Nothing Special   »   [go: up one dir, main page]

KR101476458B1 - 프로테아제 스크리닝 방법 및 이에 의해 확인된 프로테아제 - Google Patents

프로테아제 스크리닝 방법 및 이에 의해 확인된 프로테아제 Download PDF

Info

Publication number
KR101476458B1
KR101476458B1 KR20097002442A KR20097002442A KR101476458B1 KR 101476458 B1 KR101476458 B1 KR 101476458B1 KR 20097002442 A KR20097002442 A KR 20097002442A KR 20097002442 A KR20097002442 A KR 20097002442A KR 101476458 B1 KR101476458 B1 KR 101476458B1
Authority
KR
South Korea
Prior art keywords
protease
delete delete
polypeptide
active portion
catalytically active
Prior art date
Application number
KR20097002442A
Other languages
English (en)
Other versions
KR20090031936A (ko
Inventor
에드윈 엘. 매디슨
Original Assignee
카탈리스트 바이오사이언시즈, 인코포레이티드
토레이 파인스 인스티튜트 포 몰레큘라 스터디즈
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by 카탈리스트 바이오사이언시즈, 인코포레이티드, 토레이 파인스 인스티튜트 포 몰레큘라 스터디즈 filed Critical 카탈리스트 바이오사이언시즈, 인코포레이티드
Publication of KR20090031936A publication Critical patent/KR20090031936A/ko
Application granted granted Critical
Publication of KR101476458B1 publication Critical patent/KR101476458B1/ko

Links

Images

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
    • C12N15/1034—Isolating an individual clone by screening libraries
    • C12N15/1037—Screening libraries presented on the surface of microorganisms, e.g. phage display, E. coli display
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P1/00—Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P1/00—Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
    • A61P1/02—Stomatological preparations, e.g. drugs for caries, aphtae, periodontitis
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P1/00—Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
    • A61P1/04—Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system for ulcers, gastritis or reflux esophagitis, e.g. antacids, inhibitors of acid secretion, mucosal protectants
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P11/00—Drugs for disorders of the respiratory system
    • A61P11/06—Antiasthmatics
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P13/00—Drugs for disorders of the urinary system
    • A61P13/12—Drugs for disorders of the urinary system of the kidneys
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P17/00—Drugs for dermatological disorders
    • A61P17/02—Drugs for dermatological disorders for treating wounds, ulcers, burns, scars, keloids, or the like
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P17/00—Drugs for dermatological disorders
    • A61P17/06—Antipsoriatics
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P19/00—Drugs for skeletal disorders
    • A61P19/02—Drugs for skeletal disorders for joint disorders, e.g. arthritis, arthrosis
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P21/00—Drugs for disorders of the muscular or neuromuscular system
    • A61P21/02—Muscle relaxants, e.g. for tetanus or cramps
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P21/00—Drugs for disorders of the muscular or neuromuscular system
    • A61P21/04—Drugs for disorders of the muscular or neuromuscular system for myasthenia gravis
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00—Drugs for disorders of the nervous system
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00—Drugs for disorders of the nervous system
    • A61P25/28—Drugs for disorders of the nervous system for treating neurodegenerative disorders of the central nervous system, e.g. nootropic agents, cognition enhancers, drugs for treating Alzheimer's disease or other forms of dementia
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P27/00—Drugs for disorders of the senses
    • A61P27/02—Ophthalmic agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P29/00—Non-central analgesic, antipyretic or antiinflammatory agents, e.g. antirheumatic agents; Non-steroidal antiinflammatory drugs [NSAID]
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P3/00—Drugs for disorders of the metabolism
    • A61P3/08—Drugs for disorders of the metabolism for glucose homeostasis
    • A61P3/10—Drugs for disorders of the metabolism for glucose homeostasis for hyperglycaemia, e.g. antidiabetics
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/04—Antibacterial agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
    • A61P37/02—Immunomodulators
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
    • A61P37/02—Immunomodulators
    • A61P37/06—Immunosuppressants, e.g. drugs for graft rejection
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P7/00—Drugs for disorders of the blood or the extracellular fluid
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P7/00—Drugs for disorders of the blood or the extracellular fluid
    • A61P7/02—Antithrombotic agents; Anticoagulants; Platelet aggregation inhibitors
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P7/00—Drugs for disorders of the blood or the extracellular fluid
    • A61P7/08—Plasma substitutes; Perfusion solutions; Dialytics or haemodialytics; Drugs for electrolytic or acid-base disorders, e.g. hypovolemic shock
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P9/00—Drugs for disorders of the cardiovascular system
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P9/00—Drugs for disorders of the cardiovascular system
    • A61P9/08—Vasodilators for multiple indications
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P9/00—Drugs for disorders of the cardiovascular system
    • A61P9/10—Drugs for disorders of the cardiovascular system for treating ischaemic or atherosclerotic diseases, e.g. antianginal drugs, coronary vasodilators, drugs for myocardial infarction, retinopathy, cerebrovascula insufficiency, renal arteriosclerosis
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P9/00—Drugs for disorders of the cardiovascular system
    • A61P9/14—Vasoprotectives; Antihaemorrhoidals; Drugs for varicose therapy; Capillary stabilisers
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14—Hydrolases (3)
    • C12N9/48—Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
    • C12N9/50—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14—Hydrolases (3)
    • C12N9/48—Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
    • C12N9/50—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25)
    • C12N9/64—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14—Hydrolases (3)
    • C12N9/48—Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
    • C12N9/50—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25)
    • C12N9/64—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue
    • C12N9/6402—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue from non-mammals
    • C12N9/6405—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue from non-mammals not being snakes
    • C12N9/6408—Serine endopeptidases (3.4.21)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14—Hydrolases (3)
    • C12N9/48—Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
    • C12N9/50—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25)
    • C12N9/64—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue
    • C12N9/6421—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue from mammals
    • C12N9/6424—Serine endopeptidases (3.4.21)
    • C12N9/6456—Plasminogen activators
    • C12N9/6462—Plasminogen activators u-Plasminogen activator (3.4.21.73), i.e. urokinase
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/34—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving hydrolase
    • C12Q1/37—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving hydrolase involving peptidase or proteinase
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Y—ENZYMES
    • C12Y304/00—Hydrolases acting on peptide bonds, i.e. peptidases (3.4)
    • C12Y304/21—Serine endopeptidases (3.4.21)
    • C12Y304/21073—Serine endopeptidases (3.4.21) u-Plasminogen activator (3.4.21.73), i.e. urokinase
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Y—ENZYMES
    • C12Y304/00—Hydrolases acting on peptide bonds, i.e. peptidases (3.4)
    • C12Y304/21—Serine endopeptidases (3.4.21)
    • C12Y304/21109—Matriptase (3.4.21.109)
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
    • G01N33/6803—General methods of protein analysis not limited to specific proteins or families of proteins
    • G01N33/6842—Proteomic analysis of subsets of protein mixtures with reduced complexity, e.g. membrane proteins, phosphoproteins, organelle proteins
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2319/00—Fusion polypeptide
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2319/00—Fusion polypeptide
    • C07K2319/01—Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
    • C07K2319/02—Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif containing a signal sequence
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2319/00—Fusion polypeptide
    • C07K2319/20—Fusion polypeptide containing a tag with affinity for a non-protein ligand
    • C07K2319/21—Fusion polypeptide containing a tag with affinity for a non-protein ligand containing a His-tag
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2319/00—Fusion polypeptide
    • C07K2319/20—Fusion polypeptide containing a tag with affinity for a non-protein ligand
    • C07K2319/23—Fusion polypeptide containing a tag with affinity for a non-protein ligand containing a GST-tag
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2319/00—Fusion polypeptide
    • C07K2319/30—Non-immunoglobulin-derived peptide or protein having an immunoglobulin constant or Fc region, or a fragment thereof, attached thereto
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2319/00—Fusion polypeptide
    • C07K2319/40—Fusion polypeptide containing a tag for immunodetection, or an epitope for immunisation
    • C07K2319/41—Fusion polypeptide containing a tag for immunodetection, or an epitope for immunisation containing a Myc-tag
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2319/00—Fusion polypeptide
    • C07K2319/40—Fusion polypeptide containing a tag for immunodetection, or an epitope for immunisation
    • C07K2319/42—Fusion polypeptide containing a tag for immunodetection, or an epitope for immunisation containing a HA(hemagglutinin)-tag

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
  • Diabetes (AREA)
  • Neurology (AREA)
  • Cardiology (AREA)
  • Heart & Thoracic Surgery (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)

Abstract

본원은 기질 특이성 또는 기타 성질이 변형된 프로테아제를 확인하는 방법을 제공한다. 상기 방법은, 기질의 절단시 안정한 복합체를 형성함에 의해 프로테아제를 포획하는 서핀, 알파 마크로글로불린 또는 p35 계열 단백질 또는 변형된 서핀 및 변형된 p35 계열 구성원 또는 변형된 알파 마크로글로불린과 같은 기질을 프로테아제와 접촉시켜 후보물 및 변형된 프로테아제를 스크리닝하는 것이다. 또한 본원은 변형된 프로테아제를 제공한다.
프로테아제 스크리닝 방법, 프로테아제 포획 폴리펩타이드, 기질 특이성, 변형된 프로테아제, 서핀

Description

프로테아제 스크리닝 방법 및 이에 의해 확인된 프로테아제{Protease screening methods and proteases identified thereby}
관련 출원
본 출원은 에드윈 매디슨(Edwin Madison)에 의해 2006년 7월 5일자로 출원된 미국 가출원 일련번호 제60/818,804호[발명의 명칭: Protease Screening Methods and Proteases Identified Thereby] 및 에드윈 매디슨에 의해 2006년 7월 5일자로 출원된 미국 가출원 일련번호 제60/818,910호[발명의 명칭: Modified Urinary-Plasminogen Activator (u-PA) Proteases]에 대한 우선권을 주장한다. 허용되는 경우, 상기된 출원의 주요 내용은 이의 전문이 본원에 참조로서 인용된다.
본 출원은 미국 가출원 일련번호 제60/818,804 및 미국 가출원 일련번호 제60/818,910호에 대한 우선권을 주장하는, 에드윈 매디슨에 의해 2007년 7월 5일자로 출원된 미국 출원번호 제11/825,627호[발명의 명칭:Protease Screening Methods and Proteases Identified Thereby]와 관련된다.
본 출원은 또한 2003년 10월 2일자로 출원되어 2004년 7월 29일자로 미국 출원번호 제US-2004-0146938호["Methods of Generating and Screening for Proteases with Altered Specificity", J Nguyen, C Thanos, S Waugh-Ruggles, and C Craik]로 공개된 미국 출원 일련번호 제10/677,977호 및 2004년 4월 15일자로 공개된 상 응하는 국제 공개 PCT 출원 번호 WO2004/031733호와 관련되고 이들 출원은 2002년 10월 2일자로 출원된 미국 가출원 일련번호 제60/415,388호에 대한 우선권을 주장한다.
본 출원은 또한 2005년 4월 12일자로 출원되어 2006년 1월 5일자로 미국 특허원 제US-2006-0002916호["Cleavage of VEGF and VEGF Receptor by Wild - Type and Mutant MTSP -1", J Nguyen and S Waugh-Ruggles]로서 공개된 미국 출원 일련번호 제11/104,110호 및 2005년 11월 24일자로 공개된 상응하는 국제 공개 PCT 출원 번호 WO2005/110453와 관련되고 이들 출원은 2004년 4월 12일자로 출원된 미국 가출원 일련번호 제60/561,720호에 대한 우선권을 주장한다.
본 출원은 또한 2005년 4월 12일자로 출원되어 2006년 2월 2일자로 미국 출원 번호 제US-2006-0024289호["Cleavage of VEGF and VEGF Receptor by Wild - Type and Mutant Proteases", J Nguyen and S Waugh-Ruggles]로 공개된 미국 출원 일련번호 제11/104,111호 및 2005년 10월 27일자로 공개된 상응하는 국제 공개 PCT 출원 번호 WO2005/100556과 관련되고 이들 출원은 2004년 4월 12일자로 출원된 미국 가출원 일련번호 제60/561,671호에 대한 우선권을 주장한다.
본 출원은 또한 에드윈 엘. 매디슨에 의해 2005년 10월 21일자로 출원된 미국 가출원 일련번호 제60/729,817호[발명의 명칭: Modified Proteases that Inhibit Complement Activation]와 관련된다. 본 출원은 또한 2006년 10월 20일자로 출원된 미국 출원 일련번호 제11/584,776호["Modified Proteases that Inhibit Complement Activation", Edwin L. Madison, Jack Nguyen, Sandra Waugh Ruggles and Christopher Thanos] 및 2007년 4월 26일자로 공개된 상응하는 국제 공개 PCT 출원 번호 WO2007/047995호와 관련되고 이들 각각의 출원은 미국 가출원 번호 60/729,817호에 대한 우선권을 주장한다.
허용되는 경우, 상기 관련 출원 각각의 주요 내용은 이의 전문이 본원에 참조로서 인용된다.
콤팩트 디스크로 제공된 서열목록의 참조 인용
서열 목록의 콤팩스 디스크(CD-R)의 전자 버젼이 4개의 복사물(복사물 1, 복사물 2, 복사물 3 및 CRF로 표시됨)로 본원에 첨부되어 있고 이의 내용 전문이 본원에 참조로서 인용된다. 2007년 7월 5일자로 제작된 상기 언급된 콤팩트 디스크 각각에 대한 컴퓨터 판독가능한 파일은 동일하고 크기가 1809 킬로바이트이며 이의 명칭은 4902SEQ.PC1.txt이다.
본 출원은 변형된 기질 특이성 또는 기타 성질을 갖는 변형된 프로테아제를 확인하기 위한 방법을 제공한다. 당해 방법은 기질의 절단시 이들을 포획하는 기질과 접촉시킴에 의해 당해 후보물질 및 변형된 프로테아제를 스크리닝한다.
프로테아제는 단백질 분해 효소이다. 프로테아제는 특이적으로 상호작용하 여 표적 단백질을 불활성화시키거나 활성화시킬 수 있기 때문에 치료제로서 사용되어 왔다. 천연 프로테아제는 흔히 최적의 치료제가 아닌데 그 이유는 이들이 생물치료제로서 이들을 적합하게 하는 특이성, 안정성 및/또는 촉매 활성을 나타내지 않기 때문이다(참조: Fernandez-Gacio et al . (2003) Trends in Biotech. 21: 408-414). 중요한 치료제의 성질 중에는 면역원성 부재 또는 감소된 면역원성; 표적 분자에 대한 특이성 및 제한된 부작용이 있다. 천연 프로테아제는 일반적으로 이들 성질중 하나 이상이 결여되어 있다.
개선된 성질을 갖는 프로테아제를 가공하기 위한 시도가 계속되어 왔다. 이들 방법중에는 1) 프로테아제의 구조, 촉매 기전 및 분자 모델링에 대한 정보를 필요로 하는 이상적 디자인; 및 2) 프로테아제에 대한 다양한 돌연변이 레퍼토리의 제조 및 목적하는 특성을 나타내는 당해 돌연변이의 선별에 필요한 과정인 지시된 전개가 포함된다(참조: Bertschinger et al. (2005) in Phage display in Biotech. and Drug Discovery (Sidhu s, ed), pp. 461-491). 전자의 방법과 관련하여, 프로테아제의 구조-기능 관계에 대한 정보 부재는 대부분의 프로테아제에 대한 돌연변이를 이상적으로 디자인하기 위한 능력을 제한한다. 지시된 전개 방법이 사용되었지만 제한적인 성공을 거두었다.
개선된 프로테아제 활성에 대한 스크리닝은 기질 선택성의 상실을 유발하고 그 반대의 경우도 마찬가지이다. 최적의 치료학적 프로테아제는 표적 기질에 대해 고특이성 및 고촉매 효율을 나타내야만 한다. 최적의 특이성 및 활성을 갖는 프로테아제를 선별하는 가용한 방법의 효과가 제한되어 있기 때문에 프로테아제 선별에 대한 대체 방법을 개발할 필요성이 있다. 따라서, 목적하는 기질 특이성 및 활성을 갖는 프로테아제 또는 돌연변이 프로테아제를 선별하는 방법을 제공하는 것이 본 발명의 목적에 포함된다.
개요
본 출원은 목적하거나 예정된 기질 특이성 및 활성을 갖는 프로테아제 또는 돌연변이 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분의 선별 또는 확인을 위한 방법을 제공한다. 특히, 본 출원은 표적 기질 또는 기질들에 대한 기질 특이성 및/또는 활성이 변화되거나 개선되거나 최적화되거나 다르게 변화된 프로테아제를 확인하는 프로테아제 스크리닝 방법을 제공한다. 당해 방법은 예를 들어, 질환 또는 장애의 병인에 관여하는 표적 기질에 대한 기질 특이성 및/또는 활성이 변화된 프로테아제를 스크리닝하는데 사용될 수 있다. 표적 기질에 대한 특이성 및/또는 활성이 변화된, 전형적으로 증가됨으로써 본원에 제공된 방법에서 확인되거나 선별된 프로테아제는 표적 기질이 관여하는 질환 또는 상태의 치료에서 시약 또는 치료제로서 사용하기 위한 후보물질이다. 본원에 제공된 방법을 실시하는데 있어서, 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분의 수거물은 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 접촉시켜 수거물에서 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분이 안정한 복합체를 형성하도록 한다. 몇몇 양태에서, 당해 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 표적 기질, 예를 들어, 질환 또는 장애에 관여하는 표적 기질에 대해 예정된 기질 특이성 및/또는 활성을 갖는 프로테아제에 의해 절단되어 변형된다. 당해 방법은 표적 기질의 절단 서열에 대한 기질 특이성에 대해 복합체를 스크리닝하는 것을 추가로 포함할 수 있다. 당해 예에서, 확인되거나 선별된 프로테아제는 표적 기질에 대해 변화된 활성 및/또는 특이성을 갖는다. 하나의 예에서, 안정한 복합체는 선별된 프로테아제와 프로테아제 포획 폴리펩타이드의 공유 결합에 의해 형성된다. 선별된 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분은 본원에 제공된 방법에서 복합체로부터 확인되거나 선택된다. 본원에 제공된 방법은 수거물의 비복합체화된 프로테아제 구성원으로부터 복합체화된 프로테아제를 분리하는 단계를 추가로 포함할 수 있다. 하나의 예에서, 당해 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 검출 또는 분리를 위해 표지되고 당해 분리는 검출가능한 프로테아제 포획 폴리펩타이드 및 당해 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분을 함유하는 복합체를 포획함으로써 수행된다. 포획은 현탁액, 용액 또는 고형 지지체상에서 수행될 수 있다. 고형 지지체상에서 포획하는 경우, 프로테아제 포획 폴리펩타이드를 고형 지지체에 부착시키고 이것은 프로테아제 포획 폴리펩타이드가 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분과 접촉하기 전, 동안에 또는 후속적으로 수행될 수 있다. 고형 지지체는 예를 들어, 96-웰 플레이트의 웰을 포함할 수 있다. 몇몇 예에서, 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 비오틴으로 표지된다. 다른 예에서, 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 His 태그로 표지될 수 있고 분리는, 이에 제한되지 않지만 황산니켈(NiSO4), 염화코발트(CoCl2), 황산구리(CuSO4) 및 염화아연 (ZnCl2)과 같은 금속 킬레이트제를 사용한 포획으로 수행될 수 있다. 금속 킬레이트제는 예를 들어, 세파로스 비드 또는 자기 비드상과 같은 고형 지지체에 접합될 수 있다.
본원에 제공된 방법에서, 당해 방법은 분리된 복합체에서 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분을 증폭시키는 단계를 추가로 포함할 수 있다. 몇몇 예에서, 분리된 복합체에서 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분은 파지상에 디스플레이되고 증폭은 당해 파지를 숙주 세포에 감염시켜 수행된다. 숙주 세포는 세균, 예를 들어, 이.콜라이(E. coli)를 포함할 수 있다. 세균 세포 배지, 세균 주변세포질, 파지 상청액 또는 정제된 단백질로부터 증폭된 프로테아제는 표적 기질에 대한 특이성 및/또는 활성에 대해 스크리닝될 수 있다. 전형적으로, 표적 기질은 폴리펩타이드 또는 질환 또는 장애의 병인에 관여하는 폴리펩타이드내 절단 서열이다.
본원은 또한 프로테아제 수거물이 변형된 형태를 포함하는 다수의 상이한 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 접촉되도록 하는 다중복합 방법을 제공하고 이때, 프로테아제 포획 폴리펩타이드 각각은 이들이 확인가능하게 검출될 수 있도록 표지된다. 당해 방법에서, 2개 이상의 프로테아제 포획 폴리펩타이드가 확인가능하게 표지되어 하나 이상의 안정한 복합체가 형성될 수 있고 하나 이상의 프로테아제가 확인된다.
본원에 제공된 방법에서, 당해 방법은 또한 프로테아제 선별을 최적화하기 위한 연속 회차의 스크리닝을 포함하고, 이때 프로테아제는 제1회차의 스크리닝 방법에서 이들의 확인 또는 선별 후 증폭되어 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분의 제2 수거물을 생성시킨다. 프로테아제의 제2 수거물은 제1 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 동일하거나 상이한 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 접촉시켜 제2 세 트의 안정한 복합체를 생성시킨다. 제2 세트의 안정한 복합체내 당해 프로테아제는 확인되거나 선별된다.
본원에 제공된 방법에서, 당해 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 서핀(serpin)이고 이러한 서핀은 알파 마크로글로불린 계열의 구성원 또는 p35 계열의 구성원이다. 본원에 제공된 방법에서 사용되는 당해 폴리펩타이드 분자는 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분과 프로테아제 포획 폴리펩타이드의 공유 결합에 의해 안정한 복합체를 형성한다.
본원에 제공된 방법의 하나의 측면에서, 목적하는 기질 특이성을 갖는 프로테아제는 프로테아제 및/또는 프로테아제의 단백질분해 활성 부분의 수거물을 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 접촉시켜 프로테아제 포획 폴리펩타이드의 절단 시 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 프로테아제가 안정한 복합체를 형성함으로써 확인된다. 프로테아제 포획 폴리펩타이드 또는 이의 변형된 형태는 목적하는 기질 특이성을 갖는 프로테아제에 의해 절단되도록, 당해 방법에 사용하기 위해 선택된다. 당해 방법에서, 프로테아제 또는 이의 단백질분해 활성 부분은 목적하는 기질 특이성을 갖는 프로테아제에 대한 선별을 위해 확인된다.
본원에 제공된 방법에 사용되는 프로테아제 수거물은 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분의 임의의 수거물이고 적어도 5, 10, 50, 100, 103, 104, 105 또는 106개 이상의 상이한 구성원, 대략 당해 구성원 또는 당해 구성원과 동일한 구성원을 포함한다. 몇몇 측면에서, 프로테아제는 세린 및/또는 시스테인 프로테아제이다. 본원에 제공된 방법에서, 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분의 수거물은 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 접촉을 위해 디스플레이된다 하나의 예에서, 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분은 고형 지지체, 세포 표면 또는 미생물 표면상에 디스플레이된다. 당해 프로테아제는 효모, 세균, 바이러스, 파지, 핵산, mRNA 분자 또는 리보솜상에 디스플레이될 수 있다. 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분이 미생물상에 디스플레이되는 경우, 당해 미새물은 이.콜라이, 에스.세레비지애(S. cerevisiae) 또는 바이러스, 예를 들어, M13, fd 또는 T7 파지 또는 바쿨로바이러스를 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 본원에 제공된 방법에서, 당해 프로테아제 또는 이의 단백질분해 활성 부분은 파지 디스플레이 라이브러리상에 디스플레이되고 프로테아제 수거물은 프로테아제 파지 디스플레이 라이브러리이다. 몇몇 양태에서, 당해 프로테아제는 예를 들어, 디스플레이에 의해 전장 프로테아제의 단백질분해 활성 부분으로서 당해 수거물에 제공된다. 몇몇 예에서, 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 프로테아제 수거물의 접촉은 균일 혼합물에서 이루어진다.
본 출원은 2개 이상의 상이한 프로테아제 포획 폴리펩타이드가 수거물과 접촉되지만 프로테아제 포획 폴리펩타이드중 하나만이 검출가능하게 표지되는 프로테아제 선별 방법을 제공한다. 검출가능하게 표지되는 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 검출 가능한 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분을 함유하는 안정한 복합체의 포획을 허용한다. 당해 방법의 몇몇 예에서, 검출가능하게 표지되지 않은 하나 이상의 다른 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 반응물중에 검출가능하게 표지된 프로테아제 포획 폴리펩타이드 보다 과량으로 존재 한다. 당해 방법에서, 당해 표지는 형광 표지 또는 에피토프 표지, 예를 들어, Hig 태그와 같은 검출을 위한 임의의 표지이다. 다른 예에서, 검출가능한 표지는 비오틴이다.
본원에 제공된 방법에서 선별되는 프로테아제의 수거물은 임의의 프로테아제 수거물을 포함한다. 몇몇 예에서, 당해 프로테아제는 세린 또는 시스테인 프로테아제이다. 프로테아제의 수거물은 키모트립신 구성원 및 세린 프로테아제의 서브틸리신 계열의 구성원 또는 시스테인 프로테아제의 파파인 계열의 카스파제 기원의구성원인 것들을 포함한다. 당해 프로테아제는 표 7에 제시된 임의의 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분을 포함한다. 몇몇 예에서, 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분은 우로키나제 플라스미노겐 활성화인자(u-PA) 프로테아제, 조직 플라스미노겐 활성화인자(t-PA) 프로테아제 또는 MT-SP1 프로테아제의 수거물이다.
하나의 측면에서, 본원에 제공된 방법에서 사용되는 당해 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 서핀, p35 계열 구성원, 알파-마크로글로불린 계열 구성원 또는 이의 임의의 변형된 형태이다. 본원에 제공된 방법에서 사용되는 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 플라스미노겐 억제제-1(PAI-1), 안티트롬빈(AT3) 또는 알파 2-마크로글로불린 또는 이의 변형된 형태를 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 본원에 제공된 방법에 사용되는 프로테아제 포획 폴리펩타이드의 변형된 형태는 프로테아제 포획 폴리펩타이드의 각각의 부위에서 아미노산 대체, 결실 또는 치환을 함유하는 것들을 포함한다. 몇몇 예에서, 당해 변형은 표적 기질의 절단 서열에 상응하는 임의의 하나 이상의 아미노산 대체이다. 당해 표적 기질은 질환 또는 장애의 병인에 관여하는 임의의 단백질일 수 있다. 표적 기질의 예는 VEGFR, t-PA 절단 서열 또는 보체 단백질을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 예를 들어, 표적 기질은 VEGFR2 또는 보체 단백질 C2를 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 표적 기질의 절단 서열은 서열번호 389, 479 및 498중 임의의 하나에 제시된 것을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 몇몇 측면에서, 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 서핀이고 하나 이상의 아미노산 대체는 서핀 폴리펩타이드의 반응성 부위 루프에 있다. 반응성 부위 루프(RSL)에서 하나 이상의 대체는 P4-P2' 위치중 임의의 하나 이상에서의 대체를 포함한다. 본원에 제공된 방법에 사용되는 당해 서핀의 예는 서열번호 497, 499, 610 및 611중 임의의 하나에 제시되어 있다. 또 다른 예에서, 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 알파 2 마크로글로불린이고 하나 이상의 아미노산 대체는 폴리펩타이드의 베이트(bait) 영역에 있다. 본원의 방법에서 변형된 프로테아제 포획 폴리펩타이드에 대응하여 확인되거나 선별된 프로테아제는 비-표적 기질과 비교하여 표적 기질에 대해 변화된 기질 특이성에 대해 스크리닝되거나 선별될 수 있다. 당해 예에서, 비-표적 기질은 상응하는 주형 프로테아제의 기질을 포함한다. 전형적으로, 확인되거나 선별된 프로테아제의 기질 특이성은 1.5배, 2배, 5배, 10배, 50배, 100배, 200배, 300배, 400배, 500배 이상으로 증가한다.
본원에 제공된 방법은 반복적인 것들을 포함하고 이때 목적하는 기질 특이성을 갖는 프로테아제를 확인하고/하거나 선별하는 방법은 반복되거나 수회 수행된다. 당해 방법에서, 다수의 상이한 프로테아제는 당해 방법의 제1 반복 또는 제1회차에서 확인될 수 있다. 다른 예에서, 다수의 프로테아제는, 제1회차의 반복에 서 선별된 확인된 프로테아제를 기초로 하는 제1 반복 후 생성되고 제조된다. 추가로, 몇몇 양태에서, 제1회차 또는 반복에서 및/또는 연속 회차에서 확인된 선별된 프로테아제의 아미노산 서열을 비교하여 핫 스팟(hot spot)을 확인한다. 핫 스팟은 예를 들어, 당해 방법에 사용되는 변형된 프로테아제 수거물 기원의 야생형 또는 주형 프로테아제와 비교하여, 2, 3, 4 또는 5개 이상의 확인된 프로테아제에 존재하는 것과 같은 다중 회차에서 변형된 좌로서 인지되는 당해 위치이다.
또한 본 출원은 본원의 방법에서 프로테아제 또는 프로테아제들의 확인 후 프로테아제의 제2 수거물을 제조하는 단계(이때, 확인된 프로테아제는 제2 수거물의 구성원(이를 기초로)이 확인된 프로테아제 및 추가의 돌연변이를 갖는 폴리펩타이드를 함유하도록 프로테아제 서열 또는 이의 촉매 활성 부분에서 추가로 돌연변이를 생성시키기 위한 주형으로서 사용된다)에 이어서 제1 프로테아제 또는 프로테아제들을 분리하기 위해 사용되는 프로테아제 포획체와는 동일하거나 상이한 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 제2 수거물을 접촉시키는 단계(이때, 프로테아제 포획체는 목적하는 기질 특이성을 갖는 프로테아제에 의해 절단되도록 변형된다) 및 복합체중의 수거물로부터 프로테아제(들) 또는 프로테아제의 단백질 분해 활성 부분을 확인하는 단계(이에 의해 확인된 프로테아제는 제1 확인된 프로테아제 보다 목적하는 기질에 대해 보다 큰 활성 또는 특이성을 갖는다)를 추가로 제공한다. 제2 수거물은 확인된 주형 프로테아제(들) 또는 프로테아제의 단백질 분해 활성 부분의 아미노산 서열과 비교하여 무작위 또는 초점화된 돌연변이를 함유할 수 있다. 초점화된 돌연변이는 예를 들어, u-PA와 같은 세린 프로테아제에서 키모트립신 번호 매김을 기초로 30번, 73번, 89번 및 155번 위치와 같은 핫 스팟 위치를 포함한다.
당해 방법을 실시하는데 있어서, 안정한 복합체를 형성하기 위한 반응은 하나 이상의 파라미터를 제어함에 의해 조절될 수 있다. 당해 파라미터는 반응속도 또는 반응 정도 또는 반응의 효율을 변화시키는 임의의 파라미터이고 예를 들어, 이에 제한되지 않지만, 반응 시간, 온도, pH, 이온 농도, 라이브러리 농도 및 프로테아제 포획 폴리펩타이드 농도가 있다.
당해 반응은 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 프로테아제 또는 이의 단백질 분해 활성 부분간의 반응의 경쟁인자 존재하에 수행하여 확인된 프로테아제(들) 또는 단백질분해 활성 부분(들)의 선택성을 증진시킬 수 있다. 경쟁인자는 예를 들어, 혈청 또는 혈장을 포함한다. 예를 들어, 사람 혈청 또는 사람 혈장, 세포 또는 조직 추출물, 생물학적 유체, 예를 들어, 뇨 또는 혈액, 프로테아제 포획체의 정제되거나 부분적으로 정제된 야생형 형태(또는 기타 변형된 형태)가 있다. 당해 경쟁인자의 예는 프로테아제 포획 폴리펩타이드의 정제되거나 부분적으로 정제된 야생형 형태 또는 프로테아제 포획 폴리펩타이드의 하나 이상의 특정 변이체이다.
2개 이상의 절단 서열에 대해 특이성/선택성 및/또는 활성을 갖는 프로테아제 또는 이의 단백질분해 활성 부분을 변화시키거나 선별하거나 확인하기 위한 반복적 방법이 제공된다. 당해 방법은 a) 프로테아제 및/또는 프로테아제의 단백질분해 활성 부분의 수거물을 제1 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 접촉시켜, 프로테아제 또는 이의 단배질분해 활성 부분에 의해 프로테아제 포획 폴리펩타이드의 절단시 수거물중의 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분과 함께 프로테아제 포획 폴 리펩타이드를 함유하는 안정한 복합체를 형성시키는 단계(이때, 접촉은 경쟁인자의 존재하에 수행된다); b) 제1 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 복합체를 형성하는 프로테아제 또는 이의 단백질분해 활성 부분을 확인하거나 선별하는 단계; c) 제1 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 복합체를 형성하는 프로테아제 또는 이의 단백질분해 활성 부분을 경쟁인자의 존재하에 제2 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 접촉시키는 단계; 및 d) 제1 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 복합체를 형성하는 프로테아제 또는 이의 단백질분해 활성 부분을 확인하거나 선별하는 단계를 포함한다. 2개의 절단 서열은 하나의 표적 기질에 존재할 수 있거나 2개의 상이한 표적 기질에 존재할 수 있다. 확인되거나 선별되거나 변화된 프로테아제 또는 이의 단백질분해 활성 부분은 하나 또는 2개의 상이한 표적 기질에서 2개 이상의 상이한 절단 서열에 대해 기질 특이성 및/또는 절단 활성을 갖는다. 제1 및 제2 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 동일하거나 상이할 수 있다. 전형적으로, 당해 방법에 사용되는 제1 및 제2 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 상이하고 이의 각각은 상이한 표적 기질에 대해 예정된 기질 특이성을 갖는 프로테아제에 의해 절단되어 변형된다. 당해 방법은 추가로 2개 이상의 인지 서열에 대해 목적하거나 예정된 기질 특이성 및 절단 활성을 갖는 프로테아제가 분리될 때까지 단계 a) 및 b) 또는 a) 내지 d)를 1회 이상 반복하는 것을 포함한다. 기질 특이성 및 절단 활성은 전형적으로 주형 프로테아제와 비교하여 증가된다.
당해 방법에 사용하기 위한 경쟁인자는 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 반응할 수 있는 임의의 것을 포함하고 이는 전형적으로 표적 프로테아제 보다 안정성 이 떨어진다. 경쟁인자는 혈청, 혈장, 사람 혈청 또는 사람 혈장, 세포 또는 조직 추출물, 생물학적 유체, 예를 들어, 뇨 또는 혈액, 프로테아제 포획체의 정제되거나 부분적으로 정제된 야생형 형태 및 프로테아제 포획 폴리펩타이드의 하나 이상의 특이적 변이체를 포함하지만 이에 제한되지 않는다.
또한, 본원은 a) 프로테아제 또는 이의 단백질분해 활성 부분의 수거물을 제1 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 접촉시켜 프로테아제 포획 폴리펩타이드의 절단시 수거물중에서 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 임의의 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분의 공유 복합체를 형성시키는 단계; b) 비복합체화된 프로테아제 포획 폴리펩타이드로부터 복합체화된 프로테아제를 분리하는 단계; c) 복합체화된 프로테아제를 분리하거나 선별하거나 확인하는 단계; d) 선별된 프로테아제를 기준으로 프로테아제 또는 프로테아제의 단백질분해 활성 부분의 제2 수거물을 생성시키는 단계; 및 e) 프로테아제 또는 이의 단백질분해 활성 부분의 제2 수거물을 제1 프로테아제 포획 폴리펩타이드와는 상이한 제2 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 접촉시켜 복합체를 형성하고; 복합체를 분리하고 복합체화된 프로테아제를 분리하거나, 선별하거나 확인함에 의해 단계 a) 내지 c)를 반복하는 단계를 포함하는 프로테아제 선별 방법을 제공한다. 제1 및 제2 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 2개의 상이한 표적 기질 인지 서열을 함유하도록 변형될 수 있고 이에 의해 확인되거나 선별된 프로테아제는 2개 이상의 인지 서열에 대해 특이성 및 높은 절단 활성을 갖는다. 당해 방법은 수회 반복될 수 있다. 당해 방법에서, 프로테아제 또는 이의 단백질분해 활성 부분의 수거물은 경쟁인자의 존재하에 제1 및/또는 제2 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 접촉시킬 수 있다(상기 참조).
본원에 제공된 임의의 프로테아제 선별 방법에서, 수거물은 변형된 프로테아제를 함유할 수 있다. 프로테아제내 변형은 무작위이거나 초점화되거나 폴리펩타이드의 표적 영역에 존재할 수 있다.
또한 본 출원은 프로테아제 및/또는 이의 단백질분해 활성 부분의 수거물 및 하나 이상의 프로테아제 포획 폴리펩타이드를 함유하는 조합물을 제공한다. 당해 성분은 별도로 또는 혼합물로서 제공될 수 있다. 당해 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 서핀중에서 p35 계열 구성원, 알파-마크로글로불린 계열 구성원, 각각의 변형된 형태 및 이의 혼합물을 포함한다.
프로테아제 및/또는 이의 촉매 활성 부분의 수거물은 용액 또는 현탁액 또는 고형상에 제공되거나 다르게 디스플레이될 수 있고, 예를 들어, 고형 지지체(매트릭스 물질)상에 또는 이에 제한되지 않지만 파지 디스플레이 라이브러리와 같은 디스플레이 라이브러리중에 디스플레이될 수 있고, 이때, 구성원은 적어도 프로테아제의 단백질 분해 활성 부분을 디스플레이한다.
조합물을 함유하는 키트가 제공된다. 전형적으로 당해 키트는 팩키징된 성분을 함유하고 임의로 추가의 시약 및 당해 방법을 수행하기 위한 지침서를 함유한다.
또한 본 출원은 키모트립신 번호매김을 기준으로 30, 73, 89 및 155번으로부터 선택된 하나 이상의 잔기를 변형시킴에 의해 u-PA와 같은 세린 프로테아제의 기질 특이성을 변형시키는 방법을 제공한다.
또한 본 출원은 본원의 방법에 의해 확인된 변형된 프로테아제를 제공한다. 본원에 제공된 변형된 프로테아제는 확인된 변형에 의해 변화된 특이성 및/또는 활성을 나타낸다. 당해 선별 방법을 사용하여 확인된 본원에 제공된 임의의 변형체는 야생형 프로테아제, 이의 임의의 대립유전자 변이체 또는 종 변이체 또는 기타 다른 임의의 프로테아제 형태로 제조될 수 있다. 추가로 또한 본 출원은 본원에 방법에서 확인된 변형체가 존재하는 한 야생형 프로테아제 또는 이의 대립유전자 변이체 또는 종 변이체와 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 이상의 서열 동일성을 함유하는 변형된 프로테아제를 제공한다.
당해 프로테아제중에는 키모트립신 번호매김을 기준으로 30, 73, 89 및 155번중에서 선택되는 핫 스팟 위치에서 하나 이상의 돌연변이를 함유하여 기질 특이성이 변화된, 뇨 플라스미노겐 활성화인자(u-PA) 폴리펩타이드와 같은 키모트립신 계열에서 변형된 세린 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 단편을 포함하는 변형된 프로테아제가 있다.
본원에 제공된 것은 또한 질환 또는 장애의 병인에 관여하는 표적 기질에 대해 증가된 특이성 및/또는 활성을 나타내는, 본원의 방법에서 확인된 변형된 뇨 플라스미노겐 활성화인자(u-PA) 프로테아제를 포함한다. 당해 표적 기질은 VEGFR 또는 조직 플라스미노겐 활성화인자(t-PA) 기질을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 따라서, 본원은 t-PA 기질을 절단하는 변형된 세린 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분을 제공한다. 특히, 당해 프로테아제중에는 변형된 뇨 플라스미노겐 활성화인자(u-PA) 폴리펩타이드가 있고 여기서, u-PA 폴리펩타이드 또는 이의 촉매 활 성 부분은 키모트립신 번호매김을 기준으로 21, 24, 30, 39, 61(A), 80, 82, 84, 89, 92, 156, 158, 159 및 187번 위치로부터 선택되는 위치에서 하나 이상의 변형을 포함한다. 또한 본 출원은 F21V, I24L, F30V, F30L, T39A, Y61(A)H, E80G, E82E, E84K, I89V, K92E, K156T, T158A, V159A 및 K187E로부터 선택되는 하나 이상의 변형을 포함하는 당해 변형된 u-PA 폴리펩타이드 또는 이의 촉매 활성 부분을 제공한다. 또한 본 출원은 u-PA 폴리펩타이드 또는 이의 촉매 활성 부분이 F30V/Y61(a)H; F30V/K82E; F30V/K156T; F30V/K82E/V159A; F30V/K82E/T39A/V159A; F30V/K82E/T158A/V159A; F30V/Y61(a)H/K92E; F30V/K82E/V159A/E80G/I89V/K187E 및 F30V/K82E/V159A/E80G/E84K/I89V/K187E로부터 선택되는 2개 이상의 돌연변이를 포함하는 당해 변형된 u-PA 폴리펩타이드를 제공한다.
또한 본 출원은 VEGFR, 특히 VEGFR-2를 절단하는 변형된 세린 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분을 제공한다. 특히, 본 출원은 u-PA 폴리펩타이드 또는 이의 촉매 활성 부분이 키모트립신 번호매김을 기준으로 38, 72, 73, 75, 132, 133, 137, 138, 155, 160 및 217번 위치로부터 선택되는 위치에서 하나 이상의 변형을 포함하여 VEGFR-2 또는 이의 서열에 대한 기질 특이성이 변화된 변형된 뇨 플라스미노겐 활성화인자(u-PA) 및 이의 촉매 활성 부분을 제공한다. 본 출원은 또한 V38D, R72G, L73A, L73P, S75P, F132L, G133D, E137G, I138T, L155P, L155V, L155M, V160A 및 R217C로부터 선택되는 하나 이상의 돌연변이를 포함하는 당해 폴리펩타이드를 제공한다. 당해 폴리펩타이드는 추가로 키모트립신 번호매김을 기준으로 30번 및/또는 89번 위치에서 변형을 포함할 수 있고 예를 들어 당해 변형은 F30I, F30T, F30L, F30V, F30G, F30M 및 I89V로부터 선택된다. 또한 본 출원은 하나 이상의 돌연변이 및 몇몇 경우에 L73A/I89V; L73P; R217C; L155P; S75P/I89V/I138T; E137G; R72G/L155P; G133D; V160A; V38D; F132L/V160A; L73A/I89V/F30T; L73A/I89V/F30L; L73A/I89V/F30V; L73A/I89V/F30G; L73A/I89V/L155V; L73A/I89V/F30M; L73A/I89V/L155M; L73A/I89V/F30L/L155M 및 L73A/I89V/F30G/L155M으로부터 선택되는 2개 이상의 돌연변이를 포함하는 당해 u-PA 폴리펩타이드 또는 이의 촉매 활성 부분을 제공한다.
본 출원은 또한 u-PA 폴리펩타이드 또는 이의 촉매 활성 부분이 F30I, F30T, F30G 및 F30M으로부터 선택되는 하나 이상의 돌연변이를 포함하는 변형된 u-PA 폴리펩타이드를 제공한다.
본 출원은 또한 본원의 방법에 의해 확인된 변형된 MT-SP1 폴리펩타이드를 제공한다. 당해 변형된 폴리펩타이드는 서열번호 253으로 제시된 MT-SP1 폴리펩타이드에서 키모트립신 번호매김을 기준으로 D23E, I41F, I41T, L52M, Y60(g)s, T56K, H71R, F93L, N95K, F97Y, F97L, T98P, F99L, A126T, V129D, P131S, I136T, I136V, H143R, T144I, I154V, N164D, T166A, L171F, P173S, F184(a)L, Q192H, S201I, Q209L, Q221(a)L, R230W, F234L 및 V244G로부터 선택되는 하나 이상의 아미노산 변형을 갖는 임의의 폴리펩타이드를 포함한다. 몇몇 예에서, 당해 변형은 서열번호 505에 제시된 아미노산의 서열을 갖는 MT-SP1의 촉매 활성 부분에 있다. 또 다른 예에서, 당해 변형은 키모트립신 번호매김을 기준으로 서열번호 253에 제시된 MT-SP1 폴리펩타이드, 예를 들어, 서열번호 507 또는 517에 제시된 MT-SP1에 서 C122S의 변형에 상응하는 변형을 추가로 포함하는 MT-SP1 폴리펩타이드에 있다. 특히, 본원에 제공된 변형중에는 I41F, F97Y, L171F 및 V244G로부터 선택되는 임의의 변형이 있다. 본원에 제공된 변형된 MT-SP1 폴리펩타이드는 서열번호 253에 제시된 MT-SP1 폴리펩타이드에서 Q175R 또는 D217V에 상응하는 하나 이상의 변형을 추가로 포함할 수 있다. 당해 변형은 I136T/N164D/T166A/F184(A)L/D217V; I41F; I41F/A126T/V244G; D23E/I41F/T98P/T144I; I41F/L171F/V244G; H143R/Q175R; I41F/L171F; R230W; I41F/I154V/V244G; I141F/L52M/V129D/Q221(A)L; F99L; F97Y/I136V/Q192H/S201I; H71R/P131S/D217V; D217V; T65K/F93L/F97Y/D217V; I41T/P173S/Q209L; F97L/F234L; Q175R; N95K 및 Y60(G)S로부터 선택되는 임의의 변형을 포함한다. 상기 변형된 임의의 MT-SP1 폴리펩타이드는 C2 보체 단백질에 대한 특이성 또는 C2 보체 단백질에 대한 활성중 하나 또는 둘다를 증가시키는 변형을 나타낸다.
또한 본 출원은 변형된 u-PA 폴리펩타이드 또는 변형된 MT-SP1 폴리펩타이드와 같은 변형된 세린 프로테아제를 포함하는 변형된 프로테아제를 포함하는 약제학적 조성물을 제공한다. 당해 약제학적 조성물은 약제학적으로 허용되는 부형제를 포함하고, 전신 투여, 경구 투여, 비강 투여, 폐 투여, 국부 투여 및 국소 투여를 포함하지만 이에 제한되지 않는 임의의 적합한 투여 경로용으로 제형화될 수 있다. 또한 본 출원은 임의의 약제학적 조성물, 조성물 투여 장치 및 임의로 투여 지침서를 포함하는 키트를 제공한다.
u-PA 프로테아제 및 MT-SP1 프로테아제 및 이의 촉매 활성 부분을 포함하는 변형된 프로테아제를 암호화하는 핵산 분자가 제공된다. 또한, 핵산 분자를 포함하는 벡터 및 핵산 분자 또는 벡터를 포함하는 세포가 제공된다.
이에 제한되지 않지만 동맥 혈전증, 정맥 혈전증 및 혈전 색전증, 허혈성 졸중, 후천성 응고 장애, 파종성 혈관내 응고, 세균 감염 및 치은염, 및 t-PA의 투여에 의해 치료되는 신경 장애로부터 선택되는 질환 또는 장애와 같은 질환 또는 장애를 갖는 피검체를 변형된 u-PA 프로테아제 또는 이의 단백질분해 활성 부분을 포함하는 약제학적 조성물 또는 암호화 핵산 분자 또는 세포를 투여하여 치료하는 방법이 제공된다. 당해 방법은 피검체에 핵산 분자, 세포 또는 약제학적 조성물을 투여함에 의해 수행된다.
또한 본 출원은 VEGFR, 특히 VEGFR-2에 의해 매개되는 질환 또는 상태를 갖는 피검체를 치료하는 방법을 제공한다. 당해 질환 및 상태는 암, 혈관신생 질환, 안과 질환, 예를 들어, 황반 변성, 염증 질환 및 당뇨병, 특히 이로부터 유발되는 합병증, 예를 들어, 당뇨 망막병증을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 당해 방법은 비변형된 형태와 비교하여, VEGFR-2에 대해 특히 증가된 기질 특이성을 나타내는 변형된 u-PA 프로테아제를 함유하거나 암호화하는, 핵산 분자 또는 세포 또는 조성물을 투여함에 의해 수행된다. 당해 방법은 예를 들어, 질환이 암인 경우 항암제의 투여와 같이, 임의로 질환 또는 상태의 치료를 위해 또 다른 제제를 투여함을 포함한다.
또한 본 출원은 보체 단백질, 특히 C2에 의해 매개되는 질환 또는 상태를 갖는 피검체를 치료하는 방법을 제공한다. 당해 질환 및 상태는 패혈증, 류마티스 관절염(RA), 막증식성 사구체신염(MPGN), 다발성 경화증(MS), 중증근육무력증(MG), 천식, 염증성 장 질환, 면역 복합체(IC) 매개 급성 염증성 조직 손상, 알츠하이머 질환(AD), 허혈-재관류 손상 및 길랑 바레 증후군을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 몇몇 예에서, 허혈-재관류 손상은 이에 제한되지 않지만 심근 경색(MI), 졸중, 혈관성형술, 관상 동맥 우회 이식술, 심폐 우회(CPB) 및 혈액투석과 같은 이벤트 또는 치료에 의해 유발된다. 당해 방법은 비변형된 형태와 비교하여 C2에 대해 특히 증가된 기질 특이성을 나타내는 변형된 MT-SP1을 함유하거나 암호화하는, 핵산 분자 또는 세포 또는 조성물을 투여함에 의해 수행된다. 다른 예에서, 당해 질환 또는 상태는 피검체 치료로부터 비롯된다. 예를 들어, 당해 치료는 보체 매개 허혈-재관류 손상을 유발할 수 있다. 당해 치료는 혈관성형술 또는 관상 동맥 우회 이식술을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 당해 예에서, 변형된 MT-SP1 프로테아제는 피검체의 치료전에 투여된다. 변형된 MT-SP1 폴리펩타이드는 체액 또는 조직 샘플을 시험관내, 생체외 또는 생체내에서 접촉시킴에 의해 투여될 수 있다.
또한 본 출원은 본원에 제공된 방법에 사용된 변형된 서핀 폴리펩타이드를 제공한다. 당해 변형된 서핀 폴리펩타이드는 표적 기질에 대해 절단 서열을 갖는 위치 P4-P2'에 상응하는 위치에서 이의 반응성 부위 루프에서 변형된다. 전형적으로, 표적 기질은 질환 또는 장애의 병인에 관여한다. 당해 표적 기질은 VEGFR, 보체 단백질 또는 t-PA 기질을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 예를 들어, 표적 기질은 VEGFR2 및 보체 단백질 C2를 포함한다. 본원에 제공된 서핀의 예는 변형된 플라스미노겐-활성화인자 억제제-1(PAI-1) 및 안티트롬빈-3(AT3)이다. 대표적인 변형된 서핀은 서열번호 497, 499, 610 및 611중 임의의 하나에 제시된다.
도 1은 서핀에 의한 프로테아제의 억제 기전 및 안정한 억제된 복합체의 생성을 도시한다. 접촉 후, 서핀 (I)과 프로테아제 (E)는 처음에 비공유 마이켈리스형 복합체(EI)를 형성한다. 이후 P1-P1' 절단 용이한 결합의 절단 및 프로테아제의 촉매 세린의 서핀의 반응성 부위 루프(RSL) 카보닐에 대한 친핵성 공격 및 공유 아실-효소 중간체(EI # )의 형성이 일어난다. 반응속도론적으로 포획된 공유 억제 생성물(EI + )은 RSL 삽입, 프로테아제 이동, 프로테아제 활성 부위 뒤틀림 및 전체 프로테아제 구조의 변형 결과이다. 최소 비-억제 경로는 정상적인 절단 생성물인 서핀(I * ) 및 반응성 프로테아제(E)를 방출시킨다.
개요
A. 정의
B. 프로테아제의 스크리닝 방법
C. 프로테아제 포획 폴리펩타이드
1. 서핀: 구조, 기능 및 발현
2. 프로테아제 촉매, 서핀의 억제 기전 및 아실 효소 중간체의 형성
a. 대표적인 서핀
i. PAI-1
ii. 안티트롬빈 (AT3)
3. 기타 프로테아제 포획 폴리펩타이드
a. p35
b. 알파 마크로글로불린(aM)
4. 프로테아제 포획 폴리펩타이드 경쟁인자
5. 변이 프로테아제 포획 폴리펩타이드
D. 프로테아제
1. 후보 프로테아제
a. 프로테아제 부류
i. 세린 프로테아제
(a) 우로키나제형 플라스미노겐 활성화인자(u-PA)
(b) 조직 플라스미노겐 활성화인자 (t-PA)
(c) MT-SP1
ii. 시스테인 프로테아제
E. 스크리닝을 위한 변형된 프로테아제 및 수거물
1. 변이 프로테아제의 생성
a. 무작위 돌연변이유발
b. 초점화된 돌연변이유발
2. 변이 프로테아제의 키메라 형태
3. 조합 라이브러리 및 기타 라이브러리
a. 파지 디스플레이 라이브러리
b. 세포 표면 디스플레이 라이브러리
c. 기타 디스플레이 라이브러리
F. 선별된 프로테아제의 접촉, 분리 및 확인 방법
1. 반복적 스크리닝
2. 대표적인 선별된 프로테아제
G. 프로테아제 활성 및 특이성 평가 방법
H. 프로테아제 포획 폴리펩타이드(즉, 서핀) 또는 이의 변이체 또는 프로테아제/변형된 프로테아제를 암호화하는 핵산의 제조 방법
1. 벡터 및 세포
2. 발현
a. 원핵생물 세포
b. 효모 세포
c. 곤충 세포
d. 포유동물 세포
e. 식물
3. 정제 기술
4. 융합 단백질
5. 뉴클레오타이드 서열
I. 선별된 프로테아제 폴리펩타이드의 제조, 제형 및 투여
1. 조성물 및 전달
2. 선별된 프로테아제의 생체내 발현 및 유전자 치료
a. 핵산의 전달
i. 벡터 - 에피좀 및 통합
ii. 인공 염색체 및 기타 비-바이러스 벡터 전달 방법
iii. 리포좀 및 기타 캡슐화된 형태 및 핵산 함유 세포의 투여
b. 시험관내 및 생체외 전달
c. 전신, 국부 및 국소 전달
2. 병용 치료
3. 제품 및 키트
J. 선별된 프로테아제 폴리펩타이드를 사용한 대표적인 치료 방법
1. tPA 표적을 절단하는 선별된 uPA 폴리펩타이드에 대한 대표적인 치료 방법
a. 혈전 질환 및 상태
i. 동맥 혈전증
ii. 정맥 혈전증 및 혈전 색전증
(a) 허혈성 졸중
iii. 후천성 응고 질환
(a) 파종성 혈관내 응고(DIC)
(b) 세균 감염 및 치주염
b. 기타 tPA 표적 관련 상태
c. 진단 방법
2. VEGF 또는 VEGFR 표적을 절단하는 선별된 프로테아제 폴리펩타이드에 대한 대표적인 치료 방법
a. 혈관신생, 암, 및 기타 세포 주기 의존성 질환 또는 상태
b. VEGF 또는 VEGFR을 절단하는 선별된 프로테아제를 사용한 병용 치료
3. 보체 단백질 표적을 절단하는 선별된 MT-SP1 폴리펩타이드에 대한 대표적인 치료 방법
a. 면역 매개 염증성 질환
b. 신경퇴행성 질환
c. 심혈관 질환
K. 실시예
A. 정의
다른 정의가 없는 한, 본 명세서에 사용된 모든 기술 용어 및 과학 용어는 본 발명이 속하는 기술분야의 당업자가 일반적으로 이해하고 있는 것과 의미가 동일하다. 본 명세서 전반에 언급된 모든 특허, 특허출원, 공개출원 및 문헌, Genbank 서열, 데이터베이스, 웹사이트 및 다른 공개자료들은 다른 언급이 없는 한, 본 발명에 전문이 참고인용된 것이다. 본 명세서에서 용어에 대한 정의가 복수개인 경우에는, 이 섹션에 제시된 정의가 우세하다. URL 또는 다른 이와 같은 식별자 또는 주소가 참고되는 경우에, 이러한 식별자는 변할 수 있고, 인터넷 상의 특정 정보는 변화할 수 있지만, 인터넷 조사를 통해 동등한 정보를 얻을 수 있다. 이러한 설명은 그러한 정보의 입수용이성 및 공개 보급을 증명한다.
본원에 사용된 바와 같이, "프로테아제 포획체" 또는 "프로테아제 포획 폴리펩타이드"는 프로테아제에 의해 절단되고 절단시 프로테아제와 안정한 복합체를 형성하여 프로테아제가 실질적인 전이 상태를 통해 효소 복합체를 형성하여 프로테아제의 활성을 억제하고 이를 포획하는 기질을 언급한다. 따라서, 프로테아제 포획체는 프로테아제의 억제제이다. 프로테아제 포획체는 프로테아제에 의해 절단되어 절단시 안정한 복합체가 형성되도록 하는 아미노산 잔기를 포함하는 폴리펩타이드 또는 분자이다. 당해 복합체는 충분히 안정하여 미반응된 포획으로부터 또는 프로테아제와 덜 안정적인 상호작용을 하는 포획으로부터 복합체의 분리를 가능하게 한다. 프로테아제 포획체는 프로테아제에 의해 절단되어 절단시 프로테아제와 복합체를 형성하여 미반응된 포획으로부터 반응된 프로테아제 또는 복합체의 분리를 가능하게 하는 합성, 변형 또는 천연의 임의의 분자를 포함한다. 당해 프로테아제 포획체의 예는 서핀, 변형된 서핀, 서핀과 유사한 기전을 나타내는 분자, 예를 들어, p35 및 프로테아제에 의해 절단되어 예를 들어, 알파 2 마크로글로불린과 같은 안정한 복합체로서 프로테아제를 포획하는 임의의 기타 분자이다. 프로테아제 포획체로서, 프로테아제에 의해 절단되어 절단 시 프로테아제 또는 이의 단백질 분해 활성 부분과 안정한 복합체를 형성하는 합성 폴리펩타이드(또는 이의 단백질 분해 활성 부분)가 포함된다.
본원에 사용된 바와 같이, 서핀은 프로테아제에 의해 반응 부위가 절단된 후 안정한 아실 효소 중간체를 형성하고 안정한 공유 복합체중에 프로테아제를 포획하여 프로테아제를 억제하는 구조적으로 관련된 단백질 그룹을 언급한다. 서핀은, 서핀 분자가 안정한 공유 복합체를 형성하여 프로테아제를 억제하는 한 대립유전자 및 종 변이체를 포함한다. 서핀은 또한 최소한 프로테아제의 억제 및 프로테아제와의 안정한 공유 복합체의 형성을 촉진하기에 충분한 적어도 반응성 부위 루프(RSL) 부분을 포함하는 전장 서핀 폴리펩타이드의 아미노산의 절단되거나 연속적인 단편들을 포함한다. 대표적인 서핀은 표 2에 제시되고/되거나 서열번호 1 내지 38중 어느 하나에 제시된 아미노산 서열, 이의 대립유전자 변이체 또는 절단된 부분을 갖는다.
본원에 사용된 바와 같이, "돌연변이체" 또는 "변이체"는 아미노산 변형, 특히, 서핀의 반응성 부위 루프에서의 변형을 포함하는 서핀을 언급한다. 당해 변형은 Pn-P15-P14-P13...P4-P3-P2-P1-P1'-P2'-P3'...Pn'- 위치에 상응하는 하나 이상의 아미노산의 대체, 결실 또는 치환일 수 있다. 전형적으로, 서핀은 야생형 서핀과 비교하여 반응성 부위 루프에서 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9개 또는 10개 이상의 아미노산 위치에서 아미노산 대체를 포함한다. 가장 일반적으로 당해 대체는 위치 P4-P2'에 상응하는 하나 이상의 아미노산에서 일어난다. 예를 들어, 서열번호 11에 제시된 대표적인 PAI-1 서핀에 대해, 서열번호 11에서 아미노산 위치 366 내지 370번에 상응하는 P4-P1' 위치(VSARM)가 변형될 수 있다. 실시예 1은 VSARM 아미노산 잔기의 RRVRM 또는 PFGRS로의 변형을 기재하고 있다.
본원에 사용된 바와 같이, "절단 용이한 결합"은 프로테아제에 의해 절단되는 폴리펩타이드내 결합을 언급하고 기질의 절단 서열에서 P1-P1' 위치 사이에 형성되는 결합을 나타낸다.
본원에 사용된 바와 같이, 반응성 부위는 프로테아제에 의해 절단되는 표적 기질의 서열 부분을 언급한다. 전형적으로 반응성 부위는 P1-P1' 절단 용이한 결합 서열을 포함한다.
본원에 사용된 바와 같이, 반응성 부위 루프(RSL; 또한 반응성 중심 루프로 호칭됨, RCL)는 프로테아제 인지 부위로서 작용하고 일반적으로 프로테아제 특이성에 대한 유일하거나 주요 결정인자를 함유하는 서핀 분자내 아미노산의 서열(전형적으로 17개 내지 22개의 연속 아미노산)을 언급한다. RSL 서열의 절단 및 이의 형태 변화는 안정한 공유 복합체에서 서핀 분자에 의한 프로테아제의 포획에 관여한다. 본원의 목적을 위해 서핀의 RSL 루프에서 임의의 하나 이상의 아미노산은 목적하는 표적 단백질에서 절단 서열에 상응하도록 변형될 수 있다. 당해 변형된 서핀 또는 변이 RSL 서열을 함유하는 부분을 사용하여 기질 특이성이 변형된 프로테아제를 선별할 수 있다.
본원에 사용된 바와 같이, 분할은 이에 의해 안정한 서핀-프로테아제 복합체와 절단된 서핀을 분할하는 공정을 언급한다. 서핀에서 분할시키는 이유는 서핀 표면을 거쳐 절단된 반응성 부위 루프의 대형 전위로부터 비롯되는 억제 경로의 성질 때문이다. 프로테아제가 억제된 위치를 수용하기 전에 해리(즉, 효소-서핀 복합체의 탈아실화)할 시간을 갖는다면 분할이 발생한다. 따라서 소정의 서핀프로테아제 상호작용의 결과는 억제(k 4)와 기질 (k 5) 경로(도 1에 도시된 바와 같은)간의 분할 비율에 의존하고 이는 억제의 화학양론(SI = 1 + k 5/k 4)으로 나타내고; 우수한 억제제는 서핀 분자의 대부분이 복합체 형성으로 분할하고 k 5/k 4이 0에 근접하기 때문에 1의 값을 갖는다. 그러나, RSL 루프가 충분히 신속하게 프로테아제로 삽입되지 않는 경우 분할이 발생하고 당해 반응은 직접 절단된 생성물로 진행한다.
본원에 사용된 바와 같이, 촉매 효율 또는 kcat/km은 프로테아제가 기질을 절단하는 효율에 대한 측정값이고 당업자에게 널리 공지된 일정한 상태 조건하에서 측정된다.
본원에 사용된 바와 같이, 억제의 제2차 속도 상수는 프로테아제와 억제제의 상호작용에 대한 속도 상수를 언급한다. 일반적으로 프로테아제와 억제제(예를 들어, 프로테아제 포획체, 예를 들어, 서핀)의 상호작용은 억제제 및 프로테아제 반응물 각각의 농도의 생성물에 비례하는 제2차 반응이다. 단단한 결합 또는 비가역적 억제제 또는 프로테아제 포획체에 의한 프로테아제의 억제에 대한 제2차 속도 상수는 효소 농도와 억제제 농도를 곱하였을때 특정 억제제에 의해 효소가 불활성화되는 속도를 산출하는 상수이다. 각각의 프로테아제 포획체와 효소 쌍에 대한 속도 상수는 유일하게 이들의 상호작용을 반영한다. 제2차 반응으로서, 제2차 반응 속도로의 증가는 변형된 선별된 프로테아제와 억제제간의 상호작용이 비변형된 프로테아제와 억제제의 상호작용과 비교하여 보다 신속함을 의미한다. 따라서, 제2차 속도 상수의 변화는 반응의 성분들, 즉 프로테아제 및/또는 억제제간의 상호작용의 변화를 반영한다. 프로테아제를 스크리닝하는 경우 증가된 제2차 속도 상수는 프로테아제에서 목적하는 선택된 변형을 반영할 수 있다.
본원에 사용된 바와 같이, 아실 효소 중간체는 세린 프로테아제의 촉매 중심에서 필수 세린(전형적으로, 키모트립신 번호매김을 기준으로 Ser195)과 기질간의 촉매의 제1 단계 동안에 형성되는 공유 중간체를 언급한다. 당해 반응은 다음과 같이 진행한다: 당해 세린 OH는 기질의 P1 위치에서 카보닐 탄소를 공격하고 히스티틴의 질소는 세린의 OH로부터 수소를 수용하고 카보닐 산소의 이중 결합 기원의 전자쌍은 산소로 이동한다. 이로써 음전하 사면체의 중간체가 생성된다. 현재, 기질의 펩타이드 결합에서 질소와 탄소를 연결하는 결합은 파괴된다. 이러한 결합을 생성하는 공유 전자는 이동하여 히스티딘의 수소를 공격하고 이로써 당해 연결을 파괴한다. 이전에 카보닐 산소 이중 결합으로부터 이동된 전자는 음전하 산소로부터 역 이동하여 결합을 생성하고 공유 아실 효소 중간체를 형성한다. 아실 효소 중간체는 물에 의해 가수분해되어 탈아실화되고 절단된 기질과 유리 효소를 형성한다.
본원에 사용된 바와 같이, 프로테아제의 수거물은 10개 이상의 상이한 프로테아제 및/또는 이의 단백질분해 활성 부분을 함유하고 일반적으로 50, 100, 500, 1000, 104 또는 105개 이상의 구성원을 함유하는 수거물을 언급한다. 당해 수거물은 전형적으로 기질 특이성에 대해 스크리닝될 프로테아제(또는 이의 단백질분해 활성 부분)를 함유한다. 당해 수거물에는 천연의 프로테아제(또는 이의 단백질분해 활성 부분) 및/또는 변형된 프로테아제(또는 이의 단백질분해 활성 부분)이 포함된다. 당해 변형은 프로테아제 길이에 따른 무작위 돌연변이 및/또는 표적화되거나 선별된 영역에서의 변형(즉, 초점화된 돌연변이)를 포함한다. 당해 변형은 조합적일 수 있고 특정 위치 또는 모든 위치 또는 이의 서브세트에서 모든 아미노산의 치환에 의한 모든 변경을 포함할 수 있다. 당해 수거물은 전장의 프로테아제 또는 유일하게 프로테아제 도메인을 포함하는 이보다 짧은 프로테아제를 포함할 수 있다. 당해 프로테아제는 세린 프로테아제 및 시스테인 프로테아제와 같은 임의의 프로테아제를 포함할 수 있다. 수거물 및 특정 수거물의 크기는 사용자에 의해 결정된다. 다른 양태에서, 당해 수거물은 2개 프로테아제 정도로 적은 프로테아제를 함유할 수 있다.
본원에 사용된 바와 같이, "조합 수거물" 또는 "조합 라이브러리"는 출발 주형 프로테아제 폴리펩타이드 서열과 관련하여 이의 서열에서 독특하고 다양한 아미노산 돌연변이를 갖는 프로테아제 폴리펩타이드의 수거물을 언급한다. 당해 수거물에 나타난 돌연변이는 폴리펩타이드 서열 전반에 걸쳐 존재할 수 있거나 폴리펩타이드 서열의 특정 영역 또는 영역들에 존재할 수 있다. 당해 돌연변이는 무작위로 생성될 수 있거나 구조적 또는 기능적 정보를 토대로 실험적으로 또는 이상적으로 디자인된 표적화된 돌연변이일 수 있다.
본원에 사용된 바와 같이, "주형 프로테아제"는 이의 돌연변이유발을 위해 사용되는 아미노산의 서열을 갖는 프로테아제를 언급한다. 주형 프로테아제는 야생형 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분의 서열일 수 있거나 이것은 변이 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분의 서열일 수 있고 이에 대해 추가의 돌연변이가 생성된다. 예를 들어, 본원의 선별 방법에서 확인된 돌연변이 프로테아제는 후속적인 선별 회차에서 사용될 추가의 돌연변이 유발을 위한 출발 주형으로서 사용될 수 있다.
본원에 사용된 바와 같이, 무작위 돌연변이는 돌연변이에 대한 고려 또는 편견 없이 폴리펩타이드 서열 전반에 걸친 하나 이상의 아미노산 변화의 도입을 언급한다. 무작위 돌연변이 유발은 당업자에게 공지된 다양한 기술에 의해 촉진될 수 있고 이는 예를 들어, UV 조사, 화학적 방법 및 PCR 방법(예를 들어, 오류-빈발 PCR)을 포함한다.
본원에 사용된 바와 같이, 초점화된 돌연변이는 폴리펩타이드의 특정 영역(또는 영역들) 또는 특정 위치(또는 위치들)에서 하나 이상의 아미노산 변화를 언급한다. 예를 들어, 프로테아제의 특이성 결합 포켓에서 아미노산의 표적화된 돌연변이가 생성될 수 있다. 초점화된 돌연변이 유발은 예를 들어, 당업계에 공지된 표준 재조합 기술을 사용한 부위 지시된 돌연변이 유발 또는 다중 부위 지시된 돌연변이 유발에 의해 수행될 수 있다.
본원에 사용된 바와 같이, 프로테아제 포획체와 프로테아제 또는 이의 단백질분해 활성 부분간의 안정한 복합체는 프로테아제 포획체와 복합체를 형성하지 않는 프로테아제(즉, 비복합체화된 프로테아제)로부터 분리되기에 충분히 안정한 복합체를 언급한다. 당해 복합체는 공유, 이온 및 소수성 상호작용을 포함하는 임의의 안정한 상호작용을 통해 형성될 수 있고 분리를 위한 복합체를 분리하기에 충분한 시간 동안 복합체화된 상태로 유지하는 반응 조건하에서 충분히 안정하다. 전형적으로 당해 상호작용, 예를 들어, 서핀과 절단된 프로테아제간의 상호작용은 공유 결합이다.
본원에 사용된 바와 같이, "핫 스팟"은 목적하는 새로운 기질 서열에 대해 개선된 활성 및/또는 선택성을 나타내는 프로테아제 선별로부터 비롯되는 다수의 변이체에서 돌연변이된 위치를 언급한다. 하나 이상의 "핫 스팟"은 프로테아제 선별 동안에 확인될 수 있다. 따라서, 당해 위치는 프로테아제에 대한 특이성 및/또는 선택성 결정요소이고 이로써 기질 특이성에 기여하고 또한 프로테아제 계열, 예를 들어, 세린 프로테아제 계열 또는 특정 프로테아제 계열의 하나 이상의 구성원에서 상응하는 위치(키모트립신 번호매김을 기준으로) 전반에 걸쳐 광범위 특이성 및/또는 선택성 결정요소로서 존재할 수 있다.
본원에 사용된 바와 같이, 기질 특이성과 관련된 목적하는 특이성은 미리 결정되거나 미리 선별되거나 달리 표적화된 기질에 대한 절단 특이성을 언급한다.
본원에 사용된 바와 같이, "선별하다" 또는 이의 문법적 변형어구는 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 복합체화되는 프로테아제를 선별 또는 선택하는 것을 언급한다. 따라서, 본원의 목적을 위해 "선별하다"는 프로테아제 포획 폴리펩타이드와의 안정한 복합체에서 이의 연합을 기초로하여 프로테아제를 분리해내는 것을 언급한다. 일반적으로, 선별은 공유 복합체의 포획에 의해 촉진될 수 있고 경우에 따라 당해 프로테아제는 분리될 수 있다. 예를 들어, 당해 선별은 예를 들어, 미리 결정된 마커, 태그 또는 기타 검출가능한 잔기를 사용하여 당해 프로테아제를 표지화하여 안정한 복합체내 이의 연합을 근거로 프로테아제를 확인함에 의해 촉진될 수 있다.
본원에 사용된 바와 같이, "확인하다" 및 이의 문법적 변형어구는 안정한 복합체에서 프로테아제의 인지 또는 확인을 언급한다. 전형적으로, 본원의 방법에서, 당해 프로테아제는 프로테아제 포획 폴리펩타이드와의 안정한 복합체에서 이의 연합에 의해 확인되고 이것은 예를 들어, 복합체내 결합된 프로테아제의 증폭(즉, 적정한 숙주 세포내에서의 증가) 후 DNA 서열분석에 의해 성취될 수 있다.
본원에 사용된 바와 같이, "검출 또는 분리를 위해 표지된"은 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 같은 분자가 형광단과 같은 검출가능한 표지와 연합되어 있거나 예를 들어, 정제 또는 격리 또는 분리를 위해 태그 또는 기타 잔기와 연합된 것을 의미한다. "검출가능하게 표지된"은 검출 또는 분리를 위해 표지화되는 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 같은 분자를 언급한다.
본원에 사용된 바와 같이, 프로테아제 또는 프로테아제의 단백질 분해 활성 부분의 증폭에 대한 언급은 프로테아제 또는 촉매 활성 부분이 예를 들어, 완전한 격리 및 클로닝 및 발현을 통해 증가되거나 프로테아제 또는 단백질 분해 활성 부분이 미생물상에 디스플레이되고 미생물이 적정한 숙주로 도입되어 보다 많이 디스플레이되는 프로테아제 또는 단백질분해 활성 부분이 생성되도록 증식시키고 배양함을 의미한다.
본원에 사용된 바와 같이, 반응 혼합물과 관련된 균질성은 반응물이 용액 또는 현탁액을 포함하는 혼합물로서 액체 상에 존재함을 의미한다.
본원에 사용된 바와 같이, 프로테아제 또는 프로테아제의 단백질분해 활성 부분의 수거물이 특정 프로테아제를 기준으로 한다는 인용은 당해 수거물이, 예를들어, 무작위 또는 지시된 돌연변이 유발 또는 이상적 디자인 또는 기타 변형 계획 또는 프로토콜에 의해 특정 프로테아제로부터 유래되어 수거물이 생성됨을 의미한다.
본원에 사용된 바와 같이, t-PA의 투여에 의해 치료되는 질환 또는 상태는 이를 위해 당업자가 t-PA를 투여하는 질환 또는 상태를 언급한다. 당해 상태는 섬유용해성 상태, 예를 들어, 동맥 혈전증, 정맥 혈전증 및 혈전 색전증, 허혈성 졸중, 후천성 응고 장애, 파종성 혈관내 응고 및 이에 대한 전조, 예를 들어, 세균 또는 바이러스성 감염, 치은염 및 신경학적 상태를 포함하지만 이에 제한되지 않는다.
본원에 사용된 바와 같이, VEGFR-2에 의해 매개되는 질환 또는 상태는 병리 또는 병인에 관여한다. 당해 상태는 염증 및 혈관신생 상태, 예를 들어, 암, 당뇨 망막병증 및 황반 변성을 포함하는 안과 장애를 포함하지만 이에 제한되지 않는다.
본원에 사용된 바와 같이 "프로테아제", "프로테이나제" 및 "펩티다제"는 상호교환적으로 공유 펩타이드 결합의 가수분해를 촉매하는 효소를 언급하는데 사용된다. 이들 지정은 자이모겐 형태 및 이의 활성화된 단일, 2개 및 다중쇄 형태를 포함한다. 명확하게, 프로테아제에 대한 언급은 모든 형태를 언급한다. 프로테아제는 예를 들어, 이들의 활성 부위의 촉매 활성 및 표적 기질의 펩타이드 결합을 절단하는 기전에 따라, 세린 프로테아제, 시스테인 프로테아제, 아르파르트산 프로테아제, 트레오닌 및 메탈로-프로테아제를 포함한다.
본원에 사용된 바와 같이, 자이모겐은 성숙화 절단, 예를 들어, 활성화 절단 및/또는 다른 단백질(들) 및/또는 보조인자(들)와의 복합체 형성을 포함하는 단백질분해 절단에 의해 활성화되는 프로테아제를 언급한다. 자이모겐은 단백질분해 효소의 불활성 전구체이다. 당해 전구체는 일반적으로 보다 크지만 반드시 활성 형태 보다 큰 것은 아니다. 세린 프로테아제에 대하여, 자이모겐은 촉매 및 자가촉매 절단을 포함하는 특이적 절단 또는 활성 효소를 생성하는 활성화 보조인자의 결합에 의해 활성 효소로 전환된다. 따라서, 자이모겐은 활성화인자의 작용에 의해 단백질분해 효소로 전환되는 효소적으로 불활성인 단백질이다. 절단은 자가촉매적으로 수행될 수 있다. 자이모겐은 일반적으로 불활성이고 자이모겐으로부터 프로영역의 촉매 또는 자가촉매 절단에 의해 성숙한 활성 폴리펩타이드로 전환될 수 있다.
본 명세서에 사용된, "프로영역", "프로펩타이드" 또는 "프로 서열"은 성숙한 단백질을 생산하기 위해 절단되는 영역 또는 절편을 의미한다. 이것은 촉매 기구를 은폐시켜 촉매 중간체의 형성을 방해함으로써(즉, 기질 결합 부위를 입체적으로 폐쇄함으로써) 효소 활성을 억제하는 기능을 하는 절편을 포함할 수 있다. 프로영역은 성숙한 생물학적 활성 폴리펩타이드의 아미노 말단에 위치한 아미노산 서열이며, 소수의 작은 아미노산이거나 다중도메인 구조일 수도 있다.
본 명세서에 사용된, 활성화 서열은 활성 프로테아제를 형성하기 위해 활성화 절단 또는 성숙한 절단을 필요로 하는 부위인 자이모겐 중의 아미노산 서열을 이미한다. 활성화 서열의 절단은 자가촉매적으로 촉진되거나 또는 활성화 파트너에 의해 촉진될 수 있다.
활성화 절단은 활성에 필요한 형태적 변화가 일어나는 성숙한 절단의 한 종류이다. 이것은 전형적 활성화 경로로서, 예컨대 세린 프로테아제의 경우, 절단이 새로운 N 말단을 생성하고, 이것이 촉매 기구의 보존 영역, 예컨대 촉매 잔기와 상호작용하여 활성에 필요한 입체형태적 변화를 유도한다. 활성화는 프로테아제의 다중쇄 형태를 생성할 수 있다. 일부 경우, 프로테아제의 단일쇄 형태는 단일쇄로서 단백질분해 활성을 나타낼 수 있다.
본 명세서에 사용된, 도메인은 분자의 다른 부위와 구조적 및/또는 기능적으로 다르고 식별가능한, 단백질 또는 암호화 핵산과 같은 분자의 일부를 의미한다.
본 명세서에 사용된, 프로테아제 도메인은 프로테아제의 촉매 활성 부분이다. 프로테아제의 프로테아제 도메인이라고 하면, 이러한 임의의 단백질의 단일쇄, 이중쇄 및 다중쇄 형태를 포함하는 것이다. 단백질의 프로테아제 도메인은 단백질분해 활성에 필요한 그 단백질의 모든 필수 성질을 포함하며, 예컨대 촉매적 중심을 포함한다.
본 명세서에 사용된, 프로테아제의 촉매 활성 부분 또는 단백질 분해 활성 부분은 프로테아제 도메인 또는 프로테아제 활성을 보유하는 임의의 단편 또는 일부를 의미한다. 특히, 적어도 시험관내에서 프로테아제 및 이의 촉매적 도메인 또는 단백질분해적 활성 부위(통상, C 말단 절단물)의 단일쇄 형태가 프로테아제 활성을 나타내는 것이 중요하다.
본 명세서에 사용된, "프로테아제 도메인 또는 프로테아제의 촉매 활성 부분을 암호화하는 핵산"이란, 인접 서열로서 프로테아제의 다른 인접 부위가 아닌, 언급된 단일쇄 프로테아제 도메인 또는 이의 활성 부위를 암호화하는 핵산을 의미한다.
본 명세서에 사용된, 프로테아제 도메인으로 필수적으로 이루어진 폴리펩타이드란, 폴리펩타이드의 일부만이 프로테아제 도메인 또는 이의 촉매 활성 부분인 것을 의미한다. 이러한 폴리펩타이드는 경우에 따라 추가 비프로테아제 유래의 아미노산 서열을 포함할 수 있으며, 일반적으로 포함할 것이다.
본 명세서에 사용된, "S1-S4"는, 기질의 P1-P4 잔기에 대한 결합 부위를 형성하는 아미노산 잔기를 의미한다(예컨대, Schecter and Berger(1967) Biochem Biophys Res Commun 27: 157-162). S1-S4은 각각 인접하지 않는 것일 수 있는 1개, 2개 또는 그 이상의 잔기를 포함한다. 이들 부위는 인지 부위 N 말단에서부터 절단가능 결합(scissile bond)으로도 불리는 단백질분해작용 부위까지 순차적으로 번호가 매겨진다.
본 명세서에 사용된, "P1-P4" 및 "P1'-P4'"는 S1-S4 잔기 및 S1'-S4' 잔기와 각각 특이적으로 상호작용하고 프로테아제에 의해 절단되는, 기질 펩타이드 중의 잔기를 의미한다. P1-P4는 절단 부위의 N 말단측의 잔기 위치를 의미하고; P1'-P4'는 절단 부위의 C 말단측의 잔기 위치를 의미한다. 아미노산 잔기는 폴리펩타이드 기질의 N 말단에서부터 C 말단으로 표지가 붙여진다(Pi, ..., P3, P2, P1, P1', P2', P3', ..., Pj). 각각의 결합 서브사이트는 (Si, ..., S3, S2, S1, S1', S2', S3', ..., Sj)로 표지가 붙여진다. 절단은 P1과 P1' 사이에서 촉매된다.
본 명세서에 사용된, "결합 포켓"은 기질 위의 특정 아미노산 또는 아미노산들과 상호작용하는 잔기 또는 잔기들을 의미한다. "특이적 포켓"은 다른 것보다 더 많은 에너지를 제공하는 결합 포켓(가장 중요하거나 지배적인 결합 포켓)이다. 통상, 결합 단계는 촉매 과정이 일어나는데 필요한 전이 상태의 형성이 선행한다. S1-S4 및 S1'-S4' 아미노산은 기질 서열 결합 포켓을 구성하고 펩타이드, 폴리펩타이드 또는 단백질 기질의 P1-P4 및 P1'-P4' 아미노산과의 상호작용에 의해 각각 기질 인지를 용이하게 한다. 프로테아제가 기질과 상호작용하는지의 여부는 S1-S4 및 S1'-S4' 위치에 있는 아미노산의 함수이다. S1, S2, S3, S4, S1', S2', S3' 및 S4' 서브사이트 중 임의의 하나 이상의 부위에 있는 아미노산이 기질의 P1, P2, P3, P4, P1', P2', P3' 및 P4' 부위의 임의의 하나 이상의 아미노산과 상호작용하거나 그 아미노산을 인지한다면, 그 프로테아제는 기질을 절단할 수 있다. 결합 포켓은 펩타이드 결합의 촉매작용 및 기질의 절단이 달성되도록 프로테아제와 표적 아미노산을 위치시킨다. 예를 들어, 세린 프로테아제는 일반적으로 기질의 P4-P2' 부위를 인지하고; 다른 프로테아제는 P4-P2' 이상의 확대된 부위를 인지할 수 있다.
본 명세서에 사용된, "확대된 기질 특이성에 기여하는" 아미노산은 특이성 포켓 외에, 활성 부위 틈에 존재하는 잔기를 의미한다. 이러한 아미노산은 프로테아제의 S1-S4, S1'-S4' 잔기를 포함한다.
본 명세서에 사용된, 상호작용의 제2 부위는 활성 부위 틈의 외측이다. 이 부위는 기질 인지과 촉매작용에 기여할 수 있다. 이러한 아미노산에는 기질과 제2 및 제3 외피 상호작용에 기여할 수 있는 아미노산이 포함된다. 예를 들어, S1-S4, S1'-S4' 아미노산을 둘러싸는, 프로테아제 구조 중의 루프는 기질 중에 P1-P4, P1'-P4' 아미노산의 위치결정에 역할을 하여, 프로테아제 활성 부위에 절단가능 결합을 표시한다.
본 명세서에 사용된, 프로테아제의 활성 부위는, 기질의 촉매작용이 일어나는 기질 결합 부위를 의미한다. 활성 부위의 구조와 화학적 성질로 인해, 기질의 인지 및 결합과 이어서 기질 내의 절단가능 결합의 가수분해 및 절단이 이루어진다. 프로테아제의 활성 부위는 펩타이드 절단이 촉매 기전에 기여하는 아미노산 뿐 아니라 기질 서열 인지에 기여하는 아미노산, 예컨대 확대된 기질 결합 특이성에 기여하는 아미노산을 포함한다.
본 명세서에 사용된, 세린 또는 시스테인 프로테아제의 "촉매적 트리아드(triad)" 또는 "활성 부위 잔기"는 세린 또는 시스테인 프로테아제의 활성 부위에 존재하고 펩타이드 절단의 촉매적 기전에 기여하는 아미노산, 전형적으로 3개 아미노산의 조합을 의미한다. 일반적으로, 촉매적 트리아드는 세린 프로테아제에서 발견되고 활성 친핵체 및 산/염기 촉매작용을 제공한다. 세린 프로테아제의 촉매적 트리아드는 키모트립신의 경우에 Asp102, His57 및 Ser195인 3개의 아미노산을 포함한다. 이러한 잔기들은 세린 프로테아제의 촉매 효능에 중요하다.
본 명세서에 사용된, "기질 인지 부위" 또는 "절단 서열"은 프로테아제에 의해 절단되는, 프로테아제의 활성 부위에 의해 인지되는 서열을 의미한다. 일반적으로, 예컨대 세린 프로테아제의 경우, 절단 서열은 기질의 P1-P4 및 P1'-P4' 아미노산으로 구성되며, 여기서 절단은 P1 위치 이후에 일어난다. 일반적으로, 세린 프로테아제의 절단 서열은 많은 프로테아제의 확대된 기질 특이성에 맞추기 위해 길이가 6개인 잔기이지만, 프로테아제에 따라서 더 길거나 더 짧을 수도 있다. 예를 들어, 자가촉매작용에 필요한 MT-SP1의 기질 인지 부위 또는 절단 서열은 RQARVV이며, 여기서 R은 P4 위치이고, Q는 P3 위치이며, A는 P2 위치이고 R은 P1 위치이다. MT-SP1에서의 절단은 서열 VVGG가 후속되는 위치 R 다음에서 일어난다.
본 명세서에 사용된 표적 기질은 프로테아제에 의해 절단되는 기질을 의미한다. 최소한, 표적 기질은 절단 서열을 구성하는 아미노산을 포함한다. 경우에 따라, 표적 기질은 절단 서열을 함유하는 펩타이드와 임의의 다른 아미노산을 포함한다. 프로테아제에 의해 인지되는 절단 서열을 함유하는 전장 단백질, 대립유전자 변이체, 이소형(isoform) 또는 이의 임의의 부위는 그 프로테아제의 표적 기질이다. 또한, 표적 기질은 프로테아제에 의한 기질의 절단에 영향을 미치지 않는 추가 잔기(moiety)를 함유하는 펩타이드 또는 단백질을 포함한다. 예를 들어, 표적 기질은 4개의 아미노산 펩타이드 또는 전장의 단백질이 형광 부에 화학적으로 결합된 것을 포함할 수 있다.
본 명세서에 사용된, 절단은 프로테아제에 의한 펩타이드 결합의 파괴를 의미한다. 프로테아제의 절단 부위 모티프(motif)는 절단가능 결합에 대해 N 말단 및 C 말단의 잔기를 보유한다(프라이밍 처리된 측과 프라이밍 처리되지 않은 측은 각각 ...P3-P2-P1-P1'-P2'-P3'...로 정의되는, 프로테아제 절단 부위를 보유하고, 절단은 P1과 P1' 잔기 사이에서 일어난다). 일반적으로, 기질의 절단은 활성화 절단이거나 억제성 절단이다. 활성화 절단은 비활성 형태의 폴리펩타이드를 절단하여 활성 형태를 만드는 것을 의미한다. 이러한 예에는 자이모겐의 활성 효소로의 절단, 및/또는 전구성장 인자의 활성 성장 인자로의 절단이 있다. 예를 들어, MT-SP1은 RQAR의 P1-P4 서열에서 표적 기질을 절단하여 자가활성화할 수 있다. 또한, 활성화 절단은 단백질이 각각 활성을 갖는 하나 이상의 단백질로 절단되는 절단이다. 예를 들어, 활성화 절단은 단백질분해적 절단 사건의 비가역적 캐스케이드로서, 이의 종결 시, 염증을 자극하고, 항원 포식작용을 촉진하며 일부 세포를 직접 용해하는 복수의 이펙터 분자가 형성되는 보체 시스템에서 일어난다.
본 명세서에 사용된, 억제성 절단은 기능성이 아닌 하나 이상의 분해 산물로 단백질을 절단하는 것이다. 억제성 절단은 단백질 활성의 감소 또는 저하를 초래한다. 일반적으로, 단백질 활성 감소는 그 단백질이 수반된 경로 또는 과정을 감소시킨다. 일 예로서, 억제성 절단인 임의의 하나 이상의 표적 단백질, 예를 들어, VEGFR의 절단은 표적 기질의 임의의 하나 이상의 기능 또는 활성의 동시적 감소 또는 억제제를 유발한다. 예를 들어, VEGFR의 절단을 위해 억제될 수 있는 활성은 리간드 결합, 키나제 활성 또는 생체내 또는 시험관내 혈관신생과 같은 혈관신생 활성을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 억제성이 되기 위하여, 절단은 단백질의 천연 형태보다 적어도 약 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 99.9% 또는 그 이상 활성을 감소시킨다. 절단이 억제성이 되기 위해 필요한 단백질의 절단율은 단백질마다 다르지만, 단백질의 활성을 분석하여 측정할 수 있다.
본원에 사용된 바와 같이, 프로테아제 폴리펩타이드는 본원에 기재된 후보 프로테아제 또는 이의 변이 프로테아제중 임의의 하나에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드이다.
본 명세서에 사용된, "변형된 프로테아제" 또는 "뮤테인 프로테아제"란, 야생형 또는 주형 프로테아제와 비교했을 때 주요 서열에 하나 이상의 변형을 보유하는 프로테아제 폴리펩타이드(단백질)을 의미한다. 하나 이상의 돌연변이는 하나 이상의 아미노산 대체(치환), 삽입, 결실 및 이의 임의의 조합일 수 있다. 변형된 프로테아제 폴리펩타이드에는 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20개 또는 그 이상의 변형된 위치를 보유하는 폴리펩타이드가 포함된다. 변형된 프로테아제는 전장의 프로테아제이거나 또는 변형된 전장의 프로테아제의 촉매 활성 부분일 수 있으나, 단 변형된 프로테아제는 단백질분해적 활성이어야 한다. 일반적으로, 이러한 돌연변이는 임의의 하나 이상의 목적하거나 미리 결정된 표적 기질의 절단을 위해 야생형 또는 주형 프로테아제의 특이성 및 활성을 변화시킨다. 프로테아제의 기질 특이성을 변경시키는 영역에 변형을 포함하는 것 외에도 변형된 프로테아제는 프로테아제의 기질 특이성에 중요하지 않은 영역에 다른 변형을 허용할 수도 있다. 따라서, 변형된 프로테아제는 일반적으로 야생형 또는 스캐폴드 프로테아제의 대응하는 아미노산 서열과 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 그 이상의 서열 동일성을 보유한다. 변형된 전장의 프로테아제 또는 변형된 프로테아제의 촉매 활성 부분은 융합 단백질인 프로테아제를 포함할 수 있지만, 융합 자체가 프로테아제의 기질 특이성을 변경시키지 않아야 한다.
본 명세서에 사용된, 키모트립신 번호매김이란, 서열번호 391의 성숙한 키모트립신 폴리펩타이드의 아미노산 번호매김을 의미한다. 프로테아제 도메인을 포함하는, 키모트립신 계열의 프로테아제(즉, u-PA, t-PA, MT-SP1 및 기타)는 키모트립신과 함께 정렬될 수 있다. 이러한 경우에, 키모트립신의 아미노산에 상응하는 프로테아제의 아미노산은 키모트립신 아미노산의 번호로 매겨진다. 대응하는 위치는 수동 정렬이나 또는 이용할 수 있는 수많은 정렬 프로그램(예: BLASTP)을 이용하는 당업자에 의해 그러한 정렬을 통해 측정될 수 있다. 대응하는 위치는 또한 단백질 구조의 컴퓨터 모의 정렬 등을 이용하여 구조적 정렬에 기초하여 측정될 수도 있다. 폴리펩타이드의 아미노산이 개시된 서열의 아미노산에 대응한다는 것은, GAP 알고리듬과 같은 표준 정렬 알고리듬을 이용하여 동일성 또는 상동성(보존적 아미노산이 정렬되는 경우)이 최대가 되도록 그 폴리펩타이드를 개시된 서열과 정렬시켰을 때 확인되는 아미노산을 의미한다. 예를 들어, 성숙한 키모트립신 폴리펩타이드와 u-PA의 정렬시, 서열번호 191에 제시한 u-PA의 전구체 서열에서 아미노산 C168은 성숙한 키모트립신 폴리펩타이드의 아미노산 C1과 정렬시킨다. 따라서, u-PA내 아미노산 C168은 또한 키모트립신 번호매김을 기준으로 C1이다. 당해 키모트립신 표준 번호매김을 사용하여, 서열번호 191에 제시한 전구체 u-PA 서열에서 아미노산 L244는 키모트립신 번호매김을 기준으로 L73 아미노산과 동일하고 I260은 키모트립신 번호매김을 기준으로 I89와 동일하다. 또 다른 예에서, MT-SP1의 세린 프로테아제 도메인(서열번호 253에서 아미노산 615번 내지 855번에 상응함)과 성숙한 키모트립신의 정렬시 MT-SP1의 위치 615번에 있는 V는 키모트립신 번호매김으로 V16으로 매겨진다. 이에 따라 후속 아미노산도 번호를 매긴다. 따라서, 전장의 MT-SP1(서열번호 253)의 아미노산 위치 708번에 있는 F는 키모트립신 번호매김에 기초할 때 F99에 해당한다. 잔기가 프로테아제에는 존재하지만, 키모트립신에는 존재하지 않는 경우에는 그 아미노산 잔기에 문자 표시가 매겨진다. 예를 들어, 키모트립신 번호매김에 기초할 때 아미노산 60번인, 루프의 일부이지만 키모트립신과 비교했을 때 MT-SP1 서열에만 삽입되어 있는 키모트립신의 잔기는 예컨대 Asp60b 또는 Arg60c라고 한다.
본 명세서에 사용된, 표적 기질에 대한 특이성이란, 비-표적 기질이라고도 하는 다른 기질과 비교하여, 프로테아제에 의한 표적 기질의 절단이 우선되는 것을 의미한다. 특이성은 기질에 대한 프로테아제의 친화성과 효소의 효능의 척도인 특이성 상수(kcat/Km)로 표시된다.
본 명세서에 사용된, 절단의 특이성 상수는 (kcat/Km)이며, 여기서 Km은 마이켈리스-멘텐 상수(1/2 Vmax에서의 [S])이고 kcat는 Vmax/[ET]이며, 여기서 ET는 최종 효소 농도이다. 매개변수 kcat, Km 및 kcat/Km은 기질 농도의 역수 대 기질 절단 속도의 역수를 도표화하고, 라인위버-버크(Lineweaver-Burk) 방정식 (1/속도=(Km/Vmax)(1/[S])+1/Vmax; 여기서 Vmax = [ET]kcat)에 대입하여 계산할 수 있다. 다양한 기질 농도의 존재 하에 절단 증가 속도를 경시적으로 측정하는 임의의 방법은 특이성 상수를 계산하는데 사용될 수 있다. 예를 들어, 기질은, 프로테아제에 의해 절단 시 방출되는 형광원성 부에 결합되어 있다. 여러 효소 농도에서 절단 속도를 측정하면 특정 프로테아제에 대한 kcat가 측정될 수 있다. 특이성 상수는 기질에 공존하는 P1-P4 아미노산에 대한 프로테아제의 S1-S4 포켓의 임의의 하나 이상의 아미노산의 부위 특이적 선호도를, 당업계의 표준 방법, 예컨대 위치 스캐닝 조합 라이브러리(PS-SCL)를 사용하여 측정하는데 사용될 수 있다. 또한, 특이성 상수는 다른 기질보다 한 표적 기질에 대한 프로테아제의 선호도를 측정하는데 사용될 수 있다.
본 명세서에 사용된, 기질 특이성 비는 특이성 상수의 비이며, 2개 이상의 기질에 대한 2개 이상의 프로테아제 또는 하나의 프로테아제의 특이성을 비교하는데 사용될 수 있다. 예를 들어, 경쟁 기질에 대한 하나의 프로테아제의 기질 특이성 또는 하나의 기질에 대한 경쟁 프로테아제의 기질 특이성은 kcat/Km을 비교하여 측정할 수 있다. 예를 들어, 특이성 상수가 표적 기질에 대해서는 2 X 106 M-1sec-1이고, 비-표적 기질에 대해서는 2 X 104 M-1sec-1인 프로테아제는 표적 기질에 대한 특이성이 더 크다. 이와 같은 특이성 상수를 사용하면, 상기 프로테아제는 표적 프로테아제의 기질 특이성 비가 100이다.
본 명세서에 사용된, 표적 기질에 대한 선호도 또는 기질 특이성은 기질 특이성 비로서 나타낼 수 있다. 선호도를 반영하는 상기 비의 특정 값은 논쟁중인 기질과 프로테아제의 함수이다. 1보다 큰 기질 특이성 비는 표적 기질에 대한 선호도를 의미하고, 1 미만의 기질 특이성은 비-표적 기질에 대한 선호도를 의미한다. 일반적으로, 적어도 1 또는 약 1의 비는 프로테아제가 후보 치료제로서 고려되기에 충분한 차이를 반영한다.
본 명세서에 사용된, 변경된 특이성은 출발 야생형 또는 주형 프로테아제와 비교했을 때, 변형된 또는 선별된 프로테아제의 기질 특이성에 변화를 의미한다. 일반적으로, 특이성의 변화는 주형 프로테아제의 야생형 기질(본 명세서에서는 비-표적 기질이라고도 함)에 비해, 표적 기질에 대한 변형된 프로테아제의 선호도의 변화를 반영하는 것이다. 일반적으로, 본 명세서에 제시된 변형된 프로테아제 또는 선별된 프로테아제는 주형 프로테아제의 기질 특이성에 비해, 임의의 하나 이상의 미리 결정되거나 목적하는 절단 서열에 대해 증가된 기질 특이성을 나타낸다. 예를 들어, 표적 기질 대 비-표적 기질에 대한 기질 특이성 비가 100인 변형된 프로테아제는, 기질 특이성 비가 10인 스캐폴드 프로테아제에 비해 10배 증가된 특이성을 나타낸다. 다른 예에서, 기질 특이성 비가 0.1에 비해 1인 변형된 프로테아제는 10배 증가된 기질 특이성을 나타낸다. 스캐폴드 프로테아제에 비해 증가된 특이성을 나타내기 위해, 변형된 프로테아제는 임의의 하나 또는 그 이상의 미리 결정된 표적 단백질에 대해 1.5배, 2배, 5배, 10배, 50배, 100배, 200배, 300배, 400배, 500배 또는 그 이상 더 큰 기질 특이성을 나타낸다.
본 명세서에 사용된 "선택성"은 경쟁 기질의 혼합물 중에서 하나의 표적 기질을 선택하고 절단하는 프로테아제의 능력을 말할 때, 특이성과 혼용할 수 있는 용어이다. 프로테아제가 임의의 다른 하나 또는 그 이상의 표적 기질에 비해 한 표적 기질에 대해 나타내는 증가된 선택성은 예컨대 프로테아제에 의한 표적 기질의 절단 특이성 상수를 비교하여 측정할 수 있다. 예를 들어, 프로테아제가 표적 기질에 대한 절단 특이성 상수는 2 X 106 M-1sec-1이고 임의의 다른 하나 이상의 기질에 대해서는 2 X 104 M-1sec-1이면, 그 프로테아제는 전자의 표적 기질에 대한 선택성이 더 큰 것이다.
본 명세서에 사용된, 활성이란, 전장(완전) 단백질과 관련된 폴리펩타이드 또는 이의 일부의 기능적 활성 또는 활성들을 의미한다. 기능적 활성에는 생물학적 활성, 촉매적 또는 효소적 활성, 항원성(항폴리펩타이드 항체에 결합하기 위해 폴리펩타이드와 경쟁하거나 결합하는 능력), 면역원성, 다량체 형성능 및 폴리펩타이드의 수용체 또는 리간드에 특이적으로 결합하는 능력이 있으나, 이에 국한되는 것은 아니다.
본 명세서에 사용된, 촉매 활성 또는 절단 활성이란, 선택된 기질의 단백질분해작용을 검출하는 시험관내 단백질분해 검정법으로 평가된, 프로테아제의 활성을 의미한다. 절단 활성은 프로테아제의 촉매 효능을 평가하여 측정할 수 있다.
본 명세서에 사용된, 표적 기질에 대한 활성이란, 절단 활성 및/또는 기능적 활성, 또는 표적 기질에 또는 표적 기질에 대해 나타내는 프로테아제의 활성을 반영하는 다른 측정법을 의미한다. 절단 활성은 프로테아제의 촉매적 효능을 평가하여 측정할 수 있다. 본 발명의 목적에서, 활성은 프로테아제가 표적 기질에 더 큰 단백질분해작용 또는 절단을 나타내고/내거나, 프로테아제 부재 시와 비교했을 때 표적 기질 단백질의 기능적 활성을 변경(즉, 활성화 또는 억제)시킨다면 증가된 것이다.
본 명세서에 사용된, 세린 프로테아제 또는 세린 엔도펩티다제는 효소의 활성 중심에 세린 잔기의 존재를 특징으로 하는, 펩티다제의 한 종류를 의미한다. 세린 프로테아제는 체내의 광범위한 기능에 관여하는데, 그 예로는 혈액 응고 및 염증 뿐 아니라 원핵생물 및 진핵생물에서 소화 효소로서의 기능이 있다. 세린 프로테아제에 의한 절단 기전은 표적화된 펩타이드 결합의 세린에 의한 친핵성 공격을 기초로 한다. 아스파르테이트 또는 금속과 결합된 시스테인, 트레오닌 또는 물 분자도 이러한 역할을 할 수 있다. 세린, 히스티딘 및 아스파테이트의 정렬된 측쇄는 대부분의 세린 프로테아제에 일반적인 촉매적 트리아드를 형성한다. 세린 프로테아제의 활성 부위는 폴리펩타이드 기질이 결합하는 틈처럼 형성되어 있다. 대표적인 세린 프로테아제는 서열번호 433에 제시한 뇨 플라스미노겐 활성화인자(u-PA), 서열번호 253에 제시한 MT-SP1 및 이의 촉매 활성 부분, 예를 들어, 서열번호 505에 제시한 MT-SP1 프로테아제 도메인(또한 B쇄로 호칭됨)을 포함한다.
본 명세서에 사용된, 사람 단백질은 사람의 게놈에 존재하는 DNA와 같은 핵산 분자에 의해 암호화된 단백질은 물론, 이의 모든 대립유전자 변이체 및 보존적 변형도 포함한다. 단백질의 변이체 또는 변형된 단백질은 이 변형이 사람 단백질의 야생형 또는 주요 서열을 기초로 한다면 사람 단백질이다.
본 명세서에 사용된, 자연 발생의 α-아미노산의 잔기는 자연에서 발견되는 20개의 α-아미노산 잔기로서, 사람의 동족 mRNA 코돈과 하전성 tRNA 분자의 특이적 인지에 의해 단백질에 혼입된다.
본 명세서에 사용된, 비자연 발생의 아미노산은 유전자적으로 암호화되지 않은 아미노산을 의미한다.
본 명세서에 사용된, 핵산에는 DNA, RNA 및 이의 유사체, 예컨대 펩타이드 핵산(PNA) 및 이의 혼합물이 포함된다. 핵산은 일본쇄 또는 이본쇄일 수 있다. 경우에 따라 형광 표지 또는 방사능표지와 같은 검출성 표지 등으로 표지되는, 프로브 또는 프라이머를 언급할 때에는 일본쇄 분자인 것으로 생각해야 한다. 이러한 분자는 보통 라이브러리를 탐침 또는 프라이밍할 때 그 표적이 통계적으로 고유하거나 낮은 카피수(통상 5 미만, 보통 3 미만)일 정도의 길이를 가진 것이다. 일반적으로, 프로브 또는 프라이머는 당해 유전자에 상보적이거나 당해 유전자와 동일한, 적어도 14개, 16개 또는 30개의 인접 뉴클레오타이드 서열을 함유한다. 프로브 및 프라이머는 뉴클레오타이드 길이가 10, 20, 30, 50, 100 또는 그 이상일 수 있다.
본원에 사용된 바와 같이, 펩타이드는 길이가 2 내지 40개 아미노산인 폴리펩타이드를 언급한다.
본원에 사용된 바와 같이, 본원에 제공된 다양한 아미노산 서열중에 존재하는 아미노산은 이들의 공지된 3문자 또는 1문자 약어에 따라 나타낸다(표 1). 다양한 핵산 단편에 존재하는 뉴클레오타이드는 당업계에 통상적으로 사용되는 표준 1문자로 나타낸다.
본원에 사용된 바와 같은 "아미노산"은 아미노 그룹 및 카복실산 그룹을 함유하는 유기 화합물이다. 폴리펩타이드는 2개 이상의 아미노산을 함유한다. 본 발명의 목적상, 아미노산은 20개의 천연 아미노산, 비천연 아미노산 및 아미노산 유사체(즉, α-탄소가 측쇄를 갖는 아미노산)를 포함한다.
본원에 사용된 바와 같이, "아미노산 잔기"는 펩타이드 결합에서 폴리펩타이드의 화학적 분해(가수분해)시 형성되는 아미노산을 언급한다. 본원에 기재된 아미노산 잔기는 "L" 이소형인 것으로 간주한다. 이와 같이 지정된 "D" 이소형의 잔기는 목적하는 기능적 성질이 폴리펩타이드에 의해 보유되는 한 임의의 L-아미노산을 대체할 수 있다. NH2는 폴리펩타이드의 아미노 말단에 존재하는 자유 아미노 그룹을 언급한다. COOH는 폴리펩타이드의 카복실 말단에 존재하는 자유 카복시 그룹을 언급한다. 문헌[참조: J. Biol . Chem., 243: 3552-3559 (1969)]에 기재되고 37 C.F.R.§§1.821-1.822하에 채택된 표준 폴리펩타이드 명명법에 따른 아미노산 잔기에 대한 약어는 표 1에 나타낸다.
Figure 112009007335988-pct00001
본원에서 화학식으로 나타낸 모든 아미노산 잔기 서열은 아미노 말단에서 카복시 말단의 통상적인 방향으로 좌측에서 우측 배향을 갖는 것으로 주지되어야만 한다. 또한, 용어 "아미노산 잔기"는 대응표(표 1)에 열거된 아미노산 및 37 C.F.R.§§1.821-1.822에서 언급되고 본원에 참조로서 인용되는 것들과 같은 변형된 아미노산 및 희귀 아미노산을 포함하는 것으로 광범위하게 정의된다. 추가로, 아미노산 잔기 서열의 시작 또는 말단에서의 대시 기호는 하나 이상의 아미노산 잔기의 추가 서열에 대한 펩타이드 결합, NH2와 같은 아미노-말단 그룹에 대한 펩타이드 결합 또는 COOH와 같은 카복실-말단 그룹에 대한 펩타이드 결합을 지적하는 것으로 주지되어야만 한다.
본원에 사용된 바와 같이, "천연 아미노산"은 폴리펩타이드내에 존재하는 20개의 L-아미노산을 언급한다.
본원에 사용된 바와 같이, "비천연 아미노산"은 천연 아미노산과 유사한 구조를 갖지만 천연 아미노산의 구조 및 반응성을 모방하기 위해 변형된 유기 화합물을 언급한다. 따라서, 비천연 아미노산은 예를 들어, 20개의 천연 아미노산 이외의 아미노산 또는 이의 유사체를 포함하고 D-입체이성체의 아미노산을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 대표적인 비천연 아미노산은 본원에 기재되고 당업자에게 공지되어 있다.
본원에서 사용된 바와 같이, 등속도론적 혼합물은 아미노산의 몰비가 이들의 보고된 반응속도에 근거하여 조정된 것이다(참조: Ostresh et al., (1994) Biopolymers 34:1681).
본원에 사용된 바와 같이, DNA 작제물은 천연에서 발견되지 않는 방식으로 조합되고 인접된 DNA 절편을 함유하는, 일본쇄 또는 이본쇄, 선형 또는 환형 DNA 분자이다. DNA 작제물은 사람 조작에 따른 결과이고 조작된 분자의 클론 및 기타 카피물을 포함한다.
본원에 사용된 바와 같이, DNA 절편은 특정 성질을 갖는 대형 DNA 분자의 일부이다. 예를 들어, 특정 폴리펩타이드를 암호화하는 DNA 절편은 플라스미드 또는 플라스미드 단편과 같은 보다 긴 DNA 분자의 일부이고 5'에서 3' 방향으로 판독되는 경우 특정 폴리펩타이드의 아미노산 서열을 암호화한다.
본원에 사용된 바와 같이, 용어, 오르토로그(ortholog)는 상이한 종 기원의 폴리펩타이드 또는 단백질의 기능적 대응물인, 하나의 종으로부터 유래된 폴리펩타이드 또는 단백질을 의미한다. 오르토로그간의 서열 차이는 종 분화에 따른 결과이다.
본원에 사용된 바와 같이, 용어 폴리뉴클레오타이드는 5'에서 3' 말단으로 판독되는 데옥시리보뉴클레오타이드 또는 리보뉴클레오타이드의 일본쇄 또는 이본쇄 중합체를 의미한다. 폴리뉴클레오타이드는 RNA 및 DNA를 포함하고 천연 공급원으로부터 분리되거나 시험관내에서 합성되거나 천연 및 합성 분자의 조합으로부터 제조될 수 있다. 폴리뉴클레오타이드 분자의 길이는 본원에서 뉴클레오타이드("nt"로 약칭됨) 또는 염기쌍("bp"로 약칭됨)으로 나타낸다. 용어 핵산은 경우에 따라 일본쇄 및 이본쇄 분자에 대해 사용된다. 당해 용어가 이본쇄 분자에 적용되는 경우, 이것은 전체 길이를 나타내는데 사용되고 용어 염기쌍과 동등한 것으로 이해된다. 당업자는 이본쇄 폴리뉴클레오타이드의 2개의 가닥이 길이에 있어서 약간 상이하고 이의 말단이 어긋나서 이본쇄 폴리뉴클레오타이드 분자내에 모든 뉴클레오타이드가 쌍을 형성하지 못할 수 있음을 인지할 것이다. 당해 쌍을 이루지 않은 말단은 일반적으로 길이에 있어서 20개 뉴클레오타이드를 초과하지 않는다.
본원에 사용된 바와 같이, 2개의 단백질 또는 핵산간의 "유사성"은 단백질의 아미노산 서열 또는 핵산의 뉴클레오타이드 서열간의 관련성을 언급한다. 유사성은 잔기의 서열 및 여기에 포함되는 잔기의 동일성 정도 및/또는 상동성을 근거로 할 수 있다. 단백질 또는 핵산간의 유사성 정도를 평가하는 방법은 당업자에게 공지되어 있다. 예를 들어, 서열 유사성을 평가하는 하나의 방법에서, 2개의 아미노산 또는 뉴클레오타이드 서열은 서열간의 최대 수준의 동일성을 나타내는 방식으로 정렬된다. "동일성"은 아미노산 또는 뉴클레오타이드 서열이 불변인 정도를 언급한다. 아미노산 서열 및 어느 정도의 뉴클레오타이드 서열의 정렬은 또한 아미노산(또는 뉴클레오타이드)에서 보존적 차이 및/또는 빈번한 치환을 고려할 수 있다. 보존적 차이는 관련 잔기의 물리화학적 성질을 보존하는 것들이다. 정렬은 총체적(모든 잔기를 포함하는 서열의 전체길이에 걸쳐 비교되는 서열의 정렬) 또는 국부적(단지 가장 유사한 영역 또는 영역들을 포함하는 서열 일부의 정렬)일 수 있다.
"동일성" 자체는 당업계에서 인지되는 의미를 갖고 공개된 기술에 따라 계산될 수 있다(참조: Computational Molecular Biology, Lesk, A.M., ed., Oxford University Press, New York, 1988; Biocomputing : Informatics and Genome Projects, Smith, D.W., ed., Academic Press, New York, 1993; Computer Analysis of Sequence Data, Part I, Griffin, A.M., and Griffin, H.G., eds., Humana Press, New Jersey, 1994; Sequence Analysis in Molecular Biology, von Heinje, G., Academic Press, 1987; 및 Sequence Analysis Primer, Gribskov, M. and Devereux, J., eds., M Stockton Press, New York, 1991]. 2개의 폴리뉴클레오타이드 또는 폴리펩타이드간에 동일성을 측정하는 다수의 방법이 존재하지만 용어 "동일성"은 당업자에게 널리 공지되어 있다(참조: Carrillo, H. & Lipman, D., SIAM J Applied Math 48:1073 (1988)).
본원에 사용된 바와 같은, 상동성(뉴클레오타이드 및/또는 아미노산 서열과 관련하여)이란 약 25% 이상의 서열 상동성, 전형적으로 25%, 40%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90% 또는 95% 이상의 서열 상동성을 의미하고; 정확한 %는 경우에 따라 특정될 수 있다. 본원의 목적을 위해, 용어 "상동성" 및 "동일성"은 달리 지적되지 않는 경우 흔히 상호교환적으로 사용된다. 일반적으로, % 상동성 또는 동일성의 측정을 위해, 서열은 최고 정도의 일치가 수득되도록 정렬된다(참조: Computational Molecular Biology, Lesk, A.M., ed., Oxford University Press, New York, 1988; Biocomputing : Informatics and Genome Projects, Smith, D.W., ed., Academic Press, New York, 1993; Computer Analysis of Sequence Data , Part I, Griffin, A.M., and Griffin, H.G., eds., Humana Press, New Jersey, 1994; Sequence Analysis in Molecular Biology, von Heinje, G., Academic Press, 1987; 및 Sequence Analysis Primer, Gribskov, M. and Devereux, J., eds., M Stockton Press, New York, 1991; Carrillo et al . (1988) SIAM J Applied Math 48:1073). 서열 상동성에서, 보존성 아미노산의 수는 표준 정렬 알고리듬 프로그램에 의해 측정되고 각 공급자에게 의해 확립된 디폴트 갭 페널티와 함께 사용될 수 있다. 실질적으로 상동성 핵산 분자는 목적하는 모든 핵산의 길이를 따라 전형적으로 중간 엄중도 또는 고엄중도에서 하이브리드화한다. 또한 하이브리드화 핵산 분자에서의 코돈 대신에 축퇴성 코돈을 함유하는 핵산 분자가 고려된다.
임의의 2개의 분자가 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 이상 "동일성" 또는 "상동성"인 뉴클레오타이드 서열 또는 아미노산 서열을 갖는지의 여부는 예를 들어, 문헌[참조: Pearson et al . (1988) Proc . Natl . Acad . Sci. USA 85:2444]에서와 같은 디폴트 계수를 사용하는 "FASTA"와 같은 공지된 컴퓨터 알고리듬을 사용하여 측정될 수 있다 (다른 프로그램으로는 GCG 프로그램 패키지(참조: Devereux, J., et al ., Nucleic Acids Research 12(I):387 (1984)), BLASTP, BLASTN, FASTA(참조: Altschul, S.F., et al ., J Molec Biol 215:403 (1990))가 포함된다 (참조: Guide to Huge Computers, Martin J. Bishop, ed., Academic Press, San Diego, 1994, 및 Carrillo et al . (1988) SIAM J Applied Math 48:1073). 예를 들어, 국립 생물공학 정보 데이터베이스 센터(NCBI)의 BLAST 기능을 사용하여 동일성을 측정할 수 있다. 기타 시판되거나 대중에게 유용한 프로그램은 DNAStar "MegAlign" 프로그램(Madison, WI) 및 위스콘신 유전학 컴퓨터 그룹(the University of Wisconsin Genetics Computer Group)(UWG)의 "갭" 프로그램 (Madison WI)을 포함한다. 단백질 및/또는 핵산 분자의 % 상동성 또는 동일성은 예를 들어, GAP 컴퓨터 프로그램을 사용하여 서열 정보를 비교함으로써 측정될 수 있다(참조: Needleman et al . (1970) J. Mol . Biol . 48:443, as revised by Smith and Waterman (1981) Adv . Appl . Math . 2:482). 간략하게, GAP 프로그램은 유사한 정렬된 기호(즉, 뉴클레오타이드 또는 아미노산)의 수를 간략히 2개 서열의 총 기호의 수로 나누어서 유사성을 정의한다. GAP 프로그램에 대한 디폴트 계수는 (1) 한 요소의 비교 매트릭스(동일성은 1의 수치 및 비동일성은 0의 수치를 포함) 및 문헌[참조: Gribskov et al . (1986) Nucl . Acids Res . 14:6745, as described by Schwartz and Dayhoff, eds., ATLAS OF PROTEIN SEQUENCE AND STRUCTURE, National Biomedical Research Foundation, pp. 353358 (1979)]의 가중치 비교 매트릭스; (2) 각각의 갭에 대해 3.0의 페널티 및 추가로 각 갭중의 각 심볼에 대한 0.10의 페널티 및 (3) 말단 갭에 대한 페널티 부재를 포함할 수 있다.
따라서, 본원에 사용된 바와 같은 용어 "동일성" 또는 "상동성"은 시험 및 표준 폴리펩타이드 또는 폴리뉴클레오타이드간의 비교를 나타낸다. 본원에 사용된 바와 같은 용어 "90% 이상 동일한"은 표준 뉴클레오타이드 또는 폴리펩타이드의 아미노산 서열과 비교하여 90 내지 99.99의 동일성 %를 언급한다. 90% 이상 수준의 동일성은 예시 목적으로, 100개 아미노산의 시험 및 표준 폴리펩타이드 길이가 비교됨을 가정했을때, 시험 폴리펩타이드내 아미노산 10%(즉, 100개 중 10개) 이하가 표준 폴리펩타이드의 것과 상이하다는 사실을 지적한다. 유사하게 시험 및 표준 폴리뉴클레오타이드간에 비교될 수 있다. 당해 차이는 폴리펩타이드의 전체 길이에 걸쳐 무작위로 분포된 점 돌연변이로서 나타낼 수 있거나 이들은 허용가능한 최대값, 예를 들어 100개중 10개의 아미노산 차이(약 90% 동일성)까지 길이를 변화시키는 하나 이상의 위치에 몰릴 수 있다, 차이는 뉴클레오타이드 또는 아미노산 치환, 삽입 또는 결실로서 정의된다. 약 85 내지 90% 이상의 상동성 또는 동일성 수준에서, 당해 결과는 프로그램 및 갭 계수 세트와는 무관해야만 하고 당해 높은 동일성 수준은 흔히 소프트웨어에 의존하는 것 없이 수동 정렬에 의해 용이하게 평가될 수 있다.
본원에 사용된 바와 같은 정렬된 서열은 뉴클레오타이드 또는 아미노산의 서열에서 상응하는 위치를 정렬시키기 위한 상동성(유사성 및/또는 동일성)의 사용을 언급한다. 전형적으로, 50% 이상의 동일성에 의해 관련되는 2개 이상의 서열이 정렬된다. 정렬된 서열 세트는 상응하는 위치에 정렬되는 2개 이상의 서열을 언급하고 게놈 DNA 서열과 함께 정렬된, RNA로부터 유래된 서열, 예를 들어, EST 및 기타 cDNA를 정렬시킴을 포함할 수 있다.
본원에 사용된 바와 같이, "프라이머"는 적합한 완충액 및 적합한 온도에서 적당한 조건하에(예를 들어, 4개의 상이한 뉴클레오사이드 트리포스페이트 및 중합화제, 예를 들어, DNA 폴리머라제, RNA 폴리머라제 또는 역전사효소의 존재하에) 주형 지시된 DNA 합성의 시발점으로서 작용할 수 있는 핵산 분자를 언급한다. 특정 핵산 분자는 "프로브" 및 "프라이머"로서 작용할 수 있는 것으로 평가된다. 그러나, 프라이머는 연장을 위해 3' 하이드록실 그룹을 갖는다. 프라이머는 예를 들어, 폴리머라제 연쇄 반응(PCR), 역전사 효소(RT)-PCR, RNA PCR, LCR, 멀티플렉스 PCR, 팬핸들 PCR, 캡쳐 PCR, 발현 PCR, 3' 및 5' RACE, 동일계 PCR, 연결 매개 PCR 및 기타 증폭 프로토콜을 포함하는 다양한 방법에 사용될 수 있다
본원에 사용된 바와 같이, "프라이머 쌍"은 증폭될(예를 들어, PCR에 의해) 5' 말단의 서열과 하이브리드화하는 5'(상류) 프라이머 및 증폭될 3' 말단의 서열의 상보체와 하이브리드화하는 3'(하류) 프라이머를 포함하는 프라이머 세트를 언급한다.
본원에 사용된 바와 같은, "특이적으로 하이브리드화하는"은 표적 핵산 분자와의 핵산 분자(예를 들어, 올리고뉴클레오타이드)의 상보적 염기 쌍 형성에 의한 어닐링을 언급한다. 당업자는 특이적 하이브리드화에 영향을 주는 시험관내 및 생체내 계수, 예를 들어, 특정 분자의 길이 및 조성에 친숙하다. 특히 시험관내 하이브리드화와 관련된 계수는 추가로 어닐링 및 세척 온도, 완충액 조성 및 염 농도를 포함한다. 고엄중도에서 비특이적 결합 핵산 분자를 제거하기 위한 예시적 세척 조건은 0.1 x SSPE, 0.1% SDS, 65℃이고 중간 엄중도에서는 0.2 x SSPE, 0.1% SDS, 50℃이다. 동등한 엄중 조건은 당업계에 공지되어 있다. 당업자는 이들 계수를 용이하게 조절하여 특정 적용을 위해 적합한 표적 뉴클레오타이드로의 핵산 분자의 특이적 하이브리드화를 성취할 수 있다.
본원에 사용된 바와 같은 생성물과 실질적으로 동일한은 목적하는 성질이 실질적으로 변화되지 않아 당해 생성물 대신에 실질적으로 동일한 생성물이 사용될 수 있을 정도로 충분히 유사함을 의미한다.
본원에 사용된 바와 같이, 이것은 또한 용어 "실질적으로 동일한" 또는 "유사한"이 당업자에 의해 이해되는 내용에 따라 다양한 것으로 이해된다.
본원에 사용된 바와 같은, 대립유전자 변이체 또는 대립유전자 변이는 동일한 염색체 위치에 존재하는 유전자의 임의의 2개 이상의 또 다른 형태를 언급한다. 대립유전자 변이는 천연적으로 돌연변이를 통해 발생하고 집단내에서 표현형적 다형태를 유발할 수 있다. 유전자 돌연변이는 사일런트(암호화된 폴리펩타이드내 변화가 없음)일 수 있거나 또 다른 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드를 암호화할 수 있다. 용어 "대립유전자 변이체"는 또한 본원에서 유전자의 대립유전자 변이에 의해 암호화된 단백질을 나타내는데 사용된다. 전형적으로, 유전자 표준 형태는 종의 집단 또는 종의 단일 표준 구성원 기원의 폴리펩타이드의 야생형 형태 및/또는 주요 형태를 암호화한다. 전형적으로 종간 및 종중에서의 변이체를 포함하는 대립유전자 변이체는 동일 종 기원의 야생형 및/또는 주요 형태와 80% 또는 90% 이상의 아미노산 동일성을 갖고 동일성 정도는 유전자 및 종간에 또는 종중에서 비교되는지에 따라 다양하다. 일반적으로, 종중의 대립유전자 변이체는 폴리펩타이드의 야생형 및/또는 주요 형태와 96%, 97%, 98% 또는 99% 이상의 동일성을 포함하여 야생형 및/또는 주요 형태와 약 80%, 85%, 90% 또는 95% 이상의 동일성을 갖는다. 본원에서 대립유전자 변이체에 대한 언급은 동일 종의 구성원중의 단백질의 변화를 언급한다.
본원에 사용된 바와 같이, 본원에서 "대립유전자 변이체"와 상호 교환적으로 사용되는 "대립유전자"는 유전자의 또 다른 형태 또는 이의 일부를 언급한다. 대립유전자는 상동성 염색체상에서 동일한 좌 또는 위치에 존재한다. 피검체가 2개의 동일한 대립유전자를 갖는 경우, 피검체는 당해 유전자 또는 대립유전자에 대해 동형접합성인 것으로 호칭된다. 피검체가 상이한 대립유전자를 갖는 경우, 당해 피검체는 당해 유전자에 대해 이형접합성인 것으로 호칭된다. 특이적 유전자의 대립유전자는 단일 뉴클레오타이드 또는 여러 뉴클레오타이드에서 서로 차이가 있을 수 있고 뉴클레오타이드의 치환, 결실 및 삽입을 포함할 수 있다. 유전자의 대립유전자는 돌연변이를 함유하는 유전자 형태일 수 있다.
본원에 사용된 바와 같이 종 변이는 상이한 포유동물 종, 예를 들어, 마우스 및 사람을 포함하는 상이한 종중에서의 폴리펩타이드의 변이를 언급한다.
본원에 사용된 바와 같이, 스플라이스 변이체는 하나 이상 유형의 mRNA를 유도하는 게놈 DNA의 1차 전사체의 차등 프로세싱에 의해 생성되는 변이체를 언급한다.
본원에 사용된 바와 같이, 변형은 폴리펩타이드의 아미노산 서열의 변형 또는 핵산 분자내 뉴클레오타이드 서열의 변형을 언급하고 각각 아미노산 및 뉴클레오타이드의 결실, 삽입 및 대체를 포함한다. 폴리펩타이드를 변형시키는 방법은 예를 들어 재조합 DNA 방법을 사용하는 것으로 당업자에게는 일상적인 것이다.
본원에 사용된 바와 같이, 펩타이도모사체는 특정 펩타이드의 생물학적 활성 형태의 구조 및 특정 입체화학적 특징을 모방하는 화합물이다. 일반적으로, 펩타이도모사체는 화합물의 특정 목적하는 성질을 모방하도록 디자인되지만 생물학적 활성 구조의 상실 및 결합 파괴를 유도하는 유연성과 같은 목적하지 않은 성질에 대해서는 모방되지 않는다. 펩타이도모사체는 목적하지 않은 성질에 기여하는 특정 그룹 또는 결합을 생동등체(bioisostere)로 대체시킴에 의해 생물학적 활성 화합물로부터 제조될 수 있다. 생동등체는 당업자에게 공지되어 있다. 예를 들어, 메틸렌 생동등체 CH2S는 엔케팔린 유사체에서 아미드 대체물로서 사용되어 왔다(참조: Spatola (1983) pp. 267-357 in Chemistry and Biochemistry of Amino Acids, Peptides, and Proteins, Weinstein, Ed. volume 7, Marcel Dekker, New York)]. 경구 투여될 수 있는 모르핀은 펩타이드 엔도르핀의 펩타이도모사체인 화합물이다. 본원의 목적상, 사이클릭 펩타이드는 하나 이상의 펩타이드 결합이 모사체로 대체된 폴리펩타이드로서 펩타이도모사체중에 포함된다.
본원에 사용된 바와 같이, 표준 폴리펩타이드에 제시된 아미노산의 특정 %를 포함하는 폴리펩타이드는 폴리펩타이드와 표준 폴리펩타이드간에 공유된 동일한 연속 아미노산의 비율을 언급한다. 예를 들어, 147개의 아미노산을 언급하는 서열번호 XX에 제시된 아미노산의 서열을 갖는 표준 폴리펩타이드에 제시된 아미노산의 70%를 포함하는 이소형은 표준 폴리펩타이드가 서열번호 XX의 아미노산 서열로 제시된 103개 이상의 연속 아미노산을 함유함을 의미한다.
본원에 사용된 바와 같이, 용어 프로모터는 RNA 폴리머라제의 결합 및 전사 개시를 제공하는 DNA 서열을 함유하는 유전자의 일부를 의미한다. 프로모터 서열은 통상적으로 유전자의 5' 비암호화 영역에서 발견되지만 항상 그런 것은 아니다.
본원에 사용된 바와 같이, 분리되거나 정제된 폴리펩타이드 또는 단백질 또는 이의 생물학적 활성 부분은 실질적으로 세포 물질 또는 단백질이 유래하는 조직 샘플의 기타 오염 단백질이 없거나 화학적으로 합성되는 경우 실질적으로 화학적 전구체 또는 기타 화학물질이 없다. 제제는 이들이 분석 표준 방법에 의해 측정되는 바와 같은 용이하게 검출가능한 불순물이 부재인 것으로 나타나는 경우 실질적으로 부재인 것으로 측정될 수 있고, 여기서, 표준 분석 방법은 예를 들어, 순도 를 평가하기 위해 당업자에 의해 사용되는 박층 크로마토그래피(TLC), 겔 전기영동 및 고성능 액체 크로마토그래피(HPLC)이고 이에 의한 순도는 추가의 정제가 물질의 효소 활성 및 생물학적 활성과 같은 물리적 및 화학적 성질을 검출가능하게 변화시키지 않을 정도로 충분하다. 실질적으로 화학적으로 순수한 화합물을 제조하기 위한 화합물의 정제 방법은 당업계에 공지되어 있다. 그러나 실질적으로 화학적으로 순수한 화합물은 입체이성체의 혼합물일 수 있다. 당해 경우에, 추가의 정제는 화합물의 특이적 활성을 증가시킬 수 있다.
세포 물질이 실질적으로 없다는 용어는 단백질이 분리되거나 재조합적으로 생산되는 세포 성분으로부터 분리된 단백질의 제제를 포함한다. 한 양태에서, 실질적으로 세포 물질이 없다는 용어는 약 30% 미만(건조 중량)의 비-프로테아제 단백질(또한 본원에서 오염 단백질로서 언급됨), 일반적으로 약 20% 미만의 비-프로테아제 단백질 또는 10% 미만의 비-프로테아제 단백질 또는 약 5% 미만의 비-프로테아제 단백질을 갖는 프로테아제 단백질 제제를 포함한다. 프로테아제 단백질 또는 이의 활성 부분이 재조합적으로 제조되는 경우, 이것은 또한 배양 배지가 실질적으로 없고 즉, 배양 배지는 프로테아제 단백질 제제 용적의 약 20%, 10% 또는 5% 이하이다.
본원에 사용된 바와 같이, 화학적 전구체 또는 기타 화학물질이 실질적으로 없다는 용어는 단백질의 합성에 관여하는 화학적 전구체 또는 기타 화학물질로부터 단백질이 분리된 프로테아제 단백질의 제제를 포함한다. 당해 용어는 화학적 전구체 또는 비-프로테아제 화학물질 또는 성분이 약 30%(건조 중량), 20%, 10% 또는 5% 이하인 프로테아제 단백질 제제를 포함한다.
본원에 사용된 바와 같이, 예를 들어, 합성 핵산 분자 또는 합성 유전자 또는 합성 펩타이드와 관련된 합성은 재조합 방법 및/또는 화학적 합성 방법에 의해 제조되는 폴리펩타이드 분자를 언급한다.
본원에 사용된 바와 같이, 재조합 DNA 방법을 사용하는 재조합 수단에 의한 제조는 클로닝된 DNA에 의해 암호화된 단백질을 발현시키기 위해 널리 공지된 분자 생물학의 방법의 사용을 언급한다.
본원에 사용된 바와 같이, 벡터(또는 플라스미드)는 발현 또는 복제를 위해 이종성 핵산을 세포로 도입하기 위해 사용되는 별개의 요소들을 언급한다. 당해 벡터는 전형적으로 에피좀 상태로 남아있지만 유전자 또는 이의 일부가 게놈의 염색체로 통합되도록 디자인될 수 있다. 또한 효모 인공 염색체 및 포유동물 인공 염색체와 같은 인공 염색체인 벡터가 고려된다. 당해 벡터의 선별 및 용도는 당업자에게 널리 공지되어 있다.
본원에 사용된 바와 같이, 발현 벡터는 당해 DNA 단편을 발현시킬 수 있는 프로모터 영역과 같은 조절 서열과 작동가능하게 연결된 DNA를 발현시킬 수 있는 벡터를 포함한다. 당해 추가의 절편은 프로모터 및 터미네이터 서열을 포함할 수 있고 임의로 하나 이상의 복제 오리진, 하나 이상의 선별 마커, 인핸서 및 폴리아데닐화 시그날등을 포함할 수 있다. 발현 벡터는 일반적으로 플라스미드 또는 바이러스 DNA로부터 유래되거나 두 요소를 포함할 수 있다. 따라서, 발현 벡터는 플라스미드, 파지, 재조합 바이러스 또는 기타 벡터와 같이 적절한 숙주 세포로의 도입시 클로닝된 DNA를 발현시키는 재조합 DNA 또는 RNA 작제물을 언급한다. 적절한 발현 벡터는 당업자에게 널리 공지되어 있고 진핵생물 세포 및/또는 원핵생물 세포에서 복제할 수 있는 것들 및 에피좀 형태로 남아있는 것들 또는 숙주 세포 게놈으로 통합하는 것들을 포함한다.
본원에 사용된 바와 같이, 벡터는 또한 "바이러스 벡터" 또는 "바이러스 벡터들"을 포함한다. 바이러스 벡터는 외인성 유전자를 세포로 전달(비히클 또는 셔틀로서)하기 위해 작동가능하게 연결된 유전자 조작된 바이러스이다.
본원에 사용된 바와 같이, 아데노바이러스 벡터는 사람에서 결막염 및 상부 호흡기 감염을 유발하는 임의의 그룹의 DNA 함유 바이러스를 언급한다. 본원에 사용된 바와 같이, 누출된 DNA는 백신용 및 유전자 치료용으로 사용될 수 있는 히스톤 부재 DNA를 언급한다. 누출된 DNA는 형질전환으로 불리우는 과정의 유전자 전달 동안에 세포에서 세포로 전달되는 유전자 물질이다. 형질전환에서, 정제되거나 누출된 DNA는 수용 세포에 의해 취득되고 이것은 수용 세포에게 새로운 특징적인 표현형을 부여한다.
본원에 사용된 바와 같이, DNA 절편을 언급할때 "작동가능하게 또는 작동가능하게 연결된"은 절편이 이들의 의도된 목적을 위해 협력적으로 기능하도록, 예를 들어, 전사가 프로모터에서 개시되고 암호화 절편을 통해 터미네이터로 진행하도록 하기 위해 배열됨을 의미한다.
본원에 사용된 바와 같이, 단백질 결합 서열은 일반적으로 기타 단백질 또는 펩타이드에, 단백질 또는 펩타이드 서열 세트에 또는 특정 단백질 또는 펩타이드 서열에 특이적으로 결합할 수 있는 단백질 또는 펩타이드 서열을 언급한다.
본원에 사용된 바와 같이, 에피토프 태그는 에피토프 태그된 단백질 또는 펩타이드의 후속 생화학적 및 면역학적 분석을 촉진시키는 에피토프에 상응하는 짧은 아미노산 잔기를 언급한다. 에피토프 태그는 에피토프 태그 서열을 적당한 발현 벡터내의 단백질-암호화 서열에 첨가함에 의해 성취된다. 에피토프 태그된 단백질은 태그에 대해 만들어진 고도로 특이적인 항체를 사용하여 친화성으로 정제될 수 있다.
본원에 사용된 바와 같이, 금속 결합 서열은 일반적으로 금속 이온, 금속 이온 세트 또는 특정 금속 이온에 특이적으로 결합할 수 있는 단백질 또는 펩타이드 서열을 언급한다.
본원에 사용된 바와 같이, 용어 평가는 샘플내에 존재하는 프로테아제 또는 이의 도메인의 활성에 대한 절대 수치를 수득하고 또한 지수, 비, %, 활성 수준을 나타내는 가시적인 수치 또는 기타 수치를 수득한다는 관점에서 정량적 및 정성적 측정을 포함하는 것으로 의도된다. 평가는 직접 또는 간접적일 수 있고 실제적으로 검출되는 화학적 종은 물론 단백질 분해 생성물일 필요는 없지만 예를 들어, 이의 유도체 또는 몇몇 추가 물질일 수 있다. 예를 들어, 보체 단백질의 절단 생성물의 검출은 SDS-PAGE에 의해 수행되고 단백질을 쿠마시 블루로 염색시켜 수행된다.
본원에 사용된 바와 같이, 생물학적 활성은 화합물, 조성물 또는 기타 혼합물의 생체내 투여시 생성되는 생체내 화합물의 활성 또는 생리학적 반응을 언급한다. 따라서 생물학적 활성은 당해 화합물, 조성물 및 혼합물의 치료학적 효과 및 약제학적 활성을 포함한다. 생물학적 활성은 당해 첨가제를 시험하거나 사용하기 위해 디자인된 시험관내 시스템에서 관찰될 수 있다. 따라서, 본원의 목적을 위해, 프로테아제의 생물학적 활성은 폴리펩타이드가 가수분해되는 이의 촉매 활성이다.
본원에 사용된 바와 같이, 2개의 핵산 서열을 언급하는 경우 등가물은 미지의 2개의 서열이 동일한 아미노산 또는 등가의 단백질을 암호화하고 있음을 의미한다. 등가물이 2개의 단백질 또는 펩타이드를 언급하는데 사용되는 경우, 이것은 2개의 단백질 또는 펩타이드가 단백질 또는 펩타이드의 활성 또는 기능을 실질적으로 변화시키지 않는 단지 아미노산이 치환된 실질적으로 동일한 아미노산 서열을 갖고 있음을 의미한다. 등가물이 특정 성질을 언급하는 경우, 당해 성질은 동일한 정도로 존재할 필요는 없지만(예를 들어, 2개의 펩타이드는 동일 유형의 효소 활성의 상이한 정도를 나타낼 수 있다), 활성은 일반적으로 실질적으로 동일하다. 2개의 핵산 서열을 언급할때 상보적이라 함은 2개의 핵산 서열이 전형적으로 대응 뉴클레오타이드간에 미스매치가 25%, 15% 또는 5% 미만으로 하이브리드화할 수 있음을 의미한다. 경우에 따라, 상보성 %가 특정될 것이다. 전형적으로, 2개의 분자는 이들이 고엄중 조건하에서 하이브리드화하도록 선택된다.
본원에 사용된 바와 같이, 단백질의 활성 또는 유전자 또는 핵산의 발현을 조절하는 제제는 단백질의 활성을 감소시키거나 증가시키거나 달리 변화시키거나 몇몇 방식으로 세포내 핵산의 발현을 상향 또는 하향 조절하거나 달리 변화시킨다.
본원에 사용된 바와 같이, 약제학적 효과 또는 치료학적 효과는 질환 또는 장애의 치료 또는 이의 증상의 완화를 위해 의도된 제제의 투여시 관찰되는 효과를 언급한다.
본원에 사용된 바와 같이, "조절하다" 및 "조절" 또는 "변화"는 단백질과 같은 분자의 활성의 변화를 언급한다. 대표적인 활성은 시그날 전달과 같은 생물학적 활성을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 조절은 활성 증가(즉, 상향 조절 또는 효능제 활성), 활성 감소(즉, 하향 조절 또는 억제) 또는 활성의 임의의 다른 변화(예를 들어, 주기성, 빈도, 지속시간, 반응속도 또는 다른 계수의 변화)를 포함할 수 있다. 조절은 문맥에 따라 다양할 수 있고 전형적으로 조절은 예를 들어, 야생형 단백질, 항상성 상태의 단백질 또는 지정된 세포 유형 또는 조건에서 발현되는 단백질과 같이 지정된 상태와 비교된다.
본원에 사용된 바와 같이, "억제하다" 및 "억제"는 비억제된 활성에 상대적인 활성의 감소를 언급한다.
본원에 사용된 바와 같이, 조성물은 임의의 혼합물을 언급한다. 이것은 용제, 현탁액제, 액제, 페이스트 또는 이의 수성, 비수성 또는 임의의 조합일 수 있다.
본원에 사용된 바와 같이, 조합은 2개 이상의 항목간에 또는 이중에서의 임의의 연합을 언급한다. 당해 조합은 2개의 조성물 또는 2개의 수거물과 같이 2개 이상의 별도의 항목일 수 있거나 2개 이상의 항목의 단일 혼합물과 같은 혼합물일 수 있거나 이의 변형일 수 있다. 조합 요소는 일반적으로 기능적으로 연합되어 있거나 관련되어 있다. 키트는 임의로 조합 또는 이의 요소들에 대한 사용 지침서를 포함하는 팩키지된 조합물이다.
본원에 사용된 바와 같이, "질환 또는 장애"는 감염, 후천성 상태, 유전학적 상태를 포함하지만 이에 제한되지 않는 원인 또는 상태로부터 유래하고 확인가능한 증상에 의해 특징화되는 유기체중에서의 병리학적 상태를 언급한다. 본원에서 목적하는 질환 및 장애는 보체 활성화에 의해 매개되는 것들 및 보체 활성화가 병인 또는 병리에서 주요 역할을 하는 것들을 포함하는 보체 활성화가 관여하는 것들이다. 질환 및 장애는 또한 면역 결핍과 같은 단백질의 부재에 의해 유발되는 것들을 포함하고 이중에서 보체 활성화가 보체 단백질내 결핍으로 인해 발생되지 않는 장애가 관심대상이다.
본원에 사용된 바와 같이, 질환 또는 상태를 앓는 환자를 "치료하는"은 환자의 증상이 부분적으로 또는 전체적으로 약화되거나 치료 후 정체된 상태로 유지되는 것을 의미한다. 따라서, 치료는 예방, 치료 및/또는 치유를 포함한다. 예방은 잠재적인 질환의 예방 및/또는 증상의 악화의 예방 또는 질환 진행의 예방을 언급한다. 치료는 또한 변형된 인터페론 및 본원에서 제공되는 조성물의 임의의 약제학적 용도를 포함한다.
본원에 사용된 바와 같이, 치료제, 치료 방법, 방사선치료제 또는 화학적 치료는 당업자에게 공지된 백신을 포함하는 통상적인 약물 및 약물 치료제를 의미한다. 방사선치료제는 당업계에 널리 공지되어 있다.
본원에 사용된 바와 같이, 치료는 상태, 장애 또는 질환의 증상이 완화되거나 달리 이롭게 변화되는 임의의 방식을 의미한다. 치료는 또한 본원의 조성물의 임의의 약제학적 용도를 포함한다.
본원에 사용된 바와 같이, 치료학적 효과는 질환 또는 상태의 증상을 변화시키는, 전형적으로 개선시키거나 완화시키거나 질환 또는 상태를 치유하는 피검체의 치료로부터 비롯되는 효과를 의미한다. 치료학적 유효량은 피검체에 투여 후 치료학적 효과를 유도하는 조성물, 분자 또는 화합물의 양을 언급한다.
본원에 사용된 바와 같이, 용어 "피검체"는 사람과 같은 포유동물을 포함하는 동물을 언급한다.
본원에 사용된 바와 같이, 환자는 사람 피검체를 언급한다.
본원에 사용된 바와 같이, 예를 들어, 약제학적 조성물 또는 기타 치료제의 투여에 의한 치료를 통한 특정 질환 또는 장애의 증상의 완화는 조성물 또는 치료제의 투여와 연관되거나 이에 의해 유발될 수 있는 증상의 영구적 또는 일시적, 지속적으로 또는 일시적이든지 상관없이 임의의 감소를 언급한다.
본원에 사용된 바와 같이 차단 또는 예방은 질환 또는 상태가 발생할 위험이 감소되는 방법을 언급한다.
본원에 사용된 바와 같이, 유효량은 질환 또는 장애의 증상을 예방하거나, 치유하거나 완화시키거나 억제하거나 부분적으로 억제하는데 필요한 치료제의 양이다.
본원에 사용된 바와 같이, 변형된 프로테아제와 같은 프로테아제의 투여는 프로테아제가 이의 기질과 접촉되는 임의의 방법을 언급한다. 투여는 생체내, 생체외 또는 시험관내에서 수행될 수 있다. 예를 들어, 생체외 투여를 위해, 혈액과 같은 체액은 피검체로부터 제거되고 체외에서 변형된 비-보체 프로테아제와 접촉시킨다. 생체내 투여를 위해, 변형된 프로테아제는 예를 들어, 국부, 국소, 전신 및/또는 기타 도입 경로에 의해 체내로 도입될 수 있다. 시험관내 투여는 세포 배양 방법과 같은 방법을 포함한다.
본원에 사용된 바와 같이 단위 용량 형태는 당업계에 공지되어 있는 바와 같이 사람 및 동물 피검체에 적합하고 개별적으로 팩키징되는 물리적으로 구분된 단위를 언급한다.
본원에 사용된 바와 같이, 단일 용량 제형은 직접 투여를 위한 제형을 언급한다.
본원에 사용된 바와 같이, "제품"은 제조되고 시판되는 생성물이다. 본원 전반에 걸쳐 사용되는 바와 같이 당해 용어는 팩키징 제품에 포함되는 변형된 프로테아제 폴리펩타이드 및 핵산을 포함하는 것으로 의도된다.
본원에 사용된 바와 같이, 유체는 유동할 수 있는 임의의 조성물을 언급한다. 유체는 반고체, 페이스트, 용제, 수성 혼합물, 겔, 로션, 크림 및 기타 조성 형태의 조성물을 포함한다.
본원에 사용된 바와 같이, "키트"는 임의로 배합 요소들을 사용하여 방법을 수행하기 위한 시약 및 기타 생성물 및/또는 성분들을 포함하는 팩키징된 배합물을 언급한다. 예를 들어, 본원에 제공된 변형된 프로테아제 폴리펩타이드 또는 핵산 분자 및 투여, 진단 및 생물학적 활성 또는 성질의 평가를 포함하지만 이에 제한되지 않는 목적을 위한 기타 항목을 함유하는 키트가 제공된다. 키트는 임의로 사용 지침서를 포함한다.
본원에 사용된 바와 같이, 세포 추출물 또는 용해물은 용해되거나 파쇄된 세포로부터 형성된 제제 또는 분획물을 언급한다.
본원에 사용된 바와 같이, 동물은 영장류, 예를 들어, 사람, 고릴라 및 원숭이; 설치류, 예를 들어, 마우스 및 랫트; 가금류, 예를 들어, 닭; 반추동물, 예를 들어, 염소, 소, 사슴, 양; 양과 같은 동물, 예를 들어, 돼지 및 기타 동물과 같은 임의의 동물을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 비-사람 동물은 고려되는 동물로서 사람을 배제한다. 본원에 제공된 프로테아제는 임의의 공급원, 동물, 식물, 원핵세포 및 진균류로부터 기원하는 것이다. 대부분의 프로테아제는 포유동물 기원을 포함하는 동물 기원이다.
본원에 사용된 바와 같이, 대조군은 시험 샘플과 실질적으로 동일한 샘플을 언급하고 단, 이것은 시험 계수로 처리되지 않거나 샘플 혈장 샘플인 경우 이것은 목적하는 상태를 앓지 않는 정상적인 지원자로부터 기원하는 것일 수 있다. 대조군은 또한 내부 대조군일 수 있다.
본원에 사용된 바와 같이, 단수 형태("a," "an" 및 "the")는 문맥에서 다르게 지정하지 않는 경우 복수개의 지시물을 포함한다. 따라서, 예를 들어, "세포외 도메인"을 포함하는 화합물에 대한 언급은 하나 또는 복수개의 세포외 도메인을 갖는 화합물을 포함한다.
본원에 사용된 바와 같이, 당해 범위 및 양은 대략적인 특정 값 또는 범위로서 표현될 수 있다. "약"은 또한 정확한 양을 포함한다. 따라서, "약 5개의 염기"는 "약 5개의 염기" 및 또한 "5개의 염기"를 의미한다.
본원에 사용된 바와 같이, "임의의" 또는 "임의로"는 후속적으로 기재된 사건 또는 상황이 일어나거나 일어나지 않고 당해 기개된 내용이, 사건 또는 상황이 일어나는 경우 및 이것이 일어나지 않는 경우를 포함함을 의미한다. 예를 들어, 임의로 치환된 그룹은 당해 그룹이 치환되지 않거나 치환됨을 의미한다.
본원에 사용된 바와 같이, 임의의 보호 그룹, 아미노산 및 기타 화합물에 대한 약어는 달리 지시되지 않는 경우 이의 공통된 용법, 인지된 약어 또는 생화학적 명명법에 대한 IUPAC-IUB 규정[IUPAC-IUB Commission on Biochemical Nomenclature (참조: (1972) Biochem . 11:1726)]에 따른 것이다.
B. 프로테아제의 스크리닝 방법
본원에서는 변화된 성질, 특히 기질 특이성 및 선택성을 갖는 프로테아제를 스크리닝하는 방법이 제공된다. 당해 방법은 또한 실질적으로 변화되지 않거나 치료학적 용도를 위해 충분한 활성을 갖는 변화된 프로테아제를 제공한다. 본원에 제공된 방법은 프로테아제 변형 및 변형된 프로테아제의 디자인을 위한 임의의 방법과 함께 사용될 수 있다. 당해 방법은 라이브러리를 제조하기 위한 무작위 방법, 현존의 라이브러리의 사용 및 또한 지시된 전개 방법을 포함한다.
기질 특이성/선택성이 변화된 프로테아제를 확인하기 위한 다양한 선택 계획이 사용되어 왔지만 각각은 한계점을 갖는다. 본원에 제공된 당해 방법은 당해 간계점을 극복한다. 일반적으로 선택 계획은 1) 프로테아제 결합에 대해 선택하거나 2) 프로테아제 촉매에 대해 선택하는 계획들을 포함한다. 프로테아제 결합을 이용하는 전략의 예는 예를 들어, 전이 상태 유사체(TSA)의 사용 및 소분자 자살 기질을 사용하는 것들을 포함한다. TSA는 프로테아제의 전이 상태(기질 반응)의 전자적 특징 및 구조적 특징을 모방하는 안정한 화합물이다. 프로테아제와 기질간의 가장 강한 상호작용은 전형적으로 반응의 전이 상태에서 일어난다. TSA는 높은 결합 친화성을 갖는 프로테아제를 선별하기 위한 모델 기질로서 사용된다. TSA는 결코 실제 전이상태를 완벽하게 모방하지는 않고 이의 합성은 어렵다(참조: Bertschinger et al. (2005) in Phage display in Biotech . and Drug Discovery (Sidhu S, ed), pp. 461-491). 당해 전략은 기질 특이성이 변화된 프로테아제 변이체를 확인하였지만 당해 프로테아제는 일반적으로 프로테아제 촉매를 위한 요구조건이 선별 계획의 일부가 아니기 때문에 감소된 활성을 나타낸다.
또 다른 전략에서, 소분자 자살 기질(또한 기전을 기초로 하는 억제제로서도 호칭됨)은 결합을 기초로 하는 프로테아제를 선별하기 위해 사용되어 왔다. 당해 자살 기질은 전형적으로 효소의 활성 부위에 공유적으로 결합하는 소분자이다. 이들 자살 기질은 효소의 친핵체와 반응하여 공유 결합을 형성하는 반응성 친전자체를 함유한다. 프로테아제에 의한 천연 펩타이드 결합의 절단은 당해 반응을 위해 요구되지 않는다. 전형적으로, 당해 억제제는 올바른 효소에 결합하여 정상적인 촉매 단계를 수행하는 경우에만 반응성 친핵체를 생성한다(참조: Bertschinger et al. (2005) in Phage display in Biotech . and Drug Discovery (Sidhu S, ed), pp. 461-491). 많은 경우에, 기질 억제제는 촉매에 관여하는 제1 전이 상태의 구조를 모방하지만 완전한 촉매 사이클을 허용하지 않는다. 결과로서, 당해 억제제의 사용은 촉매 대신 강한 결합을 선별하고 기질의 손상된 해리를 갖는 비활성 효소를 선별한다(참조: Droge et al. (2006) ChemBioChem, 7:149-157). 또한, 이들의 크기 및 기질의 절단을 위한 요구조건의 부재로 인해, 이들은 천연 단백질 기질과 프로테아제의 상호작용을 재현하지 못한다.
결합 대신 촉매를 선별하는 프로테아제 선택 전략은 또한 시도되었다(참조: Heinis et al. (2001), Protein Engineering, 14: 1043-1052). 촉매에 대한 분석에서 주요 한계점중 하나는 반응 생성물이 반응이 완결된 후 신속하게 확산되어 촉매 활성 효소를 분리하기 어렵게 한다는 것이다. 결과적으로, 촉매를 선별하는 전략은 기질과 효소를 파지에 접착시켜 이들이 근접하게 존존재하도록 하는 것에 의존한다. 예를 들어, 단백질 칼모듈린은 고정화제로서 사용되어 왔다(참조: Demartis (1999) J Mol. Biol., 286:617-633). 반응 기질은 카모듈린 결합 펩타이드 유도체를 사용하여 카모듈린-태그된 효소상에 비공유적으로 접착된다. 촉매 후, 반응 생성물을 나타내는 파지는 항-생성물 친화성 시약을 사용하여 비-촉매 활성 파지로부터 분리된다. 그러나 기질은 파지 입자에 접착되어 있기 때문에 촉매 반응은 방해될 수 있다. 따라서, 프로테아제 선택을 위한 당해 방법 및 기타 방법은 한계점을 갖고 있고 특이성이 변화되고 실질적으로 변화되지 않은 치료학적 적용을 위해 충분한 활성을 갖는 프로테아제를 확인하지 못한다. 본원에 제공된 당해 방법은 이들 한계점을 해결한다.
본 출원은 기질 특이성이 변화되거나 최적화되거나 개선된 프로테아제 및/또는 프로테아제 변이체를 확인하기 위한 프로테아제 선별 방법을 제공한다. 당해 프로테아제는 최적화, 및 예를 들어, 질환 또는 장애의 병인에 관여하는 단백질 표적과 같은 목적하는 단백질 표적을 절단하고 불활성화(또는 활성화)시킬 수 있는 치료학적 프로테아제로서의 사용을 위해 확인된다. 본원에 제공된 프로테아제를 스크리닝하는 방법에서, 후보 프로테아제가 프로테아제 효소적 반응의 안정한 중간 복합체로서 포획되고 이어서 확인된다. 당해 안정한 중간체 복합체는 전형적으로 공유 복합체 또는 비-복합체화된 분자로부터 분리될 수 있는 임의의 기타 복합체이다. 당해 중간체는 예를 들어, 선택되거나 미리 결정된 기질 특이성을 갖는 프로테아제의 포획 및 궁극적으로 이의 확인을 가능하게 하는 아실 효소 중간체를 포함한다. 프로테아제의 포획(capture)(포획(trapping))은 프로테아제 수거물을, 프로테아제에 의해 절단되고 절단 즉시 안정한 복합체를 형성하는 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 접촉시킴에 의해 수행된다. 당해 프로테아제 포획 폴리펩타이드의 예는 서핀, 알파 2 마크로글로불린 및 기타 당해 분자이다. 당해 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 천연의 것일 수 있고/있거나 특정 표적 기질을 선별하도록 변형될 수 있다.
당해 방법을 수행하는데 있어서, 프로테아제 수거물, 전형적으로 변형되거나 돌연변이 프로테아제 및/또는 천연 프로테아제의 수거물을, 기질 절단 후 프로테아제와 반응하여 포획된 중간체를 함유하는 복합체를 형성하는 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 접촉시킨다. 이들 방법을 사용하여 목적하는 기질 특이성/선택성을 갖는 프로테아제를 확인할 수 있다. 목적하는 기질 특이성/선택성을 갖는 프로테아제의 확인을 성취하기 위해, 절단 용이한 결합의 아미노산 서열 및/또는 반응성 부위에서 주변 서열, 예를 들어, 반응성 루프 서열 또는 유사 서열은 프로테아제 포획 폴리펩타이드에서 변형되어 목적하는 표적 기질의 기질 절단 서열을 모방할 수 있다.
당해 스크리닝 반응은 프로테아제 수거물을, 안정한 복합체, 전형적으로 공유 복합체를 형성하는 조건하에서 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 접촉시킴에 의해 수행된다. 당해 복합체는 기타 덜 안정한 복합체 및 반응되지 않은 프로테아제 포획 폴리펩타이드로부터 분리를 허용하기에 충분한 안정성을 갖는다.
당해 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 확인가능하게 표지시키거나 치환성 태그화시켜 복합체의 확인을 용이하게 할 수 있다. 예를 들어, 형광 잔기, 친화성 태그 또는 기타 표지화/태그화 제제에 의한 프로테아제 포획 폴리펩타이드의 표지화는 프로테아제-억제제 복합체의 분리 및 선별된 프로테아제의 확인을 용이하게 한다. 선별된 프로테아제는 단백질분해 효능 및 기질 특이성을 평가하기 위해, 활성에 대해 분석될 수 있다. 당해 확인되거나 선별된 프로테아제는 또한 예를 들어, 서열분석, 또는 질량 분광측정 방법을 포함하는 기타 확인 프로토콜에 의해 또는 복합체내에서 선별된 프로테아제를 확인하기 위한 다른 표지화 방법에 의해 확인될 수 있다.
본원에 제공된 방법은 또한 임의의 반복적인 스크리닝 단계를 포함하여 당해 방법은 목적하거나 미리 결정된 특이성/선택성 및/또는 절단 활성을 갖는 프로테아제에 대해 1회 수행되거나 다중 회차로 수행될 수 있다. 예를 들어, 프로테아제 선별은 무작위로 또는 실험적으로 또는 시스템적으로 선별된 프로테아제(표적화된 영역내 및/또는 길이를 따라)를 변형시키고 프로테아제 수거물을 하나 이상의 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 접촉시키는 방법을 반복(1회, 2회, 3회 또는 4회 이상 회차)함을 포함할 수 있다.
본원에 제공된 방법은 예를 들어 2개 이상의 상이하게 표지되거나 상이하게 확인가능한 프로테아제 포획 폴리펩타이드를 포함시킴에 의해 조합될 수 있다.
본원에 제공된 방법에서, 프로테아제 포획 폴리펩타이드가 적어도, 전형적으로 1%, 2%, 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90% 이상의 검출가능한 퍼센테이지가 덜 안정한 복합체 또는 반응되지 않은 프로테아제 포획 폴리펩타이드중에서 분리되거나 달리 확인될 수 있는 안정한 복합체를 형성할 수 있는 한 복합체화 반응에서 100% 또는 심지어 그 이상의 효율을 나타낼 필요는 없다. 따라서, 프로테아제는, 프로테아제 촉매 반응을 예를 들어, 1%, 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 99% 이상으로 억제하는 프로테아제 포획 폴리펩타이드에 의해 100% 초과로 억제되는 반응에서 분획화가 일어나는 경우 선택될 수 있다. 본원에 제공된 방법에서, 선택 및 기타 계수의 엄중성은 예를 들어, 반응 시간, 온도, pH, 이온 농도 및/또는 라이브러리 기질 농도를 조절함에 의해 조절될 수 있다. 특이성 제약은 또한 선택 동안에 예를 들어, 목적하지 않은 기질 절단 서열을 함유하는 특이적 경쟁인자 또는 광범위한 부류의 경쟁인자, 예를 들어, 사람 혈장과 같은 경쟁인자를 포함시킴에 의해 조절될 수 있다.
본원에 제공된 방법은 또한 프로테아제 수거물을 하나의 프로테아제 포획 폴리펩타이드 또는 예를 들어 복합시킴에 의해 상이한 프로테아제 포획 폴리펩타이드의 혼합물과 접촉시킴에 의해 수행될 수 있다. 다수의 상이한 프로테아제 포획 폴리펩타이드가 사용되는 경우, 각각의 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 개별적으로 독특하게 표지되어 이들이 확인가능하게 검출될 수 있다. 당해 방법은 단일 반응에서 프로테아제 수거물로부터 다수의 프로테아제의 분리 및 확인을 가능하게 한다.
본원에 제공된 방법은 프로테아제의 수거물이 한번에 스크리닝되어 목적하거나 미리 결정된 특이성을 갖는 것들을 확인할 수 있게 한다. 프로테아제의 수거물은 다양한 야생형 프로테아제, 변형된 프로테아제, 이의 혼합물 및 또한 이의 단백질분해 활성 부분의 수거물을 포함하는, 임의의 프로테아제 수거물을 포함한다. 임의의 수거물이 사용될 수 있다. 당해 수거물은 또한 돌연변이 프로테아제 세트 또는 돌연변이를 포함하는 이의 단백질분해 활성 부분으로 구성될 수 있다. 당해 수거물은 수거물내 구성원이 다양한 돌연변이를 포함하는 조합 수거물을 포함한다. 당해 돌연변이는 프로테아제(또는 이의 촉매 활성 부분)의 길이를 따라 무작위일 수 있거나 예를 들어, 프로테아제의 특이성 결합 포켓과 같은 특정 위치 또는 영역으로 표적화될 수 있다. 본원에 제공된 방법은 이전에 특이성 결정요소로서 관여하지 않는 것으로 평가된 비-접촉 잔기(즉, 매장된 잔기)를 확인하고 발견할 수 있다. 따라서, 본원에 제공된 당해 프로테아제 선택 기술 방법을 사용하여 전반적으로 새로운 특이성 및 활성을 갖는 프로테아제를 제조하고/하거나 현존의 프로테아제의 특이성 또는 활성을 최적화시킬 수 있다.
C. 프로테아제 포획 폴리펩타이드
본원에 제공된 방법에 사용되는 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 절단시 안정한 프로테아제-기질 중간체 복합체를 형성하는, 프로테아제에 대해 기질로 작용하는 반응 부위를 포함하는 폴리펩타이드 또는 폴리펩타이드 부분이다. 일반적으로, 당해 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 포획된 기질-프로테아제 복합체를 생성시키는 프로테아제에 의한 절단 용이한 결합(P1-P1')의 절단을 요구하는 폴리펩타이드이다. 안정한 복합체는 전형적으로 공유 결합, 이온 결합, 소수성 결합 또는 기타 단단한 결합으로 인해 프로테아제와 프로테아제 포획 폴리펩타이드간의 결속된 상호작용을 통해 비가역적으로 형성되는 복합체이다. 이와 같이, 복합체는 일반적으로 수시간, 수일 또는 수주 이상 동안 안정하여 복합체의 분리를 허용한다. 하나의 예에서, 안정한 중간체 복합체는 세린 또는 시스테인 프로테아제와 프로테아제 포획 폴리펩타이드의 반응시 형성되는 아실 효소 중간체일 수 있다. 가장 일반적으로, 프로테아제 포획 폴리펩타이드 절단 후, 복합체내 신속한 구조적 변화는 프로테아제를 비틀어 아실-효소 복합체의 탈아실화를 방해한다. 따라서, 프로테아제를 프로테아제 포획 폴리펩타이드로 패닝(panning)시킴으로써 촉매의 속도결정 단계(즉, P1-P1' 결합의 절단 및 효소의 아실화)를 선별할 수 있고 동시에 수거물 혼합물로부터 용이하게 분리되는 매우 결속된(즉, 공유) 복합체를 형성할 수 있다.
전형적으로, 당해 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 프로테아제에 의해 인지되는 반응성 부위 서열을 포함하는 대형(100개 초과의 아미노산)의 단일 도메인 단백질이다. 일반적으로, 반응성 부위 절단 서열은 표적 기질이 되도록 유연하고 노출되고 긴 대형의 반응 루프의 일부(참조: Otlewski et al. (2005) The EMBO J. 24: 1303-1310)지만 프로테아제 포획체가 프로테아제에 의해 절단되어 기질 절단을 모방할 수 있는 반응성 부위 서열을 포함하는 한, 이것은 본원에 제공된 방법에 사용될 수 있다. 따라서, 프로테아제에 의해 절단되는 절단 용이한 결합을 함유하여 오랫동안 지속적으로 안정한 복합체내에 프로테아제를 포획하는 임의의 대형 폴리펩타이드 또는 합성적으로 생성된 폴리펩타이드는 본원에 제공된 방법에 사용될 수 있다. 당해 프로테아제 포획 폴리펩타이드의 예는 본원에 임의로 기재된 서핀이다. 기타 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 또한 본원에 제공된 방법에 사용될 수 있고 예를 들어, 이의 임의의 작용 기전은 서핀 분자의 기전과 유사하다. 이들은 예를 들어, 합성 또는 재조합적으로 제조된 서핀형 분자 또는 서핀 분자의 반응성 부위 루프의 충분한 부분을 포함하는 서핀 분자의 연속 단편 또는 서열을 포함하는 폴리펩타이드를 포함한다. 또한, 억제 기전이 서핀 기전과 유사한 기타 프로테아제 억제제가 사용될 수 있고 예를 들어, 카스카파제를 억제하는 바쿨로바이러스 p35 단백질이 있다(참조: Xu et al. (2001) Nature, 410:494-497; Otlewski et al. (2005) The EMBO J. 24: 1303-1310). 기타 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 용이하게 분리될 수 있는, 안정한 복합체로 프로테아제를 포획하는 임의의 폴리펩타이드를 포함하고 예를 들어, 알파 2 마크로글로불린이 있지만 이에 제한되지 않는다.
1. 서핀 : 구조, 기능 및 발현
서핀(세린 프로테아제 억제제)은 정상적으로 약 60개 미만의 아미노산인 기타 세린 프로테아제 억제제와 비교하여 대형 단백질 분자(약 330 내지 500개 아미노산)인 프로테아제 억제제이다. 서핀 슈퍼패밀리는 가장크고 가장 광범위하게 분포된 프로테아제 억제제이다. 1,500개 이상의 서핀 계열 구성원이 지금까지 다양한 상이한 동물, 폭스바이러스, 식물, 세균 및 고세균(Archea)에서 확인되었고(참조: Law et al. (2006) Genome Biology, 7:216), 지금까지 30개 이상의 상이한 사람 서핀이 연구되고 있다. 대부분의 사람 서핀은 혈액내에서 발견되고 여기서 이들은 예를 들어, 염증, 보체, 응집 및 섬유용해성 캐스케이드를 포함하는 광범위한 조절 역할에서 기능한다. 서핀은 또한 세포내에서 예를 들어, 비적절한 세포독성 프로테아제의 방출과 같은 세포보호 역할을 수행하는 기능을 한다. 대부분의 서핀이 프로테아제 활성에 대해 억제 역할을 갖지만 몇몇 서핀은 이에 제한되지 않지만 호르몬 수송체, 코르티코스테로이드 결합 글로불린 및 혈압 조절과 같은 기타 비-억제 역할을 수행한다(참조: Silverman et al. (2001) JBC, 276: 33293-33296). 비-억제 서핀중에는 스테로이드 결합 글로불린 및 오브알부민이 있다. 전형적으로, 서핀은 세린 프로테아제의 작용을 억제하지만 몇몇 서핀은 파파인형 시스테인 프로테아제 또는 카스파제인 것으로 확인되었다(참조: Whisstock et al. (2005) FEBS Journal, 272: 4868-4873).
서핀 계열 구성원중의 서열 실체는 빈약하지만 이의 구조는 고도로 보존되어 있다. 예를 들어, 서핀 계열의 구성원은 서핀 알파-안티트립신과 약 30%의 아미노산 서열 상동성을 공유하고 보존된 3차원 구조를 갖는다. 구조적으로, 서핀은 3개의 쉬트(A, B 및 C) 및 8 내지 9개의 나선구조(A-I)로 이루어지고 이들은 상부-배럴 도메인 및 낮은 나선구조의 도메인을 구성한다. 2개의 도메인은 서핀의 주요 구조적 특징인 5개 쇄의 B-쉬트 A에 의해 연결되어 있다(참조: Huntington et al. (2003), J. Thrombosis and Haemostasis, 1: 1535-1549). 서핀은 준안정성 단백질이어서 이들은 이들의 활성 형태에서 부분적으로 안정하고; 이들은 완전히 안정한 구조를 갖는데 프로테아제를 필요로 한다. 반응성 부위 루프(RSL)로 호칭되는 루프는 서핀 분자의 변화된 구조에 관여한다. RSL은 A와 C-쉬트 사이의 영역에서 분자의 상부로부터 돌출되어 있는 약 17개의 아미노산 잔기의 노출된 연장부이다. RSL은 프로테아제 인지 부위로서 작용하고 일반적으로 프로테아제 특이성에 대해 유일한 결정요소를 포함한다. 서핀 구조의 가장 안정한 형태는 RSL-절단된 형태이다. 프로테아제 절단 후, RSL의 아미노 말단부는 β-쉬트 A의 중앙으로 삽입되어 6개의 쇄로 이루어진 β-쉬트의 쇄 4가 된다. 이러한 구조적 변화는 "억압된"에서 "이완된"으로의(또는 S에서 R로의) 전이로 호칭된다. 이러한 변환은 5개 쇄로 이루어진 β쉬트 A의 6개 쇄로 이루어진 역평행 형태로의 재구성으로 분자의 열적 안정성이 증가된 것을 특징으로 한다(참조: Lawrence et al. (2000), J Biol . Chem., 275: 5839-5844). 다른 말로, 서핀의 본래의 구조는 단지 프로테아제 절단 후 보다 안정한 구조로 전환되는 잠재적인 중간체와 동일하다(참조: Law et al . (2006) Genome Biology , 7:216).
전형적으로, 서핀은 세린 프로테아제를 표적화하지만 몇몇 서핀은 유사한 기전을 사용하여 시스테인 프로테아제를 억제한다. RSL 루프는 이것이 표적 프로테아제에 대한 가-기질을 제공함으로써 어느 프로테아제가 억제를 위해 표적화되는 지를 결정한다. 효과적으로, 특정 서핀의 억제 특이성은 서핀중에서 가장 가변성 영역인 RSL 서열에 의해 매개된다(참조: Travis et al. (1990) Biol . Chem . Hoppe Seyler, 371: 3-11). RSL은 프로테아제의 기질 인지 서열을 모방하고 이로써 ...Pn-P3-P2-P1-P1'-P2'-P3'-P'n...으로서 번호매견진 반응성 부위를 함유하고, 이때 반응성 부위는 P1과 P1' 사이에서 절단 용이한 결합이다. 성숙한 α1-안티트립신에 대하여 P1-P1' 결합에서의 절단은 Met358-Ser359 결합(서열번호 1에 제시된 아미노산 서열의 아미노산 Met382 및 Ser389에 상응하는)에서 일어난다. 프로테아제상의 잔기에 대한 상응하는 결합 부위는 ...Sn-S3-S2-S1-S1', S2', S3', Sn'-...이다. 본원에 제공된 방법에서, RSL 서열은 하기에서 상세하게 논의되는 바와 같이 변화된 기질 특이성을 나타내는 디스플레이 라이브러리로부터 프로테아제를 선별하기 위해 변형시킨다.
2. 프로테아제 촉매, 서핀의 억제 기전 및 아실 효소 중간체의 형성
본원에 제공된 프로테아제 선별 방법은 프로테아제를 포획하는 폴리펩타이드의 능력을 이용하고 예를 들어, 변화된 기질 특이성을 갖는 프로테아제를 확인하기 위한 서핀으로 예시된다. 프로테아제 촉매 기전은 단백질분해 효소 부류: 세린, 시스테인, 아스파르트산, 트레오닌 또는 메탈로 프로테아제간에 약간 상이하다. 예를 들어, 세린 펩티다제는 활성 중심에 포함된 세린 잔기를 갖고 아스파르트산 펩티다제는 촉매 중심에 2개의 아스파르트산을 갖고 시스테인형 펩티다제는 시스테인 잔기를 갖고 트레오닌형 펩티다제는 트레오닌 잔기를 갖고 메탈로-펩티다제는 촉매 기전에서 금속 이온을 사용한다. 일반적으로, 공유 중간체를 형성하는 당해 프로테아제 계열은 본원에 제공된 프로테아제 선별 방법의 표적이다. 이들은 예를 들어, 세린 및 시스테인 프로테아제 계열의 구성원을 포함한다. 하나의 예로서, 세린 프로테아제에 대해, 촉매에서의 제1 단계는 프로테아제의 촉매 중심에서 기질과 세린간의 아실 효소 중간체의 형성이다. 당해 공유 중간체의 형성은 음전하 사면체 전이 상태 중간체를 통해 진행하고 이어서 기질의 P1-P1' 펩타이드 결합은 절단된다. 제2 단계 또는 탈아실화 동안에, 아실-효소 중간체는 물 분자에 의해 가수분해되어 펩타이드를 방출하고 효소의 Ser-하이드록실을 복귀시킨다. 또한 사면체 전이 상태 중간체의 형성을 포함하는 탈아실화는 아실화의 역반응 경로를 통해 진행한다. 탈아실화를 위해, 물 분자는 Ser 잔기를 대신하는 공격성 친핵체이다. 세린 프로테아제의 촉매 중심에서 His 잔기는 일반적인 염기를 제공하고 반응성 Ser의 OH 그룹을 수용한다.
서핀은 상기 언급된 바와 같이 S의 R로의 전이를 사용하여 세린 및 시스테인 표적 프로테아제 둘다의 촉매 반응을 억제한다. 프로테아제 억제제중에서 이들의 작용 기전은 탈아실화 진행 전 프로테아제의 활성 부위를 파괴하여 아실-효소 중간체의 형성 후 비가역적으로 단백질분해를 방해함으로써 독특하다(참조: Otlewski et al. (2005) The EMBO Journal, 24: 1303). 서핀과 프로테아제의 반응속도론적 반응 모델은 기질의 단백질분해 모델과 동일하다(참조: Figure 1; Zhou et al. (2001) J. Biol. Chem., 276: 27541-27547). 표적 프로테아제와 상호작용 후, 당해 서핀은 초기에 P1-P1' 절단 용이한 결합을 플랭킹하는 RSL내 잔기의 상호작용을 통해 비공유 마이켈리스형 복합체를 형성한다(참조: Silverman et al. (2001), J. Biol. Chem., 276: 33293-33296). 프로테아제의 활성 부위에서 세린 잔기(세린 프로테아제의 경우)는 P1-P1' 결합을 공격하여 펩타이드 결합의 절단 및 P1 잔기의 세린 잔기와 골격 카보닐 사이의 공유 에스테르 연결 형성을 촉진한다. RSL이 절단된 후, RSL은 서핀 분자의 β-쉬트 A로 삽입된다. 삽입체에 대한 제1 잔기는 P14 (즉, 서열번호 1에 제시된 아미노산 서열에서 아미노산 위치 T369에 상응하는 성숙한 α1-안티트립신에서 아미노산 345)이고 이어서 RSL의 유연성 힌지 영역(P15-P9)이 있다(참조: Buck et al . (2005) Mol . Biol . Evol., 22: 1627-1634). RSL의 삽입은 이와 함께 공유 결합된 프로테아제를 수송하여 서핀의 이완된 상태로의 전이 뿐만 아니라 비틀어진 활성 부위(도 1 참조)를 특징으로 하는 프로테아제의 형태적 변화를 유도한다. 프로테아제의 형태적 변화는 활성 부위의 트리아드를 변화시켜 P1 측쇄가 S1 포켓으로부터 제거된다. 형태적 재배열의 전체 결과는 아실 효소 중간체의 포획이다(참조: Silverman et al. (2001), J. Biol . Chem., 276: 33293-33296).
아실 표소의 형성은 서핀 상호작용에 중요하고 따라서 서핀은 전형적으로 촉매에서 아실 효소 중간체를 갖는 프로테아제 부류에 특이적이다. 이들 부류의 프로테아제중에는 주로 하기에 보다 상세하게 기재되는 프로테아제의 키모트립신 슈퍼패밀리중의 것들 및 프로테아제의 서브틸리신 슈퍼패밀리중의 것들을 포함하는 세린 프로테아제 계열의 구성원이 있다. 추가로, 서핀은 또한 예를 들어, 세린 프로테아제의 파파인 계열 및 카스파제 계열중의 것들을 포함하는 시스테인 프로테아제에 대항하여 반응성이다. 전형적으로, 서핀은 메탈로-, 트레오닌 또는 아스파르트산 계열의 프로테아제를 억제하지 않는다. 예를 들어, 서핀과 메탈로프로테아제의 상호작용은 공유 포획된 중간체를 유도하지 않지만 대신에 메탈로프로테아제는 임의의 복합체 형성 없이 억제제를 절단한다(참조: Li et al. (2004) Cancer Res. 64: 8657-8665).
따라서, 대부분의 서핀이 키모트립신 계열의 세린 프로테아제를 억제하지만 시스테인 프로테아제를 억제하는 교차 부류 억제제가 존재한다. 교차-부류 억제제중에는 둘다 카스파제 1을 억제하는 바이러스 서핀 CrmA 및 PI9 (SEPRINB9)이 있고, 카텝신 L, K 및 S를 포함하는 파파인형 시스테인 프로테아제를 억제하는 SCCA1(SERPINB3)이 있다. 세린 프로테아제의 서핀 매개 억제 기전은 또한 시스테인 프로테아제에 적용되는 것으로 나타난다. 그러나 당해 차이점은 반응속도론적으로 포획된 중간체가 세린 프로테아제의 경우에서와 같이 옥시 에스테르가 아닌 티올 에스테르라는 것이다(참조: Silverman et al. (2001) J. Biol . Chem., 276:33293-33296). 안정한 공유 티올 에스테르 유형 연결의 존재는 SCCA1과 카덴신 S간의 SDS-안정한 복합체의 검출에 의해 지지된다(참조: Silverman et al. (2001) J. Biol . Chem., 276:33293-33296; Schick et al. (1998) Biochemistry, 37:5258-5266).
당해 서핀-프로테아제 쌍은 수주에서 수년 동안 서핀-프로테아제 쌍에 따라 고도로 안정하지만 결국에는 해리되어 정상적인 단백질분해 생성물(즉, 절단된 서핀 및 활성 프로테아제; 참조: Zhou et al. (2001) J. Biol . Chem., 276: 27541-27547)을 생성하게 된다. 또한, RSL 루프가 프로테아제로 충분히 신속하게 삽입되지 않는 경우, 반응은 직접적으로 절단된 생성물로 진행한다. 이러한 현상은 분할로서 호칭되고 억제된 복합체의 형성 대 비-억제 경로로서 도 1에 도시된 바와 같은 안정한 억제 복합체 또는 서핀의 기질로의 턴오버를 유도할 수 있는 분기되는 경로의 존재를 반영한다(참조: Lawrence et al. (2000), J. Biol . Chem., 275: 5839-5844). 서핀의 분할은 RSL 루프, 특히 루프 삽입을 개시하는 RSL의 힌지 영역(즉, P14)에서 잔기를 변화시킴에 의해 또는 서핀이 최적으로 상호작용하도록 프로테아제를 변화시킴에 의해 조절될 수 있다. 예를 들어, 서핀 플라스미노겐 활성화인자 억제제-1(PAI-1)의 억제 활성은 프로테아제 uPA, tPA와 트롬빈간에 상이하고 uPA 및 tPA에 대한 표적화된 선호도를 갖는다. 추가로, 예를 들어, 힌지 영역의 P14에서 RSL 루프의 변이는 PAI-1의 표적화된 선호도를 변화시키고 하전된 아미노산(즉, Arg, Lys, Asp, Glu)에 대한 돌연변이는 uPA, tPA 및 트롬빈 각각에 대한 PAI-1의 억제 활성을 감소시키고 중성 아미노산(즉, His, Tyr, Gln, Asn)에 대한 돌연변이 또는 측쇄가 없는 Gly에 대한 돌연변이는 uPA에 비해 tPA 및 트롬빈에 대한 억제 활성을 10 내지 100배 감소시키고; 소수성 아미노산에 대한 돌연변이는 야생형 PAI-1에 비해 PAI-1의 억제 활성을 변화시키지 않는다(참조: Lawrence et al. (2000), J. Biol . Chem., 275: 5839-5844).
성공적인 프로테아제 촉매의 서핀 매개된 억제에서 중요한 인자는 RSL 루프의 길이이고 이는 서핀과 프로테아제가 서핀과 프로테아제의 몸체간의 레버리지를 제공하여 활성 부위로부터 촉매 세린의 전위 및 프로테아제의 변형을 허용하는 방식으로 상호작용하도록 보장하기에 정확한 길이이어만 한다(참조: Zhou et al. (2001) J. Biol . Chem., 276: 27541-27547; Huntington et al. (2000) Nature , 407:923-926). 실제로, 당해 프로테아제는 서핀의 몸체에 대하여 압착된다. 대부분의 서핀은 길이가 17개 잔기인 RSL을 갖고 단지 몇개(즉, α2-안티플라스민, C1-억제제 및 CrmA)는 16개 잔기의 루프를 갖는 것으로 확인되었다. α2-안티플라스민 변이체 서핀은 18개 잔기 루프를 갖고 출혈 장애를 갖는 환자로부터 확인되었지만 이러한 변이체는 기능적 억제 서핀이 아니다(참조: Zhou et al. (2001) J. Biol. Chem., 276: 27541-27547). 따라서, 서핀 억제 기전은 길지 않은 짧은 RSL을 수용할 수 있다(참조: Zhou et al. (2001) J. Biol . Chem., 276: 27541-27547). 서핀 계열 구성원중에서 루프 길이는 보존되어 있을 뿐만 아니라 서핀의 RSL은 또한 일반적으로 보존된 힌지 영역(P15-P9) 조성을 보유하고 전형적으로 하전되거나 부피가 큰 P 잔기를 갖지 않는다.
a. 대표적인 서핀
본원에 제공된 방법에 사용되는 서핀은 재조합적으로 제조된 폴리펩타이드, 합성적으로 제조된 폴리펩타이드 및 세포, 조직 및 혈액으로부터 추출된 서핀을 포함하지만 이에 제한되지 않는 임의의 서핀 폴리펩타이드일 수 있다. 서핀은 또한 사람 및 비-사람 기원의 동물, 폭스바이러스, 식물, 세균 및 고세균을 포함하지만 이에 제한되지 않는 상이한 종 기원의 대립유전자 변이체 및 폴리펩타이드를 포함한다. 전형적으로, 서핀의 대립유전자 또는 종 변이체는 본래 또는 야생형 서핀과 약 또는 적어도 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99%로 상이하다. 사람 서핀은 본원에 제공된 임의의 서핀(예를 들어, 하기의 표 2), 대립유전자 변이 이소형, 핵산 기원의 합성 분자, 사람 조직, 세포 또는 혈액으로부터 분리된 단백질 및 변형된 형태의 임의의 사람 서핀 폴리펩타이드를 포함한다. 서핀은 또한 충분한 부분의 RSL 루프가 존재하여 프로테아제와의 상호작용 및 공유 아실 효소 중간체의 형성을 매개할정도로 긴 절단된 폴리펩타이드 단편을 포함한다.
Figure 112009007335988-pct00002
Figure 112009007335988-pct00003
Figure 112009007335988-pct00004
Figure 112009007335988-pct00005
전형적으로, 본원에 제공된 방법에 사용된 서핀은 서핀과 프로테아제간에 공유 아실 효소 중간체를 형성할 수 있는 억제 서핀 또는 이의 단편이다. 일반적으로, 당해 서핀은 통상적으로 서핀에 의해 표적화된 프로테아제를 선별하기 위해 사용되고 이때, 프로테아제가 거의 완전히 억제되고 억제 복합체와 절단된 서핀 기질 사이의 분할이 최소화된다. 표 3은 세린 프로테아제의 예 및 이의 동족 서핀 억제제의 예를 보여준다. 당해 서핀/프로테아제 쌍은 억제의 높은 결합 상수 또는 2차 속도 상수 및 비-억제 복합체로의 낮은 분할 또는 분할이 없을 것으로 예상된다. 예를 들어, t-PA의 주요 생리학적 억제제는 약 50kD의 당단백질인 서핀 PAI-1이다[참조: Pannekoek et al. (1986) EMBO J., 5:2539-2544; Ginsberg et al., (1980) J. Clin . Invest., 78:1673-1680; 및 Carrell et al. In : Proteinase Inhibitors, Ed. Barrett, A.J. et al., Elsevier, Amsterdam, pages 403-420 (1986)]. 기타 서핀/프로테아제 쌍은 또한 결합 상수가 보다 낮고 분할이 보다 높은 경우에도 본원에 제공된 방법에 사용될 수 있다. 예를 들어, Cl 에스테라제 억제제 및 알파-2-안티플라스민과 같은 기타 서핀과 tPA의 결합 상수는 PAI-1의 것 보다 낮지만(참조: Ranby et al. (1982) Throm . Res., 27:175-183; Hekman et al. (1988) Arch . Biochem. Biophys., 262:199-210) 이들 서핀은 tPA를 억제한다(참조: Lucore et al. (1988) Circ. 77:660-669).
Figure 112009007335988-pct00006
따라서, 일반적으로 본원에 제공된 방법에서 프로테아제를 선별하기 위해 사용되는 서핀은 반응 생성물의 80%, 90%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 100%가 형성된 억제 복합체인 반응 생성물을 생성시킨다. 그러나 몇몇 경우에, 서핀과 프로테아제간의 증가된 분할은 예를 들어, 당해 방법에 사용된 서핀이 최적으로 프로테아제를 표적화하지 않는 경우 본원에 제공된 방법에서 일어날 수 있다. 따라서, 본원에 제공된 방법에서, 서핀은 수득한 반응이 약 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70% 또는 75% 이상의 안정한 억제 복합체를 유도하는 프로테아제를 선별하기 위해 사용될 수 있고 보다 안정한 억제 복합체와 잔여 생성물은 절단된 서핀 기질이다. 분할이 일어나는 프로테아제 선별을 최적화하기 위해 변화될 수 있는 인자는 예를 들어, 증가된 서핀 농도 및 증가된 반응 시간을 포함한다. 몇몇 경우에, 하기의 논의된 바와 같은 다른 비억제 서핀 또는 이의 돌연변이는 선별을 위한 표적 프로테아제가 서핀 기질과 상호작용할 수 있어 포획될 수 있는 공유 억제 복합체를 생성시키는 한 본원에 제공된 방법에 사용될 수 있다.
i. PAI -1
프로테아제 선별 방법에 사용되는 서핀의 예는 플라스미노겐 활성화인자 억제제-1(PAI-1) 또는 이의 변이체이다. PAI-1은 플라스미노겐의 활성화로 인해 섬유용해에 관여하는 프로테아제인 조직 플라스미노겐 활성화인자(t-PA) 및 우로키나제 또는 뇨-플라스미노겐 활성화인자(u-PA)의 주요 억제제이다. PAI-1은 t-PA 및 u-PA에 대해 약 2 X 107 M-1s-1의 2차 속도 상수를 갖는다. PAI-1은 종양 침입, 섬유용해, 세포 이동, 조직 리모델링, 조직 퇴화, 배란, 염증, 영양원형질 침입 및 악성 형질전환에 관여한다(참조: Salonen et al. (1988) J Biol . Chem., 264: 6339-6343). PAI-1은 주로 내피세포에 의해 생성되지만 또한 기타 조직 유형, 예를 들어, 지방 조직에 의해 분비된다. 기타 관련된 플라스미노겐 활성화인자 억제제는 PAI-2 및 PAI-3을 포함한다. PAI-2는 예를 들어 또한 u-PA 및 t-PA의 억제제이지만 태반에 의해 분비되고 전형적으로 임신 동안에만 높은 양으로 존재한다.
PAI-1은 절단되는 경우 379개 아미노산의 성숙한 서열을 생성시키는, 23개 아미노산 시그날 서열을 포함하는, 서열번호 11에 제시된 전구체 서열을 갖는 단일쇄 당단백질이다. 다른 서핀 처럼, PAI-1는 Arg346-Met347(즉, 서열번호 11에 제시된 전구체 서열의 아미노산 Arg369 및 Met370에 상응하는)에 위치하는 P1-P1' 반응성 부위에서 프로테아제에 의한 절단 후 잠재형에서 활성 형태로 전이함으로써 안정한 공유 복합체를 형성하고 결합된 프로테아제의 불활성화를 유도한다. 그러나, 다른 서핀과 같지 않게, PAI-1은 자발적인 잠재적 전이를 수행하여 불활성의 고도로 안정적이지만 공유적으로 온전한 형태를 유도하여 이에 의해 RSL의 잔기 P15 내지 P4는 β쉬트-A로 삽입되고 β-쉬트의 쇄 4(즉, s4A)를 형성하고 잔기 P3 내지 P10' 형태는 분자의 표면에서 연장된 루프를 형성한다(참조: De Taeye et al. (2003) J Biol. Chem., 278: 23899-23905). 따라서, 활성 PAI-1은 37℃에서 비교적 불안정하고 잠재형으로의 자발적인 전환 전에 단지 2.5 시간의 반감기를 나타낸다. 그러나 이러한 잠재적 형태는 예를 들어, 나트륨 도데실 설페이트, 구아니디늄 클로라이드 및 우레아(참조: Declerek et al. (1992) J. Biol . Chem., 267: 11693-11696) 및 열(참조: Katagiri et al. (1988) Eur J. Biochem., 176: 81-87)에 의해 재활성화될 수 있다. PAI-1의 활성 형태는 또한 비트로넥틴과의 상호작용에 의해 안정화된다. 잠재적 형태로 전환될 수 없어 승온 및 상승된 pH에서 연장된 시간 동안 보다 안정한 돌연변이 PAI-1가 확인되었다(참조: Berkenpas et al. (1995) The EMBO J., 14:2969-2977).
세린 프로테아제(즉, t-PA 또는 u-PA) 및/또는 억제 서핀(즉, PAI-1)은 프로테아제가 이의 동족 서핀 억제제 또는 이의 변이체에 내성이도록 억제의 2차 속도 상수를 조절하거나 변화시켜 예를 들어, 야생형 프로테아제의 활성이 요구되는 치료학적 적용에 사용하기 위해 변형시켰다(참조: 미국 특허 제5,866,413호; 제5,728,564호; 제5,550,042호; 제5,486,602호; 제5,304,482호).
ii . 안티트롬빈( AT3 )
본원의 방법에 사용하기 위한 또 다른 대표적인 서핀 또는 이의 변이체는 안티트롬빈(AT3)이다. AT3은 또한 서핀 계열의 구성원이고 예를 들어, 이에 제한되지 않지만 인자 X, 인자 IX, 인자 II(트롬빈), 인자 VII, 인자 XI 및 인자 XII와 같은 응고 시스템 기원의 효소를 포함하는 효소 구성원을 불활성시킨다. 전형적으로, 안티트롬빈은 주로 혈액에서 발견되고 여기서 당해 안티트롬빈은 예를 들어, 트롬빈의 기능을 차단하여 응고를 차단하거나 억제한다. AT3의 활성은 하나 이상의 보조인자, 전형적으로 헤파린의 존재로 증가한다. 헤파린과 상호작용하는 즉시 AT3은 서핀 구조로부터 루프의 돌출 및 노출된 프로테아제 접근가능한 형태를 갖는 AT3 구조를 유도하는 P1 노출을 포함하는 형태적 재배열을 진행한다. 추가로, 헤파린은 프로테아제 및 억제제 둘다에 결합함으로써 억제 기전을 가속화시킬 수 있다(참조: Law et al. (2006) Genome Biology, 7(216): 1-11).
AT3에 대한 유전자 서열은 서열번호 5에 제시된 전구체 단백질을 암호화하는 7개의 엑손 스패닝 DNA를 암호화한다. 서열번호 5에 제시된 서열의 아미노산 1번 내지 32번에 상응하는 시그날 서열의 절단은 분자량이 약 58,000 달톤인 432개의 아미노산의 성숙한 단백질을 유도한다. 아미노산중 6개는 분자내 디설파이드 결합의 형성을 유도하는 시스테인이다. AT3의 RSL에서 P4-P2' 위치는 서열번호 5로 제시된 아미노산의 서열에서 아미노산 422번 내지 427번에 상응하는 아미노산 잔기 IAGRSL(서열번호 478)을 함유하고 이때 반응 부위 P1-P1'에서의 절단은 아미노산 Arg425-Ser426 사이에서 일어난다.
3. 기타 프로테아제 포획 폴리펩타이드
서핀과 유사한 억제 기전(예를 들어, 프로테아제의 구조에 안정한 중간체 및 형태적 변화를 생성시키는 프로테아제에 의한 표적 기질의 절단)을 나타내는 추가의 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 당업계에 공지되어 있거나 확인될 수 있다. 당해 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 본원에 제공된 방법에 사용하기 위해 고려된다. 당해 프로테아제 포획 폴리펩타이드의 예는 p35이다. 또한, 프로테아제에 의해 절단되어 오랫동안 지속적으로 프로테아제를 포획하는 임의의 다른 분자인 안정한 복합체가 본원에 제공된 방법에 사용될 수 있다.
a. p35
예를 들어, 광범위 스펙트럼 카스파제 억제제인 바쿨로바이러스 p35 단백질(서열번호 473)은 당해 방식으로 카스파제를 억제할 수 있다(참조: Xu et al . (2001) Nature 410:494-497; Xu et al . (2003) J. Biol . Chem. 278(7):5455-5461). 카스파제에 의한 p35의 P1-P1' 결합의 절단(카스파제 절단 부위 DQMD87에서)은 p35 루프의 아미노 세그먼트(Asp87)와 카스파제 촉매 트리아드의 시스테인 잔기(카스파제-8에서 Cys350) 사이에서 공유 티오에스테르 중간체를 생성시킨다. 티오에스테르 결합을 형성하는 즉시, 프로테아제는 형태적 변화를 진행하여 절단된 루프의 아미노 세그먼트가 카스파제내에 매장되도록 하고 2번 위치에서 Cys 잔기를 함유하는 p35의 N-말단은 카스파제 활성 부위로 삽입되어 카스파제-8에서 His 317 잔기의 용매 접근가능성을 차단한다. 따라서 가수분해 물 분자로의 접근불가능으로 인해 티오에스테르 결합의 후속 가수분해는 차단된다.
p35 뿐만 아니라 유사한 바이러스 카스파제 억제제는 p49(서열번호 491) 및 서핀 CrmA 우두 유전자(서열번호 492)를 포함하지만 이에 제한되지 않는다. p49 억제제는 안정한 티오에스테르 결합이 p49 카스파제 인지 서열 TVTD94의 절단시 카스파제의 활성 부위와 함께 형성된다는 점에서 p35의 기전과 유사한 카스파제 억제 기전을 나타낸다.
본원에 제공된 방법을 사용한 스크리닝을 위한 표적 기질은 p35, p49 또는 CrmA 폴리펩타이드와 같은 바이러스 카스파제 억제제 폴리펩타이드를 포함할 수 있다. 본원에 제공된 서핀의 RSL 루프의 변형 방법은 바이러스 카스파제 억제제 폴리펩타이드의 변형에 용이하게 적용될 수 있다. 예를 들어, p35 RSL내 절단을 위한 표적 부위를 변형시켜 표적 기질에 대해 변화된 반응성 또는 특이성을 갖는 프로테아제를 선별할 수 있다. 야생형 p35에서, 카스파제 인지는 아미노산 위치 84 내지 87번(DQMD87)에서 발견된다. 따라서 바이러스 카스파제 억제제 폴리펩타이드에 대한 변형은 절단 서열 및/또는 주변 아미노산 잔기를 변화시키는 변형을 포함할 수 있다. 예를 들어, 당해 변형된 카스파제 억제제 폴리펩타이드, 예를 들어, p35, p49 또는 CrmA 폴리펩타이드는 예를 들어, 질환 또는 장애의 병인에 관여하는 표적 기질과 같은 목적하는 표적 기질의 절단 서열을 모방하도록 디자인된다. 바이러스 카스파제 억제제 폴리펩타이드의 RSL 루프 서열내에서의 임의의 변형은 본원에 제공된 방법에서 수행될 수 있다.
본원에 제공된 방법에 사용되는 p35, p49 또는 CrmA 폴리펩타이드와 같은 바이러스 카스파제 억제제 폴리펩타이드는 재조합적으로 제조된 폴리펩타이드, 합성적으로 제조된 폴리펩타이드 및 바쿨로바이러스 정제 방법에 의해 제조된 p35 또는 p49를 포함하지만 이에 제한되지 않는 임의의 바이러스 카스파제 억제제 폴리펩타이드일 수 있다. 또한 바이러스 카스파제 억제제 폴리펩타이드는 p35, p49 또는 CrmA 폴리펩타이드 변이체와 같은 폴리펩타이드의 대립유전자 변이체를 포함한다.
b. 알파 마크로글로불린( aM )
프로테아제의 알파 마크로글로불린(aM) 계열은 예시된 프로테아제 억제제 알파-2-마크로글로불린(a2M; 서열번호 490)과 같은 프로테아제 억제제를 포함하고 본원에 제공된 방법에서 프로테아제 포획체로서 사용하기 위해 고려된다. aM 분자는 모든 부류의 프로테아제를 억제한다. aM 프로테아제 포획체는 프로테아제에 의한 억제제의 베이트 영역의 절단을 포함하는 유사한 억제 기전을 특징으로 한다. 당해 베이트 영역은 단백질분해 절단에 민감한 세그먼트이고 이는 절단시 aM 분자내 형태적 변화를 개시하여 프로테아제 주변의 구조적 붕괴를 유도한다. 서열번호 490으로 제시되는 대표적인 a2M 서열에 대해, 베이트 영역은 아미노산 690번 내지 728번에 상응한다. 수득한 aM-프로테아제 안정한 복합체에서, 당해 프로테아제의 활성 부위는 입체적으로 차폐되어 정상적인 프로테아제 기질로의 접근을 감소시킨다. 전형적으로, 포획된 프로테아제는 소형 펩타이드 기질에 대한 활성을 유지하지만 대형 단백질 기질 또는 억제제와 상호작용하는 능력은 상실된다. 또한, aM 분자는 반응성 티올 에스테르의 존재를 특징으로 하고 이는 티올 에스테르와 아민의 반응에 의해 억제 능력을 불활성화시킨다. 추가로, 베이트 영역의 절단시 일어나는 형태적 변화는 보존된 COOH-말단 수용체 결합 도메인(RBD)을 노출시킨다. RBD 서열의 노출은 순환계로부터의 aM-프로테아제 복합체의 제거를 촉진시킨다.
4. 프로테아제 포획 폴리펩타이드 경쟁인자
경쟁인자는 본원에 제공된 방법에 사용하여 표적 기질에 대해 선별된 프로테아제의 특이성 및 선택성 구속력을 조절할 수 있다. 당해 경쟁인자는 임의의 시점, 예를 들어, 프로테아제와 목적하는 프로테아제 포획 폴리펩타이드 또는 경쟁인자의 접촉 전 또는 후에 프로테아제 또는 이의 수거물과 접촉될 수 있고 목적하는 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 동시에 프로테아제와 접촉될 수 있다. 경쟁인자는 특이적 경쟁인자 또는 광범위 경쟁인자일 수 있다.
미리결정된 비-표적 기질을 모방하여 미리 결정된 잠재력 부재 표적으로서 작용하는 특이적 경쟁인자를 디자인한다. 전형적으로, 당해 경쟁인자는 표지화되지 않아 형성된 안정한 프로테아제 복합체는 이에 대해 선별되지 않는다. 추가로, 당해 경쟁인자는 선택 계획에 사용되는 디자인된 프로테아제 포획 폴리펩타이드에 비해 과량으로, 전형적으로 몰 과량으로 첨가되어 당해 경쟁인자는 수거물에서 목적하지 않은 프로테아제에 결합한다. 특정 경쟁의 한 예에서 각각 상이한 기질 인지를 모방하도록 디자인된 2개의 상이한 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 프로테아제 포획 폴리펩타이드중 단지 1개가 검출가능하게 표지된 프로테아제 수거물과 접촉시킨다. 예를 들어, 경쟁인자는 비-표적 기질의 절단 서열을 모방하는 이의 반응성 부위를 갖도록 디자인된 폴리펩타이드 프로테아제 포획체를 포함할 수 있다. 따라서, 서핀과 같은 경쟁인자는 미리결정된 비-표적 기질의 절단 서열로 대체된 이의 P4-P1' RSL 잔기를 갖도록 디자인될 수 있다. 당해 경쟁인자는 프로테아제 포획 폴리펩타이드, 예를 들어, 또 다른 서핀 폴리펩타이드(이의 RSL 서열은 목적하거나 미리 결정된 표적 기질의 절단 서열을 모방하여 이의 분리를 위해 표지화되는 P4-P1' 위치에서 아미노산을 함유하도록 변형되었다)와 혼합하여 방법에 사용될 수 있다. 따라서, 프로테아제 포획 폴리펩타이드 둘다는 표적 또는 비-표적 절단 서열에 대한 특이성을 나타내는 프로테아제를 선별하지만 목적하는 표적 기질 특이성을 나타내고 검출가능하게 표지화되는 당해 안정한 프로테아제 복합체만이 당해 반응으로부터 분리될 수 있다. 특이적 경쟁인자의 다른 예는 예를 들어, 본원에 제공된 방법에서 반응성 부위가 변형된 본래의 프로테아제 포획 폴리펩타이드를 포함한다. 실시예 6은 당해 전략을 예시하고 있고 이때 혈장 정제된 AT3 서핀은 변형된 서핀 AT3SLGR - KI에 대한 경쟁인자로서 사용된다.
광범위 경쟁인자는 또한 선별된 프로테아제의 특이성 및 선택성을 강제하기 위해 본원에 제공된 방법에 사용될 수 있다. 광범위 경쟁인자의 예는 예를 들어, 다양한 천연 프로테아제 억제제를 함유하는 사람 혈장 또는 사람 혈청을 포함한다. 또한, 프로테아제 포획 폴리펩타이드의 광범위 소분자 라이브러리(예를 들어, Acxxx-Thiaphine 라이브러리)가 생성될 수 있고 이때 P2, P3 또는 P4의 모든 위치는 상이하게 된다.
5. 변이 프로테아제 포획 폴리펩타이드
반응성 부위에서 변화된 절단 서열을 갖도록 변형된 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 목적하거나 미리 결정된 표적 기질과 함께 프로테아제를 선별하기 위해 본원에 제공된 방법에 사용될 수 있다. 따라서, 프로테아제 포획체는 표적 기질에 대해 변화된 반응성 또는 특이성을 갖는 프로테아제를 선별하기 위해 프로테아제의 인지된 절단 부위로서 작용하는 이들의 서열 영역에서 변형된다. 예를 들어, 서핀은 RSL 루프에서 절단 용이한 결합에서 또는 이의 주변에서 변화된 절단 서열을 갖도록 변형될 수 있다. 또 다른 예에서, a2M은 이의 베이트 영역에서 변화된 절단 서열을 갖도록 변형될 수 있다. 당해 변형된 프로테아제 포획체는 예를 들어, 질환 또는 장애의 병인에 관여하는 표적 기질과 같은 목적하는 표적 기질의 절단 서열을 모방하도록 디자인할 수 있다.
서핀 분자의 RSL 루프 서열에서 임의의 변형은 본원에 제공된 방법에서 수행될 수 있다. 대표적인 야생형 서핀의 RSL 서열의 배열은 하기 표 4에 제시한다. 하기의 표에서, P15 내지 P5' 위치를 지정하는 숫자는 성숙한 α1-안티트립신 분자(서열번호 1에 제시한 아미노산 서열의 아미노산 367번 내지 387번에 상응하는)에 대한 것이다. RSL 루프 서열의 실체는 당업자에게 공지되어 있고/있거나 예를 들어 하기 표 4에 제시한 바와 같은 서핀과의 배열에 의해 결정될 수 있다.
Figure 112009007335988-pct00007
따라서, 서핀의 반응성 부위에서 임의의 하나 이상의 아미노산(즉, 예를 들어, 상기 표 4에 제시한 바와 같은 P15 내지 P5' 위치에 상응하는 임의의 하나 이상의 아미노산)에 상응하는 서핀의 RSL 루프내 아미노산 서열은 변형될 수 있다. 전형적으로, RSL 루프 서열의 힌지 영역의 일부인 아미노산(즉, P15-P9 위치에 상응하는 아미노산)은 변형되지 않는다. 하나의 예에서, 절단 용이한 결합을 플랭킹하는 당해 아미노산에 상응하는 P1 및/또는 P1' 위치에서의 하나 이상의 아미노산은 변형된다. 또 다른 예에서, 반응성 부위 위치 P4-P2'에 상응하는 임의의 하나 이상의 아미노산은 변형된다. 예를 들어, PAI-1의 P4-P1'는 VSARM(서열번호 378)이고 이때 절단은 R(P1)과 M(P1') 아미노산 사이에서 일어난다. VSARM 서열의 임의의 하나 이상의 아미노산의 변형은 PAI-I의 절단 서열을 변형시켜 변화된 특이성을 갖는 프로테아제를 선별하기 위해 수행될 수 있다. 실시예 1은 PAI-I의 변형을 예시하고 이때 반응성 부위 루프내 VSARM 서열은 RRARM(서열번호 379)이 되도록 변형된다. 또 다른 예에서, 반응성 부위 루프인 VSARM 서열은 공지된 효율적인 펩타이드 기질 PFGRS (서열번호 389)로 변형될 수 있다. 당해 돌연변이 PAI-1의 예는 서열번호 610 및 611에 제시되어 있다.
또 다른 예에서, 변형은 안티트롬빈 III(AT3)의 RSL에서 수행될 수 있다. 예를 들어, AT3의 P4-P1'는 IAGRSL(서열번호 478)이고, 이때 절단은 R(P1)과 S (P1') 아미노산 사이에서 일어난다. IAGRSL 서열의 임의의 하나 이상의 아미노산의 변형은 AT3의 절단 서열을 변형시켜 변화된 특이성을 갖는 프로테아제를 선별하기 위해 수행될 수 있다. 실시예 6 및 7은 AT3의 변형을 예시하고 이때 반응성 부위 루프에서 IAGRSL 서열은 RRVRKE(서열번호 498)이 되도록 변형된다. 또 다른 예에서, 반응성 부위 루프에서 IAGRSL 아미노산 서열은 SLGRKI(서열번호 479)로 변형될 수 있다. 다른 변형된 AT3 폴리펩타이드는 IAGRSL 아미노산 서열이 아미노산 서열 SKGRSL(서열번호 501) 또는 아미노산 서열 PRFKII(서열번호 503)로 대체된다. 당해 돌연변이 AT3 분자의 예는 임의의 서열번호 497, 499, 500 및 502로 제시된다.
또한, 및 경우에 따라, 임의의 하나 이상의 위치 P4-P2'에서의 변형은 한번에 1회, 한번에 2회, 한번에 3회 등으로 수행될 수 있고 수득한 변형된 서핀은 연속 회차의 선별에서 별도로 시험되어 각각의 변형된 위치에서 기질 특이성 및/또는 선택성을 나타내는 프로테아제를 최적화시킬 수 있다.
대부분의 경우에, 야생형 서핀의 반응성 부위 루프에서 아미노산 잔기 또는 또 다른 프로테아제 포획체에서 유사 서열을 대체하는 아미노산 잔기는 목적하는 표적 기질에서 절단 서열을 기준으로 선택된다. 표적 기질 단백질은 통상적으로 병리에 관여하는 단백질이고 이때 소정의 기질 서열에서 표적 단백질의 절단이 병리에 대한 치료로서 작용한다(참조: 미국 특허공개 제US2004/0146938호, 제US2006/0024289호, 제US2006/0002916호, 및 가출원 제60/729,817호). 예를 들어, 표적 단백질은 류마티스 관절염에 관여하는 단백질(즉, TNFR), 패혈증에 관여하는 단백질(즉, 단백질 C), 종양원성에 관여하는 단백질(즉, 성장 인자 수용체, 예를 들어 VEGFR), 또는 염증에 관여하는 단백질(즉, 보체 단백질)일 수 있다. 표적 기질은 또한 바이러스 단백질일 수 있고, 이때 바이러스 단백질의 절단 시 바이러스는 세포를 감염시킬 수 없다. 하기 표 5는 대표적인 표적 기질을 제시한다.
Figure 112009007335988-pct00008
표적 단백질내 절단 부위는 공지되어 있거나 용이하게 확인될 수 있다. 표적 단백질내 절단 부위는 하기의 기준에 의해 확인된다: 1) 이들은 단백질의 노출된 표면상에 위치한다; 2) 이들은 구조 예측 알고리듬의 원자 구조에 의해 결정되는 바와 같이 2차 구조가 없는 영역(즉, 나선의 P 쉬트가 아닌 영역)에 위치하고 당해 영역은 단백질 표면상의 루프 또는 세포 표면 수용체상의 스톡(stalk)인 경향이 있다; 3) 이들은 이의 공지된 기능을 기초로 단백질을 불활성화(또는 활성화)시킬 수 있는 부위에 위치한다. 절단 서열은 예를 들어 프로테아제의 확대된 기질 특이성과 일치하는 4개의 잔기(즉, P1-P4 위치)의 길이이지만 보다 길거나 짧을 수 있다. 예를 들어, 보체 인자 C2에서 절단 서열에 대한 P4-P1 아미노산 잔기는 SLGR (서열번호 431)이지만 또한 SLGRKI (서열번호 479)의 P4-P2' 서열로서 나타낼 수 있고, 여기서 절단은 P1과 P1' 위치 사이(즉, R/K 사이)에서 일어난다. 따라서, P4-P1을 포함하는 임의의 하나 이상의 잔기 P4-P2'를 포함하는 절단 서열내 임의의 하나 이상의 잔기는 예를 들어, 서핀의 RSL중에 프로테아제 포획 폴리펩타이드에 도입되어 돌연변이 프로테아제 포획 폴리펩타이드를 생성시킬 수 있다.
절단 서열은 당업계에 공지된 임의의 방법에 의해 표적 기질에서 확인될 수 있다(참조: 공개된 미국 특허원 제US 2004/0146938호). 하나의 예에서, 표적 기질의 절단은 표적 기질을 기질을 절단하는 것으로 공지된 임의의 프로테아제과 항온처리하여 결정된다. 프로테아제와의 항온처리 후 표적 단백질은 SDS-PAGE에 의해 분리될 수 있고 분해 생성물은 쿠마시 블루와 같은 단백질 염료로 염색시킴에 의해 확인될 수 있다. 단백질분해 단편을 서열분석하여 절단 서열, 예를 들어, 6개 아미노산 P4-P2' 절단 서열 및 특히, 4개 아미노산 P4-P1 절단 서열 잔기의 실체를 결정할 수 있다. 표 6은 대표적인 표적 기질에 대한 위치 P4-P1에 상응하는 절단 서열을 확인한다.
Figure 112009007335988-pct00009
따라서, 서핀의 RSL 또는 다른 프로테아제 포획체에서 유사한 서열은 표적 기질의 임의의 목적하거나 미리 결정된 절단 서열로 변형될 수 있다. 하나의 예에서, 선택된 절단 서열은 특히 t-PA의 효율적인 절단 서열인 서열일 수 있다. 당해 절단 서열은 예를 들어 PFGRS (서열번호 389; 참조: Ding et al. (1995) PNAS, 92:7627-7631)이다. 따라서, 예를 들어 t-PA의 기질 특이성과 동일하도록 변화된 기질 특이성을 갖는 프로테아제를 선별할 수 있다. t-PA는 흔히 섬유용해 장애의 치료를 위한 치료제로서 사용되기 때문에 당해 선별된 프로테아제는 또 다른 t-PA 치료제로 최적화될 수 있고 흔히 t-PA 치료와 관련된 부작용(즉, 과다출혈)을 최소화한다.
또 다른 예에서, 보체 단백질에 대한 절단 서열은 본원에 제공된 방법을 사용하여 프로테아제의 선별을 위한 미리 결정되거나 목적하는 절단 서열로서 표적화될 수 있다. 임의의 하나 이상의 보체 단백질에 대해 증가된 기질 특이성을 갖는 것으로 선별된 프로테아제는 예를 들어, 이에 제한되지 않지만, 류마티스 관절염 및 낭창과 같은 자가면역 질환, 심장 장애, 및 패혈증 및 허혈-재관류 손상과 같은 기타 염증 장애와 같은 염증과 관련된 장애 및 질환의 치료를 위한 치료학적 후보물이 될 것이다(참조: 가출원 제60/729,817호). 실시예 6 내지 실시예 15는 본래의 P4-P2' 잔기 IAGRSL(서열번호 478)를 C2 보체 단백질(즉, SLGRKI, 서열번호 479)로 대체함에 의해 변형된 AT3 서핀 분자에 대한 MT-SP1 프로테아제의 선별을 예시한다. SLGRKI 절단 서열 또는 하기에 기재된 바와 같은 이의 중간체에 의한 아미노산 잔기의 변형 또는 대체는 목적하는 바와 같은 임의의 후보 프로테아제의 선별을 위해 임의의 서핀 폴리펩타이드와 같은 임의의 프로테아제 포획 폴리펩타이드에서 수행될 수 있다.
추가의 예에서, 절단 서열은 VEGFR의 스톡 영역에서와 같이 VEGFR에서 선별될 수 있고 VEGFR은 당해 절단 서열에 대해 특이성을 갖는 프로테아제에 의해 절단되는 즉시 불활성화된다. VEGFR에서 절단 서열의 예는 본원에 기재되고 관련 문헌[참조: 공개된 미국 특허원 제US20060024289호 및 제US20060002916호]에 제시되어 있다. 예를 들어, 서핀의 RSL, 또는 다른 프로테아제 포획체내 유사 서열, 예를 들어, 알파-2 마크로글로불린내 베이트 영역은 VEGFR의 절단 서열로 대체된 임의의 하나 이상의 아미노산 위치 P4-P2'를 갖도록 변형될 수 있다. 하나의 예에서, 본래의 서핀내 아미노산 잔기는 RRVR(서열번호 489) 절단 서열 또는 전체 P4-P2' 서열 RRVRKE(서열번호 498)에 상응하는 P4-P1 위치를 함유하도록 변형될 수 있다. 당해 변형된 서핀에 대해 선별된 프로테아제는 예를 들어, 혈관신생 장애와 같은 VEGFR 매개 장애를 치료하기 위한 후보물이 된다.
몇몇 경우에, 본원에 제공된 방법에서, 서핀 RSL의 임의의 하나 이상의 P4-P2' 위치 또는 기타 프로테아제 포획체에서 유사 서열에서의 변형은 목적하거나 미리 결정된 기질 특이성을 갖는 프로테아제 선별을 위해 최적화시키는 후속 회차에서 수행될 수 있다. 예를 들어, u-PA 및 t-PA 프로테아제 둘다는 P2 위치에서 소형 아미노산 및 P3 및 P4 위치에서 매우 상이한 아미노산을 선호한다. 따라서, 최종 표적 절단 서열에 대한 중간체인 변형된 서핀이 생성될 수 있고, 이때 제1 중간체는 P3 및 P4 위치에서 특이성을 나타내는 프로테아제를 선별하기 위한 단지 P3 및 P4 위치의 변형에 의해 생성된다. 따라서 선별된 프로테아제 또는 프로테아제들은 추가로 변화된 P2 위치를 갖도록 변화된 새로운 서핀 분자에 대해 새로운 조합 라이브러리의 제조를 위해 주형으로서 사용될 수 있다.
따라서, 예를 들어, VEGFR 절단 서열 RRVR에 대해 증가된 기질 특이성을 나타내는 u-PA 프로테아제 또는 이의 변이체의 선별에서, 제1회차의 선별은 서핀과 같은 중간체 변형된 프로테아제 포획 폴리펩타이드에 대해 수행될 수 있고, 이때, P3 및 P4 위치만이 당해 위치에서 본래의 서열과 비교하여 변화된다. 예를 들어, 서핀 PAI-1의 RSL 루프에서 본래의 P4-P1' 아미노산이 VSARM인 경우, 변형된 중간체 PAI-1은 단지 P4 및 P3 VEGFR 절단 서열의 대체에 의해 P4-P1' 위치에서 RRARM(서열번호 379)을 함유하는 중간체 서핀 분자를 생성시켜 제조될 수 있다. 후속 회차의 프로테아제 선별은 P2 위치에서 추가로 변형된 PAI-1 서핀에 대해 수행될 수 있다.
서핀을 포함하는 프로테아제 포획체는 단백질의 변형을 위해 당업계에 공지된 임의의 방법을 사용하여 변형될 수 있다. 당해 방법은 단일 또는 다중 부위 지시된 돌연변이 유발을 포함하는 부위 지시된 돌연변이 유발을 포함한다. 또한, 변이 프로테아제 포획 폴리펩타이드의 발현 및 정제를 포함하는 프로테아제 포획 폴리펩타이드의 발현 및 정제는 폴리펩타이드의 발현 및 정제를 위한 당업계의 표준 방법을 사용하여 수행될 수 있다. 임의의 숙주 세포 시스템이 발현을 위해 사용될 수 있고 여기에는 포유동물 세포, 세균 세포 또는 곤충 세포가 포함되지만 이에 제한되지 않는다. 추가로, 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 또한 프로테아제 포획 폴리펩타이드의 확인 및 정제에 일조하는 추가의 서열을 포함하도록 추가로 변형될 수 있다. 예를 들어, 이에 제한되지 않지만 His 태그 또는 Flag 태그와 같은 에피토프 태그가 폴리펩타이드의 친화성 정제를 도와주기 위해 첨가될 수 있다. 몇몇 예에서, 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 포획 및/또는 정제를 도와주기 위해 직접 비오티닐화된다. 프로테아제 포획 폴리펩타이드를 비오티닐화하기 위한 예시적 방법은 실시예 16에 기재되어 있다.
서핀 분자 또는 기타 프로테아제 포획체의 생물학적 기능에 대한 분석과 같은 분석은 당업계에 공지되어 있고 본원에 제공된 방법에서 억제제로서 변형된 프로테아제 포획체의 활성을 평가하기 위해 사용될 수 있다. 당해 분석은 본원에 제공된 방법에 사용하기 위해 변형된 프로테아제 포획 폴리펩타이드에 따라 다양하다. PAI-1에 대한 당해 분석의 예는 예를 들어, 표준 트립신에 대한 활성 부위 적정 또는 실시예 1에 기재된 바와 같은 표준 트립신의 적정을 포함한다. 또한 당해 분석의 예는 당업계에 공지된 프로테아제 억제 분석이고 활성 프로테아제에 의한 형광 기질의 절단을 억제하는 프로테아제 포획체의 능력은 프로테아제 포획 활성에 대한 정보로서 사용된다. 프로테아제 억제 분석의 예는 매트립타제(MT-SP1) 억제 분석이다. 당해 분석의 하나의 예에서, 프로테아제 포획체는 서핀이다. 특정 예에서, 서핀은 본원에 제공된 방법에 따라 제조된 AT3 또는 변이 AT3 단백질이고 형광 기질은 RQAR-ACC이다. 기질의 절단은 예를 들어, 실시예 14A에 예시된 바와 같이 측정된다. 트롬빈 억제 분석은 또한 AT3 또는 변형된 AT3의 활성을 평가하기 위해 사용될 수 있다. 유사한 분석은 프로테아제 포획 폴리펩타이드 또는 이의 변이체가 통상적으로 상호작용하는 동족 프로테아제에 따라 디자인될 수 있거나 당업자에게 공지되어 있다. 또한, 변형된 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 프로테아제 포획 활성 또는 기능의 정상 분석에서 야생형 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 비교하여 감소된 활성을 가질 것으로 예상되고 흔히 그렇다.
D. 프로테아제
본원에 제공된 방법에서, 전형적으로 미리 결정되거나 목적하는 기질에 대해 변화된 기질 특이성을 나타내는 후보물 프로테아제가 선별된다. 프로테아제, 돌연변이 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분의 수거물은 예를 들어, 서핀 또는 변형된 서핀을 포함하는 본원에 임의로 제공된 바와 같은 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 접촉시켜 변화된 기질 특이성을 갖는 프로테아제를 선별한다. 프로테아제 수거물은 고형 지지체상에 또는 용액 또는 현탁액에서와 같이 균일 혼합물에 제공될 수 있다. 선별된 프로테아제는 프로테아제 포획 폴리펩타이드와의 안정한 복합체로서 분리될 수 있고 확인될 수 있다. 선별된 프로테아제는 목적하거나 미리 결정된 표적 기질에 대해 증가된 촉매 효율성 및 반응성을 나타내고 이로써, 예를 들어 표적 기질이 관여하는 임의의 질환 또는 장애에서 치료제로서 사용하기 위한 후보물이다.
1. 후보 프로테아제
본원에 제공된 방법에서, 질환 또는 장애에 관여하는 목적하는 기질에 대해 변화되고/되거나 증가된 특이성을 갖는 프로테아제가 선별된다. 일반적으로, 프로테아제는 표적 기질을 가수분해시키지만 다른 것들은 온전한 상태로 유지시키는 고도로 특이적인 단백질이다. 천연 기질의 절단을 위해, 프로테아제는 기질 절단이 선호되지만 비-기질 절단은 선호되지 않는 고도의 선택성을 나타낸다(참조: Coombs et al. (1996) J. Biol . Chem., 271: 4461-4467). 목적하는 표적 기질에 대해 변화된 특이성 및 선택성을 갖는 프로테아제에 대한 선별은 질환 또는 장애를 감소시키거나 완화시키거나 예방하기 위해 단백질을 선택적으로 활성화시키거나 불활성화시키는 치료제로서 프로테아제를 사용가능하게 한다. 본원에 제공된 프로테아제 포획 선별 방법에 사용되는 표적 프로테아제는 프로테아제 포획체가 상호작용하여 펩타이드 결합을 가수분해시킬 수 있는 임의의 공지된 부류의 프로테아제일 수 있다. 전형적으로, 서핀에 대해, 당해 프로테아제는 일반적으로 서핀이 반응하여 이와 함께 공유 중간체 복합체를 형성하는 세린 또는 시스테인 프로테아제이다. 세린 및 시스테인 프로테아제의 예는 하기 표 7에 제시된 임의의 프로테아제이다. 전형적으로, 변형된 프로테아제의 라이브러리는 본원에 제공된 방법에서 서핀 또는 이의 변이체와 같은 표적 프로테아제 포획체 또는 이의 변이체에 대해 증가된 특이성 또는 선택성을 나타내는 프로테아제 변이체를 선별하기 위해 사용된다.
본원에 제공된 선별 방법에서 사용될 수 있고 사용되기 위해 변형될 수 있는 대표적인 프로테아제가 기재되어 있고 촉매 활성 부분을 포함하는 절단된 폴리펩타이드를 포함한다. 대표적인 후보 프로테아제는 표 7에 열거되고 본원에 기재되어 있다(참조: www.merops.sanger.ac.uk). 대표적인 후보 프로테아제 각각에 대한 뉴클레오타이드 서열 및 암호화된 아미노산 전구체 서열의 서열 확인번호(서열번호)는 표에 나타낸다. 성숙한 단백질을 생성시키는 시그날 펩타이드 또는 프로펩타이드에 상응하는 암호화된 아미노산은 표에 나타낸다. 또한, 프로테아제 도메인(즉, 펩티다제 단위)을 지정하는 아미노산은 예를 들어, 각각의 프로테아제에 대한 촉매 트리아드를 구성하는 활성 부위 잔기로서 표시된다. 상호작용은 동적이기 때문에 표시된 아미노산 위치는 참조 및 예시를 위한 것이다. 표시된 위치는 2, 3, 4 또는 5개 이상의 아미노산으로 다양한 위치의 범위를 반영한다. 또한 당해 변형은 대립유전자 변이체 및 종 변이체중에 존재한다. 당업자는 가시적 비교 또는 쉽게 가용한 알고리듬 및 소프트웨어를 포함하는 다른 비교에 의해 상응하는 서열을 확인할 수 있다.
전형적으로 선별을 위한 후보 프로테아제는 야생형 또는 대립유전자 변이체 및 임의의 하나의 단백질의 이소형을 포함하는, 야생형 후보 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분의 변형되거나 변이된 형태이다. 후보 프로테아제는 천연 공급원으로부터의 분리, 세포, 조직 및 기관에서 재조합적으로 제조된 단백질의 분리를 포함하는 당업계에 공지된 임의의 방법, 재조합 방법 및 인실리코(in silico) 단계를 포함하는 방법, 합성 방법 및 당업자에게 공지된 임의의 방법에 의해 제조되거나 분리될 수 있다. 선별을 위한 후보 프로테아제는 하기에 기재된 임의의 방법과 같은 당업자에게 공지된 임의의 방법에 의해 변형될 수 있다.
Figure 112009007335988-pct00010
Figure 112009007335988-pct00011
Figure 112009007335988-pct00012
Figure 112009007335988-pct00013
Figure 112009007335988-pct00014
Figure 112009007335988-pct00015
Figure 112009007335988-pct00016
Figure 112009007335988-pct00017
Figure 112009007335988-pct00018
a. 프로테아제 부류
프로테아제 (또한, 프로테이나제 또는 펩티다제로 지칭)는 표적 단백질 내의 아미노산의 서열 또는 폴리펩타이드 기질을 인지하는 단백질-분해 효소이다. 아미노산의 기질 서열을 인지하면서, 프로테아제는 표적 단백질 내의 펩타이드 결합의 가수분해 또는 절단을 촉매한다. 표전 서열의 전체-길이 서열의 환경 내에서 펩타이드 결합의 위치에 의존하는 표적 단백질의 이러한 가수분해는 표적을 불활성화시킬 수 있거나 몇몇 경우에 활성화시킬 수 있다.
프로테아제는 이들이 단백질을 공격하는 방식에 근거하여 엑소- 또는 엔도-프로테아제로 분류된다. 프로테이나제 또는 엔도펩티다제는 단백질의 내부를 공격하여 큰 펩타이드를 생성시킨다. 펩티다제 또는 엑소펩티다제는 단백질의 말단 또는 단편을 공격하여 작은 펩타이드 또는 아미노산을 생성시킨다. 펩티다제는 이들의 작용 패턴에 따라, 아미노 말단부터 아미노산을 절단하는 아미노펩티다제, 카복실 말단부터 아미노산을 절단하는 아미노펩티다제; 카복실 말단부터 아미노산을 절단하는 카복시펩티다제; 2개의 아미노산을 절단하는 디펩티딜 펩티다제; 디펩타이드를 나누는 디펩티다제 및 트리펩타이드로부터 아미노산을 절단하는 트리펩티다제로 분류된다. 대부분의 프로테아제는 21,000 내지 45,000 달톤으로 작다. 다수의 프로테아제는 자이모겐으로 지칭되는 불활성 형태로 합성되고 분비되고 연이어 단백질 분해작용에 의해 활성화된다. 이는 효소의 활성 부위의 구조를 변화시킨다.
촉매적 기전의 몇 가지 구분되는 종류가 프로테아제에 의해 이용된다(참조: Barret et al. (1994) Meth . Enzymol. 244:18-61; Barret et al. (1994) Meth . Enzymol 244:461-486; Barret et al. (1994) Meth . Enzymol. 248:105-120; Barret et al. (1994) Meth . Enzymol. 248:183-228). 이들의 촉매적 기전에 근거하여, 카복시펩티다제는 세린-, 메탈로 및 시스테인- 형태의 카복시 펩티다제로 하위 분류되고, 에도펩티다아제는 세린-, 시스테인, 아스파르트산-, 트레오닌- 및 메탈로엔도펩티다제이다. 세린 펩티다제는 활성 중심에 참여하는 세린 잔기를 갖고, 아스파르트산은 촉매 중심에 아스파트산을 갖고, 시스테인-형태 펩티다제는 시스테인 잔기를 갖고, 트레오닌-형태의 펩티다제는 트레오닌 잔기를 갖고, 메탈로-펩티다제는 촉매 기전에서 금속 이온을 이용한다. 통상, 프로테아제는 이들의 촉매 활성에 근거하여 분류를 나누어서, 프로테아제의 분류는 세린, 시스테인, 아스파르트산, 트레오닌 또는 메탈로-프로테아제를 포함할 수 있다. 프로테아제의 촉매 활성은 표적 기질의 절단을 필요로 한다. 그러므로, 프로테아제의 촉매 활성을 변화시키기 위한 프로테아제의 변형은 기질을 절단하는 프로테아제의 능력에 영향을 줄 수 있다 (즉, 특이성/선택성을 변형시킨다).
각 프로테아제는 활성 부위 포켓이 정렬하고 기질과 직접 접촉하게 하는 연속된 아미노산을 갖는다. 펩티다제의 결정학상 구조는 활성 부위가 통상적으로 인접한 구조적 도메인 사이의 분자 표면상의 홈 (groove)에 위치하고, 기질 특이성은 절단될 수 있는 결합의 가수분해의 원인이 되는 촉매적 부위의 한쪽 또는 양쪽의 홈을 따라 배열된 결합 부위의 특정에 의해 지시됨을 나타낸다. 따라서, 펩티다제의 특이성은 아미노산 잔기의 측쇄에 위치할 수 있는 각 하위 부위의 능력에 의해 기술된다. 당해 부위는 촉매 부위, S1, S2...Sn으로부터 기질의 N-말단으로 및 S1', S2'...Sn'으로부터 C-말단으로 순서를 정한다. 이들에 위치한 잔기는 각각, P1, P2...Pn 및 P1', P2'...Pn'으로 순서를 정한다. 표적 단백질의 절단은 P1 및 P1' 사이에서 촉매되고, 이때, 폴리펩타이드 기질의 N으로부터 C 말단으로의 아미노산 잔기는 (Pi, ..., P3, P2, P1, P1', P2', P3', ..., Pj)으로 표시하고 프로테아제 상의 이들의 상응하는 결합 인지 포켓은 (Si, ..., S3, S2, S1, S1', S2', S3', ..., Sj)로 표시한다(참조: Schecter and Berger (1967) Biochem Biophys Res Commun 27:157-162). 그러므로, P2는 S2, P1은 S1, P1'은 S1'과 상호작용한다. 결론적으로, 프로테아제의 기질 특이성은 활성 부위의 S1 내지 S4 위치에 기인하고, 프로테아제는 펩타이드 기질 서열의 P1 내지 P4 잔기와 접촉한다. 어떤 경우에, 활성 부위의 S1 내지 S4 포켓 사이에 상호작용이 (있는 경우라도) 거의 없으므로, 각 포켓은 다른 포켓과는 독립적으로 펩타이드 기질 서열상의 상응하는 잔기를 인지하여 결합하는 것으로 나타난다. 그러므로, 특이성 결정기는 다른 포켓의 특이성에 영향을 주지 않고 하나의 포켓에서 변화될 수 있다. 다수의 구조 및 계열 구성원의 모델링에 근거하여, 확대된 기질 특이성에 기여하는 표면 잔기 및 기질과의 다른 2차적 상호작용이 세린, 시스테인, 아스파르트산, 메탈로- 및 트레오닌 계열의 프로테아제를 포함하는 다수의 프로테아제에 대해 정의되었다(참조: Wang et al., (2001) Biochemistry 40(34): 10038-46; Hopfner et al., (1999) Structure Fold Des. 7(8):989-96; Friedrich et al. (2002) J Biol Chem. 277(3):2160-8; Waugh et al., (2000) Nat Struct Biol. 7(9):762-5; Cameron et al., (1993) J Biol Chem. 268:11711; Cameron et al., (1994) J Biol Chem. 269: 11170).
i. 세린 프로테아제
분비된 효소 및 세포질 저장 기관내에 격리된 효소를 포함하는 세린 프로테아제(SP)는 다양한 생리학적 역할을 갖고 이는 혈액 순환, 상처 치유, 분해, 면역 반응 및 종양 침습 및 전이에서의 역할을 포함한다. 예를 들어, 키모트립신, 트립신 및 엘라스타제는 소화관에서 기능하고; 인자 10, 인자 11, 트롬빈 및 플라스민은 응고 및 상처 치유에 관여하고; C1r, C1s 및 C3 컨버타제는 상기 논의된 바와 같이 보체 활성화에서 특정 역할을 수행한다.
II형 막관통 세린 프로테아제로 지정된 세포 표면 단백질의 부류는 세포외 도메인을 함유하는 막-고정 단백질인 프로테아제이다. 세포 표면 단백질로서, 이들은 세포내 시그날 전달 및 세포 표면 단백질 분해 작용을 매개하는데 작용한다. 다른 세린 프로테아제는 막 결합 프로테아제이고 유사한 방식으로 작용한다. 다른 것들은 분비된다. 다수의 세린 프로테아제는 세포 표면 수용체에 결합하여 이들의 활성을 발휘하므로, 세포 표면에 작용한다. 세포 표면 단백질 분해작용은 다양한 세포 기능을 매개하는 생물학적 활성 단백질의 발생을 위한 기전이다.
분비형 및 막 관통 세린 프로테아제를 포함하는 세린 프로테아제는 종양 발달 및 진행을 포함하는 과정에 관여한다. 이들 프로테아제의 정확한 역할이 완전히 밝혀졌지만, 세린 프로테아제 및 이의 억제제는 암 세포의 침투 및 전이 확산 및 종양의 신생혈관형성에서 퇴행성 작용을 포함하는 다수의 세포내- 및 세포외 생리학적 과정에 관여한다. 프로테아제는 세포외 매트릭스(ECM)의 분해 및 리모델링에 관여하고 조직 리모델링에 기여하고, 암 침투 및 전이를 위해 필요하다. 몇몇 프로테아제의 활성 및/또는 발현은 종양 진행 및 발생과 관련됨을 나타낸다.
20개 계열 이상(S1-S27로 명기됨)의 세린 프로테아제가 확인되었고 이들은 구조적 유사성 및 기타 기능적 증거를 바탕으로 6개 그룹(SA, SB, SC, SE, SF 및 SG)으로 분류된다(참조: Rawlings ND et al. (1994) Meth . Enzymol. 244: 19-61). 여러 세린 펩티아제의 반응 기전에는 유사성이 있다. 키모트립신, 서브틸리신 및 카복시펩티다제 C 그룹은 공통적으로 세린, 아스파르테이트 및 히스티딘의 촉매 트리아드를 갖는다: 세린은 친핵체로서, 아스파르테이트는 친전자체로서 히스티딘은 염기로서 작용한다. 촉매 잔기의 기하학적 배향은 상이한 단백질 폴드에도 불구하고 계열간에 유사하다. 촉매 잔기의 선형 배열은 공통적으로 그룹 관계를 반영한다. 예를 들어, 키모트립신 그룹(SA)내 촉매 트리아드는 HDS로 정렬되지만 서브틸리신 그룹(SB)에서는 DHS로서 정렬되고 카복시펩티다제 그룹(SC)에서는 SDH로서 정렬된다.
키모트립신 슈퍼패밀리의 세린 프로테아제의 예는 조직형 플라스미노겐 활성화인자(tPA), 트립신, 트립신형 프로테아제, 키모트립신, 플라스민, 엘라스타제, 우로키나제(또는 뇨형 플라스미노겐 활성화인자, u-PA), 아크로신, 활성화된 단백질 C, C1 에스테라제, 카텝신 G, 키나제, 및 칼리크레인, 트롬빈 및 인자 VIIa, IXa, Xa, XIa, 및 XIIa를 포함하는 혈액 응고 캐스케이드의 프로테아제를 포함한다(참조: Barret, A.J., In: Proteinase Inhibitors, Ed. Barrett, A.J., Et al., Elsevier, Amsterdam, Pages 3-22 (1986); Strassburger, W. et al., (1983) FEBS Lett., 157:219-223; Dayhoff, M.O., Atlas of Protein Sequence and Structure, Vol 5, National Biomedical Research Foundation, Silver Spring, Md. (1972); 및 Rosenberg, R.D. et al. (1986) Hosp . Prac., 21: 131-137).
세린 프로테아제 계열의 프로테아제의 활성은 이들의 활성 부위를 형성하는 아미노산의 세트에 의존한다. 잔기 중 하나는 항상 세린이므로, 이들을 세린 프로테아제로 칭한다. 예를 들어, 키모트립신, 트립신 및 엘라스타제는 유사한 구조를 공유하고 이들의 활성 세린 잔기는 3개 모두에서 동일한 위치(Ser-195)에 있다. 이들의 유사점에도 불구하고, 이들은 상이한 기질 특이성을 갖는다. 이들은 단백질 분해 동안에 상이한 펩타이드 결합을 절단한다. 예를 들어, 키모트립신은 카보닐 그룹이 절단될 펩타이드 결합의 일부인 잔기 상의 방향족 측쇄를 선호한다. 트립신은 당해 위치에서 양전하의 Lys 또는 Arg 잔기를 선호한다. 세린 프로테아제는 이들의 기질 인지 특성이 현저히 상이하다: 몇몇은 특이성이 높다 (즉, 프로테아제가 혈액 응집 및 면역 보체 시스템에 관여한다); 몇몇은 단지 일부 특이적이다 (즉, 포유류 분해 프로테아제 트립신 및 키모트립신); 서브틸리신과 같은 기타 세균 프로테아제는 완전히 비특이적이다. 특이성의 이러한 차이에도 불구하고, 세린 프로테아제의 촉매 기전은 잘 보존되어 있다.
세린 프로테아제에 의한 표적 단백질의 절단 기전은 세린에 의한 표적 펩타이드 결합의 친핵성 공격에 기초한다. 시스테인, 트레오닌 또는 아스파르테이트 또는 금속과 결합된 물 분자가 또한 이러한 작용을 할 수 있다. 다수의 경우에서, 그룹의 친핵성 특성은 아스파르테이트에 의한 "양성자 수용 상태"에 고정된 히스티딘의 존재에 의해 개선된다. 세린, 히스티딘 및 아스파테이트의 정렬된 측쇄는 대부분의 세린 프로테아제에서 일반적인 촉매적 트리아드를 형성한다. 예를 들어, 키모트립신의 활성 부위 및 MT-SP1과 같은 키모트립신과 같은 동일한 계열의 구성원인 세린프로테아제는 Asp102, His57 및 Ser195이다.
키모트립신 슈퍼패밀리의 모든 세린 프로테아제의 촉매 도메인은 서열 상동성 및 구조적 상동성 둘다를 갖는다. 당해 서열 상동성은 다음의 보존 잔기를 포함한다: 1) 특징적인 활성 부위 잔기 (예를 들어, 트립신의 경우에 Ser195, His57, 및 Asp102); 2) 산소음이온(oxyanion) 구멍(예를 들어, 트립신의 경우에 Gly193, Asp194); 및 3) 구조에서 디설파이드 브릿지를 형성하는 시스테인 잔기(참조: Hartley, B.S., (1974) Symp . Soc . Gen . Microbiol., 24: 152-182). 구조적 상동성은 1) 2개의 그리스 키 구조를 특징으로 하는 공통된 폴드(참조: Richardson, J. (1981) Adv. Prot. Chem., 34:167-339); 2) 촉매 잔기의 공통된 배열 및 3) 분자 코어내 세부적인 구조의 보존성(참조: Stroud, R.M. (1974) Sci. Am., 231: 24-88)을 포함한다.
세린 프로테아제의 키모트립신 계열 전체에서, 기질과 효소 사이의 골격 상호작용은 완전히 보존되어 있지만, 측쇄 상호작용은 상당히 다양하다. 활성 부위의 S1 내지 S4 포켓을 함유하는 아미노산의 특성은 당해 특정 포켓의 기질 특이성을 결정한다. 하나의 세린 프로테아제의 아미노산을 동일한 폴딩의 다른 것으로 이식하는 것은 하나의 특이성을 다른 것으로 변형시킨다. 통상적으로, S1 내지 S4 포켓을 함유하는 프로테아제의 아미노산은 기질의 4 내지 5 옹스트롬 내에 측쇄를 갖는 것들이다. 프로테아제 기질을 갖는 이들 아미노산의 상호작용은 이들이 기질과 직접 접촉하므로 통상 "제1 쉘 (shell)" 상호작용이라 불린다. 그러나, 궁극적으로 제1 쉘 아미노산 위치하는 "제2 쉘" 및 "제3 쉘" 상호작용일 수 있다. 제1 쉘 및 제2 쉘 기질 결합 효과는 주로 베타-배럴 (barrel) 도메인 사이의 루프 (loop)에 의해 결정된다. 이들 루프는 단백질의 중심 요소가 아니기 때문에, 폴딩의 고유 특성은 유지되고, 신규한 기질 특이성을 갖는 루프 변이체는 분자적 수준에서 필요한 대사 또는 조절 니케 (niche)를 만족시키는 진화적 과정 동안에 선택될 수 있다. 통상적으로, 세린 프로테아제에 대해, 키모트립신 번호매김에 기초한 주요 서열의 다음의 아미노산은 특이성의 결정기이고: 195, 102, 57 (촉매적 트리아드); 189, 190, 191, 192 및 226 (S1); 58, 64 내지 99의 루프(S2); 192, 217, 218 (S3); Cys168 내지 Cys 180 사이의 루프, 215 및 97 내지 100 (S4); 및 41 및 151 (S2'), S1 위치 내의 아미노산은 P1 특이성에 영향을 주고, S2 위치 내의 아미노산은 P2 특이성에 영향을 주고, S3 위치 내의 아미노산은 P3 특이성에 영향을 주고, S4 위치 내의 아미노산은 P4 특이성에 영향을 준다. 세린 프로테아제 내의 위치 189는 S1 특이성을 결정하는 포켓의 바닥에 내포된 잔기이다. 다양한 세린 프로테아제에 대한 구조적 결정기는 성숙한 키모트립신의 번호매김을 기준으로 키모트립신의 프로테아제 도메인의 그것과 결합된 각각의 고안된 프로테아제에 대한 프로테아제 도메인과 함께 표 8에 기재된다. Cys168-Cys182 및 60's 루프 컬럼 표제 밑의 번호는 2개의 아미노산 및 루프 사이의 루프의 아미노산 번호를 나타낸다. Cys191-Cys220 컬럼 표제 아래의 yes/no 표시는 이황화 결합이 프로테아제 내에 존재함을 나타낸다. 이들 영역은 키모트립신-유사 세린 프로테아제의 계열 내에서 다양하고 이들 자신의 구조적 결정기를 나타낸다. S1 내지 S4 포켓 내의 임의의 하나 이상의 아미노산을 전환하는 프로테아제의 변형은 표적 특이성에 대한 프로테아제의 특이성 또는 선택성에 영향을 준다.
Figure 112009007335988-pct00019
(a) 우로키나제형 플라스미노겐 활성화인자 (u- PA )
우로키나제형 플라스미노겐 활성화인자(u-PA, 또한 뇨 플라스미노겐 활성화인자)는 본원의 방법에서 선별을 위한 후보물로서 사용되는 대표적인 프로테아제이다. u-PA는 서열번호 190에 제시되어 있고 서열번호 191에 제시된 전구체 아미노산 서열을 암호화한다. u-PA는 뇨, 혈액, 정액 및 많은 암 조직에서 발견된다. 이것은 플라스미노겐의 플라스민(이 자체는 세린 프로테아제이다)으로의 전환과 관련된 다양한 생물학적 과정에 관여한다. 플라스민은 예를 들어, 피브린, 피브로넥틴, 프로테오글리칸 및 라미닌을 포함하는 다양한 분자의 절단을 통한 세포 이동 및 조직 파괴를 포함하는 다양한 정상적이고 병리학적인 과정에서 역할을 갖는다. u-PA는 상처 치유, 염증 세포 이동, 신생혈관형성 및 종양 세포 침입 동안에 조직 리모델링에 관여한다. u-PA는 또한 간세포 성장 인자/스캐터 인자(HGF/SF), 막 1형 매트릭스 메탈로프로테아제(MT-SP1)의 잠재적 형태 및 기타를 포함하지만 이에 제한되지 않는 다른 기질을 절단하고 활성화시킨다.
u-PA의 성숙한 형태는 411개 잔기 단백질(20개의 아미노산 시그날 펩타이드를 함유하는 전구체 형태인 서열번호 191에 제시된 서열에서 아미노산 잔기 21번 내지 431번에 상응하는)이다. u-PA는 3개의 도메인을 함유한다: 세린 프로테아제 도메인, 크링글 도메인 및 성장 인자 도메인. 사람 u-PA의 성숙한 형태에서, 아미노산 1번 내지 158번은 성장 인자 도메인(아미노산 1번 내지 49번), 크링글 도메인(아미노산 50번 내지 131번) 및 도메인간 링커 영역(아미노산 132번 내지 158번)을 포함하는 N-말단 A 쇄를 나타낸다. 아미노산 159번 내지 411번은 C-말단 세린 프로테아제 도메인 또는 B 쇄를 나타낸다. u-PA는 합성되고 단일쇄 자이모겐 분자로서 분비되고 이는 예를 들어, 플라스민, 칼리크레인, 카텝신 B 및 신경 성장 인자-감마를 포함하는 다양한 프로테아제에 의해 활성 2개의 쇄 u-PA로 전환된다. 2개 쇄 형태로의 절단은 성숙한 u-PA 서열중 잔기 158번과 159번(서열번호 191에서 아미노산 잔기 178번 및 179번에 상응함) 사이에서 일어난다. 2개의 수득한 쇄는 디설파이드 결합에 의해 함께 유지되어 2개의 쇄 형태의 u-PA를 형성한다.
u-PA는 고친화성 세포 표면 수용체, uPAR에 결합함에 의해 조절된다. u-PA의 uPAR로의 결합은 플라스미노겐 활성화 속도를 증가시키고 세포외 매트릭스 분해 및 세포 침입을 증진시킨다. uPAR과 u-PA 사이에서 형성된 이원 복합체는 막-연합된 플라스미노겐과 반응하여 플라스미노겐 활성화에 대한 Km(즉, 기질에 대한 대략적 친화성의 반응속도론적 속도 상수)을 감소시키는 고도의 활성화 복합체를 형성한다(참조: Bass et al. (2002) Biochem . Soc , Trans., 30: 189-194). 또한, u-PA의 uPAR로의 결합은 동족 억제제, 즉 PAI-1에 의한 억제로부터 프로테아제를 보호한다. 이것은 단일쇄 통상적으로 혈장에 존재하는 u-PA가 PAI-1에 의한 억제에 민감하지 않고 혈장중에 임의의 활성 u-PA가 PAI-1에 의해 억제되기 때문이다. 수용체에 결합하는 활성 u-PA는 PAI-1에 의한 억제를 위해 완전히 유용하지만 PAI-1은 결합된 활성 분자에 접근할 수 없다(참조: Bass et al. (2002) Biochem . Soc , Trans., 30: 189-194). 결과로서, u-PA는 주로 세포 표면상에 작용하고 이의 기능은 플라스민 의존성 세포주변 단백질분해의 활성화와 관련된다.
u-PA 및 t-PA의 확대된 기질 특이성(하기에 논의됨)은 이 둘다가 플라스미노겐을 활성 플라스민으로 절단하는데 관여한다는 사실때문에 유사하다. u-PA 및 t-PA 둘다는 P1 Arg 이후 절단에 대해 높은 특이성을 갖고 이들은 유사하게 P2 위치에서 소형 아미노산을 선호함을 보여준다. P3 및 P4 위치 둘다는 u-PA 및 t-PA의 기질에 대한 특이성 결정요소이고 특히 P3 위치에서 주요 역할을 갖는다(참조: Ke et al. (1997) J. Biol. Chem., 272: 16603-16609). P3 위치에서 아미노산에 대한 선호도는 명백하고 2개 프로테아제간의 변화된 기질 식별을 위한 주요 결정요소이다. t-PA는 P3 위치에서 방향족 아미노산(Phe 및 Tyr)에 대한 선호도를 갖는 반면 u-PA는 소형 극성 아미노산(Thr 및 Ser)에 대한 선호도를 갖는다(참조: Ke et al. (1997) J. Biol. Chem., 272: 16603-16609; Harris et al. (2000) PNAS, 97: 7754-7759).
