KR20240004694A - 항체 - Google Patents
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Abstract
본 발명은 TREM1에 결합하고 이와 이의 천연 리간드들 중 하나 이상의 상호작용을 억제하는 항체에 관한 것이다. 이러한 항체의 구체적인 예를 제공한다. 상기 항체의 치료적 용도 및 이를 생성하는 방법도 제공한다.
Description
본 발명은 항-TREM1 항체, 및 신경학적 장애의 치료, 보다 구체적으로 근위축성 측삭 경화증(ALS) 및 알츠하이머병의 치료를 위한 이의 용도에 관한 것이다.
골수 세포에서 발현되는 유발 수용체(TREM)는 인간 염색체 6p21 및 마우스 염색체 17에 맵핑되는 MHC 유전자 클러스터에 의해 코딩된 면역 활성화 및 억제 이소폼(isoform)을 포함하는 수용체이다. TREM은 주로 말초의 단핵구, 호중구 및 수지상 세포를 비롯한 골수 계통의 세포, 및 중추신경계(CNS)의 미세아교세포에서 발현되는 면역글로불린(Ig) 수퍼패밀리의 구성원이다. 분화 클러스터 354로서도 알려져 있는, 골수 세포에서 발현되는 유발 수용체 1(TREM1)은 확인된 TREM 패밀리의 첫 번째 구성원이며 Ig 수퍼패밀리의 다른 수용체와 제한된 상동성을 가진다. TREM1은 단일 Ig 유사 도메인, 그의 신호전달 파트너 DAP12의 음으로 하전된 아스파르트산과 상호작용하는 (+) 하전된 라이신 잔기를 가진 막횡단 영역, 및 임의의 신호전달 도메인을 결여하는 짧은 세포질 꼬리를 가진 막횡단 당단백질이다.
그의 제안된 리간드인 펩티도글리칸 인식 단백질 1(PGLYRP1), 고이동성 군 B1(HMGB1), 가용성 CD177, 열 충격 단백질 70(HSP70), 세포외 저온 유도성 RNA 결합 단백질(eCIRP)과의 상호작용을 통한 TREM1 활성화는 "헤드-투-테일(head-to-tail)" 동종이량체의 형성을 유도하는 것으로 제안되었다. 이량체 가교결합은 동원된 DAP12에서 면역 수용체 티로신 기반 활성화 모티프(ITAM)의 인산화를 유발하여, 비장 티로신 키나제(SYK), 및 제타 쇄 관련 단백질 키나제 70(ZAP70), 카시타스(casitas) b-계통 림프종(Cbl), 손 오프 세븐리스(son of sevenless; SOS) 및 성장 인자 수용체 결합 단백질 2(GRB2)를 포함하는 그의 다운스트림 신호전달 파트너에 대한 도킹 부위를 제공함으로써 신호전달 및 작용을 가능하게 한다. 이러한 상호작용은 포스파티딜이노시톨 3-키나제(PI3K), 포스포리파제-C-γ 2(PLC-γ2) 및 ERK 경로를 통해 다운스트림 신호 전달도입을 유발한다. 이러한 사건 후, 칼슘 이동, 및 ETS 함유 단백질(ELK1), 활성화된 T 세포의 핵 인자(NFAT), AP1, c-fos, c-Jun 및 NF-κB를 포함하는 전사 인자의 활성화가 일어난다. 이 경로는 TREM 패밀리 TREM2의 또 다른 구성원과 공유된다.
명백히 면역 활성화제인 TREM1과 달리, TREM2는 각각 고친화성 리간드 및 저친화성 리간드에 결합할 때 염증촉진제 및 소염제 둘 다로서 작용할 수 있다. 항상성 조건 하에서 TREM2와 저친화성 리간드의 상호작용은 항상성 유지를 확인하는 경로를 유지한다(Konishi H., et al. Frontiers Cellular Neuroscience 2018).
신경염증성 신경퇴행성 질병에서, (다른 TREM1 리간드 중에서) 손상 관련 분자 패턴(DAMP)으로서도 알려진 세포내 인자는 사멸하는 뉴런으로부터 흘러나오고 TREM1 및 기타 패턴 인식 수용체를 통해 감시 미세아교세포를 활성화시킨다. TREM1-DAMP 상호작용은 TREM2 활성을 압도하여, 미세아교세포/선천성 면역 활성화, 직접적인 신경독성, 및 비정상적인 식세포작용을 통한 시냅스 구조의 파괴를 초래한다. TREM1은 경로 조절에서 TREM2와 그의 "음양" 역학을 넘어 Toll 유사 수용체(TLR) 및 NOD 유사 수용체 패밀리를 포함하는 선천성 면역 반응의 다른 핵심 조절제의 강화제로서 독특하고 차별화된 기능을 담당한다. 이러한 수용체의 증폭은 TREM1에 의해 유도된 TLR의 과발현, 그의 다운스트림 중심점(node), 예컨대, MYD88 및 IKk, 또는 PGN(TLR2/TLR4 자극제) 및 PGLYRP1(TREM1 리간드)의 경우처럼 TLR 아고니스트와 TREM1 리간드 사이에 형성된 TREM1 리간드 복합체를 통한 직접적인 가교결합을 통해 발생한다.
TREM1 다중경로 활성화의 결과는 사이토카인 및 케모카인 방출, 보조자극 분자/항원 제시의 상향조절 및 비정상적인 식세포작용 활성을 포함하는 증폭된 선천성 면역/미세아교세포 염증촉진성 반응을 야기한다. 다운스트림(Buchon et al, 2000). 이러한 과정은 다양한 신경퇴행성 장애, 신경발달 장애 및 자가면역 중추신경계 장애에서 병리생물학에 대한 공통 분모이다. 게놈 범위 관련 연구(Genome Wide Association; GWAS)를 포함하는 인간 유전학은 TREM2, TREM1/TREM2 경로의 다운스트림에 있는 여러 중심점, 예컨대, DAP12, Syk, PLCγ2 및 TLR을 다양한 신경퇴행성 질환의 위험 유전자로서 암시하였다.
미국 특허 제9,000,127호는 TREM1과 그의 리간드의 상호작용을 파괴하는 항-TREM1 항체를 제공한다. 개시된 항체는 류마티스 관절염 및 염증성 장 질환과 같은 염증성 질환을 가진 개체의 치료를 위해 제공된다.
국제 특허 출원 공개 제WO 2017/152102호는 TREM1 단백질에 결합하고 하나 이상의 TREM1 활성을 조절하거나 향상시키는 항체를 개시한다.
본 발명은 본원에 기재된 기능적 및 구조적 성질을 가진 항-TREM1 항체를 제공함으로써 신경학적 장애의 새로운 치료에 대한 필요성을 다룬다.
구체적으로, 본 발명은
서열번호 11을 포함하는 CDR-L1,
서열번호 12를 포함하는 CDR-L2, 및
서열번호 13을 포함하는 CDR-L3
을 포함하는 경쇄 가변 영역; 및
서열번호 14를 포함하는 CDR-H1,
서열번호 15를 포함하는 CDR-H2, 및
서열번호 16을 포함하는 CDR-H3
을 포함하는 중쇄 가변 영역
을 포함하는, 인간 TREM1에 결합하는 항체를 제공한다.
본 발명은 첨부된 도면을 참고함으로써 이하에 설명되어 있다:
도 1은 항체 12172 경쇄의 인간화를 보여준다. 해당 쇄에 대해 생성된 다양한 변이체도 표시되어 있다. CDR 서열은 밑줄로 표시되어 있다.
도 2는 항체 12172 중쇄의 인간화를 보여준다. 해당 쇄에 대해 생성된 다양한 변이체도 표시되어 있다. CDR 서열은 밑줄로 표시되어 있다.
도 3A 및 3B는 PGLYRP1 및 12172 토끼 Fab에 결합된 인간 TREM1의 결정 구조를 보여준다. (3A) PGLYRP1에 결합된 인간 TREM1의 결정 구조. PGLYRP1에 속하는 임의의 원자의 4 옹스트롬 이내의 원자를 가진 TREM1 잔기는 검은색으로 강조되어 있다. (3B) 12172 토끼 Fab에 결합된 인간 TREM1의 결정 구조. 12172에 속하는 임의의 원자의 4 옹스트롬 이내의 원자를 가진 TREM1 잔기는 검은색으로 강조되어 있다.
도 4는 12172 항체의 다양한 변이체의 열 안정성을 보여준다. 12172 gL2gH11 및 12172 gL6gH6(hIgG4P 및 hIgG1 LALA)에 대한 온도기록도는 통상의 제제화 전 완충제(pH 7.4)에서 측정되었다.
도 5는 1차 인간 단핵구로부터의 TNF-α, IL-6 및 IL-1β의 TREM1 매개 방출이 12172 gL2gH11 hIgG4P에 의해 억제됨을 보여준다.
도 6은 1차 인간 단핵구로부터의 IL-1R 길항제의 방출이 다양한 I2172 변이체 및 기준 항체에 의해 증가됨을 보여준다.
도 7은 자극되지 않은 1차 인간 단핵구로부터의 IL-1RA 방출을 증가시키는 데 있어서 12172 gL2gH11 hIgG4P 및 O318-IgG1.3f의 효과를 보여준다.
도 8은 건강한 대조군 및 알츠하이머병(AD) PBMC로부터의 TNF-α 및 IL-6 방출에 대한 12172 gL2gH11 hIgG4P의 효능을 보여준다.
도 9는 건강한 대조군 및 ALS PBMC로부터의 TNF-α 및 IL-6 방출에 대한 12172 gL2gH11 hIgG4P의 효능을 보여준다.
도 10은 ALS 및 AD PBMC로부터의 염증촉진성 사이토카인 및 케모카인 방출에 대한 12172 gL2gH11 hIgG4P의 효능을 보여준다.
도 11a 내지 11c는 (이소타입 대조군과 비교될 때) 인간 단핵구를 12172 항체 변이체(11a 및 11b) 또는 0318-IgG1.3f(11c)로 처리하고 TREM1 리간드 복합체로 자극한 후 차등적으로 발현된 유전자(DEG)(0.05의 FDR을 고려함)를 보여주는 볼케이노 플롯(volcano plot)을 보여준다.
도 12a 내지 12c는 (이소타입 대조군과 비교될 때) 인간 단핵구를 12172 항체 변이체(12a 및 12b) 또는 0318-IgG1.3f(12c)로 처리하고 아폽토시스 인간 iPSC 유래 운동 뉴런으로 자극한 후 DEG(0.05의 FDR을 고려함)를 보여주는 볼케이노 플롯을 보여준다.
도 13은 12172 gL2gH11 hIgG4P가 시험관내에서 인간 호중구 및 단핵구에 의한 대장균(E. coli) 제거에 영향을 미치지 않는다는 것을 보여준다. 데이터는 12172 gL2gH11 hIgG4P v 이소타입에 대한 3명의 개별 공여자 및 비교를 위한 0318-IgG1.3f(Ab 318) 분자를 포함하는 1명의 공여자를 대표한다. 통계학적 분석인 일원 ANOVA 던넷(Dunnet) 사후 검정을 수행하여 항-TREM1 항체를 이소타입 대조군과 비교하였다****(p<0.0001).
도 14는 hTREM1/hDAP-12 Flp-In 293 세포에서 SYK 활성화를 차단하는 데 있어서 12172 항체 변이체의 효능 및 효력을 보여준다.
도 1은 항체 12172 경쇄의 인간화를 보여준다. 해당 쇄에 대해 생성된 다양한 변이체도 표시되어 있다. CDR 서열은 밑줄로 표시되어 있다.
도 2는 항체 12172 중쇄의 인간화를 보여준다. 해당 쇄에 대해 생성된 다양한 변이체도 표시되어 있다. CDR 서열은 밑줄로 표시되어 있다.
도 3A 및 3B는 PGLYRP1 및 12172 토끼 Fab에 결합된 인간 TREM1의 결정 구조를 보여준다. (3A) PGLYRP1에 결합된 인간 TREM1의 결정 구조. PGLYRP1에 속하는 임의의 원자의 4 옹스트롬 이내의 원자를 가진 TREM1 잔기는 검은색으로 강조되어 있다. (3B) 12172 토끼 Fab에 결합된 인간 TREM1의 결정 구조. 12172에 속하는 임의의 원자의 4 옹스트롬 이내의 원자를 가진 TREM1 잔기는 검은색으로 강조되어 있다.
도 4는 12172 항체의 다양한 변이체의 열 안정성을 보여준다. 12172 gL2gH11 및 12172 gL6gH6(hIgG4P 및 hIgG1 LALA)에 대한 온도기록도는 통상의 제제화 전 완충제(pH 7.4)에서 측정되었다.
도 5는 1차 인간 단핵구로부터의 TNF-α, IL-6 및 IL-1β의 TREM1 매개 방출이 12172 gL2gH11 hIgG4P에 의해 억제됨을 보여준다.
도 6은 1차 인간 단핵구로부터의 IL-1R 길항제의 방출이 다양한 I2172 변이체 및 기준 항체에 의해 증가됨을 보여준다.
도 7은 자극되지 않은 1차 인간 단핵구로부터의 IL-1RA 방출을 증가시키는 데 있어서 12172 gL2gH11 hIgG4P 및 O318-IgG1.3f의 효과를 보여준다.
도 8은 건강한 대조군 및 알츠하이머병(AD) PBMC로부터의 TNF-α 및 IL-6 방출에 대한 12172 gL2gH11 hIgG4P의 효능을 보여준다.
도 9는 건강한 대조군 및 ALS PBMC로부터의 TNF-α 및 IL-6 방출에 대한 12172 gL2gH11 hIgG4P의 효능을 보여준다.
도 10은 ALS 및 AD PBMC로부터의 염증촉진성 사이토카인 및 케모카인 방출에 대한 12172 gL2gH11 hIgG4P의 효능을 보여준다.
도 11a 내지 11c는 (이소타입 대조군과 비교될 때) 인간 단핵구를 12172 항체 변이체(11a 및 11b) 또는 0318-IgG1.3f(11c)로 처리하고 TREM1 리간드 복합체로 자극한 후 차등적으로 발현된 유전자(DEG)(0.05의 FDR을 고려함)를 보여주는 볼케이노 플롯(volcano plot)을 보여준다.
도 12a 내지 12c는 (이소타입 대조군과 비교될 때) 인간 단핵구를 12172 항체 변이체(12a 및 12b) 또는 0318-IgG1.3f(12c)로 처리하고 아폽토시스 인간 iPSC 유래 운동 뉴런으로 자극한 후 DEG(0.05의 FDR을 고려함)를 보여주는 볼케이노 플롯을 보여준다.
도 13은 12172 gL2gH11 hIgG4P가 시험관내에서 인간 호중구 및 단핵구에 의한 대장균(E. coli) 제거에 영향을 미치지 않는다는 것을 보여준다. 데이터는 12172 gL2gH11 hIgG4P v 이소타입에 대한 3명의 개별 공여자 및 비교를 위한 0318-IgG1.3f(Ab 318) 분자를 포함하는 1명의 공여자를 대표한다. 통계학적 분석인 일원 ANOVA 던넷(Dunnet) 사후 검정을 수행하여 항-TREM1 항체를 이소타입 대조군과 비교하였다****(p<0.0001).
도 14는 hTREM1/hDAP-12 Flp-In 293 세포에서 SYK 활성화를 차단하는 데 있어서 12172 항체 변이체의 효능 및 효력을 보여준다.
약어
정의
본 명세서 전체에 걸쳐 다음 용어가 사용된다.
본원에서 사용되는 용어 "수용자 인간 프레임워크"는 인간 면역글로불린 프레임워크 또는 인간 컨센서스 프레임워크로부터 유래한 경쇄 가변 도메인(VL) 프레임워크 또는 중쇄 가변 도메인(VH) 프레임워크의 아미노산 서열을 포함하는 프레임워크이다. 인간 면역글로불린 프레임워크 또는 인간 컨센서스 프레임워크로부터 유래한 수용자 인간 프레임워크는 그의 동일한 아미노산 서열을 포함할 수 있거나 아미노산 서열 변화를 함유할 수 있다.
용어 "친화성"은 항체와 그의 표적 단백질 사이의 모든 비공유 상호작용의 강도를 의미한다. 달리 표시되지 않는 한, 본원에서 사용된 바와 같이, 용어 "결합 친화성"은 결합 쌍의 구성원(예를 들어, 항체와 항원) 사이의 1:1 상호작용을 반영하는 내재적 결합 친화성을 의미한다. 그의 결합 파트너에 대한 분자의 친화성은 일반적으로 해리 상수(KD)로 표시될 수 있다. 친화성은 본원에 기재된 방법을 포함하는, 당분야에 알려진 통상의 방법에 의해 측정될 수 있다.
항체와 관련하여 용어 "친화성 성숙된"은 초가변 영역에서 하나 이상의 변경을 가진 항체를 의미하며, 이러한 변경은 이러한 변경을 보유하지 않는 모 항체에 비해 항원에 대한 항체의 친화성을 개선한다.
본원에서 용어 "항체"는 가장 넓은 의미로 사용되고, 원하는 항원 결합 활성을 나타내는 한, 단일클론 항체, 다중클론 항체 및 다중특이적 항체를 포함하나 이들로 제한되지 않는 다양한 항체 구조물을 포괄한다. 본원에서 사용된 용어 항체는 전체(전체 길이) 항체(즉, 2개의 중쇄 및 2개의 경쇄라는 요소를 포함함) 및 이의 기능적 활성 단편(즉, 항체 단편 또는 항원 결합 단편으로서도 지칭되는, 항원에 특이적으로 결합하는 항원 결합 도메인을 함유하는 분자)을 의미한다. 항체와 관련하여 본원에 기재된 특징은, 문맥이 달리 표시하지 않는 한, 항체 단편에도 적용된다. 용어 "항체"는 1가 항체, 즉 오직 하나의 항원 결합 도메인을 포함하는 항체(예를 들어, "절반-항체"로서도 지칭되는, 상호연결된 전체 길이 중쇄 및 전체 길이 경쇄를 포함하는 1-아암(one-armed) 항체), 및 다가 항체, 즉 하나 초과의 항원 결합 도메인을 포함하는 항체, 예를 들어, 2가 항체를 포괄한다.
용어 "기준 항체와 동일한 에피토프에 결합하는 항체"는 경쟁 어세이에서 기준 항체와 그의 항원의 결합을 50% 이상 차단하는 항체를 의미하고, 대조적으로 기준 항체는 경쟁 어세이에서 항체와 그의 항원의 결합을 50% 이상 차단한다.
용어 "항체 의존적 세포 매개 세포독성" 또는 "ADCC"는 항체로 코팅된 표적 세포가 이펙터 세포에서 발현된 Fc 감마 수용체(FcγR)를 통해 용해 활성을 가진 이펙터 세포, 예컨대, 천연 킬러 세포, 단핵구, 대식세포 및 호중구와 상호작용하는 것에 의존하는 세포 사멸 유도 기작이다.
본원에서 사용된 용어 "항원 결합 단편"은 Fab, 변형된 Fab, Fab', 변형된 Fab', F(ab')2, Fv, 단일 도메인 항체, scFv, Fv, 2가, 3가 또는 4가 항체, Bis-scFv, 디아바디, 트리아바디, 테트라바디, 및 이들 중 임의의 것의 에피토프 결합 단편을 포함하나 이들로 제한되지 않는 기능적 활성 항체 결합 단편을 의미한다(예를 들어, 문헌[Holliger and Hudson, 2005, Nature Biotech. 23(9): 1126-1136; Adair and Lawson, 2005, Drug Design Reviews - Online 2(3), 209-217] 참조). 본원에서 사용된 "결합 단편"은 단편을 펩티드 또는 항원에 특이적인 것으로서 특징짓기에 충분한 친화성으로 표적 펩티드 또는 항원에 결합할 수 있는 단편을 의미한다.
용어 "항체 변이체"는 본원에 기재된 원하는 특징을 보유하고 기준 항체의 VH 및/또는 VL과 적어도 약 80% 아미노산 서열 동일성을 가진 VH 및/또는 VL을 포함하는 폴리펩티드, 예를 들어, 항체를 의미한다. 이러한 항체 변이체는 예를 들어, 하나 이상의 아미노산 잔기가 VH 및/또는 VL 도메인에 추가되거나 이 도메인으로부터 결실된 항체를 포함한다. 통상적으로, 항체 변이체는 본원에 기재된 항체와 적어도 약 80% 아미노산 서열 동일성, 대안적으로 적어도 약 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 아미노산 서열 동일성을 가질 것이다. 임의로, 변이체 항체는 본원에 제공된 항체 서열에 비해 1개 이하의 보존적 아미노산 치환, 대안적으로 본원에 제공된 항체 서열에 비해 약 2개, 3개, 4개, 5개, 6개, 7개, 8개, 9개 또는 10개 이하의 보존적 아미노산 치환을 가질 것이다. 실시양태에서, "항체 변이체"는 VH 및/또는 VL을 포함하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 의미하는 것으로, 이때 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 비-CDR 영역은 본원에 기재된 항체와 적어도 약 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 아미노산 서열 동일성을 가진다.
본원에서 사용된 용어 "항원 결합 도메인"은 표적 항원과 특이적으로 상호작용하는, 하나 이상의 가변 도메인의 일부 또는 전부, 예를 들어, 한 쌍의 가변 도메인 VH 및 VL의 일부 또는 전부를 포함하는 항체의 일부를 의미한다. 결합 도메인은 단일 도메인 항체를 포함할 수 있다. 각각의 결합 도메인은 1가일 수 있다. 각각의 결합 도메인은 1개 이하의 VH 및 1개의 VL을 포함할 수 있다.
본원에서 사용된 용어 "이중특이적" 또는 "이중특이적 항체"는 2종의 항원 특이성을 가진 항체를 의미한다.
용어 "상보성 결정 영역" 또는 "CDR"은 일반적으로 항체가 6개의 CDR, 즉 VH에서 3개의 CDR(H1, H2, H3)을 포함하고 VL에서 3개의 CDR(L1, L2, L3)을 포함한다는 것을 의미한다. 중쇄 가변 도메인의 CDR은 카바트(Kabat) 넘버링 시스템에 따라 잔기 31 내지 35(CDR-H1), 잔기 50 내지 65(CDR-H2) 및 잔기 95 내지 102(CDR-H3)에 위치한다. 그러나, 초티아(Chothia)(Chothia, C. and Lesk, A.M. J. Mol. Biol., 196, 901-917 (1987))에 따르면, CDR-H1과 동등한 루프는 잔기 26부터 잔기 32까지 걸쳐 있다. 따라서, 달리 표시되어 있지 않는 한, 본원에서 사용된 "CDR-H1"은 카바트 넘버링 시스템과 초티아의 위상학적 루프 정의의 조합에 의해 기재된 바와 같이 잔기 26 내지 35를 지칭하기 위한 것이다. 경쇄 가변 도메인의 CDR은 카바트 넘버링 시스템에 따라 잔기 24 내지 34(CDR-L1), 잔기 50 내지 56(CDR-L2) 및 잔기 89 내지 97(CDR-L3)에 위치한다. 달리 표시되어 있지 않는 한, 가변 도메인의 CDR 잔기 및 기타 잔기(예를 들어, FR 잔기)는 본원에서 카바트에 따라 넘버링된다.
용어 "키메라" 항체는 중쇄 및/또는 경쇄의 가변 도메인(또는 이의 적어도 일부)이 특정 공급원 또는 종으로부터 유래하는 반면, 중쇄 및/또는 경쇄의 나머지 부분(즉, 불변 도메인)이 상이한 공급원 또는 종으로부터 유래하는 항체를 의미한다(Morrison; PNAS 81, 6851 (1984)). 키메라 항체는 예를 들어, 비인간 가변 도메인 및 인간 불변 도메인을 포함할 수 있다. 키메라 항체는 전형적으로 재조합 DNA 방법을 이용함으로써 생성된다. "키메라 항체"의 하위카테고리는 "인간화 항체"이다.
항체의 "클래스"는 그의 중쇄가 보유하는 불변 도메인 또는 불변 영역의 유형을 의미한다. 항체의 5가지 주요 클래스인 IgA, IgD, IgE, IgG 및 IgM이 있고, 이들 중 일부는 서브클래스(이소타입), 예를 들어, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 및 IgA2로 더 나누어질 수 있다. 면역글로불린의 상이한 클래스에 상응하는 중쇄 불변 도메인은 각각 α, δ, ε, γ 및 μ로서 지칭된다.
용어 "보체 의존적 세포독성" 또는 "CDC"는 표적에 결합된 항체의 Fc 이펙터 도메인이 보체 성분 C1q에 결합하여 이를 활성화시킴으로써, 결과적으로 보체 캐스케이드를 활성화시켜 세포 사멸을 이끌어내는 세포 사멸 유도 기작을 의미한다.
본원에서 사용된 용어 "불변 도메인(들)" 또는 "불변 영역"은 가변 영역 외부에 있는 항체의 도메인(들)을 지칭하기 위해 교환 가능하게 사용된다. 불변 도메인은 동일한 이소타입의 모든 항체에서 동일하지만 이소타입마다 상이하다. 전형적으로, 중쇄의 불변 영역은 3개 또는 4개의 불변 도메인을 포함하는 CH1-힌지-CH2-CH3-임의로 CH4에 의해 N-말단부터 C-말단까지 형성된다.
용어 "경쟁 항체" 또는 "교차경쟁 항체"는 청구된 항체가 (i) 기준 항체가 결합하는 위치와 동일한 위치에서 항원에 결합하거나, (ii) 항체가 기준 항체와 항원의 결합을 입체적으로 방해하는 위치에서 항원에 결합한다는 의미로서 해석되어야 한다.
본원에서 사용된 용어 "유도체"는 반응성 유도체, 예를 들어, 말레이미드 등과 같은 티올 선택적 반응성 기를 포함하기 위한 것이다. 반응성 기는 직접적으로 또는 링커 분절을 통해 중합체에 연결될 수 있다. 이러한 기의 잔기는 일부 경우 항체 단편과 중합체 사이의 연결기로서 생성물의 일부를 형성할 것임을 이해할 것이다.
가변 서열의 생성과 관련하여 용어 "로부터 유래한"은 사용된 서열 또는 사용된 서열과 매우 유사한 서열이 원래의 유전 물질, 예컨대, 항체의 경쇄 또는 중쇄로부터 수득되었다는 사실을 의미한다.
본원에서 사용된 용어 "디아바디"는 2개의 Fv 쌍, 즉 제1 VH/VL 쌍, 및 2개의 Fv간 링커를 가진 추가 VH/VL 쌍을 의미하므로, 제1 Fv의 VH는 제2 Fv의 VL과 연결되고 제1 Fv의 VL은 제2 Fv의 VH에 연결된다.
본원에서 사용된 용어 "DiFab"는 그들의 중쇄의 C-말단을 통해 연결된 2개의 Fab 분자를 의미한다.
본원에서 사용된 용어 "DiFab'"는 그의 힌지 영역에서 하나 이상의 디설파이드 결합을 통해 연결된 2개의 Fab' 분자를 의미한다.
본원에서 사용된 용어 "dsscFv" 또는 "디설파이드 안정화된 단일 쇄 가변 단편"은 VH 가변 도메인과 VL 가변 도메인 사이의 펩티드 링커에 의해 안정화되고 VH와 VL 사이의 도메인간 디설파이드 결합도 포함하는 단일 쇄 가변 단편을 의미한다(예를 들어, 문헌[Weatherill et al., Protein Engineering, Design & Selection, 25 (321-329), 2012] 및 국제 특허 출원 공개 제WO2007109254호 참조).
용어 "DVD-Ig"(이중 V 도메인 IgG로서도 알려짐)는 각각의 중쇄 및 각각의 경쇄의 N-말단에 하나씩, 4개의 추가 가변 도메인을 가진 전체 길이 항체를 의미한다.
용어 "이펙터 기능"은 항체 이소타입에 따라 달라지는, 항체의 Fc 영역에 기인할 수 있는 생물학적 활성을 의미한다. 항체 이펙터 기능의 예는 C1q 결합 및 보체 의존적 세포독성(CDC), Fc 수용체 결합, 항체 의존적 세포 매개 세포독성(ADCC), 식세포작용, 세포 표면 수용체(예를 들어, B 세포 수용체)의 하향조절 및 B 세포 활성화를 포함한다.
본원에서 사용된 용어 "이펙터 분자"는 예를 들어, 항신생물제, 약물, 독소, 생물학적 활성 단백질, 예를 들어, 효소, 다른 항체 또는 항체 단편, 합성 또는 천연 생성 중합체, 핵산 및 이의 단편, 예를 들어, DNA, RNA 및 이의 단편, 방사성핵종, 특히 방사성요오드, 방사성동위원소, 킬레이팅된 금속, 나노입자 및 리포터 기, 예컨대, 형광 화합물, 또는 NMR 또는 ESR 분광법에 의해 검출될 수 있는 화합물을 포함한다.
항체와 관련하여 용어 "에피토프" 또는 "결합 부위"는 항체의 파라토프가 결합하거나 인식하는 항원의 부위(또는 일부)를 의미한다. 에피토프는 연속 아미노산(종종 "선형 에피토프"로서도 지칭됨) 또는 단백질의 3차 폴딩에 의해 형성된 비연속 아미노산(종종 "입체구조적 에피토프"로서도 지칭됨) 둘 다로부터 형성될 수 있다. 연속 아미노산으로부터 형성된 에피토프는 전형적으로 변성 용매에 노출될 때 유지되는 반면, 폴딩에 의해 형성된 에피토프는 전형적으로 변성 용매로 처리 시 상실된다. 에피토프는 전형적으로 독특한 공간적 입체구조로 적어도 3개, 더 일반적으로 적어도 5개 내지 10개의 아미노산을 포함한다. 에피토프는 일반적으로 아미노산 및 당 측쇄와 같은 분자의 화학적 활성 표면 기로 구성되며 일반적으로 특정 3D 구조적 특성과 전하 특성을 가진다.
"EU 지수" 또는 "카바트에서와 같은 EU 지수" 또는 "EU 넘버링 체계"는 EU 항체의 넘버링을 의미한다(Edelman et al., 1969, Proc Natl Acad Sci USA 63:78-85). 이는 일반적으로 항체 중쇄 불변 영역의 잔기를 언급할 때 사용된다(예를 들어, 문헌[Kabat et al.]에 보고된 바와 같음). 달리 언급되지 않는 한, EU 넘버링 체계는 본원에 기재된 항체 중쇄 불변 영역의 잔기를 지칭하는 데 사용된다.
본원에서 사용된 용어 "Fab"는 경쇄의 VL(가변 경쇄) 도메인 및 불변 도메인(CL)을 포함하는 경쇄 단편, 및 중쇄의 VH(가변 중쇄) 도메인 및 제1 불변 도메인(CH1)을 포함하는 항체 단편을 의미한다. 본 개시내용에 따른 Fab'의 이량체는 F(ab')2를 생성하며, 이때, 예를 들어, 이량체화는 힌지를 통해 이루어질 수 있다.
본원에서 사용된 용어 "Fab'-Fv"는 FabFv와 유사하고, 이때 Fab 부분은 Fab'로 교체된다. 포맷은 그의 PEG화된 버전으로서 제공될 수 있다.
본원에서 사용된 용어 "Fab'-scFv"는 경쇄 또는 중쇄의 C-말단에 부착된 scFv를 가진 Fab' 분자이다.
본원에서 사용된 용어 "Fab-dsFv"는 Fv 내부 디설파이드 결합이 부착된 C-말단 가변 영역을 안정화시키는 FabFv를 의미한다. 포맷은 그의 PEG화된 버전으로서 제공될 수 있다.
본원에서 사용된 용어 "Fab-Fv"는 중쇄의 CH1 및 경쇄의 CL 각각의 C-말단에 부착된 가변 영역을 가진 Fab 단편을 의미한다. 포맷은 그의 PEG화된 버전으로서 제공될 수 있다.
본원에서 사용된 용어 "Fab-scFv"는 경쇄 또는 중쇄의 C-말단에 부착된 scFv를 가진 Fab 분자이다.
용어 "Fc", "Fc 단편" 및 "Fc 영역"은 제1 불변 영역 면역글로불린 도메인을 제외한 항체의 불변 영역을 포함하는 항체의 C-말단 영역을 지칭하기 위해 교환 가능하게 사용된다. 따라서, Fc는 IgA, IgD 및 IgG의 마지막 2개의 불변 도메인인 CH2 및 CH3, 또는 IgE 및 IgM의 마지막 3개의 불변 도메인, 및 이 도메인들의 N-말단에 있는 유연성 힌지를 의미한다. 인간 IgG1 중쇄 Fc 영역은 그의 카르복실 말단까지 잔기 C226을 포함하는 것으로 본원에서 정의되며, 이때 넘버링은 EU 지수에 따른다. 인간 IgG1과 관련하여, EU 지수에 따라 하부 힌지는 위치 226 내지 236을 의미하고, CH2 도메인은 위치 237 내지 340을 의미하고, CH3 도메인은 위치 341 내지 447을 의미한다. 다른 면역글로불린의 상응하는 Fc 영역은 서열 정렬에 의해 확인될 수 있다.
용어 "프레임워크" 또는 "FR"은 초가변 영역 잔기 이외의 가변 도메인 잔기를 의미한다. 가변 도메인의 FR은 일반적으로 4개의 FR 도메인, 즉 FR1, FR2, FR3 및 FR4로 구성된다. 따라서, HVR 및 FR 서열은 일반적으로 VH(또는 VL)에서 다음 순서로 나타난다: FR1-H1(L1)-FR2-H2(L2)-FR3-H3(L3)-FR4.
본원에서 사용된 용어 "전체 길이 항체"는 천연 항체 구조와 실질적으로 유사한 구조를 갖거나 본원에 정의된 Fc 영역을 함유하는 중쇄를 가진 항체를 의미한다. 각각의 경쇄는 경쇄 가변 영역(본원에서 VL로서 약칭됨) 및 경쇄 불변 영역(CL)으로 구성된다. 각각의 중쇄는 중쇄 가변 영역(본원에서 VH로서 약칭됨), 및 Ig 클래스에 따라 3개의 불변 도메인 CH1, CH2 및 CH3, 또는 4개의 불변 도메인 CH1, CH2, CH3 및 CH4로 구성된 중쇄 불변 영역(CH)으로 구성된다. 항체의 불변 영역은 면역 시스템의 다양한 세포(예를 들어, 이펙터 세포) 및 고전적 보체 시스템의 제1 성분(C1q)을 비롯한 숙주 조직 또는 인자와 면역글로불린의 결합을 매개할 수 있다.
용어 "Fv"는 전체 길이 항체의 2개의 가변 도메인, 예를 들어, 협동 가변 도메인, 예컨대, 동족 쌍 또는 친화성 성숙된 가변 도메인, 즉 VH 및 VL 쌍을 의미한다.
아미노산 서열과 관련하여 사용된 용어 "매우 유사한"은 그의 전체 길이에 걸쳐 95% 이상 유사한, 예컨대, 96%, 97%, 98% 또는 99% 유사한 아미노산 서열을 의미하기 위한 것이다.
용어 "인간 항체"는 인간 또는 인간 세포에 의해 생성된 항체, 또는 인간 항체 레퍼토리를 이용하는 비인간 공급원으로부터 유래한 항체의 아미노산 서열 또는 다른 인간 항체 코딩 서열에 상응하는 아미노산 서열을 보유하는 항체를 의미한다. 인간 항체의 이 정의는 비인간 항원 결합 잔기를 포함하는 인간화 항체를 구체적으로 배제한다.
용어 "인간 컨센서스 프레임워크"는 인간 면역글로불린 VL 또는 VH 프레임워크 서열의 선택에서 가장 흔히 발생하는 아미노산 잔기를 나타내는 프레임워크를 의미한다. 일반적으로, 인간 면역글로불린 VL 또는 VH 서열의 선택은 가변 도메인 서열의 하위군으로부터의 선택이다. 일반적으로, 서열의 하위군은 문헌[Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Edition, NIH Publication 91-3242, Bethesda MD (1991), vols. 1-3]에 기재된 바와 같은 하위군이다. 일부 실시양태에서, VL의 경우, 하위군은 상기 문헌[Kabat et al.]에 기재된 바와 같은 하위군 카파 I이다. 일부 실시양태에서, VH의 경우, 하위군은 상기 문헌[Kabat et al.]에 기재된 바와 같은 하위군 III이다. 일부 실시양태에서, VH의 경우, 하위군은 상기 문헌[Kabat et al.]에 기재된 바와 같은 하위군 IV이다.
용어 "인간화" 항체는 비인간 HVR로부터의 아미노산 잔기 및 인간 FR로부터의 아미노산 잔기를 포함하는 항체를 의미한다. 전형적으로, 중쇄 및/또는 경쇄는 공여자 항체(예를 들어, 뮤린 또는 토끼 단일클론 항체와 같은 비인간 항체)로부터의 하나 이상의 CDR(원하는 경우 하나 이상의 변형된 CDR을 포함함)을 함유하고 수용자 항체(인간 항체)의 중쇄 및/또는 경쇄 가변 영역 프레임워크 내로 이식된다(예를 들어, 문헌[Vaughan et al, Nature Biotechnology, 16, 535-539, 1998] 참조). 이러한 인간화 항체의 장점은 모 비인간 항체의 특이성과 친화성을 유지하면서 인간에 대한 면역원성을 감소시킨다는 점이다. 전체 CDR이 전달되기 보다는, 본원에 기재된 CDR들 중 어느 한 CDR로부터의 특이성 결정 잔기 중 하나 이상만이 인간 항체 프레임워크로 전달될 수 있다(예를 들어, 문헌[Kashmiri et al., 2005, Methods, 36, 25-34] 참조). "인간화" 항체는 비인간 HVR로부터의 아미노산 잔기 및 인간 FR로부터의 아미노산 잔기를 포함하는 키메라 항체를 의미한다. 항체의 "인간화 형태", 예를 들어, 비인간 항체는 인간화를 거친 항체를 의미한다.
본원에서 사용된 용어 "초가변 영역" 또는 "HVR"은 서열이 초가변적("상보성 결정 영역" 또는 "CDR")이고/이거나 구조적으로 정의된 루프("초가변 루프")를 형성하고/하거나 항원 접촉 잔기("항원 접촉")를 함유하는 항체 가변 도메인의 영역 각각을 의미한다.
본원에서 사용된 용어 "IC50"은 특정 생물학적 또는 생화학적 기능을 억제하는 데 있어서 항체와 같은 물질의 효과의 측정치인 절반 최대 억제 농도를 의미한다. IC50은 주어진 생물학적 과정을 50% 억제하기 위해 얼마나 많은 특정 물질이 필요한지를 표시하는 정량적 측정치이다.
서열의 아미노산들 사이의 "동일성"은 정렬된 서열에서 임의의 특정 위치에서 아미노산 잔기가 서열들 사이에 동일함을 표시한다.
본원에서 사용된 용어 "IgG-scFv"는 중쇄 각각 또는 경쇄 각각의 C-말단에서 scFv를 가진 전체 길이 항체이다.
본원에서 사용된 용어 "IgG-V"는 중쇄 각각 또는 경쇄 각각의 C-말단에서 가변 도메인을 가진 전체 길이 항체이다.
용어 "IgG1 LALA" 또는 "hIgG1 LALA"는 아미노산 치환 L234A/L235A가 IgG1의 불변 영역에 도입되어 있는 야생형 인간 IgG1 이소폼의 돌연변이체를 의미한다.
용어 "IgG4P" 또는 "hIgG4P"는 예를 들어, 문헌[Angal et al., Molecular Immunology, 1993, 30 (1), 105-108]에 기재된 바와 같이, (EU 넘버링에 따른) 아미노산 228이 프롤린으로 교체되어 있는 야생형 인간 IgG4 이소폼의 돌연변이체를 의미한다.
본 명세서 전반에 걸쳐 용어 "단리된"은 경우에 따라 항체 또는 폴리뉴클레오타이드가 자연에서 발생할 수 있는 환경과 상이한 물리적 환경에 존재할 수 있다는 것을 의미한다. 용어 "단리된" 핵산은 그의 천연 환경으로부터 단리되어 있거나 합성적으로 생성된 핵산 분자를 의미한다. 단리된 핵산은 예를 들어, 화학적 처리에 의해 생성된 합성 DNA, cDNA, 게놈 DNA 또는 이들의 임의의 조합을 포함할 수 있다.
용어 "카바트 잔기 표기" 또는 "카바트"는 항체를 위해 통상적으로 이용되는 잔기 넘버링 체계를 의미한다. 이는 아미노산 잔기의 선형 넘버링에 항상 직접적으로 상응하지는 않는다. 실제 선형 아미노산 서열은 기본 가변 도메인 구조의 프레임워크이든 아니면 상보성 결정 영역(CDR)이든 관계없이 구조적 성분의 단축 또는 구조적 성분 내로의 삽입에 상응하는, 엄격한 카바트 넘버링보다 더 적은 아미노산 또는 추가 아미노산을 함유할 수 있다. 항체 서열의 상동성 잔기를 "표준" 카바트 넘버링된 서열과 정렬함으로써 주어진 항체에 대한 잔기의 정확한 카바트 넘버링을 결정할 수 있다. 자세한 내용은 문헌[Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (1991)]을 참조한다. 달리 표시되어 있지 않는 한, 명세서 전반에 걸쳐 카바트 넘버링이 사용된다.
본원에서 사용된 용어 "KD"는 Ka에 대한 Kd의 비(즉, Kd/Ka)로부터 수득되고 몰 농도(M)로서 표현되는 해리 상수를 의미한다. Kd 및 Ka는 각각 특정 항원-항체 상호작용의 해리 속도 및 결합 속도를 의미한다. 항체에 대한 KD 값은 당분야에 잘 확립된 방법을 이용함으로써 측정될 수 있다.
용어 "단일클론 항체"(또는 "mAb")는 실질적으로 균질한 항체의 집단으로부터 수득된 항체를 의미한다. 즉, 단일클론 항체 제제의 각각의 개체는 미량으로 존재할 수 있는 가능한 돌연변이(예를 들어, 천연 발생 돌연변이)를 제외하고는 동일하다. 그럼에도 불구하고, 조성물에 존재하는 다양한 상이한 항체 분자들 사이에 번역 후 변형(예를 들어, 중쇄 C-말단 라이신의 절단, 아스파라긴 잔기의 탈아미드화 및/또는 아스파르테이트 잔기의 이성질체화)과 연관된 단백질 서열의 특정 차이가 존재할 수 있다. 다중클론 항체 제제와 대조적으로, 단일클론 항체 제제의 단일클론 항체 각각은 항원의 단일 결정인자에 대해 유도된다.
본원에서 사용된 용어 "다중파라토픽 항체"는 동일한 항원 또는 2개의 상이한 항원으로부터의 상이한 에피토프와 상호작용하는 2개 이상의 상이한 파라토프를 포함하는 본원에 기재된 항체를 의미한다. 본원에 기재된 다중파라토픽 항체는 이중파라토픽 항체, 삼중파라토픽 항체, 사중파라토픽 항체일 수 있다.
본원에서 사용된 용어 "다중특이적" 또는 "다중특이적 항체"는 적어도 2개의 결합 도메인, 즉 2개 이상의 결합 도메인, 예를 들어, 2개 또는 3개의 결합 도메인을 가진 본원에 기재된 항체를 지칭하며, 이때 적어도 2개의 결합 도메인은 2개의 상이한 항원 또는 동일한 항원의 2개의 상이한 에피토프에 독립적으로 결합한다. 다중특이적 항체는 일반적으로 각각의 특이성(항원)에 대해 1가이다. 본원에 기재된 다중특이적 항체는 1가 및 다가, 예를 들어, 2가, 3가, 4가 다중특이적 항체를 포괄한다. 예를 들어, 항체는 2개의 scFv 또는 dsscFv에 연결된 Fab를 포함할 수 있으며, 이때 각각의 scFv 또는 dsscFv는 동일하거나 상이한 표적에 결합한다(예를 들어, 치료 표적에 결합하는 하나의 scFv 또는 dsscFv, 및 예를 들어, 알부민에 결합하여 반감기를 증가시키는 하나의 scFv 또는 dsscFv). 이러한 항체는 국제 특허 출원 공개 제WO2015/197772호에 기재되어 있다.
항체와 관련하여 용어 "중화시키는"(또는 "중화시킨다")는 그의 표적(표적 단백질)의 생물학적 신호전달 활성을 억제할 수 있거나 약화시킬 수 있는 항체를 기술한다.
용어 "파라토프"는 항원을 인식하고 이에 결합하는 항체의 영역을 의미한다.
폴리펩티드 및 항체 서열과 관련하여 용어 "퍼센트(%) 서열 동일성(또는 유사성)"은 서열을 정렬하고 필요하다면 갭을 도입하여 최대 퍼센트 서열 동일성을 달성하고 임의의 보존적 치환을 서열 동일성의 일부로서 간주하지 않은 후, 비교되는 폴리펩티드에서 아미노산 잔기와 동일한(또는 유사한) 후보 서열의 아미노산 잔기의 백분율로서 정의된다.
"약학적으로 허용되는 담체"는 대상체에서 독성을 나타내지 않는, 활성 성분 이외의 약학 제제의 성분을 의미한다. 약학적으로 허용되는 담체는 완충제, 부형제, 안정화제 또는 보존제를 포함하나 이들로 제한되지 않는다.
용어 "다중클론 항체"는 항원의 하나 초과의 에피토프에 결합하는(또는 상호작용하는) 다양한 항체 분자의 혼합물을 의미한다.
항체와 관련하여 용어 "방해한다"는 본원에서 용어 "억제한다"와 교환 가능하게 사용되며, 본 발명에 따른 항체가 특정 생물학적 과정 또는 분자 상호작용에 대해 미치는 영향을 표시한다.
용어 "sc디아바디"는 분자가 3개의 링커를 포함하고 추가 Fv 쌍의 가변 영역 중 하나에 각각 연결된 VH 및 VL 말단을 가진 정상 scFv를 형성하도록 Fv 내부 링커를 포함하는 디아바디를 의미한다.
본원에서 사용된 용어 "Sc디아바디-CH3"은 예를 들어, 힌지를 통해 CH3 도메인에 각각 연결된 2개의 sc디아바디 분자를 의미한다.
본원에서 사용된 용어 "Sc디아바디-Fc"는 예를 들어, 힌지를 통해 불변 영역 단편 -CH2CH3의 CH2 도메인의 N-말단에 각각 하나씩 부착된 2개의 sc디아바디이다.
본원에서 사용된 용어 "단일 쇄 가변 단편" 또는 "scFv"는 VH 가변 도메인과 VL 가변 도메인 사이의 펩티드 링커에 의해 안정화된 단일 쇄 가변 단편을 의미한다.
