 и 21, и введение мутации подтверждали при помощи анализа путем секвенирования. Рекомбинантные штаммы были названы Corynebacterium glutamicum CJ7V и CJ8V, соответственно.Gene fragments were then amplified from the Corynebacterium glutamicum transformants selected above by PCR using the primer pair of SEQ ID NOs: 18 and 21, and the introduction of mutation was confirmed by sequencing analysis. The recombinant strains were named Corynebacterium glutamicum CJ7V and CJ8V, respectively.
Эксперимент по определению ферментационного титра осуществляли на основе штаммов Corynebacterium glutamicum АТСС14067 и АТСС13869 дикого типа, и штаммов CJ7V и CJ8V, сконструированных выше. Каждый штамм подвергали субкультивированию в питательной среде и затем инокулировали в колбу с угловыми перегородками объемом 250 мл, содержащей 25 мл продуцирующей среды, и выращивали при перемешивании при 30°С в течение 72 часов при 200 об./мин. Затем концентрации L-валина анализировали с использованием HPLC (высокоэффективной жидкостной хроматографии), и проанализированные концентрации L-валина представлены в таблице 2 ниже.The experiment to determine the fermentation titer was carried out on the basis of wild-type Corynebacterium glutamicum strains ATCC14067 and ATCC13869, and strains CJ7V and CJ8V constructed above. Each strain was subcultured in growth medium and then inoculated into a 250 ml corner flask containing 25 ml of production medium and grown with stirring at 30°C for 72 hours at 200 rpm. L-valine concentrations were then analyzed using HPLC (High Performance Liquid Chromatography) and the L-valine concentrations analyzed are presented in Table 2 below.
Питательная среда (рН 7,2)Nutrient medium (pH 7.2)
10 г глюкозы, 5 г мясного бульона, 10 г полипептона, 2,5 г хлорида натрия, 5 г дрожжевого экстракта, 20 г агара, 2 г мочевины (на основе 1 л дистиллированной воды).10 g glucose, 5 g meat broth, 10 g polypeptone, 2.5 g sodium chloride, 5 g yeast extract, 20 g agar, 2 g urea (based on 1 liter of distilled water).
Продуцирующая среда (рН 7,0)Production medium (pH 7.0)
100 г глюкозы, 40 г (NH4)2SO4, 2,5 г соевого белка, 5 г кукурузного экстракта, 3 г мочевины, 1 г KH2PO4, 0,5 г MgSO4⋅7H2O, 100 мкг биотина, 1 мг тиамина-HCl, 2 мг пантотената кальция, 3 мг никотинамида и 30 г СаСО3 (на основе 1 л дистиллированной воды).100 g glucose, 40 g (NH 4 ) 2 SO 4 , 2.5 g soy protein, 5 g corn extract, 3 g urea, 1 g KH 2 PO 4 , 0.5 g MgSO 4 ⋅ 7H 2 O, 100 μg biotin, 1 mg thiamine-HCl, 2 mg calcium pantothenate, 3 mg nicotinamide and 30 g CaCO 3 (based on 1 liter of distilled water).
В соответствии с представленным в вышеприведенных результатах подтвердили то, что способность продуцировать L-валин увеличивалась в штаммах CJ7V и CJ8V, в которые была введена мутация гена ilvN(A42V), по сравнению с штаммами Corynebacterium glutamicum АТСС 14067 и АТСС 13 869 дикого типа.In accordance with the above results, it was confirmed that the ability to produce L-valine was increased in strains CJ7V and CJ8V into which the ilvN(A42V) gene mutation was introduced, compared with wild-type Corynebacterium glutamicum strains ATCC 14067 and ATCC 13,869.
Пример 2: Конструирование штаммов, обладающих высокой валинпродуцирующей способностью и их оценкаExample 2: Construction of strains with high valine-producing ability and their evaluation
Пример 2-1. Конструирование штаммов с усиленным геном биосинтеза валина ilvD и их оценкаExample 2-1. Construction of strains with enhanced valine biosynthesis gene ilvD and their evaluation
Вектор pDZ-Pcj7-ilvD для замены промотора гена ilvD конструировали с использованием пар праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 13 и 14, SEQ ID NO: 15 и 16, и SEQ ID NO: 17 и 18 для конструирования штамма, обладающего высокой валинпродуцирующей способностью, при которой усилена экспрессия гена биосинтеза валина ilvD.The pDZ-Pcj7-ilvD vector to replace the ilvD gene promoter was constructed using primer pairs according to SEQ ID NOs: 13 and 14, SEQ ID NOs: 15 and 16, and SEQ ID NOs: 17 and 18 to construct a highly valine-producing strain an ability in which the expression of the valine biosynthesis gene ilvD is enhanced.
В частности, для конструирования pDZ-Pcj7-ilvD ПЦР осуществляли с использованием пар праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 13 и 14, SEQ ID NO: 15 и 16, и SEQ ID NO: 17 и 18, основанных на геномной ДНК штамма дикого типа Corynebacterium glutamicum АТСС 14067 в качестве матрицы с получением, соответственно, фрагмента гена. Условия ПЦР были следующими: денатурация при 94°С в течение 5 минут и затем 25 циклов денатурации при 94°С в течение 30 секунд; отжиг при 55°С в течение 30 секунд и полимеризация при 72°С в течение 60 секунд, а затем полимеризация при 72°С в течение 7 минут.Specifically, to construct pDZ-Pcj7-ilvD, PCR was performed using primer pairs according to SEQ ID NOs: 13 and 14, SEQ ID NOs: 15 and 16, and SEQ ID NOs: 17 and 18, based on the genomic DNA of the wild strain type Corynebacterium glutamicum ATCC 14067 as a template to obtain, respectively, a gene fragment. PCR conditions were as follows: denaturation at 94°C for 5 minutes and then 25 cycles of denaturation at 94°C for 30 seconds; annealing at 55°C for 30 seconds and polymerizing at 72°C for 60 seconds, and then polymerizing at 72°C for 7 minutes.
ПЦР осуществляли с перекрывающимися праймерами, основанными на фрагментах, полученных выше, в качестве матрицы с использованием пары праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 13 и 18 с получением фрагмента 3 с введенной мутацией. Полученный таким образом фрагмент 3 с введенной мутацией обрабатывали ферментом рестрикции XbaI (New England Biolabs, Beverly, MaA) и затем лигировали в вектор pDZ, который был обработан тем же самым ферментом рестрикции, с использованием лигазы Т4 (New England Biolabs, Beverly, MA) для конструирования вектора, который был назван pDZ-Pcj7-ilvD.PCR was carried out with overlapping primers based on the fragments obtained above as a template using the primer pair according to SEQ ID NO: 13 and 18 to obtain fragment 3 with the introduced mutation. The thus obtained fragment 3 with the introduced mutation was treated with the restriction enzyme XbaI (New England Biolabs, Beverly, MA) and then ligated into the pDZ vector, which had been treated with the same restriction enzyme, using T4 ligase (New England Biolabs, Beverly, MA) to construct a vector which was named pDZ-Pcj7-ilvD.
Затем сконструированный выше pDZ-Pcj7-ilvD трансформировали в каждый из CJ7V, CJ8V и KCCM11201P, которые представляют собой штаммы, основанные на получении валина, для индукции гомологичной рекомбинации в хромосоме (van der Rest et al., Appl Microbiol Biotechnol 52:541-545, 1999). Штаммы, в который был введен вектор в хромосому путем рекомбинации гомологичных последовательностей, отбирали в среде, содержащей 25 мг/л канамицина. Затем фрагменты гена амплифицировали на основании трансформантов Corynebacterium glutamicum, отобранных выше, при помощи ПЦР с использованием пары праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 13 и 18, и введение мутации подтверждали при помощи анализа путем секвенирования гена. Отобранные рекомбинантные штаммы были названы Corynebacterium glutamicum CJ7V:ilvD, CJ8V:ilvD, KCCM11201P:ilvD, соответственно. Ферментационный титр отобранных штаммов с усиленным геном ilvD определяли тем же самым образом, как в примере 1, и результаты представлены ниже.The above constructed pDZ-Pcj7-ilvD was then transformed into each of CJ7V, CJ8V and KCCM11201P, which are valine-derived strains, to induce homologous recombination in the chromosome (van der Rest et al., Appl Microbiol Biotechnol 52:541-545 , 1999). Strains into which the vector was introduced into the chromosome by recombination of homologous sequences were selected in a medium containing 25 mg/l kanamycin. Gene fragments were then amplified from the Corynebacterium glutamicum transformants selected above by PCR using the primer pair of SEQ ID NOs: 13 and 18, and the introduction of the mutation was confirmed by gene sequencing analysis. The selected recombinant strains were named Corynebacterium glutamicum CJ7V:ilvD, CJ8V:ilvD, KCCM11201P:ilvD, respectively. The fermentation titer of the selected strains with the enhanced ilvD gene was determined in the same way as in example 1, and the results are presented below.
В соответствии с представленными выше результатами, когда усиливали ilvD, представляющий собой один из генов биосинтеза валина, тогда подтверждали то, что способность продуцировать валин у всех продуцирующих валин штаммов CJ7V, CJ8V и KCCM11201P увеличивалась.According to the above results, when ilvD, which is one of the valine biosynthesis genes, was enhanced, it was then confirmed that the ability to produce valine in all valine-producing strains CJ7V, CJ8V and KCCM11201P was increased.
Пример 2-2. Конструирование штаммов с делецией avtA и с ослабленным alg, и их оценкаExample 2-2. Construction of avtA deletion and alg attenuated strains and their evaluation
Для конструирования штаммов, обладающих высокой способностью продуцировать валин, была сделана попытка ослабить (модифицируя стартовый кодон гена avtA при помощи GTG) или удалить avtA. Соответственно, вектор для конструирования штамма с ослабленным avtA (путем модификации стартового кодона гена avtA при помощи GTG) конструировали с использованием пар праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 19 и 20, и SEQ ID NO: 21 и 22 ниже, и вектор для конструирования устранения активности avtA с использованием пар праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 23 и 24 и SEQ ID NO: 25 и 26 ниже, которые были названы, соответственно, pDZ-avtA(Alg) и pDZ-avtA(del).To construct strains with a high ability to produce valine, an attempt was made to weaken (by modifying the start codon of the avtA gene with GTG) or delete avtA. Accordingly, a vector for constructing a strain with attenuated avtA (by modifying the start codon of the avtA gene with GTG) was constructed using primer pairs in accordance with SEQ ID NOs: 19 and 20, and SEQ ID NOs: 21 and 22 below, and the vector for construction eliminating avtA activity using primer pairs according to SEQ ID NOs: 23 and 24 and SEQ ID NOs: 25 and 26 below, which were named pDZ-avtA(Alg) and pDZ-avtA(del), respectively.
В частности, для конструирования вектора с ослабленным avtA (pDZ-avtA(Alg)) ПЦР осуществляли с использованием пар праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 19 и 20 и SEQ ID NO: 21 и 22, основанных на геномной ДНК штамма дикого типа Corynebacterium glutamicum АТСС 14067 в качестве матрицы. Условия ПЦР были следующими: денатурация при 94°С в течение 5 минут и затем 25 циклов денатурации при 94°С в течение 30 секунд; отжиг при 55°С в течение 30 секунд и полимеризация при 72°С в течение 60 секунд, а затем полимеризация при 72°С в течение 7 минут. Осуществляли ПЦР с перекрывающимися праймерами, основанными на каждом из фрагментов, полученных выше, в качестве матрицы с использованием пары праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 19 и 22 с получением фрагмента 4 с введенной мутацией. Полученный таким образом фрагмент 4 с введенной мутацией обрабатывали ферментом рестрикции XbaI (New England Biolabs, Beverly, MaA) и затем лигировали в вектор pDZ, который был обработан тем же самым ферментом рестрикции, с использованием лигазы Т4 (New England Biolabs, Beverly, MA) для конструирования ДНК вектора pDZ-avtA(Alg).Specifically, to construct the avtA attenuated vector (pDZ-avtA(Alg)), PCR was performed using primer pairs according to SEQ ID NOs: 19 and 20 and SEQ ID NOs: 21 and 22, based on the genomic DNA of the wild-type Corynebacterium strain glutamicum ATCC 14067 as a matrix. PCR conditions were as follows: denaturation at 94°C for 5 minutes and then 25 cycles of denaturation at 94°C for 30 seconds; annealing at 55°C for 30 seconds and polymerizing at 72°C for 60 seconds, and then polymerizing at 72°C for 7 minutes. PCR was performed with overlapping primers based on each of the fragments obtained above as a template using the primer pair according to SEQ ID NOs: 19 and 22 to obtain fragment 4 with the introduced mutation. The thus obtained fragment 4 with the introduced mutation was treated with the restriction enzyme XbaI (New England Biolabs, Beverly, MA) and then ligated into the pDZ vector, which had been treated with the same restriction enzyme, using T4 ligase (New England Biolabs, Beverly, MA) to construct the DNA vector pDZ-avtA(Alg).
Для конструирования вектора с делецией avtA (pDZ-avtA(del)) осуществляли ПЦР с использованием пар праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 23 и 24 и SEQ ID NO: 25 и 26, основанных на геномной ДНК штамма дикого типа Corynebacterium glutamicum АТСС14067 в качестве матрицы. Условия ПЦР были следующими: денатурация при 94°С в течение 5 минут и затем 25 циклов денатурации при 94°С в течение 30 секунд; отжиг при 55°С в течение 30 секунд и полимеризация при 72°С в течение 60 секунд, а затем полимеризация при 72°С в течение 7 минут. Осуществляли ПЦР с перекрывающимися праймерами, основанными на каждом из фрагментов, полученных выше, в качестве матрицы с использованием пары праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 23 и 26 с получением фрагмента 5 с введенной мутацией. Полученный таким образом фрагмент 5 с введенной мутацией обрабатывали ферментом рестрикции Xbal (New England Biolabs, Beverly, MaA) и затем лигировали в вектор pDZ, который был обработан тем же самым ферментом рестрикции, с использованием лигазы Т4 (New England Biolabs, Beverly, MA) для конструирования вектора pDZ-avtA(del).To construct the avtA deletion vector (pDZ-avtA(del)), PCR was performed using primer pairs in accordance with SEQ ID NOs: 23 and 24 and SEQ ID NOs: 25 and 26, based on the genomic DNA of the wild-type strain Corynebacterium glutamicum ATCC14067 in as a matrix. PCR conditions were as follows: denaturation at 94°C for 5 minutes and then 25 cycles of denaturation at 94°C for 30 seconds; annealing at 55°C for 30 seconds and polymerizing at 72°C for 60 seconds, and then polymerizing at 72°C for 7 minutes. PCR was performed with overlapping primers based on each of the fragments obtained above as a template using the primer pair according to SEQ ID NOs: 23 and 26 to obtain fragment 5 with the introduced mutation. The thus obtained fragment 5 with the introduced mutation was treated with the restriction enzyme Xbal (New England Biolabs, Beverly, MA) and then ligated into the pDZ vector, which had been treated with the same restriction enzyme, using T4 ligase (New England Biolabs, Beverly, MA) to construct the vector pDZ-avtA(del).
Затем pDZ-avtA(del) и pDZ-avtA(Alg) трансформировали в каждый из CJ7V:ilvD, CJ8V:ilvD и KCCM11201P:ilvD, которые представляют собой штаммы, продуцирующие валин, для индукции гомологичной рекомбинации в хромосоме (van der Rest et al., Appl Microbiol Biotechnol 52:541-545, 1999). Штаммы, в которые были введены векторы в хромосому путем рекомбинации гомологичных последовательностей, отбирали в среде, содержащей 25 мг/л канамицина.pDZ-avtA(del) and pDZ-avtA(Alg) were then transformed into each of CJ7V:ilvD, CJ8V:ilvD and KCCM11201P:ilvD, which are valine-producing strains, to induce homologous recombination in the chromosome (van der Rest et al ., Appl Microbiol Biotechnol 52:541-545, 1999). Strains into which vectors were introduced into the chromosome by recombination of homologous sequences were selected in a medium containing 25 mg/l kanamycin.
Затем фрагменты гена амплифицировали на основании трансформантов Corynebacterium glutamicum, отобранных выше при помощи ПЦР, с использованием пар праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 19 и 20, SEQ ID NO: 21 и 22, SEQ ID NO: 23 и 24 и SEQ ID NO: 25 и 26, и введение мутации подтверждали при помощи анализа путем секвенирования гена тем же самым образом, как в примере 1. Рекомбинантные штаммы были названы Corynebacterium glutamicum CJ7V:ilvD-avtA(del), CJ7V:ilvD-avtA (alg), CJ8V:ilvD-avtA(del), CJ8V:ilvD-avtA (alg), KCCM11201P:ilvD-avtA(del) и KCCM11201P:ilvD-avtA (alg), как представлено ниже, и оценку титра осуществляли тем же самым образом, как в примере 1.Gene fragments were then amplified from the Corynebacterium glutamicum transformants selected above by PCR using primer pairs according to SEQ ID NOs: 19 and 20, SEQ ID NOs: 21 and 22, SEQ ID NOs: 23 and 24, and SEQ ID NOs : 25 and 26, and the introduction of the mutation was confirmed by gene sequencing analysis in the same manner as in Example 1. The recombinant strains were named Corynebacterium glutamicum CJ7V:ilvD-avtA(del), CJ7V:ilvD-avtA(alg), CJ8V :ilvD-avtA(del), CJ8V:ilvD-avtA (alg), KCCM11201P:ilvD-avtA(del) and KCCM11201P:ilvD-avtA (alg) as presented below, and titer assessment was carried out in the same manner as in example 1.
В соответствии с представленными выше результатами, когда avtA подвергали делеции, тогда способность продуцировать валин усиливалась, и когда экспрессию avtA ослабляли, тогда способность продуцировать валин увеличивалась в штамме CJ8V:ilvD-avtA (alg) по сравнению с штаммом CJ8V:ilvD, демонстрируя равный или более высокий уровень способности продуцировать валин по сравнению с контрольными штаммами с усиленным ilvD. Подтвердили то, что способность продуцировать валин усиливалась во всех случаях штаммов с усиленным ilvD, и штаммов с делецией avtA или штаммов с ослабленным avtA по сравнению с штаммами CJ7V, CJ8V и KCCM11201P, как представлено в таблице 4.Consistent with the results presented above, when avtA was deleted, then the ability to produce valine was enhanced, and when avtA expression was attenuated, then the ability to produce valine was increased in the CJ8V:ilvD-avtA (alg) strain compared to the CJ8V:ilvD strain, showing equal or higher level of ability to produce valine compared to ilvD-enhanced control strains. It was confirmed that the ability to produce valine was enhanced in all cases of ilvD-enhanced strains and avtA deletion strains or avtA-attenuated strains compared with strains CJ7V, CJ8V and KCCM11201P, as presented in Table 4.
