RU2766333C1 - New n4-modified 5-methyl-2'-deoxycytidines exhibiting antimicotic activity - Google Patents
New n4-modified 5-methyl-2'-deoxycytidines exhibiting antimicotic activity Download PDFInfo
- Publication number
- RU2766333C1 RU2766333C1 RU2021107757A RU2021107757A RU2766333C1 RU 2766333 C1 RU2766333 C1 RU 2766333C1 RU 2021107757 A RU2021107757 A RU 2021107757A RU 2021107757 A RU2021107757 A RU 2021107757A RU 2766333 C1 RU2766333 C1 RU 2766333C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- methyl
- mmol
- evaporated
- dideoxycytidine
- ddd
- Prior art date
Links
- 0 CC(OC[C@@](C(C1)OC(C)=O)O[C@]1N(C=C(C)C(N*)=N1)C1=O)=O Chemical compound CC(OC[C@@](C(C1)OC(C)=O)O[C@]1N(C=C(C)C(N*)=N1)C1=O)=O 0.000 description 2
- XRFIKURHWPMIMP-COBSHVIPSA-N CC(C(N1)=O)=CN(C(O[C@@H]2CO)=CC2O)C1=O Chemical compound CC(C(N1)=O)=CN(C(O[C@@H]2CO)=CC2O)C1=O XRFIKURHWPMIMP-COBSHVIPSA-N 0.000 description 1
- RGVBNBFNSBMXID-PQDIPPBSSA-N CC(OC[C@H](C(C1)OC(C)=O)O[C@H]1N(C=C(C)C(N1)=O)C1=O)=O Chemical compound CC(OC[C@H](C(C1)OC(C)=O)O[C@H]1N(C=C(C)C(N1)=O)C1=O)=O RGVBNBFNSBMXID-PQDIPPBSSA-N 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B44—DECORATIVE ARTS
- B44D—PAINTING OR ARTISTIC DRAWING, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; PRESERVING PAINTINGS; SURFACE TREATMENT TO OBTAIN SPECIAL ARTISTIC SURFACE EFFECTS OR FINISHES
- B44D7/00—Preserving paintings, e.g. by varnishing
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H19/00—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
- C07H19/02—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
- C07H19/04—Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
- C07H19/06—Pyrimidine radicals
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
Abstract
Description
Область техники, к которой относится изобретениеThe field of technology to which the invention belongs
Изобретение относится к молекулярной биологии и микробиологии, а именно к применению новых производных N4-производных 5-метил-2'-дезоксицитидина для подавления роста мицелиальных грибов.The invention relates to molecular biology and microbiology, and in particular to the use of new derivatives of N 4 -derivatives of 5-methyl-2'-deoxycytidine to suppress the growth of filamentous fungi.
Уровень техникиState of the art
Сообщества микроорганизмов играют одну из ключевых ролей в биоповреждении объектов культурного наследия вследствие своей способности ферментативного разложения кожи, масла, казеина, клея, камней и других материалов, используемых в произведениях исторического искусстве [Sterflinger K. Fungi: Their role in deterioration of cultural heritage. Fungal Biol Rev. 2010, 24, 47-55. doi:10.1016/J.FBR.2010.03.003]. Грибы из разных систематических групп могут повредить многие предметы искусства: от масляной живописи на холсте, темперной живописи, пергамента, каменных памятников до экспонатов целых музеев, библиотек, монастырей, наскальных рисунков, фресок в гротах и т.д. [López-Miras М. del М., Martin-Sánchez I., Yebra-Rodriguez Á., Romero-Noguera J., Bolivar-Galiano F., Ettenauer J., et al. PLoS One. 2013, 8, e80198 doi:10.1371/journal.pone.0080198; 52. Sterflinger K., Pinzari F. Environ Microbiol. 2012, 14, 559-566. doi:10.1111/j. 1462-2920.2011.02584.x; Garg K.L., Jain K.K., Mishra A.K. Sci Total Environ. 1995, 167, 255-271. doi:10.1016/0048-9697(95)04587-Q; Li Q., Zhang В., He Z., Yang X. PLoS One. 2016, 11, e0163287. doi:10.1371/journal.pone.0163287; Gorbushina A.A., Heyrman J., Dornieden Т., Gonzalez-Delvalle M., Krumbein W.E., Laiz L. Int Biodeterior Biodegrad. 2004, doi:10.1016/j.ibiod.2003.07.003]. Традиционные антисептики, используемые для противогрибкового лечения при реставрации и консервации темперных картин, используются с рядом ограничений; только небольшое количество антимикозных агентов было проверено на предмет их совместимости с историческими материалами, кроме того было проведено незначительное количество исследований на предмет долгосрочных эффектов биоцидов, таких как возможные изменения цвета или возникновения продуктов разложения [Zhgun, А.А.; Avdanina, D.A.; Shagdarova, В.Т.; Troyan, E. V.; Nuraeva, G.K.; Potapov, M.P.; Il'ina, Shitov, M.V.; Varlamov, V.P. Search for Efficient Chitosan-Based Fungicides to Protect the 15th-16th Centuries Tempera Painting in Exhibits from the State Tretyakov Gallery. Microbiology 2020, 89, 750-755, doi:10.1134/S0026261720060193]. Известно, что микроорганизмы способны к эффективному росту на самых разнообразных субстратах, применяемых в темперной живописи (темперы, пластификаторы, лаки, клеи), причем наилучшей средой для грибного роста явились варианты самих темперных красок [Zhgun АА, Avdanina DA, Simonenko NP, Volkov IA, Ivanov VV. Detection of biodeterioration on materials used in tempera painting. Znan misel J. 2018; 1: 7-15; Zhgun A. et al. PLoS ONE 2020, 15(4):e0230591]. В результате, биодеструкция является важнейшим фактором повреждения объектов культурного наследия. Неудивительно, что для ее предупреждения уже разработано значительное разнообразие соединений, обладающих фунгицидными свойствами. Однако большинство из них обладает теми или иными недостатками.Communities of microorganisms play one of the key roles in the biodamage of cultural heritage objects due to their ability to enzymatically decompose leather, oil, casein, glue, stones and other materials used in works of historical art [Sterflinger K. Fungi: Their role in degradation of cultural heritage. Fungal Biol Rev. 2010, 24, 47-55. doi:10.1016/J.FBR.2010.03.003]. Mushrooms from different systematic groups can damage many art objects: from oil painting on canvas, tempera painting, parchment, stone monuments to exhibits of entire museums, libraries, monasteries, rock paintings, frescoes in grottoes, etc. [López-Miras M. del M., Martin-Sánchez I., Yebra-Rodriguez A., Romero-Noguera J., Bolivar-Galiano F., Ettenauer J., et al. PLOS One. 2013, 8, e80198 doi:10.1371/journal.pone.0080198; 52. Sterflinger K., Pinzari F. Environ Microbiol. 2012, 14, 559-566. doi:10.1111/j. 1462-2920.2011.02584.x; Garg KL, Jain KK, Mishra AK Sci Total Environ. 1995, 167, 255-271. doi:10.1016/0048-9697(95)04587-Q; Li Q., Zhang B., He Z., Yang X. PLoS One. 2016, 11, e0163287. doi:10.1371/journal.pone.0163287; Gorbushina AA, Heyrman J., Dornieden T., Gonzalez-Delvalle M., Krumbein WE, Laiz L. Int Biodeterior Biodegrad. 2004, doi:10.1016/j.ibiod.2003.07.003]. Traditional antiseptics used for antifungal treatment in the restoration and conservation of tempera paintings are used with a number of limitations; only a small number of antimycotic agents have been tested for their compatibility with historical materials, and a small number of studies have been conducted on the long-term effects of biocides, such as possible color changes or the formation of degradation products [Zhgun, A.A.; Avdanina, D.A.; Shagdarova, V.T.; Troyan, E.V.; Nuraeva, GK; Potapov, MP; Il'ina, Shitov, M.V.; Varlamov, VP Search for Efficient Chitosan-Based Fungicides to Protect the 15 th -16 th Centuries Tempera Painting in Exhibits from the State Tretyakov Gallery. Microbiology 2020, 89, 750-755, doi:10.1134/S0026261720060193]. It is known that microorganisms are able to grow effectively on a wide variety of substrates used in tempera painting (temperas, plasticizers, varnishes, adhesives), and the best medium for fungal growth was the variants of the tempera paints themselves [Zhgun AA, Avdanina DA, Simonenko NP, Volkov IA , Ivanov VV. Detection of biodeterioration on materials used in tempera painting. Znan misel J. 2018; 1:7-15; Zhgun A. et al. PLoS ONE 2020, 15(4):e0230591]. As a result, biodegradation is the most important factor in damage to cultural heritage sites. Not surprisingly, a significant variety of compounds with fungicidal properties have already been developed to prevent it. However, most of them have some disadvantages.
Многие фунгициды, используемые сегодня для защиты объектов культурного наследия, представляют собой металлорганические соединения. Например, немецкие исследователи показали, что по активности и длительности действия фенилртутный ацетат превосходит другие соединения, предлагавшиеся для обработки настенной живописи: пентахлорфенол (ПХФ), производные бензимидазола, оловоорганические соединения [Hirte W.F., Glathe I., Thürmer L. Untersuchungen zum Schuts von Gemälden vor Befall mit Pilzen. Zbl. Mikrobiol., 1987, Bl. 142, N5. S. 377]. Недостатком фенилацетата ртути является высокая токсичность и коррозионная активность по отношению к цветным металлам. Еще одним примером металлорганических фунгицидов является ТБТО (трибутилолово оксид), который применяется вместе с биоцидами из класса органических соединений, в частности, вместе с четвертичными аммониевыми соединениями (ЧАС). ТБТО и ЧАС в 70%-ном изопропиловом спирте были применены для обработки потолочных росписей в Швейцарии в церкви эпохи барокко [Raschle P. Experience of combating moulds during restoration of ceiling paintings in a Swiss baroque monastery church. Biodeterioration 5: ed., T.A. Oxley, S. Barry (International Biodeterioration Symposium 1981, 5th Aberdeen) 1983, Chichester N.Y., p.433]. Однако использование данной комбинации является временной защитой: пока не будут созданы микроклиматические условия, исключающие возможность биоповреждения живописи. Недостатком ТБТО и других оловоорганических соединений является их высокая токсичность. Этот недостаток в принципе свойственен большинству металлорганических фунгицидов.Many fungicides used today to protect cultural heritage sites are organometallic compounds. For example, German researchers have shown that in terms of activity and duration of action, phenylmercuric acetate is superior to other compounds proposed for processing wall paintings: pentachlorophenol (PCP), benzimidazole derivatives, organotin compounds [Hirte WF, Glathe I., Thürmer L. Untersuchungen zum Schuts von Gemälden vor Befall mit Pilzen. Zbl. Microbiol., 1987, Bl. 142, N5. S. 377]. The disadvantage of mercury phenylacetate is its high toxicity and corrosivity towards non-ferrous metals. Another example of organometallic fungicides is TBTO (tributyltin oxide), which is used together with biocides from the class of organic compounds, in particular, together with quaternary ammonium compounds (QAC). TBTO and HOUR in 70% isopropyl alcohol were used to process ceiling paintings in Switzerland in a baroque church [Raschle P. Experience of combating molds during restoration of ceiling paintings in a Swiss baroque monastery church. Biodeterioration 5: ed., T.A. Oxley, S. Barry (International Biodeterioration Symposium 1981, 5th Aberdeen) 1983, Chichester N.Y., p.433]. However, the use of this combination is a temporary protection: until microclimatic conditions are created that exclude the possibility of biodamage to the painting. The disadvantage of TBTO and other organotin compounds is their high toxicity. This drawback is inherent in principle to most organometallic fungicides.
В России среди реставраторов, работающих с настенной живописью, относящихся к памятникам искусства, получили распространение биоциды на основе полигексаметиленгуанидина (полигексаметиленгуанидин хлорид-метацид, полисепт или полигексаметиленгуанидин фосфат-фогуцид). Недостатком этих соединений является хорошая растворимость в воде. В условиях конденсации влаги или протечек они не могут обеспечить длительность антимикробного действия.In Russia, biocides based on polyhexamethylene guanidine (polyhexamethylene guanidine chloride-methacid, polysept or polyhexamethylene guanidine phosphate-fogucid) have become widespread among restorers working with wall paintings belonging to art monuments. The disadvantage of these compounds is their good solubility in water. In conditions of moisture condensation or leaks, they cannot provide a long antimicrobial effect.
В патенте US 5882731 В (B05D 3/00, A01N 25/02, A01N 29/00, A01N 31/02) представлено изобретение по защите внешних и внутренних поверхностей от поражения микроскопическими грибами, плесенью. Изобретение представляет собой пленочные композиции, в состав которых в различных концентрациях входят наполнители из воска, аминов жирного ряда, аминосиликонов, ПАВ и водного растворителя и действующее вещество - фунгицид. В качестве фунгицида могут выступать следующие вещества: 2-(тиоцианометилтио)бензотиазол; 3-иод-2-пропинил-бутилкарбамат; 2,4,5,6-тетрахлоризофталонитрил; 2-(4-тиазолил)бензимидазол; 2-N-октил-4-изотиазолинон-3; n-толилдииодметилсульфон, а также смесь этих веществ в различных пропорциях. Поверхности рекомендуется обрабатывать этим составом превентивно путем нанесения тонкой пленки. Предложенные в патенте химические вещества являются эффективными, однако их недостатком является их высокая токсичность.In US patent 5882731 B (B05D 3/00, A01N 25/02, A01N 29/00, A01N 31/02) an invention is presented for protecting external and internal surfaces from damage by microscopic fungi, mold. The invention is a film composition, which in various concentrations includes fillers from wax, fatty amines, amino silicones, surfactants and an aqueous solvent, and the active substance is a fungicide. The following substances can act as a fungicide: 2-(thiocyanomethylthio)benzothiazole; 3-iodine-2-propynyl-butylcarbamate; 2,4,5,6-tetrachloroisophthalonitrile; 2-(4-thiazolyl)benzimidazole; 2-N-octyl-4-isothiazolinone-3; n-tolyldiiodomethylsulfone, as well as a mixture of these substances in various proportions. Surfaces are recommended to be treated with this composition preventively by applying a thin film. The chemicals proposed in the patent are effective, but their disadvantage is their high toxicity.
В изобретении SU 992241 А1 (МПК B44D 7/00, C07D 263/56) для защиты произведений изобразительного искусства предложено использовать антисептический препарат 1-(2-бензоксазолил)-3,3,3-трифторацетон в водно-спиртовом или водно-ацетоновом растворе в рыбьем клею. Обработка темперных красок 1%-ным водно-ацетоновым раствором или масляных красок 1%-ным водно-спиртовым раствором защищает красочное покрытие от растрескивания, отслаивания и изменения окраски даже после 30-ти дневного нахождения обработанных макетов окрасок на солнечном свете при комнатной температуре, т.е. препарат является нейтральным по отношению к материалам изобразительного искусства. В изобретении отмечается, что предлагаемое соединение обладает гораздо большей бактерицидной активностью в сравнении с имеющимися традиционными антисептиками, такими как катамин АБ, катапин и пентахлорфенолят натрия [Воронина Л.И. Дезинфекция станковой масляной и темперной живописи четвертичными солями аммония. Сборник. Реставрация, исследование, хранение произведений станковой живописи. Вып. 1, М., 1979 г.]. Однако предлагаемый препарат тестировался исключительно против бактерий рода Bacillus, выделенных из защищенного стандартным антисептиком рыбьего клея, применяемого в реставрационной практике. Тестирование 1-(2-бензоксазолил)-3,3,3-трифторацетона не проводилось на широком спектре прокариотических культур и, тем более, не тестировался на плесневых мицелиальных грибах, создающих микробном того или иного музея.In the invention SU 992241 A1 (IPC B44D 7/00, C07D 263/56), it is proposed to use the antiseptic drug 1-(2-benzoxazolyl)-3,3,3-trifluoroacetone in an aqueous-alcoholic or aqueous-acetone solution to protect works of fine art in fish glue. Treatment of tempera paints with 1% water-acetone solution or oil paints with 1% water-alcohol solution protects the paint coating from cracking, peeling and discoloration even after 30 days of exposure to sunlight at room temperature, t .e. the drug is neutral with respect to fine art materials. The invention notes that the proposed compound has a much greater bactericidal activity in comparison with the available traditional antiseptics, such as catamine AB, catapine and sodium pentachlorophenolate [Voronina L.I. Disinfection of easel oil and tempera painting with quaternary ammonium salts. Collection. Restoration, research, storage of easel paintings. Issue. 1, M., 1979]. However, the proposed drug was tested exclusively against bacteria of the genus Bacillus isolated from fish glue protected by a standard antiseptic used in restoration practice. Testing of 1-(2-benzoxazolyl)-3,3,3-trifluoroacetone has not been carried out on a wide range of prokaryotic cultures and, moreover, has not been tested on mold filamentous fungi that create the microbe of a particular museum.
Среди перспективных классов биологически активных соединений стоит обратить внимание на нуклеозиды и их производные. Антимикозная активность нуклеозидов в отношении объектов культурного наследия до недавнего времени не изучалась. В последнее время появились сообщения о нескольких группах модифицированных нуклеозидов, продемонстрировавших заметную антимикозную активность в отношении возбудителей грибковых инфекций у человека [Serpi М, Ferrari V, Pertusati F. Nucleoside Derived Antibiotics to Fight Microbial Drug Resistance: New Utilities for an Established Class of Drugs? J Med Chem. 2016;59: 10343-10382; Niu G, Zheng J, Tan H. Biosynthesis and combinatorial biosynthesis of antifungal nucleoside antibiotics. Sci China Life Sci. 2017; 60: 939-947]. Антимикозная активность нуклеозидов, в особенности N4-модифицированных нуклеозидов, приводящая к ингибированию роста грибов-биодеструкторов объектов культурного наследия, до настоящего времени не была выявлена.Among the promising classes of biologically active compounds, attention should be paid to nucleosides and their derivatives. The antimycotic activity of nucleosides in relation to objects of cultural heritage has not been studied until recently. Recently, there have been reports of several groups of modified nucleosides that have demonstrated significant antimycotic activity against pathogens of fungal infections in humans [Serpi M, Ferrari V, Pertusati F. Nucleoside Derived Antibiotics to Fight Microbial Drug Resistance: New Utilities for an Established Class of Drugs? J Med Chem. 2016;59: 10343-10382; Niu G, Zheng J, Tan H. Biosynthesis and combinatorial biosynthesis of antifungal nucleoside antibiotics. Sci China Life Sci. 2017; 60: 939-947]. The antimycotic activity of nucleosides, especially N 4 -modified nucleosides, leading to inhibition of the growth of fungi biodestructors of cultural heritage objects, has not yet been identified.
Раскрытие сущности изобретенияDisclosure of the essence of the invention
Целью данного изобретения является получение новых N4-модифицированных 5-метил-2'-дезоксицитидинов, содержащих в своем составе протяженный (с длиной углеродной цепи С10-С12) алкильный заместитель, подавляющих рост мицелиальных грибов. Введение протяженных алкильных заместителей в молекулу нуклеозида приводит к увеличению гидрофобности, и, как следствие, снижает водорастворимость целевых соединений.The purpose of this invention is to obtain new N 4 -modified 5-methyl-2'-deoxycytidines containing in its composition an extended (with a carbon chain length of C 10 -C 12 ) alkyl substituent that inhibits the growth of filamentous fungi. The introduction of extended alkyl substituents into the nucleoside molecule leads to an increase in hydrophobicity and, as a consequence, reduces the water solubility of the target compounds.
Для осуществления поставленной цели используют такие методы, как:To achieve this goal, methods such as:
- введение защитных групп (блокирование гидроксильных групп нуклеозида проводят с целью предотвращения нежелательных реакций в ходе синтеза, а также с целью улучшения подвижности промежуточных соединений при хроматографическом разделении, что облегчает их очистку);- the introduction of protective groups (blocking of the hydroxyl groups of the nucleoside is carried out in order to prevent unwanted reactions during the synthesis, as well as to improve the mobility of intermediate compounds during chromatographic separation, which facilitates their purification);
- метод Дивакара и Риса (введение алкильных заместителей по N4-положению нуклеозида);- method of Divakar and Rice (introduction of alkyl substituents at the N 4 position of the nucleoside);
- восстановительное аминирование (восстановление азидогруппы до аминогруппы с одновременной конденсацией с альдегидом;- reductive amination (reduction of the azido group to the amino group with simultaneous condensation with aldehyde;
- деблокирование защитных групп (если это необходимо).- deblocking of protective groups (if necessary).
Следующим пунктом осуществления изобретения является проверка антимикозной активности полученных соединений, для этого тестируемое производное добавляют в твердую питательную среду, на которую затем высевают штаммы мицелиальных грибов, изолированные с экспонатов и поверхностей залов Живописи Древней Руси Третьяковской галереи.The next point in the implementation of the invention is to check the antimycotic activity of the obtained compounds, for this the tested derivative is added to a solid nutrient medium, on which strains of filamentous fungi are then sown, isolated from the exhibits and surfaces of the halls of Ancient Russia Painting of the Tretyakov Gallery.