본원에서 사용된 용어 "ScFv-Fc-scFv"는 CH2CH3 단편의 중쇄 둘 다의 N-말단 및 C-말단에 각각 하나씩 부착된 4개의 scFv를 의미한다.
본원에서 사용된 용어 "scFv-IgG"는 중쇄 각각 또는 경쇄 각각의 N-말단에서 scFv를 가진 전체 길이 항체이다.
본원에서 사용된 용어 "유사성"은 정렬된 서열의 임의의 특정 위치에서 아미노산 잔기가 서열들 사이에 유사한 유형의 아미노산 잔기임을 표시한다. 예를 들어, 류신은 이소류신 또는 발린으로 치환될 수 있다. 종종 서로 치환될 수 있는 다른 아미노산은
- 페닐알라닌, 티로신 및 트립토판(방향족 측쇄를 가진 아미노산);
- 라이신, 아르기닌 및 히스티딘(염기성 측쇄를 가진 아미노산);
- 아스파르테이트 및 글루타메이트(산성 측쇄를 가진 아미노산);
- 아스파라긴 및 글루타민(아미드 측쇄를 가진 아미노산); 및
- 시스테인 및 메티오닌(황 함유 측쇄를 가진 아미노산)
을 포함하나 이들로 제한되지 않는다.
본원에서 사용된 용어 "단일 도메인 항체"는 단일 단량체성 가변 도메인으로 구성된 항체 단편을 의미한다. 단일 도메인 항체의 예는 VH 또는 VL 또는 VHH 또는 V-NAR을 포함한다.
항체와 관련하여 본원에서 사용된 용어 "특이적"은 특이적 항원만을 인식하는 항체, 또는 비특이적 항원에의 결합에 비해 특이적 항원에 대해 유의미하게 더 높은 결합 친화성, 예를 들어, 적어도 5배, 6배, 7배, 8배, 9배, 10배 더 높은 결합 친화성을 가진 항체를 의미하기 위한 것이다.
본원에서 사용된 용어 "입체적으로 차단하는" 또는 "입체적으로 방해하는"은 제1 단백질과 제3 단백질의 결합으로 제1 단백질과 제2 단백질 사이의 상호작용을 차단하는 수단을 의미하기 위한 것이다. 제1 단백질과 제3 단백질 사이의 결합은 제2 단백질과 제3 단백질 사이의 유리하지 않은 반 데르 발스 또는 정전기적 상호작용으로 인해 제2 단백질이 제1 단백질에 결합하는 것을 방해한다.
치료 및 진단과 관련하여 용어 "대상체" 또는 "개체"는 일반적으로 포유동물을 의미한다. 포유동물은 사육 동물(예를 들어, 소, 양, 고양이, 개 및 말), 영장류(예를 들어, 인간 및 비인간 영장류, 예컨대, 원숭이), 토끼 및 설치류(예를 들어, 마우스 및 래트)를 포함하나 이들로 제한되지 않는다. 보다 구체적으로, 개체 또는 대상체는 인간이다.
본원에서 사용된 용어 "탠덤 scFv"는 단일 Fv간 링커가 존재하도록 단일 링커를 통해 연결된 적어도 2개의 scFv를 의미한다.
본원에서 사용된 용어 "탠덤 scFv-Fc"는 예를 들어, 힌지를 통해 불변 영역 단편 -CH2CH3의 CH2 도메인의 N-말단에 각각 하나씩 부착된 적어도 2개의 탠덤 scFv를 의미한다.
본원에서 사용된 용어 "표적" 또는 "항체 표적"은 항체가 결합하는 표적 항원을 의미한다.
본원에서 사용된 용어 "테트라바디"는 4개의 Fv 및 4개의 Fv간 링커를 포함하는 디아바디와 유사한 포맷을 의미한다.
용어 "치료 유효량"은 질환을 치료하기 위해 대상체에게 투여될 때 질환에 대한 이러한 치료를 생성하기에 충분한 항체의 양을 의미한다. 치료 유효량은 항체, 질환 및 이의 중증도, 및 치료되는 대상체의 연령, 체중 등에 따라 달라질 것이다.
본원에서 사용된 용어 "트리바디"(Fab(scFv)2로서도 지칭됨)는 경쇄의 C-말단에 부착된 제1 scFv 및 중쇄의 C-말단에 부착된 제2 scFv를 가진 Fab 단편을 의미한다.
본원에서 사용된 용어 "삼중특이적 또는 삼중특이적 항체"는 3종의 항원 결합 특이성을 가진 항체를 의미한다. 예를 들어, 항체는 3개의 상이한 항원, 또는 동일한 항원의 3개의 상이한 에피토프에 독립적으로 결합하는 3개의 항원 결합 도메인(3가)을 가진 항체이다. 즉, 각각의 결합 도메인은 각각의 항원에 대해 1가이다. 삼중특이적 항체 포맷의 예 중 하나는 TrYbe이다.
용어 "예방한다" 또는 "예방하는" 등은 질환 또는 이의 증상을 완전히 또는 부분적으로 예방한다는 관점에서 예방 효과를 수득하는 것을 의미한다. 따라서, 예방은 질환에 걸리기 쉬울 수 있지만 아직 질환을 가진 것으로서 진단되지 않은 대상에서 질환이 발생하는 것을 중단시키는 것을 포괄한다.
용어 "치료", "치료하는" 등은 원하는 약리학적 및/또는 생리학적 효과를 수득하는 것을 의미한다. 효과는 질환 및/또는 질환에 기인할 수 있는 부작용의 부분적 또는 완전한 치유이라는 관점에서 치료 효과일 수 있다. 따라서, 치료는 (a) 질환을 억제하는 것, 즉 그의 발생을 저지하는 것; (b) 질환을 완화하는 것, 즉 질환의 퇴행을 야기하는 것을 포괄한다.
본원에서 사용된 용어 "TrYbe"는 2개의 dsscFv를 포함하는 트리바디를 의미한다. 본원에 사용된 dsFab는 가변 영역 내부 디설파이드 결합을 가진 Fab를 의미한다.
용어 "가변 영역" 또는 "가변 도메인"은 항체와 항원의 결합에 관여하는 항체 중쇄 또는 경쇄의 도메인을 의미한다. 전체 길이 항체의 중쇄(VH) 및 경쇄(VL)의 가변 도메인은 일반적으로 유사한 구조를 가지며, 이때 각각의 도메인은 4개의 보존된 프레임워크 영역(FR) 및 3개의 CDR을 포함한다(예를 들어, 문헌[Kindt et al. Kuby Immunology, 6th ed., W.H. Freeman and Co., page 91 (2007)] 참조). 단일 VH 또는 VL 도메인은 항원 결합 특이성을 부여하기에 충분할 수 있다. 각각의 VH 및 VL은 FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3, FR4의 순서로 아미노-말단부터 카르복시-말단까지 배열된, 3개의 CDR과 4개의 FR로 구성된다. CDR과 FR은 함께 가변 영역을 형성한다. 관례적으로, 항체의 중쇄 가변 영역에 있는 CDR은 CDR-H1, CDR-H2 및 CDR-H3으로서 지칭되고, 경쇄 가변 영역에 있는 CDR은 CDR-L1, CDR-L2 및 CDR-L3으로서 지칭된다. 이들은 각각의 쇄의 N-말단에서 C-말단 방향으로 순차적으로 넘버링된다. CDR은 통상적으로 카바트에 의해 고안된 시스템에 따라 넘버링된다.
본원에서 사용된 용어 "벡터"는 그에 연결된 또 다른 핵산을 증폭할 수 있는 핵산 분자를 의미한다. 이 용어는 자가-복제 핵산 구조물로서의 벡터뿐만 아니라, 벡터가 도입되어 있는 숙주 세포의 게놈에 통합된 벡터도 포함한다. 일부 벡터는 그 자신에 작동 가능하게 연결되어 있는 핵산의 발현을 유도할 수 있다. 이러한 벡터는 본원에서 "발현 벡터"로서 지칭된다. 용어 "벡터"는 "발현 벡터"를 포함한다.
용어 "VH"는 중쇄의 가변 도메인(또는 서열)을 의미한다.
본원에서 사용된 용어 "V-IgG"는 중쇄 각각 또는 경쇄 각각의 N-말단에서 가변 도메인을 가진 전체 길이 항체이다.
용어 "VL"은 경쇄의 가변 도메인(또는 서열)을 의미한다.
TREM1
용어 "TREM1"은 단핵구, 대식세포, 호중구 및 기타 유형의 세포에서 발현되는 수용체를 의미하는 "골수 세포에서 발현되는 유발 수용체 1"(TREM-1 및 CD354로서도 알려짐)을 의미한다. TREM1에 대한 주요 리간드는 펩티도글리칸(PGN) 결합 단백질(PGRP)의 패밀리에 속하는 펩티도글리칸 인식 단백질 1(PGLYRP1)을 포함한다. 용어 "TREM1"은 세포에 의해 천연적으로 발현되는 임의의 TREM1 변이체 또는 이소폼을 포함한다.
인간 TREM1의 세 가지 이소폼이 확인되었다. 이소폼 1(수탁번호 NP 061113.1; 서열번호 1)은 234개의 아미노산으로 구성되고 표준 서열을 나타낸다. 이소폼 2(수탁번호 NP 001229518.1; 서열번호 2)는 225개의 아미노산으로 구성되고 아미노산 잔기 201 내지 234에서 표준 서열과 상이하다. 아미노산 잔기는 막횡단 도메인의 일부 및 세포질 도메인을 코딩한다. 이소폼 3(수탁번호 NP 001229519; 서열번호 3)은 150개의 아미노산으로 구성되고 가용성을 띤다. 이것은 막횡단 도메인, 세포질 도메인 및 세포외 도메인의 일부를 코딩하는 아미노산 잔기 151 내지 234를 결여한다. 아미노산 잔기 138 내지 150도 전술된 표준 서열과 상이하다.
항-TREM1 항체를 확인하는 방법
PGLYRP1 리간드와 상호작용하는 TREM1의 아미노산 잔기와 상이한 TREM1의 아미노산 잔기와 상호작용하고 하나 이상의 TREM1 활성을 중화시키는 항체를 확인하기 위해, 시험 항체와 TREM1의 결합 및 시험 항체의 기능적 성질의 측정뿐만 아니라, 상기 결합의 구조적 측면(표적 에피토프 잔기)의 고처리율 측정도 포함하는 특별한 스크리닝 및 시험 전략이 개발되어야 한다. 이 방법은 PGLYRP1과의 상호작용에 관여하는 TREM1 잔기를 확립함으로써, PGLYRP1이 결합하는 TREM1의 부위와 상이한 TREM1의 부위에 결합할 항체의 빠른 시험을 수행할 수 있게 하고 추가 개발을 위해 이러한 항체를 선택할 수 있게 한다. 이러한 항체는 TREM1의 상이한 부위와 상호작용하는 다른 잠재적인 리간드의 결합을 방해한다는 추가 이점을 제공할 수 있다.
따라서, 본원은 PGLYRP1과 상호작용하는 TREM1의 아미노산 잔기와 상이한 TREM1의 아미노산 잔기와 상호작용하고 인간 TREM1의 활성을 중화시키는 항체를 확인하는 방법으로서,
a) 인간 TREM1을 일시적으로 발현하는 세포로 동물을 예방접종하는 단계;
b) 상기 동물로부터 B 세포를 회수하는 단계; 및
c) i. 적어도 1 nM의 친화성으로 인간 TREM1에 결합하고; ii. THP1 단핵구 TREM1/DAP12 NF-κB 루시퍼라제 리포터 세포 어세이에서 PGLYRP1 매개 신호전달을 차단하고; iii. PGLYRP1이 결합하는 인간 TREM1의 부위와 상이한 인간 TREM1의 부위에 결합하는 능력을 기준으로 상기 B 세포에 의해 생성된 항체를 선택하는 단계
를 포함하는 방법을 제공한다.
PGLYRP1이 결합하는 부위와 상이한 부위에 결합하는 항체를 확인하기 위해, TREM1 단백질에서 결합 부위(시험 항체와의 상호작용에 관여하는 TREM1의 잔기)를 신속하게 시험할 수 있게 하는 돌연변이체 TREM1 단백질의 어레이를 사용하는 방법을 개발하였다. 상기 방법을 이용하여 PGLYRP1 리간드의 결합 부위를 확인한다. 시험 항체(또는 PGLYRP1)의 결합 부위를 형성하는 TREM1의 아미노산 잔기를 확인하는 이러한 방법은
a) TREM1에 대한 3D 구조 정보를 수득하는 단계;
b) 수득된 3D 구조 데이터를 사용하여 접근 가능한 표면 영역 내에 있는 아미노산 잔기를 확인하는 단계;
c) 확인된 아미노산 각각에 대해, 확인된 아미노산으로부터 소정의 거리 내에 있고 접근 가능한 표면 영역 내에 있는 1개 또는 2개의 아미노산을 선택하는 단계로서, 아미노산 잔기의 이러한 조합이 2개 또는 3개의 아미노산의 패치(패치)를 형성하는 것인 단계;
d) TREM1 단백질이 잘못 폴딩될 수 있게 할 가능성이 있는 패치의 수를 최소화하면서, TREM1의 접근 가능한 표면 영역의 대부분을 덮는 대표적인 패치 세트를 다수의 생성된 가능한 패치들로부터 선택하는 단계;
e) 돌연변이체 단백질 세트를 생성하는 단계로서, 돌연변이체 단백질 각각이 표적 단백질의 돌연변이된 서열을 포함하고, 돌연변이된 서열 각각이 단계 (c)에서 확인된 아미노산의 단일 돌연변이된 패치를 포함하고, 패치의 아미노산 각각이 또 다른 아미노산으로 치환되는 것인 단계;
f) 돌연변이체 단백질 각각의 결합 성질을 측정하는 단계; 및
g) 이러한 패치를 포함하는 상응하는 돌연변이체 TREM1 단백질에 대한 항체의 감소된 결합 성질을 나타내는 패치를 확인하는 단계로서, 이러한 패치 내의 잔기가 항체의 결합 부위의 일부인 것으로서 확인되는 것인 단계
를 포함한다.
바람직한 실시양태에서, 항체는 인간 TREM1의 잔기 E26, E27, K28, Y29, E30, L31, K32 및 Q35와 상호작용하는 경우 선택된다(이때 넘버링은 서열번호 1에 따른다).
TREM1의 돌연변이체 버전을 생성하는 아미노산 잔기를 확인하기 위해, TREM1에 대한 3D 구조 데이터를 수득할 필요가 있다. 이러한 데이터는 PDB 구조의 형태(PDB 코드: 1SMO, 쇄 A)로 입수될 수 있다. 대안적으로, 그러한 구조 데이터는 당업자에게 알려진 기법을 이용함으로써 수득될 수 있다. 이러한 기법은 X-선 분석 또는 NMR 데이터를 포함한다. 바람직하게는, 이러한 3D 데이터는 표적 잔기를 확인할 수 있게 할 만큼 충분한 공간 해상도를 가진다.
구체적으로, 패치 각각의 잔기 사이의 소정의 거리는 4Å, 5Å, 6Å 또는 7Å이다. 바람직하게는, 이러한 거리는 6Å이다. 바람직하게는, 알라닌 및 글리신은 치환을 위해 선택되지 않는다. 3D 구조에서 Cys 잔기의 관련성에 따라 이러한 잔기는 치환될 수 있거나 치환을 위해 선택되지 않을 수 있다. Cys는 종종 단백질에서 S-S 결합의 형성에 관여하며 3차 구조에 중요하다. Gly는 매우 유연한 아미노산이고 이를 Ala과 같은 더 큰 아미노산으로 치환하는 것은 구조적 효과도 가질 수 있다. 임의로, Pro 잔기는 종종 2차 구조 형성에 관여하므로 분석으로부터 제외될 수도 있다.
보다 구체적으로, 접근 가능한 표면 영역 내의 아미노산은 측쇄의 계산된 용매 접근 가능한 표면 영역을 기준으로 선택된다. 용매 접근성을 계산하는 표준 방법을 적용할 수 있다. 전형적인 예에서, 1.4Å의 프로브가 계산에 사용된다(H2O 분자의 단순화된 버전, 이때 이러한 프로브는 H2O 분자와 유사한 크기를 가진다). 이러한 계산에서 프로브와 접촉하는 아미노산 잔기의 원자는 표면 접근 가능한 원자로서 분류된다. 각각의 아미노산의 표면 접근성은 A2로 계산된다. 그 후, 실제 표면 노출된 영역(Å2)과 이론적으로 가능한 표면 노출(Å2) 사이의 비가 계산된다. 원하는 정확도 및 단백질의 크기에 따라 다양한 컷오프를 선택할 수 있다. 이러한 컷오프는 0.5, 0.2로부터 선택될 수 있으며, 바람직하게는 이러한 컷오프는 0.05 내지 0.1이고, 보다 바람직하게는 이러한 컷오프는 0.07이다. 이러한 여과 단계는 잠재적으로 잘못 폴딩되는 단백질을 제거하는 데 유용하다.
최종 어레이에서 잘못 폴딩된 TREM1 단백질의 양을 감소시키기 위한 추가 단계가 수행될 수 있다. 예를 들어, 각각의 돌연변이된 패치의 원래 잔기들 중 임의의 잔기(2개 또는 3개의 잔기)와 단백질의 나머지 부분 사이에 하나 초과의 수소 결합의 파괴를 야기하는 잔기를 바람직하게는 피한다. 유사하게, 염 가교의 임의의 파괴도 바람직하게는 피해야 한다. 추가로, 단백질의 큰 소수성 영역을 노출시키는 돌연변이 잔기도 피한다. 또 다른 실시양태에서, 단백질 내에서 2개 초과의 수소 결합의 파괴를 야기하는 잔기도 피한다. 유사하게, 염 가교의 임의의 파괴도 바람직하게는 피해야 한다.
따라서, 상기 방법의 바람직한 실시양태에서, 상기 방법은 1) 수소 결합의 파괴를 초래하는 패치(바람직하게는 최대 2개의 파괴된 결합이 허용됨) 및 2) 염 가교(바람직하게는 최대 1개의 파괴된 결합이 허용됨)뿐만 아니라, 3) 큰 소수성 패치의 노출(바람직하게는 최대 15Å 2의 노출된 소수성 표면이 허용됨)도 배제하거나 걸러낸다. 패치를 정의하기 위한 거리 임계값은 6 내지 6.5Å로 설정될 수 있으며 최소 측쇄 표면 노출은 7%로 설정될 수 있다.
임의로, 임의의 널리 사용되는 시뮬레이션 팩키지(예를 들어, AMBER, GROMACS, DESMOND 등)를 사용하여 분자 동역학 시뮬레이션을 수행하고 상호작용 지속성의 후속 분석을 수행함으로써 추가 입상도를 달성할 수 있다. 시뮬레이션 궤적의 대부분에 존재하는 수소 결합 및 염 가교는 "필수적인" 것으로 간주될 수 있고 Ala 돌연변이에 의해 파괴되어서는 안 되는 반면, 시뮬레이션의 일부에서만 관찰되는 결합은 단백질의 안정성에 거의 영향을 미치지 않을 가능성이 높다.
추가로, 잔기의 모든 패치가 확인된 후, 중복을 생성하는 패치를 제거함으로써 이러한 패치의 임의의 중복이 제거된다. 접근 가능한 표면 영역을 덮는 데 있어서 일부 중복을 갖는 것이 유리할 수 있기 때문에, 이 단계는 임의적 단계이지만, 이러한 중복을 갖는 것은 추후에 돌연변이체 클론을 생성하는 데 있어서 기술적인 어려움을 제공할 수 있다. 따라서, 이러한 중복은 상응하는 돌연변이체 단백질을 설계하는 데 있어서 단백질 크기, 복잡성 및 기술적 한계와 관련하여 고려되어야 한다.
이상적으로, 상기 단계들은 최대 표면 접근 가능한 영역이 확인된 패치에 의해 덮이도록 전체 단백질 표면에 대해 수행된다. 이러한 패치에 의해 덮이지 않는 표면 접근 가능한 영역의 일부를 갖는 것을 피하는 것이 바람직할 것이다. 목적은 생성된 잘못 폴딩된 단백질의 수를 최소화하면서 용매 접근 가능한 표면을 덮는 것이다.
예를 들어, 2개의 치환의 패치를 사용하는 것이 전체 표면 접근 가능한 영역을 덮지 않을 경우, 3개의 치환으로 구성된 추가 패치를 설계할 수 있다. 3개 초과의 치환의 더 큰 패치도 사용할 수 있으나, 3개 초과의 치환은 돌연변이체 TREM1 단백질의 폴딩오류를 유발할 수 있다. 따라서, 바람직하게는 2개 또는 3개의 Ala 치환을 함유하는 패치가 사용된다. 원하는 경우, 추가 단일 Ala 치환도 선택될 수 있다. 그러나, 이것은 2개 또는 3개의 치환에 비해 원하는 민감성을 제공하지 않을 수 있다.
이 전략에 따라 2개 또는 3개의 Ala 패치를 가진 돌연변이체 TREM1 단백질의 어레이가 실시예에 제공된다.
그 후, 돌연변이된 TREM1 단백질의 생성된 서열이 실험적 시험을 위해 생성된다. 이를 생성하는 전형적인 방식은 서열을 적합한 발현 벡터에 클로닝하는 것이다. 관심 있는 표적 단백질의 야생형 서열도 대조군으로서 클로닝된다.
돌연변이체 TREM1 단백질의 어레이는 당업자에게 알려진 기법을 이용함으로써 생성될 수 있다. 표적 세포에서 단백질을 발현시키기 위해 임의의 적합한 발현 시스템이 사용될 수 있다. 바람직하게는, 포유동물 세포 시스템이 클로닝된 돌연변이체 펩티드의 발현을 위해 사용된다. 포유동물 세포는 돌연변이체 폴리펩티드가 이러한 세포 밖으로 분비될 수 있게 할 것이고 이러한 펩티드를 더 쉽게 시험할 수 있게 할 것이다. 돌연변이체 펩티드 각각의 충분한 발현을 허용하는 한, 임의의 포유동물 세포 또는 세포주를 사용할 수 있다. 이러한 포유동물 시스템에서, 적합한 발현 벡터가 사용될 수 있다. 많은 포유동물 발현 벡터가 상업적으로 입수 가능하다. 전형적으로, 이러한 벡터는 사이토메갈로바이러스(CMV) 프로모터와 같은 항시성 프로모터를 포함할 것이다.
돌연변이체 TREM1 단백질 각각은 Fc 영역, 바람직하게는 인간 Fc 도메인에 융합될 수 있다. 이러한 융합 단백질에서의 Fc 도메인의 사용은 실용적인 장점, 예컨대, 검출 시 강인성이 더 높다는 점, 및 이러한 융합 단백질이 표면에 포획되기 쉽다는 점을 제공한다. 임의로, 필요하다면, 삼중 Ala 링커와 같은 하나 이상의 링커 서열을 Fc 도메인과 표적 돌연변이체 단백질 사이의 융합 단백질 서열에 도입할 수 있다.
바람직하게는, 인간 Fc 도메인을 포함하는 이러한 융합 단백질은 포유동물 Expi293 세포, 또는 충분한 농도의 단백질을 생성할 수 있는 임의의 다른 세포에서 발현된다.
임의로, 잠재적으로 잘못 폴딩될 수 있는 TREM1 단백질은 TREM1에 대한 다중클론 항체(다수의 에피토프를 표적화함) 또는 ELISA 어세이에 적합한 알려진 에피토프의 임의의 시판되는 단일클론 항체(이러한 항체는 구조적 에피토프를 인식할 것임)를 사용하여 어레이를 사전스크리닝함으로써 어레이로부터 제거될 수 있다.
마지막으로, 어레이에서 돌연변이체 표적 단백질 각각에 대한 항체의 결합 성질을 측정한다. 이러한 측정은 임의의 이용 가능한 적절한 방법을 이용함으로써 수행될 수 있다. 바람직하게는, 이러한 측정은 고처리율 방법을 이용함으로써 수행된다.
당분야에서 통상의 기술을 가진 자는 통상적인 기법, 예를 들어, 문헌[Scatchard et al. (Ann. KY. Acad. Sci. 51:660-672 (1949))]에 기재된 기법, 또는 비아코어(BIAcore)와 같은 시스템을 사용하는 표면 플라즈몬 공명(SPR)을 이용하여 관심 있는 분자의 친화성뿐만 아니라, 이러한 분자가 표적 단백질에의 결합을 억제하는 정도도 측정할 수 있다. 표면 플라즈몬 공명을 위해, 돌연변이체 단백질을 고체상에 고정시키고 유동 셀을 따라 이동하는 이동상에서 리간드 및/또는 관심 있는 분자에 노출시킨다. 리간드와 고정된 표적의 결합이 일어나면, 국소 굴절률이 변하여, SPR 각도의 변화를 유발하고, 이 변화는 반사된 광의 강도 변화를 검출함으로써 실시간으로 모니터링될 수 있다. SPR 신호의 변화율을 분석하여 결합 반응의 결합 및 해리 단계에 대한 겉보기 속도 상수를 얻을 수 있다. 이 값들의 비는 겉보기 평형 상수(친화성)를 제공한다(예를 들어, 문헌[Wolff et al, Cancer Res. 53:2560-65 (1993)] 참조).
SPR과 유사한 기법을 이용하는 대안적 플랫폼, 예컨대, 카테라(Carterra) LSA 플랫폼은 카테라(Cartera)(carterra-bio.com)에 의해 제공된다. 이것은 유동 프린팅 미세유체학과 고처리율 표면 플라즈몬 공명(SPR) 검출 기술을 겸비한 고처리율 항체 특징규명 플랫폼이다.
다른 유형의 플랫폼은 세포 표면 발현 어레이를 이용하는 기법을 포함한다. 이러한 플랫폼의 예는 단백질과 세포 표면 수용체의 결합을 추적하는 데 특히 적합하고 결합 속도와 해리 속도뿐만 아니라 친화성도 측정할 수 있게 하는 리간드트레이서(LigandTracer)(ligandtracer.com)이다.
측정을 단순화하기 위해, 어레이의 돌연변이체 단백질 각각을 분자 또는 단백질에 융합시켜, 이를 표면에 포획할 수 있게 하여 결합 성질을 보다 쉽게 검출할 수 있다.
바람직하게는, 각각의 돌연변이체 단백질과의 결합은 표지 부재 기술인 생물층 간섭측정(BLI)을 이용함으로써 확인된다. 이것은 2개의 표면, 즉 바이오센서 팁에 고정된 단백질 층 및 내부 기준 층으로부터 반사된 백색광의 간섭 패턴을 분석하는 광학 분석 기법이다. 바이오센서 팁에 결합된 분자 수의 임의의 변화는 실시간(REF)으로 측정될 수 있는 간섭 패턴의 변동을 야기한다.
전형적으로, 30개 내지 60개의 클로닝된 돌연변이체 단백질의 어레이가 사용된다. 그러나, 이러한 어레이의 크기는 표적 단백질의 크기 및 용매 접근 가능한 영역의 원하는 덮는 정도에 의해 좌우된다. 바람직하게는, 돌연변이체 단백질은 96웰 플레이트 또는 384웰 플레이트에 제공된다. 일반적으로, BLI 기기는 측정을 위해 96웰 또는 384웰 플레이트를 취급할 수 있다.
BLI 기술을 이용할 때, 전형적으로 각각의 센서는 결합 부위가 확인되는 관심 있는 분자(예컨대, 항체 또는 리간드)를 함유하는 용액에 노출된다. BLI 기술의 장점은 거의 일반 비아코어만큼 민감하고, 처리율이 높으며(96개의 클론을 동시에 시험할 수 있음), 일회용 센서 팁을 사용하므로, 비아코어의 이용 시 전형적으로 하는 것처럼 표면을 재생하고 칩을 재사용할 필요가 없다는 점이다.
시험 항체와 돌연변이체 TREM1 단백질의 결합의 다양한 측정치를 사용하여 어떤 돌연변이체 단백질이 감소된 결합을 나타내는지를 확인할 수 있다. 전형적으로, 해리 상수 또는 결합 상수를 측정한다. 전형적으로, 결합의 완전히 상실, 또는 관심 있는 분자가 돌연변이체 단백질로부터 얼마나 빨리 나오는지를 측정할 수 있다. 항체의 결합 성질을 측정할 때 일반적으로 적절한 대조군이 사용된다. 통상적으로, 결합 성질은 표적 단백질의 모 서열(야생형, WT)과 비교된다. 전형적으로, 대다수의 돌연변이체 단백질은 WT와 동일한 Kd를 보일 것이다. 결합의 차이를 보이는 돌연변이체 단백질을 고려해야 한다. 전형적으로, 야생형 TREM1에 비해 적어도 2배, 3배, 4배, 5배, 6배, 7배, 8배, 9배 또는 10배 이상의 임의의 해리 상수 차이가 고려된다. 바람직하게는, 적어도 3배의 임의의 차이는 유의미한 것으로 간주된다. 노이즈 대 신호 해상도가 낮은 결과를 생성하는 돌연변이체 TREM1 단백질은 무시되거나 재측정된다.
원하는 경우, 2개 또는 3개 치환의 패치와 같은 상이한 크기의 패치를 포함하는 돌연변이체 단백질을 어레이에서 사용할 수 있다. 단일 치환을 포함하는 돌연변이체 단백질은, 이것이 측정 가능한 효과를 수득하기에 충분한 민감성을 제공하는 한, 더 높은 정밀도가 필요한 경우 결합 성질에 대해 추가로 시험될 수도 있다.
TREM1에 결합하는 항체
본 발명은 인간 TREM1(표적 폴리펩티드)에 결합하고 본원에 추가로 기재된 기능적 및 구조적 성질을 가진 항-TREM1 항체를 제공한다.
본 발명과 관련하여 항체는 전체 항체 및 기능적 활성 항체 단편(즉, 항원 결합 단편으로서도 지칭되는, 항원에 특이적으로 결합하는 항원 결합 도메인을 함유하는 분자)을 포함한다. 문맥이 달리 명시하지 않는 한, 본원에 기재된 특징은 항체 단편에도 적용된다. 항체는 다중클론, 단일클론, 다가, 다중특이적, 이중특이적, 완전 인간, 인간화 또는 키메라 항체일 수 있다(또는 이들로부터 유래할 수 있다).
추가로 기재된 항체는 특정 항체 유형이며 본 발명의 범위를 제한하지 않는다.
본 발명에 따라 사용되는 항체는 단일클론 항체 또는 다중클론 항체일 수 있고, 바람직하게는 단일클론 항체이다. 본 발명에 따라 사용되는 항체는 키메라 항체, CDR 이식된 항체(예를 들어, CDR이 유래한 공여자 항체의 클래스/유형을 고려하여, 마우스, 영장류 및 인간 프레임워크 영역을 포함하는 임의의 적절한 수용자 가변 영역 프레임워크 서열이 사용될 수 있음), 나노바디, 인간 또는 인간화 항체일 수 있다. 단일클론 항체 및 다중클론 항체 둘 다를 생성하기 위해, 이러한 항체를 생성하는 데 사용되는 동물은 전형적으로 비인간 포유동물, 예컨대, 염소, 토끼, 래트 또는 마우스이지만, 항체는 다른 종에서도 생성될 수 있다.
다중클론 항체는 관심 있는 항원으로 적합한 동물을 예방접종하는 것과 같은 관용적인 방법에 의해 생성될 수 있다. 이어서, 이러한 동물로부터 혈액을 제거하할 수 있고 생성된 항체를 정제할 수 있다.
단일클론 항체는 하이브리도마 방법, 재조합 DNA 방법, 파지-디스플레이 방법, 및 인간 면역글로불린 유전자좌의 전부 또는 일부를 함유하는 형질전환 동물을 이용하는 방법을 포함하나 이들로 제한되지 않는 다양한 기법에 의해 제조될 수 있다. 단일클론 항체를 제조하는 일부 예시적인 방법이 본원에 기재되어 있다.
예를 들어, 단일클론 항체는 하이브리도마 기법(Kohler & Milstein, 1975, Nature, 256:495-497), 트리오마 기법, 인간 B 세포 하이브리도마 기법(Kozbor et al., 1983, Immunology Today, 4:72) 및 EBV-하이브리도마 기법(Cole et al., Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy, pp77-96, Alan R Liss, Inc., 1985)을 이용함으로써 제조될 수 있다.
항체는 예를 들어, 국제 특허 출원 공개 제WO9202551호, 제WO2004051268호 및 제WO2004106377호에 기재된 방법으로 특정 항체의 생성을 위해 선택된 단일 림프구로부터 생성된 면역글로불린 가변 영역 cDNA를 클로닝하고 발현시킴으로써 단일 림프구 항체 방법의 이용을 통해 생성될 수도 있다.
동물의 예방접종이 필요한 경우, 잘 알려져 있고 관용적인 프로토콜을 이용하여 폴리펩티드를 동물, 바람직하게는 비인간 동물에게 투여함으로써, 표적 폴리펩티드에 대해 생성된 항체를 수득할 수 있다(예를 들어, 문헌[Handbook of Experimental Immunology, D. M. Weir (ed.), Vol 4, Blackwell Scientific Publishers, Oxford, England, 1986] 참조). 토끼, 마우스, 래트, 양, 소, 낙타 또는 돼지와 같은 많은 동물들이 예방접종될 수 있다. 그러나, 마우스, 토끼, 돼지 및 래트가 일반적으로 사용된다.
단일클론 항체는 또한 당분야에 알려진 다양한 파지 디스플레이 방법을 이용함으로써 생성될 수 있으며 문헌[Brinkman et al. (in J. Immunol. Methods, 1995, 182: 41-50)], 문헌[Ames et al. (J. Immunol. Methods, 1995, 184:177-186)], 문헌[Kettleborough et al. (Eur. J. Immunol. 1994, 24:952-958)], 문헌[Persic et al. (Gene, 1997 187 9-18)], 문헌[Burton et al. (Advances in Immunology, 1994, 57:191-280)]에 개시된 항체들을 포함할 수 있다. 특정 파지 디스플레이 방법에서, VH 및 VL 유전자의 레퍼토리는 중합효소 연쇄 반응(PCR)에 의해 개별적으로 클로닝되고 파지 라이브러리에서 무작위로 재조합된 다음, 문헌[Winter et al., Ann. Rev. Immunol, 12: 433-455 (1994)]에 기재된 바와 같이 항원 결합 파지에 대해 스크리닝될 수 있다. 파지는 전형적으로 단일 쇄 Fv(scFv) 단편 또는 Fab 단편으로서 항체 단편을 표시한다. 예방접종된 공급원으로부터의 라이브러리는 하이브리도마를 구축할 것을 요구하지 않으면서 면역원에 대한 고친화성 항체를 제공한다. 대안적으로, 미감작 레퍼토리는 문헌[Griffiths et al., EMBO J 12: 725-734 (1993)]에 기재된 바와 같이 임의의 예방접종 없이 광범위한 비-자가 항원 및 또한 자가 항원에 대한 항체의 단일 공급원을 제공하도록 (예를 들어, 인간으로부터) 클로닝될 수 있다. 마지막으로, 미감작 라이브러리는 문헌[Hoogenboom and Winter, J. Mol. Biol, 227: 381-388 (1992)]에 기재된 바와 같이 줄기 세포로부터 재배열되지 않은 V 유전자 분절을 클로닝하고, 고도 가변성 CDR3 영역을 코딩하고 시험관 내에서 재배열을 달성하도록 무작위 서열을 함유하는 PCR 프라이머를 사용함으로써 합성적으로 제조될 수도 있다. 인간 항체 파지 라이브러리를 설명하는 특허 공보는 예를 들어, 미국 특허 제5,750,373호, 및 미국 특허 출원 공개 제2005/0079574호, 제2005/0119455호, 제2005/0266000호, 제2007/0117126호, 제2007/0160598호, 제2007/0237764호, 제2007/0292936호 및 제2009/0002360호를 포함한다.
항체에 대한 스크리닝은 표적 폴리펩티드와의 결합을 측정하는 어세이 및/또는 특정 상호작용을 차단하는 항체의 능력을 측정하는 어세이를 이용함으로써 수행될 수 있다. 결합 어세이의 예는 예를 들어, 플레이트에 고정된 표적 폴리펩티드의 융합 단백질을 사용하고 접합된 2차 항체를 사용하여 표적에 결합된 항체를 검출하는 ELISA이다. 차단 어세이의 예는 리간드 단백질과 표적 폴리펩티드의 결합의 차단을 측정하는 유세포분석 기반 어세이이다. 형광 표지가 부착된 2차 항체는 표적 폴리펩티드에 결합하는 이러한 리간드 단백질의 양을 검출하는 데 사용된다.
항체는 원하는 활성 또는 활성들을 가진 항체에 대해 조합 라이브러리를 스크리닝함으로써 단리될 수 있다. 예를 들어, 파지 디스플레이 라이브러리를 생성하고 원하는 결합 특성을 보유하는 항체에 대해 이러한 라이브러리를 스크리닝하는 다양한 방법들이 당분야에 알려져 있다.
인간 항체 라이브러리로부터 단리된 항체 또는 항체 단편은 인간 항체 또는 인간 항체 단편으로서 간주된다.
항체는 전체 길이 항체일 수 있다. 보다 구체적으로, 항체는 IgG 이소타입의 항체일 수 있다. 보다 구체적으로, 항체는 IgG1 또는 IgG4일 수 있다.
존재한다면, 항체의 불변 영역 도메인은 항체 분자의 제안된 기능, 특히 요구될 수 있는 이펙터 기능을 고려하여 선택될 수 있다. 예를 들어, 불변 영역 도메인은 인간 IgA, IgD, IgE, IgG 또는 IgM 도메인일 수 있다. 구체적으로, 항체 분자가 치료 용도를 위한 것이고 항체 이펙터 기능이 요구되는 경우 특히 IgG1 및 IgG3 이소타입의 인간 IgG 불변 영역 도메인이 사용될 수 있다. 대안적으로, 항체 분자가 치료 목적을 위한 것이고 항체 이펙터 기능이 요구되지 않는 경우 IgG2 및 IgG4 이소타입이 사용될 수 있다. 이들 불변 영역 도메인의 서열 변이체도 사용될 수 있음을 이해할 것이다. 항체가 다양한 번역 후 변형을 겪을 수 있다는 것도 당업자에게 알려져 있을 것이다. 이러한 변형의 유형과 정도는 종종 항체를 발현하는 데 사용되는 숙주 세포주 및 세포 배양 조건에 의해 좌우된다. 이러한 변형은 글리코실화, 메티오닌 산화, 디케토피페라진 형성, 아스파르테이트 이성질체화 및 아스파라긴 탈아미드화의 변경을 포함할 수 있다. 빈번한 변형은 카르복시펩티다제의 작용으로 인한 카르복시 말단 염기성 잔기(예컨대, 라이신 또는 아르기닌)의 상실이다(문헌[Harris, RJ. Journal of Chromatography 705:129-134]에 기재됨). 따라서, 항체 중쇄의 C-말단 라이신은 부재할 수 있다.
대안적으로, 항체는 항원 결합 단편이다.
특정 항원 결합 단편의 검토를 위해서는 문헌[Hudson et al. Nat. Med. 9: 129-134 (2003)]을 참조한다. scFv 단편의 검토를 위해서는, 예를 들어, 문헌[Pluckthun, in The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, vol. 113, Rosenburg and Moore eds., (Springer- Verlag, New York), pp. 269-315 (1994)]을 참조하고, 국제 특허 출원 공개 제WO 93/16185호, 및 미국 특허 제5,571,894호 및 제5,587,458호도 참조한다. 살비지(salvage) 수용체 결합 에피토프 잔기를 포함하고 증가된 생체내 반감기를 가진 Fab 및 F(ab')2 단편은 미국 특허 제5,869,046호에 개시되어 있다.
항원 결합 단편 및 이의 제조 방법은 당분야에 잘 알려져 있다(예를 들어, 문헌[Verma et al., 1998, Journal of Immunological Methods, 216, 165-181; Adair and Lawson, 2005. Therapeutic antibodies. Drug Design Reviews-Online 2(3):209-217] 참조). Fab-Fv 포맷은 국제 특허 출원 공개 제WO2009/040562호에 처음 개시되었고 이의 디설파이드 안정화된 버전인 Fab-dsFv는 국제 특허 출원 공개 제WO2010/035012호에 처음 개시되었으며, TrYbe 포맷은 국제 특허 출원 공개 제WO2015/197772호에 개시되었다.
항체 단편의 제조를 위해 다양한 기법이 개발되었다. 이러한 단편은 온전한 항체의 단백질용해성 분해를 통해 유도될 수 있다(예를 들어, 문헌[Morimoto et al., Journal of Biochemical and Biophysical Methods 24: 107-117 (1992)] 및 문헌[Brennan et al, Science 229:81 (1985)] 참조). 그러나, 항체 단편은 재조합 숙주 세포에 의해 직접 생성될 수도 있다. 예를 들어, 항체 단편은 앞서 논의된 항체 파지 라이브러리로부터 단리될 수 있다. 대안적으로, Fab'-SH 단편은 대장균으로부터 직접 회수될 수 있고 화학적으로 커플링되어 F(ab')2 단편을 형성할 수 있다(Carter et al., Bio/Technology 10: 163-167 (1992)).
F(ab')2 단편은 재조합 숙주 세포 배양물로부터 직접 단리될 수 있다. 항체는 단일 쇄 Fv 단편(scFv)일 수 있다. 이것은 국제 특허 출원 공개 제WO 93/16185호; 미국 특허 제5,571,894호; 및 미국 특허 제5,587,458호에 기재되어 있다. 항체 단편은 또한 예를 들어, 미국 특허 제5,641,870호에 기재된 바와 같이 "선형 항체"일 수 있다. 이러한 선형 항체 단편은 단일특이적일 수 있거나 이중특이적일 수 있다.
항체는 Fab, Fab', F(ab')2, Fv, dsFv, scFv 또는 dsscFv일 수 있다. 항체는 단일 도메인 항체 또는 나노바디, 예를 들어, VH 또는 VL 또는 VHH 또는 VNAR일 수 있다. 항체는 국제 특허 출원 공개 제WO2011/117648호, 제WO2005/003169호, 제WO2005/003170호 및 제WO2005/003171호에 기재된 Fab 또는 Fab' 단편일 수 있다.
항체는 디설파이드 안정화된 단일 쇄 가변 단편(dsscFv)일 수 있다.
가변 도메인 VH와 VL 사이의 디설파이드 결합은 아래 나열된 잔기들 중 2개의 잔기 사이, 및 분자에 위치된 가변 영역 쌍에서 이에 상응하는 위치 또는 위치들에 있을 수 있다:
VH44 + VL100(예를 들어, 문헌[Weatherill et al., Protein Engineering, Design & Selection, 25 (321-329), 2012] 참조);
VH105 + VL43(예를 들어, 문헌[Proc. Natl. Acad. Sci. USA Vol. 90 pp.7538-7542 Brinkmann et al(1993)]; 또는 문헌[Proteins 19, 35-47 Jung et al (1994)] 참조);
디설파이드 결합은 위치 VH44와 VL100 사이에 형성될 수 있다.
당업자는 본원에 기재된 항원 결합 단편이 단일클론, 키메라, 인간화, 완전 인간, 다중특이적, 이중특이적 등으로서 특징규명될 수도 있고 이 용어들의 논의도 이러한 단편과 관련된다는 것을 인식할 것이다.
다중특이적 항체
본 발명의 항체는 다중특이적 항체일 수 있다.
본 개시내용과 관련하여 마찬가지로 사용이 고려되는 다중특이적 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 예는 2가, 3가 또는 4가 항체, Bis-scFv, 디아바디, 트리아바디, 테트라바디, 비바디 및 트리바디를 포함한다(예를 들어, 문헌[Holliger and Hudson, 2005, Nature Biotech 23(9): 1126-1136; Schoonjans et al. 2001, Biomolecular Engineering, 17(6), 193-202] 참조).
다양한 다중특이적 항체 포맷이 생성되었다. 다양한 분류가 제안되었으나, 다중특이적 IgG 항체 포맷은 예를 들어, 문헌[Spiess et al., Alternative molecular formats and therapeutic applications for bispecific antibodies. Mol Immunol. 67(2015):95-106]에 기재된 바와 같이, 일반적으로 이중특이적 IgG, 부착된 IgG, 다중특이적(예를 들어, 이중특이적) 항체 단편, 다중특이적(예를 들어, 이중특이적) 융합 단백질 및 다중특이적(예를 들어, 이중특이적) 항체 접합체를 포함한다.
항체는 이중특이적 항체일 수 있다. 한 실시양태에서, 항체는 2개의 항원 결합 도메인을 포함하며, 이때 하나의 결합 도메인은 TREM1에 결합하고 다른 결합 도메인은 또 다른 항원에 결합한다. 즉, 각각의 결합 도메인은 각각의 항원에 대해 1가이다. 한 실시양태에서, 항체는 4가 이중특이적 항체이다. 즉, 항체는 4개의 항원 결합 도메인을 포함하고, 이때 예를 들어, 2개의 결합 도메인은 TREM1에 결합하고 나머지 2개의 결합 도메인은 또 다른 항원에 결합한다. 한 실시양태에서, 항체는 3가 이중특이적 항체이다.
이중특이적 항체를 제조하는 기법은 크로스맙(CrossMab) 기술(Klein et al. Engineering therapeutic bispecific antibodies using CrossMab technology, Methods 154 (2019) 21-31), 놉스-인-홀스(Knobs-in-holes) 조작(예를 들어, 국제 특허 출원 공개 제WO1996027011호 및 제WO1998050431호), 듀오바디(DuoBody) 기술(예를 들어, 국제 특허 출원 공개 제WO2011131746호), 아지메트릭(Azymetric) 기술(예를 들어, 국제 특허 출원 공개 제WO2012058768호)을 포함하나 이들로 제한되지 않는다. 이중특이적 항체를 제조하는 추가 기술은 예를 들어, 문헌[Godar et al., 2018, Therapeutic bispecific antibody formats: a patent applications review (1994-2017), Expert Opinion on Therapeutic Patents, 28:3, 251-276]에 기재되어 있다. 이중특이적 항체는 특히 크로스맙 항체, DAF(2-in-1), DAF(4-in-1), 듀타맙(DutaMab), DT-IgG, 놉스-인-홀스 공통 LC, 놉스-인-홀스 어셈블리, 전하 쌍, Fab-아암 교환, SEEDbody, 트리오맙(Triomab), LUZ-Y, Fcab, κλ-바디 및 오르토고날(orthogonal) Fab를 포함한다.
항체 구축물은 삼중특이적 항체일 수 있다.
항체는 다중파라토픽 항체일 수 있다.