Пример 2-3. Конструирование штаммов с делецией асеЕ и штаммов с ослабленным асеЕ (alg, Q432A, K435A) и их оценкаExample 2-3. Construction of strains with aceE deletion and strains with attenuated aceE (alg, Q432A, K435A) and their evaluation
Для конструирования штаммов, обладающих высокой способностью продуцировать валин, была сделана попытка ослабить или удалить асеЕ. Соответственно, для конструирования штаммов с ослабленным асеЕ, вектор для конструирования штамма, в котором стартовый кодон гена асеЕ был модифицирован до GTG, конструировали с использованием пар праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 27 и 28 и SEQ ID NO: 29 и 30, вектор для конструирования штамма aceE(Q432A) конструировали с использованием пар праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 27 и 32 и SEQ ID NO: 33 и 36, и вектор для конструирования штамма асеЕ(K435A) конструировали с использованием пар праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 27 и 34 и SEQ ID NO: 35 и 36. Дополнительно, вектор для конструирования штамма с делецией асеЕ (aceE(del)) конструировали с использованием пар праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 37 и 38 и SEQ ID NO: 39 и 40. Сконструированные таким образом векторы были названы, соответственно, pDZ-aceE(Alg), pDZ-aceE(Q432A), pDZ-aceE(K435A) и pDZ-aceE(del).To construct strains with a high ability to produce valine, an attempt was made to attenuate or remove aceE. Accordingly, to construct strains with attenuated aceE, a vector for constructing a strain in which the start codon of the aceE gene was modified to GTG was constructed using primer pairs in accordance with SEQ ID NOs: 27 and 28 and SEQ ID NOs: 29 and 30, vector to construct the aceE(Q432A) strain was constructed using primer pairs according to SEQ ID NOs: 27 and 32 and SEQ ID NOs: 33 and 36, and the vector for constructing the aceE(K435A) strain was constructed using primer pairs according to SEQ ID NOs: 27 and 34 and SEQ ID NOs: 35 and 36. Additionally, a vector for constructing an aceE deletion strain (aceE(del)) was constructed using primer pairs according to SEQ ID NOs: 37 and 38 and SEQ ID NO: 39 and 40. The vectors thus constructed were named pDZ-aceE(Alg), pDZ-aceE(Q432A), pDZ-aceE(K435A) and pDZ-aceE(del), respectively.
В частности, для конструирования вектора для ослабления стартового кодона асеЕ осуществляли ПЦР с использованием пар праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 27 и 28 и SEQ ID NO: 29 и 30, основанных на геномной ДНК штамма дикого типа Corynebacterium glutamicum АТСС 14067 в качестве матрицы. Условия ПЦР были следующими: денатурация при 94°С в течение 5 минут и затем 25 циклов денатурации при 94°С в течение 30 секунд; отжиг при 55°С в течение 30 секунд и полимеризация при 72°С в течение 60 секунд, а затем полимеризация при 72°С в течение 7 минут. Осуществляли ПЦР с перекрывающимися праймерами, основанными на каждом из фрагментов, полученных выше, в качестве матрицы с использованием пары праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 27 и 30 с получением фрагмента 6 с введенной мутацией. Полученный таким образом фрагмент 6 с введенной мутацией обрабатывали ферментом рестрикции Xbal (New England Biolabs, Beverly, MaA) и затем лигировали в вектор pDZ, который был обработан тем же самым ферментом рестрикции, с использованием лигазы Т4 (New England Biolabs, Beverly, MA) для конструирования ДНК вектора pDZ-aceE(Alg).Specifically, to construct a vector to weaken the start codon of AcE, PCR was performed using primer pairs in accordance with SEQ ID NOs: 27 and 28 and SEQ ID NOs: 29 and 30, based on the genomic DNA of the wild-type strain Corynebacterium glutamicum ATCC 14067 as a template. . PCR conditions were as follows: denaturation at 94°C for 5 minutes and then 25 cycles of denaturation at 94°C for 30 seconds; annealing at 55°C for 30 seconds and polymerizing at 72°C for 60 seconds, and then polymerizing at 72°C for 7 minutes. PCR was carried out with overlapping primers based on each of the fragments obtained above as a template using the primer pair according to SEQ ID NO: 27 and 30 to obtain fragment 6 with the introduced mutation. The thus obtained fragment 6 with the introduced mutation was treated with the restriction enzyme Xbal (New England Biolabs, Beverly, MA) and then ligated into the pDZ vector, which had been treated with the same restriction enzyme, using T4 ligase (New England Biolabs, Beverly, MA) to construct the DNA vector pDZ-aceE(Alg).
Для конструирования вектора для введения мутации aceE(Q432A) осуществляли ПЦР с использованием пар праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 27 и 28 и SEQ ID NO: 33 и 36, основанных на геномной ДНК штамма дикого типа Corynebacterium glutamicum АТСС14067 в качестве матрицы. Условия ПЦР были следующими: денатурация при 94°С в течение 5 минут и затем 25 циклов денатурации при 94°С в течение 30 секунд; отжиг при 55°С в течение 30 секунд и полимеризация при 72°С в течение 60 секунд, а затем полимеризация при 72°С в течение 7 минут. Осуществляли ПЦР с перекрывающимися праймерами, основанными на каждом из фрагментов, полученных выше, в качестве матрицы с использованием пары праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 27 и 36 с получением фрагмента 7 с введенной мутацией. Полученный таким образом фрагмент 7 с введенной мутацией обрабатывали ферментом рестрикции XbaI (New England Biolabs, Beverly, MaA) и затем лигировали в вектор pDZ, который был обработан тем же самым ферментом рестрикции, с использованием лигазы Т4 (New England Biolabs, Beverly, MA) для конструирования ДНК вектора pDZ-aceE(Q432A).To construct a vector for introducing the aceE(Q432A) mutation, PCR was performed using primer pairs according to SEQ ID NOs: 27 and 28 and SEQ ID NOs: 33 and 36, based on the genomic DNA of the wild-type strain Corynebacterium glutamicum ATCC14067 as a template. PCR conditions were as follows: denaturation at 94°C for 5 minutes and then 25 cycles of denaturation at 94°C for 30 seconds; annealing at 55°C for 30 seconds and polymerizing at 72°C for 60 seconds, and then polymerizing at 72°C for 7 minutes. PCR was carried out with overlapping primers based on each of the fragments obtained above as a template using the primer pair according to SEQ ID NOs: 27 and 36 to obtain fragment 7 with the introduced mutation. The thus obtained fragment 7 with the introduced mutation was treated with the restriction enzyme XbaI (New England Biolabs, Beverly, MA) and then ligated into the pDZ vector, which had been treated with the same restriction enzyme, using T4 ligase (New England Biolabs, Beverly, MA) to construct the DNA vector pDZ-aceE(Q432A).
Для конструирования вектора для введения мутации асеЕ(K435A) осуществляли ПЦР с использованием пар праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 27 и 34 и SEQ ID NO: 35 и 36, основанных на геномной ДНК штамма дикого типа Corynebacterium glutamicum АТСС14067 в качестве матрицы. Условия ПЦР были следующими: денатурация при 94°С в течение 5 минут и затем 25 циклов денатурации при 94°С в течение 30 секунд; отжиг при 55°С в течение 30 секунд и полимеризация при 72°С в течение 60 секунд, а затем полимеризация при 72°С в течение 7 минут. Осуществляли ПЦР с перекрывающимися праймерами, основанными на каждом из фрагментов, полученных выше, в качестве матрицы с использованием пары праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 27 и 36 с получением фрагмента 8 с введенной мутацией. Полученный таким образом фрагмент 8 с введенной мутацией обрабатывали ферментом рестрикции XbaI (New England Biolabs, Beverly, MaA) и затем лигировали в вектор pDZ, который был обработан тем же самым ферментом рестрикции, с использованием лигазы Т4 (New England Biolabs, Beverly, MA) для конструирования ДНК вектора pDZ-aceE(K435A).To construct a vector for introducing the aceE(K435A) mutation, PCR was performed using primer pairs in accordance with SEQ ID NOs: 27 and 34 and SEQ ID NOs: 35 and 36, based on the genomic DNA of the wild-type strain Corynebacterium glutamicum ATCC14067 as a template. PCR conditions were as follows: denaturation at 94°C for 5 minutes and then 25 cycles of denaturation at 94°C for 30 seconds; annealing at 55°C for 30 seconds and polymerizing at 72°C for 60 seconds, and then polymerizing at 72°C for 7 minutes. PCR was performed with overlapping primers based on each of the fragments obtained above as a template using the primer pair according to SEQ ID NOs: 27 and 36 to obtain fragment 8 with the introduced mutation. The thus obtained fragment 8 with the introduced mutation was treated with the restriction enzyme XbaI (New England Biolabs, Beverly, MA) and then ligated into the pDZ vector, which had been treated with the same restriction enzyme, using T4 ligase (New England Biolabs, Beverly, MA) to construct DNA vector pDZ-aceE(K435A).
Для введения вектора, используемого для введения мутации aceE(del) осуществляли ПЦР с использованием пар праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 37 и 38 и SEQ ID NO: 39 и 40, основанных на геномной ДНК штамма дикого типа Corynebacterium glutamicum АТСС 14067 в качестве матрицы. Условия ПЦР были следующими: денатурация при 94°С в течение 5 минут и затем 25 циклов денатурации при 94°С в течение 30 секунд; отжиг при 55°С в течение 30 секунд и полимеризация при 72°С в течение 60 секунд, а затем полимеризация при 72°С в течение 7 минут. Осуществляли ПЦР с перекрывающимися праймерами, основанными на каждом из фрагментов, полученных выше, в качестве матрицы с использованием пары праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 37 и 40 с получением фрагмента 9 с введенной мутацией. Полученный таким образом фрагмент 9 с введенной мутацией обрабатывали ферментом рестрикции XbaI (New England Biolabs, Beverly, MaA) и затем лигировали в вектор pDZ, который был обработан тем же самым ферментом рестрикции, с использованием лигазы Т4 (New England Biolabs, Beverly, MA) для конструирования ДНК вектора pDZ-aceE(del).To introduce the vector used to introduce the aceE(del) mutation, PCR was performed using primer pairs in accordance with SEQ ID NOs: 37 and 38 and SEQ ID NOs: 39 and 40, based on the genomic DNA of the wild-type strain Corynebacterium glutamicum ATCC 14067 as matrices. PCR conditions were as follows: denaturation at 94°C for 5 minutes and then 25 cycles of denaturation at 94°C for 30 seconds; annealing at 55°C for 30 seconds and polymerizing at 72°C for 60 seconds, and then polymerizing at 72°C for 7 minutes. PCR was carried out with overlapping primers based on each of the fragments obtained above as a template using the primer pair according to SEQ ID NO: 37 and 40 to obtain fragment 9 with the introduced mutation. The thus obtained fragment 9 with the introduced mutation was treated with the restriction enzyme XbaI (New England Biolabs, Beverly, MA) and then ligated into the pDZ vector, which had been treated with the same restriction enzyme, using T4 ligase (New England Biolabs, Beverly, MA) to construct the DNA vector pDZ-aceE(del).
Затем pDZ-aceE(del), pDZ-aceE(Alg), pDZ-aceE(Q432A) и pDZ-aceE(K435A) трансформировали в каждый из CJ7V:ilvD, CJ8V:ilvD и KCCM11201P:ilvD, которые представляют собой штаммы, продуцирующие валин, для индукции гомологичной рекомбинации в хромосоме (van der Rest et al., Appl Microbiol Biotechnol 52:541-545, 1999). Штаммы, в которые были введены векторы в хромосому путем рекомбинации гомологичных последовательностей, отбирали в среде, содержащей 25 мг/л канамицина.Then pDZ-aceE(del), pDZ-aceE(Alg), pDZ-aceE(Q432A) and pDZ-aceE(K435A) were transformed into each of CJ7V:ilvD, CJ8V:ilvD and KCCM11201P:ilvD, which are strains producing valine, to induce homologous recombination in the chromosome (van der Rest et al., Appl Microbiol Biotechnol 52:541-545, 1999). Strains into which vectors were introduced into the chromosome by recombination of homologous sequences were selected in a medium containing 25 mg/l kanamycin.
Затем фрагменты гена амплифицировали на основании трансформантов Corynebacterium glutamicum, отобранных выше при помощи ПЦР, с использованием пары праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 27 и 36, и введение мутации подтверждали при помощи анализа путем секвенирования гена. Рекомбинантные штаммы были названы Corynebacterium glutamicum CJ7V:ilvD-aceE(del), CJ7V:ilvD-aceE (alg), CJ7V:ilvD-aceE(Q432A), CJ7V:ilvD-aceE(K435A), CJ8V:ilvD-aceE(del), CJ8V:ilvD-aceE (alg), CJ8V:ilvD-aceE(Q432A), CJ8V:ilvD-aceE(K435A), KCCM11201P:ilvD-aceE(del), KCCM11201P:ilvD-aceE(alg), KCCM11201P:ilvD-aceE(Q432A), и KCCM11201P:ilvD-aceE(K435A), как представлено ниже, и оценку титра осуществляли тем же самым образом, как в примере 1.Gene fragments were then amplified from the Corynebacterium glutamicum transformants selected above by PCR using the primer pair of SEQ ID NOs: 27 and 36, and the introduction of the mutation was confirmed by gene sequencing analysis. The recombinant strains were named Corynebacterium glutamicum CJ7V:ilvD-aceE(del), CJ7V:ilvD-aceE (alg), CJ7V:ilvD-aceE(Q432A), CJ7V:ilvD-aceE(K435A), CJ8V:ilvD-aceE(del) , CJ8V:ilvD-aceE (alg), CJ8V:ilvD-aceE(Q432A), CJ8V:ilvD-aceE(K435A), KCCM11201P:ilvD-aceE(del), KCCM11201P:ilvD-aceE(alg), KCCM11201P:ilvD- aceE(Q432A), and KCCM11201P:ilvD-aceE(K435A) as presented below, and titer assessment was carried out in the same manner as in Example 1.
В соответствии с представленными выше результатами, когда асеЕ дополнительно подвергали делеции в штаммах, обладающих усиленной активностью дегидратазы дигидроксикислоты (ilvD), тогда скорости роста и потребления сахара быстро уменьшались, приводя в результате к уменьшенной способности продуцировать валин. В то же самое время, в случае штаммов, обладающих ослабленным асеЕ, подтвердили то, что скорости роста и потребления сахара были не значимыми, и способность продуцировать валин увеличивалась, хотя имелись различия в зависимости от уровня ослабления.Consistent with the results presented above, when aceE was further deleted in strains having enhanced dihydroxyacid dehydratase (ilvD) activity, then growth rates and sugar consumption were rapidly reduced, resulting in a reduced ability to produce valine. At the same time, in the case of strains having attenuated aceE, it was confirmed that the growth rates and sugar consumption were not significant, and the ability to produce valine increased, although there were differences depending on the level of attenuation.
Пример 2-4. Конструирование штаммов с ослабленным gltA (alg, N241T, M312I) и их оценкаExample 2-4. Construction of strains with weakened gltA (alg, N241T, M312I) and their evaluation
Для конструирования штаммов, обладающих высокой способностью продуцировать валин, была сделана попытка ослабить gltA. Соответственно, вектор для конструирования штамма с ослабленным gltA, в котором стартовый кодон гена gltA модифицирован до GTG, конструировали с использованием пар праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 41 и 42 и SEQ ID NO: 43 и 44, вектор для конструирования штамма gltA(N241T) конструировали с использованием пар праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 45 и 46 и SEQ ID NO: 47 и 50, и вектор для конструирования штамма gltA(M312I) конструировали с использованием пар праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 45 и 48 и SEQ ID NO: 49 и 50. Сконструированные таким образом векторы были названы, соответственно, pDZ-gltA(Alg), pDZ-gltA(N241T) и pDZ-gltA(M312I).To construct strains with a high ability to produce valine, an attempt was made to weaken gltA. Accordingly, a vector for constructing a gltA attenuated strain in which the start codon of the gltA gene is modified to GTG was constructed using primer pairs in accordance with SEQ ID NOs: 41 and 42 and SEQ ID NOs: 43 and 44, vector for constructing a gltA strain ( N241T) was constructed using primer pairs according to SEQ ID NOs: 45 and 46 and SEQ ID NOs: 47 and 50, and the gltA(M312I) strain construction vector was constructed using primer pairs according to SEQ ID NOs: 45 and 48 and SEQ ID NOs: 49 and 50. The vectors thus constructed were named pDZ-gltA(Alg), pDZ-gltA(N241T) and pDZ-gltA(M312I), respectively.
Для введения вектора для введения мутации, ослабляющей стартовый кодон gltA, осуществляли ПЦР с использованием пар праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 41 и 42 и SEQ ID NO: 43 и 44, основанных на геномной ДНК штамма дикого типа Corynebacterium glutamicum АТСС 14067 в качестве матрицы. Условия ПЦР были следующими: денатурация при 94°С в течение 5 минут и затем 25 циклов денатурации при 94°С в течение 30 секунд; отжиг при 55°С в течение 30 секунд и полимеризация при 72°С в течение 60 секунд, а затем полимеризация при 72°С в течение 7 минут. Осуществляли ПЦР с перекрывающимися праймерами, основанными на каждом из фрагментов (А, В), полученных выше, в качестве матрицы с использованием пары праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 41 и 44 с получением фрагмента 10 с введенной мутацией. Полученный таким образом фрагмент 10 с введенной мутацией обрабатывали ферментом рестрикции XbaI (New England Biolabs, Beverly, MaA) и затем лигировали в вектор pDZ, который был обработан тем же самым ферментом рестрикции, с использованием лигазы Т4 (New England Biolabs, Beverly, MA) для конструирования ДНК вектора pDZ-gltA(Alg).To introduce a vector to introduce a mutation weakening the gltA start codon, PCR was performed using primer pairs in accordance with SEQ ID NOs: 41 and 42 and SEQ ID NOs: 43 and 44, based on the genomic DNA of the wild-type strain Corynebacterium glutamicum ATCC 14067 as matrices. PCR conditions were as follows: denaturation at 94°C for 5 minutes and then 25 cycles of denaturation at 94°C for 30 seconds; annealing at 55°C for 30 seconds and polymerizing at 72°C for 60 seconds, and then polymerizing at 72°C for 7 minutes. PCR was performed with overlapping primers based on each of the fragments (A, B) obtained above as a template using the primer pair according to SEQ ID NOs: 41 and 44 to obtain fragment 10 with the introduced mutation. The thus obtained fragment 10 with the introduced mutation was treated with the restriction enzyme XbaI (New England Biolabs, Beverly, MA) and then ligated into the pDZ vector, which had been treated with the same restriction enzyme, using T4 ligase (New England Biolabs, Beverly, MA) to construct the DNA vector pDZ-gltA(Alg).
Для введения вектора для введения мутации gltA(N241T) осуществляли ПЦР с использованием пар праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 45 и 46 и SEQ ID NO: 47 и 50, основанных на геномной ДНК штамма дикого типа Corynebacterium glutamicum АТСС14067 в качестве матрицы. Условия ПЦР были следующими: денатурация при 94°С в течение 5 минут и затем 25 циклов денатурации при 94°С в течение 30 секунд; отжиг при 55°С в течение 30 секунд и полимеризация при 72°С в течение 60 секунд, а затем полимеризация при 72°С в течение 7 минут. Осуществляли ПЦР с перекрывающимися праймерами, основанными на каждом из фрагментов (А, В), полученных выше, в качестве матрицы с использованием пары праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 45 и 50 с получением фрагмента 11 с введенной мутацией. Полученный таким образом фрагмент 11 с введенной мутацией обрабатывали ферментом рестрикции XbaI (New England Biolabs, Beverly, MaA) и затем лигировали в вектор pDZ, который был обработан тем же самым ферментом рестрикции, с использованием лигазы Т4 (New England Biolabs, Beverly, MA) для конструирования ДНК вектора pDZ-gltA(N241T).To introduce a vector for introducing the gltA(N241T) mutation, PCR was performed using primer pairs according to SEQ ID NOs: 45 and 46 and SEQ ID NOs: 47 and 50, based on the genomic DNA of the wild-type strain Corynebacterium glutamicum ATCC14067 as a template. PCR conditions were as follows: denaturation at 94°C for 5 minutes and then 25 cycles of denaturation at 94°C for 30 seconds; annealing at 55°C for 30 seconds and polymerizing at 72°C for 60 seconds, and then polymerizing at 72°C for 7 minutes. PCR was carried out with overlapping primers based on each of the fragments (A, B) obtained above as a template using the primer pair according to SEQ ID NO: 45 and 50 to obtain fragment 11 with the introduced mutation. The thus obtained fragment 11 with the introduced mutation was treated with the restriction enzyme XbaI (New England Biolabs, Beverly, MA) and then ligated into the pDZ vector, which had been treated with the same restriction enzyme, using T4 ligase (New England Biolabs, Beverly, MA) to construct the DNA vector pDZ-gltA(N241T).
