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KR102437995B1 - 항-p53 항체의 검출 - Google Patents

항-p53 항체의 검출 Download PDF

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KR102437995B1 KR1020187025578A KR20187025578A KR102437995B1 KR 102437995 B1 KR102437995 B1 KR 102437995B1 KR 1020187025578 A KR1020187025578 A KR 1020187025578A KR 20187025578 A KR20187025578 A KR 20187025578A KR 102437995 B1 KR102437995 B1 KR 102437995B1
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니나 마이쓸러
마리온 니쓰너
랑게 막달레나 스비아텍-데
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에프. 호프만-라 로슈 아게
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Abstract

본 개시 내용은 샘플에서 p53에 대한 항체 (항-p53 항체)를 검출하기 위한 시험관내 (in vitro) 방법에 관한 것으로서, 방법은 분석하려는 샘플을 p53 포획 항원 및 p53 검출 항원과 인큐베이션시켜, p53 포획 항원, 항-p53 항체 및 p53 검출 항원을 포함하는 복합체를 형성시키는 단계, 형성된 복합체를 미결합된 검출 항원으로부터 분리시키는 단계, 및 수득된 복합체를 그에 포함된 검출 항원을 통해 측정하여, 샘플에 포함된 항-p53 항체를 검출하는 단계를 포함한다.

Description

항-p53 항체의 검출
본 개시 내용은 p53에 대한 항체 (항-p53 항체)의 검출을 위한 방법에 관한 것이다. 개시된 방법은 종래 방법과 비교하여 더 높은 특이성으로 항-p53 항체를 검출할 수 있게 한다. 본 개시 내용에 따른 방법은 p53 포획 항원 및 p53 검출 항원을 필요로 한다. 방법은 p53 포획 항원 및 p53 검출 항원을 항-p53 항체를 포함하는 것으로 알려져 있거나 의심되는 샘플과 인큐베이션시켜, p53 포획 항원, 항-p53 항체 및 p53 검출 항원을 포함하는 복합체가 형성되게 하는 단계, 형성된 복합체를 미결합된 검출 항원으로부터 분리시키는 단계, 수득된 복합체를 그에 포함된 검출 항원을 통해 측정하여, 샘플에 포함된 항-p53 항체를 검출하는 단계를 포함한다.
항-p53 항체 (항-p53 Ab)는 종양-회합된 항원 스크리닝 과정 동안 30년이 넘는 그 이전에 발견되었다 (Crawford L.V. et al., Int. J. Cancer, 30: 403-408, 1982). 하지만, 1980년대 초에 수행된 이 연구를 비롯하여 소수의 유사한 연구들은 그 시기 동안 p53에 대한 관심의 결여 때문에 10년이 넘게 사실상 무시되었었다.
1990년대 초에, p53 유전자가 거의 모든 유형의 인간 암에서 분자적 변경을 위한 가장 일반적인 표적이라는 것을 발견하였다. 이것은 정상 및 형질전환 세포에서 p53 단백질 및 이의 기능에 관한 연구에 상당한 관심을 불러일으켰다. 이것은 또한 보다 초기에 이미 암 환자에서 확인된 바 있는 체액성 반응의 재발견을 유도하였다.
종양 억제인자 p53은 정상 세포의 핵에서는 거의 검출가능하지 않은 인단백질이다 (Benchimol, S. et al., EMBO J. 1 (1982) 1055-1062). 특히 DNA 손상에 의해 유도되는 세포 스트레스 시, p53은 세포 주기 진행을 정지시킬 수 있고, 따라서 DNA가 복구될 수 있게 하거나 아포프토시스 (apoptosis) 를 야기시킬 수 있다. 돌연변이체 p53을 보유하는 암 세포에서, 이 단백질은 더 이상 세포 증식을 제어할 수 없어서, 그 결과로 비효율적인 DNA 복구가 일어난다 (Levine, A. Cell 88 (1997) 323-331). 인간 암에서 p53의 가장 일반적인 변화는 결장, 위, 유방, 폐, 뇌 및 식도의 암에서 확인되는 점 미스센스 돌연변이 (point missense mutation) 이다 (Greenblatt, M. et al., Cancer Res. 54 (1994) 4855-4878). p53 돌연변이는 인간 암에서 가장 빈번한 유전자 사건이고 사례 중 50%를 넘게 차지하는 것으로 추정된다. p53 항체의 빈도와 p53 돌연변이의 빈도 사이에 매우 강력한 상관관계가 존재하여 p53 돌연변이가 이들 항체의 출현에 관여한다는 것을 나타낸다 (Soussi, T. Cancer Res. 60 (2000) 1777-1788). 항-p53 항체는 약 96%의 특이성으로 인간 암 환자에서 확인되지만, 이러한 검출 감도는 단지 약 30%이다.
항-p53 항체와 p53 돌연변이의 연관성은, 항-p53 체액성 면역 반응이 p53 단백질의 강력한 면역원성과 연결된 자가-면역 과정에 기인한다는 것을 시사한다.
발암과정에서 p53 돌연변이의 역할이 광범위하게 연구되었고 항-p53 항체는 수많은 암 유형 예컨대 다른 것들 중에서도 직결장암 (CRC), 식도암 및 유방암과 연관된 것으로 확인되었다. 이들 3가지 암 유형은 상당한 건강관리 부담을 의미한다.
남성에서 연간 746,000 건의 사례의 발생률을 갖는 CRC는 전세계적으로 남성에서 3번째로 가장 흔한 암이고, 남성 환자 중 전체 암의 10.0%에 해당된다. CRC는 또한 전세계 여성에서 2번째로 가장 흔한데 매년 614,000 건의 신규 사례가 발생되어, 여성 환자가 앓는 암의 9.2%에 해당된다. 식도암은 암에 의한 사망 원인 중 6번째로 가장 흔하고 남성과 여성에서 456,000 건의 신규 사례가 발생되는 것으로 추정되어 매년 전체 신규 암의 3.2%에 해당된다. 유방암은 여성에서 단연코 가장 빈번한 암이며 2012년 전세계적으로 1.67백만 건의 신규 암 사례가 진단된 것으로 추산되며 여성 환자의 전체 암 중 25%에 해당된다. 전체적으로, 유방암은 전세계에서 2번째로 가장 흔한 암이다. 항-p53 (자가-) 항체와 연관된 암 유형의 높은 발병률로부터 분명한 것은, 항-p53 (자가-) 항체의 검출을 위한 민감하고 신뢰할만한 진단 방법이 필요하다는 것이다.
Soussi, T. (Cancer Research 60 (2000) 1777-1788)가 요약한 바와 같이, 항-p53에 대한 많은 논문들이 공개되었다. 사용된 검출 방법은 상당히 다양한데 ELISA-방법, 면역 침전 방법 및 웨스턴 블롯팅이 가장 두드러진 것들이다. 아마도 항-p53 항체의 검출을 위해 많은 상이한 방법의 사용은 일부 모순된 결과와 항-p53 항체의 진단적 유용성과 관련된 일부 불확실성을 야기시킬 수 있을 것이다.