Далее изобретение будет раскрыто подробнее со ссылками на фигуры и примеры, которые приводятся исключительно с целью иллюстрации и пояснения сущности заявленного изобретения, но которые не предназначены для ограничения объема притязаний.Hereinafter the invention will be described in more detail with reference to the figures and examples, which are provided solely for the purpose of illustrating and explaining the essence of the claimed invention, but which are not intended to limit the scope of the claims.
Краткое описание фигур и таблицBrief description of figures and tables
Фиг. 1. Синтез N4-модифицированных 5-метил-2'-дезоксицитидинов (1-1 - 1-7). Условия проведения реакций: i) уксусный ангидрид, пиридин, +37°С, 20 ч; ii) 1,2,4-триазол, 2-хлорфенилдихлорфосфат, пиридин, +20°С, 20 ч; iii) R-NH2 или RO-NH2, диоксан, +20°С, 20 ч; iv) 25% NH3/H2O, диоксан, +20°С, 20 ч.Fig. 1. Synthesis of N 4 -modified 5-methyl-2'-deoxycytidines (1-1 - 1-7). Reaction conditions: i) acetic anhydride, pyridine, +37°C, 20 h; ii) 1,2,4-triazole, 2-chlorophenyl dichlorophosphate, pyridine, +20°С, 20 h; iii) R-NH 2 or RO-NH 2 , dioxane, +20°C, 20 h; iv) 25% NH 3 /H 2 O, dioxane, +20°C, 20 h.
Фиг. 2. Синтез 3'-замещенных N4-алкил-5-метил-2',3'-дидезоксицитидинов (1-8 - 1-20). Условия проведения реакций: i) TBDMSCl, пиридин, +37°С, 20 ч; ii) 1,2,4-триазол, 2-хлорфенилдихлорфосфат, пиридин, +20°С, 20 ч; iii) R-NH2, диоксан, +20°С, 20 ч; iv) Bu4NF⋅3H2O, диоксан, 20 ч; v) 1: Ph3P, диоксан, +20°С, 20 ч; 2: 25% NH3/H2O, диоксан, +20°С, 20 ч; vi) Ac2O, пиридин, +20°С, 20 ч; vii) 1: СН3СНО, EtOH, 5°С, 2 ч; 2: NaBH4, +20°С, 20 ч; viii) 1: СН3СНО, EtOH, 5°С, 2 ч; 2: NaBH3(CN), +20°С, 20 ч; ix) 1: СН2О, МеОН, +20°С, 2 ч; 2: NaBH3(CN), +20°С, 20 ч.Fig. 2. Synthesis of 3'-substituted N 4 -alkyl-5-methyl-2',3'-dideoxycytidines (1-8 - 1-20). Reaction conditions: i) TBDMSCl, pyridine, +37°С, 20 h; ii) 1,2,4-triazole, 2-chlorophenyl dichlorophosphate, pyridine, +20°С, 20 h; iii) R-NH 2 , dioxane, +20°C, 20 h; iv) Bu 4 NF⋅3H 2 O, dioxane, 20 h; v) 1: Ph 3 P, dioxane, +20°C, 20 h; 2: 25% NH 3 /H 2 O, dioxane, +20°C, 20 h; vi) Ac 2 O, pyridine, +20°C, 20 h; vii) 1: CH 3 CHO, EtOH, 5° C., 2 h; 2: NaBH 4 , +20°С, 20 h; viii) 1: CH 3 CHO, EtOH, 5° C., 2 h; 2: NaBH 3 (CN), +20°С, 20 h; ix) 1: CH 2 O, MeOH, +20°C, 2 h; 2: NaBH 3 (CN), +20°С, 20 h.
Фиг. 3. Синтез 3'-триэтиленгликолевых производных N4-алкил-5-метил-2',3'-дидезоксицитидинов (1-21, 1-22). Условия проведения реакций: i) уксусный ангидрид, пиридин, +37°С, 20 ч; ii) CDI, DMF, +37°С, 48 ч; iii) триэтиленгликоль, диоксан, +37°С, 48 ч; iv) TBDMS-Cl, пиридин, +20°С, 20 ч; v) 1,2,4-триазол, 2-хлорфенилдихлорфосфат, пиридин, +20°С, 20 ч; vi) R-NH2, диоксан, +20°С, 20 ч; vii) Bu4NF⋅3H2O, диоксан, 20 ч.Fig. 3. Synthesis of 3'-triethylene glycol derivatives of N 4 -alkyl-5-methyl-2',3'-dideoxycytidines (1-21, 1-22). Reaction conditions: i) acetic anhydride, pyridine, +37°C, 20 h; ii) CDI, DMF, +37°C, 48 h; iii) triethylene glycol, dioxane, +37°С, 48 h; iv) TBDMS-Cl, pyridine, +20°С, 20 h; v) 1,2,4-triazole, 2-chlorophenyl dichlorophosphate, pyridine, +20°C, 20 h; vi) R-NH 2 , dioxane, +20°C, 20 h; vii) Bu 4 NF⋅3H 2 O, dioxane, 20 h.
Фиг. 4. Рост различных штаммов мицелиальных грибов на агаризованной среде Чапека-Докса с добавлением N4-модифицированных 5-метил-2'-дезоксицитидинов в концентрации 0.7 мМ, а также без добавления (контроль) 30 дней после инокуляции.Fig. Fig. 4. Growth of various strains of filamentous fungi on Czapek-Dox agar medium with the addition of N 4 -modified 5-methyl-2'-deoxycytidines at a concentration of 0.7 mM, and also without addition (control) 30 days after inoculation.
Фиг. 5. Динамика ингибирования роста штаммов мицелиальных грибов, изолированных из залов и с произведений искусств Государственной Третьяковской галереи, соединениями 1-1-1-3, 1-21 и 5FC на среде ЧДА, добавленными в концентрациях 0.5 мМ и 3 мМ. Приведены данные на 6, 12, 24, 30, 42 и 48 дни после инокуляции.Fig. Fig. 5. Dynamics of growth inhibition of strains of filamentous fungi isolated from the halls and works of art of the State Tretyakov Gallery by compounds 1-1-1-3, 1-21, and 5FC on an analytical medium added at concentrations of 0.5 mM and 3 mM. Data are given for 6, 12, 24, 30, 42 and 48 days after inoculation.
Фиг. 6. Степень чувствительности штаммов мицелиальных грибов к N4-модифицированным 5-метил-2'-дезоксицитидинам (1-1 - 1-3, 1-5, 1-6, 1-11 - 1-13, 1-15 - 1-21) в концентрации 0.7 мМ и к 5FC.Fig. 6. The degree of sensitivity of strains of filamentous fungi to N 4 -modified 5-methyl-2'-deoxycytidines (1-1 - 1-3, 1-5, 1-6, 1-11 - 1-13, 1-15 - 1 -21) at a concentration of 0.7 mM and to 5FC.
Таблица 1. N4-модифицированные 5-метил-2'-дезоксирибоцитидины.Table 1. N 4 -modified 5-methyl-2'-deoxyribocytidines.
Осуществление изобретенияImplementation of the invention
Синтез соединений осуществлялся на основе коммерчески доступных тимидина и 3'-азидо-3'-дезокситимидина. Это позволило получить ряд модифицированных 5-метил-2'-дезоксирибоцитидинов, содержащих протяженный алкильный заместитель в N4-Положении. Для некоторого улучшения их крайне низкой растворимости в некоторых случаях была произведена модификация положения 3', а именно замена гидроксила на амино-, моноалкиламино- и диалкиламиногрупп, а также конденсация триэтиленгликоля через карбонатный линкер. Список синтезированных соединений приведен в Таблице 1 (см. в конце описания).Synthesis of compounds was carried out on the basis of commercially available thymidine and 3'-azido-3'-deoxythymidine. This made it possible to obtain a number of modified 5-methyl-2'-deoxyribocytidines containing an extended alkyl substituent in the N 4 position. To somewhat improve their extremely low solubility, in some cases, the 3' position was modified, namely, the replacement of the hydroxyl with amino, monoalkylamino, and dialkylamino groups, as well as the condensation of triethylene glycol through a carbonate linker. The list of synthesized compounds is given in Table 1 (see at the end of the description).
Для получения N4-алкил производных 5-метил-2'-дезоксирибоцитидина использовали тимидин (2), в котором в первую очередь проводили защиту двух гидроксильных групп с помощью ацетильной группы, для чего тимидин обрабатывали уксусным ангидридом. Затем, согласно методу [Divakar, K.J.; Reese, С.В. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 1982, 1, 1171] или его модификации [Lee, B.-Y.; Park, S.R.; Jeon, H.B.; Kim, R.S.; Tetrahedron Lett., 2006, 47, 5105], в полученное соединение 3 в результате последовательных обработок 2-хлорфенилдихлорфосфатом с 1,2,4-триазолом, а затем соответствующим амином или О-алкилгидроксиламином в присутствии N,N-диизопропилэтиламина (Фиг. 1) вводили протяженный н-алкильный заместитель. После деблокирования защитных групп в соединении 4 водно-диоксановым раствором аммиака выделяли целевые соединения (1-1 - 1-7) колоночной хроматографией на силикагеле, элюируя хлороформом или этилацетатом с увеличивающейся концентрацией этанола.To obtain N 4 -alkyl derivatives of 5-methyl-2'-deoxyribocytidine, thymidine (2) was used, in which, first of all, two hydroxyl groups were protected with an acetyl group, for which thymidine was treated with acetic anhydride. Then, according to the method of [Divakar, KJ; Reese, S.V. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 1982, 1, 1171] or its modifications [Lee, B.-Y.; Park, S. R.; Jeon, HB; Kim, RS; Tetrahedron Lett., 2006, 47, 5105], to the resulting
5'-O-TBDMS-3'-азидо-N4-алкил-5-метил-2',3'-дидезоксицитидины (6-8) получали методом, аналогичном для синтеза соединений 1-1-1-7, исходя из азидотимидина 5, а в качестве защитной группой использовали трет-бутилдиметилсилильную группу (Фиг. 2). Деблокирование 5'-OTBDMS группы действием тригидрата фторида тетрабутиламмония дало 3'-азидо-N4-алкил-5-метил-2',3'-дидезоксицитидины (1-8-1-10). Восстановление 5'-O-TBDMS-3'-азидо-N4-алкил-5-метил-2',3'-дидезоксицитидинов (6-8) трифенилфосфином позволило получить ключевые 5'-O-TBDMS-3'-амино-N4-алкил-5-метил-2',3'-дидезоксицитидины (9-10), а последующее деблокирование защитной группы действием тригидрата фторида тетрабутиламмония привело к целевым 3'-амино-N4-алкил-5-метил-2',3'-дидезоксицитидинам (1-11 и 1-12). Взаимодействием 9-10 или с уксусным ангидридом, или с уксусным альдегидом и NaBH4, с последующим деблокированием 5'-O-TBDMS группы действием тригидрата фторида тетрабутиламмония привело к 3'-ацетамидо- (1-13 и 1-14) и 3'-этиламино-N4-алкил-5-метил-2',3'-дидезоксицитидинам (1-15 и 1-16), соответственно. Для получения 3'-диалкиламино-N4-алкил-5-метил-2',3'-дидезоксицитидинов (1-17-1-20) использовали формальдегид и ацетальдегид, а в качестве восстановителя-цианоборгидрид натрия (NaBH3(CN)).5'-O-TBDMS-3'-azido-N 4 -alkyl-5-methyl-2',3'-dideoxycytidines (6-8) were obtained by a method analogous to the synthesis of compounds 1-1-1-7, starting from
Исходным соединением в синтезе триэтиленгликолевых производных N4-модифицированных 5-метил-2'-дезоксицитидинов являлся тимидин 2 (Фиг. 3). На первой стадии синтеза производили избирательную защиту гидроксильной группы в 5'-положении углеводного остатка путем конденсации 2 с трет-бутилдиметилсилилхлоридом в пиридине при охлаждении до +4°С. 3'-О-Карбонилтриэтиленгликолевое производное 5'-O-TBDMS-тимидина (11) получали последовательной обработкой защищенного тимидина с помощью карбонилдиимидазолом (CDI) в DMF и далее, без выделения интермедиата, триэтиленгликолем в диоксане. Затем, после экстракции водой из смеси хлороформ-гексан, органический слой упаривали и обрабатывали TBDMSC1 в пиридине с получением ключевого соединения (12). Обработка (12) 2-хлорфенилдихлорфосфатом и 1,2,4-триазолом, с последующей конденсацией с соответствующим амином (аналогично описанному выше методу) и деблокированием О-TBDMS защитных групп действием тригидрата фторида тетрабутиламмония позволила получить 3'-О-карбонилтриэтиленгликолевые производные (1-21 и 1-22), которые выделяли колоночной хроматографией на силикагеле, элюируя хлороформом или этилацетатом с увеличивающейся концентрацией этанола.The starting compound in the synthesis of triethylene glycol derivatives of N 4 -modified 5-methyl-2'-deoxycytidines was thymidine 2 (Fig. 3). At the first stage of the synthesis, selective protection of the hydroxyl group in the 5'-position of the carbohydrate residue was carried out by condensation of 2 with tert-butyldimethylsilyl chloride in pyridine upon cooling to +4°C. The 3'-O-Carbonyltriethylene glycol derivative of 5'-O-TBDMS-thymidine (11) was obtained by successive treatment of the protected thymidine with carbonyldiimidazole (CDI) in DMF and then, without isolation of the intermediate, with triethylene glycol in dioxane. Then, after extraction with water from chloroform-hexane, the organic layer was evaporated and treated with TBDMSC1 in pyridine to give the key compound (12). Treatment of (12) with 2-chlorophenyl dichlorophosphate and 1,2,4-triazole, followed by condensation with the corresponding amine (similar to the method described above) and deprotection of O-TBDMS protective groups by the action of tetrabutylammonium fluoride trihydrate, made it possible to obtain 3'-O-carbonyltriethylene glycol derivatives (1 -21 and 1-22), which were isolated by silica gel column chromatography, eluting with chloroform or ethyl acetate with increasing concentration of ethanol.
Противогрибковую активность N4-модифицированных 5-метил-2'-дезоксицитидинов или 5-фторцитозина (5FC), как положительного контроля, оценивали в отношении 11-ти штаммов мицелиальных грибов, включая пять представителей семейства Aspergillus, два представителя семейства Cladosporium и по одному представителю семейств Ulocladium, Simplicillium, Microascus и Penicillium. Эффективность соединений оценивали количественно по проценту ингибирования роста колоний на агаризованной среде Чапека-Докса (ЧДА), дополненной N4-модифицированными 5-метил-2'-дезоксицитидинами или 5FC по сравнению с ростом на контрольной среде (без добавок). Тестируемые штаммы мицелиальных грибов изолировали с экспонатов и поверхностей залов Живописи Древней Руси (залы 56, 57 и 61) основного исторического здания Третьяковской Галереи (Лаврушинский пер., 10, Москва), а именно: штамм Aspergillus versicolor STG-25G (SRX7729174; MK260015.1), Ulocladium sp.AAZ-2020a STG-36 (SRX7729176; MW590700) - с иконы «Церковь Воинствующая» (1550-е), Cladosporium halotolerans STG-52B (SRX7729178; МК258720.1) - с бюстового фрагмента статуи «Святой Великомученик Георгий Победоносец» (1464, Известковый камень, темпера), Aspergillus creber STG-57 (SRX7729180; MK266993.1) - с иконы «Святой Великомученик Димитрий Солунский» (16 век), Aspergillus versicolor STG-86 (SRX7729182; MK262781.1), Aspergillus creber STG-93W (SRX7729186; MW575292), Cladosporium parahalotolerans STG-93B (SRX7729188; MK262909.1), Simplicillium lamellicola (STG-96 (SRX7729190; MK262921.1) - с поверхностей зала 61, Microascus paisii STG-103 (SRX7729192; MW591474)-в зале 57, Aspergillus protuberus STG-106 (SRX7729194; MK268342.1) и Penicillium chrysogenum STG-117 (MW556011.1) - в зале 56.Antifungal activity of N 4 -modified 5-methyl-2'-deoxycytidines or 5-fluorocytosine (5FC), as a positive control, was evaluated against 11 strains of filamentous fungi, including five members of the Aspergillus family, two members of the Cladosporium family, and one member each of families Ulocladium, Simplicilium, Microascus and Penicillium. Compound efficacy was quantified by the percent inhibition of colony growth on Czapek-Dox agar medium (CDA) supplemented with N4-modified 5-methyl-2'-deoxycytidines or 5FC compared to growth on control medium (no additives). The tested strains of filamentous fungi were isolated from the exhibits and surfaces of the halls of the Paintings of Ancient Russia (
Полученные результаты наглядно демонстрируют антимикозную активность для большинства из полученных соединений, добавленных в концентрации 0.7 мМ (Фиг. 4). Соединения 1-12, 1-16 и 1-20 показали полное подавление роста всех тестируемых штаммов грибов после 60-ти дней культивирования на ЧДА при 26°С. Добавление соединений 1-11, 1-15 и 1-19 привело к полному подавлению роста большинства микроорганизмов, кроме S. lamellicola (STG-96) и P. chrysogenum (STG-117), характеризующихся быстрорастущими колониями, устойчивыми к широкому спектру антисептиков. Соединения 1-17 и 1-18 показали неполное ингибирование роста штаммов STG-96 и STG-117. Данные соединения также не смогли полностью подавить рост некоторых аспергилл. Так, штаммы STG-25G и STG-57 показали среднюю чувствительность против 1-17, а штамм STG-106 показал среднюю чувствительность как против 1-17, так и против 1-18. Интересный спектр резистентности выявлен в отношении соединения 1-3. Оно полностью подавляет быстрорастущие штаммы STG-96 и STG-117, но оказывает лишь частичное воздействие на аспергиллы (штаммы STG-25G, STG-57, STG-86, STG-93W и STG-106). Возможно, замена аминогруппы (или ее алкильных производных) на гидроксильную группу в 3'-положении углеводного остатка несколько меняет механизм фунгицидного действия, что отражается в чувствительности различных систематических групп грибов к этим соединениям.The results obtained clearly demonstrate the antimycotic activity for most of the obtained compounds added at a concentration of 0.7 mm (Fig. 4). Compounds 1-12, 1-16 and 1-20 showed complete inhibition of growth of all fungal strains tested after 60 days of cultivation on analytical grade at 26°C. The addition of compounds 1-11, 1-15 and 1-19 resulted in complete suppression of the growth of most microorganisms, except for S. lamellicola (STG-96) and P. chrysogenum (STG-117), which are characterized by fast-growing colonies resistant to a wide range of antiseptics. Compounds 1-17 and 1-18 showed incomplete growth inhibition of strains STG-96 and STG-117. These compounds also failed to completely suppress the growth of some Aspergillus. Thus, strains STG-25G and STG-57 showed moderate sensitivity against 1-17, and strain STG-106 showed moderate sensitivity against both 1-17 and 1-18. An interesting resistance spectrum was found for compound 1-3. It completely suppresses the fast growing strains STG-96 and STG-117, but has only a partial effect on Aspergillus (strains STG-25G, STG-57, STG-86, STG-93W and STG-106). It is possible that the replacement of the amino group (or its alkyl derivatives) with a hydroxyl group in the 3'-position of the carbohydrate residue somewhat changes the mechanism of fungicidal action, which is reflected in the sensitivity of various systematic groups of fungi to these compounds.
Также можно проследить несколько характерных зависимостей в ряду синтезированных соединений. Чувствительность изученных штаммов грибов к соединениям с гидроксильной группой в 3'-положении углеводного остатка возрастает в ряду 1-1 - 1-2 - 1-3. Другими словами, увеличение длины алкильного заместителя с восьми до двенадцати атомов углерода приводит к улучшению ингибиторной активности. Особенно хорошо этот эффект выражен в случае с соединениями, содержащими аминогруппу в 3'-положении углеводного остатка: во всех случаях наличие додецила в положении N4 приводило к заметно большей ингибиторной активности по сравнению с децилом. Введение в 3'-положение углеводного остатка азидной или ацетамидной группы приводит практически к полной утрате фунгицидного действия нуклеозида в тестируемых концентрациях.It is also possible to trace several characteristic dependences in the series of synthesized compounds. The sensitivity of the studied strains of fungi to compounds with a hydroxyl group in the 3'-position of the carbohydrate residue increases in the order 1-1 - 1-2 - 1-3. In other words, increasing the length of the alkyl substituent from eight to twelve carbon atoms leads to an improvement in inhibitory activity. This effect is especially pronounced in the case of compounds containing an amino group in the 3'-position of the carbohydrate residue: in all cases, the presence of dodecyl in position N 4 led to a markedly greater inhibitory activity compared to decyl. The introduction of an azide or acetamide group into the 3'-position of the carbohydrate residue leads to almost complete loss of the fungicidal effect of the nucleoside at the tested concentrations.