한 실시양태에서, 각각의 결합 도메인은 1가이다. 바람직하게는, 각각의 결합 도메인은 1개 이하의 VH 및 1개의 VL을 포함한다.
부착된 IgG는 고전적으로 추가 항원 결합 도메인 또는 항원 결합 단편을 IgG의 중쇄 및/또는 경쇄의 N-말단 및/또는 C-말단에 부착시킴으로써 조작된 전체 길이 IgG를 포함한다. 이러한 추가 항원 결합 단편의 예는 sdAb 항체(예를 들어, VH 또는 VL), Fv, scFv, dsscFv, Fab, scFab를 포함한다. 부착된 IgG 항체 포맷은 예를 들어, 문헌[Spiess et al., Alternative molecular formats and therapeutic applications for bispecific antibodies. Mol Immunol. 67(2015):95-106]에 기재된 바와 같이, 특히 DVD-IgG, IgG(H)-scFv, scFv-(H)IgG, IgG(L)-scFv, scFv-(L)IgG, IgG(L,H)-Fv, IgG(H)-V, V(H)-IgG, IgC(L)-V, V(L)-IgG, KIH IgG-scFab, 2scFv-IgG, lgG-2scFv, scFv4-Ig, 자이바디(Zybody) 및 DVI-IgG(4-in-1)를 포함한다.
다중특이적 항체 단편은 예를 들어, 문헌[Spiess et al., Alternative molecular formats and therapeutic applications for bispecific antibodies. Mol Immunol. 67(2015):95-106]에 기재된 바와 같이, 나노바디, 나노바디-HSA, BiTE, 디아바디, DART, TandAb, sc디아바디, sc-디아바디-CH3, 디아바디-CH3, 트리플 바디(Triple Body), 미니항체; 미니바디(Minibody), Tri Bi 미니바디, scFv-CH3 KIH, Fab-scFv, scFv-CH-CL-scFv, F(ab')2, F(ab')2-scFv2, scFv-KIH, Fab-scFv-Fc, 4가 HCAb, sc디아바디-Fc, 디아바디-Fc, 탠덤 scFv-Fc; 및 인트라바디(intrabody)를 포함한다.
다중특이적 융합 단백질은 독 앤 락(Dock and Lock), ImmTAC, HSAbody, sc디아바디-HSA 및 탠덤 scFv-독소를 포함한다.
다중특이적 항체 접합체는 IgG-IgG; Cov-X-바디; 및 scFv1-PEG-scFv2를 포함한다.
추가 다중특이적 항체 포맷, 예를 들어, 탠덤 scFv, 트리플바디, Fab-VHH, taFv-Fc, scFv4-Ig, scFv2-Fcab, scFv4-IgG는 예를 들어, 문헌[Brinkmann et al, The making of bispecific antibodies, mAbs, 9:2, 182-212 (2017)], 특히 도 2에 기재되어 있다. 비바디, 트리바디 및 이의 제조 방법은 예를 들어, 국제 특허 출원 공개 제WO99/37791호에 개시되어 있다.
본 발명에 사용하기 위한 또 다른 항체는 2개의 scFv 또는 dsscFv에 연결된 Fab일 수 있으며, 이때 각각의 scFv 또는 dsscFv는 동일하거나 상이한 표적에 결합한다(예를 들어, 치료 표적에 결합하는 하나의 scFv 또는 dsscFv, 및 예를 들어, 알부민에 결합하여 반감기를 증가시키는 하나의 scFv 또는 dsscFv). 이러한 항체 단편은 국제 특허 출원 공개 제WO2015/197772호에 기재되어 있다. 본 발명의 단편에 사용하기 위한 또 다른 바람직한 항체는 예를 들어, 국제 특허 출원 공개 제WO2013/068571호 및 문헌[Dave et al., Mabs, 8(7) 1319-1335 (2016)]에 기재된 바와 같이 단 하나의 scFv 또는 dsscFv에만 연결된 Fab를 포함한다.
본 발명에 사용하기 위한 또 다른 항체는 놉스-인투-홀스 항체("KiH")이다. 이것은 이종이량체화를 위한(예를 들어, 이중특이적 항체, 다중특이적 항체 또는 1-아암 항체의 효율적인 생성을 위한) 중쇄 동종이량체로 구성된 다중특이적 항체 포맷이다. 일반적으로, 이러한 기술은 이종이량체 형성을 촉진하고 동종이량체 형성을 방해하기 위해 돌출부(protuberance)가 캐비티(cavity)에 위치할 수 있도록 돌출부("놉)를 제1 폴리펩티드(예컨대, 제1 항체 중쇄의 제1 CH3 도메인)의 계면에 도입하고 상응하는 캐비티("홀")를 제2 폴리펩티드(예컨대, 제2 항체 중쇄의 제2 CH3 도메인)의 계면에 도입하는 단계를 포함한다. 돌출부는 제1 폴리펩티드(예컨대, 제1 항체 중쇄의 제1 CH3 도메인)의 계면으로부터 작은 아미노산 측쇄를 더 큰 측쇄(예를 들어, 아르기닌, 페닐알라닌, 티로신 또는 트립토판)로 교체함으로써 구축된다. 큰 아미노산 측쇄를 더 작은 아미노산 측쇄(예를 들어, 알라닌, 세린, 발린 또는 트레오닌)로 교체함으로써, 돌출부와 동일하거나 유사한 크기의 보상 캐비티가 제2 폴리펩티드(예컨대, 제2 항체 중쇄의 제2 CH3 도메인)의 계면에서 생성된다. 돌출부 및 캐비티는 예를 들어, 부위 특이적 돌연변이유발 또는 펩티드 합성으로 폴리펩티드를 코딩하는 핵산을 변경함으로써 만들어질 수 있다. "놉스-인투-홀스" 기술에 관한 추가 세부사항은 예를 들어, 미국 특허 제5,731,168호; 미국 특허 제7,695,936호; 국제 특허 출원 공개 제WO 2009/089004호; 미국 특허 출원 공개 제2009/0182127호; 문헌[Marvin md Z u, Acta Pharmacologica Sincia (2005) 26(6):649-658]; 문헌[Kontermann Acta Pharmacologica Sincia (2005) 26: 1-9]; 문헌[Ridgway et al, Prot Eng 9, 617-621 (1996)]; 및 문헌[Carter, J Immunol Meth 248, 7-15 (2001)]에 기재되어 있다.
인간화, 인간 및 키메라 항체, 및 이의 제조 방법
본 발명의 항체는 인간화, 완전 인간 또는 키메라 항체일 수 있으나 이들로 제한되지 않는다.
한 실시양태에서, 항체는 인간화된다. 보다 구체적으로, 항체는 키메라, 인간 또는 인간화 항체이다.
특정 실시양태에서, 본원에 제공된 항체는 키메라 항체이다. 키메라 항체의 예는 예를 들어, 미국 특허 제4,816,567호; 및 문헌[Morrison et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81: 6851-6855 (1984)]에 기재되어 있다. 한 예에서, 키메라 항체는 비인간 가변 영역(예를 들어, 마우스, 래트, 햄스터, 토끼 또는 비인간 영장류, 예컨대, 원숭이로부터 유래한 가변 영역) 및 인간 불변 영역을 포함한다. 추가 예에서, 키메라 항체는 클래스 또는 서브클래스가 모 항체의 클래스 또는 서브클래스로부터 변경되어 있는 "클래스 전환된" 항체이다. 키메라 항체는 이의 항원 결합 단편을 포함한다.
한 실시양태에서, 항체는 인간화 항체이다.
인간화 항체는 임의로 CDR이 유래한 비인간 종으로부터 유래한 하나 이상의 프레임워크 잔기를 추가로 포함할 수 있다. 전체 CDR보다는 CDR의 특이성 결정 잔기를 전달하는 것만이 필요할 수 있음을 이해할 것이다(예를 들어, 문헌[Kashmiri et al., 2005, Methods, 36, 25-34] 참조).
적합하게는, 본 발명에 따른 인간화 항체는 인간 수용자 프레임워크 영역뿐만 아니라 하나 이상의 CDR도 포함하고 임의로 하나 이상의 공여자 프레임워크 잔기를 추가로 포함하는 가변 도메인을 가진다.
따라서, 한 실시양태에서, 가변 도메인이 인간 수용자 프레임워크 영역 및 비인간 공여자 CDR을 포함하는 인간화 항체가 제공된다.
CDR 또는 특이성 결정 잔기가 이식될 때, CDR이 유래한 공여자 항체의 클래스/유형을 고려하여 마우스, 영장류 및 인간 프레임워크 영역을 포함하는 임의의 적절한 수용자 가변 영역 프레임워크 서열을 사용할 수 있다.
본 발명에 사용될 수 있는 인간 프레임워크의 예는 KOL, NEWM, REI, EU, TUR, TEI, LAY 및 POM이다(Kabat et al). 예를 들어, KOL 및 NEWM은 중쇄를 위해 사용될 수 있고, REI는 경쇄를 위해 사용될 수 있으며, EU, LAY 및 POM은 중쇄 및 경쇄 둘 다를 위해 사용될 수 있다. 대안적으로, 인간 생식세포계열 서열이 사용될 수 있으며; 이들은 www.imgt.org에서 입수될 수 있다. 실시양태에서, 수용자 프레임워크는 IGKV1-9 인간 생식세포계열 및/또는 IGHV3-66 인간 생식세포계열이다. 실시양태에서, 인간 프레임워크는 1개 내지 5개, 1개 내지 4개, 1개 내지 3개, 1개 또는 2개의 공여자 항체 아미노산 잔기를 함유한다.
본 발명의 인간화 항체에서, 수용자 중쇄 및 경쇄는 반드시 동일한 항체로부터 유래할 필요는 없으며, 원하는 경우, 상이한 쇄로부터 유래한 프레임워크 영역을 가진 복합 쇄를 포함할 수 있다.
특정 실시양태에서, 본원에 제공된 항체는 인간 항체이다. 인간 항체는 당분야에 알려진 다양한 기법을 이용함으로써 생성될 수 있다.
인간 항체는 항체의 가변 영역 또는 전체 길이 쇄가 인간 생식세포계열 면역글로불린 유전자를 사용하는 시스템으로부터 수득되는 경우 특정 생식세포계열 서열의 "생성물"이거나 이러한 서열로부터 "유래한" 중쇄 또는 경쇄 가변 영역 또는 전체 길이 중쇄 또는 경쇄를 포함한다. 이러한 시스템은 인간 면역글로불린 유전자를 보유하는 형질전환 마우스를 관심 있는 항원으로 예방접종하거나 파지 상에 표시된 인간 면역글로불린 유전자 라이브러리를 관심 있는 항원으로 스크리닝하는 것을 포함한다. 인간 생식세포계열 면역글로불린 서열의 "생성물"이거나 이러한 서열로부터 "유래한" 인간 항체 또는 이의 단편은 인간 항체의 아미노산 서열을 인간 생식세포계열 면역글로불린의 아미노산 서열과 비교하고 서열이 인간 항체의 서열과 가장 가까운(즉, 최대 % 동일성) 인간 생식세포계열 면역글로불린 서열을 선택함으로써 그 자체로서 확인될 수 있다. 특정 인간 생식세포계열 면역글로불린 서열의 "생성물"이거나 이러한 서열로부터 "유래한" 인간 항체는 예를 들어, 천연 발생 체세포 돌연변이 또는 부위 지정 돌연변이의 의도적인 도입으로 인해 생식세포계열 서열에 비해 아미노산 차이를 함유할 수 있다. 그러나, 선택된 인간 항체는 전형적으로 아미노산 서열이 인간 생식세포계열 면역글로불린 유전자에 의해 코딩된 아미노산 서열과 적어도 90% 동일하고 다른 종의 생식세포계열 면역글로불린 아미노산 서열(예를 들어, 뮤린 생식세포계열 서열)과 비교될 때 인간 항체를 인간 항체로서 확인시켜 주는 아미노산 잔기를 함유한다. 일부 경우, 인간 항체는 아미노산 서열이 생식세포계열 면역글로불린 유전자에 의해 코딩된 아미노산 서열과 적어도 60%, 70%, 80%, 90%, 또는 적어도 95%, 또는 심지어 적어도 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일할 수 있다. 전형적으로, 특정 인간 생식세포계열 서열로부터 유래한 인간 항체는 인간 생식세포계열 면역글로불린 유전자에 의해 코딩된 아미노산 서열과 10개 이하의 아미노산 차이를 나타낼 것이다. 일부 경우, 인간 항체는 생식세포계열 면역글로불린 유전자에 의해 코딩된 아미노산 서열과 5개 이하, 또는 심지어 4개, 3개, 2개 또는 1개 이하의 아미노산 차이를 나타낼 수 있다.
항체의 구조적 특징
본 발명의 항체는 결합 도메인을 포함한다. 결합 도메인은 일반적으로 6개의 CDR, 즉 중쇄로부터의 3개의 CDR 및 경쇄로부터의 3개의 CDR을 포함할 것이다. 한 실시양태에서, CDR은 프레임워크 내에 있고 함께 가변 영역을 형성한다. 따라서, 항체는 항원에 특이적인 결합 도메인을 가지며, 이때 상기 결합 도메인은 경쇄 가변 영역 및 중쇄 가변 영역을 포함한다.
한 실시양태에서, 항체는 중쇄 및 경쇄를 포함하고, 이때 중쇄는 CH1 도메인을 포함하고 경쇄는 카파 또는 람다 CL 도메인을 포함한다.
본 발명의 실시예에 의해 입증된 바와 같이, 중쇄 및 경쇄의 가변 영역의 다양한 변이체들을 생성하여 이들의 결합 친화성에 대해 시험하였다. 이러한 변이체들은 동일한 CDR 서열 세트를 포함하며 유사한 범위의 결합 친화성을 나타낸다. 선택된 항체 변이체의 다양한 구조적 요소의 개요는 표 3에 제시되어 있다.
한 실시양태에서, 본 발명은
서열번호 11을 포함하는 CDR-L1,
서열번호 12를 포함하는 CDR-L2, 및
서열번호 13을 포함하는 CDR-L3
중 적어도 하나를 포함하는 경쇄 가변 도메인을 포함하는, 인간 TREM1에 결합하는 항체를 제공한다.
한 실시양태에서, 본 발명은
서열번호 11을 포함하는 CDR-L1,
서열번호 12를 포함하는 CDR-L2, 및
서열번호 13을 포함하는 CDR-L3
을 포함하는 경쇄 가변 도메인을 포함하는, 인간 TREM1에 결합하는 항체를 제공한다.
한 실시양태에서, 본 발명은
서열번호 14를 포함하는 CDR-H1,
서열번호 15를 포함하는 CDR-H2, 및
서열번호 16을 포함하는 CDR-H3
중 적어도 하나를 포함하는 중쇄 가변 도메인을 포함하는, 인간 TREM1에 결합하는 항체를 제공한다.
한 실시양태에서, 본 발명은
서열번호 14를 포함하는 CDR-H1,
서열번호 15를 포함하는 CDR-H2, 및
서열번호 16을 포함하는 CDR-H3
을 포함하는 중쇄 가변 도메인을 포함하는, 인간 TREM1에 결합하는 항체를 제공한다.
본 발명의 항체 분자는 각각 상보적인 경쇄 또는 상보적인 중쇄를 포함할 수 있다.
따라서, 한 실시양태에서, 본 발명은
서열번호 11을 포함하는 CDR-L1,
서열번호 12를 포함하는 CDR-L2, 및
서열번호 13을 포함하는 CDR-L3
을 포함하는 경쇄 가변 영역; 및
서열번호 14를 포함하는 CDR-H1,
서열번호 15를 포함하는 CDR-H2, 및
서열번호 16을 포함하는 CDR-H3
을 포함하는 중쇄 가변 영역
을 포함하는, 인간 TREM1에 결합하는 항체를 제공한다.
한 실시양태에서, 본 발명의 항체는 서열번호 29 또는 서열번호 33으로 제공된 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역을 포함한다.
한 실시양태에서, 본 발명의 항체는 서열번호 57 또는 서열번호 79로 제공된 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역을 포함한다.
한 실시양태에서, 본 발명의 항체는 서열번호 33으로 제공된 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역 및 서열번호 57로 제공된 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역을 포함한다.
대안적 실시양태에서, 본 발명의 항체는 서열번호 29로 제공된 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역 및 서열번호 79로 제공된 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역을 포함한다.
한 실시양태에서, 본 발명의 항체는
서열번호 11을 포함하는 CDR-L1,
서열번호 12를 포함하는 CDR-L2, 및
서열번호 13을 포함하는 CDR-L3
을 포함하는 경쇄 가변 영역; 및
서열번호 14를 포함하는 CDR-H1,
서열번호 15를 포함하는 CDR-H2, 및
서열번호 16을 포함하는 CDR-H3
을 포함하는 중쇄 가변 영역
을 포함하는 전체 길이 항체이다.
한 실시양태에서, 본 발명의 항체는
서열번호 11을 포함하는 CDR-L1,
서열번호 12를 포함하는 CDR-L2, 및
서열번호 13을 포함하는 CDR-L3
을 포함하는 경쇄 가변 영역; 및
서열번호 14를 포함하는 CDR-H1,
서열번호 15를 포함하는 CDR-H2, 및
서열번호 16을 포함하는 CDR-H3
을 포함하는 중쇄 가변 영역
을 포함하는 IgG1 LALA이다.
또 다른 실시양태에서, 본 발명의 항체는 서열번호 35로 제공된 서열을 포함하는 경쇄 및 서열번호 65로 제공된 서열을 포함하는 중쇄를 포함하는 IgG1 LALA이다.
또 다른 실시양태에서, 본 발명의 항체는 서열번호 31로 제공된 서열을 포함하는 경쇄 및 서열번호 87로 제공된 서열을 포함하는 중쇄를 포함하는 IgG1 LALA이다.
또 다른 실시양태에서, IgG4P가 바람직하다. 본원에 기재된 12172 항체의 여러 변이체는 이들의 물리적-화학적 성질을 확인하기 위해 여러 어세이에서 시험되었으며, 이들은 모두 다른 변이체보다 덜 바람직한 성질을 가진 IgG4P 변이체와 매우 유사한 개발 가능성 프로파일을 나타내었다. 그러나, IgG4P 변이체는 다른 변이체에서는 관찰되지 않는 놀라운 생물학적 성질을 나타내었으므로, 이러한 성질이 유익한 응용분야, 예를 들어, 이러한 성질이 치료 효과를 제공하는 질병의 치료에 바람직한 변이체이다.
IgG4P는 힌지 안정성을 개선하기 위해 힌지 영역 내에 Ser-228-Pro 돌연변이를 함유하고, 이때 넘버링은 EU 넘버링에 따른다(카바트 넘버링에 따른 Ser-241-Pro)(Angal S et al, (1993), Mol Immunol, 30(1), 105-108).
따라서, 한 실시양태에서, 본 발명의 항체는
서열번호 11을 포함하는 CDR-L1,
서열번호 12를 포함하는 CDR-L2, 및
서열번호 13을 포함하는 CDR-L3
을 포함하는 경쇄 가변 영역; 및
서열번호 14를 포함하는 CDR-H1,
서열번호 15를 포함하는 CDR-H2, 및
서열번호 16을 포함하는 CDR-H3
을 포함하는 중쇄 가변 영역
을 포함하는 IgG4P이다.
또 다른 실시양태에서, 본 발명의 항체는 서열번호 35로 제공된 서열을 포함하는 경쇄 및 서열번호 59로 제공된 서열을 포함하는 중쇄를 포함하는 IgG4P이다.
보다 구체적인 실시양태에서, 본 발명의 항체는 서열번호 31로 제공된 서열을 포함하는 경쇄 및 서열번호 81로 제공된 서열을 포함하는 중쇄를 포함하는 IgG4P이다.
항-TREM1 항체의 기능적 성질
한 실시양태에서, 본 발명의 항체는 중화 항체이다. 바람직하게는, 본 발명에 따른 항체는 하나 이상의 TREM1 활성을 중화시킨다.
본 발명의 항체는 인간 TREM1, 보다 구체적으로 인간 TREM1의 세포외 도메인 내의 특정 영역에 특이적으로 결합한다. 일부 실시양태에서, 상기 항체는 TREM1 리간드(예를 들어, PGLYRP1)가 결합하는 TREM1 부위와 상이하거나 최소한으로 중첩되는 TREM1 부위에 특이적으로 결합한다. 일부 실시양태에서, 상기 항체는 길항제 항체이다. 즉, 이 항체는 세포에 대한 TREM1의 활성을 억제하거나 저해한다. 이러한 세포는 단핵구, 대식세포 및/또는 호중구일 것이다. 일부 실시양태에서, 상기 항체는 단일 리간드에 대해 오르토스테릭 방식보다는 알로스테릭 방식으로 TREM1에 특이적으로 결합할 수 있으므로, PGLYRP1가 결합하는 TREM1 부위와 상이한 TREM1 부위에 결합하는 다른 리간드의 결합의 더 효과적인 억제를 제공할 수 있다.
실시예에 의해 입증된 바와 같이, PGLYRP1은 TREM1의 에피토프에 결합하며, 이때 상기 에피토프는 4Å 미만의 접촉 거리에서 확인될 때 인간 TREM1(서열번호 1)의 E27, D42 내지 E46, A49, Y90 내지 L95 및 F126으로 구성된 목록으로부터 선택된 잔기를 포함한다.
한 특정 실시양태에서, 본 발명은 결합이 여전히 TREM1과 PGLYRP1 사이의 상호작용을 방해하도록 PGLYRP1의 결합 부위와 상이한 TREM1의 영역에 결합하는 항체를 제공한다.
일부 실시양태에서, 항-TREM1 항체는 사이노몰구스 TREM1과의 매우 약한 결합을 보인다. 일부 실시양태에서, 항-TREM1 항체는 마우스, 래트, 돼지 또는 개 TREM1과의 검출 가능한 결합을 보이지 않는다.
일부 실시양태에서, 항-TREM1 항체는 활성화된 인간 단핵구로부터의 많은 사이토카인 및 케모카인, 예컨대, CCL-3, CCL-20, CXCL-9, GM-CSF, IFN-γ, IL-1α, IL-1β, IL-6, IL-10, IL-12p40, IL-15, IL-18, IL-27, TNF-α 및 TNF-β의 방출을 감소시킨다.
일부 실시양태에서, 항-TREM1 항체는 IgG4P이고, 1차 인간 단핵구로부터의 IL-1 경로의 소염성 음성 조절제인 IL-1R 길항제(IL-1RA)의 방출을 유의미하게 증가시킨다.
본 발명에 따른 항체는 인간 TREM1에 특이적이다.
일부 실시양태에서, 상기 항체는 충분한 친화성 및 특이성으로 인간 TREM1에 결합한다. 특정 실시양태에서, 상기 항체는 약 1 μM, 100 nM, 50 nM, 40 nM, 30 nM, 20 nM, 10 nM, 5 nM, 1 nM, 0.5 nM(이 값들 사이의 임의의 범위를 포함함) 중 어느 한 값의 KD로 인간 TREM1에 결합한다. 한 실시양태에서, 본 발명에 따른 항체는 600 pM 미만의 KD로 인간 TREM1에 결합한다. 보다 구체적인 실시양태에서, 본 발명에 따른 항체는 300 내지 1200 pM, 보다 바람직하게는 300 내지 600 pM의 KD로 인간 TREM1에 결합한다.
당업자는 통상적인 기법, 예를 들어, 문헌[Scatchard et al. (Ann. KY. Acad. Sci. 51:660-672 (1949))]에 기재된 기법, 또는 비아코어와 같은 시스템을 사용하는 표면 플라즈몬 공명(SPR)을 이용하여 항체의 친화성뿐만 아니라, 항체가 결합을 억제하는 정도도 측정할 수 있다. 표면 플라즈몬 공명을 위해, 표적 분자를 고체상에 고정시키고 유동 셀을 따라 이동하는 이동상에서 리간드에 노출시킨다. 리간드와 고정된 표적의 결합이 일어나면, 국소 굴절률이 변하여, SPR 각도의 변화를 유발하고, 이 변화는 반사된 광의 강도 변화를 검출함으로써 실시간으로 모니터링될 수 있다. SPR 신호의 변화율을 분석하여 결합 반응의 결합 및 해리 단계에 대한 겉보기 속도 상수를 얻을 수 있다. 이 값들의 비는 겉보기 평형 상수(친화성)를 제공한다(예를 들어, 문헌[Wolff et al., Cancer Res. 53:2560-65 (1993)] 참조).
바람직하게는, 본 발명에 따른 항체는 인간 TREM1에 특이적이다.
특히 결합 친화성과 특이성 및 활성과 관련하여 항체에 관한 본원의 개시내용은 항원 결합 단편 및 항체 유사 분자에도 적용될 수 있다.
동일한 에피토프에 결합하는 항체
항체는 경쇄, 중쇄, 경쇄 가변 영역(LCVR), 중쇄 가변 영역(HCVR) 또는 CDR 서열의 관점에서 TREM1에 결합하기 위해 상기 정의된 항체와 경쟁할 수 있거나 상기 정의된 항체와 동일한 에피토프에 결합할 수 있다.
구체적으로, 본 발명은 TREM1에 결합하기 위해 서열번호 11/12/13/14/15/16의 CDR-L1/CDR-L2/CDR-L3/CDR-H1/CDR-H2/CDR-H3 서열 조합을 포함하는 항체와 경쟁하거나 이러한 항체와 동일한 에피토프에 결합하는 항체를 제공한다. 항체는 TREM1에 결합하기 위해 서열번호 29/79의 LCVR 및 HCVR 서열 쌍을 포함하는 항체와 경쟁할 수 있거나 이러한 항체와 동일한 에피토프에 결합할 수 있다. 항체는 TREM1에 결합하기 위해 서열번호 11/12/13/14/15/16의 CDR-L1/CDR-L2/CDR-L3/CDR-H1/CDR-H2/CDR-H3 서열 조합을 포함하는 IgG4P와 경쟁할 수 있거나 이러한 IgG4P와 동일한 에피토프에 결합할 수 있다.
일부 실시양태에서, 항-TREM1 항체는 인간 TREM1의 에피토프에 결합하고, 이때 상기 에피토프는 잔기 E26, E27, K28, Y29, E30, L31, K32 및 Q35를 포함한다(이때 넘버링은 서열번호 1에 따른다). 이러한 에피토프는 돌연변이체 TREM1 단백질의 어레이를 설계하는 단계, 및 상기 잔기들 중 2개 또는 3개의 잔기가 Ala와 같은 더 작은 아미노산으로 돌연변이되어 있는 상기 잔기를 포함하는 돌연변이체 TREM1 단백질과 상기 항체의 결합을 측정하는 단계를 포함하는, 본원에 개시된 방법을 이용함으로써 확인될 수 있다.
한 실시양태에서, 본 발명은 인간 TREM1의 에피토프에 결합하는 IgG4P 항체를 제공하는 것으로, 이때 상기 에피토프는 인간 TREM1(서열번호 1)의 잔기 E26, E27, K28, Y29, E30, L31, K32 및 Q35를 포함한다.
한 실시양태에서, 본 발명은 TREM1의 에피토프에 결합하는 항-TREM1 항체를 제공하는 것으로, 이때 상기 에피토프는 4Å 미만의 접촉 거리에서 확인될 때 인간 TREM1(서열번호 1)의 E26, E27, K28, Y29, E30, L31, K32, Q35, T36, D38, K40, D42, R97, D127, T134 및 G136으로 구성된 목록으로부터 선택된 적어도 3개, 적어도 4개, 적어도 5개, 적어도 6개, 적어도 7개, 적어도 8개, 적어도 9개, 적어도 10개 또는 모든 잔기를 포함한다.
한 실시양태에서, 본 발명은 인간 TREM1의 에피토프에 결합하는 IgG4P 항체를 제공하는 것으로, 이때 상기 에피토프는 4Å 미만의 접촉 거리에서 확인될 때 인간 TREM1(서열번호 1)의 E26, E27, K28, Y29, E30, L31, K32, Q35, T36, D38, K40, D42, R97, D127, T134 및 G136으로 구성된 목록으로부터 선택된 적어도 3개, 적어도 4개, 적어도 5개, 적어도 6개, 적어도 7개, 적어도 8개, 적어도 9개, 적어도 10개 또는 모든 잔기를 포함한다.
일부 실시양태에서, 본 발명은 PGLYRP1이 결합하는 에피토프와 상이한 에피토프에 결합하는 항-TREM1 항체를 제공한다. 일부 실시양태에서, 본 발명은 TREM1의 에피토프에 결합하는 항-TREM1 항체를 제공하는 것으로, 이때 상기 에피토프는 4Å 미만의 접촉 거리에서 확인될 때 인간 TREM1(서열번호 1)의 E27, D42 내지 E46, A49, Y90 내지 L95, 및 F126으로 구성된 목록으로부터 선택된 1개 또는 2개 이하의 잔기를 포함한다.
에피토프는 본 발명에 의해 제공된 항체들 중 어느 한 항체와 병용되는, 당분야에 알려진 임의의 적합한 결합 부위 맵핑 방법에 의해 확인될 수 있다. 돌연변이체 잔기들 중 어떤 잔기가 특정 항체에 대한 결합에 중요한지를 확립하기 위해 돌연변이체 TREM1 단백질의 어레이에 의존하는 특정 방법이 본 개시내용에 의해 제공된다. 이러한 방법을 이용하여 본 발명에 의해 제공된 항체와 본질적으로 동일한 아미노산 잔기에 결합하는 항체를 확인할 수 있다. 에피토프 맵핑 방법의 다른 예는 전체 길이 표적 단백질로부터 유래한 다양한 길이의 펩티드를 본 발명의 항체 또는 이의 단편과의 결합에 대해 스크리닝하고, 상기 항체에 의해 인식되는 에피토프의 서열을 함유하는 항체에 특이적으로 결합할 수 있는 단편을 확인하는 것을 포함한다. 표적 펩티드는 합성에 의해 생성될 수 있다. 항체에 결합하는 펩티드는 예를 들어, 질량 분광측정 분석에 의해 확인될 수 있다. 또 다른 예에서, NMR 분광법 또는 X-선 결정학을 이용하여 본 발명의 항체에 의해 결합된 에피토프를 확인할 수 있다. 전형적으로, X-선 결정학으로 에피토프 확인을 수행할 때, CDR로부터 4Å 이내에 있는 항원의 아미노산 잔기는 에피토프의 아미노산 잔기 부분인 것으로 간주된다. 일단 확인되면, 에피토프는 본 발명의 항체에 결합하는 단편을 제조하는 데 사용될 수 있고, 필요한 경우, 동일한 에피토프에 결합하는 추가 항체를 수득하기 위한 면역원으로서 사용될 수 있다.
한 실시양태에서, 항체의 에피토프는 X-선 결정학에 의해 확인된다.
당분야에 알려진 관용적인 방법을 이용함으로써, 항체가 기준 항체와 동일한 에피토프에 결합하거나 결합을 위해 기준 항체와 경쟁하는지를 용이하게 확인할 수 있다. 예를 들어, 시험 항체가 본 발명의 기준 항체와 동일한 에피토프에 결합하는지를 확인하기 위해, 기준 항체가 포화 조건 하에서 단백질 또는 펩티드에 결합할 수 있게 한다. 다음으로, 단백질 또는 펩티드에 결합하는 시험 항체의 능력을 평가한다. 기준 항체와의 포화 결합 후에 시험 항체가 단백질 또는 펩티드에 결합할 수 있는 경우, 시험 항체는 기준 항체와 상이한 에피토프에 결합한다는 결론을 내릴 수 있다. 다른 한편으로, 기준 항체와의 포화 결합 후에 시험 항체가 단백질 또는 펩티드에 결합할 수 없는 경우, 시험 항체는 본 발명의 기준 항체에 의해 결합된 에피토프와 동일한 에피토프에 결합할 수 있거나, 기준 항체는 항원의 입체구조적 변화를 야기함으로써, 시험 항체의 결합을 방해한다.
항체가 결합을 위해 기준 항체와 경쟁하는지를 확인하기 위해, 앞서 설명된 결합 방법을 두 가지 상이한 실험 설정에서 수행한다. 제1 설정에서, 기준 항체가 포화 조건 하에서 항원에 결합할 수 있게 한 후, 시험 항체와 항원의 결합을 평가한다. 제2 설정에서, 시험 항체가 포화 조건 하에서 항원에 결합할 수 있게 한 후, 기준 항체와 단백질/펩티드의 결합을 평가한다. 두 가지 실험 설정에서, 제1 (포화) 항체만이 단백질/펩티드에 결합할 수 있는 경우, 시험 항체와 기준 항체가 항원에 결합하기 위해 경쟁한다는 결론을 내린다. 당업자에 의해 인식될 바와 같이, 결합을 위해 기준 항체와 경쟁하는 항체는 반드시 기준 항체와 동일한 에피토프에 결합할 필요는 없지만, 중첩되거나 인접한 에피토프에 결합함으로써 기준 항체의 결합을 입체적으로 차단할 수 있거나 결합의 결여로 이어지는 입체구조적 변화를 야기할 수 있다.
각각의 항체가 다른 항체와 항원의 결합을 경쟁적으로 억제(차단)하는 경우, 두 항체는 동일하거나 중첩되는 에피토프에 결합한다. 대안적으로, 한 항체의 결합을 감소시키거나 제거하는, 항원의 본질적으로 모든 아미노산 돌연변이가 다른 항체의 결합을 감소시키거나 제거하는 경우, 두 항체는 동일한 에피토프를 가진다. 한 항체의 결합을 감소시키거나 제거하는 일부 아미노산 돌연변이가 다른 항체의 결합을 감소시키거나 제거하는 경우, 두 항체는 중첩되는 에피토프를 가진다.
그 다음, 추가 관용적인 실험(예를 들어, 펩티드 돌연변이 및 결합 분석)을 수행하여 시험 항체의 관찰된 결합 결여가 실제로 기준 항체와 동일한 항원 부분과의 결합에 기인하는지, 아니면 입체적 차단(또는 또 다른 현상)이 관찰된 결합 결여의 원인인지를 확인할 수 있다. 이러한 종류의 실험은 ELISA, RIA, 표면 플라즈몬 공명, 유세포분석, 또는 당분야에서 이용 가능한 임의의 다른 정량적 또는 정성적 항체 결합 어세이를 이용함으로써 수행될 수 있다.
항체 변이체
특정 실시양태에서, 하나 이상의 아미노산 치환, 삽입 및/또는 결실을 가진 항체 변이체가 제공된다. 치환 돌연변이유발을 위한 관심 있는 부위는 CDR 및 FR을 포함한다. 아미노산 치환을 관심 있는 항체에 도입할 수 있으며 생성물을 원하는 활성, 예를 들어, 유지/개선된 항원 결합, 감소된 면역원성, 또는 개선된 ADCC 또는 CDC에 대해 스크리닝할 수 있다.
특정 실시양태에서, 본원에 기재된 항체의 아미노산 서열 변이체가 예상된다. 예를 들어, 항체의 결합 친화성 및/또는 다른 생물학적 성질을 개선하는 것이 바람직할 수 있다. 항-TREM1 항체의 아미노산 서열 변이체는 적절한 변형을, 단백질을 코딩하는 뉴클레오타이드 서열에 도입함으로써 제조될 수 있거나, 펩티드 합성에 의해 제조될 수 있다. 이러한 변형은 예를 들어, 항-TREM1 항체의 아미노산 서열(예를 들어, 하나 이상의 CDR 및/또는 프레임워크 서열, 또는 VH 및/또는 VL 도메인) 내의 잔기로부터의 결실, 및/또는 이러한 잔기 내로의 삽입, 및/또는 이러한 잔기의 치환을 포함한다. 최종 구축물이 원하는 특성을 갖는 한, 결실, 삽입 및 치환의 임의의 조합을 만들어 최종 구축물에 도달할 수 있다.
본원에 제공된 변이체 VH 및 VL 서열의 특정 실시양태에서, 각각의 HVR은 변경되지 않거나, 1개, 2개 또는 3개 이하의 아미노산 치환을 함유한다.
TREM1에 결합하고 TREM1 활성을 중화시키는 항체의 능력을 유의미하게 변경시키지 않으면서, 본 발명에 의해 제공된 CDR에 대한 하나 이상의 아미노산 치환, 추가 및/또는 결실을 만들 수 있음을 이해할 것이다. 당업자는 예를 들어, 본원에 기재된 방법, 특히 실시예에 예시된 방법을 이용하여, TREM1 결합 및 TREM1과 이의 천연 리간드의 상호작용의 억제를 확인함으로써 임의의 아미노산 치환, 추가 및/또는 결실의 효과를 용이하게 시험할 수 있다.
결과적으로, 변이체 VH 및 VL 서열의 특정 실시양태에서, 각각의 CDR은 1개, 2개 또는 3개 이하의 아미노산 치환을 함유하며, 이때 이러한 아미노산 치환은 보존적 치환이고, 항체는 TREM1에 대한 그의 결합 성질을 유지한다.
따라서, 본 발명은 (서열번호 11을 포함하는) CDR-L1, (서열번호 12를 포함하는) CDR-L2, (서열번호 13을 포함하는) CDR-L3, (서열번호 14를 포함하는) CDR-H1, (서열번호 15를 포함하는) CDR-H2 및 (서열번호 16을 포함하는) CDR-H3으로부터 선택된 하나 이상의 CDR을 포함하는 항-TREM1 항체를 제공하는 것으로, 이때 하나 이상의 CDR에서 하나 이상의 아미노산은 또 다른 아미노산, 예를 들어, 아래 정의된 바와 같은 유사한 아미노산으로 치환된다.
한 실시양태에서, 본 발명은 (서열번호 11을 포함하는) CDR-L1, (서열번호 12를 포함하는) CDR-L2, (서열번호 13을 포함하는) CDR-L3, (서열번호 14를 포함하는) CDR-H1, (서열번호 15를 포함하는) CDR-H2 및 (서열번호 16을 포함하는) CDR-H3을 포함하는 항-TREM1 항체를 제공하는 것으로, 예를 들어, 이때 하나 이상의 CDR에서 하나 이상의 아미노산은 또 다른 아미노산, 예컨대, 아래 정의된 바와 같은 유사한 아미노산으로 치환된다.
한 실시양태에서, 본 발명은 (서열번호 12를 포함하는) 항-TREM1 항체 CDR-L2를 제공하는 것으로, 이때, 서열번호 12의 첫 번째 아미노산은 또 다른 아미노산으로 치환된다. 보다 구체적으로, K는 S로 치환된다.
한 실시양태에서, 본 발명의 항-TREM1 항체는 3개의 CDR을 포함하는 경쇄 가변 도메인을 포함하고, 이때 CDR-L1의 서열은 서열번호 11로 제공된 서열과 적어도 70%, 80%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일성 또는 유사성을 가진 서열을 포함하고/하거나, CDR-L2는 서열번호 12로 제공된 서열과 적어도 70%, 80%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일성 또는 유사성을 가진 서열을 포함하고/하거나, CDR-L3은 서열번호 13으로 제공된 서열과 적어도 70%, 80%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일성 또는 유사성을 가진 서열을 포함한다.
한 실시양태에서, 본 발명의 항-TREM1 항체는 3개의 CDR을 포함하는 중쇄 가변 도메인을 포함하고, 이때 CDR-H1의 서열은 서열번호 14로 제공된 서열과 적어도 70%, 80%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일성 또는 유사성을 가진 서열을 포함하고/하거나, CDR-H2는 서열번호 15로 제공된 서열과 적어도 70%, 80%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일성 또는 유사성을 가진 서열을 포함하고/하거나, CDR-H3은 서열번호 16으로 제공된 서열과 적어도 70%, 80%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일성 또는 유사성을 가진 서열을 포함한다.
한 실시양태에서, 본 발명의 항-TREM1 항체는 서열번호 29로 제공된 서열과 적어도 70%, 80%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일성 또는 유사성을 가진 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역을 포함한다.
한 실시양태에서, 본 발명의 항체는 서열번호 79로 제공된 서열과 적어도 70%, 80%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일성 또는 유사성을 가진 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역을 포함한다.
한 실시양태에서, 본 발명의 항-TREM1 항체는 경쇄 가변 영역 및 중쇄 가변 영역을 포함하고, 이때 경쇄 가변 영역은 서열번호 29로 제공된 서열과 적어도 70%, 80%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일성 또는 유사성을 가진 서열을 포함하고/하거나, 중쇄 가변 영역은 서열번호 79로 제공된 서열과 적어도 70%, 80%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일성 또는 유사성을 가진 서열을 포함한다.
한 실시양태에서, 본 발명의 항-TREM1 항체는 각각 서열번호 11/12/13/14/15/16을 포함하는 CDR-L1/CDR-L2/CDR-L3/CDR-H1/CDR-H2/CDR-H3 서열을 포함하고, 경쇄 및 중쇄 가변 영역의 나머지 부분은 각각 서열번호 29 및 79와 적어도 70%, 80%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일성 또는 유사성을 가진다.
한 실시양태에서, 본 발명의 항-TREM1 항체는 서열번호 31로 제공된 서열과 적어도 70%, 80%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일성 또는 유사성을 가진 서열을 포함하는 경쇄, 및 서열번호 81로 제공된 서열과 적어도 70%, 80%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일성 또는 유사성을 가진 서열을 포함하는 중쇄를 포함하는 IgG4P이다.
한 실시양태에서, 본 발명의 항-TREM1 항체는 각각 서열번호 11/12/13/14/15/16으로 제공된 CDR-L1/CDR-L2/CDR-L3/CDR-H1/CDR-H2/CDR-H3 서열을 포함하는 IgG4P이고, 경쇄 및 중쇄의 나머지 부분은 각각 서열번호 31 및 81과 적어도 70%, 80%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일성 또는 유사성을 가진다.
한 실시양태에서, 본 발명의 항체는 경쇄 가변 영역 및 중쇄 가변 영역을 포함하고, 이때 경쇄 가변 영역은 서열번호 29로 제공된 서열을 포함하고, 이때 위치 1, 2, 3, 18 및 50의 하나 이상의 잔기는 또 다른 아미노산으로 치환되고; 중쇄 가변 영역은 서열번호 79로 제공된 서열을 포함하고, 이때 위치 23, 48, 49, 71, 73, 75 및 78의 하나 이상의 잔기는 또 다른 아미노산으로 치환된다.
서열 동일성 및 유사성
서열 사이의 동일성 및 유사성의 정도는 쉽게 계산될 수 있다. "% 서열 동일성"(또는 "% 서열 유사성")은 (1) 비교 윈도우(예를 들어, 더 긴 서열의 길이, 더 짧은 서열의 길이, 특정된 윈도우 등)에 걸쳐 2개의 최적으로 정렬된 서열을 비교하고, (2) 동일한(또는 유사한) 아미노산을 함유하는 위치의 수를 확인하여(예를 들어, 동일한 아미노산이 두 서열에 존재하고 유사한 아미노산이 두 서열에 존재함) 일치된 위치의 수를 얻고, (3) 일치된 위치의 수를 비교 윈도우 내의 총 위치 수(예를 들어, 더 긴 서열의 길이, 더 짧은 서열의 길이, 특정된 윈도우)로 나누고, (4) 결과에 100을 곱하여 % 서열 동일성 또는 % 서열 유사성을 수득함으로써 계산된다.
비교를 위한 서열 정렬 방법은 당분야에 잘 알려져 있다. 비교를 위한 최적 서열 정렬은 예를 들어, 문헌[Smith & Waterman, Adv. Appl. Math. 2:482 (1981)]의 국소 상동성 알고리즘, 문헌[Needleman & Wunsch, J. Mol. Biol. 48:443 (1970)]의 상동성 정렬 알고리즘, 문헌[Pearson & Lipman, Proc. Nat'l. Acad. Sci. USA 85:2444 (1988)]의 유사성 검색 방법, 이 알고리즘들의 전산화된 구현(위스콘신 제네틱스 소프트웨어 팩키지(Wisconsin Genetics Software Package)의 GAP, BESTFIT, FASTA 및 TFASTA, 제네틱스 컴퓨터 그룹(Genetics Computer Group), 위스콘신주 매디슨 사이언스 드라이브 575), 또는 수동 정렬과 육안 검사(예를 들어, 문헌[Current Protocols in Molecular Biology (Ausubel et al., eds. 1995 supplement)] 참조)에 의해 수행될 수 있다.
퍼센트 서열 동일성 및 서열 유사성을 측정하는 데 적합한 알고리즘의 바람직한 예는 문헌[Altschul et al., Nuc. Acids Res. 25:3389-3402 (1977)] 및 문헌[Altschul et al., J. Mol. Biol. 215:403-410 (1990)]에 기재되어 있는 BLAST 및 BLAST 2.0 알고리즘을 포함한다. 디폴트 또는 권장된 파라미터를 사용하는 FASTA를 사용하여 폴리펩티드 서열을 비교할 수도 있다. FASTA(예를 들어, FASTA2 및 FASTA3)는 조회 서열과 검색 서열 사이에 가장 우수한 중첩이 있는 영역의 정렬 및 % 서열 동일성을 제공한다.
특정 실시양태에서, 변경이 표적에 결합하는 항체의 능력을 실질적으로 감소시키지 않는 한, 치환, 삽입 또는 결실은 하나 이상의 CDR 내에서 발생할 수 있다.
예를 들어, 결합 친화성을 실질적으로 감소시키지 않는 보존적 변경이 CDR에서 이루어질 수 있다. 이러한 변경은 CDR의 항원 접촉 잔기 외부에서 이루어질 수 있다.
보존적 치환은 보다 더 실질적인 "예시적인 치환"과 함께 표 4에 제시되어 있다.
항체 변이체의 생물학적 성질의 실질적인 변형은 치환 영역에서 폴리펩티드 골격의 구조 유지, 표적 부위에서 분자의 전하 또는 소수성, 또는 측쇄의 용적에 대한 치환의 효과 면에서 유의미하게 상이한 치환을 선택함으로써 달성될 수 있다. 아미노산은 그들의 측쇄의 성질의 유사성에 따라 분류될 수 있다(A. L. Lehninger, Biochemistry second ed., pp. 73-75, Worth Publishers, New York(1975)).
치환 변이체의 한 유형은 모 항체(인간화 또는 인간 항체)의 하나 이상의 CDR 영역 잔기를 치환하는 것을 포함한다. 일반적으로, 추가 연구를 위해 선택된 생성된 변이체(들)는 모 항체에 비해 특정 생물학적 성질의 변화(예를 들어, 증가된 친화성, 감소된 면역원성)을 가질 것이고/이거나, 모 항체의 실질적으로 유지된 특정 생물학적 성질을 가질 것이다. 예시적인 치환 변이체는 예를 들어, 파지 디스플레이 기반 친화성 성숙 기법을 이용함으로써 편리하게 생성될 수 있는 친화성 성숙된 항체이다. 요약하건대, 하나 이상의 CDR 잔기가 돌연변이되고 변이체 항체가 파지 상에 표시되고 특정 생물학적 활성(예를 들어, 결합 친화성)에 대해 스크리닝된다.