(b) 조직 플라스미노겐 활성화인자(t- PA )
본원에 제공된 방법에서 프로테아제 포획체에 대한 선별을 위한 후보 프로테아제는 또한 대표적인 세린 프로테아제 조직 플라스미노겐 활성화인자(t-PA) 및 이의 변이체를 포함한다. t-PA는 플라스미노겐을 플라스민으로 전환시키는 세린 프로테아제이고 섬유용해 또는 혈액 응고 형성에 관여한다. 재조합 t-PA는 혈액 응고를 특징으로 하는 질환, 예를 들어, 졸중의 치료제로서 사용된다. t-PA 유전자의 택일적 스플라이싱은 2개의 전사체를 생성시킨다. 주요 전사체는 서열번호 192에 제시되어 있고 20 내지 23개 아미노산 시그날 서열 및 12개 내지 15개 아미노산 프로-서열을 함유하는 서열번호 193에 제시된 전구체 단백질을 암호화한다. 다른 전사체는 서열번호 194 및 196에 제시되어 있고 각각 서열번호 195 및 197에 제시된 아미노산 서열을 갖는 전구체 단배길을 암호화한다. 시그날 서열 및 프로펩타이드 서열이 부재인 t-PA의 성숙한 서열은 527개 아미노산이다.
t-PA는 혈관의 내피세포에 의해 분비되고 단일쇄 형태로서 혈액내에서 순환한다. 많은 다른 세린 프로테아제 같지 않게 t-PA의 단일쇄 또는 전구효소 형태는 높은 촉매 효율을 갖는다. t-PA의 활성은 피브린의 존재하에 증가된다. 피브린의 부재하에 단일쇄 t-PA는 2개의 쇄 t-PA와 비교하여 이의 활성의 약 8%이지만 피브린의 존재하에서 t-PA의 단일쇄 및 2개의 쇄 형태는 유사한 활성을 나타낸다(참조: Strandberg et al. (1995) J. Biol . Chem., 270: 23444-23449). 따라서, 단일쇄 t-PA의 활성화는 활성화 절단(즉, 자이모겐 절단)으로 2개의 쇄 형태를 유도하거나 보조인자 피브린에 결합시킴에 의해 수행될 수 있다. 활성화 절단은 플라스민, 조직 칼리크레인 및 아미노산 위치 Arg275-Ile276 (서열번호 193에 제시된 아미노산 서열중에 Arg310-Ile311에 상응함)에서 활성화된 인자 X에 의한 절단 후 일어나고 활성 2개 쇄 형태의 t-PA를 유도한다. 2개의 쇄 폴리펩타이드는 상호 쇄 디설파이드 결합에 의해 연결된 A 및 B 쇄를 함유한다.
성숙한 t-PA는 16개 디설파이드 브릿지를 함유하고 5개의 독특한 도메인으로 구성된다(참조: Gething et al. (1988), The EMBO J., 7: 2731-2740). 성숙한 단백질의 잔기 4번 내지 50번은 핑거 도메인을 형성하고 잔기 51번 내지 87번은 EGF형 도메인을 형성하고 잔기 88번 내지 175번 및 176번 내지 263번은 각각 도메인내 디설파이드 결합을 함유하는 2개의 크링글 도메인을 형성하고 성숙한 단백질의 잔기 277번 내지 527번(서열번호 193에 제시된 전구체 서열의 아미노산 잔기 311번 내지 562번에 상응함)은 세린 프로테아제 도메인을 구성한다.
세포 수용체 결합 활성화인자로서 작용하는 u-PA와는 반대로 t-PA는 피브린 의존성 순환 활성화 효소로서 기능한다. 또한, t-PA의 단일쇄 및 2개 쇄 형태 모두는 이들이 동족 억제제, 예를 들어, PAI-1에 의한 억제에 민감하지만 2개의 t-PA는 단일쇄 t-PA 보다 대략 1.4배 신속하게 PAI-1에 의해 억제된다(참조: Tachias et al. (1997) J Biol . Chem., 272: 14580-5). t-PA는 내피세포상에서 이의 세포 결합 부위 아넥신-II와 결합함으로써 억제로부터 보호될 수 있다. 따라서, t-PA와 u-PA 둘다는 플라스미노겐을 절단하고 활성화시키지만 혈중 t-PA의 작용은 플라스미노겐의 주요 섬유용해 활성화인자로서 t-PA를 지지하고 u-PA는 플라스미노겐의 주요 세포 활성화인자이다.
(c) MT - SP1
막형 세린 프로테아제 MT-SP1(또한 매트립타제, TADG-15, 종양원성 14의 서프레서, ST14로 호칭됨)은 목적하거나 미리 결정된 기질 절단 서열에 대해 변화된 기질 특이성을 갖는 변이체를 선별하기 위해 본원에 제공된 방법에서 선별용의 대표적인 프로테아제이다. MT-SP1의 서열은 서열번호 252에 제시되어 있고 서열번호 253에 제시된 아미노산 서열을 갖는 855개의 아미노산 폴리펩타이드를 암호화한다. 이것은 C-말단 세린 프로테이나제 도메인을 갖는 다중도메인 프로테이나제이다 (참조: Friedrich et al. (2002) J Biol Chem 277(3):2160). 프로테아제의 683개 아미노산 변이체가 분리되었지만 당해 단백질은 절단된 형태 또는 엑토도메인 형태인 것으로 나타난다.
MT-SP1은 전립선, 유방 및 결장직장암에서 고도로 발현되거나 활성이고 이것은 유방 및 전립선암의 전이에서 특정 역할을 할 수 있다. MT-SP1은 또한 다양한 상피 조직에서 발현되고 사람 위장관 및 전립선에서 고수준의 활성 및/또는 발현이 나타난다. 기타 종의 MT-SP1은 공지되어 있다. 예를 들어, MT-SP1의 마우스 유사체가 확인되었고 에피틴으로 호칭된다.
MT-SP1은 서열번호 253으로 제시된 서열에서 아미노산 615번 내지 854번(또는 문헌에서의 다양성에 따라 615번 내지 855번) 사이에 막관통 도메인, 2개의 CUB 도메인, 4개의 LDLR 반복체 및 세린 프로테아제 도메인(또는 펩티다제 S1 도메인; 또한 B 쇄로서 호칭됨)을 포함한다. 프로테아제 도메인의 아미노산 서열은 서열번호 505로 제시되고 서열번호 504로 제시된 핵산의 서열에 의해 암호화된다. MT-SP1은 자이모겐으로서 합성되고 절단에 의해 이중쇄로 활성화된다. 또한, 단독의 단일쇄 단백질분해 도메인은 촉매적으로 활성이고 기능성이다.
키모트립신 번호매김을 기준으로 서열번호 253 또는 505로 제시된 MT-SP1의 야생형 서열에 상응하는 C122S의 돌연변이를 갖는 CB469로 호칭되는 MT-SP1 변이체는 파지미드 벡터상에 개선된 디스플레이를 나타낸다. 당해 변이 MT-SP1은 서열번호 515(전장 MT-SP1) 또는 서열번호 507(프로테아제 도메인)에 제시되고 하기 본원에 기재된 방법에 사용될 수 있다.
MT-SP1은 키모트립신 및 트립신을 포함하는 세린 프로테아제의 펩티다제 S1 계열(또한 키모트립신 계열로서 언급됨)에 속한다. 일반적으로, 키모트립신 계열 구성원은 키모트립신과 서열 및 구조적 상동성을 공유한다. MT-SP1은 본원에서 성숙한 키모트립신의 번호매김에 따라 번호를 매기고 이의 프로테아제 도메인은 키모트립신의 프로테아제 도메인과 정렬되고 이의 잔기는 상응하게 번호를 매긴다. 키모트립신 번호매김을 기준으로, 활성 부위 잔기는 Asp102, His57 및 Ser195 (서열번호 253에서 Asp711, His656 및 Ser805에 상응함)이다. 선형 아미노산 서열은 키모트립신의 서열과 정렬될 수 있고 키모트립신의 β 쉬트에 따라 번호를 매긴다. 삽입 및 결실은 베타 쉬트 사이의 루프에서 일어나지만 구조적 계열 전반에 걸쳐서 코어 쉬트는 보존된다. 세린 프로테아제는 보존된 베타 쉬트 방식으로 기질과 상호작용한다. 6개 이하의 보존된 수소 결합은 기질과 효소 사이에서 발생할 수 있다. 키모트립신 계열의 모든 세린 프로테아제는 촉매 활성에 필요한 프로테아제 도메인의 N-말단에서 보존된 영역(즉, IIGG, VVGG 또는 IVGG, 여기서, 당해 4개 잔기에서 첫번째 아미노산은 키모트립신 번호매김에 따라 번호를 매기고 Ile16으로 지정된다. 당해 번호매김은 전구체 서열의 길이를 반영하지 않는다)을 갖는다.
프로테아제 도메인에서 MT-SP1의 기질 특이성은 위치 스캐닝 합성 조합 라이브러리 및 기질 파지 디스플레이를 사용하여 맵핑되었다(참조: Takeuchi et al . (2000) J Biol Chem 275: 26333). MT-SP1에 의해 인지되는 기질내 절단 잔기는 P4에 Arg/Lys 및 P3에 염기성 잔기 또는 Gln, P2에서 소형 잔기, P1에서 Arg 또는 Lys, 및 P1'에서 Ala를 포함한다. 효과적인 기질은 각각 P4 내지 P1 부위에서 Lys-Arg-Ser-Arg를 포함한다. 일반적으로, MT-SP1에 대한 기질 특이성은 P3이 염기성인 경우 P4는 비염기성인 경향이 있고 P4가 염기성인 경우 P3은 비염기성인 경향이 있다는 동향을 밝힌다. 예를 들어, 프로테아제 활성화된 수용체-2(PAR-2), 단일쇄 uPA(sc-uPA), MT-SP1의 전구형태 및 간세포 성장 인자를 포함하는 MT-SP1에 대해 공지된 기질은 MT-SP1 특이적 기질에 대한 절단 서열과 일치한다.
MT-SP1은 트립신만큼 효율적으로 선택된 합성 기질을 절단할 수 있지만 트립신 보다 기질에 대해 보다 제한된 특이성을 나타낸다. MT-SP1의 촉매 도메인은 (키모)트립신형 세린 프로테아제의 전체 구조적 폴드를 갖지만 소수성/산성 S2/S4 아부위 및 노출된 60 루프와 같은 독특한 성질을 나타낸다. 유사하게, MT-SP1은 접근가능한 Lys 또는 Arg 잔기에서 펩타이드 기질을 무분별하게 절단하지 않지만 접근가능한 펩타이드 결합 주변의 추가 잔기의 인지를 필요로 한다. 연장된 주요 서열에 대한 당해 필요성은 이의 기질에 대한 MT-SP1의 특이성을 강조한다. 예를 들어, MT-SP1은 프로테이나제 활성화된 수용체-2(PAR-2)(Ser-Lys-Gly-Arg의 P4 내지 P1 표적 서열을 나타냄)를 절단하지만 당해 효소는 PAR-1, PAR-3 및 PAR-4와 같이 절단 용이한 결합 근처에서 연장된 MT-SP1 특이성과 일치하는 표적 기질을 나타내지 않는 당해 기질과 밀접하게 관련된 단백질을 활성화시키지 못한다 (참조: Friedrich et al . (2002) J Biol Chem 277: 2160).
MT-SP1의 프로테아제 도메인은 프로-영역 및 촉매 도메인으로 구성된다. 폴리펩타이드의 촉매 활성 부분은 자가활성 부위 이후에 성숙한 단백질의 아미노산 잔기 611번에서 개시한다(예를 들어 RQAR에 이어서 잔기 VVGG의 서열번호 253 참조). MT-SP1 및 트립신의 S1 포켓은 Arg P1 잔기 뿐만 아니라 Lys에 대한 양호한 상보성과 유사함으로 기질 절단에서 트립신과 몇몇 유사성을 나타낸다. P1-Lys 잔기의 수용은 이의 측쇄가 추가의 수소 결합을 제공하여 매장된 α-암모늄 그룹을 안정화시키는 Ser190에 의해 매개된다(참조: Friedrich et al . (2002) J Biol Chem 277: 2160). S2 포켓은 P2 아미노산의 소형 내지 중간 크기의 소수성 측쇄를 수용하고 일반적으로 P2 위치에서 광범위 아미노산을 수용하도록 하는 형태를 취하고 있다. 기질 결합시 S2 아부위는 Phe99 벤질 그룹의 회전에 의해 입증되는 바와 같이 단단하지 않다. 위치 P3(Gln 또는 염기성 잔기에 대한) 및 P4(Arg 및 Lys 잔기에 대한)에서 기질 아미노산은, S3 및 S4 포켓에서 효소 활성 부위 틈에 접근함으로써 특정 염기성 펩타이드 기질을 우선적으로 미리 배향시킬 수 있는 Asp-217 및/또는 Asp-96의 산성 측쇄와의 정전기적 정전기 상호작용에 의해 매개되는 것으로 나타난다. P3 잔기의 측쇄는 또한 Gln192의 카복스아미드 그룹과 수소결합할 수 있거나 또한 P3 측쇄는 S4-아부위로 연장하여 Phe97과의 수소 결합을 형성함으로써 Gly216과의 주쇄 상호간 수소결합을 약화시킬 수 있다. 하나의 형태에서, 염기성 P3 측쇄는 우선적으로 MT-SP1 S4 포켓의 음성 전위와 우선적으로 상호작용할 수 있다. 동일한 S4 부위로부터 상호 전하 보상 및 배척은 우수한 MT-SP1 기질내 P3 및 P4에서 Arg/Lys 잔기가 동시에 존재할 가능성이 낮음을 설명한다. 일반적으로, 기질 결합에 대해 확대된 특이성에 기여하는 MT-SP1의 아미노산 위치(키모트립신 번호매김을 기준으로)는 146 및 151 (S1'); 189, 190, 191, 192, 216, 226 (S1); 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 99 (S2); 192, 217, 218, 146 (S3); 96, 97, 98, 99, 100, 168, 169, 170, 170A, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 178, 179, 180, 215, 217, 224 (S4)를 포함한다.
ii . 시스테인 프로테아제
시스테인 프로테아제는 시스테인 설프히드릴기가 관여하는 촉매 기전을 갖는다. 인접 히스티딘 잔기에 의한 시스테인 설프히드릴의 탈양성자화 후, 펩타이드 카보닐 탄소 상의 시스테인의 친핵성 공격이 일어난다. 신규 카복시-말단이 시스테인티올로 결합된 티오에스테르는 반응의 중간체이다 (세린 프로테아제의 아실-효소 중간체와 비교가능함). 시스테인 프로테아제는 파파인, 카텝신, 캐스파제 및 칼페인을 포함한다.
파파인-유사 시스테인 프로테아제는 파파인에 대한 구조적 유사성에 의해 관련된 티올 의존성 엔도-펩티다제의 계열이다. 이들은 R 및 L (오른쪽 및 왼쪽)으로 표시하는 도메인과 함께 2개의 도메인 단백질을 형성하고 2개의 도메인으로부터의 루프는 기질 인지 홈을 형성한다. 이들은 아미노산 Cys25, His159 및 Asn175로 이루어진 촉매 트리아드를 갖는다. 기질의 베타-시트 형태에 기초하여 표적 펩타이드를 인지하고 단백질분해하는 세린 프로테아제와는 달리, 당해 프로테아제 계열은 기질 인지를 위한 포켓이 잘 규명되어있지 않다. 주요 기질 인지는 P2 아미노산에서 발생한다 (세린 프로테아제의 P1 잔기와 비교).
다수의 시스테인 프로테아제 (사람 카텝신 L, V, K, S, F, B, 파파인 및 크루자인)의 기질 특이성은 완전 다양한 위치 조사 합성 조합 라이브러리 (PS-SCL)을 이용하여 결정된다. 완전 라이브러리는 P1, P2, P3 및 P4의 테트라펩타이드 기질을 함유하고, 이때, 하나의 위치가 고정된 채로 있으면, 다른 3개의 위치가 20개의 가능한 아미노산의 동일한 몰 혼합물과 함께 자유롭게 존재하여, 전체 약 160,000개의 테트라펩타이드 서열의 다양성을 제공한다.
전체적으로, P1 특이성은 강하게 선호되는 Arg 및 Lys와 함께 카텝신 사이에서 거의 동일하고, 작은 지방족 아미노산은 용인된다. 상당한 선택성이, 사람 카텝신이 소수성 아미노산에 대해 엄격하게 선택적인 P2 위치에서 발견된다. 흥미롭게도, 소수성 잔기에 대한 P2 특이성은 Phe, Tyr 및 Trp (카텝신 L, V)와 같은 방향족 아미노산과 Val 또는 Leu (카텝신 K, S, F)과 같은 대형 방향족 아미노산으로 나누어진다. P2 위치에 대해 비교하면, P3 위치에서의 선택성은 현저하게 덜 엄격하다. 그러나, 이들 프로테아제의 몇몇은 프롤린 (카텝신 V, S 및 파파인), 류신 (카텝신 B) 또는 아르기닌 (카텝신 S, 크루자인)을 명백하게 선호한다. 당해 프로테아제는 P4 위치에서 선호되는 아미노산이 없는 넓은 특이성을 나타낸다.
S2 포켓은 가장 선별적이고 프로테아제 기질 인지 부위의 특성이 가장 잘 규명되어 있다. 이는 공간 위치 (파파인 번호매김): 66, 67, 68, 133, 157, 160 및 205에서의 아미노산에 의해 정의된다. 위치 205는 세린 프로테아제에서 특이성을 결정하는 포켓의 바닥에 매장된 잔기-위치 189와 유사한 역할을 한다. 다른 특이성 결정기는 아미노산 (파파인에 따른 번호매김) 61 및 66 (S3) 19, 20 및 158 (S1)을 포함한다. 다양한 시스테인 프로테아제의 구조적 결정기는 표 9에 기재한다. 통상적으로, 확대된 특이성 결합 포켓 또는 상호작용의 제2의 다른 부위에서의 하나 이상의 아미노산을 전환하기 위한 파파인 프로테아제와 같은 시스테인 프로테아제의 변형은 보체 단백질 표적 기질을 포함하는 표적 기질에 대한 프로테아제의 특이성 또는 선택성에 영향을 준다.
Figure 112009007335988-pct00020
E. 스크리닝을 위한 변형된 프로테아제 및 수거물
프로테아제 또는 이의 변이체는 본원의 방법에 사용하여 목적하는 기질 특이성, 가장 흔하게는 변화되거나 개선되거나 최적화된 기질 특이성을 갖는 프로테아제를 확인할 수 있다. 본원에 제공된 방법에 사용되는 변형된 프로테아제는 일반적으로 당업계에 공지된 임의의 방법을 사용하여 프로테아제의 임의의 하나 이상의 아미노산 잔기를 돌연변이시킴에 의해 제조될 수 있다(참조: 공개된 미국 특허원 제2004/0146938호). 본원에 제공된 변형 및 방법을 위한 프로테아제는 예를 들어, 전장 야생형 프로테아제, 프로테아제의 공지된 변이체 형태, 촉매 활성, 예를 들어, 기질 단백질분해를 위해 충분한 프로테아제의 단편을 포함한다. 당해 변형된 프로테아제는 표적 프로테아제 포획체, 예를 들어, 서핀 또는 변형된 서핀에 대해 개별적으로 스크리닝될 수 있거나 이들은 예를 들어, 조합 라이브러를 포함하는 디스플레이 라이브러리를 사용함에 의해 수거물로서 스크리닝될 수 있고 이때, 프로테아제의 디스플레이는 예를 들어, 파지 디스플레이, 세포 표면 디스플레이, 비드 디스플레이, 리보솜 디스플레이 또는 기타에 의한 것이다. 안정한 공유 억제 복합체의 형성으로 인해 프로테아제 포획체 또는 이의 변형된 형태를 나타내는 프로테아제의 선별은 무엇보다 친화성 표지화 및/또는 정제, ELISA, 색원성 분석, 형광 기반 분석(예를 들어, 형광 켄칭 또는 FRET)을 포함하지만 이에 제한되지 않는 당업자에게 공지된 임의의 검출 계획에 의해 촉진될 수 있다.
1. 변이 프로테아제의 생성
프로테아제 서열을 돌연변이시키는 방법의 예는 프로테아제 서열의 선택 영역 또는 도메인의 초점화된 돌연변이유발을 초래하는 방법 또는 전제 서열에 따른 무작위 돌연변이 유발을 초래하는 방법을 포함한다. 하나의 예에서, 프로테아제에 대해 달성된 돌연변이의 수는 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 또는 20개이다. 바람직한 양태에서, 돌연변이(들)은 증가된 기질 특이성을 부여한다. 일부 예에서, 프로테아제 변이체의 활성은 야생형 프로테아제의 활성보다 10배 이상, 100배 이상 또는 1000배 이상 증가한다. 관련 측면에서, 활성에 있어서의 증가는 기질 특이성에 있다.
a. 무작위 돌연변이유발
무작위 돌연변이 유발 방법은 예를 들면, 이.콜라이 XL1red, UV 조사, 탈아민화와 같은 화학적 변형, 알킬화, 또는 염기 유사체 돌연변이원, 또는 DNA 셔플링(DNA shuffling), 카세트 돌연변이유발(cassette mutagenesis), 부위-지시된 무작위 돌연변이유발과 같은 PCR 방법, 또는 오류 빈발 PCR(참조: 미국 특허원 제2006-0115874호)을 포함한다. 이러한 예는 하이드록실아민에 의한 화학적 변형[참조: Ruan, H., et al . (1997) Gene 188:35-39], dNTP 유사체의 사용[참조: Zaccolo, M., et al . (1996) J. Mol . Biol . 255:589-603], 또는 예를 들면, GeneMorph PCR-기반 무작위 돌연변이유발 키트[제조원: 스트라타젠(Stratagene)] 또는 다양화 무작위 돌연변이유발 키트(Diversify random Mutagenesis kits)[제조원: 클론테크(Clontech)]와 같은 시판되는 무작위 돌연변이유발 키트의 사용을 포함하나, 이에 한정되지 않는다. 다양화 무작위 돌연변이유발 키트는 반응 혼합물 중 망간(Mn2+) 및 dGTP의 양을 변화시킴으로써 제공된 DNA 서열(2 내지 8개의 돌연변이/1000개의 염기쌍)에 대해 바람직한 돌연변이율의 선택을 허용한다. 망간 수준의 상승은 초기에 돌연변이율을 증가시키며, 추가의 돌연변이율은 증가된 농도의 dGTP에 의해 제공된다. 심지어 보다 높은 비율의 돌연변이는 PCR의 추가 회차를 수행함으로써 달성할 수 있다.
b. 초점화된 돌연변이유발
초점화된 돌연변이는 예를 들면, 촉매 활성을 매개하는 프로테아제 도메인의 영역내 유전자 서열의 예비-측정된 영역내에서 하나 이상의 돌연변이를 제조함으로써 달성할 수 있다. 하나의 예에서, 프로테아제의 하나 이상의 아미노산은 예를 들면, 퀵체인지(QuikChange)[제조원: 스트라타젠(Stratagene)]와 같은 어떠한 표준의 단일 또는 다수 부위-지시된 돌연변이유발 키트를 사용하여 돌연변이시킨다. 다른 예에서, 프로테아제의 어떠한 하나 이상의 아미노산은 예를 들면, 활성 부위 잔기의 돌연변이유발과 같은 포화 돌연변이유발에 의해 돌연변이된다[참조: Zheng et al. (2004) Nucl . Acids . Res., 32:115]. 당해 실시예에서, 프로테아제(여기서, 프로테아제는 펩타이드 기질의 P1-P4 잔기와 접촉하고 있다)의 S1-S4 포켓(pocket)을 형성하고/하거나 특이성의 중요한 결정인자인 것으로 밝혀진 잔기를 매 가능한 아미노산에 대해 단독으로 또는 함께 돌연변이시킨다. 일부 경우에, 활성 부위의 S1-S4 포켓 사이에 상호작용이 (존재하더라도) 거의 없으므로, 각각의 포켓은 다른 포켓과 독립적인 펩타이드 기질상의 상응하는 잔기를 인지하여 결합하는 것으로 여겨진다. 따라서, 특이성 결정인자는 일반적으로 다른 포켓의 특이성에 영향을 미치지 않으면서 하나의 포켓에서 변화될 수 있다. 하나의 대표적인 양태에서, 포켓을 라이닝(lining)하는 잔기(들)이 20개의 가능한 아미노산 중 각각에 대해 돌연변이되는 포화 돌연변이유발 기술이 사용된다(참조: 예를 들면, the Kunkle method, Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley and Sons, Inc., Media Pa.). 이러한 기술에서, 변성 돌연변이유발원성 올리고뉴클레오타이드 프라이머를 합성할 수 있으며, 당해 프라이머는 선택된 아미노산(들)을 암호화하는 바람직한 코돈(들)에서 뉴클레오타이드의 무작위화를 함유한다. 대표적인 무작위화 도식은 NNS- 또는 NNK-무작위화를 포함하며, 여기서, N은 특정의 뉴클레오타이드를 나타내고, S는 구아닌 또는 사이토신을 나타내며 K는 구아닌 또는 티민을 나타낸다. 변성 돌연변이유발원성 프라이머는 일본쇄 DNA 주형에 어닐링하며 DNA 폴리머라제를 가하여 주형의 상보성 쇄를 합성한다. 연결시킨 후, 이본쇄 DNA 주형을 증폭시키기 위해 이.콜라이내로 형질전환시킨다.
대표적인 프로테아제의 연장된 기질 결합 포켓을 형성하는 아미노산이 본원에 기술되어 있다. 일반적으로, 프로테아제의 기질 특이성은 예를 들면, 예를 들면, 프로테아제 및 기질 복합체의 3-차원 구조를 기준으로 한 분자 모델링에 의해서와 같이 공지되어 있다[참조: Wang et al ., (2001) Biochemistry 40(34):10038; Hopfner et al ., Structure Fold Des . 1999 7(8):989; Friedrich et al., (2002) J Biol Chem 277(3):2160; Waugh et al ., (2000) Nat Struct Biol. 7(9):762]. 예를 들어, MT-SP1의 초점화된 돌연변이는 195, 102, 157 [촉매적 트리아드(catalytic triad)]; 189, 190, 191, 192, 216 및 226 (S1); 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 99 (S2); 146, 192, 217, 218 (S3); 96, 97, 98, 99, 100, 168, 169, 170, 170A, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 178, 179, 180, 215, 217, 224 (S4)을 포함하는 기질 특이성에 기여하는 어떠한 하나 이상의 잔기(키모트립신 번호매김 기준)에 존재할 수 있다. 다른 예에서, 파파인 계열 프로테아제내 아미노산 잔기의 돌연변이는 66-68, 133, 157, 160 및/또는 215를 포함하는 P2 특이성(표준 파파인 번호매김)에 영향을 미치는 특정의 하나 이상의 단기에 존재할 수 있다. 또한, 프로테아제 기질과 직접 접촉하지 않으나 접촉 잔기(예를 들면, 위에서 나열한 것들과 같은)의 구조에 영향을 미치는 잔기를 또한 돌연변이시켜 프로테아제 스캐폴드의 특이성을 변경시킬 수 있다.
다른 예에서, 돌연변이유발을 위한 초점화된 아미노산은 유사한 기질 특이성을 갖는 동종 프로테아제의 서열 비교에 의해 선택할 수 있다. 컨센서스 아미노산 잔기는 동종 단백질의 아미노산 서열의 정렬, 예를 들면, 기질 결합에 포함된 프로테아제의 영역의 정렬에 의해 확인할 수 있다. 통상적으로, 유사한 기질 특이성을 갖는 프로테아제는 컨센서스 아미노산을 공유하는데, 예를 들어, 기질 결합 포켓내 아미노산은 비교된 프로테아제 사이에 동일하거나 또는 유사할 수 있다. 추가로, 기질 특이성이 상이한 프로테아제의 아미노산 서열을 비교하여 기질 인지에 포함될 수 있는 아미노산을 확인할 수 있다. 이들 방법은 돌연변이유발에 대한 표적 잔기를 확인하기 위해 3-차원 모델링과 같은 방법과 결합시킬 수 있다.
추가의 예에서, 초점화된 돌연변이유발은 프로테아제 스크리닝의 초기 회차에서 핫 스팟으로 확인된 아미노산에 한정될 수 있다. 예를 들면, 무작위적으로 돌연변이유발된 조합 라이브러리로부터 프로테아제의 선택에 이어, 몇가지 "핫 스팟" 위치가 대표적으로 관측되며 스크리닝 방법에서 재차 다시 선택된다. 가장 흔하게, 무작위 돌연변이유발은 폴리펩타이드 서열을 광범위하게 돌연변이시키지만 각각의 부위에서 단지 약간의 돌연변이와 함께, 초점화된 돌연변이유발은 추가의 돌연변이유발을 위한 핫 스팟 위치를 특이적으로 표적화하기 위한 제2 방법으로 사용된다. 핫 스팟 위치의 초점화된 돌연변이유발은 폴리펩타이드 서열의 무작위 돌연변이유발에 이어 발생하는 보다 얕은 돌연변이유발과는 반대되는 것으로서, 특별히 정의된 위치에서 보다 다양하고 깊은 돌연변이유발을 허용한다. 예를 들어, 포화 돌연변이유발을 사용하여, 예를 들면 이들 위치에서 NNt/g 또는 NNt/c를 함유하는 올리고를 사용함에 의해 "핫 스팟"을 돌연변이시킬 수 있다. 하나의 예에서, 본원에 제공된 방법을 사용하여, 다음 핫 스팟을 키모트립신 번호매김을 기준으로, 73, 80, 30 및 155의 증가된 기질 특이성에 기여하면서 u-PA에서 확인되어 왔다. 이들 위치의 돌연변이는 예를 들면, 이들 위치의 하나 이상에서 야생형 또는 주형 프로테아제 서열의 포화 돌연변이유발을 사용함에 의해 달성하여 후속적인 스크리닝에 사용될 프로테아제 돌연변이체를 선택할 수 있다.
2. 변이 프로테아제의 키메라 형태
본원에 제공된 변이 프로테아제는 키메라 또는 융합 단백질을 포함할 수 있다. 하나의 예에서, 프로테아제 융합 단백질은 프로테아제 단백질의 하나 이상의 촉매적으로 활성인 부위를 포함한다. 다른 예에서, 프로테아제 융합 단백질은 프로테아제의 2개 이상의 촉매적으로 활성인 부위를 포함한다. 융합 단백질내에서, 비-프로테아제 폴리펩타이드는 프로테아제 폴리펩타이드의 N-말단 또는 C-말단에 융합될 수 있다. 하나의 양태에서, 융합 단백질은 비-프로테아제 폴리펩타이드로부터 프로테아제를 분리하는 유연성(flexible) 펩타이드 링커 또는 스페이서를 포함할 수 있다. 다른 양태에서, 융합 단백질은 태그 또는 검출가능한 폴리펩타이드를 포함할 수 있다. 대표적인 태그 및 검출가능한 단백질은 당해 분야에 공지되어 있으며, 예를 들면, 히스티딘 태그, 헤마글루티닌 태그, myc 태그 또는 형광성 단백질을 포함하나, 이에 한정되지 않는다. 또 다른 양태에서, 융합 단백질은, 프로테아제 서열이 GST(글루타티온 S-트랜스퍼라제) 서열의 N-말단에 융합된 GST-프로테아제 융합 단백질이다. 이러한 융합 단백질은 재조합체 프로테아제 폴리펩타이드의 정제를 용이하게 할 수 있다. 다른 양태에서, 융합 단백질은 Fc 융합체이며, 여기서, 프로테아제 서열은 면역글로불린 G로부터 Fc 도메인의 N-말단에 융합된다. 이러한 융합 단백질은 생체내에서 우수한 약동학적 특성을 가질 수 있다. 다른 양태에서, 융합 단백질은 이의 N-말단에서 이종 시그날 서열을 함유하는 프로테아제 단백질이다. 특정의 숙주 세포(예를 들면, 포유동물 숙주 세포)에서, 프로테아제의 발현 및/또는 분비는 이종 시그날 서열의 사용을 통해 증가시킬 수 있다.
프로테아제 키메라 또는 융합 단백질은 표준 재조합 DNA 기술로 생산할 수 있다. 예를 들어, 상이한 폴리펩타이드 서열을 암호화하는 DNA 단편을 통상의 기술에 따라, 예를 들면, 연결용 평활-말단 또는 스태거(stagger)-종결된 말단의 사용, 적절한 말단을 제공하기 위한 제한 효소 분해, 경우에 따라 점착 말단의 충진(filling-in), 바람직하지 않은 연결을 피하기 위한 알칼린 포스파타제 처리 및 효소 연결에 의해 프레임내(in-frame)에서 함께 연결시킨다. 다른 양태에서, 융합 유전자는 자동화된 DNA 합성기를 포함하는 통상의 기술로 합성할 수 있다. 또는, 유전자 단편의 PCR 증폭을 후속적으로 어닐링하고 재증폭시켜 키메라 유전자 서열을 생성할 수 있는 2개의 연속된 유전자 단편 사이의 상보성 오버행(overhang)을 생성하는 앵커 프라이머(anchor primer)를 사용하여 수행할 수 있다[참조: 예를 들면, Ausubel et al. (eds.) CURRENT PROTOCOLS IN MOLECULAR BIOLOGY, John Wiley & Sons, 1992]. 또한, 융합 잔기를 이미 암호화하고 있는 많은 발현 벡터(예를 들면, GST 폴리펩타이드)가 시판된다. 프로테아제-암호화 핵산을 이러한 발현 벡터내로 클로닝함으로써 융합 단백질을 프로테아제 단백질에 프레임내 연결시킬 수 있다.
3. 조합 라이브러리 및 기타 라이브러리
스크리닝 검정용 화합물의 공급원은 조합 라이브러리를 포함하나, 이에 한정되지 않는 라이브러리와 같은 수집일 수 있다. 조합 라이브러리를 합성하는 방법 및 이러한 조합 라이브러리의 특성은 당해 분야에 공지되어 있다[참조: 일반적으로, Combinatorial libraries: Synthesis, Screening and Application Potential (Cortese Ed.) Walter de Gruyter, Inc., 1995; Tietze and Lieb, Curr. Opin. Chem. Biol., 2(3):363-71 (1998); Lam, Anticancer Drug Des., 12(3):145-67 (1997); Blaney and Martin, Curr. Opin. Chem. Biol., 1(1):54-9 (1997); 및 Schultz and Schultz, Biotechnol. Prog., 12(6):729-43 (1996)].
위치 스캐닝 합성 조합 라이브러리(PSSCL)를 포함하는, 프로테아제 또는 효소 라이브러리를 포함하는 다양한 라이브러리를 생성하기 위한 방법 및 전략은 분자 생물학 방법 및/또는 동시 화학 합성 방법을 사용하여 개발되어 왔다[참조: 예를 들면, Georgiou, et al. (1997) Nat. Biotechnol. 15:29-34; Kim et al. (2000) Appl Environ Microbiol. 66: 788 793; MacBeath, G.P. et al. (1998) Science 279:1958-1961; Soumillion, P.L. et al. (1994) Appl. Biochem. Biotechnol. 47:175-189, Wang, C. I. et al. (1996). Methods Enzymol. 267:52-68, 미국 특허 제6,867,010호, 제6,168,919호, 미국 특허원 제2006-0024289호]. 수득되는 조합 라이브러리는 선택된 활성을 나타내는 화합물을 확인하기 위해 스크리닝할 수 있는 수많은 화합물을 잠정적으로 함유한다.
하나의 예에서, 프로테아제의 수집 또는 라이브러리의 성분은 폴리펩타이드 잔기를 나타낼 수 있는 파지, 바이러스 또는 세균과 같은 특정의 복제가능한 벡터를 포함하나, 이에 한정되지 않는 유전자 패키지상에 나타낼 수 있다. 나타낸 폴리펩타이드의 다수는 프로테아제 또는 이의 촉매적으로 활성인 부위와 같이 폴리펩타이드가 표적 폴리펩타이드에 결합하고/하거나 상호작용하도록 하는 방식으로 유전 패키지에 의해 나타낸다. 대표적인 유전 패키지는 박테리오파지[참조: 예를 들면, Clackson et 25 a/. (1991) Making Antibody Fragments Using Phage Display Libraries,, Nature, 352:624-628; Glaser et al. (1992) Antibody Engineering by Condon-Based Mutagenesis in a Filamentous Phage Vector System, J. Immunol., 149:3903 3913; Hoogenboom et al. (1991) Multi-Subunit Proteins on the Surface of Filamentous Phage: Methodologies for Displaying Antibody (Fate) Heavy and 30 Light Chains, Nucleic acids Res., 19:4133-41370], 바큘로바이러스[참조: 예를 들면, Boublik et a/. (1995) Eukaryotic Virus Display: Engineering the Major Surface Glycoprotein of the Autographa California Nuclear Polyhedrosis Virus (ACNPV) for the Presentation of Foreign protein on the Virus Surface, Bio/Technology, 13:1079-1084], 파지-디스플레이된 프로테아제와 같이 단백질을 나타내기 위한 다른 적합한 세균 및 기타 적합한 벡터를 포함하나, 이에 한정되지 않는다. 예를 들어, 목적한 박테리오파지는 T4 파지, M13 파지 및 HI 파지를 포함하나, 이에 한정되지 않는다. 유전적 패키지는 세균 세포내에서와 같이 임의로 증폭된다. 이들 유전 패키지 중 어느 것 및 당해 분야의 숙련가에게 공지된 어떠한 다른 것도 프로테아제 또는 이의 촉매적으로 활성인 부위를 나타내기 위해 본원에 제공된 방법에서 사용된다.
a. 파지 디스플레이 라이브러리
스크리닝을 위한 변이 프로테아제 또는 이의 촉매적으로 활성인 부위의 라이브러리는 M13, fd, f1, T7 및 λ 파지와 같은, 그러나 이에 한정되지 않는 표면 박테리오파지상에서 발현될 수 있다[참조: 예를 들면, Santini (1998) J. Mol. Biol. 282:125-135; Rosenberg et al. (1996) Innovations 6:1-6; Houshmand et al. (1999) Anal Biochem 268:363-370, Zanghi et al. (2005) Nuc. Acid Res. 33(18)e160:1-8]. 변이 프로테아제는 공유, 비-공유 또는 비-펩타이드 결합을 갖는 박테리오파지 외피 단백질에 융합될 수 있다[참조: 예를 들면, 미국 특허 제5,223,409호, Crameri et al. (1993) Gene 137:69 및 제WO 01/05950호]. 변이 프로테아제를 암호화하는 핵산은 외피 단백질을 암호화하는 핵산에 융합시켜 프로테아제-외피 단백질 융합 단백질을 생산할 수 있으며, 여기서, 변이체 단백질은 박테리오파지의 표면상에서 발현된다. 예를 들어, 변이 프로테아제를 암호화하는 핵산은 사상 파지(filamentous phage) M13 유전자 III(gIIIp; 서열번호 512)의 C-말단 도메인을 암호화하는 핵산에 융합시킬 수 있다. 일부 예에서, 파지상에서 개선된 디스플레이를 나타내는 돌연변이 프로테아제를 주형으로 사용하여 본원에 기술된 바와 같은 돌연변이체 파지 디스플레이 라이브러리를 생성한다. 예를 들면, 실시예 8에 기술된 바와 같이, 키모트립신 번호매김을 기준으로, 야생형 MT-SP1의 122번 위치에 상응하는 위치에서 세린의 시스테인으로의 돌연변이를 갖는 돌연변이 MT-SP1은 개선된 파지 디스플레이를 나타낸다. 따라서, 이러한 돌연변이체를 주형으로 사용하여 라이브러리에 있어서 다양성을 생성할 수 있다.
추가로, 융합 단백질은 유연성 펩타이드 링커 또는 스페이서, 태그 또는 검출가능한 폴리펩타이드, 프로테아제 부위, 또는 융합 단백질의 발현 및/또는 유용성을 증진시키기 위한 추가의 아미노산 변형을 포함할 수 있다. 예를 들어, 프로테아제 부위의 부가는 선택 과정에 이은 목적한 박테리오파지의 효율적인 회수를 허용할 수 있다. 대표적인 태그 및 검출가능한 단백질은 당해 분야에 공지되어 있으며 예를 들면, 히스티딘 태그, 헤마글루티닌 태그, myc 태그 또는 형광성 단백질을 포함하나, 이에 한정되지 않는다. 다른 예에서, 프로테아제-외피 단백질 융합체를 암호화하는 핵산을 리더 서열에 융합시켜 폴리펩타이드의 발현을 증진시킬 수 있다. 리더 서열의 예는 STII 또는 OmpA를 포함하나, 이에 한정되지 않는다. 파지 디스플레이는 예를 들면, 문헌[참조: Ladner et al., 미국 특허 제5,223,409호; Rodi et al. (2002) Curr. Opin. Chem. Biol. 6:92-96; Smith (1985) Science 228:1315-1317; WO 92/18619; WO 91/17271; WO 92/20791; WO 92/15679; WO 93/01288; WO 92/01047; WO 92/09690; WO 90/02809; de Haard et al. (1999) J. Biol. Chem 274:18218-30; Hoogenboom et al. (1998) Immunotechnology 4:1-20; Hoogenboom et al. (2000) Immunol Today 2:371-8; Fuchs et al. (1991) Bio/Technology 9:1370-1372; Hay et al. (1992) Hum Antibod Hybridomas 3:81-85; Huse et al. (1989) Science 246:1275-1281; Griffiths et al. (1993) EMBO J 12:725-734; Hawkins et al. (1992) J Mol Biol 226:889-896; Clackson et al. (1991) Nature 352:624-628; Gram et al. (1992) PNAS 89:3576-3580; Garrard et al. (1991) Bio/Technology 9:1373-1377; Rebar et al. (1996) Methods Enzymol. 267:129-49; Hoogenboom et al. (1991) Nuc Acid Res 19:4133-4137; 및 Barbas et al. (1991) PNAS 88:7978-7982]에 기술되어 있다.
파지 디스플레이에 적합한 핵산, 예를 들어, 파지 벡터는 당해 분야에 공지되어 있다[참조: 예를 들면, Andris-Widhopf et al. (2000) J Immunol Methods, 28: 159-81; Armstrong et al. (1996) Academic Press, Kay et al., Ed. pp.35-53; Corey et al. (1993) Gene 128(1):129-34; Cwirla et al. (1990) Proc Natl Acad Sci USA 87(16):6378-82; Fowlkes et al. (1992) Biotechniques 13(3):422-8; Hoogenboom et al. (1991) Nuc Acid Res 19(15):4133-7; McCafferty et al. (1990) Nature 348(6301):552-4; McConnell et al. (1994) Gene 151(1-2):115-8; Scott and Smith (1990) Science 249(4967):386-90].
프로테아제-외피 단백질 융합 단백질을 암호화하는 핵산의 라이브러리, 대표적으로 위에서 기술한 바와 같이 생성된 프로테아제 변이체는 박테리오파지의 게놈내로 통합시키거나, 또는 파지미드 벡터내로 삽입시킬 수 있다. 파지미드 시스템에서, 디스플레이 단백질을 암호화하는 핵산은, 통상적으로 6000개 미만의 뉴클레오타이드 길이인 파지미드 벡터상에 제공된다. 파지미드 벡터는 파지 복제 오리진을 포함함으로써 파지미드는, 플라스미드를 지닌 세균 세포가 헬퍼 파지, 예를 들면, M13K01 또는 M13VCS로 감염되는 경우 박테리오파지 입자내로 통합된다. 그러나, 파지미드는 충분한 파지 유전자 세트를 결여함으로써 감염 후 안정한 파지 입자를 생산한다. 이들 파지 유전자는 헬퍼 파지에 의해 제공될 수 있다. 대표적으로, 헬퍼 파지는 유전자 III 외피 단백질의 완전한 카피 및 파지 복제 및 어셈블리에 요구되는 다른 파지 유전자를 제공한다. 헬퍼 파지는 감염성 복제 오리진을 가지기 때문에, 헬퍼 파지 게놈은 야생형 기원을 갖는 플라스미드에 비해 파지 입자내로 효율적으로 통합되지 않는다(참조: 미국 특허 제5,821,047호). 파지미드 게놈은 검출가능한 마커 유전자, 예를 들면, 라이브러리 구성원에 의해 감염된 세포의 선택을 위한 AmpR 또는 KanR (각각 암피실린 또는 카나마이신 내성)을 함유한다.
파지 디스플레이의 다른 예에서, 발현되는 경우 감염성 파지 입자, 파지 패키징 시그날 및 자가 복제 서열을 생산하기에 충분한 파지 유전자 세트를 암호화하는 핵산을 수반하는 벡터를 사용할 수 있다. 예를 들어, 벡터는 디스플레이 단백질을 암호화하는 서열을 포함하도록 변형된 파지 게놈일 수 있다. 파지 디스플레이 벡터는 또한 제한 효소 분해 부위를 함유하는 다수 클로닝 부위와 같이, 외부 핵산 서열이 삽입될 수 있는 부위를 또한 포함할 수 있다. 예를 들어, 파지 벡터내 디스플레이 단백질을 암호화하는 외부 핵산 서열은 리보솜 결합 부위, 시그날 서열(예를 들면, M13 시그날 서열) 및 전사 종결 서열에 연결시킬 수 있다.
벡터는 표준 클로닝 기술에 의해 프로테아제 파지 외피 단백질의 일부를 포함하며 조절가능한 프로모터에 작동가능하게 연결된 폴리펩타이드를 암호화하는 서열을 함유하도록 작제할 수 있다. 일부 예에서, 파지 디스플레이 벡터는 파지 외피 단백질의 동일한 영역을 암호화하는 2개의 핵산 서열을 포함한다. 예를 들어, 벡터는 디스플레이 단백질을 암호화하는 서열에 작동가능하게 연결된 위치에서 이러한 영역을 암호화하는 하나의 서열, 및 외피 단백질을 암호화하는 작용성 파지 유전자(예를 들면, 야생형 파지 유전자)와 관련하여 이러한 영역을 암호화하는 다른 서열을 포함한다. 야생형 및 융합 외피 단백질 둘다의 발현은 파지 입자당 제조된 융합 단백질의 양을 저하시킴에 의해 성숙한 파지의 생산에 도움을 줄 수 있다. 이러한 방법은, 융합 단백질이 파지에 의해 거의 내성이 아닌 상황에서 특히 유리하다.
파지 디스플레이 시스템은 대표적으로 M13, fd 및 f1과 같은 사상 파지를 이용한다. 사상 파지를 사용하는 일부 예에서, 디스플레이 단백질은 파지 외피 단백질 앵커 도메인에 융합된다. 융합 단백질은 동일한 앵커 도메인을 갖는 다른 폴리펩타이드, 예를 들면, 외피 단백질의 야생형 또는 내인성 카피와 함께 공동발현시킬 수 있다. 단백질 디스플레이에 사용될 수 있는 파지 외피 단백질은 (i) 유전자 III 단백질(gIIIp)과 같은 사상 파지의 약간의 외피 단백질, 및 (ii) 유전자 VIII 단백질(gVIIIp)과 같은 사상 파지의 주요 외피 단백질을 포함한다. 유전자 VI 단백질, 유전자 VII 단백질 또는 유전자 IX 단백질과 같은 다른 파지 외피 단백질에 대한 융합체를 또한 사용할 수 있다(참조: 예를 들면, 제WO 00/71694호).
이들 단백질의 부위(예를 들면, 도메인 또는 단편)을 또한 사용할 수 있다. 유용한 부위는 파지 입자내로 안정하게 통합된 도메인을 포함함으로써, 예를 들면, 융합 단백질이 선택 과정을 통해 입자내에 잔존한다. 하나의 예에서, gIIIp의 앵커 도메인이 사용된다(참조: 예를 들면, 미국 특허 제5,658,727호 및 하기 실시예). 다른 예에서, gVIIIp가 사용되며(참조: 예를 들면, 미국 특허 제5,223,409호), 이는 디스플레이 단백질에 융합된 성숙하고, 완전한 길이의 gVIIIp일 수 있다. 사상 파지 디스플레이 시스템은 대표적으로 단백질 융합체를 사용하여 이종 아미노산 서열을 파지 외피 단백질 또는 앵커 도메인에 부착시킨다. 예를 들어, 파지는 시그날 서열, 이종 아미노산 서열, 및 앵커 도메인, 예를 들면, gIIIp 앵커 도메인을 암호화하는 유전자를 포함할 수 있다.
발현된 융합 단백질의 수가(valency)는 파지 외피 단백질을 선택함으로써 조절할 수 있다. 예를 들어, gIIIp 단백질은 대표적으로 파지 외피에 비리온당 3 내지 5개 카피로 통합된다. 따라서, 변이 프로테아제에 대한 gIIIp의 융합은 낮은 수가를 생산한다. 비교시, gVIII 단백질은 대표적으로 파지 외피에 비리온당 2700개 카피로 통합된다[참조: Marvin (1998) Curr. Opin. Struct. Biol. 8:150-158]. gVIIIp의 높은 수가로 인하여, 10개 잔기보다 큰 펩타이드는 일반적으로 파지에 의해 잘 견디지 못한다. 파지미드 시스템은 융합 단백질의 수가를 감소시키기 위한 외파 단백질의 야생형 카피를 제공함으로써 보다 큰 펩타이드에 대한 파지 내성을 증가시키는데 사용될 수 있다. 또한, 보다 큰 펩타이드의 발현에 최적화된 gVIIIp의 돌연변이체를 사용할 수 있다. 하나의 이러한 예에서, 돌연변이체 gVIIp는 표면 디스플레이 특성이 개선된 gVIIIp에 대한 돌연변이유발 스크리닝에서 수득되었다[참조: Sidhu et al. (2000) J. Mol. Biol. 296:487-495].
조절가능한 프로모터를 또한 사용하여 디스플레이 단백질의 수가를 조절할 수 있다. 조절된 발현을 사용하여 디스플레이 단백질의 낮은 수가를 갖는 파지를 생산할 수 있다. 많은 조절가능한(예를 들면, 유도성 및/또는 제어성) 프로모터 서열은 공지되어 있다. 이러한 서열은, 이의 활성이 사용자의 개입, 예를 들면, 온도와 같은 환경 매개변수의 조작, 또는 조절성 분자의 첨가 또는 리프레서 단백질의 제거에 의해 변형되거나 또는 조절될 수 있는 조절가능한 프로모터를 포함한다. 에를 들어, 외인성 화학 화합물을 가하여 일부 프로모터의 전사를 조절할 수 있다. 조절가능한 프로모터는 하나 이상의 전사 활성인자 또는 리프레서 단백질에 대한 결합 부위를 함유할 수 있다. 전사 인자 결합 부위를 포함하는 합성 프로모터를 작제하고 또한 조절가능한 프로모터로서 사용할 수 있다. 대표적인 조절가능한 프로모터는 환경 매개변수, 예를 들면, 온도 변화, 호르몬, 금속, 대사산물, 항생제 또는 화학제에 대해 반응성인 프로모터를 포함한다. 이.콜라이에서 사용하기에 적합한 조절가능한 프로모터는 lac, tac, trp, trc 및 tet 오퍼레이터 서열 또는 오페론으로부터의 전사 인자 결합 부위를 함유하는 프로모터, 알칼린 포스파타제 프로모터(pho), araBAD 프로모터와 같은 아라비노즈 프로모터, 람노즈 프로모터, 프로모터들 자체 또는 이의 작용성 단편을 포함한다[참조: 예를 들면, Elvin et al. (1990) Gene 37: 123-126; Tabor and Richardson, (1998) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1074-1078; Chang et al. (1986) Gene 44: 121-125; Lutz and Bujard, (1997) Nucl. Acids. Res. 25: 1203-1210; D. V Goeddel et al. (1979) Proc. Nat. Acad. Sci. U.S.A., 76:106-110; J. D. Windass et al. (1982) Nucl. Acids. Res., 10:6639-57; R. Crowl et al. (1985) Gene, 38:31-38; Brosius (1984) Gene 27: 161-172; Amanna and Brosius, (1985) Gene 40: 183-190; Guzman et al. (1992) J. Bacteriol., 174: 7716-7728; Haldimann et al. (1998) J. Bacteriol., 180: 1277-1286].
예를 들어, lac 프로모터는 락토즈 또는 이소프로필-베타-D-티오갈락토시다제(IPTG)와 같은 구조적으로 관련된 분자에 의해 유도될 수 있으며 글루코즈에 의해 제어된다. 일부 유도가능한 프로모터는 탈제어, 예를 들면, 리프레서 분자의 불활성화에 의해 유도된다.
조절가능한 프로모터 서열은 또한 간접적으로 조절될 수 있다. 간접적인 조절을 위해 조작될 수 있는 프로모터의 예는 파지 람다 PR, PL, 파지 T7, SP6 및 T5 프로모터를 포함한다. 예를 들어, 조절 서열은, 이의 발현이 조절된 인자, 에를 들면, 환경 매개변수에 의해 제어되거나 또는 활성화된다. 이러한 프로모터의 하나의 예는 T7 프로모터이다. T7 RNA 폴리머라제의 발현은 lac 프로모터와 같은 환경적으로 반응성인 프로모터에 의해 조절될 수 있다. 예를 들어, 세포는 T7 RNA 폴리머라제 및 환경 매개변수에 의해 조절되는 조절 서열(예를 들면, lac 프로모터)을 포함할 수 있다. T7 RNA 폴리머라제의 활성은 또한 T7 라이소자임과 같은 RNA 폴리머라제의 천연 억제제의 존재하에 조절될 수 있다.
다른 구조에서, 람다 PL을 환경 매개변수에 의해 조절되도록 조작할 수 있다. 예를 들어, 세포는 람다 리프레서의 감온성 변이체를 암호화하는 핵산 서열을 포함할 수 있다. 비-허용 온도에 대한 세포의 노출은 제어로부터 PL 프로모터를 방출한다.
프로모터 또는 전사 조절 서열의 조절 특성은 프로모터 또는 서열을 리포터 단백질(또는 어떠한 검출가능한 단백질)을 암호화하는 서열에 작동가능하게 연결시킴에 의해 용이하게 시험할 수 있다. 이러한 프로모터-리포트 융합 서열은 세균 세포, 대표적으로 플라스미드 또는 벡터내로 도입시키며, 리포터 단백질의 풍부성을 각종 환경 조건하에 평가한다. 유용한 프로모터 또는 서열은 특정 조건에서 선택적으로 활성화되거나 또는 제어되는 것이다.
일부 양태에서, 비-조절가능한 프로모터가 사용된다. 예를 들면, 관련 조건하에서 적절한 양의 전사를 생산하는 프로모터를 선택할 수 있다. 조절가능하지 않은 프로모터의 예는 gIII 프로모터이다.
b. 세포 표면 디스플레이 라이브러리
스크리닝을 위한 변이 프로테아제의 라이브러리를 세포, 예를 들면, 원핵생물 세포 또는 진핵생물 세포의 표면상에서 발현시킬 수 있다. 세포 표면 발현을 위한 대표적인 세포는 세균, 효모, 곤충 세포, 조류 세포, 식물 세포 및 포유동물 세포를 포함하나, 이에 한정되지 않는다[참조: Chen and Georgiou (2002) Biotechnol Bioeng 79: 496-503]. 하나의 예에서, 발현용 세균 세포는 에스케리키아 콜라이(Escherichia coli)이다.
변이 프로테아제는 막 단백질 또는 세포 표면-관련 단백질과 같은 세포의 표면상에서 발현된 단백질인 당백질과의 융합 단백질로서 발현될 수 있다. 예를 들어, 변이 프로테아제는 이.콜라이 내에서 이.콜라이 외막 단백질(예: OmpA), 주요 이.콜라이 지단백질(Lpp) 및 외막 단백질 OmpA의 유전적으로 조작된 하이브리드 분자 또는 세포 표면-관련 당백질[예를 들면, 섬모(pili) 및 편모 소단위]와의 융합 단백질로서 발현될 수 있다. 일반적으로, 세균 외막 단백질이 이종 펩타이드 또는 단백질의 디스플레이에 사용되는 경우, 이는 담체 단백질의 증식허용 부위(permissive site)내로 유전적 삽입을 통해 달성된다. 이종 펩타이드 또는 단백질의 발현은, 당해 펩타이드 또는 단백질이 단백질의 N- 또는 C-말단에서의 융합체와 비교하여 증식허용 부위내로 삽입되는 경우 보다 더 구속되므로, 삽입된 단백질 도메인의 구조적 특성에 의존적이다. 융합 단백질에 대한 변형은 유연성 펩타이드 링커 또는 스페이서 서열의 삽입 또는 세균 단백질의 변형(예를 들면, 아미노산 서열내 돌연변이, 삽입, 또는 결실에 의해)과 같은 융합 단백질의 발현을 개선시키기 위해 수행할 수 있다. 셀룰로모나스 피미(Cellulomonas fimi)의 β-락타마제 및 Cex 엑소글루카나제와 같은 효소는 이.콜라이의 표면상에서 Lpp-OmpA 융합 단백질로서 성공적으로 발현되어왔다[참조: Francisco J.A. and Georgiou G. Ann N Y Acad Sci. 745:372-382 (1994) 및 Georgiou G. et al. Protein Eng. 9:239-247 (1996)]. 15 내지 514개 아미노산의 다른 펩타이드는 OmpA의 표면상에서 제2, 제3 및 제4 외부 루프내에서 나타난다[참조: Samuelson et al. J. Biotechnol. 96: 129-154 (2002)]. 따라서, 외막 단백질은 세균의 외부 표면상에서 이존 유전자 생성물을 수반하여 나타낼 수 있다.
다른 예에서, 변이 프로테아제는 엔.고노호에아에(N. gonorrhoeae) IgA1 프로테아제, 세라티아 마르세센스(Serratia marcescens) 세린 프로테아제, 시겔라 플렉스네리(Shigella flexneri) VirG 단백질, 및 이.콜라이 코헤신 AIDA-I과 같은 단백질의 자가트랜스포터 도메인(autotransporter domain)에 융합될 수 있다[참조: Klauser et al. EMBO J. 1991-1999 (1990); Shikata S, et al. J Biochem.114:723-731 (1993); Suzuki T et al. J Biol Chem. 270:30874-30880 (1995); 및 Maurer J et al. J Bacteriol. 179:794-804 (1997)]. 다른 자가트랜스포터 단백질은 그람 음성 종[예를 들면, 이.콜라이, 살모넬라 혈청형 티피무리움(Salmonella serovar Typhimurium), 및 에스.플렉스네리(S. flexneri)]내에 존재하는 것들을 포함한다. β-락타마제와 같은 효소는 당해 시스템을 사용하여 이.콜라이의 표면상에서 성공적으로 발현되었다[참조: Lattemann CT et al. J Bacteriol. 182(13): 3726-3733 (2000)].
세균은 재조합적으로 조작하여 막 융합 단백질과 같은 융합 단백질을 발현할 수 있다. 변이 프로테아제를 암호화하는 핵산은 세균 OmpA 단백질과 같은, 그러나 이에 한정되지 않는 세포 표면 단백질을 암호화하는 핵산에 융합될 수 있다. 변이 프로테아제를 암호화하는 핵산은 막 단백질의 세포외 루프와 같은 막 단백질내 허용되는 부위내로 삽입될 수 있다. 또한, 융합 단백질을 암호화하는 핵산은 태그 또는 검출가능한 단백질을 암호화하는 핵산에 융합될 수 있다. 이러한 태그 및 검출가능한 단백질은 당해 분야에 공지되어 있으며, 예를 들면, 히스티딘 태그, 헤마글루티닌 태그, myc 태그 또는 형광성 단백질을 포함하나, 이에 한정되지 않는다. 융합 단백질을 암호화하는 핵산은 세균내에서 발현시키기 위해 프로모터에 작동가능하게 연결시킬 수 있다. 예를 들어, 핵산은 융합 단백질의 발현용 프로모터 및 임의로 항생제 내성과 같은 선택을 위한 추가의 유전자를 수반할 수 있는 벡터 또는 플라스미드내로 삽입시킬 수 있다. 세균은 전기천공(electroporation) 또는 화학적 형질전환에 의해 이러한 플라스미드로 형질전환시킬 수 있다. 이러한 기술은 당해 분야의 통상의 숙련가에게 알려져 있다.
외막 또는 주변세포질 영역내 단백질은 일반적으로 시그날 서열에서 절단되어 세포질 외부로 배출되는 성숙한 단백질을 생성하는, 예비성숙한 단백질로서 세포질 속에서 합성된다. 이.콜라이용 재조합체 단백질의 분비적 생산에 사용된 대표적인 시그날 서열은 알려져 있다. Met 연장없이, N-말단 아미노산 서열은, 목적 유전자가 시그날 서열에 정확하게 융합되는 경우 시그날 펩티다제에 의해 절단된 후 수득될 수 있다. 따라서, 성숙한 단백질은 목적 단백질의 아미노산 서열의 변화없이 생산할 수 있다[참조: Choi 및 Lee. Appl. Microbiol. Biotechnol. 64: 625-635 (2004)].
다른 세포 표면 디스플레이 시스템은 당해 분야에 공지되어 있으며 빙 핵형성 단백질(ice nucleation protein)(Inp)-계 세균 표면 디스플레이 시스템[참조: Lebeault J M (1998) Nat Biotechnol. 16: 576 80), 효모 디스플레이(예를 들면, 효모 Aga2p 세포벽 단백질과의 융합체; 참조: 미국 특허 제6,423,538호), 곤충 세포 디스플레이[예를 들면, 바큘로바이러스 디스플레이; 참조: Ernst et al. (1998) nucleic acids Research, Vol 26, Issue 7 1718-1723], 포유동물 세포 디스플레이 및 다른 진핵세포 디스플레이 시스템(참조: 예를 들면, 제5,789,208호 및 제WO 03/029456호]을 포함하나, 이에 한정되지 않는다.
c. 기타 디스플레이 라이브러리
변이 프로테아제의 라이브러리, 예를 들면, 이의 변이가 본원에 기술된 바와 같이 설게된 라이브러리를 스크리닝하기 위해 다른 디스플레이 포맷을 사용하는 것도 또한 가능하다. 대표적인 다른 디스플레이 포맷은 핵산-단백질 융합체, 리보자임 디스플레이[참조: 예를 들면, Hanes and Pluckthun (1997) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 13:4937-4942], 비드 디스플레이[참조: Lam, K. S. et al. Nature (1991) 354, 82-84; , K. S. et al. (1991) Nature, 354, 82-84; Houghten, R. A. et al. (1991) Nature, 354, 84-86; Furka, A. et al. (1991) Int. J. Peptide Protein Res. 37, 487-493; Lam, K. S., et al. (1997) Chem. Rev., 97, 411-448; 미국 특허 공보 제2004-0235054호) 및 단배질 배열[참조: 예를 들면, Cahill (2001) J. Immunol. Meth. 250:81-91, 제WO 01/40803호, 제WO 99/51773호, 및 US 제2002-0192673-A1호]을 포함한다.
특정의 다른 경우에서, 프로테아제, 변이 프로테아제 또는 촉매적으로 활성인 부위 또는 파지 라이브러리 또는 변이 프로테아제를 발현하는 세포를 고체 지지체에 대신 부착하는 것이 유리할 수 있다. 예를 들어, 일부 실시예에서, 변이 프로테아제를 발현하는 세포를 비드에 천연적으로 흡착시킴으로써 비드의 집단이 비드당 단일 세포를 함유하도록 할 수 있다[참조: Freeman et al. Biotechnol. Bioeng. (2004) 86:196-200]. 유리 지지체에 고정화한 후, 마이크로콜로니를 성장시키고 색소생성 또는 형광생성 기질로 스크리닝할 수 있다. 다른 예에서, 변이 프로테아제 또는 파지 라이브러리 또는 변이 프로테아제를 발현하는 세포는 역가 플레이트내로 배열하고 고정화시킬 수 있다.
F. 선별된 프로테아제의 접촉, 분리 및 확인 방법
프로테아제 또는 이의 촉매적으로 활성인 부위를 나타내는 라이브러리 또는 수집물 다수를 선택하여 제조한 후, 라이브러리를 사용하여 표적 프로테아제 포획 폴리펩타이드를 프로테아제 성분들과 접촉시킨다. 예를 들어, 목적한 절단 서열을 가지도록 이의 RSL 루프내에서 돌연변이된 서핀과 같은 프로테아제 포획 폴리펩타이드를 포함하는 표적 기질을 기질 특이성이 변경된 프로테아제의 선택을 위해 디스플레이된 프로테아제 라이브러리와 접촉시킨다. 프로테아제 및 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 현탁액, 용액 속에서, 또는 고체 지지체를 통해 접촉시킬 수 있다. 성분들은 상호작용이 일어나고 후속적인 절단 반응 및 선별된 프로테아제 및 프로테아제 포획 폴리펩타이드의 안정한 중간체 복합체의 형성을 위해 충분한 시간, 온도 또는 농도로 접촉된다. 반응이 유지되는 엄중성(stringency)은 반응물의 온도, 프로테아제 포획 폴리펩타이드 억제제의 농도, 경쟁인자(포함될 경우)의 농도, 혼합물중 프로테아제의 수집 농도 및 항온처리 시간의 길이로부터의 하나 이상의 매개변수를 변화시킴에 의해 조절할 수 있다.
프로테아제 포획 폴리펩타이드와 공유 복합체를 형성하는 선별된 프로테아제를 포획하여 분리한다. 포획을 용이하게 하기 위해, 스크리닝용 프로테아제 포획 폴리펩타이드를 용액, 현탁액 속에 제공하거나, 또는 검정 방법에 적절한 고체 지지체에 부착시킬 수 있다. 예를 들어, 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 예를 들면, 하나 이상의 비드 또는 입자, 미세구, 튜브 또는 플레이트의 표면, 여과기 막 및 당해 분야에 공지된 다른 고체 지지체와 같은 고체 지지체에 부착시킬 수 있다. 대표적인 고체 지지체 시스템은 예를 들면, 유리, 규소, 금속, 나일론, 셀룰로즈, 플라스틱 또는 멀티웰, 플레이트 또는 막을 포함하는 합성물로 구조된 평편 표면을 포함하거나; 또는 실리카 겔, 조절된 공극 유리, 자기[다이나비드((Dynabead)] 또는 셀룰로즈 비드와 같은 비드의 형태일 수 있다. 이러한 방법은 현탁액에서 사용하기 위해 또는 컬럼의 형태로 채택될 수 있다. 표적 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 폴리아크릴아미드 비드와 같은 고체 지지체에 직접 또는 간접적으로 부착시킬 수 있다. 공유 또는 비-공유 결합 방법을 부착에 사용할 수 있다. 표적 화합물의 부착의 공유결합 방법은 화학적 가교결합 방법을 포함한다. 반응성 시약은 표적 분자와 지지체상의 작용 그룹들 사이에 공유 결합을 생성할 수 있다. 화학적으로 반응할 수 있는 작용 그룹의 예는 아미노, 티올 및 카복실 그룹이 있다. N-에틸말레이미드, 요오도아세트아미드, N-하이드로석신이미드 및 글루타르알데하이드는 작용 그룹과 반응하는 시약의 예이다. 다른 예에서, 표적 기질은 예를 들면, 면역친화성 또는 리간드-수용체 상호작용(예를 들면, 비오틴-스트렙트아비딘 또는 글루타티온 S-트랜스퍼라제-글루타티온)과 같은, 그러나 이에 한정되지 않는 방법에 의해 고체 지지체에 간접적으로 부착시킬 수 있다. 예를 들어, 프로테아제-포획 폴리펩타이드는 ELISA 플레이트, 또는 기타 유사한 어드레스할 수 있는 배열에 피복시킬 수 있다. 하나의 예에서, 플레이트의 웰은 프로테아제-포획 폴리펩타이드에 결합하여 이를 포획하는 친화성 포획제로 피복시킬 수 있다. 실시예 9는, 비오티닐화된 항-His 항체를 스트렙트아비딘 함유 플레이트상에 피복시켜 His-태그를 함유하는 프로테아제-포획 폴리펩타이드의 포획을 촉진하는 방법을 예시한다.
고체 지지체에 대한 프로테아제 포획 폴리펩타이드의 부착은 변이 프로테아제 또는 파지 라이브러리 또는 변이 프로테아제를 발현하는 세포와의 접촉 전에, 동안에 또는 이후에 수행할 수 있다. 예를 들어, 표적 기질은 변이 프로테아제와의 항온처리 전에 크로마토그래피 컬럼과 같은 고체 지지체에 예비-흡착시킬 수 있다. 다른 예에서, 고체 지지체의 부착은, 표적 기질이 변이 프로테아제에 결합된 후 수행한다.
이러한 실시예에서, 복합체화된 기질-프로테아제 쌍을 함유하는 고체 지지체를 세척하여 어떠한 결합하지 않은 프로테아제도 제거할 수 있다. 복합체는 고체 지지체로부터 당해 분야의 숙련가에게 익히 공지된 방법, 예를 들면, 희석 산의 처리에 이은 중화[참조: Fu et al. (1997) J Biol. Chem. 272:25678-25684) 또는 트리에틸아민의 처리[참조: Chiswell et al. (1992) Trends Biotechnol. 10:80-84]에 의해 회수할 수 있다. 당해 단게는 고체 지지체로부터 디스플레이 공급원의 재생적 및 정량적 회수를 보장하기 위해 최적화할 수 있다. 예를 들어, 고체 지지체에 부착된 표적 기질에 대한 디스플레이 공급원의 결합은 M13 파지[예를 들면, 매사츄세츠 소재의 뉴 잉글랜드 바이오랩스(New England Biolabs) 제조원] 및 표준 ELISA[참조: 예를 들면, Ausubel et al. (1987) Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, New York]에 대해서와 같은 파지에 대해 지시된 항체를 사용함에 의해서와 같이, 당해 분야의 숙련가에게 익히 공지된 방법을 사용하여 독립적으로 모니터할 수 있다.
기질-프로테아제 복합체를 포획하고 분리하는 다른 방법은 용액으로부터 있다. 통상적으로, 이러한 방법에서, 프로테아제 포획 폴리펩타이드 또는 이의 변이체는 예를 들면 소 용적의 적절한 결합 완충액(즉, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 200, 300, 400, 500 마이크로리터 이상) 속에서 프로테아제의 수집물을 접촉시키며, 여기서, 각각의 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 예정된 마커, 태그 또는 이의 확인 및 분리를 위한 다른 검출가능한 잔기와 연합된다. 검출가능한 잔기는 기질-프로테아제 복합체의 검출 및 분리를 용이하게 하는 어떠한 잔기일 수 있다. 예를 들어, 잔기는, 태그에 대해 특이적인 항체가 존재하는 에피토프 태그(즉, myc-태그, His-태그 또는 기타)일 수 있다. 항체는 비드와 같은 고체 지지체에 결합하여 안정한 복합체의 포획을 촉진시킬 수 있다. 다른 유사한 방법을 사용할 수 있으며 예를 들면, 비오틴을 사용한 표적 기질의 표지 및 자기 비드, 또는 미세역가 플레이트와 같은 고체 지지체에 부착된 스트렙트아비딘을 사용한 포획 또는 폴리히스티딘(예를 들면, His 6-태그)을 사용한 표지 및 황산니켈(NiSO4), 염화코발트(CoCl2), 황산구리(CuSO4) 또는 염화아연(ZnCl2)과 같은, 그러나 이에 한정되지 않는 금속 킬레이트제를 사용한 포획을 포함한다. 포획제는 예를 들면, 세파로즈 비드와 같은 거대 비드에 커플링시킴으로써, 결합된 비드의 분리를 원심분리에 의해 용이하게 달성할 수 있다. 또는, 포획제를 예를 들면, 자기 컬럼을 사용하여 용이하게 분리할 수 있는 자기 비드[즉, 밀테니이 바이오테크(Miltenyi Biotec) 제조원]와 같은 보다 작은 비드에 커플링시킬 수 있다. 또한, 잔기는 형광성 잔기일 수 있다. 예를 들어, 세포 표면 디스플레이 시스템과 같은 일부 디스플레이 시스템에서, 예를 들면, 형광성 표지는 형광성 활성화된 세포 분류에 의해 선택된 복합체의 분리를 촉진할 수 있다(FACS; 참조: Levin et al. (2006) Molecular BioSystems, 2: 49-57).
일부 예에서, 하나 이상의 명백한 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 프로테아제의 수집물과 접촉되며, 여기서, 각각의 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 상이한 검출 잔기와 연합됨으로써 하나 또는 하나 이상의 프로테아제 포획 폴리펩타이드-프로테아제 복합체를 개별적으로 분리한다. 단일 반응에 각각 상이한 목적한 RSL 절단 서열을 갖는 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10개 이상의 명백한 프로테아제 포획 폴리펩타이드를 포함하는 능력은 수백 또는 수천개의 공유결합 복합체를 동시에 검출하여 분리하도록 한다.
프로테아제 포획 폴리펩타이드와 공유결합 복합체로서 포획된 선별된 프로테아제는 프로테아제의 수집으로부터의 비복합체화된 프로테아제로부터 분리될 수 있다. 이후에, 선별된 프로테아제를 증폭시켜 선별된 프로테아제의 확인을 용이하게 할 수 있다. 프로테아제 포획 폴리펩타이드에 대한 어떠한 비복합체화된 프로테아제도 제거한 후, 프로테아제가 나타난 물질 공급원(즉, 파지, 세포, 비드 등)을 증폭시키고 적절한 숙주 세포내에서 발현시킨다. 예를 들면, 프로테아제가 파지상에 나타난 경우, 일반적으로, 프로테아제 포획 폴리펩타이드와의 복합체내 프로테아제-파지를 숙주 세포와 함께 항온처리하여 파지가 흡착되도록 한 후, 소 용적의 영양 브로쓰를 첨가하고 배양물을 교반하여 번식하는 숙주내에서 파지 프로브 DNA 복제를 촉진시킨다. 일부 예에서, 숙주 세포가 파지에 의해 감염되도록 하기 위하여 헬퍼 파지의 존재하에 이를 수행한다. 이러한 항온처리 후, 배지에 항생제 및/또는 유도인자를 보충한다. 파지 프로테아제 게놈은 또한 파지 프로테아제 DNA를 유지하는 세균 세포의 선택적인 성장을 허용하는 항생제에 대한 내성을 암호화하는 유전자를 함유할 수 있다. 통상적으로, 선별된 프로테아제를 함유하는 파지 상청액의 공급원으로서 파지의 증폭을 위해, 파지 구출(rescue)이 헬퍼 파지의 사용에 의해 요구된다. 일부 예에서, 구출 단계없이 선별된 프로테아제의 존재를 검정하는 것도 가능하다. 예를 들면, 선택되거나 또는 확인된 프로테아제를 함유하는 포획된 복합체를 숙주 세포, 예를 들면, 세균과 함께 항온처리하고 선택제의 존재하에 성장시킨 후, 주변세포질 또는 세포 배양 배지를 예를 들면, 프로테아제 활성을 측정하기 위하여, 선별된 프로테아제의 공급원으로서 직접 샘플링할 수 있다. 이러한 과정은 실시예 17에 기술되어 있다.
또한, 예를 들면, 세균 숙주에서와 같은 디스플레이 공급원의 증폭은 각종 방법으로 최적화시킬 수 있다. 예를 들면, 마이크로웰과 같은 검정 물질에 가해진 세균의 양은 파지 게놈의 정량적 형질도입을 보장하는 결합 단계로부터 회수한 파지 공급원의 거대한 초과량일 수 있다. 형질도입 효능은 임의로 파지가 선택된 경우 측정할 수 있다. 증폭 단계는 파지 게놈과 같은 디스플레이 공급원을 증폭시키며 관련 신호의 과-발현 및 DNA 서열분석에 의해서와 같은 이의 확인을 허용하면서 파지 게놈과 같은 디스플레이 공급원의 게놈을 증폭시킨다.
패닝 접근법을 사용할 수 있으며, 이에 의해 프로테아제 또는 프로테아제 포획 폴리펩타이드 또는 이의 RSL 변이체와 같은, 표적 단백질과 상호작용하는 이의 촉매적으로 활성인 부위가 신속하게 선택된다. 패닝은 예를 들면, 파지-디스플레이된 프로테아제와 같은 파지-디스플레이된 폴리펩타이드의 라이브러리를 표면-결합된 또는 가용성 표적 단백질과 함께 항온처리하고, 결합하지 않은 파지를 세척 제거하며 특이적으로 및 공유적으로 결합된 파지를 용출시킴에 의해 수행한다. 용출된 파지는 이후에 숙주의 감염을 통해 증폭시켜 추가의 패닝 및 증폭 주기를 수행하여 표적 폴리펩타이드에 대해 최대 친화성을 갖는 것들에 대한 파지의 혼주물이 충분히 풍부해지도록 한다. 수회 회차 후, 개개의 클론을 DNA 서열분석에 의해서 확인하고 이들의 활성을 하기 G 부문에서 제시한 어떠한 방법에 의해서와 같이 측정할 수 있다.
선별된 프로테아제가 확인되면, 이를 디스플레이 공급원으로부터 정제하여 활성에 대해 시험할 수 있다. 일반적으로, 이러한 방법은 일반적인 생화학 및 재조합 DNA 기술을 포함하며 당해 분야의 숙련가에게 통상적이다. 하나의 방법에서, 폴리에틸렌 글리콜(PEG) 침전을 사용하여 정제되고 선택된 파지 상청액중 잠재적으로 오염된 프로테아제 활성을 제거할 수 있다. 이러한 예에서, 헬퍼 파지의 존재하에서 파지 구출 후, 선별된 프로테아제를 함유하는 파지 상청액을 PEG의 존재하에 침전시킬 수 있다. 당해 분야의 숙련가는 특수 침전 적용에 요구되는 PEG의 퍼센트를 측정할 수 있다. 일반적으로, 프로테아제 상청액의 침전을 위해, 20% PEG가 사용된다.
일부 예에서, 구출된 파지 상청액으로부터 또는 세균 세포 주변세포질 또는 세포 배지(파지 구출이 없는)로부터의 상청액을 본원에서 기술한 바와 같은 프로테아제 활성을 위해 검정할 수 있다. 대안으로 또는 추가로, 선별된 프로테아제는 상청액 또는 다른 공급원으로부터 정제할 수 있다. 예를 들어, 선별된 프로테아제 도메인을 암호화하는 DNA를 디스플레이 공급원으로부터 분리하여 선택된 단백질이 정제되도록 할 수 있다. 예를 들어, 위에서 제시한 것으로서 선택된 파지를 사용한 이.콜라이 숙주 세포의 감염 후, 개개의 클론을 집어서 당해 분야의 숙련가에게 공지된 특정의 방법을 사용하여 플라스미드 정제를 위해 성장시키고, 경우에 따라 예를 들면, 미디 플라스미드 정제 키트(Midi Plasmid Purification Kit)[제조원: 퀴아젠(Qiagen)]를 사용하여 대량으로 제조할 수 있다. 정제된 플라스미드는 변이 프로테아제의 서열을 확인하기 위한 DNA 서열분석에 사용할 수 있거나, 또는 포유동물 발현 시스템과 같은, 그러나 이에 한정되지 않는 발현용 특정 세포내로 형질감염시킬 수 있다. 경우에 따라, 1 또는 2-단계 PCR을 수행하여 선택된 서열을 증폭시킬 수 있으며, 이를 선택한 발현 벡터내로 서브클로닝시킬 수 있다. PCR 프라이머를 설계하여 제한 효소 부위의 부가를 포함함에 의함과 같이 서브클로닝을 촉진할 수 있다. 실시예 4는 완전한 길이의 u-PA 유전자의 증폭 및 정제를 달성하기 위한 2단계 PCR 과정을 예시하고 있으며, 여기서, 선별된 프로테아제 파지는 단지 u-PA 유전자의 프로테아제 도메인만을 함유하였다. 하기에 상세히 기술되어 있는 바와 같이 발현에 적합한 세포내로 형질감염시키기 위하여, 프로테아제 폴리펩타이드 또는 이의 촉매적으로 활성인 부위를 함유하는 조건 배지를 활성 검정에서 시험하거나 또는 추가의 정제를 위해 사용할 수 있다. 또한, 경우에 따라, 단일쇄 형태를 2쇄 형태로 절단함에 의해서와 같이 프로테아제를 상응하게 프로세싱하여 활성 프로테아제를 수득할 수 있다. 이러한 조작은 당해 분야의 숙련가에게 공지되어 있다. 예를 들어, 단일쇄 u-PA는 본원에 기술된 바와 같이 플라스미드 절단을 활성화할 수 있다.
1. 반복적 스크리닝
본원에 제공된 방법에서, 반복된 스크리닝을 사용하여 프로테아제의 변형을 최적화한다. 즉, 반복적 스크리닝의 방법에서, 프로테아제를 패닝(panning) 반응을 예를 들면, 상이한 프로테아제 포획 폴리펩타이드 또는 경쟁인자를 사용함에 의해서와 같은 다양한 매개변수하에 수회 수행함으로써 프로테아제를 생성시킬 수 있다. 이러한 반복적 스크리닝의 방법에서, 프로테아제 수집은 성공적인 스크리닝 회차에서 일정하게 유지시킬 수 있다. 또는, 새로운 프로테아제 수집을 앞서의 회차에서 확인된 선별된 프로테아제만을 함유하고/하거나 제1회차에서 확인된 주형 프로테아제와 비교하여 추가로 돌연변이된 돌연변이 프로테아제의 새로운 수집을 생성함에 의해 생성시킬 수 있다.
하나의 예에서, 프로테아제 라이브러리의 제1회차 스크리닝은 프로테아제의 특이성을 변경시키는 하나 이상의 돌연변이를 함유하는 변이 프로테아제를 확인할 수 있다. 이후에, 제2회차 라이브러리 합성을 수행하는데, 여기서, 돌연변이 중 하나의 아미노산 위치는 일정하게 유지되며, 초점화된 또는 무작위 돌연변이 유발은 단백질의 나머지 또는 목적한 영역 또는 잔기상에서 수행한다. 추가의 회차의 스크리닝 후, 선별된 프로테아제를 라이브러리 합성 및 스크리닝의 추가의 회차에 적용시킬 수 있다. 예를 들어, 2, 3, 4, 5 이상의 회차의 라이브러리 합성 및 스크리닝을 수행할 수 있다. 일부 예에서, 변경된 기질에 대한 변이 프로테아제의 특이성을 각각의 회차의 선택으로 추가로 최적화시킨다.
반복된 스크리닝의 다른 방법에서, 프로테아제 선택물의 제1회차 스크리닝을 중간 프로테아제 포획 폴리펩타이드에 대해 수행하여 중간체 기질에 대한 프로테아제의 특이성을 변경시키는 하나 이상의 돌연변이를 함유하는 변이 프로테아제를 확인할 수 있다. 선별된 프로테아제 복합체를 분리하고, 성장시키며 적절한 숙주 세포내에서 증폭시키고 표적 폴리펩타이드의 완전한 절단 서열을 함유하는 프로테아제 포획 폴리펩타이드에 대한 제2회차 스크리닝에서 프로테아제 수집물로 사용할 수 있다. 예를 들어, 이러한 시도를 사용하여 VEGFR 절단 서열에 대해 기질 특이성을 갖는 프로테아제를 선택할 수 있으며, 여기서, 하나 이상의 회차의 패닝은 RRARM 중간체 절단 서열에 대해서 존재하며, 후속적인 회차의 패닝은 VEGFR2 절단 서열 RRVR을 함유하는 프로테아제 포획 폴리펩타이드에 대해 수행된다.
반복적 스크리닝의 추가의 예에서, 상이한 기질 인지 또는 2개 이상의 상이한 폴리펩타이드에 대한 절단 서열을 함유하는 2개 이상의 프로테아제 포획 폴리펩타이드를 반복적 회차의 패닝에서의 방법에 사용한다. 이러한 방법은 2개의 상이한 기질에 대한 선택성을 가지도록 최적화된 프로테아제를 선택하는데 유용하다. 선택된 변이체는 통상적으로 협소한 특이성을 가지지만, 2개 이상의 기질 인지 서열에 대해서는 높은 활성을 갖는다. 이러한 방법에서, 제1의 예정된 기질 특이성을 가진 프로테아제에 대해 선택하도록 변형된 제1 프로테아제 포획 폴리펩타이드에 대한 프로테아제 수집물의 제1회차 스크리닝은 프로테아제의 특이성을 변경시키는 하나 이상의 돌연변이를 함유하는 변이 프로테아제를 확인할 수 있다. 선별된 프로테아제를 분리하여, 성장시키고, 적절한 숙주 세포내에서 증폭시켜 제2의 예정된 기질 특이성을 가진 프로테아제에 대해 선택하도록 변형된 제2 프로테아제 프랩 폴리펩타이드에 대한 제2회차의 스크리닝에서 프로테아제 수집물로 사용할 수 있다. 방법들에서 사용된 제1 및 제2 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 동일하거나 또는 상이할 수 있으나, 각각은 이의 반응성 부위에서 상이하게 변형되어 상이한 표적 기질의 기질 인지 부위(즉, 절단 서열)을 모사한다. 일부 예에서, 선택에서의 엄중성은 예를 들면, 본원에 기술된 바와 같은 협소하거나 또는 광범위한 경쟁인자와 같은 경쟁인자의 존재하에서 향상될 수 있다.
2. 대표적인 선별된 프로테아제
변경되고/되거나 개선된 기질 특이성을 가진 것으로서 본원에 제공된 방법에서 확인된 변이 u-PA 및 MT-SP1 폴리펩타이드가 제공된다. 이러한 변이 u-PA 및 MT-SP1 폴리펩타이드는 표적 단백질의 선택되거나 또는 목적한 절단 서열에 대대 증가된 특이성을 가진 것으로 확인되었다. 이러한 표적 단백질의 예는 VEGFR 및 보체 단백질, 예를 들면, 보체 단백질 C2에서의 절단 서열을 포함하나, 이에 한정되지 않는다. 특정의 변형된 서핀을 본원의 선택 방법에서 사용하여 변이 프로테아제를 확인할 수 있다. 이러한 변형된 서핀의 예는 본원의 상기에서 기술한 바와 같은, 표적 단백질, 예를 들면, VEGFR 또는 C2에 대한 절단 서열을 함유하도록 이들의 RSL에서 변형된 PAI-1 또는 AT3이다. 수득되는 선택되고 변형된 프로테아제는 선택된 변형을 함유하지 않는 주형 또는 출발 프로테아제와 비교하여 표적 단백질내에 절단 서열에 대해 변경된, 통상적으로 개선된 기질 특이성을 나타낸다. 하기 기술된 바와 같이, 특이성이 통상적으로 증가되며 표적화되지 않는 기질에 대하여 선택된 표적 기질에 대한 야생형 또는 주형 프로테아제의 특이성과 비교하여 일반적으로 2배 이상, 4배 이상, 5배 이상, 6배 이상, 7배 이상, 8, 9, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 200, 300, 400, 500, 600, 700, 800, 900, 1000배 이상이다.
a. 변이 u- PA 폴리펩타이드
예를 들면, 본원에 제공된 변이 u-PA 폴리펩타이드는 천연의 P4-P1' 반응성 부위 아미노산을 목적한 또는 선택된 표적 단백질로 치환시킴에 의해 이의 RSL 서열내에서 변형된 돌연변이체 서핀 폴리펩타이드에 대해 증가된 반응성을 지니도록 선택되었다. 하나의 예에서, 변이 u-PA 폴리펩타이드는 변형된 PAI-1 폴리펩타이드에 대해 확인되었다. 본원에서 제공된 u-PA 선택 방법에 사용된 변형된 PAI-1 폴리펩타이드 분자의 예는 예를 들면 이의 천연 P4-P1' 잔기 VSARM (서열번호 378)에서 중간체 VEGFR-2 절단 서열 RRARM (서열번호 379)에 대한 아미노산 잔기[여기서, P4-P1 부위내 목적한 절단 서열은 VEGFR-2 절단 서열 RRVR (서열번호 489)이다], 또는 최적 t-PA 절단 서열 PFGRS(서열번호 389)에 대한 아미노산 잔기로 변형된 PAI-I를 포함한다.
본원에 제공된 방법을 사용하여, 다음 위치가 u-PA 폴리펩타이드의 기질 특이성에 기여하는 것으로 확인되었다: 키모트립신 번호매김을 기준으로 하여, 21, 24, 30, 38, 39, 61(A), 72, 73, 75, 80, 82, 84, 89, 92, 132, 133, 137, 138, 155, 156, 158, 159, 160, 187 및 217. 아미노산 치환 또는 치환들은 키모트립신 번호매김을 기준으로 하여 서열번호 433의 u-PA 폴리펩타이드와 같은 u-PA 폴리펩타이드의 F21, I24, F30, V38, T39, Y61(A), R72, L73, S75, E80, K82, E84, I89, K92, F132, G133, E137, I138, L155, K156, T158, V159, V160, K187 및 R217, 또는 이의 촉매적으로 활성인 부위에 상응하는 어떠한 하나 이상의 위치에서도 존재할 수 있다. 증가된 기질 특이성을 나타내는 본원에서 제공된 변형된 u-PA 폴리펩타이드는 키모트립신 번호매김을 기준으로 하여 서열번호 433의 u-PA 폴리펩타이드와 같은 u-PA 폴리펩타이드 또는 이의 촉매적으로 활성인 부위의 F21V, I24L, F30I, F30V, F30L, F30T, F30G, F30M, V38D, T39A, Y61(A)H, R72G, L73A, L73P, S75P, E80G, K82E, E84K, I89V, K92E, F132L, G133D, E137G, I138T, L155P, L155V, L155M, K156Y, T158A, V159A, V160A, K187E 및 R217C의 하나 이상의 변형에 상응하는 하나 이상의 아미노산 변형을 함유한다.
하나의 예에서, VEGFR-2 절단 서열에 대한 증가된 기질 특이성을 갖는 본원에 제공된 변형된 u-PA 폴리펩타이드는 키모트립신 번호매김을 기준으로 하여 V38D, F30I, F30T, F30L, F30V, F30G, F30M, R72G, L73A, L73P, S75P, I89V, F132L, G133D, E137G, I138T, L155P, L155V, L155M, V160A 및 R217C의 어떠한 하나 이상의 변형에 상응하는 하나 이상의 아미노산 변형을 함유한다. 이러한 폴리펩타이드의 예는 서열번호 433의 아미노산 서열을 갖는 u-PA 폴리펩타이드와 같은 u-PA 폴리펩타이드 또는 이의 촉매적으로 활성인 단편에서 F30I; L73A/I89V; L73P; R217C; L155P; S75P/I89V/I138T; E137G; R72G/L155P; G133D; V160A; V38D; F132L/V160A; L73A/I89V/F30T; L73A/I89V/F30L; L73A/I89V/F30V; L73A/I89V/F30G; L73A/I89V/L155V; L73A/I89V/F30M; L73A/I89V/L155M; L73A/I89V/F30L/L155M 및 L73A/I89V/F30G/L155M 중 어느 것에 상응하는 하나 이상의 아미노산 변형을 함유하는 u-PA 폴리펩타이드이다. 이러한 서열의 예는 서열번호 434 내지 459의 아미노산을 갖는 u-PA 폴리펩타이드와 같은 u-PA 폴리펩타이드 또는 이의 촉매적으로 활성인 단편이다. 특히, 다음 아미노산 변형을 갖는 변형된 u-PA 폴리펩타이드가 제공된다: 키모트립신 번호매김을 기준으로 하여, L73A/I89V; L155P; R72G/L155P; F132L/V160A; L73A/I89V/F30T; L73A/I89V/L155V; L73A/I89V/L155M 및 L73A/I89V/F30L/L155M.
다른 예에서, t-PA에 의해 인지된 절단 서열에 대해 증가된 특이성을 갖는 본원에 제공된 변형된 u-PA 폴리펩타이드는 키모트립신 번호매김을 기준으로 하여, F21V, I24L, F30V, F30L, T39A, Y61(A)H, E80G, K82E, E84K, I89V, K92E, K156T, T158A, V159A 및 K187E 중 하나 이상의 변형에 상응하는 하나 이상의 아미노산 변형을 함유한다. 이러한 폴리펩타이드의 예는 서열번호 433의 아미노산 서열을 갖는 u-PA 폴리펩타이드 또는 이의 촉매적으로 활성인 단편에서 F21V; I24L; F30V; F30L; F30V/Y61(A)H; F30V/K82E; F30V/K156T; F30V/K82E/V159A; F30V/K82E/T39A/V159A; F30V/K82E/T158A/V159A; F30V/Y61(A)H/K92E; F30V/K82E/V159A/E80G/I89V/K187E 및 F30V/K82E/V159A/E80G/E84K/I89V/K187E 중 어느 것에 상응하는 하나 이상의 아미노산 변형을 함유하는 u-PA 폴리펩타이드이다. 이러한 서열의 예는 서열번호 460 내지 472 중 어느 것에 제시된 것들, 또는 돌연변이를 함유하고 촉매 활성을 갖는 연속 아미노산의 이의 단편이다.
또한 키모트립신 번호매김을 기준으로 하여, 본원에 제공된 변이 u-PA 폴리펩타이드와 비교하여 상응하는 돌연변이를 갖는 키모트립신 계열의 변이 프로테아제가 본원에 제공된다. 예를 들어, 키모트립신 번호매김을 기준으로 하여, u-PA내 F30 위치의 변형은 t-PA내 Q30, 트립신내 Q30 및 키모트립신내 Q30 위치의 변형에 상응한다[참조: Bode et al. (1997) Current Opinion in Structural Biology, 7: 865-872]. 당해 분야의 숙련가는 표 7에 제시된 특정의 프로테아제의 변형을 포함하나, 이에 한정되지 않고 서열번호 40, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 60, 62, 64, 66, 68, 70, 72, 74, 76, 78, 80, 82, 84, 86, 88, 90, 92, 94, 96, 98, 99, 101, 103, 105, 107, 109, 111, 113, 115, 117, 119, 121, 123, 125, 127, 129, 131, 133, 135, 137, 139, 141, 143, 145, 147, 149, 151, 153, 155, 157, 159, 161, 163, 165, 167, 169, 171, 173, 175, 177, 179, 181, 183, 185, 187, 189, 193, 195, 197, 199, 201, 203, 205, 207, 209, 211, 213, 215, 217, 219, 221, 223, 225, 227, 229, 231, 233, 235, 237, 239, 241, 242, 243, 245, 247, 249, 251, 253, 255, 257, 259, 261, 262, 264, 266, 268, 270, 272의 아미노산 서열, 또는 이의 촉매적으로 활성인 단편을 갖는 다른 어떠한 키모트립신 계열 구성원에서 상응하는 돌연변이를 측정할 수 있다.
b. 변이 MT - SP1 폴리펩타이드
다른 실시예에서, 본원에서 제공된 변이 MT-SP1 폴리펩타이드는 천연의 P4-P2' 반응성 부위 아미노산을 목적한 또는 선택된 표적 단백질의 것으로 치환시킴에 의해 이의 RSL 서열내에서 변형된 돌연변이체 서핀 폴리펩타이드에 대해 증가된 반응성을 갖도록 선택되었다. 하나의 예에서, 변이 MT-SP1 폴리펩타이드는 변형된 AT3 폴리펩타이드의 선택에 대해 확인되었다. 본원에 제공된 MT-SP1 선택 방법에서 사용된 변형된 AT3 폴리펩타이드 분자의 예는 예를 들면, 이의 천연 P4-P2' 잔기 IAGRSL(서열번호 478)에서 아미노산 잔기가 보체 단백질 C2 절단 서열 SLGRKI(서열번호 479)로 변형된 AT3을 포함한다.
본원에 제공된 방법을 사용하여, 다음 위치는 MT-SP1 폴리펩타이드의 기질 특이성에 기여하는 것으로서 확인하였다: 키모트립신 번호매김을 기준으로 하여, 23, 41, 52, 60(g), 65, 71, 93, 95, 97, 98, 99, 126, 129, 131, 136, 143, 144, 154, 164, 166, 171, 173, 175, 184(a), 192, 201, 209, 217, 221(a), 230, 234 및 244. 아미노산 치환 또는 치환들은 다음 위치 중 어느 것에 상응하는 어떠한 하나 이상의 위치일 수 있다: 키모트립신 번호매김을 기준으로 하여, 서열번호 253 또는 515에 제시된 완전한 길이의 MT-SP1 폴리펩타이드와 같은 MT-SP1 폴리펩타이드 또는 서열번호 505 또는 507에 제시된 이의 촉매적으로 활성인 부위의 D23, I41, L52, Y60(g), T65, H71, F93, N95, F97, I98, F99, A126, V129, P131, I136, H143, T144, I154, N164, T166, L171, P173, Q175, F184(a), Q192, S201, Q209, D217, Q221(a), R230, F234 및 V244. 증가된 기질 특이성을 나타내는 본원에 제공된 변형된 MT-SP1 폴리펩타이드는 서열번호 253 또는 515의 완전한 길이의 MT-SP1 폴리펩타이드와 같은 MT-SP1 폴리펩타이드, 또는 서열번호 505 또는 507의 이의 촉매적으로 활성인 부위의 D23E, I41F, I41T, L52M, Y60(g)s, T56K, H71R, F93L, N95K, F97Y, F97L, T98P, F99L, A126T, V129D, P131S, I136T, I136V, H143R, T144I, I154V, N164D, T166A, L171F, P173S, Q175R, F184(a)L, Q192H, S201I, Q209L, D217V, Q221(a)L, R230W, F234L 및 V244G 중 어떠한 하나 이상의 변형에 상응하는 하나 이상의 아미노산 변형을 함유할 수 있다. 특히, 변형된 MT-SP1 폴리펩타이드는 I41F, F97Y, L171F, Q175R, D217V 및 V244G의 특정의 하나 이상의 변형, 예를 들면, I41F, F97Y, L171F 및 V244G 중 특정의 하나 이상의 변형에 상응하는 하나 이상의 아미노산 변형을 함유한다.
통상적으로, 이러한 변형된 MT-SP1 폴리펩타이드는 보체 단백질 C2에 대한 증가된 기질 특이성을 나타낸다. 이러한 폴리펩타이드의 예는 서열번호 253의 아미노산을 갖는 MT-SP1 폴리펩타이드 또는 서열번호 505의 이의 촉매적으로 활성인 단편과 같은 MT-SP1 폴리펩타이드내 I136T/N164D/T166A/F184(A)L/D217V; I41F; I41F/A126T/V244G; D23E/I41F/T98P/T144I; I41F/L171F/V244G; H143R/Q175R; I41F/L171F; R230W; I41F/I154V/V244G; I141F/L52M/V129D/Q221(A)L; F99L; F97Y/I136V/Q192H/S201I; H71R/P131S/D217V; D217V; T65K/F93L/F97Y/D217V; I41T/P173S/Q209L; F97L/F234L; Q175R; N95K 및 Y60(G)S 중 어느 것에 상응하는 하나 이상의 아미노산 변형을 함유하는 MT-SP1 폴리펩타이드이다. 이러한 서열의 예는 서열번호 589 내지 609의 아미노산 서열, 또는 돌연변이를 함유하고 예를 들면, 서열번호 568 내지 588 중 어느 것과 같이 촉매 활성을 갖는 연속된 아미노산의 이의 단편이다. 일부 예에서, 본원에 제공된 변이 MT-SP1 폴리펩타이드는 추가로 서열번호 253의 아미노산을 갖는 MT-SP1 폴리펩타이드와 같은 MT-SP1 폴리펩타이드 또는 서열번호 505의 이의 촉매적으로 활성인 단편내 C122S에 상응하는 변형을 또한 함유한다. 이러한 변이 MT-SP1 폴리펩타이드의 예는 서열번호 537 내지 557 중 어느 것에 제시되어 있거나, 또는 예를 들면, 서열번호 516 내지 536 중 어느 것과 같은 촉매 활성을 갖고 돌연변이를 함유하는 연속된 아미노산의 이의 단편이다.
특히, 다음 아미노산 변형을 갖는 변형된 u-PA 폴리펩타이드가 제공된다: 키모트립신 번호매김을 기초로 하여, L73A/I89V; L155P; R72G/L155P; F132L/V160A; L73A/I89V/F30T; L73A/I89V/L155V; L73A/I89V/L155M 및 L73A/I89V/F30L/L155M.
G. 프로테아제 활성 및 특이성 평가 방법
본원에 제공된 방법에서 선별된 프로테아제를 시험하여, 선별 후에, 프로테아제가 촉매 효능을 보유하며 바람직한 기질 특이성을 나타내는지를 측정할 수 있다. 활성 평가는 정제된 단백질로부터 또는 증폭된 디스플레이 공급원으로부터의 상청액을 사용하여 수행할 수 있다. 예를 들어, 위에서 논의한 바와 같이, 파지 상청액은 헬퍼 파지를 사용한 파지 구출 및 파지 증폭 후에 검정할 수 있다. 또는, 프로테아제 활성을 세포 배지 또는 감염된 세균의 세포질로부터 직접 검정할 수 있다. 정제되고 선별된 프로테아제의 프로테아제 활성을 또한 측정할 수 있다.
촉매 효능 및/또는 기질 특이성은 프로테아제의 공지된 기질을 사용하여 기질 절단에 대해 검정함으로써 평가할 수 있다. 예를 들어, 플라스미노겐의 절단은, t-PA 또는 u-Pa가 본원의 선택 방법에 사용되는 경우에 평가할 수 있다. 다른 예에서, 프로테아제에 의해 인지된 펩타이드 기질을 사용할 수 있다. 예를 들어, MT-SP1의 자가활성 부위인 RQAR (서열번호 513)을 사용하여 선택된 MT-SP1 프로테아제의 활성을 평가할 수 있다. 하나의 양태에서, 펩타이드 기질의 형광생성적으로 표지된 테트라펩타이드, 예를 들면, ACC- 또는 AMC-테트라펩타이드를 사용할 수 있다. 또한, 프로테아제가 이에 대해 선택되는 목적한 표적 기질의 절단 서열을 기준으로 하여 설계된 형광생성 펩타이드 기질을 사용하여 활성을 평가할 수 있다.
일부 예에서, 선별된 프로테아제는 선별 방법에 사용된 변이 프로테아제 포획 폴리펩타이드의 존재 또는 부재하에 공지된 펩타이드 기질에 대한 이의 활성에 대해 평가할 수 있다. 통상적으로, 이러한 활성 평가는 표적 기질의 목적한 절단 서열을 함유하는 프로테아제 포획 폴리펩타이드의 존재하에 억제된 프로테아제에 대해 추가로 선택함으로써 표적 기질에 대한 개선된 선택성을 갖는 선별된 프로테아제에 대해 최적화하기 위해 수행된다. 억제의 비교는 야생형 또는 주형 프로테아제에 대해 및/또는 선택 방법에서 확인된 모든 다른 프로테아제를 사용하여 달성할 수 있다.
선별된 프로테아제의 천연 기질의 분해의 반응속도 분석을 비교하여 목적한 표적 기질의 절단을 분석함으로써 표적 서열에 대한 선별된 프로테아제의 특이성을 평가할 수 있다. 또한, 억제의 2차 속도 상수(ki)를 평가하여 예를 들면, 선택 방법에 사용된 프로테아제 포획 폴리펩타이드 또는 이의 변이체와 같은 기질에 대한 선별된 프로테아제의 효능 및 반응성을 모니터할 수 있다. 실시예 5는 본원에 제공된 방법에서 확인된 돌연변이 u-PA 폴리펩타이드의 활성 및 촉매 효능을 평가하기 위해 사용된 각종 검정을 예시한다. 실시예 10 및 실시예 12는 선별된 MT-SP1 파지 상청액의 촉매 효능을 평가하기 위해 사용된 각종 검정을 예시한다. 실시예 14는 선택되고 정제된 변이 MT-SP1 프로테아제의 촉매 효능 및 반응성을 평가하기 위해 사용된 각종 검정을 예시한다.
하나의 예에서, 예를 들어, 돌연변이된 프로테아제 포획 폴리펩타이드의 목적한 특이성 프로파일을 매치시키기 위해 선택되는, 선택된 u-PA 또는 MT-SP1 프로테아제와 같은 선별된 프로테아제는 목적한 절단 서열에 상응하는 개개의 형광생성 펩타이드 기질을 사용하여 검정할 수 있다. 예를 들어, 표적 기질의 목적한 절단 서열 중 하나 이상을 절단할 수 있는 변형된 프로테아제를 검정하는 방법은 (a) 펩타이드 형광생성 샘플(목적한 표적 절단 서열 함유)을 프로테아제와, 형광생성 잔기가 프로테아제의 작용시 펩타이드 기질 서열로부터 방출되는 방식으로 접촉시킴에 의해 형광성 잔기를 생성하는 단계; 및 (b) 샘플이 형광성에 있어 검출가능한 변화를 겪는지를 관찰하는 단계를 포함하며, 여기서, 검출가능한 변화는 샘플내 효소적으로 활성인 프로테아제의 존재의 지표이다. 이러한 실시예에서, 프로테아제가 이에 대해 선택되는 목적한 절단 서열은 당해 분야에 공지된 방법에 의해 형광생성 펩타이드로 제조된다. 하나의 양태에서, 개개의 펩타이드 절단 서열은 예를 들면, ACC 또는 AMC 형광생성 이탈 그룹과 같은 형광생성적으로 태그화된 기질에 부착될 수 있으며, 형광생성 잔기의 방출은 펩타이드 절단 서열에 대한 프로테아제의 특이성의 척도로서 측정할 수 있다. 표적 절단 서열의 형광성의 증가 속도는 형광성 분광광도계를 사용함으로써 측정할 수 있다. 형광성의 증가 속도는 시간에 따라 측정할 수 있다. 마이켈리스-멘텐 반응속도 상수는 표적 반응속도 방법으로 측정할 수 있다. 반응속도 상수 kcat, Km 및 kcat/Km은 기질 절단 속도의 역수에 대해 기질 농도의 역수를 그래프화하고, 라인위버-버크 방정식 (1/속도=(Km/Vmax)(1/[S]) + 1/Vmax; 여기서, Vmax=[ET]kcat이다)에 적용시켜 계산할 수 있다. 2차 속도 상수 또는 특이성 상수(kcat/Km)는, 기질이 특수 프로테아제에 의해 얼마가 잘 절단되는지의 척도이다. 예를 들어, Ac-RRAR-AMC, Ac-SLGR-AMC, Ac-SLGR-ACC, Ac-RQAR-ACC와 같은 ACC-또는 AMC-테트라펩타이드를 제조하여 본원에 제공된 방법에서 선별된 프로테아제와 함께 항온처리하고 프로테아제의 활성을 형광생성 잔기의 방출을 검정함으로써 평가할 수 있다. 테트라펩타이드의 선택은 검정될 목적한 절단 서열에 의존하며 경험적으로 측정할 수 있다.
용액중 프로테아제에 대한 검정은 프로테아제에 대한 스톡 용액의 양을 형광생성 프로테아제 지시인자 펩타이드에 가하고 후속적으로 형광성의 후속적인 증가 또는 흡착 스펙트럼내 여기 밴드에 있어서의 감소를 측정함을 필요로 한다. 용액 및 형광생성 지시인자는 또한 결합시켜 프로테아제의 활성을 최적화하는 "분해 완충액" 속에서 검정할 수 있다. 프로테아제 활성을 검정하는데 적합한 완충액은 당해 분야의 숙련가에게 잘 알려져 있다. 일반적으로, 완충액은 특수 프로테아제의 최적 pH에 상응하는 pH로 선택된다. 예를 들어, 엘라스타제 활성을 검정하는데 특히 적합한 완충액은 pH 8.9에서 50mM 인산나트륨, 1mM EDTA를 함유하는 엘라스타제 활성을 검정하기에 특히 적합하다. 측정은 대부분 형광단에 대한 "여기" 광 공급원을 제공한 후 특수 파장에서 후속적으로 방사된 광을 측정하는 장치인 형광계에서 용이하게 수행된다. 프로테아제를 결여하고 있는 대조군 지시인자 용액과의 비교는 프로테아제 활성의 척도를 제공한다. 활성 수준은, 활성이 공지된 프로테아제 용액에 의해 생산된 형광성의 변화율을 측정하는 프로테아제/지시인자 조합에 대한 표준 곡선을 생성시킴으로써 정밀하게 정량화할 수 있다.
형광생성 화합물의 검출은 형광계를 사용하여 달성할 수 있으며, 검출은 당해 분야의 숙련가에게 익히 공지된 각종의 다른 방법으로 달성할 수 있다. 따라서, 예를 들면, 형광단이 가시적인 파장으로 방사하는 경우, 검출은 단순히 광 공급원에 의한 여기에 반응시 형광성의 가시적인 관측으로 단순히 달성할 수 있다. 검출은 또한 디지털화기(digitizer)에 연결된 비디오 카메라 또는 다른 영상 획득 시스템을 사용한 영상 분석 시스템의 수단으로 이룰 수 있다. 검출은 또한 형광 현미경하에 여과기를 통한 가시화로 수행할 수 있다. 현미경은 작동기에 의해 단순히 가시화되는 시그날을 제공한다. 또는, 시그날을 사진 필름상에 또는 비디오 분석 시스템을 사용하여 기록할 수 있다. 시그날은 또한 영상 분석 시스템 또는 광도계를 사용하여 실시간으로 정량화할 수 있다.
따라서, 예를 들면, 샘플의 프로테아제 활성에 대한 기본 검정은 샘플을 완충액(검정되는 특수 프로테아제의 최적 pH) 속에 현탁시키거나 또는 용해하고, 완충액에 형광생성 프로테아제 펩타이드 지시인자를 가하고 문헌[참조: Harris et al., (1998) J Biol Chem 273:27364]에 나타낸 바와 같은 분광형광계를 사용하여 형광성의 수득되는 변화를 모니터링함을 포함한다. 분광형광계는 형광단의 여기 파장에서 형광단을 여기시키도록 설정된다. 형광생성 프로테아제 지시인자는 지시인자를 절단하는 프로테아제로 인하여 형광성에 있어서 변화하는 프로테아제의 기질 서열이다.
선별된 프로테아제를 또한 검정하여, 이들이 완전한 길이의 단백질의 측면에서 나타나는 경우 목적한 서열을 절단할지를 추정할 수 있다. 하나의 예에서, 정제된 표적 단백질, 즉, VEGFR2 또는 보체 단백질 C2를 선별된 프로테아제의 존재 또는 부재하에 항온처리하고 절단 현상을 단백질에 대해 SDS-PAGE에 이은 쿠마시 브릴리언트 블루 염색에 의해 및 절단 생성물의 분석은 농도계로 모니터할 수 있다. 프로테아제에 의한 완전한 길이의 단백질의 절단의 일정한 특이성은 겔 농도계를 사용하여 측정함으로써 시간에 걸쳐 프로테아제의 존재하에 항온처리된 완전한 길이의 표적 기질 밴드의 농도계내에서의 변화를 평가할 수 있다. 또한, 표적 단백질의 활성은 목적한 표적 단백질의 활성을 검정하기 위한 당해 분야에 잘 알려진 방법을 사용하여 검정함으로써 절단 현상에 의해 이의 기능이 파괴되는지를 입증할 수 있다.
특정 양태에서, 선별된 프로테아제, 대표적으로 변형된 프로테아제의 특이성의 비교를 사용하여, 선별된 프로테아제가 변경된, 예를 들면, 야생형 또는 주형 프로테아제와 비교하여 특이성이 증가되는지를 측정할 수 있다. 표적 기질에 대한 프로테아제의 특이성은, 야생형 또는 주형 프로테아제와 비교하여 제공된 활성에서 변형된 프로테아제가 얼마나 많은 별개의 서열로 절단하는지를 관찰함으로써 측정할 수 있다. 변형된 프로테아제가 야생형 프로테아제보다 더 적은 표적 기질을 분해하는 경우, 변형된 프로테아제는 표적 기질에 대한 야생형 프로테아제보다 더 큰 특이성을 갖는다. 표적 기질에 대한 프로테아제의 특이성은 비-표적 기질(즉, 프로테아제의 천연의 야생형 기질 서열)과 비교하여 표적 기질의 절단의 일정한 특이성으로부터 측정할 수 있다. 표적 기질 대 비-표적 기질에 대한 변형된 프로테아제의 일정한 특이성의 비율을 작성하여 프로테아제의 절단 효율의 비를 측정할 수 있다. 변형된 프로테아제 및 야생형 또는 주형 프로테아제 사이의 절단 효능의 비의 비교를 사용하여 표적 기질에 대한 특이성에 있어서의 배수 변화를 평가할 수 있다. 특이성은, 표적 기질 대 비-표적 기질에 대한 야생형 또는 주형 프로테아제의 특이성과 비교하여 2배 이상, 4배 이상, 5배 이상, 6배 이상, 7배 이상, 8, 9, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 200, 300, 400, 500, 600, 700, 800, 900, 1000배 이상일 수 있다.
H. 프로테아제 포획 폴리펩타이드 (즉, 서핀 ) 또는 이의 변이체 또는 프로테아제/변형된 프로테아제를 암호화하는 핵산의 제조 방법
프로테아제 포획 폴리펩타이드 또는 프로테아제 폴리펩타이드, 또는 변형된 u-PA 폴리펩타이드 또는 변형된 MT-SP1 폴리펩타이드를 포함하는 이의 촉매적으로 활성인 부위를 포함하는, 본원에 제시된 폴리펩타이드는 단백질 정제 및 재조합체 단백질 발현에 대해 당해 분야에 익히 공지된 방법으로 수득할 수 있다. 목적한 유전자를 암호화하는 핵산을 확인하기 위한 당해 분야의 숙련가에게 공지된 어떠한 방법도 사용할 수 있다. 당해 분야에 유용한 어떠한 방법도 사용하여 세포 또는 조직 공급원으로부터 목적한 프로테아제 포획 폴리펩타이드 또는 프로테아제 단백질을 암호화하는 완전한 길이(즉, 전체 암호화 영역을 포함하는) cDNA 또는 게놈성 DNA를 수득할 수 있다. 변이 프로테아제 포획 폴리펩타이드 또는 선택된 변이 프로테아제와 같은 변형된 폴리펩타이드는 부위-지시된 돌연변이유발과 같은 야생형 폴리펩타이드로부터 본원에 기술된 바와 같이 조작할 수 있다.
폴리펩타이드는 핵산 분자를 클로닝하고 분리하기 위한 당해 분야에 공지된 어떠한 유용한 방법을 사용하여 클로닝하거나 또는 분리할 수 있다. 이러한 방법은 핵산의 PCR 증폭 및 핵산 하이브리드화 스크리닝, 항체-기반 스크리닝 및 활성-기반 스크리닝을 포함하는, 라이브러리의 스크리닝을 포함한다.
예를 들면, 폴리머라제 연쇄 반응(PCR) 방법을 포함하는, 핵산을 증폭시키는 방법을 사용하여 목적한 폴리펩타이드를 암호화하는 핵산 분자를 분리할 수 있다. 물질을 함유하는 핵산은, 목적한 폴리펩타이드-암호화 핵산 분자가 분리되는 출발 물질로서 사용할 수 있다. 예를 들어, DNA 및 mRNA 제제, 세포 추출물, 조직 추출물, 유체 샘플(예: 혈액, 체액, 타액), 건강하고/하거나 질병이 있는 피검체로부터의 샘플을 증폭 방법에 사용할 수 있다. 핵산 라이브러리를 또한 출발 물질의 공급원으로 사용할 수 있다. 프라이머를 설계하여 목적한 폴리펩타이드를 증폭시킬 수 있다. 예를 들어, 프라이머는, 목적한 폴리펩타이드가 생성되는 발현된 서열을 기준으로 설계할 수 있다. 프라이머는 폴리펩타이드 아미노산 서열의 역-해독을 기준으로 설계할 수 있다. 증폭에 의해 생성된 핵산 분자는 서열분석하여 목적한 폴리펩타이드를 암호화하는지 확인할 수 있다.
추가의 뉴클레오타이드 서열은 합성 유전자를 벡터, 예를 들면, 코어 단백질 암호화 DNA 서열의 증폭을 위해 설계된 벡터 또는 단백질 발현 벡터내로 클로닝하기 위한 목적의 제한 엔도뉴클레아제 부위를 함유하는 링커 서열을 포함하는, 핵산 분자 암호화 폴리펩타이드에 연결시킬 수 있다. 또한, 추가의 DNA 성분들 규정하는 추가의 뉴클레오타이드 서열은 폴리펩타이드-암호화 핵산 분자에 작동가능하게 연결시킬 수 있다. 이러한 서열의 예는 세포내 단백질 발현을 촉진시키기 위해 설계된 프로모터 서열, 및 단백질 분비를 촉진시키기 위해 설계된 분비 서열을 포함하나, 이에 한정되지 않는다. 단백질 결합 영역을 규정하는 염기의 서열과 같은 추가의 뉴클레오타이드 잔기 서열을 또한 프로테아제-암호화 핵산 분자에 연결시킬 수 있다. 이러한 영역은 프로테아제의 특정 표적 세포내로의 흡수를 촉진시키거나, 또는 합성 유전자 생성물의 약력학을 변경시키는 단백질을 암호화하거나 또는 촉진시키는 잔기의 서열을 포함하나, 이에 한정되지 않는다.
또한, 태그 또는 기타 잔기를 예를 들면, 폴리펩타이드의 검출 또는 친화성 정제에 도움을 주기 위해 가할 수 있다. 예를 들면, 에피토프 태그 또는 기타 검출가능한 마커를 규정하는 염기의 서열과 같은 추가의 뉴클레오타이드 잔기 서열을 또한 프로테아제-암호화 핵산 분자 또는 서핀-암호화 핵산 분자 또는 이의 변이체에 연결시킬 수 있다. 이러한 서열의 예는 His 태그(예를 들면, 6xHis, HHHHH; 서열번호 496) 또는 Flag 태그(DYKDDDDK; 서열번호 495)를 암호화하는 핵산 서열이다.
이후에, 확인되고 분리된 핵산은 적절한 클로닝 벡터내로 삽입시킬 수 있다. 당해 분야에 공지된 다수의 벡터-숙주 시스템을 사용할 수 있다. 가능한 벡터는 플라스미드 또는 변형된 바이러스를 포함하나, 이에 한정되지 않지만, 벡터 시스템은 사용된 숙주 세포와 혼용성이어야 한다. 이러한 벡터는 람다 유도체와 같은 박테리오파지, 또는 pCMV4, pBR322 또는 pUC 플라스미드 유도체와 같은 플라스미드 또는 Bluescript 벡터[제조원: 캘리포니아주 라 졸라 소재의 스트라타젠(Stratagene)]를 포함하나, 이에 한정되지 않는다. 클로닝 벡터내로의 삽입은 예를 들면 상보적인 점착성 말단을 갖는 클로닝 벡터내로 DNA 단편을 연결시킴에 의해 달성할 수 있다. 삽입은 TOPO 클로닝 벡터[제조원: 캘리포니아주 칼스바드 소재의 인비트로겐(INVITROGEN)]을 사용하여 수행할 수 있다. DNA를 단편화하는데 사용된 상보성 제한 부위가 클로닝 벡터내에 존재하지 않는 경우, DNA 분자의 말단을 효소적으로 변형시킬 수 있다. 또한, 목적한 어떠한 부위도 뉴클레오타이드 서열(링커)를 DNA 말단에 연결시켜 생산할 수 있으며, 이러한 연결된 링커는 제한 엔도뉴클레아제 인지 서열을 암호화하는 화학적으로 합성된 특정의 올리고뉴클레오타이드를 함유할 수 있다. 다른 방법에서, 절단된 벡터 및 단백질 유전자는 단독중합체성 테일링(tailing)에 의해 변형시킬 수 있다. 재조합체 분자는 숙주 세포내로 예를 들면, 형질전환, 형질감염, 감염, 전기천공 및 소노포레이션(sonoporation)을 통해 도입시킴으로써 유전자 서열의 많은 카피를 생성할 수 있다.
특정 양태에서, 분리된 단백질 유전자, cDNA 또는 합성된 DNA 서열을 혼입하는 재조합체 DNA 분자를 사용한 숙주 세포의 형질전환은 유전자의 다수의 카피의 생성이 가능하도록 한다. 따라서, 유전자는 형질전환체를 성장시키고, 재조합체 DNA 분자를 형질전환체로부터 분리하고, 경우에 따라, 삽입된 유전자를 분리된 재조합체 DNA로부터 회수함에 의해 대량으로 수득할 수 있다.
1. 벡터 및 세포
본원에 기술된 것과 같은 목적한 단백질 중 하나 이상의 재조합체 발현을 위해, 단백질을 암호화하는 뉴클레오타이드 서열의 모두 또는 일부를 함유하는 핵산을 적절한 발현 벡터, 즉, 삽입된 단백질 암호화 서열의 전사 및 해독을 위해 필요한 성분들을 함유하는 벡터내로 삽입시킬 수 있다. 필수적인 전사 및 해독 시그날을 또한 프로테아제 유전자에 대한 천연의 프로모터 및/또는 이들의 플랭킹 영역으로 공급할 수 있다.
또한 프로테아제 또는 변형된 프로테아제를 암호화하는 핵산을 함유하는 벡터가 제공된다. 벡터를 함유하는 세포가 또한 제공된다. 세포는 진핵생물 및 원핵생물 세포를 포함하며, 벡터는 본원에 사용하기에 적합한 모든 것이다.
벡터를 함유하는, 내피세포를 포함하는 원핵생물 및 진핵생물 세포가 제공된다. 이러한 세포는 세균 세포, 효모 세포, 진균 세포, 고세균, 식물 세포, 곤충 세포 및 동물 세포를 포함한다. 세포는 상술한 세포를 암호화된 단백질이 세포에 의해 발현되는 조건하에서 성장시키고, 발현된 단백질을 회수함에 의해 이의 단백질을 생산하기 위해 사용된다. 본원의 목적을 위해, 예를 들면, 프로테아제는 배지내로 분비될 수 있다.
하나의 양태에서, 본원에서 제공된 u-PA 변이체 폴리펩타이드 중 어느 것을 암호화하는 것과 같은, 프로테아제 활성을 갖고 프로테아제 도메인의 모든 또는 일부, 또는 이의 다수의 카피를 함유하는 폴리펩타이드를 암호화하는 뉴클레오타이드 서열이 제공된다. 또한, 완전한 길이의 프로테아제 단백질을 포함하는 프로테아제 단백질의 추가의 부위 및 프로테아제 도메인을 암호화하는 뉴클레오타이드의 서열을 함유하는 벡터가 제공된다. 벡터는 세포내에서 변형된 프로테아제 단백질 또는 이의 프로테아제 도메인의 발현을 위해 선택됨으로써 프로테아제 단백질이 분비된 단백질로 발현되도록 한다. 프로테아제 도메인이 발현된 경우, 핵산은 사카로마이세스 세레비지아에(Saccharomyces cerevisiae) " 교배 인자 시그날 서열 또는 이의 일부, 또는 천연의 시그날 서열과 같은 분비 시그날을 암호화하는 핵산에 연결된다.
각종의 숙주-벡터 시스템을 사용하여 단백질 암호화 서열을 발현시킬 수 있다. 이들은 바이러스(예: 박시니아 바이러스, 아데노바이러스 및 기타 바이러스)로 감염된 포유동물 세포 시스템; 바이러스(예: 바큘로바이러스)로 감염된 곤충 세포 시스템; 효소 벡터를 함유하는 효모와 같은 미생물; 또는 박테리오파지, DNA, 플라스미드 DNA 또는 코스미드 DNA로 감염된 세균을 포함하나, 이에 한정되지 않는다. 벡터의 발현 성분들은 길이 및 특이성에 있어 다양하다. 사용된 숙주-벡터 시스템에 따라서, 다수의 적합한 전사 및 해독 성분 중 하나를 사용할 수 있다.
DNA 단편을 벡터내로 삽입시키기 위한 당해 분야의 숙련가에게 공지된 어떠한 방법도 사용하여 적절한 전사/해독 대조군 시그날 및 단백질 암호화 서열을 함유하는 키메라 유전자를 함유하는 발현 벡터를 작제할 수 있다. 이들 방법은 시험관내 재조합체 DNA 및 합성 기술 및 생체내 재조합체(유전자 재조합)를 포함할 수 있다. 단백질, 또는 이의 도메인, 유도체, 단편 또는 유사체를 암호화하는 핵산 서열의 발현은 제2 핵산 서열로 조절함으로써 유전자 또는 이의 단편이 재조합체 DNA 분자(들)로 형질감염된 숙주내에서 발현되도록 할 수 있다. 예를 들어, 단백질의 발현은 당해 분야에 공지된 특정의 프로모터/인핸서에 의해 조절될 수 있다. 특정 양태에서, 프로모터는 목적한 단백질에 대한 유전자에 대해 인공적이다. 사용될 수 있는 프로모터는 SV40 얼리 프로모터[참조: Bernoist and Chambon, Nature 290:304-310 (1981)], 라우스 육종 바이러스(Rous sarcoma virus)의 3' 긴 말단 반복물에 함유된 프로모터[참조: Yamamoto et al. Cell 22:787-797 (1980)], 헤르페스 티미딘 키나제 프로모터[참조: Wagner et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 78:1441-1445 (1981)], 메탈로티오네인 유전자의 조절 서열[참조: Brinster et al., Nature 296:39-42 (1982)]; β-락타마제 프로모터와 같은 원핵세포 발현 벡터[참조: Jay et al., (1981) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 78:5543] 또는 tac 프로모터[참조: DeBoer et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 80:21-25 (1983)]; 또한 문헌[참조: "Useful Proteins from Recombinant Bacteria": in Scientific American 242:79-94 (1980)]; 노팔린 신테타제 프로모터를 함유하는 식물 발현 벡터[참조: Herrar-Estrella et al., Nature 303:209-213 (1984)) 또는 콜리플라워 모자익 바이러스(cauliflower mosaic virus) 35S RNA 프로모터[참조: Garder et al., Nucleic acids Res. 9:2871 (1981)], 및 광합성 효소 리불로즈 비포스페이트 카복실레이트의 프로모터[참조: Herrera-Estrella et al., Nature 310:115-120 (1984)]; Gal4 프로모터, 알코올 데하이드로게나제 프로모터, 포스포글리세릴 키나제 프로모터, 알칼린 포스파타제 프로모터 및 조직 특이성을 나타내며 유전자전이(transgenic) 동물에 사용된 다음의 동물 전사 조절 영역: 췌장 샘꽈리 세포에서 활성인 엘라스타제 I 유전자 조절 영역[참조: Swift et al., Cell 38:639-646 (1984); Ornitz et al., Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 50:399-409 (1986); MacDonald, Hepatology 7:425-515 (1987)]; 췌장 베타 세포에서 활성인 인슐린 유전자 조절 영역[참조: Hanahan et al., Nature 315:115-122 (1985)], 림프구 세포에서 활성인 면역글로불린 유전자 조절 영역[참조: Grosschedl et al., Cell 38:647-658 (1984); Adams et al., Nature 318:533-538 (1985); Alexander et al., Mol. Cell Biol. 7:1436-1444 (1987)], 고환, 유방, 림프구 및 유방 세포에서 활성인 마우스 유방 종양 바이러스 조절 영역[참조: Leder et al., Cell 45:485-495 (1986)], 간에서 활성인 알부민 유전자 조절 영역[참조: Pinckert et al., Genes and Devel. 1:268-276 (1987)], 간에서 활성인 알파-페토단백질 유전자 조절 영역[참조: Krumlauf et al., Mol. Cell. Biol. 5:1639-1648 (1985); Hammer et al., Science 235:53-58 1987)], 간에서 활성인 알파-1 안티트립신 유전자 조절 영역[참조: Kelsey et al., Genes and Devel. 1:161-171 (1987)], 골수 세포에서 활성인 베타 글로빈 유전자 조절 영역[참조: Mogram et al., Nature 315:338-340 (1985); Kollias et al., Cell 46:89-94 (1986)], 뇌의 희소돌기아교세포에서 활성인 말이집 기본 단백질 유전자 조절 영역[참조: Readhead et al., Cell 48:703-712 (1987)), 골격근에서 활성인 미오신 경쇄-2 유전자 조절 영역[참조: Sani, Nature 314:283-286 (1985)), 및 시상하부의 성선자극 호르몬 분비세포에서 활성인 고나도트로핀 방출 호르몬 유전자 조절 영역[참조: Mason et al., Science 234:1372-1378 (1986)]을 포함하나, 이에 한정되지 않는다.
특정 양태에서, 목적한 단백질, 또는 이의 도메인, 단편, 유도체 또는 유사체, 하나 이상의 복제 오리진, 및 임의로 하나 이상의 선별가능 마커(예: 항생제 내성 유전자)를 암호화하는 핵산에 작동가능하게 연결된 프로모터를 함유하는 벡터가 사용된다. 예를 들면, 프로테아제 단백질의 프로테아제 도메인의 발현 벡터 및 시스템은 특히 암호화된 단백질의 분비를 위해 설계된 것들인, 익히 공지된 피키아(Pichia) 벡터(제조원: 예를 들면, 캘리포니아주 샌 디에고 소재의 인비트로겐)를 포함한다. 이.콜라이 세포의 형질전환을 위한 대표적인 플라스미드 벡터는 예를 들면, pQE 발현 벡터[제조원: 캘리포니아주 발렌시아 소재의 퀴아젠; 또한 이러한 시스템을 기술하는 퀴아젠에 의해 발표된 문헌 참조]를 포함한다. pQE 벡터는 파지 T5 프로모터(이.콜라이 RNA 폴리머라제에 의해 인지됨) 및 이.콜라이내에서 재조합체 단백질의 엄격히 조절된, 고-수준 발현을 제공하기 위한 이본쇄 lac 오퍼레이터 제어 모듈, 효율적인 해독을 위한 합성 리보솜 결합 부위(RBS II), 6XHis 태그 암호화 서열, t0 및 T1 전사 터미네이터, ColE1 복제 오리진, 및 암피실린 내성을 부여하기 위한 베타-락타마제 유전자를 갖는다. pQE 벡터는 재조합체 단백질의 N- 또는 C-말단에서 6xHis 태그의 교체가 가능하다. 이러한 플라스미드는 모든 3개의 판독 프레임에 대한 다수의 클로닝 부위를 제공하며, N-말단이 6xHis-태그화된 단백질의 발현을 제공하는 pQE 32, pQE 30 및 pQE 31을 포함한다. 이.콜라이 세포의 형질전환을 위한 다른 대표적인 플라스미드 벡터는 예를 들면, pET 발현 벡터(참조: 위스콘신주 매디슨 소재의 노바겐(NOVAGEN)으로부터 유용한 미국 특허 제4,952,496호; 참조: 또한 이러한 시스템을 기술하는 노바겐에 의해 발표된 문헌)을 포함한다. 이러한 플라스미드는 T7lac 프로모터, T7 터미네이터, 및 이.콜라이 lac 오퍼레이터 및 lac 제어 유전자를 함유하는 pET 11a; T7 프로모터, T7 터미네이터 및 이.콜라이 ompT 분비 시그날을 포함하는 pET 12a-c; 및 His 컬럼을 사용한 정제시 사용하기 위한 His-TagTM 리터 서열 및 절단 후 컬럼위에서의 정제를 허용하는 트롬빈 절단 부위, T7-lac 프로모터 영역 및 T7 터미네이터를 함유하는 pET 15b 및 pET19b(제조원: 위스콘신주 매디슨 소재의 노바겐)을 포함한다.
2. 발현
특정 프로테아제 포획 폴리펩타이드 또는 이의 변이체, 또는 선별된 프로테아제 또는 이의 촉매적으로 활성인 부위와 같은 단백질은 생체내 및 시험관내 방법을 포함하는 당해 분야의 숙련가에게 공지된 어떠한 방법으로도 생산할 수 있다. 목적한 단백질은 예를 들면 투여 및 치료에 요구되는 단백질의 형태 및 요구량을 생산하기에 적함한 어떠한 유기체내에서도 발현될 수 있다. 발현 숙주는 이.콜라이, 효모, 식물, 곤충 세포, 사람 세포주를 포함하는 포유동물 세포 및 유전자전이 동물을 포함한다. 발현 숙주는 이들의 단백질 생산 수준 및 발현된 단백질상에 존재하는 해독 후 변형의 유형에 있어 상이할 수 있다. 발현 숙주의 선택은 조절 및 안정성 고려, 생산 비용 및 정제 요구도 및 방법과 같은 이들 및 기타 인자들을 기준으로 달성할 수 있다.
많은 발현 벡터가 유용하며 당해 분야의 숙련가에게 공지되어 있고 단백질의 발현에 사용할 수 있다. 발현 벡터의 선택은 숙주 발현 시스템의 선택에 영향받을 것이다. 일반적으로, 발현 벡터는 전사 프로모터 및 임의로 인핸서, 해독 시그날 및 전사 및 해독 말단 시그날을 포함할 수 있다. 안정한 형질전환에 사용된 발현 벡터는 통상적으로 형질전환된 세포의 선택 및 유지를 허용하는 선별가능 마커를 갖는다. 일부 경우에, 복제 오리진을 사용하여 벡터의 카피 수를 증폭시킬 수 있다.
예를 들면, 본원에 제공된 어떠한 변이 프로테아제 또는 특정의 프로테아제 포획 폴리펩타이드 또는 이의 변이체와 같은 단백질을 또한 단백질 융합체로서 이용하거나 또는 발현시킬 수 있다. 예를 들어, 프로테아제 융합물을 생성시켜 프로테아제에 추가의 작용성을 가할 수 있다. 프로테아제 융합 단백질의 예는 시그날 서열, 국재화용과 같은 태그, 예를 들면, his6 태그 또는 myc 태그 또는 정제용 태그, 예를 들면, GST 융합물, 및 단백질 분비 및/또는 막 연합을 지시하는 서열을 포함하나, 이에 한정되지 않는다.
하나의 양태에서, 프로테아제는 활성 형태로 발현될 수 있다. 다른 양태에서, 프로테아제는 불활성의 자이모겐 형태로 발현된다.
a. 원핵생물 세포
원핵생물 세포, 특히 이.콜라이는 다량의 단백질을 생산하는 시스템을 제공한다. 이.콜라이의 형질전환은 당해 분야의 숙련가에게 잘 알려진 단순하고 신속한 기술이다. 이.콜라이용 발현 벡터는 유도성 프로모터를 함유할 수 있으며, 이러한 프로모터는 높은 수준의 단백질 발현을 유도하고 숙주 세포에 대해 일부 독성을 나타내는 단백질을 발현하는데 유용하다. 유도성 프로모터의 예는 lac 프로모터, trp 프로모터, 하이브리드 tac 프로모터, T7 및 SP6 RNA 프로모터 및 온도 조절된 λPL 프로모터를 포함한다.
본원에 제공된 것과 같은 단백질은 이.콜라이의 세포질 환경에서 발현시킬 수 있다. 세포질은 환원 환경이며 일부 분자의 경우, 이는 불용성 봉입체의 형성을 초래할 수 있다. 디티오트레이톨 및 β-머캅토에탄올과 같은 환원제 및 구아니딘-HCl 및 우레아와 같은 변성제를 사용하여 단백질을 재용해시킬 수 있다. 대안적인 시도는 산화 환경 및 카페로닌-유사 및 디설파이드 이소머라제를 제공하고 가용성 단백질의 생산을 가져오는 세균의 주변세포질 영역내 단백질의 발현이다. 통상적으로, 리더 서열은 단백질을 주변세포질로 지시하는 발현될 단백질에 융합된다. 이후에, 리더는 주변세포질내 시그날 펩티다제에 의해 제거된다. 주변세포질-표적화 리더 서열의 예는 펙테이트 리아제 유전자로부터의 pelB 리더 및 알칼린 포스파타제 유전자로부터 기원한 리더를 포함한다. 일부 경우에, 주변세포질 발현은 발현된 단백질의 배양 배지내로의 유출을 허용한다. 단백질의 분비는 배양 상청액으로부터 신속하고 단순한 정제를 허용한다. 분비되지 않는 단백질은 삼투압성 용해(lysis)에 의해 주변세포질로부터 수득될 수 있다. 세포질 발현과 유사하게, 일부 경우에 단백질은 불용성이 되며 변성제 및 환원제를 사용하여 가용화 및 재폴딩화를 촉진시킬 수 있다. 유도 및 성장 온도는 또한 발현 수준 및 가용성에 영향을 미칠 수 있으며, 통상적으로 25℃ 내지 37℃의 온도가 사용된다. 통상적으로, 세균은 아글리코실화된 단백질을 생산한다. 따라서, 단백질이 작용을 위한 글리코실화를 필요로 하는 경우, 글리코실화는 숙주 세포로부터의 정제 후 시험관내에서 가해질 수 있다.
b. 효모 세포
사카로마이세스 세레비지아에(Saccharomyces cerevisae), 스키조사카로마이세스 폼베(Schizosaccharomyces pombe), 야로위아 리폴리티카(Yarrowia lipolytica), 클루이베로마이세스 락티스(Kluyveromyces lactis) 및 피키아 파스토리스(Pichia pastoris)는 본원에 기술된 것과 같은 단백질의 생산에 사용될 수 있는 잘 알려진 효모 발현 숙주이다. 효모는 에피솜 복제 벡터로 또는 동종 재조합에 의한 안정한 염색체 통합에 의해 형질전환시킬 수 있다. 통상적으로, 유도성 프로모터를 사용하여 유전자 발현을 조절한다. 이러한 프로모터의 예는 GAL1, GAL7 및 GAL5과, CUP1, AOX1 또는 기타 피키아 또는 다른 효모 프로모터와 같은 메탈로티오네인 프로모터를 포함한다. 발현 벡터는 흔히 형질전환된 DNA의 선택 및 유지를 위한 LEU2, TRP1, HIS3 및 URA3와 같은 선별가능 마커를 포함한다. 효모에서 발현된 단백질은 흔히 가용성이다. Bip 및 단백질 디설파이드 이소머라제와 같은 카오페로닌을 사용한 공동발현은 발현 수준 및 가용성을 개선시킬 수 있다. 또한, 효모에서 발현된 단백질은 사카로마이세스 세레비지아에로부터의 효모 교배 유형 알파-인자 분비 시그날과 같은 분비 시그날 펩타이드 융합체 및 Aga2p 교배 부착 수용체 또는 아르술라 아데니니보란스(Arxula adeninivorans) 글루코아밀라제와 같은 효모 세포 표면 단백질과의 융합체를 사용하여 분비에 대해 지시될 수 있다. Kex-2 프로테아제와 같은 프로테아제 절단 부위는, 이들이 분비 경로로 배출되면서 발현된 폴리펩타이드로부터 융합된 서열을 제거하도록 조작될 수 있다. 효모는 또한 Asn-X-Ser/Thr 모티프에서 글리코실화시킬 수 있다.
c. 곤충 세포
특히 바큘로바이러스 발현을 사용한 곤충 세포는 변형된 프포테아제 또는 변형된 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 같은 폴리펩타이드를 발현시키는데 사용된다. 곤충 세포는 높은 수준의 단백질을 발현하며 고등 진핵세포에 의해 사용된 해독 후 변형의 대부분을 수행할 수 있다. 바큘로바이러스는 진핵세포 발현의 측면에서 안정성을 개선시키고 조절을 감소시키는 제한적인 숙주 범위를 갖는다. 대표적인 발현 벡터는 바큘로바이러스의 폴리헤드린 프로모터와 같은 높은 수준의 발현을 위한 프로모터를 사용한다. 일반적으로 사용된 바큘로바이러스 시스템은 아우토그라파 칼리포르니카(Autographa californica) 핵 폴리헤드로시스 바이러스(AcNPV) 및 봄빅스 모리(bombyx mori) 핵 폴리헤드로시스 바이러스(BmNPV)와 같은 바큘로바이러스, 및 스포도프테라 프루기페르다(Spodoptera frugiperda), 슈달레티아 우니푼크타(Pseudaletia unipuncta)(A7S) 및 다나우스 플렉시푸스(Danaus plexippus)(DpN1)로부터 기원한 Sf9와 같은 곤충 세포주를 포함한다. 높은 수준의 발현을 위해, 발현될 분자의 뉴클레오타이드 서열을 바이러스의 폴리헤드린 개시 코돈의 바로 하부에 융합시킨다. 포유동물 분비 시그날은 곤충 세포내에서 정확히 프로세싱되며 발현된 단백질을 배양 배지내로 분비시키는데 사용될 수 있다. 또한, 세포주 슈달레티아 우니푼크타(A7S) 및 다나우스 플렉시푸스(DpN1)는 포유동물 세포 시스템과 유사한 글리코실화 패턴을 갖는 단백질을 생산한다.
곤충 세포내 대안의 발현 시스템은 안정하게 형질전환된 세포의 사용이다. 쉬나이더(Schnieder) 2 (S2) 및 Kc 세포[드로소필라 멜라노가스터(Drosophila melanogaster)] 및 C7 세포[아에데스 알보픽투스(Aedes albopictus)]와 같은 세포주를 발현에 사용할 수 있다. 드로소필라 메탈로티오네인 프로모터는 카드뮴 또는 구리를 사용하는 중금속 유도의 존재하에 높은 발현 수준을 유도하는데 사용할 수 있다.
d. 포유동물 세포
포유동물 발현 시스템은 변형된 프로테아제 또는 이의 촉매적으로 활성인 부위, 또는 프로테아제 포획 폴리펩타이드 또는 이의 변이체를 포함하는 단백질을 발현시키는데 사용할 수 있다. 발현 작제물은 아데노바이러스와 같은 바이러스 감염에 의해 또는 리포좀, 칼슘 포스페이트, DEAE-덱스트란과 같은 직접적인 DNA 전달 및 전기천공 및 미세주사와 같은 물리적 수단에 의해 포유동물 세포로 형질감염시킬 수 있다. 포유동물 세포용 발현 벡터는 대표적으로 mRNA cap 부위, TATA 박스, 해독 개시 서열[코작 컨센서스 서열(Kozak consensus sequence)] 및 폴리아데닐화 성분을 포함한다. 이러한 벡터는 흔히 높은 수준의 발현을 위핸 전사 프로모터-인핸서, 예를 들면, SV40 프로모터-인핸서, 사람 사이토메갈로바이러스(CMV) 프로모터 및 라우스 육종 바이러스(RSV)의 간 말단 반복물을 포함한다. 이들 프로모터-인핸서는 많은 세포 유형에서 활성이다. 조직 및 세포-유형 프로모터 및 인핸서 영역을 또한 발현에 사용할 수 있다. 대표적인 프로모터/인핸서 영역은 엘라스타제 I, 인슐린, 면역글로불린, 마우스 유방 종양 바이러스, 알부민, 알파 페토단백질, 알파 1 안티트립신, 베타 글로빈, 마이엘린 염기성 단백질, 미오신 경쇄 2 및 고나도트로핀 방출 호르몬 유전자 재조군을 포함하나, 이에 한정되지 않는다. 선별가능 마커는 발현 작제물을 사용하여 세포를 선택하고 유지하는데 사용할 수 있다. 선별가능 마커 유전자의 예는 하이드로마이신 B 포스포트랜스퍼라제, 아데노신 데아미나제, 크산틴-구아닌 포스포리보실 트랜스퍼라제, 아미노글리코시드 포스포트랜스퍼라제, 디하이드로폴레이트 리덕타제 및 티미딘 키나제를 포함하나, 이에 한정되지 않는다. TCR-ζ 및 FcεRI-γ와 같은 세포 표면 시그날링 분자와의 융합체는 세포 표면상에서 활성인 상태의 단백질의 발현을 지시할 수 있다.
마우스, 랫트, 사람, 원숭이, 닭 및 햄스터 세포를 포함하는 많은 세포주가 포유동물 발현에 이용가능하다. 대표적인 세포주는 CHO, Balb/3T3, HeLa, MT2, 마우스 NS0(비분비성) 및 기타 골수종 세포주, 림프구, 섬유아세포, Sp2/0, COS, NIH3T3, HEK293, 293S, 2B8 및 HKB 세포를 포함하나, 이에 한정되지 않는다. 세포주는 또한 세포 배양 배지로부터 분비된 단백질의 정제를 촉진하는 무혈청 배지에 유용하게 채택된다. 하나의 이러한 예는 무혈청 EBNA-1 세포주이다[참조: Pham et al., (2003) Biotechnol. Bioeng. 84:332-42.].
e. 식물
유전자전이 식물 세포 및 식물을 사용하여 본원에 기술된 것과 같은 단백질을 발현할 수 있다. 발현 작제물은 통상적으로 미세투사 포격(microprojectile bombardment) 및 원형질내로 PEG-매개된 이동 및 아그로박테리움-매개된 형질전환을 사용하여 식물에 형질전환시킬 수 있다. 발현 벡터는 프로모터 및 인핸서 서열, 전사 터미네이터 성분 및 해독 조절 성분을 포함할 수 있다. 발현 벡터 및 형질전환 기술은 일반적으로 아라비돕시스 및 담배와 같은 쌍자엽 숙주 및 옥수수 및 벼와 같은 단자엽 숙주 사이에서 나누어진다. 발현에 사용된 식물 프로모터의 예는 콜리플라워 모자익 바이러스 프로모터, 노팔린 신타제 프로모터, 리보스 비포스페이트 카복실라제 프로모터 및 우비퀴틴 및 UBQ3 프로모터를 포함한다. 하이드로마이신, 포스포만노즈 이소머라제 및 네오마이신 포스포트랜스퍼라제와 같은 선별가능 마커를 흔히 사용하여 형질전환된 세포의 선택 및 유지를 촉진한다. 형질전환된 식물 세포는 세포, 응집물(캘러스 조직)과 같은 배양물내에서 유지시키거나 전체 식물로 재생시킬 수 있다. 유전자전이 식물 세포는 또한 프로테아제 또는 변형된 프로테아제를 생산하도록 조작된 조류를 포함할 수 있다[참조: 예를 들면, Mayfield et al. (2003) PNAS 100:438-442]. 식물은 포유동물 세포와 상이한 글리코실화 패턴을 가지므로, 이는 이들 숙주내에서 생산된 단백질의 선택에 영향을 미칠 수 있다.
3. 정제 기술
숙주 세포로부터 프로테아제 폴리펩타이드 또는 기타 단백질을 포함하는 폴리펩타이드의 정제 방법은 선택된 숙주 세포 및 발현 시스템에 의존할 것이다. 분비된 분자의 경우, 단백질은 일반적으로 세포를 제거한 후 배양 배지로부터 정제된다. 세포내 발현을 위해, 세포를 용해하고 단백질을 추출물로부터 정제한다. 유전자전이 식물 및 동물과 같은 유전자전이 유기체를 발현에 사용하는 경우, 조직 또는 기관을 출발 물질로 사용하여 용해된 세포 추출물을 제조할 수 있다. 또한, 유전자전이 동물 생산은 우유 또는 난황속에서 폴리펩타이드의 생산을 포함하며, 이는 수집될 수 있고, 경우에 따라, 단백질이 추출되어 당해 분야의 표준 방법을 사용하여 정제될 수 있다.
하나의 예에서, 프로테아제는 발현되고 정제되어 불활성 형태(자이모겐 형태)로 되거나, 또는 발현된 프로테아제는 프로영역을 제거하기 위한 자가촉매작용에 의해 2쇄 형태와 같은 활성형으로 정제될 수 있다. 통상적으로, 자가활성화는 실온에서 24 내지 72시간 동안 항온처리함으로써 정제 과정 동안 발생할 수 있다. 활성화의 속도 및 정도는 단백질 농도 및 특정의 변형된 프로테아제에 의존하므로, 예를 들어, 보다 희석된 샘플이 보다 장기간 동안 실온에서 항온처리되는것이 요구될 수 있다. 활성화는 SDS-PAGE (예를 들면, 3킬로달톤 이동) 및 효소 활성(형광발생 기질의 절단)에 의해 모니터할 수 있다. 통상적으로, 프로테아제는 정제 전에 75% 초과의 활성화를 달성하도록 한다.
프로테아제 또는 프로테아제-포획 폴리펩타이드와 같은 단백질은 SDS-PAGE, 크기 분획 및 크기 배출 크로마토그래피, 암모늄 설페이트 침전 및 음이온 교환과 같은 이온 교환 크로마토그래피를 포함하나, 이에 한정되지 않는 당해 분야에 공지된 표준 단백질 정제 기술을 사용하여 정제할 수 있다. 친화성 정제 기술을 또한 이용하여 제제의 효능 및 순도를 개선시킬 수 있다. 예를 들어, 항체, 수용체 및 프로테아제 또는 프로테아제 포획 폴리펩타이드를 결합시키는 기타 분자를 친화성 정제에서 사용할 수 있다. 발현 작제물은 또한 myc 에피토프, GST 융합체 또는 His6와 같은 단백질에 친화성 태그를 가하기 위해 조작한 후 myc 항체, 글루타티온 수지 및 Ni-수지 각각으로 친화성 정제할 수 있다. 순도는 겔 전기영동 및 염색 및 분광광도계 기술을 포함하여 당해 분야에 공지된 어떠한 방법으로도 평가할 수 있다.
4. 융합 단백질
본원에 제공된 변이 프로테아제를 함유하는 융합 단백질 및 하나 이상의 다른 폴리펩타이드가 또한 제공된다. 적합한 경로에 의해 투여용으로 제형화된 이러한 융합 단백질을 함유하는 약제학적 조성물도 제공된다. 융합 단백질은 변형된 프로테아제와 항체 또는 이의 단편, 성장 인자, 수용체, 리간드 및 프로테아제의 정제를 촉진시키는 목적의 다른 이러한 제제와 같은 다른 폴리펩타이드를 어떠한 순서로도 연결시키고 프로테아제를 표적화된 세포 또는 조직에 지시함으로써 프로테아제의 약동학적 특성을 변경시키고/시키거나 프로테아제의 발현 또는 분비를 증가시킴에 의해 형성된다. 프로테아제 융합 단백질내에서, 프로테아제 폴리펩타이드는 프로테아제 단백질의 모두 또는 이의 촉매적으로 활성인 부위에 상응할 수 있다. 일부 양태에서, 프로테아제 또는 이의 촉매적으로 활성인 부위는 변형된 프로테아제이다. 본원에 제공된 융합 단백질은 특정의 하나 이상의 목적한 표적 기질에 대해 자체의 특이성 및/또는 선택성 모두를 실질적으로 보유한다. 일반적으로, 프로테아제 융합 폴리펩타이드는 비-융합 프로테아제와 비교하여 96%, 97%, 98%, 99% 이상의 기질 특이성을 포함하여, 비-융합 프로테아제와 비교하여 적어도 약 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90% 또는 95% 이상의 기질 특이성 및/또는 선택성을 보유한다.
프로테아제 폴리펩타이드와 다른 폴리펩타이드의 연결은 링커를 통해 간접적으로 또는 직접 수행할 수 있다. 하나의 예에서, 연결은 이종이작용성 제제 또는 티올 연결 또는 다른 이러한 연결을 통하는 것과 같은 화학적 연결로 이룰 수 있다. 프로테아제의 다른 폴리펩타이드로의 융합은 프로테아제 폴리펩타이드의 N- 또는 C- 말단에서 존재할 수 있다. 본원에 제공된 프로테아제와의 융합 단백질에서 사용될 수 있는 폴리펩타이드의 비제한적 예는 예를 들면, GST(글루타티온 S-트랜스퍼라제) 폴리펩타이드, 면역글로불린으로부터의 Fc 도메인 또는 이종 시그날 서열을 포함한다. 융합 단백질은 이.콜라이 세포에 의한 단백질의 흡수에 도움을 주는 말토즈 결합 단백질(MBP)과 같은 추가의 성분을 함유할 수 있다(참조: 국제 PCT 특허원 제WO 01/32711호).
프로테아제 융합 단백질은 표준 재조합 기술로 생산할 수 있다. 예를 들면, 상이한 폴리펩타이드 서열을 암호화하는 DNA 단편을 통상의 기술, 예를 들면, 연결을 위한 평활-말단 또는 점착-말단을 사용함으로써 통상의 기술에 따라 프레임내에 함께 연결시키고, 제한 효소 분해하여 적절한 말단을 제공하고, 적절하게는 점착 말단으로 채우고, 알칼린 포스파타제로 처리하여 바람직하지 않은 연결을 피하고, 효소적으로 연결시킴에 의해 프레임내에서 함께 연결시킬 수 있다. 다른 양태에서, 융합 유전자는 자동화된 DNA 합성기를 포함하는 통상의 기술로 합성할 수 있다. 또는, 유전자 단편의 PCR 증폭을 후속적으로 어닐링시키고 재증폭시켜 키메라 유전자 서열을 생성시킬 수 있는 2개의 연속된 유전자 단편 사이에 상보적인 오버행을 생성하는 앵커 프라이머를 사용하여 수행할 수 있다[참조: 예를 들면, Ausubel et al. (eds.) CURRENT PROTOCOLS IN MOLECULAR BIOLOGY, John Wiley & Sons, 1992]. 또한, 이미 융합 잔기(예를 들면, GST 폴리펩타이드)를 암호화하는 많은 발현 벡터들이 시판되고 있다. 프로테아제-암호화 핵산은 이러한 발현 벡터내로 클로닝시킴으로써 융합 잔기를 프로테아제 단백질에 프레임내로 연결시킨다.
5. 뉴클레오타이드 서열
변형된 프로테아제를 암호화하는 핵산 분자가 본원에 제공된다. 핵산 분자는 특정의 암호화된 프로테아제 또는 이의 촉매적으로 활성인 부위의 대립유전자 변이체 또는 이의 스플라이스 변이체를 포함한다. 하나의 양태에서, 본원에 제공된 핵산 분자는 적어도 50, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 91, 92, 93, 94, 95 또는 99%의 서열 동일성을 갖거나 또는 야생형 프로테아제 또는 이의 촉매적으로 활성인 부위를 암호화한 특정의 핵산의 완전한 길이의 70% 이상을 따라 중간 또는 높은 엄중성의 조건하에서 하이브리드화된다. 다른 양태에서, 핵산 분자는 본원에 제공된 것과 같은 특정의 프로테아제 또는 이의 촉매적으로 활성인 부위의 축퇴 코돈 서열을 지닌 것들을 포함할 수 있다.
포유동물 세포내에서 발현을 위한 유도성 프로모터와 같은 작동가능하게 연결된 핵산 분자, 또는 핵산 분자의 촉매적으로 활성인 부위를 함유하는 융합 단백질이 또한 제공된다. 이러한 프로모터는 CMV 및 SV40 프로모터; HPV E7 종양단백질에 대해 반응성인 E2 유전자 프로모터와 같은 아데노바이러스 프로모터; PV E2 단백질에 대해 반응성인 PBV p89 프로모터와 같은 PV 프로모터; 및 HIV 또는 PV 또는 종양유전자에 의해 활성화된 다른 프로모터를 포함하나, 이에 한정되지 않는다.
본원에서 제공된 변형된 프로테아제는 유전자 전달 벡터내 세포에 전달될 수 있다. 전달 벡터는 또한 프로테아제가 투여되는 응고 질환 또는 암과 같은 질병 또는 질환 치료용의 추가의 다른 치료제를 암호화할 수 있다. 프로테아제를 암호화하는 전달 벡터는 핵산을 피검체에게 투여함으로써 전신적으로 사용할 수 있다. 예를 들어, 전달 벡터는 아데노바이러스 벡터와 같은 바이러스 벡터일 수 있다. 프로테아제를 암호화하는 벡터는 또한 줄기 세포 및 치료 부위에서 줄기 세포를 이식하거나 또는 접목시킴에 의해서와 같이 피검체에 투여된 이러한 줄기 세포내로 혼입될 수 있다. 예를 들어, 중간엽 줄기 세포(MSC)를 조작하여 프로테아제를 발현시킬 수 있으며 이러한 MSC는 치료요법을 위한 종양 부위에서 주입된다.
I. 선별된 프로테아제 폴리펩타이드의 제조, 제형 및 투여
1. 조성물 및 전달
예를 들면, 선택된 돌연변이 u-PA 폴리펩타이드와 같은 선별된 프로테아제의 조성물은 근육내, 정맥내, 피내, 복강내 주사, 피하, 경막외, 비강, 경구, 직장, 국소, 흡입, 구강(예: 설하) 및 경피 투여 또는 어떠한 경로를 포함하는 당해 분야의 숙련가에게 공지된 어떠한 경로에 의해 투여하기 위해 제형화할 수 있다. 선별된 프로테아제는 통상의 경로, 예를 들면, 주입 또는 일시 주사에 의해, 내피 또는 점막 내층(예: 경구 점막, 직장 및 장 점막 등)을 통한 흡수에 의해 투여할 수 있으며 다른 생물학적 활성제와 함께 연속적으로, 간헐적으로 또는 동일한 조성물로 투여할 수 있다. 투여는 투여 위치에 따라 국부, 국소 또는 전신계일 수 있다. 치료가 요구되는 부위로의 국부 투여는 예를 들면, 수술 동안 국부 주입, 국소 적용, 예를 들면, 수술 후 상처 드레싱과 함께, 주사에 의해, 카테터의 수단에 의해, 좌제의 수단에 의해, 또는 임플란트의 수단에 의해 달성할 수 있으며, 이에 한정되지 않는다. 투여는 또한 조절된 방출 제형 및 펌프의 수단에 의해서와 같은 방출이 조절된 장치를 포함하는 조절된 방출 시스템을 포함할 수 있다. 제공된 경우에서 가장 적합한 경로는 질병의 특성, 질병의 진행, 특정 조성물이 사용된 질병의 중증도에 따른다.
리포좀, 미세입자, 미세캡슐내 봉입, 화합물을 발현할 수 있는 재조합체 세포, 수용체 매개된 세포내이입 및 레트로바이러스 전달 시스템과 같이 선별된 프로테아제를 암호화하는 핵산의 전달을 포함하나, 이에 한정되지 않는 각종 전달 시스템이 공지되어 있으며 선별된 프로테아제를 투여하는데 사용될 수 있다.
선별된 프로테아제를 함유하는 약제학적 조성물이 제조될 수 있다. 일반적으로, 약제학적으로 허용되는 조성물은 동물 및 사람에서 사용하기 위해 일반적으로 인지된 약전에 따라 설립된 조절 기관 또는 기타 기관에서의 승인에 의해 제조된다. 약제학적 조성물은 이소형과 함께 투여되는 희석제, 보조제, 부형제 또는 비히클과 같은 담체를 포함할 수 있다. 이러한 약제학적 담체는 땅콩 오일, 대두 오일, 광 오일 및 참깨 오일과 같은 석유, 동물, 식물 또는 합성 기원의 것들을 포함하는 물 및 오일과 같은 멸균 액체일 수 있다. 물은, 약제학적 조성물이 정맥내 투여되는 경우 통상의 담체이다. 염수 용액 및 수성 덱스트로즈 및 글리세롤 용액을 또한 특히 주사가능한 용액을 위한 액체 담체로서 사용할 수 있다. 조성물은 활성 성분과 함께 다음 성분을 함유할 수 있다: 락토즈, 슈크로즈, 이칼슘 포스페이트 또는 카복시메틸셀룰로즈와 같은 희석제, 마그네슘 스테아레이트, 칼슘 스테아레이트 및 활석과 같은 윤활제; 및 전분, 검 아카시아젤라틴과 같은 천연 검, 글루코즈, 당밀, 폴리비닐피롤리돈, 셀룰로즈 및 이의 유도체, 포비돈, 크로스포비돈과 같은 결합제 및 당해 분야의 숙련가에게 공지된 다른 이러한 결합제. 적합한 약제학적 보조제는 전분, 글루코즈, 락토즈, 슈크로즈, 젤라틴, 맥아, 벼, 분말, 석회, 실리카 겔, 나트륨 스테아레이트, 글리세롤 모노스테아레이트, 활석, 염화나트륨, 건조된 탈지유, 글리세롤, 프로필렌, 글리콜, 물 및 에탄올을 포함한다. 경우에 따라, 조성물은 또한 미량의 습윤제 또는 유화제, 또는 pH 조절제, 예를 들면, 아세테이트, 나트륨 시트레이트, 사이클로덱스트린 유도체, 소르비탄 모노라우레이트, 트리에탄올아민 나트륨 아세테이트, 트리에탄올아민 올레이트 및 다른 이러한 제제를 함유할 수 있다. 이러한 조성물은 용액제, 현탁액제, 에멀젼제, 정제, 환제, 캡슐제, 산제 및 서방성 제형의 형태를 취할 수 있다. 조성물은 전통적인 결합제 및 트리글리세라이드와 같은 담체와 함께 좌제로서 제형화될 수 있다. 경구 제형은 약제학적 등급의 만니톨, 락토즈, 전분, 마그네슘 스테아레이트, 나트륨 사카린, 셀룰로즈, 마그네슘 카보네이트 및 기타 이러한 제제와 같은 표준 담체를 포함할 수 있다. 적합한 약제학적 담체의 예는 이. 더블유. 마틴(E. W. Martin)의 저서(참조: "Remington's Pharmaceutical Sciences")에 기술되어 있다. 이러한 조성물은 일반적으로 정제된 형태의 치료학적 유효량의 화합물과 함께 적절한 양의 담체를 포함함으로써 환자에 적절히 투여하기 위한 형태를 제공할 것이다. 제형은 투여 방식에 적합하여야 한다.
제형은 사람 및 동물에게 정제, 캡슐제, 환제, 산제, 입제, 멸균 비경구 액제 또는 현탁액제, 및 경구 용액제 또는 현탁액제, 및 적합한 양의 화합물 또는 이러한 화합물의 약제학적으로 허용되는 유도체를 함유하는 오일 수 에멀젼과 같은 단위 용량 형태로 제공된다. 약제학적으로 치료학적 활성인 화합물 및 이의 유도체는 단위 용량형 또는 다수 용량형으로 통상적으로 제형화되어 투여된다. 각각의 단위 투여량은 목적한 치료학적 효과를 생산하기에 충분한 예정된 양의 치료학적 활성 화합물과 함께 요구되는 약제학적 담체, 비히클 또는 희석제를 함유한다. 단위 투여량 형태의 예는 앰플 및 주사기 및 개별적으로 포장된 정제 또는 캡슐제를 포함한다. 단위 투여량 형태는 분획 또는 이의 다수로 투여될 수 있다. 다수의 투여량 형태는 분리된 단위 투여량 형태로 투여될 단일 용기속에 포장된 다수의 동일한 단위 용량형이다. 다수 투여량 형태의 예는 정제 또는 캡슐제의 바이알, 병, 또는 파인트 또는 갈론의 병을 포함한다. 따라서, 다수 투여량 형태는 포장시 격리되지 않은 다수의 단위 투여량이다.
무독성 담체로부터 제조된 평형을 지니며 0.005% 내지 100%의 범위의 활성 성분을 함유하는 용량 형 또는 조성물을 제조할 수 있다. 경구 투여를 위해, 약제학적 조성물은 예를 들면 결합제(예: 예비젤라틴화된 옥수수 전분, 폴리비닐 피롤리돈 또는 하이드록시프로필 메틸셀룰로즈); 충전재(예: 락토즈, 미세결정성 셀룰로즈 또는 칼슘 수소 포스페이트); 윤활제(예: 마그네슘 스테아레이트, 활석 또는 실리카); 붕해제(예: 감자 전분 또는 나트륨 전분 글리콜레이트); 또는 습윤제(예: 나트륨 라우릴 설페이트)와 같은 약제학적으로 허용되는 부형제를 사용하여 통상의 수단으로 제조된 예를 들면, 정제 또는 캡슐제의 형태를 취할 수 있다. 정제는 당해 분야에 익히 공지된 방법으로 피복시킬 수 있다.
약제학적 제제는 또한 액체 형태, 예를 들면, 액제, 시럽제 또는 현탁액제일 수 있거나, 또는 사용 전에 물 또는 기타 적합한 비히클로 재구성시키기 위한 약물 생성물로 제공될 수 있다. 이러한 액체 제제는 현탁화제(예: 소르비톨 시럽, 셀룰로즈 유도체 또는 할로겐화된 식용가능한 지방); 유화제(예: 레시틴 또는 아카시아); 비-수성 비히클(예: 알몬드 오일, 오일성 에스테르 또는 분획화된 식물 오일); 및 방부제(예: 메틸 또는 프로필-p-하이드록시벤조에이트 또는 소르브산)과 같은 약제학적으로 허용되는 첨가제를 사용하여 통상의 수단으로 제조할 수 있다.
직장 투여용으로 적합한 제형은 단위 투여량 좌제로 제공될 수 있다. 이들은 활성 화합물을 하나 이상의 통상의 고체 담체, 예를 들면, 코코아 버터와 혼합한 후, 수득되는 혼합물을 형상화하여 제조할 수 있다.
피부 또는 눈에 국소 적용하기에 적합한 제형은 연고제, 크림제, 로션제, 페이스트제, 겔제, 분무제, 에어로졸 및 오일을 포함한다. 대표적인 담체는 바셀린, 라놀린, 폴리에틸렌 글리콜, 알코올 및 이의 2개 이상의 배합물을 포함한다. 국소 제형은 또한 하이드록시프로필 메틸 셀룰로즈, 메틸 셀룰로즈, 폴리비닐피롤리돈, 폴리비닐 알코올, 폴리(알킬렌 글리콜), 폴히하이드록시알킬, (메트)아크릴레이트 또는 폴리(메트)아크릴아미드 중에서 선택된 0.05 내지 15, 20, 25 중량%의 증점제를 함유할 수 있다. 국소 제형은 흔히 흡입에 의해 또는 결막낭내로 연고로서 적용된다. 이는 또한 눈, 안면 동, 및 바깥귀길의 세척 또는 윤활화에 사용할 수 있다. 액체 상태의 국소 제형은 또한, 활성 성분을 방출하는 스트라이프 또는 콘택트렌즈 형태의 친수성 3차원 중합체 매트릭스로 존재할 수 있다.
흡입에 의한 투여를 위해, 본원에서 사용하기 위한 화합물은 가압 팩 또는 적합한 추진제, 예를 들면, 디클로로디플루오로메탄, 트리클로로플루오로메탄, 디클로로테트라플루오로에탄, 이산화탄소 또는 다른 적합한 가스를 사용한 분무기로부터의 에어로졸 분무 제시의 형태로 전달될 수 있다. 가압 에어로졸의 경우에, 용량 단위는 계량된 양을 전달하기 위한 밸브를 제공함으로써 측정할 수 있다. 흡입기 또는 취입기에서 사용하기 위한, 예를 들면 젤라틴의 캡슐 및 카트리지는 화합물 및 락토즈 또는 전분과 같은 적합한 분말 기재의 분말 혼합물을 함유하도록 제형화할 수 있다.
구강(설하) 투여에 적합한 제형은 예를 들면, 풍미된 기재, 일반적으로 슈크로즈 및 아카시아 또는 트라가칸트 속에 활성 화합물을 함유하는 로젠지제; 및 젤라틴 및 글리세린 또는 슈크로즈 및 아카시아와 같은 불활성 기재 속에 화합물을 함유하는 향정제를 포함한다.
선별된 프로테아제의 약제학적 조성물은 주사, 예를 들면, 일시 주사 또는 연속 주입에 의한 비경구 투여용으로 제형화할 수 있다. 주사용 제형은 단위 용량형, 예를 들면, 앰플 또는 다수-투여량 용기로 첨가된 방부제와 함께 제공될 수 있다. 조성물은 오일 또는 수성 비히클 중 현탁액, 용액 또는 에멀젼일 수 있으며 현탁화제, 안정화제 및/또는 분산화제와 같은 제형화제를 함유할 수 있다. 또는, 활성 성분은 사용 전에 적합한 비히클, 예를 들면, 발열원이 없는 멸균수 또는 기타 용매로 재구성시키기 위한 분말 형태일 수 있다.
경피 투여에 적합한 제형이 제공된다. 이들은 장기간 동안 수용체의 상피와 긴밀하게 접촉하도록 채택된 별개의 패취와 같은 어떠한 적합한 형태로도 제공될 수 있다. 이러한 패취는 활성 성분을 임의로 예를 들면, 활성 화합물과 관련하여 0.1 내지 0.2M 농도의 완충된 수용액 속에 함유한다. 경피 투여에 적합한 제형은 또한 이온삼투용법에 의해 전달될 수 있으며[참조: 예를 들면, Pharmaceutical Research 3(6), 318 (1986)] 활성 화합물의 임의로 완충액 수용액의 형태를 취할 수 있다.
약제학적 조성물은 또한 방출이 조절된 제형 및/또는 전달 장치로 투여될 수 있다(참조: 예를 들면, 미국 특허 제3,536,809호; 제3,598,123호; 제3,630,200호; 제3,845,770호; 제3,847,770호; 제3,916,899호; 제4,008,719호; 제4,687,610호; 제4,769,027호; 제5,059,595호; 제5,073,543호; 제5,120,548호; 제5,354,566호; 제5,591,767호; 제5,639,476호; 제5,674,533호 및 제5,733,566호).
특정 양태에서, 리포좀 및/또는 나노입자를 또한 선별된 프로테아제 투여에 사용할 수 있다. 리포좀은 수성 매질 속에 분산되고 동시에 다층라멜라 중심 이중층 비히클[다층라멜라 비히클(MLV)로 명명]을 형성하는 인지질로부터 형성된다. MLV은 일반적으로 직경이 25 nm 내지 4 ㎛이다. MLV의 초음파처리는 코어내에 수용액을 함유하는 200 내지 500 옹스트롬 범위의 작은 단일라멜라 비히클(SUV)의 형성을 초래한다.
인지질은 물 속에 분산되는 경우, 물에 대한 지질의 몰 비에 따라서 인지질외에 다양한 구조를 형성할 수 있다. 낮은 비율에서, 인지질이 형성된다. 리포좀의 물리적 특성은 pH, 이온 농도 및 2가 양이온의 존재에 의존한다. 리포좀은 이온성 및 극성 물질에 대한 침투능이 낮을 수 있으나, 승온에서 이들의 침투능을 현저히 변경시키는 상 전이를 겪는다. 상 전이는 겔 상태로 공지된, 밀접하게 패킹된 정령된 구조로부터 유동 상태로 공지된 느슨하게 패킹된 거의 정렬되지 않은 구조로의 변화를 포함한다. 이는 특징적인 상 전이 온도에서 일어나며 이온, 당 및 약물에 대한 침투능에 있어서의 증가를 초래한다.
리포좀은 상이한 기전: 즉 대식세포 및 호중구와 같은 세망세피계의 대식세포에 의한 세포내이입; 비특이적인 약한 소수성 또는 정전기력에 의해 또는 세포-표면 성분들과의 특이적인 상호작용에 의해 세포 표면으로의 부착; 리포좀의 지질 이중층의 혈장 막으로의 삽입과 리포좀 내용물의 세포질내로의 동시 방출에 의한 혈장 세포막과의 융합; 및 리포좀 성분의 어떠한 연합없이, 리포좀 지질의 세포 또는 아세포 막으로의 전달 또는 이의 역을 통해 세포화 상호작용한다. 리포좀 제형을 변화시킴으로써, 비록 하나 이상이 동시에 작동될 수 있다고 하더라도, 기전이 작동적이 되도록 변경시킬 수 있다. 나노캡슐은 일반적으로 안정하고 재생적인 방식으로 화합물을 포착할 수 있다. 세포내 중합체성 과부하로 인한 부작용을 피하기 위하여, 이러한 초미세 입자(0.1㎛ 주변의 크기)를 생체내에서 분해될 수 있는 중합체를 사용하여 설계할 수 있다. 이들 요건들을 만족시키는 생분해가능한 폴리알킬-시아노아크릴레이트 나노입자가 본원에서 사용하기 위해 고려되며, 이러한 입자는 용이하게 제조할 수 있다.
투여 방법은 단백질분해적 붕해와 같은 붕해 과정 및 항원 및 면역원성 반응을 통한 면역학적 중재에 대해 선별된 프로테아제의 노출을 감소시키도록 사용할 수 있다. 이러한 방법의 예는 치료 부위에서의 국소 투여를 포함한다. 치료제의 페길화는 단백질분해에 대한 내성을 증가시키고, 혈장 반감기를 증가시키며, 항원성 및 면역원성을 감소시키는 것으로 보고되어 있다. 페길화 방법의 예는 당해 분야에 공지되어 있다[참조: 예를 들면, Lu and Felix, Int. J. Peptide Protein Res., 43: 127-138, 1994; Lu and Felix, Peptide Res., 6: 142-6, 1993; Felix et al., Int. J. Peptide Res., 46 : 253-64, 1995; Benhar et al., J. Biol. Chem., 269: 13398-404, 1994; Brumeanu et al., J Immunol., 154: 3088-95, 1995; 또한, 참조: Caliceti et al. (2003) Adv. Drug Deliv. Rev. 55(10):1261-77 및 Molineux (2003) Pharmacotherapy 23 (8 Pt 2):3S-8S]. 페길화는 또한 생체내에서 핵산 분자의 전달에 사용할 수 있다. 예를 들어, 아데노바이러스의 페길화는 안정성 및 유전자 전달을 증가시킬 수 있다[참조: 예를 들면, Cheng et al. (2003) Pharm. Res. 20(9): 1444-51].
바람직한 혈액 수준은 혈장 수준에 의해 추정된 것으로서 활성제의 연속적 주입으로 유지시킬 수 있다. 주치의는 독성, 골수, 간 또는 신장 기능부전에 기인하여 치료요법을 보다 낮은 용량으로 종결시키거나, 중지시키거나 또는 조절하는 방법 및 시기를 인지할 수 있음은 주지하여야 한다. 역으로, 주치의는 또한, 임상 반응이 적절하지 않은 경우(독성 부작용은 제외) 보다 높은 수준으로 치료를 조절하는 방법 및 시기를 또한 인지할 것이다.
약제학적 조성물은 예를 들면, 경구, 폐, 비경구(근육내, 복강내, 정맥내(IV) 또는 피하 주사), 흡입(미세 분말 제형), 경피, 비강, 질, 직장 또는 설하 투여 경로로 투여할 수 있으며 각각의 투여 경로에 적절한 용량형으로 제형화할 수 있다[참조: 예를 들면, 국제 PCT 특허원 제WO 93/25221호 및 제WO 94/17784호; 및 유럽 특허원 제613,683호).
선별된 프로테아제는 약제학적으로 허용되는 담체 속에 치료된 환자에 바람직하지 않은 부작용의 부재하에서 치료학적으로 유용한 효과를 발휘하기에 충분한 양으로 포함된다. 치료학적으로 효과적인 농도는 화합물을 공지된 시험관내 및 생체내 시스템 속에서 본원에 제공된 검정과 같이 시험함으로써 실험적으로 측정할 수 있다.
조성물중 선별된 프로테아제의 농도는 복합체의 흡수, 불활성화 및 배출률, 복합체의 물리화학적 특성, 용량 스케줄 및 투여된 양 및 당해 분야의 숙련가에게 공지된 기타 인자들에 따른다. 질병 또는 상태, 예를 들면, 암 또는 혈관신생 치료를 위해 투여될 선별된 프로테아제의 양은 표준 임상 기술로 측정할 수 있다. 또한, 시험관내 검정 및 동물 모델을 사용하여 최적 용량 범위를 확인하는데 도움을 줄 수 있다. 실험적으로 측정할 수 있는 정확한 용량은 투여 경로 및 질병의 중증도에 의존할 수 있다.
선별된 프로테아제는 시간 간격으로 투여될 작은 투여량의 수로 나누거나 또는 한번에 투여할 수 있다. 선별된 프로테아제는 치료 과정에 걸쳐, 예를 들면, 수시간, 수일, 수주 또는 수개월에 걸쳐 1회 이상의 투여량으로 투여할 수 있다. 일부 경우에, 연속 투여가 유용하다. 치료의 정확한 용량 및 경과는 치료되는 질병의 함수이며 생체내 또는 시험관내 시험 데이터로부터 외삽에 의해 또는 공지된 시험 프로토콜을 사용하여 실험적으로 측정할 수 있다. 농도 및 용량 값은 또한 완화시킬 상태의 중증도에 따라 변화시킬 수 있음에 주목하여야 한다. 또한 특정 개인에 대해, 특정 용량 처방을 개개인의 요구도 및 화합물을 투여하거나 화합물 투여를 감독하는 사람의 전문적인 판단에 따라 시간에 걸쳐 조절되어야 하고, 본원에 제시된 농도 범위는 단지 예시이며 이들을 함유하는 조성물 및 배합물의 범위 또는 용도를 제한하는 것으로 의도되지 않음을 이해하여야 한다. 조성물은 시간마다. 매일, 매주, 매달, 매년 또는 1회 투여할 수 있다. 폴리펩타이드를 함유하는 조성물 및 유전자 치료요법을 위한 핵산을 함유하는 조성물의 투여 방식은 병변내, 복강내, 근육내 및 정맥내 투여를 포함하나, 이에 한정되지 않는다. 또한, 주입, 경막내, 피하, 리포좀-매개된, 데포트-매개된 투여가 포함된다. 또한, 비강, 안구, 경구, 국소, 국부 및 귀 전달이 포함된다. 용량은 실험적으로 측정될 수 있으며, 지시, 투여 방식 및 피검체에 의존한다. 대표적인 용량은 피검체의 체중 kg당 하루에 0.1, 1, 10, 100, 200mg 이상을 포함한다.
2. 선별된 프로테아제의 생체내 발현 및 유전자 치료
선별된 프로테아제는 세포 및 조직으로 핵산 분자의 발현에 의해 전달할 수 있다. 선별된 프로테아제는 생체외 기술 및 직접적인 생체내 발현을 포함하는, 선별된 프로테아제를 암호화하는 핵산 분자로서 투여할 수 있다.
a. 핵산의 전달
핵산은 세포 및 조직에 당해 분야의 숙련가에게 공지된 어떠한 방법으로도 전달할 수 있다.
i. 벡터 - 에피좀 및 통합
암호화된 핵산 분자의 발현에 의해 선별된 프로테아제를 투여하는 방법은 재조합체 벡터의 투여를 포함한다. 벡터는 복제 오리진의 포함에 의해 에피좀에 잔존하도록 설계하거나, 또는 세포내 염색체내로 통합되도록 설계할 수 있다. 재조합체 벡터는 바이러스 벡터 및 비-바이러스 벡터를 포함할 수 있다. 비제한적인 바이러스 벡터는 예를 들면, 아데노바이러스 벡터, 헤르페스 바이러스 벡터, 레트로바이러스 벡터 및 당해 분야의 숙련가에게 공지된 다른 어떠한 바이러스 벡터를 포함한다. 비제한적인 비-바이러스 벡터는 인공 염색체 또는 리포좀 또는 다른 비-바이러스 벡터를 포함한다. 선별된 프로테아제는 또한 생체외 유전자 발현 치료요법에서 바이러스 및 비-바이러스 벡터로 사용할 수 있다. 예를 들어, 세포는 선별된 프로테아제-암호화 핵산을 게놈 위치내로 조절 서열에 작동가능하게 연결시키거나, 이것이 게놈 위치내에서 조절 서열에 작동가능하게 연결되도록 위치하도록 함으로써 선별된 프로테아제를 발현하도록 조작할 수 있다. 이후에, 이러한 세포를 치료가 요구되는 환자와 같은 피검체내에 국소적으로 또는 전신적으로 투여할 수 있다.
선별된 프로테아제는 치료가 요구되는 피검체에게 투여된 바이러스에 의해 발현될 수 있다. 유전자 치료요법에 적합한 바이러스 벡터는 아데노바이러스, 아데노-관련 바이러스, 레트로바이러스, 렌티바이러스 및 위에 나타낸 다른 것들을 포함한다. 예를 들어, 아데노바이러스 발현 기술은 당해 분야에 익히 공지되어 있으며 아데노바이러스 생산 및 투여 방법 또한 익히 공지되어 있다. 아데노바이러스 혈청형은 예를 들면, 아메리칸 타입 컬쳐 컬렉션(American Type Culture Collection: ATCC, 매릴랜드주 록크빌 소재)로부터 이용가능하다. 아데노바이러스는 생체외에서 사용될 수 있는데, 예를 들면, 세포를 치료가 요구되는 환자로부터 분리하여, 선별된 프로테아제-발현 아데노바이러스 벡터를 사용하여 형질유도시킬 수 있다. 적합한 배양 기간 후에, 형질유도된 세포를 피검체에게 국소적으로 및/또는 전신적으로 투여한다. 또는, 선별된 프로테아제-발현 아데노바이러스 입자를 분리하여 피검체의 질병 또는 상태를 예방하거나, 치료하거나 또는 완화시키기 위한 치료학적 유효량으로 전달용의 약제학적으로 허용되는 담체속에 제형화한다. 통상적으로, 아데노바이러스 입자는 피검체 kg당 1개 입자 내지 1014개 입자, 일반적으로 피검체 체중당 106 또는 108개 입자 내지 1012개 입자의 범위의 투여량으로 전달된다. 일부 상황에서, 핵산 공급원과 세포 표면 막 단백질 또는 표적 세포에 대해 특이적인 항체, 또는 표적 세포상에서 수용체에 대한 리간드와 같이 세포를 표적화하는 제제와 함께 제공하는 것이 바람직하다.
ii . 인공 염색체 및 기타 비-바이러스 벡터 전달 방법
핵산 분자는 인공 염색체 및 다른 비-바이러스 벡터내로 도입시킬 수 있다. 인공 염색체(참조: 미국 특허 제6,077,697호 및 제PCT 국제 특허원 제WO 02/097059호)를 조작하여 이소형을 암호화하고 발현하도록 할 수 있다.
iii . 리포좀 및 기타 캡슐화된 형태 및 핵산 함유 세포의 투여
핵산은 리포좀과 같은 비히클내로 봉입시키거나, 또는 세균 세포, 특히 약독화시킨 세균과 같은 세포내로, 또는 바이러스 벡터내로 도입시킬 수 있다. 예를 들어, 리포좀이 사용되는 경우, 세포내이입과 관련된 세포 표면 막 단백질에 결합하는 단백질을 예를 들면 특정 세포 유형에 대해 향성인 캡시드 단백질 또는 이의 단편, 주기에서 내부화를 겪는 단백질, 및 세포내 국재화를 표적화하고 세포내 반감기를 향상시키는 단백질에 대한 항체를 표적화하고/하거나 흡수를 촉진시키는데 사용할 수 있다.
b. 시험관내 및 생체외 전달
생체외 및 생체내 방법을 위해, 선별된 프로테아제를 암호화하는 핵산 분자를 적합한 공여자 또는 치료할 피검체로부터의 세포내로 도입시킨다. 핵산이 치료 목적으로 도입될 수 있는 세포는 예를 들면, 경우에 따라, 상피 세포, 내피 세포, 각질 세포, 섬유아세포, 근육 세포, 간세포; T 림프구, B 림프구, 단핵구, 대식세포, 호중구, 호산구, 거대핵세포, 과립구와 같은 혈액 세포; 각종 줄기 또는 전구 세포, 특히 예를 들면 골수, 제대혈, 말초 혈액, 태아 간 및 이의 다른 공급원으로부터 수득된 줄기 세포와 같은 조혈 줄기 또는 전구 세포를 포함하나 이에 한정되지 않는, 치료할 질병 또는 상태에 적합한 이용가능한 세포 유형을 포함한다.
생체외 치료를 위해, 치료할 피검체와 혼용인 공여자로부터의 세포, 또는 치료할 피검체로부터의 세포를 제거하고, 핵산을 이들 분리된 세포내로 도입하고, 변형된 세포를 피검체에게 투여한다. 치료는 예를 들면, 환자에게 이식되는 다공성 막내 봉입시키는 것과 같은 직접 투여를 포함한다(참조: 미국 특허 제4,892,538호 및 제5,283,187호). 핵산을 포유동물 세포내로 시험관내에서 전달하기에 적합한 기술은 리포좀 및 양이온성 지질(예를 들면, DOTMA, DOPE 및 DC-Chol) 전기천공, 미세주사, 세포 융합, DEAE-덱스트란 및 칼슘 포스페이트 침전 방법의 사용을 포함한다. DNA 전달 방법을 사용하여 생체내에서 선별된 프로테아제를 발현시킬 수 있다. 이러한 방법은 전기천공, 초음파 및 칼슘 포스페이트 전달을 사용하는 것과 같은 국소 및 전신계 전달을 포함하는, 핵산의 리포좀 전달 및 노출된 DNA 전달을 포함한다. 다른 기술은 미세주사, 세포 융합, 염색체 매개된 유전자 전달, 미세세포-매개된 유전자 전달 및 스페로플라스트(spheroplast) 융합을 포함한다.
선별된 프로테아제의 생체내 발현은 추가의 분자의 발현과 연결시킬 수 있다. 예를 들어, 선별된 프로테아제의 발현은 조작된 바이러스내에서와 같은 세포독성 생성물의 발현과 연결시키거나, 또는 세포독성 바이러스내에서 발현시킬 수 있다. 이러한 바이러스는 치료 효과에 대해 표적화하는 특정 세포 유형에 대해 표적화될 수 있다. 발현되고 선별된 프로테아제를 사용하여 바이러스의 세포독성을 향상시킬 수 있다.
선별된 프로테아제의 생체내 발현은 선별된 프로테아제 암호화 핵산 분자를 세포-특이적 또는 조직-특이적 프로모터와 같은 특이적 조절 서열에 작동가능하게 연결시킴을 포함할 수 있다. 선별된 프로테아제는 또한 표적 세포 유형 및/또는 조직내에서 특이적으로 감염시키고/시키거나 복제하는 벡터로부터 발현될 수 있다. 유도성 프로모터를 사용하여 선별된 프로테아제 발현을 선택적으로 조절할 수 있다.
c. 전신, 국부 및 국소 전달
벡터, 인공 염색체, 리포좀 및 기타 비히클내 노출된 핵산과 같은 핵산 분자는 피검체에게 전신계 투여, 국소, 국부 및 다른 투여 경로로 투여할 수 있다. 전신계 및 생체내의 경우, 핵산 분자 또는 핵산 분자를 함유하는 비히클은 세포에 대해 표적화될 수 있다.
투여는 또한 세포 또는 조직을 대표적으로 표적하는 벡터 또는 세포의 투여과 같이 직접적일 수 있다. 예를 들어, 종양 세포 및 증식 세포는 선별된 프로테아제의 생체내 발현을 위해 표적화된 세포일 수 있다. 이소형의 생체내 발현에 사용된 세포는 또한 환자에 대해 자가인 세포를 포함한다. 이러한 세포는 환자로부터부 제거하고, 선별된 프로테아제의 발현용 핵산을 도입한 후 환자에게 주사 또는 이식에 의해 투여할 수 있다.
2. 병용 치료
어떠한 선별된 프로테아제 폴리펩타이드 및 본원에 기술된 선별된 프로테아제 폴리펩타이드를 암호화하는 핵산 분자를 다른 생물학적, 소 분자 화합물 및 수술을 포함하나, 이에 한정되는 않는 다른 치료제 또는 과정과 함께, 전에, 간헐적으로 또는 연속해서 투여할 수 있다. 다른 제제 및 치료가 이용가능한 위에서 예시한 모든 것들을 포함하는 특정 질병 또는 조건의 경우, 이러한 질병 및 상태에 대한 선별된 프로테아제 폴리펩타이드를 이와 함께 사용할 수 있다. 예를 들어, 암과 같은 증식병을 치료하기 위해 예를 들면, 본원에 제공된 선별된 프로테아제 폴리펩타이드는 다른 항암 치료제, 예를 들면, 화학치료제, 방사선핵종, 조사 치료요법, 사이토카인, 성장 인자, 광감작화제, 독소, 항-대사산물, 시그날링 조절인자, 항암 항생제, 항암 항체, 혈관신생 억제제 또는 이의 조합과 함께, 전에, 간헐적으로 또는 후속적으로 투여할 수 있다. 특정 실시예에서, 혈전 질환의 치료를 위해 본원에 제공된 선별된 프로테아제 폴리펩타이드는 혈소판 억제제, 혈관확장인자, 섬유소분해 활성화인자 또는 기타 항응고제를 포함하나, 이에 한정되지 않는 다른 항응고제와 함께, 전에, 간헐적으로, 또는 후속적으로 투여할 수 있다. 대표적인 항응고제는 헤파린, 쿠마린, 히루딘, 아스피린, 나프록센, 메클로페남산, 이부프로펜, 인도메타신, 페닐부타자레, 티클로피딘, 스트렙토키나제, 우로키나제 및 조직 플로스미노겐 활성인자를 포함한다.
3. 제품 및 키트
선별된 프로테아제 폴리펩타이드를 암호화하는 핵산 또는 이의 유도체 또는 생물학적으로 활성인 부위에 대한 선별된 프로테아제 폴리펩타이드의 약제학적 화합물은 포장재, 질병 또는 질환의 치료에 효과적인 약제학적 조성물, 및 선별된 프로테아제 폴리펩타이드 또는 핵산 분자가 질병 또는 질환을 치료하는데 사용됨을 지시하는 표지를 함유하는 제품으로서 포장할 수 있다.
본원에 제공된 제품은 포장재를 함유한다. 약제학적 제품을 포장하는데 사용하기 위한 포장재는 당해 분야의 숙련가에 익히 공지되어 있다(참조: 각각 이의 전문이 본원에 참조로 인용된 미국 특허 제5,323,907호, 제5,052,558호 및 제5,033,252호). 약제학적 포장재의 예는 블리스터 팩, 병, 튜브, 흡입기, 펌프, 백, 바이알, 용기, 주사기, 병 및 선택된 제형 및 의도된 투여 및 치료 유형에 적합한 특정 포장재를 포함하나, 이에 한정되지 않는다. 본원에 제공된 화합물 및 조성물의 조성물의 광범위한 배열은 특정의 표적-매개된 질병 또는 질환의 다양한 치료인 것으로 고려된다.
선별된 프로테아제 폴리펩타이드 및 핵산 분자는 또한 키트로서 제공될 수 있다. 키트는 본원에 기술된 약제학적 조성물 및 투여 항목을 포함할 수 있다. 예를 들어, 선별된 프로테아제는 주사기, 흡입기, 용량 컵, 점적기 또는 적용기와 같은 투여 장치와 함께 공급될 수 있다. 키트는 임의로 용량, 투여 방법 및 투여 방식에 대한 지시를 포함하는 적용 지시를 포함할 수 있다. 키트는 또한 본원에 기술된 약제학적 조성물 및 진단 항목을 포함할 수 있다. 예를 들면, 이러한 키트는 피검체내에서 선별된 프로테아제의 농도, 양 또는 활성을 측정하기 위한 항목을 포함할 수 있다.
J. 선별된 프로테아제 폴리펩타이드를 사용한 대표적인 치료 방법
본원에 제공된 선별된 프로테아제를 암호화하는 특수 표적 및 핵산 분자를 절단하는 본원에 제공된 선별된 프로테아제 폴리펩타이드를, 표적 서열을 절단하는 프로테아제가 사용되거나 또는 표적 서열을 함유하는 단백질과 연관된 특정 질병 또는 상태를 치료하는데 사용할 수 있다. 예를 들어, 플라스미노겐과 같은 tPA 표적을 절단하도록 조작된 선택된 uPA 폴리펩타이드를 tPA 표적 기질과 연관되거나 또는 tPA 폴리펩타이드가 사용된 질병 또는 상태의 치료에 사용할 수 있다. tPA 표적 기질과 연관된 대표적인 질병은 혈전용해 질환을 포함하며, 여기서, 본원에 제공된 선별된 프로테아제를 사용한 치료는 플라스미노겐의 이의 활성 프로테아제 형태인 플라스민으로의 절단을 촉진하고, 응고의 용해를 유도할 수 있다.
선별된 프로테아제 폴리펩타이드는 단독으로 또는 다른 제제와 함께 치료학적 활성을 갖는다. 본원에 제공된 선별된 프로테아제 폴리펩타이드는 경쟁하는 결합 단백질보다 개선된 특성을 나타내도록 설계된다. 이러한 특성은, 예를 들면, 폴리펩타이드의 치료학적 효능을 개선시킬 수 있다. 본 단락은 이의 대표적인 용도 및 투여 방법을 제공한다. 이들 기술된 치료요법은 선별된 프로테아제 폴리펩타이드의 적용의 예이며 이에 한정되지 않는다.
본원에서 제공된 선별된 프로테아제 폴리펩타이드는 표적 서열을 함유하는 단백질과 연관된 각종 치료 및 진단 방법에 사용될 수 있다. 이러한 방법은 하기 기술되고 나열된 생리학적 및 의학적 상태의 치료방법을 포함하나, 이에 한정되지 않는다. 본원에서 제공된 선별된 프로테아제 폴리펩타이드는 경쟁하는 결합 프로테아제 또는 동일한 효과, 보다 지속적인 치료학적 효과 및 투여 및 치료에 있어서 다른 개선점을 달성하기 위한 보다 적은 용량을 포함하는 특정 표적을 절단하는 프로테아제와 비교하여 생체내 활성 및 치료학적 효과의 개선을 나타낼 수 있다. 선별된 프로테아제 폴리펩타이드를 사용한 치료학적 개선의 예는 보다 우수한 표적 조직 침투(예: 종양 침투), 보다 높은 효능, 보다 낮은 용량, 보다 적고/적거나 아주 적은 투여 빈도, 감소된 부작용 및 증가된 치료학적 효과를 포함하나, 이에 한정되지 않는다. 놀랍게도, 선별된 프로테아제는 다수의 표적 기질을 절단하고 불활성화시킬 수 있으므로, 선별된 프로테아제는 실질적인 치료학적 증폭을 제공한다.
특히, 선별된 프로테아제 폴리펩타이드는 치료학적 방법에서 사용하도록 의도되며, 여기서, 특정 표적을 절단하는 프로테아제가 치료에 사용된다. 이러한 방법은 혈전 질환 및 파종 혈관내응고를 포함하는 혈액 응고 질환, 심혈관병, 신경학적 질환, 암과 같은 증식성 질병, 염증병, 자가면역병, 바이러스 감염, 세균 감염, 호흡기병, 위장 질환 및 대사병과 같은, 그러나 이에 한정되지 않는 질병 및 질환의 치료방법을 포함하나, 이에 한정되지 않는다.
선별된 프로테아제 폴리펩타이드를 사용한 질병 및 상태의 치료는 근육내, 정맥내, 피내, 복강내 주사, 피하, 복강외, 비강, 경구, 직장, 국소, 흡입, 구강(예: 설하) 및 경피 투여를 포함하나, 이에 한정되지 않는 본원에 기술된 바와 같은 적합한 제형을 사용하여 어떠한 적합한 투여 경로에 의해서도 수행할 수 있다. 경우에 따라, 특정 용량 및 경과기간 및 치료 프로토콜을 실험적으로 측정하거나 외삽할 수 있다. 예를 들어, 유사한 서열을 절단하는 야생형 프로테아제 폴리펩타이드의 대표적인 투여량을 출발점으로 사용하여 적절한 용량을 결정할 수 있다. 예를 들어, 재조합체 tPA 폴리펩타이드의 용량은 tPA 표적을 절단하는 선택된 uPA 폴리펩타이드의 용량을 결정하기 위한 기준으로서 사용할 수 있다.
용량 수준 및 방법은 공지된 용량 및 방법을 기준으로 측정할 수 있으며, 경우에 따라 선별된 프로테아제 폴리펩타이드의 특성에 있어서의 변화를 기준으로 외삽하고/하거나 각종 인자를 기준으로 실험적으로 측정할 수 있다. 다른 유사한 프로테아제와 비교하여 선별된 프로테아제 폴리펩타이드의 활성 수준 및 반감기와 같은 인자를 이러한 측정인자를 작성하는데 사용할 수 있다. 특정 용량 및 방법을 경험적으로 측정할 수 있다. 다른 이러한 인자들은 개체의 체중, 일반적인 건강, 연령, 사용된 특수 화합물의 활성, 성별, 식이, 투여 시간, 배출률, 약물 조합, 질병의 중증도 및 경과 및 환자의 질병에 대한 성향 및 치료하는 주치의의 판단을 포함한다. 활성 성분인, 선별된 프로테아제 폴리펩타이드는 대표적으로 약제학적으로 효과적인 담체와 조합된다. 담체 물질과 조합하여 단일 용량형 또는 다중 용량형을 생산할 수 있는 활성 성분의 양은 치료된 숙주 및 특정 투여 방식에 따라 변할 수 있다.
질병의 치료 또는 질병의 증상의 완화시 선별된 프로테아제 폴리펩타이드의 효과는 치료할 특수 질병에 대한 당해 분야에 공지된 어떠한 진단 시험을 사용하여서도 모니터할 수 있다. 환자의 상태의 개선시, 유지 투여량의 화합물 또는 조성물을 투여할 수 있고; 경우에 따라, 용량, 투여형, 또는 투여 횟수, 또는 이의 조합을 변형시킬 수 있다. 일부 경우에, 피검체는 질병 증상의 어떠한 재발시 또는 계획된 용량을 기준으로 하여 장기간 기준으로 간헐적인 치료를 요구할 수 있다. 다른 경우에, 추가의 투여가 출혈, 외상 또는 외과 수술과 같은 급성 사태에 대한 반응시 요구될 수 있다.
일부 예에서, 프로테아제 효능제(즉, 모사체) 또는 프로테아제 길항제로서 작용하는 선별된 프로테아제 단백질의 변이체가 사용된다. 선별된 프로테아제 폴리펩타이드의 변이체는 돌연변이유발(예: 별개의 점 돌연변이 또는 프로테아제 단백질의 절두(truncation))에 의해 생성시킬 수 있다. 선별된 프로테아제 폴리펩타이드의 효능제는 실질적으로 동일하게 유지되거나, 또는 선별된 프로테아제 폴리펩타이드의 천연적으로 존재하는 형태의 생물학적 활성의 서브세트로 유지될 수 있다. 선별된 프로테아제 폴리펩타이드의 길항제는 예를 들면, 동일한 표적 단백질을 선별된 프로테아제 폴리펩타이드로서 절단함으로써 선별된 프로테아제 폴리펩타이드의 천연적으로 존재하는 형태의 하나 이상의 활성을 억제할 수 있다. 따라서, 특수 생물학적 효과가 제한된 작용의 변이체를 사용한 치료에 의해 유발될 수 있다. 하나의 양태에서, 선별된 프로테아제 폴리펩타이드의 천연적으로 존재하는 생물학적 활성의 서브세트를 갖는 변이체를 사용한 피검체의 치료는 선별된 프로테아제 폴리펩타이드의 천연적으로 존재하는 형태를 사용한 치료와 관련하여 피검체에서 보다 적은 부작용을 갖는다.
다음은 선별된 프로테아제가 단독으로 또는 다른 제제와 함께 치료제로서 사용될 수 있는 일부 대표적인 질병 또는 상태이다. 프로테아제의 선택을 위한 대표적인 표적은 나열의 목적이며 본원에 제공한 방법에서 사용하기 위한 가능한 표적의 영역을 제한하는 것으로 의도되지 않는다.
1. tPA 표적을 절단하는 선별된 uPA 폴리펩타이드에 대한 대표적인 치료 방법
tPA 표적 서열을 절단하는 선택된 uPA 폴리펩타이드는 급성 및 만성 상태 둘다를 포함하는 혈전 질환을 완화시키는데 사용하기 위한 치료학적 적용시 유용하다. 급성 상태는 다른 것들 중에서도 심장 발작 및 졸중 둘다를 포함하는 반면 만성 상태는 동맥 및 심정맥 혈전증 및 재협착 상태를 포함한다. 선택된 uPA 폴리펩타이드는 이러한 상태들을 완화시키기 위한 혈전용해 치료제로서 사용할 수 있다. 치료학적 조성물은 폴리펩타이드, cDNA 분자 단독, 또는 리포좀 전달 시스템 등에 나타난 바이러스 벡터 전달 시스템 또는 기타 벡터-기반 유전자 발현 전달 시스템의 일부를 포함한다. 혈전용해 치료제로서 사용하기 위한 조성물은 일반적으로 약제학적으로 적합한 부형제중에 선택된 uPA 폴리펩타이드의 생리학적으로 효과적인 양이다. 투여 방식 및 치료될 상태에 따라서, 혈전분해 치료제를 단일 또는 다수 투여량으로 투여한다. 당해 분야의 숙련가는, 용량에 있어서의 변화가 치료될 상태에 의존함에 익숙할 것이다.
혈액 응고를 억제하거나 또는 길항하는 본원에 제공된 선택된 uPA 폴리펩타이드는 말초 혈액 질환, 폐 색전, 정맥 혈전증, 신정맥 혈전증(DVT), 얕은 혈전성정맥염(SVT), 동맥 혈전증, 심근 경색증, 일시적인 허혈성 발작, 불안정성 협심증, 가역적인 허혈성 신경학적 결핍, 보조적인 혈전용해 활성, 과도한 응고 상태, 재관류 손상, 겸형적혈구빈혈 또는 졸중 질환과 같은 허혈성 질환의 항응고 치료방법에 사용할 수 있다. DVT 또는 SVT와 같은 과도한 응고의 위험이 증가되어 있는 환자에 있어서, 수술중에, 본원에서 제공된 프로테아제 불활성의 선택된 uPA 폴리펩타이드를 투여하여 심장 수술, 혈관성형술, 폐 수술, 복부 수술, 척추 수술, 뇌 수술, 혈관 수술 또는 심장, 폐, 췌장 또는 간의 이식을 포함하는 기관 이식 수술과 같은, 그러나 이에 제한되지 않는 수술에서 과도한 응고를 방지하기 위해 투여될 수 있다. 일부 경우에 치료는 선택된 uPA 폴리펩타이드 단독을 사용하여 수행한다. 일부 경우에, 선택된 uPA 폴리펩타이드는 치료할 상태 또는 질병에 의해 요구되는 것으로서 추가의 항응고 인자와 함께 투여된다.
tPA는 식품의약국(FDA)에 의해 승인된 급성 혈전색전증성 졸중용의 유일한 치료제이다. tPA 및 이의 변이체는 시판되고 있으며 각종 상태의 경우 사람에게 투여하는 것이 승인되었다. 예를 들면, 알테플라제[Activase®, 제조원: 캘리포니아주 사우쓰 샌프란시스코 소재의 제넨테크(Genentech)]는 재조합체 사람 tPA이다. 레테플라제[Retavase®, Rapilysin®; 제조원: 제조원: 베링거 만하임(Boehringer Mannheim), 제조원: 로슈 센토로르(Roche Centoror)]는 사람 tPA의 재조합체 비-글리코실화 형태이며, 여기서, 분자는 원래의 단백질의 527개 아미노산 중 355개를 함유하도록 유전적으로 조작된다. 테넥테플라제[TNKase®, 제넨테크)는 천연적으로 존재하는 사람 tPA와는 3개의 아미노산 치환을 가짐에 의해 상이한 사람 tPA의 527개 아미노산 당단백질이다. 이들 치환은 혈장 제거율을 감소시키고, 피브린 결합을 증가시키며(이에 의해 피브린 특이성을 증가시킴), 플라스미노겐 활성인자 억제제-1(PAI-1)에 대한 내성을 증가시킨다. 아니스트레플라제[Eminase®, 제조원: 비참 소재의 스미쓰클라인(SmithKline)]은 또 다른 시판되는 사람 tPA이다. 본원에서 제공된 tPA 표적에 대해 특이성을 갖는 선택된 uPA 폴리펩타이드는 tPA로 치료가능한 어떠한 치료요법에 대해 유사하게 변형되어 처방될 수 있다.
a. 혈전 질환 및 상태
혈전 질환은 고응고, 또는 점적 응고에 대한 지혈의 조절저하로 특징화된다. 대표적인 혈전 질환 및 상태는 동맥 혈전증, 정맥 혈전증, 정맥 혈전색전증, 폐 색전증, 심정맥 혈전증, 졸중, 허혈성 졸중, 심근경색, 불안정성 협심증, 동맥 세동, 신장 손상, 경피 경혈관 심장동맥 확장술, 파종 혈관내 응고, 패혈증, 인공 기관, 문합술 또는 보철물, 및 하기 논의된 것으로서, 기타 후천적 혈전성 질병을 포함한다. 혈전성 질병의 대표적인 치료요법은 응고 캐스케이드의 억제를 포함하는, 항응고 치료요법을 포함한다.
본원에서 제공된 선택된 uPA 폴리펩타이드 및 본원에서 제공된 선택된 uPA 폴리펩타이드를 암호화하는 핵산은 혈관내 응고를 포함하는 상태의 치료를 포함하는, 혈전성 질병 및 상태에 대한 항응고 치료요법에 사용할 수 있다. 혈액 응고를 억제할 수 있는 본원에 제공된 선택된 uPA 폴리펩타이는 예를 들면, 혈전의 형성을 제어하거나, 용해하거나, 또는 예방하는데 사용할 수 있다. 특수 양태에서, 본원의 선택된 uPA 폴리펩타이드, 및 선택된 uPA 폴리펩타이드를 암호화하는 핵산은 동맥 혈전성 질환을 치료하는데 사용할 수 있다. 다른 양태에서, 본원의 선택된 uPA 폴리펩타이드, 및 변형된 선택된 uPA 폴리펩타이드를 암호화하는 핵산은 심정맥 혈전증과 같은 정맥 혈전성 질환에 사용할 수 힝따. 특수 양태에서, 본원의 선택된 uPA 폴리펩타이드, 및 선택된 uPA 폴리펩타이드를 암호화하는 핵산은 졸중과 같은 허혈성 질환의 치료에 사용할 수 있다. 선택된 uPA 폴리펩타이드를 사용하는 치료학적 개선의 예는 예를 들면, 낮은 용량, 보다 적고/적거나 아주 적은 투여 횟수, 감소된 부작용 및 증가되 치료 효과를 포함하나, 이에 한정되지 않는다. 선택된 uPA 폴리펩타이드는 예를 들면, 동물 모델을 사용함에 의해 치료학적 효능에 대해 시험할 수 있다. 예를 들어, 허혈성 졸중의 마우스 모델, 또는 혈전성 질병 또는 상태의 다른 어떠한 공지된 질병 모델은 선택된 uPA 폴리펩타이드로 치료할 수 있다[참조: Dodds, Ann NY Acad Sci 516: 631-635 (1987)]. 질병 증상 및 표현형의 진행은 선택된 uPA 폴리펩타이드의 효과를 평가하기 위해 모니터한다. 선택된 uPA 폴리펩타이드는 또한 동물 모델 및 임상 시도시와 같은 피검체에 투여하여 위약 대조군과 비교한 생체내 효능을 평가할 수 있다.
i. 동맥 혈전증
동맥 혈전증은 동맥 혈관 벽내 파열의 결과로서 형성된다. 가장 흔히 파열은 죽상경화증과 같은 혈관병을 가진 환자에서 발생한다. 동맥 혈전은 일반적으로 복잡한 혈류 영역 및 혈전생성 피하밑층을 혈소판 및 응고 단백질에 노출시켜 궁극적으로 응고 캐스케이드를 활성화시키는 죽상경화판에 기인한 파열 부위에서 일반적으로 형성된다. 판 파열은 또한 판내로의 출혈로 인하여 혈관의 협소화를 생성할 수 있다. 비폐쇄 혈전은 혈관벽내로 혼입되어 죽상경화판의 성장을 가속화시킬 수 있다. 동맥 혈전증의 형성은 혈류를 폐쇄시키거나 또는 먼 미세순환내로의 색전에 의해 허혈을 초래할 수 있다. 혈소판 기능 및 응고 캐스케이드를 제어하는 항응고제 및 약물이 동맥 혈전증의 예방 및 치료에 효과적일 수 있다. 이러한 부류의 약물은 동맥 혈전증의 치료에 효과적이다. 동맥 혈전증은 불안정성 협심증 및 급성 심근경색의 상태를 초래할 수 있다. 응고를 억제하는 본원에서 제공된 선택된 uPA 폴리펩타이드는 불안정성 협심증 및 급성 심근경색과 같은 상태 및 동맥 혈전증의 치료 및/또는 예방에 사용할 수 있다.
ii . 정맥 혈전증 및 혈전 색전증
정맥 혈전증은, 핼액 응고가 특히 정맥 시스템을 통한 낮은 혈류의 예에서와 같은 응고형성 대 응고 용해에 대한 시그날에 있어서의 불균형으로 인하여 정맥내에서 형성되는 상태이다. 혈전 형성의 결과는, 비록 혈관벽이 통상적으로 완벽하다고 해도, 정맥 및 정맥의 판막에 대한 손상을 포함할 수 있다. 응고는 흔히 색전화되거나, 파괴되어 혈류를 통해 이동하는데, 여기서, 이들은 폐(폐 색전증), 뇌(허혈성 졸중, 일시적인 허혈성 발작); 심장(심장 발작/심근 경색, 불안정성 협심증); 피부(전격성 자반), 및 부신과 같은 유기 영역내로 머무르게 된다. 재발성 혈관 혈전색전증을 가지는 경향이 있는 환자는 혈전기호증을 갖는 것으로 특징화된다. 혈전색전증병으로 진행되는 위험 인자는 외상, 고정, 악성 질병, 심부전, 비만, 높은 수준의 에스트로겐, 다리 마비, 심근경색, 다리 정맥류, 암, 탈수증, 흡연, 경구 피임 및 임신을 포함한다. 혈전성향증을 가진 가족의 유전 연구는 FVIII, FIX 및 FXI를 포함하는, 유전가능한 높은 수준의 응고 인자를 입증하였다[참조: Lavigne et al. J. Thromb. Haemost. 1:2134-2130 (2003)].
심정맥 혈전증(DVT)은 다리 심정맥내 정맥성 점 응고의 형성을 말한다. DVT에 기여하는 3개의 주요 요인은 정맥 내증, 응고로의 혈액에 대한 증가된 경향성 및 혈류 저하이다. 총체적으로, 이들 인자는 비르쵸우 트리아드(Virchow's triad)라고 불린다. 정맥은 외상 또는 수술 동안, 또는 버거병(Buerger's disease) 또는 DIC와 같은 질병 상태, 또는 다른 응고의 결과로써 손상될 수 있다. DVT의 진행에 대한 다른 기여 요인은 위에서 논의한 보다 일반적인 혈전색전성 질병의 것과 유사하다. DVT에서 형성된 응고는 단지 약간의 염증만을 유발하므로, 이는 혈류로 보다 용이하게 분해되도록 한다. 흔히, 혈전은 다리 근육의 약간의 수축의 결과로 떨어질 수 있다. 혈전이 색전이 되면 이는 폐의 혈관내에 머물게 될 수 있으며 여기서 폐 경색을 유발할 수 있다. 혈류내에 활성 FIX의 수준이 높은 환자는 심정맥 혈전증으로 진행될 위험성이 크다[참조: Weltermann et al. J. Thromb. Haemost. 1(1): 16-18 (2003)].
혈전색전성 질병은 유전될 수 있으며, 여기서, 당해 질병은 응고 인자에 있어서 유전적 비정상에 의해 유발됨으로써 지혈에 있어서의 불균형을 초래한다. 몇가지 선천성 결핍은 안티트롬빈 III, 단백질 C, 단백질 S 또는 플라스미노겐을 포함한다. 다른 요인은 활성화된 단백질 C에 대한 내성(또한 APC 내성 또는 인자 V가 단백질 C에 의한 분해에 대해 내성이 되도록 하는 인자 V 라이덴 효과로 불림), 프로트롬빈에 있어서의 돌연변이, 이상섬유소원혈증(돌연변이가 섬유소용해에 대한 내성을 부여한다) 및 고호모시스테인혈증을 포함한다. 젊은 환자에서 혈전색전성 질병의 진행은 대부분 흔히 위에서 기술한 선천성 결합에 기인하며 소아 혈전기호증으로 불린다.
정맥 혈전색전증 질병 및 DVT에 대한 치료는 대표적으로 항응고 치료요법을 포함하며, 여기서, 헤파린 및 와파린의 경구 투여량이 투여된다. 헤파린은 일반적으로 환자에게 주입되어 급성 상태를 조절하며, 이어 와파린을 사용한 장기간의 경구 항응고 치료요법에 의해 미래의 에피소드를 조절한다. 다른 치료요법은 직접적인 트롬빈 서프레서, 아스피린 및 덱스트란과 같은 혈소판 작용의 억제제, 및 압박 스타킹 및 공기 압축 장치를 포함하는 정맥 협착을 방해하는 치료요법을 포함한다. 혈액 응고를 억제하는 본원에 제공된 선택된 uPA 폴리펩타이드는 혈전색전성 질병 및/또는 DVT에 대한 항응고 치료요법에 사용할 수 있다. 일부 양태에서, 혈액 응고를 억제하는 본원에 제공된 선택된 uPA 폴리펩타이드는 혈전색전성 질병 및/또는 DVT에 대한 위험 인자들을 나타내는 환자에서 혈전색전성 질병 및/또는 DVT의 예방 치료요법에 사용할 수 있다.
(a) 허혈성 졸중
허혈성 졸중은, 뇌로 혈류가 차단되는 경우 발생하며, 여기서, 뇌의 영역으로 급작스러운 순환의 손실은 상응하는 신경 기능의 손실을 초래한다. 대뇌속 출혈로 특징화되는 출혈성 졸중과는 대조적으로, 허혈성 졸중은 일반적으로 혈전증 또는 색전증에 의해 유발된다. 허혈성 졸중은 모든 졸중의 약 80%를 차지한다. 위에서 논의한 바와 같은 혈전색전증으로 진행될 원인 및 위험 인자외에, 대뇌 동맥의 박리를 유발하는 과정(예를 들면, 외상, 가슴 대동맥 박리, 동맥염)은 혈전성 졸중을 유발할 수 있다. 다른 원인들은 2개의 대뇌 동맥 영역 사이의 취약한 분수령 영역의 저관류 또는 협착성 또는 폐쇄된 동맥에서 먼 저관류를 포함한다. 허혈성 졸중에 대한 치료는 상태의 예방 및 치료용 항응고 치료요법을 포함한다. 응고를 억제하는 본원에 제공된 선택된 uPA 폴리펩타이드는 허혈성 졸중의 위험을 치료하고/하거나 예방 또는 감소시키는데 사용할 수 있다.
iii . 후천성 응고 질환
후천성 응고 질환은 비타민 K 결핍, 간 질병, 파종성 혈관내 응고(DIC) 또는 순환 항응고인자의 발달과 같은 상태 또는 질병의 결과이다. 혈액 응고의 결함은 상태 또는 질병에 의해 유발된 응고 인자에 있어서의 2차 결함의 결과이다. 예를 들어, 간으로부터 응고 인자의 생산은 흔히, 간이 질병 상태인 경우 손상된다. 응고 인자의 감소된 합성과 함께, 섬유소용해가 증가되고 혈소판감소증(혈소판의 결핍)이 증가한다. 간에 의한 응고 인자의 감소된 생산은 또한 전격간염 또는 급성 지방간으로부터 초래될 수 있다. 이러한 상태는 이용가능한 응고 인자를 소모하는 혈관내 응고를 촉진한다. 본원에서 제공한 선택된 uPA 폴리펩타이드는 혈액 응고 인자에서 결핍을 완화하기 위한 후천적 응고 질환의 치료시 사용될 수 있다.
(a) 파종성 혈관내 응고( DIC )
파종성 혈관내 응고(DIC)는 광범위하고 진행중인 활성화가 특징인 질환이다. DIC에서는, 응고의 트롬빈 활성화 및 점적 응고의 플라스민 분해 사이의 균형이 손실되어 있다. 그 결과 혈관 또는 미세혈관 피브린 침착은 각종 기관으로의 혈관 공급을 절충할 수 있으며, 이는 기관 부전에 기여할 수 있다. 아-급성 또는 만성 DIC에서, 초응고 현상, 과도한 혈전 형성으로부터의 혈전증, 및 혈관 혈전증의 증상 및 신호를 나타내는 환자가 존재할 수 있다. 급성 DIC와는 대조적으로, 아-급성 또는 만성 DIC는 헤파린, 항-트롬빈 III 및 활성화된 단백질 C 치료를 포함하는 초혈전증을 완화시키는 방법으로 치료한다. 본원에서 제공된 선택된 uPA 폴리펩타이드 및 본원에서 제공된 선택된 uPA 폴리펩타이드를 암호화하는 핵산은 아-급성 또는 만성 DIC의 치료요법에 사용할 수 있다. 하나의 양태에서, 본원의 아-급성 또는 만성 DIC 폴리펩타이드, 및 선택된 uPA 폴리펩타이드를 암호화하는 핵산은 다른 항응고 치료요법과 함께 사용할 수 있다. 선택된 uPA 폴리펩타이드는 예를 들면, 동물 모델을 사용함으로써 치료학적 효능에 대해 시험할 수 있다. 질병 증상 및 표현형의 진행은 선택된 uPA 폴리펩타이드의 효과를 평가하기 위해 모니터한다. 선택된 uPA 폴리펩타이드는 또한 동물 모델 및 임상 시도중인 피검체에게 투여하여 위약 대조군과 비교한 생체내 효능을 평가할 수 있다.
(b) 세균 감염 및 치주염
세균과 같은 미생물의 전신계 감염은 일반적으로 DIC와 관련되어 있다. 응고 경로의 상향조절은 상승된 수준의 사이토카인을 초래하는 염증 반응을 유발하는 세균 외독소(예: 스타필로코커스 알파 독소) 또는 미생물의 세포막 성분(리포폴리사카라이드 또는 내독소)에 의해 일부 매개될 수 있다. 결국, 사이토카인은 응고의 유도에 영향을 미칠 수 있다.
포르피루스 긴기발리스(Porphyrus gingivalis)와 같은 세균 병원체는 성인 치주염에 대한 유발 인자로서 잘 알려져 있다. 포르피루스 긴기발리스 세균은 발병력 인자로서 작용하는 아르기닌-특이적인 시스테인 프로테이나제를 생산한다[참조: Grenier et al. J. Clin. Microbiol. 25:738-740 (1987), Smalley et al. Oral Microbiol. Immunol. 4:178-181 (1989), Marsh, et al. FEMS Microbiol. 59:181-185 (1989), 및 Potempa et al. J. Biol. Chem. 273:21648-21657 (1998)]. 포르피루스 긴기발리스는 50 kDa 및 95 kDa 긴기파인 R (각각 RgpB 및 HRgpA)로 언급되는 2개의 프로테이나제를 생성하였다. 프로테아제는 단백질분해적으로 절단되어 응고 인자를 활성화시킨다. 따라서, 세균 감염 동안에 긴기파인 R의 혈류내로의 방출은 트롬빈의 과생산을 가져오는 응고 캐스케이드의 조절되지 않는 활성화를 초래하고 파종성 혈관내 응고(DIC)의 유발 가능성을 증가시킬 수 있다. 트롬빈 농도에 있어서의 큰 증가는 또한 치주염의 부위에서 파골세포에 의한 치조골 재흡수에 기여할 수 있다.
혈액 응고를 억제하는 본원에 제공된 선택된 uPA 폴리펩타이드, 및 선택된 uPA 폴리펩타이드를 암호화하는 핵산은 치주염의 치료에 사용할 수 있다. 선택된 uPA 폴리펩타이드는 치주염 모델에서 기도 반응성에 대한 치료학적 효능에 대해 시험할 수 있다. 이러한 모델은 비-사람 영장류, 개, 마우스, 랫트, 햄스터 및 기니아 피그와 같은 동물에서 이용가능하다[참조: Weinberg and Bral, J. of Periodontology 26(6), 335-340). 선택된 uPA 폴리펩타이드는 또한 동물 모델 및 피검체에게 임상 시도에서와 같이 투여되어 위약 대조군과 비교하여 생체내 효능을 평가할 수 있다.
b. 기타 tPA 표적 관련 상태
본원에 제공된 선택된 uPA 폴리펩타이드는 또한 tPA가 관여된 신경학적 상태의 치료시 사용될 수 있다. tPA는 세포외 매트릭스 단백질 및 기타 기질을 가수분해하는 tPA의 능력에 기인한 조직 리모델링 및 가소성을 포함하는 생리학적 과정을 조절하는 것으로 고려된다[참조: Gravanis and Tsirska (2004) Glia 49:177-183]. 졸중 또는 손상(예를 들면, 사고 또는 수술로 인한)과 같은 사건을 겪은 환자는 흔히 본원에서 제공한 선택된 uPA 폴리펩타이드로 치료가능한 신경학적 손상으로 고생한다. 본원에서 제공된 선택된 uPA 폴리펩타이드는 다발경화증, 근육위축가쪽경화증, 아급성 경화번뇌염, 파킨슨병(Parkinson's disease), 헌팅톤병(Huntington's disease), 근육퇴행위축, 및 영양 결핍 또는 독소(예: 신경독소, 남용 약물)에 의해 유발된 상태와 같은 신경퇴행성 질병을 포함하나, 이에 한정되지 않는 각종 신경학적 질병 및 상태로 고생하는 피검체를 치료하는데 유용할 수 있다. 또한, 선택된 uPA 폴리펩타이드는 인지 향상의 제공 및/또는 인지 저하, 예를 들면, "양성 노인성 건망증(benign senescent forgetfulness)", "연령-관련 기억 손상", "연령-관련 인지 저하" 등[참조: Petersen et al., J Immunological Meth. 257:107-116 (2001)] 및 알츠하이머병의 치료에 유용할 수 있다.
선택된 uPA 폴리펩타이드는 신경계에 대한 손상에 대해 각종 동물중 어느 것을 사용하여 시험할 수 있다. 사용될 수 있는 모델은 혈전색전성 졸중에 대한 설치류, 토끼, 고양이, 개 또는 영장류 모델[참조: Krueger and Busch, Invest. Radiol. 37:600-8 (2002); Gupta and Briyal, Indian J Physiol. Pharmacol. 48:379-94 (2004)], 척추 손상 모델[참조: Webb et al., Vet. Rec. 155:225-30 (2004)] 등을 포함하나, 이에 한정되지 않는다. 당해 방법 및 조성물은 또한 사람에서 시험할 수 있다. 표준화된 시험 및 스코어링 시스템(scoring system)을 포함하는 각종의 상이한 방법들이 동물 및 사람에서 운동, 감각, 행위 및/또는 인지 작용의 회복을 평가하는데 유용할 수 있다. 어떠한 적합한 방법도 사용할 수 있다. 하나의 예에서, 사람에서 감각 기능의 회복을 측정하는 기본 장치가 되는, 미국 척추 손상 협회 점수(American Spinal Injury Association score)를 각종 스코어링 시스템 및 방법의 예로 사용할 수 있다[참조: 예를 들면, Martinez-Arizala, J Rehabil. Res. Dev. 40:35-9 (2003), Thomas and Noga, J Rehabil. Res. Dev. 40:25-33 (2003), Kesslak and Keirstead, J Spinal Cord Med. 26:323-8 (2003)]. 사람에서 사용하기에 바람직한 투여량 범위는 제제의 효능 및 또한 관측된 독성을 고려하여 동물 모델 및 조직 배양 시스템에서 제제를 시험함으로써 확립할 수 있다.
c. 진단 방법
본원에서 제공된 선택된 uPA 폴리펩타이드는 피브린 및 활성이 변경된 피브린 분해 생성물을 검출하기 위한 진단 검정을 포함하나, 이에 한정되지 않는 진단 방법에서 사용할 수 있다. 따라서, 검정은 혈전 상태를 나타낸다. 다른 진단 적용은 선택된 uPA 폴리펩타이드에 대한 항체를 함유하는 키트를 포함하며 당해 분야의 숙련가에게 익숙하다.
2. VEGF 또는 VEGFR 표적을 절단하는 선별된 프로테아제 폴리펩타이드에 대한 대표적인 치료 방법
혈관 내피 성장 인자(VEGF)는 새로운 혈관이 존재하는 혈관구조로부터 생성되는 과정인 혈관신생을 조절하기 위해 특이적인 세포 표면 수용체(vegfr)를 통해 결합하여 시그날을 제공하는 사이토카인이다. 병리학적 혈관신생은 질병과 관련된 증가된 혈관구조를 기술하며 고형 종양의 성장[참조: McMahon, (2000) Oncologist. 5 Suppl 1:3-10], 황반 변성 및 당뇨병과 같은 현상을 포함한다. 암에서, 고형 종양은 성장 및 전이를 위한 현저히 증가하는 혈액 공급량을 필요로 한다. 저산소증 또는 종양원성 돌연변이는 종양 및 주변 간질 세포에서 VEGF 및 VEGF-R mRNA의 수준을 증가시켜 존재하는 혈관의 확장 및 새로운 혈관 네트워크의 형성을 가져온다. 이들 혈관은 혈액 및 유체를 황반 손상 광수용체 세포내로 누출한다. 눈 주변의 모세관 성장의 VEGF 자극은 적절히 작용하지 않는 질환이 있는 혈관을 초래한다.
VEGF의 3개의 타이로신 키나제 계열 수용체가 확인되었다(VEGF-R-1/Flt-1, VEGF-R-2/Flk-1/KDR, VEGF-R-3/Flt-4). KDR(마우스 동족체는 Flk-1이다)은, 내피 세포상에서 과도하게 발현된, Kd가 400 내지 800 pM인 VEGF의 고 친화성 수용체이다[참조: Waltenberger, (1994) J Biol Chem. 269(43):26988-95]. VEGF 및 KDR 연합은 병리학적 혈관신생에 요구되는 주요 내피세포-특이적인 시그날링 경로로서 확인되었다[참조: Kim, (1993) Nature. 362 (6423):841-4; Millauer, (1994) Nature. 367 (6463):576-9; Yoshiji, (1999) Hepatology. 30(5): 1179-86]. 리간드 결합시 수용체의 이량체화는 세포질 도메인의 자가인산화, 및 세포질을 통해서 및 핵내로의 시그날링을 전파하여 세포 성장 프로그램을 변화시키는 결합 파트너의 보충을 유발한다. 가용성 VEGF-R2를 사용한 종양의 치료는 종양 성장을 억제하고[참조: Lin, (1998) Cell Growth Differ. 9(1):49-58], 인산화의 화학적 억제는 종양 세포의 아폽토시스(apoptosis)가 일어나도록 한다[참조: Shaheen, (1999) Cancer Res. 59(21):5412-6].
혈관 내피 성장 인자(VEGF) 및 이의 수용체에 의한 시그날링은 병리학적 혈관신생 및 암에서 종양 혈관구조의 신속한 발달과 연관되어 있다. 이러한 시그날링 경로를 차단하는 약물은 성장 및 종양 혈액 공급의 유지를 방지하며, 종양의 전신적 사멸을 가져온다. 전이성 결장암 환자에서 항-VEGF 항체 AVASTIN™의 최근 성공은 암의 항-혈관신생 치료요법에 대한 표적으로서 VEGF를 효과적이도록 하였다. 이러한 유망한 결과에도 불구하고, 종양 진행은 여전히 항-VEGF 치료에도 불구하고 발생한다. VEGF 작용에 영향을 미치는 항체의 기전 및 항체가 종양 성장을 방해하는 방법은 알려져 있지 않다. 녹다운(knock down) 실험은 VEGF 작용의 차단이 혈관신생을 차단함을 나타낸다. 따라서, VEGF-2를 통한 혈관신생 시그날링의 억제는 신규 표적화를 사용한 조작된 프로테아제의 개발에 이상적인 미개발된 치료학적 분야를 나타낸다.
VEGF 수용체 및 Flk-1/KDR를 표적화하는 치료요법은 특히 병리학적 혈관신생을 억제하며 사람 및 마우스 고형 종양의 다수 마우스 모델에서 단독으로 및 세포독성 치료요법과 함께[참조: Klement, (2000) J Clin Invest. 105(8):R15-24], 종양 크기의 감소를 나타낸다[참조: Prewett, (1999) Cancer Res. 59(20):5209-18; Fong, (1999) Neoplasia 1(1):31-41. Erratum in: (1999) Neoplasia 1(2):183]. 소 분자 억제제 및 항체를 사용한 연구는, VEGF 수용체 계열을 강력한 항-혈관신생 표적으로서 가치있게 하나 여전히 보다 효과적인 치료요법이 요구된다.
VEGFR은 7개의 면역글로불린(Ig)-유사 도메인의 세포외 영역, 막관통 영역, 및 2개의 세포질 타이로신 키나제 도메인으로 구성된다. 첫번째 3개의 Ig-유사 도메인은 리간드 결합을 조절하는 것으로 밝혀졌으나, 도메인 4 내지 7은 리간드의 부재하에 정확한 이량체화 및 시그날링을 억제하는데 역할을 한다. 조작된 프로테아제에 의한 선택된 단백질분해에 대한 표적으로서, 이는 다음의 유망한 표적 특성을 갖는다: 단백질분해에 대해 허용가능한 아미노산의 불안정 영역; 사람, 랫트 및 마우스 종 사이의 높은 서열 동일성; 분해시 시그날링의 하향 조절; 및 리간드에 비-생산적으로 결합할 수 있는 가용성 수용체의 단백질분해 생성. VEGF-R2의 몇가지 영역은 Ig-유사 도메인 사이에 미구조적 루프 및 막관통 영역 앞의 스톡 영역을 포함하는 특수 단백질분해에 이용가능하다. 하나의 예에서, 본원에서 제공된 세린-유사 프로테아제는 이들의 막관통 및 사이토카인 사이의 특이적인 표적 수용체 또는 성장 인자 결합 도메인(예를 들면, VEGFR) 사이에 특이적인 표적 수용체를 절단하도록 조작할 수 있다. 세포 표면 또는 루프 영역에 대한 다른 단백질 수용체에 작용하는 스톡 영역은 폴리펩타이드 쇄내 구형 도메인으로부터 차단된다.
a. 혈관신생, 암, 및 기타 세포 주기 의존성 질병 또는 상태
본원에 제공된 대표적인 선별된 프로테아제는 혈관신생의 조절에 관여하는 VEGF 또는 VEGFR을 절단한다. 세포 표면 분자는 종양 혈관신생에서 VEGFR 시그날링이며, 절단은 암의 확산을 방지한다. 예를 들면, VEGFR 분자로부터 세포 표면 도메인의 절단은 세포외 시그날, 특히 세포 증식 시그날을 전달하는 이의 능력을 불활성화시킬 수 있다. 종양에 공급하기 위한 혈관신생없이, 암 세포는 흔히 증식하지 않는다. 따라서, 하나의 양태에서, 본원에 제공된 선별된 프로테아제는 암을 치료하는데 사용된다. 또한, VEGFR의 분해는 황반 변성, 염증 및 당뇨병과 같은 다른 병리학에서 혈관신생을 조절하는데 사용될 수 있다. 하나의 양태에서, 세포 주기 진행시 관여된 표적 VEGF 또는 VEGFR 단백질의 분해는 단백질의 능력을 불활성화시켜 세포 주기가 진행되도록 한다. 세포 주기의 진행없이, 암세포는 증식할 수 없다. 따라서, VEGF 또는 VEGFR을 절단하는 본원에 제공된 선별된 프로테아제는 암 및 다른 세포 주기 의존성 병리학을 치료하는데 사용할 수 있다.
본원에 제공된 선별된 프로테아제는 또한 종양생성에 관여하는 가용성 단백질을 절단할 수 있다. VEGF 폴리펩타이드의 절단은 VEGF 수용체를 통한 시그날링을 방지하고 혈관신생을 감소시킴으로써 혈관신생이 중요한 역할을 하는, 암, 황반 변성, 염증 및 당뇨병과 같은 질병을 감소시킨다. 또한, VEGF 시그날링은 특정의 세포 유형에서 세포 주기의 조절에 관여한다. 따라서, VEGF를 절단하는 본원에 제공된 선별된 프로테아제는 암 및 다른 세포 주기 의존성 병리학의 치료시 유용하다.
b. VEGF 또는 VEGFR 을 절단하는 선별된 프로테아제를 사용한 병용 치료
하나의 양태에서, 암과 같은 병리학의 치료는 이를 필요로 하는 환자에게 치료학적 유효량의 하나 이상의 항암제와 배합된 것과 같은 VEGF/VEGFR-2 복합체의 시그날링을 특이적으로 절단시켜 불활성화시키는 프로테아제를 투여함을 포함한다. 항혈관신생 치료요법은 고형 암 및 혈액암에 대해 성공적인 것으로 입증되었다[참조: 예를 들면, Ribatti et al. (2003) J Hematother Stem Cell Res. 12(1), 11-22]. 따라서, 항혈관신생 치료요법으로서 본원에서 제공된 조성물은 혈액학적 및 고형 조직 암 둘다의 치료를 촉진시킬 수 있다. 본원에 제공된 조성물 및 치료방법은 단독으로 또는 당해 분야의 숙련가에게 공지된 다른 적절한 항암 치료와 함께 투여할 수 있다. 예를 들어, 본원에 제공된 선별된 프로테아제는 AVASTINTM 투여가 치료학적 이점을 제공하는 어떠한 치료요법에서도 AVASTINTM과 함께 또는 이것 대신에 투여할 수 있다.
하나의 양태에서, 항암제는 하나 이상의 화학치료제이다. 관련 양태에서, 프로테아제의 투여는 하나 이상의 방사치료요법과 병용된다. 병용 치료요법의 투여는 혈관신생 시그날을 약화시키고 유리 VEGF 수준을 저하시키는 가용성 수용체의 풀(pool)을 생성할 것이다. 특정 양태에서, 본원에 제공된 선별된 프로테아제는 6개의 아미노산 영역에 걸쳐 수용체의 중요 영역, Flk-1/KDR 스톡과 매치하는 시험관내 특이성을 갖는다.
본원에 제공된 선별된 프로테아제 폴리펩타이드는 하나 이상의 치료제를 함유하는 조성물로 투여될 수 있다. 치료제는 동일하거나 또는 상이할 수 있으며, 예를 들면, 치료학적 방사선핵종, 약물, 호르몬, 호르몬 길항제, 수용체 길항제, 효소 또는 다른 제제에 의해 활성화된 효소 또는 전구효소, 오토크린, 사이토카인 또는 당해 분야의 숙련가에게 공지된 어떠한 적합한 항암제일 수 있다. 하나의 양태에서, 선별된 프로테아제 폴리펩타이드와 공동투여되는 항암제는 AVASTINTM이다. 본원에 제공된 방법에서 유용한 다른 치료제는 독소, 항-DNA-DNA, 항-RNA, 안티센스 올리고뉴클레오타이드와 같은 방사표지된 올리고뉴클레오타이드, 항-단백질 및 항-염색질 세포독성 또는 항미생물제제를 포함한다. 다른 치료제는 당해 분야의 숙련가에게 공지되어 있으며, 본원에 제공된 방법에 따라 이러한 다른 치료제의 사용이 특히 고려된다.
항종양제는 알킬화제, 항대사산물, 호르몬제, 항생제, 항체, 항암 생물제, 글리벡, 콜키킨, 빈카 알칼로이드, L-아스파라기나제, 프로카르바진, 하이드록시우레아, 미토탄, 니트로소우레아 또는 이미다졸 카복스아미드와 같은 다수의 화학치료요법제 중 하나일 수 있다. 적합한 제제는 트롬빈의 탈분극화를 촉진하거나 또는 종양 세포 증식을 방지하는 제제이다. 고려된 화학치료제는 식품의약국 및 미국 건강 및 복지사업국에 의해 편집된 서적: Orange Book of Approved Drug Products With Therapeutic Equivalence Evaluations에 나열된 항암제를 포함하나, 이에 한정되지 않는다. 상기 화학치료제 외에, 본원에 제공된 세린 프로테아제-유사 프로테아제 또한 방사 치료요법 치료와 함께 투여될 수 있다. 당해 분야에 공지된 추가의 치료도 고려된다.
치료제는 화학치료제일 수 있다. 화학치료제는 당해 분야에 공지되어 있으며 적어도 탁산, 질소 무스타드, 에틸렌 유도체, 알킬 설포네이트, 니트로소우레아, 트리아젠, 엽산 유사체, 피리미딘 유사체, 퓨린 유사체, 빈카 알칼로이드, 항생제, 효소, 플라티늄 배위 착물, 치환된 우레아, 메틸 하이드라진 유도체, 아드레노코르티칼 억제제 또는 길항제를 포함한다. 보다 상세하게는, 화학치료제는 스테로이드, 프로게스틴, 에스트로겐, 항에스트로겐 또는 안드로겐의 비제한된 그룹 중에서 선택된 하나 이상의 제제일 수 있다. 보다 더 상세하게는, 화학치료제는 아자리빈, 블레오마이신, 브리오스타틴-1, 부설판, 카르무스틴, 클로람부실, 시스플라틴, DPT-11, 사이클로포스파미드, 사이타라빈, 다카르바진, 닥티노마이신, 다우노루비신, 덱사메타손, 디에틸스틸베스트롤, 독소루비신, 에티닐 에스트라디올, 에토포시드, 플루오로우라실, 플루옥시메스테론, 겜시타빈, 하이드록시프로게스테론 카프로에이트, 하이드록시우레아, L-아스파라기나제, 류코보린, 로무스틴, 메클로르에타민, 메드로프로게스테론 아세테이트, 메게스트롤 아세테이트, 멜팔란, 머캅토퓨린, 메토트렉세이트, 미트라미신, 미토마이신, 미토탄, 페닐 부티레이트, 프레드니손, 프로카르바진, 세루스틴 스트렙토조신, 타목시펜, 탁산, 탁솔, 테스토스테론 프로피오네이트, 탈리도미드, 티오구아닌, 티오테파, 우라실 무스타드, 빈블라스틴 또는 빈크리스틴일 수 있다. 화학치료제의 어떠한 병용물의 사용 또한 고려된다. 화학치료제의 투여는 세린 프로테아제-유사 뮤테인 폴리펩타이드의 투여전, 동안 또는 후에 수행할 수 있다.
본원에 제공된 선별된 프로테아제 폴리펩타이드와 공동투여하기 위한 또는 병용하여 사용하기 위한 다른 적합한 치료제는 방사동위원소, 보론 아덴드, 면역조절인자, 독소, 광활성제 또는 염료, 암 화학치료 약물, 항바이러스 약물, 항진균 약물, 항세균 약물, 항원생동물 약물 및 화학감작화제로 이루어진 그룹 중에서 선택된다(참조: 미국 특허 제4,925,648호 및 제4,932,412호). 적합한 화학치료제는 예를 들면, 문헌[참조: REMINGTON'S PHARMACEUTICAL SCIENCES, 19th Ed. (Mack Publishing Co. 1995), 및 Goodman and Gilman's THE PHARMACOLOGICAL BASIS OF THERAPEUTICS, Goodman et al., Eds. Macmillan Publishing Co., New York, 1980 and 2001 editions]에 기술되어 있다. 실험 약물과 같은 다른 적합한 화학치료제는 당해 분야의 숙련가에게 공지되어 있다. 또한, 적합한 치료학적 방사동위원소는 ax-방출기, β-방출기, γ-방출기, 오제(Auger) 전자 방출기, 전자 포획에 의해 붕괴되는 방사동위원소 및 α-입자를 방출하는 중성자 포획제로 이루어진 그룹 중에서 선택된다. 바람직하게는, 방사동위원소는 225Ac, 198Au, 32P, 131I, 131I, 90Y, 186Re, 188Re, 67Cu, 177Lu, 213Bi, 10B 및 211At로 이루어진 그룹 중에서 선택된다.
하나 이상의 치료제가 본원에 제공된 선별된 프로테아제와 함께 사용되는 경우, 이들은 동일한 부류 또는 유형일 수 있거나 또는 상이한 부류 또는 유형일 수 있다. 예를 들어, 치료제는 상이한 방사선핵종, 또는 약물 및 방사선핵종을 포함할 수 있다.
다른 양태에서, 이들의 개개의 에너지 방사의 결과로서 상이한 거리에 걸쳐 효과적인 상이한 방사동위원소를 본원에 제공된 프로테아제와 함께 제1 및 제2 치료제로서 사용한다. 이러한 제제는 보다 효과적인 종양 치료를 달성하기 위해 사용될 수 있으며, 일반적인 임상 상황에서와 같이, 크기가 상이한 다수 종양을 지닌 환자에서 유용하다.
가장 작은 종양 침착물 및 단일 세포를 치료하는데 유용한 사용가능한 방사동위원소는 거의 없다. 이러한 상황에서, 약물 또는 독소는 본원에 제공된 프로테아제와 공동투여하기 위한 보다 유용한 치료제일 수 있다. 따라서, 일부 양태에서, 동위원소는 약물, 독소 및 중성자 포획제와 같은 비-방사성 종과 함께 사용되며 본원에 제공된 프로테아제와 공동투여된다. 세포에서 세포독성 효과를 갖는 많은 약물 및 독소가 공지되어 있으며, 본원에 제공된 프로테아제와 함께 사용될 수 있다. 이들은 머크 인덱스(Merck Index), 굿맨(Goodman) 및 길만(Gilman) 등과 같은 약물 및 독소 개론, 및 위에서 인용한 문헌들에서 찾아야 한다.
세포내 단백질 합성을 방해하는 약물은 본원의 치료학적 방법에서 프로테아제와 함께 사용될 수 있으며; 이러한 약물은 당해 분야의 숙련가에게 공지되어 있고 퓨로마이신, 사이클로헥스이미드 및 리보뉴클레아제를 포함한다.
본원에 제공된 치료학적 방법은 암 치료요법에 사용될 수 있다. 방사동위원소, 약물 및 독소가 암 세포에 의해 또는 이와 관련된 마커에 특이적으로 결합하는 항체 또는 항체 단편과 접합할 수 있으며, 이러한 항체 접합물은 이들의 치료 효능을 향상시키고 부작용을 최소화하기 위해 종양 부위에 방사동위원소, 약물 또는 독소를 표적화하는데 사용될 수 있음은 잘 알려져 있다. 이러한 제제 및 방법의 예는 문헌[참조: Wawrzynczak and Thorpe, Introduction to the Cellular and Molecular Biology of Cancer, L. M. Franks and N. M. Teich, eds, Chapter 18, pp. 378-410, Oxford University Press. Oxford, 1986; Immunoconjugates: Antibody Conjugates in Radioimaging and Therapy of Cancer, C. W. Vogel, ed., 3-300, Oxford University Press, N.Y., 1987; Dillman, R. O., CRC Critical Reviews in Oncology/Hematology 1:357, CRC Press, Inc., 1984; Pastan et al., Cell 47:641, 1986; Vitetta et al., Science 238:1098-1104, 1987; 및 Brady et al., Int. J. Rad. Oncol. Biol. Phys. 13:1535-1544, 1987]에서 고찰할 수 있다. 암에 대한 면역접합체 및 치료요법의 다른 형태의 사용의 다른 예는 특히 미국 특허 제4,331,647호, 제4,348,376호, 제4,361,544호, 제4,468,457호, 제4,444,744호, 제4,460,459호, 제4,460,561호, 제4,624,846호, 제4,818,709호, 제4,046,722호, 제4,671,958호, 제4,046,784호, 제5,332,567호, 제5,443,953호, 제5,541,297호, 제5,601,825호, 제5,635,603호, 제5,637,288호, 제5,677,427호, 제5,686,578호, 제5,698,178호, 제5,789,554호, 제5,922,302호, 제6,187,287호 및 제6,319,500호에 기술되어 있다.
또한, 본원에 제공된 치료 방법은, 본원의 선별된 프로테아제가 특정의 세포독성제의 부작용을 예방하거나, 경감시키거나 또는 회복시키는 다른 화합물 또는 기술과 병용하여 사용된다. 이러한 병용의 예는 예를 들면, 미국 특허 제4,624,846호에 기술된 바와 같은, IL-1과 신속한 제거를 위한 항체의 투여를 포함한다. 이러한 투여는 그랜자임 B 뮤테인 또는 MT-SP1 뮤테인과 항암제(예: 방사동위원소, 약물 또는 세포독성 성분으로서의 독소)의 1차 치료학적 치료의 투여 후 3 내지 72시간째에 수행할 수 있다. 이는 순환으로부터 접합체, 약물 또는 독소의 제거를 향상시키고 치료제에 의해 유발된 골수 및 다른 혈액 독성을 완화시키거나 또는 회복시키는데 사용될 수 있다.
다른 예에서 및 위에서 나타낸 바와 같이, 암 치료요법은 하나 이상의 살종양제, 예를 들면, 약물 및 방사동위원소, 또는 방사동위원소와 중성자-활성화된 치료요법을 위한 보론-10 제제, 또는 약물과 생물학적 반응 개질제, 또는 융합 분자 접합체 및 생물학적 반응 개질제의 조합을 포함할 수 있다. 사이토카인은 이러한 치료 방법내로 통합되어 이의 각각의 성분의 효능을 최대화할 수 있다.
유사하게, β 또는 α-방출기인 방사동위원소와 접합된 특정의 항백혈병 및 항림프종 항체는, 종양 세포에 대해 단독으로 지시되지 않는 경우, 골수종 및 다른 혈액학적 부작용을 유발할 수 있다. 이는 특히, 종양 세포가 순환하며 혈액-형성 기관에 있는 경우 관측된다. 하나 이상의 혈액학적 사이토카인(예: G-CSF 및 GM-CSF와 같은 콜로니 자극 인자와 같은 성장 인자)의 동시 및/또는 후속적인 투여는 항암 효과를 증진시키면서, 혈액학적 부작용을 감소시키거나 또는 완화시키는데 바람직하다.
각종의 방사선핵종 치료요법의 방법은 문헌[참조: 예를 들면, Harbert, "Nuclear Medicine Therapy", New York, Thieme Medical Publishers, 1087, pp. 1-340]에 기술된 바와 같은 암 및 기타 병리학적 상태의 치료에 사용될 수 있음은 당해 분야에 익히 공지되어 있다. 이러한 과정에 경험이 있는 임상의는 이의 어떠한 혈액학적 부작용을 완화시키기 위한 이러한 과정에 대해 본원에 기술된 사이토카인 보조제 치료요법을 용이하게 채택할 수 있을 것이다. 유사하게, 사이토카인 약물을 사용한, 프로테아제 뮤테인과 함께 공동투여된 치료요법을 예를 들면, 암, 감염성 또는 자가면역병 및 기관 거부 치료요법에 사용할 수 있다. 이러한 치료는 동위원소 또는 방사표지된 항체를 사용한 방사동위원소 치료요법에 대한 유사한 원리에 의해 결정된다. 즉, 통상의 숙련의는 1차 항암 치료요법 전, 동안 및/또는 후에 사이토카인을 투여함으로써 골수 억제 및 다른 이러한 혈액학적 부작용을 완화시키기 위한 사이토카인 사용의 기술을 채택할 수 있을 것이다.
3. 보체 단백질 표적을 절단하는 선별된 MT - SP1 폴리펩타이드에 대한 대표적인 치료 방법
본원에 제공된 프로테아제 폴리펩타이드 및 핵산 분자는, 보체 경로의 활성화가 관여된 특정 상태, 특히, 패혈성 쇼크와 같은 급성 염증 상태, 및 류마티스 관절염(RA)와 같은 만성 염증 상태를 포함하는 염증 상태를 치료하기 위해 사용될 수 있다. 급성 및 염증 상태는 예를 들면, 면역-복합체-매개된 염증에 의해 유발된 자가면역병 또는 조직 손상과 같은 면역-매개된 질병으로서 나타날 수 있다. 보체-매개된 염증 상태는 또한 염증 성분들을 가진 신경퇴행성 또는 심혈관병으로서 나타날 수 있다. 본 단락은 프로테아제의 대표적인 사용 및 투여 방법을 제공한다. 이러한 기술된 치료요법은 예시적이며 프로테아제의 적용을 제한하지 않는다. 이러한 방법은 하기 기술되고 나열된 생리학적 및 의학적 상태의 치료 방법을 포함하나, 이에 한정되지 않는다. 이러한 방법은 패혈증, 류마티스 관절염(RA), 막증식사구체신염(MPGN), 홍반 루푸스, 다발경화증(MS), 중증근육무력증(MG), 천식, 염증성 창자병, 호흡곤란증후군, 면역 복합체(IC)-매개된 급성 염증성 조직 손상, 다-기관 기능부전, 알츠하이머병(AD), 심근경색(MI), 졸중, 심폐 우회(CPB) 또는 관상 동맥 우회 이식술, 혈관성형술, 또는 혈액투석 또는 길랑 바레 증후군과 같은 상태 또는 치료에 의해 유발된 허혈-재관류 손상을 포함하나, 이에 한정되지 않는다.
