KR20120094469A - 면역원성 말라리아원충 포자소체 단백질 에피토프로 재조합 아데노바이러스의 변형 - Google Patents
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Abstract
본 발명은 재조합 아데노바이러스의 트랜스유전자에 대한 면역 반응을 증강시키도록 또한 기존의 항-아데노바이러스 면역성을 속이도록 아데노바이러스 단백질 변형들에 관한 것이다. 일정 구현예들은 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터가 이종유래 프로모터에 작동적으로 연결된 말라리아원충 서컴포자소체 단백질 유전자 또는 그의 항원성 부분, 또한 말라리아원충 서컴포자소체의 면역원성 에피토프가 하나 이상의 캡시드 및/또는 코아 단백질 내로 삽입되거나 그의 적어도 일부분을 치환시킨 변형된 캡시드 및/또는 코아 단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는, 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터로부터 유래한 재조합 아데노바이러스를 지향한다. 다른 구현예들은 상기 구현예들에 따른 재조합 아데노바이러스를 포함하는 약제학적 조성물 또는 말라리아 백신 조성물을 지향한다. 다른 구현예들은 상기 구현들에 따른 약제학적 조성물 또는 말라리아 백신 조성물의 치료적 유효량을 투여하는 것을 포함하는, 말라리아를 치료하거나, 예방하거나, 진단하는 방법을 포함한다.
Description
우선권 주장
본 출원은 본 명세서에서 전적으로 설명된 것처럼 참고문헌에 의해 내용 전부가 통합되어 있는, 2009년 8월 18일자로 제출된 국제특허출원 제 PCT/US09/054212호에 대한 우선권을 주장하고 이의 일부 연속 (continuation-in-part) 출원이다.
연방정부의 지원을 받은 연구에 관한 진술
본 발명은 국립보건원 (National Institutes of Health)에 속하는 국립 알레르기 및 감염성질환 연구소 (National Institute of Allergy and Infectious Diseases, NIAID)가 수여하는 정부 지원 연구비 AI081510-01A1 하에서 이루어졌다. 정부는 본 발명에서 소정의 권리를 가진다.
발명의 분야
본 발명은 의학 및 생물공학 (biotechnology) 분야에 관한 것이다. 보다 상세하게, 본 발명은 말라리아원충 서컴포자소체 (Plasmodium circumsporozoite) 단백질과 같은 말라리아 기생충 항원에 대한 강력한 면역 반응을 유도하는 캡시드-변형된 아데노바이러스성 벡터들 (adenoviral vectors)의 용도에 관한 것이고, 이들은 말라리아에 대한 백신으로 적합하다.
말라리아는 전세계적으로 열대 지역에서 가장 만연한 감염으로 순위가 매겨지는 심각한 질병이다. 매년 대략적으로 300 - 500 백만 사람들이 비교적 높은 유병율 (morbidity) 및 치사율 (mortality)로 감염되고 있다. 심각한 유병율 및 치사율이 특히 아동들에서 또한 이전에 말라리아에 노출된 적이 없이 말라리아 만연한 지역으로 이동한 어른들에서 발생한다. 세계보건기구 (World Health Organization, WHO)는 매년 아프리카에서만 2 - 3백만 어린이들이 말라리아로 죽어가고 있는 것으로 추산한다. 약물 저항성 기생충 (플라스모듐 팔리파룸 (Plasmodium falciparum), 최근에는 플라스모듐 비박스 (Plasmodium vivax)도 역시 해당됨) 및 살충제-저항성 매개체 (아노펠레스 모기 (Anopheles mosquitoes))에 의해 유발되는, 많은 국가들에서 말라리아의 광범위한 발생 및 유병율의 증가는 본 질병의 새로운 통제 방법을 개발해야 할 필요성을 강조하고 있다 (Nussenzweig and Long 1994).
말라리아 기생충은 전-전혈구, 적혈구 또한 말라리아 백신의 개발을 위한 잠재적인 표적이 되는 유성의 기생 형태로 이루어진 복잡한 생활환 (life cycle)을 가진다. 전-적혈구 및 적혈구 형태는 숙주에서 발견되는 반면, 유성 형태는 매개체에서 발생된다. 생-약독화된 방사선조사된 포자소체 (IrSp)로의 면역접종 (immunization)은 마우스 (Nussenzweig et al. 1967), 비-인간 유인원 (Gwadz et al. 1979) 및 인간 (Clyde et al. 1973, Edelman et al. 1993)에서 무균 보호작용 (sterile protection)을 유도하는 것이 확인되었다 (예로, 기생충 감염 (challenge)에 대한 완벽한 저항성). IrSp에 의해 부여되는 보호작용은 체액성 (B 세포) 및 세포성 (T 세포) 면역 반응 둘 다에 의한 포자소체 중화 (sporozoite neutralization)에 의해 달성된다 (Tsuji et al. 2001). IrSp 백신접종 (vaccinization)이 매력적인 해법이기는 하더라도, 포자소체 (sporozoites)를 획득하는 유일한 방법은 모기 침샘을 해부하는 것에 의하는 데, 현재까지 시험관내에서 많은 수의 포자소체들을 배양하는 기지의 기술은 전혀 없다. 따라서, 동등하게 말라리아에 대항하여 강한 보호작용을 하는 면역성 (protective immunity)을 이끌어내는 대안의 백신 매개체가 필요하다.
이러한 백신 매개체를 위한 한 가지 유력한 표적은 포자소체의 표면 상에서 발현되는 서컴포자소체 (circumsporozoite, CS) 단백질이다. 효과적인 중화 항체는 서컴포자소체 (CS) 단백질의 면역우세한 (immunodominant), 종 특이적 반복서열 도메인에게로 인도된다 (directed against). 플라스모듐 팔시파룸 (Plasmodium falciparum) (인간 말라리아 기생충)에서, 반복서열 (NANP)n은 세계 전지역으로부터 나온 분리물들 간에 보존되고 있다. 본 중앙 반복서열 (central repeat)은 B 세포 에피토프의 복수의 반복서열을 포함하고, 따라서 CS 단백질은 B 세포를 촉발하여 강한 체액성 면역 반응을 유도할 수 있다 (Tsuji et al. 2001). CS-단백질의 C-부위에는 여러가지의 T 세포 에피토프가 존재하고, 이는 유의한 세포성 면역 반응을 유도할 수 있다 (Tsuji et al. 2001). 체액성 (항체) 반응은 간세포를 칩입하기 이전에 포자소체 (세포외 기생충)와 반응하고 그의 감염성을 중화하여 기생충을 제거할 수 있는 반면, 세포성 (T 세포) 반응은 인터페론-감마를 분비하여 EEF (세포내 기생충)을 공격할 수 있다. 이들 면역 반응은 EEFs가 혈액에 재침투하여 우리가 말라리아라고 알고 있는 질병을 유발하는 적혈구를 감염시키는 수천 개의 분열소체 (merozoites)가 형성되도록 신속하게 성숙하고 분열하는 것을 막는다.
현재 인간 임상시험을 진행하고 있는 한 가지 CS-기초 말라리아 백신은 바이러스-유사 입자의 형태로 있는 글락소스미스클라인 (GlaxoSmithKline)사의 RTS, S, B형 간염 바이러스 표면 항원의 융합 단백질 및 플라스모듐 팔시파룸 (Plasmodium falciparum) 서컴포자소체 단백질 (PfCSP)의 일부분이고 (1992년 11월 11일자로 출원된 스미스클라인 비참 바이오로지칼사 S.A. (SmithKline Beecham Biologicals S.A.)의 국제특허출원 제 PCT/EP1992/002591호), 임상시험에서 말라리아 감염을 감소시키는 것으로 확인되었다 (Alonso et al. 2004, Alonso et al. 2005, Bejon et al. 2008). RTS, S는 항-PfCSP 체액성 면역 반응을 유도하기는 하지만, 비교적 약한 PfCSP-특이 세포성 (CD8+) 반응을 유도하고 (Kester et al. 2008), 이는 RTS, S에 의한 비교적 약한 보호작용의 이유가 될 것이다. 대조적으로, 아데노바이러스-기초 말라리아 백신은 보호작용하는 세포성 면역 반응을 유도한다 (2003년 12월 16일자로 제출된 국제특허출원 제 PCT/EP2003/051019호, Rodrigues et al. 1997). 그러나, 현재 말라리아 백신으로서 아데노바이러스-기초 형식의 사용을 제한하는 두 가지 장애물이 존재한다: (1) 트랜스유전자 (transgene) 산물에 대한 강력한 체액성 반응을 유도하는 능력의 결여, 또한 (2) 아데노바이러스-기초 백신의 면역원성 (immunogenicity)을 손상시키는, 아데노바이러스, 특히 아데노바이러스 혈청형 5에 대한 기존의 (pre-existing) 면역성.
최근 들어, 아데노바이러-유도성 체액성 반응을 증강시키도록 시도되어 왔던 한 가지 접근법은 B 세포 항원성 에피토프를 헥손 (Hexon), 파이버 (Fiber), 펜톤 (Penton) 및 pIX와 같은 아데노바이러스 캡시드 단백질 내에 삽입하는 것이다 (Worgall et al. 2005, McConnell et al. 2006, Krause et al. 2006, Worgall et al. 2007).
또한 아데노바이러스 혈청형 5 (Ad5)에 대한 기존의 면역을 속이기 위하여, 더 낮은 혈청 빈도 (seroprevalence)를 가지는 아데노바이러스 혈청형 11, 35, 26, 48, 49 및 50와 같은 다른 아데노바이러스 혈청형들이 백신 형식 (vaccine platform)으로서 평가되었으며, 이들은 항-Ad5 면역성의 존재에도 불구하고 트랜스유전자 (transgene)에 면역 반응을 유도하는 것으로 확인되었다 (2005년 10월 12일자로 출원된 크루셀 홀랜사 B.V. (Crucell Holland B.V.)의 국제특허출원 제 PCT/EP2005/055183호, Abbink et al. 2007). 중화 항체의 표적 캡시드 단백질이 되는 다른 혈청형의 헥손으로 Ad5 헥손의 치환 (substitution)도 역시 기존의 항-Ad5 면역성을 회피하도록 제작되었다 (Wu et al. 2002, Roberts et al. 2006).
그러나, 아데노바이러스성 벡터를 상기 언급된 말라리아 백신에 적용하는 데 있어 두 가지 장애물을 동시에 극복하였던 것으로 보고된 개선된 아데노바이러스성 벡터는 전혀 없다. 말라리아 만연 지역에서 Ad5의 혈청 빈도가 높은 경우 (Ophorst et al. 2006), 아데노바이러스에 대한 기존의 면역 존재 시 보호작용하는 체액성 및 세포성 면역 반응 둘 다를 유도하는 아데노바이러스-기초 말라리아 백신의 필요성이 있다.
개요
본 발명의 기재 내용은 재조합 아데노바이러스성 백신의 트랜스유전자에 대한 면역 반응을 증강시키고 기존의 항-아데노바이러스 면역을 속이도록 다양한 아데노바이러스 단백질 변형들에 관한 것이다.
보다 상세하게, 한 가지 구현예는 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터가 (i) 이종유래 프로모터에 작동적으로 연결된 말라리아원충 서컴포자소체 (Plasmodium circumsporozoite) 단백질 유전자 또는 그의 항원성 부분, 및 (ii) 말라리아원충 서컴포자소체의 면역원성 에피토프 (immunogenic epitope)가 캡시드 또는 코아 단백질 내로 삽입되었거나 그의 적어도 일부분을 치환시킨 변형된 캡시드 또는 코아 단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는, 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터로부터 유래한 재조합 아데노바이러스를 지향한다.
일정 구현예들에서, 말라리아원충 서컴포자소체 단백질은 좀 더 나아가 플라스모듐 팔시파룸 (Plasmodium falciparum) 또는 플라스모듐 옐리 (Plasmodium yoelii) 서컴포자소체 단백질을 포함한다. 좀 더 나아가 서컴포자소체 단백질은 코돈-최적화된 플라스모듐 팔시파룸 또는 플라스모듐 옐리 서컴포자소체 단백질을 포함할 수 있고, 일정 관점에서 서열번호 2 또는 서열번호 1의 뉴클레오타이드 서열에 의해 인코드될 수 있다.
다른 구현예들에서, 면역원성 에피토프 서열은 좀 더 나아가 말라리아원충 서컴포자소체 단백질의 B 세포 에피토프를 포함한다. B 세포 에피토프는 변형된 캡시드 단백질 내에 통합될 수 있고, 일정 관점에서 캡시드 단백질은 헥손 과다가변 부위 (Hexon hypervariable region, HRV)을 포함할 수 있다. HRV은 좀 더 나아가 HVR1 또는 HVR5의 일부가 B 세포 에피토프로 치환된, HVR1 또는 HVR5을 포함할 수 있다. 다른 관점들에서, 캡시드 단백질은 좀 더 나아가 B 세포 에피토프가 파이버 단백질 내에 삽입된 캡시드 파이버 단백질을 포함할 수 있다. 일정 관점들에서, B 세포 에피토프는 플라스모듐 팔시파룸 서컴포자소체 단백질 B 세포 에피토프이고, 여기에서 B 세포 에피토프는 반복 서열 (repeat sequence), 예를 들어 반복 서열이 (NANP)4, (NANP)6, (NANP)8, (NANP)10, (NANP)12, (NANP)14, (NANP)16, (NANP)18, (NANP)20, (NANP)22, 또는 (NANP)28가 될 수 있는 (NANP)n (서열번호 60)이다. 다른 관점들에서, B 세포 에피토프는 플라스모듐 옐리 서컴포자소체 단백질 B 세포 에피토프 서열이고, 여기에서 B 세포 에피토프는 반복 서열, 예를 들어 반복 서열은 (QGPGAP)3, (QGPGAP)4, (QGPGAP)5, (QGPGAP)6, (QGPGAP)7, (QGPGAP)8, (QGPGAP)9, (QGPGAP)11, 또는 (QGPGAP)12가 될 수 있는 (QGPGAP)n (서열번호 59)이다.
보다 또 다른 구현예들에서, 면역원성 에피토프 서열은 좀 더 나아가 말라리아원충 서컴포자소체 단백질 유전자의 CD4+ 또는 CD8+ T 세포 에피토프를 포함한다. CD4+ 또는 CD8+ T 세포 에피토프는 변형된 캡시드 또는 코아 단백질 내에 통합될 수 있다. 일정 관점들에서, 캡시드 단백질은 헥손 과다가변 부위 (Hexon hypervariable region, HVR)를 포함할 수 있다. HVR은 좀 더 나아가 HVR1의 일부가 CD4+ 또는 CD8+ T 세포 에피토프로 치환된, HVR1을 포함할 수 있다. 다른 관점들에서, 코아 단백질은 좀 더 나아가 pVII 단백질을 포함하고 CD4+ T 세포 에피토프는 pVII 단백질 내에 삽입된다. 일정 관점들에서, CD4+ T 세포 에피토프는 플라스모듐 팔시파룸 서컴포자소체 CD4+ T 세포 에피토프이고, 여기에서 CD4+ T 세포 에피토프는 EYLNKIQNSLSTEWSPCSVT (서열번호 62)이다. 다른 관점들에서, CD4+ T 세포 에피토프는 플라스모듐 옐리 서컴포자소체 CD4+ T 세포 에피토프이고, 여기에서 CD4+ T 세포 에피토프는 YNRNIVNRLLGDALNGKPEEK (서열번호 61)이다.
다른 구현예들은 상기 구현예들에 따른 재조합 아데노바이러스를 포함하는 약제학적 조성물 또는 말라리아 백신 조성물을 지향한다. 좀 더 나아간 구현예들은 상기 구현예들에 따른 약제학적 조성물 또는 말라리아 백신 조성물의 치료적 유효량을 투여하는 것을 포함하는, 말라리아를 치료하고, 예방하고, 진단하는 방법을 포함한다.
또 다른 구현예에서, 개체에게 주어진 시간 간격으로 일련의 증가하는 용량 또는 동일한 용량을 주는, 감작-추가자극 백신접종 (prime-boost vaccination)을 투여하는 것을 포함하는 치료 방법이 지향된다. 시간 간격은 체액성 및/또는 세포성 면역 반응을 생성하는 데 충분한 길이일 수 있다. 예를 들어 하기에 기술된 바와 같이, 간격은 이에 제한되는 것은 아니지만 3주마다 한 번일 수 있다.
도 1은 본 기재내용의 구현예들에 따른 캡시드-변형된 재조합 아데노바이러스의 모식도를 나타낸 것이다.
도 2는 HVR1-변형된 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터의 HVR1-변형된 아데노바이러스 DNA의 제작을 도시하는 모식도를 나타낸 것이다.
도 3은 HVR5-변형된 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터의 HVR5-변형된 아데노바이러스 DNA의 제작을 도시하는 모식도를 나타낸 것이다.
도 4는 파이버-변형된 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터의 파이버-변형된 아데노바이러스 DNA의 제작을 도시하는 모식도를 나타낸 것이다.
도 5는 HVR1 및 파이버-변형된 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터의 HVR1 및 파이버-변형된 아데노바이러스 DNA의 제작을 도시하는 모식도를 나타낸 것이다.
도 6은 파이버 및 pVII-변형된 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터의 파이버 및 pVII-변형된 아데노바이러스 DNA의 제작을 도시하는 모식도를 나타낸 것이다.
도 7은 HVR1 및 pVII-변형된 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터의 HVR1 및 pVII-변형된 아데노바이러스 DNA의 제작을 도시하는 모식도를 나타낸 것이다.
도 8은 HVR1, 파이버 및 pVII-변형된 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터의 HVR1, 파이버 및 pVII-변형된 아데노바이러스 DNA의 제작을 도시하는 모식도를 나타낸 것이다.
도 9는 코돈-최적화된 플라스모듐 옐리 서컴포자소체 단백질의 핵산 서열 (PyCS, 서열번호 1) 및 이에 해당하는 아미노산 서열 (서열번호 30)을 나타낸 것이다.
도 10은 코돈-최적화된 플라스모듐 팔시파룸 서컴포자소체 단백질의 핵산 서열 (PfCSP, 서열번호 2) 및 이에 해당하는 아미노산 서열 (서열번호 43)을 나타낸 것이다.
도 11은 HVR1에서 PyCS B 세포 에피토프 서열 (QGPGAP)n의 3개의 반복서열 (서열번호 59; n = 3)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 3의 핵산; 서열번호 31의 아미노산). 삽입된 (QGPGAP)3 서열은 밑줄로 표시된다.
도 12는 HVR1에서 PyCS B 세포 에피토프 서열 (QGPGAP)n의 4개의 반복서열 (서열번호 59; n = 4)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 4의 핵산; 서열번호 32의 아미노산). 삽입된 (QGPGAP)4 서열은 밑줄로 표시된다.
도 13은 HVR1에서 PyCS B 세포 에피토프 서열 (QGPGAP)n의 5개의 반복서열 (서열번호 59; n = 5)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 5의 핵산; 서열번호 33의 아미노산). 삽입된 (QGPGAP)5 서열은 밑줄로 표시된다.
도 14는 HVR1에서 PyCS B 세포 에피토프 서열 (QGPGAP)n의 6개의 반복서열 (서열번호 59; n = 6)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 6의 핵산; 서열번호 34의 아미노산). 삽입된 (QGPGAP)6 서열은 밑줄로 표시된다.
도 15는 HVR1에서 PyCS B 세포 에피토프 서열 (QGPGAP)n의 7개의 반복서열 (서열번호 59; n = 7)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 7의 핵산; 서열번호 35의 아미노산). 삽입된 (QGPGAP)7 서열은 밑줄로 표시된다.
도 16은 HVR1에서 PyCS B 세포 에피토프 서열 (QGPGAP)n의 8개의 반복서열 (서열번호 59; n = 8)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 8의 핵산; 서열번호 36의 아미노산). 삽입된 (QGPGAP)8 서열은 밑줄로 표시된다.
도 17은 HVR1에서 PyCS B 세포 에피토프 서열 (QGPGAP)n의 9개의 반복서열 (서열번호 59; n = 9)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 9의 핵산; 서열번호 37의 아미노산). 삽입된 (QGPGAP)9 서열은 밑줄로 표시된다.
도 18은 HVR1에서 PyCS B 세포 에피토프 서열 (QGPGAP)n의 11개의 반복서열 (서열번호 59; n = 11)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 10의 핵산; 서열번호 38의 아미노산). 삽입된 (QGPGAP)11 서열은 밑줄로 표시된다.
도 19는 HVR1에서 PyCS B 세포 에피토프 서열 (QGPGAP)n의 12개의 반복서열 (서열번호 59; n = 12)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 11의 핵산; 서열번호 39의 아미노산). 삽입된 (QGPGAP)12 서열은 밑줄로 표시된다.
도 20은 HVR1에서 PfCSP B 세포 에피토프 서열 (NANP)n의 4개의 반복서열 (서열번호 60; n = 4)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 12의 핵산; 서열번호 44의 아미노산). 삽입된 (NANP)4 서열은 밑줄로 표시된다.
도 21은 HVR1에서 PfCSP B 세포 에피토프 서열 (NANP)n의 6개의 반복서열 (서열번호 60; n = 6)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 13 핵산; 서열번호 45의 아미노산). 삽입된 (NANP)6 서열은 밑줄로 표시된다.
도 22는 HVR1에서 PfCSP B 세포 에피토프 서열 (NANP)n의 8개의 반복서열 (서열번호 60; n = 8)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 14의 핵산; 서열번호 46의 아미노산). 삽입된 (NANP)8 서열은 밑줄로 표시된다.
도 23은 HVR1에서 PfCSP B 세포 에피토프 서열 (NANP)n의 10개의 반복서열 (서열번호 60; n = 10)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 15의 핵산; 서열번호 47의 아미노산). 삽입된 (NANP)10 서열은 밑줄로 표시된다.
도 24는 HVR1에서 PfCSP B 세포 에피토프 서열 (NANP)n의 12개의 반복서열 (서열번호 60; n = 12)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 16의 핵산; 서열번호 48의 아미노산). 삽입된 (NANP)12 서열은 밑줄로 표시된다.
도 25는 HVR1에서 PfCSP B 세포 에피토프 서열 (NANP)n의 14개의 반복서열 (서열번호 60; n = 14)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 17의 핵산; 서열번호 49의 아미노산). 삽입된 (NANP)14 서열은 밑줄로 표시된다.
도 26은 HVR1에서 PfCSP B 세포 에피토프 서열 (NANP)n의 16개의 반복서열 (서열번호 60; n = 16)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 18의 핵산; 서열번호 50의 아미노산). 삽입된 (NANP)16 서열은 밑줄로 표시된다.
도 27은 HVR1에서 PfCSP B 세포 에피토프 서열 (NANP)n의 18개의 반복서열 (서열번호 60; n = 18)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 19의 핵산; 서열번호 51의 아미노산). 삽입된 (NANP)18 서열은 밑줄로 표시된다.
도 28은 HVR1에서 PfCSP B 세포 에피토프 서열 (NANP)n의 20개의 반복서열 (서열번호 60; n = 20)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 20의 핵산; 서열번호 52의 아미노산). 삽입된 (NANP)20 서열은 밑줄로 표시된다.
도 29는 HVR1에서 PfCSP B 세포 에피토프 서열 (NANP)n의 22개의 반복서열 (서열번호 60; n = 22)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 21의 핵산; 서열번호 53의 아미노산). 삽입된 (NANP)22 서열은 밑줄로 표시된다.
도 30은 HVR1에서 PfCSP B 세포 에피토프 서열 (NANP)n의 28개의 반복서열 (서열번호 60; n = 28)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 22의 핵산; 서열번호 54의 아미노산). 삽입된 (NANP)28 서열은 밑줄로 표시된다.
도 31은 HVR5에서 PyCS B 세포 에피토프 서열 (QGPGAP)n의 3개의 반복서열 (서열번호 59; n = 3)을 가지는 변형된 파이버의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 23의 핵산; 서열번호 40의 아미노산). 삽입된 (QGPGAP)3 서열은 밑줄로 표시된다.
도 32는 파이버에서 PyCS B 세포 에피토프 서열 (QGPGAP)n의 3개의 반복서열 (서열번호 59; n = 3)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 24의 핵산; 서열번호 41의 아미노산). 삽입된 (QGPGAP)3 서열은 밑줄로 표시된다.
도 33은 파이버에서 PfCSP B 세포 에피토프 서열 (NANP)n의 4개의 반복서열 (서열번호 60; n = 4)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 25의 핵산; 서열번호 55의 아미노산). 삽입된 (NANP)4 서열은 밑줄로 표시된다.
도 34는 pVII의 N-말단에서 PyCS CD4+ 에피토프 서열 YNRNIVNRLLGDALNGKPEEK (서열번호 61)을 가지는 변형된 pVII의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 26의 핵산; 서열번호 42의 아미노산). 삽입된 YNRNIVNRLLGDALNGKPEEK 서열은 밑줄로 표시된다.
도 35는 pVII의 C-말단에서 PfCSP CD4+ 에피토프 서열 EYLNKIQNSLSTEWSPCSVT (서열번호 62)을 가지는 변형된 pVII의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (pVII-1; 서열번호 27의 핵산; 서열번호 56의 아미노산). 삽입된 EYLNKIQNSLSTEWSPCSVT 서열은 밑줄로 표시된다.
도 36은 pVII의 첫 번째 핵 정착 신호 (NLS) 이전에 PfCSP CD4+ 에피토프 서열 EYLNKIQNSLSTEWSPCSVT (서열번호 62)을 가지는 변형된 pVII의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (pVII-2; 서열번호 28의 핵산; 서열번호 57의 아미노산). 삽입된 EYLNKIQNSLSTEWSPCSVT 서열은 밑줄로 표시된다.
도 37은 pVII의 두 개의 핵 정착 신호 (NLSs) 사이에 PfCSP CD4+ 에피토프 서열 EYLNKIQNSLSTEWSPCSVT (서열번호 62)을 가지는 변형된 pVII의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (pVII-3; 서열번호 29의 핵산; 서열번호 58의 아미노산). 삽입된 EYLNKIQNSLSTEWSPCSVT 서열은 밑줄로 표시된다.
도 38은 AD293 세포에서 PyCS-GFP/pShuttle-CMV로의 일시적 형질전환 이후에 PyCS 단백질 발현을 나타낸 것이다. PyCS 단백질은 마우스 모노클론 항-PyCS 항체 (9D3)를 사용한 웨스턴 블럿팅에 의해 검출되었다.
도 39는 아데노바이러스 캡시드 단백질 내로 (QGPGAP)3 에피토프 (서열번호 59; n = 3)의 삽입을 검증하도록 정제된 캡시드-변형된 재조합 PyCS-GFP 아데노바이러스의 은 염색 및 웨스턴 블럿팅 (A) 또한 엘라이자 분석 (B)의 결과들을 나타낸 것이다. 엘라이자 분석에서, 엘라이자 플레이트는 정제된 아데노바이러스로 직접 코팅되었고 아데노바이러스 입자에 삽입된 에피토프는 항-PyCS 항체로 검출되었다.
도 40은 아데노바이러스 캡시드 단백질 내로 (QGPGAP)n 에피토프 (서열번호 59)의 삽입을 검증하도록 정제된 캡시드-변형된 재조합 PyCS 아데노바이러스의 은 염색 및 웨스턴 블럿팅 (A) 또한 엘라이자 분석 (B)의 결과들을 나타낸 것이다. 엘라이자 분석에서, 엘라이자 플레이트는 정제된 아데노바이러스로 직접 코팅되었고 아데노바이러스 입자에서 삽입된 에피토프는 항-PyCS 항체로 검출되었다.
도 41은 (QGPGAP)n 반복서열 (서열번호 59; n = 3, 4, 5, 6, 9, 12)을 가지는 캡시드-변형된 PyCS 아데노바이러스로 단일 면역접종 섭생 (A) 또한 면역접종 2주 이후에 PyCS-특이 CD8+ 반응 (B)을 나타낸 것이다.
도 42는 (QGPGAP)n 반복서열 (서열번호 59; n = 3)을 가지는 캡시드-변형된 PyCS 아데노바이러스로 감작 및 추가자극 면역접종 섭생 (A), 10주 이후에 PyCS-특이 체액성 반응 (B), 또한 포자소체 감염 42시간 이후에 간에서 말라리아 기생충 부하 (C)를 나타낸 것이다.
도 43은 도 42에서의 섭생이 주어진 마우스로부터 준비된 혈청 풀 시료의 간접 면역형광 분석법 (IFA)에 의해 결정된 항-포자소체 항체 역가 (A) 및 시험관내 포자소체 중화 활성 (B)을 나타낸 것이다.