Замена децильного заместителя в положении N4 (соединение 1-2) на децилокси (соединение 1-5) приводит к снижению активности соединения (уровень антимикозной активности опускается до уровня соединения 1-1, с радикалом октил в соответствующем положении). Увеличение длины алкилокси-заместителя в этом же положении на одну метиленовую группу (соединение 1-6) несколько увеличивает активность по сравнению с 1-5 (при этом радикал ундецилокси в положении N4 приводит примерно к той же активности, что и радикал децил в том же положении (Фиг. 6)).Replacing the decyl substituent in position N 4 (compound 1-2) with decyloxy (compound 1-5) leads to a decrease in the activity of the compound (the level of antimycotic activity drops to the level of compound 1-1, with the octyl radical in the corresponding position). An increase in the length of the alkyloxy substituent in the same position by one methylene group (compound 1-6) slightly increases the activity compared to 1-5 (in this case, the undecyloxy radical in position N 4 leads to approximately the same activity as the decyl radical in that same position (Fig. 6)).
Таким образом, для изученных штаммов грибов наиболее эффективными явились соединения, содержащие додецильный радикал в положении N4 и аминогруппу в 3'-положении углеводного остатка (против всех штаммов). Замена аминогруппы на гидроксильную группу приводит к утрате ингибиторной активности в отношении аспергилл.Thus, for the studied strains of fungi, the most effective were compounds containing a dodecyl radical in position N 4 and an amino group in the 3'-position of the carbohydrate residue (against all strains). Replacing the amino group with a hydroxyl group results in the loss of inhibitory activity against aspergillus.
Коммерческие реагенты были закуплены от фирм Acros, Aldrich и Fluka. Все растворители были очищены согласно общеизвестным методам. Колоночную хроматографию проводили на силикагеле диаметром 40-63 мкм (Acros),тонкослойную хроматографию-на пластинках с силикагелем 60 F254 (Merck, Germany). Спектры ЯМР регистрировали на спектрометре АМХ III-400 (Bruker BioSpin, GmbH, Germany) с рабочей частотой 400 МГц для 1Н ЯМР (Me4Si как внутренний стандарт для органических растворителей) и 101 МГц для 13С ЯМР (с подавлением С-Н корреляции) или на спектрометре АМ-300 (Bruker BioSpin, GmbH, Germany) с рабочей частотой 300 МГц для 1Н ЯМР (Me4Si как внутренний стандарт для органических растворителей) и 75 МГц для 13С ЯМР (с подавлением С-Н корреляции). УФ спектры были записаны с использованием Perkin Elmer lambda 25 (Perkin Elmer, USA) в метаноле. Масс-спектры высокого разрешения были записаны на масс-спектрометре Bruker Daltonics micrOTOF-Q II (Bruker-MS, GmbH, Germany) с ионизацией электроспреем. Измерения были проведены в режиме положительных ионов в соответствии с прежде использованными условиями.Commercial reagents were purchased from Acros, Aldrich and Fluka. All solvents were purified according to well known methods. Column chromatography was performed on silica gel 40–63 μm in diameter (Acros), thin layer chromatography was performed on silica gel 60 F 254 plates (Merck, Germany). NMR spectra were recorded on an AMX III-400 spectrometer (Bruker BioSpin, GmbH, Germany) with an operating frequency of 400 MHz for 1 H NMR (Me 4 Si as an internal standard for organic solvents) and 101 MHz for 13 C NMR (with suppression of C-H correlation) or on an AM-300 spectrometer (Bruker BioSpin, GmbH, Germany) with an operating frequency of 300 MHz for 1 H NMR (Me 4 Si as an internal standard for organic solvents) and 75 MHz for 13 C NMR (with suppression of CH correlation ). UV spectra were recorded using Perkin Elmer lambda 25 (Perkin Elmer, USA) in methanol. High resolution mass spectra were recorded on a Bruker Daltonics micrOTOF-Q II mass spectrometer (Bruker-MS, GmbH, Germany) with electrospray ionization. The measurements were carried out in the positive ion mode in accordance with the previously used conditions.
Далее приведены примеры, иллюстрирующие данное изобретение. Варианты и модификации осуществления изобретения, которые могут быть воспроизведены, не отходя от общей концепции настоящего изобретения и без привлечения собственной изобретательской деятельности, также будут входить в объем притязаний настоящего изобретения.The following are examples illustrating the present invention. Variants and modifications of the invention, which can be reproduced without departing from the general concept of the present invention and without involving one's own inventive activity, will also be included in the scope of the present invention.
Пример 1. Синтез N4-октил-5-метил-2'-дезоксицитидина (1-1)Example 1 Synthesis of N 4 -octyl-5-methyl-2'-deoxycytidine (1-1)
К раствору тимидина 2 (121 мг, 0.5 ммоль) в абсолютном пиридине добавляли уксусный ангидрид (118 мкл, 1.25 ммоль) и оставляли при +37°С на 20 ч. Реакционную смесь упаривали, твердый остаток растворяли в минимальном объеме этанола и оставляли при +4°С на 48 ч. Полученные кристаллы отфильтровывали, промывали этанолом, охлажденным до -20°С, затем оставляли в эксикаторе над парафином при низком давлении на 48 ч. К полученному таким образом соединению 3, растворенному в абсолютном пиридине и охлажденному до 0°С, добавляли 1,2,4-триазол (200 мг, 3 ммоль) и 2-хлорфенилдихлорфосфат (188 мг, 0.77 ммоль). Смесь оставляли на 20 ч при комнатной температуре, затем упаривали, остаток распределяли между хлороформом и 0.5 М бикарбонатом натрия, органический слой промывали водой, высушивали над Na2SO4, упаривали, растворяли в безводном диоксане, охлаждали до 0°С и добавляли 1-октиламин (165 мкл, 1 ммоль) и N,N-диизопропилэтиламин (175 мкл, 1 ммоль). Смесь оставляли на 20 ч при комнатной температуре, затем добавляли 3 мл 25%-ного водного раствора аммиака и оставляли на 40 ч при комнатной температуре. Реакционную смесь упаривали. Полученную твердую смесь веществ разделяли на колонке (2×15 см) с силикагелем, элюируя системой хлороформ: этанол в соотношении 9: 1 (об./об.). Целевой продукт 1-1 был получен в количестве 138 мг (78%) в виде твердых белых кристаллов. УФ: λmax 273 нм. 1Н ЯМР (400 МГц, DMSO-d6) δ 0.84 (3Н, t, J=6.8 Гц, -CH2-СН3), 1.21-1.30 (10Н, m, -NH-(CH2)2-(CH 2 ) 5 -), 1.46-1.55 (2Н, m, -NH-CH2-CH 2 -), 1.84 (3Н, s, 5-СН3), 1.95 (1Н, ddd, J=13.3, 7.7, 6.0 Гц, 2'-На), 2.06 (1Н, ddd, J=13.1, 6.0, 3.2 Гц, 2'-Hb), 3.25-3.31 (2Н, m, -NH-CH 2 -), 3.54 (1H, ddd, J=12.0, 5.3, 3.9 Гц, 5'-На), 3.59 (1H, ddd, J=11.8, 5.5, 3.8 Гц, 5'-Hb), 3.75 (1Н, td, J=3.9, 3.3 Гц, 4'-Н), 4.21 (1Н, ddt, J=6.0, 4.3, 3.3 Гц, 3'-Н), 4.96 (1H t, J=5.3 Гц, 5'-ОН), 5.15 (1Н, d, J=4.3 Гц, 3'-ОН), 6.17 (1Н, dd, J=7.6, 6.0 Гц, 1'-H), 7.10 (1Н, t, J=5.7 Гц, N4-H), 7.56 (1H, s, 6-H). 13C ЯМР (101 МГц, DMSO-d6) δ 13.05 (5-CH3), 13.84 (-CH2-CH 3 ), 22.01, 26.43, 28.54, 28.61, 28.76, 31.19 (-NH-CH2 -(CH 2 ) 6 -). 40.05 (2'-C), 40.17 (-NH-CH 2 -), 61.39 (5'-C), 70.42 (3'-C), 84.56 (l'-C), 87.03 (4'-C), 101.63 (5-C), 137.09 (6-C), 155.09 (2-C), 162.61 (4-C). HRMS (ESI) рассчитано для C18H31N3O4, m/z: 354.2387 [M+H]+, найдено 354.2383.Acetic anhydride (118 μl, 1.25 mmol) was added to a solution of thymidine 2 (121 mg, 0.5 mmol) in absolute pyridine and left at +37°С for 20 h. The reaction mixture was evaporated, the solid residue was dissolved in a minimum volume of ethanol and left at + 4°C for 48 h. The resulting crystals were filtered off, washed with ethanol cooled to -20°C, then left in a desiccator over paraffin at low pressure for 48 h. To
Пример 2. Синтез N4-децил-5-метил-2'-дезоксицитидина (1-2)Example 2 Synthesis of N 4 -decyl-5-methyl-2'-deoxycytidine (1-2)
Получен по методу, описанному в Примере 1, из 2 (121 мг, 0.5 ммоль) и 1-дециламина (200 мкл, 1 ммоль). Выход 147 мг (77%) в виде твердых белых кристаллов. УФ: λmax 273 нм. 1Н ЯМР (400 МГц, DMSO-d6) δ 0.84 (3Н, t, J=6.8 Гц, -СН2 -СН 3 ), 1.21-1.28 (14Н, m, -NH-(CH2)2-(CH 2 ) 7 -), 1.45-1.55 (2Н, m, -NH-CH2-CH 2 -), 1.84 (3Н, d, J=1.0 Гц, 5-СН3), 1.95 (1H, ddd, J=13.3, 7.8, 6.1 Гц, 2'-На), 2.06 (1H, ddd, J=13.1, 6.0, 3.2 Гц, 2'-Hb), 3.25-3.31 (2Н, m, -NH-CH 2 -), 3.54 (1H, ddd, J=11.7, 5.3, 4.0 Гц, 5'-На), 3.59 (1Н, ddd, J=11.7, 5.3, 3.8 Гц, 5'-Hb), 3.75 (1Н, ddd, J=4.2, 3.7, 3.1 Гц, 4'-Н), 4.21 (1H, ddt, J=6.0, 4.2, 3.2 Гц, 3'-Н), 4.96 (1Н, t, J=5.3 Гц, 5'-ОН), 5.16 (1H, d, J=4.2 Гц, 3'-ОН), 6.17 (1Н, dd, J=7.6, 5.9 Гц, 1'-H), 7.09 (1Н, t, J=5.7 Гц, N4-H), 7.56 (1H, d, J=1.2 Гц, 6-H). 13C ЯМР (101 МГц, DMSO-d6) δ 13.08 (5-CH3), 13.87 (-CH2-CH 3 ), 22.05, 26.45, 28.57, 28.67, 28.83, 28.94, 28.99, 31.26 (-NH-CH2-(CH 2 ) 8 -), 40.14 (2'-C), 40.20 (-NH-CH 2 -), 61.42 (5'-C), 70.45 (3'-C), 84.59 (1'-C), 87.05 (4'-C), 101.66 (5-C), 137.11 (6-C), 155.12 (2-C), 162.64 (4-C). HRMS (ESI) рассчитано для C20H35N3O4, m/z: 382.2700 [M+H]+, найдено 382.2703.Obtained according to the method described in Example 1, from 2 (121 mg, 0.5 mmol) and 1-decylamine (200 μl, 1 mmol). Yield 147 mg (77%) as solid white crystals. UV: λ max 273 nm. 1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 ) δ 0.84 (3H, t, J=6.8 Hz, -CH 2 -CH 3 ), 1.21-1.28 (14H, m, -NH-(CH 2 ) 2 -( CH 2 ) 7 -), 1.45-1.55 (2Н, m, -NH-CH 2 - CH 2 -), 1.84 (3Н, d, J=1.0 Hz, 5-CH 3 ), 1.95 (1H, ddd, J =13.3, 7.8, 6.1 Hz, 2'-Ha), 2.06 (1H, ddd, J=13.1, 6.0, 3.2 Hz, 2'-Hb), 3.25-3.31 (2H, m, -NH- CH 2 -) , 3.54 (1H, ddd, J=11.7, 5.3, 4.0 Hz, 5'-Ha), 3.59 (1Н, ddd, J=11.7, 5.3, 3.8 Hz, 5'-Hb), 3.75 (1Н, ddd, J =4.2, 3.7, 3.1 Hz, 4'-H), 4.21 (1H, ddt, J=6.0, 4.2, 3.2 Hz, 3'-H), 4.96 (1H, t, J=5.3 Hz, 5'-OH ), 5.16 (1H, d, J=4.2 Hz, 3'-OH), 6.17 (1H, dd, J=7.6, 5.9 Hz, 1'-H), 7.09 (1H, t, J=5.7 Hz, N 4 -H), 7.56 (1H, d, J=1.2 Hz, 6-H). 13 C NMR (101 MHz, DMSO-d 6 ) δ 13.08 (5- CH 3 ), 13.87 (-CH 2 -CH 3 ) , 22.05, 26.45, 28.57, 28.67, 28.83, 28.94, 28.99, 31.26 CH 2 - (CH 2 ) 8 -), 40.14 (2'-C), 40.20 (-NH- CH 2 -), 61.42 (5'-C), 70.45 (3'-C), 84.59 (1'- C), 87.05 (4'-C), 101.66 (5-C), 137.11 (6-C), 155.12 (2-C), 162.64 (4-C). HRMS (ESI) calculated for C 20 H 35 N 3 O 4 , m/z: 382.2700 [M+H]+, found 382.2703.
Пример 3. Синтез N4-додецил-5-метил-2'-дезоксицитидина (1-3)Example 3 Synthesis of N 4 -dodecyl-5-methyl-2'-deoxycytidine (1-3)
Получен по методу, описанному в Примере 1, из 2 (121 мг, 0.5 ммоль) мг и 1-додециламин (185 мг, 1 ммоль). Выход 147 мг (77%) в виде твердых белых кристаллов. УФ: λmax 273 нм. 1Н ЯМР (300 МГц, DMSO-d6) δ 0.86 (3Н, t, J=6.8 Гц, -СН2-СН 3 ), 1.23 -1.28 (18Н, m, -NH-(CH2)2 -(CH 2 ) 9 -), 1.47-1.56 (2H, m, -NH-CH2-CH 2 -), 1.84 (3H, d, J=. 1.0 Гц, 5-СН3), 1.95 (1H, ddd, J=13.2, 7.8, 6.0 Гц, 2'-Ha), 2.06 (1H, ddd, J=13.1, 6.0, 3.2 Гц, 2'-Hb), 3.19-3.32 (2H, m, -NH-CH2-), 3.53 (1H, ddd, J=11.8, 5.3, 4.2 Гц, 5'-Hb), 3.59 (1H, ddd, J=11.7, 5.3, 3.9 Гц, 5'-Ha), 3.75 (1H, ddd, J=4.1, 3.6, 3.0 Гц, 4'-H), 4.21 (1H, dddd, J=6.0, 4.2, 3.2, 2.8 Гц, 3'-Н), 4.97 (1H, t, J=5.3 Гц, 5'-OH), 5.16 (1H, d, J=4.2 Гц, 3'-ОН), 6.18 (1H, dd, J=7.6, 6.0 Гц, 1'-H), 7.10 (1H, t, J=5.7 Гц, N4-H), 7.56 (1H, d, J=1.2 Гц, 6-H). 13C ЯМР (75 МГц, DMSO-d6) δ 13.11 (5-СН3), 13.90 (-C11H22-CH 3 ), 22.06, 26.45, 28.57, 28.68, 28.84, 29.00, 29.03, 31.27 (-NH-CH2-(CH 2 ) 10 -). 40.11 (2'-C), 40.24 (-NH-CH2-), 61.40 (5'-C), 70.43 (3'-C), 84.58 (1'-C), 87.07 (4'-C), 101.65 (5-C), 137.18 (6-C), 154.93 (2-C), 162.50 (4-C). HRMS (ESI) рассчитано для C22H39N3O4, m/z: 410.3019 [M+H]+, найдено 410.3022.Obtained according to the method described in Example 1, from 2 (121 mg, 0.5 mmol) mg and 1-dodecylamine (185 mg, 1 mmol). Yield 147 mg (77%) as solid white crystals. UV: λ max 273 nm. 1 H NMR (300 MHz, DMSO-d 6 ) δ 0.86 (3H, t, J=6.8 Hz, -CH 2 - CH 3 ), 1.23 -1.28 (18H, m, -NH-(CH 2 ) 2 -( CH 2 ) 9 -), 1.47-1.56 (2H, m, -NH-CH 2 - CH 2 - ), 1.84 (3H, d, J=. 1.0 Hz, 5-CH 3 ), 1.95 (1H, ddd, J=13.2, 7.8, 6.0 Hz, 2'-Ha), 2.06 (1H, ddd, J=13.1, 6.0, 3.2 Hz, 2'-Hb), 3.19-3.32 (2H, m, -NH-CH 2 - ), 3.53 (1H, ddd, J=11.8, 5.3, 4.2 Hz, 5'-Hb), 3.59 (1H, ddd, J=11.7, 5.3, 3.9 Hz, 5'-Ha), 3.75 (1H, ddd, J=4.1, 3.6, 3.0 Hz, 4'-H), 4.21 (1H, dddd, J=6.0, 4.2, 3.2, 2.8 Hz, 3'-H), 4.97 (1H, t, J=5.3 Hz, 5 '-OH), 5.16 (1H, d, J=4.2 Hz, 3'-OH), 6.18 (1H, dd, J=7.6, 6.0 Hz, 1'-H), 7.10 (1H, t, J=5.7 Hz, N 4 -H), 7.56 (1H, d, J=1.2 Hz, 6-H). 13 C NMR (75 MHz, DMSO-d 6 ) δ 13.11 (5-CH 3 ), 13.90 (-C 11 H 22 - CH 3 ), 22.06, 26.45, 28.57, 28.68, 28.84, 29.00, 29.03, 31.27 (- NH-CH 2 - (CH 2 ) 10 -). 40.11 (2'-C), 40.24 (-NH-CH 2 -), 61.40 (5'-C), 70.43 (3'-C), 84.58 (1'-C), 87.07 (4'-C), 101.65 (5-C), 137.18 (6-C), 154.93 (2-C), 162.50 (4-C). HRMS (ESI) calculated for C 22 H 39 N 3 O 4 , m/z: 410.3019 [M+H]+, found 410.3022.
Пример 4. Синтез N4-октилокси-5-метил-2'-дезоксицитидина (1-4)Example 4 Synthesis of N 4 -octyloxy-5-methyl-2'-deoxycytidine (1-4)
Получен по методу, описанному в Примере 1, из 2 (121 мг, 0.5 ммоль) и О-октилгидроксиламина (145 мг, 1 ммоль). Выход 138 мг (78%) в виде твердых белых кристаллов. УФ: λmax 276 нм. 1Н ЯМР (DMCO-d6): δ 0.84 (3Н, t, J=6.8 Гц, -(СН 2 ) 5 СН3), 1.25-1.48 (10Н, m, -СН2СН2(CH 2 ) 5 СН3), 1.50 (2Н, m, -СН2 СН 2 (СН2)5СН3), 1.84 (3Н, s, 5-СН3), 1.93-1.99 (1Н, m, 2'-На), 2.03-2.08 (1H, m, 2'-Hb), 3.27 (2Н, m, -СН 2СН2(СН2)5СН3), 3.54-3.56 (2Н, m, 5'-Н), 3.76 (1Н, m, 4'-Н), 3.85 (2Н, m, O-СН2), 4.19-4.21 (1Н, m, 3'-СН), 4.96 (1Н, t, J=5.3 Гц, 5'-ОН), 5.15 (1H, d, J=4.2 Гц, 3'-ОН), 6.18 (1Н, t, J=7 Гц, 1'-H), 7.56 (1Н, s, 6-CH), 9.48 (1H, s, NH). 13C ЯМР (ДМСО-d6): δ 13.05 (5-СН3), 13.83 (-(СН2)7 СН 3 ), 22.0-31.19 (-C7H14), 40.17 (2'-C), 61.38 (5'-C), 70.31 (3'-C), 84.55 (l'-C), 87.01 (4'-C), 101.61 (5-C), 137.07 (6-C), 155.07 (2-C), 162.59 (4-C). HRMS (ESI) рассчитано для C18H31N3O5, m/z: 370.2342 [M+H]+, найдено 370.2330.Obtained according to the method described in Example 1, from 2 (121 mg, 0.5 mmol) and O-octylhydroxylamine (145 mg, 1 mmol). Yield 138 mg (78%) as solid white crystals. UV: λ max 276 nm. 1 H NMR (DMCO-d 6 ): δ 0.84 (3H, t, J=6.8 Hz, -(CH 2 ) 5 CH 3 ), 1.25-1.48 (10H, m, -CH 2 CH 2 ( CH 2 ) 5 CH 3 ), 1.50 (2Н, m, -CH 2 CH 2 (CH 2 ) 5 CH 3 ), 1.84 (3Н, s, 5-CH 3 ), 1.93-1.99 (1Н, m, 2'-Нa), 2.03-2.08 (1H, m, 2'-Hb), 3.27 (2H, m, -CH 2 CH 2 (CH 2 ) 5 CH 3 ), 3.54-3.56 (2H, m, 5'-H), 3.76 ( 1H, m, 4'-H), 3.85 (2H, m, O-CH 2 ), 4.19-4.21 (1H, m, 3'-CH), 4.96 (1H, t, J=5.3 Hz, 5'- OH), 5.15 (1H, d, J=4.2 Hz, 3'-OH), 6.18 (1H, t, J=7 Hz, 1'-H), 7.56 (1H, s, 6-CH), 9.48 ( 1H, s, NH). 13 C NMR (DMSO-d 6 ): δ 13.05 (5-CH 3 ), 13.83 (-(CH 2 ) 7 CH 3 ), 22.0-31.19 (-C 7 H 14 ), 40.17 (2'-C), 61.38 (5'-C), 70.31 (3'-C), 84.55 (l'-C), 87.01 (4'-C), 101.61 (5-C), 137.07 (6-C), 155.07 (2- C), 162.59 (4-C). HRMS (ESI) calculated for C 18 H 31 N 3 O 5 , m/z: 370.2342 [M+H]+, found 370.2330.