예를 들어, 항체 친화성을 개선하기 위해 CDR을 변경(예를 들어, 치환)시킬 수 있다. 이러한 변경은 HVR "핫스팟", 즉 체세포 성숙 과정 동안 높은 빈도로 돌연변이를 겪는 코돈에 의해 코딩된 잔기(예를 들어, 문헌[Chowdhury, Methods Mol. Biol. 207: 179-196 (2008)] 참조), 및/또는 항원과 접촉하는 잔기에서 이루어질 수 있고, 이때 생성된 변이체 VH 또는 VL은 결합 친화성에 대해 시험된다. 2차 라이브러리를 구축하고 이 라이브러리부터 재선택함으로써 달성되는 친화성 성숙은 예를 들어, 문헌[Hoogenboom et al. Methods in Molecular Biology 178: 1-37 (O'Brien et al., ed., Human Press, Totowa, NJ, (2001))]에 기재되어 있다. 친화성 성숙의 일부 실시양태에서, 다양성은 다양한 방법들 중 임의의 방법(예를 들어, 오류 유발 PCR, 쇄 셔플링 또는 올리고뉴클레오타이드 지정 돌연변이유발)에 의해 성숙을 위해 선택된 가변 유전자에 도입된다. 그 후, 2차 라이브러리가 생성된다. 그 다음, 상기 라이브러리를 스크리닝하여 원하는 친화성을 가진 임의의 항체 변이체를 확인한다.
돌연변이유발을 위해 표적화될 수 있는 항체의 잔기 또는 영역을 확인하는 데 이용될 수 있는 방법들 중 하나는 알라닌 스캐닝 돌연변이유발이다(Cunningham and Wells (1989) Science, 244: 1081-1085). 이 방법에서, 하나의 잔기 또는 다수의 표적 잔기를 확인하고 알라닌으로 교체하여, 항체와 항원의 상호작용이 영향을 받는지를 확인한다. 대안적으로 또는 추가로, 항원-항체 복합체의 X-선 구조를 사용하여 항체와 이의 항원 사이의 접촉점을 확인할 수 있다. 변이체를 스크리닝하여, 이 변이체가 원하는 성질을 갖는지를 확인할 수 있다.
불변 영역 변이체
일부 실시양태에서, 하나 이상의 아미노산 변형을 본원에 제공된 항체의 Fc 영역에 도입함으로써, Fc 영역 변이체를 생성할 수 있다. Fc 영역 변이체는 하나 이상의 아미노산 위치에서 아미노산 변형(예를 들어, 치환)을 포함하는 인간 Fc 영역 서열(예를 들어, 인간 IgG1, IgG2, IgG3 또는 IgG4 Fc 영역)을 포함할 수 있다.
FcR과의 결합이 개선되었거나 감소된 특정 항체 변이체가 기재되어 있다(예를 들어, 미국 특허 제6,737,056호; 국제 특허 출원 공개 제WO 2004/056312호, 및 문헌[Shields et al., J. Biol. Chem. 9(2): 6591-6604 (2001)] 참조).
반감기가 증가되었고 신생아 Fc 수용체(FcRn)와의 결합이 개선된 항체는 미국 특허 출원 공개 제2005/0014934A1호에 기재되어 있다. 이러한 항체는 Fc 영역과 FcRn의 결합을 개선하는 하나 이상의 치환을 가진 Fc 영역을 포함한다.
특정 실시양태에서, 항체 변이체는 ADCC를 개선하는 하나 이상의 아미노산 치환, 예를 들어, Fc 영역의 위치 298, 333 및/또는 334(잔기의 EU 넘버링)에서의 치환을 가진 Fc 영역을 포함한다.
이펙터 기능이 감소된 항체는 Fc 영역 잔기 234, 235, 237, 238, 265, 269, 270, 297, 327 및 329 중 하나 이상의 잔기의 치환을 가진 항체를 포함한다(예를 들어, 미국 특허 제6,737,056호 참조). 이러한 Fc 돌연변이체는 아미노산 위치 265, 269, 270, 297 및 327 중 2개 이상의 아미노산 위치에서 치환을 가진 Fc 돌연변이체를 포함하고, 이때 아미노산 잔기는 EU 넘버링 시스템에 따라 넘버링된다.
CDC 및/또는 ADCC 활성의 감소/고갈을 확인하기 위해 시험관내 및/또는 생체내 세포독성 어세이를 수행할 수 있다. 예를 들어, Fc 수용체(FcR) 결합 어세이를 수행하여, 항체가 FcγR 결합을 결여하지만(따라서 ADCC 활성을 결여할 가능성이 높음) FcRn 결합 능력을 유지하는지를 확인할 수 있다. ADCC를 매개하는 1차 세포인 NK 세포는 FcγRIII만을 발현하는 반면, 단핵구는 FcRI, FcγRII 및 FcγRIII을 발현한다. 조혈 세포에서의 FcR 발현은 문헌[Ravetch and Kinet, Annu. Rev. Immunol. 9:457-492 (1991)]에 요약되어 있다. 관심 있는 분자의 ADCC 활성을 평가하기 위한 시험관내 어세이의 비제한적인 예는 미국 특허 제5,500,362호 및 미국 특허 제5,821,337호에 기재되어 있다. 대안적으로 또는 추가로, 관심 있는 분자의 ADCC 활성은 생체내, 예를 들어, 동물 모델, 예컨대, 문헌[Clynes et al. Proc. Nat l Acad. Sci. USA 95:652-656 (1998)]에 개시된 동물 모델에서 평가될 수 있다. C1q 결합 어세이도 수행하여, 항체가 C1q에 결합할 수 없으므로 CDC 활성을 결여함을 확인할 수 있다. 예를 들어, 국제 특허 출원 공개 제WO 2006/029879호 및 제WO 2005/100402호의 C1q 및 C3c 결합 ELISA를 참조한다. 보체 활성화를 평가하기 위해, CDC 어세이를 수행할 수 있다(예를 들어, 문헌[Gazzano-Santoro et al, J. Immunol. Methods 202: 163 (1996)]; 문헌[Cragg, M.S. et al, Blood 101: 1045-1052 (2003)]; 및 문헌[Cragg, M.S. and M.I Glennie, Blood 103:2738-2743 (2004)] 참조). 당분야에서 알려진 방법을 이용하여 FcRn 결합 및 생체내 제거/반감기 측정도 수행할 수 있다(예를 들어, 문헌[Petkova, S.B. et al, Int l. Immunol. 18(12): 1759-1769 (2006)] 참조).
본 발명의 항체 분자의 불변 영역 도메인은 존재하는 경우 항체 분자의 제안된 기능, 특히 요구될 수 있는 이펙터 기능을 고려하여 선택될 수 있다. 예를 들어, 불변 영역 도메인은 인간 IgA, IgD, IgE, IgG 또는 IgM 도메인일 수 있다. 구체적으로, 항체 분자가 치료 용도를 위한 것이고 항체 이펙터 기능이 요구될 때 인간 IgG 불변 영역 도메인, 특히 IgG1 및 IgG3 이소타입의 인간 IgG 불변 영역 도메인이 사용될 수 있다. 대안적으로, 항체 분자가 치료 목적을 위한 것이고 항체 이펙터 기능이 요구되지 않을 때 IgG2 및 IgG4 이소타입이 사용될 수 있다. 이 불변 영역 도메인들의 서열 변이체도 사용될 수 있음을 이해할 것이다.
일부 실시양태에서, 항체는 (EU 넘버링에 따른) 아미노산 치환 L234A/L235A가 IgG1의 불변 영역에 도입되어 있는, 야생형 인간 IgG1 이소폼의 돌연변이체인 IgG1 LALA이다.
일부 실시양태에서, 항체는 예를 들어, 문헌[Angal et al., Molecular Immunology, 1993, 30 (1), 105-108]에 기재된 바와 같이 (EU 넘버링에 따른) 아미노산 228이 프롤린으로 교체되어 있는, 야생형 인간 IgG4 이소폼의 돌연변이체인 IgG4P이다.
글리코실화 변이체
특정 실시양태에서, 본원에 제공된 항체는 항체가 글리코실화되는 정도를 증가시키거나 감소시키도록 변경된다. 글리코실화 부위를 항체에 추가하거나 항체로부터 결실시키는 것은 하나 이상의 글리코실화 부위가 생성되거나 제거되도록 아미노산 서열을 변경시킴으로써 편리하게 달성될 수 있다.
인간화, 인간 및 키메라 항체
본 발명의 항체는 인간화, 완전 인간 또는 키메라 항체일 수 있으나 이들로 제한되지 않는다.
한 실시양태에서, 항체는 인간화된다. 보다 구체적으로, 항-TREM1 항체는 키메라, 인간 또는 인간화 항체이다.
특정 실시양태에서, 본원에 제공된 항체는 키메라 항체이다. 키메라 항체의 예는 예를 들어, 미국 특허 제4,816,567호; 및 문헌[Morrison et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81 :6851-6855 (1984)]에 기재되어 있다. 한 예에서, 키메라 항체는 비인간 가변 영역(예를 들어, 마우스, 래트, 햄스터, 토끼 또는 비인간 영장류, 예컨대, 원숭이로부터 유래한 가변 영역) 및 인간 불변 영역을 포함한다. 또 다른 예에서, 키메라 항체는 클래스 또는 서브클래스가 모 항체의 클래스 또는 서브클래스로부터 변경되어 있는 "클래스 전환된" 항체이다.
키메라 항체는 요소가 그 자신이 유래한 종의 특성을 유지하도록 2개의 상이한 종으로부터 유래한 요소로 구성된다. 일반적으로, 키메라 항체는 한 종, 예를 들어, 마우스, 래트, 토끼 등으로부터의 가변 영역, 및 또 다른 종, 예컨대, 인간으로부터의 불변 영역을 포함할 것이다.
특정 실시양태에서, 키메라 항체는 인간화 항체이다.
전체 CDR보다는 CDR의 특이성 결정 잔기를 전달하는 것만이 필요할 수 있음을 이해할 것이다(예를 들어, 문헌[Kashmiri et al., 2005, Methods, 36, 25-34] 참조). 인간화 항체는 임의로 CDR이 유래한 비인간 종으로부터 유래한 하나 이상의 프레임워크 잔기를 추가로 포함할 수 있다.
적합하게는, 본 발명에 따른 인간화 항체는 인간 수용자 프레임워크 영역뿐만 아니라 하나 이상의 CDR을 포함하고 임의로 하나 이상의 공여자 프레임워크 잔기를 추가로 포함하는 가변 도메인을 가진다.
한 실시양태에서, 항체는 인간화 항체이고, 이때 가변 도메인은 인간 수용자 프레임워크 영역 및 비인간 공여자 CDR을 포함한다.
CDR이 이식될 때, CDR이 유래한 공여자 항체의 클래스/유형을 고려하여 마우스, 영장류 및 인간 프레임워크 영역을 포함하는 임의의 적절한 수용자 가변 영역 프레임워크 서열을 사용할 수 있다.
본 발명에 사용될 수 있는 인간 프레임워크의 예는 KOL, NEWM, REI, EU, TUR, TEI, LAY 및 POM이다(Kabat et al). 예를 들어, KOL 및 NEWM은 중쇄를 위해 사용될 수 있고, REI는 경쇄를 위해 사용될 수 있으며, EU, LAY 및 POM은 중쇄 및 경쇄 둘 다를 위해 사용될 수 있다. 대안적으로, 인간 생식세포계열 서열을 사용할 수 있으며; 이들은 www.imgt.org에서 입수될 수 있다. 실시양태에서, 수용자 프레임워크는 IGKV1-9 인간 생식세포계열 및/또는 IGHV3-66 인간 생식세포계열이다. 실시양태에서, 인간 프레임워크는 1개 내지 5개, 1개 내지 4개, 1개 내지 3개, 1개 또는 2개의 공여자 항체 아미노산 잔기를 함유한다.
본 발명의 인간화 항체에서, 수용자 중쇄 및 경쇄는 반드시 동일한 항체로부터 유래할 필요는 없으며, 원하는 경우, 상이한 쇄로부터 유래한 프레임워크 영역을 가진 복합 쇄를 포함할 수 있다.
일부 실시양태에서, 항체는 인간 항체이다. 인간 항체는 당분야에 알려진 다양한 기법을 이용함으로써 생성될 수 있다. 보다 구체적으로, 항-TREM1 항체는 인간 항체 중쇄 불변 영역 및 인간 경쇄 불변 영역을 포함한다.
인간 항체는 항체의 가변 영역 또는 전체 길이 쇄가 인간 생식세포계열 면역글로불린 유전자를 사용하는 시스템으로부터 수득되는 경우 특정 생식세포계열 서열로부터 유래한 중쇄 또는 경쇄 가변 영역 또는 전체 길이 중쇄 또는 경쇄를 포함한다. 이러한 시스템은 인간 면역글로불린 유전자를 보유하는 형질전환 마우스를 관심 있는 항원으로 예방접종하거나 파지 상에 표시된 인간 면역글로불린 유전자 라이브러리를 관심 있는 항원으로 스크리닝하는 것을 포함한다. 인간 생식세포계열 면역글로불린 서열로부터 유래한 인간 항체는 인간 항체의 아미노산 서열을 인간 생식세포계열 면역글로불린의 아미노산 서열과 비교하고 서열이 인간 항체의 서열과 가장 가까운(즉, 최대 % 동일성) 인간 생식세포계열 면역글로불린 서열을 선택함으로써 그 자체로서 확인될 수 있다. 특정 인간 생식세포계열 면역글로불린 서열로부터 유래한 인간 항체는 예를 들어, 천연 발생 체세포 돌연변이 또는 부위 지정 돌연변이의 의도적인 도입으로 인해 생식세포계열 서열에 비해 아미노산 차이를 함유할 수 있다. 그러나, 선택된 인간 항체는 전형적으로 아미노산 서열이 인간 생식세포계열 면역글로불린 유전자에 의해 코딩된 아미노산 서열과 적어도 90% 동일하고 다른 종의 생식세포계열 면역글로불린 아미노산 서열(예를 들어, 뮤린 생식세포계열 서열)과 비교될 때 인간 항체를 인간 항체로서 확인시켜 주는 아미노산 잔기를 함유한다. 일부 경우, 인간 항체는 아미노산 서열이 생식세포계열 면역글로불린 유전자에 의해 코딩된 아미노산 서열과 적어도 60%, 70%, 80%, 90%, 또는 적어도 95%, 또는 심지어 적어도 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일할 수 있다. 전형적으로, 특정 인간 생식세포계열 서열로부터 유래한 인간 항체는 인간 생식세포계열 면역글로불린 유전자에 의해 코딩된 아미노산 서열과 10개 이하의 아미노산 차이를 나타낼 것이다. 일부 경우, 인간 항체는 생식세포계열 면역글로불린 유전자에 의해 코딩된 아미노산 서열과 5개 이하, 심지어 4개, 3개, 2개 또는 1개 이하의 아미노산 차이를 나타낼 수 있다.
인간 항체는 당업자에게 알려진 다수의 방법에 의해 생성될 수 있다. 인간 항체는 인간 골수종 또는 마우스-인간 이종골수종 세포주를 사용하는 하이브리도마 방법에 의해 제조될 수 있다(Kozbor, J Immunol; (1984) 133:3001; Brodeur, Monoclonal Isolated Antibody Production Techniques and Applications, pp51-63, Marcel Dekker Inc, 1987). 대안적 방법은 둘 다 인간 가변 영역 레퍼토리를 이용하는 파지 라이브러리 또는 형질전환 마우스의 사용을 포함한다(Winter G; (1994) Annu Rev Immunol 12:433-455, Green LL, (1999) J Immunol Methods 231:11-23). 인간 항체는 예를 들어, 미국 특허 제5,545,806호, 제5,569,825호, 제5,625,126호, 제5,633,425호, 제5,661,016호 및 제5,770,429호에 설명된 바와 같이 뮤린 면역글로불린 가변 및 임의로 불변 영역 유전자가 이들의 인간 대응물로 교체되어 있는 마우스에 의해 생성될 수 있다.
이펙터 분자
원하는 경우, 본 발명에 따른 항체는 하나 이상의 이펙터 분자(들)에 접합될 수 있다. 한 실시양태에서, 항체는 이펙터 분자에 부착되지 않는다.
이펙터 분자는 본 발명의 항체에 부착될 수 있는 단일 모이어티를 형성하도록 연결된 단일 이펙터 분자 또는 2개 이상의 이러한 분자를 포함할 수 있음을 이해할 것이다. 이펙터 분자에 연결된 항체 단편을 수득하고자 하는 경우, 이것은 항체 단편이 직접적으로 또는 커플링제를 통해 이펙터 분자에 연결되는 표준 화학적 또는 재조합 DNA 절차에 의해 제조될 수 있다. 이러한 이펙터 분자를 항체에 접합시키는 기법은 당분야에 잘 알려져 있다(예를 들어, 문헌[Hellstrom et al., Controlled Drug Delivery, 2nd Ed., Robinson et al., eds., 1987, pp. 623-53]; 문헌[Thorpe et al., 1982, Immunol. Rev., 62:119-58]; 및 문헌[Dubowchik et al., 1999, Pharmacology and Therapeutics, 83, 67-123] 참조). 특정 화학적 절차는 예를 들어, 국제 특허 출원 공개 제WO 93/06231호, 제WO 92/22583호, 제WO 89/00195호, 제WO 89/01476호 및 제WO 03/031581호에 기재된 화학적 절차를 포함한다. 대안적으로, 이펙터 분자가 단백질 또는 폴리펩티드인 경우, 연결은 예를 들어, 국제 특허 출원 공개 제WO 86/01533호 및 유럽 특허 제0392745호에 기재된 바와 같이 재조합 DNA 절차를 이용함으로써 달성될 수 있다.
이펙터 분자의 예는 세포에 해로운(예를 들어, 세포를 사멸시키는) 임의의 작용제를 포함하는 세포독소 또는 세포독성제를 포함할 수 있다. 예는 콤브레스타틴(combrestatin), 돌라스타틴(dolastatin), 에포틸론(epothilone), 스타우로스포린(staurosporin), 메이탄시노이드(maytansinoid), 스폰지스타틴(spongistatin), 리족신(rhizoxin), 할리콘드린(halichondrin), 로리딘(roridin), 헤미아스터린(hemiasterlin), 탁솔(taxol), 사이토칼라신(cytochalasin) B, 그라미시딘(gramicidin) D, 에티듐 브로마이드, 에메틴(emetine), 미토마이신(mitomycin), 에토포사이드(etoposide), 테노포사이드(tenoposide), 빈크리스틴(vincristine), 빈블라스틴(vinblastine), 콜히친(colchicin), 독소루비신(doxorubicin), 다우노루비신(daunorubicin), 디하이드록시 안트라신 디온(dihydroxy anthracin dione), 미톡산트론(mitoxantrone), 미쓰라마이신(mithramycin), 악티노마이신(actinomycin) D, 1-데하이드로테스토스테론, 글루코코르티코이드, 프로카인(procaine), 테트라카인(tetracaine), 리도카인(lidocaine), 프로프라놀롤(propranolol) 및 퓨로마이신(puromycin), 및 이들의 유사체 또는 동족체를 포함한다.
이펙터 분자는 항대사물질(예를 들어, 메토트렉세이트, 6-머캡토퓨린, 6-티오구아닌, 사이타라빈, 5-플루오로우라실 데카르바진), 알킬화제(예를 들어, 메클로레타민, 티오테파 클로람부실, 멜팔란, 카르무스틴(BSNU) 및 로무스틴(CCNU), 사이클로포스파미드, 부설판, 디브로모만니톨, 스트렙토조토신, 미토마이신 C, 및 시스-디클로로디아민 백금(II)(DDP) 시스플라틴), 안쓰라사이클린(예를 들어, 다우노루비신(이전 명칭: 다우노마이신) 및 독소루비신), 항생제(예를 들어, 닥티노마이신(이전 명칭: 악티노마이신), 블레오마이신, 미쓰라마이신, 안쓰라마이신(AMC), 칼리케아미신 또는 듀오카르마이신) 및 항유사분열제(예를 들어, 빈크리스틴 및 빈블라스틴)도 포함하나 이들로 제한되지 않는다.
다른 이펙터 분자는 111In 및 90Y, Lu177, 비스무트213, 캘리포르늄252, 이리듐192 및 텅스텐188/레늄188과 같은 킬레이팅된 방사성핵종; 또는 알킬포스포콜린, 토포이소머라제 I 억제제, 탁소이드 및 수라민(suramin)과 같은, 그러나 이들로 제한되지 않는, 약물을 포함할 수 있다.
다른 이펙터 분자는 단백질, 펩티드 및 효소를 포함한다. 관심 있는 효소는 단백질용해성 효소, 하이드롤라제(hydrolase), 리아제(lyase), 이소머라제(isomerase), 트랜스퍼라제(transferase)를 포함하나 이들로 제한되지 않는다. 관심 있는 단백질, 폴리펩티드 및 펩티드는 면역글로불린, 독소, 예컨대, 아브린(abrin), 리신(ricin) A, 슈도모나스 외독소 또는 디프테리아 독소, 단백질, 예컨대, 인슐린, 종양 괴사 인자, α-인터페론, β-인터페론, 신경 성장 인자, 혈소판 유래 성장 인자 또는 조직 플라스미노겐 활성화제, 혈전증제 또는 항혈관신생제, 예를 들어, 안지오스타틴(angiostatin) 또는 엔도스타틴(endostatin), 또는 생물학적 반응 변형제, 예컨대, 림포카인, 인터류킨-1(IL-1), 인터류킨-2(IL-2), 과립구 대식세포 콜로니 자극 인자(GM-CSF), 과립구 콜로니 자극 인자(G-CSF), 신경 성장 인자(NGF) 또는 다른 성장 인자 및 면역글로불린을 포함하나 이들로 제한되지 않는다.
다른 이펙터 분자는 예를 들어, 진단에 유용한 검출 가능한 물질을 포함할 수 있다. 검출 가능한 물질의 예는 다양한 효소, 보결분자단, 형광 물질, 발광 물질, 생체발광 물질, 방사성 핵종, 양전자 방출 금속(양전자 방출 단층 촬영술에 사용됨) 및 비방사성 상자성 금속 이온을 포함한다. 진단제로서 사용하기 위해 항체에 접합될 수 있는 금속 이온에 대해서는 일반적으로 미국 특허 제4,741,900호를 참조한다. 적합한 효소는 호스라디쉬 퍼록시다제, 알칼리성 포스파타제, 베타 갈락토시다제 또는 아세틸콜린에스테라제를 포함하고; 적합한 보결분자단은 스트렙타비딘, 아비딘 및 바이오틴을 포함하고; 적합한 형광 물질은 움벨리페론, 플루오레세인, 플루오레세인 이소티오시아네이트, 로다민, 디클로로트리아지닐아민 플루오레세인, 단실 클로라이드 및 파이코에리쓰린을 포함하고; 적합한 발광 물질은 루미놀을 포함하고; 적합한 생체발광 물질은 루시퍼라제(luciferase), 루시페린(luciferin) 및 에쿠오린(aequorin)을 포함하고; 적합한 방사성 핵종은 125I, 131I, 111In 및 99Tc를 포함한다.
또 다른 예에서, 이펙터 분자는 생체내에서 항체의 반감기를 증가시킬 수 있고/있거나, 항체의 면역원성을 감소시킬 수 있고/있거나, 상피 장벽을 가로질러 항체를 면역 시스템으로 전달하는 것을 향상시킬 수 있다. 이러한 유형의 적합한 이펙터 분자의 예는 중합체, 알부민, 알부민 결합 단백질 또는 알부민 결합 화합물, 예컨대, 국제 특허 출원 공개 제WO2005/117984호에 기재된 것들을 포함한다.
이펙터 분자가 중합체인 경우, 이것은 일반적으로 합성 또는 천연 생성 중합체, 예를 들어, 임의로 치환된 직쇄 또는 분지쇄 폴리알킬렌, 폴리알케닐렌 또는 폴리옥시알킬렌 중합체, 또는 분지된 또는 비분지된 다당류, 예를 들어, 동종 또는 이종 다당류일 수 있다.
상기 언급된 합성 중합체에 존재할 수 있는 구체적인 임의적 치환기는 하나 이상의 하이드록시, 메틸 또는 메톡시 기를 포함한다.
합성 중합체의 구체적인 예는 임의로 치환된 직쇄 또는 분지쇄 폴리(에틸렌글리콜), 폴리(프로필렌글리콜), 폴리(비닐알코올) 또는 이들의 유도체, 특히 임의로 치환된 폴리(에틸렌글리콜), 예컨대, 메톡시폴리(에틸렌글리콜) 또는 이들의 유도체를 포함한다.
구체적인 천연 생성 중합체는 락토스, 아밀로스, 덱스트란, 글리코겐 또는 이들의 유도체를 포함한다.
한 실시양태에서, 중합체는 알부민 또는 이의 단편, 예컨대, 인간 혈청 알부민 또는 이의 단편이다.
중합체의 크기는 원하는 대로 변경될 수 있으나, 일반적으로 500 Da 내지 50000 Da, 예를 들어, 5000 Da 내지 40000 Da, 예컨대, 20000 Da 내지 40000 Da의 평균 분자량 범위 내에 있을 것이다. 구체적으로, 생성물의 의도된 용도, 예를 들어, 종양과 같은 특정 조직에 국한되거나 순환 반감기를 연장하는 능력을 기준으로 중합체 크기를 선택할 수 있다(검토를 위해서는 문헌[Chapman, 2002, Advanced Drug Delivery Reviews, 54, 531-545] 참조). 따라서, 예를 들어, 생성물이 종양의 치료에 사용되기 위해 순환계를 떠나 조직으로 침투하도록 의도된 경우, 예를 들어, 약 5000 Da의 분자량을 가진 저분자량 중합체를 사용하는 것이 유리할 수 있다. 생성물이 순환계에 남아있는 응용분야의 경우, 예를 들어, 20000 Da 내지 40000 Da의 분자량을 가진 고분자량 중합체를 사용하는 것이 유리할 수 있다.
적합한 중합체는 특히 약 15000 Da 내지 약 40000 Da의 분자량을 가진 폴리알킬렌 중합체, 예컨대, 폴리(에틸렌글리콜) 또는 특히 메톡시폴리(에틸렌글리콜) 또는 이의 유도체를 포함한다.
한 예에서, 본 발명에 따른 항체는 폴리(에틸렌글리콜)(PEG) 모이어티에 부착된다. 한 특정 실시양태에서, 본 발명에 따른 항원 결합 단편 및 PEG 분자는 항체 단편에 위치한 임의의 이용 가능한 아미노산 측쇄 또는 말단 아미노산 작용기, 예를 들어, 임의의 유리 아미노, 이미노, 티올, 하이드록실 또는 카르복실 기를 통해 부착될 수 있다. 이러한 아미노산은 항체 단편에 천연적으로 존재할 수 있거나 재조합 DNA 방법을 이용함으로써 단편 내로 조작될 수 있다(예를 들어, 미국 특허 제5,219,996호; 미국 특허 제5,667,425호; 국제 특허 출원 공개 제WO98/25971호; 국제 특허 출원 공개 제WO2008/038024호 참조). 한 예에서, 본 발명의 항체 분자는 변형된 Fab 단편이며, 이때 변형은 이펙터 분자의 부착을 허용하도록 하나 이상의 아미노산을 그의 중쇄의 C-말단에 추가하는 것이다. 적절하게는, 추가 아미노산은 이펙터 분자가 부착될 수 있는 하나 이상의 시스테인 잔기를 함유하는 변형된 힌지 영역을 형성한다. 다수의 부위를 사용하여 2개 이상의 PEG 분자를 부착할 수 있다.
적합하게는, PEG 분자는 항체 단편에 위치한 적어도 하나의 시스테인 잔기의 티올 기를 통해 공유연결된다. 변형된 항체 단편에 부착된 각각의 중합체 분자는 단편에 위치한 시스테인 잔기의 황 원자에 공유연결될 수 있다. 공유연결은 일반적으로 디설파이드 결합 또는, 특히, 황-탄소 결합일 것이다. 티올 기가 적절하게 활성화된 이펙터 분자의 부착점으로서 사용되는 경우, 예를 들어, 말레이미드 및 시스테인 유도체와 같은 티올 선택적 유도체가 사용될 수 있다. 활성화된 중합체는 전술된 바와 같이 중합체 변형된 항체 단편의 제조에서 출발 물질로서 사용될 수 있다. 활성화된 중합체는 티올 반응성 기, 예컨대, α-할로카르복실산 또는 에스테르, 예를 들어, 요오도아세트아미드, 이미드, 예를 들어, 말레이미드, 비닐 설폰 또는 디설파이드를 함유하는 임의의 중합체일 수 있다. 이러한 출발 물질은 (예를 들어, 미국 앨라배마주 헌츠빌에 위치하는 넥타르(Nektar)(이전 명칭: Shearwater Polymers Inc.))로부터 상업적으로 입수될 수 있거나, 통상적인 화학적 절차를 이용함으로써 상업적으로 입수 가능한 출발 물질로부터 제조될 수 있다. 구체적인 PEG 분자는 20K 메톡시-PEG-아민(넥타르(이전 명칭: Shearwater); 랩 폴리미어(Rapp Polymere); 및 선바이오(SunBio)로부터 입수 가능함) 및 M-PEG-SPA(넥타르(이전 명칭: Shearwater)로부터 입수 가능함)를 포함한다.
한 실시양태에서, 항체는 예를 들어, 유럽 특허 제0948544호 또는 제1090037호에 개시된 방법에 따라 PEG화된, 즉, 그 자신에 공유부착된 PEG(폴리(에틸렌글리콜))를 가진 변형된 Fab 단편, Fab' 단편 또는 diFab이다[문헌["Poly(ethyleneglycol) Chemistry, Biotechnical and Biomedical Applications", 1992, J. Milton Harris (ed), Plenum Press, New York, "Poly(ethyleneglycol) Chemistry and Biological Applications", 1997, J. Milton Harris and S. Zalipsky (eds), American Chemical Society, Washington DC and "Bioconjugation Protein Coupling Techniques for the Biomedical Sciences", 1998, M. Aslam and A. Dent, Grove Publishers, New York; Chapman, A. 2002, Advanced Drug Delivery Reviews 2002, 54:531-545] 또한 참조]. 한 예에서, PEG는 힌지 영역의 시스테인에 부착된다. 한 예에서, PEG 변형된 Fab 단편은 변형된 힌지 영역에서 단일 티올 기에 공유연결된 말레이미드 기를 가진다. 라이신 잔기는 말레이미드 기에 공유연결될 수 있고, 대략 20,000 Da의 분자량을 가진 메톡시폴리(에틸렌글리콜) 중합체는 라이신 잔기의 아민 기 각각에 부착될 수 있다. 따라서, Fab 단편에 부착된 PEG의 총 분자량은 대략 40,000 Da일 수 있다.
한 실시양태에서, 항체는 이펙터 분자가 부착되는 적어도 하나의 시스테인 잔기를 함유하는 변형된 힌지 영역을 그의 중쇄의 C-말단에서 가진 변형된 Fab' 단편이다. 적합하게는, 이펙터 분자는 PEG이고 국제 특허 출원 공개 제WO 98/25971호 및 제WO 2004/072116호 또는 제WO 2007/003898호에 기재된 방법을 이용함으로써 부착된다. 이펙터 분자는 국제 특허 출원 공개 제WO 2005/003169호, 제WO 2005/003170호 및 제WO 2005/003171호에 기재된 방법을 이용함으로써 항체 단편에 부착될 수 있다.
한 실시양태에서, 항체는 이펙터 분자에 부착되지 않는다.
폴리뉴클레오타이드 및 벡터
본 발명은 또한 본 발명에 따른 항체 또는 이의 일부를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드(예컨대, 표 5에 나열된 아미노산 서열번호)를 제공한다. 본 발명에 따른 단리된 폴리뉴클레오타이드는 예를 들어, 화학적 처리에 의해 생성된 합성 DNA, cDNA, 게놈 DNA 또는 이들의 임의의 조합을 포함할 수 있다.
적합한 서열의 예가 본원에 제공된다. 따라서, 한 실시양태에서, 본 발명은 서열번호 34, 58, 36, 64, 66, 60, 62, 30, 80, 32, 86, 88, 82 또는 84로 제공된 서열을 포함하는, 항체를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드를 제공한다.
한 실시양태에서, 본 발명은 각각 서열번호 88 또는 82로 제공된 서열을 포함하는, 본 발명의 IgG1 LALA 또는 IgG4P 항체의 중쇄를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드를 제공한다.
서열번호 32로 제공된 서열을 포함하는, 본 발명의 IgG1 LALA 또는 IgG4P 항체의 경쇄를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드도 제공한다.
또 다른 실시양태에서, 본 발명은 본 발명의 IgG4P 항체의 중쇄 및 경쇄를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드를 제공하는 것으로, 이때 중쇄를 코딩하는 폴리뉴클레오타이드는 서열번호 82로 제공된 서열을 포함하고, 경쇄를 코딩하는 폴리뉴클레오타이드는 서열번호 32로 제공된 서열을 포함한다.
본 발명은 본원에 기재된 하나 이상의 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 클로닝 또는 발현 벡터도 제공한다. 한 예에서, 본 발명에 따른 클로닝 또는 발현 벡터는 서열번호 34, 58, 36, 64, 66, 60, 62, 30, 80, 32, 86, 88, 82 또는 84로부터 선택된 서열을 포함하는 하나 이상의 단리된 폴리뉴클레오타이드를 포함한다.
분자생물학의 표준 기법을 이용하여 본 발명의 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 코딩하는 DNA 서열을 제조할 수 있다. 올리고뉴클레오타이드 합성 기법을 이용하여 원하는 DNA 서열을 완전히 또는 부분적으로 합성할 수 있다. 부위 지정 돌연변이유발 및 중합효소 연쇄 반응(PCR) 기법이 적절하게 사용될 수 있다.
벡터를 구축할 수 있는 일반적인 방법, 형질감염 방법 및 배양 방법은 당업자에게 잘 알려져 있다. 이와 관련하여, 문헌["Current Protocols in Molecular Biology", 1999, F. M. Ausubel (ed), Wiley Interscience, New York and the Maniatis Manual produced by Cold Spring Harbor Publishing]을 참조한다.
항체 및 이의 항원 결합 단편을 생성하기 위한 숙주 세포
본 발명에 따른 하나 이상의 단리된 폴리뉴클레오타이드 서열, 또는 본 발명의 항체를 코딩하는 하나 이상의 단리된 폴리뉴클레오타이드 서열을 포함하는 하나 이상의 클로닝 또는 발현 벡터를 포함하는 숙주 세포도 제공한다. 임의의 적합한 숙주 세포/벡터 시스템이 본 발명의 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 코딩하는 폴리뉴클레오타이드 서열의 발현을 위해 사용될 수 있다. 박테리아, 예를 들어, 대장균 및 다른 미생물 시스템이 사용될 수 있거나, 진핵생물, 예를 들어, 포유동물, 숙주 세포 발현 시스템도 사용될 수 있다. 적합한 포유동물 숙주 세포는 CHO, 골수종 또는 하이브리도마 세포를 포함한다.
추가 실시양태에서, 이러한 핵산(들) 또는 벡터(들)를 포함하는 숙주 세포를 제공한다. 이러한 한 실시양태에서, 숙주 세포는 (1) 항-TREM1 항체의 VL을 포함하는 아미노산 서열 및 항-TREM1 항체의 VH를 포함하는 아미노산 서열을 코딩하는 핵산을 포함하는 벡터; 또는 (2) 항-TREM1 항체의 VL을 포함하는 아미노산 서열을 코딩하는 핵산을 포함하는 제1 벡터 및 항-TREM1 항체의 VH를 포함하는 아미노산 서열을 코딩하는 핵산을 포함하는 제2 벡터를 포함한다(예를 들어, 이러한 벡터로 형질전환된다). 한 실시양태에서, 숙주 세포는 진핵 세포, 예를 들어, 중국 햄스터 난소(CHO) 세포 또는 림프구 세포(예를 들어, Y0, NS0, Sp20 세포)이다. 한 실시양태에서, 숙주 세포는 원핵 세포, 예를 들어, 대장균 세포이다. 한 실시양태에서, 항-TREM1 항체를 제조하는 방법으로서, 상기 제공된 바와 같이 상기 항체를 코딩하는 핵산을 포함하는 숙주 세포를 항체의 발현에 적합한 조건 하에서 배양하는 단계, 및 임의로 상기 숙주 세포(또는 숙주 세포 배양 배지)로부터 상기 항체를 회수하는 단계를 포함하는 방법을 제공한다.
항체 코딩 벡터의 클로닝 또는 발현에 적합한 숙주 세포는 본원에 기재된 원핵 또는 진핵 세포를 포함한다. 예를 들어, 항체는 특히 글리코실화 및 Fc 이펙터 기능이 필요하지 않은 경우 박테리아에서 생성될 수 있다. 박테리아에서의 항체 단편 및 폴리펩티드의 발현에 대해서는, 예를 들어, 미국 특허 제5,648,237호, 제5,789,199호 및 제5,840,523호를 참조한다(대장균에서의 항체 단편의 발현을 설명하는 문헌[Charlton, Methods in Molecular Biology, Vol. 248 (B.K.C. Lo, ed., Humana Press, Totowa, NJ, 2003), pp. 245-254]도 참조). 발현 후, 항체는 박테리아 세포 페이스트로부터 가용성 분획으로 단리될 수 있으며 추가로 정제될 수 있다.
원핵생물 이외에, 글리코실화 경로가 "인간화"되어 부분적으로 또는 전체적으로 인간 글리코실화 패턴을 가진 항체의 생성을 야기하는 진균 및 효모 균주를 포함하는, 사상 진균 또는 효모와 같은 진핵 미생물도 항체 코딩 벡터에 적합한 클로닝 또는 발현 숙주이다. 문헌[Gerngross, Nat. Biotech. 22: 1409-1414 (2004)] 및 문헌[Li et al., Nat. Biotech. 24:210-215 (2006)]을 참조한다.
본 발명에 사용되기에 적합한 유형의 중국 햄스터 난소(CHO) 세포는 DHFR 선택 마커와 함께 사용될 수 있는 dhfr-CHO 세포, 예컨대, CHO-DG44 세포 및 CHO-DXB11 세포 또는 글루타민 합성효소 선택 마커와 함께 사용될 수 있는 CHOK1-SV 세포를 포함하는 CHO 및 CHO-K1 세포를 포함할 수 있다. 항체 발현에 사용되는 다른 세포 유형은 림프구 세포주, 예를 들어, NS0 골수종 세포 및 SP2 세포, COS 세포를 포함한다. 숙주 세포는 본 발명에 따른 단리된 폴리뉴클레오타이드 서열 또는 발현 벡터에 의해 안정하게 형질전환될 수 있거나 형질감염될 수 있다.
항체 생성 과정
본 발명은 또한 본 발명에 따른 항체를 제조하는 방법으로서, 본 발명에 따른 항체를 생성하기에 적합한 조건 하에서 본 발명에 따른 숙주 세포를 배양하는 단계, 및 상기 항체를 단리하는 단계를 포함하는 방법을 제공한다.
항체는 중쇄 또는 경쇄 폴리펩티드만을 포함할 수 있고, 이 경우 중쇄 또는 경쇄 폴리펩티드 코딩 서열만이 숙주 세포를 형질감염시키는 데 사용될 필요가 있다. 중쇄와 경쇄 둘 다를 포함하는 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 생성하기 위해, 세포주를 2개의 벡터, 즉 경쇄 폴리펩티드를 코딩하는 제1 벡터 및 중쇄 폴리펩티드를 코딩하는 제2 벡터로 형질감염시킬 수 있다. 대안적으로, 경쇄 및 중쇄 폴리펩티드를 코딩하는 서열을 포함하는 단일 벡터가 사용될 수 있다.
따라서, 숙주 세포를 배양하고 항체를 발현시키고, 항체를 단리하고 임의로 항체를 정제하여 단리된 항체를 제공하는 방법이 제공된다. 한 실시양태에서, 이 방법은 이펙터 분자를 단리된 항체에 접합시키는 단계를 추가로 포함한다.
본 발명은 본 발명에 따른 항체를 제조하는 방법으로서, 본 발명의 항체 분자를 코딩하는 DNA로부터 단백질의 발현을 유발하기에 적합한 조건 하에서 본 발명의 벡터를 함유하는 숙주 세포를 배양하는 단계, 및 상기 항체 분자를 단리하는 단계를 포함하는 방법도 제공한다.
항체 분자는 중쇄 또는 경쇄 폴리펩티드만을 포함할 수 있고, 이 경우 중쇄 또는 경쇄 폴리펩티드 코딩 서열만이 숙주 세포를 형질감염시키는 데 사용될 필요가 있다. 중쇄와 경쇄 둘 다를 포함하는 생성물을 생성하기 위해, 세포주를 2개의 벡터, 즉 경쇄 폴리펩티드를 코딩하는 제1 벡터 및 중쇄 폴리펩티드를 코딩하는 제2 벡터로 형질감염시킬 수 있다. 대안적으로, 경쇄 및 중쇄 폴리펩티드를 코딩하는 서열을 포함하는 단일 벡터가 사용될 수 있다.
본 발명에 따른 항체는 숙주 세포로부터 우수한 수준으로 발현된다. 따라서, 항체의 성질은 상업적 가공에 최적화된 것으로 보인다.
정제된 항체
한 실시양태에서, 실질적으로 정제된 형태, 특히 내독소 및/또는 숙주 세포 단백질 또는 DNA를 갖지 않거나 실질적으로 갖지 않는 형태의 정제된 항체, 예를 들어, 인간화 항체, 특히 본 발명에 따른 항체가 제공된다.
내독소를 실질적으로 갖지 않는다는 것은 일반적으로 항체 생성물 mg당 1 EU 이하, 예컨대, 생성물 mg당 0.5 또는 0.1 EU의 내독소 함량을 의미하기 위한 것이다.
숙주 세포 단백질 또는 DNA를 실질적으로 갖지 않는다는 것은 일반적으로 항체 생성물 mg당 400 ㎍ 이하, 예컨대, mg당 100 ㎍ 이하, 특히 적절하게는 mg당 20 ㎍의 숙주 세포 단백질 및/또는 DNA 함량을 의미하기 위한 것이다.
항체의 치료적 용도
본 발명의 항체, 이의 제제 또는 약학 조성물은 예방적 및/또는 치료적 치료를 위해 투여될 수 있다.
본 발명은 의약으로서 사용하기 위한 본 발명의 항-TREM1 항체 또는 이의 약학 조성물을 제공한다.
예방적 적용에서, 항체, 제제 또는 조성물은 질병 또는 이의 증상 중 하나 이상의 후속 효과를 예방하거나 감소시키기에 충분한 양으로 본원에 기재된 장애 또는 질병의 위험이 있는 대상체에게 투여된다.
치료적 적용에서, 항체는 질병 또는 이의 증상 중 하나 이상을 치유하거나, 완화하거나 부분적으로 저지하기에 충분한 양으로 본원에 기재된 장애 또는 질병을 이미 앓고 있는 대상체에게 투여된다. 이러한 치료적 치료는 질환 증상의 중증도를 감소시킬 수 있거나 무증상 기간의 빈도 또는 지속을 증가시킬 수 있다.
치료되는 대상체는 동물일 수 있다. 바람직하게는, 본 발명에 따른 약학 조성물은 인간 대상체에게 투여되도록 조정된다.
본 발명은 본원에 기재된 장애 또는 질병의 치료를 필요로 하는 대상체에서 이러한 장애 또는 질병을 치료하는 방법으로서, 본 발명에 따른 항체를 상기 대상체에게 투여하는 단계를 포함하는 방법을 제공한다. 이러한 항체는 치료 유효량으로 투여된다.
본 발명은 본원에 기재된 장애 또는 질병의 치료에 사용하기 위한 본 발명의 항체도 제공한다.
치료 적응증
본 발명의 항체는 TREM1 활성과 연관된 임의의 질병, 예를 들어, 전체적으로 또는 부분적으로 TREM1을 통한 신호전달로부터 비롯된 임의의 질병을 치료하거나, 예방하거나 완화하는 데 사용될 수 있다.
TREM1 및 이의 여러 경로는 다수의 신경학적 질병, 신경발달 질병, 정신과 질병, 전신성 질병 및 자가면역 염증성 질병과 관련되어 있다. 본 발명의 항체 및 조성물을 사용하여 치료할 수 있는 질병의 일부 예는 근위축성 측삭 경화증, 알츠하이머병(AD), 파킨슨병(PD), 타우병증 질환, 치매, 전두측두엽 치매, 혈관성 치매, 혼합 치매, 다계통 위축증, 복합 결절성 경화증 및 국소 피질 이형성증을 포함하는 간질, 헌팅톤병, 척수 손상, 외상성 뇌 손상, 만성 외상성 뇌병증, 허혈성 뇌졸중, 다발성 경화증, 자가면역 신경염, 조현병, 자폐 스펙트럼 장애, 주요 우울 장애, 양극성 장애, 유전 질병 또는 이들의 임의의 조합을 포함한다.
본 발명의 항체 및 조성물은 신경학적 장애를 치료하는 데 사용될 수 있다. 보다 구체적으로, 상기 신경학적 장애는 근위축성 측삭 경화증(ALS) 또는 알츠하이머병이다.
항체 및 이의 항원 결합 단편의 진단적 용도
본 발명은 또한 진단 활성 작용제로서 본 발명의 항체의 용도, 또는 예를 들어, 질환 또는 이의 중증도를 진단하기 위한 진단 어세이에서의 본 발명의 항체의 용도를 제공한다.
진단은 바람직하게는 생물학적 샘플에 대해 수행될 수 있다. "생물학적 샘플"은 개체로부터 수득되고 진단 또는 모니터링 어세이에 사용될 수 있는 다양한 유형의 샘플을 포괄한다. 이 정의는 뇌척수액, 혈액, 예컨대, 혈장 및 혈청, 및 생물학적 기원의 다른 액체 샘플, 예컨대, 소변 및 타액, 고체 조직 샘플, 예컨대, 생검 표본 또는 조직 배양물 또는 이로부터 유래한 세포 및 이의 자손을 포괄한다. 상기 정의는 샘플의 입수 후 임의의 방식으로, 예컨대, 시약을 사용한 처리, 용해, 또는 폴리뉴클레오타이드와 같은 특정 성분에 대한 농후화에 의해 조작된 샘플도 포함한다.