항-p53 항체의 측정을 위한 최초의 상업적 어세이의 이용가능성은 항-p53 항체에 대한 논문/데이타의 비교가능성을 개선시키는데 상당한 가치를 갖는다. 항-p53 항체의 측정을 위해 가장 빈번하게 사용되는 어세이 중 하나는 MEDICAL & BIOLOGICAL LABORATORIES CO., LTD. (KDX Nagoya, Japan)가 공급하는 "MESACUP Anti-p53 TEST"이다. 인간 혈청에서 항-p53 IgG의 검출을 위한 이러한 효소 면역어세이는 어렵고 예를 들어 각각 특이적 (비특이적 포함) 및 비특이적 결합 둘 모두의 동시 측정을 요구한다. 그리고 나서 특이적 결합의 분획은 특이적 및 비특이적 결합의 총합에서 비특이적 결합에 대해 측정된 값을 빼서 계산해야만 한다.
일반적으로 항체의 IgM 부류의 항체는 보다 점성이 있어서 추가의 복잡한 문제, 예를 들어 추가의 교차 반응성 및 비특이적 결합을 초래한다. 이러한 이유로 대부분의 경우에서 항-p53 검출 방법은 항-인간 IgG 검출 시약, 즉 면역글로불린 M 부류의 것들이 아닌 면역글로불린 G 부류의 인간 (자가-) 항체만의 검출에 의존적이다. Mesacup 어세이가 수행되어야 하는 방식으로 더욱 증명된 바와 같이, 비특이적 결합은 필시 항-p53 항체의 검출에서 사용되는 임의 방법에 대한 핵심 문제일 것이다.
항-p53 (자가-) 항체와 연관된 암 유형의 높은 발생률로부터 분명한 바와 같이, 그리고 그들 항체를 검출하는데 사용되는 종래 방법의 단점으로부터 더욱 명백한 바와 같이, 항-p53 (자가-) 항체의 검출을 위한 민감하고 신뢰할만한 면역어세이 방법에 대한 상당한 요구가 존재한다.
하기 본 명세서에서 개시하는 바와 같은 항-p53 (자가-) 항체를 검출하기 위한 방법이 신속하고, 신뢰할만하며, 특이적이고, 민감하며, 항-p53 (자가-) 항체의 검출에서 새로운 표준을 설정할 잠재력을 갖는다는 것을 놀랍게도 확인하였다.
본 명세서는 샘플에서 p53에 대한 항체 (항-p53 항체)를 검출하기 위한 시험관내 (in vitro) 방법을 보고하며, 이 방법은 a) 분석하려는 샘플을 p53 포획 항원 및 p53 검출 항원과 인큐베이션시켜, p53 포획 항원, 항-p53 항체 및 p53 검출 항원을 포함하는 복합체를 형성시키는 단계, b) (a)에서 형성된 복합체를 미결합된 검출 항원으로부터 분리시키는 단계, c) 단계 (b)에서 수득된 복합체를 그에 포함된 검출 항원을 통해 측정하여, 샘플에 포함된 항-p53 항체를 검출하는 단계를 포함한다. 추가의 보다 상세한 구체예는 예를 들어 본 개시 내용에 따른 방법에서 사용을 위한 p53의 특이적 부분 서열에 관한 것이다.
본 개시 내용은 샘플에서 p53에 대한 항체 (항-p53 항체)를 검출하기 위한 시험관내 방법에 관한 것으로서, 이 방법은 a) 분석하려는 샘플을 p53 포획 항원 및 p53 검출 항원과 인큐베이션시켜, p53 포획 항원, 항-p53 항체 및 p53 검출 항원을 포함하는 복합체를 형성시키는 단계, b) (a)에서 형성된 복합체를 미결합된 검출 항원으로부터 분리시키는 단계, c) 단계 (b)에서 수득된 복합체를 그에 포함된 검출 항원을 통해 측정하여, 샘플에 포함된 항-p53 항체를 검출하는 단계를 포함한다.
다음에서 용어 "항-p53 (자가-) 항체", "항-p53 항체" 또는 "p53 항체"는 상호교환적으로 사용된다. 항-p53 항체는 서열번호 3의 p53 폴리펩티드 또는 이의 부분 서열에 결합하는 항체이다.
상기에 언급된 바와 같이, 본 발명에 따른 방법은 각각 p53 포획 항원 및 p53 검출 항원 둘 모두의 사용을 요구한다. 조사하려는 샘플에 존재하는 p53에 대한 항체는 이들 항원 둘 모두에 결합하여, p53 포획 항원, 항-p53 항체 및 p53 검출 항원을 포함하는 복합체를 형성한다.
용어 "포획 항원"은 당업자에게 익숙하다.
이중 항원 샌드위치 면역 어세이를 수행하기 위해서 에피토프를 적어도 2회 제공하는 것이 요구되며, 적어도 1회는 고체상 (solid phase) 에 대한 결합을 매개하도록 포획 항원 상에, 그리고 적어도 1회는 형성된 샌드위치 복합체 (항원-항체-항원)의 검출이 가능하게 검출 항원 상에 제공된다.
일 구체예에서 p53 포획 항원은 고체상에 결합할 수 있다.
고체상 (고형 지지체)을 제작하기 위한 재료는 당분야에 잘 알려져 있고, 그중에서도, 상업적으로 입수할 수 있는 컬럼 재료, 폴리스티렌 비드, 라텍스 비드, 자성 비드, 콜로이드 금속 입자, 유리 및/또는 실리콘 칩 및 표면, 니트로셀룰로스 스트립, 막, 시트, 듀라사이트 (duracyte), 반응 트레이의 웰 및 벽, 반응 용기의 웰 및 벽, 플라스틱 튜브 등을 포함한다.
일 구체예에서 고체상은 마이크로타이터 플레이트의 웰 및 벽을 의미한다.
일 구체예에서 고체상은 입자의 형태로 존재한다. 입자는 자성 또는 강자성 금속, 합금 또는 조성물이거나 그를 포함하는 미세입자일 수 있다. 추가 구체예에서, 고체상 재료는 특이적 특성을 가질 수 있고 예를 들어 소수성이거나 친수성일 수 있다. 본 발명의 일 구체예에서, 미세입자는 상자성 미세입자이고 본 개시 내용에 따른 측정 방법에서 이러한 입자의 분리는 자기력에 의해 촉진된다. 자력은 용액/현탁액으로부터 상자성 또는 자성 입자를 끌어당기고 용액/현탁액의 액체를 제거시킬 수 있고 입자를 예를 들어 세척할 수 있으면서 바람직하게 그들을 유지시키기 위해 적용된다.
상기에 표시된 바와 같이, 일 구체예에서, p53 포획 항원은 고체상에 결합할 수 있다. 포획 항원을 고체상에 결합할 수 있도록 하기 위해서, 특이적 결합쌍을 적용하는 것이 바람직하다. 이러한 결합 쌍의 한 파트너는 포획 항원에 결합되고 이러한 결합쌍의 나머지 파트너는 고체상에 결합된다.
본 명세서에서 사용시 "결합쌍" 은 높은 친화성, 즉 1 나노몰 친화성으로 또는 더 양호하게 서로에 결합하는 2개의 파트너로 이루어진다. 결합쌍에 대한 구체예는 예를 들어 수용체 및 리간드, 항원 및 항체, 합텐 및 항-합텐 항체로 이루어진 결합쌍, 및 자연적 발생 고친화성 결합쌍을 기반으로 하는 결합쌍이다.