Пример 5. Синтез N4-децилокси-5-метил-2'-дезоксицитидина (1-5)Example 5 Synthesis of N 4 -decyloxy-5-methyl-2'-deoxycytidine (1-5)
Получен по методу, описанному в Примере 1, из 2 (121 мг, 0.5 ммоль) и О-децилгидроксиламина (173 мг, 1 ммоль). Выход 161 мг (77%) в виде твердых белых кристаллов. УФ: λmax 277 нм. 1Н ЯМР (ДМСО-d6): δ 0.81 (3Н, t, J=6.8 Гц, -(CH2)9 СН 3 ), 1.21 (14Н, m, -СН2СН2(СН 2 ) 7 CH3. 1.52 (2Н, m, -СН2 СН 2 (СН2)7СН3), 1.57 (3Н, s, 5-СН3), 1.92-2.08 (2Н, m, 2'-Н), 3.51-3.54 (2Н, m, 5'-Н), 3.76 (1Н, m, 4'-Н), 3.85 (2Н, m, О-CH 2 (C9H18)-), 4.18-4.20 (1H, m, 3'-Н), 4.93 (1Н, t, J=5.3 Гц, 5'-ОН), 5.15 (1H, d, J=4.2 Гц, 3'-ОН), 6.15 (1Н, t, J=7 Гц, 1'-CH), 7.93 (1Н, s, 6-H), 9.47 (1H, s, NH). 13C ЯМР (ДМСО-d6): δ 13.05 (5-CH3), 13.87 (-(СН2)9 СН 3 ), 22.02-31.23 (-C9H28), 39.29 (2'-C), 61.38 (5'-C), 70.42 (3'-C), 84.78 (1'-C), 87.1 (4'-C), 94.62 (5-C), 139.55 (6-C), 155.1 (2-C), 163.22 (4-C). HRMS (ESI) рассчитано для C20H35N3O5, m/z: 398.2655 [M+H]+, найдено 398.2659.Obtained according to the method described in Example 1, from 2 (121 mg, 0.5 mmol) and O-decylhydroxylamine (173 mg, 1 mmol). Yield 161 mg (77%) as solid white crystals. UV: λ max 277 nm. 1 H NMR (DMSO-d 6 ): δ 0.81 (3H, t, J=6.8 Hz, -(CH 2 ) 9 CH 3 ), 1.21 (14H, m, -CH 2 CH 2 ( CH 2 ) 7 CH 3 1.52 (2H, m, -CH 2 CH 2 (CH 2 ) 7 CH 3 ), 1.57 (3H, s, 5-CH 3 ), 1.92-2.08 (2H, m, 2'-H), 3.51-3.54 (2H, m, 5'-H), 3.76 (1H, m, 4'-H), 3.85 (2H, m, O- CH 2 (C 9 H 18 )-), 4.18-4.20 (1H, m, 3'-H), 4.93 (1H, t, J=5.3 Hz, 5'-OH), 5.15 (1H, d, J=4.2 Hz, 3'-OH), 6.15 (1H, t, J=7 Hz , 1' -CH), 7.93 (1H, s, 6 -H), 9.47 (1H, s, NH). CH 2 ) 9 CH 3 ), 22.02-31.23 (-C 9 H 28 ), 39.29 (2'-C), 61.38 (5'-C), 70.42 (3'-C), 84.78 (1'-C) , 87.1 (4'-C), 94.62 (5-C), 139.55 (6-C), 155.1 (2-C), 163.22 (4-C) HRMS (ESI) calculated for C 20 H 35 N 3 O 5 , m/z: 398.2655 [M+H]+, found 398.2659.
Пример 6. Синтез N4-ундецилокси-5-метил-2'-дезоксицитидина (1-6)Example 6 Synthesis of N 4 -undecyloxy-5-methyl-2'-deoxycytidine (1-6)
Получен по методу, описанному в Примере 1, из 2 (121 мг, 0.5 ммоль) и О-ундецилгидроксиламина (187 мг, 1 ммоль). Выход 161 мг (78%) в виде твердых белых кристаллов. УФ: λmax 277 нм. 1Н ЯМР (400 МГц, DMSO-d6) δ 0.85 (3Н, t, J=6.8 Гц, -СН2-СН 3 ), 1.21-1.28 (16Н, m, -NH-(CH2)2-(CH 2 ) 8), 1.84 (3Н, d, J=1.0 Гц, 5-CH3), 1.95 (1Н, ddd, J=13.3, 7.8, 6.1 Гц, 2'-Ha), 2.06 (1Н, ddd, J=13.1, 6.0, 3.2 Гц, 2'-Hb), 3.54 (1H, ddd, J=11.7, 5.3, 4.0 Гц, 5'-Ha), 3.59 (1H, ddd, J=11.7, 5.3, 3.8 Гц, 5'-Hb), 3.75 (1H, ddd, J=4.2, 3.7, 3.1 Гц, 4'-H), 3.86 (2H, m, -NH-O-CH 2 -), 4.21 (1H, ddt, J=6.0, 4.2, 3.2 Гц, 3'-Н), 4.96 (1H, t, J=5.3 Гц, 5'-OH), 5.16 (1H, d, J=4.2 Гц, 3'-ОН), 6.17 (1H, dd, J=7.6, 5.9 Гц, 1'-H), 7.56 (1H, d, J=1.2 Гц, 6-H), 9.46 (1H, s, NH). 13C ЯМР (101 МГц, DMSO-d6) δ 13.08 (-CH2-CH3), 13.87 (5-CH3), 22.05, 26.45, 28.57, 28.67, 28.83, 28.94, 28.99, 31.26 (-NH-CH2-(CH 2 ) 9 -). 40.14 (2'-C), 40.20 (-NH-CH 2 -), 61.42 (5'-C), 70.45 (3'-C), 84.59 (1'-C), 87.05 (4'-C), 101.66 (5-C), 137.11 (6-C), 155.12 (2-C), 162.64 (4-C). HRMS (ESI) рассчитано для C21H37N3O5, m/z: 412.2812 [M+H]+, найдено 412.2814.Obtained according to the method described in Example 1, from 2 (121 mg, 0.5 mmol) and O-undecylhydroxylamine (187 mg, 1 mmol). Yield 161 mg (78%) as solid white crystals. UV: λ max 277 nm. 1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 ) δ 0.85 (3H, t, J=6.8 Hz, -CH 2 - CH 3 ), 1.21-1.28 (16H, m, -NH-(CH 2 ) 2 -( CH 2 ) 8 ), 1.84 (3Н, d, J=1.0 Hz, 5-CH 3 ), 1.95 (1Н, ddd, J=13.3, 7.8, 6.1 Hz, 2'-Ha), 2.06 (1Н, ddd, J=13.1, 6.0, 3.2 Hz, 2'-Hb), 3.54 (1H, ddd, J=11.7, 5.3, 4.0 Hz, 5'-Ha), 3.59 (1H, ddd, J=11.7, 5.3, 3.8 Hz , 5'-Hb), 3.75 (1H, ddd, J=4.2, 3.7, 3.1 Hz, 4'-H), 3.86 (2H, m, -NH-O- CH 2 -), 4.21 (1H, ddt, J=6.0, 4.2, 3.2 Hz, 3'-H), 4.96 (1H, t, J=5.3 Hz, 5'-OH), 5.16 (1H, d, J=4.2 Hz, 3'-OH), 6.17 (1H, dd, J=7.6, 5.9 Hz, 1'-H), 7.56 (1H, d, J=1.2 Hz, 6-H), 9.46 (1H, s, NH). 13 C NMR (101 MHz, DMSO-d 6 ) δ 13.08 (-CH 2 -CH 3 ), 13.87 (5-CH 3 ), 22.05, 26.45, 28.57, 28.67, 28.83, 28.94, 28.99, 31.26 (-NH- CH 2 -( CH 2 ) 9 -). 40.14 (2'-C), 40.20 (-NH- CH 2 -), 61.42 (5'-C), 70.45 (3'-C), 84.59 (1'-C), 87.05 (4'-C), 101.66 (5-C), 137.11 (6-C), 155.12 (2-C), 162.64 (4-C). HRMS (ESI) calculated for C 21 H 37 N 3 O 5 , m/z: 412.2812 [M+H]+, found 412.2814.
Пример 7. Синтез N4-додецилокси-5-метил-2'-дезоксицитидина (1-7)Example 7 Synthesis of N 4 -dodecyloxy-5-methyl-2'-deoxycytidine (1-7)
Получен по методу, описанному в Примере 1, из 2 (121 мг, 0.5 ммоль) и О-додецилгидроксиламина (201 мг, 1 ммоль). Выход 154 мг (75%) в виде твердых белых кристаллов. UV: λmax 273 нм. 1Н ЯМР (400 МГц, DMSO-d6) δ 0.81 (3Н, t, J=6.8 Гц, -СН2-СН3), 1.19 (18Н, m, -NH-(CH2)2-(CH 2 ) 9- ). 1.49-1.58 (2Н, m, -NH-CH2-CH2-), 1.85 (3Н, d, J=1.0 Гц, 5-СН3), 1.95 (1H, ddd, J=13.2, 7.8, 6.0 Гц, 2'-Ha), 2.06 (1H, ddd, J=13.1, 6.0, 3.2 Гц, 2'-Hb), 3.19-3.32 (2H, m, -NH-CH 2 -), 3.53 (1H, ddd, J=11.8, 5.3, 4.2 Гц, 5'-Hb), 3.59 (1H, ddd, J=11.7, 5.3, 3.9 Гц, 5'-Ha), 3.75 (1H, ddd, J=4.1, 3.6, 3.0 Гц, 4'-H),. 3.85 (2H, -NH-O-CH 2 -), 4.21 (1Н, dddd, J=6.0, 4.2, 3.2, 2.8 Гц, 3'-Н), 4.97 (1H, t, J=5.3 Гц, 5'-ОН), 5.16 (1H, d, J=4.2 Гц, 3'-ОН), 6.11 (1H, dd, J=7.6, 6.0 Гц, 1'-H), 6.94 (1H, d, J=1.2 Гц, 6-H), 9.46 (1H, s, NH). 13C ЯМР (75 МГц, DMSO-d6) δ 13.11 (-CH2-CH 3 ), 13.90 (5-СН3), 22.06, 26.45, 28.57, 28.68, 28.84, 29.00, 29.03, 31.27 (-NH-CH2-(CH 2 ) 10 -). 40.11 (2'-C), 40.24 (-NH-CH 2 -), 61.40 (5'-C), 70.43 (3'-C), 84.58 (1'-C), 87.07 (4'-C), 101.65 (5-C), 137.18 (6-C), 154.93 (2-C), 162.50 (4-C). HRMS (ESI) рассчитано для C22H39N3O5, m/z: 426.2968 [M+H]+, найдено 426.2969.Obtained according to the method described in Example 1, from 2 (121 mg, 0.5 mmol) and O-dodecylhydroxylamine (201 mg, 1 mmol). Yield 154 mg (75%) as white solid crystals. UV: λ max 273 nm. 1 H NMR (400 MHz, DMSO-d 6 ) δ 0.81 (3H, t, J=6.8 Hz, -CH 2 -CH 3 ), 1.19 (18H, m, -NH-(CH 2 ) 2 - (CH 2 ) 9- ). 1.49-1.58 (2Н, m, -NH-CH 2 -CH 2 -), 1.85 (3Н, d, J=1.0 Hz, 5-CH 3 ), 1.95 (1H, ddd, J=13.2, 7.8, 6.0 Hz , 2'-Ha), 2.06 (1H, ddd, J=13.1, 6.0, 3.2 Hz, 2'-Hb), 3.19-3.32 (2H, m, -NH- CH 2 -), 3.53 (1H, ddd, J=11.8, 5.3, 4.2 Hz, 5'-Hb), 3.59 (1H, ddd, J=11.7, 5.3, 3.9 Hz, 5'-Ha), 3.75 (1H, ddd, J=4.1, 3.6, 3.0 Hz , 4'-H). 3.85 (2H, -NH-O- CH 2 -), 4.21 (1H, dddd, J=6.0, 4.2, 3.2, 2.8 Hz, 3'-H), 4.97 (1H, t, J=5.3 Hz, 5' -OH), 5.16 (1H, d, J=4.2 Hz, 3'-OH), 6.11 (1H, dd, J=7.6, 6.0 Hz, 1'-H), 6.94 (1H, d, J=1.2 Hz , 6-H), 9.46 (1H, s, NH). 13 C NMR (75 MHz, DMSO-d 6 ) δ 13.11 (-CH 2 -CH 3 ) , 13.90 (5- CH 3 ), 22.06, 26.45, 28.57, 28.68, 28.84, 29.00, 29.03, 31.27 (-NH- CH 2 - (CH 2 ) 10 -). 40.11 (2'-C), 40.24 (-NH- CH 2 -), 61.40 (5'-C), 70.43 (3'-C), 84.58 (1'-C), 87.07 (4'-C), 101.65 (5-C), 137.18 (6-C), 154.93 (2-C), 162.50 (4-C). HRMS (ESI) calculated for C 22 H 39 N 3 O 5 , m/z: 426.2968 [M+H]+, found 426.2969.
Пример 8. Синтез 3'-азидо-N4-октил-5-метил-2',3'-дидезоксицитидина (1-8)Example 8 Synthesis of 3'-azido-N 4 -octyl-5-methyl-2',3'-dideoxycytidine (1-8)
К раствору азидотимидина 5 (134 мг, 0.5 ммоль) в абсолютном пиридине добавляли трет-бутилдиметилсилилхлорид (98 мг, 0.65 ммоль) и оставляли при +37°С на 20 ч, после чего полученный раствор упаривали, остаток распределяли между этилацетатом и 0.5 М бикарбонатом натрия. Органическую фракцию собирали, сушили над Na2SO4 и упаривали. К полученному твердому остатку добавляли 1,2,4-триазол (345 мг, 5 ммоль) и 2-хлорфенилдихлорфосфат (165 мкл, 1 ммоль) и оставляли при комнатной температуре на 20 ч. Затем реакционную смесь упаривали, твердый остаток распределяли между этилацетатом и 0.5 М бикарбонатом натрия. Органическую фазу сушили над Na2SO4, после чего упаривали. К твердому остатку добавляли 1-октиламин (0.165 мкл, 1 ммоль) и N,N-диизопропилэтиламин (348 мкл, 2 ммоль). Реакционную смесь упаривали, остаток распределяли между хлороформом и 0.5 М бикарбонатом натрия, органический слой промывали водой, высушивали над Na2SO4, упаривали. Соединение 6 очищали на колонке (2×15 см) с силикагелем в системе этилацетат: гексан в соотношении 1:1 (об./об.). Полученный раствор упаривали, растворяли в диоксане, добавляли тригидрат фторида тетрабутиламмония (205 мг, 0.65 ммоль), оставляли на 20 ч при комнатной температуре, после чего упаривали. Твердый остаток очищали на колонке (2×15 см) с силикагелем. Продукт 1-8 элюировали системой хлороформ: этанол (20:1). Выход 161 мг (85%) в виде твердых белых кристаллов. UV: λmax 277 нм. 1Н ЯМР (400 МГц, DMSO-d6) δ 0.85 (3Н, t, J=7.0 Гц, -C7H14 CH 3 ), 1.25 (10Н, m, -NH-(CH2)2-C 5 H 10 -CH3), 1.51 (2Н, m, -NH-CH2-CH 2 -), 1.84 (3Н, d,J=0.6 Гц, 5-СН3), 2.24 (2Н, t, J=6.3 Гц, 2'-Н), 3.28 (2Н, m, -NHCH 2 -), 3.58 (1H, ddd, J=11.8, 5.4, 4.1 Гц, 5'-На), 3.64 (1Н, ddd, J=11.8, 5.4, 4.1 Гц, 5'-Hb), 3.81 (1Н, q, J=4.1 Гц, 4'-Н), 4.34 (1H, td, J=6.3, 4.1 Гц, 3'-Н), 5.16 (1Н, t, J=5.4 Гц, 5'-ОН), 6.10 (1Н, t, J=6.5 Гц, 1'-H), 7.13 (1H, t, J=5.6 Гц, -NHCH2-), 7.54 (1H, m, 6-H). 13C ЯМР (101 МГц, DMSO-d6) δ 13.05 (5-СН3), 13.88 (-C7H14 CH 3 ), 22.04, 26.44, 28.54, 28.62, 28.77, 31.21 (-NHCH2-C 6 H 12 -CH3), 36.74 (-NHCH2-), 40.20 (2'-C), 60.37 (3'-C), 60.95 (5'-C), 83.86 (1'-C), 84.25 (4'-C), 101.83 (5-C), 137.04 (6-C), 154.92 (2-C), 162.69 (4-C). HRMS (ESI) рассчитано для C18H30N6O3, m/z: 401,2277 [M+Na]+, найдено 401,2272.To a solution of azidothymidine 5 (134 mg, 0.5 mmol) in absolute pyridine was added tert-butyldimethylsilyl chloride (98 mg, 0.65 mmol) and left at +37°C for 20 h, after which the resulting solution was evaporated, the residue was partitioned between ethyl acetate and 0.5 M bicarbonate sodium. The organic fraction was collected, dried over Na 2 SO 4 and evaporated. 1,2,4-triazole (345 mg, 5 mmol) and 2-chlorophenyl dichlorophosphate (165 μl, 1 mmol) were added to the obtained solid residue and left at room temperature for 20 h. Then the reaction mixture was evaporated, the solid residue was partitioned between ethyl acetate and 0.5 M sodium bicarbonate. The organic phase was dried over Na 2 SO 4 and then evaporated. 1-octylamine (0.165 µl, 1 mmol) and N,N-diisopropylethylamine (348 µl, 2 mmol) were added to the solid residue. The reaction mixture was evaporated, the residue was partitioned between chloroform and 0.5 M sodium bicarbonate, the organic layer was washed with water, dried over Na 2 SO 4 and evaporated.