진단 시험은 바람직하게는 인간 또는 동물 신체와 접촉되지 않은 생물학적 샘플에 대해 수행될 수 있다. 이러한 진단 시험은 시험관내 시험으로서도 지칭된다. 시험관내 진단 시험은 대상체로부터 수득된 생물학적 샘플에서 TREM1을 검출하는 시험관내 방법에 의존할 수 있다.
약학 조성물 및 진단 조성물
본 발명의 항체는 약학 조성물로 제공될 수 있다. 약학 조성물은 일반적으로 멸균될 것이며 약학적으로 허용되는 보조제 및/또는 담체를 추가로 포함할 수 있다.
본 발명의 항체는 본원에 기재된 장애 또는 질병의 치료, 진단 및/또는 예방에 유용하기 때문에, 본 발명은 하나 이상의 약학적으로 허용되는 담체, 부형제 또는 희석제와 함께 본 발명에 따른 항체 또는 이의 항원 결합 단편을 포함하는 약학 또는 진단 조성물도 제공한다.
구체적으로, 상기 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 하나 이상의 약학적으로 허용되는 부형제, 희석제 또는 담체를 포함하는 약학 조성물로서 제공된다.
이 조성물은 치료 활성 성분(들) 이외에, 약학적으로 허용되는 부형제, 담체, 희석제, 완충제, 안정화제, 또는 당업자에게 잘 알려진 다른 물질을 포함할 수 있다. 이러한 물질은 독성이 없어야 하며 활성 성분의 효능을 방해해서는 안 된다.
또한, 본 발명의 항-TREM1 항체, 또는 본 발명의 항체를 코딩하는 서열을 포함하는 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 약학 제제를 비롯한 조성물이 제공된다. 특정 실시양태에서, 조성물은 본 발명의 하나 이상의 항체, 또는 본 발명의 하나 이상의 항체를 코딩하는 서열을 포함하는 하나 이상의 폴리뉴클레오타이드를 포함한다. 이 조성물은 당분야에 잘 알려진 적합한 담체, 예컨대, 완충제를 포함하는 약학적으로 허용되는 부형제 및/또는 보조제를 추가로 포함할 수 있다.
본 발명의 항체의 약학 조성물은 원하는 정도의 순도를 가진 이러한 항체를 동결건조된 제제 또는 수용액의 형태로 하나 이상의 임의적 약학적으로 허용되는 담체와 혼합함으로써 제조된다.
앞서 언급된 기법 및 프로토콜의 예는 문헌[Remington's Pharmaceutical Sciences, 20th Edition, 2000, pub. Lippincott, Williams & Wilkins]에서 발견될 수 있다.
약학적으로 허용되는 담체는 일반적으로 사용된 용량 및 농도에서 수용자에게 독성을 나타내지 않고, 완충제, 예컨대, 인산염, 구연산염 및 다른 유기산; 아스코르브산 및 메티오닌을 포함하는 항산화제; 보존제(예컨대, 옥타데실디메틸벤질 암모늄 클로라이드; 헥사메토늄 클로라이드; 벤즈알코늄 클로라이드; 벤즈에토늄 클로라이드; 페놀, 부틸 또는 벤질 알코올; 알킬 파라벤, 예컨대, 메틸 또는 프로필 파라벤; 카테콜; 레조르시놀; 사이클로헥산올; 3-펜탄올; 및 m-크레졸); 저분자량(약 10개 미만의 잔기) 폴리펩티드; 단백질, 예컨대, 혈청 알부민, 젤라틴 또는 면역글로불린; 친수성 중합체, 예컨대, 폴리비닐피롤리돈; 아미노산, 예컨대, 글리신, 글루타민, 아스파라긴, 히스티딘, 아르기닌 또는 라이신; 단당류, 이당류, 및 글루코스, 만노스 또는 덱스트린을 비롯한 다른 탄수화물; 킬레이팅제, 예컨대, EDTA; 당, 예컨대, 수크로스, 만니톨, 트레할로스 또는 소르비톨; 염 형성 반대 이온, 예컨대, 나트륨; 금속 착물(예를 들어, Zn-단백질 착물); 및/또는 비이온성 계면활성제, 예컨대, 폴리에틸렌 글리콜(PEG)을 포함하나 이들로 제한되지 않는다. 본원에서 예시적인 약학적으로 허용되는 담체는 간질성 약물 분산제, 예컨대, 가용성 중성 활성 히알루로니다제 당단백질(sHASEGP), 예를 들어, 인간 가용성 PH-20 히알루로니다제 당단백질, 예컨대, rHuPH20(HYLENEX®, Baxter International, Inc.)을 추가로 포함한다. rHuPH20을 포함하는 특정 예시적인 sHASEGP 및 사용 방법은 미국 특허 출원 공개 제2005/0260186호 및 제2006/0104968호에 기재되어 있다. 한 측면에서, sHASEGP는 콘드로이티나제와 같은 하나 이상의 추가 글리코사미노글리카나제와 조합된다.
활성 성분은 예를 들어, 코아세르베이션 기법 또는 계면 중합에 의해 제조된 마이크로캡슐, 예를 들어, 각각 콜로이드성 약물 전달 시스템(예를 들어, 리포좀, 알부민 마이크로스피어, 마이크로에멀젼, 나노입자 및 나노캡슐) 또는 마크로에멀젼 중의 하이드록시메틸셀룰로스 또는 젤라틴 마이크로캡슐 및 폴리-(메틸메타크릴레이트) 마이크로캡슐에 포획될 수 있다. 이러한 기법은 문헌[Remington's Pharmaceutical Sciences 16th edition, Osol, A. Ed. (1980)]에 개시되어 있다.
서방출 제제도 제조될 수 있다. 서방출 제제의 적합한 예는 항체를 함유하는 고체 소수성 중합체의 반투과성 매트릭스를 포함하고, 이 매트릭스는 성형품, 예를 들어, 필름 또는 마이크로캡슐의 형태로 존재한다.
생체내 투여에 사용되는 제제는 일반적으로 멸균된다. 멸균은 예를 들어, 멸균 여과막을 통한 여과에 의해 용이하게 달성될 수 있다.
본 발명의 약학 조성물은 하나 이상의 약학적으로 허용되는 염을 포함할 수 있다.
약학적으로 허용되는 담체는 수성 담체 또는 희석제를 포함한다. 본 발명의 약학 조성물에 사용될 수 있는 적합한 수성 담체의 예는 물, 완충수 및 식염수를 포함한다. 다른 담체의 예는 에탄올, 폴리올(예컨대, 글리세롤, 프로필렌 글리콜, 폴리에틸렌 글리콜 등) 및 이들의 적합한 혼합물, 식물성 오일, 예컨대, 올리브유, 및 주사 가능한 유기 에스테르, 예컨대, 에틸 올레이트를 포함한다. 많은 경우, 등장화제, 예를 들어, 당, 폴리알코올, 예컨대, 만니톨, 소르비톨 또는 염화나트륨을 조성물에 포함시키는 것이 바람직할 것이다.
약학 조성물은 전형적으로 제조 및 저장 조건 하에서 멸균 상태이고 안정해야 한다. 조성물은 용액, 마이크로에멀젼, 리포좀, 또는 높은 약물 농도에 적합한 다른 정렬된 구조로서 제제화될 수 있다.
한 실시양태에서, 본 발명의 항체는 유일한 활성 성분이다. 또 다른 실시양태에서, 본 발명의 항체는 하나 이상의 추가 활성 성분과 조합된다. 대안적으로, 약학 조성물은 유일한 활성 성분인 본 발명의 항체를 포함하고, 다른 작용제, 약물 또는 호르몬과 함께(예를 들어, 동시에, 순차적으로 또는 별도로) 환자에게 개별적으로 투여될 수 있다.
담체 또는 다른 물질의 정확한 성질은 투여 경로, 예를 들어, 경구, 정맥내, 피부 또는 피하, 비강, 근육내 및 복강내 경로에 의해 좌우될 수 있다. 예를 들어, 고체 경구 제형은 희석제, 예를 들어, 락토스, 덱스트로스, 사카로스, 셀룰로스, 옥수수 전분 또는 감자 전분; 활택제, 예를 들어, 실리카, 활석, 스테아르산, 스테아르산마그네슘 또는 스테아르산칼슘, 및/또는 폴리에틸렌 글리콜; 결합제, 예를 들어, 전분, 아라비아 검, 젤라틴, 메틸셀룰로스, 카르복시메틸셀룰로스 또는 폴리비닐 피롤리돈; 붕해제, 예를 들어, 전분, 알긴산, 알기네이트 또는 나트륨 전분 글리콜레이트; 발포성 혼합물; 염료; 감미제; 습윤제, 예컨대, 레시틴, 폴리소르베이트, 라우릴설페이트; 및 일반적으로 약학 제제에 사용되는 무독성 및 약리학적 불활성 물질을 활성 성분과 함께 함유할 수 있다. 이러한 약학 제제는 공지된 방식, 예를 들어, 혼합, 과립화, 타정, 당 코팅 또는 필름 코팅 과정에 의해 제조될 수 있다.
경구 제제는 예를 들어, 약학 등급의 만니톨, 락토스, 전분, 스테아르산마그네슘, 사카린나트륨, 셀룰로스, 탄산마그네슘 등과 같은 일반적으로 사용되는 부형제를 포함한다. 이 조성물은 용액, 현탁액, 정제, 환제, 캡슐제, 지속 방출 제제 또는 산제의 형태를 취하고 10% 내지 95%, 바람직하게는 25% 내지 70%의 활성 성분을 함유한다. 약학 조성물이 동결건조되는 경우, 동결건조된 물질은 투여 전에, 예를 들어, 현탁액으로서 재구성될 수 있다. 재구성은 바람직하게는 완충제에서 수행된다.
정맥내 투여 또는 주입을 위한 용액은 예를 들어, 멸균수를 담체로서 함유할 수 있거나 바람직하게는 멸균 수성 등장성 식염수 용액의 형태로 존재할 수 있다.
바람직하게는, 약학 또는 진단 조성물은 본 발명에 따른 인간화 항체를 포함한다.
치료 유효량 및 용량 결정
본 발명에 따른 항체 및 약학 조성물은 필요한 치료 유효량을 확인하기 위해 환자에게 적절하게 투여될 수 있다. 임의의 항체에 대한 치료 유효량은 처음에는 세포 배양 어세이 또는 동물 모델, 통상적으로 설치류, 토끼, 개, 돼지 또는 영장류에서 추정될 수 있다. 적절한 농도 범위와 투여 경로를 결정하기 위해 동물 모델을 사용할 수도 있다. 그 다음, 이러한 정보를 사용하여 인간에게 투여하기에 유용한 용량 및 경로를 결정할 수 있다.
인간 대상체를 위한 정확한 치료 유효량은 질환 상태의 중증도, 대상체의 일반적인 건강, 대상체의 연령, 체중 및 성별, 식습관, 투여의 시간 및 빈도, 약물 조합(들), 반응 민감성 및 치료에 대한 내성/반응에 의해 좌우될 것이다. 조성물은 용량당 소정의 양의 본 개시내용의 활성제를 함유하는 유닛 용량 형태로 편리하게 제공될 수 있다. 본원에 기재된 실시양태들 중 임의의 실시양태를 위한 용량 범위 및 용법은 1 mg 내지 1000 mg 유닛 용량 범위의 용량을 포함하나 이들로 제한되지 않는다.
본 발명의 항체 또는 약학 조성물의 적합한 용량은 숙련된 의료 전문가에 의해 결정될 수 있다. 본 발명의 약학 조성물에서 활성 성분의 실제 용량 수준은 환자에게 독성을 야기하지 않으면서 특정 환자, 조성물 및 투여 방식에 대해 원하는 치료 반응을 달성하는 데 효과적인 활성 성분의 양을 얻도록 변경될 수 있다. 선택된 용량 수준은 사용된 본 발명의 구체적인 조성물의 활성, 투여 경로, 투여 시간, 사용되는 구체적인 화합물의 배출 속도, 투여의 지속시간, 사용되는 구체적인 조성물과 함께 사용되는 다른 약물, 화합물 및/또는 물질, 치료되는 환자의 연령, 성별, 체중, 상태, 일반적인 건강 및 이전 병력, 및 의학 분야에 잘 알려진 유사한 요인을 비롯한 다양한 약동학적 요인에 의해 좌우될 것이다.
적합한 용량은 예를 들어, 치료되는 환자의 체중 kg당 약 0.01 ㎍ 내지 약 1000 mg, 전형적으로 체중 kg당 약 0.1 ㎍ 내지 약 100 mg의 범위 내에 있을 수 있다.
최적의 원하는 반응(예를 들어, 치료 반응)을 제공하기 위해 용량 용법을 조절할 수 있다. 예를 들어, 단일 용량이 투여될 수 있거나, 여러 분할된 용량이 시간 경과에 따라 투여될 수 있거나, 치료 상황의 긴급성에 의해 표시될 때 용량이 비례적으로 감소될 수 있거나 증가될 수 있다. 본원에서 사용된 용량 유닛 형태는 치료될 대상체에 대한 단위 용량으로서 적합한 물리적으로 분리된 유닛을 의미하고; 각각의 유닛은 원하는 치료 효과를 생성하도록 계산된 소정의 양의 활성 화합물을 요구된 약학 담체와 함께 함유한다.
약학 조성물 또는 제제의 투여
본원에 기재된 항체 또는 이의 제제 또는 조성물은 예방적 및/또는 치료적 치료를 위해 투여될 수 있다.
본 발명의 항체 또는 약학 조성물은 당분야에 알려진 다양한 방법들 중 하나 이상의 방법을 이용함으로써 하나 이상의 투여 경로를 통해 투여될 수 있다. 당업자가 인식할 바와 같이, 투여 경로 및/또는 방식은 원하는 결과에 따라 달라질 것이다. 본 발명의 항체 또는 약학 조성물의 투여 경로의 예는 예를 들어, 주사 또는 주입에 의한 정맥내, 근육내, 피내, 안구내, 복강내, 피하, 척수 또는 다른 비경구 투여 경로를 포함한다. 대안적으로, 본 발명의 항체 또는 약학 조성물은 비경구 경로, 예컨대, 국소, 표피 또는 점막 투여 경로를 통해 투여될 수 있다. 본 발명의 항체 또는 약학 조성물은 경구 투여용일 수 있다.
투여에 적합한 형태는 정맥내, 흡입 가능한 또는 피하 형태로, 예를 들어, 주사 또는 주입에 의한, 예를 들어, 볼루스 주사 또는 연속 주입에 의한 비경구 투여에 적합한 형태를 포함한다. 생성물이 주사용 또는 주입용인 경우, 생성물은 유성 또는 수성 비히클 중의 현탁액, 용액 또는 에멀젼의 형태를 취할 수 있으며 추가 작용제, 예컨대, 현탁제, 보존제, 안정화제 및/또는 분산제를 함유할 수 있다. 대안적으로, 본 발명에 따른 항체 또는 이의 항원 결합 단편은 사용 전에 적절한 멸균 액체에 의해 재구성될 건조된 형태로 존재할 수 있다. 주사 전 액체 비히클 중의 용액 또는 현탁액에 적합한 고체 형태도 제조될 수 있다.
일단 제제화되면, 본 발명의 약학 조성물은 대상체에게 직접 투여될 수 있다. 따라서, 본원은 의약의 제조를 위한 본 발명에 따른 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 용도를 제공한다.
제품 및 키트
본 개시내용은 본 발명의 항-TREM1 항체 및 사용 설명서를 포함하는 키트도 제공한다. 이 키트는 앞서 논의된 바와 같이 하나 이상의 추가 시약, 예컨대, 추가 치료제 또는 예방제를 추가로 함유할 수 있다.
본 발명은 의약의 제조를 위한 본 발명에 따른 항체 또는 이의 약학 조성물의 용도를 제공한다.
본 발명은 또한 본원에 기재된 장애 또는 질병의 치료를 위한 의약의 제조를 위한 본 발명의 항체의 용도를 제공한다.
특정 실시양태에서, 제품 또는 키트는 본 발명의 항체 또는 본원에 기재된 조성물 중 하나 이상을 함유하는 용기를 포함한다. 특정 실시양태에서, 제품 또는 키트는 본원에 기재된 항체 또는 조성물 중 하나(또는 더 많은 수)를 코딩하는 핵산(들)을 함유하는 용기를 포함한다. 일부 실시양태에서, 키트는 본원에 기재된 항체를 생성하는 세포 또는 세포주를 포함한다.
특정 실시양태에서, 제품 또는 키트는 용기, 및 용기 상에 있거나 용기와 회합된 표지 또는 포장 삽입물을 포함한다. 적합한 용기는 예를 들어, 병, 바이알, 주사기, IV 용액 백 등을 포함한다. 용기는 유리 또는 플라스틱과 같은 다양한 재료로부터 형성될 수 있다. 용기는 그 자체로 존재하거나 치료, 예방 및/또는 진단에 효과적인 다른 조성물과 조합된 조성물을 보유하고 멸균 출입구를 가질 수 있다. 조성물에서 적어도 하나의 작용제는 본 발명의 항체이다. 표지 또는 포장 삽입물은 조성물이 본원에 기재된 장애 또는 질병의 치료에 사용된다는 것을 표시한다.
앞서 언급된 실시양태는 본 발명을 제한하기보다는 예시하며, 당업자는 청구범위를 벗어나지 않으면서 많은 대안적 실시양태를 설계할 수 있을 것임을 인지해야 한다. 청구범위에서, 괄호 사이에 표시된 임의의 참조 부호는 청구범위를 제한하는 것으로서 해석되어서는 안 된다.
본 발명에 포함된 서열은 표 6 및 7에 제시되어 있다:
실시예
실시예 1: TREM1 단백질의 생성
N-말단 헥사히스티딘 SUMO(작은 유비퀴틴 관련 변형제) 가용성 태그(CID101907)와 융합된 인간 TREM1 IgV 유사 도메인을 대장균 BL21(DE3)에서 발현시켰다. 박테리아를 원심분리로 수거하고, 100 mM Tris(pH 8), 300 mM NaCl, 250 U 벤조나제(Benzonase), 1 PI 탭(tab)에 재현탁하고 초음파처리로 용해시켰다. 용해물을 42,000 RPM(Ti45) 및 4℃에서 45분 동안 원심분리하여 정화하고 5 ㎖ HiTrap Ni 킬레이팅 컬럼에 적용하였다. 컬럼을 5 CV에 걸쳐 100 mM Tris(pH 8), 300 mM NaCl로 세척하였다. 결합된 TREM1 단백질을 15 CV에 걸쳐 선형 구배 2% 내지 60% 100 mM Tris(pH 8), 300 mM NaCl, 500 mM 이미다졸 완충제로 용출한 후, 4 CV에 걸쳐 100% 완충제 B로 용출하였다. TREM1을 함유하는 분획을 모아 100 mM Tris(pH 8), 300 mM NaCl 내로 투석하고(10 kDa MWCO) 4℃에서 밤새 ULP-1로 분해하였다. 절단된 단백질을 5 ㎖ HiTrap Ni 킬레이팅 컬럼에 적용하고 유동 통과 분획을 모아 비바스핀(Vivaspin) PES Turbo, 10 kDa MWCO 농축기에서 농축하였다. 그 다음, 수퍼덱스(superdex) s75 컬럼(GE Healthcare)을 사용하여 절단된 IgV 단백질을 세정하고 100 mM Tris(pH 8.0), 300 mM NaCl, 0.5 mM EDTA로 완충제 교환하였다. 나노드롭(Nanodrop) UV 분광측정기로 280 nm 흡광도를 측정하여 최종 단백질 농도를 확인하였다. 도데실황산나트륨 폴리아크릴아미드 겔 전기영동(SDS-PAGE)으로 단백질 순도를 평가하였다.
천연 N-말단 신호 서열 및 C-말단 아비딘 친화성 태그(AVI), TEV 프로테아제 절단 부위 및 HKH 친화성 태그를 함유하는 인간(CID101904) 및 사이노(CID101953) TREM1 세포외 도메인(ECD) 둘 다를 포유동물 HEK 세포에서 발현시켰다. 배지를 접선 유동 여과(TFF)에 통과시키고 HiTrap Ni 킬레이팅 5 ㎖ 컬럼에 적용하고 100 mM HEPES(pH 7.0), 300 mM NaCl로 세척하였다. 결합된 TREM1 단백질을 각각 4 CV에 걸쳐 2% 내지 60%에 이어 100% 100 mM HEPES(pH 7.0), 300 mM NaCl, 500 mM 이미다졸 선형 구배로 용출하였다. TREM1을 함유하는 분획을 모아 비바스핀 PES Turbo, 10 kDa MWCO 농축기에서 농축하였다. 그 다음, 세파크릴(sephacryl) s300 컬럼을 사용하여 단백질을 세정하고 50 mM HEPES(pH 7.0), 250 mM NaCl로 완충제 교환하였다. 최종 단백질 농도 및 순도를 전술된 바와 같이 평가하였다.
천연 N-말단 신호 서열 및 절단 불가능한 C-말단 his 태그를 함유하는 인간 PGLYRP1(CID101951)을 포유동물 HEK 세포에서 발현시켰다. 배지를 HiTrap Ni Excel 2 x 5 ㎖ 컬럼에 적용하고 100 mM HEPES(pH 7.0), 300 mM NaCl로 세척하였다. 결합된 PGLYRP1 단백질을 각각 4 CV에 걸쳐 0% 내지 60%에 이어 100% 100 mM HEPES(pH 7.0), 300 mM NaCl, 500 mM 이미다졸 선형 구배로 용출하였다. PGLYRP1을 함유하는 분획을 모으고 비바스핀 PES Turbo, 10 kDa MWCO 농축기에서 농축하였다. 그 다음, 수퍼덱스 S200 컬럼을 사용하여 단백질을 세정하고 PBS(pH 7.0)로 완충제 교환하였다. 최종 단백질 농도 및 순도를 전술된 바와 같이 평가하였다.
실시예 2. 치료 항-TREM1 항체 12172의 생성 및 선택
세포 표면에서 인간 TREM1을 일시적으로 발현하는 3x107개의 토끼 섬유모세포로 한 마리의 암컷 뉴질랜드 백색 토끼를 피하 예방접종하였다. 전기천공을 통해 세포를 형질감염시키고 항-TREM1 항체(R&D FAB1278P)를 사용하여 유세포분석으로 TREM1의 발현을 검증하였다. 세포를 사용한 예방접종과 동시에 동등한 부피의 완전 프로인트 면역보강제를 별도의 부위에서 토끼에 피하 주사하였다.
세포 표면에서 인간 TREM1을 일시적으로 발현하는 토끼 섬유모세포를 사용한 2회 부스터 주사를 14일 간격으로 토끼에게 제공하였다. 각각의 예방접종 전에 귀 정맥으로부터 헤파린처리된 혈액(200 ㎕)을 채취하였다. 벤치 탑 원심분리기에서 5분 동안 10,000 rpm으로 회전시킨 후 혈액로부터 혈청을 모아 -20℃에서 동결시켰다. 제조된 후 B 세포 발견 목적을 위해 요구될 때까지 -80℃에서 10% DMSO/FCS에 냉동된 비장, 림프절, 골수 및 말초 혈액 단핵 세포의 단일 세포 현탁액을 사용하여 최종 부스팅한 지 14일 후 종료하였다. 종료 시 혈액을 다시 채취하고 전술된 바와 같이 혈청을 준비하였다.
문헌[Tickle et al. (2015) in J Biomol Screen 20(4):492-7]에 기재된 방법을 이용하여 기억 B 세포 배양을 설정하였고, TTP 랩테크 미러볼(Labtech Mirrorball) 시스템 상의 세포 기반 어세이에서 인간 및 사이노몰구스 TREM1에 결합하는 능력에 대해 상청액을 먼저 스크리닝하였다. 세포 기반 어세이는 인간 TREM1 또는 사이노몰구스 TREM1 DNA로 일시적으로 형질감염시킨 HEK 293 세포를 사용하는 균질한 다중체 어세이였고, 관련 없는 DNA로 일시적으로 형질감염시킨 HEK 293 세포에 대해 반대 스크리닝하였다. 세포를 VybrantTM DIO 또는 DIL 표지부착(ThermoFisher), 및 표시제로서 염소 항-토끼 Fc-AF647 접합체로 염색하였다.
총 20 x 200 플레이트 B 세포 배양 실험으로부터 대략 7000개의 TREM1 특이적 양성 히트를 1차 미러볼 스크린에서 확인하였다. 그 다음, 해리 속도를 추정하기 위해 비아코어에서의 프로파일링에 의한 추가 특징규명을 이 어세이로부터의 양성 상청액에 대해 수행하였다.
형광 초점 방법 및 단일 세포 역전사(RT) 및 PCR(RT-PCR)을 이용한 V 영역 유전자 회수를, 300초 해리 단계의 조사 동안 25% 미만의 결합 상실을 초래하는 해리 속도를 가진 웰에 대해 수행하였다.
선별된 세포의 역전사(RT) 및 PCR 후, 항체의 V 영역을 코딩하는 '전사 활성 PCR'(TAP) 생성물을 생성하고 HEK-293 세포를 일시적으로 형질감염시키는 데 사용하였다. 재조합 항체를 함유하는 생성된 TAP 상청액을 ELISA로 인간(CID101904; 서열번호 7) 및 사이노몰구스(CID101953; 서열번호 8) TREM1 세포외 도메인(실시예 1에 기재된 바와 같이 생성됨)에 결합하는 능력에 대해 시험하였고, 비아코어에서 적어도 1000 pM의 친화성으로 인간 sTREM1에 결합하는 능력에 대해 시험하였고, THP1 단핵구 TREM1/DAP12 NF-κB 루시퍼라제 리포터 세포 어세이에서 PGLYRP1 매개 신호전달을 차단하는 능력에 대해 시험하였다.
인간 TREM1을 통한 PGLYRP1/PGN 매개 NF-κB 신호전달 활성화를 억제하는 항체의 능력으로 기능성을 평가하였다. 이를 위해, THP1 단핵구 TREM1/DAP12 NF-κB 루시퍼라제 리포터 세포를 사용하였다(UCB에서 생성됨). 이 세포는 인간 TREM1, 인간 DAP12 및 NF-κB 루시퍼라제 리포터 유전자를 안정적으로 발현한다. 대장균의 가용성 펩티도글리칸(PGN)과 복합체를 형성한 PGLYRP1을, TREM1에 결합하여 NF-κB 활성화를 유도하는 TREM1 리간드로서 사용하였다. TREM1에 결합하지 않는 PGN도 NF-κB 활성화를 유도하지만, 그 정도는 덜하고 대안적 신호전달 경로를 통해 유도한다. 루시퍼라제 활성의 억제는 이 시스템에서 항체의 기능적 차단 활성을 입증한다.
표준 조직 배양 기법을 이용하여 선택 항생제를 함유하는 완전 배지(RPMI + 10% FBS + 50 μM 2-머캡토에탄올 + 10 ㎍/㎖ 블라스티시딘 + 1 ㎍/㎖ 퓨로마이신 + 200 ㎍/㎖ 제네티신)에서 THP1 단핵구 TREM1/DAP12 NF-κB 루시퍼라제 리포터 세포를 배양하였다. 어세이 설정 3일 전, 세포를 T175 플라스크 내의 50 ㎖ 완전 배지에 10x106개의 세포로 시딩하고(200,000개 세포/㎖) 인큐베이터에 편평하게 놓았다. 어세이 당일, 세포를 플라스크로부터 꺼내어 50 ㎖ 팔콘(falcon)으로 옮기고 300 x g에서 5분 동안 원심분리하였다. 배지를 제거하고 세포를 5 내지 10 ㎖의 완전 배지에 재현탁하고 계수하였다. 그 다음, 세포 현탁액을 완전 배지에 첨가하여 세포를 1x106개 세포/㎖로 재현탁하고, 10 ㎕/웰을 어세이 플레이트(Corning #3570)에 첨가하였다. 항체를 384웰 희석 플레이트(Greiner #781281) 내의 완전 배지로 연속 희석하였다. 그 다음, 항체의 연속 희석액을 어세이 플레이트(10 ㎕/웰)로 옮기고 어세이 플레이트를 37℃/5% CO2에서 1시간 동안 인큐베이션하였다. 실온의 멸균 DPBS에서 1시간 동안 재조합 인간 PGLYRP1(R&D Systems #2590-PGB)과 PGN(Invivogen #tlrl-ksspgn)의 복합체를 형성하였다. 1시간 후, 용액을 완전 배지로 희석한 다음, 2.5 ㎍/㎖ PGLYRP1 및 10 ㎍/㎖ PGN의 최종 어세이 농도까지 어세이 플레이트(10 ㎕/웰)로 옮겼다. 플레이트 대조군(항체가 첨가되지 않음)은 각각 어세이 최대 값 및 최소 값으로서 PGLYRP1/PGN 복합체 및 PGN 단독을 포함하였다. 이어서, 어세이 플레이트를 37℃/5% CO2에서 16시간 ± 2시간 동안 인큐베이션하였다. 인큐베이션 후, 스테디글로(SteadyGlo) 루시퍼라제 어세이 시스템(Promega #E2520)을 사용하여 루시퍼라제 활성을 측정하였다. 스테디글로 시약을 제조업체의 설명서에 따라 제조하고 30 ㎕/웰을 어세이 플레이트에 첨가하였다. 그 다음, 플레이트를 200 x g에서 3분 동안 원심분리한 후, 실온에서 추가 2분 동안 인큐베이션하여, 스테디글로 시약을 사용한 총 인큐베이션 시간이 5분이 되게 하였다. 그 다음, 시너지 네오(Synergy Neo) 2 플레이트 판독기를 이용하여 발광을 측정하고 원시 발광 값을 사용하여 대조군 웰에 비해 상대적 억제율을 측정하였다. 액티비티베이스(ActivityBase) v9.4를 이용하여 4PL 곡선 피팅 및 IC50 값의 계산을 수행하였다.
이어서, 관심 있는 TAP 생성물로부터의 중쇄 및 경쇄 가변 영역 유전자 쌍을 토끼 IgG 항체로서 클로닝하고 HEK-293 일시적 발현 시스템에서 재발현시켰다. 총 144개의 V 영역이 클로닝되었다. 그 후, 재조합 클로닝된 항체를 ELISA로 인간 및 사이노몰구스 TREM1에 결합하는 능력에 대해 재시험하고, 비아코어에서 결합에 대해 재시험하고, NF-κB 루시퍼라제 리포터 세포 어세이에서 PGLYRP1+PGN 매개 신호전달의 억제에 대해 재시험하였다. 인간 TREM1 알라닌 돌연변이체 어레이(TREM1 억제 항체에 대해 아래에 추가로 설명된 바와 동일한 접근법)를 사용하여 알려진 TREM1 리간드 PGLYRP1의 리간드 결합 부위를 특징규명한 후, 동일한 결합 부위에 결합하는 항체가 직접적인 리간드 차단을 통해 TREM1 기능을 조절한다고 추정하였다. 기능을 부여하는 TREM1의 대안적 항체 결합 부위를 확인하기 위해, NF-κB 루시퍼라제 리포터 세포 어세이에서 TREM1 활성을 억제하는 것으로 입증된 항체를, 인간 TREM1 알라닌 돌연변이체 어레이를 이용하여 에피토프 위치에 대해 평가하였다.
인간 TREM1 IgV 도메인 돌연변이체 클론의 어레이가 생성되었다. 이 어레이는 알라닌으로 돌연변이된 근접한 3개의 표면 잔기를 각각 가진 58개의 클론; 알라닌으로 돌연변이된 근접한 2개의 표면 잔기를 각각 가진 65개의 클론; 또는 알라닌으로 돌연변이된 단일 표면 잔기를 각각 가진 63개의 클론으로 구성되었다. 모든 어레이는 야생형 인간 TREM1 클론을 포함하였다. 야생형을 포함하는 돌연변이체 인간 TREM1 어레이 클론의 서열은 표 8, 9 및 10에 제시되어 있다.
상기 클론 각각을 인간 Fc 도메인에 융합된 삼중 알라닌 링커가 뒤따르는 TREM1 IgV 도메인으로 구성된 융합 단백질로서 발현시켰다. 클론 각각을 항-인간 Fc 항체로 코팅된 센서에 포획하였다. 그 후, 상기 센서를 관심 있는 항체가 함유된 용액에 담갔다. 생물층 간섭측정(BLI) 기기(Octet RED384 또는 Octet HTX, ForteBio)를 이용하여 결합 동역학을 모니터링하였다.
돌연변이체 TREM1 클론 각각에 대한 항체의 결합 동역학을 모니터링하고 이를 야생형 단백질에 대한 동역학과 비교함으로써, 에피토프를 추론할 수 있었다. 항체 해리 속도 상수의 증가 또는 항체와 단백질의 결합의 상실은 그 클론에서 돌연변이된 잔기가 항체 결합에 중요하므로 그의 에피토프의 일부임을 시사하였다.
12172 항체를 TREM1 활성의 강력한 억제제로서 선택하였다. 흥미롭게도, 알라닌 스캐닝 접근법은 이 분자가 확인된 PGLYRP1 리간드 결합 부위로부터 멀리 떨어진 에피토프를 보유함을 입증하였다. 이어서, 이것을 리드(lead) 분자로서 선택하였다.
상기 방법을 이용하고 세 가지 어레이 모두를 고려하여, 12172 항체의 핵심 에피토프 잔기가 잔기 E26, E27, K28, Y29, E30, L31, K32 및 Q35임을 확인하였다(이때 넘버링은 서열번호 1에 따른다).
실시예 3: 항체 인간화
토끼 V 영역의 CDR을 인간 생식세포계열 항체 V 영역 프레임워크에 이식함으로써 항체 12172를 인간화하였다. 항체의 활성을 회복하기 위해, 토끼 V 영역의 다수의 프레임워크 잔기들도 인간화 서열에서 유지되었다. 국제 특허 출원 공개 제WO91/09967호(Adair et al.)에 요약된 프로토콜을 이용하여 이 잔기들을 선택하였다. 토끼 항체(공여자) V 영역 서열과 인간 생식세포계열(수용자) V 영역 서열의 정렬은 설계된 인간화 서열과 함께 도 1 및 2에 제시되어 있다. 공여자로부터 수용자 서열로 이식된 CDR은 조합된 초티아/카바트 정의가 사용되는 CDR-H1을 제외하고 카바트(Kabat et al., 1987)에 의해 정의된 바와 같다(국제 특허 출원 공개 제WO91/09967호(Adair et al.) 참조).
인간 V 영역 IGKV1-9 + IGKJ4 J 영역(IMGT, http://www.imgt.org/)을 항체 12172 경쇄 CDR에 대한 수용자로서 선택하였다. (서열번호 25를 기준으로) 잔기 1, 2 및 3을 포함하는 군으로부터의 0개, 1개, 2개 또는 3개의 잔기를 제외하고, 인간화 이식편 변이체의 경쇄 프레임워크 잔기는 모두 인간 생식세포계열 유전자로부터 유래하고, 이때 공여자 잔기 알라닌(A1), 발린(V2) 및 발린(V3)은 각각 유지되었다(도 1 및 표 11).
인간 V 영역 IGHV3-66 + IGHJ4 J 영역(IMGT, http://www.imgt.org/)을 항체 12172의 중쇄 CDR에 대한 수용체로서 선택하였다. 많은 토끼 항체들과 마찬가지로, 항체 12172의 VH 유전자는 선택된 인간 수용자보다 더 짧다. 인간 수용자 서열과 정렬될 때, 항체 12172의 VH 영역의 프레임워크 1은 인간화 항체에서 유지되는 N-말단 잔기를 결여한다(도 2). 12172 토끼 VH 영역의 프레임워크 3도 베타 시트 가닥 D와 E 사이의 루프에서 2개의 잔기(서열번호 45를 기준으로 75 및 76)를 결여한다: 인간화 이식편 변이체에서 상기 갭은 선택된 인간 수용자 서열로부터의 상응하는 잔기(라이신 75, K75; 아스파라긴 76, N76)로 채워진다(도 2). (서열번호 45를 기준으로) 잔기 23, 48, 49, 71, 73 및 78을 포함하는 군으로부터의 하나 이상의 잔기를 제외하고, 인간화 이식편 변이체의 중쇄 프레임워크 잔기는 모두 인간 생식세포계열 유전자로부터 유래하고, 이때 공여자 잔기 트레오닌(T23), 이소류신(I48), 글리신(G49), 라이신(K71), 세린(S73) 및 발린(V78)은 각각 유지되었다.
다수의 변이체 중쇄 및 경쇄 V 영역 서열을 코딩하는 유전자는 ATUM(미국 캘리포니아주)에 의해 자동화 합성 접근법에 의해 설계되고 구축되었다. 올리고뉴클레오타이드 지정 돌연변이유발로 VH 및 VK 유전자를 변형시킴으로써 중쇄 및 경쇄 V 영역의 추가 변이체를 생성하였다. 포유동물 세포에서 일시적으로 발현시키기 위해, 인간화 경쇄 V 영역 유전자를, 인간 카파 쇄 불변 영역(Km3 알로타입)을 코딩하는 DNA를 함유하는 UCB 경쇄 발현 벡터 pMhCK에 클로닝하였다. 인간화 중쇄 V 영역 유전자를, 힌지 안정화 돌연변이 S228P를 가진 인간 감마-4 중쇄 불변 영역을 코딩하는 DNA를 함유하는 UCB 인간 감마-4 중쇄 발현 벡터 pMhγ4PFL(Angal S., King D.J., Bodmer M.W., Turner A., Lawson A.D.G., Roberts G., Pedley B. and Adair J.R. A single amino acid substitution abolishes the heterogeneity of chimeric mouse/human (IgG4) antibody. Mol. Immunol.1993, 30 (1):105-8), 또는 Fc 감마 수용체(FcγR)와의 결합을 감소시키기 위한 돌연변이 L234A 및 L235A를 가진 인간 감마-1 중쇄 불변 영역을 코딩하는 DNA를 함유하는 UCB 감마-1 LALA 중쇄 발현 벡터 pMhγ1 L234A L235A(Canfield S.M. and Morrison S.L. The Binding affinity of Human IgG for its High Affinity Fc Receptor Is Determined by Multiple Amino Acids in the CH2 Domain and Is Modulated by the Hinge Region. J. Exp. Med. 1991, 173:1483-1491)에 클로닝하였다. ExpiFectamine™ 293 형질감염 시약(A14525, ThermoFisher Scientific)을 사용하여 Expi293™ 현탁 세포 내로의 생성된 중쇄 및 경쇄 벡터의 공-형질감염을 달성하고 인간화 재조합 IgG4P 및 IgG1 LALA 항체의 발현을 제공하였다.
변이체 인간화 항체 쇄 및 이의 조합을 발현시키고 모 항체에 비해 인간 TREM1에 대한 이들의 결합 친화성을 평가하고, 형광 기반 열 변동 어세이(실시예 13에 기재됨)로 이들의 열 안정성을 평가하고, AC-SINS(실시예 17에 기재된 친화성 포획 자가-상호작용 나노입자 분광법)로 자가-상호작용하는 성향을 평가하였다. 표면 플라즈몬 공명으로 측정하였을 때, 이식편 gH11에서 VH 프레임워크 공여자 잔기 I48, G49 및 K71의 유지는 인간 TREM1에 대한 최고 친화성 결합에 필수적이었다(표 11). 이식편 gL2의 경쇄 프레임워크 잔기는 모두 인간 생식세포계열 유전자로부터 유래하였다. 이식편 gL6에서 VL 공여자 잔기 V3의 유지는 AC-SINS 어세이로 측정하였을 때 자가-상호작용하는 성향을 감소시켰다(표 22).
열 언폴딩(변성)에 대한 저항성은 입체구조적 안정성 및 장기간 저장 안정성의 지표이다. 인간화 IgG4P 항체는 73.5℃ 내지 74.6℃의 범위에서 Fab 도메인에 대한 언폴딩의 중간점(Tm)을 가짐으로써 우수한 열 안정성을 가진다(표 11).
분자 자가-상호작용은 특히 치료 mAb의 피하 투여에 사용되는 높은 단백질 농도에서 천연 상태 응집 및 좋지 않은 용해도로 이어질 수 있다. 항체 Fv 도메인의 순 전하는 이소타입 특이적 방식으로 pH 7.4 및 pH 5.0에서 인간 IgG의 천연 상태 응집에 영향을 미치는 것으로 밝혀졌다(Heads JT, Lamb R, Kelm S, Adams R, Elliott P, Tyson K, Topia S, West S, Nan R, Turner A, Lawson ADG. Electrostatic interactions modulate the differential aggregation propensities of IgG1 and IgG4P antibodies and inform charged residue substitutions for improved developability. Protein Eng Des Sel. 2019 Dec 31;32(6):277-288. doi: 10.1093/protein/gzz046. PMID: 31868219; PMCID: PMC7036597). AC-SINS 어세이에 의해 측정된 높은 Δλmax 값(본 실시예의 표 12 및 실시예 17의 표 22)으로 표시되는, 인간화 12172 hIgG4P 항체의 자가-상호작용 성향을 감소시키기 위해, 양으로 하전된 잔기를 중성 또는 음으로 하전된 잔기로 돌연변이시킴으로써 Fv 도메인의 순 양전하를 감소시켰다. 국제 특허 출원 공개 제WO2019/234094호(Heads et al (2019))에 요약된 이론적 근거를 이용하여 이 잔기들을 선택하였다. 이식편 gL9 및 gL11에서 인간화 경쇄 이식편 12712gL2(서열번호 29)의 잔기 18 및 50을 각각 아르기닌(R18)에서 세린(S18)으로, 그리고 라이신(K50)에서 세린(S50)으로 돌연변이시켰다. 이식편 gH26, gH48 및 gH49에서 인간화 중쇄 이식편 12172gH11(서열번호 79)의 잔기 75를 각각 라이신(K75)에서 세린(S75), 글루타민(Q75) 또는 글루탐산(E75)으로 돌연변이시켰다. 변형된 중쇄 및 경쇄 유전자를 함께 Expi293™ 현탁 세포에서 일시적으로 발현시켰고, 재조합 IgG4P 항체를 인간 TREM1에 대한 그의 결합 친화성, 열 안정성 및 자가-상호작용 성향에 대해 평가하였다(표 12). 인간화 12172 전하 돌연변이체는 인간 TREM1에 대한 친화성을 유지하였고, AC-SINS 어세에 의해 측정된 Δλmax의 감소에 의해 표시되는 자가-상호작용 성향의 감소를 나타내었다.
실시예 12 내지 20에 기재된 바와 같이 개발 가능성을 평가하기 위해 다양한 응력 조건을 사용하여 인간화 12172 gL2gH11 및 12172 gL6gH6(둘 다 hIgG4P 및 hIgG1 LALA 포맷)의 생체물리학적 특징규명을 수행하였다. 추가로, 모든 분자들을 액체 크로마토그래피 질량 분광측정(LC-MS)으로 분석하여 예측된 서열 분자량(MW)이 실험 데이터와 일치하였음을 확인하였다.
인간화 12172gL2gH11 IgG4P 항체는 THP1 단핵구 TREM1/DAP12 NF-κB 루시퍼라제 리포터 세포 어세이(실시예 2에 기재됨)에서 토끼 모 12172 항체와 유사한 NF-κB 억제를 보였다(표 13 참조).
실시예 4. 토끼 12172 Fab의 발현 및 정제
ExpiFectamine™ 293 형질감염 시약(A14525, ThermoFisher Scientific)을 사용하여 Expi293™ 현탁 세포 내로의 중쇄 및 경쇄 벡터 CID102769 및 CID102770의 공-형질감염을 달성하고, 토끼 재조합 12172 Fab의 발현을 제공하였다. PALL 0.4/0.2 ㎛ 캡슐 필터를 통해 배지를 여과하고 XK16/60 컬럼에 침전된 단백질 G 감마바인드 플러스(GammaBind Plus) 수지(7 ㎖)에 적용하고 10 CV 1x PBS(pH 7.4)로 세척하였다. 결합된 Fab 복합체 단백질을 50 ㎖의 100 mM 글리신(pH 2.7)으로 용출하고 즉시 10% 1 M Tris(pH 8)로 중화시켰다. 12172 Fab 복합체를 함유하는 분획을 모아 비바스핀 PES 20, 10 kDa MWCO 농축기에서 농축하였다. 그 다음, 수퍼덱스 s200 16/60 컬럼(GE Healthcare)을 사용하여 세정하고 1x PBS(pH 7.4)로 완충제 교환하였다. 최종 단백질 농도 및 순도를 실시예 1에 전술된 바와 같이 평가하였다.
실시예 5. 12172 gL2gH11/gL6gH6 hIgG4P 및 hIgG1 LALA의 발현 및 정제
일시적인 포유동물 발현, CHOSXE 배양
현탁 CHOSXE 세포를 2 mM(100x) 글루타맥스(Glutamax)로 보충된 CDCHO 무혈청 배지(Invitrogen)에 미리 적응시켰다.
세포를 그의 대수 생장기에서 유지하고 진탕 인큐베이터(Kuhner AG, 스위스 비르스펠덴)에서 190 rpm으로 교반하고 8% CO2로 보충된 37℃에서 배양하였다.
전기천공 형질감염
형질감염 전, Vi-Cell™ XR 세포 생존율 분석기(Beckman Coulter)를 이용하여 세포 수와 생존율을 측정하고 99% 생존율에서 필요한 수의 세포(2.3x108개 세포/㎖)를 원심분리 원추형 튜브로 옮기고 15분 동안 1500 rpm으로 회전시켰다. 펠릿화된 세포를 Hyclone™ MaxCyte® 완충제(Thermo Scientific)로 세척하고 추가 15분 동안 원심분리하였다. 펠릿을 새로운 완충제에 2.3x108개 세포/㎖로 재현탁하였다.
퀴아젠 플라스미드 플러스 기가 키트(Qiagen Plasmid Plus Giga Kit)®를 사용함으로써 정제된 플라스미드 DNA를 400 ㎍/㎖로 첨가하였다. 맥스사이트(MaxCyte) STx® 유동 전기천공 기기를 이용한 전기천공 후, 세포를 2 mM 글루타맥스, 0.75 mM 부티르산나트륨(n-부티르산 나트륨염, Sigma B-5887), 항생제 항유사분열제 100x 용액(500분의 1) 및 0일째 날에 첨가된 볼루스 공급물이 함유된 ProCHO™ 5 무단백질 CHO 배지(Lonza)로 옮겼다.
이어서, 형질감염된 세포를 환기 플라스크로 직접 옮기고 37℃, 8% CO2 및 190 rpm 진탕으로 설정된 쿠너(Kuhner) 진탕기 인큐베이터에서 배양하였다. 형질감염 24시간 후에 온도를 32℃로 낮추고 세포를 추가 11일 내지 13일 동안 배양하였다.