Для введения вектора для введения мутации gltA(M312I) осуществляли ПЦР с использованием пар праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 45 и 48 и SEQ ID NO: 49 и 50, основанных на геномной ДНК штамма дикого типа Corynebacterium glutamicum АТСС14067 в качестве матрицы. Условия ПЦР были следующими: денатурация при 94°С в течение 5 минут и затем 25 циклов денатурации при 94°С в течение 30 секунд; отжиг при 55°С в течение 30 секунд и полимеризация при 72°С в течение 60 секунд, а затем полимеризация при 72°С в течение 7 минут. Осуществляли ПЦР с перекрывающимися праймерами, основанными на каждом из фрагментов (А, В), полученных выше, в качестве матрицы с использованием пары праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 45 и 50 с получением фрагмента 12 с введенной мутацией. Полученный таким образом фрагмент 12 с введенной мутацией обрабатывали ферментом рестрикции XbaI (New England Biolabs, Beverly, MaA) и затем лигировали в вектор pDZ, который был обработан тем же самым ферментом рестрикции, с использованием лигазы Т4 (New England Biolabs, Beverly, MA) для конструирования ДНК вектора pDZ-gltA(M312I).To introduce a vector for introducing the gltA(M312I) mutation, PCR was performed using primer pairs according to SEQ ID NOs: 45 and 48 and SEQ ID NOs: 49 and 50, based on the genomic DNA of the wild-type strain Corynebacterium glutamicum ATCC14067 as a template. PCR conditions were as follows: denaturation at 94°C for 5 minutes and then 25 cycles of denaturation at 94°C for 30 seconds; annealing at 55°C for 30 seconds and polymerizing at 72°C for 60 seconds, and then polymerizing at 72°C for 7 minutes. PCR was carried out with overlapping primers based on each of the fragments (A, B) obtained above as a template using the primer pair according to SEQ ID NO: 45 and 50 to obtain fragment 12 with the introduced mutation. The thus obtained fragment 12 with the introduced mutation was treated with the restriction enzyme XbaI (New England Biolabs, Beverly, MA) and then ligated into the pDZ vector, which had been treated with the same restriction enzyme, using T4 ligase (New England Biolabs, Beverly, MA) to construct the DNA vector pDZ-gltA(M312I).
Затем pDZ-gltA(Alg), pDZ-gltA(N241T) и pDZ-gltA(M312I) трансформировали в каждый из CJ7V:ilvD, CJ8V:ilvD и KCCM11201P:ilvD, которые представляют собой штаммы, продуцирующие валин, для индукции гомологичной рекомбинации в хромосоме (van der Rest et al., Appl Microbiol Biotechnol 52:541-545, 1999). Штаммы, в которые были введены векторы в хромосому путем рекомбинации гомологичных последовательностей, отбирали в среде, содержащей 25 мг/л канамицина.pDZ-gltA(Alg), pDZ-gltA(N241T), and pDZ-gltA(M312I) were then transformed into each of CJ7V:ilvD, CJ8V:ilvD, and KCCM11201P:ilvD, which are valine-producing strains, to induce homologous recombination in chromosome (van der Rest et al., Appl Microbiol Biotechnol 52:541-545, 1999). Strains into which vectors were introduced into the chromosome by recombination of homologous sequences were selected in a medium containing 25 mg/l kanamycin.
Затем фрагменты гена амплифицировали на основании трансформантов Corynebacterium glutamicum, отобранных выше, при помощи ПЦР с использованием пары праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 45 и 50, и введение мутации подтверждали при помощи анализа путем секвенирования гена. Рекомбинантные штаммы были названы Corynebacterium glutamicum CJ7V:ilvD-gltA (alg), CJ7V:ilvD-gltA(N241T), CJ7V:ilvD-gltA(M312I), CJ8V:ilvD-gltA(alg), CJ8V:ilvD-gltA(N241T), CJ8V:ilvD-gltA(M312I), KCCM11201P:ilvD-gltA(alg), KCCM11201P:ilvD-gitA(N241T), и KCCM11201P:ilvD-gltA(M312I), и оценку титра осуществляли тем же самым образом, как в примере 1.Gene fragments were then amplified from the Corynebacterium glutamicum transformants selected above by PCR using the primer pair of SEQ ID NOs: 45 and 50, and the introduction of the mutation was confirmed by gene sequencing analysis. The recombinant strains were named Corynebacterium glutamicum CJ7V:ilvD-gltA (alg), CJ7V:ilvD-gltA(N241T), CJ7V:ilvD-gltA(M312I), CJ8V:ilvD-gltA(alg), CJ8V:ilvD-gltA(N241T) . 1.
В соответствии с представленными выше результатами, когда gltA был ослаблен в штаммах, обладающих усиленной активностью дегидратазы дигидроксикислоты (ilvD), тогда подтвердили то, что скорости роста и потребления сахара были не значимыми и способность продуцировать валин увеличивалась, хотя существовали различия в зависимости от уровня ослабления.Consistent with the results presented above, when gltA was attenuated in strains having enhanced dihydroxyacid dehydratase (ilvD) activity, it was then confirmed that growth rates and sugar consumption were not significant and the ability to produce valine was increased, although there were differences depending on the level of attenuation. .
Пример 2-5. Конструирование комбинации штаммов для показателей эффективных мутантов и их оценкиExample 2-5. Designing a combination of strains for the performance of effective mutants and their evaluation
На основании результатов, подтвержденных в примерах 2-2 - 2-4, сделана попытка определить то, существовало ли синергетическое действие в отношении способности продуцировать валин, когда комбинировали различные мутации. Векторы pDZ-avtA(del) и pDZ-aceE(K435A) трансформировали в каждый из CJ7V:ilvD-gltA-ослабленный(N241T), CJ8V:ilvD-gltA-ослабленный(N241T) и KCCM11201P:ilvD-gltA-ослабленный(М241Т), которые представляют собой штаммы, продуцирующие валин, сконструированные в примере 2-4 (van der Rest et al., Appl Microbiol Biotechnol 52:541-545, 1999). Штаммы, в которых векторы были введены в хромосому путем рекомбинации гомологичных последовательностей, отбирали в среде, содержащей 25 мг/л канамицина.Based on the results confirmed in Examples 2-2 to 2-4, an attempt was made to determine whether there was a synergistic effect on the ability to produce valine when different mutations were combined. Vectors pDZ-avtA(del) and pDZ-aceE(K435A) were transformed into each of CJ7V:ilvD-gltA-attenuated(N241T), CJ8V:ilvD-gltA-attenuated(N241T), and KCCM11201P:ilvD-gltA-attenuated(M241T) , which are the valine-producing strains constructed in Example 2-4 (van der Rest et al., Appl Microbiol Biotechnol 52:541-545, 1999). Strains in which vectors were introduced into the chromosome by recombination of homologous sequences were selected in a medium containing 25 mg/l kanamycin.
Затем фрагменты гена амплифицировали на основании трансформантов Corynebacterium glutamicum, в которых была завершена вторичная рекомбинация, при помощи ПЦР с использованием пар праймеров в соответствии с SEQ ID NO: 23 и 26 и SEQ ID NO: 27 и 36, и затем штаммы с введенной мутацией подтверждали путем анализа секвенирования гена. Рекомбинантные штаммы были названы, как представлено ниже, и оценку титра осуществляли тем же самым образом, как в примере 1.Gene fragments were then amplified from Corynebacterium glutamicum transformants in which secondary recombination had been completed by PCR using primer pairs according to SEQ ID NOs: 23 and 26 and SEQ ID NOs: 27 and 36, and strains with the introduced mutation were then confirmed by gene sequencing analysis. The recombinant strains were named as follows and titer assessment was carried out in the same manner as in Example 1.
В соответствии с представленными выше результатами подтвердили то, что когда штаммы с ослабленным асеЕ и штаммы с делецией avtA вводили в штаммы с усиленным ilvD и ослабленным gltA, тогда скорости роста и потребления сахара были на том же самом уровне, и способность продуцировать валин дополнительно увеличивалась.According to the above results, it was confirmed that when the aceE-attenuated strains and the avtA-deletion strains were introduced into the ilvD-enhanced and gltA-attenuated strains, then the growth rates and sugar consumption were at the same level, and the ability to produce valine was further increased.
Вектор pDZ-aceE(K435A) трансформировали в KCCM11201P:ilvD-gltA-ослабленный (N241T) штамм, и штамм, в который была введена мутация асе(K435A) в хромосоме путем рекомбинации гомологичных последовательностей, был назван СА08-1592. СА08-1592 был депонирован в Корейский центр культур микроорганизмов (KCCM) в соответствии с Будапештским договором 3 июля 2020 года под номером KCCM12761P.The pDZ-aceE(K435A) vector was transformed into the KCCM11201P:ilvD-gltA-attenuated (N241T) strain, and the strain into which the ace(K435A) mutation was introduced into the chromosome by recombination of homologous sequences was named CA08-1592. CA08-1592 was deposited with the Korea Center for Microbial Culture (KCCM) under the Treaty of Budapest on July 3, 2020, under the number KCCM12761P.
В соответствии с вышеизложенным специалист в данной области техники, в отношении которого направлено описание настоящего изобретения, будет в состоянии понять, что описание настоящего изобретения может быть воплощено в других конкретных формах без модификации технических понятий или существенных характеристик описания настоящего изобретения. В этой связи примеры воплощений, раскрытые здесь, приведены исключительно в иллюстративных целях, и их не следует истолковывать как ограничивающие объем описания настоящего изобретения. Наоборот, описание настоящего изобретения предназначено для того, чтобы охватить не только примеры воплощений, а также и различные альтернативы, модификации, эквиваленты и другие воплощения, которые могут быть включены в сущность и объем описания настоящего изобретения, определенные в формуле изобретения.In accordance with the foregoing, one skilled in the art to whom the description of the present invention is directed will be able to understand that the description of the present invention can be embodied in other specific forms without modification of the technical concepts or essential features of the description of the present invention. Accordingly, the exemplary embodiments disclosed herein are provided for illustrative purposes only and should not be construed as limiting the scope of the present invention. On the contrary, the description of the present invention is intended to cover not only exemplary embodiments, but also various alternatives, modifications, equivalents and other embodiments that may be included within the spirit and scope of the description of the present invention as defined in the claims.
--->--->
ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙLIST OF SEQUENCES
<110> CJ CheilJedang Corporation<110>CJ CheilJedang Corporation
<120> МИКРООРГАНИЗМ, ПРОДУЦИРУЮЩИЙ L-ВАЛИН, И СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ L-<120> MICROORGANISM PRODUCING L-VALINE AND METHOD FOR PRODUCING L-
ВАЛИНА С ЕГО ИСПОЛЬЗОВАНИЕМVALINE WITH ITS USE
<130> OPA21084-PCT<130> OPA21084-PCT
<150> KR 10-2020-0111084<150> KR 10-2020-0111084
<151> 2020-09-01<151> 2020-09-01
<160> 50<160> 50
<170> KoPatentIn 3.0<170> KoPatentIn 3.0
<210> 1<210> 1
<211> 613<211> 613
<212> PRT<212>PRT
<213> Unknown<213> Unknown
<220><220>
<223> Дегидратаза дигидроксикислоты Corynebacterium sp<223> Dihydroxy acid dehydratase Corynebacterium sp
<400> 1<400> 1
Met Ile Pro Leu Arg Ser Lys Val Thr Thr Val Gly Arg Asn Ala AlaMet Ile Pro Leu Arg Ser Lys Val Thr Thr Val Gly Arg Asn Ala Ala
1 5 10 15 1 5 10 15
Gly Ala Arg Ala Leu Trp Arg Ala Thr Gly Thr Lys Glu Asn Glu PheGly Ala Arg Ala Leu Trp Arg Ala Thr Gly Thr Lys Glu Asn Glu Phe
20 25 30 20 25 30
Gly Lys Pro Ile Val Ala Ile Val Asn Ser Tyr Thr Gln Phe Val ProGly Lys Pro Ile Val Ala Ile Val Asn Ser Tyr Thr Gln Phe Val Pro
35 40 45 35 40 45
Gly His Val His Leu Lys Asn Val Gly Asp Ile Val Ala Asp Ala ValGly His Val His Leu Lys Asn Val Gly Asp Ile Val Ala Asp Ala Val
50 55 60 50 55 60
Arg Lys Ala Gly Gly Val Pro Lys Glu Phe Asn Thr Ile Ala Val AspArg Lys Ala Gly Gly Val Pro Lys Glu Phe Asn Thr Ile Ala Val Asp
65 70 75 80 65 70 75 80
Asp Gly Ile Ala Met Gly His Gly Gly Met Leu Tyr Ser Leu Pro SerAsp Gly Ile Ala Met Gly His Gly Gly Met Leu Tyr Ser Leu Pro Ser
85 90 95 85 90 95
Arg Glu Ile Ile Ala Asp Ser Val Glu Tyr Met Val Asn Ala His ThrArg Glu Ile Ile Ala Asp Ser Val Glu Tyr Met Val Asn Ala His Thr
100 105 110 100 105 110
Ala Asp Ala Met Val Cys Ile Ser Asn Cys Asp Lys Ile Thr Pro GlyAla Asp Ala Met Val Cys Ile Ser Asn Cys Asp Lys Ile Thr Pro Gly
115 120 125 115 120 125
Met Leu Asn Ala Ala Met Arg Leu Asn Ile Pro Val Val Phe Val SerMet Leu Asn Ala Ala Met Arg Leu Asn Ile Pro Val Val Phe Val Ser
130 135 140 130 135 140
Gly Gly Pro Met Glu Ala Gly Lys Ala Val Val Val Asp Gly Val AlaGly Gly Pro Met Glu Ala Gly Lys Ala Val Val Val Asp Gly Val Ala
145 150 155 160 145 150 155 160
His Ala Pro Thr Asp Leu Ile Thr Ala Ile Ser Ala Ser Ala Ser AspHis Ala Pro Thr Asp Leu Ile Thr Ala Ile Ser Ala Ser Ala Ser Asp
165 170 175 165 170 175
Ala Val Asp Asp Ala Gly Leu Ala Ala Val Glu Ala Ser Ala Cys ProAla Val Asp Asp Ala Gly Leu Ala Ala Val Glu Ala Ser Ala Cys Pro
180 185 190 180 185 190
