Claims (17)
1. Изолированный полинуклеотид, включающий последовательность, выбранную из группы, включающей (a) последовательности, представленные в SEQ ID NO: 390, 392, 394, 396, 398-420, 422-424, 428-433 и 440-583; (b) последовательности, комплементарные последовательностям, представленным в SEQ ID NO: 390, 392, 394, 396, 398-420, 422-424, 428-433 и 440-583; (c) последовательности, состоящие, по крайней мере, из 20 следующих друг за другом остатков последовательности, представленной в SEQ ID NO: 390, 392, 394, 396, 398-420, 422-424, 428-433 и 440-583; (d) последовательности, которые гибридизуются с последовательностью, представленной в SEQ ID NO: 390, 392, 394, 396, 398-420, 422-424, 428-433 и 440-583, при умеренно жестких условиях; (e) последовательности, обладающие, по крайней мере, 75%-ной идентичностью в отношении последовательности SEQ ID NO: 390, 392, 394, 396, 398-420, 422-424, 428-433 и 440-583; (f) последовательности, обладающие, по крайней мере, 90%-ной идентичностью в отношении последовательности SEQ ID NO: 390, 392, 394, 396, 398-420, 422-424, 428-433 и 440-583; и (g) вырожденные варианты последовательности, представленной в SEQ ID NO: 390, 392, 394, 396, 398-420, 422-424, 428-433 и 440-583.1. An isolated polynucleotide comprising a sequence selected from the group comprising (a) the sequences shown in SEQ ID NO: 390, 392, 394, 396, 398-420, 422-424, 428-433 and 440-583; (b) sequences complementary to the sequences shown in SEQ ID NO: 390, 392, 394, 396, 398-420, 422-424, 428-433 and 440-583; (c) sequences consisting of at least 20 consecutive residues of the sequence shown in SEQ ID NO: 390, 392, 394, 396, 398-420, 422-424, 428-433 and 440-583; (d) sequences that hybridize to the sequence shown in SEQ ID NO: 390, 392, 394, 396, 398-420, 422-424, 428-433 and 440-583, under moderately stringent conditions; (e) sequences having at least 75% identity with respect to the sequence of SEQ ID NO: 390, 392, 394, 396, 398-420, 422-424, 428-433 and 440-583; (f) sequences having at least 90% identity with respect to the sequence of SEQ ID NO: 390, 392, 394, 396, 398-420, 422-424, 428-433 and 440-583; and (g) degenerate variants of the sequence shown in SEQ ID NO: 390, 392, 394, 396, 398-420, 422-424, 428-433 and 440-583.
2. Изолированный полипептид, включающий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, включающей (a) SEQ ID NO: 584-587; (b) последовательности, кодируемые полинуклеотидом по п.1; и (c) последовательности, обладающие, по крайней мере, 70%-ной идентичностью в отношении последовательности, кодируемой полинуклеотидом по п.1; и (d) последовательности, обладающие, по крайней мере, 90%-ной идентичностью в отношении последовательности, кодируемой полинуклеотидом по п.1.2. An isolated polypeptide comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of (a) SEQ ID NO: 584-587; (b) sequences encoded by the polynucleotide according to claim 1; and (c) sequences having at least 70% identity with respect to the sequence encoded by the polynucleotide according to claim 1; and (d) sequences having at least 90% identity with respect to the sequence encoded by the polynucleotide according to claim 1.
3. Экспрессирующий вектор, включающий полинуклеотид по п.1, функционально связанный последовательностью контроля экспрессии.3. An expression vector comprising the polynucleotide according to claim 1, operably linked by an expression control sequence.
4. Клетка-хозяин, трансформированная или трансфицированная экспрессирующим вектором по п.3.4. A host cell transformed or transfected with an expression vector according to claim 3.
5. Изолированное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которое специфично связывается с полипептидом по п.2.5. An isolated antibody or antigen binding fragment thereof that specifically binds to the polypeptide of claim 2.
6. Способ определения наличия у пациента злокачественной опухоли, включающий стадии (a) получения от пациента биологического образца; (b) контактирования биологического образца со связывающим агентом, который связывает полипептид по п.2; (c) определения в образце количества полипептида, который связывается со связывающим агентом; и (d) сравнения количества данного полипептида с предварительно определенным уровнем отсечения и определения отсюда наличия у пациента злокачественной опухоли.6. A method for determining the presence of a malignant tumor in a patient, comprising the steps of (a) obtaining a biological sample from a patient; (b) contacting the biological sample with a binding agent that binds the polypeptide according to claim 2; (c) determining in the sample the amount of polypeptide that binds to a binding agent; and (d) comparing the amount of a given polypeptide with a predetermined cut-off level and thereby determining the presence of a cancer in the patient.
7. Слитый белок, включающий, по крайней мере, один полипептид по п.2.7. A fusion protein comprising at least one polypeptide according to claim 2.