12일째 날 내지 14일째 날, 배양물을 원심분리 튜브로 옮기고 4000 rpm에서 30분 동안 회전시킨 후 세포로부터 상청액을 분리하였다. 0.22 ㎛ Sartobran® P 밀리포어(Millipore) 카트리지를 통해 여과한 후 0.22 ㎛ Millipak® 감마 골드(Gamma Gold) 필터를 통해 여과하여 보유된 상청액을 더 정화하였다. 표준물로서 1 mg/㎖의 A33 hIgG1, 0.8 ㎖ POROS™ G 20 ㎛ 컬럼 및 아질런트(Agilent) 1100 시리즈 HPLC 시스템을 사용하여 단백질 G 정량 HPLC 어세이로 최종 발현 역가를 측정하였다. 정화된 세포 배양 회수물을 정제 전에 4℃에서 저장하였다.
항체 정제 및 분석
정화된 세포 배양 회수물을 실온으로 가온한 후, AKTA Pure 25L 크로마토그래피 시스템(Cytiva)을 이용하여 Hyclone™ 인산염 완충 식염수(PBS)(pH 7.4)로 사전평형화된 215 ㎖ MabSelect™ SuRe™ 컬럼(Cytiva)에 로딩하였다. PBS(pH 7.4)로 세척한 후, 인간 IgG1 이소타입의 경우 pH를 3.4(0.1 M 구연산나트륨 완충제)로 감소시키거나, 인간 IgG4P 이소타입의 경우 pH를 pH 3.7(30 mM 아세트산나트륨)로 감소시킨 후 pH 3.6(0.1 M 구연산나트륨 완충제)로 감소시켜 결합된 물질을 용출하였다. 용출 후, 컬럼을 0.1 M 구연산(pH 2.0)으로 스트립핑하여 임의의 강하게 결합된 응집체를 제거하였다. 친화성 포획 용출 피크 분획을 모으고 2 M Tris-HCl(pH 8.5)을 첨가하여 pH 5.5 내지 7.5로 중화시켰다. 나노드롭을 사용하여 280 nm에서 흡광도를 판독하여 단백질 농도를 측정하고 분석적 크기 배제 HPLC(아래 방법)로 순도를 측정하였다.
HiLoad 수퍼덱스 200 26/60(Cytiva) 또는 50/60 분취 등급 컬럼(사이티바(Cytiva)에 의해 맞춤 팩킹됨)에 로딩하기 위해 원심분리 여과 장치(Centricon® Plus-70 또는 Amicon® Ultra-15), 또는 부피에 따라 10 KDa 또는 30 KDa MWCO 막을 가진 가압된 교반 셀 챔버(Amicon®)를 사용하여 친화성 풀을 농축하였다. HiLoad 수퍼덱스 200 26/60 또는 50/60 컬럼을 50 mM 아세트산나트륨, 125 mM 염화나트륨 완충제(pH 5.0)로 평형화시킨 후, AKTA 크로마토그래피 시스템(Cytiva)을 이용하여 샘플을 로딩하였다. 등용매 용출을 실행하고 0.3 CV 후에 분획을 모았다. 분석 크기 배제 HPLC에서 분획 또는 모의 풀을 실행하여 단량체를 함유하는 분획을 확인하였다. >98% 단량체 함량을 수득하도록 분획을 모았다. 원심분리 여과 장치(Centricon® Plus-70 또는 Amicon® Ultra-15), 또는 부피에 따라 10 KDa 또는 30 KDa MWCO 막을 가진 가압된 교반 셀 챔버(Amicon®)를 사용하여 풀을 10 내지 15 mg/㎖까지 농축한 후 회수하고, Stericup® 여과 유닛 또는 Millex GV 주사기 필터를 사용하여 0.22 ㎛ 멸균 여과하였다.
나노드롭을 사용하여 280 nm에서 흡광도를 판독함으로써 최종 단백질 농도를 측정하였다. 단량체 함량을 분석적 크기 배제 HPLC로 측정하였다. 인비트로겐(Invitrogen) Novex™ WedgeWell™ 4% 내지 20% 트리스-글리신 및 XCell SureLock™ 미니-셀(Mini-Cell) 전기영동 시스템과 쿠마시(Coomassie) 염료를 사용하여 SDS-PAGE로 정확한 밴딩 패턴을 확인하였다. 찰스 리버(Charles River) Endosafe® LAL 시약 카트리지 기술 및 Endosafe® nexgen-PTS 판독기를 이용하여 내독소 수준을 측정하였고, 이때 <1EU/mg의 수준이 허용 가능한 품질이다. 중쇄 및 경쇄 질량, 예상된 변형 및 동일성을 확인하기 위해 샘플을 온전한 질량 분광측정으로 분석하였다.
분석적 크기 배제 HPLC
아질런트 1100 또는 1200 시리즈 HPLC를 이용하여 TSKgel G3000SWXL HPLC 컬럼(Tosoh)을 하이클론(Hyclone) 인산염 완충 식염수(PBS)(pH 7.4)로 평형화시켰다. 20 내지 50 ㎍의 샘플을 주입하고 등용매 용출 조건(PBS pH 7.4)에서 1 ㎖/분의 속도로 16분 동안 실행하였다. 데이터를 바이오라드(BioRad) 분자량 마커 표준물과 비교하였다. 단량체 및 고분자량 생성물 관련 불순물과 저분자량 생성물 관련 불순물에 대한 보유 시간 및 퍼센트를 보고하였다.
실시예 6. 인간 및 사이노몰구스 TREM1에 대한 12172gL2gH11 hIgG4P의 결합 동역학
인간 및 사이노몰구스 TREM1에 결합하는 12172gL2gH11 hIgG4P의 동역학을 비아코어 T200 기기 및 비아코어 8k 기기에서 표면 플라즈몬 공명으로 25℃에서 측정하였다.
아민 커플링 화학반응을 통해 염소 항-인간 IgG, Fc 단편 특이적 항체(F(ab')2 단편, Jackson ImmunoResearch 109-006-098)을 CM5 센서 칩에 대략 5000 RU의 수준으로 고정시켰다. 기준 셀도 동일한 방식으로 처리하였다. 아민 커플링이 완료된 후, 포획 용액을 제외한 모든 후속 용액을 기준 셀 및 샘플 셀 위로 직렬로 유동시키고, 실행 전체에 걸쳐 기준 셀의 반응을 샘플 셀로부터 차감하였다.
각각의 분석 주기는 대략 250 RU의 12172gL2gH11 hIgG4P를 항-Fc 표면에 포획시키는 단계, (분당 30 ㎕의 유속으로 25℃에서) 180초 동안 피분석물을 주입하는 단계, 600초 동안 피분석물을 해리시킨 후, (50 mM HCl의 60초 주입, 5 mM NaOH의 30초 주입, 및 50 mM HCl의 추가 60초 주입으로) 표면을 재생시키는 단계로 구성되었다. 인간 TREM1 ECD 피분석물(사내제조, His 태그가 부착됨)을 T200에서 200 nM 내지 2.5 nM의 농도, 및 8k에서 500 nM 내지 2 nM의 농도로 HBS-EP+ 실행 완충제(GE Healthcare) 중의 3배 연속 희석액으로 주입하였다. 사이노 TREM1 ECD 피분석물(사내제조, His 태그가 부착됨)을 4100 nM 내지 17 nM의 농도로 HBS-EP+ 실행 완충제(GE Healthcare) 중의 3배 연속 희석액으로 주입하였다 - 이것은 T200에서만 실행되었다. 기기 노이즈(noise) 및 드리프트(drift)를 차감하기 위해 완충제 블랭크 주입을 포함시켰다.
비아코어 T200 평가 소프트웨어(버전 3.0) 또는 비아코어 인사이트 평가 소프트웨어(버전 3.0)를 적절하게 사용하여 1:1 결합 모델을 이용하여 동역학 파라미터를 측정하였다. 12172gL2gH11 hIgG4P는 인간 TREM1에 대해 0.52 nM의 친화성, 및 사이노 TREM1에 대해 870 nM의 친화성을 가진 것으로 확인되었다. 동역학 파라미터는 표 14에 요약되어 있다.
실시예 7. 12172gL2gH11 hIgG4P와 다양한 종의 TREM1의 결합
다양한 종의 TREM1에 결합하는 12172gL2gH11 hIgG4P의 동역학을 비아코어T200 기기에서 표면 플라즈몬 공명으로 25℃에서 측정하였다. 시험된 종은 인간, 사이노몰구스, 붉은털원숭이, 마모셋, 래트, 마우스, 개 및 돼지이었다.
아민 커플링 화학반응을 통해 염소 항-인간 IgG, Fc 단편 특이적 항체(F(ab')2 단편, Jackson ImmunoResearch 109-006-098)을 CM5 센서 칩에 대략 5000 RU 수준으로 고정시켰다. 기준 셀을 동일한 방식으로 처리하였다. 아민 커플링이 완료된 후, 포획 용액을 제외한 모든 후속 용액을 기준 셀 및 샘플 셀 위로 직렬로 유동시키고, 실행 전체에 걸쳐 기준 셀의 반응을 샘플 셀로부터 차감하였다.
각각의 분석 주기는 대략 250 RU의 12172gL2gH11 hIgG4P를 항-Fc 표면에 포획시키는 단계, (분당 30 ㎕의 유속으로 25℃에서) 180초 동안 피분석물을 주입하는 단계, 600초 동안 피분석물을 해리시킨 후, (50 mM HCl의 60초 주입, 5 mM NaOH의 30초 주입, 및 50 mM HCl의 추가 60초 주입으로) 표면을 재생시키는 단계로 구성되었다. TREM1 ECD 피분석물(사내제조, His 태그가 부착됨)을 HBS-EP+ 실행 완충제(GE Healthcare) 중의 3배 연속 희석액으로 주입하였고, 최고 농도는 표 15에 표시되어 있으며, 3배 연속 희석을 2 nM의 최저 농도까지 수행하였다. 기기 노이즈 및 드리프트를 차감하기 위해 완충제 블랭크 주입을 포함시켰다.
비아코어 인사이트 평가 소프트웨어(버전 3.0)를 사용하여 1:1 결합 모델을 이용하여 동역학 파라미터를 측정하였다. 12172 gL2gH11 hIgG4P는 이 실험에서 인간 TREM1에 대해 0.54 nM의 친화성을 가진 것으로 밝혀졌다(표 15에 요약된 동역학 파라미터). 결합 동역학을 측정하기에는 불충분하지만 사이노몰구스 및 붉은털 원숭이의 경우 최소 결합 반응이 관찰되었다. 12172gL2gH11 hIgG4P와 임의의 다른 종의 TREM1의 결합은 검출되지 않았다(표 16에 요약됨).
실시예 8. 12172gL2gH11 hIgG4P에 의한 TREM1/PGLYRP1 상호작용의 차단
12172gL2gH11 hIgG4P는 25℃에서 인간 TREM1과 인간 PGLYRP1 사이의 상호작용을 차단한다는 것이 비아코어 T200 기기에서 표면 플라즈몬 공명에 의해 입증되었다.
아민 커플링 화학반응을 통해 염소 항-인간 IgG, Fc 단편 특이적 항체 F(ab')2 단편(Jackson ImmunoResearch 109-006-098)을 HC30M 센서 칩(XanTec Bioanalytics)의 4개 유동 셀 모두에 대략 4000 RU 수준으로 고정시켰다. 실행 전체에 걸쳐 유동 셀 1의 반응을 유동 셀 2의 반응으로부터 차감하였고, 유사하게 실행 전체에 걸쳐 유동 셀 3의 반응을 유동 셀 4의 반응으로부터 차감하였다.
각각의 분석 주기는 대략 100 RU의 TREM1-Fc(R&D 1278-TR Lot GZF0220071)를 유동 셀 2의 표면에 포획시키는 단계, 대략 150 RU의 12172gL2gH11 hIgG4P를 유동 셀 4의 표면에 포획시키는 단계, 및 TREM1 ECD 피분석물(사내제조, His 태그가 부착됨)을 180초 동안 유동 셀 3 및 4의 표면 위로 유동시키는 단계로 구성되었다. PGLYRP1(R&D 2590-PGB, NLC1520031)과 PGN(Invivogen tlrl-ksspgn lot KSS-41-01)의 혼합물을 180초 동안 모든 표면 위로 유동시키고 결합을 모니터링한 후, 300초의 해리 시간을 두었다. 그 다음, (50 mM HCl의 60초 주입, 5 mM NaOH의 30초 주입 및 50 mM HCl의 추가 60초 주입으로) 표면을 재생시켰다.
12172gL2gH11 hIgG4P는 PGN의 존재 및 부재 하에서 PGLYRP1과 TREM1의 상호작용을 차단하였다(표 17 참조).
실시예 9: 결정학에 의한 인간 PGLYRP1과 인간 TREM1의 결합 계면의 확인
결정학
PBS(pH 7.0)에서 15 mg/㎖로 인간 TREM1 IgV 도메인과 전체 길이 인간 PGLYRP1과 복합체(1:1 몰비)를 형성하고 4℃에서 1시간 동안 인큐베이션하였다. 0.2 ㎕ 단백질 및 0.2 ㎕ 저장소 몰레큘라 디멘션스(Molecular Dimensions) ProPlex 스크린 D7(15%(w/V) PEG 6000, 100 mM 삼염기성 구연산나트륨/수산화나트륨 pH 5.5)로 구성된 현적 증기 확산으로 단백질을 공-결정화하였다. 냉동보호를 위해 20% 에틸렌 글리콜을 사용하였다.
X-선 회절, 데이터 수집, 구조 확인 및 개량
극저온(100K) X-선 회절 데이터를 APS 21-ID-F에서 원격으로 수집하였다. XDS를 사용하여 원시 데이터 프레임을 색인화하고 통합하고 확장하였다. 결정의 공간 군은 P21이었고, 이때 유닛 셀 파라미터는 2.55Å의 해상도까지 a = 58.68Å, b = 98.73Å, c = 60.43Å, α = 90°, β = 109.145°, γ= 90°이었다. 구조의 품질 파라미터는 구조의 전체 R-인자 = 17.9% 및 자유 R-인자 = 22.9%로 양호하였다. 단백질 복합체 구조를 COOT에서 모델링하고 TLS 프로토콜을 포함하는 PHENIX를 사용하여 개량하였다. 물 분자를 첨가하고 COOT로 확인하였다.
인간 TREM1 IgV 도메인(위치 21 내지 139)(서열번호 9)은 전체 길이 PGLYRP1(서열번호 10)과 복합체를 형성하였다. 결정 복합체의 화학량론은 1:2이고, 이때 등몰 혼합에도 불구하고 단일 hTREM1 분자는 이량체화된 PGLYRP1 분자에 결합하였다. CCP4 프로그램 제품군의 프로그램 NCONT를 사용하여 인간 TREM1의 IgV 유사 도메인과 hPGLYRP1 사이의 4Å 이하의 분자간 거리 분석을 수행하였다. 에피토프는 다음과 같이 결정학적으로 확인되었다: 잔기 E27, D42 내지 E46, A49, Y90 내지 L95, 및 F126(위치는 서열번호 1에 상응함). 도 3A는 hTREM1:PDBPDB 1SMO에서 PGLYRP1 리간드 결합 부위의 구조적 맵핑을 보여준다.
실시예 10: X-선 결정학에 의한 12172 토끼 모 Fab 인간 TREM1 에피토프의 확인
결정학
12172 항체의 정확한 에피토프를 확인하기 위해, X-선 결정학을 이용하였다. PBS(pH 7.4)에서 인간 TREM1 IgV 도메인(서열번호 9)과 토끼 모 Fab의 복합체(1:1 몰비)를 형성하고 크기 배제에 적용하였다. 샤페론(Chaperone) Fab 11994를 15 mg/㎖로 hTREM1:Fab 복합체와 혼합하고 4℃에서 1시간 동안 인큐베이션하였다. 0.2 ㎕ 단백질 및 0.1 ㎕ 저장소 몰레큘라 디멘션스 ProPlex 스크린 A6(25%(w/V) PEG 1000, 200 mM 염화나트륨, 100 mM 이염기성 인산칼륨/일염기성 인산나트륨 pH 6.5)으로 구성된 현적 증기 확산으로 단백질을 공-결정화하였다. 냉동보호를 위해 20% 에틸렌 글리콜을 사용하였다.
X-선 회절, 데이터 수집, 구조 확인 및 개량
극저온(100K) X-선 회절 데이터를 APS 21-ID-F에서 원격으로 수집하였다. XDS를 사용하여 원시 데이터 프레임을 색인화하고 통합하고 확장하였다. 결정의 공간 군은 I222이었고, 이때 유닛 셀 파라미터는 2.60Å의 해상도까지 a = 91.98Å, b = 139.10Å, c = 224.81Å, α = 90°, β = 190°, γ = 90°이었다. 구조의 품질 파라미터는 구조의 전체 R-인자 = 19.3% 및 자유 R-인자 = 22.6%로 양호하였다. 단백질 복합체 구조를 COOT에서 모델링하고 TLS 프로토콜을 포함하는 PHENIX를 사용하여 개량하였다. 물 분자를 첨가하고 COOT로 확인하였다.
토끼 모 Fab(12172)(서열번호 19 및 23)와 복합체를 형성한 인간 TREM1 IgV 도메인(위치 21 내지 139)(서열번호 9)을 샤페론 Fab 분자(11994)의 존재 하에서 수득하였다. 수소 중수소 교환 질량 분광측정(HDX-MS)을 이용하여, 12172 토끼 모 Fab의 결정학에 사용된 11994 Fab 샤페론이 12172과 TREM1의 결합에 영향을 미치지 않는다는 것을 확인하였다. 결정 복합체의 화학량론은 1:1:1이며, 이때 Fab 에피토프는 hTREM1 분자의 반대쪽에 결합한다. CCP4 프로그램 제품군의 프로그램 NCONT를 사용하여 인간 TREM1의 IgV 유사 도메인과 Fab 12172 사이의 4Å 이하의 분자간 거리 분석을 수행하였다. 에피토프는 다음과 같이 결정학적으로 확인되었다: 잔기 E26 내지 K32, Q35, T36, D38, K40, D42, R97, D127, T134 및 G136(위치는 서열번호 1에 상응함). 도 3B는 hTREM1:PDBPDB 1SMO에서 Fab 12172 에피토프의 구조적 맵핑을 보여준다. 이 에피토프는 PGLYRP1의 에피토프와 상이한 것으로 확인되었다(실시예 9 참조).
실시예 11. 전체 길이 항체 12172gL2gH11 hIgG4P - 포유동물 세포주 발생
12172gL2gH11 hIgG4P의 안정한 발현을 입증하기 위해, 안정적으로 발현하는 포유동물 세포주를 생성하였다. CHO 세포주를 플라스미드 벡터 12172_gL2_ckappa_gH11_IgG4(p)로 형질감염시켰다. 상기 세포주를 클로닝하고 적합한 제조 과정에 피팅되는지를 평가하였다. 관심 있는 단백질의 품질과 양을 평가하고 최적 세포주가 선택되었는지를 확인하기 위해, 제조 유가식 생물반응기의 소규모 모델에서 세포주를 평가하였다. 12172gL2gH11 hIgG4P를 허용 가능한 수준으로 발현하고 95% 초과의 단량체를 함유하는 클론성 CHO 세포주를 선택하였다.
실시예 12. 액체 크로마토그래피-질량 분광측정(LC-MS)에 의한 항체 분자의 특징규명
Xevo G2 Q-ToF 질량 분광측정기를 갖춘 워터스(Waters) ACQUITY UPLC 시스템을 사용하여 LC-MS로 온전한 분자(비환원) 및 별도의 중쇄와 경쇄(환원) 둘 다에 대해 생성된 12172 gL2gH11(hIgG4P 및 hIG1 LALA) 및 12172 gL6gH6(hIgG4P 및 hIgG1 LALA) 항체 분자의 분자량(MW)을 측정하였다. 37℃에서 150 mM 아세트산암모늄 중의 5 mM 트리스(2-카르복시에틸) 포스핀(TCEP)을 사용하여 40분 동안 샘플(약 5 ㎍)을 환원시켰다. 비환원(온전한) 측정을 위해, 샘플을 PBS(pH 7.4)로 동일한 농도까지 희석하고 전술된 바와 같이 인큐베이션한 후 분석하였다. LC 컬럼은 0.6 ㎖/분의 유속으로 95% 용매 A(물/0.02% 트리플루오로아세트산(TFA)/0.08% 포름산) 및 5% 용매 B(95% 아세토니트릴/5% 물/0.02% TFA/0.08% 포름산)에 의해 평형화된, 80℃로 유지된 워터스 BioResolve™ RP mAb 폴리페닐, 450Å, 2.7 ㎛이었다. 단백질을 8.8분에 걸쳐 5% 내지 50% 구배의 용매 B로 용출한 후, 95% 용매 B 세척 및 재평형화를 수행하였다. UV 데이터를 280 nm에서 획득하였다. MS 조건은 다음과 같았다: 이온 모드: ESI 양이온, 해상 모드, 질량 범위: 400 내지 5000 m/z, 및 NaI을 사용한 외부 보정.
워터스 MassLynx™ 및 MaxEnt 소프트웨어를 사용하여 데이터를 분석하였다.
표 18 및 19에 나타낸 바와 같이, 12172 gL2gH11(hIgG4P 및 hIgG1 LALA) 및 12172 gL6gH6(hIgG4P 및 hIgG1 LALA) 항체 분자의 서열로부터 예측된 MW는 LC-MS에 의해 측정된, 온전한 분자 및 중쇄와 경쇄에 대한 MW와 일치하였다.
실시예 13. 열 안정성(Tm) 측정
(i) 열 변동 어세이 또는 (ii) 시차 주사 열량측정(DSC)을 이용하여 용융 온도(Tm) 또는 언폴딩의 중간점에서의 온도를 측정하여 분자의 입체구조적 안정성을 평가함으로써, 제조에 대한 강인성 및 장기간 안정성을 평가하였다.
열 변동 어세이
초기 이식편 스크리닝 및 선택에 대해 열 변동 어세이를 수행하였다(실시예 3 참조).
온도가 증가함에 따라 노출되는 소수성 영역에 결합함으로써 단백질 언폴딩 과정을 모니터링하기 위해 형광 염료 SYPRO® 오랜지(Orange)를 사용하였다. 반응 혼합물은 시험 완충제에 의해 5000x 농축액으로부터 희석된 5 ㎕의 30x SYPRO® 오랜지 단백질 겔 염료(Thermofisher science, S6651)를 함유하였다. 통상의 제제화 전 저장 완충제(pH 7.4) 중의 0.2 mg/㎖의 샘플 45 ㎕를 상기 염료에 첨가하고 혼합하였다. 10 ㎕의 이 용액을 384 PCR 광학 웰 플레이트에 사중으로 분배하고 콴트스튜디오(QuantStudio) 7 실시간 PCR 시스템(Thermofisher™)에서 실행하였다. PCR 시스템 가열 장치를 20℃로 설정하고 1.1℃/분의 속도로 99℃까지 증가시켰다. 전하 커플링 장치는 웰에서의 형광 변화를 모니터링하였다. 형광 강도 증가를 작도하고, 기울기(들)의 변곡점을 사용하여 겉보기 중간점 온도(Tm)를 생성하였다. 데이터는 표 11 및 12에 제시되어 있다(실시예 3 참조).
시차 주사 열량측정(DSC)
시차 주사 열량측정을 이용하여 열 안정성을 평가하였다. 모든 샘플을 400 ㎕의 총 부피로 통상의 제제화 전 저장 완충제(pH 7.4 또는 pH 5.0)로 10 μM까지 희석하고 96웰 플레이트에 첨가하고 4,000 x g에서 5분 동안 원심분리하여 기포를 제거하였다. 1℃/분의 속도, 15분의 스캔 전 온도조절, 8초의 여과 시간 및 수동 피드백 모드로 플레이트를 자동화 MicroCal VP DSC(Malvern Panalytical)에서 10℃부터 100℃까지 실행하였다. 데이터를 수동 기준 보정으로 완충제 차감하고, 데이터를 Origin 7.0의 비-2-상태 모델에 피팅하였다. 전이 중간점(Tm) 및 언폴딩의 시작은 아래 표 20 및 도 4에 표시되어 있다.
IgG4P 이소타입은 3개의 전이에 피팅된 반면, IgG1 LALA는 2개의 전이에 피팅되었는데, 이때 Fab와 CH3 언폴딩은 구별될 수 없었다. 열 안정성은 각각의 이소타입에 대해 예상된 범위 내에 있었다.
실시예 14. 실험적 등전점(pI) 측정
12172 gL2gH11 및 12172 gL6gH6에 대한 실험적 pI는 hIgG4P 포맷과 유사한 것으로 밝혀졌다. 이것은 hIgG1 LALA 분자의 경우에도 관찰되었다. pI는 제조 단계 및 제제화 완충제에 좋을 것으로 예상된 범위 내에 있었다. 상이한 하전된 종의 존재는 다른 치료 분자의 관찰과 일치하였고 통상의 번역 후 변형, 예컨대, 라이신의 C-말단 중쇄 제거에 기인하였다.
실시예 15. 소수성 상호작용 크로마토그래피(HIC)
소수성 상호작용 크로마토그래피(HIC)를 이용하여 hIgG4P 포맷으로서 12172 gL2gH11 및 12172 gL6gH6의 소수성을 측정하였다. HIC는 소수성이 증가하는 순서로 분자를 분리한다. 분자는 고농도의 극성 염의 존재 하에서 소수성 고정상에 결합하고 염의 농도가 감소함에 따라 이동상 내로 탈착된다. 더 긴 체류 시간은 더 큰 소수성에 해당한다.
모든 분자는 낮은 겉보기 소수성을 보였다(15분 미만의 체류 시간). 12172 gL2gH11 분자와 12172 gL6gH6 hIgG4P 분자 사이에 유의미한 차이는 없었다. 유사하게, hIgG1 LALA 샘플에 대한 소수성 체류 시간의 유의미한 차이는 없었다. hIgG4P 분자는 상응하는 hIgG1 LALA 분자에 비해 약간 더 늦은 체류 시간을 보였다.
실시예 16. 폴리에틸렌 글리콜(PEG) 응집 어세이를 이용한 용해도 측정
고농도 용해도를 모의하기 위해 PEG 응집 어세이를 이용하였다. PEG는 비흡착 비변성 중합체이며 그의 불활성 성질로 인해 주로 배제된 부피 효과를 통해 단백질 침전을 촉진하는 데 사용되었다. 샘플을 증가하는 농도의 PEG 3350에 노출시시켰고, A280 nm에서의 흡광도를 작도함으로써 용액에 남아있는 샘플의 양을 측정하였다. 샘플의 절반이 침전된 % PEG 농도의 측정은 PEG 중간점(PEGmdpnt) 점수를 생성하였다. 이 점수는 시험 분자가 겉보기 천연 상태 응집 성향에 따라 순위가 매겨질 수 있게 하였고, 낮은 PEGmdpnt 점수(예를 들어, ≤10)는 천연 상태 응집에 대한 더 큰 성향을 표시한다.
통상의 제제화 전 저장 완충제(pH 7.4 및 5.0) 및 통상의 제제화 전 완충제(pH 5.5)로 스톡 40% PEG 3350(Merck, 202444) 용액(w/v)을 제조하였다. ASSIST PLUS 액체 취급 로봇(INTEGRA 4505)으로 연속 적정을 수행하여, 40% 내지 15.4% PEG 3350의 범위를 얻었다. 비-평형 침전을 최소화하기 위해, 샘플 제조는 항체와 PEG 용액을 1:1 부피비로 혼합하는 단계로 구성되었다. 액체 취급 로봇으로 35 ㎕의 PEG 3350 스톡 용액을 96웰 v 바닥 PCR 플레이트(A1 내지 H1)에 첨가하였다. 35 ㎕의 2 mg/㎖ 샘플 용액을 PEG 스톡 용액에 첨가하여, 1 mg/㎖ 시험 농도와 20% 내지 7.7%의 최종 PEG 3350 농도를 얻었다. 이 용액을 자동화 저속 반복 피펫팅으로 혼합하고 37℃에서 0.5시간 동안 인큐베이션하여 임의의 비-평형 응집체를 재용해시켰다. 그 다음, 샘플을 20℃에서 24시간 동안 인큐베이션하였다. 이어서, 샘플 플레이트를 20℃에서 4000 x g로 1시간 동안 원심분리하였다. 50 ㎕의 상청액을 UV-Star®, 절반 영역, 96웰, μClear®, 마이크로플레이트(Greiner, 675801)에 분배하였다. FLUOstar® Omega 다중검출 마이크로플레이트 판독기(BMG LABTECH)를 이용하여 280 nm에서 UV 분광광도측정으로 단백질 농도를 측정하였다. 그래프패드(Graphpad) 프리즘(버전 7.04)을 사용하여 얻은 값을 작도하였고; S자형 용량-반응(가변 기울기) 피트의 중간점으로부터 PEG 중간점(PEGmdpnt) 점수를 유도하였다.
데이터는 표 21에 제시되어 있고, 이때 더 높은 PEG 중간점(%)은 더 큰 용해도에 해당한다.
시험된 분자에 대해 완충제 의존적 용해도가 관찰되었다. 통상의 제제화 전 저장 완충제(pH 7.4)에서, 12172 gL2gH11 및 12172 gL6gH6의 두 이소타입(hIgG4P 및 hIgG1 LALA)은 낮은 PEG 중간점 점수를 나타내었는데, 이는 고농도에서 낮은 용해도를 표시한다. 증가된 PEG 중간점 점수는 통상의 제제화 전 저장 완충제(pH 5)에서 관찰되었다. 특히, 모든 샘플들은 통상의 제제화 전 완충제(pH 5.5)에서 제제화되었을 때 실질적으로 개선된 PEG 중간점 점수를 보였다. hIgG1 LALA 샘플은 이 완충제에서 PEG 3350의 최고 시험 농도에서 침전되지 않았다.
실시예 17. AC-SINS(친화성 포획 자가-상호작용 나노입자 분광법)를 이용한 단백질-단백질 자가-상호작용의 평가
AC-SINS 어세이를 이용하여 단백질-단백질 자가-상호작용 성향을 측정하여 잠재적인 응집 안정성에 대한 정보를 제공함으로써, 12172 gL2gH11 및 12172 gL6gH6(hIgG4P 및 hIgG1 LALA로서; 또한 실시예 3 참조)을 포함하는 인간화 분자의 개발 가능성을 스크리닝하였다. 이것을 통상의 제제화 전 저장 완충제(pH 7.4)에서 수행하였다.
염소 항-인간-Fcγ 특이적 포획 항체(Jackson ImmunoResearch)를 20 mM 아세트산나트륨(pH 4.3)으로 완충제 교환하고 0.4 mg/㎖까지 희석하고 50 ㎕를 450 ㎕ 구연산염 안정화된 20 nm 금 나노입자(TedPella, 미국)에 첨가하고 실온에서 밤새 방치하였다. 접합된 나노입자를 55 ㎕ PEG 메틸 에테르 티올(평균 Mn = 2,000(Sigma #729140))로 1시간 동안 차단하고, 21,000 x g에서 6분 동안 원심분리하고, 상청액을 제거하고 150 ㎕의 최종 부피까지 20 mM 아세트산나트륨(pH 4.3)에 재현탁하였다.
항체 샘플을 통상의 제제화 전 저장 완충제(pH 7.4)(180 ㎕)로 22 ㎍/㎖까지 희석하고 222 ㎍/㎖(Jackson ImmunoResearch)로 20 ㎕의 모의 상청액 및 200 ㎕의 비특이적 전체 IgG에 첨가하고, 짧게 볼텍싱하고 72 ㎕를 96웰 플레이트에 첨가하였다. 8 ㎕의 나노입자를 각각의 웰에 첨가하였다(n = 4). 흡광도를 BMG 플레이트 판독기에서 500 nm부터 600 nm까지 판독하고 로렌지안(Lorenzian) 곡선(RShiny)에 피팅하고 통상의 제제화 전 저장 완충제만을 샘플로부터 차감하여 Δλmax를 제공하였다.
데이터는 표 22에 요약되어 있고, 이때 더 높은 Δλmax(nm) 값은 더 높은 단백질-단백질 자가-상호작용 성향에 해당한다. 12172 gL2gH11 및 12172 gL6gH6 둘 다에 대한 hIgG1 LALA 분자는 더 낮은 Δλmax(nm)에 의해 표시된 바와 같이 상응하는 hIgG4P 분자보다 더 적은 자가-상호작용을 보이는 것으로 밝혀졌다. 추가로, 12172 gL6gH6(hIgG4P 및 hIgG1 LALA) 분자는 12172 gL2gH11(hIgG4P 및 hIgG1 LALA) 분자보다 약간 더 낮은 Δλmax(nm) 값을 보였다.
실시예 18. kD 상호작용 파라미터 측정(콜로이드 안정성)
kD 상호작용 파라미터를 사용하여 콜로이드 안정성을 평가하였는데, 이때 양수 값 및 음수 값은 각각 분자간 반발력 및 인력을 의미한다.
DynaPro III 플레이트 판독기(Wyatt Technology Corp, 미국 캘리포니아주 산타바바라)에서 동적 광 산란(DLS)을 수행하였다. 샘플을 통상의 제제화 전 저장 완충제(pH 7.4)로 희석하였거나, 통상의 제제화 전 저장 완충제(pH 5.0)로 완충제 교환하고 1 mg/㎖씩 증가시키면서 7 mg/㎖부터 1 mg/㎖까지 희석하였다. 완충제를 함유하는 웰을 용매 오프셋으로서 선택하였고, 20%로 설정된 레이저 출력 및 실행 가능해진 자동 감쇠를 이용하여 25℃에서 측정을 수행하였다. 각각의 측정치는 삼중으로 5회 5초 스캔(5x3)의 평균이었다. 확산 계수를 측정하였고(Dm) 상호작용 파라미터(kD)를 아래 방정식에 따라 계산하였는데, 이때 D 0 는 무한 희석에서의 확산 계수를 나타낸다.
방정식: Y 절편에서 Debye 플롯에 의해 제공된 D0. 기울기 = kD*D0.
확산 계수는 콜로이드 안정성을 평가하는 데 사용된 단백질 농도와 kD의 함수로서 측정되었으며, 이때 양수 값 및 음수 값은 각각 분자간 반발력 및 인력을 암시한다. 인력/자가-회합을 보이는 샘플의 경우, 확산 계수는 단백질 농도의 함수로서 더 커지고 이것은 음수 kD 값으로 반영된다. 데이터는 표 23에 제시되어 있다.
kD 상호작용 파라미터는 통상의 제제화 전 저장 완충제(pH 7.4)에서 수득된 데이터에 비해 통상의 제제화 전 저장 완충제(pH 5)에서 hIgG4P 및 hIgG1 LALA 분자 둘 다에 대해 덜 음성적인(더 콜로이드적으로 안정한) 것으로 확인되었다. hIgG1 LALA 분자는 상응하는 hIgG4P 분자보다 더 안정한 것으로 확인되었다. 추가로, 12172 gL6gH6(hIgG4P 및 hIgG1 LALA) 분자는 12172 gL2gH11(hIgG4P 및 hIgG1 LALA)보다 약간 더 큰 콜로이드 안정성을 나타내었다. 이 데이터는 AC-SINS 어세이로부터 생성된 데이터를 확인시켜 주었다(실시예 17 참조).
실시예 19. 응집 안정성에 대한 기계적 응력의 영향(응집 어세이)
단백질은 소수성 표면이 소수성 환경(공기)에 제시되고 친수성 표면이 친수성 환경(물)에 제시되는 공기-액체 계면에 노출될 때 언폴딩되는 경향이 있다. 단백질 용액의 교반은 응집을 유도할 수 있는 큰 공기-액체 계면을 달성한다. 이 어세이는 제조 동안 분자에 가해지는 응력(예를 들어, 한외여과)을 모방하고 상이한 항체 분자들을 구별하기 위해 엄격한 조건을 제공하는 역할을 한다.
에펜도르프 써모믹서 컴포트(Eppendorf Thermomixer Comfort)™를 사용하여 볼텍싱함으로써 통상의 제제화 전 저장 완충제(pH 7.4 또는 pH 5) 중의 샘플에 응력을 가하였다. 볼텍싱 전, 적절한 흡광 계수(hIgG1 LALA 및 hIgG4P에 대해 각각 1.42 및 1.43 흡광도 280 nm, 1 mg/㎖, 1 cm 경로 길이)를 사용하여 농도를 1 mg/㎖로 조절하였고, 0시간 판독을 확립하기 위해 바리안 캐리(Varian Cary)® 50-Bio 분광광도측정기를 사용하여 595 nm에서 흡광도를 수득하였다. 각각의 샘플을 1.5 ㎖ 원뿔형 에펜도르프®-스타일 캡핑 튜브(3x 250 ㎕)에 하위분취하고 25℃에서 24시간 동안 1400 rpm으로 볼텍싱하였다. 볼텍싱 후 3시간 및 24시간에서 바리안 캐리® 50-Bio 분광광도측정기를 이용하여 595 nm에서 샘플을 측정하여 응집(탁도)을 모니터링하였다. 데이터는 표 24에 요약되어 있다.
12172 gL2gH11 및 12172 gL6gH6(hIgG4P 및 hIgG1 LALA) 둘 다가 볼텍싱 후 3시간에서 두 완충제(통상의 제제화 전 저장 완충제 pH 7.4 및 pH 5)에서 우수한 응집 안정성을 보였다. 즉, 탁도가 595 nm에서 관찰되지 않았다. 24시간에서, 12172 gL2gH11 및 12172 gL6gH6(hIgG1 LALA)이 두 완충제에서 상응하는 hIgG4P 분자보다 더 큰 응집 안정성을 보인 경우 분자들을 구별할 수 있었다. hIgG4P 분자의 경우, pH 5에 비해 pH 7.4에서 통상의 제제화 전 저장 완충제에서 더 큰 응집 안정성이 관찰되었다. 12172 gL2gH11 및 12172 gL6gH6(hIgG4P 및 hIgG1 LALA로서)은 제조 동안 전단 응력 조건, 예를 들어, 한외여과에 안정한 응집일 것으로 예상될 것이다.
실시예 20. 12172 gL2gH11(hIgG4P 및 hIgG1 LALA)에 대한 다양한 농도에서의 점도 평가
높은 항체 농도에서 낮은 점도는 치료 분자의 피하 투여에 중요하므로, 피하 투여에 대한 적합성을 평가하기 위해 통상의 제제화 전 완충제(pH 5)에서 증가하는 농도에서 점도를 수득하였다. 이것은 12172 gL2gH11(hIgG4P 및 hIgG1 LALA)에 대해 확인되었다.
아래에 상세히 설명된 바와 같이 (i) 샘플의 초기 농도 및 (ii) 점도 측정으로 연구를 수행하였다.
12172 gL2gH11(hIgG4P 및 hIgG1 LALA)의 농도
20℃에서 4000 x g로 비바스핀 20 MWCO 30 kDa 원심분리 필터(Z14637, Sigma-Aldrich)를 이용하여 통상의 제제화 전 저장 완충제(pH 5.0) 중의 12 ㎖ 12172 gL2gH11 hIgG4P(15.2 mg/㎖) 및 11 ㎖ 12172 gL2 gH11 IgG1 LALA(15.5 mg/㎖)를 농축하였다. 약 750 ㎕의 부피가 수득될 때까지 샘플을 원심분리하였다. 잔류 용액을 회수하고 280 nm에서 UV 흡광도 측정(NanoDrop™ 1000)을 이용하여 생성된 항체 농도를 측정하였다. 12172 gL2gH11 hIgG4P의 경우 1.43 ㎖/(mg cm)의 흡광 계수 및 12172 gL2gH11 IgG1 LALA의 경우 1.42 ㎖/(mg cm)의 흡광 계수를 사용하였다.
그 다음, 점도 시험에 적합한 농도 범위를 제공하기 위해 통상의 제제화 전 저장 완충제(pH 5.0)를 사용하여 항체 샘플을 희석하였다. 280 nm에서 UV 흡광도를 재측정하여 희석된 항체의 농도를 확인하였다. 농도는 12172 gL2gH11 hIgG4P의 경우 158 mg/㎖, 94 mg/㎖ 및 52 mg/㎖이고, 12172 gL2gH11 hIgG1 LALA의 경우 144 mg/㎖, 100 mg/㎖ 및 45 mg/㎖인 것으로 확인되었다.
12172 gL2gH11(hIgG4P 및 hIgG1 LALA)의 점도 측정
온도 제어를 위한 펠티에(Peltier) 플레이트 및 액체 냉각 시스템, 및 측정을 위한 20 mm 스테인리스 강철 평행 플레이트 기하구조를 가진 디스커버리 하이브리드 레오미터(Discovery Hybrid Rheometer)-1(DHR-1, TA Instruments)를 이용하여 각각의 농도에서 점도를 측정하였다. 샘플(80 ㎕)을 펠티에 플레이트의 중심에 놓고 2.87918 s-1부터 287.918 s-1까지 다양한 전단 속도로 20℃로 설정한 정상 상태 유동 스위프 절차를 이용하여 점도(mPa·s 또는 cP 단위)를 측정하였다. 각각의 전단 속도 점에서의 값이 일정할 때(SD±5%) 측정된 점도의 평균을 산출하였다. 샘플 농도에 대한 점도의 변화를 관찰하기 위해, 상기 기기를 이용하여 상이한 농도에서 12172 gL2gH11 hIgG4P 및 12172 hIgG1 LALA 분자 둘 다를 측정하였다. 결과는 표 25에 요약되어 있다.
12172 gL2gH11 hIgG4P 및 12172 hIgG1 LALA 분자 둘 다가 농도와 점도 계수 사이에 증가하는 경향을 보였다. 12172 hIgG4P의 경우 농도가 52 mg/㎖에서 158 mg/㎖로 증가함에 따라 점도는 1.2 cP에서 4.1 cP로 증가하였다. 유사하게, IgG1 LALA 분자에 대한 점도는 농도가 45 mg/㎖에서 144 mg/㎖로 증가함에 따라 1.4 cP에서 5.4 cP로 증가하였다. 이 샘플들 모두가 다양한 전단 속도에서 일정한 점도 계수(5% 미만의 가변성)를 보였다. 이 결과는 12172 hIgG4P 및 12172 hIgG1 LALA가 더 높은 농도에서 낮은 점도 수준을 나타내므로 피하 투여에 적합한 것으로 예상될 수 있음을 보여주었다.
실시예 21. 인간 TREM1 THP1 NF-κB 리포터 세포주를 사용한 12172 gL2gH11 hIgG4P의 기능적 활성 평가
본 연구의 목적은 인간 TREM1을 통한 PGLYRP1/PGN 매개 NF-κB 신호전달 활성화를 억제하는 12172 gL2gH11 hIgG4P의 능력을 평가하는 것이었다. 이를 위해, THP1 단핵구 TREM1/DAP12 NF-κB 루시퍼라제 리포터 세포를 사용하였다. 이 세포는 인간 TREM1, 인간 DAP12 및 NF-κB 루시퍼라제 리포터 유전자를 안정적으로 발현한다. 대장균의 가용성 펩티도글리칸(PGN)과 복합체를 형성한 PGLYRP1은 TREM1에 결합하여 NF-κB 활성화를 유도하는 TREM1 리간드로서 사용되었다. TREM1에 결합하지 않는 PGN도 NF-κB 활성화를 유도하지만, 그 정도는 덜하고 대안적 신호전달 경로를 통해 유도한다. 루시퍼라제 활성의 억제는 이 시스템에서 12172 gL2gH11 hIgG4P의 기능적 차단 활성을 입증한다.
표준 조직 배양 기법을 이용하여 선택 항생제를 함유하는 완전 배지(RPMI + 10% FBS + 50 μM 2-머캡토에탄올 + 10 ㎍/㎖ 블라스티시딘 + 1 ㎍/㎖ 퓨로마이신 + 200 ㎍/㎖ 제네티신)에서 THP1 단핵구 TREM1/DAP12 NF-κB 루시퍼라제 리포터 세포를 배양하였다. 어세이 설정 3일 전, 세포를 T175 플라스크 내의 50 ㎖ 완전 배지에 10x106개의 세포로 시딩하고(200,000개 세포/㎖) 인큐베이터에 편평하게 놓았다. 어세이 당일, 세포를 플라스크로부터 꺼내어 50 ㎖ 팔콘으로 옮기고 300 x g에서 5분 동안 원심분리하였다. 배지를 제거하고 세포를 5 내지 10 ㎖의 완전 배지에 재현탁하고 계수하였다. 그 다음, 세포 현탁액을 완전 배지에 첨가하여 세포를 1x106개 세포/㎖로 재현탁하고, 10 ㎕/웰을 어세이 플레이트(Corning #3570)에 첨가하였다. 12172 gL2gH11 hIgG4P를 33.3 nM 내지 1.69 pM의 최종 어세이 농도 범위까지 384웰 희석 플레이트(Greiner #781281) 내의 완전 배지로 연속 희석하였다. 그 다음, 12172 gL2gH11 hIgG4P의 연속 희석액을 어세이 플레이트(10 ㎕/웰)로 옮기고 어세이 플레이트를 37℃/5% CO2에서 1시간 동안 인큐베이션하였다. 실온의 멸균 DPBS에서 1시간 동안 재조합 인간 PGLYRP1(R&D Systems #2590-PGB)과 PGN(Invivogen #tlrl-ksspgn)의 복합체를 형성하였다. 1시간 후, 용액을 완전 배지로 희석한 다음, 2.5 ㎍/㎖ PGLYRP1 및 10 ㎍/㎖ PGN의 최종 어세이 농도까지 어세이 플레이트(10 ㎕/웰)로 옮겼다. 플레이트 대조군(항체가 첨가되지 않음)은 각각 어세이 최대 값 및 최소 값으로서 PGLYRP1/PGN 복합체 및 PGN 단독을 포함하였다. 이어서, 어세이 플레이트를 37℃/5% CO2에서 16±2시간 동안 인큐베이션하였다. 인큐베이션 후, 스테디글로 루시퍼라제 어세이 시스템(Promega #E2520)을 사용하여 루시퍼라제 활성을 측정하였다. 스테디글로 시약을 제조업체의 설명서에 따라 제조하고 30 ㎕/웰을 어세이 플레이트에 첨가하였다. 그 다음, 플레이트를 200 x g에서 3분 동안 원심분리한 후, 실온에서 추가 2분 동안 인큐베이션하여, 스테디글로 시약을 사용한 총 인큐베이션 시간이 5분이 되게 하였다. 그 다음, 시너지 네오 2 플레이트 판독기를 이용하여 발광을 측정하고 원시 발광 값을 사용하여 대조군 웰에 비해 상대적 억제율을 측정하였다. 액티비티베이스 v9.4를 이용하여 4PL 곡선 피팅 및 IC50 값의 계산을 수행하였다.