Thr Cys Gly Ser Cys Ser Gly Met Phe Thr Ala Asn Ser Met Asn CysThr Cys Gly Ser Cys Ser Gly Met Phe Thr Ala Asn Ser Met Asn Cys
195 200 205 195 200 205
Leu Thr Glu Ala Leu Gly Leu Ser Leu Pro Gly Asn Gly Ser Thr LeuLeu Thr Glu Ala Leu Gly Leu Ser Leu Pro Gly Asn Gly Ser Thr Leu
210 215 220 210 215 220
Ala Thr His Ala Ala Arg Arg Ala Leu Phe Glu Lys Ala Gly Glu ThrAla Thr His Ala Ala Arg Arg Ala Leu Phe Glu Lys Ala Gly Glu Thr
225 230 235 240 225 230 235 240
Val Val Glu Leu Cys Arg Arg Tyr Tyr Gly Glu Glu Asp Glu Ser ValVal Val Glu Leu Cys Arg Arg Tyr Tyr Gly Glu Glu Asp Glu Ser Val
245 250 255 245 250 255
Leu Pro Arg Gly Ile Ala Thr Lys Lys Ala Phe Glu Asn Ala Met AlaLeu Pro Arg Gly Ile Ala Thr Lys Lys Ala Phe Glu Asn Ala Met Ala
260 265 270 260 265 270
Leu Asp Met Ala Met Gly Gly Ser Thr Asn Thr Ile Leu His Ile LeuLeu Asp Met Ala Met Gly Gly Ser Thr Asn Thr Ile Leu His Ile Leu
275 280 285 275 280 285
Ala Ala Ala Gln Glu Gly Glu Val Asp Phe Asp Leu Ala Asp Ile AspAla Ala Ala Gln Glu Gly Glu Val Asp Phe Asp Leu Ala Asp Ile Asp
290 295 300 290 295 300
Glu Leu Ser Lys Asn Val Pro Cys Leu Ser Lys Val Ala Pro Asn SerGlu Leu Ser Lys Asn Val Pro Cys Leu Ser Lys Val Ala Pro Asn Ser
305 310 315 320 305 310 315 320
Asp Tyr His Met Glu Asp Val His Arg Ala Gly Gly Ile Pro Ala LeuAsp Tyr His Met Glu Asp Val His Arg Ala Gly Gly Ile Pro Ala Leu
325 330 335 325 330 335
Leu Gly Glu Leu Asn Arg Gly Gly Leu Leu Asn Lys Asp Val His SerLeu Gly Glu Leu Asn Arg Gly Gly Leu Leu Asn Lys Asp Val His Ser
340 345 350 340 345 350
Val His Ser Asn Asp Leu Glu Gly Trp Leu Asp Asp Trp Asp Ile ArgVal His Ser Asn Asp Leu Glu Gly Trp Leu Asp Asp Trp Asp Ile Arg
355 360 365 355 360 365
Ser Gly Lys Thr Thr Glu Val Ala Thr Glu Leu Phe His Ala Ala ProSer Gly Lys Thr Thr Glu Val Ala Thr Glu Leu Phe His Ala Ala Pro
370 375 380 370 375 380
Gly Gly Ile Arg Thr Thr Glu Ala Phe Ser Thr Glu Asn Arg Trp AspGly Gly Ile Arg Thr Thr Glu Ala Phe Ser Thr Glu Asn Arg Trp Asp
385 390 395 400 385 390 395 400
Glu Leu Asp Thr Asp Ala Ala Lys Gly Cys Ile Arg Asp Val Glu HisGlu Leu Asp Thr Asp Ala Ala Lys Gly Cys Ile Arg Asp Val Glu His
405 410 415 405 410 415
Ala Tyr Thr Ala Asp Gly Gly Leu Val Val Leu Arg Gly Asn Ile SerAla Tyr Thr Ala Asp Gly Gly Leu Val Val Leu Arg Gly Asn Ile Ser
420 425 430 420 425 430
Pro Asp Gly Ala Val Ile Lys Ser Ala Gly Ile Glu Glu Glu Leu TrpPro Asp Gly Ala Val Ile Lys Ser Ala Gly Ile Glu Glu Glu Leu Trp
435 440 445 435 440 445
Asn Phe Thr Gly Pro Ala Arg Val Val Glu Ser Gln Glu Glu Ala ValAsn Phe Thr Gly Pro Ala Arg Val Val Glu Ser Gln Glu Glu Ala Val
450 455 460 450 455 460
Ser Val Ile Leu Thr Lys Thr Ile Gln Ala Gly Glu Val Leu Val ValSer Val Ile Leu Thr Lys Thr Ile Gln Ala Gly Glu Val Leu Val Val
465 470 475 480 465 470 475 480
Arg Tyr Glu Gly Pro Ser Gly Gly Pro Gly Met Gln Glu Met Leu HisArg Tyr Glu Gly Pro Ser Gly Gly Pro Gly Met Gln Glu Met Leu His
485 490 495 485 490 495
Pro Thr Ala Phe Leu Lys Gly Ser Gly Leu Gly Lys Lys Cys Ala LeuPro Thr Ala Phe Leu Lys Gly Ser Gly Leu Gly Lys Lys Cys Ala Leu
500 505 510 500 505 510
Ile Thr Asp Gly Arg Phe Ser Gly Gly Ser Ser Gly Leu Ser Ile GlyIle Thr Asp Gly Arg Phe Ser Gly Gly Ser Ser Gly Leu Ser Ile Gly
515 520 525 515 520 525
His Val Ser Pro Glu Ala Ala His Gly Gly Val Ile Gly Leu Ile GluHis Val Ser Pro Glu Ala Ala His Gly Gly Val Ile Gly Leu Ile Glu
530 535 540 530 535 540
Asn Gly Asp Ile Val Ser Ile Asp Val His Asn Arg Lys Leu Glu ValAsn Gly Asp Ile Val Ser Ile Asp Val His Asn Arg Lys Leu Glu Val
545 550 555 560 545 550 555 560
Gln Val Ser Asp Glu Glu Leu Gln Arg Arg Arg Asp Ala Met Asn AlaGln Val Ser Asp Glu Glu Leu Gln Arg Arg Arg Asp Ala Met Asn Ala
565 570 575 565 570 575
Ser Glu Lys Pro Trp Gln Pro Val Asn Arg Asn Arg Val Val Thr LysSer Glu Lys Pro Trp Gln Pro Val Asn Arg Asn Arg Val Val Thr Lys
580 585 590 580 585 590
Ala Leu Arg Ala Tyr Ala Lys Met Ala Thr Ser Ala Asp Lys Gly AlaAla Leu Arg Ala Tyr Ala Lys Met Ala Thr Ser Ala Asp Lys Gly Ala
595 600 605 595 600 605
Val Arg Gln Val AspVal Arg Gln Val Asp
610 610
<210> 2<210> 2
<211> 383<211> 383
<212> PRT<212>PRT
<213> Unknown<213>Unknown
<220><220>
<223> Трансаминаза C Corynebacterium sp<223> Transaminase C Corynebacterium sp
<400> 2<400> 2
Met Lys Pro Ser Thr Arg Ser Asn Val Gln Pro Phe Arg Val Met GlnMet Lys Pro Ser Thr Arg Ser Asn Val Gln Pro Phe Arg Val Met Gln
1 5 10 15 1 5 10 15
Met Leu Asp Arg Val His Arg Arg Arg Arg Glu Gly Lys Asp Thr IleMet Leu Asp Arg Val His Arg Arg Arg Arg Glu Gly Lys Asp Thr Ile
20 25 30 20 25 30
Met Phe Cys Ala Gly Gln Pro Ser Thr Gly Ala Pro Glu Ala Val IleMet Phe Cys Ala Gly Gln Pro Ser Thr Gly Ala Pro Glu Ala Val Ile
35 40 45 35 40 45
Glu Glu Ala Glu Ile Ala Leu Arg Ser Gly Pro Leu Gly Tyr Thr GluGlu Glu Ala Glu Ile Ala Leu Arg Ser Gly Pro Leu Gly Tyr Thr Glu
50 55 60 50 55 60
Val Ile Gly Asp Arg Glu Phe Arg Glu Arg Ile Ala Asp Trp His SerVal Ile Gly Asp Arg Glu Phe Arg Glu Arg Ile Ala Asp Trp His Ser
65 70 75 80 65 70 75 80
Ala Thr Tyr Asp Val Asp Thr Asn Pro Asp Asn Val Ile Val Thr ThrAla Thr Tyr Asp Val Asp Thr Asn Pro Asp Asn Val Ile Val Thr Thr
85 90 95 85 90 95
Gly Ser Ser Gly Gly Phe Val Ala Ser Phe Ile Ala Thr Leu Asp HisGly Ser Ser Gly Gly Phe Val Ala Ser Phe Ile Ala Thr Leu Asp His
100 105 110 100 105 110
Gly Asp Tyr Val Ala Met Pro Thr Pro Gly Tyr Pro Ala Tyr Arg AsnGly Asp Tyr Val Ala Met Pro Thr Pro Gly Tyr Pro Ala Tyr Arg Asn
115 120 125 115 120 125
Ile Leu Glu Ser Leu Gly Ala Lys Val Leu Asn Leu Arg Cys Thr AlaIle Leu Glu Ser Leu Gly Ala Lys Val Leu Asn Leu Arg Cys Thr Ala
130 135 140 130 135 140
Glu Thr Arg Phe Gln Pro Thr Ala Gln Met Leu Glu Glu Leu Pro HisGlu Thr Arg Phe Gln Pro Thr Ala Gln Met Leu Glu Glu Leu Pro His
145 150 155 160 145 150 155 160
Lys Pro Lys Ala Val Ile Val Thr Ser Pro Gly Asn Pro Thr Gly ThrLys Pro Lys Ala Val Ile Val Thr Ser Pro Gly Asn Pro Thr Gly Thr
165 170 175 165 170 175
Ile Ile Asp Pro Glu Glu Leu Glu Arg Ile Ala Lys Trp Cys Asp AspIle Ile Asp Pro Glu Glu Leu Glu Arg Ile Ala Lys Trp Cys Asp Asp
180 185 190 180 185 190
Asn Asp Ala Val Leu Ile Ser Asp Glu Asp Tyr His Gly Met Ser PheAsn Asp Ala Val Leu Ile Ser Asp Glu Asp Tyr His Gly Met Ser Phe
195 200 205 195 200 205
Gly Arg Pro Leu Ala Thr Ala His Gln Phe Ser Lys Asn Ala Ile ValGly Arg Pro Leu Ala Thr Ala His Gln Phe Ser Lys Asn Ala Ile Val
210 215 220 210 215 220
Val Gly Thr Leu Ser Lys Tyr Phe Ser Met Thr Gly Trp Arg Val GlyVal Gly Thr Leu Ser Lys Tyr Phe Ser Met Thr Gly Trp Arg Val Gly
225 230 235 240 225 230 235 240
Trp Ile Ile Val Pro Asp Glu Leu Val Thr Ser Ile Glu Asn Leu GlnTrp Ile Ile Val Pro Asp Glu Leu Val Thr Ser Ile Glu Asn Leu Gln
245 250 255 245 250 255
Ala Ser Leu Ser Leu Cys Ala Pro Ala Ile Gly Gln Ala Ala Gly ArgAla Ser Leu Ser Leu Cys Ala Pro Ala Ile Gly Gln Ala Ala Gly Arg
260 265 270 260 265 270
Ala Ala Phe Thr Leu Glu Ala Gly Ala Glu Leu Asp Ala His Val GluAla Ala Phe Thr Leu Glu Ala Gly Ala Glu Leu Asp Ala His Val Glu
275 280 285 275 280 285
Ala Tyr Arg Glu Ala Arg Glu Val Phe Val Asp Lys Leu Pro Glu IleAla Tyr Arg Glu Ala Arg Glu Val Phe Val Asp Lys Leu Pro Glu Ile
290 295 300 290 295 300
Gly Leu Gly Thr Phe Ala Asp Pro Asp Gly Gly Leu Tyr Leu Trp ValGly Leu Gly Thr Phe Ala Asp Pro Asp Gly Gly Leu Tyr Leu Trp Val
305 310 315 320 305 310 315 320
Asp Val Ser Ala Tyr Thr Asp Asp Ser Glu Glu Trp Val Leu Arg LeuAsp Val Ser Ala Tyr Thr Asp Asp Ser Glu Glu Trp Val Leu Arg Leu
325 330 335 325 330 335
Leu Asp Glu Ala Gly Val Ala Val Ala Pro Gly Val Asp Phe Asp ProLeu Asp Glu Ala Gly Val Ala Val Ala Pro Gly Val Asp Phe Asp Pro
340 345 350 340 345 350
Glu Glu Gly His Lys Trp Ile Arg Leu Ser Leu Cys Ala Ser Lys GluGlu Glu Gly His Lys Trp Ile Arg Leu Ser Leu Cys Ala Ser Lys Glu
355 360 365 355 360 365
Asp Thr Ile Glu Gly Val Arg Lys Ile Gly Glu Phe Ile Lys LysAsp Thr Ile Glu Gly Val Arg Lys Ile Gly Glu Phe Ile Lys Lys
370 375 380 370 375 380
<210> 3<210> 3
<211> 922<211> 922
<212> PRT<212>PRT
<213> Unknown<213>Unknown
<220><220>
<223> Пируватдегидрогеназа Corynebacterium sp<223> Pyruvate dehydrogenase Corynebacterium sp
<400> 3<400> 3
Met Ala Asp Gln Ala Lys Leu Gly Gly Lys Pro Ser Asp Asp Ser AsnMet Ala Asp Gln Ala Lys Leu Gly Gly Lys Pro Ser Asp Asp Ser Asn
1 5 10 15 1 5 10 15
Phe Ala Met Ile Arg Asp Gly Val Ala Ser Tyr Leu Asn Asp Ser AspPhe Ala Met Ile Arg Asp Gly Val Ala Ser Tyr Leu Asn Asp Ser Asp
20 25 30 20 25 30
Pro Glu Glu Thr Asn Glu Trp Met Asp Ser Leu Asp Gly Leu Leu GlnPro Glu Glu Thr Asn Glu Trp Met Asp Ser Leu Asp Gly Leu Leu Gln
35 40 45 35 40 45
Glu Ser Ser Pro Glu Arg Ala Arg Tyr Leu Met Leu Arg Leu Leu GluGlu Ser Ser Pro Glu Arg Ala Arg Tyr Leu Met Leu Arg Leu Leu Glu
50 55 60 50 55 60
Arg Ala Ser Ala Lys Arg Val Ser Leu Pro Pro Met Thr Ser Thr AspArg Ala Ser Ala Lys Arg Val Ser Leu Pro Pro Met Thr Ser Thr Asp
65 70 75 80 65 70 75 80
Tyr Val Asn Thr Ile Pro Thr Ser Met Glu Pro Glu Phe Pro Gly AspTyr Val Asn Thr Ile Pro Thr Ser Met Glu Pro Glu Phe Pro Gly Asp
85 90 95 85 90 95
Glu Glu Met Glu Lys Arg Tyr Arg Arg Trp Ile Arg Trp Asn Ala AlaGlu Glu Met Glu Lys Arg Tyr Arg Arg Trp Ile Arg Trp Asn Ala Ala
100 105 110 100 105 110
Ile Met Val His Arg Ala Gln Arg Pro Gly Ile Gly Val Gly Gly HisIle Met Val His Arg Ala Gln Arg Pro Gly Ile Gly Val Gly Gly His
115 120 125 115 120 125
Ile Ser Thr Tyr Ala Gly Ala Ala Pro Leu Tyr Glu Val Gly Phe AsnIle Ser Thr Tyr Ala Gly Ala Ala Pro Leu Tyr Glu Val Gly Phe Asn
130 135 140 130 135 140
His Phe Phe Arg Gly Lys Asp His Pro Gly Gly Gly Asp Gln Ile PheHis Phe Phe Arg Gly Lys Asp His Pro Gly Gly Gly Asp Gln Ile Phe
145 150 155 160 145 150 155 160
Phe Gln Gly His Ala Ser Pro Gly Met Tyr Ala Arg Ala Phe Met GluPhe Gln Gly His Ala Ser Pro Gly Met Tyr Ala Arg Ala Phe Met Glu
165 170 175 165 170 175
Gly Arg Leu Ser Glu Asp Asp Leu Asp Gly Phe Arg Gln Glu Val SerGly Arg Leu Ser Glu Asp Asp Leu Asp Gly Phe Arg Gln Glu Val Ser
180 185 190 180 185 190
Arg Glu Gln Gly Gly Ile Pro Ser Tyr Pro His Pro His Gly Met LysArg Glu Gln Gly Gly Ile Pro Ser Tyr Pro His Pro His Gly Met Lys
195 200 205 195 200 205
Asp Phe Trp Glu Phe Pro Thr Val Ser Met Gly Leu Gly Pro Met AspAsp Phe Trp Glu Phe Pro Thr Val Ser Met Gly Leu Gly Pro Met Asp
210 215 220 210 215 220
Ala Ile Tyr Gln Ala Arg Phe Asn Arg Tyr Leu Glu Asn Arg Gly IleAla Ile Tyr Gln Ala Arg Phe Asn Arg Tyr Leu Glu Asn Arg Gly Ile
225 230 235 240 225 230 235 240
Lys Asp Thr Ser Asp Gln His Val Trp Ala Phe Leu Gly Asp Gly GluLys Asp Thr Ser Asp Gln His Val Trp Ala Phe Leu Gly Asp Gly Glu
245 250 255 245 250 255
Met Asp Glu Pro Glu Ser Arg Gly Leu Ile Gln Gln Ala Ala Leu AsnMet Asp Glu Pro Glu Ser Arg Gly Leu Ile Gln Gln Ala Ala Leu Asn
260 265 270 260 265 270
Asn Leu Asp Asn Leu Thr Phe Val Val Asn Cys Asn Leu Gln Arg LeuAsn Leu Asp Asn Leu Thr Phe Val Val Asn Cys Asn Leu Gln Arg Leu
275 280 285 275 280 285
Asp Gly Pro Val Arg Gly Asn Thr Lys Ile Ile Gln Glu Leu Glu SerAsp Gly Pro Val Arg Gly Asn Thr Lys Ile Ile Gln Glu Leu Glu Ser
290 295 300 290 295 300
Phe Phe Arg Gly Ala Gly Trp Ser Val Ile Lys Val Val Trp Gly ArgPhe Phe Arg Gly Ala Gly Trp Ser Val Ile Lys Val Val Trp Gly Arg
305 310 315 320 305 310 315 320
Glu Trp Asp Glu Leu Leu Glu Lys Asp Gln Asp Gly Ala Leu Val GluGlu Trp Asp Glu Leu Leu Glu Lys Asp Gln Asp Gly Ala Leu Val Glu
325 330 335 325 330 335
Ile Met Asn Asn Thr Ser Asp Gly Asp Tyr Gln Thr Phe Lys Ala AsnIle Met Asn Asn Thr Ser Asp Gly Asp Tyr Gln Thr Phe Lys Ala Asn
340 345 350 340 345 350
Asp Gly Ala Tyr Val Arg Glu His Phe Phe Gly Arg Asp Pro Arg ThrAsp Gly Ala Tyr Val Arg Glu His Phe Phe Gly Arg Asp Pro Arg Thr
355 360 365 355 360 365
Ala Lys Leu Val Glu Asn Met Thr Asp Glu Glu Ile Trp Lys Leu ProAla Lys Leu Val Glu Asn Met Thr Asp Glu Glu Ile Trp Lys Leu Pro
370 375 380 370 375 380
Arg Gly Gly His Asp Tyr Arg Lys Val Tyr Ala Ala Tyr Lys Arg AlaArg Gly Gly His Asp Tyr Arg Lys Val Tyr Ala Ala Tyr Lys Arg Ala
385 390 395 400 385 390 395 400
Leu Glu Thr Lys Asp Arg Pro Thr Val Ile Leu Ala His Thr Ile LysLeu Glu Thr Lys Asp Arg Pro Thr Val Ile Leu Ala His Thr Ile Lys
405 410 415 405 410 415
Gly Tyr Gly Leu Gly His Asn Phe Glu Gly Arg Asn Ala Thr His GlnGly Tyr Gly Leu Gly His Asn Phe Glu Gly Arg Asn Ala Thr His Gln
420 425 430 420 425 430
Met Lys Lys Leu Thr Leu Asp Asp Leu Lys Leu Phe Arg Asp Lys GlnMet Lys Lys Leu Thr Leu Asp Asp Leu Lys Leu Phe Arg Asp Lys Gln
435 440 445 435 440 445
Gly Ile Pro Ile Thr Asp Glu Gln Leu Glu Lys Asp Pro Tyr Leu ProGly Ile Pro Ile Thr Asp Glu Gln Leu Glu Lys Asp Pro Tyr Leu Pro
450 455 460 450 455 460
Pro Tyr Tyr His Pro Gly Glu Asp Ala Pro Glu Ile Lys Tyr Met LysPro Tyr Tyr His Pro Gly Glu Asp Ala Pro Glu Ile Lys Tyr Met Lys
465 470 475 480 465 470 475 480
Glu Arg Arg Ala Ala Leu Gly Gly Tyr Leu Pro Glu Arg Arg Glu AsnGlu Arg Arg Ala Ala Leu Gly Gly Tyr Leu Pro Glu Arg Arg Glu Asn
485 490 495 485 490 495
Tyr Asp Pro Ile Gln Val Pro Pro Leu Asp Lys Leu Arg Ser Val ArgTyr Asp Pro Ile Gln Val Pro Pro Leu Asp Lys Leu Arg Ser Val Arg
500 505 510 500 505 510
Lys Gly Ser Gly Lys Gln Gln Ile Ala Thr Thr Met Ala Thr Val ArgLys Gly Ser Gly Lys Gln Gln Ile Ala Thr Thr Met Ala Thr Val Arg
515 520 525 515 520 525