수용체-리간드 결합쌍의 일례는 스테로이드 호르몬 수용체 및 상응하는 스테로이드 호르몬으로 이루어진 쌍이다.
본 발명에 따른 방법에 적합한 결합쌍의 한 가지 추가 유형은 합텐 및 항-합텐 항체 결합쌍이다. 합텐은 100 내지 2000 달톤, 바람직하게 150 내지 1000 달톤의 분자량을 갖는 유기 분자이다. 그 자체로 사용되는 경우 비면역원성인 이러한 소형 분자는 그러나 캐리어 분자와 이의 커플링에 의해 면역원성이 부여될 수 있고 항-합텐 항체는 표준 절차에 따라 생성될 수 있다. 합텐은 스테롤, 담즙산, 성 호르몬, 코르티코이드, 카르데놀리드, 카르데놀리드-글리코시드, 부파디에놀리드, 스테로이드-사포게닌 및 스테로이드 알칼로이드, 카르데놀리드 및 카르데놀리드-글리코시드를 포함하는 군으로부터 선택될 수 있다. 이들 물질 부류의 대표적인 것은 디옥시게닌, 디지톡시게닌, 기톡시게닌, 스트로판티딘, 디곡신, 디지톡신, 디톡신, 스트로판틴이 있다. 다른 적합한 합텐은 예를 들어 플루오레세인이다.
자연적 발생 고친화성 결합쌍을 기반으로 하는 결합쌍의 예에는 바이오틴 또는 바이오틴 유사체 예컨대 아미노바이오틴, 이미노바이오틴 또는 데스티오바이오틴 및 아비딘 또는 스트렙타비딘을 비롯하여 FimG 및 DsF 결합쌍이 있다. 바이오틴-(스트렙트)아비딘 결합쌍이 당 분야에서 잘 알려져 있다. FimG-DsF 결합쌍의 기본 원리는 예를 들어 WO2012/028697에 기술되어 있다.
일 구체예에서, p53 포획 항원은 결합쌍의 제1 파트너에 공유결합적으로 결합되고 상기 결합쌍의 제2 파트너는 고체상에 결합된다.
일 구체예에서, 결합쌍의 제1 파트너는 합텐, 바이오틴 또는 바이오틴 유사체 예컨대 아미노바이오틴, 이미노바이오틴 또는 데스티오바이오틴, DsF 및 수용체에 대한 리간드로부터 선택되고, 상기 결합쌍의 제2 파트너는 항-합텐 항체, 아비딘 또는 스트렙타비딘, FimG 및 리간드-수용체로부터 선택된다.
일 구체예에서, 결합쌍의 제1 파트너는 합텐, 바이오틴 또는 바이오틴 유사체 예컨대 아미노바이오틴, 이미노바이오틴 또는 데스티오바이오틴 및 DsF로부터 선택되고, 상기 결합쌍의 제2 파트너는 항-합텐 항체, 아비딘 또는 스트렙타비딘 및 FimG로부터 선택된다.
일 구체예에서, 결합쌍의 제1 파트너는 바이오틴 또는 바이오틴 유사체, 예컨대 아미노바이오틴, 이미노바이오틴 또는 데스티오바이오틴, 및 DsF로부터 선택되고, 상기 결합쌍의 제2 파트너는 아비딘 또는 스트렙타비딘 및 FimG로부터 선택된다.
일 구체예에서, 결합쌍의 제1 파트너는 바이오틴 또는 바이오틴 유사체 예컨대 아미노바이오틴, 이미노바이오틴 또는 데스티오바이오틴이고, 상기 결합쌍의 제2 파트너는 아비딘 또는 스트렙타비딘으로부터 선택된다.
일 구체예에서, 결합쌍의 제1 파트너는 바이오틴이고 상기 결합쌍의 제2 파트너는 스트렙타비딘이다.
일 구체예에서, 본 발명에 따른 방법은 바이오틴화된 (biotinylated) p53 포획 항원 및 아비딘 또는 스트렙타비딘이 코팅된 고체상을 사용해 실시된다.
그러나, 포획 항원을 고체상에 직접 결합시키는 것도 가능하다. 일 구체예에서, 본 발명에 따른 방법은 고체상에 결합된 p53 포획 항원을 사용해 실시된다.
항체는 적어도 2가이며, 다시 말해서 하나의 '팔 (arm)'로는 포획 항원에 결합하고 다른 팔 (또는 다가 항체의 경우 다른 팔 중 임의의 것)로는 검출 항원에 결합하는 잠재력을 갖는다.
조사하려는 샘플에 존재하는 p53에 대한 항체는 이들 항원 둘 모두에 결합하여, 포획 항원, 항-p53 항체 및 검출 항원을 포함하는 복합체를 형성한다.
당업자는 용어 "검출 항원"에 익숙하다.
용어 검출 항원은 이 항원이 검출될 수 있다는 것을 암시한다. 이러한 검출은 직접적으로 또는 간접적으로 검출가능한 다양한 유형의 표지 (label) 에 의해 수행될 수 있다.
일 구체예에서, 본 개시 내용에 따른 방법은 p53 검출 항원이 직접적으로 검출가능한 표지를 포함하는 방법이다.
용어 검출가능하게 표지됨은 직접적으로 또는 간접적으로 검출할 수 있는 표지를 포함한다.
직접적으로 검출가능한 표지는 검출가능한 신호를 제공하거나 또는 그들이 제2 표지와 상호작용하여, 제1 또는 제2 표지에 의해 제공되는 검출가능한 신호를 변형시키며, 예를 들어 FRET (형광 공명 에너지 전달 (fluorescence resonance energy transfer))를 제공한다. 표지 예컨대 형광 염료 및 발광 (화학발광 (chemiluminescent) 및 전기화학발광 (electrochemiluminescent) 포함) 염료는 검출가능한 신호를 제공하고 일반적으로 표지화에 적용될 수 있다 (Briggs et al "Synthesis of Functionalised Fluorescent Dyes and Their Coupling to Amines and Amino Acids," J. Chem. Soc., Perkin-Trans. 1 (1997) 1051-1058). 일 구체예에서, 검출가능하게 표지됨은 검출가능한 신호를 제공하거나 또는 검출가능한 신호를 제공하도록 유도가능한 표지, 즉 각각 발광 표지, 형광 표지, 화학발광 표지 또는 전기화학발광 표지를 의미한다.
본 개시 내용에 따른 일 구체예에서, 미세입자-기반 피분석물-특이적 결합 어세이는 화학발광 또는 전기화학발광 표지 및 상응하는 광 검출 시스템을 이용한다. 표지에 의해 생성된 빛을 측정하며, 직접적으로 또는 간접적으로 피분석물의 존재 또는 양을 의미한다.