도 44는 HVR1에서 (QGPGAP)n 반복서열 (서열번호 59; n = 4, 6)을 가지는 캡시드-변형된 PyCS 아데노바이러스로 감작 및 추가자극 면역접종 섭생 (A), 9주 이후에 PyCS-특이 체액성 반응 (B), 포자소체 감염 42시간 이후에 간에서 말라리아 기생충 부하 (C), 또한 혈청 풀 시료의 시험관내 포자소체 중화 활성 (D)을 나타낸 것이다. 마우스는 아쥬반트 존재 또는 부재 시 면역화되었다.
도 45는 HVR1에서 (QGPGAP)n 반복서열 (서열번호 59; n = 6, 9, 12)을 가지는 캡시드-변형된 PyCS 아데노바이러스로 감작 및 추가자극 면역접종 섭생 (A), 9주 이후에 PyCS-특이 체액성 반응 (B), 9주 이후에 PyCS-특이 CD8+ T 세포 반응 (C), 또한 포자소체 감염 42시간 이후에 간에서 말라리아 기생충 부하 (D)를 나타낸 것이다. 마우스는 아쥬반트 존재 또는 부재 시 면역화되었다.
도 46은 AD293 세포에서 PfCSP/pShuttle-CMV로의 일시적 형질전환 이후에 PfCSP 단백질 발현을 나타낸 것이다. PfCSP는 마우스 모노클론 항-NANP 항체 (2A10)를 사용한 웨스턴 블럿팅에 의해 검출되었다.
도 47은 아데노바이러스 캡시드 단백질 내로 (NANP)4 에피토프 (서열번호 60; n = 4)의 삽입을 검증하도록 정제된 캡시드-변형된 재조합 PfCSP 아데노바이러스의 은 염색 및 웨스턴 블럿팅 (A) 또한 엘라이자 분석 (B)의 결과들을 나타낸 것이다. 삽입된 (NANP)4 에피토프 (서열번호 60; n = 4)는 마우스 모노클론 항-NANP 항체 (2A10)로 검출되었다. 엘라이자 분석에서, 엘라이자 플레이트는 정제된 아데노바이러스로 직접 코팅되었다.
도 48은 아데노바이러스 캡시드 단백질 내로 (NANP)n 에피토프 (서열번호 60; n = 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22)의 삽입을 검증하도록 정제된 캡시드-변형된 재조합 PfCSP 아데노바이러스의 은 염색 및 웨스턴 블럿팅 (A) 또한 엘라이자 분석 (B)의 결과들을 나타낸 것이다. 엘라이자 분석에서, 엘라이자 플레이트는 정제된 아데노바이러스로 직접 코팅되었고, 아데노바이러스 입자에서 삽입된 에피토프는 항-PfCSP 항체 (2A10)로 검출되었다.
도 49는 (NANP)4 에피토프 (서열번호 60; n = 4)를 가지는 캡시드-변형된 재조합 PfCSP 아데노바이러스로 감작 및 추가자극 면역접종 섭생 (A), 또한 9주 이후에 PfCSP-특이 체액성 반응 (B)을 나타낸 것이다.
도 50은 (NANP)n 에피토프 (서열번호 60; n = 4, 6, 8, 10)를 가지는 캡시드-변형된 재조합 PfCSP 아데노바이러스로 감작 및 추가자극 면역접종 섭생 (A), 또한 9주 이후에 PfCSP-특이 체액성 반응 (B)을 나타낸 것이다.
도 51은 (NANP)n 에피토프 (서열번호 60; n = 10, 16, 22)를 가지는 캡시드-변형된 재조합 PfCSP 아데노바이러스로 감작 및 추가자극 면역접종 섭생 (A), 또한 9주 이후에 PfCSP-특이 체액성 반응 (B)을 나타낸 것이다. 마우스는 아쥬반트 존재 또는 부재 시 면역화되었다.
도 52는 정제된 (QGPGAP)3-변형된 파이버 및 pVII-1 ((QGPGAP)3-Fib/CD4-pVII-1/PyCS-GFP) 아데노바이러스의 은 염색 분석의 결과 (A) 또한 도 49(B)에서 기술된 바와 같이 (QGPGAP)3-Fib/PyCS-GFP 또는 (QGPGAP)3-Fib/CD4-pVII-1/PyCS-GFP로 면역화된 마우스에서 10주 이후에 항-QGPGAP 항체 역가를 나타낸 것이다. 두 가지 독립적인 실험의 결과는 B-Fib/PyCS-GFP-면역화된 그룹에서 항체 역가의 중앙값으로 정상화 이후에 도면에 좌표화되었다.
도 53은 pVII의 첫 번째 핵 정착 신호 (NLS) 이전에 및 pVII의 두 개 NLSs 사이에 삽입된 PfCSP CD4+ 에피토프 서열 EYLNKIQNSLSTEWSPCSVT (서열번호 62)을 가지는 아데노바이러스 pVII 단백질 (PfCD4-pVII-3; 서열번호 29의 핵산; 서열번호 58의 아미노산)의 구조 모식도 (A) 또한 pVII 내의 에피토프 삽입을 검증하도록 은 염색의 결과 (B)를 나타낸 것이다.
도 54는 HVR1 및 pVII-변형된 재조합 PfCSP 아데노바이러스로 감작 및 추가자극 면역접종 섭생 (A), 6주에 PfCSP-특이 체액성 반응 (B), 또한 9주에 PfCSP-특이 CD4+ (EYLNKIQNSLSTEWSPCSVT; 서열번호 62) 반응을 나타낸 것이다.
도 55는 인간 혈청 시료에 의한 재조합 아데노바이러스의 시험관내 중화를 나타낸 것이다. AD293 세포는 희석된 인간 혈청의 존재 시 재조합 아데노바이러스로 하룻밤 동안 감염시켰고 GFP 발현은 감염의 마커로서 측정되었다.
도 56은 생체내에서 캡시드-변형된 PyCS-GFP 아데노바이러스에 의해 PyCS-특이 T 세포 반응의 유도에 미치는 항-아데노바이러스 면역성의 효과를 나타낸 것이다. (A)는 본 연구 설계의 간략한 기술내용이다. (B)는 야생형 (wt)/공 아데노바이러스로 두 번 면역화되고 캡시드-변형된 PyCS-GFP 아데노바이러스로 감작된 마우스에서 PyCS-특이 CD8+ T 세포 반응을 나타낸 것이다.
도 57은 생체내에서 캡시드-변형된 PyCS-GFP 아데노바이러스에 의해 PyCS-특이 체액성 면역 반응의 유도에 미치는 항-아데노바이러스 면역성의 효과를 나타낸 것이다. (A)는 본 연구 설계의 간략한 기술내용이다. (B)는 야생형 (wt)/공 아데노바이러스로 두 번 또한 캡시드-변형된 PyCS-GFP 아데노바이러스의 두 번 용량으로 면역화된 마우스에서 PyCS-특이 체액성 면역 반응을 나타낸 것이다.
도 2는 HVR1-변형된 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터의 HVR1-변형된 아데노바이러스 DNA의 제작을 도시하는 모식도를 나타낸 것이다.
도 3은 HVR5-변형된 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터의 HVR5-변형된 아데노바이러스 DNA의 제작을 도시하는 모식도를 나타낸 것이다.
도 4는 파이버-변형된 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터의 파이버-변형된 아데노바이러스 DNA의 제작을 도시하는 모식도를 나타낸 것이다.
도 5는 HVR1 및 파이버-변형된 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터의 HVR1 및 파이버-변형된 아데노바이러스 DNA의 제작을 도시하는 모식도를 나타낸 것이다.
도 6은 파이버 및 pVII-변형된 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터의 파이버 및 pVII-변형된 아데노바이러스 DNA의 제작을 도시하는 모식도를 나타낸 것이다.
도 7은 HVR1 및 pVII-변형된 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터의 HVR1 및 pVII-변형된 아데노바이러스 DNA의 제작을 도시하는 모식도를 나타낸 것이다.
도 8은 HVR1, 파이버 및 pVII-변형된 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터의 HVR1, 파이버 및 pVII-변형된 아데노바이러스 DNA의 제작을 도시하는 모식도를 나타낸 것이다.
도 9는 코돈-최적화된 플라스모듐 옐리 서컴포자소체 단백질의 핵산 서열 (PyCS, 서열번호 1) 및 이에 해당하는 아미노산 서열 (서열번호 30)을 나타낸 것이다.
도 10은 코돈-최적화된 플라스모듐 팔시파룸 서컴포자소체 단백질의 핵산 서열 (PfCSP, 서열번호 2) 및 이에 해당하는 아미노산 서열 (서열번호 43)을 나타낸 것이다.
도 11은 HVR1에서 PyCS B 세포 에피토프 서열 (QGPGAP)n의 3개의 반복서열 (서열번호 59; n = 3)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 3의 핵산; 서열번호 31의 아미노산). 삽입된 (QGPGAP)3 서열은 밑줄로 표시된다.
도 12는 HVR1에서 PyCS B 세포 에피토프 서열 (QGPGAP)n의 4개의 반복서열 (서열번호 59; n = 4)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 4의 핵산; 서열번호 32의 아미노산). 삽입된 (QGPGAP)4 서열은 밑줄로 표시된다.
도 13은 HVR1에서 PyCS B 세포 에피토프 서열 (QGPGAP)n의 5개의 반복서열 (서열번호 59; n = 5)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 5의 핵산; 서열번호 33의 아미노산). 삽입된 (QGPGAP)5 서열은 밑줄로 표시된다.
도 14는 HVR1에서 PyCS B 세포 에피토프 서열 (QGPGAP)n의 6개의 반복서열 (서열번호 59; n = 6)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 6의 핵산; 서열번호 34의 아미노산). 삽입된 (QGPGAP)6 서열은 밑줄로 표시된다.
도 15는 HVR1에서 PyCS B 세포 에피토프 서열 (QGPGAP)n의 7개의 반복서열 (서열번호 59; n = 7)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 7의 핵산; 서열번호 35의 아미노산). 삽입된 (QGPGAP)7 서열은 밑줄로 표시된다.
도 16은 HVR1에서 PyCS B 세포 에피토프 서열 (QGPGAP)n의 8개의 반복서열 (서열번호 59; n = 8)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 8의 핵산; 서열번호 36의 아미노산). 삽입된 (QGPGAP)8 서열은 밑줄로 표시된다.
도 17은 HVR1에서 PyCS B 세포 에피토프 서열 (QGPGAP)n의 9개의 반복서열 (서열번호 59; n = 9)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 9의 핵산; 서열번호 37의 아미노산). 삽입된 (QGPGAP)9 서열은 밑줄로 표시된다.
도 18은 HVR1에서 PyCS B 세포 에피토프 서열 (QGPGAP)n의 11개의 반복서열 (서열번호 59; n = 11)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 10의 핵산; 서열번호 38의 아미노산). 삽입된 (QGPGAP)11 서열은 밑줄로 표시된다.
도 19는 HVR1에서 PyCS B 세포 에피토프 서열 (QGPGAP)n의 12개의 반복서열 (서열번호 59; n = 12)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 11의 핵산; 서열번호 39의 아미노산). 삽입된 (QGPGAP)12 서열은 밑줄로 표시된다.
도 20은 HVR1에서 PfCSP B 세포 에피토프 서열 (NANP)n의 4개의 반복서열 (서열번호 60; n = 4)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 12의 핵산; 서열번호 44의 아미노산). 삽입된 (NANP)4 서열은 밑줄로 표시된다.
도 21은 HVR1에서 PfCSP B 세포 에피토프 서열 (NANP)n의 6개의 반복서열 (서열번호 60; n = 6)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 13 핵산; 서열번호 45의 아미노산). 삽입된 (NANP)6 서열은 밑줄로 표시된다.
도 22는 HVR1에서 PfCSP B 세포 에피토프 서열 (NANP)n의 8개의 반복서열 (서열번호 60; n = 8)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 14의 핵산; 서열번호 46의 아미노산). 삽입된 (NANP)8 서열은 밑줄로 표시된다.
도 23은 HVR1에서 PfCSP B 세포 에피토프 서열 (NANP)n의 10개의 반복서열 (서열번호 60; n = 10)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 15의 핵산; 서열번호 47의 아미노산). 삽입된 (NANP)10 서열은 밑줄로 표시된다.
도 24는 HVR1에서 PfCSP B 세포 에피토프 서열 (NANP)n의 12개의 반복서열 (서열번호 60; n = 12)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 16의 핵산; 서열번호 48의 아미노산). 삽입된 (NANP)12 서열은 밑줄로 표시된다.
도 25는 HVR1에서 PfCSP B 세포 에피토프 서열 (NANP)n의 14개의 반복서열 (서열번호 60; n = 14)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 17의 핵산; 서열번호 49의 아미노산). 삽입된 (NANP)14 서열은 밑줄로 표시된다.
도 26은 HVR1에서 PfCSP B 세포 에피토프 서열 (NANP)n의 16개의 반복서열 (서열번호 60; n = 16)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 18의 핵산; 서열번호 50의 아미노산). 삽입된 (NANP)16 서열은 밑줄로 표시된다.
도 27은 HVR1에서 PfCSP B 세포 에피토프 서열 (NANP)n의 18개의 반복서열 (서열번호 60; n = 18)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 19의 핵산; 서열번호 51의 아미노산). 삽입된 (NANP)18 서열은 밑줄로 표시된다.
도 28은 HVR1에서 PfCSP B 세포 에피토프 서열 (NANP)n의 20개의 반복서열 (서열번호 60; n = 20)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 20의 핵산; 서열번호 52의 아미노산). 삽입된 (NANP)20 서열은 밑줄로 표시된다.
도 29는 HVR1에서 PfCSP B 세포 에피토프 서열 (NANP)n의 22개의 반복서열 (서열번호 60; n = 22)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 21의 핵산; 서열번호 53의 아미노산). 삽입된 (NANP)22 서열은 밑줄로 표시된다.
도 30은 HVR1에서 PfCSP B 세포 에피토프 서열 (NANP)n의 28개의 반복서열 (서열번호 60; n = 28)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 22의 핵산; 서열번호 54의 아미노산). 삽입된 (NANP)28 서열은 밑줄로 표시된다.
도 31은 HVR5에서 PyCS B 세포 에피토프 서열 (QGPGAP)n의 3개의 반복서열 (서열번호 59; n = 3)을 가지는 변형된 파이버의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 23의 핵산; 서열번호 40의 아미노산). 삽입된 (QGPGAP)3 서열은 밑줄로 표시된다.
도 32는 파이버에서 PyCS B 세포 에피토프 서열 (QGPGAP)n의 3개의 반복서열 (서열번호 59; n = 3)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 24의 핵산; 서열번호 41의 아미노산). 삽입된 (QGPGAP)3 서열은 밑줄로 표시된다.
도 33은 파이버에서 PfCSP B 세포 에피토프 서열 (NANP)n의 4개의 반복서열 (서열번호 60; n = 4)을 가지는 변형된 헥손의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 25의 핵산; 서열번호 55의 아미노산). 삽입된 (NANP)4 서열은 밑줄로 표시된다.
도 34는 pVII의 N-말단에서 PyCS CD4+ 에피토프 서열 YNRNIVNRLLGDALNGKPEEK (서열번호 61)을 가지는 변형된 pVII의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (서열번호 26의 핵산; 서열번호 42의 아미노산). 삽입된 YNRNIVNRLLGDALNGKPEEK 서열은 밑줄로 표시된다.
도 35는 pVII의 C-말단에서 PfCSP CD4+ 에피토프 서열 EYLNKIQNSLSTEWSPCSVT (서열번호 62)을 가지는 변형된 pVII의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (pVII-1; 서열번호 27의 핵산; 서열번호 56의 아미노산). 삽입된 EYLNKIQNSLSTEWSPCSVT 서열은 밑줄로 표시된다.
도 36은 pVII의 첫 번째 핵 정착 신호 (NLS) 이전에 PfCSP CD4+ 에피토프 서열 EYLNKIQNSLSTEWSPCSVT (서열번호 62)을 가지는 변형된 pVII의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (pVII-2; 서열번호 28의 핵산; 서열번호 57의 아미노산). 삽입된 EYLNKIQNSLSTEWSPCSVT 서열은 밑줄로 표시된다.
도 37은 pVII의 두 개의 핵 정착 신호 (NLSs) 사이에 PfCSP CD4+ 에피토프 서열 EYLNKIQNSLSTEWSPCSVT (서열번호 62)을 가지는 변형된 pVII의 핵산 및 아미노산 서열을 나타낸 것이다 (pVII-3; 서열번호 29의 핵산; 서열번호 58의 아미노산). 삽입된 EYLNKIQNSLSTEWSPCSVT 서열은 밑줄로 표시된다.
도 38은 AD293 세포에서 PyCS-GFP/pShuttle-CMV로의 일시적 형질전환 이후에 PyCS 단백질 발현을 나타낸 것이다. PyCS 단백질은 마우스 모노클론 항-PyCS 항체 (9D3)를 사용한 웨스턴 블럿팅에 의해 검출되었다.
도 39는 아데노바이러스 캡시드 단백질 내로 (QGPGAP)3 에피토프 (서열번호 59; n = 3)의 삽입을 검증하도록 정제된 캡시드-변형된 재조합 PyCS-GFP 아데노바이러스의 은 염색 및 웨스턴 블럿팅 (A) 또한 엘라이자 분석 (B)의 결과들을 나타낸 것이다. 엘라이자 분석에서, 엘라이자 플레이트는 정제된 아데노바이러스로 직접 코팅되었고 아데노바이러스 입자에 삽입된 에피토프는 항-PyCS 항체로 검출되었다.
도 40은 아데노바이러스 캡시드 단백질 내로 (QGPGAP)n 에피토프 (서열번호 59)의 삽입을 검증하도록 정제된 캡시드-변형된 재조합 PyCS 아데노바이러스의 은 염색 및 웨스턴 블럿팅 (A) 또한 엘라이자 분석 (B)의 결과들을 나타낸 것이다. 엘라이자 분석에서, 엘라이자 플레이트는 정제된 아데노바이러스로 직접 코팅되었고 아데노바이러스 입자에서 삽입된 에피토프는 항-PyCS 항체로 검출되었다.
도 41은 (QGPGAP)n 반복서열 (서열번호 59; n = 3, 4, 5, 6, 9, 12)을 가지는 캡시드-변형된 PyCS 아데노바이러스로 단일 면역접종 섭생 (A) 또한 면역접종 2주 이후에 PyCS-특이 CD8+ 반응 (B)을 나타낸 것이다.
도 42는 (QGPGAP)n 반복서열 (서열번호 59; n = 3)을 가지는 캡시드-변형된 PyCS 아데노바이러스로 감작 및 추가자극 면역접종 섭생 (A), 10주 이후에 PyCS-특이 체액성 반응 (B), 또한 포자소체 감염 42시간 이후에 간에서 말라리아 기생충 부하 (C)를 나타낸 것이다.
도 43은 도 42에서의 섭생이 주어진 마우스로부터 준비된 혈청 풀 시료의 간접 면역형광 분석법 (IFA)에 의해 결정된 항-포자소체 항체 역가 (A) 및 시험관내 포자소체 중화 활성 (B)을 나타낸 것이다.
도 44는 HVR1에서 (QGPGAP)n 반복서열 (서열번호 59; n = 4, 6)을 가지는 캡시드-변형된 PyCS 아데노바이러스로 감작 및 추가자극 면역접종 섭생 (A), 9주 이후에 PyCS-특이 체액성 반응 (B), 포자소체 감염 42시간 이후에 간에서 말라리아 기생충 부하 (C), 또한 혈청 풀 시료의 시험관내 포자소체 중화 활성 (D)을 나타낸 것이다. 마우스는 아쥬반트 존재 또는 부재 시 면역화되었다.
도 45는 HVR1에서 (QGPGAP)n 반복서열 (서열번호 59; n = 6, 9, 12)을 가지는 캡시드-변형된 PyCS 아데노바이러스로 감작 및 추가자극 면역접종 섭생 (A), 9주 이후에 PyCS-특이 체액성 반응 (B), 9주 이후에 PyCS-특이 CD8+ T 세포 반응 (C), 또한 포자소체 감염 42시간 이후에 간에서 말라리아 기생충 부하 (D)를 나타낸 것이다. 마우스는 아쥬반트 존재 또는 부재 시 면역화되었다.
도 46은 AD293 세포에서 PfCSP/pShuttle-CMV로의 일시적 형질전환 이후에 PfCSP 단백질 발현을 나타낸 것이다. PfCSP는 마우스 모노클론 항-NANP 항체 (2A10)를 사용한 웨스턴 블럿팅에 의해 검출되었다.
도 47은 아데노바이러스 캡시드 단백질 내로 (NANP)4 에피토프 (서열번호 60; n = 4)의 삽입을 검증하도록 정제된 캡시드-변형된 재조합 PfCSP 아데노바이러스의 은 염색 및 웨스턴 블럿팅 (A) 또한 엘라이자 분석 (B)의 결과들을 나타낸 것이다. 삽입된 (NANP)4 에피토프 (서열번호 60; n = 4)는 마우스 모노클론 항-NANP 항체 (2A10)로 검출되었다. 엘라이자 분석에서, 엘라이자 플레이트는 정제된 아데노바이러스로 직접 코팅되었다.
도 48은 아데노바이러스 캡시드 단백질 내로 (NANP)n 에피토프 (서열번호 60; n = 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22)의 삽입을 검증하도록 정제된 캡시드-변형된 재조합 PfCSP 아데노바이러스의 은 염색 및 웨스턴 블럿팅 (A) 또한 엘라이자 분석 (B)의 결과들을 나타낸 것이다. 엘라이자 분석에서, 엘라이자 플레이트는 정제된 아데노바이러스로 직접 코팅되었고, 아데노바이러스 입자에서 삽입된 에피토프는 항-PfCSP 항체 (2A10)로 검출되었다.
도 49는 (NANP)4 에피토프 (서열번호 60; n = 4)를 가지는 캡시드-변형된 재조합 PfCSP 아데노바이러스로 감작 및 추가자극 면역접종 섭생 (A), 또한 9주 이후에 PfCSP-특이 체액성 반응 (B)을 나타낸 것이다.
도 50은 (NANP)n 에피토프 (서열번호 60; n = 4, 6, 8, 10)를 가지는 캡시드-변형된 재조합 PfCSP 아데노바이러스로 감작 및 추가자극 면역접종 섭생 (A), 또한 9주 이후에 PfCSP-특이 체액성 반응 (B)을 나타낸 것이다.
도 51은 (NANP)n 에피토프 (서열번호 60; n = 10, 16, 22)를 가지는 캡시드-변형된 재조합 PfCSP 아데노바이러스로 감작 및 추가자극 면역접종 섭생 (A), 또한 9주 이후에 PfCSP-특이 체액성 반응 (B)을 나타낸 것이다. 마우스는 아쥬반트 존재 또는 부재 시 면역화되었다.
도 52는 정제된 (QGPGAP)3-변형된 파이버 및 pVII-1 ((QGPGAP)3-Fib/CD4-pVII-1/PyCS-GFP) 아데노바이러스의 은 염색 분석의 결과 (A) 또한 도 49(B)에서 기술된 바와 같이 (QGPGAP)3-Fib/PyCS-GFP 또는 (QGPGAP)3-Fib/CD4-pVII-1/PyCS-GFP로 면역화된 마우스에서 10주 이후에 항-QGPGAP 항체 역가를 나타낸 것이다. 두 가지 독립적인 실험의 결과는 B-Fib/PyCS-GFP-면역화된 그룹에서 항체 역가의 중앙값으로 정상화 이후에 도면에 좌표화되었다.
도 53은 pVII의 첫 번째 핵 정착 신호 (NLS) 이전에 및 pVII의 두 개 NLSs 사이에 삽입된 PfCSP CD4+ 에피토프 서열 EYLNKIQNSLSTEWSPCSVT (서열번호 62)을 가지는 아데노바이러스 pVII 단백질 (PfCD4-pVII-3; 서열번호 29의 핵산; 서열번호 58의 아미노산)의 구조 모식도 (A) 또한 pVII 내의 에피토프 삽입을 검증하도록 은 염색의 결과 (B)를 나타낸 것이다.
도 54는 HVR1 및 pVII-변형된 재조합 PfCSP 아데노바이러스로 감작 및 추가자극 면역접종 섭생 (A), 6주에 PfCSP-특이 체액성 반응 (B), 또한 9주에 PfCSP-특이 CD4+ (EYLNKIQNSLSTEWSPCSVT; 서열번호 62) 반응을 나타낸 것이다.
도 55는 인간 혈청 시료에 의한 재조합 아데노바이러스의 시험관내 중화를 나타낸 것이다. AD293 세포는 희석된 인간 혈청의 존재 시 재조합 아데노바이러스로 하룻밤 동안 감염시켰고 GFP 발현은 감염의 마커로서 측정되었다.
도 56은 생체내에서 캡시드-변형된 PyCS-GFP 아데노바이러스에 의해 PyCS-특이 T 세포 반응의 유도에 미치는 항-아데노바이러스 면역성의 효과를 나타낸 것이다. (A)는 본 연구 설계의 간략한 기술내용이다. (B)는 야생형 (wt)/공 아데노바이러스로 두 번 면역화되고 캡시드-변형된 PyCS-GFP 아데노바이러스로 감작된 마우스에서 PyCS-특이 CD8+ T 세포 반응을 나타낸 것이다.
도 57은 생체내에서 캡시드-변형된 PyCS-GFP 아데노바이러스에 의해 PyCS-특이 체액성 면역 반응의 유도에 미치는 항-아데노바이러스 면역성의 효과를 나타낸 것이다. (A)는 본 연구 설계의 간략한 기술내용이다. (B)는 야생형 (wt)/공 아데노바이러스로 두 번 또한 캡시드-변형된 PyCS-GFP 아데노바이러스의 두 번 용량으로 면역화된 마우스에서 PyCS-특이 체액성 면역 반응을 나타낸 것이다.
과제의 해결 수단
본 발명자들은 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터로부터 유래한 새로운 캡시드-변형된 구조를 가지는 새로운 재조합 아데노바이러스를 발견하였다. 본 재조합 아데노바이러스는 포유동물 세포를 감염시킬 수 있고, 세포가 말라리아원충 서컴포자소체 단백질을 발현하도록 유도한다. 재조합 아데노바이러스는 또한 말라리아원충 서컴포자소체 단백질의 B 세포 에피토프, T 세포 에피토프와 같은 원하는 면역원성 항원을 가지도록 변형되었던 하나 이상의 캡시드 단백질을 가진다. 재조합 아데노바이러스는 세포를 직선형 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터로 형질전환하는 방법에 의해 획득된다. 획득된 재조합 아데노바이러스를 사용하여, 본 발명자들은 말라리아 감염의 예방 및 치료적 효과를 가지는 재조합 아데노바이러스를 활성 성분으로서 포함하는 약제 (pharmaceuticals)에 관한 철저한 연구를 수행하였다. 그 결과, 본 발명자들은 획득된 재조합 아데노바이러스가 목적하는 제약 효과를 가짐을 발견하였다.
상세한 설명
다음의 기술내용은 본 발명의 구현예들의 완벽한 이해 및 시행가능한 기술내용을 위한 특정한 세부사항을 제공한다. 그러나, 당업자라면 본 기재내용이 이들 세부사항이 없이도 시행될 수 있는 점을 이해할 것이다. 다른 예를 들면, 잘-알려진 구조 및 기능은 본 발명의 구현예들의 기술내용이 가려지는 것을 불필요하게 피하기 위하여 세부적으로 도시되거나 기술되지 않았다.
본 기재내용에서 아미노산, 펩타이드, 염기 서열 및 핵산에 사용되는 약칭들 (abbreviations)은 생화학적 명명법에 관한 IUPAC-IUB 회의 (IUPAC-IUB Communication on Biochemical Nomenclature, Eur. J. Biochem., 138: 9 (1984))에서 "염기 서열 및 아미노산 서열을 포함하는 명세서를 제작하기 위한 지침 (Guideline for Preparing Specifications Including Base Sequences and Amino Acid Sequences)" (미국 특허 및 상표청)에 특정된 약칭들 및 본 기술 분야에서 보편적으로 사용되는 것을 기초로 한다.