Пример 9. Синтез 3'-азидо-N4-децил-5-метил-2',3'-дидезоксицитидина (1-9)Example 9 Synthesis of 3'-azido-N 4 -decyl-5-methyl-2',3'-dideoxycytidine (1-9)
Получен по методу, описанному в Примере 8, из 5 (134 мг, 0.5 ммоль) и 1-дециламина (200 мкл, 1 ммоль). Выход 169 мг (83%) в виде твердых белых кристаллов. UV: λmax 276 нм. 1Н ЯМР (DMSO-d6, 400 МГц) δ 0.85 (3Н, t, J=6.8 Гц, -С9Н18-СН 3 ), 1.21-1.29 (14Н, m, -NH-(CH2)2-C 7 H 14 -), 1.45-1.56 (2Н, m, -NH-CH2-CH 2 -), 1.84 (3Н, s, 5-СН3), 2.24 (2Н, t, J=6.3 Гц, Н-2'), 3.23-3.30 (2Н, m, -NH-CH 2 -), 3.58 (1Н, ddd, J=11.8,5.4, 4.1 Гц, H-5'a), 3.64 (1Н, ddd, J=11.8, 5.4, 4.1 Гц, H-5'b), 3.81 (1Н, q, J=4.1 Гц, H-4'), 4.34 (1H, td, J=6.3, 4.1 Гц, H-3'), 5.16 (1H, t, J=5.4 Гц, -OH), 6.10 (1H, t, J =6.5 Гц, H-1'), 7.12 (1Н, t, J=5.6 Гц, H-N4), 7.51-7.58 (1H, m, Н-6). 13С ЯМР (DMSO-d6, 101 МГц) δ 13.05 (5-СН3), 13.88 (-C9H1 8 CH3), 22.04, 26.43, 28.65, 28.81, 28.92, 28.98, 31.25 (-NH-(CH2)2-C 7 H14-), 28.54 (-NH-CH2-CH2-), 36.75 (С-2'), 40.19 (-NH-CH2-), 60.37 (С-3'), 60.95 (С-5'), 83.86 (С-1'), 84.25 (С-4'), 101.83 (С-5), 137.04 (С-6), 154.92 (С-2), 162.69 (С-4). HRMS (ESI) рассчитано для C20H34N6O3, m/z: 429.2590 [M+Na]+, найдено 429.2599.Obtained according to the method described in Example 8, from 5 (134 mg, 0.5 mmol) and 1-decylamine (200 μl, 1 mmol). Yield 169 mg (83%) as solid white crystals. UV: λ max 276 nm. 1 H NMR (DMSO-d 6 , 400 MHz) δ 0.85 (3H, t, J=6.8 Hz, -C 9 H 18 - CH 3 ), 1.21-1.29 (14H, m, -NH-(CH 2 ) 2 - C 7 H 14 - ), 1.45-1.56 (2Н, m, -NH-CH 2 - CH 2 -), 1.84 (3Н, s, 5-CH 3 ), 2.24 (2Н, t, J=6.3 Hz, H-2'), 3.23-3.30 (2H, m, -NH- CH 2 -), 3.58 (1H, ddd, J=11.8,5.4, 4.1 Hz, H-5'a), 3.64 (1H, ddd, J=11.8, 5.4, 4.1 Hz, H-5'b), 3.81 (1H, q, J=4.1 Hz, H-4'), 4.34 (1H, td, J=6.3, 4.1 Hz, H-3' ), 5.16 (1H, t, J=5.4 Hz, -OH), 6.10 (1H, t, J=6.5 Hz, H-1'), 7.12 (1Н, t, J=5.6 Hz, HN 4 ), 7.51 -7.58 (1H, m, H-6). 13 С NMR (DMSO-d 6 , 101 MHz) δ 13.05 (5-CH 3 ), 13.88 (-C 9 H 1 8 C H 3 ), 22.04, 26.43, 28.65, 28.81, 28.92, 28.98, 31.25 (-NH -(CH 2 ) 2 - C 7 H 14 -), 28.54 (-NH- C H 2 -CH 2 -), 36.75 (C-2'), 40.19 (-NH- C H 2 -), 60.37 (C -3'), 60.95 (C-5'), 83.86 (C-1'), 84.25 (C-4'), 101.83 (C-5), 137.04 (C-6), 154.92 (C-2), 162.69 (C-4). HRMS (ESI) calculated for C 20 H 34 N 6 O 3 , m/z: 429.2590 [M+Na]+, found 429.2599.
Пример 10. Синтез 3'-азидо-N4-додецил-5-метил-2',3'-дидезоксицитидина (1-10)Example 10 Synthesis of 3'-azido-N 4 -dodecyl-5-methyl-2',3'-dideoxycytidine (1-10)
Получен по методу, описанному в примере 8, из 5 (134 мг, 0.5 ммоль) и 1-додециламина (185 мг, 1 ммоль). Выход 180 мг (83%) в виде твердых белых кристаллов. UV: λmax 276 нм. 1Н ЯМР (DMSO-d6, 300 МГц) δ 0.86 (3Н, t, J=6.7 Гц, -С11Н22-СН 3), 1.21-1.30 (18Н, m, -NH-(CH2)2-C 9 H 18 -), 1.42-1.60 (2Н, m, -NH-CH2-CH 2 -), 1.85 (3Н, d, J=0.8 Гц, 5-СН3), 2.25 (2Н, t, J=6.3 Гц, Н-2'), 3.20-3.31 (2Н, m, -NH-СН2-), 3.59 (1Н, ddd, J=11.9, 5.4, 4.1 Гц, H-5'b), 3.65 (1H, ddd, J=11.9, 5.4, 4.1 Гц, Н-5'а), 3.82 (1H, q, J=4.4 Гц, Н-4'), 4.35 (1Н, td, J=6.3, 4.4 Гц, Н-3'), 5.17 (1H, t, J=5.4 Гц, -ОН), 6.10 (1Н, t, J=6.5 Гц, Н-1'), 7.14 (1Н, t, J=5.6 Гц, H-N4), 7.51-7.58 (1Н, m, Н-6). 13С ЯМР (DMSO-d6, 75 МГц) δ 13.07 (5-СН3), 13.90 (-С11Н22-СН3), 22.06, 26.44, 28.67, 28.83, 28.99, 31.26 (-NH-(CH2)2-C 9 H18-), 28.55 (-NH-CH2-CH2-), 36.74 (-NH-CH2-), 40.19 (С-2'), 60.36 (С-3'), 60.94 (С-5'), 83.85 (С-1'), 84.22 (С-4'), 101.81 (С-5), 137.04 (С-6), 154.90 (С-2), 162.68 (С-4). HRMS (ESI) рассчитано для C22H38N6O3, m/z: 457.2903 [M+Na]+, найдено 457.2902.Obtained according to the method described in example 8, from 5 (134 mg, 0.5 mmol) and 1-dodecylamine (185 mg, 1 mmol). Yield 180 mg (83%) as solid white crystals. UV: λ max 276 nm. 1 H NMR (DMSO-d 6 , 300 MHz) δ 0.86 (3H, t, J=6.7 Hz, -C 11 H 22 - CH 3 ), 1.21-1.30 (18H, m, -NH-(CH 2 ) 2 - C 9 H 18 -), 1.42-1.60 (2Н, m, -NH-CH 2 - CH 2 -), 1.85 (3Н, d, J=0.8 Hz, 5-CH 3 ), 2.25 (2Н, t, J=6.3 Hz, H-2'), 3.20-3.31 (2H, m, -NH-CH 2 -), 3.59 (1H, ddd, J=11.9, 5.4, 4.1 Hz, H-5'b), 3.65 (1H, ddd, J=11.9, 5.4, 4.1 Hz, H-5'a), 3.82 (1H, q, J=4.4 Hz, H-4'), 4.35 (1H, td, J=6.3, 4.4 Hz , H-3'), 5.17 (1H, t, J=5.4 Hz, -OH), 6.10 (1H, t, J=6.5 Hz, H-1'), 7.14 (1H, t, J=5.6 Hz, HN 4 ), 7.51-7.58 (1H, m, H-6). 13 C NMR (DMSO-d 6 , 75 MHz) δ 13.07 (5-CH 3 ), 13.90 (-C 11 H 22 -CH 3 ), 22.06, 26.44, 28.67, 28.83, 28.99, 31.26 (-NH-(CH 2 ) 2 - C 9 H 18 -), 28.55 (-NH-CH 2 -CH 2 -), 36.74 (-NH-CH 2 -), 40.19 (C-2'), 60.36 (C-3'), 60.94 (С-5'), 83.85 (С-1'), 84.22 (С-4'), 101.81 (С-5), 137.04 (С-6), 154.90 (С-2), 162.68 (С-4 ). HRMS (ESI) calculated for C 22 H 38 N 6 O 3 , m/z: 457.2903 [M+Na]+, found 457.2902.
Пример 11. Синтез 3'-амино-N4-децил-5-метил-2',3'-дидезоксицитидина (1-11)Example 11 Synthesis of 3'-amino-N 4 -decyl-5-methyl-2',3'-dideoxycytidine (1-11)
К раствору азидотимидина 5 (134 мг, 0.5 ммоль) в абсолютном пиридине добавляли трет-бутилдиметилсилилхлорид (98 мг, 0.65 ммоль) и оставляли при +37°С на 20 ч, после чего полученный раствор упаривали, остаток распределяли между этилацетатом и 0.5 М бикарбонатом натрия. Органическую фракцию собирали, сушили над Na2SO4 и упаривали. К полученному твердому остатку добавляли 1,2,4-триазол (345 мг, 5 ммоль) и 2-хлорфенилдихлорфосфат (165 мкл, 1 ммоль) и оставляли при комнатной температуре на 20 ч. Затем реакционную смесь упаривали, твердый остаток распределяли между этилацетатом и 0.5 М бикарбонатом натрия. Органическую фазу сушили над Na2SO4, после чего упаривали. К твердому остатку добавляли 1-дециламин (200 мкл, 1 ммоль) и N,N-диизопропилэтиламин (348 мкл, 2 ммоль). Реакционную смесь упаривали, остаток распределяли между хлороформом и 0.5 М бикарбонатом натрия, органический слой промывали водой, высушивали над Na2SO4, упаривали. Соединение 7 очищали на колонке (2×15 см) с силикагелем в системе этилацетат: гексан в соотношении 1:1 (об./об.). Полученный раствор упаривали, растворяли в диоксане (5 мл) и добавляли трифенилфосфин (262 мг, 1 ммоль), после чего выдерживали 20 ч при комнатной температуре, затем добавляли 1,5 мл 25%-ного водного раствора аммиака и оставляли на 20 ч при комнатной температуре. Реакционную смесь упаривали, продукт 9 выделяли на колонке с силикагелем (2×15 см) смесью растворителей хлороформ-этанол 9:1 (об/об). Полученный раствор упаривали, растворяли в диоксане, добавляли тригидрат фторида тетрабутиламмония (205 мг, 0.65 ммоль), оставляли на 20 ч при комнатной температуре, после чего упаривали. Твердый остаток очищали на колонке (2×15 см) с силикагелем. Продукт 1-11 элюировали смесью растворителей хлороформ: метанол (3:2). Выход 143 мг (75%) в виде твердых белых кристаллов. UV: λmax 277 нм. 1Н ЯМР (DMSO-d6, 300 МГц) δ 0.85 (3Н, t, J=6.7 Гц, -C9H18 CH 3 ), 1.21-1.30 (14Н, m, -NH-(CH2)2-C 7 H 14 -), 1.45-1.56 (2Н, m, -NH-CH2-CH 2 -), 1.84 (3Н, d, J=0.8 Гц, 5-СН3), 1.92-2.08 (2Н, m, Н-2'), 3.15-3.26 (2Н, m, -NH-CH2-), 3.41-3.46 (1Н, m, Н-3'), 3.50-3.56 (1Н, m, Н-4'), 3.56-3.63 (1Н, m, H-5'a), 3.63-3.72 (1H, m, H-5'b), 6.07 (1Н, t, J=5.8 Гц, Н-1'), 7.06 (1Н, t, J=5.6 Гц, Н-N4), 7.62-7.66 (1Н, m, Н-6). 13С ЯМР (DMSO-d6, 75 МГц) δ 13.15(5-СН3), 13.95 (-С9Н18СН3), 22.10, 26.50, 28.71, 28.88, 28.98, 29.04, 31.31 (-NH-(CH2)2-C 7 H14-), 28.63 (-NH-CH2-CH2-), 40.23 (-NH-CH2-), 41.04 (С-2'), 50.56 (С-3'), 60.78 (С-5'), 84.15 (С-1'), 87.11 (С-4'), 101.32 (С-5), 137.30 (С-6), 155.12 (С-2), 162.70 (С-4). HRMS (ESI) рассчитано для C20H36N4O3, m/z: 381.2866 [М+Н]+, найдено 381.2857.To a solution of azidothymidine 5 (134 mg, 0.5 mmol) in absolute pyridine was added tert-butyldimethylsilyl chloride (98 mg, 0.65 mmol) and left at +37°C for 20 h, after which the resulting solution was evaporated, the residue was partitioned between ethyl acetate and 0.5 M bicarbonate sodium. The organic fraction was collected, dried over Na 2 SO 4 and evaporated. 1,2,4-triazole (345 mg, 5 mmol) and 2-chlorophenyl dichlorophosphate (165 μl, 1 mmol) were added to the obtained solid residue and left at room temperature for 20 h. Then the reaction mixture was evaporated, the solid residue was partitioned between ethyl acetate and 0.5 M sodium bicarbonate. The organic phase was dried over Na 2 SO 4 and then evaporated. To the solid residue were added 1-decylamine (200 μl, 1 mmol) and N,N-diisopropylethylamine (348 μl, 2 mmol). The reaction mixture was evaporated, the residue was partitioned between chloroform and 0.5 M sodium bicarbonate, the organic layer was washed with water, dried over Na 2 SO 4 and evaporated.
Пример 12. Синтез 3'-амино-N4-додецил-5-метил-2',3'-дидезоксицитидина (1-12)Example 12 Synthesis of 3'-amino-N 4 -dodecyl-5-methyl-2',3'-dideoxycytidine (1-12)
Получен по методу, описанному в Примере 11, из 5 (134 мг, 0.5 ммоль) и 1-додециламина (185 мг, 1 ммоль) с выходом 161 мг (79%) в виде твердых белых кристаллов. UV: λmax 277 нм. 1Н ЯМР (DMSO-d6, 300 МГц) δ 0.85 (2Н, t, J=6.8 Гц, -С11Н22-СН 3 ), 1.20-1.30 (19Н, m, -NH-(CH2)2-C 9 H 18 -), 1.45-1.56 (2Н, m, -NH-CH2-CH 2 -), 1.85 (3Н, d, J=1.0 Гц, 5-СН3), 1.93-2.10 (2Н, m, Н-2'), 3.24-3.33 (2Н, m, -NH-CH 2 -), 3.37-3.47 (1Н, m, Н-3'), 3.54-3.58 (1Н, m, Н-4'), 3.58-3.63 (1H, m, H-5'a), 3.63-3.75 (1Н, m, H-5'b), 6.09 (1Н, dd, J=6.4, 5.3 Гц, Н-1'), 7.09 (1Н, t, J=5.7 Гц, H-N4), 7.63 -7.68 (1H, m, Н-6). 13С ЯМР (DMSO-d6, 75 МГц) δ 13.11 (5-СН3), 13.87 (-С11Н22-СН3), 22.06, 26.49, 28.69, 28.87, 29.01, 29.04, 31.27 (-NH-(CH2)2-C 9H18-), 28.60 (-NH-CH2-CH2-), 40.19 (-NH-CH2-), 40.78 (С-2'), 50.50 (С-3'), 60.73 (С-5'), 84.12 (С-1'), 86.88 (С-4'), 101.28 (С-5), 137.22 (С-6), 155.07 (С-2), 162.64 (С-4). HRMS (ESI) рассчитано для C22H40N4O3, m/z: 409.3179 [М+Н]+, найдено 409.3188.Obtained according to the method described in Example 11, from 5 (134 mg, 0.5 mmol) and 1-dodecylamine (185 mg, 1 mmol) with a yield of 161 mg (79%) in the form of solid white crystals. UV: λ max 277 nm. 1 H NMR (DMSO-d 6 , 300 MHz) δ 0.85 (2H, t, J=6.8 Hz, -C 11 H 22 - CH 3 ), 1.20-1.30 (19H, m, -NH-(CH 2 ) 2 - C 9 H 18 -), 1.45-1.56 (2Н, m, -NH-CH 2 - CH 2 -), 1.85 (3Н, d, J=1.0 Hz, 5-CH 3 ), 1.93-2.10 (2Н, m, H-2'), 3.24-3.33 (2H, m, -NH- CH 2 -), 3.37-3.47 (1H, m, H-3'), 3.54-3.58 (1H, m, H-4' ), 3.58-3.63 (1H, m, H-5'a), 3.63-3.75 (1H, m, H-5'b), 6.09 (1H, dd, J=6.4, 5.3 Hz, H-1') , 7.09 (1Н, t, J=5.7 Hz, HN 4 ), 7.63 -7.68 (1H, m, Н-6). 13 C NMR (DMSO-d 6 , 75 MHz) δ 13.11 (5-CH 3 ), 13.87 (-C 11 H 22 -CH 3 ), 22.06, 26.49, 28.69, 28.87, 29.01, 29.04, 31.27 (-NH- (CH 2 ) 2 - C 9 H 18 -), 28.60 (-NH-CH 2 - C H 2 -), 40.19 (-NH- C H 2 -), 40.78 (C-2'), 50.50 (C- 3'), 60.73 (С-5'), 84.12 (С-1'), 86.88 (С-4'), 101.28 (С-5), 137.22 (С-6), 155.07 (С-2), 162.64 (S-4). HRMS (ESI) calculated for C 22 H 40 N 4 O 3 , m/z: 409.3179 [M+H]+, found 409.3188.
Пример 13. Синтез 3'-ацетамидо-N4-децил-5-метил-2',3'-дидезоксицитидина (1-13)Example 13 Synthesis of 3'-acetamido-N 4 -decyl-5-methyl-2',3'-dideoxycytidine (1-13)
К раствору азидотимидина 5 (134 мг, 0.5 ммоль) в абсолютном пиридине добавляли трет-бутилдиметилсилилхлорид (98 мг, 0.65 ммоль) и оставляли при +37°С на 20 ч, после чего полученный раствор упаривали, остаток распределяли между этилацетатом и 0.5 М бикарбонатом натрия. Органическую фракцию собирали, сушили над Na2SO4 и упаривали. К полученному твердому остатку добавляли 1,2,4-триазол (345 мг, 5 ммоль) и 2-хлорфенилдихлорфосфат (165 мкл, 1 ммоль) и оставляли при комнатной температуре на 20 ч. Затем реакционную смесь упаривали, твердый остаток распределяли между этилацетатом и 0.5 М бикарбонатом натрия. Органическую фазу сушили над Na2SO4, после чего упаривали. К твердому остатку добавляли 1-дециламин (200 мкл, 1 ммоль) и N,N-диизопропилэтиламин (348 мкл, 2 ммоль). Реакционную смесь упаривали, остаток распределяли между хлороформом и 0.5 М бикарбонатом натрия, органический слой промывали водой, высушивали над Na2SO4, упаривали. Соединение 7 очищали на колонке (2×15 см) с силикагелем в системе этилацетат: гексан, 1:1 (об./об.). Полученный раствор упаривали, растворяли в диоксане (5 мл) и добавляли трифенилфосфин (262 мг, 1 ммоль), после чего выдерживали 20 ч при комнатной температуре, затем добавляли 1,5 мл 25%-ного водного раствора аммиака и оставляли на 20 ч при комнатной температуре. Реакционную смесь упаривали, продукт 9 выделяли на колонке с силикагелем (2×15 см) смесью растворителей хлороформ-этанол 9:1 (об./об.). Полученный раствор упаривали, растворяли в пиридине, добавляли уксусный ангидрид (61 мкл, 0.65 ммоль) и оставляли на 20 ч. Затем реакционную смесь упаривали, растворяли в диоксане, добавляли тригидрат фторида тетрабутиламмония (205 мг, 0.65 ммоль), оставляли на 20 ч при комнатной температуре, после чего упаривали. Твердый остаток очищали на колонке (2×15 см) с силикагелем. Продукт 1-13 элюировали системой растворителей этилацетат: этанол (9:1). Выход 188 мг (89%) в виде твердых белых кристаллов. UV: λmax 277 нм. 1Н ЯМР (DMSO-d6, 300 МГц) δ 0.86 (3Н, t, J=6.7 Гц, -С9Н18 СН 3 ), 1.22-1.30 (14Н, m, -NH-(CH2)2-C 7 H 14 -), 1.45-1.58 (2Н, m, -NH-CH2-CH 2 -), 1.83 (3Н, s, -СОСН3), 1.85 (3Н, d, J=0.7 Гц, 5-СН3), 2.07 (2Н, t, J=6.5 Гц, Н-2'), 3.23-3.32 (2Н, m, -NH-CH 2 -), 3.54 (1H, dt, J=11.9, 4.6 Гц, H-5'b), 3.64 (1Н, ddd, J=11.8, 5.2, 3.0 Гц, H-5'a), 3.75 (1Н, td, J=4.6, 3.0 Гц, Н-4'), 4.27 (1H, dtd, J=7.3, 6.5, 4.3 Гц, Н-3'), 5.01 (1Н, t, J=5.3 Гц, -ОН), 6.18 (1Н, t, J=6.5 Гц, Н-1'), 7.12 (1H, t, J=5.6 Гц, H-N4), 7.61-7.68 (1H, m, H-6), 8.30 (1H, d, J=7.3 Гц, -NH-СОСН3). 13C ЯМР (DMSO-d6, 75 МГц) δ 13.09 (5-CH3), 13.87 (-C9H18-CH3), 22.02, 26.43, 28.64, 28.80, 28.91, 28.96, 31.23 (-NH-(CH2)2-C 7H14-), 22.50 (-COCH3), 28.55 (-NH-CH2-CH2-), 37.75 (-NH-CH2-), 40.17 (C-2'), 49.02 (C-3'), 61.36 (C-5'), 84.18 (C-1'), 84.85 (С-4'), 101.62 (C-5), 137.03 (C-6), 154.97 (C-2), 162.63 (C-4), 169.11 (-COCH3). HRMS (ESI) рассчитано для C22H38N4O4, m/z: 445.2790 [M+Na]+, найдено 445.2796.To a solution of azidothymidine 5 (134 mg, 0.5 mmol) in absolute pyridine was added tert-butyldimethylsilyl chloride (98 mg, 0.65 mmol) and left at +37°C for 20 h, after which the resulting solution was evaporated, the residue was partitioned between ethyl acetate and 0.5 M bicarbonate sodium. The organic fraction was collected, dried over Na 2 SO 4 and evaporated. 1,2,4-triazole (345 mg, 5 mmol) and 2-chlorophenyl dichlorophosphate (165 μl, 1 mmol) were added to the obtained solid residue and left at room temperature for 20 h. Then the reaction mixture was evaporated, the solid residue was partitioned between ethyl acetate and 0.5 M sodium bicarbonate. The organic phase was dried over Na 2 SO 4 and then evaporated. To the solid residue were added 1-decylamine (200 μl, 1 mmol) and N,N-diisopropylethylamine (348 μl, 2 mmol). The reaction mixture was evaporated, the residue was partitioned between chloroform and 0.5 M sodium bicarbonate, the organic layer was washed with water, dried over Na 2 SO 4 and evaporated.