전기화학발광 (ECL) 어세이는 관심 피분석물의 존재 및 농도의 민감하고 정밀한 측정을 제공한다. 이러한 기술은 적절한 화학적 환경에서 전기화학적으로 산화되거나 또는 환원될 때 발광되도록 유도시킬 수 있는 표지 또는 다른 반응물을 이용한다. 이러한 전기화학발광은 특정 시간에 특정 방식으로 작동 전극 상에 부과되는 전압에 의해 촉발된다. 표지에 의해 생성되는 빛을 측정하고, 피분석물의 존재 또는 양을 의미한다. 이러한 ECL 기술의 보다 상세한 설명을 위해서, US 특허 제5,221,605호, US 특허 제5,591,581호, US 특허 제5,597,910호, PCT 공개 특허 출원 WO90/05296, PCT 공개 특허 출원 WO92/14139, PCT 공개 특허 출원 WO90/05301, PCT 공개 특허 출원 WO96/24690, PCT 공개 특허 출원 US95/03190, PCT 특허 US97/16942, PCT 공개 특허 출원 US96/06763, PCT 공개 특허 출원 WO95/08644, PCT 공개 특허 출원 WO96/06946, PCT 공개 특허 출원 WO96/33411, PCT 공개 특허 출원 WO87/06706, PCT 공개 특허 출원 WO96/39534, PCT 공개 특허 출원 WO96/41175, PCT 공개 특허 출원 WO96/40978, PCT/US97/03653 및 US 특허 출원 08/437,348 (U.S. 특허 제5,679,519호)를 참조한다. 또한 Knight 등 (Analyst, 1994, 119: 879-890)에 의한 ECL의 분석적 적용에 관한 1994년도 리뷰 및 그에 인용된 참조 문헌을 참조한다. 일 구체예에서, 본 설명에 따른 방법은 전기화학발광 표지를 사용해 실시한다.
일 구체예에서 직접적으로 검출가능한 표지 (본 개시 내용의 방법에서 검출 항원을 표지하는데 사용됨)는 발광 표지, 형광 표지, 화학발광 표지 또는 전기화학발광 표지로 이루어진 군으로부터 선택된다.
일 구체예에서 직접적으로 검출가능한 표지는 화학발광 또는 전기화학발광 표지이다.
일 구체예에서, 본 개시 내용에 따른 이중-항원 샌드위치 어세이는 포획을 비롯하여 검출 항원 둘 모두로서 서열번호 3의 전장 (full length) p53 폴리펩티드를 사용한다.
p53 폴리펩티드의 p53의 적어도 하나의 중요한 에피토프를 나타내는, 합성 펩티드는 본 개시내용에 따른 방법에서 높은 유용성을 갖는다. 이론에 국한하려는 것은 아니나, 이러한 합성 펩티드 서열은 또한 전장 p53 폴리펩티드에 결합하는 샘플 중 상당한 백분율의 항체가 결합하는 에피토프를 아마도 포함할 것이다. 동시에 항-p53 항체 (예를 들어 체액 샘플에 포함된 바와 같음)가 거의 또는 전혀 결합하지 않는 p53 폴리펩티드의 스트렛치 (stretch) 는 항체, 특히 점성 IgM-부류 항체의 비특이적인 결합에 상당히 기여하는 서열 스트렛치일 것이다.
일 구체예에서 본 발명에 따른 항-p53 항체의 검출을 위한 시험관내 방법은 이중 항원 샌드위치 면역 어세이 방법이고, 여기서 p53 포획 항원 및 p53 검출 항원 둘 모두는 서열번호 1의 펩티드를 포함한다.
일 구체예에서 본 발명에 따른 항-p53 항체의 검출을 위한 시험관내 방법은 이중 항원 샌드위치 면역 어세이 방법이고, 여기서 p53 포획 항원 및 p53 검출 항원 둘 모두는 서열번호 2의 펩티드를 포함한다.
일 구체예에서, 본 발명에 따른 항-p53 항체의 검출을 위한 방법은 이중 항원 샌드위치 면역 어세이 방법이고, 여기서 서열번호 1 및 서열번호 2의 펩티드는 각각 p53 포획 항원 및 p53 검출 항원 둘 모두에 포함된다.
일 구체예에서, 본 발명에 따른 항-p53 항체의 검출을 위한 방법에서 사용되는 p53 폴리펩티드의 관련 부분 서열을 나타내는 펩티드는 각각 서열번호 1 및 서열번호 2로 이루어진 펩티드이다.
일 구체예에서, 본 발명에 따른 항-p53 항체의 검출을 위한 방법은 이중 항원 샌드위치 면역 어세이 방법이고, 여기서 p53 검출 항원은 적어도 2 회 서열번호 1 및 서열번호 2의 펩티드 둘 모두를 포함하는 단일 폴리펩티드이다.
일 구체예에서 본 발명에 따른 항-p53 항체의 검출을 위한 방법은 이중 항원 샌드위치 면역 어세이 방법이고, 여기서 p53 검출 항원은 적어도 하나의 다량체화 도메인, 적어도 하나의 서열번호 1의 폴리펩티드 및 적어도 하나의 서열번호 2의 폴리펩티드를 포함하는 융합 폴리펩티드를 포함하고, 여기서 다량체화 도메인은 FkpA, Skp, SecB, Hsp25, MIP, GroEL, ClpB 및 ClpX로 이루어진 군으로부터 선택되는 원핵생물 또는 진핵생물 샤페론 (chaperone) 이다.
일 구체예에서 본 개시 내용은 적어도 하나의 다량체화 도메인, 적어도 하나의 서열번호 1의 폴리펩티드 및 적어도 하나의 서열번호 2의 폴리펩티드를 포함하는 융합 폴리펩티드에 관한 것이고, 여기서 다량체화 도메인은 FkpA, Skp, SecB, Hsp25, MIP, GroEL, ClpB 및 ClpX로 이루어진 군으로부터 선택되는 원핵생물 또는 진핵생물 샤페론이다.
다량체화 도메인은 바람직하게 융합 폴리펩티드의 N-말단 및/또는 C-말단, 보다 바람직하게 N-말단에 위치된다. 다량체화 도메인은 개별 융합 폴리펩티드 분자의 다량체화를 지원하는 폴리펩티드 서열이고, 여기서 비공유결합적 상호작용에 의해 회합된 복수의 단량체성 서브유닛으로 구성된 다량체가 형성된다. 복합체의 단량체성 서브유닛은 유전자 융합 단백질이고, 여기서 개별 아미노산 잔기는 펩티드 결합에 의해 연결된다. 다량체의 단량체성 서브유닛은 바람직하게 동일하다.
예를 들어, 다량체화 도메인은 이량체화 도메인, 즉 2개 서브유닛의 비공유결합적 회합을 지원하는 도메인, 3개 서브유닛의 비공유결합적 회합을 지원하는 삼량체화 도메인, 사량체화 도메인 또는 심지어 보다 더 높은 다량체화 도메인일 수 있다. 바람직하게, 다량체화 도메인은 이량체화 도메인, 삼량체화 도메인 또는 사량체화 도메인이다.