프로테아제를 사용한 질병 및 상태의 치료는 피하 주사, 경구 및 경피 투여를 포함하나, 이에 한정되지 않는, 본원에 기술된 적합한 제형을 사용하여 적합한 투여 경로로 수행할 수 있다. 경우에 따라서, 특정 용량 및 기간 및 치료 프로토콜을 실험적으로 결정하거나 또는 외삽할 수 있다. 예를 들어, 재조합체 및 천연의 프로테아제 폴리펩타이드의 대표적인 투여량을 초기에 사용하여 적절한 용량을 측정할 수 있다. 야생형 또는 스캐폴드 프로테아제와 비교하여 보다 특이성 및/또는 선택성을 갖는 변형된 프로테아제는 감소된 용량 및 횟수에서 효과적일 수 있다. 용량 수준은 개체의 체중, 일반적인 건강, 연령, 사용된 특정 화합물의 활성, 식이, 투여 시간, 배출 속도, 약물 배합, 질병의 중증도 및 과정, 및 질병에 대한 환자의 경향성 및 치료하는 주치의의 판단과 같은 각종 인자들을 기준으로 측정할 수 있다. 단일 용량형을 생산하기 위해 담체 물질과 배합될 수 있는 활성 성분의 양은 치료된 숙주 및 특정 투여 방식에 따라 변할 것이다.
환자의 상태가 개선되면, 화합물 또는 조성물의 유지 투여량을 투여할 수 있으며; 경우에 따라, 용량, 용량형 또는 투여 횟수, 또는 이의 조합을 변형시킬 수 있다. 일부 경우에, 피검체는 질병 증상의 어떠한 재발시 장기간 기준으로 간헐적인 치료를 필요로 할 수 있다.
a. 면역- 매개된 염증성 질환
본원에 제공된 변이 MT-SP1 프로테아제를 포함하나 이에 한정되지 않는 본원에 기술된 방법에서 선별된 프로테아제 및 변형된 프로테아제를 사용하여 염증 질병을 치료할 수 있다. 프로테아제로 치료될 수 있는 염증병은 급성 및 만성 염증병을 포함한다. 대표적인 염증병은 중추 신경계 질병(CNS), 자가면역병, 천식과 같은 기도 과-반응성 상태, 류마티스 관절염, 염증성 창자병 및 면역 복합체(IC)-매개된 급성 염증성 조직 손상을 포함한다.
실험적인 자가면역 뇌척수염(EAE)은 다발경화증(MS)의 모델로서 제공될 수 있다[참조: Piddlesden et al., (1994) J Immunol 152:5477]. EAE는 말이집 기본 단백질, 단백지질 단백질 및 말이집 희소돌기아교세포 당단백질(MOG)과 같은 말이집 및 말이집 성분들을 사용한 면역화에 의해 다수의 유전적으로 민감한 종에서 유도될 수 있다. 예를 들면, MOG-유도된 EAE는 염증의 병리조직학적 트리아드 과정 동안 만성의, 재발성 임상 질병, 반응성 신경아교증 및 거대한 융합성 탈수초 플라크의 형성을 포함하는 사람 MS의 필수적인 특징을 반복한다. 프로테아제 및 변형된 프로테아제는 EAE 동물 모델에서 평가할 수 있다. 프로테아제는 매일 복강내 주사에 의해서와 같이 투여되며, 증상의 과정 및 진행은 대조군 동물과 비교하여 모니터한다. 질병을 악화시킬 수 있는 염증성 보체 성분들의 수준은 또한 용혈빈혈 검정에서 혈청 보체 활성을 검정하고 예를 들면, C1, C3 및 C9와 같은 보체 성분들의 침착에 대해 검정함으로써 측정할 수 있다.
보체 활성화는 류마티스 관절염(RA)과 같은 질병에서 염증을 조절한다[참조: Wang et al., (1995) PNAS 92:8955]. 본원에 제공된 변이 MT-SP1 폴리펩타이드를 포함하는 프로테아제 및 변형된 프로테아제는 RA를 치료할 수 있다. 예를 들어, 프로테아제는 국부적으로 또는 전신적으로 주사할 수 있다. 프로테아제는 매일 또는 주단위로 투여할 수 있다. 페길화된 프로테아제를 사용하여 면역원성을 감소시킬 수 있다. 하나의 예에서, 제II형 콜라겐-유도된 관절염(CIA)은 염증성 윤활막염, 판누스 형성 및 연골 및 골의 침식으로 특징화되는 RA와 조직학적으로 유사한 자가면역 염증 관절병의 모델로서 마우스에서 유발시킬 수 있다. CIA를 유발시키기 위하여, 완전 프로인트 애주번트의 존재하에 소 제II형 콜라겐(B-CII)을 꼬리의 기저에 경피적으로 주사할 수 있다. 21일 후, 마우스를 동일한 프로토콜을 사용하여 재면역화할 수 있다. MT-SP1 폴리펩타이드를 포함하는 프로테아제 또는 변형된 프로테아제의 효과를 시험하기 위해, B-CII로 초기 챌린지한지 3주 후, 프로테아제 또는 대조군을 복강내에 3주 동안 주당 2회 투여할 수 있다. 마우스를 조직학적 분석을 위해 초기 면역화 후 7주째에 희생시킬 수 있다. 확립된 질병에서 프로테아제의 치료학적 효과를 평가하기 위하여, 프로테아제를 총 10일 동안 매일 투여한 후 하나 이상의 사지에서 임상적 관절염을 발병시킬 수 있다. 초기 영향받은 관절에서 팽윤 정도를 캘리퍼를 사용하여 발 두께를 측정함으로써 모니터할 수 있다. 모델 둘다에서, 혈청을 용혈 분석 및 예를 들면, C5a 및 C5b-9와 같은 활성화의 보체 마커의 측정을 위해 마우스로부터 회수할 수 있다. 다른 예에서, 영장류 모델이 RA 치료에 대해 이용가능하다. 허약하고 팽윤된 관절의 반응은 프로테아제 폴리펩타이드 및 대조군으로 치료한 피검체에서 모니터하여 프로테아제 치료를 평가한다.
본원에서 제공한 변이 MT-SP1 폴리펩타이드를 포함하나, 이에 한정되지 않는 프로테아제 또는 변형된 프로테아제는 면역 복합체(IC)-매개된 급성 염증성 조직 손상을 치료하는데 사용할 수 있다. IC-매개된 손상은 조직에서 IC 침착에 대한 국부 염증 반응에 의해 유발된다. 이에 따른 염증 반응은 부종, 호중구증가증, 출혈 및 최종적으로 조직 괴사에 의해 특징화된다. IC-매개된 조직 손상은 생체내 관절(RPA) 반응에서 연구될 수 있다. 요약하면, RPA 반응에서, 과도한 항체(예를 들면, 토끼 IgG 항-난황 알부민)를 예를 들면, 상응하는 항원(즉, 난황 알부민)으로 미리 정맥내 주입한 랫트 또는 기니아 피그와 같은 동물의 피부내로 주사한다[참조: Szalai et al., (2000) J Immunol 164:463]. RPA 반응의 개시 직전, 프로테아제 또는 볼루스(bolus) 대조군을 상응하는 항원으로서 동시에 정맥내 주사에 의해 우측 대퇴부 정맥을 통해 투여할 수 있다. 또는, 프로테아제를 항원의 주사 직후 및 항체의 피부 주사 직전에 개시하여 RPA 반응의 초기 시간 동안 투여할 수 있다. 보체-의존성 IC-매개된 조직 손상의 생성시 프로테아제의 효과는 혈액을 수집하여 혈청 용혈 활성을 측정하고, 피부의 감염된 부위를 병변 크기의 정량화를 위해 수거함으로써 RPA의 개시 후 다양한 시간에 평가할 수 있다.
본원에 제공된 변이 MT-SP1 폴리펩타이드를 포함하는 본원에 기술된 것들과 같은 치료학적 프로테아제는 패혈증 및 치명적인 쇼크를 초래할 수 있는 심각한 패혈증을 치료하는데 사용될 수 있다. 보체-매개된 치명적인 쇼크의 모델을 사용하여 치료제로서 프로테아제의 효과를 시험할 수 있다. 하나의 이러한 예에서, 랫트를 미량의 지질다당류(LPS)로 프라이밍한 후, 보체의 막 억제제(항-Crry)에 대한 모노클로날 항체가 투여될 수 있다[참조: Mizuno M et al., (2002) Int Arch Allergy Immunol 127:55]. 프로테아제 또는 대조군은 LPS 프라이밍 전, LPS 프라이밍 후, 또는 항-Crry 투여 후 및 치명적인 쇼크와 같은 치명적인 쇼크의 개시 과정 동안 어느 시기에도 투여할 수 있으며 치명적인 쇼크로부터 랫트의 회복을 평가할 수 있다.
b. 신경퇴행성 질병
보체 활성화는 알츠하이머병(AD)의 진행을 가속화시키며 AD 뇌에서 신경돌기 손실에 기여한다. 본원에 제공된 MT-SP1 폴리펩타이드를 포함하나 이에 한정되지 않는, 본원에 기술된 프로테아제 및 변형된 프로테아제는 AD를 치료하는데 사용될 수 있다. AD의 신경병리학적 및 행동적 특징의 일부를 모사하는 마우스 모델은 프로테아제의 치료학적 효과를 평가하는데 사용될 수 있다. 유전자전이 마우스 모델의 예는 사람 아밀로이드 전구체 단백질(APP) 또는 질병-생성 돌연변이를 갖는 프레세닐린 1 (PS1) 단백질을 공격성 프로모터의 조절하에 마우스내로 도입시킴을 포함한다. 이들 마우스는 베타-아밀로이드 플라크 및 비정상적 신경돌기에 있어서의 증가를 포함하는 AD의 특징으로 진행된다. APP 및 PS1 돌연변이 단백질에 대한 이중 유전자전이 마우스는 보다 다수의 섬유원성 베타-아밀로이드 플라크로 진행되며 플라크와 관련된 보체 인자들 및 활성화된 아교세포를 나타낸다. 프로테아제는 매일 복강내 또는 정맥내 주사로 투여될 수 있으며, 과정 및 증상의 진행은 대조군 동물과 비교하여 모니터한다.
c. 심혈관 질환
본원에 제공된 변이 MT-SP1 프로테아제를 포함하나 이에 한정되지 않는, 본원에 기술된 프로테아제 및 변형된 프로테아제는 심혈관병을 치료하는데 사용될 수 있다. 프로테아제는 졸중, 심근경색, 심폐 우회, 관상 동맥 우회 이식술, 혈관성형술, 또는 혈액투석으로부터 초래되는 허혈성 재관류 손상을 포함하는 심혈관병의 치료시 사용될 수 있다. 프로테아제는 또한 조직 손상에 기여할 수 있는 심폐 우회와 관련된 염증 반응의 치료에 사용될 수 있다. 일반적으로, 프로테아제는 보체-매개된 허혈-재관류 손상을 유발하는 치료 또는 사건전에, 동시에 또는 후속해서 투여할 수 있다. 하나의 예에서, 프로테아제는 예를 들면, 혈관성형술의 관상 동맥 우회 이식술과 같은 보체-매개된, 혀혈성-손상 유도 사건에 의해 피검체의 치료 전에 피검체에게 투여될 수 있다.
허혈-재관류 손상의 치료시 프로테아제의 효과는 손상의 동물 모델에서 평가할 수 있다. 하나의 이러한 모델에서, 심근 허혈은 이의 기원으로부터 5 내지 8mm의 좌전하방(LAD) 관상 동맥주변을 3-0 실크 봉합하고 결찰을 단단히 묶어 혈관이 완전히 폐쇄되도록 함으로써 내부 심낭막이 절개된 토끼에서 유발시킨다[참조: Buerke et al., (2001) J Immunol 167:5375]. 예를 들면, 본원에 제공된 변이 MT-SP1 폴리펩타이드와 같은 프로테아제, 또는 염수와 같은 대조군 비히클을 관상 폐색후 55분(즉, 재관류 5분 전)에 볼루스로서 증가되는 투여량으로 정맥내 제공할 수 있다. 5분 후(즉, 총 60분의 허혈 후), LAD 결찰을 풀고 허혈성 심근을 3시간 동안 재관류시킬 수 있다. 재관류 기간의 말기에, LAD 주변의 결찰을 단단히 묶는다. 허혈 손상에 있어서 프로테아제의 효과는 심근 괴사, 혈소판 크레아틴 키나제 수준, 및 예를 들면, 마이엘로퍼옥시다제 활성 및 슈퍼옥사이드 라디칼 방출과 같은 호중구 활성화의 마커에 있어서의 효과를 평가함으로써 분석할 수 있다.
6% 사람 혈장을 함유하는 크렙스-헨셀레이트(Krebs-Henseleit) 완충액을 사용한 분리된 마우스 심장의 관류시 지속된 보체-매개된 심근 손상의 다른 모델에서, 프로테아제 또는 변형된 프로테아제를 사용한 치료를 사용하여 심장에 대한 조직 손상을 제한할 수 있다. 이러한 예에서, 심장을 관류시키는데 사용된 완충제는 본원에 제공된 MT-SP1 폴리펩타이드와 같은, 그러나 이에 한정되지 않는, 다양한 투여량의 프로테아제로 보충시킬 수 있다. 관류된 심장은 사람 C3 및 C5b-9의 침착, 관상 동맥 관류압, 말단-확장기압 및 심장 속도에 대해 평가할 수 있다.
예를 들면, 본원에 제공된 변이 MT-SP1 폴리펩타이드와 같은 프로테아제 및 변형된 프로테아제는 심폐 우회(CPB) 또는 관상 동맥 우회 이식술 이전 또는 후에 치료제로서 사용함으로써 흔히 우회를 수반하고 조직 손상에 기여할 수 있는 염증성 면역 반응을 억제할 수 있다. 체외 우회 회로에서 전혈의 시험관내 재순환을 사용하여 혈소판 및 백혈구 변화 및 CPB에 의해 유발된 보체 활성화를 자극할 수 있다[참조: Rinder et al. (1995) J. Clin. Invest. 96:1564]. 이러한 모델에서, 다양한 투여량의 프로테아제 또는 변형된 프로테아제 또는 대조군 완충제의 첨가제를 건강한 공여자로부터의 혈액 및 돼지 헤파린을 이미 함유하는 이동 팩에, 체외 회로에 혈액을 첨가하기 직전에 가할 수 있다. 혈액 샘플은 재순환 후 5, 15, 30, 45, 60, 75 및 90분째에 회수하여 예를 들면, 용혈 검정 및/또는 보체 활성화와 같은 보체 연구를 위해 검정하여 C5a, C3a 및/또는 sC5b-9를 측정할 수 있다. 혈액 샘플의 유동 세포분석을 수행하여 예를 들면, CD11b 및 P-셀렉틴 수준과 같은 혈액내 순환하는 백혈구(즉, 호중구)의 집단에 대해 부착 분자의 수준을 측정할 수 있다.
K. 실시예
하기 실시예는 단지 예시 목적으로 포함되며 본 발명의 범위를 한정하는 것으로 의도되지 않는다.
실시예 1
돌연변이 PAI -1 억제제
A. 돌연변이 PAI -1 억제제의 발현 및 정제
사람 PAI-1의 cDNA를 보유하는 재조합체 플라스미드, pPAIST7HS(서열번호 396에 제시된 N-말단 Met를 함유하는 성숙한 PAI-1을 암호화)를 주형으로 사용하여 PAI-1 반응성 중심 루프의 아미노산 서열내로 변형을 도입시켰다. 플라스미드 pPAISTHS는 뉴클레오타이드 쌍 1에서 HindIII 부위 및 뉴클레오타이드 쌍 2106에서 SalI 부위를 결여하고 있는 플라스미드 pPAIST7의 유도체이다. 플라스미드 pPAIST7은 문헌[참조: Franke et al. (1990) Biochimic et Biophysica Acta 1037: 16-23]에 기술된 바와 같이 생성시켰다. 요약하면, PAI-1 cDNA 클론 pPAI-11RB를 제한 엔도뉴클레아제 ApaLI 및 PflMI으로 절단하고 PAI-1의 잔기 1에 대한 코돈 중 2bp를 함유하는 PAI-1의 1127 bp 단편 및 379-잔기 단백질의 잔기 2 내지 376에 대한 완전한 암호화 서열을 겔 전기영동으로 정제하였다. 합성 링커를 작제하여 PAI-1 cDNA 암호화 서열의 말단 둘다를 재작제하고 서열번호 396에 제시된 아미노산 서열을 갖는 성숙한 PAI-1을 생성하는 성숙한 PAI-1의 첫번째 잔기를 암호화하는 트리플렛(triplet) 바로 앞에 ATG 단백질 합성 개시 코돈을 도입시켰다. 또한, cDNA 암호화 영역의 플라스미드 pBR322내로의 삽입을 촉진시키기 위해, 링커를 설계하여 PAI-1 cDNA 단편의 5' 및 3' 말단 각각에서 EcoRI 및 HindIII 제한 엔도뉴클레아제 부위를 생성시켰다. 합성 링커는 다음과 같다: N-말단, 5'AATTCTATGG-3'(서열번호 392) 및 5'-TGCACCATAG-3'(서열번호 393); C-말단, 5'-ATGGAACCCTGAA-3'(서열번호 394) 및 5'-AGCTTCAGGGTTCCATCAC-3'(서열번호 395). 링커를 사용전에 폴리뉴클레아제 키나제로 처리하였다. 이후에, 합성 링커(5' 말단에서 10 bp 및 3' 말단에서 13 bp)를 1127 bp ApaLI-PflMI DNA 단편에 연결하고, EcoRI 및 HindIII로 분해하고 1146 bp EcoRI-HindIII 단편을 겔 전기영동으로 분리하고 EcoRI 및 HindIII 절단된 pBR32(서열번호 377)내로 클로닝하였다.
pPAIST-7 발현 플라스미드의 작제를 개시하기 위해, pBR322 벡터내 서브클론을 EcoRI으로 절단하고 선형 플라스미드를 세균 알칼린 포스파타제로 탈인산화하였다. trp 프로모터 및 리보솜 결합 부위를 함유하는 pC5A-48로부터 360 bp EcoRI DNA 단편을 사용하여 pPAIST-7을 표준 연결에 이어 생성시켰다.
pPAIST7HS 원핵생물 세포 발현 벡터[참조: Shubeita et al. (1990) J Biol. Chem., 265: 18379-18385]를 생성시키기 위해, pPAIST7를 HindIII로 부분 분해하여 플라스미드를 선형화시키고, 이.콜라이 DNA 폴리머라제 I의 클레노우 단편으로 평활-말단화하고 연결하여 상부 HindIII 부위를 제거하였다. HindIII 및 SalI 부위 사이에 PAI-1 암호화 서열의 하류에 pPAIST7내 서열의 결실 및 SalI 부위의 제거는 일련의 부분 SalI 분해, 완전한 HindIII 분해, 이.콜라이 DNA 폴리머라제 I의 클레노우 단편을 사용한 평활-말단화 및 연결로 달성하였다.
돌연변이유발 반응은 다수 부위 돌연변이유발 키트(제조원: 스트라타젠)에 이은 공급업자가 정의한 조건에 따라 수행하였다. 아미노산 VSARM(서열번호 378)에 상응하는 반응성 중심 루프내 P4-P1' 위치에서 야생형 PAI-1내 아미노산의 돌연변이유발을 이루었다. P4-P1' 위치로부터의 PAI-1 반응성 중심 루프내 야생형 아미노산 서열 VSARM의 RRARM(서열번호 379)으로의 치환(PAI-1/RRAR)을 함유하는 돌연변이 PAI-1(PAI-1/RRAR)을 제조하였다. RRARM 돌연변이유발원성 프라이머의 서열은 5'-CCACAGCTGTCATAAGGAGGGCCAGAATGGCCCCCGAGGAGATC-3'(서열번호 380)이다. P4 내지 P1' 위치로부터 PAI-1 반응성 중심 루프내 야생형 아미노산 서열 VSARM의 PFGRS(서열번호 389)로의 치환을 함유하는 제2 돌연변이 PAI-1(PAI-1/69)을 제조하였다. PFGRS 돌연변이유발원성 프라이머에 대한 서열은 5'-CACAGCTGTCATACCCTTCGGCAGAAGCGCCCCCGAGGAGATC-3'(서열번호 390)이다. 돌연변이유발에 이어, 형질전환체로부터 분리한 DNA를 완전히 서열분석하여 임의의 추가의 돌 연변이의 부재 및 바람직한 돌연변이의 존재를 확인하였다.
돌연변이 PAI-1/RRAR 및 PAI-1/69를 pPAIST7HS 벡터에 존재하는 N-말단 폴리 히스티딘 잔기를 이용하여 융합 단백질로서 발현시켰다. 돌연변이 PAI-1 (즉, PAI-1/RRAR 및 PAI-1/69)의 발현 및 정제는 문헌[참조: Ke et al., J Biol. Chem., 272: 16603-16609 (1997)]에 기술된 방법을 기초로 하였다. PAI-1의 야생형 및 돌연변이된 변이체의 발현은 돌연변이 PAI-1을 암호화하는 pPAIST7HS 벡터의 0.1㎍ DNA를 이소프로필-1-티오-β-D-갈락토피라노사이드의 존재하에 T7 RNA 폴리머라제를 합성하는 이.콜라이 균주 BL21[DE3]pLysS(제조원: 노바겐)내로 형질전환시켜 달성하였다. 세균 배양물을 37℃에서 1.1 내지 1.3의 A595 흡광도까지 격렬히 진탕시키면서 성장시키고, 이소프로필-1-티오-β-D-갈락토피라노사이드를 1　mM의 최종 농도로 가하여 T7 RNA 폴리머라제의 합성 및 PAI-1 단백질의 생산을 유도하였다. 배양물을 추가로 1 내지 2시간 동안 37℃에서 성장시킨 후 30℃에서 2 내지 6시간 동안 성장시켰다. 세포를 8000 x g에서 20분 동안 4℃에서 원심분리하여 펠릿화하고 40　ml의 냉 출발 완충액(20　mM 나트륨 아세테이트, 200　mM NaCl 및 0.01% 트윈 20,　pH 5.6) 속에 재현탁시켰다. 세포 현탁액을 프렌치 압력 셀(French pressure cell)[제조원: 아미코(Aminco)] 속에서 파괴하고 25분 동안 32,000 x g에서 한외원심분리로 제거하였다.
가용성의, 활성 돌연변이 PAI-1의 정제는 PAI-1/RRAR 또는 PAI-1/69를 함유하는 이.콜라이의 분해물을 CM-50 세파덱스[제조원: 파마시아(Pharmacia)]가 충진 된 XK-26 컬럼[제조원: 파마시아 바이오테크 인크(Pharmacia Biotech Inc)]상에 주사하여 수행하였다[참조: 예를 들면, Sancho et al. (1994) Eur. J.　Biochem. 224, 125-134]. 컬럼을 5개 컬럼 용적의 출발 완충액(20　mM 나트륨 아세테이트, 200　mM NaCl 및 0.01% 트윈 20,　pH 5.6)으로 세척하고, PAI-1 단백질을 동일한 완충액 속에서 0.2 내지 1.8 M 선형구배의 NaCl을 사용하여 용출시켰다. 피크 분획을 수집하고, 혼주하여 센티플러스 30　원심분리기(제조원: 아미콘)를 사용하여 농축시켰다. 농축된 분획을 활성 측정에 사용하였다.
B. PAI -1 활성 측정
1. 표준 트립신에 대한 활성 부위 적정
PAI-1/RRAR 및 PAI-1/69의 활성 농도는 문헌[참조: Olson et al., J. Biol. Chem., 270: 30007 (1995)]에 기술된 바와 같이 표준 트립신에 대한 활성 부위 적정으로 측정하였다. 요약하면, 농축된 억제제(0.5 내지 6.0 μM)의 연속적인 첨가로 1μM β-트립신(제조원: 시그마) 및 10μM p-아미노벤즈아미딘 프로브(제조원: 시그마)의 용액으로 제조하였다. 결합을 결합된 억제제로서 효소 활성 부위로부터 결합된 프로브의 교체를 동반하는 형광성의 감소로부터 모니터하였다. 각각의 농축된 억제제를 첨가한 후 1 내지 2분 평형 시간을 각각 325nm 및 345nm의 여기 및 방사 파장에서 형광성 변화의 평가전에 허용하여 결합된 및 유리된 프로브 형광성 사이의 차이를 최대화하였다. 트립신 효소의 부재하에서 억제제를 사용한 프로브 만의 대조군 적정을 수행하여 백그라운드 형광성을 교정하였다. 억제제-효소 적정은 선형 회귀 분석으로 적합하게 하였다.
2. 표준화된 t- PA 제제의 역가
돌연변이 PAI-1을 또한 활성을 평가하기 위해 표준화된 t-PA 제제에 대해 적정하였다. 야생형 PAI-1 또는 돌연변이 PAI-1의 억제 활성을 tPA[제조원: 아메리칸 디아그노스틱스, 인크(American Diagnostics, Inc), 100 U/㎍) 및 색소생성 tPA 기질 H-D-Ile-Pro-Arg-파라-니트로아닐린 기질[S-2288, 제조원: 크로모게닉스(Chromogenix)]을 사용한 직접적인 색소생성 검정으로 측정하였다. 연속 희석된 PAI-1 (0.1 내지 4.0 ㎍)을 t-PA와 미세역가 플레이트 속에서 고정 시간(통상적으로, 20 내지 60분) 동안 실온에서 항온처리하고 tPA의 잔류 활성을 색소생성 기질 S-2288을 0.5 mM의 최종 농도로 첨가하여 측정하였다. t-PA의 잔류 활성에 이은 증가하는 농도의 억제제와의 항온처리는 405 nm에서의 흡광도를 측정하여 평가하였다.
실시예 2
u- PA 변이체의 파지 디스플레이 라이브러리의 작제
A. 파지미드로의 야생형 u- PA 의 클로닝
파지상에서 u-PA의 프로테아제 도메인의 작용성 디스플레이를 입증하기 위하여, 고 정확도 PCR을 프라이머 496 및 497, Pfu DNA 폴리머라제 및 주형으로서 완전한 길이의 u-PA 유전자(서열번호 474)의 cDNA를 함유하는 pCMV4 플라스미드(서열 번호 373)를 사용하여 수행하였다. PCR 증폭에 사용된 프라이머는 다음과 같다: 496, 5'-ACGTGGCCCAGGCGGCCTTTCAGTGTGGCCAAAAG-3'(서열번호 374); 497, 5'-TCCTGGCCGGCCTGGCCGAGCAGGCCATTCTC-3'(서열번호 375). 프라이머 둘다는 5' 말단에서 SfiI 효소에 대한 제한 부위(밑줄)를 보유한다. 정제 및 SfiI 분해 후, PCR 생성물을 SfiI 분해된 파지미드 벡터, pComb3H (서열번호 376)[참조: Andris-Widhopf et al. (2000) J Immunol Methods, 28: 159-81]로 연결시켰다. 파지미드는 야생형 또는 돌연변이 u-PA의 일가 디스플레이에 사용하였다(하기 참조). 당해 작제물은 fd 파지의 gIIp 유전자의 C-말단을 암호화하는 서열을 함유한다. 2개의 상이한 인지 서열을 갖는 벡터내 2개의 SfiI 제한 부위의 존재는 상기 언급한 프라이머를 설계하기 위해 이용하였다. PCR 생성물은 u-PA 프로테아제 도메인 cDNA(서열번호 475)의 프라이머 496 및 497 가능한 직접적인 클로닝을 사용하여 파지미드내로 증폭시켰다(연결 조건에 대해서는 하기 참조). 최종 작제시, u-PA 프로테아제 도메인을 함유하는 PCR 생성물을 OmpA 및 gIIIp 서열의 중간에 클로닝하여 야생형 또는 돌연변이 u-PA를 N-말단 gIIIp 융합체로서 나타내었다.
B. 돌연변이 u- PA 및 돌연변이 u- PA 의 파지 디스플레이 라이브러리의 작제
u-PA 파지 디스플레이 라이브러리를 작제하기 위해, 오류-빈발 PCR 증폭을 주형으로서 uPA 유전자의 cDNA를 함유하는 pCMV4/u-PA 플라스미드를 사용하여 위에서 제시한 바와 같이, PCR 다양화 돌연변이유발 키트(제조원: 클론테크)로 보충된 시약을 사용하여 100㎕ 반응 혼합물 속에서 25회 주기로 수행하였다. 적절한 PCR 조건은 제조업자가 기술한 바와 같이 변화하는 양의 망간(MN2+) 또는 dGTP에 의해 상기한 프라이머 496 및 497을 사용하여 uPA 유전자 (서열번호 475)의 프로테아제 도메인만을 증폭시키기 위해 3개의 상이한 PCR 반응을 설정하기 위해 수반하여 cDNA내로 0.2, 0.5 또는 0.9%의 돌연변이율 혼입을 달성하였다. 증폭된 PCR 생성물(805 bp, 서열번호 475)을 PCR 정제 키트[제조원: 퀴아젠]에 이어 SfiI 효소 분해로 정제하였다. 각각의 돌연변이유발 반응물로부터 SfiI 분해된 PCR 생성물을 사용하여 3개의 상이한 라이브러리를 생성하였다.
라이브러리 작제를 위해, pComb3H 벡터 (서열번호 376)를 SfiI 효소로 분해하고 이러한 반응물로부터 보다 큰 DNA 단편을 "겔 슬라이스 키트(Gel slice kit)" (제조원; 퀴아젠)를 사용하여 정제하였다. 3개의 별개의 연결 반응을 수행하여 0.2, 0.5 및 0.9% 돌연변이율을 함유하는 PCR 생성물을 가진 3개의 라이브러리를 작제하였다. 적어도 1㎍의 겔 정제된 벡터를 SfiI 분해된 PCR 생성물(1:2 비)와 혼합하고 연결 혼합물을 밤새 18℃에서 항온처리하였다. 그 다음, 연결 혼합물을 퀴아젠 미니 용출 키트(제조원: 퀴아젠)를 사용하여 정제하고 DNA를 최종적으로 60㎕의 미니 Q 정제된 물속으로 용출시켰다. 정제된 DNA를 400㎕의 이.콜라이 XL Blue1 전기천공 적격(competent) 세포(제조원: 스트라타젠)내로 유전자 펄서(pulser)[제조원: 바이오 라드(Bio Rad)]를 사용하여 전기천공시켰다. 이후에 세포를 10 ml의 SOC 배지(제조원: 인비트로젠)으로 옮기고 37℃에서 진탕기 속에서 1시간 동안 항온배양 한 후 카르베니실린(75㎍/mL)이 보충된 거대한 LB 한천 클레이트(245 mm X 245 mm) 상에 플레이팅하였다. 플레이트를 30℃에서 밤새 항온처리 한 후, 형질전환체를 세포 스크래퍼로 긁어 수득되는 배양물을 카르베니실린(75㎍/ml)이 보충된 2X YT 배지 속에서 37℃로 2시간 동안 진탕하면서 성장시켰다. 배양물을 헬퍼 파지(VCS M13)로 MOI(감염 다중도) 5로 라이브러리의 증폭을 위해 감염시켰다. 37℃에서 1시간 동안 진탕시킨 후, 배양물에 카나마이신을 3㎍/mL의 최종 농도로 보충하고 밤새 30℃에서 진탕하며 성장시켰다. 세포를 수거하고 상청액 속에 존재하는 파지 입자를 PEG-NaCl 용액을 사용하여 침전시켰다. 동시에, 각각의 라이브러리의 다양성을 계산하기 위하여, 전기천공된 세포의 분취량을 카브베니실린(100㎍/ml)이 보충된 LB 한천 플레이트상에서 플레이팅하고 37℃에서 밤새 항온배양한 후 콜로니를 계수하였다. 동일한 방법을 사용하여 PAI-1/RRAR 억제제에 대한 확인된 u-PA 변이체의 추가의 개선에 대해 u-PA 파지 디스플레이 라이브러리의 연속 세대를 생성시켰다. 앞서의 라이브러리로부터 확인된 u-PA 변이체의 DNA를 다음 세대 라이브러리의 작제를 위한 주형으로서 사용하였다.
무작위 돌연변이유발을 사용하여 생성시킨 야생형 또는 u-PA 파지의 촉매 효능을 간접적인 플라스미노겐 활성화 검정을 사용하여 분석하였다. 요약하면, 5㎕의 u-PA 파지(통상적으로 약 5 x 1012 cfu), 0.2μM Lys-플라스미노겐[제조원: 아메리칸 디아그노스틱(American Diagnostic)] 및 0.62 mM 스펙트로자임 PL(제조원: 아메리칸 디아그노스티카)을 총 100㎕의 용적 속에 두었다. 검정은 미세역가 플레이트 속에서 수행하였으며, 405 nm에서의 광학 밀도를 몰레큘러 디바이스 터모막스(Molecular Devices Thermomax) 속에서 1시간 동안 매 30초마다 판독하였다. 반응은 37℃에서 수행하였다. u-PA 또는 u-PA 변이체 파지의 억제를 또한 평가하였 다. 요약하면, 5㎕의 u-PA 파지(통상적으로 약 5 x 1012 cfu)를 wt-PAI-1 (0.1μM) 또는 돌연변이 PAI-1/RRAR 억제제(1.0 μM)와 혼합하고 30분 동안 실온에서 항온배양한 후 0.62 mM 스펙트로자임 PL, 0.2μM Lys-플라스미노겐(제조원: 아메리칸 디아그노스틱스, 인크.)을 첨가하였다. 검정물을 위에서 언급한 바와 같이 판독하였다.
실시예 3
돌연변이체 억제제에 대한 u- PA 파지 라이브러리로부터의 변이 u- PA 의 선별
A. u- PA 파지/돌연변이 PAI -1 복합체의 선별
돌연변이 PAI-1/RRAR 억제제 또는 PAI-1/69를 패닝 시험(panning experiment)에서 "베이트 기질(bait substrate)"로서 사용하여 상기 실시예 2에 기술된 거대한 조합 u-PA 파지 디스플레이 라이브러리로부터 돌연변이체 기질 서열에 대한 개선된 반응성을 가진 변경된 u-PA 파지를 분리하였다. 요약하면, 모든 3개의 u-PA 파지 라이브러리(0.2, 0.5 및 0.9% 돌연변이유발 빈도)로부터 u-PA 파지의 동일한 표시를 함유하는 5㎕(약 2 X 1012 내지 약 1 X1013) u-PA 파지를 5㎕ 베이트 기질(0.1 내지 1.0μM의 PAI-1/RRAR 또는 PAI-1/69) 및 10 ㎕ 10X 간접 완충액 pH 7.4 (0.5 M 트리스, 1.0 M NaCl, 10 mM EDTA, 0.1% 트윈 80)을 총 100㎕의 용적(즉, 80㎕ H20를 함유한 반응물) 속에서 혼합하였다. 반응물을 다양한 시간 동안 실온(통상적으로 1시간, 그러나 항온처리 시간은 용액의 엄중성을 제어하기 위해 조절되었다)에서 항온처리하였다.
u-PA 파지-PAI-1 억제제 복합체를 CuSO4 활성화된 세파로즈를 사용하여 포획하였다. 킬레이팅 세파로즈(200 ㎕; 제조원: 파마시아)의 예비-활성화는 CuSO4 (100 mM)로 처리하여 달성하였다. CuSO4 활성화된 세파로즈를 PBS 완충액속에서 0.5% BSA로 1시간 동안 실온에서 차단시켰다. 100㎕의 BSA 차단된 세파로즈 비드를 100㎕의 상기 패닝 혼합물 반응물에 800㎕의 결합 완충액(0.5 M NaCl, 20 mM 트리스, 20 mM 이미다졸, pH7.4)의 존재하에 가하여 His-태그화된 PAI-1 억제제-u-PA 파지 복합체를 포획하였다. 항온처리를 추가로 1시간 동안 실온에서 지속하였다. 그 다음, 패닝 혼합물을 1분 동안 2000rpm에서 원심분리하고 결합된 u-PA 파지-PAI-1 억제제 복합체를 함유하는 세파로즈 비드를 1 ml의 결합 완충액으로 세척하여 결합하지 않은 파지를 제거하였다. 세척 단계를 5 내지 10회 반복하고 결합된 복합체를 함유하는 비드를 각각의 세척 후 새로운 튜브로 옮겨 비특이적 파지의 임의의 잠재적인 "이동(carry over)"을 피하였다.
결합된 u-PA 파지-PAI-1/RRAR 복합체를 100㎕의 용출 완충액 (0.5M EDTA) 속에서 용출시켰다. 95㎕의 분취량의 용출된 파지를 사용하여 1 ml의 XL-1 Blue 이.콜라이 세포 (0.6 OD)를 감염시켜 라이브러리의 배출을 계산하였다(선택 후 수득된 파지의 수를 나타냄). 감염된 세균을 카르베니실린(75 ㎍/ml)을 함유하는 거대 플레이트(245 mm X 245 mm) 상에 플레이팅하여 선택듸 다음 회차에 대한 라이브러리 를 생성시켰다. 최종적으로 나머지 배출 라이브러리(즉, 선택된 파지)를 사용하여 다음 회차의 선택을 위한 새로운 라이브러리를 스크리닝하고/하거나 생성하기 위한 개개의 파지 클론을 제조하였다. 선택에 사용된 베이트 기질의 농도 및 라이브러리와 베이트 기질의 항온처리 시간을 목적한 엄중성 수준에 따라 조절하였다. 예를 들면, 조건을 선택하여 라이브러리의 u-PA 활성의 <1%, 2%, 5%, 10% 또는 10% 이상이 베이트 기질 서열를 함유하는 "베이트 PAI-1"에 의해 억제되도록 할 수 있었다. 통상적으로, 처음 회차의 선택은 보다 높은 농도(예를 들면, 0.5μM)의 베이트 PAI-1을 사용하여 수행하고 성공적인 회차의 선택을 위해 베이트 서핀 농도 및 라이브러리와의 항온처리 시간을 감소시켰다. 또한, 다수의 엄중성을 각각의 회차의 선택에서 일치하게 사용하였다. 배출[예를 들면, 쌍을 이룬 +/- 베이트 서핀 선택에서 파지 배출의 노이즈 비에 대한 시그날(하기 기술 참조)]의 품질 및 작용 분석을 기준으로 수득되는 "히트(hit)"의 품질을 기준으로 하여, 하나 이상의 이러한 선택으로부터 파지 배출을 다음 회차의 선택을 향해 수행하였다.
일치하게, 대조군 시험을 베이트없이 u-PA 라이브러리로부터의 파지 선택을 위한 상술한 조건을 사용하여 수행하고, 당해 대조군 시험으로부터의 파지를 베이트 서핀 기질의 존재하에 라이브러리 선택의 배출과 비요하였다. 베이트의 존재하에 선택된 라이브러리의 배출로부터의 cfu는 일반적으로 대조군 선택으로부터 수득된 배출보다 104 내지 105 더 높은 범위였다. 보다 높은 백그라운드가 대조군 선택으로 관측된 경우, 패닝을 배양 시간 감소, 반응물(라이브러리, 베이트 또는 비드)의 농도 증가 및 킬레이팅 세파로즈에 결합된 선택된 파지의 세척 수 및 시간의 증 가(10배 이상까지)와 같은 보다 엄중한 조건을 사용하여 반복하였다.
B. 새로운 기질 서열에 대한 증가된 반응성 및 촉매 효능을 갖는 u- PA 파지의 스크리닝
용출된 u-PA 파지 (5㎕)의 분취량을 XL-1Blue 이.콜라이 세포 (100 ㎕)와 감염을 위해 혼합하고 37℃에서 1시간 동안 항온배양하였다. 감염된 이.콜라이 세포를 이후에, 카르베니실린(100 ㎍/ml)이 보충된 LB 한천 플레이트 상에 플레이팅하였다. 37℃에서 밤새 항온배양한 후, 개개의 콜로니를 파지 제조를 위해 집었다. 세포를 2 ml의 카르베니실린(100㎍/ml) 및 테트라사이클린(10㎍/ml)이 보충된 2x YT 속에서 성장시키고 파지 제조를 기술한 바와 같이 수행하였다[참조: Sambrook, J et al (1989) Molecular Cloning, A laboratory manual, Cold spring Harbor laboratory]. 확인된 파지를 다음 검정에서 시험하여 활성을 평가하였다. 개개의 파지 제제를 간접적인 플라스미노겐 활성화 검정에 사용하여 활성 파지를 확인하고, 활성 파지 제제를 억제 검정에 사용하였다.
1. 간접적인 플라스미노겐 활성화 검정
개개의 파지 제제를 간접적인 플라스미노겐 활성화 검정에 사용하여 활성 u-PA 파지를 확인하였다. 요약하면, 5㎕의 u-PA 파지 (통상적으로 약 5 x 1012 cfu), 0.2mM Lys-플라스미노겐(제조원: 아메리칸 디아그노스틱) 및 0.62mM 스펙트로자임 PL (제조원: 아메리칸 디아그노스티카)를 총 100㎕의 용적 속에 둔다. 검정을 미세역가 플레이트속에서 수행하고, 405nm에서의 광학 밀도를 1시간 동안 매 30초마 다 몰레큘러 디바이스 터모막스(Molecular Devices Thermomax) 속에서 판독하였다. 반응을 37℃에서 수행하였다.
2. 돌연변이 PAI -1/ RRAR 에 의한 u- PA 파지의 억제
간접적인 플라스미노겐 활성 검정에서 활성으로 확인된 파지를 또한 돌연변이 PAI-1/RRAR에 의한 억제에 대해 시험하였다. 요약하면, 억제 검정을 위해, 5㎕의 활성 u-PA 파지(통상적으로 약 5 x 1012 cfu)를 미세역가 플레이트의 2개 웰 속에 가한 후 고정된 농도의 돌연변이 PAI-1(예를 들면, 1.0μM)를 하나의 웰에 가하고 포스페이트 완충된 염수(PBS)를 2개의 웰에 가하였다. 혼합 후, 반응이 고정 시간(예를 들면, 30분) 동안 실온에서 지속되도록 한 후 0.62 mM 스펙트로자임 PL, 0.2μM Lys-플라스미노겐(제조원: 아메리칸 디아그노스틱스, 인크)를 첨가하였다. 대조군 시험을 위해, 야생형 u-PA 파지를 동일한 조건하에서 평가하였다. 플레이트를 분광광도계 속에서 2시간 동안 405nm에서 판독하였다. 야생형 u-PA 파지와 비교하여 PAI-1/RRAR 또는 PAI-1/69에 대해 개선된 선택성을 나타낸 선택된 u-PA 파지를 추가의 분석을 위해 선택하고 DNA 서열분석에 적용시켰다.
3. 펩타이드 기질 스크리닝
또한, 개선된 촉매 효능을 갖는 u-PA 파지의 변이체를 확인하기 위해, 개개의 파지 클론을 Ac-RRAR-AMC 기질에 대해 스크리닝하였다. 검정을 위해, 고정된 용적의 파지 상청액(예를 들면, 35㎕)을 75μM Ac-RRAR-AMC 기질과 1X 간접 검정 완충액(50 mM 트리스, 100 mM NaCl, 1 mM EDTA, 0.01% 트윈 80) 속에서 총 100㎕의 용적으로 혼합하였다. 검정을 96-웰 또는 384-웰 차단 검정 플레이트[제조원: 코 닝(Corning)] 속에서 수행하고 2시간 동안 분광광도계[제조원: 몰레큘러 디바이스] 판독기에서 2시간 동안 380 내지 450 nm에서 판독하였다.
이들의 개선을 확인하기 위해, 억제제 및 펩타이드 기질 스크리닝 후 확인된 양성 u-PA 파지를 위에 제시된 검정을 사용하여 재-스크리닝하였다.
C. 선별된 u- PA 돌연변이체의 확인 및 확인된 돌연변이체의 최적화
양성 파지 클론을 위에서 언급한 바와 같이 감염용 XL-1Blue 이.콜라이 세포와 혼합하고 배양물을 밤새 진탕하면서 37℃에서 성장시켰다. 플라스미드 DNA를 밤새 배양물로부터 플라스미드 제조 키트(제조원: 퀴아젠)를 사용하여 정제하였다. DNA를 다음 프라이머를 사용하여 통상의 서열분석하였다: 535- 5'-CAGCTATCGCGATTGCAG-3'(서열번호 381); 5542- 5'-GTGCGCAGCCATCCCGG-3'(서열번호 382). 돌연변이 u-PA 유전자에서 변경된 아미노산 잔기는 서열분석 데이터를 분석한 후 확인하였다.
표 10은 PAI-1/RRAR 돌연변이체 억제제에 대한 u-PA 파지 라이브러리로부터 변이 u-PA의 선택으로부터 확인된 u-PA의 변이체를 제시한다. 하기 표 10에 제시된 돌연변이는 키모트립신 번호매김을 사용하였다. 괄호안의 숫자는 돌연변이체가 파지 선택 방법에서 확인된 횟수를 나타낸다. 활성 검정으로부터의 결과를 기준으로 하여, u-PA 파지의 가장 우수한 변이체를 밑줄로 강조한다. 설계된 돌연변이를 함유하는 성숙한 u-PA 프리프로단백질 (서열번호 433)은 서열번호 434 내지 445 중 어느 것으로 제시된다.
Figure 112009007335988-pct00021
PAI-1/69 억제제에 대한 증가된 선택성에 이어 PAI-1/69 억제제에 대한 선택을 나타내는 돌연변이 u-PA 유전자내 변경된 아미노산 잔기를 위에서 제시한 서열분석 데이터를 분석한 후 확인하였다. 제1 세대 프로테아제 파지 디스플레이 라이브러리(I)로부터 확인된 돌연변이체는 하기 표 11에서 제시한다. 프로테아제 파지 디스플레이 라이브러리의 후속적인 세대를 실시예 2B에서 상기 제시된 바와 같은 방법을 사용하여 PCR 다양성 돌연변이유발 키트 및 프라이머 496 및 497을 사용하여 생성하였다. 제II 세대 파지 디스플레이 라이브러리에 대해, 키모트립신 번호매김을 기준으로 하여 F30V에 상응하는 돌연변이를 함유하는 u-PA 돌연변이 u-PA/Ic를 돌연변이유발 반응용 주형으로 사용하였다. 제2 세대 프로테아제 파지 디스플레이 라이브러리(II)로부터 확인된 돌연변이체는 하기 표 11에 제시한다. 제III 세대 파지 디스플레이 라이브러리를 위해, 키모트립신 번호매김을 기준으로 하여, F30V/Y61(A)H 또는 F30V/K82E를 각각 함유하는 u-PA 돌연변이 u-PA-IIb 또는 u-PA-IIb 돌연변이체를 돌연변이유발 반응용 주형으로 사용하였다. 제3 세대 프로테아제 파지 디스플레이 라이브러리(III)로부터 확인된 돌연변이체는 하기 표 11에 나타낸다. 제IV 세대 파지 디스플레이 라이브러리를 위해, 키모트립신 번호매김을 기준으로 하여 F30V/K82E/V159A에 상응하는 돌연변이를 함유하는 u-PA 돌연변이 u-PA/IIIa를 돌연변이유발 반응용 주형으로 사용하였다. 제4 세대 프로테아제 파지 디스플레이 라이브러리(IV)로부터 확인된 돌연변이체는 하기 표 11에 제시한다. 괄호안의 숫자는 동일한 돌연변이를 갖는 것에 대해 u-PA 파지가 선별된 횟수를 나타낸다. 밑줄은 돌연변이체에 의해 획득된 신규 돌연변이를 나타낸다. 지정된 돌연변이를 함유하는 성숙한 u-PA 프리프로단백질(서열번호 433)의 아미노산 서열은 서열번호 460 내지 472 중 어느 것에 제시한다.
Figure 112009007335988-pct00022
1. PAI -1/ RRAR 억제제에 대해 초점화된 파지 디스플레이 라이브러리에서 아미노산 잔기 30 및 155의 최적화 및 재조합화
PAI-1/RRAR 억제제에 대한 u-PA 변이체의 민감성을 풍부하게 하기 위해, 키모트립신 번호매김을 기준으로 하여 아미노산 30 및 아미노산 155번(상기 표 10에 제시된 것으로서 첫번째 선택에서 핫 스팟으로 확인됨)를 무작위 및 다음 프라이머 각각을 사용한 재조합을 위해 표적화하였다:
TC30- 5'GCCCTGGNNSGCGGCCATC-3' (서열번호 383)
TC155- 5'GGAGCAGNNSAAAATGACTG-3'(서열번호 384)
돌연변이유발을 퀵 챈스 다중 부위-지시된 돌연변이유발 키트(Quick Change multi site-directed mutagenesis kit)(제조원; 스트라타젠)을 사용하고 제조업자가 기술한 조건에 따라 수행하였다. 요약하면, T4 폴리뉴클레오타이드 키나제(제조원: 뉴질랜드 잉글랜드 바이오랩(New England Biolabs)]를 사용하여 제조업자가 기술한 조건에 따라 프라이머를 인산화한 후, 3개의 상이한 반응을 잔기 30 및 155의 무작위화에 대해 수행하였다: 1) 개별적으로 30; 2) 개별적으로 155 ; 및 30과 155 함께. 상응하는 야생형 u-PA 프로테아제 도메인 서열과 비교하여 잔기 L73A 및 I89V에서 돌연변이를 보유하는 DNA 작제물, pComb3H/u-PA 변이체 (pARF 81)를 프라이머 TC30 (서열번호 383) 및 TC155 (서열번호 384)를 개별적으로 위치 30 및 155 각각의 무작위화를 위해 사용하는 돌연변이유발 반응에서 주형으로 사용하였다. 다른 반응에서, 이들 2개의 프라이머를 사용하여 다중 부위 돌연변이유발 키스(제조원: 스트라타젠)을 사용하여 공급업자가 명시한 조건에 따라 수행하였다. 돌연변이유발 후, 반응 생성물을 라이브러리 작제를 위해 XL-1 Blue 이.콜라이 세포내로 형질전환시켰다(참조: 상기 실시예 2). 증폭된 u-PA 파지 라이브러리를 상기 실시예 3A 및 3B에 제시된 개선된 변이체의 선별에 사용하였다.
표 12는 초점화된 u-PA 파지 라이브러리로부터 변이 u-PA의 PAI-1/RRAR 돌연변이체 억제제에 대한 선택으로부터 확인한 u-PA의 변이체를 제시하는데, 여기서, 모든 변이체는 키모트립신 번호매김을 기준으로 아미노산 잔기 L73A 및 I89V에서의 백그라운드 돌연변이를 갖는다. 하기 표 12에 제시된 돌연변이는 키모트립신 번호매김을 사용한다. 괄호안의 숫자는, 돌연변이체가 파지 선택 방법에서 확인된 횟수이다. 활성 검정으로부터의 결과를 기준으로 하여, u-PA 파지의 가장 우수한 변이체는 밑줄로 강조하였다. 설계된 돌연변이를 함유하는 성숙한 u-PA 프리프로단백질(서열번호 433)의 아미노산 서열을 서열번호 446 내지 459 중 어느 것으로 제시한다.
Figure 112009007335988-pct00023
실시예 4
COS 세포의 일시적인 형질감염에 의한 변형된 u- PA 효소의 발현
포유동물 발현 시스템에서 변이 u-PA 효소의 발현을 위해, 파지 디스플레이로부터 확인된 양성 클론을 선택된 u-PA 변이체 유전자를 암호화하는 cDNA의 PCR 증폭용 주형(돌연변이 u-PA 프로테아제 도메인 서열을 보유하는 pComb3H)으로 사용하였다. 오버랩 연장 PCR[참조: Ho, S et al (1989) Gene 77, 51-59]을 다음 프라이머를 사용하여 수행하였다:
717, 5'-TTTCAGTGTGGCCAAAAG-3'(서열번호 385);
718, 5'-CAGAGTCTTTTGGCCACA-3'(서열번호 386);
850, 5'-GGGGTACCGCCACCATGAGAGCCCTGCTGGCGCGC-3'(서열번호 387);
851, 5'-GCTCTAGATCATCAGAGGGCCAGGCCATTCTCT-3'(서열번호 388). 프라이머 850 및 851은 KpnI 및 XbaI 제한효소(밑줄) 각각에 대한 서열을 보유한다.
PCR을 하기 기술된 바와 같이 돌연변이된 cDNA u-PA 유전자의 완전한 길이 증폭을 달성하기 위해 2 단계로 수행하였다. 제1 단계에서, PCR을 100㎕ 반응물 속에서 수행하여 500 bp 생성물[u-PA의 EGF 및 크링글(Kringle) 도메인에 상응]을 Pfu DNA 폴리머라제, 프라이머 850, 718 및 완전한 길이의 uPA 유전자(서열번호 474)를 함유하는 pCMV4를 주형으로 사용하여 증폭시켰다. 유사하게, 다른 PCR을 수행하여 주형으로 프로아머 851 및 717을 적절한 돌연변이 u-PA-pComb3H를 사용하여 돌연변이 u-PA 프로테아제 도메인(800 bp, 즉, 서열번호 475에 제시된 야생형 서열과 비교하여 돌연변이체 서열에 상응)을 증폭시켰다. 이들 2개의 PCR 생성물을 겔 정제하고 다음 회차의 PCR 증폭에 사용하였다. 제2 단계에서, 겔 정제된 PCR 생성물(5㎕ 각각)을 100㎕의 반응 혼합물 속에서 주형으로 프라이머 850 및 851와 함께 사용하였다. 프라이머 717 및 718은 제2 단계 PCR에서 완전한 길이의 u-PA cDNA (1.3 kb)의 증폭을 허용하는 오버행 상보성 서열을 갖는다. PCR 생성물을 PCR 정제 키트(제조원: 퀴아젠)을 사용하여 정제한 후 KpnI 및 XbaI 제한 효소로 분해하였다. QIAquick 컬럼(제조원: 퀴아젠)을 사용하여 정제한 후, 완전한 길이의 u-PA 유전자를 KpnI 및 XbaI으로 미리 분해시킨 pCMV4 포유동물 발현 벡터 (서열번호 373)로 분해하였다. 연결 혼합물을 이.콜라이 XL-1Blue 세포내로 전기천공시키고 카르베니실린(100 ㎍/ml)이 보충된 LB 플레이트상에 플레이팅하였다. 플레이트를 37℃에서 밤새 항온처리한 후, 개개의 콜로니를 집어올려 플라스미드 정제를 위해 2ml의 LB 배지속에서 성장시켰다. 플라스미드를 다음 서열분석 프라이머를 사용하여 전체 u-PA 유전자를 서열분석하는데 사용하였다.
UPAF1- 5'ATGAGAGCCCTGCTGGCGCGCC-3' (서열번호 476) 및
UPAF2- 5'GGAAAAGAGAATTCTACCG-3' (서열번호 477).
추가의 돌연변이체들 없이, 정확한 돌연변이를 가진 돌연변이 u-PA 클론을 미디 플라스미드 제조 키트(제조원: 퀴아젠)를 사용하여 대량으로 제조하고 COS-1 세포내로 바이오-라드 유전자 펄서를 사용하여 전기천공하는데 사용하였다. 20㎍의 cDNA, 100㎍의 운반체 DNA 및 대략 107개의 COS-1 세포를 0.4-cm 큐베트내에 두고, 전기천공을 320 V, 960 마이크로파라드 및 Ω=∞에서 수행하였다[참조: Tachias et al. (1995) J Biol. Chem., 270: 18319-18322]. 전기천공 후, 형질감염된 세포를 밤새 37℃에서 10% 태아 송아지 혈청 및 5 mM 나트륨 부티레이트를 함유하는 DMEM 배지[제조원: 이르빈 사이언티픽(Irvine Scientific)] 속에서 항온배양하였다. 이후에, 세포를 무혈청 배지로 세척하고 DMEM 속에서 48시간 동안 37℃에서 항온배양하였다. 무혈청 배지를 항온배양한 후, 조건 배지를 수집하고 추가의 특성규명을 위해 사용하였다.
실시예 5
정제된 돌연변이 u-PA의 특성규명
A. 효소 농도의 측정
조건 배지 중 돌연변이 u-PA 효소의 단일쇄 형태를 플라스민-세파로즈[제조원: 칼바이오켐(Calbiochem)]로 처리함으로써 상응하는 2쇄 효소로 전환시켰다. 당해 배지 중 활성 u-PA의 농도를 상기 실시예 1에서 기술한 바와 같이 트립신 1차 표준물에 대해 미리 적정한 표준 PAI-1 억제제 제제로 활성 부위 적정하여 측정하였다. 전체 효소 농도를 실험실 매뉴얼의 프로토콜에 따라 효소-결합된 면역흡착 검정에 의해 측정하였다[참조: Harlow et al (1998) Using Antibodies, Cold Spring Harbor Laboratory]. 이들 농도의 비는 각각의 배지에서 활성인 u-PA 변이체의 분획을 생성한다.
B. u- PA 의 직접적인 색소원 검정
u-PA 활성의 직접적인 검정은 기질 카보벤즈옥시-L-γ-글루타밀(α-t-부톡시)-글리실-아르기닌-p-니트로아닐리드 모노아세테이트 염(Cbo-L-(γ)-Glu(α-t-βuO)-Gly-Arg-pNA AcOH; Spectrozyme® uPA, 제조원: 아메리칸 디아그노스티카(American diagnostica)]를 사용하였다[참조: Madison et al. (1995) J Biol. Chem., 270:7558-7562]. 효소 활성은 405nm의 흡광도에서 단위 시간당 생성된 유리(pNA)의 흡광도에 있어서의 증가를 측정함으로써 측정하였다. 반응속도 분석은 시간에 걸쳐 6 내지 8 nM의 효소 농도를 사용하여 수행하였다. Spectrazyme® uPA의 농도는 2쇄 uPA의 검정에서 25 내지 150 μM로 u-PA의 프로테아제 도메인의 검정에서 200μM로 변하였다. 반응을 96-웰 미세역가 플레이트 속에서 수행하고 반응 속도는 405 nm에서 2시간 이하 동안 매 30초마다 스펙트로막스(Spectromax) M2 또는 M5 플레이트 판독기[제조원: 몰레큘러 디바이스(Molecular Devices)]를 사용하여 측정하여 검정하였다. 반응속도 상수 kcat, Km 및 kcat/Km (특이성 상수)는 OD405에서의 흡광도 속도의 역수에 대해 기질 농도의 역수를 그래프화하고, 라인위버-버크 방정식 (1/속도=(Km/Vmax)(1/[S]) + 1/Vmax; 여기서, Vmax=[E]*kcat)에 적용시켰다.
하기 표 13은 u-PA 효소 활성의 직접적인 검정시 PAI-1/69 억제제에 대해 증가된 민감성을 나타내는 것으로 확인된, u-PA의 돌연변이체의 반응속도 분석의 결과를 나타낸다. 당해 결과는, 확인된 각각의 돌연변이 u-PA가 Spectrozyme® uPA 기질의 분해에 대한 특이성 상수(kcat/Km)의 측정으로부터 측정되는 것으로서 야생형 u-PA와 비교하여 감소된 효소 활성을 지님을 나타낸다. 표에서, 시험한 변이체는 u-PA 파지 디스플레이 라이브러리의 연속된 세대(I 내지 IV)로부터 선택 후 상기 표 11에 확인된 것들이다.
Figure 112009007335988-pct00024
C. 형광생성 기질을 사용한 u- PA 변이체의 반응속도 분석
RRAR 표적 기질 서열에 대한 u-PA 변이체의 활성을 측정하기 위한 직접적인 검정을 Ac-RRAR-AMC 기질을 사용하여 수행하였다. 7-아미노-4-메틸쿠마린(AMC) 형광생성 펩타이드 기질의 사용은 프로테아제 특이성을 측정하기 위한 통상의 방법이다[참조: Zimmerman et al. (1977) Anal Biochem, 78:47-51; Harris et al. (2000) PNAS, 97:7754-7759]. 아닐리드 결합의 특이적 절단은 형광생성 AMC 이탈 그룹을 유리시키면서, 개개의 기질에 대한 절단 속도를 측정하기 위한 효과적인 수단을 제공한다. 기질을 0.05 내지 12.0 mM로 연속 희석시키고 코스타르 96-웰 블랙 하프-영역 검정 플레이트(Costar 96-well black half-area assay plate) 속에서 프로테아제(9 내지 25nM)의 존재하에 항온처리하였다. 유리된 AMC 이탈 그룹으로부터의 형광성은 여기 파장(380nm)에서 형광성 분광광도계[제조원: 몰레큘러 디바이스 게미니 엑스피에스(Molecular Devices Gemini XPS)] 속에서 AMC 표준물에 대한 참조와 함께 측정하였다. 형광성의 증가율을 30초 간격으로 판독하면서 30분에 걸쳐 측정하였다. 반응속도 상수 kcat, Km 및 kcat/Km (특이성 상수)은 기질 절단의 속도의 역수에 대해 기질 농도의 역수를 그래프화하고, 라인위버-버크 방정식 (1/속도=(Km/Vmax)(1/[S]) + 1/Vmax; 여기서, Vmax=[E]*kcat)에 적용시켜 계산하였다.
표 14는 Ac-RRAR-AMC 기질에 대한 u-PA 변이체 ARF2 및 ARF36의 반응속도 분석의 결과를 나타낸다. 결과는, 선택된 u-PA 프로테아제 변이체에 대한 RRAR 기질에 대한 특이성 상수가 야생형 u-PA와 비교하여 약 10배 이상 증가함을 나타낸다.
Figure 112009007335988-pct00025
D. 간접적인 색소원 검정을 사용한 플라스미노겐 활성화의 반응속도 분석
간접적인 색소원 검정을 수행하여 정제된 단백질 제제로서 생산된 돌연변이 u-PA 및 야생형 u-PA의 활성을 측정하였다[참조: Madison et al. (1989) Nature, 339: 721-724; Madison et al. (1990) J Biol. Chem., 265: 21423-21426]. 당해 검정에서, 유리된 p-니트로아닐린을 색소원 기질 스펙트로자임 PL (H-D-노르루이실헥사하이드로타이로실-라이신-p-니트로아닐리드 이아세테이트 염, 제조원: 아메리칸 디아그노스틱스, 인크.)로부터 플라스미노겐상에서 u-PA의 작용에 의해 생성된 플라스민의 작용에 의해 방출시켰다. 유리된 p-니트로아닐린의 방출을 OD405nm에서 분광광도계로 측정하였다.
검정을 위해, 0.25-1 ng의 시험할 uPA 효소, 0.62 mM 스펙트로자임 PL, 0.2μM Lys-플라스미노겐(제조원: 아메리칸 디아그노스틱스, 인크.)을 함유하는 100㎕ 반응 혼합물을 50 mM 트리스-HCL (pH 7.5), 0.1 M NaCl, 1.0 mM EDTA 및 0.01% (v/v) 트윈 80을 함유하는 완충액 속에서 합하였다. 반응물을 37℃에서 96-웰, 평편-바닥 미세역가 플레이트(제조원: 코스타르, 인크.) 속에서 항온처리하고 405nm에서 광학 밀도를 몰레큘러 디바이스 텀막스 속에서 1시간 동안 매 30초마다 판독하였다. 반응속도 상수 kcat, Km 및 kcat/Km (특이성 상수)를 앞서 기술한 바와 같이 계산하였다[참조: Madison, E. L (1989) Nature 339, 721-724].
하기 표 15는 u-PA 효소 활성의 간접적인 검정에서 PAI-1/69 억제제에 대해 증가된 민감성을 나타내는 것으로서 확인된, u-PA의 돌연변이체의 반응속도 분석의 결과를 제시한 것이다. 당해 결과는, 확인된 돌연변이체 u-PA가 Spectrozyme® PL 기질의 절단의 절단에 대한 특이성 상수(kcat/Km)의 간접적인 측정으로부터 측정된 것으로서 야생형 u-PA와 비교하여 감소된 효소 활성을 갖는다. 표에서, 시험한 변이체는 u-PA 파지 디스플레이 라이브러리의 연속 세대(I 내지 IV)의 선택 후 상기 표 11에 확인된 것들이다.
Figure 112009007335988-pct00026
E. 야생형 PAI -1 및 돌연변이 PAI -1에 의한 돌연변이 u-PA 효소의 억제의 반응속도 분석
돌연변이체 및 야생형 u-PA (양성 대조군)의 억제에 대한 2차 속도 상수(ki)를 슈도-1차(ki <2 x 106 ) 또는 2차 (ki >2 x 106 ) 조건을 사용하여 측정하였다. 각각의 효소에 대해, 효소 및 억제제(돌연변이 PAI-1)의 농도를 선택하여 잔류 효소 활성이 초기 활성의 20 내지 80%에서 변한 몇가지 데이터 점을 수득하였다. 야생형 및 돌연변이 u-PA와 야생형 및 돌연변이 PAI-1의 상호작용 속도에 대한 반응속도론적 측정은 24℃에서 0.1 mM EDTA 및 0.1% (v/v) 트윈 20을 함유하는 0.1 M 트리스-HCl 완충액 (pH 7.4) 속에서 수행하였다. 상기 D 단락에서 기술한 바와 같은 간접적인 색소원 검정을 사용하여 시간의 함수로서 잔류하는 잔류 효소 활성을 측정하였다.
야생형 또는 돌연변이 u-PA의 PAI-1에 의한 억제에 대한 속도 상수는 앞서 기술한 바와 같이 u-PA에 걸쳐 과량의 PAI-1에 대한 슈도-1차 조건하에 있다[참조: 예를 들면, Holmes et al. (1987) Biochemistry, 26: 5133-5140; Beatty et al. (1980) J. Biol. Chem., 255:3931-3934; Madison et al. (1990) PNAS, 87: 3530-3533; Madison et al. (1993) Methods Enzymol., 223:249-271]. 요약하면, 정제된 야생형 또는 돌연변이 u-PA (3 내지 50 fmol)를 실온에서 0 내지 120분 동안 야생형 또는 돌연변이 PAI-1 (35 내지 1330 fmol)과 함께 항온처리하였다. 항온처리한 후, 혼합물을 희석하고 잔류 효소 활성을 상기 D에 제시된 바와 같이 표준 색소원 검정에서 측정하였다. 데이터는 시간에 대한 ln(잔류 활성/초기 활성)을 플롯팅하고 얻어지는 직선의 기울기를 측정하여 분석하였다. 이후에, 슈도-1차 속도 상수는 기울기를 반응물중 억제제의 농도로 나누어 유도시켰다.
2차 반응을 위해, 등몰 농도의 야생형 또는 돌연변이 u-PA 및 야생형 또는 돌연변이 PAI-1을 미세역가 플레이트 웰 속에서 직접 혼합하고 실온에서 0 내지 30분의 변화하는 기간 동안 예비항온처리하였다. 예비항온처리한 후, 혼합물을 과량의 중화 항-PAI 항체로 퀀칭시키고 잔류 효소 활성을 간접적인 색소원 검정으로 측정하였다. 간접적인, 색소원 검정은 PAI-1을 함유하지 않거나 또는 PAI-1이 예비항온처리 후 및 항-PAI-1 항체, 플라스미노겐 및 스텍트로자인 PL이 반응 혼합물에 첨가된 대조군 반응물과 비교하였다. 데이터는 시간에 대한 ln (잔류 활성/초기 활성)을 플롯팅하고 얻어지는 직선의 기울기를 측정하여 분석하였다. 이후에, 2차 속도 상수는 기울기를 반응물중 억제제의 농도로 나누어 유도하였다.
하기 표 16은 u-PA 변이체의 PAI-1/RRAR 억제제에 의한 억제에 대한 2차 속도 상수를 나타낸다. 당해 결과는, 변이체 ARF2 및 ARF36이 야생형 u-pA와 비교한 것으로서 억제에 대해 증가된 ki 속도 상수로 평가되는 것으로서 PAI-1/RRAR 억제제 기질에 대한 특이성에 있어서 약 20배 개선되어 있음을 나타낸다.
Figure 112009007335988-pct00027
하기 표 17 및 18은 PAI-1/69 억제제에 대해 선택된 야생형 u-PA 또는 u-PA 변이체에 의한 야생형(표 17) 또는 돌연변이 PAI-1/69 억제제 (표 18)에 대한 억제의 2차 속도 상수의 결과이다. 표 17 및 18 각각에 제시된 변이 u-PA는 상기 표 11에 기술된 것으로서 u-PA 파지 라이브러리 선택의 I 내지 IV 연속 회차의 u-PA 파지 라이브러리 선택으로부터 확인된 것들이다. 표 17의 결과는 돌연변이 u-PA(즉, u-PA/IIIa, u-PA/IIIb 및 u-PA/IVa) 중 일부가 야생형 u-PA와 비교된 것으로서 억제에 대한 약간 증가된 2차 속도 상수를 가지며 돌연변이 u-PA/Ic, u-PA/IIb 및 u-PA/IVb가 야생형 u-PA와 비교된 것으로서 억제에 대한 감소된 2차 속도 상수를 가짐을 나타낸다. 표 18의 결과는, 억제에 대한 2차 속도 상수가 돌연변이 PAI-1/69 억제제에 의한 억제의 경우 선택된 U-PA 돌연변이체 각각에 대해 현저히 증가됨을 나타낸다. 당해 결과는, 선택된 변이체 각각이 PAI-1/69 억제제 기질에 대한 선택성에 있어 13배 크게 개선되어 있으며, 변이 u-PA/IIIb, u-PA/IVa 및 u-PA/IVb 각각은 특이성에 있어서 40배 이상에 근접하게 개선되어 있음을 나타낸다.
Figure 112009007335988-pct00028
Figure 112009007335988-pct00029
실시예 6
돌연변이 AT3 억제제에 대한 MT - SP1 파지 라이브러리로부터의 변이 MT - SP1 의 선별
아미노산 IAGRSL(서열번호 478)에 상응하는 야생형 AT3의 반응성 부위 루프 (RSL) 잔기 P4-P3-P2-P1-P1'-P2'내 헥사-펩타이드 서열을 함유하는 돌연변이체 안티트롬빈 III (AT3) 억제제 (서열번호 5)를 돌연변이시켜 보체 C2 절단 서열의 아미노산 잔기에 상응하는 SLGRKI (서열번호 479)에 대해 이들 잔기내 치환을 함유하도록 하였다. 돌연변이 AT3SLGR - KI는 프로테아제 선별 시험에서 "베이트 기질"로 사용하여 거대한 조합 MT-SP1 파지 디스플레이 라이브러리로부터 돌연변이체 기질 서열에 대한 개선된 반응성을 가진 파지를 분리하였다. 요약하면, 제1 세대 선별의 분석을 위해 효소 활성을 갖는 돌연변이유발 빈도 라이브러리(즉, 0.2 내지 0.5% 돌연변이유발 빈도)가 낮은 5㎕의 1:100 SM1 (약 3 X 1013) MT-SP1 파지 라이브러리를 높은 돌연변이유발 빈도(즉, 0.9%)를 함유하는 5㎕의 1:100 SM2 (약 3 X 1012) MT-SP1 파지 라이브러리와 동일한 비로 합하였다. 파지 라이브러리를 5㎕ 헤파린(5 ng/㎕; 돼지 장 점막의 스톡으로부터), 5 ㎕ 베이트 AT3SLGR - KI 기질 (0 (즉, 5㎕ H20), 0.018 μM, 0.18 μM, 1.8 μM 또는 18μM)의 농도 범위)과 5 ㎕(18 μM) 야생형, 혈장 정제된 AT3 및 5 ㎕ 10X MTSP 활성 완충액 (0.5 M 트리스 HCl, pH 8, 0.3 M NaCl, 0.1% 트윈 30)의 존재하에 총 50㎕(즉, 20 ㎕ H20를 함유한 반응물)의 용적에서 혼합하였다. 반응물을 4.5시간 동안 37℃에서 항온처리하였다.
MTSP-1 파지-AT3 억제제 복합체를 CuSO4 활성화된 세파로즈를 사용하여 포획하였다. 200㎕의 킬레이팅 세파로즈[제조원: 파마시아(Pharmacia)]를 CuSO4 (100 mM)와 함께 예비-활성화시켰다. CuSO4 활성화된 세파로즈(100㎕)를 2ml의 PBS 완충액중 0.5% BSA로 1시간 동안 실온에서 차단시켰다. 비드를 차단 용액으로부터 6500 rpm에서 60초 동안 펠릿화하고 450㎕의 결합 완충액 (0.5 M NaCl, 100 M 트리스 pH 8, 10 mM 이미다졸, 0.1% 트윈 20) 속에서 재현탁시켜 수거하였다. 50㎕의 상기 패닝 혼합물 반응물을 CuSO4 활성화된 세파로즈 비드에 가하여 His-태드된 AT3 억제제-MTSP-1 파지 복합체를 포획하였다. 항온처리를 다른 1시간 동안 실온에서 지속하였다. 그 다음, 패닝 혼합물을 1분 동안 2000rpm에서 원심분리하고 결합된 AT3 파지-MTSP-1 억제제 복합체를 함유하는 세파로즈 비드를 500㎕의 결합 완충액으로 세척하여 결합하지 않은 파지를 제거하였다. 세척 단계를 5회 반복하고 비드 복합체를 함유하는 비드를 새로운 튜브에 각각의 세척 후에 옮겨 비특이적 파지의 어떠한 잠재적인 "이동(carry over)"을 피하도록 하였다.
결합된 MT-SP1 파지- AT3SLGR - KI 복합체를 100㎕의 용출 완충액 (0.5 M EDTA, pH 8.0) 속에서 용출시켰다. 50㎕ 분취량의 용출된 파지를 사용하여 활발하게 성장하는 3 ml의 TG1 이.콜라이 세포(A600= 0.5; 0.5 OD= 약 1.5 X 108개 콜로니/ml)를 20분 동안 37℃에서 감염시켰다. 감염된 세균을 카르베니실린(75㎍/ml)을 함유하는 거대 플레이트(245 mm X 245 mm) 상에 플레이팅하고 30℃에서 밤새 항온처리하였다. 다음날 아침에 플레이트를 수거하였다. 각각의 플레이트상의 콜로니를 계수하고 AT3SLGR - KI 억제제를 함유하지 않는 백그라운드 플레이트와 비교하였다. 콜로니 계수의 결과를 표 19에 나타낸다.
Figure 112009007335988-pct00030
AT3SLGR - KI-함유 플레이트로부터의 콜로니를, 25 ml의 카르베니실린(약 100㎍/ml)로 보충된 25ml의 2YT내로 스크래핑한 후 플레이트를 냉실에서 2시간 동안 두어 한천을 굳혔다. 20 ml의 2YT 세균을 함유하는 배지를 500 ml의 2YT를 함유하는 카르베니실린에 가하고 A600을 0.13이 되도록 측정하였다. 세균을 OD= 약 0.5가 되도록 성장시킨 후 약 1 X 1010 내지 2.6 X 1013 cfu/ml의 파지 (VS M13)(약 150 ㎕ 내지 200 ㎕)를 라이브러리의 증폭을 위해 가하였다. 37℃에서 진탕시키면서 1시간 성장시킨 후, 배양물에 카나마이신을 보충하여 최종 농도가 3㎍/mL가 되도록 하고 밤새 30℃에서 진탕시키면서 성장시켰다. 세포를 수거하고 상청액 속에 존재하는 파지 입자를 PEG-NaCl 용액을 사용하여 침전시켰다. 제2 세대의 MT-SP1 파지 선택의 분석을 위해서는, 조건을 제1 세대와 유사하게 하되, AT3SLGR - KI 베이트 기질에 대한 반응을 4.5시간 대신 단지 27분만 수행하여 선별의 엄중성을 향상시켰다.
위에서 기술한 바와 같이 결합된 MT-SP1 파지-AT3SLGR - KI 복합체의 용출 후, 50㎕의 분취량의 용출된 파지를 사용하여 활발하게 성장하는 3 ml의 TG1 이.콜라이 세포 (A600= 0.5; 0.5 OD= 약 1.5 X 108 콜로니/ml)를 20분 동안 37℃에서 감염시켰다. 감염된 세균을 카르베니실린(75㎍/ml)을 함유하는 거대 플레이트(245 mm X 245 mm) 상에 플레이팅하고 30℃에서 밤새 항온처리하였다. 다음날 아침 플레이트를 수거하였다. 각각의 플레이트상의 콜로니를 계수하고 AT3SLGR - KI 억제제를 함유하지 않는 백그라운드 플레이트와 비교하였다. 콜로니 수의 결과를 표 20에 나타낸다.
Figure 112009007335988-pct00031
콜로니를 추가의 특성규명을 위해 집었다. 세포를 카르베니실린(100㎍/ml) 및 테트라사이클린(10㎍/ml)이 보충된 2 ml의 2x YT 속에서 성장시키고, 파지 제조를 문헌[참조: Sambrook, J et al (1989) Molecular Cloning, A laboratory manual, Cold spring Harbor laboratory]에 기술한 바와 같이 수행하였다. 선택된 파지를 Ac-SLGR-ACC 기질에 대해 효소 활성에 대해 시험하였다. 또한, 선택된 파지를 야생형 AT3 또는 혈장에 의해 불활성화에 대한 내성을 위해 선택하였다.
실시예 7
돌연변이 AT3 억제제의 발현 및 정제
A. 변이 AT3의 생성
프로테아제 포획 "베이트 기질"로서 사용하기 위한 돌연변이 AT3 단백질을, 사람 안티트롬빈 III (AT3) 유전자 (서열번호 612, 오리젠 테크놀로지스(Origene Technologies)에서 시판, 제품 번호 TC110831)의 암호화 영역을 주형으로 사용하여 AT3 반응성 중심 루프(RCL)의 아미노산 서열내로 변형을 도입하여 생성하였다. AT3 cDNA를 서열번호 626: GTCACTGACTGACGT GGATCCCACGGGAGCCCTGTGGACATC(이는 스투퍼(stuffer) 서열(상기 굵은 글씨체), BamH1 부위(이탤릭체로 나타냄) 및 AT3 유전자(보통 글씨체로 나타냄)를 함유함)에 제시된 핵산 서열을 갖는 정방향 프라이머 및 서열번호 628: GTAGCCAACCCTTGTGTTAAGGGAGGCGGAAGCCATCACCACCATCACCACTAAGAATTC에 제시된 핵산의 서열을 갖는 역방향 프라이머를 사용하여 PCR로 증폭시켰다. 증폭시킨 후, cDNA를 제한 효소 Bam 및 EcoRI를 사용하여 pAcGP67b 바큘로바이러스 전달 벡터(제조원: 비디 바이오사이언시스(BD Biosciences) 서열번호 494)내로 서브클로닝시켰다. C-말단 6xHis-tag (서열번호 496) 또는 C-말단 FLAG-tag (DYKDDDDK; 서열번호 495)을 당해 서브클로닝 단계 동안 가하여 후에 AT3 돌연변이체를 친화성 정제로 분리할 수 있도록 하였다. 4개의 아미노산 GGGS 링커(서열번호 620)를 사용하여 6xHis 태그에 융합된 AT3를 함유하는, 클로닝된 AT3 융합 단백질의 뉴클레오타이드 및 아미노산 서열을 각각 서열번호 613 및 614에 나타낸다.
다양한 특이성을 가진 표적 프로테아제를 분리하기 위한 돌연변이 AT3 베이트 기질을 제조하기 위해서, 돌연변이유발 반응을 Quikchange® 부위-지시된 돌연변이유발 키트(제조원: 스트라타젠)을 사용하여 공급업자가 정의한 조건에 따라 수행하여 야생형 AT3 반응성 중심 루프(RCL) 서열, IAGRSL (서열번호 478) (서열번호 5에 제시된 전구체 AT3 폴리펩타이드 서열의 아미노산 잔기 422-427; 및 서열번호 493에 제시된 돌연변이 AT3 폴리펩타이드 서열의 아미노산 잔기 390-395) 대신 표적 절단 서열의 아미노산 잔기를 도입시켰다.
하나의 이러한 돌연변이체, AT3 (AT3/ RRVR-KE)(서열번호 497)은 야생형 IAGRSL 아미노산 서열을 표적화된 VEGFR2 절단 서열로부터의 아미노산 잔기 RRVRKE (서열번호 498)로 치환시켜 제조하였다. 다른 돌연변이체, AT3 (AT3/ SLGR-KI) (서열번호 499)은 야생형 IAGRSL 아미노산 서열을 표적화된 보체 C2 단백질 절단 서열로부터의 아미노산 잔기 SLGRKI (서열번호 479)로 치환하여 제조하였다.
Quikchange® PCR의 경우, 야생형 AT3 RCL 프라이머는 서열번호 630: GCTGCAAGTACCGCTGTTGTGATTGCTGGCCGTTCGCTAAACCCCAACAGGGTGACTTTC에 제시된 핵산 서열을 가졌다. 보체 C2 표적 서열 프라이머는 서열번호 632: GCTGCAAGTACCGCTGTTGTGTCGTTAGGCCGTAAAATTAACCCCAACAGGGTGACTTTC에 제시된 핵산 서열을 가졌다. VEGFR2 표적 서열 프라이머는 서열번호 634: GCTGCAAGTACCGCTGTTCTGCGCCGTGTGCGCAAAGAAAACCCCAACAGGGTGACTTTC에 제시된 핵산의 서열을 가졌다.
야생형 AT3 cDNA을 함유하는 벡터 및 돌연변이 AT3 cDNA를 함유하는 벡터 각각을 형질전환시키고 XL-1-Blue 초적격(supercompetent) 세포(제조원: 스트라타젠)내에서 증폭시켰다. 플라스미드 DNA를 퀴아젠 플라스미드 막시 키트(제조원: 퀴아젠)을 사용하여 공급업자가 정의한 조건에 따라 세포로부터 정제하였다.
B. AT3 돌연변이체의 발현
Sf9 곤충 세포를 사용하여 His-태그화된 및 FLAG-태그화된 야생형 및 돌연변이 AT3 단백질 둘다를 위에서 기술한 AT3-함유 pAcGP67b 전달 벡터를 사용하여 발현시키고 정제하였다. Sf9 세포를 SF900 II 무혈청 배지(제조원; 인비트로젠) 속에서 성장시키기 위해 적응시키고 35mm 디쉬에서 85 내지 90% 컨플루언스(confluence)로 성장시켰다. 세포를 FlashBac® 바큘로바이러스 발현 시스템[제조원: 옥스포드 익스프레션 테크놀로지스(Oxford Expression Technologies)]을 사용하여 공급업자가 정의한 조건 및 프로토콜에 따라 형질감염시켰다. 500 ng의 AT3 전달 벡터 및 500 ng의 FlashBac® 재조합 벡터를 20분 동안 5㎕의 Cellfectin® 형질감염 시약(제조원: 인비트로젠) 과 함께 1 ml의 항생제가 들어있지 않은 SF900 II 무혈청 배지 속에서 예비-항온처리한 후, 세포에 적가하였다. 형질감염시킨지 5시간 후, 세포를 원심분리하고 항생제(항생제/항진균 용액; 제조원: 셀그로(Cellgro))가 들어있는 2 mL의 SF900 II 무혈청 배지 속에서 재현탁시키고 28℃에서 4일 동안 항온처리하였다. 바이러스를 Sf9 세포 속에서 플라크 검정에 의해 측정한 것으로서, 1 x 106 pfu/mL의 최대 역가로 확장시켰다. 이후에, 재조합체 AT3를 High Five®(BTI-TN5B1-4) 곤충 세포주(제조원: 인비트로젠) 및 ExcellTM 405 무혈청 배지[제조원: 제이알에이치 바이오사이언시스(JRH Biosciences)]를 사용하여 발현시켰다. 세포를 0.1 내지 1의 다중감염도(MOI)로 감염시키고 1L의 에를렌마이어 플라스크(Erlenmeyer flask) 속에서 300mL의 배양 용적으로 4 내지 5일 동안 회전식 진탕 플랫폼(orbital shaking platform)상에서 125 RPM에서 진탕시키면서 성장시켰다.
C. 야생형 및 돌연변이 AT3 단백질의 친화성-기반 정제
His-태그화된 AT3 단백질의 친화성-기반 정제를 위해, 실시예 7B로부터의 배양물의 상청액을 원심분리에 의해 투명하게 하고 0.45μM 여과기를 사용하여 여과하고 50 mM 나트륨 포스페이트 pH 7.5, 300 mM NaCl을 함유하는 완충액내로 투석하였다. 단백질을 BioLogic DuoflowTM 크로마토그래피 장치(제조원: 바이오-라드) 및 10 mL의 TALON® 코발트 금속 친화성 수지(제조원: 크론테크)를 사용하여 컬럼 크로마토그래피로 정제하였다. 수지-결합된 His-태그화된 단백질을 50 mM 나트륨 포스페이트 pH 7.5, 300 mM NaCl 및 50 mM 나트륨 포스페이트 pH 6.5, 300 mM NaCl, 150 mM 이미다졸의 선형 구배를 사용하여 용출시켰다. 단백질을 함유하는 분획들을 합하고 AT3 저장 완충액 (50 mM 나트륨 포스페이트 pH 6.5, 300 mM NaCl, 5% 글리세롤)내로 투석하였다. AT3 제제가 활성 단백질을 함유함을 입증하기 위하여, 본원의 하기 실시예 14에 기술된 MT-SP1 억제(활성 부위 적정) 검정을 수행하여 기질을 절단시키기 위해 MT-SP1의 능력을 억제하는 투석된 AT3의 능력을 측정하였다. 당해 MT-SP1 억제 검정으로부터의 반응 혼합물을 SpectraMax® M5(SpectraMax® M5 미세플레이트 판독기, Molecular Devices)[제조원: 몰레큘러 디바이스, 인크.(Molecular Devices, Inc)] 상에서 0.4 mM Ac-RQAR-ACC (아세틸-Arg-Gln-Ala-Arg-ACC) 기질(주문 합성(custom synthesis))의 절단에 대해 반응속도론적으로 평가하였다. 당해 기질 명칭에서 "ACC"는 7-아미노-4-카바모일메틸쿠마린 이탈 그룹을 말한다. ACC 이탈 그룹은 여기 (Ex)의 파장 = 380, 방사 (Em) = 450 및 컷오프(cutoff) (c/o) = 435에서 검출하였다. 정제된 His-태그화된 AT3 단백질의 총 수율은 대략 1 내지 3 mg/L이었다.
FLAG-태그화된 AT3 단백질의 친화성-기반 정제를 위해, 배양물로부터의 상청액을 원심분리로 투명하게 하고 위에서 기술한 바와 같이 여과하였다. 투명해진 상청액을 트리스-완충된 염수(TBS) pH 7.4 내로 투석하고 새로운 1L의 에를렌마이어 플라스크에 300 mL의 총 용적으로 가하였다. 2 mL의 예비-평형화시킨 항-FLAG M2 친화성 겔[제조원; 시그마(Sigma)]를 가하고, 총 용적을 회전식 진탕 플랫폼상에서 125 RPM으로 3시간 동안 4℃에서 항온처리하였다. 수지-결합된 FLAG-태그화된 AT3 단백질을 프릿된 20 mL 크로마토그래피 컬럼(제조원: 바이오-라드)을 사용하여 중력에 의해 수집하였다. 수지를 5 mL의 TBS로 처음 세척하고, 5 mL의 TBST (0.1% 트윈-20을 함유하는 TBS)로 먼저, 및 5 mL의 TBS로 두번째 세척하였다. 이후에, AT3 단백질을 0.2 mg/mL의 FLAG 펩타이드(제조원: 시그마)를 함유하는 10 mL TBS를 가하여 용출시켰다. 용출물을 농축시키고 AT3 저장 완충액 (50 mM 나트륨 포스페이트 pH 6.5, 300 mM NaCl, 5% 글리세롤)내로 투석하고 활성을 위에서 및 하기 실시예 14A에 기술한 같이, 마트립타제(MT-SP1) 억제(활성 부위 적정) 검정을 사용하여 위에서와 같이 검정하였다. 정제된 FLAG-태그화된 AT3 단백질의 총 수율은 대략 0.5 내지 1 mg/L이었다.
이들 정제된 FLAG- 및 His-태그화된 AT3 단백질을 프로테아제 포획으로서 특정 표적 부위 서열을 인지하는 프로테아제의 확인을 위해, 하기 실시예에 기술된 방법에서 사용하였다.
실시예 8
프로테아제 변이체의 파지-디스플레이 라이브러리의 작제
A. pMal - C2 파지미드 디스플레이 벡터내로의 야생형 및 C122S MT - SP1 프로테아제 도메인(B-쇄)의 클로닝
서열번호 253에 제시된 완전한 길이의 MT-SP1 단백질의 아미노산 615 내지 854를 함유하는 성숙한 MT-SP1 프로테아제 도메인(MT-SP1 B-쇄)(서열번호 505)을 암호화하는 cDNA (서열번호 504)를, 분비를 촉진시키기 위한 STII 리더 서열 (TGAAAAAGAATATCGCATTTCTTCTTGCATCTATGTTCGTTTTTTCTATTGCTACAAACGCGTATGCA)(서열번호 636) 및 선형 파지 M13 유전자III (서열번호 616)의 C-말단 도메인을 암호화하는 핵산을 함유하는 pMal-C2 벡터 (서열번호 615) [제조원: 뉴 잉글랜드 바이오랩스)]내로 제한 부위 Nde1 및 HindIII를 사용하여 클로닝하였다. MT-SP1 프로테아제 도메인 cDNA를 리더 서열 및 유전자III 도메인 사이에 삽입시켜 최종 작제물이 MT-SP1 N-말단 유전자III 융합 단백질을 암호화하는 서열번호 510에 제시된 핵산의 서열을 함유하도록 하였다. 당해 융합 단백질의 암호화된 핵산 서열(서열번호 506)을 보통 글씨체의 STII 리더 서열(서열번호 511), 굵은 글씨체의 성숙한 MT-SP1 도메인 및 이탤릭체의 C-말단 유전자III　(서열번호 512) 도메인과 함께 하기 제시하였다. *는 단백질을 암호화하는 핵산 서열내 종결 코돈의 존재를 나타낸다.
서열번호 506:
mkkniafllasmfvfsiatnayavvggtdadegewpwqvslhalgqghicgaslispnwlvsaahcyiddrgfrysdptqwtaflglhdqsqrsapgvqerrlkriishpffndftfdydiallelekpaeyssmvrpiclpdashvfpagkaiwvtgwghtqyggtgalilqkgeirvinqttcenllpqqitprmmcvgflsggvdscqgdsggplssveadgrifqagvvswgdgcaqrnkpgvytrlplfrdwikentgv sgssgggsegggsegggsegggsgggsgsgdfdyekmanankgamtenadenalqsdakgkldsvatdygaaidgfigdvsglangngatgdfagsnsqmaqvgdgdnsplmnnfrqylpslpqsvecrpfvfsagkpyefsidcdkinlfrgvfafllyvatfmyvfstfanilrnkes *
야생형 MT-SP1 B-쇄 융합 단백질외에, MT-SP1 B-쇄 변이체 (CB469) - 유전자III 융합 단백질을 위에서 기술한 방법을 사용하여 생성시켰다. 서열번호 507에 제시된 CB469 변이체 아미노산 서열은 상기 이탤릭체로 나타내고 서열번호 505로 제시된 서열에 나타낸, 야생형 MT-SP1 프로테아제 도메인 서열의 122번 위치(키모트립신 번호매김 기준)에서 시스테인을 세린으로 치환시켜 생성시켰다. 당해 CB469 서열을 위에서 기술한 바와 같이 pMal-C2 벡터내로 클로닝시켰다. 개선된 디스플레이를 달성하기 위하여, 당해 변이 MT-SP1 융합 단백질을 암호화하는 핵산을 함유하는 파지미드 벡터를 사용하여 하기 실시예 8B에 기술한 바와 같이 MT-SP1 돌연변이체 파지 디스플레이 라이브러리를 생성시켰다.
B. 돌연변이체 파지 디스플레이 라이브러리의 생성을 위한 프로테아제 도메인의 돌연변이유발
돌연변이된 프로테아제 도메인을 함유하는 파지 디스플레이 라이브러리의 생성을 하기 예시된 바와 같이 당해 분야에 공지된 표준 오류-빈발 PCR 돌연변이유발 프로토콜(참조: Matsumura et al., Methods Mol Biol. 2002;182:259-67; Cirino et al., Methods Mol Biol. 2003;231:3-9)을 사용하여 수행하였다.
1. B-쇄 MT - SP1 융합 단백질의 돌연변이유발
돌연변이 MT-SP1-함유 융합 단백질을 작제하기 위하여, MT-SP1 CB469 cDNA를 pMal-C2 벡터로부터 오류-빈발 PCR로부터 Diversify® PCR 무작위 돌연변이유발 키트[제조원: 비디 바이오사이언시스(BD Biosciences), 클론테크(Clonetech)]를 사용하여 공급업자가 제안한 조건에 따라 증폭시켜 킬로베이스당 5개의 돌연변이를 수득하였다. 당해 PCR에 사용된, 서열번호 508에 제시된 핵산 서열: GCGCAGATATCGTACCGCATATG AAAAAGAATATCGCATTTCTT를 갖는 MT-SP1 정방향 프라이머를 설계하여, STII 리더 서열(이탤릭체로 나타낸 잔기를 갖는)내에 하이브리드화하고 Nde 제한 부위 서열(굵은 글씨체로 나타냄)을 함유시켰다. 서열번호 509: GTGCATGCTGACTGACTGAGCT CCCGCTTACCCCAGTGTTCTC에 제시된 핵산의 서열을 갖는 MT-SP1 역방향 프라이머를 설계하여 MT-SP1 프로테아제 도메인(이탤릭체로 나타낸 잔기)를 암호화하는 서열의 3' 부위내에 하이브리드화하여 Sac1 제한 부위 서열(굵은 글씨체로 나타냄)을 함유하도록 하였다.
2. 돌연변이유발 생성물의 정제
Taq 폴리머라제는 DNA에 강력하게 결합하므로 퀴아젠 PCR 정제 키트에 의해 완전히 제거되지 않으며; 이의 존재는 PCR 생성물의 하류 제한 분해를 방해할 수 있다[참조: Crowe et al., Nucleic Acids Res. 1991 January 11; 19(1): 184; Wybranietz et al., Biotechniques (1998) 24, 578-580]. 따라서, 이들의 정제 전에, 실시예 8B(1)으로부터 증폭된 야생형 및 돌연변이체 PCR 생성물로부터 Taq 폴리머라제를 제거하기 위하여, 5 mM EDTA, 0.5% SDS, 50 ng/㎕ 프로테이나제 K를 반응물에 가하였다. Taq 폴리머라제를 제거하기 위하여, 혼합물을 65℃에서 15분 동안 항온처리하였다.
잔류하는 야생형 주형(이는 하기 기술된 선택 방법을 강력히 방해할 수 있다)이 없도록 하기 위해, PCR 생성물을 정제하여 주형 DNA를 제거하였다. PCR 생성물로부터의 벡터를 분리하기 위하여, 샘플을 PCR 생성물 또는 래더(ladder)와 공동-이동하지 않는 10X 오렌지 G 겔 로딩 완충액 (제조원: 뉴 잉글랜드 바이오랩스)의 존재하에 1% 아가로즈 겔상에 로딩하였다. PCR 생성물을 스칼펠(scalpel)을 사용하여 겔로부터 절개하였다. 절개된 생성물을 QIAquick® Gel 추출 키트 프로토콜(제조원: 퀴아젠) 또는 ZymocleanTM 겔 추출 키트[제조원: 자이모클린 씨에이(Zymoclean CA), 제품 번호 D4001)을 사용하여 공급업자가 명시한 조건에 따라 정제하였다.
퀴아젠 겔 추출 키트를 위해, 절개된 겔 단편을 QG 완충액 속에 가용화시키고 각각 약 5 내지 10㎍의 결합력을 가지며 2mL 이상을 유지하지 않는 퀴아젠 QG 컬럼을 서서히 통과시켰다. 충분한 수의 컬럼을 사용하여 전체 용적의 출발 물질을 공급하였다. 컬럼을 수집기 튜브속에서 14,000rpm으로 원심분리하여 어떠한 잔류 완충액 QG도 제거하였다. 0.7 mL의 완충액 PE를 각각의 컬럼에 가하고 샘플을 2 내지 5분 동안 항온처리하였다. 이후에, 컬럼을 2회 각각 추가로 1분 동안 13,000 rpm에서 원심분리하여 모든 잔류 PE 완충액을 제거하였다. 샘플을 새로운 1.5mL 미세원심분리 튜브에 옮긴 후 50μL H20를 첨가하고 2분 동안 항온처리하였다. 결합된 DNA를 7000 rpm에서 원심분리하여 용출시켰다. 통상의 수율은 샘플의 출발 양의 30% 내지 60%이었다.
ZymocleanTM 겔 추출 키트의 경우, 하나 이상의 ZymocleanTM 겔 추출 키트 컬럼(이들 각각은 5㎍의 최대 결합 용량을 갖는다) 또는 ZymocleanTM DNA Clean & ConcentratorTM 키트(이들 각각은 25㎍의 용량을 갖는다)를 출발 물질의 양에 따라 사용하였다. 당해 키트를 사용하여, 절개된 DNA 단편을 1.5ml의 미세원심분리 튜브내로 옮긴 후, 3 용적의 ADB BufferTM을 겔로부터 절개된 아가로즈의 각각의 용적에 가하였다. 샘플을 37 내지 55℃에서 5 내지 10분 동안 겔 단편이 완전히 용해될 때까지 항온처리하였다. 용해된 아가로즈 용액을 수집 튜브내 Zymo-Spin ITM 컬럼에 옮기고 적어도 10,000 rpm에서 30 내지 60초 동안 원심분리하였다. 컬럼을 통한 관류물을 버렸다. 200μL의 세척 완충액을 컬럼에 가하고 적어도 10,000 rpm에서 30초 동안 원심분리하였다. 관류물을 버리고 세척 단계를 반복하였다. 50μL의 물을 컬럼 매트릭스에 직접 가하였다. 최소 용출 용적은 ZymocleanTM 겔 용출 컬럼의 경우 10μL이고 DNA Clean & ConcentratorTM 컬럼의 경우 35ml였다. 컬럼을 1.5ml의 튜브에 두고 적어도 10,000 rpm에서 30 내지 60초 동안 원심분리하여 DNA를 용출시켰다.
이들 2개의 방법 중 하나를 사용하여 용출시킨 후, 샘플을 수거하고 DNA 농축물을, 샘플을 260nm에서 70μL UV 큐베트 속에서 분광형광계를 사용하여 측정함으로써 평가하였다. DNA 농도를 다음 식에 따라 계산하였다: 1A260 = 50 ng/㎕ ds DNA.
C. pMal - C2 파지미드 벡터를 사용한 프로테아제 돌연변이체 파지 라이브러리의 작제
돌연변이 프로테아제 도메인을 발현하는 파지 디스플레이 라이브러리의 작제를 위해, 상기 실시예 8A 및 B에 기술된 프로테아제 PCR 돌연변이유발 및 정제로부터 수득된 것들과 같은 분해된 PCR 생성물을 위에서 기술한 pMal-C2 파지미드 벡터에 연결시켰다. 당해 과정을 위해, 벡터를 Nde1 및 Sac1을 사용하여 분해하고, 생성물을 겔 정제하고 연결 반응물(하기 기술됨) 속에서 정제된, 제한-분해된 PCR 생성물과 합하였다. Nde1/Sac1 분해되고, 겔 정제된 pSTII-g3 pMal-C2 파지미드의 분자량(MW)은 5835 염기쌍(bp)이고; Nde1/Sac1 분해된 MT-SP1 PCR 생성물의 MW는 806 bp이다. 통상적으로, 2 mL의 연결 반응물의 경우, 7.58㎍ 절단 벡터는 약 1 nM의 벡터이고 3.14㎍ 절단 MT-SP1 생성물은 약 3 nM 삽입체 생성물이다.
MT-SP1 생성물의 연결을 위해, 40 ㎕(3 nM, 3.14 ㎍)의 분해되고, 정제된 생성물을 40 ㎕(1 nM, 7.58 ㎍)의 분해되고, 정제된 벡터; 1510 ㎕ H20; 400㎕의 5X T4 DNA 리가제 완충액(제조원: 기브코); 및 10 ㎕(10 단위)의 T4 DNA 리가제(제조원: 뉴 잉글랜드 바이오랩스)와 합하였다. 연결 반응을 밤새 16℃ 또는 실온에서 4시간 동안 2mL 용적 속에서 수행하였다. 연결후, DNA 리가제를, 연결 반응 혼합물을 65℃에서 15분 동안 항온처리한 후, 4 mL의 자이모리서치(ZymoResearch) DNA 결합 완충액을 첨가하여 열-불활성화시켰다. 이후에, 샘플을 가하고 이 때 800㎕를 25㎍의 자이모리서치 컬럼에 가하였다. 컬럼을 600㎕ 자이모리서치 세척 완충액으로 2회 세척하고 42℃로 예비-가온시킨 50μL의 물로 용출시켰다. DNA 회수 퍼센트는 희석된 용출 샘플(70㎕의 H2O 중 3㎕ 용출액)의 흡광도를 260nm에서 분광혈광계를 사용하여 측정함으로써 평가하였다. 예를 들면, 상기 3mL의 연결에 대해, A260이 0.12 = 140 ng/㎕에 상응하는 경우, 총 수율은 약 7㎍(이는 연결로부터 DNA의 약 70% 회수이다)인 것으로 측정되었다.
연결 생성물을 XL-1 블루 세포내로 천기천공시키고, 이를 전기천공에 의해 약 500 ng/㎕를 공급할 수 있다. 7.5㎕의 140 ng/㎕ 연결물을 200㎕의 XL-1 블루 세포(제조원: 스트라타젠)당 가하였다. 세포를 0.2 cm 갭 큐베트에 가하고 진 펄서[Gene Pulsar, 제조원: 캘리포니아주 소재의 바이오-라드(Bio-Rad)] 속에서 다음 조건을 사용하여 전기천공시켰다. 전압(V) = 2500, 전기용량 = 25 (uF), 저항 = 200 옴. 전기천공 직후, 1 mL의 SOC 배지(제조원: 인비트로겐)을 큐베트에 가하였다. 이후에, 세포를 25 mL의 SOC 배지로 옮기고 37℃에서 20분 동안 항온처리하였다. 항온처리에 이어 5개의 작은 분취량(100 ㎕)의 세포의 연속의 100배 희석물을 제조하고 작은 2YT 카르베니실린 한천 플레이트 상에서 플레이팅하고 37℃에서 콜로니의 수(전기천공에 의해 생성된 라이브러리로부터의 클론의 수를 대표함)를 계수하기 위해 밤새 항온처리하였다. 하나의 방법에서, 나머지 배양물 용적을 원심분리하여 세포를 펠릿화한 후 12mL의 SOC 완충액 속에서 재현탁시키고 카르베니실린(75 ㎍/ml)으로 보충된 거대 한천 플레이트(245 mm X 245 mm)상에 플레이팅한 후 밤새 30℃에서 성장시켰다. 또는, 라이브러리로부터 파지 스톡을 제조하기 위해, 세포를 카르베니실린(75 ㎍/ml)과 1x 1010 CFU/mL에서 M13KO7 헬퍼 파지가 보충된 500 mL 2YT 배지에 직접 가하고 밤새 37℃에서 성장시켰다.
실시예 9
돌연변이 AT3 프로테아제 포획체를 사용한 프로테아제 도메인 파지 라이브러리로부터의 변이 프로테아제 도메인의 선별
A. MT - SP1 파지/돌연변이 AT3 복합체의 선별 및 ELISA -기반 판독 검정
당해 실시예에서, 상기 실시예 7에 기술된 바와 같은 보체 C2 표적 절단 서열 SLGRKI를 함유하는 돌연변이 AT3 억제제를 표적 절단 서열에 대해 개선된 반응성을 가진 돌연변이 MT-SP1-보유 파지의 존재를 분리하고 이에 대한 판독 둘다를 제공하도록 설계된 패닝 시험에서 "베이트 기질"로서 사용하였다. 파지를 다음 과정을 사용하여 상기 실시예 8A, 8B 및 8C에 기술된 바와 같이 생산된 거대한, 조합 MT-SP1 파지 디스플레이 라이브러리로부터 분리하였다.
1. AT3 변이체의 돌연변이 MT - SP1 -보유 파지와의 상호작용 및 절단
파지 라이브러리로부터 파지-결합된 MT-SP1 돌연변이체를 우선 다음과 같이 표적 절단 부위를 갖는 돌연변이 AT3를 사용하여 선택하였다. 각각의 절단 반응을 96-웰 폴리스티렌 플레이트[제조원: 눈크 막시소르프(Nunc Maxysorp)]의 이중 웰 속에서 60분 동안 37℃에서 다음 반응 성분을 70 μL의 용적 속에서 항온처리하여 수행하였다: 3.14E12 CFU/ml에서의 35㎕의 MT-SP1 라이브러리 파지; 7㎕의 10X MT-SP1 활성 완충액 (0.5 M 트리스-HCl, pH 7.4, 1M, NaCl, 1% 트윈20); 7μL의 10X 저분자량 헤파린[제조원: 비디 바이오사이언시스(BD Biosciences)]; 14μL의 H2O; 및 7μL의 His-태그화된 돌연변이 AT3-SLGRKI. 개개의 절단 반응을 다음의 상이한 AT3-SLGRKI 농도에서 수행하였다: 100 nM, 33 nM, 11 nM, 3.3 nM, 1.1 nM 및 0.33 M. 각각의 반응을 2μL의 100 mg/ml의 프로테아제 억제제 4-(2-아미노)-벤젠설포닐 플루오라이드[페파블록(Pefabloc), 제조원: 로슈 디아그노스틱스(Roche Diagnostics)]를 첨가하여 종결시켰다. 이어서 40μL의 0.55% BSA, 0.275% 트윈 20 용액을 가하고 피펫팅을 상하로 하여 완전 혼합하였다.
2. 항- His 항체를 사용한 MT - SP1 파지- AT3 복합체의 포획
한편, 다른 96-웰 폴리스티렌 플레이트(제조원: 눈크 막시소르프) 중 웰을 1시간 동안 실온에서 100μL의 5 ng/μl의 스트렙트아비딘[제조원: 피어스(Pierce)]과 0.2 M 카보네이트 완충액 (pH 9, 제조원: 피어스) 속에서 진탕시켜 피복하였다. 이후에, 웰을 250μL PBST로 3회 세척하고, 200μL의 PBS중 0.2% BSA로 2시간 동안 실온에서 차단시키고 1시간 동안 실온에서, 100μl의 5ng/μl의 비오티닐화된 항-6HIS 항체와 함께 항온처리하여 His-태그화된 AT3 돌연변이체를 포획하고, PBST로 완전 세척하였다. 이후에, 실시예 9A(1)에서의 AT3 절단 반응물로부터의 각각의 돌연변이 MT-SP1 파지 샘플을 피복된 96 웰 플레이트에 2회 가하고 1시간 동안 실온에서 항온처리하였다. 이후에, 플레이트를 250μL PBST로 14회 세척하였다.
3. MT - SP1 파지- AT3 복합체의 선별을 위한 ELISA -기반 판독
세척 후, 미세역가 플레이트내 2개의 열의 첫번째를 사용하여 ELISA (효소-연결된 면역검정)-기반 검정을 수행하여 파지 포획물에 대한 판독물을 수득하였다. 당해 열내 각각의 웰에, 100μL의 1:5000 희석물의 HRP 접합체 항 M13 파지 항체[제조원: 지이 헬쓰케어(GE Healthcare)]를 가하고 1시간 동안 결합하도록 하였다. 이후에, 당해 열의 웰을 스칸워셔 플레이트 세척기(Skanwasher plate washer)(제조원: 몰레큘러 디바이스)를 사용하여 8회 세척한 후, 100μL의 TMB/퍼옥사이드 기질 용액(제조원: 피어스)를 첨가하고 실온에서 5분 동안 항온처리하였다. 당해 반응물을 100μL의 2M H2SO4로 퀀칭시키고 SpectraMax® 플레이트 판독기(제조원: 몰레큘러 디바이스) 상에서 450nM에서의 흡광도에 대해 검정하였다. 당해 판독물을 파지-AT3 복합체의 존재에 대한 대응물로서 사용하였다. 당해 검정에서, 흡광도에 있어서 농도-의존적 증가를 관측하였다[실시예 9A(1)에서의 절단 반응에 사용된 AT3-SLGRKI 베이트의 증가하는 농도 기준]. 또한, 과정을 본원에 기술된 바와 같은 연속적인 회차의 패닝을 사용하여 수행하는 경우, 증가된 흡광도가 각각의 회차 후 관측되었으며, 이는, 당해 패닝 방법이 표적 절단 분해 친화성에 대한 파지 혼주물을 성공적으로 풍부하게 할 수 있음을 나타낸다. 당해 데이터는, 이러한 방법을 사용하여 파지 라이브러리부터 특정 표적 서열에 대해 친화성을 갖는 돌연변이 프로테아제 도메인 융합 단백질을 선택할 수 있음을 제안한다. 당해 ELISA 검정은 친화성-기반 포획 및 하기 실시예 9A(4)에 기술된 후속적인 용출에 사용된 동일한 96-웰 플레이트를 사용하여 당해 선택 및 풍부에 대한 판독물을 수득하는 방법을 제공하였다.
4. 선별된 MT - SP1 파지의 용출
이후에, 실시예 9A(2)로부터의 미세역가 플레이트의 2개의 이중 열 중 두번째를 사용하여 후속적인 정제 및 스크리닝에 사용하기 위한 특이적으로 결합된 파지를 용출하였다. 당해 열에서 각각의 웰에, 100μL의 100 mM HCL을 가하고 5분 동안 항온처리하여 특이적으로 결합된 파지를 용출시켰다. 수득되는 파지 용출물을 감염전 산 중화를 위해 33μL의 1M 트리스 pH 8을 함유하는 별개의 웰에 가하였다. 이어서, 133μL의 파지 혼합물을 0.5의 OD600에서 성장하는 1 ml의 XL-1 블루 세포에 가한 후, 이를 20분 동안 37℃에서 항온처리하고 카르베니실린으로 보충된 2xYT 한천 플레이트(245 mm x 245 mm)에 플레이팅하였다. 이들 세포를 후속적인 스크리닝 및 하기 실시예에 기술된 바와 같은 정제 방법에 사용하였다.
당해 단락 및 ELISA-기반 검정 방법을 또한 사용하여 상기 실시예 2 및 3에서 기술한 것들과 같은, uPA 라이브러리로부터의 uPA 돌연변이체를 선택하고 평가하였다.
B. 선별된 프로테아제 도메인-보유 파지의 정제
당해 시험은 베이트 억제제를 사용하여 선택된 파지 상청액의 분리 방법을 기술한다. 상기 실시예 9A에서 회수된 것들과 같은 선택된 파지의 역가(cfu/mL)를 측정하였다. 파지 스톡을 PBS로 희석시키고 0.5의 OD600 또는 대략 2.1 x 108 세포/mL로 성장하는 이.콜라이 XL-1 블루 세포를 감염시키는데 사용하였다. 목적한 감염성 범위는 플레이트당 1000 내지 2000 콜로니였다. 감염된 세포를 사각형 245mm x 245mm 폴리스티렌 바이오검정(제조원: 코닝)에서 100㎍/mL의 카르베니실린으로 보충된 2YT 한천상에 플레이팅하고 16 내지 20시간 동안 또는 콜로니 크기가 대략 2mm의 직경이 될 때까지 성장하도록 하였다. 자동화된 콜로니 피커(Colony Picker)를 사용하여, 개개의 코로니를 집어올려 100㎍/mL의 카브베니실린 및 12㎍/mL의 테트라사이클린이 보충된 150-170 μL의 2YT 배지를 함유하는 96 웰 폴리프로필렌 플레이트내 웰내로 분산시켰다. 대조군 웰에 주형 파지(돌연변이유발에 대한 주형으로서 사용된 프로테아제 도메인을 갖는 파지) 또는 불활성 프로테아제 변이체를 함유하는 융합 단백질을 함유하는 파지로 형질감염된 세포를 접종하였다. 접종된 플레이트를 공기-침투성 막으로 밀봉하고 HiGro[제조원: 진머신(GeneMachines)] 항온처리기내에 두고 400 rpm에서 37℃로 14 내지 20시간 동안 진탕시켰다.
항온처리 후, 대수기 세포를 수득하기 위하여, 각각의 웰로부터 100μL를 사용하여 100 ㎍/mL 카르베니실린 및 12 ㎍/mL 테트라사이클린이 보충된 1mL의 2YT 배지를 함유하는 깊은 웰 96 웰 플레이트내 웰에 접종하였다. 이후에, 깊은 웰 플레이트를 공기-침투성 막으로 밀봉하고 400rpm에서 37℃로 산소 통기하면서, 세포 밀도가 0.4 내지 0.6의 OD600에 이를 때까지 진탕시키면서 HiGro®에 두었다. 대표적인 항온처리 기간은 4 내지 5시간이었다. 항온처리 후, 100μL의 헬퍼 파지 스톡을 각각이 웰에 가하고 플레이트를 밀봉하고 400 rpm에서 5 내지 10분 동안 37℃에서 진탕시켰다. 5 내지 10분 동안 진탕시킨 후, 플레이트를 37℃에서 정지 상태로 30 내지 45분 동안 진탕하지 않고 항온처리하였다. 이후에, 진탕을 400 rpm에서 15 내지 30분 동안 37℃에서 재개하였다. 진탕에 이어, 100μL의 카나마이신 용액(400㎍/mL)을 각각의 웰에 가하여 각각의 웰내 33.3 ㎍/mL의 최종 농도를 수득하였다. 플레이트를 재밀봉하고, 400 rpm에서 37℃로 12 내지 16시간 동안 진탕시켰다. 세포를 펠릿화하기 위하여, 이후에, 플레이트를 3500 내지 4500 rpm에서 20분 동안 4℃에서 원심분리하였다. 원심분리한 후, 분리된 파지를 함유한 상청액을 하기 실시예에서 기술한 바와 같은 스크리닝에 즉시 사용하거나, 또는 우선 4℃에서 저장하였다.
C. 프로테아제 도메인 파지 상청액의 폴리에틸렌 글리콜( PEG ) 침전
당해 실시예는 폴리에틸렌 글리콜 침전을 사용하는 정제되고 선택된 파지 상청액에서 잠재적으로 오염시키는 백그라운드 프로테아제 활성(여기에 본원에 하기 기술된 일부 특성규명 검정은 민감성이다)을 제거하는 방법을 기술한다. 당해 방법에서, MT-SP1-보유 파지 상청액(실시예 9A에서 선택되고 용출된 것들과 같은)을 밤새(12 내지 16시간) 헬퍼 파지로 구제한 후, 샘플을 20분 동안 4℃에서 3500 내지 4500 rpm에서 원심분리하고 1000μL의 상청액을 각각의 웰로부터 제거하여 다른 96 웰 깊은 웰 플레이트내 웰로 옮겼다.
침전을 위해, 250μL의 2.5M NaCl중 20(용적)%를 함유하는 용액을 각각의 웰에 가하였다. 플레이트를 밀봉하고 격렬하게 반전시켜 혼합한 후 빙-수욕 속에 두고 1 내지 2시간 동안 정치상태로 두었다. 이후에, 플레이트를 60분 동안 4500 rpm에서 또는 90분 동안 3500 rpm에서 원심분리하였다. 각각의 웰로부터의 상청액 용액을 버리고 플레이트를 두들겨 건조시키고 20 내지 30분 동안 배수되도록 하였다. 수득되는 침전물을 PBS를 사용하여 원래의 파지 상청액 용적(200μL)의 20%와 동등한 최종 용적에서 재현탁시켜 5배 농도를 수득하였다. 당해 물질을 하기 기술된 검정에 직접 사용하거나, 또는 시험 준비때까지 4℃에서 저장하였다.
실시예 10
표적 기질 서열에 대한 증가된 반응성 및 촉매 효율을 갖는 프로테아제 도메인-보유 파지의 스크리닝
실시예 9B 및 9C에 기술된 것들과 같은 개개의 파지 제제를 각종 검정에 사용하여 이들의 특이성 및/또는 활성을 측정하였다.
A. 베이트 단백질에 의한 형광생성 펩타이드 가수분해의 억제를 모니터링함에 의한 파지 발현 프로테아제 도메인 변이체의 분석
돌연변이 프로테아제-보유 파지 클론을 평가하기 위한 하나의 시도로서, 생화학적 억제 검정을, 선택된 변이 프로테아제 도메인의 활성을 억제하는 억제제(베이트 서핀)의 능력을 파지미드 라이브러리 작제에 원래 사용된 주형 프로테아제 도메인(즉, "모" 프로테아제)의 활성을 억제하는 이의 능력과 비교하여 수행할 수 있다. 당해 시도를 사용하여, 상기 실시예 9에서 회수한 것들과 같은, 돌연변이 프로테아제-보유 파지의 표적 기질 서열을 함유하는 형광생성 기질을 절단하는 능력을 제공된 농도의 억제제 베이트의 존재 및 부재하에서 평가하고, 동일한 베이트의 존재하에서 동일한 서열을 절단하는 주형 프로테아제 도메인의 능력을 비교하였다. 형광생성 펩타이드 기질의 용도는 프로테아제 특이성의 측정을 위한 통상의 방법이다[참조: Zimmerman et al. (1977) Anal Biochem, 78:47-51; Harris et al. (2000) PNAS, 97:7754-7759].
MT-SP1 B-쇄 주형[실시예 8B(1)에서의 돌연변이에 대해 사용]의 억제에 대해 비교된 MT-SP1 B-쇄 돌연변이체의 억제의 분석을 위해, 변이 AT3(목적한 표적 서열을 지닌)를 억제제로서 사용하고 Ac-RQAR-ACC를 기질로서 사용할 수 있다. 당해 기질에서, 아닐리드 결합의 특이적 절단은 형광성 ACC 이탈 그룹을 유리시켜, 개개의 기질에 대한 절단율을 측정하는 효율적인 수단을 제공한다.
이러한 검정의 하나의 예에서, 형광생성 기질 Ac-AGR-AMC (서열번호 617)을 절단하는, 상기 실시예 3에서 회수된 것들과 같은 uPA 프로테아제-보유 파지의 능력을 제공된 농도의 PAI 베이트의 존재 및 부재하에 평가하였다. 위에서 기술된 바와 같이, 이러한 7-아미노-4-메틸쿠마린(AMC) 형광생성 펩타이드 기질의 사용은 프로테아제 특이성을 측정하기 위한 통상의 방법이다. 당해 실시예에서, 35μL의 파지 상청액[실시예 3(A)에 기술된 바와 같이 수득된 것과 같은]을 384-웰 폴리프로필렌 플레이트(CoStar, #3658)내 지정된 검정 웰 및 지정된 대조군 웰 둘다로 옮겼다. 35μL의 2x 간접적인 검정 완충액(억제제 부재)을 상응하는 대조군 웰에 가하였다. 플레이트를 37℃에서 60분 동안 항온처리하였다. 파지를 억제제 또는 대조군 완충액과 혼합한 후, 간접적인 검정 완충액 중 60μM의 최종 검정 농도로 희석된 10μL의 AGR-AMC 형광생성 펩타이드 기질을 당해 웰에 가하였다. 형광성을 Molecular Devices SpectraMax® 플레이트 판독기를 380nm에서의 여기, 460nm로 제시된 방사로, 1시간 동안 반응속도론적 판독 모드로 사용하여 측정하였다. 주형 프로테아제와 관련하여 표적 기질의 향상된 억제를 나타내는 콜로니를 추가로 분석하였다.
B. 형광생성 펩타이드 기질을 사용한 변이 프로테아제 활성의 분석
MT-SP1 돌연변이체의 활성 및 특이성을 직접적으로 평가하기 위하여, 검정을 형광생성 펩타이드 기질 Ac-RQAR-ACC(야생형 MT-SP1에 의해 인지된 천연의 자가촉매 절단 서열을 갖는) 및 C2 표적 부위 절단 서열을 갖는 Ac-SLGR-ACC (아세틸-Ser-Leu-Gly-Arg-ACC)를 사용하여 수행하였다. 위에서 나타낸 바와 같이, 이러한 기질의 명칭에서 ACC는 7-아미노-4-카바모일메틸쿠마린을 나타내며, 이는 형광성 이탈 그룹이다. 또한, 위에 나타낸 바와 같이, 형광생성 펩타이드 기질의 사용은 프로테아제 특이성을 측정하기 위한 통상의 방법이다[참조: Zimmerman et al. (1977) Anal Biochem, 78:47-51; Harris et al. (2000) PNAS, 97:7754-7759]. 당해 실시예에서, 아닐리드 결합의 특이적 절단은 형광성 ACC 이탈 그룹을 유리시키며, 개개의 기질에 대한 절단율을 측정하기 위한 효율적인 수단을 제공한다. 당해 방법에서, 35μL의 2x 간접적인 검정 완충액을 모든 시험 웰에 가하였다. 35μL의 파지 상청액(실시예 9B에 기술된 바와 같이 분리된) 또는 재현탁된 PEG 침전된 파지(실시예 9C에 기술된 바와 같이 분리된)을 각각의 설계된 웰에 가하였다. 파지를 첨가한 후, 플레이트를 2000rpm에서 1분 동안 원심분리하여 공기 거품을 제거하였다. 10μL의 각각의 펩타이드 기질(Ac-SLGR-ACC (최종 검정 농도 = 125 μM) 및 Ac-RQAR-ACC (최종 검정 농도 = 60 uM))를 1X 간접 검정 완충액으로 희석한 후 개별적으로 각각의 웰에 가하였다. 기질 절단의 지표인, 상대적 형광성 단위/초(RFU/s)로 측정한, 가수분해 속도(ROH)를 시간에 걸쳐 SpectraMax® M5 마이크로플레이트 판독기(제조원: 몰레큘러 디바이스)를 사용하여 반응속도론적 판독 모드로 모니터하였다.
실시예 11
MT - SP1 돌연변이체의 생산, 선별, 평가 및 확인
A. 파지미드 라이브러리로부터 B-쇄 MT - SP1 돌연변이체의 형광생성 검정
당해 실시예는 실시예 8에 기술된 바와 같이 생성된 라이브러리를 사용하여 MT-SP1 프로테아제 도메인-보유 파지의 활성 및 특이성을 분석하기 위해 수행된 형광생성 검정을 기술한다. MT-SP1 라이브러리를 상기 실시예 8에 기술된 바와 같이 주형으로서 키모트립신 번호매김(실시예 507)을 기준으로 하여 122번 위치에서 시스테인 대신에 세린을 갖는 MT-SP1의 천연의 B-쇄를 사용하여 제조하였다. 라이브러리는 위에서 기술한 바와 같이 공급업자가 추천한 pMal-C2 벡터 및 오류-빈발 PCR 조건을 사용하여 제조함으로써 0.5%의 대략적인 돌연변이유발률을 달성하였다. 당해 돌연변이유발 반응으로부터의 수율은 4 x 109개 재조합체이었다.
표적 기질 서열(천연의 RCL 대신; 실시예 7에서 기술된 바와 같은)을 함유하는 변이 AT3와의 상호작용 및 절단율을 기준으로한 파지의 선택을 실시예 9A에 기술된 바와 같이 폴리프로필렌 96웰 포맷을 사용하여 수행하였다. 당해 선택을 위해, 1x 1012개 재조합체 파지를 SLGRKI RCL 서열을 보유하는 3.3 nM 변이 AT3와 30분 동안 혼합하였다. 세척한 후, 파지를 상기 실시예 9A에 기술된 바와 같이 용출시키고 실시예 9B에 기술된 바와 같이 XL-1 블루 세포를 형질감염시키는데 사용하였다.
연속적인 회차의 선별을 수행하여 본원에서 제공되고 기술된 방법으로 표적 기질 서열과의 신속한 상호작용 및 절단을 풍부하게 하였다. 예를 들면, 첫번째 회차에서 선별된 클론을 본원에 기술된 바와 같이, 3.3, 1.1 및 0.33 nM AT3을 사용하여 1시간 동안 실시예 9A(3)에 기술된 바와 같이 제2회차의 선별에 적용시켰다.
제1회차의 선별 후, 파지 상청액을 실시예 9C에서와 같이 선별된 클론으로부터의 PEG 침전을 사용하여 제조하였다. 파지 클론을 상기 실시예 10(B)이 방법으로, 형광생성 기질로서, Ac-SLGR-ACC (C2 표적 절단 부위 서열 함유) 및 Ac-RQAR-ACC (천연 MT-SP1에 대한 천연의 절단 서열 함유) 둘다를 사용하여 스크리닝하였다. 각각의 클론에 대해, Ac-SLGR-ACC 검정으로부터 측정된 형광성율(ROF)을 표적 기질 서열상의 이의 활성에 대한 천연 기질 서열상의 각각의 돌연변이된 MT-SP1 프로테아제 도메인의 활성을 비교하기 위한 수단으로서 Ac-RQAR-ACC 검정으로부터 측정된 ROF와 비교하였다. 돌연변이 MT-SP1 검정에서 ROF는 또한 주형(C122S) MT-SP1 검정에서 ROF와 비교하였다. 개개의 클론을 사용하여 수득된 결과는 클론 수를 나타내고 RFU/s(초당 상대적 형광 단위)로서 형광성 율을 나열한 하기 표 21에 나타낸다.
Figure 112009007335988-pct00032
B. DNA 서열분석에 의한 선별된 MT - SP1 돌연변이체 파지의 확인
당해 실시예는 앞서의 실시예에서 기술된 바와 같이 제조되고 상기 실시예 10B에 기술된 것과 같은, 형광생성 검정으로부터의 결과를 기준으로 선택된 양성 파지 클론의 확인에 사용된 방법을 기술한다. 당해 방법을 위해, 개개의 클론을 형질감염용 XL-1 블루 이.콜라이 세포와 혼합하고 배양물을 37℃에서 진탕하면서 밤새 성장시켰다. 플라스미드 DNA를 플라스미드 제조 키트(제조원: 퀴아젠)를 사용하여 밤새 배양물로부터 정제하고, DNA를 돌연변이체의 확인을 위한 서열분석을 의뢰하였다.
당해 방법의 하나의 예에서, 상기 실시예 11A로부터의 선택된 B-쇄 MT-SP1 돌연변이체의 아미노산 서열을 상기 요약된 단계를 사용하여 확인하였다. 당해 클론을 확인하는데 사용된 서열분석 프라이머는 서열번호 618: 5'GGTGTTTTCACGAGCACTTC 3'에 제시된다. 서열분석 데이터를 분석함으로써 수득된 결과를 하기 표 22에 제시한다. 당해 표는 하나 이상의 분리체에서 돌연변이된 것으로 밝혀진 잔기를 가진 돌연변이체만을 나열한다. 표 22는 서열분석 데이터의 분석으로 측정한, 야생형 MT-SP1 B-쇄 서열 (서열번호 505)과 비교한 각각의 클론에 대한 아미노산 돌연변이/위치를 나열한다. 아미노산 번호매김은 키모트립신 번호매김에 따른다. 서열 번호는 또한 나타낸 아미노산 돌연변이를 함유하는 MT-SP1 프로테아제 도메인(B-쇄)을 암호화하는 아미노산 잔기의 서열 및 동일한 돌연변이를 갖는 완전한 길이의 MT-SP1 단백질을 암호화하는 아미노산 잔기의 서열에 대해 나열한다.
Figure 112009007335988-pct00033
실시예 12
대량의 선별된 파지- 결합된 MT - SP1 프로테아제의 제조 및 특성규명
A. MT - SP1 파지의 대규모 제조
당해 실시예는 전체 MT-SP1 프로테아제에서 시험관내 해독과 같은 하류 방법에서 선별된 프로테아제 도메인의 분석 및 후속적인 용도를 위한 선택된 MT-SP1 프로테아제 도메인-보유 파지의 대량 제조를 기술한다. 당해 실시예를 위해, 상기 실시예 11에서와 같이 선택된 단일 파지-보유 콜로니를 카르베니실린이 50㎍/mL의 최종 농도로 및 테트라사이클린이 12㎍/mL의 최종 농도로 보충된 2YT 배지 속에서 작은 멸균 코닝 오렌지 캡핑된 에를렌마이어 플라스크 속에서 밤새 성장시켰다. 글리세롤 스톡을 제조하기 위해, 85μL의 60% 글리세롤을 500μl의 각각이 배양물에 가한 후 -80℃에서 저장하였다. 각각의 배양물의 나머지 용적을 카르베니실린 및 테트라사이클린이 보충된 500ml의 2YT 배지를 함유하는 2L의 와이드마우스 배플드 플라스크에 가하였다. 또는, 당해 단계를 500mL의 플라스크 속에서 50mL의 용적으로 수행하였다. 배양물을, 0.5의 OD600에 이를 때까지 성장시켰다.
M13KO7 헬퍼 파지를 배양물에 가하여 1E10 CFU/ml를 수득하고, 배양물을 1시간 동안 37℃에서 항온처리하였다. 카나마이신을 30㎍/mL의 최종 농도로 가하였다. 헬퍼 파지가 들어있는 배양물을 37℃에서 항온처리함으로써 밤새 구제하였다. 밤새 배양한 후, 샘플을 6000 rpm에서 15분 동안 원심분리하였다. 1 용적의 PEG/NaCl (20% PEG 8K/1.5 M NaCl) 용액을 배양물 5 용적당 가하였다. 이후에, 샘플을 4℃에서 20분 동안 교반하였다. 샘플을 10,000 rpm에서 20분 동안 교반하였다. 샘플을 10,000 rpm에서 20분 동안 원심분리하고 상청액을 제거하였다. 10,000rpm에서 두번째 원심분리한 후, 펠릿을 5 mL (초기 500 mL 용적에 대해) 또는 1 mL (초기 50 mL 용적에 대해) PBS 속에 재현탁시켰다. 재현탁되지 않은 침전된 세포를 14,000 rpm에서 2분 동안 약간 원심분리하여 제거하였다. 글리세롤을 10용적%에서 재현탁된 세포를 함유하는 상청액에 가하였다. 세포를 -80℃에서 동결시켰다.
B. ACC 및 QF 기질을 사용하여 제조된 파지의 검정
당해 실시예는 실시예 12A에서 제조된 파지의 활성 및 특이성을 평가하는데 사용된 형광생성 검정을 기술한다. 실시예 12A에 기술된 바와 같이 50mL 용적의 배양물을 사용하여 제조한 PEC-침전된 돌연변이 MT-SP1-보유 파지 클론을 1E13 입자/ml로 표준화하였다. 이후에, 파지를 ACC 형광생성 및 QF(Quenched Fluorescence) 기질을 다음과 같이 사용하여 효소적으로 검정하였다. 5μL 파지 (1E13 입자/ml)를 각각의 웰에 차단 코스타 폴리프로필렌 하프-웰 미세역가 플레이트(제조원: 코닝) 내 각각의 웰에 5μL 10X MT-SP1 검정 완충액, 35μL H2O 및 5μL 기질과 함께 총 50μL의 용적으로 가하였다. 개개의 웰에 사용된 기질은 Ac-SLGR-ACC (120 μM의 최종 농도), Ac-RQAR-ACC (60 μM의 최종 농도), 또는 다음의 퀀칭된-형광성 기질: SLGR-KI, 및 RQAR-SA (둘다 0.625 μM의 최종 농도에서 사용)이었다. Ac-SLGR-ACC 기질을 사용하여 표적(보체 C2) 절단 서열의 돌연변이 MT-SP1 클론에 의한 절단을 평가하는 한편, Ac-RQAR-ACC 기질을 사용하여 MT-SP1에 대한 천연의 표적 절단 서열의 절단을 평가하였다. 유사하게, SLGR-KI 기질을 사용하여 표적(보체 C2) 절단 서열의 절단을 평가하는 한편, RQAR-SA 기질을 사용하여 MT-SP1에 대한 천연의 표적 절단 서열의 절단을 평가하였다. 이들 2개의 절단율에 대한 비율은 표적화된 새로운 절단 서열에 대한 선별된 프로테아제의 선택성의 하나의 정량적 척도이었다. 선택된 변이체 및 상응하는 원래의 스캐폴드(즉, 모) 프로테아제에 대한 이들 비의 비교는, 선별된 프로테아제가 표적화된 새로운 절단 서열에 대한 향상된 선택성을 나타내었다. ACC 판독의 경우, SpectraMax® 플레이트 판독기를 380 nM의 여기에 대해 및 435 nM 컷오프를 사용하여 460nM에서의 방사를 검출하기 위해 제시하였다. QF 판독의 경우, SpectraMax® 플레이트 판독기는 490 nM에서의 여기로 제시하여 515nM의 컷오프로 520nM에서의 방사를 검출하였다. 당해 검정의 결과는 하기 표 23에 제시한다. 위에서와 같이, 서열들은 나타낸 아미노산 돌연변이를 함유하는 MT-SP1 프로테아제 도메인(B-쇄)를 암호화하는 아미노산 잔기의 서열 및 또한 상기 실시예 11B에 기술된 바와 같이, 서열분석에 의해 측정한 것으로서, 동일한 돌연변이를 갖는 완전한 길이의 MT-SP1 단백질을 암호화하는 아미노산 잔기에 대해 나타낸다. RFU(상대적 형광성 단위) 수는 각각의 기질에 대한 37℃에서 60분 반응시 관측된 가수분해 속도에 상응한다.
Figure 112009007335988-pct00034
실시예 13
시험관내 해독을 사용한 선별된 MT - SP1 돌연변이 단백질의 발현
본 실시예는 유전자 III 융합 단백질의 일부가 아닌, 위에서 기술한 실시예에서와 같이 선택하여 스크리닝한 MT-SP1 프로테아제 도메인의 발현을 기술한다.
A. 변형된 IVEX 벡터내로의 MT - SP1 서열의 서브클로닝
상기 실시예에서 기술한 바와 같이, 유전자 III 융합 단백질로서 합성되지 않는 파지상에서 선택된 MT-SP1 프로테아제를 발현시키기 위하여, N-말단 활성화 서열 및 C-말단 6xHis 태그를 함유하는 MT-SP1 프로테아제 도메인에 대한 암호화 영역을 시험관내 헤독 벡터(제조원: 로슈, 서열번호 559)내 pIVEX.2.3d RTS내로 NdeI 및 XhoI 제한 부위를 사용하여 클로닝하였다. RQAR 절단 부위 앞의 pIVEX.2.3d.MT-SP1의 완전한 N-말단 아미노산 서열은 서열번호 558: MEKTRHHHHHHSGSDCGLRSFTRQAR에 제시되어 있다. 상기에 기술된 바와 같이 파지미드 라이브러리를 사용하여 선택하고, 실시예 10B 및 11A에 기술된 바와 같은 형광생성 스크리닝 방법을 사용하여 검정하고 실시예 11B에 기술된 바와 같이 서열분석한 MT-SP1 B-쇄 단백질을 암호화하는 잔기를 pIVEX.2.3d.MT-SP1 벡터내로 내부 SphI 및 BsrGI 제한 부위를 사용하여 서브클로닝하였다. 이들 내부 부위 바깥에 있는 MT-SP1 서열내 돌연변이를 갖는 파지미드 선택인자를 PCR 돌연변이유발에 의해 당해 방법에서 사용하기 위해 생성하였다.
B. 시험관내 해독에 의한 MT - SP1 의 발현
시험관내 해독 키트를 사용한 MT-SP1 프로테아제 도메인의 발현, RTS 100 이.콜라이 이황화물 키트[제조원: 로슈 어플라이드 사이언스(Roche Applied Science)]를 다음 최적화를 사용하여 공급업자가 명시한 조건을 사용하여 수행하였다: 50μl의 반응 용액의 성분을 변형시켜 12μl의 아미노산 혼합물, 10μl의 반응 혼합물, 12μl의 가수분해물과 함께 5μl의 1M 헤페스 pH 8 완충액, 2.5μl 12nM 트윈-20, 2.5μl의 단백질 이황화물 이소머라제(PDI), 및 6μl의 카페론 RTS GroE 보충물(제조원: 로슈 어플라이드 사이언스)를 포함시켰다. 1mL의 공급 혼합물을 또한 변형시켜 168μl의 아미노산 혼합물, 24μl의 메티오닌, 608μl의 공급물 혼합물, 100μl의 1M 헤페스 pH 8, 50μl의 12nM 트윈-20, 및 50μl의 물을 첨가하면서 포함시켰다. 시험관내 해독(IVT) 반응물을 플레이트 진탕기상에서 30℃로 18시간 동안 항온처리하였다.
C. His -태그화된 MT - SP1 의 정제
시험관내 해독(IVT) 반응에 이어, 불용성 단백질을 원심분리에 의해 투명하게 하고 새로운 튜브내로 옮겼다. 투명화된 상청액(대략 45μl의 용적)을 1mL 최종 용적의 50mM 나트륨 포스페이트, pH 7.5, 300 mM NaCl이 되도록 하였다. 당해 용액을 2 mL의 프릿된 크로마토그래피 컬럼(제조원: 클론테크) 내 300μl의 예비-평형화된 TALON® 수지에 적용시키고 중력에 의해 관류되도록 하였다. 당해 컬럼을 50 mM 나트륨 포스페이트 pH 7, 300 mM NaCl 및 7.5 mM 이미다졸을 함유하는 3mL의 용액으로 세척하고 50 mM 나트륨 포스페이트 pH 6.5, 300 mM NaCl 및 75 mM 이미다졸을 함유하는 600μl의 용액으로 용출시켰다. 용출물을 포스페이트-완충된 염수내로 0.1% 트윈-20 (PBST)을 사용하여 투석시키고 20μL로 농축시켰다. 통상적으로, 정제된 프로테아제의 수율은 약 70%였다.
실시예 4
돌연변이된 MT - SP1 프로테아제 도메인의 특성규명
당해 실시예는 상기 실시예 13에서와 같이 생산된 돌연변이된 돌연변이 MT-SP1 프로테아제 도메인의 특성규명을 기술한다.
A. IVT 반응물의 활성 부위 적정
프로테아제 활성을 평가하기 위해서, 시험관내-해독된 돌연변이 MT-SP1 프로테아제 도메인의 활성 부위 적정을 투명한 상청액상에서 MT-SP1 억제제 M84R 에코틴을 사용하여 문헌[참조: Takeuchi et al, (1999) PNAS 96,11054-11061]에 기술된 바와 같이, 수행하였다. 당해 검정을 위해, IVT 단백질을 1X MT-SP1 활성 완충액 속에서 1:10,000의 최종 농도로 희석시키고 15 nM 에코틴과 1:2.5의 연속 희석으로 1시간 동안 30℃에서 항온처리하였다. 반응물을 0.4 mM Ac-RQAR-ACC 기질의 절단에 대해 SpectraMax® M5 마이크로플레이트 판독기(제조원: 몰레큘러 디바이스, 인크.) 상에서 반응속도론적으로 평가하였다. ACC 이탈 그룹을 여기(Ex) = 380, 방사 (Em) = 450의 파장 및 컷오프 (c/o) = 435에서 검출하였다. 20% 내지 80%의 억제되지 않은 활성 사이의 분획 활성을 나타내는 검정 시점을 활성 대 에코틴 농도의 그래프 상에 플롯팅하고, 선을 점을 통해 플롯팅하였다. 선의 x-절편을 사용하여 IVT 프로테아제의 활성 농도를 확립하였다. 반응을 IVT 프로테아제의 활성 농도를 나타내는 곡선의 선형 부분을 사용하여 그래프화하였다. 따라서, 활성 부위 농도(하기 표 24에서 몇가지 돌연변이체에 대해 제시; 활성 부위 농도)를 활성 부위 적정을 사용하여 측정하였다.
B. ACC 및 QF 기질을 사용한 IVT MT - SP1 프로테아제 도메인 돌연변이체의 검정
몇가지 IVT-생산된 MT-SP1 파지 선택인자를 퀀칭된 형광성(QF) 반응속도론적 효소 검정에 의해 천연의 RQAR MT-SP1 절단 부위에 걸쳐 돌연변이체 RCL 절단 부위에 대한 증가된 특이성에 대해 평가하였다. 상기 실시예 13C에 기술된 바와 같이 투명화된 IVT 상청액을 1X MT-SP1 활성 완충액 속에서 1:10,000으로 희석시키고 6.25μM의 천연의 RQAR-SL QF 기질 또는 돌연변이체 RCL C2 절단 기질, SLGR-KI와 함께 항온처리하였다. 절단을 SpectraMax® M5 마이크로플레이트 판독기(제조원: 몰레큘러 디바이스)를 사용하여 Ex = 490, Em = 520 및 c/o = 515의 파장으로 평가하였다. 천연 서열에 걸쳐 RCL 표적 서열에 대한 IVT-생산된 프로테아제의 상대적인 특이성을 RFU/s(초당 상대적 형광 단위)의 비를 사용하여 SLGR-KI 및 RQAR-SL에 대해 계산하였다. 당해 결과는 하기 표 24에 나타낸다. 컬럼에서, 나타낸 아미노산 돌연변이를 함유하는 프로테아제 도메인의 아미노산 서열을 제시한 표지된 서열, 서열 번호를 우선 나열하고, 나타낸 아미노산 돌연변이를 함유하는 완전한 길이의 MT-SP1을 암호화하는 아미노산 잔기의 서열을 제시한 서열 번호를 괄호에 나타낸다. RFU 수는 각각이 기질에 대해 측정한 상대적 형광 단위(가수분해 속도)를 나타낸다.
Figure 112009007335988-pct00035
실시예 15
선별된 MT - SP1 돌연변이 단백질의 정제된 단백질로서의 발현
A. MT - SP1 프로테아제 도메인의 pQE 벡터내로의 이동
앞서의 실시예에서 검정한 MT-SP1 프로테아제 도메인-보유 파지 클론의 서브세트는 MT-SP1 프로테아제 도메인 서열을 야생형 MT-SP1 프로테아제 도메인의 발현을 위해 앞서 변형시킨 pQE30 발현 벡터내로 옮기기 위해 선택하였다. 인퓨전 드라이다운 PCR 클로닝 키트(InFusion DryDown PCR Cloning Kit(제조원; 클론테크)를 사용하여 선택된 클론을 pQE30-MT-SP1 (서열번호 624) 내로 문헌[참조: Benoit et al. (2006), Protein Expression & Purification 45:66-71]에 기술된 바와 같이 및 공급업자가 명시한 조건을 사용하여 옮겼다. 당해 과정을 위해 MT-SP1 프로테아제 도메인을 암호화하는 파지 클론 DNA의 일부를 폴리머라제 연쇄 반응(PCR)으로 각각 어닐링되지 않은 5' 테일을 보유하는, pQE-Insert-F2 정방향 프라이머: TTCACGAGACAGGCTCGTGTTGTTGGGGGCACGGAT (서열번호 560) 및 pQE-Insert-R3 역방향 프라이머: CAGCTAATTAAGCTTATTATACCCCAGTGTTCTCTTT (서열번호 561)을 사용하여 증폭시켰다. MT-SP1의 프로테아제 도메인이 없는 플라스미드 pQE30-MT-SP1을 PCR을 사용하여 정방향 프라이머: pQE-Linear-F2: ACGAGCCTGTCTCGTGAATGACCGCAGCCC (서열번호 562) 및 역방향 프라이머: pQE-Linear-R1: TAATAAGCTTAATTAGCTGAGCTTGGACTCC (서열번호 563)로 선형화한 후 공여체 및 수용체 PCR 생성물을 DpnI 효소로 처리하였다. 상기 제시된 각각의 선형화된 프라이머 서열에 대해, 18-nt 길이의 상동 영역, 어닐링되지 않은 5' 프라이머 테일을 굵은 글씨로 나타낸다. 이후에, 수용체 및 공여체 DNA 둘다를 함께 혼합하고, 인퓨전 반응을 10μL 용적 속에서 공급업자가 규정한 조건을 사용하여 수행하였다. 2μL의 반응 혼합물을 50μL의 이.콜라이 TOP10F' 적격 세포 (제조원: 캘리포니아주 칼스바드 소재의 인비트로젠)내로 형질전환시켰다. 콜로니를 100ppm 카르베니실린이 보충된 LB 한천 플레이트상에서 선택하였다. 플라스미드 DNA를 선택된 클론으로부터 분리하고, 정방향 프라이머: MT-SP1-5F: GGAGAAACCGGCAGAGTAC (서열번호 564) 및 역방향 프라이머 MT-SP1-5R: GGTTCTCGCAGGTGGTCTG (서열번호 565)을 사용하여 서열분석함으로써 정확한 형질감염을 입증하였다. 이들 프라이머는 완전히 어닐링되었다.
B. 돌연변이된 MT - SP1 프로테아제 도메인의 발현, 리폴딩 및 정제
상기 실시예 15B에 기술된 pQE30 벡터 (제조원: 퀴아젠)내 MT-SP1 변이체의 프로테아제 도메인을 암호화하는 플라스미드를 BL21-Gold(DE3) 이.콜라이 세포 (제조원: 스트라타젠)내로 형질전환시켰다. 100㎍/mL 카르베니실린으로 보충된 1mL LB를 함유하는 작은 스타터 배양물을 8 내지 10시간 동안 37℃에서 항온처리하였다. 100μL의 당해 배양물을 사용하여 100㎍/mL 카르베니실린이 보충된 50 mL의 2xYT 배지에 접종하고 밤새 성장시켰다. 50 mL의 원뿔 튜브(제조원: 코닝)에, 세포를 원심분리로 수거하고 용해하였다. 봉입체(IB)를 BugBuster® 시약(제조원: 노바겐)로 공급업자가 명시한 조건을 사용하여 분리하였다. IB 펠릿을 100 mM 트리스 pH 8, 6 M GdmHCL 및 20 mM DTT를 함유하는 1mL의 변성 용액으로 가용화하였다. 미세원심분리 튜브 속에서 원심분리 (20,000 x g로 10분)하여 불용성 물질을 제거한 후, 상청액을 1.5M 아르기닌, 1mM 트리스 pH 8, 150mM NaCl, 5mM 환원된 글루타티온 및 50μM 산화된 글루타티온을 함유하는 40mL 리폴딩 용액내로 50mL 원뿔 튜브(제조원: 코닝) 속에서 희석시켰다. 당해 튜브를 뉴테이터 플랫폼(Nutator platform)[제조원: 피셔 사이언티픽(Fisher Scientific)] 상에서 4℃로 3 내지 4일 동안 수평으로 두었다. 리폴딩되었으나 활성화되지는 않은 MT-SP1 변이체를 이후에 실온에서 25 mM 트리스 pH 8, 25 mM NaCl에 대해 3 내지 4일 동안 강력하게 투석하였다. 투석 동안 아르기닌을 제거한 후, MT-SP1 프로테아제 도메인 변이체는 활성화될 수 있었다.
이후에, 활성화된 MT-SP1 프로테아제 도메인 변이체의 조 제제를 회차당 7개 이상의 변이체의 프로세싱을 가능하도록 하는 자동화 모드로 작동하는 AKTA 시스템에 부착된 5 mL HiTrapTM Q HP 컬럼(제조원: 지이 헬쓰케어) 상에서 크로마토그래피하였다. 전개 완충액은 25 mM Bis-트리스 pH 6.5이었으며 정제된 MT-SP1은 50 mL 구배내에서 350 mM NaCl로 용출시켰다. 활성화 분획을 수거한 후, 완충액을 PBS + 20 mM 벤즈아미딘내로 교환하고 0.5 내지 10 mg/mL로 아미콘-울트라 15 장치(제조원: 밀리포어)를 사용하여 10 kDa의 MWCO로 농축시켰다. 최종적으로, 분취량을 액체 질소속에서 급속-동결시키고 -80℃에서 저장하였다.
실시예 16
비오티닐화된 돌연변이 PAI 억제제 베이트의 제조
당해 실시예는 uPA 라이브러리로부터 변이체 uPA 프로테아제를 선별하는데 사용하기 위한, 스트렙트아비딘 피복된 표면상에 포획하기 위해 비오틴으로 태그화된, 돌연변이 PAI 억제제 단백질을 발현하고 정제하는데 사용한 방법을 기술한다. 이들 돌연변이 PAI 억제제는 또한 PAI에 사용된 RCL 서열 및 MT-SP1 돌연변이체에 따라, MT-SP1 라이브러리로부터 일부 변이 MT-SP1 프로테아제의 선택에 유용하다.
A. 6 xHis - PAI -1의 N-말단 비오티닐 화
6xHis-PAI-1 또는 이의 반응성 중심 루프 변이체의 비오티닐화를 위해, 실시예 1에서 본원에 기술되어 있는 바와 같은, 야생형 His-태그화된 PAI-1 (서열번호 625) 및 His-태그화된 PAI-1 변이체를 로제타-2 (DE3)pLysS 숙주 균주(제조원: 노바겐)내로 형질전환시켰다. 발현은 다음 변형과 함께 본질적으로 문헌[참조: Blouse, G. E., Perron, M. J., Thompson, J. H., Day, D. E., Link, C. A., and Shore, J. D. (2002) Biochemistry 41(40), 11997-12009]에 기술된 바와 같이 수행하였다. 유도는 3시간 동안 30℃여서 0.2% 글루코즈, 100㎍/mL 사르베니실린 및 10㎍/mL 클로람페니콜(Cm)이 보충된 2XYT 배지 속에서 수행하였다. 이후에, 6xHis-PAI-1의 활성 분획을 문헌[참조: Blouse, G. E., Perron, M. J., Kvassman, J. O., Yunus, S., Thompson, J. H., Betts, R. L., Lutter, L. C., 및 Shore, J. D. (2003) Biochemistry 42(42), 12260-12272; Kvassman, J.-O., 및 Shore, J. D. (1995) Fibrinolysis 9, 215-221]에 기술된 바와 같이 세포 용해물로부터 정제하였다.
6xHis-PAI-1 변이체를 이황화물 절단가능한 시약 EZ-Link NHS-SS-PEO4-비오틴 (제조원: 록폴드 소재의 피어스, IL #21442)을 사용하여 N-말단에서 우선적으로 비오티닐화하였다. 반응은 pH 6.2에서 4시간 동안, 4℃에서 빙상에서 50 mM NaPi/300 mM NaCl/1 mM EDTA를 함유하는 완충액 속에서 수행하였다. 반응은 5배 과량의 DMSO 속에 용해된 비오티닐화 시약을 첨가하여 개시하였다. 반응물중 DMSO의 최종 농도는 1% 이하로 유지시켰다. 비오티닐화 반응물은 0.5 M 트리스/1.0 NaCl/10 mM EDTA, pH 7.4을 20 mM의 최종 트리스 농도로 첨가하여 퀀칭시켰다. 과량의 비오티닐화 시약을 50 mM NaPi/300 mM NaCl/1 mM EDTA, pH 6.2를 함유하는 저장 완충액에 대한 강력한 투석으로 제거하였다. 수득되는 용액중 PAI-1의 농도는 0.93 mL mg-1 cm-1 [참조: Kvassman, J.-O., and Shore, J. D. (1995) Fibrinolysis 9, 215-221]의 흡광계수를 사용하여 확인하였다. 비오티닐화 정도는 EZ-Quant HABA/아비딘 키트(제조원: 록폴드 소재의 피어스, IL #28005)을 사용하여, 공급업자-규정 조건에 따라 측정하였으며 통상적으로 1몰의 PAI-A 변이체당 1.0 내지 1.2 몰의 비오틴이었다.
B. PAI 의 생체내 비오티닐 화 : 생체내 BRS - TEV - OptiPAI -1 stab 의 비오티닐 화 :
당해 실시예는 PAI를 생체내 비오티닐화하는데 사용된 방법을 기술한다. 당해 실시예에서, 적절한 인지 서열을 베이트 분자를 암호화하는 유전자내로 도입시켜 베이트의 비오틴-태그화를 시험관내에서 정제된 베이트를 사용하여 수행하는 것 대신 성장하는 세포내에서 달성할 수 있다. N150H, K154T, Q319L 및 M354I 돌연변이체[참조: Berkenpas, M. B., Lawrence, D. A., and Ginsburg, D. (1995) EMBO J. 14(13), 2969-2977]를 갖는 안정한 PAI-1 단백질 (서열번호 567에 제시된 아미노산 잔기의 서열을 갖는, PAI-1stab)를 설계하여 1) 출발 코돈, 2) 비오틴 인지 서열(BRS), 3) 토바코 에치 바이러스(Tobacco Etch Virus) 프로테아제 서열 (TEV) 4) PAI 암호화 서열 및 5) 종결 코돈의 순서로 이들 영역을 에스케리키아 콜라이 코돈 최적화와 함께 함유하도록 하였다. 당해 합성 PAI-1stab 유전자를 시판되는 발현 벡터 pET21-a (제조원: 위스콘신주 매디슨 소재의 노바겐)(서열번호 566)내로 XbaI 및 HindIII 제한 효소를 사용하여 클로닝시켜 플라스미드 pCAT0002 (서열번호 619)를 수득하며, 이는 최적화된 PAI-1 (OptiPAI-1; 서열번호 621에 제시된 아미노산 서열에 의해 암호화됨, 여기서, 3 내지 17 및 20 내지 26의 위치의 아미노산 잔기는 각각 BRS 및 TEV 부위에 상응한다)를 T7 발현 시스템으로 발현하였다. 이후에, 플라스미드 pCAT0002는 이.콜라이 비오틴 리가제, BirA를 과발현하는, 플라스미드 pBirA [문헌: Asai et al., (1999) J. Biol. Chem. 274:20079-20078에 기술]를 보유하는 이.콜라이 BL21-골드(DE3) 적격 세포(제조원: 캘리포니아주 산 디에고 소재의 스트라타젠)내로 공동-형질전환시켰다. 형질전환체를 100 ㎍/mL 카르베니실린 및 10㎍/mL 클로람페니콜(Cm)이 보충된 루리아-베르타니(LB) 한천 플레이트상에서 선택하였다.
BRS-TEV-OptiPAI-1stab (서열번호 621) 및 이의 반응성 중심 루프 변이체의 발현은 본질적으로 문헌[참조: Blouse, G. E., Perron, M. J., Thompson, J. H., Day, D. E., Link, C. A., and Shore, J. D. (2002) Biochemistry 41(40), 11997-12009]에 기술된 바와 같이, 다음 변형과 함께 수행하였다. 유도는 0.1 mM IPTG 및 0.1 mM D-비오틴을 3시간 동안 30℃에서 0.2% 글루코즈, 100 ㎍/mL 카르베니실린 및 10 ㎍/mL 클로람페니콜(Cm)이 보충된 2XYT 배지 속에서 첨가하여 개시하였다. BRS-TEV-OptiPAI-1stab의 활성 분획을 후속적으로 문헌[참조: Blouse, G. E., Perron, M. J., Kvassman, J. O., Yunus, S., Thompson, J. H., Betts, R. L., Lutter, L. C., and Shore, J. D. (2003) Biochemistry 42(42), 12260-12272; 및 Kvassman, J.-O., and Shore, J. D. (1995) Fibrinolysis 9, 215-221]에 기술된 바와 같이 세포 용해물로부터 또는 단량체성 아비딘(제조원: 일리노이주 록폴드 소재의 피어스, #20227)상에서 공급업자가 명시한 조건에 따라 다음 변형과 함께 크로마토그래피로 선택함으로써 정제하였다. 50 mM Tris/100 mM NaCl/1 mM EDTA/0.01% 트윈-80을 함유하고 pH가 7.4인 결합 완충액; 및 결합 완충액과 2mM D-비오틴을 함유한 경쟁적 용출 완충액을 사용하였다. 경쟁적 용출 단계로부터의 비오틴을 50 mM NaPi/300 mM NaCl/1 mM EDTA, pH 6.2를 함유하는 저장 완충액에 대해 집중적으로 투석하여 제거하였다. PAI-1 농도는 문헌[참조: Kvassman, J.-O., and Shore, J. D. (1995) Fibrinolysis 9, 215-221]에 기술된 바와 같이 0.93 mL mg-1 cm-1의 흡광계수를 사용하여 확인하였다.
C. V1C OptiPAI -1 stab 의 시험관내 비오티닐 화
당해 실시예는 PAI 변이체의 N-말단 비오티닐화에 대한 방법을 제시한다. 당해 실시예에 기술된 방법을 수행하여 적절한 반응성 그룹을 PAI 베이트 분자를 암호화하는 유전자내로 혼입시킴으로써 비오틴을 사용한 베이트의 태그화를 단백질이 정제된 후 완성함으로써 베이트의 부위-특이적인 표지화를 허용하였다. 당해 실시예에서, 천연의 PAI는 어떠한 시스테인 잔기도 함유하지 않으므로, 시스테인 코돈을 PAI 유전자를 암호화하는 DNA에 가하여 Cys-함유 PAI를 생성한 후, 이를 Cys-반응성 비오티닐화 시약과 반응시켰다.
위에서 기술한 플라스미드 pCAT0002내, OptiPAI-1의 N-말단 BRS-TEV 서열은 QuikChange-XL 돌연변이유발 키트(제조원: 캘리포니아주 산 디에고 소재의 스트라타젠)를 사용하여 제조업자의 지침에 따라 V1C 돌연변이를 동시에 도입함으로써 결실시켜 V1C OptiPAI-1stab 단백질 (서열번호 622)을 발현하는 플라스미드 pCAT0051 (서열번호 623)을 생성시켰다. 플라스미드 pCAT0051을 이.콜라이 BL21(DE3) pLysS 적격 세포 (제조원: 캘리포니아주 산 디에고 소재의 스트라타젠)내로 형질전환시켰다. 형질전환체를 100 ㎍/mL 카르베니실린 및 10 ㎍/mL 클로람페니콜(Cm)이 보충된 루리아-베르타니(LB) 한천 플레이트상에서 선택하였다.
V1C OptiPAI-1stab 단백질 및 이의 반응성 루프 변이체의 발현을 본질적으로 문헌[참조: Blouse, G. E., Perron, M. J., Thompson, J. H., Day, D. E., Link, C. A., and Shore, J. D. (2002) Biochemistry 41(40), 11997-12009]에 기술된 바와 같이 다음 변형과 함께 수행하였다. 유도는 0.1 mM IPTG를 3시간 동안 30℃에서 3시간 동안 0.2% 글루코즈, 100 ㎍/mL 카르베니실린 및 10 ug/mL 클로람페니콜이 보충된 2XYT 배지 속에서 첨가하여 개시하였다. V1C OptiPAI-1stab 또는 이의 변이체의 활성 분획을 문헌[참조: Blouse, G. E., Perron, M. J., Kvassman, J. O., Yunus, S., Thompson, J. H., Betts, R. L., Lutter, L. C., and Shore, J. D. (2003) Biochemistry 42(42), 12260-12272; 및 Kvassman, J.-O., and Shore, J. D. (1995) Fibrinolysis 9, 215-221]에 기술된 바와 같이 세포 용해물로부터 정제하였다.
V1C OptiPAI-1 단백질 및 변이체를 조작된 N-말단 시스테인 잔기에서 티올-반응성 및 가역성 비오티닐화 시약, EZ-링크 비오틴-HPDP (N-(6-(비오틴아미도)헥실)-3'-(2'-피리딜디티오)-프로피온아미드)(제조원: 록폴드 소재의 피어스, IL #21341)을 사용하여 비오티닐화하였다. 비오틴 접합은 공급업자의 지시에 따라 일부 변형과 함께 다음과 같이 달성하였다. 비오틴-HPDP의 스톡 용액을 무수 DMF (9.3 mM)속에서 5 mg/mL로 제조하였다. V1C OptiPAI-1stab을 G-25 겔 여과 컬럼상에서 신속하게 탈염시키면, 이로부터 이것이 50 mM NaPi/150 mM NaCl/1 mM EDTA/0.01% 트윈-80, pH 7.4를 함유하는 접합 완충액내로 용출되었다. 비오티닐화 반응은 10배 과량의 스톡 비오틴-HPDP를 첨가하여 개시하였다. 디메틸포름아미드(DMF)의 최종 농도를 2 내지 3% 이하로 유지시켰다.
반응을 4시간 동안 25℃에서 수행하고 반응 진행은 343nm에서 피리딘-2-티온 이탈 그룹의 방출을 사용하여 수행되었다. 과량의 비오티닐화 시약을 50 mM NaPi/300 mM NaCl/1 mM EDTA, pH 6.2를 함유하는 저장 완충액에 대한 집중적인 투석에 의해 제거하였다. PAI-1 농도를 0.93 mL mg-1 cm- 1 의 흡광 계수를 사용하여 문헌[참조: Kvassman, J.-O., and Shore, J. D. (1995) Fibrinolysis 9, 215-221]에 기술된 바와 같이 확인하였다. 비오티닐화 정도는 EZ-Quant HABA/아비딘 키트 및 피리딘-2-티온(제조원: 록폴드 소재의 피어스, IL #28005)의 방출을 사용한 PAI-1 변이체의 몰당 통상적으로 1.0 내지 1.2 몰의 비오틴이었다.
실시예 17
이. 콜라이 배양 상청액 및 주변세포질 추출물로부터의 MT - SP1 변이체의 스크리닝
당해 실시예는 이.콜라이 주변세포질 공간으로부터의 단백질 또는 이.콜라이 세포 배양 배지로부터의 단백질을 검정함에 의해 파지 상에서 MT-SP1의 활성을 스크리닝하기 위한 대안으로서 각각 사용된 2개의 방법을 기술한다.
방법 둘다의 경우, 1mL의 배양물을 다음과 같이 제조하였다. 100㎍/mL 카르베니실린 및 12㎍/mL 테트라사이클린이 보충된 1mL의 2YT 배지를 96 웰 깊은 웰 플레이트의 각각의 웰 내로 분산시키고, 96 웰 마스터 플레이트로부터, 상기 실시예 14에 기술된 바와 같이 MT-SP1 프로테아제 도메인-보유 파지로 밤새 감염시킨 XL-1 블루 세포 10μL를 접종하였다. 깊은 웰 플레이트를 공기-투과성 막으로 밀봉하고 HiGro 진탕기 항온처리기 속에서 400rpm으로 37℃에서 산소 통기와 함께 세포 밀도가 0.4 내지 0.6 OD600(일반적으로 4 내지 5시간 진탕)에 이를 때까지 진탕하면서 두었다. 이때 IPTG를 0.5 mM의 최종 농도로 가하고 진탕하명서 밤새 계속 성장시켰다. 다음 날, 플레이트를 3600 rpm에서 20분 동안 원심분리하여 세포를 펠릿화하였다.
A. 주변세포질 프렙으로부터의 MT - SP1 변이체의 스크리닝
당해 실시예의 방법을 사용하여 완전한 길이의 MT-SP1-유전자 III 융합 단백질, 및 이.콜라이 주변세포질 공간내로 수송된 융합 단백질의 효소적으로 활성인 절단 생성물을 검정하였다. 3600rpm에서 원심분리한 후, 배양 상청액을 버리고 세포 펠릿을 사용하여 다음 조건을 사용하여 주변세포질 단백질을 방출하였다: 조건 1: 세포 펠릿을 150μL 냉 포스페이트 완충된 염수 (PBS) 속에 재현탁시키고; 현착액을 96 웰 PCR 플레이트로 옮긴 후; 1단계 동결 해동(-80℃에서 20분/실온 수욕 속에서 10분)을 수행하거나; 또는 조건 2: 세포 펠릿을 150 μL의 3% 버그부스터(BugBuster) 단백질 추출 시약(제조원: 노바젠) 속에 재현탁시키고; 현탁액을 96 웰 PCR 플레이트로 옮기고; 현탁액을 실온에서 30분 동안 항온처리하였다. 그 다음, 세포 현탁액을 20분 동안 3600 rpm에서 4℃로 원심분리하고 주변세포질 단백질을 함유하는 상청액을 펠릿을 파괴하지 않으면서 조심스럽게 제거하였다. 추가로, 주변세포질 추출물을 사용하여 MT-SP1 변이체의 효소 활성을 실시예 10, 단락 B에 기술된 바와 같은 적절한 기질을 사용하여 측정하였다.
B. 상청액 프렙으로부터의 MT - SP1 변이체의 스크리닝
본 실시예의 방법을 사용하여 완전한 길이의 MT-SP1 유전자 III 융합 단백질 및 주변세포질로부터 및 세균 세포 배양 배지내로 확산된 촉매적으로 활성인 단편을 검정하였다. 당해 실시예에서, 1mL의 배양물 속에서 원심분리한 후, 10μL의 배양 상청액을 제거하고, 추가의 25μL의 검정 완충액을 반응물에 가하는 것을 제외하고는, 실시예 10, 단락 B에 기술된 프로테아제 검정을 사용하여 검정하였다.
변형물은 당해 분야의 숙련자에게 명백할 것이므로, 본 발명은 첨부된 청구항의 범위에 의해서만 한정되는 것으로 의도된다.
<110> Catalyst Biosciences, Inc. Torrey Pines Institute for Molecular Studies <120> Protease screening methods and proteases identified thereby <130> 19049-002WO1/4902PC <150> US 60/818,804 <151> 2006-07-05 <150> US 60/818,910 <151> 2006-07-05 <160> 636 <170> KopatentIn 1.71 <210> 1 <211> 418 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Alpha-1-antitrypsin precursor SERPINA1 <400> 1 Met Pro Ser Ser Val Ser Trp Gly Ile Leu Leu Leu Ala Gly Leu Cys 1 5 10 15 Cys Leu Val Pro Val Ser Leu Ala Glu Asp Pro Gln Gly Asp Ala Ala 20 25 30 Gln Lys Thr Asp Thr Ser His His Asp Gln Asp His Pro Thr Phe Asn 35 40 45 Lys Ile Thr Pro Asn Leu Ala Glu Phe Ala Phe Ser Leu Tyr Arg Gln 50 55 60 Leu Ala His Gln Ser Asn Ser Thr Asn Ile Phe Phe Ser Pro Val Ser 65 70 75 80 Ile Ala Thr Ala Phe Ala Met Leu Ser Leu Gly Thr Lys Ala Asp Thr 85 90 95 His Asp Glu Ile Leu Glu Gly Leu Asn Phe Asn Leu Thr Glu Ile Pro 100 105 110 Glu Ala Gln Ile His Glu Gly Phe Gln Glu Leu Leu Arg Thr Leu Asn 115 120 125 Gln Pro Asp Ser Gln Leu Gln Leu Thr Thr Gly Asn Gly Leu Phe Leu 130 135 140 Ser Glu Gly Leu Lys Leu Val Asp Lys Phe Leu Glu Asp Val Lys Lys 145 150 155 160 Leu Tyr His Ser Glu Ala Phe Thr Val Asn Phe Gly Asp Thr Glu Glu 165 170 175 Ala Lys Lys Gln Ile Asn Asp Tyr Val Glu Lys Gly Thr Gln Gly Lys 180 185 190 Ile Val Asp Leu Val Lys Glu Leu Asp Arg Asp Thr Val Phe Ala Leu 195 200 205 Val Asn Tyr Ile Phe Phe Lys Gly Lys Trp Glu Arg Pro Phe Glu Val 210 215 220 Lys Asp Thr Glu Glu Glu Asp Phe His Val Asp Gln Val Thr Thr Val 225 230 235 240 Lys Val Pro Met Met Lys Arg Leu Gly Met Phe Asn Ile Gln His Cys 245 250 255 Lys Lys Leu Ser Ser Trp Val Leu Leu Met Lys Tyr Leu Gly Asn Ala 260 265 270 Thr Ala Ile Phe Phe Leu Pro Asp Glu Gly Lys Leu Gln His Leu Glu 275 280 285 Asn Glu Leu Thr His Asp Ile Ile Thr Lys Phe Leu Glu Asn Glu Asp 290 295 300 Arg Arg Ser Ala Ser Leu His Leu Pro Lys Leu Ser Ile Thr Gly Thr 305 310 315 320 Tyr Asp Leu Lys Ser Val Leu Gly Gln Leu Gly Ile Thr Lys Val Phe 325 330 335 Ser Asn Gly Ala Asp Leu Ser Gly Val Thr Glu Glu Ala Pro Leu Lys 340 345 350 Leu Ser Lys Ala Val His Lys Ala Val Leu Thr Ile Asp Glu Lys Gly 355 360 365 Thr Glu Ala Ala Gly Ala Met Phe Leu Glu Ala Ile Pro Met Ser Ile 370 375 380 Pro Pro Glu Val Lys Phe Asn Lys Pro Phe Val Phe Leu Met Ile Glu 385 390 395 400 Gln Asn Thr Lys Ser Pro Leu Phe Met Gly Lys Val Val Asn Pro Thr 405 410 415 Gln Lys <210> 2 <211> 420 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Alpha-1-antitrypsin-related precursor SERPINA2 <400> 2 Met Pro Phe Ser Val Ser Trp Gly Val Leu Leu Leu Ala Gly Leu Cys 1 5 10 15 Cys Leu Val Pro Ser Ser Leu Val Glu Asp Pro Gln Gly Asp Ala Ala 20 25 30 Gln Lys Thr Asp Thr Ser His His Asp Gln Gly Asp Trp Glu Asp Leu 35 40 45 Ala Cys Gln Lys Ile Ser Tyr Asn Val Thr Asp Leu Ala Phe Asp Leu 50 55 60 Tyr Lys Ser Trp Leu Ile Tyr His Asn Gln His Val Leu Val Thr Pro 65 70 75 80 Thr Ser Val Ala Met Ala Phe Arg Met Leu Ser Leu Gly Thr Lys Ala 85 90 95 Asp Thr Arg Thr Glu Ile Leu Glu Gly Leu Asn Val Asn Leu Thr Glu 100 105 110 Thr Pro Glu Ala Lys Ile His Glu Cys Phe Gln Gln Val Leu Gln Ala 115 120 125 Leu Ser Arg Pro Asp Thr Arg Leu Gln Leu Thr Thr Gly Ser Ser Leu 130 135 140 Phe Val Asn Lys Ser Met Lys Leu Val Asp Thr Phe Leu Glu Asp Thr 145 150 155 160 Lys Lys Leu Tyr His Ser Glu Ala Ser Ser Ile Asn Phe Arg Asp Thr 165 170 175 Glu Glu Ala Lys Glu Gln Ile Asn Asn Tyr Val Glu Lys Arg Thr Gly 180 185 190 Arg Lys Val Val Asp Leu Val Lys His Leu Lys Lys Asp Thr Ser Leu 195 200 205 Ala Leu Val Asp Tyr Ile Ser Phe His Gly Lys Trp Lys Asp Lys Phe 210 215 220 Lys Ala Glu Arg Ile Met Val Glu Gly Phe His Val Asp Asp Lys Thr 225 230 235 240 Ile Ile Arg Val Pro Met Ile Asn His Leu Gly Arg Phe Asp Ile His 245 250 255 Arg Asp Arg Glu Leu Ser Ser Trp Val Leu Ala Gln His Tyr Val Gly 260 265 270 Asn Ala Thr Ala Phe Phe Ile Leu Pro Asp Pro Lys Lys Met Trp Gln 275 280 285 Leu Glu Glu Lys Leu Thr Tyr Ser His Leu Glu Asn Ile Gln Arg Ala 290 295 300 Phe Asp Ile Arg Ser Ile Asn Leu His Phe Pro Lys Leu Ser Ile Ser 305 310 315 320 Gly Thr Tyr Lys Leu Lys Arg Val Pro Arg Asn Leu Gly Ile Thr Lys 325 330 335 Ile Phe Ser Asn Glu Ala Asp Leu Ser Gly Val Ser Gln Glu Ala Pro 340 345 350 Leu Lys Leu Ser Lys Ala Val His Val Ala Val Leu Thr Ile Asp Glu 355 360 365 Lys Gly Thr Glu Ala Thr Gly Ala Pro His Leu Glu Glu Lys Ala Trp 370 375 380 Ser Lys Tyr Gln Thr Val Met Phe Asn Arg Pro Phe Leu Val Ile Ile 385 390 395 400 Lys Glu Tyr Ile Thr Asn Phe Pro Leu Phe Ile Gly Lys Val Val Asn 405 410 415 Pro Thr Gln Lys 420 <210> 3 <211> 490 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Alpha-2-antiplasmin SERPINF2 <400> 3 Met Ala Leu Leu Trp Gly Leu Leu Val Leu Ser Trp Ser Cys Leu Gln 1 5 10 15 Gly Pro Cys Ser Val Phe Ser Pro Val Ser Ala Met Glu Pro Leu Gly 20 25 30 Arg Gln Leu Thr Ser Gly Pro Asn Gln Glu Gln Val Ser Pro Leu Thr 35 40 45 Leu Leu Lys Leu Gly Asn Gln Glu Pro Gly Gly Gln Thr Ala Leu Lys 50 55 60 Ser Pro Pro Gly Val Cys Ser Arg Asp Pro Thr Pro Glu Gln Thr His 65 70 75 80 Arg Leu Ala Arg Ala Met Met Ala Phe Thr Ala Asp Leu Phe Ser Leu 85 90 95 Val Ala Gln Thr Ser Thr Cys Pro Asn Leu Ile Leu Ser Pro Leu Ser 100 105 110 Val Ala Leu Ala Leu Ser His Leu Ala Leu Gly Ala Gln Asn His Thr 115 120 125 Leu Gln Arg Leu Gln Gln Val Leu His Ala Gly Ser Gly Pro Cys Leu 130 135 140 Pro His Leu Leu Ser Arg Leu Cys Gln Asp Leu Gly Pro Gly Ala Phe 145 150 155 160 Arg Leu Ala Ala Arg Met Tyr Leu Gln Lys Gly Phe Pro Ile Lys Glu 165 170 175 Asp Phe Leu Glu Gln Ser Glu Gln Leu Phe Gly Ala Lys Pro Val Ser 180 185 190 Leu Thr Gly Lys Gln Glu Asp Asp Leu Ala Asn Ile Asn Gln Trp Val 195 200 205 Lys Glu Ala Thr Glu Gly Lys Ile Gln Glu Phe Leu Ser Gly Leu Pro 210 215 220 Glu Asp Thr Val Leu Leu Leu Leu Asn Ala Ile His Phe Gln Gly Phe 225 230 235 240 Trp Arg Asn Lys Phe Asp Pro Ser Leu Thr Gln Arg Asp Ser Phe His 245 250 255 Leu Asp Glu Gln Phe Thr Val Pro Val Glu Met Met Gln Ala Arg Thr 260 265 270 Tyr Pro Leu Arg Trp Phe Leu Leu Glu Gln Pro Glu Ile Gln Val Ala 275 280 285 His Phe Pro Phe Lys Asn Asn Met Ser Phe Val Val Leu Val Pro Thr 290 295 300 His Phe Glu Trp Asn Val Ser Gln Val Leu Ala Asn Leu Ser Trp Asp 305 310 315 320 Thr Leu His Pro Pro Leu Val Trp Glu Arg Pro Thr Lys Val Arg Leu 325 330 335 Pro Lys Leu Tyr Leu Lys His Gln Met Asp Leu Val Ala Thr Leu Ser 340 345 350 Gln Leu Gly Leu Gln Glu Leu Phe Gln Ala Pro Asp Leu Arg Gly Ile 355 360 365 Ser Glu Gln Ser Leu Val Val Ser Gly Val Gln His Gln Ser Thr Leu 370 375 380 Glu Leu Ser Glu Val Gly Val Glu Ala Ala Ala Ala Thr Ser Ile Ala 385 390 395 400 Met Ser Arg Met Ser Leu Ser Ser Phe Ser Val Asn Arg Pro Phe Leu 405 410 415 Phe Phe Ile Phe Glu Asp Thr Thr Gly Leu Pro Leu Phe Val Gly Ser 420 425 430 Val Arg Asn Pro Asn Pro Ser Ala Pro Arg Glu Leu Lys Glu Gln Gln 435 440 445 Asp Ser Pro Gly Asn Lys Asp Phe Leu Gln Ser Leu Lys Gly Phe Pro 450 455 460 Arg Gly Asp Lys Leu Phe Gly Pro Asp Leu Lys Leu Val Pro Pro Met 465 470 475 480 Glu Glu Asp Tyr Pro Gln Phe Gly Ser Pro 485 490 <210> 4 <211> 423 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Alpha-1-antichymotrypsin precursor SERPINA3 <400> 4 Met Glu Arg Met Leu Pro Leu Leu Ala Leu Gly Leu Leu Ala Ala Gly 1 5 10 15 Phe Cys Pro Ala Val Leu Cys His Pro Asn Ser Pro Leu Asp Glu Glu 20 25 30 Asn Leu Thr Gln Glu Asn Gln Asp Arg Gly Thr His Val Asp Leu Gly 35 40 45 Leu Ala Ser Ala Asn Val Asp Phe Ala Phe Ser Leu Tyr Lys Gln Leu 50 55 60 Val Leu Lys Ala Pro Asp Lys Asn Val Ile Phe Ser Pro Leu Ser Ile 65 70 75 80 Ser Thr Ala Leu Ala Phe Leu Ser Leu Gly Ala His Asn Thr Thr Leu 85 90 95 Thr Glu Ile Leu Lys Gly Leu Lys Phe Asn Leu Thr Glu Thr Ser Glu 100 105 110 Ala Glu Ile His Gln Ser Phe Gln His Leu Leu Arg Thr Leu Asn Gln 115 120 125 Ser Ser Asp Glu Leu Gln Leu Ser Met Gly Asn Ala Met Phe Val Lys 130 135 140 Glu Gln Leu Ser Leu Leu Asp Arg Phe Thr Glu Asp Ala Lys Arg Leu 145 150 155 160 Tyr Gly Ser Glu Ala Phe Ala Thr Asp Phe Gln Asp Ser Ala Ala Ala 165 170 175 Lys Lys Leu Ile Asn Asp Tyr Val Lys Asn Gly Thr Arg Gly Lys Ile 180 185 190 Thr Asp Leu Ile Lys Asp Leu Asp Ser Gln Thr Met Met Val Leu Val 195 200 205 Asn Tyr Ile Phe Phe Lys Ala Lys Trp Glu Met Pro Phe Asp Pro Gln 210 215 220 Asp Thr His Gln Ser Arg Phe Tyr Leu Ser Lys Lys Lys Trp Val Met 225 230 235 240 Val Pro Met Met Ser Leu His His Leu Thr Ile Pro Tyr Phe Arg Asp 245 250 255 Glu Glu Leu Ser Cys Thr Val Val Glu Leu Lys Tyr Thr Gly Asn Ala 260 265 270 Ser Ala Leu Phe Ile Leu Pro Asp Gln Asp Lys Met Glu Glu Val Glu 275 280 285 Ala Met Leu Leu Pro Glu Thr Leu Lys Arg Trp Arg Asp Ser Leu Glu 290 295 300 Phe Arg Glu Ile Gly Glu Leu Tyr Leu Pro Lys Phe Ser Ile Ser Arg 305 310 315 320 Asp Tyr Asn Leu Asn Asp Ile Leu Leu Gln Leu Gly Ile Glu Glu Ala 325 330 335 Phe Thr Ser Lys Ala Asp Leu Ser Gly Ile Thr Gly Ala Arg Asn Leu 340 345 350 Ala Val Ser Gln Val Val His Lys Ala Val Leu Asp Val Phe Glu Glu 355 360 365 Gly Thr Glu Ala Ser Ala Ala Thr Ala Val Lys Ile Thr Leu Leu Ser 370 375 380 Ala Leu Val Glu Thr Arg Thr Ile Val Arg Phe Asn Arg Pro Phe Leu 385 390 395 400 Met Ile Ile Val Pro Thr Asp Thr Gln Asn Ile Phe Phe Met Ser Lys 405 410 415 Val Thr Asn Pro Lys Gln Ala 420 <210> 5 <211> 464 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Antithrombin-III precursor SERPINC1 <400> 5 Met Tyr Ser Asn Val Ile Gly Thr Val Thr Ser Gly Lys Arg Lys Val 1 5 10 15 Tyr Leu Leu Ser Leu Leu Leu Ile Gly Phe Trp Asp Cys Val Thr Cys 20 25 30 His Gly Ser Pro Val Asp Ile Cys Thr Ala Lys Pro Arg Asp Ile Pro 35 40 45 Met Asn Pro Met Cys Ile Tyr Arg Ser Pro Glu Lys Lys Ala Thr Glu 50 55 60 Asp Glu Gly Ser Glu Gln Lys Ile Pro Glu Ala Thr Asn Arg Arg Val 65 70 75 80 Trp Glu Leu Ser Lys Ala Asn Ser Arg Phe Ala Thr Thr Phe Tyr Gln 85 90 95 His Leu Ala Asp Ser Lys Asn Asp Asn Asp Asn Ile Phe Leu Ser Pro 100 105 110 Leu Ser Ile Ser Thr Ala Phe Ala Met Thr Lys Leu Gly Ala Cys Asn 115 120 125 Asp Thr Leu Gln Gln Leu Met Glu Val Phe Lys Phe Asp Thr Ile Ser 130 135 140 Glu Lys Thr Ser Asp Gln Ile His Phe Phe Phe Ala Lys Leu Asn Cys 145 150 155 160 Arg Leu Tyr Arg Lys Ala Asn Lys Ser Ser Lys Leu Val Ser Ala Asn 165 170 175 Arg Leu Phe Gly Asp Lys Ser Leu Thr Phe Asn Glu Thr Tyr Gln Asp 180 185 190 Ile Ser Glu Leu Val Tyr Gly Ala Lys Leu Gln Pro Leu Asp Phe Lys 195 200 205 Glu Asn Ala Glu Gln Ser Arg Ala Ala Ile Asn Lys Trp Val Ser Asn 210 215 220 Lys Thr Glu Gly Arg Ile Thr Asp Val Ile Pro Ser Glu Ala Ile Asn 225 230 235 240 Glu Leu Thr Val Leu Val Leu Val Asn Thr Ile Tyr Phe Lys Gly Leu 245 250 255 Trp Lys Ser Lys Phe Ser Pro Glu Asn Thr Arg Lys Glu Leu Phe Tyr 260 265 270 Lys Ala Asp Gly Glu Ser Cys Ser Ala Ser Met Met Tyr Gln Glu Gly 275 280 285 Lys Phe Arg Tyr Arg Arg Val Ala Glu Gly Thr Gln Val Leu Glu Leu 290 295 300 Pro Phe Lys Gly Asp Asp Ile Thr Met Val Leu Ile Leu Pro Lys Pro 305 310 315 320 Glu Lys Ser Leu Ala Lys Val Glu Lys Glu Leu Thr Pro Glu Val Leu 325 330 335 Gln Glu Trp Leu Asp Glu Leu Glu Glu Met Met Leu Val Val His Met 340 345 350 Pro Arg Phe Arg Ile Glu Asp Gly Phe Ser Leu Lys Glu Gln Leu Gln 355 360 365 Asp Met Gly Leu Val Asp Leu Phe Ser Pro Glu Lys Ser Lys Leu Pro 370 375 380 Gly Ile Val Ala Glu Gly Arg Asp Asp Leu Tyr Val Ser Asp Ala Phe 385 390 395 400 His Lys Ala Phe Leu Glu Val Asn Glu Glu Gly Ser Glu Ala Ala Ala 405 410 415 Ser Thr Ala Val Val Ile Ala Gly Arg Ser Leu Asn Pro Asn Arg Val 420 425 430 Thr Phe Lys Ala Asn Arg Pro Phe Leu Val Phe Ile Arg Glu Val Pro 435 440 445 Leu Asn Thr Ile Ile Phe Met Gly Arg Val Ala Asn Pro Cys Val Lys 450 455 460 <210> 6 <211> 499 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Heparin cofactor 2 precursor SERPIND1 <400> 6 Met Lys His Ser Leu Asn Ala Leu Leu Ile Phe Leu Ile Ile Thr Ser 1 5 10 15 Ala Trp Gly Gly Ser Lys Gly Pro Leu Asp Gln Leu Glu Lys Gly Gly 20 25 30 Glu Thr Ala Gln Ser Ala Asp Pro Gln Trp Glu Gln Leu Asn Asn Lys 35 40 45 Asn Leu Ser Met Pro Leu Leu Pro Ala Asp Phe His Lys Glu Asn Thr 50 55 60 Val Thr Asn Asp Trp Ile Pro Glu Gly Glu Glu Asp Asp Asp Tyr Leu 65 70 75 80 Asp Leu Glu Lys Ile Phe Ser Glu Asp Asp Asp Tyr Ile Asp Ile Val 85 90 95 Asp Ser Leu Ser Val Ser Pro Thr Asp Ser Asp Val Ser Ala Gly Asn 100 105 110 Ile Leu Gln Leu Phe His Gly Lys Ser Arg Ile Gln Arg Leu Asn Ile 115 120 125 Leu Asn Ala Lys Phe Ala Phe Asn Leu Tyr Arg Val Leu Lys Asp Gln 130 135 140 Val Asn Thr Phe Asp Asn Ile Phe Ile Ala Pro Val Gly Ile Ser Thr 145 150 155 160 Ala Met Gly Met Ile Ser Leu Gly Leu Lys Gly Glu Thr His Glu Gln 165 170 175 Val His Ser Ile Leu His Phe Lys Asp Phe Val Asn Ala Ser Ser Lys 180 185 190 Tyr Glu Ile Thr Thr Ile His Asn Leu Phe Arg Lys Leu Thr His Arg 195 200 205 Leu Phe Arg Arg Asn Phe Gly Tyr Thr Leu Arg Ser Val Asn Asp Leu 210 215 220 Tyr Ile Gln Lys Gln Phe Pro Ile Leu Leu Asp Phe Lys Thr Lys Val 225 230 235 240 Arg Glu Tyr Tyr Phe Ala Glu Ala Gln Ile Ala Asp Phe Ser Asp Pro 245 250 255 Ala Phe Ile Ser Lys Thr Asn Asn His Ile Met Lys Leu Thr Lys Gly 260 265 270 Leu Ile Lys Asp Ala Leu Glu Asn Ile Asp Pro Ala Thr Gln Met Met 275 280 285 Ile Leu Asn Cys Ile Tyr Phe Lys Gly Ser Trp Val Asn Lys Phe Pro 290 295 300 Val Glu Met Thr His Asn His Asn Phe Arg Leu Asn Glu Arg Glu Val 305 310 315 320 Val Lys Val Ser Met Met Gln Thr Lys Gly Asn Phe Leu Ala Ala Asn 325 330 335 Asp Gln Glu Leu Asp Cys Asp Ile Leu Gln Leu Glu Tyr Val Gly Gly 340 345 350 Ile Ser Met Leu Ile Val Val Pro His Lys Met Ser Gly Met Lys Thr 355 360 365 Leu Glu Ala Gln Leu Thr Pro Arg Val Val Glu Arg Trp Gln Lys Ser 370 375 380 Met Thr Asn Arg Thr Arg Glu Val Leu Leu Pro Lys Phe Lys Leu Glu 385 390 395 400 Lys Asn Tyr Asn Leu Val Glu Ser Leu Lys Leu Met Gly Ile Arg Met 405 410 415 Leu Phe Asp Lys Asn Gly Asn Met Ala Gly Ile Ser Asp Gln Arg Ile 420 425 430 Ala Ile Asp Leu Phe Lys His Gln Gly Thr Ile Thr Val Asn Glu Glu 435 440 445 Gly Thr Gln Ala Thr Thr Val Thr Thr Val Gly Phe Met Pro Leu Ser 450 455 460 Thr Gln Val Arg Phe Thr Val Asp Arg Pro Phe Leu Phe Leu Ile Tyr 465 470 475 480 Glu His Arg Thr Ser Cys Leu Leu Phe Met Gly Arg Val Ala Asn Pro 485 490 495 Ser Arg Ser <210> 7 <211> 500 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Plasma protease C1 inhibitor precursor SERPING1 <400> 7 Met Ala Ser Arg Leu Thr Leu Leu Thr Leu Leu Leu Leu Leu Leu Ala 1 5 10 15 Gly Asp Arg Ala Ser Ser Asn Pro Asn Ala Thr Ser Ser Ser Ser Gln 20 25 30 Asp Pro Glu Ser Leu Gln Asp Arg Gly Glu Gly Lys Val Ala Thr Thr 35 40 45 Val Ile Ser Lys Met Leu Phe Val Glu Pro Ile Leu Glu Val Ser Ser 50 55 60 Leu Pro Thr Thr Asn Ser Thr Thr Asn Ser Ala Thr Lys Ile Thr Ala 65 70 75 80 Asn Thr Thr Asp Glu Pro Thr Thr Gln Pro Thr Thr Glu Pro Thr Thr 85 90 95 Gln Pro Thr Ile Gln Pro Thr Gln Pro Thr Thr Gln Leu Pro Thr Asp 100 105 110 Ser Pro Thr Gln Pro Thr Thr Gly Ser Phe Cys Pro Gly Pro Val Thr 115 120 125 Leu Cys Ser Asp Leu Glu Ser His Ser Thr Glu Ala Val Leu Gly Asp 130 135 140 Ala Leu Val Asp Phe Ser Leu Lys Leu Tyr His Ala Phe Ser Ala Met 145 150 155 160 Lys Lys Val Glu Thr Asn Met Ala Phe Ser Pro Phe Ser Ile Ala Ser 165 170 175 Leu Leu Thr Gln Val Leu Leu Gly Ala Gly Glu Asn Thr Lys Thr Asn 180 185 190 Leu Glu Ser Ile Leu Ser Tyr Pro Lys Asp Phe Thr Cys Val His Gln 195 200 205 Ala Leu Lys Gly Phe Thr Thr Lys Gly Val Thr Ser Val Ser Gln Ile 210 215 220 Phe His Ser Pro Asp Leu Ala Ile Arg Asp Thr Phe Val Asn Ala Ser 225 230 235 240 Arg Thr Leu Tyr Ser Ser Ser Pro Arg Val Leu Ser Asn Asn Ser Asp 245 250 255 Ala Asn Leu Glu Leu Ile Asn Thr Trp Val Ala Lys Asn Thr Asn Asn 260 265 270 Lys Ile Ser Arg Leu Leu Asp Ser Leu Pro Ser Asp Thr Arg Leu Val 275 280 285 Leu Leu Asn Ala Ile Tyr Leu Ser Ala Lys Trp Lys Thr Thr Phe Asp 290 295 300 Pro Lys Lys Thr Arg Met Glu Pro Phe His Phe Lys Asn Ser Val Ile 305 310 315 320 Lys Val Pro Met Met Asn Ser Lys Lys Tyr Pro Val Ala His Phe Ile 325 330 335 Asp Gln Thr Leu Lys Ala Lys Val Gly Gln Leu Gln Leu Ser His Asn 340 345 350 Leu Ser Leu Val Ile Leu Val Pro Gln Asn Leu Lys His Arg Leu Glu 355 360 365 Asp Met Glu Gln Ala Leu Ser Pro Ser Val Phe Lys Ala Ile Met Glu 370 375 380 Lys Leu Glu Met Ser Lys Phe Gln Pro Thr Leu Leu Thr Leu Pro Arg 385 390 395 400 Ile Lys Val Thr Thr Ser Gln Asp Met Leu Ser Ile Met Glu Lys Leu 405 410 415 Glu Phe Phe Asp Phe Ser Tyr Asp Leu Asn Leu Cys Gly Leu Thr Glu 420 425 430 Asp Pro Asp Leu Gln Val Ser Ala Met Gln His Gln Thr Val Leu Glu 435 440 445 Leu Thr Glu Thr Gly Val Glu Ala Ala Ala Ala Ser Ala Ile Ser Val 450 455 460 Ala Arg Thr Leu Leu Val Phe Glu Val Gln Gln Pro Phe Leu Phe Val 465 470 475 480 Leu Trp Asp Gln Gln His Lys Phe Pro Val Phe Met Gly Arg Val Tyr 485 490 495 Asp Pro Arg Ala 500 <210> 8 <211> 406 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Plasma serine protease inhibitor precursor SERPINA5 <400> 8 Met Gln Leu Phe Leu Leu Leu Cys Leu Val Leu Leu Ser Pro Gln Gly 1 5 10 15 Ala Ser Leu His Arg His His Pro Arg Glu Met Lys Lys Arg Val Glu 20 25 30 Asp Leu His Val Gly Ala Thr Val Ala Pro Ser Ser Arg Arg Asp Phe 35 40 45 Thr Phe Asp Leu Tyr Arg Ala Leu Ala Ser Ala Ala Pro Ser Gln Asn 50 55 60 Ile Phe Phe Ser Pro Val Ser Ile Ser Met Ser Leu Ala Met Leu Ser 65 70 75 80 Leu Gly Ala Gly Ser Ser Thr Lys Met Gln Ile Leu Glu Gly Leu Gly 85 90 95 Leu Asn Leu Gln Lys Ser Ser Glu Lys Glu Leu His Arg Gly Phe Gln 100 105 110 Gln Leu Leu Gln Glu Leu Asn Gln Pro Arg Asp Gly Phe Gln Leu Ser 115 120 125 Leu Gly Asn Ala Leu Phe Thr Asp Leu Val Val Asp Leu Gln Asp Thr 130 135 140 Phe Val Ser Ala Met Lys Thr Leu Tyr Leu Ala Asp Thr Phe Pro Thr 145 150 155 160 Asn Phe Arg Asp Ser Ala Gly Ala Met Lys Gln Ile Asn Asp Tyr Val 165 170 175 Ala Lys Gln Thr Lys Gly Lys Ile Val Asp Leu Leu Lys Asn Leu Asp 180 185 190 Ser Asn Ala Val Val Ile Met Val Asn Tyr Ile Phe Phe Lys Ala Lys 195 200 205 Trp Glu Thr Ser Phe Asn His Lys Gly Thr Gln Glu Gln Asp Phe Tyr 210 215 220 Val Thr Ser Glu Thr Val Val Arg Val Pro Met Met Ser Arg Glu Asp 225 230 235 240 Gln Tyr His Tyr Leu Leu Asp Arg Asn Leu Ser Cys Arg Val Val Gly 245 250 255 Val Pro Tyr Gln Gly Asn Ala Thr Ala Leu Phe Ile Leu Pro Ser Glu 260 265 270 Gly Lys Met Gln Gln Val Glu Asn Gly Leu Ser Glu Lys Thr Leu Arg 275 280 285 Lys Trp Leu Lys Met Phe Lys Lys Arg Gln Leu Glu Leu Tyr Leu Pro 290 295 300 Lys Phe Ser Ile Glu Gly Ser Tyr Gln Leu Glu Lys Val Leu Pro Ser 305 310 315 320 Leu Gly Ile Ser Asn Val Phe Thr Ser His Ala Asp Leu Ser Gly Ile 325 330 335 Ser Asn His Ser Asn Ile Gln Val Ser Glu Met Val His Lys Ala Val 340 345 350 Val Glu Val Asp Glu Ser Gly Thr Arg Ala Ala Ala Ala Thr Gly Thr 355 360 365 Ile Phe Thr Phe Arg Ser Ala Arg Leu Asn Ser Gln Arg Leu Val Phe 370 375 380 Asn Arg Pro Phe Leu Met Phe Ile Val Asp Asn Asn Ile Leu Phe Leu 385 390 395 400 Gly Lys Val Asn Arg Pro 405 <210> 9 <211> 427 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Kallistatin precursor SERPINA4 <400> 9 Met His Leu Ile Asp Tyr Leu Leu Leu Leu Leu Val Gly Leu Leu Ala 1 5 10 15 Leu Ser His Gly Gln Leu His Val Glu His Asp Gly Glu Ser Cys Ser 20 25 30 Asn Ser Ser His Gln Gln Ile Leu Glu Thr Gly Glu Gly Ser Pro Ser 35 40 45 Leu Lys Ile Ala Pro Ala Asn Ala Asp Phe Ala Phe Arg Phe Tyr Tyr 50 55 60 Leu Ile Ala Ser Glu Thr Pro Gly Lys Asn Ile Phe Phe Ser Pro Leu 65 70 75 80 Ser Ile Ser Ala Ala Tyr Ala Met Leu Ser Leu Gly Ala Cys Ser His 85 90 95 Ser Arg Ser Gln Ile Leu Glu Gly Leu Gly Phe Asn Leu Thr Glu Leu 100 105 110 Ser Glu Ser Asp Val His Arg Gly Phe Gln His Leu Leu His Thr Leu 115 120 125 Asn Leu Pro Gly His Gly Leu Glu Thr Arg Val Gly Ser Ala Leu Phe 130 135 140 Leu Ser His Asn Leu Lys Phe Leu Ala Lys Phe Leu Asn Asp Thr Met 145 150 155 160 Ala Val Tyr Glu Ala Lys Leu Phe His Thr Asn Phe Tyr Asp Thr Val 165 170 175 Gly Thr Ile Gln Leu Ile Asn Asp His Val Lys Lys Glu Thr Arg Gly 180 185 190 Lys Ile Val Asp Leu Val Ser Glu Leu Lys Lys Asp Val Leu Met Val 195 200 205 Leu Val Asn Tyr Ile Tyr Phe Lys Ala Leu Trp Glu Lys Pro Phe Ile 210 215 220 Ser Ser Arg Thr Thr Pro Lys Asp Phe Tyr Val Asp Glu Asn Thr Thr 225 230 235 240 Val Arg Val Pro Met Met Leu Gln Asp Gln Glu His His Trp Tyr Leu 245 250 255 His Asp Arg Tyr Leu Pro Cys Ser Val Leu Arg Met Asp Tyr Lys Gly 260 265 270 Asp Ala Thr Val Phe Phe Ile Leu Pro Asn Gln Gly Lys Met Arg Glu 275 280 285 Ile Glu Glu Val Leu Thr Pro Glu Met Leu Met Arg Trp Asn Asn Leu 290 295 300 Leu Arg Lys Arg Asn Phe Tyr Lys Lys Leu Glu Leu His Leu Pro Lys 305 310 315 320 Phe Ser Ile Ser Gly Ser Tyr Val Leu Asp Gln Ile Leu Pro Arg Leu 325 330 335 Gly Phe Thr Asp Leu Phe Ser Lys Trp Ala Asp Leu Ser Gly Ile Thr 340 345 350 Lys Gln Gln Lys Leu Glu Ala Ser Lys Ser Phe His Lys Ala Thr Leu 355 360 365 Asp Val Asp Glu Ala Gly Thr Glu Ala Ala Ala Ala Thr Ser Phe Ala 370 375 380 Ile Lys Phe Phe Ser Ala Gln Thr Asn Arg His Ile Leu Arg Phe Asn 385 390 395 400 Arg Pro Phe Leu Val Val Ile Phe Ser Thr Ser Thr Gln Ser Val Leu 405 410 415 Phe Leu Gly Lys Val Val Asp Pro Thr Lys Pro 420 425 <210> 10 <211> 410 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Neuroserpin precursor SERPINII <400> 10 Met Ala Phe Leu Gly Leu Phe Ser Leu Leu Val Leu Gln Ser Met Ala 1 5 10 15 Thr Gly Ala Thr Phe Pro Glu Glu Ala Ile Ala Asp Leu Ser Val Asn 20 25 30 Met Tyr Asn Arg Leu Arg Ala Thr Gly Glu Asp Glu Asn Ile Leu Phe 35 40 45 Ser Pro Leu Ser Ile Ala Leu Ala Met Gly Met Met Glu Leu Gly Ala 50 55 60 Gln Gly Ser Thr Gln Lys Glu Ile Arg His Ser Met Gly Tyr Asp Ser 65 70 75 80 Leu Lys Asn Gly Glu Glu Phe Ser Phe Leu Lys Glu Phe Ser Asn Met 85 90 95 Val Thr Ala Lys Glu Ser Gln Tyr Val Met Lys Ile Ala Asn Ser Leu 100 105 110 Phe Val Gln Asn Gly Phe His Val Asn Glu Glu Phe Leu Gln Met Met 115 120 125 Lys Lys Tyr Phe Asn Ala Ala Val Asn His Val Asp Phe Ser Gln Asn 130 135 140 Val Ala Val Ala Asn Tyr Ile Asn Lys Trp Val Glu Asn Asn Thr Asn 145 150 155 160 Asn Leu Val Lys Asp Leu Val Ser Pro Arg Asp Phe Asp Ala Ala Thr 165 170 175 Tyr Leu Ala Leu Ile Asn Ala Val Tyr Phe Lys Gly Asn Trp Lys Ser 180 185 190 Gln Phe Arg Pro Glu Asn Thr Arg Thr Phe Ser Phe Thr Lys Asp Asp 195 200 205 Glu Ser Glu Val Gln Ile Pro Met Met Tyr Gln Gln Gly Glu Phe Tyr 210 215 220 Tyr Gly Glu Phe Ser Asp Gly Ser Asn Glu Ala Gly Gly Ile Tyr Gln 225 230 235 240 Val Leu Glu Ile Pro Tyr Glu Gly Asp Glu Ile Ser Met Met Leu Val 245 250 255 Leu Ser Arg Gln Glu Val Pro Leu Ala Thr Leu Glu Pro Leu Val Lys 260 265 270 Ala Gln Leu Val Glu Glu Trp Ala Asn Ser Val Lys Lys Gln Lys Val 275 280 285 Glu Val Tyr Leu Pro Arg Phe Thr Val Glu Gln Glu Ile Asp Leu Lys 290 295 300 Asp Val Leu Lys Ala Leu Gly Ile Thr Glu Ile Phe Ile Lys Asp Ala 305 310 315 320 Asn Leu Thr Gly Leu Ser Asp Asn Lys Glu Ile Phe Leu Ser Lys Ala 325 330 335 Ile His Lys Ser Phe Leu Glu Val Asn Glu Glu Gly Ser Glu Ala Ala 340 345 350 Ala Val Ser Gly Met Ile Ala Ile Ser Arg Met Ala Val Leu Tyr Pro 355 360 365 Gln Val Ile Val Asp His Pro Phe Phe Phe Leu Ile Arg Asn Arg Arg 370 375 380 Thr Gly Thr Ile Leu Phe Met Gly Arg Val Met His Pro Glu Thr Met 385 390 395 400 Asn Thr Ser Gly His Asp Phe Glu Glu Leu 405 410 <210> 11 <211> 402 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Plasminogen activator inhibitor 1 precursor SERPINE1 <400> 11 Met Gln Met Ser Pro Ala Leu Thr Cys Leu Val Leu Gly Leu Ala Leu 1 5 10 15 Val Phe Gly Glu Gly Ser Ala Val His His Pro Pro Ser Tyr Val Ala 20 25 30 His Leu Ala Ser Asp Phe Gly Val Arg Val Phe Gln Gln Val Ala Gln 35 40 45 Ala Ser Lys Asp Arg Asn Val Val Phe Ser Pro Tyr Gly Val Ala Ser 50 55 60 Val Leu Ala Met Leu Gln Leu Thr Thr Gly Gly Glu Thr Gln Gln Gln 65 70 75 80 Ile Gln Ala Ala Met Gly Phe Lys Ile Asp Asp Lys Gly Met Ala Pro 85 90 95 Ala Leu Arg His Leu Tyr Lys Glu Leu Met Gly Pro Trp Asn Lys Asp 100 105 110 Glu Ile Ser Thr Thr Asp Ala Ile Phe Val Gln Arg Asp Leu Lys Leu 115 120 125 Val Gln Gly Phe Met Pro His Phe Phe Arg Leu Phe Arg Ser Thr Val 130 135 140 Lys Gln Val Asp Phe Ser Glu Val Glu Arg Ala Arg Phe Ile Ile Asn 145 150 155 160 Asp Trp Val Lys Thr His Thr Lys Gly Met Ile Ser Asn Leu Leu Gly 165 170 175 Lys Gly Ala Val Asp Gln Leu Thr Arg Leu Val Leu Val Asn Ala Leu 180 185 190 Tyr Phe Asn Gly Gln Trp Lys Thr Pro Phe Pro Asp Ser Ser Thr His 195 200 205 Arg Arg Leu Phe His Lys Ser Asp Gly Ser Thr Val Ser Val Pro Met 210 215 220 Met Ala Gln Thr Asn Lys Phe Asn Tyr Thr Glu Phe Thr Thr Pro Asp 225 230 235 240 Gly His Tyr Tyr Asp Ile Leu Glu Leu Pro Tyr His Gly Asp Thr Leu 245 250 255 Ser Met Phe Ile Ala Ala Pro Tyr Glu Lys Glu Val Pro Leu Ser Ala 260 265 270 Leu Thr Asn Ile Leu Ser Ala Gln Leu Ile Ser His Trp Lys Gly Asn 275 280 285 Met Thr Arg Leu Pro Arg Leu Leu Val Leu Pro Lys Phe Ser Leu Glu 290 295 300 Thr Glu Val Asp Leu Arg Lys Pro Leu Glu Asn Leu Gly Met Thr Asp 305 310 315 320 Met Phe Arg Gln Phe Gln Ala Asp Phe Thr Ser Leu Ser Asp Gln Glu 325 330 335 Pro Leu His Val Ala Gln Ala Leu Gln Lys Val Lys Ile Glu Val Asn 340 345 350 Glu Ser Gly Thr Val Ala Ser Ser Ser Thr Ala Val Ile Val Ser Ala 355 360 365 Arg Met Ala Pro Glu Glu Ile Ile Met Asp Arg Pro Phe Leu Phe Val 370 375 380 Val Arg His Asn Pro Thr Gly Thr Val Leu Phe Met Gly Gln Val Met 385 390 395 400 Glu Pro <210> 12 <211> 405 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Myoepithelium-derived serine protease inhibitor SERPIN12 <400> 12 Met Asp Thr Ile Phe Leu Trp Ser Leu Leu Leu Leu Phe Phe Gly Ser 1 5 10 15 Gln Ala Ser Arg Cys Ser Ala Gln Lys Asn Thr Glu Phe Ala Val Asp 20 25 30 Leu Tyr Gln Glu Val Ser Leu Ser His Lys Asp Asn Ile Ile Phe Ser 35 40 45 Pro Leu Gly Ile Thr Leu Val Leu Glu Met Val Gln Leu Gly Ala Lys 50 55 60 Gly Lys Ala Gln Gln Gln Ile Arg Gln Thr Leu Lys Gln Gln Glu Thr 65 70 75 80 Ser Ala Gly Glu Glu Phe Phe Val Leu Lys Ser Phe Phe Ser Ala Ile 85 90 95 Ser Glu Lys Lys Gln Glu Phe Thr Phe Asn Leu Ala Asn Ala Leu Tyr 100 105 110 Leu Gln Glu Gly Phe Thr Val Lys Glu Gln Tyr Leu His Gly Asn Lys 115 120 125 Glu Phe Phe Gln Ser Ala Ile Lys Leu Val Asp Phe Gln Asp Ala Lys 130 135 140 Ala Cys Ala Glu Met Ile Ser Thr Trp Val Glu Arg Lys Thr Asp Gly 145 150 155 160 Lys Ile Lys Asp Met Phe Ser Gly Glu Glu Phe Gly Pro Leu Thr Arg 165 170 175 Leu Val Leu Val Asn Ala Ile Tyr Phe Lys Gly Asp Trp Lys Gln Lys 180 185 190 Phe Arg Lys Glu Asp Thr Gln Leu Ile Asn Phe Thr Lys Lys Asn Gly 195 200 205 Ser Thr Val Lys Ile Pro Met Met Lys Ala Leu Leu Arg Thr Lys Tyr 210 215 220 Gly Tyr Phe Ser Glu Ser Ser Leu Asn Tyr Gln Val Leu Glu Leu Ser 225 230 235 240 Tyr Lys Gly Asp Glu Phe Ser Leu Ile Ile Ile Leu Pro Ala Glu Gly 245 250 255 Met Asp Ile Glu Glu Val Glu Lys Leu Ile Thr Ala Gln Gln Ile Leu 260 265 270 Lys Trp Leu Ser Glu Met Gln Glu Glu Glu Val Glu Ile Ser Leu Pro 275 280 285 Arg Phe Lys Val Glu Gln Lys Val Asp Phe Lys Asp Val Leu Tyr Ser 290 295 300 Leu Asn Ile Thr Glu Ile Phe Ser Gly Gly Cys Asp Leu Ser Gly Ile 305 310 315 320 Thr Asp Ser Ser Glu Val Tyr Val Ser Gln Val Thr Gln Lys Val Phe 325 330 335 Phe Glu Ile Asn Glu Asp Gly Ser Glu Ala Ala Thr Ser Thr Gly Ile 340 345 350 His Ile Pro Val Ile Met Ser Leu Ala Gln Ser Gln Phe Ile Ala Asn 355 360 365 His Pro Phe Leu Phe Ile Met Lys His Asn Pro Thr Glu Ser Ile Leu 370 375 380 Phe Met Gly Arg Val Thr Asn Pro Asp Thr Gln Glu Ile Lys Gly Arg 385 390 395 400 Asp Leu Asp Ser Leu 405 <210> 13 <211> 444 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Protein Z-dependent protease inhibitor precursor SERPINA10 <400> 13 Met Lys Val Val Pro Ser Leu Leu Leu Ser Val Leu Leu Ala Gln Val 1 5 10 15 Trp Leu Val Pro Gly Leu Ala Pro Ser Pro Gln Ser Pro Glu Thr Pro 20 25 30 Ala Pro Gln Asn Gln Thr Ser Arg Val Val Gln Ala Pro Lys Glu Glu 35 40 45 Glu Glu Asp Glu Gln Glu Ala Ser Glu Glu Lys Ala Ser Glu Glu Glu 50 55 60 Lys Ala Trp Leu Met Ala Ser Arg Gln Gln Leu Ala Lys Glu Thr Ser 65 70 75 80 Asn Phe Gly Phe Ser Leu Leu Arg Lys Ile Ser Met Arg His Asp Gly 85 90 95 Asn Met Val Phe Ser Pro Phe Gly Met Ser Leu Ala Met Thr Gly Leu 100 105 110 Met Leu Gly Ala Thr Gly Pro Thr Glu Thr Gln Ile Lys Arg Gly Leu 115 120 125 His Leu Gln Ala Leu Lys Pro Thr Lys Pro Gly Leu Leu Pro Ser Leu 130 135 140 Phe Lys Gly Leu Arg Glu Thr Leu Ser Arg Asn Leu Glu Leu Gly Leu 145 150 155 160 Thr Gln Gly Ser Phe Ala Phe Ile His Lys Asp Phe Asp Val Lys Glu 165 170 175 Thr Phe Phe Asn Leu Ser Lys Arg Tyr Phe Asp Thr Glu Cys Val Pro 180 185 190 Met Asn Phe Arg Asn Ala Ser Gln Ala Lys Arg Leu Met Asn His Tyr 195 200 205 Ile Asn Lys Glu Thr Arg Gly Lys Ile Pro Lys Leu Phe Asp Glu Ile 210 215 220 Asn Pro Glu Thr Lys Leu Ile Leu Val Asp Tyr Ile Leu Phe Lys Gly 225 230 235 240 Lys Trp Leu Thr Pro Phe Asp Pro Val Phe Thr Glu Val Asp Thr Phe 245 250 255 His Leu Asp Lys Tyr Lys Thr Ile Lys Val Pro Met Met Tyr Gly Ala 260 265 270 Gly Lys Phe Ala Ser Thr Phe Asp Lys Asn Phe Arg Cys His Val Leu 275 280 285 Lys Leu Pro Tyr Gln Gly Asn Ala Thr Met Leu Val Val Leu Met Glu 290 295 300 Lys Met Gly Asp His Leu Ala Leu Glu Asp Tyr Leu Thr Thr Asp Leu 305 310 315 320 Val Glu Thr Trp Leu Arg Asn Met Lys Thr Arg Asn Met Glu Val Phe 325 330 335 Phe Pro Lys Phe Lys Leu Asp Gln Lys Tyr Glu Met His Glu Leu Leu 340 345 350 Arg Gln Met Gly Ile Arg Arg Ile Phe Ser Pro Phe Ala Asp Leu Ser 355 360 365 Glu Leu Ser Ala Thr Gly Arg Asn Leu Gln Val Ser Arg Val Leu Gln 370 375 380 Arg Thr Val Ile Glu Val Asp Glu Arg Gly Thr Glu Ala Val Ala Gly 385 390 395 400 Ile Leu Ser Glu Ile Thr Ala Tyr Ser Met Pro Pro Val Ile Lys Val 405 410 415 Asp Arg Pro Phe His Phe Met Ile Tyr Glu Glu Thr Ser Gly Met Leu 420 425 430 Leu Phe Leu Gly Arg Val Val Asn Pro Thr Leu Leu 435 440 <210> 14 <211> 398 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Glia-derived nexin precursor SERPINE2 <400> 14 Met Asn Trp His Leu Pro Leu Phe Leu Leu Ala Ser Val Thr Leu Pro 1 5 10 15 Ser Ile Cys Ser His Phe Asn Pro Leu Ser Leu Glu Glu Leu Gly Ser 20 25 30 Asn Thr Gly Ile Gln Val Phe Asn Gln Ile Val Lys Ser Arg Pro His 35 40 45 Asp Asn Ile Val Ile Ser Pro His Gly Ile Ala Ser Val Leu Gly Met 50 55 60 Leu Gln Leu Gly Ala Asp Gly Arg Thr Lys Lys Gln Leu Ala Met Val 65 70 75 80 Met Arg Tyr Gly Val Asn Gly Val Gly Lys Ile Leu Lys Lys Ile Asn 85 90 95 Lys Ala Ile Val Ser Lys Lys Asn Lys Asp Ile Val Thr Val Ala Asn 100 105 110 Ala Val Phe Val Lys Asn Ala Ser Glu Ile Glu Val Pro Phe Val Thr 115 120 125 Arg Asn Lys Asp Val Phe Gln Cys Glu Val Arg Asn Val Asn Phe Glu 130 135 140 Asp Pro Ala Ser Ala Cys Asp Ser Ile Asn Ala Trp Val Lys Asn Glu 145 150 155 160 Thr Arg Asp Met Ile Asp Asn Leu Leu Ser Pro Asp Leu Ile Asp Gly 165 170 175 Val Leu Thr Arg Leu Val Leu Val Asn Ala Val Tyr Phe Lys Gly Leu 180 185 190 Trp Lys Ser Arg Phe Gln Pro Glu Asn Thr Lys Lys Arg Thr Phe Val 195 200 205 Ala Ala Asp Gly Lys Ser Tyr Gln Val Pro Met Leu Ala Gln Leu Ser 210 215 220 Val Phe Arg Cys Gly Ser Thr Ser Ala Pro Asn Asp Leu Trp Tyr Asn 225 230 235 240 Phe Ile Glu Leu Pro Tyr His Gly Glu Ser Ile Ser Met Leu Ile Ala 245 250 255 Leu Pro Thr Glu Ser Ser Thr Pro Leu Ser Ala Ile Ile Pro His Ile 260 265 270 Ser Thr Lys Thr Ile Asp Ser Trp Met Ser Ile Met Val Pro Lys Arg 275 280 285 Val Gln Val Ile Leu Pro Lys Phe Thr Ala Val Ala Gln Thr Asp Leu 290 295 300 Lys Glu Pro Leu Lys Val Leu Gly Ile Thr Asp Met Phe Asp Ser Ser 305 310 315 320 Lys Ala Asn Phe Ala Lys Ile Thr Thr Gly Ser Glu Asn Leu His Val 325 330 335 Ser His Ile Leu Gln Lys Ala Lys Ile Glu Val Ser Glu Asp Gly Thr 340 345 350 Lys Ala Ser Ala Ala Thr Thr Ala Ile Leu Ile Ala Arg Ser Ser Pro 355 360 365 Pro Trp Phe Ile Val Asp Arg Pro Phe Leu Phe Phe Ile Arg His Asn 370 375 380 Pro Thr Gly Ala Val Leu Phe Met Gly Gln Ile Asn Lys Pro 385 390 395 <210> 15 <211> 379 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Leukocyte elastase inhibitor SERPINB1 <400> 15 Met Glu Gln Leu Ser Ser Ala Asn Thr Arg Phe Ala Leu Asp Leu Phe 1 5 10 15 Leu Ala Leu Ser Glu Asn Asn Pro Ala Gly Asn Ile Phe Ile Ser Pro 20 25 30 Phe Ser Ile Ser Ser Ala Met Ala Met Val Phe Leu Gly Thr Arg Gly 35 40 45 Asn Thr Ala Ala Gln Leu Ser Lys Thr Phe His Phe Asn Thr Val Glu 50 55 60 Glu Val His Ser Arg Phe Gln Ser Leu Asn Ala Asp Ile Asn Lys Arg 65 70 75 80 Gly Ala Ser Tyr Ile Leu Lys Leu Ala Asn Arg Leu Tyr Gly Glu Lys 85 90 95 Thr Tyr Asn Phe Leu Pro Glu Phe Leu Val Ser Thr Gln Lys Thr Tyr 100 105 110 Gly Ala Asp Leu Ala Ser Val Asp Phe Gln His Ala Ser Glu Asp Ala 115 120 125 Arg Lys Thr Ile Asn Gln Trp Val Lys Gly Gln Thr Glu Gly Lys Ile 130 135 140 Pro Glu Leu Leu Ala Ser Gly Met Val Asp Asn Met Thr Lys Leu Val 145 150 155 160 Leu Val Asn Ala Ile Tyr Phe Lys Gly Asn Trp Lys Asp Lys Phe Met 165 170 175 Lys Glu Ala Thr Thr Asn Ala Pro Phe Arg Leu Asn Lys Lys Asp Arg 180 185 190 Lys Thr Val Lys Met Met Tyr Gln Lys Lys Lys Phe Ala Tyr Gly Tyr 195 200 205 Ile Glu Asp Leu Lys Cys Arg Val Leu Glu Leu Pro Tyr Gln Gly Glu 210 215 220 Glu Leu Ser Met Val Ile Leu Leu Pro Asp Asp Ile Glu Asp Glu Ser 225 230 235 240 Thr Gly Leu Lys Lys Ile Glu Glu Gln Leu Thr Leu Glu Lys Leu His 245 250 255 Glu Trp Thr Lys Pro Glu Asn Leu Asp Phe Ile Glu Val Asn Val Ser 260 265 270 Leu Pro Arg Phe Lys Leu Glu Glu Ser Tyr Thr Leu Asn Ser Asp Leu 275 280 285 Ala Arg Leu Gly Val Gln Asp Leu Phe Asn Ser Ser Lys Ala Asp Leu 290 295 300 Ser Gly Met Ser Gly Ala Arg Asp Ile Phe Ile Ser Lys Ile Val His 305 310 315 320 Lys Ser Phe Val Glu Val Asn Glu Glu Gly Thr Glu Ala Ala Ala Ala 325 330 335 Thr Ala Gly Ile Ala Thr Phe Cys Met Leu Met Pro Glu Glu Asn Phe 340 345 350 Thr Ala Asp His Pro Phe Leu Phe Phe Ile Arg His Asn Ser Ser Gly 355 360 365 Ser Ile Leu Phe Leu Gly Arg Phe Ser Ser Pro 370 375 <210> 16 <211> 415 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Plasminogen activator inhibitor 2 precursor SERPINB2 <400> 16 Met Glu Asp Leu Cys Val Ala Asn Thr Leu Phe Ala Leu Asn Leu Phe 1 5 10 15 Lys His Leu Ala Lys Ala Ser Pro Thr Gln Asn Leu Phe Leu Ser Pro 20 25 30 Trp Ser Ile Ser Ser Thr Met Ala Met Val Tyr Met Gly Ser Arg Gly 35 40 45 Ser Thr Glu Asp Gln Met Ala Lys Val Leu Gln Phe Asn Glu Val Gly 50 55 60 Ala Asn Ala Val Thr Pro Met Thr Pro Glu Asn Phe Thr Ser Cys Gly 65 70 75 80 Phe Met Gln Gln Ile Gln Lys Gly Ser Tyr Pro Asp Ala Ile Leu Gln 85 90 95 Ala Gln Ala Ala Asp Lys Ile His Ser Ser Phe Arg Ser Leu Ser Ser 100 105 110 Ala Ile Asn Ala Ser Thr Gly Asn Tyr Leu Leu Glu Ser Val Asn Lys 115 120 125 Leu Phe Gly Glu Lys Ser Ala Ser Phe Arg Glu Glu Tyr Ile Arg Leu 130 135 140 Cys Gln Lys Tyr Tyr Ser Ser Glu Pro Gln Ala Val Asp Phe Leu Glu 145 150 155 160 Cys Ala Glu Glu Ala Arg Lys Lys Ile Asn Ser Trp Val Lys Thr Gln 165 170 175 Thr Lys Gly Lys Ile Pro Asn Leu Leu Pro Glu Gly Ser Val Asp Gly 180 185 190 Asp Thr Arg Met Val Leu Val Asn Ala Val Tyr Phe Lys Gly Lys Trp 195 200 205 Lys Thr Pro Phe Glu Lys Lys Leu Asn Gly Leu Tyr Pro Phe Arg Val 210 215 220 Asn Ser Ala Gln Arg Thr Pro Val Gln Met Met Tyr Leu Arg Glu Lys 225 230 235 240 Leu Asn Ile Gly Tyr Ile Glu Asp Leu Lys Ala Gln Ile Leu Glu Leu 245 250 255 Pro Tyr Ala Gly Asp Val Ser Met Phe Leu Leu Leu Pro Asp Glu Ile 260 265 270 Ala Asp Val Ser Thr Gly Leu Glu Leu Leu Glu Ser Glu Ile Thr Tyr 275 280 285 Asp Lys Leu Asn Lys Trp Thr Ser Lys Asp Lys Met Ala Glu Asp Glu 290 295 300 Val Glu Val Tyr Ile Pro Gln Phe Lys Leu Glu Glu His Tyr Glu Leu 305 310 315 320 Arg Ser Ile Leu Arg Ser Met Gly Met Glu Asp Ala Phe Asn Lys Gly 325 330 335 Arg Ala Asn Phe Ser Gly Met Ser Glu Arg Asn Asp Leu Phe Leu Ser 340 345 350 Glu Val Phe His Gln Ala Met Val Asp Val Asn Glu Glu Gly Thr Glu 355 360 365 Ala Ala Ala Gly Thr Gly Gly Val Met Thr Gly Arg Thr Gly His Gly 370 375 380 Gly Pro Gln Phe Val Ala Asp His Pro Phe Leu Phe Leu Ile Met His 385 390 395 400 Lys Ile Thr Asn Cys Ile Leu Phe Phe Gly Arg Phe Ser Ser Pro 405 410 415 <210> 17 <211> 376 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Placental thrombin inhibitor SERPINB6 <400> 17 Met Asp Val Leu Ala Glu Ala Asn Gly Thr Phe Ala Leu Asn Leu Leu 1 5 10 15 Lys Thr Leu Gly Lys Asp Asn Ser Lys Asn Val Phe Phe Ser Pro Met 20 25 30 Ser Met Ser Cys Ala Leu Ala Met Val Tyr Met Gly Ala Lys Gly Asn 35 40 45 Thr Ala Ala Gln Met Ala Gln Ile Leu Ser Phe Asn Lys Ser Gly Gly 50 55 60 Gly Gly Asp Ile His Gln Gly Phe Gln Ser Leu Leu Thr Glu Val Asn 65 70 75 80 Lys Thr Gly Thr Gln Tyr Leu Leu Arg Val Ala Asn Arg Leu Phe Gly 85 90 95 Glu Lys Ser Cys Asp Phe Leu Ser Ser Phe Arg Asp Ser Cys Gln Lys 100 105 110 Phe Tyr Gln Ala Glu Met Glu Glu Leu Asp Phe Ile Ser Ala Val Glu 115 120 125 Lys Ser Arg Lys His Ile Asn Thr Trp Val Ala Glu Lys Thr Glu Gly 130 135 140 Lys Ile Ala Glu Leu Leu Ser Pro Gly Ser Val Asp Pro Leu Thr Arg 145 150 155 160 Leu Val Leu Val Asn Ala Val Tyr Phe Arg Gly Asn Trp Asp Glu Gln 165 170 175 Phe Asp Lys Glu Asn Thr Glu Glu Arg Leu Phe Lys Val Ser Lys Asn 180 185 190 Glu Glu Lys Pro Val Gln Met Met Phe Lys Gln Ser Thr Phe Lys Lys 195 200 205 Thr Tyr Ile Gly Glu Ile Phe Thr Gln Ile Leu Val Leu Pro Tyr Val 210 215 220 Gly Lys Glu Leu Asn Met Ile Ile Met Leu Pro Asp Glu Thr Thr Asp 225 230 235 240 Leu Arg Thr Val Glu Lys Glu Leu Thr Tyr Glu Lys Phe Val Glu Trp 245 250 255 Thr Arg Leu Asp Met Met Asp Glu Glu Glu Val Glu Val Ser Leu Pro 260 265 270 Arg Phe Lys Leu Glu Glu Ser Tyr Asp Met Glu Ser Val Leu Arg Asn 275 280 285 Leu Gly Met Thr Asp Ala Phe Glu Leu Gly Lys Ala Asp Phe Ser Gly 290 295 300 Met Ser Gln Thr Asp Leu Ser Leu Ser Lys Val Val His Lys Ser Phe 305 310 315 320 Val Glu Val Asn Glu Glu Gly Thr Glu Ala Ala Ala Ala Thr Ala Ala 325 330 335 Ile Met Met Met Arg Cys Ala Arg Phe Val Pro Arg Phe Cys Ala Asp 340 345 350 His Pro Phe Leu Phe Phe Ile Gln His Ser Lys Thr Asn Gly Ile Leu 355 360 365 Phe Cys Gly Arg Phe Ser Ser Pro 370 375 <210> 18 <211> 397 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Bomapin SERPINB10 <400> 18 Met Asp Ser Leu Ala Thr Ser Ile Asn Gln Phe Ala Leu Glu Leu Ser 1 5 10 15 Lys Lys Leu Ala Glu Ser Ala Gln Gly Lys Asn Ile Phe Phe Ser Ser 20 25 30 Trp Ser Ile Ser Thr Ser Leu Thr Ile Val Tyr Leu Gly Ala Lys Gly 35 40 45 Thr Thr Ala Ala Gln Met Ala Gln Val Leu Gln Phe Asn Arg Asp Gln 50 55 60 Gly Val Lys Cys Asp Pro Glu Ser Glu Lys Lys Arg Lys Met Glu Phe 65 70 75 80 Asn Leu Ser Asn Ser Glu Glu Ile His Ser Asp Phe Gln Thr Leu Ile 85 90 95 Ser Glu Ile Leu Lys Pro Asn Asp Asp Tyr Leu Leu Lys Thr Ala Asn 100 105 110 Ala Ile Tyr Gly Glu Lys Thr Tyr Ala Phe His Asn Lys Tyr Leu Glu 115 120 125 Asp Met Lys Thr Tyr Phe Gly Ala Glu Pro Gln Pro Val Asn Phe Val 130 135 140 Glu Ala Ser Asp Gln Ile Arg Lys Asp Ile Asn Ser Trp Val Glu Arg 145 150 155 160 Gln Thr Glu Gly Lys Ile Gln Asn Leu Leu Pro Asp Asp Ser Val Asp 165 170 175 Ser Thr Thr Arg Met Ile Leu Val Asn Ala Leu Tyr Phe Lys Gly Ile 180 185 190 Trp Glu His Gln Phe Leu Val Gln Asn Thr Thr Glu Lys Pro Phe Arg 195 200 205 Ile Asn Glu Thr Thr Ser Lys Pro Val Gln Met Met Phe Met Lys Lys 210 215 220 Lys Leu His Ile Phe His Ile Glu Lys Pro Lys Ala Val Gly Leu Gln 225 230 235 240 Leu Tyr Tyr Lys Ser Arg Asp Leu Ser Leu Leu Ile Leu Leu Pro Glu 245 250 255 Asp Ile Asn Gly Leu Glu Gln Leu Glu Lys Ala Ile Thr Tyr Glu Lys 260 265 270 Leu Asn Glu Trp Thr Ser Ala Asp Met Met Glu Leu Tyr Glu Val Gln 275 280 285 Leu His Leu Pro Lys Phe Lys Leu Glu Asp Ser Tyr Asp Leu Lys Ser 290 295 300 Thr Leu Ser Ser Met Gly Met Ser Asp Ala Phe Ser Gln Ser Lys Ala 305 310 315 320 Asp Phe Ser Gly Met Ser Ser Ala Arg Asn Leu Phe Leu Ser Asn Val 325 330 335 Phe His Lys Ala Phe Val Glu Ile Asn Glu Gln Gly Thr Glu Ala Ala 340 345 350 Ala Gly Ser Gly Ser Glu Ile Asp Ile Arg Ile Arg Val Pro Ser Ile 355 360 365 Glu Phe Asn Ala Asn His Pro Phe Leu Phe Phe Ile Arg His Asn Lys 370 375 380 Thr Asn Thr Ile Leu Phe Tyr Gly Arg Leu Cys Ser Pro 385 390 395 <210> 19 <211> 392 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Epipen SERPINB11 <400> 19 Met Gly Ser Leu Ser Thr Ala Asn Val Glu Phe Cys Leu Asp Val Phe 1 5 10 15 Lys Glu Leu Asn Ser Asn Asn Ile Gly Asp Asn Ile Phe Phe Ser Ser 20 25 30 Leu Ser Leu Leu Tyr Ala Leu Ser Met Val Leu Leu Gly Ala Arg Gly 35 40 45 Glu Thr Ala Glu Gln Leu Glu Lys Val Leu His Phe Ser His Thr Val 50 55 60 Asp Ser Leu Lys Pro Gly Phe Lys Asp Ser Pro Lys Cys Ser Gln Ala 65 70 75 80 Gly Arg Ile His Ser Glu Phe Gly Val Glu Phe Ser Gln Ile Asn Gln 85 90 95 Pro Asp Ser Asn Cys Thr Leu Ser Ile Ala Asn Arg Leu Tyr Gly Thr 100 105 110 Lys Thr Met Ala Phe His Gln Gln Tyr Leu Ser Cys Ser Glu Lys Trp 115 120 125 Tyr Gln Ala Arg Leu Gln Thr Val Asp Phe Glu Gln Ser Thr Glu Glu 130 135 140 Thr Arg Lys Met Ile Asn Ala Trp Val Glu Asn Lys Thr Asn Gly Lys 145 150 155 160 Val Ala Asn Leu Phe Gly Lys Ser Thr Ile Asp Pro Ser Ser Val Met 165 170 175 Val Leu Val Asn Ile Ile Tyr Phe Lys Gly Gln Arg Gln Asn Lys Phe 180 185 190 Gln Val Arg Glu Thr Val Lys Ser Pro Phe Gln Leu Ser Glu Gly Lys 195 200 205 Asn Val Thr Val Glu Met Met Tyr Gln Ile Gly Thr Phe Lys Leu Ala 210 215 220 Phe Val Lys Glu Pro Gln Met Gln Val Leu Glu Leu Pro Tyr Val Asn 225 230 235 240 Asn Lys Leu Ser Met Ile Ile Leu Leu Pro Val Gly Ile Ala Asn Leu 245 250 255 Lys Gln Ile Glu Lys Gln Leu Asn Ser Gly Thr Phe His Glu Trp Thr 260 265 270 Ser Ser Ser Asn Met Met Glu Arg Glu Val Glu Val His Leu Pro Arg 275 280 285 Phe Lys Leu Glu Ile Lys Tyr Glu Leu Asn Ser Leu Leu Lys Pro Leu 290 295 300 Gly Val Thr Asp Leu Phe Asn Gln Val Lys Ala Asp Leu Ser Gly Met 305 310 315 320 Ser Pro Thr Lys Gly Leu Tyr Leu Ser Lys Ala Ile His Lys Ser Tyr 325 330 335 Leu Asp Val Ser Glu Glu Gly Thr Glu Ala Ala Ala Ala Thr Gly Asp 340 345 350 Ser Ile Ala Val Lys Ser Leu Pro Met Arg Ala Gln Phe Lys Ala Asn 355 360 365 His Pro Phe Leu Phe Phe Ile Arg His Thr His Thr Asn Thr Ile Leu 370 375 380 Phe Cys Gly Lys Leu Ala Ser Pro 385 390 <210> 20 <211> 405 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Yukopin SERPINB12 <400> 20 Met Asp Ser Leu Val Thr Ala Asn Thr Lys Phe Cys Phe Asp Leu Phe 1 5 10 15 Gln Glu Ile Gly Lys Asp Asp Arg His Lys Asn Ile Phe Phe Ser Pro 20 25 30 Leu Ser Leu Ser Ala Ala Leu Gly Met Val Arg Leu Gly Ala Arg Ser 35 40 45 Asp Ser Ala His Gln Ile Asp Glu Val Leu His Phe Asn Glu Phe Ser 50 55 60 Gln Asn Glu Ser Lys Glu Pro Asp Pro Cys Leu Lys Ser Asn Lys Gln 65 70 75 80 Lys Ala Gly Ser Leu Asn Asn Glu Ser Gly Leu Val Ser Cys Tyr Phe 85 90 95 Gly Gln Leu Leu Ser Lys Leu Asp Arg Ile Lys Thr Asp Tyr Thr Leu 100 105 110 Ser Ile Ala Asn Arg Leu Tyr Gly Glu Gln Glu Phe Pro Ile Cys Gln 115 120 125 Glu Tyr Leu Asp Gly Val Ile Gln Phe Tyr His Thr Thr Ile Glu Ser 130 135 140 Val Asp Phe Gln Lys Asn Pro Glu Lys Ser Arg Gln Glu Ile Asn Phe 145 150 155 160 Trp Val Glu Cys Gln Ser Gln Gly Lys Ile Lys Glu Leu Phe Ser Lys 165 170 175 Asp Ala Ile Asn Ala Glu Thr Val Leu Val Leu Val Asn Ala Val Tyr 180 185 190 Phe Lys Ala Lys Trp Glu Thr Tyr Phe Asp His Glu Asn Thr Val Asp 195 200 205 Ala Pro Phe Cys Leu Asn Ala Asn Glu Asn Lys Ser Val Lys Met Met 210 215 220 Thr Gln Lys Gly Leu Tyr Arg Ile Gly Phe Ile Glu Glu Val Lys Ala 225 230 235 240 Gln Ile Leu Glu Met Arg Tyr Thr Lys Gly Lys Leu Ser Met Phe Val 245 250 255 Leu Leu Pro Ser His Ser Lys Asp Asn Leu Lys Gly Leu Glu Glu Leu 260 265 270 Glu Arg Lys Ile Thr Tyr Glu Lys Met Val Ala Trp Ser Ser Ser Glu 275 280 285 Asn Met Ser Glu Glu Ser Val Val Leu Ser Phe Pro Arg Phe Thr Leu 290 295 300 Glu Asp Ser Tyr Asp Leu Asn Ser Ile Leu Gln Asp Met Gly Ile Thr 305 310 315 320 Asp Ile Phe Asp Glu Thr Arg Ala Asp Leu Thr Gly Ile Ser Pro Ser 325 330 335 Pro Asn Leu Tyr Leu Ser Lys Ile Ile His Lys Thr Phe Val Glu Val 340 345 350 Asp Glu Asn Gly Thr Gln Ala Ala Ala Ala Thr Gly Ala Val Val Ser 355 360 365 Glu Arg Ser Leu Arg Ser Trp Val Glu Phe Asn Ala Asn His Pro Phe 370 375 380 Leu Phe Phe Ile Arg His Asn Lys Thr Gln Thr Ile Leu Phe Tyr Gly 385 390 395 400 Arg Val Cys Ser Pro 405 <210> 21 <211> 391 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Headpin SERPINB13 <400> 21 Met Asp Ser Leu Gly Ala Val Ser Thr Arg Leu Gly Phe Asp Leu Phe 1 5 10 15 Lys Glu Leu Lys Lys Thr Asn Asp Gly Asn Ile Phe Phe Ser Pro Val 20 25 30 Gly Ile Leu Thr Ala Ile Gly Met Val Leu Leu Gly Thr Arg Gly Ala 35 40 45 Thr Ala Ser Gln Leu Glu Glu Val Phe His Ser Glu Lys Glu Thr Lys 50 55 60 Ser Ser Arg Ile Lys Ala Glu Glu Lys Glu Val Ile Glu Asn Thr Glu 65 70 75 80 Ala Val His Gln Gln Phe Gln Lys Phe Leu Thr Glu Ile Ser Lys Leu 85 90 95 Thr Asn Asp Tyr Glu Leu Asn Ile Thr Asn Arg Leu Phe Gly Glu Lys 100 105 110 Thr Tyr Leu Phe Leu Gln Lys Tyr Leu Asp Tyr Val Glu Lys Tyr Tyr 115 120 125 His Ala Ser Leu Glu Pro Val Asp Phe Val Asn Ala Ala Asp Glu Ser 130 135 140 Arg Lys Lys Ile Asn Ser Trp Val Glu Ser Lys Thr Asn Glu Lys Ile 145 150 155 160 Lys Asp Leu Phe Pro Asp Gly Ser Ile Ser Ser Ser Thr Lys Leu Val 165 170 175 Leu Val Asn Met Val Tyr Phe Lys Gly Gln Trp Asp Arg Glu Phe Lys 180 185 190 Lys Glu Asn Thr Lys Glu Glu Lys Phe Trp Met Asn Lys Ser Thr Ser 195 200 205 Lys Ser Val Gln Met Met Thr Gln Ser His Ser Phe Ser Phe Thr Phe 210 215 220 Leu Glu Asp Leu Gln Ala Lys Ile Leu Gly Ile Pro Tyr Lys Asn Asn 225 230 235 240 Asp Leu Ser Met Phe Val Leu Leu Pro Asn Asp Ile Asp Gly Leu Glu 245 250 255 Lys Ile Ile Asp Lys Ile Ser Pro Glu Lys Leu Val Glu Trp Thr Ser 260 265 270 Pro Gly His Met Glu Glu Arg Lys Val Asn Leu His Leu Pro Arg Phe 275 280 285 Glu Val Glu Asp Gly Tyr Asp Leu Glu Ala Val Leu Ala Ala Met Gly 290 295 300 Met Gly Asp Ala Phe Ser Glu His Lys Ala Asp Tyr Ser Gly Met Ser 305 310 315 320 Ser Gly Ser Gly Leu Tyr Ala Gln Lys Phe Leu His Ser Ser Phe Val 325 330 335 Ala Val Thr Glu Glu Gly Thr Glu Ala Ala Ala Ala Thr Gly Ile Gly 340 345 350 Phe Thr Val Thr Ser Ala Pro Gly His Glu Asn Val His Cys Asn His 355 360 365 Pro Phe Leu Phe Phe Ile Arg His Asn Glu Ser Asn Ser Ile Leu Phe 370 375 380 Phe Gly Arg Phe Ser Ser Pro 385 390 <210> 22 <211> 390 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Squamous cell carcinoma antigen 1 SERPINB3 <400> 22 Met Asn Ser Leu Ser Glu Ala Asn Thr Lys Phe Met Phe Asp Leu Phe 1 5 10 15 Gln Gln Phe Arg Lys Ser Lys Glu Asn Asn Ile Phe Tyr Ser Pro Ile 20 25 30 Ser Ile Thr Ser Ala Leu Gly Met Val Leu Leu Gly Ala Lys Asp Asn 35 40 45 Thr Ala Gln Gln Ile Lys Lys Val Leu His Phe Asp Gln Val Thr Glu 50 55 60 Asn Thr Thr Gly Lys Ala Ala Thr Tyr His Val Asp Arg Ser Gly Asn 65 70 75 80 Val His His Gln Phe Gln Lys Leu Leu Thr Glu Phe Asn Lys Ser Thr 85 90 95 Asp Ala Tyr Glu Leu Lys Ile Ala Asn Lys Leu Phe Gly Glu Lys Thr 100 105 110 Tyr Leu Phe Leu Gln Glu Tyr Leu Asp Ala Ile Lys Lys Phe Tyr Gln 115 120 125 Thr Ser Val Glu Ser Val Asp Phe Ala Asn Ala Pro Glu Glu Ser Arg 130 135 140 Lys Lys Ile Asn Ser Trp Val Glu Ser Gln Thr Asn Glu Lys Ile Lys 145 150 155 160 Asn Leu Ile Pro Glu Gly Asn Ile Gly Ser Asn Thr Thr Leu Val Leu 165 170 175 Val Asn Ala Ile Tyr Phe Lys Gly Gln Trp Glu Lys Lys Phe Asn Lys 180 185 190 Glu Asp Thr Lys Glu Glu Lys Phe Trp Pro Asn Lys Asn Thr Tyr Lys 195 200 205 Ser Ile Gln Met Met Arg Gln Tyr Thr Ser Phe His Phe Ala Ser Leu 210 215 220 Glu Asp Val Gln Ala Lys Val Leu Glu Ile Pro Tyr Lys Gly Lys Asp 225 230 235 240 Leu Ser Met Ile Val Leu Leu Pro Asn Glu Ile Asp Gly Leu Gln Lys 245 250 255 Leu Glu Glu Lys Leu Thr Ala Glu Lys Leu Met Glu Trp Thr Ser Leu 260 265 270 Gln Asn Met Arg Glu Thr Arg Val Asp Leu His Leu Pro Arg Phe Lys 275 280 285 Val Glu Glu Ser Tyr Asp Leu Lys Asp Thr Leu Arg Thr Met Gly Met 290 295 300 Val Asp Ile Phe Asn Gly Asp Ala Asp Leu Ser Gly Met Thr Gly Ser 305 310 315 320 Arg Gly Leu Val Leu Ser Gly Val Leu His Lys Ala Phe Val Glu Val 325 330 335 Thr Glu Glu Gly Ala Glu Ala Ala Ala Ala Thr Ala Val Val Gly Phe 340 345 350 Gly Ser Ser Pro Thr Ser Thr Asn Glu Glu Phe His Cys Asn His Pro 355 360 365 Phe Leu Phe Phe Ile Arg Gln Asn Lys Thr Asn Ser Ile Leu Phe Tyr 370 375 380 Gly Arg Phe Ser Ser Pro 385 390 <210> 23 <211> 390 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Squamous cell carcinoma antigen 2 SERPINB4 <400> 23 Met Asn Ser Leu Ser Glu Ala Asn Thr Lys Phe Met Phe Asp Leu Phe 1 5 10 15 Gln Gln Phe Arg Lys Ser Lys Glu Asn Asn Ile Phe Tyr Ser Pro Ile 20 25 30 Ser Ile Thr Ser Ala Leu Gly Met Val Leu Leu Gly Ala Lys Asp Asn 35 40 45 Thr Ala Gln Gln Ile Ser Lys Val Leu His Phe Asp Gln Val Thr Glu 50 55 60 Asn Thr Thr Glu Lys Ala Ala Thr Tyr His Val Asp Arg Ser Gly Asn 65 70 75 80 Val His His Gln Phe Gln Lys Leu Leu Thr Glu Phe Asn Lys Ser Thr 85 90 95 Asp Ala Tyr Glu Leu Lys Ile Ala Asn Lys Leu Phe Gly Glu Lys Thr 100 105 110 Tyr Gln Phe Leu Gln Glu Tyr Leu Asp Ala Ile Lys Lys Phe Tyr Gln 115 120 125 Thr Ser Val Glu Ser Thr Asp Phe Ala Asn Ala Pro Glu Glu Ser Arg 130 135 140 Lys Lys Ile Asn Ser Trp Val Glu Ser Gln Thr Asn Glu Lys Ile Lys 145 150 155 160 Asn Leu Phe Pro Asp Gly Thr Ile Gly Asn Asp Thr Thr Leu Val Leu 165 170 175 Val Asn Ala Ile Tyr Phe Lys Gly Gln Trp Glu Asn Lys Phe Lys Lys 180 185 190 Glu Asn Thr Lys Glu Glu Lys Phe Trp Pro Asn Lys Asn Thr Tyr Lys 195 200 205 Ser Val Gln Met Met Arg Gln Tyr Asn Ser Phe Asn Phe Ala Leu Leu 210 215 220 Glu Asp Val Gln Ala Lys Val Leu Glu Ile Pro Tyr Lys Gly Lys Asp 225 230 235 240 Leu Ser Met Ile Val Leu Leu Pro Asn Glu Ile Asp Gly Leu Gln Lys 245 250 255 Leu Glu Glu Lys Leu Thr Ala Glu Lys Leu Met Glu Trp Thr Ser Leu 260 265 270 Gln Asn Met Arg Glu Thr Cys Val Asp Leu His Leu Pro Arg Phe Lys 275 280 285 Met Glu Glu Ser Tyr Asp Leu Lys Asp Thr Leu Arg Thr Met Gly Met 290 295 300 Val Asn Ile Phe Asn Gly Asp Ala Asp Leu Ser Gly Met Thr Trp Ser 305 310 315 320 His Gly Leu Ser Val Ser Lys Val Leu His Lys Ala Phe Val Glu Val 325 330 335 Thr Glu Glu Gly Val Glu Ala Ala Ala Ala Thr Ala Val Val Val Val 340 345 350 Glu Leu Ser Ser Pro Ser Thr Asn Glu Glu Phe Cys Cys Asn His Pro 355 360 365 Phe Leu Phe Phe Ile Arg Gln Asn Lys Thr Asn Ser Ile Leu Phe Tyr 370 375 380 Gly Arg Phe Ser Ser Pro 385 390 <210> 24 <211> 380 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Megsin SERPINB7 <400> 24 Met Ala Ser Leu Ala Ala Ala Asn Ala Glu Phe Cys Phe Asn Leu Phe 1 5 10 15 Arg Glu Met Asp Asp Asn Gln Gly Asn Gly Asn Val Phe Phe Ser Ser 20 25 30 Leu Ser Leu Phe Ala Ala Leu Ala Leu Val Arg Leu Gly Ala Gln Asp 35 40 45 Asp Ser Leu Ser Gln Ile Asp Lys Leu Leu His Val Asn Thr Ala Ser 50 55 60 Gly Tyr Gly Asn Ser Ser Asn Ser Gln Ser Gly Leu Gln Ser Gln Leu 65 70 75 80 Lys Arg Val Phe Ser Asp Ile Asn Ala Ser His Lys Asp Tyr Asp Leu 85 90 95 Ser Ile Val Asn Gly Leu Phe Ala Glu Lys Val Tyr Gly Phe His Lys 100 105 110 Asp Tyr Ile Glu Cys Ala Glu Lys Leu Tyr Asp Ala Lys Val Glu Arg 115 120 125 Val Asp Phe Thr Asn His Leu Glu Asp Thr Arg Arg Asn Ile Asn Lys 130 135 140 Trp Val Glu Asn Glu Thr His Gly Lys Ile Lys Asn Val Ile Gly Glu 145 150 155 160 Gly Gly Ile Ser Ser Ser Ala Val Met Val Leu Val Asn Ala Val Tyr 165 170 175 Phe Lys Gly Lys Trp Gln Ser Ala Phe Thr Lys Ser Glu Thr Ile Asn 180 185 190 Cys His Phe Lys Ser Pro Lys Cys Ser Gly Lys Ala Val Ala Met Met 195 200 205 His Gln Glu Arg Lys Phe Asn Leu Ser Val Ile Glu Asp Pro Ser Met 210 215 220 Lys Ile Leu Glu Leu Arg Tyr Asn Gly Gly Ile Asn Met Tyr Val Leu 225 230 235 240 Leu Pro Glu Asn Asp Leu Ser Glu Ile Glu Asn Lys Leu Thr Phe Gln 245 250 255 Asn Leu Met Glu Trp Thr Asn Pro Arg Arg Met Thr Ser Lys Tyr Val 260 265 270 Glu Val Phe Phe Pro Gln Phe Lys Ile Glu Lys Asn Tyr Glu Met Lys 275 280 285 Gln Tyr Leu Arg Ala Leu Gly Leu Lys Asp Ile Phe Asp Glu Ser Lys 290 295 300 Ala Asp Leu Ser Gly Ile Ala Ser Gly Gly Arg Leu Tyr Ile Ser Arg 305 310 315 320 Met Met His Lys Ser Tyr Ile Glu Val Thr Glu Glu Gly Thr Glu Ala 325 330 335 Thr Ala Ala Thr Gly Ser Asn Ile Val Glu Lys Gln Leu Pro Gln Ser 340 345 350 Thr Leu Phe Arg Ala Asp His Pro Phe Leu Phe Val Ile Arg Lys Asp 355 360 365 Asp Ile Ile Leu Phe Ser Gly Lys Val Ser Cys Pro 370 375 380 <210> 25 <211> 374 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Cytoplasmic antiproteinase 2 SERPINB8 <400> 25 Met Asp Asp Leu Cys Glu Ala Asn Gly Thr Phe Ala Ile Ser Leu Phe 1 5 10 15 Lys Ile Leu Gly Glu Glu Asp Asn Ser Arg Asn Val Phe Phe Ser Pro 20 25 30 Met Ser Ile Ser Ser Ala Leu Ala Met Val Phe Met Gly Ala Lys Gly 35 40 45 Ser Thr Ala Ala Gln Met Ser Gln Ala Leu Cys Leu Tyr Lys Asp Gly 50 55 60 Asp Ile His Arg Gly Phe Gln Ser Leu Leu Ser Glu Val Asn Arg Thr 65 70 75 80 Gly Thr Gln Tyr Leu Leu Arg Thr Ala Asn Arg Leu Phe Gly Glu Lys 85 90 95 Thr Cys Asp Phe Leu Pro Asp Phe Lys Glu Tyr Cys Gln Lys Phe Tyr 100 105 110 Gln Ala Glu Leu Glu Glu Leu Ser Phe Ala Glu Asp Thr Glu Glu Cys 115 120 125 Arg Lys His Ile Asn Asp Trp Val Ala Glu Lys Thr Glu Gly Lys Ile 130 135 140 Ser Glu Val Leu Asp Ala Gly Thr Val Asp Pro Leu Thr Lys Leu Val 145 150 155 160 Leu Val Asn Ala Ile Tyr Phe Lys Gly Lys Trp Asn Glu Gln Phe Asp 165 170 175 Arg Lys Tyr Thr Arg Gly Met Leu Phe Lys Thr Asn Glu Glu Lys Lys 180 185 190 Thr Val Gln Met Met Phe Lys Glu Ala Lys Phe Lys Met Gly Tyr Ala 195 200 205 Asp Glu Val His Thr Gln Val Leu Glu Leu Pro Tyr Val Glu Glu Glu 210 215 220 Leu Ser Met Val Ile Leu Leu Pro Asp Asp Asn Thr Asp Leu Ala Val 225 230 235 240 Val Glu Lys Ala Leu Thr Tyr Glu Lys Phe Lys Ala Trp Thr Asn Ser 245 250 255 Glu Lys Leu Thr Lys Ser Lys Val Gln Val Phe Leu Pro Arg Leu Lys 260 265 270 Leu Glu Glu Ser Tyr Asp Leu Glu Pro Phe Leu Arg Arg Leu Gly Met 275 280 285 Ile Asp Ala Phe Asp Glu Ala Lys Ala Asp Phe Ser Gly Met Ser Thr 290 295 300 Glu Lys Asn Val Pro Leu Ser Lys Val Ala His Lys Cys Phe Val Glu 305 310 315 320 Val Asn Glu Glu Gly Thr Glu Ala Ala Ala Ala Thr Ala Val Val Arg 325 330 335 Asn Ser Arg Cys Ser Arg Met Glu Pro Arg Phe Cys Ala Asp His Pro 340 345 350 Phe Leu Phe Phe Ile Arg Arg His Lys Thr Asn Cys Ile Leu Phe Cys 355 360 365 Gly Arg Phe Ser Ser Pro 370 <210> 26 <211> 376 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Cytoplasmic antiproteinase 3 SERPINB9 <400> 26 Met Glu Thr Leu Ser Asn Ala Ser Gly Thr Phe Ala Ile Arg Leu Leu 1 5 10 15 Lys Ile Leu Cys Gln Asp Asn Pro Ser His Asn Val Phe Cys Ser Pro 20 25 30 Val Ser Ile Ser Ser Ala Leu Ala Met Val Leu Leu Gly Ala Lys Gly 35 40 45 Asn Thr Ala Thr Gln Met Ala Gln Ala Leu Ser Leu Asn Thr Glu Glu 50 55 60 Asp Ile His Arg Ala Phe Gln Ser Leu Leu Thr Glu Val Asn Lys Ala 65 70 75 80 Gly Thr Gln Tyr Leu Leu Arg Thr Ala Asn Arg Leu Phe Gly Glu Lys 85 90 95 Thr Cys Gln Phe Leu Ser Thr Phe Lys Glu Ser Cys Leu Gln Phe Tyr 100 105 110 His Ala Glu Leu Lys Glu Leu Ser Phe Ile Arg Ala Ala Glu Glu Ser 115 120 125 Arg Lys His Ile Asn Thr Trp Val Ser Lys Lys Thr Glu Gly Lys Ile 130 135 140 Glu Glu Leu Leu Pro Gly Ser Ser Ile Asp Ala Glu Thr Arg Leu Val 145 150 155 160 Leu Val Asn Ala Ile Tyr Phe Lys Gly Lys Trp Asn Glu Pro Phe Asp 165 170 175 Glu Thr Tyr Thr Arg Glu Met Pro Phe Lys Ile Asn Gln Glu Glu Gln 180 185 190 Arg Pro Val Gln Met Met Tyr Gln Glu Ala Thr Phe Lys Leu Ala His 195 200 205 Val Gly Glu Val Arg Ala Gln Leu Leu Glu Leu Pro Tyr Ala Arg Lys 210 215 220 Glu Leu Ser Leu Leu Val Leu Leu Pro Asp Asp Gly Val Glu Leu Ser 225 230 235 240 Thr Val Glu Lys Ser Leu Thr Phe Glu Lys Leu Thr Ala Trp Thr Lys 245 250 255 Pro Asp Cys Met Lys Ser Thr Glu Val Glu Val Leu Leu Pro Lys Phe 260 265 270 Lys Leu Gln Glu Asp Tyr Asp Met Glu Ser Val Leu Arg His Leu Gly 275 280 285 Ile Val Asp Ala Phe Gln Gln Gly Lys Ala Asp Leu Ser Ala Met Ser 290 295 300 Ala Glu Arg Asp Leu Cys Leu Ser Lys Phe Val His Lys Ser Phe Val 305 310 315 320 Glu Val Asn Glu Glu Gly Thr Glu Ala Ala Ala Ala Ser Ser Cys Phe 325 330 335 Val Val Ala Glu Cys Cys Met Glu Ser Gly Pro Arg Phe Cys Ala Asp 340 345 350 His Pro Phe Leu Phe Phe Ile Arg His Asn Arg Ala Asn Ser Ile Leu 355 360 365 Phe Cys Gly Arg Phe Ser Ser Pro 370 375 <210> 27 <211> 376 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Placental thrombin inhibitor SERPINB6 <400> 27 Met Asp Val Leu Ala Glu Ala Asn Gly Thr Phe Ala Leu Asn Leu Leu 1 5 10 15 Lys Thr Leu Gly Lys Asp Asn Ser Lys Asn Val Phe Phe Ser Pro Met 20 25 30 Ser Met Ser Cys Ala Leu Ala Met Val Tyr Met Gly Ala Lys Gly Asn 35 40 45 Thr Ala Ala Gln Met Ala Gln Ile Leu Ser Phe Asn Lys Ser Gly Gly 50 55 60 Gly Gly Asp Ile His Gln Gly Phe Gln Ser Leu Leu Thr Glu Val Asn 65 70 75 80 Lys Thr Gly Thr Gln Tyr Leu Leu Arg Val Ala Asn Arg Leu Phe Gly 85 90 95 Glu Lys Ser Cys Asp Phe Leu Ser Ser Phe Arg Asp Ser Cys Gln Lys 100 105 110 Phe Tyr Gln Ala Glu Met Glu Glu Leu Asp Phe Ile Ser Ala Val Glu 115 120 125 Lys Ser Arg Lys His Ile Asn Thr Trp Val Ala Glu Lys Thr Glu Gly 130 135 140 Lys Ile Ala Glu Leu Leu Ser Pro Gly Ser Val Asp Pro Leu Thr Arg 145 150 155 160 Leu Val Leu Val Asn Ala Val Tyr Phe Arg Gly Asn Trp Asp Glu Gln 165 170 175 Phe Asp Lys Glu Asn Thr Glu Glu Arg Leu Phe Lys Val Ser Lys Asn 180 185 190 Glu Glu Lys Pro Val Gln Met Met Phe Lys Gln Ser Thr Phe Lys Lys 195 200 205 Thr Tyr Ile Gly Glu Ile Phe Thr Gln Ile Leu Val Leu Pro Tyr Val 210 215 220 Gly Lys Glu Leu Asn Met Ile Ile Met Leu Pro Asp Glu Thr Thr Asp 225 230 235 240 Leu Arg Thr Val Glu Lys Glu Leu Thr Tyr Glu Lys Phe Val Glu Trp 245 250 255 Thr Arg Leu Asp Met Met Asp Glu Glu Glu Val Glu Val Ser Leu Pro 260 265 270 Arg Phe Lys Leu Glu Glu Ser Tyr Asp Met Glu Ser Val Leu Arg Asn 275 280 285 Leu Gly Met Thr Asp Ala Phe Glu Leu Gly Lys Ala Asp Phe Ser Gly 290 295 300 Met Ser Gln Thr Asp Leu Ser Leu Ser Lys Val Val His Lys Ser Phe 305 310 315 320 Val Glu Val Asn Glu Glu Gly Thr Glu Ala Ala Ala Ala Thr Ala Ala 325 330 335 Ile Met Met Met Arg Cys Ala Arg Phe Val Pro Arg Phe Cys Ala Asp 340 345 350 His Pro Phe Leu Phe Phe Ile Gln His Ser Lys Thr Asn Gly Ile Leu 355 360 365 Phe Cys Gly Arg Phe Ser Ser Pro 370 375 <210> 28 <211> 485 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Angiotensinogen precursor SERPINA8 <400> 28 Met Arg Lys Arg Ala Pro Gln Ser Glu Met Ala Pro Ala Gly Val Ser 1 5 10 15 Leu Arg Ala Thr Ile Leu Cys Leu Leu Ala Trp Ala Gly Leu Ala Ala 20 25 30 Gly Asp Arg Val Tyr Ile His Pro Phe His Leu Val Ile His Asn Glu 35 40 45 Ser Thr Cys Glu Gln Leu Ala Lys Ala Asn Ala Gly Lys Pro Lys Asp 50 55 60 Pro Thr Phe Ile Pro Ala Pro Ile Gln Ala Lys Thr Ser Pro Val Asp 65 70 75 80 Glu Lys Ala Leu Gln Asp Gln Leu Val Leu Val Ala Ala Lys Leu Asp 85 90 95 Thr Glu Asp Lys Leu Arg Ala Ala Met Val Gly Met Leu Ala Asn Phe 100 105 110 Leu Gly Phe Arg Ile Tyr Gly Met His Ser Glu Leu Trp Gly Val Val 115 120 125 His Gly Ala Thr Val Leu Ser Pro Thr Ala Val Phe Gly Thr Leu Ala 130 135 140 Ser Leu Tyr Leu Gly Ala Leu Asp His Thr Ala Asp Arg Leu Gln Ala 145 150 155 160 Ile Leu Gly Val Pro Trp Lys Asp Lys Asn Cys Thr Ser Arg Leu Asp 165 170 175 Ala His Lys Val Leu Ser Ala Leu Gln Ala Val Gln Gly Leu Leu Val 180 185 190 Ala Gln Gly Arg Ala Asp Ser Gln Ala Gln Leu Leu Leu Ser Thr Val 195 200 205 Val Gly Val Phe Thr Ala Pro Gly Leu His Leu Lys Gln Pro Phe Val 210 215 220 Gln Gly Leu Ala Leu Tyr Thr Pro Val Val Leu Pro Arg Ser Leu Asp 225 230 235 240 Phe Thr Glu Leu Asp Val Ala Ala Glu Lys Ile Asp Arg Phe Met Gln 245 250 255 Ala Val Thr Gly Trp Lys Thr Gly Cys Ser Leu Met Gly Ala Ser Val 260 265 270 Asp Ser Thr Leu Ala Phe Asn Thr Tyr Val His Phe Gln Gly Lys Met 275 280 285 Lys Gly Phe Ser Leu Leu Ala Glu Pro Gln Glu Phe Trp Val Asp Asn 290 295 300 Ser Thr Ser Val Ser Val Pro Met Leu Ser Gly Met Gly Thr Phe Gln 305 310 315 320 His Trp Ser Asp Ile Gln Asp Asn Phe Ser Val Thr Gln Val Pro Phe 325 330 335 Thr Glu Ser Ala Cys Leu Leu Leu Ile Gln Pro His Tyr Ala Ser Asp 340 345 350 Leu Asp Lys Val Glu Gly Leu Thr Phe Gln Gln Asn Ser Leu Asn Trp 355 360 365 Met Lys Lys Leu Ser Pro Arg Thr Ile His Leu Thr Met Pro Gln Leu 370 375 380 Val Leu Gln Gly Ser Tyr Asp Leu Gln Asp Leu Leu Ala Gln Ala Glu 385 390 395 400 Leu Pro Ala Ile Leu His Thr Glu Leu Asn Leu Gln Lys Leu Ser Asn 405 410 415 Asp Arg Ile Arg Val Gly Glu Val Leu Asn Ser Ile Phe Phe Glu Leu 420 425 430 Glu Ala Asp Glu Arg Glu Pro Thr Glu Ser Thr Gln Gln Leu Asn Lys 435 440 445 Pro Glu Val Leu Glu Val Thr Leu Asn Arg Pro Phe Leu Phe Ala Val 450 455 460 Tyr Asp Gln Ser Ala Thr Ala Leu His Phe Leu Gly Arg Val Ala Asn 465 470 475 480 Pro Leu Ser Thr Ala 485 <210> 29 <211> 405 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Corticosteroid-binding globulin precursor SERPINA6 <400> 29 Met Pro Leu Leu Leu Tyr Thr Cys Leu Leu Trp Leu Pro Thr Ser Gly 1 5 10 15 Leu Trp Thr Val Gln Ala Met Asp Pro Asn Ala Ala Tyr Val Asn Met 20 25 30 Ser Asn His His Arg Gly Leu Ala Ser Ala Asn Val Asp Phe Ala Phe 35 40 45 Ser Leu Tyr Lys His Leu Val Ala Leu Ser Pro Lys Lys Asn Ile Phe 50 55 60 Ile Ser Pro Val Ser Ile Ser Met Ala Leu Ala Met Leu Ser Leu Gly 65 70 75 80 Thr Cys Gly His Thr Arg Ala Gln Leu Leu Gln Gly Leu Gly Phe Asn 85 90 95 Leu Thr Glu Arg Ser Glu Thr Glu Ile His Gln Gly Phe Gln His Leu 100 105 110 His Gln Leu Phe Ala Lys Ser Asp Thr Ser Leu Glu Met Thr Met Gly 115 120 125 Asn Ala Leu Phe Leu Asp Gly Ser Leu Glu Leu Leu Glu Ser Phe Ser 130 135 140 Ala Asp Ile Lys His Tyr Tyr Glu Ser Glu Val Leu Ala Met Asn Phe 145 150 155 160 Gln Asp Trp Ala Thr Ala Ser Arg Gln Ile Asn Ser Tyr Val Lys Asn 165 170 175 Lys Thr Gln Gly Lys Ile Val Asp Leu Phe Ser Gly Leu Asp Ser Pro 180 185 190 Ala Ile Leu Val Leu Val Asn Tyr Ile Phe Phe Lys Gly Thr Trp Thr 195 200 205 Gln Pro Phe Asp Leu Ala Ser Thr Arg Glu Glu Asn Phe Tyr Val Asp 210 215 220 Glu Thr Thr Val Val Lys Val Pro Met Met Leu Gln Ser Ser Thr Ile 225 230 235 240 Ser Tyr Leu His Asp Ser Glu Leu Pro Cys Gln Leu Val Gln Met Asn 245 250 255 Tyr Val Gly Asn Gly Thr Val Phe Phe Ile Leu Pro Asp Lys Gly Lys 260 265 270 Met Asn Thr Val Ile Ala Ala Leu Ser Arg Asp Thr Ile Asn Arg Trp 275 280 285 Ser Ala Gly Leu Thr Ser Ser Gln Val Asp Leu Tyr Ile Pro Lys Val 290 295 300 Thr Ile Ser Gly Val Tyr Asp Leu Gly Asp Val Leu Glu Glu Met Gly 305 310 315 320 Ile Ala Asp Leu Phe Thr Asn Gln Ala Asn Phe Ser Arg Ile Thr Gln 325 330 335 Asp Ala Gln Leu Lys Ser Ser Lys Val Val His Lys Ala Val Leu Gln 340 345 350 Leu Asn Glu Glu Gly Val Asp Thr Ala Gly Ser Thr Gly Val Thr Leu 355 360 365 Asn Leu Thr Ser Lys Pro Ile Ile Leu Arg Phe Asn Gln Pro Phe Ile 370 375 380 Ile Met Ile Phe Asp His Phe Thr Trp Ser Ser Leu Phe Leu Ala Arg 385 390 395 400 Val Met Asn Pro Val 405 <210> 30 <211> 417 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> 47 kDa heat shock protein precursor SERPINH1 <400> 30 Met Arg Ser Leu Leu Leu Gly Thr Leu Cys Leu Leu Ala Val Ala Leu 1 5 10 15 Ala Ala Glu Val Lys Lys Pro Val Glu Ala Ala Ala Pro Gly Thr Ala 20 25 30 Glu Lys Leu Ser Ser Lys Ala Thr Thr Leu Ala Glu Pro Ser Thr Gly 35 40 45 Leu Ala Phe Ser Leu Tyr Gln Ala Met Ala Lys Asp Gln Ala Val Glu 50 55 60 Asn Ile Leu Val Ser Pro Val Val Val Ala Ser Ser Leu Gly Leu Val 65 70 75 80 Ser Leu Gly Gly Lys Ala Thr Thr Ala Ser Gln Ala Lys Ala Val Leu 85 90 95 Ser Ala Glu Gln Leu Arg Asp Glu Glu Val His Ala Gly Leu Gly Glu 100 105 110 Leu Leu Arg Ser Leu Ser Asn Ser Thr Ala Arg Asn Val Thr Trp Lys 115 120 125 Leu Gly Ser Arg Leu Tyr Gly Pro Ser Ser Val Ser Phe Ala Asp Asp 130 135 140 Phe Val Arg Ser Ser Lys Gln His Tyr Asn Cys Glu His Ser Lys Ile 145 150 155 160 Asn Phe Pro Asp Lys Arg Ser Ala Leu Gln Ser Ile Asn Glu Trp Ala 165 170 175 Ala Gln Thr Thr Asp Gly Lys Leu Pro Glu Val Thr Lys Asp Val Glu 180 185 190 Arg Thr Asp Gly Ala Leu Leu Val Asn Ala Met Phe Phe Lys Pro His 195 200 205 Trp Asp Glu Lys Phe His His Lys Met Val Asp Asn Arg Gly Phe Met 210 215 220 Val Thr Arg Ser Tyr Thr Val Gly Val Thr Met Met His Arg Thr Gly 225 230 235 240 Leu Tyr Asn Tyr Tyr Asp Asp Glu Lys Glu Lys Leu Gln Leu Val Glu 245 250 255 Met Pro Leu Ala His Lys Leu Ser Ser Leu Ile Ile Leu Met Pro His 260 265 270 His Val Glu Pro Leu Glu Arg Leu Glu Lys Leu Leu Thr Lys Glu Gln 275 280 285 Leu Lys Ile Trp Met Gly Lys Met Gln Lys Lys Ala Val Ala Ile Ser 290 295 300 Leu Pro Lys Gly Val Val Glu Val Thr His Asp Leu Gln Lys His Leu 305 310 315 320 Ala Gly Leu Gly Leu Thr Glu Ala Ile Asp Lys Asn Lys Ala Asp Leu 325 330 335 Ser Arg Met Ser Gly Lys Lys Asp Leu Tyr Leu Ala Ser Val Phe His 340 345 350 Ala Thr Ala Phe Glu Leu Asp Thr Asp Gly Asn Pro Phe Asp Gln Asp 355 360 365 Ile Tyr Gly Arg Glu Glu Leu Arg Ser Pro Lys Leu Phe Tyr Ala Asp 370 375 380 His Pro Phe Ile Phe Leu Val Arg Asp Thr Gln Ser Gly Ser Leu Leu 385 390 395 400 Phe Ile Gly Arg Leu Val Arg Leu Lys Gly Asp Lys Met Arg Asp Glu 405 410 415 Leu <210> 31 <211> 418 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Pigment epithelium-derived factor precursor SERPINF1 <400> 31 Met Gln Ala Leu Val Leu Leu Leu Cys Ile Gly Ala Leu Leu Gly His 1 5 10 15 Ser Ser Cys Gln Asn Pro Ala Ser Pro Pro Glu Glu Gly Ser Pro Asp 20 25 30 Pro Asp Ser Thr Gly Ala Leu Val Glu Glu Glu Asp Pro Phe Phe Lys 35 40 45 Val Pro Val Asn Lys Leu Ala Ala Ala Val Ser Asn Phe Gly Tyr Asp 50 55 60 Leu Tyr Arg Val Arg Ser Ser Met Ser Pro Thr Thr Asn Val Leu Leu 65 70 75 80 Ser Pro Leu Ser Val Ala Thr Ala Leu Ser Ala Leu Ser Leu Gly Ala 85 90 95 Glu Gln Arg Thr Glu Ser Ile Ile His Arg Ala Leu Tyr Tyr Asp Leu 100 105 110 Ile Ser Ser Pro Asp Ile His Gly Thr Tyr Lys Glu Leu Leu Asp Thr 115 120 125 Val Thr Ala Pro Gln Lys Asn Leu Lys Ser Ala Ser Arg Ile Val Phe 130 135 140 Glu Lys Lys Leu Arg Ile Lys Ser Ser Phe Val Ala Pro Leu Glu Lys 145 150 155 160 Ser Tyr Gly Thr Arg Pro Arg Val Leu Thr Gly Asn Pro Arg Leu Asp 165 170 175 Leu Gln Glu Ile Asn Asn Trp Val Gln Ala Gln Met Lys Gly Lys Leu 180 185 190 Ala Arg Ser Thr Lys Glu Ile Pro Asp Glu Ile Ser Ile Leu Leu Leu 195 200 205 Gly Val Ala His Phe Lys Gly Gln Trp Val Thr Lys Phe Asp Ser Arg 210 215 220 Lys Thr Ser Leu Glu Asp Phe Tyr Leu Asp Glu Glu Arg Thr Val Arg 225 230 235 240 Val Pro Met Met Ser Asp Pro Lys Ala Val Leu Arg Tyr Gly Leu Asp 245 250 255 Ser Asp Leu Ser Cys Lys Ile Ala Gln Leu Pro Leu Thr Gly Ser Met 260 265 270 Ser Ile Ile Phe Phe Leu Pro Leu Lys Val Thr Gln Asn Leu Thr Leu 275 280 285 Ile Glu Glu Ser Leu Thr Ser Glu Phe Ile His Asp Ile Asp Arg Glu 290 295 300 Leu Lys Thr Val Gln Ala Val Leu Thr Val Pro Lys Leu Lys Leu Ser 305 310 315 320 Tyr Glu Gly Glu Val Thr Lys Ser Leu Gln Glu Met Lys Leu Gln Ser 325 330 335 Leu Phe Asp Ser Pro Asp Phe Ser Lys Ile Thr Gly Lys Pro Ile Lys 340 345 350 Leu Thr Gln Val Glu His Arg Ala Gly Phe Glu Trp Asn Glu Asp Gly 355 360 365 Ala Gly Thr Thr Pro Ser Pro Gly Leu Gln Pro Ala His Leu Thr Phe 370 375 380 Pro Leu Asp Tyr His Leu Asn Gln Pro Phe Ile Phe Val Leu Arg Asp 385 390 395 400 Thr Asp Thr Gly Ala Leu Leu Phe Ile Gly Lys Ile Leu Asp Pro Arg 405 410 415 Gly Pro <210> 32 <211> 375 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Maspin SERPINB5 <400> 32 Met Asp Ala Leu Gln Leu Ala Asn Ser Ala Phe Ala Val Asp Leu Phe 1 5 10 15 Lys Gln Leu Cys Glu Lys Glu Pro Leu Gly Asn Val Leu Phe Ser Pro 20 25 30 Ile Cys Leu Ser Thr Ser Leu Ser Leu Ala Gln Val Gly Ala Lys Gly 35 40 45 Asp Thr Ala Asn Glu Ile Gly Gln Val Leu His Phe Glu Asn Val Lys 50 55 60 Asp Ile Pro Phe Gly Phe Gln Thr Val Thr Ser Asp Val Asn Lys Leu 65 70 75 80 Ser Ser Phe Tyr Ser Leu Lys Leu Ile Lys Arg Leu Tyr Val Asp Lys 85 90 95 Ser Leu Asn Leu Ser Thr Glu Phe Ile Ser Ser Thr Lys Arg Pro Tyr 100 105 110 Ala Lys Glu Leu Glu Thr Val Asp Phe Lys Asp Lys Leu Glu Glu Thr 115 120 125 Lys Gly Gln Ile Asn Asn Ser Ile Lys Asp Leu Thr Asp Gly His Phe 130 135 140 Glu Asn Ile Leu Ala Asp Asn Ser Val Asn Asp Gln Thr Lys Ile Leu 145 150 155 160 Val Val Asn Ala Ala Tyr Phe Val Gly Lys Trp Met Lys Lys Phe Pro 165 170 175 Glu Ser Glu Thr Lys Glu Cys Pro Phe Arg Leu Asn Lys Thr Asp Thr 180 185 190 Lys Pro Val Gln Met Met Asn Met Glu Ala Thr Phe Cys Met Gly Asn 195 200 205 Ile Asp Ser Ile Asn Cys Lys Ile Ile Glu Leu Pro Phe Gln Asn Lys 210 215 220 His Leu Ser Met Phe Ile Leu Leu Pro Lys Asp Val Glu Asp Glu Ser 225 230 235 240 Thr Gly Leu Glu Lys Ile Glu Lys Gln Leu Asn Ser Glu Ser Leu Ser 245 250 255 Gln Trp Thr Asn Pro Ser Thr Met Ala Asn Ala Lys Val Lys Leu Ser 260 265 270 Ile Pro Lys Phe Lys Val Glu Lys Met Ile Asp Pro Lys Ala Cys Leu 275 280 285 Glu Asn Leu Gly Leu Lys His Ile Phe Ser Glu Asp Thr Ser Asp Phe 290 295 300 Ser Gly Met Ser Glu Thr Lys Gly Val Ala Leu Ser Asn Val Ile His 305 310 315 320 Lys Val Cys Leu Glu Ile Thr Glu Asp Gly Gly Asp Ser Ile Glu Val 325 330 335 Pro Gly Ala Arg Ile Leu Gln His Lys Asp Glu Leu Asn Ala Asp His 340 345 350 Pro Phe Ile Tyr Ile Ile Arg His Asn Lys Thr Arg Asn Ile Ile Phe 355 360 365 Phe Gly Lys Phe Cys Ser Pro 370 375 <210> 33 <211> 418 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Collagen-binding protein 2 precursor SERPINH2 <400> 33 Met Arg Ser Leu Leu Leu Leu Ser Ala Phe Cys Leu Leu Glu Ala Ala 1 5 10 15 Leu Ala Ala Glu Val Lys Lys Pro Ala Ala Ala Ala Ala Pro Gly Thr 20 25 30 Ala Glu Lys Leu Ser Pro Lys Ala Ala Thr Leu Ala Glu Arg Ser Ala 35 40 45 Gly Leu Ala Phe Ser Leu Tyr Gln Ala Met Ala Lys Asp Gln Ala Val 50 55 60 Glu Asn Ile Leu Val Ser Pro Val Val Val Ala Ser Ser Leu Gly Leu 65 70 75 80 Val Ser Leu Gly Gly Lys Ala Thr Thr Ala Ser Gln Ala Lys Ala Val 85 90 95 Leu Ser Ala Glu Gln Leu Arg Asp Glu Glu Val His Ala Gly Leu Gly 100 105 110 Glu Leu Leu Arg Ser Leu Ser Asn Ser Thr Ala Arg Asn Val Thr Trp 115 120 125 Lys Leu Gly Ser Arg Leu Tyr Gly Pro Ser Ser Val Ser Phe Ala Asp 130 135 140 Asp Phe Val Arg Ser Ser Lys Gln His Tyr Asn Cys Glu His Ser Lys 145 150 155 160 Ile Asn Phe Arg Asp Lys Arg Ser Ala Leu Gln Ser Ile Asn Glu Trp 165 170 175 Ala Ala Gln Thr Thr Asp Gly Lys Leu Pro Glu Val Thr Lys Asp Val 180 185 190 Glu Arg Thr Asp Gly Ala Leu Leu Val Asn Ala Met Phe Phe Lys Pro 195 200 205 His Trp Asp Glu Lys Phe His His Lys Met Val Asp Asn Arg Gly Phe 210 215 220 Met Val Thr Arg Ser Tyr Thr Val Gly Val Met Met Met His Arg Thr 225 230 235 240 Gly Leu Tyr Asn Tyr Tyr Asp Asp Glu Lys Glu Lys Leu Gln Ile Val 245 250 255 Glu Met Pro Leu Ala His Lys Leu Ser Ser Leu Ile Ile Leu Met Pro 260 265 270 His His Val Glu Pro Leu Glu Arg Leu Glu Lys Leu Leu Thr Lys Glu 275 280 285 Gln Leu Lys Ile Trp Met Gly Lys Met Gln Lys Lys Ala Val Ala Ile 290 295 300 Ser Leu Pro Lys Gly Val Val Glu Val Thr His Asp Leu Gln Lys His 305 310 315 320 Leu Ala Gly Leu Gly Leu Thr Glu Ala Ile Asp Lys Asn Lys Ala Asp 325 330 335 Leu Ser Arg Met Ser Gly Lys Lys Asp Leu Tyr Leu Ala Ser Val Phe 340 345 350 His Ala Thr Ala Phe Glu Leu Asp Thr Asp Gly Asn Pro Phe Asp Gln 355 360 365 Asp Ile Tyr Gly Arg Glu Glu Leu Arg Ser Pro Lys Leu Phe Tyr Ala 370 375 380 Asp His Pro Phe Ile Phe Leu Val Arg Asp Thr Gln Ser Gly Ser Leu 385 390 395 400 Leu Phe Ile Gly Arg Leu Val Arg Pro Lys Gly Asp Lys Met Arg Asp 405 410 415 Glu Leu <210> 34 <211> 415 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Thyroxine-binding globulin precursor SERPINA7 <400> 34 Met Ser Pro Phe Leu Tyr Leu Val Leu Leu Val Leu Gly Leu His Ala 1 5 10 15 Thr Ile His Cys Ala Ser Pro Glu Gly Lys Val Thr Ala Cys His Ser 20 25 30 Ser Gln Pro Asn Ala Thr Leu Tyr Lys Met Ser Ser Ile Asn Ala Asp 35 40 45 Phe Ala Phe Asn Leu Tyr Arg Arg Phe Thr Val Glu Thr Pro Asp Lys 50 55 60 Asn Ile Phe Phe Ser Pro Val Ser Ile Ser Ala Ala Leu Val Met Leu 65 70 75 80 Ser Phe Gly Ala Cys Cys Ser Thr Gln Thr Glu Ile Val Glu Thr Leu 85 90 95 Gly Phe Asn Leu Thr Asp Thr Pro Met Val Glu Ile Gln His Gly Phe 100 105 110 Gln His Leu Ile Cys Ser Leu Asn Phe Pro Lys Lys Glu Leu Glu Leu 115 120 125 Gln Ile Gly Asn Ala Leu Phe Ile Gly Lys His Leu Lys Pro Leu Ala 130 135 140 Lys Phe Leu Asn Asp Val Lys Thr Leu Tyr Glu Thr Glu Val Phe Ser 145 150 155 160 Thr Asp Phe Ser Asn Ile Ser Ala Ala Lys Gln Glu Ile Asn Ser His 165 170 175 Val Glu Met Gln Thr Lys Gly Lys Val Val Gly Leu Ile Gln Asp Leu 180 185 190 Lys Pro Asn Thr Ile Met Val Leu Val Asn Tyr Ile His Phe Lys Ala 195 200 205 Gln Trp Ala Asn Pro Phe Asp Pro Ser Lys Thr Glu Asp Ser Ser Ser 210 215 220 Phe Leu Ile Asp Lys Thr Thr Thr Val Gln Val Pro Met Met His Gln 225 230 235 240 Met Glu Gln Tyr Tyr His Leu Val Asp Met Glu Leu Asn Cys Thr Val 245 250 255 Leu Gln Met Asp Tyr Ser Lys Asn Ala Leu Ala Leu Phe Val Leu Pro 260 265 270 Lys Glu Gly Gln Met Glu Ser Val Glu Ala Ala Met Ser Ser Lys Thr 275 280 285 Leu Lys Lys Trp Asn Arg Leu Leu Gln Lys Gly Trp Val Asp Leu Phe 290 295 300 Val Pro Lys Phe Ser Ile Ser Ala Thr Tyr Asp Leu Gly Ala Thr Leu 305 310 315 320 Leu Lys Met Gly Ile Gln His Ala Tyr Ser Glu Asn Ala Asp Phe Ser 325 330 335 Gly Leu Thr Glu Asp Asn Gly Leu Lys Leu Ser Asn Ala Ala His Lys 340 345 350 Ala Val Leu His Ile Gly Glu Lys Gly Thr Glu Ala Ala Ala Val Pro 355 360 365 Glu Val Glu Leu Ser Asp Gln Pro Glu Asn Thr Phe Leu His Pro Ile 370 375 380 Ile Gln Ile Asp Arg Ser Phe Met Leu Leu Ile Leu Glu Arg Ser Thr 385 390 395 400 Arg Ser Ile Leu Phe Leu Gly Lys Val Val Asn Pro Thr Glu Ala 405 410 415 <210> 35 <211> 417 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Germinal center B-cell expressed transcript 1 protein SERPINA9 <400> 35 Met Ala Ser Tyr Leu Tyr Gly Val Leu Phe Ala Val Gly Leu Cys Ala 1 5 10 15 Pro Ile Tyr Cys Val Ser Pro Ala Asn Ala Pro Ser Ala Tyr Pro Arg 20 25 30 Pro Ser Ser Thr Lys Ser Thr Pro Ala Ser Gln Val Tyr Ser Leu Asn 35 40 45 Thr Asp Phe Ala Phe Arg Leu Tyr Arg Arg Leu Val Leu Glu Thr Pro 50 55 60 Ser Gln Asn Ile Phe Phe Ser Pro Val Ser Val Ser Thr Ser Leu Ala 65 70 75 80 Met Leu Ser Leu Gly Ala His Ser Val Thr Lys Thr Gln Ile Leu Gln 85 90 95 Gly Leu Gly Phe Asn Leu Thr His Thr Pro Glu Ser Ala Ile His Gln 100 105 110 Gly Phe Gln His Leu Val His Ser Leu Thr Val Pro Ser Lys Asp Leu 115 120 125 Thr Leu Lys Met Gly Ser Ala Leu Phe Val Lys Lys Glu Leu Gln Leu 130 135 140 Gln Ala Asn Phe Leu Gly Asn Val Lys Arg Leu Tyr Glu Ala Glu Val 145 150 155 160 Phe Ser Thr Asp Phe Ser Asn Pro Ser Ile Ala Gln Ala Arg Ile Asn 165 170 175 Ser His Val Lys Lys Lys Thr Gln Gly Lys Val Val Asp Ile Ile Gln 180 185 190 Gly Leu Asp Leu Leu Thr Ala Met Val Leu Val Asn His Ile Phe Phe 195 200 205 Lys Ala Lys Trp Glu Lys Pro Phe His Pro Glu Tyr Thr Arg Lys Asn 210 215 220 Phe Pro Phe Leu Val Gly Glu Gln Val Thr Val His Val Pro Met Met 225 230 235 240 His Gln Lys Glu Gln Phe Ala Phe Gly Val Asp Thr Glu Leu Asn Cys 245 250 255 Phe Val Leu Gln Met Asp Tyr Lys Gly Asp Ala Val Ala Phe Phe Val 260 265 270 Leu Pro Ser Lys Gly Lys Met Arg Gln Leu Glu Gln Ala Leu Ser Ala 275 280 285 Arg Thr Leu Arg Lys Trp Ser His Ser Leu Gln Lys Arg Trp Ile Glu 290 295 300 Val Phe Ile Pro Arg Phe Ser Ile Ser Ala Ser Tyr Asn Leu Glu Thr 305 310 315 320 Ile Leu Pro Lys Met Gly Ile Gln Asn Ala Phe Asp Lys Asn Ala Asp 325 330 335 Phe Ser Gly Ile Ala Lys Arg Asp Ser Leu Gln Val Ser Lys Ala Thr 340 345 350 His Lys Ala Val Leu Asp Val Ser Glu Glu Gly Thr Glu Ala Thr Ala 355 360 365 Ala Thr Thr Thr Lys Phe Ile Val Arg Ser Lys Asp Gly Pro Ser Tyr 370 375 380 Phe Thr Val Ser Phe Asn Arg Thr Phe Leu Met Met Ile Thr Asn Lys 385 390 395 400 Ala Thr Asp Gly Ile Leu Phe Leu Gly Lys Val Glu Asn Pro Thr Lys 405 410 415 Ser <210> 36 <211> 414 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Vaspin SERPINA12 <400> 36 Met Asn Pro Thr Leu Gly Leu Ala Ile Phe Leu Ala Val Leu Leu Thr 1 5 10 15 Val Lys Gly Leu Leu Lys Pro Ser Phe Ser Pro Arg Asn Tyr Lys Ala 20 25 30 Leu Ser Glu Val Gln Gly Trp Lys Gln Arg Met Ala Ala Lys Glu Leu 35 40 45 Ala Arg Gln Asn Met Asp Leu Gly Phe Lys Leu Leu Lys Lys Leu Ala 50 55 60 Phe Tyr Asn Pro Gly Arg Asn Ile Phe Leu Ser Pro Leu Ser Ile Ser 65 70 75 80 Thr Ala Phe Ser Met Leu Cys Leu Gly Ala Gln Asp Ser Thr Leu Asp 85 90 95 Glu Ile Lys Gln Gly Phe Asn Phe Arg Lys Met Pro Glu Lys Asp Leu 100 105 110 His Glu Gly Phe His Tyr Ile Ile His Glu Leu Thr Gln Lys Thr Gln 115 120 125 Asp Leu Lys Leu Ser Ile Gly Asn Thr Leu Phe Ile Asp Gln Arg Leu 130 135 140 Gln Pro Gln Arg Lys Phe Leu Glu Asp Ala Lys Asn Phe Tyr Ser Ala 145 150 155 160 Glu Thr Ile Leu Thr Asn Phe Gln Asn Leu Glu Met Ala Gln Lys Gln 165 170 175 Ile Asn Asp Phe Ile Ser Gln Lys Thr His Gly Lys Ile Asn Asn Leu 180 185 190 Ile Glu Asn Ile Asp Pro Gly Thr Val Met Leu Leu Ala Asn Tyr Ile 195 200 205 Phe Phe Arg Ala Arg Trp Lys His Glu Phe Asp Pro Asn Val Thr Lys 210 215 220 Glu Glu Asp Phe Phe Leu Glu Lys Asn Ser Ser Val Lys Val Pro Met 225 230 235 240 Met Phe Arg Ser Gly Ile Tyr Gln Val Gly Tyr Asp Asp Lys Leu Ser 245 250 255 Cys Thr Ile Leu Glu Ile Pro Tyr Gln Lys Asn Ile Thr Ala Ile Phe 260 265 270 Ile Leu Pro Asp Glu Gly Lys Leu Lys His Leu Glu Lys Gly Leu Gln 275 280 285 Val Asp Thr Phe Ser Arg Trp Lys Thr Leu Leu Ser Arg Arg Val Val 290 295 300 Asp Val Ser Val Pro Arg Leu His Met Thr Gly Thr Phe Asp Leu Lys 305 310 315 320 Lys Thr Leu Ser Tyr Ile Gly Val Ser Lys Ile Phe Glu Glu His Gly 325 330 335 Asp Leu Thr Lys Ile Ala Pro His Arg Ser Leu Lys Val Gly Glu Ala 340 345 350 Val His Lys Ala Glu Leu Lys Met Asp Glu Arg Gly Thr Glu Gly Ala 355 360 365 Ala Gly Thr Gly Ala Gln Thr Leu Pro Met Glu Thr Pro Leu Val Val 370 375 380 Lys Ile Asp Lys Pro Tyr Leu Leu Leu Ile Tyr Ser Glu Lys Ile Pro 385 390 395 400 Ser Val Leu Phe Leu Gly Lys Ile Val Asn Pro Ile Gly Lys 405 410 <210> 37 <211> 422 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Serpin A11 precursor SERPINA11 <400> 37 Met Gly Pro Ala Trp Leu Trp Leu Leu Gly Thr Gly Ile Leu Ala Ser 1 5 10 15 Val His Cys Gln Pro Leu Leu Ala His Gly Asp Lys Ser Leu Gln Gly 20 25 30 Pro Gln Pro Pro Arg His Gln Leu Ser Glu Pro Ala Pro Ala Tyr His 35 40 45 Arg Ile Thr Pro Thr Ile Thr Asn Phe Ala Leu Arg Leu Tyr Lys Glu 50 55 60 Leu Ala Ala Asp Ala Pro Gly Asn Ile Phe Phe Ser Pro Val Ser Ile 65 70 75 80 Ser Thr Thr Leu Ala Leu Leu Ser Leu Gly Ala Gln Ala Asn Thr Ser 85 90 95 Ala Leu Ile Leu Glu Gly Leu Gly Phe Asn Leu Thr Glu Thr Pro Glu 100 105 110 Ala Asp Ile His Gln Gly Phe Arg Ser Leu Leu His Thr Leu Ala Leu 115 120 125 Pro Ser Pro Lys Leu Glu Leu Lys Val Gly Asn Ser Leu Phe Leu Asp 130 135 140 Lys Arg Leu Lys Pro Arg Gln His Tyr Leu Asp Ser Ile Lys Glu Leu 145 150 155 160 Tyr Gly Ala Phe Ala Phe Ser Ala Asn Phe Thr Asp Ser Val Thr Thr 165 170 175 Gly Arg Gln Ile Asn Asp Tyr Leu Arg Arg Gln Thr Tyr Gly Gln Val 180 185 190 Val Asp Cys Leu Pro Glu Phe Ser Gln Asp Thr Phe Met Val Leu Ala 195 200 205 Asn Tyr Ile Phe Phe Lys Ala Lys Trp Lys His Pro Phe Ser Arg Tyr 210 215 220 Gln Thr Gln Lys Gln Glu Ser Phe Phe Val Asp Glu Arg Thr Ser Leu 225 230 235 240 Gln Val Pro Met Met His Gln Lys Glu Met His Arg Phe Leu Tyr Asp 245 250 255 Gln Asp Leu Ala Cys Thr Val Leu Gln Ile Glu Tyr Arg Gly Asn Ala 260 265 270 Leu Ala Leu Leu Val Leu Pro Asp Pro Gly Lys Met Lys Gln Val Glu 275 280 285 Ala Ala Leu Gln Pro Gln Thr Leu Arg Lys Trp Gly Gln Leu Leu Leu 290 295 300 Pro Ser Leu Leu Asp Leu His Leu Pro Arg Phe Ser Ile Ser Gly Thr 305 310 315 320 Tyr Asn Leu Glu Asp Ile Leu Pro Gln Ile Gly Leu Thr Asn Ile Leu 325 330 335 Asn Leu Glu Ala Asp Phe Ser Gly Val Thr Gly Gln Leu Asn Lys Thr 340 345 350 Ile Ser Lys Val Ser His Lys Ala Met Val Asp Met Ser Glu Lys Gly 355 360 365 Thr Glu Ala Gly Ala Ala Ser Gly Leu Leu Ser Gln Pro Pro Ser Leu 370 375 380 Asn Thr Met Ser Asp Pro His Ala His Phe Asn Arg Pro Phe Leu Leu 385 390 395 400 Leu Leu Trp Glu Val Thr Thr Gln Ser Leu Leu Phe Leu Gly Lys Val 405 410 415 Val Asn Pro Val Ala Gly 420 <210> 38 <211> 307 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Serpin A13 precursor SERPINA13 <400> 38 Met Glu Ala Ser Arg Trp Trp Leu Leu Val Thr Val Leu Met Ala Gly 1 5 10 15 Ala His Cys Val Ala Leu Val Asp Gln Glu Ala Ser Asp Leu Ile His 20 25 30 Ser Gly Pro Gln Asp Ser Ser Pro Gly Pro Ala Leu Pro Cys His Lys 35 40 45 Ile Ser Val Ser Asn Ile Asp Phe Ala Phe Lys Leu Tyr Arg Gln Leu 50 55 60 Ala Leu Asn Ala Pro Gly Glu Asn Ile Leu Phe Phe Pro Val Ser Ile 65 70 75 80 Ser Leu Ala Leu Ala Met Leu Ser Trp Gly Ala Pro Val Ala Ser Arg 85 90 95 Thr Gln Leu Leu Glu Gly Leu Gly Phe Thr Leu Thr Val Val Pro Glu 100 105 110 Glu Glu Ile Gln Glu Gly Phe Trp Asp Leu Leu Ile Arg Leu Arg Gly 115 120 125 Gln Gly Pro Arg Leu Leu Leu Thr Met Asp Gln Arg Arg Phe Ser Gly 130 135 140 Leu Gly Ala Arg Ala Asn Gln Ser Leu Glu Glu Ala Gln Lys His Ile 145 150 155 160 Asp Glu Tyr Thr Glu Gln Gln Thr Gln Gly Lys Leu Gly Ala Trp Glu 165 170 175 Lys Asp Leu Gly Ser Glu Thr Thr Ala Val Leu Val Asn His Met Leu 180 185 190 Leu Arg Ala Glu Trp Met Lys Pro Phe Asp Ser His Ala Thr Ser Pro 195 200 205 Lys Glu Phe Phe Val Asp Glu His Ser Ala Val Trp Val Pro Met Met 210 215 220 Lys Glu Lys Ala Ser His Arg Phe Leu His Asp Arg Glu Leu Gln Cys 225 230 235 240 Ser Val Leu Arg Met Asp His Ala Gly Asn Thr Thr Thr Phe Phe Ile 245 250 255 Phe Pro Asn Arg Gly Lys Met Arg His Leu Glu Asp Ala Leu Leu Pro 260 265 270 Glu Thr Leu Ile Lys Trp Asp Ser Leu Leu Arg Thr Arg Glu Leu Asp 275 280 285 Phe His Phe Pro Lys Phe Ser Ile Ser Arg Thr Cys Arg Leu Glu Met 290 295 300 Leu Leu Pro 305 <210> 39 <211> 934 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> granzyme B <400> 39 tgagaagatg caaccaatcc tgcttctgct ggccttcctc ctgctgccca gggcagatgc 60 aggggagatc atcgggggac atgaggccaa gccccactcc cgcccctaca tggcttatct 120 tatgatctgg gatcagaagt ctctgaagag gtgcggtggc ttcctgatac aagacgactt 180 cgtgctgaca gctgctcact gttggggaag ctccataaat gtcaccttgg gggcccacaa 240 tatcaaagaa caggagccga cccagcagtt tatccctgtg aaaagaccca tcccccatcc 300 agcctataat cctaagaact tctccaacga catcatgcta ctgcagctgg agagaaaggc 360 caagcggacc agagctgtgc agcccctcag gctacctagc aacaaggccc aggtgaagcc 420 agggcagaca tgcagtgtgg ccggctgggg gcagacggcc cccctgggaa aacactcaca 480 cacactacaa gaggtgaaga tgacagtgca ggaagatcga aagtgcgaat ctgacttacg 540 ccattattac gacagtacca ttgagttgtg cgtgggggac ccagagatta aaaagacttc 600 ctttaagggg gactctggag gccctcttgt gtgtaacaag gtggcccagg gcattgtctc 660 ctatggacga aacaatggca tgcctccacg agcctgcacc aaagtctcaa gctttgtaca 720 ctggataaag aaaaccatga aacgctacta actacaggaa gcaaactaag cccccgctgt 780 aatgaaacac cttctctgga gccaagtcca gatttacact gggagaggtg ccagcaactg 840 aataaatacc tctcccagtg taaatctgga gccaagtcca gatttacact gggagaggtg 900 ccagcaactg aataaatacc tcttagctga gtgg 934 <210> 40 <211> 247 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> granzyme B <400> 40 Met Gln Pro Ile Leu Leu Leu Leu Ala Phe Leu Leu Leu Pro Arg Ala 1 5 10 15 Asp Ala Gly Glu Ile Ile Gly Gly His Glu Ala Lys Pro His Ser Arg 20 25 30 Pro Tyr Met Ala Tyr Leu Met Ile Trp Asp Gln Lys Ser Leu Lys Arg 35 40 45 Cys Gly Gly Phe Leu Ile Gln Asp Asp Phe Val Leu Thr Ala Ala His 50 55 60 Cys Trp Gly Ser Ser Ile Asn Val Thr Leu Gly Ala His Asn Ile Lys 65 70 75 80 Glu Gln Glu Pro Thr Gln Gln Phe Ile Pro Val Lys Arg Pro Ile Pro 85 90 95 His Pro Ala Tyr Asn Pro Lys Asn Phe Ser Asn Asp Ile Met Leu Leu 100 105 110 Gln Leu Glu Arg Lys Ala Lys Arg Thr Arg Ala Val Gln Pro Leu Arg 115 120 125 Leu Pro Ser Asn Lys Ala Gln Val Lys Pro Gly Gln Thr Cys Ser Val 130 135 140 Ala Gly Trp Gly Gln Thr Ala Pro Leu Gly Lys His Ser His Thr Leu 145 150 155 160 Gln Glu Val Lys Met Thr Val Gln Glu Asp Arg Lys Cys Glu Ser Asp 165 170 175 Leu Arg His Tyr Tyr Asp Ser Thr Ile Glu Leu Cys Val Gly Asp Pro 180 185 190 Glu Ile Lys Lys Thr Ser Phe Lys Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val 195 200 205 Cys Asn Lys Val Ala Gln Gly Ile Val Ser Tyr Gly Arg Asn Asn Gly 210 215 220 Met Pro Pro Arg Ala Cys Thr Lys Val Ser Ser Phe Val His Trp Ile 225 230 235 240 Lys Lys Thr Met Lys Arg Tyr 245 <210> 41 <211> 1165 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Testisin transcript variant 1 <400> 41 gctgggagta gagggcagag ctcccacccc gccccgcccc cagggggcgc cccgggcccg 60 gcgcgagagg aggcagaggg ggcgtcaggc cgcgggagag gaggccatgg gcgcgcgcgg 120 ggcgctgctg ctggcgctgc tgctggctcg ggctggactc aggaagccgg agtcgcagga 180 ggcggcgccg ttatcaggac catgcggccg acgggtcatc acgtcgcgca tcgtgggtgg 240 agaggacgcc gaactcgggc gttggccgtg gcaggggagc ctgcgcctgt gggattccca 300 cgtatgcgga gtgagcctgc tcagccaccg ctgggcactc acggcggcgc actgctttga 360 aacctatagt gaccttagtg atccctccgg gtggatggtc cagtttggcc agctgacttc 420 catgccatcc ttctggagcc tgcaggccta ctacacccgt tacttcgtat cgaatatcta 480 tctgagccct cgctacctgg ggaattcacc ctatgacatt gccttggtga agctgtctgc 540 acctgtcacc tacactaaac acatccagcc catctgtctc caggcctcca catttgagtt 600 tgagaaccgg acagactgct gggtgactgg ctgggggtac atcaaagagg atgaggcact 660 gccatctccc cacaccctcc aggaagttca ggtcgccatc ataaacaact ctatgtgcaa 720 ccacctcttc ctcaagtaca gtttccgcaa ggacatcttt ggagacatgg tttgtgctgg 780 caatgcccaa ggcgggaagg atgcctgctt cggtgactca ggtggaccct tggcctgtaa 840 caagaatgga ctgtggtatc agattggagt cgtgagctgg ggagtgggct gtggtcggcc 900 caatcggccc ggtgtctaca ccaatatcag ccaccacttt gagtggatcc agaagctgat 960 ggcccagagt ggcatgtccc agccagaccc ctcctggccg ctactctttt tccctcttct 1020 ctgggctctc ccactcctgg ggccggtctg agcctacctg agcccatgca gcctggggcc 1080 actgccaagt caggccctgg ttctcttctg tcttgtttgg taataaacac attccagttg 1140 atgccttgca