본 기재내용에 의해 참작되는 바 "뉴클레오타이드 서열 (nucleotide sequence)", "폴리뉴클레오타이드 (polynucleotide)" 또는 "DNA 분자 (DNA molecule)"는 이중가닥 DN 또는 단일가닥 DNA (예로, 이중가닥 DNA를 구성하는 센스 사슬 및 안티센스 사슬)을 포함할 수 있고, 그들의 전장 (full length)에 제한되지는 않는다. 하기 본 명세서에서 기재되는 것과 같은 면역원성 외래 유전자를 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열은 달리 언급되지 않는 경우라면, 게놈 DNA를 포함하는 이중가닥 DNA, cDNA를 포함하는 단일가닥 DNA (센스 사슬), 센스 사슬에 상보적인 서열을 가지는 단일가닥 DNA (안티센스 사슬), 합성 DNA, 및 그들의 단편들을 포괄한다.
본 명세서에서 사용되는 바 뉴클레오타이드 서열, 폴리뉴클레오타이드 또는 DNA 분자는 기능적 부위에 제한되지 않고 발현 억제 부위 (expression suppression region), 코딩 부위, 선도 서열 (leader sequence), 엑손 및 인트론의 적어도 하나를 포함할 수 있다. 좀 더 나아가, 뉴클레오타이드 서열 또는 폴리뉴클레오타이드의 예로는 RNA 또는 DNA를 포함할 수 있다. 특이 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드 및 특이 DNA 서열을 포함하는 폴리뉴클레오타이드는 폴리뉴클레오타이드의 단편, 상동체, 유도체 및 돌연변이체를 포함할 수 있다. 뉴클레오타이드 서열 또는 폴리뉴클레오타이드의 돌연변이체의 예로는 (돌연변이 DNA와 같음) 자연적으로 발생하는 대립인자 돌연변이체 (allelic mutants); 인위적 돌연변이체 (artificial mutants); 또한 결실 (deletion), 치환 (substitution), 첨가 (addition), 및/또는 삽입 (insertion)을 가지는 돌연변이체를 포함한다. 이러한 돌연변이체는 원래의 미-돌연변이된 (non-mutated) 폴리뉴클레오타이드에 의해 인코드되는 폴리펩타이드와 실질적으로 동일한 기능을 가지는 폴리펩타이드를 인코드하는 것으로 이해되어야 한다.
본 기재내용은 말라리아원충 기생충의 항원성 결정기 (antigenic determinant)를 발현하고 하나 이상의 변형된 캡시드 및/또는 코아 단백질을 포함하는 재조합 아데노바이러스에 관한 것이다. 재조합 아데노바이러스는 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터로부터 유래하고, 그의 생성 과정은 하기 실시예에서 기술되어 있다. 벡터로서의 아데노바이러스의 용도는 하기에 좀 더 논의된다. 본 명세서에서 기술된 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터들은 말라리아원충 기생충에 대한 체액성 및 세포성 면역 반응 둘 다를 유도하는 말라리아 백신 또는 약제학적 조성물로서 사용될 수 있다.
말라리아원충 기생충은 기지의 플라스모듐 (Plasmodium, P) 종, 예를 들어 P. 팔시파룸 (P. falciparum), P. 말라리아 (P. malariae), P. 오발 (P. ovale), P. 비박스 (P. vivax), P. 노우레시 (P. knowlesi), P. 베르게이 (P. berghei,), P. 샤바우디 (P. chabaudi) 및 P. 옐리 (P. yoelii)라면 모두로부터 선택될 수 있다.
한 가지 구현예에서, 재조합 아데노바이러스 캡시드-변형된 플라스미드 벡터 (본 명세서에서는 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터라고도 기술됨)는 하나 이상의 변형된 캡시드 및/또는 코아 단백질을 포함하는 구조를 가지는 캡시드 및/또는 코아-변형된 재조합 아데노바이러스 (본 명세서에서는 재조합 아데노바이러스라고도 기술됨)를 인코드하고 생산하는 플라스미드이다. 본 기재내용의 구현예들에 따르면, 캡시드 및/또는 코아 단백질의 변형은 말라리아원충 서컴포자소체 단백질의 면역원성 에피토프 적어도 하나의 삽입에 의해 달성될 수 있다. 대안으로, 캡시드 및/또는 코아 단백질의 적어도 일부는 결실될 수 있고 말라리아원충 서컴포자소체 단백질의 면역원성 에피토프 적어도 하나에 의해 치환될 수 있다. 일정 구현예들에서, 면역원성 에피토프는 말라리아원충 서컴포자소체 단백질의 B-세포 및/또는 T-세포 에피토프이다. B 세포 또는 T 세포 에피토프의 첨가는 CS 단백질에 대한 체액성 면역 반응을 확립하거나 증진하여 말라리아 백신으로서 사용되는 아데노바이러스성 벡터의 효능을 증진하도록 작용할 수 있다. 변형된 캡시드 및 코아 단백질 또한 본 명세서에서 기술되는 재조합 아데노바이러스에서 그들의 사용의 측면에서 그들의 중요성은 하기에 좀 더 논의된다.
하나 이상의 변형된 캡시드 및/또는 코아 단백질은 변형된 헥손 단백질, 변형된 파이버 단백질, 변형된 pVII 단백질 또는 그들의 조합일 수 있다. 한 가지 구현예에서, 헥손 과다가변 부위 (HVR)의 일부 및/또는 파이버 단백질의 일부는 말라리아원충 서컴포자소체 단백질의 B-세포 및/또는 T-세포 에피토프 적어도 하나에 의해 치환된다. 대안으로, 말라리아원충 서컴포자소체 단백질의 B-세포 및/또는 T-세포 에피토프 하나 이상은 파이버 단백질 또는 헥손 HVR 내에 삽입될 수 있다. 일정 관점들에서, 변형된 HVR은 HVR1, HVR2, HVR3, HVR4, HVR5, HVR6 또는 HVR7일 수 있다. 다른 관점들에서, 변형된 HVR은 HVR1 또는 HVR5일 수 있다. 일정 구현예들에서, HVR-변형된 헥손은 서열번호 3 (도 11), 서열번호 4 (도 12), 서열번호 5 (도 13), 서열번호 6 (도 14), 서열번호 7 (도 15), 서열번호 8 (도 16), 서열번호 9 (도 17), 서열번호 10 (도 18), 서열번호 11 (도 19), 서열번호 12 (도 20), 서열번호 13 (도 21), 서열번호 14 (도 22), 서열번호 15 (도 23), 서열번호 16 (도 24), 서열번호 17 (도 25), 서열번호 18 (도 26), 서열번호 19 (도 27), 서열번호 20 (도 28), 서열번호 21 (도 29), 서열번호 22 (도 30), 또는 서열번호 23 (도 31)의 핵산 서열을 가질 수 있다. 다른 구현예들에서, 변형된 파이버 단백질은 서열번호 24 (도 32) 또는 서열번호 25 (도 33)의 핵산 서열을 가질 수 있다.
또 다른 구현예들에서, 말라리아원충 서컴포자소체 단백질의 T-세포 에피토프는 다음의 부위라면 모두에서 아데노바이러스 코아 pVII 단백질 내에 삽입될 수 있다: 첫 번째 핵 정착 신호 (NLS) 이전 또는 두 개의 NLS 사이의 C-말단. 대안으로, 말라리아원충 서컴포자소체 단백질의 T-세포 에피토프는 pVII 단백질의 일부를 치환할 수 있다. 일정 구현예들에서, 변형된 pVII 단백질은 서열번호 26 (도 34), 서열번호 27 (도 35), 서열번호 28 (도 36) 또는 서열번호 29 (도 37)의 핵산 서열을 가질 수 있다.
재조합 아데노바이러스는 트랜스유전자 (transgenic) 단백질 또는 재조합 트랜스유전자 단백질을 발현할 수 있다. 일정 구현예들에서, 트랜스유전자 단백질 또는 재조합 트랜스유전자 단백질은 본 명세서에서 기술된 바와 같이 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터에 의해 인코드되고, 하나 이상의 숙주 세포의 감염 이후에 상기 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터에 의해 생산되는 재조합 아데노바이러스에 의해 발현되는 말라리아원충 서컴포자소체 단백질 또는 항원성 결정기이다.
따라서 일정 구현예들에서, 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터는 재조합 트랜스유전자 단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함한다. 한 가지 구현예에서, 재조합 트랜스유전자 단백질은 P. 옐리 서컴포자소체 (CS) 단백질 유전자 또는 그의 항원성 부분을 포함하는, 설치류-특이 기생충인 P. 옐리의 항원성 결정기를 포함할 수 있다. 또 다른 구현예에서, 재조합 형질전환 단백질은 P. 팔시파룸 서컴포자소체 (CS) 단백질 유전자 또는 그의 항원성 부분을 포함하는, 인간-특이 기생충인 P. 팔시파룸의 항원성 결정기를 포함할 수 있다. P. 팔시파룸 CS 단백질은 인간에서 모기-기원 감염에 대한 활성을 가진 면역접종 (active immunization)의 근거로 사용될 때 말라리아의 예방 효과를 나타내었다. 항원성 결정기는 좀 더 나아가 B 세포 및/또는 T 세포 에피토프와 같은 면역원성 에피토프를 포함할 수 있다.
일정 구현예들에서, CS 단백질은 개체에서 증진된 발현을 위해 코돈-최적화되어 있다. 코돈-최적화 (codon-optimizatin)는 요구되는 아미노산 함량, 관심있는 개체에서 일반적인 최적의 코돈 사용도 (usage) 뿐만 아니라 적절한 발현을 보장하도록 반드시 피해야 하는 점이라면 모두를 근거로 한다. 이러한 관점들은 스프라이싱 공여자 또는 수여자 (splice dornor and acceptor) 부위, 종결 코돈, 폴리아데닐화 (pA) 신호, GC- 및 AT-풍부 서열, 내부 TATA 박스, 또는 당해 기술분야에 알려진 관점이라면 모두일 수 있다. 일정 구현예들에서, 코돈-최적화된 CS 트랜스유전자의 DNA 서열은 도 9 (서열번호 1, P. 옐리) 및 도 10 (서열번호 2, P. 팔시파룸)에 나타나있다.
일정 구현예들에서, 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터는 다음의 변형된 P. 팔시파룸 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터들의 하나 일 수 있다: (NANP)n (서열번호 60)의 B 세포 에피토프 코딩 서열을 사용하여, 도 2에 나타낸 바와 같이 제작된 HVR1-변형된 아데노바이러스 벡터 (NANP-HVR1/PfCSP); (NANP)n (서열번호 60)의 B 세포 에피토프 코딩 서열을 사용하여, 도 4에 나타낸 바와 같이 제작된 파이버-변형된 아데노바이러스 벡터 (NANP-Fib/PfCSP); (NANP)n (서열번호 60)의 B 세포 에피토프 코딩 서열을 사용하여, 도 5에 나타낸 바와 같이 제작된 HVR1 및 파이버-변형된 아데노바이러스 벡터 (NANP-HVR1/B-Fib/PfCSP); (NANP)n (서열번호 60)의 B 세포 에피토프 및 EYLNKIQNSLSTEWSPCSVT (서열번호 62)의 CD4 에피토프 코딩 서열을 사용하여, 도 7에 나타낸 바와 같이 제작된 HVR1 및 pVII-변형된 아데노바이러스 벡터 (NANP-HVR1/CD4-pVII/PfCSP); (NANP)n (서열번호 60)의 B 세포 에피토프 및 EYLNKIQNSLSTEWSPCSVT (서열번호 62)의 CD4 에피토프 코딩 서열을 사용하여, 도 6에 나타낸 바와 같이 제작된 파이버 및 pVII-변형된 아데노바이러스 벡터 (NANP-Fib/CD4-pVII/PfCSP); 또한 (NANP)n (서열번호 60)의 B 세포 에피토프 및 EYLNKIQNSLSTEWSPCSVT (서열번호 62)의 CD4 에피토프 코딩 서열을 사용하여, 도 8에 나타낸 바와 같이 제작된 HVR1, 파이버 및 pVII-변형된 아데노바이러스 벡터 (NANP-HVR1/Fib/CD4-pVII/PfCSP).
다른 구현예들에서, 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터는 다음의 변형된 P. 옐리 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터들의 하나일 수 있다: (QGPGAP)n (서열번호 59)의 B 세포 에피토프 코딩 서열을 사용하여, 도 2에 나타낸 바와 같이 제작된 HVR1-변형된 아데노바이러스 벡터 (QGPGAP-HVR1/PyCS); (QGPGAP)n (서열번호 59)의 B 세포 에피토프 코딩 서열을 사용하여, 도 4에 나타낸 바와 같이 제작된 파이버-변형된 아데노바이러스 벡터 (QGPGAP-Fib/PyCS); (QGPGAP)n (서열번호 59)의 B 세포 에피토프 코딩 서열을 사용하여, 도 5에 나타낸 바와 같이 제작된 HVR1 및 파이버-변형된 아데노바이러스 벡터 (QGPGAP-HVR1/B-Fib/PyCS); (QGPGAP)n (서열번호 59)의 B 세포 에피토프 및 YNRNIVNRLLGDALNGKPEEK (서열번호 61)의 CD4 에피토프 코딩 서열을 사용하여, 도 7에 나타낸 바와 같이 제작된 HVR1 및 pVII-변형된 아데노바이러스 벡터 (QGPGAP-HVR1/CD4-pVII/PyCS); (QGPGAP)n (서열번호 59)의 B 세포 에피토프 및 YNRNIVNRLLGDALNGKPEEK (서열번호 61)의 CD4 에피토프 코딩 서열을 사용하여, 도 6에 나타낸 바와 같이 제작된 파이버 및 pVII-변형된 아데노바이러스 벡터 (QGPGAP-Fib/CD4-pVII/PyCS); 또한 (QGPGAP)n (서열번호 59)의 B 세포 에피토프 및 YNRNIVNRLLGDALNGKPEEK (서열번호 61)의 CD4 에피토프 코딩 서열을 사용하여, 도 8에 나타낸 바와 같이 제작된 HVR1, 파이버 및 pVII-변형된 아데노바이러스 벡터 (QGPGAP-HVR1/Fib/CD4-pVII/PyCS).
다른 구현예들에서, 재조합 아데노바이러스는 다음의 변형된 P. 팔시파룸 또는 P. 옐리 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터들의 하나에 의해 생산될 수 있다: NANP-HVR1/PfCSP 또는 QGPGAP-HVR1/PyCS (도 2), NANP-Fib/PfCSP 또는 QGPGAP-Fib/PyCS (도 4), NANP-HVR1/B-Fib/PfCSP 또는 QGPGAP-HVR1/B-Fib/PyCS (도 5), NANP-HVR1/CD4-pVII/PfCSP 또는 QGPGAP-HVR1/CD4-pVII/PyCS (도 7), NANP-Fib/CD4-pVII/PfCSP 또는 QGPGAP-Fib/CD4-pVII/PyCS (도 6), NANP-HVR1/Fib/CD4-pVII/PfCSP 또는 QGPGAP-HVR1/Fib/CD4-pVII/PyCS (도 8). 재조합 아데노바이러스는 본 명세서에서 기술된, 포유동물 숙주세포에서 재조합 트랜스유전자 단백질 (예로, 말라리아원충 CS 단백질)을 발현하는 능력을 가진 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터를 생산하는 방법에 따라 생산될 수 있다.
재조합 아데노바이러스의 정제는 기지의 바이러스 정제 방법을 사용하여 수행될 수 있다. 예를 들어, AD293 세포와 같은 곤충세포 (1 x 107개 세포/10 cm 디쉬)를 접종하여 재조합 아데노바이러스 단백질을 생산하는 방법에 의해 획득되는 0.5 내지 1.0 mL의 바이러스 스톡의 정제. 다음으로 배양 상청액은 감염 수 일 이후에 수집되고 원심분리에 의해 획득된 바이러스 펠렛은 PBS (인산 완충 식염액)와 같은 완충용액에 현탁시킨다. 그 결과 얻은 현탁액은 10 내지 60%의 슈크로스 농도 구배에 넣은 다음 원심분리하여 (4℃에서 60분 동안 25,000 rpm) 바이러스 밴드를 수집한다. 수집된 바이러스는 좀 더 나아가 PBS에서 현탁시키고, 연속적으로 상기와 동일한 조건 하에서 원심분리하며, 그 결과 정제된 재조합 바이러스 펠렛은 PBS와 같은 완충용액에서 4℃로 저장된다.
또 다른 구현예는 적어도 하나의 활성 성분을 필수적으로 포함하는 약제학적 조성물을 지향한다. 한 가지 구현예에서, 약제학적 조성물의 활성 성분은 본 명세서에서 기술된 유전적 조작 기법에 의해 획득될 수 있는 재조합 아데노바이러스를 포함할 수 있다. 보다 상세하게, 활성 성분은 헥손 과다가변 부위 (HVR)의 일부, 파이버 단백질의 일부, pVII 단백질의 일부 또는 그들의 조합이 말라리아원충 서컴포자소체 단백질의 면역원성 에피토프 적어도 하나에 의해 치환된, 변형된 캡시드 및/또는 코아 단백질을 포함하는 재조합 아데노바이러스일 수 있다. 대안으로, 말라리아원충 서컴포자소체 단백질의 B-세포 및/또는 T-세포 에피토프 하나 이상은 파이버 단백질, 헥손 HVR 또는 pVII 단백질 내에 삽입될 수 있다. 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터는 좀 더 나아가 하나 이상의 숙주세포를 감염시킨 이후에 재조합 아데노바이러스에 의해 발현되는 트랜스유전자 단백질 또는 재조합 트랜스유전자 단백질을 포함한다. 트랜스유전자 단백질 또는 재조합 트랜스유전자 단백질은 말라리아원충 서컴포자소체 단백질 또는 말라리아원충 서컴포자소체 단백질의 말라리아 항원일 수 있고, 여기에서 말라리아 항원은 말라리아원충 서컴포자소체 단백질의 적어도 하나의 면역원성 에피토프 (예로, B 세포 또는 T 세포 에피토프)를 포함한다.
일정 구현예들에서, 약제학적 조성물의 활성 성분은 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터로부터 유래한 재조합 아데노바이러스이고, 여기에서 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터는 다음의 변형된 P. 팔리파룸 또는 P. 옐리 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터들의 하나이다: NANP-HVR1/PfCSP 또는 QGPGAP-HVR1/PyCS (도 2), NANP-Fib/PfCSP 또는 QGPGAP-Fib/PyCS (도 4), NANP-HVR1/B-Fib/PfCSP 또는 QGPGAP-HVR1/B-Fib/PyCS (도 5), NANP-HVR1/CD4-pVII/PfCSP 또는 QGPGAP-HVR1/CD4-pVII/PyCS (도 7), NANP-Fib/CD4-pVII/PfCSP 또는 QGPGAP-Fib/CD4-pVII/PyCS (도 6), NANP-HVR1/Fib/CD4-pVII/PfCSP 또는 QGPGAP-HVR1/Fib/CD4-pVII/PyCS (도 8). 이들 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터는 세포 (예로, AD293 세포) 내로 형질전환될 때 재조합 아데노바이러스를 생산할 수 있고, 여기에서 재조합 트랜스유전자 단백질이 인간 세포를 포함하는 포유동물 세포에서 발현될 수 있다.
개체에게 주어질 때, 본 명세서에서 기술되는 바 재조합 아데노바이러스인 활성 성분을 가지는 약제학적 조성물은 하기 실시예들에서 좀 더 기술되는 바와 같이 말라리아 감염성 항원에 대항하는 말라리아 감염-예방 효과를 증진시키고 감염도 역가 (infectivity titer)를 감소시킨다. 따라서, 재조합 아데노바이러스는 표적 세포 및 조직의 감염과 연관된 말라리아 감염의 치료에 사용될 수 있다. 이러한 말라리아 감염에 의해 영향을 받는 표적 세포의 예로는 혈액 세포, 간 세포, 신장 세포, 뇌 세포, 폐 세포, 표피 세포 및 근육 세포를 포함한다. 이러한 세포를 포함하는 조직의 예로는 폐, 간, 신장, 뇌, 동맥 및 정맥, 위, 창자, 요도, 피부, 및 근육을 포함한다.
일정 관점들에서, 약제학적 조성물은 감염성 항원, 예를 들어 말라리아 기생충의 포자소체 표면 항원 (서컴포자소체 단백질 (CSP) 및 트롬보스폰딘 관련 부착 단백질 (Thrombospondin Related Adhesive Protein, TRAP)), 분열소체 표면 막 단백질 (MSPI), 말라리아로 감염된 적혈구로부터 분비된 말라리아 S 항원, 또한 말라리아로 감염된 적혈구 융기에 존재하는 P. 팔시파룸 적혈구 막 단백질-1 (PfEMPl)과 같은 말라리아 항원에 대항하는 말라리아 감염-예방 효과를 증진시킬 수 있다. 약제학적 조성물은 감염도 역가를 감소시켜서, 기지의 플라스모듐 (P) 종, 예를 들어 P. 팔시파룸 (P. falciparum), P. 말라리아 (P. malariae), P. 오발 (P. ovale), P. 비박스 (P. vivax), P. 노우레시 (P. knowlesi), P. 베르게이 (P. berghei,), P. 샤바우디 (P. chabaudi) 및 P. 옐리 (P. yoelii)라면 모두로부터 선택된 말라리아원충 기생충에 대항하는 말라리아 감염-예방 효과를 증진시킬 수 있다. 개체에게 투여될 때, 약제학적 조성물에 의한 감염도 역가의 감소는 약제학적 조성물을 투여하지 않은 개체와 대비할 때 증가된 생존, 무-질병 생존, 또는 무-감염 생존기간 및 생존, 무-질병 생존율 또는 무-감염 생존율을 가져올 수 있다. 따라서 일정 관점들에서, 약제학적 조성물은 말라리아원충과 같은 병원균에 의해 초래되는 말라리아 감염을 위한 예방 또는 치료적 제제로서 유용하다. 더 나아간 관점들에서, 약제학적 조성물은 말라리아원충과 같은 병원균에 의해 초래되는 말라리아 감염으로부터 유발되는 합병증을 위한 예방 또는 치료적 제제로서 유용하다.
본 발명의 재조합 아데노바이러스의 개체에서의 감염-예방 효과는, 예를 들어 본 발명의 캡시드-변형된 재조합 아데노바이러스 및 약제학적 투여를 위한 첨가물을 포함하는 약제학적 조성물을 근육내 (i.m.), 피하 (s.c.), 표피내 (i.c.), 진피내 (i.d.), 복강내 (i.p.), 비강내 , 또는 호흡 경로에 의해, 척추동물 상세하게는 인간을 포함하는 포유동물에게 투여한 다음 본 명세서에서 기술된 재조합 아데노바이러스를 활성 성분으로 포함하는 약제학적 조성물로 척추동물을 여러 번 면역화하여 제공될 수 있다. 감염-예방 효과를 평가하기 위하여, 약제학적 조성물로 여러 번 면역화된 다음 표적 병원균 (선택된 말라리아원충 종과 같음)에 의한 감염이 연속하여 주어진 개체의 생존율, 무-질병 생존, 또는 무-감염 생존은 약제학적 조성물이 주어지지 않는 개체의 생존율, 무-질병 생존, 또는 무-감염 생존과 비교될 수 있다.
일정 구현예들에서, 약제학적 조성물은 추가적으로 본 명세서에서 기술된 바 캡시드 및/또는 코아-변형된 재조합 아데노바이러스의 치료적 유효량 및 약제학적으로 허용가능한 담체를 포함할 수 있고, 이는 하기에 좀 더 기술된다.
또 다른 구현예는 적어도 하나의 활성 성분을 필수적으로 포함하는 백신 조성물을 지향한다. 한 가지 구현예에서, 백신 조성물의 활성 성분은 본 명세서에서 기술된 바 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터로부터 유래한 재조합 아데노바이러스를 포함할 수 있다. 보다 상세하게, 활성 성분은 헥손 과다가변 부위 (HVR)의 일부, 파이버 단백질의 일부, pVII 단백질의 일부 또는 그들의 조합이 말라리아원충 서컴포자소체 단백질의 면역원성 에피토프 적어도 하나에 의해 치환된, 변형된 캡시드 및/또는 코아 단백질을 포함하는 재조합 아데노바이러스일 수 있다. 대안으로, 말라리아원충 서컴포자소체 단백질의 면역원성 에피토프 적어도 하나는 pVII 단백질, 파이버 단백질, 또는 헥손 HVR 또는 그들의 조합 내에 삽입될 수 있다. 일정 구현예들에서, 백신 조성물의 활성 성분으로 도 2 내지 도 8에서 도시된 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터, 예를 들어 NANP-HVR1/PfCSP 또는 QGPGAP-HVR1/PyCS (도 2), NANP-Fib/PfCSP 또는 QGPGAP-Fib/PyCS (도 4), NANP-HVR1/B-Fib/PfCSP 또는 QGPGAP-HVR1/B-Fib/PyCS (도 5), NANP-HVR1/CD4-pVII/PfCSP 또는 QGPGAP-HVR1/CD4-pVII/PyCS (도 7), NANP-Fib/CD4-pVII/PfCSP 또는 QGPGAP-Fib/CD4-pVII/PyCS (도 6), NANP-HVR1/Fib/CD4-pVII/PfCSP 또는 QGPGAP-HVR1/Fib/CD4-pVII/PyCS (도 8)로부터 유래할 수 있다.
일정 관점들에서 개체에게 투여될 때, 백신 조성물은 먼저 캡시드 또는 코아 단백질의 적어도 일부 내로 삽입되거나 치환된 말라리아원충 CS 단백질의 항원성 부분 (예로, B 세포 에피토프, T 세포 에피토프 또는 둘 다) 하나 이상을 가지는 재조합 아데노바이러스를 포함한다. 다음으로, 백신 조성물은 재조합 트랜스유전자 단백질을 발현하고, 여기에서 재조합 트랜스유전자 단백질은 B 세포 에피토프, T 세포 에피토프 또는 둘 다를 포함하는 말라리아원충 CS 단백질이다. 말라리아원충 CS 단백질의 항원성 부분은 재조합 트랜스유전자 단백질에서 발견되고 변형된 캡시드 또는 코아 단백질은 하기 실시예에서 기술된 바와 같이 후천적 체액성 면역, 세포성 면역, 또는 둘 다를 촉진하거나 증진한다. 따라서 일정 관점들에서, 본 명세서에서 기술된 바 재조합 아데노바이러스는 체액성 면역, 세포성 면역 또는 둘 다를 촉진하거나 증진하는 백신으로서 유용하다.
좀 더 나아간 구현예들에서, 백신 조성물은 감염성 항원, 예를 들어 말라리아 기생충의 포자소체 표면 항원 (CSP 및 TRAP), 분열소체 표면 막 단백질 (MSPI), 말라리아로 감염된 적혈구로부터 분비된 말라리아 S 항원, 말라리아로 감염된 적혈구 융기에 존재하는 PfEMPl, 세린-풍부 항원 (Serine-Rich Antigen, SERA) 단백질, 타이로신-풍부 산성 매트릭스 단백질 (Tyrosine-Rich Acidic Matrix Protein, TRAMP), 또한 첨단 막 항원-1 (Apical Membrane Antigen-1, AMAl)과 같은 말라리아 항원에 대항하는 말라리아 감염-예방 효과를 증진시킬 수 있다. 좀 더 나아가, 본 명세서에서 기술된 백신 조성물의 투여로부터 유도되는 감소된 감염도 역가는 백신 조성물을 투여하지 않은 개체와 비교할 때 증가된 생존, 무-질병 생존 또는 무-감염 생존기간 및 생존, 무-질병 생존율 또는 무-감염 생존율을 가져올 수 있다. 따라서 일정 관점들에서, 백신 조성물도 역시 말라리아원충과 같은 병원균에 의해 초래되는 말라리아 감염을 위한 예방 또는 치료적 제제로서 유용하다. 더 나아간 관점들에서, 백신 조성물은 또한 말라리아원충과 같은 병원균에 의해 초래되는 말라리아 감염으로부터 유발되는 합병증을 위한 예방 또는 치료적 제제로서 유용하다.
본 명세서에서 기술되는 바 백신 조성물은 본 명세서에서 기술되는 바 재조합 아데노바이러스의 치료적 유효량을 포함할 수 있고, 좀 더 나아가 표준 방법에 따른 약제학적으로 허용가능한 담체를 포함한다. 허용가능한 담체의 예로는 무균의 식염수 및 무균의 완충된 식염수와 같은 생리학적으로 허용가능한 용액을 포함한다.