Thr Phe Lys Glu Leu Met Arg Asp Lys Gly Leu Ala Asp Arg Leu ValThr Phe Lys Glu Leu Met Arg Asp Lys Gly Leu Ala Asp Arg Leu Val
530 535 540 530 535 540
Pro Ile Ile Pro Asp Glu Ala Arg Thr Phe Gly Leu Asp Ser Trp PhePro Ile Ile Pro Asp Glu Ala Arg Thr Phe Gly Leu Asp Ser Trp Phe
545 550 555 560 545 550 555 560
Pro Thr Leu Lys Ile Tyr Asn Pro His Gly Gln Asn Tyr Val Pro ValPro Thr Leu Lys Ile Tyr Asn Pro His Gly Gln Asn Tyr Val Pro Val
565 570 575 565 570 575
Asp His Asp Leu Met Leu Ser Tyr Arg Glu Ala Pro Glu Gly Gln IleAsp His Asp Leu Met Leu Ser Tyr Arg Glu Ala Pro Glu Gly Gln Ile
580 585 590 580 585 590
Leu His Glu Gly Ile Asn Glu Ala Gly Ser Met Ala Ser Phe Ile AlaLeu His Glu Gly Ile Asn Glu Ala Gly Ser Met Ala Ser Phe Ile Ala
595 600 605 595 600 605
Ala Gly Thr Ser Tyr Ala Thr His Gly Lys Ala Met Ile Pro Leu TyrAla Gly Thr Ser Tyr Ala Thr His Gly Lys Ala Met Ile Pro Leu Tyr
610 615 620 610 615 620
Ile Phe Tyr Ser Met Phe Gly Phe Gln Arg Thr Gly Asp Ser Ile TrpIle Phe Tyr Ser Met Phe Gly Phe Gln Arg Thr Gly Asp Ser Ile Trp
625 630 635 640 625 630 635 640
Ala Ala Ala Asp Gln Met Ala Arg Gly Phe Leu Leu Gly Ala Thr AlaAla Ala Ala Asp Gln Met Ala Arg Gly Phe Leu Leu Gly Ala Thr Ala
645 650 655 645 650 655
Gly Arg Thr Thr Leu Thr Gly Glu Gly Leu Gln His Met Asp Gly HisGly Arg Thr Thr Leu Thr Gly Glu Gly Leu Gln His Met Asp Gly His
660 665 670 660 665 670
Ser Pro Val Leu Ala Ser Thr Asn Glu Gly Val Glu Thr Tyr Asp ProSer Pro Val Leu Ala Ser Thr Asn Glu Gly Val Glu Thr Tyr Asp Pro
675 680 685 675 680 685
Ser Phe Ala Tyr Glu Ile Ala His Leu Val His Arg Gly Ile Asp ArgSer Phe Ala Tyr Glu Ile Ala His Leu Val His Arg Gly Ile Asp Arg
690 695 700 690 695 700
Met Tyr Gly Pro Gly Lys Gly Glu Asp Val Ile Tyr Tyr Ile Thr IleMet Tyr Gly Pro Gly Lys Gly Glu Asp Val Ile Tyr Tyr Ile Thr Ile
705 710 715 720 705 710 715 720
Tyr Asn Glu Pro Thr Pro Gln Pro Ala Glu Pro Glu Gly Leu Asp ValTyr Asn Glu Pro Thr Pro Gln Pro Ala Glu Pro Glu Gly Leu Asp Val
725 730 735 725 730 735
Glu Gly Leu His Lys Gly Ile Tyr Leu Tyr Ser Arg Gly Glu Gly ThrGlu Gly Leu His Lys Gly Ile Tyr Leu Tyr Ser Arg Gly Glu Gly Thr
740 745 750 740 745 750
Gly His Glu Ala Asn Ile Leu Ala Ser Gly Val Gly Met Gln Trp AlaGly His Glu Ala Asn Ile Leu Ala Ser Gly Val Gly Met Gln Trp Ala
755 760 765 755 760 765
Leu Lys Ala Ala Ser Ile Leu Glu Ala Asp Tyr Gly Val Arg Ala AsnLeu Lys Ala Ala Ser Ile Leu Glu Ala Asp Tyr Gly Val Arg Ala Asn
770 775 780 770 775 780
Ile Tyr Ser Ala Thr Ser Trp Val Asn Leu Ala Arg Asp Gly Ala AlaIle Tyr Ser Ala Thr Ser Trp Val Asn Leu Ala Arg Asp Gly Ala Ala
785 790 795 800 785 790 795 800
Arg Asn Lys Ala Gln Leu Arg Asn Pro Gly Ala Asp Ala Gly Glu AlaArg Asn Lys Ala Gln Leu Arg Asn Pro Gly Ala Asp Ala Gly Glu Ala
805 810 815 805 810 815
Phe Val Thr Thr Gln Leu Lys Gln Thr Ser Gly Pro Tyr Val Ala ValPhe Val Thr Thr Gln Leu Lys Gln Thr Ser Gly Pro Tyr Val Ala Val
820 825 830 820 825 830
Ser Asp Phe Ser Thr Asp Leu Pro Asn Gln Ile Arg Glu Trp Val ProSer Asp Phe Ser Thr Asp Leu Pro Asn Gln Ile Arg Glu Trp Val Pro
835 840 845 835 840 845
Gly Asp Tyr Thr Val Leu Gly Ala Asp Gly Phe Gly Phe Ser Asp ThrGly Asp Tyr Thr Val Leu Gly Ala Asp Gly Phe Gly Phe Ser Asp Thr
850 855 860 850 855 860
Arg Pro Ala Ala Arg Arg Phe Phe Asn Ile Asp Ala Glu Ser Ile ValArg Pro Ala Ala Arg Arg Phe Phe Asn Ile Asp Ala Glu Ser Ile Val
865 870 875 880 865 870 875 880
Val Ala Val Leu Asn Ser Leu Ala Arg Glu Gly Lys Ile Asp Val SerVal Ala Val Leu Asn Ser Leu Ala Arg Glu Gly Lys Ile Asp Val Ser
885 890 895 885 890 895
Val Ala Ala Gln Ala Ala Glu Lys Phe Lys Leu Asp Asp Pro Thr SerVal Ala Ala Gln Ala Ala Glu Lys Phe Lys Leu Asp Asp Pro Thr Ser
900 905 910 900 905 910
Val Ser Val Asp Pro Asn Ala Pro Glu GluVal Ser Val Asp Pro Asn Ala Pro Glu Glu
915 920 915 920
<210> 4<210> 4
<211> 437<211> 437
<212> PRT<212>PRT
<213> Unknown<213>Unknown
<220><220>
<223> Цитратсинтаза Corynebacterium sp<223> Citrate synthase Corynebacterium sp
<400> 4<400> 4
Met Phe Glu Arg Asp Ile Val Ala Thr Asp Asn Asn Lys Ala Val LeuMet Phe Glu Arg Asp Ile Val Ala Thr Asp Asn Asn Lys Ala Val Leu
1 5 10 15 1 5 10 15
His Tyr Pro Gly Gly Glu Phe Glu Met Asp Ile Ile Glu Ala Ser GluHis Tyr Pro Gly Gly Glu Phe Glu Met Asp Ile Ile Glu Ala Ser Glu
20 25 30 20 25 30
Gly Asn Asn Gly Val Val Leu Gly Lys Met Leu Ser Glu Thr Gly LeuGly Asn Asn Gly Val Val Leu Gly Lys Met Leu Ser Glu Thr Gly Leu
35 40 45 35 40 45
Ile Thr Phe Asp Pro Gly Tyr Val Ser Thr Gly Ser Thr Glu Ser LysIle Thr Phe Asp Pro Gly Tyr Val Ser Thr Gly Ser Thr Glu Ser Lys
50 55 60 50 55 60
Ile Thr Tyr Ile Asp Gly Asp Ala Gly Ile Leu Arg Tyr Arg Gly TyrIle Thr Tyr Ile Asp Gly Asp Ala Gly Ile Leu Arg Tyr Arg Gly Tyr
65 70 75 80 65 70 75 80
Asp Ile Ala Asp Leu Ala Glu Asn Ala Thr Phe Asn Glu Val Ser TyrAsp Ile Ala Asp Leu Ala Glu Asn Ala Thr Phe Asn Glu Val Ser Tyr
85 90 95 85 90 95
Leu Leu Ile Asn Gly Glu Leu Pro Thr Pro Asp Glu Leu His Lys PheLeu Leu Ile Asn Gly Glu Leu Pro Thr Pro Asp Glu Leu His Lys Phe
100 105 110 100 105 110
Asn Asp Glu Ile Arg His His Thr Leu Leu Asp Glu Asp Phe Lys SerAsn Asp Glu Ile Arg His His Thr Leu Leu Asp Glu Asp Phe Lys Ser
115 120 125 115 120 125
Gln Phe Asn Val Phe Pro Arg Asp Ala His Pro Met Ala Thr Leu AlaGln Phe Asn Val Phe Pro Arg Asp Ala His Pro Met Ala Thr Leu Ala
130 135 140 130 135 140
Ser Ser Val Asn Ile Leu Ser Thr Tyr Tyr Gln Asp Gln Leu Asn ProSer Ser Val Asn Ile Leu Ser Thr Tyr Tyr Gln Asp Gln Leu Asn Pro
145 150 155 160 145 150 155 160
Leu Asp Glu Ala Gln Leu Asp Lys Ala Thr Val Arg Leu Met Ala LysLeu Asp Glu Ala Gln Leu Asp Lys Ala Thr Val Arg Leu Met Ala Lys
165 170 175 165 170 175
Val Pro Met Leu Ala Ala Tyr Ala His Arg Ala Arg Lys Gly Ala ProVal Pro Met Leu Ala Ala Tyr Ala His Arg Ala Arg Lys Gly Ala Pro
180 185 190 180 185 190
Tyr Met Tyr Pro Asp Asn Ser Leu Asn Ala Arg Glu Asn Phe Leu ArgTyr Met Tyr Pro Asp Asn Ser Leu Asn Ala Arg Glu Asn Phe Leu Arg
195 200 205 195 200 205
Met Met Phe Gly Tyr Pro Thr Glu Pro Tyr Glu Ile Asp Pro Ile MetMet Met Phe Gly Tyr Pro Thr Glu Pro Tyr Glu Ile Asp Pro Ile Met
210 215 220 210 215 220
Val Lys Ala Leu Asp Lys Leu Leu Ile Leu His Ala Asp His Glu GlnVal Lys Ala Leu Asp Lys Leu Leu Ile Leu His Ala Asp His Glu Gln
225 230 235 240 225 230 235 240
Asn Cys Ser Thr Ser Thr Val Arg Met Ile Gly Ser Ala Gln Ala AsnAsn Cys Ser Thr Ser Thr Val Arg Met Ile Gly Ser Ala Gln Ala Asn
245 250 255 245 250 255
Met Phe Val Ser Ile Ala Gly Gly Ile Asn Ala Leu Ser Gly Pro LeuMet Phe Val Ser Ile Ala Gly Gly Ile Asn Ala Leu Ser Gly Pro Leu
260 265 270 260 265 270
His Gly Gly Ala Asn Gln Ala Val Leu Glu Met Leu Glu Asp Ile LysHis Gly Gly Ala Asn Gln Ala Val Leu Glu Met Leu Glu Asp Ile Lys
275 280 285 275 280 285
Asn Asn His Gly Gly Asp Ala Thr Ala Phe Met Asn Lys Val Lys AsnAsn Asn His Gly Gly Asp Ala Thr Ala Phe Met Asn Lys Val Lys Asn
290 295 300 290 295 300
Lys Glu Asp Gly Val Arg Leu Met Gly Phe Gly His Arg Val Tyr LysLys Glu Asp Gly Val Arg Leu Met Gly Phe Gly His Arg Val Tyr Lys
305 310 315 320 305 310 315 320
Asn Tyr Asp Pro Arg Ala Ala Ile Val Lys Glu Thr Ala His Glu IleAsn Tyr Asp Pro Arg Ala Ala Ile Val Lys Glu Thr Ala His Glu Ile
325 330 335 325 330 335
Leu Glu His Leu Gly Gly Asp Asp Leu Leu Asp Leu Ala Ile Lys LeuLeu Glu His Leu Gly Gly Asp Asp Leu Leu Asp Leu Ala Ile Lys Leu
340 345 350 340 345 350
Glu Glu Ile Ala Leu Ala Asp Asp Tyr Phe Ile Ser Arg Lys Leu TyrGlu Glu Ile Ala Leu Ala Asp Asp Tyr Phe Ile Ser Arg Lys Leu Tyr
355 360 365 355 360 365
Pro Asn Val Asp Phe Tyr Thr Gly Leu Ile Tyr Arg Ala Met Gly PhePro Asn Val Asp Phe Tyr Thr Gly Leu Ile Tyr Arg Ala Met Gly Phe
370 375 380 370 375 380
Pro Thr Asp Phe Phe Thr Val Leu Phe Ala Ile Gly Arg Leu Pro GlyPro Thr Asp Phe Phe Thr Val Leu Phe Ala Ile Gly Arg Leu Pro Gly
385 390 395 400 385 390 395 400
Trp Ile Ala His Tyr Arg Glu Gln Leu Gly Ala Ala Asp Asn Lys IleTrp Ile Ala His Tyr Arg Glu Gln Leu Gly Ala Ala Asp Asn Lys Ile
405 410 415 405 410 415
Asn Arg Pro Arg Gln Val Tyr Thr Gly Asn Glu Ser Arg Lys Leu ValAsn Arg Pro Arg Gln Val Tyr Thr Gly Asn Glu Ser Arg Lys Leu Val
420 425 430 420 425 430
Pro Arg Glu Glu ArgPro Arg Glu Glu Arg
435 435
<210> 5<210> 5
<211> 922<211> 922
<212> PRT<212>PRT
<213> Unknown<213>Unknown
<220><220>
<223> Вариант пируватдегидрогеназы Corynebacterium sp<223> Variant of pyruvate dehydrogenase Corynebacterium sp
<400> 5<400> 5
Met Ala Asp Gln Ala Lys Leu Gly Gly Lys Pro Ser Asp Asp Ser AsnMet Ala Asp Gln Ala Lys Leu Gly Gly Lys Pro Ser Asp Asp Ser Asn
1 5 10 15 1 5 10 15
Phe Ala Met Ile Arg Asp Gly Val Ala Ser Tyr Leu Asn Asp Ser AspPhe Ala Met Ile Arg Asp Gly Val Ala Ser Tyr Leu Asn Asp Ser Asp
20 25 30 20 25 30
Pro Glu Glu Thr Asn Glu Trp Met Asp Ser Leu Asp Gly Leu Leu GlnPro Glu Glu Thr Asn Glu Trp Met Asp Ser Leu Asp Gly Leu Leu Gln
35 40 45 35 40 45
Glu Ser Ser Pro Glu Arg Ala Arg Tyr Leu Met Leu Arg Leu Leu GluGlu Ser Ser Pro Glu Arg Ala Arg Tyr Leu Met Leu Arg Leu Leu Glu
50 55 60 50 55 60
Arg Ala Ser Ala Lys Arg Val Ser Leu Pro Pro Met Thr Ser Thr AspArg Ala Ser Ala Lys Arg Val Ser Leu Pro Pro Met Thr Ser Thr Asp
65 70 75 80 65 70 75 80
Tyr Val Asn Thr Ile Pro Thr Ser Met Glu Pro Glu Phe Pro Gly AspTyr Val Asn Thr Ile Pro Thr Ser Met Glu Pro Glu Phe Pro Gly Asp
85 90 95 85 90 95
Glu Glu Met Glu Lys Arg Tyr Arg Arg Trp Ile Arg Trp Asn Ala AlaGlu Glu Met Glu Lys Arg Tyr Arg Arg Trp Ile Arg Trp Asn Ala Ala
100 105 110 100 105 110
Ile Met Val His Arg Ala Gln Arg Pro Gly Ile Gly Val Gly Gly HisIle Met Val His Arg Ala Gln Arg Pro Gly Ile Gly Val Gly Gly His
115 120 125 115 120 125
Ile Ser Thr Tyr Ala Gly Ala Ala Pro Leu Tyr Glu Val Gly Phe AsnIle Ser Thr Tyr Ala Gly Ala Ala Pro Leu Tyr Glu Val Gly Phe Asn
130 135 140 130 135 140
His Phe Phe Arg Gly Lys Asp His Pro Gly Gly Gly Asp Gln Ile PheHis Phe Phe Arg Gly Lys Asp His Pro Gly Gly Gly Asp Gln Ile Phe
145 150 155 160 145 150 155 160
Phe Gln Gly His Ala Ser Pro Gly Met Tyr Ala Arg Ala Phe Met GluPhe Gln Gly His Ala Ser Pro Gly Met Tyr Ala Arg Ala Phe Met Glu
165 170 175 165 170 175
Gly Arg Leu Ser Glu Asp Asp Leu Asp Gly Phe Arg Gln Glu Val SerGly Arg Leu Ser Glu Asp Asp Leu Asp Gly Phe Arg Gln Glu Val Ser
180 185 190 180 185 190
Arg Glu Gln Gly Gly Ile Pro Ser Tyr Pro His Pro His Gly Met LysArg Glu Gln Gly Gly Ile Pro Ser Tyr Pro His Pro His Gly Met Lys
195 200 205 195 200 205
Asp Phe Trp Glu Phe Pro Thr Val Ser Met Gly Leu Gly Pro Met AspAsp Phe Trp Glu Phe Pro Thr Val Ser Met Gly Leu Gly Pro Met Asp
210 215 220 210 215 220
Ala Ile Tyr Gln Ala Arg Phe Asn Arg Tyr Leu Glu Asn Arg Gly IleAla Ile Tyr Gln Ala Arg Phe Asn Arg Tyr Leu Glu Asn Arg Gly Ile
225 230 235 240 225 230 235 240
Lys Asp Thr Ser Asp Gln His Val Trp Ala Phe Leu Gly Asp Gly GluLys Asp Thr Ser Asp Gln His Val Trp Ala Phe Leu Gly Asp Gly Glu
245 250 255 245 250 255
Met Asp Glu Pro Glu Ser Arg Gly Leu Ile Gln Gln Ala Ala Leu AsnMet Asp Glu Pro Glu Ser Arg Gly Leu Ile Gln Gln Ala Ala Leu Asn
260 265 270 260 265 270
Asn Leu Asp Asn Leu Thr Phe Val Val Asn Cys Asn Leu Gln Arg LeuAsn Leu Asp Asn Leu Thr Phe Val Val Asn Cys Asn Leu Gln Arg Leu
275 280 285 275 280 285
Asp Gly Pro Val Arg Gly Asn Thr Lys Ile Ile Gln Glu Leu Glu SerAsp Gly Pro Val Arg Gly Asn Thr Lys Ile Ile Gln Glu Leu Glu Ser
290 295 300 290 295 300
Phe Phe Arg Gly Ala Gly Trp Ser Val Ile Lys Val Val Trp Gly ArgPhe Phe Arg Gly Ala Gly Trp Ser Val Ile Lys Val Val Trp Gly Arg
305 310 315 320 305 310 315 320
Glu Trp Asp Glu Leu Leu Glu Lys Asp Gln Asp Gly Ala Leu Val GluGlu Trp Asp Glu Leu Leu Glu Lys Asp Gln Asp Gly Ala Leu Val Glu
325 330 335 325 330 335
Ile Met Asn Asn Thr Ser Asp Gly Asp Tyr Gln Thr Phe Lys Ala AsnIle Met Asn Asn Thr Ser Asp Gly Asp Tyr Gln Thr Phe Lys Ala Asn
340 345 350 340 345 350
Asp Gly Ala Tyr Val Arg Glu His Phe Phe Gly Arg Asp Pro Arg ThrAsp Gly Ala Tyr Val Arg Glu His Phe Phe Gly Arg Asp Pro Arg Thr
355 360 365 355 360 365
Ala Lys Leu Val Glu Asn Met Thr Asp Glu Glu Ile Trp Lys Leu ProAla Lys Leu Val Glu Asn Met Thr Asp Glu Glu Ile Trp Lys Leu Pro
370 375 380 370 375 380
Arg Gly Gly His Asp Tyr Arg Lys Val Tyr Ala Ala Tyr Lys Arg AlaArg Gly Gly His Asp Tyr Arg Lys Val Tyr Ala Ala Tyr Lys Arg Ala
385 390 395 400 385 390 395 400
Leu Glu Thr Lys Asp Arg Pro Thr Val Ile Leu Ala His Thr Ile LysLeu Glu Thr Lys Asp Arg Pro Thr Val Ile Leu Ala His Thr Ile Lys
405 410 415 405 410 415
Gly Tyr Gly Leu Gly His Asn Phe Glu Gly Arg Asn Ala Thr His AlaGly Tyr Gly Leu Gly His Asn Phe Glu Gly Arg Asn Ala Thr His Ala
420 425 430 420 425 430
Met Lys Lys Leu Thr Leu Asp Asp Leu Lys Leu Phe Arg Asp Lys GlnMet Lys Lys Leu Thr Leu Asp Asp Leu Lys Leu Phe Arg Asp Lys Gln
435 440 445 435 440 445
Gly Ile Pro Ile Thr Asp Glu Gln Leu Glu Lys Asp Pro Tyr Leu ProGly Ile Pro Ile Thr Asp Glu Gln Leu Glu Lys Asp Pro Tyr Leu Pro
450 455 460 450 455 460
Pro Tyr Tyr His Pro Gly Glu Asp Ala Pro Glu Ile Lys Tyr Met LysPro Tyr Tyr His Pro Gly Glu Asp Ala Pro Glu Ile Lys Tyr Met Lys
465 470 475 480 465 470 475 480
Glu Arg Arg Ala Ala Leu Gly Gly Tyr Leu Pro Glu Arg Arg Glu AsnGlu Arg Arg Ala Ala Leu Gly Gly Tyr Leu Pro Glu Arg Arg Glu Asn
485 490 495 485 490 495