gggcattctt caaaa 1165 <210> 42 <211> 314 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Testisin isoform 1 <400> 42 Met Gly Ala Arg Gly Ala Leu Leu Leu Ala Leu Leu Leu Ala Arg Ala 1 5 10 15 Gly Leu Arg Lys Pro Glu Ser Gln Glu Ala Ala Pro Leu Ser Gly Pro 20 25 30 Cys Gly Arg Arg Val Ile Thr Ser Arg Ile Val Gly Gly Glu Asp Ala 35 40 45 Glu Leu Gly Arg Trp Pro Trp Gln Gly Ser Leu Arg Leu Trp Asp Ser 50 55 60 His Val Cys Gly Val Ser Leu Leu Ser His Arg Trp Ala Leu Thr Ala 65 70 75 80 Ala His Cys Phe Glu Thr Tyr Ser Asp Leu Ser Asp Pro Ser Gly Trp 85 90 95 Met Val Gln Phe Gly Gln Leu Thr Ser Met Pro Ser Phe Trp Ser Leu 100 105 110 Gln Ala Tyr Tyr Thr Arg Tyr Phe Val Ser Asn Ile Tyr Leu Ser Pro 115 120 125 Arg Tyr Leu Gly Asn Ser Pro Tyr Asp Ile Ala Leu Val Lys Leu Ser 130 135 140 Ala Pro Val Thr Tyr Thr Lys His Ile Gln Pro Ile Cys Leu Gln Ala 145 150 155 160 Ser Thr Phe Glu Phe Glu Asn Arg Thr Asp Cys Trp Val Thr Gly Trp 165 170 175 Gly Tyr Ile Lys Glu Asp Glu Ala Leu Pro Ser Pro His Thr Leu Gln 180 185 190 Glu Val Gln Val Ala Ile Ile Asn Asn Ser Met Cys Asn His Leu Phe 195 200 205 Leu Lys Tyr Ser Phe Arg Lys Asp Ile Phe Gly Asp Met Val Cys Ala 210 215 220 Gly Asn Ala Gln Gly Gly Lys Asp Ala Cys Phe Gly Asp Ser Gly Gly 225 230 235 240 Pro Leu Ala Cys Asn Lys Asn Gly Leu Trp Tyr Gln Ile Gly Val Val 245 250 255 Ser Trp Gly Val Gly Cys Gly Arg Pro Asn Arg Pro Gly Val Tyr Thr 260 265 270 Asn Ile Ser His His Phe Glu Trp Ile Gln Lys Leu Met Ala Gln Ser 275 280 285 Gly Met Ser Gln Pro Asp Pro Ser Trp Pro Leu Leu Phe Phe Pro Leu 290 295 300 Leu Trp Ala Leu Pro Leu Leu Gly Pro Val 305 310 <210> 43 <211> 1159 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Testisin transcript variant 2 <400> 43 gctgggagta gagggcagag ctcccacccc gccccgcccc cagggggcgc cccgggcccg 60 gcgcgagagg aggcagaggg ggcgtcaggc cgcgggagag gaggccatgg gcgcgcgcgg 120 ggcgctgctg ctggcgctgc tgctggctcg ggctggactc aggaagccgg agtcgcagga 180 ggcggcgccg ttatcaggac catgcggccg acgggtcatc acgtcgcgca tcgtgggtgg 240 agaggacgcc gaactcgggc gttggccgtg gcaggggagc ctgcgcctgt gggattccca 300 cgtatgcgga gtgagcctgc tcagccaccg ctgggcactc acggcggcgc actgctttga 360 aactgacctt agtgatccct ccgggtggat ggtccagttt ggccagctga cttccatgcc 420 atccttctgg agcctgcagg cctactacac ccgttacttc gtatcgaata tctatctgag 480 ccctcgctac ctggggaatt caccctatga cattgccttg gtgaagctgt ctgcacctgt 540 cacctacact aaacacatcc agcccatctg tctccaggcc tccacatttg agtttgagaa 600 ccggacagac tgctgggtga ctggctgggg gtacatcaaa gaggatgagg cactgccatc 660 tccccacacc ctccaggaag ttcaggtcgc catcataaac aactctatgt gcaaccacct 720 cttcctcaag tacagtttcc gcaaggacat ctttggagac atggtttgtg ctggcaatgc 780 ccaaggcggg aaggatgcct gcttcggtga ctcaggtgga cccttggcct gtaacaagaa 840 tggactgtgg tatcagattg gagtcgtgag ctggggagtg ggctgtggtc ggcccaatcg 900 gcccggtgtc tacaccaata tcagccacca ctttgagtgg atccagaagc tgatggccca 960 gagtggcatg tcccagccag acccctcctg gccgctactc tttttccctc ttctctgggc 1020 tctcccactc ctggggccgg tctgagccta cctgagccca tgcagcctgg ggccactgcc 1080 aagtcaggcc ctggttctct tctgtcttgt ttggtaataa acacattcca gttgatgcct 1140 tgcagggcat tcttcaaaa 1159 <210> 44 <211> 312 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Testisin isoform 2 <400> 44 Met Gly Ala Arg Gly Ala Leu Leu Leu Ala Leu Leu Leu Ala Arg Ala 1 5 10 15 Gly Leu Arg Lys Pro Glu Ser Gln Glu Ala Ala Pro Leu Ser Gly Pro 20 25 30 Cys Gly Arg Arg Val Ile Thr Ser Arg Ile Val Gly Gly Glu Asp Ala 35 40 45 Glu Leu Gly Arg Trp Pro Trp Gln Gly Ser Leu Arg Leu Trp Asp Ser 50 55 60 His Val Cys Gly Val Ser Leu Leu Ser His Arg Trp Ala Leu Thr Ala 65 70 75 80 Ala His Cys Phe Glu Thr Asp Leu Ser Asp Pro Ser Gly Trp Met Val 85 90 95 Gln Phe Gly Gln Leu Thr Ser Met Pro Ser Phe Trp Ser Leu Gln Ala 100 105 110 Tyr Tyr Thr Arg Tyr Phe Val Ser Asn Ile Tyr Leu Ser Pro Arg Tyr 115 120 125 Leu Gly Asn Ser Pro Tyr Asp Ile Ala Leu Val Lys Leu Ser Ala Pro 130 135 140 Val Thr Tyr Thr Lys His Ile Gln Pro Ile Cys Leu Gln Ala Ser Thr 145 150 155 160 Phe Glu Phe Glu Asn Arg Thr Asp Cys Trp Val Thr Gly Trp Gly Tyr 165 170 175 Ile Lys Glu Asp Glu Ala Leu Pro Ser Pro His Thr Leu Gln Glu Val 180 185 190 Gln Val Ala Ile Ile Asn Asn Ser Met Cys Asn His Leu Phe Leu Lys 195 200 205 Tyr Ser Phe Arg Lys Asp Ile Phe Gly Asp Met Val Cys Ala Gly Asn 210 215 220 Ala Gln Gly Gly Lys Asp Ala Cys Phe Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu 225 230 235 240 Ala Cys Asn Lys Asn Gly Leu Trp Tyr Gln Ile Gly Val Val Ser Trp 245 250 255 Gly Val Gly Cys Gly Arg Pro Asn Arg Pro Gly Val Tyr Thr Asn Ile 260 265 270 Ser His His Phe Glu Trp Ile Gln Lys Leu Met Ala Gln Ser Gly Met 275 280 285 Ser Gln Pro Asp Pro Ser Trp Pro Leu Leu Phe Phe Pro Leu Leu Trp 290 295 300 Ala Leu Pro Leu Leu Gly Pro Val 305 310 <210> 45 <211> 1135 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Testisin transcript variant 3 <400> 45 gctgggagta gagggcagag ctcccacccc gccccgcccc cagggggcgc cccgggcccg 60 gcgcgagagg aggcagaggg ggcgtcaggc cgcgggagag gaggccatgg gcgcgcgcgg 120 ggcgctgctg ctggcgctgc tgctggctcg ggctggactc aggaagccgg agtcgcagga 180 ggcggcgccg ttatcaggac catgcggccg acgggtcatc acgtcgcgca tcgtgggtgg 240 agaggacgcc gaactcgggc gttggccgtg gcaggggagc ctgcgcctgt gggattccca 300 cgtatgcgga gtgagcctgc tcagccaccg ctgggcactc acggcggcgc actgctttga 360 aacctatagt gaccttagtg atccctccgg gtggatggtc cagtttggcc agctgacttc 420 catgccatcc ttctggagcc tgcaggccta ctacacccgt tacttcgtat cgaatatcta 480 tctgagccct cgctacctgg ggaattcacc ctatgacatt gccttggtga agctgtctgc 540 acctgtcacc tacactaaac acatccagcc catctgtctc caggcctcca catttgagtt 600 tgagaaccgg acagactgct gggtgactgg ctgggggtac atcaaagagg atgaggcact 660 gccatctccc cacaccctcc aggaagttca ggtcgccatc ataaacaact ctatgtgcaa 720 ccacctcttc ctcaagtaca gtttccgcaa ggacatcttt ggagacatgg gtgactcagg 780 tggacccttg gcctgtaaca agaatggact gtggtatcag attggagtcg tgagctgggg 840 agtgggctgt ggtcggccca atcggcccgg tgtctacacc aatatcagcc accactttga 900 gtggatccag aagctgatgg cccagagtgg catgtcccag ccagacccct cctggccgct 960 actctttttc cctcttctct gggctctccc actcctgggg ccggtctgag cctacctgag 1020 cccatgcagc ctggggccac tgccaagtca ggccctggtt ctcttctgtc ttgtttggta 1080 ataaacacat tccagttgat gccttgcagg gcattcttca aaaaaaaaaa aaaaa 1135 <210> 46 <211> 300 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Testisin isoform 3 <400> 46 Met Gly Ala Arg Gly Ala Leu Leu Leu Ala Leu Leu Leu Ala Arg Ala 1 5 10 15 Gly Leu Arg Lys Pro Glu Ser Gln Glu Ala Ala Pro Leu Ser Gly Pro 20 25 30 Cys Gly Arg Arg Val Ile Thr Ser Arg Ile Val Gly Gly Glu Asp Ala 35 40 45 Glu Leu Gly Arg Trp Pro Trp Gln Gly Ser Leu Arg Leu Trp Asp Ser 50 55 60 His Val Cys Gly Val Ser Leu Leu Ser His Arg Trp Ala Leu Thr Ala 65 70 75 80 Ala His Cys Phe Glu Thr Tyr Ser Asp Leu Ser Asp Pro Ser Gly Trp 85 90 95 Met Val Gln Phe Gly Gln Leu Thr Ser Met Pro Ser Phe Trp Ser Leu 100 105 110 Gln Ala Tyr Tyr Thr Arg Tyr Phe Val Ser Asn Ile Tyr Leu Ser Pro 115 120 125 Arg Tyr Leu Gly Asn Ser Pro Tyr Asp Ile Ala Leu Val Lys Leu Ser 130 135 140 Ala Pro Val Thr Tyr Thr Lys His Ile Gln Pro Ile Cys Leu Gln Ala 145 150 155 160 Ser Thr Phe Glu Phe Glu Asn Arg Thr Asp Cys Trp Val Thr Gly Trp 165 170 175 Gly Tyr Ile Lys Glu Asp Glu Ala Leu Pro Ser Pro His Thr Leu Gln 180 185 190 Glu Val Gln Val Ala Ile Ile Asn Asn Ser Met Cys Asn His Leu Phe 195 200 205 Leu Lys Tyr Ser Phe Arg Lys Asp Ile Phe Gly Asp Met Gly Asp Ser 210 215 220 Gly Gly Pro Leu Ala Cys Asn Lys Asn Gly Leu Trp Tyr Gln Ile Gly 225 230 235 240 Val Val Ser Trp Gly Val Gly Cys Gly Arg Pro Asn Arg Pro Gly Val 245 250 255 Tyr Thr Asn Ile Ser His His Phe Glu Trp Ile Gln Lys Leu Met Ala 260 265 270 Gln Ser Gly Met Ser Gln Pro Asp Pro Ser Trp Pro Leu Leu Phe Phe 275 280 285 Pro Leu Leu Trp Ala Leu Pro Leu Leu Gly Pro Val 290 295 300 <210> 47 <211> 1194 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> trypstase beta 1 <400> 47 ataaatgggg aggggagagc ccactgggta gaaggaacag ggagcggcca ggatgctgaa 60 tctgctgctg ctggcgctgc ccgtcctggc gagccgcgcc tacgcggccc ctgccccagg 120 ccaggccctg cagcgagtgg gcatcgtcgg gggtcaggag gcccccagga gcaagtggcc 180 ctggcaggtg agcctgagag tccacggccc atactggatg cacttctgcg ggggctccct 240 catccacccc cagtgggtgc tgaccgcagc gcactgcgtg ggaccggacg tcaaggatct 300 ggccgccctc agggtgcaac tgcgggagca gcacctctac taccaggacc agctgctgcc 360 ggtcagcagg atcatcgtgc acccacagtt ctacaccgcc cagatcggag cggacatcgc 420 cctgctggag ctggaggagc cggtgaacgt ctccagccac gtccacacgg tcaccctgcc 480 ccctgcctca gagaccttcc ccccggggat gccgtgctgg gtcactggct ggggcgatgt 540 ggacaatgat gagcgcctcc caccgccatt tcctctgaag caggtgaagg tccccataat 600 ggaaaaccac atttgtgacg caaaatacca ccttggcgcc tacacgggag acgacgtccg 660 catcgtccgt gacgacatgc tgtgtgccgg gaacacccgg agggactcat gccagggcga 720 ctccggaggg cccctggtgt gcaaggtgaa tggcacctgg ctgcaggcgg gcgtggtcag 780 ctggggcgag ggctgtgccc agcccaaccg gcctggcatc tacacccgtg tcacctacta 840 cttggactgg atccaccact atgtccccaa aaagccgtga gtcaggcctg ggttggccac 900 ctgggtcact ggaggaccaa cccctgctgt ccaaaacacc actgcttcct acccaggtgg 960 cgactgcccc ccacaccttc cctgccccgt cctgagtgcc ccttcctgtc ctaagccccc 1020 tgctctcttc tgagcccctt cccctgtcct gaggaccctt ccctatcctg agcccccttc 1080 cctgtcctaa gcctgacgcc tgcaccgggc cctccagccc tcccctgccc agatagctgg 1140 tggtgggcgc taatcctcct gagtgctgga cctcattaaa gtgcatggaa atca 1194 <210> 48 <211> 275 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> trypstase beta 1 <400> 48 Met Leu Asn Leu Leu Leu Leu Ala Leu Pro Val Leu Ala Ser Arg Ala 1 5 10 15 Tyr Ala Ala Pro Ala Pro Gly Gln Ala Leu Gln Arg Val Gly Ile Val 20 25 30 Gly Gly Gln Glu Ala Pro Arg Ser Lys Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu 35 40 45 Arg Val His Gly Pro Tyr Trp Met His Phe Cys Gly Gly Ser Leu Ile 50 55 60 His Pro Gln Trp Val Leu Thr Ala Ala His Cys Val Gly Pro Asp Val 65 70 75 80 Lys Asp Leu Ala Ala Leu Arg Val Gln Leu Arg Glu Gln His Leu Tyr 85 90 95 Tyr Gln Asp Gln Leu Leu Pro Val Ser Arg Ile Ile Val His Pro Gln 100 105 110 Phe Tyr Thr Ala Gln Ile Gly Ala Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu 115 120 125 Glu Pro Val Asn Val Ser Ser His Val His Thr Val Thr Leu Pro Pro 130 135 140 Ala Ser Glu Thr Phe Pro Pro Gly Met Pro Cys Trp Val Thr Gly Trp 145 150 155 160 Gly Asp Val Asp Asn Asp Glu Arg Leu Pro Pro Pro Phe Pro Leu Lys 165 170 175 Gln Val Lys Val Pro Ile Met Glu Asn His Ile Cys Asp Ala Lys Tyr 180 185 190 His Leu Gly Ala Tyr Thr Gly Asp Asp Val Arg Ile Val Arg Asp Asp 195 200 205 Met Leu Cys Ala Gly Asn Thr Arg Arg Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser 210 215 220 Gly Gly Pro Leu Val Cys Lys Val Asn Gly Thr Trp Leu Gln Ala Gly 225 230 235 240 Val Val Ser Trp Gly Glu Gly Cys Ala Gln Pro Asn Arg Pro Gly Ile 245 250 255 Tyr Thr Arg Val Thr Tyr Tyr Leu Asp Trp Ile His His Tyr Val Pro 260 265 270 Lys Lys Pro 275 <210> 49 <211> 1528 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein hk5 <400> 49 ggaaggcaca ggcctgagaa gtctgcggct gagctgggag caaatccccc accccctacc 60 tgggggacag ggcaagtgag acctggtgag ggtggctcag caggaaggga aggagaggtg 120 tctgtgcgtc ctgcacccac atctttctct gtcccctcct tgccctgtct ggaggctgct 180 agactcctat cttctgaatt ctatagtgcc tgggtctcag cgcagtgccg atggtggccc 240 gtccttgtgg ttcctctcta cctggggaaa taaggtgcag cggccatggc tacagcaaga 300 cccccctgga tgtgggtgct ctgtgctctg atcacagcct tgcttctggg ggtcacagag 360 catgttctcg ccaacaatga tgtttcctgt gaccacccct ctaacaccgt gccctctggg 420 agcaaccagg acctgggagc tggggccggg gaagacgccc ggtcggatga cagcagcagc 480 cgcatcatca atggatccga ctgcgatatg cacacccagc cgtggcaggc cgcgctgttg 540 ctaaggccca accagctcta ctgcggggcg gtgttggtgc atccacagtg gctgctcacg 600 gccgcccact gcaggaagaa agttttcaga gtccgtctcg gccactactc cctgtcacca 660 gtttatgaat ctgggcagca gatgttccag ggggtcaaat ccatccccca ccctggctac 720 tcccaccctg gccactctaa cgacctcatg ctcatcaaac tgaacagaag aattcgtccc 780 actaaagatg tcagacccat caacgtctcc tctcattgtc cctctgctgg gacaaagtgc 840 ttggtgtctg gctgggggac aaccaagagc ccccaagtgc acttccctaa ggtcctccag 900 tgcttgaata tcagcgtgct aagtcagaaa aggtgcgagg atgcttaccc gagacagata 960 gatgacacca tgttctgcgc cggtgacaaa gcaggtagag actcctgcca gggtgattct 1020 ggggggcctg tggtctgcaa tggctccctg cagggactcg tgtcctgggg agattaccct 1080 tgtgcccggc ccaacagacc gggtgtctac acgaacctct gcaagttcac caagtggatc 1140 caggaaacca tccaggccaa ctcctgagtc atcccaggac tcagcacacc ggcatcccca 1200 cctgctgcag ggacagccct gacactcctt tcagaccctc attccttccc agagatgttg 1260 agaatgttca tctctccagc ccctgacccc atgtctcctg gactcagggt ctgcttcccc 1320 cacattgggc tgaccgtgtc tctctagttg aaccctggga acaatttcca aaactgtcca 1380 gggcgggggt tgcgtctcaa tctccctggg gcactttcat cctcaagctc agggcccatc 1440 ccttctctgc agctctgacc caaatttagt cccagaaata aactgagaag tggaaaaaaa 1500 aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaa 1528 <210> 50 <211> 293 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein hk5 <400> 50 Met Ala Thr Ala Arg Pro Pro Trp Met Trp Val Leu Cys Ala Leu Ile 1 5 10 15 Thr Ala Leu Leu Leu Gly Val Thr Glu His Val Leu Ala Asn Asn Asp 20 25 30 Val Ser Cys Asp His Pro Ser Asn Thr Val Pro Ser Gly Ser Asn Gln 35 40 45 Asp Leu Gly Ala Gly Ala Gly Glu Asp Ala Arg Ser Asp Asp Ser Ser 50 55 60 Ser Arg Ile Ile Asn Gly Ser Asp Cys Asp Met His Thr Gln Pro Trp 65 70 75 80 Gln Ala Ala Leu Leu Leu Arg Pro Asn Gln Leu Tyr Cys Gly Ala Val 85 90 95 Leu Val His Pro Gln Trp Leu Leu Thr Ala Ala His Cys Arg Lys Lys 100 105 110 Val Phe Arg Val Arg Leu Gly His Tyr Ser Leu Ser Pro Val Tyr Glu 115 120 125 Ser Gly Gln Gln Met Phe Gln Gly Val Lys Ser Ile Pro His Pro Gly 130 135 140 Tyr Ser His Pro Gly His Ser Asn Asp Leu Met Leu Ile Lys Leu Asn 145 150 155 160 Arg Arg Ile Arg Pro Thr Lys Asp Val Arg Pro Ile Asn Val Ser Ser 165 170 175 His Cys Pro Ser Ala Gly Thr Lys Cys Leu Val Ser Gly Trp Gly Thr 180 185 190 Thr Lys Ser Pro Gln Val His Phe Pro Lys Val Leu Gln Cys Leu Asn 195 200 205 Ile Ser Val Leu Ser Gln Lys Arg Cys Glu Asp Ala Tyr Pro Arg Gln 210 215 220 Ile Asp Asp Thr Met Phe Cys Ala Gly Asp Lys Ala Gly Arg Asp Ser 225 230 235 240 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Val Val Cys Asn Gly Ser Leu Gln 245 250 255 Gly Leu Val Ser Trp Gly Asp Tyr Pro Cys Ala Arg Pro Asn Arg Pro 260 265 270 Gly Val Tyr Thr Asn Leu Cys Lys Phe Thr Lys Trp Ile Gln Glu Thr 275 280 285 Ile Gln Ala Asn Ser 290 <210> 51 <211> 4942 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Corin <400> 51 aaatcatccg tagtgcctcc ccgggggaca cgtagaggag agaaaagcga ccaagataaa 60 agtggacaga agaataagcg agacttttta tccatgaaac agtctcctgc cctcgctccg 120 gaagagcgct gccgcagagc cgggtcccca aagccggtct tgagagctga tgacaataac 180 atgggcaatg gctgctctca gaagctggcg actgctaacc tcctccggtt cctattgctg 240 gtcctgattc catgtatctg tgctctcgtt ctcttgctgg tgatcctgct ttcctatgtt 300 ggaacattac aaaaggtcta ttttaaatca aatgggagtg aacctttggt cactgatggt 360 gaaatccaag ggtccgatgt tattcttaca aatacaattt ataaccagag cactgtggtg 420 tctactgcac atcccgacca acacgttcca gcctggacta cggatgcttc tctcccaggg 480 gaccaaagtc acaggaatac aagtgcctgt atgaacatca cccacagcca gtgtcagatg 540 ctgccctacc acgccacgct gacacctctc ctctcagttg tcagaaacat ggaaatggaa 600 aagttcctca agtttttcac atatctccat cgcctcagtt gctatcaaca tatcatgctg 660 tttggctgta ccctcgcctt ccctgagtgc atcattgatg gcgatgacag tcatggactc 720 ctgccctgta ggtccttctg tgaggctgca aaagaaggct gtgaatcagt cctggggatg 780 gtgaattact cctggccgga tttcctcaga tgctcccagt ttagaaacca aactgaaagc 840 agcaatgtca gcagaatttg cttctcacct cagcaggaaa acggaaagca attgctctgt 900 ggaaggggtg agaactttct gtgtgccagt ggaatctgca tccccgggaa actgcaatgt 960 aatggctaca acgactgtga cgactggagt gacgaggctc attgcaactg cagcgagaat 1020 ctgtttcact gtcacacagg caagtgcctt aattacagcc ttgtgtgtga tggatatgat 1080 gactgtgggg atttgagtga tgagcaaaac tgtgattgca atcccacaac agagcatcgc 1140 tgcggggacg ggcgctgcat cgccatggag tgggtgtgtg atggtgacca cgactgtgtg 1200 gataagtctg acgaggtcaa ctgctcctgt cacagccagg gtctggtgga atgcagaaat 1260 ggacaatgta tccccagcac gtttcaatgt gatggtgacg aggactgcaa ggatgggagt 1320 gatgaggaga actgcagcgt cattcagact tcatgtcaag aaggagacca aagatgcctc 1380 tacaatccct gccttgattc atgtggtggt agctctctct gtgacccgaa caacagtctg 1440 aataactgta gtcaatgtga accaattaca ttggaactct gcatgaattt gccctacaac 1500 agtacaagtt atccaaatta ttttggccac aggactcaaa aggaagcatc catcagctgg 1560 gagtcttctc ttttccctgc acttgttcaa accaactgtt ataaatacct catgttcttt 1620 tcttgcacca ttttggtacc aaaatgtgat gtgaatacag gcgagcatat ccctccttgc 1680 agggcattgt gtgaacactc taaagaacgc tgtgagtctg ttcttgggat tgtgggccta 1740 cagtggcctg aagacacaga ttgcagtcaa tttccagagg aaaattcaga caatcaaacc 1800 tgcctgatgc ctgatgaata tgtggaagaa tgctcaccta gtcatttcaa gtgccgctca 1860 ggacagtgtg ttctggcttc cagaagatgt gatggccagg ccgactgtga cgatgacagt 1920 gatgaggaaa actgtggttg taaagagaga gatctttggg aatgtccatc caataaacaa 1980 tgtttgaagc acacagtgat ctgcgatggg ttcccagact gccctgatta catggacgag 2040 aaaaactgct cattttgcca agatgatgag ctggaatgtg caaaccatgc gtgtgtgtca 2100 cgtgacctgt ggtgtgatgg tgaagccgac tgctcagaca gttcagatga atgggactgt 2160 gtgaccctct ctataaatgt gaactcctct tcctttctga tggttcacag agctgccaca 2220 gaacaccatg tgtgtgcaga tggctggcag gagatattga gtcagctggc ctgcaagcag 2280 atgggtttag gagaaccatc tgtgaccaaa ttgatacagg aacaggagaa agagccgcgg 2340 tggctgacat tacactccaa ctgggagagc ctcaatggga ccactttaca tgaacttcta 2400 gtaaatgggc agtcttgtga gagcagaagt aaaatttctc ttctgtgtac taaacaagac 2460 tgtgggcgcc gccctgctgc ccgaatgaac aaaaggatcc ttggaggtcg gacgagtcgc 2520 cctggaaggt ggccatggca gtgttctctg cagagtgaac ccagtggaca tatctgtggc 2580 tgtgtcctca ttgccaagaa gtgggttctg acagttgccc actgcttcga ggggagagag 2640 aatgctgcag tttggaaagt ggtgcttggc atcaacaatc tagaccatcc atcagtgttc 2700 atgcagacac gctttgtgaa gaccatcatc ctgcatcccc gctacagtcg agcagtggtg 2760 gactatgaca tcagcatcgt tgagctgagt gaagacatca gtgagactgg ctacgtccgg 2820 cctgtctgct tgcccaaccc ggagcagtgg ctagagcctg acacgtactg ctatatcaca 2880 ggctggggcc acatgggcaa taaaatgcca tttaagctgc aagagggaga ggtccgcatt 2940 atttctctgg aacattgtca gtcctacttt gacatgaaga ccatcaccac tcggatgata 3000 tgtgctggct atgagtctgg cacagttgat tcatgcatgg gtgacagcgg tgggcctctt 3060 gtttgtgaga agcctggagg acggtggaca ttatttggat taacttcatg gggctccgtc 3120 tgcttttcca aagtcctggg gcctggcgtt tatagtaatg tgtcatattt cgtcgaatgg 3180 attaaaagac agatttacat ccagaccttt ctcctaaact aattataagg atgatcagag 3240 acttttgcca gctacactaa aagaaaatgg ccttcttgac tgtgaagagc tgcctgcaga 3300 gagctgtaca gaagcacttt tcatggacag aaatgctcaa tcgtgcactg caaatttgca 3360 tgtttgtttt ggactaattt ttttcaattt attttttcac cttcattttt ctcttatttc 3420 aagttcaatg aaagacttta caaaagcaaa caaagcagac tttgtccttt tgccaggcct 3480 aaccatgact gcagcacaaa attatcgact ctggcgagat ttaaaatcag gtgctacagt 3540 aacaggttat ggaatggtct cttttatcct atcacaaaaa aagacataga tatttaggct 3600 gattaattat ctctaccagt ttttgtttct caagctcagt gcatagtggt aaatttcagt 3660 gttaacattg gagacttgct tttctttttc tttttttata ccccacaatt cttttttatt 3720 acacttcgaa ttttagggta cacgagcaca acgtgcaggt tagttacata tgtatacatg 3780 tgccatgttg gtgtgctgaa cccagtaact cgtcatttga tttattaaaa gccaagataa 3840 tttacatgtt taaagtattt actattaccc ccttctaatg tttgcataat tctgagaact 3900 gataaaagac agcaataaaa gaccagtgtc atccatttag gtagcaagac atattgaatg 3960 caaagttctt tagatatcaa tattaacact tgacattatt ggacccccca ttctggatgt 4020 atatcaagat cataatttta tagaagagtc tctatagaac tgtcctcata gctgggtttg 4080 ttcaggatat atgagttggc tgattgagac tgcaacaact acatctatat ttatgggcaa 4140 tattttgttt tacttatgtg gcaaagaact ggatattaaa ctttgcaaaa gagaatttag 4200 atgagagatg caatttttta aaaagaaaat taatttgcat ccctcgttta attaaattta 4260 tttttcagtt ttcttgcgtt catccatacc aacaaagtca taaagagcat attttagagc 4320 acagtaagac tttgcatgga gtaaaacatt ttgtaatttt cctcaaaaga tgtttaatat 4380 ctggtttctt ctcattggta attaaaattt tagaaatgat ttttagctct aggccacttt 4440 acgcaactca atttctgaag caattagtgg taaaaagtat ttttccccac taaaaaactt 4500 taaaacacaa atcttcatat atacttaatt taattagtca ggcatccatt ttgcctttta 4560 aacaactagg attccctact aacctccacc agcaacctgg actgcctcag cattccaaat 4620 agatactacc tgcaatttta tacatgtatt tttgtatctt ttctgtgtgt aaacatagtt 4680 gaaattcaaa aagttgtagc aatttctata ctattcatct cctgtccttc agtttgtata 4740 aacctaagga gagtgtgaaa tccagcaact gaattgtggt cacgattgta tgaaagttca 4800 agaacatatg tcagttttgt tacagttgta gctacatact caatgtatca acttttagcc 4860 tgctcaactt aggctcagtg aaatatatat attatactta ttttaaataa ttcttaatac 4920 aaataaaatg gtaatggtct aa 4942 <210> 52 <211> 1042 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Corin <400> 52 Met Lys Gln Ser Pro Ala Leu Ala Pro Glu Glu Arg Cys Arg Arg Ala 1 5 10 15 Gly Ser Pro Lys Pro Val Leu Arg Ala Asp Asp Asn Asn Met Gly Asn 20 25 30 Gly Cys Ser Gln Lys Leu Ala Thr Ala Asn Leu Leu Arg Phe Leu Leu 35 40 45 Leu Val Leu Ile Pro Cys Ile Cys Ala Leu Val Leu Leu Leu Val Ile 50 55 60 Leu Leu Ser Tyr Val Gly Thr Leu Gln Lys Val Tyr Phe Lys Ser Asn 65 70 75 80 Gly Ser Glu Pro Leu Val Thr Asp Gly Glu Ile Gln Gly Ser Asp Val 85 90 95 Ile Leu Thr Asn Thr Ile Tyr Asn Gln Ser Thr Val Val Ser Thr Ala 100 105 110 His Pro Asp Gln His Val Pro Ala Trp Thr Thr Asp Ala Ser Leu Pro 115 120 125 Gly Asp Gln Ser His Arg Asn Thr Ser Ala Cys Met Asn Ile Thr His 130 135 140 Ser Gln Cys Gln Met Leu Pro Tyr His Ala Thr Leu Thr Pro Leu Leu 145 150 155 160 Ser Val Val Arg Asn Met Glu Met Glu Lys Phe Leu Lys Phe Phe Thr 165 170 175 Tyr Leu His Arg Leu Ser Cys Tyr Gln His Ile Met Leu Phe Gly Cys 180 185 190 Thr Leu Ala Phe Pro Glu Cys Ile Ile Asp Gly Asp Asp Ser His Gly 195 200 205 Leu Leu Pro Cys Arg Ser Phe Cys Glu Ala Ala Lys Glu Gly Cys Glu 210 215 220 Ser Val Leu Gly Met Val Asn Tyr Ser Trp Pro Asp Phe Leu Arg Cys 225 230 235 240 Ser Gln Phe Arg Asn Gln Thr Glu Ser Ser Asn Val Ser Arg Ile Cys 245 250 255 Phe Ser Pro Gln Gln Glu Asn Gly Lys Gln Leu Leu Cys Gly Arg Gly 260 265 270 Glu Asn Phe Leu Cys Ala Ser Gly Ile Cys Ile Pro Gly Lys Leu Gln 275 280 285 Cys Asn Gly Tyr Asn Asp Cys Asp Asp Trp Ser Asp Glu Ala His Cys 290 295 300 Asn Cys Ser Glu Asn Leu Phe His Cys His Thr Gly Lys Cys Leu Asn 305 310 315 320 Tyr Ser Leu Val Cys Asp Gly Tyr Asp Asp Cys Gly Asp Leu Ser Asp 325 330 335 Glu Gln Asn Cys Asp Cys Asn Pro Thr Thr Glu His Arg Cys Gly Asp 340 345 350 Gly Arg Cys Ile Ala Met Glu Trp Val Cys Asp Gly Asp His Asp Cys 355 360 365 Val Asp Lys Ser Asp Glu Val Asn Cys Ser Cys His Ser Gln Gly Leu 370 375 380 Val Glu Cys Arg Asn Gly Gln Cys Ile Pro Ser Thr Phe Gln Cys Asp 385 390 395 400 Gly Asp Glu Asp Cys Lys Asp Gly Ser Asp Glu Glu Asn Cys Ser Val 405 410 415 Ile Gln Thr Ser Cys Gln Glu Gly Asp Gln Arg Cys Leu Tyr Asn Pro 420 425 430 Cys Leu Asp Ser Cys Gly Gly Ser Ser Leu Cys Asp Pro Asn Asn Ser 435 440 445 Leu Asn Asn Cys Ser Gln Cys Glu Pro Ile Thr Leu Glu Leu Cys Met 450 455 460 Asn Leu Pro Tyr Asn Ser Thr Ser Tyr Pro Asn Tyr Phe Gly His Arg 465 470 475 480 Thr Gln Lys Glu Ala Ser Ile Ser Trp Glu Ser Ser Leu Phe Pro Ala 485 490 495 Leu Val Gln Thr Asn Cys Tyr Lys Tyr Leu Met Phe Phe Ser Cys Thr 500 505 510 Ile Leu Val Pro Lys Cys Asp Val Asn Thr Gly Glu His Ile Pro Pro 515 520 525 Cys Arg Ala Leu Cys Glu His Ser Lys Glu Arg Cys Glu Ser Val Leu 530 535 540 Gly Ile Val Gly Leu Gln Trp Pro Glu Asp Thr Asp Cys Ser Gln Phe 545 550 555 560 Pro Glu Glu Asn Ser Asp Asn Gln Thr Cys Leu Met Pro Asp Glu Tyr 565 570 575 Val Glu Glu Cys Ser Pro Ser His Phe Lys Cys Arg Ser Gly Gln Cys 580 585 590 Val Leu Ala Ser Arg Arg Cys Asp Gly Gln Ala Asp Cys Asp Asp Asp 595 600 605 Ser Asp Glu Glu Asn Cys Gly Cys Lys Glu Arg Asp Leu Trp Glu Cys 610 615 620 Pro Ser Asn Lys Gln Cys Leu Lys His Thr Val Ile Cys Asp Gly Phe 625 630 635 640 Pro Asp Cys Pro Asp Tyr Met Asp Glu Lys Asn Cys Ser Phe Cys Gln 645 650 655 Asp Asp Glu Leu Glu Cys Ala Asn His Ala Cys Val Ser Arg Asp Leu 660 665 670 Trp Cys Asp Gly Glu Ala Asp Cys Ser Asp Ser Ser Asp Glu Trp Asp 675 680 685 Cys Val Thr Leu Ser Ile Asn Val Asn Ser Ser Ser Phe Leu Met Val 690 695 700 His Arg Ala Ala Thr Glu His His Val Cys Ala Asp Gly Trp Gln Glu 705 710 715 720 Ile Leu Ser Gln Leu Ala Cys Lys Gln Met Gly Leu Gly Glu Pro Ser 725 730 735 Val Thr Lys Leu Ile Gln Glu Gln Glu Lys Glu Pro Arg Trp Leu Thr 740 745 750 Leu His Ser Asn Trp Glu Ser Leu Asn Gly Thr Thr Leu His Glu Leu 755 760 765 Leu Val Asn Gly Gln Ser Cys Glu Ser Arg Ser Lys Ile Ser Leu Leu 770 775 780 Cys Thr Lys Gln Asp Cys Gly Arg Arg Pro Ala Ala Arg Met Asn Lys 785 790 795 800 Arg Ile Leu Gly Gly Arg Thr Ser Arg Pro Gly Arg Trp Pro Trp Gln 805 810 815 Cys Ser Leu Gln Ser Glu Pro Ser Gly His Ile Cys Gly Cys Val Leu 820 825 830 Ile Ala Lys Lys Trp Val Leu Thr Val Ala His Cys Phe Glu Gly Arg 835 840 845 Glu Asn Ala Ala Val Trp Lys Val Val Leu Gly Ile Asn Asn Leu Asp 850 855 860 His Pro Ser Val Phe Met Gln Thr Arg Phe Val Lys Thr Ile Ile Leu 865 870 875 880 His Pro Arg Tyr Ser Arg Ala Val Val Asp Tyr Asp Ile Ser Ile Val 885 890 895 Glu Leu Ser Glu Asp Ile Ser Glu Thr Gly Tyr Val Arg Pro Val Cys 900 905 910 Leu Pro Asn Pro Glu Gln Trp Leu Glu Pro Asp Thr Tyr Cys Tyr Ile 915 920 925 Thr Gly Trp Gly His Met Gly Asn Lys Met Pro Phe Lys Leu Gln Glu 930 935 940 Gly Glu Val Arg Ile Ile Ser Leu Glu His Cys Gln Ser Tyr Phe Asp 945 950 955 960 Met Lys Thr Ile Thr Thr Arg Met Ile Cys Ala Gly Tyr Glu Ser Gly 965 970 975 Thr Val Asp Ser Cys Met Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Glu 980 985 990 Lys Pro Gly Gly Arg Trp Thr Leu Phe Gly Leu Thr Ser Trp Gly Ser 995 1000 1005 Val Cys Phe Ser Lys Val Leu Gly Pro Gly Val Tyr Ser Asn Val Ser 1010 1015 1020 Tyr Phe Val Glu Trp Ile Lys Arg Gln Ile Tyr Ile Gln Thr Phe Leu 1025 1030 1035 1040 Leu Asn <210> 53 <211> 945 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein 12 transcript variant 1 <400> 53 gcaggtaggt ggacggagag atagcagcga cgaggacagg ccaaacagtg acagccacgt 60 agaggatctg gcagacaaag agacaaggtg agaaggagac tttggaagtg acccaccatg 120 gggctcagca tctttttgct cctgtgtgtt cttgggctca gccaggcagc cacaccgaag 180 attttcaatg gcactgagtg tgggcgtaac tcacagccgt ggcaggtggg gctgtttgag 240 ggcaccagcc tgcgctgcgg gggtgtcctt attgaccaca ggtgggtcct cacagcggct 300 cactgcagcg gcagcaggta ctgggtgcgc ctgggggaac acagcctcag ccagctcgac 360 tggaccgagc agatccggca cagcggcttc tctgtgaccc atcccggcta cctgggagcc 420 tcgacgagcc acgagcacga cctccggctg ctgcggctgc gcctgcccgt ccgcgtaacc 480 agcagcgttc aacccctgcc cctgcccaat gactgtgcaa ccgctggcac cgagtgccac 540 gtctcaggct ggggcatcac caaccaccca cggaacccat tcccggatct gctccagtgc 600 ctcaacctct ccatcgtctc ccatgccacc tgccatggtg tgtatcccgg gagaatcacg 660 agcaacatgg tgtgtgcagg cggcgtcccg gggcaggatg cctgccaggg tgattctggg 720 ggccccctgg tgtgtggggg agtccttcaa ggtctggtgt cctgggggtc tgtggggccc 780 tgtggacaag atggcatccc tggagtctac acctatattt gcaactccac tcttgttggc 840 ctgggaactt cttggaactt taactcctgc cagcccttct aagacccacg agcggggtga 900 gagaagtgtg caatagtctg gaataaatat aaatgaagga ggggc 945 <210> 54 <211> 254 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein 12 isoform 1 <400> 54 Met Gly Leu Ser Ile Phe Leu Leu Leu Cys Val Leu Gly Leu Ser Gln 1 5 10 15 Ala Ala Thr Pro Lys Ile Phe Asn Gly Thr Glu Cys Gly Arg Asn Ser 20 25 30 Gln Pro Trp Gln Val Gly Leu Phe Glu Gly Thr Ser Leu Arg Cys Gly 35 40 45 Gly Val Leu Ile Asp His Arg Trp Val Leu Thr Ala Ala His Cys Ser 50 55 60 Gly Ser Arg Tyr Trp Val Arg Leu Gly Glu His Ser Leu Ser Gln Leu 65 70 75 80 Asp Trp Thr Glu Gln Ile Arg His Ser Gly Phe Ser Val Thr His Pro 85 90 95 Gly Tyr Leu Gly Ala Ser Thr Ser His Glu His Asp Leu Arg Leu Leu 100 105 110 Arg Leu Arg Leu Pro Val Arg Val Thr Ser Ser Val Gln Pro Leu Pro 115 120 125 Leu Pro Asn Asp Cys Ala Thr Ala Gly Thr Glu Cys His Val Ser Gly 130 135 140 Trp Gly Ile Thr Asn His Pro Arg Asn Pro Phe Pro Asp Leu Leu Gln 145 150 155 160 Cys Leu Asn Leu Ser Ile Val Ser His Ala Thr Cys His Gly Val Tyr 165 170 175 Pro Gly Arg Ile Thr Ser Asn Met Val Cys Ala Gly Gly Val Pro Gly 180 185 190 Gln Asp Ala Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Gly Gly 195 200 205 Val Leu Gln Gly Leu Val Ser Trp Gly Ser Val Gly Pro Cys Gly Gln 210 215 220 Asp Gly Ile Pro Gly Val Tyr Thr Tyr Ile Cys Asn Ser Thr Leu Val 225 230 235 240 Gly Leu Gly Thr Ser Trp Asn Phe Asn Ser Cys Gln Pro Phe 245 250 <210> 55 <211> 1074 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein 12 transcript variant 2 <400> 55 gcaggtaggt ggacggagag atagcagcga cgaggacagg ccaaacagtg acagccacgt 60 agaggatctg gcagacaaag agacaaggtg agaaggagac tttggaagtg acccaccatg 120 gggctcagca tctttttgct cctgtgtgtt cttgggctca gccaggcagc cacaccgaag 180 attttcaatg gcactgagtg tgggcgtaac tcacagccgt ggcaggtggg gctgtttgag 240 ggcaccagcc tgcgctgcgg gggtgtcctt attgaccaca ggtgggtcct cacagcggct 300 cactgcagcg gcagcaggta ctgggtgcgc ctgggggaac acagcctcag ccagctcgac 360 tggaccgagc agatccggca cagcggcttc tctgtgaccc atcccggcta cctgggagcc 420 tcgacgagcc acgagcacga cctccggctg ctgcggctgc gcctgcccgt ccgcgtaacc 480 agcagcgttc aacccctgcc cctgcccaat gactgtgcaa ccgctggcac cgagtgccac 540 gtctcaggct ggggcatcac caaccaccca cggaacccat tcccggatct gctccagtgc 600 ctcaacctct ccatcgtctc ccatgccacc tgccatggtg tgtatcccgg gagaatcacg 660 agcaacatgg tgtgtgcagg cggcgtcccg gggcaggatg cctgccaggg tgattctggg 720 ggccccctgg tgtgtggggg agtccttcaa ggtctggtgt cctgggggtc tgtggggccc 780 tgtggacaag atggcatccc tggagtctac acctatattt gcaagtatgt ggactggatc 840 cggatgatca tgaggaacaa ctgacctgtt tcctccacct ccacccccac cccttaactt 900 gggtacccct ctggccctca gagcaccaat atctcctcca tcacttcccc tagctccact 960 cttgttggcc tgggaacttc ttggaacttt aactcctgcc agcccttcta agacccacga 1020 gcggggtgag agaagtgtgc aatagtctgg aataaatata aatgaaggag gggc 1074 <210> 56 <211> 248 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein 12 isoform 2 <400> 56 Met Gly Leu Ser Ile Phe Leu Leu Leu Cys Val Leu Gly Leu Ser Gln 1 5 10 15 Ala Ala Thr Pro Lys Ile Phe Asn Gly Thr Glu Cys Gly Arg Asn Ser 20 25 30 Gln Pro Trp Gln Val Gly Leu Phe Glu Gly Thr Ser Leu Arg Cys Gly 35 40 45 Gly Val Leu Ile Asp His Arg Trp Val Leu Thr Ala Ala His Cys Ser 50 55 60 Gly Ser Arg Tyr Trp Val Arg Leu Gly Glu His Ser Leu Ser Gln Leu 65 70 75 80 Asp Trp Thr Glu Gln Ile Arg His Ser Gly Phe Ser Val Thr His Pro 85 90 95 Gly Tyr Leu Gly Ala Ser Thr Ser His Glu His Asp Leu Arg Leu Leu 100 105 110 Arg Leu Arg Leu Pro Val Arg Val Thr Ser Ser Val Gln Pro Leu Pro 115 120 125 Leu Pro Asn Asp Cys Ala Thr Ala Gly Thr Glu Cys His Val Ser Gly 130 135 140 Trp Gly Ile Thr Asn His Pro Arg Asn Pro Phe Pro Asp Leu Leu Gln 145 150 155 160 Cys Leu Asn Leu Ser Ile Val Ser His Ala Thr Cys His Gly Val Tyr 165 170 175 Pro Gly Arg Ile Thr Ser Asn Met Val Cys Ala Gly Gly Val Pro Gly 180 185 190 Gln Asp Ala Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Gly Gly 195 200 205 Val Leu Gln Gly Leu Val Ser Trp Gly Ser Val Gly Pro Cys Gly Gln 210 215 220 Asp Gly Ile Pro Gly Val Tyr Thr Tyr Ile Cys Lys Tyr Val Asp Trp 225 230 235 240 Ile Arg Met Ile Met Arg Asn Asn 245 <210> 57 <211> 814 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein 12 transcript variant 3 <400> 57 gcaggtaggt ggacggagag atagcagcga cgaggacagg ccaaacagtg acagccacgt 60 agaggatctg gcagacaaag agacaaggtg agaaggagac tttggaagtg acccaccatg 120 gggctcagca tctttttgct cctgtgtgtt cttgggctca gccaggcagc cacaccgaag 180 attttcaatg gcactgagtg tgggcgtaac tcacagccgt ggcaggtggg gctgtttgag 240 ggcaccagcc tgcgctgcgg gggtgtcctt attgaccaca ggtgggtcct cacagcggct 300 cactgcagcg gcagacccat tcccggatct gctccagtgc ctcaacctct ccatcgtctc 360 ccatgccacc tgccatggtg tgtatcccgg gagaatcacg agcaacatgg tgtgtgcagg 420 cggcgtcccg gggcaggatg cctgccaggg tgattctggg ggccccctgg tgtgtggggg 480 agtccttcaa ggtctggtgt cctgggggtc tgtggggccc tgtggacaag atggcatccc 540 tggagtctac acctatattt gcaagtatgt ggactggatc cggatgatca tgaggaacaa 600 ctgacctgtt tcctccacct ccacccccac cccttaactt gggtacccct ctggccctca 660 gagcaccaat atctcctcca tcacttcccc tagctccact cttgttggcc tgggaacttc 720 ttggaacttt aactcctgcc agcccttcta agacccacga gcggggtgag agaagtgtgc 780 aatagtctgg aataaatata aatgaaggag gggc 814 <210> 58 <211> 111 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein 12 isoform 3 <400> 58 Met Gly Leu Ser Ile Phe Leu Leu Leu Cys Val Leu Gly Leu Ser Gln 1 5 10 15 Ala Ala Thr Pro Lys Ile Phe Asn Gly Thr Glu Cys Gly Arg Asn Ser 20 25 30 Gln Pro Trp Gln Val Gly Leu Phe Glu Gly Thr Ser Leu Arg Cys Gly 35 40 45 Gly Val Leu Ile Asp His Arg Trp Val Leu Thr Ala Ala His Cys Ser 50 55 60 Gly Arg Pro Ile Pro Gly Ser Ala Pro Val Pro Gln Pro Leu His Arg 65 70 75 80 Leu Pro Cys His Leu Pro Trp Cys Val Ser Arg Glu Asn His Glu Gln 85 90 95 His Gly Val Cys Arg Arg Arg Pro Gly Ala Gly Cys Leu Pro Gly 100 105 110 <210> 59 <211> 1471 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> DESC1 oritease <400> 59 tgacttggat gtagacctcg accttcacag gactcttcat tgctggttgg caatgatgta 60 tcggccagat gtggtgaggg ctaggaaaag agtttgttgg gaaccctggg ttatcggcct 120 cgtcatcttc atatccctga ttgtcctggc agtgtgcatt ggactcactg ttcattatgt 180 gagatataat caaaagaaga cctacaatta ctatagcaca ttgtcattta caactgacaa 240 actatatgct gagtttggca gagaggcttc taacaatttt acagaaatga gccagagact 300 tgaatcaatg gtgaaaaatg cattttataa atctccatta agggaagaat ttgtcaagtc 360 tcaggttatc aagttcagtc aacagaagca tggagtgttg gctcatatgc tgttgatttg 420 tagatttcac tctactgagg atcctgaaac tgtagataaa attgttcaac ttgttttaca 480 tgaaaagctg caagatgctg taggaccccc taaagtagat cctcactcag ttaaaattaa 540 aaaaatcaac aagacagaaa cagacagcta tctaaaccat tgctgcggaa cacgaagaag 600 taaaactcta ggtcagagtc tcaggatcgt tggtgggaca gaagtagaag agggtgaatg 660 gccctggcag gctagcctgc agtgggatgg gagtcatcgc tgtggagcaa ccttaattaa 720 tgccacatgg cttgtgagtg ctgctcactg ttttacaaca tataagaacc ctgccagatg 780 gactgcttcc tttggagtaa caataaaacc ttcgaaaatg aaacggggtc tccggagaat 840 aattgtccat gaaaaataca aacacccatc acatgactat gatatttctc ttgcagagct 900 ttctagccct gttccctaca caaatgcagt acatagagtt tgtctccctg atgcatccta 960 tgagtttcaa ccaggtgatg tgatgtttgt gacaggattt ggagcactga aaaatgatgg 1020 ttacagtcaa aatcatcttc gacaagcaca ggtgactctc atagacgcta caacttgcaa 1080 tgaacctcaa gcttacaatg acgccataac tcctagaatg ttatgtgctg gctccttaga 1140 aggaaaaaca gatgcatgcc agggtgactc tggaggacca ctggttagtt cagatgctag 1200 agatatctgg taccttgctg gaatagtgag ctggggagat gaatgtgcga aacccaacaa 1260 gcctggtgtt tatactagag ttacggcctt gcgggactgg attacttcaa aaactggtat 1320 ctaagagaga aaagcctcat ggaacagata acattttttt ttgttttttg ggtgtggagg 1380 ccatttttag agatacagaa ttggagaaga cttgcaaaac agctagattt gactgatctc 1440 aataaactgt ttgcttgatg caaaaaaaaa a 1471 <210> 60 <211> 422 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> DESC1 oritease <400> 60 Met Tyr Arg Pro Asp Val Val Arg Ala Arg Lys Arg Val Cys Trp Glu 1 5 10 15 Pro Trp Val Ile Gly Leu Val Ile Phe Ile Ser Leu Ile Val Leu Ala 20 25 30 Val Cys Ile Gly Leu Thr Val His Tyr Val Arg Tyr Asn Gln Lys Lys 35 40 45 Thr Tyr Asn Tyr Tyr Ser Thr Leu Ser Phe Thr Thr Asp Lys Leu Tyr 50 55 60 Ala Glu Phe Gly Arg Glu Ala Ser Asn Asn Phe Thr Glu Met Ser Gln 65 70 75 80 Arg Leu Glu Ser Met Val Lys Asn Ala Phe Tyr Lys Ser Pro Leu Arg 85 90 95 Glu Glu Phe Val Lys Ser Gln Val Ile Lys Phe Ser Gln Gln Lys His 100 105 110 Gly Val Leu Ala His Met Leu Leu Ile Cys Arg Phe His Ser Thr Glu 115 120 125 Asp Pro Glu Thr Val Asp Lys Ile Val Gln Leu Val Leu His Glu Lys 130 135 140 Leu Gln Asp Ala Val Gly Pro Pro Lys Val Asp Pro His Ser Val Lys 145 150 155 160 Ile Lys Lys Ile Asn Lys Thr Glu Thr Asp Ser Tyr Leu Asn His Cys 165 170 175 Cys Gly Thr Arg Arg Ser Lys Thr Leu Gly Gln Ser Leu Arg Ile Val 180 185 190 Gly Gly Thr Glu Val Glu Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Ala Ser Leu 195 200 205 Gln Trp Asp Gly Ser His Arg Cys Gly Ala Thr Leu Ile Asn Ala Thr 210 215 220 Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Phe Thr Thr Tyr Lys Asn Pro Ala 225 230 235 240 Arg Trp Thr Ala Ser Phe Gly Val Thr Ile Lys Pro Ser Lys Met Lys 245 250 255 Arg Gly Leu Arg Arg Ile Ile Val His Glu Lys Tyr Lys His Pro Ser 260 265 270 His Asp Tyr Asp Ile Ser Leu Ala Glu Leu Ser Ser Pro Val Pro Tyr 275 280 285 Thr Asn Ala Val His Arg Val Cys Leu Pro Asp Ala Ser Tyr Glu Phe 290 295 300 Gln Pro Gly Asp Val Met Phe Val Thr Gly Phe Gly Ala Leu Lys Asn 305 310 315 320 Asp Gly Tyr Ser Gln Asn His Leu Arg Gln Ala Gln Val Thr Leu Ile 325 330 335 Asp Ala Thr Thr Cys Asn Glu Pro Gln Ala Tyr Asn Asp Ala Ile Thr 340 345 350 Pro Arg Met Leu Cys Ala Gly Ser Leu Glu Gly Lys Thr Asp Ala Cys 355 360 365 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Ser Ser Asp Ala Arg Asp Ile 370 375 380 Trp Tyr Leu Ala Gly Ile Val Ser Trp Gly Asp Glu Cys Ala Lys Pro 385 390 395 400 Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Thr Ala Leu Arg Asp Trp Ile 405 410 415 Thr Ser Lys Thr Gly Ile 420 <210> 61 <211> 1124 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> tryptase gamma 1 <400> 61 ccatggccct tggggcctgt ggcctcctgc tgctcctggc tgtgcccggt gtgtccctca 60 ggactttgca gccagggtgt ggccggccgc aggtttcgga tgcaggcggc cggatcgtgg 120 ggggtcacgc tgccccggcc ggcgcatggc catggcaggc cagcctccgc ctgcggagga 180 tgcacgtgtg cggcgggtca ctgctcagcc cccagtgggt gctcacagct gcccactgct 240 tctccgggtc cctgaactca tccgactacc aggtgcacct gggggaactg gagatcactt 300 tgtctcccca cttctccacc gtgaggcaga tcatcctgca ctccagcccc tcaggacagc 360 cggggaccag cggggacatc gccctggtgg agctcagtgt ccccgtgacc ctctccagcc 420 ggatcctgcc cgtctgcctc ccggaggcct cagatgactt ctgccctggg atccggtgct 480 gggtgaccgg ctggggctat acgcgggagg gagagcctct gccacccccg tacagcctgc 540 gggaggtgaa agtctccgtg gtggacacag agacctgccg ccgggactat cccggccccg 600 ggggcagcat ccttcagccc gacatgctgt gtgcccgggg ccccggggat gcctgccagg 660 acgactccgg ggggcctctg gtctgccagg tgaacggtgc ctgggtgcag gctggcattg 720 tgagctgggg tgagggctgc ggccgcccca acaggccggg agtctacact cgtgtccctg 780 cctacgtgaa ctggatccgc cgccacatca cagcatcagg gggctcagag tctgggtacc 840 ccaggctccc cctcctggct ggcttcttcc tccccggcct cttccttctg ctagtctcct 900 gtgtcctgct ggccaagtgc ctgctgcacc catctgcgga tggtactccc ttccccgccc 960 ctgactgatg gcaggaatcc aagtgcattt cttaaataag ttactattta ttccgctccg 1020 ccccctccct ctcccttgag aagctgagtc ttctgcatca gattattgca acatttaacc 1080 tgaatttaaa agcacacgaa acaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaa 1124 <210> 62 <211> 321 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> tryptase gamma 1 <400> 62 Met Ala Leu Gly Ala Cys Gly Leu Leu Leu Leu Leu Ala Val Pro Gly 1 5 10 15 Val Ser Leu Arg Thr Leu Gln Pro Gly Cys Gly Arg Pro Gln Val Ser 20 25 30 Asp Ala Gly Gly Arg Ile Val Gly Gly His Ala Ala Pro Ala Gly Ala 35 40 45 Trp Pro Trp Gln Ala Ser Leu Arg Leu Arg Arg Met His Val Cys Gly 50 55 60 Gly Ser Leu Leu Ser Pro Gln Trp Val Leu Thr Ala Ala His Cys Phe 65 70 75 80 Ser Gly Ser Leu Asn Ser Ser Asp Tyr Gln Val His Leu Gly Glu Leu 85 90 95 Glu Ile Thr Leu Ser Pro His Phe Ser Thr Val Arg Gln Ile Ile Leu 100 105 110 His Ser Ser Pro Ser Gly Gln Pro Gly Thr Ser Gly Asp Ile Ala Leu 115 120 125 Val Glu Leu Ser Val Pro Val Thr Leu Ser Ser Arg Ile Leu Pro Val 130 135 140 Cys Leu Pro Glu Ala Ser Asp Asp Phe Cys Pro Gly Ile Arg Cys Trp 145 150 155 160 Val Thr Gly Trp Gly Tyr Thr Arg Glu Gly Glu Pro Leu Pro Pro Pro 165 170 175 Tyr Ser Leu Arg Glu Val Lys Val Ser Val Val Asp Thr Glu Thr Cys 180 185 190 Arg Arg Asp Tyr Pro Gly Pro Gly Gly Ser Ile Leu Gln Pro Asp Met 195 200 205 Leu Cys Ala Arg Gly Pro Gly Asp Ala Cys Gln Asp Asp Ser Gly Gly 210 215 220 Pro Leu Val Cys Gln Val Asn Gly Ala Trp Val Gln Ala Gly Ile Val 225 230 235 240 Ser Trp Gly Glu Gly Cys Gly Arg Pro Asn Arg Pro Gly Val Tyr Thr 245 250 255 Arg Val Pro Ala Tyr Val Asn Trp Ile Arg Arg His Ile Thr Ala Ser 260 265 270 Gly Gly Ser Glu Ser Gly Tyr Pro Arg Leu Pro Leu Leu Ala Gly Phe 275 280 285 Phe Leu Pro Gly Leu Phe Leu Leu Leu Val Ser Cys Val Leu Leu Ala 290 295 300 Lys Cys Leu Leu His Pro Ser Ala Asp Gly Thr Pro Phe Pro Ala Pro 305 310 315 320 Asp <210> 63 <211> 1459 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein hK14 <400> 63 gcacctagca gatcccaagc tggggaatgc cagttctggc accaaccttc ctgctccctg 60 ctggggcctc tgctccccca tctctcagga gtcgaaagtg agaaagcaag acatcaagga 120 gggacctgtg ccctgctcca catcctccca cctgccgccc gcagagcctg caggccccgc 180 ccccctcgtc tctggtccct acctctctgc tgtgtcttca tgtccctgag ggtcttgggc 240 tctgggacct ggccctcagc ccctaaaatg ttcctcctgc tgacagcact tcaagtcctg 300 gctatagcca tgacacagag ccaagaggat gagaacaaga taattggtgg ccatacgtgc 360 acccggagct cccagccgtg gcaggcggcc ctgctggcgg gtcccaggcg ccgcttcctc 420 tgcggaggcg ccctgctttc aggccagtgg gtcatcactg ctgctcactg cggccgcccg 480 atccttcagg ttgccctggg caagcacaac ctgaggaggt gggaggccac ccagcaggtg 540 ctgcgcgtgg ttcgtcaggt gacgcacccc aactacaact cccggaccca cgacaacgac 600 ctcatgctgc tgcagctaca gcagcccgca cggatcggga gggcagtcag gcccattgag 660 gtcacccagg cctgtgccag ccccgggacc tcctgccgag tgtcaggctg gggaactata 720 tccagcccca tcgccaggta ccccgcctct ctgcaatgcg tgaacatcaa catctccccg 780 gatgaggtgt gccagaaggc ctatcctaga accatcacgc ctggcatggt ctgtgcagga 840 gttccccagg gcgggaagga ctcttgtcag ggtgactctg ggggacccct ggtgtgcaga 900 ggacagctcc agggcctcgt gtcttgggga atggagcgct gcgccctgcc tggctacccc 960 ggtgtctaca ccaacctgtg caagtacaga agctggattg aggaaacgat gcgggacaaa 1020 tgatggtctt cacggtggga tggacctcgt cagctgccca ggccctcctc tctctactca 1080 ggacccagga gtccaggccc cagcccctcc tccctcagac ccaggagtcc aggcccccag 1140 cccctcctcc ctcagacccg ggagtccagg cccccagccc ctcctccctc agacccagga 1200 gccccagtcc ccagcatcct gatctttact ccggctctga tctctccttt cccagagcag 1260 ttgcttcagg cgttttctcc ccaccaagcc cccacccttg ctgtgtcacc atcactactc 1320 aagaccggag gcacagaggg caggagcaca gaccccttaa accggcattg tattccaaag 1380 acgacaattt ttaacacgct tagtgtctct aaaaaccgaa taaataatga caataaaaat 1440 ggaatcatcc taaattgta 1459 <210> 64 <211> 251 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Kallikrein-14 precursor S01.029 <400> 64 Met Phe Leu Leu Leu Thr Ala Leu Gln Val Leu Ala Ile Ala Met Thr 1 5 10 15 Gln Ser Gln Glu Asp Glu Asn Lys Ile Ile Gly Gly His Thr Cys Thr 20 25 30 Arg Ser Ser Gln Pro Trp Gln Ala Ala Leu Leu Ala Gly Pro Arg Arg 35 40 45 Arg Phe Leu Cys Gly Gly Ala Leu Leu Ser Gly Gln Trp Val Ile Thr 50 55 60 Ala Ala His Cys Gly Arg Pro Ile Leu Gln Val Ala Leu Gly Lys His 65 70 75 80 Asn Leu Arg Arg Trp Glu Ala Thr Gln Gln Val Leu Arg Val Val Arg 85 90 95 Gln Val Thr His Pro Asn Tyr Asn Ser Arg Thr His Asp Asn Asp Leu 100 105 110 Met Leu Leu Gln Leu Gln Gln Pro Ala Arg Ile Gly Arg Ala Val Arg 115 120 125 Pro Ile Glu Val Thr Gln Ala Cys Ala Ser Pro Gly Thr Ser Cys Arg 130 135 140 Val Ser Gly Trp Gly Thr Ile Ser Ser Pro Ile Ala Arg Tyr Pro Ala 145 150 155 160 Ser Leu Gln Cys Val Asn Ile Asn Ile Ser Pro Asp Glu Val Cys Gln 165 170 175 Lys Ala Tyr Pro Arg Thr Ile Thr Pro Gly Met Val Cys Ala Gly Val 180 185 190 Pro Gln Gly Gly Lys Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu 195 200 205 Val Cys Arg Gly Gln Leu Gln Gly Leu Val Ser Trp Gly Met Glu Arg 210 215 220 Cys Ala Leu Pro Gly Tyr Pro Gly Val Tyr Thr Asn Leu Cys Lys Tyr 225 230 235 240 Arg Ser Trp Ile Glu Glu Thr Met Arg Asp Lys 245 250 <210> 65 <211> 3008 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> hyaluronan-binding serine protease (HGF activator-like protein) <400> 65 cctgaatcct tggagactga catttttccc ccctaaaggc atagacaaca aaagaaattt 60 tattgagagg aaaacacaag tccttaaact gcaaagatgt ttgccaggat gtctgatctc 120 catgttctgc tgttaatggc tctggtggga aagacagcct gtgggttctc cctgatgtct 180 ttattggaaa gcctggaccc agactggacc cctgaccagt atgattacag ctacgaggat 240 tataatcagg aagagaacac cagtagcaca cttacccacg ctgagaatcc tgactggtac 300 tacactgagg accaagctga tccatgccag cccaacccct gtgaacacgg tggggactgc 360 ctcgtccatg ggagcacctt cacatgcagc tgcctggctc ctttctctgg gaataagtgt 420 cagaaagtgc aaaatacgtg caaggacaac ccatgtggcc ggggccaatg tctcattacc 480 cagagtcctc cctactaccg ctgtgtctgt aaacaccctt acacaggtcc cagctgctcc 540 caagtggttc ctgtatgcag gccaaacccc tgccagaatg gggctacctg ctcccggcat 600 aagcggagat ccaagttcac ctgtgcctgt cccgaccagt tcaaggggaa attctgtgaa 660 ataggttctg atgactgcta tgttggcgat ggctactctt accgagggaa aatgaatagg 720 acagtcaacc agcatgcgtg cctttactgg aactcccacc tcctcttgca ggagaattac 780 aacatgttta tggaggatgc tgaaacccat gggattgggg aacacaattt ctgcagaaac 840 ccagatgcgg acgaaaagcc ctggtgcttt attaaagtta ccaatgacaa ggtgaaatgg 900 gaatactgtg atgtctcagc ctgctcagcc caggacgttg cctacccaga ggaaagcccc 960 actgagccat caaccaagct tccggggttt gactcctgtg gaaagactga gatagcagag 1020 aggaagatca agagaatcta tggaggcttt aagagcacgg cgggcaagca cccatggcag 1080 gcgtccctcc agtcctcgct gcctctgacc atctccatgc cccagggcca cttctgtggt 1140 ggggcgctga tccacccctg ctgggtgctc actgctgccc actgcaccga cataaaaacc 1200 agacatctaa aggtggtgct aggggaccag gacctgaaga aagaagaatt tcatgagcag 1260 agctttaggg tggagaagat attcaagtac agccactaca atgaaagaga tgagattccc 1320 cacaatgata ttgcattgct caagttaaag ccagtggatg gtcactgtgc tctagaatcc 1380 aaatacgtga agactgtgtg cttgcctgat gggtcctttc cctctgggag tgagtgccac 1440 atctctggct ggggtgttac agaaacagga aaagggtccc gccagctcct ggatgccaaa 1500 gtcaagctga ttgccaacac tttgtgcaac tcccgccaac tctatgacca catgattgat 1560 gacagtatga tctgtgcagg aaatcttcag aaacctgggc aagacacctg ccagggtgac 1620 tctggaggcc ccctgacctg tgagaaggac ggcacctact acgtctatgg gatagtgagc 1680 tggggcctgg agtgtgggaa gaggccaggg gtctacaccc aagttaccaa attcctgaat 1740 tggatcaaag ccaccatcaa aagtgaaagt ggcttctaag gtactgtctt ctggacctca 1800 gagcccactc tccttggcac cctgacaccg ggaggcctca tggccaacaa tggacacctc 1860 cagagcctcc aggggaccac acagtagact atccctactc taagcagaga caactgccac 1920 ccagcctggg ccttcccaga ccagcatttg cacaatatca ccaggcttct tctgcctccc 1980 ttggtaaccc aaggaatgat ggaatcaaca caacatagta tgtttgcttt ccttacccaa 2040 ttgtaccttc tagaaaatca gtgttcacag agactgcctc caccacaggc atcctgcaaa 2100 tgcagactcc agaatcccca gcatcagcgg gaaccaccat cacatcttta ttcctcagcc 2160 cagacactcg aggcactcaa cagaatcagc catccacgtc taggtatcag agaggaccac 2220 aaatacaaca ttctccatct gctttcagag ttattatttt aataaaggaa gatctgggat 2280 gggctggtgg gccattccag cttgccgaaa tcaaagccat ctgaagcctg tctctggtga 2340 acaaacttcc tctctggcct ctcaggaatc agggtggcat ggctcacaac agcagggcct 2400 tcttcttttt gacgtgcaga atctcagtgg catctgggtt cacctcccca ctctgatgat 2460 ctccagcctc cactgcttct gccccccgct gctgaaatca aacatacccc aagttaaaat 2520 gaagctcccc cacccccact cccggccccg gttcccacag gacacgctaa gaagcacagg 2580 gagcatttaa caggctcacc ctccctttcc ttttcccctc ttctaccctc cccaagaaaa 2640 agggccttca aggcaggaat gagaaagcaa agccaatctc tcatttagac ctggcttctt 2700 tcttctgaac aaagtagggt tcaaaatgca gactgtcata tccagcgagt ccctgaccct 2760 ttctgcgaat gtaacgagca agcagtcagc acagcctggg ctgccctggc ccgggattga 2820 tgtagccccg gtaggtttgc ctctgcagaa ctaatggctg tgacttcaga gaaagccctg 2880 caggaagttt aacctgcgtg tcatctgcct ggtcatctca gacccatgaa attaggcgcc 2940 ttgtttgagc tgcgtttcac acttctttag agctagctga cctttggcca aaaataaact 3000 ttgaaaag 3008 <210> 66 <211> 560 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> hyaluronan-binding serine protease (HGF activator-like protein) <400> 66 Met Phe Ala Arg Met Ser Asp Leu His Val Leu Leu Leu Met Ala Leu 1 5 10 15 Val Gly Lys Thr Ala Cys Gly Phe Ser Leu Met Ser Leu Leu Glu Ser 20 25 30 Leu Asp Pro Asp Trp Thr Pro Asp Gln Tyr Asp Tyr Ser Tyr Glu Asp 35 40 45 Tyr Asn Gln Glu Glu Asn Thr Ser Ser Thr Leu Thr His Ala Glu Asn 50 55 60 Pro Asp Trp Tyr Tyr Thr Glu Asp Gln Ala Asp Pro Cys Gln Pro Asn 65 70 75 80 Pro Cys Glu His Gly Gly Asp Cys Leu Val His Gly Ser Thr Phe Thr 85 90 95 Cys Ser Cys Leu Ala Pro Phe Ser Gly Asn Lys Cys Gln Lys Val Gln 100 105 110 Asn Thr Cys Lys Asp Asn Pro Cys Gly Arg Gly Gln Cys Leu Ile Thr 115 120 125 Gln Ser Pro Pro Tyr Tyr Arg Cys Val Cys Lys His Pro Tyr Thr Gly 130 135 140 Pro Ser Cys Ser Gln Val Val Pro Val Cys Arg Pro Asn Pro Cys Gln 145 150 155 160 Asn Gly Ala Thr Cys Ser Arg His Lys Arg Arg Ser Lys Phe Thr Cys 165 170 175 Ala Cys Pro Asp Gln Phe Lys Gly Lys Phe Cys Glu Ile Gly Ser Asp 180 185 190 Asp Cys Tyr Val Gly Asp Gly Tyr Ser Tyr Arg Gly Lys Met Asn Arg 195 200 205 Thr Val Asn Gln His Ala Cys Leu Tyr Trp Asn Ser His Leu Leu Leu 210 215 220 Gln Glu Asn Tyr Asn Met Phe Met Glu Asp Ala Glu Thr His Gly Ile 225 230 235 240 Gly Glu His Asn Phe Cys Arg Asn Pro Asp Ala Asp Glu Lys Pro Trp 245 250 255 Cys Phe Ile Lys Val Thr Asn Asp Lys Val Lys Trp Glu Tyr Cys Asp 260 265 270 Val Ser Ala Cys Ser Ala Gln Asp Val Ala Tyr Pro Glu Glu Ser Pro 275 280 285 Thr Glu Pro Ser Thr Lys Leu Pro Gly Phe Asp Ser Cys Gly Lys Thr 290 295 300 Glu Ile Ala Glu Arg Lys Ile Lys Arg Ile Tyr Gly Gly Phe Lys Ser 305 310 315 320 Thr Ala Gly Lys His Pro Trp Gln Ala Ser Leu Gln Ser Ser Leu Pro 325 330 335 Leu Thr Ile Ser Met Pro Gln Gly His Phe Cys Gly Gly Ala Leu Ile 340 345 350 His Pro Cys Trp Val Leu Thr Ala Ala His Cys Thr Asp Ile Lys Thr 355 360 365 Arg His Leu Lys Val Val Leu Gly Asp Gln Asp Leu Lys Lys Glu Glu 370 375 380 Phe His Glu Gln Ser Phe Arg Val Glu Lys Ile Phe Lys Tyr Ser His 385 390 395 400 Tyr Asn Glu Arg Asp Glu Ile Pro His Asn Asp Ile Ala Leu Leu Lys 405 410 415 Leu Lys Pro Val Asp Gly His Cys Ala Leu Glu Ser Lys Tyr Val Lys 420 425 430 Thr Val Cys Leu Pro Asp Gly Ser Phe Pro Ser Gly Ser Glu Cys His 435 440 445 Ile Ser Gly Trp Gly Val Thr Glu Thr Gly Lys Gly Ser Arg Gln Leu 450 455 460 Leu Asp Ala Lys Val Lys Leu Ile Ala Asn Thr Leu Cys Asn Ser Arg 465 470 475 480 Gln Leu Tyr Asp His Met Ile Asp Asp Ser Met Ile Cys Ala Gly Asn 485 490 495 Leu Gln Lys Pro Gly Gln Asp Thr Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro 500 505 510 Leu Thr Cys Glu Lys Asp Gly Thr Tyr Tyr Val Tyr Gly Ile Val Ser 515 520 525 Trp Gly Leu Glu Cys Gly Lys Arg Pro Gly Val Tyr Thr Gln Val Thr 530 535 540 Lys Phe Leu Asn Trp Ile Lys Ala Thr Ile Lys Ser Glu Ser Gly Phe 545 550 555 560 <210> 67 <211> 2124 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> transmembrane protease, serine 4 transcript variant 1 <400> 67 aatcaagctg cccaaagtcc cccaatcact cctggaatac acagagagag gcagcagctt 60 gctcagcgga caaggatgct gggcgtgagg gaccaaggcc tgccctgcac tcgggcctcc 120 tccagccagt gctgaccagg gacttctgac ctgctggcca gccaggacct gtgtggggag 180 gccctcctgc tgccttgggg tgacaatctc agctccaggc tacagggaga ccgggaggat 240 cacagagcca gcatgttaca ggatcctgac agtgatcaac ctctgaacag cctcgatgtc 300 aaacccctgc gcaaaccccg tatccccatg gagaccttca gaaaggtggg gatccccatc 360 atcatagcac tactgagcct ggcgagtatc atcattgtgg ttgtcctcat caaggtgatt 420 ctggataaat actacttcct ctgcgggcag cctctccact tcatcccgag gaagcagctg 480 tgtgacggag agctggactg tcccttgggg gaggacgagg agcactgtgt caagagcttc 540 cccgaagggc ctgcagtggc agtccgcctc tccaaggacc gatccacact gcaggtgctg 600 gactcggcca cagggaactg gttctctgcc tgtttcgaca acttcacaga agctctcgct 660 gagacagcct gtaggcagat gggctacagc agcaaaccca ctttcagagc tgtggagatt 720 ggcccagacc aggatctgga tgttgttgaa atcacagaaa acagccagga gcttcgcatg 780 cggaactcaa gtgggccctg tctctcaggc tccctggtct ccctgcactg tcttgcctgt 840 gggaagagcc tgaagacccc ccgtgtggtg ggtggggagg aggcctctgt ggattcttgg 900 ccttggcagg tcagcatcca gtacgacaaa cagcacgtct gtggagggag catcctggac 960 ccccactggg tcctcacggc agcccactgc ttcaggaaac ataccgatgt gttcaactgg 1020 aaggtgcggg caggctcaga caaactgggc agcttcccat ccctggctgt ggccaagatc 1080 atcatcattg aattcaaccc catgtacccc aaagacaatg acatcgccct catgaagctg 1140 cagttcccac tcactttctc aggcacagtc aggcccatct gtctgccctt ctttgatgag 1200 gagctcactc cagccacccc actctggatc attggatggg gctttacgaa gcagaatgga 1260 gggaagatgt ctgacatact gctgcaggcg tcagtccagg tcattgacag cacacggtgc 1320 aatgcagacg atgcgtacca gggggaagtc accgagaaga tgatgtgtgc aggcatcccg 1380 gaagggggtg tggacacctg ccagggtgac agtggtgggc ccctgatgta ccaatctgac 1440 cagtggcatg tggtgggcat cgttagctgg ggctatggct gcgggggccc gagcacccca 1500 ggagtataca ccaaggtctc agcctatctc aactggatct acaatgtctg gaaggctgag 1560 ctgtaatgct gctgcccctt tgcagtgctg ggagccgctt ccttcctgcc ctgcccacct 1620 ggggatcccc caaagtcaga cacagagcaa gagtcccctt gggtacaccc ctctgcccac 1680 agcctcagca tttcttggag cagcaaaggg cctcaattcc tgtaagagac cctcgcagcc 1740 cagaggcgcc cagaggaagt cagcagccct agctcggcca cacttggtgc tcccagcatc 1800 ccagggagag acacagccca ctgaacaagg tctcaggggt attgctaagc caagaaggaa 1860 ctttcccaca ctactgaatg gaagcaggct gtcttgtaaa agcccagatc actgtgggct 1920 ggagaggaga aggaaagggt ctgcgccagc cctgtccgtc ttcacccatc cccaagccta 1980 ctagagcaag aaaccagttg taatataaaa tgcactgccc tactgttggt atgactaccg 2040 ttacctactg ttgtcattgt tattacagct atggccacta ttattaaaga gctgtgtaac 2100 atctctggaa aaaaaaaaaa aaaa 2124 <210> 68 <211> 437 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> transmembrane protease, serine 4 isoform 1 <400> 68 Met Leu Gln Asp Pro Asp Ser Asp Gln Pro Leu Asn Ser Leu Asp Val 1 5 10 15 Lys Pro Leu Arg Lys Pro Arg Ile Pro Met Glu Thr Phe Arg Lys Val 20 25 30 Gly Ile Pro Ile Ile Ile Ala Leu Leu Ser Leu Ala Ser Ile Ile Ile 35 40 45 Val Val Val Leu Ile Lys Val Ile Leu Asp Lys Tyr Tyr Phe Leu Cys 50 55 60 Gly Gln Pro Leu His Phe Ile Pro Arg Lys Gln Leu Cys Asp Gly Glu 65 70 75 80 Leu Asp Cys Pro Leu Gly Glu Asp Glu Glu His Cys Val Lys Ser Phe 85 90 95 Pro Glu Gly Pro Ala Val Ala Val Arg Leu Ser Lys Asp Arg Ser Thr 100 105 110 Leu Gln Val Leu Asp Ser Ala Thr Gly Asn Trp Phe Ser Ala Cys Phe 115 120 125 Asp Asn Phe Thr Glu Ala Leu Ala Glu Thr Ala Cys Arg Gln Met Gly 130 135 140 Tyr Ser Ser Lys Pro Thr Phe Arg Ala Val Glu Ile Gly Pro Asp Gln 145 150 155 160 Asp Leu Asp Val Val Glu Ile Thr Glu Asn Ser Gln Glu Leu Arg Met 165 170 175 Arg Asn Ser Ser Gly Pro Cys Leu Ser Gly Ser Leu Val Ser Leu His 180 185 190 Cys Leu Ala Cys Gly Lys Ser Leu Lys Thr Pro Arg Val Val Gly Gly 195 200 205 Glu Glu Ala Ser Val Asp Ser Trp Pro Trp Gln Val Ser Ile Gln Tyr 210 215 220 Asp Lys Gln His Val Cys Gly Gly Ser Ile Leu Asp Pro His Trp Val 225 230 235 240 Leu Thr Ala Ala His Cys Phe Arg Lys His Thr Asp Val Phe Asn Trp 245 250 255 Lys Val Arg Ala Gly Ser Asp Lys Leu Gly Ser Phe Pro Ser Leu Ala 260 265 270 Val Ala Lys Ile Ile Ile Ile Glu Phe Asn Pro Met Tyr Pro Lys Asp 275 280 285 Asn Asp Ile Ala Leu Met Lys Leu Gln Phe Pro Leu Thr Phe Ser Gly 290 295 300 Thr Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Phe Phe Asp Glu Glu Leu Thr Pro 305 310 315 320 Ala Thr Pro Leu Trp Ile Ile Gly Trp Gly Phe Thr Lys Gln Asn Gly 325 330 335 Gly Lys Met Ser Asp Ile Leu Leu Gln Ala Ser Val Gln Val Ile Asp 340 345 350 Ser Thr Arg Cys Asn Ala Asp Asp Ala Tyr Gln Gly Glu Val Thr Glu 355 360 365 Lys Met Met Cys Ala Gly Ile Pro Glu Gly Gly Val Asp Thr Cys Gln 370 375 380 Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Met Tyr Gln Ser Asp Gln Trp His Val 385 390 395 400 Val Gly Ile Val Ser Trp Gly Tyr Gly Cys Gly Gly Pro Ser Thr Pro 405 410 415 Gly Val Tyr Thr Lys Val Ser Ala Tyr Leu Asn Trp Ile Tyr Asn Val 420 425 430 Trp Lys Ala Glu Leu 435 <210> 69 <211> 1983 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> transmembrane protease, serine 4 transcript variant 2 <400> 69 aatcaagctg cccaaagtcc cccaatcact cctggaatac acagagagag gcagcagctt 60 gctcagcgga caaggatgct gggcgtgagg gaccaaggcc tgccctgcac tcgggcctcc 120 tccagccagt gctgaccagg gacttctgac ctgctggcca gccaggacct gtgtggggag 180 gccctcctgc tgccttgggg tgacaatctc agctccaggc tacagggaga ccgggaggat 240 cacagagcca gcatggatcc tgacagtgat caacctctga acagcctcga tgtcaaaccc 300 ctgcgcaaac cccgtatccc catggagacc ttcagaaagg tggggatccc catcatcata 360 gcactactga gcctggcgag tatcatcatt gtggttgtcc tcatcaaggt gattctggat 420 aaatactact tcctctgcgg gcagcctctc cacttcatcc cgaggaagca gctgtgtgac 480 ggagagctgg actgtccctt gggggaggac gaggagcact gtgtcaagag cttccccgaa 540 gggcctgcag tggcagtccg cctctccaag gaccgatcca cactgcaggt gctggactcg 600 gccacaggga actggttctc tgcctgtttc gacaacttca cagaagctct cgctgagaca 660 gcctgtaggc agatgggcta cagcagcaaa cccactttca gagctgtgga gattggccca 720 gaccaggatc tggatgttgt tgaaatcaca gaaaacagcc aggagcttcg catgcggaac 780 tcaagtgggc cctgtctctc aggctccctg gtctccctgc actgtcttgc ctgtgggaag 840 agcctgaaga ccccccgtgt ggtgggtggg gaggaggcct ctgtggattc ttggccttgg 900 caggtcagca tccagtacga caaacagcac gtctgtggag ggagcatcct ggacccccac 960 tgggtcctca cggcagccca ctgcttcagg aaacataccg atgtgttcaa ctggaaggtg 1020 cgggcaggct cagacaaact gggcagcttc ccatccctgg ctgtggccaa gatcatcatc 1080 attgaattca accccatgta ccccaaagac aatgacatcg ccctcatgaa gctgcagttc 1140 ccactcactt tctcaggcac agtcaggccc atctgtctgc ccttctttga tgaggagctc 1200 actccagcca ccccactctg gatcattgga tggggcttta cgaagcagaa tggagggtga 1260 cagtggtggg cccctgatgt accaatctga ccagtggcat gtggtgggca tcgttagctg 1320 gggctatggc tgcgggggcc cgagcacccc aggagtatac accaaggtct cagcctatct 1380 caactggatc tacaatgtct ggaaggctga gctgtaatgc tgctgcccct ttgcagtgct 1440 gggagccgct tccttcctgc cctgcccacc tggggatccc ccaaagtcag acacagagca 1500 agagtcccct tgggtacacc cctctgccca cagcctcagc atttcttgga gcagcaaagg 1560 gcctcaattc ctgtaagaga ccctcgcagc ccagaggcgc ccagaggaag tcagcagccc 1620 tagctcggcc acacttggtg ctcccagcat cccagggaga gacacagccc actgaacaag 1680 gtctcagggg tattgctaag ccaagaagga actttcccac actactgaat ggaagcaggc 1740 tgtcttgtaa aagcccagat cactgtgggc tggagaggag aaggaaaggg tctgcgccag 1800 ccctgtccgt cttcacccat ccccaagcct actagagcaa gaaaccagtt gtaatataaa 1860 atgcactgcc ctactgttgg tatgactacc gttacctact gttgtcattg ttattacagc 1920 tatggccact attattaaag agctgtgtaa catctctgga aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1980 aaa 1983 <210> 70 <211> 335 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> transmembrane protease, serine 4 isoform 2 <400> 70 Met Asp Pro Asp Ser Asp Gln Pro Leu Asn Ser Leu Asp Val Lys Pro 1 5 10 15 Leu Arg Lys Pro Arg Ile Pro Met Glu Thr Phe Arg Lys Val Gly Ile 20 25 30 Pro Ile Ile Ile Ala Leu Leu Ser Leu Ala Ser Ile Ile Ile Val Val 35 40 45 Val Leu Ile Lys Val Ile Leu Asp Lys Tyr Tyr Phe Leu Cys Gly Gln 50 55 60 Pro Leu His Phe Ile Pro Arg Lys Gln Leu Cys Asp Gly Glu Leu Asp 65 70 75 80 Cys Pro Leu Gly Glu Asp Glu Glu His Cys Val Lys Ser Phe Pro Glu 85 90 95 Gly Pro Ala Val Ala Val Arg Leu Ser Lys Asp Arg Ser Thr Leu Gln 100 105 110 Val Leu Asp Ser Ala Thr Gly Asn Trp Phe Ser Ala Cys Phe Asp Asn 115 120 125 Phe Thr Glu Ala Leu Ala Glu Thr Ala Cys Arg Gln Met Gly Tyr Ser 130 135 140 Ser Lys Pro Thr Phe Arg Ala Val Glu Ile Gly Pro Asp Gln Asp Leu 145 150 155 160 Asp Val Val Glu Ile Thr Glu Asn Ser Gln Glu Leu Arg Met Arg Asn 165 170 175 Ser Ser Gly Pro Cys Leu Ser Gly Ser Leu Val Ser Leu His Cys Leu 180 185 190 Ala Cys Gly Lys Ser Leu Lys Thr Pro Arg Val Val Gly Gly Glu Glu 195 200 205 Ala Ser Val Asp Ser Trp Pro Trp Gln Val Ser Ile Gln Tyr Asp Lys 210 215 220 Gln His Val Cys Gly Gly Ser Ile Leu Asp Pro His Trp Val Leu Thr 225 230 235 240 Ala Ala His Cys Phe Arg Lys His Thr Asp Val Phe Asn Trp Lys Val 245 250 255 Arg Ala Gly Ser Asp Lys Leu Gly Ser Phe Pro Ser Leu Ala Val Ala 260 265 270 Lys Ile Ile Ile Ile Glu Phe Asn Pro Met Tyr Pro Lys Asp Asn Asp 275 280 285 Ile Ala Leu Met Lys Leu Gln Phe Pro Leu Thr Phe Ser Gly Thr Val 290 295 300 Arg Pro Ile Cys Leu Pro Phe Phe Asp Glu Glu Leu Thr Pro Ala Thr 305 310 315 320 Pro Leu Trp Ile Ile Gly Trp Gly Phe Thr Lys Gln Asn Gly Gly 325 330 335 <210> 71 <211> 855 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> tryptase delta 1 <400> 71 aggcccacga tgctcctcct tgctccccag atgctgagcc tgctgctgct ggcgctgccc 60 gtcctggcga gcccggccta cgtggcccct gccccaggcc aggccctgca gcaaacgggc 120 attgttgggg ggcaggaggc ccccaggagc aagtggccct ggcaggtgag cctgagagtc 180 cgcggcccat actggatgca cttctgcggg ggctccctca tccaccccca gtgggtgcta 240 accgcggcgc actgcgtgga accggacatc aaggatctgg ccgccctcag ggtgcaactg 300 cgggagcagc acctctacta ccaggaccag ctgctgccgg tcagcaggat catcgtgcac 360 ccacagttct acatcatcca gaccggggcg gacatcgccc tgctggagct ggaggagccc 420 gtgaacatct ccagccacat ccacacggtc acgctgcccc ctgcctcgga gaccttcccc 480 ccggggatgc cgtgctgggt cactggctgg ggcgacgtgg acaataatgt gcacctgccg 540 ccgccatacc cgctgaagga ggtggaagtc cccgtagtgg aaaaccacct ttgcaacgcg 600 gaatatcaca ccggcctcca tacgggccac agctttcaaa tcgtccgcga tgacatgctg 660 tgtgcgggga gcgaaaatca cgactcctgc cagggtgact ctggagggcc cctggtctgc 720 aaggtgaatg gcacctaact gcaggcgggc gtggtcagct gggaggagag ctgtgcccag 780 cccaaccggc ctggcatcta cacccgtgtc acctactact tggactggat ccaccactat 840 gtccccaaga agccc 855 <210> 72 <211> 242 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> tryptase delta 1 <400> 72 Met Leu Leu Leu Ala Pro Gln Met Leu Ser Leu Leu Leu Leu Ala Leu 1 5 10 15 Pro Val Leu Ala Ser Pro Ala Tyr Val Ala Pro Ala Pro Gly Gln Ala 20 25 30 Leu Gln Gln Thr Gly Ile Val Gly Gly Gln Glu Ala Pro Arg Ser Lys 35 40 45 Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu Arg Val Arg Gly Pro Tyr Trp Met His 50 55 60 Phe Cys Gly Gly Ser Leu Ile His Pro Gln Trp Val Leu Thr Ala Ala 65 70 75 80 His Cys Val Glu Pro Asp Ile Lys Asp Leu Ala Ala Leu Arg Val Gln 85 90 95 Leu Arg Glu Gln His Leu Tyr Tyr Gln Asp Gln Leu Leu Pro Val Ser 100 105 110 Arg Ile Ile Val His Pro Gln Phe Tyr Ile Ile Gln Thr Gly Ala Asp 115 120 125 Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Glu Pro Val Asn Ile Ser Ser His Ile 130 135 140 His Thr Val Thr Leu Pro Pro Ala Ser Glu Thr Phe Pro Pro Gly Met 145 150 155 160 Pro Cys Trp Val Thr Gly Trp Gly Asp Val Asp Asn Asn Val His Leu 165 170 175 Pro Pro Pro Tyr Pro Leu Lys Glu Val Glu Val Pro Val Val Glu Asn 180 185 190 His Leu Cys Asn Ala Glu Tyr His Thr Gly Leu His Thr Gly His Ser 195 200 205 Phe Gln Ile Val Arg Asp Asp Met Leu Cys Ala Gly Ser Glu Asn His 210 215 220 Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Lys Val Asn 225 230 235 240 Gly Thr <210> 73 <211> 1462 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Marapsin <400> 73 ctgtctcaaa aaattaaaaa aaataataat aataataatg aatgaagctg gacggacttc 60 gcgtgcaccg cggtcagctc ggggtctgct ggggggtctg ggtcagctca gggtccagga 120 accgaggcca acggcacccc gtgctgcgct ggggtgaggg gtctgccctg gggtctcggg 180 gttcagggct aggtcacgga ggagtcggct ctgggcgctt ccttcctgag gagaggagct 240 gggcaggccg ggccgacggg ttgggccgca tagccgggcc tgtgctcatc tccagcataa 300 aactccactt catggagcct gcacctcgct cgtgctccaa cgcttctgcc accgccgacc 360 acggccctgc gccccagcca ggcctgagga catgaggcgg ccggcggcgg tgccgctcct 420 gctgctgctg tgttttgggt ctcagagggc caaggcagca acagcctgtg gtcgccccag 480 gatgctgaac cgaatggtgg gcgggcagga cacgcaggag ggcgagtggc cctggcaagt 540 cagcatccag cgcaacggaa gccacttctg cgggggcagc ctcatcgcgg agcagtgggt 600 cctgacggct gcgcactgct tccgcaacac ctctgagacg tccctgtacc aggtcctgct 660 gggggcaagg cagctagtgc agccgggacc acacgctatg tatgcccggg tgaggcaggt 720 ggagagcaac cccctgtacc agggcacggc ctccagcgct gacgtggccc tggtggagct 780 ggaggcacca gtgcccttca ccaattacat cctccccgtg tgcctgcctg acccctcggt 840 gatctttgag acgggcatga actgctgggt cactggctgg ggcagcccca gtgaggaaga 900 cctcctgccc gaaccgcgga tcctgcagaa actcgctgtg cccatcatcg acacacccaa 960 gtgcaacctg ctctacagca aagacaccga gtttggctac caacccaaaa ccatcaagaa 1020 tgacatgctg tgcgccggct tcgaggaggg caagaaggat gcctgcaagg gcgactcggg 1080 cggccccctg gtgtgcctcg tgggtcagtc gtggctgcag gcgggggtga tcagctgggg 1140 tgagggctgt gcccgccaga accgcccagg tgtctacatc cgtgtcaccg cccaccacaa 1200 ctggatccat cggatcatcc ccaaactgca gttccagcca gcgaggttgg gcggccagaa 1260 gtgagacccc cggggccagg agccccttga gcagagctct gcacccagcc tgcccgccca 1320 caccatcctg ctggtcctcc cagcgctgct gttgcacctg tgagccccac cagactcatt 1380 tgtaaatagc gctccttcct cccctctcaa atacccttat tttatttatg tttctcccaa 1440 taaaaaccca gcctgtgtgc ca 1462 <210> 74 <211> 290 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Marapsin <400> 74 Met Arg Arg Pro Ala Ala Val Pro Leu Leu Leu Leu Leu Cys Phe Gly 1 5 10 15 Ser Gln Arg Ala Lys Ala Ala Thr Ala Cys Gly Arg Pro Arg Met Leu 20 25 30 Asn Arg Met Val Gly Gly Gln Asp Thr Gln Glu Gly Glu Trp Pro Trp 35 40 45 Gln Val Ser Ile Gln Arg Asn Gly Ser His Phe Cys Gly Gly Ser Leu 50 55 60 Ile Ala Glu Gln Trp Val Leu Thr Ala Ala His Cys Phe Arg Asn Thr 65 70 75 80 Ser Glu Thr Ser Leu Tyr Gln Val Leu Leu Gly Ala Arg Gln Leu Val 85 90 95 Gln Pro Gly Pro His Ala Met Tyr Ala Arg Val Arg Gln Val Glu Ser 100 105 110 Asn Pro Leu Tyr Gln Gly Thr Ala Ser Ser Ala Asp Val Ala Leu Val 115 120 125 Glu Leu Glu Ala Pro Val Pro Phe Thr Asn Tyr Ile Leu Pro Val Cys 130 135 140 Leu Pro Asp Pro Ser Val Ile Phe Glu Thr Gly Met Asn Cys Trp Val 145 150 155 160 Thr Gly Trp Gly Ser Pro Ser Glu Glu Asp Leu Leu Pro Glu Pro Arg 165 170 175 Ile Leu Gln Lys Leu Ala Val Pro Ile Ile Asp Thr Pro Lys Cys Asn 180 185 190 Leu Leu Tyr Ser Lys Asp Thr Glu Phe Gly Tyr Gln Pro Lys Thr Ile 195 200 205 Lys Asn Asp Met Leu Cys Ala Gly Phe Glu Glu Gly Lys Lys Asp Ala 210 215 220 Cys Lys Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Leu Val Gly Gln Ser 225 230 235 240 Trp Leu Gln Ala Gly Val Ile Ser Trp Gly Glu Gly Cys Ala Arg Gln 245 250 255 Asn Arg Pro Gly Val Tyr Ile Arg Val Thr Ala His His Asn Trp Ile 260 265 270 His Arg Ile Ile Pro Lys Leu Gln Phe Gln Pro Ala Arg Leu Gly Gly 275 280 285 Gln Lys 290 <210> 75 <211> 1755 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Tryptase homologue 2 <400> 75 ccaggacttc cgtctgagat gggatttctg gacagaacaa tggagcgcag aagctccagc 60 aacgtgtgct ctgcagggag cccagaccag agtccaagcc ctaggcagtg ccacccttac 120 ccagcccagc cttgaagaca gaatgagagg ggtttcctgt ctccaggtcc tgctccttct 180 ggtgctggga gctgctggga ctcagggaag gaagtctgca gcctgcgggc agccccgcat 240 gtccagtcgg atcgttgggg gccgggatgg ccgggacgga gagtggccgt ggcaggcgag 300 catccagcat cgtggggcac acgtgtgcgg ggggtcgctc atcgcccccc agtgggtgct 360 gacagcggcg cactgcttcc ccaggagggc actgccagct gagtaccgcg tgcgcctggg 420 ggcgctgcgt ctgggctcca cctcgccccg cacgctctcg gtgcccgtgc gacgggtgct 480 gctgcccccg gactactccg aggacggggc ccgcggcgac ctggcactgc tgcagctgcg 540 tcgcccggtg cccctgagcg ctcgcgtcca acccgtctgc ctgcccgtgc ccggcgcccg 600 cccgccgccc ggcacaccat gccgggtcac cggctggggc agcctccgcc caggagtgcc 660 cctcccagag tggcgaccgc tacaaggagt aagggtgccg ctgctggact cgcgcacctg 720 cgacggcctc taccacgtgg gcgcggacgt gccccaggct gagcgcattg tgctgcctgg 780 gagtctgtgt gccggctacc cccagggcca caaggacgcc tgccagggtg attctggggg 840 acctctgacc tgcctgcagt ctgggagctg ggtcctggtg ggcgtggtga gctggggcaa 900 gggttgtgcc ctgcccaacc gtccaggggt ctacaccagt gtggccacat atagcccctg 960 gattcaggct cgcgtcagct tctaatgcta gccggtgagg ctgacctgga gccagctgct 1020 ggggtccctc agcctcctgg ttcatccagg cacctgccta taccccacat cccttctgcc 1080 tcgaggccaa gatgcctaaa aaagctaaag gccaccccac cccccaccca ccacctcctg 1140 cctcctctcc tctttgggga tcaccagctc tgactccacc aaccctcatc caggaatctg 1200 ccatgagtcc cagggagtca cactccccac tcccttcctg gcttgtattt acttttcttg 1260 gccctggcca gggctgggcg caaggcacgc agtgatgggc aaaccaattg ctgcccatct 1320 ggcctgtgtg cccatctttt tctggagaaa gtcagattca cagcatgaca gagatttgac 1380 accagggaga tcctccatag ctggctttga ggacacgggg accacagcca tgagcggcct 1440 ctaagagctg agagacagcc ggcagggaat cggaaccctc agacccacag ccgcaaggca 1500 ctggattctg gcagcaccct gaaggagctg ggaagtaagt tcttccccag cctccagata 1560 agagccccgc cggccaatcc cttcatttca acctaaagag accctaagca gagaacctag 1620 ctgagccact cctgacctac aaagttgtga cttaataaat gtgtgctttg aacccaaaaa 1680 aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1740 aaaaaaaaaa aaaaa 1755 <210> 76 <211> 284 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Tryptase homologue 2 <400> 76 Met Arg Gly Val Ser Cys Leu Gln Val Leu Leu Leu Leu Val Leu Gly 1 5 10 15 Ala Ala Gly Thr Gln Gly Arg Lys Ser Ala Ala Cys Gly Gln Pro Arg 20 25 30 Met Ser Ser Arg Ile Val Gly Gly Arg Asp Gly Arg Asp Gly Glu Trp 35 40 45 Pro Trp Gln Ala Ser Ile Gln His Pro Gly Ala His Val Cys Gly Gly 50 55 60 Ser Leu Ile Ala Pro Gln Trp Val Leu Thr Ala Ala His Cys Phe Pro 65 70 75 80 Arg Arg Ala Leu Pro Ala Glu Tyr Arg Val Arg Leu Gly Ala Leu Arg 85 90 95 Leu Gly Ser Thr Ser Pro Arg Thr Leu Ser Val Pro Val Arg Arg Val 100 105 110 Leu Leu Pro Pro Asp Tyr Ser Glu Asp Gly Ala Arg Gly Asp Leu Ala 115 120 125 Leu Leu Gln Leu Arg Arg Pro Val Pro Leu Ser Ala Arg Val Gln Pro 130 135 140 Val Cys Leu Pro Val Pro Gly Ala Arg Pro Pro Pro Gly Thr Pro Cys 145 150 155 160 Arg Val Thr Gly Trp Gly Ser Leu Arg Pro Gly Val Pro Leu Pro Glu 165 170 175 Trp Arg Pro Leu Gln Gly Val Arg Val Pro Leu Leu Asp Ser Arg Thr 180 185 190 Cys Asp Gly Leu Tyr His Val Gly Ala Asp Val Pro Gln Ala Glu Arg 195 200 205 Ile Val Leu Pro Gly Ser Leu Cys Ala Gly Tyr Pro Gln Gly His Lys 210 215 220 Asp Ala Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Thr Cys Leu Gln Ser 225 230 235 240 Gly Ser Trp Val Leu Val Gly Val Val Ser Trp Gly Lys Gly Cys Ala 245 250 255 Leu Pro Asn Arg Pro Gly Val Tyr Thr Ser Val Ala Thr Tyr Ser Pro 260 265 270 Trp Ile Gln Ala Arg Val Thr Ser Asn Ala Ser Arg 275 280 <210> 77 <211> 321 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Tryptase homologue 3 <400> 77 gcgctggtgg cgggcggagt ggagtccgcg cgcgggcgct ggccatggca ggccagcctg 60 cgcctgagga gacgccaccg atgtggaggg agcctgctca gccgccgctg ggtgctctcg 120 gctgcgcact gcttcgctcc ccagggtgac tcaggtggac ccttggtctg tgacaaggat 180 ggactgtggt atcaggttgg aatcgtgagc tggggaatgg actgcggtca acccaatcgg 240 cctggtgtct acaccaacat cagtgtgtac ttccactgga tccggagggt gatgtcccac 300 agtacaccca ggccaaaccc c 321 <210> 78 <211> 107 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Tryptase homologue 3 <400> 78 Ala Leu Val Ala Gly Gly Val Glu Ser Ala Arg Gly Arg Trp Pro Trp 1 5 10 15 Gln Ala Ser Leu Arg Leu Arg Arg Arg His Arg Cys Gly Gly Ser Leu 20 25 30 Leu Ser Arg Arg Trp Val Leu Ser Ala Ala His Cys Phe Ala Pro Gln 35 40 45 Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Asp Lys Asp Gly Leu Trp Tyr 50 55 60 Gln Val Gly Ile Val Ser Trp Gly Met Asp Cys Gly Gln Pro Asn Arg 65 70 75 80 Pro Gly Val Tyr Thr Asn Ile Ser Val Tyr Phe His Trp Ile Arg Arg 85 90 95 Val Met Ser His Ser Thr Pro Arg Pro Asn Pro 100 105 <210> 79 <211> 2468 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> transmembrane protease, serine 3 transcript variant A <400> 79 accgggcacc ggacggctcg ggtactttcg ttcttaatta ggtcatgccc gtgtgagcca 60 ggaaagggct gtgtttatgg gaagccagta acactgtggc ctactatctc ttccgtggtg 120 ccatctacat ttttgggact cgggaattat gaggtagagg tggaggcgga gccggatgtc 180 agaggtcctg aaatagtcac catgggggaa aatgatccgc ctgctgttga agcccccttc 240 tcattccgat cgctttttgg ccttgatgat ttgaaaataa gtcctgttgc accagatgca 300 gatgctgttg ctgcacagat cctgtcactg ctgccattga agttttttcc aatcatcgtc 360 attgggatca ttgcattgat attagcactg gccattggtc tgggcatcca cttcgactgc 420 tcagggaagt acagatgtcg ctcatccttt aagtgtatcg agctgatagc tcgatgtgac 480 ggagtctcgg attgcaaaga cggggaggac gagtaccgct gtgtccgggt gggtggtcag 540 aatgccgtgc tccaggtgtt cacagctgct tcgtggaaga ccatgtgctc cgatgactgg 600 aagggtcact acgcaaatgt tgcctgtgcc caactgggtt tcccaagcta tgtgagttca 660 gataacctca gagtgagctc gctggagggg cagttccggg aggagtttgt gtccatcgat 720 cacctcttgc cagatgacaa ggtgactgca ttacaccact cagtatatgt gagggaggga 780 tgtgcctctg gccacgtggt taccttgcag tgcacagcct gtggtcatag aaggggctac 840 agctcacgca tcgtgggtgg aaacatgtcc ttgctctcgc agtggccctg gcaggccagc 900 cttcagttcc agggctacca cctgtgcggg ggctctgtca tcacgcccct gtggatcatc 960 actgctgcac actgtgttta tgacttgtac ctccccaagt catggaccat ccaggtgggt 1020 ctagtttccc tgttggacaa tccagcccca tcccacttgg tggagaagat tgtctaccac 1080 agcaagtaca agccaaagag gctgggcaat gacatcgccc ttatgaagct ggccgggcca 1140 ctcacgttca atgaaatgat ccagcctgtg tgcctgccca actctgaaga gaacttcccc 1200 gatggaaaag tgtgctggac gtcaggatgg ggggccacag aggatggagc aggtgacgcc 1260 tcccctgtcc tgaaccacgc ggccgtccct ttgatttcca acaagatctg caaccacagg 1320 gacgtgtacg gtggcatcat ctccccctcc atgctctgcg cgggctacct gacgggtggc 1380 gtggacagct gccaggggga cagcgggggg cccctggtgt gtcaagagag gaggctgtgg 1440 aagttagtgg gagcgaccag ctttggcatc ggctgcgcag aggtgaacaa gcctggggtg 1500 tacacccgtg tcacctcctt cctggactgg atccacgagc agatggagag agacctaaaa 1560 acctgaagag gaaggggaca agtagccacc tgagttcctg aggtgatgaa gacagcccga 1620 tcctcccctg gactcccgtg taggaacctg cacacgagca gacacccttg gagctctgag 1680 ttccggcacc agtagcaggc ccgaaagagg cacccttcca tctgattcca gcacaacctt 1740 caagctgctt tttgtttttt gtttttttga ggtggagtct cgctctgttg cccaggctgg 1800 agtgcagtgg cgaaatccct gctcactgca gcctccgctt ccctggttca agcgattctc 1860 ttgcctcagc ttccccagta gctgggacca caggtgcccg ccaccacacc caactaattt 1920 ttgtattttt agtagagaca gggtttcacc atgttggcca ggctgctctc aaacccctga 1980 cctcaaatga tgtgcctgct tcagcctccc acagtgctgg gattacaggc atgggccacc 2040 acgcctagcc tcacgctcct ttctgatctt cactaagaac aaaagaagca gcaacttgca 2100 agggcggcct ttcccactgg tccatctggt tttctctcca ggggtcttgc aaaattcctg 2160 acgagataag cagttatgtg acctcacgtg caaagccacc aacagccact cagaaaagac 2220 gcaccagccc agaagtgcag aactgcagtc actgcacgtt ttcatctcta gggaccagaa 2280 ccaaacccac cctttctact tccaagactt attttcacat gtggggaggt taatctagga 2340 atgactcgtt taaggcctat tttcatgatt tctttgtagc atttggtgct tgacgtatta 2400 ttgtcctttg attccaaata atatgtttcc ttccctcaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2460 aaaaaaaa 2468 <210> 80 <211> 454 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> transmembrane protease, serine 3 isoform 1 <400> 80 Met Gly Glu Asn Asp Pro Pro Ala Val Glu Ala Pro Phe Ser Phe Arg 1 5 10 15 Ser Leu Phe Gly Leu Asp Asp Leu Lys Ile Ser Pro Val Ala Pro Asp 20 25 30 Ala Asp Ala Val Ala Ala Gln Ile Leu Ser Leu Leu Pro Leu Lys Phe 35 40 45 Phe Pro Ile Ile Val Ile Gly Ile Ile Ala Leu Ile Leu Ala Leu Ala 50 55 60 Ile Gly Leu Gly Ile His Phe Asp Cys Ser Gly Lys Tyr Arg Cys Arg 65 70 75 80 Ser Ser Phe Lys Cys Ile Glu Leu Ile Ala Arg Cys Asp Gly Val Ser 85 90 95 Asp Cys Lys Asp Gly Glu Asp Glu Tyr Arg Cys Val Arg Val Gly Gly 100 105 110 Gln Asn Ala Val Leu Gln Val Phe Thr Ala Ala Ser Trp Lys Thr Met 115 120 125 Cys Ser Asp Asp Trp Lys Gly His Tyr Ala Asn Val Ala Cys Ala Gln 130 135 140 Leu Gly Phe Pro Ser Tyr Val Ser Ser Asp Asn Leu Arg Val Ser Ser 145 150 155 160 Leu Glu Gly Gln Phe Arg Glu Glu Phe Val Ser Ile Asp His Leu Leu 165 170 175 Pro Asp Asp Lys Val Thr Ala Leu His His Ser Val Tyr Val Arg Glu 180 185 190 Gly Cys Ala Ser Gly His Val Val Thr Leu Gln Cys Thr Ala Cys Gly 195 200 205 His Arg Arg Gly Tyr Ser Ser Arg Ile Val Gly Gly Asn Met Ser Leu 210 215 220 Leu Ser Gln Trp Pro Trp Gln Ala Ser Leu Gln Phe Gln Gly Tyr His 225 230 235 240 Leu Cys Gly Gly Ser Val Ile Thr Pro Leu Trp Ile Ile Thr Ala Ala 245 250 255 His Cys Val Tyr Asp Leu Tyr Leu Pro Lys Ser Trp Thr Ile Gln Val 260 265 270 Gly Leu Val Ser Leu Leu Asp Asn Pro Ala Pro Ser His Leu Val Glu 275 280 285 Lys Ile Val Tyr His Ser Lys Tyr Lys Pro Lys Arg Leu Gly Asn Asp 290 295 300 Ile Ala Leu Met Lys Leu Ala Gly Pro Leu Thr Phe Asn Glu Met Ile 305 310 315 320 Gln Pro Val Cys Leu Pro Asn Ser Glu Glu Asn Phe Pro Asp Gly Lys 325 330 335 Val Cys Trp Thr Ser Gly Trp Gly Ala Thr Glu Asp Gly Ala Gly Asp 340 345 350 Ala Ser Pro Val Leu Asn His Ala Ala Val Pro Leu Ile Ser Asn Lys 355 360 365 Ile Cys Asn His Arg Asp Val Tyr Gly Gly Ile Ile Ser Pro Ser Met 370 375 380 Leu Cys Ala Gly Tyr Leu Thr Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp 385 390 395 400 Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Gln Glu Arg Arg Leu Trp Lys Leu Val 405 410 415 Gly Ala Thr Ser Phe Gly Ile Gly Cys Ala Glu Val Asn Lys Pro Gly 420 425 430 Val Tyr Thr Arg Val Thr Ser Phe Leu Asp Trp Ile His Glu Gln Met 435 440 445 Glu Arg Asp Leu Lys Thr 450 <210> 81 <211> 2554 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> transmembrane protease, serine 3 transcript variant B <400> 81 gccacgttgg attagggccc accctaatga ctcattttaa ctagatgact ctgtaaagac 60 tctccaggcc atctccaaat aagatgccat tctgaggtac taagagttaa gacctcaacg 120 tgtctttctg ggggatacta ttcaacccat agcacatccc ctcatccccc atggaataac 180 cgggtcagag gtggagcagg taggactgaa ctagagaatg tgccccttgg tgggtggccc 240 tttccctaat taaggcacct ttctttgggc tgagacttct ctgcaaagag gggaggggga 300 aaggatagtt aaatttgtaa gtttcatggc actccaagtc aggttctggg gctttctgct 360 cttccttttt ctggttatca gatgcagatg ctgttgctgc acagatcctg tcactgctgc 420 cattgaagtt ttttccaatc atcgtcattg ggatcattgc attgatatta gcactggcca 480 ttggtctggg catccacttc gactgctcag ggaagtacag atgtcgctca tcctttaagt 540 gtatcgagct gatagctcga tgtgacggag tctcggattg caaagacggg gaggacgagt 600 accgctgtgt ccgggtgggt ggtcagaatg ccgtgctcca ggtgttcaca gctgcttcgt 660 ggaagaccat gtgctccgat gactggaagg gtcactacgc aaatgttgcc tgtgcccaac 720 tgggtttccc aagctatgtg agttcagata acctcagagt gagctcgctg gaggggcagt 780 tccgggagga gtttgtgtcc atcgatcacc tcttgccaga tgacaaggtg actgcattac 840 accactcagt atatgtgagg gagggatgtg cctctggcca cgtggttacc ttgcagtgca 900 cagcctgtgg tcatagaagg ggctacagct cacgcatcgt gggtggaaac atgtccttgc 960 tctcgcagtg gccctggcag gccagccttc agttccaggg ctaccacctg tgcgggggct 1020 ctgtcatcac gcccctgtgg atcatcactg ctgcacactg tgtttatgac ttgtacctcc 1080 ccaagtcatg gaccatccag gtgggtctag tttccctgtt ggacaatcca gccccatccc 1140 acttggtgga gaagattgtc taccacagca agtacaagcc aaagaggctg ggcaatgaca 1200 tcgcccttat gaagctggcc gggccactca cgttcaatga aatgatccag cctgtgtgcc 1260 tgcccaactc tgaagagaac ttccccgatg gaaaagtgtg ctggacgtca ggatgggggg 1320 ccacagagga tggagcaggt gacgcctccc ctgtcctgaa ccacgcggcc gtccctttga 1380 tttccaacaa gatctgcaac cacagggacg tgtacggtgg catcatctcc ccctccatgc 1440 tctgcgcggg ctacctgacg ggtggcgtgg acagctgcca gggggacagc ggggggcccc 1500 tggtgtgtca agagaggagg ctgtggaagt tagtgggagc gaccagcttt ggcatcggct 1560 gcgcagaggt gaacaagcct ggggtgtaca cccgtgtcac ctccttcctg gactggatcc 1620 acgagcagat ggagagagac ctaaaaacct gaagaggaag gggacaagta gccacctgag 1680 ttcctgaggt gatgaagaca gcccgatcct cccctggact cccgtgtagg aacctgcaca 1740 cgagcagaca cccttggagc tctgagttcc ggcaccagta gcaggcccga aagaggcacc 1800 cttccatctg attccagcac aaccttcaag ctgctttttg ttttttgttt ttttgaggtg 1860 gagtctcgct ctgttgccca ggctggagtg cagtggcgaa atccctgctc actgcagcct 1920 ccgcttccct ggttcaagcg attctcttgc ctcagcttcc ccagtagctg ggaccacagg 1980 tgcccgccac cacacccaac taatttttgt atttttagta gagacagggt ttcaccatgt 2040 tggccaggct gctctcaaac ccctgacctc aaatgatgtg cctgcttcag cctcccacag 2100 tgctgggatt acaggcatgg gccaccacgc ctagcctcac gctcctttct gatcttcact 2160 aagaacaaaa gaagcagcaa cttgcaaggg cggcctttcc cactggtcca tctggttttc 2220 tctccagggg tcttgcaaaa ttcctgacga gataagcagt tatgtgacct cacgtgcaaa 2280 gccaccaaca gccactcaga aaagacgcac cagcccagaa gtgcagaact gcagtcactg 2340 cacgttttca tctctaggga ccagaaccaa acccaccctt tctacttcca agacttattt 2400 tcacatgtgg ggaggttaat ctaggaatga ctcgtttaag gcctattttc atgatttctt 2460 tgtagcattt ggtgcttgac gtattattgt cctttgattc caaataatat gtttccttcc 2520 ctcaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaa 2554 <210> 82 <211> 327 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> transmembrane protease, serine 3 isoform 2 <400> 82 Met Cys Ser Asp Asp Trp Lys Gly His Tyr Ala Asn Val Ala Cys Ala 1 5 10 15 Gln Leu Gly Phe Pro Ser Tyr Val Ser Ser Asp Asn Leu Arg Val Ser 20 25 30 Ser Leu Glu Gly Gln Phe Arg Glu Glu Phe Val Ser Ile Asp His Leu 35 40 45 Leu Pro Asp Asp Lys Val Thr Ala Leu His His Ser Val Tyr Val Arg 50 55 60 Glu Gly Cys Ala Ser Gly His Val Val Thr Leu Gln Cys Thr Ala Cys 65 70 75 80 Gly His Arg Arg Gly Tyr Ser Ser Arg Ile Val Gly Gly Asn Met Ser 85 90 95 Leu Leu Ser Gln Trp Pro Trp Gln Ala Ser Leu Gln Phe Gln Gly Tyr 100 105 110 His Leu Cys Gly Gly Ser Val Ile Thr Pro Leu Trp Ile Ile Thr Ala 115 120 125 Ala His Cys Val Tyr Asp Leu Tyr Leu Pro Lys Ser Trp Thr Ile Gln 130 135 140 Val Gly Leu Val Ser Leu Leu Asp Asn Pro Ala Pro Ser His Leu Val 145 150 155 160 Glu Lys Ile Val Tyr His Ser Lys Tyr Lys Pro Lys Arg Leu Gly Asn 165 170 175 Asp Ile Ala Leu Met Lys Leu Ala Gly Pro Leu Thr Phe Asn Glu Met 180 185 190 Ile Gln Pro Val Cys Leu Pro Asn Ser Glu Glu Asn Phe Pro Asp Gly 195 200 205 Lys Val Cys Trp Thr Ser Gly Trp Gly Ala Thr Glu Asp Gly Ala Gly 210 215 220 Asp Ala Ser Pro Val Leu Asn His Ala Ala Val Pro Leu Ile Ser Asn 225 230 235 240 Lys Ile Cys Asn His Arg Asp Val Tyr Gly Gly Ile Ile Ser Pro Ser 245 250 255 Met Leu Cys Ala Gly Tyr Leu Thr Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly 260 265 270 Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Gln Glu Arg Arg Leu Trp Lys Leu 275 280 285 Val Gly Ala Thr Ser Phe Gly Ile Gly Cys Ala Glu Val Asn Lys Pro 290 295 300 Gly Val Tyr Thr Arg Val Thr Ser Phe Leu Asp Trp Ile His Glu Gln 305 310 315 320 Met Glu Arg Asp Leu Lys Thr 325 <210> 83 <211> 2135 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> transmembrane protease, serine 3 transcript variant C <400> 83 gcagggggac agttgttagt gttgcactct gaaagagctg ttggttaatt cctgccttcc 60 tcccttttcc cagtccactt cgactgctca gggaagtaca gatgtcgctc atcctttaag 120 tgtatcgagc tgatagctcg atgtgacgga gtctcggatt gcaaagacgg ggaggacgag 180 taccgctgtg tccgggtggg tggtcagaat gccgtgctcc aggtgttcac agctgcttcg 240 tggaagacca tgtgctccga tgactggaag ggtcactacg caaatgttgc ctgtgcccaa 300 ctgggtttcc caagctatgt gagttcagat aacctcagag tgagctcgct ggaggggcag 360 ttccgggagg agtttgtgtc catcgatcac ctcttgccag atgacaaggt gactgcatta 420 caccactcag tatatgtgag ggagggatgt gcctctggcc acgtggttac cttgcagtgc 480 acagcctgtg gtcatagaag gggctacagc tcacgcatcg tgggtggaaa catgtccttg 540 ctctcgcagt ggccctggca ggccagcctt cagttccagg gctaccacct gtgcgggggc 600 tctgtcatca cgcccctgtg gatcatcact gctgcacact gtgtttatga cttgtacctc 660 cccaagtcat ggaccatcca ggtgggtcta gtttccctgt tggacaatcc agccccatcc 720 cacttggtgg agaagattgt ctaccacagc aagtacaagc caaagaggct gggcaatgac 780 atcgccctta tgaagctggc cgggccactc acgttcaatg aaatgatcca gcctgtgtgc 840 ctgcccaact ctgaagagaa cttccccgat ggaaaagtgt gctggacgtc aggatggggg 900 gccacagagg atggagcagg tgacgcctcc cctgtcctga accacgcggc cgtccctttg 960 atttccaaca agatctgcaa ccacagggac gtgtacggtg gcatcatctc cccctccatg 1020 ctctgcgcgg gctacctgac gggtggcgtg gacagctgcc agggggacag cggggggccc 1080 ctggtgtgtc aagagaggag gctgtggaag ttagtgggag cgaccagctt tggcatcggc 1140 tgcgcagagg tgaacaagcc tggggtgtac acccgtgtca cctccttcct ggactggatc 1200 cacgagcaga tggagagaga cctaaaaacc tgaagaggaa ggggacaagt agccacctga 1260 gttcctgagg tgatgaagac agcccgatcc tcccctggac tcccgtgtag gaacctgcac 1320 acgagcagac acccttggag ctctgagttc cggcaccagt agcaggcccg aaagaggcac 1380 ccttccatct gattccagca caaccttcaa gctgcttttt gttttttgtt tttttgaggt 1440 ggagtctcgc tctgttgccc aggctggagt gcagtggcga aatccctgct cactgcagcc 1500 tccgcttccc tggttcaagc gattctcttg cctcagcttc cccagtagct gggaccacag 1560 gtgcccgcca ccacacccaa ctaatttttg tatttttagt agagacaggg tttcaccatg 1620 ttggccaggc tgctctcaaa cccctgacct caaatgatgt gcctgcttca gcctcccaca 1680 gtgctgggat tacaggcatg ggccaccacg cctagcctca cgctcctttc tgatcttcac 1740 taagaacaaa agaagcagca acttgcaagg gcggcctttc ccactggtcc atctggtttt 1800 ctctccaggg gtcttgcaaa attcctgacg agataagcag ttatgtgacc tcacgtgcaa 1860 agccaccaac agccactcag aaaagacgca ccagcccaga agtgcagaac tgcagtcact 1920 gcacgttttc atctctaggg accagaacca aacccaccct ttctacttcc aagacttatt 1980 ttcacatgtg gggaggttaa tctaggaatg actcgtttaa ggcctatttt catgatttct 2040 ttgtagcatt tggtgcttga cgtattattg tcctttgatt ccaaataata tgtttccttc 2100 cctcaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaa 2135 <210> 84 <211> 327 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> transmembrane protease, serine 3 isoform 2 <400> 84 Met Cys Ser Asp Asp Trp Lys Gly His Tyr Ala Asn Val Ala Cys Ala 1 5 10 15 Gln Leu Gly Phe Pro Ser Tyr Val Ser Ser Asp Asn Leu Arg Val Ser 20 25 30 Ser Leu Glu Gly Gln Phe Arg Glu Glu Phe Val Ser Ile Asp His Leu 35 40 45 Leu Pro Asp Asp Lys Val Thr Ala Leu His His Ser Val Tyr Val Arg 50 55 60 Glu Gly Cys Ala Ser Gly His Val Val Thr Leu Gln Cys Thr Ala Cys 65 70 75 80 Gly His Arg Arg Gly Tyr Ser Ser Arg Ile Val Gly Gly Asn Met Ser 85 90 95 Leu Leu Ser Gln Trp Pro Trp Gln Ala Ser Leu Gln Phe Gln Gly Tyr 100 105 110 His Leu Cys Gly Gly Ser Val Ile Thr Pro Leu Trp Ile Ile Thr Ala 115 120 125 Ala His Cys Val Tyr Asp Leu Tyr Leu Pro Lys Ser Trp Thr Ile Gln 130 135 140 Val Gly Leu Val Ser Leu Leu Asp Asn Pro Ala Pro Ser His Leu Val 145 150 155 160 Glu Lys Ile Val Tyr His Ser Lys Tyr Lys Pro Lys Arg Leu Gly Asn 165 170 175 Asp Ile Ala Leu Met Lys Leu Ala Gly Pro Leu Thr Phe Asn Glu Met 180 185 190 Ile Gln Pro Val Cys Leu Pro Asn Ser Glu Glu Asn Phe Pro Asp Gly 195 200 205 Lys Val Cys Trp Thr Ser Gly Trp Gly Ala Thr Glu Asp Gly Ala Gly 210 215 220 Asp Ala Ser Pro Val Leu Asn His Ala Ala Val Pro Leu Ile Ser Asn 225 230 235 240 Lys Ile Cys Asn His Arg Asp Val Tyr Gly Gly Ile Ile Ser Pro Ser 245 250 255 Met Leu Cys Ala Gly Tyr Leu Thr Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly 260 265 270 Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Gln Glu Arg Arg Leu Trp Lys Leu 275 280 285 Val Gly Ala Thr Ser Phe Gly Ile Gly Cys Ala Glu Val Asn Lys Pro 290 295 300 Gly Val Tyr Thr Arg Val Thr Ser Phe Leu Asp Trp Ile His Glu Gln 305 310 315 320 Met Glu Arg Asp Leu Lys Thr 325 <210> 85 <211> 1359 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> transmembrane protease, serine 3 transcript variant D <400> 85 accgggcacc ggacggctcg ggtactttcg ttcttaatta ggtcatgccc gtgtgagcca 60 ggaaagggct gtgtttatgg gaagccagta acactgtggc ctactatctc ttccgtggtg 120 ccatctacat ttttgggact cgggaattat gaggtagagg tggaggcgga gccggatgtc 180 agaggtcctg aaatagtcac catgggggaa aatgatccgc ctgctgttga agcccccttc 240 tcattccgat cgctttttgg ccttgatgat ttgaaaataa gtcctgttgc accagatgca 300 gatgctgttg ctgcacagat cctgtcactg ctgccattga agttttttcc aatcatcgtc 360 attgggatca ttgcattgat attagcactg gccattggtc tgggcatcca cttcgactgc 420 tcagggaagt acagatgtcg ctcatccttt aagtgtatcg agctgatagc tcgatgtgac 480 ggagtctcgg attgcaaaga cggggaggac gagtaccgct gtgtccgggt gggtggtcag 540 aatgccgtgc tccaggtgtt cacagctgct tcgtggaaga ccatgtgctc cgatgactgg 600 aagggtcact acgcaaatgt tgcctgtgcc caactgggtt tcccaagcta tgtgagttca 660 gataacctca gagtgagctc gctggagggg cagttccggg aggagtttgt gtccatcgat 720 cacctcttgc cagatgacaa ggtgactgca ttacaccact cagtatatgt gagggaggga 780 tgtgcctctg gccacgtggt taccttgcag tgcacagcct gtggtcatag aaggggctac 840 agctcacgca tcgtgggtgg aaacatgtcc ttgctctcgc agtggccctg gcaggccagc 900 cttcagttcc agggctacca cctgtgcggg ggctctgtca tcacgcccct gtggatcatc 960 actgctgcac actgtgttta tgacttgtac ctccccaagt catggaccat ccaggtgggt 1020 ctagtttccc tgttggacaa tccagcccca tcccacttgg tggagaagat tgtctaccac 1080 agcaagtaca agccaaagag gctgggcaat gacatcgccc ttatgaagct ggccgggcca 1140 ctcacgttca atggtacatc tgggtctcta tgtggttctg cagctcttcc tttgtttcaa 1200 gaggatttgc aattgctcat tgaagcattc ttatgatggc tgctttataa tccttgtcag 1260 atattaataa ttccaactcc tgattcatgt tggtgttggc atcagttgat tatcttttct 1320 cattaaaatt gtgatgctcc taaaaaaaaa aaaaaaaaa 1359 <210> 86 <211> 344 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> transmembrane protease, serine 3 isoform 3 <400> 86 Met Gly Glu Asn Asp Pro Pro Ala Val Glu Ala Pro Phe Ser Phe Arg 1 5 10 15 Ser Leu Phe Gly Leu Asp Asp Leu Lys Ile Ser Pro Val Ala Pro Asp 20 25 30 Ala Asp Ala Val Ala Ala Gln Ile Leu Ser Leu Leu Pro Leu Lys Phe 35 40 45 Phe Pro Ile Ile Val Ile Gly Ile Ile Ala Leu Ile Leu Ala Leu Ala 50 55 60 Ile Gly Leu Gly Ile His Phe Asp Cys Ser Gly Lys Tyr Arg Cys Arg 65 70 75 80 Ser Ser Phe Lys Cys Ile Glu Leu Ile Ala Arg Cys Asp Gly Val Ser 85 90 95 Asp Cys Lys Asp Gly Glu Asp Glu Tyr Arg Cys Val Arg Val Gly Gly 100 105 110 Gln Asn Ala Val Leu Gln Val Phe Thr Ala Ala Ser Trp Lys Thr Met 115 120 125 Cys Ser Asp Asp Trp Lys Gly His Tyr Ala Asn Val Ala Cys Ala Gln 130 135 140 Leu Gly Phe Pro Ser Tyr Val Ser Ser Asp Asn Leu Arg Val Ser Ser 145 150 155 160 Leu Glu Gly Gln Phe Arg Glu Glu Phe Val Ser Ile Asp His Leu Leu 165 170 175 Pro Asp Asp Lys Val Thr Ala Leu His His Ser Val Tyr Val Arg Glu 180 185 190 Gly Cys Ala Ser Gly His Val Val Thr Leu Gln Cys Thr Ala Cys Gly 195 200 205 His Arg Arg Gly Tyr Ser Ser Arg Ile Val Gly Gly Asn Met Ser Leu 210 215 220 Leu Ser Gln Trp Pro Trp Gln Ala Ser Leu Gln Phe Gln Gly Tyr His 225 230 235 240 Leu Cys Gly Gly Ser Val Ile Thr Pro Leu Trp Ile Ile Thr Ala Ala 245 250 255 His Cys Val Tyr Asp Leu Tyr Leu Pro Lys Ser Trp Thr Ile Gln Val 260 265 270 Gly Leu Val Ser Leu Leu Asp Asn Pro Ala Pro Ser His Leu Val Glu 275 280 285 Lys Ile Val Tyr His Ser Lys Tyr Lys Pro Lys Arg Leu Gly Asn Asp 290 295 300 Ile Ala Leu Met Lys Leu Ala Gly Pro Leu Thr Phe Asn Gly Thr Ser 305 310 315 320 Gly Ser Leu Cys Gly Ser Ala Ala Leu Pro Leu Phe Gln Glu Asp Leu 325 330 335 Gln Leu Leu Ile Glu Ala Phe Leu 340 <210> 87 <211> 1191 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein hK15 transcript variant 1 <400> 87 actgcagccg aaccctggtc cctcctccac aatgtggctt ctcctcactc tctccttcct 60 gctggcatcc acagcagccc aggatggtga caagttgctg gaaggtgacg agtgtgcacc 120 ccactcccag ccatggcaag tggctctcta cgagcgtgga cgctttaact gtggcgcttc 180 cctcatctcc ccacactggg tgctgtctgc ggcccactgc caaagccgct tcatgagagt 240 gcgcctggga gagcacaacc tgcgcaagcg cgatggccca gagcaactac ggaccacgtc 300 tcgggtcatt ccacacccgc gctacgaagc gcgcagccac cgcaacgaca tcatgttgct 360 gcgcctagtc cagcccgcac gcctgaaccc ccagtgagtc tcccagatac gttgcattgt 420 gccaacatca gcattatctc ggacacatct tgtgacaaga gctacccagg gcgcctgaca 480 aacaccatgg tgtgtgcagg cgcggagggc agaggcgcag aatcctgtga gggtgactct 540 gggggacccc tggtctgtgg gggcatcctg cagggcattg tgtcctgggg tgacgtccct 600 tgtgacaaca ccaccaagcc tggtgtctat accaaagtct gccactactt ggagtggatc 660 agggaaacca tgaagaggaa ctgactattc tagcctatct cctgtgcccc tgactgagca 720 gaagccccca cagctggcca gcagccccgc ctgacatgga acagaacgga gccatccccc 780 aagaccctgt ccaaggccca gatgttagcc aaggacttgt cccacctgag gacaaagctg 840 gcgctcaagg tcacctgttt aatgccaaga taacaaagcg ctgatccaag ttgctctgta 900 ggaatttctg tgactttttt ctggggtcaa agagaaaccc cgagacactg tacactgttc 960 cttttcaccc accaccccga tccctaggtg aggagaagcg gcttgaagca gggctccatt 1020 cattcaacac acatgaccac ccgtgtgatc ttgaacaaga ggcccaatct cacttcgcct 1080 tggtttcctt atctgtaaaa tgagaccatc ttattgctga cttcaaaggg ctgttgtgag 1140 gattaaatga gatgattcgt ctgaactgat taaaatcgtg tctggcactg a 1191 <210> 88 <211> 121 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein hK15 isoform 1 <400> 88 Met Trp Leu Leu Leu Thr Leu Ser Phe Leu Leu Ala Ser Thr Ala Ala 1 5 10 15 Gln Asp Gly Asp Lys Leu Leu Glu Gly Asp Glu Cys Ala Pro His Ser 20 25 30 Gln Pro Trp Gln Val Ala Leu Tyr Glu Arg Gly Arg Phe Asn Cys Gly 35 40 45 Ala Ser Leu Ile Ser Pro His Trp Val Leu Ser Ala Ala His Cys Gln 50 55 60 Ser Arg Phe Met Arg Val Arg Leu Gly Glu His Asn Leu Arg Lys Arg 65 70 75 80 Asp Gly Pro Glu Gln Leu Arg Thr Thr Ser Arg Val Ile Pro His Pro 85 90 95 Arg Tyr Glu Ala Arg Ser His Arg Asn Asp Ile Met Leu Leu Arg Leu 100 105 110 Val Gln Pro Ala Arg Leu Asn Pro Gln 115 120 <210> 89 <211> 1172 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein hK15 transcript variant 2 <400> 89 actgcagccg aaccctggtc cctcctccac aatgtggctt ctcctcactc tctccttcct 60 gctggcatcc acagcagccc aggatggtga caagttgctg gaaggtgacg agtgtgcacc 120 ccactcccag ccatggcaag tggctctcta cgagcgtgga cgctttaact gtggcgcttc 180 cctcatctcc ccacactggg tgctgtctgc ggcccactgc caaagccgct tcatgagagt 240 gcgcctggga gagcacaacc tgcgcaagcg cgatggccca gagcaactac ggaccacgtc 300 tcgggtcatt ccacacccgc gctacgaagc gcgcagccac cgcaacgaca tcatgttgct 360 gcgcctagtc cagcccgcac gcctgaaccc ccaggtgcgc cccgcggtgc tacccacgcg 420 ttgcccccac ccgggggagg cctgtgtggt gtctggctgg ggcctggtgt cccacaacga 480 gcctgggacc gctgggagcc cccggtcaca agggtgactc tgggggaccc ctggtctgtg 540 ggggcatcct gcagggcatt gtgtcctggg gtgacgtccc ttgtgacaac accaccaagc 600 ctggtgtcta taccaaagtc tgccactact tggagtggat cagggaaacc atgaagagga 660 actgactatt ctagcctatc tcctgtgccc ctgactgagc agaagccccc acagctggcc 720 agcagccccg cctgacatgg aacagaacgg agccatcccc caagaccctg tccaaggccc 780 agatgttagc caaggacttg tcccacctga ggacaaagct ggcgctcaag gtcacctgtt 840 taatgccaag ataacaaagc gctgatccaa gttgctctgt aggaatttct gtgacttttt 900 tctggggtca aagagaaacc ccgagacact gtacactgtt ccttttcacc caccaccccg 960 atccctaggt gaggagaagc ggcttgaagc agggctccat tcattcaaca cacatgacca 1020 cccgtgtgat cttgaacaag aggcccaatc tcacttcgcc ttggtttcct tatctgtaaa 1080 atgagaccat cttattgctg acttcaaagg gctgttgtga ggattaaatg agatgattcg 1140 tctgaactga ttaaaatcgt gtctggcact ga 1172 <210> 90 <211> 161 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein hK15 isoform 2 <400> 90 Met Trp Leu Leu Leu Thr Leu Ser Phe Leu Leu Ala Ser Thr Ala Ala 1 5 10 15 Gln Asp Gly Asp Lys Leu Leu Glu Gly Asp Glu Cys Ala Pro His Ser 20 25 30 Gln Pro Trp Gln Val Ala Leu Tyr Glu Arg Gly Arg Phe Asn Cys Gly 35 40 45 Ala Ser Leu Ile Ser Pro His Trp Val Leu Ser Ala Ala His Cys Gln 50 55 60 Ser Arg Phe Met Arg Val Arg Leu Gly Glu His Asn Leu Arg Lys Arg 65 70 75 80 Asp Gly Pro Glu Gln Leu Arg Thr Thr Ser Arg Val Ile Pro His Pro 85 90 95 Arg Tyr Glu Ala Arg Ser His Arg Asn Asp Ile Met Leu Leu Arg Leu 100 105 110 Val Gln Pro Ala Arg Leu Asn Pro Gln Val Arg Pro Ala Val Leu Pro 115 120 125 Thr Arg Cys Pro His Pro Gly Glu Ala Cys Val Val Ser Gly Trp Gly 130 135 140 Leu Val Ser His Asn Glu Pro Gly Thr Ala Gly Ser Pro Arg Ser Gln 145 150 155 160 Gly <210> 91 <211> 1054 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein hK15 transcript variant 3 <400> 91 actgcagccg aaccctggtc cctcctccac aatgtggctt ctcctcactc tctccttcct 60 gctggcatcc acagcagccc aggatggtga caagttgctg gaaggtgacg agtgtgcacc 120 ccactcccag ccatggcaag tggctctcta cgagcgtgga cgctttaact gtggcgcttc 180 cctcatctcc ccacactggg tgctgtctgc ggcccactgc caaagccgct tcatgagagt 240 gcgcctggga gagcacaacc tgcgcaagcg cgatggccca gagcaactac ggaccacgtc 300 tcgggtcatt ccacacccgc gctacgaagc gcgcagccac cgcaacgaca tcatgttgct 360 gcgcctagtc cagcccgcac gcctgaaccc ccagggtgac tctgggggac ccctggtctg 420 tgggggcatc ctgcagggca ttgtgtcctg gggtgacgtc ccttgtgaca acaccaccaa 480 gcctggtgtc tataccaaag tctgccacta cttggagtgg atcagggaaa ccatgaagag 540 gaactgacta ttctagccta tctcctgtgc ccctgactga gcagaagccc ccacagctgg 600 ccagcagccc cgcctgacat ggaacagaac ggagccatcc cccaagaccc tgtccaaggc 660 ccagatgtta gccaaggact tgtcccacct gaggacaaag ctggcgctca aggtcacctg 720 tttaatgcca agataacaaa gcgctgatcc aagttgctct gtaggaattt ctgtgacttt 780 tttctggggt caaagagaaa ccccgagaca ctgtacactg ttccttttca cccaccaccc 840 cgatccctag gtgaggagaa gcggcttgaa gcagggctcc attcattcaa cacacatgac 900 cacccgtgtg atcttgaaca agaggcccaa tctcacttcg ccttggtttc cttatctgta 960 aaatgagacc atcttattgc tgacttcaaa gggctgttgt gaggattaaa tgagatgatt 1020 cgtctgaact gattaaaatc gtgtctggca ctga 1054 <210> 92 <211> 171 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein hK15 isoform 3 <400> 92 Met Trp Leu Leu Leu Thr Leu Ser Phe Leu Leu Ala Ser Thr Ala Ala 1 5 10 15 Gln Asp Gly Asp Lys Leu Leu Glu Gly Asp Glu Cys Ala Pro His Ser 20 25 30 Gln Pro Trp Gln Val Ala Leu Tyr Glu Arg Gly Arg Phe Asn Cys Gly 35 40 45 Ala Ser Leu Ile Ser Pro His Trp Val Leu Ser Ala Ala His Cys Gln 50 55 60 Ser Arg Phe Met Arg Val Arg Leu Gly Glu His Asn Leu Arg Lys Arg 65 70 75 80 Asp Gly Pro Glu Gln Leu Arg Thr Thr Ser Arg Val Ile Pro His Pro 85 90 95 Arg Tyr Glu Ala Arg Ser His Arg Asn Asp Ile Met Leu Leu Arg Leu 100 105 110 Val Gln Pro Ala Arg Leu Asn Pro Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu 115 120 125 Val Cys Gly Gly Ile Leu Gln Gly Ile Val Ser Trp Gly Asp Val Pro 130 135 140 Cys Asp Asn Thr Thr Lys Pro Gly Val Tyr Thr Lys Val Cys His Tyr 145 150 155 160 Leu Glu Trp Ile Arg Glu Thr Met Lys Arg Asn 165 170 <210> 93 <211> 1309 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein hK15 transcript variant 4 <400> 93 actgcagccg aaccctggtc cctcctccac aatgtggctt ctcctcactc tctccttcct 60 gctggcatcc acagcagccc aggatggtga caagttgctg gaaggtgacg agtgtgcacc 120 ccactcccag ccatggcaag tggctctcta cgagcgtgga cgctttaact gtggcgcttc 180 cctcatctcc ccacactggg tgctgtctgc ggcccactgc caaagccgct tcatgagagt 240 gcgcctggga gagcacaacc tgcgcaagcg cgatggccca gagcaactac ggaccacgtc 300 tcgggtcatt ccacacccgc gctacgaagc gcgcagccac cgcaacgaca tcatgttgct 360 gcgcctagtc cagcccgcac gcctgaaccc ccaggtgcgc cccgcggtgc tacccacgcg 420 ttgcccccac ccgggggagg cctgtgtggt gtctggctgg ggcctggtgt cccacaacga 480 gcctgggacc gctgggagcc cccggtcaca agtgagtctc ccagatacgt tgcattgtgc 540 caacatcagc attatctcgg acacatcttg tgacaagagc tacccagggc gcctgacaaa 600 caccatggtg tgtgcaggcg cggagggcag aggcgcagaa tcctgtgagg gtgactctgg 660 gggacccctg gtctgtgggg gcatcctgca gggcattgtg tcctggggtg acgtcccttg 720 tgacaacacc accaagcctg gtgtctatac caaagtctgc cactacttgg agtggatcag 780 ggaaaccatg aagaggaact gactattcta gcctatctcc tgtgcccctg actgagcaga 840 agcccccaca gctggccagc agccccgcct gacatggaac agaacggagc catcccccaa 900 gaccctgtcc aaggcccaga tgttagccaa ggacttgtcc cacctgagga caaagctggc 960 gctcaaggtc acctgtttaa tgccaagata acaaagcgct gatccaagtt gctctgtagg 1020 aatttctgtg acttttttct ggggtcaaag agaaaccccg agacactgta cactgttcct 1080 tttcacccac caccccgatc cctaggtgag gagaagcggc ttgaagcagg gctccattca 1140 ttcaacacac atgaccaccc gtgtgatctt gaacaagagg cccaatctca cttcgccttg 1200 gtttccttat ctgtaaaatg agaccatctt attgctgact tcaaagggct gttgtgagga 1260 ttaaatgaga tgattcgtct gaactgatta aaatcgtgtc tggcactga 1309 <210> 94 <211> 256 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein hK15 isoform 4 <400> 94 Met Trp Leu Leu Leu Thr Leu Ser Phe Leu Leu Ala Ser Thr Ala Ala 1 5 10 15 Gln Asp Gly Asp Lys Leu Leu Glu Gly Asp Glu Cys Ala Pro His Ser 20 25 30 Gln Pro Trp Gln Val Ala Leu Tyr Glu Arg Gly Arg Phe Asn Cys Gly 35 40 45 Ala Ser Leu Ile Ser Pro His Trp Val Leu Ser Ala Ala His Cys Gln 50 55 60 Ser Arg Phe Met Arg Val Arg Leu Gly Glu His Asn Leu Arg Lys Arg 65 70 75 80 Asp Gly Pro Glu Gln Leu Arg Thr Thr Ser Arg Val Ile Pro His Pro 85 90 95 Arg Tyr Glu Ala Arg Ser His Arg Asn Asp Ile Met Leu Leu Arg Leu 100 105 110 Val Gln Pro Ala Arg Leu Asn Pro Gln Val Arg Pro Ala Val Leu Pro 115 120 125 Thr Arg Cys Pro His Pro Gly Glu Ala Cys Val Val Ser Gly Trp Gly 130 135 140 Leu Val Ser His Asn Glu Pro Gly Thr Ala Gly Ser Pro Arg Ser Gln 145 150 155 160 Val Ser Leu Pro Asp Thr Leu His Cys Ala Asn Ile Ser Ile Ile Ser 165 170 175 Asp Thr Ser Cys Asp Lys Ser Tyr Pro Gly Arg Leu Thr Asn Thr Met 180 185 190 Val Cys Ala Gly Ala Glu Gly Arg Gly Ala Glu Ser Cys Glu Gly Asp 195 200 205 Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Gly Gly Ile Leu Gln Gly Ile Val Ser 210 215 220 Trp Gly Asp Val Pro Cys Asp Asn Thr Thr Lys Pro Gly Val Tyr Thr 225 230 235 240 Lys Val Cys His Tyr Leu Glu Trp Ile Arg Glu Thr Met Lys Arg Asn 245 250 255 <210> 95 <211> 920 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Mername-AA031 peptidase <400> 95 cagacaggag gcgtctgtag agatatcatg aacttcaact tagctttgtt ttccagagac 60 tggagctaaa ctgggctttc aacatcatca tgaagtttat cctcctctgg gccctcttga 120 atctgactgt tgctttggcc tttaatccag attacacagt cagctccact cccccttact 180 tggtctattt gaaatctgac tacttgccct gcgctggagt cctgatccac ccgctttggg 240 tgatcacagc tgcacactgc aatttaccaa agcttcgggt gatattgggg gttacaatcc 300 cagcagactc taatgaaaag catctgcaag tgattggcta tgagaagatg attcatcatc 360 cacacttctc agtcacttct attgatcatg acatcatgct aatcaagctg aaaacagagg 420 ctgaactcaa tgactatgtg aaattagcca acctgcccta ccaaactatc tctgaaaata 480 ccatgtgctc tgtctctacc tggagctaca atgtgtgtga tatctacaaa gagcccgatt 540 cactgcaaac tgtgaacatc tctgtaatct ccaagcctca gtgtcgcgat gcctataaaa 600 cctacaacat cacggaaaat atgctgtgtg tgggcattgt gccaggaagg aggcagccct 660 gcaaggaagt ttctgctgcc ccggcaatct gcaatgggat gcttcaagga atcctgtctt 720 ttgcggatgg atgtgttttg agagccgatg ttggcatcta tgccaaaatt ttttactata 780 taccctggat tgaaaatgta atccaaaata actgagctgt ggcagttgtg gaccatatga 840 cacagcttgt ccccatcgtt cacctttaga attaaatata aattaactcc tcaaaaaaaa 900 aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 920 <210> 96 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mername-AA031 peptidase <400> 96 Met Lys Phe Ile Leu Leu Trp Ala Leu Leu Asn Leu Thr Val Ala Leu 1 5 10 15 Ala Phe Asn Pro Asp Tyr Thr Val Ser Ser Thr Pro Pro Tyr Leu Val 20 25 30 Tyr Leu Lys Ser Asp Tyr Leu Pro Cys Ala Gly Val Leu Ile His Pro 35 40 45 Leu Trp Val Ile Thr Ala Ala His Cys Asn Leu Pro Lys Leu Arg Val 50 55 60 Ile Leu Gly Val Thr Ile Pro Ala Asp Ser Asn Glu Lys His Leu Gln 65 70 75 80 Val Ile Gly Tyr Glu Lys Met Ile His His Pro His Phe Ser Val Thr 85 90 95 Ser Ile Asp His Asp Ile Met Leu Ile Lys Leu Lys Thr Glu Ala Glu 100 105 110 Leu Asn Asp Tyr Val Lys Leu Ala Asn Leu Pro Tyr Gln Thr Ile Ser 115 120 125 Glu Asn Thr Met Cys Ser Val Ser Thr Trp Ser Tyr Asn Val Cys Asp 130 135 140 Ile Tyr Lys Glu Pro Asp Ser Leu Gln Thr Val Asn Ile Ser Val Ile 145 150 155 160 Ser Lys Pro Gln Cys Arg Asp Ala Tyr Lys Thr Tyr Asn Ile Thr Glu 165 170 175 Asn Met Leu Cys Val Gly Ile Val Pro Gly Arg Arg Gln Pro Cys Lys 180 185 190 Glu Val Ser Ala Ala Pro Ala Ile Cys Asn Gly Met Leu Gln Gly Ile 195 200 205 Leu Ser Phe Ala Asp Gly Cys Val Leu Arg Ala Asp Val Gly Ile Tyr 210 215 220 Ala Lys Ile Phe Tyr Tyr Ile Pro Trp Ile Glu Asn Val Ile Gln Asn 225 230 235 240 Asn <210> 97 <211> 2393 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> membrane-type mosaic serine protease <400> 97 cgcccgggca ggttgagaag ccaggggcca agatggatct tctcctcgac atcagctaag 60 cctggaggac tcttcccctc agagaccatg gagagggaca gccacgggaa tgcatctcca 120 gcaagaacac cttcagctgg agcatctcca gcccaggcat ctccagctgg gacacctcca 180 ggccgggcat ctccagccca ggcatctcca gcccaggcat ctccagctgg gacacctccg 240 ggccgggcat ctccagccca ggcatctcca gctggtacac ctccaggccg ggcatctcca 300 ggccgggcat ctccagccca ggcatctcca gcccgggcat ctccggctct ggcatcactt 360 tccaggtcct catccggcag gtcatcatcc gccaggtcag cctcggtgac aacctcccca 420 accagagtgt accttgttag agcaacacca gtgggggctg tacccatccg atcatctcct 480 gccaggtcag caccagcaac cagggccacc agggagagcc caggtacgag cctgcccaag 540 ttcacctggc gggagggcca gaagcagcta ccgctcatcg ggtgcgtgct cctcctcatt 600 gccctggtgg tttcgctcat catcctcttc cagttctggc agggccacac agggatcagg 660 cacaaggagc agagggagag ctgtcccaag cacgctgttc gctgtgacgg ggtggtggac 720 tgcaagctga agagtgacga gctgggctgc gtgaggtttg actgggacaa gtctctgctt 780 aaaatctact ctgggtcctc ccatcagtgg cttcccatct gtagcagcaa ctggaatgac 840 tcctactcag agaagacctg ccagcagctg ggtttcgaga gtgctcaccg gacaaccgag 900 gttgcccaca gggattttgc caacagcttc tcaatcttga gatacaactc caccatccag 960 gaaagcctcc acaggtctga atgcccttcc cagcggtata tctccctcca gtgttcccac 1020 tgcggactga gggccatgac cgggcggatc gtgggagggg cgctggcctc ggatagcaag 1080 tggccttggc aagtgagtct gcacttcggc accacccaca tctgtggagg cacgctcatt 1140 gacgcccagt gggtgctcac tgccgcccac tgcttcttcg tgacccggga gaaggtcctg 1200 gagggctgga aggtgtacgc gggcaccagc aacctgcacc agttgcctga ggcagcctcc 1260 attgccgaga tcatcatcaa cagcaattac accgatgagg aggacgacta tgacatcgcc 1320 ctcatgcggc tgtccaagcc cctgaccctg tccgctcaca tccaccctgc ttgcctcccc 1380 atgcatggac agacctttag cctcaatgag acctgctgga tcacaggctt tggcaagacc 1440 agggagacag atgacaagac atcccccttc ctccgggagg tgcaggtcaa tctcatcgac 1500 ttcaagaaat gcaatgacta cttggtctat gacagttacc ttaccccaag gatgatgtgt 1560 gctggggacc ttcgtggggg cagagactcc tgccagggag acagcggggg gcctcttgtc 1620 tgtgagcaga acaaccgctg gtacctggca ggtgtcacca gctggggcac aggctgtggc 1680 cagagaaaca aacctggtgt gtacaccaaa gtgacagaag ttcttccctg gatttacagc 1740 aagatggagg taagatccct gcagcaggac actgcaccca gcaggctggg aacttcctca 1800 ggtggggacc ctggaggagc acccagggtg taggcagagg tcccctcagc gtccccatat 1860 tcggggggtg ttctggacag ggtcaaatgt gatgcctggg gtcaatccca gctgtctgtg 1920 tttctttccc tgcttttctt ccctcagaac agagctcagc gggttgaaaa agggtggacc 1980 tacaggccag gcaggcagtt gctgggcaga tgttctccca gaagtatttt tttgtgtaag 2040 gttgcaatgg actttgaaaa cgtttcagtt tctgcagagg attttgtgat agtctttgtt 2100 atcaagcatt tatgcatggg aatccgctct tcatggcctt tcccagctct gtttgtttta 2160 gtctttttga ttttcttttt gttgttgttg ttgtcttttt ttaaaaacac aagtgactcc 2220 attttaactc tgacaacttt cacagctgtc accagaatgc tccctgagaa ctaccattct 2280 ttccctttcc cacttaaaat atttcatcag aacctcacca ctatcataaa agagtataaa 2340 gtaataaaat aataaaaagc gaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaa 2393 <210> 98 <211> 581 <212> PRT <213> Homo Sapiens <220> <223> membrane-type mosaic serine protease <400> 98 Met Glu Arg Asp Ser His Gly Asn Ala Ser Pro Ala Arg Thr Pro Ser 1 5 10 15 Ala Gly Ala Ser Pro Ala Gln Ala Ser Pro Ala Gly Thr Pro Pro Gly 20 25 30 Arg Ala Ser Pro Ala Gln Ala Ser Pro Ala Gln Ala Ser Pro Ala Gly 35 40 45 Thr Pro Pro Gly Arg Ala Ser Pro Ala Gln Ala Ser Pro Ala Gly Thr 50 55 60 Pro Pro Gly Arg Ala Ser Pro Gly Arg Ala Ser Pro Ala Gln Ala Ser 65 70 75 80 Pro Ala Arg Ala Ser Pro Ala Leu Ala Ser Leu Ser Arg Ser Ser Ser 85 90 95 Gly Arg Ser Ser Ser Ala Arg Ser Ala Ser Val Thr Thr Ser Pro Thr 100 105 110 Arg Val Tyr Leu Val Arg Ala Thr Pro Val Gly Ala Val Pro Ile Arg 115 120 125 Ser Ser Pro Ala Arg Ser Ala Pro Ala Thr Arg Ala Thr Arg Glu Ser 130 135 140 Pro Gly Thr Ser Leu Pro Lys Phe Thr Trp Arg Glu Gly Gln Lys Gln 145 150 155 160 Leu Pro Leu Ile Gly Cys Val Leu Leu Leu Ile Ala Leu Val Val Ser 165 170 175 Leu Ile Ile Leu Phe Gln Phe Trp Gln Gly His Thr Gly Ile Arg His 180 185 190 Lys Glu Gln Arg Glu Ser Cys Pro Lys His Ala Val Arg Cys Asp Gly 195 200 205 Val Val Asp Cys Lys Leu Lys Ser Asp Glu Leu Gly Cys Val Arg Phe 210 215 220 Asp Trp Asp Lys Ser Leu Leu Lys Ile Tyr Ser Gly Ser Ser His Gln 225 230 235 240 Trp Leu Pro Ile Cys Ser Ser Asn Trp Asn Asp Ser Tyr Ser Glu Lys 245 250 255 Thr Cys Arg Gln Leu Gly Phe Glu Ser Ala His Arg Thr Thr Glu Val 260 265 270 Ala His Arg Asp Phe Ala Asn Ser Phe Ser Ile Leu Arg Tyr Asn Ser 275 280 285 Thr Ile Gln Glu Ser Leu His Arg Ser His Cys Pro Ser Gln Arg Tyr 290 295 300 Ile Ser Leu Gln Cys Ser His Cys Gly Leu Arg Ala Met Thr Gly Arg 305 310 315 320 Ile Val Gly Gly Ala Leu Ala Ser Asp Ser Lys Trp Pro Trp Gln Val 325 330 335 Ser Leu His Phe Gly Thr Thr His Ile Cys Gly Gly Thr Leu Ile Asp 340 345 350 Ala Gln Trp Val Leu Thr Ala Ala His Cys Phe Phe Val Thr Arg Glu 355 360 365 Lys Val Leu Glu Gly Trp Lys Val Tyr Ala Gly Thr Ser Asn Leu His 370 375 380 Gln Leu Pro Glu Ala Ala Ser Ile Ala Glu Ile Ile Ile Asn Ser Asn 385 390 395 400 Tyr Thr Asp Glu Glu Asp Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Met Arg Leu Ser 405 410 415 Lys Pro Leu Thr Leu Ser Ala His Ile His Pro Ala Cys Leu Pro Met 420 425 430 His Gly Gln Thr Phe Ser Leu Asn Glu Thr Cys Trp Ile Thr Gly Phe 435 440 445 Gly Lys Thr Arg Glu Thr Asp Asp Lys Thr Ser Pro Phe Leu Arg Glu 450 455 460 Val Gln Val Asn Leu Ile Asp Phe Lys Lys Cys Asn Asp Tyr Leu Val 465 470 475 480 Tyr Asp Ser Tyr Leu Thr Pro Arg Met Met Cys Ala Gly Asp Leu His 485 490 495 Gly Gly Arg Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys 500 505 510 Glu Gln Asn Asn Arg Trp Tyr Leu Ala Gly Val Thr Ser Trp Gly Thr 515 520 525 Gly Cys Gly Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Lys Val Thr Glu 530 535 540 Val Leu Pro Trp Ile Tyr Ser Lys Met Glu Val Arg Ser Leu Gln Gln 545 550 555 560 Asp Thr Ala Pro Ser Arg Leu Gly Thr Ser Ser Gly Gly Asp Pro Gly 565 570 575 Gly Ala Pro Arg Val 580 <210> 99 <211> 148 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> mername-AA038 peptidase <400> 99 Cys Gly Lys Pro Lys Val Val Gly Lys Ile Tyr Gly Gly Arg Asp Ala 1 5 10 15 Ala Ala Gly Gln Trp Pro Trp Gln Ala Ser Leu Leu Tyr Trp Gly Ser 20 25 30 His Leu Cys Gly Ala Val Leu Ile Asp Ser Cys Trp Leu Val Ser Thr 35 40 45 Thr His Cys Phe Leu Asn Lys Ser Gln Ala Pro Lys Asn Tyr Gln Val 50 55 60 Leu Leu Gly Asn Ile Gln Leu Tyr His Gln Thr Gln His Thr Gln Lys 65 70 75 80 Met Ser Val His Arg Ile Ile Thr His Pro Asp Phe Glu Lys Leu His 85 90 95 Pro Phe Gly Ser Asp Ile Ala Met Leu Gln Leu His Leu Pro Met Asn 100 105 110 Phe Thr Ser Tyr Ile Val Pro Val Cys Leu Pro Ser Arg Asp Met Gln 115 120 125 Leu Pro Ser Asn Val Ser Cys Trp Ile Thr Gly Trp Gly Met Ala Ile 130 135 140 Leu Gly Gly Leu 145 <210> 100 <211> 712 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> mername-AA128 peptidase <400> 100 cacagagggc tccagcgtga ttgccactgg ttaatgacct gccacccccg cccccccaac 60 ctctggtgcc gtccaaggac tctgacccca gtgcagtgtc tgtagggaag aggagccatg 120 gggcttcggg caggccccat cctgcttctg ctgctgtggc tgctgccaga atgcggccac 180 tccaaggagg ccgggaggat tgtgggaggc caagacaccc aggaaggacg ctggccgtgg 240 caggttggcc tgtggttgac ctcagtgggg catgtatgtg ggggcttcct catccaccca 300 cgctgggtgc tcacagccgc ccactgcttc ctgagggtga ctccgggggg ccgctggtct 360 gccccatcaa tgatacgtgg atccaggccg gcattgtgag ctggggattc ggctgtgccc 420 ggcctttccg gcctggtgtc tacacccagg tgctaagcta cacagactgg attcagagaa 480 ccctggctga atctcactca ggcatgtctg gggcccgccc aggtgcccca ggatcccact 540 caggcacctc cagatcccac ccagtgctgc tgcttgagct gttgaccgta tgcttgcttg 600 ggtccctgtg aaccatgagc catggagtcc gggatcccct ttctggtagg attgatggaa 660 tctaataata aaaactgtag gttttttatg tgaaaaaaaa aaaaaaaaaa aa 712 <210> 101 <211> 146 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> mername-AA128 peptidase <400> 101 Met Arg Pro Leu Gln Gly Gly Arg Glu Asp Cys Gly Arg Pro Arg His 1 5 10 15 Pro Gly Arg Thr Leu Ala Val Ala Gly Trp Pro Val Val Asp Leu Ser 20 25 30 Gly Ala Cys Met Trp Gly Leu Pro His Pro Pro Thr Leu Gly Ala His 35 40 45 Ser Arg Pro Leu Leu Pro Glu Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys 50 55 60 Pro Ile Asn Asp Thr Trp Ile Gln Ala Gly Ile Val Ser Trp Gly Phe 65 70 75 80 Gly Cys Ala Arg Pro Phe Arg Pro Gly Val Tyr Thr Gln Val Leu Ser 85 90 95 Tyr Thr Asp Trp Ile Gln Arg Thr Leu Ala Glu Ser His Ser Gly Met 100 105 110 Ser Gly Ala Arg Pro Gly Ala Pro Gly Ser His Ser Gly Thr Ser Arg 115 120 125 Ser His Pro Val Leu Leu Leu Glu Leu Leu Thr Val Cys Leu Leu Gly 130 135 140 Ser Leu 145 <210> 102 <211> 800 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> cationic trypsin (Homo sapiens-type 1) (cationic) <400> 102 accaccatga atccactcct gatccttacc tttgtggcag ctgctcttgc tgcccccttt 60 gatgatgatg acaagatcgt tgggggctac aactgtgagg agaattctgt cccctaccag 120 gtgtccctga attctggcta ccacttctgt ggtggctccc tcatcaacga acagtgggtg 180 gtatcagcag gccactgcta caagtcccgc atccaggtga gactgggaga gcacaacatc 240 gaagtcctgg aggggaatga gcagttcatc aatgcagcca agatcatccg ccacccccaa 300 tacgacagga agactctgaa caatgacatc atgttaatca agctctcctc acgtgcagta 360 atcaacgccc gcgtgtccac catctctctg cccaccgccc ctccagccac tggcacgaag 420 tgcctcatct ctggctgggg caacactgcg agctctggcg ccgactaccc agacgagctg 480 cagtgcctgg acgctcctgt gctgagccag gctaagtgtg aagcctccta ccctggaaag 540 attaccagca acatgttctg tgtgggcttc cttgagggag gcaaggattc atgtcagggt 600 gattctggtg gccctgtggt ctgcaatgga cagctccaag gagttgtctc ctggggtgat 660 ggctgtgccc agaagaacaa gcctggagtc tacaccaagg tctacaacta tgtgaaatgg 720 attaagaaca ccatagctgc caatagctaa agcccccagt atctcttcag tctctatacc 780 aataaagtga ccctgttctc 800 <210> 103 <211> 247 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> cationic trypsin (Homo sapiens-type 1) (cationic) <400> 103 Met Asn Pro Leu Leu Ile Leu Thr Phe Val Ala Ala Ala Leu Ala Ala 1 5 10 15 Pro Phe Asp Asp Asp Asp Lys Ile Val Gly Gly Tyr Asn Cys Glu Glu 20 25 30 Asn Ser Val Pro Tyr Gln Val Ser Leu Asn Ser Gly Tyr His Phe Cys 35 40 45 Gly Gly Ser Leu Ile Asn Glu Gln Trp Val Val Ser Ala Gly His Cys 50 55 60 Tyr Lys Ser Arg Ile Gln Val Arg Leu Gly Glu His Asn Ile Glu Val 65 70 75 80 Leu Glu Gly Asn Glu Gln Phe Ile Asn Ala Ala Lys Ile Ile Arg His 85 90 95 Pro Gln Tyr Asp Arg Lys Thr Leu Asn Asn Asp Ile Met Leu Ile Lys 100 105 110 Leu Ser Ser Arg Ala Val Ile Asn Ala Arg Val Ser Thr Ile Ser Leu 115 120 125 Pro Thr Ala Pro Pro Ala Thr Gly Thr Lys Cys Leu Ile Ser Gly Trp 130 135 140 Gly Asn Thr Ala Ser Ser Gly Ala Asp Tyr Pro Asp Glu Leu Gln Cys 145 150 155 160 Leu Asp Ala Pro Val Leu Ser Gln Ala Lys Cys Glu Ala Ser Tyr Pro 165 170 175 Gly Lys Ile Thr Ser Asn Met Phe Cys Val Gly Phe Leu Glu Gly Gly 180 185 190 Lys Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Val Val Cys Asn Gly 195 200 205 Gln Leu Gln Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln Lys Asn 210 215 220 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Lys Val Tyr Asn Tyr Val Lys Trp Ile Lys 225 230 235 240 Asn Thr Ile Ala Ala Asn Ser 245 <210> 104 <211> 938 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Neutrophil elastase <400> 104 gcacggaggg gcagagaccc cggagcccca gccccaccat gaccctcggc cgccgactcg 60 cgtgtctttt cctcgcctgt gtcctgccgg ccttgctgct ggggggcacc gcgctggcct 120 cggagattgt ggggggccgg cgagcgcggc cccacgcgtg gcccttcatg gtgtccctgc 180 agctgcgcgg aggccacttc tgcggcgcca ccctgattgc gcccaacttc gtcatgtcgg 240 ccgcgcactg cgtggcgaat gtaaacgtcc gcgcggtgcg ggtggtcctg ggagcccata 300 acctctcgcg gcgggagccc acccggcagg tgttcgccgt gcagcgcatc ttcgaaaacg 360 gctacgaccc cgtaaacttg ctcaacgaca tcgtgattct ccagctcaac gggtcggcca 420 ccatcaacgc caacgtgcag gtggcccagc tgccggctca gggacgccgc ctgggcaacg 480 gggtgcagtg cctggccatg ggctggggcc ttctgggcag gaaccgtggg atcgccagcg 540 tcctgcagga gctcaacgtg acggtggtga cgtccctctg ccgtcgcagc aacgtctgca 600 ctctcgtgag gggccggcag gccggcgtct gtttcgggga ctccggcagc cccttggtct 660 gcaacgggct aatccacgga attgcctcct tcgtccgggg aggctgcgcc tcagggctct 720 accccgatgc ctttgccccg gtggcacagt ttgtaaactg gatcgactct atcatccaac 780 gctccgagga caacccctgt ccccaccccc gggacccgga cccggccagc aggacccact 840 gagaagggct gcccgggtca cctcagctgc ccacacccac actctccagc atctggcaca 900 ataaacattc tctgttttgt agaaaaaaaa aaaaaaaa 938 <210> 105 <211> 267 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Neutrophil elastase <400> 105 Met Thr Leu Gly Arg Arg Leu Ala Cys Leu Phe Leu Ala Cys Val Leu 1 5 10 15 Pro Ala Leu Leu Leu Gly Gly Thr Ala Leu Ala Ser Glu Ile Val Gly 20 25 30 Gly Arg Arg Ala Arg Pro His Ala Trp Pro Phe Met Val Ser Leu Gln 35 40 45 Leu Arg Gly Gly His Phe Cys Gly Ala Thr Leu Ile Ala Pro Asn Phe 50 55 60 Val Met Ser Ala Ala His Cys Val Ala Asn Val Asn Val Arg Ala Val 65 70 75 80 Arg Val Val Leu Gly Ala His Asn Leu Ser Arg Arg Glu Pro Thr Arg 85 90 95 Gln Val Phe Ala Val Gln Arg Ile Phe Glu Asn Gly Tyr Asp Pro Val 100 105 110 Asn Leu Leu Asn Asp Ile Val Ile Leu Gln Leu Asn Gly Ser Ala Thr 115 120 125 Ile Asn Ala Asn Val Gln Val Ala Gln Leu Pro Ala Gln Gly Arg Arg 130 135 140 Leu Gly Asn Gly Val Gln Cys Leu Ala Met Gly Trp Gly Leu Leu Gly 145 150 155 160 Arg Asn Arg Gly Ile Ala Ser Val Leu Gln Glu Leu Asn Val Thr Val 165 170 175 Val Thr Ser Leu Cys Arg Arg Ser Asn Val Cys Thr Leu Val Arg Gly 180 185 190 Arg Gln Ala Gly Val Cys Phe Gly Asp Ser Gly Ser Pro Leu Val Cys 195 200 205 Asn Gly Leu Ile His Gly Ile Ala Ser Phe Val Arg Gly Gly Cys Ala 210 215 220 Ser Gly Leu Tyr Pro Asp Ala Phe Ala Pro Val Ala Gln Phe Val Asn 225 230 235 240 Trp Ile Asp Ser Ile Ile Gln Arg Ser Glu Asp Asn Pro Cys Pro His 245 250 255 Pro Arg Asp Pro Asp Pro Ala Ser Arg Thr His 260 265 <210> 106 <211> 3895 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> mannan-binding lectin-associated serine protease-3 <400> 106 attccggcac agggacacaa acaagctcac ccaacaaagc caagctggga ggaccaaggc 60 cgggcagccg ggagcaccca aggcaggaaa atgaggtggc tgcttctcta ttatgctctg 120 tgcttctccc tgtcaaaggc ttcagcccac accgtggagc taaacaatat gtttggccag 180 atccagtcgc ctggttatcc agactcctat cccagtgatt cagaggtgac ttggaatatc 240 actgtcccag atgggtttcg gatcaagctt tacttcatgc acttcaactt ggaatcctcc 300 tacctttgtg aatatgacta tgtgaaggta gaaactgagg accaggtgct ggcaaccttc 360 tgtggcaggg agaccacaga cacagagcag actcccggcc aggaggtggt cctctcccct 420 ggctccttca tgtccatcac tttccggtca gatttctcca atgaggagcg tttcacaggc 480 tttgatgccc actacatggc tgtggatgtg gacgagtgca aggagaggga ggacgaggag 540 ctgtcctgtg accactactg ccacaactac attggcggct actactgctc ctgccgcttc 600 ggctacatcc tccacacaga caacaggacc tgccgagtgg agtgcagtga caacctcttc 660 actcaaagga ctggggtgat caccagccct gacttcccaa acccttaccc caagagctct 720 gaatgcctgt ataccatcga gctggaggag ggtttcatgg tcaacctgca gtttgaggac 780 atatttgaca ttgaggacca tcctgaggtg ccctgcccct atgactacat caagatcaaa 840 gttggtccaa aagttttggg gcctttctgt ggagagaaag ccccagaacc catcagcacc 900 cagagccaca gtgtcctgat cctgttccat agtgacaact cgggagagaa ccggggctgg 960 aggctctcat acagggctgc aggaaatgag tgcccagagc tacagcctcc tgtccatggg 1020 aaaatcgagc cctcccaagc caagtatttc ttcaaagacc aagtgctcgt cagctgtgac 1080 acaggctaca aagtgctgaa ggataatgtg gagatggaca cattccagat tgagtgtctg 1140 aaggatggga cgtggagtaa caagattccc acctgtaaaa ttgtagactg tagagcccca 1200 ggagagctgg aacacgggct gatcaccttc tctacaagga acaacctcac cacatacaag 1260 tctgagatca aatactcctg tcaggagccc tattacaaga tgctcaacaa taacacaggt 1320 atatatacct gttctgccca aggagtctgg atgaataaag tattggggag aagcctaccc 1380 acctgccttc cagagtgtgg tcagccctcc cgctccctgc caagcctggt caagaggatc 1440 attgggggcc gaaatgctga gcctggcctc ttcccgtggc aggccctgat agtggtggag 1500 gacacttcga gagtgccaaa tgacaagtgg tttgggagtg gggccctgct ctctgcgtcc 1560 tggatcctca cagcagctca tgtgctgcgc tcccagcgta gagacaccac ggtgatacca 1620 gtctccaagg agcatgtcac cgtctacctg ggcttgcatg atgtgcgaga caaatcgggg 1680 gcagtcaaca gctcagctgc ccgagtggtg ctccacccag acttcaacat ccaaaactac 1740 aaccacgata tagctctggt gcagctgcag gagcctgtgc ccctgggacc ccacgttatg 1800 cctgtctgcc tgccaaggct tgagcctgaa ggcccggccc cccacatgct gggcctggtg 1860 gccggctggg gcatctccaa tcccaatgtg acagtggatg agatcatcag cagtggcaca 1920 cggaccttgt cagatgtcct gcagtatgtc aagttacccg tggtgcctca cgctgagtgc 1980 aaaactagct atgagtcccg ctcgggcaat tacagcgtca cggagaacat gttctgtgct 2040 ggctactacg agggcggcaa agacacgtgc cttggagata gcggtggggc ctttgtcatc 2100 tttgatgact tgagccagcg ctgggtggtg caaggcctgg tgtcctgggg gggacctgaa 2160 gaatgcggca gcaagcaggt ctatggagtc tacacaaagg tctccaatta cgtggactgg 2220 gtgtgggagc agatgggctt accacaaagt gttgtggagc cccaggtgga acggtgagct 2280 gacttacttc ctcggggcct gcctcccctg agcgaagcta caccgcactt ccgacagcac 2340 actccacatt acttatcaga ccatatggaa tggaacacac tgacctagcg gtggcttctc 2400 ctaccgagac agcccccagg accctgagag gcagagtgtg gtatagggaa aaggctccag 2460 gcaggagacc tgtgttcctg agcttgtcca agtctctttc cctgtctggg cctcactcta 2520 ccgagtaata caatgcagga gctcaaccaa ggcctctgtg ccaatcccag cactcctttc 2580 caggccatgc ttcttacccc agtggccttt attcactcct gaccacttat caaacccatc 2640 ggtcctactg ttggtataac tgagcttgga cctgactatt agaaaatggt ttctaacatt 2700 gaactgaatg ccgcatctgt atattttcct gctctgcctt ctgggactag ccttggccta 2760 atccttcctc taggagaaga gcattcaggt tttgggagat ggctcatagc caagcccctc 2820 tctcttagtg tgatcccttg gagcaccttc atgcctgggg tttctctccc aaaagcttct 2880 tgcagtctaa gccttatccc ttatgttccc cattaaagga atttcaaaag acatggagaa 2940 agttgggaag gtttgtgctg actgctggga gcagaatagc cgtgggaggc ccaccaagcc 3000 cttaaattcc cattgtcaac tcagaacaca tttgggccca tatgccaccc tggaacacca 3060 gctgacacca tgggcgtcca cacctgctgc tccagacaag cacaaagcaa tctttcagcc 3120 ttgaaatgta ttatctgaaa ggctacctga agcccaggcc cgaatatggg gacttagtcg 3180 attacctgga aaaagaaaag acccacactg tgtcctgctg tgcttttggg caggaaaatg 3240 gaagaaagag tggggtgggc acattagaag tcacccaaat cctgccaggc tgcctggcat 3300 ccctggggca tgagctgggc ggagaatcca ccccgcagga tgttcagagg gacccactcc 3360 ttcatttttc agagtcaaag gaatcagagg ctcacccatg gcaggcagtg aaaagagcca 3420 ggagtcctgg gttctagtcc ctgctctgcc cccaactggc tgtataacct ttgaaaaatc 3480 attttctttg tctgagtctc tggttctccg tcagcaacag gctggcataa ggtcccctgc 3540 aggttccttc tagctggagc actcagagct tccctgactg ctagcagcct ctctggccct 3600 cacagggctg attgttctcc ttctccctgg agctctctct cctgaaaatc tccatcagag 3660 caaggcagcc agagaagccc ctgagaggga atgattggga agtgtccact ttctcaaccg 3720 gctcatcaaa cacactcctt tgtctatgaa tggcacatgt aaatgatgtt atattttgta 3780 tcttttatat catatgcttc accattctgt aaagggcctc tgcattgttg ctcccatcag 3840 gggtctcaag tggaaataaa ccctcgtgga taaccaaaaa aaaaaaaaaa aaaaa 3895 <210> 107 <211> 728 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> mannan-binding lectin-associated serine protease-3 <400> 107 Met Arg Trp Leu Leu Leu Tyr Tyr Ala Leu Cys Phe Ser Leu Ser Lys 1 5 10 15 Ala Ser Ala His Thr Val Glu Leu Asn Asn Met Phe Gly Gln Ile Gln 20 25 30 Ser Pro Gly Tyr Pro Asp Ser Tyr Pro Ser Asp Ser Glu Val Thr Trp 35 40 45 Asn Ile Thr Val Pro Asp Gly Phe Arg Ile Lys Leu Tyr Phe Met His 50 55 60 Phe Asn Leu Glu Ser Ser Tyr Leu Cys Glu Tyr Asp Tyr Val Lys Val 65 70 75 80 Glu Thr Glu Asp Gln Val Leu Ala Thr Phe Cys Gly Arg Glu Thr Thr 85 90 95 Asp Thr Glu Gln Thr Pro Gly Gln Glu Val Val Leu Ser Pro Gly Ser 100 105 110 Phe Met Ser Ile Thr Phe Arg Ser Asp Phe Ser Asn Glu Glu Arg Phe 115 120 125 Thr Gly Phe Asp Ala His Tyr Met Ala Val Asp Val Asp Glu Cys Lys 130 135 140 Glu Arg Glu Asp Glu Glu Leu Ser Cys Asp His Tyr Cys His Asn Tyr 145 150 155 160 Ile Gly Gly Tyr Tyr Cys Ser Cys Arg Phe Gly Tyr Ile Leu His Thr 165 170 175 Asp Asn Arg Thr Cys Arg Val Glu Cys Ser Asp Asn Leu Phe Thr Gln 180 185 190 Arg Thr Gly Val Ile Thr Ser Pro Asp Phe Pro Asn Pro Tyr Pro Lys 195 200 205 Ser Ser Glu Cys Leu Tyr Thr Ile Glu Leu Glu Glu Gly Phe Met Val 210 215 220 Asn Leu Gln Phe Glu Asp Ile Phe Asp Ile Glu Asp His Pro Glu Val 225 230 235 240 Pro Cys Pro Tyr Asp Tyr Ile Lys Ile Lys Val Gly Pro Lys Val Leu 245 250 255 Gly Pro Phe Cys Gly Glu Lys Ala Pro Glu Pro Ile Ser Thr Gln Ser 260 265 270 His Ser Val Leu Ile Leu Phe His Ser Asp Asn Ser Gly Glu Asn Arg 275 280 285 Gly Trp Arg Leu Ser Tyr Arg Ala Ala Gly Asn Glu Cys Pro Glu Leu 290 295 300 Gln Pro Pro Val His Gly Lys Ile Glu Pro Ser Gln Ala Lys Tyr Phe 305 310 315 320 Phe Lys Asp Gln Val Leu Val Ser Cys Asp Thr Gly Tyr Lys Val Leu 325 330 335 Lys Asp Asn Val Glu Met Asp Thr Phe Gln Ile Glu Cys Leu Lys Asp 340 345 350 Gly Thr Trp Ser Asn Lys Ile Pro Thr Cys Lys Ile Val Asp Cys Arg 355 360 365 Ala Pro Gly Glu Leu Glu His Gly Leu Ile Thr Phe Ser Thr Arg Asn 370 375 380 Asn Leu Thr Thr Tyr Lys Ser Glu Ile Lys Tyr Ser Cys Gln Glu Pro 385 390 395 400 Tyr Tyr Lys Met Leu Asn Asn Asn Thr Gly Ile Tyr Thr Cys Ser Ala 405 410 415 Gln Gly Val Trp Met Asn Lys Val Leu Gly Arg Ser Leu Pro Thr Cys 420 425 430 Leu Pro Glu Cys Gly Gln Pro Ser Arg Ser Leu Pro Ser Leu Val Lys 435 440 445 Arg Ile Ile Gly Gly Arg Asn Ala Glu Pro Gly Leu Phe Pro Trp Gln 450 455 460 Ala Leu Ile Val Val Glu Asp Thr Ser Arg Val Pro Asn Asp Lys Trp 465 470 475 480 Phe Gly Ser Gly Ala Leu Leu Ser Ala Ser Trp Ile Leu Thr Ala Ala 485 490 495 His Val Leu Arg Ser Gln Arg Arg Asp Thr Thr Val Ile Pro Val Ser 500 505 510 Lys Glu His Val Thr Val Tyr Leu Gly Leu His Asp Val Arg Asp Lys 515 520 525 Ser Gly Ala Val Asn Ser Ser Ala Ala Arg Val Val Leu His Pro Asp 530 535 540 Phe Asn Ile Gln Asn Tyr Asn His Asp Ile Ala Leu Val Gln Leu Gln 545 550 555 560 Glu Pro Val Pro Leu Gly Pro His Val Met Pro Val Cys Leu Pro Arg 565 570 575 Leu Glu Pro Glu Gly Pro Ala Pro His Met Leu Gly Leu Val Ala Gly 580 585 590 Trp Gly Ile Ser Asn Pro Asn Val Thr Val Asp Glu Ile Ile Ser Ser 595 600 605 Gly Thr Arg Thr Leu Ser Asp Val Leu Gln Tyr Val Lys Leu Pro Val 610 615 620 Val Pro His Ala Glu Cys Lys Thr Ser Tyr Glu Ser Arg Ser Gly Asn 625 630 635 640 Tyr Ser Val Thr Glu Asn Met Phe Cys Ala Gly Tyr Tyr Glu Gly Gly 645 650 655 Lys Asp Thr Cys Leu Gly Asp Ser Gly Gly Ala Phe Val Ile Phe Asp 660 665 670 Asp Leu Ser Gln Arg Trp Val Val Gln Gly Leu Val Ser Trp Gly Gly 675 680 685 Pro Glu Glu Cys Gly Ser Lys Gln Val Tyr Gly Val Tyr Thr Lys Val 690 695 700 Ser Asn Tyr Val Asp Trp Val Trp Glu Gln Met Gly Leu Pro Gln Ser 705 710 715 720 Val Val Glu Pro Gln Val Glu Arg 725 <210> 108 <211> 924 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> cathepsin G <400> 108 gcacagcagc aactgactgg gcagcctttc aggaaagatg cagccactcc tgcttctgct 60 ggcctttctc ctacccactg gggctgaggc aggggagatc atcggaggcc gggagagcag 120 gccccactcc cgcccctaca tggcgtatct tcagatccag agtccagcag gtcagagcag 180 atgtggaggg ttcctggtgc gagaagactt tgtgctgaca gcagctcatt gctggggaag 240 caatataaat gtcaccctgg gcgcccacaa tatccagaga cgggaaaaca cccagcaaca 300 catcactgcg cgcagagcca tccgccaccc tcaatataat cagcggacca tccagaatga 360 catcatgtta ttgcagctga gcagaagagt cagacggaat cgaaacgtga acccagtggc 420 tctgcctaga gcccaggagg gactgagacc cgggacgctg tgcactgtgg ccggctgggg 480 cagggtcagc atgaggaggg gaacagatac actccgagag gtgcagctga gagtgcagag 540 ggataggcag tgcctccgca tcttcggttc ctacgacccc cgaaggcaga tttgtgtggg 600 ggaccggcgg gaacggaagg ctgccttcaa gggggattcc ggaggccccc tgctgtgtaa 660 caatgtggcc cacggcatcg tctcctatgg aaagtcgtca ggggttcctc cagaagtctt 720 caccagggtc tcaagtttcc tgccctggat aaggacaaca atgagaagct tcaaactgct 780 ggatcagatg gagacccccc tgtgactgac tcttcttctc ggggacacag gccagctcca 840 cagtgttgcc agagccttaa taaacgtcca cagagtataa ataaccaatt cctcatttgt 900 tcattaaacg tcattcagta ctta 924 <210> 109 <211> 255 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> cathepsin G <400> 109 Met Gln Pro Leu Leu Leu Leu Leu Ala Phe Leu Leu Pro Thr Gly Ala 1 5 10 15 Glu Ala Gly Glu Ile Ile Gly Gly Arg Glu Ser Arg Pro His Ser Arg 20 25 30 Pro Tyr Met Ala Tyr Leu Gln Ile Gln Ser Pro Ala Gly Gln Ser Arg 35 40 45 Cys Gly Gly Phe Leu Val Arg Glu Asp Phe Val Leu Thr Ala Ala His 50 55 60 Cys Trp Gly Ser Asn Ile Asn Val Thr Leu Gly Ala His Asn Ile Gln 65 70 75 80 Arg Arg Glu Asn Thr Gln Gln His Ile Thr Ala Arg Arg Ala Ile Arg 85 90 95 His Pro Gln Tyr Asn Gln Arg Thr Ile Gln Asn Asp Ile Met Leu Leu 100 105 110 Gln Leu Ser Arg Arg Val Arg Arg Asn Arg Asn Val Asn Pro Val Ala 115 120 125 Leu Pro Arg Ala Gln Glu Gly Leu Arg Pro Gly Thr Leu Cys Thr Val 130 135 140 Ala Gly Trp Gly Arg Val Ser Met Arg Arg Gly Thr Asp Thr Leu Arg 145 150 155 160 Glu Val Gln Leu Arg Val Gln Arg Asp Arg Gln Cys Leu Arg Ile Phe 165 170 175 Gly Ser Tyr Asp Pro Arg Arg Gln Ile Cys Val Gly Asp Arg Arg Glu 180 185 190 Arg Lys Ala Ala Phe Lys Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Leu Cys Asn 195 200 205 Asn Val Ala His Gly Ile Val Ser Tyr Gly Lys Ser Ser Gly Val Pro 210 215 220 Pro Glu Val Phe Thr Arg Val Ser Ser Phe Leu Pro Trp Ile Arg Thr 225 230 235 240 Thr Met Arg Ser Phe Lys Leu Leu Asp Gln Met Glu Thr Pro Leu 245 250 255 <210> 110 <211> 1001 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> myeloblastin (proteinase 3) <400> 110 cgtgggtgca ccctggaccc caccatggct caccggcccc ccagccctgc cctggcgtcc 60 gtgctgctgg ccttgctgct gagcggtgct gcccgagctg cggagatcgt gggcgggcac 120 gaggcgcagc cacactcccg gccctacatg gcctccctgc agatgcgggg gaacccgggc 180 agccacttct gcggaggcac cttgatccac cccagcttcg tgctgacggc cgcgcactgc 240 ctgcgggaca taccccagcg cctggtgaac gtggtgctcg gagcccacaa cgtgcggacg 300 caggagccca cccagcagca cttctcggtg gctcaggtgt ttctgaacaa ctacgacgcg 360 gagaacaaac tgaacgacgt tctcctcatc cagctgagca gcccagccaa cctcagtgcc 420 tccgtcgcca cagtccagct gccacagcag gaccagccag tgccccacgg cacccagtgc 480 ctggccatgg gctggggccg cgtgggtgcc cacgaccccc cagcccaggt cctgcaggag 540 ctcaatgtca ccgtggtcac cttcttctgc cggccacata acatttgcac tttcgtccct 600 cgccgcaagg ccggcatctg cttcggagac tcaggtggcc ccctgatctg tgatggcatc 660 atccaaggaa tagactcctt cgtgatctgg ggatgtgcca cccgcctttt ccctgacttc 720 ttcacgcggg tagccctcta cgtggactgg atccgttcca cgctgcgccg tgtggaggcc 780 aagggccgcc cctgaaccgc ccctcccaca gcgctggccg ggaccccgag cctggctcca 840 aaccctcgag gcggatcttt ggacagaagc agctcttccc cgaacactgt ggcgtccggg 900 acggccccac ccgtcccccc acactccctc ccacggggct ccgggagaca ggccggccct 960 gcacctcacc ccaccgtgac ctcaataaac gttgaaactc c 1001 <210> 111 <211> 256 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> myeloblastin (proteinase 3) <400> 111 Met Ala His Arg Pro Pro Ser Pro Ala Leu Ala Ser Val Leu Leu Ala 1 5 10 15 Leu Leu Leu Ser Gly Ala Ala Arg Ala Ala Glu Ile Val Gly Gly His 20 25 30 Glu Ala Gln Pro His Ser Arg Pro Tyr Met Ala Ser Leu Gln Met Arg 35 40 45 Gly Asn Pro Gly Ser His Phe Cys Gly Gly Thr Leu Ile His Pro Ser 50 55 60 Phe Val Leu Thr Ala Ala His Cys Leu Arg Asp Ile Pro Gln Arg Leu 65 70 75 80 Val Asn Val Val Leu Gly Ala His Asn Val Arg Thr Gln Glu Pro Thr 85 90 95 Gln Gln His Phe Ser Val Ala Gln Val Phe Leu Asn Asn Tyr Asp Ala 100 105 110 Glu Asn Lys Leu Asn Asp Val Leu Leu Ile Gln Leu Ser Ser Pro Ala 115 120 125 Asn Leu Ser Ala Ser Val Ala Thr Val Gln Leu Pro Gln Gln Asp Gln 130 135 140 Pro Val Pro His Gly Thr Gln Cys Leu Ala Met Gly Trp Gly Arg Val 145 150 155 160 Gly Ala His Asp Pro Pro Ala Gln Val Leu Gln Glu Leu Asn Val Thr 165 170 175 Val Val Thr Phe Phe Cys Arg Pro His Asn Ile Cys Thr Phe Val Pro 180 185 190 Arg Arg Lys Ala Gly Ile Cys Phe Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ile 195 200 205 Cys Asp Gly Ile Ile Gln Gly Ile Asp Ser Phe Val Ile Trp Gly Cys 210 215 220 Ala Thr Arg Leu Phe Pro Asp Phe Phe Thr Arg Val Ala Leu Tyr Val 225 230 235 240 Asp Trp Ile Arg Ser Thr Leu Arg Arg Val Glu Ala Lys Gly Arg Pro 245 250 255 <210> 112 <211> 878 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> granzyme A <400> 112 cagattttca ggttgattga tgtgggacag cagccacaat gaggaactcc tatagatttc 60 tggcatcctc tctctcagtt gtcgtttctc tcctgctaat tcctgaagat gtctgtgaaa 120 aaattattgg aggaaatgaa gtaactcctc attcaagacc ctacatggtc ctacttagtc 180 ttgacagaaa aaccatctgt gctggggctt tgattgcaaa agactgggtg ttgactgcag 240 ctcactgtaa cttgaacaaa aggtcccagg tcattcttgg ggctcactca ataaccaggg 300 aagagccaac aaaacagata atgcttgtta agaaagagtt tccctatcca tgctatgacc 360 cagccacacg cgaaggtgac cttaaacttt tacagctgac ggaaaaagca aaaattaaca 420 aatatgtgac tatccttcat ctacctaaaa agggggatga tgtgaaacca ggaaccatgt 480 gccaagttgc agggtggggg aggactcaca atagtgcatc ttggtccgat actctgagag 540 aagtcaatat caccatcata gacagaaaag tctgcaatga tcgaaatcac tataatttta 600 accctgtgat tggaatgaat atggtttgtg ctggaagcct ccgaggtgga agagactcgt 660 gcaatggaga ttctggaagc cctttgttgt gcgagggtgt tttccgaggg gtcacttcct 720 ttggccttga aaataaatgc ggagaccctc gtgggcctgg tgtctatatt cttctctcaa 780 agaaacacct caactggata attatgacta tcaagggagc agtttaaata accgtttcct 840 ttcatttact gtggcttctt aatcttttca caaataaa 878 <210> 113 <211> 262 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> granzyme A <400> 113 Met Arg Asn Ser Tyr Arg Phe Leu Ala Ser Ser Leu Ser Val Val Val 1 5 10 15 Ser Leu Leu Leu Ile Pro Glu Asp Val Cys Glu Lys Ile Ile Gly Gly 20 25 30 Asn Glu Val Thr Pro His Ser Arg Pro Tyr Met Val Leu Leu Ser Leu 35 40 45 Asp Arg Lys Thr Ile Cys Ala Gly Ala Leu Ile Ala Lys Asp Trp Val 50 55 60 Leu Thr Ala Ala His Cys Asn Leu Asn Lys Arg Ser Gln Val Ile Leu 65 70 75 80 Gly Ala His Ser Ile Thr Arg Glu Glu Pro Thr Lys Gln Ile Met Leu 85 90 95 Val Lys Lys Glu Phe Pro Tyr Pro Cys Tyr Asp Pro Ala Thr Arg Glu 100 105 110 Gly Asp Leu Lys Leu Leu Gln Leu Thr Glu Lys Ala Lys Ile Asn Lys 115 120 125 Tyr Val Thr Ile Leu His Leu Pro Lys Lys Gly Asp Asp Val Lys Pro 130 135 140 Gly Thr Met Cys Gln Val Ala Gly Trp Gly Arg Thr His Asn Ser Ala 145 150 155 160 Ser Trp Ser Asp Thr Leu Arg Glu Val Asn Ile Thr Ile Ile Asp Arg 165 170 175 Lys Val Cys Asn Asp Arg Asn His Tyr Asn Phe Asn Pro Val Ile Gly 180 185 190 Met Asn Met Val Cys Ala Gly Ser Leu Arg Gly Gly Arg Asp Ser Cys 195 200 205 Asn Gly Asp Ser Gly Ser Pro Leu Leu Cys Glu Gly Val Phe Arg Gly 210 215 220 Val Thr Ser Phe Gly Leu Glu Asn Lys Cys Gly Asp Pro Arg Gly Pro 225 230 235 240 Gly Val Tyr Ile Leu Leu Ser Lys Lys His Leu Asn Trp Ile Ile Met 245 250 255 Thr Ile Lys Gly Ala Val 260 <210> 114 <211> 947 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> granzyme M <400> 114 ggctcggggc cggggccagc acccacactg ggtctccaca gcggcatgga ggcctgcgtg 60 tcttcactgc tggtgctggc cctgggggcc ctgtcagtag gcagctcctt tgggacccag 120 atcatcgggg gccgggaggt gatcccccac tcgcgcccgt acatggcctc actgcagaga 180 aatggctccc acctgtgcgg gggtgtcctg gtgcacccaa agtgggtgct gacggctgcc 240 cactgcctgg cccagcggat ggcccagctg aggctggtgc tggggctcca caccctggac 300 agccccggtc tcaccttcca catcaaggca gccatccagc accctcgcta caagcccgtc 360 cctgccctgg agaacgacct cgcgctgctt cagctggacg ggaaagtgaa gcccagccgg 420 accatccggc cgttggccct gcccagtaag cgccaggtgg tggcagcagg gactcggtgc 480 agcatggccg gctgggggct gacccaccag ggcgggcgcc tgtcccgggt gctgcgggag 540 ctggacctcc aagtgctgga cacccgcatg tgtaacaaca gccgcttctg gaacggcagc 600 ctctccccca gcatggtctg cctggcggcc gactccaagg accaggctcc ctgcaagggt 660 gactcgggcg ggcccctggt gtgtggcaaa ggccgggtgt tggccggagt cctgtccttc 720 agctccaggg tctgcactga catcttcaag cctcccgtgg ccaccgctgt ggcgccttac 780 gtgtcctgga tcaggaaggt caccggccga tcggcctgat gccctggggt gatggggacc 840 ccctcgctgt ctccacagga cccttcccct ccaggggtgc agtggggtgg gtgaggacgg 900 gtgggaggga cagggaggga ccaataaatc ataatgaaga aacgctc 947 <210> 115 <211> 257 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> granzyme M <400> 115 Met Glu Ala Cys Val Ser Ser Leu Leu Val Leu Ala Leu Gly Ala Leu 1 5 10 15 Ser Val Gly Ser Ser Phe Gly Thr Gln Ile Ile Gly Gly Arg Glu Val 20 25 30 Ile Pro His Ser Arg Pro Tyr Met Ala Ser Leu Gln Arg Asn Gly Ser 35 40 45 His Leu Cys Gly Gly Val Leu Val His Pro Lys Trp Val Leu Thr Ala 50 55 60 Ala His Cys Leu Ala Gln Arg Met Ala Gln Leu Arg Leu Val Leu Gly 65 70 75 80 Leu His Thr Leu Asp Ser Pro Gly Leu Thr Phe His Ile Lys Ala Ala 85 90 95 Ile Gln His Pro Arg Tyr Lys Pro Val Pro Ala Leu Glu Asn Asp Leu 100 105 110 Ala Leu Leu Gln Leu Asp Gly Lys Val Lys Pro Ser Arg Thr Ile Arg 115 120 125 Pro Leu Ala Leu Pro Ser Lys Arg Gln Val Val Ala Ala Gly Thr Arg 130 135 140 Cys Ser Met Ala Gly Trp Gly Leu Thr His Gln Gly Gly Arg Leu Ser 145 150 155 160 Arg Val Leu Arg Glu Leu Asp Leu Gln Val Leu Asp Thr Arg Met Cys 165 170 175 Asn Asn Ser Arg Phe Trp Asn Gly Ser Leu Ser Pro Ser Met Val Cys 180 185 190 Leu Ala Ala Asp Ser Lys Asp Gln Ala Pro Cys Lys Gly Asp Ser Gly 195 200 205 Gly Pro Leu Val Cys Gly Lys Gly Arg Val Leu Ala Gly Val Leu Ser 210 215 220 Phe Ser Ser Arg Val Cys Thr Asp Ile Phe Lys Pro Pro Val Ala Thr 225 230 235 240 Ala Val Ala Pro Tyr Val Ser Trp Ile Arg Lys Val Thr Gly Arg Ser 245 250 255 Ala <210> 116 <211> 784 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> chymase (human-type) <400> 116 agcatttgct caggcagcct ctctgggaag atgctgcttc ttcctctccc cctgctgctc 60 tttctcttgt gctccagagc tgaagctggg gagatcatcg ggggcacaga atgcaagcca 120 cattcccgcc cctacatggc ctacctggaa attgtaactt ccaacggtcc ctcaaaattt 180 tgtggtggtt tccttataag acggaacttt gtgctgacgg ctgctcattg tgcaggaagg 240 tctataacag tcacccttgg agcccataac ataacagagg aagaagacac atggcagaag 300 cttgaggtta taaagcaatt ccgtcatcca aaatataaca cttctactct tcaccacgat 360 atcatgttac taaagttgaa ggagaaagcc agcctgaccc tggctgtggg gacactcccc 420 ttcccatcac aattcaactt tgtcccacct gggagaatgt gccgggtggc tggctgggga 480 agaacaggtg tgttgaagcc gggctcagac actctgcaag aggtgaagct gagactcatg 540 gatccccagg cctgcagcca cttcagagac tttgaccaca atcttcagct gtgtgtgggc 600 aatcccagga agacaaaatc tgcatttaag ggagactctg ggggccctct tctgtgtgct 660 ggggtggccc agggcatcgt atcctatgga cggtcggatg caaagccccc tgctgtcttc 720 acccgaatct cccattaccg gccctggatc aaccagatcc tgcaggcaaa ttaatcctgg 780 atcc 784 <210> 117 <211> 247 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> chymase (human-type) <400> 117 Met Leu Leu Leu Pro Leu Pro Leu Leu Leu Phe Leu Leu Cys Ser Arg 1 5 10 15 Ala Glu Ala Gly Glu Ile Ile Gly Gly Thr Glu Cys Lys Pro His Ser 20 25 30 Arg Pro Tyr Met Ala Tyr Leu Glu Ile Val Thr Ser Asn Gly Pro Ser 35 40 45 Lys Phe Cys Gly Gly Phe Leu Ile Arg Arg Asn Phe Val Leu Thr Ala 50 55 60 Ala His Cys Ala Gly Arg Ser Ile Thr Val Thr Leu Gly Ala His Asn 65 70 75 80 Ile Thr Glu Glu Glu Asp Thr Trp Gln Lys Leu Glu Val Ile Lys Gln 85 90 95 Phe Arg His Pro Lys Tyr Asn Thr Ser Thr Leu His His Asp Ile Met 100 105 110 Leu Leu Lys Leu Lys Glu Lys Ala Ser Leu Thr Leu Ala Val Gly Thr 115 120 125 Leu Pro Phe Pro Ser Gln Phe Asn Phe Val Pro Pro Gly Arg Met Cys 130 135 140 Arg Val Ala Gly Trp Gly Arg Thr Gly Val Leu Lys Pro Gly Ser Asp 145 150 155 160 Thr Leu Gln Glu Val Lys Leu Arg Leu Met Asp Pro Gln Ala Cys Ser 165 170 175 His Phe Arg Asp Phe Asp His Asn Leu Gln Leu Cys Val Gly Asn Pro 180 185 190 Arg Lys Thr Lys Ser Ala Phe Lys Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Leu 195 200 205 Cys Ala Gly Val Ala Gln Gly Ile Val Ser Tyr Gly Arg Ser Asp Ala 210 215 220 Lys Pro Pro Ala Val Phe Thr Arg Ile Ser His Tyr Arg Pro Trp Ile 225 230 235 240 Asn Gln Ile Leu Gln Ala Asn 245 <210> 118 <211> 1194 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> tryptase alpha (1) <400> 118 ataaatgggg aggggagagc ccactgggta gaaggaacag ggagcggcca ggatgctgaa 60 tctgctgctg ctggcgctgc ccgtcctggc gagccgcgcc tacgcggccc ctgccccagg 120 ccaggccctg cagcgagtgg gcatcgtcgg gggtcaggag gcccccagga gcaagtggcc 180 ctggcaggtg agcctgagag tccacggccc atactggatg cacttctgcg ggggctccct 240 catccacccc cagtgggtgc tgaccgcagc gcactgcgtg ggaccggacg tcaaggatct 300 ggccgccctc agggtgcaac tgcgggagca gcacctctac taccaggacc agctgctgcc 360 ggtcagcagg atcatcgtgc acccacagtt ctacaccgcc cagatcggag cggacatcgc 420 cctgctggag ctggaggagc cggtgaacgt ctccagccac gtccacacgg tcaccctgcc 480 ccctgcctca gagaccttcc ccccggggat gccgtgctgg gtcactggct ggggcgatgt 540 ggacaatgat gagcgcctcc caccgccatt tcctctgaag caggtgaagg tccccataat 600 ggaaaaccac atttgtgacg caaaatacca ccttggcgcc tacacgggag acgacgtccg 660 catcgtccgt gacgacatgc tgtgtgccgg gaacacccgg agggactcat gccagggcga 720 ctccggaggg cccctggtgt gcaaggtgaa tggcacctgg ctgcaggcgg gcgtggtcag 780 ctggggcgag ggctgtgccc agcccaaccg gcctggcatc tacacccgtg tcacctacta 840 cttggactgg atccaccact atgtccccaa aaagccgtga gtcaggcctg ggttggccac 900 ctgggtcact ggaggaccaa cccctgctgt ccaaaacacc actgcttcct acccaggtgg 960 cgactgcccc ccacaccttc cctgccccgt cctgagtgcc ccttcctgtc ctaagccccc 1020 tgctctcttc tgagcccctt cccctgtcct gaggaccctt ccctatcctg agcccccttc 1080 cctgtcctaa gcctgacgcc tgcaccgggc cctccagccc tcccctgccc agatagctgg 1140 tggtgggcgc taatcctcct gagtgctgga cctcattaaa gtgcatggaa atca 1194 <210> 119 <211> 275 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> tryptase alpha (1) <400> 119 Met Leu Asn Leu Leu Leu Leu Ala Leu Pro Val Leu Ala Ser Arg Ala 1 5 10 15 Tyr Ala Ala Pro Ala Pro Gly Gln Ala Leu Gln Arg Val Gly Ile Val 20 25 30 Gly Gly Gln Glu Ala Pro Arg Ser Lys Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu 35 40 45 Arg Val His Gly Pro Tyr Trp Met His Phe Cys Gly Gly Ser Leu Ile 50 55 60 His Pro Gln Trp Val Leu Thr Ala Ala His Cys Val Gly Pro Asp Val 65 70 75 80 Lys Asp Leu Ala Ala Leu Arg Val Gln Leu Arg Glu Gln His Leu Tyr 85 90 95 Tyr Gln Asp Gln Leu Leu Pro Val Ser Arg Ile Ile Val His Pro Gln 100 105 110 Phe Tyr Thr Ala Gln Ile Gly Ala Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu 115 120 125 Glu Pro Val Asn Val Ser Ser His Val His Thr Val Thr Leu Pro Pro 130 135 140 Ala Ser Glu Thr Phe Pro Pro Gly Met Pro Cys Trp Val Thr Gly Trp 145 150 155 160 Gly Asp Val Asp Asn Asp Glu Arg Leu Pro Pro Pro Phe Pro Leu Lys 165 170 175 Gln Val Lys Val Pro Ile Met Glu Asn His Ile Cys Asp Ala Lys Tyr 180 185 190 His Leu Gly Ala Tyr Thr Gly Asp Asp Val Arg Ile Val Arg Asp Asp 195 200 205 Met Leu Cys Ala Gly Asn Thr Arg Arg Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser 210 215 220 Gly Gly Pro Leu Val Cys Lys Val Asn Gly Thr Trp Leu Gln Ala Gly 225 230 235 240 Val Val Ser Trp Gly Glu Gly Cys Ala Gln Pro Asn Arg Pro Gly Ile 245 250 255 Tyr Thr Arg Val Thr Tyr Tyr Leu Asp Trp Ile His His Tyr Val Pro 260 265 270 Lys Lys Pro 275 <210> 120 <211> 1074 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> granzyme K <400> 120 gatcaacaca tttcatctgg gcttcttaaa tctaaatctt taaaatgact aagttttctt 60 ccttttctct gtttttccta atagttgggg cttatatgac tcatgtgtgt ttcaatatgg 120 aaattattgg agggaaagaa gtgtcacctc attccaggcc atttatggcc tccatccagt 180 atggcggaca tcacgtttgt ggaggtgttc tgattgatcc acagtgggtg ctgacagcag 240 cccactgcca atatcggttt accaaaggcc agtctcccac tgtggtttta ggcgcacact 300 ctctctcaaa gaatgaggcc tccaaacaaa cactggagat caaaaaattt ataccattct 360 caagagttac atcagatcct caatcaaatg atatcatgct ggttaagctt caaacagccg 420 caaaactcaa taaacatgtc aagatgctcc acataagatc caaaacctct cttagatctg 480 gaaccaaatg caaggttact ggctggggag ccaccgatcc agattcatta agaccttctg 540 acaccctgcg agaagtcact gttactgtcc taagtcgaaa actttgcaac agccaaagtt 600 actacaacgg cgaccctttt atcaccaaag acatggtctg tgcaggagat gccaaaggcc 660 agaaggattc ctgtaagggt gactcagggg gccccttgat ctgtaaaggt gtcttccacg 720 ctatagtctc tggaggtcat gaatgtggtg ttgccacaaa gcctggaatc tacaccctgt 780 taaccaagaa ataccagact tggatcaaaa gcaaccttgt cccgcctcat acaaattaag 840 ttacaaataa ttttattgga tgcacttgct tcttttttcc taatatgctc gcaggttaga 900 gttgggtgta agtaaagcag agcacatatg gggtccattt ttgcacttgt aagtcatttt 960 attaaggaat caagttcttt ttcacttgta tcactgatgt atttctacca tgctggtttt 1020 attctaaata aaatttagaa gactcaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaa 1074 <210> 121 <211> 264 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> granzyme K <400> 121 Met Thr Lys Phe Ser Ser Phe Ser Leu Phe Phe Leu Ile Val Gly Ala 1 5 10 15 Tyr Met Thr His Val Cys Phe Asn Met Glu Ile Ile Gly Gly Lys Glu 20 25 30 Val Ser Pro His Ser Arg Pro Phe Met Ala Ser Ile Gln Tyr Gly Gly 35 40 45 His His Val Cys Gly Gly Val Leu Ile Asp Pro Gln Trp Val Leu Thr 50 55 60 Ala Ala His Cys Gln Tyr Arg Phe Thr Lys Gly Gln Ser Pro Thr Val 65 70 75 80 Val Leu Gly Ala His Ser Leu Ser Lys Asn Glu Ala Ser Lys Gln Thr 85 90 95 Leu Glu Ile Lys Lys Phe Ile Pro Phe Ser Arg Val Thr Ser Asp Pro 100 105 110 Gln Ser Asn Asp Ile Met Leu Val Lys Leu Gln Thr Ala Ala Lys Leu 115 120 125 Asn Lys His Val Lys Met Leu His Ile Arg Ser Lys Thr Ser Leu Arg 130 135 140 Ser Gly Thr Lys Cys Lys Val Thr Gly Trp Gly Ala Thr Asp Pro Asp 145 150 155 160 Ser Leu Arg Pro Ser Asp Thr Leu Arg Glu Val Thr Val Thr Val Leu 165 170 175 Ser Arg Lys Leu Cys Asn Ser Gln Ser Tyr Tyr Asn Gly Asp Pro Phe 180 185 190 Ile Thr Lys Asp Met Val Cys Ala Gly Asp Ala Lys Gly Gln Lys Asp 195 200 205 Ser Cys Lys Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ile Cys Lys Gly Val Phe 210 215 220 His Ala Ile Val Ser Gly Gly His Glu Cys Gly Val Ala Thr Lys Pro 225 230 235 240 Gly Ile Tyr Thr Leu Leu Thr Lys Lys Tyr Gln Thr Trp Ile Lys Ser 245 250 255 Asn Leu Val Pro Pro His Thr Asn 260 <210> 122 <211> 1047 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> granzyme H <400> 122 ggagtcaaca ccaacagctc tgacctgggc agccttcctg agaaaatgca gccattcctc 60 ctcctgttgg cctttcttct gacccctggg gctgggacag aggagatcat cgggggccat 120 gaggccaagc cccactcccg cccctacatg gcctttgttc agtttctgca agagaagagt 180 cggaagaggt gtggcggcat cctagtgaga aaggactttg tgctgacagc tgctcactgc 240 cagggaagct ccataaatgt caccttgggg gcccacaata tcaaggaaca ggagcggacc 300 cagcagttta tccctgtgaa aagacccatc ccccatccag cctataatcc taagaacttc 360 tccaacgaca tcatgctact gcagctggag agaaaggcca agtggaccac agctgtgcgg 420 cctctcaggc tacctagcag caaggcccag gtgaagccag ggcagctgtg cagtgtggct 480 ggctggggtt atgtctcaat gagcacttta gcaaccacac tgcaggaagt gttgctgaca 540 gtgcagaagg actgccagtg tgaacgtctc ttccatggca attacagcag agccactgag 600 atttgtgtgg gggatccaaa gaagacacag accggtttca agggggactc cggggggccc 660 ctcgtgtgta aggacgtagc ccaaggtatt ctctcctatg gaaacaaaaa agggacacct 720 ccaggagtct acatcaaggt ctcacacttc ctgccctgga taaagagaac aatgaagcgc 780 ctctaacagc aggcatgaga ctaaccttcc tctgggcctg accatctctg ggacagaggc 840 aagaatcccc aaggggtggg cagtcagggt tgcaggactg taataaatgg atctctggtg 900 tagaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 960 aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1020 aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaa 1047 <210> 123 <211> 246 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> granzyme H <400> 123 Met Gln Pro Phe Leu Leu Leu Leu Ala Phe Leu Leu Thr Pro Gly Ala 1 5 10 15 Gly Thr Glu Glu Ile Ile Gly Gly His Glu Ala Lys Pro His Ser Arg 20 25 30 Pro Tyr Met Ala Phe Val Gln Phe Leu Gln Glu Lys Ser Arg Lys Arg 35 40 45 Cys Gly Gly Ile Leu Val Arg Lys Asp Phe Val Leu Thr Ala Ala His 50 55 60 Cys Gln Gly Ser Ser Ile Asn Val Thr Leu Gly Ala His Asn Ile Lys 65 70 75 80 Glu Gln Glu Arg Thr Gln Gln Phe Ile Pro Val Lys Arg Pro Ile Pro 85 90 95 His Pro Ala Tyr Asn Pro Lys Asn Phe Ser Asn Asp Ile Met Leu Leu 100 105 110 Gln Leu Glu Arg Lys Ala Lys Trp Thr Thr Ala Val Arg Pro Leu Arg 115 120 125 Leu Pro Ser Ser Lys Ala Gln Val Lys Pro Gly Gln Leu Cys Ser Val 130 135 140 Ala Gly Trp Gly Tyr Val Ser Met Ser Thr Leu Ala Thr Thr Leu Gln 145 150 155 160 Glu Val Leu Leu Thr Val Gln Lys Asp Cys Gln Cys Glu Arg Leu Phe 165 170 175 His Gly Asn Tyr Ser Arg Ala Thr Glu Ile Cys Val Gly Asp Pro Lys 180 185 190 Lys Thr Gln Thr Gly Phe Lys Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys 195 200 205 Lys Asp Val Ala Gln Gly Ile Leu Ser Tyr Gly Asn Lys Lys Gly Thr 210 215 220 Pro Pro Gly Val Tyr Ile Lys Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Lys 225 230 235 240 Arg Thr Met Lys Arg Leu 245 <210> 124 <211> 865 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> chymotrypsin B <400> 124 ccctgccagc ggcaccatgg ctttcctctg gctcctctcc tgctgggccc tcctgggtac 60 caccttcggc tgcggggtcc ccgccatcca ccctgtgctc agcggcctgt ccaggatcgt 120 gaatggggag gacgccgtcc ccggctcctg gccctggcag gtgtccctgc aggacaaaac 180 cggcttccac ttctgcgggg gctccctcat cagcgaggac tgggtggtca ccgctgccca 240 ctgcggggtc aggacctccg acgtggtcgt ggctggggag tttgaccagg gctctgacga 300 ggagaacatc caggtcctga agatcgccaa ggtcttcaag aaccccaagt tcagcattct 360 gaccgtgaac aatgacatca ccctgctgaa gctggccaca cctgcccgct tctcccagac 420 agtgtccgcc gtgtgcctgc ccagcgccga cgacgacttc cccgcgggga cactgtgtgc 480 caccacaggc tggggcaaga ccaagtacaa cgccaacaag acccctgaca agctgcagca 540 ggcagccctg cccctcctgt ccaatgccga atgcaagaag tcctggggca ggaggatcac 600 cgacgtgatg atctgtgccg gggccagtgg cgtctcctcc tgcatgggcg actctggcgg 660 tcccctggtc tgccaaaagg atggagcctg gaccctggtg ggcattgtgt cctggggcag 720 cgacacctgc tccacctcca gccctggcgt gtacgcccgt gtcaccaagc tcataccttg 780 ggtgcagaag atcctggctg ccaactgagc ccgcggctcc ctccgaccct gctccccaca 840 gagcctcagt aaacccatgg aacac 865 <210> 125 <211> 263 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> chymotrypsin B <400> 125 Met Ala Phe Leu Trp Leu Leu Ser Cys Trp Ala Leu Leu Gly Thr Thr 1 5 10 15 Phe Gly Cys Gly Val Pro Ala Ile His Pro Val Leu Ser Gly Leu Ser 20 25 30 Arg Ile Val Asn Gly Glu Asp Ala Val Pro Gly Ser Trp Pro Trp Gln 35 40 45 Val Ser Leu Gln Asp Lys Thr Gly Phe His Phe Cys Gly Gly Ser Leu 50 55 60 Ile Ser Glu Asp Trp Val Val Thr Ala Ala His Cys Gly Val Arg Thr 65 70 75 80 Ser Asp Val Val Val Ala Gly Glu Phe Asp Gln Gly Ser Asp Glu Glu 85 90 95 Asn Ile Gln Val Leu Lys Ile Ala Lys Val Phe Lys Asn Pro Lys Phe 100 105 110 Ser Ile Leu Thr Val Asn Asn Asp Ile Thr Leu Leu Lys Leu Ala Thr 115 120 125 Pro Ala Arg Phe Ser Gln Thr Val Ser Ala Val Cys Leu Pro Ser Ala 130 135 140 Asp Asp Asp Phe Pro Ala Gly Thr Leu Cys Ala Thr Thr Gly Trp Gly 145 150 155 160 Lys Thr Lys Tyr Asn Ala Asn Lys Thr Pro Asp Lys Leu Gln Gln Ala 165 170 175 Ala Leu Pro Leu Leu Ser Asn Ala Glu Cys Lys Lys Ser Trp Gly Arg 180 185 190 Arg Ile Thr Asp Val Met Ile Cys Ala Gly Ala Ser Gly Val Ser Ser 195 200 205 Cys Met Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Gln Lys Asp Gly Ala 210 215 220 Trp Thr Leu Val Gly Ile Val Ser Trp Gly Ser Asp Thr Cys Ser Thr 225 230 235 240 Ser Ser Pro Gly Val Tyr Ala Arg Val Thr Lys Leu Ile Pro Trp Val 245 250 255 Gln Lys Ile Leu Ala Ala Asn 260 <210> 126 <211> 952 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> pancreatic elastase <400> 126 ttggtccaag caagaaggca gtggtctact ccatcggcaa catgctggtc ctttatggac 60 acagcaccca ggaccttccg gaaaccaatg cccgcgtagt cggagggact gaggccggga 120 ggaattcctg gccctctcag atttccctcc agtaccggtc tggaggttcc cggtatcaca 180 cctgtggagg gacccttatc agacagaact gggtgatgac agctgctcac tgcgtggatt 240 accagaagac tttccgcgtg gtggctggag accataacct gagccagaat gatggcactg 300 agcagtacgt gagtgtgcag aagatcgtgg tgcatccata ctggaacagc gataacgtgg 360 ctgccggcta tgacatcgcc ctgctgcgcc tggcccagag cgttaccctc aatagctatg 420 tccagctggg tgttctgccc caggagggag ccatcctggc taacaacagt ccctgctaca 480 tcacaggctg gggcaagacc aagaccaatg ggcagctggc ccagaccctg cagcaggctt 540 acctgccctc tgtggactac gccatctgct ccagctcctc ctactggggc tccactgtga 600 agaacaccat ggtgtgtgct ggtggagatg gagttcgctc tggatgccag ggtgactctg 660 ggggccccct ccattgcttg gtgaatggca agtattctgt ccatggagtg accagctttg 720 tgtccagccg gggctgtaat gtctccagga agcctacagt cttcacccag gtctctgctt 780 acatctcctg gataaataat gtcatcgcct ccaactgaac attttcctga gtccaacgac 840 cttcccaaaa tggttcttag atctgcaata ggacttgcga tcaaaaagta aaacacattc 900 tgaaagacta ttgagccatt gatagaaaag caaataaaac tagatataca tt 952 <210> 127 <211> 258 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> pancreatic elastase <400> 127 Met Leu Val Leu Tyr Gly His Ser Thr Gln Asp Leu Pro Glu Thr Asn 1 5 10 15 Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Glu Ala Gly Arg Asn Ser Trp Pro Ser 20 25 30 Gln Ile Ser Leu Gln Tyr Arg Ser Gly Gly Ser Arg Tyr His Thr Cys 35 40 45 Gly Gly Thr Leu Ile Arg Gln Asn Trp Val Met Thr Ala Ala His Cys 50 55 60 Val Asp Tyr Gln Lys Thr Phe Arg Val Val Ala Gly Asp His Asn Leu 65 70 75 80 Ser Gln Asn Asp Gly Thr Glu Gln Tyr Val Ser Val Gln Lys Ile Val 85 90 95 Val His Pro Tyr Trp Asn Ser Asp Asn Val Ala Ala Gly Tyr Asp Ile 100 105 110 Ala Leu Leu Arg Leu Ala Gln Ser Val Thr Leu Asn Ser Tyr Val Gln 115 120 125 Leu Gly Val Leu Pro Gln Glu Gly Ala Ile Leu Ala Asn Asn Ser Pro 130 135 140 Cys Tyr Ile Thr Gly Trp Gly Lys Thr Lys Thr Asn Gly Gln Leu Ala 145 150 155 160 Gln Thr Leu Gln Gln Ala Tyr Leu Pro Ser Val Asp Tyr Ala Ile Cys 165 170 175 Ser Ser Ser Ser Tyr Trp Gly Ser Thr Val Lys Asn Thr Met Val Cys 180 185 190 Ala Gly Gly Asp Gly Val Arg Ser Gly Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly 195 200 205 Pro Leu His Cys Leu Val Asn Gly Lys Tyr Ser Val His Gly Val Thr 210 215 220 Ser Phe Val Ser Ser Arg Gly Cys Asn Val Ser Arg Lys Pro Thr Val 225 230 235 240 Phe Thr Gln Val Ser Ala Tyr Ile Ser Trp Ile Asn Asn Val Ile Ala 245 250 255 Ser Asn <210> 128 <211> 963 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> pancreatic endopeptidase E (A) <400> 128 tcctatcatc acaaaactca tgatgctccg gctgctcagt tccctcctcc ttgtggccgt 60 tgcctcaggc tatggcccac cttcctctca ctcttccagc cgcgttgtcc atggtgagga 120 tgcggtcccc tacagctggc cctggcaggt ttccctgcag tatgagaaaa gtggaagctt 180 ctaccacacg tgtggcggta gcctcatcgc ccccgattgg gttgtgactg ccggccactg 240 catctcgagg gatctgacct accaggtggt gttgggtgag tacaaccttg ctgtgaagga 300 gggccccgag caggtgatcc ccatcaactc tgaggagctg tttgtgcatc cactctggaa 360 ccgctcgtgt gtggcctgtg gcaatgacat cgccctcatc aagctctcac gcagcgccca 420 gctgggagat gccgtccagc tcgcctcact ccctcccgct ggtgacatcc ttcccaacaa 480 gacaccctgc tacatcaccg gctggggccg tctctatacc aatgggccac tcccagacaa 540 gctgcagcag gcccggctgc ccgtggtgga ctataagcac tgctccaggt ggaactggtg 600 gggttccacc gtgaagaaaa ccatggtgtg tgctggaggg tacatccgct ccggctgcaa 660 cggtgactct ggaggacccc tcaactgccc cacagaggat ggtggctggc aggtccacgg 720 tgtgaccagc tttgtttctg gctttggctg caacttcatc tggaagccca cggtgttcac 780 tcgagtctcc gccttcatcg actggattga ggagaccata gcaagccact agaaccaagg 840 cccagctggc agtgctgatc gatcccacat cctgaataaa gaataaagat ctctcagaaa 900 attccaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 960 aaa 963 <210> 129 <211> 270 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> pancreatic endopeptidase E (A) <400> 129 Met Met Leu Arg Leu Leu Ser Ser Leu Leu Leu Val Ala Val Ala Ser 1 5 10 15 Gly Tyr Gly Pro Pro Ser Ser His Ser Ser Ser Arg Val Val His Gly 20 25 30 Glu Asp Ala Val Pro Tyr Ser Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu Gln Tyr 35 40 45 Glu Lys Ser Gly Ser Phe Tyr His Thr Cys Gly Gly Ser Leu Ile Ala 50 55 60 Pro Asp Trp Val Val Thr Ala Gly His Cys Ile Ser Arg Asp Leu Thr 65 70 75 80 Tyr Gln Val Val Leu Gly Glu Tyr Asn Leu Ala Val Lys Glu Gly Pro 85 90 95 Glu Gln Val Ile Pro Ile Asn Ser Glu Glu Leu Phe Val His Pro Leu 100 105 110 Trp Asn Arg Ser Cys Val Ala Cys Gly Asn Asp Ile Ala Leu Ile Lys 115 120 125 Leu Ser Arg Ser Ala Gln Leu Gly Asp Ala Val Gln Leu Ala Ser Leu 130 135 140 Pro Pro Ala Gly Asp Ile Leu Pro Asn Lys Thr Pro Cys Tyr Ile Thr 145 150 155 160 Gly Trp Gly Arg Leu Tyr Thr Asn Gly Pro Leu Pro Asp Lys Leu Gln 165 170 175 Gln Ala Arg Leu Pro Val Val Asp Tyr Lys His Cys Ser Arg Trp Asn 180 185 190 Trp Trp Gly Ser Thr Val Lys Lys Thr Met Val Cys Ala Gly Gly Tyr 195 200 205 Ile Arg Ser Gly Cys Asn Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Asn Cys Pro 210 215 220 Thr Glu Asp Gly Gly Trp Gln Val His Gly Val Thr Ser Phe Val Ser 225 230 235 240 Gly Phe Gly Cys Asn Phe Ile Trp Lys Pro Thr Val Phe Thr Arg Val 245 250 255 Ser Ala Phe Ile Asp Trp Ile Glu Glu Thr Ile Ala Ser His 260 265 270 <210> 130 <211> 914 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> pancreatic elastase II (IIA) <400> 130 ttttacagaa ctcccacgga cacaccatga taaggacgct gctgctgtcc actttggtgg 60 ctggagccct cagttgtggg gaccccactt acccacctta tgtgactagg gtggttggcg 120 gtgaagaagc gaggcccaac agctggccct ggcaggtctc cctgcagtac agctccaatg 180 gcaagtggta ccacacctgc ggagggtccc tgatagccaa cagctgggtc ctgacggctg 240 cccactgcat cagctcctcc aggacctacc gcgtggggct gggccggcac aacctctacg 300 ttgcggagtc cggctcgctg gcagtcagtg tctctaagat tgtggtgcac aaggactgga 360 actccaacca aatctccaaa gggaacgaca ttgccctgct caaactggct aaccccgtct 420 ccctcaccga caagatccag ctggcctgcc tccctcctgc cggcaccatt ctacccaaca 480 actacccctg ctacgtcacg ggctggggaa ggctgcagac caacggggct gttcctgatg 540 tcctgcagca gggccggttg ctggttgtgg actatgccac ctgctccagc tctgcctggt 600 ggggcagcag cgtgaaaacc agtatgatct gtgctggggg tgatggcgtg atctccagct 660 gcaacggaga ctctggcggg ccactgaact gtcaggcgtc tgacggccgg tggcaggtgc 720 acggcatcgt cagcttcggg tctcgcctcg gctgcaacta ctaccacaag ccctccgtct 780 tcacgcgggt ctccaattac atcgactgga tcaattcggt gattgcaaat aactaaccaa 840 aagaagtccc tgggactgtt tcagacttgg aaaggtcaca gaaggaaaat aatataataa 900 agtgacaact atgc 914 <210> 131 <211> 269 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> pancreatic elastase II (IIA) <400> 131 Met Ile Arg Thr Leu Leu Leu Ser Thr Leu Val Ala Gly Ala Leu Ser 1 5 10 15 Cys Gly Asp Pro Thr Tyr Pro Pro Tyr Val Thr Arg Val Val Gly Gly 20 25 30 Glu Glu Ala Arg Pro Asn Ser Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu Gln Tyr 35 40 45 Ser Ser Asn Gly Lys Trp Tyr His Thr Cys Gly Gly Ser Leu Ile Ala 50 55 60 Asn Ser Trp Val Leu Thr Ala Ala His Cys Ile Ser Ser Ser Arg Thr 65 70 75 80 Tyr Arg Val Gly Leu Gly Arg His Asn Leu Tyr Val Ala Glu Ser Gly 85 90 95 Ser Leu Ala Val Ser Val Ser Lys Ile Val Val His Lys Asp Trp Asn 100 105 110 Ser Asn Gln Ile Ser Lys Gly Asn Asp Ile Ala Leu Leu Lys Leu Ala 115 120 125 Asn Pro Val Ser Leu Thr Asp Lys Ile Gln Leu Ala Cys Leu Pro Pro 130 135 140 Ala Gly Thr Ile Leu Pro Asn Asn Tyr Pro Cys Tyr Val Thr Gly Trp 145 150 155 160 Gly Arg Leu Gln Thr Asn Gly Ala Val Pro Asp Val Leu Gln Gln Gly 165 170 175 Arg Leu Leu Val Val Asp Tyr Ala Thr Cys Ser Ser Ser Ala Trp Trp 180 185 190 Gly Ser Ser Val Lys Thr Ser Met Ile Cys Ala Gly Gly Asp Gly Val 195 200 205 Ile Ser Ser Cys Asn Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Asn Cys Gln Ala 210 215 220 Ser Asp Gly Arg Trp Gln Val His Gly Ile Val Ser Phe Gly Ser Arg 225 230 235 240 Leu Gly Cys Asn Tyr Tyr His Lys Pro Ser Val Phe Thr Arg Val Ser 245 250 255 Asn Tyr Ile Asp Trp Ile Asn Ser Val Ile Ala Asn Asn 260 265 <210> 132 <211> 3696 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Enteropeptidase <400> 132 accagacagt tcttaaatta gcaagccttc aaaaccaaaa atggggtcga aaagaggcat 60 atcttctagg catcattctc tcagctccta tgaaatcatg tttgcagctc tctttgccat 120 attggtagtg ctctgtgctg gattaattgc agtatcctgc ctgacaatca aggaatccca 180 acgaggtgca gcacttggac agagtcatga agccagagcg acatttaaaa taacatccgg 240 agttacatat aatcctaatt tgcaagacaa actctcagtg gatttcaaag ttcttgcttt 300 tgaccttcag caaatgatag atgagatctt tctatcaagc aatctgaaga atgaatataa 360 gaactcaaga gttttacaat ttgaaaatgg cagcattata gtcgtatttg accttttctt 420 tgcccagtgg gtgtcagatc aaaatgtaaa agaagaactg attcaaggcc ttgaagcaaa 480 taaatccagc caactggtca ctttccatat tgatttgaac agcgttgata tcctagacaa 540 gctaacaacc accagtcatc tggcaactcc aggaaatgtc tcaatagagt gcctgcctgg 600 ttcaagtcct tgtactgatg ctctaacgtg tataaaagct gatttatttt gtgatggaga 660 agtaaactgt ccagatggtt ctgacgaaga caataaaatg tgtgccacag tttgtgatgg 720 aagatttttg ttaactggat catctgggtc tttccaggct actcattatc caaaaccttc 780 tgaaacaagt gttgtctgcc agtggatcat acgtgtaaac caaggacttt ccattaaact 840 gagcttcgat gattttaata catattatac agatatatta gatatttatg aaggtgtagg 900 atcaagcaag attttaagag cttctatttg ggaaactaat cctggcacaa taagaatttt 960 ttccaaccaa gttactgcca cctttcttat agaatctgat gaaagtgatt atgttggctt 1020 taatgcaaca tatactgcat ttaacagcag tgagcttaat aattatgaga aaattaattg 1080 taactttgag gatggctttt gtttctgggt ccaggatcta aatgatgata atgaatggga 1140 aaggattcag ggaagcacct tttctccttt tactggaccc aattttgacc acacttttgg 1200 caatgcttca ggattttaca tttctacccc aactggacca ggagggagac aagaacgagt 1260 ggggctttta agcctccctt tggaccccac tttggagcca gcttgcctta gtttctggta 1320 tcatatgtat ggtgaaaatg tccataaatt aagcattaat atcagcaatg accaaaatat 1380 ggagaagaca gttttccaaa aggaaggaaa ttatggagac aattggaatt atggacaagt 1440 aaccctaaat gaaacagtta aatttaaggt tgcttttaat gcttttaaaa acaagatcct 1500 gagtgatatt gcgttggatg acattagcct aacatatggg atttgcaatg ggagtcttta 1560 tccagaacca actttggtgc caactcctcc accagaactt cctacggact gtggaggacc 1620 ttttgagctg tgggagccaa atacaacatt cagttctacg aactttccaa acagctaccc 1680 taatctggct ttctgtgttt ggattttaaa tgcacaaaaa ggaaagaata tacaacttca 1740 ttttcaagaa tttgacttag aaaatattaa cgatgtagtt gaaataagag atggtgaaga 1800 agctgattcc ttgctcttag ctgtgtacac agggcctggc ccagtaaagg atgtgttctc 1860 taccaccaac agaatgactg tgcttctcat cactaacgat gtgttggcaa gaggagggtt 1920 taaagcaaac tttactactg gctatcactt ggggattcca