일정 구현예들에서, 백신 또는 약제학적 조성물은 항-말라리아 효과를 증진하도록 치료적 유효량의 아쥬반트와 조합하여 사용될 수 있다. 자체적으로 특이 항원 효과라면 모두를 가지지 않고, 면역계를 자극하고 백신에 대한 반응을 증가시킬 수 있는 면역학적 아쥬반트가 아쥬반트로서 사용될 수 있다. 많은 면역학적 아쥬반트들이 병원성-연관 분자적 양상 (pathogen-associated molecular patterns, PAMPs)으로서 알려져 있는 진화적으로 보존된 분자를 모방하고 톨-유사 수용체 (oll-like Receptors, TLRs)로서 알려져 있는 한 벌의 면역 수용체에 의해 인식된다. 본 명세서에서 기술된 구현예에 따라 사용될 수 있는 아쥬반트의 예로는 프런드 완전 아쥬반트 (Freund's complete adjuvant), 프런드 불완전 아쥬반트 (Freund's incomplete adjuvant), 이중가닥 RNA (TLR3 리간드), LPS, 모노포스포릴 지질 A (TLR4 리간드)와 같은 LPS 유사체, 플라젤린 (flagellin) (TLR5 리간드), 지질단백질 (lipoproteins), 지질펩타이드 (lipopeptides), 단일가닥 RNA, 단일가닥 DNA, 이미다조퀴놀린 유사체 (imidazoquinolin analogs) (TLR7 및 TLR8 리간드), CpG DNA (TLR9 리간드), 리비 아쥬반트 (Ribi's adjuvant) (모노포스포릴-지질 A/트레할로스 디코리노이콜레이트 (trehalose dicorynoycolate)), 당지질 (glycolipids) (α-GalCer 유사체), 비-메틸화된 CpG 아일랜드, 오일 에멀전, 리포좀 (liposomes), 비로좀 (virosomes), 사포닌 (QS21와 같은 사포닌의 활성 분획), 무라닌 디펩타이드 (muramyl dipeptide), 알럼 (alum), 알루미늄 하이도록사이드, 스쿠알렌 (squalene), BCG, GM-CSF 및 IL-12와 같은 사이토카인, MIP 1-α 및 RANTES와 같은 케모카인, N-아세틸무라민-L-알라닐-D-이소글루타민 (N-acetylmuramine-L-alanyl-D-isoglutamine, MDP), 타이모신 α1 (thymosin α1) 또한 MF59를 포함한다. 사용되는 아쥬반트의 양은 이러한 유형의 백신의 투여 이후에 인간 또는 동물에서 면역 반응의 일부로서 표현될 수 있는 피부의 연화, 통증, 홍반, 열, 두통 및 근육 통증과 같은 증상의 정도에 따라 선택될 수 있다.
일정 구현예들에서, 본 명세서에서 기술된 백신 또는 약제학적 조성물은 면역 반응-촉진하는 펩타이드 및 항박테리아 제제 (합성 항-박테리아 제제)와 같은 다른 기지의 약제학적 산물과 조합하여 사용될 수 있다. 백신 또는 약제학적 조성물은 좀 더 나아가 다른 약물 및 첨가제를 포함할 수 있다. 본 명세서에서 기술된 백신 또는 약제학적 조성물과 조합하여 사용될 수 있는 약물 또는 첨가제의 예로는 본 발명의 재조합 아데노바이러스 또는 재조합 트랜스유전자 단백질의 세포내 흡수를 돕는 약물, 리포좀 및 형질전환을 용이하게 하는 다른 약물 및/또는 첨가제 (예로, 형광탄소 에멀전화제 (fluorocarbon emulsifiers), 코크리에이트 (cochleates), 세관 (tubules), 골든 입자 (golden particles), 생분해성 미세구 (biodegradable microspheres) 및 양이온성 중합체)를 포함한다.
일정 구현예들에서, 본 명세서에서 기술된 백신 또는 약제학적 조성물에 포함되는 활성 성분의 양은, 그것이 치료적 또는 약제학적 유효량인 경우라면 넓은 범위의 농도, 바이러스 입자 단위 (VPU), 플라크 형성 단위 (PFU), 무게 대비 부피 백분율 (w/v %) 또는 다른 활성 성분 양의 정량적 척도로부터 선택될 수 있다. 백신 또는 약제학적 조성물의 용량은 원하는 치료적 효과, 투여 방법 (투여 경로), 치료 기간, 환자의 연령, 성별 및 기타 조건 등을 따라 넓은 범위로부터 적절하게 선택될 수 있다.
일정 관점들에서, 재조합 아데노바이러스가 백신 또는 약제학적 조성물의 활성 성분으로서 인간 개체에게 투여될 때, 재조합 아데노바이러스의 용량은 재조합 바이러스의 PFU로서 계산되는 환자 당 대략적으로 102 내지 1014 PFU, 바람직하게는 105 내지 1012 PFU, 더욱 바람직하게는 106 내지 1010 PFU에 해당하는 양으로 투여될 수 있다.
좀 더 나아간 관점들에서, 재조합 아데노바이러스가 백신 또는 약제학적 조성물의 활성 성분으로서 개체에게 투여될 때, 용량은 백신 숙주 내에 도입되는 발현가능한 DNA의 양 또는 전사된 RNA의 양의 견지에서 넓은 범위로부터 선택될 수 있다. 용량도 또한 사용된 전달 벡터라면 모두에 사용되는 전사 및 해독 프로모터의 강도에 의존한다.
일정 구현예들에서, 본 명세서에서 기술된 백신 조성물 또는 약제학적 조성물은 재조합 아데노바이러스를 PBS (인산 완충 식염수) 또는 식염수에 현탁하여 제조된 재조합 아데노바이러스 현탁액을 국소적 부위 내에 (예로, 폐 조직, 간, 근육 또는 뇌 내에) 직접 주입하는 것에 의해, 코 또는 호흡기 흡입에 의해, 또는 근육내 (i.v.) (예로, 동맥내, 정맥내 및 간문맥), 피하 (s.c.), 표피내 (i.c.), 피부내 (i.d.) 또는 복강내 (i.p.) 투여에 의해 투여될 수 있다. 본 발명의 백신 또는 약제학적 조성물은 한 번 이상 투여될 수 있다. 보다 상세하게, 초기 투여 이후에 한 번 이상의 추가적인 백신접종이 추가자극 (booster)으로서 주어질 수 있다. 한 번 이상의 추가자극 투여는 원하는 효과를 증진시킬 수 있다. 백신 또는 약제학적 조성물의 투여 이후에, 본 명세서에서 기술되는 바 재조합 아데노바이러스를 포함하는 약제학적 조성물로 추가자극 면역접종이 수행될 수 있다.
좀 더 나아간 구현예들에서, 본 발명의 백신과 함께 다양한 다른 아쥬반트, 약물 또는 첨가물의 사용이 상기에 논의된 바와 같이, 백신 또는 약제학적 조성물의 투여에 의해 달성되는 치료적 효과를 증진시킬 수 있다. 약제학적으로 허용가능한 담체는 등장성 (isotonicity) 및 화학적 안정성을 증진하는 물질과 같은 미량의 첨가물을 포함할 수 있다. 이러한 첨가물은 사용되는 용량 및 농도에서 인간 또는 다른 포유동물 개체에게 비-독성이어야 하고, 그의 예로는 인산, 시트르산, 숙신산, 아세트산, 및 다른 유기산 또한 그들의 염과 같은 완충용액; 아스코브산과 같은 항산화제; 저분자량 (예로, 약 10개 이하의 잔기) 폴리펩타이드 (예로, 폴리아르기닌 및 트리펩타이드) 단백질 (예로, 혈청 알부민, 젤라틴, 및 면역글로불린); 아미노산 (예로, 글리신, 글루탐산, 아스파트산 및 아르기닌); 모노사카라이드, 디사카라이드, 및 다른 카보하이드레이트 (예로, 셀룰로스 및 그의 유도체, 포도당, 만노스, 및 덱스트린); 킬레이팅제 (예로, EDTA); 슈가 알코올 (예로, 만니톨 및 소르비톨); 반대이온 (예로, 소듐); 비이온성 표면활성제 (예로, 폴리솔베이트 및 폴록사머 (ploxamer))를 포함한다.
본 명세서에서 기술된 재조합 아데노바이러스를 포함하는 백신 또는 약제학적 조성물은 밀봉된 앰풀 또는 바이알과 같은 단위 또는 복수 용량 용기에 수성 용액 또는 냉동동결된 산물로서 저장될 수 있다.
또 다른 구현예는 좀 더 나아가 재조합 아데노바이러스성 백신, 제형물, 또는 약제학적 조성물의 유효량을 투여하는 것을 포함하는 말라리아 감염을 예방하는 방법, 또는 말라리아를 치료하는 방법을 제공한다. 본 발명은 좀 더 나아가 재조합 아데노바이러스성 백신 조성물, 제형물, 약제학적 조성물 또는 그들의 조합의 유효량을 개체에게 투여하는 것을 면역촉진 (immunostimulation) 방법을 제공한다. 개체로는 인간, 동물 (포유동물, 조류, 파충류, 어류, 및 양서류), 또는 말라리아 기생충으로 감염될 수 있는 기타 다른 개체들을 포함한다. 말라리아 기생충으로는 기지의 플라스모듐 (P) 종, 예를 들어 P. 팔시파룸, P. 말라리아, P. 오발, P. 비박스, P. 노우레시 , P. 베르게이, P. 샤바우디 및 P. 옐리라면 모두로부터 선택된 말라리아원충 기생충을 포함할 수 있다.
일정 구현예들에서, 본 명세서에서 기술된 바 재조합 아데노바이러스는 단독으로 형성되거나 백신 조성물, 제형물 또는 약제학적 조성물 내에 약제학적으로 허용가능한 담체와 함께 형성되어, 개체에 투여될 수 있다. 투여 경로는, 예를 들어 상기에 언급된 투여 경로라면 모두일 수 있다. 본 발명에서의 용도를 위한 약제학적으로 허용가능한 담체는 본 기술적 분야에서 보편적으로 사용되는 담체들로부터 생산될 약제학적 조성물의 형태에 따라 적합하게 선택될 수 있다. 예를 들어 약학적 조성물이 수성의 용액으로 형성될 때, 정제된 물 (무균의 물) 또는 생리학적 완충용액이 담체로서 사용될 수 있다. 약제학적 조성물이 다른 적절한 용액으로 형성될 때, 글리콜, 글리세롤 및 올리브 오일과 같은 주입될 수 있는 유기 에스테르가 담체로서 사용될 수 있다. 본 조성물은 안정화제, 부형제 또한 본 기술적 분야 상세하게는 백신 제형물의 분야에서 보편적으로 사용되는 다른 물질들을 포함할 수 있다.
좀 더 나아간 구현예들에서, 백신 조성물, 제형물, 또는 약제학적 조성물에서 사용되는 재조합 아데노바이러스의 양은 넓은 범위의 농도, VPU, PFU, 무게 대비 부피 백분율 (w/v %) 또는 다른 활성 성분 양의 정량적 척도로부터 적합하게 선택될 수 있다. 일정 관점들에서, 조성물에서 재조합 아데노바이러스의 적합한 범위는 바람직하게 약 0.0002 내지 약 0.2 (w/v %), 또한 더욱 바람직하게는 0.001 내지 0.1 (w/v %)이다. 일정 구현예들에 따른 재조합 아데노바이러스 백신 조성물, 제형물, 또는 약제학적 조성물의 투여 방법은 용량 형태, 환자의 연령, 성별 및 질환의 중증도 (severity)와 같은 기타 조건에 따라 적합하게 선택될 수 있다. 적합한 용량 형태는 주사, 점적제, 코 점적제 (nasal drops), 및 흡입제와 같은 비경구 투여용 형태이다. 조성물이 주사 또는 점적제로 형성될 때, 주사는 정맥내로 투여될 수 있고 적절한 경우 포도당 용액 또는 아미노산 용액과 같은 치환 수액 (replacement fluid)과 혼합될 수 있으며, 또는 근육내 (i.m.), 표피내 (i.c.), 피하 (s.c.), 진피내 (i.d.), 또는 복강내 (i.p.)로 투여될 수 있다.
다른 구현예들에서, 재조합 아데노바이러스 백신 조성물, 제형물, 또는 약제학적 조성물의 매일 용량은 개체의 조건, 체중, 연령, 성별 등에 따라 변화될 수 있다. 일정 관점들에서, 재조합 아데노바이러스의 용량은 하루 체중 kg 당 대략적으로 0.001 내지 100 mg의 양으로 투여된다. 본 발명의 백신, 제형물, 또는 조성물은 하루 한 번 이상의 투여로 투여될 수 있다.
좀 더 나아간 구현예들에서, 재조합 아데노바이러스가 백신 조성물, 제형물 또는 약제학적 조성물의 활성 성분으로서 인간 개체에게 투여될 때, 재조합 아데노바이러스의 용량은 재조합 바이러스 입자의 PFU로서 계산되는 환자 당 대략적으로 102 내지 1014 PFU, 바람직하게는 105 내지 1012 PFU, 더욱 바람직하게는 106 내지 1010 PFU에 해당하는 양으로 투여될 수 있다. 본 발명의 백신 조성물은 굳 메디칼 시행법 (Good Medical Practice)에 따라 각 환자의 임상적 조건 (예를 들어, 예방되거나 치료될 조건), 재조합 아데노바이러스를 포함하는 백신 조성물의 전달 부위, 표적 조직, 투여 방법, 용량 섭생, 또한 당업자에게 알려져 있는 다른 요인들을 고려하여 투여되어야 한다. 따라서, 본 명세서에서의 백신 조성물의 적절한 용량은 상기를 고려하여 결정된다.
보다 또 다른 기재내용은 재조합 아데노바이러스를 포함하는 말라리아 백신 조성물의 면역학적 또는 치료적 양을 투여하는 것을 포함하는, 개체에서 말라리아 감염을 치료하거나 예방하는 방법에 관한 것이다. 말라리아 백신의 재조합 아데노바이러스는 말라리아원충 기생충의 항원성 결정기를 포함할 수 있고, 좀 더 나아가 하나 이상의 변형된 캡시드 또는 코아 단백질을 포함할 수 있다. 면역학적, 약학적 또는 치료적 양은 강력한 면역 반응이 (CS) 단백질 (예로, 트랜스유전자, B 세포 에피토프, 또는 CD4+ T 세포 에피토프)의 하나 이상의 항원성 부분에 대항하여 생성되어 말라리아 감염이 예방되고 중증도가 감소되는 적합한 양이라면 모두일 수 있다.
개체가 처음 아데노바이러스 벡터에 노출되거나 "감작된 (primed)" 때, 면역계는 그 특정한 벡터에 대한 중화 항체를 생산한다. 아데노바이러스에 대한 면역 반응은 일반적으로 캡시드 단백질에게로 유도된다. 따라서, 동일한 아데노바이러스 벡터, 또는 "추가자극 (boosts)"에 대한 연속적 노출은 트랜스유전자 발현의 효능을 감소시킬 수 있다. 따라서 일정 구현예들에서, 상기에 기술된 말라리아 감염을 치료하거나 예방하는 방법은 먼저 재조합 아데노바이러스 벡터를 사용하는 감작 단계 (priming step), 이어지는 하나 이상의 서로 다른 재조합 아데노바이러 벡터를 사용하는 하나 이상의 추가자극 단계 (boosting steps)를 포함할 수 있다. 본 방법은 야생형 아데노바이러스 전혀 노출된 적이 없었던 개체에서 또는 이전에 야생형 아데노바이러스에 미리 노출되었던 적이 있었던 개체에서 사용될 수 있고, 감작 단계에서 재조합 아데노바이러스 벡터는 기존의 아데노바이러스 면역을 속이는 데 사용된다. 좀 더 나아간 구현예들 및 실시예들은 하기에 기술된다.
벡터로서의
아데노바이러스
아데노바이러스는 시험관내 (in vitro) 및 생체내 (in vivo)에서 다양한 세포들에 하나 이상의 치료적 또는 항원성 트랜스유전자를 전달하는 데 널리 사용되어 왔던, 한 벌의 바이러스성 캡시드 단백질 (하기에 기술됨) 및 바이러스성 게놈을 포함하는 외투가 없는 (non-enveloped) DNA 바이러스이다. 많은 아데노바이러스 혈청형이 존재하고 있다. 바람직하게는 기지의 아데노바이러스 혈청형들 중의 혈청형 5 (Ad5)가 그의 강한 생체내 감염도 때문에 외래 유전자 형질감염 (transduction)을 위한 벡터로서 사용된다 (Abbink et al. 2007). 항원성 트랜스유전자의 발현은 당해 기술분야에 알려져 있는 프로모터 또는 인핸서라면 모두에 의해 조절될 수 있다. 유전자 발현을 조절하는 데 사용될 수 있는 프로모터로는, 이에 제한되는 것은 아니지만 사이토메갈로바이러스 초기 프로모터 (cytomegalovirus immediate early promoter, CMV), 원숭이 바이러스 40 (SV40) 초기 프로모터, 세포성 폴리펩타이드 사슬 연장인자 1 알파 (EF1α) 프로모터, 라우 사코마 바이러스 (RSV) 프로모터, 및 테트라사이클린-조절 (TR) 프로모터를 포함한다. 코딩 서열 이후에 폴리아데닐화 (pA) 신호도 역시 효율적인 전사 및 해독에 사용될 수 있다. 본 명세서에서 기술된 재조합 아데노바이러스 벡터는, E1 부위가 복제, 전사, 해독 및 패키징 과정에 요구되기 때문에 적어도 아데노바이러스 게놈의 E1 부위에서의 결실을 가지면서, 복제-결함성 (replication-defective)일 수 있다. 일정 관점들에서, E2, E3 및/또는 E4 부위도 역시 결실될 수 있다. 좀 더 나아간 관점들에서, 코작 공통서열 (Kozak consensus sequence)이 더욱 효율적인 해독에 사용될 수 있다 (Kozak 1987).
아데노바이러스 (Ad) 시스템은 많은 이유로 재조합 백신의 개발을 위한 매력적인 벡터이다. 한 가지 이유는 재조합 아데노바이러스성 벡터가 이에 제한되는 것은 아니지만 마우스 및 인간 세포 유형을 포함하는 대부분의 포유동물 세포 유형들 (복제성 및 미-복제성 둘 다)를 감염시키는 것이다. 따라서, 동일한 벡터가 마우스 모델 및 인간 임상시험에서 같이 성공적으로 사용될 수 있다. 또 다른 이유는 전달된 유전적 정보라면 모두가 염색체 외부에 (epichromosomal) 남아있어서, 세포 유전형의 삽입적 돌연변화 및 변경 (alteration)을 회피하는 것이다 (Crystal 1995). 보다 또 다른 이유는 트랜스유전자가 바이러스 복제의 연속적인 순환 이후에도 변하지 않고 남아있는 것이다. 아데노바이러스를 사용하는 것의 다른 장점은 재조합 아데노바이러스가: 1) 높은 비리온 (virion) 안정성을 가지고, 2) 잘 인내하고 (well tolerated), 3) 높은 역가로 배양될 수 있고, 4) 많은 트랜스유전자를 수용할 수 있고, 5) 오랫 동안 철저하게 연구되었던 게놈을 가져서, 여러 가지 혈청형들의 완전한 DNA 서열들이 알려져 있으며, 재조합 DNA 기법에 의한 Ad 게놈의 조작이 용이한 점을 포함한다 (Graham and Prevec 1992).
한 가지 구현예에서, 아데노바이러스 백신 형식은 전-전혈구성 말라리아 기생충을 표적하고 말라리아 감염으로부터 보호작용을 제공하는 백신의 개발을 위한 바이러스성 벡터로서 사용된다. 기지의 재조합 바이러스성 벡터들 중에서 (Rodrigues et al. 1997, Bruna-Romero et al. 2001, Anderson et al. 2004, Tao et al. 2005), 아데노바이러스는 전-적혈구성 말라리아 기생충에 대한 강한 보호작용을 하는 세포성 면역 반응을 유도할 수 있기 때문에 말라리아 백신에 적합한 바이러스성 벡터가 되는 것으로 확인되었다 (Rodrigues et al. 1997). 말라리아 기생충은 플라스모듐 과 (family)에 속하는 것이라면 모두일 수 있다. 일정 구현예들에서, 표적된 기생충은 P. 옐리 또는 P. 팔시파룸일 수 있다.
트랜스유전자로서
PyCS
를 발현하는
아데노바이러스
벡터는 말라리아 특이 CD8+ T 세포 반응을 이끌어낸다
아데노바이러스는 말라리아에 대한 유의한 CD8+ T 세포 매개성 보호적 면역성을 유도하는 매력적인 벡터이다 (Rodrigues et al. 1997, Rodrigues et al. 1998). P. 옐리 (설치류 말라리아 기생충) CS 단백질, AdPyCS을 발현하는 재조합 아데노바이러스의 면역원성은 설치류 말라리아 모델을 사용하여 결정되었다. AdPyCS로 마우스의 접종은 마우스의 유의한 비율에서 완전한 면역을 유도하여 기생충 혈증 (parasitemia)의 발생을 예방한다 (Rodrigues et al. 1997). 이러한 보호작용 효과는 T 세포 집단의 결핍에 의해 입증된 바와 같이 CD8+ T 세포에 의해 주로 달성되고 AdPyCS가 말라리아 기생충에 대한 항체 반응의 높은 역가를 유도하지 않는 점에 의해 확증된다.
캡시드-변형된 아데노바이러스의 감염도를 정량적으로 측정하기 위하여, 셔틀 벡터 (shuttle vector)는 GFP 발현 카세트 및 트랜스유전자를 위한 클로닝 부위를 포함할 수 있다. 그 결과 얻은 셔틀 벡터 (GFP/pShuttle-CMV)는 트랜스유전자를 위한 이중의 pCMV 프로모터들 및 SV40pAs 또한 pmaxGFP로부터 나온 GFP (아마사사 (Amaxa), 독일)를 가진다. 최적화된 PyCS 단편은 GFP/pShuttle-CMV의 KpnI 및 HindIII 부위 내로 삽입되었다.
Ad(PyCS+GFP)의 면역원성은 CS-특이 CD8+ T 세포 반응의 강도 및 말라리아원충의 간 단계에 대한 보호작용 면역성 (protective immunity)의 수준을 측정하여 결정되었다. 최적의 용량, 1010개의 바이러스성 입자 (v.p.)를 사용하여 서로 다른 경로를 통하여 Ad(PyCS+GFP)의 투여는, AdPyCS가 생-P. 옐리 포자소체로 감염된 마우스에서 가장 높은 정도의 간 단계 저해를 유발하도록 가장 강한 반응을 유도하는 피하 (s.c.) 및 근육내 (i.m.) 경로로 이끌어낸 것으로 확인된 것과 동일한 양상의 항-말라리아 보호작용을 이끌어내었다. 이것은 백신으로서 Ad(PyCS+GFP)가 AdPyCS와 동등하게 행동하고 (Rodrigues et al 1997), 잠재적으로 AdPyCS의 생체내 주성 (tropism)을 결정하는 데 유용한 도구라는 점을 설명하고 있다.
아데노바이러스
캡시드
및
코아
단백질
상기의 연구들은 CS 단백질을 발현하는 재조합 아데노바이러스성 벡터가 CD8+ T 세포에 의한 강한 세포성 면역 반응을 이끌어내기는 하지만, 평가가능한 체액성 반응은 전혀 그렇지 못하다. 따라서, 야생형 아데노바이러스에 대한 체액성 반응이 종종 캡시드 단백질으로 인해 생길 수 있기 때문에 변형된 캡시드 및 코아 단백질을 가진 재조합 아데노바이러스성 벡터는 1) B 세포 활성를 통한 체액성 면역을 증진시키고, 2) T 헬퍼 세포 활성화를 통한 체액성 면역을 증진시키고, 또한 3) 기존의 아데노바이러스성 면역성을 속이도록 제작되었다.
아데노바이러스는 20면체의 (icosahedral) 모양을 가진 외투가 없고 (non-enveloped) 노출된 (naked) 이중가닥 DNA 바이러스이다. 아데노바이러스 캡시드는 252개의 캡소머 (capsomers)로 구성되고 이중에서 240개는 헥손 삼중체이고 12개는 펜톤 오중체 (penton pentamers)이다. 파이버 단백질은 각 펜톤 베이스 (penton base)로부터 돌출되고, 세포성 수용체와 상호작용에 의해 숙주 세포에 부착을 달성한다. 두 번째 상호작용은 αvβ3, αvβ5 및 유사한 인테그린들과 펜톤 베이스에 있는 RGD (Asp-Arg-Gly) 모티브 사이에 일어나고, 세포 내로 아데노바이러스의 연속된 내재화 (internalization)를 용이하게 한다 (Mathias et al. 1994, Wickham et al. 1993). 대부분의 아데노바이러스는 콕사키-아데노바이러스 수용체 (coxsackie-adenovirus receptor), CAR를 세포성 수용체로서 사용한다 (Bergelson et al. 1997). 또한, MHC 클래스 I 분자, VCAM, 및 헤파란 설페이트는 Ad5의 부착 및 침입을 매개하는 것으로 확인되었다 (Chu et al. 2001, Hong et al. 1997). 세포내입 (endocytosis)을 통한 침입을 이어서, Ad5는 세포질액 내로 들어오는 세포내입 부위 (endocytic compartments)로부터 신속하게 피한다 (Meier and Greber 2003, Leopold and Crystal 2007). 다음으로, 비리온은 미세세관을 사용하여 핵 내로 전위된다. 파이버 단백질은 프로세싱에서 가장 초기 캡시드 단백질로서 분비된다 (Nakano et al. 2000, Hong et al 2003). 서로 다른 혈청형의 아데노바이러스는 서로 다른 운반 방식 (trafficking patterns)을 보여주고 있다 (Miyazawa et al. 1999, Miyazawa et al. 2001). 파이버 단백질을 변화시키거나 변형하는 것은 운반에 충격을 줄 수 있고, 이는 항원 프로세싱 및 표현 (presentation), 이어서 항원 표현 세포 (APC)의 감염의 측면에서 특히 중요할 수 있다.
아데노바이러스 파이버는 파이버 꼬리 (tail), 몸통 (shaft) 및 융기 (knob) 도메인으로 나누어진 삼중체이다 (Henry et al. 1994, Rux and Burnett 2004, Chroboczek et al. 1995). 융기 도메인의 3차원적 구조는 알려져 있고, 돌연변이화 (mutagenesis) 연구들과 함께 이들 연구는 CAR 상호작용 및 삼중합 (trimerization)에 관여하는 영역이 영상화되도록 한다 (Kirby et al. 1999, Xia et al. 1995). 파이버 몸통은 비리온으로부터 돌출되고 파이버 융기는 콕사키 (Coxsackie) 및 아데노바이러스 수용체 (CAR) 상호작용 도메인을 포함한다 (Roelvink et al. 1999, Bewley et al. 1999). 파이버 융기의 CAR-결합 부위는 일차적으로 AB 루프 및 CD 루프로부터 나온 잔기들로 구성되고 이차적으로 FG 및 HI 루프 또한 B, E 및 F β 시트로 연장된다 (Roelvink et al. 1999, Bewley et al. 1999). HI 루프는 파이버 융기 상에서 최고로 잘 연구된 삽입 부위이고 (Worgall et al. 2004, Mizuguchi and Hayakawa 2004, Koizumi et al. 2003, Belousova et al. 2002, Noureddini and Curiel 2005, Nicklin et al. 2001), HI 루프 내로 에피토프의 삽입 (잔기 543 및 544)은 강력한 항-에피토프 면역성을 유도하였다 (Krause et al. 2006). 따라서, 면역우세한 CS-유래 B 세포 에피토프가 처음 파이버 단백질의 HI 루프 내로 삽입되었다.
헥손은 비리온 당 720개의 사본수를 가진 아데노바이러스 캡시드의 가장 풍부한 단백질이다. 성숙한 바이러스에서, 헥손은 20면체 비리온의 절단면을 만드는 호모삼중체 캡소머로서 존재한다 (Rux and Burnett 2004). 아데노바이러스 혈청형 2 및 5 (Ad2 및 Ad5) 헥손의 결정 구조가 풀리고 복잡한 분자적 건축구조가 밝혀졌다 (Athapilly et al. 1994, Roberts et al. 1986, Rux and Burnett 2000). 각 단일체 소단위 (monomeric subunit)의 기본는 많은 20면체 바이러스들의 캡시드 단백질에 존재하는 두 개의 베타-배럴 모티브로 구성된다. 세 개의 긴 루프 (DE1, FG1, 및 FG2)가 기본 구조로부터 뻗어나와 각 분자의 타워 부위를 형성한다 (Rux and Burnett 2004). 이들 루프 도메인 내의 서열은 캡시드의 표면으로 돌출되어 비리온의 외부를 형성한다. 서로 다른 아데노바이러스 혈청형들로부터 나온 정렬은 캡시드 외부 상에 위치한 서열이 길이 및 아미노산 서열 둘 다에서 약하게 보존되는 것을 보여준다 (Crawford-Miksza and Schnurr 1996). 또한, 과다가변 부위 (hypervariable regions, HVRs)로 명명되는 이들 약하게 보존되는 도메인 상에 위치한 서열들은 이에 대한 혈청형-특이 항체가 생산되는 결정기들을 포함한다 (Top 1975, Rux and Burnett 2000, Top et al. 1971).