다량체화 도메인은 원핵생물 또는 진핵생물 샤페론, 바람직하게 ATP 독립적 샤페론으로부터 선택될 수 있다. 다량체화 도메인의 특정 예는 이. 콜라이 (E. coli) 유래의 단백질 FkpA, Skp 및 SecB 또는 다른 원핵생물 유기체 유래의 이의 동족체 (ortholog)이다. FkpA는 이. 콜라이 유래의 ATP-독립적 주변세포질 이량체화 샤페론이다. Skp는 이. 콜라이 유래의 ATP-독립적 주변세포질 삼량체화 샤페론이다. SecB는 이. 콜라이 유래의 ATP-독립적 시토졸 사량체화 샤페론이다. 추가의 적합한 다량체화 도메인은 진핵생물 또는 원핵생물 유기체 유래의 열충격 단백질, 예를 들어 Hsp25, ATP-독립적 진핵생물 시토졸/핵 올리고머성 샤페론이다. 추가의 적합한 다량체화 도메인은 MIP (대식세포 감염성 포텐시에이터 (macrophage infectivity potentiator)), FkpA와 구조적으로 관련된 ATP-독립적 이량체화 샤페론이다. GroEL과 같은 ATP-의존적 샤페론, ClpB 또는 이. 콜라이 유래의 ATP-의존적 시토졸 칠량체화 샤페론, ClpX 또는 이. 콜라이 유래의 ATP-의존적 육량체화 샤페론이 또한 적합하다. 더욱이, 다량체화 도메인은 그들의 다량체 형성 능력을 보유하는, 상기 폴리펩티드의 단편 또는 변이체로부터 선택될 수 있다.
융합 폴리펩티드에서 각각 서열번호 1 및 서열번호 2의 개별 폴리펩티드 서열은 스페이서 서열에 의해 이격될 수 있다. 스페이서 서열은 바람직하게 p53과 이종성인 서열이다. 실질적인 목적을 위해, 스페이서 서열은 항-p53 항체를 결정하기 위한 항원으로서 융합 폴리펩티드의 사용을 적어도 거의 방해하지 않는다면 그 서열로부터 선택된다. 이것은 스페이서 서열이 시험하려는 항체에 대하여 면역학적으로 반응성이지 않다는 의미이다. 예를 들어, 스페이서 서열은 글리신 및/또는 세린 잔기를 포함한다. 일 구체예에서 스페이서는 폴리-글리신 스페이서이다. 스페이서 서열의 길이는 바람직하게 1 내지 10개 아미노산이다.
더욱이, 스페이서 서열은 다량체화 도메인과 서열번호 1의 폴리펩티드 및/또는 서열번호 2의 폴리펩티드 사이에 존재할 수 있다.
이러한 스페이서 서열은 예를 들어 1 내지 100개 아미노산의 길이를 가질 수 있다. 바람직하게, 이러한 스페이서 서열은 상기 기술된 바와 같다.
일 구체예에서 본 개시 내용에 따른 방법은 간접적으로 검출가능한 표지를 포함하는 p53 검출 항원을 사용하여 실시한다.
간접적으로 검출가능하게 표지됨은 예를 들어 합텐을 포함하는 검출 항원 및 직접적으로 검출가능한 표지를 보유하는 항-합텐 항체에 의한 이러한 합텐화된 (haptenylated) 화합물의 검출 또는 효소를 포함하는 검출 항원 및 적절한 염료 기질의 전환을 야기시키는 이의 상응하는 효소적 활성에 의한 이러한 효소의 검출을 의미한다. 다양한 효소-기질 표지가 이용가능하거나 개시되어 있다 (예를 들어 US 4,275,149 참조). 효소는 일반적으로 다양한 기술을 사용해 측정할 수 있는 발색성 기질의 화학적 변경을 촉매작용시킨다. 예를 들어, 효소는 분광광도적으로 측정할 수 있는 기질의 색상 변화를 촉매작용시킬 수 있다. 대안적으로, 효소는 기질의 형광 또는 화학발광을 변경시킬 수 있다. 화학발광 기질은 화학 반응에 의해 전자적으로 여기되고, 이후 측정할 수 있는 (예를 들어, 화학발광측정기 사용) 빛을 발광할 수 있거나, 형광 수용체 (fluorescent acceptor) 에 에너지를 제공한다. 효소적 표지의 예는 루시퍼라제 (예를 들어, 반딧불이 루시퍼라제 및 박테리아 루시퍼라제; US 4,737,456), 루시페린, 2,3-디히드로프탈라진디온, 말레이트 데히드로게나제, 우레아제, 퍼옥시다제 예컨대 홀스래디시 퍼옥시다제 (HRP), 알칼리성 포스파타제 (AP), (3-갈락토시다제, 글루코아밀라제, 리소자임, 사카라이드 옥시다제 (예를 들어, 글루코스 옥시다제, 갈락토스 옥시다제, 및 글루코스-6-포스페이트 데히드로게나제), 복소환 옥시다제 (예컨대 유리카제 및 잔틴 옥시다제), 락토퍼옥시다제, 마이크로퍼옥시다제 등을 포함한다. 폴리펩티드에 효소를 접합시키기 위한 기술은 문헌 [O'Sullivan et al "Methods for the Preparation of Enzyme-Antibody Conjugates for use in Enzyme Immunoassay", in Methods in Enzym. (ed. by J. Langone & IT Van Vunakis), Academic Press, New York, 73 (1981) 147-166]에 기술되어 있다.
효소-기질 조합의 예 (US 4,275,149; US 4,318,980)는 예를 들어, 히드로겐 퍼옥시다제가 염료 전구체 (예를 들어, 오르토페닐렌 디아민 (OPD) 또는 3,3',5,5'-테트라메틸벤지딘 히드로클로라이드 (TMB))를 산화시키는, 기질로서 히드로겐 퍼옥시다제와 홀스래디시 퍼옥시다제 (HRP); 알칼리성 포스파타제(AP)와 발색성 기질로서 파라-니트로페닐 포스페이트; 및 (3-D-갈락토시다제 ((3-D-Gal))와 발색성 기질 (예를 들어, p-니트로 페닐-(3-D-갈락토시다제) 또는 형광발생원 (fluorogenic) 기질 4-메틸엄벨리페릴-3-D-갈락토시다제를 포함한다.
상기에서 언급하고 실시예 부문에서 입증하는 바와 같이, 항-p53 항체는 CRC에서 가장 빈번하게 발견된다. 일 구체예에서 본 발명은 샘플에서 p53에 대한 항체 (항-p53 항체)를 검출하여 CRC를 진단하기 위한 시험관내 방법에 관한 것으로서, 이 방법은 a) 분석하려는 샘플을 p53 포획 항원 및 p53 검출 항원과 인큐베이션시켜, p53 포획 항원, 항-p53 항체 및 p53 검출 항원을 포함하는 복합체를 형성시키는 단계, b) (a)에서 형성된 복합체를 미결합된 검출 항원으로부터 분리시키는 단계, c) 단계 (b)에서 수득된 복합체를 그에 포함된 검출 항원을 통해 측정하는 단계, 및 d) 항-p53 항체가 샘플에서 측정되면 CRC를 진단하는 단계를 포함한다.
액체 샘플이 본 개시 내용에 따른 방법에서 항-p53 항체의 특이적 시험관내 검출을 위한 방법에서 사용될 수 있다. 샘플은 항-p53 항체를 포함하는 것으로 알려져 있거나 항-p53 항체를 포함하는 것으로 의심될 수 있다. 일 구체예에서 본 개시 내용에 따른 방법에서 사용되는 시험관내 진단을 위한 샘플은 전혈, 혈액 혈청, 혈액 혈장, 분비액 (liquor), 소변 또는 타액으로부터 선택되는 체액이다. 일 구체예에서 항-p53 항체를 포함하는 것으로 의심되거나 그를 포함하는 샘플은 혈청, 혈장 또는 분비액이다. 일 구체예에서 항-p53 항체를 포함하는 것으로 의심되거나 그를 포함하는 샘플은 혈청 또는 혈장이다.