gagccatgca aggcagacca 1980 ttttcaatgt aaaaatggag agtgtgttcc actggtgaat ctctgtgacg gtcatctgca 2040 ctgtgaggat ggctcagatg aagcagattg tgtgcgtttt ttcaatggca caacgaacaa 2100 caatggttta gtgcggttca gaatccagag catatggcat acagcttgtg ctgagaactg 2160 gaccacccag atttcaaatg atgtttgtca actgctggga ctagggagtg gaaactcatc 2220 aaagccaatc ttctctaccg atggtggacc atttgtcaaa ttaaacacag cacctgatgg 2280 ccacttaata ctaacaccca gtcaacagtg tttacaggat tccttgattc ggttacagtg 2340 taaccataaa tcttgtggaa aaaaactggc agctcaagac atcaccccaa agattgttgg 2400 aggaagtaat gccaaagaag gggcctggcc ctgggttgtg ggtctgtatt atggcggccg 2460 actgctctgc ggcgcatctc tcgtcagcag tgactggctg gtgtccgccg cacactgcgt 2520 gtatgggaga aacttagagc catccaagtg gacagcaatc ctaggcctgc atatgaaatc 2580 aaatctgacc tctcctcaaa cagtccctcg attaatagat gaaattgtca taaaccctca 2640 ttacaatagg cgaagaaagg acaacgacat tgccatgatg catctggaat ttaaagtgaa 2700 ttacacagat tacatacaac ctatttgttt accggaagaa aatcaagttt ttcctccagg 2760 aagaaattgt tctattgctg gttgggggac ggttgtatat caaggtacta ctgcaaacat 2820 attgcaagaa gctgatgttc ctcttctatc aaatgagaga tgccaacagc agatgccaga 2880 atataacatt actgaaaata tgatatgtgc aggctatgaa gaaggaggaa tagattcttg 2940 tcagggggat tcaggaggac cattaatgtg ccaagaaaac aacaggtggt tccttgctgg 3000 tgtgacctca tttggataca agtgtgccct gcctaatcgc cccggagtgt atgccagggt 3060 ctcaaggttt accgaatgga tacaaagttt tctacattag cgcatttctt aaactaaaca 3120 ggaaagtcgc attattttcc cattctactc tagaaagcat ggaaattaag tgtttcgtac 3180 aaaaatttta aaaagttacc aaaggttttt attcttacct atgtcaatga aatgctaggg 3240 ggccagggaa acaaaatttt aaaaataata aaattcacca tagcaataca gaataacttt 3300 aaaataccat taaatacatt tgtatttcat tgtgaacagg tatttcttca cagatctcat 3360 ttttaaaatt cttaatgatt atttttatta cttactgttg tttaaaggga tgttatttta 3420 aagcatatac catacactta agaaatttga gcagaattta aaaaagaaag aaaataaatt 3480 gtttttccca aagtatgtca ctgttggaaa taaactgcca taaattttct agttccagtt 3540 tagtttgctg ctattagcag aaactcaatt gtttctctgt cttttctatc aaaattttca 3600 acatatgcat aaccttagta ttttcccaac caatagaaac tatttattgt aagcttatgt 3660 cacaggcctg gactaaattg attttacgtt cctctt 3696 <210> 133 <211> 1019 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Enteropeptidase <400> 133 Met Gly Ser Lys Arg Gly Ile Ser Ser Arg His His Ser Leu Ser Ser 1 5 10 15 Tyr Glu Ile Met Phe Ala Ala Leu Phe Ala Ile Leu Val Val Leu Cys 20 25 30 Ala Gly Leu Ile Ala Val Ser Cys Leu Thr Ile Lys Glu Ser Gln Arg 35 40 45 Gly Ala Ala Leu Gly Gln Ser His Glu Ala Arg Ala Thr Phe Lys Ile 50 55 60 Thr Ser Gly Val Thr Tyr Asn Pro Asn Leu Gln Asp Lys Leu Ser Val 65 70 75 80 Asp Phe Lys Val Leu Ala Phe Asp Leu Gln Gln Met Ile Asp Glu Ile 85 90 95 Phe Leu Ser Ser Asn Leu Lys Asn Glu Tyr Lys Asn Ser Arg Val Leu 100 105 110 Gln Phe Glu Asn Gly Ser Ile Ile Val Val Phe Asp Leu Phe Phe Ala 115 120 125 Gln Trp Val Ser Asp Gln Asn Val Lys Glu Glu Leu Ile Gln Gly Leu 130 135 140 Glu Ala Asn Lys Ser Ser Gln Leu Val Thr Phe His Ile Asp Leu Asn 145 150 155 160 Ser Val Asp Ile Leu Asp Lys Leu Thr Thr Thr Ser His Leu Ala Thr 165 170 175 Pro Gly Asn Val Ser Ile Glu Cys Leu Pro Gly Ser Ser Pro Cys Thr 180 185 190 Asp Ala Leu Thr Cys Ile Lys Ala Asp Leu Phe Cys Asp Gly Glu Val 195 200 205 Asn Cys Pro Asp Gly Ser Asp Glu Asp Asn Lys Met Cys Ala Thr Val 210 215 220 Cys Asp Gly Arg Phe Leu Leu Thr Gly Ser Ser Gly Ser Phe Gln Ala 225 230 235 240 Thr His Tyr Pro Lys Pro Ser Glu Thr Ser Val Val Cys Gln Trp Ile 245 250 255 Ile Arg Val Asn Gln Gly Leu Ser Ile Lys Leu Ser Phe Asp Asp Phe 260 265 270 Asn Thr Tyr Tyr Thr Asp Ile Leu Asp Ile Tyr Glu Gly Val Gly Ser 275 280 285 Ser Lys Ile Leu Arg Ala Ser Ile Trp Glu Thr Asn Pro Gly Thr Ile 290 295 300 Arg Ile Phe Ser Asn Gln Val Thr Ala Thr Phe Leu Ile Glu Ser Asp 305 310 315 320 Glu Ser Asp Tyr Val Gly Phe Asn Ala Thr Tyr Thr Ala Phe Asn Ser 325 330 335 Ser Glu Leu Asn Asn Tyr Glu Lys Ile Asn Cys Asn Phe Glu Asp Gly 340 345 350 Phe Cys Phe Trp Val Gln Asp Leu Asn Asp Asp Asn Glu Trp Glu Arg 355 360 365 Ile Gln Gly Ser Thr Phe Ser Pro Phe Thr Gly Pro Asn Phe Asp His 370 375 380 Thr Phe Gly Asn Ala Ser Gly Phe Tyr Ile Ser Thr Pro Thr Gly Pro 385 390 395 400 Gly Gly Arg Gln Glu Arg Val Gly Leu Leu Ser Leu Pro Leu Asp Pro 405 410 415 Thr Leu Glu Pro Ala Cys Leu Ser Phe Trp Tyr His Met Tyr Gly Glu 420 425 430 Asn Val His Lys Leu Ser Ile Asn Ile Ser Asn Asp Gln Asn Met Glu 435 440 445 Lys Thr Val Phe Gln Lys Glu Gly Asn Tyr Gly Asp Asn Trp Asn Tyr 450 455 460 Gly Gln Val Thr Leu Asn Glu Thr Val Lys Phe Lys Val Ala Phe Asn 465 470 475 480 Ala Phe Lys Asn Lys Ile Leu Ser Asp Ile Ala Leu Asp Asp Ile Ser 485 490 495 Leu Thr Tyr Gly Ile Cys Asn Gly Ser Leu Tyr Pro Glu Pro Thr Leu 500 505 510 Val Pro Thr Pro Pro Pro Glu Leu Pro Thr Asp Cys Gly Gly Pro Phe 515 520 525 Glu Leu Trp Glu Pro Asn Thr Thr Phe Ser Ser Thr Asn Phe Pro Asn 530 535 540 Ser Tyr Pro Asn Leu Ala Phe Cys Val Trp Ile Leu Asn Ala Gln Lys 545 550 555 560 Gly Lys Asn Ile Gln Leu His Phe Gln Glu Phe Asp Leu Glu Asn Ile 565 570 575 Asn Asp Val Val Glu Ile Arg Asp Gly Glu Glu Ala Asp Ser Leu Leu 580 585 590 Leu Ala Val Tyr Thr Gly Pro Gly Pro Val Lys Asp Val Phe Ser Thr 595 600 605 Thr Asn Arg Met Thr Val Leu Leu Ile Thr Asn Asp Val Leu Ala Arg 610 615 620 Gly Gly Phe Lys Ala Asn Phe Thr Thr Gly Tyr His Leu Gly Ile Pro 625 630 635 640 Glu Pro Cys Lys Ala Asp His Phe Gln Cys Lys Asn Gly Glu Cys Val 645 650 655 Pro Leu Val Asn Leu Cys Asp Gly His Leu His Cys Glu Asp Gly Ser 660 665 670 Asp Glu Ala Asp Cys Val Arg Phe Phe Asn Gly Thr Thr Asn Asn Asn 675 680 685 Gly Leu Val Arg Phe Arg Ile Gln Ser Ile Trp His Thr Ala Cys Ala 690 695 700 Glu Asn Trp Thr Thr Gln Ile Ser Asn Asp Val Cys Gln Leu Leu Gly 705 710 715 720 Leu Gly Ser Gly Asn Ser Ser Lys Pro Ile Phe Ser Thr Asp Gly Gly 725 730 735 Pro Phe Val Lys Leu Asn Thr Ala Pro Asp Gly His Leu Ile Leu Thr 740 745 750 Pro Ser Gln Gln Cys Leu Gln Asp Ser Leu Ile Arg Leu Gln Cys Asn 755 760 765 His Lys Ser Cys Gly Lys Lys Leu Ala Ala Gln Asp Ile Thr Pro Lys 770 775 780 Ile Val Gly Gly Ser Asn Ala Lys Glu Gly Ala Trp Pro Trp Val Val 785 790 795 800 Gly Leu Tyr Tyr Gly Gly Arg Leu Leu Cys Gly Ala Ser Leu Val Ser 805 810 815 Ser Asp Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Val Tyr Gly Arg Asn Leu 820 825 830 Glu Pro Ser Lys Trp Thr Ala Ile Leu Gly Leu His Met Lys Ser Asn 835 840 845 Leu Thr Ser Pro Gln Thr Val Pro Arg Leu Ile Asp Glu Ile Val Ile 850 855 860 Asn Pro His Tyr Asn Arg Arg Arg Lys Asp Asn Asp Ile Ala Met Met 865 870 875 880 His Leu Glu Phe Lys Val Asn Tyr Thr Asp Tyr Ile Gln Pro Ile Cys 885 890 895 Leu Pro Glu Glu Asn Gln Val Phe Pro Pro Gly Arg Asn Cys Ser Ile 900 905 910 Ala Gly Trp Gly Thr Val Val Tyr Gln Gly Thr Thr Ala Asn Ile Leu 915 920 925 Gln Glu Ala Asp Val Pro Leu Leu Ser Asn Glu Arg Cys Gln Gln Gln 930 935 940 Met Pro Glu Tyr Asn Ile Thr Glu Asn Met Ile Cys Ala Gly Tyr Glu 945 950 955 960 Glu Gly Gly Ile Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Met 965 970 975 Cys Gln Glu Asn Asn Arg Trp Phe Leu Ala Gly Val Thr Ser Phe Gly 980 985 990 Tyr Lys Cys Ala Leu Pro Asn Arg Pro Gly Val Tyr Ala Arg Val Ser 995 1000 1005 Arg Phe Thr Glu Trp Ile Gln Ser Phe Leu His 1010 1015 <210> 134 <211> 917 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> chymotrypsin C <400> 134 cagccagtcc tgagcaccta accatgttgg gcatcactgt cctcgctgcg ctcttggcct 60 gtgcctccag ctgtggggtg cccagcttcc cgcccaacct atccgcccga gtggtgggag 120 gagaggatgc ccggccccac agctggccct ggcagatctc cctccagtac ctcaagaacg 180 acacgtggag gcatacgtgt ggcgggactt tgattgctag caacttcgtc ctcactgccg 240 cccactgcat cagcaacacc cggacctacc gtgtggccgt gggaaagaac aacctggagg 300 tggaagacga agaaggatcc ctgtttgtgg gtgtggacac catccacgtc cacaagagat 360 ggaatgccct cctgttgcgc aatgatattg ccctcatcaa gcttgcagag catgtggagc 420 tgagtgacac catccaggtg gcctgcctgc cagagaagga ctccctgctc cccaaggact 480 acccctgcta tgtcaccggc tggggccgcc tctggaccaa cggccccatt gctgataagc 540 tgcagcaggg cctgcagccc gtggtggatc acgccacgtg ctccaggatt gactggtggg 600 gcttcagggt gaagaaaacc atggtgtgcg ctgggggcga tggcgtcatc tcagcctgca 660 atggggactc cggtggccca ctgaactgcc agttggagaa cggttcctgg gaggtgtttg 720 gcatcgtcag ctttggctcc cggcggggct gcaacacccg caagaagccg gtagtctaca 780 cccgggtgtc cgcctacatc gactggatca acgagaaaat gcagctgtga tttgttgctg 840 ggagcggcgg cagcgagtcc ctgcaacagc aataaacttc cttctcctcg ggccacctga 900 aaaaaaaaaa aaaaaaa 917 <210> 135 <211> 268 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> chymotrypsin C <400> 135 Met Leu Gly Ile Thr Val Leu Ala Ala Leu Leu Ala Cys Ala Ser Ser 1 5 10 15 Cys Gly Val Pro Ser Phe Pro Pro Asn Leu Ser Ala Arg Val Val Gly 20 25 30 Gly Glu Asp Ala Arg Pro His Ser Trp Pro Trp Gln Ile Ser Leu Gln 35 40 45 Tyr Leu Lys Asn Asp Thr Trp Arg His Thr Cys Gly Gly Thr Leu Ile 50 55 60 Ala Ser Asn Phe Val Leu Thr Ala Ala His Cys Ile Ser Asn Thr Arg 65 70 75 80 Thr Tyr Arg Val Ala Val Gly Lys Asn Asn Leu Glu Val Glu Asp Glu 85 90 95 Glu Gly Ser Leu Phe Val Gly Val Asp Thr Ile His Val His Lys Arg 100 105 110 Trp Asn Ala Leu Leu Leu Arg Asn Asp Ile Ala Leu Ile Lys Leu Ala 115 120 125 Glu His Val Glu Leu Ser Asp Thr Ile Gln Val Ala Cys Leu Pro Glu 130 135 140 Lys Asp Ser Leu Leu Pro Lys Asp Tyr Pro Cys Tyr Val Thr Gly Trp 145 150 155 160 Gly Arg Leu Trp Thr Asn Gly Pro Ile Ala Asp Lys Leu Gln Gln Gly 165 170 175 Leu Gln Pro Val Val Asp His Ala Thr Cys Ser Arg Ile Asp Trp Trp 180 185 190 Gly Phe Arg Val Lys Lys Thr Met Val Cys Ala Gly Gly Asp Gly Val 195 200 205 Ile Ser Ala Cys Asn Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Asn Cys Gln Leu 210 215 220 Glu Asn Gly Ser Trp Glu Val Phe Gly Ile Val Ser Phe Gly Ser Arg 225 230 235 240 Arg Gly Cys Asn Thr Arg Lys Lys Pro Val Val Tyr Thr Arg Val Ser 245 250 255 Ala Tyr Ile Asp Trp Ile Asn Glu Lys Met Gln Leu 260 265 <210> 136 <211> 1938 <212> DNA <213> Homo sapoens <220> <223> Prostasin <400> 136 gactttggtg gcaagaggag ctggcggagc ccagccagtg ggcggggcca ggggaggggc 60 gggcaggtag gtgcagccac tcctgggagg accctgcgtg gccagacggt gctggtgact 120 cgtccacact gctcgcttcg gatactccag gcgtctcccg ttgcggccgc tccctgcctt 180 agaggccagc cttggacact tgctgcccct ttccagcccg gattctggga tccttccctc 240 tgagccaaca tctgggtcct gccttcgaca ccaccccaag gcttcctacc ttgcgtgcct 300 ggagtctgcc ccaggggccc ttgtcctggg ccatggccca gaagggggtc ctggggcctg 360 ggcagctggg ggctgtggcc attctgctct atcttggatt actccggtcg gggacaggag 420 cggaaggggc agaagctccc tgcggtgtgg ccccccaagc acgcatcaca ggtggcagca 480 gtgcagtcgc cggtcagtgg ccctggcagg tcagcatcac ctatgaaggc gtccatgtgt 540 gtggtggctc tctcgtgtct gagcagtggg tgctgtcagc tgctcactgc ttccccagcg 600 agcaccacaa ggaagcctat gaggtcaagc tgggggccca ccagctagac tcctactccg 660 aggacgccaa ggtcagcacc ctgaaggaca tcatccccca ccccagctac ctccaggagg 720 gctcccaggg cgacattgca ctcctccaac tcagcagacc catcaccttc tcccgctaca 780 tccggcccat ctgcctccct gcagccaacg cctccttccc caacggcctc cactgcactg 840 tcactggctg gggtcatgtg gccccctcag tgagcctcct gacgcccaag ccactgcagc 900 aactcgaggt gcctctgatc agtcgtgaga cgtgtaactg cctgtacaac atcgacgcca 960 agcctgagga gccgcacttt gtccaagagg acatggtgtg tgctggctat gtggaggggg 1020 gcaaggacgc ctgccagggt gactctgggg gcccactctc ctgccctgtg gagggtctct 1080 ggtacctgac gggcattgtg agctggggag atgcctgtgg ggcccgcaac aggcctggtg 1140 tgtacactct ggcctccagc tatgcctcct ggatccaaag caaggtgaca gaactccagc 1200 ctcgtgtggt gccccaaacc caggagtccc agcccgacag caacctctgt ggcagccacc 1260 tggccttcag ctctgcccca gcccagggct tgctgaggcc catccttttc ctgcctctgg 1320 gcctggctct gggcctcctc tccccatggc tcagcgagca ctgagctggc cctacttcca 1380 ggatggatgc atcacactca aggacaggag cctggtcctt ccctgatggc ctttggaccc 1440 agggcctgac ttgagccact ccttccttca ggactctgcg ggaggctggg gccccatctt 1500 gatctttgag cccattcttc tgggtgtgct ttttgggacc atcactgaga gtcaggagtt 1560 ttactgcctg tagcaatggc cagagcctct ggcccctcac ccaccatgga ccagcccatt 1620 ggccgagctc ctggggagct cctgggaccc ttggctatga aaatgagccc tggctcccac 1680 ctgtttctgg aagactgctc ccggcccgcc tgcccagact gatgagcaca tctctctgcc 1740 ctctccctgt gttctgggct ggggccacct ttgtgcagct tcgaggacag gaaaggcccc 1800 aatcttgccc actggccgct gagcgccccc gagccctgac tcctggactc cggaggactg 1860 agcccccacc ggaactgggc tggcgcttgg atctggggtg ggagtaacag ggcagaaatg 1920 attaaaatgt ttgagcac 1938 <210> 137 <211> 343 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Prostasin <400> 137 Met Ala Gln Lys Gly Val Leu Gly Pro Gly Gln Leu Gly Ala Val Ala 1 5 10 15 Ile Leu Leu Tyr Leu Gly Leu Leu Arg Ser Gly Thr Gly Ala Glu Gly 20 25 30 Ala Glu Ala Pro Cys Gly Val Ala Pro Gln Ala Arg Ile Thr Gly Gly 35 40 45 Ser Ser Ala Val Ala Gly Gln Trp Pro Trp Gln Val Ser Ile Thr Tyr 50 55 60 Glu Gly Val His Val Cys Gly Gly Ser Leu Val Ser Glu Gln Trp Val 65 70 75 80 Leu Ser Ala Ala His Cys Phe Pro Ser Glu His His Lys Glu Ala Tyr 85 90 95 Glu Val Lys Leu Gly Ala His Gln Leu Asp Ser Tyr Ser Glu Asp Ala 100 105 110 Lys Val Ser Thr Leu Lys Asp Ile Ile Pro His Pro Ser Tyr Leu Gln 115 120 125 Glu Gly Ser Gln Gly Asp Ile Ala Leu Leu Gln Leu Ser Arg Pro Ile 130 135 140 Thr Phe Ser Arg Tyr Ile Arg Pro Ile Cys Leu Pro Ala Ala Asn Ala 145 150 155 160 Ser Phe Pro Asn Gly Leu His Cys Thr Val Thr Gly Trp Gly His Val 165 170 175 Ala Pro Ser Val Ser Leu Leu Thr Pro Lys Pro Leu Gln Gln Leu Glu 180 185 190 Val Pro Leu Ile Ser Arg Glu Thr Cys Asn Cys Leu Tyr Asn Ile Asp 195 200 205 Ala Lys Pro Glu Glu Pro His Phe Val Gln Glu Asp Met Val Cys Ala 210 215 220 Gly Tyr Val Glu Gly Gly Lys Asp Ala Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly 225 230 235 240 Pro Leu Ser Cys Pro Val Glu Gly Leu Trp Tyr Leu Thr Gly Ile Val 245 250 255 Ser Trp Gly Asp Ala Cys Gly Ala Arg Asn Arg Pro Gly Val Tyr Thr 260 265 270 Leu Ala Ser Ser Tyr Ala Ser Trp Ile Gln Ser Lys Val Thr Glu Leu 275 280 285 Gln Pro Arg Val Val Pro Gln Thr Gln Glu Ser Gln Pro Asp Ser Asn 290 295 300 Leu Cys Gly Ser His Leu Ala Phe Ser Ser Ala Pro Ala Gln Gly Leu 305 310 315 320 Leu Arg Pro Ile Leu Phe Leu Pro Leu Gly Leu Ala Leu Gly Leu Leu 325 330 335 Ser Pro Trp Leu Ser Glu His 340 <210> 138 <211> 874 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein 1 <400> 138 agttcctcca cctgctggcc cctggacacc tctgtcacca tgtggttcct ggttctgtgc 60 ctcgccctgt ccctgggggg gactggtgct gcgcccccga ttcagtcccg gattgtggga 120 ggctgggagt gtgagcagca ttcccagccc tggcaggcgg ctctgtacca tttcagcact 180 ttccagtgtg ggggcatcct ggtgcaccgc cagtgggtgc tcacagctgc tcattgcatc 240 agcgacaatt accagctctg gctgggtcgc cacaacttgt ttgacgacga aaacacagcc 300 cagtttgttc atgtcagtga gagcttccca caccctggct tcaacatgag cctcctggag 360 aaccacaccc gccaagcaga cgaggactac agccacgacc tcatgctgct ccgcctgaca 420 gagcctgctg ataccatcac agatgctgtg aaggtcgtgg agttgcccac cgaggaaccc 480 gaagtgggga gcacctgttt ggcttccggc tggggcagca tcgaaccaga gaatttctca 540 tttccagatg atctccagtg tgtggacctc aaaatcctgc ctaatgatga gtgcaaaaaa 600 gcccacgtcc agaaggtgac agacttcatg ctgtgtgtcg gacacctgga aggtggcaaa 660 gacacctgtg tgggtgattc agggggcccg ctgatgtgtg atggtgtgct ccaaggtgtc 720 acatcatggg gctacgtccc ttgtggcacc cccaataagc cttctgtcgc cgtcagagtg 780 ctgtcttatg tgaagtggat cgaggacacc atagcggaga actcctgaac gcccagccct 840 gtcccctacc cccagtaaaa tcaaatgtgc atcc 874 <210> 139 <211> 262 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein 1 <400> 139 Met Trp Phe Leu Val Leu Cys Leu Ala Leu Ser Leu Gly Gly Thr Gly 1 5 10 15 Ala Ala Pro Pro Ile Gln Ser Arg Ile Val Gly Gly Trp Glu Cys Glu 20 25 30 Gln His Ser Gln Pro Trp Gln Ala Ala Leu Tyr His Phe Ser Thr Phe 35 40 45 Gln Cys Gly Gly Ile Leu Val His Arg Gln Trp Val Leu Thr Ala Ala 50 55 60 His Cys Ile Ser Asp Asn Tyr Gln Leu Trp Leu Gly Arg His Asn Leu 65 70 75 80 Phe Asp Asp Glu Asn Thr Ala Gln Phe Val His Val Ser Glu Ser Phe 85 90 95 Pro His Pro Gly Phe Asn Met Ser Leu Leu Glu Asn His Thr Arg Gln 100 105 110 Ala Asp Glu Asp Tyr Ser His Asp Leu Met Leu Leu Arg Leu Thr Glu 115 120 125 Pro Ala Asp Thr Ile Thr Asp Ala Val Lys Val Val Glu Leu Pro Thr 130 135 140 Glu Glu Pro Glu Val Gly Ser Thr Cys Leu Ala Ser Gly Trp Gly Ser 145 150 155 160 Ile Glu Pro Glu Asn Phe Ser Phe Pro Asp Asp Leu Gln Cys Val Asp 165 170 175 Leu Lys Ile Leu Pro Asn Asp Glu Cys Lys Lys Ala His Val Gln Lys 180 185 190 Val Thr Asp Phe Met Leu Cys Val Gly His Leu Glu Gly Gly Lys Asp 195 200 205 Thr Cys Val Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Met Cys Asp Gly Val Leu 210 215 220 Gln Gly Val Thr Ser Trp Gly Tyr Val Pro Cys Gly Thr Pro Asn Lys 225 230 235 240 Pro Ser Val Ala Val Arg Val Leu Ser Tyr Val Lys Trp Ile Glu Asp 245 250 255 Thr Ile Ala Glu Asn Ser 260 <210> 140 <211> 2855 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein hK2 transcript variant 1 <400> 140 agccccaaac tcaccacctg gccgtggaca cctgtgtcag catgtgggac ctggttctct 60 ccatcgcctt gtctgtgggg tgcactggtg ccgtgcccct catccagtct cggattgtgg 120 gaggctggga gtgtgagaag cattcccaac cctggcaggt ggctgtgtac agtcatggat 180 gggcacactg tgggggtgtc ctggtgcacc cccagtgggt gctcacagct gcccattgcc 240 taaagaagaa tagccaggtc tggctgggtc ggcacaacct gtttgagcct gaagacacag 300 gccagagggt ccctgtcagc cacagcttcc cacacccgct ctacaatatg agccttctga 360 agcatcaaag ccttagacca gatgaagact ccagccatga cctcatgctg ctccgcctgt 420 cagagcctgc caagatcaca gatgttgtga aggtcctggg cctgcccacc caggagccag 480 cactggggac cacctgctac gcctcaggct ggggcagcat cgaaccagag gagttcttgc 540 gccccaggag tcttcagtgt gtgagcctcc atctcctgtc caatgacatg tgtgctagag 600 cttactctga gaaggtgaca gagttcatgt tgtgtgctgg gctctggaca ggtggtaaag 660 acacttgtgg gggtgattct gggggtccac ttgtctgtaa tggtgtgctt caaggtatca 720 catcatgggg ccctgagcca tgtgccctgc ctgaaaagcc tgctgtgtac accaaggtgg 780 tgcattaccg gaagtggatc aaggacacca tcgcagccaa cccctgagtg cccctgtccc 840 acccctacct ctagtaaatt taagtccacc tcacgttctg gcatcacttg gcctttctgg 900 atgctggaca cctgaagctt ggaactcacc tggccgaagc tcgagcctcc tgagtcctac 960 tgacctgtgc tttctggtgt ggagtccagg gctgctagga aaaggaatgg gcagacacag 1020 gtgtatgcca atgtttctga aatgggtata atttcgtcct ctccttcgga acactggctg 1080 tctctgaaga cttctcgctc agtttcagtg aggacacaca caaagacgtg ggtgaccatg 1140 ttgtttgtgg ggtgcagaga tgggaggggt ggggcccacc ctggaagagt ggacagtgac 1200 acaaggtgga cactctctac agatcactga ggataagctg gagccacaat gcatgaggca 1260 cacacacagc aaggatgacg ctgtaaacat agcccacgct gtcctggggg cactgggaag 1320 cctagataag gccgtgagca gaaagaaggg gaggatcctc ctatgttgtt gaaggaggga 1380 ctagggggag aaactgaaag ctgattaatt acaggaggtt tgttcaggtc ccccaaacca 1440 ccgtcagatt tgatgatttc ctagcaggac ttacagaaat aaagagctat catgctgtgg 1500 tttattatgg tttgttacat tgatgggata catactgaaa tcagcaaaca aaacagatgt 1560 atagattaga gtgtggagaa aacagaggaa aacttgcagt tacgaagact ggcaacttgg 1620 ctttactaag ttttcagact ggcaggaagt caaacctatt aggctgagga ccttgtggag 1680 tgtagctgat ccagctgata gaggaactag ccaggtgggg gcctttccct ttggatgggg 1740 ggcatatctg acagttattc tctccaagtg gagacttacg gacagcatat aattctccct 1800 gcaaggatgt atgataatat gtacaaagta attccaactg aggaagctca cctgatcctt 1860 agtgtccaag gtttttactg ggggtctgta ggacgagtat ggagtacttg aataattgac 1920 ctgaagtcct cagacctgag gttccctaga gttcaaacag atacagcatg gtccagagtc 1980 ccagatgtac aaaaacaggg attcatcaca aatcccatct ttagcatgaa gggtctggca 2040 tggcccaagg ccccaagtat atcaaggcac ttgggcagaa catgccaagg aatcaaatgt 2100 catctcccag gagttattca agggtgagcc ctttacttgg gatgtacagg ctttgagcag 2160 tgcagggctg ctgagtcaac cttttattgt acaggggatg agggaaaggg agaggatgag 2220 gaagcccccc tggggatttg gtttggtctt gtgatcaggt ggtctatggg gctatcccta 2280 caaagaagaa tccagaaata ggggcacatt gaggaatgat actgagccca aagagcattc 2340 aatcattgtt ttatttgcct tcttttcaca ccattggtga gggagggatt accaccctgg 2400 ggttatgaag atggttgaac accccacaca tagcaccgga gatatgagat caacagtttc 2460 ttagccatag agattcacag cccagagcag gaggacgctg cacaccatgc aggatgacat 2520 gggggatgcg ctcgggattg gtgtgaagaa gcaaggactg ttagaggcag gctttatagt 2580 aacaagacgg tggggcaaac tctgatttcc gtgggggaat gtcatggtct tgctttacta 2640 agttttgaga ctggcaggta gtgaaactca ttaggctgag aaccttgtgg aatgcagctg 2700 acccagctga tagaggaagt agccaggtgg gagcctttcc cagtgggtgt gggacatatc 2760 tggcaagatt ttgtggcact cctggttaca gatactgggg cagcaaataa aactgaatct 2820 tgttttcaga ccttaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaa 2855 <210> 141 <211> 261 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein hK2 isoform 1 <400> 141 Met Trp Asp Leu Val Leu Ser Ile Ala Leu Ser Val Gly Cys Thr Gly 1 5 10 15 Ala Val Pro Leu Ile Gln Ser Arg Ile Val Gly Gly Trp Glu Cys Glu 20 25 30 Lys His Ser Gln Pro Trp Gln Val Ala Val Tyr Ser His Gly Trp Ala 35 40 45 His Cys Gly Gly Val Leu Val His Pro Gln Trp Val Leu Thr Ala Ala 50 55 60 His Cys Leu Lys Lys Asn Ser Gln Val Trp Leu Gly Arg His Asn Leu 65 70 75 80 Phe Glu Pro Glu Asp Thr Gly Gln Arg Val Pro Val Ser His Ser Phe 85 90 95 Pro His Pro Leu Tyr Asn Met Ser Leu Leu Lys His Gln Ser Leu Arg 100 105 110 Pro Asp Glu Asp Ser Ser His Asp Leu Met Leu Leu Arg Leu Ser Glu 115 120 125 Pro Ala Lys Ile Thr Asp Val Val Lys Val Leu Gly Leu Pro Thr Gln 130 135 140 Glu Pro Ala Leu Gly Thr Thr Cys Tyr Ala Ser Gly Trp Gly Ser Ile 145 150 155 160 Glu Pro Glu Glu Phe Leu Arg Pro Arg Ser Leu Gln Cys Val Ser Leu 165 170 175 His Leu Leu Ser Asn Asp Met Cys Ala Arg Ala Tyr Ser Glu Lys Val 180 185 190 Thr Glu Phe Met Leu Cys Ala Gly Leu Trp Thr Gly Gly Lys Asp Thr 195 200 205 Cys Gly Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Asn Gly Val Leu Gln 210 215 220 Gly Ile Thr Ser Trp Gly Pro Glu Pro Cys Ala Leu Pro Glu Lys Pro 225 230 235 240 Ala Val Tyr Thr Lys Val Val His Tyr Arg Lys Trp Ile Lys Asp Thr 245 250 255 Ile Ala Ala Asn Pro 260 <210> 142 <211> 2892 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein hK2 transcript variant 2 <400> 142 agccccaaac tcaccacctg gccgtggaca cctgtgtcag catgtgggac ctggttctct 60 ccatcgcctt gtctgtgggg tgcactggtg ccgtgcccct catccagtct cggattgtgg 120 gaggctggga gtgtgagaag cattcccaac cctggcaggt ggctgtgtac agtcatggat 180 gggcacactg tgggggtgtc ctggtgcacc cccagtgggt gctcacagct gcccattgcc 240 taaagaagaa tagccaggtc tggctgggtc ggcacaacct gtttgagcct gaagacacag 300 gccagagggt ccctgtcagc cacagcttcc cacacccgct ctacaatatg agccttctga 360 agcatcaaag ccttagacca gatgaagact ccagccatga cctcatgctg ctccgcctgt 420 cagagcctgc caagatcaca gatgttgtga aggtcctggg cctgcccacc caggagccag 480 cactggggac cacctgctac gcctcaggct ggggcagcat cgaaccagag gagttcttgc 540 gccccaggag tcttcagtgt gtgagcctcc atctcctgtc caatgacatg tgtgctagag 600 cttactctga gaaggtgaca gagttcatgt tgtgtgctgg gctctggaca ggtggtaaag 660 acacttgtgg ggtgagtcat ccctactccc aacatctgga ggggaaaggg tgattctggg 720 ggtccacttg tctgtaatgg tgtgcttcaa ggtatcacat catggggccc tgagccatgt 780 gccctgcctg aaaagcctgc tgtgtacacc aaggtggtgc attaccggaa gtggatcaag 840 gacaccatcg cagccaaccc ctgagtgccc ctgtcccacc cctacctcta gtaaatttaa 900 gtccacctca cgttctggca tcacttggcc tttctggatg ctggacacct gaagcttgga 960 actcacctgg ccgaagctcg agcctcctga gtcctactga cctgtgcttt ctggtgtgga 1020 gtccagggct gctaggaaaa ggaatgggca gacacaggtg tatgccaatg tttctgaaat 1080 gggtataatt tcgtcctctc cttcggaaca ctggctgtct ctgaagactt ctcgctcagt 1140 ttcagtgagg acacacacaa agacgtgggt gaccatgttg tttgtggggt gcagagatgg 1200 gaggggtggg gcccaccctg gaagagtgga cagtgacaca aggtggacac tctctacaga 1260 tcactgagga taagctggag ccacaatgca tgaggcacac acacagcaag gatgacgctg 1320 taaacatagc ccacgctgtc ctgggggcac tgggaagcct agataaggcc gtgagcagaa 1380 agaaggggag gatcctccta tgttgttgaa ggagggacta gggggagaaa ctgaaagctg 1440 attaattaca ggaggtttgt tcaggtcccc caaaccaccg tcagatttga tgatttccta 1500 gcaggactta cagaaataaa gagctatcat gctgtggttt attatggttt gttacattga 1560 tgggatacat actgaaatca gcaaacaaaa cagatgtata gattagagtg tggagaaaac 1620 agaggaaaac ttgcagttac gaagactggc aacttggctt tactaagttt tcagactggc 1680 aggaagtcaa acctattagg ctgaggacct tgtggagtgt agctgatcca gctgatagag 1740 gaactagcca ggtgggggcc tttccctttg gatggggggc atatctgaca gttattctct 1800 ccaagtggag acttacggac agcatataat tctccctgca aggatgtatg ataatatgta 1860 caaagtaatt ccaactgagg aagctcacct gatccttagt gtccaaggtt tttactgggg 1920 gtctgtagga cgagtatgga gtacttgaat aattgacctg aagtcctcag acctgaggtt 1980 ccctagagtt caaacagata cagcatggtc cagagtccca gatgtacaaa aacagggatt 2040 catcacaaat cccatcttta gcatgaaggg tctggcatgg cccaaggccc caagtatatc 2100 aaggcacttg ggcagaacat gccaaggaat caaatgtcat ctcccaggag ttattcaagg 2160 gtgagccctt tacttgggat gtacaggctt tgagcagtgc agggctgctg agtcaacctt 2220 ttattgtaca ggggatgagg gaaagggaga ggatgaggaa gcccccctgg ggatttggtt 2280 tggtcttgtg atcaggtggt ctatggggct atccctacaa agaagaatcc agaaataggg 2340 gcacattgag gaatgatact gagcccaaag agcattcaat cattgtttta tttgccttct 2400 tttcacacca ttggtgaggg agggattacc accctggggt tatgaagatg gttgaacacc 2460 ccacacatag caccggagat atgagatcaa cagtttctta gccatagaga ttcacagccc 2520 agagcaggag gacgctgcac accatgcagg atgacatggg ggatgcgctc gggattggtg 2580 tgaagaagca aggactgtta gaggcaggct ttatagtaac aagacggtgg ggcaaactct 2640 gatttccgtg ggggaatgtc atggtcttgc tttactaagt tttgagactg gcaggtagtg 2700 aaactcatta ggctgagaac cttgtggaat gcagctgacc cagctgatag aggaagtagc 2760 caggtgggag cctttcccag tgggtgtggg acatatctgg caagattttg tggcactcct 2820 ggttacagat actggggcag caaataaaac tgaatcttgt tttcagacct taaaaaaaaa 2880 aaaaaaaaaa aa 2892 <210> 143 <211> 223 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein hK2 isoform 2 <400> 143 Met Trp Asp Leu Val Leu Ser Ile Ala Leu Ser Val Gly Cys Thr Gly 1 5 10 15 Ala Val Pro Leu Ile Gln Ser Arg Ile Val Gly Gly Trp Glu Cys Glu 20 25 30 Lys His Ser Gln Pro Trp Gln Val Ala Val Tyr Ser His Gly Trp Ala 35 40 45 His Cys Gly Gly Val Leu Val His Pro Gln Trp Val Leu Thr Ala Ala 50 55 60 His Cys Leu Lys Lys Asn Ser Gln Val Trp Leu Gly Arg His Asn Leu 65 70 75 80 Phe Glu Pro Glu Asp Thr Gly Gln Arg Val Pro Val Ser His Ser Phe 85 90 95 Pro His Pro Leu Tyr Asn Met Ser Leu Leu Lys His Gln Ser Leu Arg 100 105 110 Pro Asp Glu Asp Ser Ser His Asp Leu Met Leu Leu Arg Leu Ser Glu 115 120 125 Pro Ala Lys Ile Thr Asp Val Val Lys Val Leu Gly Leu Pro Thr Gln 130 135 140 Glu Pro Ala Leu Gly Thr Thr Cys Tyr Ala Ser Gly Trp Gly Ser Ile 145 150 155 160 Glu Pro Glu Glu Phe Leu Arg Pro Arg Ser Leu Gln Cys Val Ser Leu 165 170 175 His Leu Leu Ser Asn Asp Met Cys Ala Arg Ala Tyr Ser Glu Lys Val 180 185 190 Thr Glu Phe Met Leu Cys Ala Gly Leu Trp Thr Gly Gly Lys Asp Thr 195 200 205 Cys Gly Val Ser His Pro Tyr Ser Gln His Leu Glu Gly Lys Gly 210 215 220 <210> 144 <211> 2879 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein hK2 transcript variant 3 <400> 144 agccccaaac tcaccacctg gccgtggaca cctgtgtcag catgtgggac ctggttctct 60 ccatcgcctt gtctgtgggg tgcactggtg ccgtgcccct catccagtct cggattgtgg 120 gaggctggga gtgtgagaag cattcccaac cctggcaggt ggctgtgtac agtcatggat 180 gggcacactg tgggggtgtc ctggtgcacc cccagtgggt gctcacagct gcccattgcc 240 taaagaagaa tagccaggtc tggctgggtc ggcacaacct gtttgagcct gaagacacag 300 gccagagggt ccctgtcagc cacagcttcc cacacccgct ctacaatatg agccttctga 360 agcatcaaag ccttagacca gatgaagact ccagccatga cctcatgctg ctccgcctgt 420 cagagcctgc caagatcaca gatgttgtga aggtcctggg cctgcccacc caggagccag 480 cactggggac cacctgctac gcctcaggct ggggcagcat cgaaccagag gagtgagtct 540 tcagtgtgtg agcctccatc tcctgtccaa tgacatgtgt gctagagctt actctgagaa 600 ggtgacagag ttcatgttgt gtgctgggct ctggacaggt ggtaaagaca cttgtggggt 660 gagtcatccc tactcccaac atctggaggg gaaagggtga ttctgggggt ccacttgtct 720 gtaatggtgt gcttcaaggt atcacatcat ggggccctga gccatgtgcc ctgcctgaaa 780 agcctgctgt gtacaccaag gtggtgcatt accggaagtg gatcaaggac accatcgcag 840 ccaacccctg agtgcccctg tcccacccct acctctagta aatttaagtc cacctcacgt 900 tctggcatca cttggccttt ctggatgctg gacacctgaa gcttggaact cacctggccg 960 aagctcgagc ctcctgagtc ctactgacct gtgctttctg gtgtggagtc cagggctgct 1020 aggaaaagga atgggcagac acaggtgtat gccaatgttt ctgaaatggg tataatttcg 1080 tcctctcctt cggaacactg gctgtctctg aagacttctc gctcagtttc agtgaggaca 1140 cacacaaaga cgtgggtgac catgttgttt gtggggtgca gagatgggag gggtggggcc 1200 caccctggaa gagtggacag tgacacaagg tggacactct ctacagatca ctgaggataa 1260 gctggagcca caatgcatga ggcacacaca cagcaaggat gacgctgtaa acatagccca 1320 cgctgtcctg ggggcactgg gaagcctaga taaggccgtg agcagaaaga aggggaggat 1380 cctcctatgt tgttgaagga gggactaggg ggagaaactg aaagctgatt aattacagga 1440 ggtttgttca ggtcccccaa accaccgtca gatttgatga tttcctagca ggacttacag 1500 aaataaagag ctatcatgct gtggtttatt atggtttgtt acattgatgg gatacatact 1560 gaaatcagca aacaaaacag atgtatagat tagagtgtgg agaaaacaga ggaaaacttg 1620 cagttacgaa gactggcaac ttggctttac taagttttca gactggcagg aagtcaaacc 1680 tattaggctg aggaccttgt ggagtgtagc tgatccagct gatagaggaa ctagccaggt 1740 gggggccttt ccctttggat ggggggcata tctgacagtt attctctcca agtggagact 1800 tacggacagc atataattct ccctgcaagg atgtatgata atatgtacaa agtaattcca 1860 actgaggaag ctcacctgat ccttagtgtc caaggttttt actgggggtc tgtaggacga 1920 gtatggagta cttgaataat tgacctgaag tcctcagacc tgaggttccc tagagttcaa 1980 acagatacag catggtccag agtcccagat gtacaaaaac agggattcat cacaaatccc 2040 atctttagca tgaagggtct ggcatggccc aaggccccaa gtatatcaag gcacttgggc 2100 agaacatgcc aaggaatcaa atgtcatctc ccaggagtta ttcaagggtg agccctttac 2160 ttgggatgta caggctttga gcagtgcagg gctgctgagt caacctttta ttgtacaggg 2220 gatgagggaa agggagagga tgaggaagcc cccctgggga tttggtttgg tcttgtgatc 2280 aggtggtcta tggggctatc cctacaaaga agaatccaga aataggggca cattgaggaa 2340 tgatactgag cccaaagagc attcaatcat tgttttattt gccttctttt cacaccattg 2400 gtgagggagg gattaccacc ctggggttat gaagatggtt gaacacccca cacatagcac 2460 cggagatatg agatcaacag tttcttagcc atagagattc acagcccaga gcaggaggac 2520 gctgcacacc atgcaggatg acatggggga tgcgctcggg attggtgtga agaagcaagg 2580 actgttagag gcaggcttta tagtaacaag acggtggggc aaactctgat ttccgtgggg 2640 gaatgtcatg gtcttgcttt actaagtttt gagactggca ggtagtgaaa ctcattaggc 2700 tgagaacctt gtggaatgca gctgacccag ctgatagagg aagtagccag gtgggagcct 2760 ttcccagtgg gtgtgggaca tatctggcaa gattttgtgg cactcctggt tacagatact 2820 ggggcagcaa ataaaactga atcttgtttt cagaccttaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaa 2879 <210> 145 <211> 164 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein hK2 isoform 3 <400> 145 Met Trp Asp Leu Val Leu Ser Ile Ala Leu Ser Val Gly Cys Thr Gly 1 5 10 15 Ala Val Pro Leu Ile Gln Ser Arg Ile Val Gly Gly Trp Glu Cys Glu 20 25 30 Lys His Ser Gln Pro Trp Gln Val Ala Val Tyr Ser His Gly Trp Ala 35 40 45 His Cys Gly Gly Val Leu Val His Pro Gln Trp Val Leu Thr Ala Ala 50 55 60 His Cys Leu Lys Lys Asn Ser Gln Val Trp Leu Gly Arg His Asn Leu 65 70 75 80 Phe Glu Pro Glu Asp Thr Gly Gln Arg Val Pro Val Ser His Ser Phe 85 90 95 Pro His Pro Leu Tyr Asn Met Ser Leu Leu Lys His Gln Ser Leu Arg 100 105 110 Pro Asp Glu Asp Ser Ser His Asp Leu Met Leu Leu Arg Leu Ser Glu 115 120 125 Pro Ala Lys Ile Thr Asp Val Val Lys Val Leu Gly Leu Pro Thr Gln 130 135 140 Glu Pro Ala Leu Gly Thr Thr Cys Tyr Ala Ser Gly Trp Gly Ser Ile 145 150 155 160 Glu Pro Glu Glu <210> 146 <211> 1464 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein 3 transcript variant 1 <400> 146 agccccaagc ttaccacctg cacccggaga gctgtgtcac catgtgggtc ccggttgtct 60 tcctcaccct gtccgtgacg tggattggtg ctgcacccct catcctgtct cggattgtgg 120 gaggctggga gtgcgagaag cattcccaac cctggcaggt gcttgtggcc tctcgtggca 180 gggcagtctg cggcggtgtt ctggtgcacc cccagtgggt cctcacagct gcccactgca 240 tcaggaacaa aagcgtgatc ttgctgggtc ggcacagcct gtttcatcct gaagacacag 300 gccaggtatt tcaggtcagc cacagcttcc cacacccgct ctacgatatg agcctcctga 360 agaatcgatt cctcaggcca ggtgatgact ccagccacga cctcatgctg ctccgcctgt 420 cagagcctgc cgagctcacg gatgctgtga aggtcatgga cctgcccacc caggagccag 480 cactggggac cacctgctac gcctcaggct ggggcagcat tgaaccagag gagttcttga 540 ccccaaagaa acttcagtgt gtggacctcc atgttatttc caatgacgtg tgtgcgcaag 600 ttcaccctca gaaggtgacc aagttcatgc tgtgtgctgg acgctggaca gggggcaaaa 660 gcacctgctc gggtgattct gggggcccac ttgtctgtaa tggtgtgctt caaggtatca 720 cgtcatgggg cagtgaacca tgtgccctgc ccgaaaggcc ttccctgtac accaaggtgg 780 tgcattaccg gaagtggatc aaggacacca tcgtggccaa cccctgagca cccctatcaa 840 ccccctattg tagtaaactt ggaaccttgg aaatgaccag gccaagactc aagcctcccc 900 agttctactg acctttgtcc ttaggtgtga ggtccagggt tgctaggaaa agaaatcagc 960 agacacaggt gtagaccaga gtgtttctta aatggtgtaa ttttgtcctc tctgtgtcct 1020 ggggaatact ggccatgcct ggagacatat cactcaattt ctctgaggac acagatagga 1080 tggggtgtct gtgttatttg tggggtacag agatgaaaga ggggtgggat ccacactgag 1140 agagtggaga gtgacatgtg ctggacactg tccatgaagc actgagcaga agctggaggc 1200 acaacgcacc agacactcac agcaaggatg gagctgaaaa cataacccac tctgtcctgg 1260 aggcactggg aagcctagag aaggctgtga gccaaggagg gagggtcttc ctttggcatg 1320 ggatggggat gaagtaagga gagggactgg accccctgga agctgattca ctatgggggg 1380 aggtgtattg aagtcctcca gacaaccctc agatttgatg atttcctagt agaactcaca 1440 gaaataaaga gctgttatac tgtg 1464 <210> 147 <211> 261 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein 3 isoform 1 <400> 147 Met Trp Val Pro Val Val Phe Leu Thr Leu Ser Val Thr Trp Ile Gly 1 5 10 15 Ala Ala Pro Leu Ile Leu Ser Arg Ile Val Gly Gly Trp Glu Cys Glu 20 25 30 Lys His Ser Gln Pro Trp Gln Val Leu Val Ala Ser Arg Gly Arg Ala 35 40 45 Val Cys Gly Gly Val Leu Val His Pro Gln Trp Val Leu Thr Ala Ala 50 55 60 His Cys Ile Arg Asn Lys Ser Val Ile Leu Leu Gly Arg His Ser Leu 65 70 75 80 Phe His Pro Glu Asp Thr Gly Gln Val Phe Gln Val Ser His Ser Phe 85 90 95 Pro His Pro Leu Tyr Asp Met Ser Leu Leu Lys Asn Arg Phe Leu Arg 100 105 110 Pro Gly Asp Asp Ser Ser His Asp Leu Met Leu Leu Arg Leu Ser Glu 115 120 125 Pro Ala Glu Leu Thr Asp Ala Val Lys Val Met Asp Leu Pro Thr Gln 130 135 140 Glu Pro Ala Leu Gly Thr Thr Cys Tyr Ala Ser Gly Trp Gly Ser Ile 145 150 155 160 Glu Pro Glu Glu Phe Leu Thr Pro Lys Lys Leu Gln Cys Val Asp Leu 165 170 175 His Val Ile Ser Asn Asp Val Cys Ala Gln Val His Pro Gln Lys Val 180 185 190 Thr Lys Phe Met Leu Cys Ala Gly Arg Trp Thr Gly Gly Lys Ser Thr 195 200 205 Cys Ser Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Asn Gly Val Leu Gln 210 215 220 Gly Ile Thr Ser Trp Gly Ser Glu Pro Cys Ala Leu Pro Glu Arg Pro 225 230 235 240 Ser Leu Tyr Thr Lys Val Val His Tyr Arg Lys Trp Ile Lys Asp Thr 245 250 255 Ile Val Ala Asn Pro 260 <210> 148 <211> 1906 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein 3 transcript variant 3 <400> 148 agccccaagc ttaccacctg cacccggaga gctgtgtcac catgtgggtc ccggttgtct 60 tcctcaccct gtccgtgacg tggattggtg ctgcacccct catcctgtct cggattgtgg 120 gaggctggga gtgcgagaag cattcccaac cctggcaggt gcttgtggcc tctcgtggca 180 gggcagtctg cggcggtgtt ctggtgcacc cccagtgggt cctcacagct gcccactgca 240 tcaggaacaa aagcgtgatc ttgctgggtc ggcacagcct gtttcatcct gaagacacag 300 gccaggtatt tcaggtcagc cacagcttcc cacacccgct ctacgatatg agcctcctga 360 agaatcgatt cctcaggcca ggtgatgact ccagccacga cctcatgctg ctccgcctgt 420 cagagcctgc cgagctcacg gatgctgtga aggtcatgga cctgcccacc caggagccag 480 cactggggac cacctgctac gcctcaggct ggggcagcat tgaaccagag gagttcttga 540 ccccaaagaa acttcagtgt gtggacctcc atgttatttc caatgacgtg tgtgcgcaag 600 ttcaccctca gaaggtgacc aagttcatgc tgtgtgctgg acgctggaca gggggcaaaa 660 gcacctgctc gtgggtcatt ctgatcaccg aactgaccat gccagccctg ccgatggtcc 720 tccatggctc cctagtgccc tggagaggag gtgtctagtc agagagtagt cctggaaggt 780 ggcctctgtg aggagccacg gggacagcat cctgcagatg gtcctggccc ttgtcccacc 840 gacctgtcta caaggactgt cctcgtggac cctcccctct gcacaggagc tggaccctga 900 agtcccttcc ccaccggcca ggactggagc ccctacccct ctgttggaat ccctgcccac 960 cttcttctgg aagtcggctc tggagacatt tctctcttct tccaaagctg ggaactgcta 1020 tctgttatct gcctgtccag gtctgaaaga taggattgcc caggcagaaa ctgggactga 1080 cctatctcac tctctccctg cttttaccct tagggtgatt ctgggggccc acttgtctgt 1140 aatggtgtgc ttcaaggtat cacgtcatgg ggcagtgaac catgtgccct gcccgaaagg 1200 ccttccctgt acaccaaggt ggtgcattac cggaagtgga tcaaggacac catcgtggcc 1260 aacccctgag cacccctatc aaccccctat tgtagtaaac ttggaacctt ggaaatgacc 1320 aggccaagac tcaagcctcc ccagttctac tgacctttgt ccttaggtgt gaggtccagg 1380 gttgctagga aaagaaatca gcagacacag gtgtagacca gagtgtttct taaatggtgt 1440 aattttgtcc tctctgtgtc ctggggaata ctggccatgc ctggagacat atcactcaat 1500 ttctctgagg acacagatag gatggggtgt ctgtgttatt tgtggggtac agagatgaaa 1560 gaggggtggg atccacactg agagagtgga gagtgacatg tgctggacac tgtccatgaa 1620 gcactgagca gaagctggag gcacaacgca ccagacactc acagcaagga tggagctgaa 1680 aacataaccc actctgtcct ggaggcactg ggaagcctag agaaggctgt gagccaagga 1740 gggagggtct tcctttggca tgggatgggg atgaagtaag gagagggact ggaccccctg 1800 gaagctgatt cactatgggg ggaggtgtat tgaagtcctc cagacaaccc tcagatttga 1860 tgatttccta gtagaactca cagaaataaa gagctgttat actgtg 1906 <210> 149 <211> 238 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein 3 isoform 3 <400> 149 Met Trp Val Pro Val Val Phe Leu Thr Leu Ser Val Thr Trp Ile Gly 1 5 10 15 Ala Ala Pro Leu Ile Leu Ser Arg Ile Val Gly Gly Trp Glu Cys Glu 20 25 30 Lys His Ser Gln Pro Trp Gln Val Leu Val Ala Ser Arg Gly Arg Ala 35 40 45 Val Cys Gly Gly Val Leu Val His Pro Gln Trp Val Leu Thr Ala Ala 50 55 60 His Cys Ile Arg Asn Lys Ser Val Ile Leu Leu Gly Arg His Ser Leu 65 70 75 80 Phe His Pro Glu Asp Thr Gly Gln Val Phe Gln Val Ser His Ser Phe 85 90 95 Pro His Pro Leu Tyr Asp Met Ser Leu Leu Lys Asn Arg Phe Leu Arg 100 105 110 Pro Gly Asp Asp Ser Ser His Asp Leu Met Leu Leu Arg Leu Ser Glu 115 120 125 Pro Ala Glu Leu Thr Asp Ala Val Lys Val Met Asp Leu Pro Thr Gln 130 135 140 Glu Pro Ala Leu Gly Thr Thr Cys Tyr Ala Ser Gly Trp Gly Ser Ile 145 150 155 160 Glu Pro Glu Glu Phe Leu Thr Pro Lys Lys Leu Gln Cys Val Asp Leu 165 170 175 His Val Ile Ser Asn Asp Val Cys Ala Gln Val His Pro Gln Lys Val 180 185 190 Thr Lys Phe Met Leu Cys Ala Gly Arg Trp Thr Gly Gly Lys Ser Thr 195 200 205 Cys Ser Trp Val Ile Leu Ile Thr Glu Leu Thr Met Pro Ala Leu Pro 210 215 220 Met Val Leu His Gly Ser Leu Val Pro Trp Arg Gly Gly Val 225 230 235 <210> 150 <211> 1335 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein 3 transcript variant 4 <400> 150 agccccaagc ttaccacctg cacccggaga gctgtgtcac catgtgggtc ccggttgtct 60 tcctcaccct gtccgtgacg tggattggtg ctgcacccct catcctgtct cggattgtgg 120 gaggctggga gtgcgagaag cattcccaac cctggcaggt gcttgtggcc tctcgtggca 180 gggcagtctg cggcggtgtt ctggtgcacc cccagtgggt cctcacagct gcccactgca 240 tcaggaagcc aggtgatgac tccagccacg acctcatgct gctccgcctg tcagagcctg 300 ccgagctcac ggatgctgtg aaggtcatgg acctgcccac ccaggagcca gcactgggga 360 ccacctgcta cgcctcaggc tggggcagca ttgaaccaga ggagttcttg accccaaaga 420 aacttcagtg tgtggacctc catgttattt ccaatgacgt gtgtgcgcaa gttcaccctc 480 agaaggtgac caagttcatg ctgtgtgctg gacgctggac agggggcaaa agcacctgct 540 cgggtgattc tgggggccca cttgtctgta atggtgtgct tcaaggtatc acgtcatggg 600 gcagtgaacc atgtgccctg cccgaaaggc cttccctgta caccaaggtg gtgcattacc 660 ggaagtggat caaggacacc atcgtggcca acccctgagc acccctatca accccctatt 720 gtagtaaact tggaaccttg gaaatgacca ggccaagact caagcctccc cagttctact 780 gacctttgtc cttaggtgtg aggtccaggg ttgctaggaa aagaaatcag cagacacagg 840 tgtagaccag agtgtttctt aaatggtgta attttgtcct ctctgtgtcc tggggaatac 900 tggccatgcc tggagacata tcactcaatt tctctgagga cacagatagg atggggtgtc 960 tgtgttattt gtggggtaca gagatgaaag aggggtggga tccacactga gagagtggag 1020 agtgacatgt gctggacact gtccatgaag cactgagcag aagctggagg cacaacgcac 1080 cagacactca cagcaaggat ggagctgaaa acataaccca ctctgtcctg gaggcactgg 1140 gaagcctaga gaaggctgtg agccaaggag ggagggtctt cctttggcat gggatgggga 1200 tgaagtaagg agagggactg gaccccctgg aagctgattc actatggggg gaggtgtatt 1260 gaagtcctcc agacaaccct cagatttgat gatttcctag tagaactcac agaaataaag 1320 agctgttata ctgtg 1335 <210> 151 <211> 218 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein 3 isoform 4 <400> 151 Met Trp Val Pro Val Val Phe Leu Thr Leu Ser Val Thr Trp Ile Gly 1 5 10 15 Ala Ala Pro Leu Ile Leu Ser Arg Ile Val Gly Gly Trp Glu Cys Glu 20 25 30 Lys His Ser Gln Pro Trp Gln Val Leu Val Ala Ser Arg Gly Arg Ala 35 40 45 Val Cys Gly Gly Val Leu Val His Pro Gln Trp Val Leu Thr Ala Ala 50 55 60 His Cys Ile Arg Lys Pro Gly Asp Asp Ser Ser His Asp Leu Met Leu 65 70 75 80 Leu Arg Leu Ser Glu Pro Ala Glu Leu Thr Asp Ala Val Lys Val Met 85 90 95 Asp Leu Pro Thr Gln Glu Pro Ala Leu Gly Thr Thr Cys Tyr Ala Ser 100 105 110 Gly Trp Gly Ser Ile Glu Pro Glu Glu Phe Leu Thr Pro Lys Lys Leu 115 120 125 Gln Cys Val Asp Leu His Val Ile Ser Asn Asp Val Cys Ala Gln Val 130 135 140 His Pro Gln Lys Val Thr Lys Phe Met Leu Cys Ala Gly Arg Trp Thr 145 150 155 160 Gly Gly Lys Ser Thr Cys Ser Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys 165 170 175 Asn Gly Val Leu Gln Gly Ile Thr Ser Trp Gly Ser Glu Pro Cys Ala 180 185 190 Leu Pro Glu Arg Pro Ser Leu Tyr Thr Lys Val Val His Tyr Arg Lys 195 200 205 Trp Ile Lys Asp Thr Ile Val Ala Asn Pro 210 215 <210> 152 <211> 1341 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein 3 transcript variant 5 <400> 152 agccccaagc ttaccacctg cacccggaga gctgtgtcac catgtgggtc ccggttgtct 60 tcctcaccct gtccgtgacg tggattggtg ctgcacccct catcctgtct cggattgtgg 120 gaggctggga gtgcgagaag cattcccaac cctggcaggt gcttgtggcc tctcgtggca 180 gggcagtctg cggcggtgtt ctggtgcacc cccagtgggt cctcacagct gcccactgca 240 tcaggaacaa aagcgtgatc ttgctgggtc ggcacagcct gtttcatcct gaagacacag 300 gccaggtatt tcaggtcagc cacagcttcc cacacccgct ctacgatatg agcctcctga 360 agaatcgatt cctcaggcca ggtgatgact ccagcattga accagaggag ttcttgaccc 420 caaagaaact tcagtgtgtg gacctccatg ttatttccaa tgacgtgtgt gcgcaagttc 480 accctcagaa ggtgaccaag ttcatgctgt gtgctggacg ctggacaggg ggcaaaagca 540 cctgctcggg tgattctggg ggcccacttg tctgtaatgg tgtgcttcaa ggtatcacgt 600 catggggcag tgaaccatgt gccctgcccg aaaggccttc cctgtacacc aaggtggtgc 660 attaccggaa gtggatcaag gacaccatcg tggccaaccc ctgagcaccc ctatcaaccc 720 cctattgtag taaacttgga accttggaaa tgaccaggcc aagactcaag cctccccagt 780 tctactgacc tttgtcctta ggtgtgaggt ccagggttgc taggaaaaga aatcagcaga 840 cacaggtgta gaccagagtg tttcttaaat ggtgtaattt tgtcctctct gtgtcctggg 900 gaatactggc catgcctgga gacatatcac tcaatttctc tgaggacaca gataggatgg 960 ggtgtctgtg ttatttgtgg ggtacagaga tgaaagaggg gtgggatcca cactgagaga 1020 gtggagagtg acatgtgctg gacactgtcc atgaagcact gagcagaagc tggaggcaca 1080 acgcaccaga cactcacagc aaggatggag ctgaaaacat aacccactct gtcctggagg 1140 cactgggaag cctagagaag gctgtgagcc aaggagggag ggtcttcctt tggcatggga 1200 tggggatgaa gtaaggagag ggactggacc ccctggaagc tgattcacta tggggggagg 1260 tgtattgaag tcctccagac aaccctcaga tttgatgatt tcctagtaga actcacagaa 1320 ataaagagct gttatactgt g 1341 <210> 153 <211> 220 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein 3 isoform 5 <400> 153 Met Trp Val Pro Val Val Phe Leu Thr Leu Ser Val Thr Trp Ile Gly 1 5 10 15 Ala Ala Pro Leu Ile Leu Ser Arg Ile Val Gly Gly Trp Glu Cys Glu 20 25 30 Lys His Ser Gln Pro Trp Gln Val Leu Val Ala Ser Arg Gly Arg Ala 35 40 45 Val Cys Gly Gly Val Leu Val His Pro Gln Trp Val Leu Thr Ala Ala 50 55 60 His Cys Ile Arg Asn Lys Ser Val Ile Leu Leu Gly Arg His Ser Leu 65 70 75 80 Phe His Pro Glu Asp Thr Gly Gln Val Phe Gln Val Ser His Ser Phe 85 90 95 Pro His Pro Leu Tyr Asp Met Ser Leu Leu Lys Asn Arg Phe Leu Arg 100 105 110 Pro Gly Asp Asp Ser Ser Ile Glu Pro Glu Glu Phe Leu Thr Pro Lys 115 120 125 Lys Leu Gln Cys Val Asp Leu His Val Ile Ser Asn Asp Val Cys Ala 130 135 140 Gln Val His Pro Gln Lys Val Thr Lys Phe Met Leu Cys Ala Gly Arg 145 150 155 160 Trp Thr Gly Gly Lys Ser Thr Cys Ser Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu 165 170 175 Val Cys Asn Gly Val Leu Gln Gly Ile Thr Ser Trp Gly Ser Glu Pro 180 185 190 Cys Ala Leu Pro Glu Arg Pro Ser Leu Tyr Thr Lys Val Val His Tyr 195 200 205 Arg Lys Trp Ile Lys Asp Thr Ile Val Ala Asn Pro 210 215 220 <210> 154 <211> 555 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein 3 transcript variant 6 <400> 154 agccccaagc ttaccacctg cacccggaga gctgtgtcac catgtgggtc ccggttgtct 60 tcctcaccct gtccgtgacg tggattggtg ctgcacccct catcctgtct cggattgtgg 120 gaggctggga gtgcgagaag cattcccaac cctggcaggt gcttgtggcc tctcgtggca 180 gggcagtctg cggcggtgtt ctggtgcacc cccagtgggt cctcacagct gcccactgca 240 tcaggaagtg agtaggggcc tggggtctgg ggagcaggtg tctgtgtccc agaggaataa 300 cagctgggca ttttccccag gataacctct aaggccagcc ttgggactgg gggagagagg 360 gaaagttctg gttcaggtca catggggagg cagggttggg gctggaccac cctccccatg 420 gctgcctggg tctccatctg tgttcctcta tgtctctttg tgtcgctttc attatgtctc 480 ttggtaactg gcttcggttg tgtctctccg tgtgactatt ttgttctctc tctccctctc 540 ttctctgtct tcagt 555 <210> 155 <211> 69 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein 3 isoform 6 <400> 155 Met Trp Val Pro Val Val Phe Leu Thr Leu Ser Val Thr Trp Ile Gly 1 5 10 15 Ala Ala Pro Leu Ile Leu Ser Arg Ile Val Gly Gly Trp Glu Cys Glu 20 25 30 Lys His Ser Gln Pro Trp Gln Val Leu Val Ala Ser Arg Gly Arg Ala 35 40 45 Val Cys Gly Gly Val Leu Val His Pro Gln Trp Val Leu Thr Ala Ala 50 55 60 His Cys Ile Arg Lys 65 <210> 156 <211> 807 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Mesotrypsin <400> 156 acactctacc accatgaatc cattcctgat ccttgccttt gtgggagctg ctgttgctgt 60 cccctttgac gatgatgaca agattgttgg gggctacacc tgtgaggaga attctctccc 120 ctaccaggtg tccctgaatt ctggctccca cttctgcggt ggctccctca tcagcgaaca 180 gtgggtggta tcagcagctc actgctacaa gacccgcatc caggtgagac tgggagagca 240 caacatcaaa gtcctggagg ggaatgagca gttcatcaat gcggccaaga tcatccgcca 300 ccctaaatac aacagggaca ctctggacaa tgacatcatg ctgatcaaac tctcctcacc 360 tgccgtcatc aatgcccgcg tgtccaccat ctctctgccc accgcccctc cagctgctgg 420 cactgagtgc ctcatctccg gctggggcaa cactctgagc tttggtgctg actacccaga 480 cgagctgaag tgcctggatg ctccggtgct gacccaggct gagtgtaaag cctcctaccc 540 tggaaagatt accaacagca tgttctgtgt gggcttcctt gagggaggca aggattcctg 600 ccagcgtgac tctggtggcc ctgtggtctg caacggacag ctccaaggag ttgtctcctg 660 gggccatggc tgtgcctgga agaacaggcc tggagtctac accaaggtct acaactatgt 720 ggactggatt aaggacacca tcgctgccaa cagctaaagc ccccggtccc tctgcagtct 780 ctataccaat aaagtggccc tgctctc 807 <210> 157 <211> 247 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mesotrypsin <400> 157 Met Asn Pro Phe Leu Ile Leu Ala Phe Val Gly Ala Ala Val Ala Val 1 5 10 15 Pro Phe Asp Asp Asp Asp Lys Ile Val Gly Gly Tyr Thr Cys Glu Glu 20 25 30 Asn Ser Leu Pro Tyr Gln Val Ser Leu Asn Ser Gly Ser His Phe Cys 35 40 45 Gly Gly Ser Leu Ile Ser Glu Gln Trp Val Val Ser Ala Ala His Cys 50 55 60 Tyr Lys Thr Arg Ile Gln Val Arg Leu Gly Glu His Asn Ile Lys Val 65 70 75 80 Leu Glu Gly Asn Glu Gln Phe Ile Asn Ala Ala Lys Ile Ile Arg His 85 90 95 Pro Lys Tyr Asn Arg Asp Thr Leu Asp Asn Asp Ile Met Leu Ile Lys 100 105 110 Leu Ser Ser Pro Ala Val Ile Asn Ala Arg Val Ser Thr Ile Ser Leu 115 120 125 Pro Thr Ala Pro Pro Ala Ala Gly Thr Glu Cys Leu Ile Ser Gly Trp 130 135 140 Gly Asn Thr Leu Ser Phe Gly Ala Asp Tyr Pro Asp Glu Leu Lys Cys 145 150 155 160 Leu Asp Ala Pro Val Leu Thr Gln Ala Glu Cys Lys Ala Ser Tyr Pro 165 170 175 Gly Lys Ile Thr Asn Ser Met Phe Cys Val Gly Phe Leu Glu Gly Gly 180 185 190 Lys Asp Ser Cys Gln Arg Asp Ser Gly Gly Pro Val Val Cys Asn Gly 195 200 205 Gln Leu Gln Gly Val Val Ser Trp Gly His Gly Cys Ala Trp Lys Asn 210 215 220 Arg Pro Gly Val Tyr Thr Lys Val Tyr Asn Tyr Val Asp Trp Ile Lys 225 230 235 240 Asp Thr Ile Ala Ala Asn Ser 245 <210> 158 <211> 1055 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> pancreatic endopeptidase E form B (B) <400> 158 acctgcattt ccaccacctg ttctgggagt ggggcccagt cagccccctt tgcttacctt 60 ctgccctata ttagagcccc aggttctgtg cccttttcct atcatcgcaa aactcatgat 120 gctccggctg ctcagttccc tcctccttgt ggccgttgcc tcaggctatg gcccaccttc 180 ctctcgccct tccagccgcg ttgtcaatgg tgaggatgcg gtcccctaca gctggccctg 240 gcaggtttcc ctgcagtatg agaaaagcgg aagcttctac cacacctgtg gcggtagcct 300 catcgccccc gactgggttg tgactgccgg ccactgcatc tcgagctccc ggacctacca 360 ggtggtgttg ggcgagtacg accgtgctgt gaaggagggc cccgagcagg tgatccccat 420 caactctggg gacctctttg tgcatccact ctggaaccgc tcgtgtgtgg cctgtggcaa 480 tgacatcgcc ctcatcaagc tctcacgcag cgcccagctg ggagacgccg tccagctcgc 540 ctcactccct ccggctggtg acatccttcc caacgagaca ccctgctaca tcaccggctg 600 gggccgtctc tataccaacg ggccactccc agacaagctg caggaggccc tgctgccggt 660 ggtggactat gaacactgct ccaggtggaa ctggtggggt tcctccgtga agaagaccat 720 ggtgtgtgct ggaggggaca tccgctccgg ctgcaatggt gactctggag gacccctcaa 780 ctgccccaca gaggatggtg gctggcaggt ccatggcgtg accagctttg tttctgcctt 840 tggctgcaac acccgcagga agcccacggt gttcactcga gtctccgcct tcattgactg 900 gattgaggag accatagcaa gccactagaa ccaaggccca gctggcagtg ctgatcgatc 960 ccacatcctg aataaagaat aaagatctct cagaaaattc caaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1020 aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaa 1055 <210> 159 <211> 270 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> pancreatic endopeptidase E form B (B) <400> 159 Met Met Leu Arg Leu Leu Ser Ser Leu Leu Leu Val Ala Val Ala Ser 1 5 10 15 Gly Tyr Gly Pro Pro Ser Ser Arg Pro Ser Ser Arg Val Val Asn Gly 20 25 30 Glu Asp Ala Val Pro Tyr Ser Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu Gln Tyr 35 40 45 Glu Lys Ser Gly Ser Phe Tyr His Thr Cys Gly Gly Ser Leu Ile Ala 50 55 60 Pro Asp Trp Val Val Thr Ala Gly His Cys Ile Ser Ser Ser Arg Thr 65 70 75 80 Tyr Gln Val Val Leu Gly Glu Tyr Asp Arg Ala Val Lys Glu Gly Pro 85 90 95 Glu Gln Val Ile Pro Ile Asn Ser Gly Asp Leu Phe Val His Pro Leu 100 105 110 Trp Asn Arg Ser Cys Val Ala Cys Gly Asn Asp Ile Ala Leu Ile Lys 115 120 125 Leu Ser Arg Ser Ala Gln Leu Gly Asp Ala Val Gln Leu Ala Ser Leu 130 135 140 Pro Pro Ala Gly Asp Ile Leu Pro Asn Glu Thr Pro Cys Tyr Ile Thr 145 150 155 160 Gly Trp Gly Arg Leu Tyr Thr Asn Gly Pro Leu Pro Asp Lys Leu Gln 165 170 175 Glu Ala Leu Leu Pro Val Val Asp Tyr Glu His Cys Ser Arg Trp Asn 180 185 190 Trp Trp Gly Ser Ser Val Lys Lys Thr Met Val Cys Ala Gly Gly Asp 195 200 205 Ile Arg Ser Gly Cys Asn Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Asn Cys Pro 210 215 220 Thr Glu Asp Gly Gly Trp Gln Val His Gly Val Thr Ser Phe Val Ser 225 230 235 240 Ala Phe Gly Cys Asn Thr Arg Arg Lys Pro Thr Val Phe Thr Arg Val 245 250 255 Ser Ala Phe Ile Asp Trp Ile Glu Glu Thr Ile Ala Ser His 260 265 270 <210> 160 <211> 941 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> pancreatic elastase II form B (Homos sapiens) (IIB) <400> 160 cttacagaac tcccacggac acaccatgat taggaccctg ctgctgtcca ctttggtggc 60 tggagccctc agttgtgggg tctccactta cgcgcctgat atgtctagga tgcttggagg 120 tgaagaagcg aggcccaaca gctggccctg gcaggtctcc ctgcagtaca gctccaatgg 180 ccagtggtac cacacctgcg gagggtccct gatagccaac agctgggtcc tgacggctgc 240 ccactgcatc agctcctccg ggatctaccg cgtgatgctg ggccagcata acctctacgt 300 tgcagagtcc ggctcgctgg ccgtcagtgt ctctaagatt gtggtgcaca aggactggaa 360 ctccgaccag gtctccaaag ggaacgacat tgccctgctc aaactggcta accccgtctc 420 cctcaccgac aagatccagc tggcctgcct ccctcctgcc ggcaccattc tacccaacaa 480 ctacccctgc tacgtcacgg gctggggaag gctgcagacc aacggggctc tccctgatga 540 cctgaagcag ggccggttgc tggttgtgga ctatgccacc tgctccagct ctggctggtg 600 gggcagcacc gtgaagacga atatgatctg tgctgggggt gatggcgtga tatgcacctg 660 caacggagac tccggtgggc cgctgaactg tcaggcatct gacggccggt gggaggtgca 720 tggcatcggc agcctcacgt cggtccttgg ttgcaactac tactacaagc cctccatctt 780 cacgcgggtc tccaactaca acgactggat caattcggtg attgcaaata actaaccaaa 840 agaagtccct gggactgttt cagacttgga aaggtcacag aaggaaaata atattatata 900 aagtgacaac tatgcaaatc acaaaaaaaa aaaaaaaaaa a 941 <210> 161 <211> 269 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> pancreatic elastase II form B (Homos sapiens) (IIB) <400> 161 Met Ile Arg Thr Leu Leu Leu Ser Thr Leu Val Ala Gly Ala Leu Ser 1 5 10 15 Cys Gly Val Ser Thr Tyr Ala Pro Asp Met Ser Arg Met Leu Gly Gly 20 25 30 Glu Glu Ala Arg Pro Asn Ser Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu Gln Tyr 35 40 45 Ser Ser Asn Gly Gln Trp Tyr His Thr Cys Gly Gly Ser Leu Ile Ala 50 55 60 Asn Ser Trp Val Leu Thr Ala Ala His Cys Ile Ser Ser Ser Gly Ile 65 70 75 80 Tyr Arg Val Met Leu Gly Gln His Asn Leu Tyr Val Ala Glu Ser Gly 85 90 95 Ser Leu Ala Val Ser Val Ser Lys Ile Val Val His Lys Asp Trp Asn 100 105 110 Ser Asp Gln Val Ser Lys Gly Asn Asp Ile Ala Leu Leu Lys Leu Ala 115 120 125 Asn Pro Val Ser Leu Thr Asp Lys Ile Gln Leu Ala Cys Leu Pro Pro 130 135 140 Ala Gly Thr Ile Leu Pro Asn Asn Tyr Pro Cys Tyr Val Thr Gly Trp 145 150 155 160 Gly Arg Leu Gln Thr Asn Gly Ala Leu Pro Asp Asp Leu Lys Gln Gly 165 170 175 Arg Leu Leu Val Val Asp Tyr Ala Thr Cys Ser Ser Ser Gly Trp Trp 180 185 190 Gly Ser Thr Val Lys Thr Asn Met Ile Cys Ala Gly Gly Asp Gly Val 195 200 205 Ile Cys Thr Cys Asn Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Asn Cys Gln Ala 210 215 220 Ser Asp Gly Arg Trp Glu Val His Gly Ile Gly Ser Leu Thr Ser Val 225 230 235 240 Leu Gly Cys Asn Tyr Tyr Tyr Lys Pro Ser Ile Phe Thr Arg Val Ser 245 250 255 Asn Tyr Asn Asp Trp Ile Asn Ser Val Ile Ala Asn Asn 260 265 <210> 162 <211> 2048 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> coagulation factor XIIa <400> 162 ctattgatct ggactcctgg ataggcagct ggaccaacgg acggacgcca tgagggctct 60 gctgctcctg gggttcctgc tggtgagctt ggagtcaaca ctttcgattc caccttggga 120 agcccccaag gagcataagt acaaagctga agagcacaca gtcgttctca ctgtcaccgg 180 ggagccctgc cacttcccct tccagtacca ccggcagctg taccacaaat gtacccacaa 240 gggccggcca ggccctcagc cctggtgtgc taccaccccc aactttgatc aggaccagcg 300 atggggatac tgtttggagc ccaagaaagt gaaagaccac tgcagcaaac acagcccctg 360 ccagaaagga gggacctgtg tgaacatgcc aagcggcccc cactgtctct gtccacaaca 420 cctcactgga aaccactgcc agaaagagaa gtgctttgag cctcagcttc tccggttttt 480 ccacaagaat gagatatggt atagaactga gcaagcagct gtggccagat gccagtgcaa 540 gggtcctgat gcccactgcc agcggctggc cagccaggcc tgccgcacca acccgtgcct 600 ccatgggggt cgctgcctag aggtggaggg ccaccgcctg tgccactgcc cggtgggcta 660 caccggaccc ttctgcgacg tggacaccaa ggcaagctgc tatgatggcc gcgggctcag 720 ctaccgcggc ctggccagga ccacgctctc gggtgcgccc tgtcagccgt gggcctcgga 780 ggccacctac cggaacgtga ctgccgagca agcgcggaac tggggactgg gcggccacgc 840 cttctgccgg aacccggaca acgacatccg cccgtggtgc ttcgtgctga accgcgaccg 900 gctgagctgg gagtactgcg acctggcaca gtgccagacc ccaacccagg cggcgcctcc 960 gaccccggtg tcccctaggc ttcatgtccc actcatgccc gcgcagccgg caccgccgaa 1020 gcctcagccc acgacccgga ccccgcctca gtcccagacc ccgggagcct tgccggcgaa 1080 gcgggagcag ccgccttccc tgaccaggaa cggcccactg agctgcgggc agcggctccg 1140 caagagtctg tcttcgatga cccgcgtcgt tggcgggctg gtggcgctac gcggggcgca 1200 cccctacatc gccgcgctgt actggggcca cagtttctgc gccggcagcc tcatcgcccc 1260 ctgctgggtg ctgacggccg ctcactgcct gcaggaccgg cccgcacccg aggatctgac 1320 ggtggtgctc ggccaggaac gccgtaacca cagctgtgag ccgtgccaga cgttggccgt 1380 gcgctcctac cgcttgcacg aggccttctc gcccgtcagc taccagcacg acctggctct 1440 gttgcgcctt caggaggatg cggacggcag ctgcgcgctc ctgtcgcctt acgttcagcc 1500 ggtgtgcctg ccaagcggcg ccgcgcgacc ctccgagacc acgctctgcc aggtggccgg 1560 ctggggccac cagttcgagg gggcggagga atatgccagc ttcctgcagg aggcgcaggt 1620 accgttcctc tccctggagc gctgctcagc cccggacgtg cacggatcct ccatcctccc 1680 cggcatgctc tgcgcagggt tcctcgaggg cggcaccgat gcgtgccagg gtgattccgg 1740 aggcccgctg gtgtgtgagg accaagctgc agagcgccgg ctcaccctgc aaggcatcat 1800 cagctgggga tcgggctgtg gtgaccgcaa caagccaggc gtctacaccg atgtggccta 1860 ctacctggcc tggatccggg agcacaccgt ttcctgattg ctcagggact catctttccc 1920 tccttggtga ttccgcagtg agagagtggc tggggcatgg aaggcaagat tgtgtcccat 1980 tcccccagtg cggccagctc cgcgccagga tggcgaggaa ctcaataaag tgctttgaaa 2040 atgctgag 2048 <210> 163 <211> 615 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> coagulation factor XIIa <400> 163 Met Arg Ala Leu Leu Leu Leu Gly Phe Leu Leu Val Ser Leu Glu Ser 1 5 10 15 Thr Leu Ser Ile Pro Pro Trp Glu Ala Pro Lys Glu His Lys Tyr Lys 20 25 30 Ala Glu Glu His Thr Val Val Leu Thr Val Thr Gly Glu Pro Cys His 35 40 45 Phe Pro Phe Gln Tyr His Arg Gln Leu Tyr His Lys Cys Thr His Lys 50 55 60 Gly Arg Pro Gly Pro Gln Pro Trp Cys Ala Thr Thr Pro Asn Phe Asp 65 70 75 80 Gln Asp Gln Arg Trp Gly Tyr Cys Leu Glu Pro Lys Lys Val Lys Asp 85 90 95 His Cys Ser Lys His Ser Pro Cys Gln Lys Gly Gly Thr Cys Val Asn 100 105 110 Met Pro Ser Gly Pro His Cys Leu Cys Pro Gln His Leu Thr Gly Asn 115 120 125 His Cys Gln Lys Glu Lys Cys Phe Glu Pro Gln Leu Leu Arg Phe Phe 130 135 140 His Lys Asn Glu Ile Trp Tyr Arg Thr Glu Gln Ala Ala Val Ala Arg 145 150 155 160 Cys Gln Cys Lys Gly Pro Asp Ala His Cys Gln Arg Leu Ala Ser Gln 165 170 175 Ala Cys Arg Thr Asn Pro Cys Leu His Gly Gly Arg Cys Leu Glu Val 180 185 190 Glu Gly His Arg Leu Cys His Cys Pro Val Gly Tyr Thr Gly Pro Phe 195 200 205 Cys Asp Val Asp Thr Lys Ala Ser Cys Tyr Asp Gly Arg Gly Leu Ser 210 215 220 Tyr Arg Gly Leu Ala Arg Thr Thr Leu Ser Gly Ala Pro Cys Gln Pro 225 230 235 240 Trp Ala Ser Glu Ala Thr Tyr Arg Asn Val Thr Ala Glu Gln Ala Arg 245 250 255 Asn Trp Gly Leu Gly Gly His Ala Phe Cys Arg Asn Pro Asp Asn Asp 260 265 270 Ile Arg Pro Trp Cys Phe Val Leu Asn Arg Asp Arg Leu Ser Trp Glu 275 280 285 Tyr Cys Asp Leu Ala Gln Cys Gln Thr Pro Thr Gln Ala Ala Pro Pro 290 295 300 Thr Pro Val Ser Pro Arg Leu His Val Pro Leu Met Pro Ala Gln Pro 305 310 315 320 Ala Pro Pro Lys Pro Gln Pro Thr Thr Arg Thr Pro Pro Gln Ser Gln 325 330 335 Thr Pro Gly Ala Leu Pro Ala Lys Arg Glu Gln Pro Pro Ser Leu Thr 340 345 350 Arg Asn Gly Pro Leu Ser Cys Gly Gln Arg Leu Arg Lys Ser Leu Ser 355 360 365 Ser Met Thr Arg Val Val Gly Gly Leu Val Ala Leu Arg Gly Ala His 370 375 380 Pro Tyr Ile Ala Ala Leu Tyr Trp Gly His Ser Phe Cys Ala Gly Ser 385 390 395 400 Leu Ile Ala Pro Cys Trp Val Leu Thr Ala Ala His Cys Leu Gln Asp 405 410 415 Arg Pro Ala Pro Glu Asp Leu Thr Val Val Leu Gly Gln Glu Arg Arg 420 425 430 Asn His Ser Cys Glu Pro Cys Gln Thr Leu Ala Val Arg Ser Tyr Arg 435 440 445 Leu His Glu Ala Phe Ser Pro Val Ser Tyr Gln His Asp Leu Ala Leu 450 455 460 Leu Arg Leu Gln Glu Asp Ala Asp Gly Ser Cys Ala Leu Leu Ser Pro 465 470 475 480 Tyr Val Gln Pro Val Cys Leu Pro Ser Gly Ala Ala Arg Pro Ser Glu 485 490 495 Thr Thr Leu Cys Gln Val Ala Gly Trp Gly His Gln Phe Glu Gly Ala 500 505 510 Glu Glu Tyr Ala Ser Phe Leu Gln Glu Ala Gln Val Pro Phe Leu Ser 515 520 525 Leu Glu Arg Cys Ser Ala Pro Asp Val His Gly Ser Ser Ile Leu Pro 530 535 540 Gly Met Leu Cys Ala Gly Phe Leu Glu Gly Gly Thr Asp Ala Cys Gln 545 550 555 560 Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Glu Asp Gln Ala Ala Glu Arg 565 570 575 Arg Leu Thr Leu Gln Gly Ile Ile Ser Trp Gly Ser Gly Cys Gly Asp 580 585 590 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Asp Val Ala Tyr Tyr Leu Ala Trp 595 600 605 Ile Arg Glu His Thr Val Ser 610 615 <210> 164 <211> 2245 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> plasma kallikrein <400> 164 agaacagctt gaagaccgtt catttttaag tgacaagaga ctcacctcca agaagcaatt 60 gtgttttcag aatgatttta ttcaagcaag caacttattt catttccttg tttgctacag 120 tttcctgtgg atgtctgact caactctatg aaaacgcctt cttcagaggt ggggatgtag 180 cttccatgta caccccaaat gcccaatact gccagatgag gtgcacattc cacccaaggt 240 gtttgctatt cagttttctt ccagcaagtt caatcaatga catggagaaa aggtttggtt 300 gcttcttgaa agatagtgtt acaggaaccc tgccaaaagt acatcgaaca ggtgcagttt 360 ctggacattc cttgaagcaa tgtggtcatc aaataagtgc ttgccatcga gacatttata 420 aaggagttga tatgagagga gtcaatttta atgtgtctaa ggttagcagt gttgaagaat 480 gccaaaaaag gtgcaccaat aacattcgct gccagttttt ttcatatgcc acgcaaacat 540 ttcacaaggc agagtaccgg aacaattgcc tattaaagta cagtcccgga ggaacaccta 600 ccgctataaa ggtgctgagt aacgtggaat ctggattctc actgaagccc tgtgcccttt 660 cagaaattgg ttgccacatg aacatcttcc agcatcttgc gttctcagat gtggatgttg 720 ccagggttct cactccagat gcttttgtgt gtcggaccat ctgcacctat caccccaact 780 gcctcttctt tacattctat acaaatgtat ggaaaatcga gtcacaaaga aatgtttgtc 840 ttcttaaaac atctgaaagt ggcacaccaa gttcctctac tcctcaagaa aacaccatat 900 ctggatatag ccttttaacc tgcaaaagaa ctttacctga accctgccat tctaaaattt 960 acccgggagt tgactttgga ggagaagaat tgaatgtgac ttttgttaaa ggagtgaatg 1020 tttgccaaga gacttgcaca aagatgattc gctgtcagtt tttcacttat tctttactcc 1080 cagaagactg taaggaagag aagtgtaagt gtttcttaag attatctatg gatggttctc 1140 caactaggat tgcgtatggg acacaaggga gctctggtta ctctttgaga ttgtgtaaca 1200 ctggggacaa ctctgtctgc acaacaaaaa caagcacacg cattgttgga ggaacaaact 1260 cttcttgggg agagtggccc tggcaggtga gcctgcaggt gaagctgaca gctcagaggc 1320 acctgtgtgg agggtcactc ataggacacc agtgggtcct cactgctgcc cactgctttg 1380 atgggcttcc cctgcaggat gtttggcgca tctatagtgg cattttaaat ctgtcagaca 1440 ttacaaaaga tacacctttc tcacaaataa aagagattat tattcaccaa aactataaag 1500 tctcagaagg gaatcatgat atcgccttga taaaactcca ggctcctttg aattacactg 1560 aattccaaaa accaatatgc ctaccttcca aaggtgacac aagcacaatt tataccaact 1620 gttgggtaac cggatggggc ttctcgaagg agaaaggtga aatccaaaat attctacaaa 1680 aggtaaatat tcctttggta acaaatgaag aatgccagaa aagatatcaa gattataaaa 1740 taacccaacg gatggtctgt gctggctata aagaaggggg aaaagatgct tgtaagggag 1800 attcaggtgg tcccttagtt tgcaaacaca acggaatgtg gcgtttggtg ggcatcacaa 1860 gctggggtga aggctgtgcc cgcagggagc aacctggtgt ctacaccaaa gtcgctgagt 1920 acatggactg gattttagag aaaacacaga gcagtgatgg aaaagctcag atgcagtcac 1980 cagcatgaga agcagtccag agtctaggca atttttacaa cctgagttca agtcaaattc 2040 tgagcctggg gggtcctcat ctgcaaagca tggagagtgg catcttcttt gcatcctaag 2100 gacgaaagac acagtgcact cagagctgct gaggacaatg tctgctgaag cccgctttca 2160 gcacgccgta accaggggct gacaatgcga ggtcgcaact gagatctcca tgactgtgtg 2220 ttgtgaaata aaatggtgaa agatc 2245 <210> 165 <211> 638 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> plasma kallikrein <400> 165 Met Ile Leu Phe Lys Gln Ala Thr Tyr Phe Ile Ser Leu Phe Ala Thr 1 5 10 15 Val Ser Cys Gly Cys Leu Thr Gln Leu Tyr Glu Asn Ala Phe Phe Arg 20 25 30 Gly Gly Asp Val Ala Ser Met Tyr Thr Pro Asn Ala Gln Tyr Cys Gln 35 40 45 Met Arg Cys Thr Phe His Pro Arg Cys Leu Leu Phe Ser Phe Leu Pro 50 55 60 Ala Ser Ser Ile Asn Asp Met Glu Lys Arg Phe Gly Cys Phe Leu Lys 65 70 75 80 Asp Ser Val Thr Gly Thr Leu Pro Lys Val His Arg Thr Gly Ala Val 85 90 95 Ser Gly His Ser Leu Lys Gln Cys Gly His Gln Ile Ser Ala Cys His 100 105 110 Arg Asp Ile Tyr Lys Gly Val Asp Met Arg Gly Val Asn Phe Asn Val 115 120 125 Ser Lys Val Ser Ser Val Glu Glu Cys Gln Lys Arg Cys Thr Asn Asn 130 135 140 Ile Arg Cys Gln Phe Phe Ser Tyr Ala Thr Gln Thr Phe His Lys Ala 145 150 155 160 Glu Tyr Arg Asn Asn Cys Leu Leu Lys Tyr Ser Pro Gly Gly Thr Pro 165 170 175 Thr Ala Ile Lys Val Leu Ser Asn Val Glu Ser Gly Phe Ser Leu Lys 180 185 190 Pro Cys Ala Leu Ser Glu Ile Gly Cys His Met Asn Ile Phe Gln His 195 200 205 Leu Ala Phe Ser Asp Val Asp Val Ala Arg Val Leu Thr Pro Asp Ala 210 215 220 Phe Val Cys Arg Thr Ile Cys Thr Tyr His Pro Asn Cys Leu Phe Phe 225 230 235 240 Thr Phe Tyr Thr Asn Val Trp Lys Ile Glu Ser Gln Arg Asn Val Cys 245 250 255 Leu Leu Lys Thr Ser Glu Ser Gly Thr Pro Ser Ser Ser Thr Pro Gln 260 265 270 Glu Asn Thr Ile Ser Gly Tyr Ser Leu Leu Thr Cys Lys Arg Thr Leu 275 280 285 Pro Glu Pro Cys His Ser Lys Ile Tyr Pro Gly Val Asp Phe Gly Gly 290 295 300 Glu Glu Leu Asn Val Thr Phe Val Lys Gly Val Asn Val Cys Gln Glu 305 310 315 320 Thr Cys Thr Lys Met Ile Arg Cys Gln Phe Phe Thr Tyr Ser Leu Leu 325 330 335 Pro Glu Asp Cys Lys Glu Glu Lys Cys Lys Cys Phe Leu Arg Leu Ser 340 345 350 Met Asp Gly Ser Pro Thr Arg Ile Ala Tyr Gly Thr Gln Gly Ser Ser 355 360 365 Gly Tyr Ser Leu Arg Leu Cys Asn Thr Gly Asp Asn Ser Val Cys Thr 370 375 380 Thr Lys Thr Ser Thr Arg Ile Val Gly Gly Thr Asn Ser Ser Trp Gly 385 390 395 400 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu Gln Val Lys Leu Thr Ala Gln Arg 405 410 415 His Leu Cys Gly Gly Ser Leu Ile Gly His Gln Trp Val Leu Thr Ala 420 425 430 Ala His Cys Phe Asp Gly Leu Pro Leu Gln Asp Val Trp Arg Ile Tyr 435 440 445 Ser Gly Ile Leu Asn Leu Ser Asp Ile Thr Lys Asp Thr Pro Phe Ser 450 455 460 Gln Ile Lys Glu Ile Ile Ile His Gln Asn Tyr Lys Val Ser Glu Gly 465 470 475 480 Asn His Asp Ile Ala Leu Ile Lys Leu Gln Ala Pro Leu Asn Tyr Thr 485 490 495 Glu Phe Gln Lys Pro Ile Cys Leu Pro Ser Lys Gly Asp Thr Ser Thr 500 505 510 Ile Tyr Thr Asn Cys Trp Val Thr Gly Trp Gly Phe Ser Lys Glu Lys 515 520 525 Gly Glu Ile Gln Asn Ile Leu Gln Lys Val Asn Ile Pro Leu Val Thr 530 535 540 Asn Glu Glu Cys Gln Lys Arg Tyr Gln Asp Tyr Lys Ile Thr Gln Arg 545 550 555 560 Met Val Cys Ala Gly Tyr Lys Glu Gly Gly Lys Asp Ala Cys Lys Gly 565 570 575 Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Lys His Asn Gly Met Trp Arg Leu 580 585 590 Val Gly Ile Thr Ser Trp Gly Glu Gly Cys Ala Arg Arg Glu Gln Pro 595 600 605 Gly Val Tyr Thr Lys Val Ala Glu Tyr Met Asp Trp Ile Leu Glu Lys 610 615 620 Thr Gln Ser Ser Asp Gly Lys Ala Gln Met Gln Ser Pro Ala 625 630 635 <210> 166 <211> 2217 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> coagulation factor XIa transcript variant 1 <400> 166 tgctgtactg agagagaatg ttacataaca ttgagaacta gtacaagtaa atattaaagt 60 gaagtgacca tttcctacac aagctcattc agaggaggat gaagaccatt ttggaggaag 120 aaaagcaccc ttattaagaa ttgcagcaag taagccaaca aggtcttttc aggatgattt 180 tcttatatca agtggtacat ttcattttat ttacttcagt ttctggtgaa tgtgtgactc 240 agttgttgaa ggacacctgc tttgaaggag gggacattac tacggtcttc acaccaagcg 300 ccaagtactg ccaggtagtc tgcacttacc acccaagatg tttactcttc actttcacgg 360 cggaatcacc atctgaggat cccacccgat ggtttacttg tgtcctgaaa gacagtgtta 420 cagaaacact gccaagagtg aataggacag cagcgatttc tgggtattct ttcaagcaat 480 gctcacacca aataagcgct tgcaacaaag acatttatgt ggacctagac atgaagggca 540 taaactataa cagctcagtt gccaagagtg ctcaagaatg ccaagaaaga tgcacggatg 600 acgtccactg ccactttttc acgtacgcca caaggcagtt tcccagcctg gagcatcgta 660 acatttgtct actgaagcac acccaaacag ggacaccaac cagaataacg aagctcgata 720 aagtggtgtc tggattttca ctgaaatcct gtgcactttc taatctggct tgtattaggg 780 acattttccc taatacggtg tttgcagaca gcaacatcga cagtgtcatg gctcccgatg 840 cttttgtctg tggccgaatc tgcactcatc atcccggttg cttgtttttt accttctttt 900 cccaggaatg gcccaaagaa tctcaaagaa atctttgtct ccttaaaaca tctgagagtg 960 gattgcccag tacacgcatt aaaaagagca aagctctttc tggtttcagt ctacaaagct 1020 gcaggcacag catcccagtg ttctgccatt cttcatttta ccatgacact gatttcttgg 1080 gagaagaact ggatattgtt gctgcaaaaa gtcacgaggc ctgccagaaa ctgtgcacca 1140 atgccgtccg ctgccagttt tttacctata ccccagccca agcatcctgc aacgaaggga 1200 agggcaagtg ttacttaaag ctttcttcaa acggatctcc aactaaaata cttcacggga 1260 gaggaggcat ctctggatac acattaaggt tgtgtaaaat ggataatgag tgtaccacca 1320 aaatcaagcc caggatcgtt ggaggaactg cgtctgttcg tggtgagtgg ccgtggcagg 1380 tgaccctgca cacaacctca cccactcaga gacacctgtg tggaggctcc atcattggaa 1440 accagtggat attaacagcc gctcactgtt tctatggggt agagtcacct aagattttgc 1500 gtgtctacag tggcatttta aatcaatctg aaataaaaga ggacacatct ttctttgggg 1560 ttcaagaaat aataatccat gatcagtata aaatggcaga aagcgggtat gatattgcct 1620 tgttgaaact ggaaaccaca gtgaattaca cagattctca acgacccata tgcctgcctt 1680 ccaaaggaga tagaaatgta atatacactg attgctgggt gactggatgg gggtacagaa 1740 aactaagaga caaaatacaa aatactctcc agaaagccaa gataccctta gtgaccaacg 1800 aagagtgcca gaagagatac agaggacata aaataaccca taagatgatc tgtgccggct 1860 acagggaagg agggaaggac gcttgcaagg gagattcggg aggccctctg tcctgcaaac 1920 acaatgaggt ctggcatctg gtaggcatca cgagctgggg cgaaggctgt gctcaaaggg 1980 agcggccagg tgtttacacc aacgtggtcg agtacgtgga ctggattctg gagaaaactc 2040 aagcagtgtg aatgggttcc caggggccat tggagtccct gaaggaccca ggatttgctg 2100 ggagagggtg ttgagttcac tgtgccagca tgcttcctcc acagtaacac gctgaagggg 2160 cttggtgttt gtaagaaaat gctagaagaa aacaaactgt cacaagttgt tatgtcc 2217 <210> 167 <211> 625 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> coagulation factor XIa isoform 1 <400> 167 Met Ile Phe Leu Tyr Gln Val Val His Phe Ile Leu Phe Thr Ser Val 1 5 10 15 Ser Gly Glu Cys Val Thr Gln Leu Leu Lys Asp Thr Cys Phe Glu Gly 20 25 30 Gly Asp Ile Thr Thr Val Phe Thr Pro Ser Ala Lys Tyr Cys Gln Val 35 40 45 Val Cys Thr Tyr His Pro Arg Cys Leu Leu Phe Thr Phe Thr Ala Glu 50 55 60 Ser Pro Ser Glu Asp Pro Thr Arg Trp Phe Thr Cys Val Leu Lys Asp 65 70 75 80 Ser Val Thr Glu Thr Leu Pro Arg Val Asn Arg Thr Ala Ala Ile Ser 85 90 95 Gly Tyr Ser Phe Lys Gln Cys Ser His Gln Ile Ser Ala Cys Asn Lys 100 105 110 Asp Ile Tyr Val Asp Leu Asp Met Lys Gly Ile Asn Tyr Asn Ser Ser 115 120 125 Val Ala Lys Ser Ala Gln Glu Cys Gln Glu Arg Cys Thr Asp Asp Val 130 135 140 His Cys His Phe Phe Thr Tyr Ala Thr Arg Gln Phe Pro Ser Leu Glu 145 150 155 160 His Arg Asn Ile Cys Leu Leu Lys His Thr Gln Thr Gly Thr Pro Thr 165 170 175 Arg Ile Thr Lys Leu Asp Lys Val Val Ser Gly Phe Ser Leu Lys Ser 180 185 190 Cys Ala Leu Ser Asn Leu Ala Cys Ile Arg Asp Ile Phe Pro Asn Thr 195 200 205 Val Phe Ala Asp Ser Asn Ile Asp Ser Val Met Ala Pro Asp Ala Phe 210 215 220 Val Cys Gly Arg Ile Cys Thr His His Pro Gly Cys Leu Phe Phe Thr 225 230 235 240 Phe Phe Ser Gln Glu Trp Pro Lys Glu Ser Gln Arg Asn Leu Cys Leu 245 250 255 Leu Lys Thr Ser Glu Ser Gly Leu Pro Ser Thr Arg Ile Lys Lys Ser 260 265 270 Lys Ala Leu Ser Gly Phe Ser Leu Gln Ser Cys Arg His Ser Ile Pro 275 280 285 Val Phe Cys His Ser Ser Phe Tyr His Asp Thr Asp Phe Leu Gly Glu 290 295 300 Glu Leu Asp Ile Val Ala Ala Lys Ser His Glu Ala Cys Gln Lys Leu 305 310 315 320 Cys Thr Asn Ala Val Arg Cys Gln Phe Phe Thr Tyr Thr Pro Ala Gln 325 330 335 Ala Ser Cys Asn Glu Gly Lys Gly Lys Cys Tyr Leu Lys Leu Ser Ser 340 345 350 Asn Gly Ser Pro Thr Lys Ile Leu His Gly Arg Gly Gly Ile Ser Gly 355 360 365 Tyr Thr Leu Arg Leu Cys Lys Met Asp Asn Glu Cys Thr Thr Lys Ile 370 375 380 Lys Pro Arg Ile Val Gly Gly Thr Ala Ser Val Arg Gly Glu Trp Pro 385 390 395 400 Trp Gln Val Thr Leu His Thr Thr Ser Pro Thr Gln Arg His Leu Cys 405 410 415 Gly Gly Ser Ile Ile Gly Asn Gln Trp Ile Leu Thr Ala Ala His Cys 420 425 430 Phe Tyr Gly Val Glu Ser Pro Lys Ile Leu Arg Val Tyr Ser Gly Ile 435 440 445 Leu Asn Gln Ser Glu Ile Lys Glu Asp Thr Ser Phe Phe Gly Val Gln 450 455 460 Glu Ile Ile Ile His Asp Gln Tyr Lys Met Ala Glu Ser Gly Tyr Asp 465 470 475 480 Ile Ala Leu Leu Lys Leu Glu Thr Thr Val Asn Tyr Thr Asp Ser Gln 485 490 495 Arg Pro Ile Cys Leu Pro Ser Lys Gly Asp Arg Asn Val Ile Tyr Thr 500 505 510 Asp Cys Trp Val Thr Gly Trp Gly Tyr Arg Lys Leu Arg Asp Lys Ile 515 520 525 Gln Asn Thr Leu Gln Lys Ala Lys Ile Pro Leu Val Thr Asn Glu Glu 530 535 540 Cys Gln Lys Arg Tyr Arg Gly His Lys Ile Thr His Lys Met Ile Cys 545 550 555 560 Ala Gly Tyr Arg Glu Gly Gly Lys Asp Ala Cys Lys Gly Asp Ser Gly 565 570 575 Gly Pro Leu Ser Cys Lys His Asn Glu Val Trp His Leu Val Gly Ile 580 585 590 Thr Ser Trp Gly Glu Gly Cys Ala Gln Arg Glu Arg Pro Gly Val Tyr 595 600 605 Thr Asn Val Val Glu Tyr Val Asp Trp Ile Leu Glu Lys Thr Gln Ala 610 615 620 Val 625 <210> 168 <211> 2055 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> coagulation factor XIa transcript variant 2 <400> 168 tgctgtactg agagagaatg ttacataaca ttgagaacta gtacaagtaa atattaaagt 60 gaagtgacca tttcctacac aagctcattc agaggaggat gaagaccatt ttggaggaag 120 aaaagcaccc ttattaagaa ttgcagcaag taagccaaca aggtcttttc aggatgattt 180 tcttatatca agtggtacat ttcattttat ttacttcagt ttctggtgaa tgtgtgactc 240 agttgttgaa ggacacctgc tttgaaggag gggacattac tacggtcttc acaccaagcg 300 ccaagtactg ccaggtagtc tgcacttacc acccaagatg tttactcttc actttcacgg 360 cggaatcacc atctgaggat cccacccgat ggtttacttg tgtcctgaaa gacagtgtta 420 cagaaacact gccaagagtg aataggacag cagcgatttc tgggtattct ttcaagcaat 480 gctcacacca aataagtaac atttgtctac tgaagcacac ccaaacaggg acaccaacca 540 gaataacgaa gctcgataaa gtggtgtctg gattttcact gaaatcctgt gcactttcta 600 atctggcttg tattagggac attttcccta atacggtgtt tgcagacagc aacatcgaca 660 gtgtcatggc tcccgatgct tttgtctgtg gccgaatctg cactcatcat cccggttgct 720 tgttttttac cttcttttcc caggaatggc ccaaagaatc tcaaagaaat ctttgtctcc 780 ttaaaacatc tgagagtgga ttgcccagta cacgcattaa aaagagcaaa gctctttctg 840 gtttcagtct acaaagctgc aggcacagca tcccagtgtt ctgccattct tcattttacc 900 atgacactga tttcttggga gaagaactgg atattgttgc tgcaaaaagt cacgaggcct 960 gccagaaact gtgcaccaat gccgtccgct gccagttttt tacctatacc ccagcccaag 1020 catcctgcaa cgaagggaag ggcaagtgtt acttaaagct ttcttcaaac ggatctccaa 1080 ctaaaatact tcacgggaga ggaggcatct ctggatacac attaaggttg tgtaaaatgg 1140 ataatgagtg taccaccaaa atcaagccca ggatcgttgg aggaactgcg tctgttcgtg 1200 gtgagtggcc gtggcaggtg accctgcaca caacctcacc cactcagaga cacctgtgtg 1260 gaggctccat cattggaaac cagtggatat taacagccgc tcactgtttc tatggggtag 1320 agtcacctaa gattttgcgt gtctacagtg gcattttaaa tcaatctgaa ataaaagagg 1380 acacatcttt ctttggggtt caagaaataa taatccatga tcagtataaa atggcagaaa 1440 gcgggtatga tattgccttg ttgaaactgg aaaccacagt gaattacaca gattctcaac 1500 gacccatatg cctgccttcc aaaggagata gaaatgtaat atacactgat tgctgggtga 1560 ctggatgggg gtacagaaaa ctaagagaca aaatacaaaa tactctccag aaagccaaga 1620 tacccttagt gaccaacgaa gagtgccaga agagatacag aggacataaa ataacccata 1680 agatgatctg tgccggctac agggaaggag ggaaggacgc ttgcaaggga gattcgggag 1740 gccctctgtc ctgcaaacac aatgaggtct ggcatctggt aggcatcacg agctggggcg 1800 aaggctgtgc tcaaagggag cggccaggtg tttacaccaa cgtggtcgag tacgtggact 1860 ggattctgga gaaaactcaa gcagtgtgaa tgggttccca ggggccattg gagtccctga 1920 aggacccagg atttgctggg agagggtgtt gagttcactg tgccagcatg cttcctccac 1980 agtaacacgc tgaaggggct tggtgtttgt aagaaaatgc tagaagaaaa caaactgtca 2040 caagttgtta tgtcc 2055 <210> 169 <211> 571 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> coagulation factor XIa isoform 2 <400> 169 Met Ile Phe Leu Tyr Gln Val Val His Phe Ile Leu Phe Thr Ser Val 1 5 10 15 Ser Gly Glu Cys Val Thr Gln Leu Leu Lys Asp Thr Cys Phe Glu Gly 20 25 30 Gly Asp Ile Thr Thr Val Phe Thr Pro Ser Ala Lys Tyr Cys Gln Val 35 40 45 Val Cys Thr Tyr His Pro Arg Cys Leu Leu Phe Thr Phe Thr Ala Glu 50 55 60 Ser Pro Ser Glu Asp Pro Thr Arg Trp Phe Thr Cys Val Leu Lys Asp 65 70 75 80 Ser Val Thr Glu Thr Leu Pro Arg Val Asn Arg Thr Ala Ala Ile Ser 85 90 95 Gly Tyr Ser Phe Lys Gln Cys Ser His Gln Ile Ser Asn Ile Cys Leu 100 105 110 Leu Lys His Thr Gln Thr Gly Thr Pro Thr Arg Ile Thr Lys Leu Asp 115 120 125 Lys Val Val Ser Gly Phe Ser Leu Lys Ser Cys Ala Leu Ser Asn Leu 130 135 140 Ala Cys Ile Arg Asp Ile Phe Pro Asn Thr Val Phe Ala Asp Ser Asn 145 150 155 160 Ile Asp Ser Val Met Ala Pro Asp Ala Phe Val Cys Gly Arg Ile Cys 165 170 175 Thr His His Pro Gly Cys Leu Phe Phe Thr Phe Phe Ser Gln Glu Trp 180 185 190 Pro Lys Glu Ser Gln Arg Asn Leu Cys Leu Leu Lys Thr Ser Glu Ser 195 200 205 Gly Leu Pro Ser Thr Arg Ile Lys Lys Ser Lys Ala Leu Ser Gly Phe 210 215 220 Ser Leu Gln Ser Cys Arg His Ser Ile Pro Val Phe Cys His Ser Ser 225 230 235 240 Phe Tyr His Asp Thr Asp Phe Leu Gly Glu Glu Leu Asp Ile Val Ala 245 250 255 Ala Lys Ser His Glu Ala Cys Gln Lys Leu Cys Thr Asn Ala Val Arg 260 265 270 Cys Gln Phe Phe Thr Tyr Thr Pro Ala Gln Ala Ser Cys Asn Glu Gly 275 280 285 Lys Gly Lys Cys Tyr Leu Lys Leu Ser Ser Asn Gly Ser Pro Thr Lys 290 295 300 Ile Leu His Gly Arg Gly Gly Ile Ser Gly Tyr Thr Leu Arg Leu Cys 305 310 315 320 Lys Met Asp Asn Glu Cys Thr Thr Lys Ile Lys Pro Arg Ile Val Gly 325 330 335 Gly Thr Ala Ser Val Arg Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val Thr Leu His 340 345 350 Thr Thr Ser Pro Thr Gln Arg His Leu Cys Gly Gly Ser Ile Ile Gly 355 360 365 Asn Gln Trp Ile Leu Thr Ala Ala His Cys Phe Tyr Gly Val Glu Ser 370 375 380 Pro Lys Ile Leu Arg Val Tyr Ser Gly Ile Leu Asn Gln Ser Glu Ile 385 390 395 400 Lys Glu Asp Thr Ser Phe Phe Gly Val Gln Glu Ile Ile Ile His Asp 405 410 415 Gln Tyr Lys Met Ala Glu Ser Gly Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Lys Leu 420 425 430 Glu Thr Thr Val Asn Tyr Thr Asp Ser Gln Arg Pro Ile Cys Leu Pro 435 440 445 Ser Lys Gly Asp Arg Asn Val Ile Tyr Thr Asp Cys Trp Val Thr Gly 450 455 460 Trp Gly Tyr Arg Lys Leu Arg Asp Lys Ile Gln Asn Thr Leu Gln Lys 465 470 475 480 Ala Lys Ile Pro Leu Val Thr Asn Glu Glu Cys Gln Lys Arg Tyr Arg 485 490 495 Gly His Lys Ile Thr His Lys Met Ile Cys Ala Gly Tyr Arg Glu Gly 500 505 510 Gly Lys Asp Ala Cys Lys Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Cys Lys 515 520 525 His Asn Glu Val Trp His Leu Val Gly Ile Thr Ser Trp Gly Glu Gly 530 535 540 Cys Ala Gln Arg Glu Arg Pro Gly Val Tyr Thr Asn Val Val Glu Tyr 545 550 555 560 Val Asp Trp Ile Leu Glu Lys Thr Gln Ala Val 565 570 <210> 170 <211> 2804 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> coagulation factor IXa <400> 170 accactttca caatctgcta gcaaaggtta tgcagcgcgt gaacatgatc atggcagaat 60 caccaggcct catcaccatc tgccttttag gatatctact cagtgctgaa tgtacagttt 120 ttcttgatca tgaaaacgcc aacaaaattc tgaatcggcc aaagaggtat aattcaggta 180 aattggaaga gtttgttcaa gggaaccttg agagagaatg tatggaagaa aagtgtagtt 240 ttgaagaagc acgagaagtt tttgaaaaca ctgaaagaac aactgaattt tggaagcagt 300 atgttgatgg agatcagtgt gagtccaatc catgtttaaa tggcggcagt tgcaaggatg 360 acattaattc ctatgaatgt tggtgtccct ttggatttga aggaaagaac tgtgaattag 420 atgtaacatg taacattaag aatggcagat gcgagcagtt ttgtaaaaat agtgctgata 480 acaaggtggt ttgctcctgt actgagggat atcgacttgc agaaaaccag aagtcctgtg 540 aaccagcagt gccatttcca tgtggaagag tttctgtttc acaaacttct aagctcaccc 600 gtgctgagac tgtttttcct gatgtggact atgtaaattc tactgaagct gaaaccattt 660 tggataacat cactcaaagc acccaatcat ttaatgactt cactcgggtt gttggtggag 720 aagatgccaa accaggtcaa ttcccttggc aggttgtttt gaatggtaaa gttgatgcat 780 tctgtggagg ctctatcgtt aatgaaaaat ggattgtaac tgctgcccac tgtgttgaaa 840 ctggtgttaa aattacagtt gtcgcaggtg aacataatat tgaggagaca gaacatacag 900 agcaaaagcg aaatgtgatt cgaattattc ctcaccacaa ctacaatgca gctattaata 960 agtacaacca tgacattgcc cttctggaac tggacgaacc cttagtgcta aacagctacg 1020 ttacacctat ttgcattgct gacaaggaat acacgaacat cttcctcaaa tttggatctg 1080 gctatgtaag tggctgggga agagtcttcc acaaagggag atcagcttta gttcttcagt 1140 accttagagt tccacttgtt gaccgagcca catgtcttcg atctacaaag ttcaccatct 1200 ataacaacat gttctgtgct ggcttccatg aaggaggtag agattcatgt caaggagata 1260 gtgggggacc ccatgttact gaagtggaag ggaccagttt cttaactgga attattagct 1320 ggggtgaaga gtgtgcaatg aaaggcaaat atggaatata taccaaggta tcccggtatg 1380 tcaactggat taaggaaaaa acaaagctca cttaatgaaa gatggatttc caaggttaat 1440 tcattggaat tgaaaattaa cagggcctct cactaactaa tcactttccc atcttttgtt 1500 agatttgaat atatacattc tatgatcatt gctttttctc tttacagggg agaatttcat 1560 attttacctg agcaaattga ttagaaaatg gaaccactag aggaatataa tgtgttagga 1620 aattacagtc atttctaagg gcccagccct tgacaaaatt gtgaagttaa attctccact 1680 ctgtccatca gatactatgg ttctccacta tggcaactaa ctcactcaat tttccctcct 1740 tagcagcatt ccatcttccc gatcttcttt gcttctccaa ccaaaacatc aatgtttatt 1800 agttctgtat acagtacagg atctttggtc tactctatca caaggccagt accacactca 1860 tgaagaaaga acacaggagt agctgagagg ctaaaactca tcaaaaacac tactcctttt 1920 cctctaccct attcctcaat cttttacctt ttccaaatcc caatccccaa atcagttttt 1980 ctctttctta ctccctctct cccttttacc ctccatggtc gttaaaggag agatggggag 2040 catcattctg ttatacttct gtacacagtt atacatgtct atcaaaccca gacttgcttc 2100 catagtggag acttgctttt cagaacatag ggatgaagta aggtgcctga aaagtttggg 2160 ggaaaagttt ctttcagaga gttaagttat tttatatata taatatatat ataaaatata 2220 taatatacaa tataaatata tagtgtgtgt gtgtatgcgt gtgtgtagac acacacgcat 2280 acacacatat aatggaagca ataagccatt ctaagagctt gtatggttat ggaggtctga 2340 ctaggcatga tttcacgaag gcaagattgg catatcattg taactaaaaa agctgacatt 2400 gacccagaca tattgtactc tttctaaaaa taataataat aatgctaaca gaaagaagag 2460 aaccgttcgt ttgcaatcta cagctagtag agactttgag gaagaattca acagtgtgtc 2520 ttcagcagtg ttcagagcca agcaagaagt tgaagttgcc tagaccagag gacataagta 2580 tcatgtctcc tttaactagc ataccccgaa gtggagaagg gtgcagcagg ctcaaaggca 2640 taagtcattc caatcagcca actaagttgt ccttttctgg tttcgtgttc accatggaac 2700 attttgatta tagttaatcc ttctatcttg aatcttctag agagttgctg accaactgac 2760 gtatgtttcc ctttgtgaat taataaactg gtgttctggt tcat 2804 <210> 171 <211> 461 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> coagulation factor IXa <400> 171 Met Gln Arg Val Asn Met Ile Met Ala Glu Ser Pro Gly Leu Ile Thr 1 5 10 15 Ile Cys Leu Leu Gly Tyr Leu Leu Ser Ala Glu Cys Thr Val Phe Leu 20 25 30 Asp His Glu Asn Ala Asn Lys Ile Leu Asn Arg Pro Lys Arg Tyr Asn 35 40 45 Ser Gly Lys Leu Glu Glu Phe Val Gln Gly Asn Leu Glu Arg Glu Cys 50 55 60 Met Glu Glu Lys Cys Ser Phe Glu Glu Ala Arg Glu Val Phe Glu Asn 65 70 75 80 Thr Glu Arg Thr Thr Glu Phe Trp Lys Gln Tyr Val Asp Gly Asp Gln 85 90 95 Cys Glu Ser Asn Pro Cys Leu Asn Gly Gly Ser Cys Lys Asp Asp Ile 100 105 110 Asn Ser Tyr Glu Cys Trp Cys Pro Phe Gly Phe Glu Gly Lys Asn Cys 115 120 125 Glu Leu Asp Val Thr Cys Asn Ile Lys Asn Gly Arg Cys Glu Gln Phe 130 135 140 Cys Lys Asn Ser Ala Asp Asn Lys Val Val Cys Ser Cys Thr Glu Gly 145 150 155 160 Tyr Arg Leu Ala Glu Asn Gln Lys Ser Cys Glu Pro Ala Val Pro Phe 165 170 175 Pro Cys Gly Arg Val Ser Val Ser Gln Thr Ser Lys Leu Thr Arg Ala 180 185 190 Glu Thr Val Phe Pro Asp Val Asp Tyr Val Asn Ser Thr Glu Ala Glu 195 200 205 Thr Ile Leu Asp Asn Ile Thr Gln Ser Thr Gln Ser Phe Asn Asp Phe 210 215 220 Thr Arg Val Val Gly Gly Glu Asp Ala Lys Pro Gly Gln Phe Pro Trp 225 230 235 240 Gln Val Val Leu Asn Gly Lys Val Asp Ala Phe Cys Gly Gly Ser Ile 245 250 255 Val Asn Glu Lys Trp Ile Val Thr Ala Ala His Cys Val Glu Thr Gly 260 265 270 Val Lys Ile Thr Val Val Ala Gly Glu His Asn Ile Glu Glu Thr Glu 275 280 285 His Thr Glu Gln Lys Arg Asn Val Ile Arg Ile Ile Pro His His Asn 290 295 300 Tyr Asn Ala Ala Ile Asn Lys Tyr Asn His Asp Ile Ala Leu Leu Glu 305 310 315 320 Leu Asp Glu Pro Leu Val Leu Asn Ser Tyr Val Thr Pro Ile Cys Ile 325 330 335 Ala Asp Lys Glu Tyr Thr Asn Ile Phe Leu Lys Phe Gly Ser Gly Tyr 340 345 350 Val Ser Gly Trp Gly Arg Val Phe His Lys Gly Arg Ser Ala Leu Val 355 360 365 Leu Gln Tyr Leu Arg Val Pro Leu Val Asp Arg Ala Thr Cys Leu Arg 370 375 380 Ser Thr Lys Phe Thr Ile Tyr Asn Asn Met Phe Cys Ala Gly Phe His 385 390 395 400 Glu Gly Gly Arg Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro His Val 405 410 415 Thr Glu Val Glu Gly Thr Ser Phe Leu Thr Gly Ile Ile Ser Trp Gly 420 425 430 Glu Glu Cys Ala Met Lys Gly Lys Tyr Gly Ile Tyr Thr Lys Val Ser 435 440 445 Arg Tyr Val Asn Trp Ile Lys Glu Lys Thr Lys Leu Thr 450 455 460 <210> 172 <211> 2478 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> coagulation factor VIIa transcript variant 1 <400> 172 agtcccatgg ggaatgtcaa caggcagggg cagcactgca gagatttcat catggtctcc 60 caggccctca ggctcctctg ccttctgctt gggcttcagg gctgcctggc tgcaggcggg 120 gtcgctaagg cctcaggagg agaaacacgg gacatgccgt ggaagccggg gcctcacaga 180 gtcttcgtaa cccaggagga agcccacggc gtcctgcacc ggcgccggcg cgccaacgcg 240 ttcctggagg agctgcggcc gggctccctg gagagggagt gcaaggagga gcagtgctcc 300 ttcgaggagg cccgggagat cttcaaggac gcggagagga cgaagctgtt ctggatttct 360 tacagtgatg gggaccagtg tgcctcaagt ccatgccaga atgggggctc ctgcaaggac 420 cagctccagt cctatatctg cttctgcctc cctgccttcg agggccggaa ctgtgagacg 480 cacaaggatg accagctgat ctgtgtgaac gagaacggcg gctgtgagca gtactgcagt 540 gaccacacgg gcaccaagcg ctcctgtcgg tgccacgagg ggtactctct gctggcagac 600 ggggtgtcct gcacacccac agttgaatat ccatgtggaa aaatacctat tctagaaaaa 660 agaaatgcca gcaaacccca aggccgaatt gtggggggca aggtgtgccc caaaggggag 720 tgtccatggc aggtcctgtt gttggtgaat ggagctcagt tgtgtggggg gaccctgatc 780 aacaccatct gggtggtctc cgcggcccac tgtttcgaca aaatcaagaa ctggaggaac 840 ctgatcgcgg tgctgggcga gcacgacctc agcgagcacg acggggatga gcagagccgg 900 cgggtggcgc aggtcatcat ccccagcacg tacgtcccgg gcaccaccaa ccacgacatc 960 gcgctgctcc gcctgcacca gcccgtggtc ctcactgacc atgtggtgcc cctctgcctg 1020 cccgaacgga cgttctctga gaggacgctg gccttcgtgc gcttctcatt ggtcagcggc 1080 tggggccagc tgctggaccg tggcgccacg gccctggagc tcatggtgct caacgtgccc 1140 cggctgatga cccaggactg cctgcagcag tcacggaagg tgggagactc cccaaatatc 1200 acggagtaca tgttctgtgc cggctactcg gatggcagca aggactcctg caagggggac 1260 agtggaggcc cacatgccac ccactaccgg ggcacgtggt acctgacggg catcgtcagc 1320 tggggccagg gctgcgcaac cgtgggccac tttggggtgt acaccagggt ctcccagtac 1380 atcgagtggc tgcaaaagct catgcgctca gagccacgcc caggagtcct cctgcgagcc 1440 ccatttccct agcccagcag ccctggcctg tggagagaaa gccaaggctg cgtcgaactg 1500 tcctggcacc aaatcccata tattcttctg cagttaatgg ggtagaggag ggcatgggag 1560 ggagggagag gtggggaggg agacagagac agaaacagag agagacagag acagagagag 1620 actgagggag agactctgag gacatggaga gagactcaaa gagactccaa gattcaaaga 1680 gactaataga gacacagaga tggaatagaa aagatgagag gcagaggcag acaggcgctg 1740 gacagagggg caggggagtg ccaaggttgt cctggaggca gacagcccag ctgagcctcc 1800 ttacctccct tcagccaagc cccacctgca cgtgatctgc tggccctcag gctgctgctc 1860 tgccttcatt gctggagaca gtagaggcat gaacacacat ggatgcacac acacacacgc 1920 caatgcacac acacagagat atgcacacac acggatgcac acacagatgg tcacacagag 1980 atacgcaaac acaccgatgc acacgcacat agagatatgc acacacagat gcacacacag 2040 atatacacat ggatgcacgc acatgccaat gcacgcacac atcagtgcac acggatgcac 2100 agagatatgc acacaccgat gtgcgcacac acagatatgc acacacatgg atgagcacac 2160 acacaccaag tgcgcacaca caccgatgta cacacacaga tgcacacaca gatgcacaca 2220 caccgatgct gactccatgt gtgctgtcct ctgaaggcgg ttgtttagct ctcacttttc 2280 tggttcttat ccattatcat cttcacttca gacaattcag aagcatcacc atgcatggtg 2340 gcgaatgccc ccaaactctc ccccaaatgt atttctccct tcgctgggtg ccgggctgca 2400 cagactattc cccacctgct tcccagcttc acaataaacg gctgcgtctc ctccgcacac 2460 ctgtggtgcc tgccaccc 2478 <210> 173 <211> 466 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> coagulation factor VIIa isoform 1 <400> 173 Met Val Ser Gln Ala Leu Arg Leu Leu Cys Leu Leu Leu Gly Leu Gln 1 5 10 15 Gly Cys Leu Ala Ala Gly Gly Val Ala Lys Ala Ser Gly Gly Glu Thr 20 25 30 Arg Asp Met Pro Trp Lys Pro Gly Pro His Arg Val Phe Val Thr Gln 35 40 45 Glu Glu Ala His Gly Val Leu His Arg Arg Arg Arg Ala Asn Ala Phe 50 55 60 Leu Glu Glu Leu Arg Pro Gly Ser Leu Glu Arg Glu Cys Lys Glu Glu 65 70 75 80 Gln Cys Ser Phe Glu Glu Ala Arg Glu Ile Phe Lys Asp Ala Glu Arg 85 90 95 Thr Lys Leu Phe Trp Ile Ser Tyr Ser Asp Gly Asp Gln Cys Ala Ser 100 105 110 Ser Pro Cys Gln Asn Gly Gly Ser Cys Lys Asp Gln Leu Gln Ser Tyr 115 120 125 Ile Cys Phe Cys Leu Pro Ala Phe Glu Gly Arg Asn Cys Glu Thr His 130 135 140 Lys Asp Asp Gln Leu Ile Cys Val Asn Glu Asn Gly Gly Cys Glu Gln 145 150 155 160 Tyr Cys Ser Asp His Thr Gly Thr Lys Arg Ser Cys Arg Cys His Glu 165 170 175 Gly Tyr Ser Leu Leu Ala Asp Gly Val Ser Cys Thr Pro Thr Val Glu 180 185 190 Tyr Pro Cys Gly Lys Ile Pro Ile Leu Glu Lys Arg Asn Ala Ser Lys 195 200 205 Pro Gln Gly Arg Ile Val Gly Gly Lys Val Cys Pro Lys Gly Glu Cys 210 215 220 Pro Trp Gln Val Leu Leu Leu Val Asn Gly Ala Gln Leu Cys Gly Gly 225 230 235 240 Thr Leu Ile Asn Thr Ile Trp Val Val Ser Ala Ala His Cys Phe Asp 245 250 255 Lys Ile Lys Asn Trp Arg Asn Leu Ile Ala Val Leu Gly Glu His Asp 260 265 270 Leu Ser Glu His Asp Gly Asp Glu Gln Ser Arg Arg Val Ala Gln Val 275 280 285 Ile Ile Pro Ser Thr Tyr Val Pro Gly Thr Thr Asn His Asp Ile Ala 290 295 300 Leu Leu Arg Leu His Gln Pro Val Val Leu Thr Asp His Val Val Pro 305 310 315 320 Leu Cys Leu Pro Glu Arg Thr Phe Ser Glu Arg Thr Leu Ala Phe Val 325 330 335 Arg Phe Ser Leu Val Ser Gly Trp Gly Gln Leu Leu Asp Arg Gly Ala 340 345 350 Thr Ala Leu Glu Leu Met Val Leu Asn Val Pro Arg Leu Met Thr Gln 355 360 365 Asp Cys Leu Gln Gln Ser Arg Lys Val Gly Asp Ser Pro Asn Ile Thr 370 375 380 Glu Tyr Met Phe Cys Ala Gly Tyr Ser Asp Gly Ser Lys Asp Ser Cys 385 390 395 400 Lys Gly Asp Ser Gly Gly Pro His Ala Thr His Tyr Arg Gly Thr Trp 405 410 415 Tyr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Gln Gly Cys Ala Thr Val Gly 420 425 430 His Phe Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser Gln Tyr Ile Glu Trp Leu Gln 435 440 445 Lys Leu Met Arg Ser Glu Pro Arg Pro Gly Val Leu Leu Arg Ala Pro 450 455 460 Phe Pro 465 <210> 174 <211> 2412 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> coagulation factor VIIa transcript variant 2 <400> 174 agtcccatgg ggaatgtcaa caggcagggg cagcactgca gagatttcat catggtctcc 60 caggccctca ggctcctctg ccttctgctt gggcttcagg gctgcctggc tgcagtcttc 120 gtaacccagg aggaagccca cggcgtcctg caccggcgcc ggcgcgccaa cgcgttcctg 180 gaggagctgc ggccgggctc cctggagagg gagtgcaagg aggagcagtg ctccttcgag 240 gaggcccggg agatcttcaa ggacgcggag aggacgaagc tgttctggat ttcttacagt 300 gatggggacc agtgtgcctc aagtccatgc cagaatgggg gctcctgcaa ggaccagctc 360 cagtcctata tctgcttctg cctccctgcc ttcgagggcc ggaactgtga gacgcacaag 420 gatgaccagc tgatctgtgt gaacgagaac ggcggctgtg agcagtactg cagtgaccac 480 acgggcacca agcgctcctg tcggtgccac gaggggtact ctctgctggc agacggggtg 540 tcctgcacac ccacagttga atatccatgt ggaaaaatac ctattctaga aaaaagaaat 600 gccagcaaac cccaaggccg aattgtgggg ggcaaggtgt gccccaaagg ggagtgtcca 660 tggcaggtcc tgttgttggt gaatggagct cagttgtgtg gggggaccct gatcaacacc 720 atctgggtgg tctccgcggc ccactgtttc gacaaaatca agaactggag gaacctgatc 780 gcggtgctgg gcgagcacga cctcagcgag cacgacgggg atgagcagag ccggcgggtg 840 gcgcaggtca tcatccccag cacgtacgtc ccgggcacca ccaaccacga catcgcgctg 900 ctccgcctgc accagcccgt ggtcctcact gaccatgtgg tgcccctctg cctgcccgaa 960 cggacgttct ctgagaggac gctggccttc gtgcgcttct cattggtcag cggctggggc 1020 cagctgctgg accgtggcgc cacggccctg gagctcatgg tgctcaacgt gccccggctg 1080 atgacccagg actgcctgca gcagtcacgg aaggtgggag actccccaaa tatcacggag 1140 tacatgttct gtgccggcta ctcggatggc agcaaggact cctgcaaggg ggacagtgga 1200 ggcccacatg ccacccacta ccggggcacg tggtacctga cgggcatcgt cagctggggc 1260 cagggctgcg caaccgtggg ccactttggg gtgtacacca gggtctccca gtacatcgag 1320 tggctgcaaa agctcatgcg ctcagagcca cgcccaggag tcctcctgcg agccccattt 1380 ccctagccca gcagccctgg cctgtggaga gaaagccaag gctgcgtcga actgtcctgg 1440 caccaaatcc catatattct tctgcagtta atggggtaga ggagggcatg ggagggaggg 1500 agaggtgggg agggagacag agacagaaac agagagagac agagacagag agagactgag 1560 ggagagactc tgaggacatg gagagagact caaagagact ccaagattca aagagactaa 1620 tagagacaca gagatggaat agaaaagatg agaggcagag gcagacaggc gctggacaga 1680 ggggcagggg agtgccaagg ttgtcctgga ggcagacagc ccagctgagc ctccttacct 1740 cccttcagcc aagccccacc tgcacgtgat ctgctggccc tcaggctgct gctctgcctt 1800 cattgctgga gacagtagag gcatgaacac acatggatgc acacacacac acgccaatgc 1860 acacacacag agatatgcac acacacggat gcacacacag atggtcacac agagatacgc 1920 aaacacaccg atgcacacgc acatagagat atgcacacac agatgcacac acagatatac 1980 acatggatgc acgcacatgc caatgcacgc acacatcagt gcacacggat gcacagagat 2040 atgcacacac cgatgtgcgc acacacagat atgcacacac atggatgagc acacacacac 2100 caagtgcgca cacacaccga tgtacacaca cagatgcaca cacagatgca cacacaccga 2160 tgctgactcc atgtgtgctg tcctctgaag gcggttgttt agctctcact tttctggttc 2220 ttatccatta tcatcttcac ttcagacaat tcagaagcat caccatgcat ggtggcgaat 2280 gcccccaaac tctcccccaa atgtatttct cccttcgctg ggtgccgggc tgcacagact 2340 attccccacc tgcttcccag cttcacaata aacggctgcg tctcctccgc acacctgtgg 2400 tgcctgccac cc 2412 <210> 175 <211> 444 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> coagulation factor VIIa isoform 2 <400> 175 Met Val Ser Gln Ala Leu Arg Leu Leu Cys Leu Leu Leu Gly Leu Gln 1 5 10 15 Gly Cys Leu Ala Ala Val Phe Val Thr Gln Glu Glu Ala His Gly Val 20 25 30 Leu His Arg Arg Arg Arg Ala Asn Ala Phe Leu Glu Glu Leu Arg Pro 35 40 45 Gly Ser Leu Glu Arg Glu Cys Lys Glu Glu Gln Cys Ser Phe Glu Glu 50 55 60 Ala Arg Glu Ile Phe Lys Asp Ala Glu Arg Thr Lys Leu Phe Trp Ile 65 70 75 80 Ser Tyr Ser Asp Gly Asp Gln Cys Ala Ser Ser Pro Cys Gln Asn Gly 85 90 95 Gly Ser Cys Lys Asp Gln Leu Gln Ser Tyr Ile Cys Phe Cys Leu Pro 100 105 110 Ala Phe Glu Gly Arg Asn Cys Glu Thr His Lys Asp Asp Gln Leu Ile 115 120 125 Cys Val Asn Glu Asn Gly Gly Cys Glu Gln Tyr Cys Ser Asp His Thr 130 135 140 Gly Thr Lys Arg Ser Cys Arg Cys His Glu Gly Tyr Ser Leu Leu Ala 145 150 155 160 Asp Gly Val Ser Cys Thr Pro Thr Val Glu Tyr Pro Cys Gly Lys Ile 165 170 175 Pro Ile Leu Glu Lys Arg Asn Ala Ser Lys Pro Gln Gly Arg Ile Val 180 185 190 Gly Gly Lys Val Cys Pro Lys Gly Glu Cys Pro Trp Gln Val Leu Leu 195 200 205 Leu Val Asn Gly Ala Gln Leu Cys Gly Gly Thr Leu Ile Asn Thr Ile 210 215 220 Trp Val Val Ser Ala Ala His Cys Phe Asp Lys Ile Lys Asn Trp Arg 225 230 235 240 Asn Leu Ile Ala Val Leu Gly Glu His Asp Leu Ser Glu His Asp Gly 245 250 255 Asp Glu Gln Ser Arg Arg Val Ala Gln Val Ile Ile Pro Ser Thr Tyr 260 265 270 Val Pro Gly Thr Thr Asn His Asp Ile Ala Leu Leu Arg Leu His Gln 275 280 285 Pro Val Val Leu Thr Asp His Val Val Pro Leu Cys Leu Pro Glu Arg 290 295 300 Thr Phe Ser Glu Arg Thr Leu Ala Phe Val Arg Phe Ser Leu Val Ser 305 310 315 320 Gly Trp Gly Gln Leu Leu Asp Arg Gly Ala Thr Ala Leu Glu Leu Met 325 330 335 Val Leu Asn Val Pro Arg Leu Met Thr Gln Asp Cys Leu Gln Gln Ser 340 345 350 Arg Lys Val Gly Asp Ser Pro Asn Ile Thr Glu Tyr Met Phe Cys Ala 355 360 365 Gly Tyr Ser Asp Gly Ser Lys Asp Ser Cys Lys Gly Asp Ser Gly Gly 370 375 380 Pro His Ala Thr His Tyr Arg Gly Thr Trp Tyr Leu Thr Gly Ile Val 385 390 395 400 Ser Trp Gly Gln Gly Cys Ala Thr Val Gly His Phe Gly Val Tyr Thr 405 410 415 Arg Val Ser Gln Tyr Ile Glu Trp Leu Gln Lys Leu Met Arg Ser Glu 420 425 430 Pro Arg Pro Gly Val Leu Leu Arg Ala Pro Phe Pro 435 440 <210> 176 <211> 1502 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> coagulation factor Xa <400> 176 cagggacaca gtactcggcc acaccatggg gcgcccactg cacctcgtcc tgctcagtgc 60 ctccctggct ggcctcctgc tgctcgggga aagtctgttc atccgcaggg agcaggccaa 120 caacatcctg gcgagggtca cgagggccaa ttcctttctt gaagagatga agaaaggaca 180 cctcgaaaga gagtgcatgg aagagacctg ctcatacgaa gaggcccgcg aggtctttga 240 ggacagcgac aagacgaatg aattctggaa taaatacaaa gatggcgacc agtgtgagac 300 cagtccttgc cagaaccagg gcaaatgtaa agacggcctc ggggaataca cctgcacctg 360 tttagaagga ttcgaaggca aaaactgtga attattcaca cggaagctct gcagcctgga 420 caacggggac tgtgaccagt tctgccacga ggaacagaac tctgtggtgt gctcctgcgc 480 ccgcgggtac accctggctg acaacggcaa ggcctgcatt cccacagggc cctacccctg 540 tgggaaacag accctggaac gcaggaagag gtcagtggcc caggccacca gcagcagcgg 600 ggaggcccct gacagcatca catggaagcc atatgatgca gccgacctgg accccaccga 660 gaaccccttc gacctgcttg acttcaacca gacgcagcct gagaggggcg acaacaacct 720 caccaggatc gtgggaggcc aggaatgcaa ggacggggag tgtccctggc aggccctgct 780 catcaatgag gaaaacgagg gtttctgtgg tggaaccatt ctgagcgagt tctacatcct 840 aacggcagcc cactgtctct accaagccaa gagattcaag gtgagggtag gggaccggaa 900 cacggagcag gaggagggcg gtgaggcggt gcacgaggtg gaggtggtca tcaagcacaa 960 ccggttcaca aaggagacct atgacttcga catcgccgtg ctccggctca agacccccat 1020 caccttccgc atgaacgtgg cgcctgcctg cctccccgag cgtgactggg ccgagtccac 1080 gctgatgacg cagaagacgg ggattgtgag cggcttcggg cgcacccacg agaagggccg 1140 gcagtccacc aggctcaaga tgctggaggt gccctacgtg gaccgcaaca gctgcaagct 1200 gtccagcagc ttcatcatca cccagaacat gttctgtgcc ggctacgaca ccaagcagga 1260 ggatgcctgc cagggggaca gcgggggccc gcacgtcacc cgcttcaagg acacctactt 1320 cgtgacaggc atcgtcagct ggggagaggg ctgtgcccgt aaggggaagt acgggatcta 1380 caccaaggtc accgccttcc tcaagtggat cgacaggtcc atgaaaacca ggggcttgcc 1440 caaggccaag agccatgccc cggaggtcat aacgtcctct ccattaaagt gagatcccac 1500 tc 1502 <210> 177 <211> 488 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> coagulation factor Xa <400> 177 Met Gly Arg Pro Leu His Leu Val Leu Leu Ser Ala Ser Leu Ala Gly 1 5 10 15 Leu Leu Leu Leu Gly Glu Ser Leu Phe Ile Arg Arg Glu Gln Ala Asn 20 25 30 Asn Ile Leu Ala Arg Val Thr Arg Ala Asn Ser Phe Leu Glu Glu Met 35 40 45 Lys Lys Gly His Leu Glu Arg Glu Cys Met Glu Glu Thr Cys Ser Tyr 50 55 60 Glu Glu Ala Arg Glu Val Phe Glu Asp Ser Asp Lys Thr Asn Glu Phe 65 70 75 80 Trp Asn Lys Tyr Lys Asp Gly Asp Gln Cys Glu Thr Ser Pro Cys Gln 85 90 95 Asn Gln Gly Lys Cys Lys Asp Gly Leu Gly Glu Tyr Thr Cys Thr Cys 100 105 110 Leu Glu Gly Phe Glu Gly Lys Asn Cys Glu Leu Phe Thr Arg Lys Leu 115 120 125 Cys Ser Leu Asp Asn Gly Asp Cys Asp Gln Phe Cys His Glu Glu Gln 130 135 140 Asn Ser Val Val Cys Ser Cys Ala Arg Gly Tyr Thr Leu Ala Asp Asn 145 150 155 160 Gly Lys Ala Cys Ile Pro Thr Gly Pro Tyr Pro Cys Gly Lys Gln Thr 165 170 175 Leu Glu Arg Arg Lys Arg Ser Val Ala Gln Ala Thr Ser Ser Ser Gly 180 185 190 Glu Ala Pro Asp Ser Ile Thr Trp Lys Pro Tyr Asp Ala Ala Asp Leu 195 200 205 Asp Pro Thr Glu Asn Pro Phe Asp Leu Leu Asp Phe Asn Gln Thr Gln 210 215 220 Pro Glu Arg Gly Asp Asn Asn Leu Thr Arg Ile Val Gly Gly Gln Glu 225 230 235 240 Cys Lys Asp Gly Glu Cys Pro Trp Gln Ala Leu Leu Ile Asn Glu Glu 245 250 255 Asn Glu Gly Phe Cys Gly Gly Thr Ile Leu Ser Glu Phe Tyr Ile Leu 260 265 270 Thr Ala Ala His Cys Leu Tyr Gln Ala Lys Arg Phe Lys Val Arg Val 275 280 285 Gly Asp Arg Asn Thr Glu Gln Glu Glu Gly Gly Glu Ala Val His Glu 290 295 300 Val Glu Val Val Ile Lys His Asn Arg Phe Thr Lys Glu Thr Tyr Asp 305 310 315 320 Phe Asp Ile Ala Val Leu Arg Leu Lys Thr Pro Ile Thr Phe Arg Met 325 330 335 Asn Val Ala Pro Ala Cys Leu Pro Glu Arg Asp Trp Ala Glu Ser Thr 340 345 350 Leu Met Thr Gln Lys Thr Gly Ile Val Ser Gly Phe Gly Arg Thr His 355 360 365 Glu Lys Gly Arg Gln Ser Thr Arg Leu Lys Met Leu Glu Val Pro Tyr 370 375 380 Val Asp Arg Asn Ser Cys Lys Leu Ser Ser Ser Phe Ile Ile Thr Gln 385 390 395 400 Asn Met Phe Cys Ala Gly Tyr Asp Thr Lys Gln Glu Asp Ala Cys Gln 405 410 415 Gly Asp Ser Gly Gly Pro His Val Thr Arg Phe Lys Asp Thr Tyr Phe 420 425 430 Val Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Glu Gly Cys Ala Arg Lys Gly Lys 435 440 445 Tyr Gly Ile Tyr Thr Lys Val Thr Ala Phe Leu Lys Trp Ile Asp Arg 450 455 460 Ser Met Lys Thr Arg Gly Leu Pro Lys Ala Lys Ser His Ala Pro Glu 465 470 475 480 Val Ile Thr Ser Ser Pro Leu Lys 485 <210> 178 <211> 1997 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Thrombin <400> 178 aattcctcag tgacccagga gctgacacac tatggcgcac gtccgaggct tgcagctgcc 60 tggctgcctg gccctggctg ccctgtgtag ccttgtgcac agccagcatg tgttcctggc 120 tcctcagcaa gcacggtcgc tgctccagcg ggtccggcga gccaacacct tcttggagga 180 ggtgcgcaag ggcaacctag agcgagagtg cgtggaggag acgtgcagct acgaggaggc 240 cttcgaggct ctggagtcct ccacggctac ggatgtgttc tgggccaagt acacagcttg 300 tgagacagcg aggacgcctc gagataagct tgctgcatgt ctggaaggta actgtgctga 360 gggtctgggt acgaactacc gagggcatgt gaacatcacc cggtcaggca ttgagtgcca 420 gctatggagg agtcgctacc cacataagcc tgaaatcaac tccactaccc atcctggggc 480 cgacctacag gagaatttct gccgcaaccc cgacagcagc accacgggac cctggtgcta 540 cactacagac cccaccgtga ggaggcagga atgcagcatc cctgtctgtg gccaggatca 600 agtcactgta gcgatgactc cacgctccga aggctccagt gtgaatctgt cacctccatt 660 ggagcagtgt gtccctgatc gggggcagca gtaccagggg cgcctggcgg tgaccacaca 720 tgggctcccc tgcctggcct gggccagcgc acaggccaag gccctgagca agcaccagga 780 cttcaactca gctgtgcagc tggtggagaa cttctgccgc aacccagacg gggatgagga 840 gggcgtgtgg tgctatgtgg ccgggaagcc tggcgacttt gggtactgcg acctcaacta 900 ttgtgaggag gccgtggagg aggagacagg agatgggctg gatgaggact cagacagggc 960 catcgaaggg cgtaccgcca ccagtgagta ccagactttc ttcaatccga ggacctttgg 1020 ctcgggagag gcagactgtg ggctgcgacc tctgttcgag aagaagtcgc tggaggacaa 1080 aaccgaaaga gagctcctgg aatcctacat cgacgggcgc attgtggagg gctcggatgc 1140 agagatcggc atgtcacctt ggcaggtgat gcttttccgg aagagtcccc aggagctgct 1200 gtgtggggcc agcctcatca gtgaccgctg ggtcctcacc gccgcccact gcctcctgta 1260 cccgccctgg gacaagaact tcaccgagaa tgaccttctg gtgcgcattg gcaagcactc 1320 ccgcacaagg tacgagcgaa acattgaaaa gatatccatg ttggaaaaga tctacatcca 1380 ccccaggtac aactggcggg agaacctgga ccgggacatt gccctgatga agctgaagaa 1440 gcctgttgcc ttcagtgact acattcaccc tgtgtgtctg cccgacaggg agacggcagc 1500 cagcttgctc caggctggat acaaggggcg ggtgacaggc tggggcaacc tgaaggagac 1560 gtggacagcc aacgttggta aggggcagcc cagtgtcctg caggtggtga acctgcccat 1620 tgtggagcgg ccggtctgca aggactccac ccggatccgc atcactgaca acatgttctg 1680 tgctggttac aagcctgatg aagggaaacg aggggatgcc tgtgaaggtg acagtggggg 1740 accctttgtc atgaagagcc cctttaacaa ccgctggtat caaatgggca tcgtctcatg 1800 gggtgaaggc tgtgaccggg atgggaaata tggcttctac acacatgtgt tccgcctgaa 1860 gaagtggata cagaaggtca ttgatcagtt tggagagtag gggccactca tattctgggc 1920 tcctggaacc aatcccgtga aagaattatt tttgtgtttc taaaactatg gttcccaata 1980 aaagtgactc tcagcgg 1997 <210> 179 <211> 622 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Thrombin <400> 179 Met Ala His Val Arg Gly Leu Gln Leu Pro Gly Cys Leu Ala Leu Ala 1 5 10 15 Ala Leu Cys Ser Leu Val His Ser Gln His Val Phe Leu Ala Pro Gln 20 25 30 Gln Ala Arg Ser Leu Leu Gln Arg Val Arg Arg Ala Asn Thr Phe Leu 35 40 45 Glu Glu Val Arg Lys Gly Asn Leu Glu Arg Glu Cys Val Glu Glu Thr 50 55 60 Cys Ser Tyr Glu Glu Ala Phe Glu Ala Leu Glu Ser Ser Thr Ala Thr 65 70 75 80 Asp Val Phe Trp Ala Lys Tyr Thr Ala Cys Glu Thr Ala Arg Thr Pro 85 90 95 Arg Asp Lys Leu Ala Ala Cys Leu Glu Gly Asn Cys Ala Glu Gly Leu 100 105 110 Gly Thr Asn Tyr Arg Gly His Val Asn Ile Thr Arg Ser Gly Ile Glu 115 120 125 Cys Gln Leu Trp Arg Ser Arg Tyr Pro His Lys Pro Glu Ile Asn Ser 130 135 140 Thr Thr His Pro Gly Ala Asp Leu Gln Glu Asn Phe Cys Arg Asn Pro 145 150 155 160 Asp Ser Ser Thr Thr Gly Pro Trp Cys Tyr Thr Thr Asp Pro Thr Val 165 170 175 Arg Arg Gln Glu Cys Ser Ile Pro Val Cys Gly Gln Asp Gln Val Thr 180 185 190 Val Ala Met Thr Pro Arg Ser Glu Gly Ser Ser Val Asn Leu Ser Pro 195 200 205 Pro Leu Glu Gln Cys Val Pro Asp Arg Gly Gln Gln Tyr Gln Gly Arg 210 215 220 Leu Ala Val Thr Thr His Gly Leu Pro Cys Leu Ala Trp Ala Ser Ala 225 230 235 240 Gln Ala Lys Ala Leu Ser Lys His Gln Asp Phe Asn Ser Ala Val Gln 245 250 255 Leu Val Glu Asn Phe Cys Arg Asn Pro Asp Gly Asp Glu Glu Gly Val 260 265 270 Trp Cys Tyr Val Ala Gly Lys Pro Gly Asp Phe Gly Tyr Cys Asp Leu 275 280 285 Asn Tyr Cys Glu Glu Ala Val Glu Glu Glu Thr Gly Asp Gly Leu Asp 290 295 300 Glu Asp Ser Asp Arg Ala Ile Glu Gly Arg Thr Ala Thr Ser Glu Tyr 305 310 315 320 Gln Thr Phe Phe Asn Pro Arg Thr Phe Gly Ser Gly Glu Ala Asp Cys 325 330 335 Gly Leu Arg Pro Leu Phe Glu Lys Lys Ser Leu Glu Asp Lys Thr Glu 340 345 350 Arg Glu Leu Leu Glu Ser Tyr Ile Asp Gly Arg Ile Val Glu Gly Ser 355 360 365 Asp Ala Glu Ile Gly Met Ser Pro Trp Gln Val Met Leu Phe Arg Lys 370 375 380 Ser Pro Gln Glu Leu Leu Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Asp Arg Trp 385 390 395 400 Val Leu Thr Ala Ala His Cys Leu Leu Tyr Pro Pro Trp Asp Lys Asn 405 410 415 Phe Thr Glu Asn Asp Leu Leu Val Arg Ile Gly Lys His Ser Arg Thr 420 425 430 Arg Tyr Glu Arg Asn Ile Glu Lys Ile Ser Met Leu Glu Lys Ile Tyr 435 440 445 Ile His Pro Arg Tyr Asn Trp Arg Glu Asn Leu Asp Arg Asp Ile Ala 450 455 460 Leu Met Lys Leu Lys Lys Pro Val Ala Phe Ser Asp Tyr Ile His Pro 465 470 475 480 Val Cys Leu Pro Asp Arg Glu Thr Ala Ala Ser Leu Leu Gln Ala Gly 485 490 495 Tyr Lys Gly Arg Val Thr Gly Trp Gly Asn Leu Lys Glu Thr Trp Thr 500 505 510 Ala Asn Val Gly Lys Gly Gln Pro Ser Val Leu Gln Val Val Asn Leu 515 520 525 Pro Ile Val Glu Arg Pro Val Cys Lys Asp Ser Thr Arg Ile Arg Ile 530 535 540 Thr Asp Asn Met Phe Cys Ala Gly Tyr Lys Pro Asp Glu Gly Lys Arg 545 550 555 560 Gly Asp Ala Cys Glu Gly Asp Ser Gly Gly Pro Phe Val Met Lys Ser 565 570 575 Pro Phe Asn Asn Arg Trp Tyr Gln Met Gly Ile Val Ser Trp Gly Glu 580 585 590 Gly Cys Asp Arg Asp Gly Lys Tyr Gly Phe Tyr Thr His Val Phe Arg 595 600 605 Leu Lys Lys Trp Ile Gln Lys Val Ile Asp Gln Phe Gly Glu 610 615 620 <210> 180 <211> 1843 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> protein C (activated) <400> 180 ctgcaggggg gggggggggg gggggctgtc atggcggcag gacggcgaac ttgcagtatc 60 tccacgaccc gcccctacag gtgccagtgc ctccagaatg tggcagctca caagcctcct 120 gctgttcgtg gccacctggg gaatttccgg cacaccagct cctcttgact cagtgttctc 180 cagcagcgag cgtgcccacc aggtgctgcg gatccgcaaa cgtgccaact ccttcctgga 240 ggagctccgt cacagcagcc tggagcggga gtgcatagag gagatctgtg acttcgagga 300 ggccaaggaa attttccaaa atgtggatga cacactggcc ttctggtcca agcacgtcga 360 cggtgaccag tgcttggtct tgcccttgga gcacccgtgc gccagcctgt gctgcgggca 420 cggcacgtgc atcgacggca tcggcagctt cagctgcgac tgccgcagcg gctgggaggg 480 ccgcttctgc cagcgcgagg tgagcttcct caattgctcg ctggacaacg gcggctgcac 540 gcattactgc ctagaggagg tgggctggcg gcgctgtagc tgtgcgcctg gctacaagct 600 gggggacgac ctcctgcagt gtcaccccgc agtgaagttc ccttgtggga ggccctggaa 660 gcggatggag aagaagcgca gtcacctgaa acgagacaca gaagaccaag aagaccaagt 720 agatccgcgg ctcattgatg ggaagatgac caggcgggga gacagcccct ggcaggtggt 780 cctgctggac tcaaagaaga agctggcctg cggggcagtg ctcatccacc cctcctgggt 840 gctgacagcg gcccactgca tggatgagtc caagaagctc cttgtcaggc ttggagagta 900 tgacctgcgg cgctgggaga agtgggagct ggacctggac atcaaggagg tcttcgtcca 960 ccccaactac agcaagagca ccaccgacaa tgacatcgca ctgctgcacc tggcccagcc 1020 cgccaccctc tcgcagacca tagtgcccat ctgcctcccg gacagcggcc ttgcagagcg 1080 cgagctcaat caggccggcc aggagaccct cgtgacgggc tggggctacc acagcagccg 1140 agagaaggag gccaagagaa accgcacctt cgtcctcaac ttcatcaaga ttcccgtggt 1200 cccgcacaat gagtgcagcg aggtcatgag caacatggtg tctgagaaca tgctgtgtgc 1260 gggcatcctc ggggaccggc aggatgcctg cgagggcgac agtggggggc ccatggtcgc 1320 ctccttccac ggcacctggt tcctggtggg cctggtgagc tggggtgagg gctgtgggct 1380 ccttcacaac tacggcgttt acaccaaagt cagccgctac ctcgactgga tccatgggca 1440 catcagagac aaggaagccc cccagaagag ctgggcacct tagcgaccct ccctgcaggg 1500 ctgggctttt gcatggcaat ggatgggaca ttaaagggac atgtaacaag cacaccggcc 1560 tgctgttctg tccttccatc cctcttttgg gctcttctgg agggaagtaa catttactga 1620 gcacctgttg tatgtcacat gccttatgaa tagaatctta actcctagag caactctgtg 1680 gggtggggag gagcagatcc aagttttgcg gggtctaaag ctgtgtgtgt tgagggggat 1740 actctgttta tgaaaaagaa taaaaaacac aaccacgaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 1800 aaaaaaaaaa aaaaaaaccc ccccccgccc cccccccctg cag 1843 <210> 181 <211> 461 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> protein C (activated) <400> 181 Met Trp Gln Leu Thr Ser Leu Leu Leu Phe Val Ala Thr Trp Gly Ile 1 5 10 15 Ser Gly Thr Pro Ala Pro Leu Asp Ser Val Phe Ser Ser Ser Glu Arg 20 25 30 Ala His Gln Val Leu Arg Ile Arg Lys Arg Ala Asn Ser Phe Leu Glu 35 40 45 Glu Leu Arg His Ser Ser Leu Glu Arg Glu Cys Ile Glu Glu Ile Cys 50 55 60 Asp Phe Glu Glu Ala Lys Glu Ile Phe Gln Asn Val Asp Asp Thr Leu 65 70 75 80 Ala Phe Trp Ser Lys His Val Asp Gly Asp Gln Cys Leu Val Leu Pro 85 90 95 Leu Glu His Pro Cys Ala Ser Leu Cys Cys Gly His Gly Thr Cys Ile 100 105 110 Asp Gly Ile Gly Ser Phe Ser Cys Asp Cys Arg Ser Gly Trp Glu Gly 115 120 125 Arg Phe Cys Gln Arg Glu Val Ser Phe Leu Asn Cys Ser Leu Asp Asn 130 135 140 Gly Gly Cys Thr His Tyr Cys Leu Glu Glu Val Gly Trp Arg Arg Cys 145 150 155 160 Ser Cys Ala Pro Gly Tyr Lys Leu Gly Asp Asp Leu Leu Gln Cys His 165 170 175 Pro Ala Val Lys Phe Pro Cys Gly Arg Pro Trp Lys Arg Met Glu Lys 180 185 190 Lys Arg Ser His Leu Lys Arg Asp Thr Glu Asp Gln Glu Asp Gln Val 195 200 205 Asp Pro Arg Leu Ile Asp Gly Lys Met Thr Arg Arg Gly Asp Ser Pro 210 215 220 Trp Gln Val Val Leu Leu Asp Ser Lys Lys Lys Leu Ala Cys Gly Ala 225 230 235 240 Val Leu Ile His Pro Ser Trp Val Leu Thr Ala Ala His Cys Met Asp 245 250 255 Glu Ser Lys Lys Leu Leu Val Arg Leu Gly Glu Tyr Asp Leu Arg Arg 260 265 270 Trp Glu Lys Trp Glu Leu Asp Leu Asp Ile Lys Glu Val Phe Val His 275 280 285 Pro Asn Tyr Ser Lys Ser Thr Thr Asp Asn Asp Ile Ala Leu Leu His 290 295 300 Leu Ala Gln Pro Ala Thr Leu Ser Gln Thr Ile Val Pro Ile Cys Leu 305 310 315 320 Pro Asp Ser Gly Leu Ala Glu Arg Glu Leu Asn Gln Ala Gly Gln Glu 325 330 335 Thr Leu Val Thr Gly Trp Gly Tyr His Ser Ser Arg Glu Lys Glu Ala 340 345 350 Lys Arg Asn Arg Thr Phe Val Leu Asn Phe Ile Lys Ile Pro Val Val 355 360 365 Pro His Asn Glu Cys Ser Glu Val Met Ser Asn Met Val Ser Glu Asn 370 375 380 Met Leu Cys Ala Gly Ile Leu Gly Asp Arg Gln Asp Ala Cys Glu Gly 385 390 395 400 Asp Ser Gly Gly Pro Met Val Ala Ser Phe His Gly Thr Trp Phe Leu 405 410 415 Val Gly Leu Val Ser Trp Gly Glu Gly Cys Gly Leu Leu His Asn Tyr 420 425 430 Gly Val Tyr Thr Lys Val Ser Arg Tyr Leu Asp Trp Ile His Gly His 435 440 445 Ile Arg Asp Lys Glu Ala Pro Gln Lys Ser Trp Ala Pro 450 455 460 <210> 182 <211> 1388 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Acrosin <400> 182 caggcagtgc aggagtatgg ttgagatgct accaactgcc attctgctgg tcttggcagt 60 gtccgtggtt gctaaagata acgccacgtg tgatggcccc tgtgggttac ggttcaggca 120 aaacccacag ggtggtgtcc gcatcgtcgg cgggaaggct gcacagcatg gggcctggcc 180 ctggatggtc agcctccaga tcttcacgta caacagccac aggtaccaca catgtggagg 240 cagcttgctg aattcacgat gggtgctcac tgctgctcac tgcttcgtcg gcaaaaataa 300 tgtgcatgac tggagactgg ttttcggagc aaaggaaatt acatatggga acaataaacc 360 agtaaaggcg cctgtgcaag agagatatgt ggagaaaatc atcattcatg aaaaatacaa 420 ctctgcgaca gagggaaatg acattgccct cgtggagatc acccctccca tttcgtgtgg 480 gcgcttcatt gggccgggct gcctgcccca cttgaaggca ggcctcccca gaggctccca 540 gagctgctgg gtggccggct ggggatatat agaagagaaa gcccccaggc catcatctat 600 actgatggag gcacgtgtgg atctcatcga cctggacttg tgtaactcga cccagtggta 660 caatgggcgc gttcagccaa ccaatgtgtg cgcggggtat cctgtaggca agatcgacac 720 ctgccaggga gacagcggcg ggcctctcat gtgcaaagac agcaaggaaa gcgcctatgt 780 ggtcgtggga atcacaagct ggggggtagg ctgtgcccgt gccaagcgcc ccggaatcta 840 cacggccacc tggccttatc tgaactggat cgcctccaag attggttcta acgctttgcg 900 tatgattcaa tcggccaccc ctccaccgcc caccactcga ccgcccccga ttcgaccccc 960 cttctcccac cctatctctg ctcaccttcc ttggtatttc caaccgcccc ctcgaccact 1020 tccaccccga ccaccggcag cccagccccg acccccacct tcacccccgc ccccaccccc 1080 acctccagcc tcacctttac ccccaccccc acccccaccc ccacctacac cctcatctac 1140 cacaaaactt ccccaaggac tttcttttgc caagcgccta cagcagctca tagaggtctt 1200 gaaggggaag acctattccg acggaaagaa ccattatgac atggagacca cagagctccc 1260 agaactgacc tcgacctcct gatctgacct ggttctcaac agacccagtg agcccttcac 1320 tcctgagaaa aaggaaagat gaaataaata aataaacata tatatataga tataaaaaaa 1380 aaaaaaaa 1388 <210> 183 <211> 421 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Acrosin <400> 183 Met Val Glu Met Leu Pro Thr Ala Ile Leu Leu Val Leu Ala Val Ser 1 5 10 15 Val Val Ala Lys Asp Asn Ala Thr Cys Asp Gly Pro Cys Gly Leu Arg 20 25 30 Phe Arg Gln Asn Pro Gln Gly Gly Val Arg Ile Val Gly Gly Lys Ala 35 40 45 Ala Gln His Gly Ala Trp Pro Trp Met Val Ser Leu Gln Ile Phe Thr 50 55 60 Tyr Asn Ser His Arg Tyr His Thr Cys Gly Gly Ser Leu Leu Asn Ser 65 70 75 80 Arg Trp Val Leu Thr Ala Ala His Cys Phe Val Gly Lys Asn Asn Val 85 90 95 His Asp Trp Arg Leu Val Phe Gly Ala Lys Glu Ile Thr Tyr Gly Asn 100 105 110 Asn Lys Pro Val Lys Ala Pro Val Gln Glu Arg Tyr Val Glu Lys Ile 115 120 125 Ile Ile His Glu Lys Tyr Asn Ser Ala Thr Glu Gly Asn Asp Ile Ala 130 135 140 Leu Val Glu Ile Thr Pro Pro Ile Ser Cys Gly Arg Phe Ile Gly Pro 145 150 155 160 Gly Cys Leu Pro His Leu Lys Ala Gly Leu Pro Arg Gly Ser Gln Ser 165 170 175 Cys Trp Val Ala Gly Trp Gly Tyr Ile Glu Glu Lys Ala Pro Arg Pro 180 185 190 Ser Ser Ile Leu Met Glu Ala Arg Val Asp Leu Ile Asp Leu Asp Leu 195 200 205 Cys Asn Ser Thr Gln Trp Tyr Asn Gly Arg Val Gln Pro Thr Asn Val 210 215 220 Cys Ala Gly Tyr Pro Val Gly Lys Ile Asp Thr Cys Gln Gly Asp Ser 225 230 235 240 Gly Gly Pro Leu Met Cys Lys Asp Ser Lys Glu Ser Ala Tyr Val Val 245 250 255 Val Gly Ile Thr Ser Trp Gly Val Gly Cys Ala Arg Ala Lys Arg Pro 260 265 270 Gly Ile Tyr Thr Ala Thr Trp Pro Tyr Leu Asn Trp Ile Ala Ser Lys 275 280 285 Ile Gly Ser Asn Ala Leu Arg Met Ile Gln Ser Ala Thr Pro Pro Pro 290 295 300 Pro Thr Thr Arg Pro Pro Pro Ile Arg Pro Pro Phe Ser His Pro Ile 305 310 315 320 Ser Ala His Leu Pro Trp Tyr Phe Gln Pro Pro Pro Arg Pro Leu Pro 325 330 335 Pro Arg Pro Pro Ala Ala Gln Pro Arg Pro Pro Pro Ser Pro Pro Pro 340 345 350 Pro Pro Pro Pro Pro Ala Ser Pro Leu Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro 355 360 365 Pro Pro Thr Pro Ser Ser Thr Thr Lys Leu Pro Gln Gly Leu Ser Phe 370 375 380 Ala Lys Arg Leu Gln Gln Leu Ile Glu Val Leu Lys Gly Lys Thr Tyr 385 390 395 400 Ser Asp Gly Lys Asn His Tyr Asp Met Glu Thr Thr Glu Leu Pro Glu 405 410 415 Leu Thr Ser Thr Ser 420 <210> 184 <211> 2363 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Hepsin transcript variant 1 <400> 184 tcgagcccgc tttccaggga ccctacctga gggcccacag gtgaggcagc ctggcctagc 60 aggccccacg ccaccgcctc tgcctccagg ccgcccgctg ctgcggggcc accatgctcc 120 tgcccaggcc tggagactga cccgaccccg gcactacctc gaggctccgc ccccacctgc 180 tggaccccag ggtaaggaca agggccccca gactcacagt tccagccctg aggacagggg 240 ttccctcatc cccccaccca gcctaatgcc cacctcctaa tagaggggtt cctggggacc 300 tgaagagggg gcactatgac gtctccccaa gcacctaggt gttctgtcct gctcttcctt 360 cagactcagc cgttggaccc cagtcctttc ctccccagac ccaggagttc cagccctcag 420 gcccctcctc cctcatacta gggagtcctg gcccccaaat tcctcctttc ccaagactta 480 tgatttcagg tcctcagctg tctcctccct caaaccggga tcctcagtcc cctgctccac 540 caggctcagg catgggggtc cccatccctg caaatccagg cgtccccccg ctgctggtca 600 gacactgacc ccatccttga acccagccca atctgcgtcc gtgatcacgg cgtgctctgg 660 ccaaggccca gtccctacag cctgcctgga tggacgcctg ggactggggg cgccaggact 720 gggctgggct gggctccccc aggccctgcc tccccgtcca tctcctcaca ggtcccaccc 780 tggcccagga ggtcagccag ggaatcatta acaagaggca gtgacatggc gcagaaggag 840 ggtggccgga ctgtgccatg ctgctccaga cccaaggtgg cagctctcac tgcggggacc 900 ctgctacttc tgacagccat cggggcggca tcctgggcca ttgtggctgt tctcctcagg 960 agtgaccagg agccgctgta cccagtgcag gtcagctctg cggacgctcg gctcatggtc 1020 tttgacaaga cggaagggac gtggcggctg ctgtgctcct cgcgctccaa cgccagggta 1080 gccggactca gctgcgagga gatgggcttc ctcagggcac tgacccactc cgagctggac 1140 gtgcgaacgg cgggcgccaa tggcacgtcg ggcttcttct gtgtggacga ggggaggctg 1200 ccccacaccc agaggctgct ggaggtcatc tccgtgtgtg attgccccag aggccgtttc 1260 ttggccgcca tctgccaaga ctgtggccgc aggaagctgc ccgtggaccg catcgtggga 1320 ggccgggaca ccagcttggg ccggtggccg tggcaagtca gccttcgcta tgatggagca 1380 cacctctgtg ggggatccct gctctccggg gactgggtgc tgacagccgc ccactgcttc 1440 ccggagcgga accgggtcct gtcccgatgg cgagtgtttg ccggtgccgt ggcccaggcc 1500 tctccccacg gtctgcagct gggggtgcag gctgtggtct accacggggg ctatcttccc 1560 tttcgggacc ccaacagcga ggagaacagc aacgatattg ccctggtcca cctctccagt 1620 cccctgcccc tcacagaata catccagcct gtgtgcctcc cagctgccgg ccaggccctg 1680 gtggatggca agatctgtac cgtgacgggc tggggcaaca cgcagtacta tggccaacag 1740 gccggggtac tccaggaggc tcgagtcccc ataatcagca atgatgtctg caatggcgct 1800 gacttctatg gaaaccagat caagcccaag atgttctgtg ctggctaccc cgagggtggc 1860 attgatgcct gccagggcga cagcggtggt ccctttgtgt gtgaggacag catctctcgg 1920 acgccacgtt ggcggctgtg tggcattgtg agttggggca ctggctgtgc cctggcccag 1980 aagccaggcg tctacaccaa agtcagtgac ttccgggagt ggatcttcca ggccataaag 2040 actcactccg aagccagcgg catggtgacc cagctctgac cggtggcttc tcgctgcgca 2100 gcctccaggg cccgaggtga tcccggtggt gggatccacg ctgggccgag gatgggacgt 2160 ttttcttctt gggcccggtc cacaggtcca aggacaccct ccctccaggg tcctctcttc 2220 cacagtggcg ggcccactca gccccgagac cacccaacct caccctcctg acccccatgt 2280 aaatattgtt ctgctgtctg ggactcctgt ctaggtgccc ctgatgatgg gatgctcttt 2340 aaataataaa gatggttttg att 2363 <210> 185 <211> 417 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Hepsin <400> 185 Met Ala Gln Lys Glu Gly Gly Arg Thr Val Pro Cys Cys Ser Arg Pro 1 5 10 15 Lys Val Ala Ala Leu Thr Ala Gly Thr Leu Leu Leu Leu Thr Ala Ile 20 25 30 Gly Ala Ala Ser Trp Ala Ile Val Ala Val Leu Leu Arg Ser Asp Gln 35 40 45 Glu Pro Leu Tyr Pro Val Gln Val Ser Ser Ala Asp Ala Arg Leu Met 50 55 60 Val Phe Asp Lys Thr Glu Gly Thr Trp Arg Leu Leu Cys Ser Ser Arg 65 70 75 80 Ser Asn Ala Arg Val Ala Gly Leu Ser Cys Glu Glu Met Gly Phe Leu 85 90 95 Arg Ala Leu Thr His Ser Glu Leu Asp Val Arg Thr Ala Gly Ala Asn 100 105 110 Gly Thr Ser Gly Phe Phe Cys Val Asp Glu Gly Arg Leu Pro His Thr 115 120 125 Gln Arg Leu Leu Glu Val Ile Ser Val Cys Asp Cys Pro Arg Gly Arg 130 135 140 Phe Leu Ala Ala Ile Cys Gln Asp Cys Gly Arg Arg Lys Leu Pro Val 145 150 155 160 Asp Arg Ile Val Gly Gly Arg Asp Thr Ser Leu Gly Arg Trp Pro Trp 165 170 175 Gln Val Ser Leu Arg Tyr Asp Gly Ala His Leu Cys Gly Gly Ser Leu 180 185 190 Leu Ser Gly Asp Trp Val Leu Thr Ala Ala His Cys Phe Pro Glu Arg 195 200 205 Asn Arg Val Leu Ser Arg Trp Arg Val Phe Ala Gly Ala Val Ala Gln 210 215 220 Ala Ser Pro His Gly Leu Gln Leu Gly Val Gln Ala Val Val Tyr His 225 230 235 240 Gly Gly Tyr Leu Pro Phe Arg Asp Pro Asn Ser Glu Glu Asn Ser Asn 245 250 255 Asp Ile Ala Leu Val His Leu Ser Ser Pro Leu Pro Leu Thr Glu Tyr 260 265 270 Ile Gln Pro Val Cys Leu Pro Ala Ala Gly Gln Ala Leu Val Asp Gly 275 280 285 Lys Ile Cys Thr Val Thr Gly Trp Gly Asn Thr Gln Tyr Tyr Gly Gln 290 295 300 Gln Ala Gly Val Leu Gln Glu Ala Arg Val Pro Ile Ile Ser Asn Asp 305 310 315 320 Val Cys Asn Gly Ala Asp Phe Tyr Gly Asn Gln Ile Lys Pro Lys Met 325 330 335 Phe Cys Ala Gly Tyr Pro Glu Gly Gly Ile Asp Ala Cys Gln Gly Asp 340 345 350 Ser Gly Gly Pro Phe Val Cys Glu Asp Ser Ile Ser Arg Thr Pro Arg 355 360 365 Trp Arg Leu Cys Gly Ile Val Ser Trp Gly Thr Gly Cys Ala Leu Ala 370 375 380 Gln Lys Pro Gly Val Tyr Thr Lys Val Ser Asp Phe Arg Glu Trp Ile 385 390 395 400 Phe Gln Ala Ile Lys Thr His Ser Glu Ala Ser Gly Met Val Thr Gln 405 410 415 Leu <210> 186 <211> 1783 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Hepsin transcript variant 2 <400> 186 tcgagcccgc tttccaggga ccctacctga gggcccacag gtgaggcagc ctggcctagc 60 aggccccacg ccaccgcctc tgcctccagg ccgcccgctg ctgcggggcc accatgctcc 120 tgcccaggcc tggagactga cccgaccccg gcactacctc gaggctccgc ccccacctgc 180 tggaccccag ggtcccaccc tggcccagga ggtcagccag ggaatcatta acaagaggca 240 gtgacatggc gcagaaggag ggtggccgga ctgtgccatg ctgctccaga cccaaggtgg 300 cagctctcac tgcggggacc ctgctacttc tgacagccat cggggcggca tcctgggcca 360 ttgtggctgt tctcctcagg agtgaccagg agccgctgta cccagtgcag gtcagctctg 420 cggacgctcg gctcatggtc tttgacaaga cggaagggac gtggcggctg ctgtgctcct 480 cgcgctccaa cgccagggta gccggactca gctgcgagga gatgggcttc ctcagggcac 540 tgacccactc cgagctggac gtgcgaacgg cgggcgccaa tggcacgtcg ggcttcttct 600 gtgtggacga ggggaggctg ccccacaccc agaggctgct ggaggtcatc tccgtgtgtg 660 attgccccag aggccgtttc ttggccgcca tctgccaaga ctgtggccgc aggaagctgc 720 ccgtggaccg catcgtggga ggccgggaca ccagcttggg ccggtggccg tggcaagtca 780 gccttcgcta tgatggagca cacctctgtg ggggatccct gctctccggg gactgggtgc 840 tgacagccgc ccactgcttc ccggagcgga accgggtcct gtcccgatgg cgagtgtttg 900 ccggtgccgt ggcccaggcc tctccccacg gtctgcagct gggggtgcag gctgtggtct 960 accacggggg ctatcttccc tttcgggacc ccaacagcga ggagaacagc aacgatattg 1020 ccctggtcca cctctccagt cccctgcccc tcacagaata catccagcct gtgtgcctcc 1080 cagctgccgg ccaggccctg gtggatggca agatctgtac cgtgacgggc tggggcaaca 1140 cgcagtacta tggccaacag gccggggtac tccaggaggc tcgagtcccc ataatcagca 1200 atgatgtctg caatggcgct gacttctatg gaaaccagat caagcccaag atgttctgtg 1260 ctggctaccc cgagggtggc attgatgcct gccagggcga cagcggtggt ccctttgtgt 1320 gtgaggacag catctctcgg acgccacgtt ggcggctgtg tggcattgtg agttggggca 1380 ctggctgtgc cctggcccag aagccaggcg tctacaccaa agtcagtgac ttccgggagt 1440 ggatcttcca ggccataaag actcactccg aagccagcgg catggtgacc cagctctgac 1500 cggtggcttc tcgctgcgca gcctccaggg cccgaggtga tcccggtggt gggatccacg 1560 ctgggccgag gatgggacgt ttttcttctt gggcccggtc cacaggtcca aggacaccct 1620 ccctccaggg tcctctcttc cacagtggcg ggcccactca gccccgagac cacccaacct 1680 caccctcctg acccccatgt aaatattgtt ctgctgtctg ggactcctgt ctaggtgccc 1740 ctgatgatgg gatgctcttt aaataataaa gatggttttg att 1783 <210> 187 <211> 417 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Hepsin <400> 187 Met Ala Gln Lys Glu Gly Gly Arg Thr Val Pro Cys Cys Ser Arg Pro 1 5 10 15 Lys Val Ala Ala Leu Thr Ala Gly Thr Leu Leu Leu Leu Thr Ala Ile 20 25 30 Gly Ala Ala Ser Trp Ala Ile Val Ala Val Leu Leu Arg Ser Asp Gln 35 40 45 Glu Pro Leu Tyr Pro Val Gln Val Ser Ser Ala Asp Ala Arg Leu Met 50 55 60 Val Phe Asp Lys Thr Glu Gly Thr Trp Arg Leu Leu Cys Ser Ser Arg 65 70 75 80 Ser Asn Ala Arg Val Ala Gly Leu Ser Cys Glu Glu Met Gly Phe Leu 85 90 95 Arg Ala Leu Thr His Ser Glu Leu Asp Val Arg Thr Ala Gly Ala Asn 100 105 110 Gly Thr Ser Gly Phe Phe Cys Val Asp Glu Gly Arg Leu Pro His Thr 115 120 125 Gln Arg Leu Leu Glu Val Ile Ser Val Cys Asp Cys Pro Arg Gly Arg 130 135 140 Phe Leu Ala Ala Ile Cys Gln Asp Cys Gly Arg Arg Lys Leu Pro Val 145 150 155 160 Asp Arg Ile Val Gly Gly Arg Asp Thr Ser Leu Gly Arg Trp Pro Trp 165 170 175 Gln Val Ser Leu Arg Tyr Asp Gly Ala His Leu Cys Gly Gly Ser Leu 180 185 190 Leu Ser Gly Asp Trp Val Leu Thr Ala Ala His Cys Phe Pro Glu Arg 195 200 205 Asn Arg Val Leu Ser Arg Trp Arg Val Phe Ala Gly Ala Val Ala Gln 210 215 220 Ala Ser Pro His Gly Leu Gln Leu Gly Val Gln Ala Val Val Tyr His 225 230 235 240 Gly Gly Tyr Leu Pro Phe Arg Asp Pro Asn Ser Glu Glu Asn Ser Asn 245 250 255 Asp Ile Ala Leu Val His Leu Ser Ser Pro Leu Pro Leu Thr Glu Tyr 260 265 270 Ile Gln Pro Val Cys Leu Pro Ala Ala Gly Gln Ala Leu Val Asp Gly 275 280 285 Lys Ile Cys Thr Val Thr Gly Trp Gly Asn Thr Gln Tyr Tyr Gly Gln 290 295 300 Gln Ala Gly Val Leu Gln Glu Ala Arg Val Pro Ile Ile Ser Asn Asp 305 310 315 320 Val Cys Asn Gly Ala Asp Phe Tyr Gly Asn Gln Ile Lys Pro Lys Met 325 330 335 Phe Cys Ala Gly Tyr Pro Glu Gly Gly Ile Asp Ala Cys Gln Gly Asp 340 345 350 Ser Gly Gly Pro Phe Val Cys Glu Asp Ser Ile Ser Arg Thr Pro Arg 355 360 365 Trp Arg Leu Cys Gly Ile Val Ser Trp Gly Thr Gly Cys Ala Leu Ala 370 375 380 Gln Lys Pro Gly Val Tyr Thr Lys Val Ser Asp Phe Arg Glu Trp Ile 385 390 395 400 Phe Gln Ala Ile Lys Thr His Ser Glu Ala Ser Gly Met Val Thr Gln 405 410 415 Leu <210> 188 <211> 2038 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> hepatocyte growth factor activator <400> 188 gccatggggc gctgggcctg ggtccccagc ccctggcccc caccggggct gggccccttc 60 ctcctcctcc tcctgctgct gctgctgctg ccacgggggt tccagcccca gcctggcggg 120 aaccgtacgg agtccccaga acctaatgcc acagcgaccc ctgcgatccc cactatcctg 180 gtgacctctg tgacctctga gaccccagca acaagtgctc cagaggcaga gggaccccaa 240 agtggggggc tcccgccccc gcccagggca gttccctcga gcagtagccc ccaggcccaa 300 gcactcaccg aggacgggag gccctgcagg ttccccttcc gctacggggg ccgcatgctg 360 catgcctgca cttcggaggg cagtgcacac aggaagtggt gtgccacaac tcacaactac 420 gaccgggaca gggcctgggg ctactgtgtg gaggccaccc cgcctccagg gggcccagct 480 gccctggatc cctgtgcctc cggcccctgc ctcaatggag gctcctgctc caatacccag 540 gacccccagt cctatcactg cagctgcccc cgggccttca ccggcaagga ctgcggcaca 600 gagaaatgct ttgatgagac ccgctacgag tacctggagg ggggcgaccg ctgggcccgc 660 gtgcgccagg gccacgtgga acagtgcgag tgcttcgggg gccggacctg gtgcgaaggc 720 acccgacata cagcttgtct gagcagccct tgcctgaacg ggggcacctg ccacctgatc 780 gtggccaccg ggaccaccgt gtgtgcctgc ccaccaggct tcgctggacg gctctgcaac 840 atcgagcctg atgagcgctg cttcttgggg aacggcactg ggtaccgtgg cgtggccagc 900 acctcagcct cgggcctcag ctgcctggcc tggaactccg atctgctcta ccaggagctg 960 cacgtggact ccgtgggcgc cgcggccctg ctgggcctgg gcccccatgc ctactgccgg 1020 aatccggaca atgacgagag gccctggtgc tacgtggtga aggacagcgc gctctcctgg 1080 gagtactgcc gcctggaggc ctgcgaatcc ctcaccagag tccaactgtc accggatctc 1140 ctggcgaccc tgcctgagcc agcctccccg gggcgccagg cctgcggcag gaggcacaag 1200 aagaggacgt tcctgcggcc acgtatcatc ggcggctcct cctcgctgcc cggctcgcac 1260 ccctggctgg ccgccatcta catcggggac agcttctgcg ccgggagcct ggtccacacc 1320 tgctgggtgg tgtcggccgc ccactgcttc tcccacagcc cccccaggga cagcgtctcc 1380 gtggtgctgg gccagcactt cttcaaccgc acgacggacg tgacgcagac cttcggcatc 1440 gagaagtaca tcccgtacac cctgtactcg gtgttcaacc ccagcgacca cgacctcgtc 1500 ctgatccggc tgaagaagaa aggggaccgc tgtgccacac gctcgcagtt cgtgcagccc 1560 atctgcctgc ccgagcccgg cagcaccttc cccgcaggac acaagtgcca gattgcgggc 1620 tggggccact tggatgagaa cgtgagcggc tactccagct ccctgcggga ggccctggtc 1680 cccctggtcg ccgaccacaa gtgcagcagc cctgaggtct acggcgccga catcagcccc 1740 aacatgctct gtgccggcta cttcgactgc aagtccgacg cctgccaggg ggactcaggg 1800 gggcccctgg cctgcgagaa gaacggcgtg gcttacctct acggcatcat cagctggggt 1860 gacggctgcg ggcggctcca caagccgggg gtctacaccc gcgtggccaa ctatgtggac 1920 tggatcaacg accggatacg gcctcccagg cggcttgtgg ctccctcctg accctccagc 1980 gggacaccct ggttcccacc attccctgcc ttgctgacaa taaagatatt tccaagaa 2038 <210> 189 <211> 655 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> hepatocyte growth factor activator <400> 189 Met Gly Arg Trp Ala Trp Val Pro Ser Pro Trp Pro Pro Pro Gly Leu 1 5 10 15 Gly Pro Phe Leu Leu Leu Leu Leu Leu Leu Leu Leu Leu Pro Arg Gly 20 25 30 Phe Gln Pro Gln Pro Gly Gly Asn Arg Thr Glu Ser Pro Glu Pro Asn 35 40 45 Ala Thr Ala Thr Pro Ala Ile Pro Thr Ile Leu Val Thr Ser Val Thr 50 55 60 Ser Glu Thr Pro Ala Thr Ser Ala Pro Glu Ala Glu Gly Pro Gln Ser 65 70 75 80 Gly Gly Leu Pro Pro Pro Pro Arg Ala Val Pro Ser Ser Ser Ser Pro 85 90 95 Gln Ala Gln Ala Leu Thr Glu Asp Gly Arg Pro Cys Arg Phe Pro Phe 100 105 110 Arg Tyr Gly Gly Arg Met Leu His Ala Cys Thr Ser Glu Gly Ser Ala 115 120 125 His Arg Lys Trp Cys Ala Thr Thr His Asn Tyr Asp Arg Asp Arg Ala 130 135 140 Trp Gly Tyr Cys Val Glu Ala Thr Pro Pro Pro Gly Gly Pro Ala Ala 145 150 155 160 Leu Asp Pro Cys Ala Ser Gly Pro Cys Leu Asn Gly Gly Ser Cys Ser 165 170 175 Asn Thr Gln Asp Pro Gln Ser Tyr His Cys Ser Cys Pro Arg Ala Phe 180 185 190 Thr Gly Lys Asp Cys Gly Thr Glu Lys Cys Phe Asp Glu Thr Arg Tyr 195 200 205 Glu Tyr Leu Glu Gly Gly Asp Arg Trp Ala Arg Val Arg Gln Gly His 210 215 220 Val Glu Gln Cys Glu Cys Phe Gly Gly Arg Thr Trp Cys Glu Gly Thr 225 230 235 240 Arg His Thr Ala Cys Leu Ser Ser Pro Cys Leu Asn Gly Gly Thr Cys 245 250 255 His Leu Ile Val Ala Thr Gly Thr Thr Val Cys Ala Cys Pro Pro Gly 260 265 270 Phe Ala Gly Arg Leu Cys Asn Ile Glu Pro Asp Glu Arg Cys Phe Leu 275 280 285 Gly Asn Gly Thr Gly Tyr Arg Gly Val Ala Ser Thr Ser Ala Ser Gly 290 295 300 Leu Ser Cys Leu Ala Trp Asn Ser Asp Leu Leu Tyr Gln Glu Leu His 305 310 315 320 Val Asp Ser Val Gly Ala Ala Ala Leu Leu Gly Leu Gly Pro His Ala 325 330 335 Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Asp Glu Arg Pro Trp Cys Tyr Val Val 340 345 350 Lys Asp Ser Ala Leu Ser Trp Glu Tyr Cys Arg Leu Glu Ala Cys Glu 355 360 365 Ser Leu Thr Arg Val Gln Leu Ser Pro Asp Leu Leu Ala Thr Leu Pro 370 375 380 Glu Pro Ala Ser Pro Gly Arg Gln Ala Cys Gly Arg Arg His Lys Lys 385 390 395 400 Arg Thr Phe Leu Arg Pro Arg Ile Ile Gly Gly Ser Ser Ser Leu Pro 405 410 415 Gly Ser His Pro Trp Leu Ala Ala Ile Tyr Ile Gly Asp Ser Phe Cys 420 425 430 Ala Gly Ser Leu Val His Thr Cys Trp Val Val Ser Ala Ala His Cys 435 440 445 Phe Ser His Ser Pro Pro Arg Asp Ser Val Ser Val Val Leu Gly Gln 450 455 460 His Phe Phe Asn Arg Thr Thr Asp Val Thr Gln Thr Phe Gly Ile Glu 465 470 475 480 Lys Tyr Ile Pro Tyr Thr Leu Tyr Ser Val Phe Asn Pro Ser Asp His 485 490 495 Asp Leu Val Leu Ile Arg Leu Lys Lys Lys Gly Asp Arg Cys Ala Thr 500 505 510 Arg Ser Gln Phe Val Gln Pro Ile Cys Leu Pro Glu Pro Gly Ser Thr 515 520 525 Phe Pro Ala Gly His Lys Cys Gln Ile Ala Gly Trp Gly His Leu Asp 530 535 540 Glu Asn Val Ser Gly Tyr Ser Ser Ser Leu Arg Glu Ala Leu Val Pro 545 550 555 560 Leu Val Ala Asp His Lys Cys Ser Ser Pro Glu Val Tyr Gly Ala Asp 565 570 575 Ile Ser Pro Asn Met Leu Cys Ala Gly Tyr Phe Asp Cys Lys Ser Asp 580 585 590 Ala Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ala Cys Glu Lys Asn Gly 595 600 605 Val Ala Tyr Leu Tyr Gly Ile Ile Ser Trp Gly Asp Gly Cys Gly Arg 610 615 620 Leu His Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ala Asn Tyr Val Asp Trp 625 630 635 640 Ile Asn Asp Arg Ile Arg Pro Pro Arg Arg Leu Val Ala Pro Ser 645 650 655 <210> 190 <211> 2360 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> u-plasminogen activator (uPA) <400> 190 acagtgcgga gaccgcagcc ccggagcccg ggccagggtc cacctgtccc cgcagcgccg 60 gctcgcgccc tcctgccgca gccaccgagc cgccgtctag cgccccgacc tcgccaccat 120 gagagccctg ctggcgcgcc tgcttctctg cgtcctggtc gtgagcgact ccaaaggcag 180 caatgaactt catcaagttc catcgaactg tgactgtcta aatggaggaa catgtgtgtc 240 caacaagtac ttctccaaca ttcactggtg caactgccca aagaaattcg gagggcagca 300 ctgtgaaata gataagtcaa aaacctgcta tgaggggaat ggtcactttt accgaggaaa 360 ggccagcact gacaccatgg gccggccctg cctgccctgg aactctgcca ctgtccttca 420 gcaaacgtac catgcccaca gatctgatgc tcttcagctg ggcctgggga aacataatta 480 ctgcaggaac ccagacaacc ggaggcgacc ctggtgctat gtgcaggtgg gcctaaagcc 540 gcttgtccaa gagtgcatgg tgcatgactg cgcagatgga aaaaagccct cctctcctcc 600 agaagaatta aaatttcagt gtggccaaaa gactctgagg ccccgcttta agattattgg 660 gggagaattc accaccatcg agaaccagcc ctggtttgcg gccatctaca ggaggcaccg 720 ggggggctct gtcacctacg tgtgtggagg cagcctcatc agcccttgct gggtgatcag 780 cgccacacac tgcttcattg attacccaaa gaaggaggac tacatcgtct acctgggtcg 840 ctcaaggctt aactccaaca cgcaagggga gatgaagttt gaggtggaaa acctcatcct 900 acacaaggac tacagcgctg acacgcttgc tcaccacaac gacattgcct tgctgaagat 960 ccgttccaag gagggcaggt gtgcgcagcc atcccggact atacagacca tctgcctgcc 1020 ctcgatgtat aacgatcccc agtttggcac aagctgtgag atcactggct ttggaaaaga 1080 gaattctacc gactatctct atccggagca gctgaaaatg actgttgtga agctgatttc 1140 ccaccgggag tgtcagcagc cccactacta cggctctgaa gtcaccacca aaatgctgtg 1200 tgctgctgac ccacagtgga aaacagattc ctgccaggga gactcagggg gacccctcgt 1260 ctgttccctc caaggccgca tgactttgac tggaattgtg agctggggcc gtggatgtgc 1320 cctgaaggac aagccaggcg tctacacgag agtctcacac ttcttaccct ggatccgcag 1380 tcacaccaag gaagagaatg gcctggccct ctgagggtcc ccagggagga aacgggcacc 1440 acccgctttc ttgctggttg tcatttttgc agtagagtca tctccatcag ctgtaagaag 1500 agactgggaa gataggctct gcacagatgg atttgcctgt gccacccacc agggcgaacg 1560 acaatagctt taccctcagg cataggcctg ggtgctggct gcccagaccc ctctggccag 1620 gatggagggg tggtcctgac tcaacatgtt actgaccagc aacttgtctt tttctggact 1680 gaagcctgca ggagttaaaa agggcagggc atctcctgtg catgggtgaa gggagagcca 1740 gctcccccga cggtgggcat ttgtgaggcc catggttgag aaatgaataa tttcccaatt 1800 aggaagtgta acagctgagg tctcttgagg gagcttagcc aatgtgggag cagcggtttg 1860 gggagcagag acactaacga cttcagggca gggctctgat attccatgaa tgtatcagga 1920 aatatatatg tgtgtgtatg tttgcacact tgtgtgtggg ctgtgagtgt aagtgtgagt 1980 aagagctggt gtctgattgt taagtctaaa tatttcctta aactgtgtgg actgtgatgc 2040 cacacagagt ggtctttctg gagaggttat aggtcactcc tggggcctct tgggtccccc 2100 acgtgacagt gcctgggaat gtattattct gcagcatgac ctgtgaccag cactgtctca 2160 gtttcacttt cacatagatg tccctttctt ggccagttat cccttccttt tagcctagtt 2220 catccaatcc tcactgggtg gggtgaggac cactcctgta cactgaatat ttatatttca 2280 ctatttttat ttatattttt gtaattttaa ataaaagtga tcaataaaat gtgatttttc 2340 tgatgaaaaa aaaaaaaaaa 2360 <210> 191 <211> 431 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> u-plasminogen activator (uPA) <400> 191 Met Arg Ala Leu Leu Ala Arg Leu Leu Leu Cys Val Leu Val Val Ser 1 5 10 15 Asp Ser Lys Gly Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp 20 25 30 Cys Leu Asn Gly Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile 35 40 45 His Trp Cys Asn Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile 50 55 60 Asp Lys Ser Lys Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly 65 70 75 80 Lys Ala Ser Thr Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser 85 90 95 Ala Thr Val Leu Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu 100 105 110 Gln Leu Gly Leu Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg 115 120 125 Arg Arg Pro Trp Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln 130 135 140 Glu Cys Met Val His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro 145 150 155 160 Pro Glu Glu Leu Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg 165 170 175 Phe Lys Ile Ile Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp 180 185 190 Phe Ala Ala Ile Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val 195 200 205 Cys Gly Gly Ser Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His 210 215 220 Cys Phe Ile Asp Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly 225 230 235 240 Arg Ser Arg Leu Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Lys Phe Glu Val 245 250 255 Glu Asn Leu Ile Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His 260 265 270 His Asn Asp Ile Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys 275 280 285 Ala Gln Pro Ser Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr 290 295 300 Asn Asp Pro Gln Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys 305 310 315 320 Glu Asn Ser Thr Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Leu Lys Met Thr Val 325 330 335 Val Lys Leu Ile Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly 340 345 350 Ser Glu Val Thr Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys 355 360 365 Thr Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu 370 375 380 Gln Gly Arg Met Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys 385 390 395 400 Ala Leu Lys Asp Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu 405 410 415 Pro Trp Ile Arg Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 420 425 430 <210> 192 <211> 2653 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> t-plasminogen activator (tPA) transcript variant 1 <400> 192 atggccctgt ccactgagca tcctcccgcc acacagaaac ccgcccagcc ggggccaccg 60 accccacccc ctgcctggaa acttaaggag gccggagctg tggggagctc agagctgaga 120 tcctacagga gtccagggct ggagagaaaa cctctgcgag gaaagggaag gagcaagccg 180 tgaatttaag ggacgctgtg aagcaatcat ggatgcaatg aagagagggc tctgctgtgt 240 gctgctgctg tgtggagcag tcttcgtttc gcccagccag gaaatccatg cccgattcag 300 aagaggagcc agatcttacc aagtgatctg cagagatgaa aaaacgcaga tgatatacca 360 gcaacatcag tcatggctgc gccctgtgct cagaagcaac cgggtggaat attgctggtg 420 caacagtggc agggcacagt gccactcagt gcctgtcaaa agttgcagcg agccaaggtg 480 tttcaacggg ggcacctgcc agcaggccct gtacttctca gatttcgtgt gccagtgccc 540 cgaaggattt gctgggaagt gctgtgaaat agataccagg gccacgtgct acgaggacca 600 gggcatcagc tacaggggca cgtggagcac agcggagagt ggcgccgagt gcaccaactg 660 gaacagcagc gcgttggccc agaagcccta cagcgggcgg aggccagacg ccatcaggct 720 gggcctgggg aaccacaact actgcagaaa cccagatcga gactcaaagc cctggtgcta 780 cgtctttaag gcggggaagt acagctcaga gttctgcagc acccctgcct gctctgaggg 840 aaacagtgac tgctactttg ggaatgggtc agcctaccgt ggcacgcaca gcctcaccga 900 gtcgggtgcc tcctgcctcc cgtggaattc catgatcctg ataggcaagg tttacacagc 960 acagaacccc agtgcccagg cactgggcct gggcaaacat aattactgcc ggaatcctga 1020 tggggatgcc aagccctggt gccacgtgct gaagaaccgc aggctgacgt gggagtactg 1080 tgatgtgccc tcctgctcca cctgcggcct gagacagtac agccagcctc agtttcgcat 1140 caaaggaggg ctcttcgccg acatcgcctc ccacccctgg caggctgcca tctttgccaa 1200 gcacaggagg tcgcccggag agcggttcct gtgcgggggc atactcatca gctcctgctg 1260 gattctctct gccgcccact gcttccagga gaggtttccg ccccaccacc tgacggtgat 1320 cttgggcaga acataccggg tggtccctgg cgaggaggag cagaaatttg aagtcgaaaa 1380 atacattgtc cataaggaat tcgatgatga cacttacgac aatgacattg cgctgctgca 1440 gctgaaatcg gattcgtccc gctgtgccca ggagagcagc gtggtccgca ctgtgtgcct 1500 tcccccggcg gacctgcagc tgccggactg gacggagtgt gagctctccg gctacggcaa 1560 gcatgaggcc ttgtctcctt tctattcgga gcggctgaag gaggctcatg tcagactgta 1620 cccatccagc cgctgcacat cacaacattt acttaacaga acagtcaccg acaacatgct 1680 gtgtgctgga gacactcgga gcggcgggcc ccaggcaaac ttgcacgacg cctgccaggg 1740 cgattcggga ggccccctgg tgtgtctgaa cgatggccgc atgactttgg tgggcatcat 1800 cagctggggc ctgggctgtg gacagaagga tgtcccgggt gtgtacacca aggttaccaa 1860 ctacctagac tggattcgtg acaacatgcg accgtgacca ggaacacccg actcctcaaa 1920 agcaaatgag atcccgcctc ttcttcttca gaagacactg caaaggcgca gtgcttctct 1980 acagacttct ccagacccac cacaccgcag aagcgggacg agaccctaca ggagagggaa 2040 gagtgcattt tcccagatac ttcccatttt ggaagttttc aggacttggt ctgatttcag 2100 gatactctgt cagatgggaa gacatgaatg cacactagcc tctccaggaa tgcctcctcc 2160 ctgggcagaa agtggccatg ccaccctgtt ttcagctaaa gcccaacctc ctgacctgtc 2220 accgtgagca gctttggaaa caggaccaca aaaatgaaag catgtctcaa tagtaaaaga 2280 taacaagatc tttcaggaaa gacggattgc attagaaata gacagtatat ttatagtcac 2340 aagagcccag cagggcctca aagttggggc aggctggctg gcccgtcatg ttcctcaaaa 2400 gcacccttga cgtcaagtct ccttcccctt tccccactcc ctggctctca gaaggtattc 2460 cttttgtgta cagtgtgtaa agtgtaaatc ctttttcttt ataaacttta gagtagcatg 2520 agagaattgt atcatttgaa caactaggct tcagcatatt tatagcaatc catgttagtt 2580 tttactttct gttgccacaa ccctgtttta tactgtactt aataaattca gatatatttt 2640 tcacagtttt tcc 2653 <210> 193 <211> 562 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> t-plasminogen activator (tPA) isoform 1 <400> 193 Met Asp Ala Met Lys Arg Gly Leu Cys Cys Val Leu Leu Leu Cys Gly 1 5 10 15 Ala Val Phe Val Ser Pro Ser Gln Glu Ile His Ala Arg Phe Arg Arg 20 25 30 Gly Ala Arg Ser Tyr Gln Val Ile Cys Arg Asp Glu Lys Thr Gln Met 35 40 45 Ile Tyr Gln Gln His Gln Ser Trp Leu Arg Pro Val Leu Arg Ser Asn 50 55 60 Arg Val Glu Tyr Cys Trp Cys Asn Ser Gly Arg Ala Gln Cys His Ser 65 70 75 80 Val Pro Val Lys Ser Cys Ser Glu Pro Arg Cys Phe Asn Gly Gly Thr 85 90 95 Cys Gln Gln Ala Leu Tyr Phe Ser Asp Phe Val Cys Gln Cys Pro Glu 100 105 110 Gly Phe Ala Gly Lys Cys Cys Glu Ile Asp Thr Arg Ala Thr Cys Tyr 115 120 125 Glu Asp Gln Gly Ile Ser Tyr Arg Gly Thr Trp Ser Thr Ala Glu Ser 130 135 140 Gly Ala Glu Cys Thr Asn Trp Asn Ser Ser Ala Leu Ala Gln Lys Pro 145 150 155 160 Tyr Ser Gly Arg Arg Pro Asp Ala Ile Arg Leu Gly Leu Gly Asn His 165 170 175 Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Arg Asp Ser Lys Pro Trp Cys Tyr Val 180 185 190 Phe Lys Ala Gly Lys Tyr Ser Ser Glu Phe Cys Ser Thr Pro Ala Cys 195 200 205 Ser Glu Gly Asn Ser Asp Cys Tyr Phe Gly Asn Gly Ser Ala Tyr Arg 210 215 220 Gly Thr His Ser Leu Thr Glu Ser Gly Ala Ser Cys Leu Pro Trp Asn 225 230 235 240 Ser Met Ile Leu Ile Gly Lys Val Tyr Thr Ala Gln Asn Pro Ser Ala 245 250 255 Gln Ala Leu Gly Leu Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Gly 260 265 270 Asp Ala Lys Pro Trp Cys His Val Leu Lys Asn Arg Arg Leu Thr Trp 275 280 285 Glu Tyr Cys Asp Val Pro Ser Cys Ser Thr Cys Gly Leu Arg Gln Tyr 290 295 300 Ser Gln Pro Gln Phe Arg Ile Lys Gly Gly Leu Phe Ala Asp Ile Ala 305 310 315 320 Ser His Pro Trp Gln Ala Ala Ile Phe Ala Lys His Arg Arg Ser Pro 325 330 335 Gly Glu Arg Phe Leu Cys Gly Gly Ile Leu Ile Ser Ser Cys Trp Ile 340 345 350 Leu Ser Ala Ala His Cys Phe Gln Glu Arg Phe Pro Pro His His Leu 355 360 365 Thr Val Ile Leu Gly Arg Thr Tyr Arg Val Val Pro Gly Glu Glu Glu 370 375 380 Gln Lys Phe Glu Val Glu Lys Tyr Ile Val His Lys Glu Phe Asp Asp 385 390 395 400 Asp Thr Tyr Asp Asn Asp Ile Ala Leu Leu Gln Leu Lys Ser Asp Ser 405 410 415 Ser Arg Cys Ala Gln Glu Ser Ser Val Val Arg Thr Val Cys Leu Pro 420 425 430 Pro Ala Asp Leu Gln Leu Pro Asp Trp Thr Glu Cys Glu Leu Ser Gly 435 440 445 Tyr Gly Lys His Glu Ala Leu Ser Pro Phe Tyr Ser Glu Arg Leu Lys 450 455 460 Glu Ala His Val Arg Leu Tyr Pro Ser Ser Arg Cys Thr Ser Gln His 465 470 475 480 Leu Leu Asn Arg Thr Val Thr Asp Asn Met Leu Cys Ala Gly Asp Thr 485 490 495 Arg Ser Gly Gly Pro Gln Ala Asn Leu His Asp Ala Cys Gln Gly Asp 500 505 510 Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Leu Asn Asp Gly Arg Met Thr Leu Val 515 520 525 Gly Ile Ile Ser Trp Gly Leu Gly Cys Gly Gln Lys Asp Val Pro Gly 530 535 540 Val Tyr Thr Lys Val Thr Asn Tyr Leu Asp Trp Ile Arg Asp Asn Met 545 550 555 560 Arg Pro <210> 194 <211> 2160 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> t-plasminogen activator (tPA) transcript variant 2 <400> 194 atggccctgt ccactgagca tcctcccgcc acacagaaac ccgcccagcc ggggccaccg 60 accccacccc ctgcctggaa acttaaggag gccggagctg tggggagctc agagctgaga 120 tcctacagga gtccagggct ggagagaaaa cctctgcgag gaaagggaag gagcaagccg 180 tgaatttaag ggacgctgtg aagcaatcat ggatgcaatg aagagagggc tctgctgtgt 240 gctgctgctg tgtggagcag tcttcgtttc gcccagccag gaaatccatg cccgattcag 300 aagaggagcc agatcttacc aagtgatctg cagagatgaa aaaacgcaga tgatatacca 360 gcaacatcag tcatggctgc gccctgtgct cagaagcaac cgggtggaat attgctggtg 420 caacagtggc agggcacagt gccactcagt gcctgtcaaa agttgcagcg agccaaggtg 480 tttcaacggg ggcacctgcc agcaggccct gtacttctca gatttcgtgt gccagtgccc 540 cgaaggattt gctgggaagt gctgtgaaat agataccagg gccacgtgct acgaggacca 600 gggcatcagc tacaggggca cgtggagcac agcggagagt ggcgccgagt gcaccaactg 660 gaacagcagc gcgttggccc agaagcccta cagcgggcgg aggccagacg ccatcaggct 720 gggcctgggg aaccacaact actgcagaaa cccagatcga gactcaaagc cctggtgcta 780 cgtctttaag gcggggaagt acagctcaga gttctgcagc acccctgcct gctctgaggg 840 aaacagtgac tgctactttg ggaatgggtc agcctaccgt ggcacgcaca gcctcaccga 900 gtcgggtgcc tcctgcctcc cgtggaattc catgatcctg ataggcaagg tttacacagc 960 acagaacccc agtgcccagg cactgggcct gggcaaacat aattactgcc ggactggacg 1020 gagtgtgagc tctccggcta cggcaagcat gaggccttgt ctcctttcta ttcggagcgg 1080 ctgaaggagg ctcatgtcag actgtaccca tccagccgct gcacatcaca acatttactt 1140 aacagaacag tcaccgacaa catgctgtgt gctggagaca ctcggagcgg cgggccccag 1200 gcaaacttgc acgacgcctg ccagggcgat tcgggaggcc ccctggtgtg tctgaacgat 1260 ggccgcatga ctttggtggg catcatcagc tggggcctgg gctgtggaca gaaggatgtc 1320 ccgggtgtgt acaccaaggt taccaactac ctagactgga ttcgtgacaa catgcgaccg 1380 tgaccaggaa cacccgactc ctcaaaagca aatgagatcc cgcctcttct tcttcagaag 1440 acactgcaaa ggcgcagtgc ttctctacag acttctccag acccaccaca ccgcagaagc 1500 gggacgagac cctacaggag agggaagagt gcattttccc agatacttcc cattttggaa 1560 gttttcagga cttggtctga tttcaggata ctctgtcaga tgggaagaca tgaatgcaca 1620 ctagcctctc caggaatgcc tcctccctgg gcagaaagtg gccatgccac cctgttttca 1680 gctaaagccc aacctcctga cctgtcaccg tgagcagctt tggaaacagg accacaaaaa 1740 tgaaagcatg tctcaatagt aaaagataac aagatctttc aggaaagacg gattgcatta 1800 gaaatagaca gtatatttat agtcacaaga gcccagcagg gcctcaaagt tggggcaggc 1860 tggctggccc gtcatgttcc tcaaaagcac ccttgacgtc aagtctcctt cccctttccc 1920 cactccctgg ctctcagaag gtattccttt tgtgtacagt gtgtaaagtg taaatccttt 1980 ttctttataa actttagagt agcatgagag aattgtatca tttgaacaac taggcttcag 2040 catatttata gcaatccatg ttagttttta ctttctgttg ccacaaccct gttttatact 2100 gtacttaata aattcagata tatttttcac agtttttcca aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2160 <210> 195 <211> 291 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> t-plasminogen activator (tPA) isoform 2 <400> 195 Met Asp Ala Met Lys Arg Gly Leu Cys Cys Val Leu Leu Leu Cys Gly 1 5 10 15 Ala Val Phe Val Ser Pro Ser Gln Glu Ile His Ala Arg Phe Arg Arg 20 25 30 Gly Ala Arg Ser Tyr Gln Val Ile Cys Arg Asp Glu Lys Thr Gln Met 35 40 45 Ile Tyr Gln Gln His Gln Ser Trp Leu Arg Pro Val Leu Arg Ser Asn 50 55 60 Arg Val Glu Tyr Cys Trp Cys Asn Ser Gly Arg Ala Gln Cys His Ser 65 70 75 80 Val Pro Val Lys Ser Cys Ser Glu Pro Arg Cys Phe Asn Gly Gly Thr 85 90 95 Cys Gln Gln Ala Leu Tyr Phe Ser Asp Phe Val Cys Gln Cys Pro Glu 100 105 110 Gly Phe Ala Gly Lys Cys Cys Glu Ile Asp Thr Arg Ala Thr Cys Tyr 115 120 125 Glu Asp Gln Gly Ile Ser Tyr Arg Gly Thr Trp Ser Thr Ala Glu Ser 130 135 140 Gly Ala Glu Cys Thr Asn Trp Asn Ser Ser Ala Leu Ala Gln Lys Pro 145 150 155 160 Tyr Ser Gly Arg Arg Pro Asp Ala Ile Arg Leu Gly Leu Gly Asn His 165 170 175 Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Arg Asp Ser Lys Pro Trp Cys Tyr Val 180 185 190 Phe Lys Ala Gly Lys Tyr Ser Ser Glu Phe Cys Ser Thr Pro Ala Cys 195 200 205 Ser Glu Gly Asn Ser Asp Cys Tyr Phe Gly Asn Gly Ser Ala Tyr Arg 210 215 220 Gly Thr His Ser Leu Thr Glu Ser Gly Ala Ser Cys Leu Pro Trp Asn 225 230 235 240 Ser Met Ile Leu Ile Gly Lys Val Tyr Thr Ala Gln Asn Pro Ser Ala 245 250 255 Gln Ala Leu Gly Leu Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Thr Gly Arg Ser 260 265 270 Val Ser Ser Pro Ala Thr Ala Ser Met Arg Pro Cys Leu Leu Ser Ile 275 280 285 Arg Ser Gly 290 <210> 196 <211> 2534 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> t-plasminogen activator (tPA) transcript variant 3 <400> 196 atggccctgt ccactgagca tcctcccgcc acacagaaac ccgcccagcc ggggccaccg 60 accccacccc ctgcctggaa acttaaggag gccggagctg tggggagctc agagctgaga 120 tcctacagga gtccagggct ggagagaaaa cctctgcgag gaaagggaag gagcaagccg 180 tgaatttaag ggacgctgtg aagcaatcat ggatgcaatg aagagagggc tctgctgtgt 240 gctgctgctg tgtggagcag tcttcgtttc gcccagccag gaaatccatg cccgattcag 300 aagaggagcc agatcttacc aaggttgcag cgagccaagg tgtttcaacg ggggcacctg 360 ccagcaggcc ctgtacttct cagatttcgt gtgccagtgc cccgaaggat ttgctgggaa 420 gtgctgtgaa atagatacca gggccacgtg ctacgaggac cagggcatca gctacagggg 480 cacgtggagc acagcggaga gtggcgccga gtgcaccaac tggaacagca gcgcgttggc 540 ccagaagccc tacagcgggc ggaggccaga cgccatcagg ctgggcctgg ggaaccacaa 600 ctactgcaga aacccagatc gagactcaaa gccctggtgc tacgtcttta aggcggggaa 660 gtacagctca gagttctgca gcacccctgc ctgctctgag ggaaacagtg actgctactt 720 tgggaatggg tcagcctacc gtggcacgca cagcctcacc gagtcgggtg cctcctgcct 780 cccgtggaat tccatgatcc tgataggcaa ggtttacaca gcacagaacc ccagtgccca 840 ggcactgggc ctgggcaaac ataattactg ccggaatcct gatggggatg ccaagccctg 900 gtgccacgtg ctgaagaacc gcaggctgac gtgggagtac tgtgatgtgc cctcctgctc 960 cacctgcggc ctgagacagt acagccagcc tcagtttcgc atcaaaggag ggctcttcgc 1020 cgacatcgcc tcccacccct ggcaggctgc catctttgcc aagcacagga ggtcgcccgg 1080 agagcggttc ctgtgcgggg gcatactcat cagctcctgc tggattctct ctgccgccca 1140 ctgcttccag gagaggtttc cgccccacca cctgacggtg atcttgggca gaacataccg 1200 ggtggtccct ggcgaggagg agcagaaatt tgaagtcgaa aaatacattg tccataagga 1260 attcgatgat gacacttacg acaatgacat tgcgctgctg cagctgaaat cggattcgtc 1320 ccgctgtgcc caggagagca gcgtggtccg cactgtgtgc cttcccccgg cggacctgca 1380 gctgccggac tggacggagt gtgagctctc cggctacggc aagcatgagg ccttgtctcc 1440 tttctattcg gagcggctga aggaggctca tgtcagactg tacccatcca gccgctgcac 1500 atcacaacat ttacttaaca gaacagtcac cgacaacatg ctgtgtgctg gagacactcg 1560 gagcggcggg ccccaggcaa acttgcacga cgcctgccag ggcgattcgg gaggccccct 1620 ggtgtgtctg aacgatggcc gcatgacttt ggtgggcatc atcagctggg gcctgggctg 1680 tggacagaag gatgtcccgg gtgtgtacac caaggttacc aactacctag actggattcg 1740 tgacaacatg cgaccgtgac caggaacacc cgactcctca aaagcaaatg agatcccgcc 1800 tcttcttctt cagaagacac tgcaaaggcg cagtgcttct ctacagactt ctccagaccc 1860 accacaccgc agaagcggga cgagacccta caggagaggg aagagtgcat tttcccagat 1920 acttcccatt ttggaagttt tcaggacttg gtctgatttc aggatactct gtcagatggg 1980 aagacatgaa tgcacactag cctctccagg aatgcctcct ccctgggcag aaagtggcca 2040 tgccaccctg ttttcagcta aagcccaacc tcctgacctg tcaccgtgag cagctttgga 2100 aacaggacca caaaaatgaa agcatgtctc aatagtaaaa gataacaaga tctttcagga 2160 aagacggatt gcattagaaa tagacagtat atttatagtc acaagagccc agcagggcct 2220 caaagttggg gcaggctggc tggcccgtca tgttcctcaa aagcaccctt gacgtcaagt 2280 ctccttcccc tttccccact ccctggctct cagaaggtat tccttttgtg tacagtgtgt 2340 aaagtgtaaa tcctttttct ttataaactt tagagtagca tgagagaatt gtatcatttg 2400 aacaactagg cttcagcata tttatagcaa tccatgttag tttttacttt ctgttgccac 2460 aaccctgttt tatactgtac ttaataaatt cagatatatt tttcacagtt tttccaaaaa 2520 aaaaaaaaaa aaaa 2534 <210> 197 <211> 516 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> t-plasminogen activator (tPA) isoform 3 <400> 197 Met Asp Ala Met Lys Arg Gly Leu Cys Cys Val Leu Leu Leu Cys Gly 1 5 10 15 Ala Val Phe Val Ser Pro Ser Gln Glu Ile His Ala Arg Phe Arg Arg 20 25 30 Gly Ala Arg Ser Tyr Gln Gly Cys Ser Glu Pro Arg Cys Phe Asn Gly 35 40 45 Gly Thr Cys Gln Gln Ala Leu Tyr Phe Ser Asp Phe Val Cys Gln Cys 50 55 60 Pro Glu Gly Phe Ala Gly Lys Cys Cys Glu Ile Asp Thr Arg Ala Thr 65 70 75 80 Cys Tyr Glu Asp Gln Gly Ile Ser Tyr Arg Gly Thr Trp Ser Thr Ala 85 90 95 Glu Ser Gly Ala Glu Cys Thr Asn Trp Asn Ser Ser Ala Leu Ala Gln 100 105 110 Lys Pro Tyr Ser Gly Arg Arg Pro Asp Ala Ile Arg Leu Gly Leu Gly 115 120 125 Asn His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Arg Asp Ser Lys Pro Trp Cys 130 135 140 Tyr Val Phe Lys Ala Gly Lys Tyr Ser Ser Glu Phe Cys Ser Thr Pro 145 150 155 160 Ala Cys Ser Glu Gly Asn Ser Asp Cys Tyr Phe Gly Asn Gly Ser Ala 165 170 175 Tyr Arg Gly Thr His Ser Leu Thr Glu Ser Gly Ala Ser Cys Leu Pro 180 185 190 Trp Asn Ser Met Ile Leu Ile Gly Lys Val Tyr Thr Ala Gln Asn Pro 195 200 205 Ser Ala Gln Ala Leu Gly Leu Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro 210 215 220 Asp Gly Asp Ala Lys Pro Trp Cys His Val Leu Lys Asn Arg Arg Leu 225 230 235 240 Thr Trp Glu Tyr Cys Asp Val Pro Ser Cys Ser Thr Cys Gly Leu Arg 245 250 255 Gln Tyr Ser Gln Pro Gln Phe Arg Ile Lys Gly Gly Leu Phe Ala Asp 260 265 270 Ile Ala Ser His Pro Trp Gln Ala Ala Ile Phe Ala Lys His Arg Arg 275 280 285 Ser Pro Gly Glu Arg Phe Leu Cys Gly Gly Ile Leu Ile Ser Ser Cys 290 295 300 Trp Ile Leu Ser Ala Ala His Cys Phe Gln Glu Arg Phe Pro Pro His 305 310 315 320 His Leu Thr Val Ile Leu Gly Arg Thr Tyr Arg Val Val Pro Gly Glu 325 330 335 Glu Glu Gln Lys Phe Glu Val Glu Lys Tyr Ile Val His Lys Glu Phe 340 345 350 Asp Asp Asp Thr Tyr Asp Asn Asp Ile Ala Leu Leu Gln Leu Lys Ser 355 360 365 Asp Ser Ser Arg Cys Ala Gln Glu Ser Ser Val Val Arg Thr Val Cys 370 375 380 Leu Pro Pro Ala Asp Leu Gln Leu Pro Asp Trp Thr Glu Cys Glu Leu 385 390 395 400 Ser Gly Tyr Gly Lys His Glu Ala Leu Ser Pro Phe Tyr Ser Glu Arg 405 410 415 Leu Lys Glu Ala His Val Arg Leu Tyr Pro Ser Ser Arg Cys Thr Ser 420 425 430 Gln His Leu Leu Asn Arg Thr Val Thr Asp Asn Met Leu Cys Ala Gly 435 440 445 Asp Thr Arg Ser Gly Gly Pro Gln Ala Asn Leu His Asp Ala Cys Gln 450 455 460 Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Leu Asn Asp Gly Arg Met Thr 465 470 475 480 Leu Val Gly Ile Ile Ser Trp Gly Leu Gly Cys Gly Gln Lys Asp Val 485 490 495 Pro Gly Val Tyr Thr Lys Val Thr Asn Tyr Leu Asp Trp Ile Arg Asp 500 505 510 Asn Met Arg Pro 515 <210> 198 <211> 2732 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Plasmin <400> 198 aacaacatcc tgggattggg acccactttc tgggcactgc tggccagtcc caaaatggaa 60 cataaggaag tggttcttct acttctttta tttctgaaat caggtcaagg agagcctctg 120 gatgactatg tgaataccca gggggcttca ctgttcagtg tcactaagaa gcagctggga 180 gcaggaagta tagaagaatg tgcagcaaaa tgtgaggagg acgaagaatt cacctgcagg 240 gcattccaat atcacagtaa agagcaacaa tgtgtgataa tggctgaaaa caggaagtcc 300 tccataatca ttaggatgag agatgtagtt ttatttgaaa agaaagtgta tctctcagag 360 tgcaagactg ggaatggaaa gaactacaga gggacgatgt ccaaaacaaa aaatggcatc 420 acctgtcaaa aatggagttc cacttctccc cacagaccta gattctcacc tgctacacac 480 ccctcagagg gactggagga gaactactgc aggaatccag acaacgatcc gcaggggccc 540 tggtgctata ctactgatcc agaaaagaga tatgactact gcgacattct tgagtgtgaa 600 gaggaatgta tgcattgcag tggagaaaac tatgacggca aaatttccaa gaccatgtct 660 ggactggaat gccaggcctg ggactctcag agcccacacg ctcatggata cattccttcc 720 aaatttccaa acaagaacct gaagaagaat tactgtcgta accccgatag ggagctgcgg 780 ccttggtgtt tcaccaccga ccccaacaag cgctgggaac tttgcgacat cccccgctgc 840 acaacacctc caccatcttc tggtcccacc taccagtgtc tgaagggaac aggtgaaaac 900 tatcgcggga atgtggctgt taccgtttcc gggcacacct gtcagcactg gagtgcacag 960 acccctcaca cacataacag gacaccagaa aacttcccct gcaaaaattt ggatgaaaac 1020 tactgccgca atcctgacgg aaaaagggcc ccatggtgcc atacaaccaa cagccaagtg 1080 cggtgggagt actgtaagat accgtcctgt gactcctccc cagtatccac ggaacaattg 1140 gctcccacag caccacctga gctaacccct gtggtccagg actgctacca tggtgatgga 1200 cagagctacc gaggcacatc ctccaccacc accacaggaa agaagtgtca gtcttggtca 1260 tctatgacac cacaccggca ccagaagacc ccagaaaact acccaaatgc tggcctgaca 1320 atgaactact gcaggaatcc agatgccgat aaaggcccct ggtgttttac cacagacccc 1380 agcgtcaggt gggagtactg caacctgaaa aaatgctcag gaacagaagc gagtgttgta 1440 gcacctccgc ctgttgtcct gcttccagat gtagagactc cttccgaaga agactgtatg 1500 tttgggaatg ggaaaggata ccgaggcaag agggcgacca ctgttactgg gacgccatgc 1560 caggactggg ctgcccagga gccccataga cacagcattt tcactccaga gacaaatcca 1620 cgggcgggtc tggaaaaaaa ttactgccgt aaccctgatg gtgatgtagg tggtccctgg 1680 tgctacacga caaatccaag aaaactttac gactactgtg atgtccctca gtgtgcggcc 1740 ccttcatttg attgtgggaa gcctcaagtg gagccgaaga aatgtcctgg aagggttgtg 1800 ggggggtgtg tggcccaccc acattcctgg ccctggcaag tcagtcttag aacaaggttt 1860 ggaatgcact tctgtggagg caccttgata tccccagagt gggtgttgac tgctgcccac 1920 tgcttggaga agtccccaag gccttcatcc tacaaggtca tcctgggtgc acaccaagaa 1980 gtgaatctcg aaccgcatgt tcaggaaata gaagtgtcta ggctgttctt ggagcccaca 2040 cgaaaagata ttgccttgct aaagctaagc agtcctgccg tcatcactga caaagtaatc 2100 ccagcttgtc tgccatcccc aaattatgtg gtcgctgacc ggaccgaatg tttcatcact 2160 ggctggggag aaacccaagg tacttttgga gctggccttc tcaaggaagc ccagctccct 2220 gtgattgaga ataaagtgtg caatcgctat gagtttctga atggaagagt ccaatccacc 2280 gaactctgtg ctgggcattt ggccggaggc actgacagtt gccagggtga cagtggaggt 2340 cctctggttt gcttcgagaa ggacaaatac attttacaag gagtcacttc ttggggtctt 2400 ggctgtgcac gccccaataa gcctggtgtc tatgttcgtg tttcaaggtt tgttacttgg 2460 attgagggag tgatgagaaa taattaattg gacgggagac agagtgacgc actgactcac 2520 ctagaggctg ggacgtgggt agggatttag catgctggaa ataactggca gtaatcaaac 2580 gaagacactg tccccagcta ccagctacgc caaacctcgg cattttttgt gttattttct 2640 gactgctgga ttctgtagta aggtgacata gctatgacat ttgttaaaaa taaactctgt 2700 acttaacttt gatttgagta aattttggtt tt 2732 <210> 199 <211> 810 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Plasmin <400> 199 Met Glu His Lys Glu Val Val Leu Leu Leu Leu Leu Phe Leu Lys Ser 1 5 10 15 Gly Gln Gly Glu Pro Leu Asp Asp Tyr Val Asn Thr Gln Gly Ala Ser 20 25 30 Leu Phe Ser Val Thr Lys Lys Gln Leu Gly Ala Gly Ser Ile Glu Glu 35 40 45 Cys Ala Ala Lys Cys Glu Glu Asp Glu Glu Phe Thr Cys Arg Ala Phe 50 55 60 Gln Tyr His Ser Lys Glu Gln Gln Cys Val Ile Met Ala Glu Asn Arg 65 70 75 80 Lys Ser Ser Ile Ile Ile Arg Met Arg Asp Val Val Leu Phe Glu Lys 85 90 95 Lys Val Tyr Leu Ser Glu Cys Lys Thr Gly Asn Gly Lys Asn Tyr Arg 100 105 110 Gly Thr Met Ser Lys Thr Lys Asn Gly Ile Thr Cys Gln Lys Trp Ser 115 120 125 Ser Thr Ser Pro His Arg Pro Arg Phe Ser Pro Ala Thr His Pro Ser 130 135 140 Glu Gly Leu Glu Glu Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Asp Pro Gln 145 150 155 160 Gly Pro Trp Cys Tyr Thr Thr Asp Pro Glu Lys Arg Tyr Asp Tyr Cys 165 170 175 Asp Ile Leu Glu Cys Glu Glu Glu Cys Met His Cys Ser Gly Glu Asn 180 185 190 Tyr Asp Gly Lys Ile Ser Lys Thr Met Ser Gly Leu Glu Cys Gln Ala 195 200 205 Trp Asp Ser Gln Ser Pro His Ala His Gly Tyr Ile Pro Ser Lys Phe 210 215 220 Pro Asn Lys Asn Leu Lys Lys Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Arg Glu 225 230 235 240 Leu Arg Pro Trp Cys Phe Thr Thr Asp Pro Asn Lys Arg Trp Glu Leu 245 250 255 Cys Asp Ile Pro Arg Cys Thr Thr Pro Pro Pro Ser Ser Gly Pro Thr 260 265 270 Tyr Gln Cys Leu Lys Gly Thr Gly Glu Asn Tyr Arg Gly Asn Val Ala 275 280 285 Val Thr Val Ser Gly His Thr Cys Gln His Trp Ser Ala Gln Thr Pro 290 295 300 His Thr His Asn Arg Thr Pro Glu Asn Phe Pro Cys Lys Asn Leu Asp 305 310 315 320 Glu Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Gly Lys Arg Ala Pro Trp Cys His 325 330 335 Thr Thr Asn Ser Gln Val Arg Trp Glu Tyr Cys Lys Ile Pro Ser Cys 340 345 350 Asp Ser Ser Pro Val Ser Thr Glu Gln Leu Ala Pro Thr Ala Pro Pro 355 360 365 Glu Leu Thr Pro Val Val Gln Asp Cys Tyr His Gly Asp Gly Gln Ser 370 375 380 Tyr Arg Gly Thr Ser Ser Thr Thr Thr Thr Gly Lys Lys Cys Gln Ser 385 390 395 400 Trp Ser Ser Met Thr Pro His Arg His Gln Lys Thr Pro Glu Asn Tyr 405 410 415 Pro Asn Ala Gly Leu Thr Met Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Ala Asp 420 425 430 Lys Gly Pro Trp Cys Phe Thr Thr Asp Pro Ser Val Arg Trp Glu Tyr 435 440 445 Cys Asn Leu Lys Lys Cys Ser Gly Thr Glu Ala Ser Val Val Ala Pro 450 455 460 Pro Pro Val Val Leu Leu Pro Asp Val Glu Thr Pro Ser Glu Glu Asp 465 470 475 480 Cys Met Phe Gly Asn Gly Lys Gly Tyr Arg Gly Lys Arg Ala Thr Thr 485 490 495 Val Thr Gly Thr Pro Cys Gln Asp Trp Ala Ala Gln Glu Pro His Arg 500 505 510 His Ser Ile Phe Thr Pro Glu Thr Asn Pro Arg Ala Gly Leu Glu Lys 515 520 525 Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Gly Asp Val Gly Gly Pro Trp Cys Tyr 530 535 540 Thr Thr Asn Pro Arg Lys Leu Tyr Asp Tyr Cys Asp Val Pro Gln Cys 545 550 555 560 Ala Ala Pro Ser Phe Asp Cys Gly Lys Pro Gln Val Glu Pro Lys Lys 565 570 575 Cys Pro Gly Arg Val Val Gly Gly Cys Val Ala His Pro His Ser Trp 580 585 590 Pro Trp Gln Val Ser Leu Arg Thr Arg Phe Gly Met His Phe Cys Gly 595 600 605 Gly Thr Leu Ile Ser Pro Glu Trp Val Leu Thr Ala Ala His Cys Leu 610 615 620 Glu Lys Ser Pro Arg Pro Ser Ser Tyr Lys Val Ile Leu Gly Ala His 625 630 635 640 Gln Glu Val Asn Leu Glu Pro His Val Gln Glu Ile Glu Val Ser Arg 645 650 655 Leu Phe Leu Glu Pro Thr Arg Lys Asp Ile Ala Leu Leu Lys Leu Ser 660 665 670 Ser Pro Ala Val Ile Thr Asp Lys Val Ile Pro Ala Cys Leu Pro Ser 675 680 685 Pro Asn Tyr Val Val Ala Asp Arg Thr Glu Cys Phe Ile Thr Gly Trp 690 695 700 Gly Glu Thr Gln Gly Thr Phe Gly Ala Gly Leu Leu Lys Glu Ala Gln 705 710 715 720 Leu Pro Val Ile Glu Asn Lys Val Cys Asn Arg Tyr Glu Phe Leu Asn 725 730 735 Gly Arg Val Gln Ser Thr Glu Leu Cys Ala Gly His Leu Ala Gly Gly 740 745 750 Thr Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Phe Glu 755 760 765 Lys Asp Lys Tyr Ile Leu Gln Gly Val Thr Ser Trp Gly Leu Gly Cys 770 775 780 Ala Arg Pro Asn Lys Pro Gly Val Tyr Val Arg Val Ser Arg Phe Val 785 790 795 800 Thr Trp Ile Glu Gly Val Met Arg Asn Asn 805 810 <210> 200 <211> 1527 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Neurosin transcript variant A <400> 200 ggcggacaaa gcccgattgt tcctgggccc tttccccatc gcgcctgggc ctgctcccca 60 gcccggggca ggggcggggg ccagtgtggt gacacacgct gtagctgtct ccccggctgg 120 ctggctcgct ctctcctggg gacacagagg tcggcaggca gcacacagag ggacctacgg 180 gcagctgttc cttcccccga ctcaagaatc cccggaggcc cggaggcctg cagcaggagc 240 ggccatgaag aagctgatgg tggtgctgag tctgattgct gcagcctggg cagaggagca 300 gaataagttg gtgcatggcg gaccctgcga caagacatct cacccctacc aagctgccct 360 ctacacctcg ggccacttgc tctgtggtgg ggtccttatc catccactgt gggtcctcac 420 agctgcccac tgcaaaaaac cgaatcttca ggtcttcctg gggaagcata accttcggca 480 aagggagagt tcccaggagc agagttctgt tgtccgggct gtgatccacc ctgactatga 540 tgccgccagc catgaccagg acatcatgct gttgcgcctg gcacgcccag