Пример 14. Синтез 3'-ацетамидо-N4-додецил-5-метил-2',3'-дидезоксицитидина (1-14)Example 14 Synthesis of 3'-acetamido-N 4 -dodecyl-5-methyl-2',3'-dideoxycytidine (1-14)
Получен по методу, описанному в Примере 13, из 5 (134 мг, 0.5 ммоль) и 1-додециламина (185 мг, 1 ммоль) с выходом 192 мг (85%) в виде твердых белых кристаллов. UV: λmax 277 нм. 1Н ЯМР (DMSO-d5, 300 МГц) δ 0.86 (3Н, t, J=6.7 Гц, -С11Н22 СН 3 ), 1.22-1.30 (18Н, m, -NH-(CH2)2-C 9 H 18 -), 1.45-1.58 (2Н, m, -NH-CH2-CH 2 -), 1.83 (3Н, s, -СОСН3), 1.85 (3Н, d, J=0.7 Гц, 5-СН3), 2.07 (2Н, t, J=6.5 Гц, Н-2'), 3.23 -3.32 (2Н, m, -NH-CH 2 -). 3.54 (1H, dt, J=11.9, 4.6 Гц, H-5'b), 3.64 (1Н, ddd, J=11.8, 5.2, 3.0 Гц, H-5'a), 3.75 (1H, td, J=4.6, 3.0 Гц, Н-4'), 4.27 (1Н, dtd, J=7.3, 6.5, 4.3 Гц, Н-3'), 5.01 (1Н, t, J=5.3 Гц, -ОН), 6.18 (1Н, t, J=6.5 Гц, Н-1'), 7.12 (1H, t, J=5.6 Гц, H-N4),.7.61-7.68 (1Н, m, Н-6), 8.30 (1H, d, J=7.3 Гц, -NH-СОСН3). 13С ЯМР (DMSO-d6, 75 МГц) δ 13.09 (5-СН3), 13.87 (-C9H18-CH3), 22.02, 26.43, 28.64, 28.80, 28.91, 28.96, 31.23 (-NH-(CH2)2-C 7H14-), 22.50 (-СОСН3), 28.55 (-NH-CH2-CH2-), 37.75 (-NH-CH2-), 40.17 (C-2'), 49.02 (C-3'), 61.36 (C-5'), 84.18 (С-1'), 84.85 (C-4'), 101.62 (C-5), 137.03 (C-6), 154.97 (C-2), 162.63 (C-4), 169.11 (-COCH3). HRMS (ESI) рассчитано для C24H42N4O4, m/z: 473.3104 [M+Na]+, найдено 473.3103.Obtained according to the method described in Example 13, from 5 (134 mg, 0.5 mmol) and 1-dodecylamine (185 mg, 1 mmol) with a yield of 192 mg (85%) in the form of solid white crystals. UV: λ max 277 nm. 1 H NMR (DMSO-d 5 , 300 MHz) δ 0.86 (3H, t, J=6.7 Hz, -C 11 H 22 CH 3 ), 1.22-1.30 (18H, m, -NH-(CH 2 ) 2 - C 9 H 18 - ), 1.45-1.58 (2Н, m, -NH-CH 2 - CH 2 -), 1.83 (3Н, s, -СОСН 3 ), 1.85 (3Н, d, J=0.7 Hz, 5- CH 3 ), 2.07 (2Н, t, J=6.5 Hz, Н-2'), 3.23 -3.32 (2Н, m, -NH- CH 2 -). 3.54 (1H, dt, J=11.9, 4.6 Hz, H-5'b), 3.64 (1H, ddd, J=11.8, 5.2, 3.0 Hz, H-5'a), 3.75 (1H, td, J= 4.6, 3.0 Hz, H-4'), 4.27 (1H, dtd, J=7.3, 6.5, 4.3 Hz, H-3'), 5.01 (1H, t, J=5.3 Hz, -OH), 6.18 (1H , t, J=6.5 Hz, H-1'), 7.12 (1H, t, J=5.6 Hz, HN 4 ), .7.61-7.68 (1H, m, H-6), 8.30 (1H, d, J \u003d 7.3 Hz, - NH - COCH 3 ). 13 C NMR (DMSO-d 6 , 75 MHz) δ 13.09 (5-CH 3 ), 13.87 (-C 9 H 18 - C H 3 ), 22.02, 26.43, 28.64, 28.80, 28.91, 28.96, 31.23 (-NH -(CH 2 ) 2 - C 7 H 14 -), 22.50 (-CO CH 3 ), 28.55 (-NH-CH 2 - C H 2 -), 37.75 (-NH-CH 2 -), 40.17 ( C -2'), 49.02 (C-3'), 61.36 (C-5'), 84.18 (C-1'), 84.85 (C-4'), 101.62 (C-5), 137.03 (C-6) , 154.97 (C-2), 162.63 (C-4), 169.11 ( -C OCH3). HRMS (ESI) calculated for C 24 H 42 N 4 O 4 , m/z: 473.3104 [M+Na]+, found 473.3103.
Пример 15. Синтез 3'-этиламино-N4-децил-5-метал-2',3'-дидезоксицитидина (1-15)Example 15 Synthesis of 3'-ethylamino-N 4 -decyl-5-metal-2',3'-dideoxycytidine (1-15)
К раствору азидотимидина 5 (134 мг, 0.5 ммоль) в абсолютном пиридине добавляли трет-бутилдиметилсилилхлорид (98 мг, 0.65 ммоль) и оставляли при +37°С на 20 ч, после чего полученный раствор упаривали, остаток распределяли между этилацетатом и 0.5 М бикарбонатом натрия. Органическую фракцию собирали, сушили над Na2SO4 и упаривали. К полученному твердому остатку добавляли 1,2,4-триазол (345 мг, 5 ммоль) и 2-хлорфенилдихлорфосфат (165 мкл, 1 ммоль) и оставляли при комнатной температуре на 20 ч. Затем реакционную смесь упаривали, твердый остаток распределяли между этилацетатом и 0.5 М бикарбонатом натрия. Органическую фазу сушили над Na2SO4, после чего упаривали. К твердому остатку добавляли 1-дециламин (200 мкл, 1 ммоль) и N,N-диизопропилэтиламин (348 мкл, 2 ммоль). Реакционную смесь упаривали, остаток распределяли между хлороформом и 0.5 М бикарбонатом натрия, органический слой промывали водой, высушивали над Na2SO4, упаривали. Соединение 7 очищали на колонке (2×15 см) с силикагелем в системе этилацетат: гексан, 1:1 (об./об.). Полученный раствор упаривали, растворяли в диоксане (5 мл) и добавляли трифенилфосфин (262 мг, 1 ммоль), после чего выдерживали 20 ч при комнатной температуре, затем добавляли 1,5 мл 25%-ного водного раствора аммиака и оставляли на 20 ч при комнатной температуре. Реакционную смесь упаривали, продукт 9 выделяли на колонке с силикагелем (2×15 см) смесью растворителей хлороформ-этанол 9:1 (об./об.). Полученный раствор упаривали, твердый остаток растворяли в этаноле и охлаждали до +4°С, добавляли уксусный альдегид (84 мкл, 1.5 ммоль), оставляли при +4°С на 2 ч, после чего добавляли боргидрид натрия (38 мг, 1 ммоль) и оставляли при комнатной температуре на 20 ч при перемешивании. Реакционную смесь упаривали, твердый остаток очищали на колонке с силикагелем. Продукт элюировали в системе хлороформ: этанол, 9:1 (об./об.), после чего полученный раствор упаривали, твердый остаток растворяли в диоксане, добавляли тригидрат фторида тетрабутиламмония (205 мг, 0.65 ммоль), оставляли на 20 ч при комнатной температуре, после чего упаривали. Твердый остаток очищали на колонке (2×15 см) с силикагелем. Продукт 1-15 элюировали системой растворителей хлороформ: метанол в соотношении 3:2 (об./об.). Выход 141 мг (69%) в виде твердых белых кристаллов. UV: λmax 277 нм. 1Н ЯМР (DMSO-d6, 300 МГц) δ 0.86 (3Н, t, J=6.5 Гц, -С9Н18-СН 3 ), 1.11 (3Н, t, J=7.1 Гц, -NH-CH2-CH 3 ), 1.17-1.38 (14Н, m, -NH-(CH2)2-C 7 H 14 -), 1.40-1.61 (4Н, m, -NH-CH2-CH 2 -), 1.85 (3Н, d, J=0.7 Гц, 5-СН3), 2.08 (1H, ddd, J=13.5, 7.4, 6.7 Гц, H-2'b), 2.26 (1H, ddd, J=13.5, 6.1, 4.9 Гц, H-2'a), 2.73 (2H, qd, J=6.9, 2.1 Гц, -NH-СН 2 -СН3), 3.29 (2H, dt, J=7.8, 6.4 Гц, -NH-CH 2 -), 3.48 (1H, ddd, J=7.4, 4.9, 4.1 Гц, H-3'), 3.60 (1H, dd, J=11.9, 3.9 Гц, H-5'b), 3.67 (1H, dd, J=11.8, 3.5 Гц, H-5'a), 3.89 (1H, dt, J=4.1, 3.5 Гц, H-4'), 4.90-5.43 (1H, m, -OH), 6.19 (1H, t, J=6.7, 6.1 Гц, Н-1'), 7.14 (1H, t, J=5.6 Гц, H-N4), 7.56-7.67 (1H, m, Н-6). 13C ЯМР (DMSO-d6, 75 МГц) δ 13.12 (5-СН3), 13.43 (-NH-CH2-CH3), 13.89 (-C9H18 CH3), 22.04, 26.44, 28.65, 28.82, 28.93, 28.98, 31.25 (-NH-(CH2)2-C 7H14-), 28.56 (-NH-CH2-CH2-), 36.68 (-NH-CH2-СН3), 40.18 (-NH-CH2-), 41.41 (C-2'), 57.27, (C-3'), 61.43 (C-5'), 83.52 (C-4'), 84.45 (С-1'), 101.66 (C-5), 137.12 (C-6), 155.00 (C-2), 162.66 (C-4). HRMS (ESI) рассчитано для C22H40N4O3, m/z: 409.3179 [M+H]+, найдено 409.3168.To a solution of azidothymidine 5 (134 mg, 0.5 mmol) in absolute pyridine was added tert-butyldimethylsilyl chloride (98 mg, 0.65 mmol) and left at +37°C for 20 h, after which the resulting solution was evaporated, the residue was partitioned between ethyl acetate and 0.5 M bicarbonate sodium. The organic fraction was collected, dried over Na 2 SO 4 and evaporated. 1,2,4-triazole (345 mg, 5 mmol) and 2-chlorophenyl dichlorophosphate (165 μl, 1 mmol) were added to the obtained solid residue and left at room temperature for 20 h. Then the reaction mixture was evaporated, the solid residue was partitioned between ethyl acetate and 0.5 M sodium bicarbonate. The organic phase was dried over Na 2 SO 4 and then evaporated. To the solid residue were added 1-decylamine (200 μl, 1 mmol) and N,N-diisopropylethylamine (348 μl, 2 mmol). The reaction mixture was evaporated, the residue was partitioned between chloroform and 0.5 M sodium bicarbonate, the organic layer was washed with water, dried over Na 2 SO 4 and evaporated.
Пример 16. Синтез 3'-этиламино-N4-додецил-5-метил-2',3'-дидезоксицитидина (1-16)Example 16 Synthesis of 3'-ethylamino-N 4 -dodecyl-5-methyl-2',3'-dideoxycytidine (1-16)
Получен по методу, описанному в примере 15, из 5 (134 мг, 0.5 ммоль) и 1-додециламина (185 мг, 1 ммоль) с выходом 164 мг (75%) в виде твердых белых кристаллов. UV: λmax 277 нм. 1Н ЯМР (DMSO-d6, 300 МГц) δ 0.86 (3Н, t, J=6.9 Гц, -С11Н22-СН 3 ), 1.12 (3Н, t, J=7.1 Гц, -NH-CH2-CH 3 ), 1.18-1.35 (18Н, m, -NH-(CH2)2-С 9 Н 18 -), 1.44-1.58 (2Н, m, -NH-CH2-CH 2 -), 1.85 (3Н, d, J=1.0 Гц, 5-CH3), 2.08 (1Н, ddd, J=13.9, 7.3, 6.7 Гц, H-2'a), 2.27 (1H, ddd, J=13.8, 6.4, 4.4 Гц, H-2'b), 2.74 (2H, qd, J=7.1, 2.2 Гц, -NH-CH 2 -CH3), 3.22-3.35 (2H, m, -NH-CH 2 -), 3.49 (1H, dt, J=7.3, 4.4 Гц, H-3'), 3.60 (1H, dd, J=11.9, 3.9 Гц, H-5'b), 3.67 (1H, dd, J=11.9, 3.5 Гц, H-5'a), 3.90 (1H, dt, J=4.2, 3.5 Гц, H-4'), 4.87-5.33 (1H, m, -OH), 6.19 (1H, t, J=6.5 Гц, Н-1'), 7.14 (1H, t, J=5.6 Гц, H-N4), 7.53-7.66 (1H, m, Н-6). 13C ЯМР (DMSO-d6, 75 МГц) δ 13.12 (5-СН3), 13.34 (-NH-CH2-CH3), 13.90 (-C11H22-CH3), 22.04, 26.45, 28.66, 28,83, 28.97, 31.25 (NH-(CH2)2-C 9H18-), 28.56 (-NH-CH2-CH2-), 36.59 (-NH-CH2-CH3), 40.18 (-NH-CH2-), 41.39 (C-2'), 57.25 (C-3'), 61.42 (C-5'), 83.43 (C-4'), 84.44 (С-1'), 101.67 (C-5), 137.12 (C-6), 154.99 (C-2), 162.66 (C-4). HRMS (ESI) рассчитано для C24H44N4O3, m/z: 437.3492 [M+H]+, найдено 437.3495.Obtained according to the method described in example 15, from 5 (134 mg, 0.5 mmol) and 1-dodecylamine (185 mg, 1 mmol) with a yield of 164 mg (75%) in the form of solid white crystals. UV: λ max 277 nm. 1 H NMR (DMSO-d 6 , 300 MHz) δ 0.86 (3H, t, J=6.9 Hz, -C 11 H 22 - CH 3 ), 1.12 (3H, t, J=7.1 Hz, -NH-CH 2 - CH 3 ), 1.18-1.35 (18Н, m, -NH-(CH 2 ) 2 - С 9 H 18 -), 1.44-1.58 (2Н, m, -NH-CH 2 - CH 2 - ), 1.85 ( 3Н, d, J=1.0 Hz, 5-CH 3 ), 2.08 (1Н, ddd, J=13.9, 7.3, 6.7 Hz, H-2'a), 2.27 (1H, ddd, J=13.8, 6.4, 4.4 Hz, H-2'b), 2.74 (2H, qd, J=7.1, 2.2 Hz, -NH- CH 2 -CH 3 ), 3.22-3.35 (2H, m, -NH- CH 2 -), 3.49 ( 1H, dt, J=7.3, 4.4 Hz, H-3'), 3.60 (1H, dd, J=11.9, 3.9 Hz, H-5'b), 3.67 (1H, dd, J=11.9, 3.5 Hz, H-5'a), 3.90 (1H, dt, J=4.2, 3.5 Hz, H-4'), 4.87-5.33 (1H, m, -OH), 6.19 (1H, t, J=6.5 Hz, H -1'), 7.14 (1H, t, J=5.6 Hz, HN 4 ), 7.53-7.66 (1H, m, H-6). 13 C NMR (DMSO-d 6 , 75 MHz) δ 13.12 (5-CH 3 ), 13.34 (-NH-CH 2 - C H 3 ), 13.90 (-C 11 H 22 - C H 3 ), 22.04, 26.45 , 28.66, 28.83, 28.97, 31.25 (NH-(CH 2 ) 2 - C 9 H 18 -), 28.56 (-NH-CH 2 - C H 2 -), 36.59 (-NH-CH 2 -CH 3 ), 40.18 (-NH-CH 2 -), 41.39 (C-2'), 57.25 (C-3'), 61.42 (C-5'), 83.43 (C-4'), 84.44 (C-1' ), 101.67 (C-5), 137.12 (C-6), 154.99 (C-2), 162.66 (C-4). HRMS (ESI) calculated for C 24 H 44 N 4 O 3 , m/z: 437.3492 [M+H]+, found 437.3495.
Пример 17. Синтез 3'-диэтиламино-N4-децил-5-метил-2',3'-дидезоксицитидина (1-17)Example 17 Synthesis of 3'-diethylamino-N 4 -decyl-5-methyl-2',3'-dideoxycytidine (1-17)
К раствору азидотимидина 5 (134 мг, 0.5 ммоль) в абсолютном пиридине добавляли трет-бутилдиметилсилилхлорид (98 мг, 0.65 ммоль) и оставляли при +37°С на 20 ч, после чего полученный раствор упаривали, остаток распределяли между этилацетатом и 0.5 М бикарбонатом натрия. Органическую фракцию собирали, сушили над Na2SO4 и упаривали. К полученному твердому остатку добавляли 1,2,4-триазол (345 мг, 5 ммоль) и 2-хлорфенилдихлорфосфат (165 мкл, 1 ммоль) и оставляли при комнатной температуре на 20 ч. Затем реакционную смесь упаривали, твердый остаток распределяли между этилацетатом и 0.5 М бикарбонатом натрия. Органическую фазу сушили над Na2SO4, после чего упаривали. К твердому остатку добавляли 1-дециламин (200 мкл, 1 ммоль) и N,N-диизопропилзтиламин (348 мкл, 2 ммоль). Реакционную смесь упаривали, остаток распределяли между хлороформом и 0.5 М бикарбонатом натрия, органический слой промывали водой, высушивали над Na2SO4, упаривали. Соединение 7 очищали на колонке (2×15 см) с силикагелем в системе этилацетат: гексан в соотношении 1:1 (об./об.). Полученный раствор упаривали, растворяли в диоксане (5 мл) и добавляли трифенилфосфин (262 мг, 1 ммоль), после чего выдерживали 20 ч при комнатной температуре, затем добавляли 1,5 мл 25%-ного водного раствора аммиака и оставляли на 20 ч при комнатной температуре. Реакционную смесь упаривали, продукт 9 выделяли на колонке с силикагелем (2×15 см) смесью растворителей хлороформ-этанол 9:1 (об./об.). Полученный раствор упаривали, твердый остаток растворяли в этаноле и охлаждали до +4°С, добавляли уксусный альдегид (560 мкл, 10 ммоль), оставляли при +4°С на 2 ч, после чего добавляли цианоборгидрид натрия (94 мг, 1.5 ммоль) и выдерживали при комнатной температуре на 20 ч при перемешивании. Реакционную смесь упаривали, твердый остаток очищали на колонке с силикагелем. Продукт элюировали в системе хлороформ: этанол в соотношении 9:1 (об./об.), после чего полученный раствор упаривали, твердый осадок растворяли в диоксане, добавляли тригидрат фторида тетрабутиламмония (205 мг, 0.65 ммоль), оставляли на 20 ч при комнатной температуре, после чего упаривали. Твердый остаток очищали на колонке (2×15 см) с силикагелем. Продукт 1-17 элюировали системой растворителей хлороформ: этанол в соотношении 4:1 (об./об.). Выход 170 мг (78%) в виде твердых белых кристаллов. UV: λmax 277 нм. 1Н ЯМР (DMSO-d6, 300 МГц) δ 0.86 (3Н, t, J=6.6 Гц, -С9Н18-СН 3 ), 1.09 (6Н, t, J=7.1 Гц, -N-(CH2-CH 3 )2), 1.17-1.38 (14Н, m, -NH-(CH2)2-C 7 H 14 -), 1.40-1.61 (4H, m, -NH-CH2-CH2-), 1.85 (3Н, d,J=0.7 Гц, 5-CH3), 2.08 (1H, ddd, J=13.5, 7.7, 6.7 Гц, H-2'b), 2.26 (1Н, ddd, J=13.5, 6.1, 4.7 Гц, H-2'a), 2.65 (4H, qd, J=6.9, 2.1 Гц, -N-(CH2-CH3)2), 3.29 (2H, dt, J=7.8, 6.4 Гц, -NH-CH2-). 3.45 (1H, ddd, J=1.1, 4.7, 4.5 Гц, H-3'), 3.60 (1H, dd, J=11.9, 3.9 Гц, H-5'b), 3.67 (1H, dd, J=11.8, 3.5 Гц, H-5'a), 3.89 (1H, dt, J=4.5, 3.5 Гц, H-4'), 4.90-5.43 (1H, m, -OH), 6.19 (1H, t, J=6.7, 6.1 Гц, Н-1'), 7.14 (1H, t, J=5.6 Гц, H-N4), 7.56-7.67 (1H, m, Н-6). 13C ЯМР (DMSO-d6, 75 МГц) δ 13.12 (5-СН3), 13.43 (-NH-CH2-CH3), 13.89 (-C9H18CH3), 22.04, 26.44, 28.65, 28.82, 28.93, 28.98, 31.25 (-NH-(CH2)2-C7H14-), 28.56 (-NH-CH2-CH2-), 36.68 (-NH-CH2-CH3), 40.18 (-NH-CH2-), 41.41 (C-2'), 57.27, (C-3'), 61.43 (C-5'), 83.52 (C-4'), 84.45 (С-1'), 101.66 (C-5), 137.12 (C-6), 155.00 (C-2), 162.66 (C-4). HRMS (ESI) рассчитано для C24H44N4O3, m/z: 437.3492 [M+H]+, найдено 437.3494.To a solution of azidothymidine 5 (134 mg, 0.5 mmol) in absolute pyridine was added tert-butyldimethylsilyl chloride (98 mg, 0.65 mmol) and left at +37°C for 20 h, after which the resulting solution was evaporated, the residue was partitioned between ethyl acetate and 0.5 M bicarbonate sodium. The organic fraction was collected, dried over Na 2 SO 4 and evaporated. 1,2,4-triazole (345 mg, 5 mmol) and 2-chlorophenyl dichlorophosphate (165 μl, 1 mmol) were added to the obtained solid residue and left at room temperature for 20 h. Then the reaction mixture was evaporated, the solid residue was partitioned between ethyl acetate and 0.5 M sodium bicarbonate. The organic phase was dried over Na 2 SO 4 and then evaporated. To the solid residue were added 1-decylamine (200 μl, 1 mmol) and N,N-diisopropylethylamine (348 μl, 2 mmol). The reaction mixture was evaporated, the residue was partitioned between chloroform and 0.5 M sodium bicarbonate, the organic layer was washed with water, dried over Na 2 SO 4 and evaporated.