실시예 22. 1차 인간 단핵구로부터의 TREM1 매개 염증촉진성 사이토카인 및 케모카인 방출을 차단하는 데 있어서 12172 항체의 효능 및 효력
TREM1 신호전달을 차단하는 항-TREM1 12172 변이체 항체의 능력을 평가하기 위해, 활성화된 1차 인간 단핵구로부터의 염증촉진성 사이토카인 및 케모카인의 방출을 12172 항체 치료 후에 측정하였다. 음성 선택(Miltenyi, 130-117-337)을 통해 건강한 인간 공여자의 냉동보존된 말초 혈액 단핵 세포(PBMC)로부터 단핵구를 단리하였다. 단핵구 생존율 및 순도는 유세포분석에 의해 평가되었고 ≥ 90%를 초과하였다. 단핵구를 96웰 플레이트(Falcon)에 웰당 5x104개 세포의 밀도로 시딩하고 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis)의 사전복합체화된 펩티도글리칸(PGN-BS; 3 ㎍/㎖; Invivogen, tlrl-pgnb3) 및 재조합 인간 펩티도글리칸 인식 단백질 1(PGLYRP1; 1 ㎍/㎖; R&D Systems, 2590-PGB)로 자극하여 TREM1을 활성화시켰다. 24시간 후에 세포 상청액을 모아, 균질 시간 분해 형광® 기술(HTRF®; Cisbio)로 염증촉진성 사이토카인 방출(TNF-α, IL-6, IL-1β)을 측정하였다.
표 27에 나타낸 바와 같이, 12172 gL2gH11 hIgG4P 변이체는 1차 인간 단핵구로부터의 TNF-α(기하평균(Geomean) IC50 = 15 pM), IL-6(기하평균 IC50 = 27 pM) 및 IL-1β(기하평균 IC50 = 5 pM)의 TREM1 매개 방출을 억제하는 데 있어서 가장 강력하였다. 도 5에 나타낸 바와 같이, 1차 인간 단핵구에서 12172 gL2gH11 hIgG4P의 효력이 공여자 전체에 걸쳐 관찰되었다.
TREM1 매개 염증촉진성 사이토카인 및 케모카인 방출을 차단하는 데 있어서 항-TREM1 12172 변이체 항체의 능력을 더 평가하기 위해, 항-TREM1 항체(1 nM)로 처리되고 사전복합체화된 PGN-BS/PGLYRP1에 의해 활성화된 1차 인간 단핵구로부터의 상청액을, 두 가지 다중체 면역어세이를 이용하여 정량적으로 분석하였다: MILLIPLEX® 인간 사이토카인/케모카인/성장 인자 패널 A(Merck Millipore, HCYTA-60K-PX48) 및 맞춤형 LegendPlex 패널(Biolegend).
표 28에 나타낸 바와 같이, 다양한 12172 항체 변이체를 사용한 TREM1의 억제는 활성화된 1차 인간 단핵구(n = 4명의 공여자)로부터의 다수의 사이토카인 및 케모카인(CCL-3, CCL-20, CXCL-9, G-CSF, GM-CSF, IFN-γ, IL-1α, IL-1β, IL-6, IL-10, IL-12p40, IL-15, IL-18, IL-27, TNF-α, TNF-β)의 방출을 강하게 감소시켰다. 12172 gL2gH11 hIgG4P 변이체는 57% 내지 110%의 퍼센트 억제 값을 가진 가장 효과적인 12172 변이체이었다. 도 6에 나타낸 바와 같이, 12172 gL2gH11 hIgG4P는 공여자 전체에 걸쳐 1차 단핵구로부터의 IL-1 경로의 음성 조절제인 IL-1R 길항제(IL-1RA)의 방출을 유의미하게 증가시켰다. IL-1RA는 중증 전신 자가면역 질환과 연관된 단일염기변이(낮은 수준의 IL-1RA를 야기하는 돌연변이)를 가진다. (IL-1RA를 코딩하는) IL-1RN의 단일 뉴클레오타이드 다형성이 ALS 환자에서 확인되었다. 더 높은 순환 IL-1RA 수준은 더 낮은 ALS 위험과 유의미하게 연관되어 있다(Yuan et al. 2020 Eur J Neurol). IL-1RA 수준은 또한 건강한 대조군에 비해 AD 환자의 뇌척수액에서 유의미하게 감소된다(Tarkowski et al. 2001 Dement Geriatr Cogn Disord). 12172 gL2gH11 hIgG4P와 대조적으로, 선행기술의 항-TREM1 항체(0318-IgG1.3f)는 1차 단핵구로부터의 IL-1RA 방출에 영향을 미치지 않았다.
실시예 23: 자극되지 않은 1차 인간 단핵구로부터의 IL-1RA 방출을 증가시키는 데 있어서 12172 gL2gH11 hIgG4P의 효능 및 효력
12172 gL2gH11 hIgG4P가 TREM1 리간드에 의해 자극된 인간 단핵구로부터의 IL-1RA 방출을 유의미하게 증가시켰다는 것이 관찰되었으므로, 자극되지 않은 인간 단핵구로부터의 IL-1RA 방출에 대한 이의 영향도 평가하였다. 인간 단핵구를 실시예 22에 이미 기재된 바와 같이 단리하고 시딩하였고, IL-1RA 콴티카인(Quantikine) ELISA 키트(R&D Systems)를 사용하여 IL-1RA를 측정하기 위해 상청액을 모으기 전에 24시간 동안 항체를 첨가하였다.
표 29 및 도 7에 나타낸 바와 같이, 12172 gL2gH11 hIgG4P는 자극되지 않은 1차 인간 단핵구에서 IL-1RA의 방출을 용량 의존적으로 증가시켰다. 12172 gL2gH11 hIgG4P와 대조적으로, 또 다른 선행기술의 항-TREM1 항체(0318-IgG1.3f)는 자극되지 않은 1차 인간 단핵구로부터의 IL-1RA 방출에 영향을 미치지 않았다.
실시예 24. 알츠하이머병(AD) 및 근위축성 측삭 경화증(ALS) 환자의 PBMC로부터의 TREM1 매개 염증촉진성 사이토카인 및 케모카인 방출을 차단하는 데 있어서 12172 gL2gH11 hIgG4P의 효능
AD 및 ALS의 신경퇴행 및 신경 염증은 환자의 CSF 및 혈액 중의 여러 염증촉진성 사이토카인 및 케모카인의 상승된 수준과 연관되어 있다. 예를 들어, TNF-α, IL-6 및 IL-1β의 수준은 ALS 환자의 혈액에서 유의미하게 증가되는 반면(Hu et al. 2017 Sci Rep), CCL-3, G-CSF 및 TNF-α는 ALS 환자의 CSF에서 상승되고(Chen et al. 2018 Front Immunol), 본 발명자들은 모든 인자들이 인간 단핵구에서 TREM1 억제에 의해 감소되는 것을 관찰하였다.
환자 유래 세포에서 TREM1 신호전달을 차단하는 항-TREM1 12172 gL2gH11 hIgG4P의 효능을 평가하기 위해, TREM1 활성화 후 AD 및 ALS 환자로부터의 PBMC에서 염증촉진성 사이토카인 및 케모카인의 방출을 측정하였다. AD 및 ALS 환자, 및 상응하는 일치된 건강한 대조군의 전혈로부터 밀도 구배 원심분리로 PBMC를 단리하였다. PBMC를 96웰 플레이트(Falcon)에 웰당 1x105개 세포의 밀도로 시딩하고, 12172 gL2gH11 hIgG4P(1 nM)로 1시간 동안 전처리하고 바실러스 서브틸리스의 사전복합체화된 펩티도글리칸(PGN-BS; 3 ㎍/㎖; Invivogen, tlrl-pgnb3) 및 재조합 인간 펩티도글리칸 인식 단백질 1(PGLYRP1; 1 ㎍/㎖; R&D Systems, 2590-PGB)로 자극하여 TREM1을 활성화시켰다. 24시간 후에 세포 상청액을 모아, 균질 시간 분해 형광® 기술(HTRF®; Cisbio) 및 MILLIPLEX® 인간 사이토카인/케모카인/성장 인자 패널 A(Merck Millipore, HCYTA-60K-PX48)를 이용하여 염증촉진성 사이토카인 및 케모카인 방출을 측정하였다.
도 8 및 표 30에 나타낸 바와 같이, 12172 gL2gH11 hIgG4P는 AD 환자의 PBMC로부터의 TREM1 매개 TNF-α 방출(66%±15의 억제) 및 IL-6 방출(70%±17)을 억제하는 데 효과적이었다. 도 9 및 표 31에 나타낸 바와 같이, 12172 gL2gH11 hIgG4P도 ALS 환자의 PBMC로부터의 TREM1 매개 TNF-α 방출(72%±7의 억제) 및 IL-6 방출(69%±9)을 억제하는 데 효과적이었다. 도 10에 나타낸 바와 같이, 12172 gL2gH11 hIgG4P를 사용한 TREM1의 억제도 ALS PBMC(n = 4명의 공여자를 대표함) 및 AD PBMC(n = 5명의 공여자를 대표함)로부터의 여러 사이토카인 및 케모카인(CCL-3, CCL-4, CCL-20, CCL-22, CXCL-9, G-CSF, GM-CSF, GRO-α, IL-1α, IL-1β, IL-6, IL-10, IL-12p40, TNF-α)의 방출을 강하게 감소시켰다.
실시예 25. TREM1 리간드 복합체 또는 아폽토시스 iPSC 유래 인간 운동 뉴런으로 자극하고 12172 항체 변이체로 처리한 후 인간 단핵구의 전사체 프로파일
항-TREM1 12172 항체 변이체의 세포 프로파일을 추가로 특징규명하기 위해, ALS 질환 관련 리간드인 TREM1 리간드 복합체 또는 아폽토시스 유도 다분화능 줄기 세포(iPSC) 유래 인간 운동 뉴런에 의해 자극된 인간 단핵구에 대해 전사체 분석을 수행하였다. 음성 선택(Miltenyi, 130-117-337)을 통해 건강한 인간 공여자(n = 8)의 냉동보존된 말초 혈액 단핵 세포(PBMC)로부터 단핵구를 단리하였다. 단핵구 생존율 및 순도는 유세포분석에 의해 평가되었으며 ≥ 90%를 초과하였다. 단핵구를 6웰 플레이트(Falcon)에 웰당 2x106개 세포의 밀도로 시딩하고 12172 항체 변이체(1 nM)로 1시간 동안 전처리하였다. 그 다음, (i) TREM1을 활성화시키기 위해 바실러스 서브틸리스의 사전복합체화된 펩티도글리칸(PGN-BS; 3 ㎍/㎖; Invivogen, tlrl-pgnb3) 및 재조합 인간 펩티도글리칸 인식 단백질 1(PGLYRP1; 1 ㎍/㎖; R&D Systems, 2590-PGB) 또는 (ii) 자외선에 의해 유도된 아폽토시스 iPSC 유래 인간 운동 뉴런으로 단핵구를 4시간 동안 자극하였다. RNeasy 플러스 미니 키트(Qiagen)를 사용하여 RNA를 단리하고 Experion™ RNA 분석 키트(Bio-Rad)를 사용하여 RNA 품질을 평가하였다. NEBNext 울트라 II 방향성 RNA 라이브러리 프렙 키트(New England BioLabs)를 사용하여 시퀀싱 라이브러리를 제조하고 일루미나(Illumina) NovaSeq6000을 이용하여 샘플을 시퀀싱하였다.
도 11(a 및 b) 및 표 32에 나타낸 바와 같이, TREM1 리간드 복합체 자극 후, 12172 gL2gH11 및 12172 gL6gH6의 hIgG4P 포맷이 사용되었을 때 가장 높은 수의 유의미한 차등적으로 발현된 유전자(DEG)가 관찰되었다. 상위 DEG 중에서, 2개의 12172 hIgG4P 항체도 유사한 전사체 프로파일(예를 들어, HERC5, OAS1, DDX58, TNF-α의 하향조절)을 보였다. 이 프로파일은 선행기술의 항-TREM1 항체(0318-IgG1.3f)(도 11c)와 대조적이었다. 또한, 표 33에 나타낸 바와 같이, 0318-IgG1.3f로 처리된 단핵구와 비교하였을 때 12172 gL2gH11 hIgG4P로 처리된 단핵구에서 유의미하게 상향조절된 111개의 유전자 및 유의미하게 하향조절된 121개의 유전자가 있었다.
도 12(a 및 b) 및 표 34에 나타낸 바와 같이, TREM1 리간드 복합체 자극과 비교하였을 때 아폽토시스 iPSC 유래 인간 운동 뉴런으로 자극한 후 더 높은 수의 DEG가 있었다. 상위 DEG 중에서, 2개의 12172 hIgG4P 항체는 예를 들어, CCR2의 하향조절 및 IL-1RA를 코딩하는 유전자인 IL-1RN의 상향조절을 포함하는 일부 중첩을 보였다. 대조적으로, 상위 DEG는 선행기술의 항-TREM1 항체(0318-IgG1.3f)(도 12c)와 상이하였고, 이 항체를 사용하였을 때에는 IL-1RN의 유의미한 상향조절이 관찰되지 않았다. 또한, 표 35에 나타낸 바와 같이, 0318-IgG1.3f로 처리된 단핵구와 비교하였을 때 12172 gL2gH11 hIgG4P로 처리된 단핵구에서 유의미하게 상향조절된 598개의 유전자 및 유의미하게 하향조절된 808개의 유전자가 있었다.
실시예 26. 1차 인간 단핵구 및 호중구에 의한 TREM1 매개 식세포작용 및 반응성 산소 종(ROS)의 생성을 차단하는 데 있어서 12172 항체의 효능
항-미생물 면역 반응에 대한 TREM1 신호전달 차단의 영향을 평가하기 위해, 전혈 중의 활성화된 1차 인간 단핵구 및 호중구의 식세포작용 및 ROS 생성 둘 다를 유세포분석으로 평가하였다. ROS 생성을 조사하기 위해, 디하이드로로다민-123(5 ㎍/㎖)을 건강한 인간 공여자의 혈액(25 ㎕)에 5분 동안 첨가한 후, 12172 gL2gH11 hIgG4P 또는 0318-IgG1.3f 항체(10 ㎍/㎖)와 함께 추가 30분 동안 사전인큐베이션하였다. 그 다음, 전혈 샘플을 1x106개의 mCherry 발현 박테리아와 함께 1시간 동안 배양하였다. 샘플을 세척하고 CD45 및 CD14에 대한 표면 항체로 염색하여, 유세포분석으로 호중구와 단핵구를 구별하였다.
도 13에 나타낸 바와 같이, 12172 gL2gH11 hIgG4P 변이체는 호중구 또는 단핵구에 의한 박테리아 제거를 손상시키지 않았으며 반응성 산소 종을 생성하는 이들의 능력에도 영향을 미치지 않았다. 대조적으로, 0318-IgG1.3f의 분석은 호중구 및 단핵구 둘 다에 의한 대장균 유도 ROS 생성의 유의미한 감소를 보여주었다. 상기 면역 세포 유형 둘 다의 식세포작용 능력은 0318-IgG1.3f에 의해 유의미하게 영향을 받지 않았다.
실시예 27: 비장 티로신 키나제(SYK)의 TREM1 매개 활성화를 차단하는 데 있어서 12172 항체의 효능 및 효력
TREM1과 그의 어댑터 단백질 DAP-12의 결합은 DAP-12의 인산화 및 비장 티로신 키나제(SYK; Carrasco et al. 2018 Cell Mol Immunol)의 후속 동원과 인산화로 이어진다. SYK는 TREM1 매개 신경염증성 손상을 유발하는 데 이미 연루되어 있고(Xu et al. 2019 Cell Death Dis) 아밀로이드-β 침착 및 병리학적 타우(tau) 종의 형성 후에 활성화되는 것으로 알려져 있다(Schweig et al. 2017 Acta Neuropathol Commun). TREM1 매개 SYK 활성화를 차단하는 항-TREM1 12172 변이체 항체의 능력을 평가하기 위해, 인간 TREM1 및 인간 DAP-12를 안정적으로 발현하는 Flp-In™ 293 세포에서 인산화된 SYK(pSYK) 수준을 측정하였다. 세포를 384웰 플레이트(Greiner)에 웰당 25,000개 세포의 밀도로 시딩하고, 12172 변이체 항체 또는 이소타입 항체로 1시간 동안 전처리하고, 대장균의 사전복합체화된 펩티도글리칸(PGN-EC, 5 ㎍/㎖; Invivogen, tlrl-pgnb3) 및 재조합 인간 펩티도글리칸 인식 단백질 1(PGLYRP1; 2.5 ㎍/㎖; R&D Systems, 2590-PGB)로 자극하여 TREM1을 활성화시켰다. 30분 후에 단백질 용해물을 모아, 알파리사 슈어파이어 울트라(AlphaLISA SureFire Ultra) p-SYK(Tyr525/526) 어세이 키트®(PerkinElmer)를 사용하여 pSYK 수준을 측정하였다.
표 36 및 도 14에 나타낸 바와 같이, 4개의 12172 변이체 항체 모두가 TREM1 활성화 후 SYK 활성화를 차단하는 데 있어서 효율적이고(Emax = 57% 내지 72%) 강력한(357 내지 1015 pM) 반면, A33 이소타입 항체는 활성을 보이지 않았다.
실시예 28: 12172 gL2gH11 hIgG4P 세포 표면 TREM1 친화성 측정
살아있는 세포에서 발현된 인간 또는 사이노몰구스 TREM1에 결합하는 12172 gL2gH11 hIgG4P의 동역학을, 리간드트레이서(LigandTracer)를 이용하여 25℃에서 측정하였다. 인간 또는 사이노몰구스 TREM1을 발현시키기 위해 2개의 HEK293 다중클론 세포주를 사내에서 개발하였고, 모 정상 부착성 HEK293을 대조군 세포로서 사용하였다. 세 가지 세포 유형 모두를 태아 소 혈청(Invitrogen, 10082) 및 글루타맥스(Gibco, 35050061)로 보충된 생장 배지 DMEM(Gibco, 21969-035)에서 유지하였고, TREM1 다중클론 세포주에서 선택을 유지하기 위해 0.5 mg/㎖의 제네티신(Gibco, 10131-027)도 포함시켰다. 실험 전날, 1.4x106개의 세포를 제조업체의 설명서에 따라 폴리-D-라이신(Gibco, A38904-01)으로 미리 코팅한 리간드트레이서 멀티디쉬(MultiDish) 2×2(Ridgeview, 1-04-204-5)의 4분의 1 각각에 시딩하고 37℃/5% CO2에서 밤새 인큐베이션하였다. TREM1 발현 세포를 각각의 디쉬 구획의 1/4에 시딩하고 음성 발현 대조군 세포를 다른 1/4에 시딩하였다. 다음날 아침, 각각의 디쉬 구획(절반)에서 배지를 정확히 1.8 ㎖의 새로운 생장 배지(제네티신 없음)로 교환하고 리간드트레이서 기기에 넣었다. 회전을 시작하여 대략 20분 동안 또는 안정될 때까지 기준 판독값을 기록하였다. 회전을 중단하고 AlexaFluor647 표지가 부착된 12172 gL2gH11 hIgG4P(사내제조)를 예상된 12172 gL2gH11 hIgG4P KD에 가까운 농도인 0.5 nM의 농도로 첨가하였다. 회전을 다시 시작하고, 평형 정도를 표시하는 곡률이 관찰될 때까지(대략 2시간 소요) 항체와 세포의 실시간 결합을 나타내는 형광 측정치를 기록하였다. 이러한 방식으로 1.5 nM 및 5 nM에서 항체를 두 번 더 첨가하였는데, 각각은 마지막 농도보다 약 3배 더 높았다. 마지막으로, 항체를 함유하는 모든 배지를 제거하고 새로운 배지로 교체하였다. 해리 신호가 적어도 10% 떨어질 때까지 회전 및 측정을 계속하였거나, 해리가 느린 경우 회전 및 측정을 밤새 계속하였다. 친화성 측정치를 리간드트레이서 "TraceDrawer" 소프트웨어(버전 1.9.2) 내에서 분석하고 계산하였다. 대조군 세포와의 결합으로부터의 등가 판독값을 차감함으로써, 12172 gL2gH11 hIgG4P와 TREM1 발현 세포의 결합에 대한 원시 데이터 판독값을 먼저 정규화하였다. 상기 소프트웨어의 1:1 결합 모델을 사용하여 차감된 트레이스(trace)를 평가하였다. 1:1 모델이 데이터 트레이스에 적절하지 않은 경우 대안적 모델을 고려하였다. 12172 gL2gH11 hIgG4P는 인간 TREM1에 대해 16.5 pM의 친화성을 갖고 사이노 TREM1에 대해 더 약한 친화성, 즉 약 300배 더 약한 친화성을 가진 것으로 확인되었다. 동역학 파라미터는 표 37 및 38에 요약되어 있다. 12172 gL2gH11 hIgG4P는 1:1 모델에 의해 잘 표시되는 결합을 보였다. 느린 해리 속도는 리간드트레이서 기기가 정확한 범위의 한계에 가까워짐에 따라 측정하기 어렵지만, 5회 재현 실험은 유사한 데이터를 제공하였다. 12172 gL2gH11 hIgG4P와 사이노몰구스 TREM1의 결합은 현저히 더 복잡했으며 1:1 결합 모델에 피팅되지 않았다. 1:2 모델 또는 1:1-2 상태 모델은 데이터를 더 잘 나타내었고 유사한 친화성 값을 제공하였지만(모든 데이터가 표시되지는 않음), 이러한 대안적 피트 중 어떤 피트가 결합을 정확히 기술하는지를 확인하기 위해서는 추가 실험이 필요할 것이다. 그러나, 일반적으로, 인간 TREM1에 비해 사이노몰구스 TREM1에 대한 12172 gL2gH11 hIgG4P의 친화성은 대략 300배까지 분명히 감소되었다. 종합하건대, 12172 gL2gH11 hIgG4P는 세포에 대한 결합 결합력으로 인해 가용성 인간 TREM1 ECD(실시예 6)에 비해 세포 표면 인간 TREM1에 대해 더 강한 친화성을 나타내었고, 이때 두 방법들(비아코어 및 리간드트레이서)은 인간 TREM1에 비해 사이노몰구스 TREM1에 대한 12172 gL2gH11 hIgG4P의 상당히 더 약한 친화성을 보여주었다.
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SEQUENCE LISTING
<110> UCB Biopharma SRL
<120> ANTIBODIES
<130> PF0306-WO-PCT
<150> US 63/183280
<151> 2021-05-03
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65 70 75 80
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65 70 75 80
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85 90 95
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130 135 140
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Ala Ser Ser Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro
50 55 60
Lys Thr Leu Ala Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val
65 70 75 80
Gln Val Gly Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu
85 90 95
Arg Val Arg Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln
100 105 110
Cys Val Ile Tyr Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg
115 120 125
Ile Arg Leu Val Val Thr Lys Gly Phe Ser Gly Thr Pro Gly Ser Asn
130 135 140
Glu Asn Ser Thr Gln Asn Val Tyr Lys Ile Pro Pro Thr Thr Thr Lys
145 150 155 160
Ala Leu Cys Pro Leu Tyr Thr Ser Pro Arg Thr Val Thr Gln Ala Pro
165 170 175
Pro Lys Ser Thr Ala Asp Val Ser Thr Pro Asp Ser Glu Ile Asn Leu
180 185 190
Thr Asn Val Thr Asp Ile Ile Arg Leu Glu Gly Gly Gly Ser Gly Gly
195 200 205
Ser Gly Gly Leu Asn Asp Ile Phe Glu Ala Gln Lys Ile Glu Trp His
210 215 220
Glu Asn Leu Tyr Phe Gln Gly Gly Ser His His His His His His Lys
225 230 235 240
Ala Lys Gly Ser Lys Gly Lys Gly Ser Lys Lys Ala Gly His His His
245 250 255
His His His His His His His
260
<210> 8
<211> 264
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CID101953 cTREM1_1-201-Avi-Tev-HKH
<400> 8
Met Arg Lys Thr Arg Leu Trp Gly Leu Leu Trp Met Leu Phe Val Ser
1 5 10 15
Glu Leu Arg Ala Thr Thr Glu Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Tyr Lys
20 25 30
Glu Gly Gln Thr Leu Glu Val Lys Cys Asp Tyr Ala Leu Glu Lys Tyr
35 40 45
Ala Asn Ser Arg Lys Ala Trp Gln Lys Met Glu Gly Lys Met Pro Lys
50 55 60
Ile Leu Ala Lys Thr Glu Arg Pro Ser Glu Asn Ser His Pro Val Gln
65 70 75 80
Val Gly Arg Ile Thr Leu Glu Asp Tyr Pro Asp His Gly Leu Leu Gln
85 90 95
Val Arg Met Thr Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys
100 105 110
Val Ile Tyr Gln His Pro Lys Glu Ser His Val Leu Phe Asn Pro Ile
115 120 125
Cys Leu Val Val Thr Lys Gly Ser Ser Gly Thr Pro Gly Ser Ser Glu
130 135 140
Asn Ser Thr Gln Asn Val Tyr Arg Thr Pro Ser Thr Thr Ala Lys Ala
145 150 155 160
Leu Gly Pro Arg Tyr Thr Ser Pro Arg Thr Val Thr Gln Ala Pro Pro
165 170 175
Glu Ser Thr Val Val Val Ser Thr Pro Gly Ser Glu Ile Asn Leu Thr
180 185 190
Asn Val Thr Asp Ile Ile Arg Val Pro Leu Glu Gly Gly Gly Ser Gly
195 200 205
Gly Ser Gly Gly Leu Asn Asp Ile Phe Glu Ala Gln Lys Ile Glu Trp
210 215 220
His Glu Asn Leu Tyr Phe Gln Gly Gly Ser His His His His His His
225 230 235 240
Lys Ala Lys Gly Ser Lys Gly Lys Gly Ser Lys Lys Ala Gly His His
245 250 255
His His His His His His His His
260
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<211> 215
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CID101907 hTREM1 IgV (His-Smt-TREM1_21-139)
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Lys Pro Glu Thr His Ile Asn Leu Lys Val Ser Asp Gly Ser Ser Glu
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Ile Phe Phe Lys Ile Lys Lys Thr Thr Pro Leu Arg Arg Leu Met Glu
35 40 45
Ala Phe Ala Lys Arg Gln Gly Lys Glu Met Asp Ser Leu Arg Phe Leu
50 55 60
Tyr Asp Gly Ile Arg Ile Gln Ala Asp Gln Thr Pro Glu Asp Leu Asp
65 70 75 80
Met Glu Asp Asn Asp Ile Ile Glu Ala His Arg Glu Gln Ile Gly Gly
85 90 95
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
100 105 110
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
115 120 125
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
130 135 140
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
145 150 155 160
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
165 170 175
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
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Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
195 200 205
Val Thr Lys Gly Phe Ser Gly
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CID101951 hPGLYRP1_1-196-His
<400> 10
Met Ser Arg Arg Ser Met Leu Leu Ala Trp Ala Leu Pro Ser Leu Leu
1 5 10 15
Arg Leu Gly Ala Ala Gln Glu Thr Glu Asp Pro Ala Cys Cys Ser Pro
20 25 30
Ile Val Pro Arg Asn Glu Trp Lys Ala Leu Ala Ser Glu Cys Ala Gln
35 40 45
His Leu Ser Leu Pro Leu Arg Tyr Val Val Val Ser His Thr Ala Gly
50 55 60
Ser Ser Cys Asn Thr Pro Ala Ser Cys Gln Gln Gln Ala Arg Asn Val
65 70 75 80
Gln His Tyr His Met Lys Thr Leu Gly Trp Cys Asp Val Gly Tyr Asn
85 90 95
Phe Leu Ile Gly Glu Asp Gly Leu Val Tyr Glu Gly Arg Gly Trp Asn
100 105 110
Phe Thr Gly Ala His Ser Gly His Leu Trp Asn Pro Met Ser Ile Gly
115 120 125
Ile Ser Phe Met Gly Asn Tyr Met Asp Arg Val Pro Thr Pro Gln Ala
130 135 140
Ile Arg Ala Ala Gln Gly Leu Leu Ala Cys Gly Val Ala Gln Gly Ala
145 150 155 160
Leu Arg Ser Asn Tyr Val Leu Lys Gly His Arg Asp Val Gln Arg Thr
165 170 175
Leu Ser Pro Gly Asn Gln Leu Tyr His Leu Ile Gln Asn Trp Pro His
180 185 190
Tyr Arg Ser Pro His His His His His His
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<211> 11
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
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Lys Ala Ala Thr Leu Ala Ser
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Gln Gln Tyr Tyr Tyr Gly Ser Ala Gly Ala Asp Thr Asp Thr
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Gly Phe Ser Leu Ser Ser Tyr Ala Met Thr
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Ile Ile Tyr Ala Gly Gly Ser Pro Ser Tyr Ala Ser Trp Ala Lys Gly
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Gly Thr Gly Asp Thr Val Tyr Thr Tyr Phe Asn Ile
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<213> Artificial Sequence
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<223> Rabbit Ab 12172 VL region
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Ala Val Val Leu Thr Gln Thr Ala Ser Pro Val Ser Ala Pro Val Gly
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Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Glu Pro Gly Gln Pro Pro Lys Leu Leu Ile
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Tyr Lys Ala Ala Thr Leu Ala Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Lys Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Gly Val Gln Cys
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Glu Asp Gly Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Tyr Tyr Gly Ser Ala
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Gly Ala Asp Thr Asp Thr Phe Gly Gly Gly Thr Glu Val Val Val Lys
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Rabbit Ab 12172 VL region
<400> 18
gccgtcgtgc tgacccagac tgcatccccc gtgtctgcac ctgtgggagg cacagtcacc 60
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gggcagccac ccaagctcct gatctacaag gcagccactc tggcatctgg ggtcccatcg 180
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CID102770: Rabbit Ab 12172 light chain (Fab)
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Ala Val Val Leu Thr Gln Thr Ala Ser Pro Val Ser Ala Pro Val Gly
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Gly Thr Val Thr Ile Lys Cys Gln Ala Ser Gln Asn Ile Gly Ser Asp
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Glu Pro Gly Gln Pro Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Lys Ala Ala Thr Leu Ala Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Lys Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Gly Val Gln Cys
65 70 75 80
Glu Asp Gly Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Tyr Tyr Gly Ser Ala
85 90 95
Gly Ala Asp Thr Asp Thr Phe Gly Gly Gly Thr Glu Val Val Val Lys
100 105 110
Arg Thr Pro Val Ala Pro Thr Val Leu Ile Phe Pro Pro Ala Ala Asp
115 120 125
Gln Val Ala Thr Gly Thr Val Thr Ile Val Cys Val Ala Asn Lys Tyr
130 135 140
Phe Pro Asp Val Thr Val Thr Trp Glu Val Asp Gly Thr Thr Gln Thr
145 150 155 160
Thr Gly Ile Glu Asn Ser Lys Thr Pro Gln Asn Ser Ala Asp Cys Thr
165 170 175
Tyr Asn Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Thr Ser Thr Gln Tyr Asn Ser
180 185 190
His Lys Glu Tyr Thr Cys Lys Val Thr Gln Gly Thr Thr Ser Val Val
195 200 205
Gln Ser Phe Asn Arg Gly Asp Cys
210 215
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<211> 648
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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<223> Rabbit Ab 12172 light chain
<400> 20
gccgtcgtgc tgacccagac tgcatccccc gtgtctgcac ctgtgggagg cacagtcacc 60
atcaagtgcc aggccagtca gaacattggt agcgacttag cctggtatca gcaggaacca 120
gggcagccac ccaagctcct gatctacaag gcagccactc tggcatctgg ggtcccatcg 180
cggttcaaag gcagtggatc tgggacagag ttcactctca ccatcagtgg cgtgcagtgt 240
gaagatggtg ccacttacta ctgtcaacag tattattatg gtagtgctgg tgctgatacg 300
gatactttcg gcggagggac cgaggtggtg gtcaaacgta cgccagttgc acctactgtc 360
ctcatcttcc caccagctgc tgatcaggtg gcaactggaa cagtcaccat cgtgtgtgtg 420
gcgaataaat actttcccga tgtcaccgtc acctgggagg tggatggcac cacccaaaca 480
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<213> Artificial Sequence
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<223> Rabbit Ab 12172 VH region
<400> 21
Gln Ser Leu Glu Glu Ser Gly Gly Arg Leu Val Thr Pro Gly Thr Pro
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Leu Thr Leu Thr Cys Thr Ala Ser Gly Phe Ser Leu Ser Ser Tyr Ala
20 25 30
Met Thr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Gly
35 40 45
Ile Ile Tyr Ala Gly Gly Ser Pro Ser Tyr Ala Ser Trp Ala Lys Gly
50 55 60
Arg Phe Thr Ile Ser Lys Thr Ser Thr Thr Val Asp Leu Lys Met Thr
65 70 75 80
Ser Pro Thr Thr Glu Asp Thr Ala Thr Tyr Phe Cys Ala Arg Gly Thr
85 90 95
Gly Asp Thr Val Tyr Thr Tyr Phe Asn Ile Trp Gly Pro Gly Thr Leu
100 105 110
Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 22
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Rabbit Ab 12172 VH region
<400> 22
cagtcgctgg aggagtccgg gggtcgcctg gtcacgcctg ggacacccct gacactcacc 60
tgcacagcct ctggattctc cctcagtagc tatgcaatga cctgggtccg ccaggctcca 120
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<211> 220
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CID120769: Rabbit Ab 12172 heavy chain (Fab)
<400> 23
Gln Ser Leu Glu Glu Ser Gly Gly Arg Leu Val Thr Pro Gly Thr Pro
1 5 10 15
Leu Thr Leu Thr Cys Thr Ala Ser Gly Phe Ser Leu Ser Ser Tyr Ala
20 25 30
Met Thr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Gly
35 40 45
Ile Ile Tyr Ala Gly Gly Ser Pro Ser Tyr Ala Ser Trp Ala Lys Gly
50 55 60
Arg Phe Thr Ile Ser Lys Thr Ser Thr Thr Val Asp Leu Lys Met Thr
65 70 75 80
Ser Pro Thr Thr Glu Asp Thr Ala Thr Tyr Phe Cys Ala Arg Gly Thr
85 90 95
Gly Asp Thr Val Tyr Thr Tyr Phe Asn Ile Trp Gly Pro Gly Thr Leu
100 105 110
Val Thr Val Ser Ser Gly Gln Pro Lys Ala Pro Ser Val Phe Pro Leu
115 120 125
Ala Pro Cys Cys Gly Asp Thr Pro Ser Ser Thr Val Thr Leu Gly Cys
130 135 140
Leu Val Lys Gly Tyr Leu Pro Glu Pro Val Thr Val Thr Trp Asn Ser
145 150 155 160
Gly Thr Leu Thr Asn Gly Val Arg Thr Phe Pro Ser Val Arg Gln Ser
165 170 175
Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Ser Val Thr Ser Ser Ser
180 185 190
Gln Pro Val Thr Cys Asn Val Ala His Pro Ala Thr Asn Thr Lys Val
195 200 205
Asp Lys Thr Val Ala Pro Ser Thr Cys Ser Lys Pro
210 215 220
<210> 24
<211> 660
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Rabbit Ab 12172 heavy chain (Fab)
<400> 24
cagtcgctgg aggagtccgg gggtcgcctg gtcacgcctg ggacacccct gacactcacc 60
tgcacagcct ctggattctc cctcagtagc tatgcaatga cctgggtccg ccaggctcca 120
gggaaggggc tggaatggat cggaatcatt tatgctggtg gtagcccatc ctacgcgagc 180
tgggcgaaag gccgattcac catctccaaa acctcgacca cggtggatct gaaaatgacc 240
agtccgacaa ccgaggacac ggccacctat ttctgtgcca gagggactgg tgatactgtt 300
tatacctact ttaatatttg gggcccaggc accctggtca ccgtctcgag tgggcaacct 360
aaggctccat cagtcttccc actggccccc tgctgcgggg acacacccag ctccacggtg 420
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ggcaccctca ccaatggggt acgcaccttc ccgtccgtcc ggcagtcctc aggcctctac 540
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<213> Artificial Sequence
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Ala Val Val Leu Thr Gln Ser Pro Ser Phe Leu Ser Ala Ser Val Gly
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Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
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Tyr Lys Ala Ala Thr Leu Ala Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Tyr Tyr Gly Ser Ala
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Gly Ala Asp Thr Asp Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
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<213> Artificial Sequence
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<400> 26
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 12172gL1 light chain
<400> 27
Ala Val Val Leu Thr Gln Ser Pro Ser Phe Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Gln Ala Ser Gln Asn Ile Gly Ser Asp
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Lys Ala Ala Thr Leu Ala Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Tyr Tyr Gly Ser Ala
85 90 95
Gly Ala Asp Thr Asp Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105 110
Arg Thr Val Ala Ala Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu
115 120 125
Gln Leu Lys Ser Gly Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe
130 135 140
Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln
145 150 155 160
Ser Gly Asn Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser
165 170 175
Thr Tyr Ser Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu
180 185 190
Lys His Lys Val Tyr Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser
195 200 205
Pro Val Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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<223> 12172gL1 light chain
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gccgtggtgc tgactcagtc cccctccttc ctgagcgcct cagtgggaga tcgcgtgacc 60
atcacctgtc aagccagcca gaacattggg tccgacttgg cctggtatca gcagaagcct 120
ggcaaagcgc cgaagctgct gatctacaag gccgctactc tcgcgtcggg agtgccatcc 180
cggttttccg gttcgggaag cgggaccgag ttcaccctta ccatttcctc gctccaaccg 240
gaggacttcg ccacgtacta ctgccagcag tactactacg gttcagccgg agcagacact 300
gataccttcg gcggaggcac caaggtcgaa atcaagcgta cggtagcggc cccatctgtc 360
ttcatcttcc cgccatctga tgagcagttg aaatctggaa ctgcctctgt tgtgtgcctg 420
ctgaataact tctatcccag agaggccaaa gtacagtgga aggtggataa cgccctccaa 480
tcgggtaact cccaggagag tgtcacagag caggacagca aggacagcac ctacagcctc 540
agcagcaccc tgacgctgag caaagcagac tacgagaaac acaaagtcta cgcctgcgaa 600
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 12172gL2 V-region
<400> 29
Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Phe Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
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20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Lys Ala Ala Thr Leu Ala Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Tyr Tyr Gly Ser Ala
85 90 95
Gly Ala Asp Thr Asp Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105 110
<210> 30
<211> 336
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 12172gL2 V-region
<400> 30
gacatccagc tgactcagtc cccctccttc ctgagcgcct cagtgggaga tcgcgtgacc 60
atcacctgtc aagccagcca gaacattggg tccgacttgg cctggtatca gcagaagcct 120
ggcaaagcgc cgaagctgct gatctacaag gccgctactc tcgcgtcggg agtgccatcc 180
cggttttccg gttcgggaag cgggaccgag ttcaccctta ccatttcctc gctccaaccg 240
gaggacttcg ccacgtacta ctgccagcag tactactacg gttcagccgg agcagacact 300
gataccttcg gcggaggcac caaggtcgaa atcaag 336
<210> 31
<211> 219
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 12172gL2 light chain
<400> 31
Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Phe Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Gln Ala Ser Gln Asn Ile Gly Ser Asp
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Lys Ala Ala Thr Leu Ala Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Tyr Tyr Gly Ser Ala
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Gly Ala Asp Thr Asp Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105 110
Arg Thr Val Ala Ala Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu
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Gln Leu Lys Ser Gly Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe
130 135 140
Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln
145 150 155 160
Ser Gly Asn Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser
165 170 175
Thr Tyr Ser Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu
180 185 190
Lys His Lys Val Tyr Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser
195 200 205
Pro Val Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys
210 215
<210> 32
<211> 657
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 12172gL2 light chain
<400> 32
gacatccagc tgactcagtc cccctccttc ctgagcgcct cagtgggaga tcgcgtgacc 60
atcacctgtc aagccagcca gaacattggg tccgacttgg cctggtatca gcagaagcct 120
ggcaaagcgc cgaagctgct gatctacaag gccgctactc tcgcgtcggg agtgccatcc 180
cggttttccg gttcgggaag cgggaccgag ttcaccctta ccatttcctc gctccaaccg 240
gaggacttcg ccacgtacta ctgccagcag tactactacg gttcagccgg agcagacact 300
gataccttcg gcggaggcac caaggtcgaa atcaagcgta cggtggccgc tccctccgtg 360
ttcatcttcc caccctccga cgagcagctg aagtccggca ccgcctccgt cgtgtgcctg 420
ctgaacaact tctacccccg cgaggccaag gtgcagtgga aggtggacaa cgccctgcag 480
tccggcaact cccaggaatc cgtcaccgag caggactcca aggacagcac ctactccctg 540
tcctccaccc tgaccctgtc caaggccgac tacgagaagc acaaggtgta cgcctgcgaa 600
gtgacccacc agggcctgtc cagccccgtg accaagtcct tcaaccgggg cgagtgc 657
<210> 33
<211> 112
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 12172gL6 V-region
<400> 33
Asp Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ser Phe Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Gln Ala Ser Gln Asn Ile Gly Ser Asp
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Lys Ala Ala Thr Leu Ala Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Tyr Tyr Gly Ser Ala
85 90 95
Gly Ala Asp Thr Asp Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105 110
<210> 34
<211> 336
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 12172gL6 V-region
<400> 34
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ggcaaagcgc cgaagctgct gatctacaag gccgctactc tcgcgtcggg agtgccatcc 180
cggttttccg gttcgggaag cgggaccgag ttcaccctta ccatttcctc gctccaaccg 240
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 12172gL6 light chain
<400> 35
Asp Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ser Phe Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Gln Ala Ser Gln Asn Ile Gly Ser Asp
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Lys Ala Ala Thr Leu Ala Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Tyr Tyr Gly Ser Ala
85 90 95
Gly Ala Asp Thr Asp Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105 110
Arg Thr Val Ala Ala Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu
115 120 125
Gln Leu Lys Ser Gly Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe
130 135 140
Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln
145 150 155 160
Ser Gly Asn Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser
165 170 175
Thr Tyr Ser Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu
180 185 190
Lys His Lys Val Tyr Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser
195 200 205
Pro Val Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys
210 215
<210> 36
<211> 657
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 12172gL6 light chain
<400> 36
gacatcgtgc tgactcagtc cccctccttc ctgagcgcct cagtgggaga tcgcgtgacc 60
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ggcaaagcgc cgaagctgct gatctacaag gccgctactc tcgcgtcggg agtgccatcc 180
cggttttccg gttcgggaag cgggaccgag ttcaccctta ccatttcctc gctccaaccg 240
gaggacttcg ccacgtacta ctgccagcag tactactacg gttcagccgg agcagacact 300
gataccttcg gcggaggcac caaggtcgaa atcaagcgta cggtggccgc tccctccgtg 360
ttcatcttcc caccctccga cgagcagctg aagtccggca ccgcctccgt cgtgtgcctg 420
ctgaacaact tctacccccg cgaggccaag gtgcagtgga aggtggacaa cgccctgcag 480
tccggcaact cccaggaatc cgtcaccgag caggactcca aggacagcac ctactccctg 540
tcctccaccc tgaccctgtc caaggccgac tacgagaagc acaaggtgta cgcctgcgaa 600
gtgacccacc agggcctgtc cagccccgtg accaagtcct tcaaccgggg cgagtgc 657
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 12172gL9 V-region
<400> 37
Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Phe Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Ser Val Thr Ile Thr Cys Gln Ala Ser Gln Asn Ile Gly Ser Asp
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Lys Ala Ala Thr Leu Ala Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Tyr Tyr Gly Ser Ala
85 90 95
Gly Ala Asp Thr Asp Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105 110
<210> 38
<211> 336
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 12172gL9 V-region
<400> 38
gacatccagc tgactcagtc cccctccttc ctgagcgcct cagtgggaga tagcgtgacc 60
atcacctgtc aagccagcca gaacattggg tccgacttgg cctggtatca gcagaagcct 120
ggcaaagcgc cgaagctgct gatctacaag gccgctactc tcgcgtcggg agtgccatcc 180
cggttttccg gttcgggaag cgggaccgag ttcaccctta ccatttcctc gctccaaccg 240
gaggacttcg ccacgtacta ctgccagcag tactactacg gttcagccgg agcagacact 300
gataccttcg gcggaggcac caaggtcgaa atcaag 336
<210> 39
<211> 219
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 12172gL9 light chain
<400> 39
Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Phe Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Ser Val Thr Ile Thr Cys Gln Ala Ser Gln Asn Ile Gly Ser Asp
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Lys Ala Ala Thr Leu Ala Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Tyr Tyr Gly Ser Ala
85 90 95
Gly Ala Asp Thr Asp Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105 110
Arg Thr Val Ala Ala Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu
115 120 125
Gln Leu Lys Ser Gly Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe
130 135 140
Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln
145 150 155 160
Ser Gly Asn Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser
165 170 175
Thr Tyr Ser Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu
180 185 190
Lys His Lys Val Tyr Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser
195 200 205
Pro Val Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys
210 215
<210> 40
<211> 657
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 12172gL9 light chain
<400> 40
gacatccagc tgactcagtc cccctccttc ctgagcgcct cagtgggaga tagcgtgacc 60
atcacctgtc aagccagcca gaacattggg tccgacttgg cctggtatca gcagaagcct 120
ggcaaagcgc cgaagctgct gatctacaag gccgctactc tcgcgtcggg agtgccatcc 180
cggttttccg gttcgggaag cgggaccgag ttcaccctta ccatttcctc gctccaaccg 240
gaggacttcg ccacgtacta ctgccagcag tactactacg gttcagccgg agcagacact 300
gataccttcg gcggaggcac caaggtcgaa atcaagcgta cggtagcggc cccatctgtc 360
ttcatcttcc cgccatctga tgagcagttg aaatctggaa ctgcctctgt tgtgtgcctg 420
ctgaataact tctatcccag agaggccaaa gtacagtgga aggtggataa cgccctccaa 480
tcgggtaact cccaggagag tgtcacagag caggacagca aggacagcac ctacagcctc 540
agcagcaccc tgacgctgag caaagcagac tacgagaaac acaaagtcta cgcctgcgaa 600
gtcacccatc agggcctgag ctcgcccgtc acaaagagct tcaacagggg agagtgt 657
<210> 41
<211> 112
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 12172gL11 V-region
<400> 41
Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Phe Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Gln Ala Ser Gln Asn Ile Gly Ser Asp
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Ser Ala Ala Thr Leu Ala Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Tyr Tyr Gly Ser Ala
85 90 95
Gly Ala Asp Thr Asp Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105 110
<210> 42
<211> 336
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 12172gL11 V-region
<400> 42
gacatccagc tgactcagtc cccctccttc ctgagcgcct cagtgggaga tcgcgtgacc 60
atcacctgtc aagccagcca gaacattggg tccgacttgg cctggtatca gcagaagcct 120
ggcaaagcgc cgaagctgct gatctacagc gccgctactc tcgcgtcggg agtgccatcc 180
cggttttccg gttcgggaag cgggaccgag ttcaccctta ccatttcctc gctccaaccg 240
gaggacttcg ccacgtacta ctgccagcag tactactacg gttcagccgg agcagacact 300
gataccttcg gcggaggcac caaggtcgaa atcaag 336
<210> 43
<211> 219
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 12172gL11 light chain
<400> 43
Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Phe Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Gln Ala Ser Gln Asn Ile Gly Ser Asp
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Ser Ala Ala Thr Leu Ala Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Tyr Tyr Gly Ser Ala
85 90 95
Gly Ala Asp Thr Asp Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105 110
Arg Thr Val Ala Ala Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu
115 120 125
Gln Leu Lys Ser Gly Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe
130 135 140
Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln
145 150 155 160
Ser Gly Asn Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser
165 170 175
Thr Tyr Ser Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu
180 185 190
Lys His Lys Val Tyr Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser
195 200 205
Pro Val Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys
210 215
<210> 44
<211> 657
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 12172gL11 light chain
<400> 44
gacatccagc tgactcagtc cccctccttc ctgagcgcct cagtgggaga tcgcgtgacc 60
atcacctgtc aagccagcca gaacattggg tccgacttgg cctggtatca gcagaagcct 120
ggcaaagcgc cgaagctgct gatctacagc gccgctactc tcgcgtcggg agtgccatcc 180
cggttttccg gttcgggaag cgggaccgag ttcaccctta ccatttcctc gctccaaccg 240
gaggacttcg ccacgtacta ctgccagcag tactactacg gttcagccgg agcagacact 300
gataccttcg gcggaggcac caaggtcgaa atcaagcgta cggtagcggc cccatctgtc 360
ttcatcttcc cgccatctga tgagcagttg aaatctggaa ctgcctctgt tgtgtgcctg 420
ctgaataact tctatcccag agaggccaaa gtacagtgga aggtggataa cgccctccaa 480
tcgggtaact cccaggagag tgtcacagag caggacagca aggacagcac ctacagcctc 540
agcagcaccc tgacgctgag caaagcagac tacgagaaac acaaagtcta cgcctgcgaa 600
gtcacccatc agggcctgag ctcgcccgtc acaaagagct tcaacagggg agagtgt 657
<210> 45
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 12172gH1 V-region
<400> 45
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Thr Ala Ser Gly Phe Ser Leu Ser Ser Tyr
20 25 30
Ala Met Thr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Ile Ile Tyr Ala Gly Gly Ser Pro Ser Tyr Ala Ser Trp Ala Lys
50 55 60
Gly Arg Phe Thr Ile Ser Lys Asp Ser Ser Lys Asn Thr Val Tyr Leu
65 70 75 80
Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95
Arg Gly Thr Gly Asp Thr Val Tyr Thr Tyr Phe Asn Ile Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 46
<211> 360
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 12172gH1 V-region
<400> 46
gaagtgcagc tcgtggagtc gggcggaggt ctggtgcagc ccggaggaag cctgcgcctg 60
tcatgcaccg ccagcgggtt ctcgctttcc tcctacgcca tgacctgggt cagacaggca 120
ccgggaaagg gcctcgaatg gattggcatt atctatgcgg gtggcagccc ttcctacgcc 180
tcctgggcta aagggcggtt caccatctcg aaggactcct ccaagaacac ggtgtacttg 240
caaatgaact cactgagggc cgaggacact gcggtgtact actgtgcccg gggaactgga 300
gataccgtgt acacctactt taacatctgg ggccagggaa ccctggtcac tgtctcgagc 360
<210> 47
<211> 447
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 12172gH1 heavy chain (IgG4P)
<400> 47
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Thr Ala Ser Gly Phe Ser Leu Ser Ser Tyr
20 25 30
Ala Met Thr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Ile Ile Tyr Ala Gly Gly Ser Pro Ser Tyr Ala Ser Trp Ala Lys
50 55 60
Gly Arg Phe Thr Ile Ser Lys Asp Ser Ser Lys Asn Thr Val Tyr Leu
65 70 75 80
Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95
Arg Gly Thr Gly Asp Thr Val Tyr Thr Tyr Phe Asn Ile Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val
115 120 125
Phe Pro Leu Ala Pro Cys Ser Arg Ser Thr Ser Glu Ser Thr Ala Ala
130 135 140
Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser
145 150 155 160
Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val
165 170 175
Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro
180 185 190
Ser Ser Ser Leu Gly Thr Lys Thr Tyr Thr Cys Asn Val Asp His Lys
195 200 205
Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Arg Val Glu Ser Lys Tyr Gly Pro
210 215 220
Pro Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Phe Leu Gly Gly Pro Ser Val
225 230 235 240
Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr
245 250 255
Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser Gln Glu Asp Pro Glu
260 265 270
Val Gln Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys
275 280 285
Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Phe Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser
290 295 300
Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys
305 310 315 320
Cys Lys Val Ser Asn Lys Gly Leu Pro Ser Ser Ile Glu Lys Thr Ile
325 330 335
Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro
340 345 350
Pro Ser Gln Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu
355 360 365
Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn
370 375 380
Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser
385 390 395 400
Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Arg Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg
405 410 415
Trp Gln Glu Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu
420 425 430
His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Leu Gly Lys
435 440 445
<210> 48
<211> 1341
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 12172gH1 heavy chain (IgG4P)
<400> 48
gaagtgcagc tcgtggagtc gggcggaggt ctggtgcagc ccggaggaag cctgcgcctg 60
tcatgcaccg ccagcgggtt ctcgctttcc tcctacgcca tgacctgggt cagacaggca 120
ccgggaaagg gcctcgaatg gattggcatt atctatgcgg gtggcagccc ttcctacgcc 180
tcctgggcta aagggcggtt caccatctcg aaggactcct ccaagaacac ggtgtacttg 240
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aaatatggtc ccccatgccc accatgccca gcacctgagt tcctgggggg accatcagtc 720
ttcctgttcc ccccaaaacc caaggacact ctcatgatct cccggacccc tgaggtcacg 780
tgcgtggtgg tggacgtgag ccaggaagac cccgaggtcc agttcaactg gtacgtggat 840
ggcgtggagg tgcataatgc caagacaaag ccgcgggagg agcagttcaa cagcacgtac 900
cgtgtggtca gcgtcctcac cgtcctgcac caggactggc tgaacggcaa ggagtacaag 960
tgcaaggtct ccaacaaagg cctcccgtcc tccatcgaga aaaccatctc caaagccaaa 1020
gggcagcccc gagagccaca ggtgtacacc ctgcccccat cccaggagga gatgaccaag 1080
aaccaggtca gcctgacctg cctggtcaaa ggcttctacc ccagcgacat cgccgtggag 1140
tgggagagca atgggcagcc ggagaacaac tacaagacca cgcctcccgt gctggactcc 1200
gacggctcct tcttcctcta cagcaggcta accgtggaca agagcaggtg gcaggagggg 1260
aatgtcttct catgctccgt gatgcatgag gctctgcaca accactacac acagaagagc 1320
ctctccctgt ctctgggtaa a 1341
<210> 49
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 12172gH2 V-region
<400> 49
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Ser Leu Ser Ser Tyr
20 25 30
Ala Met Thr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Gly Ile Ile Tyr Ala Gly Gly Ser Pro Ser Tyr Ala Ser Trp Ala Lys
50 55 60
Gly Arg Phe Thr Ile Ser Lys Asp Ser Ser Lys Asn Thr Val Tyr Leu
65 70 75 80
Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95
Arg Gly Thr Gly Asp Thr Val Tyr Thr Tyr Phe Asn Ile Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 50
<211> 360
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 12172gH2 V-region
<400> 50
gaagtgcagc tcgtggagtc gggcggaggt ctggtgcagc ccggaggaag cctgcgcctg 60
tcatgcgctg ccagcgggtt ctcgctttcc tcctacgcca tgacctgggt cagacaggca 120
ccgggaaagg gcctcgaatg ggtcggcatt atctatgcgg gtggcagccc ttcctacgcc 180
tcctgggcta aagggcggtt caccatctcg aaggactcct ccaagaacac ggtgtacttg 240
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gataccgtgt acacctactt taacatctgg ggccagggaa ccctggtcac tgtctcgagc 360
<210> 51
<211> 447
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 12172gH2 heavy chain (IgG4P)
<400> 51
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Ser Leu Ser Ser Tyr
20 25 30
Ala Met Thr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Gly Ile Ile Tyr Ala Gly Gly Ser Pro Ser Tyr Ala Ser Trp Ala Lys
50 55 60
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65 70 75 80
Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95
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<220>
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Gly Arg Phe Thr Ile Ser Lys Asp Ser Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu
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<213> Artificial Sequence
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<220>
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275 280 285
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Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val
115 120 125
Phe Pro Leu Ala Pro Cys Ser Arg Ser Thr Ser Glu Ser Thr Ala Ala
130 135 140
Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser
145 150 155 160
Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val
165 170 175
Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro
180 185 190
Ser Ser Ser Leu Gly Thr Lys Thr Tyr Thr Cys Asn Val Asp His Lys
195 200 205
Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Arg Val Glu Ser Lys Tyr Gly Pro
210 215 220
Pro Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Phe Leu Gly Gly Pro Ser Val
225 230 235 240
Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr
245 250 255
Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser Gln Glu Asp Pro Glu
260 265 270
Val Gln Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys
275 280 285
Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Phe Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser
290 295 300
Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys
305 310 315 320
Cys Lys Val Ser Asn Lys Gly Leu Pro Ser Ser Ile Glu Lys Thr Ile
325 330 335
Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro
340 345 350
Pro Ser Gln Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu
355 360 365
Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn
370 375 380
Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser
385 390 395 400
Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Arg Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg
405 410 415
Trp Gln Glu Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu
420 425 430
His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Leu Gly Lys
435 440 445
<210> 100
<211> 1341
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 12172gH48 heavy chain (hIgG4P)
<400> 100
gaagtgcagc tcgtggagtc gggcggaggt ctggtgcagc ccggaggaag cctgcgcctg 60
tcatgcgctg ccagcgggtt ctcgctttcc tcctacgcca tgacctgggt cagacaggca 120
ccgggaaagg gcctcgaatg gattggcatt atctatgcgg gtggcagccc ttcctacgcc 180
tcctgggcta aagggcggtt caccatctcg aaggacaatt cccagaacac gctgtacttg 240
caaatgaact cactgagggc cgaggacact gcggtgtact actgtgcccg gggaactgga 300
gataccgtgt acacctactt taacatctgg ggccagggaa ccctggtcac tgtctcgagc 360
gcttctacaa agggcccatc cgtcttcccc ctggcgccct gctccaggag cacctccgag 420
agcacagccg ccctgggctg cctggtcaag gactacttcc ccgaaccggt gacggtgtcg 480
tggaactcag gcgccctgac cagcggcgtg cacaccttcc cggctgtcct acagtcctca 540
ggactctact ccctcagcag cgtggtgacc gtgccctcca gcagcttggg cacgaagacc 600
tacacctgca acgtagatca caagcccagc aacaccaagg tggacaagag agttgagtcc 660
aaatatggtc ccccatgccc accatgccca gcacctgagt tcctgggggg accatcagtc 720
ttcctgttcc ccccaaaacc caaggacact ctcatgatct cccggacccc tgaggtcacg 780
tgcgtggtgg tggacgtgag ccaggaagac cccgaggtcc agttcaactg gtacgtggat 840
ggcgtggagg tgcataatgc caagacaaag ccgcgggagg agcagttcaa cagcacgtac 900
cgtgtggtca gcgtcctcac cgtcctgcac caggactggc tgaacggcaa ggagtacaag 960
tgcaaggtct ccaacaaagg cctcccgtcc tccatcgaga aaaccatctc caaagccaaa 1020
gggcagcccc gagagccaca ggtgtacacc ctgcccccat cccaggagga gatgaccaag 1080
aaccaggtca gcctgacctg cctggtcaaa ggcttctacc ccagcgacat cgccgtggag 1140
tgggagagca atgggcagcc ggagaacaac tacaagacca cgcctcccgt gctggactcc 1200
gacggctcct tcttcctcta cagcaggcta accgtggaca agagcaggtg gcaggagggg 1260
aatgtcttct catgctccgt gatgcatgag gctctgcaca accactacac acagaagagc 1320
ctctccctgt ctctgggtaa a 1341
<210> 101
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 12172gH49 V-region
<400> 101
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Ser Leu Ser Ser Tyr
20 25 30
Ala Met Thr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Ile Ile Tyr Ala Gly Gly Ser Pro Ser Tyr Ala Ser Trp Ala Lys
50 55 60
Gly Arg Phe Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Glu Asn Thr Leu Tyr Leu
65 70 75 80
Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95
Arg Gly Thr Gly Asp Thr Val Tyr Thr Tyr Phe Asn Ile Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 102
<211> 360
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 12172gH49 V-region
<400> 102
gaagtgcagc tcgtggagtc gggcggaggt ctggtgcagc ccggaggaag cctgcgcctg 60
tcatgcgctg ccagcgggtt ctcgctttcc tcctacgcca tgacctgggt cagacaggca 120
ccgggaaagg gcctcgaatg gattggcatt atctatgcgg gtggcagccc ttcctacgcc 180
tcctgggcta aagggcggtt caccatctcg aaggacaatt ccgagaacac gctgtacttg 240
caaatgaact cactgagggc cgaggacact gcggtgtact actgtgcccg gggaactgga 300
gataccgtgt acacctactt taacatctgg ggccagggaa ccctggtcac tgtctcgagc 360
<210> 103
<211> 447
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 12172gH49 heavy chain (hIgG4P)
<400> 103
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Ser Leu Ser Ser Tyr
20 25 30
Ala Met Thr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Ile Ile Tyr Ala Gly Gly Ser Pro Ser Tyr Ala Ser Trp Ala Lys
50 55 60
Gly Arg Phe Thr Ile Ser Lys Asp Asn Ser Glu Asn Thr Leu Tyr Leu
65 70 75 80
Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95
Arg Gly Thr Gly Asp Thr Val Tyr Thr Tyr Phe Asn Ile Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val
115 120 125
Phe Pro Leu Ala Pro Cys Ser Arg Ser Thr Ser Glu Ser Thr Ala Ala
130 135 140
Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser
145 150 155 160
Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val
165 170 175
Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro
180 185 190
Ser Ser Ser Leu Gly Thr Lys Thr Tyr Thr Cys Asn Val Asp His Lys
195 200 205
Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Arg Val Glu Ser Lys Tyr Gly Pro
210 215 220
Pro Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Phe Leu Gly Gly Pro Ser Val
225 230 235 240
Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr
245 250 255
Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser Gln Glu Asp Pro Glu
260 265 270
Val Gln Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys
275 280 285
Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Phe Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser
290 295 300
Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys
305 310 315 320
Cys Lys Val Ser Asn Lys Gly Leu Pro Ser Ser Ile Glu Lys Thr Ile
325 330 335
Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro
340 345 350
Pro Ser Gln Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu
355 360 365
Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn
370 375 380
Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser
385 390 395 400
Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Arg Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg
405 410 415
Trp Gln Glu Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu
420 425 430
His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Leu Gly Lys
435 440 445
<210> 104
<211> 1341
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 12172gH49 heavy chain (hIgG4P)
<400> 104
gaagtgcagc tcgtggagtc gggcggaggt ctggtgcagc ccggaggaag cctgcgcctg 60
tcatgcgctg ccagcgggtt ctcgctttcc tcctacgcca tgacctgggt cagacaggca 120
ccgggaaagg gcctcgaatg gattggcatt atctatgcgg gtggcagccc ttcctacgcc 180
tcctgggcta aagggcggtt caccatctcg aaggacaatt ccgagaacac gctgtacttg 240
caaatgaact cactgagggc cgaggacact gcggtgtact actgtgcccg gggaactgga 300
gataccgtgt acacctactt taacatctgg ggccagggaa ccctggtcac tgtctcgagc 360
gcttctacaa agggcccatc cgtcttcccc ctggcgccct gctccaggag cacctccgag 420
agcacagccg ccctgggctg cctggtcaag gactacttcc ccgaaccggt gacggtgtcg 480
tggaactcag gcgccctgac cagcggcgtg cacaccttcc cggctgtcct acagtcctca 540
ggactctact ccctcagcag cgtggtgacc gtgccctcca gcagcttggg cacgaagacc 600
tacacctgca acgtagatca caagcccagc aacaccaagg tggacaagag agttgagtcc 660
aaatatggtc ccccatgccc accatgccca gcacctgagt tcctgggggg accatcagtc 720
ttcctgttcc ccccaaaacc caaggacact ctcatgatct cccggacccc tgaggtcacg 780
tgcgtggtgg tggacgtgag ccaggaagac cccgaggtcc agttcaactg gtacgtggat 840
ggcgtggagg tgcataatgc caagacaaag ccgcgggagg agcagttcaa cagcacgtac 900
cgtgtggtca gcgtcctcac cgtcctgcac caggactggc tgaacggcaa ggagtacaag 960
tgcaaggtct ccaacaaagg cctcccgtcc tccatcgaga aaaccatctc caaagccaaa 1020
gggcagcccc gagagccaca ggtgtacacc ctgcccccat cccaggagga gatgaccaag 1080
aaccaggtca gcctgacctg cctggtcaaa ggcttctacc ccagcgacat cgccgtggag 1140
tgggagagca atgggcagcc ggagaacaac tacaagacca cgcctcccgt gctggactcc 1200
gacggctcct tcttcctcta cagcaggcta accgtggaca agagcaggtg gcaggagggg 1260
aatgtcttct catgctccgt gatgcatgag gctctgcaca accactacac acagaagagc 1320
ctctccctgt ctctgggtaa a 1341
<210> 105
<211> 107
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human IGKV1-9 IGKJ4 acceptor framework
<400> 105
Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Phe Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Gly Ile Ser Ser Tyr
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Ala Ala Ser Thr Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Leu Asn Ser Tyr Pro Leu
85 90 95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105
<210> 106
<211> 321
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human IGKV1-9 IGKJ4 acceptor framework
<400> 106
gacatccagt tgacccagtc tccatccttc ctgtctgcat ctgtaggaga cagagtcacc 60
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aggttcagcg gcagtggatc tgggacagaa ttcactctca caatcagcag cctgcagcct 240
gaagattttg caacttatta ctgtcaacag cttaatagtt accctctcac tttcggcgga 300
gggaccaagg tggagatcaa a 321
<210> 107
<211> 112
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human IGHV3-66 IGHJ4 acceptor framework
<400> 107
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Val Ser Ser Asn
20 25 30
Tyr Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Val Ile Tyr Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys
50 55 60
Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu
65 70 75 80
Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95
Arg Tyr Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
100 105 110
<210> 108
<211> 336
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human IGHV3-66 IGHJ4 acceptor framework
<400> 108
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtccagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccgtcagt agcaactaca tgagctgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtctcagtt atttatagcg gtggtagcac atactacgca 180