초기 서열 정렬에 기초하여, 7가지의 HVRs가 헥손 분자를 통틀어 확인되었다 (Crawford-Miksza and Schnurr 1996, Roberts et al 2006). HVRs은 혈청형들 간에 약하게 보존되고 헥손의 구조적 특성을 유지하는 데 관여하지 않는 것으로 여겨지기 때문에, 이들 도메인에 작은 변화가 바이러스의 생존도에 영향을 주지 않고도 만들어질 수 있다 (Rux and Burnett 2000). 예를 들어, 바이러스 생존도와 타협하지 않고도 헥사히스티딘 태그가 HVR2, HVR3, HVR5, HVR6, 및 HVR7 내로 삽입될 수 있다 (Wu et al. 2005). 따라서, 헥손 HVRs은 종종 헥손 HVRs에 위치하는 펩타이드에 대한 항체 반응을 효율적으로 유도하는 데 표적으로서 사용된다 (Worgall et al. 2005, Crompton et al. 1994). 혈청형들 간 길이에서 그의 약한 보존 및 아데노바이러스 캡시드의 가장 외부의 표면 상에 그의 위치로 인하여 (Rux and Burnett 2000, Crawford-Miksza and Schnurr 1996), 헥손 HVR5은 처음에 에피토프 삽입을 위한 부위로서 선택되었다. 좀 더 나아가, 헥손의 결정 구조는 HVR5이 캡시드 표면 상의 유연한 루프인 것을 가르키고, HVR5이 캡시드의 구조적 특성과 타협하지 않고도 비교적 큰 펩타이드를 수용할 수 있는 점을 제시하고 있다 (Roberts et al. 1986). 헥손-특이 CD4+ 및 CD8+ 에피토프는 최근에 확인되었고 (Leen et al. 2008), 아데노바이러스에 대한 CD4+ T 세포 반응은 인간에서 헥손 단백질 내에 있는 보존된 잔기에 대항하는 데 중점을 둔다 (Onion et al. 2007, Heemskerk et al. 2006).
아데노바이러스 코어는 바이러스성 게놈 및 네 개의 코아 단백질로 구성된다. 말단 단백질 (terminal protein, TP)은 비리온 당 두 개의 사본수로 직선형 바이러스성 DNA 가닥 각각의 5' 말단에 공유적으로 결합된다. 세 가지의 다른 코아 단백질, 뮤 (μ), V (pV) 및 VII (pVII)가 아르기닌-풍부 부분을 통해 바이러스성 DNA에 비공유적으로 또한 비특이적으로 결합된다. pVII는 대략적으로 비리온당 700 - 800개의 사본수로 분포하는 주요한 코아 단백질이고, 주변에 바이러스성 DNA가 감싸서 뉴클레오좀 (nucleosome) 구조를 형성하는 히스톤-유사 중심으로서 작용한다.
체액성
면역을 증진하도록
아데노바이러스
캡시드
구조의 변형
일정 구현예들에서, 아데노바이러스 캡시드 단백질에 있는 (헥손 또는 파이버 내에 삽입됨) 면역우세한 CS 단백질 B 에피토프를 가지는 서컴포자소체 (CS) 아데노바이러스성 벡터가 기술된다. 트랜스유전자는 CS에 대한 세포-매개성 및 체액성 면역 반응을 증강시키도록 CMV와 같은 프로모터 하에 있을 수 있다.
중앙의 반복서열 부위는 플라스모듐 종 중에서 CS 단백질의 보존된 구조이고, 본 반복서열에 대한 항체는 포자소체 중화 활성을 가지는 것으로 확인되었다. 말라리아원충 CS 단백질에 있는 반복서열의 예로는 (NANP)n 반복서열 (P. 팔시파룸; 서열번호 60), ANGAGNQPG 반복서열 (P. 비박스; 서열번호 63) 및 NAAG 반복서열 (P. 말라리아; 서열번호 64)를 들 수 있고, 이는 아데노바이러스 캡시드 단백질 내로 삽입될 수 있다. 일정 구현예들에서, PfCSP의 4개 이상의 (NANP)n 반복서열 (서열번호 60)이 아데노바이러스 혈청형 5 헥손의 HVR1 내로 삽입될 수 있다. 일정 구현예들에서, 2, 4, 6, 8, 10, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 또는 28개의 (NANP)n 반복서열 (서열번호 60; n = 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28)이 아데노바이러스 혈청형 5 헥손의 HVR1 내로 삽입될 수 있다. (NANP)n 반복서열은 추가적으로 파이버의 HI 루프 내로 삽입될 수 있다.
일정 구현예들에서, CS에 대해 면역우세한 중화 B 세포 에피토프는 개선된 CS 단백질 아데노바이러스 백신을 개발하도록 지도작성되었다. 재조합 P. 옐리 CS 단백질 (PyCS)로 면역화된 마우스는 두 가지 주요 면역우세한 B 에피토프, QGPGAP (서열번호 59) 및 QQPP (서열번호 65)에 대한 높은 역가를 생성하였지만, 시험관내 중화 분석법은 QGPGAP 에피토프 (서열번호 59)에 대한 체액성 반응이 (QGPGAP)3 펩타이드 (서열번호 59; n = 3)를 배지에 첨가하여 중화가 역전될 수 있기 때문에 중화 활성을 설명할 수 있는 점을 보여주었다. 일정 구현예들에서, PyCS의 3개 이상의 (QGPGAP)n 반복서열 (서열번호 59)이 아데노바이러스 혈청형 5 헥손의 HVR1 내로 삽입될 수 있다. 일정 구현예들에서, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 또는 12개의 (QGPGAP)n 반복서열 (서열번호 59; n = 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12)이 아데노바이러스 혈청형 5 헥손의 HVR1 내로 삽입될 수 있다. (QGPGAP)n 반복서열은 추가적으로 파이버의 HI 루프 내로 삽입될 수 있다.
B 세포 에피토프 펩타이드는 면역계가 에피토프를 효율적으로 인식할 수 있도록 아데노바이러스 비리온의 표면 상에 표현되어야 한다. 이러한 삽입 부위는 헥손의 HVRs 및 파이버에서의 루프 구조일 수 있고, 서로 다른 삽입 부위가 결합될 수도 있다.
T
헬퍼
세포 활성화를 증진하도록
아데노바이러스
캡시드
및
코아
단백질의 변형
또 다른 구현예에서, 아데노바이러스성 벡터에서 사용되는 트랜스유전자에 특이적인 CD+ 에피토프는 아데노바이러스-기초 백신의 면역원성을 증강시키도록 pVII, pV 및 헥손과 같은 아데노바이러스 단백질 내로 통합될 수 있다. 가지세포 (DC) 및 B 세포와 같은 전문적인 항원 표현 세포 (APC)는 세포내입을 통하여 바이러스 입자와 같은 입자화된 병원균을 흡수하고 병원균에 있는 CD4+ 에피토프를 체액성 및/또는 세포성 면역 반응을 위해 헬퍼 세포로서 작용하는 CD4+ T 세포에 나타낼 수 있다. pVII 및 헥손은 한 개의 비리온 당 높은 사본수의 pVII (700 - 800개의 사본수) 및 헥손 (720개의 사본수) 때문에 항원성 CD4+ 펩타이드를 삽입하도록 아데노바이러스 표적 단백질로서 쉽게 사용될 수 있다.
기존의
아데노바이러스
면역성을 속이도록
아데노바이러스
캡시드
단백질의 변형
일정 구현예들에서, 아데노바이러스 파이버 및 헥손 캡시드 단백질은 아데노바이러스에 대한 기존의 면역성을 극복하고 및/또는 아데노바이러스 백신에 대한 체액성 반응을 증진하도록 B 세포 또는 T 헬퍼 세포 에피토프를 삽입하여 변형될 수 있다. 인구 중 80% 정도로 추정되는 청년들이 아데노바이러스, 특히 혈청형 5 (Ad5)에 대항하여 순환하는 중화 항체를 가진다 (Douglas 2007). 아데노바이러스를 유전자 치료법 벡터로서 사용하는 연구들에서, 동물에서 중화 항체의 존재가 아데노바이러스에 의해 전달된 트랜스유전자의 발현을 제한하는 것이 확인되었다. 중화 항체에 덧붙여, CD8+ T 세포 반응도 또한 재조합 유전자 발현의 제한에 기여하였다 (Yang et al. 1995, Yang et al 1996). 이러한 아데노바이러스에 대한 기존의 면역성은 재조합 아데노바이러스 백신의 효능을 저해하고 (Papp et al. 1999) 임상시험에서 아데노바이러스-기초 백신의 면역원성도 역시 감소시키는 것이 이전에 보고된 바 있었다 (Priddy et al. 2008).
헥손은 항-Ad 캡시드 면역 반응을 위한 주요한 표적이고 (Roy et al. 2005, Wohlfart 1988), CD4+ 및 CD8+ T 세포 반응을 포함하여 아데노바이러스의 강력한 아쥬반트 효과를 부여하는 것 같다. 따라서, 기존의 항-아데노바이러스 면역성을 속이도록 적용되어 왔던 한 가지 전략은 예를 들어 아데노바이러스 11, 24, 26 및 35와 같은 희귀한 혈청형의 서로 다른 단백질로 헥손의 전부 또는 일부를 치환시키는 것이다. 헥손은 항-아데노바이러스 중화 항체의 주요한 표적이기 때문에, (Youil et al. 2002, Sumida et al. 2005), 헥손 전부 또는 헥손의 HVRs는 희귀한 혈청형의 것으로 교환될 수 있다 (Wu et al. 2002, Roberts et al. 2006).
본 명세서에서 한 가지 구현예로 기술된 바와 같이 또 다른 전략에서, 아데노바이러스성 헥손은 기존의 항-아데노바이러스 면역성 또는 아데노바이러스성 벡터로의 이전의 백신접종에 의해 유도된 항-아데노바이러스 중화 항체를 속이도록 항원성 펩타이드를 사용한 HVR1 또는 HVR5의 치환에 의해 변형될 수 있다. 일정 구현예들에서, 항원성 펩타이드는 말라리아원충 CS 단백질의 면역원성 에피토프일 수 있고, 소정의 관점에서 에피토프는 중앙의 반복서열, CD4+ 에피토프 서열 또는 CD8+ 에피토프 서열을 포함할 수 있다.
동일한 혈청형의 Ad 벡터를 사용한 반복 투여는 면역접종에 이어지는 항-Ad 면역성으로 인해 방지된다. 따라서, 많은 Ad 백신들은 트랜스유전자에 의해 인코드되는 항원의 발현 및 표현을 방지하여 백신의 추가자극을 방해한다 (Yang 1995, Hackett et al. 2000, Harvey et al. 1999, Mastrangeli et al. 1996). 하기 실시예들에서 기술된 것과 같은 Ad 캡시드에 대한 특이 항체의 첨가는 일정 구현예들에 따른 본 방해를 감소시키거나 제거할 수 있다.
다음의 실시예들은 구현예들을 더 잘 설명하도록 제공되고 청구된 구현예라면 모두의 범위를 제한하는 것으로 해석되지는 않는다. 특정한 물질들이 언급되는 정도는 단지 설명의 목적을 위한 것이고 본 발명을 제한하도록 의도되지 않는다. 당업자라면 발명 능력의 훈련이 없이도 또한 본 발명의 범위를 벗어남이 없이 동등한 수단 또는 반응물들을 개발할 수 있다. 많은 변형들이 본 발명의 범주 이내로 여전히 유지되면서 본 명세서에서 기술된 절차로 만들어질 수 있는 것으로 이해될 것이다. 본 발명자들의 의도는 이러한 변형들이 본 발명의 범위 내에 포함되는 것이다.
실시예
1:
캡시드
-변형된 말라리아원충
서컴포자소체
단백질
아데노바이러스
플라스미드 벡터 및 재조합
아데노바이러스
입자의 제작
에피토프
지도작성
먼저, PyCS에서 B 세포 에피토프를 중화하는 면역우세기 (immunodominant)가 선택되었다. 순수 (naive) Balb/c 마우스가 재조합 PyCS-단백질로 불완전 프런드 아쥬반트와 함께 세 번 면역화되었고 혈청 풀이 중화 항체의 중요한 (critical) 에피토프를 결정하는 데 사용되었다.
간략하게는, 중화 분석법에서 인간 CD81을 발현하는 HepG2 세포가 표적 세포로서 사용되었다. CD81은 말라리아 기생충이 기생충형성 소포 (parasitophorous vacuoles)를 증식시키고 분열체 (schizonts)로 발달하는 간세포에서 이들을 형성하는 데 필요한 분자이고 (Silvie et al 2006), 따라서 분열소체의 시험관내 감염도를 크게 증가시킨다.
본 분석법에서, PyCS 합성 펩타이드가 펩타이드 특이 항체를 차단시키도록 웰에 첨가되었다. 에피토프 지도작성 (epitope mapping)의 결과는 PyCS 중앙 반복서열, QGPGAP (서열번호 59)가 QQPP (서열번호 65)보다 PyCS에서 더욱 강력한 중화 에피토프라는 점을 가르켰다. 따라서, (QGPGAP)n 에피토프 (서열번호 59)의 삽입이 아데노바이러스 캡시드 단백질, 헥손 및/또는 파이버를 변형하는 데 사용되었다.
캡시드
-변형된 플라스미드 벡터의 제작
아데노바이러스 셔틀 벡터 pShuttle-CMV (스트라타젠사 (STRATAGENE))가 GFP-발현 카세트를 클로닝 부위 하에 삽입하여 변형되었다. 먼저, BsmBI-SacI 단편 (pCMV+GFP) 및 pmaxGFP (론자사 (Lonza), 독일 퀼른)의 SacI-BsmBI 단편 (SV40 폴리 A 신호)이 블런트 처리되고 pUC19의 블런트 처리된 Sall 및 Kpnl 부위 내에 각각 삽입되었다. 그 결과 얻은 pCMV-GFP/pUC19의 BamHI-EcoRI 단편은 SV40pA/ pUC19의 동일한 부위 내에 삽입되어 SV40pA-pCMV-GFP 단편이 만들어졌다. 단편은 블런트 처리되어 pShuttle-CMV의 EcoRV 부위 내로 삽입되었다. 그 결과 얻은 셔틀 벡터 (GFP/pShuttle-CMV)는 트랜스유전자와 GFP를 위한 이중의 pCMV 프로모터들 및 SV40pAs를 가진다.
CMV 프로모터를 pQBI-AdCMV5 (QBIO진사 (QBIOgene))로부터 나온 CMV5 프로모터로 치환하도록 아데노바이러스 셔틀 벡터 pShuttle-CMV의 또 다른 변형이 시행되었다. pShuttle-CMV의 SgrAI-KpnI 단편은 CMV5 프로모터 서열 및 pShuttle-CMV에서 CMV 프로모터로부터 상류 서열을 포함하는 단편으로 치환시켜서 pShuttle-CMV 벡터를 제작하였다.
P. 옐리 CS (PyCS) 유전자는 JCat 코돈-최적화 알고리즘 (http://www jcat de/)에 기초한 PCR 반응을 겹쳐서 실행하여 (overlapping) (QGPGAP)n 반복서열 (서열번호 59)를 제외하고 코돈-최적화되었다.
P. 팔시파룸 3D7 균주의 PfCSP 아미노산 서열이 코돈-최적화를 위한 주형 서열로서 사용되었다. 인간에서 단백질 발현을 위한 코돈-최적화는 통합된 DNA 기법 (Integrated DNA Technologies') (코랄빌시, IA 미국) 최적화 소프트웨어에 의해 시행되었다. C-말단에서 GPI-고정된 모티브를 제외하고 PfCSP 전부를 인코드하는 DNA 단편 (도 10; 서열번호 2)이 통합된 DNA 기법에 의해 합성되었다.
코돈-최적화된 PyCS 유전자 (도 9; 서열번호 1) 또는 PfCSP 유전자 (도 10; 서열번호 2)는 pShuttle-CMV, pShuttle-CMV5, 또는 GFP/pShuttle-CMVgene의 KpnI 및 HindIII 부위 내로 삽입되었다. 그 결과 얻은 말라리아원충 서컴포자소체 단백질을 코딩하는 아데노바이러스 셔틀 벡터는 AdEasy-1과의 상동적 재조합 (homologous recombination)에 사용되어 말라리아원충 서컴포자소체 항원성 유전자 및 원래의 (intact) 아데노바이러스 단백질 코딩 서열을 가지는 아데노바이러스 게놈을 제작하였다. 간략하게, 말라리아원충 서컴포자소체 단백질을 코딩하는 아데노바이러스 셔틀 벡터는 PmeI 소화에 의해 직선화되었고, 대장균 BJ5183 세포가 상동적 재조합을 위해 직선화된 셔틀 벡터 및 pAdEasy-1 vector (Bruna-Romero et al 2003)로 공-형질전환되었다.
아데노바이러스 캡시드 단백질의 변형은 도 1에 요약되어 도시되고 있다. 아데노바이러스 게놈 DNA에서 HVR1 서열의 변형은 도 2에 도시되고 있다. 간략하게, AdEasy-1는 SfiI으로 소화되었고 6.4kbp 단편은 EcoRI-SfiI 및 PstI-SfiI 링커 올리고머를 사용하여 pUC19의 EcoRI 및 PstI 부위 내에 서브클론되었다. HVR1을 말라리아원충 서컴포자소체 단백질 B 세포 에피토프로 치환하기 위하여, AgeI 및 NdeI 부위를 포함하는 부위가 HVR1 서열 대신에 에피토프 서열을 가지는 프라이머를 사용하는 두-단계 PCR에 의해 증폭되었다. PCR 산물은 AgeI 및 NdeI으로 소화된 다음 SfiI/pUC19 벡터에서 SfiI 단편의 그대로의 AgeI-NdeI 부위를 치환하는 데 사용되었다. 서열을 확인한 이후, 아데노바이러스 게놈 DNA의 SfiI 단편은 HVR1-변형된 헥손을 생산하도록 서컴포자소체 에피토프 서열을 포함하는 SfiI 단편으로 치환되었다. 일정 구현예들에서, HVR-변형된 헥손은 서열번호 3 (도 11), 서열번호 4 (도 12), 서열번호 5 (도 13), 서열번호 6 (도 14), 서열번호 7 (도 15), 서열번호 8 (도 16), 서열번호 9 (도 17), 서열번호 10 (도 18), 서열번호 11 (도 19), 서열번호 12 (도 20), 서열번호 13 (도 21), 서열번호 14 (도 22), 서열번호 15 (도 23), 서열번호 16 (도 24), 서열번호 17 (도 25), 서열번호 18 (도 26), 서열번호 19 (도 27), 서열번호 20 (도 28), 서열번호 21 (도 29), 서열번호 22 (도 30), 또는 서열번호 23 (도 31)의 핵산 서열을 가질 수 있다.
HVR1에서 (NANP)28 (서열번호 60; n = 28)을 삽입하기 위하여, 코돈-최적화된 PfCSP의 중앙 반복서열 부위의 일부는 5'에서 헥손-특이 서열 또한 3'에서 NANP-특이 서열을 가지는 프라이머를 사용하는 PCR에 의해 증폭되었고, 그 결과 얻는 DNA 단편은 두 번째 PCR에 의해 AgeI-NdeI 부위 내로 삽입되었다.
HVR5-변형의 경우 도 3에서 도시된 바와 같이, XbaI 부위가 AdEasy-1에서 헥손의 L1 루프 내에 도입된 다음 말라리아원충 서컴포자소체 단백질 에피토프를 코딩하는 합성되고 인산화된 이중가닥 올리고머가 XbaI 부위 내로 삽입되었다. 삽입은 서열결정 (sequencing)에 의해 확인되었다 (도 31; 서열번호 23).
파이버-변형의 경우 도 4에서 도시된 바와 같이, AdEasy-1의 SpeI-PacI 단편이 pUC19의 EcoRI-PacI 내로 EcoRI-PacI 및 PstI-SpeI 링커 올리고머를 사용하여 서브클론되었다. 말라리아원충 서컴포자소체 단백질 B-세포 에피토프 서열을 파이버 융기의 HI 루프 내로 삽입하기 위하여, EcoNI (또는 NheI) 및 MfeI 부위가 에피토프 서열을 가지는 프라이머를 사용하는 두-단계 PCR에 의해 증폭되었다. PCR 산물은 EcoNI (또는 NheI)로 소화된 다음 Spel-PacI/pUC19 벡터에서 파이버의 순수 EcoNI (또는 NheI)-MfeI 부위를 치환하는 데 사용되었다. 서열 (도 32, 서열번호 24; 도 33, 서열번호 25)을 확인한 이후에, AdEasy-1의 SpeI-PacI 단편은 에피토프 서열을 포함하는 SpeI-PacI 단편으로 치환되었다. 그 결과 얻은 파이버-변형된 아데노바이러스 DNA는 파이버-변형된 말라리아원충 서컴포자소체 단백질 아데노바이러스 DNA를 생산하도록 말라리아원충 서컴포자소체 단백질을 코딩하는 아데노바이러스 셔틀 벡터와의 상동적 재조합에 사용되었다.
두 가지의 에피토프 삽입을 가지는 HVR1 및 파이버-변형된 아데노바이러스 DNA를 제작하기 위하여, 도 5에서 도시된 바와 같이 파이버-변형된 아데노바이러스 DNA의 SfiI-SfiI 단편이 HVR1에 서컴포자소체 단백질 에피토프를 가지는 SfiI-SfiI 단편으로 치환되었다.
pVII의 C-말단을 변형하기 위하여, SfiI 및 SalI 부위를 포함하는 부위가 서컴포자소체 단백질 에피토프 서열을 가지는 프라이머를 사용한 두-단계 PCR에 의해 증폭되었다. PCR 산물은 SfiI 및 SalI으로 소화된 다음 SfiI/pUC19 벡터의 순수 SfiI-SalI 부위를 치환하도록 사용되었다 (도 6, 도 7 및 도8). 서열을 확인한 이후에 (도 34, 서열번호 26; 도 36, 서열번호 27), HVR1 및/또는 파이버-변형된 서컴포자소체 단백질 아데노바이러스 DNA의 SfiI-SfiI 단편이 pVII에 서컴포자소체 단백질 에피토프를 가지는 SfiI-SfiI 단편으로 치환되었다.
서컴포자소체 단백질 CD4+ 에피토프 서열 EYLNKIQNSLSTEWSPCSVT (서열번호 62)을 pVII의 중간에 삽입하기 위하여, pAdEasy-1의 약 7.7 kb 단편이 RsrII 소화에 의해 제조되었고 RsrII 링커를 사용하여 pUC19 플라스미드의 EcoRI 및 HindIII 부위 사이에 클론되었다 (RsrII/pUC19). RsrII/pUC19에서 AscI 및 BglII 부위를 포함하는 영역 (region)은 에피토프 서열을 가지는 프라이머들을 사용하여 두-단계 PCR에 의해 증폭되었다. PCR 산물은 소화된 다음 RsrII/pUC19 플라스미드에서 순수 AscI 및 BglII 부위를 치환하는 데 사용되었다. 치환된 부위의 서열을 확인한 이후에 (도 36, 서열번호 28; 도 37, 서열번호 29), HVR1-변형된 아데노바이러스 DNA가 에피토프 서열을 포함하는 RsrII 단편으로 치환되었다.
하기 표 1 (P. 옐리) 및 표 2 (P. 팔시파룸)에 나열된 재조합 아데노바이러스는 감염도, 면역원성 및 기존의 항-아데노바이러스 면역성에 대한 민감도에 미치는 에피토프 삽입의 효과를 평가하도록 작성되었다. 사용된 재조합 아데노바이러스 벡터는 복제 결함성, E1 및 E2-결실된 아데노바이러스 혈청형 5 (스트라타젠사)이었다. 도 1은 캡시드-변형된 말라리아원충 서컴포자소체 단백질 재조합 아데노바이러의 모식적 구조를 나타낸다.
표 1은 재조합 아데노바이러스 (플라스모듐 옐리 서컴포자소체 단백질)를 나열한 것이다.
표 2는 재조합 아데노바이러스 (플라스모듐 팔시파룸 서컴포자소체 단백질)를 나열한 것이다.
캡시드-변형된 아데노바이러스 게놈 DNA 플라스미드는 정제되었고 PacI 소화에 의해 직선화되었으며 AD293 세포의 형질전환에 사용되었다.
아데노바이러스 입자는 4번의 냉동/해동 과정에 의해 제조되었고 좀 더 나아가 바이러스 증폭에 사용되었다. 최종의 증폭 이후에, 아데노바이러스 입자는 CsCl 구배 원심분리에 의해 정제되었다. 그 다음 밴드가 수집되었고 CsCl를 제거하도록 투석 완충용액으로 투석되었다. 바이러스 입자 (v.p.)는 O.D. 260 (1 O.D.260 = 1.25 x 1012 v.p./mL)에 기초하여 계산되었다 (Bruna-Romero et al. 2003).
아데노바이러스 증폭 과정 동안, 아데노바이러스 성장에서 작은 차이점이 캡시드-변형된 아데노바이러스 중에서 관찰되었고, 이는 아데노바이러스 감염도 및 생산도가 변형에 의해 역효과가 내지 않는 것을 의미한다.
실시예
2:
플라스모듐
옐리
서컴포자소체
단백질-특이 면역 반응
플라스모듐
옐리
재조합
아데노바이러스의
확인
말라리아원충 서컴포자소체 단백질 코딩하는 아데노바이러스 셔틀 벡터는 AD293 세포를 사용한 말라리아원충 서컴포자소체 단백질 발현을 확인하도록 형질전환하는데 사용되었다 (도 38). 형질전환 24시간 이후에, 세포는 SDS 시료 완충용액으로 용해되었고 SDS PAGE 전기영동 및 항-PyCS 모노클론 항체 (9D3)로의 웨스턴 블럿팅으로 이어졌다.
아데노바이러스 캡시드 단백질 내로 에피토프 삽입을 확인하기 위하여, 정제된 재조합 아데노바이러스가 SDS-PAGE (2 x 109 v.p./레인)에 의해 분석되었고 (QGPGAP)n (서열번호 59) 반복서열을 인식하는 항-포자소체 항체로의 웨스턴 블럿 (1 x 109 v.p./레인)이 도 39A 및 도 40A에서 나타낸 바와 같이 시행되었다. 도 39A에서 밴드의 강도는 아데노바이러스 비리온에서 캡시드 단백질의 사본수 (copy number)와 상호관련이 있었다: 파이버의 사본수 (비리온 당 36개의 사본)는 헥손 (비리온 당 720개의 사본)보다 20배 더 적었다. 도 39A의 레인 4에서 더 적은 밴드는 아마도 분해된 헥손일 것이다. 도 40A에서 밴드의 강도는 HVR1 내로 삽입된 (QGPGAP)n (서열번호 59) 반복서열의 수와 상호관련이 있었다.
PyCS-B 에피토프가 아데노바이러스 비리온의 외부에 노출되어 있었는지 여부를 평가하기 위하여, 일련의 희석된 정제된 재조합 아데노바이러스 입자가 효소-결합된 면역흡착 분석법 (Enzyme-Linked Immunosorbent Assay, ELISA) 플레이트 상에 코팅되었고 (QGPGAP)n (서열번호 59) 반복서열을 인식하는 항-PyCS 항체로 검출되었다. 항체는 캡시드-변형된 아데노바이러스 모두를 인식하였다 (도 39B 및 도 40B). 엘라이자 (ELISA) 분석법의 결과는 캡시드 단백질 내에 통합된 PyCS-B 에피토프가 아데노바이러스 비리온의 외부에 잘 노출되어 있었던 것을 제시하고 있다.