Tyr Asp Pro Ile Gln Val Pro Pro Leu Asp Lys Leu Arg Ser Val ArgTyr Asp Pro Ile Gln Val Pro Pro Leu Asp Lys Leu Arg Ser Val Arg
500 505 510 500 505 510
Lys Gly Ser Gly Lys Gln Gln Ile Ala Thr Thr Met Ala Thr Val ArgLys Gly Ser Gly Lys Gln Gln Ile Ala Thr Thr Met Ala Thr Val Arg
515 520 525 515 520 525
Thr Phe Lys Glu Leu Met Arg Asp Lys Gly Leu Ala Asp Arg Leu ValThr Phe Lys Glu Leu Met Arg Asp Lys Gly Leu Ala Asp Arg Leu Val
530 535 540 530 535 540
Pro Ile Ile Pro Asp Glu Ala Arg Thr Phe Gly Leu Asp Ser Trp PhePro Ile Ile Pro Asp Glu Ala Arg Thr Phe Gly Leu Asp Ser Trp Phe
545 550 555 560 545 550 555 560
Pro Thr Leu Lys Ile Tyr Asn Pro His Gly Gln Asn Tyr Val Pro ValPro Thr Leu Lys Ile Tyr Asn Pro His Gly Gln Asn Tyr Val Pro Val
565 570 575 565 570 575
Asp His Asp Leu Met Leu Ser Tyr Arg Glu Ala Pro Glu Gly Gln IleAsp His Asp Leu Met Leu Ser Tyr Arg Glu Ala Pro Glu Gly Gln Ile
580 585 590 580 585 590
Leu His Glu Gly Ile Asn Glu Ala Gly Ser Met Ala Ser Phe Ile AlaLeu His Glu Gly Ile Asn Glu Ala Gly Ser Met Ala Ser Phe Ile Ala
595 600 605 595 600 605
Ala Gly Thr Ser Tyr Ala Thr His Gly Lys Ala Met Ile Pro Leu TyrAla Gly Thr Ser Tyr Ala Thr His Gly Lys Ala Met Ile Pro Leu Tyr
610 615 620 610 615 620
Ile Phe Tyr Ser Met Phe Gly Phe Gln Arg Thr Gly Asp Ser Ile TrpIle Phe Tyr Ser Met Phe Gly Phe Gln Arg Thr Gly Asp Ser Ile Trp
625 630 635 640 625 630 635 640
Ala Ala Ala Asp Gln Met Ala Arg Gly Phe Leu Leu Gly Ala Thr AlaAla Ala Ala Asp Gln Met Ala Arg Gly Phe Leu Leu Gly Ala Thr Ala
645 650 655 645 650 655
Gly Arg Thr Thr Leu Thr Gly Glu Gly Leu Gln His Met Asp Gly HisGly Arg Thr Thr Leu Thr Gly Glu Gly Leu Gln His Met Asp Gly His
660 665 670 660 665 670
Ser Pro Val Leu Ala Ser Thr Asn Glu Gly Val Glu Thr Tyr Asp ProSer Pro Val Leu Ala Ser Thr Asn Glu Gly Val Glu Thr Tyr Asp Pro
675 680 685 675 680 685
Ser Phe Ala Tyr Glu Ile Ala His Leu Val His Arg Gly Ile Asp ArgSer Phe Ala Tyr Glu Ile Ala His Leu Val His Arg Gly Ile Asp Arg
690 695 700 690 695 700
Met Tyr Gly Pro Gly Lys Gly Glu Asp Val Ile Tyr Tyr Ile Thr IleMet Tyr Gly Pro Gly Lys Gly Glu Asp Val Ile Tyr Tyr Ile Thr Ile
705 710 715 720 705 710 715 720
Tyr Asn Glu Pro Thr Pro Gln Pro Ala Glu Pro Glu Gly Leu Asp ValTyr Asn Glu Pro Thr Pro Gln Pro Ala Glu Pro Glu Gly Leu Asp Val
725 730 735 725 730 735
Glu Gly Leu His Lys Gly Ile Tyr Leu Tyr Ser Arg Gly Glu Gly ThrGlu Gly Leu His Lys Gly Ile Tyr Leu Tyr Ser Arg Gly Glu Gly Thr
740 745 750 740 745 750
Gly His Glu Ala Asn Ile Leu Ala Ser Gly Val Gly Met Gln Trp AlaGly His Glu Ala Asn Ile Leu Ala Ser Gly Val Gly Met Gln Trp Ala
755 760 765 755 760 765
Leu Lys Ala Ala Ser Ile Leu Glu Ala Asp Tyr Gly Val Arg Ala AsnLeu Lys Ala Ala Ser Ile Leu Glu Ala Asp Tyr Gly Val Arg Ala Asn
770 775 780 770 775 780
Ile Tyr Ser Ala Thr Ser Trp Val Asn Leu Ala Arg Asp Gly Ala AlaIle Tyr Ser Ala Thr Ser Trp Val Asn Leu Ala Arg Asp Gly Ala Ala
785 790 795 800 785 790 795 800
Arg Asn Lys Ala Gln Leu Arg Asn Pro Gly Ala Asp Ala Gly Glu AlaArg Asn Lys Ala Gln Leu Arg Asn Pro Gly Ala Asp Ala Gly Glu Ala
805 810 815 805 810 815
Phe Val Thr Thr Gln Leu Lys Gln Thr Ser Gly Pro Tyr Val Ala ValPhe Val Thr Thr Gln Leu Lys Gln Thr Ser Gly Pro Tyr Val Ala Val
820 825 830 820 825 830
Ser Asp Phe Ser Thr Asp Leu Pro Asn Gln Ile Arg Glu Trp Val ProSer Asp Phe Ser Thr Asp Leu Pro Asn Gln Ile Arg Glu Trp Val Pro
835 840 845 835 840 845
Gly Asp Tyr Thr Val Leu Gly Ala Asp Gly Phe Gly Phe Ser Asp ThrGly Asp Tyr Thr Val Leu Gly Ala Asp Gly Phe Gly Phe Ser Asp Thr
850 855 860 850 855 860
Arg Pro Ala Ala Arg Arg Phe Phe Asn Ile Asp Ala Glu Ser Ile ValArg Pro Ala Ala Arg Arg Phe Phe Asn Ile Asp Ala Glu Ser Ile Val
865 870 875 880 865 870 875 880
Val Ala Val Leu Asn Ser Leu Ala Arg Glu Gly Lys Ile Asp Val SerVal Ala Val Leu Asn Ser Leu Ala Arg Glu Gly Lys Ile Asp Val Ser
885 890 895 885 890 895
Val Ala Ala Gln Ala Ala Glu Lys Phe Lys Leu Asp Asp Pro Thr SerVal Ala Ala Gln Ala Ala Glu Lys Phe Lys Leu Asp Asp Pro Thr Ser
900 905 910 900 905 910
Val Ser Val Asp Pro Asn Ala Pro Glu GluVal Ser Val Asp Pro Asn Ala Pro Glu Glu
915 920 915 920
<210> 6<210> 6
<211> 922<211> 922
<212> PRT<212>PRT
<213> Unknown<213> Unknown
<220><220>
<223> Вариант пируватдегидрогеназы Corynebacterium sp<223> Variant of pyruvate dehydrogenase Corynebacterium sp
<400> 6<400> 6
Met Ala Asp Gln Ala Lys Leu Gly Gly Lys Pro Ser Asp Asp Ser AsnMet Ala Asp Gln Ala Lys Leu Gly Gly Lys Pro Ser Asp Asp Ser Asn
1 5 10 15 1 5 10 15
Phe Ala Met Ile Arg Asp Gly Val Ala Ser Tyr Leu Asn Asp Ser AspPhe Ala Met Ile Arg Asp Gly Val Ala Ser Tyr Leu Asn Asp Ser Asp
20 25 30 20 25 30
Pro Glu Glu Thr Asn Glu Trp Met Asp Ser Leu Asp Gly Leu Leu GlnPro Glu Glu Thr Asn Glu Trp Met Asp Ser Leu Asp Gly Leu Leu Gln
35 40 45 35 40 45
Glu Ser Ser Pro Glu Arg Ala Arg Tyr Leu Met Leu Arg Leu Leu GluGlu Ser Ser Pro Glu Arg Ala Arg Tyr Leu Met Leu Arg Leu Leu Glu
50 55 60 50 55 60
Arg Ala Ser Ala Lys Arg Val Ser Leu Pro Pro Met Thr Ser Thr AspArg Ala Ser Ala Lys Arg Val Ser Leu Pro Pro Met Thr Ser Thr Asp
65 70 75 80 65 70 75 80
Tyr Val Asn Thr Ile Pro Thr Ser Met Glu Pro Glu Phe Pro Gly AspTyr Val Asn Thr Ile Pro Thr Ser Met Glu Pro Glu Phe Pro Gly Asp
85 90 95 85 90 95
Glu Glu Met Glu Lys Arg Tyr Arg Arg Trp Ile Arg Trp Asn Ala AlaGlu Glu Met Glu Lys Arg Tyr Arg Arg Trp Ile Arg Trp Asn Ala Ala
100 105 110 100 105 110
Ile Met Val His Arg Ala Gln Arg Pro Gly Ile Gly Val Gly Gly HisIle Met Val His Arg Ala Gln Arg Pro Gly Ile Gly Val Gly Gly His
115 120 125 115 120 125
Ile Ser Thr Tyr Ala Gly Ala Ala Pro Leu Tyr Glu Val Gly Phe AsnIle Ser Thr Tyr Ala Gly Ala Ala Pro Leu Tyr Glu Val Gly Phe Asn
130 135 140 130 135 140
His Phe Phe Arg Gly Lys Asp His Pro Gly Gly Gly Asp Gln Ile PheHis Phe Phe Arg Gly Lys Asp His Pro Gly Gly Gly Asp Gln Ile Phe
145 150 155 160 145 150 155 160
Phe Gln Gly His Ala Ser Pro Gly Met Tyr Ala Arg Ala Phe Met GluPhe Gln Gly His Ala Ser Pro Gly Met Tyr Ala Arg Ala Phe Met Glu
165 170 175 165 170 175
Gly Arg Leu Ser Glu Asp Asp Leu Asp Gly Phe Arg Gln Glu Val SerGly Arg Leu Ser Glu Asp Asp Leu Asp Gly Phe Arg Gln Glu Val Ser
180 185 190 180 185 190
Arg Glu Gln Gly Gly Ile Pro Ser Tyr Pro His Pro His Gly Met LysArg Glu Gln Gly Gly Ile Pro Ser Tyr Pro His Pro His Gly Met Lys
195 200 205 195 200 205
Asp Phe Trp Glu Phe Pro Thr Val Ser Met Gly Leu Gly Pro Met AspAsp Phe Trp Glu Phe Pro Thr Val Ser Met Gly Leu Gly Pro Met Asp
210 215 220 210 215 220
Ala Ile Tyr Gln Ala Arg Phe Asn Arg Tyr Leu Glu Asn Arg Gly IleAla Ile Tyr Gln Ala Arg Phe Asn Arg Tyr Leu Glu Asn Arg Gly Ile
225 230 235 240 225 230 235 240
Lys Asp Thr Ser Asp Gln His Val Trp Ala Phe Leu Gly Asp Gly GluLys Asp Thr Ser Asp Gln His Val Trp Ala Phe Leu Gly Asp Gly Glu
245 250 255 245 250 255
Met Asp Glu Pro Glu Ser Arg Gly Leu Ile Gln Gln Ala Ala Leu AsnMet Asp Glu Pro Glu Ser Arg Gly Leu Ile Gln Gln Ala Ala Leu Asn
260 265 270 260 265 270
Asn Leu Asp Asn Leu Thr Phe Val Val Asn Cys Asn Leu Gln Arg LeuAsn Leu Asp Asn Leu Thr Phe Val Val Asn Cys Asn Leu Gln Arg Leu
275 280 285 275 280 285
Asp Gly Pro Val Arg Gly Asn Thr Lys Ile Ile Gln Glu Leu Glu SerAsp Gly Pro Val Arg Gly Asn Thr Lys Ile Ile Gln Glu Leu Glu Ser
290 295 300 290 295 300
Phe Phe Arg Gly Ala Gly Trp Ser Val Ile Lys Val Val Trp Gly ArgPhe Phe Arg Gly Ala Gly Trp Ser Val Ile Lys Val Val Trp Gly Arg
305 310 315 320 305 310 315 320
Glu Trp Asp Glu Leu Leu Glu Lys Asp Gln Asp Gly Ala Leu Val GluGlu Trp Asp Glu Leu Leu Glu Lys Asp Gln Asp Gly Ala Leu Val Glu
325 330 335 325 330 335
Ile Met Asn Asn Thr Ser Asp Gly Asp Tyr Gln Thr Phe Lys Ala AsnIle Met Asn Asn Thr Ser Asp Gly Asp Tyr Gln Thr Phe Lys Ala Asn
340 345 350 340 345 350
Asp Gly Ala Tyr Val Arg Glu His Phe Phe Gly Arg Asp Pro Arg ThrAsp Gly Ala Tyr Val Arg Glu His Phe Phe Gly Arg Asp Pro Arg Thr
355 360 365 355 360 365
Ala Lys Leu Val Glu Asn Met Thr Asp Glu Glu Ile Trp Lys Leu ProAla Lys Leu Val Glu Asn Met Thr Asp Glu Glu Ile Trp Lys Leu Pro
370 375 380 370 375 380
Arg Gly Gly His Asp Tyr Arg Lys Val Tyr Ala Ala Tyr Lys Arg AlaArg Gly Gly His Asp Tyr Arg Lys Val Tyr Ala Ala Tyr Lys Arg Ala
385 390 395 400 385 390 395 400
Leu Glu Thr Lys Asp Arg Pro Thr Val Ile Leu Ala His Thr Ile LysLeu Glu Thr Lys Asp Arg Pro Thr Val Ile Leu Ala His Thr Ile Lys
405 410 415 405 410 415
Gly Tyr Gly Leu Gly His Asn Phe Glu Gly Arg Asn Ala Thr His GlnGly Tyr Gly Leu Gly His Asn Phe Glu Gly Arg Asn Ala Thr His Gln
420 425 430 420 425 430
Met Lys Ala Leu Thr Leu Asp Asp Leu Lys Leu Phe Arg Asp Lys GlnMet Lys Ala Leu Thr Leu Asp Asp Leu Lys Leu Phe Arg Asp Lys Gln
435 440 445 435 440 445
Gly Ile Pro Ile Thr Asp Glu Gln Leu Glu Lys Asp Pro Tyr Leu ProGly Ile Pro Ile Thr Asp Glu Gln Leu Glu Lys Asp Pro Tyr Leu Pro
450 455 460 450 455 460
Pro Tyr Tyr His Pro Gly Glu Asp Ala Pro Glu Ile Lys Tyr Met LysPro Tyr Tyr His Pro Gly Glu Asp Ala Pro Glu Ile Lys Tyr Met Lys
465 470 475 480 465 470 475 480
Glu Arg Arg Ala Ala Leu Gly Gly Tyr Leu Pro Glu Arg Arg Glu AsnGlu Arg Arg Ala Ala Leu Gly Gly Tyr Leu Pro Glu Arg Arg Glu Asn
485 490 495 485 490 495
Tyr Asp Pro Ile Gln Val Pro Pro Leu Asp Lys Leu Arg Ser Val ArgTyr Asp Pro Ile Gln Val Pro Pro Leu Asp Lys Leu Arg Ser Val Arg
500 505 510 500 505 510
Lys Gly Ser Gly Lys Gln Gln Ile Ala Thr Thr Met Ala Thr Val ArgLys Gly Ser Gly Lys Gln Gln Ile Ala Thr Thr Met Ala Thr Val Arg
515 520 525 515 520 525
Thr Phe Lys Glu Leu Met Arg Asp Lys Gly Leu Ala Asp Arg Leu ValThr Phe Lys Glu Leu Met Arg Asp Lys Gly Leu Ala Asp Arg Leu Val
530 535 540 530 535 540
Pro Ile Ile Pro Asp Glu Ala Arg Thr Phe Gly Leu Asp Ser Trp PhePro Ile Ile Pro Asp Glu Ala Arg Thr Phe Gly Leu Asp Ser Trp Phe
545 550 555 560 545 550 555 560
Pro Thr Leu Lys Ile Tyr Asn Pro His Gly Gln Asn Tyr Val Pro ValPro Thr Leu Lys Ile Tyr Asn Pro His Gly Gln Asn Tyr Val Pro Val
565 570 575 565 570 575
Asp His Asp Leu Met Leu Ser Tyr Arg Glu Ala Pro Glu Gly Gln IleAsp His Asp Leu Met Leu Ser Tyr Arg Glu Ala Pro Glu Gly Gln Ile
580 585 590 580 585 590
Leu His Glu Gly Ile Asn Glu Ala Gly Ser Met Ala Ser Phe Ile AlaLeu His Glu Gly Ile Asn Glu Ala Gly Ser Met Ala Ser Phe Ile Ala
595 600 605 595 600 605
Ala Gly Thr Ser Tyr Ala Thr His Gly Lys Ala Met Ile Pro Leu TyrAla Gly Thr Ser Tyr Ala Thr His Gly Lys Ala Met Ile Pro Leu Tyr
610 615 620 610 615 620
Ile Phe Tyr Ser Met Phe Gly Phe Gln Arg Thr Gly Asp Ser Ile TrpIle Phe Tyr Ser Met Phe Gly Phe Gln Arg Thr Gly Asp Ser Ile Trp
625 630 635 640 625 630 635 640
Ala Ala Ala Asp Gln Met Ala Arg Gly Phe Leu Leu Gly Ala Thr AlaAla Ala Ala Asp Gln Met Ala Arg Gly Phe Leu Leu Gly Ala Thr Ala
645 650 655 645 650 655
Gly Arg Thr Thr Leu Thr Gly Glu Gly Leu Gln His Met Asp Gly HisGly Arg Thr Thr Leu Thr Gly Glu Gly Leu Gln His Met Asp Gly His
660 665 670 660 665 670
Ser Pro Val Leu Ala Ser Thr Asn Glu Gly Val Glu Thr Tyr Asp ProSer Pro Val Leu Ala Ser Thr Asn Glu Gly Val Glu Thr Tyr Asp Pro
675 680 685 675 680 685
Ser Phe Ala Tyr Glu Ile Ala His Leu Val His Arg Gly Ile Asp ArgSer Phe Ala Tyr Glu Ile Ala His Leu Val His Arg Gly Ile Asp Arg
690 695 700 690 695 700
Met Tyr Gly Pro Gly Lys Gly Glu Asp Val Ile Tyr Tyr Ile Thr IleMet Tyr Gly Pro Gly Lys Gly Glu Asp Val Ile Tyr Tyr Ile Thr Ile
705 710 715 720 705 710 715 720
Tyr Asn Glu Pro Thr Pro Gln Pro Ala Glu Pro Glu Gly Leu Asp ValTyr Asn Glu Pro Thr Pro Gln Pro Ala Glu Pro Glu Gly Leu Asp Val
725 730 735 725 730 735
Glu Gly Leu His Lys Gly Ile Tyr Leu Tyr Ser Arg Gly Glu Gly ThrGlu Gly Leu His Lys Gly Ile Tyr Leu Tyr Ser Arg Gly Glu Gly Thr
740 745 750 740 745 750
Gly His Glu Ala Asn Ile Leu Ala Ser Gly Val Gly Met Gln Trp AlaGly His Glu Ala Asn Ile Leu Ala Ser Gly Val Gly Met Gln Trp Ala
755 760 765 755 760 765
Leu Lys Ala Ala Ser Ile Leu Glu Ala Asp Tyr Gly Val Arg Ala AsnLeu Lys Ala Ala Ser Ile Leu Glu Ala Asp Tyr Gly Val Arg Ala Asn
770 775 780 770 775 780
Ile Tyr Ser Ala Thr Ser Trp Val Asn Leu Ala Arg Asp Gly Ala AlaIle Tyr Ser Ala Thr Ser Trp Val Asn Leu Ala Arg Asp Gly Ala Ala
785 790 795 800 785 790 795 800
Arg Asn Lys Ala Gln Leu Arg Asn Pro Gly Ala Asp Ala Gly Glu AlaArg Asn Lys Ala Gln Leu Arg Asn Pro Gly Ala Asp Ala Gly Glu Ala
805 810 815 805 810 815
Phe Val Thr Thr Gln Leu Lys Gln Thr Ser Gly Pro Tyr Val Ala ValPhe Val Thr Thr Gln Leu Lys Gln Thr Ser Gly Pro Tyr Val Ala Val
820 825 830 820 825 830
Ser Asp Phe Ser Thr Asp Leu Pro Asn Gln Ile Arg Glu Trp Val ProSer Asp Phe Ser Thr Asp Leu Pro Asn Gln Ile Arg Glu Trp Val Pro
835 840 845 835 840 845
Gly Asp Tyr Thr Val Leu Gly Ala Asp Gly Phe Gly Phe Ser Asp ThrGly Asp Tyr Thr Val Leu Gly Ala Asp Gly Phe Gly Phe Ser Asp Thr
850 855 860 850 855 860
Arg Pro Ala Ala Arg Arg Phe Phe Asn Ile Asp Ala Glu Ser Ile ValArg Pro Ala Ala Arg Arg Phe Phe Asn Ile Asp Ala Glu Ser Ile Val
865 870 875 880 865 870 875 880
Val Ala Val Leu Asn Ser Leu Ala Arg Glu Gly Lys Ile Asp Val SerVal Ala Val Leu Asn Ser Leu Ala Arg Glu Gly Lys Ile Asp Val Ser
885 890 895 885 890 895
Val Ala Ala Gln Ala Ala Glu Lys Phe Lys Leu Asp Asp Pro Thr SerVal Ala Ala Gln Ala Ala Glu Lys Phe Lys Leu Asp Asp Pro Thr Ser
900 905 910 900 905 910
Val Ser Val Asp Pro Asn Ala Pro Glu GluVal Ser Val Asp Pro Asn Ala Pro Glu Glu