8. Олигонуклеотид, который гибридизуется с последовательностью, представленной в SEQ ID NO: 390, 392, 394, 396, 398-420, 422-424, 428-433 и 440-583, при умеренно жестких условиях.8. An oligonucleotide that hybridizes with the sequence shown in SEQ ID NO: 390, 392, 394, 396, 398-420, 422-424, 428-433 and 440-583, under moderately stringent conditions.
9. Способ стимуляции и/или экспансии T-клеток, специфичных в отношении опухолевого белка, включающий контактирование Т-клеток, по крайней мере, с одним компонентом, выбранным из группы, включающей (a) полипептиды по п.2; (b) полинуклеотиды по п.1.; и (c) антиген-презентирующие клетки, которые экспрессируют полипептид по п.1 при условиях и в течение времени, достаточных для осуществления стимуляции и/или экспансии T-клеток.9. A method of stimulating and / or expanding T cells specific for a tumor protein, comprising contacting the T cells with at least one component selected from the group comprising (a) the polypeptides of claim 2; (b) polynucleotides according to claim 1; and (c) antigen-presenting cells that express the polypeptide according to claim 1 under conditions and for a time sufficient to effect stimulation and / or expansion of T cells.
10. Изолированная популяция Т-клеток, включающая Т-клетки, полученные способом по п.9.10. An isolated population of T cells, including T cells obtained by the method according to claim 9.
11. Композиция, включающая первый компонент, выбранный из группы, состоящей из физиологически приемлемых носителей и иммуностимуляторов, и второй компонент, выбранный из группы, включающей (a) полипептиды по п.2; (b) полинуклеотиды по п.1; (c) антитела по п.5; (d) слитые белки по п.7; (e) популяции T-клеток по п.10; и (f) антиген-презентирующие клетки, которые экспрессируют полипептид по п.2.11. A composition comprising a first component selected from the group consisting of physiologically acceptable carriers and immunostimulants, and a second component selected from the group comprising (a) the polypeptides of claim 2; (b) polynucleotides according to claim 1; (c) the antibodies of claim 5; (d) the fusion proteins of claim 7; (e) the T cell population of claim 10; and (f) antigen-presenting cells that express the polypeptide of claim 2.
12. Способ стимуляции у пациента иммунного ответа, включающий введение пациенту композиции по п.11.12. A method of stimulating an immune response in a patient, comprising administering to the patient a composition according to claim 11.
13. Способ лечения у пациента злокачественной опухоли, включающий введение пациенту композиции по п.11.13. A method of treating a patient with a malignant tumor, comprising administering to the patient a composition according to claim 11.
14. Способ определения наличия у пациента злокачественной опухоли, включающий стадии (a) получения от пациента биологического образца; (b) контактирования биологического образца с олигонуклеотидом по п.8; (c) определения в образце количества полинуклеотида, который гибридизуется с данным олигонуклеотидом; и (d) сравнения количества полинуклеотида, который гибридизуется с данным олигонуклеотидом, с предварительно определенным уровнем отсечения, и определения отсюда наличия у пациента злокачественной опухоли.14. A method for determining the presence of a malignant tumor in a patient, comprising the steps of (a) obtaining a biological sample from a patient; (b) contacting the biological sample with the oligonucleotide of claim 8; (c) determining in the sample the amount of polynucleotide that hybridizes with the oligonucleotide; and (d) comparing the amount of polynucleotide that hybridizes with the oligonucleotide to a predetermined cutoff level, and thereby determining whether the patient has a malignant tumor.
15. Диагностический набор, включающий, по крайней мере, один олигонуклеотид по п.8.15. A diagnostic kit comprising at least one oligonucleotide according to claim 8.
16. Диагностический набор, включающий, по крайней мере, одно антитело по п.5, и реагент для детекции, где реагент для детекции включает репортерную группу.16. A diagnostic kit comprising at least one antibody according to claim 5, and a detection reagent, where the detection reagent includes a reporter group.
17. Способ ингибирования развития у пациента злокачественной опухоли, включающий стадии (a) инкубации CD4+- и/или CD8+-T-клеток, изолированных от пациента, по крайней мере, с одним компонентом, выбранным из группы, включающей: (i) полипептиды по п.2; (ii) полинуклеотиды по п.1; и (iii) антиген-презентирующие клетки, которые экспрессируют полипептид по п.2, так что Т-клетки пролиферируют; (b) введения пациенту эффективного количества пролиферировавших Т-клеток, и ингибирования за счет этого развития у пациента злокачественной опухоли.17. A method of inhibiting a patient's development of a malignant tumor, comprising the steps of (a) incubating CD4 + and / or CD8 + T cells isolated from the patient with at least one component selected from the group consisting of: (i) polypeptides according to claim 2; (ii) polynucleotides according to claim 1; and (iii) antigen-presenting cells that express the polypeptide of claim 2, such that the T cells proliferate; (b) administering to the patient an effective amount of proliferating T cells, and inhibiting the development of a malignant tumor in the patient.