캡시드
-변형된
PyCS
아데노바이러스로의
면역접종 이후에
플라스모듐
옐리
서컴포자소체 단백질-특이 면역 반응
6주 내지 8주 지난 암컷 Balb/c 마우스는 타코닉사 (Taconic, 허드슨시, NY, USA)로부터 구입하였고 록펠러 대학교의 실험실 동물연구 센터 (Laboratory Animal Research Center)에서 표준 조건 하에서 유지되었다. 면역접종을 위해, 아데노바이러스는 PBS로 희석되었고 표시된 용량으로 근육내로 주사되었다.
단일 면역접종 이후에 재조합 아데노바이러스의 면역원성을 평가하기 위하여, 순수 Balb/c 마우스의 그룹 (그룹 당 다섯 마리)은 1 x 109 v.p.의 다양한 재조합 PyCS 아데노바이러스들로 면역화되었고, PyCS-특이 세포-매개성 면역 반응 (CMl)은 면역접종 2주 이후에 엘라스폿 2 (ELISPOT 2)에 의해 측정되었다 (도 41A).
면역화된 마우스의 비장에서 PyCS-특이, IFN-ν-분비하는 CD8+ T 세포의 수는 PyCS 단백질 내의 CD8+ T 세포 에피토프 (SYVPSAEQI; 서열번호 66)에 해당하는 합성 펩타이드를 사용하는 엘리스폿 분석법에 의해 결정되었다. 간략하게, 96-웰 니트로셀룰로스 플레이트 (밀리타이터 HA (Milititer HA), 밀리포아사 (Millipore))가 항-마우스 인터페론 νmAb, R4로 하룻밤 동안 코팅되었다. 상온에서 밤샘 배양 이후에, 웰은 배양 배지로 반복하여 세척되었고 배양 배지로 4시간 동안 차단되었다. 면역화된 마우스로부터 나온 5 x 105개의 비장세포가 엘리스폿 웰에 10 μg/mL CD8+ T 세포 에피토프 펩타이드의 존재 또는 부재 시 첨가되었고 37℃ 및 5% CO2에서 24시간 동안 배양되었다. 0.05% 트윈 20 (PBST)을 포함하는 PBS로 플레이트의 철저한 세척 이후에, PBST에 넣은 바이오틴화된 항-마우스 인터페론 νmAb, XMG1.2가 첨가되었고 40℃에서 하룻밤 동안 배양되었다. PBST로 세척한 이후에, 플레이트는 퍼옥시다제-표지된 아비딘 (e바이오사이언스사 (eBiosciences))으로 배양될 것이다. AEC 기질 (BD 바이오사이언스사 (BD Biosciences))을 첨가하여 점 표식 (spots)이 현상되었다.
모든 캡시드-변형된 아데노바이러스들은 본 용량으로 원래의 캡시드 단백질을 가지는 아데노바이러스 대비한 CMI의 비교가능한 수준을 유도하였다.
다음으로, 순수 Balb/c 마우스는 도 42A에서 나타낸 바와 같이 3주 간격으로 증가하는 용량 1 x 108, 1 x 109, 및 1 x 1010 v.p.으로 재조합 아데노바이러스의 복수의 용량이 주어졌다. PyCS-특이 체액성 반응은 엘라이자 (ELISA)에 의해 결정되었다. 5 마이크로리터의 혈액이 면역화된 마우스의 꼬리 정맥으로부터 수집되었고 495 μl의 PBS로 희석된 다음 시료는 희석된 혈장 시료 (x 100)를 제조하도록 5,000 rpm에서 5분 동안 원심분리되었다. 맥시소프 엘라이자 (Maxisorp ELISA) 플레이트는 5 μg/ml의 CS-특이 펩타이드 ((QGPGAP)3; 서열번호 59, n = 3)을 사용하여 0.1 M 소듐 카보네이트 완충용액 (pH 9.5)에서 4℃로 하룻밤 동안 코팅되었다. 플레이트는 세척되었고 상온에서 2시간 동안 1x 희석액으로 차단되었다. 플레이트는 다시 세척되었고 1x 희석액에서 일련으로 두 배-희석된 혈장 또는 혈청 100 μl이 플레이트에 첨가되었고 플레이트는 상온에서 1시간 동안 배양되었다. 플레이트는 세척되었고 100 μl의 HRP-표지된 염소 항-마우스 IgG 항체와 배양되었다. 모든 펩타이드들은 바이오신테시스사 (Biosyntheis, 루이스빌시, TX 미국)에 의해 합성되었다.
본 면역접종 섭생을 사용하여, 캡시드-변형된 아데노바이러스 모두가 10주에서 wt/PyCS-GFP보다 유의하게 더 높은 수준의 항-(QGPGAP)3 항체 반응을 유도하였다 (도 42B).
캡시드-변형된 아데노바이러스의 백신 효능을 결정하기 위하여, 면역화된 마우스가 10주에 꼬리 정맥 주사를 통해 2 x 104개의 감염성 P. 옐리 포자소체로 접종되었다. 포자소체 접종 42시간 이후에 기생충 부하 (burden)가 마우스들 간 기생충-특이 리보좀 RNA의 양을 정량하여 결정되었고 마우스 GAPDH mRNA 대비 기생충 리보좀 RNA의 절대적 사본수의 비율로서 기술되었다. 통계적 분석을 위해, 값이 로그로 전환된 다음 원-웨이 아노바 (one-way ANOVA) 또한 이어지는 듀넷 테스트 (Dunnett's test)가 차이를 결정하도록 실행되었다.
(QGPGAP)3-HVR1/PyCS-GFP, (QGPGAP)3-Fib/PyCS-GFP 또는 (QGPGAP)3-HVR1/Fib/PyCS-GFP로의 면역접종은 wt/PyCS-GFP보다 더 높은 수준의 보호작용을 유도하였고, 말라리아 감염된 마우스에서 유의하게 더 낮은 기생충 부하를 가져왔다 (도 42C).
다음으로, 캡시드-변형된 아데노바이러스에 의해 유도되는 PyCs-특이 항체의 기능성이 평가되었다. 먼저, 10주에서 아데노바이러스-면역화된 마우스의 혈청 (도 42A)이 원래의 포자소체를 인식할 수 있었는지 여부를 테스트하기 위하여, 간접 면역형광 분석법 (indirect immunofluorescene assay, IFA)가 수행되었다. IFA에서, 복수-점 표식 유리 슬라이드 상의 공기-건조된 포자소체는 3% 소혈청 알부민과 PBS에서 1시간 동안 배양된 다음 희석된 혈청과 1시간 동안 배양되었다. 세척 이후에, 슬라이드는 형광-표지된 이차 항체와 1시간 동안 배양되었다. 슬라이드는 세척되었고 IFA 역가가 형광 현미경 하에서 형광을 생산하는 가장 높은 희석으로서 결정되었다. (QGPGAP)3-HVR1/PyCS-GFP 및 (QGPGAP)3-HVR1/Fib/PyCS-GFP 둘 다가 포자소체에 대한 가장 높은 IFA 역가를 유도하였으며 (도 43A), 아데노바이러스 헥손의 HVR1에서 (QGPGAP)3 에피토프의 삽입이 PyCS 아데노바이러스가 합성 펩타이드뿐만 아니라 말라리라 기생충에 존재하는 후천적 에피토프에 대해서도 건강한 항체 반응을 이끌어내도록 한 것을 가르키고 있었다.
둘째, 캡시드-변형된 아데노바이러스로 면역화된 마우스 (도 42A)가 포자소체의 감염도를 중화할 수 있는 "기능적" 항체를 생성하였는지 여부를 결정하기 위하여, 시험관내 포자소체 중화 분석법이 수행되었다.
시험관내 중화 분석법에서, P. 옐리 포자소체가 아데노바이러스-면역화된 마우스로부터 나온 30-배 희석된 혈청 풀의 존재 시 96-웰 플레이트에서 CD81/HepG2 에 첨가되었다. 두-시간 배양 이후에, 미감염된 포자소체는 배지로 세척되어 제거된 다음 세포는 42시간 동안 배양되었다. 인간 GAPDH mRNA에 대비한 기생충 리보좀 RNA의 상대적 양이 실시간 PCR에 의해 측정되었다 (Ophorst et al. 2006).
캡시드-변형된 아데노바이러스, 상세하게는 (QGPGAP)3-HVR1/PyCS-GFP 및 (QGPGAP)3-HVR1/Fib/PyCS-GFP로 면역화된 마우스로부터 나온 혈청 풀 시료는 시험관내에서 포자소체 감염도를 거의 완전하게 (99%) 저해하였다 (도 43B). 본 분석법에서 저해 정도는 도 43A에서 나타낸 IFA 역가와 역으로 상호관련되어 있었던 것을 알 수 있었다.
혈액 단계 말라리아 감염으로부터 보호작용
다음으로, 캡시드-변형된 rAd로 면역이 마우스를 포자소체 접종 이후에 혈액-단계 말라리아 감염이 발생하는 것으로부터 보호작용하는지 여부가 결정되었다. 실험은 두 번 수행되었고, 도 42A에서 나타낸 바와 같이 각 실험에서 각 그룹마다 20마리의 Balb/c 마우스가 wt/PyCS-GFP 또는 (QGPGAP)3-HVR1/PyCS-GFP로 세 번 면역화되었으며, 최종의 면역접종 4주 이후에 마우스는 50개의 P. 옐리 포자소체로 근육내 접종되었다. 김자-염색된 (Giemsa-stained) 혈액 도말은 혈액 단계 말라리아 기생충 감염을 검출하도록 접종하고 3 내지 12일 이후에 분석되었다. wt/CS-GFP 면역화된 그룹에서, 40마리 마우스 중에서 30마리 (75%)가 감염되었던 반면 순수 그룹에서는 40마리 중에서 35마리 (87.5%)가 감염되었다 (하기 표 3). (QGPGAP)3-HVR1/CS-GFP 면역화된 마우스는 wt/CS-GFP보다 더욱 보호되었으며; 단지 40마리 중에서 15마리만 (37.5%)이 감염되었고, 이는 간에서 기생충 부하에 의해 측정된 보호작용 실험의 결과와 일치하고 있다 (도 42C).
표 3은 wt/PyCS-GFP 또는 (QGPGAP)3-HVR1/PyCS-GFP로의 면역접종 이후에 혈액 단계 말라리아 기생충 감염의 검출을 나타낸 것이다.
감작
-추가자극 면역접종 1
다음으로, 순수 BALB/c 마우스에는 (QGPGAP)n (서열번호 59; n = 4, 6)의 4 내지 6개의 반복서열을 가지는 HVR1-변형된 PyCS 아데노바이러스의 "추가자극"이 도 44A에서 나타낸 바와 같이 복수의 증가 용량 (예로, 1 x 108, 1 x 109, 및 1 x 1010 v.p.)에서 아쥬반트의 존재 또는 부재 시 3주 간격으로 주어졌다. 본 실험에 사용되는 아쥬반트는 200 mg/mL 사포닌 (시그마-알드리치사)를 포함하는 시그마 아쥬반트 시스템 (Sigma Adjuvant System, 시그마-알드리치사)이다. 시그마 아쥬반트 시스템의 바이알 (1 mL)은 물에서 2% 오일 (스쿠알렌)-트윈 80에 녹인 살모넬라 미네소타 (Salmonella minnesota)로부터 나온 0.5 mg의 모노포스포릴 지질 A (탈독성화된 엔도톡신) 및 0.5 mg 합성 트레할로스 디코리노마이콜레이트 (synthetic Trehalose Dicorynomycolate)을 포함한다. 아데노바이러스 용액은 면역접종 이전에 동일한 양의 아쥬반트와 혼합되었다. 아데노바이러스-아쥬반트 혼합물의 100 마이클로리터가 근육내로 주사되었다. PyCS-특이 체액성 및 세포-매개성 면역 반응이 상기에 기술된 바와 같이 측정되었다. 6개의 반복서열을 가지는 HVR1-변형된 아데노바이러스가 4개의 반복서열을 가지는 것보다 더 높은 항체 역가를 유도하였고 아쥬반트의 사용이 항체 역가를 증강시켰던 경향성이 관찰되었다 (도 44B). 대조적으로, CMI에 미치는 아쥬반트의 효과는 전혀 없었다.
HVR1-변형된 PyCS 아데노바이러스의 백신 효능을 결정하기 위하여, 각 그룹에서 5마리의 마우스가 9주에 꼬리 정맥 주사를 통해 2 x 104개의 감염성 P. 옐리 포자소체로 접종되었다. 포자소체 접종 42시간 이후에 기생충 부하가 상기에 기술된 바와 같이 결정되었다. 통계적 분석을 위해, 값이 로그로 전환된 다음 원-웨이 아노바 또한 이어지는 듀넷 테스트가 차이를 결정하도록 실행되었다. 6개의 반복서열을 가지는 HVR1-변형된 아데노바이러스가 4개의 반복서열을 가지는 것보다 더욱 기생충 부하를 감소시켰고 아쥬반트의 사용이 보호작용을 증강시켰던 경향성이 존재하였다 (도 44C).
HVR1-변형된 PyCS 아데노바이러스에 의해 유도된 항체의 기능성을 평가하기 위하여, 상기에 기술된 바와 같이 우리는 시험관내 포자소체 중화 분석법을 수행하였다. HVR1-변형된 PyCS 아데노바이러스로 9주차 면역화된 마우스로부터 나온 혈청 풀 시료는 50-배 희석으로 포자소체 침입을 중화시켰다 (도 44D).
감작
-추가자극 면역접종 2
순수 BALB/c 마우스에는 (QGPGAP)n (서열번호 59; n = 6, 9, 12)의 6, 9 또는 12개의 반복서열을 가지는 HVR1-변형된 PyCS 아데노바이러스의 "추가자극"이 도 45A에서 나타낸 바와 같이 1 x 1010 v.p.의 세 번 용량으로 아쥬반트의 존재 또는 부재 시 3주 간격으로 주어졌다. 본 실험에 사용되는 아쥬반트는 200 μg/mL 사포닌 (시그마-알드리치사)를 포함하는 시그마 아쥬반트 시스템 (시그마-알드리치사)이다. 아데노바이러스 용액은 면역접종 이전에 동일한 양의 아쥬반트와 혼합되었다. PyCS-특이 체액성 및 세포-매개성 면역 반응은 상기에 기술된 바와 같이 측정되었다. 아쥬반트와 함께 12개의 (QGPGAP)n (서열번호 59; n = 12) 반복서열을 가지는 HVR1-변형된 아데노바이러스가 9주차 그룹들 중에서 가장 높은 항체 역가를 유도하였고, 12개까지 더 긴 에피토프의 삽입이 생체내 아데노바이러스 감염도를 손상시키지 않는 것을 가르키고 있었다 (도 45C). 좀 더 나아가, 아쥬반트가 CMI를 유도하는 아데노바이러스의 능력에는 전혀 영향을 주지 않았다 (도 45C).
HVR1-변형된 PyCS 아데노바이러스의 백신 효능을 결정하기 위하여, 각 그룹에서 5마리의 마우스가 9주에 꼬리 정맥 주사를 통해 2 x 104개의 감염성 P. 옐리 포자소체로 접종되었다. 포자소체 접종 42시간 이후에 기생충 부하가 상기에 기술된 바와 같이 결정되었다. 아쥬반트 존재 또는 부재 시 (QGPGAP)n (서열번호 59; n = 6, 9, 12) 반복서열을 가지는 HVR1-변형된 아데노바이러스는 증가된 보호작용을 나타냈다. 그러나, 아쥬반트 존재 시 12개의 (QGPGAP)n (서열번호 59; n = 12)의 반복서열을 가지는 HVR1-변형된 아데노바이러스는 최고의 보호작용을 나타냈으며, 이는 유의하게 기타 다른 처리보다 더욱 보호작용을 하였다.
실시예
3:
플라스모듐
팔시파룸
서컴포자소체
단백질-특이 면역 반응
플라스모듐
팔시파룸
재조합
아데노바이러스의
확인
말라리아원충 서컴포자소체 단백질 코딩하는 아데노바이러스 셔틀 벡터는 AD293 세포를 사용한 말라리아원충 서컴포자소체 단백질 발현을 확인하도록 형질전환하는데 사용되었다 (도 46A). 형질전환 24시간 이후에, 세포는 SDS 시료 완충용액으로 용해되었고 SDS PAGE 전기영동 또한 항-PyCS 모노클론 항체 (9D3)로의 웨스턴 블럿팅으로 이어졌다.
아데노바이러스 캡시드 단백질 내로 에피토프 삽입을 확인하기 위하여, 정제된 재조합 아데노바이러스가 SDS-PAGE (2 x 109 v.p./레인)에 의해 분석되었고 (QGPGAP)n (서열번호 59) 반복서열을 인식하는 항-포자소체 항체로의 웨스턴 블럿 (1 x 109 v.p./레인)이 도 47A 및 도 48A에서 나타낸 바와 같이 시행되었다. 도 47A에서 밴드의 강도는 아데노바이러스 비리온에서 캡시드 단백질의 사본수 (copy number)와 상호관련이 있었다: 파이버의 사본수 (비리온 당 36개의 사본)는 헥손 (비리온 당 720개의 사본)보다 20배 더 적었다. 도 48A에서 밴드의 강도는 NANP 반복서열 HVR1의 수와 상호관련이 있었다.
PfCSP-B 에피토프가 아데노바이러스 비리온의 외부에 노출되어 있었는지 여부를 평가하기 위하여, 일련으로 희석된 정제된 재조합 아데노바이러스 입자가 효소-결합된 면역흡착 분석법 (ELISA) 플레이트 상에 코팅되었고 (NANP)n (서열번호 60) 반복서열을 인식하는 항-PyCS 항체로 검출되었다. 항체는 캡시드-변형된 아데노바이러스 모두를 인식하였다 (도 47B 및 도 48B). 엘라이자 (ELISA) 분석법의 결과는 캡시드 단백질 내에 통합된 PfCSP-B 에피토프가 아데노바이러스 비리온의 외부에 잘 노출되었던 점을 제시하고 있다.
감작
-추가자극 면역접종 3
순수 Balb/c 마우스에는 도 49A에 나타낸 바와 같이 재조합 PfCSP 아데노바이러스의 복수의 증가하는 용량 (예로, 1 x 108, 1 x 109, 및 1 x 1010v.p.)으로 3일 간격으로 주어졌다. PfCSP-특이 체액성 반응은 (NANP)n 반복서열 (서열번호 60)을 포함하는 1 mg/ml (T1B)4, CS 반복서열 펩타이드를 사용하여 상기에 기술된 바와 같이 엘라이자에 의해 결정되었다 (Calvo-Calle et al 2006). 통계적 분석을 위해, 값이 로그로 전환된 다음 원-웨이 아노바 또한 이어지는 듀넷 테스트가 wt/PfCSP 및 캡시드-변형된 아데노바이러스 사이의 차이를 결정하도록 실행되었다. 모든 캡시드-변형된 아데노바이러스는 wt/PfCSP보다 통계적으로 더 높은 항-NANP 항체 역가를 유도하였다.
감작
-추가자극 면역접종 4
다음으로, 순수 Balb/c 마우스에는 도 50A에 나타낸 바와 같이 4, 6, 8, 또는 10개의 (NANP)n 반복서열 (서열번호 60; n = 4, 6, 8, 10)을 가지는 HVR1-변형된 PfCSP 아데노바이러스의 "추가자극"이 복수의 증가하는 용량 (예로, 1 x 108, 1 x 109, 및 1 x 1010v.p.)으로 3일 간격으로 주어졌다. PfCSP-특이 체액성 반응은 상기에 기술된 바와 같이 측정되었다. 모든 HVR1-변형된 아데노바이러스는 9주차에 wt/PfCSP보다 유의하게 더 높은 항-NANP 항체 역가를 유도하였다 (도 50B). 통계적 분석을 위해, 값이 로그로 전환된 다음 원-웨이 아노바 또한 이어지는 듀넷 테스트가 차이를 결정하도록 실행되었다.
감작
-추가자극 면역접종 5
순수 Balb/c 마우스에는 도 51A에 나타낸 바와 같이 10, 16, 또는 22개의 (NANP)n 반복서열 (서열번호 60; n = 10, 16, 22)을 가지는 HVR1-변형된 PfCSP 아데노바이러스의 "추가자극"이 1 x 1010 v.p.의 세 번 용량으로 아쥬반트의 존재 또는 부재 시 3주 간격으로 주어졌다. 본 실험에 사용되는 아쥬반트는 200 μg/mL 사포닌 (시그마-알드리치사)를 포함하는 시그마 아쥬반트 시스템 (시그마-알드리치사)이다. 아데노바이러스 용액은 면역접종 이전에 동일한 양의 아쥬반트와 혼합되었다. PyCS-특이 체액성 및 세포-매개성 면역 반응은 상기에 기술된 바와 같이 측정되었고, 더 긴 B 세포 에피토프를 가진 HVR1-변형된 아데노바이러스는 더 높은 항체 역가를 유도하였던 점이 확인되었다 (도 51B).
실시예
4:
아데노바이러스
코아
단백질
pVII
내로
PyCS
CD4
에피토프
삽입
항원-특이 CD4 T 세포가 항원-특이 B 세포 생성 및 증식을 위해 요구된다. 따라서 아데노바이러스 내에 PyCS CD4 에피토프를 삽입하여 캡시드-변형된 아데노바이러스에 의해 유도된 PyCS-특이 체액성 면역 반응을 증진하는 것이 가능한지 여부를 결정하기 위하여, pVII 내에 PyCS CD4 에피토프를 가지는 (QGPGAP)3-Fib/PyCS-GFP ((QGPGAP)3-Fib/CD4-pVII-1/PyCS-GFP)가 제작되었다. pVII는 아데노바이러스 코아의 하나이고 비리온 당 사본수는 700 - 800개이며, 이는 MHC 클래스 II 분자 상에서 효율적인 CD4 에피토프 표현 (presentation)을 위해 이상적인 수이다. 도 52A에서 나타낸 바와 같이, pVII 밴드는 pVII 내의 PyCS CD4 에피토프 삽입에 의해 SDS PAGE 젤 상에서 이동되었다.
pVII 내의 PyCS CD4 에피토프 삽입의 효과를 테스트하기 위하여, 도 42A에 나타낸 바와 같이 순수 Balb/c 마우스는 (QGPGAP)3-Fib/PyCS-GFP 또는 (QGPGAP)3-Fib/CD4-pVII-1/PyCS-GFP로 면역화되었고 항-QGPGAP 항체 역가가 10주에 엘라이자에 의해 결정되었다. (QGPGAP)3-Fib/CD4-pVII-1/PyCS-GFP는 (QGPGAP)3-Fib/PyCS-GFP보다 유의하게 더 높은 항-QGPGAP 항체 역가를 유도하였으며 (도 52B), 이는 pVII 내의 PyCS CD4 에피토프 삽입이 캡시드-변형된 아데노바이러스에 의해 유도된 체액성 면역 반응을 증강시켰던 점을 가르키고 있었다.
아데노바이러스
코아
단백질
pVII
내로
PfCSP
CD4
에피토프
삽입
아데노바이러스-유도성 면역 반응에 미치는 아데노바이러스 코아 단백질 pVII에 있는 서로 다른 위치 내로 PfCSP CD4+ 에피토프 삽입의 효과를 평가하기 위하여, 첫 번째 핵 정착 신호 (NLS) 바로 이전 또는 두 개의 NLS 사이에 PfCSP CD4+ 에피토프를 가지는 HVR1-변형된 PfCSP 아데노바이러스가 제작되었다 (도 53A).
pVII 내에 에피토프 삽입을 확인하기 위하여, 정제된 재조합 아데노바이러스가 상기에 기술된 바와 같이 SDS-PAGE에 의해 분석되었다. 도 53B에 나타낸 바와 같이, NANP)4-HVR1/CD4-pVII-2/PfCSP 및 (NANP)4-HVR1/CD4-pVII-3/PfCSP의 pVII 밴드가 에피토프 삽입 때문에 위쪽으로 이동되었다.
HVR1
및
pVII
-변형된
PfCSP
아데노바이러스에
의해 유도된
PfCSP
-특이 면역 반응
다음으로, 순수 Balb/c 마우스에는 도 54A에 나타낸 바와 같이 HVR1에서 NANP의 4개 반복서열 또한 pVII에서 PfCD4+ 에피토프를 가지는 HVR1 및 pVII-변형된 PfCSP 아데노바이러스의 "추가자극"이 복수의 증가하는 용량 (예로, 1 x 108, 1 x 109, 및 1 x 1010v.p.)으로 3주 간격으로 주어졌다. PfCSP-특이 체액성 반응은 t상기에 기술된 바와 같이 측정되었다. NANP)4-HVR1/CD4-pVII-2/PfCSP 및 (NANP)4-HVR1/CD4-pVII-3/PfCSP는 6주차에 (NANP)4-HVR1/PfCSP보다 유의하게 더 높은 항-NANP항체 역가를 유도하였다 (도 54B). CMI의 견지에서, (NANP)4-HVR1/CD4-pVII-3/PfCSP는 (NANP)4-HVR1/PfCSP보다 유의하게 더 높은 IFNν 및 IL-4-분비하는 PfCSP-특이 CD4+ T 세포를 유도하였다 (도 54C).
실시예
5: 항-
아데노바이러스
면역성에 미치는
캡시드
-변형의 효과
시험관내 아데노바이러스 중화 실험을 위해, 아데노바이러스 감염 이전에 AD293 세포에 혈청이 표시된 희석으로 첨가되었다. 백인 혈청 시료는 이노베이티브 리서치사 (Innovative Research, 노비시, MI, 미국)로부터 획득되었다. 모든 유동 세포측정법 데이타는 플로우조 버전 8.8 (FlowJo v8.8) 소프트웨어 (트리스타사 (Tree Star, Inc), 애쉬랜드시, OR, 미국)로 분석되었다. AD293 세포는 표시된 희석에서 인간 아데노바이러스 중화 혈청 시료의 존재 시 각 캡시드-변형된 아데노바이러스로 감염되었고 유동 세포측정법에 의해 GFP 발현을 측정하는 것이 이어졌다. PyCS-V 에피토프로 HVR1의 치환은 항-아데노바이러스 혈청형 5 혈청에 반발하는 아데노바이러스를 분명하게 만들었던 반면, HVR5 또는 파이버의 변형은 전혀 효과가 없었다 (도 55).
다음으로, HVR1이 생체내 중화의 중요한 분자인지 여부가 결정되었다. 본 목적을 위해, 마우스는 기존의 항-아데노바이러스 면역성을 충분히 부여하도록 1 x 1010 v.p. wt/공 아데노바이러스로 감염되었고 엘라이자에 의해 결정된 바와 같이 그들의 항-아데노바이러스 항체 역가를 기초로 하여 임의로 추출되었다. 다음으로, 마우스에는 캡시드-변형된 아데노바이러스 또는 미변형된 아데노바이러스의 단일 면역접종 용량이 주어졌고 PyCS-특이 CD8+ T 세포 반응이 상기에 기술된 바와 같이 측정되었다. (QGPGAP)3-HVR1/PyCS-GFP 또는 (QGPGAP)3-HVR1/Fib/PyCS-GFP로의면역접종만이 다른 캡시드-변형되거나 미변형된 아데노바이러스에 의해 유도된 것에 대비하여 유의하게 더 강력한 CS-특이 CD8+ T 세포 반응을 유도할 수 있었다 (도 56B).
(QGPGAP)3 에피토프에 대한 항체 반응의 수준도 역시 측정되었고, 이는 wt/공 Ad로 감염되고 캡시드-변형된 rAd로 면역접종이 이어졌던 마우스에서 rAd의 캡시드 단백질 상에서 발현된다 (도 57A). (QGPGAP)3-HVR1/PyCS-GFP 및 (QGPGAP)3-HVR1/Fib/PyCS-GFP로 백신접종된 마우스만이 wt/PyCS-GFP로 백신접종된 것들보다 유의하게 항-QGPGAP 항체의 더 높은 역가를 올릴 수 있었다 (도 57B).
상기에 기술된 실시예들은 구현예들을 보다 완벽하게 설명하려고 의도하며 청구된 구현예라면 모두의 범위를 제한하는 것으로 해석되어서는 안된다. 또한, 본 기재내용 이내에 인용된 참고문헌들 및 하기에 나열된 참고문헌들은 본 명세서에서 전적으로 설명되어 있는 것처럼 그들의 내용 전부가 참고문헌으로 본 명세서에 의해 통합된다.
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Worgall, S., Krause, A., Qiu, J., Joh, J., Hackett, N.R., and Crystal, R.G. 2007. Protective immunity to pseudomonas aeruginosa induced with a capsid-modified adenovirus expressing P. aeruginosa OprF. J Virol . 81:13801-13808.