915 920 915 920
<210> 7<210> 7
<211> 922<211> 922
<212> PRT<212>PRT
<213> Unknown<213>Unknown
<220><220>
<223> Вариант цитратсинтазы Corynebacterium sp<223> Citrate synthase variant Corynebacterium sp
<400> 7<400> 7
Met Ala Asp Gln Ala Lys Leu Gly Gly Lys Pro Ser Asp Asp Ser AsnMet Ala Asp Gln Ala Lys Leu Gly Gly Lys Pro Ser Asp Asp Ser Asn
1 5 10 15 1 5 10 15
Phe Ala Met Ile Arg Asp Gly Val Ala Ser Tyr Leu Asn Asp Ser AspPhe Ala Met Ile Arg Asp Gly Val Ala Ser Tyr Leu Asn Asp Ser Asp
20 25 30 20 25 30
Pro Glu Glu Thr Asn Glu Trp Met Asp Ser Leu Asp Gly Leu Leu GlnPro Glu Glu Thr Asn Glu Trp Met Asp Ser Leu Asp Gly Leu Leu Gln
35 40 45 35 40 45
Glu Ser Ser Pro Glu Arg Ala Arg Tyr Leu Met Leu Arg Leu Leu GluGlu Ser Ser Pro Glu Arg Ala Arg Tyr Leu Met Leu Arg Leu Leu Glu
50 55 60 50 55 60
Arg Ala Ser Ala Lys Arg Val Ser Leu Pro Pro Met Thr Ser Thr AspArg Ala Ser Ala Lys Arg Val Ser Leu Pro Pro Met Thr Ser Thr Asp
65 70 75 80 65 70 75 80
Tyr Val Asn Thr Ile Pro Thr Ser Met Glu Pro Glu Phe Pro Gly AspTyr Val Asn Thr Ile Pro Thr Ser Met Glu Pro Glu Phe Pro Gly Asp
85 90 95 85 90 95
Glu Glu Met Glu Lys Arg Tyr Arg Arg Trp Ile Arg Trp Asn Ala AlaGlu Glu Met Glu Lys Arg Tyr Arg Arg Trp Ile Arg Trp Asn Ala Ala
100 105 110 100 105 110
Ile Met Val His Arg Ala Gln Arg Pro Gly Ile Gly Val Gly Gly HisIle Met Val His Arg Ala Gln Arg Pro Gly Ile Gly Val Gly Gly His
115 120 125 115 120 125
Ile Ser Thr Tyr Ala Gly Ala Ala Pro Leu Tyr Glu Val Gly Phe AsnIle Ser Thr Tyr Ala Gly Ala Ala Pro Leu Tyr Glu Val Gly Phe Asn
130 135 140 130 135 140
His Phe Phe Arg Gly Lys Asp His Pro Gly Gly Gly Asp Gln Ile PheHis Phe Phe Arg Gly Lys Asp His Pro Gly Gly Gly Asp Gln Ile Phe
145 150 155 160 145 150 155 160
Phe Gln Gly His Ala Ser Pro Gly Met Tyr Ala Arg Ala Phe Met GluPhe Gln Gly His Ala Ser Pro Gly Met Tyr Ala Arg Ala Phe Met Glu
165 170 175 165 170 175
Gly Arg Leu Ser Glu Asp Asp Leu Asp Gly Phe Arg Gln Glu Val SerGly Arg Leu Ser Glu Asp Asp Leu Asp Gly Phe Arg Gln Glu Val Ser
180 185 190 180 185 190
Arg Glu Gln Gly Gly Ile Pro Ser Tyr Pro His Pro His Gly Met LysArg Glu Gln Gly Gly Ile Pro Ser Tyr Pro His Pro His Gly Met Lys
195 200 205 195 200 205
Asp Phe Trp Glu Phe Pro Thr Val Ser Met Gly Leu Gly Pro Met AspAsp Phe Trp Glu Phe Pro Thr Val Ser Met Gly Leu Gly Pro Met Asp
210 215 220 210 215 220
Ala Ile Tyr Gln Ala Arg Phe Asn Arg Tyr Leu Glu Asn Arg Gly IleAla Ile Tyr Gln Ala Arg Phe Asn Arg Tyr Leu Glu Asn Arg Gly Ile
225 230 235 240 225 230 235 240
Lys Asp Thr Ser Asp Gln His Val Trp Ala Phe Leu Gly Asp Gly GluLys Asp Thr Ser Asp Gln His Val Trp Ala Phe Leu Gly Asp Gly Glu
245 250 255 245 250 255
Met Asp Glu Pro Glu Ser Arg Gly Leu Ile Gln Gln Ala Ala Leu AsnMet Asp Glu Pro Glu Ser Arg Gly Leu Ile Gln Gln Ala Ala Leu Asn
260 265 270 260 265 270
Asn Leu Asp Asn Leu Thr Phe Val Val Asn Cys Asn Leu Gln Arg LeuAsn Leu Asp Asn Leu Thr Phe Val Val Asn Cys Asn Leu Gln Arg Leu
275 280 285 275 280 285
Asp Gly Pro Val Arg Gly Asn Thr Lys Ile Ile Gln Glu Leu Glu SerAsp Gly Pro Val Arg Gly Asn Thr Lys Ile Ile Gln Glu Leu Glu Ser
290 295 300 290 295 300
Phe Phe Arg Gly Ala Gly Trp Ser Val Ile Lys Val Val Trp Gly ArgPhe Phe Arg Gly Ala Gly Trp Ser Val Ile Lys Val Val Trp Gly Arg
305 310 315 320 305 310 315 320
Glu Trp Asp Glu Leu Leu Glu Lys Asp Gln Asp Gly Ala Leu Val GluGlu Trp Asp Glu Leu Leu Glu Lys Asp Gln Asp Gly Ala Leu Val Glu
325 330 335 325 330 335
Ile Met Asn Asn Thr Ser Asp Gly Asp Tyr Gln Thr Phe Lys Ala AsnIle Met Asn Asn Thr Ser Asp Gly Asp Tyr Gln Thr Phe Lys Ala Asn
340 345 350 340 345 350
Asp Gly Ala Tyr Val Arg Glu His Phe Phe Gly Arg Asp Pro Arg ThrAsp Gly Ala Tyr Val Arg Glu His Phe Phe Gly Arg Asp Pro Arg Thr
355 360 365 355 360 365
Ala Lys Leu Val Glu Asn Met Thr Asp Glu Glu Ile Trp Lys Leu ProAla Lys Leu Val Glu Asn Met Thr Asp Glu Glu Ile Trp Lys Leu Pro
370 375 380 370 375 380
Arg Gly Gly His Asp Tyr Arg Lys Val Tyr Ala Ala Tyr Lys Arg AlaArg Gly Gly His Asp Tyr Arg Lys Val Tyr Ala Ala Tyr Lys Arg Ala
385 390 395 400 385 390 395 400
Leu Glu Thr Lys Asp Arg Pro Thr Val Ile Leu Ala His Thr Ile LysLeu Glu Thr Lys Asp Arg Pro Thr Val Ile Leu Ala His Thr Ile Lys
405 410 415 405 410 415
Gly Tyr Gly Leu Gly His Asn Phe Glu Gly Arg Asn Ala Thr His GlnGly Tyr Gly Leu Gly His Asn Phe Glu Gly Arg Asn Ala Thr His Gln
420 425 430 420 425 430
Met Lys Ala Leu Thr Leu Asp Asp Leu Lys Leu Phe Arg Asp Lys GlnMet Lys Ala Leu Thr Leu Asp Asp Leu Lys Leu Phe Arg Asp Lys Gln
435 440 445 435 440 445
Gly Ile Pro Ile Thr Asp Glu Gln Leu Glu Lys Asp Pro Tyr Leu ProGly Ile Pro Ile Thr Asp Glu Gln Leu Glu Lys Asp Pro Tyr Leu Pro
450 455 460 450 455 460
Pro Tyr Tyr His Pro Gly Glu Asp Ala Pro Glu Ile Lys Tyr Met LysPro Tyr Tyr His Pro Gly Glu Asp Ala Pro Glu Ile Lys Tyr Met Lys
465 470 475 480 465 470 475 480
Glu Arg Arg Ala Ala Leu Gly Gly Tyr Leu Pro Glu Arg Arg Glu AsnGlu Arg Arg Ala Ala Leu Gly Gly Tyr Leu Pro Glu Arg Arg Glu Asn
485 490 495 485 490 495
Tyr Asp Pro Ile Gln Val Pro Pro Leu Asp Lys Leu Arg Ser Val ArgTyr Asp Pro Ile Gln Val Pro Pro Leu Asp Lys Leu Arg Ser Val Arg
500 505 510 500 505 510
Lys Gly Ser Gly Lys Gln Gln Ile Ala Thr Thr Met Ala Thr Val ArgLys Gly Ser Gly Lys Gln Gln Ile Ala Thr Thr Met Ala Thr Val Arg
515 520 525 515 520 525
Thr Phe Lys Glu Leu Met Arg Asp Lys Gly Leu Ala Asp Arg Leu ValThr Phe Lys Glu Leu Met Arg Asp Lys Gly Leu Ala Asp Arg Leu Val
530 535 540 530 535 540
Pro Ile Ile Pro Asp Glu Ala Arg Thr Phe Gly Leu Asp Ser Trp PhePro Ile Ile Pro Asp Glu Ala Arg Thr Phe Gly Leu Asp Ser Trp Phe
545 550 555 560 545 550 555 560
Pro Thr Leu Lys Ile Tyr Asn Pro His Gly Gln Asn Tyr Val Pro ValPro Thr Leu Lys Ile Tyr Asn Pro His Gly Gln Asn Tyr Val Pro Val
565 570 575 565 570 575
Asp His Asp Leu Met Leu Ser Tyr Arg Glu Ala Pro Glu Gly Gln IleAsp His Asp Leu Met Leu Ser Tyr Arg Glu Ala Pro Glu Gly Gln Ile
580 585 590 580 585 590
Leu His Glu Gly Ile Asn Glu Ala Gly Ser Met Ala Ser Phe Ile AlaLeu His Glu Gly Ile Asn Glu Ala Gly Ser Met Ala Ser Phe Ile Ala
595 600 605 595 600 605
Ala Gly Thr Ser Tyr Ala Thr His Gly Lys Ala Met Ile Pro Leu TyrAla Gly Thr Ser Tyr Ala Thr His Gly Lys Ala Met Ile Pro Leu Tyr
610 615 620 610 615 620
Ile Phe Tyr Ser Met Phe Gly Phe Gln Arg Thr Gly Asp Ser Ile TrpIle Phe Tyr Ser Met Phe Gly Phe Gln Arg Thr Gly Asp Ser Ile Trp
625 630 635 640 625 630 635 640
Ala Ala Ala Asp Gln Met Ala Arg Gly Phe Leu Leu Gly Ala Thr AlaAla Ala Ala Asp Gln Met Ala Arg Gly Phe Leu Leu Gly Ala Thr Ala
645 650 655 645 650 655
Gly Arg Thr Thr Leu Thr Gly Glu Gly Leu Gln His Met Asp Gly HisGly Arg Thr Thr Leu Thr Gly Glu Gly Leu Gln His Met Asp Gly His
660 665 670 660 665 670
Ser Pro Val Leu Ala Ser Thr Asn Glu Gly Val Glu Thr Tyr Asp ProSer Pro Val Leu Ala Ser Thr Asn Glu Gly Val Glu Thr Tyr Asp Pro
675 680 685 675 680 685
Ser Phe Ala Tyr Glu Ile Ala His Leu Val His Arg Gly Ile Asp ArgSer Phe Ala Tyr Glu Ile Ala His Leu Val His Arg Gly Ile Asp Arg
690 695 700 690 695 700
Met Tyr Gly Pro Gly Lys Gly Glu Asp Val Ile Tyr Tyr Ile Thr IleMet Tyr Gly Pro Gly Lys Gly Glu Asp Val Ile Tyr Tyr Ile Thr Ile
705 710 715 720 705 710 715 720
Tyr Asn Glu Pro Thr Pro Gln Pro Ala Glu Pro Glu Gly Leu Asp ValTyr Asn Glu Pro Thr Pro Gln Pro Ala Glu Pro Glu Gly Leu Asp Val
725 730 735 725 730 735
Glu Gly Leu His Lys Gly Ile Tyr Leu Tyr Ser Arg Gly Glu Gly ThrGlu Gly Leu His Lys Gly Ile Tyr Leu Tyr Ser Arg Gly Glu Gly Thr
740 745 750 740 745 750
Gly His Glu Ala Asn Ile Leu Ala Ser Gly Val Gly Met Gln Trp AlaGly His Glu Ala Asn Ile Leu Ala Ser Gly Val Gly Met Gln Trp Ala
755 760 765 755 760 765
Leu Lys Ala Ala Ser Ile Leu Glu Ala Asp Tyr Gly Val Arg Ala AsnLeu Lys Ala Ala Ser Ile Leu Glu Ala Asp Tyr Gly Val Arg Ala Asn
770 775 780 770 775 780
Ile Tyr Ser Ala Thr Ser Trp Val Asn Leu Ala Arg Asp Gly Ala AlaIle Tyr Ser Ala Thr Ser Trp Val Asn Leu Ala Arg Asp Gly Ala Ala
785 790 795 800 785 790 795 800
Arg Asn Lys Ala Gln Leu Arg Asn Pro Gly Ala Asp Ala Gly Glu AlaArg Asn Lys Ala Gln Leu Arg Asn Pro Gly Ala Asp Ala Gly Glu Ala
805 810 815 805 810 815
Phe Val Thr Thr Gln Leu Lys Gln Thr Ser Gly Pro Tyr Val Ala ValPhe Val Thr Thr Gln Leu Lys Gln Thr Ser Gly Pro Tyr Val Ala Val
820 825 830 820 825 830
Ser Asp Phe Ser Thr Asp Leu Pro Asn Gln Ile Arg Glu Trp Val ProSer Asp Phe Ser Thr Asp Leu Pro Asn Gln Ile Arg Glu Trp Val Pro
835 840 845 835 840 845
Gly Asp Tyr Thr Val Leu Gly Ala Asp Gly Phe Gly Phe Ser Asp ThrGly Asp Tyr Thr Val Leu Gly Ala Asp Gly Phe Gly Phe Ser Asp Thr
850 855 860 850 855 860
Arg Pro Ala Ala Arg Arg Phe Phe Asn Ile Asp Ala Glu Ser Ile ValArg Pro Ala Ala Arg Arg Phe Phe Asn Ile Asp Ala Glu Ser Ile Val
865 870 875 880 865 870 875 880
Val Ala Val Leu Asn Ser Leu Ala Arg Glu Gly Lys Ile Asp Val SerVal Ala Val Leu Asn Ser Leu Ala Arg Glu Gly Lys Ile Asp Val Ser
885 890 895 885 890 895
Val Ala Ala Gln Ala Ala Glu Lys Phe Lys Leu Asp Asp Pro Thr SerVal Ala Ala Gln Ala Ala Glu Lys Phe Lys Leu Asp Asp Pro Thr Ser
900 905 910 900 905 910
Val Ser Val Asp Pro Asn Ala Pro Glu GluVal Ser Val Asp Pro Asn Ala Pro Glu Glu
915 920 915 920
<210> 8<210> 8
<211> 437<211> 437
<212> PRT<212>PRT
<213> Unknown<213>Unknown
<220><220>
<223> Вариант цитратсинтазы Corynebacterium sp<223> Citrate synthase variant Corynebacterium sp
<400> 8<400> 8
Met Phe Glu Arg Asp Ile Val Ala Thr Asp Asn Asn Lys Ala Val LeuMet Phe Glu Arg Asp Ile Val Ala Thr Asp Asn Asn Lys Ala Val Leu
1 5 10 15 1 5 10 15
His Tyr Pro Gly Gly Glu Phe Glu Met Asp Ile Ile Glu Ala Ser GluHis Tyr Pro Gly Gly Glu Phe Glu Met Asp Ile Ile Glu Ala Ser Glu
20 25 30 20 25 30
Gly Asn Asn Gly Val Val Leu Gly Lys Met Leu Ser Glu Thr Gly LeuGly Asn Asn Gly Val Val Leu Gly Lys Met Leu Ser Glu Thr Gly Leu
35 40 45 35 40 45
Ile Thr Phe Asp Pro Gly Tyr Val Ser Thr Gly Ser Thr Glu Ser LysIle Thr Phe Asp Pro Gly Tyr Val Ser Thr Gly Ser Thr Glu Ser Lys
50 55 60 50 55 60
Ile Thr Tyr Ile Asp Gly Asp Ala Gly Ile Leu Arg Tyr Arg Gly TyrIle Thr Tyr Ile Asp Gly Asp Ala Gly Ile Leu Arg Tyr Arg Gly Tyr
65 70 75 80 65 70 75 80
Asp Ile Ala Asp Leu Ala Glu Asn Ala Thr Phe Asn Glu Val Ser TyrAsp Ile Ala Asp Leu Ala Glu Asn Ala Thr Phe Asn Glu Val Ser Tyr
85 90 95 85 90 95
Leu Leu Ile Asn Gly Glu Leu Pro Thr Pro Asp Glu Leu His Lys PheLeu Leu Ile Asn Gly Glu Leu Pro Thr Pro Asp Glu Leu His Lys Phe
100 105 110 100 105 110
Asn Asp Glu Ile Arg His His Thr Leu Leu Asp Glu Asp Phe Lys SerAsn Asp Glu Ile Arg His His Thr Leu Leu Asp Glu Asp Phe Lys Ser
115 120 125 115 120 125
Gln Phe Asn Val Phe Pro Arg Asp Ala His Pro Met Ala Thr Leu AlaGln Phe Asn Val Phe Pro Arg Asp Ala His Pro Met Ala Thr Leu Ala
130 135 140 130 135 140
Ser Ser Val Asn Ile Leu Ser Thr Tyr Tyr Gln Asp Gln Leu Asn ProSer Ser Val Asn Ile Leu Ser Thr Tyr Tyr Gln Asp Gln Leu Asn Pro
145 150 155 160 145 150 155 160
Leu Asp Glu Ala Gln Leu Asp Lys Ala Thr Val Arg Leu Met Ala LysLeu Asp Glu Ala Gln Leu Asp Lys Ala Thr Val Arg Leu Met Ala Lys
165 170 175 165 170 175
Val Pro Met Leu Ala Ala Tyr Ala His Arg Ala Arg Lys Gly Ala ProVal Pro Met Leu Ala Ala Tyr Ala His Arg Ala Arg Lys Gly Ala Pro
180 185 190 180 185 190
Tyr Met Tyr Pro Asp Asn Ser Leu Asn Ala Arg Glu Asn Phe Leu ArgTyr Met Tyr Pro Asp Asn Ser Leu Asn Ala Arg Glu Asn Phe Leu Arg
195 200 205 195 200 205
Met Met Phe Gly Tyr Pro Thr Glu Pro Tyr Glu Ile Asp Pro Ile MetMet Met Phe Gly Tyr Pro Thr Glu Pro Tyr Glu Ile Asp Pro Ile Met
210 215 220 210 215 220
Val Lys Ala Leu Asp Lys Leu Leu Ile Leu His Ala Asp His Glu GlnVal Lys Ala Leu Asp Lys Leu Leu Ile Leu His Ala Asp His Glu Gln
225 230 235 240 225 230 235 240
Asn Cys Ser Thr Ser Thr Val Arg Met Ile Gly Ser Ala Gln Ala AsnAsn Cys Ser Thr Ser Thr Val Arg Met Ile Gly Ser Ala Gln Ala Asn
245 250 255 245 250 255
Met Phe Val Ser Ile Ala Gly Gly Ile Asn Ala Leu Ser Gly Pro LeuMet Phe Val Ser Ile Ala Gly Gly Ile Asn Ala Leu Ser Gly Pro Leu
260 265 270 260 265 270
His Gly Gly Ala Asn Gln Ala Val Leu Glu Met Leu Glu Asp Ile LysHis Gly Gly Ala Asn Gln Ala Val Leu Glu Met Leu Glu Asp Ile Lys
275 280 285 275 280 285
Asn Asn His Gly Gly Asp Ala Thr Ala Phe Met Asn Lys Val Lys AsnAsn Asn His Gly Gly Asp Ala Thr Ala Phe Met Asn Lys Val Lys Asn
290 295 300 290 295 300
Lys Glu Asp Gly Val Arg Leu Ile Gly Phe Gly His Arg Val Tyr LysLys Glu Asp Gly Val Arg Leu Ile Gly Phe Gly His Arg Val Tyr Lys
305 310 315 320 305 310 315 320
Asn Tyr Asp Pro Arg Ala Ala Ile Val Lys Glu Thr Ala His Glu IleAsn Tyr Asp Pro Arg Ala Ala Ile Val Lys Glu Thr Ala His Glu Ile
325 330 335 325 330 335
Leu Glu His Leu Gly Gly Asp Asp Leu Leu Asp Leu Ala Ile Lys LeuLeu Glu His Leu Gly Gly Asp Asp Leu Leu Asp Leu Ala Ile Lys Leu
340 345 350 340 345 350
Glu Glu Ile Ala Leu Ala Asp Asp Tyr Phe Ile Ser Arg Lys Leu TyrGlu Glu Ile Ala Leu Ala Asp Asp Tyr Phe Ile Ser Arg Lys Leu Tyr
355 360 365 355 360 365
Pro Asn Val Asp Phe Tyr Thr Gly Leu Ile Tyr Arg Ala Met Gly PhePro Asn Val Asp Phe Tyr Thr Gly Leu Ile Tyr Arg Ala Met Gly Phe
370 375 380 370 375 380
Pro Thr Asp Phe Phe Thr Val Leu Phe Ala Ile Gly Arg Leu Pro GlyPro Thr Asp Phe Phe Thr Val Leu Phe Ala Ile Gly Arg Leu Pro Gly
385 390 395 400 385 390 395 400