하기의 실시예는 본 발명의 이해를 돕기 위해 제공되며, 본 발명의의 진정한 범주는 첨부된 청구항에 기재된다. 본 발명의 사조를 벗어나지 않고 기재된 절차로 변형이 만들어질 수 있다는 것을 이해한다.
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Elecsys 항-p53 어세이의 어세이 원리.
이중 항원 샌드위치 어세이 (double antigen sandwich assay) (DAGS) 형식
=> 샘플에 존재하는 항-p53 자가-항체의 검출은 바이오틴화된 포획 항원 (상자성 비드에 코팅된 스트렙타비딘에 결합) 및 루테늄화된 (ruthenylated) p53 검출 항원을 통해 수행된다.
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실시예 1:
항-p53 자가-항체의 검출을 위해 사용되는 포획 및 검출 항원
다양한 유형의 이중 항원 샌드위치 어세이 (DAGS)가 사용되었다.
마이크로타이터 플레이트에서 효소-연결 면역 흡착 어세이 (ELISA)로서 샘플에 존재하는 항-p53 자가-항체의 검출을 위해 DAGS 어세이를 수행하는 것이 가능하다.
서열번호 1 및 서열번호 2의 합성 펩티드가 각각 유리한 것으로 입증되었다. 이는 쉽고 재현가능하게 합성될 수 있었고 이에 대한 항-p53 항체의 특이적 결합으로 인해 적절한 것으로 보였다.
더 높은 처리량 (through-put) 및 더 높은 재현성을 위해 항-p53 어세이는 Roche Diagnostics (Mannheim, Germany)의 자동화 전기화학발광-기반 분석기 상에서 작동되게 개발되었다.
하나의 어세이 형식에서, 2종의 바이오틴화된 펩티드 (하나는 서열번호 1의 펩티드를 포함하고 다른 하나는 서열번호 2의 펩티드를 포함함) 가 포획 항원으로서 사용되고 이들 펩티드 둘 모두의 루테늄화된 형태는 검출 항원으로서 사용된다.
1.1 포획 항원으로서 사용되는 바이오틴화된 펩티드
상기에 언급된 바와 같이, 서열번호 1 및 서열번호 2의 서열 둘 모두는 각각 바람직하게 항 p53 (자가-) 항체가 결합되는 에피토프를 포함하는 것으로 나타났다. 이러한 서열 + 이의 N-말단에서 3회의 디펩티드 글루탐산 (E)-ß-알라닌 (U) (=EU3)으로 이루어진 링커를 포함하는 합성 펩티드는, 활성화된 바이오틴에 N 말단적으로 커플링되어, 하기에 보다 상세하게 기술되는 Elecsys 방법에서 함께 사용되는 2개 포획 항원을 생성시켰다. 이들 바이오틴화된 포획 항원은 각각 p53(11-35)[Bi(EU)3-11]amid 및 p53(41-60)[Bi(EU)3-41]amid 로 명명하였다.
1.2 검출 항원으로 사용되는 루테늄화된 재조합 융합 단백질
다량체성 검출 항원의 사용에 의해 어세이 감도를 개선시키는 것이 가능하다는 것을 확인하였다. 다량체성 항원의 사용은 저친화성 IgG-자가항체의 결합을 가능하게 하고/하거나 IgM 유형의 자가항체의 결합을 또한 가능하게 한다. 이를 위해 서열번호 1 (p53의 아미노산 11-35) 및 서열번호 2 (p53의 아미노산 41-60)의 p53 펩티드는 Skp, 2회의 서열번호 1 및 서열번호 2 및 옥타 His-태그를 포함하는 재조합 폴리펩티드의 일부로서 이. 콜라이에서 발현되었다.
재조합 p53-구성체의 서열 (서열번호 4)은 하기와 같다:
Figure 112018087804572-pct00001
서열의 밑줄친 부분은 각각 서열번호 1 및 서열번호 2를 나타낸다. 필기체로 표시된 서열 부분은 샤페론 Skp으로부터 유래된 서열에 상응한다. 옥타-His-태그는 p53 검출 항원에서 사용되는 바와 같은 이러한 재조합 폴리펩티드의 C-말단에 존재한다.
서열번호 3의 재조합 폴리펩티드는 당분야에 잘 알려져 있고 예를 들어 EP 1 982 993 B1에 상세하게 기술된 절차에 따라 생성되었다.
루테늄화는 표준 절차에 따라 수행하였다. 루테늄화를 위한 전형적인 프로토콜에서 융합 단백질의 리신 ε-아미노기는, N-히드록시-숙신이미드 활성화된 루테늄 표지로 약 10 mg/mL의 단백질 농도에서 개질되었다. 표지:단백질 몰비율은 표지의 밀도를 위한 요건으로 각각의 융합 단백질에 따라 2:1 내지 7:1로 다양할 수 있다. 반응 완충액은 일반적으로 150 mM 포타슘 포스페이트 (pH 8.0), 50 mM 포타슘 클로라이드, 1 mM EDTA이다. 커플링 또는 표지화 반응은 일반적으로 실온에서 10분 동안 수행되고 완충된 L-리신을 10 mM의 최종 농도로 첨가하여 중지시켰다. 활성화된 표지의 가수분해적 불활성화를 피하기 위해서, 각각의 스톡 용액을 예를 들어, 건조된 DMSO (세코졸브 품질 (seccosolv quality), Merck, Germany)에서 제조하였다. 반응 완충액 중 최대 20%의 DMSO 농도는 본 명세서에 개시된 바와 같은 서열번호 4의 융합 단백질에 의해 충분히 용인된다. 커플링 반응 이후, 미반응된 자유 표지 및 유기 용매는 겔 여과 컬럼 (Superdex 200 HiLoad) 상에서 미정제 단백질 접합체를 통과시켜 제거하였다.
p53-구성체의 샤페론-부분 ("Skp)으로 인해, 단백질은 제어된 리폴딩 및 정제 과정에서 Ni-NTA 컬럼으로부터의 용리 동안 자발적으로 삼량체화된다. 생성된 삼량체는 매우 안정하며 루테늄화 및 추가 처리 동안 이의 배열을 유지한다.
실시예 2:
항-p53 자가-항체의 측정을 위한 Elecsys® 어세이
항-p53 항체의 검출을 위한 Elecsys® 어세이의 어세이 원리
간략하게, 바이오틴화된 포획 항원 (실시예 1.1의 바이오틴화된 펩티드), 샘플 및 루테늄화된 검출 항원 (실시예 1.2의 표지화된 융합 단백질)을 인큐베이션시켜서, 포획 항원 - 항-p53 항체 - 검출 항원의 복합체의 형성을 가능하게 하였다. Elecsys® 면역어세이에서 신호 검출은 전기화학발광을 기반으로 한다. 바이오틴-접합된 포획 항원은 스트렙타비딘-코팅된 자성 비드의 표면 상에 고정되는 반면, 검출 항원은 발광 모이어티로서 복합체화된 루테늄 양이온을 보유한다. 항-p53 항체의 존재에서, 발색성 루테늄 복합체가 고체상에 가교되고, 플래티늄 전극에서 여기 후 620 nm에서 빛을 발광한다. 신호 출력은 임의적 빛 단위이다.