Пример 18. Синтез 3'-диэтиламино-N4-додецил-5-метил-2',3'-дидезоксицитидина (1-18)Example 18 Synthesis of 3'-diethylamino-N 4 -dodecyl-5-methyl-2',3'-dideoxycytidine (1-18)
Получен по методу, описанному в Примере 17, из 5 (134 мг, 0.5 ммоль) и 1-додециламина (185 мг, 1 ммоль) с выходом 153 мг (66%) в виде твердых белых кристаллов. UV: λmax 211 нм. 1Н ЯМР (DMSO-d6, 300 МГц) δ 0.86 (3Н, t, J=6.6 Гц, -C11H22-CH3), 1.09 (6Н, t, J=7.1 Гц, -N-(CH2-CH 3 )2), 1.17-1.38 (18Н, m, -NH-(CH2)2-C 9 H 18 -), 1.40-1.61 (4H, m, -NH-CH2-CH2-), 1.85 (3Н, d, J=0.7 Гц, 5-СН3), 2.08 (1H, ddd, J=13.5, 7.7, 6.7 Гц, H-2'b), 2.26 (1H, ddd, J=13.5, 6.1, 4.7 Гц, H-2'a), 2.65 (4H, qd, J=6.9, 2.1 Гц, -N-(CH 2 -CH3)2), 3.29 (2H, dt, J=7.8, 6.4 Гц, -NH-CH2-), 3.45 (1H, ddd, J=7.7, 4.7, 4.5 Гц, H-3'), 3.60 (1H, dd, J=11.9, 3.9 Гц, H-5'b), 3.67 (1H, dd, J=11.8, 3.5 Гц, H-5'а), 3.89 (1Н, dt, J=4.5, 3.5 Гц, Н-4'), 4.90-5.43 (1H, m, -OH), 6.19 (1H, t, J=6.7, 6.1 Гц, H-l'), 7.14 (1H, t, J=5.6 Гц, H-N4), 7.56-7.67 (1H, m, Н-6). 13C ЯМР (DMSO-d6, 75 МГц) δ 13.12 (5-СН3), 13.43 (-NH-CH2-CH3), 13.89 (-C9H18 CH3), 22.04, 26.44, 28.65, 28.82, 28.93, 28.98, 31.25 (-NH-(CH2)2-C 7H14-), 28.56 (-NH-CH2-CH2-), 36.68 (-NH-CH2-CH3), 40.18 (-NH-CH2-), 41.41 (C-2'), 57.27, (C-3'), 61.43 (C-5'), 83.52 (C-4'), 84.45 (С-1'), 101.66 (C-5), 137.12 (C-6), 155.00 (C-2), 162.66 (C-4). HRMS (ESI) рассчитано для C26H48N4O3, m/z: 465.3805 [M+H]+, найдено 465.3806.Obtained according to the method described in Example 17, from 5 (134 mg, 0.5 mmol) and 1-dodecylamine (185 mg, 1 mmol) with a yield of 153 mg (66%) in the form of solid white crystals. UV: λ max 211 nm. 1 H NMR (DMSO-d 6 , 300 MHz) δ 0.86 (3H, t, J=6.6 Hz, -C 11 H 22 -CH 3 ), 1.09 (6H, t, J=7.1 Hz, -N-(CH 2 - CH 3 ) 2 ), 1.17-1.38 (18Н, m, -NH-(CH 2 ) 2 - C 9 H 18 -), 1.40-1.61 (4H, m, -NH-CH 2 -CH 2 -) , 1.85 (3H, d, J=0.7 Hz, 5-CH 3 ), 2.08 (1H, ddd, J=13.5, 7.7, 6.7 Hz, H-2'b), 2.26 (1H, ddd, J=13.5, 6.1, 4.7 Hz, H-2'a), 2.65 (4H, qd, J=6.9, 2.1 Hz, -N-( CH 2 -CH 3 ) 2 ), 3.29 (2H, dt, J=7.8, 6.4 Hz , -NH-CH 2 -), 3.45 (1H, ddd, J=7.7, 4.7, 4.5 Hz, H-3'), 3.60 (1H, dd, J=11.9, 3.9 Hz, H-5'b), 3.67 (1H, dd, J=11.8, 3.5 Hz, H-5'a), 3.89 (1H, dt, J=4.5, 3.5 Hz, H-4'), 4.90-5.43 (1H, m, -OH) , 6.19 (1H, t, J=6.7, 6.1 Hz, H-l'), 7.14 (1H, t, J=5.6 Hz, HN 4 ), 7.56-7.67 (1H, m, H-6). 13 C NMR (DMSO-d 6 , 75 MHz) δ 13.12 (5-CH 3 ), 13.43 (-NH-CH 2 - C H 3 ), 13.89 (-C 9 H 18 C H 3 ), 22.04, 26.44, 28.65, 28.82, 28.93, 28.98, 31.25 (-NH-(CH 2 ) 2 - C 7 H 14 -), 28.56 (-NH-CH 2 - C H 2 -), 36.68 (-NH- CH 2 -CH 3 ), 40.18 (-NH-CH 2 -), 41.41 (C-2'), 57.27 (C-3'), 61.43 (C-5'), 83.52 (C-4'), 84.45 (C- 1'), 101.66 (C-5), 137.12 (C-6), 155.00 (C-2), 162.66 (C-4). HRMS (ESI) calculated for C 26 H 48 N 4 O 3 , m/z: 465.3805 [M+H]+, found 465.3806.
Пример 19. Синтез 3'-диметиламино-N4-децил-5-метил-2',3'-дидезоксицитидина (1-19)Example 19 Synthesis of 3'-dimethylamino-N 4 -decyl-5-methyl-2',3'-dideoxycytidine (1-19)
К раствору азидотимидина 5 (134 мг, 0.5 ммоль) в абсолютном пиридине добавляли трет-бутилдиметилсилилхлорид (98 мг, 0.65 ммоль) и оставляли при +37°С на 20 ч, после чего полученный раствор упаривали, остаток распределяли между этилацетатом и 0.5 М бикарбонатом натрия. Органическую фракцию собирали, сушили над Na2SO4 и упаривали. К полученному твердому остатку добавляли 1,2,4-триазол (345 мг, 5 ммоль) и 2-хлорфенилдихлорфосфат (165 мкл, 1 ммоль) и оставляли при комнатной температуре на 20 ч. Затем реакционную смесь упаривали, твердый остаток распределяли между этилацетатом и 0.5 М бикарбонатом натрия. Органическую фазу сушили над Na2SO4, после чего упаривали. К твердому остатку добавляли 1-дециламин (200 мкл, 1 ммоль) и N,N-диизопропилэтиламин (348 мкл, 2 ммоль). Реакционную смесь упаривали, остаток распределяли между хлороформом и 0.5 М бикарбонатом натрия, органический слой промывали водой, высушивали над Na2SO4, упаривали. Соединение 7 очищали на колонке (2×15 см) с силикагелем в системе этилацетат: гексан в соотношении 1:1 (об./об.). Полученный раствор упаривали, растворяли в диоксане (5 мл) и добавляли трифенилфосфин (262 мг, 1 ммоль), после чего выдерживали 20 ч при комнатной температуре, затем добавляли 1,5 мл 25%-ного водного раствора аммиака и оставляли на 20 ч при комнатной температуре. Реакционную смесь упаривали, продукт 9 выделяли на колонке с силикагелем (2×15 см) смесью растворителей хлороформ-этанол 9:1 (об./об.). Полученный раствор упаривали, твердый остаток растворяли в метаноле, добавляли 37%-й формалин (370 мкл, 5 ммоль), ждали 2 ч, после чего добавляли цианоборгидрид натрия (94 мг, 1.5 ммоль) и оставляли при комнатной температуре на 20 ч при перемешивании. Реакционную смесь упаривали, твердый остаток очищали на колонке с силикагелем. Продукт элюировали в системе хлороформ: этанол в соотношении 9:1 (об./об.), после чего полученный раствор упаривали, твердый остаток растворяли в диоксане, добавляли тригидрат фторида тетрабутиламмония (205 мг, 0.65 ммоль), оставляли на 20 ч при комнатной температуре, после чего упаривали. Твердый остаток очищали на колонке (2×15 см) с силикагелем. Продукт 1-17 элюировали системой растворителей хлороформ: этанол в соотношении 3: 2 (об./об.). Выход 125 мг (61%) в виде твердых белых кристаллов. UV: λmax 277 нм. 1Н ЯМР (DMSO-d6, 300 МГц) δ 0.86 (3Н, t, J=6.6 Гц, -С9Н18-СН 3 ), 1.17-1.38 (14Н, m, -NH-(CH2)2-C 7 H 14 -), 1.40-1.61 (4Н, m, -NH-CH2-СН 2-), 1.85 (3Н, d, J=0.7 Гц, 5-СН3), 2.08 (1H, ddd, J=13.5, 7.7, 6.7 Гц, H-2'b), 2.26 (1H, ddd, J=13.5, 6.1, 4.8 Гц, H-2'a), 2.46 (6Н, s, -N-(CH 3 ) 2 ), 3.29 (2Н, dt, J=7.8, 6.4 Гц, -NH-СН 2 -), 3.45 (1H, ddd, J=7.7, 4.8, 4.3 Гц, H-3'), 3.60 (1H, dd, J=11.9, 3.9 Гц, H-5'b), 3.67 (1H, dd, J=11.8, 3.5 Гц, H-5'a), 3.89 (1H, dt, J=4.3, 3.5 Гц, H-4'), 4.90-5.43 (1H, m, -OH), 6.19 (1H, t, J=6.7, 6.1 Гц, Н-1'), 7.14 (1H, t, J=5.6 Гц, H-N4), 7.56-7.67 (1H, m, H-6). 13C ЯМР (DMSO-d6, 75 МГц) δ 13.12 (5-CH3), 13.43 (-NH-CH2-CH3), 13.89 (-C9H18CH3), 22.04, 26.44, 28.65, 28.82, 28.93, 28.98, 31.25 (-NH-(CH2)2-C 7H14-), 28.56 (-NH-CH2-CH2-), 36.68 (-NH-CH2-CH3), 40.18 (-NH-CH2-), 41.41 (C-2'), 57.27, (C-3'), 61.43 (C-5'), 83.52 (C-4'), 84.45 (С-1'), 101.66 (C-5), 137.12 (C-6), 155.00 (C-2), 162.66 (C-4). HRMS (ESI) рассчитано для C22H40N4O3, m/z: 409.3179 [M+H]+, найдено 409.3175.To a solution of azidothymidine 5 (134 mg, 0.5 mmol) in absolute pyridine was added tert-butyldimethylsilyl chloride (98 mg, 0.65 mmol) and left at +37°C for 20 h, after which the resulting solution was evaporated, the residue was partitioned between ethyl acetate and 0.5 M bicarbonate sodium. The organic fraction was collected, dried over Na 2 SO 4 and evaporated. 1,2,4-triazole (345 mg, 5 mmol) and 2-chlorophenyl dichlorophosphate (165 μl, 1 mmol) were added to the obtained solid residue and left at room temperature for 20 h. Then the reaction mixture was evaporated, the solid residue was partitioned between ethyl acetate and 0.5 M sodium bicarbonate. The organic phase was dried over Na 2 SO 4 and then evaporated. To the solid residue were added 1-decylamine (200 μl, 1 mmol) and N,N-diisopropylethylamine (348 μl, 2 mmol). The reaction mixture was evaporated, the residue was partitioned between chloroform and 0.5 M sodium bicarbonate, the organic layer was washed with water, dried over Na 2 SO 4 and evaporated.
Пример 20. Синтез 3'-диметиламино-N4-додецил-5-метил-2',3'-дидезоксицитидина (1-20)Example 20 Synthesis of 3'-dimethylamino-N 4 -dodecyl-5-methyl-2',3'-dideoxycytidine (1-20)
Получен по методу, описанному в примере 19, из 5 (134 мг, 0.5 ммоль) и 1-додециламина (185 мг, 1 ммоль) с выходом 162 мг (74%) в виде твердых белых кристаллов. UV: λmax 277 нм. 1Н ЯМР (DMSO-d6, 300 МГц) δ 0.86 (3Н, t, J=6.6 Гц, -С11Н22-СН 3 ), 1.17-1.38 (18Н, m, -NH-(CH2)2-C 9 H 18 -), 1.40-1.61 (4Н, m, -NH-CH2-CH 2 -), 1.85 (3Н, d, J=0.7 Гц, 5-СН3), 2.08 (1Н, ddd, J=13.5, 7.7, 6.7 Гц, H-2'b), 2.26 (1H, ddd, J=13.5, 6.1, 4.8 Гц, H-2'a), 2.46 (6H, s, -N-(CH 3 )2), 3.29 (2H, dt, J=7.8, 6.4 Гц, -NH-CH 2 -), 3.45 (1H, ddd, J=7.7, 4.8, 4.3 Гц, H-3'), 3.60 (1H, dd, J=11.9, 3.9 Гц, H-5'b), 3.67 (1H, dd, J=11.8, 3.5 Гц, H-5'a), 3.89 (1H, dt, J=4.3, 3.5 Гц, H-4'), 4.90-5.43 (1H, m, -OH), 6.19 (1H, t, J=6.7, 6.1 Гц, Н-1'), 7.14 (1H, t,J=5.6 Гц, H-N4), 7.56-7.67 (1H, m, Н-6), 13C ЯМР (DMSO-d6, 75 МГц) δ 13.12 (5-СНз), 13.43 (-NH-CH2-CH3), 13.89 (-C9H18 CH3), 22.04, 26.44, 28.65, 28.82, 28.93, 28.98, 31.25 (-NH-(CH2)2-C 7H14-), 28.56 (-NH-CH2-CH2-), 36.68 (-NH-CH2-CH3), 40.18 (-NH-CH2-), 41.41 (C-2'), 57.27, (C-3'), 61.43.(C-5'), 83.52 (C-4'), 84.45 (С-1'), 101.66 (C-5), 137.12 (C-6), 155.00 (C-2), 162.66 (C-4). HRMS (ESI) рассчитано для C24H44N4O3, m/z: 437.3492 [M+H]+, найдено 437.3486.Obtained according to the method described in example 19, from 5 (134 mg, 0.5 mmol) and 1-dodecylamine (185 mg, 1 mmol) with a yield of 162 mg (74%) in the form of solid white crystals. UV: λ max 277 nm. 1 H NMR (DMSO-d 6 , 300 MHz) δ 0.86 (3H, t, J=6.6 Hz, -C 11 H 22 - CH 3 ), 1.17-1.38 (18H, m, -NH-(CH 2 ) 2 - C 9 H 18 -), 1.40-1.61 (4Н, m, -NH-CH 2 - CH 2 -), 1.85 (3Н, d, J=0.7 Hz, 5-CH 3 ), 2.08 (1Н, ddd, J=13.5, 7.7, 6.7 Hz, H-2'b), 2.26 (1H, ddd, J=13.5, 6.1, 4.8 Hz, H-2'a), 2.46 (6H, s, -N-( CH 3 ) 2 ), 3.29 (2H, dt, J=7.8, 6.4 Hz, -NH- CH 2 -), 3.45 (1H, ddd, J=7.7, 4.8, 4.3 Hz, H-3'), 3.60 (1H, dd, J=11.9, 3.9 Hz, H-5'b), 3.67 (1H, dd, J=11.8, 3.5 Hz, H-5'a), 3.89 (1H, dt, J=4.3, 3.5 Hz, H -4'), 4.90-5.43 (1H, m, -OH), 6.19 (1H, t, J=6.7, 6.1 Hz, H-1'), 7.14 (1H, t, J=5.6 Hz, HN 4 ) , 7.56-7.67 (1H, m, H-6), 13 C NMR (DMSO-d 6 , 75 MHz) δ 13.12 (5-CH3), 13.43 (-NH-CH 2 - C H 3 ), 13.89 (- C 9 H 18 C H 3 ), 22.04, 26.44, 28.65, 28.82, 28.93, 28.98, 31.25 (-NH-(CH 2 ) 2 - C 7 H 14 -), 28.56 (-NH-CH 2 - C H 2 -), 36.68 (-NH-CH 2 -CH 3 ), 40.18 (-NH-CH 2 -), 41.41 (C-2'), 57.27, (C-3'), 61.43.(C-5' ), 83.52 (C-4'), 84.45 (C-1'), 101.66 (C-5), 137.12 (C-6), 155.00 (C-2), 162.66 (C-4). HRMS (ESI) calculated for C 24 H 44 N 4 O 3 , m/z: 437.3492 [M+H]+, found 437.3486.