ccaaactctc 600 tgaactcatc cagccccttc ccctggagag ggactgctca gccaacacca ccagctgcca 660 catcctgggc tggggcaaga cagcagatgg tgatttccct gacaccatcc agtgtgcata 720 catccacctg gtgtcccgtg aggagtgtga gcatgcctac cctggccaga tcacccagaa 780 catgttgtgt gctggggatg agaagtacgg gaaggattcc tgccagggtg attctggggg 840 tccgctggta tgtggagacc acctccgagg ccttgtgtca tggggtaaca tcccctgtgg 900 atcaaaggag aagccaggag tctacaccaa cgtctgcaga tacacgaact ggatccaaaa 960 aaccattcag gccaagtgac cctgacatgt gacatctacc tcccgaccta ccaccccact 1020 ggctggttcc agaacgtctc tcacctagac cttgcctccc ctcctctcct gcccagctct 1080 gaccctgatg cttaataaac gcagcgacgt gagggtcctg attctccctg gttttacccc 1140 agctccatcc ttgcatcact ggggaggacg tgatgagtga ggacttgggt cctcggtctt 1200 acccccacca ctaagagaat acaggaaaat cccttctagg catctcctct ccccaaccct 1260 tccacacgtt tgatttcttc ctgcagaggc ccagccacgt gtctggaatc ccagctccgc 1320 tgcttactgt cggtgtcccc ttgggatgta cctttcttca ctgcagattt ctcacctgta 1380 agatgaagat aaggatgata cagtctccat aaggcagtgg ctgttggaaa gatttaaggt 1440 ttcacaccta tgacatacat ggaatagcac ctgggccacc atgcactcaa taaagaatga 1500 attttattat gaaaaaaaaa aaaaaaa 1527 <210> 201 <211> 244 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Neurosin isoform A <400> 201 Met Lys Lys Leu Met Val Val Leu Ser Leu Ile Ala Ala Ala Trp Ala 1 5 10 15 Glu Glu Gln Asn Lys Leu Val His Gly Gly Pro Cys Asp Lys Thr Ser 20 25 30 His Pro Tyr Gln Ala Ala Leu Tyr Thr Ser Gly His Leu Leu Cys Gly 35 40 45 Gly Val Leu Ile His Pro Leu Trp Val Leu Thr Ala Ala His Cys Lys 50 55 60 Lys Pro Asn Leu Gln Val Phe Leu Gly Lys His Asn Leu Arg Gln Arg 65 70 75 80 Glu Ser Ser Gln Glu Gln Ser Ser Val Val Arg Ala Val Ile His Pro 85 90 95 Asp Tyr Asp Ala Ala Ser His Asp Gln Asp Ile Met Leu Leu Arg Leu 100 105 110 Ala Arg Pro Ala Lys Leu Ser Glu Leu Ile Gln Pro Leu Pro Leu Glu 115 120 125 Arg Asp Cys Ser Ala Asn Thr Thr Ser Cys His Ile Leu Gly Trp Gly 130 135 140 Lys Thr Ala Asp Gly Asp Phe Pro Asp Thr Ile Gln Cys Ala Tyr Ile 145 150 155 160 His Leu Val Ser Arg Glu Glu Cys Glu His Ala Tyr Pro Gly Gln Ile 165 170 175 Thr Gln Asn Met Leu Cys Ala Gly Asp Glu Lys Tyr Gly Lys Asp Ser 180 185 190 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Gly Asp His Leu Arg 195 200 205 Gly Leu Val Ser Trp Gly Asn Ile Pro Cys Gly Ser Lys Glu Lys Pro 210 215 220 Gly Val Tyr Thr Asn Val Cys Arg Tyr Thr Asn Trp Ile Gln Lys Thr 225 230 235 240 Ile Gln Ala Lys <210> 202 <211> 1527 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Neurosin transcript variant B <400> 202 aggacgttcc agaagcatct ggggacagaa ccagcctctt ccagggaggc ctgggagctg 60 ggggtgtgtg tctggcagtc cctgcagccc tgggctctgc ggcccctgcg tcctccgctt 120 ggctctgcca ctgcatctga gtgtcttctc tcctcacggc tccccgcatt tctaactctt 180 tctgcctcct cgtctcaaag ctgttccttc ccccgactca agaatccccg gaggcccgga 240 ggcctgcagc aggagcggcc atgaagaagc tgatggtggt gctgagtctg attgctgcag 300 cctgggcaga ggagcagaat aagttggtgc atggcggacc ctgcgacaag acatctcacc 360 cctaccaagc tgccctctac acctcgggcc acttgctctg tggtggggtc cttatccatc 420 cactgtgggt cctcacagct gcccactgca aaaaaccgaa tcttcaggtc ttcctgggga 480 agcataacct tcggcaaagg gagagttccc aggagcagag ttctgttgtc cgggctgtga 540 tccaccctga ctatgatgcc gccagccatg accaggacat catgctgttg cgcctggcac 600 gcccagccaa actctctgaa ctcatccagc cccttcccct ggagagggac tgctcagcca 660 acaccaccag ctgccacatc ctgggctggg gcaagacagc agatggtgat ttccctgaca 720 ccatccagtg tgcatacatc cacctggtgt cccgtgagga gtgtgagcat gcctaccctg 780 gccagatcac ccagaacatg ttgtgtgctg gggatgagaa gtacgggaag gattcctgcc 840 agggtgattc tgggggtccg ctggtatgtg gagaccacct ccgaggcctt gtgtcatggg 900 gtaacatccc ctgtggatca aaggagaagc caggagtcta caccaacgtc tgcagataca 960 cgaactggat ccaaaaaacc attcaggcca agtgaccctg acatgtgaca tctacctccc 1020 gacctaccac cccactggct ggttccagaa cgtctctcac ctagaccttg cctcccctcc 1080 tctcctgccc agctctgacc ctgatgctta ataaacgcag cgacgtgagg gtcctgattc 1140 tccctggttt taccccagct ccatccttgc atcactgggg aggacgtgat gagtgaggac 1200 ttgggtcctc ggtcttaccc ccaccactaa gagaatacag gaaaatccct tctaggcatc 1260 tcctctcccc aacccttcca cacgtttgat ttcttcctgc agaggcccag ccacgtgtct 1320 ggaatcccag ctccgctgct tactgtcggt gtccccttgg gatgtacctt tcttcactgc 1380 agatttctca cctgtaagat gaagataagg atgatacagt ctccataagg cagtggctgt 1440 tggaaagatt taaggtttca cacctatgac atacatggaa tagcacctgg gccaccatgc 1500 actcaataaa gaatgaattt tattatg 1527 <210> 203 <211> 244 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Neurosin isoform A preprotein <400> 203 Met Lys Lys Leu Met Val Val Leu Ser Leu Ile Ala Ala Ala Trp Ala 1 5 10 15 Glu Glu Gln Asn Lys Leu Val His Gly Gly Pro Cys Asp Lys Thr Ser 20 25 30 His Pro Tyr Gln Ala Ala Leu Tyr Thr Ser Gly His Leu Leu Cys Gly 35 40 45 Gly Val Leu Ile His Pro Leu Trp Val Leu Thr Ala Ala His Cys Lys 50 55 60 Lys Pro Asn Leu Gln Val Phe Leu Gly Lys His Asn Leu Arg Gln Arg 65 70 75 80 Glu Ser Ser Gln Glu Gln Ser Ser Val Val Arg Ala Val Ile His Pro 85 90 95 Asp Tyr Asp Ala Ala Ser His Asp Gln Asp Ile Met Leu Leu Arg Leu 100 105 110 Ala Arg Pro Ala Lys Leu Ser Glu Leu Ile Gln Pro Leu Pro Leu Glu 115 120 125 Arg Asp Cys Ser Ala Asn Thr Thr Ser Cys His Ile Leu Gly Trp Gly 130 135 140 Lys Thr Ala Asp Gly Asp Phe Pro Asp Thr Ile Gln Cys Ala Tyr Ile 145 150 155 160 His Leu Val Ser Arg Glu Glu Cys Glu His Ala Tyr Pro Gly Gln Ile 165 170 175 Thr Gln Asn Met Leu Cys Ala Gly Asp Glu Lys Tyr Gly Lys Asp Ser 180 185 190 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Gly Asp His Leu Arg 195 200 205 Gly Leu Val Ser Trp Gly Asn Ile Pro Cys Gly Ser Lys Glu Lys Pro 210 215 220 Gly Val Tyr Thr Asn Val Cys Arg Tyr Thr Asn Trp Ile Gln Lys Thr 225 230 235 240 Ile Gln Ala Lys <210> 204 <211> 1495 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Neurosin transcript variant C <400> 204 aggacgttcc agaagcatct ggggacagaa ccagcctctt ccagggaggc ctgggagctg 60 ggggtgtgtg tctggcagtc cctgcagccc tgggctctgc ggcccctgcg tcctccgctt 120 ggctctgcca ctgcatctga gtgtcttctc tcctcacggc tccccgcatt tctaactctt 180 tctgcctcct cgtctcaaag ctgttccttc ccccgactca agaatccccg gaggcccgga 240 ggcctgcagc agcctgggca gaggagcaga ataagttggt gcatggcgga ccctgcgaca 300 agacatctca cccctaccaa gctgccctct acacctcggg ccacttgctc tgtggtgggg 360 tccttatcca tccactgtgg gtcctcacag ctgcccactg caaaaaaccg aatcttcagg 420 tcttcctggg gaagcataac cttcggcaaa gggagagttc ccaggagcag agttctgttg 480 tccgggctgt gatccaccct gactatgatg ccgccagcca tgaccaggac atcatgctgt 540 tgcgcctggc acgcccagcc aaactctctg aactcatcca gccccttccc ctggagaggg 600 actgctcagc caacaccacc agctgccaca tcctgggctg gggcaagaca gcagatggtg 660 atttccctga caccatccag tgtgcataca tccacctggt gtcccgtgag gagtgtgagc 720 atgcctaccc tggccagatc acccagaaca tgttgtgtgc tggggatgag aagtacggga 780 aggattcctg ccagggtgat tctgggggtc cgctggtatg tggagaccac ctccgaggcc 840 ttgtgtcatg gggtaacatc ccctgtggat caaaggagaa gccaggagtc tacaccaacg 900 tctgcagata cacgaactgg atccaaaaaa ccattcaggc caagtgaccc tgacatgtga 960 catctacctc ccgacctacc accccactgg ctggttccag aacgtctctc acctagacct 1020 tgcctcccct cctctcctgc ccagctctga ccctgatgct taataaacgc agcgacgtga 1080 gggtcctgat tctccctggt tttaccccag ctccatcctt gcatcactgg ggaggacgtg 1140 atgagtgagg acttgggtcc tcggtcttac ccccaccact aagagaatac aggaaaatcc 1200 cttctaggca tctcctctcc ccaacccttc cacacgtttg atttcttcct gcagaggccc 1260 agccacgtgt ctggaatccc agctccgctg cttactgtcg gtgtcccctt gggatgtacc 1320 tttcttcact gcagatttct cacctgtaag atgaagataa ggatgataca gtctccataa 1380 ggcagtggct gttggaaaga tttaaggttt cacacctatg acatacatgg aatagcacct 1440 gggccaccat gcactcaata aagaatgaat tttattatga aaaaaaaaaa aaaaa 1495 <210> 205 <211> 137 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Neurosin isoform B <400> 205 Met Leu Leu Arg Leu Ala Arg Pro Ala Lys Leu Ser Glu Leu Ile Gln 1 5 10 15 Pro Leu Pro Leu Glu Arg Asp Cys Ser Ala Asn Thr Thr Ser Cys His 20 25 30 Ile Leu Gly Trp Gly Lys Thr Ala Asp Gly Asp Phe Pro Asp Thr Ile 35 40 45 Gln Cys Ala Tyr Ile His Leu Val Ser Arg Glu Glu Cys Glu His Ala 50 55 60 Tyr Pro Gly Gln Ile Thr Gln Asn Met Leu Cys Ala Gly Asp Glu Lys 65 70 75 80 Tyr Gly Lys Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys 85 90 95 Gly Asp His Leu Arg Gly Leu Val Ser Trp Gly Asn Ile Pro Cys Gly 100 105 110 Ser Lys Glu Lys Pro Gly Val Tyr Thr Asn Val Cys Arg Tyr Thr Asn 115 120 125 Trp Ile Gln Lys Thr Ile Gln Ala Lys 130 135 <210> 206 <211> 1386 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Neurosin transcript variant D <400> 206 aggacgttcc agaagcatct ggggacagaa ccagcctctt ccagggaggc ctgggagctg 60 ggggtgtgtg tctggcagtc cctgcagccc tgggctctgc ggcccctgcg tcctccgctt 120 ggctctgcca ctgcatctga gtgtcttctc tcctcacggc tccccgcatt tctaactctt 180 tctgcctcct cgtctcaaag ctgttccttc ccccgactca agaatccccg gaggcccgga 240 ggcctgcagc aggagcggcc atgaagaagc tgatggtggt gctgagtctg attgctgcag 300 gaatcttcag gtcttcctgg ggaagcataa ccttcggcaa agggagagtt cccaggagca 360 gagttctgtt gtccgggctg tgatccaccc tgactatgat gccgccagcc atgaccagga 420 catcatgctg ttgcgcctgg cacgcccagc caaactctct gaactcatcc agccccttcc 480 cctggagagg gactgctcag ccaacaccac cagctgccac atcctgggct ggggcaagac 540 agcagatggt gatttccctg acaccatcca gtgtgcatac atccacctgg tgtcccgtga 600 ggagtgtgag catgcctacc ctggccagat cacccagaac atgttgtgtg ctggggatga 660 gaagtacggg aaggattcct gccagggtga ttctgggggt ccgctggtat gtggagacca 720 cctccgaggc cttgtgtcat ggggtaacat cccctgtgga tcaaaggaga agccaggagt 780 ctacaccaac gtctgcagat acacgaactg gatccaaaaa accattcagg ccaagtgacc 840 ctgacatgtg acatctacct cccgacctac caccccactg gctggttcca gaacgtctct 900 cacctagacc ttgcctcccc tcctctcctg cccagctctg accctgatgc ttaataaacg 960 cagcgacgtg agggtcctga ttctccctgg ttttacccca gctccatcct tgcatcactg 1020 gggaggacgt gatgagtgag gacttgggtc ctcggtctta cccccaccac taagagaata 1080 caggaaaatc ccttctaggc atctcctctc cccaaccctt ccacacgttt gatttcttcc 1140 tgcagaggcc cagccacgtg tctggaatcc cagctccgct gcttactgtc ggtgtcccct 1200 tgggatgtac ctttcttcac tgcagatttc tcacctgtaa gatgaagata aggatgatac 1260 agtctccata aggcagtggc tgttggaaag atttaaggtt tcacacctat gacatacatg 1320 gaatagcacc tgggccacca tgcactcaat aaagaatgaa ttttattatg aaaaaaaaaa 1380 aaaaaa 1386 <210> 207 <211> 40 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Neurosin isoform C <400> 207 Met Lys Lys Leu Met Val Val Leu Ser Leu Ile Ala Ala Gly Ile Phe 1 5 10 15 Arg Ser Ser Trp Gly Ser Ile Thr Phe Gly Lys Gly Arg Val Pro Arg 20 25 30 Ser Arg Val Leu Leu Ser Gly Leu 35 40 <210> 208 <211> 3351 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Neurotrypsin <400> 208 gcccgagaag ctggggagca tggaccagac cccgcagcgc tggcaccatg acgctcgccc 60 gcttcgtgct agccctgatg ttaggggcgc tccccgaagt ggtcggcttt gattctgtcc 120 tcaatgattc cctccaccac agccaccgcc attcgccccc tgcgggtccg cactacccct 180 attaccttcc cacccagcag cggcccccga cgacgcgtcc gccgccgcct ctcccgcgct 240 tcccgcgccc cccgcgggcg ctccctgccc agcgcccgca cgccctccag gccgggcaca 300 cgccccggcc gcacccctgg ggctgccccg ccggcgagcc atgggtcagc gtgacggact 360 tcggcgcccc gtgtctgcgg tgggcggagg tgccaccctt cctggagcgg tcgcccccag 420 cgagctgggc tcagctgcga ggacagcgcc acaacttttg tcggagcccc gacggcgcgg 480 gcagaccctg gtgtttctac ggagacgccc gtggcaaggt ggactggggc tactgcgact 540 gcagacacgg atcagtacga cttcgtggcg gcaaaaatga gtttgaaggc acagtggaag 600 tatatgcaag tggagtttgg ggcactgtct gtagcagcca ctgggatgat tctgatgcat 660 cagtcatttg tcaccagctg cagctgggag gaaaaggaat agcaaaacaa accccgtttt 720 ctggactggg ccttattccc atttattgga gcaatgtccg ttgccgagga gatgaagaaa 780 atatactgct ttgtgaaaaa gacatctggc agggtggggt gtgtcctcag aagatggcag 840 ctgctgtcac gtgtagcttt tcccatggcc caacgttccc catcattcgc cttgctggag 900 gcagcagtgt gcatgaaggc cgggtggagc tctaccatgc tggccagtgg ggaaccgttt 960 gtgatgacca atgggatgat gccgatgcag aagtgatctg caggcagctg ggcctcagtg 1020 gcattgccaa agcatggcat caggcatatt ttggggaagg gtctggccca gttatgttgg 1080 atgaagtacg ctgcactggg aatgagcttt caattgagca gtgtccaaag agctcctggg 1140 gagagcataa ctgtggccat aaagaagatg ctggagtgtc ctgtacccct ctaacagatg 1200 gggtcatcag acttgcaggt gggaaaggca gccatgaggg tcgcttggag gtatattaca 1260 gaggccagtg gggaactgtc tgtgatgatg gctggactga gctgaataca tacgtggttt 1320 gtcgacagtt gggatttaaa tatggtaaac aagcatctgc caaccatttt gaagaaagca 1380 cagggcccat atggttggat gacgtcagct gctcaggaaa ggaaaccaga tttcttcagt 1440 gttccaggcg acagtgggga aggcatgact gcagccaccg cgaagatgtt agcattgcct 1500 gctaccctgg cggcgaggga cacaggctct ctctgggttt tcctgtcaga ctgatggatg 1560 gagaaaataa gaaagaagga cgagtggagg tttttatcaa tggccagtgg ggaacaatct 1620 gtgatgatgg atggactgat aaggatgcag ctgtgatctg tcgtcagctt ggctacaagg 1680 gtcctgccag agcaagaacc atggcttact ttggagaagg aaaaggaccc atccatgtgg 1740 ataatgtgaa gtgcacagga aatgagaggt ccttggctga ctgtatcaag caagatattg 1800 gaagacacaa ctgccgccac agtgaagatg caggagttat ttgtgattat tttggcaaga 1860 aggcctcagg taacagtaat aaagagtccc tctcatctgt ttgtggcttg agattactgc 1920 accgtcggca gaagcggatc attggtggga aaaattcttt aaggggtggt tggccttggc 1980 aggtttccct ccggctgaag tcatcccatg gagatggcag gctcctctgc ggggctacgc 2040 tcctgagtag ctgctgggtc ctcacagcag cacactgttt caagaggtat ggcaacagca 2100 ctaggagcta tgctgttagg gttggagatt atcatactct ggtaccagag gagtttgagg 2160 aagaaattgg agttcaacag attgtgattc atcgggagta tcgacccgac cgcagtgatt 2220 atgacatagc cctggttaga ttacaaggac cagaagagca atgtgccaga ttcagcagcc 2280 atgttttgcc agcctgttta ccactctgga gagagaggcc acagaaaaca gcatccaact 2340 gttacataac aggatggggt gacacaggac gagcctattc aagaacacta caacaagcag 2400 ccattccctt acttcctaaa aggttttgtg aagaacgtta taagggtcgg tttacaggga 2460 gaatgctttg tgctggaaac ctccatgaac acaaacgcgt ggacagctgc cagggagaca 2520 gcggaggacc actcatgtgt gaacggcccg gagagagctg ggtggtgtat ggggtgacct 2580 cctgggggta tggctgtgga gtcaaggatt ctcctggtgt ttataccaaa gtctcagcct 2640 ttgtaccttg gataaaaagt gtcaccaaac tgtaattctt catggaaact tcaaagcagc 2700 atttaaacaa atggaaaact ttgaaccccc actattagca ctcagcagag atgacaacaa 2760 atggcaagat ctgtttttgc tttgtgttgt ggtaaaaaat tgtgtacccc ctgctgcttt 2820 tgagaaattt gtgaacattt tcagaggcct cagtgtagtg gaagtgataa tccttaaatg 2880 aacattttct accctaattt cactggagtg acttattcta agcctcatct atcccctacc 2940 tatttctcaa aatcattcta tgctgatttt acaaaagatc atttttacat ttgaactgag 3000 aacccctttt aattgaatca gtggtgtctg aaatcatatt aaatacccac atttgacata 3060 aatgcggtac cctttactac actcatgagt ggcatattta tgcttaggtc ttttcaaaag 3120 acttgacaag aaatcttcat attctctgta gcctttgtca agtgaggaaa tcagtggtta 3180 aagaattcca ctataaactt ttaggcctga ataggagtag taaagcctca aggacatctg 3240 cctgtcacaa tatattctca aagtgatctg atatttggaa acaagtatcc ttgttgagta 3300 ccaagtgcta cagaaaccat aagataaaaa tactttctac ctacagcgtg c 3351 <210> 209 <211> 875 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Neurotrypsin <400> 209 Met Thr Leu Ala Arg Phe Val Leu Ala Leu Met Leu Gly Ala Leu Pro 1 5 10 15 Glu Val Val Gly Phe Asp Ser Val Leu Asn Asp Ser Leu His His Ser 20 25 30 His Arg His Ser Pro Pro Ala Gly Pro His Tyr Pro Tyr Tyr Leu Pro 35 40 45 Thr Gln Gln Arg Pro Pro Thr Thr Arg Pro Pro Pro Pro Leu Pro Arg 50 55 60 Phe Pro Arg Pro Pro Arg Ala Leu Pro Ala Gln Arg Pro His Ala Leu 65 70 75 80 Gln Ala Gly His Thr Pro Arg Pro His Pro Trp Gly Cys Pro Ala Gly 85 90 95 Glu Pro Trp Val Ser Val Thr Asp Phe Gly Ala Pro Cys Leu Arg Trp 100 105 110 Ala Glu Val Pro Pro Phe Leu Glu Arg Ser Pro Pro Ala Ser Trp Ala 115 120 125 Gln Leu Arg Gly Gln Arg His Asn Phe Cys Arg Ser Pro Asp Gly Ala 130 135 140 Gly Arg Pro Trp Cys Phe Tyr Gly Asp Ala Arg Gly Lys Val Asp Trp 145 150 155 160 Gly Tyr Cys Asp Cys Arg His Gly Ser Val Arg Leu Arg Gly Gly Lys 165 170 175 Asn Glu Phe Glu Gly Thr Val Glu Val Tyr Ala Ser Gly Val Trp Gly 180 185 190 Thr Val Cys Ser Ser His Trp Asp Asp Ser Asp Ala Ser Val Ile Cys 195 200 205 His Gln Leu Gln Leu Gly Gly Lys Gly Ile Ala Lys Gln Thr Pro Phe 210 215 220 Ser Gly Leu Gly Leu Ile Pro Ile Tyr Trp Ser Asn Val Arg Cys Arg 225 230 235 240 Gly Asp Glu Glu Asn Ile Leu Leu Cys Glu Lys Asp Ile Trp Gln Gly 245 250 255 Gly Val Cys Pro Gln Lys Met Ala Ala Ala Val Thr Cys Ser Phe Ser 260 265 270 His Gly Pro Thr Phe Pro Ile Ile Arg Leu Ala Gly Gly Ser Ser Val 275 280 285 His Glu Gly Arg Val Glu Leu Tyr His Ala Gly Gln Trp Gly Thr Val 290 295 300 Cys Asp Asp Gln Trp Asp Asp Ala Asp Ala Glu Val Ile Cys Arg Gln 305 310 315 320 Leu Gly Leu Ser Gly Ile Ala Lys Ala Trp His Gln Ala Tyr Phe Gly 325 330 335 Glu Gly Ser Gly Pro Val Met Leu Asp Glu Val Arg Cys Thr Gly Asn 340 345 350 Glu Leu Ser Ile Glu Gln Cys Pro Lys Ser Ser Trp Gly Glu His Asn 355 360 365 Cys Gly His Lys Glu Asp Ala Gly Val Ser Cys Thr Pro Leu Thr Asp 370 375 380 Gly Val Ile Arg Leu Ala Gly Gly Lys Gly Ser His Glu Gly Arg Leu 385 390 395 400 Glu Val Tyr Tyr Arg Gly Gln Trp Gly Thr Val Cys Asp Asp Gly Trp 405 410 415 Thr Glu Leu Asn Thr Tyr Val Val Cys Arg Gln Leu Gly Phe Lys Tyr 420 425 430 Gly Lys Gln Ala Ser Ala Asn His Phe Glu Glu Ser Thr Gly Pro Ile 435 440 445 Trp Leu Asp Asp Val Ser Cys Ser Gly Lys Glu Thr Arg Phe Leu Gln 450 455 460 Cys Ser Arg Arg Gln Trp Gly Arg His Asp Cys Ser His Arg Glu Asp 465 470 475 480 Val Ser Ile Ala Cys Tyr Pro Gly Gly Glu Gly His Arg Leu Ser Leu 485 490 495 Gly Phe Pro Val Arg Leu Met Asp Gly Glu Asn Lys Lys Glu Gly Arg 500 505 510 Val Glu Val Phe Ile Asn Gly Gln Trp Gly Thr Ile Cys Asp Asp Gly 515 520 525 Trp Thr Asp Lys Asp Ala Ala Val Ile Cys Arg Gln Leu Gly Tyr Lys 530 535 540 Gly Pro Ala Arg Ala Arg Thr Met Ala Tyr Phe Gly Glu Gly Lys Gly 545 550 555 560 Pro Ile His Val Asp Asn Val Lys Cys Thr Gly Asn Glu Arg Ser Leu 565 570 575 Ala Asp Cys Ile Lys Gln Asp Ile Gly Arg His Asn Cys Arg His Ser 580 585 590 Glu Asp Ala Gly Val Ile Cys Asp Tyr Phe Gly Lys Lys Ala Ser Gly 595 600 605 Asn Ser Asn Lys Glu Ser Leu Ser Ser Val Cys Gly Leu Arg Leu Leu 610 615 620 His Arg Arg Gln Lys Arg Ile Ile Gly Gly Lys Asn Ser Leu Arg Gly 625 630 635 640 Gly Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu Arg Leu Lys Ser Ser His Gly Asp 645 650 655 Gly Arg Leu Leu Cys Gly Ala Thr Leu Leu Ser Ser Cys Trp Val Leu 660 665 670 Thr Ala Ala His Cys Phe Lys Arg Tyr Gly Asn Ser Thr Arg Ser Tyr 675 680 685 Ala Val Arg Val Gly Asp Tyr His Thr Leu Val Pro Glu Glu Phe Glu 690 695 700 Glu Glu Ile Gly Val Gln Gln Ile Val Ile His Arg Glu Tyr Arg Pro 705 710 715 720 Asp Arg Ser Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Val Arg Leu Gln Gly Pro Glu 725 730 735 Glu Gln Cys Ala Arg Phe Ser Ser His Val Leu Pro Ala Cys Leu Pro 740 745 750 Leu Trp Arg Glu Arg Pro Gln Lys Thr Ala Ser Asn Cys Tyr Ile Thr 755 760 765 Gly Trp Gly Asp Thr Gly Arg Ala Tyr Ser Arg Thr Leu Gln Gln Ala 770 775 780 Ala Ile Pro Leu Leu Pro Lys Arg Phe Cys Glu Glu Arg Tyr Lys Gly 785 790 795 800 Arg Phe Thr Gly Arg Met Leu Cys Ala Gly Asn Leu His Glu His Lys 805 810 815 Arg Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Met Cys Glu 820 825 830 Arg Pro Gly Glu Ser Trp Val Val Tyr Gly Val Thr Ser Trp Gly Tyr 835 840 845 Gly Cys Gly Val Lys Asp Ser Pro Gly Val Tyr Thr Lys Val Ser Ala 850 855 860 Phe Val Pro Trp Ile Lys Ser Val Thr Lys Leu 865 870 875 <210> 210 <211> 1165 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> tryptase beta 2 (I) <400> 210 agaaggaaca gggagcggcc aggatgctga atctgctgct gctggcgctg cccgtcctgg 60 cgagccgcgc ctacgcggcc cctgccccag gccaggccct gcagcgagtg ggcatcgttg 120 ggggtcagga ggcccccagg agcaagtggc cctggcaggt gagcctgaga gtccgcgacc 180 gatactggat gcacttctgc gggggctccc tcatccaccc ccagtgggtg ctgaccgcag 240 cgcactgcgt gggaccggac gtcaaggatc tggccgccct cagggtgcaa ctgcgggagc 300 agcacctcta ctaccaggac cagctgctgc cggtcagcag gatcatcgtg cacccacagt 360 tctacaccgc ccagatcgga gcggacatcg ccctgctgga gctggaggag ccggtgaacg 420 tctccagcca cgtccacacg gtcaccctgc cccctgcctc agagaccttc cccccgggga 480 tgccgtgctg ggtcactggc tggggcgatg tggacaatga tgagcgcctc ccaccgccat 540 ttcctctgaa gcaggtgaag gtccccataa tggaaaacca catttgtgac gcaaaatacc 600 accttggcgc ctacacggga gacgacgtcc gcatcgtccg tgacgacatg ctgtgtgccg 660 ggaacacccg gagggactca tgccagggcg actccggagg gcccctggtg tgcaaggtga 720 atggcacctg gctgcaggcg ggcgtggtca gctggggcga gggctgtgcc cagcccaacc 780 ggcctggcat ctacacccgt gtcacctact acttggactg gatccaccac tatgtcccca 840 aaaagccgtg agtcaggcct ggggtgtcca cctgggtcac tggagagcca gcccctcctg 900 tccaaaacac cactgcttcc tacccaggtg gcgactgccc cccacacctt ccctgccccg 960 tcctgagtgc cccttcctgt cctaagcccc ctgctctctt ctgagcccct tcccctgtcc 1020 tgaggaccct tccccatcct gagccccctt ccctgtccta agcctgacgc ctgcaccggg 1080 ccctccggcc ctcccctgcc caggcagctg gtggtgggcg ctaatcctcc tgagtgctgg 1140 acctcattaa agtgcatgga aatca 1165 <210> 211 <211> 275 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> tryptase beta 2 (I) <400> 211 Met Leu Asn Leu Leu Leu Leu Ala Leu Pro Val Leu Ala Ser Arg Ala 1 5 10 15 Tyr Ala Ala Pro Ala Pro Gly Gln Ala Leu Gln Arg Val Gly Ile Val 20 25 30 Gly Gly Gln Glu Ala Pro Arg Ser Lys Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu 35 40 45 Arg Val Arg Asp Arg Tyr Trp Met His Phe Cys Gly Gly Ser Leu Ile 50 55 60 His Pro Gln Trp Val Leu Thr Ala Ala His Cys Val Gly Pro Asp Val 65 70 75 80 Lys Asp Leu Ala Ala Leu Arg Val Gln Leu Arg Glu Gln His Leu Tyr 85 90 95 Tyr Gln Asp Gln Leu Leu Pro Val Ser Arg Ile Ile Val His Pro Gln 100 105 110 Phe Tyr Thr Ala Gln Ile Gly Ala Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu 115 120 125 Glu Pro Val Asn Val Ser Ser His Val His Thr Val Thr Leu Pro Pro 130 135 140 Ala Ser Glu Thr Phe Pro Pro Gly Met Pro Cys Trp Val Thr Gly Trp 145 150 155 160 Gly Asp Val Asp Asn Asp Glu Arg Leu Pro Pro Pro Phe Pro Leu Lys 165 170 175 Gln Val Lys Val Pro Ile Met Glu Asn His Ile Cys Asp Ala Lys Tyr 180 185 190 His Leu Gly Ala Tyr Thr Gly Asp Asp Val Arg Ile Val Arg Asp Asp 195 200 205 Met Leu Cys Ala Gly Asn Thr Arg Arg Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser 210 215 220 Gly Gly Pro Leu Val Cys Lys Val Asn Gly Thr Trp Leu Gln Ala Gly 225 230 235 240 Val Val Ser Trp Gly Glu Gly Cys Ala Gln Pro Asn Arg Pro Gly Ile 245 250 255 Tyr Thr Arg Val Thr Tyr Tyr Leu Asp Trp Ile His His Tyr Val Pro 260 265 270 Lys Lys Pro 275 <210> 212 <211> 1013 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Neuropsin transcript variant 1 <400> 212 gttcccagaa gctccccagg ctctagtgca ggaggagaag gaggaggagc aggaggtgga 60 gattcccagt taaaaggctc cagaatcgtg taccaggcag agaactgaag tactggggcc 120 tcctccactg ggtccgaatc agtaggtgac cccgcccctg gattctggaa gacctcacca 180 tgggacgccc ccgacctcgt gcggccaaga cgtggatgtt cctgctcttg ctggggggag 240 cctgggcagg acactccagg gcacaggagg acaaggtgct ggggggtcat gagtgccaac 300 cccattcgca gccttggcag gcggccttgt tccagggcca gcaactactc tgtggcggtg 360 tccttgtagg tggcaactgg gtccttacag ctgcccactg taaaaaaccg aaatacacag 420 tacgcctggg agaccacagc ctacagaata aagatggccc agagcaagaa atacctgtgg 480 ttcagtccat cccacacccc tgctacaaca gcagcgatgt ggaggaccac aaccatgatc 540 tgatgcttct tcaactgcgt gaccaggcat ccctggggtc caaagtgaag cccatcagcc 600 tggcagatca ttgcacccag cctggccaga agtgcaccgt ctcaggctgg ggcactgtca 660 ccagtccccg agagaatttt cctgacactc tcaactgtgc agaagtaaaa atctttcccc 720 agaagaagtg tgaggatgct tacccggggc agatcacaga tggcatggtc tgtgcaggca 780 gcagcaaagg ggctgacacg tgccagggcg attctggagg ccccctggtg tgtgatggtg 840 cactccaggg catcacatcc tggggctcag acccctgtgg gaggtccgac aaacctggcg 900 tctataccaa catctgccgc tacctggact ggatcaagaa gatcataggc agcaagggct 960 gattctagga taagcactag atctccctta ataaactcac aactctctgg ttc 1013 <210> 213 <211> 260 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Neuropsin isoform 1 <400> 213 Met Gly Arg Pro Arg Pro Arg Ala Ala Lys Thr Trp Met Phe Leu Leu 1 5 10 15 Leu Leu Gly Gly Ala Trp Ala Gly His Ser Arg Ala Gln Glu Asp Lys 20 25 30 Val Leu Gly Gly His Glu Cys Gln Pro His Ser Gln Pro Trp Gln Ala 35 40 45 Ala Leu Phe Gln Gly Gln Gln Leu Leu Cys Gly Gly Val Leu Val Gly 50 55 60 Gly Asn Trp Val Leu Thr Ala Ala His Cys Lys Lys Pro Lys Tyr Thr 65 70 75 80 Val Arg Leu Gly Asp His Ser Leu Gln Asn Lys Asp Gly Pro Glu Gln 85 90 95 Glu Ile Pro Val Val Gln Ser Ile Pro His Pro Cys Tyr Asn Ser Ser 100 105 110 Asp Val Glu Asp His Asn His Asp Leu Met Leu Leu Gln Leu Arg Asp 115 120 125 Gln Ala Ser Leu Gly Ser Lys Val Lys Pro Ile Ser Leu Ala Asp His 130 135 140 Cys Thr Gln Pro Gly Gln Lys Cys Thr Val Ser Gly Trp Gly Thr Val 145 150 155 160 Thr Ser Pro Arg Glu Asn Phe Pro Asp Thr Leu Asn Cys Ala Glu Val 165 170 175 Lys Ile Phe Pro Gln Lys Lys Cys Glu Asp Ala Tyr Pro Gly Gln Ile 180 185 190 Thr Asp Gly Met Val Cys Ala Gly Ser Ser Lys Gly Ala Asp Thr Cys 195 200 205 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Asp Gly Ala Leu Gln Gly 210 215 220 Ile Thr Ser Trp Gly Ser Asp Pro Cys Gly Arg Ser Asp Lys Pro Gly 225 230 235 240 Val Tyr Thr Asn Ile Cys Arg Tyr Leu Asp Trp Ile Lys Lys Ile Ile 245 250 255 Gly Ser Lys Gly 260 <210> 214 <211> 1148 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Neuropsin transcript variant 2 <400> 214 gttcccagaa gctccccagg ctctagtgca ggaggagaag gaggaggagc aggaggtgga 60 gattcccagt taaaaggctc cagaatcgtg taccaggcag agaactgaag tactggggcc 120 tcctccactg ggtccgaatc agtaggtgac cccgcccctg gattctggaa gacctcacca 180 tgggacgccc ccgacctcgt gcggccaaga cgtggatgtt cctgctcttg ctggggggag 240 cctgggcagc gtgtggaagc ctggacctcc tcactaagtt gtatgcggag aacttgccgt 300 gtgtccattt gaacccacag tggccttccc agccctcgca ctgccccaga gggtggcgat 360 ccaaccctct ccctcctgct gcaggacact ccagggcaca ggaggacaag gtgctggggg 420 gtcatgagtg ccaaccccat tcgcagcctt ggcaggcggc cttgttccag ggccagcaac 480 tactctgtgg cggtgtcctt gtaggtggca actgggtcct tacagctgcc cactgtaaaa 540 aaccgaaata cacagtacgc ctgggagacc acagcctaca gaataaagat ggcccagagc 600 aagaaatacc tgtggttcag tccatcccac acccctgcta caacagcagc gatgtggagg 660 accacaacca tgatctgatg cttcttcaac tgcgtgacca ggcatccctg gggtccaaag 720 tgaagcccat cagcctggca gatcattgca cccagcctgg ccagaagtgc accgtctcag 780 gctggggcac tgtcaccagt ccccgagaga attttcctga cactctcaac tgtgcagaag 840 taaaaatctt tccccagaag aagtgtgagg atgcttaccc ggggcagatc acagatggca 900 tggtctgtgc aggcagcagc aaaggggctg acacgtgcca gggcgattct ggaggccccc 960 tggtgtgtga tggtgcactc cagggcatca catcctgggg ctcagacccc tgtgggaggt 1020 ccgacaaacc tggcgtctat accaacatct gccgctacct ggactggatc aagaagatca 1080 taggcagcaa gggctgattc taggataagc actagatctc ccttaataaa ctcacaactc 1140 tctggttc 1148 <210> 215 <211> 305 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Neuropsin isoform 2 <400> 215 Met Gly Arg Pro Arg Pro Arg Ala Ala Lys Thr Trp Met Phe Leu Leu 1 5 10 15 Leu Leu Gly Gly Ala Trp Ala Ala Cys Gly Ser Leu Asp Leu Leu Thr 20 25 30 Lys Leu Tyr Ala Glu Asn Leu Pro Cys Val His Leu Asn Pro Gln Trp 35 40 45 Pro Ser Gln Pro Ser His Cys Pro Arg Gly Trp Arg Ser Asn Pro Leu 50 55 60 Pro Pro Ala Ala Gly His Ser Arg Ala Gln Glu Asp Lys Val Leu Gly 65 70 75 80 Gly His Glu Cys Gln Pro His Ser Gln Pro Trp Gln Ala Ala Leu Phe 85 90 95 Gln Gly Gln Gln Leu Leu Cys Gly Gly Val Leu Val Gly Gly Asn Trp 100 105 110 Val Leu Thr Ala Ala His Cys Lys Lys Pro Lys Tyr Thr Val Arg Leu 115 120 125 Gly Asp His Ser Leu Gln Asn Lys Asp Gly Pro Glu Gln Glu Ile Pro 130 135 140 Val Val Gln Ser Ile Pro His Pro Cys Tyr Asn Ser Ser Asp Val Glu 145 150 155 160 Asp His Asn His Asp Leu Met Leu Leu Gln Leu Arg Asp Gln Ala Ser 165 170 175 Leu Gly Ser Lys Val Lys Pro Ile Ser Leu Ala Asp His Cys Thr Gln 180 185 190 Pro Gly Gln Lys Cys Thr Val Ser Gly Trp Gly Thr Val Thr Ser Pro 195 200 205 Arg Glu Asn Phe Pro Asp Thr Leu Asn Cys Ala Glu Val Lys Ile Phe 210 215 220 Pro Gln Lys Lys Cys Glu Asp Ala Tyr Pro Gly Gln Ile Thr Asp Gly 225 230 235 240 Met Val Cys Ala Gly Ser Ser Lys Gly Ala Asp Thr Cys Gln Gly Asp 245 250 255 Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Asp Gly Ala Leu Gln Gly Ile Thr Ser 260 265 270 Trp Gly Ser Asp Pro Cys Gly Arg Ser Asp Lys Pro Gly Val Tyr Thr 275 280 285 Asn Ile Cys Arg Tyr Leu Asp Trp Ile Lys Lys Ile Ile Gly Ser Lys 290 295 300 Gly 305 <210> 216 <211> 590 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Neuropsin transcript variant 3 <400> 216 gttcccagaa gctccccagg ctctagtgca ggaggagaag gaggaggagc aggaggtgga 60 gattcccagt taaaaggctc cagaatcgtg taccaggcag agaactgaag tactggggcc 120 tcctccactg ggtccgaatc agtaggtgac cccgcccctg gattctggaa gacctcacca 180 tgggacgccc ccgacctcgt gcggccaaga cgtggatgtt cctgctcttg ctggggggag 240 cctgggcaga gaattttcct gacactctca actgtgcaga agtaaaaatc tttccccaga 300 agaagtgtga ggatgcttac ccggggcaga tcacagatgg catggtctgt gcaggcagca 360 gcaaaggggc tgacacgtgc cagggcgatt ctggaggccc cctggtgtgt gatggtgcac 420 tccagggcat cacatcctgg ggctcagacc cctgtgggag gtccgacaaa cctggcgtct 480 ataccaacat ctgccgctac ctggactgga tcaagaagat cataggcagc aagggctgat 540 tctaggataa gcactagatc tcccttaata aactcacaac tctctggttc 590 <210> 217 <211> 119 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Neuropsin isoform 3 <400> 217 Met Gly Arg Pro Arg Pro Arg Ala Ala Lys Thr Trp Met Phe Leu Leu 1 5 10 15 Leu Leu Gly Gly Ala Trp Ala Glu Asn Phe Pro Asp Thr Leu Asn Cys 20 25 30 Ala Glu Val Lys Ile Phe Pro Gln Lys Lys Cys Glu Asp Ala Tyr Pro 35 40 45 Gly Gln Ile Thr Asp Gly Met Val Cys Ala Gly Ser Ser Lys Gly Ala 50 55 60 Asp Thr Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Asp Gly Ala 65 70 75 80 Leu Gln Gly Ile Thr Ser Trp Gly Ser Asp Pro Cys Gly Arg Ser Asp 85 90 95 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Asn Ile Cys Arg Tyr Leu Asp Trp Ile Lys 100 105 110 Lys Ile Ile Gly Ser Lys Gly 115 <210> 218 <211> 456 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Neuropsin transcript variant 4 <400> 218 gttcccagaa gctccccagg ctctagtgca ggaggagaag gaggaggagc aggaggtgga 60 gattcccagt taaaaggctc cagaatcgtg taccaggcag agaactgaag tactggggcc 120 tcctccactg ggtccgaatc agtaggtgac cccgcccctg gattctggaa gacctcacca 180 tgggacgccc ccgacctcgt gcggccaaga cgtggatgtt cctgctcttg ctggggggag 240 cctgggcagg gcgattctgg aggccccctg gtgtgtgatg gtgcactcca gggcatcaca 300 tcctggggct cagacccctg tgggaggtcc gacaaacctg gcgtctatac caacatctgc 360 cgctacctgg actggatcaa gaagatcata ggcagcaagg gctgattcta ggataagcac 420 tagatctccc ttaataaact cacaactctc tggttc 456 <210> 219 <211> 32 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Neuropsin isoform 4 <400> 219 Met Gly Arg Pro Arg Pro Arg Ala Ala Lys Thr Trp Met Phe Leu Leu 1 5 10 15 Leu Leu Gly Gly Ala Trp Ala Gly Arg Phe Trp Arg Pro Pro Gly Val 20 25 30 <210> 220 <211> 1580 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein hK10 transcript variant 1 <400> 220 catcctgcca cccctagcct tgctggggac gtgaaccctc tccccgcgcc tgggaagcct 60 tcttggcacc gggacccgga gaatccccac ggaagccagt tccaaaaggg atgaaaaggg 120 ggcgtttcgg gcactgggag aagcctgtat tccagggccc ctcccagagc aggaatctgg 180 gacccaggag tgccagcctc acccacgcag atcctggcca tgagagctcc gcacctccac 240 ctctccgccg cctctggcgc ccgggctctg gcgaagctgc tgccgctgct gatggcgcaa 300 ctctgggccg cagaggcggc gctgctcccc caaaacgaca cgcgcttgga ccccgaagcc 360 tatggctccc cgtgcgcgcg cggctcgcag ccctggcagg tctcgctctt caacggcctc 420 tcgttccact gcgcgggtgt cctggtggac cagagttggg tgctgacggc cgcgcactgc 480 ggaaacaagc cactgtgggc tcgagtaggg gatgaccacc tgctgcttct tcagggagag 540 cagctccgcc ggaccactcg ctctgttgtc catcccaagt accaccaggg ctcaggcccc 600 atcctgccaa ggcgaacgga tgagcacgat ctcatgttgc tgaagctggc caggcccgta 660 gtgctggggc cccgcgtccg ggccctgcag cttccctacc gctgtgctca gcccggagac 720 cagtgccagg ttgctggctg gggcaccacg gccgcccgga gagtgaagta caacaagggc 780 ctgacctgct ccagcatcac tatcctgagc cctaaagagt gtgaggtctt ctaccctggc 840 gtggtcacca acaacatgat atgtgctgga ctggaccggg gccaggaccc ttgccagagt 900 gactctggag gccccctggt ctgtgacgag accctccaag gcatcctctc gtggggtgtt 960 tacccctgtg gctctgccca gcatccagct gtctacaccc agatctgcaa atacatgtcc 1020 tggatcaata aagtcatacg ctccaactga tccagatgct acgctccagc tgatccagat 1080 gttatgctcc tgctgatcca gatgcccaga ggctccatcg tccatcctct tcctccccag 1140 tcggctgaac tctccccttg tctgcactgt tcaaacctct gccgccctcc acacctctaa 1200 acatctcccc tctcacctca ttcccccacc tatccccatt ctctgcctgt actgaagctg 1260 aaatgcagga agtggtggca aaggtttatt ccagagaagc caggaagccg gtcatcaccc 1320 agcctctgag agcagttact ggggtcaccc aacctgactt cctctgccac tccctgctgt 1380 gtgactttgg gcaagccaag tgccctctct gaacctcagt ttcctcatct gcaaaatggg 1440 aacaatgacg tgcctacctc ttagacatgt tgtgaggaga ctatgatata acatgtgtat 1500 gtaaatcttc atggtgattg tcatgtaagg cttaacacag tgggtggtga gttctgacta 1560 aaggttacct gttgtcgtga 1580 <210> 221 <211> 276 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein hK10 <400> 221 Met Arg Ala Pro His Leu His Leu Ser Ala Ala Ser Gly Ala Arg Ala 1 5 10 15 Leu Ala Lys Leu Leu Pro Leu Leu Met Ala Gln Leu Trp Ala Ala Glu 20 25 30 Ala Ala Leu Leu Pro Gln Asn Asp Thr Arg Leu Asp Pro Glu Ala Tyr 35 40 45 Gly Ser Pro Cys Ala Arg Gly Ser Gln Pro Trp Gln Val Ser Leu Phe 50 55 60 Asn Gly Leu Ser Phe His Cys Ala Gly Val Leu Val Asp Gln Ser Trp 65 70 75 80 Val Leu Thr Ala Ala His Cys Gly Asn Lys Pro Leu Trp Ala Arg Val 85 90 95 Gly Asp Asp His Leu Leu Leu Leu Gln Gly Glu Gln Leu Arg Arg Thr 100 105 110 Thr Arg Ser Val Val His Pro Lys Tyr His Gln Gly Ser Gly Pro Ile 115 120 125 Leu Pro Arg Arg Thr Asp Glu His Asp Leu Met Leu Leu Lys Leu Ala 130 135 140 Arg Pro Val Val Leu Gly Pro Arg Val Arg Ala Leu Gln Leu Pro Tyr 145 150 155 160 Arg Cys Ala Gln Pro Gly Asp Gln Cys Gln Val Ala Gly Trp Gly Thr 165 170 175 Thr Ala Ala Arg Arg Val Lys Tyr Asn Lys Gly Leu Thr Cys Ser Ser 180 185 190 Ile Thr Ile Leu Ser Pro Lys Glu Cys Glu Val Phe Tyr Pro Gly Val 195 200 205 Val Thr Asn Asn Met Ile Cys Ala Gly Leu Asp Arg Gly Gln Asp Pro 210 215 220 Cys Gln Ser Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Asp Glu Thr Leu Gln 225 230 235 240 Gly Ile Leu Ser Trp Gly Val Tyr Pro Cys Gly Ser Ala Gln His Pro 245 250 255 Ala Val Tyr Thr Gln Ile Cys Lys Tyr Met Ser Trp Ile Asn Lys Val 260 265 270 Ile Arg Ser Asn 275 <210> 222 <211> 1443 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein hK10 transcript variant 2 <400> 222 accagcggca gaccacaggc agggcagagg cacgtctggg tcccctccct ccttcctatc 60 ggcgactccc aggatcctgg ccatgagagc tccgcacctc cacctctccg ccgcctctgg 120 cgcccgggct ctggcgaagc tgctgccgct gctgatggcg caactctggg ccgcagaggc 180 ggcgctgctc ccccaaaacg acacgcgctt ggaccccgaa gcctatggct ccccgtgcgc 240 gcgcggctcg cagccctggc aggtctcgct cttcaacggc ctctcgttcc actgcgcggg 300 tgtcctggtg gaccagagtt gggtgctgac ggccgcgcac tgcggaaaca agccactgtg 360 ggctcgagta ggggatgacc acctgctgct tcttcaggga gagcagctcc gccggaccac 420 tcgctctgtt gtccatccca agtaccacca gggctcaggc cccatcctgc caaggcgaac 480 ggatgagcac gatctcatgt tgctgaagct ggccaggccc gtagtgctgg ggccccgcgt 540 ccgggccctg cagcttccct accgctgtgc tcagcccgga gaccagtgcc aggttgctgg 600 ctggggcacc acggccgccc ggagagtgaa gtacaacaag ggcctgacct gctccagcat 660 cactatcctg agccctaaag agtgtgaggt cttctaccct ggcgtggtca ccaacaacat 720 gatatgtgct ggactggacc ggggccagga cccttgccag agtgactctg gaggccccct 780 ggtctgtgac gagaccctcc aaggcatcct ctcgtggggt gtttacccct gtggctctgc 840 ccagcatcca gctgtctaca cccagatctg caaatacatg tcctggatca ataaagtcat 900 acgctccaac tgatccagat gctacgctcc agctgatcca gatgttatgc tcctgctgat 960 ccagatgccc agaggctcca tcgtccatcc tcttcctccc cagtcggctg aactctcccc 1020 ttgtctgcac tgttcaaacc tctgccgccc tccacacctc taaacatctc ccctctcacc 1080 tcattccccc acctatcccc attctctgcc tgtactgaag ctgaaatgca ggaagtggtg 1140 gcaaaggttt attccagaga agccaggaag ccggtcatca cccagcctct gagagcagtt 1200 actggggtca cccaacctga cttcctctgc cactccctgc tgtgtgactt tgggcaagcc 1260 aagtgccctc tctgaacctc agtttcctca tctgcaaaat gggaacaatg acgtgcctac 1320 ctcttagaca tgttgtgagg agactatgat ataacatgtg tatgtaaatc ttcatggtga 1380 ttgtcatgta aggcttaaca cagtgggtgg tgagttctga ctaaaggtta cctgttgtcg 1440 tga 1443 <210> 223 <211> 276 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein hK10 <400> 223 Met Arg Ala Pro His Leu His Leu Ser Ala Ala Ser Gly Ala Arg Ala 1 5 10 15 Leu Ala Lys Leu Leu Pro Leu Leu Met Ala Gln Leu Trp Ala Ala Glu 20 25 30 Ala Ala Leu Leu Pro Gln Asn Asp Thr Arg Leu Asp Pro Glu Ala Tyr 35 40 45 Gly Ser Pro Cys Ala Arg Gly Ser Gln Pro Trp Gln Val Ser Leu Phe 50 55 60 Asn Gly Leu Ser Phe His Cys Ala Gly Val Leu Val Asp Gln Ser Trp 65 70 75 80 Val Leu Thr Ala Ala His Cys Gly Asn Lys Pro Leu Trp Ala Arg Val 85 90 95 Gly Asp Asp His Leu Leu Leu Leu Gln Gly Glu Gln Leu Arg Arg Thr 100 105 110 Thr Arg Ser Val Val His Pro Lys Tyr His Gln Gly Ser Gly Pro Ile 115 120 125 Leu Pro Arg Arg Thr Asp Glu His Asp Leu Met Leu Leu Lys Leu Ala 130 135 140 Arg Pro Val Val Leu Gly Pro Arg Val Arg Ala Leu Gln Leu Pro Tyr 145 150 155 160 Arg Cys Ala Gln Pro Gly Asp Gln Cys Gln Val Ala Gly Trp Gly Thr 165 170 175 Thr Ala Ala Arg Arg Val Lys Tyr Asn Lys Gly Leu Thr Cys Ser Ser 180 185 190 Ile Thr Ile Leu Ser Pro Lys Glu Cys Glu Val Phe Tyr Pro Gly Val 195 200 205 Val Thr Asn Asn Met Ile Cys Ala Gly Leu Asp Arg Gly Gln Asp Pro 210 215 220 Cys Gln Ser Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Asp Glu Thr Leu Gln 225 230 235 240 Gly Ile Leu Ser Trp Gly Val Tyr Pro Cys Gly Ser Ala Gln His Pro 245 250 255 Ala Val Tyr Thr Gln Ile Cys Lys Tyr Met Ser Trp Ile Asn Lys Val 260 265 270 Ile Arg Ser Asn 275 <210> 224 <211> 3226 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Epitheliasin <400> 224 cgcgagctaa gcaggaggcg gaggcggagg cggagggcga ggggcgggga gcgccgcctg 60 gagcgcggca ggtcatattg aacattccag atacctatca ttactcgatg ctgttgataa 120 cagcaagatg gctttgaact cagggtcacc accagctatt ggaccttact atgaaaacca 180 tggataccaa ccggaaaacc cctatcccgc acagcccact gtggtcccca ctgtctacga 240 ggtgcatccg gctcagtact acccgtcccc cgtgccccag tacgccccga gggtcctgac 300 gcaggcttcc aaccccgtcg tctgcacgca gcccaaatcc ccatccggga cagtgtgcac 360 ctcaaagact aagaaagcac tgtgcatcac cttgaccctg gggaccttcc tcgtgggagc 420 tgcgctggcc gctggcctac tctggaagtt catgggcagc aagtgctcca actctgggat 480 agagtgcgac tcctcaggta cctgcatcaa cccctctaac tggtgtgatg gcgtgtcaca 540 ctgccccggc ggggaggacg agaatcggtg tgttcgcctc tacggaccaa acttcatcct 600 tcagatgtac tcatctcaga ggaagtcctg gcaccctgtg tgccaagacg actggaacga 660 gaactacggg cgggcggcct gcagggacat gggctataag aataattttt actctagcca 720 aggaatagtg gatgacagcg gatccaccag ctttatgaaa ctgaacacaa gtgccggcaa 780 tgtcgatatc tataaaaaac tgtaccacag tgatgcctgt tcttcaaaag cagtggtttc 840 tttacgctgt atagcctgcg gggtcaactt gaactcaagc cgccagagca ggatcgtggg 900 cggtgagagc gcgctcccgg gggcctggcc ctggcaggtc agcctgcacg tccagaacgt 960 ccacgtgtgc ggaggctcca tcatcacccc cgagtggatc gtgacagccg cccactgcgt 1020 ggaaaaacct cttaacaatc catggcattg gacggcattt gcggggattt tgagacaatc 1080 tttcatgttc tatggagccg gataccaagt agaaaaagtg atttctcatc caaattatga 1140 ctccaagacc aagaacaatg acattgcgct gatgaagctg cagaagcctc tgactttcaa 1200 cgacctagtg aaaccagtgt gtctgcccaa cccaggcatg atgctgcagc cagaacagct 1260 ctgctggatt tccgggtggg gggccaccga ggagaaaggg aagacctcag aagtgctgaa 1320 cgctgccaag gtgcttctca ttgagacaca gagatgcaac agcagatatg tctatgacaa 1380 cctgatcaca ccagccatga tctgtgccgg cttcctgcag gggaacgtcg attcttgcca 1440 gggtgacagt ggagggcctc tggtcacttc gaagaacaat atctggtggc tgatagggga 1500 tacaagctgg ggttctggct gtgccaaagc ttacagacca ggagtgtacg ggaatgtgat 1560 ggtattcacg gactggattt atcgacaaat gagggcagac ggctaatcca catggtcttc 1620 gtccttgacg tcgttttaca agaaaacaat ggggctggtt ttgcttcccc gtgcatgatt 1680 tactcttaga gatgattcag aggtcacttc atttttatta aacagtgaac ttgtctggct 1740 ttggcactct ctgccattct gtgcaggctg cagtggctcc cctgcccagc ctgctctccc 1800 taaccccttg tccgcaaggg gtgatggccg gctggttgtg ggcactggcg gtcaagtgtg 1860 gaggagaggg gtggaggctg ccccattgag atcttcctgc tgagtccttt ccaggggcca 1920 attttggatg agcatggagc tgtcacctct cagctgctgg atgacttgag atgaaaaagg 1980 agagacatgg aaagggagac agccaggtgg cacctgcagc ggctgccctc tggggccact 2040 tggtagtgtc cccagcctac ctctccacaa ggggattttg ctgatgggtt cttagagcct 2100 tagcagccct ggatggtggc cagaaataaa gggaccagcc cttcatgggt ggtgacgtgg 2160 tagtcacttg taaggggaac agaaacattt ttgttcttat ggggtgagaa tatagacagt 2220 gcccttggtg cgagggaagc aattgaaaag gaacttgccc tgagcactcc tggtgcaggt 2280 ctccacctgc acattgggtg gggctcctgg gagggagact cagccttcct cctcatcctc 2340 cctgaccctg ctcctagcac cctggagagt gcacatgccc cttggtcctg gcagggcgcc 2400 aagtctggca ccatgttggc ctcttcaggc ctgctagtca ctggaaattg aggtccatgg 2460 gggaaatcaa ggatgctcag tttaaggtac actgtttcca tgttatgttt ctacacattg 2520 ctacctcagt gctcctggaa acttagcttt tgatgtctcc aagtagtcca ccttcattta 2580 actctttgaa actgtatcac ctttgccaag taagagtggt ggcctatttc agctgctttg 2640 acaaaatgac tggctcctga cttaacgttc tataaatgaa tgtgctgaag caaagtgccc 2700 atggtggcgg cgaagaagag aaagatgtgt tttgttttgg actctctgtg gtcccttcca 2760 atgctgtggg tttccaacca ggggaagggt cccttttgca ttgccaagtg ccataaccat 2820 gagcactact ctaccatggt tctgcctcct ggccaagcag gctggtttgc aagaatgaaa 2880 tgaatgattc tacagctagg acttaacctt gaaatggaaa gtcttgcaat cccatttgca 2940 ggatccgtct gtgcacatgc ctctgtagag agcagcattc ccagggacct tggaaacagt 3000 tggcactgta aggtgcttgc tccccaagac acatcctaaa aggtgttgta atggtgaaaa 3060 cgtcttcctt ctttattgcc ccttcttatt tatgtgaaca actgtttgtc tttttttgta 3120 tcttttttaa actgtaaagt tcaattgtga aaatgaatat catgcaaata aattatgcga 3180 tttttttttc aaagcaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaa 3226 <210> 225 <211> 492 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Epitheliasin <400> 225 Met Ala Leu Asn Ser Gly Ser Pro Pro Ala Ile Gly Pro Tyr Tyr Glu 1 5 10 15 Asn His Gly Tyr Gln Pro Glu Asn Pro Tyr Pro Ala Gln Pro Thr Val 20 25 30 Val Pro Thr Val Tyr Glu Val His Pro Ala Gln Tyr Tyr Pro Ser Pro 35 40 45 Val Pro Gln Tyr Ala Pro Arg Val Leu Thr Gln Ala Ser Asn Pro Val 50 55 60 Val Cys Thr Gln Pro Lys Ser Pro Ser Gly Thr Val Cys Thr Ser Lys 65 70 75 80 Thr Lys Lys Ala Leu Cys Ile Thr Leu Thr Leu Gly Thr Phe Leu Val 85 90 95 Gly Ala Ala Leu Ala Ala Gly Leu Leu Trp Lys Phe Met Gly Ser Lys 100 105 110 Cys Ser Asn Ser Gly Ile Glu Cys Asp Ser Ser Gly Thr Cys Ile Asn 115 120 125 Pro Ser Asn Trp Cys Asp Gly Val Ser His Cys Pro Gly Gly Glu Asp 130 135 140 Glu Asn Arg Cys Val Arg Leu Tyr Gly Pro Asn Phe Ile Leu Gln Met 145 150 155 160 Tyr Ser Ser Gln Arg Lys Ser Trp His Pro Val Cys Gln Asp Asp Trp 165 170 175 Asn Glu Asn Tyr Gly Arg Ala Ala Cys Arg Asp Met Gly Tyr Lys Asn 180 185 190 Asn Phe Tyr Ser Ser Gln Gly Ile Val Asp Asp Ser Gly Ser Thr Ser 195 200 205 Phe Met Lys Leu Asn Thr Ser Ala Gly Asn Val Asp Ile Tyr Lys Lys 210 215 220 Leu Tyr His Ser Asp Ala Cys Ser Ser Lys Ala Val Val Ser Leu Arg 225 230 235 240 Cys Ile Ala Cys Gly Val Asn Leu Asn Ser Ser Arg Gln Ser Arg Ile 245 250 255 Val Gly Gly Glu Ser Ala Leu Pro Gly Ala Trp Pro Trp Gln Val Ser 260 265 270 Leu His Val Gln Asn Val His Val Cys Gly Gly Ser Ile Ile Thr Pro 275 280 285 Glu Trp Ile Val Thr Ala Ala His Cys Val Glu Lys Pro Leu Asn Asn 290 295 300 Pro Trp His Trp Thr Ala Phe Ala Gly Ile Leu Arg Gln Ser Phe Met 305 310 315 320 Phe Tyr Gly Ala Gly Tyr Gln Val Glu Lys Val Ile Ser His Pro Asn 325 330 335 Tyr Asp Ser Lys Thr Lys Asn Asn Asp Ile Ala Leu Met Lys Leu Gln 340 345 350 Lys Pro Leu Thr Phe Asn Asp Leu Val Lys Pro Val Cys Leu Pro Asn 355 360 365 Pro Gly Met Met Leu Gln Pro Glu Gln Leu Cys Trp Ile Ser Gly Trp 370 375 380 Gly Ala Thr Glu Glu Lys Gly Lys Thr Ser Glu Val Leu Asn Ala Ala 385 390 395 400 Lys Val Leu Leu Ile Glu Thr Gln Arg Cys Asn Ser Arg Tyr Val Tyr 405 410 415 Asp Asn Leu Ile Thr Pro Ala Met Ile Cys Ala Gly Phe Leu Gln Gly 420 425 430 Asn Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Thr Ser 435 440 445 Lys Asn Asn Ile Trp Trp Leu Ile Gly Asp Thr Ser Trp Gly Ser Gly 450 455 460 Cys Ala Lys Ala Tyr Arg Pro Gly Val Tyr Gly Asn Val Met Val Phe 465 470 475 480 Thr Asp Trp Ile Tyr Arg Gln Met Arg Ala Asp Gly 485 490 <210> 226 <211> 1280 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Prostase <400> 226 atggccacag caggaaatcc ctggggctgg ttcctggggt acctcatcct tggtgtcgca 60 ggatctctcg tctctggtag ctgcagccaa atcataaacg gcgaggactg cagcccgcac 120 tcgcagccct ggcaggcggc actggtcatg gaaaacgaat tgttctgctc gggcgtcctg 180 gtgcatccgc agtgggtgct gtcagccgca cactgtttcc agaactccta caccatcggg 240 ctgggcctgc acagtcttga ggccgaccaa gagccaggga gccagatggt ggaggccagc 300 ctctccgtac ggcacccaga gtacaacaga cccttgctcg ctaacgacct catgctcatc 360 aagttggacg aatccgtgtc cgagtctgac accatccgga gcatcagcat tgcttcgcag 420 tgccctaccg cggggaactc ttgcctcgtt tctggctggg gtctgctggc gaacggcaga 480 atgcctaccg tgctgcagtg cgtgaacgtg tcggtggtgt ctgaggaggt ctgcagtaag 540 ctctatgacc cgctgtacca ccccagcatg ttctgcgccg gcggagggca agaccagaag 600 gactcctgca acggtgactc tggggggccc ctgatctgca acgggtactt gcagggcctt 660 gtgtctttcg gaaaagcccc gtgtggccaa gttggcgtgc caggtgtcta caccaacctc 720 tgcaaattca ctgagtggat agagaaaacc gtccaggcca gttaactctg gggactggga 780 acccatgaaa ttgaccccca aatacatcct gcggaaggaa ttcaggaata tctgttccca 840 gcccctcctc cctcaggccc aggagtccag gcccccagcc cctcctccct caaaccaagg 900 gtacagatcc ccagcccctc ctccctcaga cccaggagtc cagacccccc agcccctcct 960 ccctcagacc caggagtcca gcccctcctc cctcagaccc aggagtccag accccccagc 1020 ccctcctccc tcagacccag gggtccaggc ccccaacccc tcctccctca gactcagagg 1080 tccaagcccc caacccctcc ttccccagac ccagaggtcc aggtcccagc ccctcctccc 1140 tcagacccag cggtccaatg ccacctagac tctccctgta cacagtgccc ccttgtggca 1200 cgttgaccca accttaccag ttggtttttc attttttgtc cctttcccct agatccagaa 1260 ataaagtcta agagaagcgc 1280 <210> 227 <211> 254 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Prostase <400> 227 Met Ala Thr Ala Gly Asn Pro Trp Gly Trp Phe Leu Gly Tyr Leu Ile 1 5 10 15 Leu Gly Val Ala Gly Ser Leu Val Ser Gly Ser Cys Ser Gln Ile Ile 20 25 30 Asn Gly Glu Asp Cys Ser Pro His Ser Gln Pro Trp Gln Ala Ala Leu 35 40 45 Val Met Glu Asn Glu Leu Phe Cys Ser Gly Val Leu Val His Pro Gln 50 55 60 Trp Val Leu Ser Ala Ala His Cys Phe Gln Asn Ser Tyr Thr Ile Gly 65 70 75 80 Leu Gly Leu His Ser Leu Glu Ala Asp Gln Glu Pro Gly Ser Gln Met 85 90 95 Val Glu Ala Ser Leu Ser Val Arg His Pro Glu Tyr Asn Arg Pro Leu 100 105 110 Leu Ala Asn Asp Leu Met Leu Ile Lys Leu Asp Glu Ser Val Ser Glu 115 120 125 Ser Asp Thr Ile Arg Ser Ile Ser Ile Ala Ser Gln Cys Pro Thr Ala 130 135 140 Gly Asn Ser Cys Leu Val Ser Gly Trp Gly Leu Leu Ala Asn Gly Arg 145 150 155 160 Met Pro Thr Val Leu Gln Cys Val Asn Val Ser Val Val Ser Glu Glu 165 170 175 Val Cys Ser Lys Leu Tyr Asp Pro Leu Tyr His Pro Ser Met Phe Cys 180 185 190 Ala Gly Gly Gly Gln Asp Gln Lys Asp Ser Cys Asn Gly Asp Ser Gly 195 200 205 Gly Pro Leu Ile Cys Asn Gly Tyr Leu Gln Gly Leu Val Ser Phe Gly 210 215 220 Lys Ala Pro Cys Gly Gln Val Gly Val Pro Gly Val Tyr Thr Asn Leu 225 230 235 240 Cys Lys Phe Thr Glu Trp Ile Glu Lys Thr Val Gln Ala Ser 245 250 <210> 228 <211> 1391 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Brain serine proteinase 2 <400> 228 acacaccctg acccgcatcg ccctgggtct ctcgagcctg ctgcctgctc ccccgcccca 60 ccagccatgg tggtttctgg agcgccccca gccctgggtg ggggctgtct cggcaccttc 120 acctccctgc tgctgctggc gtcgacagcc atcctcaatg cggccaggat acctgttccc 180 ccagcctgtg ggaagcccca gcagctgaac cgggttgtgg gcggcgagga cagcactgac 240 agcgagtggc cctggatcgt gagcatccag aagaatggga cccaccactg cgcaggttct 300 ctgctcacca gccgctgggt gatcactgct gcccactgtt tcaaggacaa cctgaacaaa 360 ccatacctgt tctctgtgct gctgggggcc tggcagctgg ggaaccctgg ctctcggtcc 420 cagaaggtgg gtgttgcctg ggtggagccc caccctgtgt attcctggaa ggaaggtgcc 480 tgtgcagaca ttgccctggt gcgtctcgag cgctccatac agttctcaga gcgggtcctg 540 cccatctgcc tacctgatgc ctctatccac ctccctccaa acacccactg ctggatctca 600 ggctggggga gcatccaaga tggagttccc ttgccccacc ctcagaccct gcagaagctg 660 aaggttccta tcatcgactc ggaagtctgc agccatctgt actggcgggg agcaggacag 720 ggacccatca ctgaggacat gctgtgtgcc ggctacttgg agggggagcg ggatgcttgt 780 ctgggcgact ccgggggccc cctcatgtgc caggtggacg gcgcctggct gctggccggc 840 atcatcagct ggggcgaggg ctgtgccgag cgcaacaggc ccggggtcta catcagcctc 900 tctgcgcacc gctcctgggt ggagaagatc gtgcaagggg tgcagctccg cgggcgcgct 960 caggggggtg gggccctcag ggcaccgagc cagggctctg gggccgccgc gcgctcctag 1020 ggcgcagcgg gacgcggggc tcggatctga aaggcggcca gatccacatc tggatctgga 1080 tctgcggcgg cctcgggcgg tttcccccgc cgtaaatagg ctcatctacc tctacctctg 1140 ggggcccgga cggctgctgc ggaaaggaaa ccccctcccc gacccgcccg acggcctcag 1200 gccccgcctc caaggcatca ggccccgccc aacggcctca tgtccccgcc cccacgactt 1260 ccggccccgc cccgggcccc agcgcttttg tgtatataaa tgttaatgat ttttataggt 1320 atttgtaacc ctgcccacat atcttattta ttcctccaat ttcaataaat tatttattct 1380 ccagtgaaaa a 1391 <210> 229 <211> 317 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Brain serine proteinase 2 <400> 229 Met Val Val Ser Gly Ala Pro Pro Ala Leu Gly Gly Gly Cys Leu Gly 1 5 10 15 Thr Phe Thr Ser Leu Leu Leu Leu Ala Ser Thr Ala Ile Leu Asn Ala 20 25 30 Ala Arg Ile Pro Val Pro Pro Ala Cys Gly Lys Pro Gln Gln Leu Asn 35 40 45 Arg Val Val Gly Gly Glu Asp Ser Thr Asp Ser Glu Trp Pro Trp Ile 50 55 60 Val Ser Ile Gln Lys Asn Gly Thr His His Cys Ala Gly Ser Leu Leu 65 70 75 80 Thr Ser Arg Trp Val Ile Thr Ala Ala His Cys Phe Lys Asp Asn Leu 85 90 95 Asn Lys Pro Tyr Leu Phe Ser Val Leu Leu Gly Ala Trp Gln Leu Gly 100 105 110 Asn Pro Gly Ser Arg Ser Gln Lys Val Gly Val Ala Trp Val Glu Pro 115 120 125 His Pro Val Tyr Ser Trp Lys Glu Gly Ala Cys Ala Asp Ile Ala Leu 130 135 140 Val Arg Leu Glu Arg Ser Ile Gln Phe Ser Glu Arg Val Leu Pro Ile 145 150 155 160 Cys Leu Pro Asp Ala Ser Ile His Leu Pro Pro Asn Thr His Cys Trp 165 170 175 Ile Ser Gly Trp Gly Ser Ile Gln Asp Gly Val Pro Leu Pro His Pro 180 185 190 Gln Thr Leu Gln Lys Leu Lys Val Pro Ile Ile Asp Ser Glu Val Cys 195 200 205 Ser His Leu Tyr Trp Arg Gly Ala Gly Gln Gly Pro Ile Thr Glu Asp 210 215 220 Met Leu Cys Ala Gly Tyr Leu Glu Gly Glu Arg Asp Ala Cys Leu Gly 225 230 235 240 Asp Ser Gly Gly Pro Leu Met Cys Gln Val Asp Gly Ala Trp Leu Leu 245 250 255 Ala Gly Ile Ile Ser Trp Gly Glu Gly Cys Ala Glu Arg Asn Arg Pro 260 265 270 Gly Val Tyr Ile Ser Leu Ser Ala His Arg Ser Trp Val Glu Lys Ile 275 280 285 Val Gln Gly Val Gln Leu Arg Gly Arg Ala Gln Gly Gly Gly Ala Leu 290 295 300 Arg Ala Pro Ser Gln Gly Ser Gly Ala Ala Ala Arg Ser 305 310 315 <210> 230 <211> 1184 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Chymopasin <400> 230 atctgccacg atgttgctgc tcagcctgac cctaagcctg gttctcctcg gctcctcctg 60 gggctgcggc attcctgcca tcaaaccggc actgagcttc agccagagga ttgtcaacgg 120 ggagaatgca gtgttgggct cctggccctg gcaggtgtcc ctgcaggaca gcagcggctt 180 ccacttctgc ggtggttctc tcatcagcca gtcctgggtg gtcactgctg cccactgcaa 240 tgtcagccct ggccgccatt ttgttgtcct gggcgagtat gaccgatcat caaacgcaga 300 gcccttgcag gttctgtccg tctctcgggc cattacacac cctagctgga actctaccac 360 catgaacaat gacgtgacgc tgctgaagct cgcctcgcca gcccagtaca caacacgcat 420 ctcgccagtt tgcctggcat cctcaaacga ggctctgact gaaggcctca cgtgtgtcac 480 caccggctgg ggtcgcctca gtggcgtggg caatgtgaca ccagcacatc tgcagcaggt 540 ggctttgccc ctggtcactg tgaatcagtg ccggcagtac tggggctcaa gtatcactga 600 ctccatgatc tgtgcaggtg gcgcaggtgc ctcctcgtgc cagggtgact ccggaggccc 660 tcttgtctgc cagaagggaa acacatgggt gcttattggt attgtctcct ggggcaccaa 720 aaactgcaat gtgcgcgcac ctgctgtgta tactcgagtt agcaagttca gcacctggat 780 caaccaggtc atagcctaca actgagctca ccacaggccc tccccagctc aacccattaa 840 agacccaggc cctgtcccat catgcattca tgtctgtctt cctggctcag gagaaagaag 900 aggctgttga gggtccgact ccctacttgg acttctggca cagaaggggc tgagtgactc 960 cttgagtagc agtggctctt cctagagtag ccatgccgag gccggggccc ccacccctcc 1020 tccagggcaa ccccttggtc ctacagcaag aagccagaac tgttggaatg aatggcagcc 1080 ctccctggag aggcagcctg tttactgaat acagaggata cgtttacaaa ctgaatacgc 1140 ataataaata actgcacatt ctccatccaa aaaaaaaaaa aaaa 1184 <210> 231 <211> 264 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Chymopasin <400> 231 Met Leu Leu Leu Ser Leu Thr Leu Ser Leu Val Leu Leu Gly Ser Ser 1 5 10 15 Trp Gly Cys Gly Ile Pro Ala Ile Lys Pro Ala Leu Ser Phe Ser Gln 20 25 30 Arg Ile Val Asn Gly Glu Asn Ala Val Leu Gly Ser Trp Pro Trp Gln 35 40 45 Val Ser Leu Gln Asp Ser Ser Gly Phe His Phe Cys Gly Gly Ser Leu 50 55 60 Ile Ser Gln Ser Trp Val Val Thr Ala Ala His Cys Asn Val Ser Pro 65 70 75 80 Gly Arg His Phe Val Val Leu Gly Glu Tyr Asp Arg Ser Ser Asn Ala 85 90 95 Glu Pro Leu Gln Val Leu Ser Val Ser Arg Ala Ile Thr His Pro Ser 100 105 110 Trp Asn Ser Thr Thr Met Asn Asn Asp Val Thr Leu Leu Lys Leu Ala 115 120 125 Ser Pro Ala Gln Tyr Thr Thr Arg Ile Ser Pro Val Cys Leu Ala Ser 130 135 140 Ser Asn Glu Ala Leu Thr Glu Gly Leu Thr Cys Val Thr Thr Gly Trp 145 150 155 160 Gly Arg Leu Ser Gly Val Gly Asn Val Thr Pro Ala His Leu Gln Gln 165 170 175 Val Ala Leu Pro Leu Val Thr Val Asn Gln Cys Arg Gln Tyr Trp Gly 180 185 190 Ser Ser Ile Thr Asp Ser Met Ile Cys Ala Gly Gly Ala Gly Ala Ser 195 200 205 Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Gln Lys Gly Asn 210 215 220 Thr Trp Val Leu Ile Gly Ile Val Ser Trp Gly Thr Lys Asn Cys Asn 225 230 235 240 Val Arg Ala Pro Ala Val Tyr Thr Arg Val Ser Lys Phe Ser Thr Trp 245 250 255 Ile Asn Gln Val Ile Ala Tyr Asn 260 <210> 232 <211> 1207 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein 11 transcript variant 1 <400> 232 ggagtgcagg cttggaaagc aggagagctc agcctacgtc tttaatcctc ctgcccaccc 60 cttggattct gtctccactg ggactcaaga gaggaacctg gggcccgctc ctcccccctc 120 caggccatga ggattctgca gttaatcctg cttgctctgg caacagggct tgtaggggga 180 gagaccagga tcatcaaggg gttcgagtgc aagcctcact cccagccctg gcaggcagcc 240 ctgttcgaga agacgcggct actctgtggg gcgacgctca tcgcccccag atggctcctg 300 acagcagccc actgcctcaa gccccgctac atagttcacc tggggcagca caacctccag 360 aaggaggagg gctgtgagca gacccggaca gccactgagt ccttccccca ccccggcttc 420 aacaacagcc tccccaacaa agaccaccgc aatgacatca tgctggtgaa gatggcatcg 480 ccagtctcca tcacctgggc tgtgcgaccc ctcaccctct cctcacgctg tgtcactgct 540 ggcaccagct gcctcatttc cggctggggc agcacgtcca gcccccagtt acgcctgcct 600 cacaccttgc gatgcgccaa catcaccatc attgagcacc agaagtgtga gaacgcctac 660 cccggcaaca tcacagacac catggtgtgt gccagcgtgc aggaaggggg caaggactcc 720 tgccagggtg actccggggg ccctctggtc tgtaaccagt ctcttcaagg cattatctcc 780 tggggccagg atccgtgtgc gatcacccga aagcctggtg tctacacgaa agtctgcaaa 840 tatgtggact ggatccagga gacgatgaag aacaattaga ctggacccac ccaccacagc 900 ccatcaccct ccatttccac ttggtgtttg gttcctgttc actctgttaa taagaaaccc 960 taagccaaga ccctctacga acattctttg ggcctcctgg actacaggag atgctgtcac 1020 ttaataatca acctggggtt cgaaatcagt gagacctgga ttcaaattct gccttgaaat 1080 attgtgactc tgggaatgac aacacctggt ttgttctctg ttgtatcccc agccccaaag 1140 acagctcctg gccatatatc aaggtttcaa taaatatttg ctaaatgagt gaaaaaaaaa 1200 aaaaaaa 1207 <210> 233 <211> 250 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein 11 isoform 1 <400> 233 Met Arg Ile Leu Gln Leu Ile Leu Leu Ala Leu Ala Thr Gly Leu Val 1 5 10 15 Gly Gly Glu Thr Arg Ile Ile Lys Gly Phe Glu Cys Lys Pro His Ser 20 25 30 Gln Pro Trp Gln Ala Ala Leu Phe Glu Lys Thr Arg Leu Leu Cys Gly 35 40 45 Ala Thr Leu Ile Ala Pro Arg Trp Leu Leu Thr Ala Ala His Cys Leu 50 55 60 Lys Pro Arg Tyr Ile Val His Leu Gly Gln His Asn Leu Gln Lys Glu 65 70 75 80 Glu Gly Cys Glu Gln Thr Arg Thr Ala Thr Glu Ser Phe Pro His Pro 85 90 95 Gly Phe Asn Asn Ser Leu Pro Asn Lys Asp His Arg Asn Asp Ile Met 100 105 110 Leu Val Lys Met Ala Ser Pro Val Ser Ile Thr Trp Ala Val Arg Pro 115 120 125 Leu Thr Leu Ser Ser Arg Cys Val Thr Ala Gly Thr Ser Cys Leu Ile 130 135 140 Ser Gly Trp Gly Ser Thr Ser Ser Pro Gln Leu Arg Leu Pro His Thr 145 150 155 160 Leu Arg Cys Ala Asn Ile Thr Ile Ile Glu His Gln Lys Cys Glu Asn 165 170 175 Ala Tyr Pro Gly Asn Ile Thr Asp Thr Met Val Cys Ala Ser Val Gln 180 185 190 Glu Gly Gly Lys Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val 195 200 205 Cys Asn Gln Ser Leu Gln Gly Ile Ile Ser Trp Gly Gln Asp Pro Cys 210 215 220 Ala Ile Thr Arg Lys Pro Gly Val Tyr Thr Lys Val Cys Lys Tyr Val 225 230 235 240 Asp Trp Ile Gln Glu Thr Met Lys Asn Asn 245 250 <210> 234 <211> 1289 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein 11 transcript variant 2 <400> 234 ctgccttgct ccacacctgg tcaggggaga gaggggagga aagccaaggg aagggaccta 60 actgaaaaca aacaagctgg gagaagcagg aatctgcgct cgggttccgc agatgcagag 120 gttgaggtgg ctgcgggact ggaagtcatc gggcagaggt ctcacagcag ccaaggaacc 180 tggggcccgc tcctcccccc tccaggccat gaggattctg cagttaatcc tgcttgctct 240 ggcaacaggg cttgtagggg gagagaccag gatcatcaag gggttcgagt gcaagcctca 300 ctcccagccc tggcaggcag ccctgttcga gaagacgcgg ctactctgtg gggcgacgct 360 catcgccccc agatggctcc tgacagcagc ccactgcctc aagccccgct acatagttca 420 cctggggcag cacaacctcc agaaggagga gggctgtgag cagacccgga cagccactga 480 gtccttcccc caccccggct tcaacaacag cctccccaac aaagaccacc gcaatgacat 540 catgctggtg aagatggcat cgccagtctc catcacctgg gctgtgcgac ccctcaccct 600 ctcctcacgc tgtgtcactg ctggcaccag ctgcctcatt tccggctggg gcagcacgtc 660 cagcccccag ttacgcctgc ctcacacctt gcgatgcgcc aacatcacca tcattgagca 720 ccagaagtgt gagaacgcct accccggcaa catcacagac accatggtgt gtgccagcgt 780 gcaggaaggg ggcaaggact cctgccaggg tgactccggg ggccctctgg tctgtaacca 840 gtctcttcaa ggcattatct cctggggcca ggatccgtgt gcgatcaccc gaaagcctgg 900 tgtctacacg aaagtctgca aatatgtgga ctggatccag gagacgatga agaacaatta 960 gactggaccc acccaccaca gcccatcacc ctccatttcc acttggtgtt tggttcctgt 1020 tcactctgtt aataagaaac cctaagccaa gaccctctac gaacattctt tgggcctcct 1080 ggactacagg agatgctgtc acttaataat caacctgggg ttcgaaatca gtgagacctg 1140 gattcaaatt ctgccttgaa atattgtgac tctgggaatg acaacacctg gtttgttctc 1200 tgttgtatcc ccagccccaa agacagctcc tggccatata tcaaggtttc aataaatatt 1260 tgctaaatga gtgaaaaaaa aaaaaaaaa 1289 <210> 235 <211> 282 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein 11 isoform 2 <400> 235 Met Gln Arg Leu Arg Trp Leu Arg Asp Trp Lys Ser Ser Gly Arg Gly 1 5 10 15 Leu Thr Ala Ala Lys Glu Pro Gly Ala Arg Ser Ser Pro Leu Gln Ala 20 25 30 Met Arg Ile Leu Gln Leu Ile Leu Leu Ala Leu Ala Thr Gly Leu Val 35 40 45 Gly Gly Glu Thr Arg Ile Ile Lys Gly Phe Glu Cys Lys Pro His Ser 50 55 60 Gln Pro Trp Gln Ala Ala Leu Phe Glu Lys Thr Arg Leu Leu Cys Gly 65 70 75 80 Ala Thr Leu Ile Ala Pro Arg Trp Leu Leu Thr Ala Ala His Cys Leu 85 90 95 Lys Pro Arg Tyr Ile Val His Leu Gly Gln His Asn Leu Gln Lys Glu 100 105 110 Glu Gly Cys Glu Gln Thr Arg Thr Ala Thr Glu Ser Phe Pro His Pro 115 120 125 Gly Phe Asn Asn Ser Leu Pro Asn Lys Asp His Arg Asn Asp Ile Met 130 135 140 Leu Val Lys Met Ala Ser Pro Val Ser Ile Thr Trp Ala Val Arg Pro 145 150 155 160 Leu Thr Leu Ser Ser Arg Cys Val Thr Ala Gly Thr Ser Cys Leu Ile 165 170 175 Ser Gly Trp Gly Ser Thr Ser Ser Pro Gln Leu Arg Leu Pro His Thr 180 185 190 Leu Arg Cys Ala Asn Ile Thr Ile Ile Glu His Gln Lys Cys Glu Asn 195 200 205 Ala Tyr Pro Gly Asn Ile Thr Asp Thr Met Val Cys Ala Ser Val Gln 210 215 220 Glu Gly Gly Lys Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val 225 230 235 240 Cys Asn Gln Ser Leu Gln Gly Ile Ile Ser Trp Gly Gln Asp Pro Cys 245 250 255 Ala Ile Thr Arg Lys Pro Gly Val Tyr Thr Lys Val Cys Lys Tyr Val 260 265 270 Asp Trp Ile Gln Glu Thr Met Lys Asn Asn 275 280 <210> 236 <211> 802 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> anionic trypsin (II) <400> 236 accaccatga atctacttct gatccttacc tttgttgcag ctgctgttgc tgcccccttt 60 gatgatgatg acaagatcgt tgggggctac atctgtgagg agaattctgt cccctaccag 120 gtgtccttga attctggcta ccacttctgc ggtggctccc tcatcagcga acagtgggtg 180 gtgtcagcag gtcactgcta caagtcccgc atccaggtga gactgggaga gcacaacatc 240 gaagtcctgg aggggaatga acagttcatc aatgcagcca agatcatccg ccaccccaaa 300 tacaacagcc ggactctgga caatgacatc ctgctgatca agctctcctc acctgccgtc 360 atcaattccc gcgtgtccgc catctctctg cccactgccc ctccagctgc tggcaccgag 420 tccctcatct ccggctgggg caacactctg agttctggtg ccgactaccc agacgagctg 480 cagtgcctgg atgctcctgt gctgagccag gctgagtgtg aagcctccta ccctggaaag 540 attaccaaca acatgttctg tgtgggcttc ctcgagggag gcaaggattc ctgccagggt 600 gattctggtg gccctgtggt ctccaatgga gagctccaag gaattgtctc ctggggctat 660 ggctgtgccc agaagaacag gcctggagtc tacaccaagg tctacaacta tgtggactgg 720 attaaggaca ccatagctgc caacagctaa agcccctggt ccctctgcag tctctatacc 780 aataaagtga ccctgctctc ac 802 <210> 237 <211> 247 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> anionic trypsin (II) <400> 237 Met Asn Leu Leu Leu Ile Leu Thr Phe Val Ala Ala Ala Val Ala Ala 1 5 10 15 Pro Phe Asp Asp Asp Asp Lys Ile Val Gly Gly Tyr Ile Cys Glu Glu 20 25 30 Asn Ser Val Pro Tyr Gln Val Ser Leu Asn Ser Gly Tyr His Phe Cys 35 40 45 Gly Gly Ser Leu Ile Ser Glu Gln Trp Val Val Ser Ala Gly His Cys 50 55 60 Tyr Lys Ser Arg Ile Gln Val Arg Leu Gly Glu His Asn Ile Glu Val 65 70 75 80 Leu Glu Gly Asn Glu Gln Phe Ile Asn Ala Ala Lys Ile Ile Arg His 85 90 95 Pro Lys Tyr Asn Ser Arg Thr Leu Asp Asn Asp Ile Leu Leu Ile Lys 100 105 110 Leu Ser Ser Pro Ala Val Ile Asn Ser Arg Val Ser Ala Ile Ser Leu 115 120 125 Pro Thr Ala Pro Pro Ala Ala Gly Thr Glu Ser Leu Ile Ser Gly Trp 130 135 140 Gly Asn Thr Leu Ser Ser Gly Ala Asp Tyr Pro Asp Glu Leu Gln Cys 145 150 155 160 Leu Asp Ala Pro Val Leu Ser Gln Ala Glu Cys Glu Ala Ser Tyr Pro 165 170 175 Gly Lys Ile Thr Asn Asn Met Phe Cys Val Gly Phe Leu Glu Gly Gly 180 185 190 Lys Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Val Val Ser Asn Gly 195 200 205 Glu Leu Gln Gly Ile Val Ser Trp Gly Tyr Gly Cys Ala Gln Lys Asn 210 215 220 Arg Pro Gly Val Tyr Thr Lys Val Tyr Asn Tyr Val Asp Trp Ile Lys 225 230 235 240 Asp Thr Ile Ala Ala Asn Ser 245 <210> 238 <211> 1475 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> LOC144757 peptidase <400> 238 acctgccgcc atcttgctca ccagcctcca aaatgcggct ggggctcctg agcgtggcgc 60 tgttgtttgt ggggagctct cacttatact cagaccacta ctcgccctct ggaaggcaca 120 ggctcggccc ctcgccggaa ccggcggcta gttcccagca ggctgaggcc gtccgcaaga 180 ggctccggcg gcggagggag ggaggggcgc atgcaaagga ttgtggaaca gcaccgctta 240 aggatgtgtt gcaagggtct cggattatag ggggcaccga agcacaagct ggcgcatggc 300 cgtgggtggt gagcctgcag attaaatatg gccgtgttct tgttcatgta tgtgggggaa 360 ccctagtgag agagaggtgg gtcctcacag ctgcccactg cactaaagac gctagcgatc 420 ctttaatgtg gacagctgtg attggaacta ataatataca tggacgctat cctcatacca 480 agaagataaa aattaaagca atcattattc atccaaactt cattttggaa tcttatgtaa 540 atgatattgc actttttcac ttaaaaaaag cagtgaggta taatgactat attcagccta 600 tttgcctacc ttttgatgtt ttccaaatcc tggacggaaa cacaaagtgt tttataagtg 660 gctggggaag aacaaaagaa gaaggtaacg ctacaaatat tttacaagat gcagaagtgc 720 attatatttc tcgagagatg tgtaattctg agaggagtta tgggggaata attcctaaca 780 cttcattttg tgcaggtgat gaagatggag cttttgatac ttgcaggggt gacagtgggg 840 gaccattaat gtgctactta ccagaatata aaagattttt tgtaatggga attaccagtt 900 acggacatgg ctgtggtcga agaggttttc ctggtgtcta tattgggcca tccttctacc 960 aaaagtggct gacagagcat ttcttccatg caagcactca aggcatactt actataaata 1020 ttttacgtgg ccagatcctc atagctttat gttttgtcat cttactagca acaacataaa 1080 gaaattctga aggctttcat atctttattt tgcattgtgt ccctttctat gttctatata 1140 atgaacatca tttattcttc tagcaattaa ttgcctacat tagagatttc atgtgaacat 1200 tttatgggct ataagtattg tgacagatat acaattgtaa ttttggcact gaatcacatg 1260 tctccttgaa atatcttgat tattttataa tcataattct gtatctggaa tactcataga 1320 gtttgtacaa aatattcagt taaacatata tgtgtataaa tgccaaataa tagtttataa 1380 ttaaaatgaa agctgtcatt tggttaaatt aataaaaatt ctttcttaga ttttattcta 1440 aaaaaaaaaa aaaaaaaaga aaaaaaaaaa aaaaa 1475 <210> 239 <211> 348 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> LOC144757 peptidase <400> 239 Met Arg Leu Gly Leu Leu Ser Val Ala Leu Leu Phe Val Gly Ser Ser 1 5 10 15 His Leu Tyr Ser Asp His Tyr Ser Pro Ser Gly Arg His Arg Leu Gly 20 25 30 Pro Ser Pro Glu Pro Ala Ala Ser Ser Gln Gln Ala Glu Ala Val Arg 35 40 45 Lys Arg Leu Arg Arg Arg Arg Glu Gly Gly Ala His Ala Lys Asp Cys 50 55 60 Gly Thr Ala Pro Leu Lys Asp Val Leu Gln Gly Ser Arg Ile Ile Gly 65 70 75 80 Gly Thr Glu Ala Gln Ala Gly Ala Trp Pro Trp Val Val Ser Leu Gln 85 90 95 Ile Lys Tyr Gly Arg Val Leu Val His Val Cys Gly Gly Thr Leu Val 100 105 110 Arg Glu Arg Trp Val Leu Thr Ala Ala His Cys Thr Lys Asp Ala Ser 115 120 125 Asp Pro Leu Met Trp Thr Ala Val Ile Gly Thr Asn Asn Ile His Gly 130 135 140 Arg Tyr Pro His Thr Lys Lys Ile Lys Ile Lys Ala Ile Ile Ile His 145 150 155 160 Pro Asn Phe Ile Leu Glu Ser Tyr Val Asn Asp Ile Ala Leu Phe His 165 170 175 Leu Lys Lys Ala Val Arg Tyr Asn Asp Tyr Ile Gln Pro Ile Cys Leu 180 185 190 Pro Phe Asp Val Phe Gln Ile Leu Asp Gly Asn Thr Lys Cys Phe Ile 195 200 205 Ser Gly Trp Gly Arg Thr Lys Glu Glu Gly Asn Ala Thr Asn Ile Leu 210 215 220 Gln Asp Ala Glu Val His Tyr Ile Ser Arg Glu Met Cys Asn Ser Glu 225 230 235 240 Arg Ser Tyr Gly Gly Ile Ile Pro Asn Thr Ser Phe Cys Ala Gly Asp 245 250 255 Glu Asp Gly Ala Phe Asp Thr Cys Arg Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu 260 265 270 Met Cys Tyr Leu Pro Glu Tyr Lys Arg Phe Phe Val Met Gly Ile Thr 275 280 285 Ser Tyr Gly His Gly Cys Gly Arg Arg Gly Phe Pro Gly Val Tyr Ile 290 295 300 Gly Pro Ser Phe Tyr Gln Lys Trp Leu Thr Glu His Phe Phe His Ala 305 310 315 320 Ser Thr Gln Gly Ile Leu Thr Ile Asn Ile Leu Arg Gly Gln Ile Leu 325 330 335 Ile Ala Leu Cys Phe Val Ile Leu Leu Ala Thr Thr 340 345 <210> 240 <211> 1164 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Mername-AA169 peptidase <400> 240 atgattgccg ttctcattgt gttgtccctg acagtggtgg cagtgaccat aggtctcctg 60 gttcacttcc tagtatttga ccaaaaaaag gagtactatc atggctcctt taaaatttta 120 gatccacaaa tcaataacaa tttcggacaa agcaacacat atcaacttaa ggacttacga 180 gagacgaccg aaaatttggt ggatgagata tttatagatt cagcctggaa gaaaaattat 240 atcaagaacc aagtagtcag actgactcca gaggaagatg gtgtgaaagt agatgtcatt 300 atggtgttcc agttcccctc tactgaacaa agggcagtaa gagagaagaa aatccaaagc 360 atcttaaatc agaagataag gaatttaaga gccttgccaa taaatgcctc atcagttcaa 420 gttaatggtt gtggtaaacg agttgttcca ttaaacgtca acagaatagc atctggagtc 480 attgcaccca aggcggcctg gccttggcaa gcttcccttc agtatgataa catccatcag 540 tgtggggcca ccttgattag taacacatgg cttgtcactg cagcacactg cttccagaag 600 tataaaaatc cacatcaatg gactgttagt tttggaacaa aaatcaaccc tcccttaatg 660 aaaagaaatg tcagaagatt tattatccat gagaagtacc gctctgcagc aagagagtac 720 gacattgctg ttgtgcaggt ctcttccaga gtcacctttt cggatgacat acgccagatt 780 tgtttgccag aagcctctgc atccttccaa ccaaatttga ctgtccacat cacaggattt 840 ggagcacttt actatggtgg ggaatcccaa aatgatctcc gagaagccag agtgaaaatc 900 ataagtgatg atgtctgcaa gcaaccacag gtgtatggca atgatataaa acctggaatg 960 ttctgtgccg gatatatgga aggaatttat gatgcctgca ggggtgattc tgggggacct 1020 ttagtcacaa gggatctgaa agatacgtgg tatctcattg gaattgtaag ctggggagat 1080 aactgtggtc aaaaggacaa gcctggagtc tacacacaag tgacttatta ccgaaactgg 1140 attgcttcaa aaacaggcat ctaa 1164 <210> 241 <211> 387 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mername-AA169 peptidase <400> 241 Met Ile Ala Val Leu Ile Val Leu Ser Leu Thr Val Val Ala Val Thr 1 5 10 15 Ile Gly Leu Leu Val His Phe Leu Val Phe Asp Gln Lys Lys Glu Tyr 20 25 30 Tyr His Gly Ser Phe Lys Ile Leu Asp Pro Gln Ile Asn Asn Asn Phe 35 40 45 Gly Gln Ser Asn Thr Tyr Gln Leu Lys Asp Leu Arg Glu Thr Thr Glu 50 55 60 Asn Leu Val Asp Glu Ile Phe Ile Asp Ser Ala Trp Lys Lys Asn Tyr 65 70 75 80 Ile Lys Asn Gln Val Val Arg Leu Thr Pro Glu Glu Asp Gly Val Lys 85 90 95 Val Asp Val Ile Met Val Phe Gln Phe Pro Ser Thr Glu Gln Arg Ala 100 105 110 Val Arg Glu Lys Lys Ile Gln Ser Ile Leu Asn Gln Lys Ile Arg Asn 115 120 125 Leu Arg Ala Leu Pro Ile Asn Ala Ser Ser Val Gln Val Asn Gly Cys 130 135 140 Gly Lys Arg Val Val Pro Leu Asn Val Asn Arg Ile Ala Ser Gly Val 145 150 155 160 Ile Ala Pro Lys Ala Ala Trp Pro Trp Gln Ala Ser Leu Gln Tyr Asp 165 170 175 Asn Ile His Gln Cys Gly Ala Thr Leu Ile Ser Asn Thr Trp Leu Val 180 185 190 Thr Ala Ala His Cys Phe Gln Lys Tyr Lys Asn Pro His Gln Trp Thr 195 200 205 Val Ser Phe Gly Thr Lys Ile Asn Pro Pro Leu Met Lys Arg Asn Val 210 215 220 Arg Arg Phe Ile Ile His Glu Lys Tyr Arg Ser Ala Ala Arg Glu Tyr 225 230 235 240 Asp Ile Ala Val Val Gln Val Ser Ser Arg Val Thr Phe Ser Asp Asp 245 250 255 Ile Arg Gln Ile Cys Leu Pro Glu Ala Ser Ala Ser Phe Gln Pro Asn 260 265 270 Leu Thr Val His Ile Thr Gly Phe Gly Ala Leu Tyr Tyr Gly Gly Glu 275 280 285 Ser Gln Asn Asp Leu Arg Glu Ala Arg Val Lys Ile Ile Ser Asp Asp 290 295 300 Val Cys Lys Gln Pro Gln Val Tyr Gly Asn Asp Ile Lys Pro Gly Met 305 310 315 320 Phe Cys Ala Gly Tyr Met Glu Gly Ile Tyr Asp Ala Cys Arg Gly Asp 325 330 335 Ser Gly Gly Pro Leu Val Thr Arg Asp Leu Lys Asp Thr Trp Tyr Leu 340 345 350 Ile Gly Ile Val Ser Trp Gly Asp Asn Cys Gly Gln Lys Asp Lys Pro 355 360 365 Gly Val Tyr Thr Gln Val Thr Tyr Tyr Arg Asn Trp Ile Ala Ser Lys 370 375 380 Thr Gly Ile 385 <210> 242 <211> 431 <212> PRT <213> Rattus norvegicus <220> <223> Mername-AA171 peptidase <400> 242 Met Ala Arg Gly Gln Pro Arg Arg Ser Glu Glu Pro Trp Thr Ala Leu 1 5 10 15 Arg Asn Arg Thr Glu Cys Lys Thr Lys Ile Lys Leu Thr Lys Cys Gly 20 25 30 Lys Ile Thr Leu Gly Ile Leu Thr Ala Val Ile Ala Ala Val Val Ile 35 40 45 Gly Leu Ile Ala Tyr Phe Ala Ala Cys Gly Lys Thr Pro Phe Tyr Tyr 50 55 60 His Val Ser Phe Lys Val Asn Asn Ile Asp Tyr Asp Ser Lys Phe Ala 65 70 75 80 Lys Pro Tyr Ser Gln Glu Tyr Met Asp Leu Asn Lys Arg Ile Val Ser 85 90 95 Leu Met Asn Glu Thr Phe His Glu Ser Lys Leu Arg Lys Gln Tyr Val 100 105 110 Lys Ala His Thr Val Gln Val Ser Lys Ala Lys Gly Lys Val Val Ile 115 120 125 His Gly Val Leu Lys Phe Lys Ser Cys Tyr Lys Asn Asn Val Glu Lys 130 135 140 Phe Trp Asp Ser Val Glu Thr Ile Leu Tyr Gln Lys Leu Lys Ser Gln 145 150 155 160 Thr Arg Leu Leu Ile Asp Ser Ser Ser Phe Lys Phe Ser Asp Ile Ala 165 170 175 Met Pro Ile Ala Glu Asp Leu Leu Asn Thr Cys Cys Gly Arg Arg Thr 180 185 190 Ile Thr Pro Gly Gly His Lys Val Ala Gly Gly Gln Asp Ala Glu Glu 195 200 205 Gly Glu Trp Pro Trp Gln Ala Ser Leu Gln Gln Asn Asn Val His Arg 210 215 220 Cys Gly Ala Thr Leu Ile Ser Asn Ser Trp Leu Ile Thr Ala Ala His 225 230 235 240 Cys Phe Val Arg Ser Ala Asn Pro Lys Asp Trp Lys Val Ser Phe Gly 245 250 255 Phe Leu Leu Ser Lys Pro Gln Ala Gln Arg Ala Val Lys Ser Ile Val 260 265 270 Ile His Glu Asn Tyr Ser Tyr Pro Ala His Asn Asn Asp Ile Ala Val 275 280 285 Val Arg Leu Ser Ser Pro Val Leu Tyr Glu Asn Asn Ile Arg Arg Ala 290 295 300 Cys Leu Pro Glu Ala Thr Gln Lys Phe Pro Pro Asn Ser Asp Val Val 305 310 315 320 Val Thr Gly Trp Gly Thr Leu Lys Ser Asp Gly Asp Ser Pro Asn Ile 325 330 335 Leu Gln Lys Gly Arg Val Lys Ile Ile Asp Asn Lys Thr Cys Asn Ser 340 345 350 Gly Lys Ala Tyr Gly Gly Val Ile Thr Pro Gly Met Leu Cys Ala Gly 355 360 365 Phe Leu Glu Gly Arg Val Asp Ala Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro 370 375 380 Leu Val Ser Glu Asp Ser Lys Gly Ile Trp Phe Leu Ala Gly Ile Val 385 390 395 400 Ser Trp Gly Asp Glu Cys Ala Leu Pro Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr 405 410 415 Arg Val Thr His Tyr Arg Asp Trp Ile Ser Ser Lys Thr Gly Leu 420 425 430 <210> 243 <211> 247 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mername-AA174 peptidase <400> 243 Met Asn Pro Leu Leu Ile Leu Ala Phe Val Gly Ala Ala Val Ala Val 1 5 10 15 Pro Phe Asp Asp Asp Asp Lys Ile Val Gly Gly Tyr Thr Cys Glu Glu 20 25 30 Asn Ser Val Pro Tyr Gln Val Ser Leu Asn Ser Gly Ser His Phe Cys 35 40 45 Gly Gly Ser Leu Ile Ser Glu Gln Trp Val Val Ser Ala Gly His Cys 50 55 60 Tyr Lys Pro His Ile Gln Val Arg Leu Gly Glu His Asn Ile Glu Val 65 70 75 80 Leu Glu Gly Asn Glu Gln Phe Ile Asn Ala Ala Lys Ile Ile Arg His 85 90 95 Pro Lys Tyr Asn Arg Ile Thr Leu Asn Asn Asp Ile Met Leu Ile Lys 100 105 110 Leu Ser Thr Pro Ala Val Ile Asn Ala His Val Ser Thr Ile Ser Leu 115 120 125 Pro Thr Ala Pro Pro Ala Ala Gly Thr Glu Cys Leu Ile Ser Gly Trp 130 135 140 Gly Asn Thr Leu Ser Ser Gly Ala Asp Tyr Pro Asp Glu Leu Gln Cys 145 150 155 160 Leu Asp Ala Pro Val Leu Thr Gln Ala Lys Cys Lys Ala Ser Tyr Pro 165 170 175 Leu Lys Ile Thr Ser Lys Met Phe Cys Val Gly Phe Leu Glu Gly Gly 180 185 190 Lys Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Val Val Cys Asn Gly 195 200 205 Gln Leu Gln Gly Ile Val Ser Trp Gly Tyr Gly Cys Ala Gln Lys Arg 210 215 220 Arg Pro Gly Val Tyr Thr Lys Val Tyr Asn Tyr Val Asp Trp Ile Lys 225 230 235 240 Asp Thr Ile Ala Ala Asn Ser 245 <210> 244 <211> 1099 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Mername-AA175 peptidase <400> 244 gcacagccca gggccatgct cctgttctca gtgttgctgc tcctgtccct ggtcacggga 60 actcagctcg gtccacggac tcctctccca gaggctggag tggctatcct aggcagggct 120 aggggagccc accgccctca gccccgtcat ccccccagcc cagtcagtga atgtggtgac 180 agatctattt tcgagggaag aactcggtat tccagaatca caggggggat ggaggcggag 240 gtgggtgagt ttccgtggca ggtgagtatt caggcaagaa gtgaaccttt ctgtggcggc 300 tccatcctca acaagtggtg gattctcact gcggctcact gcttatattc cgaggagctg 360 tttccagaag aactgagtgt cgtgctgggg accaacgact taactagccc atccatggaa 420 ataaaggagg tcgccagcat cattcttcac aaagacttta agagagccaa catggacaat 480 gacattgcct tgctgctgct ggcttcgccc atcaagctcg atgacctgaa ggtgcccatc 540 tgcctcccca cgcagcccgg ccctgccaca tggcgcgaat gctgggtggc aggttggggc 600 cagaccaatg ctgctgacaa aaactctgtg aaaacggatc tgatgaaagt gccaatggtc 660 atcatggact gggaggagtg ttcaaagatg tttccaaaac ttaccaaaaa tatgctgtgt 720 gccggataca agaatgagag ctatgatgcc tgcaagggtg acagtggggg gcctctggtc 780 tgcaccccag agcctggtga gaagtggtac caggtgggca tcatcagctg gggaaagagc 840 tgtggagaga agaacacccc agggatatac acctcgttgg tgaactacaa cctctggatc 900 gagaaagtga cccagctaga gggcaggccc ttcaatgcag agaaaaggag gacttctgtc 960 aaacagaaac ctatgggctc cccagtctcg ggagtcccag agccaggcag ccccagatcc 1020 tggctcctgc tctgtcccct gtcccatgtg ttgttcagag ctattttgta ctgataataa 1080 aatagaggct attctttca 1099 <210> 245 <211> 352 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mername-AA175 peptidase <400> 245 Met Leu Leu Phe Ser Val Leu Leu Leu Leu Ser Leu Val Thr Gly Thr 1 5 10 15 Gln Leu Gly Pro Arg Thr Pro Leu Pro Glu Ala Gly Val Ala Ile Leu 20 25 30 Gly Arg Ala Arg Gly Ala His Arg Pro Gln Pro Arg His Pro Pro Ser 35 40 45 Pro Val Ser Glu Cys Gly Asp Arg Ser Ile Phe Glu Gly Arg Thr Arg 50 55 60 Tyr Ser Arg Ile Thr Gly Gly Met Glu Ala Glu Val Gly Glu Phe Pro 65 70 75 80 Trp Gln Val Ser Ile Gln Ala Arg Ser Glu Pro Phe Cys Gly Gly Ser 85 90 95 Ile Leu Asn Lys Trp Trp Ile Leu Thr Ala Ala His Cys Leu Tyr Ser 100 105 110 Glu Glu Leu Phe Pro Glu Glu Leu Ser Val Val Leu Gly Thr Asn Asp 115 120 125 Leu Thr Ser Pro Ser Met Glu Ile Lys Glu Val Ala Ser Ile Ile Leu 130 135 140 His Lys Asp Phe Lys Arg Ala Asn Met Asp Asn Asp Ile Ala Leu Leu 145 150 155 160 Leu Leu Ala Ser Pro Ile Lys Leu Asp Asp Leu Lys Val Pro Ile Cys 165 170 175 Leu Pro Thr Gln Pro Gly Pro Ala Thr Trp Arg Glu Cys Trp Val Ala 180 185 190 Gly Trp Gly Gln Thr Asn Ala Ala Asp Lys Asn Ser Val Lys Thr Asp 195 200 205 Leu Met Lys Val Pro Met Val Ile Met Asp Trp Glu Glu Cys Ser Lys 210 215 220 Met Phe Pro Lys Leu Thr Lys Asn Met Leu Cys Ala Gly Tyr Lys Asn 225 230 235 240 Glu Ser Tyr Asp Ala Cys Lys Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys 245 250 255 Thr Pro Glu Pro Gly Glu Lys Trp Tyr Gln Val Gly Ile Ile Ser Trp 260 265 270 Gly Lys Ser Cys Gly Glu Lys Asn Thr Pro Gly Ile Tyr Thr Ser Leu 275 280 285 Val Asn Tyr Asn Leu Trp Ile Glu Lys Val Thr Gln Leu Glu Gly Arg 290 295 300 Pro Phe Asn Ala Glu Lys Arg Arg Thr Ser Val Lys Gln Lys Pro Met 305 310 315 320 Gly Ser Pro Val Ser Gly Val Pro Glu Pro Gly Ser Pro Arg Ser Trp 325 330 335 Leu Leu Leu Cys Pro Leu Ser His Val Leu Phe Arg Ala Ile Leu Tyr 340 345 350 <210> 246 <211> 1927 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> stratum corneum chymotryptic enzyme transcript variant 1 <400> 246 tgccagccca agtcggaact tggatcacat cagatcctct cgagctccag caggagaggc 60 ccttcctcgc ctggcagccc ctgagcggct cagcagggca ccatggcaag atcccttctc 120 ctgcccctgc agatcttact gctatcctta gccttggaaa ctgcaggaga agaagcccag 180 ggtgacaaga ttattgatgg cgccccatgt gcaagaggct cccacccatg gcaggtggcc 240 ctgctcagtg gcaatcagct ccactgcgga ggcgtcctgg tcaatgagcg ctgggtgctc 300 actgccgccc actgcaagat gaatgagtac accgtgcacc tgggcagtga tacgctgggc 360 gacaggagag ctcagaggat caaggcctcg aagtcattcc gccaccccgg ctactccaca 420 cagacccatg ttaatgacct catgctcgtg aagctcaata gccaggccag gctgtcatcc 480 atggtgaaga aagtcaggct gccctcccgc tgcgaacccc ctggaaccac ctgtactgtc 540 tccggctggg gcactaccac gagcccagat gtgacctttc cctctgacct catgtgcgtg 600 gatgtcaagc tcatctcccc ccaggactgc acgaaggttt acaaggactt actggaaaat 660 tccatgctgt gcgctggcat ccccgactcc aagaaaaacg cctgcaatgg tgactcaggg 720 ggaccgttgg tgtgcagagg taccctgcaa ggtctggtgt cctggggaac tttcccttgc 780 ggccaaccca atgacccagg agtctacact caagtgtgca agttcaccaa gtggataaat 840 gacaccatga aaaagcatcg ctaacgccac actgagttaa ttaactgtgt gcttccaaca 900 gaaaatgcac aggagtgagg acgccgatga cctatgaagt caaatttgac tttacctttc 960 ctcaaagata tatttaaacc aacctcatgc cctgttgata aaccaatcaa attggtaaag 1020 acctaaaacc aaaacaaata aagaaacaca aaaccctcag tgctggagaa gagtcagtga 1080 gaccagcact ctcaaacact ggaactggac gttcgtacag tctttacgga agacacttgg 1140 tcaacgtaca ccgagaccct tattcaccac ctttgaccca gtaactctaa tcttaggaag 1200 aacctactga aacaaaaaaa atccaaaatg tagaacaaga cttgaattta ccatgatatt 1260 atttatcaca gaaatgaagt gaaaccatca aacatgttcc aaaagtacca gatggcttaa 1320 ataatagtct ggcttggcac aacgatgttt tttttctttg agacagagtc tctgttgctt 1380 gggctgcaat gcagtgatgc aatcttggct cactgcaacc tccgcctcct gggttcaagt 1440 gattctcgtg cttcagcctc ccaagtacct gggactacag gtgtgcacca ccacaccagg 1500 ctaatttttt gtgtattttt actagagaca gggtttcacc atgttggcca gcgtggtctt 1560 gaacgcctga cctcagatga tccacccacc ttggcctccc aaagtgctgg gattacaggc 1620 atgagccacc acggccagcc cacaatgata ttacaaacct attaaaaatg atacttagac 1680 agaattgtca gtattattca agaacattta ggctatagga tgttaaatga caaaaggaag 1740 gacaaaaata tatatgtatg tgaccctacc cataaaaaat gaaatattca cagaatcaga 1800 tctgaaaaca catgtcccag actgcatact ggggtcgtca tgaggtgtct ccttccttct 1860 gtgtactttt ccttgaatgt gcacttttat aacatgaaaa ataaaggtgg ggaaaaaagt 1920 ctgaaga 1927 <210> 247 <211> 253 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> stratum corneum chymotryptic enzyme transcript variant 1 <400> 247 Met Ala Arg Ser Leu Leu Leu Pro Leu Gln Ile Leu Leu Leu Ser Leu 1 5 10 15 Ala Leu Glu Thr Ala Gly Glu Glu Ala Gln Gly Asp Lys Ile Ile Asp 20 25 30 Gly Ala Pro Cys Ala Arg Gly Ser His Pro Trp Gln Val Ala Leu Leu 35 40 45 Ser Gly Asn Gln Leu His Cys Gly Gly Val Leu Val Asn Glu Arg Trp 50 55 60 Val Leu Thr Ala Ala His Cys Lys Met Asn Glu Tyr Thr Val His Leu 65 70 75 80 Gly Ser Asp Thr Leu Gly Asp Arg Arg Ala Gln Arg Ile Lys Ala Ser 85 90 95 Lys Ser Phe Arg His Pro Gly Tyr Ser Thr Gln Thr His Val Asn Asp 100 105 110 Leu Met Leu Val Lys Leu Asn Ser Gln Ala Arg Leu Ser Ser Met Val 115 120 125 Lys Lys Val Arg Leu Pro Ser Arg Cys Glu Pro Pro Gly Thr Thr Cys 130 135 140 Thr Val Ser Gly Trp Gly Thr Thr Thr Ser Pro Asp Val Thr Phe Pro 145 150 155 160 Ser Asp Leu Met Cys Val Asp Val Lys Leu Ile Ser Pro Gln Asp Cys 165 170 175 Thr Lys Val Tyr Lys Asp Leu Leu Glu Asn Ser Met Leu Cys Ala Gly 180 185 190 Ile Pro Asp Ser Lys Lys Asn Ala Cys Asn Gly Asp Ser Gly Gly Pro 195 200 205 Leu Val Cys Arg Gly Thr Leu Gln Gly Leu Val Ser Trp Gly Thr Phe 210 215 220 Pro Cys Gly Gln Pro Asn Asp Pro Gly Val Tyr Thr Gln Val Cys Lys 225 230 235 240 Phe Thr Lys Trp Ile Asn Asp Thr Met Lys Lys His Arg 245 250 <210> 248 <211> 1927 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> stratum corneum chymotryptic enzyme transcript variant 2 <400> 248 ggagagggtg atgctggctc caagcctgac tctgctctcg agagctccag caggagaggc 60 ccttcctcgc ctggcagccc ctgagcggct cagcagggca ccatggcaag atcccttctc 120 ctgcccctgc agatcttact gctatcctta gccttggaaa ctgcaggaga agaagcccag 180 ggtgacaaga ttattgatgg cgccccatgt gcaagaggct cccacccatg gcaggtggcc 240 ctgctcagtg gcaatcagct ccactgcgga ggcgtcctgg tcaatgagcg ctgggtgctc 300 actgccgccc actgcaagat gaatgagtac accgtgcacc tgggcagtga tacgctgggc 360 gacaggagag ctcagaggat caaggcctcg aagtcattcc gccaccccgg ctactccaca 420 cagacccatg ttaatgacct catgctcgtg aagctcaata gccaggccag gctgtcatcc 480 atggtgaaga aagtcaggct gccctcccgc tgcgaacccc ctggaaccac ctgtactgtc 540 tccggctggg gcactaccac gagcccagat gtgacctttc cctctgacct catgtgcgtg 600 gatgtcaagc tcatctcccc ccaggactgc acgaaggttt acaaggactt actggaaaat 660 tccatgctgt gcgctggcat ccccgactcc aagaaaaacg cctgcaatgg tgactcaggg 720 ggaccgttgg tgtgcagagg taccctgcaa ggtctggtgt cctggggaac tttcccttgc 780 ggccaaccca atgacccagg agtctacact caagtgtgca agttcaccaa gtggataaat 840 gacaccatga aaaagcatcg ctaacgccac actgagttaa ttaactgtgt gcttccaaca 900 gaaaatgcac aggagtgagg acgccgatga cctatgaagt caaatttgac tttacctttc 960 ctcaaagata tatttaaacc aacctcatgc cctgttgata aaccaatcaa attggtaaag 1020 acctaaaacc aaaacaaata aagaaacaca aaaccctcag tgctggagaa gagtcagtga 1080 gaccagcact ctcaaacact ggaactggac gttcgtacag tctttacgga agacacttgg 1140 tcaacgtaca ccgagaccct tattcaccac ctttgaccca gtaactctaa tcttaggaag 1200 aacctactga aacaaaaaaa atccaaaatg tagaacaaga cttgaattta ccatgatatt 1260 atttatcaca gaaatgaagt gaaaccatca aacatgttcc aaaagtacca gatggcttaa 1320 ataatagtct ggcttggcac aacgatgttt tttttctttg agacagagtc tctgttgctt 1380 gggctgcaat gcagtgatgc aatcttggct cactgcaacc tccgcctcct gggttcaagt 1440 gattctcgtg cttcagcctc ccaagtacct gggactacag gtgtgcacca ccacaccagg 1500 ctaatttttt gtgtattttt actagagaca gggtttcacc atgttggcca gcgtggtctt 1560 gaacgcctga cctcagatga tccacccacc ttggcctccc aaagtgctgg gattacaggc 1620 atgagccacc acggccagcc cacaatgata ttacaaacct attaaaaatg atacttagac 1680 agaattgtca gtattattca agaacattta ggctatagga tgttaaatga caaaaggaag 1740 gacaaaaata tatatgtatg tgaccctacc cataaaaaat gaaatattca cagaatcaga 1800 tctgaaaaca catgtcccag actgcatact ggggtcgtca tgaggtgtct ccttccttct 1860 gtgtactttt ccttgaatgt gcacttttat aacatgaaaa ataaaggtgg ggaaaaaagt 1920 ctgaaga 1927 <210> 249 <211> 253 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> stratum corneum chymotryptic enzyme <400> 249 Met Ala Arg Ser Leu Leu Leu Pro Leu Gln Ile Leu Leu Leu Ser Leu 1 5 10 15 Ala Leu Glu Thr Ala Gly Glu Glu Ala Gln Gly Asp Lys Ile Ile Asp 20 25 30 Gly Ala Pro Cys Ala Arg Gly Ser His Pro Trp Gln Val Ala Leu Leu 35 40 45 Ser Gly Asn Gln Leu His Cys Gly Gly Val Leu Val Asn Glu Arg Trp 50 55 60 Val Leu Thr Ala Ala His Cys Lys Met Asn Glu Tyr Thr Val His Leu 65 70 75 80 Gly Ser Asp Thr Leu Gly Asp Arg Arg Ala Gln Arg Ile Lys Ala Ser 85 90 95 Lys Ser Phe Arg His Pro Gly Tyr Ser Thr Gln Thr His Val Asn Asp 100 105 110 Leu Met Leu Val Lys Leu Asn Ser Gln Ala Arg Leu Ser Ser Met Val 115 120 125 Lys Lys Val Arg Leu Pro Ser Arg Cys Glu Pro Pro Gly Thr Thr Cys 130 135 140 Thr Val Ser Gly Trp Gly Thr Thr Thr Ser Pro Asp Val Thr Phe Pro 145 150 155 160 Ser Asp Leu Met Cys Val Asp Val Lys Leu Ile Ser Pro Gln Asp Cys 165 170 175 Thr Lys Val Tyr Lys Asp Leu Leu Glu Asn Ser Met Leu Cys Ala Gly 180 185 190 Ile Pro Asp Ser Lys Lys Asn Ala Cys Asn Gly Asp Ser Gly Gly Pro 195 200 205 Leu Val Cys Arg Gly Thr Leu Gln Gly Leu Val Ser Trp Gly Thr Phe 210 215 220 Pro Cys Gly Gln Pro Asn Asp Pro Gly Val Tyr Thr Gln Val Cys Lys 225 230 235 240 Phe Thr Lys Trp Ile Asn Asp Thr Met Lys Lys His Arg 245 250 <210> 250 <211> 2800 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> trypsin-like enzyme, respiratory <400> 250 atttgagtgg gaatctcaaa gcagttgagt aggcagaaaa aagaacctct tcattaagga 60 ttaaaatgta taggccagca cgtgtaactt cgacttcaag atttctgaat ccatatgtag 120 tatgtttcat tgtcgtcgca ggggtagtga tcctggcagt caccatagct ctacttgttt 180 actttttagc ttttgatcaa aaatcttact tttataggag cagttttcaa ctcctaaatg 240 ttgaatataa tagtcagtta aattcaccag ctacacagga atacaggact ttgagtggaa 300 gaattgaatc tctgattact aaaacattca aagaatcaaa tttaagaaat cagttcatca 360 gagctcatgt tgccaaactg aggcaagatg gtagtggtgt gagagcggat gttgtcatga 420 aatttcaatt cactagaaat aacaatggag catcaatgaa aagcagaatt gagtctgttt 480 tacgacaaat gctgaataac tctggaaacc tggaaataaa cccttcaact gagataacat 540 cacttactga ccaggctgca gcaaattggc ttattaatga atgtggggcc ggtccagacc 600 taataacatt gtctgagcag agaatccttg gaggcactga ggctgaggag ggaagctggc 660 cgtggcaagt cagtctgcgg ctcaataatg cccaccactg tggaggcagc ctgatcaata 720 acatgtggat cctgacagca gctcactgct tcagaagcaa ctctaatcct cgtgactgga 780 ttgccacgtc tggtatttcc acaacatttc ctaaactaag aatgagagta agaaatattt 840 taattcataa caattataaa tctgcaactc atgaaaatga cattgcactt gtgagacttg 900 agaacagtgt cacctttacc aaagatatcc atagtgtgtg tctcccagct gctacccaga 960 atattccacc tggctctact gcttatgtaa caggatgggg cgctcaagaa tatgctggcc 1020 acacagttcc agagctaagg caaggacagg tcagaataat aagtaatgat gtatgtaatg 1080 caccacatag ttataatgga gccatcttgt ctggaatgct gtgtgctgga gtacctcaag 1140 gtggagtgga cgcatgtcag ggtgactctg gtggcccact agtacaagaa gactcacggc 1200 ggctttggtt tattgtgggg atagtaagct ggggagatca gtgtggcctg ccggataagc 1260 caggagtgta tactcgagtg acagcctacc ttgactggat taggcaacaa actgggatct 1320 agtgcaacaa gtgcatccct gttgcaaagt ctgtatgcag gtgtgcctgt cttaaattcc 1380 aaagctttac atttcaactg aaaaagaaac tagaaatgtc ctaatttaac atcttgttac 1440 ataaatatgg tttaacaaac actgtttaac ctttctttat tattaaaggt tttctatttt 1500 ctccagagaa ctatatgaat gttgcatagt actgtggctg tgtaacagaa gaaacacact 1560 aaactaatta caaagttaac aatttcatta cagttgtgct aaatgcccgt agtgagaaga 1620 acaggaacct tgagcatgta tagtagagga acctgcacag gtctgatggg tcagaggggt 1680 cttctctggg tttcactgag gatgagaagt aagcaaactg tggaaacatg caaaggaaaa 1740 agtgatagaa taatattcaa gacaaaaaga acagtatgag gcaagagaaa taatatgtat 1800 ttaaaatttt tggttactca atatcttata cttagtatga gtcctaaaat taaaaatgtg 1860 aaactgttgt actatacgta taacctaacc ttaattattc tgtaagaaca tgcttccata 1920 ggaaatagtg gataattttc agctatttaa ggcaaaagct aaaatagttc actcctcaac 1980 tgagacccaa agaattatag atatttttca tgatgaccca tgaaaaatat cactcatcta 2040 cataaaggag agactatatc tattttatag agaagctaag aaatatacct acacaaactt 2100 gtcaggtgct ttacaactac atagtacttt ttaacaacaa aataataatt ttaagaatga 2160 aaaatttaat catcgggaag aacgtcccac tacagacttc ctatcactgg cagttatatt 2220 tttgagcgta aaagggtcgt caaacgctaa atctaagtaa cgaattgaaa gtttaaagag 2280 ggggaagagt tggtttgcaa aggaaaagtt taaatagctt aatatcaata gaatgatcct 2340 gaagacagaa aaaactttgt cactcttcct ctctcatttt ctttctctct ctctcccctt 2400 ctcatacaca tgcctccccc accaaagaat ataatgtaaa ttaaatccac taaaatgtaa 2460 tggcatgaaa atctctgtag tctgaatcac taatattcct gagtttttat gagctcctag 2520 tacagctaaa gtttgcctat gcatgatcat ctatgcgtca gagcttcctc cttctacaag 2580 ctaactccct gcatctgggc atcaggactg ctccatacat ttgctgaaaa cttcttgtat 2640 ttcctgatgt aaaattgtgc aaacacctac aataaagcca tctactttta gggaaaggga 2700 gttgaaaatg caaccaactc ttggcgaact gtacaaacaa atctttgcta tactttattt 2760 caaataaatt ctttttaaaa taaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2800 <210> 251 <211> 418 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> trypsin-like enzyme, respiratory <400> 251 Met Tyr Arg Pro Ala Arg Val Thr Ser Thr Ser Arg Phe Leu Asn Pro 1 5 10 15 Tyr Val Val Cys Phe Ile Val Val Ala Gly Val Val Ile Leu Ala Val 20 25 30 Thr Ile Ala Leu Leu Val Tyr Phe Leu Ala Phe Asp Gln Lys Ser Tyr 35 40 45 Phe Tyr Arg Ser Ser Phe Gln Leu Leu Asn Val Glu Tyr Asn Ser Gln 50 55 60 Leu Asn Ser Pro Ala Thr Gln Glu Tyr Arg Thr Leu Ser Gly Arg Ile 65 70 75 80 Glu Ser Leu Ile Thr Lys Thr Phe Lys Glu Ser Asn Leu Arg Asn Gln 85 90 95 Phe Ile Arg Ala His Val Ala Lys Leu Arg Gln Asp Gly Ser Gly Val 100 105 110 Arg Ala Asp Val Val Met Lys Phe Gln Phe Thr Arg Asn Asn Asn Gly 115 120 125 Ala Ser Met Lys Ser Arg Ile Glu Ser Val Leu Arg Gln Met Leu Asn 130 135 140 Asn Ser Gly Asn Leu Glu Ile Asn Pro Ser Thr Glu Ile Thr Ser Leu 145 150 155 160 Thr Asp Gln Ala Ala Ala Asn Trp Leu Ile Asn Glu Cys Gly Ala Gly 165 170 175 Pro Asp Leu Ile Thr Leu Ser Glu Gln Arg Ile Leu Gly Gly Thr Glu 180 185 190 Ala Glu Glu Gly Ser Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu Arg Leu Asn Asn 195 200 205 Ala His His Cys Gly Gly Ser Leu Ile Asn Asn Met Trp Ile Leu Thr 210 215 220 Ala Ala His Cys Phe Arg Ser Asn Ser Asn Pro Arg Asp Trp Ile Ala 225 230 235 240 Thr Ser Gly Ile Ser Thr Thr Phe Pro Lys Leu Arg Met Arg Val Arg 245 250 255 Asn Ile Leu Ile His Asn Asn Tyr Lys Ser Ala Thr His Glu Asn Asp 260 265 270 Ile Ala Leu Val Arg Leu Glu Asn Ser Val Thr Phe Thr Lys Asp Ile 275 280 285 His Ser Val Cys Leu Pro Ala Ala Thr Gln Asn Ile Pro Pro Gly Ser 290 295 300 Thr Ala Tyr Val Thr Gly Trp Gly Ala Gln Glu Tyr Ala Gly His Thr 305 310 315 320 Val Pro Glu Leu Arg Gln Gly Gln Val Arg Ile Ile Ser Asn Asp Val 325 330 335 Cys Asn Ala Pro His Ser Tyr Asn Gly Ala Ile Leu Ser Gly Met Leu 340 345 350 Cys Ala Gly Val Pro Gln Gly Gly Val Asp Ala Cys Gln Gly Asp Ser 355 360 365 Gly Gly Pro Leu Val Gln Glu Asp Ser Arg Arg Leu Trp Phe Ile Val 370 375 380 Gly Ile Val Ser Trp Gly Asp Gln Cys Gly Leu Pro Asp Lys Pro Gly 385 390 395 400 Val Tyr Thr Arg Val Thr Ala Tyr Leu Asp Trp Ile Arg Gln Gln Thr 405 410 415 Gly Ile <210> 252 <211> 3149 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Matripase <400> 252 gacgcctgtg agacccgcga gcggcctcgg ggaccatggg gagcgatcgg gcccgcaagg 60 gcggaggggg cccgaaggac ttcggcgcgg gactcaagta caactcccgg cacgagaaag 120 tgaatggctt ggaggaaggc gtggagttcc tgccagtcaa caacgtcaag aaggtggaaa 180 agcatggccc ggggcgctgg gtggtgctgg cagccgtgct gatcggcctc ctcttggtct 240 tgctggggat cggcttcctg gtgtggcatt tgcagtaccg ggacgtgcgt gtccagaagg 300 tcttcaatgg ctacatgagg atcacaaatg agaattttgt ggatgcctac gagaactcca 360 actccactga gtttgtaagc ctggccagca aggtgaagga cgcgctgaag ctgctgtaca 420 gcggagtccc attcctgggc ccctaccaca aggagtcggc tgtgacggcc ttcagcgagg 480 gcagcgtcat cgcctactac tggtctgagt tcagcatccc gcagcacctg gtggaggagg 540 ccgagcgcgt catggccgag gagcgcgtag tcatgctgcc cccgcgggcg cgctccctga 600 agtcctttgt ggtcacctca gtggtggctt tccccacgga ctccaaaaca gtacagagga 660 cccaggacaa cagctgcagc tttggcctgc acgcccgcgg tgtggagctg atgcgcttca 720 ccacgcccgg cttccctgac agcccctacc ccgctcatgc ccgctgccag tgggccctgc 780 ggggggacgc cgactcagtg ctgagcctca ccttccgcag ctttgacctt gcgtcctgcg 840 acgagcgcgg cagcgacctg gtgacggtgt acaacaccct gagccccatg gagccccacg 900 ccctggtgca gttgtgtggc acctaccctc cctcctacaa cctgaccttc cactcctccc 960 agaacgtcct gctcatcaca ctgataacca acactgagcg gcggcatccc ggctttgagg 1020 ccaccttctt ccagctgcct aggatgagca gctgtggagg ccgcttacgt aaagcccagg 1080 ggacattcaa cagcccctac tacccaggcc actacccacc caacattgac tgcacatgga 1140 acattgaggt gcccaacaac cagcatgtga aggtgcgctt caaattcttc tacctgctgg 1200 agcccggcgt gcctgcgggc acctgcccca aggactacgt ggagatcaat ggggagaaat 1260 actgcggaga gaggtcccag ttcgtcgtca ccagcaacag caacaagatc acagttcgct 1320 tccactcaga tcagtcctac accgacaccg gcttcttagc tgaatacctc tcctacgact 1380 ccagtgaccc atgcccgggg cagttcacgt gccgcacggg gcggtgtatc cggaaggagc 1440 tgcgctgtga tggctgggcc gactgcaccg accacagcga tgagctcaac tgcagttgcg 1500 acgccggcca ccagttcacg tgcaagaaca agttctgcaa gcccctcttc tgggtctgcg 1560 acagtgtgaa cgactgcgga gacaacagcg acgagcaggg gtgcagttgt ccggcccaga 1620 ccttcaggtg ttccaatggg aagtgcctct cgaaaagcca gcagtgcaat gggaaggacg 1680 actgtgggga cgggtccgac gaggcctcct gccccaaggt gaacgtcgtc acttgtacca 1740 aacacaccta ccgctgcctc aatgggctct gcttgagcaa gggcaaccct gagtgtgacg 1800 ggaaggagga ctgtagcgac ggctcagatg agaaggactg cgactgtggg ctgcggtcat 1860 tcacgagaca ggctcgtgtt gttgggggca cggatgcgga tgagggcgag tggccctggc 1920 aggtaagcct gcatgctctg ggccagggcc acatctgcgg tgcttccctc atctctccca 1980 actggctggt ctctgccgca cactgctaca tcgatgacag aggattcagg tactcagacc 2040 ccacgcagtg gacggccttc ctgggcttgc acgaccagag ccagcgcagc gcccctgggg 2100 tgcaggagcg caggctcaag cgcatcatct cccacccctt cttcaatgac ttcaccttcg 2160 actatgacat cgcgctgctg gagctggaga aaccggcaga gtacagctcc atggtgcggc 2220 ccatctgcct gccggacgcc tcccatgtct tccctgccgg caaggccatc tgggtcacgg 2280 gctggggaca cacccagtat ggaggcactg gcgcgctgat cctgcaaaag ggtgagatcc 2340 gcgtcatcaa ccagaccacc tgcgagaacc tcctgccgca gcagatcacg ccgcgcatga 2400 tgtgcgtggg cttcctcagc ggcggcgtgg actcctgcca gggtgattcc gggggacccc 2460 tgtccagcgt ggaggcggat gggcggatct tccaggccgg tgtggtgagc tggggagacg 2520 gctgcgctca gaggaacaag ccaggcgtgt acacaaggct ccctctgttt cgggactgga 2580 tcaaagagaa cactggggta taggggccgg ggccacccaa atgtgtacac ctgcggggcc 2640 acccatcgtc caccccagtg tgcacgcctg caggctggag actggaccgc tgactgcacc 2700 agcgccccca gaacatacac tgtgaactca atctccaggg ctccaaatct gcctagaaaa 2760 cctctcgctt cctcagcctc caaagtggag ctgggaggta gaaggggagg acactggtgg 2820 ttctactgac ccaactgggg gcaaaggttt gaagacacag cctcccccgc cagccccaag 2880 ctgggccgag gcgcgtttgt gtatatctgc ctcccctgtc tgtaaggagc agcgggaacg 2940 gagcttcgga gcctcctcag tgaaggtggt ggggctgccg gatctgggct gtggggccct 3000 tgggccacgc tcttgaggaa gcccaggctc ggaggaccct ggaaaacaga cgggtctgag 3060 actgaaaatg gtttaccagc tcccaggtga cttcagtgtg tgtattgtgt aaatgagtaa 3120 aacattttat ttctttttaa aaaaaaaaa 3149 <210> 253 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Matripase <400> 253 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 254 <211> 1258 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein hK13 <400> 254 tcaggccccg cccgccctgc cctcccctcc cgatcccgga gccatgtggc ccctggccct 60 agtgatcgcc tccctgacct tggccttgtc aggaggtgtc tcccaggagt cttccaaggt 120 tctcaacacc aatgggacca gtgggtttct cccaggtggc tacacctgct tcccccactc 180 tcagccctgg caggctgccc tactagtgca agggcggcta ctctgtgggg gagtcctggt 240 ccaccccaaa tgggtcctca ctgccgcaca ctgtctaaag gaggggctca aagtttacct 300 aggcaagcac gccctagggc gtgtggaagc tggtgagcag gtgagggaag ttgtccactc 360 tatcccccac cctgaatacc ggagaagccc cacccacctg aaccacgacc atgacatcat 420 gcttctggag ctgcagtccc cggtccagct cacaggctac atccaaaccc tgcccctttc 480 ccacaacaac cgcctaaccc ctggcaccac ctgtcgggtg tctggctggg gcaccaccac 540 cagcccccag gtgaattacc ccaaaactct acaatgtgcc aacatccaac ttcgctcaga 600 tgaggagtgt cgtcaagtct acccaggaaa gatcactgac aacatgttgt gtgccggcac 660 aaaagagggt ggcaaagact cctgtgaggg tgactctggg ggccccctgg tctgtaacag 720 aacactgtat ggcatcgtct cctggggaga cttcccatgt gggcaacctg accggcctgg 780 tgtctacacc cgtgtctcaa gatacgtcct gtggatccgt gaaacaatcc gaaaatatga 840 aacccagcag caaaaatggt tgaagggccc acaataaaag ttgagaaatg taccggcttc 900 catcctgtca ccatgacttc ctcacatggt ctgcttagcc cttctctgct ccttattccc 960 agtgttccat ttgaaccagt gatccatgtc ctgaaaaatg ctcaatctca gctaacattc 1020 catgtttcag aagcattcag gcactgccag gcttgcagtc tcccagatgt tgcatccctg 1080 aaacatctca acaacctgaa tgtcccaacc cagacaatgg cccaggtctc tcaacttcat 1140 cagtgtggct tctatgagcc cagatcacca cctgaacgtt ctgtctgtgg cacattctta 1200 aatatttcca tcagcccatc tcaacaatat atgtcctata aatggaccat ccttgaca 1258 <210> 255 <211> 277 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein hK13 <400> 255 Met Trp Pro Leu Ala Leu Val Ile Ala Ser Leu Thr Leu Ala Leu Ser 1 5 10 15 Gly Gly Val Ser Gln Glu Ser Ser Lys Val Leu Asn Thr Asn Gly Thr 20 25 30 Ser Gly Phe Leu Pro Gly Gly Tyr Thr Cys Phe Pro His Ser Gln Pro 35 40 45 Trp Gln Ala Ala Leu Leu Val Gln Gly Arg Leu Leu Cys Gly Gly Val 50 55 60 Leu Val His Pro Lys Trp Val Leu Thr Ala Ala His Cys Leu Lys Glu 65 70 75 80 Gly Leu Lys Val Tyr Leu Gly Lys His Ala Leu Gly Arg Val Glu Ala 85 90 95 Gly Glu Gln Val Arg Glu Val Val His Ser Ile Pro His Pro Glu Tyr 100 105 110 Arg Arg Ser Pro Thr His Leu Asn His Asp His Asp Ile Met Leu Leu 115 120 125 Glu Leu Gln Ser Pro Val Gln Leu Thr Gly Tyr Ile Gln Thr Leu Pro 130 135 140 Leu Ser His Asn Asn Arg Leu Thr Pro Gly Thr Thr Cys Arg Val Ser 145 150 155 160 Gly Trp Gly Thr Thr Thr Ser Pro Gln Val Asn Tyr Pro Lys Thr Leu 165 170 175 Gln Cys Ala Asn Ile Gln Leu Arg Ser Asp Glu Glu Cys Arg Gln Val 180 185 190 Tyr Pro Gly Lys Ile Thr Asp Asn Met Leu Cys Ala Gly Thr Lys Glu 195 200 205 Gly Gly Lys Asp Ser Cys Glu Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys 210 215 220 Asn Arg Thr Leu Tyr Gly Ile Val Ser Trp Gly Asp Phe Pro Cys Gly 225 230 235 240 Gln Pro Asp Arg Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser Arg Tyr Val Leu 245 250 255 Trp Ile Arg Glu Thr Ile Arg Lys Tyr Glu Thr Gln Gln Gln Lys Trp 260 265 270 Leu Lys Gly Pro Gln 275 <210> 256 <211> 1438 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein hK9 <400> 256 catggaggag gaaggagatg gcatggctta ccataaagaa gcactggacg ccgggtgcac 60 gttccaggat ccaggtgccc aggggtcatg aagctgggac tcctctgtgc tctgctctct 120 ctgctggcag ggcatggctg ggcagacacc cgtgccatcg gggccgagga atgtcgcccc 180 aactcccagc cttggcaggc cggcctcttc caccttactc ggctcttctg tggggcgacc 240 ctcatcagtg accgctggct gctcacagct gcccactgcc gcaagccgta tctgtgggtc 300 cgccttggag agcaccacct ctggaaatgg gagggtccgg agcagctgtt ccgggttacg 360 gacttcttcc cccaccctgg cttcaacaag gacctcagcg ccaatgacca caatgatgac 420 atcatgctga tccgcctgcc caggcaggca cgtctgagtc ctgctgtgca gcccctcaac 480 ctcagccaga cctgtgtctc cccaggcatg cagtgtctca tctcaggctg gggggccgtg 540 tccagcccca aggcgctgtt tccagtcaca ctgcagtgtg ccaacatcag catcctggag 600 aacaaactct gtcactgggc ataccctgga cacatctcgg acagcatgct ctgtgcgggc 660 ctgtgggagg ggggccgagg ttcctgccag ggtgactctg ggggccccct ggtttgcaat 720 ggaaccttgg caggcgtggt gtctgggggt gctgagccct gctccagacc ccggcgcccc 780 gcagtctaca ccagcgtatg ccactacctt gactggatcc aagaaatcat ggagaactga 840 gcccgcgcgc cacgggggca ccttggaaga ccaagagagg ccgaagggca cggggtaggg 900 ggttctcgta gggtcccagc ctcaatggtt cccgccctgg acctccagct gccctgactc 960 ccctctggac actaagactc cgcccctgag gctccgcccc ctcacgaggt caagcaagac 1020 acagtcgcgc cccctcggaa cggagcaggg acacgccctt cagagcccgt ctctatgacg 1080 tcaccgacag ccatcacctc cttcttggaa cagcacagcc tgtggctccg ccccaaggaa 1140 ccacttacac aaaatagctc cgcccctcgg aactttgccc agtgggactt cccctcggga 1200 ctccacccct tgtggccccg cctccttcac cagagatctc gcccctcgtg atgtcagggg 1260 cgcagtagct ccgcccacgt ggagctcggg cggtgtagag ctcagcccct tgtggccccg 1320 tcctgggcgt gtgctgggtt tgaatcctgg cggagacctg gggggaaatt gagggagggt 1380 ctggatacct ttagagccaa tgcaacggat gatttttcag taaacgcggg aaacctca 1438 <210> 257 <211> 250 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> kallikrein hK9 <400> 257 Met Lys Leu Gly Leu Leu Cys Ala Leu Leu Ser Leu Leu Ala Gly His 1 5 10 15 Gly Trp Ala Asp Thr Arg Ala Ile Gly Ala Glu Glu Cys Arg Pro Asn 20 25 30 Ser Gln Pro Trp Gln Ala Gly Leu Phe His Leu Thr Arg Leu Phe Cys 35 40 45 Gly Ala Thr Leu Ile Ser Asp Arg Trp Leu Leu Thr Ala Ala His Cys 50 55 60 Arg Lys Pro Tyr Leu Trp Val Arg Leu Gly Glu His His Leu Trp Lys 65 70 75 80 Trp Glu Gly Pro Glu Gln Leu Phe Arg Val Thr Asp Phe Phe Pro His 85 90 95 Pro Gly Phe Asn Lys Asp Leu Ser Ala Asn Asp His Asn Asp Asp Ile 100 105 110 Met Leu Ile Arg Leu Pro Arg Gln Ala Arg Leu Ser Pro Ala Val Gln 115 120 125 Pro Leu Asn Leu Ser Gln Thr Cys Val Ser Pro Gly Met Gln Cys Leu 130 135 140 Ile Ser Gly Trp Gly Ala Val Ser Ser Pro Lys Ala Leu Phe Pro Val 145 150 155 160 Thr Leu Gln Cys Ala Asn Ile Ser Ile Leu Glu Asn Lys Leu Cys His 165 170 175 Trp Ala Tyr Pro Gly His Ile Ser Asp Ser Met Leu Cys Ala Gly Leu 180 185 190 Trp Glu Gly Gly Arg Gly Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu 195 200 205 Val Cys Asn Gly Thr Leu Ala Gly Val Val Ser Gly Gly Ala Glu Pro 210 215 220 Cys Ser Arg Pro Arg Arg Pro Ala Val Tyr Thr Ser Val Cys His Tyr 225 230 235 240 Leu Asp Trp Ile Gln Glu Ile Met Glu Asn 245 250 <210> 258 <211> 3212 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Mername-AA035 peptidase <400> 258 cttgagccag acccagtcca gctctggtgc ctgccctctg gtgcgagctg acctgagatg 60 cacttccctc ctctgtgagc tgtctcggca cccacttgca gtcactgccg cctgatgttg 120 ttactcttcc actccaaaag gatgcccgtg gccgaggccc cccaggtggc tggcgggcag 180 ggggacggag gtgatggcga ggaagcggag ccggagggga tgttcaaggc ctgtgaggac 240 tccaagagaa aagcccgggg ctacctccgc ctggtgcccc tgtttgtgct gctggccctg 300 ctcgtgctgg cttcggcggg ggtgctactc tggtatttcc tagggtacaa ggcggaggtg 360 atggtcagcc aggtgtactc aggcagtctg cgtgtactca atcgccactt ctcccaggat 420 cttacccgcc gggaatctag tgccttccgc agtgaaaccg ccaaagccca gaagatgctc 480 aaggagctca tcaccagcac ccgcctggga acttactaca actccagctc cgtctattcc 540 tttggggagg gacccctcac ctgcttcttc tggttcattc tccaaatccc cgagcaccgc 600 cggctgatgc tgagccccga ggtggtgcag gcactgctgg tggaggagct gctgtccaca 660 gtcaacagct cggctgccgt cccctacagg gccgagtacg aagtggaccc cgagggccta 720 gtgatcctgg aagccagtgt gaaagacata gctgcattga attccacgct gggttgttac 780 cgctacagct acgtgggcca gggccaggtc ctccggctga aggggcctga ccacctggcc 840 tccagctgcc tgtggcacct gcagggcccc aaggacctca tgctcaaact ccggctggag 900 tggacgctgg cagagtgccg ggaccgactg gccatgtatg acgtggccgg gcccctggag 960 aagaggctca tcacctcggt gtacggctgc agccgccagg agcccgtggt ggaggttctg 1020 gcgtcggggg ccatcatggc ggtcgtctgg aagaagggcc tgcacagcta ctacgacccc 1080 ttcgtgctct ccgtgcagcc ggtggtcttc caggcctgtg aagtgaacct gacgctggac 1140 aacaggctcg actcccaggg cgtcctcagc accccgtact tccccagcta ctactcgccc 1200 caaacccact gctcctggca cctcacggtg ccctctctgg actacggctt ggccctctgg 1260 tttgatgcct atgcactgag gaggcagaag tatgatttgc cgtgcaccca gggccagtgg 1320 acgatccaga acaggaggct gtgtggcttg cgcatcctgc agccctacgc cgagaggatc 1380 cccgtggtgg ccacggccgg gatcaccatc aacttcacct cccagatctc cctcaccggg 1440 cccggtgtgc gggtgcacta tggcttgtac aaccagtcgg acccctgccc tggagagttc 1500 ctctgttctg tgaatggact ctgtgtccct gcctgtgatg gggtcaagga ctgccccaac 1560 ggcctggatg agagaaactg cgtttgcaga gccacattcc agtgcaaaga ggacagcaca 1620 tgcatctcac tgcccaaggt ctgtgatggg cagcctgatt gtctcaacgg cagcgacgaa 1680 gagcagtgcc aggaaggggt gccatgtggg acattcacct tccagtgtga ggaccggagc 1740 tgcgtgaaga agcccaaccc gcagtgtgat gggcggcccg actgcaggga cggctcggat 1800 gaggagcact gtgactgtgg cctccagggc ccctccagcc gcattgttgg tggagctgtg 1860 tcctccgagg gtgagtggcc atggcaggcc agcctccagg ttcggggtcg acacatctgt 1920 gggggggccc tcatcgctga ccgctgggtg ataacagctg cccactgctt ccaggaggac 1980 agcatggcct ccacggtgct gtggaccgtg ttcctgggca aggtgtggca gaactcgcgc 2040 tggcctggag aggtgtcctt caaggtgagc cgcctgctcc tgcacccgta ccacgaagag 2100 gacagccatg actacgacgt ggcgctgctg cagctcgacc acccggtggt gcgctcggcc 2160 gccgtgcgcc ccgtctgcct gcccgcgcgc tcccacttct tcgagcccgg cctgcactgc 2220 tggattacgg gctggggcgc cttgcgcgag ggcggcccca tcagcaacgc tctgcagaaa 2280 gtggatgtgc agttgatccc acaggacctg tgcagcgagg tctatcgcta ccaggtgacg 2340 ccacgcatgc tgtgtgccgg ctaccgcaag ggcaagaagg atgcctgtca gggtgactca 2400 ggtggtccgc tggtgtgcaa ggcactcagt ggccgctggt tcctggcggg gctggtcagc 2460 tggggcctgg gctgtggccg gcctaactac ttcggcgtct acacccgcat cacaggtgtg 2520 atcagctgga tccagcaagt ggtgacctga ggaactgccc ccctgcaaag cagggcccac 2580 ctcctggact cagagagccc agggcaactg ccaagcaggg ggacaagtat tctggcgggg 2640 ggtgggggag agagcaggcc ctgtggtggc aggaggtggc atcttgtctc gtccctgatg 2700 tctgctccag tgatggcagg aggatggaga agtgccagca gctgggggtc aagacgtccc 2760 ctgaggaccc aggcccacac ccagcccttc tgcctcccaa ttctctctcc tccgtcccct 2820 tcctccactg ctgcctaatg caaggcagtg gctcagcagc aagaatgctg gttctacatc 2880 ccgaggagtg tctgaggtgc gccccactct gtacagaggc tgtttgggca gccttgcctc 2940 cagagagcag attccagctt cggaagcccc tggtctaact tgggatctgg gaatggaagg 3000 tgctcccatc ggaggggacc ctcagagccc tggagactgc caggtgggcc tgctgccact 3060 gtaagccaaa aggtggggaa gtcctgactc cagggtcctt gccccacccc tgcctgccac 3120 ctgggccctc acagcccaga ccctcactgg gaggtgagct cagctgccct ttggaataaa 3180 gctgcctgat caaaaaaaaa aaaaaaaaaa aa 3212 <210> 259 <211> 811 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mername-AA035 peptidase <400> 259 Met Leu Leu Leu Phe His Ser Lys Arg Met Pro Val Ala Glu Ala Pro 1 5 10 15 Gln Val Ala Gly Gly Gln Gly Asp Gly Gly Asp Gly Glu Glu Ala Glu 20 25 30 Pro Glu Gly Met Phe Lys Ala Cys Glu Asp Ser Lys Arg Lys Ala Arg 35 40 45 Gly Tyr Leu Arg Leu Val Pro Leu Phe Val Leu Leu Ala Leu Leu Val 50 55 60 Leu Ala Ser Ala Gly Val Leu Leu Trp Tyr Phe Leu Gly Tyr Lys Ala 65 70 75 80 Glu Val Met Val Ser Gln Val Tyr Ser Gly Ser Leu Arg Val Leu Asn 85 90 95 Arg His Phe Ser Gln Asp Leu Thr Arg Arg Glu Ser Ser Ala Phe Arg 100 105 110 Ser Glu Thr Ala Lys Ala Gln Lys Met Leu Lys Glu Leu Ile Thr Ser 115 120 125 Thr Arg Leu Gly Thr Tyr Tyr Asn Ser Ser Ser Val Tyr Ser Phe Gly 130 135 140 Glu Gly Pro Leu Thr Cys Phe Phe Trp Phe Ile Leu Gln Ile Pro Glu 145 150 155 160 His Arg Arg Leu Met Leu Ser Pro Glu Val Val Gln Ala Leu Leu Val 165 170 175 Glu Glu Leu Leu Ser Thr Val Asn Ser Ser Ala Ala Val Pro Tyr Arg 180 185 190 Ala Glu Tyr Glu Val Asp Pro Glu Gly Leu Val Ile Leu Glu Ala Ser 195 200 205 Val Lys Asp Ile Ala Ala Leu Asn Ser Thr Leu Gly Cys Tyr Arg Tyr 210 215 220 Ser Tyr Val Gly Gln Gly Gln Val Leu Arg Leu Lys Gly Pro Asp His 225 230 235 240 Leu Ala Ser Ser Cys Leu Trp His Leu Gln Gly Pro Lys Asp Leu Met 245 250 255 Leu Lys Leu Arg Leu Glu Trp Thr Leu Ala Glu Cys Arg Asp Arg Leu 260 265 270 Ala Met Tyr Asp Val Ala Gly Pro Leu Glu Lys Arg Leu Ile Thr Ser 275 280 285 Val Tyr Gly Cys Ser Arg Gln Glu Pro Val Val Glu Val Leu Ala Ser 290 295 300 Gly Ala Ile Met Ala Val Val Trp Lys Lys Gly Leu His Ser Tyr Tyr 305 310 315 320 Asp Pro Phe Val Leu Ser Val Gln Pro Val Val Phe Gln Ala Cys Glu 325 330 335 Val Asn Leu Thr Leu Asp Asn Arg Leu Asp Ser Gln Gly Val Leu Ser 340 345 350 Thr Pro Tyr Phe Pro Ser Tyr Tyr Ser Pro Gln Thr His Cys Ser Trp 355 360 365 His Leu Thr Val Pro Ser Leu Asp Tyr Gly Leu Ala Leu Trp Phe Asp 370 375 380 Ala Tyr Ala Leu Arg Arg Gln Lys Tyr Asp Leu Pro Cys Thr Gln Gly 385 390 395 400 Gln Trp Thr Ile Gln Asn Arg Arg Leu Cys Gly Leu Arg Ile Leu Gln 405 410 415 Pro Tyr Ala Glu Arg Ile Pro Val Val Ala Thr Ala Gly Ile Thr Ile 420 425 430 Asn Phe Thr Ser Gln Ile Ser Leu Thr Gly Pro Gly Val Arg Val His 435 440 445 Tyr Gly Leu Tyr Asn Gln Ser Asp Pro Cys Pro Gly Glu Phe Leu Cys 450 455 460 Ser Val Asn Gly Leu Cys Val Pro Ala Cys Asp Gly Val Lys Asp Cys 465 470 475 480 Pro Asn Gly Leu Asp Glu Arg Asn Cys Val Cys Arg Ala Thr Phe Gln 485 490 495 Cys Lys Glu Asp Ser Thr Cys Ile Ser Leu Pro Lys Val Cys Asp Gly 500 505 510 Gln Pro Asp Cys Leu Asn Gly Ser Asp Glu Glu Gln Cys Gln Glu Gly 515 520 525 Val Pro Cys Gly Thr Phe Thr Phe Gln Cys Glu Asp Arg Ser Cys Val 530 535 540 Lys Lys Pro Asn Pro Gln Cys Asp Gly Arg Pro Asp Cys Arg Asp Gly 545 550 555 560 Ser Asp Glu Glu His Cys Asp Cys Gly Leu Gln Gly Pro Ser Ser Arg 565 570 575 Ile Val Gly Gly Ala Val Ser Ser Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Ala 580 585 590 Ser Leu Gln Val Arg Gly Arg His Ile Cys Gly Gly Ala Leu Ile Ala 595 600 605 Asp Arg Trp Val Ile Thr Ala Ala His Cys Phe Gln Glu Asp Ser Met 610 615 620 Ala Ser Thr Val Leu Trp Thr Val Phe Leu Gly Lys Val Trp Gln Asn 625 630 635 640 Ser Arg Trp Pro Gly Glu Val Ser Phe Lys Val Ser Arg Leu Leu Leu 645 650 655 His Pro Tyr His Glu Glu Asp Ser His Asp Tyr Asp Val Ala Leu Leu 660 665 670 Gln Leu Asp His Pro Val Val Arg Ser Ala Ala Val Arg Pro Val Cys 675 680 685 Leu Pro Ala Arg Ser His Phe Phe Glu Pro Gly Leu His Cys Trp Ile 690 695 700 Thr Gly Trp Gly Ala Leu Arg Glu Gly Gly Pro Ile Ser Asn Ala Leu 705 710 715 720 Gln Lys Val Asp Val Gln Leu Ile Pro Gln Asp Leu Cys Ser Glu Val 725 730 735 Tyr Arg Tyr Gln Val Thr Pro Arg Met Leu Cys Ala Gly Tyr Arg Lys 740 745 750 Gly Lys Lys Asp Ala Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys 755 760 765 Lys Ala Leu Ser Gly Arg Trp Phe Leu Ala Gly Leu Val Ser Trp Gly 770 775 780 Leu Gly Cys Gly Arg Pro Asn Tyr Phe Gly Val Tyr Thr Arg Ile Thr 785 790 795 800 Gly Val Ile Ser Trp Ile Gln Gln Val Val Thr 805 810 <210> 260 <211> 3750 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> umbilical vein proteinase <400> 260 gcgctgctcg ccagcttgct cgcactcggc tgtgcggcgg ggcaggcatg ggagccgcgc 60 gctctctccc ggcgcccaca cctgtctgag cggcgcagcg agccgcggcc cgggcgggct 120 gctcggcgcg gaacagtgct cggcatggca gggattccag ggctcctctt ccttctcttc 180 tttctgctct gtgctgttgg gcaagtgagc ccttacagtg ccccctggaa acccacttgg 240 cctgcatacc gcctccctgt cgtcttgccc cagtctaccc tcaatttagc caagccagac 300 tttggagccg aagccaaatt agaagtatct tcttcatgtg gaccccagtg tcataaggga 360 actccactgc ccacttacga agaggccaag caatatctgt cttatgaaac gctctatgcc 420 aatggcagcc gcacagagac gcaggtgggc atctacatcc tcagcagtag tggagatggg 480 gcccaacacc gagactcagg gtcttcagga aagtctcgaa ggaagcggca gatttatggc 540 tatgacagca ggttcagcat ttttgggaag gacttcctgc tcaactaccc tttctcaaca 600 tcagtgaagt tatccacggg ctgcaccggc accctggtgg cagagaagca tgtcctcaca 660 gctgcccact gcatacacga tggaaaaacc tatgtgaaag gaacccagaa gcttcgagtg 720 ggcttcctaa agcccaagtt taaagatggt ggtcgagggg ccaacgactc cacttcagcc 780 atgcccgagc agatgaaatt tcagtggatc cgggtgaaac gcacccatgt gcccaagggt 840 tggatcaagg gcaatgccaa tgacatcggc atggattatg attatgccct cctggaactc 900 aaaaagcccc acaagagaaa atttatgaag attggggtga gccctcctgc taagcagctg 960 ccagggggca gaattcactt ctctggttat gacaatgacc gaccaggcaa tttggtgtat 1020 cgcttctgtg acgtcaaaga cgagacctat gacttgctct accagcaatg cgatgcccag 1080 ccaggggcca gcgggtctgg ggtctatgtg aggatgtgga agagacagca gcagaagtgg 1140 gagcgaaaaa ttattggcat tttttcaggg caccagtggg tggacatgaa tggttcccca 1200 caggatttca acgtggctgt cagaatcact cctctcaaat atgcccagat ttgctattgg 1260 attaaaggaa actacctgga ttgtagggag gggtgacaca gtgttccctc ctggcagcaa 1320 ttaagggtct tcatgttctt attttaggag aggccaaatt gttttttgtc attggcgtgc 1380 acacgtgtgt gtgtgtgtgt gtgtgtgtgt aaggtgtctt ataatctttt acctatttct 1440 tacaattgca agatgactgg ctttactatt tgaaaactgg tttgtgtatc atatcatata 1500 tcatttaagc agtttgaagg catacttttg catagaaata aaaaaaatac tgatttgggg 1560 caatgaggaa tatttgacaa ttaagttaat cttcacgttt ttgcaaactt tgatttttat 1620 ttcatctgaa cttgtttcaa agatttatat taaatatttg gcatacaaga gatatgaatt 1680 cttatatgtg tgcatgtgtg ttttcttctg agattcatct tggtggtggg tttttttgtt 1740 tttttaattc agtgcctgat ctttaatgct tccataaggc agtgttccca tttaggaact 1800 ttgacagcat ttgttaggca gaatattttg gatttggagg catttgcatg gtagtctttg 1860 aacagtaaaa tgatgtgttg actatactga tacacatatt aaactatacc ttatagtaaa 1920 ccagtatccc aagctgcttt tagttccaaa aatagtttct tttccaaagg ttgttgctct 1980 actttgtagg aagtctttgc atatggccct cccaacttta aagtcatacc agagtggcca 2040 agagtgttta tcccaaccct tccatttaac aggatttcac tcacatttct ggaactagct 2100 atttttcaga agacaataat cagggcttaa ttagaacagg ctgtatttcc tcccagcaaa 2160 cagttgtggc cacactaaaa acaatcatag cattttaccc ctggattata gcacatctca 2220 tgttttatca tttggatgga gtaatttaaa atgaattaaa ttccagagaa caatggaagc 2280 attgcctggc agatgtcaca acagaataac cacttgtttg gagcctggca cagtcctcca 2340 gcctgatcaa aaattattct gcatagtttt cagtgtgctt tctgggagct atgtacttct 2400 tcaatttgga aacttttctc tctcatttat agtgaaaata cttggaagtt actttaagaa 2460 aaccagtgtg gcctttttcc ctctagcttt aaaagggccg cttttgctgg aatgctctag 2520 gttatagata aacaattagg tataatagca aaaatgaaaa ttggaagaat gcaaaatgga 2580 tcagaatcat gccttccaat aaaggccttt acacatgttt tatcaatatg attatcaaat 2640 cacagcatat acagaaaaga cttggactta ttgtatgttt ttattttatg gctctcggcc 2700 taagcacttc tttctaaatg tatcggagaa aaaatcaaat ggactacaag cacgtgtttg 2760 ctgtgcttgc accccaggta aacctgcatt gtagcaattt gtaaggatat tcagatggag 2820 cactgtcact tagacattct ctgggggatt ttctgcttgt ctttcttgag ctttttggaa 2880 ggataattct gataaggcac tcaagaaacg tacaaccaca gtgctttctt caaatcatat 2940 gagaaatact atgcatagca aggagatgca gagccgccag gaaaattctg agttccagca 3000 caattttctt tggaatctaa caggaatcta gcctgaggaa gaagggaggt ctccatttct 3060 atgtctggta tttgggggtt ttgtttgttt ttgctttagc ttggtgaaaa aaagttcact 3120 gaacaccaag accagaatgg atttttttaa aaaaatagat gttccttttg tgaagcacct 3180 tgattccttg attttgattt tttgcaaagt tagacaatgg cacaaagtca aaatgaaatc 3240 aatgtttagt tcacaagtag atgtaattta ctaaagaatg atacacccat atgctatata 3300 cagcttaact cacagaactg taaaagaaaa ttataaaata attcaacatg tccatctttt 3360 tagtgataat aaaagaaagc atggtattaa actatcatag aagtagacag aaaaagaaaa 3420 aaggactcat ggcattatta atataattag tgctttacat gtgttagtta tacatattag 3480 aagcatattt gcctagtaag gctagtagaa ccacatttcc caaagtgtgc tccttaaaca 3540 ctcatgcctt atgattttct accaaaagta aaaagggttg tattaagtca gaggaagatg 3600 cctctccatt ttccctctct ttatcagagg ttcacatgcc tgtctgcaca ttaaaagctc 3660 tgggaagacc tgttgtaaag ggacaagttg aggttgtaaa atctgcattt aaataaacat 3720 ctttgatcac aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3750 <210> 261 <211> 383 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> umbilical vein proteinase <400> 261 Met Ala Gly Ile Pro Gly Leu Leu Phe Leu Leu Phe Phe Leu Leu Cys 1 5 10 15 Ala Val Gly Gln Val Ser Pro Tyr Ser Ala Pro Trp Lys Pro Thr Trp 20 25 30 Pro Ala Tyr Arg Leu Pro Val Val Leu Pro Gln Ser Thr Leu Asn Leu 35 40 45 Ala Lys Pro Asp Phe Gly Ala Glu Ala Lys Leu Glu Val Ser Ser Ser 50 55 60 Cys Gly Pro Gln Cys His Lys Gly Thr Pro Leu Pro Thr Tyr Glu Glu 65 70 75 80 Ala Lys Gln Tyr Leu Ser Tyr Glu Thr Leu Tyr Ala Asn Gly Ser Arg 85 90 95 Thr Glu Thr Gln Val Gly Ile Tyr Ile Leu Ser Ser Ser Gly Asp Gly 100 105 110 Ala Gln His Arg Asp Ser Gly Ser Ser Gly Lys Ser Arg Arg Lys Arg 115 120 125 Gln Ile Tyr Gly Tyr Asp Ser Arg Phe Ser Ile Phe Gly Lys Asp Phe 130 135 140 Leu Leu Asn Tyr Pro Phe Ser Thr Ser Val Lys Leu Ser Thr Gly Cys 145 150 155 160 Thr Gly Thr Leu Val Ala Glu Lys His Val Leu Thr Ala Ala His Cys 165 170 175 Ile His Asp Gly Lys Thr Tyr Val Lys Gly Thr Gln Lys Leu Arg Val 180 185 190 Gly Phe Leu Lys Pro Lys Phe Lys Asp Gly Gly Arg Gly Ala Asn Asp 195 200 205 Ser Thr Ser Ala Met Pro Glu Gln Met Lys Phe Gln Trp Ile Arg Val 210 215 220 Lys Arg Thr His Val Pro Lys Gly Trp Ile Lys Gly Asn Ala Asn Asp 225 230 235 240 Ile Gly Met Asp Tyr Asp Tyr Ala Leu Leu Glu Leu Lys Lys Pro His 245 250 255 Lys Arg Lys Phe Met Lys Ile Gly Val Ser Pro Pro Ala Lys Gln Leu 260 265 270 Pro Gly Gly Arg Ile His Phe Ser Gly Tyr Asp Asn Asp Arg Pro Gly 275 280 285 Asn Leu Val Tyr Arg Phe Cys Asp Val Lys Asp Glu Thr Tyr Asp Leu 290 295 300 Leu Tyr Gln Gln Cys Asp Ala Gln Pro Gly Ala Ser Gly Ser Gly Val 305 310 315 320 Tyr Val Arg Met Trp Lys Arg Gln Gln Gln Lys Trp Glu Arg Lys Ile 325 330 335 Ile Gly Ile Phe Ser Gly His Gln Trp Val Asp Met Asn Gly Ser Pro 340 345 350 Gln Asp Phe Asn Val Ala Val Arg Ile Thr Pro Leu Lys Tyr Ala Gln 355 360 365 Ile Cys Tyr Trp Ile Lys Gly Asn Tyr Leu Asp Cys Arg Glu Gly 370 375 380 <210> 262 <211> 26 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> LCLP proteinase (LCLP (N-terminus)) <400> 262 Ile Ile Gly Gly Thr Glu Ser Lys Pro Asp Ser Arg Pro Tyr Met Ala 1 5 10 15 Leu Leu Gln Ile Val Glu Pro Ala Val His 20 25 <210> 263 <211> 2265 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Spinesin <400> 263 acgcgggata cagggagggg ccatgtgcga accagggaga cctcatcttc caaccaagct 60 tgctgggctt gcatttaatc aatgcatggc cagagaacag gagcggaaca ttgcctagta 120 gaccctgagg ctttacaaca gtgctactga cccctatgag cctgatgctg gatgaccaac 180 cccctatgga ggcccagtat gcagaggagg gcccaggacc tgggatcttc agagcagagc 240 ctggagacca gcagcatccc atttctcagg cggtgtgctg gcgttccatg cgacgtggct 300 gtgcagtgct gggagccctg gggctgctgg ccggtgcagg tgttggctca tggctcctag 360 tgctgtatct gtgtcctgct gcctctcagc ccatttccgg gaccttgcag gatgaggaga 420 taactttgag ctgctcagag gccagcgctg aggaagctct gctccctgca ctccccaaaa 480 cagtatcttt cagaataaac agcgaagact tcttgctgga agcgcaagtg agggatcagc 540 cacgctggct cctggtctgc catgagggct ggagccccgc cctggggctg cagatctgct 600 ggagccttgg gcatctcaga ctcactcacc acaagggagt aaacctcact gacatcaaac 660 tcaacagttc ccaggagttt gctcagctct ctcctagact gggaggcttc ctggaggagg 720 cgtggcagcc caggaacaac tgcacttctg gtcaagttgt ttccctcaga tgctctgagt 780 gtggagcgag gcccctggct tcccggatag ttggtgggca gtctgtggct cctgggcgct 840 ggccgtggca ggccagcgtg gccctgggct tccggcacac gtgtgggggc tctgtgctag 900 cgccacgctg ggtggtgact gctgcacatt gtatgcacag tttcaggctg gcccgcctgt 960 ccagctggcg ggttcatgcg gggctggtca gccacagtgc cgtcaggccc caccaagggg 1020 ctctggtgga gaggattatc ccacaccccc tctacagtgc ccagaatcat gactacgacg 1080 tcgccctcct gaggctccag accgctctca acttctcaga cactgtgggc gctgtgtgcc 1140 tgccggccaa ggaacagcat tttccgaagg gctcgcggtg ctgggtgtct ggctggggcc 1200 acacccaccc tagccatact tacagctcgg atatgctcca ggacacggtg gtgcccttgt 1260 tcagcactca gctctgcaac agctcttgcg tgtacagcgg agccctcacc ccccgcatgc 1320 tttgcgctgg ctacctggac ggaagggctg atgcatgcca gggagatagc gggggccccc 1380 tagtgtgccc agatggggac acatggcgcc tagtgggggt ggtcagctgg gggcgtgcgt 1440 gcgcagagcc caatcaccca ggtgtctacg ccaaggtagc tgagtttctg gactggatcc 1500 atgacactgc tcaggactcc ctcctctgag tcctgctgtt tcctccagtc tcactgcaca 1560 ccactgcctc atgcttcctg gggcctccag cagctccact aatggaggag aggcagtagc 1620 ctccgacaca gaacgcatgg acctcctact actgtgtgtg aggaacagtc actacccact 1680 ggccagccac ccagccaaca ggtctctcct cttgggccct gatttcagag tcctctttct 1740 cactagagac tcaatgacag aagagaggct gggacttggt tgggcatgct gtggttgctg 1800 agggatgagg gggaggagag aggtaggagc tggagatgaa gagactgcta gaagcagcag 1860 gaagcctgcc cttctgccct ctcccctccc tgcccctgtg tgagtctttt agggagggtg 1920 actgggaggt gccccccgtc ccaccttttt cctgtgctct aggtgggcta agtgcctccc 1980 tagaggactc catggctgag aggctcctgg gcagatgggg tcaaggctgg gccagtccca 2040 gatgaagcct atgggagtca ggaccctctc cactctccct ctccactccc cttcctgttc 2100 tcacctggct gtggctggcc ctgtgtgggg tgggtacact ggaaaacaag aaggttggag 2160 ttggtctagg acattggttt taaatgacag ttctgtgaac tggtccaagg aggttctgtt 2220 attaaagtga tatatggtct tgaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaa 2265 <210> 264 <211> 457 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Spinesin <400> 264 Met Ser Leu Met Leu Asp Asp Gln Pro Pro Met Glu Ala Gln Tyr Ala 1 5 10 15 Glu Glu Gly Pro Gly Pro Gly Ile Phe Arg Ala Glu Pro Gly Asp Gln 20 25 30 Gln His Pro Ile Ser Gln Ala Val Cys Trp Arg Ser Met Arg Arg Gly 35 40 45 Cys Ala Val Leu Gly Ala Leu Gly Leu Leu Ala Gly Ala Gly Val Gly 50 55 60 Ser Trp Leu Leu Val Leu Tyr Leu Cys Pro Ala Ala Ser Gln Pro Ile 65 70 75 80 Ser Gly Thr Leu Gln Asp Glu Glu Ile Thr Leu Ser Cys Ser Glu Ala 85 90 95 Ser Ala Glu Glu Ala Leu Leu Pro Ala Leu Pro Lys Thr Val Ser Phe 100 105 110 Arg Ile Asn Ser Glu Asp Phe Leu Leu Glu Ala Gln Val Arg Asp Gln 115 120 125 Pro Arg Trp Leu Leu Val Cys His Glu Gly Trp Ser Pro Ala Leu Gly 130 135 140 Leu Gln Ile Cys Trp Ser Leu Gly His Leu Arg Leu Thr His His Lys 145 150 155 160 Gly Val Asn Leu Thr Asp Ile Lys Leu Asn Ser Ser Gln Glu Phe Ala 165 170 175 Gln Leu Ser Pro Arg Leu Gly Gly Phe Leu Glu Glu Ala Trp Gln Pro 180 185 190 Arg Asn Asn Cys Thr Ser Gly Gln Val Val Ser Leu Arg Cys Ser Glu 195 200 205 Cys Gly Ala Arg Pro Leu Ala Ser Arg Ile Val Gly Gly Gln Ser Val 210 215 220 Ala Pro Gly Arg Trp Pro Trp Gln Ala Ser Val Ala Leu Gly Phe Arg 225 230 235 240 His Thr Cys Gly Gly Ser Val Leu Ala Pro Arg Trp Val Val Thr Ala 245 250 255 Ala His Cys Met His Ser Phe Arg Leu Ala Arg Leu Ser Ser Trp Arg 260 265 270 Val His Ala Gly Leu Val Ser His Ser Ala Val Arg Pro His Gln Gly 275 280 285 Ala Leu Val Glu Arg Ile Ile Pro His Pro Leu Tyr Ser Ala Gln Asn 290 295 300 His Asp Tyr Asp Val Ala Leu Leu Arg Leu Gln Thr Ala Leu Asn Phe 305 310 315 320 Ser Asp Thr Val Gly Ala Val Cys Leu Pro Ala Lys Glu Gln His Phe 325 330 335 Pro Lys Gly Ser Arg Cys Trp Val Ser Gly Trp Gly His Thr His Pro 340 345 350 Ser His Thr Tyr Ser Ser Asp Met Leu Gln Asp Thr Val Val Pro Leu 355 360 365 Phe Ser Thr Gln Leu Cys Asn Ser Ser Cys Val Tyr Ser Gly Ala Leu 370 375 380 Thr Pro Arg Met Leu Cys Ala Gly Tyr Leu Asp Gly Arg Ala Asp Ala 385 390 395 400 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Pro Asp Gly Asp Thr 405 410 415 Trp Arg Leu Val Gly Val Val Ser Trp Gly Arg Ala Cys Ala Glu Pro 420 425 430 Asn His Pro Gly Val Tyr Ala Lys Val Ala Glu Phe Leu Asp Trp Ile 435 440 445 His Asp Thr Ala Gln Asp Ser Leu Leu 450 455 <210> 265 <211> 1243 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Mername-AA178 peptidase <400> 265 atggctgccc ctgcttccgt catgggccca ctcgggccct ctgccctggg ccttctgctg 60 ctgctcctgg tggtggcccc tccccgggtc gcagcattgg tccacagaca gccagagaac 120 cagggaatct ccctaactgg cagcgtggcc tgtggtcggc ccagcatgga ggggaaaatc 180 ctgggcggcg tccctgcgcc cgagaggaag tggccgtggc aggtcagcgt gcactacgca 240 ggcctccacg tctgcggcgg ctccatcctc aatgagtact gggtgctgtc agctgcgcac 300 tgctttcaca gggacaagaa tatcaaaatc tatgacatgt acgtaggcct cgtaaacctc 360 agggtggccg gcaaccacac ccagtggtat gaggtgaaca gggtgatcct gcaccccaca 420 tatgagatgt accaccccat cggaggtgac gtggccctgg tgcagctgaa gacccgcatt 480 gtgttttctg agtccgtgct cccggtttgc cttgcaactc cagaagtgaa ccttaccagt 540 gccaattgct gggctacggg atggggacta gtctcaaaac aaggtgagac ctcagacgag 600 ctgcaggaga tgcagctccc gctgatcctg gagccctggt gccacctgct ctacggacac 660 atgtcctaca tcatgcccga catgctgtgt gctggggaca tcctgaatgc taagaccgtg 720 tgtgagggcg actccggggg cccacttgtc tgtgaattca accgcagctg gttgcagatt 780 ggaattgtga gctggggccg aggctgctcc aaccctctgt accctggagt gtatgccagt 840 gtttcctatt tctcaaaatg gatatgtgat aacatagaaa tcacgcccac tcctgctcag 900 ccagcccctg ctctctctcc agctctgggg cccactctca gcgtcctaat ggccatgctg 960 gctggctggt cagtgctgtg aggtcaggat acccactcta ggattctcat ggctgcacac 1020 cctgccccag cccagctgcc tccagacccc taagcatctc ctgtcctggc ctctctgaag 1080 cagacaaggg ccacctatcc cgggggtgga tgctgagtcc aggaggtgat gagcaagtgt 1140 acaaaagaaa aaagggaagg gggagagggg ctggtcaggg agaacccagc ttgggcagag 1200 tgcacctgag atttgataag atcattaaat atttacaaag caa 1243 <210> 266 <211> 326 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mername-AA178 peptidase <400> 266 Met Ala Ala Pro Ala Ser Val Met Gly Pro Leu Gly Pro Ser Ala Leu 1 5 10 15 Gly Leu Leu Leu Leu Leu Leu Val Val Ala Pro Pro Arg Val Ala Ala 20 25 30 Leu Val His Arg Gln Pro Glu Asn Gln Gly Ile Ser Leu Thr Gly Ser 35 40 45 Val Ala Cys Gly Arg Pro Ser Met Glu Gly Lys Ile Leu Gly Gly Val 50 55 60 Pro Ala Pro Glu Arg Lys Trp Pro Trp Gln Val Ser Val His Tyr Ala 65 70 75 80 Gly Leu His Val Cys Gly Gly Ser Ile Leu Asn Glu Tyr Trp Val Leu 85 90 95 Ser Ala Ala His Cys Phe His Arg Asp Lys Asn Ile Lys Ile Tyr Asp 100 105 110 Met Tyr Val Gly Leu Val Asn Leu Arg Val Ala Gly Asn His Thr Gln 115 120 125 Trp Tyr Glu Val Asn Arg Val Ile Leu His Pro Thr Tyr Glu Met Tyr 130 135 140 His Pro Ile Gly Gly Asp Val Ala Leu Val Gln Leu Lys Thr Arg Ile 145 150 155 160 Val Phe Ser Glu Ser Val Leu Pro Val Cys Leu Ala Thr Pro Glu Val 165 170 175 Asn Leu Thr Ser Ala Asn Cys Trp Ala Thr Gly Trp Gly Leu Val Ser 180 185 190 Lys Gln Gly Glu Thr Ser Asp Glu Leu Gln Glu Met Gln Leu Pro Leu 195 200 205 Ile Leu Glu Pro Trp Cys His Leu Leu Tyr Gly His Met Ser Tyr Ile 210 215 220 Met Pro Asp Met Leu Cys Ala Gly Asp Ile Leu Asn Ala Lys Thr Val 225 230 235 240 Cys Glu Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Glu Phe Asn Arg Ser 245 250 255 Trp Leu Gln Ile Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ser Asn Pro 260 265 270 Leu Tyr Pro Gly Val Tyr Ala Ser Val Ser Tyr Phe Ser Lys Trp Ile 275 280 285 Cys Asp Asn Ile Glu Ile Thr Pro Thr Pro Ala Gln Pro Ala Pro Ala 290 295 300 Leu Ser Pro Ala Leu Gly Pro Thr Leu Ser Val Leu Met Ala Met Leu 305 310 315 320 Ala Gly Trp Ser Val Leu 325 <210> 267 <211> 1695 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Mername-AA180 peptidase <400> 267 atgcttataa gcaggaacaa gctgatttta ctactaggaa tagtcttttt tgaacgaggt 60 aaatctgcaa ctctttcgct ccccaaagct cccagttgtg ggcagagtct ggttaaggta 120 cagccttgga attattttaa cattttcagt cgcattcttg gaggaagcca agtggagaag 180 ggttcctatc cctggcaggt atctctgaaa caaaggcaga agcatatttg tggaggaagc 240 atcgtctcac cacagtgggt gatcacggcg gctcactgca ttgcaaacag aaacattgtg 300 tctactttga atgttactgc tggagagtat gacttaagcc agacagaccc aggagagcaa 360 actctcacta ttgaaactgt catcatacat ccacatttct ccaccaagaa accaatggac 420 tatgatattg cccttttgaa gatggctgga gccttccaat ttggccactt tgtggggccc 480 atatgtcttc cagagctgcg ggagcaattt gaggctggtt ttatttgtac aactgcaggc 540 tggggccgct taactgaagg tggcgtcctc tcacaagtct tgcaggaagt gaatctgcct 600 attttgacct gggaagagtg tgtggcagct ctgttaacac taaagaggcc catcagtggg 660 aagacctttc tttgcacagg ttttcctgat ggagggagag acgcatgtca gggagattca 720 ggaggttcac tcatgtgccg gaataagaaa ggggcctgga ctctggctgg tgtgacttcc 780 tggggtttgg gctgtggtcg aggctggaga aacaatgtga ggaaaagtga tcaaggatcc 840 cctgggatct tcacagacat tagtaaagtg cttccctgga tccacgaaca catccaaact 900 ggtaatcgga gaaagagctc cagagcctgg tgcagtgagc aggatgtcat agtcagcggg 960 gctgagggga agctgcactt cccagaaagc ctccacctat attatgagag caagcaacgg 1020 tgtgtctgga ccctgctggt accagaggaa atgcatgtgt tgctcagttt ttcccaccta 1080 gatgttgagt cttgtcacca cagttacctg tcaatgtatt ctttagaaga cagacccatt 1140 ggaaaatttt gtggagaaag cctcccttca tccattctta ttggctctaa ttctctaagg 1200 ctgaaattcg tctctgatgc cacagattat gcagctgggt ttaatcttac ctataaagct 1260 cttaaaccaa actacattcc tgattcaggt tgcagttact taactgtcct ttttgaagaa 1320 ggtctcatac agagtctaaa ctatcctgaa aactacagtg acaaggctaa ctgtgactgg 1380 atttttcaag cctccaaaca tcacctaatt aagctttcat ttcagagtct ggaaatagaa 1440 gaaagtggag actgcacttc cgactatgtg acagtgcaca gcgatgtaga aaggaagaag 1500 gaaatagctc ggctgtgtgg ctatgatgtc cccacccctg tgctgagccc ctccagcatc 1560 atgctcatca gcttccaatc agatgaaaac gggacctgca ggggctttca ggctacagtc 1620 tccttcattc ctaaagcagg taagaagata gagttaccaa ctctttggtt cccagttcta 1680 atccttgtga tgtga 1695 <210> 268 <211> 564 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mername-AA180 peptidase <400> 268 Met Leu Ile Ser Arg Asn Lys Leu Ile Leu Leu Leu Gly Ile Val Phe 1 5 10 15 Phe Glu Arg Gly Lys Ser Ala Thr Leu Ser Leu Pro Lys Ala Pro Ser 20 25 30 Cys Gly Gln Ser Leu Val Lys Val Gln Pro Trp Asn Tyr Phe Asn Ile 35 40 45 Phe Ser Arg Ile Leu Gly Gly Ser Gln Val Glu Lys Gly Ser Tyr Pro 50 55 60 Trp Gln Val Ser Leu Lys Gln Arg Gln Lys His Ile Cys Gly Gly Ser 65 70 75 80 Ile Val Ser Pro Gln Trp Val Ile Thr Ala Ala His Cys Ile Ala Asn 85 90 95 Arg Asn Ile Val Ser Thr Leu Asn Val Thr Ala Gly Glu Tyr Asp Leu 100 105 110 Ser Gln Thr Asp Pro Gly Glu Gln Thr Leu Thr Ile Glu Thr Val Ile 115 120 125 Ile His Pro His Phe Ser Thr Lys Lys Pro Met Asp Tyr Asp Ile Ala 130 135 140 Leu Leu Lys Met Ala Gly Ala Phe Gln Phe Gly His Phe Val Gly Pro 145 150 155 160 Ile Cys Leu Pro Glu Leu Arg Glu Gln Phe Glu Ala Gly Phe Ile Cys 165 170 175 Thr Thr Ala Gly Trp Gly Arg Leu Thr Glu Gly Gly Val Leu Ser Gln 180 185 190 Val Leu Gln Glu Val Asn Leu Pro Ile Leu Thr Trp Glu Glu Cys Val 195 200 205 Ala Ala Leu Leu Thr Leu Lys Arg Pro Ile Ser Gly Lys Thr Phe Leu 210 215 220 Cys Thr Gly Phe Pro Asp Gly Gly Arg Asp Ala Cys Gln Gly Asp Ser 225 230 235 240 Gly Gly Ser Leu Met Cys Arg Asn Lys Lys Gly Ala Trp Thr Leu Ala 245 250 255 Gly Val Thr Ser Trp Gly Leu Gly Cys Gly Arg Gly Trp Arg Asn Asn 260 265 270 Val Arg Lys Ser Asp Gln Gly Ser Pro Gly Ile Phe Thr Asp Ile Ser 275 280 285 Lys Val Leu Pro Trp Ile His Glu His Ile Gln Thr Gly Asn Arg Arg 290 295 300 Lys Ser Ser Arg Ala Trp Cys Ser Glu Gln Asp Val Ile Val Ser Gly 305 310 315 320 Ala Glu Gly Lys Leu His Phe Pro Glu Ser Leu His Leu Tyr Tyr Glu 325 330 335 Ser Lys Gln Arg Cys Val Trp Thr Leu Leu Val Pro Glu Glu Met His 340 345 350 Val Leu Leu Ser Phe Ser His Leu Asp Val Glu Ser Cys His His Ser 355 360 365 Tyr Leu Ser Met Tyr Ser Leu Glu Asp Arg Pro Ile Gly Lys Phe Cys 370 375 380 Gly Glu Ser Leu Pro Ser Ser Ile Leu Ile Gly Ser Asn Ser Leu Arg 385 390 395 400 Leu Lys Phe Val Ser Asp Ala Thr Asp Tyr Ala Ala Gly Phe Asn Leu 405 410 415 Thr Tyr Lys Ala Leu Lys Pro Asn Tyr Ile Pro Asp Ser Gly Cys Ser 420 425 430 Tyr Leu Thr Val Leu Phe Glu Glu Gly Leu Ile Gln Ser Leu Asn Tyr 435 440 445 Pro Glu Asn Tyr Ser Asp Lys Ala Asn Cys Asp Trp Ile Phe Gln Ala 450 455 460 Ser Lys His His Leu Ile Lys Leu Ser Phe Gln Ser Leu Glu Ile Glu 465 470 475 480 Glu Ser Gly Asp Cys Thr Ser Asp Tyr Val Thr Val His Ser Asp Val 485 490 495 Glu Arg Lys Lys Glu Ile Ala Arg Leu Cys Gly Tyr Asp Val Pro Thr 500 505 510 Pro Val Leu Ser Pro Ser Ser Ile Met Leu Ile Ser Phe Gln Ser Asp 515 520 525 Glu Asn Gly Thr Cys Arg Gly Phe Gln Ala Thr Val Ser Phe Ile Pro 530 535 540 Lys Ala Gly Lys Lys Ile Glu Leu Pro Thr Leu Trp Phe Pro Val Leu 545 550 555 560 Ile Leu Val Met <210> 269 <211> 3420 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Mername-AA182 peptidase <400> 269 atgggcctgc tggccagtgc tggtttgttg ctgttgctgg tcatcggcca ccccagaagc 60 ctaggactga agtgtggaat tcgcatggtc aacatgaaaa gtaaggaacc tgccgtggga 120 tctagattct tctctagaat tagtagttgg agaaattcaa cagtgactgg acatccatgg 180 caggtctccc taaaatcaga tgagcaccac ttctgtggag gaagcttgat tcaagaagat 240 cgggttgtta cagcagcaca ctgcctggac agcctcagtg agaagcagct gaagaatata 300 actgtgactt ctggggagta cagcctcttt cagaaggata agcaagaaca gaatattcct 360 gtctcaaaaa ttattaccca tcctgaatac aacagccgtg aatatatgag tcctgatatt 420 gcactgctgt atctaaaaca caaagtcaag tttggaaatg ctgttcagcc aatctgtctt 480 cctgacagcg atgataaagt tgaaccagga attctttgct tatccagtgg atggggcaag 540 atttccaaaa catcagaata ttcaaatgtc ctacaagaaa tggaacttcc catcatggat 600 gacagagcgt gtaatactgt gctcaagagc atgaacctcc ctcccctggg aaggaccatg 660 ctgtgtgctg gcttccctga ttggggaatg gacgcctgcc agggggactc tggaggacca 720 ctggtttgta gaagaggtgg tggaatctgg attcttgctg ggataacttc ctgggtagct 780 ggttgtgctg gaggttcagt tcccgtaaga aacaaccatg tgaaggcatc acttggcatt 840 ttctccaaag tgtctgagtt gatggatttt atcactcaaa acctgttcac aggtttggat 900 cggggccaac ccctctcaaa agtgggctca aggtatataa caaaggccct gagttctgtc 960 caagaagtga atggaagcca gagaggaaag ggtattttag acatggaaaa gcaagttgga 1020 tgtgatcatg actatgtatc tttacgatca agcagtggag tgctttttaa tcagagatct 1080 ctcatggaag acgatggaaa acaaaacaaa cgtgtctgtg gaaaaatatt gccttcacca 1140 ttgctggcag agaccagtga ggccatggtt ccatttgttt ctgatacaga agacagtggc 1200 agtggctttg agcttaccgt tactgctgta cagaagtcag aagcagggtc aggttgtggg 1260 agtctggcta tattggtaga agaagggaca aatcactctg ccaagtatcc tgatttgtat 1320 cccagtaaca caaggtgtca ttggttcatt tgtgctccag agaagcacat tataaagttg 1380 acatttgagg actttgctgt caaatttagt ccaaactgta tttatgatgc tgttgtgatt 1440 tacggtgatt ctgaagaaaa gcacaagtta gctaaacttt gtggaatgtt gaccatcact 1500 tcaatattca gttctagtaa catgacggtg atatacttta aaagtgatgg taaaaatcgt 1560 ttacaaggct tcaaggccag atttaccatt ttgccctcag agtctttaaa caaatttgaa 1620 ccaaagttac ctccccaaaa caatcctgta tctaccgtaa aagctattct gcatgatgtc 1680 tgtggcatcc ctccatttag tccccagtgg ctttccagaa gaatcgcagg aggggaagaa 1740 gcctgccccc actgttggcc atggcaggtg ggtctgaggt ttctaggcga ttaccaatgt 1800 ggaggtgcca tcatcaaccc agtgtggatt ctgaccgcag cccactgtgt gcaattgaag 1860 aataatccac tctcctggac tattattgct ggggaccatg acagaaacct gaaggaatca 1920 acagagcagg tgagaagggc caaacacata atagtgcatg aagactttaa cacactaagt 1980 tatgactctg acattgccct aatacaacta agctctcctc tggagtacaa ctcggtggtg 2040 aggccagtat gtctcccaca cagcgcagag cctctatttt cctcggagat ctgtgctgtg 2100 accggatggg gaagcatcag tgcagatggt ggcctagcaa gtcgcctaca gcagattcaa 2160 gtgcatgtgt tagaaagaga ggtctgtgaa cacacttact attctgccca tccaggaggg 2220 atcacagaga agatgatctg tgctggcttt gcagcatctg gagagaaaga tttctgccag 2280 ggagactctg gtgggccact agtatgtaga catgaaaatg gtccctttgt cctctatggc 2340 attgtcagct ggggagctgg ctgtgtccag ccatggaagc cgggtgtatt tgccagagtg 2400 atgatcttct tggactggat ccaatcaaaa atcaatggtc ctgcttcact tcagacaaat 2460 aataaatgca aaaccttaaa acaacaattg ccaccaccca caccttcacc agacagtgca 2520 tcttggccag gttgttgctc tgaagcagag ctagaaaagc ctagaggctt ttttcccaca 2580 ccacggtatc tactggatta tagaggaaga ctggaatgtt cttgggtgct cagagtttca 2640 gcaagcagta tggcaaaatt taccattgag tatctgtcac tcctggggtc tcctgtgtgt 2700 caagactcag ttctaattat ttatgaagaa agacacagta agagaaagac ggcaggtgga 2760 ttacatggaa gaagacttta ctcaatgact ttcatgagtc ctggaccgct ggtgagggtg 2820 acattccatg cccttgtacg aggtgcattt ggtataagct atattgactt gaaagtccta 2880 ggtccaaagg acagtaaaat aaccagactt tcccaaagtt caaacagaga gcacttggtc 2940 ccttgtgagg atgttcttct gaccaagcca gaagggatca tgcagatccc aagaaattct 3000 cacagaacta ctatggggtg ccaatggaga ttagtagccc ctttaaatca catcattcag 3060 cttaatatta ttaacttccc gatgaagcca acaacttttg tctgtcatgg tcatctgcgt 3120 gtttacgaag gatttggacc aggaaaaaaa ttaatagctt cattcgctgg aactctggca 3180 atgatactga caaaagacat attaaaaaga gaaaaactga attttattaa cacatatatc 3240 atgcatatat gggaaaattc agtgtatgat aatgtaagaa gtgttggaaa aagaaaacag 3300 aagaaatttg catcaaattt aagttatagt atggaggctg agaagtccag gatccaggtg 3360 ccagcagatt tggtgcctgc taagggctca ctttctggtt cttaggcaca gcccattctc 3420 <210> 270 <211> 1134 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mername-AA182 peptidase <400> 270 Met Gly Leu Leu Ala Ser Ala Gly Leu Leu Leu Leu Leu Val Ile Gly 1 5 10 15 His Pro Arg Ser Leu Gly Leu Lys Cys Gly Ile Arg Met Val Asn Met 20 25 30 Lys Ser Lys Glu Pro Ala Val Gly Ser Arg Phe Phe Ser Arg Ile Ser 35 40 45 Ser Trp Arg Asn Ser Thr Val Thr Gly His Pro Trp Gln Val Ser Leu 50 55 60 Lys Ser Asp Glu His His Phe Cys Gly Gly Ser Leu Ile Gln Glu Asp 65 70 75 80 Arg Val Val Thr Ala Ala His Cys Leu Asp Ser Leu Ser Glu Lys Gln 85 90 95 Leu Lys Asn Ile Thr Val Thr Ser Gly Glu Tyr Ser Leu Phe Gln Lys 100 105 110 Asp Lys Gln Glu Gln Asn Ile Pro Val Ser Lys Ile Ile Thr His Pro 115 120 125 Glu Tyr Asn Ser Arg Glu Tyr Met Ser Pro Asp Ile Ala Leu Leu Tyr 130 135 140 Leu Lys His Lys Val Lys Phe Gly Asn Ala Val Gln Pro Ile Cys Leu 145 150 155 160 Pro Asp Ser Asp Asp Lys Val Glu Pro Gly Ile Leu Cys Leu Ser Ser 165 170 175 Gly Trp Gly Lys Ile Ser Lys Thr Ser Glu Tyr Ser Asn Val Leu Gln 180 185 190 Glu Met Glu Leu Pro Ile Met Asp Asp Arg Ala Cys Asn Thr Val Leu 195 200 205 Lys Ser Met Asn Leu Pro Pro Leu Gly Arg Thr Met Leu Cys Ala Gly 210 215 220 Phe Pro Asp Trp Gly Met Asp Ala Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro 225 230 235 240 Leu Val Cys Arg Arg Gly Gly Gly Ile Trp Ile Leu Ala Gly Ile Thr 245 250 255 Ser Trp Val Ala Gly Cys Ala Gly Gly Ser Val Pro Val Arg Asn Asn 260 265 270 His Val Lys Ala Ser Leu Gly Ile Phe Ser Lys Val Ser Glu Leu Met 275 280 285 Asp Phe Ile Thr Gln Asn Leu Phe Thr Gly Leu Asp Arg Gly Gln Pro 290 295 300 Leu Ser Lys Val Gly Ser Arg Tyr Ile Thr Lys Ala Leu Ser Ser Val 305 310 315 320 Gln Glu Val Asn Gly Ser Gln Arg Gly Lys Gly Ile Leu Asp Met Glu 325 330 335 Lys Gln Val Gly Cys Asp His Asp Tyr Val Ser Leu Arg Ser Ser Ser 340 345 350 Gly Val Leu Phe Asn Gln Arg Ser Leu Met Glu Asp Asp Gly Lys Gln 355 360 365 Asn Lys Arg Val Cys Gly Lys Ile Leu Pro Ser Pro Leu Leu Ala Glu 370 375 380 Thr Ser Glu Ala Met Val Pro Phe Val Ser Asp Thr Glu Asp Ser Gly 385 390 395 400 Ser Gly Phe Glu Leu Thr Val Thr Ala Val Gln Lys Ser Glu Ala Gly 405 410 415 Ser Gly Cys Gly Ser Leu Ala Ile Leu Val Glu Glu Gly Thr Asn His 420 425 430 Ser Ala Lys Tyr Pro Asp Leu Tyr Pro Ser Asn Thr Arg Cys His Trp 435 440 445 Phe Ile Cys Ala Pro Glu Lys His Ile Ile Lys Leu Thr Phe Glu Asp 450 455 460 Phe Ala Val Lys Phe Ser Pro Asn Cys Ile Tyr Asp Ala Val Val Ile 465 470 475 480 Tyr Gly Asp Ser Glu Glu Lys His Lys Leu Ala Lys Leu Cys Gly Met 485 490 495 Leu Thr Ile Thr Ser Ile Phe Ser Ser Ser Asn Met Thr Val Ile Tyr 500 505 510 Phe Lys Ser Asp Gly Lys Asn Arg Leu Gln Gly Phe Lys Ala Arg Phe 515 520 525 Thr Ile Leu Pro Ser Glu Ser Leu Asn Lys Phe Glu Pro Lys Leu Pro 530 535 540 Pro Gln Asn Asn Pro Val Ser Thr Val Lys Ala Ile Leu His Asp Val 545 550 555 560 Cys Gly Ile Pro Pro Phe Ser Pro Gln Trp Leu Ser Arg Arg Ile Ala 565 570 575 Gly Gly Glu Glu Ala Cys Pro His Cys Trp Pro Trp Gln Val Gly Leu 580 585 590 Arg Phe Leu Gly Asp Tyr Gln Cys Gly Gly Ala Ile Ile Asn Pro Val 595 600 605 Trp Ile Leu Thr Ala Ala His Cys Val Gln Leu Lys Asn Asn Pro Leu 610 615 620 Ser Trp Thr Ile Ile Ala Gly Asp His Asp Arg Asn Leu Lys Glu Ser 625 630 635 640 Thr Glu Gln Val Arg Arg Ala Lys His Ile Ile Val His Glu Asp Phe 645 650 655 Asn Thr Leu Ser Tyr Asp Ser Asp Ile Ala Leu Ile Gln Leu Ser Ser 660 665 670 Pro Leu Glu Tyr Asn Ser Val Val Arg Pro Val Cys Leu Pro His Ser 675 680 685 Ala Glu Pro Leu Phe Ser Ser Glu Ile Cys Ala Val Thr Gly Trp Gly 690 695 700 Ser Ile Ser Ala Asp Gly Gly Leu Ala Ser Arg Leu Gln Gln Ile Gln 705 710 715 720 Val His Val Leu Glu Arg Glu Val Cys Glu His Thr Tyr Tyr Ser Ala 725 730 735 His Pro Gly Gly Ile Thr Glu Lys Met Ile Cys Ala Gly Phe Ala Ala 740 745 750 Ser Gly Glu Lys Asp Phe Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val 755 760 765 Cys Arg His Glu Asn Gly Pro Phe Val Leu Tyr Gly Ile Val Ser Trp 770 775 780 Gly Ala Gly Cys Val Gln Pro Trp Lys Pro Gly Val Phe Ala Arg Val 785 790 795 800 Met Ile Phe Leu Asp Trp Ile Gln Ser Lys Ile Asn Gly Pro Ala Ser 805 810 815 Leu Gln Thr Asn Asn Lys Cys Lys Thr Leu Lys Gln Gln Leu Pro Pro 820 825 830 Pro Thr Pro Ser Pro Asp Ser Ala Ser Trp Pro Gly Cys Cys Ser Glu 835 840 845 Ala Glu Leu Glu Lys Pro Arg Gly Phe Phe Pro Thr Pro Arg Tyr Leu 850 855 860 Leu Asp Tyr Arg Gly Arg Leu Glu Cys Ser Trp Val Leu Arg Val Ser 865 870 875 880 Ala Ser Ser Met Ala Lys Phe Thr Ile Glu Tyr Leu Ser Leu Leu Gly 885 890 895 Ser Pro Val Cys Gln Asp Ser Val Leu Ile Ile Tyr Glu Glu Arg His 900 905 910 Ser Lys Arg Lys Thr Ala Gly Gly Leu His Gly Arg Arg Leu Tyr Ser 915 920 925 Met Thr Phe Met Ser Pro Gly Pro Leu Val Arg Val Thr Phe His Ala 930 935 940 Leu Val Arg Gly Ala Phe Gly Ile Ser Tyr Ile Asp Leu Lys Val Leu 945 950 955 960 Gly Pro Lys Asp Ser Lys Ile Thr Arg Leu Ser Gln Ser Ser Asn Arg 965 970 975 Glu His Leu Val Pro Cys Glu Asp Val Leu Leu Thr Lys Pro Glu Gly 980 985 990 Ile Met Gln Ile Pro Arg Asn Ser His Arg Thr Thr Met Gly Cys Gln 995 1000 1005 Trp Arg Leu Val Ala Pro Leu Asn His Ile Ile Gln Leu Asn Ile Ile 1010 1015 1020 Asn Phe Pro Met Lys Pro Thr Thr Phe Val Cys His Gly His Leu Arg 1025 1030 1035 1040 Val Tyr Glu Gly Phe Gly Pro Gly Lys Lys Leu Ile Ala Ser Phe Ala 1045 1050 1055 Gly Thr Leu Ala Met Ile Leu Thr Lys Asp Ile Leu Lys Arg Glu Lys 1060 1065 1070 Leu Asn Phe Ile Asn Thr Tyr Ile Met His Ile Trp Glu Asn Ser Val 1075 1080 1085 Tyr Asp Asn Val Arg Ser Val Gly Lys Arg Lys Gln Lys Lys Phe Ala 1090 1095 1100 Ser Asn Leu Ser Tyr Ser Met Glu Ala Glu Lys Ser Arg Ile Gln Val 1105 1110 1115 1120 Pro Ala Asp Leu Val Pro Ala Lys Gly Ser Leu Ser Gly Ser 1125 1130 <210> 271 <211> 2810 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Mername-AA122 peptidase <400> 271 acttggctct gcctccgctg actctagcgc catggcccgg cacctgctcc tcccccttgt 60 gatgcttgtc atcagtccca tcccaggagc cttccaggac tcagctctca gtcctaccca 120 ggaagaacct gaagatctgg actgcgggcg ccctgagccc tcggcccgca tcgtgggggg 180 gctcaaacgc gcagccgggc acctggcctt ggcaagtgag cctgcaccat ggaggtggcc 240 acatctgcgg gggctccctc atcgccccct cctgggtcct ctccgctgct cactgtttca 300 tgacgaatgg gacgctggag cccgcggccg agtggtcggt actgctgggc gtgcactccc 360 aggacgggcc cctggacggc gcgcacaccc gcgcagtggc cgccatcgtg gtgccggcca 420 actacagcca agtggagctg ggcgccgacc tggccctgct gcgcctggcc tcacccgcca 480 gcctgggccc cgccgtgtgg cctgtctgcc tgccccgcgc ctcacaccgc ttcgtgcacg 540 gcaccgcctg ctgggccacc ggctggggag acgtccagga ggcagatcct ctgcctctcc 600 cctgggtgct acaggaagtg gagctaaggc tgctgggcga ggccacctgt caatgtctct 660 acagccagcc cggtcccttc aacctcactc tccagatatt gccagggatg ctgtgtgctg 720 gctacccaga gggccgcagg gacacctgcc agggcgactc tggggggccc ctggtctgtg 780 aggaaggcgg ccgctggttc caggcaggaa tcaccagctt tggctttggc tgtggacgga 840 gaaaccgccc tggagttttc actgctgtgg ctacctatga ggcatggata cgggagcagg 900 tgatgggttc agagcctggg cctgcctttc ccacccagcc ccagaagacc cagtcagatc 960 cccaggagcc cagggaggag aactgcacca ttgccctgcc tgagtgcggg aaggccccgc 1020 ggccaggggc ctggccctgg gaggcccagg tgatggtgcc aggatccaga ccctgccatg 1080 gggcgctggt gtctgaaagc tgggtcttgg cacctgccag ctgctttctg gacccgaaca 1140 gctccgacag cccaccccgc gacctcgacg cctggcgcgt gctgctgccc tcgcgcccgc 1200 gcgcggagcg ggtggcgcgc ctggtgcagc acgagaacgc ttcgtgggac aacgcctcgg 1260 acctggcgct gctgcagctg cgcacgcccg tgaacctgag tgcggcttcg cggcccgtgt 1320 gcctacccca cccggaacac tacttcctgc ccgggagccg ctgccgcctg gcccgctggg 1380 gccgcgggga acccgcgctt ggcccaggcg cgctgctgga ggcggagctg ttaggcggct 1440 ggtggtgcca ctgcctgtac ggccgccagg gggcggcagt accgctgccc ggagacccgc 1500 cgcacgcgct ctgccctgcc taccaggaaa aggaggaggt gggcagctgc tggaatgact 1560 cgcgttggag ccttttgtgc caggaggagg ggacctggtt tctggctgga atcagagact 1620 ttcccagtgg ctgtctacgt ccccgagcct tcttccctct gcagactcat ggcccatgga 1680 tcagccatgt gactcgggga gcctacctgg aggaccagct agcctgggac tggggccctg 1740 atggggagga gactgagaca cagacttgtc ccccacacac agagcatggt gcctgtggcc 1800 tgcggctgga ggctgctcca gtgggggtcc tgtggccctg gctggcagag gtgcatgtgg 1860 ctggtgatcg agtctgcact gggatcctcc tggccccagg ctgggtcctg gcagccactc 1920 actgtgtcct caggccaggc tctacaacag tgccttacat tgaagtgtat ctgggccggg 1980 caggggccag ctccctccca cagggccacc aggtatcccg cttggtcatc agcatccggc 2040 tgccccagca cctgggactc aggccccccc tggccctcct ggagctgagc tcccgggtgg 2100 agccctcccc atcagccctg cccatctgtc tccacccggc gggtatcccc ccgggggcca 2160 gctgctgggt gttgggctgg aaagaacccc aggaccgagt ccctgtggct gctgctgtct 2220 ccatcttgac acaacgaatc tgtgactgcc tctatcaggg catcctgccc cctggaaccc 2280 tctgtgtcct gtatgcagag gggcaggaga acaggtgtga gatgacctca gcaccgcccc 2340 tcctgtgcca gatgacggaa gggtcctgga tcctcgtggg catggctgtt caagggagcc 2400 gggagctgtt tgctgccatt ggtcctgaag aggcctggat ctcccagaca gtgggagagg 2460 ccaacctcct gccccccagt ggctccccac actggcccac tggaggcagc aatctctgcc 2520 ccccagaact ggccaaggcc tcgggatccc cgcatgcagt ctacttcctg ctcctgctga 2580 ctctcctgat ccagagctga ggggctaggg tcccagcacc acttccccct tctccaccct 2640 ctacttcccg cccagtgggg ctggaatgtg gcccagccgg ctggaacctc aagggcccca 2700 cccaccgaga ttgcagcggc tctggctaat tgggcctctg tgcccgggct attttgaacc 2760 caggaatcct tgggggtggt gggaggagcg gacaataaag gtgtaaacac 2810 <210> 272 <211> 766 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mername-AA122 peptidase <400> 272 Met Thr Asn Gly Thr Leu Glu Pro Ala Ala Glu Trp Ser Val Leu Leu 1 5 10 15 Gly Val His Ser Gln Asp Gly Pro Leu Asp Gly Ala His Thr Arg Ala 20 25 30 Val Ala Ala Ile Val Val Pro Ala Asn Tyr Ser Gln Val Glu Leu Gly 35 40 45 Ala Asp Leu Ala Leu Leu Arg Leu Ala Ser Pro Ala Ser Leu Gly Pro 50 55 60 Ala Val Trp Pro Val Cys Leu Pro Arg Ala Ser His Arg Phe Val His 65 70 75 80 Gly Thr Ala Cys Trp Ala Thr Gly Trp Gly Asp Val Gln Glu Ala Asp 85 90 95 Pro Leu Pro Leu Pro Trp Val Leu Gln Glu Val Glu Leu Arg Leu Leu 100 105 110 Gly Glu Ala Thr Cys Gln Cys Leu Tyr Ser Gln Pro Gly Pro Phe Asn 115 120 125 Leu Thr Leu Gln Ile Leu Pro Gly Met Leu Cys Ala Gly Tyr Pro Glu 130 135 140 Gly Arg Arg Asp Thr Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys 145 150 155 160 Glu Glu Gly Gly Arg Trp Phe Gln Ala Gly Ile Thr Ser Phe Gly Phe 165 170 175 Gly Cys Gly Arg Arg Asn Arg Pro Gly Val Phe Thr Ala Val Ala Thr 180 185 190 Tyr Glu Ala Trp Ile Arg Glu Gln Val Met Gly Ser Glu Pro Gly Pro 195 200 205 Ala Phe Pro Thr Gln Pro Gln Lys Thr Gln Ser Asp Pro Gln Glu Pro 210 215 220 Arg Glu Glu Asn Cys Thr Ile Ala Leu Pro Glu Cys Gly Lys Ala Pro 225 230 235 240 Arg Pro Gly Ala Trp Pro Trp Glu Ala Gln Val Met Val Pro Gly Ser 245 250 255 Arg Pro Cys His Gly Ala Leu Val Ser Glu Ser Trp Val Leu Ala Pro 260 265 270 Ala Ser Cys Phe Leu Asp Pro Asn Ser Ser Asp Ser Pro Pro Arg Asp 275 280 285 Leu Asp Ala Trp Arg Val Leu Leu Pro Ser Arg Pro Arg Ala Glu Arg 290 295 300 Val Ala Arg Leu Val Gln His Glu Asn Ala Ser Trp Asp Asn Ala Ser 305 310 315 320 Asp Leu Ala Leu Leu Gln Leu Arg Thr Pro Val Asn Leu Ser Ala Ala 325 330 335 Ser Arg Pro Val Cys Leu Pro His Pro Glu His Tyr Phe Leu Pro Gly 340 345 350 Ser Arg Cys Arg Leu Ala Arg Trp Gly Arg Gly Glu Pro Ala Leu Gly 355 360 365 Pro Gly Ala Leu Leu Glu Ala Glu Leu Leu Gly Gly Trp Trp Cys His 370 375 380 Cys Leu Tyr Gly Arg Gln Gly Ala Ala Val Pro Leu Pro Gly Asp Pro 385 390 395 400 Pro His Ala Leu Cys Pro Ala Tyr Gln Glu Lys Glu Glu Val Gly Ser 405 410 415 Cys Trp Asn Asp Ser Arg Trp Ser Leu Leu Cys Gln Glu Glu Gly Thr 420 425 430 Trp Phe Leu Ala Gly Ile Arg Asp Phe Pro Ser Gly Cys Leu Arg Pro 435 440 445 Arg Ala Phe Phe Pro Leu Gln Thr His Gly Pro Trp Ile Ser His Val 450 455 460 Thr Arg Gly Ala Tyr Leu Glu Asp Gln Leu Ala Trp Asp Trp Gly Pro 465 470 475 480 Asp Gly Glu Glu Thr Glu Thr Gln Thr Cys Pro Pro His Thr Glu His 485 490 495 Gly Ala Cys Gly Leu Arg Leu Glu Ala Ala Pro Val Gly Val Leu Trp 500 505 510 Pro Trp Leu Ala Glu Val His Val Ala Gly Asp Arg Val Cys Thr Gly 515 520 525 Ile Leu Leu Ala Pro Gly Trp Val Leu Ala Ala Thr His Cys Val Leu 530 535 540 Arg Pro Gly Ser Thr Thr Val Pro Tyr Ile Glu Val Tyr Leu Gly Arg 545 550 555 560 Ala Gly Ala Ser Ser Leu Pro Gln Gly His Gln Val Ser Arg Leu Val 565 570 575 Ile Ser Ile Arg Leu Pro Gln His Leu Gly Leu Arg Pro Pro Leu Ala 580 585 590 Leu Leu Glu Leu Ser Ser Arg Val Glu Pro Ser Pro Ser Ala Leu Pro 595 600 605 Ile Cys Leu His Pro Ala Gly Ile Pro Pro Gly Ala Ser Cys Trp Val 610 615 620 Leu Gly Trp Lys Glu Pro Gln Asp Arg Val Pro Val Ala Ala Ala Val 625 630 635 640 Ser Ile Leu Thr Gln Arg Ile Cys Asp Cys Leu Tyr Gln Gly Ile Leu 645 650 655 Pro Pro Gly Thr Leu Cys Val Leu Tyr Ala Glu Gly Gln Glu Asn Arg 660 665 670 Cys Glu Met Thr Ser Ala Pro Pro Leu Leu Cys Gln Met Thr Glu Gly 675 680 685 Ser Trp Ile Leu Val Gly Met Ala Val Gln Gly Ser Arg Glu Leu Phe 690 695 700 Ala Ala Ile Gly Pro Glu Glu Ala Trp Ile Ser Gln Thr Val Gly Glu 705 710 715 720 Ala Asn Leu Leu Pro Pro Ser Gly Ser Pro His Trp Pro Thr Gly Gly 725 730 735 Ser Asn Leu Cys Pro Pro Glu Leu Ala Lys Ala Ser Gly Ser Pro His 740 745 750 Ala Val Tyr Phe Leu Leu Leu Leu Thr Leu Leu Ile Gln Ser 755 760 765 <210> 273 <211> 1575 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Cathepsin L <400> 273 agaaccgcga cctccgcaac cttgagcggc atccgtggag tgcgcctgca gctacgaccg 60 cagcaggaaa gcgccgccgg ccaggcccag ctgtggccgg acagggactg gaagagagga 120 cgcggtcgag taggtgtgca ccagccctgg caacgagagc gtctaccccg aactctgctg 180 gccttgaggt ggggaagccg gggagggcag ttgaggaccc cgcggaggcg cgtgactggt 240 tgagcgggca ggccagcctc cgagccgggt ggacacaggt tttaaaacat gaatcctaca 300 ctcatccttg ctgccttttg cctgggaatt gcctcagcta ctctaacatt tgatcacagt 360 ttagaggcac agtggaccaa gtggaaggcg atgcacaaca gattatacgg catgaatgaa 420 gaaggatgga ggagagcagt gtgggagaag aacatgaaga tgattgaact gcacaatcag 480 gaatacaggg aagggaaaca cagcttcaca atggccatga acgcctttgg agacatgacc 540 agtgaagaat tcaggcaggt gatgaatggc tttcaaaacc gtaagcccag gaaggggaaa 600 gtgttccagg aacctctgtt ttatgaggcc cccagatctg tggattggag agagaaaggc 660 tacgtgactc ctgtgaagaa tcagggtcag tgtggttctt gttgggcttt tagtgctact 720 ggtgctcttg aaggacagat gttccggaaa actgggaggc ttatctcact gagtgagcag 780 aatctggtag actgctctgg gcctcaaggc aatgaaggct gcaatggtgg cctaatggat 840 tatgctttcc agtatgttca ggataatgga ggcctggact ctgaggaatc ctatccatat 900 gaggcaacag aagaatcctg taagtacaat cccaagtatt ctgttgctaa tgacaccggc 960 tttgtggaca tccctaagca ggagaaggcc ctgatgaagg cagttgcaac tgtggggccc 1020 atttctgttg ctattgatgc aggtcatgag tccttcctgt tctataaaga aggcatttat 1080 tttgagccag actgtagcag tgaagacatg gatcatggtg tgctggtggt tggctacgga 1140 tttgaaagca cagaatcaga taacaataaa tattggctgg tgaagaacag ctggggtgaa 1200 gaatggggca tgggtggcta cgtaaagatg gccaaagacc ggagaaacca ttgtggaatt 1260 gcctcagcag ccagctaccc cactgtgtga gctggtggac ggtgatgagg aaggacttga 1320 ctggggatgg cgcatgcatg ggaggaattc atcttcagtc taccagcccc cgctgtgtcg 1380 gatacacact cgaatcattg aagatccgag tgtgatttga attctgtgat attttcacac 1440 tggtaaatgt tacctctatt ttaattactg ctataaatag gtttatatta ttgattcact 1500 tactgacttt gcattttcgt ttttaaaagg atgtataaat ttttacctgt ttaaataaaa 1560 tttaatttca aatgt 1575 <210> 274 <211> 333 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Cathepsin L <400> 274 Met Asn Pro Thr Leu Ile Leu Ala Ala Phe Cys Leu Gly Ile Ala Ser 1 5 10 15 Ala Thr Leu Thr Phe Asp His Ser Leu Glu Ala Gln Trp Thr Lys Trp 20 25 30 Lys Ala Met His Asn Arg Leu Tyr Gly Met Asn Glu Glu Gly Trp Arg 35 40 45 Arg Ala Val Trp Glu Lys Asn Met Lys Met Ile Glu Leu His Asn Gln 50 55 60 Glu Tyr Arg Glu Gly Lys His Ser Phe Thr Met Ala Met Asn Ala Phe 65 70 75 80 Gly Asp Met Thr Ser Glu Glu Phe Arg Gln Val Met Asn Gly Phe Gln 85 90 95 Asn Arg Lys Pro Arg Lys Gly Lys Val Phe Gln Glu Pro Leu Phe Tyr 100 105 110 Glu Ala Pro Arg Ser Val Asp Trp Arg Glu Lys Gly Tyr Val Thr Pro 115 120 125 Val Lys Asn Gln Gly Gln Cys Gly Ser Cys Trp Ala Phe Ser Ala Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Glu Gly Gln Met Phe Arg Lys Thr Gly Arg Leu Ile Ser 145 150 155 160 Leu Ser Glu Gln Asn Leu Val Asp Cys Ser Gly Pro Gln Gly Asn Glu 165 170 175 Gly Cys Asn Gly Gly Leu Met Asp Tyr Ala Phe Gln Tyr Val Gln Asp 180 185 190 Asn Gly Gly Leu Asp Ser Glu Glu Ser Tyr Pro Tyr Glu Ala Thr Glu 195 200 205 Glu Ser Cys Lys Tyr Asn Pro Lys Tyr Ser Val Ala Asn Asp Thr Gly 210 215 220 Phe Val Asp Ile Pro Lys Gln Glu Lys Ala Leu Met Lys Ala Val Ala 225 230 235 240 Thr Val Gly Pro Ile Ser Val Ala Ile Asp Ala Gly His Glu Ser Phe 245 250 255 Leu Phe Tyr Lys Glu Gly Ile Tyr Phe Glu Pro Asp Cys Ser Ser Glu 260 265 270 Asp Met Asp His Gly Val Leu Val Val Gly Tyr Gly Phe Glu Ser Thr 275 280 285 Glu Ser Asp Asn Asn Lys Tyr Trp Leu Val Lys Asn Ser Trp Gly Glu 290 295 300 Glu Trp Gly Met Gly Gly Tyr Val Lys Met Ala Lys Asp Arg Arg Asn 305 310 315 320 His Cys Gly Ile Ala Ser Ala Ala Ser Tyr Pro Thr Val 325 330 <210> 275 <211> 1342 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Cathepsin V <400> 275 cggctgtaat ctcagaggct tgtttgctga gggtgcctgc gcacgtgcga cggctgctgg 60 ttttgaaaca tgaatctttc gctcgtcctg gctgcctttt gcttgggaat agcctccgct 120 gttccaaaat ttgaccaaaa tttggataca aagtggtacc agtggaaggc aacacacaga 180 agattatatg gcgcgaatga agaaggatgg aggagagcag tgtgggaaaa gaatatgaaa 240 atgattgaac tgcacaatgg ggaatacagc caagggaaac atggcttcac aatggccatg 300 aatgcttttc ctgacatgac caatgaagaa ttcaggcaga tgatgggttg ctttcgaaac 360 cagaaattca ggaaggggaa agtgttccgt gagcctctgt ttcttgatct tcccaaatct 420 gtggattgga gaaagaaagg ctacgtgacg ccagtgaaga atcagaaaca gtgtggttct 480 tgttgggctt ttagtgcgac tggtgctctt gaaggacaga tgttccggaa aactgggaaa 540 cttgtctcac tgagcgagca gaatctggtg gactgttcgc gtcctcaagg caatcagggc 600 tgcaatggtg gcttcatggc tagggccttc cagtatgtca aggagaacgg aggcctggac 660 tctgaggaat cctatccata tgtagcagtg gatgaaatct gtaagtacag acctgagaat 720 tctgttgcta atgacactgg cttcacagtg gtcgcacctg gaaaggagaa ggccctgatg 780 aaagcagtcg caactgtggg gcccatctcc gttgctatgg atgcaggcca ttcgtccttc 840 cagttctaca aatcaggcat ttattttgaa ccagactgca gcagcaaaaa cctggatcat 900 ggtgttctgg tggttggcta cggctttgaa ggagcaaatt cgaataacag caagtattgg 960 ctcgtcaaaa acagctgggg tccagaatgg ggctcgaatg gctatgtaaa aatagccaaa 1020 gacaagaaca accactgtgg aatcgccaca gcagccagct accccaatgt gtgagctgat 1080 ggatggtgag gaggaaggac ttaaggacag catgtctggg gaaattttat cttgaaactg 1140 accaaacgct tattgtgtaa gataaaccag ttgaatcatt gaggatccaa gttgagattt 1200 taattctgtg acatttttac aagggtaaaa tgttaccact actttaatta ttgttataca 1260 cagctttatg atatcaaaga ctcattgctt aattctaaga cttttgaatt ttcatttttt 1320 aaaaagatgt acaaaacagt tt 1342 <210> 276 <211> 334 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Cathepsin V <400> 276 Met Asn Leu Ser Leu Val Leu Ala Ala Phe Cys Leu Gly Ile Ala Ser 1 5 10 15 Ala Val Pro Lys Phe Asp Gln Asn Leu Asp Thr Lys Trp Tyr Gln Trp 20 25 30 Lys Ala Thr His Arg Arg Leu Tyr Gly Ala Asn Glu Glu Gly Trp Arg 35 40 45 Arg Ala Val Trp Glu Lys Asn Met Lys Met Ile Glu Leu His Asn Gly 50 55 60 Glu Tyr Ser Gln Gly Lys His Gly Phe Thr Met Ala Met Asn Ala Phe 65 70 75 80 Gly Asp Met Thr Asn Glu Glu Phe Arg Gln Met Met Gly Cys Phe Arg 85 90 95 Asn Gln Lys Phe Arg Lys Gly Lys Val Phe Arg Glu Pro Leu Phe Leu 100 105 110 Asp Leu Pro Lys Ser Val Asp Trp Arg Lys Lys Gly Tyr Val Thr Pro 115 120 125 Val Lys Asn Gln Lys Gln Cys Gly Ser Cys Trp Ala Phe Ser Ala Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Glu Gly Gln Met Phe Arg Lys Thr Gly Lys Leu Val Ser 145 150 155 160 Leu Ser Glu Gln Asn Leu Val Asp Cys Ser Arg Pro Gln Gly Asn Gln 165 170 175 Gly Cys Asn Gly Gly Phe Met Ala Arg Ala Phe Gln Tyr Val Lys Glu 180 185 190 Asn Gly Gly Leu Asp Ser Glu Glu Ser Tyr Pro Tyr Val Ala Val Asp 195 200 205 Glu Ile Cys Lys Tyr Arg Pro Glu Asn Ser Val Ala Asn Asp Thr Gly 210 215 220 Phe Thr Val Val Ala Pro Gly Lys Glu Lys Ala Leu Met Lys Ala Val 225 230 235 240 Ala Thr Val Gly Pro Ile Ser Val Ala Met Asp Ala Gly His Ser Ser 245 250 255 Phe Gln Phe Tyr Lys Ser Gly Ile Tyr Phe Glu Pro Asp Cys Ser Ser 260 265 270 Lys Asn Leu Asp His Gly Val Leu Val Val Gly Tyr Gly Phe Glu Gly 275 280 285 Ala Asn Ser Asn Asn Ser Lys Tyr Trp Leu Val Lys Asn Ser Trp Gly 290 295 300 Pro Glu Trp Gly Ser Asn Gly Tyr Val Lys Ile Ala Lys Asp Lys Asn 305 310 315 320 Asn His Cys Gly Ile Ala Thr Ala Ala Ser Tyr Pro Asn Val 325 330 <210> 277 <211> 1661 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Cathepsin K <400> 277 attcggcacg agccgcaatc ccgatggaat aaatctagca cccctgatgg tgtgcccaca 60 ctttgctgcc gaaacgaagc cagacaacag atttccatca gcaggatgtg ggggctcaag 120 gttctgctgc tacctgtggt gagctttgct ctgtaccctg aggagatact ggacacccac 180 tgggagctat ggaagaagac ccacaggaag caatataaca acaaggtgga tgaaatctct 240 cggcgtttaa tttgggaaaa aaacctgaag tatatttcca tccataacct tgaggcttct 300 cttggtgtcc atacatatga actggctatg aaccacctgg gggacatgac cagtgaagag 360 gtggttcaga agatgactgg actcaaagta cccctgtctc attcccgcag taatgacacc 420 ctttatatcc cagaatggga aggtagagcc ccagactctg tcgactatcg aaagaaagga 480 tatgttactc ctgtcaaaaa tcagggtcag tgtggttcct gttgggcttt tagctctgtg 540 ggtgccctgg agggccaact caagaagaaa actggcaaac tcttaaatct gagtccccag 600 aacctagtgg attgtgtgtc tgagaatgat ggctgtggag ggggctacat gaccaatgcc 660 ttccaatatg tgcagaagaa ccggggtatt gactctgaag atgcctaccc atatgtggga 720 caggaagaga gttgtatgta caacccaaca ggcaaggcag ctaaatgcag agggtacaga 780 gagatccccg aggggaatga gaaagccctg aagagggcag tggcccgagt gggacctgtc 840 tctgtggcca ttgatgcaag cctgacctcc ttccagtttt acagcaaagg tgtgtattat 900 gatgaaagct gcaatagcga taatctgaac catgcggttt tggcagtggg atatggaatc 960 cagaagggaa acaagcactg gataattaaa aacagctggg gagaaaactg gggaaacaaa 1020 ggatatatcc tcatggctcg aaataagaac aacgcctgtg gcattgccaa cctggccagc 1080 ttccccaaga tgtgactcca gccagccaaa tccatcctgc tcttccattt cttccacgat 1140 ggtgcagtgt aacgatgcac tttggaaggg agttggtgtg ctatttttga agcagatgtg 1200 gtgatactga gattgtctgt tcagtttccc catttgtttg tgcttcaaat gatccttcct 1260 actttggttc tctcctccca tgaccttttt cactgtggcc atcaggactt tccctgacag 1320 ctgtgtactc ttaggctaag agatgtgact acagcctgcc cctgactgtg ttgtcccagg 1380 gctgatgctg tacaggtaca ggctggagat tttcacatag gttagattct cattcacggg 1440 actagttagc tttaagcacc ctagaggact agggtaatct gacttctcac ttcctaagtt 1500 cccttcaata tcctcaaggt agaaatgtct atgttttcta ctccaattca taaatctatt 1560 cataagtctt tggtacaagt ttacatgata aaaagaaatg tgatttgtct tcccttcttt 1620 gcacttttga aataaagtat ttatctcctg tctacagttt a 1661 <210> 278 <211> 329 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Cathepsin K <400> 278 Met Trp Gly Leu Lys Val Leu Leu Leu Pro Val Val Ser Phe Ala Leu 1 5 10 15 Tyr Pro Glu Glu Ile Leu Asp Thr His Trp Glu Leu Trp Lys Lys Thr 20 25 30 His Arg Lys Gln Tyr Asn Asn Lys Val Asp Glu Ile Ser Arg Arg Leu 35 40 45 Ile Trp Glu Lys Asn Leu Lys Tyr Ile Ser Ile His Asn Leu Glu Ala 50 55 60 Ser Leu Gly Val His Thr Tyr Glu Leu Ala Met Asn His Leu Gly Asp 65 70 75 80 Met Thr Ser Glu Glu Val Val Gln Lys Met Thr Gly Leu Lys Val Pro 85 90 95 Leu Ser His Ser Arg Ser Asn Asp Thr Leu Tyr Ile Pro Glu Trp Glu 100 105 110 Gly Arg Ala Pro Asp Ser Val Asp Tyr Arg Lys Lys Gly Tyr Val Thr 115 120 125 Pro Val Lys Asn Gln Gly Gln Cys Gly Ser Cys Trp Ala Phe Ser Ser 130 135 140 Val Gly Ala Leu Glu Gly Gln Leu Lys Lys Lys Thr Gly Lys Leu Leu 145 150 155 160 Asn Leu Ser Pro Gln Asn Leu Val Asp Cys Val Ser Glu Asn Asp Gly 165 170 175 Cys Gly Gly Gly Tyr Met Thr Asn Ala Phe Gln Tyr Val Gln Lys Asn 180 185 190 Arg Gly Ile Asp Ser Glu Asp Ala Tyr Pro Tyr Val Gly Gln Glu Glu 195 200 205 Ser Cys Met Tyr Asn Pro Thr Gly Lys Ala Ala Lys Cys Arg Gly Tyr 210 215 220 Arg Glu Ile Pro Glu Gly Asn Glu Lys Ala Leu Lys Arg Ala Val Ala 225 230 235 240 Arg Val Gly Pro Val Ser Val Ala Ile Asp Ala Ser Leu Thr Ser Phe 245 250 255 Gln Phe Tyr Ser Lys Gly Val Tyr Tyr Asp Glu Ser Cys Asn Ser Asp 260 265 270 Asn Leu Asn His Ala Val Leu Ala Val Gly Tyr Gly Ile Gln Lys Gly 275 280 285 Asn Lys His Trp Ile Ile Lys Asn Ser Trp Gly Glu Asn Trp Gly Asn 290 295 300 Lys Gly Tyr Ile Leu Met Ala Arg Asn Lys Asn Asn Ala Cys Gly Ile 305 310 315 320 Ala Asn Leu Ala Ser Phe Pro Lys Met 325 <210> 279 <211> 1255 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Cathepsin S <400> 279 ctaaagatga aacggctggt ttgtgtgctc ttggtgtgct cctctgcagt ggcacagttg 60 cataaagatc ctaccctgga tcaccactgg catctctgga agaaaaccta tggcaaacaa 120 tacaaggaaa agaatgaaga agcagtacga cgtctcatct gggaaaagaa tctaaagttt 180 gtgatgcttc acaacctgga gcattcaatg ggaatgcact catacgatct gggcatgaac 240 cacctgggag acatgaccag tgaagaagtg atgtctttga cgagttccct gagagttccc 300 agccagtggc agagaaatat cacatataag tcaaacccta atcggatatt gcctgattct 360 gtggactgga gagagaaagg gtgtgttact gaagtgaaat atcaaggttc ttgtggtgct 420 tgctgggctt tcagtgctgt gggggccctg gaagcacagc tgaagctgaa aacaggaaag 480 ctggtgactc tcagtgccca gaacctggtg gattgctcaa ctgaaaaata tggaaacaaa 540 ggctgcaatg gtggcttcat gacaacggct ttccagtaca tcattgataa caagggcatc 600 gactcagacg cttcctatcc ctacaaagcc atggatcaga aatgtcaata tgactcaaaa 660 tatcgtgctg ccacatgttc aaagtacact gaacttcctt atgggagaga agatgtcctg 720 aaagaagctg tggccaataa aggcccagtg tctgttggtg tagatgcgcg tcatccttct 780 ttcttcctct acagaagtgg tgtctactat gaaccatcct gtactcagaa tgtgaatcat 840 ggtgtacttg tggttggcta tggtgatctt aatgggaaag aatactggct tgtgaaaaac 900 agctggggcc acaactttgg tgaagaagga tatattcgga tggcaagaaa taaaggaaat 960 cattgtggga ttgctagctt tccctcttac ccagaaatct agaggatctc tcctttttat 1020 aacaaatcaa gaaatatgaa gcactttctc ttaacttaat ttttcctgct gtatccagaa 1080 gaaataattg tgtcatgatt aatgtgtatt tactgtacta atagaaaata tagtttgagg 1140 ccgggcactg tctggctcac gcctgtaatc ccagtacttg ggaggccaag gaggcatatc 1200 aacttgaggc caggagttaa agagcagcct ggctaactgt gaaaccctct ctact 1255 <210> 280 <211> 331 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Cathepsin