다음의 면역학적 시약을 사용하였다:
Figure 112018087804572-pct00002
각각 상기 주어진 농도로 펩티드 모두를 포함하는 75 ㎕의 포획 항원, 75 ㎕의 검출 항원 및 20 ㎕의 샘플을 9분 동안 인큐베이션시켰다. 자성 Elecsys® 비드 30 ㎕를 첨가하였고, 9분 동안 인큐베이션시켜 포획 항원 - 항-p53 항체 - 검출 항원의 복합체가 흡착되게 하였다.
신호 측정은 표준 절차에 따라서 Elecsys® e601 분석기 상에서 수행하였다.
포획 항원에 사용된 완충액은 다음의 성분들을 포함한다:
Figure 112018087804572-pct00003
검출 항원에 사용된 완충액은 다음의 성분들을 포함한다:
Figure 112018087804572-pct00004
실시예 3:
임상 샘플에서 항-p53 자가-항체의 검출
463명의 환자 유래의 샘플을, 실시예 2에 기술된 바와 같은 항-p53 어세이, 및 MEDICAL & BIOLOGICAL LABORATORIES CO., LTD.(KDX Nagoya, Japan)에서 공급하는 상업적으로 입수할 수 있는 어세이 "MESACUP Anti-p53 TEST"를 사용해 항-p53에 대해서 차례로 분석하였다. 후자는 제조사가 제공하는 지시서에 따라 사용하였다.
Figure 112018087804572-pct00005
상기 표에서 확인할 수 있듯이, 신규한 항-p53 항체 어세이는 경쟁자 어세이와 비교하여 직결장암 환자에서 필적하는 양으로 또는 약간 적게 항-p53 양성 샘플을 검출하였다.
하지만, 놀랍게도 신규하게 개발된 어세이는 p53에 대한 항체와 연관된 것으로 알려지지 않은 질환 엔티티 (entity) 에서 "양성" 신호를 발생시키는 경향이 훨씬 덜하다.
곡선 하 영역 (AUC)은 상업적으로 입수할 수 있는 키트와 비교하여 본원에서 개발된 어세이가 더 양호하다.
아마도 CRC 스크리닝으로부터의 대조군, IBD (감염성 장질환), 골관절염, 류마티스성 관절염, 간경화증, 신부전증 또는 자가면역 질환을 갖는 환자에서 확인된 양성 측정값은 거짓 양성 측정값을 의미할 수 있다. 오직 매우 소수의 거짓 양성 샘플이 새로운 어세이에서 나타나는 반면, 종래 어세이는 매우 흔히 거짓 양성 결과를 초래할 것이다. 분명하게, 상기에서 나타낸 CRC 사례에서 경쟁자 어세이로 확인된 추가의 양성 중 일부는 아마도 상당히 항-p53 경쟁자 어세이에 대해 거짓 양성일 수 있다.
본 명세서에서 개시된 바와 같은 항-p53 항체의 시험관내 검출을 위해 신규하게 개발된 어세이는, 매우 양호한 특이성을 갖는다. 이러한 양호한 특이성은 예를 들어 환자가 항-p53 항체 양성으로서 잘못되게 확인되는 임상적 워크업 (work-up) 이 낮다는 것으로 해석된다.
SEQUENCE LISTING <110> Roche Diagnostics GmbH F. Hoffmann-La Roche AG <120> Detection of anti-p53 antibodies <130> P33437-WO <150> EP16158911.4 <151> 2016-03-07 <160> 4 <170> PatentIn version 3.5 <210> 1 <211> 25 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 1 Glu Pro Pro Leu Ser Gln Glu Thr Phe Ser Asp Leu Trp Lys Leu Leu 1 5 10 15 Pro Glu Asn Asn Val Leu Ser Pro Leu 20 25 <210> 2 <211> 20 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 2 Asp Asp Leu Met Leu Ser Pro Asp Asp Ile Glu Gln Trp Phe Thr Glu 1 5 10 15 Asp Pro Gly Pro 20 <210> 3 <211> 393 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 3 Met Glu Glu Pro Gln Ser Asp Pro Ser Val Glu Pro Pro Leu Ser Gln 1 5 10 15 Glu Thr Phe Ser Asp Leu Trp Lys Leu Leu Pro Glu Asn Asn Val Leu 20 25 30 Ser Pro Leu Pro Ser Gln Ala Met Asp Asp Leu Met Leu Ser Pro Asp 35 40 45 Asp Ile Glu Gln Trp Phe Thr Glu Asp Pro Gly Pro Asp Glu Ala Pro 50 55 60 Arg Met Pro Glu Ala Ala Pro Pro Val Ala Pro Ala Pro Ala Ala Pro 65 70 75 80 Thr Pro Ala Ala Pro Ala Pro Ala Pro Ser Trp Pro Leu Ser Ser Ser 85 90 95 Val Pro Ser Gln Lys Thr Tyr Gln Gly Ser Tyr Gly Phe Arg Leu Gly 100 105 110 Phe Leu His Ser Gly Thr Ala Lys Ser Val Thr Cys Thr Tyr Ser Pro 115 120 125 Ala Leu Asn Lys Met Phe Cys Gln Leu Ala Lys Thr Cys Pro Val Gln 130 135 140 Leu Trp Val Asp Ser Thr Pro Pro Pro Gly Thr Arg Val Arg Ala Met 145 150 155 160 Ala Ile Tyr Lys Gln Ser Gln His Met Thr Glu Val Val Arg Arg Cys 165 170 175 Pro His His Glu Arg Cys Ser Asp Ser Asp Gly Leu Ala Pro Pro Gln 180 185 190 His Leu Ile Arg Val Glu Gly Asn Leu Arg Val Glu Tyr Leu Asp Asp 195 200 205 Arg Asn Thr Phe Arg His Ser Val Val Val Pro Tyr Glu Pro Pro Glu 210 215 220 Val Gly Ser Asp Cys Thr Thr Ile His Tyr Asn Tyr Met Cys Asn Ser 225 230 235 240 Ser Cys Met Gly Gly Met Asn Arg Arg Pro Ile Leu Thr Ile Ile Thr 245 250 255 Leu Glu Asp Ser Ser Gly Asn Leu Leu Gly Arg Asn Ser Phe Glu Val 260 265 270 Arg Val Cys Ala Cys Pro Gly Arg Asp Arg Arg Thr Glu Glu Glu Asn 275 280 285 Leu Arg Lys Lys Gly Glu Pro His His Glu Leu Pro Pro Gly Ser Thr 290 295 300 Lys Arg Ala Leu Pro Asn Asn Thr Ser Ser Ser Pro Gln Pro Lys Lys 305 310 315 320 Lys Pro Leu Asp Gly Glu Tyr Phe Thr Leu Gln Ile Arg Gly Arg Glu 325 330 335 Arg Phe Glu Met Phe Arg Glu Leu Asn Glu Ala Leu Glu Leu Lys Asp 340 345 