Wu, H., Dmitriev, I., Kashentseva, E., Seki, T., Wang, M., et al. 2002. Construction and characterization of adenovirus serotype 5 packaged by serotype 3 Hexon. J Virol. 76:12775-12782.
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Youil, R., Toner, T.J., Su, Q., Chen, M., Tang, A., et al. 2002. Hexon gene switch strategy for the generation of chimeric recombinant adenovirus. Hum Gene Ther. 13: 311-320.
SEQUENCE LISTING
<110> Takayuki SHIRATSHUCHI
Moriya TSUJI
<120> MODIFICATION OF RECOMBINANT ADENOVIRUS WITH IMMUNOGENIC
PLASMODIUM CIRCUMSPOROZOITE PROTEIN EPITOPES
<130> 71624.8001.WO01
<140> PCT/US10/045952
<141> 2010-08-18
<150> PCT/US09/054212
<151> 2009-08-18
<160> 66
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 1127
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Codon-optimized Plasmodium yoelii circumsporozoite protein
<220>
<221> CDS
<222> (13)..(1119)
<400> 1
ggtaccgcca cc atg aag aag tgc acc atc ctg gtg gtg gcc agc ctg ctg 51
Met Lys Lys Cys Thr Ile Leu Val Val Ala Ser Leu Leu
1 5 10
ctg gtg gac agc ctg ctg ccc ggc tac ggc cag aac aag agc gtg cag 99
Leu Val Asp Ser Leu Leu Pro Gly Tyr Gly Gln Asn Lys Ser Val Gln
15 20 25
gcc cag agg aac ctg aac gag ctg tgc tac aac gag gag aac gac aac 147
Ala Gln Arg Asn Leu Asn Glu Leu Cys Tyr Asn Glu Glu Asn Asp Asn
30 35 40 45
aag ctg tac cac gtg ctg aac agc aag aac ggc aag atc tac aac agg 195
Lys Leu Tyr His Val Leu Asn Ser Lys Asn Gly Lys Ile Tyr Asn Arg
50 55 60
aac atc gtg aac agg ctg ctg ggc gac gcc ctg aac ggc aag ccc gag 243
Asn Ile Val Asn Arg Leu Leu Gly Asp Ala Leu Asn Gly Lys Pro Glu
65 70 75
gag aag aag gac gac ccc ccc aag gac gac aac aag gac gac ctg ccc 291
Glu Lys Lys Asp Asp Pro Pro Lys Asp Asp Asn Lys Asp Asp Leu Pro
80 85 90
aag gag gag aag aag gac gac ctg ccc aag gag gag aag aag gac gac 339
Lys Glu Glu Lys Lys Asp Asp Leu Pro Lys Glu Glu Lys Lys Asp Asp
95 100 105
ccc ccc aag gac ccc aag aag gac gac ccc ccc aag gag gcc cag aac 387
Pro Pro Lys Asp Pro Lys Lys Asp Asp Pro Pro Lys Glu Ala Gln Asn
110 115 120 125
aag ctg aac cag ccc gta gtg gca gat gaa aat gta gat caa ggg cca 435
Lys Leu Asn Gln Pro Val Val Ala Asp Glu Asn Val Asp Gln Gly Pro
130 135 140
gga gca cca caa ggg cca gga gca cca caa ggg cca gga gca cca cag 483
Gly Ala Pro Gln Gly Pro Gly Ala Pro Gln Gly Pro Gly Ala Pro Gln
145 150 155
ggg cca gga gca cca cag ggg cca gga gca cca caa ggg cca gga gca 531
Gly Pro Gly Ala Pro Gln Gly Pro Gly Ala Pro Gln Gly Pro Gly Ala
160 165 170
cca caa gga cca gga gca cca caa ggg cca gga gca cca caa ggg cca 579
Pro Gln Gly Pro Gly Ala Pro Gln Gly Pro Gly Ala Pro Gln Gly Pro
175 180 185
gga gca cca caa ggg cca gga gca ccg cag ggg cca gga gca cca caa 627
Gly Ala Pro Gln Gly Pro Gly Ala Pro Gln Gly Pro Gly Ala Pro Gln
190 195 200 205
ggg cca gga gca cca caa gga cca gga gca cca cag ggt cca gga gca 675
Gly Pro Gly Ala Pro Gln Gly Pro Gly Ala Pro Gln Gly Pro Gly Ala
210 215 220
cca caa gga cca gga gca cca caa gga cca gga gca cca caa ggt cca 723
Pro Gln Gly Pro Gly Ala Pro Gln Gly Pro Gly Ala Pro Gln Gly Pro
225 230 235
gga gca cca cag ggg cca gga gca cca caa ggg cca gga gca cca caa 771
Gly Ala Pro Gln Gly Pro Gly Ala Pro Gln Gly Pro Gly Ala Pro Gln
240 245 250
gaa cca ccc caa caa ccc cca caa cag cca cca caa cag cca cca caa 819
Glu Pro Pro Gln Gln Pro Pro Gln Gln Pro Pro Gln Gln Pro Pro Gln
255 260 265
cag cca cca caa cag cca cca caa caa cca aac aac aac aac aac aac 867
Gln Pro Pro Gln Gln Pro Pro Gln Gln Pro Asn Asn Asn Asn Asn Asn
270 275 280 285
aac ggc aac aac aac gag gac agc tac gtg ccc agc gcc gag cag atc 915
Asn Gly Asn Asn Asn Glu Asp Ser Tyr Val Pro Ser Ala Glu Gln Ile
290 295 300
ctg gag ttc gtg aag cag atc agc agc cag ctg acc gag gag tgg agc 963
Leu Glu Phe Val Lys Gln Ile Ser Ser Gln Leu Thr Glu Glu Trp Ser
305 310 315
cag tgc agc gtg acc tgc ggc agc ggc gtg agg gtg agg aag agg aag 1011
Gln Cys Ser Val Thr Cys Gly Ser Gly Val Arg Val Arg Lys Arg Lys
320 325 330
aac gtg aac aag cag ccc gag aac ctg acc ctg gag gac atc gac acc 1059
Asn Val Asn Lys Gln Pro Glu Asn Leu Thr Leu Glu Asp Ile Asp Thr
335 340 345
gag atc tgc aag atg gac aag tgc agc agc atc ttc aac atc gtg agc 1107
Glu Ile Cys Lys Met Asp Lys Cys Ser Ser Ile Phe Asn Ile Val Ser
350 355 360 365
aac agc ctg ggc taaagctt 1127
Asn Ser Leu Gly
<210> 2
<211> 1145
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Codon-optimized Plasmodium falciparus circumsporozoite protein
<220>
<221> CDS
<222> (13)..(1134)
<400> 2
ggtaccgcca cc atg atg cgc aag ctc gcc ata ctg tct gtt agt agc ttt 51
Met Met Arg Lys Leu Ala Ile Leu Ser Val Ser Ser Phe
1 5 10
ctc ttt gta gag gcc ctg ttt cag gaa tac cag tgc tat ggc agc agc 99
Leu Phe Val Glu Ala Leu Phe Gln Glu Tyr Gln Cys Tyr Gly Ser Ser
15 20 25
agc aac act cgt gtg ctg aac gaa ctt aac tat gat aat gca gga aca 147
Ser Asn Thr Arg Val Leu Asn Glu Leu Asn Tyr Asp Asn Ala Gly Thr
30 35 40 45
aat tta tat aac gaa ctg gag atg aat tac tat ggt aag cag gaa aat 195
Asn Leu Tyr Asn Glu Leu Glu Met Asn Tyr Tyr Gly Lys Gln Glu Asn
50 55 60
tgg tac tct ctg aaa aag aac tct aga tct ctg ggc gag aac gac gac 243
Trp Tyr Ser Leu Lys Lys Asn Ser Arg Ser Leu Gly Glu Asn Asp Asp
65 70 75
ggc aat aat gaa gac aat gaa aag ctg agg aag cca aag cac aaa aaa 291
Gly Asn Asn Glu Asp Asn Glu Lys Leu Arg Lys Pro Lys His Lys Lys
80 85 90
cta aag cag ccc gca gac ggc aat cca gac ccc aat gct aac cca aac 339
Leu Lys Gln Pro Ala Asp Gly Asn Pro Asp Pro Asn Ala Asn Pro Asn
95 100 105
gtg gac ccc aat gct aat cca aac gtg gat cct aac gct aac ccg aat 387
Val Asp Pro Asn Ala Asn Pro Asn Val Asp Pro Asn Ala Asn Pro Asn
110 115 120 125
gtg gac cct aac gcc aat cca aat gcg aat ccc aac gct aat cct aac 435
Val Asp Pro Asn Ala Asn Pro Asn Ala Asn Pro Asn Ala Asn Pro Asn
130 135 140
gca aac ccg aat gct aac cct aac gca aac ccc aac gct aac ccc aac 483
Ala Asn Pro Asn Ala Asn Pro Asn Ala Asn Pro Asn Ala Asn Pro Asn
145 150 155
gcg aac ccc aat gcc aac ccc aac gcc aac ccg aac gcc aat cca aac 531
Ala Asn Pro Asn Ala Asn Pro Asn Ala Asn Pro Asn Ala Asn Pro Asn
160 165 170
gct aac cct aat gcc aat cct aat gcc aat ccg aac gcc aat cca aat 579
Ala Asn Pro Asn Ala Asn Pro Asn Ala Asn Pro Asn Ala Asn Pro Asn
175 180 185
gcc aat cca aat gct aat ccc aac gtg gac ccc aac gcg aac cct aat 627
Ala Asn Pro Asn Ala Asn Pro Asn Val Asp Pro Asn Ala Asn Pro Asn
190 195 200 205
gcc aac ccc aac gct aat cca aat gcg aac cct aac gcc aac ccg aat 675
Ala Asn Pro Asn Ala Asn Pro Asn Ala Asn Pro Asn Ala Asn Pro Asn
210 215 220
gct aat ccc aat gcc aac ccc aat gct aat ccc aat gcg aac cct aat 723
Ala Asn Pro Asn Ala Asn Pro Asn Ala Asn Pro Asn Ala Asn Pro Asn
225 230 235
gcc aat ccc aac gcc aac ccc aac gca aac cct aat gct aac ccg aac 771
Ala Asn Pro Asn Ala Asn Pro Asn Ala Asn Pro Asn Ala Asn Pro Asn
240 245 250
gcc aat ccg aac gca aat cct aat gct aat cct aac gct aac ccc aac 819
Ala Asn Pro Asn Ala Asn Pro Asn Ala Asn Pro Asn Ala Asn Pro Asn
255 260 265
gcc aat cca aat aag aac aat caa ggc aac ggg cag ggg cac aat atg 867
Ala Asn Pro Asn Lys Asn Asn Gln Gly Asn Gly Gln Gly His Asn Met
270 275 280 285
cca aat gac cct aac cgg aat gtc gac gag aat gca aat gcc aat agc 915
Pro Asn Asp Pro Asn Arg Asn Val Asp Glu Asn Ala Asn Ala Asn Ser
290 295 300
gcc gtg aaa aat aat aat aac gag gag cca agt gac aaa cac att aag 963
Ala Val Lys Asn Asn Asn Asn Glu Glu Pro Ser Asp Lys His Ile Lys
305 310 315
gaa tat ttg aac aag att caa aac tcc ctc tca aca gaa tgg tct cct 1011
Glu Tyr Leu Asn Lys Ile Gln Asn Ser Leu Ser Thr Glu Trp Ser Pro
320 325 330
tgc agc gtg act tgt gga aat ggc atc cag gtt cgt att aaa cca ggt 1059
Cys Ser Val Thr Cys Gly Asn Gly Ile Gln Val Arg Ile Lys Pro Gly
335 340 345
agt gcc aac aag ccc aag gat gaa cta gac tat gcg aat gat ata gag 1107
Ser Ala Asn Lys Pro Lys Asp Glu Leu Asp Tyr Ala Asn Asp Ile Glu
350 355 360 365
aaa aaa atc tgt aag atg gag aaa tgc tagcttctag a 1145
Lys Lys Ile Cys Lys Met Glu Lys Cys
370
<210> 3
<211> 2832
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> (QGPGAP)3-HVR1 modified Hexon protein
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(2829)
<400> 3
atg gct acc cct tcg atg atg ccg cag tgg tct tac atg cac atc tcg 48
Met Ala Thr Pro Ser Met Met Pro Gln Trp Ser Tyr Met His Ile Ser
1 5 10 15
ggc cag gac gcc tcg gag tac ctg agc ccc ggg ctg gtg cag ttt gcc 96
Gly Gln Asp Ala Ser Glu Tyr Leu Ser Pro Gly Leu Val Gln Phe Ala
20 25 30
cgc gcc acc gag acg tac ttc agc ctg aat aac aag ttt aga aac ccc 144
Arg Ala Thr Glu Thr Tyr Phe Ser Leu Asn Asn Lys Phe Arg Asn Pro
35 40 45
acg gtg gcg cct acg cac gac gtg acc aca gac cgg tcc cag cgt ttg 192
Thr Val Ala Pro Thr His Asp Val Thr Thr Asp Arg Ser Gln Arg Leu
50 55 60
acg ctg cgg ttc atc cct gtg gac cgt gag gat act gcg tac tcg tac 240
Thr Leu Arg Phe Ile Pro Val Asp Arg Glu Asp Thr Ala Tyr Ser Tyr
65 70 75 80
aag gcg cgg ttc acc cta gct gtg ggt gat aac cgt gtg ctg gac atg 288
Lys Ala Arg Phe Thr Leu Ala Val Gly Asp Asn Arg Val Leu Asp Met
85 90 95
gct tcc acg tac ttt gac atc cgc ggc gtg ctg gac agg ggc cct act 336
Ala Ser Thr Tyr Phe Asp Ile Arg Gly Val Leu Asp Arg Gly Pro Thr
100 105 110
ttt aag ccc tac tct ggc act gcc tac aac gcc ctg gct ccc aag ggt 384
Phe Lys Pro Tyr Ser Gly Thr Ala Tyr Asn Ala Leu Ala Pro Lys Gly
115 120 125
gcc cca aat cct tgc gaa tgg gat gaa cag ggc cct gga gct cca cag 432
Ala Pro Asn Pro Cys Glu Trp Asp Glu Gln Gly Pro Gly Ala Pro Gln
130 135 140
gga cca ggt gca cct caa ggg cct gga gcc cct aaa act cac gta ttt 480
Gly Pro Gly Ala Pro Gln Gly Pro Gly Ala Pro Lys Thr His Val Phe
145 150 155 160
ggg cag gcg cct tat tct ggt ata aat att aca aag gag ggt att caa 528
Gly Gln Ala Pro Tyr Ser Gly Ile Asn Ile Thr Lys Glu Gly Ile Gln
165 170 175
ata ggt gtc gaa ggt caa aca cct aaa tat gcc gat aaa aca ttt caa 576
Ile Gly Val Glu Gly Gln Thr Pro Lys Tyr Ala Asp Lys Thr Phe Gln
180 185 190
cct gaa cct caa ata gga gaa tct cag tgg tac gaa aca gaa att aat 624
Pro Glu Pro Gln Ile Gly Glu Ser Gln Trp Tyr Glu Thr Glu Ile Asn
195 200 205
cat gca gct ggg aga gtc cta aaa aag act acc cca atg aaa cca tgt 672
His Ala Ala Gly Arg Val Leu Lys Lys Thr Thr Pro Met Lys Pro Cys
210 215 220
tac ggt tca tat gca aaa ccc aca aat gaa aat gga ggg caa ggc att 720
Tyr Gly Ser Tyr Ala Lys Pro Thr Asn Glu Asn Gly Gly Gln Gly Ile
225 230 235 240
ctt gta aag caa caa aat gga aag cta gaa agt caa gtg gaa atg caa 768
Leu Val Lys Gln Gln Asn Gly Lys Leu Glu Ser Gln Val Glu Met Gln
245 250 255
ttt ttc tca act act gag gca gcc gca ggc aat ggt gat aac ttg act 816
Phe Phe Ser Thr Thr Glu Ala Ala Ala Gly Asn Gly Asp Asn Leu Thr
260 265 270
cct aaa gtg gta ttg tac agt gaa gat gta gat ata gaa acc cca gac 864
Pro Lys Val Val Leu Tyr Ser Glu Asp Val Asp Ile Glu Thr Pro Asp
275 280 285
act cat att tct tac atg ccc act att aag gaa ggt aac tca cga gaa 912
Thr His Ile Ser Tyr Met Pro Thr Ile Lys Glu Gly Asn Ser Arg Glu
290 295 300
cta atg ggc caa caa tct atg ccc aac agg cct aat tac att gct ttt 960
Leu Met Gly Gln Gln Ser Met Pro Asn Arg Pro Asn Tyr Ile Ala Phe
305 310 315 320
agg gac aat ttt att ggt cta atg tat tac aac agc acg ggt aat atg 1008
Arg Asp Asn Phe Ile Gly Leu Met Tyr Tyr Asn Ser Thr Gly Asn Met
325 330 335
ggt gtt ctg gcg ggc caa gca tcg cag ttg aat gct gtt gta gat ttg 1056
Gly Val Leu Ala Gly Gln Ala Ser Gln Leu Asn Ala Val Val Asp Leu
340 345 350
caa gac aga aac aca gag ctt tca tac cag ctt ttg ctt gat tcc att 1104
Gln Asp Arg Asn Thr Glu Leu Ser Tyr Gln Leu Leu Leu Asp Ser Ile
355 360 365
ggt gat aga acc agg tac ttt tct atg tgg aat cag gct gtt gac agc 1152
Gly Asp Arg Thr Arg Tyr Phe Ser Met Trp Asn Gln Ala Val Asp Ser
370 375 380
tat gat cca gat gtt aga att att gaa aat cat gga act gaa gat gaa 1200
Tyr Asp Pro Asp Val Arg Ile Ile Glu Asn His Gly Thr Glu Asp Glu
385 390 395 400
ctt cca aat tac tgc ttt cca ctg gga ggt gtg att aat aca gag act 1248
Leu Pro Asn Tyr Cys Phe Pro Leu Gly Gly Val Ile Asn Thr Glu Thr
405 410 415
ctt acc aag gta aaa cct aaa aca ggt cag gaa aat gga tgg gaa aaa 1296
Leu Thr Lys Val Lys Pro Lys Thr Gly Gln Glu Asn Gly Trp Glu Lys
420 425 430
gat gct aca gaa ttt tca gat aaa aat gaa ata aga gtt gga aat aat 1344
Asp Ala Thr Glu Phe Ser Asp Lys Asn Glu Ile Arg Val Gly Asn Asn
435 440 445
ttt gcc atg gaa atc aat cta aat gcc aac ctg tgg aga aat ttc ctg 1392
Phe Ala Met Glu Ile Asn Leu Asn Ala Asn Leu Trp Arg Asn Phe Leu
450 455 460
tac tcc aac ata gcg ctg tat ttg ccc gac aag cta aag tac agt cct 1440
Tyr Ser Asn Ile Ala Leu Tyr Leu Pro Asp Lys Leu Lys Tyr Ser Pro
465 470 475 480
tcc aac gta aaa att tct gat aac cca aac acc tac gac tac atg aac 1488
Ser Asn Val Lys Ile Ser Asp Asn Pro Asn Thr Tyr Asp Tyr Met Asn
485 490 495
aag cga gtg gtg gct ccc ggg cta gtg gac tgc tac att aac ctt gga 1536
Lys Arg Val Val Ala Pro Gly Leu Val Asp Cys Tyr Ile Asn Leu Gly
500 505 510
gca cgc tgg tcc ctt gac tat atg gac aac gtc aac cca ttt aac cac 1584
Ala Arg Trp Ser Leu Asp Tyr Met Asp Asn Val Asn Pro Phe Asn His
515 520 525
cac cgc aat gct ggc ctg cgc tac cgc tca atg ttg ctg ggc aat ggt 1632
His Arg Asn Ala Gly Leu Arg Tyr Arg Ser Met Leu Leu Gly Asn Gly
530 535 540
cgc tat gtg ccc ttc cac atc cag gtg cct cag aag ttc ttt gcc att 1680
Arg Tyr Val Pro Phe His Ile Gln Val Pro Gln Lys Phe Phe Ala Ile
545 550 555 560
aaa aac ctc ctt ctc ctg ccg ggc tca tac acc tac gag tgg aac ttc 1728
Lys Asn Leu Leu Leu Leu Pro Gly Ser Tyr Thr Tyr Glu Trp Asn Phe
565 570 575
agg aag gat gtt aac atg gtt ctg cag agc tcc cta gga aat gac cta 1776
Arg Lys Asp Val Asn Met Val Leu Gln Ser Ser Leu Gly Asn Asp Leu
580 585 590
agg gtt gac gga gcc agc att aag ttt gat agc att tgc ctt tac gcc 1824
Arg Val Asp Gly Ala Ser Ile Lys Phe Asp Ser Ile Cys Leu Tyr Ala
595 600 605
acc ttc ttc ccc atg gcc cac aac acc gcc tcc acg ctt gag gcc atg 1872
Thr Phe Phe Pro Met Ala His Asn Thr Ala Ser Thr Leu Glu Ala Met
610 615 620
ctt aga aac gac acc aac gac cag tcc ttt aac gac tat ctc tcc gcc 1920
Leu Arg Asn Asp Thr Asn Asp Gln Ser Phe Asn Asp Tyr Leu Ser Ala
625 630 635 640
gcc aac atg ctc tac cct ata ccc gcc aac gct acc aac gtg ccc ata 1968
Ala Asn Met Leu Tyr Pro Ile Pro Ala Asn Ala Thr Asn Val Pro Ile
645 650 655
tcc atc ccc tcc cgc aac tgg gcg gct ttc cgc ggc tgg gcc ttc acg 2016
Ser Ile Pro Ser Arg Asn Trp Ala Ala Phe Arg Gly Trp Ala Phe Thr
660 665 670
cgc ctt aag act aag gaa acc cca tca ctg ggc tcg ggc tac gac cct 2064
Arg Leu Lys Thr Lys Glu Thr Pro Ser Leu Gly Ser Gly Tyr Asp Pro
675 680 685
tat tac acc tac tct ggc tct ata ccc tac cta gat gga acc ttt tac 2112
Tyr Tyr Thr Tyr Ser Gly Ser Ile Pro Tyr Leu Asp Gly Thr Phe Tyr
690 695 700
ctc aac cac acc ttt aag aag gtg gcc att acc ttt gac tct tct gtc 2160
Leu Asn His Thr Phe Lys Lys Val Ala Ile Thr Phe Asp Ser Ser Val
705 710 715 720
agc tgg cct ggc aat gac cgc ctg ctt acc ccc aac gag ttt gaa att 2208
Ser Trp Pro Gly Asn Asp Arg Leu Leu Thr Pro Asn Glu Phe Glu Ile
725 730 735
aag cgc tca gtt gac ggg gag ggt tac aac gtt gcc cag tgt aac atg 2256
Lys Arg Ser Val Asp Gly Glu Gly Tyr Asn Val Ala Gln Cys Asn Met
740 745 750
acc aaa gac tgg ttc ctg gta caa atg cta gct aac tat aac att ggc 2304
Thr Lys Asp Trp Phe Leu Val Gln Met Leu Ala Asn Tyr Asn Ile Gly
755 760 765
tac cag ggc ttc tat atc cca gag agc tac aag gac cgc atg tac tcc 2352
Tyr Gln Gly Phe Tyr Ile Pro Glu Ser Tyr Lys Asp Arg Met Tyr Ser
770 775 780
ttc ttt aga aac ttc cag ccc atg agc cgt cag gtg gtg gat gat act 2400
Phe Phe Arg Asn Phe Gln Pro Met Ser Arg Gln Val Val Asp Asp Thr
785 790 795 800
aaa tac aag gac tac caa cag gtg ggc atc cta cac caa cac aac aac 2448
Lys Tyr Lys Asp Tyr Gln Gln Val Gly Ile Leu His Gln His Asn Asn
805 810 815
tct gga ttt gtt ggc tac ctt gcc ccc acc atg cgc gaa gga cag gcc 2496
Ser Gly Phe Val Gly Tyr Leu Ala Pro Thr Met Arg Glu Gly Gln Ala
820 825 830
tac cct gct aac ttc ccc tat ccg ctt ata ggc aag acc gca gtt gac 2544
Tyr Pro Ala Asn Phe Pro Tyr Pro Leu Ile Gly Lys Thr Ala Val Asp
835 840 845
agc att acc cag aaa aag ttt ctt tgc gat cgc acc ctt tgg cgc atc 2592
Ser Ile Thr Gln Lys Lys Phe Leu Cys Asp Arg Thr Leu Trp Arg Ile
850 855 860
cca ttc tcc agt aac ttt atg tcc atg ggc gca ctc aca gac ctg ggc 2640
Pro Phe Ser Ser Asn Phe Met Ser Met Gly Ala Leu Thr Asp Leu Gly
865 870 875 880
caa aac ctt ctc tac gcc aac tcc gcc cac gcg cta gac atg act ttt 2688
Gln Asn Leu Leu Tyr Ala Asn Ser Ala His Ala Leu Asp Met Thr Phe
885 890 895
gag gtg gat ccc atg gac gag ccc acc ctt ctt tat gtt ttg ttt gaa 2736
Glu Val Asp Pro Met Asp Glu Pro Thr Leu Leu Tyr Val Leu Phe Glu
900 905 910
gtc ttt gac gtg gtc cgt gtg cac cag ccg cac cgc ggc gtc atc gaa 2784
Val Phe Asp Val Val Arg Val His Gln Pro His Arg Gly Val Ile Glu
915 920 925
acc gtg tac ctg cgc acg ccc ttc tcg gcc ggc aac gcc aca aca taa 2832
Thr Val Tyr Leu Arg Thr Pro Phe Ser Ala Gly Asn Ala Thr Thr
930 935 940
<210> 4
<211> 2790
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> (QGPGAP)4-HVR1 modified Hexon protein
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(2787)
<400> 4
atg gct acc cct tcg atg atg ccg cag tgg tct tac atg cac atc tcg 48
Met Ala Thr Pro Ser Met Met Pro Gln Trp Ser Tyr Met His Ile Ser
1 5 10 15
ggc cag gac gcc tcg gag tac ctg agc ccc ggg ctg gtg cag ttt gcc 96
Gly Gln Asp Ala Ser Glu Tyr Leu Ser Pro Gly Leu Val Gln Phe Ala
20 25 30
cgc gcc acc gag acg tac ttc agc ctg aat aac aag ttt aga aac ccc 144
Arg Ala Thr Glu Thr Tyr Phe Ser Leu Asn Asn Lys Phe Arg Asn Pro
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acg gtg gcg cct acg cac gac gtg acc aca gac cgg tcc cag cgt ttg 192
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acg ctg cgg ttc atc cct gtg gac cgt gag gat act gcg tac tcg tac 240
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gcc cca aat cct tgc gaa tgg gat gaa cag gga cca gga gca cca cag 432
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gcc cca aat cct tgc gaa tgg gat gaa cag gga cca gga gca cca cag 432
Ala Pro Asn Pro Cys Glu Trp Asp Glu Gln Gly Pro Gly Ala Pro Gln
130 135 140
gga cca gga gca cca cag gga cca gga gca ccg caa ggt cct ggt gct 480
Gly Pro Gly Ala Pro Gln Gly Pro Gly Ala Pro Gln Gly Pro Gly Ala
145 150 155 160
cct cag gga cca gga gca cca cag gga cca gga gca cca aaa act cac 528
Pro Gln Gly Pro Gly Ala Pro Gln Gly Pro Gly Ala Pro Lys Thr His
165 170 175
gta ttt ggg cag gcg cct tat tct ggt ata aat att aca aag gag ggt 576
Val Phe Gly Gln Ala Pro Tyr Ser Gly Ile Asn Ile Thr Lys Glu Gly
180 185 190
att caa ata ggt gtc gaa ggt caa aca cct aaa tat gcc gat aaa aca 624
Ile Gln Ile Gly Val Glu Gly Gln Thr Pro Lys Tyr Ala Asp Lys Thr
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ttt caa cct gaa cct caa ata gga gaa tct cag tgg tac gaa aca gaa 672
Phe Gln Pro Glu Pro Gln Ile Gly Glu Ser Gln Trp Tyr Glu Thr Glu
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att aat cat gca gct ggg aga gtc cta aaa aag act acc cca atg aaa 720
Ile Asn His Ala Ala Gly Arg Val Leu Lys Lys Thr Thr Pro Met Lys
225 230 235 240
cca tgt tac ggt tca tat gca aaa ccc aca aat gaa aat gga ggg caa 768
Pro Cys Tyr Gly Ser Tyr Ala Lys Pro Thr Asn Glu Asn Gly Gly Gln
245 250 255
ggc att ctt gta aag caa caa aat gga aag cta gaa agt caa gtg gaa 816
Gly Ile Leu Val Lys Gln Gln Asn Gly Lys Leu Glu Ser Gln Val Glu
260 265 270
atg caa ttt ttc tca act act gag gca gcc gca ggc aat ggt gat aac 864
Met Gln Phe Phe Ser Thr Thr Glu Ala Ala Ala Gly Asn Gly Asp Asn
275 280 285
ttg act cct aaa gtg gta ttg tac agt gaa gat gta gat ata gaa acc 912
Leu Thr Pro Lys Val Val Leu Tyr Ser Glu Asp Val Asp Ile Glu Thr
290 295 300
cca gac act cat att tct tac atg ccc act att aag gaa ggt aac tca 960
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cga gaa cta atg ggc caa caa tct atg ccc aac agg cct aat tac att 1008
Arg Glu Leu Met Gly Gln Gln Ser Met Pro Asn Arg Pro Asn Tyr Ile
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Ala Phe Arg Asp Asn Phe Ile Gly Leu Met Tyr Tyr Asn Ser Thr Gly
340 345 350
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Asn Met Gly Val Leu Ala Gly Gln Ala Ser Gln Leu Asn Ala Val Val