S <400> 280 Met Lys Arg Leu Val Cys Val Leu Leu Val Cys Ser Ser Ala Val Ala 1 5 10 15 Gln Leu His Lys Asp Pro Thr Leu Asp His His Trp His Leu Trp Lys 20 25 30 Lys Thr Tyr Gly Lys Gln Tyr Lys Glu Lys Asn Glu Glu Ala Val Arg 35 40 45 Arg Leu Ile Trp Glu Lys Asn Leu Lys Phe Val Met Leu His Asn Leu 50 55 60 Glu His Ser Met Gly Met His Ser Tyr Asp Leu Gly Met Asn His Leu 65 70 75 80 Gly Asp Met Thr Ser Glu Glu Val Met Ser Leu Met Ser Ser Leu Arg 85 90 95 Val Pro Ser Gln Trp Gln Arg Asn Ile Thr Tyr Lys Ser Asn Pro Asn 100 105 110 Arg Ile Leu Pro Asp Ser Val Asp Trp Arg Glu Lys Gly Cys Val Thr 115 120 125 Glu Val Lys Tyr Gln Gly Ser Cys Gly Ala Cys Trp Ala Phe Ser Ala 130 135 140 Val Gly Ala Leu Glu Ala Gln Leu Lys Leu Lys Thr Gly Lys Leu Val 145 150 155 160 Thr Leu Ser Ala Gln Asn Leu Val Asp Cys Ser Thr Glu Lys Tyr Gly 165 170 175 Asn Lys Gly Cys Asn Gly Gly Phe Met Thr Thr Ala Phe Gln Tyr Ile 180 185 190 Ile Asp Asn Lys Gly Ile Asp Ser Asp Ala Ser Tyr Pro Tyr Lys Ala 195 200 205 Met Asp Gln Lys Cys Gln Tyr Asp Ser Lys Tyr Arg Ala Ala Thr Cys 210 215 220 Ser Lys Tyr Thr Glu Leu Pro Tyr Gly Arg Glu Asp Val Leu Lys Glu 225 230 235 240 Ala Val Ala Asn Lys Gly Pro Val Ser Val Gly Val Asp Ala Arg His 245 250 255 Pro Ser Phe Phe Leu Tyr Arg Ser Gly Val Tyr Tyr Glu Pro Ser Cys 260 265 270 Thr Gln Asn Val Asn His Gly Val Leu Val Val Gly Tyr Gly Asp Leu 275 280 285 Asn Gly Lys Glu Tyr Trp Leu Val Lys Asn Ser Trp Gly His Asn Phe 290 295 300 Gly Glu Glu Gly Tyr Ile Arg Met Ala Arg Asn Lys Gly Asn His Cys 305 310 315 320 Gly Ile Ala Ser Phe Pro Ser Tyr Pro Glu Ile 325 330 <210> 281 <211> 1517 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Cathepsin F <400> 281 gaattccggg tctgttgggt ccgggccgcc ggcttcgccc tcgccatggc gccctggctg 60 cagctcctgt cgctgctggg gctgctcccg ggcgcagtgg ccgcccccgc ccagccccga 120 gccgccagct ttcaggcctg ggggccgccg tccccggagc tgctggcgcc cacccgcttc 180 gcgctggaga tgttcaaccg cggccgggct gcggggacgc gggccgtgct gggccttgtg 240 cgcggccgcg tccgccgggc gggtcagggg tcgctgtact ccctggaggc caccctggag 300 gagccaccct gcaacgaccc catggtgtgc cggctccccg tgtccaagaa aaccctgctc 360 tgcagcttcc aagtcctgga tgagctcgga agacacgtgc tgctgcggaa ggactgtggc 420 ccagtggaca ccaaggttcc aggtgctggg gagcccaagt cagccttcac tcagggctca 480 gccatgattt cttctctgtc ccaaaaccat ccagacaaca gaaacgagac tttcagctca 540 gtcatttccc tgttgaatga ggatcccctg tcccaggact tgcctgtgaa gatggcttca 600 atcttcaaga actttgtcat tacctataac cggacatatg agtcaaagga agaagcccgg 660 tggcgcctgt ccgtctttgt caataacatg gtgcgagcac agaagatcca ggccctggac 720 cgtgggacag ctcagtatgg agtcaccaag ttcagtgatc tcacagagga ggagttccgc 780 actatctacc tgaatactct cctgaggaaa gagcctggca acaagatgaa gcaagccaag 840 tctgtgggtg acctcgcccc acctgaatgg gactggagga gtaagggggc tgtcacaaaa 900 gtcaaagacc agggcatgtg tggctcctgc tgggccttct cagtcacagg caatgtggag 960 ggccagtggt ttctcaacca ggggaccctg ctctccctct ctgaacagga gctcttggac 1020 tgtgacaaga tggacaaggc ctgcatgggc ggcttgccct ccaatgccta ctcggccata 1080 aagaatttgg gagggctgga gacagaggat gactacagct accagggtca catgcagtcc 1140 tgcaacttct cagcagagaa ggccaaggtc tacatcaatg actccgtgga gctgagccag 1200 aacgagcaga agctggcagc ctggctggcc aagagaggcc caatctccgt ggccatcaat 1260 gcctttggca tgcagtttta ccgccacggg atctcccgcc ctctccggcc cctctgcagc 1320 ccttggctca ttgaccatgc ggtgttgctt gtgggctacg gcaaccgctc tgacgttccc 1380 ttttgggcca tcaagaacag ctggggcact gactggggtg agaagggtta ctactacttg 1440 catcgtgggt ccggggcctg tggcgtgaac accatggcca gctcggcggt ggtggactga 1500 agaggggccc cgaattc 1517 <210> 282 <211> 484 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Cathepsin F <400> 282 Met Ala Pro Trp Leu Gln Leu Leu Ser Leu Leu Gly Leu Leu Pro Gly 1 5 10 15 Ala Val Ala Ala Pro Ala Gln Pro Arg Ala Ala Ser Phe Gln Ala Trp 20 25 30 Gly Pro Pro Ser Pro Glu Leu Leu Ala Pro Thr Arg Phe Ala Leu Glu 35 40 45 Met Phe Asn Arg Gly Arg Ala Ala Gly Thr Arg Ala Val Leu Gly Leu 50 55 60 Val Arg Gly Arg Val Arg Arg Ala Gly Gln Gly Ser Leu Tyr Ser Leu 65 70 75 80 Glu Ala Thr Leu Glu Glu Pro Pro Cys Asn Asp Pro Met Val Cys Arg 85 90 95 Leu Pro Val Ser Lys Lys Thr Leu Leu Cys Ser Phe Gln Val Leu Asp 100 105 110 Glu Leu Gly Arg His Val Leu Leu Arg Lys Asp Cys Gly Pro Val Asp 115 120 125 Thr Lys Val Pro Gly Ala Gly Glu Pro Lys Ser Ala Phe Thr Gln Gly 130 135 140 Ser Ala Met Ile Ser Ser Leu Ser Gln Asn His Pro Asp Asn Arg Asn 145 150 155 160 Glu Thr Phe Ser Ser Val Ile Ser Leu Leu Asn Glu Asp Pro Leu Ser 165 170 175 Gln Asp Leu Pro Val Lys Met Ala Ser Ile Phe Lys Asn Phe Val Ile 180 185 190 Thr Tyr Asn Arg Thr Tyr Glu Ser Lys Glu Glu Ala Arg Trp Arg Leu 195 200 205 Ser Val Phe Val Asn Asn Met Val Arg Ala Gln Lys Ile Gln Ala Leu 210 215 220 Asp Arg Gly Thr Ala Gln Tyr Gly Val Thr Lys Phe Ser Asp Leu Thr 225 230 235 240 Glu Glu Glu Phe Arg Thr Ile Tyr Leu Asn Thr Leu Leu Arg Lys Glu 245 250 255 Pro Gly Asn Lys Met Lys Gln Ala Lys Ser Val Gly Asp Leu Ala Pro 260 265 270 Pro Glu Trp Asp Trp Arg Ser Lys Gly Ala Val Thr Lys Val Lys Asp 275 280 285 Gln Gly Met Cys Gly Ser Cys Trp Ala Phe Ser Val Thr Gly Asn Val 290 295 300 Glu Gly Gln Trp Phe Leu Asn Gln Gly Thr Leu Leu Ser Leu Ser Glu 305 310 315 320 Gln Glu Leu Leu Asp Cys Asp Lys Met Asp Lys Ala Cys Met Gly Gly 325 330 335 Leu Pro Ser Asn Ala Tyr Ser Ala Ile Lys Asn Leu Gly Gly Leu Glu 340 345 350 Thr Glu Asp Asp Tyr Ser Tyr Gln Gly His Met Gln Ser Cys Asn Phe 355 360 365 Ser Ala Glu Lys Ala Lys Val Tyr Ile Asn Asp Ser Val Glu Leu Ser 370 375 380 Gln Asn Glu Gln Lys Leu Ala Ala Trp Leu Ala Lys Arg Gly Pro Ile 385 390 395 400 Ser Val Ala Ile Asn Ala Phe Gly Met Gln Phe Tyr Arg His Gly Ile 405 410 415 Ser Arg Pro Leu Arg Pro Leu Cys Ser Pro Trp Leu Ile Asp His Ala 420 425 430 Val Leu Leu Val Gly Tyr Gly Asn Arg Ser Asp Val Pro Phe Trp Ala 435 440 445 Ile Lys Asn Ser Trp Gly Thr Asp Trp Gly Glu Lys Gly Tyr Tyr Tyr 450 455 460 Leu His Arg Gly Ser Gly Ala Cys Gly Val Asn Thr Met Ala Ser Ser 465 470 475 480 Ala Val Val Asp <210> 283 <211> 2002 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Cathepsin B <400> 283 aattccgcgg caaccgctcc ggcaacgcca accgctccgc tgcgcgcagg ctgggctgca 60 ggctctcggc tgcagcgctg ggctggtgtg cagtggtgcg accacggctc acggcagcct 120 cagccaccca gatgtaagcg atctggttcc cacctcagcc ttccgagtag tggatctagg 180 atctggcttc caacatgtgg cagctctggg cctccctctg ctgcctgctg gtgttggcca 240 atgcccggag caggccctct ttccatcccg tgtcggatga gctggtcaac tatgtcaaca 300 aacggaatac cacgtggcag gccgggcaca acttctacaa cgtggacatg agctacttga 360 agaggctatg tggtaccttc ctgggtgggc ccaagccacc ccagagagtt atgtttaccg 420 aggacctgaa gctgcctgca agcttcgatg cacgggaaca atggccacag tgtcccacca 480 tcaaagagat cagagaccag ggctcctgtg gctcctgctg ggccttcggg gctgtggaag 540 ccatctctga ccgcatctgc atccacacca atgcgcacgt cagcgtggag gtgtcggcgg 600 aggacctgct cacctgctgt ggcagcatgt gtggggacgg ctgtaatggt ggctatcctg 660 ctgaagcttg gaacttctgg acaagaaaag gcctggtttc tggtggcctc tatgaatccc 720 atgtagggtg cagaccgtac tccatccctc cctgtgagca ccacgtcaac ggctcccggc 780 ccccatgcac gggggaggga gataccccca agtgtagcaa gatctgtgag cctggctaca 840 gcccgaccta caaacaggac aagcactacg gatacaattc ctacagcgtc tccaatagcg 900 agaaggacat catggccgag atctacaaaa acggccccgt ggagggagct ttctctgtgt 960 attcggactt cctgctctac aagtcaggag tgtaccaaca cgtcaccgga gagatgatgg 1020 gtggccatgc catccgcatc ctgggctggg gagtggagaa tggcacaccc tactggctgg 1080 ttgccaactc ctggaacact gactggggtg acaatggctt ctttaaaata ctcagaggac 1140 aggatcactg cggaatcgaa tcagaagtgg tggctggaat tccacgcacc gatcagtact 1200 gggaaaagat ctaatctgcc gtgggcctgt cgtgccagtc ctgggggcga gatcggggta 1260 gaaagtcatt ttattcttta agttcacgta agatacaagt ttcaggcagg gtctgaagga 1320 ctggattggc caaagtcctc caaggagacc aagtcctggc tacatcccag cctgtggtta 1380 cagtgcagac aggccatgtg agccaccgct gccagcacag agcgtccttc cccctgtaga 1440 ctagtgccgt gggagtacct gctgcccagc tgctgtggcc ccctccgtga tccatccatc 1500 tccagggagc aagacagaga cgcaggatgg aaagcggagt tcctaacagg atgaaagttc 1560 ccccatcagt tcccccagta cctccaagca agtagctttc cacatttgtc acagaaatca 1620 gaggagagat ggtgttggga gccctttgga gaacgccagt ctccaggtcc ccctgcatct 1680 atcgagtttg caatgtcaca acctctctga tcttgtgctc agcatgattc tttaatagaa 1740 gttttatttt tcgtgcactc tgctaatcat gtgggtgagc cagtggaaca gcgggagcct 1800 gtgctggttt gcagattgcc tcctaatgac gcggctcaaa aggaaaccaa gtggtcagga 1860 gttgtttctg acccactgat ctctactacc acaaggaaaa tagtttagga gaaaccagct 1920 tttactgttt ttgaaaaatt acagcttcac cctgtcaagt taacaaggaa tgcctgtgcc 1980 aataaaaggt ttctccaact tg 2002 <210> 284 <211> 339 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Cathepsin B <400> 284 Met Trp Gln Leu Trp Ala Ser Leu Cys Cys Leu Leu Val Leu Ala Asn 1 5 10 15 Ala Arg Ser Arg Pro Ser Phe His Pro Leu Ser Asp Glu Leu Val Asn 20 25 30 Tyr Val Asn Lys Arg Asn Thr Thr Trp Gln Ala Gly His Asn Phe Tyr 35 40 45 Asn Val Asp Met Ser Tyr Leu Lys Arg Leu Cys Gly Thr Phe Leu Gly 50 55 60 Gly Pro Lys Pro Pro Gln Arg Val Met Phe Thr Glu Asp Leu Lys Leu 65 70 75 80 Pro Ala Ser Phe Asp Ala Arg Glu Gln Trp Pro Gln Cys Pro Thr Ile 85 90 95 Lys Glu Ile Arg Asp Gln Gly Ser Cys Gly Ser Cys Trp Ala Phe Gly 100 105 110 Ala Val Glu Ala Ile Ser Asp Arg Ile Cys Ile His Thr Asn Ala His 115 120 125 Val Ser Val Glu Val Ser Ala Glu Asp Leu Leu Thr Cys Cys Gly Ser 130 135 140 Met Cys Gly Asp Gly Cys Asn Gly Gly Tyr Pro Ala Glu Ala Trp Asn 145 150 155 160 Phe Trp Thr Arg Lys Gly Leu Val Ser Gly Gly Leu Tyr Glu Ser His 165 170 175 Val Gly Cys Arg Pro Tyr Ser Ile Pro Pro Cys Glu His His Val Asn 180 185 190 Gly Ser Arg Pro Pro Cys Thr Gly Glu Gly Asp Thr Pro Lys Cys Ser 195 200 205 Lys Ile Cys Glu Pro Gly Tyr Ser Pro Thr Tyr Lys Gln Asp Lys His 210 215 220 Tyr Gly Tyr Asn Ser Tyr Ser Val Ser Asn Ser Glu Lys Asp Ile Met 225 230 235 240 Ala Glu Ile Tyr Lys Asn Gly Pro Val Glu Gly Ala Phe Ser Val Tyr 245 250 255 Ser Asp Phe Leu Leu Tyr Lys Ser Gly Val Tyr Gln His Val Thr Gly 260 265 270 Glu Met Met Gly Gly His Ala Ile Arg Ile Leu Gly Trp Gly Val Glu 275 280 285 Asn Gly Thr Pro Tyr Trp Leu Val Ala Asn Ser Trp Asn Thr Asp Trp 290 295 300 Gly Asp Asn Gly Phe Phe Lys Ile Leu Arg Gly Gln Asp His Cys Gly 305 310 315 320 Ile Glu Ser Glu Val Val Ala Gly Ile Pro Arg Thr Asp Gln Tyr Trp 325 330 335 Glu Lys Ile <210> 285 <211> 1292 <212> DNA <213> Carica papaya <220> <223> Papain <400> 285 atccattccc acttaagaag taaaaagata tagctagtgt cacaatggct atgatacctt 60 caatttcaaa gttgcttttt gttgcaatat gtctttttgt ttatatgggt ttgtcatttg 120 gtgatttttc tattgtgggt tattctcaaa atgacttgac atccactgaa agacttattc 180 agctatttga atcgtggatg ttgaagcaca ataagattta taagaatatt gatgaaaaaa 240 tctacagatt tgaaattttt aaagataatc ttaaatatat tgatgagaca aataagaaaa 300 ataacagtta ttggcttgga ttaaatgtgt ttgctgatat gagcaatgat gaattcaaag 360 aaaagtatac tggttctatt gctggaaatt atacaacaac cgaactatca tacgaagaag 420 tgcttaatga tggtgatgta aatatcccgg agtatgtcga ttggagacaa aaaggagctg 480 tcactcctgt aaaaaatcag ggttcttgtg gtagttgttg ggcattctca gctgttgtaa 540 ctatagaggg aataattaag attagaactg ggaacttaaa tgaatactca gagcaagaac 600 tgcttgactg cgacagacgt agctacgggt gcaatggagg ttacccttgg agtgcacttc 660 aattagtggc tcaatatggt attcactaca gaaatactta cccatatgag ggagtgcaac 720 gttattgtcg ctcaagggag aaaggtcctt atgcagccaa aaccgatggg gttcgacaag 780 tgcaaccata taatgaaggg gctctcttat attcaattgc aaaccaacct gtgagcgttg 840 tccttgaagc tgctggaaaa gatttccaat tatatagagg gggaatattt gtggggccat 900 gcggaaacaa agtagatcat gcagtcgcag cagttgggta tggaccaaat tacatactca 960 taaagaattc atggggtaca ggatggggtg aaaatggata tataagaatc aaaagaggca 1020 ctggaaactc ctatggagta tgtggacttt atacaagctc attctatcct gttaaaaact 1080 gatgagatca cggctttcat aaaatccctt atatatatat atatatatag aacttgtata 1140 ctcatcgtgt gttgaaataa taaatgagag gattaataat ttgtgtaatc ctatatatca 1200 cagtttgttg tgacaaactt ttgcatcgct tgttatatta tttgtaataa tgtttgtttt 1260 gattgaataa acttttacat atacttttat gc 1292 <210> 286 <211> 345 <212> PRT <213> Carica papaya <220> <223> Papain <400> 286 Met Ala Met Ile Pro Ser Ile Ser Lys Leu Leu Phe Val Ala Ile Cys 1 5 10 15 Leu Phe Val Tyr Met Gly Leu Ser Phe Gly Asp Phe Ser Ile Val Gly 20 25 30 Tyr Ser Gln Asn Asp Leu Thr Ser Thr Glu Arg Leu Ile Gln Leu Phe 35 40 45 Glu Ser Trp Met Leu Lys His Asn Lys Ile Tyr Lys Asn Ile Asp Glu 50 55 60 Lys Ile Tyr Arg Phe Glu Ile Phe Lys Asp Asn Leu Lys Tyr Ile Asp 65 70 75 80 Glu Thr Asn Lys Lys Asn Asn Ser Tyr Trp Leu Gly Leu Asn Val Phe 85 90 95 Ala Asp Met Ser Asn Asp Glu Phe Lys Glu Lys Tyr Thr Gly Ser Ile 100 105 110 Ala Gly Asn Tyr Thr Thr Thr Glu Leu Ser Tyr Glu Glu Val Leu Asn 115 120 125 Asp Gly Asp Val Asn Ile Pro Glu Tyr Val Asp Trp Arg Gln Lys Gly 130 135 140 Ala Val Thr Pro Val Lys Asn Gln Gly Ser Cys Gly Ser Cys Trp Ala 145 150 155 160 Phe Ser Ala Val Val Thr Ile Glu Gly Ile Ile Lys Ile Arg Thr Gly 165 170 175 Asn Leu Asn Glu Tyr Ser Glu Gln Glu Leu Leu Asp Cys Asp Arg Arg 180 185 190 Ser Tyr Gly Cys Asn Gly Gly Tyr Pro Trp Ser Ala Leu Gln Leu Val 195 200 205 Ala Gln Tyr Gly Ile His Tyr Arg Asn Thr Tyr Pro Tyr Glu Gly Val 210 215 220 Gln Arg Tyr Cys Arg Ser Arg Glu Lys Gly Pro Tyr Ala Ala Lys Thr 225 230 235 240 Asp Gly Val Arg Gln Val Gln Pro Tyr Asn Glu Gly Ala Leu Leu Tyr 245 250 255 Ser Ile Ala Asn Gln Pro Val Ser Val Val Leu Glu Ala Ala Gly Lys 260 265 270 Asp Phe Gln Leu Tyr Arg Gly Gly Ile Phe Val Gly Pro Cys Gly Asn 275 280 285 Lys Val Asp His Ala Val Ala Ala Val Gly Tyr Gly Pro Asn Tyr Ile 290 295 300 Leu Ile Lys Asn Ser Trp Gly Thr Gly Trp Gly Glu Asn Gly Tyr Ile 305 310 315 320 Arg Ile Lys Arg Gly Thr Gly Asn Ser Tyr Gly Val Cys Gly Leu Tyr 325 330 335 Thr Ser Ser Phe Tyr Pro Val Lys Asn 340 345 <210> 287 <211> 1845 <212> DNA <213> Trypanosoma cruzi <220> <223> Cruzain (Cruzapain) <400> 287 atgtctggct gggcgcgtgc gctgttgctc gcggccgtcc tggtcgtcat ggcgtgcctc 60 gtccccgcgg cgacggcgag cctgcatgcg gaggagacgc tgacgtcgca attcgcagaa 120 ttcaagcaga agcatggcag ggtgtacgag agcgccgcgg aggaggcgtt ccgcctgagc 180 gtgttcaggg agaacctgtt tcttgcgagg ctgcacgccg cggcaaaccc acacgcgacc 240 ttcggcgtca cgcccttctc ggacctcacg cgcgaggaat tccggtcccg ctaccacaac 300 ggcgcggcgc actttgcggc ggcgcaggag cgcgcgagag tgccggtgaa ggtggaggta 360 gttggcgcgc ccgcggcagt ggattggcgt gcgagaggcg ccgtgacagc cgtcaaggac 420 cagggccaat gcggttcgtg ctgggccttc tccgccattg gcaacgttga gtgccagtgg 480 tttcttgccg gccacccgct gacgaacctg tcggagcaga tgctcgtgtc gtgcgacaaa 540 acggactctg gctgcagtgg tggcctgatg aacaacgcct ttgagtggat tgtgcaggag 600 aataacggcg ccgtgtacac ggaggacagc tacccttatg cgtcgggcga ggggatatcg 660 ccgccgtgca cgacgtcagg ccacacggtg ggtgccacga ttaccggtca cgttgaatta 720 cctcaggacg aggcccaaat agccgcatgg cttgcagtca atggcccggt tgccgttgcc 780 gtcgacgcca gcagctggat gacctacacg ggcggcgtta tgacgagctg cgtctccgag 840 cagctggatc acggcgttct tctcgtcggc tacaatgaca gcgccgcagt gccgtactgg 900 atcatcaaga actcgtggac cacgcagtgg ggcgaggaag gctacatccg cattgcaaag 960 ggctcgaacc agtgccttgt caaggaggag gcgagctccg cggtggtcgg tggtcccgga 1020 cccactcccg agccaaccac cacgacaacc acaagtgccc caggaccgtc cccatcgtac 1080 tttgtgcaga tgtcctgcac tgacgctgcg tgcattgtcg ggtgcgagaa cgtgacgtta 1140 ccgaccggtc agtgtctcct gaccaccagc ggcgtctctg ccattgtcac gtgcggtgct 1200 gagactctca cagaagaagt cttccttacg agtacgcact gcagcggccc atcggtgagg 1260 tcctctgttc ctctcaacaa atgcaaccgg cttttaagag gctccgttga gttcttctgc 1320 ggctccagct ccagtggccg actggccgac gtggacaggc agcgtcgcca tcagccatac 1380 cacagccgtc atcgccgcct ctgagggcac tctttgtttc tgatgctgcc ttttctctca 1440 ttttactttt ttattattat tgagcgagcg tcggtgctgc ggcacactgg gcaaataagt 1500 cccagtggag tggattgttt attgatttgc tccatgtatg tgttttcttt tttgtgcaca 1560 actgcaaata tgtgtccgcg atcgacgtct cagccacgcg tgtgtttttt ctattatatg 1620 cttctgttga gcgcccgagc attccccact gtggctgaac ccaccgccgt ccccgactgt 1680 cacccgacca tgcggggcgg ggtggcgtgg caacgctcct ttgccgcggc gtgcacatac 1740 acgcgcgcat gcttcttctc tccacgtcaa cgccgacacc accacagtct gaaggtgacg 1800 ctgttgaagg cacacaagga aggaaacaca cccacacaag cagta 1845 <210> 288 <211> 467 <212> PRT <213> Trypanosoma cruzi <220> <223> Cruzain (Cruzapain) <400> 288 Met Ser Gly Trp Ala Arg Ala Leu Leu Leu Ala Ala Val Leu Val Val 1 5 10 15 Met Ala Cys Leu Val Pro Ala Ala Thr Ala Ser Leu His Ala Glu Glu 20 25 30 Thr Leu Thr Ser Gln Phe Ala Glu Phe Lys Gln Lys His Gly Arg Val 35 40 45 Tyr Glu Ser Ala Ala Glu Glu Ala Phe Arg Leu Ser Val Phe Arg Glu 50 55 60 Asn Leu Phe Leu Ala Arg Leu His Ala Ala Ala Asn Pro His Ala Thr 65 70 75 80 Phe Gly Val Thr Pro Phe Ser Asp Leu Thr Arg Glu Glu Phe Arg Ser 85 90 95 Arg Tyr His Asn Gly Ala Ala His Phe Ala Ala Ala Gln Glu Arg Ala 100 105 110 Arg Val Pro Val Lys Val Glu Val Val Gly Ala Pro Ala Ala Val Asp 115 120 125 Trp Arg Ala Arg Gly Ala Val Thr Ala Val Lys Asp Gln Gly Gln Cys 130 135 140 Gly Ser Cys Trp Ala Phe Ser Ala Ile Gly Asn Val Glu Cys Gln Trp 145 150 155 160 Phe Leu Ala Gly His Pro Leu Thr Asn Leu Ser Glu Gln Met Leu Val 165 170 175 Ser Cys Asp Lys Thr Asp Ser Gly Cys Ser Gly Gly Leu Met Asn Asn 180 185 190 Ala Phe Glu Trp Ile Val Gln Glu Asn Asn Gly Ala Val Tyr Thr Glu 195 200 205 Asp Ser Tyr Pro Tyr Ala Ser Gly Glu Gly Ile Ser Pro Pro Cys Thr 210 215 220 Thr Ser Gly His Thr Val Gly Ala Thr Ile Thr Gly His Val Glu Leu 225 230 235 240 Pro Gln Asp Glu Ala Gln Ile Ala Ala Trp Leu Ala Val Asn Gly Pro 245 250 255 Val Ala Val Ala Val Asp Ala Ser Ser Trp Met Thr Tyr Thr Gly Gly 260 265 270 Val Met Thr Ser Cys Val Ser Glu Gln Leu Asp His Gly Val Leu Leu 275 280 285 Val Gly Tyr Asn Asp Ser Ala Ala Val Pro Tyr Trp Ile Ile Lys Asn 290 295 300 Ser Trp Thr Thr Gln Trp Gly Glu Glu Gly Tyr Ile Arg Ile Ala Lys 305 310 315 320 Gly Ser Asn Gln Cys Leu Val Lys Glu Glu Ala Ser Ser Ala Val Val 325 330 335 Gly Gly Pro Gly Pro Thr Pro Glu Pro Thr Thr Thr Thr Thr Thr Ser 340 345 350 Ala Pro Gly Pro Ser Pro Ser Tyr Phe Val Gln Met Ser Cys Thr Asp 355 360 365 Ala Ala Cys Ile Val Gly Cys Glu Asn Val Thr Leu Pro Thr Gly Gln 370 375 380 Cys Leu Leu Thr Thr Ser Gly Val Ser Ala Ile Val Thr Cys Gly Ala 385 390 395 400 Glu Thr Leu Thr Glu Glu Val Phe Leu Thr Ser Thr His Cys Ser Gly 405 410 415 Pro Ser Val Arg Ser Ser Val Pro Leu Asn Lys Cys Asn Arg Leu Leu 420 425 430 Arg Gly Ser Val Glu Phe Phe Cys Gly Ser Ser Ser Ser Gly Arg Leu 435 440 445 Ala Asp Val Asp Arg Gln Arg Arg His Gln Pro Tyr His Ser Arg His 450 455 460 Arg Arg Leu 465 <210> 289 <211> 379 <212> PRT <213> Bacillus licheniformis <220> <223> Subtilisin Carlsberg precursor S08.001 <400> 289 Met Met Arg Lys Lys Ser Phe Trp Leu Gly Met Leu Thr Ala Phe Met 1 5 10 15 Leu Val Phe Thr Met Ala Phe Ser Asp Ser Ala Ser Ala Ala Gln Pro 20 25 30 Ala Lys Asn Val Glu Lys Asp Tyr Ile Val Gly Phe Lys Ser Gly Val 35 40 45 Lys Thr Ala Ser Val Lys Lys Asp Ile Ile Lys Glu Ser Gly Gly Lys 50 55 60 Val Asp Lys Gln Phe Arg Ile Ile Asn Ala Ala Lys Ala Lys Leu Asp 65 70 75 80 Lys Glu Ala Leu Lys Glu Val Lys Asn Asp Pro Asp Val Ala Tyr Val 85 90 95 Glu Glu Asp His Val Ala His Ala Leu Ala Gln Thr Val Pro Tyr Gly 100 105 110 Ile Pro Leu Ile Lys Ala Asp Lys Val Gln Ala Gln Gly Phe Lys Gly 115 120 125 Ala Asn Val Lys Val Ala Val Leu Asp Thr Gly Ile Gln Ala Ser His 130 135 140 Pro Asp Leu Asn Val Val Gly Gly Ala Ser Phe Val Ala Gly Glu Ala 145 150 155 160 Tyr Asn Thr Asp Gly Asn Gly His Gly Thr His Val Ala Gly Thr Val 165 170 175 Ala Ala Leu Asp Asn Thr Thr Gly Val Leu Gly Val Ala Pro Ser Val 180 185 190 Ser Leu Tyr Ala Val Lys Val Leu Asn Ser Ser Gly Ser Gly Thr Tyr 195 200 205 Ser Gly Ile Val Ser Gly Ile Glu Trp Ala Thr Thr Asn Gly Met Asp 210 215 220 Val Ile Asn Met Ser Leu Gly Gly Pro Ser Gly Ser Thr Ala Met Lys 225 230 235 240 Gln Ala Val Asp Asn Ala Tyr Ala Arg Gly Val Val Val Val Ala Ala 245 250 255 Ala Gly Asn Ser Gly Ser Ser Gly Asn Thr Asn Thr Ile Gly Tyr Pro 260 265 270 Ala Lys Tyr Asp Ser Val Ile Ala Val Gly Ala Val Asp Ser Asn Ser 275 280 285 Asn Arg Ala Ser Phe Ser Ser Val Gly Ala Glu Leu Glu Val Met Ala 290 295 300 Pro Gly Ala Gly Val Tyr Ser Thr Tyr Pro Thr Ser Thr Tyr Ala Thr 305 310 315 320 Leu Asn Gly Thr Ser Met Ala Ser Pro His Val Ala Gly Ala Ala Ala 325 330 335 Leu Ile Leu Ser Lys His Pro Asn Leu Ser Ala Ser Gln Val Arg Asn 340 345 350 Arg Leu Ser Ser Thr Ala Thr Tyr Leu Gly Ser Ser Phe Tyr Tyr Gly 355 360 365 Lys Gly Leu Ile Asn Val Glu Ala Ala Ala Gln 370 375 <210> 290 <211> 1588 <212> DNA <213> Bacillus licheniformis <220> <223> Subtilisin Carlsberg precursor S08.001 <400> 290 gatcgacaag accgcaacct ccttcgacaa aaaatgatct cttaaaataa atgaatagta 60 ttttcataaa atgaatcaga tggagcaatc tcctgtcatt cgcggccctc gggacctctt 120 tccctgccag gctgaagcgg tctattcata ctttcgaact gaacattttt ctaaaacagt 180 tattaataac caaaaaattt taaattggtc ctccaaaaaa ataggcctac catataattc 240 attttttttc tataataaat taacagaata attggaatag attatattat ccttctattt 300 aaattattct gaataaagag gaggagagtg agtaatgatg aggaaaaaga gtttttggct 360 tgggatgctg acggccttca tgctcgtgtt cacgatggca ttcagcgatt ccgcttctgc 420 tgctcaaccg gcgaaaaatg ttgaaaagga ttatattgtc ggatttaagt caggagtgaa 480 aaccgcatct gtcaaaaagg acatcatcaa agagagcggc ggaaaagtgg acaagcagtt 540 tagaatcatc aacgcggcaa aagcgaagct agacaaagaa gcgcttaagg aagtcaaaaa 600 tgatccggat gtcgcttatg tggaagagga tcatgtggcc catgccttgg cgcaaaccgt 660 tccttacggc attcctctca ttaaagcgga caaagtgcag gctcaaggct ttaagggagc 720 gaatgtaaaa gtagccgtcc tggatacagg aatccaagct tctcatccgg acttgaacgt 780 agtcggcgga gcaagctttg tggctggcga agcttataac accgacggca acggacacgg 840 cacacatgtt gccggtacag tagctgcgct tgacaataca acgggtgtat taggcgttgc 900 gccaagcgta tccttgtacg cggttaaagt actgaattca agcggaagcg gaacttacag 960 cggcattgta agcggaatcg agtgggcgac gacaaacggc atggatgtta tcaacatgag 1020 tcttggagga ccatcaggct caacagcgat gaaacaggcg gttgacaatg catatgcaag 1080 aggggttgtc gttgtggcgg ctgctgggaa cagcggatct tcaggaaaca cgaatacaat 1140 cggctatcct gcgaaatacg actctgtcat cgcagttggc gcggtagact ctaacagcaa 1200 cagagcttca ttttccagcg tcggagcaga gcttgaagtc atggctcctg gcgcaggcgt 1260 gtacagcact tacccaacca gcacttatgc aacattgaac ggaacgtcaa tggcttctcc 1320 tcatgtagcg ggagcagcag ctttgatctt gtcaaaacat ccgaaccttt cagcttcaca 1380 agtccgcaac cgtctctcca gtacggcgac ttatttggga agctccttct actatggaaa 1440 aggtctgatc aatgtcgaag ctgccgctca ataacatatt ctaacaaatg gcatatagaa 1500 aaagctagtg tttttagcac tagctttttc ttcattcagt tgaagactgt tcaatatttt 1560 gaatccgttc cattatggtc ggatggcc 1588 <210> 291 <211> 275 <212> PRT <213> Bacillus pumilus <220> <223> Subtilisin (Alkaline mesentericopeptidase) S08.002 <400> 291 Ala Gln Ser Val Pro Tyr Gly Ile Ser Gln Ile Lys Ala Pro Ala Leu 1 5 10 15 His Ser Gln Gly Tyr Thr Gly Ser Asn Val Lys Val Ala Val Ile Asp 20 25 30 Ser Gly Ile Asp Ser Ser His Pro Asp Leu Asn Val Arg Gly Gly Ala 35 40 45 Ser Phe Val Pro Ser Glu Thr Asn Pro Tyr Gln Asp Gly Ser Ser His 50 55 60 Gly Thr His Val Ala Gly Thr Ile Ala Ala Leu Asn Asn Ser Ile Gly 65 70 75 80 Val Leu Gly Val Ala Pro Ser Ser Ala Leu Tyr Ala Val Lys Val Leu 85 90 95 Asp Ser Thr Gly Ser Gly Gln Tyr Ser Trp Ile Ile Asn Gly Ile Glu 100 105 110 Trp Ala Ile Ser Asn Asn Met Asp Val Ile Asn Met Ser Leu Gly Gly 115 120 125 Pro Thr Gly Ser Thr Ala Leu Lys Thr Val Val Asp Lys Ala Val Ser 130 135 140 Ser Gly Ile Val Val Ala Ala Ala Ala Gly Asn Glu Gly Ser Ser Gly 145 150 155 160 Ser Thr Ser Thr Val Gly Tyr Pro Ala Lys Tyr Pro Ser Thr Ile Ala 165 170 175 Val Gly Ala Val Asn Ser Ala Asn Gln Arg Ala Ser Phe Ser Ser Ala 180 185 190 Gly Ser Glu Leu Asp Val Met Ala Pro Gly Val Ser Ile Gln Ser Thr 195 200 205 Leu Pro Gly Gly Thr Tyr Gly Ala Tyr Asn Gly Thr Ser Met Ala Thr 210 215 220 Pro His Val Ala Gly Ala Ala Ala Leu Ile Leu Ser Lys His Pro Thr 225 230 235 240 Trp Thr Asn Ala Gln Val Arg Asp Arg Leu Glu Ser Thr Ala Thr Tyr 245 250 255 Leu Gly Ser Ser Phe Tyr Tyr Gly Lys Gly Leu Ile Asn Val Gln Ala 260 265 270 Ala Ala Gln 275 <210> 292 <211> 269 <212> PRT <213> Bacillus lentus <220> <223> Subtilisin Savinase (Alkaline protease) S08.003 <400> 292 Ala Gln Ser Val Pro Trp Gly Ile Ser Arg Val Gln Ala Pro Ala Ala 1 5 10 15 His Asn Arg Gly Leu Thr Gly Ser Gly Val Lys Val Ala Val Leu Asp 20 25 30 Thr Gly Ile Ser Thr His Pro Asp Leu Asn Ile Arg Gly Gly Ala Ser 35 40 45 Phe Val Pro Gly Glu Pro Ser Thr Gln Asp Gly Asn Gly His Gly Thr 50 55 60 His Val Ala Gly Thr Ile Ala Ala Leu Asn Asn Ser Ile Gly Val Leu 65 70 75 80 Gly Val Ala Pro Ser Ala Glu Leu Tyr Ala Val Lys Val Leu Gly Ala 85 90 95 Ser Gly Ser Gly Ser Val Ser Ser Ile Ala Gln Gly Leu Glu Trp Ala 100 105 110 Gly Asn Asn Gly Met His Val Ala Asn Leu Ser Leu Gly Ser Pro Ser 115 120 125 Pro Ser Ala Thr Leu Glu Gln Ala Val Asn Ser Ala Thr Ser Arg Gly 130 135 140 Val Leu Val Val Ala Ala Ser Gly Asn Ser Gly Ala Gly Ser Ile Ser 145 150 155 160 Tyr Pro Ala Arg Tyr Ala Asn Ala Met Ala Val Gly Ala Thr Asp Gln 165 170 175 Asn Asn Asn Arg Ala Ser Phe Ser Gln Tyr Gly Ala Gly Leu Asp Ile 180 185 190 Val Ala Pro Gly Val Asn Val Gln Ser Thr Tyr Pro Gly Ser Thr Tyr 195 200 205 Ala Ser Leu Asn Gly Thr Ser Met Ala Thr Pro His Val Ala Gly Ala 210 215 220 Ala Ala Leu Val Lys Gln Lys Asn Pro Ser Trp Ser Asn Val Gln Ile 225 230 235 240 Arg Asn His Leu Lys Asn Thr Ala Thr Ser Leu Gly Ser Thr Asn Leu 245 250 255 Tyr Gly Ser Gly Leu Val Asn Ala Glu Ala Ala Thr Arg 260 265 <210> 293 <211> 279 <212> PRT <213> Thermoactinomyces vulgaris <220> <223> Thermitase S08.007 <400> 293 Tyr Thr Pro Asn Asp Pro Tyr Phe Ser Ser Arg Gln Tyr Gly Pro Gln 1 5 10 15 Lys Ile Gln Ala Pro Gln Ala Trp Asp Ile Ala Glu Gly Ser Gly Ala 20 25 30 Lys Ile Ala Ile Val Asp Thr Gly Val Gln Ser Asn His Pro Asp Leu 35 40 45 Ala Gly Lys Val Val Gly Gly Trp Asp Phe Val Asp Asn Asp Ser Thr 50 55 60 Pro Gln Asn Gly Asn Gly His Gly Thr His Cys Ala Gly Ile Ala Ala 65 70 75 80 Ala Val Thr Asn Asn Ser Thr Gly Ile Ala Gly Thr Ala Pro Lys Ala 85 90 95 Ser Ile Leu Ala Val Arg Val Leu Asp Asn Ser Gly Ser Gly Thr Trp 100 105 110 Thr Ala Val Ala Asn Gly Ile Thr Tyr Ala Ala Asp Gln Gly Ala Lys 115 120 125 Val Ile Ser Leu Ser Leu Gly Gly Thr Val Gly Asn Ser Gly Leu Gln 130 135 140 Gln Ala Val Asn Tyr Ala Trp Asn Lys Gly Ser Val Val Val Ala Ala 145 150 155 160 Ala Gly Asn Ala Gly Asn Thr Ala Pro Asn Tyr Pro Ala Tyr Tyr Ser 165 170 175 Asn Ala Ile Ala Val Ala Ser Thr Asp Gln Asn Asp Asn Lys Ser Ser 180 185 190 Phe Ser Thr Tyr Gly Ser Val Val Asp Val Ala Ala Pro Gly Ser Trp 195 200 205 Ile Tyr Ser Thr Tyr Pro Thr Ser Thr Tyr Ala Ser Leu Ser Gly Thr 210 215 220 Ser Met Ala Thr Pro His Val Ala Gly Val Ala Gly Leu Leu Ala Ser 225 230 235 240 Gln Gly Arg Ser Ala Ser Asn Ile Arg Ala Ala Ile Glu Asn Thr Ala 245 250 255 Asp Lys Ile Ser Gly Thr Gly Thr Tyr Trp Ala Lys Gly Arg Val Asn 260 265 270 Ala Tyr Lys Ala Val Gln Tyr 275 <210> 294 <211> 401 <212> PRT <213> Bacillus sp. AK1 <220> <223> Thermophilic serine proteinase precursor (Ak.1 protease) S08.009 <400> 294 Met Lys Phe Lys Ala Ile Val Ser Leu Ser Leu Ala Val Ser Met Ser 1 5 10 15 Leu Phe Pro Phe Leu Val Glu Ala Ala Ser Asn Asp Gly Val Glu Ser 20 25 30 Pro Lys Thr Val Ser Glu Ile Asn Val Ser His Glu Lys Gly Ala Tyr 35 40 45 Val Gln Gly Glu Val Ile Val Gln Phe Lys Glu Gln Val Asn Ala Glu 50 55 60 Glu Lys Ala Lys Ala Leu Lys Glu Val Gly Ala Thr Ala Val Pro Asp 65 70 75 80 Asn Asp Arg Val Lys Ser Lys Phe Asn Val Leu Lys Val Gly Asn Val 85 90 95 Glu Ala Val Val Lys Ala Leu Asn Asn Asn Pro Leu Val Glu Tyr Ala 100 105 110 Glu Pro Asn Tyr Leu Phe Asn Ala Ala Trp Thr Pro Asn Asp Thr Tyr 115 120 125 Tyr Gln Gly Tyr Gln Tyr Gly Pro Gln Asn Thr Tyr Thr Asp Tyr Ala 130 135 140 Trp Asp Val Thr Lys Gly Ser Ser Gly Gln Glu Ile Ala Val Ile Asp 145 150 155 160 Thr Gly Val Asp Tyr Thr His Pro Asp Leu Asp Gly Lys Val Ile Lys 165 170 175 Gly Tyr Asp Phe Val Asp Asn Asp Tyr Asp Pro Met Asp Leu Asn Asn 180 185 190 His Gly Thr His Val Ala Gly Ile Ala Ala Ala Glu Thr Asn Asn Ala 195 200 205 Thr Gly Ile Ala Gly Met Ala Pro Asn Thr Arg Ile Leu Ala Val Arg 210 215 220 Ala Leu Asp Arg Asn Gly Ser Gly Thr Leu Ser Asp Ile Ala Asp Ala 225 230 235 240 Ile Ile Tyr Ala Ala Asp Ser Gly Ala Glu Val Ile Asn Leu Ser Leu 245 250 255 Gly Cys Asp Cys His Thr Thr Thr Leu Glu Asn Ala Val Asn Tyr Ala 260 265 270 Trp Asn Lys Gly Ser Val Val Val Ala Ala Ala Gly Asn Asn Gly Ser 275 280 285 Ser Thr Thr Phe Glu Pro Ala Ser Tyr Glu Asn Val Ile Ala Val Gly 290 295 300 Ala Val Asp Gln Tyr Asp Arg Leu Ala Ser Phe Ser Asn Tyr Gly Thr 305 310 315 320 Trp Val Asp Val Val Ala Pro Gly Val Asp Ile Val Ser Thr Ile Thr 325 330 335 Gly Asn Arg Tyr Ala Tyr Met Ser Gly Thr Ser Met Ala Ser Pro His 340 345 350 Val Ala Gly Leu Ala Ala Leu Leu Ala Ser Gln Gly Arg Asn Asn Ile 355 360 365 Glu Ile Arg Gln Ala Ile Glu Gln Thr Ala Asp Lys Ile Ser Gly Thr 370 375 380 Gly Thr Tyr Phe Lys Tyr Gly Arg Ile Asn Ser Tyr Asn Ala Val Thr 385 390 395 400 Tyr <210> 295 <211> 1591 <212> DNA <213> Bacillus sp <220> <223> Thermophilic serine proteinase precursor (Ak.1 protease) S08.009 <400> 295 gcatgctacg attaaatatc taagaatccc caattaaata ccattatttt acaaaattat 60 attatattaa aataaatgtc gagatttttg agaaaaaatt tttcattcct cccccttcct 120 caacgtaaaa ttaataccgc aattccattt aaagggggaa tatttccatg aagtttaaag 180 cgattgtaag tttatccctc gctgtttcca tgtcactttt tccattcctt gtggaagcag 240 cctctaatga tggggtagaa tctccaaaaa ccgtttccga aattaacgtg tctcatgaaa 300 aaggagcata tgtccaggga gaagtcattg tccaattcaa agaacaagta aatgctgaag 360 aaaaggcaaa ggcattaaaa gaagttgggg caacggcggt tccagataat gatcgagtta 420 aatctaaatt taatgtacta aaagtaggaa atgtggaagc tgttgtgaaa gcattaaata 480 ataacccgtt agtagaatac gcagagccaa actatttatt taatgcagct tggactccaa 540 atgatacgta ctatcagggt tatcaatatg gtccacaaaa tacgtatacc gactatgctt 600 gggatgttac aaaaggcagt agcggtcaag agattgctgt tattgataca ggtgtagatt 660 atacacatcc tgatttagat ggaaaagtca tcaaaggata tgatttcgta gataatgatt 720 acgacccaat ggatttgaat aatcatggta cgcacgtagc tggaatagca gctgcggaaa 780 caaacaatgc tacaggtatt gccggcatgg ccccaaacac aagaattttg gctgtgcgcg 840 ctttagatcg aaatggcagt ggtactctaa gtgatattgc cgatgcgatc atttatgctg 900 ctgattcagg cgctgaagtc attaacctgt cacttggttg tgattgtcat acaaccacat 960 tggagaatgc tgtaaactat gcatggaata agggttctgt agtagttgcc gcagccggaa 1020 ataatggatc ctctacaaca tttgaaccgg cttcttatga aaatgtaatt gcagttggcg 1080 cagtagatca atatgatcgg ttagcatcat tctcgaacta tggaacatgg gtagatgtcg 1140 tagctccagg tgtagacatt gtctcaacta ttactggtaa ccgatatgcc tatatgtcgg 1200 gcacttccat ggcatcccct catgtagccg gtcttgcagc cttactagcg agtcaaggac 1260 ggaataacat agaaattcgt caagccatcg agcaaacagc agacaaaatc tccggaactg 1320 gaacatactt caaatatgga agaatcaatt cttataatgc tgtaacatat taaatagatt 1380 taaataacga caccgtgcca acgccaaggg cacggtgtct taattcaagc tttttggaaa 1440 atcacgacat acaaattatg taagaaagct tattctccca taggaattga agaggaaaac 1500 caatattatt cttttatctc agcaaaaata aaaaaactgc caaatggcag actctaacta 1560 actatttttt gcttccttct ttctgctgca g 1591 <210> 296 <211> 1167 <212> PRT <213> Streptococcus pyogenes <220> <223> C5a peptidase precursor (SCP) S08.020 <400> 296 Met Arg Lys Lys Gln Lys Leu Pro Phe Asp Lys Leu Ala Ile Ala Leu 1 5 10 15 Met Ser Thr Ser Ile Leu Leu Asn Ala Gln Ser Asp Ile Lys Ala Asn 20 25 30 Thr Val Thr Glu Asp Thr Pro Val Thr Glu Gln Ala Val Glu Thr Pro 35 40 45 Gln Pro Thr Ala Val Ser Glu Glu Val Pro Ser Ser Lys Glu Thr Lys 50 55 60 Thr Pro Gln Thr Pro Asp Asp Ala Glu Glu Thr Ile Ala Asp Asp Ala 65 70 75 80 Asn Asp Leu Ala Pro Gln Ala Pro Ala Lys Thr Ala Asp Thr Pro Ala 85 90 95 Thr Ser Lys Ala Thr Ile Arg Asp Leu Asn Asp Pro Ser Gln Val Lys 100 105 110 Thr Leu Gln Glu Lys Ala Gly Lys Gly Ala Gly Thr Val Val Ala Val 115 120 125 Ile Asp Ala Gly Phe Asp Lys Asn His Glu Ala Trp Arg Leu Thr Asp 130 135 140 Lys Thr Lys Ala Arg Tyr Gln Ser Lys Glu Asp Leu Glu Lys Ala Lys 145 150 155 160 Lys Glu His Gly Ile Thr Tyr Gly Glu Trp Val Asn Asp Lys Val Ala 165 170 175 Tyr Tyr His Asp Tyr Ser Lys Asp Gly Lys Thr Ala Val Asp Gln Glu 180 185 190 His Gly Thr His Val Ser Gly Ile Leu Ser Gly Asn Ala Pro Ser Glu 195 200 205 Thr Lys Glu Pro Tyr Arg Leu Glu Gly Ala Met Pro Glu Ala Gln Leu 210 215 220 Leu Leu Met Arg Val Glu Ile Val Asn Gly Leu Ala Asp Tyr Ala Arg 225 230 235 240 Asn Tyr Ala Gln Ala Ile Arg Asp Ala Val Asn Leu Gly Ala Lys Val 245 250 255 Ile Asn Met Ser Phe Gly Asn Ala Ala Leu Ala Tyr Ala Asn Leu Pro 260 265 270 Asp Glu Thr Lys Lys Ala Phe Asp Tyr Ala Lys Ser Lys Gly Val Ser 275 280 285 Ile Val Thr Ser Ala Gly Asn Asp Ser Ser Phe Gly Gly Lys Thr Arg 290 295 300 Leu Pro Leu Ala Asp His Pro Asp Tyr Gly Val Val Gly Thr Pro Ala 305 310 315 320 Ala Ala Asp Ser Thr Leu Thr Val Ala Ser Tyr Ser Pro Asp Lys Gln 325 330 335 Leu Thr Glu Thr Ala Met Val Lys Thr Asp Asp Gln Gln Asp Lys Glu 340 345 350 Met Pro Val Leu Ser Thr Asn Arg Phe Glu Pro Asn Lys Ala Tyr Asp 355 360 365 Tyr Ala Tyr Ala Asn Arg Gly Met Lys Glu Asp Asp Phe Lys Asp Val 370 375 380 Lys Gly Lys Ile Ala Leu Ile Glu Arg Gly Asp Ile Asp Phe Lys Asp 385 390 395 400 Lys Val Ala Asn Ala Lys Lys Ala Gly Ala Val Gly Val Leu Ile Tyr 405 410 415 Asp Asn Gln Asp Lys Gly Phe Pro Ile Glu Leu Pro Asn Val Asp Gln 420 425 430 Met Pro Ala Ala Phe Ile Ser Arg Lys Asp Gly Leu Leu Leu Lys Asp 435 440 445 Asn Pro Gln Lys Thr Ile Thr Phe Asn Ala Thr Pro Lys Val Leu Pro 450 455 460 Thr Ala Ser Gly Thr Lys Leu Ser Arg Phe Ser Ser Trp Gly Leu Thr 465 470 475 480 Ala Asp Gly Asn Ile Lys Pro Asp Ile Ala Ala Pro Gly Gln Asp Ile 485 490 495 Leu Ser Ser Val Ala Asn Asn Lys Tyr Ala Lys Leu Ser Gly Thr Ser 500 505 510 Met Ser Ala Pro Leu Val Ala Gly Ile Met Gly Leu Leu Gln Lys Gln 515 520 525 Tyr Glu Thr Gln Tyr Pro Asp Met Thr Pro Ser Glu Arg Leu Asp Leu 530 535 540 Ala Lys Lys Val Leu Met Ser Ser Ala Thr Ala Leu Tyr Asp Glu Asp 545 550 555 560 Glu Lys Ala Tyr Phe Ser Pro Arg Gln Gln Gly Ala Gly Ala Val Asp 565 570 575 Ala Lys Lys Ala Ser Ala Ala Thr Met Tyr Val Thr Asp Lys Asp Asn 580 585 590 Thr Ser Ser Lys Val His Leu Asn Asn Val Ser Asp Lys Phe Glu Val 595 600 605 Thr Val Thr Val His Asn Lys Ser Asp Lys Pro Gln Glu Leu Tyr Tyr 610 615 620 Gln Ala Thr Val Gln Thr Asp Lys Val Asp Gly Lys His Phe Ala Leu 625 630 635 640 Ala Pro Lys Val Leu Tyr Glu Ala Ser Trp Gln Lys Ile Thr Ile Pro 645 650 655 Ala Asn Ser Ser Lys Gln Val Thr Val Pro Ile Asp Ala Ser Arg Phe 660 665 670 Ser Lys Asp Leu Leu Ala Gln Met Lys Asn Gly Tyr Phe Leu Glu Gly 675 680 685 Phe Val Arg Phe Lys Gln Asp Pro Thr Lys Glu Glu Leu Met Ser Ile 690 695 700 Pro Tyr Ile Gly Phe Arg Gly Asp Phe Gly Asn Leu Ser Ala Val Glu 705 710 715 720 Lys Pro Ile Tyr Asp Ser Lys Asp Gly Ser Ser Tyr Tyr His Glu Ala 725 730 735 Asn Ser Asp Ala Lys Asp Gln Leu Asp Gly Asp Gly Leu Gln Phe Tyr 740 745 750 Ala Leu Lys Asn Asn Phe Thr Ala Leu Thr Thr Glu Ser Asn Pro Trp 755 760 765 Thr Ile Ile Lys Ala Val Lys Glu Gly Val Glu Asn Ile Glu Asp Ile 770 775 780 Glu Ser Ser Glu Ile Thr Glu Thr Ile Phe Ala Gly Thr Phe Ala Lys 785 790 795 800 Gln Asp Asp Asp Ser His Tyr Tyr Ile His Arg His Ala Asn Gly Glu 805 810 815 Pro Tyr Ala Ala Ile Ser Pro Asn Gly Asp Gly Asn Arg Asp Tyr Val 820 825 830 Gln Phe Gln Gly Thr Phe Leu Arg Asn Ala Lys Asn Leu Val Ala Glu 835 840 845 Val Leu Asp Lys Glu Gly Asn Val Val Trp Thr Ser Glu Val Thr Glu 850 855 860 Gln Val Val Lys Asn Tyr Asn Asn Asp Leu Ala Ser Thr Leu Gly Ser 865 870 875 880 Thr Arg Phe Glu Lys Thr Arg Trp Asp Gly Lys Asp Lys Asp Gly Lys 885 890 895 Val Val Ala Asn Gly Thr Tyr Thr Tyr Arg Val Arg Tyr Thr Pro Ile 900 905 910 Ser Ser Gly Ala Lys Glu Gln His Thr Asp Phe Asp Val Ile Val Asp 915 920 925 Asn Thr Thr Pro Glu Val Ala Thr Ser Ala Thr Phe Ser Thr Glu Asp 930 935 940 Arg Arg Leu Thr Leu Ala Ser Lys Pro Lys Thr Ser Gln Pro Val Tyr 945 950 955 960 Arg Glu Arg Ile Ala Tyr Thr Tyr Met Asp Glu Asp Leu Pro Thr Thr 965 970 975 Glu Tyr Ile Ser Pro Asn Glu Asp Gly Thr Phe Thr Leu Pro Glu Glu 980 985 990 Ala Glu Thr Met Glu Gly Ala Thr Val Pro Leu Lys Met Ser Asp Phe 995 1000 1005 Thr Tyr Val Val Glu Asp Met Ala Gly Asn Ile Thr Tyr Thr Pro Val 1010 1015 1020 Thr Lys Leu Leu Glu Gly His Ser Asn Lys Pro Glu Gln Asp Gly Ser 1025 1030 1035 1040 Gly Gln Thr Pro Asp Lys Lys Pro Glu Ala Lys Pro Glu Gln Asp Gly 1045 1050 1055 Ser Asp Gln Ala Pro Asp Lys Lys Pro Glu Ala Lys Pro Glu Gln Asp 1060 1065 1070 Gly Ser Gly Gln Thr Pro Asp Lys Lys Pro Glu Thr Lys Pro Glu Lys 1075 1080 1085 Asp Ser Ser Gly Gln Thr Pro Gly Lys Thr Pro Gln Lys Gly Gln Pro 1090 1095 1100 Ser Arg Thr Leu Glu Lys Arg Ser Ser Lys Arg Ala Leu Ala Thr Lys 1105 1110 1115 1120 Ala Ser Thr Arg Asp Gln Leu Pro Thr Thr Asn Asp Lys Asp Thr Asn 1125 1130 1135 Arg Leu His Leu Leu Lys Leu Val Met Thr Thr Phe Phe Phe Gly Leu 1140 1145 1150 Val Ala His Ile Phe Lys Thr Lys Arg Gln Lys Glu Thr Lys Lys 1155 1160 1165 <210> 297 <211> 4637 <212> DNA <213> Streptococcus pyogenes <220> <223> C5a peptidase precursor (SCP) S08.020 <400> 297 cctgtattga tacatagccc aagaatatgc gtaaaaatag actcaatcaa gcctttttct 60 tgaaagcgac gggaataatt tttgccatag gttgtgaaat gtggcacctt gtcatccaaa 120 gtcaaaccta aaaaccagcg ataggcagta ttcacttcaa tatccttgat ggtctgacgc 180 atggaacgaa tgccataaaa gcactgaatc agagggattt taaccaacat gacaggatca 240 aggctagggc gaccattatc agacgaatag gtgtcttcta ctaggtcata gatgaagtcg 300 aagtcaatca cagcttccac ttagcgcagg aaatgttcat caggcactaa ctggtcaagg 360 gtatagaaac cgtactgatt gcggttatag tcaggttttt ctttgtgtaa cataggagaa 420 cctcacaagt cctttttctt atattatact cctaaatatc atgaaaagcc cctagaaaag 480 cgattctaag gactttgtct tcagtctgaa gagagaaccg atcggttctc tcttttatgt 540 ctaaaagaat gaggataagg aggtcacaaa ctaaacaact cttaaaaagc tgacctttac 600 taataatcgt ctttttttta taataaagat gttagtaata taattgataa atgagataca 660 tttaatcatt atggcaaaag caagaaaaat agctgtatca tatgcaaata acccctgttt 720 gctctttaaa aaagatatta tccttatttc tccacgcaca gatggacagc taggagagaa 780 tcgtttgatt ctctcttttc ttaatggtca taaagacaaa gtctctcatc aggaaaggac 840 gacacattgc gtaaaaaaca aaaattacca tttgataaac ttgccattgc gctcatgtct 900 acgagcatct tgctcaatgc acaatcagac attaaagcaa atactgtgac agaagacact 960 cctgttaccg aacaagccgt agaaacccca caaccaacag cggtttctga ggaagtacca 1020 tcatcaaagg aaaccaaaac cccacaaact cctgatgacg cagaagaaac aatagcagat 1080 gacgctaatg atctagcccc tcaagctcct gctaaaactg ctgatacacc agcaacctca 1140 aaagcgacta ttagggattt gaacgaccct tctcaggtca aaaccctgca ggaaaaagca 1200 ggcaagggag ctgggactgt tgttgcagtg attgatgctg gttttgataa aaatcatgaa 1260 gcgtggcgct taacagacaa aaccaaagca cgttaccaat caaaagaaga tcttgaaaaa 1320 gctaaaaaag agcacggtat tacctatggc gagtgggtca atgataaggt tgcttattac 1380 cacgactata gcaaagatgg taaaaccgct gtcgatcaag agcacggcac acacgtgtca 1440 gggatcttgt caggaaatgc tccatctgaa acgaaagaac cttaccgcct agaaggtgcg 1500 atgcctgagg ctcaattgct tttgatgcgt gtcgaaattg taaatggact agcagactat 1560 gctcgtaact acgctcaagc tatcagagat gctgtcaact tgggagctaa ggtgattaat 1620 atgagctttg gtaatgctgc actagcctac gctaacctcc cagacgaaac caaaaaagcc 1680 tttgactatg ccaaatcaaa aggtgttagc attgtgacct cagctggtaa tgatagtagc 1740 tttgggggca agacccgtct acctctagca gatcatcctg attatggggt ggttgggaca 1800 cctgcagcgg cagactcaac attgacagtt gcttcttaca gcccagataa acagctcact 1860 gaaactgcta tggtcaaaac agacgatcag caagataaag aaatgcctgt tctttcaaca 1920 aaccgttttg agccaaacaa ggcttacgac tatgcttatg ctaatcgtgg gatgaaagag 1980 gatgatttta aggatgtcaa aggcaagatt gcccttattg aacgtggcga tattgatttc 2040 aaagataagg ttgcaaacgc taaaaaagct ggtgctgtag gggtcttgat ctatgacaat 2100 caggacaagg gcttcccgat tgaattgcca aatgttgatc agatgcctgc ggcctttatc 2160 agtcgaaaag acggtctctt attaaaagac aatccccaaa aaaccatcac cttcaatgcg 2220 acacctaagg tattgccaac agcaagtggc accaaactaa gccgcttctc aagctggggt 2280 ctgacagctg acggcaatat taagccagat attgcagcac ccggccaaga tattttgtca 2340 tcagtggcta acaacaagta tgccaaactt tctggaacta gtatgtctgc gccattagta 2400 gcgggtatca tgggactgtt gcaaaagcaa tatgagacac agtatcctga tatgacacca 2460 tcagagcgtc ttgatttagc taaaaaagta ttgatgagct cagcaactgc cttatatgat 2520 gaagatgaaa aagcttattt ttctcctcgc caacaaggag caggagcggt cgatgctaaa 2580 aaagcttcag cagcaacgat gtatgtgaca gataaggata atacctcaag caaggttcac 2640 ctgaacaatg tttctgataa atttgaagta acagtaactg ttcacaacaa atctgataaa 2700 cctcaagagt tgtattacca agcaactgtt caaacagata aagtagatgg aaaacacttt 2760 gccttggctc ctaaagtatt gtatgaggca tcatggcaaa aaatcacaat tccagccaat 2820 agcagcaaac aagtcaccgt tccaatcgat gctagtcgat ttagcaagga cttgcttgcc 2880 caaatgaaaa atggctattt cttagaaggt tttgttcgtt tcaaacaaga tcctacaaaa 2940 gaagagctta tgagcattcc atatattggt ttccgaggtg attttggcaa tctgtcagcc 3000 gtagaaaaac caatctatga tagcaaagac ggtagcagct actatcatga agcaaatagt 3060 gatgccaaag accaattaga tggtgatgga ttacagtttt acgctctgaa aaacaacttt 3120 acagcactta ccacagagtc taacccatgg acgattatta aggctgtcaa agaaggggtt 3180 gaaaacatag aggatatcga atcttcagag atcacagaaa ccatttttgc aggtactttt 3240 gcaaaacaag acgatgatag ccactactat atccaccgtc acgctaatgg cgagccatat 3300 gctgcgatct ctccaaatgg ggacggtaac agagattatg tccaattcca aggtactttc 3360 ttgcgtaatg ctaaaaacct tgtggctgaa gtcttggaca aagaaggaaa tgttgtttgg 3420 acaagtgagg taaccgagca agttgttaaa aactacaaca atgacttggc aagcacactt 3480 ggttcaaccc gttttgaaaa aactcgttgg gacggtaaag ataaagacgg caaagttgtt 3540 gctaacggaa cctacaccta tcgtgtccgc tacactccga ttagttcagg tgcaaaagaa 3600 caacacactg attttgatgt gattgtagac aatacgacac ctgaagtcgc aacatcggca 3660 acattctcaa cagaagatcg tcgtttgaca cttgcatcta aaccaaaaac cagccaaccg 3720 gtttaccgtg agcgtattgc ttacacttat atggatgagg atctgccaac aacagagtat 3780 atttctccaa atgaagatgg tacctttact cttcctgaag aggctgaaac aatggaaggc 3840 gctactgttc cattgaaaat gtcagacttt acttatgttg ttgaagatat ggctggtaat 3900 atcacttata caccagtgac taagctattg gagggccact ctaataagcc agaacaagac 3960 ggttcaggtc aaacaccaga taaaaaacca gaagctaaac cagaacaaga cggttcagat 4020 caagcaccag acaaaaaacc agaagctaaa ccagaacaag acggttcagg tcaaacacca 4080 gataaaaaac cagaaactaa accagaaaaa gatagttcag gtcaaacacc aggtaaaact 4140 cctcaaaaag gtcaaccttc tcgtactcta gagaaacgct cttctaagcg tgctttagct 4200 acaaaagcat caacaagaga tcagttacca acgactaatg acaaggatac aaatcgttta 4260 catctcctta agttagttat gaccactttc ttctttggat tagtagctca tatctttaaa 4320 acaaaacgcc aaaaagaaac taaaaaatag tattacttaa actgataaga gcttatttaa 4380 tagagggaac caatttggtt ctctctattt ttttagatgt gctgcctcat caaaaagaag 4440 ttaggacaaa tagctgtcaa caattgcctt ttgcttatct tttcagttgc tgtgataaaa 4500 gatggcacgc caaacgcatg aagaaacttt tgttttcaga aaactagatt cataatgaca 4560 aaatcaatca aagtagtaca ctatagatga ggtgactacg atgattgatt ttattatttc 4620 tcaaccattc tatttct 4637 <210> 298 <211> 699 <212> PRT <213> Fervidobacterium pennivorans <220> <223> fervidolysin S08.020 <400> 298 Met Arg Lys Val Leu Leu Ile Ala Ser Ile Val Ala Leu Ile Leu Ala 1 5 10 15 Leu Phe Ser Cys Ala Asn Pro Ser Phe Glu Pro Arg Ser Lys Ala Lys 20 25 30 Asp Leu Ala Ser Leu Pro Glu Ile Lys Ser Gln Gly Tyr His Ile Leu 35 40 45 Phe Gly Glu Leu Arg Asp Gly Glu Tyr Thr Glu Gly Lys Ile Leu Val 50 55 60 Gly Tyr Asn Asp Arg Ser Glu Val Asp Lys Ile Val Lys Ala Val Asn 65 70 75 80 Gly Lys Val Val Leu Glu Leu Pro Gln Ile Lys Val Val Ser Ile Lys 85 90 95 Leu Asn Gly Met Thr Val Lys Gln Ala Tyr Asp Lys Ile Lys Ala Leu 100 105 110 Ala Leu Lys Gly Ile Arg Tyr Val Glu Pro Ser Tyr Lys Arg Glu Leu 115 120 125 Ile Lys Pro Thr Val Val Lys Pro Asn Pro Asp Met Tyr Lys Ile Arg 130 135 140 Lys Pro Gly Leu Asn Ser Thr Ala Arg Asp Tyr Gly Glu Glu Leu Ser 145 150 155 160 Asn Glu Leu Trp Gly Leu Glu Ala Ile Gly Val Thr Gln Gln Leu Trp 165 170 175 Glu Glu Ala Ser Gly Thr Asn Ile Ile Val Ala Val Val Asp Thr Gly 180 185 190 Val Asp Gly Thr His Pro Asp Leu Glu Gly Gln Val Ile Ala Gly Tyr 195 200 205 Arg Pro Ala Phe Asp Glu Glu Leu Pro Ala Gly Thr Asp Ser Ser Tyr 210 215 220 Gly Gly Ser His Gly Thr His Val Ala Gly Thr Ile Ala Ala Lys Lys 225 230 235 240 Asp Gly Lys Gly Ile Val Gly Val Ala Pro Gly Ala Lys Ile Met Pro 245 250 255 Ile Val Ile Phe Asp Asp Pro Ala Leu Val Gly Gly Asn Gly Tyr Val 260 265 270 Gly Asp Asp Tyr Val Ala Ala Gly Ile Ile Trp Ala Thr Asp His Gly 275 280 285 Ala Lys Val Met Asn His Ser Trp Gly Gly Trp Gly Tyr Ser Tyr Thr 290 295 300 Met Lys Glu Ala Phe Asp Tyr Ala Met Glu His Gly Val Val Met Val 305 310 315 320 Val Ser Ala Gly Asn Asn Thr Ser Asp Ser His His Gln Tyr Pro Ala 325 330 335 Gly Tyr Pro Gly Val Ile Gln Val Ala Ala Leu Asp Tyr Tyr Gly Gly 340 345 350 Thr Phe Arg Val Ala Gly Phe Ser Ser Arg Ser Asp Gly Val Ser Val 355 360 365 Gly Ala Pro Gly Val Thr Ile Leu Ser Thr Val Pro Gly Glu Asp Ser 370 375 380 Ile Gly Tyr Glu Gly His Asn Glu Asn Val Pro Ala Thr Asn Gly Gly 385 390 395 400 Thr Tyr Asp Tyr Tyr Gln Gly Thr Ser Met Ala Ala Pro His Val Thr 405 410 415 Gly Val Val Ala Val Leu Leu Gln Lys Phe Pro Asn Ala Lys Pro Trp 420 425 430 Gln Ile Arg Lys Leu Leu Glu Asn Thr Ala Phe Asp Phe Asn Gly Asn 435 440 445 Gly Trp Asp His Asp Thr Gly Tyr Gly Leu Val Lys Leu Asp Ala Ala 450 455 460 Leu Gln Gly Pro Leu Pro Thr Gln Gly Gly Val Glu Glu Phe Gln Val 465 470 475 480 Val Val Thr Asp Ala Lys Gly Asn Phe Gly Val Pro Thr Val Phe Val 485 490 495 Ser Met Met Arg Asp Asn Gly Ser Cys Tyr Tyr Ala Lys Thr Gly Pro 500 505 510 Asp Gly Ile Ala Arg Phe Pro His Ile Asp Ser Gly Thr Tyr Asp Ile 515 520 525 Phe Val Gly Gly Pro Asp His Trp Asp Arg Ala Leu Ala Pro Tyr Asp 530 535 540 Gly Glu Ser Ile Pro Gly Gly Tyr Ala Ile Ala Leu Arg Met Ala Glu 545 550 555 560 Glu Arg Gln Ala Ser Phe Val Gly Phe Gly Val Ser Pro Asp Ala Thr 565 570 575 Gln Leu Asn Val Asn Phe Asn Ser Thr Leu Gln Val Lys Phe Ser Thr 580 585 590 Asn Leu Ser Thr Leu Lys Asp Pro Gln Phe Val Val Val Asp Pro Leu 595 600 605 Leu Arg Gly Val Tyr Gly Arg Val Ala Tyr Ala Arg Asn Gln Thr Tyr 610 615 620 Asp Leu Ser Leu Leu Ser Gly Gln Ile Ser Phe Gly Ile Gln Thr Leu 625 630 635 640 Leu Pro Ala Ala Thr Asp Ile Thr Ile Gln Gly Thr Val Thr Leu Asn 645 650 655 Gly Glu Asp Ile Pro Val Tyr Gly Val Leu Lys Ala Gly Thr Thr Trp 660 665 670 Thr Ile Ile Asp Asp Phe Gly Gly Leu Asn Leu Gly Thr Asp Ser Gln 675 680 685 Pro Ile Tyr Val Trp Trp Thr Ile Phe Gly Gln 690 695 <210> 299 <211> 2227 <212> DNA <213> Fervidobacterium pennivorans <220> <223> fervidolysin S08.020 <400> 299 aaaacagaga tttaccacag atttgtaacc ggtgagaact aagaaagggg ggattgcgat 60 gagaaaagta ttgttgatag cttccattgt tgctcttatt ctcgcgctct tttcatgtgc 120 aaatccgagt tttgagccaa ggagcaaagc aaaagattta gcatcgttac cggagataaa 180 atctcagggt taccatatac tcttcggtga attgagggac ggggaatata ccgagggtaa 240 aatcctcgtt ggttacaacg ataggtcgga agtagataaa atagtcaaag cagttaacgg 300 taaagtagtg ctcgaattac cacagattaa agtggtctcc ataaaactca atggaatgac 360 ggttaaacaa gcatacgaca agataaaggc acttgcactt aaaggtatca ggtatgttga 420 accaagttac aagagggagc tcataaaacc aacagttgtg aagccaaatc ctgatatgta 480 caaaatcaga aaacctgggt tgaacagtac tgcaagagat tacggtgaag aactttccaa 540 cgaactctgg ggccttgagg caattggtgt aacacaacag ctttgggaag aagcatcggg 600 aacaaatatt atcgttgcgg ttgttgatac tggtgtcgac ggcacccatc cagatttgga 660 agggcaagtt atcgcaggat acagaccggc atttgatgaa gaactcccag caggaacaga 720 ttcatcctac ggtggttcac atggaacaca cgttgctgga acgattgcgg caaagaaaga 780 tggaaaaggt atcgttggtg ttgcacctgg tgcaaagata atgccgatag ttatattcga 840 tgacccagca cttgttggtg gaaatggtta cgttggcgac gattatgtcg cagcaggtat 900 aatttgggca acagaccatg gtgcaaaggt aatgaaccac tcttggggtg gctggggtta 960 cagctacaca atgaaagaag catttgatta tgcgatggag catggagttg tcatggttgt 1020 ctcagctggt aacaatacat cagattcaca ccatcaatat ccagcaggtt atcctggtgt 1080 tatccaagtt gctgctcttg actactacgg tggaacattt agagtggcag gtttttcaag 1140 cagaagcgat ggagtctcag ttggcgcacc tggagttacg attctctcga cggttcctgg 1200 cgaagatagt atcggatacg aagggcacaa cgaaaacgtt cctgcaacaa atggcggtac 1260 ttatgattac tatcaaggaa cctcaatggc tgcaccgcat gtaacaggtg ttgttgctgt 1320 attgctacaa aaattcccga acgcaaaacc atggcagata agaaaattac tcgaaaacac 1380 agcattcgat tttaacggaa atggttggga tcacgatacc ggttatggtc tggtaaagct 1440 cgatgcagca ttgcaaggtc ctcttccgac acaaggtgga gtcgaagagt tccaagtagt 1500 tgttacggat gctaaaggaa atttcggagt cccaacggtc tttgtatcaa tgatgagaga 1560 caatggttca tgctattatg cgaaaacagg tcctgatggt atagcaaggt tcccacacat 1620 cgacagcggc acttacgaca tatttgttgg tggaccagac cactgggata gagctctggc 1680 tccttacgat ggagaaagta ttcccggagg ttatgccatt gctttgagaa tggctgagga 1740 aaggcaagct tccttcgtcg gctttggagt ttctccagat gcaacacaac tcaatgtcaa 1800 ttttaattcg acactgcaag ttaaattcag cactaacctc tcaacactga aagacccaca 1860 atttgtggtt gttgatccgt tactaagagg agtttacggt cgtgtggcat acgcaagaaa 1920 tcaaacatac gatttgtcgt tactctcagg tcaaatttca tttggtatac aaacgctctt 1980 accagcagcg acagatatta caatccaagg aacagtaaca ttgaacggtg aagacatccc 2040 tgtttacgga gttctaaaag ctggaaccac atggactata attgatgact ttggtggatt 2100 gaatttgggc accgactcgc agccaatcta tgtctggtgg acaatcttcg gacagtgata 2160 gtttcatttt aacgtcaaag caaaccgatg gggtgttcag accccatcgg ttttttgttt 2220 tgccttt 2227 <210> 300 <211> 381 <212> PRT <213> Geobacillus stearothermophilus <220> <223> Subtilisin J precursor S08.035 <400> 300 Met Arg Ser Lys Lys Leu Trp Ile Ser Leu Leu Phe Ala Leu Thr Leu 1 5 10 15 Ile Phe Thr Met Ala Phe Ser Asn Met Ser Val Gln Ala Ala Gly Lys 20 25 30 Ser Ser Thr Glu Lys Lys Tyr Ile Val Gly Phe Lys Gln Thr Met Ser 35 40 45 Ala Met Ser Ser Ala Lys Lys Lys Asp Val Ile Ser Glu Lys Gly Gly 50 55 60 Lys Val Gln Lys Gln Phe Lys Tyr Val Asn Ala Ala Ala Ala Thr Leu 65 70 75 80 Asp Glu Lys Ala Val Lys Glu Leu Lys Lys Asp Pro Ser Val Ala Tyr 85 90 95 Val Glu Glu Asp His Ile Ala His Glu Tyr Ala Gln Ser Val Pro Tyr 100 105 110 Gly Ile Ser Gln Ile Lys Ala Pro Ala Leu His Ser Gln Gly Tyr Thr 115 120 125 Gly Ser Asn Val Lys Val Ala Val Ile Asp Ser Gly Ile Asp Ser Ser 130 135 140 His Pro Asp Leu Asn Val Arg Gly Gly Ala Ser Phe Val Pro Ser Glu 145 150 155 160 Thr Asn Pro Tyr Gln Asp Gly Ser Ser His Gly Thr His Val Ala Gly 165 170 175 Thr Ile Ala Ala Leu Asn Asn Ser Ile Gly Val Leu Gly Val Ser Pro 180 185 190 Ser Ala Ser Leu Tyr Ala Val Lys Val Leu Asp Ser Thr Gly Ser Gly 195 200 205 Gln Tyr Ser Trp Ile Ile Asn Gly Ile Glu Trp Ala Ile Ser Asn Asn 210 215 220 Met Asp Val Ile Asn Met Ser Leu Gly Gly Pro Ser Gly Ser Thr Ala 225 230 235 240 Leu Lys Thr Val Val Asp Lys Ala Val Ser Ser Gly Ile Val Val Ala 245 250 255 Ala Ala Ala Gly Asn Glu Gly Ser Ser Gly Ser Ser Ser Thr Val Gly 260 265 270 Tyr Pro Ala Lys Tyr Pro Ser Thr Ile Ala Val Gly Ala Val Asn Ser 275 280 285 Ser Asn Gln Arg Ala Ser Phe Ser Ser Ala Gly Ser Glu Leu Asp Val 290 295 300 Met Ala Pro Gly Val Ser Ile Gln Ser Thr Leu Pro Gly Gly Thr Tyr 305 310 315 320 Gly Ala Tyr Asn Gly Thr Ser Met Ala Thr Pro His Val Ala Gly Ala 325 330 335 Ala Ala Leu Ile Leu Ser Lys His Pro Thr Trp Thr Asn Ala Gln Val 340 345 350 Arg Asp Arg Leu Glu Ser Thr Ala Thr Tyr Leu Gly Asn Ser Phe Tyr 355 360 365 Tyr Gly Lys Gly Leu Ile Asn Val Gln Ala Ala Ala Gln 370 375 380 <210> 301 <211> 2494 <212> DNA <213> Geobacillus stearothermophilus <220> <223> Subtilisin J precursor S08.035 <400> 301 gaattctcca ttttcttctg ctatcaaaat aacagactcg tgattttcca aacgagcttt 60 caaaaaagcc tctgcccctt gcaaatcgga tgcctgtcta taaaattccc gatattggtt 120 aaacaacggc gcaatggcgg ccgcatctga tgtctttgct tggcgaatgt tcatcttatt 180 tcttcctccc tctcaataat tttttcattc tatccctttt ctgtaaagtt tatttttcag 240 aatactttta tcatcatgct ttgaaaaaat atcacgataa tatccattgt tctcacggaa 300 gcacacgcag gtcatttgaa cgaatttttt cgacagaaat ttgccgggac tcaggagcat 360 ttaacctaaa aaagcatgac atttcagcat aatgaacatt tactcatgtc tattttcgtt 420 cttttctgta tgaaaatagt tatttcgagt ctctacggaa atagcgagag atgatatacc 480 taaatagaga taaaatcatc tcaaaaaaat gggtctacta aaatattatt ccatctatta 540 caataaattc acagaatagt cttttaagta agtctactct gaattttttt aaaaggagag 600 ggtaaagagt gagaagcaaa aaattgtgga tcagcttgtt gtttgcgtta acgttaatct 660 ttacgatggc gttcagcaac atgtctgtgc aggctgccgg aaaaagcagt acagaaaaga 720 aatacattgt cggatttaaa cagacaatga gtgccatgag ttccgccaag aaaaaggatg 780 ttatttctga aaaaggcgga aaggttcaaa agcaatttaa gtatgttaac gcggccgcag 840 caacattgga tgaaaaagct gtaaaagaat tgaaaaaaga tccgagcgtt gcatatgtgg 900 aagaagatca tattgcacat gaatatgcgc aatctgttcc ttatggcatt tctcaaatta 960 aagcgccggc tcttcactct caaggctaca caggctctaa cgtaaaagta gctgttatcg 1020 acagcggaat tgactcttct catcctgact taaacgtcag aggcggagca agcttcgtac 1080 cttctgaaac aaacccatac caggacggca gttctcacgg tacgcatgta gccggtacga 1140 ttgccgctct taataactca atcggtgttc tgggcgtcag cccaagcgca tcattatatg 1200 cagtaaaagt gcttgattca acaggaagcg gccaatatag ctggattatt aacggcattg 1260 aatgggccat ttccaacaat atggatgtta ttaacatgag ccttggcgga ccttctggtt 1320 ctacagcgct gaaaacagtc gttgataaag ccgtttccag cggtatcgtc gttgctgccg 1380 ctgccggaaa cgaaggttcg tccggaagct caagcacagt cggctaccct gcaaaatatc 1440 cttctactat tgcggtaggt gcggtaaaca gcagcaacca aagagcttca ttctcaagcg 1500 caggttctga gcttgatgtg atggctcctg gcgtatccat ccaaagcaca cttcctggag 1560 gcacttacgg tgcttacaac ggcacgtcca tggcgactcc tcacgttgcc ggagcagcag 1620 cgctaattct ttctaagcac ccgacttgga caaacgcgca agtccgtgat cgtttagaaa 1680 gcactgcaac atatcttgga aactctttct actatggaaa agggttaatc aacgtacaag 1740 cagctgcaca ataatagtaa aaagaagcag gttcctccat acctgcttct ttttatttgt 1800 cagcatcctg atgttccggc gcattctctt ctttctccgt atgttgaatc cgttccatga 1860 tcgaaggatg gctgcctctg aaaatcttca caagcaccgg aggatcaacc tggctcagcc 1920 ccgtcacggc caaatcctga aacgttttaa cagcggcttc tctgttctct gtcaactcga 1980 tcccatactg gtcagcctta ttctcctgat aacgcgagac agcattagaa aaaggcgtca 2040 ccgcaaagct caaaacagaa aacaaaagca ataacagcgg aagtgccgca agatcatgcc 2100 gcccttctaa atgaaacatg ctgcgggtta ggcgaaccgt ccgcttgtaa agcttatcaa 2160 tgacataaaa tccggcgagc gacacgagca aataaccagc cagaccgatg taaacgtgct 2220 tcatgacata atggcccatt tcgtggccca taataaacag gatttctgaa tcgtcaagtt 2280 tgttcagcgt cgtatcccac aatacaatcc gtttattggc cccaattcct gtaacatagg 2340 cattcagcgc atttgttttt tctgacatgt tcacttcata tacatggtca gccggaatat 2400 tggcttcatc tgccagctct aaaattttgc tttcaagctc tttgtttttc agcggataaa 2460 aatcattgta taaaggatcg actctagagg atcc 2494 <210> 302 <211> 381 <212> PRT <213> Bacillus subtilis <220> <223> Subtilisin E precursor S08.036 <400> 302 Met Arg Ser Lys Lys Leu Trp Ile Ser Leu Leu Phe Ala Leu Thr Leu 1 5 10 15 Ile Phe Thr Met Ala Phe Ser Asn Met Ser Val Gln Ala Ala Gly Lys 20 25 30 Ser Ser Thr Glu Lys Lys Tyr Ile Val Gly Phe Lys Gln Thr Met Ser 35 40 45 Ala Met Ser Ser Ala Lys Lys Lys Asp Val Ile Ser Glu Lys Gly Gly 50 55 60 Lys Val Gln Lys Gln Phe Lys Tyr Val Asn Ala Ala Ala Ala Thr Leu 65 70 75 80 Asp Glu Lys Ala Val Lys Glu Leu Lys Lys Asp Pro Ser Val Ala Tyr 85 90 95 Val Glu Glu Asp His Ile Ala His Glu Tyr Ala Gln Ser Val Pro Tyr 100 105 110 Gly Ile Ser Gln Ile Lys Ala Pro Ala Leu His Ser Gln Gly Tyr Thr 115 120 125 Gly Ser Asn Val Lys Val Ala Val Ile Asp Ser Gly Ile Asp Ser Ser 130 135 140 His Pro Asp Leu Asn Val Arg Gly Gly Ala Ser Phe Val Pro Ser Glu 145 150 155 160 Thr Asn Pro Tyr Gln Asp Gly Ser Ser His Gly Thr His Val Ala Gly 165 170 175 Thr Ile Ala Ala Leu Asn Asn Ser Ile Gly Val Leu Gly Val Ser Pro 180 185 190 Ser Ala Ser Leu Tyr Ala Val Lys Val Leu Asp Ser Thr Gly Ser Gly 195 200 205 Gln Tyr Ser Trp Ile Ile Asn Gly Ile Glu Trp Ala Ile Ser Asn Asn 210 215 220 Met Asp Val Ile Asn Met Ser Leu Gly Gly Pro Thr Gly Ser Thr Ala 225 230 235 240 Leu Lys Thr Val Val Asp Lys Ala Val Ser Ser Gly Ile Val Val Ala 245 250 255 Ala Ala Ala Gly Asn Glu Gly Ser Ser Gly Ser Thr Ser Thr Val Gly 260 265 270 Tyr Pro Ala Lys Tyr Pro Ser Thr Ile Ala Val Gly Ala Val Asn Ser 275 280 285 Ser Asn Gln Arg Ala Ser Phe Ser Ser Ala Gly Ser Glu Leu Asp Val 290 295 300 Met Ala Pro Gly Val Ser Ile Gln Ser Thr Leu Pro Gly Gly Thr Tyr 305 310 315 320 Gly Ala Tyr Asn Gly Thr Ser Met Ala Thr Pro His Val Ala Gly Ala 325 330 335 Ala Ala Leu Ile Leu Ser Lys His Pro Thr Trp Thr Asn Ala Gln Val 340 345 350 Arg Asp Arg Leu Glu Ser Thr Ala Thr Tyr Leu Gly Asn Ser Phe Tyr 355 360 365 Tyr Gly Lys Gly Leu Ile Asn Val Gln Ala Ala Ala Gln 370 375 380 <210> 303 <211> 1500 <212> DNA <213> Bacillus subtilis <220> <223> Subtilisin E precursor S08.036 <400> 303 gatataccta aatagagata aaatcatctc aaaaaaatgg gtctactaaa atattattcc 60 atctattaca ataaattcac agaatagtct tttaagtaag tctactctga atttttttaa 120 aaggagaggg taaagagtga gaagcaaaaa attgtggatc agcttgttgt ttgcgttaac 180 gttaatcttt acgatggcgt tcagcaacat gtctgcgcag gctgccggaa aaagcagtac 240 agaaaagaaa tacattgtcg gatttaaaca gacaatgagt gccatgagtt ccgccaagaa 300 aaaggatgtt atttctgaaa aaggcggaaa ggttcaaaag caatttaagt atgttaacgc 360 ggccgcagca acattggatg aaaaagctgt aaaagaattg aaaaaagatc cgagcgttgc 420 atatgtggaa gaagatcata ttgcacatga atatgcgcaa tctgttcctt atggcatttc 480 tcaaattaaa gcgccggctc ttcactctca aggctacaca ggctctaacg taaaagtagc 540 tgttatcgac agcggaattg actcttctca tcctgactta aacgtcagag gcggagcaag 600 cttcgtacct tctgaaacaa acccatacca ggacggcagt tctcacggta cgcatgtagc 660 cggtacgatt gccgctctta ataactcaat cggtgttctg ggcgttagcc caagcgcatc 720 attatatgca gtaaaagtgc ttgattcaac aggaagcggc caatatagct ggattattaa 780 cggcattgag tgggccattt ccaacaatat ggatgttatc aacatgagcc ttggcggacc 840 tactggttct acagcgctga aaacagtcgt tgacaaagcc gtttccagcg gtatcgtcgt 900 tgctgccgca gccggaaacg aaggttcatc cggaagcaca agcacagtcg gctaccctgc 960 aaaatatcct tctactattg cagtaggtgc ggtaaacagc agcaaccaaa gagcttcatt 1020 ctccagcgca ggttctgagc ttgatgtgat ggctcctggc gtgtccatcc aaagcacact 1080 tcctggaggc acttacggcg cttataacgg aacgtccatg gcgactcctc acgttgccgg 1140 agcagcagcg ttaattcttt ctaagcaccc gacttggaca aacgcgcaag tccgtgatcg 1200 tttagaaagc actgcaacat atcttggaaa ctctttctac tatggaaaag ggttaatcaa 1260 cgtacaagca gctgcacaat aatagtaaaa agaagcaggt tcctccatac ctgcttcttt 1320 ttatttgtca gcatcctgat gttccggcgc attctcttct ttctccgcat gttgaatccg 1380 ttccatgatc gacggatggc tgcctctgaa aatcttcaca agcaccggag gatcaacctg 1440 ctcagccccg tcacggccaa atcctgaaac gttttaacac tggcttctct gttctctgtc 1500 <210> 304 <211> 274 <212> PRT <213> Bacillus licheniformis <220> <223> Subtilisin DY S08.037 <400> 304 Ala Gln Thr Val Pro Tyr Gly Ile Pro Leu Ile Lys Ala Asp Lys Val 1 5 10 15 Gln Ala Gln Gly Tyr Lys Gly Ala Asn Val Lys Val Gly Ile Ile Asp 20 25 30 Thr Gly Ile Ala Ala Ser His Thr Asp Leu Lys Val Val Gly Gly Ala 35 40 45 Ser Phe Val Ser Gly Glu Ser Tyr Asn Thr Asp Gly Asn Gly His Gly 50 55 60 Thr His Val Ala Gly Thr Val Ala Ala Leu Asp Asn Thr Thr Gly Val 65 70 75 80 Leu Gly Val Ala Pro Asn Val Ser Leu Tyr Ala Ile Lys Val Leu Asn 85 90 95 Ser Ser Gly Ser Gly Thr Tyr Ser Ala Ile Val Ser Gly Ile Glu Trp 100 105 110 Ala Thr Gln Asn Gly Leu Asp Val Ile Asn Met Ser Leu Gly Gly Pro 115 120 125 Ser Gly Ser Thr Ala Leu Lys Gln Ala Val Asp Lys Ala Tyr Ala Ser 130 135 140 Gly Ile Val Val Val Ala Ala Ala Gly Asn Ser Gly Ser Ser Gly Ser 145 150 155 160 Gln Asn Thr Ile Gly Tyr Pro Ala Lys Tyr Asp Ser Val Ile Ala Val 165 170 175 Gly Ala Val Asp Ser Asn Lys Asn Arg Ala Ser Phe Ser Ser Val Gly 180 185 190 Ala Glu Leu Glu Val Met Ala Pro Gly Val Ser Val Tyr Ser Thr Tyr 195 200 205 Pro Ser Asn Thr Tyr Thr Ser Leu Asn Gly Thr Ser Met Ala Ser Pro 210 215 220 His Val Ala Gly Ala Ala Ala Leu Ile Leu Ser Lys Tyr Pro Thr Leu 225 230 235 240 Ser Ala Ser Gln Val Arg Asn Arg Leu Ser Ser Thr Ala Thr Asn Leu 245 250 255 Gly Asp Ser Phe Tyr Tyr Gly Lys Gly Leu Ile Asn Val Glu Ala Ala 260 265 270 Ala Gln <210> 305 <211> 384 <212> PRT <213> Engyodontium album <220> <223> Proteinase K precursor S08.054 <400> 305 Met Arg Leu Ser Val Leu Leu Ser Leu Leu Pro Leu Ala Leu Gly Ala 1 5 10 15 Pro Ala Val Glu Gln Arg Ser Glu Ala Ala Pro Leu Ile Glu Ala Arg 20 25 30 Gly Glu Met Val Ala Asn Lys Tyr Ile Val Lys Phe Lys Glu Gly Ser 35 40 45 Ala Leu Ser Ala Leu Asp Ala Ala Met Glu Lys Ile Ser Gly Lys Pro 50 55 60 Asp His Val Tyr Lys Asn Val Phe Ser Gly Phe Ala Ala Thr Leu Asp 65 70 75 80 Glu Asn Met Val Arg Val Leu Arg Ala His Pro Asp Val Glu Tyr Ile 85 90 95 Glu Gln Asp Ala Val Val Thr Ile Asn Ala Ala Gln Thr Asn Ala Pro 100 105 110 Trp Gly Leu Ala Arg Ile Ser Ser Thr Ser Pro Gly Thr Ser Thr Tyr 115 120 125 Tyr Tyr Asp Glu Ser Ala Gly Gln Gly Ser Cys Val Tyr Val Ile Asp 130 135 140 Thr Gly Ile Glu Ala Ser His Pro Glu Phe Glu Gly Arg Ala Gln Met 145 150 155 160 Val Lys Thr Tyr Tyr Tyr Ser Ser Arg Asp Gly Asn Gly His Gly Thr 165 170 175 His Cys Ala Gly Thr Val Gly Ser Arg Thr Tyr Gly Val Ala Lys Lys 180 185 190 Thr Gln Leu Phe Gly Val Lys Val Leu Asp Asp Asn Gly Ser Gly Gln 195 200 205 Tyr Ser Thr Ile Ile Ala Gly Met Asp Phe Val Ala Ser Asp Lys Asn 210 215 220 Asn Arg Asn Cys Pro Lys Gly Val Val Ala Ser Leu Ser Leu Gly Gly 225 230 235 240 Gly Tyr Ser Ser Ser Val Asn Ser Ala Ala Ala Arg Leu Gln Ser Ser 245 250 255 Gly Val Met Val Ala Val Ala Ala Gly Asn Asn Asn Ala Asp Ala Arg 260 265 270 Asn Tyr Ser Pro Ala Ser Glu Pro Ser Val Cys Thr Val Gly Ala Ser 275 280 285 Asp Arg Tyr Asp Arg Arg Ser Ser Phe Ser Asn Tyr Gly Ser Val Leu 290 295 300 Asp Ile Phe Gly Pro Gly Thr Ser Ile Leu Ser Thr Trp Ile Gly Gly 305 310 315 320 Ser Thr Arg Ser Ile Ser Gly Thr Ser Met Ala Thr Pro His Val Ala 325 330 335 Gly Leu Ala Ala Tyr Leu Met Thr Leu Gly Lys Thr Thr Ala Ala Ser 340 345 350 Ala Cys Arg Tyr Ile Ala Asp Thr Ala Asn Lys Gly Asp Leu Ser Asn 355 360 365 Ile Pro Phe Gly Thr Val Asn Leu Leu Ala Tyr Asn Asn Tyr Gln Ala 370 375 380 <210> 306 <211> 2347 <212> DNA <213> Engyodontium album <220> <223> Proteinase K precursor S08.054 <400> 306 cgaacagtat aaagaaatag aggggaccta aactcatgtt caactctagg gccccgttga 60 atcattcccc caaagtggga acgccagtgg cgacaaatct gtatactgtt tcctgctttt 120 tctggtttgt caaggttctc attaccctct tggctttctc ctcttttcgc gacattgtgc 180 ttgtggtgtg cctatgtatg ttgtagtcaa tgctatatgt caatggtttt tgtcaaatgc 240 catggcctag tggctctatg ctggagctgc taattctggg cctttatcga ctcctccgac 300 tagtcctgat gaagaagttg caacactacc agcgtcacat tcgccccatt gatcacttct 360 tgatccttcg caataacctt cacggctgct cgaatgactt gacgtcacga tgggcctact 420 atccaacttc cagaacagga aagtcgagat agttctacat agaccatgga cgagttcatg 480 agatgttgga ttcaaggata aatagctggc catgtcgccg cttcgataca gtttgtttca 540 tctccatcat cagcatcaat cgcagcaata caaagcatcc tctcaaactc aacaaacttt 600 cttgattaag caccgctttc tcattcatca acaacagcca aaatgcgttt gtctgttctt 660 ctgagtcttc ttcccctcgc tctcggcgct cctgccgttg agcagcgctc cgaggctgct 720 cctctgatcg aggcccgcgg cgagatggtt gccaacaagt acattgtcaa gttcaaggag 780 ggtagcgctc tttctgctct cgatgctgcc atggagaaga tttctggcaa gcccgaccac 840 gtctacaaga acgtcttcag tggtttcgct gcgacccttg acgagaacat ggttcgggtt 900 ctccgcgccc atcccgatgt aagttttccc atctataatc tcttccccta aaaagtctct 960 cccttctaat atcgccgtca ggttgagtac attgagcagg atgctgttgt caccatcaac 1020 gctgcgcaga ccaacgctcc ctggggcctt gctcgcatct ccagcaccag ccccggtacc 1080 tctacttact actatgacga atctgccggc caaggctcct gcgtctacgt gattgacacc 1140 ggtatcgagg catcgcaccc cgagtttgag ggtcgtgccc agatggtcaa gacctactac 1200 tactccagtc gcgacggtaa cggtcacggc actcactgcg ctggtaccgt tggctcccga 1260 acctacggtg tcgccaagaa gacccagctc tttggtgtca aggtcctcga tgacaacggc 1320 agtggccagt actccaccat catcgccggt atggactttg ttgccagcga caagaacaac 1380 cgcaactgcc ccaaaggtgt cgttgcctcc ttgtcccttg gcggtggtta ctcctcctcc 1440 gtgaacagcg ccgctgccag gctccagagc tctggtgtca tggtcgccgt cgctgccggt 1500 aacaacaacg ctgacgcccg caactactcc cctgcttctg agccctcggt ctgcactgtc 1560 ggtgcttctg accgctacga cagacgctcc agcttctcca actacggcag cgttttggac 1620 atctttggcc ctggtaccag cattctctcc acctggatcg gcggcagcac ccgctccatc 1680 tctggaactt ccatggctac tccccacgtt gccggtctcg ctgcctacct catgactctt 1740 ggaaagacta ccgccgccag cgcttgccga tacattgccg acaccgccaa caagggcgac 1800 ttgagcaaca ttcccttcgg cactgtcaac ctgcttgcct acaacaacta ccaggcttaa 1860 gtccttcagt caacgccaaa agctcaagat atgaaacaag ttatgaatgc atctgtatat 1920 agacgagcat acttcatatc agtacataac catccttagt atatttaaaa aggcaacgaa 1980 tttgcagatt tagctgtcag acagttagat ttgcatgaat cagaagatat ttgctttcat 2040 aaattgcctc gtctcctttt tgcgcttcac ttattatctt tcttgacaaa ttgaaacagt 2100 ggcattaatt tcctttctaa ggaaatcgca tttaaatagt gaatgtaatc atatttgcac 2160 ttactagagg taggaccaaa ttatcgagga acagttggtc atcgggcggg ttcctcggct 2220 tctttctgtt ttagcaagtg tgtagtcctc gtgcatggcc gatgatgatt agtctgagag 2280 aacttgtgag ctaacaacgg catctcgagg aaacgttcaa ctatgagccg aaagacaagt 2340 acttaat 2347 <210> 307 <211> 534 <212> PRT <213> Vibrio alginolyticus <220> <223> Alkaline serine exoprotease A precursor S08.050 <400> 307 Met Leu Lys Lys Leu Leu Ser Cys Cys Ile Thr Ser Ala Leu Cys Phe 1 5 10 15 His Ser Ser Leu Ala Phe Ser Gln Pro Asn Glu Ile Ala Asp Ser Ala 20 25 30 Glu Leu Gln Gln Ala Pro Asp Thr Leu Pro Ala Thr Leu Met Leu Ala 35 40 45 Pro Asp Asp Ile Ala Ile Ala Asp Arg Tyr Ile Val Val Phe Gln Gln 50 55 60 Pro Gln Met Met Ala Ser Ser Ser Pro Glu Phe Glu Gln Phe Thr Gln 65 70 75 80 Gln Ser Val Asp Arg Met Ser Gly Leu Tyr Ser Ile Gln Val Glu Ser 85 90 95 Val Phe Asp His Ser Ile Ser Gly Phe Val Ala Asn Leu Ser Pro Glu 100 105 110 Gln Leu Lys Asp Leu Arg Ser Asp Pro Arg Val Asp Tyr Ile Glu Gln 115 120 125 Asp Arg Ile Leu Ser Leu Asp Pro Ile Val Ser Ala Asp Ala Asn Gln 130 135 140 Thr Asn Ala Ile Trp Gly Leu Asp Arg Ile Asp Gln Arg Asn Leu Pro 145 150 155 160 Leu Asp Asn Asn Tyr Ser Ala Asn Phe Asp Gly Thr Gly Val Thr Ala 165 170 175 Tyr Val Ile Asp Thr Gly Val Asn Asn Ala His Val Glu Phe Gly Gly 180 185 190 Arg Ser Val Ser Gly Tyr Asp Phe Val Asp Asn Asp Ala Asp Ala Ser 195 200 205 Asp Cys Asn Gly His Gly Thr His Val Ala Gly Thr Ile Gly Gly Ser 210 215 220 Leu Tyr Gly Val Ala Lys Asn Val Asn Leu Val Gly Val Arg Val Leu 225 230 235 240 Ser Cys Ser Gly Ser Gly Ser Thr Ser Gly Val Ile Ala Gly Val Asp 245 250 255 Trp Val Ala Ala Asn Ala Ser Gly Pro Ser Val Ala Asn Met Ser Leu 260 265 270 Gly Gly Gly Gln Ser Val Ala Leu Asp Ser Ala Val Gln Ser Ala Val 275 280 285 Gln Ser Gly Val Ser Phe Met Leu Ala Ala Gly Asn Ser Asn Ala Asp 290 295 300 Ala Cys Asn Tyr Ser Pro Ala Arg Val Ala Thr Gly Val Thr Val Gly 305 310 315 320 Ser Thr Thr Ser Thr Asp Ala Arg Ser Ser Phe Ser Asn Trp Gly Ser 325 330 335 Cys Val Asp Val Phe Ala Pro Gly Ser Gln Ile Lys Ser Ala Trp Tyr 340 345 350 Asp Gly Gly Tyr Lys Thr Ile Ser Gly Thr Ser Met Ala Thr Pro His 355 360 365 Val Ala Gly Val Ala Ala Leu Tyr Leu Gln Glu Asn Ser Ser Val Ser 370 375 380 Pro Ser Gln Val Glu Ala Leu Ile Val Ser Arg Ala Ser Thr Gly Lys 385 390 395 400 Val Thr Asp Thr Arg Gly Ser Val Asn Lys Leu Leu Tyr Ser Leu Thr 405 410 415 Asp Ala Asp Cys Gly Gln Asp Cys Gly Gly Pro Asp Pro Thr Pro Asp 420 425 430 Pro Glu Gly Lys Leu Thr Ser Gly Val Pro Val Ser Gly Leu Ser Gly 435 440 445 Ser Ser Gly Gln Val Ala Tyr Tyr Tyr Val Asp Val Glu Ala Gly Gln 450 455 460 Arg Leu Thr Val Gln Met Tyr Gly Gly Ser Gly Asp Ala Asp Leu Tyr 465 470 475 480 Leu Arg Phe Gly Ala Lys Pro Thr Leu Asn Ala Trp Asp Cys Arg Pro 485 490 495 Phe Lys Tyr Gly Asn Asn Glu Thr Cys Thr Val Ser Ala Thr Gln Ser 500 505 510 Gly Arg Tyr His Val Met Ile Gln Gly Tyr Ser Asn Tyr Ser Gly Val 515 520 525 Ser Ile Gln Ala Asn Tyr 530 <210> 308 <211> 1856 <212> DNA <213> Vibrio alginolyticus <220> <223> Alkaline serine exoprotease A precursor S08.050 <400> 308 ctgcagcacg tattgagcat accacgctga ttgtctgtgt tttcgtgttg acagtttggt 60 actaggtaaa atcaacaaga ctatgatttc aaggaacatt ttatgttaaa gaaactacta 120 agttgttgta tcacctccgc gctctgtttt cattcttctc tcgctttttc gcaacccaat 180 gagattgcgg acagtgcaga gttacaacaa gctcccgaca cattgcctgc cactttgatg 240 cttgcaccgg acgacatcgc cattgcagat cgatatatag tggtatttca acaaccgcaa 300 atgatggcga gcagctcacc ggaattcgag caattcacgc aacagtctgt agaccgcatg 360 tccggtttat attcgataca agtggagtcg gtttttgacc actcgatcag tggatttgtc 420 gctaacttga gtcctgagca actaaaagat ctgcgttctg atcctcgtgt ggactacatt 480 gagcaagaca gaatcctatc gcttgaccca atagtctcgg cagacgcaaa tcaaaccaat 540 gccatttggg gactagatcg aatcgaccaa cgtaacttgc cactcgataa caactacagt 600 gccaactttg atgggactgg tgtaacggct tatgttatcg atactggtgt gaacaatgca 660 catgttgagt ttggtgggcg ctcggtttct gggtatgact ttgtcgataa tgatgcagat 720 gcaagtgact gtaatggaca cggcacacac gtggcgggca ccattggcgg cagcttgtat 780 ggtgttgcga aaaacgtcaa ccttgtcggc gtgagagtat tgagctgtag cggatcgggg 840 tctacgtctg gtgttatcgc cggtgtggat tgggtggctg cgaacgcttc cggaccttca 900 gttgccaata tgagtttagg tggcggtcaa tctgtcgctc tcgatagtgc ggtgcaaagt 960 gcggttcaat caggtgtcag ctttatgctt gcagcaggta actccaatgc cgatgcgtgt 1020 aactactctc cagcgcgcgt tgctactggt gtaactgtcg gctcgaccac cagcacggat 1080 gcacgttcga gtttttcaaa ctggggcagt tgtgtggacg tgttcgcgcc aggctcacaa 1140 atcaaatctg cgtggtatga cggtggttac aaaaccatta gtggtacatc gatggcgacg 1200 ccacatgtag cgggtgtagc agcactgtat cttcaagaaa acagttccgt gtcgccaagc 1260 caagtagagg ccttgatcgt gagccgcgca agtaccggaa aggtgacgga cacaagaggc 1320 agcgtgaaca agctacttta tagcttaacg gatgcagatt gtggccaaga ctgcggtggc 1380 ccagatccaa caccggaccc agaaggcaag ttaacctcgg gcgtgccagt gagcggttta 1440 agtggctcaa gcggtcaagt agcgtattac tatgttgatg tagaagctgg gcagcgctta 1500 accgtacaaa tgtatggtgg cagcggtgat gcggatttgt atctccgttt tggtgcaaaa 1560 ccgacactga atgcatggga ctgccgacct ttcaaatacg gtaacaatga aacatgtacg 1620 gtcagcgcga cacaaagtgg acgctaccac gtcatgattc aaggttactc aaactatagc 1680 ggtgtcagca ttcaagctaa ctactagttg ttattctcgt tactaaaaga gaacaaagcc 1740 cgcttttcgg tgggctttgc tttcgggaat actaagttta ataggtggcg ttcgatgcta 1800 ttcaaacgca ccggcctttt tcttcaagaa ctcaactcga agcggcatcg aagctt 1856 <210> 309 <211> 461 <212> PRT <213> Staphylococcus epidermidis <220> <223> Epidermin leader peptide-processing serine protease epiP precursor S08.060 <400> 309 Met Asn Lys Phe Lys Phe Phe Ile Val Phe Leu Ile Leu Ser Leu Val 1 5 10 15 Phe Leu Gln Asn Glu Tyr Ala Phe Gly Ser Ser Leu Asn Glu Glu Leu 20 25 30 Ser Tyr Tyr Ser Val Glu Tyr Asp Asn Ala Lys Thr Phe Lys Glu Ser 35 40 45 Ile Lys Gln Lys Asn Ile Glu Leu Thr Tyr Lys Ile Pro Glu Leu His 50 55 60 Thr Ala Gln Ile Lys Thr Ser Lys Ser Lys Leu Asn Ser Leu Ile Lys 65 70 75 80 Ser Asn Lys Asn Val Lys Phe Val Asn Pro Thr Cys Ser Thr Cys Val 85 90 95 Val Glu Lys Ser Val Lys Thr Gly Lys Asn Leu Asn Asn Lys Lys Asn 100 105 110 Gly Ser His Asp Leu Phe Asp Arg Gln Trp Asp Met Arg Lys Ile Thr 115 120 125 Asn Glu Gly Lys Ser Tyr Lys Leu Ser Pro Asp Arg Lys Lys Ala Lys 130 135 140 Val Ala Leu Val Asp Ser Gly Val Asn Ser Ser His Thr Asp Leu Lys 145 150 155 160 Ser Ile Asn Lys Ile Val Asn Glu Val Pro Lys Asn Gly Phe Arg Gly 165 170 175 Ser Glu Asn Asp Glu Ser Gly Asn Lys Asn Phe Glu Glu Asp Lys Leu 180 185 190 Asn His Gly Thr Leu Val Ala Gly Gln Ile Gly Ala Asn Gly Asn Leu 195 200 205 Lys Gly Val Asn Pro Gly Val Glu Met Asn Val Tyr Arg Val Phe Gly 210 215 220 Ser Lys Lys Ser Glu Met Leu Trp Val Ser Lys Gly Ile Ile Asp Ala 225 230 235 240 Ala Asn Asp Asp Asn Asp Val Ile Asn Val Ser Leu Gly Asn Tyr Leu 245 250 255 Ile Lys Asp Asn Gln Asn Lys Lys Lys Leu Arg Asp Asp Glu Lys Val 260 265 270 Asp Tyr Asp Ala Leu Gln Lys Ala Ile Asn Tyr Ala Gln Lys Lys Gly 275 280 285 Ser Ile Val Val Ala Ala Val Gly Asn Asp Gly Ile Asn Val Lys Lys 290 295 300 Val Lys Glu Ile Asn Lys Lys Arg Asn Leu Asn Ser Lys Thr Ser Lys 305 310 315 320 Lys Val Tyr Asp Ser Pro Ala Asn Leu Asn Asn Val Met Thr Val Gly 325 330 335 Ser Ile Asp Asp Asn Asp Tyr Ile Ser Glu Phe Ser Asn Tyr Gly Asn 340 345 350 Asn Phe Ile Asp Leu Met Thr Ile Gly Gly Ser Tyr Lys Leu Leu Asp 355 360 365 Lys Tyr Gly Lys Asp Ala Trp Leu Glu Lys Gly Tyr Met Gln Lys Gln 370 375 380 Ser Val Leu Ser Thr Ser Ser Asn Gly Arg Tyr Ile Tyr Gln Ser Gly 385 390 395 400 Thr Ser Leu Ala Ala Pro Lys Val Ser Gly Ala Leu Ala Leu Glu Ile 405 410 415 Asp Lys Tyr Gln Leu Lys Asp Gln Pro Glu Thr Ala Ile Glu Leu Phe 420 425 430 Lys Lys Lys Gly Ile Glu Lys Glu Lys Tyr Met Asp Lys Lys His Tyr 435 440 445 Gly Asn Gly Lys Leu Asp Val Tyr Lys Leu Leu Lys Glu 450 455 460 <210> 310 <211> 8700 <212> DNA <213> Staphylococcus epidermidis <220> <223> Epidermin leader peptide-processing serine protease epiP precursor S08.060 <400> 310 agatcttgtg ttatataact aaacaaattt ctccattcgt atttagaaaa ttgactttta 60 tcaagtttat ccaaatatat atttccagta tattctgtat ttaacccagc taatatattt 120 aataatgtac tttttccaca cccactttca cctataatat tgtagatata acctttatga 180 agatccaaac ttatagaatt tattatttgt ttattgtctt ttgtgaagtt caaatcattt 240 atttccattt tttgaacaaa gttattgtaa gttgttttaa tagttaatac ctcttctggt 300 tctttattta tttttaaaat tctatctgaa gatccaattg ctcgttgtac ttccgtccaa 360 taagatgtaa tagatactat tggattaata atttgaaata aatataaaac ataagcaaac 420 atatctccgc ttttcatcat attattttcc attaagtaat aacccaaaaa taaaatacca 480 aaaatgttaa taaatagaat taagttcata attggttcga aaaaagataa tactttgatc 540 ttatgtaact ctatatcgaa tatatttttt aatagggtat agttttttat tttttcgata 600 ttatatgtac ttaaagtttt tattaatttt attgtagata atctattact ataataagaa 660 gataatttag cagtagcttc ttgagattta cttgatactc ttttcattat atttcctata 720 ggtagtatta caattatcaa tataggtaat gtacacacta aatataatgt caaggttttg 780 ttaattatat ataaaaatat tagtgatact ataactgaaa ataaattcta cagaaaaaac 840 tctagttatg ttcatagtat cgtttactaa cctactagtt aagttacttg ctgagttttt 900 taagtgaaaa ctataaggta actttatcac tttattccat gtaacacttc taatgttttg 960 tattattttt tgacctatat atccaagaat ataagtagaa acaccagaaa atattaaagt 1020 cagaccaaaa catataataa tgattacaat tttatctgtt gataagctag atttgtttaa 1080 ggcatttcta attattaaag gaatgtataa tgaaaaacta gttccaatca aactaaatat 1140 tagtccaata cttaaaagta gagtgttagg tttggttatt ttccataaat catatagacc 1200 tttgataata tcatcacctt ttaaacttta tatcattaat ataatgttta ggaaaagtag 1260 aagaaaatta cacttttgta attttctgaa tatacatagt atttattttg ggggagtact 1320 aaaataataa ttgaaaaggg ttttataatc ctttttaata aatttttagg agtgtttaaa 1380 atggaagcag taaaagaaaa aaatgatctt tttaatcttg atgttaaagt taatgcaaaa 1440 gaatctaacg attcaggagc tgaaccaaga attgctagta aatttatatg tactcctgga 1500 tgtgcaaaaa caggtagttt taacagttat tgttgttaat tcagaagaat tagattggca 1560 gggcttcaat agaggctctg tcttaatttt gaggtgaaat agaattggat aatatatttg 1620 ttccatcgaa tatatatatg gtaagaactc ctatattttc aattgaatta tataatcaat 1680 tcttaaaatc tgacaatata gattatgact taattttaca aaacgatatt tttaaagaat 1740 ctataatgac aacgacatat aatctttatc aaagtattgg caaaatagac tgggaaaagg 1800 ataataaaaa aaccagaaat gtaaaagaaa gtttattaaa atatctcata agaatgagta 1860 ctagaagtac accatatgga atgctaagcg gtgtagcttt aggggaattt agtgaaaata 1920 ataatattaa aattaaggac tcttcgtttc ataaaaaaga tgtaaaaata gatgggcaat 1980 ggttatataa attagtccat tatttagaaa gcgattacac atattataaa gacagttttg 2040 tcatatggaa tcaacaaaat tatatttata acaatcgttt atatttagat aataattcat 2100 caatcactga aaataaaaga aatgatgtat tatctgtcaa atacaattct atattagtgt 2160 ttatacatga gaattctaaa aaaaatatta cttatgaaga acttgtacaa ttgatatcta 2220 gtaagtacag tatagaaaat aaagaagaag taaaagtatt tgttcaagaa ctcataaata 2280 aagaaattat attttctgat ttgagaccta cattagagaa taaaaatcct ttagattaca 2340 ttattaatag tttaaatcca aaaaatagtt tagttggaac acttattaat atttctaatg 2400 aaattacaaa atattctaaa atgcctttag gaaaaggaga atataaatat ttagatattg 2460 ttaatttaat gtcacaatta tttgtttcta aaaactattt gcaaatagat acctatatag 2520 attattcaag aaatgaatta aaacaaagtt tagctgataa tattagtgaa gcagcatata 2580 ttctctggtt attatctcct aatcattttg gtacaaaaac tattaggaat tatcacgaat 2640 tttttatgga taaatatgga tttgaacaac tagtaaattt aaagcaattg ctctcagata 2700 taaatggatt tggctatccc aaaaaagaca gttatagttt ttctaataac attgcatttt 2760 taaaagaaaa gtatttgctt gcaattcaaa ataacagcca tattgaaata acagaaaacg 2820 acgttaaaaa tttagaaaag aataatacag tttctaaaat caatgcgcct gtttcaactg 2880 aaatatatag tgagatatat tttggaaatt caataaaagg ttatgaggat tttgccgtga 2940 taagtccaat attaggatct tttaatgccg gtgcaacttt tggaaggttt acgggaaatt 3000 tcaatataaa gaaaaaaaat caattacaaa aagaaatagt gcatcattac aataattaca 3060 tgaatgaaaa tggtttagaa ataagccaat taaatgaagg tcctcttaac tcaagaaatg 3120 taaatatttt gaataataat agaatatata atacttgttt aaatttaaat ttacctaaaa 3180 gtgatataga tataaatgac atatttattg gagctacatt taacaaactt tatctatatt 3240 ctgaaaaaca tgattcaaga attgtattcg tatctaattc aatgtttaat tatgagtttg 3300 gatctgaatt atacaaattt ttaagagaaa tttcatttga aaaaacaaaa tttatacaac 3360 ctataactga agaaggcatt gactcattac ctttttgtcc aagaattatt tataaaaata 3420 ttattttaaa accagctact tggaaaataa attcagaaat gttttctgaa actgaaaatt 3480 ggttaaatag gttcgcaact attagagaaa aatggcatat tccaaaagat gtaattattg 3540 cttttggaga taatcgattg ctattaaatt tattaaatga caagcatctc attatactaa 3600 aaaaagaact aaaaaaacat ggtaggattc gaatattaga aagctttatc aatgaatcta 3660 ataatgagag aatgttagaa attgttacgc cattatataa aaaaactagt ttaaaagaac 3720 aatctttcat tatacctaaa aatagaaata agcacttcaa taatcttaaa gattggtttt 3780 caattcattt aagtattcct aaaacatacc aagataattt tattcaagat tatctattac 3840 catttataac ggaattaaaa gttaataatt ttattaataa atttttttac ataaaattta 3900 aagaagatga agattttata aaattaagat tattaagaga agatgaagat tattctcaaa 3960 tttattcttt cataaaaaat tggaaagatt attgcttatt aaatagtgaa ttatatgact 4020 attctatagt tgattatgtt cctgaagtat atagatatgg tggtccacac gtaattgaag 4080 atattgagaa tttttttatg tatgatagtc tattatcaat aaatataata caatcagagt 4140 tcaaaattcc aaaagaattt atcgttgcta tatcaataga ttttttatta gattatttag 4200 aaattaataa aagtgagaaa gaagaaattt taattaataa tgcggaagat ttatatcgta 4260 gtaatgacat aagagaatat aaaaatttat tagctaaact taccaatcct aaaaatgact 4320 atgaaatttt aaaaaaagaa tttccgaatc ttcatgaatt tctatttaat aaaattagta 4380 ttttagaaaa tcttaaaaag acactacaaa aaagcttata tacttcacgt tctaggataa 4440 ttggcagttt tatacacatg cgttgtaata gaatattcgg tattaatcct gaaaaagaaa 4500 aatttgtttt atctattttt aatgaaatta caaaaactaa aaaatattgg gatggttgtg 4560 attaatatta ataacattaa aaaaatttta gaaaataaaa tcaccttttt gtctgacatt 4620 gaaaaagcta catatattat agaaaatcaa agtgagtatt gggatcctta tactctatct 4680 catggttatc caggtataat acttttttta agcgcatcag aaaaagtatt tcataaagat 4740 ttagaaaaag taatacatca atatattaga aaactaggcc cttatttaga aagtggtatt 4800 gatggatttt cactttttag tggtctttcc ggaattggat ttgcgctaga cattgcgtct 4860 gataaacagt actcttatca aagtatctta gaacaaattg ataatttact tgttcaatat 4920 gtttttgatt ttttaaataa cgatgcattg gaagtaaccc ctactaacta tgatataata 4980 caaggatttt ctggtatagg aaggtacttg ttaaatagaa tatcgtataa ttataatgca 5040 aaaaaagcat taaagcatat acttaattac ttcaaaacaa ttcattactc taaagacaat 5100 tggttagttt caaatgaaca tcaattttta gatatagata agcaaaattt tccgtcagga 5160 aatataaatt taggattagc gcatggtatt ttaggtcctc tatcattaac agctttgagt 5220 aaaatgaatg ggattgaaat cgaaggccat gaagagtttt tacaagactt cacttcattt 5280 ttgctcaaac ctgaattcaa aaataataat gaatggttcg atcgctatga tatattagaa 5340 aattatatac ctaattattc cgtcagaaac ggttggtgtt acggtgatac agggattatg 5400 aatacattac ttttgtctgg taaagcctta aataatgaag gcttaattaa aatgtctaaa 5460 aatattttaa ttaacataat agataagaat aatgatgatt taatcagtcc aaccttctgt 5520 cacggactag catcgcactt aaccattatt catcaagcga ataaattctt taatctatct 5580 caagtaagca catatatcga taccattgtc agaaaaatta ttagtcatta ttctgaagaa 5640 agtagtttta tgttccaaga catagagtac tcatacggac aaaaaattta taaaaacaaa 5700 gtgggaattc tagagggtga attaggtgtt cttttagctt tactagatta tattgataca 5760 caaaaccaat caaggaaaaa ttggaaaaat atgtttttaa taacataata ggaggaataa 5820 gatatgtatg gaaaattatt gatatgcgct acagcatcga taaatgtaat taatattaat 5880 cactacatag ttgagttaaa gcaacatttt gatgaagtta atatattatt tagtcctagt 5940 agtaaaaatt ttataaatac tgatgttctc aagttatttt gtgataactt gtacgatgaa 6000 attaaagatc ctcttttaaa tcatatcaat attgtagaaa atcatgaata tattttagta 6060 ttacctgcat cagcaaatac tattaataaa atagctaatg gtatatgtga taatctttta 6120 actactgtat gtttaaccgg atatcaaaaa ttatttatat ttccaaatat gaacataaga 6180 atgtggggaa atccattttt acaaaaaaat attgatttac ttaaaaataa tgatgtgaaa 6240 gtgtattccc ctgatatgaa taaatcattc gaaatatcta gtggccgtta caaaaacaat 6300 atcacaatgc ctaatattga aaatgtacta aattttgtat taaataacga aaaaagacct 6360 ttggattaac aaaggtcttt tctaattaaa attttatatc cgagtttacg ttcattaata 6420 atttctatct ctttacaatt ttttaaacta tcccttaatc gatggatata tacatttatt 6480 gtattagaat caacaaagtc ttctgtatcc cacactccct tttttaattc ctcttttgat 6540 acatatcttc caagattaat atataagcac cgtagaattt ttaattctat attagaaaga 6600 ttaactaagt aattattaaa cacaaattga tggttttcaa agtctataaa atcatcatta 6660 acatatttaa tatacttttt tatttcattt aaaattctac ataatattaa acttttgctt 6720 tcattatttt ttataatata taaatctatg cctaaactat aaaaataaca cttcctacta 6780 tagctagtat tacctgttat tataactatt ggaatttttc ctataaattc ttttaaaaac 6840 gtataatact catcaaactt ttcatacaca attataaaat ttgggtctat atttgaagaa 6900 ttaattgtaa ttcttctatc taattctaaa atactttcaa taagaataga atctacctca 6960 ccgacaatat taatagaaat cattttattc ccttcattct ttaagtaatt tgtatacgtc 7020 tagttttcca ttaccataat gttttttatc catatatttt tctttttcta tccctttttt 7080 cttaaataac tctatagctg tttcgggttg gtcttttaat tgatacttat caatttctag 7140 tgctaaagct ccagaaacct tgggtgcagc aagtgatgtc cctgattgat atatgtatct 7200 tccattagaa gaagtactta aaacactttg tttttgcata tatccttttt ctaaccaagc 7260 atcttttcca tacttatcta aaagtttata agaacctcct atcgtcatta aatctataaa 7320 attatttcca taattagaaa actcagaaat ataatcatta tcatcgatgg atcctacagt 7380 cataacatta tttagatttg ctgggctatc atataccttt tttgatgttt tagaatttag 7440 atttcttttt ttatttattt cttttacttt ttttacattg ataccgtcat tacccacagc 7500 tgcaacaaca atactacctt ttttttgagc atagtttata gctttctgta gtgcatcgta 7560 atcaactttt tcatcatctc ttaatttttt tttattttga ttatctttaa ttaaataatt 7620 tcctaaacta acgttgatta catcattgtc atcatttgct gcatcaataa ttcctttaga 7680 tacccaaagc atttcacttt tctttgagcc aaatactcgg tatacattca tctctactcc 7740 agggtttaca ccttttaaat taccgtttgc tcctatttgt cctgctacta atgtaccatg 7800 attcaattta tcttcttcaa aatttttatt tcctgattca tcgttttcgc tacctctaaa 7860 accattttta ggcacttcat taactatctt atttatactc tttaaatctg tatgactact 7920 attcacacca gaatctacta aagcaacttt tgcttttttt ctatctggac ttagcttata 7980 acttttacct tcatttgtta tttttcgcat atcccattgt ctgtcaaata aatcatggct 8040 gccatttttt ttattattta aattttttcc tgtctttaca gatttttcaa ctacacaagt 8100 ggaacaggta ggatttacaa acttgacgtt tttattactc tttattagtg aatttaattt 8160 tgatttgcta gttttaattt gtgctgtatg tagttcagga attttataag ttaactcgat 8220 atttttttgt ttaatggatt ctttaaaagt ttttgcatta tcatattcaa cactataata 8280 acttaattct tcatttagtg aacttccaaa agcatactca ttttgcaaaa aaactaatga 8340 caatattaaa aaaacaatga aaaatttaaa tttgttcata tagcacctct aacatattat 8400 ttatattaaa cattaattta acacttatgt ttttactttt ttatttatat tatctttaat 8460 aatgttctgt tgcaagatga aaaatacgag gtatcaaagt accgatacag cgagtattac 8520 actcaattaa ttaaaaataa aatatgttgt gattaaaatt tattttataa aagtatgggc 8580 aatttattat tattcaagtt aaaacaaaga gtccgggaca taaagtttca gcctcttcgt 8640 cctaattacc aaaaaactta ctccaaaatc cttttttaga ttggtttttt ctaatttttt 8700 <210> 311 <211> 1052 <212> PRT <213> Cricetulus griseus <220> <223> Site-1 protease (Subtilisin/kexin-isozyme 1) S08.063 <400> 311 Met Lys Leu Ile Asn Ile Trp Leu Leu Leu Leu Val Val Leu Leu Cys 1 5 10 15 Gly Lys Lys His Leu Gly Asp Arg Leu Gly Lys Lys Ala Phe Glu Lys 20 25 30 Ala Ser Cys Pro Ser Cys Ser His Leu Thr Leu Lys Val Glu Phe Ser 35 40 45 Ser Thr Val Val Glu Tyr Glu Tyr Ile Val Ala Phe Asn Gly Tyr Phe 50 55 60 Thr Ala Lys Ala Arg Asn Ser Phe Ile Ser Ser Ala Leu Lys Ser Ser 65 70 75 80 Glu Val Asp Asn Trp Arg Ile Ile Pro Arg Asn Asn Pro Ser Ser Asp 85 90 95 Tyr Pro Ser Asp Phe Glu Val Ile Gln Ile Lys Glu Lys Gln Lys Ala 100 105 110 Gly Leu Leu Thr Leu Glu Asp His Pro Asn Ile Lys Arg Val Thr Pro 115 120 125 Gln Arg Lys Val Phe Arg Ser Leu Lys Phe Ala Glu Ser Asp Pro Ile 130 135 140 Val Pro Cys Asn Glu Thr Arg Trp Ser Gln Lys Trp Gln Ser Ser Arg 145 150 155 160 Pro Leu Arg Arg Ala Ser Leu Ser Leu Gly Ser Gly Phe Trp His Ala 165 170 175 Thr Gly Arg His Ser Ser Arg Arg Leu Leu Arg Ala Ile Pro Arg Gln 180 185 190 Val Ala Gln Thr Leu Gln Ala Asp Val Leu Trp Gln Met Gly Tyr Thr 195 200 205 Gly Ala Asn Val Arg Val Ala Val Phe Asp Thr Gly Leu Ser Glu Lys 210 215 220 His Pro His Phe Lys Asn Val Lys Glu Arg Thr Asn Trp Thr Asn Glu 225 230 235 240 Arg Thr Leu Asp Asp Gly Leu Gly His Gly Thr Phe Val Ala Gly Val 245 250 255 Ile Ala Ser Met Arg Glu Cys Gln Gly Phe Ala Pro Asp Ala Glu Leu 260 265 270 His Ile Phe Arg Val Phe Thr Asn Asn Gln Val Ser Tyr Thr Ser Trp 275 280 285 Phe Leu Asp Ala Phe Asn Tyr Ala Ile Leu Lys Lys Ile Asp Val Leu 290 295 300 Asn Leu Ser Ile Gly Gly Pro Asp Phe Met Asp His Pro Phe Val Asp 305 310 315 320 Lys Val Trp Glu Leu Thr Ala Asn Asn Val Ile Met Val Ser Ala Ile 325 330 335 Gly Asn Asp Gly Pro Leu Tyr Gly Thr Leu Asn Asn Pro Ala Asp Gln 340 345 350 Met Asp Val Ile Gly Val Gly Gly Ile Asp Phe Glu Asp Asn Ile Ala 355 360 365 Arg Phe Ser Ser Arg Gly Met Thr Thr Trp Glu Leu Pro Gly Gly Tyr 370 375 380 Gly Arg Val Lys Pro Asp Ile Val Thr Tyr Gly Ala Gly Val Arg Gly 385 390 395 400 Ser Gly Val Lys Gly Gly Cys Arg Ala Leu Ser Gly Thr Ser Val Ala 405 410 415 Ser Pro Val Val Ala Gly Ala Val Thr Leu Leu Val Ser Thr Val Gln 420 425 430 Lys Arg Glu Leu Val Asn Pro Ala Ser Val Lys Gln Ala Leu Ile Ala 435 440 445 Ser Ala Arg Arg Leu Pro Gly Val Asn Met Phe Glu Gln Gly His Gly 450 455 460 Lys Leu Asp Leu Leu Arg Ala Tyr Gln Ile Leu Ser Ser Tyr Lys Pro 465 470 475 480 Gln Ala Ser Leu Ser Pro Ser Tyr Ile Asp Leu Thr Glu Cys Pro Tyr 485 490 495 Met Trp Pro Tyr Cys Ser Gln Pro Ile Tyr Tyr Gly Gly Met Pro Thr 500 505 510 Ile Val Asn Val Thr Ile Leu Asn Gly Met Gly Val Thr Gly Arg Ile 515 520 525 Val Asp Lys Pro Glu Trp Arg Pro Tyr Leu Pro Gln Asn Gly Asp Asn 530 535 540 Ile Glu Val Ala Phe Ser Tyr Ser Ser Val Leu Trp Pro Trp Ser Gly 545 550 555 560 Tyr Leu Ala Ile Ser Ile Ser Val Thr Lys Lys Ala Ala Ser Trp Glu 565 570 575 Gly Ile Ala Gln Gly His Ile Met Ile Thr Val Ala Ser Pro Ala Glu 580 585 590 Thr Glu Ala Lys Asn Gly Ala Glu His Thr Ser Thr Val Lys Leu Pro 595 600 605 Ile Lys Val Lys Ile Ile Pro Thr Pro Pro Arg Ser Lys Arg Val Leu 610 615 620 Trp Asp Gln Tyr His Asn Leu Arg Tyr Pro Pro Gly Tyr Phe Pro Arg 625 630 635 640 Asp Asn Leu Arg Met Lys Asn Asp Pro Leu Asp Trp Asn Gly Asp His 645 650 655 Val His Thr Asn Phe Arg Asp Met Tyr Gln His Leu Arg Ser Met Gly 660 665 670 Tyr Phe Val Glu Val Leu Gly Ala Pro Phe Thr Cys Phe Asp Ala Thr 675 680 685 Gln Tyr Gly Thr Leu Leu Met Val Asp Ser Glu Glu Glu Tyr Phe Pro 690 695 700 Glu Glu Ile Ala Lys Leu Arg Arg Asp Val Asp Asn Gly Leu Ser Leu 705 710 715 720 Val Ile Phe Ser Asp Trp Tyr Asn Thr Ser Val Met Arg Lys Val Lys 725 730 735 Phe Tyr Asp Glu Asn Thr Arg Gln Trp Trp Met Pro Asp Thr Gly Gly 740 745 750 Ala Asn Ile Pro Ala Leu Asn Glu Leu Leu Ser Val Trp Asn Met Gly 755 760 765 Phe Ser Asp Gly Leu Tyr Glu Gly Glu Phe Ala Leu Ala Asn His Asp 770 775 780 Met Tyr Tyr Ala Ser Gly Cys Ser Ile Ala Lys Phe Pro Glu Asp Gly 785 790 795 800 Val Val Ile Thr Gln Thr Phe Lys Asp Gln Gly Leu Glu Val Leu Lys 805 810 815 Gln Glu Thr Ala Val Val Glu Asn Val Pro Ile Leu Gly Leu Tyr Gln 820 825 830 Ile Pro Ala Glu Gly Gly Gly Arg Ile Val Leu Tyr Gly Asp Ser Asn 835 840 845 Cys Leu Asp Asp Ser His Arg Gln Lys Asp Cys Phe Trp Leu Leu Asp 850 855 860 Ala Leu Leu Gln Tyr Thr Ser Tyr Gly Val Asn Pro Pro Ser Leu Ser 865 870 875 880 His Ser Gly Asn Arg Gln Arg Pro Pro Ser Gly Ala Gly Leu Ala Pro 885 890 895 Pro Glu Arg Met Glu Gly Asn His Leu His Arg Tyr Ser Lys Val Leu 900 905 910 Glu Ala His Leu Gly Asp Pro Lys Pro Arg Pro Leu Pro Ala Cys Pro 915 920 925 His Leu Ser Trp Ala Lys Pro Gln Pro Leu Asn Glu Thr Ala Pro Ser 930 935 940 Asn Leu Trp Lys His Gln Lys Leu Leu Ser Ile Asp Leu Asp Lys Val 945 950 955 960 Val Leu Pro Asn Phe Arg Ser Asn Arg Pro Gln Val Arg Pro Leu Ser 965 970 975 Pro Gly Glu Ser Gly Ala Trp Asp Ile Pro Gly Gly Ile Met Pro Gly 980 985 990 Arg Tyr Asn Gln Glu Val Gly Gln Thr Ile Pro Val Phe Ala Phe Leu 995 1000 1005 Gly Ala Met Val Ala Leu Ala Phe Phe Val Val Gln Ile Ser Lys Ala 1010 1015 1020 Lys Ser Arg Pro Lys Arg Arg Arg Pro Arg Ala Lys Arg Pro Gln Leu 1025 1030 1035 1040 Thr Gln Gln Thr His Pro Pro Arg Thr Pro Ser Val 1045 1050 <210> 312 <211> 4198 <212> DNA <213> Cricetulus griseus <220> <223> Site-1 protease (Subtilisin/kexin-isozyme 1) S08.063 <400> 312 tgttcgcggc agaggcgccg ttcccccggg cccgccgacc tcgagcctga ggcggacgca 60 ggtcggccct cagagtggtt tcttgggcat ccccactaga tttgggtctg tggtgcaaat 120 ggagtctagg actcagtcga ctctgcccta atgagagaag cccctgtcca agatggagaa 180 gaagcggaga aagaaatgaa agcctctttt tgggccaagc tgtgggtgac catgggactg 240 aggttttctt tacgttggac aagtctgtag gatggctgat cagtaaggtt gcagctttta 300 gccaaaacag aaattcactt ctgatcaagg aagaacctag tgcgatttga atttatgcaa 360 ttttatgacc atattcactt aggaccatga agctcatcaa catctggctt cttctgctgg 420 tggttttgct ctgtggaaag aagcatctgg gtgacaggct ggggaagaaa gcgtttgaaa 480 aggcatcatg ccctagctgt tcccacctga ctttgaaggt ggaattctcc tcaactgtgg 540 tggaatatga atatattgtg gctttcaacg gatacttcac agccaaagct agaaactcat 600 ttatttcaag tgctctgaaa agcagtgaag tagacaactg gagaattata cctcggaaca 660 acccatccag tgactaccct agtgattttg aggtgattca gataaaagag aagcagaagg 720 ccgggctgct cacacttgaa gatcatccaa acatcaagcg ggtgacacct caacgcaaag 780 tctttcgttc cttgaagttt gctgaatctg accccattgt gccatgtaat gaaactcggt 840 ggagccagaa gtggcagtca tcacgacccc tgagaagagc cagtctctcc ctgggctctg 900 gattctggca tgcaacagga agacattcaa gccggcgatt gctgagagcc attcctcgac 960 aggttgccca gacattgcag gcagatgtgc tgtggcagat gggatacaca ggtgctaatg 1020 tcagggttgc tgtttttgat actgggctca gtgagaagca tccacacttc aagaatgtga 1080 aggagagaac caactggacc aatgagcgga ccctggatga tgggctgggc catggcacat 1140 ttgtcgcagg tgtgattgcc agcatgaggg agtgccaggg atttgcccca gatgcagagc 1200 tgcacatctt ccgggtcttt accaacaatc aggtgtctta cacatcttgg tttttggacg 1260 ctttcaacta tgccatccta aagaagattg atgttctaaa ccttagcatc ggcgggcctg 1320 acttcatgga tcatcccttt gttgacaagg tgtgggaatt aacagctaac aatgtaatca 1380 tggtttctgc tatcggcaat gatggacctc tttatggcac tctgaataac ccagctgatc 1440 agatggatgt gattggagtg ggtggcattg actttgaaga taacatcgcc cgcttttctt 1500 ccaggggaat gactacctgg gaactaccag gaggctatgg tcgcgtgaaa cctgacattg 1560 tcacctatgg tgccggagtg cggggttccg gtgtgaaagg gggctgccgg gcactctcag 1620 ggaccagtgt cgcttcccca gtggttgctg gggctgtcac cttgttagta agcacagtgc 1680 agaagcggga gctagtgaat cctgccagtg tgaagcaagc cctgattgca tcagcccgga 1740 ggcttcctgg tgttaacatg ttcgagcaag gccatggcaa gctggatctg ctgcgagcct 1800 atcagatcct cagcagctac aaaccacagg cgagcttgag tcctagctac atcgacctga 1860 ctgagtgtcc ctacatgtgg ccttactgtt ctcagcccat ctactatgga ggaatgccaa 1920 caattgttaa tgtcaccatc ctcaatggca tgggagtcac aggaagaatt gtggataagc 1980 ctgagtggcg gccctattta ccacagaatg gagacaacat tgaagtggcc ttctcctact 2040 cctcagtgtt atggccttgg tcaggctacc tggccatctc catttctgtg accaagaagg 2100 cagcttcctg ggaaggcatt gcacagggtc acatcatgat cacggtggct tccccagcag 2160 agacggaagc aaaaaatggt gccgagcata cttccacagt gaagcttccc attaaggtga 2220 agatcattcc cacccctcct cggagcaaga gagtcctctg ggaccagtat cacaacctcc 2280 gctacccccc aggctacttt cccagggaca acttgcggat gaagaatgat cctttagact 2340 ggaatggcga ccatgtccac accaatttca gggacatgta ccagcacctg cgcagcatgg 2400 gctacttcgt ggaggtgctc ggtgccccat tcacgtgctt tgatgctaca cagtatggca 2460 ctttgctcat ggtggatagt gaagaagagt acttcccaga ggagattgcc aagctgagga 2520 gggacgtgga caatggcctt tccctcgtca tcttcagtga ctggtacaac acttctgtta 2580 tgagaaaagt gaagttttac gatgaaaaca caaggcagtg gtggatgcca gatactggag 2640 gagccaacat cccagctctg aacgagctgc tgtctgtgtg gaacatgggg ttcagcgatg 2700 gcctttatga aggggagttt gccctggcga atcatgacat gtattatgca tcgggatgca 2760 gcatcgccaa gtttccagaa gatggtgttg tgatcacaca gactttcaag gaccaaggat 2820 tggaggtctt aaaacaagag acagcagttg ttgaaaatgt tcccattttg gggctttatc 2880 agattccagc tgaaggtggg ggccggatcg tgttgtatgg agattccaat tgcttggatg 2940 acagtcacag acagaaggat tgcttttggc ttctggatgc actccttcag tacacatcat 3000 atggcgtgaa ccctcccagc ctcagccatt cagggaaccg gcagcgccca cccagtggag 3060 ctggcttggc ccctcctgaa aggatggaag gaaaccacct tcatcgatac tccaaggttc 3120 ttgaggccca tctgggagac ccaaaacctc ggcctcttcc agcctgtcca cacttgtcat 3180 gggccaagcc acagcctttg aatgagactg cgcccagtaa tctttggaaa catcagaagc 3240 tgctctccat tgacctggac aaagtagtgt tacccaactt tcgatcgaat cgccctcaag 3300 tgagaccttt gtcccctgga gaaagtggtg cctgggacat tcctggaggg atcatgcctg 3360 gccgctacaa ccaagaggtg ggccagacca tccctgtctt tgccttcctc ggagccatgg 3420 tggccctggc cttctttgtg gtacagatca gcaaggccaa aagccggccg aagcggagga 3480 ggcccagggc aaagcgtcca cagcttacac agcagaccca cccaccaagg accccgtcag 3540 tgtgatcatc acagtggcca gccacagaag ccaacaagcc ttggaccact ctgatggcca 3600 cacagggcat cagaagagca tcctgggagg tgcctatttc caagggaccc catctccagc 3660 ttgtggctgg gttagtgtgt tctccccagg catctctgag ttacatcctg aagtacctca 3720 ctgtgctggg ctcttgacag gaggtgctca gtagctcagc ctccagtggt gtcagcaggc 3780 ccagtgacag tgcaccaaag acacagagcc tggaagggct gtcgggacac actttctaca 3840 taaagcttac aatcctgacc aagcgaagaa atgcttgtta caggctattt tctatattta 3900 ttgtggggag agtcacttta aagacttgta ctgtttggaa gcaaagctgt tgtgtttgtc 3960 agttgagtgc agttttctgc agtgacatca taaggagtca gatcccatga cctttttgat 4020 gagaggacag actgaactga agggcatgtg cacagatctg ggaaatgcaa gccttcgctt 4080 tatttttata agtatcaact gccatcatgt tttgtaattt ggggtcttga tttcaccatt 4140 gttggtgaaa gaaattttca ataaatatgc ataaccttaa aaaaaaaaaa aaaaaaaa 4198 <210> 313 <211> 409 <212> PRT <213> Hypocrea lixii <220> <223> Alkaline proteinase precursor (ALP) S08.066 <400> 313 Met Thr Ser Ile Arg Arg Leu Ala Leu Tyr Leu Gly Ala Leu Leu Pro 1 5 10 15 Ala Val Leu Ala Ala Pro Ala Ala Leu His Lys Lys Pro Glu Ala Val 20 25 30 Pro Asn Lys Phe Ile Val Thr Leu Lys Glu Gly Ala Ser Ile Asp Thr 35 40 45 Asp Ser His Leu Ala Trp Val Thr Asp Ile His Thr Arg Ser Leu Thr 50 55 60 Lys Arg Ser Thr Ala Gly Val Glu Lys Thr Tyr Asn Ile His Thr Trp 65 70 75 80 Asn Ala Tyr Ala Gly Glu Phe Asp Glu Glu Thr Ile Glu Gln Ile Lys 85 90 95 Ser Asn Pro Asp Val Ala Ser Val Glu Pro Asp Tyr Ile Met His Leu 100 105 110 Ser Asp Ile Val Glu Asp Lys Arg Ala Leu Thr Thr Gln Ser Gly Ala 115 120 125 Pro Trp Gly Leu Gly Thr Val Ser His Arg Thr Ser Gly Ser Thr Ser 130 135 140 Tyr Ile Tyr Asp Ser Ser Ala Gly Ala Gly Thr Phe Ala Tyr Val Val 145 150 155 160 Asp Ser Gly Ile Asn Thr Ser His Gln Gln Phe Gly Gly Arg Ala Ser 165 170 175 Leu Gly Tyr Asn Ala Ala Gly Gly Gln His Val Asp Thr Leu Gly His 180 185 190 Gly Thr His Val Ser Gly Thr Ile Gly Gly Ser Thr Tyr Gly Val Ala 195 200 205 Lys Gln Ala Ser Leu Ile Ser Val Lys Val Phe Ala Gly Glu Ser Ala 210 215 220 Ser Thr Ser Val Ile Leu Asp Gly Tyr Asn Trp Ala Val Asn Asp Ile 225 230 235 240 Val Ser Lys Ser Arg Ala Ser Lys Ser Ala Ile Asn Met Ser Leu Gly 245 250 255 Gly Pro Ala Ser Ser Thr Trp Thr Thr Ala Ile Asn Ala Ala Phe Asn 260 265 270 Gln Gly Val Leu Thr Ile Val Ala Ala Gly Asn Gly Asp Ser Leu Gly 275 280 285 Asn Pro Gln Pro Val Ser Gly Thr Ser Pro Ala Asn Val Pro Asn Ala 290 295 300 Ile Thr Val Ala Ala Leu Asp Ile Asn Trp Arg Thr Ala Ser Phe Thr 305 310 315 320 Asn Tyr Gly Ala Gly Val Asp Val Phe Ala Pro Gly Val Asn Ile Leu 325 330 335 Ser Ser Trp Ile Gly Ser Asn Thr Ala Thr Asn Thr Ile Ser Gly Thr 340 345 350 Ser Met Ala Thr Pro His Val Val Gly Leu Ala Leu Tyr Leu Gln Ser 355 360 365 Leu Glu Gly Leu Thr Ser Pro Thr Ala Val Thr Asn Arg Ile Lys Ala 370 375 380 Leu Ala Thr Ser Gly Arg Val Thr Gly Ser Leu Asn Gly Ser Pro Asn 385 390 395 400 Val Ile Ile Phe Asn Gly Asn Ser Ser 405 <210> 314 <211> 1458 <212> DNA <213> Hypocrea lixii <220> <223> Alkaline proteinase precursor (ALP) S08.066 <400> 314 ctcctccact atacaaagca catcacagcc atgaccagca ttcgtcgtct cgctctctat 60 cttggagctt tgctcccggc tgtcctcgct gctcctgcag ctcttcacaa gaagcctgaa 120 gccgtaccca acaagttcat cgtcactctt aaagagggtg cttctattga taccgactct 180 catctcgcct gggtaacgga catccacacc cgttcgttga ccaagcgtag cactgctggt 240 gttgaaaaga cttataacat tcatacttgg aatgcttatg cgggcgagtt tgacgaggag 300 acaattgagc agatcaagtc caaccccgat gttgcgtctg ttgagccaga ctacatcatg 360 catctgtcgg acattgttga agacaagcgt gctctgacca cacaatctgg tgctccttgg 420 ggtctcggca ctgtgtccca tcgcacatct ggatccacaa gctacattta tgatagctca 480 gccggcgccg gcacctttgc ctatgtggtt gactctggta tcaacacttc tcatcagcaa 540 ttcggcgggc gtgccagcct tggctacaat gctgcaggag gacagcatgt cgatactctt 600 ggccatggta ctcatgtttc cggaacaatt ggtggatcta catacggtgt tgctaagcag 660 gcgagcctaa tctctgtcaa ggtctttgct ggtgaaagtg cttccacctc tgttatcctt 720 gacggctata actgggctgt aaacgacatc gtctcgaaaa gccgtgctag caagtctgct 780 attaacatgt cgcttggagg acctgcctca tctacctgga cgaccgccat taacgcagcc 840 tttaaccagg gcgtgcttac cattgtcgcc gctggtaatg gcgactctct gggaaacccc 900 cagccagtct ccggcacttc tcctgctaac gttcctaacg ccataaccgt tgccgcattg 960 gacatcaact ggcgcactgc ttccttcacc aactatggtg ctggcgttga tgtttttgcc 1020 cctggcgtca acattctgtc gtcatggatt ggatccaaca ctgctaccaa cacaatcagc 1080 ggtacttcca tggctacacc tcacgttgtt ggcctggccc tctatcttca atctctcgag 1140 ggtctcacct ctccgaccgc tgtcactaac cgaattaaag ctctggctac atctggtcgt 1200 gtaaccggaa gcctcaacgg cagccccaac gttatcatct tcaacggaaa cagttcttaa 1260 atcgttgatg gagcgaagga tgaagtgaaa tgttcatgga agggcagcac agctgttgct 1320 tggcttgctt agctcattta agaagctaat caccatgatg gagtgcgatg ggtatataag 1380 cttctacagc gttttcaact tagctagatg accctctata gatcgctaaa acaaaaagat 1440 atgacagata cctgtgct 1458 <210> 315 <211> 1045 <212> PRT <213> Serratia marcescens <220> <223> Extracellular serine protease precursor S08.094 <400> 315 Met Ile Leu Asn Lys Arg Leu Lys Leu Ala Tyr Cys Val Phe Leu Gly 1 5 10 15 Cys Tyr Gly Leu Ser Ile His Ser Ser Leu Ala Ala Tyr Gln Asp Pro 20 25 30 Gly Arg Leu Gly Ala Pro Asp Ser Trp Lys Thr Ala Glu Phe Asn Arg 35 40 45 Gln Trp Gly Leu Glu Ala Ile Ser Ala Glu Phe Ala Tyr Ala Arg Gly 50 55 60 Tyr Thr Gly Lys Gly Ile Thr Ile Gly Val Ile Asp Asn Ala Ile Leu 65 70 75 80 Ser His Ser Glu Phe Ser Gly Lys Leu Thr Arg Leu Asp Asn Gly Ser 85 90 95 Tyr Asn Phe Ser Tyr Asp Lys Gln Asp Asn Met Ser Phe Gly Asp His 100 105 110 Gly Thr His Val Ala Gly Ile Ala Ala Ala Lys Arg Asp Gly Ala Gly 115 120 125 Met His Gly Val Ala Phe Asp Ala Asp Ile Ile Gly Thr Lys Leu Asn 130 135 140 Asp Tyr Gly Asn Arg Asn Gly Arg Glu Glu Leu Ile Gln Ser Ala Ala 145 150 155 160 Arg Val Ile Asn Asn Ser Trp Gly Ile Ala Pro Asp Ile Arg Arg Asp 165 170 175 Ala Lys Gly Asp Ile Ile Trp Leu Pro Asn Gly Arg Pro Asp Tyr Val 180 185 190 Ala Phe Val Lys Ser Glu Val Ile Ala Glu Met Met Arg Ser Lys Ser 195 200 205 Ser Val Glu Trp Gly Ser Glu Gln Pro Val Pro Thr Gly Gly His Ser 210 215 220 Ala Met Ser Thr Leu Leu Arg Ala Ala Arg His Gly Lys Leu Ile Val 225 230 235 240 Phe Ser Ala Gly Asn Tyr Asn Asn Tyr Asn Ile Pro Glu Ala Gln Lys 245 250 255 Ser Leu Pro Tyr Ala Phe Pro Asp Val Leu Asn Asn Tyr Leu Ile Val 260 265 270 Thr Asn Leu Ser Asp Glu Asn Gln Leu Ser Val Ser Ser Thr Ser Cys 275 280 285 Gly Gln Thr Ala Ser Tyr Cys Val Ser Ala Pro Gly Ser Asp Ile Tyr 290 295 300 Ser Thr Val Gly Arg Leu Glu Ser Asn Thr Gly Gly Ala Val Asn Arg 305 310 315 320 Glu Ala Tyr Asn Lys Gly Glu Leu Ser Leu Asn Pro Gly Tyr Gly Asn 325 330 335 Lys Ser Gly Thr Ser Met Ala Ala Pro His Val Thr Gly Val Ala Ala 340 345 350 Val Leu Met Gln Arg Phe Pro Tyr Met Ser Ala Asp Gln Ile Ser Ala 355 360 365 Val Ile Lys Thr Thr Ala Thr Asp Leu Gly Val Ala Gly Ile Asp Asn 370 375 380 Leu Phe Gly Trp Gly Arg Val Asn Leu Arg Asp Ala Ile Asn Gly Pro 385 390 395 400 Lys Met Phe Ile Thr Lys Glu Asp Ile Pro Gln Glu Tyr Tyr Val Pro 405 410 415 Gly Ser Tyr Ser Glu Lys Gln Phe Val Val Asn Ile Pro Gly Leu Gly 420 425 430 Asn Ile Val Glu Pro Gly Thr Pro Val Glu Arg Arg Cys Thr Ser Ser 435 440 445 Glu Cys Ser Phe Asp Ser Trp Ser Asn Asp Ile Ser Gly His Gly Gly 450 455 460 Leu Thr Lys Thr Gly Ala Gly Thr Leu Ala Leu Leu Gly Asn Asn Thr 465 470 475 480 Tyr Arg Gly Asp Thr Trp Val Lys Gln Gly Val Leu Ala Ile Asp Gly 485 490 495 Ser Val Ala Ser Asn Val Tyr Ile Glu Asn Ser Gly Thr Leu Ser Gly 500 505 510 Glu Gly Thr Val Gly Ala Phe Arg Ala Ala Arg Ser Gly Ser Val Ala 515 520 525 Pro Gly Asn Gly Ile Gly Thr Leu His Val Leu His Asp Ala Ile Phe 530 535 540 Asp Arg Gly Ser Gln Tyr Asn Val Glu Val Ala Asp Asn Gly Arg Ser 545 550 555 560 Asp Lys Ile Ala Ala Arg Arg Ala Phe Leu Asn Gly Gly Ser Val Asn 565 570 575 Val Ser Leu Glu Arg Ser Gln Asn Leu Leu Ser Gln Asn Glu Ala Gln 580 585 590 Ser Leu Leu Gly Asn Lys Tyr Thr Ile Leu Thr Thr Thr Asp Gly Val 595 600 605 Thr Gly Arg Phe Glu Asn Ala Asn Pro Ser Tyr Pro Phe Val Lys Val 610 615 620 Ala Leu Asp Tyr Arg Gly Asn Asp Val Gly Leu Gly Ile Thr Arg Thr 625 630 635 640 Asp Ala Ser Phe Asp Ser Leu Ala Ser Thr Glu Asn Glu Lys Ala Val 645 650 655 Ala Arg Ala Val Glu Thr Leu Asn Ala Thr Glu Pro Val Thr Glu Thr 660 665 670 Ala Lys Arg Ser Val Ala Ile Pro Ala Ala Glu Glu Ala Asn Leu Leu 675 680 685 Gln Ser Asp Gly Gly Glu Ala Gln Ala Val Asn Glu Glu Ala Ser Ile 690 695 700 Val Ala Gly His Pro Ile Tyr Glu Ser Phe Leu Gly Phe Thr Ser Ala 705 710 715 720 Arg Glu Leu Gln Gln Ala Thr Arg Gln Leu Ser Gly Gln Ile His Ala 725 730 735 Asp Met Ala Ser Ala Gln Ile Asn Glu Ser Arg Tyr Leu Arg Asp Thr 740 745 750 Ala Thr Glu Arg Leu Arg Gln Ala Glu Gly Arg Arg Thr Ala Thr Asp 755 760 765 Ile Lys Ala Asp Asp Asn Gly Ala Trp Ala Lys Leu Leu Gly Ser Trp 770 775 780 Gly His Ala Ser Gly Asn Asp Asn Ala Thr Gly Tyr Gln Thr Ser Thr 785 790 795 800 Tyr Gly Val Leu Leu Gly Leu Asp Ser Glu Leu Phe Gly Asp Gly Arg 805 810 815 Leu Gly Met Met Thr Gly Tyr Thr Arg Thr Ser Leu Asp Gly Gly Tyr 820 825 830 Gln Ser Asp Ala His Ser Asp Asn Tyr His Leu Gly Leu Tyr Gly Asp 835 840 845 Lys Arg Phe Gly Ala Leu Ala Leu Arg Ala Gly Gly Thr Tyr Thr Trp 850 855 860 His Arg Ile Asp Thr Ser Arg Ser Val Asn Tyr Gly Ala Gln Ser Asp 865 870 875 880 Arg Glu Lys Ala Lys Tyr Asn Ala Arg Thr Gly Gln Leu Phe Ile Glu 885 890 895 Ser Gly Tyr Asp Trp Thr Ser Asp Ala Val Asn Leu Glu Pro Phe Ala 900 905 910 Asn Leu Ala Tyr Thr His Tyr Arg Asn Glu Glu Ile Asn Glu Gln Gly 915 920 925 Gly Ala Ala Ala Leu Arg Gly Asp Lys Gln Ser Gln Ser Ala Thr Ala 930 935 940 Ser Thr Leu Gly Leu Arg Ala Asp Thr Glu Trp Gln Thr Asp Ser Val 945 950 955 960 Ala Ile Ala Leu Arg Gly Glu Leu Gly Trp Gln His Gln Tyr Gly Lys 965 970 975 Leu Glu Arg Lys Thr Gln Leu Met Phe Lys Arg Thr Asp Ala Ala Phe 980 985 990 Asp Val Asn Ser Val Pro Val Ser Arg Asp Gly Ala Ile Leu Lys Ala 995 1000 1005 Gly Val Asp Val Ser Ile Asn Lys Asn Ala Val Leu Ser Leu Gly Tyr 1010 1015 1020 Gly Gly Gln Leu Ser Ser Asn His Gln Asp Asn Ser Val Asn Ala Gly 1025 1030 1035 1040 Leu Thr Trp Arg Phe 1045 <210> 316 <211> 3675 <212> DNA <213> Serratia marcescens <220> <223> Extracellular serine protease precursor S08.094 <400> 316 gatccttacg cccggtcccg atggtcggtc attccggcgc aacgggcgaa acgtacattc 60 gcctcctctc cagacgtcct gcgccatagc cgcggcgcga tggcatccct ttgtctgtcc 120 gcgcccattt gcatctctca gcatgtctgt tcgtgcggcc cgcgccgggt ccgcatgtgt 180 tatccgtcgt ttcacgatca taggaggttt cagcgcggtt aaaacgtaag ttttcttctg 240 ggtataaata aacatggagc gtaaaatgat acttaataaa agattgaagt tagcgtattg 300 cgtttttctg ggttgttatg gcttatccat tcattcttct cttgccgctt atcaggatcc 360 cggtcgattg ggcgcgcctg acagttggaa aaccgcggag tttaatcgcc aatgggggct 420 tgaagctatt tccgccgaat tcgcctatgc cagaggctat accggaaaag gtataaccat 480 cggcgttatc gataacgcta ttctttccca ttctgaattc tccggtaaac tgacgcgcct 540 ggataacggc agttataatt tctcgtatga taaacaagat aatatgtctt tcggcgatca 600 cggcacgcac gtagccggta tcgctgcggc taaaagagat ggcgcaggca tgcacggcgt 660 cgctttcgac gcggatatta tcggcaccaa attgaatgat tacggtaatc gcaacggccg 720 tgaagagctg attcagagcg cggctcgcgt catcaataac agctggggga tcgcgccgga 780 tatccggcga gacgccaaag gcgatatcat ctggttgccg aacggcaggc cggactacgt 840 ggcattcgta aaaagcgaag tgatcgccga gatgatgcgc agcaaatcca gcgtggaatg 900 gggcagcgaa caaccggtgc ccaccggcgg gcacagcgcc atgtcgacgc tgctgcgggc 960 ggccaggcac ggcaagctga tcgtcttctc ggcgggcaat tacaacaatt acaatattcc 1020 ggaagcgcaa aagtcactgc cttacgcttt cccggacgta ctgaataatt acctgattgt 1080 gaccaacctg agtgacgaaa atcagttaag cgtttcctcg accagctgcg ggcaaacggc 1140 cagctattgt gtttccgcgc cgggttctga tatttacagc accgtcggcc ggctggagtc 1200 caataccggc ggcgccgtga atcgcgaagc ttataataag ggcgagctgt cgcttaatcc 1260 tggttacggc aacaaatccg gcacctcaat ggcggcgccg catgtgaccg gcgtcgccgc 1320 cgtattgatg cagcgcttcc catatatgag cgccgatcaa atatctgcag tcattaaaac 1380 caccgccacc gatttaggcg ttgccggcat tgataattta ttcggctggg ggcgcgtcaa 1440 tttacgcgat gcgatcaacg gcccgaaaat gtttattacc aaagaggata tcccgcagga 1500 atattatgtg ccgggttcct acagtgagaa acagtttgtg gtgaatatcc ccggcctggg 1560 aaatatcgtc gaacccggca cgccggttga gcggcgctgc acgtcgagcg aatgcagttt 1620 cgattcgtgg agtaacgaca tcagcgggca cggcggcttg accaaaacgg gcgccggtac 1680 gctggcgctg ttgggtaata acacctatcg cggtgatacc tgggtgaaac agggcgtgtt 1740 ggcgatcgac ggttcggtgg catccaacgt ctatatcgaa aatagcggca cattgtccgg 1800 cgagggcacc gtaggcgcct tcagagcggc tcggagcggc agcgtcgcgc cgggcaacgg 1860 catcggcacg ctgcatgtgt tgcacgatgc catttttgat cgcggttcgc agtataacgt 1920 ggaagtggcg gacaatggcc gcagcgataa gatcgccgcg cggcgcgctt tcctcaacgg 1980 cggcagtgtg aatgtcagcc tggaacgcag ccaaaacctg ctgtcgcaga atgaggcgca 2040 gagtctgctg ggcaacaagt acaccatcct gaccacgacg gacggcgtta ccggtagatt 2100 cgaaaacgcc aacccatcgt atccgtttgt taaagtcgcg ctggattatc ggggcaatga 2160 cgtcggcctt ggcatcacgc gcaccgacgc cagctttgac agcctggcca gcactgagaa 2220 cgagaaagcg gtagctcgtg cggtggagac gctcaacgcg acggaaccgg tcacggaaac 2280 ggccaaacgc agcgtggcga tcccggcggc cgaagaggcc aacctgctgc aaagcgatgg 2340 gggcgaggcg caagccgtga acgaagaggc gagcatcgtg gcgggccatc cgatctatga 2400 aagcttcctc ggcttcacct cggccagaga attgcaacag gcgacccgtc aactgtccgg 2460 ccagatccac gcggatatgg cttccgccca gatcaacgaa agccgttacc tgcgcgatac 2520 cgccaccgag cgcttgcgcc aggcggaagg ccgccgcacc gctaccgaca ttaaagcgga 2580 tgacaacggc gcctgggcga aactgctggg tagctggggg catgcttccg gcaacgacaa 2640 cgccaccggt taccagacct ccacctatgg cgtgctgtta ggtctggaca gcgaactgtt 2700 tggcgacggc cggcttggca tgatgaccgg gtatacccgc acttcgctgg atggaggtta 2760 tcagtcagat gctcacagcg acaactacca tctggggctg tacggcgaca aacgcttcgg 2820 cgcgttggcg ctgcgagcgg gcggcaccta tacctggcat cgcatcgaca cctcgcgttc 2880 ggtgaactac ggcgcgcagt cggatcgcga gaaggccaag tataacgcgc gcaccggtca 2940 gctgttcatc gaaagcggct acgattggac gagcgatgcg gtcaaccttg agccgttcgc 3000 caacctggcg tatacccatt accgtaacga ggagatcaac gagcaaggcg gggcagcggc 3060 gctgcgcggc gacaaacaaa gtcagtccgc caccgcctcg acgttgggtc tgcgcgccga 3120 caccgagtgg caaaccgaca gcgtggcgat cgcgctgcgc ggcgagctgg gttggcagca 3180 tcagtacggc aagctggagc gtaaaacgca gctgatgttc aaacgcactg atgcggcgtt 3240 cgacgtgaac agcgtgcctg tttctcgcga tggcgcgatt ctgaaagcgg gcgtcgatgt 3300 atcgattaac aaaaacgccg tcctgtccct tggctacggc gggcagctgt cgtccaacca 3360 ccaggacaac agcgtcaacg ccggtctgac ctggcgcttc tgatcgcggt tgcatgcttt 3420 gctttattca gccctcatcg agacgatggg ggcttttttt tcgcggccag ccggccttct 3480 gcggcatgag cgatactttc tccgcgacct attcccccgg ccggtgttcg ccgccgggtt 3540 aatcaatcag aggaaaacaa acgctgctgc caatagcgca attgcgtcag cgtgatcggc 3600 gcagcggcgg caatgaccgc gcgattttcc aacgcaatct cccgcgcacg ttgcaacggc 3660 tcggcgctga ggcct 3675 <210> 317 <211> 1441 <212> PRT <213> Drosophila melanogaster <220> <223> Tripeptidyl-peptidase II (TPP-II) S08.090 <400> 317 Met Phe Asn Arg Phe Arg Leu Val His Lys Gln Leu Arg Leu Tyr Lys 1 5 10 15 Asn Phe Gly Leu Leu Gly Gln Lys Ala Ser Val Gly Leu Thr Leu Pro 20 25 30 Ile Ile Ser Leu Ser Arg Pro Tyr Met Ala Tyr Met Gly Thr Glu Arg 35 40 45 Ser Val Val Met Ile Thr Ala Pro Ala Thr Lys Glu Phe Ala Glu Ser 50 55 60 Ser Glu Arg Ser Asn Ser Ser Lys Lys Thr Thr Asn Lys Glu Gln Ser 65 70 75 80 Asp Lys Ser Ala Glu Ser Arg Met Ala Thr Ser Gly Ile Val Glu Ser 85 90 95 Phe Pro Thr Gly Ala Leu Val Pro Lys Ala Glu Thr Gly Val Leu Asn 100 105 110 Phe Leu Gln Lys Tyr Pro Glu Tyr Asp Gly Arg Asp Val Thr Ile Ala 115 120 125 Ile Phe Asp Ser Gly Val Asp Pro Arg Ala Thr Gly Leu Glu Thr Leu 130 135 140 Cys Asp Gly Lys Thr Val Lys Val Ile Glu Arg Tyr Asp Cys Ser Gly 145 150 155 160 Cys Gly Asp Val Asp Met Lys Lys Lys Val Thr Pro Asp Glu Asn Gly 165 170 175 Asn Ile Lys Gly Leu Ser Gly Asn Ser Leu Lys Leu Ser Pro Glu Leu 180 185 190 Met Ala Leu Asn Thr Asp Pro Glu Lys Ala Val Arg Val Gly Leu Lys 195 200 205 Ser Phe Ser Asp Leu Leu Pro Ser Lys Val Arg Asn Asn Ile Val Ala 210 215 220 Gln Ala Lys Leu Lys His Trp Asp Lys Pro His Lys Thr Ala Thr Ala 225 230 235 240 Asn Ala Ser Arg Lys Ile Val Glu Phe Glu Ser Gln Asn Pro Gly Glu 245 250 255 Ala Ser Lys Leu Pro Trp Asp Lys Lys Ile Leu Lys Glu Asn Leu Asp 260 265 270 Phe Glu Leu Glu Met Leu Asn Ser Tyr Glu Lys Val Tyr Gly Asp Ile 275 280 285 Lys Thr Ser Tyr Asp Cys Ile Leu Phe Pro Thr Ala Asp Gly Trp Leu 290 295 300 Thr Ile Val Asp Thr Thr Glu Gln Gly Asp Leu Asp Gln Ala Leu Arg 305 310 315 320 Ile Gly Glu Tyr Ser Arg Thr His Glu Thr Arg Asn Val Asp Asp Phe 325 330 335 Leu Ser Ile Ser Val Asn Val His Asp Glu Gly Asn Val Leu Glu Val 340 345 350 Val Gly Met Ser Ser Pro His Gly Thr His Val Ser Ser Ile Ala Ser 355 360 365 Gly Asn His Ser Ser Arg Asp Val Asp Gly Val Ala Pro Asn Ala Lys 370 375 380 Ile Val Ser Met Thr Ile Gly Asp Gly Arg Leu Gly Ser Met Glu Thr 385 390 395 400 Gly Thr Ala Leu Val Arg Ala Met Thr Lys Val Met Glu Leu Cys Arg 405 410 415 Asp Gly Arg Arg Ile Asp Val Ile Asn Met Ser Tyr Gly Glu His Ala 420 425 430 Asn Trp Ser Asn Ser Gly Arg Ile Gly Glu Leu Met Asn Glu Val Val 435 440 445 Asn Lys Tyr Gly Val Val Trp Val Ala Ser Ala Gly Asn His Gly Pro 450 455 460 Ala Leu Cys Thr Val Gly Thr Pro Pro Asp Ile Ser Gln Pro Ser Leu 465 470 475 480 Ile Gly Val Gly Ala Tyr Val Ser Pro Gln Met Met Glu Ala Glu Tyr 485 490 495 Ala Met Arg Glu Lys Leu Pro Gly Asn Val Tyr Thr Trp Thr Ser Arg 500 505 510 Asp Pro Cys Ile Asp Gly Gly Gln Gly Val Thr Val Cys Ala Pro Gly 515 520 525 Gly Ala Ile Ala Ser Val Pro Gln Phe Thr Met Ser Lys Ser Gln Leu 530 535 540 Met Asn Gly Thr Ser Met Ala Ala Pro His Val Ala Gly Ala Val Ala 545 550 555 560 Leu Leu Ile Ser Gly Leu Lys Gln Gln Asn Ile Glu Tyr Ser Pro Tyr 565 570 575 Ser Ile Lys Arg Ala Ile Ser Val Thr Ala Thr Lys Leu Gly Tyr Val 580 585 590 Asp Pro Phe Ala Gln Gly His Gly Leu Leu Asn Val Glu Lys Ala Phe 595 600 605 Glu His Leu Thr Glu His Arg Gln Ser Lys Asp Asn Met Leu Arg Phe 610 615 620 Ser Val Arg Val Gly Asn Asn Ala Asp Lys Gly Ile His Leu Arg Gln 625 630 635 640 Gly Val Gln Arg Asn Ser Ile Asp Tyr Asn Val Tyr Ile Glu Pro Ile 645 650 655 Phe Tyr Asn Asp Lys Glu Ala Asp Pro Lys Asp Lys Phe Asn Phe Asn 660 665 670 Val Arg Leu Asn Leu Ile Ala Ser Gln Pro Trp Val Gln Cys Gly Ala 675 680 685 Phe Leu Asp Leu Ser Tyr Gly Thr Arg Ser Ile Ala Val Arg Val Asp 690 695 700 Pro Thr Gly Leu Gln Pro Gly Val His Ser Ala Val Ile Arg Ala Tyr 705 710 715 720 Asp Thr Asp Cys Val Gln Lys Gly Ser Leu Phe Glu Ile Pro Val Thr 725 730 735 Val Val Gln Pro His Val Leu Glu Ser Asp Gln Asn Thr Pro Val Phe 740 745 750 Glu Pro Ala Ser Ser Lys Gly Asp Asn Ser Val Glu Phe Gln Pro Asn 755 760 765 Thr Ile Gln Arg Asp Phe Ile Leu Val Pro Glu Arg Ala Thr Trp Ala 770 775 780 Glu Leu Arg Met Arg Ile Thr Asp Pro Asn Arg Gly Glu Asp Ile Gly 785 790 795 800 Lys Phe Phe Val His Thr Asn Gln Leu Leu Pro Lys Gln Ser Cys Arg 805 810 815 Lys Leu Glu Thr Met Lys Ile Val Ser Val Gly Ser Glu Asn Glu Ser 820 825 830 Ile Met Ala Phe Lys Val Lys Ser Gly Arg Ile Leu Glu Leu Cys Ile 835 840 845 Ala Lys Tyr Trp Ser Asn Tyr Gly Gln Ser His Leu Lys Tyr Ser Leu 850 855 860 Arg Phe Arg Gly Val Glu Ala His Asn Pro Asn Ala Tyr Val Met His 865 870 875 880 Ala Gly Arg Gly Ile His Lys Leu Glu Ile Glu Ala Leu Val Ala Glu 885 890 895 Asp Val Gln Pro Gln Leu Gln Leu Lys Asn Ala Glu Val Val Leu Lys 900 905 910 Pro Thr Glu Ala Lys Ile Ser Pro Leu Ser Ala Thr Arg Asp Val Ile 915 920 925 Pro Asp Gly Arg Gln Val Tyr Gln Asn Leu Leu Ala Phe Asn Leu Asn 930 935 940 Val Ala Lys Ala Ala Asp Val Ser Ile Tyr Ala Pro Ile Phe Asn Asp 945 950 955 960 Leu Leu Tyr Glu Ala Glu Phe Glu Ser Gln Met Trp Met Leu Phe Asp 965 970 975 Ala Asn Lys Ala Leu Val Ala Thr Gly Asp Ala His Ser His Thr Ser 980 985 990 Phe Thr Lys Leu Asp Lys Gly Glu Tyr Thr Ile Arg Leu Gln Val Arg 995 1000 1005 His Glu Lys Arg Asp Leu Leu Glu Lys Ile Ser Glu Ala Asn Leu Val 1010 1015 1020 Ala Ser Phe Lys Leu Thr Ser Pro Leu Thr Leu Asp Phe Tyr Glu Asn 1025 1030 1035 1040 Tyr Asn Gln Cys Ile Val Gly Gly Arg Lys Tyr Val Ser Ser Pro Leu 1045 1050 1055 Arg Leu Ser Thr Arg Val Leu Tyr Ile Ala Pro Ile Thr Gln Glu Arg 1060 1065 1070 Leu Thr Lys Ala Asn Leu Pro Ala Gln Cys Ala Trp Leu Ser Gly Asn 1075 1080 1085 Leu Val Phe Pro Gln Asp Glu Val Gly Arg Arg Val Ala Gln His Pro 1090 1095 1100 Phe Thr Tyr Ile Leu Asn Pro Ala Glu Lys Lys Ser His Thr Asn Gly 1105 1110 1115 1120 Ser Ser Asn Gly Ser Ser Ala Ala Gly Ser Thr Ala Thr Ala Ala Ala 1125 1130 1135 Val Thr Thr Ala Asn Gly Ala Lys Pro Lys Ala Pro Ala Thr Pro Gln 1140 1145 1150 Ala Ala Thr Ser Val Thr Asn Pro Ala Ala Gly Asp Gly Ile Ser Val 1155 1160 1165 Gln Asn Asp Pro Pro Val Asp Ser Ser Gly Ser Pro Ala Ser Pro Lys 1170 1175 1180 Lys Gly Lys Ala Asn Ala Asp Asp Tyr Ala Glu Ser Phe Arg Asp Phe 1185 1190 1195 1200 Gln Cys Ser Gln Ile Val Lys Cys Glu Leu Glu Met Ala Glu Lys Ile 1205 1210 1215 Tyr Asn Asp Val Val Ala Ala His Pro Lys His Leu Gln Ala Asn Leu 1220 1225 1230 Leu Leu Ile Gln Asn Ile Glu Ser Asn Gln Leu Lys Ser Gln Leu Pro 1235 1240 1245 Leu Thr Phe Val Asn Ala Gln Lys Thr Ser Pro Pro Glu Ala Gly Glu 1250 1255 1260 Ser Ala Asp Lys Gln Lys Glu Asp Gln Lys Lys Val Arg Ser Ala Leu 1265 1270 1275 1280 Glu Arg Ile Val Lys Leu Ala Asp Lys Val Ile Gln Glu Thr Asp Ser 1285 1290 1295 Glu Ala Leu Leu Ser Tyr Tyr Gly Leu Lys Asn Asp Thr Arg Ala Asp 1300 1305 1310 Ala Ala Lys Ile Lys Thr Asn Met Asp Lys Gln Lys Asn Thr Leu Ile 1315 1320 1325 Glu Ala Leu Ser Lys Lys Gly Ile Ala Val Ala Lys Leu Ala Val Leu 1330 1335 1340 Asp Asp Cys Ile Lys Asp Ser Leu Ala Glu Ile Asn Glu Leu Tyr Thr 1345 1350 1355 1360 Glu Ile Ile Lys Phe Val Asp Ala Asn Asp Ser Lys Ala Ile Gln Phe 1365 1370 1375 Ala Leu Trp His Ala Tyr Ala His Gly His Tyr Gly Arg Met Tyr Lys 1380 1385 1390 Tyr Val Val Lys Leu Ile Glu Glu Lys Arg Thr Arg Asp His Phe Val 1395 1400 1405 Glu Leu Ala Ala Ile Asn Gly Ala Leu Gly His Glu His Ile Arg Thr 1410 1415 1420 Val Ile Asn Arg Met Met Ile Thr Ala Phe Pro Ser Ser Phe Arg Leu 1425 1430 1435 1440 Phe <210> 318 <211> 4309 <212> DNA <213> Drosophila melanogaster <220> <223> Tripeptidyl-peptidase II (TPP-II) S08.090 <400> 318 ggcccgagta ccaatccgat tcttcattga acagctacga aggaattcgc agagagttct 60 gagcgcagca atagcagcaa gaagactacc aacaaagagc agagcgacaa atcagcggag 120 agcaggatgg ccaccagcgg tattgtcgag tcatttccca cgggcgcact ggtgcccaag 180 gcggagacgg gagtcctgaa ctttctgcag aagtacccgg agtacgatgg acgcgacgtc 240 accatagcca tcttcgattc cggcgtcgat ccccgggcaa cgggactgga gacgctgtgc 300 gatggaaaga ccgttaaagt aatagagcgg tacgactgtt ccggatgcgg cgacgtggac 360 atgaagaaga aggtgacgcc ggacgagaac ggcaacatta agggcctgtc cggaaactcg 420 ctcaagctga gtccggagct gatggctctg aacacagatc cggagaaggc ggtgcgggta 480 ggcctcaaga gcttcagcga tttgttgccc tccaaggtgc ggaacaacat tgtggcccag 540 gccaagctga agcactggga caagccgcac aagacggcca ctgcaaacgc cagtcgcaag 600 attgttgaat ttgagtcaca aaatccagga gaagcctcaa aactgccctg ggacaagaag 660 atattgaaag agaatctaga ctttgagcta gagatgttga atagctacga gaaggtgtac 720 ggcgacatta agacctccta cgattgcatc ctttttccca cggccgacgg atggctgaca 780 atcgtcgaca ccacggagca gggcgatctg gatcaggctc tgcgcattgg cgagtattcc 840 cgcacgcacg agacccgcaa tgtggacgac tttctttcca tatcggtaaa cgtccacgac 900 gagggcaacg tactggaggt ggtcggcatg agctcacccc acggcaccca cgtatcgtct 960 attgccagcg gcaaccatag ctcccgggac gtggatggcg tggcgccgaa tgctaagatc 1020 gtttctatga ccatcggtga tggtcgactt gggtctatgg agaccggcac ggcactagtg 1080 cgtgccatga ctaaggtgat ggaactatgt cgcgatggca gacgcatcga tgtgatcaac 1140 atgagctatg gcgagcatgc caattggtca aattccggcc gcattgggga gctcatgaac 1200 gaggttgtca acaagtatgg cgtggtgtgg gtggcatcgg ccggcaacca tggtccggca 1260 ctttgtactg tgggaactcc gccggacatc agccagccca gtttgatcgg cgtgggcgcg 1320 tacgtatcac cccaaatgat ggaggccgag tatgcgatgc gagaaaagct gcccgggaac 1380 gtgtacacct ggacatcgcg agatccctgc atcgacggag gtcaaggcgt taccgtatgc 1440 gctccgggcg gagccattgc gtccgtgcca cagtttacta tgagcaagtc ccagctgatg 1500 aacggtacca gcatggcggc acctcacgtc gccggcgcag tggcgctgct catctccggt 1560 ctgaagcaac agaacatcga gtattcgccg tacagtatta agcgagcgat cagcgtcact 1620 gccaccaaac tgggctatgt agatcccttt gctcagggcc atggcttgct caatgtcgag 1680 aaggcattcg agcatttgac ggagcaccgc cagtccaagg ataatatgct caggttctcc 1740 gtgcgcgtgg gcaacaacgc agacaagggc attcatttgc gtcagggcgt gcagcgtaac 1800 tccatcgatt acaacgttta tatagagccc atcttctaca atgacaagga ggcggatccc 1860 aaggacaagt ttaacttcaa tgtacggcta aatctgattg cctcgcagcc gtgggtgcag 1920 tgtggagctt tcttggatct cagctatggc acccgctcca ttgccgtgcg cgtcgatccc 1980 actggactcc agccaggcgt tcacagcgct gtgattcggg cttatgacac tgactgcgta 2040 cagaagggtt ctctctttga gattcctgtc acggtggtgc agccccatgt gctggagtcg 2100 gatcagaaca cgcccgtctt cgaacccgcc tcttccaagg gagacaacag cgtggagttt 2160 cagccaaaca ccattcaaag agacttcatc ctggtgccag aacgtgctac ttgggcggag 2220 ttgcgtatgc gtataaccga tcccaatcgt ggcgaggaca ttggaaagtt ctttgtacac 2280 acgaaccaac ttcttcccaa gcaatcctgt cgtaagcttg agaccatgaa gatcgtatcg 2340 gttggctcgg aaaacgaatc tataatggct tttaaagtta agtctggcag gattctggag 2400 ctatgcattg ccaagtactg gtccaactac ggccagagtc acctgaagta cagcttgcgt 2460 ttccgtggcg tggaagcgca caatcccaat gcctacgtca tgcatgcggg caggggaatt 2520 cataagctgg agattgaggc cctggttgcc gaggatgtgc agccccagct acagctaaag 2580 aatgccgaag tggtgctaaa accgaccgag gccaagatct cgccgctaag cgccacacga 2640 gacgtcatcc cagatggacg tcaggtgtat cagaacctgc tggcctttaa cttgaacgtg 2700 gccaaggccg cagatgtgtc gatatacgca ccgatcttta acgacttgtt gtatgaagcg 2760 gagtttgagt cacagatgtg gatgcttttt gatgcaaaca aggccctggt ggccaccggc 2820 gatgctcact cccacacttc cttcacaaag ctcgataagg gcgaatacac aatcagactg 2880 caggtgcgtc acgagaagcg cgacctgctg gagaagatct cggaggcaaa tctggtggcc 2940 tcattcaagc tgactagccc cctcaccctt gatttctatg agaactacaa tcagtgcatc 3000 gtgggaggtc gtaaatacgt ctcgagtccg ctaaggctgt ccactcgggt gctttatatc 3060 gctcctatta cccaagagcg acttaccaag gccaatctgc ccgctcaatg cgcctggctg 3120 agcggcaatc tggtattccc gcaagatgag gtcggacggc gagtggctca gcatccattt 3180 acttacatcc tcaatcccgc tgagaaaaag tcacacacga atggctcgag caacggttcc 3240 agcgctgcag gatccacagc tacggcagct gctgtcacca ctgctaatgg cgcaaaaccg 3300 aaagctccgg cgactccaca agcggccacc tcagtgacca atcctgcggc cggcgatgga 3360 atttctgttc agaacgaccc gcctgtggac agcagtggga gtcccgcctc acccaaaaag 3420 ggcaaggcca atgccgacga ttatgccgaa agttttcgcg actttcaatg ttcgcagatt 3480 gtcaagtgtg aactggaaat ggcagagaaa atctataatg atgtagtcgc tgcccatccc 3540 aagcatttgc aggcaaacct gctacttatc cagaacatcg agtccaatca gctgaagtcg 3600 caactgccgc tgactttcgt caatgctcaa aagacatcgc caccagaggc aggcgagagc 3660 gccgacaagc aaaaggagga tcaaaagaaa gtacgaagcg ccctggagcg aattgttaag 3720 ctggccgaca aggtgatcca ggagaccgat tccgaggcac tgctctccta ctacggtctg 3780 aagaacgaca ctcgtgccga tgcagccaag ataaagacca acatggacaa acagaaaaac 3840 actctcattg aggcgctaag caagaagggc attgctgtgg caaagctggc tgtattagac 3900 gactgtatca aggatagcct ggctgagatc aacgagctgt atacggagat tatcaagttc 3960 gtggacgcca acgactccaa ggccatccag ttcggtctgt ggcacgccta tgcccatggc 4020 cactacggtc gcatgtacaa gtatgtggtt aagctaatcg aggagaagcg aacccgcgat 4080 cacttcgtgg agctggccgc catcaacggc gccctgggtc acgagcacat ccgtactgtc 4140 atcaaccgta tgatgatcac tgcctttccc agcagcttcc gtttgttctg agcactttcc 4200 gacagaatac gcaacaaata ttcacgcttc gaagcgatca ttgttttgta taactaatgt 4260 aatccatatg tatatgaata aatgctatta actgaaaaaa aaaaaaaaa 4309 <210> 319 <211> 806 <212> PRT <213> Bacillus subtilis <220> <223> Minor extracellular protease vpr precursor S08.114 <400> 319 Met Lys Lys Gly Ile Ile Arg Phe Leu Leu Val Ser Phe Val Leu Phe 1 5 10 15 Phe Ala Leu Ser Thr Gly Ile Thr Gly Val Gln Ala Ala Pro Ala Ser 20 25 30 Ser Lys Thr Ser Ala Asp Leu Glu Lys Ala Glu Val Phe Gly Asp Ile 35 40 45 Asp Met Thr Thr Ser Lys Lys Thr Thr Val Ile Val Glu Leu Lys Glu 50 55 60 Lys Ser Leu Ala Glu Ala Lys Glu Ala Gly Glu Ser Gln Ser Lys Ser 65 70 75 80 Lys Leu Lys Thr Ala Arg Thr Lys Ala Lys Asn Lys Ala Ile Lys Ala 85 90 95 Val Lys Asn Gly Lys Val Asn Arg Glu Tyr Glu Gln Val Phe Ser Gly 100 105 110 Phe Ser Met Lys Leu Pro Ala Asn Glu Ile Pro Lys Leu Leu Ala Val 115 120 125 Lys Asp Val Lys Ala Val Tyr Pro Asn Val Thr Tyr Lys Thr Asp Asn 130 135 140 Met Lys Asp Lys Asp Val Thr Ile Ser Glu Asp Ala Val Ser Pro Gln 145 150 155 160 Met Asp Asp Ser Ala Pro Tyr Ile Gly Ala Asn Asp Ala Trp Asp Leu 165 170 175 Gly Tyr Thr Gly Lys Gly Ile Lys Val Ala Ile Ile Asp Thr Gly Val 180 185 190 Glu Tyr Asn His Pro Asp Leu Lys Lys Asn Phe Gly Gln Tyr Lys Gly 195 200 205 Tyr Asp Phe Val Asp Asn Asp Tyr Asp Pro Lys Glu Thr Pro Thr Gly 210 215 220 Asp Pro Arg Gly Glu Ala Thr Asp His Gly Thr His Val Ala Gly Thr 225 230 235 240 Val Ala Ala Asn Gly Thr Ile Lys Gly Val Ala Pro Asp Ala Thr Leu 245 250 255 Leu Ala Tyr Arg Val Leu Gly Pro Gly Gly Ser Gly Thr Thr Glu Asn 260 265 270 Val Ile Ala Gly Val Glu Arg Ala Val Gln Asp Gly Ala Asp Val Met 275 280 285 Asn Leu Ser Leu Gly Asn Ser Leu Asn Asn Pro Asp Trp Ala Thr Ser 290 295 300 Thr Ala Leu Asp Trp Ala Met Ser Glu Gly Val Val Ala Val Thr Ser 305 310 315 320 Asn Gly Asn Ser Gly Pro Asn Gly Trp Thr Val Gly Ser Pro Gly Thr 325 330 335 Ser Arg Glu Ala Ile Ser Val Gly Ala Thr Gln Leu Pro Leu Asn Glu 340 345 350 Tyr Ala Val Thr Phe Gly Ser Tyr Ser Ser Ala Lys Val Met Gly Tyr 355 360 365 Asn Lys Glu Asp Asp Val Lys Ala Leu Asn Asn Lys Glu Val Glu Leu 370 375 380 Val Glu Ala Gly Ile Gly Glu Ala Lys Asp Phe Glu Gly Lys Asp Leu 385 390 395 400 Thr Gly Lys Val Ala Val Val Lys Arg Gly Ser Ile Ala Phe Val Asp 405 410 415 Lys Ala Asp Asn Ala Lys Lys Ala Gly Ala Ile Gly Met Val Val Tyr 420 425 430 Asn Asn Leu Ser Gly Glu Ile Glu Ala Asn Val Pro Gly Met Ser Val 435 440 445 Pro Thr Ile Lys Leu Ser Leu Glu Asp Gly Glu Lys Leu Val Ser Ala 450 455 460 Leu Lys Ala Gly Glu Thr Lys Thr Thr Phe Lys Leu Thr Val Ser Lys 465 470 475 480 Ala Leu Gly Glu Gln Val Ala Asp Phe Ser Ser Arg Gly Pro Val Met 485 490 495 Asp Thr Trp Met Ile Lys Pro Asp Ile Ser Ala Pro Gly Val Asn Ile 500 505 510 Val Ser Thr Ile Pro Thr His Asp Pro Asp His Pro Tyr Gly Tyr Gly 515 520 525 Ser Lys Gln Gly Thr Ser Met Ala Ser Pro His Ile Ala Gly Ala Val 530 535 540 Ala Val Ile Lys Gln Ala Lys Pro Lys Trp Ser Val Glu Gln Ile Lys 545 550 555 560 Ala Ala Ile Met Asn Thr Ala Val Thr Leu Lys Asp Ser Asp Gly Glu 565 570 575 Val Tyr Pro His Asn Ala Gln Gly Ala Gly Ser Ala Arg Ile Met Asn 580 585 590 Ala Ile Lys Ala Asp Ser Leu Val Ser Pro Gly Ser Tyr Ser Tyr Gly 595 600 605 Thr Phe Leu Lys Glu Asn Gly Asn Glu Thr Lys Asn Glu Thr Phe Thr 610 615 620 Ile Glu Asn Gln Ser Ser Ile Arg Lys Ser Tyr Thr Leu Glu Tyr Ser 625 630 635 640 Phe Asn Gly Ser Gly Ile Ser Thr Ser Gly Thr Ser Arg Val Val Ile 645 650 655 Pro Ala His Gln Thr Gly Lys Ala Thr Ala Lys Val Lys Val Asn Thr 660 665 670 Lys Lys Thr Lys Ala Gly Thr Tyr Glu Gly Thr Val Ile Val Arg Glu 675 680 685 Gly Gly Lys Thr Val Ala Lys Val Pro Thr Leu Leu Ile Val Lys Glu 690 695 700 Pro Asp Tyr Pro Arg Val Thr Ser Val Ser Val Ser Glu Gly Ser Val 705 710 715 720 Gln Gly Thr Tyr Gln Ile Glu Thr Tyr Leu Pro Ala Gly Ala Glu Glu 725 730 735 Leu Ala Phe Leu Val Tyr Asp Ser Asn Leu Asp Phe Ala Gly Gln Ala 740 745 750 Gly Ile Tyr Lys Asn Gln Asp Lys Gly Tyr Gln Tyr Phe Asp Trp Asp 755 760 765 Gly Thr Ile Asn Gly Gly Thr Lys Leu Pro Ala Gly Glu Tyr Tyr Leu 770 775 780 Leu Ala Tyr Ala Ala Asn Lys Gly Lys Ser Ser Gln Val Leu Thr Glu 785 790 795 800 Glu Pro Phe Thr Val Glu 805 <210> 320 <211> 2931 <212> DNA <213> Bacillus subtilis <220> <223> Minor extracellular protease vpr precursor S08.114 <400> 320 gagatatcca catgtccaca aactctatct atattttgta tacgaagtat attcctaact 60 atatatatac acaggtttat tcacttatac acagggttct gtgtataact ccttcgttat 120 acacaaacaa aatccaataa atggtccaaa tgacacaagg atttttttga attttcaaga 180 aatatatact agatctttca cattttttct aaatacaaag ggggaaacac attgaaaaag 240 gggatcattc gctttctgct tgtaagtttc gtcttatttt ttgcgttatc cacaggcatt 300 acgggcgttc aggcagctcc ggcttcttca aaaacgtcgg ctgatctgga aaaagccgag 360 gtattcggtg atatcgatat gacgacaagc aaaaaaacaa ccgttatagt ggaattaaaa 420 gaaaaatcct tggcagaagc gaaggaagcg ggagaaagcc aatcgaaaag caagctgaaa 480 accgctcgca ccaaagcaaa aaacaaagca atcaaagcag tgaaaaacgg aaaagtaaac 540 cgggaatatg agcaggtatt ctcaggcttc tctatgaagc ttccagctaa tgagattcca 600 aaacttctag cggtaaaaga cgttaaggca gtgtacccga acgtcacata taaaacagac 660 aatatgaagg ataaagacgt cacaatctcc gaagacgccg tatctccgca aatggatgac 720 agtgcgcctt atatcggagc aaacgatgca tgggatttag gctacacagg aaaaggcatc 780 aaggtggcga ttattgacac tggggttgaa tacaatcacc cagatctgaa gaaaaacttt 840 ggacaatata aaggatacga ttttgtggac aatgattacg atccaaaaga aacaccaacc 900 ggcgatccga ggggcgaggc aactgaccat ggcacacacg tagccggaac tgtggctgca 960 aacggaacga ttaaaggcgt agcgcctgat gccacacttc ttgcttatcg tgtgttaggg 1020 cctggcggaa gcggcacaac ggaaaacgtc atcgcgggcg tggaacgtgc agtgcaggac 1080 ggggcagatg tgatgaacct gtctctcgga aactctttaa acaacccgga ctgggcgaca 1140 agcacagcgc ttgactgggc catgtcagaa ggcgttgtcg ctgttacctc aaacggcaac 1200 agcggaccga acggctggac agtcggatcg ccgggcacat caagagaagc gatttctgtc 1260 ggtgcgactc agctgccgct caatgaatac gccgtcactt tcggctccta ctcttcagca 1320 aaagtgatgg gctacaacaa agaggacgac gtcaaagcgc tcaataacaa agaagttgag 1380 cttgtcgaag cgggaatcgg cgaagcaaag gattttgaag ggaaagacct gacaggcaaa 1440 gtcgccgttg tcaaacgagg cagcattgca tttgtggata aagcggataa cgctaaaaaa 1500 gccggtgcaa tcggcatggt tgtgtataac aacctctctg gagaaattga agccaatgtg 1560 ccaggcatgt ctgtcccaac gattaagctt tcattagaag acggcgaaaa actcgtcagc 1620 gccctgaaag ctggtgagac aaaaacaaca ttcaagttga cggtctcaaa agcgctcggt 1680 gaacaagtcg ctgatttctc atcacgcggc cctgttatgg atacgtggat gattaagcct 1740 gatatttccg cgccaggggt caatatcgtg agcacgatcc caacacacga tcctgaccat 1800 ccatacggct acggatcaaa acaaggaaca agcatggcat cgcctcatat tgccggagcg 1860 gttgccgtta ttaaacaagc caaaccaaag tggagcgttg aacagattaa agccgccatc 1920 atgaataccg ctgtcacttt aaaggatagc gatggggaag tatatccgca taacgctcaa 1980 ggcgcaggca gcgcaagaat tatgaacgca atcaaagccg attcgctcgt ctcacctgga 2040 agctattcat acggcacgtt cttgaaggaa aacggaaacg aaacaaaaaa tgaaacgttt 2100 acgattgaaa atcaatcttc cattagaaag tcatacacac ttgaatactc atttaatggc 2160 agcggcattt ccacatccgg cacaagccgt gttgtgattc cggcacatca aaccgggaaa 2220 gccactgcaa aagtaaaggt caatacgaag aaaacaaaag ctggcaccta tgaaggaacg 2280 gttatcgtca gagaaggcgg aaaaacggtc gctaaggtac ctacattgct gattgtgaaa 2340 gagcccgatt atccgagagt cacatctgtc tctgtcagcg aagggtctgt acaaggtacc 2400 tatcaaattg aaacctacct tcctgcggga gcggaagagc tggcgttcct cgtctatgac 2460 agcaaccttg atttcgcagg ccaagccggc atttataaaa accaagataa aggttaccag 2520 tactttgact gggacggcac gattaatggc ggaaccaaac ttccggccgg agagtattac 2580 ttgctcgcat atgccgcgaa caaaggcaag tcaagccagg ttttgaccga agaacctttc 2640 actgttgaat aagaaaaagc cctgccgatt cggcagggct ttttaaagat cagtcagcaa 2700 acgcctcctg caataagcga tacgatcgga gcttatcttc aaaatgatgc gtgatggtca 2760 ccaccatgat ttcctctgtt tcatacgcgt tactcaaagc taacagccgc tccttaacct 2820 gttctttcgt accaacaatc attcgatttc gattatcagc aattcgtctc tgttcataag 2880 gagaatacgt attttccgaa cagcttcata cgaggactcc tctaaggata c 2931 <210> 321 <211> 1902 <212> PRT <213> Lactococcus lactis subsp. cremoris <220> <223> PIII-type proteinase precursor (Lactocepin) S08.116 <400> 321 Met Gln Arg Lys Lys Lys Gly Leu Ser Ile Leu Leu Ala Gly Thr Val 1 5 10 15 Ala Leu Gly Ala Leu Ala Val Leu Pro Val Gly Glu Ile Gln Ala Lys 20 25 30 Ala Ala Ile Ser Gln Gln Thr Lys Gly Ser Ser Leu Ala Asn Thr Val 35 40 45 Thr Ala Ala Thr Ala Lys Gln Ala Ala Thr Asp Thr Thr Ala Ala Thr 50 55 60 Thr Asn Gln Ala Ile Ala Thr Gln Leu Ala Ala Lys Gly Ile Asp Tyr 65 70 75 80 Asn Lys Leu Asn Lys Val Gln Gln Gln Asp Ile Tyr Val Asp Val Ile 85 90 95 Val Gln Met Ser Ala Ala Pro Ala Ser Glu Asn Gly Ile Leu Arg Thr 100 105 110 Asp Tyr Ser Ser Thr Ala Glu Ile Gln Gln Glu Thr Asn Lys Val Ile 115 120 125 Ala Ala Gln Ala Ser Val Lys Ala Ala Val Glu Gln Val Thr Gln Gln 130 135 140 Thr Ala Gly Glu Ser Tyr Gly Tyr Val Val Asn Gly Phe Ser Thr Lys 145 150 155 160 Val Arg Val Val Asp Ile Pro Lys Leu Lys Gln Ile Ala Gly Val Lys 165 170 175 Thr Val Thr Leu Ala Lys Val Tyr Tyr Pro Thr Asp Ala Lys Ala Asn 180 185 190 Ser Met Ala Asn Val Gln Ala Val Trp Ser Asn Tyr Lys Tyr Lys Gly 195 200 205 Glu Gly Thr Val Val Ser Val Ile Asp Ser Gly Ile Asp Pro Thr His 210 215 220 Lys Asp Met Arg Leu Ser Asp Asp Lys Asp Val Lys Leu Thr Lys Ser 225 230 235 240 Asp Val Glu Lys Phe Thr Asp Thr Val Lys His Gly Arg Tyr Phe Asn 245 250 255 Ser Lys Val Pro Tyr Gly Phe Asn Tyr Ala Asp Asn Asn Asp Thr Ile 260 265 270 Thr Asp Asp Lys Val Asp Glu Gln His Gly Met His Val Ala Gly Ile 275 280 285 Ile Gly Ala Asn Gly Thr Gly Asp Asp Pro Ala Lys Ser Val Val Gly 290 295 300 Val Ala Pro Glu Ala Gln Leu Leu Ala Met Lys Val Phe Ser Asn Ser 305 310 315 320 Asp Thr Ser Ala Lys Thr Gly Ser Ala Thr Val Val Ser Ala Ile Glu 325 330 335 Asp Ser Ala Lys Ile Gly Ala Asp Val Leu Asn Met Ser Leu Gly Ser 340 345 350 Asn Ser Gly Asn Gln Thr Leu Glu Asp Pro Glu Leu Ala Ala Val Gln 355 360 365 Asn Ala Asn Glu Ser Gly Thr Ala Ala Val Ile Ser Ala Gly Asn Ser 370 375 380 Gly Thr Ser Gly Ser Ala Thr Glu Gly Val Asn Lys Asp Tyr Tyr Gly 385 390 395 400 Leu Gln Asp Asn Glu Met Val Gly Ser Pro Gly Thr Ser Arg Gly Ala 405 410 415 Thr Thr Val Ala Ser Ala Glu Asn Thr Asp Val Ile Thr Gln Ala Val 420 425 430 Thr Ile Thr Asp Gly Thr Gly Leu Gln Leu Gly Pro Glu Thr Ile Gln 435 440 445 Leu Ser Ser His Asp Phe Thr Gly Ser Phe Asp Gln Lys Lys Phe Tyr 450 455 460 Ile Val Lys Asp Ala Ser Gly Asn Leu Ser Lys Gly Ala Leu Ala Asp 465 470 475 480 Tyr Thr Ala Asp Ala Lys Gly Lys Ile Ala Ile Val Lys Arg Gly Glu 485 490 495 Phe Ser Phe Asp Asp Lys Gln Lys Tyr Ala Gln Ala Ala Gly Ala Ala 500 505 510 Gly Leu Ile Ile Val Asn Thr Asp Gly Thr Ala Thr Pro Met Thr Ser 515 520 525 Ile Ala Leu Thr Thr Thr Phe Pro Thr Phe Gly Leu Ser Ser Val Thr 530 535 540 Gly Gln Lys Leu Val Asp Trp Val Thr Ala His Pro Asp Asp Ser Leu 545 550 555 560 Gly Val Lys Ile Thr Leu Ala Met Leu Pro Asn Gln Lys Tyr Thr Glu 565 570 575 Asp Lys Met Ser Asp Phe Thr Ser Tyr Gly Pro Val Ser Asn Leu Ser 580 585 590 Phe Lys Pro Asp Ile Thr Ala Pro Gly Gly Asn Ile Trp Ser Thr Gln 595 600 605 Asn Asn Asn Gly Tyr Thr Asn Met Ser Gly Thr Ser Met Ala Ser Pro 610 615 620 Phe Ile Ala Gly Ser Gln Ala Leu Leu Lys Gln Ala Leu Asn Asn Lys 625 630 635 640 Asn Asn Pro Phe Tyr Ala Tyr Tyr Lys Gln Leu Lys Gly Thr Ala Leu 645 650 655 Thr Asp Phe Leu Lys Thr Val Glu Met Asn Thr Ala Gln Pro Ile Asn 660 665 670 Asp Ile Asn Tyr Asn Asn Val Ile Val Ser Pro Arg Arg Gln Gly Ala 675 680 685 Gly Leu Val Asp Val Lys Ala Ala Ile Asp Ala Leu Glu Lys Asn Pro 690 695 700 Ser Thr Val Val Ala Glu Asn Gly Tyr Pro Ala Val Glu Leu Lys Asp 705 710 715 720 Phe Thr Ser Thr Asp Lys Thr Phe Lys Leu Thr Phe Thr Asn Arg Thr 725 730 735 Thr His Glu Leu Thr Tyr Gln Met Asp Ser Asn Thr Asp Thr Asn Ala 740 745 750 Val Tyr Thr Ser Ala Thr Asp Pro Asn Ser Gly Val Leu Tyr Asp Lys 755 760 765 Lys Ile Asp Gly Ala Ala Ile Lys Ala Gly Ser Asn Ile Thr Val Pro 770 775 780 Ala Gly Lys Thr Ala Gln Ile Glu Phe Thr Leu Ser Leu Pro Lys Ser 785 790 795 800 Phe Asp Gln Gln Gln Phe Val Glu Gly Phe Leu Asn Phe Lys Gly Ser 805 810 815 Asp Gly Ser Arg Leu Asn Leu Pro Tyr Met Gly Phe Phe Gly Asp Trp 820 825 830 Asn Asp Gly Lys Ile Val Asp Ser Leu Asn Gly Ile Thr Tyr Ser Pro 835 840 845 Ala Gly Gly Asn Phe Gly Thr Val Pro Leu Leu Lys Asn Lys Asn Thr 850 855 860 Gly Thr Gln Tyr Tyr Gly Gly Met Val Thr Asp Ala Asp Gly Asn Lys 865 870 875 880 Thr Val Asp Asp Gln Ala Ile Ala Phe Ser Ser Asp Lys Asn Ala Leu 885 890 895 Tyr Asn Asp Ile Ser Met Lys Tyr Tyr Leu Leu Arg Asn Ile Ser Asn 900 905 910 Val Gln Val Asp Ile Leu Asp Gly Gln Gly Asn Lys Val Thr Thr Leu 915 920 925 Ser Ser Ser Thr Asn Arg Lys Lys Thr Tyr Tyr Asn Ala His Ser Gln 930 935 940 Gln Tyr Ile Tyr Tyr Asn Ala Pro Ala Trp Asp Gly Thr Tyr Tyr Asp 945 950 955 960 Gln Arg Asp Gly Asn Ile Lys Thr Ala Asp Asp Gly Ser Tyr Thr Tyr 965 970 975 Arg Ile Ser Gly Val Pro Glu Gly Gly Asp Lys Arg Gln Val Phe Asp 980 985 990 Val Pro Phe Lys Leu Asp Ser Lys Ala Pro Thr Val Arg His Val Ala 995 1000 1005 Leu Ser Ala Lys Thr Glu Asn Gly Lys Thr Gln Tyr Tyr Leu Thr Ala 1010 1015 1020 Glu Ala Lys Asp Asp Leu Ser Gly Leu Asp Ala Thr Lys Ser Val Lys 1025 1030 1035 1040 Thr Glu Ile Asn Glu Val Thr Asn Leu Asp Ala Thr Phe Thr Asp Ala 1045 1050 1055 Gly Thr Thr Ala Asp Gly Tyr Thr Lys Ile Glu Thr Pro Leu Ser Asp 1060 1065 1070 Glu Gln Ala Gln Ala Leu Gly Asn Gly Asp Asn Ser Ala Glu Leu Tyr 1075 1080 1085 Leu Thr Asp Asn Ala Ser Asn Ala Thr Asp Gln Asp Ala Ser Val Gln 1090 1095 1100 Lys Pro Gly Ser Thr Ser Phe Asp Leu Ile Val Asn Gly Gly Gly Ile 1105 1110 1115 1120 Pro Asp Lys Ile Ser Ser Thr Thr Thr Gly Tyr Glu Ala Asn Thr Gln 1125 1130 1135 Gly Gly Gly Thr Tyr Thr Phe Ser Gly Thr Tyr Pro Ala Ala Val Asp 1140 1145 1150 Gly Thr Tyr Thr Asp Ala Gln Gly Lys Lys His Asp Leu Asn Thr Thr 1155 1160 1165 Tyr Asp Ala Ala Thr Asn Ser Phe Thr Ala Ser Met Pro Val Thr Asn 1170 1175 1180 Ala Asp Tyr Ala Ala Gln Val Asp Leu Tyr Ala Asp Lys Ala His Thr 1185 1190 1195 1200 Gln Leu Leu Lys His Phe Asp Thr Lys Val Arg Leu Met Ala Pro Thr 1205 1210 1215 Phe Thr Asp Leu Lys Phe Asn Asn Gly Ser Asp Gln Thr Ser Glu Ala 1220 1225 1230 Thr Ile Lys Val Thr Gly Thr Val Ser Ala Asp Thr Lys Thr Val Asn 1235 1240 1245 Val Gly His Thr Val Ala Ala Leu Asp Ala Gln His His Phe Ser Val 1250 1255 1260 Asp Val Pro Val Asn Tyr Gly Asp Asn Thr Ile Lys Val Thr Ala Thr 1265 1270 1275 1280 Asp Lys Asp Gly Asn Thr Thr Thr Glu Gln Lys Thr Ile Thr Ser Ser 1285 1290 1295 Tyr Asp Pro Asp Met Leu Lys Lys Ser Val Thr Phe Asp Gln Gly Val 1300 1305 1310 Lys Phe Gly Thr Asn Lys Phe Asn Ala Thr Ser Ala Lys Phe Tyr Asp 1315 1320 1325 Pro Lys Thr Gly Ile Ala Thr Ile Thr Gly Lys Val Lys His Pro Thr 1330 1335 1340 Thr Thr Leu Gln Val Asp Gly Lys Gln Ile Pro Ile Lys Asp Asp Leu 1345 1350 1355 1360 Thr Phe Ser Phe Thr Leu Asp Leu Gly Thr Leu Gly Gln Lys Pro Phe 1365 1370 1375 Gly Val Val Val Gly Asp Thr Thr Gln Asn Lys Thr Phe Gln Glu Ala 1380 1385 1390 Leu Ser Phe Ile Leu Asp Ala Val Ala Pro Thr Leu Ser Leu Asp Ser 1395 1400 1405 Ser Thr Asp Ala Pro Val Tyr Thr Asn Asp Pro Asn Phe Gln Ile Thr 1410 1415 1420 Gly Thr Ala Thr Asp Asn Ala Gln Tyr Leu Ser Leu Ser Ile Asn Gly 1425 1430 1435 1440 Ser Ser Val Ala Ser Gln Tyr Glu Asp Ile Asn Ile Asn Ser Gly Lys 1445 1450 1455 Pro Gly His Met Ala Ile Asp Gln Pro Val Lys Leu Leu Glu Gly Lys 1460 1465 1470 Asn Val Leu Thr Val Ala Val Thr Asp Ser Glu Asp Asn Thr Thr Thr 1475 1480 1485 Lys Asn Ile Thr Val Tyr Tyr Glu Pro Lys Lys Thr Leu Ala Ala Pro 1490 1495 1500 Thr Val Thr Pro Ser Thr Thr Glu Pro Ala Gln Thr Val Thr Leu Thr 1505 1510 1515 1520 Ala Asn Ala Ala Ala Thr Gly Glu Thr Val Gln Tyr Ser Ala Asp Gly 1525 1530 1535 Gly Lys Thr Tyr Gln Asp Val Pro Ala Ala Gly Val Thr Ile Thr Ala 1540 1545 1550 Asn Gly Thr Phe Lys Phe Lys Ser Thr Asp Leu Tyr Gly Asn Glu Ser 1555 1560 1565 Pro Ala Val Asp Tyr Val Val Thr Asn Ile Lys Ala Asp Asp Pro Ala 1570 1575 1580 Gln Leu Gln Ala Ala Lys Gln Glu Leu Thr Asn Leu Ile Ala Ser Ala 1585 1590 1595 1600 Lys Thr Leu Ser Ala Ser Gly Lys Tyr Asp Asp Ala Thr Thr Thr Ala 1605 1610 1615 Leu Ala Ala Ala Thr Gln Lys Ala Gln Thr Ala Leu Asp Gln Thr Asn 1620 1625 1630 Ala Ser Val Asp Ser Leu Thr Gly Ala Asn Arg Asp Leu Gln Thr Ala 1635 1640 1645 Ile Asn Gln Leu Ala Ala Lys Leu Pro Ala Asp Lys Lys Thr Ser Leu 1650 1655 1660 Leu Asn Gln Leu Gln Ser Val Lys Asp Ala Leu Gly Thr Asp Leu Gly 1665 1670 1675 1680 Asn Gln Thr Asp Pro Ser Thr Gly Lys Thr Phe Thr Ala Ala Leu Asp 1685 1690 1695 Asp Leu Val Ala Gln Ala Gln Ala Gly Thr Gln Thr Asp Asp Gln Leu 1700 1705 1710 Gln Ala Thr Leu Ala Lys Ile Leu Asp Glu Val Leu Ala Lys Leu Ala 1715 1720 1725 Glu Gly Ile Lys Ala Ala Thr Pro Ala Glu Val Gly Asn Ala Lys Asp 1730 1735 1740 Ala Ala Thr Gly Lys Thr Trp Tyr Ala Asp Ile Ala Asp Thr Leu Thr 1745 1750 1755 1760 Ser Gly Gln Ala Ser Ala Asp Ala Ser Asp Lys Leu Ala His Leu Gln 1765 1770 1775 Ala Leu Gln Ser Leu Lys Thr Lys Val Ala Ala Ala Val Glu Ala Ala 1780 1785 1790 Lys Thr Val Gly Lys Gly Asp Gly Thr Thr Gly Thr Ser Asp Lys Gly 1795 1800 1805 Gly Gly Gln Gly Thr Pro Ala Pro Ala Pro Gly Asp Thr Gly Lys Asp 1810 1815 1820 Lys Gly Asp Glu Gly Ser Gln Pro Ser Ser Gly Gly Asn Ile Pro Thr 1825 1830 1835 1840 Lys Pro Ala Thr Thr Thr Ser Thr Thr Thr Asp Asp Thr Thr Asp Arg 1845 1850 1855 Asn Gly Gln Leu Thr Ser Gly Lys Gly Ala Leu Pro Lys Thr Gly Glu 1860 1865 1870 Thr Thr Glu Arg Pro Ala Phe Gly Phe Leu Gly Val Ile Val Val Ser 1875 1880 1885 Leu Met Gly Val Leu Gly Leu Lys Arg Lys Gln Arg Glu Glu 1890 1895 1900 <210> 322 <211> 8115 <212> DNA <213> Lactococcus lactis <220> <223> PIII-type proteinase precursor (Lactocepin) S08.116 <400> 322 ttttgaattg tttgccttta aaacgattca ttactctgtc ctctctgtct tttttctcaa 60 ttttacacta aaatagattt tttggaaaac tttgcaacag aaccagatct atcaactcta 120 cttgacgaag agccaatttc taaaagaact ggctgttatt tcatcttact cggttaagcc 180 ttaattcgtt gtcgcaagct tcttataact atctagcgca tccgcaagat ccttgtcttt 240 aatcgtcaca tgctgattct tcaatacctg actgataacg cgttgcatga tgcttgaatc 300 gcgagaccat ttagcgtaaa cgctggcagt tagcgccttt ttactgctag taaaggtgcc 360 tttggcggga tggttaatca ttttaataac ttcatacccg tctgtcactt tgactggggt 420 ctgcgtgtag tcaccatttt ttaatttgta ggcagcatcc ttaaatgtgg catcgagcgt 480 tttattgttt aattcaaaac taatcttccc gccgttatct ttagtcgcag tatcaatgga 540 atcagttttc gcaagcatgg caaaatcctt gccagctgct aaatcactga taacttgctt 600 agcagtgtcc tcgtcgctag ttagaatatg ttggacagtc actttgggct gataggtctt 660 ccaagcggcc ttgagctggc tttcagaaac cttttttaac tttttcagtg caacttcact 720 taaaaagttg gttcgtaggc tttccttgaa gctactgcga ctgaaaccgt tttgacttaa 780 gaaagcatcg aaattttcgc cgtattgttg tttgtagcta tcataggcat cattaactgt 840 tttagtgcta accgattttc cataggcatg attcaatgca cgataaatga gcatgttagc 900 aagcatggtc tttgtcgttg gtgactgttt gagttccttg tacaagctac tttcagtcac 960 cttgccacct gaataggtcg caactgtttg gtcggtctga tttgactgac aaccgcttag 1020 cagcagtaaa gcagttgcgg tacttgccaa taatacttta aggcgcattt ttttcttcat 1080 cgattcggtc tcctctgaaa tgcttacagt aaacgttgtg tatttattct agcgatggca 1140 attgagaatt tcaattcaaa tactcatttt ctaataagtg ctaaaaattt caaaacatct 1200 tagtctgtaa acggctaaat aataacgcta aaagttaatt tacagataaa aaaattaata 1260 agaagattaa aattttcgtt gaatttgttc ttcaatagta tataatataa tagtatataa 1320 attatattat ataatataat cttaactaca tcaagcgtag gctttgattt ggttatgaaa 1380 acttttggaa agtggaggat attggatgca aaggaaaaag aaagggctat cgatcttgtt 1440 acagtaaacg ttgtgtattt attctagcga tggcaattga gaatttcaat tcaaatactc 1500 attttctaat aaytgctaaa aatttcaaaa catctatagt ctgtaaacgg ctaaataata 1560 acgctaaaag ttaatttaca gataaaaaaa ttaatagaag attaaaattt tcgttgaatt 1620 tgttcttcaa tagtatataa tataatagta tataatatta tattatataa tataatctta 1680 actacatcaa gcgtaggctt tgatttggtt atgaaacttt tggaaagtgg aggatattgg 1740 atgcaaagga aaaagaaagg gctatcgatc ttgttagccg gtacagtcgc tttaggggcg 1800 ctggctgtct tgccagtcgg cgaaatccaa gcaaaggcgg ctatctcgca gcaaactaag 1860 ggatcatcac tcgcaaatac ggtgacggct gcgactgcta agcaagcggc cactgacaca 1920 actgcagcga caacgaatca agcgattgct acacagttgg cggctaaagg tattgattac 1980 aataagctga ataaagttca gcagcaagat atttatgttg acgtcattgt tcaaatgagc 2040 gcagcgcctg cctctgaaaa cggcatttta agaactgatt actccagcac ggcggagatt 2100 cagcaggaga ccaataaagt gatcgcggct caggcaagcg ttaaagcagc tgttgaacaa 2160 gtcacccaac aaactgccgg tgaaagttat ggctatgtcg ttaacggctt ttcaactaaa 2220 gttagggttg ttgatatccc taaactgaaa caaattgccg gagttaaaac agtcacattg 2280 gcgaaagttt attatccgac tgatgctaag gcaaactcga tggcgaatgt gcaagccgta 2340 tggtccaatt acaaatataa aggtgaaggc acagttgtct cggttattga cagtggcatt 2400 gatccaacac ataaagacat gcggctaagc gatgataaag acgttaaact aaccaaatct 2460 gatgttgaaa aattcactga taccgttaag catggccgct attttaattc aaaagtgcca 2520 tatgggttta attacgctga taataacgac accattacag atgataaggt tgacgaacaa 2580 cacggcatgc atgttgctgg gatcatcggt gctaacggga caggtgacga tccagccaag 2640 tctgttgtcg gagttgcacc agaagcacag ctactggcaa tgaaagtttt cagcaactct 2700 gacacttctg caaaaaccgg gtcagctacc gtggtttctg ccattgaaga ctcggcaaaa 2760 atcggtgccg atgtcctcaa catgtcctta ggatctaatt caggcaacca aaccttggag 2820 gatccagaac ttgctgcggt gcaaaatgct aacgaatcag gaacagccgc cgtcatttct 2880 gctgggaact caggaacatc cggttcagca actgaaggcg tcaacaaaga ttattacggt 2940 ttgcaagaca atgaaatggt gggatcgcca gggacatcac gaggagcgac cacagttgct 3000 tccgctgaaa acacggatgt catcactcag gcagtgacca ttacagatgg tacaggttta 3060 cagcttggac cggaaaccat tcagctttca agccacgatt tcactggtag ctttgaccaa 3120 aagaagtttt atattgttaa agatgctagt ggcaacctca gcaaaggggc attagccgac 3180 tatactgctg acgctaaagg caaaattgcc atcgttaaac gtggcgaatt tagctttgat 3240 gacaaacaaa aatacgccca agccgctggt gctgctggct tgatcattgt caacaccgat 3300 ggcacagcaa caccgatgac ttctattgcg ttaaccacca ccttcccaac atttgggctc 3360 tccagtgtaa ccggtcaaaa gctggttgac tgggtcacag cacacccgga tgatagtctc 3420 ggtgtcaaga ttaccctggc gatgttacca aatcagaaat atactgaaga caagatgtct 3480 gacttcacat cctatgggcc agtttccaat ctttccttca aaccagatat taccgcacca 3540 ggcggcaaca tctggtcaac gcaaaacaac aatggctaca caaatatgtc tggtacgtca 3600 atggcctcgc catttattgc cggttcacaa gcattgttga aacaagcatt gaataacaaa 3660 aacaacccat tttatgctta ctacaaacaa cttaaaggga cagcgctcac cgattttctt 3720 aagacagttg agatgaatac tgcccagcca atcaacgata ttaactacaa taatgttatc 3780 gtatcgccgc ggcggcaagg ggccggtctg gttgatgtga aggcagccat tgatgcatta 3840 gaaaagaatc cgtcaacggt tgtcgccgaa aacggctacc cggcagttga attgaaagac 3900 ttcacgagta cggacaagac ctttaaactc accttcacga atcgcacgac ccatgaacta 3960 acctatcaaa tggacagtaa tacggatact aatgccgttt atacatcagc gactgaccct 4020 aattctgggg ttttgtatga caagaagatt gatggagcag ccattaaagc tggcagtaac 4080 ataactgtgc ctgctgggaa aacggcgcag attgaattca cactatcttt gccgaagtct 4140 tttgaccaac agcaatttgt tgaaggtttt ctgaacttta agggtagcga tggatcgcgc 4200 ttgaacttgc catacatggg cttttttggt gactggaatg acggtaagat tgtcgatagt 4260 ctcaatggga tcacttatag tcctgctggt ggtaattttg gcaccgtgcc actattgaaa 4320 aacaaaaata caggcactca atattatggc ggcatggtca cagacgctga tggcaacaag 4380 acagttgacg atcaggcgat tgctttttcg agtgacaaga atgccttata taatgacatc 4440 agcatgaagt attatctatt gcgcaatatc agcaacgtcc aagttgatat tcttgatggt 4500 cagggcaata aagttacgac tctcagcagt tccaccaatc ggaagaagac ctattataat 4560 gctcattcgc agcagtacat ctactacaat gctccagcgt gggatggcac ctattatgat 4620 caacgtgatg gcaacatcaa gacggctgat gatggcagtt atacttatcg tatttccggt 4680 gtaccggaag gcggcgacaa acgtcaagtg tttgatgtgc ctttcaagct cgactctaag 4740 gcgccgacag ttcgtcatgt cgctttgtca gccaaaacgg aaaatgggaa aacccagtat 4800 tatttgacag ctgaagccaa ggatgatttg agtggtcttg atgccaccaa gagcgttaaa 4860 actgaaatta atgaagtgac gaatcttgat gctaccttta ccgatgctgg gacaacggct 4920 gatgggtaca ccaaaattga aacgccatta tctgatgaac aggcccaagc acttggcaat 4980 ggcgacaatt cggctgagct gtacttgact gataatgcat ccaatgccac tgatcaagat 5040 gccagcgttc agaagccggg gtctacatcg tttgatttaa ttgtgaacgg cggcggtatc 5100 ccagacaaga tctcaagtac cacaaccggc tacgaagcca atactcaagg tggcgggacg 5160 tatacgttta gtggaacgta tccagcagcg gttgacggta cttacactga tgcacaagga 5220 aagaaacatg atttgaacac aacctacgat gctgcgacta acagtttcac tgcctcaatg 5280 ccggtcacga atgctgatta cgccgcgcaa gtggatctat atgccgataa ggcgcatacc 5340 cagttgctta aacattttga caccaaagtt cggctgatgg cgccaacctt tactgatttg 5400 aaattcaaca atggctcgga tcagacctct gaagcgacca tcaaggttac agggacggtt 5460 agtgctgaca ccaagacagt taatgttggc cacaccgtag cagcacttga tgcacaacat 5520 cactttagtg ttgatgtacc ggttaattat ggtgacaata ccatcaaggt gaccgccacc 5580 gacaaagatg gcaacaccac gacggagcaa aagacgatta cctcgtctta tgatcctgat 5640 atgttgaaga agtctgtgac gttcgatcaa ggtgtgaaat ttggtaccaa taaattcaat 5700 gccacctcgg ctaagttcta tgaccctaag accgggattg cgacgattac tggtaaggtc 5760 aagcacccaa cgacaacgtt gcaggttgat ggtaagcaaa ttccaatcaa ggatgatctg 5820 actttcagtt tcactttaga tttaggtact cttggacaaa aaccgtttgg ggttgttgtg 5880 ggtgacacca ctcaaaacaa aaccttccaa gaagcgttgt ccttcatttt ggatgcagtg 5940 gctccaacat tgtcattgga tagctcgaca gatgcaccgg tttataccaa cgatccaaac 6000 ttccagatta ccggaacggc cactgacaat gcgcaatatc tgagtctgtc aattaacggc 6060 agttctgtcg ccagccaata cgaagacatc aacatcaata gcggcaaacc aggtcatatg 6120 gctattgatc agcccgttaa attgctcgaa ggcaaaaacg tgctgactgt tgctgttaca 6180 gatagcgaag acaacaccac gaccaagaac atcacagttt actacgaacc aaagaaaaca 6240 ctggcagcac caactgtgac gccaagtacc actgaaccag cccaaacggt gactctgacg 6300 gcaaacgctg ccgcaacggg cgaaacggtt cagtatagtg ctgatggtgg caagacatat 6360 caggatgttc cggcagccgg tgtcacgatc acggcaaatg gcaccttcaa gtttaagtcg 6420 actgatttat acggtaatga atcaccagcc gtcgactatg ttgtcaccaa tatcaaggcc 6480 gatgatcctg cacaattgca ggcagctaag caggaactga ctaatctgat tgcttccgcc 6540 aaaacgctaa gtgccagcgg taagtatgat gatgccacaa cgactgcttt agcagcggca 6600 acgcagaagg cacaaacggc gcttgatcag acgaacgcct cagttgattc acttactggt 6660 gccaatcgag acctgcaaac tgcgatcaat caattagctg ccaagttacc tgcagataag 6720 aagacttcgc tgcttaacca gttgcaatct gtgaaggatg cgctgggaac ggacttgggc 6780 aatcaaactg atccaagcac tggcaaaaca tttacggcag cgttagacga cctagtggca 6840 caagctcaag caggcacgca aacggacgac cagcttcaag caactcttgc caagatactt 6900 gatgaagtat tagcaaaact tgcggagggt attaaagcgg caacaccggc tgaggttggc 6960 aatgctaaag atgctgcaac tggcaaaact tggtatgccg acattgctga cacattgacg 7020 tctggtcaag ccagtgctga tgcgtctgac aagcttgcac atttacaagc tttgcaaagt 7080 ctgaaaacga aggtggcagc tgccgttgaa gcggccaaga cagttggtaa aggcgacggt 7140 acaaccggta ctagcgacaa aggcggcggt caaggtaccc cggcgcccgc tccaggcgac 7200 acaggtaagg acaaaggaga tgagggcagc cagcctagtt ctggcggtaa tatcccaaca 7260 aagccagcca caacgacgtc aacgaccacg gatgatacga ctgatcgtaa tggtcaactt 7320 acatccggta ctagcgacaa aggcggcggt caaggtaccc cggcgcccgc tccaggcgac 7380 ataggtaagg acaaaggcga tgagggcagc cagcctagtt ctggcggtaa tatcccaaca 7440 aatccagcca caacgacgtc aacgaccacg gatgatacga ctgatcgtaa tggtcaactt 7500 acatccggta agggagcatt acccaagaca ggagagacaa ctgagcggcc agcgtttggc 7560 ttcttgggtg tcattgtggt cagtctgatg ggggtattag gattgaaacg gaaacaacgt 7620 gaagaatagc ctgtccatgc gttgcgttta gggcagcagc gtatcgacaa aaagaaaagg 7680 gcgctacgat atttggagtt gaggttcaaa gtcaaatggt actgatgacc ggtaaaattt 7740 aatattttga accttgctta ggcagctgac ttcacattgt tgagatcagc tgccttttgc 7800 ttatagttca ttgagtagaa acggttctgt tgcgaagttt gaaaatcaaa cgcgcccgct 7860 ctgaactcca aatatcttag gctgttattc ccattaatac cttgatttca gtagacaccg 7920 aaaagccgaa gagcgttcca tttcttcggt tatttttata tattcctcga agggtctcca 7980 tgcccttaat cgtggaagag gctgtacgga gactttgata aaatttaatc cgtcgtttaa 8040 taggtcgatg gtcttgttct attaaattgt taagatactt cacagttcgg tgctctgtct 8100 tagtatataa accca 8115 <210> 323 <211> 1101 <212> PRT <213> Drosophila melanogaster <220> <223> Furin-like protease 1, isoform 1-CRR precursor (Furin-1) S08.048 <400> 323 Met Lys Asn Asp Val Val Arg Trp Ser Arg Gln Pro Thr Ser Asn Thr 1 5 10 15 Thr Asn Ser Ser Ser Ser Ser Arg Ser Asp Ser Asn Ser Thr His Lys 20 25 30 His Arg Ser Lys Ser Asn Lys Leu Asn Ala Arg Gln Leu Gly Ser Asn 35 40 45 Ala Ala Arg Ser Cys Gln Gln Arg Ser Ser Val Ala Thr Thr Leu Glu 50 55 60 Asp Glu Gln Gln Thr Ile Ile Glu Cys Asp Ile Gly Asn Phe Asn Phe 65 70 75 80 Asp Cys Asn Leu Phe Lys Thr Ser Phe Leu Thr Gln His Lys Gln Lys 85 90 95 Arg Ser Gly Lys Ser Ser Ser Lys Ser Lys Ser Asn Arg Ser Arg Pro 100 105 110 Leu Ala Lys Thr Lys Ala Val Phe Leu Leu Ala Leu Gln Phe Ser Ala 115 120 125 Val Val Phe Leu Cys Asn Ile Asn Val Gly Phe Val Ala Gly Ser Val 130 135 140 Ala Thr Ala Ala Ser Ser Ala Gly Gly Ser Ser Pro Ala Ala Pro Ser 145 150 155 160 Ser Ala Pro Ser Ser Pro Pro Thr Val Ala Val Pro Pro Pro Pro Pro 165 170 175 Pro Ser Ser Ala Leu Lys Val Asp Pro Asn Gly Gln Ser Pro Val Leu 180 185 190 Pro Pro Tyr Val Leu Asp Tyr Glu Thr Gly Gly Lys Ala Lys Leu Thr 195 200 205 Pro Asn Asn Gly Lys Phe Gly Gln Ser Gly Ser Ser Gly Ser Asn Asn 210 215 220 Asn His Ile Val Gly His Tyr Thr His Thr Trp Ala Val His Ile Pro 225 230 235 240 Asn Gly Asp Asn Gly Met Ala Asp Ala Val Ala Lys Asp His Gly Phe 245 250 255 Val Asn Leu Gly Lys Ile Phe Asp Asp His Tyr His Phe Ala His His 260 265 270 Lys Val Ser Lys Arg Ser Leu Ser Pro Ala Thr His His Gln Thr Arg 275 280 285 Leu Asp Asp Asp Asp Arg Val His Trp Ala Lys Gln Gln Arg Ala Lys 290 295 300 Ser Arg Ser Lys Arg Asp Phe Ile Arg Met Arg Pro Ser Arg Thr Ser 305 310 315 320 Ser Arg Ala Met Ser Met Val Asp Ala Met Ser Phe Asn Asp Ser Lys 325 330 335 Trp Pro Gln Met Trp Tyr Leu Asn Arg Gly Gly Gly Leu Asp Met Asn 340 345 350 Val Ile Pro Ala Trp Lys Met Gly Ile Thr Gly Lys Gly Val Val Val 355 360 365 Thr Ile Leu Asp Asp Gly Leu Glu Ser Asp His Pro Asp Ile Gln Asp 370 375 380 Asn Tyr Asp Pro Lys Ala Ser Tyr Asp Val Asn Ser His Asp Asp Asp 385 390 395 400 Pro Met Pro His Tyr Asp Met Thr Asp Ser Asn Arg His Gly Thr Arg 405 410 415 Cys Ala Gly Glu Val Ala Ala Thr Ala Asn Asn Ser Phe Cys Ala Val 420 425 430 Gly Ile Ala Tyr Gly Ala Ser Val Gly Gly Val Arg Met Leu Asp Gly 435 440 445 Asp Val Thr Asp Ala Val Glu Ala Arg Ser Leu Ser Leu Asn Pro Gln 450 455 460 His Ile Asp Ile Tyr Ser Ala Ser Trp Gly Pro Asp Asp Asp Gly Lys 465 470 475 480 Thr Val Asp Gly Pro Gly Glu Leu Ala Ser Arg Ala Phe Ile Glu Gly 485 490 495 Thr Thr Lys Gly Arg Gly Gly Lys Gly Ser Ile Phe Ile Trp Ala Ser 500 505 510 Gly Asn Gly Gly Arg Glu Gln Asp Asn Cys Asn Cys Asp Gly Tyr Thr 515 520 525 Asn Ser Ile Trp Thr Leu Ser Ile Ser Ser Ala Thr Glu Glu Gly His 530 535 540 Val Pro Trp Tyr Ser Glu Lys Cys Ser Ser Thr Leu Ala Thr Thr Tyr 545 550 555 560 Ser Ser Gly Gly Gln Gly Glu Lys Gln Val Val Thr Thr Asp Leu His 565 570 575 His Ser Cys Thr Val Ser His Thr Gly Thr Ser Ala Ser Ala Pro Leu 580 585 590 Ala Ala Gly Ile Ala Ala Leu Val Leu Gln Ser Asn Gln Asn Leu Thr 595 600 605 Trp Arg Asp Leu Gln His Ile Val Val Arg Thr Ala Lys Pro Ala Asn 610 615 620 Leu Lys Asp Pro Ser Trp Ser Arg Asn Gly Val Gly Arg Arg Val Ser 625 630 635 640 His Ser Phe Gly Tyr Gly Leu Met Asp Ala Ala Glu Met Val Arg Val 645 650 655 Ala Arg Asn Trp Lys Ala Val Pro Glu Gln Gln Arg Cys Glu Ile Asn 660 665 670 Ala Pro His Val Asp Lys Val Ile Pro Pro Arg Thr His Ile Thr Leu 675 680 685 Gln Leu Thr Val Asn His Cys Arg Ser Val Asn Tyr Leu Glu His Val 690 695 700 Gln Ala Lys Ile Thr Leu Thr Ser Gln Arg Arg Gly Asp Ile Gln Leu 705 710 715 720 Phe Leu Arg Ser Pro Ala Asn Thr Ser Val Thr Leu Leu Thr Pro Arg 725 730 735 Ile His Asp Asn Ser Arg Ser Gly Phe Asn Gln Trp Pro Phe Met Ser 740 745 750 Val His Thr Trp Gly Glu Ser Pro Gln Gly Asn Trp Gln Leu Glu Ile 755 760 765 His Asn Glu Gly Arg Tyr Met Ala Gln Ile Thr Gln Trp Asp Met Ile 770 775 780 Phe Tyr Gly Thr Glu Thr Pro Ala Gln Pro Asp Asp Val Ala Asn Pro 785 790 795 800 Ser Gln Ser Asn Gln Phe Asn Leu Tyr Gly Asn Asp Met Ala His Asn 805 810 815 Asp Val Glu Tyr Asp Ser Thr Gly Gln Trp Arg Asn Met Gln Gln Val 820 825 830 Gly Glu Val Gly Met Thr Arg Asp His Ser Asn Thr Ala Ala Cys Leu 835 840 845 Lys Trp Ser Asp Arg Lys Cys Leu Glu Cys Asn Asp Ser Ala Tyr Met 850 855 860 Phe Glu Asp Gln Cys Tyr Asp Val Cys Pro Val His Thr Tyr Pro Leu 865 870 875 880 Asp Lys Phe Gln Ala Glu Glu Asp Glu Gln Asp Asp Glu Val Thr Arg 885 890 895 Gly Pro Val Asn Pro Tyr Ser Ser Ser Pro Met Asp His Ser Leu Leu 900 905 910 Met Ser Asn Ser Leu Asp Asp Lys Gln Asp Pro Leu Gln Ala Glu Asp 915 920 925 Arg Arg Arg Arg Ser Ser Leu Thr Gln Leu Val Glu Val Pro Ser Arg 930 935 940 Val Cys Ala Ala Cys Asp Arg Ser Cys Leu Glu Cys Tyr Gly Ala Leu 945 950 955 960 Ala Ser Gln Cys Ser Thr Cys Ser Pro Gly Ser Gln Leu Arg Lys Ile 965 970 975 Leu Asn Glu Thr Phe Cys Tyr Ala Tyr Val Val Arg Ser Thr Gly Met 980 985 990 Ala Ser Val Val Asp Ile Ser Lys Met Asp Asp Arg Asp Thr Gln Gln 995 1000 1005 Tyr Met Thr Gly Thr Thr Val Leu Leu Leu Val Ser Val Ile Phe Thr 1010 1015 1020 Leu Met Gly Val Ala Val Ala Gly Gly Ile Val Tyr His Arg Arg Ala 1025 1030 1035 1040 Met Ala Arg Ser Asn Glu Leu Tyr Ser Arg Val Ser Leu Val Pro Gly 1045 1050 1055 Asp Glu Ser Asp Ser Asp Glu Asp Glu Leu Phe Thr Ala His Phe Pro 1060 1065 1070 Ala Arg Lys Ser Gly Val Asn Ile Tyr Arg Asp Glu Ala Pro Ser Glu 1075 1080 1085 Lys Ile Phe Glu Glu Asp Glu Ile Ser His Leu Val Pro 1090 1095 1100 <210> 324 <211> 3781 <212> DNA <213> Drosophila melanogaster <220> <223> Furin-like protease 1, isoform 1-CRR precursor (Furin-1) S08.048 <400> 324 gacaacaaca aatttaaatt gagattttcc atattatcaa aagttacagg cgcctatttt 60 gcagttatca gtctgaagtc ggtgtgaagt gctatcctgg acttttcgtt ttagtcaccc 120 cttggcctca tctaacatcc acttaattga aatagaacat ttgcatctca gcctcacaac 180 caatatcccg agcaacgtgc acaaaaacta ttggaaaaat cctaacccac aatgaaaaac 240 gacgtcgtgc gatggagcag gcagccaact agcaacacca ctaacagcag cagcagcagt 300 agaagcgata gcaacagcac tcataagcac agaagcaaaa gcaacaaatt aaatgctcga 360 caattagggt caaatgctgc cagaagttgt cagcaaagat cctctgtggc aacaacacta 420 gaagatgaac aacaaacaat cattgaatgt gatataggaa atttcaattt cgattgcaat 480 ttattcaaaa ctagtttttt aacgcaacac aaacagaaac gtagtggcaa gagcagcagc 540 aaaagtaaga gcaacagaag tagaccccta gcgaaaacga aagcggtgtt tctattagct 600 ctgcaattta gtgccgtagt ttttttatgt aatattaatg tcggtttcgt ggccggaagt 660 gtggcaactg cggcatcatc ggcaggcggc tcatcgccgg cagctccatc atctgcgccc 720 tcatccccgc ccacagttgc tgtaccaccg ccgccgccac cttcgtcggc actcaaagtg 780 gatccaaatg gtcagtcacc agtgctgccg ccctacgttc tcgattatga gacggggggc 840 aaggccaagc taacgccaaa caatggcaag ttcggccaat cgggcagttc cgggagcaat 900 aacaaccaca tcgtcggaca ctatacccac acctgggcgg tgcacatacc aaacggcgat 960 aatggcatgg ccgatgcggt tgccaaggat cacggattcg tcaatttggg caagatcttc 1020 gatgatcact accacttcgc acatcacaag gtctcgaagc ggtcgctctc ccccgccacg 1080 catcaccaaa ctcgcctgga tgacgacgat cgcgtccact gggcgaagca gcagcgggcc 1140 aagtcgcgat ccaaacggga ctttatccgc atgcgaccct cacggacctc ctcgcgagcc 1200 atgtcgatgg tggacgccat gtcctttaac gactccaagt ggccgcagat gtggtatctg 1260 aatcgtggtg gtggcctgga catgaatgtg atacccgcct ggaagatggg cataaccggc 1320 aagggcgtgg tggtgacaat tctggatgat ggcctggaat ccgatcatcc ggacatacag 1380 gataactacg atcccaaagc ctcgtacgat gtgaatagcc acgacgacga tccgatgccg 1440 cattacgata tgacggactc gaaccgccat ggaactcgct gtgccggcga ggtggcagcc 1500 accgccaaca attcgttctg cgcggtgggt attgcctacg gcgccagtgt gggcggagtc 1560 aggatgctgg acggagacgt cacggatgcg gttgaggcac ggtcgctgtc gctgaatccg 1620 cagcacattg acatatacag tgcctcctgg ggacccgatg acgatggcaa gacggtggac 1680 ggacccggcg aactggcatc gcgcgccttt atcgagggca caactaaggg acgcggcggc 1740 aagggcagca tcttcatatg ggcatcgggc aatggtgggc gggagcagga taactgcaac 1800 tgcgacggct acacgaactc catctggacg ctgtccatct ccagtgccac ggaggagggc 1860 catgtgccct ggtactcgga gaagtgcagc tccacgctgg ccaccaccta cagcagcggc 1920 gggcagggcg agaagcaggt ggtcaccacg gacctgcacc actcgtgcac tgtctcccac 1980 acgggcacct cggcgtcggc cccgctcgcc gctggcatag ccgccctggt gctgcagtcc 2040 aaccagaatc tcacctggcg cgatctgcag cacattgttg tgcgcaccgc caagccggcg 2100 aaccttaagg accccagctg gtcacgcaat ggggtggggc ggcgggtgag ccactccttt 2160 ggctacggat tgatggacgc cgccgagatg gtgcgcgtgg cccgcaactg gaaggcggtg 2220 ccggagcagc agcggtgcga gattaacgct ccccatgtcg acaaggtcat tccacctcgt 2280 acccatatca ccctgcaact gacggttaat cactgtcgat cggtcaatta cctggagcac 2340 gtccaggcca agattacgct aacgtcgcag agacgaggag acattcagct ctttttgagg 2400 tctcccgcaa acaccagtgt cacgctccta acgcctagga tacatgacaa ctctcgttcc 2460 ggattcaatc aatggccctt catgtctgtg cacacctggg gagagtcgcc gcaaggaaac 2520 tggcagctgg agatccacaa cgagggtcgc tatatggcac aaatcacaca atgggatatg 2580 atattctacg gcaccgaaac gcccgcccaa cccgatgacg tggccaatcc cagccagtcg 2640 aaccagttca atctgtacgg caacgatatg gcccacaatg acgtcgagta cgattccacc 2700 ggccagtgga ggaatatgca gcaggtgggc gaggtgggca tgacccgaga tcacagcaac 2760 accgccgcgt gccttaagtg gagcgatcgc aagtgcttag agtgcaatga ctccgcctat 2820 atgttcgagg accagtgcta cgatgtctgc ccggtgcaca catatccatt ggacaagttc 2880 caagcagagg aggatgagca ggatgacgag gtgacaaggg gtccggttaa tccctacagc 2940 agctccccca tggatcattc cctgttgatg tccaacagct tggatgacaa gcaagatcct 3000 ctgcaggcgg aggatcgacg tcgtcgtagt tcactcaccc aactggtgga ggtgccttct 3060 cgggtctgtg ccgcctgcga tcggagctgc ttggagtgct acggtgccct ggcctcccag 3120 tgcagcacct gctccccggg cagccaactg cgtaagatcc tgaacgagac cttctgctat 3180 gcctatgtgg tgcgtagcac gggaatggcc agtgtggtgg acatttccaa aatggacgat 3240 agagataccc agcaatatat gactggcaca attgtgctcc ttttggtttc ggtgattttc 3300 accctgatgg gcgtagcagt ggccggtggc atcgtgtatc atcgaagggc aatggctcga 3360 tccaacgaac tatactcccg agtttcccta gtccccggtg acgaaagtga ctctgacgag 3420 gatgaactgt ttacggccca cttcccagcg agaaagagtg gtgttaatat atatcgcgat 3480 gaagcgccca gcgaaaagat attcgaggaa gatgagatca gccacttggt accctaaata 3540 atcaaaacaa gttattagtt aggtcatgca tttagccatc ctcataacca ccagaaatat 3600 atctatatgt taagcaaccg acaaacgcat ttttggtcta tattttgtta cattcgacgg 3660 cattacagct cctttatttc aagccaaaat agattaaagt attaaatgta aaagaaaaaa 3720 aatcaaaact aattatttgt aatatttatg ccttaataaa atgattttaa ctgaaaaaaa 3780 a 3781 <210> 325 <211> 814 <212> PRT <213> Saccharomyces cerevisiae <220> <223> Kexin precursor (KEX2 protease) S08.048 <400> 325 Met Lys Val Arg Lys Tyr Ile Thr Leu Cys Phe Trp Trp Ala Phe Ser 1 5 10 15 Thr Ser Ala Leu Val Ser Ser Gln Gln Ile Pro Leu Lys Asp His Thr 20 25 30 Ser Arg Gln Tyr Phe Ala Val Glu Ser Asn Glu Thr Leu Ser Arg Leu 35 40 45 Glu Glu Met His Pro Asn Trp Lys Tyr Glu His Asp Val Arg Gly Leu 50 55 60 Pro Asn His Tyr Val Phe Ser Lys Glu Leu Leu Lys Leu Gly Lys Arg 65 70 75 80 Ser Ser Leu Glu Glu Leu Gln Gly Asp Asn Asn Asp His Ile Leu Ser 85 90 