350 Ala Gln Ala Gly Lys Glu Pro Gly Gly Ser Arg Ala His Ser Ser His 355 360 365 Leu Lys Ser Lys Lys Gly Gln Ser Thr Ser Arg His Lys Lys Leu Met 370 375 380 Phe Lys Thr Glu Gly Pro Asp Ser Asp 385 390 <210> 4 <211> 293 <212> PRT <213> Homo sapiens artificial sequence <400> 4 Met Ala Asp Lys Ile Ala Ile Val Asn Met Gly Ser Leu Phe Gln Gln 1 5 10 15 Val Ala Gln Lys Thr Gly Val Ser Asn Thr Leu Glu Asn Glu Phe Arg 20 25 30 Gly Arg Ala Ser Glu Leu Gln Arg Met Glu Thr Asp Leu Gln Ala Lys 35 40 45 Met Lys Lys Leu Gln Ser Met Lys Ala Gly Ser Asp Arg Thr Lys Leu 50 55 60 Glu Lys Asp Val Met Ala Gln Arg Gln Thr Phe Ala Gln Lys Ala Gln 65 70 75 80 Ala Phe Glu Gln Asp Arg Ala Arg Arg Ser Asn Glu Glu Arg Gly Lys 85 90 95 Leu Val Thr Arg Ile Gln Thr Ala Val Lys Ser Val Ala Asn Ser Gln 100 105 110 Asp Ile Asp Leu Val Val Asp Ala Asn Ala Val Ala Tyr Asn Ser Ser 115 120 125 Asp Val Lys Asp Ile Thr Ala Asp Val Leu Lys Gln Val Lys Gly Gly 130 135 140 Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly 145 150 155 160 Gly Ser Glu Pro Pro Leu Ser Gln Glu Thr Phe Ser Asp Leu Trp Lys 165 170 175 Leu Leu Pro Glu Asn Asn Val Leu Ser Pro Leu Pro Ser Gln Ala Met 180 185 190 Asp Asp Leu Met Leu Ser Pro Asp Asp Ile Glu Gln Trp Phe Thr Glu 195 200 205 Asp Pro Gly Pro Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser 210 215 220 Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Glu Pro Pro Leu Ser Gln Glu Thr 225 230 235 240 Phe Ser Asp Leu Trp Lys Leu Leu Pro Glu Asn Asn Val Leu Ser Pro 245 250 255 Leu Pro Ser Gln Ala Met Asp Asp Leu Met Leu Ser Pro Asp Asp Ile 260 265 270 Glu Gln Trp Phe Thr Glu Asp Pro Gly Pro Gly Gly Ser His His His 275 280 285 His His His His His 290

Claims (16)

  1. 샘플에서 p53에 대한 항체 (항-p53 항체)를 검출하기 위한 시험관내 (in vitro) 방법으로서,
    a) 분석하려는 샘플을 p53 포획 항원 및 p53 검출 항원과 인큐베이션시켜, p53 포획 항원, 항-p53 항체 및 p53 검출 항원을 포함하는 복합체를 형성시키는 단계,
    b) (a)에서 형성된 복합체를 미결합된 검출 항원으로부터 분리시키는 단계,
    c) 단계 (b)에서 수득된 복합체를 그에 포함된 검출 항원을 통해 측정하여, 샘플에 포함된 항-p53 항체를 검출하는 단계
    를 포함하는, 시험관내 방법.
  2. 제1항에 있어서, p53 포획 항원이 고체상 (solid phase) 에 결합할 수 있는, 시험관내 방법.
  3. 제1항 또는 제2항에 있어서, p53 포획 항원이 결합쌍의 제1 파트너에 공유결합적으로 결합하고 상기 결합쌍의 제2 파트너가 고체상에 결합되는, 시험관내 방법.
  4. 제1항 또는 제2항에 있어서, 결합쌍의 제1 파트너가 합텐, 바이오틴 또는 바이오틴 유사체 예컨대 아미노바이오틴, 이미노바이오틴 또는 데스티오바이오틴, DsF 및 수용체에 대한 리간드로부터 선택되고, 상기 결합쌍의 제2 파트너가 항-합텐 항체, 아비딘 또는 스트렙타비딘, FimG DsF, 및 리간드-수용체로부터 선택되는, 시험관내 방법.
  5. 제1항 또는 제2항에 있어서, p53 포획 항원이 바이오틴화 (biotinylated) 되고, 고체상이 아비딘 또는 스트렙타비딘으로 코팅되는, 시험관내 방법.
  6. 제1항 또는 제2항에 있어서, p53 포획 항원이 고체상에 결합되는, 시험관내 방법.
  7. 제1항 또는 제2항에 있어서, p53 검출 항원이 직접적으로 검출가능한 표지를 포함하는, 시험관내 방법.
  8. 제1항 또는 제2항에 있어서, 직접적으로 검출가능한 표지가 발광 표지, 형광 표지, 화학발광 (chemiluminescent) 표지 또는 전기화학발광 (electrochemiluminescent) 표지로 이루어진 군으로부터 선택되는, 시험관내 방법.
  9. 제1항 또는 제2항에 있어서, 직접적으로 검출가능한 표지가 화학발광 또는 전기화학발광 표지인, 시험관내 방법.
  10. 제1항 또는 제2항에 있어서, p53 포획 항원 및 p53 검출 항원 모두가 서열번호 1의 펩티드를 포함하는, 시험관내 방법.
  11. 제1항 또는 제2항에 있어서, p53 포획 항원 및 p53 검출 항원 모두가 서열번호 2의 펩티드를 포함하는, 시험관내 방법.
  12. 제1항 또는 제2항에 있어서, 서열번호 1 및 서열번호 2의 펩티드가 각각 p53 포획 항원 및 p53 검출 항원 모두에 포함되는, 시험관내 방법.
  13. 제1항 또는 제2항에 있어서, p53 검출 항원이 서열번호 1 및 서열번호 2의 펩티드 모두를 적어도 2회 포함하는, 시험관내 방법.
  14. 제1항 또는 제2항에 있어서, 검출 항원이 적어도 하나의 다량체화 도메인, 적어도 하나의 서열번호 1의 폴리펩티드 및 적어도 하나의 서열번호 2의 폴리펩티드를 포함하는 융합 폴리펩티드를 포함하고, 다량체화 도메인이 FkpA, Skp, SecB, Hsp25, MIP, GroEL, ClpB 및 ClpX로 이루어진 군으로부터 선택되는 원핵생물 또는 진핵생물 샤페론 (chaperone) 인, 시험관내 방법.
  15. 제1항 또는 제2항에 있어서, p53 검출 항원이 간접적으로 검출가능한 표지를 포함하는, 시험관내 방법.
  16. 적어도 하나의 다량체화 도메인, 적어도 하나의 서열번호 1의 폴리펩티드 및 적어도 하나의 서열번호 2의 폴리펩티드를 포함하는 융합 폴리펩티드로서, 다량체화 도메인이 FkpA, Skp, SecB, Hsp25, MIP, GroEL, ClpB 및 ClpX로 이루어진 군으로부터 선택되는 원핵생물 또는 진핵생물 샤페론인 융합 폴리펩티드.
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