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gat ttg caa gac aga aac aca gag ctt tca tac cag ctt ttg ctt gat 1152
Asp Leu Gln Asp Arg Asn Thr Glu Leu Ser Tyr Gln Leu Leu Leu Asp
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Ser Ile Gly Asp Arg Thr Arg Tyr Phe Ser Met Trp Asn Gln Leu Pro
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aat tac tgc ttt cca ctg gga ggt gtg att aat aca gag act ctt acc 1248
Asn Tyr Cys Phe Pro Leu Gly Gly Val Ile Asn Thr Glu Thr Leu Thr
405 410 415
aag gta aaa cct aaa aca ggt cag gaa aat gga tgg gaa aaa gat gct 1296
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420 425 430
aca gaa ttt tca gat aaa aat gaa ata aga gtt gga aat aat ttt gcc 1344
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Met Glu Ile Asn Leu Asn Ala Asn Leu Trp Arg Asn Phe Leu Tyr Ser
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<221> CDS
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cct caa ata gga gaa tct cag tgg tac gaa aca gaa att aat cat gca 720
Pro Gln Ile Gly Glu Ser Gln Trp Tyr Glu Thr Glu Ile Asn His Ala
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gct ggg aga gtc cta aaa aag act acc cca atg aaa cca tgt tac ggt 768
Ala Gly Arg Val Leu Lys Lys Thr Thr Pro Met Lys Pro Cys Tyr Gly
245 250 255
tca tat gca aaa ccc aca aat gaa aat gga ggg caa ggc att ctt gta 816
Ser Tyr Ala Lys Pro Thr Asn Glu Asn Gly Gly Gln Gly Ile Leu Val
260 265 270
aag caa caa aat gga aag cta gaa agt caa gtg gaa atg caa ttt ttc 864
Lys Gln Gln Asn Gly Lys Leu Glu Ser Gln Val Glu Met Gln Phe Phe
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tca act act gag gca gcc gca ggc aat ggt gat aac ttg act cct aaa 912
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gtg gta ttg tac agt gaa gat gta gat ata gaa acc cca gac act cat 960
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cct gaa cct caa ata gga gaa tct cag tgg tac gaa aca gaa att aat 768
Pro Glu Pro Gln Ile Gly Glu Ser Gln Trp Tyr Glu Thr Glu Ile Asn
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cat gca gct ggg aga gtc cta aaa aag act acc cca atg aaa cca tgt 816
His Ala Ala Gly Arg Val Leu Lys Lys Thr Thr Pro Met Lys Pro Cys
260 265 270
tac ggt tca tat gca aaa ccc aca aat gaa aat gga ggg caa ggc att 864
Tyr Gly Ser Tyr Ala Lys Pro Thr Asn Glu Asn Gly Gly Gln Gly Ile
275 280 285
ctt gta aag caa caa aat gga aag cta gaa agt caa gtg gaa atg caa 912
Leu Val Lys Gln Gln Asn Gly Lys Leu Glu Ser Gln Val Glu Met Gln
290 295 300
ttt ttc tca act act gag gca gcc gca ggc aat ggt gat aac ttg act 960
Phe Phe Ser Thr Thr Glu Ala Ala Ala Gly Asn Gly Asp Asn Leu Thr
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cct aaa gtg gta ttg tac agt gaa gat gta gat ata gaa acc cca gac 1008
Pro Lys Val Val Leu Tyr Ser Glu Asp Val Asp Ile Glu Thr Pro Asp
325 330 335
act cat att tct tac atg ccc act att aag gaa ggt aac tca cga gaa 1056
Thr His Ile Ser Tyr Met Pro Thr Ile Lys Glu Gly Asn Ser Arg Glu
340 345 350
cta atg ggc caa caa tct atg ccc aac agg cct aat tac att gct ttt 1104
Leu Met Gly Gln Gln Ser Met Pro Asn Arg Pro Asn Tyr Ile Ala Phe
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agg gac aat ttt att ggt cta atg tat tac aac agc acg ggt aat atg 1152
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ggt gtt ctg gcg ggc caa gca tcg cag ttg aat gct gtt gta gat ttg 1200
Gly Val Leu Ala Gly Gln Ala Ser Gln Leu Asn Ala Val Val Asp Leu
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caa gac aga aac aca gag ctt tca tac cag ctt ttg ctt gat tcc att 1248
Gln Asp Arg Asn Thr Glu Leu Ser Tyr Gln Leu Leu Leu Asp Ser Ile
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ggt gat aga acc agg tac ttt tct atg tgg aat cag ctt cca aat tac 1296
Gly Asp Arg Thr Arg Tyr Phe Ser Met Trp Asn Gln Leu Pro Asn Tyr
420 425 430
tgc ttt cca ctg gga ggt gtg att aat aca gag act ctt acc aag gta 1344
Cys Phe Pro Leu Gly Gly Val Ile Asn Thr Glu Thr Leu Thr Lys Val
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aaa cct aaa aca ggt cag gaa aat gga tgg gaa aaa gat gct aca gaa 1392
Lys Pro Lys Thr Gly Gln Glu Asn Gly Trp Glu Lys Asp Ala Thr Glu
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ttt tca gat aaa aat gaa ata aga gtt gga aat aat ttt gcc atg gaa 1440
Phe Ser Asp Lys Asn Glu Ile Arg Val Gly Asn Asn Phe Ala Met Glu
465 470 475 480
atc aat cta aat gcc aac ctg tgg aga aat ttc ctg tac tcc aac ata 1488
Ile Asn Leu Asn Ala Asn Leu Trp Arg Asn Phe Leu Tyr Ser Asn Ile
485 490 495
gcg ctg tat ttg ccc gac aag cta aag tac agt cct tcc aac gta aaa 1536
Ala Leu Tyr Leu Pro Asp Lys Leu Lys Tyr Ser Pro Ser Asn Val Lys
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att tct gat aac cca aac acc tac gac tac atg aac aag cga gtg gtg 1584
Ile Ser Asp Asn Pro Asn Thr Tyr Asp Tyr Met Asn Lys Arg Val Val
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Ala Pro Gly Leu Val Asp Cys Tyr Ile Asn Leu Gly Ala Arg Trp Ser
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Leu Leu Pro Gly Ser Tyr Thr Tyr Glu Trp Asn Phe Arg Lys Asp Val
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gga cca gga gca cca cag gga cca gga gca cca cag gga cca gga gca 624
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aag caa caa aat gga aag cta gaa agt caa gtg gaa atg caa ttt ttc 768
Lys Gln Gln Asn Gly Lys Leu Glu Ser Gln Val Glu Met Gln Phe Phe
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tca act act gag gca gcc gca ggc aat ggt gat aac ttg act cct aaa 816
Ser Thr Thr Glu Ala Ala Ala Gly Asn Gly Asp Asn Leu Thr Pro Lys
260 265 270
gtg gta ttg tac agt gaa gat gta gat ata gaa acc cca gac act cat 864
Val Val Leu Tyr Ser Glu Asp Val Asp Ile Glu Thr Pro Asp Thr His
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Gly Gln Gln Ser Met Pro Asn Arg Pro Asn Tyr Ile Ala Phe Arg Asp
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Asn Phe Ile Gly Leu Met Tyr Tyr Asn Ser Thr Gly Asn Met Gly Val
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ctg gcg ggc caa gca tcg cag ttg aat gct gtt gta gat ttg caa gac 1104
Leu Ala Gly Gln Ala Ser Gln Leu Asn Ala Val Val Asp Leu Gln Asp
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aga aac aca gag ctt tca tac cag ctt ttg ctt gat tcc att ggt gat 1152
Arg Asn Thr Glu Leu Ser Tyr Gln Leu Leu Leu Asp Ser Ile Gly Asp
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cca ctg gga ggt gtg att aat aca gag act ctt acc aag gta aaa cct 1248
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aga aac aca gag ctt tca tac cag ctt ttg ctt gat tcc att ggt gat 1200
Arg Asn Thr Glu Leu Ser Tyr Gln Leu Leu Leu Asp Ser Ile Gly Asp
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aga acc agg tac ttt tct atg tgg aat cag ctt cca aat tac tgc ttt 1248
Arg Thr Arg Tyr Phe Ser Met Trp Asn Gln Leu Pro Asn Tyr Cys Phe
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cca ctg gga ggt gtg att aat aca gag act ctt acc aag gta aaa cct 1296
Pro Leu Gly Gly Val Ile Asn Thr Glu Thr Leu Thr Lys Val Lys Pro
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aga acc agg tac ttt tct atg tgg aat cag ctt cca aat tac tgc ttt 1296
Arg Thr Arg Tyr Phe Ser Met Trp Asn Gln Leu Pro Asn Tyr Cys Phe
420 425 430
cca ctg gga ggt gtg att aat aca gag act ctt acc aag gta aaa cct 1344
Pro Leu Gly Gly Val Ile Asn Thr Glu Thr Leu Thr Lys Val Lys Pro
435 440 445
aaa aca ggt cag gaa aat gga tgg gaa aaa gat gct aca gaa ttt tca 1392
Lys Thr Gly Gln Glu Asn Gly Trp Glu Lys Asp Ala Thr Glu Phe Ser
450 455 460
gat aaa aat gaa ata aga gtt gga aat aat ttt gcc atg gaa atc aat 1440
Asp Lys Asn Glu Ile Arg Val Gly Asn Asn Phe Ala Met Glu Ile Asn
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cta aat gcc aac ctg tgg aga aat ttc ctg tac tcc aac ata gcg ctg 1488
Leu Asn Ala Asn Leu Trp Arg Asn Phe Leu Tyr Ser Asn Ile Ala Leu
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tat ttg ccc gac aag cta aag tac agt cct tcc aac gta aaa att tct 1536
Tyr Leu Pro Asp Lys Leu Lys Tyr Ser Pro Ser Asn Val Lys Ile Ser
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Pro Asn Ala Asn Pro Asn Ala Asn Pro Asn Ala Asn Pro Asn Ala Asn
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Glu Lys Asp Ala Thr Glu Phe Ser Asp Lys Asn Glu Ile Arg Val Gly
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aga aac aca gag ctt tca tac cag ctt ttg ctt gat tcc att ggt gat 1296
Arg Asn Thr Glu Leu Ser Tyr Gln Leu Leu Leu Asp Ser Ile Gly Asp
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aga acc agg tac ttt tct atg tgg aat cag ctt cca aat tac tgc ttt 1344
Arg Thr Arg Tyr Phe Ser Met Trp Asn Gln Leu Pro Asn Tyr Cys Phe
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cca ctg gga ggt gtg att aat aca gag act ctt acc aag gta aaa cct 1392
Pro Leu Gly Gly Val Ile Asn Thr Glu Thr Leu Thr Lys Val Lys Pro
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aaa aca ggt cag gaa aat gga tgg gaa aaa gat gct aca gaa ttt tca 1440
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gat aaa aat gaa ata aga gtt gga aat aat ttt gcc atg gaa atc aat 1488
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cta aat gcc aac ctg tgg aga aat ttc ctg tac tcc aac ata gcg ctg 1536
Leu Asn Ala Asn Leu Trp Arg Asn Phe Leu Tyr Ser Asn Ile Ala Leu
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tat ttg ccc gac aag cta aag tac agt cct tcc aac gta aaa att tct 1584
Tyr Leu Pro Asp Lys Leu Lys Tyr Ser Pro Ser Asn Val Lys Ile Ser
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gat aac cca aac acc tac gac tac atg aac aag cga gtg gtg gct ccc 1632
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cca aat gca aat cca aat gca aat cca aac gcg aac ccg aat gct aat 576
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att tct tac atg ccc act att aag gaa ggt aac tca cga gaa cta atg 1200
Ile Ser Tyr Met Pro Thr Ile Lys Glu Gly Asn Ser Arg Glu Leu Met
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aat ttt att ggt cta atg tat tac aac agc acg ggt aat atg ggt gtt 1296
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gcc att aat gca gga gat ggg ctt gaa ttt ggt tca cct aat gca cca 1056
Ala Ile Asn Ala Gly Asp Gly Leu Glu Phe Gly Ser Pro Asn Ala Pro
340 345 350
aac aca aat ccc ctc aaa aca aaa att ggc cat ggc cta gaa ttt gat 1104
Asn Thr Asn Pro Leu Lys Thr Lys Ile Gly His Gly Leu Glu Phe Asp
355 360 365
tca aac aag gct atg gtt cct aaa cta gga act ggc ctt agt ttt gac 1152
Ser Asn Lys Ala Met Val Pro Lys Leu Gly Thr Gly Leu Ser Phe Asp
370 375 380
agc aca ggt gcc att aca gta gga aac aaa aat aat gat aag cta act 1200
Ser Thr Gly Ala Ile Thr Val Gly Asn Lys Asn Asn Asp Lys Leu Thr
385 390 395 400
ttg tgg acc aca cca gct cca tct cct aac tgt aga cta aat gca gag 1248
Leu Trp Thr Thr Pro Ala Pro Ser Pro Asn Cys Arg Leu Asn Ala Glu
405 410 415
aaa gat gct aaa ctc act ttg gtc tta aca aaa tgt ggc agt caa ata 1296
Lys Asp Ala Lys Leu Thr Leu Val Leu Thr Lys Cys Gly Ser Gln Ile
420 425 430
ctt gct aca gtt tca gtt ttg gct gtt aaa ggc agt ttg gct cca ata 1344
Leu Ala Thr Val Ser Val Leu Ala Val Lys Gly Ser Leu Ala Pro Ile
435 440 445
tct gga aca gtt caa agt gct cat ctt att ata aga ttt gac gaa aat 1392
Ser Gly Thr Val Gln Ser Ala His Leu Ile Ile Arg Phe Asp Glu Asn
450 455 460
gga gtg cta cta aac aat tcc ttc ctg gac cca gaa tat tgg aac ttt 1440
Gly Val Leu Leu Asn Asn Ser Phe Leu Asp Pro Glu Tyr Trp Asn Phe
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aga aat gga gat ctt act gaa ggc aca gcc tat aca aac gct gtt gga 1488
Arg Asn Gly Asp Leu Thr Glu Gly Thr Ala Tyr Thr Asn Ala Val Gly
485 490 495
ttt atg cct aac cta tca gct tat cca aaa tct cac ggt aaa act gcc 1536
Phe Met Pro Asn Leu Ser Ala Tyr Pro Lys Ser His Gly Lys Thr Ala
500 505 510
aaa agt aac att gtc agt caa gtt tac tta aac gga gac aaa act aaa 1584
Lys Ser Asn Ile Val Ser Gln Val Tyr Leu Asn Gly Asp Lys Thr Lys
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cct gta aca cta acc att aca cta aac ggt aca cag gaa aca gga cag 1632
Pro Val Thr Leu Thr Ile Thr Leu Asn Gly Thr Gln Glu Thr Gly Gln
530 535 540
ggc cct gga gct cca cag gga cca ggt gca cct caa ggg cct gga gcc 1680
Gly Pro Gly Ala Pro Gln Gly Pro Gly Ala Pro Gln Gly Pro Gly Ala
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cct gac aca act cca agt gca tac tct atg tca ttt tca tgg gac tgg 1728
Pro Asp Thr Thr Pro Ser Ala Tyr Ser Met Ser Phe Ser Trp Asp Trp
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tct ggc cac aac tac att aat gaa ata ttt gcc aca tcc tct tac act 1776
Ser Gly His Asn Tyr Ile Asn Glu Ile Phe Ala Thr Ser Ser Tyr Thr
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ttt tca tac att gcc caa gaa taa 1800
Phe Ser Tyr Ile Ala Gln Glu
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<213> Artificial Sequence
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Met Lys Arg Ala Arg Pro Ser Glu Asp Thr Phe Asn Pro Val Tyr Pro
1 5 10 15
tat gac acg gaa acc ggt cct cca act gtg cct ttt ctt act cct ccc 96
Tyr Asp Thr Glu Thr Gly Pro Pro Thr Val Pro Phe Leu Thr Pro Pro
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ttt gta tcc ccc aat ggg ttt caa gag agt ccc cct ggg gta ctc tct 144
Phe Val Ser Pro Asn Gly Phe Gln Glu Ser Pro Pro Gly Val Leu Ser
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ttg cgc cta tcc gaa cct cta gtt acc tcc aat ggc atg ctt gcg ctc 192
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gcc tca ccc cct cta act act gcc act ggt agc ttg ggc att gac ttg 576
Ala Ser Pro Pro Leu Thr Thr Ala Thr Gly Ser Leu Gly Ile Asp Leu
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aaa gag ccc att tat aca caa aat gga aaa cta gga cta aag tac ggg 624
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aaa ggc ctt tac ttg ttt aca gct tca aac aat tcc aaa aag ctt gag 960
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gtt aac cta agc act gcc aag ggg ttg atg ttt gac gct aca gcc ata 1008
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325 330 335
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Ala Ile Asn Ala Gly Asp Gly Leu Glu Phe Gly Ser Pro Asn Ala Pro
340 345 350
aac aca aat ccc ctc aaa aca aaa att ggc cat ggc cta gaa ttt gat 1104
Asn Thr Asn Pro Leu Lys Thr Lys Ile Gly His Gly Leu Glu Phe Asp
355 360 365
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Ser Asn Lys Ala Met Val Pro Lys Leu Gly Thr Gly Leu Ser Phe Asp
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Ser Thr Gly Ala Ile Thr Val Gly Asn Lys Asn Asn Asp Lys Leu Thr
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Leu Ala Thr Val Ser Val Leu Ala Val Lys Gly Ser Leu Ala Pro Ile
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<213> Plasmodium falciparum
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20
<210> 63
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<213> Plasmodium vivax
<400> 63
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<213> Plasmodium malariae
<400> 64
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<211> 4
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<400> 65
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1
<210> 66
<211> 9
<212> PRT
<213> Plasmodium yoelii
<400> 66
Ser Tyr Val Pro Ser Ala Glu Gln Ile
1 5
Claims (28)
- 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터가
이종유래 프로모터 서열에 작동적으로 연결된 말라리아원충 (Plasmodium) 서컴포자소체 단백질 유전자 또는 그의 항원성 부분, 또한
말라리아원충 서컴포자소체의 면역원성 에피토프 서열이 하나 이상의 캡시드 및/또는 코아 단백질 유전자들 내로 삽입되었거나 그들의 적어도 일부분을 치환시킨 하나 이상의 변형된 캡시드 및/또는 코아 단백질 유전자들
을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 것인,
재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터로부터 유래한 재조합 아데노바이러스. - 제1항에 있어서, 상기 말라리아원충 서컴포자소체 단백질 유전자가 플라스모듐 팔시파룸 (Plasmodium falciparum) 또는 플라스모듐 옐리 (Plasmodium yoelii) 서컴포자소체 단백질 유전자를 더 포함하는 것인 아데노바이러스.
- 제1항에 있어서, 상기 말라리아원충 서컴포자소체 단백질 유전자가 코돈-최적화된 플라스모듐 팔시파룸 또는 플라스모듐 옐리 서컴포자소체 단백질 유전자를 더 포함하는 것인 아데노바이러스.
- 제3항에 있어서, 상기 코돈-최적화된 단백질 유전자가 서열번호 1 또는 서열번호 2에 의해 인코딩되는 것인 아데노바이러스.
- 제1항에 있어서, 상기 면역원성 에피토프 서열이 말라리아원충 서컴포자소체 단백질 유전자의 B 세포 및/또는 T 세포 에피토프 서열을 더 포함하는 것인 아데노바이러스.
- 제5항에 있어서, 상기 캡시드 단백질 유전자가 헥손 과다가변 부위 (HVR) 서열을 더 포함하는 것인 아데노바이러스.
- 제6항에 있어서, 상기 HVR 서열이 HVR1 또는 HVR5 서열을 더 포함하고, B 세포 에피토프가
a) 상기 HVR1 또는 HVR5 서열 내에 삽입되거나; 또는
b) 상기 HVR1 또는 HVR5 서열의 일부를 치환시킨 것인 아데노바이러스. - 제7항에 있어서, 상기 변형된 캡시드 단백질 유전자가 서열번호 12, 서열번호 13, 서열번호 14, 서열번호 15, 서열번호 16, 서열번호 17, 서열번호 18, 서열번호 19, 서열번호 20, 서열번호 21, 서열번호 22 또는 서열번호 23으로 이루어진 그룹으로부터 선택되는 핵산 서열에 의해 인코딩되는 것인 아데노바이러스.
- 제6항에 있어서, 상기 HVR 서열이 HVR1 또는 HVR5 서열을 더 포함하고, CD4+ 또는 CD8+ T 세포 에피토프가
a) 상기 HVR1 또는 HVR5 서열 내에 삽입되거나; 또는
b) 상기 HVR1 또는 HVR5 서열의 일부를 치환시킨 것인 아데노바이러스. - 제5항에 있어서, 상기 캡시드 단백질 유전자가 캡시드 파이버 단백질 유전자를 더 포함하고, B 세포 에피토프 서열이 파이버 단백질 유전자 내에 삽입되는 것인 아데노바이러스.
- 제10항에 있어서, 상기 변형된 캡시드 단백질 유전자가 서열번호 24 또는 서열번호 25에 의해 인코딩되는 것인 아데노바이러스.
- 제5항 내지 제11항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 B 세포 에피토프 서열이 플라스모듐 팔시파룸 서컴포자소체 단백질 유전자의 B 세포 에피토프 서열인 아데노바이러스.
- 제12항에 있어서, 상기 B 세포 에피토프 서열이 (NANP)n (서열번호 60)이고 n이 4 이상인 아데노바이러스.
- 제12항에 있어서, 상기 B 세포 에피토프 서열이 (NANP)4, (NANP)6, (NANP)8, (NANP)10, (NANP)12, (NANP)14, (NANP)16, (NANP)18, (NANP)20, (NANP)22, 또는 (NANP)28인 아데노바이러스.
- 제1항에 있어서, 상기 면역원성 에피토프 서열이 말라리아원충 서컴포자소체 단백질 유전자의 CD4+ T 세포 에피토프 서열을 더 포함하는 것인 아데노바이러스.
- 제15항에 있어서, 상기 코아 단백질 유전자가 pVII 단백질 유전자를 더 포함하고, 상기 CD4+ T 세포 에피토프 서열이 상기 pVII 단백질 유전자 내에 삽입되는 것인 아데노바이러스.
- 제16항에 있어서, 상기 변형된 코아 단백질 유전자가 서열번호 26, 서열번호 27, 서열번호 28 또는 서열번호 29에 의해 인코딩되는 것인 아데노바이러스.
- 제15항 내지 제17항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 CD4+ T 세포 에피토프 서열이 플라스모듐 팔시파룸 서컴포자소체 단백질 유전자의 CD4+ T 세포 에피토프 서열인 아데노바이러스.
- 제16항에 있어서, 상기 CD4+ T 세포 에피토프 서열이 EYLNKIQNSLSTEWSPCSVT (서열번호 62)인 아데노바이러스.
- 제1항에 있어서, 상기 아데노바이러스가 HVR1-변형된 아데노바이러스 벡터, 파이버-변형된 아데노바이러스 벡터, HVR1 및 파이버-변형된 아데노바이러스 벡터, 파이버 및 pVII-변형된 아데노바이러스 벡터, HVR1 및 pVII-변형된 아데노바이러스 벡터, 또한 HVR1, 파이버 및 pVII-변형된 아데노바이러스 벡터로 이루어진 그룹으로부터 선택된 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터들의 어느 하나로부터 생산되는 것인 아데노바이러스.
- 재조합 아데노바이러스는 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터로부터 유래하고, 상기 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터는
이종유래 프로모터에 작동적으로 연결된 말라리아원충 서컴포자소체 단백질 또는 그의 항원성 부분, 또한
말라리아원충 서컴포자소체의 면역원성 에피토프가 캡시드 또는 코아 단백질 내로 삽입되었거나 그의 적어도 일부를 치환시킨 변형된 캡시드 또는 코아 단백질
을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 것인,
상기 재조합 아데노바이러스의 적어도 하나의 용량을 개체에게 투여하는 것을 포함하는, 상기 개체에서 말라리아원충 서컴포자소체 단백질에 대한 세포성 및 체액성 면역 반응을 유도하는 방법. - 제21항에 있어서, 상기 재조합 아데노바이러스와 함께 아쥬반트를 투여하는 것을 더 포함하는 방법.
- 첫 번째 재조합 아데노바이러스는 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터로부터 유래하고, 상기 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터는 이종유래 프로모터에 작동적으로 연결된 말라리아원충 서컴포자소체 단백질 또는 그의 항원성 부분을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하고, 또한
두 번째 재조합 아데노바이러스는 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터로부터 유래하고, 상기 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터는 이종유래 프로모터에 작동적으로 연결된 말라리아원충 서컴포자소체 단백질 또는 그의 항원성 부분, 또한 말라리아원충 서컴포자소체의 면역원성 에피토프가 캡시드 또는 코아 단백질 내로 삽입되었거나 그의 적어도 일부를 치환시킨 변형된 캡시드 또는 코아 단백질을 인코딩하는 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 것인,
상기 첫 번째 재조합 아데노바이러스의 첫 번째 감작 용량, 및
상기 두 번째 재조합 아데노바이러스의 연속적 추가자극 용량
을 아데노바이러스 혈청형에 대한 기존의 중화 항체가 결여된 개체에게 투여하는 것을 포함하는, 상기 개체에서 말라리아원충 서컴포자소체 단백질에 대한 세포성 및 체액성 면역 반응을 유도하는 방법. - 제23항에 있어서, 상기 재조합 아데노바이러스와 함께 아쥬반트를 투여하는 것을 더 포함하는 방법.
- 재조합 아데노바이러스는 HVR1-변형된 아데노바이러스 벡터, 파이버-변형된 아데노바이러스 벡터, HVR1 및 파이버-변형된 아데노바이러스 벡터, 파이버 및 pVII-변형된 아데노바이러스 벡터, HVR1 및 pVII-변형된 아데노바이러스 벡터, 또한 HVR1, 파이버 및 pVII-변형된 아데노바이러스 벡터로 이루어진 그룹으로부터 선택된 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터들의 어느 하나로부터 생산되는 것인, 상기 재조합 아데노바이러스를 포함하는 약제학적 조성물.
- 재조합 아데노바이러스는 HVR1-변형된 아데노바이러스 벡터, 파이버-변형된 아데노바이러스 벡터, HVR1 및 파이버-변형된 아데노바이러스 벡터, 파이버 및 pVII-변형된 아데노바이러스 벡터, HVR1 및 pVII-변형된 아데노바이러스 벡터, 또한 HVR1, 파이버 및 pVII-변형된 아데노바이러스 벡터로 이루어진 그룹으로부터 선택된 재조합 아데노바이러스 플라스미드 벡터들의 어느 하나로부터 생산되는 것인, 상기 재조합 아데노바이러스를 포함하는 말라리아 감염을 위한 백신.
- 제26항에 있어서, 근육내, 피부내 또는 피하로 개체에게 투여되는, 말라리아 감염을 위한 백신.
- 제26항에 있어서, 아쥬반트와 함께 개체에게 투여되는, 말라리아 감염을 위한 백신.
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