Пример 21. Синтез 3'-O-(8-гидрокси-3,6-диоксаоктилоксикарбонил)-N4-децил-2'-дезоксицитидина (1-21)Example 21 Synthesis of 3'-O-(8-hydroxy-3,6-dioxaoctyloxycarbonyl)-N 4 -decyl-2'-deoxycytidine (1-21)
К раствору тимидина (2) (121 мг, 0.5 ммоль) в абсолютном пиридине, охлажденному до +4°С, добавляли трет-бутилдиметилсилилхлорид (90 мг, 0.6 ммоль) и оставляли при +4°С на 20 ч. Полученный раствор упаривали, твердый остаток распределяли между этилацетатом и 0.5 М бикарбонатом натрия. Органическую фазу сушили над Na2SO4, после чего упаривали. Твердый остаток растворяли в DMF (3 мл) и добавляли CDI (297 мг, 1.83 ммоль), после чего оставляли при +37°С на 48 ч. Затем добавляли триэтиленгликоль (273 мкл, 2 ммоль) в диоксане и выдерживали 48 ч при +37°С. Реакционную смесь упаривали, остаток распределяли между 40% гексаном в хлороформе (10 мл) и 0,5 М раствором бикарбоната натрия (10 мл), органический слой промывали водой (5×5 мл), высушивали над Na2SO4, упаривали, переупаривали с пиридином и растворяли в пиридине. К раствору добавляли TBDMSCl (98 мг, 0.65 ммоль) и оставляли при +20°С на 20 ч, затем распределяли между хлороформом (10 мл) и 0,5 М раствором бикарбоната натрия (10 мл), органический слой промывали водой (5×5 мл), высушивали над Na2SO4. Продукт 12 очищали на колонке с силикагелем (2×15 см) в системе хлороформ: этилацетат: этанол, 5:5:0,1 (об./об./об.). Целевую фракцию упаривали, переупаривали с пиридином и растворяли в пиридине (5 мл). К охлажденному до 0°С раствору добавляли 1,2,4-триазол (345 мг, 5 ммоль) и 2-хлорфенилдихлорфосфат (165 мкл, 1 ммоль). Смесь оставляли на 20 ч при комнатной температуре, затем упаривали, остаток распределяли между хлороформом и 0.5 М бикарбонатом натрия, органический слой промывали водой, высушивали над Na2SO4, упаривали, растворяли в безводном диоксане (3 мл), охлаждали до 0°С и добавляли 1-дециламин (200 мкл, 1 ммоль). Спустя 20 ч при комнатной температуре смесь упаривали, остаток распределяли между хлороформом и водой, органический слой промывали водой, высушивали над Na2SO4, упаривали. Остаток растворяли в диоксане (3 мл) и добавляли Bu4NF⋅3H2O (380 мг, 1.2 ммоль). Реакционную смесь упаривали, остаток распределяли между 40% гексаном в хлороформе (10 мл) и 0,5 М раствором бикарбоната натрия (10 мл), органический слой промывали водой (5×5 мл), высушивали над Na2SO4, упаривали. Соединение 1-21 очищали на колонке с силикагелем (2×15 см) и элюировали системой растворителей этилацетат: этанола, 20:1 (об./об.). Выход 175 мг (63%) в виде твердых белых кристаллов. УФ: λmax 273 нм. 1Н ЯМР (400 МГц, DMSO-d6) δ 0.85 (3Н, t, J=6.8 Гц, -СН2-СН 3 ), 1.23-1.29 (14Н, m, -NH-(СН2)2-(СН 2 ) 7 -), 1.46-1.56 (2Н, m, -NH-CH2-CH 2 -), 1.84 (3Н, d, J=1.1 Гц, 5-СН3), 2.19 (1H, ddd, J=14.2, 8.8, 5.9 Гц, 2'-На), 2.28 (1Н, ddd, J=14.0, 5.7, 1.8 Гц, 2'-Hb), 3.25-3.29 (2Н, m, -NH-CH2-), 3.40-3.65 (12Н, m, 5'-СН2+-CH 2 OC2 H 4 OC 2 H 4OH, 4.02 (1Н, td, J=3.6, 1.8 Гц, 4'-Н), 4.20-4.25 (2Н, m, -СО3-СН2-), 4.54 (1Н, t, J=5.5 Гц, -СН2-СН2-ОН), 5.13 (1Н, dt, J=5.9, 1.8 Гц, 3'-Н), 5.15 (1H, t, J=5.3 Гц, 5'-OH), 6.17 (1H, dd, J=8.8, 5.6 Гц, 1'-Н), 7.14 (1H, t, J=5.7 Гц, N4-H), 7.54-7.58 (1H, m, 6-H). 13C ЯМР (101 МГц, DMSO-d6) δ 13.09 (5-CH3), 13.88 (-CH2-CH3), 22.02, 26.41, 28.51, 28.63, 28.78, 28.90, 28.95, 31.23 (-NH-CH2-(CH2 ) 8 -), 36.96 (2'-C), 40.18 (-NH-CH2-), 60.18 (-CH2-CH2-OH), 61.37 (5'-C), 67.01, 68.06, 69.72, 72.31 (-СО3-СН 2ОС 2 Н 4 ОСН 2 -СН 2 -ОН), 78.62 (3'-C), 84.04 (1'-С), 84.60 (4'-C), 102.02 (5-C), 136.91 (6-C), 153.84 (-CO3-), 154.90 (2-C), 162.65 (4-C). HRMS (ESI) рассчитано для C27H47N3O9, m/z: 558.3391 [M+H]+, найдено 558.3400.To a solution of thymidine (2) (121 mg, 0.5 mmol) in absolute pyridine, cooled to +4°С, was added tert-butyldimethylsilyl chloride (90 mg, 0.6 mmol) and left at +4°С for 20 h. The resulting solution was evaporated, the solid residue was partitioned between ethyl acetate and 0.5 M sodium bicarbonate. The organic phase was dried over Na2SO4, after which it was evaporated. The solid residue was dissolved in DMF (3 ml) and CDI (297 mg, 1.83 mmol) was added, after which it was left at +37°C for 48 h. Then triethylene glycol (273 μl, 2 mmol) in dioxane was added and kept for 48 h at + 37°C. The reaction mixture was evaporated, the residue was partitioned between 40% hexane in chloroform (10 ml) and 0.5 M sodium bicarbonate solution (10 ml), the organic layer was washed with water (5×5 ml), dried over Na2SO4, evaporated, reevaporated with pyridine and dissolved in pyridine. TBDMSCl (98 mg, 0.65 mmol) was added to the solution and left at +20°C for 20 h, then partitioned between chloroform (10 ml) and 0.5 M sodium bicarbonate solution (10 ml), the organic layer was washed with water (5× 5 ml), dried over Na2SO4.
Пример 22. Синтез 3'-O-(8-гвдрокси-3,6-диоксаоктилоксикарбонил)-N4-додецил-2'-дезоксицитидина (1-22)Example 22 Synthesis of 3'-O-(8-hydrooxy-3,6-dioxaoctyloxycarbonyl)-N 4 -dodecyl-2'-deoxycytidine (1-22)
Получен по методу, описанному в примере 21, из 2 (121 мг, 0.5 ммоль) и 1-додециламина (185 мг, 1 ммоль). Выход 191 мг (65%) в виде твердых белых кристаллов. УФ: λmax 273 нм. 1Н ЯМР (300 МГц, DMSO-d6) δ 0.85 (3Н, t, J=6.6 Гц, -СН2-СН3), 1.21-1.30 (18Н, m, -NH-(CH2)2-(CH 2 ) 9 -). 1.46-1.57 (2Н, m, -NH-СН2-СН 2 -), 1.86 (3Н, s, 5-СН3), 2.20 (1H, ddd, J=14.1, 8.8, 5.8 Гц, 2'-На), 2.30 (1H, ddd, J=14.1, 5.8, 1.8 Гц, 2'-Hb), 3.26-3.33 (2Н, m, -NH-CH2-), 3.40-3.66 (12Н, m, 5'-СН 2 +-СН 2 ОС 2 Н 4 ОС 2 Н 4 ОН), 4.04 (1H, td, J=3.6, 1.8 Гц, 4'-Н), 4.18-4.27 (2Н, m, -CO3-СН2-), 4.55 (1H, t, J=5.4 Гц, -СН2-СН2-ОН), 5.15 (1Н, dt, J=5.8, 1.8 Гц, 3'-Н), 5.19 (1H, t, J=5.4 Гц, 5'-ОН), 6.19 (1Н, dd, J=8.8, 5.6 Гц, 1'-Н), 7.19 (1H, t, J=5.6 Гц, N4-H), 7.59 (1H, s, 6-H). 13C ЯМР (75 МГц, DMSO-d6) δ 13.10 (5-CH3), 13.86 (-CH2-CH3), 22.09, 26.51, 28.59, 28.73, 28.90, 29.05, 29.08, 31.31 (-NH-CH2-(CH 2 ) 10 -). 37.12 (2'-C), 40.27 (-NH-CH2-), 60.25 (-CH2-CH2-OH), 61.43 (5'-C), 67.02, 68.13, 69.76, 69.81, 72.38 (-CO3-CH 2 OC 2 H 4 OCH 2 -СН2-ОН), 78.72 (3'-C), 84.18 (l'-C), 84.74 (4'-C), 102.15 (5-C), 136.90 (6-C), 153.90 (-CO3-), 155.08 (2-C), 162.72 (4-C). HRMS (ESI) C29H51N3O9, m/z: 586.3698 [M+H]+, найдено 586.3717.Obtained according to the method described in example 21, from 2 (121 mg, 0.5 mmol) and 1-dodecylamine (185 mg, 1 mmol). Yield 191 mg (65%) as solid white crystals. UV: λ max 273 nm. 1 H NMR (300 MHz, DMSO-d 6 ) δ 0.85 (3H, t, J=6.6 Hz, -CH 2 -CH 3 ), 1.21-1.30 (18H, m, -NH-(CH 2 ) 2 - ( CH 2 ) 9 - ). 1.46-1.57 (2H, m, -NH-CH 2 - CH 2 -), 1.86 (3H, s, 5-CH 3 ), 2.20 (1H, ddd, J=14.1, 8.8, 5.8 Hz, 2'-Na ), 2.30 (1H, ddd, J=14.1, 5.8, 1.8 Hz, 2'-Hb), 3.26-3.33 (2Н, m, -NH-CH 2 -), 3.40-3.66 (12Н, m, 5'- CH 2 + - CH 2 O C 2 H 4 O C 2 H 4 OH), 4.04 (1H, td, J \u003d 3.6, 1.8 Hz, 4'-H), 4.18-4.27 (2H, m, -CO 3 - CH 2 -), 4.55 (1H, t, J=5.4 Hz, -CH 2 -CH 2 -OH), 5.15 (1H, dt, J=5.8, 1.8 Hz, 3'-H), 5.19 (1H, t , J=5.4 Hz, 5'-OH), 6.19 (1Н, dd, J=8.8, 5.6 Hz, 1'-Н), 7.19 (1H, t, J=5.6 Hz, N 4 -H), 7.59 ( 1H, s, 6-H). 13 C NMR (75 MHz, DMSO-d 6 ) δ 13.10 (5-CH 3 ), 13.86 (-CH 2 -CH 3 ), 22.09, 26.51, 28.59, 28.73, 28.90, 29.05, 29.08, 31.31 (-NH- CH 2 - (CH 2 ) 10 -). 37.12 (2'-C), 40.27 (-NH-CH 2 -), 60.25 (-CH 2 -CH 2 -OH), 61.43 (5'-C), 67.02, 68.13, 69.76, 69.81, 72.38 (-CO 3 - CH 2 O C 2 H 4 O CH 2 -CH 2 -OH), 78.72 (3'-C), 84.18 (l'-C), 84.74 (4'-C), 102.15 (5-C), 136.90 (6-C), 153.90 (-CO 3 -), 155.08 (2-C), 162.72 (4-C). HRMS (ESI) C 29 H 51 N 3 O 9 , m/z: 586.3698 [M+H] + , found 586.3717.
Пример 23. Ингибирование роста грибовExample 23 Inhibition of Fungal Growth
Штаммы мицелиальных грибов, культивировали на агаризованной среде Чапека-Докса (ЧДА) (30 г/л сахарозы, 2 г/л NaNO3, 1 г/л K2HPO4, 0,5 г/л MgSO4 × 7 H2O, 0,5 г/л KCl, 0,01 г/л FeSO4 × 7 H2O, 20 г/л агара, рН 7,0-7,4). Для определения токсического действия N4-модифицированных 5-метил-2'-дезоксицитидинов на рост грибковых клеток использовали метод капельного разбавления [М.Т. Т.А. G.K. Nuraeva, D.V. Yanvarev, М. Khomutov, E.N. Khurs, S.N. Kochetkov, J. A.A. Zhgun, A.R. Khomutov, Hydroxylamine analogue of agmatine: Magic bullet for arginine decarboxylase, Biomolecules. 10 (2020) 1-16. https://doi.org/10.3390/biom10030406] с некоторыми модификациями. Клетки собирали из скошенных агаров и разбавляли 0,9% раствором NaCl до OD600=0,5 (основная концентрация) с последующим серийным десятикратным разбавлением тем же растворителем. Затем 2 мкл клеточной суспензии инокулировали на чашки Петри со средой ЧДА, приготовленной с добавлением или без добавления тестируемых соединений (N4-модифицированных 5-метил-2'-дезоксицитидинов (1-1 - 1-22) или 5-фторцитозина (5FC) в качестве положительного контроля) в концентрациях 0,5 мМ, 0.7 мМ или 3 мМ. Инокулированные чашки инкубировали в течение 60 суток при 26°С. Ингибирующее действие соединений измеряли каждые три дня после инокуляции и оценивали по соотношению роста колоний на ЧДА к контрольному росту колоний на агаризованной среде ЧДА без каких-либо добавок. Процент ингибирования роста грибков (FGI) рассчитывали по формуле:Strains of filamentous fungi were cultivated on Czapek-Dox agar medium (ChDA) (30 g/l sucrose, 2 g/l NaNO 3 , 1 g/l K 2 HPO 4 , 0.5 g/l MgSO 4 × 7 H 2 O , 0.5 g/l KCl, 0.01 g/l FeSO 4 × 7 H 2 O, 20 g/l agar, pH 7.0-7.4). To determine the toxic effect of N 4 -modified 5-methyl-2'-deoxycytidines on the growth of fungal cells, the drop dilution method was used [M.T. T.A. GK Nuraeva, DV Yanvarev, M. Khomutov, EN Khurs, SN Kochetkov, J. AA Zhgun, AR Khomutov, Hydroxylamine analogue of agmatine: Magic bullet for arginine decarboxylase, Biomolecules. 10(2020) 1-16. https://doi.org/10.3390/biom10030406] with some modifications. Cells were collected from agar slants and diluted with 0.9% NaCl solution to OD 600 =0.5 (basic concentration) followed by serial tenfold dilution with the same solvent. Then 2 µl of the cell suspension was inoculated onto Petri dishes with analytical medium prepared with or without the addition of test compounds (N 4 -modified 5-methyl-2'-deoxycytidines (1-1 - 1-22) or 5-fluorocytosine (5FC) as a positive control) at concentrations of 0.5 mM, 0.7 mM or 3 mM. Inoculated cups were incubated for 60 days at 26°C. The inhibitory effect of the compounds was measured every three days after inoculation and was assessed by the ratio of colony growth on NDA to control colony growth on agar medium of NDA without any additives. The percentage of fungal growth inhibition (FGI) was calculated using the formula:
FGI%=[(Dc-Dt) / Dc] × 100,FGI%=[(D c -D t ) / D c ] × 100,
где Dc - диаметр колонии в контрольном наборе,where D c is the diameter of the colony in the control set,
Dt - диаметр колонии в наборе лечения.D t is the diameter of the colony in the treatment set.
Ингибирующее действие оценивали для каждой концентрации тестируемого соединения в двух параллелях и в трех повторах.The inhibitory effect was evaluated for each concentration of the test compound in duplicate and in triplicate.
Таблица 1. Синтезированные N4-модифицированные 5-метил-2'-дезоксирибоцитидина.Table 1. Synthesized N 4 -modified 5-methyl-2'-deoxyribocytidine.
Claims (28)
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
RU2021107757A RU2766333C1 (en) | 2021-03-24 | 2021-03-24 | New n4-modified 5-methyl-2'-deoxycytidines exhibiting antimicotic activity |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
RU2021107757A RU2766333C1 (en) | 2021-03-24 | 2021-03-24 | New n4-modified 5-methyl-2'-deoxycytidines exhibiting antimicotic activity |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2766333C1 true RU2766333C1 (en) | 2022-03-15 |
Family
ID=80736487
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2021107757A RU2766333C1 (en) | 2021-03-24 | 2021-03-24 | New n4-modified 5-methyl-2'-deoxycytidines exhibiting antimicotic activity |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
RU (1) | RU2766333C1 (en) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2808726C1 (en) * | 2022-12-28 | 2023-12-04 | Федеральное Государственное Бюджетное Учреждение Науки Институт Молекулярной Биологии Им. В.А. Энгельгардта Российской Академии Наук (Имб Ран) | Oligoglycol-carbonate prodrugs based on 5-modified 2'-deoxyuridines exhibiting antibacterial activity |
Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5882731A (en) * | 1996-07-24 | 1999-03-16 | Owens; Richard L. | Method of applying a mildewcide laden film and composition for the use therewith |
US7563887B1 (en) * | 2006-08-15 | 2009-07-21 | Steven Albert Benner | Universal nucleobase analogs |
RU2431479C2 (en) * | 2010-07-19 | 2011-10-20 | Государственное образовательное учреждение высшего профессионального образования Казанский государственный медицинский университет | 2-(1'-hydroxy-4'-isopropylene-1'-methylcyclohexyl-2'-thio)-methyl ethanoate exhibiting fungicidal and anti-inflammatory action |
WO2017201585A1 (en) * | 2016-05-26 | 2017-11-30 | Genea Ip Holdings Pty Ltd | Modulators of dux4 for regulation of muscle function |
WO2019122323A1 (en) * | 2017-12-22 | 2019-06-27 | Bayer Aktiengesellschaft | Fungicidal oxadiazoles |
-
2021
- 2021-03-24 RU RU2021107757A patent/RU2766333C1/en active
Patent Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5882731A (en) * | 1996-07-24 | 1999-03-16 | Owens; Richard L. | Method of applying a mildewcide laden film and composition for the use therewith |
US7563887B1 (en) * | 2006-08-15 | 2009-07-21 | Steven Albert Benner | Universal nucleobase analogs |
RU2431479C2 (en) * | 2010-07-19 | 2011-10-20 | Государственное образовательное учреждение высшего профессионального образования Казанский государственный медицинский университет | 2-(1'-hydroxy-4'-isopropylene-1'-methylcyclohexyl-2'-thio)-methyl ethanoate exhibiting fungicidal and anti-inflammatory action |
WO2017201585A1 (en) * | 2016-05-26 | 2017-11-30 | Genea Ip Holdings Pty Ltd | Modulators of dux4 for regulation of muscle function |
WO2019122323A1 (en) * | 2017-12-22 | 2019-06-27 | Bayer Aktiengesellschaft | Fungicidal oxadiazoles |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2808726C1 (en) * | 2022-12-28 | 2023-12-04 | Федеральное Государственное Бюджетное Учреждение Науки Институт Молекулярной Биологии Им. В.А. Энгельгардта Российской Академии Наук (Имб Ран) | Oligoglycol-carbonate prodrugs based on 5-modified 2'-deoxyuridines exhibiting antibacterial activity |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US7108861B1 (en) | Environmentally benign crop protection agents | |
US4808590A (en) | Antiviral, antitumor and antifungal compositions and their methods of use | |
Podunavac-Kuzmanović et al. | Antibacterial evaluation of some benzimidazole derivatives and their zinc (II) complexes | |
Alexandrova et al. | 3′-Amino modifications enhance the antifungal properties of N 4-alkyl-5-methylcytidines for potential biocides | |
Weinschenk et al. | Bis (benzoyloxybenzyl)‐DiPPro Nucleoside Diphosphates of Anti‐HIV Active Nucleoside Analogues | |
RU2766333C1 (en) | New n4-modified 5-methyl-2'-deoxycytidines exhibiting antimicotic activity | |
Alexandrova et al. | Discovery of novel N4-alkylcytidines as promising antimicrobial agents | |
CN113527221B (en) | Dekkolii derivative, application thereof and bactericide for resisting plant mycosis | |
Tessier et al. | Benzimidazolium salts prevent and disrupt methicillin-resistant Staphylococcus aureus biofilms | |
EA038460B1 (en) | Antiseptic medicinal agent | |
CN102471363A (en) | Novel flavanone derivative | |
DK167876B1 (en) | PROCEDURE FOR COMBATING CROP-BREATHING FUNGI, FUNGICID AGENT FOR USE IN THE EXERCISE OF THE PROCEDURE AND AMINOPHOSPHONIC ACID COMPOUNDS | |
US5158960A (en) | 10'-Desmethoxystreptonigrin | |
US4801606A (en) | Antiviral compositions | |
Kapoor et al. | METABOLISM OF BENZIMIDAZOLE IN WHEAT: I. FORMATION OF BENZIMIDAZOLE NUCLEOTIDE | |
Kawamata et al. | Trigonelline, an antifouling substance isolated from an octocoral Dendronephthya sp. | |
US20100034770A1 (en) | Antimicrobial surfaces | |
RU2773080C1 (en) | Trimeric quaternary pyridinium salts with biocidal action | |
RU2764522C1 (en) | 3,3'[(hexano-1,6-diylbis (azanediyl)]bis-(7-hydroxy-6-methoxycarbonyl-2-oxo-2h-chromene) with antibacterial activity | |
TWI728375B (en) | A polysaccharide priming plant resistance to viruses | |
US11918000B2 (en) | Methods for inducing resistance to virus in a plant, priming a plant to resist viruses, decreasing virus accumulation, or increasing PR1 expression in a plant | |
BRPI0902598B1 (en) | method for inducing a plant defense mechanism against pathogens, use of a compound and use of the compound 1-o-gallon-2,3; 4,6-bis-hhdp-a / ß-d-glycopyranose | |
RU2014995C1 (en) | Composition for wood protection against fungous biodegradation | |
Dubreuil et al. | Synthesis and antimicrobial activity of novel bis-benzimidazolium salts | |
CN104497067A (en) | Glucoside-1,4-pentadiene-3-ketone compounds containing acetoxyl groups as well as preparation method and use of glucoside-1,4-pentadiene-3-ketone compounds |