Trp Ile Ala His Tyr Arg Glu Gln Leu Gly Ala Ala Asp Asn Lys IleTrp Ile Ala His Tyr Arg Glu Gln Leu Gly Ala Ala Asp Asn Lys Ile
405 410 415 405 410 415
Asn Arg Pro Arg Gln Val Tyr Thr Gly Asn Glu Ser Arg Lys Leu ValAsn Arg Pro Arg Gln Val Tyr Thr Gly Asn Glu Ser Arg Lys Leu Val
420 425 430 420 425 430
Pro Arg Glu Glu ArgPro Arg Glu Glu Arg
435 435
<210> 9<210> 9
<211> 32<211> 32
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 9<400> 9
aatttctaga ggcagaccct attctatgaa gg 32aatttctaga ggcagaccct attctatgaa gg 32
<210> 10<210> 10
<211> 30<211> 30
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 10<400> 10
agtgtttcgg tctttacaga cacgagggac 30agtgtttcgg tctttacaga cacgagggac 30
<210> 11<210> 11
<211> 30<211> 30
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 11<400> 11
gtccctcgtg tctgtaaaga ccgaaacact 30gtccctcgtg tctgtaaaga ccgaaacact 30
<210> 12<210> 12
<211> 32<211> 32
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 12<400> 12
aatttctaga cgtgggagtg tcactcgctt gg 32aatttctaga cgtgggagtg tcactcgctt gg 32
<210> 13<210> 13
<211> 41<211> 41
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 13<400> 13
ttcgagctcg gtacccggtc tagagcactt tcgctcgcac c 41ttcgagctcg gtacccggtc tagagcactt tcgctcgcac c 41
<210> 14<210> 14
<211> 36<211> 36
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 14<400> 14
gatttgaaaa gcgcatcaga aacatcccag cgctac 36gatttgaaaa gcgcatcaga aacatcccag cgctac 36
<210> 15<210> 15
<211> 36<211> 36
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 15<400> 15
gtagcgctgg gatgtttctg atgcgctttt caaatc 36gtagcgctgg gatgtttctg atgcgctttt caaatc 36
<210> 16<210> 16
<211> 41<211> 41
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 16<400> 16
gaaacactat gatcccactt cgttcaaaag tcaccaccgt c 41gaaacactat gatccactt cgttcaaaag tcaccaccgt c 41
<210> 17<210> 17
<211> 41<211> 41
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 17<400> 17
gacggtggtg acttttgaac gaagtgggat catagtgttt c 41gacggtggtg acttttgaac gaagtgggat catagtgttt c 41
<210> 18<210> 18
<211> 41<211> 41
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 18<400> 18
gcatgcctgc aggtcgactc tagagcgtgt gcaacgccgt c 41gcatgcctgc aggtcgactc tagagcgtgt gcaacgccgt c 41
<210> 19<210> 19
<211> 50<211> 50
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 19<400> 19
gctcggtacc cggggatcct ctagaccgct tccttggctg cctgaagatg 50gctcggtacc cggggatcct ctagaccgct tccttggctg cctgaagatg 50
<210> 20<210> 20
<211> 26<211> 26
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 20<400> 20
tgcttggctt cacaagagac aagcct 26tgcttggctt cacaagagac aagcct 26
<210> 21<210> 21
<211> 26<211> 26
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 21<400> 21
aggcttgtct cttgtgaagc caagca 26aggcttgtct cttgtgaagc caagca 26
<210> 22<210> 22
<211> 50<211> 50
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 22<400> 22
gcctgcaggt cgacctagat ctagacctca tcagagataa gaacagcatc 50gcctgcaggt cgacctagat ctagacctca tcagagataa gaacagcatc 50
<210> 23<210> 23
<211> 50<211> 50
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 23<400> 23
gctcggtacc cggggatcct ctagatactc cggtctgctt tatgcaggta 50gctcggtacc cggggatcct ctagatactc cggtctgctt tatgcaggta 50
<210> 24<210> 24
<211> 36<211> 36
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 24<400> 24
aactaaccta gtcgcttaag agacaagcct atctgc 36aactaaccta gtcgcttaag agacaagcct atctgc 36
<210> 25<210> 25
<211> 36<211> 36
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 25<400> 25
gcagataggc ttgtctctta agcgactagg ttagtt 36gcagataggc ttgtctctta agcgactagg ttagtt 36
<210> 26<210> 26
<211> 50<211> 50
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 26<400> 26
gcctgcaggt cgacctagat ctagaaagtg ccacgagcat ttcatcagct 50gcctgcaggt cgacctagat ctagaaagtg ccacgagcat ttcatcagct 50
<210> 27<210> 27
<211> 50<211> 50
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 27<400> 27
gctcggtacc cggggatcct ctagataccg tccaaccggt actttgaacc 50gctcggtacc cggggatcct ctagataccg tccaaccggt actttgaacc 50
<210> 28<210> 28
<211> 20<211> 20
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 28<400> 28
ttgatcggcc acttccacac 20ttgatcggcc acttccacac 20
<210> 29<210> 29
<211> 21<211> 21
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 29<400> 29
ggtgtggaag tggccgatca a 21ggtgtggaag tggccgatca a 21
<210> 30<210> 30
<211> 50<211> 50
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 30<400> 30
gcctgcaggt cgacctagat ctagagatcg tcttcagaaa ggcgaccctc 50gcctgcaggt cgacctagat ctagagatcg tcttcagaaa ggcgaccctc 50
<210> 31<210> 31
<211> 50<211> 50
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 31<400> 31
gctcggtacc cggggatcct ctagaaccgt ggcatcaagg acacctctga 50gctcggtacc cggggatcct ctagaaccgt ggcatcaagg acacctctga 50
<210> 32<210> 32
<211> 22<211> 22
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 32<400> 32
agcttcttca ttgcgtgggt tg 22agcttcttca ttgcgtgggt tg 22
<210> 33<210> 33
<211> 22<211> 22
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 33<400> 33
caacccacgc aatgaagaag ct 22caacccacgc aatgaagaag ct 22
<210> 34<210> 34
<211> 21<211> 21
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 34<400> 34
aagcgtcagt gccttcatct g 21aagcgtcagt gccttcatct g 21
<210> 35<210> 35
<211> 22<211> 22
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 35<400> 35
ccagatgaag gcactgacgc tt 22ccagatgaag gcactgacgc tt 22
<210> 36<210> 36
<211> 50<211> 50
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 36<400> 36
gcctgcaggt cgacctagat ctagaagatg gagtcaccgg tgcgctggaa 50gcctgcaggt cgacctagat ctagaagatg gagtcaccgg tgcgctggaa 50
<210> 37<210> 37
<211> 50<211> 50
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 37<400> 37
gctcggtacc cggggatcct ctagaacctt tccctggaat tttttccttt 50gctcggtacc cggggatcct ctagaacctt tccctggaat tttttccttt 50
<210> 38<210> 38
<211> 38<211> 38
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 38<400> 38
tgtcccttga ggtgatttcc acacctcctg ttggaatg 38tgtcccttga ggtgatttcc acacctcctg ttggaatg 38
<210> 39<210> 39
<211> 37<211> 37
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 39<400> 39
tccaacagga ggtgtggaaa tcacctcaag ggacaga 37tccaacagga ggtgtggaaa tcacctcaag ggacaga 37
<210> 40<210> 40
<211> 50<211> 50
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 40<400> 40
gcctgcaggt cgacctagat ctagatgctg cgcggcaagc gccgtggatt 50gcctgcaggt cgacctagat ctagatgctg cgcggcaagc gccgtggatt 50
<210> 41<210> 41
<211> 50<211> 50
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 41<400> 41
gctcggtacc cggggatcct ctagaaccct gaagctgtca gttcctagca 50gctcggtacc cggggatcct ctagaaccct gaagctgtca gttcctagca 50
<210> 42<210> 42
<211> 21<211> 21
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 42<400> 42
ccctttcaaa cacatttgtt c 21ccctttcaaa cacatttgtt from 21
<210> 43<210> 43
<211> 22<211> 22
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 43<400> 43
cgaacaaatg tgtttgaaag gg 22cgaacaaatg tgtttgaaag gg 22
<210> 44<210> 44
<211> 50<211> 50
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 44<400> 44
gcctgcaggt cgacctagat ctagatgcgc ggtgtgcgta cgcagccagc 50gcctgcaggt cgacctagat ctagatgcgc ggtgtgcgta cgcagccagc 50
<210> 45<210> 45
<211> 50<211> 50
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 45<400> 45
gctcggtacc cggggatcct ctagatatgt gagcactggc tctaccgagt 50gctcggtacc cggggatcct ctagatatgt gagcactggc tctaccgagt 50
<210> 46<210> 46
<211> 22<211> 22
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 46<400> 46
aggtggagca ggtctgctcg tg 22aggtggagca ggtctgctcg tg 22
<210> 47<210> 47
<211> 22<211> 22
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 47<400> 47
cacgagcaga cctgctccac ct 22cacgagcaga cctgctccac ct 22
<210> 48<210> 48
<211> 23<211> 23
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 48<400> 48
tgtccgaagc cgatgaggcg gac 23tgtccgaagc cgatgaggcg gac 23
<210> 49<210> 49
<211> 24<211> 24
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 49<400> 49
cgtccgcctc atcggcttcg gaca 24cgtccgcctc atcggcttcg gaca 24
<210> 50<210> 50
<211> 50<211> 50
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 50<400> 50
gcctgcaggt cgacctagat ctagagtcag agattacgag atcttccggt 50gcctgcaggt cgacctagat ctagagtcag agattacgag atcttccggt 50
30thirty
<---<---
Claims (18)
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
KR10-2020-0111084 | 2020-09-01 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2822660C1 true RU2822660C1 (en) | 2024-07-11 |
Family
ID=
Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20170051323A1 (en) * | 2014-04-30 | 2017-02-23 | Evonik Degussa Gmbh | Method for Producing L-Amino Acids Using an Alkaliphilic Bacteria |
US9879289B2 (en) * | 2009-06-05 | 2018-01-30 | Evonik Degussa Gmbh | Method for the preparation of 2-keto carboxylic acid |
RU2683208C1 (en) * | 2015-03-18 | 2019-03-26 | СиДжей ЧеилДжеданг Корпорейшн | Pyruvate dehydrogenase mutant, mutant-containing microorganism, and method for producing l-amino acid using microorganism |
EP3561055A1 (en) * | 2018-02-13 | 2019-10-30 | CJ Cheiljedang Corporation | Modified polypeptide with attenuated activity of citrate synthase and method for producing l-amino acids using same |
Patent Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US9879289B2 (en) * | 2009-06-05 | 2018-01-30 | Evonik Degussa Gmbh | Method for the preparation of 2-keto carboxylic acid |
US20170051323A1 (en) * | 2014-04-30 | 2017-02-23 | Evonik Degussa Gmbh | Method for Producing L-Amino Acids Using an Alkaliphilic Bacteria |
RU2683208C1 (en) * | 2015-03-18 | 2019-03-26 | СиДжей ЧеилДжеданг Корпорейшн | Pyruvate dehydrogenase mutant, mutant-containing microorganism, and method for producing l-amino acid using microorganism |
EP3561055A1 (en) * | 2018-02-13 | 2019-10-30 | CJ Cheiljedang Corporation | Modified polypeptide with attenuated activity of citrate synthase and method for producing l-amino acids using same |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
AU2019221267B2 (en) | Modified polypeptide with attenuated activity of citrate synthase and method for producing L-amino acids using same | |
US20240026397A1 (en) | Microorganism producing l-valine and method for producing l-valine using the same | |
AU2022211934A1 (en) | Prephenate dehydratase variant and method for producing branched-chain amino acid using same | |
RU2822660C1 (en) | Microorganisms producing l-valine, and method of producing l-valine using same | |
KR102147381B1 (en) | Novel acetohydroxy acid synthase variant and microorganism comprising thereof | |
EP4321622A1 (en) | L-arginine-producing corynebacterium sp. microorganism and l-arginine production method using same | |
AU2022235362A1 (en) | Microorganism Of The Genus Corynebacterium For Producing L-Amino Acid And Method For Producing L-Amino Acid Using The Same | |
RU2819442C1 (en) | Microorganism having enhanced ability to produce l-amino acid with branched chain, and method of producing l-amino acid with branched chain using same | |
RU2817768C2 (en) | Microorganism having enhanced ability to produce l-amino acid with branched chain, and method of producing l-amino acid with branched chain using same | |
RU2826168C1 (en) | New version of gamma-aminobutyrate permease and method of producing isoleucine using same | |
RU2819925C1 (en) | Novel version of bifunctional transcriptional regulator of pyr/uracil phosphoribosyltransferase operon and method for producing imp | |
RU2817900C1 (en) | Novel version of adenine phosphoribosyltransferase and method of producing imp | |
RU2791193C1 (en) | New ferrochelatase variant and a method to produce l-tryptophan using the ferrochelatase | |
RU2827315C1 (en) | Variant of prephenate dehydratase and method of producing branched-chain amino acids using same | |
RU2795162C1 (en) | New option of the transcription regulator whca of the whib family and a method for producing l-valine using it | |
RU2794484C1 (en) | New option of dahp synthases and a method for obtaining l-lysine with its use | |
RU2792638C1 (en) | New variant of branch-chain amino acid permease and method for producing l-valine with its use | |
RU2787791C1 (en) | NEW VARIANT OF CYTOSINE PERMEASE AND A METHOD FOR PRODUCING l-TRYPTOPHAN WITH ITS USE | |
RU2793435C1 (en) | New variant of the membrane protein terc and a method for obtaining l-lysine using it | |
RU2792640C1 (en) | New variant of glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase and method for obtaining l-valine with its use | |
RU2790512C1 (en) | New variant of isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase and method for producing l-tryptophan using the same | |
RU2793185C1 (en) | New version of hydrolase and a method for obtaining l-tryptophan | |
RU2790562C1 (en) | New ppta tautomerase variant and a method to produce l-tryptophan using the ppta tautomerase | |
RU2790565C1 (en) | A new variant of copper-exporting p-type atphase a and a method to produce l-tryptophan using the copper-exporting p-type atphase a | |
RU2805253C1 (en) | New modified polypeptide with reduced citrate synthase activity and method for producing l-amino acid using it |