gactccgtga agggcagatt caccatctcc agagacaatt ccaagaacac gctgtatctt 240
caaatgaaca gcctgagagc cgaggacacg gctgtgtatt actgtgcgag atactttgac 300
tactggggcc aaggaaccct ggtcaccgtc tcctca 336
<210> 109
<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 WT 01_WT_3A
<400> 109
Met Glu Leu Arg Ala Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu
1 5 10 15
Lys Glu Gly Gln Thr Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys
20 25 30
Phe Ala Ser Ser Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met
35 40 45
Pro Lys Thr Leu Ala Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro
50 55 60
Val Gln Val Gly Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu
65 70 75 80
Leu Arg Val Arg Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr
85 90 95
Gln Cys Val Ile Tyr Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp
100 105 110
Arg Ile Arg Leu Val Val Thr Leu Glu
115 120
<210> 110
<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 02_6
<400> 110
Met Glu Leu Arg Ala Ala Ala Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu
1 5 10 15
Lys Glu Gly Gln Thr Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys
20 25 30
Phe Ala Ser Ser Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met
35 40 45
Pro Lys Thr Leu Ala Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro
50 55 60
Val Gln Val Gly Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu
65 70 75 80
Leu Arg Val Arg Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr
85 90 95
Gln Cys Val Ile Tyr Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp
100 105 110
Arg Ile Arg Leu Val Val Thr Leu Glu
115 120
<210> 111
<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 03_6_7
<400> 111
Met Glu Leu Arg Ala Ala Ala Ala Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu
1 5 10 15
Lys Glu Gly Gln Thr Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys
20 25 30
Phe Ala Ser Ser Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met
35 40 45
Pro Lys Thr Leu Ala Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro
50 55 60
Val Gln Val Gly Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu
65 70 75 80
Leu Arg Val Arg Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr
85 90 95
Gln Cys Val Ile Tyr Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp
100 105 110
Arg Ile Arg Leu Val Val Thr Leu Glu
115 120
<210> 112
<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 04_6_7_9
<400> 112
Met Glu Leu Arg Ala Ala Ala Ala Leu Ala Glu Glu Lys Tyr Glu Leu
1 5 10 15
Lys Glu Gly Gln Thr Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys
20 25 30
Phe Ala Ser Ser Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met
35 40 45
Pro Lys Thr Leu Ala Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro
50 55 60
Val Gln Val Gly Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu
65 70 75 80
Leu Arg Val Arg Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr
85 90 95
Gln Cys Val Ile Tyr Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp
100 105 110
Arg Ile Arg Leu Val Val Thr Leu Glu
115 120
<210> 113
<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 05_7_8_9
<400> 113
Met Glu Leu Arg Ala Ala Thr Ala Ala Ala Glu Glu Lys Tyr Glu Leu
1 5 10 15
Lys Glu Gly Gln Thr Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys
20 25 30
Phe Ala Ser Ser Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met
35 40 45
Pro Lys Thr Leu Ala Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro
50 55 60
Val Gln Val Gly Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu
65 70 75 80
Leu Arg Val Arg Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr
85 90 95
Gln Cys Val Ile Tyr Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp
100 105 110
Arg Ile Arg Leu Val Val Thr Leu Glu
115 120
<210> 114
<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 06_9_10_111
<400> 114
Met Glu Leu Arg Ala Ala Thr Lys Leu Ala Ala Glu Lys Tyr Glu Leu
1 5 10 15
Lys Glu Gly Gln Thr Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys
20 25 30
Phe Ala Ser Ser Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met
35 40 45
Pro Lys Thr Leu Ala Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro
50 55 60
Val Gln Val Gly Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu
65 70 75 80
Leu Arg Val Arg Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr
85 90 95
Gln Cys Val Ile Tyr Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Ala
100 105 110
Arg Ile Arg Leu Val Val Thr Leu Glu
115 120
<210> 115
<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 07_9_10_11
<400> 115
Met Glu Leu Arg Ala Ala Thr Lys Leu Ala Ala Ala Lys Tyr Glu Leu
1 5 10 15
Lys Glu Gly Gln Thr Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys
20 25 30
Phe Ala Ser Ser Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met
35 40 45
Pro Lys Thr Leu Ala Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro
50 55 60
Val Gln Val Gly Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu
65 70 75 80
Leu Arg Val Arg Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr
85 90 95
Gln Cys Val Ile Tyr Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp
100 105 110
Arg Ile Arg Leu Val Val Thr Leu Glu
115 120
<210> 116
<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 08_10_11_12
<400> 116
Met Glu Leu Arg Ala Ala Thr Lys Leu Thr Ala Ala Ala Tyr Glu Leu
1 5 10 15
Lys Glu Gly Gln Thr Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys
20 25 30
Phe Ala Ser Ser Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met
35 40 45
Pro Lys Thr Leu Ala Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro
50 55 60
Val Gln Val Gly Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu
65 70 75 80
Leu Arg Val Arg Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr
85 90 95
Gln Cys Val Ile Tyr Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp
100 105 110
Arg Ile Arg Leu Val Val Thr Leu Glu
115 120
<210> 117
<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 09_11_12_13
<400> 117
Met Glu Leu Arg Ala Ala Thr Lys Leu Thr Glu Ala Ala Ala Glu Leu
1 5 10 15
Lys Glu Gly Gln Thr Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys
20 25 30
Phe Ala Ser Ser Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met
35 40 45
Pro Lys Thr Leu Ala Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro
50 55 60
Val Gln Val Gly Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu
65 70 75 80
Leu Arg Val Arg Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr
85 90 95
Gln Cys Val Ile Tyr Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp
100 105 110
Arg Ile Arg Leu Val Val Thr Leu Glu
115 120
<210> 118
<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 10_16_118_119
<400> 118
Met Glu Leu Arg Ala Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu
1 5 10 15
Ala Glu Gly Gln Thr Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys
20 25 30
Phe Ala Ser Ser Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met
35 40 45
Pro Lys Thr Leu Ala Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro
50 55 60
Val Gln Val Gly Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu
65 70 75 80
Leu Arg Val Arg Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr
85 90 95
Gln Cys Val Ile Tyr Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp
100 105 110
Arg Ile Arg Leu Val Val Ala Ala Glu
115 120
<210> 119
<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 11_19_20_85
<400> 119
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1 5 10 15
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20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
Leu Arg Val Arg Met Ala Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr
85 90 95
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100 105 110
Arg Ile Arg Leu Val Val Thr Leu Glu
115 120
<210> 120
<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 12_22_24_26
<400> 120
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1 5 10 15
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20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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100 105 110
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 13_24_26_28
<400> 121
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1 5 10 15
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<210> 122
<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 122
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1 5 10 15
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<220>
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<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 124
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<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 17_31_32_35
<400> 125
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1 5 10 15
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35 40 45
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65 70 75 80
Leu Arg Val Arg Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr
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100 105 110
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<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 18_30_34
<400> 126
Met Glu Leu Arg Ala Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu
1 5 10 15
Lys Glu Gly Gln Thr Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Ala Lys
20 25 30
Phe Ala Ala Ser Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met
35 40 45
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<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 19_34_35_57
<400> 127
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1 5 10 15
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<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 20_35_36_56
<400> 128
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1 5 10 15
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35 40 45
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65 70 75 80
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100 105 110
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115 120
<210> 129
<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 21_40_49_50
<400> 129
Met Glu Leu Arg Ala Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu
1 5 10 15
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<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 22_43_44_47
<400> 130
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1 5 10 15
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115 120
<210> 131
<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 23_43_44_45
<400> 131
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1 5 10 15
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 24_44_45_46
<400> 132
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1 5 10 15
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Arg Ile Arg Leu Val Val Thr Leu Glu
115 120
<210> 133
<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 25_45_46_47
<400> 133
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1 5 10 15
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20 25 30
Phe Ala Ser Ser Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Ala Ala Ala
35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 26_43_46_47
<400> 134
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<210> 135
<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 27_47_48_49
<400> 135
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 28_47_49_50
<400> 136
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115 120
<210> 137
<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 29_49_50_53
<400> 137
Met Glu Leu Arg Ala Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu
1 5 10 15
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<210> 138
<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 30_50_53_55
<400> 138
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<210> 139
<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 31_55_56_57
<400> 139
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<210> 140
<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 32_34_56_57
<400> 140
Met Glu Leu Arg Ala Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu
1 5 10 15
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115 120
<210> 141
<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 33_57_59_60
<400> 141
Met Glu Leu Arg Ala Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu
1 5 10 15
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20 25 30
Phe Ala Ser Ser Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met
35 40 45
Pro Lys Thr Leu Ala Cys Thr Glu Arg Ala Ser Ala Ala Ser His Pro
50 55 60
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65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
Arg Ile Arg Leu Val Val Thr Leu Glu
115 120
<210> 142
<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 34_59_60_61
<400> 142
Met Glu Leu Arg Ala Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu
1 5 10 15
Lys Glu Gly Gln Thr Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys
20 25 30
Phe Ala Ser Ser Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met
35 40 45
Pro Lys Thr Leu Ala Cys Thr Glu Arg Pro Ser Ala Ala Ala His Pro
50 55 60
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65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
Arg Ile Arg Leu Val Val Thr Leu Glu
115 120
<210> 143
<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 35_60_61_62
<400> 143
Met Glu Leu Arg Ala Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu
1 5 10 15
Lys Glu Gly Gln Thr Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys
20 25 30
Phe Ala Ser Ser Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met
35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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100 105 110
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115 120
<210> 144
<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 36_61_62_63
<400> 144
Met Glu Leu Arg Ala Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu
1 5 10 15
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20 25 30
Phe Ala Ser Ser Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met
35 40 45
Pro Lys Thr Leu Ala Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ala Ala Ala
50 55 60
Val Gln Val Gly Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu
65 70 75 80
Leu Arg Val Arg Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr
85 90 95
Gln Cys Val Ile Tyr Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp
100 105 110
Arg Ile Arg Leu Val Val Thr Leu Glu
115 120
<210> 145
<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 37_62_63_64
<400> 145
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1 5 10 15
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35 40 45
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1 5 10 15
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20 25 30
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35 40 45
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<220>
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<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 161
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1 5 10 15
Lys Glu Gly Gln Thr Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys
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Phe Ala Ser Ser Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met
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<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 162
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20 25 30
Phe Ala Ser Ser Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met
35 40 45
Pro Lys Thr Leu Ala Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro
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Arg Ile Arg Leu Val Val Thr Leu Glu
115 120
<210> 163
<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 163
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<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 56_10_12_114
<400> 164
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<210> 165
<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 57_118_119_120
<400> 165
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<210> 166
<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 58_16_119_120
<400> 166
Met Glu Leu Arg Ala Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu
1 5 10 15
Ala Glu Gly Gln Thr Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys
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35 40 45
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50 55 60
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<210> 167
<211> 117
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 WT 01_WT_2A
<400> 167
Ala Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln
1 5 10 15
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20 25 30
Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu
35 40 45
Ala Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly
50 55 60
Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg
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Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile
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100 105 110
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<210> 168
<211> 117
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 02_2_3
<400> 168
Ala Ala Ala Ala Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln
1 5 10 15
Thr Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser
20 25 30
Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu
35 40 45
Ala Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly
50 55 60
Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg
65 70 75 80
Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile
85 90 95
Tyr Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu
100 105 110
Val Val Thr Lys Gly
115
<210> 169
<211> 117
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 03_3_4
<400> 169
Ala Ala Thr Ala Ala Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln
1 5 10 15
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35 40 45
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50 55 60
Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg
65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
Val Val Thr Lys Gly
115
<210> 170
<211> 117
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 04_4_5
<400> 170
Ala Ala Thr Lys Ala Ala Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln
1 5 10 15
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Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg
65 70 75 80
Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile
85 90 95
Tyr Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu
100 105 110
Val Val Thr Lys Gly
115
<210> 171
<211> 117
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 05_5_104
<400> 171
Ala Ala Thr Lys Leu Ala Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln
1 5 10 15
Thr Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser
20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg
65 70 75 80
Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile
85 90 95
Tyr Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Ala Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu
100 105 110
Val Val Thr Lys Gly
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<213> Artificial Sequence
<220>
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1 5 10 15
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35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
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<213> Artificial Sequence
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1 5 10 15
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100 105 110
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100 105 110
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<213> Artificial Sequence
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Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
<220>
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<213> Artificial Sequence
<220>
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<213> Artificial Sequence
<220>
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Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 190
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<211> 117
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 191
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50 55 60
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115
<210> 192
<211> 117
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 26_37_45
<400> 192
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<210> 193
<211> 117
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 27_37_47
<400> 193
Ala Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln
1 5 10 15
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Ala Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly
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Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg
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Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile
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Val Val Thr Lys Gly
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<210> 194
<211> 117
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 28_38_44
<400> 194
Ala Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln
1 5 10 15
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Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ala Arg Asp Gly Glu Met Ala Lys Thr Leu
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Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile
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Val Val Thr Lys Gly
115
<210> 195
<211> 117
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 29_38_90
<400> 195
Ala Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln
1 5 10 15
Thr Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser
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Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ala Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu
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Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg
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Val Val Thr Lys Gly
115
<210> 196
<211> 117
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 30_42_43
<400> 196
Ala Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln
1 5 10 15
Thr Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser
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Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Ala Ala Pro Lys Thr Leu
35 40 45
Ala Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly
50 55 60
Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg
65 70 75 80
Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile
85 90 95
Tyr Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu
100 105 110
Val Val Thr Lys Gly
115
<210> 197
<211> 117
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 31_42_45
<400> 197
Ala Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln
1 5 10 15
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35 40 45
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50 55 60
Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg
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100 105 110
Val Val Thr Lys Gly
115
<210> 198
<211> 117
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 32_43_44
<400> 198
Ala Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln
1 5 10 15
Thr Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser
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Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Ala Ala Lys Thr Leu
35 40 45
Ala Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly
50 55 60
Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg
65 70 75 80
Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile
85 90 95
Tyr Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu
100 105 110
Val Val Thr Lys Gly
115
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<211> 117
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 33_43_101
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1 5 10 15
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50 55 60
Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg
65 70 75 80
Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile
85 90 95
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100 105 110
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115
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<213> Artificial Sequence
<220>
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1 5 10 15
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100 105 110
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
<220>
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115
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<211> 117
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
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115
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
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115
<210> 213
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 213
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115
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<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 214
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115
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<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 215
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115
<210> 216
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 216
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115
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<211> 117
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 217
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 218
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<210> 219
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 53_85_86
<400> 219
Ala Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln
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<210> 220
<211> 117
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 220
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Tyr Gln Ala Ala Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu
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115
<210> 221
<211> 117
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 55_99_100
<400> 221
Ala Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln
1 5 10 15
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Ala Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly
50 55 60
Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg
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Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile
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100 105 110
Val Val Thr Lys Gly
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<210> 222
<211> 117
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 56_100_101
<400> 222
Ala Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln
1 5 10 15
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Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu
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Ala Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly
50 55 60
Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg
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Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile
85 90 95
Tyr Gln Pro Pro Ala Ala Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu
100 105 110
Val Val Thr Lys Gly
115
<210> 223
<211> 117
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 57_101_102
<400> 223
Ala Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln
1 5 10 15
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Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu
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50 55 60
Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg
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Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile
85 90 95
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100 105 110
Val Val Thr Lys Gly
115
<210> 224
<211> 117
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 58_102_103
<400> 224
Ala Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln
1 5 10 15
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100 105 110
Val Val Thr Lys Gly
115
<210> 225
<211> 117
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 59_103_104
<400> 225
Ala Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln
1 5 10 15
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Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu
35 40 45
Ala Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly
50 55 60
Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg
65 70 75 80
Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile
85 90 95
Tyr Gln Pro Pro Lys Glu Pro Ala Ala Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu
100 105 110
Val Val Thr Lys Gly
115
<210> 226
<211> 117
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 60_104_106
<400> 226
Ala Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln
1 5 10 15
Thr Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser
20 25 30
Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu
35 40 45
Ala Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly
50 55 60
Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg
65 70 75 80
Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile
85 90 95
Tyr Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Ala Leu Ala Asp Arg Ile Arg Leu
100 105 110
Val Val Thr Lys Gly
115
<210> 227
<211> 117
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 61_106_107
<400> 227
Ala Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln
1 5 10 15
Thr Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser
20 25 30
Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu
35 40 45
Ala Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly
50 55 60
Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg
65 70 75 80
Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile
85 90 95
Tyr Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Ala Ala Arg Ile Arg Leu
100 105 110
Val Val Thr Lys Gly
115
<210> 228
<211> 117
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 62_8_10_112
<400> 228
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1 5 10 15
Thr Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser
20 25 30
Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu
35 40 45
Ala Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly
50 55 60
Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg
65 70 75 80
Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile
85 90 95
Tyr Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu
100 105 110
Ala Val Thr Lys Gly
115
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<211> 117
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 63_37_39_40
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1 5 10 15
Thr Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser
20 25 30
Gln Lys Ala Trp Gln Ala Ile Ala Ala Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu
35 40 45
Ala Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly
50 55 60
Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg
65 70 75 80
Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile
85 90 95
Tyr Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu
100 105 110
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115
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 64_40
<400> 230
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1 5 10 15
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20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
Val Val Thr Lys Gly
115
<210> 231
<211> 117
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 65_112
<400> 231
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1 5 10 15
Thr Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser
20 25 30
Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu
35 40 45
Ala Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly
50 55 60
Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg
65 70 75 80
Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile
85 90 95
Tyr Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu
100 105 110
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115
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 WT 01_WT_1A
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50 55 60
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65 70 75 80
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100 105 110
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<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 02_1
<400> 233
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
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50 55 60
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65 70 75 80
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100 105 110
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 04_4
<400> 235
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50 55 60
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65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
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100 105 110
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<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 236
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50 55 60
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65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
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100 105 110
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 06_6
<400> 237
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1 5 10 15
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50 55 60
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65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
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100 105 110
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 07_7
<400> 238
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1 5 10 15
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50 55 60
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65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
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100 105 110
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115
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 08_8
<400> 239
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1 5 10 15
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35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
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115
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<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 09_9
<400> 240
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Ala Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
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35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 241
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 10_11
<400> 241
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1 5 10 15
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20 25 30
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35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
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100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 242
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 11_14
<400> 242
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1 5 10 15
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20 25 30
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35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 243
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 12_17
<400> 243
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Ala Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 244
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 13_19
<400> 244
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Ala Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 245
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 14_21
<400> 245
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Ala Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 246
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 15_23
<400> 246
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Ala Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
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Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
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115
<210> 247
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 16_24
<400> 247
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Ala Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 248
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 17_25
<400> 248
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Ala Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 249
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 18_26
<400> 249
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Ala Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 250
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 19_29
<400> 250
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ala Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 251
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 20_30
<400> 251
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ala Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 252
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 21_38
<400> 252
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Ala Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 253
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 22_39
<400> 253
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Ala Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 254
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 23_41
<400> 254
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Ala Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 255
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 24_42
<400> 255
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Ala Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 256
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 25_44
<400> 256
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Ala Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 257
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 26_45
<400> 257
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1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Ala Leu Ala
35 40 45
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50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 258
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 27_50
<400> 258
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1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 259
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 28_51
<400> 259
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 260
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 29_52
<400> 260
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Ala Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 261
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 30_54
<400> 261
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 262
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 31_55
<400> 262
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
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50 55 60
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65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 263
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 32_56
<400> 263
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
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35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 264
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 33_57
<400> 264
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
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100 105 110
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115
<210> 265
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 34_58
<400> 265
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
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100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 266
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 35_59
<400> 266
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Ala Gln Val Gly Arg
50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
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100 105 110
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115
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<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 36_60
<400> 267
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
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65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 268
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 37_61
<400> 268
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Ala Gly Arg
50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
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115
<210> 269
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 38_63
<400> 269
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1 5 10 15
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20 25 30
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35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Ala
50 55 60
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65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
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Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 270
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 39_65
<400> 270
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
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65 70 75 80
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Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
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115
<210> 271
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 40_71
<400> 271
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Ala His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 272
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 41_72
<400> 272
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
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65 70 75 80
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100 105 110
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115
<210> 273
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 42_78
<400> 273
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
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65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
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100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 274
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 43_80
<400> 274
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Ala Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
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100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 275
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 44_81
<400> 275
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Ala Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 276
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 45_83
<400> 276
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Ala Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 277
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 46_84
<400> 277
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Ala Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 278
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 47_85
<400> 278
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Ala Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 279
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 48_87
<400> 279
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ala Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 280
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 49_95
<400> 280
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Ala
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 281
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 50_97
<400> 281
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Ala Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
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<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 51_98
<400> 282
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1 5 10 15
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20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Ala Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
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<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 52_99
<400> 283
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1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
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65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
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115
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
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<223> Human TREM1 mutant 53_100
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20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Ala Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
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115
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<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 54_101
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1 5 10 15
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20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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100 105 110
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115
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 55_102
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50 55 60
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65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Glu Pro Ala Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
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115
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<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 56_103
<400> 287
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
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20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
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100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 57_104
<400> 288
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1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
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65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Ala Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
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115
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 58_106
<400> 289
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
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50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Ala Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 290
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 59_109
<400> 290
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1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Ala Leu Val
100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
<210> 291
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 60_111
<400> 291
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
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20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Ala
100 105 110
Val Thr Leu Glu
115
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<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 61_113
<400> 292
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
Val Ala Leu Glu
115
<210> 293
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 62_114
<400> 293
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
Val Thr Ala Glu
115
<210> 294
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human TREM1 mutant 63_115
<400> 294
Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr
1 5 10 15
Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln
20 25 30
Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala
35 40 45
Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg
50 55 60
Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met
65 70 75 80
Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr
85 90 95
Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val
100 105 110
Val Thr Leu Ala
115
Claims (33)
- 서열번호 11을 포함하는 CDR-L1,
서열번호 12를 포함하는 CDR-L2, 및
서열번호 13을 포함하는 CDR-L3
을 포함하는 경쇄 가변 영역; 및
서열번호 14를 포함하는 CDR-H1,
서열번호 15를 포함하는 CDR-H2, 및
서열번호 16을 포함하는 CDR-H3
을 포함하는 중쇄 가변 영역
을 포함하는, 인간 TREM1에 결합하는 항체. - 제1항에 있어서, TREM1과 하나 이상의 이의 천연 리간드의 결합을 억제하거나 약화시키는 항체.
- 제1항 또는 제2항에 있어서, TREM1과 PGLYRP1의 결합을 억제하거나 약화시키는 항체.
- 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, 인간 TREM1에 대해 600 pM 미만의 해리 평형 상수(KD)를 가진 항체.
- 제1항 내지 제4항 중 어느 한 항에 있어서, TREM1 상의 PGLYRP1과는 상이한 부위에 결합하는 항체.
- 제1항 내지 제5항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 항체가 인간 TREM1의 에피토프에 결합하고, 상기 에피토프가 인간 TREM1(서열번호 1)의 잔기 E26, E27, K28, Y29, E30, L31, K32를 포함하는 것인 항체.
- 제1항 내지 제5항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 항체가 인간 TREM1의 에피토프에 결합하고, 상기 에피토프는 항체와 TREM1 사이의 접촉 거리가 4Å 미만인 거리에서 결정될 때 인간 TREM1(서열번호 1)의 E26, E27, K28, Y29, E30, L31, K32, Q35, T36, D38, K40, D42, R97, D127, T134 및 G136으로부터 선택된 5개 이상의 잔기를 포함하는 것인 항체.
- 제7항에 있어서, 상기 결합이 X-선 결정학을 이용하여 결정되는 것인 항체.
- 제1항 내지 제8항 중 어느 한 항에 있어서, 경쇄 가변 영역이 서열번호 29로 제공된 서열을 포함하는 것인 항체.
- 제1항 내지 제9항 중 어느 한 항에 있어서, 중쇄 가변 영역이 서열번호 79로 제공된 서열을 포함하는 것인 항체.
- 제1항 내지 제8항 중 어느 한 항에 있어서, 경쇄 가변 영역이 서열번호 29로 제공된 서열, 또는 이와 적어도 90% 동일한 서열을 포함하고; 중쇄 가변 영역이 서열번호 79로 제공된 서열, 또는 이와 적어도 90% 동일한 서열을 포함하는 것인 항체.
- 제1항에 있어서, 각각의 CDR이 최대 3개의 아미노산 치환을 함유하고, 이러한 아미노산 치환이 보존적인 항체.
- 제1항에 있어서, 경쇄 및 중쇄 가변 영역의 나머지 부분이 각각 서열번호 29 및 79와 적어도 90% 동일성을 가진 것인 항체.
- 제1항 내지 제13항 중 어느 한 항에 있어서, 항체 단편인 항체.
- 제14항에 있어서, 상기 항체 단편이 Fab, Fab', F(ab')2, Fv, dsFv, scFv 또는 dsscFv인 항체.
- 제1항 내지 제13항 중 어느 한 항에 있어서, 전체 길이 항체인 항체.
- 제16항에 있어서, IgG1, IgG1 LALA, IgG4, IgG4P 또는 IgG4P FALA인 항체.
- 제16항에 있어서, 서열번호 31로 제공된 서열을 포함하는 경쇄 및 서열번호 81로 제공된 서열을 포함하는 중쇄를 포함하는 IgG4P인 항체.
- 제1항 내지 제8항 중 어느 한 항에 있어서, 항체가 IgG4P이고, 경쇄 및 중쇄의 나머지 부분이 각각 서열번호 31 및 81과 적어도 90% 동일성 또는 유사성을 가진 것인 항체.
- 인간 TREM1(서열번호 1)의 잔기 E26, E27, K28, Y29, E30, L31, K32 및 Q35를 포함하는 TREM1 에피토프에 결합하기 위해 제1항의 항체와 교차경쟁하는 항체.
- 인간 TREM1의 에피토프에 결합하는 IgG4P 항체로서, 상기 에피토프가 인간 TREM1(서열번호 1)의 잔기 E26, E27, K28, Y29, E30, L31, K32 및 Q35를 포함하는 것인 IgG4P 항체.
- 제1항 내지 제21항 중 어느 한 항에 따른 항체를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오타이드.
- 제22항의 폴리뉴클레오타이드를 보유하는 발현 벡터.
- 제23항에 정의된 벡터를 포함하는 숙주 세포.
- 제1항 내지 제21항 중 어느 한 항의 항체를 제조하는 방법으로서, 상기 항체의 생성을 허용하는 조건 하에서 제24항의 숙주 세포를 배양하는 단계, 및 제조된 항체를 회수하는 단계를 포함하는, 상기 항체를 제조하는 방법.
- 제1항 내지 제22항 중 어느 한 항의 항체, 및 약학적으로 허용되는 보조제 또는 담체를 포함하는 약학 조성물.
- 제1항 내지 제22항 및 제29항 중 어느 한 항에 있어서, 요법으로 인간 또는 동물 신체를 치료하는 방법에 사용하기 위한 항체 또는 약학 조성물.
- 제1항 내지 제23항 중 어느 한 항에 있어서, 의약으로서 사용하기 위한 항체 또는 약학 조성물.
- 의약의 제조를 위한, 제1항 내지 제22항 중 어느 한 항에 따른 항체 또는 제26항에 따른 약학 조성물의 용도.
- 제1항 내지 제22항 및 제26항 중 어느 한 항에 있어서, 신경학적 장애의 치료에 사용하기 위한 항체 또는 약학 조성물.
- 신경학적 장애를 치료하거나 예방하는 방법으로서, 제1항 내지 제22항 중 어느 한 항에 정의된 항체 또는 제26항에 정의된 약학 조성물의 치료 유효량을, 이러한 치료를 필요로 하는 환자에게 투여하는 단계를 포함하는 방법.
- 신경학적 장애 치료용 의약의 제조를 위한 제1항 내지 제22항 중 어느 한 항에 따른 항체 또는 제24항에 따른 약학 조성물의 용도.
- 제30항 내지 제32항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 신경학적 장애가 근위축성 측삭 경화증(ALS) 또는 알츠하이머병인 항체, 약학 조성물, 방법 또는 용도.
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