95 Val His Asp Leu Phe Pro Arg Asn Asp Leu Phe Lys Arg Leu Pro Val 100 105 110 Pro Ala Pro Pro Met Asp Ser Ser Leu Leu Pro Val Lys Glu Ala Glu 115 120 125 Asp Lys Leu Ser Ile Asn Asp Pro Leu Phe Glu Arg Gln Trp His Leu 130 135 140 Val Asn Pro Ser Phe Pro Gly Ser Asp Ile Asn Val Leu Asp Leu Trp 145 150 155 160 Tyr Asn Asn Ile Thr Gly Ala Gly Val Val Ala Ala Ile Val Asp Asp 165 170 175 Gly Leu Asp Tyr Glu Asn Glu Asp Leu Lys Asp Asn Phe Cys Ala Glu 180 185 190 Gly Ser Trp Asp Phe Asn Asp Asn Thr Asn Leu Pro Lys Pro Arg Leu 195 200 205 Ser Asp Asp Tyr His Gly Thr Arg Cys Ala Gly Glu Ile Ala Ala Lys 210 215 220 Lys Gly Asn Asn Phe Cys Gly Val Gly Val Gly Tyr Asn Ala Lys Ile 225 230 235 240 Ser Gly Ile Arg Ile Leu Ser Gly Asp Ile Thr Thr Glu Asp Glu Ala 245 250 255 Ala Ser Leu Ile Tyr Gly Leu Asp Val Asn Asp Ile Tyr Ser Cys Ser 260 265 270 Trp Gly Pro Ala Asp Asp Gly Arg His Leu Gln Gly Pro Ser Asp Leu 275 280 285 Val Lys Lys Ala Leu Val Lys Gly Val Thr Glu Gly Arg Asp Ser Lys 290 295 300 Gly Ala Ile Tyr Val Phe Ala Ser Gly Asn Gly Gly Thr Arg Gly Asp 305 310 315 320 Asn Cys Asn Tyr Asp Gly Tyr Thr Asn Ser Ile Tyr Ser Ile Thr Ile 325 330 335 Gly Ala Ile Asp His Lys Asp Leu His Pro Pro Tyr Ser Glu Gly Cys 340 345 350 Ser Ala Val Met Ala Val Thr Tyr Ser Ser Gly Ser Gly Glu Tyr Ile 355 360 365 His Ser Ser Asp Ile Asn Gly Arg Cys Ser Asn Ser His Gly Gly Thr 370 375 380 Ser Ala Ala Ala Pro Leu Ala Ala Gly Val Tyr Thr Leu Leu Leu Glu 385 390 395 400 Ala Asn Pro Asn Leu Thr Trp Arg Asp Val Gln Tyr Leu Ser Ile Leu 405 410 415 Ser Ala Val Gly Leu Glu Lys Asn Ala Asp Gly Asp Trp Arg Asp Ser 420 425 430 Ala Met Gly Lys Lys Tyr Ser His Arg Tyr Gly Phe Gly Lys Ile Asp 435 440 445 Ala His Lys Leu Ile Glu Met Ser Lys Thr Trp Glu Asn Val Asn Ala 450 455 460 Gln Thr Trp Phe Tyr Leu Pro Thr Leu Tyr Val Ser Gln Ser Thr Asn 465 470 475 480 Ser Thr Glu Glu Thr Leu Glu Ser Val Ile Thr Ile Ser Glu Lys Ser 485 490 495 Leu Gln Asp Ala Asn Phe Lys Arg Ile Glu His Val Thr Val Thr Val 500 505 510 Asp Ile Asp Thr Glu Ile Arg Gly Thr Thr Thr Val Asp Leu Ile Ser 515 520 525 Pro Ala Gly Ile Ile Ser Asn Leu Gly Val Val Arg Pro Arg Asp Val 530 535 540 Ser Ser Glu Gly Phe Lys Asp Trp Thr Phe Met Ser Val Ala His Trp 545 550 555 560 Gly Glu Asn Gly Val Gly Asp Trp Lys Ile Lys Val Lys Thr Thr Glu 565 570 575 Asn Gly His Arg Ile Asp Phe His Ser Trp Arg Leu Lys Leu Phe Gly 580 585 590 Glu Ser Ile Asp Ser Ser Lys Thr Glu Thr Phe Val Phe Gly Asn Asp 595 600 605 Lys Glu Glu Val Glu Pro Ala Ala Thr Glu Ser Thr Val Ser Gln Tyr 610 615 620 Ser Ala Ser Ser Thr Ser Ile Ser Ile Ser Ala Thr Ser Thr Ser Ser 625 630 635 640 Ile Ser Ile Gly Val Glu Thr Ser Ala Ile Pro Gln Thr Thr Thr Ala 645 650 655 Ser Thr Asp Pro Asp Ser Asp Pro Asn Thr Pro Lys Lys Leu Ser Ser 660 665 670 Pro Arg Gln Ala Met His Tyr Phe Leu Thr Ile Phe Leu Ile Gly Ala 675 680 685 Thr Phe Leu Val Leu Tyr Phe Met Phe Phe Met Lys Ser Arg Arg Arg 690 695 700 Ile Arg Arg Ser Arg Ala Glu Thr Tyr Glu Phe Asp Ile Ile Asp Thr 705 710 715 720 Asp Ser Glu Tyr Asp Ser Thr Leu Asp Asn Gly Thr Ser Gly Ile Thr 725 730 735 Glu Pro Glu Glu Val Glu Asp Phe Asp Phe Asp Leu Ser Asp Glu Asp 740 745 750 His Leu Ala Ser Leu Ser Ser Ser Glu Asn Gly Asp Ala Glu His Thr 755 760 765 Ile Asp Ser Val Leu Thr Asn Glu Asn Pro Phe Ser Asp Pro Ile Lys 770 775 780 Gln Lys Phe Pro Asn Asp Ala Asn Ala Glu Ser Ala Ser Asn Lys Leu 785 790 795 800 Gln Glu Leu Gln Pro Asp Val Pro Pro Ser Ser Gly Arg Ser 805 810 <210> 326 <211> 2848 <212> DNA <213> Saccharomyces cerevisiae <220> <223> Kexin precursor (KEX2 protease) S08.048 <400> 326 tgcataattc tgtcataagc ctgttctttt tcctggctta aacatcccgt tttgtaaaag 60 agaaatctat tccacatatt tcattcattc ggctaccata ctaaggataa actaatcccg 120 ttgttttttg gcctcgtcac ataattataa actactaacc cattatcaga tgaaagtgag 180 gaaatatatt actttatgct tttggtgggc cttttcaaca tccgctcttg tatcatcaca 240 acaaattcca ttgaaggacc atacgtcacg acagtatttt gctgtagaaa gcaatgaaac 300 attatcccgc ttggaggaaa tgcatccaaa ttggaaatat gaacatgatg ttcgagggct 360 accaaaccat tatgtttttt caaaagagtt gctaaaattg ggcaaaagat catcattaga 420 agagttacag ggggataaca acgaccacat attatctgtc catgatttat tcccgcgtaa 480 cgacctattt aagagactac cggtgcctgc tccaccaatg gactcaagct tgttaccggt 540 aaaagaagct gaggataaac tcagcataaa tgatccgctt tttgagaggc agtggcactt 600 ggtcaatcca agttttcctg gcagtgatat aaatgttctt gatctgtggt acaataatat 660 tacaggcgca ggggtcgtgg ctgccattgt tgatgatggc cttgactacg aaaatgaaga 720 cttgaaggat aatttttgcg ctgaaggttc ttgggatttc aacgacaata ccaatttacc 780 taaaccaaga ttatctgatg actaccatgg tacgagatgt gcaggtgaaa tagctgccaa 840 aaaaggtaac aatttttgcg gtgtcggggt aggttacaac gctaaaatct caggcataag 900 aatcttatcc ggtgatatca ctacggaaga tgaagctgcg tccttgattt atggtctaga 960 cgtaaacgat atatattcat gctcatgggg tcccgctgat gacggaagac atttacaagg 1020 ccctagtgac ctggtgaaaa aggctttagt aaaaggtgtt actgagggaa gagattccaa 1080 aggagcgatt tacgtttttg ccagtggaaa tggtggaact cgtggtgata attgcaatta 1140 cgacggctat actaattcca tatattctat tactattggg gctattgatc acaaagatct 1200 acatcctcct tattccgaag gttgttccgc cgtcatggca gtcacgtatt cttcaggttc 1260 aggcgaatat attcattcga gtgatatcaa cggcagatgc agtaatagcc acggtggaac 1320 gtctgcggct gctccattag ctgccggtgt ttacactttg ttactagaag ccaacccaaa 1380 cctaacttgg agagacgtac agtatttatc aatcttgtct gcggtagggt tagaaaagaa 1440 cgctgacgga gattggagag atagcgccat ggggaagaaa tactctcatc gctatggctt 1500 tggtaaaatc gatgcccata agttaattga aatgtccaag acctgggaga atgttaacgc 1560 acaaacctgg ttttacctgc caacattgta tgtttcccag tccacaaact ccacggaaga 1620 gacattagaa tccgtcataa ccatatcaga aaaaagtctt caagatgcta acttcaagag 1680 aattgagcac gtcacggtaa ctgtagatat tgatacagaa attaggggaa ctacgactgt 1740 cgatttaata tcaccagcgg ggataatttc aaaccttggc gttgtaagac caagagatgt 1800 ttcatcagag ggattcaaag actggacatt catgtctgta gcacattggg gtgagaacgg 1860 cgtaggtgat tggaaaatca aggttaagac aacagaaaat ggacacagga ttgacttcca 1920 cagttggagg ctgaagctct ttggggaatc cattgattca tctaaaacag aaactttcgt 1980 ctttggaaac gataaagagg aggttgaacc agctgctaca gaaagtaccg tatcacaata 2040 ttctgccagt tcaacttcta tttccatcag cgctacttct acatcttcta tctcaattgg 2100 tgtggaaacg tcggccattc cccaaacgac tactgcgagt accgatcctg attctgatcc 2160 aaacactcct aaaaaacttt cctctcctag gcaagccatg cattattttt taacaatatt 2220 tttgattggc gccacatttt tggtgttata cttcatgttt tttatgaaat caaggagaag 2280 gatcagaagg tcaagagcgg aaacgtatga attcgatatc attgatacag actctgagta 2340 cgattctact ttggacaatg gaacttccgg aattactgag cccgaagagg ttgaggactt 2400 cgattttgat ttgtccgatg aagaccatct tgcaagtttg tcttcatcag aaaacggtga 2460 tgctgaacat acaattgata gtgtactaac aaacgaaaat ccatttagtg accctataaa 2520 gcaaaagttc ccaaatgacg ccaacgcaga atctgcttcc aataaattac aagaattaca 2580 gcctgatgtt cctccatctt ccggacgatc gtgattcgat atgtacagaa agcttcaaat 2640 tacaaaatag catttttttc ttatagatta taatactctc tcatacgtat acgtatatgt 2700 gtatatgata tataaacaaa cattaatatc ctattccttc cgtttgaaat ccctatgatg 2760 tactttgcat tgtttgcacc cgcgaataaa atgaaaactc cgaaccgata tatcaagcac 2820 ataaaagggg agggtccaat taatgcat 2848 <210> 327 <211> 794 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Furin precursor S08.071 <400> 327 Met Glu Leu Arg Pro Trp Leu Leu Trp Val Val Ala Ala Thr Gly Thr 1 5 10 15 Leu Val Leu Leu Ala Ala Asp Ala Gln Gly Gln Lys Val Phe Thr Asn 20 25 30 Thr Trp Ala Val Arg Ile Pro Gly Gly Pro Ala Val Ala Asn Ser Val 35 40 45 Ala Arg Lys His Gly Phe Leu Asn Leu Gly Gln Ile Phe Gly Asp Tyr 50 55 60 Tyr His Phe Trp His Arg Gly Val Thr Lys Arg Ser Leu Ser Pro His 65 70 75 80 Arg Pro Arg His Ser Arg Leu Gln Arg Glu Pro Gln Val Gln Trp Leu 85 90 95 Glu Gln Gln Val Ala Lys Arg Arg Thr Lys Arg Asp Val Tyr Gln Glu 100 105 110 Pro Thr Asp Pro Lys Phe Pro Gln Gln Trp Tyr Leu Ser Gly Val Thr 115 120 125 Gln Arg Asp Leu Asn Val Lys Ala Ala Trp Ala Gln Gly Tyr Thr Gly 130 135 140 His Gly Ile Val Val Ser Ile Leu Asp Asp Gly Ile Glu Lys Asn His 145 150 155 160 Pro Asp Leu Ala Gly Asn Tyr Asp Pro Gly Ala Ser Phe Asp Val Asn 165 170 175 Asp Gln Asp Pro Asp Pro Gln Pro Arg Tyr Thr Gln Met Asn Asp Asn 180 185 190 Arg His Gly Thr Arg Cys Ala Gly Glu Val Ala Ala Val Ala Asn Asn 195 200 205 Gly Val Cys Gly Val Gly Val Ala Tyr Asn Ala Arg Ile Gly Gly Val 210 215 220 Arg Met Leu Asp Gly Glu Val Thr Asp Ala Val Glu Ala Arg Ser Leu 225 230 235 240 Gly Leu Asn Pro Asn His Ile His Ile Tyr Ser Ala Ser Trp Gly Pro 245 250 255 Glu Asp Asp Gly Lys Thr Val Asp Gly Pro Ala Arg Leu Ala Glu Glu 260 265 270 Ala Phe Phe Arg Gly Val Ser Gln Gly Arg Gly Gly Leu Gly Ser Ile 275 280 285 Phe Val Trp Ala Ser Gly Asn Gly Gly Arg Glu His Asp Ser Cys Asn 290 295 300 Cys Asp Gly Tyr Thr Asn Ser Ile Tyr Thr Leu Ser Ile Ser Ser Ala 305 310 315 320 Thr Gln Phe Gly Asn Val Pro Trp Tyr Ser Glu Ala Cys Ser Ser Thr 325 330 335 Leu Ala Thr Thr Tyr Ser Ser Gly Asn Gln Asn Glu Lys Gln Ile Val 340 345 350 Thr Thr Asp Leu Arg Gln Lys Cys Thr Glu Ser His Thr Gly Thr Ser 355 360 365 Ala Ser Ala Pro Leu Ala Ala Gly Ile Ile Ala Leu Thr Leu Glu Ala 370 375 380 Asn Lys Asn Leu Thr Trp Arg Asp Met Gln His Leu Val Val Gln Thr 385 390 395 400 Ser Lys Pro Ala His Leu Asn Ala Asn Asp Trp Ala Thr Asn Gly Val 405 410 415 Gly Arg Lys Val Ser His Ser Tyr Gly Tyr Gly Leu Leu Asp Ala Gly 420 425 430 Ala Met Val Ala Leu Ala Gln Asn Trp Thr Thr Val Ala Pro Gln Arg 435 440 445 Lys Cys Ile Ile Asp Ile Leu Thr Glu Pro Lys Asp Ile Gly Lys Arg 450 455 460 Leu Glu Val Arg Lys Thr Val Thr Ala Cys Leu Gly Glu Pro Asn His 465 470 475 480 Ile Thr Arg Leu Glu His Ala Gln Ala Arg Leu Thr Leu Ser Tyr Asn 485 490 495 Arg Arg Gly Asp Leu Ala Ile His Leu Val Ser Pro Met Gly Thr Arg 500 505 510 Ser Thr Leu Leu Ala Ala Arg Pro His Asp Tyr Ser Ala Asp Gly Phe 515 520 525 Asn Asp Trp Ala Phe Met Thr Thr His Ser Trp Asp Glu Asp Pro Ser 530 535 540 Gly Glu Trp Val Leu Glu Ile Glu Asn Thr Ser Glu Ala Asn Asn Tyr 545 550 555 560 Gly Thr Leu Thr Lys Phe Thr Leu Val Leu Tyr Gly Thr Ala Pro Glu 565 570 575 Gly Leu Pro Val Pro Pro Glu Ser Ser Gly Cys Lys Thr Leu Thr Ser 580 585 590 Ser Gln Ala Cys Val Val Cys Glu Glu Gly Phe Ser Leu His Gln Lys 595 600 605 Ser Cys Val Gln His Cys Pro Pro Gly Phe Ala Pro Gln Val Leu Asp 610 615 620 Thr His Tyr Ser Thr Glu Asn Asp Val Glu Thr Ile Arg Ala Ser Val 625 630 635 640 Cys Ala Pro Cys His Ala Ser Cys Ala Thr Cys Gln Gly Pro Ala Leu 645 650 655 Thr Asp Cys Leu Ser Cys Pro Ser His Ala Ser Leu Asp Pro Val Glu 660 665 670 Gln Thr Cys Ser Arg Gln Ser Gln Ser Ser Arg Glu Ser Pro Pro Gln 675 680 685 Gln Gln Pro Pro Arg Leu Pro Pro Glu Val Glu Ala Gly Gln Arg Leu 690 695 700 Arg Ala Gly Leu Leu Pro Ser His Leu Pro Glu Val Val Ala Gly Leu 705 710 715 720 Ser Cys Ala Phe Ile Val Leu Val Phe Val Thr Val Phe Leu Val Leu 725 730 735 Gln Leu Arg Ser Gly Phe Ser Phe Arg Gly Val Lys Val Tyr Thr Met 740 745 750 Asp Arg Gly Leu Ile Ser Tyr Lys Gly Leu Pro Pro Glu Ala Trp Gln 755 760 765 Glu Glu Cys Pro Ser Asp Ser Glu Glu Asp Glu Gly Arg Gly Glu Arg 770 775 780 Thr Ala Phe Ile Lys Asp Gln Ser Ala Leu 785 790 <210> 328 <211> 4180 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Furin precursor S08.071 <400> 328 gcggggaagc agcagcggcc aggatgaatc ccaggtgctc tggagctgga tggtgaaggt 60 cggcactctt caccctcccg agccctgccc gtctcggccc catgccccca ccagtcagcc 120 ccgggccaca ggcagtgagc aggcacctgg gagccgaggc cctatgacca ggccaaggag 180 acgggcgctc cagggtccca gccacctgtc ccccccatgg agctgaggcc ctggttgcta 240 tgggtggtag cagcaacagg aaccttggtc ctgctagcag ctgatgctca gggccagaag 300 gtcttcacca acacgtgggc tgtgcgcatc cctggaggcc cagcggtggc caacagtgtg 360 gcacggaagc atgggttcct caacctgggc cagatcttcg gggactatta ccacttctgg 420 catcgaggag tgacgaagcg gtccctgtcg cctcaccgcc cgcggcacag ccggctgcag 480 agggagcctc aagtacagtg gctggaacag caggtggcaa agcgacggac taaacgggac 540 gtgtaccagg agcccacaga ccccaagttt cctcagcagt ggtacctgtc tggtgtcact 600 cagcgggacc tgaatgtgaa ggcggcctgg gcgcagggct acacagggca cggcattgtg 660 gtctccattc tggacgatgg catcgagaag aaccacccgg acttggcagg caattatgat 720 cctggggcca gttttgatgt caatgaccag gaccctgacc cccagcctcg gtacacacag 780 atgaatgaca acaggcacgg cacacggtgt gcgggggaag tggctgcggt ggccaacaac 840 ggtgtctgtg gtgtaggtgt ggcctacaac gcccgcattg gaggggtgcg catgctggat 900 ggcgaggtga cagatgcagt ggaggcacgc tcgctgggcc tgaaccccaa ccacatccac 960 atctacagtg ccagctgggg ccccgaggat gacggcaaga cagtggatgg gccagcccgc 1020 ctcgccgagg aggccttctt ccgtggggtt agccagggcc gaggggggct gggctccatc 1080 tttgtctggg cctcggggaa cgggggccgg gaacatgaca gctgcaactg cgacggctac 1140 accaacagta tctacacgct gtccatcagc agcgccacgc agtttggcaa cgtgccgtgg 1200 tacagcgagg cctgctcgtc cacactggcc acgacctaca gcagtggcaa ccagaatgag 1260 aagcagatcg tgacgactga cttgcggcag aagtgcacgg agtctcacac gggcacctca 1320 gcctctgccc ccttagcagc cggcatcatt gctctcaccc tggaggccaa taagaacctc 1380 acatggcggg acatgcaaca cctggtggta cagacctcga agccagccca cctcaatgcc 1440 aacgactggg ccaccaatgg tgtgggccgg aaagtgagcc actcatatgg ctacgggctt 1500 ttggacgcag gcgccatggt ggccctggcc cagaattgga ccacagtggc cccccagcgg 1560 aagtgcatca tcgacatcct caccgagccc aaagacatcg ggaaacggct cgaggtgcgg 1620 aagaccgtga ccgcgtgcct gggcgagccc aaccacatca ctcggctgga gcacgctcag 1680 gcgcggctca ccctgtccta taatcgccgt ggcgacctgg ccatccacct ggtcagcccc 1740 atgggcaccc gctccaccct gctggcagcc aggccacatg actactccgc agatgggttt 1800 aatgactggg ccttcatgac aactcattcc tgggatgagg atccctctgg cgagtgggtc 1860 ctagagattg aaaacaccag cgaagccaac aactatggga cgctgaccaa gttcaccctc 1920 gtactctatg gcaccgcccc tgaggggctg cccgtacctc cagaaagcag tggctgcaag 1980 accctcacgt ccagtcaggc ctgtgtggtg tgcgaggaag gcttctccct gcaccagaag 2040 agctgtgtcc agcactgccc tccaggcttc gccccccaag tcctcgatac gcactatagc 2100 accgagaatg acgtggagac catccgggcc agcgtctgcg ccccctgcca cgcctcatgt 2160 gccacatgcc aggggccggc cctgacagac tgcctcagct gccccagcca cgcctccttg 2220 gaccctgtgg agcagacttg ctcccggcaa agccagagca gccgagagtc cccgccacag 2280 cagcagccac ctcggctgcc cccggaggtg gaggcggggc aacggctgcg ggcagggctg 2340 ctgccctcac acctgcctga ggtggtggcc ggcctcagct gcgccttcat cgtgctggtc 2400 ttcgtcactg tcttcctggt cctgcagctg cgctctggct ttagttttcg gggggtgaag 2460 gtgtacacca tggaccgtgg cctcatctcc tacaaggggc tgccccctga agcctggcag 2520 gaggagtgcc cgtctgactc agaagaggac gagggccggg gcgagaggac cgcctttatc 2580 aaagaccaga gcgccctctg atgagcccac tgcccacccc ctcaagccaa tcccctcctt 2640 gggcactttt taattcacca aagtattttt ttatcttggg actgggtttg gaccccagct 2700 gggaggcaag aggggtggag actgtttccc atcctaccct cgggcccacc tggccacctg 2760 aggtgggccc aggaccagct ggggcgtggg gagggccgta ccccaccctc agcacccctt 2820 ccatgtggag aaaggagtga aacctttagg gcagcttgcc ccggccccgg ccccagccag 2880 agttcctgcg gagtgaagag gggcagccct tgcttgttgg gattcctgac ccaggccgca 2940 gctcttgccc ttccctgtcc ctctaaagca ataatggtcc catccaggca gtcgggggct 3000 ggcctaggag atatctgagg gaggaggcca cctctccaag ggcttctgca ccctccaccc 3060 tgtcccccag ctctggtgag tcttggcggc agcagccatc ataggaaggg accaaggcaa 3120 ggcaggtgcc tccaggtgtg cacgtggcat gtggcctgtg gcctgtgtcc catgacccac 3180 ccctgtgctc cgtgcctcca ccaccactgg ccaccaggct ggcgcagcca aggccgaagc 3240 tctggctgaa ccctgtgctg gtgtcctgac caccctcccc tctcttgcac ccgcctctcc 3300 cgtcagggcc caagtccctg ttttctgagc ccgggctgcc tgggctgttg gcactcacag 3360 acctggagcc cctgggtggg tggtggggag gggcgctggc ccagccggcc tctctggcct 3420 cccacccgat gctgctttcc cctgtgggga tctcaggggc tgtttgagga tatattttca 3480 ctttgtgatt atttcacttt agatgctgat gatttgtttt tgtattttta atgggggtag 3540 cagctggact acccacgttc tcacacccac cgtccgccct gctcctccct ggctgccctg 3600 gccctgaggt gtgggggctg cagcatgttg ctgaggagtg aggaatagtt gagccccaag 3660 tcctgaagag gcgggccagc caggcgggct caaggaaagg gggtcccagt gggaggggca 3720 ggctgacatc tgtgtttcaa gtggggctcg ccatgccggg ggttcatagg tcactggctc 3780 tccaagtgcc agaggtgggc aggtggtggc actgagcccc cccaacactg tgccctggtg 3840 gagaaagcac tgacctgtca tgcccccctc aaacctcctc ttctgacgtg ccttttgcac 3900 ccctcccatt aggacaatca gtcccctccc atctgggagt ccccttttct tttctaccct 3960 agccattcct ggtacccagc catctgccca ggggtgcccc ctcctctccc atccccctgc 4020 cctcgtggcc agcccggctg gttttgtaag atactgggtt ggtgcacagt gatttttttc 4080 ttgtaattta aacaggccca gcattgctgg ttctatttaa tggacatgag ataatgttag 4140 aggttttaaa gtgattaaac gtgcagacta tgcaaaccag 4180 <210> 329 <211> 969 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Subtilisin/kexin-like protease PACE4 S08.075 <400> 329 Met Pro Pro Arg Ala Pro Pro Ala Pro Gly Pro Arg Pro Pro Pro Arg 1 5 10 15 Ala Ala Ala Ala Thr Asp Thr Ala Ala Gly Ala Gly Gly Ala Gly Gly 20 25 30 Ala Gly Gly Ala Gly Gly Pro Gly Phe Arg Pro Leu Ala Pro Arg Pro 35 40 45 Trp Arg Trp Leu Leu Leu Leu Ala Leu Pro Ala Ala Cys Ser Ala Pro 50 55 60 Pro Pro Arg Pro Val Tyr Thr Asn His Trp Ala Val Gln Val Leu Gly 65 70 75 80 Gly Pro Ala Glu Ala Asp Arg Val Ala Ala Ala His Gly Tyr Leu Asn 85 90 95 Leu Gly Gln Ile Gly Asn Leu Glu Asp Tyr Tyr His Phe Tyr His Ser 100 105 110 Lys Thr Phe Lys Arg Ser Thr Leu Ser Ser Arg Gly Pro His Thr Phe 115 120 125 Leu Arg Met Asp Pro Gln Val Lys Trp Leu Gln Gln Gln Glu Val Lys 130 135 140 Arg Arg Val Lys Arg Gln Val Arg Ser Asp Pro Gln Ala Leu Tyr Phe 145 150 155 160 Asn Asp Pro Ile Trp Ser Asn Met Trp Tyr Leu His Cys Gly Asp Lys 165 170 175 Asn Ser Arg Cys Arg Ser Glu Met Asn Val Gln Ala Ala Trp Lys Arg 180 185 190 Gly Tyr Thr Gly Lys Asn Val Val Val Thr Ile Leu Asp Asp Gly Ile 195 200 205 Glu Arg Asn His Pro Asp Leu Ala Pro Asn Tyr Asp Ser Tyr Ala Ser 210 215 220 Tyr Asp Val Asn Gly Asn Asp Tyr Asp Pro Ser Pro Arg Tyr Asp Ala 225 230 235 240 Ser Asn Glu Asn Lys His Gly Thr Arg Cys Ala Gly Glu Val Ala Ala 245 250 255 Ser Ala Asn Asn Ser Tyr Cys Ile Val Gly Ile Ala Tyr Asn Ala Lys 260 265 270 Ile Gly Gly Ile Arg Met Leu Asp Gly Asp Val Thr Asp Val Val Glu 275 280 285 Ala Lys Ser Leu Gly Ile Arg Pro Asn Tyr Ile Asp Ile Tyr Ser Ala 290 295 300 Ser Trp Gly Pro Asp Asp Asp Gly Lys Thr Val Asp Gly Pro Gly Arg 305 310 315 320 Leu Ala Lys Gln Ala Phe Glu Tyr Gly Ile Lys Lys Gly Arg Gln Gly 325 330 335 Leu Gly Ser Ile Phe Val Trp Ala Ser Gly Asn Gly Gly Arg Glu Gly 340 345 350 Asp Tyr Cys Ser Cys Asp Gly Tyr Thr Asn Ser Ile Tyr Thr Ile Ser 355 360 365 Val Ser Ser Ala Thr Glu Asn Gly Tyr Lys Pro Trp Tyr Leu Glu Glu 370 375 380 Cys Ala Ser Thr Leu Ala Thr Thr Tyr Ser Ser Gly Ala Phe Tyr Glu 385 390 395 400 Arg Lys Ile Val Thr Thr Asp Leu Arg Gln Arg Cys Thr Asp Gly His 405 410 415 Thr Gly Thr Ser Val Ser Ala Pro Met Val Ala Gly Ile Ile Ala Leu 420 425 430 Ala Leu Glu Ala Asn Ser Gln Leu Thr Trp Arg Asp Val Gln His Leu 435 440 445 Leu Val Lys Thr Ser Arg Pro Ala His Leu Lys Ala Ser Asp Trp Lys 450 455 460 Val Asn Gly Ala Gly His Lys Val Ser His Phe Tyr Gly Phe Gly Leu 465 470 475 480 Val Asp Ala Glu Ala Leu Val Val Glu Ala Lys Lys Trp Thr Ala Val 485 490 495 Pro Ser Gln His Met Cys Val Ala Ala Ser Asp Lys Arg Pro Arg Ser 500 505 510 Ile Pro Leu Val Gln Val Leu Arg Thr Thr Ala Leu Thr Ser Ala Cys 515 520 525 Ala Glu His Ser Asp Gln Arg Val Val Tyr Leu Glu His Val Val Val 530 535 540 Arg Thr Ser Ile Ser His Pro Arg Arg Gly Asp Leu Gln Ile Tyr Leu 545 550 555 560 Val Ser Pro Ser Gly Thr Lys Ser Gln Leu Leu Ala Lys Arg Leu Leu 565 570 575 Asp Leu Ser Asn Glu Gly Phe Thr Asn Trp Glu Phe Met Thr Val His 580 585 590 Cys Trp Gly Glu Lys Ala Glu Gly Gln Trp Thr Leu Glu Ile Gln Asp 595 600 605 Leu Pro Ser Gln Val Arg Asn Pro Glu Lys Gln Gly Lys Leu Lys Glu 610 615 620 Trp Ser Leu Ile Leu Tyr Gly Thr Ala Glu His Pro Tyr His Thr Phe 625 630 635 640 Ser Ala His Gln Ser Arg Ser Arg Met Leu Glu Leu Ser Ala Pro Glu 645 650 655 Leu Glu Pro Pro Lys Ala Ala Leu Ser Pro Ser Gln Val Glu Val Pro 660 665 670 Glu Asp Glu Glu Asp Tyr Thr Ala Gln Ser Thr Pro Gly Ser Ala Asn 675 680 685 Ile Leu Gln Thr Ser Val Cys His Pro Glu Cys Gly Asp Lys Gly Cys 690 695 700 Asp Gly Pro Asn Ala Asp Gln Cys Leu Asn Cys Val His Phe Ser Leu 705 710 715 720 Gly Ser Val Lys Thr Ser Arg Lys Cys Val Ser Val Cys Pro Leu Gly 725 730 735 Tyr Phe Gly Asp Thr Ala Ala Arg Arg Cys Arg Arg Cys His Lys Gly 740 745 750 Cys Glu Thr Cys Ser Ser Arg Ala Ala Thr Gln Cys Leu Ser Cys Arg 755 760 765 Arg Gly Phe Tyr His His Gln Glu Met Asn Thr Cys Val Thr Leu Cys 770 775 780 Pro Ala Gly Phe Tyr Ala Asp Glu Ser Gln Lys Asn Cys Leu Lys Cys 785 790 795 800 His Pro Ser Cys Lys Lys Cys Val Asp Glu Pro Glu Lys Cys Thr Val 805 810 815 Cys Lys Glu Gly Phe Ser Leu Ala Arg Gly Ser Cys Ile Pro Asp Cys 820 825 830 Glu Pro Gly Thr Tyr Phe Asp Ser Glu Leu Ile Arg Cys Gly Glu Cys 835 840 845 His His Thr Cys Gly Thr Cys Val Gly Pro Gly Arg Glu Glu Cys Ile 850 855 860 His Cys Ala Lys Asn Phe His Phe His Asp Trp Lys Cys Val Pro Ala 865 870 875 880 Cys Gly Glu Gly Phe Tyr Pro Glu Glu Met Pro Gly Leu Pro His Lys 885 890 895 Val Cys Arg Arg Cys Asp Glu Asn Cys Leu Ser Cys Ala Gly Ser Ser 900 905 910 Arg Asn Cys Ser Arg Cys Lys Thr Gly Phe Thr Gln Leu Gly Thr Ser 915 920 925 Cys Ile Thr Asn His Thr Cys Ser Asn Ala Asp Glu Thr Phe Cys Glu 930 935 940 Met Val Lys Ser Asn Arg Leu Cys Glu Arg Lys Leu Phe Ile Gln Phe 945 950 955 960 Cys Cys Arg Thr Cys Leu Leu Ala Gly 965 <210> 330 <211> 4403 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Subtilisin/kexin-like protease PACE4 S08.075 <400> 330 cgggaacgcg ccgcggccgc ctcctcctcc ccggctcccg cccgcggcgg tgttggcggc 60 ggcggtggcg gcggcggcgg cgcttccccg gcgcggagcg gctttaaaag gcggcactcc 120 accccccggc gcactcgcag ctcgggcgcc gcgcgagcct gtcgccgcta tgcctccgcg 180 cgcgccgcct gcgcccgggc cccggccgcc gccccgggcc gccgccgcca ccgacaccgc 240 cgcgggcgcg gggggcgcgg ggggcgcggg gggcgccggc gggcccgggt tccggccgct 300 cgcgccgcgt ccctggcgct ggctgctgct gctggcgctg cctgccgcct gctccgcgcc 360 cccgccgcgc cccgtctaca ccaaccactg ggcggtgcaa gtgctgggcg gcccggccga 420 ggcggaccgc gtggcggcgg cgcacggcta cctcaacttg ggccagattg gaaacctgga 480 agattactac catttttatc acagcaaaac ctttaaaaga tcaaccttga gtagcagagg 540 ccctcacacc ttcctcagaa tggaccccca ggtgaaatgg ctccagcaac aggaagtgaa 600 acgaagggtg aagagacagg tgcgaagtga cccgcaggcc ctttacttca acgaccccat 660 ttggtccaac atgtggtacc tgcattgtgg cgacaagaac agtcgctgcc ggtcggaaat 720 gaatgtccag gcagcgtgga agaggggcta cacaggaaaa aacgtggtgg tcaccatcct 780 tgatgatggc atagagagaa atcaccctga cctggcccca aattatgatt cctacgccag 840 ctacgacgtg aacggcaatg attatgaccc atctccacga tatgatgcca gcaatgaaaa 900 taaacacggc actcgttgtg cgggagaagt tgctgcttca gcaaacaatt cctactgcat 960 cgtgggcata gcgtacaatg ccaaaatagg aggcatccgc atgctggacg gcgatgtcac 1020 agatgtggtc gaggcaaagt cgctgggcat cagacccaac tacatcgaca tttacagtgc 1080 cagctggggg ccggacgacg acggcaagac ggtggacggg cccggccgac tggctaagca 1140 ggctttcgag tatggcatta aaaagggccg gcagggcctg ggctccattt tcgtctgggc 1200 atctgggaat ggcgggagag agggggacta ctgctcgtgc gatggctaca ccaacagcat 1260 ctacaccatc tccgtcagca gcgccaccga gaatggctac aagccctggt acctggaaga 1320 gtgtgcctcc accctggcca ccacctacag cagtggggcc ttttatgagc gaaaaatcgt 1380 caccacggat ctgcgtcagc gctgtaccga tggccacact gggacctcag tctctgcccc 1440 catggtggcg ggcatcatcg ccttggctct agaagcaaac agccagttaa cctggaggga 1500 cgtccagcac ctgctagtga agacatcccg gccggcccac ctgaaagcga gcgactggaa 1560 agtaaacggc gcgggtcata aagttagcca tttctatgga tttggtttgg tggacgcaga 1620 agctctcgtt gtggaggcaa agaagtggac agcagtgcca tcgcagcaca tgtgtgtggc 1680 cgcctcggac aagagaccca ggagcatccc cttagtgcag gtgctgcgga ctacggccct 1740 gaccagcgcc tgcgcggagc actcggacca gcgggtggtc tacttggagc acgtggtggt 1800 tcgcacctcc atctcacacc cacgccgagg agacctccag atctacctgg tttctccctc 1860 gggaaccaag tctcaacttt tggcaaagag gttgctggat ctttccaatg aagggtttac 1920 aaactgggaa ttcatgactg tccactgctg gggagaaaag gctgaagggc agtggacctt 1980 ggaaatccaa gatctgccat cccaggtccg caacccggag aagcaaggga agttgaaaga 2040 atggagcctc atactgtatg gcacagcaga gcacccgtac cacaccttca gtgcccatca 2100 gtcccgctcg cggatgctgg agctctcagc cccagagctg gagccaccca aggctgccct 2160 gtcaccctcc caggtggaag ttcctgaaga tgaggaagat tacacagctc aatccacccc 2220 aggctctgct aatattttac agaccagtgt gtgccatccg gagtgtggtg acaaaggctg 2280 tgatggcccc aatgcagacc agtgcttgaa ctgcgtccac ttcagcctgg ggagtgtcaa 2340 gaccagcagg aagtgcgtga gtgtgtgccc cttgggctac tttggggaca cagcagcaag 2400 acgctgtcgc cggtgccaca aggggtgtga gacctgctcc agcagagctg cgacgcagtg 2460 cctgtcttgc cgccgcgggt tctatcacca ccaggagatg aacacctgtg tgaccctctg 2520 tcctgcagga ttttatgctg atgaaagtca gaaaaattgc cttaaatgcc acccaagctg 2580 taaaaagtgc gtggatgaac ctgagaaatg tactgtctgt aaagaaggat tcagccttgc 2640 acggggcagc tgcattcctg actgtgagcc aggcacctac tttgactcag agctgatcag 2700 atgtggggaa tgccatcaca cctgcggaac ctgcgtgggg ccaggcagag aagagtgcat 2760 tcactgtgcg aaaaacttcc acttccacga ctggaagtgt gtgccagcct gtggtgaggg 2820 cttctaccca gaagagatgc cgggcttgcc ccacaaagtg tgtcgaaggt gtgacgagaa 2880 ctgcttgagc tgtgcaggct ccagcaggaa ctgtagcagg tgtaagacgg gcttcacaca 2940 gctggggacc tcctgcatca ccaaccacac gtgcagcaac gctgacgaga cattctgcga 3000 gatggtgaag tccaaccggc tgtgcgaacg gaagctcttc attcagttct gctgccgcac 3060 gtgcctcctg gccgggtaag ggtgcctagc tgcccacaga gggcaggcac tcccatccat 3120 ccatccgtcc accttcctcc agactgtcgg ccagagtctg tttcaggagc ggcgccctgc 3180 acctgacagc tttatctccc caggagcagc atctctgagc acccaagcca ggtgggtggt 3240 ggctcttaag gaggtgttcc taaaatggtg atatcctctc aaatgctgct tgttggctcc 3300 agtcttccga caaactaaca ggaacaaaat gaattctggg aatccacagc tctggctttg 3360 gagcagcttc tgggaccata agtttactga atcttcaaga ccaaagcaga aaagaaaggc 3420 gcttggcatc acacatcact cttctccccg tgcttttctg cggctgtgta gtaaatctcc 3480 ccggcccagc tggcgaaccc tgggccatcc tcacatgtga caaagggcca gcagtctacc 3540 tgctcgttgc ctgccactga gcagtctggg gacggtttgg tcagactata aataagatag 3600 gtttgagggc ataaaatgta tgaccactgg ggccggagta tctatttcta catagtcagc 3660 tacttctgaa actgcagcag tggcttagaa agtccaattc caaagccaga ccagaagatt 3720 ctatcccccg cagcgctctc ctttgagcaa gccgagctct ccttgttacc gtgttctgtc 3780 tgtgtcttca ggagtctcat ggcctgaacg accacctcga cctgatgcag agccttctga 3840 ggagaggcaa caggaggcat tctgtggcca gccaaaaggt accccgatgg ccaagcaatt 3900 cctctgaaca aaatgtaaag ccagccatgc attgttaatc atccatcact tcccatttta 3960 tggaattgct tttaaaatac atttggcctc tgcccttcag aagactcgtt tttaaggtgg 4020 aaactcctgt gtctgtgtat attacaagcc tacatgacac agttggattt attctgccaa 4080 acctgtgtag gcattttata agctacatgt tctaattttt accgatgtta attattttga 4140 caaatatttc atatattttc attgaaatgc acagatctgc ttgatcaatt cccttgaata 4200 gggaagtaac atttgcctta aattttttcg acctcgtctt tctccatatt gtcctgctcc 4260 cctgtttgac gacagtgcat ttgccttgtc acctgtgagc tggagagaac ccagatgttg 4320 tttattgaat ctacaactct gaaagagaaa tcaatgaagc aagtacaatg ttaaccctaa 4380 attaataaaa gagttaacat ccc 4403 <210> 331 <211> 662 <212> PRT <213> Anabaena variabilis <220> <223> Calcium-dependent protease precursor (Trypsin) S08.79 <400> 331 Met Val His Val Arg Tyr Gly Gly Gln Asn Gly Glu Gln Tyr Glu Leu 1 5 10 15 Ala Ile Ser Glu Asn His Ile Val Val Arg Thr Glu Ser Arg Ser Ser 20 25 30 Leu Ile Ser Asp Arg Pro Phe Glu Ala Ala Pro Val Ser Pro Gln Ala 35 40 45 Arg Asn Ile Leu Asn Gln Phe Glu Leu Ser Thr Arg Phe Ser Gln Ala 50 55 60 Gly Val Glu Val Leu His Val Lys Glu Pro Ser His Asp Gly Ala Leu 65 70 75 80 Arg Asp Thr Ala Arg Glu Ile Leu Asn Gln Glu Pro Glu Val Gln Phe 85 90 95 Ala Gly Arg Val Leu Ile Asp Pro Val Ser Gln Gln Pro Ile Val Tyr 100 105 110 Thr Glu Asn Leu Phe Val Lys Phe Asp His Glu Glu Asp Val Ser Phe 115 120 125 Cys Gln Glu Ile Leu Gly Arg Tyr Gly Leu Thr Ile Lys Arg Gln Leu 130 135 140 Glu Tyr Ala Arg Asn Ala Tyr Phe Val Ser Ala Pro Ser Asn Thr Gly 145 150 155 160 Leu Ala Ile Phe Asp Ile Ser Glu Arg Leu Leu Asn Glu Glu Ser Val 165 170 175 Glu Leu Cys His Pro Glu Leu Val Arg Glu Phe Arg Gln Arg Gln Ala 180 185 190 Phe Pro Pro Gln Trp His Leu Lys Gln Thr Thr Ile Gly Gly Lys Thr 195 200 205 Ile Asn Ala His Ala Asn Val Glu Ala Ala Trp Lys Leu Ser Asp Gly 210 215 220 Thr Gly Thr Ile Ile Ala Ile Ile Asp Asp Gly Val Asp Ile Asp His 225 230 235 240 Glu Glu Phe Arg Ser Ser Gly Lys Ile Val Ala Pro Arg Asp Val Thr 245 250 255 Arg Lys Thr Asn Phe Pro Thr Pro Gly Asn Arg Asp Asn His Gly Thr 260 265 270 Ala Cys Ala Gly Val Ala Cys Gly Asn Gly Asn Phe Gly Ala Ser Gly 275 280 285 Val Ala Pro Gly Ala Lys Leu Met Pro Ile Arg Phe Val Ser Ala Leu 290 295 300 Gly Ser Gln Asp Glu Ala Asp Ser Phe Val Trp Ala Ala Gln Asn Gly 305 310 315 320 Ala Asp Val Ile Ser Cys Ser Trp Gly Pro Pro Asp Gly Thr Trp Trp 325 330 335 Asp Asp Lys Asp Pro Leu His Lys Gln Lys Val Pro Leu Pro Asp Ser 340 345 350 Thr Arg Leu Ala Met Asp Tyr Ala Ile Asn Lys Gly Arg Asn Gly Lys 355 360 365 Gly Cys Val Ile Leu Phe Ala Ala Gly Asn Gly Asn Glu Ser Val Asp 370 375 380 Asn Asp Gly Tyr Ala Ser Tyr Glu Lys Val Ile Ala Val Ala Ala Cys 385 390 395 400 Asn Asp Phe Gly Thr Arg Ser Ala Tyr Ser Asp Phe Gly Thr Ala Val 405 410 415 Trp Cys Ala Phe Pro Ser Asn Asn Gly Asn Pro Ser Gln Thr Pro Gly 420 425 430 Ile Trp Thr Ala Asp Arg Thr Gly Val Val Gly Tyr Asn Ser Gly Asn 435 440 445 Thr Asn Leu Gly Asp Gln Ala Gly Asn Tyr Thr Asn Ser Phe Gly Gly 450 455 460 Thr Ser Ser Ala Cys Pro Gly Ala Ala Gly Val Ala Ala Leu Ile Leu 465 470 475 480 Ser Arg Asn Pro Asn Leu Arg Trp Asp Glu Val Arg Asp Ile Ile Lys 485 490 495 Arg Ser Cys Asp Arg Ile Asp Pro Val Gly Gly Asn Tyr Asn Ala Glu 500 505 510 Gly Arg Ser Pro Phe Tyr Gly Tyr Gly Arg Ile Asn Ala Leu Lys Ala 515 520 525 Val Glu Leu Ala Leu Pro Ala Gln Pro Glu Pro Val Ser Ile Phe Thr 530 535 540 Ala Val Gln Asp Val Pro Ile Asn Asp Leu Gln Ile Ser Gln Leu Ser 545 550 555 560 Leu Ala Ile Ala Asn Thr Asn Pro Ile Lys Ser Ile Lys Val Thr Val 565 570 575 Asp Ile Glu His Thr Tyr Ile Gly Asp Leu Val Val Ser Leu Asn Pro 580 585 590 Pro Ala Glu Ser Gly Val Leu Pro Ile Ile Leu His Asp Arg Lys Gly 595 600 605 Gly Gly Ala Asp Asp Ile Lys Gln Thr Tyr Asp Glu Val Ser Thr Pro 610 615 620 Gly Leu Thr Ala Leu Lys Gly Lys Ile Pro Gln Gly Thr Trp Thr Leu 625 630 635 640 Glu Val Ala Asp Lys Ala Gln Ala Asp Thr Gly Lys Ile Arg Ser Leu 645 650 655 Thr Ile Glu Leu Gly Phe 660 <210> 332 <211> 2187 <212> DNA <213> Anabaena variabilis <220> <223> Calcium-dependent protease precursor (Trypsin) S08.79 <400> 332 ggtaggctgt tgattttgtg ccttttcagg gttgaaaaat ttatgcacta tcctgttcta 60 gctgagtaaa atttgcagtg ggaaaagttc attacccatt acccattacc catttctgga 120 aagccagact gatagtttgt atccacagga aattgttcta agctgcgtct tatgtgtgcg 180 tcattttgga aacagcacac aaaatacaga ggcttagtat caacttaata gtaggagatt 240 aagtatggtt catgtccgct atggtggtca gaacggtgaa cagtacgaat tagcgattag 300 tgagaatcat attgtagtac ggactgaaag ccgcagctcg ctaattagcg atcgcccctt 360 tgaagccgcc cctgtttcac cccaagcccg taatatcctc aatcaattcg agttatcaac 420 tcgtttcagc caagcaggtg tagaagttct ccatgtgaag gaaccaagcc acgatggtgc 480 tttgcgcgac acagccaggg aaattctcaa tcaagaacct gaggtgcaat ttgccggacg 540 tgtgttaatt gatccggtca gtcaacaacc catagtttac acagaaaacc tcttcgtgaa 600 gtttgaccac gaagaagacg ttagtttctg ccaagaaatt ttgggacgct acggcttaac 660 aattaaacgt caactagaat acgcccgtaa tgcctacttt gtcagcgcac cctccaatac 720 tggtttagcc atctttgata tttccgaaag gttgctcaac gaggaatcgg tggaattgtg 780 tcatcctgaa ttggtgcggg aatttagaca acgtcaggca tttcccccgc aatggcatct 840 caagcaaacc acgattgggg gtaaaactat caatgcccac gccaatgttg aggcggcatg 900 gaagttgagc gatggtacgg gaacgattat tgccattatt gatgatggtg tggatatcga 960 ccatgaagag ttccgttcct ctggtaagat tgtcgcccct agagatgtca cacggaaaac 1020 caactttccc acaccaggaa accgagataa tcacggtacg gcttgtgcag gtgtagcttg 1080 tggtaatggc aactttgggg cttctggggt agcgcctggg gctaagttaa tgcccattcg 1140 tttcgtttct gccctgggtt cccaagatga agccgactct tttgtctggg ctgctcaaaa 1200 tggtgcggat gtaatttcct gtagttgggg gccaccagat ggtacatggt gggatgataa 1260 agacccccta cacaagcaga aagtacctct acccgattcc acaagactag caatggacta 1320 tgccatcaat aaggggcgta atggcaaagg atgtgtgatt ttattcgctg cgggtaatgg 1380 taacgaaagc gtagataatg acggctacgc cagctatgaa aaggtcatag ctgtcgcggc 1440 ttgtaacgac tttggtacta ggagtgctta cagtgatttt ggtacagccg tctggtgtgc 1500 ctttcctagc aacaacggta acccttccca aacccctggt atttggacag ccgatcgcac 1560 tggtgtagtc ggttataatt ccggtaatac taatctcggt gaccaggcag gcaattatac 1620 aaatagtttc ggtggcacct ctagcgcctg tcctggtgca gctggtgtcg ccgccttgat 1680 tctctctcgc aatccaaatc tgcgttggga tgaggtcaga gatattatta aacgctcatg 1740 cgatcgcatt gatccagttg gtggtaacta taacgctgaa ggtcgtagcc cattctacgg 1800 ttatggtcgt atcaatgccc tcaaagcggt agaattggca ctacccgcac aacctgagcc 1860 agtcagcatt ttcacggctg tgcaggatgt ccccatcaac gacttgcaga tatctcaact 1920 cagtttagcg atcgctaaca ccaaccccat caaatctatc aaagttacgg tagatatcga 1980 gcatacctac atcggtgact tagtagttag cctcaacccc cctgctgaat ccggtgtatt 2040 accaatcatc ctccacgacc gcaaaggcga ggcgcagatg atatcaaaca aacttacgat 2100 gaggtgagta caccaggact aactgctttg aagggtaaaa ttcctcaagg aacctggact 2160 ttagaagtag cagataaagc acaggcg 2187 <210> 333 <211> 402 <212> PRT <213> Rattus norvegicus <220> <223> Caspase-1 precursor C14.001 <400> 333 Met Ala Asp Lys Val Leu Arg Ala Lys Arg Lys Gln Phe Ile Asn Ser 1 5 10 15 Val Ser Val Gly Thr Ile Asn Gly Leu Leu Asp Glu Leu Leu Glu Lys 20 25 30 Arg Val Leu Asn Gln Glu Glu Met Asp Thr Ile Lys Leu Ala Asn Ile 35 40 45 Thr Val Met Glu Lys Ala Arg Asp Leu Cys Asp His Val Thr Lys Lys 50 55 60 Gly Pro Arg Ala Ser Gln Met Phe Ile Thr Tyr Ile Cys Asn Glu Asp 65 70 75 80 Cys Tyr Leu Ala Glu Ile Leu Glu Leu Gln Ser Gly Pro Ser Ala Glu 85 90 95 Thr Val Phe Val Thr Glu Asp Ser Lys Gly Gly His Pro Phe Ser Ser 100 105 110 Glu Thr Lys Glu Lys Leu Asn Lys Glu Gly Gly Ala Phe Pro Gly Pro 115 120 125 Ser Gly Ser Leu Lys Phe Cys Pro Leu Glu Ile Ala Gln Lys Leu Trp 130 135 140 Lys Glu Asn His Ser Glu Ile Tyr Pro Ile Met Lys Thr Pro Thr Arg 145 150 155 160 Thr Arg Leu Ala Leu Ile Ile Cys Asn Thr Asp Phe Gln His Leu Ser 165 170 175 Arg Arg Val Gly Ala Asp Val Asp Leu Arg Glu Met Lys Leu Leu Leu 180 185 190 Gln Asp Leu Gly Tyr Thr Val Lys Val Lys Glu Asn Leu Thr Ala Leu 195 200 205 Glu Met Thr Lys Glu Leu Lys Glu Phe Ala Ala Cys Pro Glu His Lys 210 215 220 Thr Ser Asp Ser Thr Phe Leu Val Phe Met Ser His Gly Leu Gln Glu 225 230 235 240 Gly Ile Cys Gly Ile Thr Tyr Ser Asn Glu Val Ala Asp Ile Leu Lys 245 250 255 Val Asp Thr Ile Phe Gln Met Met Asn Thr Leu Lys Cys Pro Ser Leu 260 265 270 Lys Asp Lys Pro Lys Val Ile Ile Ile Gln Ala Cys Arg Gly Glu Lys 275 280 285 Gln Gly Val Val Leu Leu Lys Asp Ser Val Gly Asn Ser Glu Glu Gly 290 295 300 Phe Leu Thr Asp Ala Ile Phe Glu Asp Asp Gly Ile Lys Lys Ala His 305 310 315 320 Ile Glu Lys Asp Phe Ile Ala Phe Cys Ser Ser Thr Pro Asp Asn Val 325 330 335 Ser Trp Arg His Pro Val Arg Gly Ser Leu Phe Ile Glu Ser Leu Ile 340 345 350 Lys His Met Lys Glu Tyr Ala Trp Ser Cys Asp Leu Glu Asp Ile Phe 355 360 365 Arg Lys Val Arg Phe Ser Phe Glu Gln Pro Asp Ser Arg Leu Gln Met 370 375 380 Pro Thr Thr Glu Arg Val Thr Leu Thr Lys Arg Phe Tyr Leu Phe Pro 385 390 395 400 Gly His <210> 334 <211> 1209 <212> DNA <213> Rattus norvegicus <220> <223> Caspase-1 precursor C14.001 <400> 334 atggccgaca aggtcctgag ggcaaagagg aagcaattta tcaactcagt gagtgtaggg 60 acaataaatg gattgctgga tgaactttta gagaagagag tcctgaacca ggaagagatg 120 gatacaatca aacttgcaaa tatcactgtt atggaaaagg cacgagacct gtgcgatcat 180 gtcactaaaa aaggaccccg ggcaagccag atgtttatca cttacatttg taatgaagac 240 tgctacctgg cagaaattct ggagcttcag tcaggtccat cagctgaaac tgtttttgtt 300 acagaagatt ctaagggagg acatcctttc tcctcagaaa caaaagaaaa actgaacaaa 360 gaaggtggcg catttcctgg accgagtggt tccctcaagt tttgcccttt agaaatagcc 420 cagaaattat ggaaagaaaa tcattcagag atttatccaa taatgaaaac acccactcgt 480 acacgtcttg ccctcattat ctgcaacaca gactttcaac atctttctcg gagagtcgga 540 gctgatgttg acctcagaga aatgaagttg ctgctgcagg atctgggcta tactgtgaaa 600 gtcaaagaaa atctcacagc tctggagatg acaaaagaat tgaaagaatt tgctgcctgc 660 ccagagcaca agacttctga cagtaccttc cttgtattca tgtctcatgg tctccaggag 720 ggaatatgtg ggatcacata ctctaatgaa gttgcagata ttttaaaggt tgacacaatc 780 tttcaaatga tgaacacatt gaagtgccca agcttgaaag acaagcccaa ggttatcatt 840 attcaggcat gccgtggaga gaaacaagga gtggtgttgt taaaagattc agtaggaaac 900 tccgaagagg gattcttaac agatgcaatt tttgaagatg atggcattaa gaaggcccat 960 atagagaaag attttattgc tttctgctct tcaacaccag ataatgtgtc ctggagacat 1020 cctgtccggg gatccctctt cattgagtca ctcatcaaac acatgaaaga atatgcctgg 1080 tcttgtgact tggaggacat tttcagaaag gttcgatttt ctttcgaaca accagactct 1140 agactacaga tgccaaccac tgaaagggtg accctgacaa aacgtttcta cctcttccca 1200 ggacattag 1209 <210> 335 <211> 503 <212> PRT <213> Caenorhabditis elegans <220> <223> Cell death protein 3 precursor C14.002 <400> 335 Met Met Arg Gln Asp Arg Arg Ser Leu Leu Glu Arg Asn Ile Met Met 1 5 10 15 Phe Ser Ser His Leu Lys Val Asp Glu Ile Leu Glu Val Leu Ile Ala 20 25 30 Lys Gln Val Leu Asn Ser Asp Asn Gly Asp Met Ile Asn Ser Cys Gly 35 40 45 Thr Val Arg Glu Lys Arg Arg Glu Ile Val Lys Ala Val Gln Arg Arg 50 55 60 Gly Asp Val Ala Phe Asp Ala Phe Tyr Asp Ala Leu Arg Ser Thr Gly 65 70 75 80 His Glu Gly Leu Ala Glu Val Leu Glu Pro Leu Ala Arg Ser Val Asp 85 90 95 Ser Asn Ala Val Glu Phe Glu Cys Pro Met Ser Pro Ala Ser His Arg 100 105 110 Arg Ser Arg Ala Leu Ser Pro Ala Gly Tyr Thr Ser Pro Thr Arg Val 115 120 125 His Arg Asp Ser Val Ser Ser Val Ser Ser Phe Thr Ser Tyr Gln Asp 130 135 140 Ile Tyr Ser Arg Ala Arg Ser Arg Ser Arg Ser Arg Ala Leu His Ser 145 150 155 160 Ser Asp Arg His Asn Tyr Ser Ser Pro Pro Val Asn Ala Phe Pro Ser 165 170 175 Gln Pro Ser Ser Ala Asn Ser Ser Phe Thr Gly Cys Ser Ser Leu Gly 180 185 190 Tyr Ser Ser Ser Arg Asn Arg Ser Phe Ser Lys Ala Ser Gly Pro Thr 195 200 205 Gln Tyr Ile Phe His Glu Glu Asp Met Asn Phe Val Asp Ala Pro Thr 210 215 220 Ile Ser Arg Val Phe Asp Glu Lys Thr Met Tyr Arg Asn Phe Ser Ser 225 230 235 240 Pro Arg Gly Met Cys Leu Ile Ile Asn Asn Glu His Phe Glu Gln Met 245 250 255 Pro Thr Arg Asn Gly Thr Lys Ala Asp Lys Asp Asn Leu Thr Asn Leu 260 265 270 Phe Arg Cys Met Gly Tyr Thr Val Ile Cys Lys Asp Asn Leu Thr Gly 275 280 285 Arg Gly Met Leu Leu Thr Ile Arg Asp Phe Ala Lys His Glu Ser His 290 295 300 Gly Asp Ser Ala Ile Leu Val Ile Leu Ser His Gly Glu Glu Asn Val 305 310 315 320 Ile Ile Gly Val Asp Asp Ile Pro Ile Ser Thr His Glu Ile Tyr Asp 325 330 335 Leu Leu Asn Ala Ala Asn Ala Pro Arg Leu Ala Asn Lys Pro Lys Ile 340 345 350 Val Phe Val Gln Ala Cys Arg Gly Glu Arg Arg Asp Asn Gly Phe Pro 355 360 365 Val Leu Asp Ser Val Asp Gly Val Pro Ala Phe Leu Arg Arg Gly Trp 370 375 380 Asp Asn Arg Asp Gly Pro Leu Phe Asn Phe Leu Gly Cys Val Arg Pro 385 390 395 400 Gln Val Gln Gln Val Trp Arg Lys Lys Pro Ser Gln Ala Asp Ile Leu 405 410 415 Ile Ala Tyr Ala Thr Thr Ala Gln Tyr Val Ser Trp Arg Asn Ser Ala 420 425 430 Arg Gly Ser Trp Phe Ile Gln Ala Val Cys Glu Val Phe Ser Thr His 435 440 445 Ala Lys Asp Met Asp Val Val Glu Leu Leu Thr Glu Val Asn Lys Lys 450 455 460 Val Ala Cys Gly Phe Gln Thr Ser Gln Gly Ser Asn Ile Leu Lys Gln 465 470 475 480 Met Pro Glu Met Thr Ser Arg Leu Leu Lys Lys Phe Tyr Phe Trp Pro 485 490 495 Glu Ala Arg Asn Ser Ala Val 500 <210> 336 <211> 7653 <212> DNA <213> Caenorhabditis elegans <220> <223> Cell death protein 3 precursor C14.002 <400> 336 agatctgaaa taaggtgata aattaataaa ttaagtgtat ttctgaggaa atttgactgt 60 tttagcacaa ttaatcttgt ttcagaaaaa aagtccagtt ttctagattt ttccgtctta 120 ttgtcgaatt aatatcccta ttatcacttt ttcatgctca tcctcgagcg gcacgtcctc 180 aaagaattgt gagagcaaac gcgctcccat tgacctccac actcagccgc caaaacaaac 240 gttcgaacat tcgtgtgttg tgctcctttt ccgttatctt gcagtcatct tttgtcgttt 300 ttttctttgt tctttttgtt gaacgtgttg ctaagcaatt attacatcaa ttgaagaaaa 360 ggctcgccga tttattgttg ccagaaagat tctgagattc tcgaagtcga ttttataata 420 tttaaccttg gtttttgcat tgtttcgttt aaaaaaacca ctgtttatgt gaaaaacgat 480 tagtttacta ataaaactac ttttaaacct ttacctttac ctcaccgctc cgtgttcatg 540 gctcatagat tttcgatact caaatccaaa aataaattta cgagggcaat taatgtgaaa 600 caaaaacaat cctaagattt ccacatgttt gacctctccg gcaccttctt ccttagcccc 660 accactccat cacctctttg gcggtgttct tcgaaaccca cttaggaaag cagtgtgtat 720 ctcatttggt atgctctttt cgattttata gctctttgtc gcaatttcaa tgctttaaac 780 aatccaaatc gcattatatt tgtgcatgga ggcaaatgac ggggttggaa tcttagatga 840 gatcaggagc tttcagggta aacgcccggt tcattttgta ccacatttca tcattttcct 900 gtcgtccttg gtatcctcaa cttgtcccgg ttttgttttc ggtacactct tccgtgatgc 960 cacctgtctc cgtctcaatt atcgtttaga aatgtgaact gtccagatgg gtgactcata 1020 ttgctgctgc tacaatccac tttcttttct catcggcagt cttacgagcc catcataaac 1080 ttttttttcc gcgaaatttg caataaaccg gccaaaaact ttctccaaat tgttacgcaa 1140 tatatacaat ccataagaat atcttctcaa tgtttatgat ttcttcgcag cactttctct 1200 tcgtgtgcta acatcttatt tttataatat ttccgctaaa attccgattt ttgagtatta 1260 atttatcgta aaattatcat aatagcaccg aaaactacta aaaatggtaa aagctccttt 1320 taaatcggct cgacattatc gtattaagga atcacaaaat tctgagaatg cgtactgcgc 1380 aacatatttg acggcaaaat atctcgtagc gaaaactaca gtaattcttt aaatgactac 1440 tgtagcgctt gtgtcgattt acgggctcaa tttttgaaaa taattttttt tttcgaattt 1500 tgataacccg taaatcgtca caacgctaca gtagtcattt aaaggattac tgtagttcta 1560 gctacgagat attttgcgcg ccaaatatga ctgtaatacg cattctctga attttgtgtt 1620 tccgtaataa tttcacaaga ttttggcatt ccactttaaa ggcgcacagg atttattcca 1680 atgggtctcg gcacgcaaaa agtttgatag acttttaaat tctccttgca tttttaattc 1740 aattactaaa attttcgtga atttttctgt taaaattttt aaaatcagtt ttctaatatt 1800 ttccaggctg acaaacagaa acaaaaacac aacaaacatt ttaaaaatca gttttcaaat 1860 taaaaataac gatttctcat tgaaaattgt gttttatgtt tgcgaaaata aaagagaact 1920 gattcaaaac aattttaaca aaaaaaaacc ccaaaattcg ccagaaatca agataaaaaa 1980 ttcaagaggg tcaaaatttt ccgattttac tgactttcac cttttttttc gtagttcagt 2040 gcagttgttg gagtttttga cgaaaactag gaaaaaaatc gataaaaatt actcaaatcg 2100 agctgaattt tgaggacaat gtttaaaaaa aaacactatt tttccaataa tttcactcat 2160 tttcagacta aatcgaaaat caaatcgtac tctgactacg ggtcagtaga gaggtcaacc 2220 atcagccgaa gatgatgcgt caagatagaa ggagcttgct agagaggaac attatgatgt 2280 tctctagtca tctaaaagtc gatgaaattc tcgaagttct catcgcaaaa caagtgttga 2340 atagtgataa tggagatatg attaatgtga gtttttaatc gaataataat tttaaaaaaa 2400 aattgataat ataaagaata tttttgcagt catgtggaac ggttcgcgag aagagacggg 2460 agatcgtgaa agcagtgcaa cgacggggag atgtggcgtt cgacgcgttt tatgatgctc 2520 ttcgctctac gggacacgaa ggacttgctg aagttcttga acctctcgcc agatcgtagg 2580 tttttaaagt tcggcgcaaa agcaagggtc tcacggaaaa aagaggcgga tcgtaatttt 2640 gcaacccacc ggcacggttt tttcctccga aaatcggaaa ttatgcactt tcccaaatat 2700 ttgaagtgaa atatatttta tttactgaaa gctcgagtga ttatttattt tttaacacta 2760 attttcgtgg cgcaaaaggc cattttgtag atttgccgaa aatacttgtc acacacacac 2820 acacacatct ccttcaaata tccctttttc cagtgttgac tcgaatgctg tcgaattcga 2880 gtgtccaatg tcaccggcaa gccatcgtcg gagccgcgca ttgagccccg ccggctacac 2940 ttcaccgacc cgagttcacc gtgacagcgt ctcttcagtg tcatcattca cttcttatca 3000 ggatatctac tcaagagcaa gatctcgttc tcgatcgcgt gcacttcatt catcggatcg 3060 acacaattat tcatctcctc cagtcaacgc atttcccagc caaccttgta tgttgatgcg 3120 aacactaaat tctgagaatg cgcattactc aacatatttg acgcgcaaat atctcgtagc 3180 gaaaaataca gtaacccttt aaatgactat tgtagtgtcg atttacgggc tcgattttcg 3240 aaacgaatat atgctcgaat tgtgacaacg aattttaatt tgtcattttt gtgttttctt 3300 ttgatatttt tgatcaatta ataaattatt tccgtaaaca gacaccagcg ctacagtact 3360 cttttaaaga gttacagtag ttttcgcttc aagatatttt gaaaagaatt ttaaacattt 3420 tgaaaaaaaa tcatctaaca tgtgccaaaa cgcttttttc aagtttcgca gattttttga 3480 tttttttcat tcaagatatg cttattaaca catataatta tcattaatgt gaatttcttg 3540 tagaaatttt gggcttttcg ttctagtatg ctctactttt gaaattgctc aacgaaaaaa 3600 tcatgtggtt tgttcatatg aatgacgaaa aatagcaatt ttttatatat tttcccctat 3660 tcatgttgtg cagaaaaata gtaaaaaagc gcatgcattt ttcgacattt tttacatcga 3720 acgacagctc acttcacatg ctgaagacga gagacgcgga gaaataccac acatctttct 3780 gcgtctctcg tcttcagcat gtgaaatggg atctcggtcg atgtaaaaaa atgtcgaata 3840 atgtaaaaaa tgcatgcgtt tttttacact tttctgcaca aatgaatagg gggaaaatgt 3900 attaaaatac attttttgta tttttcaaca tcacatgatt aaccccatta ttttttcgtt 3960 gagcaactta aaaagtagag aatattagag cgaaaaccaa aatttcttca agatattacc 4020 tttattgata attatagatg ttaataagca tatcttgaat gaaagtcagc aaaaatatgt 4080 gcgaaacacc tgaaaaaaat caaaaattct gcgaaaattg aaaaaatgca ttaaaataca 4140 tttttgcatt tttctacatc acatgaatgt agaaaattaa aagggaaatc aaaatttcta 4200 gaggatataa ttgaatgaaa cattgcgaaa ttaaaatgtg cgaaacgtca aaaaagagga 4260 aatttgggta tcaaaatcga tcctaaaacc aacacatttc agcatccgcc aactcttcat 4320 tcaccggatg ctcttctctc ggatacagtt caagtcgtaa tcgctcattc agcaaagctt 4380 ctggaccaac tcaatacata ttccatgaag aggatatgaa ctttgtcgat gcaccaacca 4440 taagccgtgt tttcgacgag aaaaccatgt acagaaactt ctcgagtcct cgtggaatgt 4500 gcctcatcat aaataatgaa cactttgagc agatgccaac acggaatggt accaaggccg 4560 acaaggacaa tcttaccaat ttgttcagat gcatgggcta tacggttatt tgcaaggaca 4620 atctgacggg aagggtacgg cgaaattata ttacccaaac gcgaaatttg ccattttgcg 4680 ccgaaaatgt ggcgcccggt ctcgacacga caatttgtgt taaatgcaaa aatgtataat 4740 tttgcaaaaa acaaaatttt gaacttccgc gaaaatgatt tacctagttt cgaaattttc 4800 gttttttccg gctacattat gtgttttttc ttagtttttc tataatattt gatgtaaaaa 4860 accgtttgta aattttcaga caattttccg catacaaaac ttgatagcac gaaatcaatt 4920 ttctgaattt tcaaaattat ccaaaaatgc acaatttaaa atttgtgaaa attggcaaac 4980 ggtgtttcaa tatgaaatgt atttttaaaa actttaaaaa ccactccgga aaagcaataa 5040 aaatcaaaac aacgtcacaa ttcaaattca aaagttattc atccgatttg tttatttttg 5100 caaaatttga aaaaatcatg aaggatttag aaaagtttta taacattttt tctagatttt 5160 tcaaaatttt ttttaacaaa tcgagaaaaa gagaatgaaa aatcgatttt aaaaatatcc 5220 acagcttcga gagtttgaaa ttacagtact ccttaaaggc gcacacccca tttgcattgg 5280 accaaaaatt tgtcgtgtcg agaccaggta ccgtagtttt tgtcgcaaaa attgcaccat 5340 tggacaataa accttcctaa tcaccaaaaa gtaaaattga aatcttcgaa aagccaaaaa 5400 attcaaaaaa aaagtcgaat ttcgattttt tttttggttt tttggtccca aaaaccaaaa 5460 aaatcaattt tctgcaaaat accaaaaaga aacccgaaaa aatttcccag ccttgttcct 5520 aatgtaaact gatatttaat ttccagggaa tgctcctgac aattcgagac tttgccaaac 5580 acgaatcaca cggagattct gcgatactcg tgattctatc acacggagaa gagaatgtga 5640 ttattggagt tgatgatata ccgattagta cacacgagat atatgatctt ctcaacgcgg 5700 caaatgctcc ccgtctggcg aataagccga aaatcgtttt tgtgcaggct tgtcgaggcg 5760 gttcgttttt tattttaatt ttaatataaa tattttaaat aaattcattt tcagaacgtc 5820 gtgacaatgg attcccagtc ttggattctg tcgacggagt tcctgcattt cttcgtcgtg 5880 gatgggacaa tcgagacggg ccattgttca attttcttgg atgtgtgcgg ccgcaagttc 5940 aggttgcaat ttaatttctt gaatgagaat attccttcaa aaaatctaaa atagattttt 6000 attccagaaa gtcccgatcg aaaaattgcg atataattac gaaatttgtg ataaaatgac 6060 aaaccaatca gcatcgtcga tctccgccca cttcatcgga ttggtttgaa agtgggcgga 6120 gtgaattgct gattggtcgc agttttcagt ttagagggaa tttaaaaatc gccttttcga 6180 aaattaaaaa ttgatttttt caattttttc gaaaaatatt ccgattattt tatattcttt 6240 ggagcgaaag ccccgtcctg taaacatttt taaatgataa ttaataaatt tttgcagcaa 6300 gtgtggagaa agaagccgag ccaagctgac attctgattg catacgcaac gacagctcaa 6360 tatgtttcgt ggagaaacag tgctcgtgga tcatggttca ttcaagccgt ctgtgaagtg 6420 ttctcgacac acgcaaagga tatggatgtt gttgagctgc tgactgaagt caataagaag 6480 gtcgcttgtg gatttcagac atcacaggga tcgaatattt tgaaacagat gccagaggta 6540 cttgaaacaa acaatgcatg tctaactttt aaggacacag aaaaataggc agaggctcct 6600 tttgcaagcc tgccgcgcgt caacctagaa ttttagtttt tagctaaaat gattgatttt 6660 gaatatttta tgctaatttt tttgcgttaa attttgaaat agtcactatt tatcgggttt 6720 ccagtaaaaa atgtttatta gccattggat tttactgaaa acgaaaattt gtagtttttc 6780 aacgaaattt atcgattttt aaatgtaaaa aaaaatagcg aaaattacat caaccatcaa 6840 gcatttaagc caaaattgtt aactcattta aaaattaatt caaagttgtc cacgagtatt 6900 acacggttgg cgcgcggcaa gtttgcaaaa cgacgctccg cctctttttc tgtgcggctt 6960 gaaaacaagg gatcggttta gatttttccc caaaatttaa attaaatttc agatgacatc 7020 ccgcctgctc aaaaagttct acttttggcc ggaagcacga aactctgccg tctaaaattc 7080 actcgtgatt cattgcccaa ttgataattg tctgtatctt ctcccccagt tctctttcgc 7140 ccaattagtt taaaaccatg tgtatattgt tatcctatac tcatttcact ttatcattct 7200 atcatttctc ttcccatttt cacacatttc catttctcta cgataatcta aaattatgac 7260 gtttgtgtct cgaacgcata ataattttaa taactcgttt tgaatttgat tagttgttgt 7320 gcccagtata tatgtatgta ctatgcttct atcaacaaaa tagtttcata gatcatcacc 7380 ccaaccccac caacctaccg taccatattc atttttgccg ggaatcaatt tcgattaatt 7440 ttaacctatt ttttcgccac aaaaaatcta atatttgaat taacgaatag cattcccatc 7500 tctcccgtgc cggaatgcct cccggccttt taaagttcgg aacatttggc aattatgtat 7560 aaatttgtag gtccccccca tcatttcccg cccatcatct caaattgcat tcttttttcg 7620 ccgtgatatc ccgattctgg tcagcaaaga tct 7653 <210> 337 <211> 277 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Caspase-3 precursor C14.003 <400> 337 Met Glu Asn Thr Glu Asn Ser Val Asp Ser Lys Ser Ile Lys Asn Leu 1 5 10 15 Glu Pro Lys Ile Ile His Gly Ser Glu Ser Met Asp Ser Gly Ile Ser 20 25 30 Leu Asp Asn Ser Tyr Lys Met Asp Tyr Pro Glu Met Gly Leu Cys Ile 35 40 45 Ile Ile Asn Asn Lys Asn Phe His Lys Ser Thr Gly Met Thr Ser Arg 50 55 60 Ser Gly Thr Asp Val Asp Ala Ala Asn Leu Arg Glu Thr Phe Arg Asn 65 70 75 80 Leu Lys Tyr Glu Val Arg Asn Lys Asn Asp Leu Thr Arg Glu Glu Ile 85 90 95 Val Glu Leu Met Arg Asp Val Ser Lys Glu Asp His Ser Lys Arg Ser 100 105 110 Ser Phe Val Cys Val Leu Leu Ser His Gly Glu Glu Gly Ile Ile Phe 115 120 125 Gly Thr Asn Gly Pro Val Asp Leu Lys Lys Ile Thr Asn Phe Phe Arg 130 135 140 Gly Asp Arg Cys Arg Ser Leu Thr Gly Lys Pro Lys Leu Phe Ile Ile 145 150 155 160 Gln Ala Cys Arg Gly Thr Glu Leu Asp Cys Gly Ile Glu Thr Asp Ser 165 170 175 Gly Val Asp Asp Asp Met Ala Cys His Lys Ile Pro Val Glu Ala Asp 180 185 190 Phe Leu Tyr Ala Tyr Ser Thr Ala Pro Gly Tyr Tyr Ser Trp Arg Asn 195 200 205 Ser Lys Asp Gly Ser Trp Phe Ile Gln Ser Leu Cys Ala Met Leu Lys 210 215 220 Gln Tyr Ala Asp Lys Leu Glu Phe Met His Ile Leu Thr Arg Val Asn 225 230 235 240 Arg Lys Val Ala Thr Glu Phe Glu Ser Phe Ser Phe Asp Ala Thr Phe 245 250 255 His Ala Lys Lys Gln Ile Pro Cys Ile Val Ser Met Leu Thr Lys Glu 260 265 270 Leu Tyr Phe Tyr His 275 <210> 338 <211> 2635 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Caspase-3 precursor C14.003 <400> 338 gaattcggca cgaggggtgc tattgtgagg cggttgtaga agagtttcgt gagtgctcgc 60 agctcatacc tgtggctgtg tatccgtggc cacagctggt tggcgtcgcc ttgaaatccc 120 aggccgtgag gagttagcga gccctgctca cactcggcgc tctggttttc ggtgggtgtg 180 ccctgcacct gcctcttccc ccattctcat taataaaggt atccatggag aacactgaaa 240 actcagtgga ttcaaaatcc attaaaaatt tggaaccaaa gatcatacat ggaagcgaat 300 caatggactc tggaatatcc ctggacaaca gttataaaat ggattatcct gagatgggtt 360 tatgtataat aattaataat aagaattttc ataaaagcac tggaatgaca tctcggtctg 420 gtacagatgt cgatgcagca aacctcaggg aaacattcag aaacttgaaa tatgaagtca 480 ggaataaaaa tgatcttaca cgtgaagaaa ttgtggaatt gatgcgtgat gtttctaaag 540 aagatcacag caaaaggagc agttttgttt gtgtgcttct gagccatggt gaagaaggaa 600 taatttttgg aacaaatgga cctgttgacc tgaaaaaaat aacaaacttt ttcagagggg 660 atcgttgtag aagtctaact ggaaaaccca aacttttcat tattcaggcc tgccgtggta 720 cagaactgga ctgtggcatt gagacagaca gtggtgttga tgatgacatg gcgtgtcata 780 aaataccagt ggatgccgac ttcttgtatg catactccac agcacctggt tattattctt 840 ggcgaaattc aaaggatggc tcctggttca tccagtcgct ttgtgccatg ctgaaacagt 900 atgccgacaa gcttgaattt atgcacattc ttacccgggt taaccgaaag gtggcaacag 960 aatttgagtc cttttccttt gacgctactt ttcatgcaaa gaaacagatt ccatgtattg 1020 tttccatgct cacaaaagaa ctctattttt atcactaaag aaatggttgg ttggtggttt 1080 tttttagttt gtatgccaag tgagaagatg gtatatttgg tactgtattt ccctctcatt 1140 ttgacctact ctcatgctgc agagggtact ttaagacata ctccttccat caaatagaac 1200 cactatgaag ctacctcaaa cttccagtca ggtagttgca attgaattaa attaggaata 1260 aataaaaatg gatactggtg cagtcattat gagaggcaat gattgttaat ttacagcttt 1320 catgattagc aagttacagt gatgctgtgc tatgaatttt caagtaattg tgaaaaagtt 1380 aaacattgaa gtaatgaatt tttatgatat tccccccact taagactgtg tattctagtt 1440 ttgtcaaact gtagaaatga tgatgtggaa gaacttaggc atctgtgggc atggtcaaag 1500 gctcaaacct ttattttaga attgatatac acggatgact taactgcatt ttagaccatt 1560 tatctgggat tatggttttg tgatgtttgt cctgaacact tttgttgtaa aaaaataata 1620 ataataatgt ttaatattga gaaagaaact aatattttat gtgagagaaa gtgtgagcaa 1680 actaacttga cttttaaggc taaaacttaa cattcataga ggggtggagt tttaactgta 1740 aggtgctaca atgcccctgg atctaccagc ataaatatct tctgatttgt ccctatgcat 1800 atcagttgag cttcatatac cagcaatata tctgaagagc tattatataa aaaccccaaa 1860 ctgttgatta ttagccaggt aatgtgaata aattctatag gaacatatga aaatacaact 1920 taaataataa acagtggaat ataaggaaag caataaatga atgggctgag ctgcctgtaa 1980 cttgagagta gatggtttga gcctgagcag agacatgact cagcctgttc catgaaggca 2040 gagccatgga ccacgcagga agggcctaca gcccatttct ccatacgcac tggtatgtgt 2100 ggatgatgct gccagggcgc catcgccaag taagaaagtg aagcaaatca gaaacttgtg 2160 aagtggaaat gttctaaagg tggtgaggca ataaaaatca tagtactctt tgtagcaaaa 2220 ttcttaagta tgttattttc tgttgaagtt tacaatcaaa ggaaaatagt aatgttttat 2280 actgtttact gaaagaaaaa gacctatgag cacataggac tctagacggc atccagccgg 2340 aggccagagc tgagcactca gcccgggagg caggctccag gcctcagcag gtgcggagcc 2400 gtcactgcac caagtctcac tggctgtcag tatgacattt cacgggagat ttcttgttgc 2460 tcaaaaaatg agctcgcatt tgtcaatgac agtttctttt ttcttactag acctgtaact 2520 tttgtaaata cacacagcat gtaatggtat cttaaagtgt gtttctatgt gacaattttg 2580 tacaaatttg ttattttcca tttttatttc aaaatataca ttcaaactta aaatt 2635 <210> 339 <211> 303 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <400> 339 Met Ala Asp Asp Gln Gly Cys Ile Glu Glu Gln Gly Val Glu Asp Ser 1 5 10 15 Ala Asn Glu Asp Ser Val Asp Ala Lys Pro Asp Arg Ser Ser Phe Val 20 25 30 Pro Ser Leu Phe Ser Lys Lys Lys Lys Asn Val Thr Met Arg Ser Ile 35 40 45 Lys Thr Thr Arg Asp Arg Val Pro Thr Tyr Gln Tyr Asn Met Asn Phe 50 55 60 Glu Lys Leu Gly Lys Cys Ile Ile Ile Asn Asn Lys Asn Phe Asp Lys 65 70 75 80 Val Thr Gly Met Gly Val Arg Asn Gly Thr Asp Lys Asp Ala Glu Ala 85 90 95 Leu Phe Lys Cys Phe Arg Ser Leu Gly Phe Asp Val Ile Val Tyr Asn 100 105 110 Asp Cys Ser Cys Ala Lys Met Gln Asp Leu Leu Lys Lys Ala Ser Glu 115 120 125 Glu Asp His Thr Asn Ala Ala Cys Phe Ala Cys Ile Leu Leu Ser His 130 135 140 Gly Glu Glu Asn Val Ile Tyr Gly Lys Asp Gly Val Thr Pro Ile Lys 145 150 155 160 Asp Leu Thr Ala His Phe Arg Gly Asp Arg Cys Lys Thr Leu Leu Glu 165 170 175 Lys Pro Lys Leu Phe Phe Ile Gln Ala Cys Arg Gly Thr Glu Leu Asp 180 185 190 Asp Gly Ile Gln Ala Asp Ser Gly Pro Ile Asn Asp Thr Asp Ala Asn 195 200 205 Pro Arg Tyr Lys Ile Pro Val Glu Ala Asp Phe Leu Phe Ala Tyr Ser 210 215 220 Thr Val Pro Gly Tyr Tyr Ser Trp Arg Ser Pro Gly Arg Gly Ser Trp 225 230 235 240 Phe Val Gln Ala Leu Cys Ser Ile Leu Glu Glu His Gly Lys Asp Leu 245 250 255 Glu Ile Met Gln Ile Leu Thr Arg Val Asn Asp Arg Val Ala Arg His 260 265 270 Phe Glu Ser Gln Ser Asp Asp Pro His Phe His Glu Lys Lys Gln Ile 275 280 285 Pro Cys Val Val Ser Met Leu Thr Lys Glu Leu Tyr Phe Ser Gln 290 295 300 <210> 340 <211> 912 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Caspase-7 precursor C14.004 <400> 340 atggcagatg atcagggctg tattgaagag cagggggttg aggattcagc aaatgaagat 60 tcagtggatg ctaagccaga ccggtcctcg tttgtaccgt ccctcttcag taagaagaag 120 aaaaatgtca ccatgcgatc catcaagacc acccgggacc gagtgcctac atatcagtac 180 aacatgaatt ttgaaaagct gggcaaatgc atcataataa acaacaagaa ctttgataaa 240 gtgacaggta tgggcgttcg aaacggaaca gacaaagatg ccgaggcgct cttcaagtgc 300 ttccgaagcc tgggttttga cgtgattgtc tataatgact gctcttgtgc caagatgcaa 360 gatctgctta aaaaagcttc tgaagaggac catacaaatg ccgcctgctt cgcctgcatc 420 ctcttaagcc atggagaaga aaatgtaatt tatgggaaag atggtgtcac accaataaag 480 gatttgacag cccactttag gggggataga tgcaaaaccc ttttagagaa acccaaactc 540 ttcttcattc aggcttgccg agggaccgag cttgatgatg ccatccaggc cgactcgggg 600 cccatcaatg acacagatgc taatcctcga tacaagatcc cagtggaagc tgacttcctc 660 ttcgcctatt ccacggttcc aggctattac tcgtggagga gcccaggaag aggctcctgg 720 tttgtgcaag ccctctgctc catcctggag gagcacggaa aagacctgga aatcatgcag 780 atcctcacca gggtgaatga cagagttgcc aggcactttg agtctcagtc tgatgaccca 840 cacttccatg agaagaagca gatcccctgt gtggtctcca tgctcaccaa ggaactctac 900 ttcagtcaat ag 912 <210> 341 <211> 293 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Caspase-6 precursor C14.005 <400> 341 Met Ser Ser Ala Ser Gly Leu Arg Arg Gly His Pro Ala Gly Gly Glu 1 5 10 15 Glu Asn Met Thr Glu Thr Asp Ala Phe Tyr Lys Arg Glu Met Phe Asp 20 25 30 Pro Ala Glu Lys Tyr Lys Met Asp His Arg Arg Arg Gly Ile Ala Leu 35 40 45 Ile Phe Asn His Glu Arg Phe Phe Trp His Leu Thr Leu Pro Glu Arg 50 55 60 Arg Gly Thr Cys Ala Asp Arg Asp Asn Leu Thr Arg Arg Phe Ser Asp 65 70 75 80 Leu Gly Phe Glu Val Lys Cys Phe Asn Asp Leu Lys Ala Glu Glu Leu 85 90 95 Leu Leu Lys Ile His Glu Val Ser Thr Val Ser His Ala Asp Ala Asp 100 105 110 Cys Phe Val Cys Val Phe Leu Ser His Gly Glu Gly Asn His Ile Tyr 115 120 125 Ala Tyr Asp Ala Lys Ile Glu Ile Gln Thr Leu Thr Gly Leu Phe Lys 130 135 140 Gly Asp Lys Cys His Ser Leu Val Gly Lys Pro Lys Ile Phe Ile Ile 145 150 155 160 Gln Ala Cys Arg Gly Asn Gln His Asp Val Pro Val Ile Pro Leu Asp 165 170 175 Val Val Asp Asn Gln Thr Glu Lys Leu Asp Thr Asn Ile Thr Glu Val 180 185 190 Asp Ala Ala Ser Val Tyr Thr Leu Pro Ala Gly Ala Asp Phe Leu Met 195 200 205 Cys Tyr Ser Val Ala Glu Gly Tyr Tyr Ser His Arg Glu Thr Val Asn 210 215 220 Gly Ser Trp Tyr Ile Gln Asp Leu Cys Glu Met Leu Gly Lys Tyr Gly 225 230 235 240 Ser Ser Leu Glu Phe Thr Glu Leu Leu Thr Leu Val Asn Arg Lys Val 245 250 255 Ser Gln Arg Arg Val Asp Phe Cys Lys Asp Pro Ser Ala Ile Gly Lys 260 265 270 Lys Gln Val Pro Cys Phe Ala Ser Met Leu Thr Lys Lys Leu His Phe 275 280 285 Phe Pro Lys Ser Asn 290 <210> 342 <211> 1545 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Caspase-6 precursor C14.005 <400> 342 ccgagggcgg ggccgggccc gggagcctgt ggcttcagga agaggagggc aaggtgtctg 60 gctgcgcgtt tggctgcaat gagctcggcc tcggggctcc gcagggggca cccggcaggt 120 ggggaagaaa acatgacaga aacagatgcc ttctataaaa gagaaatgtt tgatccggca 180 gaaaagtaca aaatggacca caggaggaga ggaattgctt taatcttcaa tcatgagagg 240 ttcttttggc acttaacact gccagaaagg cggcgcacct gcgcagatag agacaatctt 300 acccgcaggt tttcagatct aggatttgaa gtgaaatgct ttaatgatct taaagcagaa 360 gaactactgc tcaaaattca tgaggtgtca actgttagcc acgcagatgc cgattgcttt 420 gtgtgtgtct tcctgagcca tggcgaaggc aatcacattt atgcatatga tgctaaaatc 480 gaaattcaga cattaactgg cttgttcaaa ggagacaagt gtcacagcct ggttggaaaa 540 cccaagatat ttatcatcca ggcatgtcgg ggaaaccagc acgatgtgcc agtcattcct 600 ttggatgtag tagataatca gacagagaag ttggacacca acataactga ggtggatgca 660 gcctccgttt acacgctgcc tgctggagct gacttcctca tgtgttactc tgttgcagaa 720 ggatattatt ctcaccggga aactgtgaac ggctcatggt acattcaaga tttgtgtgag 780 atgttgggaa aatatggctc ctccttagag ttcacagaac tcctcacact ggtgaacagg 840 aaagtttctc agcgccgagt ggacttttgc aaagacccaa gtgcaattgg aaagaagcag 900 gttccctgtt ttgcctcaat gctaactaaa aagctgcatt tctttccaaa atctaattaa 960 ttaatagagg ctatctaatt tcacactctg tattgaaaat ggctttctca gccaggcgtg 1020 gttactcaca cctgtaatcc cagcactttg ggagtccaag gtgggcggat cacctgaggt 1080 cgggagttcg agaccagcct gaccaacatg gcagaagccc cgcctctact aaaaatgcaa 1140 aaaaaaattt agctaggcat ggcggcgcat gcctgcaatc ccagctactt ggaaggctga 1200 ggcaggagaa tcacttgaac ccaggaggtg gaggctgcgg tgagccgagc attgcgccat 1260 tgcactccag cctgggcaac gagtgaaact ccgtctcaaa aaaaaagaaa atgtctttct 1320 cttcctttta tataaatatc gttagggtga agcattatgg tctaatgatt caaatgtttt 1380 aaagtttaat gcctagcaga gaactgcctt aaaaaaaaaa agttcatgtt ggccatggtg 1440 aaagggtttg atatggagaa acaaaatcct caggaaatta gataaataaa aatttataag 1500 catttgtatt attttttaat aaactgcagg gttacacaaa aatct 1545 <210> 343 <211> 452 <212> PRT <213> Mus musculus <220> <223> Caspase-2 precursor C14.006 <400> 343 Met Ala Ala Pro Ser Gly Arg Ser Gln Ser Ser Leu His Arg Lys Gly 1 5 10 15 Leu Met Ala Ala Asp Arg Arg Ser Arg Ile Leu Ala Val Cys Gly Met 20 25 30 His Pro Asp His Gln Glu Thr Leu Lys Lys Asn Arg Val Val Leu Ala 35 40 45 Lys Gln Leu Leu Leu Ser Glu Leu Leu Glu His Leu Leu Glu Lys Asp 50 55 60 Ile Ile Thr Leu Glu Met Arg Glu Leu Ile Gln Ala Lys Gly Gly Ser 65 70 75 80 Phe Ser Gln Asn Val Glu Leu Leu Asn Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro 85 90 95 Gln Ala Phe Asp Ala Phe Cys Glu Ala Leu Arg Glu Thr Arg Gln Gly 100 105 110 His Leu Glu Asp Leu Leu Leu Thr Thr Leu Ser Asp Ile Gln His Val 115 120 125 Leu Pro Pro Leu Ser Cys Asp Tyr Asp Thr Ser Leu Pro Phe Ser Val 130 135 140 Cys Glu Ser Cys Pro Pro His Lys Gln Leu Arg Leu Ser Thr Asp Ala 145 150 155 160 Thr Glu His Ser Leu Asp Asn Gly Asp Gly Pro Pro Cys Leu Leu Val 165 170 175 Lys Pro Cys Thr Pro Glu Phe Tyr Gln Ala His Tyr Gln Leu Ala Tyr 180 185 190 Arg Leu Gln Ser Gln Pro Arg Gly Leu Ala Leu Val Leu Ser Asn Val 195 200 205 His Phe Thr Gly Glu Lys Asp Leu Glu Phe Arg Ser Gly Gly Asp Val 210 215 220 Asp His Thr Thr Leu Val Thr Leu Phe Lys Leu Leu Gly Tyr Asn Val 225 230 235 240 His Val Leu His Asp Gln Thr Ala Gln Glu Met Gln Glu Lys Leu Gln 245 250 255 Asn Phe Ala Gln Leu Pro Ala His Arg Val Thr Asp Ser Cys Val Val 260 265 270 Ala Leu Leu Ser His Gly Val Glu Gly Gly Ile Tyr Gly Val Asp Gly 275 280 285 Lys Leu Leu Gln Leu Gln Glu Val Phe Arg Leu Phe Asp Asn Ala Asn 290 295 300 Cys Pro Ser Leu Gln Asn Lys Pro Lys Met Phe Phe Ile Gln Ala Cys 305 310 315 320 Arg Gly Asp Glu Thr Asp Arg Gly Val Asp Gln Gln Asp Gly Lys Asn 325 330 335 His Thr Gln Ser Pro Gly Cys Glu Glu Ser Asp Ala Gly Lys Glu Glu 340 345 350 Leu Met Lys Met Arg Leu Pro Thr Arg Ser Asp Met Ile Cys Gly Tyr 355 360 365 Ala Cys Leu Lys Gly Asn Ala Ala Met Arg Asn Thr Lys Arg Gly Ser 370 375 380 Trp Tyr Ile Glu Ala Leu Thr Gln Val Phe Ser Glu Arg Ala Cys Asp 385 390 395 400 Met His Val Ala Asp Met Leu Val Lys Val Asn Ala Leu Ile Lys Glu 405 410 415 Arg Glu Gly Tyr Ala Pro Gly Thr Glu Phe His Arg Cys Lys Glu Met 420 425 430 Ser Glu Tyr Cys Ser Thr Leu Cys Gln Gln Leu Tyr Leu Phe Pro Gly 435 440 445 Tyr Pro Pro Thr 450 <210> 344 <211> 3395 <212> DNA <213> Mus musculus <220> <223> Caspase-2 precursor C14.006 <400> 344 ctggaaatgg cggcgccgag cgggaggtcg cagtcctccc tgcacaggaa ggggctgatg 60 gcggctgaca ggaggagcag gattttggca gtgtgtggaa tgcatcctga ccaccaggaa 120 acactgaaaa agaatcgagt ggtgctggcc aagcagctgc tgctgagcga gctgttagaa 180 cacctcctag agaaggacat tatcactttg gaaatgaggg agctcatcca ggccaaaggg 240 ggcagtttca gccagaatgt ggaactcctc aacctgctgc caaagagagg accccaggct 300 tttgatgcct tctgtgaagc cctgcgggag accaggcagg gtcacttgga agacttactg 360 ctcacaaccc tctcagatat tcagcacgta ctcccaccgt tgagctgtga ctatgacaca 420 agtctccctt tctcggtgtg tgagtcctgc cctcctcaca agcagctccg cctatccaca 480 gatgctacgg aacactcctt agataatggt gatggtcctc cctgtcttct ggtgaagcca 540 tgcactcctg agttttacca ggcacactac cagctggcct ataggttgca atctcagccc 600 cgtggcttgg cactggtgct gagcaatgtg cacttcactg gagagaaaga cctggaattc 660 cgctctggag gggatgtgga ccacactact ctagtcaccc tcttcaagct tttgggctac 720 aatgtccatg tgctacatga ccagaccgca caggaaatgc aagagaaact tcagaatttt 780 gcacagttac ctgcacaccg ggtcacagac tcctgcgtag tggcactcct ctcacatggt 840 gtggaaggtg gcatctatgg tgtagatggc aaactgcttc agctccaaga ggtttttcga 900 ctttttgaca atgctaactg tccaagtcta cagaacaagc caaaaatgtt cttcatccaa 960 gcatgtcgtg gagatgagac agatagaggt gtcgaccagc aagatggaaa gaaccacaca 1020 caatcccctg gatgtgagga gagtgatgct ggcaaagagg agttgatgaa gatgagactg 1080 cctactcgct cagacatgat atgtggctat gcttgcctta aaggtaatgc tgccatgcgg 1140 aacaccaaac ggggttcctg gtacattgag gccctcactc aggtgttctc tgaaagagct 1200 tgtgacatgc acgtggccga catgcttgtt aaggtgaatg cccttatcaa ggagcgtgaa 1260 ggctatgccc ctggcacaga attccaccga tgcaaggaga tgtctgagta ctgtagtact 1320 ctgtgccagc aactctacct gttcccaggc tacccaccca cgtgatgccg cctgctattc 1380 ctgctgttgg aggccactgg accactgggg gcacaatgga gacttctctt cagaatggtt 1440 tttgttctgt ctaccctctc agggatatga gattctccca ggcttgtttc ctgtcagcca 1500 tctctgtctt tgggtatgaa acataaggat ggctcctccg gtgtcgtgtt ctctacctat 1560 agagccagct ctgaatggat gtgttaccag aagcatttta gctacagcct agaaaatgac 1620 attgtgaaca cagtattatt gtgggaagag ggcatttgga tttctcaatg tttgtgatat 1680 ttttgttccc aaggcatctt aggagtactt ggatcatagc tttttttttt tttcctaaat 1740 cagttaagga gtctcagaga tcatctcctt ttttttccat atctacaacc tcatttttcc 1800 cacagtggag atttggaaga tgtcccaatt taatgtaggt gttttcatct gtcatgaagg 1860 gacagatgag atcctactac ttgcgaagtt tctatgcata cctttaagtt caggccctag 1920 gtgaaggaca gtccctcagc ctttccattg gttcctttgt gttcagtgca cccagccttt 1980 gaacagagcc tagggtctgt atgccatgac actggaagtc atagaaattt ccctggtcat 2040 gctttgtttg aactgtcact gaatgaacct tatcgggcat aactacatga aaatgcagtg 2100 acagctgagt gtgctgtgtc tcacactatc acccgtcatc aggatgtctc tccttcctta 2160 ctgtggcttc tgcatgcact tacactgtac ttgacggctg gcctccaggg tctctcttgc 2220 tttgtactgg ttcccctctt taccttcacc attcgctgct tctgccaagt ctgtgaagcc 2280 gtcctttgta ggatgtttct tgccacttac gctgtactgt agttgcttat tctttctgcc 2340 ttctgcttca gcgtgaggct tctttggttt tctgtggcag cgtctccctt ctcattgttt 2400 ctctgtgttt tagtggggat agtaccatat gtgatataac ctagaagcac ttgtctctgc 2460 tcttatgaaa cttgcttatt cttgaaaacc ttctgcattt ccattttttc ctctcttcca 2520 atttattctc catgtaacag agtagtttgg tttttaaaat atctggtgat gtcattctct 2580 tgcttagaac actagcttcc tgttacgctt catctaaaat gcaaattctt acacccagct 2640 tacgagatct ggctcatacc ttccctttgg atctcattaa atggtgattt ctcactatgc 2700 tccagcccct cttaggtcct catctccgtc ttgcaggtgt tctgaactct cctttggcta 2760 gtctctgatt tttgagtctg gcggaggcct cttgaccatg ctgcccatgc tgtctactgt 2820 gcctccttat gagggcatca tgttggtctc tgttgtgctt actgcaggct gtaatggcac 2880 ttttgcttgt ttcacttgtt ccctctgagg ctgaatgctc caagagagtg ggaactgtgc 2940 ttcttactta ctgatatcca gtaactggca cttactaggt cttcatgaat gtttcctgag 3000 taaaggaagg agaccagcag ctaaccttag ttagagccta ccttttgcag tttctaaatt 3060 gctattatag tgtacagttc aattagtata tgggtttttt tttccaggtg ttttattttt 3120 atccactgtt ttgttgttgt ttttttatat tttctacata tcacgtgtga gacaacttct 3180 ttcacatctc catagtgccc agcaaatttg aggcctatgg tagttgaggt gctcaactaa 3240 tgtttgttgt atgaaccaag tggtttgaag acttgctgcc aaattctgcc ttttgggtca 3300 gtataggatg cataagtggt agaatcttca cacttcccac tgccaagatt ttgtattgcc 3360 atcaggtgcc aaataaatgt tgatacttat tactg 3395 <210> 345 <211> 377 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Caspase-4 precursor C14.007 <400> 345 Met Ala Glu Gly Asn His Arg Lys Lys Pro Leu Lys Val Leu Glu Ser 1 5 10 15 Leu Gly Lys Asp Phe Leu Thr Gly Val Leu Asp Asn Leu Val Glu Gln 20 25 30 Asn Val Leu Asn Trp Lys Glu Glu Glu Lys Lys Lys Tyr Tyr Asp Ala 35 40 45 Lys Thr Glu Asp Lys Val Arg Val Met Ala Asp Ser Met Gln Glu Lys 50 55 60 Gln Arg Met Ala Gly Gln Met Leu Leu Gln Thr Phe Phe Asn Ile Asp 65 70 75 80 Gln Ile Ser Pro Asn Lys Lys Ala His Pro Asn Met Glu Ala Gly Pro 85 90 95 Pro Glu Ser Gly Glu Ser Thr Asp Ala Leu Lys Leu Cys Pro His Glu 100 105 110 Glu Phe Leu Arg Leu Cys Lys Glu Arg Ala Glu Glu Ile Tyr Pro Ile 115 120 125 Lys Glu Arg Asn Asn Arg Thr Arg Leu Ala Leu Ile Ile Cys Asn Thr 130 135 140 Glu Phe Asp His Leu Pro Pro Arg Asn Gly Ala Asp Phe Asp Ile Thr 145 150 155 160 Gly Met Lys Glu Leu Leu Glu Gly Leu Asp Tyr Ser Val Asp Val Glu 165 170 175 Glu Asn Leu Thr Ala Arg Asp Met Glu Ser Ala Leu Arg Ala Phe Ala 180 185 190 Thr Arg Pro Glu His Lys Ser Ser Asp Ser Thr Phe Leu Val Leu Met 195 200 205 Ser His Gly Ile Leu Glu Gly Ile Cys Gly Thr Val His Asp Glu Lys 210 215 220 Lys Pro Asp Val Leu Leu Tyr Asp Thr Ile Phe Gln Ile Phe Asn Asn 225 230 235 240 Arg Asn Cys Leu Ser Leu Lys Asp Lys Pro Lys Val Ile Ile Val Gln 245 250 255 Ala Cys Arg Gly Ala Asn Arg Gly Glu Leu Trp Val Arg Asp Ser Pro 260 265 270 Ala Ser Leu Glu Val Ala Ser Ser Gln Ser Ser Glu Asn Leu Glu Glu 275 280 285 Asp Ala Val Tyr Lys Thr His Val Glu Lys Asp Phe Ile Ala Phe Cys 290 295 300 Ser Ser Thr Pro His Asn Val Ser Trp Arg Asp Ser Thr Met Gly Ser 305 310 315 320 Ile Phe Ile Thr Gln Leu Ile Thr Cys Phe Gln Lys Tyr Ser Trp Cys 325 330 335 Cys His Leu Glu Glu Val Phe Arg Lys Val Gln Gln Ser Phe Glu Thr 340 345 350 Pro Arg Ala Lys Ala Gln Met Pro Thr Ile Glu Arg Leu Ser Met Thr 355 360 365 Arg Tyr Phe Tyr Leu Phe Pro Gly Asn 370 375 <210> 346 <211> 1291 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Caspase-4 precursor C14.007 <400> 346 gctctttcca acgctgtaaa aaaggacaga ggctgttccc tatggcagaa ggcaaccaca 60 gaaaaaagcc acttaaggtg ttggaatccc tgggcaaaga tttcctcact ggtgttttgg 120 ataacttggt ggaacaaaat gtactgaact ggaaggaaga ggaaaaaaag aaatattacg 180 atgctaaaac tgaagacaaa gttcgggtca tggcagactc tatgcaagag aagcaacgta 240 tggcaggaca aatgcttctt caaacctttt ttaacataga ccaaatatcc cccaataaaa 300 aagctcatcc gaatatggag gctggaccac ctgagtcagg agaatctaca gatgccctca 360 agctttgtcc tcatgaagaa ttcctgagac tatgtaaaga aagagctgaa gagatctatc 420 caataaagga gagaaacaac cgcacacgcc tggctctcat catatgcaat acagagtttg 480 accatctgcc tccgaggaat ggagctgact ttgacatcac agggatgaag gagctacttg 540 agggtctgga ctatagtgta gatgtagaag agaatctgac agccagggat atggagtcag 600 cgctgagggc atttgctacc agaccagagc acaagtcctc tgacagcaca ttcttggtac 660 tcatgtctca tggcatcctg gagggaatct gcggaactgt gcatgatgag aaaaaaccag 720 atgtgctgct ttatgacacc atcttccaga tattcaacaa ccgcaactgc ctcagtctga 780 aggacaaacc caaggtcatc attgtccagg cctgcagagg tgcaaaccgt ggggaactgt 840 gggtcagaga ctctccagca tccttggaag tggcctcttc acagtcatct gagaacctgg 900 aggaagatgc tgtttacaag acccacgtgg agaaggactt cattgctttc tgctcttcaa 960 cgccacacaa cgtgtcctgg agagacagca caatgggctc tatcttcatc acacaactca 1020 tcacatgctt ccagaaatat tcttggtgct gccacctaga ggaagtattt cggaaggtac 1080 agcaatcatt tgaaactcca agggccaaag ctcaaatgcc caccatagaa cgactgtcca 1140 tgacaagata tttctacctc tttcctggca attgaaaatg gaagccacaa gcagcccagc 1200 cctccttaat caacttcaag gagcaccttc attagtacag cttgcatatt taacattttg 1260 tatttcaata aaagtgaaga caaaaaaaaa a 1291 <210> 347 <211> 418 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Caspase-5 precursor C14.008 <400> 347 Met Phe Lys Gly Ile Leu Gln Ser Gly Leu Asp Asn Phe Val Ile Asn 1 5 10 15 His Met Leu Lys Asn Asn Val Ala Gly Gln Thr Ser Ile Gln Thr Leu 20 25 30 Val Pro Asn Thr Asp Gln Lys Ser Thr Ser Val Lys Lys Asp Asn His 35 40 45 Lys Lys Lys Thr Val Lys Met Leu Glu Tyr Leu Gly Lys Asp Val Leu 50 55 60 His Gly Val Phe Asn Tyr Leu Ala Lys His Asp Val Leu Thr Leu Lys 65 70 75 80 Glu Glu Glu Lys Lys Lys Tyr Tyr Asp Ala Lys Ile Glu Asp Lys Ala 85 90 95 Leu Ile Leu Val Asp Ser Leu Arg Lys Asn Arg Val Ala His Gln Met 100 105 110 Phe Thr Gln Thr Leu Leu Asn Met Asp Gln Lys Ile Thr Ser Val Lys 115 120 125 Pro Leu Leu Gln Ile Glu Ala Gly Pro Pro Glu Ser Ala Glu Ser Thr 130 135 140 Asn Ile Leu Lys Leu Cys Pro Arg Glu Glu Phe Leu Arg Leu Cys Lys 145 150 155 160 Lys Asn His Asp Glu Ile Tyr Pro Ile Lys Lys Arg Glu Asp Arg Arg 165 170 175 Arg Leu Ala Leu Ile Ile Cys Asn Thr Lys Phe Asp His Leu Pro Ala 180 185 190 Arg Asn Gly Ala His Tyr Asp Ile Val Gly Met Lys Arg Leu Leu Gln 195 200 205 Gly Leu Gly Tyr Thr Val Val Asp Glu Lys Asn Leu Thr Ala Arg Asp 210 215 220 Met Glu Ser Val Leu Arg Ala Phe Ala Ala Arg Pro Glu His Lys Ser 225 230 235 240 Ser Asp Ser Thr Phe Leu Val Leu Met Ser His Gly Ile Leu Glu Gly 245 250 255 Ile Cys Gly Thr Ala His Lys Lys Lys Lys Pro Asp Val Leu Leu Tyr 260 265 270 Asp Thr Ile Phe Gln Ile Phe Asn Asn Arg Asn Cys Leu Ser Leu Lys 275 280 285 Asp Lys Pro Lys Val Ile Ile Val Gln Ala Cys Arg Gly Glu Lys His 290 295 300 Gly Glu Leu Trp Val Arg Asp Ser Pro Ala Ser Leu Ala Val Ile Ser 305 310 315 320 Ser Gln Ser Ser Glu Asn Leu Glu Ala Asp Ser Val Cys Lys Ile His 325 330 335 Glu Glu Lys Asp Phe Ile Ala Phe Cys Ser Ser Thr Pro His Asn Val 340 345 350 Ser Trp Arg Asp Arg Thr Arg Gly Ser Ile Phe Ile Thr Glu Leu Ile 355 360 365 Thr Cys Phe Gln Lys Tyr Ser Cys Cys Cys His Leu Met Glu Ile Phe 370 375 380 Arg Lys Val Gln Lys Ser Phe Glu Val Pro Gln Ala Lys Ala Gln Met 385 390 395 400 Pro Thr Ile Glu Arg Ala Thr Leu Thr Arg Asp Phe Tyr Leu Phe Pro 405 410 415 Gly Asn <210> 348 <211> 1400 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Caspase-5 precursor C14.008 <400> 348 cggcaaaaaa aaaaggcgta agaattttga agctatgttc aaaggtatcc ttcagagtgg 60 attggataac ttcgtgataa accacatgct aaagaacaac gtggctggac aaacatctat 120 ccagacccta gtacctaata cggatcaaaa gtcgaccagt gtaaaaaaag acaaccacaa 180 aaaaaaaaca gttaagatgt tggaatacct gggcaaagat gttcttcatg gtgtttttaa 240 ttatttggca aaacacgatg ttctgacatt gaaggaagag gaaaagaaaa aatattatga 300 tgccaaaatt gaagacaagg ccctgatctt ggtagactct ttgcgaaaga atcgcgtggc 360 tcatcaaatg tttacccaaa cacttctcaa tatggaccaa aagatcacca gtgtaaaacc 420 tcttctgcaa atcgaggctg gaccacctga gtcagcagaa tctacaaata tactcaaact 480 ttgtcctcgt gaagaattcc tgagactgtg taaaaaaaat catgatgaga tctatccaat 540 aaaaaagaga gaggaccgca gacgcctggc tctcatcata tgcaatacaa agtttgatca 600 cctgcctgca aggaatgggg ctcactatga catcgtgggg atgaaaaggc tgcttcaagg 660 cctgggctac actgtggttg acgaaaagaa tctcacagcc agggatatgg agtcagtgct 720 gagggcattt gctgccagac cagagcacaa gtcctctgac agcacgttct tggtactcat 780 gtctcatggc atcctagagg gaatctgcgg aactgcgcat aaaaagaaaa aaccggatgt 840 gctgctttat gacaccatct tccagatatt caacaaccgc aactgcctca gtctaaagga 900 caaacccaag gtcatcattg tccaggcctg cagaggtgaa aaacatgggg aactctgggt 960 cagagactct ccagcatcct tggcagtcat ctcttcacag tcatctgaga acctggaggc 1020 agattctgtt tgcaagatcc acgaggagaa ggacttcatt gctttctgtt cttcaacacc 1080 acataacgtg tcctggagag accgcacaag gggctccatc ttcattacgg aactcatcac 1140 atgcttccag aaatattctt gctgctgcca cctaatggaa atatttcgga aggtacagaa 1200 atcatttgaa gttccacagg ctaaagccca gatgcccacc atagaacgag caaccttgac 1260 aagagatttc tacctctttc ctggcaattg aaaatgaaac cacaggcagc ccagccctcc 1320 tctgtcaaca tcaaagagca catttaccag tatagcttgc atagtcaata tttggtattt 1380 caataaaagt aaagactgta 1400 <210> 349 <211> 479 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Caspase-8 precursor C14.009 <400> 349 Met Asp Phe Ser Arg Asn Leu Tyr Asp Ile Gly Glu Gln Leu Asp Ser 1 5 10 15 Glu Asp Leu Ala Ser Leu Lys Phe Leu Ser Leu Asp Tyr Ile Pro Gln 20 25 30 Arg Lys Gln Glu Pro Ile Lys Asp Ala Leu Met Leu Phe Gln Arg Leu 35 40 45 Gln Glu Lys Arg Met Leu Glu Glu Ser Asn Leu Ser Phe Leu Lys Glu 50 55 60 Leu Leu Phe Arg Ile Asn Arg Leu Asp Leu Leu Ile Thr Tyr Leu Asn 65 70 75 80 Thr Arg Lys Glu Glu Met Glu Arg Glu Leu Gln Thr Pro Gly Arg Ala 85 90 95 Gln Ile Ser Ala Tyr Arg Val Met Leu Tyr Gln Ile Ser Glu Glu Val 100 105 110 Ser Arg Ser Glu Leu Arg Ser Phe Lys Phe Leu Leu Gln Glu Glu Ile 115 120 125 Ser Lys Cys Lys Leu Asp Asp Asp Met Asn Leu Leu Asp Ile Phe Ile 130 135 140 Glu Met Glu Lys Arg Val Ile Leu Gly Glu Gly Lys Leu Asp Ile Leu 145 150 155 160 Lys Arg Val Cys Ala Gln Ile Asn Lys Ser Leu Leu Lys Ile Ile Asn 165 170 175 Asp Tyr Glu Glu Phe Ser Lys Glu Arg Ser Ser Ser Leu Glu Gly Ser 180 185 190 Pro Asp Glu Phe Ser Asn Gly Glu Glu Leu Cys Gly Val Met Thr Ile 195 200 205 Ser Asp Ser Pro Arg Glu Gln Asp Ser Glu Ser Gln Thr Leu Asp Lys 210 215 220 Val Tyr Gln Met Lys Ser Lys Pro Arg Gly Tyr Cys Leu Ile Ile Asn 225 230 235 240 Asn His Asn Phe Ala Lys Ala Arg Glu Lys Val Pro Lys Leu His Ser 245 250 255 Ile Arg Asp Arg Asn Gly Thr His Leu Asp Ala Gly Ala Leu Thr Thr 260 265 270 Thr Phe Glu Glu Leu His Phe Glu Ile Lys Pro His Asp Asp Cys Thr 275 280 285 Val Glu Gln Ile Tyr Glu Ile Leu Lys Ile Tyr Gln Leu Met Asp His 290 295 300 Ser Asn Met Asp Cys Phe Ile Cys Cys Ile Leu Ser His Gly Asp Lys 305 310 315 320 Gly Ile Ile Tyr Gly Thr Asp Gly Gln Glu Ala Pro Ile Tyr Glu Leu 325 330 335 Thr Ser Gln Phe Thr Gly Leu Lys Cys Pro Ser Leu Ala Gly Lys Pro 340 345 350 Lys Val Phe Phe Ile Gln Ala Cys Gln Gly Asp Asn Tyr Gln Lys Gly 355 360 365 Ile Pro Val Glu Thr Asp Ser Glu Glu Gln Pro Tyr Leu Glu Met Asp 370 375 380 Leu Ser Ser Pro Gln Thr Arg Tyr Ile Pro Asp Glu Ala Asp Phe Leu 385 390 395 400 Leu Gly Met Ala Thr Val Asn Asn Cys Val Ser Tyr Arg Asn Pro Ala 405 410 415 Glu Gly Thr Trp Tyr Ile Gln Ser Leu Cys Gln Ser Leu Arg Glu Arg 420 425 430 Cys Pro Arg Gly Asp Asp Ile Leu Thr Ile Leu Thr Glu Val Asn Tyr 435 440 445 Glu Val Ser Asn Lys Asp Asp Lys Lys Asn Met Gly Lys Gln Met Pro 450 455 460 Gln Pro Thr Phe Thr Leu Arg Lys Lys Leu Val Phe Pro Ser Asp 465 470 475 <210> 350 <211> 2887 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Caspase-8 precursor C14.009 <400> 350 gattctgcct ttctgctgga gggaagtgtt ttcacaggtt ctcctccttt tatcttttgt 60 gttttttttc aagccctgct gaatttgcta gtcaactcaa caggaagtga ggccatggag 120 ggaggcagaa gagccagggt ggttattgaa agtagaagaa acttcttcct gggagccttt 180 cccaccccct tccctgctga gcacgtggag ttaggcaggt taggggactc ggagactgcg 240 atggtgccag gaaagggtgg agcggattat attctcctgc cttttaaaaa gatggacttc 300 agcagaaatc tttatgatat tggggaacaa ctggacagtg aagatctggc ctccctcaag 360 ttcctgagcc tggactacat tccgcaaagg aagcaagaac ccatcaagga tgccttgatg 420 ttattccaga gactccagga aaagagaatg ttggaggaaa gcaatctgtc cttcctgaag 480 gagctgctct tccgaattaa tagactggat ttgctgatta cctacctaaa cactagaaag 540 gaggagatgg aaagggaact tcagacacca ggcagggctc aaatttctgc ctacagggtc 600 atgctctatc agatttcaga agaagtgagc agatcagaat tgaggtcttt taagtttctt 660 ttgcaagagg aaatctccaa atgcaaactg gatgatgaca tgaacctgct ggatattttc 720 atagagatgg agaagagggt catcctggga gaaggaaagt tggacatcct gaaaagagtc 780 tgtgcccaaa tcaacaagag cctgctgaag ataatcaacg actatgaaga attcagcaaa 840 gagagaagca gcagccttga aggaagtcct gatgaatttt caaatgggga ggagttgtgt 900 ggggtaatga caatctcgga ctctccaaga gaacaggata gtgaatcaca gactttggac 960 aaagtttacc aaatgaaaag caaacctcgg ggatactgtc tgatcatcaa caatcacaat 1020 tttgcaaaag cacgggagaa agtgcccaaa cttcacagca ttagggacag gaatggaaca 1080 cacttggatg caggggcttt gaccacgacc tttgaagagc ttcattttga gatcaagccc 1140 cacgatgact gcacagtaga gcaaatctat gagattttga aaatctacca actcatggac 1200 cacagtaaca tggactgctt catctgctgt atcctctccc atggagacaa aggcatcatc 1260 tatggcactg atggacagga ggcccccatc tatgagctga catctcagtt cactggtttg 1320 aagtgccctt cccttgctgg aaaacccaaa gtgtttttta ttcaggcttg tcagggggat 1380 aactaccaga aaggtatacc tgttgagact gattcagagg agcaacccta tttagaaatg 1440 gatttatcat cacctcaaac gagatatatc ccggatgagg ctgactttct gctggggatg 1500 gccactgtga ataactgtgt ttcctaccga aaccctgcag agggaacctg gtacatccag 1560 tcactttgcc agagcctgag agagcgatgt cctcgaggcg atgatattct caccatcctg 1620 actgaagtga actatgaagt aagcaacaag gatgacaaga aaaacatggg gaaacagatg 1680 cctcagccta ctttcacact aagaaaaaaa cttgtcttcc cttctgattg atggtgctat 1740 tttgtttgtt ttgttttgtt ttgttttttt gagacagaat ctcgctctgt cgcccaggct 1800 ggagtgcagt ggcgtgatct cggctcaccg caagctccgc ctcccgggtt cacgccattc 1860 tcctgcctca gcctcccgag tagctgggac tacaggggcc cgccaccaca cctggctaat 1920 tttttaaaaa tatttttagt agagacaggg tttcactgtg ttagccaggg tggtcttgat 1980 ctcctgacct cgtgatccac ccacctcggc ctcccaaagt gctgggatta caggcgtgag 2040 ccaccgcgcc tggccgatgg tactatttag atataacact atgtttattt actaattttc 2100 tagattttct actttattaa ttgttttgca cttttttata agagctaaag ttaaatagga 2160 tattaacaac aataacactg tctcctttct cttacgctta aggctttggg aatgttttta 2220 gctggtggca ataaatacca gacacgtaca aaatccagct atgaatatag agggcttatg 2280 attcagattg ttatctatca actataagcc cactgttaat attctattaa ctttaattct 2340 ctttcaaagc taaattccac actaccacat taaaaaaatt agaaagtagc cacgtatggt 2400 ggctcatgtc tataatccca gcactttggg aggttgaggt gggaggattt gcttgaaccc 2460 aagaggtcca aggctgcagt gagccatgtt cacaccgctg cactcaagct tgggtgacag 2520 agcaagaccc cgtccccaaa aaaatttttt ttttaataaa cccaaatttg tttgaaaact 2580 tttaaaaatt caaatgattt ttacaagttt taaataagct ctccccaaac ttgctttatg 2640 ccttcttatt gcttttatga tatatatatg cttggctaac tatatttgct ttttgctaac 2700 aatgctctgg ggtcttttta tgcatttgca tttgctcttt catctctgct tggattattt 2760 taaatcatta ggaattaagt tatctttaaa atttaagtat cttttttcca aaacattttt 2820 taatagaata aaatataatt tgatcttaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2880 aaaaaaa 2887 <210> 351 <211> 416 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Caspase-9 precursor C14.010 <400> 351 Met Asp Glu Ala Asp Arg Arg Leu Leu Arg Arg Cys Arg Leu Arg Leu 1 5 10 15 Val Glu Glu Leu Gln Val Asp Gln Leu Trp Asp Ala Leu Leu Ser Arg 20 25 30 Glu Leu Phe Arg Pro His Met Ile Glu Asp Ile Gln Arg Ala Gly Ser 35 40 45 Gly Ser Arg Arg Asp Gln Ala Arg Gln Leu Ile Ile Asp Leu Glu Thr 50 55 60 Arg Gly Ser Gln Ala Leu Pro Leu Phe Ile Ser Cys Leu Glu Asp Thr 65 70 75 80 Gly Gln Asp Met Leu Ala Ser Phe Leu Arg Thr Asn Arg Gln Ala Ala 85 90 95 Lys Leu Ser Lys Pro Thr Leu Glu Asn Leu Thr Pro Val Val Leu Arg 100 105 110 Pro Glu Ile Arg Lys Pro Glu Val Leu Arg Pro Glu Thr Pro Arg Pro 115 120 125 Val Asp Ile Gly Ser Gly Gly Phe Gly Asp Val Gly Ala Leu Glu Ser 130 135 140 Leu Arg Gly Asn Ala Asp Leu Ala Tyr Ile Leu Ser Met Glu Pro Cys 145 150 155 160 Gly His Cys Leu Ile Ile Asn Asn Val Asn Phe Cys Arg Glu Ser Gly 165 170 175 Leu Arg Thr Arg Thr Gly Ser Asn Ile Asp Cys Glu Lys Leu Arg Arg 180 185 190 Arg Phe Ser Ser Leu His Phe Met Val Glu Val Lys Gly Asp Leu Thr 195 200 205 Ala Lys Lys Met Val Leu Ala Leu Leu Glu Leu Ala Gln Gln Asp His 210 215 220 Gly Ala Leu Asp Cys Cys Val Val Val Ile Leu Ser His Gly Cys Gln 225 230 235 240 Ala Ser His Leu Gln Phe Pro Gly Ala Val Tyr Gly Thr Asp Gly Cys 245 250 255 Pro Val Ser Val Glu Lys Ile Val Asn Ile Phe Asn Gly Thr Ser Cys 260 265 270 Pro Ser Leu Gly Gly Lys Pro Lys Leu Phe Phe Ile Gln Ala Cys Gly 275 280 285 Gly Glu Gln Lys Asp His Gly Phe Glu Val Ala Ser Thr Ser Pro Glu 290 295 300 Asp Glu Ser Pro Gly Ser Asn Pro Glu Pro Asp Ala Thr Pro Phe Gln 305 310 315 320 Glu Gly Leu Arg Thr Phe Asp Gln Leu Asp Ala Ile Ser Ser Leu Pro 325 330 335 Thr Pro Ser Asp Ile Phe Val Ser Tyr Ser Thr Phe Pro Gly Phe Val 340 345 350 Ser Trp Arg Asp Pro Lys Ser Gly Ser Trp Tyr Val Glu Thr Leu Asp 355 360 365 Asp Ile Phe Glu Gln Trp Ala His Ser Glu Asp Leu Gln Ser Leu Leu 370 375 380 Leu Arg Val Ala Asn Ala Val Ser Val Lys Gly Ile Tyr Lys Gln Met 385 390 395 400 Pro Gly Cys Phe Asn Phe Leu Arg Lys Lys Leu Phe Phe Lys Thr Ser 405 410 415 <210> 352 <211> 1481 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Caspase-9 precursor C14.010 <400> 352 gccatggacg aagcggatcg gcggctcctg cggcggtgcc ggctgcggct ggtggaagag 60 ctgcaggtgg accagctctg ggacgtcctg ctgagccgcg agctgttcag gccccatatg 120 atcgaggaca tccagcgggc aggctctgga tctcggcggg atcaggccag gcagctgatc 180 atagatctgg agactcgagg gagtcaggct cttcctttgt tcatctcctg cttagaggac 240 acaggccagg acatgctggc ttcgtttctg cgaactaaca ggcaagcagg aaagttgtcg 300 aagccaaccc tagaaaacct taccccagtg gtgctcagac cagagattcg caaaccagag 360 gttctcagac cggaaacacc cagaccagtg gacattggtt ctggaggatt cggtgatgtc 420 ggtgctcttg agagtttgag gggaaatgca gatttggctt acatcctgag catggagccc 480 tgtggccact gcctcattat caacaatgtg aacttctgcc gtgagtccgg gctccgcacc 540 cgcactggct ccaacatcga ctgtgagaag ttgcggcgtc gcttctcctc gctgcatttc 600 atggtggagg tgaagggcga cctgactgcc aagaaaatgg tgctggcttt gctggagctg 660 gcgcggcagg accacggtgc tctggactgc tgcgtggtgg tcattctctc tcacggctgt 720 caggccagcc acctgcagtt cccaggggct gtctacggca cagatggatg ccctgtgtcg 780 gtcgagaaga ttgtgaacat cttcaatggg accagctgcc ccagcctggg agggaagccc 840 aagctctttt tcatccaggc ctgtggtggg gagcagaaag accatgggtt tgaggtggcc 900 tccacttccc ctgaagacga gtcccctggc agtaaccccg agccagatgc caccccgttc 960 caggaaggtt tgaggacctt cgaccagctg gacgccatat ctagtttgcc cacacccagt 1020 gacatctttg tgtcctactc tactttccca ggttttgttt cctggaggga ccccaagagt 1080 ggctcctggt acgttgagac cctggacgac atctttgagc agtgggctca ctctgaagac 1140 ctgcagtccc tcctgcttag ggtcgctaat gctgtttcgg tgaaagggat ttataaacag 1200 atgcctggtt gctttaattt cctccggaaa aaacttttct ttaaaacatc ataaggccag 1260 ggcccctcac cctgccttat cttgcacccc caaagctttc ctgccccagg cctgaaagag 1320 gctgaggcct ggactttcct gcaactcaag gactttgcag ccggcacagg gtctgctctt 1380 tctctgccag tgacagacag gctcttagca gcttccagat tgacgacaag tgctgaacag 1440 tggaggaaga gggacagatg aatgccgtgg attgcacgtg g 1481 <210> 353 <211> 521 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Caspase-10 precursor C14.011 <400> 353 Met Lys Ser Gln Gly Gln His Trp Tyr Ser Ser Ser Asp Lys Asn Cys 1 5 10 15 Lys Val Ser Phe Arg Glu Lys Leu Leu Ile Ile Asp Ser Asn Leu Gly 20 25 30 Val Gln Asp Val Glu Asn Leu Lys Phe Leu Cys Ile Gly Leu Val Pro 35 40 45 Asn Lys Lys Leu Glu Lys Ser Ser Ser Ala Ser Asp Val Phe Glu His 50 55 60 Leu Leu Ala Glu Asp Leu Leu Ser Glu Glu Asp Pro Phe Phe Leu Ala 65 70 75 80 Glu Leu Leu Tyr Ile Ile Arg Gln Lys Lys Leu Leu Gln His Leu Asn 85 90 95 Cys Thr Lys Glu Glu Val Glu Arg Leu Leu Pro Thr Arg Gln Arg Val 100 105 110 Ser Leu Phe Arg Asn Leu Leu Tyr Glu Leu Ser Glu Gly Ile Asp Ser 115 120 125 Glu Asn Leu Lys Asp Met Ile Phe Leu Leu Lys Asp Ser Leu Pro Lys 130 135 140 Thr Glu Met Thr Ser Leu Ser Phe Leu Ala Phe Leu Glu Lys Gln Gly 145 150 155 160 Lys Ile Asp Glu Asp Asn Leu Thr Cys Leu Glu Asp Leu Cys Lys Thr 165 170 175 Val Val Pro Lys Leu Leu Arg Asn Ile Glu Lys Tyr Lys Arg Glu Lys 180 185 190 Ala Ile Gln Ile Val Thr Pro Pro Val Asp Lys Glu Ala Glu Ser Tyr 195 200 205 Gln Gly Glu Glu Glu Leu Val Ser Gln Thr Asp Val Lys Thr Phe Leu 210 215 220 Glu Ala Leu Pro Gln Glu Ser Trp Gln Asn Lys His Ala Gly Ser Asn 225 230 235 240 Gly Asn Arg Ala Thr Asn Gly Ala Pro Ser Leu Val Ser Arg Gly Met 245 250 255 Gln Gly Ala Ser Ala Asn Thr Leu Asn Ser Glu Thr Ser Thr Lys Arg 260 265 270 Ala Ala Val Tyr Arg Met Asn Arg Asn His Arg Gly Leu Cys Val Ile 275 280 285 Val Asn Asn His Ser Phe Thr Ser Leu Lys Asp Arg Gln Gly Thr His 290 295 300 Lys Asp Ala Glu Ile Leu Ser His Val Phe Gln Trp Leu Gly Phe Thr 305 310 315 320 Val His Ile His Asn Asn Val Thr Lys Val Glu Met Glu Met Val Leu 325 330 335 Gln Lys Gln Lys Cys Asn Pro Ala His Ala Asp Gly Asp Cys Phe Val 340 345 350 Phe Cys Ile Leu Thr His Gly Arg Phe Gly Ala Val Tyr Ser Ser Asp 355 360 365 Glu Ala Leu Ile Pro Ile Arg Glu Ile Met Ser His Phe Thr Ala Leu 370 375 380 Gln Cys Pro Arg Leu Ala Glu Lys Pro Lys Leu Phe Phe Ile Gln Ala 385 390 395 400 Cys Gln Gly Glu Glu Ile Gln Pro Ser Val Ser Ile Glu Ala Asp Ala 405 410 415 Leu Asn Pro Glu Gln Ala Pro Thr Ser Leu Gln Asp Ser Ile Pro Ala 420 425 430 Glu Ala Asp Phe Leu Leu Gly Leu Ala Thr Val Pro Gly Tyr Val Ser 435 440 445 Phe Arg His Val Glu Glu Gly Ser Trp Tyr Ile Gln Ser Leu Cys Asn 450 455 460 His Leu Lys Lys Leu Val Pro Arg Met Leu Lys Phe Leu Glu Lys Thr 465 470 475 480 Met Glu Ile Arg Gly Arg Lys Arg Thr Val Trp Gly Ala Lys Gln Ile 485 490 495 Ser Ala Thr Ser Leu Pro Thr Ala Ile Ser Ala Gln Thr Pro Arg Pro 500 505 510 Pro Met Arg Arg Trp Ser Ser Val Ser 515 520 <210> 354 <211> 3536 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Caspase-10 precursor C14.011 <400> 354 tgaagtctct tcccaagcaa atgggagctt ctttggacct tggagcacac agaggattct 60 actttcttta aaactttgtt ttcaggcaat ttccctgaga accgtttact tccagaagat 120 tggtggagct tgatctgaag gctggccatg aaatctcaag gtcaacattg gtattccagt 180 tcagataaaa actgtaaagt gagctttcgt gagaagcttc tgattattga ttcaaacctg 240 ggggtccaag atgtggagaa cctcaagttt ctctgcatag gattggtccc caacaagaag 300 ctggagaagt ccagctcagc ctcagatgtt tttgaacatc tcttggcaga ggatctgctg 360 agtgaggaag accctttctt cctggcagaa ctcctctata tcatacggca gaagaagctg 420 ctgcagcacc tcaactgtac caaagaggaa gtggagcgac tgctgcccac ccgacaaagg 480 gtttctctgt ttagaaacct gctctacgaa ctgtcagaag gcattgactc agagaactta 540 aaggacatga tcttccttct gaaagactcg cttcccaaaa ctgaaatgac ctccctaagt 600 ttcctggcat ttctagagaa acaaggtaaa atagatgaag ataatctgac atgcctggag 660 gacctctgca aaacagttgt acctaaactt ttgagaaaca tagagaaata caaaagagag 720 aaagctatcc agatagtgac acctcctgta gacaaggaag ccgagtcgta tcaaggagag 780 gaagaactag tttcccaaac agatgttaag acattcttgg aagccttacc gagggcagct 840 gtgtacagga tgaatcggaa ccacagaggc ctctgtgtca ttgtcaacaa ccacagcttt 900 acctccctga aggacagaca aggaacccat aaagatgctg agatcctgag tcatgtgttc 960 cagtggcttg ggttcacagt gcatatacac aataatgtga cgaaagtgga aatggagatg 1020 gtcctgcaga agcagaagtg caatccagcc catgccgacg gggactgctt cgtgttctgt 1080 attctgaccc atgggagatt tggagctgtc tactcttcgg atgaggccct cattcccatt 1140 cgggagatca tgtctcactt cacagccctg cagtgcccta gactggctga aaaacctaaa 1200 ctctttttca tccaggcctg ccaaggtgaa gagatacagc cttccgtatc catcgaagca 1260 gatgctctga accctgagca ggcacccact tccctgcagg acagtattcc tgccgaggct 1320 gacttcctac ttggtctggc cactgtccca ggctatgtat cctttcggca tgtggaggaa 1380 ggcagctggt atattcagtc tctgtgtaat catctgaaga aattggtccc aagacatgaa 1440 gacatcttat ccatcctcac tgctgtcaac gatgatgtga gtcgaagagt ggacaaacag 1500 ggaacaaaga aacagatgcc ccagcctgct ttcacactaa ggaaaaaact agtattccct 1560 gtgcccctgg atgcactttc aatatagcag agagtttttg ttggttctta gacctcaaac 1620 gaatcattgg gtataacctc cagcctcctg cccagcacag gaatcggtgg tctccacctg 1680 tcattctaga aacaggaaac accgtgtttt ctgacacagt caattctgat tttctttttc 1740 ttttgcaagt ctaaatgtta gaaaactttc tttttttgga gatagtctca ttctgtcacc 1800 cagactggag tgcagggggg caatcacggc tcactgtagt ctcgacctcc caggctcaag 1860 ctgtcctccc acctcagcct cccaagtagc tgagactaca ggtgtgtgtc catgcacagc 1920 taacttttta ttttttttgt ggagatgggg tttcactatg ttgcctaagc tggtctcaaa 1980 ctcctgggct caagcgatcc tcccacctca gcttctcaaa gttctgggac tacaggcatg 2040 aaatactgtg cctggcctgg ggaccaggtg cattttaagg ttccttggtg ttcaaaaacc 2100 acgttcttag cctagattga gcttagattg cctctctaga caactacccc ttagttataa 2160 ttctgtgtcc cctctgcatg cccttaaaca ttggacagtg aggtcacagt ccacccaccc 2220 tctctctgat ctcccccttc ctaagacttc tcttttgcac atctagtgag gtgaaaattt 2280 ggtctatgcc aggcccattt cctgcttttg tgtaaggaag gtgctcacat aggaagtttt 2340 tatttggtta gagacaggtt tccctgtagg aagatgatgg ctcatttaca ctcagctgct 2400 ctgcaagcag aaactttaca acctgatgtc atattccatt ttggactggg tgcggtgact 2460 catgcctgta atcccagtac tctgggaagc caaggcaggc agatcacttg aggtcaggag 2520 ttcgagacca gcctggccaa tacggcaaaa cctcatcatt actaaaaaca caaaaattag 2580 ccaggtgtgg cggcgagcac ctgtaatccc agctactcgg gaggctgaga caggagaatc 2640 tcttgaatcc aggaggcaga ggctgtggtg agccaagatg acacaactgc actccagctt 2700 gggcaacagg gcgagacctt gtttaaaaaa aaaattcaat attggggttg gaacatttca 2760 gttgccattg acagaacacc caattcaaat tgactgaagc aaagaaggga atttattgcc 2820 tctttcacat tgaaacccag gagtggataa cactggcttc aggcaaagct tgaatcagga 2880 ctcaatctac aggccagcac ctttctcttg gccggatgtc ctcagggctg gcagatgcag 2940 tagactgcag tggacagtcc ccaccttgtt actgctacta cactttgctc ctctggccca 3000 aggcatgagg agagaggctg tgtcagaaac tgaagctgtt ctcaggatca ctgggctctt 3060 cttggcagag gggatgtctg gcttgcctga agggagtggc tctgtaagga cgccttgatg 3120 ctttcttcat taagattttg agcattttta cgtacttgag cttttttttt tttttttttc 3180 aatttctaga ggaacttttt ctctgttaat tcctggaact gtattttgaa tccttaaagg 3240 tgagccctca tagggagatc caaagtcctg tggttaacgc cttcatttat agatgaggca 3300 gctgaggcct ggggatgtga acaacctgct cacagtcctc atttactgga tttgacttca 3360 gccaggtgaa ctggaatgcc ttggggcgtg gaagggcatt aggagtgttt catttgatat 3420 gtgaatgctc ataaaaaaat gtcaaggaat gaagaacaac aactctcagt ggtgcctgca 3480 tttataatta tttatgtgaa agtcaaattc atgtacagta aatttgttat aagaat 3536 <210> 355 <211> 373 <212> PRT <213> Mus musculus <220> <223> Caspase-11 C14.012 <400> 355 Met Ala Glu Asn Lys His Pro Asp Lys Pro Leu Lys Val Leu Glu Gln 1 5 10 15 Leu Gly Lys Glu Val Leu Thr Glu Tyr Leu Glu Lys Leu Val Gln Ser 20 25 30 Asn Val Leu Lys Leu Lys Glu Glu Asp Lys Gln Lys Phe Asn Asn Ala 35 40 45 Glu Arg Ser Asp Lys Arg Trp Val Phe Val Asp Ala Met Lys Lys Lys 50 55 60 His Ser Lys Val Gly Glu Met Leu Leu Gln Thr Phe Phe Ser Val Asp 65 70 75 80 Pro Gly Ser His His Gly Glu Ala Asn Leu Glu Met Glu Glu Pro Glu 85 90 95 Glu Ser Leu Asn Thr Leu Lys Leu Cys Ser Pro Glu Glu Phe Thr Arg 100 105 110 Leu Cys Arg Glu Lys Thr Gln Glu Ile Tyr Pro Ile Lys Glu Ala Asn 115 120 125 Gly Arg Thr Arg Lys Ala Leu Ile Ile Cys Asn Thr Glu Phe Lys His 130 135 140 Leu Ser Leu Arg Tyr Gly Ala Lys Phe Asp Ile Ile Gly Met Lys Gly 145 150 155 160 Leu Leu Glu Asp Leu Gly Tyr Asp Val Val Val Lys Glu Glu Leu Thr 165 170 175 Ala Glu Gly Met Glu Ser Glu Met Lys Asp Phe Ala Ala Leu Ser Glu 180 185 190 His Gln Thr Ser Asp Ser Thr Phe Leu Val Leu Met Ser His Gly Thr 195 200 205 Leu His Gly Ile Cys Gly Thr Met His Ser Glu Lys Thr Pro Asp Val 210 215 220 Leu Gln Tyr Asp Thr Ile Tyr Gln Ile Phe Asn Asn Cys His Cys Pro 225 230 235 240 Gly Leu Arg Asp Lys Pro Lys Val Ile Ile Val Gln Ala Cys Arg Gly 245 250 255 Gly Asn Ser Gly Glu Met Trp Ile Arg Glu Ser Ser Lys Pro Gln Leu 260 265 270 Cys Arg Gly Val Asp Leu Pro Arg Asn Met Glu Ala Asp Ala Val Lys 275 280 285 Leu Ser His Val Glu Lys Asp Phe Ile Ala Phe Tyr Ser Thr Thr Pro 290 295 300 His His Leu Ser Tyr Arg Asp Lys Thr Gly Gly Ser Tyr Phe Ile Thr 305 310 315 320 Arg Leu Ile Ser Cys Phe Arg Lys His Ala Cys Ser Cys His Leu Phe 325 330 335 Asp Ile Phe Leu Lys Val Gln Gln Ser Phe Glu Lys Ala Ser Ile His 340 345 350 Ser Gln Met Pro Thr Ile Asp Arg Ala Thr Leu Thr Arg Tyr Phe Tyr 355 360 365 Leu Phe Pro Gly Asn 370 <210> 356 <211> 1350 <212> DNA <213> Mus musculus <220> <223> Caspase-11 C14.012 <400> 356 tcttcacagt gcgaaagaac tgaggctttt tctcatggct gaaaacaaac accctgacaa 60 accacttaag gtgttggaac agctgggcaa agaagtcctt acggagtacc tagaaaaatt 120 agtacaaagc aatgtactga aattaaagga ggaagataaa caaaaattta acaatgctga 180 acgcagtgac aagcgttggg tttttgtaga tgccatgaaa aagaaacaca gcaaagtagg 240 tgaaatgctt ctccagacat tcttcagtgt ggacccaggc agccaccatg gtgaagctaa 300 tctggaaatg gaggaaccag aagaatcatt gaacactctc aagctttgtt cccctgaaga 360 gttcacaagg ctttgcagag aaaagacaca agaaatttac ccaataaagg aggccaatgg 420 ccgtacacga aaggctctta tcatatgcaa tacagagttc aaacatctct cactgaggta 480 tggggctaaa tttgacatca ttggtatgaa aggccttctt gaagacttag gctacgatgt 540 ggtggtgaaa gaggagctta cagcagaggg catggagtca gagatgaaag actttgctgc 600 actctcagaa caccagacat cagacagcac attcctggtg ctaatgtctc atggcacact 660 gcatggcatt tgtggaacaa tgcacagtga aaaaactcca gatgtgctac agtatgatac 720 catctatcag atattcaaca attgccactg tccaggtcta cgagacaaac ccaaagtcat 780 cattgtgcag gcctgcagag gtgggaactc tggagaaatg tggatcagag agtcttcaaa 840 accccagttg tgcagaggtg tagatctacc taggaatatg gaagctgatg ctgtcaagct 900 gagccacgtg gagaaggact tcattgcctt ctactctaca accccacatc acttgtccta 960 ccgagacaaa acaggaggct cttacttcat cactagactc atttcctgct tccggaaaca 1020 tgcttgctct tgtcatctct ttgatatatt cctgaaggtg caacaatcat ttgaaaaggc 1080 aagtattcat tcccagatgc ccaccattga tcgggcaacc ttgacaagat atttctacct 1140 ctttcctggc aactgagaac aaagcaacaa gcaactgaat ctcatttctt cagcttgaag 1200 aagtgatctt ggccaaggat cacattctat tcctgaaatt ccagaactag tgaaattaag 1260 gaaagaatac ttatgaattc aagaccagcc taagcaacac agtgggattc tgttccatag 1320 acaagcaaac aagcaaaaat aaaaaaaaaa 1350 <210> 357 <211> 419 <212> PRT <213> Mus musculus <220> <223> Caspase-12 precursor C14.013 <400> 357 Met Ala Ala Arg Arg Thr His Glu Arg Asp Pro Ile Tyr Lys Ile Lys 1 5 10 15 Gly Leu Ala Lys Asp Met Leu Asp Gly Val Phe Asp Asp Leu Val Glu 20 25 30 Lys Asn Val Leu Asn Gly Asp Glu Leu Leu Lys Ile Gly Glu Ser Ala 35 40 45 Ser Phe Ile Leu Asn Lys Ala Glu Asn Leu Val Glu Asn Phe Leu Glu 50 55 60 Lys Thr Asp Met Ala Gly Lys Ile Phe Ala Gly His Ile Ala Asn Ser 65 70 75 80 Gln Glu Gln Leu Ser Leu Gln Phe Ser Asn Asp Glu Asp Asp Gly Pro 85 90 95 Gln Lys Ile Cys Thr Pro Ser Ser Pro Ser Glu Ser Lys Arg Lys Val 100 105 110 Glu Asp Asp Glu Met Glu Val Asn Ala Gly Leu Ala His Glu Ser His 115 120 125 Leu Met Leu Thr Ala Pro His Gly Leu Gln Ser Ser Glu Val Gln Asp 130 135 140 Thr Leu Lys Leu Cys Pro Arg Asp Gln Phe Cys Lys Ile Lys Thr Glu 145 150 155 160 Arg Ala Lys Glu Ile Tyr Pro Val Met Glu Lys Glu Gly Arg Thr Arg 165 170 175 Leu Ala Leu Ile Ile Cys Asn Lys Lys Phe Asp Tyr Leu Phe Asp Arg 180 185 190 Asp Asn Ala Asp Thr Asp Ile Leu Asn Met Gln Glu Leu Leu Glu Asn 195 200 205 Leu Gly Tyr Ser Val Val Leu Lys Glu Asn Leu Thr Ala Gln Glu Met 210 215 220 Glu Thr Glu Leu Met Gln Phe Ala Gly Arg Pro Glu His Gln Ser Ser 225 230 235 240 Asp Ser Thr Phe Leu Val Phe Met Ser His Gly Ile Leu Glu Gly Ile 245 250 255 Cys Gly Val Lys His Arg Asn Lys Lys Pro Asp Val Leu His Asp Asp 260 265 270 Thr Ile Phe Lys Ile Phe Asn Asn Ser Asn Cys Arg Ser Leu Arg Asn 275 280 285 Lys Pro Lys Ile Leu Ile Met Gln Ala Cys Arg Gly Arg Tyr Asn Gly 290 295 300 Thr Ile Trp Val Ser Thr Asn Lys Gly Ile Ala Thr Ala Asp Thr Asp 305 310 315 320 Glu Glu Arg Val Leu Ser Cys Lys Trp Asn Asn Ser Ile Thr Lys Ala 325 330 335 His Val Glu Thr Asp Phe Ile Ala Phe Lys Ser Ser Thr Pro His Asn 340 345 350 Ile Ser Trp Lys Val Gly Lys Thr Gly Ser Leu Phe Ile Ser Lys Leu 355 360 365 Ile Asp Cys Phe Lys Lys Tyr Cys Trp Cys Tyr His Leu Glu Glu Ile 370 375 380 Phe Arg Lys Val Gln His Ser Phe Glu Val Pro Gly Glu Leu Thr Gln 385 390 395 400 Met Pro Thr Ile Glu Arg Val Ser Met Thr Arg Tyr Phe Tyr Leu Phe 405 410 415 Pro Gly Asn <210> 358 <211> 2228 <212> DNA <213> Mus musculus <220> <223> Caspase-12 precursor C14.013 <400> 358 ggcacgagcg gcacgagcgg cacgagcaca gccatggcgg ccaggaggac acatgaaaga 60 gatccaatct acaagatcaa aggtttggcc aaggacatgc tggatggggt ttttgatgac 120 ctggtggaga agaatgtttt aaatggagat gagttactca aaatagggga aagtgcgagt 180 ttcatcctga acaaggctga gaatctggtt gagaacttct tagagaaaac agacatggca 240 ggaaaaatat ttgctggcca cattgccaat tcccaggaac agctgagttt acaattttct 300 aatgatgagg atgatggacc tcagaagata tgtacacctt cttctccatc agaatccaag 360 agaaaagtag aggatgatga aatggaggta aatgctggat tggcccatga atcacatcta 420 atgctgacag ctcctcatgg actccagagc tcagaagtcc aagatacact gaagctttgt 480 ccacgtgatc agttttgtaa gataaagaca gaaagggcaa aagagatata tccagtgatg 540 gagaaggagg gacgaacacg tctggctctc atcatctgca acaaaaagtt tgactacctt 600 tttgatagag ataatgctga tactgacatt ttgaacatgc aagaactact tgaaaatctt 660 ggatactctg tggtgttaaa ggaaaacctt acagctcagg aaatggagac agagttaatg 720 cagtttgctg gccgtccaga gcaccagtcc tcagacagca cattcctggt gtttatgtcc 780 catggcatcc tggaaggaat ctgtggggtg aagcaccgaa acaaaaagcc agatgttctt 840 catgatgaca ctatcttcaa aattttcaac aactctaact gtcggagtct gagaaacaaa 900 cccaagattc tcatcatgca ggcctgcaga ggcagatata atggaactat ttgggtatcc 960 acaaacaaag ggatagccac tgctgataca gatgaggaac gtgtgttgag ctgtaaatgg 1020 aataatagta taacaaaggc ccatgtggag acagatttca ttgctttcaa atcttctacc 1080 ccacataata tttcttggaa ggtaggcaag actggttccc tcttcatttc caaactcatt 1140 gactgcttca aaaagtactg ttggtgttat catttggagg aaatttttcg aaaggttcaa 1200 cactcatttg aggtcccagg tgaactgacc cagatgccca ctattgagag agtatccatg 1260 acacgctatt tctacctttt tcccgggaat tagcacaggc aactctcatg cagttcccag 1320 tcaagtattg ctgtagctga gaagaaaaga aaattccaag atcccaggat ttttaaatgt 1380 gtaaaacttt tcagttagat attttataca atatcataag gctagataat ttccataggt 1440 tatttttagg ggaaacctga tacgtaaaat tttgcatgaa aagtatagat tcgttccttc 1500 cttccaaatc tgctcatctt ttactttatt ttattaaatt tatatttgca catttttgta 1560 aaatgaataa aggaaaaaga cactaaagaa catgtctgaa catatcctgg aacttcttct 1620 ttgtaaaatg aataaaggaa aaagacacta aagaacaaag atgatacacc ttttgatgaa 1680 ccactttcac ctataaatta gtagtaagaa tttactcaca aggaagatct tatctacaat 1740 gtagctgaga aatgaaactg ttgcatatgt aggtaaaact aatcatcttt taggaataag 1800 ataaagaggt ttatgtccac tgtttgtctc tggcatacat ggttttcatg cctagtggct 1860 acctaccatt cctttcaatc aatttcttag gatataattg acaaatttat gctatgttta 1920 taatttttct cttaaatgcc tttgtaataa gatatactca cacatacaca tttaagattc 1980 tgtctattag tgttattgaa ataaatccta gaaacaaaaa ttaaaagttt aaagcattaa 2040 agacaatttt gagacaaaat attctatgaa attctatgca aaattgaatt cttctacaag 2100 tatgtgatga agcccaccta ccactatttt tgtcatcttg aggatgttat atcattattt 2160 ttacttaact gagctcaaat taaaatcttt gtttattctt tgttctataa aaaaaaaaaa 2220 aaaaaaaa 2228 <210> 359 <211> 339 <212> PRT <213> Drosophila melanogaster <220> <223> Caspase precursor (insect) C14.015 <400> 359 Met Asp Ala Thr Asn Asn Gly Glu Ser Ala Asp Gln Val Gly Ile Arg 1 5 10 15 Val Gly Asn Pro Glu Gln Pro Asn Asp His Thr Asp Ala Leu Gly Ser 20 25 30 Val Gly Ser Gly Gly Ala Gly Ser Ser Gly Leu Val Ala Gly Ser Ser 35 40 45 His Pro Tyr Gly Ser Gly Ala Ile Gly Gln Leu Ala Asn Gly Tyr Ser 50 55 60 Ser Pro Ser Ser Ser Tyr Arg Lys Asn Val Ala Lys Met Val Thr Asp 65 70 75 80 Arg His Ala Ala Glu Tyr Asn Met Arg His Lys Asn Arg Gly Met Ala 85 90 95 Leu Ile Phe Asn His Glu His Phe Glu Val Pro Thr Leu Lys Ser Arg 100 105 110 Ala Gly Thr Asn Val Asp Cys Glu Asn Leu Thr Arg Val Leu Lys Gln 115 120 125 Leu Asp Phe Glu Val Thr Val Tyr Lys Asp Cys Arg Tyr Lys Asp Ile 130 135 140 Leu Arg Thr Ile Glu Tyr Ala Ala Ser Gln Asn His Ser Asp Ser Asp 145 150 155 160 Cys Ile Leu Val Ala Ile Leu Ser His Gly Glu Met Gly Tyr Ile Tyr 165 170 175 Ala Lys Asp Thr Gln Tyr Lys Leu Asp Asn Ile Trp Ser Phe Phe Thr 180 185 190 Ala Asn His Cys Pro Ser Leu Ala Gly Lys Pro Lys Leu Phe Phe Ile 195 200 205 Gln Ala Cys Gln Gly Asp Arg Leu Asp Gly Gly Val Thr Met Gln Arg 210 215 220 Ser Gln Thr Glu Thr Asp Gly Asp Ser Ser Met Ser Tyr Lys Ile Pro 225 230 235 240 Val His Ala Asp Phe Leu Ile Ala Tyr Ser Thr Val Pro Gly Phe Tyr 245 250 255 Ser Trp Arg Asn Thr Thr Arg Gly Ser Trp Phe Met Gln Ser Leu Cys 260 265 270 Ala Glu Leu Ala Ala Asn Gly Lys Arg Leu Asp Ile Leu Thr Leu Leu 275 280 285 Thr Phe Val Cys Gln Arg Val Ala Val Asp Phe Glu Ser Cys Thr Pro 290 295 300 Asp Thr Pro Glu Met His Gln Gln Lys Gln Ile Pro Cys Ile Thr Thr 305 310 315 320 Met Leu Thr Arg Ile Leu Arg Phe Ser Asp Lys Gln Leu Ala Pro Ala 325 330 335 Gly Arg Val <210> 360 <211> 1020 <212> DNA <213> Drosophila melanogaster <220> <223> Caspase precursor (insect) C14.015 <400> 360 atggacgcca ctaacaatgg agaatccgcc gaccaggtgg gcatcagggt gggcaatccg 60 gagcagccca acgatcacac agatgccctg ggctccgtgg gatccggagg agcgggtagc 120 agcggcctgg tcgcaggatc ctcgcatcct tacggcagcg gagccattgg gcagctggcc 180 aacgggtaca gctcaccctc gtccagctac cgaaagaatg tagccaaaat ggtcaccgac 240 cgccatgcag ccgagtacaa catgcgccac aagaaccgcg gaatggcact gatcttcaac 300 catgagcact tcgaggtgcc caccttgaag tcccgcgcgg gaaccaatgt ggactgcgag 360 aatctgactc gggtgctcaa gcagctggac ttcgaagtga ccgtgtacaa ggactgccgc 420 tacaaggaca ttttgaggac aatcgagtat tcagcgtcgc agaatcacag cgatagtgat 480 tgcatcctgg tcgccatcct gtcgcacggc gagatgggct acatctacgc caaggacaca 540 cagtacaagc tggataacat ctggagcttc ttcacggcca atcactgccc ctcgctagcc 600 ggcaaaccca agttgttctt catacaggcc tgccagggcg acagattgga tggcggagtg 660 accatgcagc gttctcagac ggaaaccgat ggcgactcct cgatgagcta caagattcca 720 gtgcacgccg actttctgat cgcctactcg acggttcctg gattctattc gtggcgcaac 780 accacccgcg gcacgtggtt catgcagagc ctgtgcgccg aactggcggc caatggcaag 840 cggctggaca tcctgaccct gctcacattc gtgtgccagc gggtggccgt ggactttgag 900 tcctgcaccc cggacactcc ggagatgcac cagcagaagc agataccctg catcaccacc 960 atgctgacgc gcattctgcg tttcagcgac aagcagttgg ctccagccgg acgggtttga 1020 <210> 361 <211> 323 <212> PRT <213> Drosophila melanogaster <220> <223> Caspase-1 precursor (insect) C14.016 <400> 361 Met Thr Asp Glu Cys Val Thr Arg Asn Tyr Gly Val Gly Ile Arg Ser 1 5 10 15 Pro Asn Gly Ser Glu Asn Arg Gly Ser Phe Ile Met Ala Asp Asn Thr 20 25 30 Asp Ala Lys Gly Cys Thr Pro Glu Ser Leu Val Val Gly Gly Ala Thr 35 40 45 Ala Ala Ser Pro Leu Pro Ala Asn Lys Phe Val Ala Arg Met Pro Val 50 55 60 Glu Arg Tyr Ala Ser Glu Tyr Asn Met Ser His Lys His Arg Gly Val 65 70 75 80 Ala Leu Ile Phe Asn His Glu Phe Phe Asp Ile Pro Ser Leu Lys Ser 85 90 95 Arg Thr Gly Thr Asn Val Asp Ala Gln Glu Leu Lys Lys Ala Phe Glu 100 105 110 Asn Leu Gly Phe Ala Val Ser Val His Lys Asp Cys Lys Leu Arg Asp 115 120 125 Ile Leu Lys His Val Gly Lys Ala Ala Glu Leu Asp His Thr Asp Asn 130 135 140 Asp Cys Leu Ala Val Ala Ile Leu Ser His Gly Glu His Gly Tyr Leu 145 150 155 160 Tyr Ala Lys Asp Thr Gln Tyr Lys Leu Asp Asn Ile Trp His Tyr Phe 165 170 175 Thr Ala Thr Phe Cys Pro Ser Leu Ala Gly Lys Pro Lys Leu Phe Phe 180 185 190 Ile Gln Ala Cys Gln Gly Asp Arg Leu Asp Gly Gly Ile Thr Leu Glu 195 200 205 Lys Gly Val Thr Glu Thr Asp Gly Glu Ser Ser Thr Ser Tyr Lys Ile 210 215 220 Pro Ile His Ala Asp Phe Leu Phe Ser Tyr Ser Thr Ile Pro Gly Tyr 225 230 235 240 Phe Ser Trp Arg Asn Ile Asn Asn Gly Ser Trp Tyr Met Gln Ser Leu 245 250 255 Ile Arg Glu Leu Asn Ala Asn Gly Lys Lys Tyr Asp Leu Leu Thr Leu 260 265 270 Leu Thr Phe Val Asn Gln Arg Val Ala Leu Asp Phe Glu Ser Asn Val 275 280 285 Pro Ala Thr Pro Met Met Asp Arg Gln Lys Gln Ile Pro Cys Leu Thr 290 295 300 Ser Met Leu Thr Arg Ile Leu Arg Phe Gly Asp Lys Pro Asn Gly Asn 305 310 315 320 Lys Ala Gly <210> 362 <211> 1757 <212> DNA <213> Drosophila melanogaster <220> <223> Caspase-1 precursor (insect) C14.016 <400> 362 agtttgtttt cgccgctcag agcacgctta acctccgtta attgattgat taaacacgtc 60 cgactgtgag ccataaaagg acattcgctc gatcgaaagc cgacaaaagc tggctgagaa 120 gcgcaaaaca gctgcgctgc gcaaagtttg gccaacgcag agcaatagaa aacagaagca 180 gtgtcagaat aaaacaagaa tcagaccaaa aagggcgcaa caactgcgga gagagaaaag 240 gaaggaaaga gcagcgcgtg acgagggagg agcaggaggg agcgaacaaa aggcaagagg 300 aaacacaagg agaaacgcaa acaatcaaaa caagaactta agcaagaaaa ggggcgcaag 360 atgaccgacg agtgcgtaac cagaaactac ggagtaggca ttcgcagccc aaatggatcg 420 gaaaatcggg gcagctttat aatggctgat aataccgatg ccaagggctg tacgccggag 480 tctcttgttg ttggtggtgc aactgcagcg agccccttgc cggccaacaa gtttgtggct 540 cgaatgcccg tggaacgata tgcaagcgaa tacaacatga gtcacaagca ccgcggagtt 600 gcgctgatct tcaaccacga attcttcgac ataccctcgc tgaagagccg caccggaaca 660 aatgtcgatg cccaagagct gaaaaaggcc tttgaaaacc tgggattcgc ggtgtccgtg 720 cacaaggact gcaagttgag ggacatcctg aagcacgtgg ggaaggccgc cgagttggac 780 cacacggaca acgactgcct tgcggtggcc atactctcgc acggggagca cggctacctg 840 tacgccaagg atacgcagta caagctggac aacatctggc actacttcac tgccaccttc 900 tgcccctcgc tggcgggcaa gccgaagctg ttcttcatcc aagcctgcca gggcgatcgc 960 ttggacggag gcatcactct ggagaagggc gttaccgaga cggacgggga gtcctcgacg 1020 agctacaaga tacccataca cgccgacttt ctcttctcct actcgaccat tccgggctac 1080 ttctcctggc gcaacatcaa caatggctcc tggtacatgc aatcgctgat ccgcgagctg 1140 aacgccaatg gcaaaaagta cgacctgctc accctgctta cattcgttaa ccagcgcgta 1200 gccctagact ttgagtcgaa cgtgcccgcc acaccgatga tggatcgcca gaagcaaata 1260 ccgtgcctca cctccatgct gacgcgcata ctgcgcttcg gcgacaagcc gaacggcaat 1320 aaggctggct aggaagagat ctcccttcga agaagaactt tcaacagagg ttgtacaacc 1380 atcgcccgca atcattcacg ttggattcca attcacttca agtttagttt tagctgacgc 1440 gtgcgattaa cccgatggat attgaagcac ccgactccct ttcattcatt cccctgcctt 1500 tcccatgccc atttcggcct tatcattgac gaaattcgtt acccatttac ccactagatg 1560 acttccgtat gcataagcga gaccttgcca atagaaaacc cacaaatttg agataagata 1620 atacaatgaa gatttataca tacatacata cttttatgta cacgcaaaca tttatatttg 1680 atatgaataa aaatgaatta aaaacataaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaacaaa 1740 aaaaaaaaaa aaaaaaa 1757 <210> 363 <211> 377 <212> PRT <213> Bos taurus <220> <223> Caspase-13 precursor C14.017 <400> 363 Met Ala Glu Asp Lys His Asn Lys Asn Pro Leu Lys Met Leu Glu Ser 1 5 10 15 Leu Gly Lys Glu Leu Ile Ser Gly Leu Leu Asp Asp Phe Val Glu Lys 20 25 30 Asn Val Leu Lys Leu Glu Glu Glu Glu Lys Lys Lys Ile Tyr Asp Ala 35 40 45 Lys Leu Gln Asp Lys Ala Arg Val Leu Val Asp Ser Ile Arg Gln Lys 50 55 60 Asn Gln Glu Ala Gly Gln Val Phe Val Gln Thr Phe Leu Asn Ile Asp 65 70 75 80 Lys Asn Ser Thr Ser Ile Lys Ala Pro Glu Glu Thr Val Ala Gly Pro 85 90 95 Asp Glu Ser Val Gly Ser Ala Ala Thr Leu Lys Leu Cys Pro His Glu 100 105 110 Glu Phe Leu Lys Leu Cys Lys Glu Arg Ala Gly Glu Ile Tyr Pro Ile 115 120 125 Lys Glu Arg Lys Asp Arg Thr Arg Leu Ala Leu Ile Ile Cys Asn Thr 130 135 140 Glu Phe Asp His Met Pro Pro Arg Asn Gly Ala Ala Leu Asp Ile Leu 145 150 155 160 Gly Met Lys Gln Leu Leu Glu Gly Leu Gly Tyr Thr Val Glu Val Glu 165 170 175 Glu Lys Leu Thr Ala Arg Asp Met Glu Ser Val Leu Trp Lys Phe Ala 180 185 190 Ala Arg Glu Glu His Lys Ser Ser Asp Ser Thr Phe Leu Val Phe Met 195 200 205 Ser His Gly Ile Leu Asp Gly Ile Cys Gly Thr Met His Ser Glu Glu 210 215 220 Glu Pro Asp Val Leu Pro Tyr Asp Thr Ile Phe Arg Thr Phe Asn Asn 225 230 235 240 Arg Asn Cys Leu Ser Leu Lys Asp Lys Pro Lys Val Ile Ile Val Gln 245 250 255 Ala Cys Arg Gly Ala Asn Arg Gly Glu Leu Trp Val Ser Asp Ser Pro 260 265 270 Pro Ala Leu Ala Asp Ser Phe Ser Gln Ser Ser Glu Asn Leu Glu Glu 275 280 285 Asp Ala Val Tyr Lys Thr His Val Glu Lys Asp Phe Ile Ala Phe Cys 290 295 300 Ser Ser Thr Pro His Asn Val Ser Trp Arg Asp Ile Lys Lys Gly Ser 305 310 315 320 Leu Phe Ile Thr Arg Leu Ile Thr Cys Phe Gln Lys Tyr Ala Trp Cys 325 330 335 Cys His Leu Glu Glu Val Phe Arg Lys Val Gln Gln Ser Phe Glu Lys 340 345 350 Pro Asn Val Lys Ala Gln Met Pro Thr Val Glu Arg Leu Ser Met Thr 355 360 365 Arg Tyr Phe Tyr Leu Phe Pro Gly Asn 370 375 <210> 364 <211> 2060 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Caspase-13 precursor C14.017 <400> 364 ccacgcgtcc gcggacgcgt gggctccttc aaggcagtag gaagatacta agcttattat 60 ctatggctga agacaaacac aacaaaaacc cacttaagat gttggaatct ttgggcaaag 120 aactcatttc tggccttttg gatgactttg tggaaaaaaa tgtcctgaaa ttggaggaag 180 aggagaagaa aaaaatttat gatgccaaac ttcaagacaa agcccgggtc ttggttgatt 240 ctatacgaca gaaaaaccaa gaggcaggtc aagtctttgt tcaaactttc ctaaacatag 300 acaaaaattc caccagtata aaagctcctg aggaaactgt ggctggacca gatgagtcag 360 tgggatctgc agctaccctc aagctttgcc ctcatgaaga attcctgaaa ctgtgtaaag 420 aaagggctgg agagatctat ccaataaagg agagaaagga ccgcactcgt ctggctctca 480 tcatatgcaa cacagagttt gatcatatgc ctcccaggaa tggggctgcc cttgacatcc 540 ttggaatgaa gcagctgctt gagggtcttg gctacactgt ggaagtggaa gagaaactca 600 cagccaggga catggaatca gtgctgtgga aatttgctgc acgtgaagag cacaaatcct 660 cagacagtac attcttggtg ttcatgtctc atggcatcct ggatgggatc tgtgggacta 720 tgcacagtga ggaagaacca gatgtgttac cttatgatac catcttccgg acattcaaca 780 accgtaattg cctcagtcta aaggacaaac ctaaagtcat cattgtccag gcctgcagag 840 gtgcaaatcg tggggaattg tgggtcagtg actctccacc agccttggca gacagctttt 900 cacagtcatc cgagaacctg gaagaggatg ctgtttacaa gacccatgta gagaaggact 960 tcattgcttt ctgttcctca actccacata atgtgtcctg gagagacata aaaaaaggtt 1020 ctctcttcat tacacgactc atcacatgct tccaaaaata tgcttggtgc tgtcatcttg 1080 aggaagtatt taggaaggta caacaatcat ttgaaaaacc aaatgttaaa gcccagatgc 1140 ccactgttga acgactctct atgacaagat atttctacct ctttcctggc aactgaaaat 1200 aaaaatcaca ggaaattcaa ccatttatca gcttcaagaa gcatttttat cagcacagca 1260 tccatgttta accttttgtc tttcattaaa gtgaaaacat atgaactgtt ctttggggtc 1320 ctctaagaaa gaatagaatt tcaattaaaa caatggatgg atggaaataa agtagaagaa 1380 gaaaactgga ttttcttgtt atattgcata taatgcctgc actttactga gtgaagagaa 1440 ctagtcatga cttgccctca gcagcagggt gaaaggagat ggtgcacatc tggagacaag 1500 gaccaaaaac tgggtcacct gctcctttga tcactcatca aaccttgcaa ctagaattat 1560 ttggaagaat atttctaatt tattatttaa ccaacatcat aggtcaagtt caattttttt 1620 tcagaaagtt gttatggtac ctatgcatct ttcttcttat ccataaatta atttgctttc 1680 ttgttgatga tttttcattc cagatttcca agcttcagga aaattttgtt atttagcaaa 1740 cacttggtaa ttgtctaaaa taaattgggc ctttgattta agatggtata attgggtgtg 1800 cttgtataga aagacagaca ttattagata cagaacatcc aagagtgtgg gaaatgtcag 1860 caatgggaaa gaaaatgtta aattttctgg aaagtgaatg tcagtagagg aattttagca 1920 acatggccat ctgagccact gactaaggag atgtaccact tcaattacat acatgcagaa 1980 tgctgaatag atatatcagg acatgctgaa ctgtattaca aataaaatga ttctctagat 2040 atcaaaaaaa aaaaaaaaaa 2060 <210> 365 <211> 242 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Caspase-14 precursor C14.018 <400> 365 Met Ser Asn Pro Arg Ser Leu Glu Glu Glu Lys Tyr Asp Met Ser Gly 1 5 10 15 Ala Arg Leu Ala Leu Ile Leu Cys Val Thr Lys Ala Arg Glu Gly Ser 20 25 30 Glu Glu Asp Leu Asp Ala Leu Glu His Met Phe Arg Gln Leu Arg Phe 35 40 45 Glu Ser Thr Met Lys Arg Asp Pro Thr Ala Glu Gln Phe Gln Glu Glu 50 55 60 Leu Glu Lys Phe Gln Gln Ala Ile Asp Ser Arg Glu Asp Pro Val Ser 65 70 75 80 Cys Ala Phe Val Val Leu Met Ala His Gly Arg Glu Gly Phe Leu Lys 85 90 95 Gly Glu Asp Gly Glu Met Val Lys Leu Glu Asn Leu Phe Glu Ala Leu 100 105 110 Asn Asn Lys Asn Cys Gln Ala Leu Arg Ala Lys Pro Lys Val Tyr Ile 115 120 125 Ile Gln Ala Cys Arg Gly Glu Gln Arg Asp Pro Gly Glu Thr Val Gly 130 135 140 Gly Asp Glu Ile Val Met Val Ile Lys Asp Ser Pro Gln Thr Ile Pro 145 150 155 160 Thr Tyr Thr Asp Ala Leu His Val Tyr Ser Thr Val Glu Gly Tyr Ile 165 170 175 Ala Tyr Arg His Asp Gln Lys Gly Ser Cys Phe Ile Gln Thr Leu Val 180 185 190 Asp Val Phe Thr Lys Arg Lys Gly His Ile Leu Glu Leu Leu Thr Glu 195 200 205 Val Thr Arg Arg Met Ala Glu Ala Glu Leu Val Gln Glu Gly Lys Ala 210 215 220 Arg Lys Thr Asn Pro Glu Ile Gln Ser Thr Leu Arg Lys Arg Leu Tyr 225 230 235 240 Leu Gln <210> 366 <211> 777 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Caspase-14 precursor C14.018 <400> 366 aggatcagac aagggtgctg agagccggga ctcacaacca aaggagaaat gagcaatccg 60 cggtctttgg aagaggagaa atatgatatg tcaggtgccc gcctggccct aatactgtgt 120 gtcaccaaag cccgggaagg ttccgaagaa gacctggatg ctctggaaca catgtttcgg 180 cagctgagat tcgaaagcac catgaaaaga gaccccactg ccgagcaatt ccaggaagag 240 ctggaaaaat tccagcaggc catcgattcc cgggaagatc ccgtcagttg tgccttcgtg 300 gtactcatgg ctcacgggag ggaaggcttc ctcaagggag aagatgggga gatggtcaag 360 ctggagaatc tcttcgaggc cctgaacaac aagaactgcc aggccctgcg agctaagccc 420 aaggtgtaca tcatacaggc ctgtcgagga gaacaaaggg accccggtga aacagtaggt 480 ggagatgaga ttgtgatggt catcaaagac agcccacaaa ccatcccaac atacacagat 540 gccttgcacg tttattccac ggtagaggga tacatcgcct accgacatga tcagaaaggc 600 tcatgcttta tccagaccct ggtggatgtg ttcacgaaga ggaaaggaca tatcttggaa 660 cttctgacag aggtgacccg gcggatggca gaagcagagc tggttcaaga aggaaaagca 720 aggaaaacga accctgaaat ccaaagcacc ctccggaaac ggctgtatct gcagtag 777 <210> 367 <211> 450 <212> PRT <213> Drosophila melanogaster <220> <223> Caspase Nc precursor C14.019 <400> 367 Met Gln Pro Pro Glu Leu Glu Ile Gly Met Pro Lys Arg His Arg Glu 1 5 10 15 His Ile Arg Lys Asn Leu Asn Ile Leu Val Glu Trp Thr Asn Tyr Glu 20 25 30 Arg Leu Ala Met Glu Cys Val Gln Gln Gly Ile Leu Thr Val Gln Met 35 40 45 Leu Arg Asn Thr Gln Asp Leu Asn Gly Lys Pro Phe Asn Met Asp Glu 50 55 60 Lys Asp Val Arg Val Glu Gln His Arg Arg Leu Leu Leu Lys Ile Thr 65 70 75 80 Gln Arg Gly Pro Thr Ala Tyr Asn Leu Leu Ile Asn Ala Leu Arg Asn 85 90 95 Ile Asn Cys Leu Asp Ala Ala Val Leu Leu Glu Ser Val Asp Glu Ser 100 105 110 Asp Ser Arg Pro Pro Phe Ile Ser Leu Asn Glu Arg Arg Thr Ser Arg 115 120 125 Lys Ser Ala Asp Ile Val Asp Thr Pro Ser Pro Glu Ala Ser Glu Gly 130 135 140 Pro Cys Val Ser Lys Leu Arg Asn Glu Pro Leu Gly Ala Leu Thr Pro 145 150 155 160 Tyr Val Gly Val Val Asp Gly Pro Glu Val Lys Lys Ser Lys Lys Ile 165 170 175 His Gly Gly Asp Ser Ala Ile Leu Gly Thr Tyr Lys Met Gln Ser Arg 180 185 190 Phe Asn Arg Gly Val Leu Leu Met Val Asn Ile Met Asp Tyr Pro Asp 195 200 205 Gln Asn Arg Arg Arg Ile Gly Ala Glu Lys Asp Ser Lys Ser Leu Ile 210 215 220 His Leu Phe Gln Glu Leu Asn Phe Thr Ile Phe Pro Tyr Gly Asn Val 225 230 235 240 Asn Gln Asp Gln Phe Phe Lys Leu Leu Thr Met Val Thr Ser Ser Ser 245 250 255 Tyr Val Gln Asn Thr Glu Cys Phe Val Met Val Leu Met Thr His Gly 260 265 270 Asn Ser Val Glu Gly Lys Glu Lys Val Glu Phe Cys Asp Gly Ser Val 275 280 285 Val Asp Met Gln Lys Ile Lys Asp His Phe Gln Thr Ala Lys Cys Pro 290 295 300 Tyr Leu Val Asn Lys Pro Lys Val Leu Met Phe Pro Phe Cys Arg Gly 305 310 315 320 Asp Glu Tyr Asp Leu Gly His Pro Lys Asn Gln Gly Asn Leu Met Glu 325 330 335 Pro Val Tyr Thr Ala Gln Glu Glu Lys Trp Pro Asp Thr Gln Thr Glu 340 345 350 Gly Ile Pro Ser Pro Ser Thr Asn Val Pro Ser Leu Ala Asp Thr Leu 355 360 365 Val Cys Tyr Ala Asn Thr Pro Gly Tyr Val Thr His Arg Asp Leu Asp 370 375 380 Thr Gly Ser Trp Tyr Ile Gln Lys Phe Cys Gln Val Met Ala Asp His 385 390 395 400 Ala His Asp Thr Asp Leu Glu Asp Ile Leu Lys Lys Thr Ser Glu Ala 405 410 415 Val Gly Asn Lys Arg Thr Lys Lys Gly Ser Met Gln Thr Gly Ala Tyr 420 425 430 Asp Asn Leu Gly Phe Asn Lys Lys Leu Tyr Phe Asn Pro Gly Phe Phe 435 440 445 Asn Glu 450 <210> 368 <211> 2090 <212> DNA <213> Drosophila melanogaster <220> <223> Caspase Nc precursor C14.019 <400> 368 tttggcggcg cgaaacgctc gttggtcctt ttgtttcgaa agaaatccta ttcgaagatc 60 cccgatcctt gctaggatca tctagtgcaa tatatagact agttaattta cttttggaaa 120 aataaggaca ccagcagggc cgccgatttg tgcccctttc ttgaaagtcg caaaacaaaa 180 acaacgacga caacaacaaa gcggagacaa agaatcgaca agtagcgata aacgaaatca 240 ttcccgggaa aaccttggag acgggtgatt cactgccaat accactgcca attggagact 300 gatcacggca gccatccttg gcgcgcccaa taagcggagt caccggaacg cgtggaagcc 360 atatccggaa tgcagccgcc ggagctcgag attggaatgc cgaagaggca tcgcgagcat 420 atacgcaaga atctgaatat actggttgaa tggacgaact acgagcgtct ggccatggag 480 tgcgtgcaac agggcatcct aaccgttcag atgctaagaa atacgcagga tctcaatggc 540 aagccattca acatggacga gaaggatgtg cgtgtggagc agcatcgtag gctcctattg 600 aagatcaccc agcgtggtcc caccgcctat aacctgctga tcaatgcact gcgcaatatc 660 aattgtctgg atgcggccgt tctattggaa tccgtcgatg agtccgattc aaggccaccc 720 tttatctcgc taaacgaacg gagaaccagc cggaagtcgg ccgatattgt ggacacaccc 780 tcacccgaag cctccgaagg accctgcgtt agcaagctcc ggaatgagcc gctgggagca 840 ctcacccctt atgtgggtgt cgttgacggt cccgaggtaa aaaaatcgaa aaagatacat 900 ggtggggata gtgccatatt gggcacatat aagatgcaat cacgtttcaa ccgaggcgtt 960 ttgctaatgg ttaacataat ggactatccg gatcaaaacc gtcgacggat cggagccgaa 1020 aaggacagca agtcgttgat acacttgttt caagaactga attttacgat tttcccctat 1080 gggaacgtga atcaggatca gttctttaaa cttctgacaa tggtgacctc ctcgtcgtat 1140 gtgcagaata ccgagtgttt cgtaatggta ctgatgacac acggcaacag tgtggaggga 1200 aaagagaagg tggagttttg cgatggatct gtggtcgata tgcagaagat caaggaccat 1260 ttccagacgg ccaaatgtcc ttatttggtg aacaagccga aggtgcttat gtttcccttt 1320 tgccgcggcg atgaatatga tttgggccat ccaaagaatc aaggcaatct catggagcca 1380 gtgtatacgg cgcaagagga gaagtggcct gacacccaga cggagggcat acccagcccg 1440 agcaccaatg tgccaagtct tgccgacact ctggtctgct atgctaatac gccgggctat 1500 gttacccacc gcgatctcga cacgggcagc tggtacatcc agaagttttg ccaagtgatg 1560 gccgatcatg cccacgacac agaccttgag gatatcctaa agaagacgag cgaagccgtg 1620 ggtaataagc gcaccaagaa gggttccatg cagacaggtg cctatgataa tcttggcttt 1680 aataagaaac tctacttcaa tcccgggttt ttcaacgaat agttgccgcc actggacatt 1740 ttatcattcc ggatgcattt ttaaccgcat ttatgttctt atcgtcgcat ttagtatgtc 1800 ttttagatta tgtgttctgt gctcgcgtgc tataaaatgt ttatattgta acaaatactc 1860 attcaagtat tcttctaata cgtattgcat acctcattta aaggtacgaa attatgtaat 1920 ttatgtgata actgccagaa atctacaaat attataatac agagttccag tatatacaca 1980 gccagatttt tgaaatcgaa catttaggca aaatgtaaag caattttcca gtctgatttt 2040 tgagtgtgta cacttacaaa ataaacgatg atatttcaca aggcccaaag 2090 <210> 369 <211> 824 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> MALT lymphoma translocation protein 1 (paracaspase) C14.026 <400> 369 Met Ser Leu Leu Gly Asp Pro Leu Gln Ala Leu Pro Pro Ser Ala Ala 1 5 10 15 Pro Thr Gly Pro Leu Leu Ala Pro Pro Ala Gly Ala Thr Leu Asn Arg 20 25 30 Leu Arg Glu Pro Leu Leu Arg Arg Leu Ser Glu Leu Leu Asp Gln Ala 35 40 45 Pro Glu Gly Arg Gly Trp Arg Arg Leu Ala Glu Leu Ala Gly Ser Arg 50 55 60 Gly Arg Leu Arg Leu Ser Cys Leu Asp Leu Glu Gln Cys Ser Leu Lys 65 70 75 80 Val Leu Glu Pro Glu Gly Ser Pro Ser Leu Cys Leu Leu Lys Leu Met 85 90 95 Gly Glu Lys Gly Cys Thr Val Thr Glu Leu Ser Asp Phe Leu Gln Ala 100 105 110 Met Glu His Thr Glu Val Leu Gln Leu Leu Ser Pro Pro Gly Ile Lys 115 120 125 Ile Thr Val Asn Pro Glu Ser Lys Ala Val Leu Ala Gly Gln Phe Val 130 135 140 Lys Leu Cys Cys Arg Ala Thr Gly His Pro Phe Val Gln Tyr Gln Trp 145 150 155 160 Phe Lys Met Asn Lys Glu Ile Pro Asn Gly Asn Thr Ser Glu Leu Ile 165 170 175 Phe Asn Ala Val His Val Lys Asp Ala Gly Phe Tyr Val Cys Arg Val 180 185 190 Asn Asn Asn Phe Thr Phe Glu Phe Ser Gln Trp Ser Gln Leu Asp Val 195 200 205 Cys Asp Ile Pro Glu Ser Phe Gln Arg Ser Val Asp Gly Val Ser Glu 210 215 220 Ser Lys Leu Gln Ile Cys Val Glu Pro Thr Ser Gln Lys Leu Met Pro 225 230 235 240 Gly Ser Thr Leu Val Leu Gln Cys Val Ala Val Gly Ser Pro Ile Pro 245 250 255 His Tyr Gln Trp Phe Lys Asn Glu Leu Pro Leu Thr His Glu Thr Lys 260 265 270 Lys Leu Tyr Met Val Pro Tyr Val Asp Leu Glu His Gln Gly Thr Tyr 275 280 285 Trp Cys His Val Tyr Asn Asp Arg Asp Ser Gln Asp Ser Lys Lys Val 290 295 300 Glu Ile Ile Ile Gly Arg Thr Asp Glu Ala Val Glu Cys Thr Glu Asp 305 310 315 320 Glu Leu Asn Asn Leu Gly His Pro Asp Asn Lys Glu Gln Thr Thr Asp 325 330 335 Gln Pro Leu Ala Lys Asp Lys Val Ala Leu Leu Ile Gly Asn Met Asn 340 345 350 Tyr Arg Glu His Pro Lys Leu Lys Ala Pro Leu Val Asp Val Tyr Glu 355 360 365 Leu Thr Asn Leu Leu Arg Gln Leu Asp Phe Lys Val Val Ser Leu Leu 370 375 380 Asp Leu Thr Glu Tyr Glu Met Arg Asn Ala Val Asp Glu Phe Leu Leu 385 390 395 400 Leu Leu Asp Lys Gly Val Tyr Gly Leu Leu Tyr Tyr Ala Gly His Gly 405 410 415 Tyr Glu Asn Phe Gly Asn Ser Phe Met Val Pro Val Asp Ala Pro Asn 420 425 430 Pro Tyr Arg Ser Glu Asn Cys Leu Cys Val Gln Asn Ile Leu Lys Leu 435 440 445 Met Gln Glu Lys Glu Thr Gly Leu Asn Val Phe Leu Leu Asp Met Cys 450 455 460 Arg Lys Arg Asn Asp Tyr Asp Asp Thr Ile Pro Ile Leu Asp Ala Leu 465 470 475 480 Lys Val Thr Ala Asn Ile Val Phe Gly Tyr Ala Thr Cys Gln Gly Ala 485 490 495 Glu Ala Phe Glu Ile Gln His Ser Gly Leu Ala Asn Gly Ile Phe Met 500 505 510 Lys Phe Leu Lys Asp Arg Leu Leu Glu Asp Lys Lys Ile Thr Val Leu 515 520 525 Leu Asp Glu Val Ala Glu Asp Met Gly Lys Cys His Leu Thr Lys Gly 530 535 540 Lys Gln Ala Leu Glu Ile Arg Ser Ser Leu Ser Glu Lys Arg Ala Leu 545 550 555 560 Thr Asp Pro Ile Gln Gly Thr Glu Tyr Ser Ala Glu Ser Leu Val Arg 565 570 575 Asn Leu Gln Trp Ala Lys Ala His Glu Leu Pro Glu Ser Met Cys Leu 580 585 590 Lys Phe Asp Cys Gly Val Gln Ile Gln Leu Gly Phe Ala Ala Glu Phe 595 600 605 Ser Asn Val Met Ile Ile Tyr Thr Ser Ile Val Tyr Lys Pro Pro Glu 610 615 620 Ile Ile Met Cys Asp Ala Tyr Val Thr Asp Phe Pro Leu Asp Leu Asp 625 630 635 640 Ile Asp Pro Lys Asp Ala Asn Lys Gly Thr Pro Glu Glu Thr Gly Ser 645 650 655 Tyr Leu Val Ser Lys Asp Leu Pro Lys His Cys Leu Tyr Thr Arg Leu 660 665 670 Ser Ser Leu Gln Lys Leu Lys Glu His Leu Val Phe Thr Val Cys Leu 675 680 685 Ser Tyr Gln Tyr Ser Gly Leu Glu Asp Thr Val Glu Asp Lys Gln Glu 690 695 700 Val Asn Val Gly Lys Pro Leu Ile Ala Lys Leu Asp Met His Arg Gly 705 710 715 720 Leu Gly Arg Lys Thr Cys Phe Gln Thr Cys Leu Met Ser Asn Gly Pro 725 730 735 Tyr Gln Ser Ser Ala Ala Thr Ser Gly Gly Ala Gly His Tyr His Ser 740 745 750 Leu Gln Asp Pro Phe His Gly Val Tyr His Ser His Pro Gly Asn Pro 755 760 765 Ser Asn Val Thr Pro Ala Asp Ser Cys His Cys Ser Arg Thr Pro Asp 770 775 780 Ala Phe Ile Ser Ser Phe Ala His His Ala Ser Cys His Phe Ser Arg 785 790 795 800 Ser Asn Val Pro Val Glu Thr Thr Asp Glu Ile Pro Phe Ser Phe Ser 805 810 815 Asp Arg Leu Arg Ile Ser Glu Lys 820 <210> 370 <211> 2828 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> MALT lymphoma translocation protein 1 (paracaspase) C14.026 <400> 370 ggggcgggga gcggacttcc tcctctgagg gccgtgccgc gctgccagat ttgttcttcc 60 gcccctgcct ccgcggctcg gaggcgagcg gaaggtgccc cggggccgag gcccgtgacg 120 gggcgggcgg gagccccggc agtccggggt cgccggcgag ggccatgtcg ctgttggggg 180 acccgctaca ggccctgccg ccctcggccg cccccacggg gccgctgctc gcccctccgg 240 ccggcgcgac cctcaaccgc ctgcgggagc cgctgctgcg gaggctcagc gagctcctgg 300 atcaggcgcc cgagggccgg ggctggagga gactggcgga gctggcgggg agtcgcgggc 360 gcctccgcct cagttgccta gacctggagc agtgttctct taaggtactg gagcctgaag 420 gaagccccag cctgtgtctg ctgaagttaa tgggtgaaaa aggttgcaca gtcacagaat 480 tgagtgattt cctgcaggct atggaacaca ctgaagttct tcagcttctc agccccccag 540 gaataaagat tactgtaaac ccagagtcaa aggcagtctt ggctggacag tttgtgaaac 600 tgtgttgccg ggcaactgga catccttttg ttcaatatca gtggttcaaa atgaataaag 660 agattccaaa tggaaataca tcagagctta tttttaatgc agtgcatgta aaagatgcag 720 gcttttatgt ctgtcgagtt aataacaatt tcacctttga attcagccag tggtcacagc 780 tggatgtttg cgacatccca gagagcttcc agagaagtgt tgatggcgtc tctgaatcca 840 agttgcaaat ctgtgttgaa ccaacttccc aaaagctgat gccaggcagc acattggttt 900 tacagtgtgt tgctgttgga agccctattc ctcactacca gtggttcaaa aatgaattac 960 cattaacaca tgagaccaaa aagctataca tggtgcctta tgtggatttg gaacaccaag 1020 gaacctactg gtgtcatgta tataatgatc gagacagtca agatagcaag aaggtagaaa 1080 tcatcatagg aagaacagat gaggcagtgg agtgcactga agatgaatta aataatcttg 1140 gtcatcctga taataaagag caaacaactg accagccttt ggcgaaggac aaggttgccc 1200 ttttgatagg aaatatgaat taccgggagc accccaagct caaagctcct ttggtggatg 1260 tgtacgaatt gactaactta ctgagacagc tggacttcaa agtggtttca ctgttggatc 1320 ttactgaata tgagatgcgt aatgctgtgg atgagttttt actcctttta gacaagggag 1380 tatatgggtt attatattat gcaggacatg gttatgaaaa ttttgggaac agcttcatgg 1440 tccccgttga tgctccaaat ccatataggt ctgaaaattg tctgtgtgta caaaatatac 1500 tgaaattgat gcaagaaaaa gaaactggac ttaatgtgtt cttattggat atgtgtagga 1560 aaagaaatga ctacgatgat accattccaa tcttggatgc actaaaagtc accgccaata 1620 ttgtgtttgg atatgccacg tgtcaaggag cagaagcttt tgaaatccag cattctggat 1680 tggcaaatgg aatctttatg aaatttttaa aagacagatt attagaagat aagaaaatca 1740 ctgtgttact ggatgaagtt gcagaagata tgggtaagtg tcaccttacc aaaggcaaac 1800 aggctctaga gattcgaagt agtttatctg agaagagagc acttactgat ccaatacagg 1860 gaacagaata ttctgctgaa tctcttgtgc ggaatctaca gtgggccaag gctcatgaac 1920 ttccagaaag tatgtgtctt aagtttgact gtggtgttca gattcaatta ggatttgcag 1980 ctgagttttc caatgtcatg atcatctata caagtatagt ttacaaacca ccggagataa 2040 taatgtgtga tgcctacgtt actgattttc cacttgatct agatattgat ccaaaagatg 2100 caaataaagg cacacctgaa gaaactggca gctacttggt atcaaaggat cttcccaagc 2160 attgcctcta taccagactc agttcactgc aaaaattaaa ggaacatcta gtcttcacag 2220 tatgtttatc atatcagtac tcaggattgg aagatactgt agaggacaag caggaagtga 2280 atgttgggaa acctctcatt gctaaattag acatgcatcg aggtttggga aggaagactt 2340 gctttcaaac ttgtcttatg tctaatggtc cttaccagag ttctgcagcc acctcaggag 2400 gagcagggca ttatcactca ttgcaagacc cattccatgg tgtttaccat tcacatcctg 2460 gtaatccaag taatgttaca ccagcagata gctgtcattg cagccggact ccagatgcat 2520 ttatttcaag tttcgctcac catgcttcat gtcattttag tagaagtaat gtgccagtag 2580 agacaactga tgaaatacca tttagtttct ctgacaggct cagaatttct gaaaaatgac 2640 ctccttgttt ttgaaagtta gcataatttt agatgcctgt gaaatagtac tgcacttaca 2700 taaagtgaga cattgtgaaa aggcaaattt gtatatgtag agaaagaata gtagtaactg 2760 tttcatagca aacttcagga ctttgagatg ttgaaattac attatttaat tacagacttc 2820 ctctttct 2828 <210> 371 <211> 480 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> CASP8 and FADD-like apoptosis regulator precursor (c-FLIP) C14.971 <400> 371 Met Ser Ala Glu Val Ile His Gln Val Glu Glu Ala Leu Asp Thr Asp 1 5 10 15 Glu Lys Glu Met Leu Leu Phe Leu Cys Arg Asp Val Ala Ile Asp Val 20 25 30 Val Pro Pro Asn Val Arg Asp Leu Leu Asp Ile Leu Arg Glu Arg Gly 35 40 45 Lys Leu Ser Val Gly Asp Leu Ala Glu Leu Leu Tyr Arg Val Arg Arg 50 55 60 Phe Asp Leu Leu Lys Arg Ile Leu Lys Met Asp Arg Lys Ala Val Glu 65 70 75 80 Thr His Leu Leu Arg Asn Pro His Leu Val Ser Asp Tyr Arg Val Leu 85 90 95 Met Ala Glu Ile Gly Glu Asp Leu Asp Lys Ser Asp Val Ser Ser Leu 100 105 110 Ile Phe Leu Met Lys Asp Tyr Met Gly Arg Gly Lys Ile Ser Lys Glu 115 120 125 Lys Ser Phe Leu Asp Leu Val Val Glu Leu Glu Lys Leu Asn Leu Val 130 135 140 Ala Pro Asp Gln Leu Asp Leu Leu Glu Lys Cys Leu Lys Asn Ile His 145 150 155 160 Arg Ile Asp Leu Lys Thr Lys Ile Gln Lys Tyr Lys Gln Ser Val Gln 165 170 175 Gly Ala Gly Thr Ser Tyr Arg Asn Val Leu Gln Ala Ala Ile Gln Lys 180 185 190 Ser Leu Lys Asp Pro Ser Asn Asn Phe Arg Leu His Asn Gly Arg Ser 195 200 205 Lys Glu Gln Arg Leu Lys Glu Gln Leu Gly Ala Gln Gln Glu Pro Val 210 215 220 Lys Lys Ser Ile Gln Glu Ser Glu Ala Phe Leu Pro Gln Ser Ile Pro 225 230 235 240 Glu Glu Arg Tyr Lys Met Lys Ser Lys Pro Leu Gly Ile Cys Leu Ile 245 250 255 Ile Asp Cys Ile Gly Asn Glu Thr Glu Leu Leu Arg Asp Thr Phe Thr 260 265 270 Ser Leu Gly Tyr Glu Val Gln Lys Phe Leu His Leu Ser Met His Gly 275 280 285 Ile Ser Gln Ile Leu Gly Gln Phe Ala Cys Met Pro Glu His Arg Asp 290 295 300 Tyr Asp Ser Phe Val Cys Val Leu Val Ser Arg Gly Gly Ser Gln Ser 305 310 315 320 Val Tyr Gly Val Asp Gln Thr His Ser Gly Leu Pro Leu His His Ile 325 330 335 Arg Arg Met Phe Met Gly Asp Ser Cys Pro Tyr Leu Ala Gly Lys Pro 340 345 350 Lys Met Phe Phe Ile Gln Asn Tyr Val Val Ser Glu Gly Gln Leu Glu 355 360 365 Asp Ser Ser Leu Leu Glu Val Asp Gly Pro Ala Met Lys Asn Val Glu 370 375 380 Phe Lys Ala Gln Lys Arg Gly Leu Cys Thr Val His Arg Glu Ala Asp 385 390 395 400 Phe Phe Trp Ser Leu Cys Thr Ala Asp Met Ser Leu Leu Glu Gln Ser 405 410 415 His Ser Ser Pro Ser Leu Tyr Leu Gln Cys Leu Ser Gln Lys Leu Arg 420 425 430 Gln Glu Arg Lys Arg Pro Leu Leu Asp Leu His Ile Glu Leu Asn Gly 435 440 445 Tyr Met Tyr Asp Trp Asn Ser Arg Val Ser Ala Lys Glu Lys Tyr Tyr 450 455 460 Val Trp Leu Gln His Thr Leu Arg Lys Lys Leu Ile Leu Ser Tyr Thr 465 470 475 480 <210> 372 <211> 1443 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> CASP8 and FADD-like apoptosis regulator precursor (c-FLIP) C14.971 <400> 372 atgtctgctg aagtcatcca tcaggttgaa gaagcacttg atacagatga gaaggagatg 60 ctgctctttt tgtgccggga tgttgctata gatgtggttc cacctaatgt cagggacctt 120 ctggatattt tacgggaaag aggtaagctg tctgtcgggg acttggctga actgctctac 180 agagtgaggc gatttgacct gctcaaacgt atcttgaaga tggacagaaa agctgtggag 240 acccacctgc tcaggaaccc tcaccttgtt tcggactata gagtgctgat ggcagagatt 300 ggtgaggatt tggataaatc tgatgtgtcc tcattaattt tcctcatgaa ggattacatg 360 ggccgaggca agataagcaa ggagaagagt ttcttggacc ttgtggttga gttggagaaa 420 ctaaatctgg ttgccccaga tcaactggat ttattagaaa aatgcctaaa gaacatccac 480 agaatagacc tgaagacaaa aatccagaag tacaagcagt ctgttcaagg agcagggaca 540 agttacagga atgttctcca agcagcaatc caaaagagtc tcaaggatcc ttcaaataac 600 ttcaggctcc ataatgggag aagtaaagaa caaagactta aggaacagct tggcgctcaa 660 caagaaccag tgaagaaatc cattcaggaa tcagaagctt ttttgcctca gagcatacct 720 gaagagagat acaagatgaa gagcaagccc ctaggaatct gcctgataat cgattgcatt 780 ggcaatgaga cagagcttct tcgagacacc ttcacttccc tgggctatga agtccagaaa 840 ttcttgcatc tcagtatgca tggtatatcc cagattcttg gccaatttgc ctgtatgccc 900 gagcaccgag actacgacag ctttgtgtgt gtcctggtga gccgaggagg ctcccagagt 960 gtgtatggtg tggatcagac tcactcaggg ctccccctgc atcacatcag gaggatgttc 1020 atgggagatt catgccctta tctagcaggg aagccaaaga tgttttttat tcagaactat 1080 gtggtgtcag agggccagct ggaggacagc agcctcttgg aggtggatgg gccagcgatg 1140 aagaatgtgg aattcaaggc tcagaagcga gggctgtgca cagttcaccg agaagctgac 1200 ttcttctgga gcctgtgtac tgcggacatg tccctgctgg agcagtctca cagctcacca 1260 tccctgtacc tgcagtgcct ctcccagaaa ctgagacaag aaagaaaacg cccactcctg 1320 gatcttcaca ttgaactcaa tggctacatg tatgattgga acagcagagt ttctgccaag 1380 gagaaatatt atgtctggct gcagcacact ctgagaaaga aacttatcct ctcctacaca 1440 taa 1443 <210> 373 <211> 4874 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pCMV4 <400> 373 cccattcgcc attcaggctg cgcaactgtt gggaagggcg atcggtgcgg gcctcttcgc 60 tattacgcca gctggcgaaa gggggatgtg ctgcaaggcg attaagttgg gtaacgccag 120 ggttttccca gtcacgacgt tgtaaaacga cggccagtgc caagctgatc tatacattga 180 atcaatattg gcaattagcc atattagtca ttggttatat agcataaatc aatattggct 240 attggccatt gcatacgttg tatctatatc ataatatgta catttatatt ggctcatgtc 300 caatatgacc gccatgttga cattgattat tgactagtta ttaatagtaa tcaattacgg 360 ggtcattagt tcatagccca tatatggagt tccgcgttac ataacttacg gtaaatggcc 420 cgcctggctg accgcccaac gacccccgcc cattgacgtc aataatgacg tatgttccca 480 tagtaacgcc aatagggact ttccattgac gtcaatgggt ggagtattta cggtaaactg 540 cccacttggc agtacatcaa gtgtatcata tgccaagtcc gccccctatt gacgtcaatg 600 acggtaaatg gcccgcctgg cattatgccc agtacatgac cttacgggac tttcctactt 660 ggcagtacat ctacgtatta gtcatcgcta ttaccatggt gatgcggttt tggcagtaca 720 ccaatgggcg tggatagcgg tttgactcac ggggatttcc aagtctccac cccattgacg 780 tcaatgggag tttgttttgg caccaaaatc aacgggactt tccaaaatgt cgtaataacc 840 ccgccccgtt gacgcaaatg ggcggtaggc gtgtacggtg ggaggtctat ataagcagag 900 ctcgtttagt gaaccgtcag aattgttttt atttttaatt ttctttcaaa tacttccatc 960 gaattcagat ctggtaccac gcgtatcgat aagcttgcat gcctgcaggt cgactctaga 1020 ggatccccgg gtggcatccc tgtgacccct ccccagtgcc tctcctggcc ttggaagttg 1080 ccactccagt gcccaccagc cttgtcctaa taaaattaag ttgcatcatt ttgtctgact 1140 aggtgtcctc tataatatta tggggtggag gggggtggta tggagcaagg ggcccaagtt 1200 gggaagacaa cctgtagggc ctgcggggtc tattcgggaa ccaagctgga gtgcagtggc 1260 acaatcttgg ctcactgcaa tctccgcctc ctgggttcaa gcgattctcc tgcctcagcc 1320 tcccgagttg ttgggattcc aggcatgcat gaccaggctc agctaatttt tgtttttttg 1380 gtagagacgg ggtttcacca tattggccag gctggtctcc aactcctaat ctcaggtgat 1440 ctacccacct tggcctccca aattgctggg attacaggcg tgaaccactg ctcccttccc 1500 tgtccttctg attttaaaat aactatacca gcaggaggac gtccagacac agcataggct 1560 acctgccatg gcccaaccgg tgggacattt gagttgcttg cttggcactg tcctctcatg 1620 cgttgggtcc actcagtaga tgcctgttga attgggtacg cggccagctt ctgtggaatg 1680 tgtgtcagtt agggtgtgga aagtccccag gctccccagc aggcagaagt atgcaaagca 1740 tgcatctcaa ttagtcagca accaggtgtg gaaaagtccc caggctcccc agcaggcaga 1800 agtatgcaaa gcatgcatct caattagtca gcaaccatag tcccgcccct aactccgccc 1860 atcccgcccc taactccgcc cagttccgcc cattctccgc cccatggctg actaattttt 1920 tttatttatg cagaggccga ggccgcctcg gcctctgagc tattccagaa gtagtgagga 1980 ggcttttttg gaggcctagg cttttgcaaa aagctcctcg aggaactgaa aaaccagaaa 2040 gttaactggt aagtttagtc tttttgtctt ttatttcagg tcccggatcc ggtggtggtg 2100 caaatcaaag aactgctcct cagtggatgt tgcctttact tctaggcctg tacggaagtg 2160 ttacttctgc tctaaaagct gctgcaggtc gactctaggg ccgcgtaccg agctcgaatt 2220 ccctatagtg agtcgtatta aattcgtaat catggtcata gctgtttcct gtgtgaaatt 2280 gttatccgct cacaattcca cacaacatac gagccggaag cataaagtgt aaagcctggg 2340 gtgcctaatg agtgagctaa ctcacattaa ttgcgttgcg ctcactgccc gctttccagt 2400 cgggaaacct gtcgtgccag ctgcattaat gaatcggcca acgcgcgggg agaggcggtt 2460 tgcgtattgg gcgctcttcc gcttcctcgc tcactgactc gctgcgctcg gtcgttcggc 2520 tgcggcgagc ggtatcagct cactcaaagg cggtaatacg gttatccaca gaatcagggg 2580 ataacgcagg aaagaacatg tgagcaaaag gccagcaaaa ggccaggaac cgtaaaaggc 2640 cgcgttgctg gcgtttttcc ataggctccg cccccctgac gagcatcaca aaaatcgacg 2700 ctcaagtcag aggtggcgaa acccgacagg actataaaga taccaggcgt ttccccctgg 2760 aagctccctc gtgcgctctc ctgttccgac cctgccgctt accggatacc tgtccgcctt 2820 tctcccttcg ggaagcgtgg cgctttctca atgctcacgc tgtaggtatc tcagttcggt 2880 gtaggtcgtt cgctccaagc tgggctgtgt gcacgaaccc cccgttcagc ccgaccgctg 2940 cgccttatcc ggtaactatc gtcttgagtc caacccggta agacacgact tatcgccact 3000 ggcagcagcc actggtaaca ggattagcag agcgaggtat gtaggcggtg ctacagagtt 3060 cttgaagtgg tggcctaact acggctacac tagaaggaca gtatttggta tctgcgctct 3120 gctgaagcca gttaccttcg gaaaaagagt tggtagctct tgatccggca aacaaaccac 3180 cgctggtagc ggtggttttt ttgtttgcaa gcagcagatt acgcgcagaa aaaaaggatc 3240 tcaagaagat cctttgatct tttctacggg gtctgacgct cagtggaacg aaaactcacg 3300 ttaagggatt ttggtcatga gattatcaaa aaggatcttc acctagatcc ttttaaatta 3360 aaaatgaagt tttaaatcaa tctaaagtat atatgagtaa acttggtctg acagttacca 3420 atgcttaatc agtgaggcac ctatctcagc gatctgtcta tttcgttcat ccatagttgc 3480 ctgactcccc gtcgtgtaga taactacgat acgggagggc ttaccatctg gccccagtgc 3540 tgcaatgata ccgcgagacc cacgctcacc ggctccagat ttatcagcaa taaaccagcc 3600 agccggaagg gccgagcgca gaagtggtcc tgcaacttta tccgcctcca tccagtctat 3660 taattgttgc cgggaagcta gagtaagtag ttcgccagtt aatagtttgc gcaacgttgt 3720 tgccattgct acaggcatcg tggtgtcacg ctcgtcgttt ggtatggctt cattcagctc 3780 cggttcccaa cgatcaaggc gagttacatg atcccccatg ttgtgcaaaa aagcggttag 3840 ctccttcggt cctccgatcg ttgtcagaag taagttggcc gcagtgttat cactcatggt 3900 tatggcagca ctgcataatt ctcttactgt catgccatcc gtaagatgct tttctgtgac 3960 tggtgagtac tcaaccaagt cattctgaga atagtgtatg cggcgaccga gttgctcttg 4020 cccggcgtca atacgggata ataccgcgcc acatagcaga actttaaaag tgctcatcat 4080 tggaaaacgt tcttcggggc gaaaactctc aaggatctta ccgctgttga gatccagttc 4140 gatgtaaccc actcgtgcac ccaactgatc ttcagcatct tttactttca ccagcgtttc 4200 tgggtgagca aaaacaggaa ggcaaaatgc cgcaaaaaag ggaataaggg cgacacggaa 4260 atgttgaata ctcatactct tcctttttca atattattga agcatttatc agggttattg 4320 tctcatgagc ggatacatat ttgaatgtat ttagaaaaat aaacaaatag gggttccgcg 4380 cacatttccc cgaaaagtgc cacctgacgc gccctgtagc ggcgcattaa gcgcggcggg 4440 tgtggtggtt acgcgcagcg tgaccgctac acttgccagc gccctagcgc ccgctccttt 4500 cgctttcttc ccttcctttc tcgccacgtt cgccggcttt ccccgtcaag ctctaaatcg 4560 gggcatccct ttagggttcc gatttagtgc tttacggcac ctcgacccca aaaaacttga 4620 ttagggtgat ggttcacgta gtgggccatc gccctgatag acggtttttc gccctttgac 4680 gttggagtcc acgttcttta atagtggact cttgttccaa actggaacaa cactcaaccc 4740 tatctcggtc tattcttttg atttataagg gattttgccg atttcggcct attggttaaa 4800 aaatgagctg atttaacaaa aatttaacgc gaattttaac aaaatattaa caaaatatta 4860 acgtttacaa tttc 4874 <210> 374 <211> 35 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer 496 <400> 374 acgtggccca ggcggccttt cagtgtggcc aaaag 35 <210> 375 <211> 32 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer 497 <400> 375 tcctggccgg cctggccgag caggccattc tc 32 <210> 376 <211> 4681 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pComb3H phagemid vector <400> 376 gggaaattgt aagcgttaat attttgttaa aattcgcgtt aaatttttgt taaatcagct 60 cattttttaa ccaataggcc gaaatcggca aaatccctta taaatcaaaa gaatagaccg 120 agatagggtt gagtgttgtt ccagtttgga acaagagtcc actattaaag aacgtggact 180 ccaacgtcaa agggcgaaaa accgtctatc agggcgatgg cccactacgt gaaccatcac 240 cctaatcaag ttttttgggg tcgaggtgcc gtaaagcact aaatcggaac cctaaaggga 300 gcccccgatt tagagcttga cggggaaagc cggcgaacgt ggcgagaaag gaagggaaga 360 aagcgaaagg agcgggcgct agggcgctgg caagtgtagc ggtcacgctg cgcgtaacca 420 ccacacccgc cgcgcttaat gcgccgctac agggcgcgtc aggtggcact tttcggggaa 480 atgtgcgcgg aacccctatt tgtttatttt tctaaataca ttcaaatatg tatccgctca 540 tgagacaata accctgataa atgcttcaat aatattgaaa aaggaagagt atgagtattc 600 aacatttccg tgtcgccctt attccctttt ttgcggcatt ttgccttcct gtttttgctc 660 acccagaaac gctggtgaaa gtaaaagatg ctgaagatca gttgggtgca cgagtgggtt 720 acatcgaact ggatctcaac agcggtaaga tccttgagag ttttcgcccc gaagaacgtt 780 ttccaatgat gagcactttt aaagttctgc tatgtggcgc ggtattatcc cgtattgacg 840 ccgggcaaga gcaactcggt cgccgcatac actattctca gaatgacttg gttgagtact 900 caccagtcac agaaaagcat cttacggatg gcatgacagt aagagaatta tgcagtgctg 960 ccataaccat gagtgataac actgcggcca acttacttct gacaacgatc ggaggaccga 1020 aggagctaac cgcttttttg cacaacatgg gggatcatgt aactcgcctt gatcgttggg 1080 aaccggagct gaatgaagcc ataccaaacg acgagcgtga caccacgatg cctgtagcaa 1140 tggcaacaac gttgcgcaaa ctattaactg gcgaactact tactctagct tcccggcaac 1200 aattaataga ctggatggag gcggataaag ttgcaggacc acttctgcgc tcggcccttc 1260 cggctggctg gtttattgct gataaatctg gagccggtga gcgtgggtct cgcggtatca 1320 ttgcagcact ggggccagat ggtaagccct cccgtatcgt agttatctac acgacgggga 1380 gtcaggcaac tatggatgaa cgaaatagac agatcgctga gataggtgcc tcactgatta 1440 agcattggta actgtcagac caagtttact catatatact ttagattgat ttaaaacttc 1500 atttttaatt taaaaggatc taggtgaaga tcctttttga taatctcatg accaaaatcc 1560 cttaacgtga gttttcgttc cactgagcgt cagaccccgt agaaaagatc aaaggatctt 1620 cttgagatcc tttttttctg cgcgtaatct gctgcttgca aacaaaaaaa ccaccgctac 1680 cagcggtggt ttgtttgccg gatcaagagc taccaactct ttttccgaag gtaactggct 1740 tcagcagagc gcagatacca aatactgtcc ttctagtgta gccgtagtta ggccaccact 1800 tcaagaactc tgtagcaccg cctacatacc tcgctctgct aatcctgtta ccagtggctg 1860 ctgccagtgg cgataagtcg tgtcttaccg ggttggactc aagacgatag ttaccggata 1920 aggcgcagcg gtcgggctga acggggggtt cgtgcacaca gcccagcttg gagcgaacga 1980 cctacaccga actgagatac ctacagcgtg agctatgaga aagcgccacg cttcccgaag 2040 ggagaaaggc ggacaggtat ccggtaagcg gcagggtcgg aacaggagag cgcacgaggg 2100 agcttccagg gggaaacgcc tggtatcttt atagtcctgt cgggtttcgc cacctctgac 2160 ttgagcgtcg atttttgtga tgctcgtcag gggggcggag cctatggaaa aacgccagca 2220 acgcggcctt tttacggttc ctggcctttt gctggccttt tgctcacatg ttctttcctg 2280 cgttatcccc tgattctgtg gataaccgta ttaccgcctt tgagtgagct gataccgctc 2340 gccgcagccg aacgaccgag cgcagcgagt cagtgagcga ggaagcggaa gagcgcccaa 2400 tacgcaaacc gcctctcccc gcgcgttggc cgattcatta atgcagctgg cacgacaggt 2460 ttcccgactg gaaagcgggc agtgagcgca acgcaattaa tgtgagttag ctcactcatt 2520 aggcacccca ggctttacac tttatgcttc cggctcgtat gttgtgtgga attgtgagcg 2580 gataacaatt gaattcagga ggaatttaaa atgaaaaaga cagctatcgc gattgcagtg 2640 gcactggctg gtttcgctac cgtggcccag gcggccgagc tcgtgttgac ccaatctcca 2700 gcttctttgg ctgtgtctct agggcagagg gccaccatct cctgcagagc cagcgaaagt 2760 gttgataatt atggcattag ttttatgaac tggttccaac agaaaccagg acagccaccc 2820 aaactcctca tctatgctgc atccaaccta ggatccgggg tccctgccag gtttagtggc 2880 agtgggtctg ggacagactt cagtctcaac atccatccta tggaggagga agatactgca 2940 atgtatttct gtcagcaaag taaggaggtt ccgctcacgt tcggtgctgg gaccaaggtg 3000 gagctgaaac gggctgatgc tgcaccaact gtatccatct tcccaccatc cagtgagcag 3060 ttaacatctg gaggtgcctc agtcgtgtgc ttcttgaaca acttctaccc caaagacatc 3120 aatgtcaagt ggaagattga tggcagtgaa cgacaaaatg gcgtcctgaa cagttggact 3180 gatcaggaca gcaaagacag cacctacagc atgagcagca ccctcacgtt gaccaaggac 3240 gagtatgaac gacataacag ctatacctgt gaggccactc acaagacatc aacttcaccc 3300 attgtcaaga gcttcaacat gaatcaccac taatctagat aattaattag gaggaattta 3360 aaatgaaata cctattgcct acggcagccg ctggattgtt attactcgct gcccaaccag 3420 ccatggccga ggtgcagctg ctcgagcagc ctgggtctgt gctggtaagg cctggagctt 3480 cagtgaagct gtcctgcaag gcttctggct acaccttcac cagctcctgg atacactggg 3540 cgaagcagag gcctggacaa ggccttgagt ggattggaga gattcatcct aatagtggta 3600 atactaacta caatgagaag ttcaagggca aggccacact gactgtagac acatcctcca 3660 gcacagccta cgtggatctc agcagcctga catctgagga ctctgcggtc tattactgtg 3720 caagatggag gtacggtagt ccctactact ttgactactg gggccaaggc accactctca 3780 ctgtctcctc agccaaaacg acacccccat ctgtctatcc actggcccct ggatctgctg 3840 cccaaactaa ctccatggtg accctgggat gcctggtcaa gggctatttc cctgagccag 3900 tgacagtgac ctggaactct ggatccctgt ccagcggtgt gcacaccttc ccagctgtcc 3960 tgcagtctga cctctacact ctgagcagct cagtgactgt cccctccagc acctggccca 4020 gcgagaccgt cacctgcaac gttgcccacc cggccagcag caccaaggtg gacaagaaaa 4080 ttgtgcccca tcatactagt ggccaggccg gccaggaggg tggtggctct gagggtggcg 4140 gttctgaggg tggcggctct gagggaggcg gttccggtgg tggctctggt tccggtgatt 4200 ttgattatga aaagatggca aacgctaata agggggctat gaccgaaaat gccgatgaaa 4260 acgcgctaca gtctgacgct aaaggcaaac ttgattctgt cgctactgat tacggtgctg 4320 ctatcgatgg tttcattggt gacgtttccg gccttgctaa tggtaatggt gctactggtg 4380 attttgctgg ctctaattcc caaatggctc aagtcggtga cggtgataat tcacctttaa 4440 tgaataattt ccgtcaatat ttaccttccc tccctcaatc ggttgaatgt cgcccttttg 4500 tctttagcgc tggtaaacca tatgaatttt ctattgattg tgacaaaata aacttattcc 4560 gtggtgtctt tgcgtttctt ttatatgttg ccacctttat gtatgtattt tctacgtttg 4620 ctaacatact gcgtaataag gagtcttaag ctagctaatt aatttaagcg gccgcagatc 4680 t 4681 <210> 377 <211> 4361 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PBR322 <400> 377 ttctcatgtt tgacagctta tcatcgataa gctttaatgc ggtagtttat cacagttaaa 60 ttgctaacgc agtcaggcac cgtgtatgaa atctaacaat gcgctcatcg tcatcctcgg 120 caccgtcacc ctggatgctg taggcatagg cttggttatg ccggtactgc cgggcctctt 180 gcgggatatc gtccattccg acagcatcgc cagtcactat ggcgtgctgc tagcgctata 240 tgcgttgatg caatttctat gcgcacccgt tctcggagca ctgtccgacc gctttggccg 300 ccgcccagtc ctgctcgctt cgctacttgg agccactatc gactacgcga tcatggcgac 360 cacacccgtc ctgtggatcc tctacgccgg acgcatcgtg gccggcatca ccggcgccac 420 aggtgcggtt gctggcgcct atatcgccga catcaccgat ggggaagatc gggctcgcca 480 cttcgggctc atgagcgctt gtttcggcgt gggtatggtg gcaggccccg tggccggggg 540 actgttgggc gccatctcct tgcatgcacc attccttgcg gcggcggtgc tcaacggcct 600 caacctacta ctgggctgct tcctaatgca ggagtcgcat aagggagagc gtcgaccgat 660 gcccttgaga gccttcaacc cagtcagctc cttccggtgg gcgcggggca tgactatcgt 720 cgccgcactt atgactgtct tctttatcat gcaactcgta ggacaggtgc cggcagcgct 780 ctgggtcatt ttcggcgagg accgctttcg ctggagcgcg acgatgatcg gcctgtcgct 840 tgcggtattc ggaatcttgc acgccctcgc tcaagccttc gtcactggtc ccgccaccaa 900 acgtttcggc gagaagcagg ccattatcgc cggcatggcg gccgacgcgc tgggctacgt 960 cttgctggcg ttcgcgacgc gaggctggat ggccttcccc attatgattc ttctcgcttc 1020 cggcggcatc gggatgcccg cgttgcaggc catgctgtcc aggcaggtag atgacgacca 1080 tcagggacag cttcaaggat cgctcgcggc tcttaccagc ctaacttcga tcactggacc 1140 gctgatcgtc acggcgattt atgccgcctc ggcgagcaca tggaacgggt tggcatggat 1200 tgtaggcgcc gccctatacc ttgtctgcct ccccgcgttg cgtcgcggtg catggagccg 1260 ggccacctcg acctgaatgg aagccggcgg cacctcgcta acggattcac cactccaaga 1320 attggagcca atcaattctt gcggagaact gtgaatgcgc aaaccaaccc ttggcagaac 1380 atatccatcg cgtccgccat ctccagcagc cgcacgcggc gcatctcggg cagcgttggg 1440 tcctggccac gggtgcgcat gatcgtgctc ctgtcgttga ggacccggct aggctggcgg 1500 ggttgcctta ctggttagca gaatgaatca ccgatacgcg agcgaacgtg aagcgactgc 1560 tgctgcaaaa cgtctgcgac ctgagcaaca acatgaatgg tcttcggttt ccgtgtttcg 1620 taaagtctgg aaacgcggaa gtcagcgccc tgcaccatta tgttccggat ctgcatcgca 1680 ggatgctgct ggctaccctg tggaacacct acatctgtat taacgaagcg ctggcattga 1740 ccctgagtga tttttctctg gtcccgccgc atccataccg ccagttgttt accctcacaa 1800 cgttccagta accgggcatg ttcatcatca gtaacccgta tcgtgagcat cctctctcgt 1860 ttcatcggta tcattacccc catgaacaga aatccccctt acacggaggc atcagtgacc 1920 aaacaggaaa aaaccgccct taacatggcc cgctttatca gaagccagac attaacgctt 1980 ctggagaaac tcaacgagct ggacgcggat gaacaggcag acatctgtga atcgcttcac 2040 gaccacgctg atgagcttta ccgcagctgc ctcgcgcgtt tcggtgatga cggtgaaaac 2100 ctctgacaca tgcagctccc ggagacggtc acagcttgtc tgtaagcgga tgccgggagc 2160 agacaagccc gtcagggcgc gtcagcgggt gttggcgggt gtcggggcgc agccatgacc 2220 cagtcacgta gcgatagcgg agtgtatact ggcttaacta tgcggcatca gagcagattg 2280 tactgagagt gcaccatatg cggtgtgaaa taccgcacag atgcgtaagg agaaaatacc 2340 gcatcaggcg ctcttccgct tcctcgctca ctgactcgct gcgctcggtc gttcggctgc 2400 ggcgagcggt atcagctcac tcaaaggcgg taatacggtt atccacagaa tcaggggata 2460 acgcaggaaa gaacatgtga gcaaaaggcc agcaaaaggc caggaaccgt aaaaaggccg 2520 cgttgctggc gtttttccat aggctccgcc cccctgacga gcatcacaaa aatcgacgct 2580 caagtcagag gtggcgaaac ccgacaggac tataaagata ccaggcgttt ccccctggaa 2640 gctccctcgt gcgctctcct gttccgaccc tgccgcttac cggatacctg tccgcctttc 2700 tcccttcggg aagcgtggcg ctttctcata gctcacgctg taggtatctc agttcggtgt 2760 aggtcgttcg ctccaagctg ggctgtgtgc acgaaccccc cgttcagccc gaccgctgcg 2820 ccttatccgg taactatcgt cttgagtcca acccggtaag acacgactta tcgccactgg 2880 cagcagccac tggtaacagg attagcagag cgaggtatgt aggcggtgct acagagttct 2940 tgaagtggtg gcctaactac ggctacacta gaaggacagt atttggtatc tgcgctctgc 3000 tgaagccagt taccttcgga aaaagagttg gtagctcttg atccggcaaa caaaccaccg 3060 ctggtagcgg tggttttttt gtttgcaagc agcagattac gcgcagaaaa aaaggatctc 3120 aagaagatcc tttgatcttt tctacggggt ctgacgctca gtggaacgaa aactcacgtt 3180 aagggatttt ggtcatgaga ttatcaaaaa ggatcttcac ctagatcctt ttaaattaaa 3240 aatgaagttt taaatcaatc taaagtatat atgagtaaac ttggtctgac agttaccaat 3300 gcttaatcag tgaggcacct atctcagcga tctgtctatt tcgttcatcc atagttgcct 3360 gactccccgt cgtgtagata actacgatac gggagggctt accatctggc cccagtgctg 3420 caatgatacc gcgagaccca cgctcaccgg ctccagattt atcagcaata aaccagccag 3480 ccggaagggc cgagcgcaga agtggtcctg caactttatc cgcctccatc cagtctatta 3540 attgttgccg ggaagctaga gtaagtagtt cgccagttaa tagtttgcgc aacgttgttg 3600 ccattgctgc aggcatcgtg gtgtcacgct cgtcgtttgg tatggcttca ttcagctccg 3660 gttcccaacg atcaaggcga gttacatgat cccccatgtt gtgcaaaaaa gcggttagct 3720 ccttcggtcc tccgatcgtt gtcagaagta agttggccgc agtgttatca ctcatggtta 3780 tggcagcact gcataattct cttactgtca tgccatccgt aagatgcttt tctgtgactg 3840 gtgagtactc aaccaagtca ttctgagaat agtgtatgcg gcgaccgagt tgctcttgcc 3900 cggcgtcaac acgggataat accgcgccac atagcagaac tttaaaagtg ctcatcattg 3960 gaaaacgttc ttcggggcga aaactctcaa ggatcttacc gctgttgaga tccagttcga 4020 tgtaacccac tcgtgcaccc aactgatctt cagcatcttt tactttcacc agcgtttctg 4080 ggtgagcaaa aacaggaagg caaaatgccg caaaaaaggg aataagggcg acacggaaat 4140 gttgaatact catactcttc ctttttcaat attattgaag catttatcag ggttattgtc 4200 tcatgagcgg atacatattt gaatgtattt agaaaaataa acaaataggg gttccgcgca 4260 catttccccg aaaagtgcca cctgacgtct aagaaaccat tattatcatg acattaacct 4320 ataaaaatag gcgtatcacg aggccctttc gtcttcaaga a 4361 <210> 378 <211> 5 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> wildtype RCL sequence from P4-P1 <400> 378 Val Ser Ala Arg Met 1 5 <210> 379 <211> 5 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> mutant RCL sequence from P4-P1' <400> 379 Arg Arg Ala Arg Met 1 5 <210> 380 <211> 44 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> RRARM mutagenic primer <400> 380 ccacagctgt cataaggagg gccagaatgg cccccgagga gatc 44 <210> 381 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer 535 <400> 381 cagctatcgc gattgcag 18 <210> 382 <211> 17 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> primer 5542 <400> 382 gtgcgcagcc atcccgg 17 <210> 383 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <221> variation <222> 8 <223> n = a, g, c, or t <220> <221> variation <222> 9 <223> n = a, g, c, or t <220> <221> variation <222> 10 <223> s = g or c <220> <223> Primer TC30 <400> 383 gccctggnns gcggccatc 19 <210> 384 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <221> variation <222> 8 <223> n = a, g, c, or t <220> <221> variation <222> 9 <223> n = a, g, c, or t <220> <221> variation <222> 10 <223> s = g or c <220> <223> Primer TC155 <400> 384 ggagcagnns aaaatgactg 20 <210> 385 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Primer 717 <400> 385 tttcagtgtg gccaaaag 18 <210> 386 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Primer 718 <400> 386 cagagtcttt tggccaca 18 <210> 387 <211> 35 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Primer 850 <400> 387 ggggtaccgc caccatgaga gccctgctgg cgcgc 35 <210> 388 <211> 33 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Primer 851 <400> 388 gctctagatc atcagagggc caggccattc tct 33 <210> 389 <211> 5 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> mutant P4-P1' RCL loop sequence <400> 389 Pro Phe Gly Arg Ser 1 5 <210> 390 <211> 44 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> PFGRS mutagenesis primer <400> 390 ccacagctgt catacccttc ggcagaagcg cccccgagga gatc 44 <210> 391 <211> 245 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> mature chymotrypsin <400> 391 Cys Gly Val Pro Ala Ile His Pro Val Leu Ser Gly Leu Ser Arg Ile 1 5 10 15 Val Asn Gly Glu Asp Ala Val Pro Gly Ser Trp Pro Trp Gln Val Ser 20 25 30 Leu Gln Asp Lys Thr Gly Phe His Phe Cys Gly Gly Ser Leu Ile Ser 35 40 45 Glu Asp Trp Val Val Thr Ala Ala His Cys Gly Val Arg Thr Ser Asp 50 55 60 Val Val Val Ala Gly Glu Phe Asp Gln Gly Ser Asp Glu Glu Asn Ile 65 70 75 80 Gln Val Leu Lys Ile Ala Lys Val Phe Lys Asn Pro Lys Phe Ser Ile 85 90 95 Leu Thr Val Asn Asn Asp Ile Thr Leu Leu Lys Leu Ala Thr Pro Ala 100 105 110 Arg Phe Ser Gln Thr Val Ser Ala Val Cys Leu Pro Ser Ala Asp Asp 115 120 125 Asp Phe Pro Ala Gly Thr Leu Cys Ala Thr Thr Gly Trp Gly Lys Thr 130 135 140 Lys Tyr Asn Ala Asn Lys Thr Pro Asp Lys Leu Gln Gln Ala Ala Leu 145 150 155 160 Pro Leu Leu Ser Asn Ala Glu Cys Lys Lys Ser Trp Gly Arg Arg Ile 165 170 175 Thr Asp Val Met Ile Cys Ala Gly Ala Ser Gly Val Ser Ser Cys Met 180 185 190 Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Gln Lys Asp Gly Ala Trp Thr 195 200 205 Leu Val Gly Ile Val Ser Trp Gly Ser Asp Thr Cys Ser Thr Ser Ser 210 215 220 Pro Gly Val Tyr Ala Arg Val Thr Lys Leu Ile Pro Trp Val Gln Lys 225 230 235 240 Ile Leu Ala Ala Asn 245 <210> 392 <211> 10 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AATTCTATGG <400> 392 aattctatgg 10 <210> 393 <211> 10 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> tgcaccatag <400> 393 tgcaccatag 10 <210> 394 <211> 13 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> ATGGAACCCTGAA <400> 394 atggaaccct gaa 13 <210> 395 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AGCTTCAGGGTTCCATCAC- <400> 395 agcttcaggg ttccatcac 19 <210> 396 <211> 380 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> PAI-I with MET as cloned into pPAIST7HS <400> 396 Met Val His His Pro Pro Ser Tyr Val Ala His Leu Ala Ser Asp Phe 1 5 10 15 Gly Val Arg Val Phe Gln Gln Val Ala Gln Ala Ser Lys Asp Arg Asn 20 25 30 Val Val Phe Ser Pro Tyr Gly Val Ala Ser Val Leu Ala Met Leu Gln 35 40 45 Leu Thr Thr Gly Gly Glu Thr Gln Gln Gln Ile Gln Ala Ala Met Gly 50 55 60 Phe Lys Ile Asp Asp Lys Gly Met Ala Pro Ala Leu Arg His Leu Tyr 65 70 75 80 Lys Glu Leu Met Gly Pro Trp Asn Lys Asp Glu Ile Ser Thr Thr Asp 85 90 95 Ala Ile Phe Val Gln Arg Asp Leu Lys Leu Val Gln Gly Phe Met Pro 100 105 110 His Phe Phe Arg Leu Phe Arg Ser Thr Val Lys Gln Val Asp Phe Ser 115 120 125 Glu Val Glu Arg Ala Arg Phe Ile Ile Asn Asp Trp Val Lys Thr His 130 135 140 Thr Lys Gly Met Ile Ser Asn Leu Leu Gly Lys Gly Ala Val Asp Gln 145 150 155 160 Leu Thr Arg Leu Val Leu Val Asn Ala Leu Tyr Phe Asn Gly Gln Trp 165 170 175 Lys Thr Pro Phe Pro Asp Ser Ser Thr His Arg Arg Leu Phe His Lys 180 185 190 Ser Asp Gly Ser Thr Val Ser Val Pro Met Met Ala Gln Thr Asn Lys 195 200 205 Phe Asn Tyr Thr Glu Phe Thr Thr Pro Asp Gly His Tyr Tyr Asp Ile 210 215 220 Leu Glu Leu Pro Tyr His Gly Asp Thr Leu Ser Met Phe Ile Ala Ala 225 230 235 240 Pro Tyr Glu Lys Glu Val Pro Leu Ser Ala Leu Thr Asn Ile Leu Ser 245 250 255 Ala Gln Leu Ile Ser His Trp Lys Gly Asn Met Thr Arg Leu Pro Arg 260 265 270 Leu Leu Val Leu Pro Lys Phe Ser Leu Glu Thr Glu Val Asp Leu Arg 275 280 285 Lys Pro Leu Glu Asn Leu Gly Met Thr Asp Met Phe Arg Gln Phe Gln 290 295 300 Ala Asp Phe Thr Ser Leu Ser Asp Gln Glu Pro Leu His Val Ala Gln 305 310 315 320 Ala Leu Gln Lys Val Lys Ile Glu Val Asn Glu Ser Gly Thr Val Ala 325 330 335 Ser Ser Ser Thr Ala Val Ile Val Ser Ala Arg Met Ala Pro Glu Glu 340 345 350 Ile Ile Met Asp Arg Pro Phe Leu Phe Val Val Arg His Asn Pro Thr 355 360 365 Gly Thr Val Leu Phe Met Gly Gln Val Met Glu Pro 370 375 380 <210> 397 <211> 21 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Manduca sexta serpin 1B RSL loop <400> 397 Glu Gly Ala Glu Ala Ala Ala Ala Asn Ala Phe Gly Ile Val Pro Lys 1 5 10 15 Ser Leu Ile Leu Tyr 20 <210> 398 <211> 21 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Manduca sexta serpin 1K RSL loop <400> 398 Glu Gly Ala Glu Ala Ala Ala Ala Asn Ala Phe Lys Ile Thr Thr Tyr 1 5 10 15 Ser Phe His Phe Val 20 <210> 399 <211> 21 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> 1-antichymotrypsin RSL loop <400> 399 Glu Gly Thr Glu Ala Ser Ala Ala Thr Ala Val Lys Ile Thr Leu Leu 1 5 10 15 Ser Ala Leu Val Glu 20 <210> 400 <211> 21 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Antithrombin-III RSL loop <400> 400 Glu Gly Ser Glu Ala Ala Ala Ser Thr Ala Val Val Ile Ala Gly Arg 1 5 10 15 Ser Leu Asn Pro Asn 20 <210> 401 <211> 21 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> PAI-II RSL loop <400> 401 Glu Gly Thr Glu Ala Ala Ala Gly Thr Gly Gly Val Met Thr Gly Arg 1 5 10 15 Thr Gly His Gly Gly 20 <210> 402 <211> 21 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> 1-antitrypsin RSL loop <400> 402 Lys Gly Thr Glu Ala Ala Gly Ala Met Phe Leu Glu Ala Ile Pro Met 1 5 10 15 Ser Ile Pro Pro Glu 20 <210> 403 <211> 21 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> PAI-I RSL loop <400> 403 Ser Gly Thr Val Ala Ser Ser Ser Thr Ala Val Ile Val Ser Ala Arg 1 5 10 15 Met Ala Pro Glu Glu 20 <210> 404 <211> 21 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> PAI-III RSL loop <400> 404 Ser Gly Thr Arg Ala Ala Ala Ala Thr Gly Thr Ile Phe Thr Phe Arg 1 5 10 15 Ser Ala Arg Leu Asn 20 <210> 405 <211> 21 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Ovalbumin RSL loop <400> 405 Ala Gly Arg Glu Val Val Gly Ser Ala Glu Ala Gly Val Asp Ala Ala 1 5 10 15 Ser Val Ser Glu Glu 20 <210> 406 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> TNF- alpha cleavage sequence <400> 406 Ala Glu Ala Lys 1 <210> 407 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> TNF-R1 cleavage sequence (1) <400> 407 Glu Asn Val Lys 1 <210> 408 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> TNF-R1 cleavage sequence (2) <400> 408 Gly Thr Glu Asp 1 <210> 409 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> TNF-R2 cleavage sequence (1) <400> 409 Ser Pro Thr Arg 1 <210> 410 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> TNF-R2 cleavage sequence (2) <400> 410 Val Ser Thr Arg 1 <210> 411 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> TNF-R2 cleavage sequence (3) <400> 411 Ser Thr Ser Phe 1 <210> 412 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> HER-2 cleavage sequence (1) <400> 412 Lys Phe Pro Asp 1 <210> 413 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> HER-2 cleavage sequence (2) <400> 413 Ala Glu Gln Arg 1 <210> 414 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> EGFR cleavage sequence (1) <400> 414 Lys Tyr Ala Asp 1 <210> 415 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> EGFR cleavage sequence (2) <400> 415 Asn Gly Pro Lys 1 <210> 416 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> VEGFR-1 cleavage sequence (1) <400> 416 Ser Ser Ala Tyr 1 <210> 417 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> VEGFR-1 cleavage sequence (2) <400> 417 Gly Thr Ser Asp 1 <210> 418 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> VEGFR-2 cleavage sequence (1) <400> 418 Ala Gln Glu Lys 1 <210> 419 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> VEGFR-2 cleavage sequence (2) <400> 419 Arg Ile Asp Tyr 1 <210> 420 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> C3 cleavage sequence (1) <400> 420 Arg Glu Phe Lys 1 <210> 421 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> C3 cleavage sequence (2) <400> 421 Gly Leu Ala Arg 1 <210> 422 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> C3 cleavage sequence (3) <400> 422 Arg Leu Gly Arg 1 <210> 423 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> C3 cleavage sequence (4) <400> 423 Ala Glu Gly Lys 1 <210> 424 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> C3 cleavage sequence (5) <400> 424 Gln His Ala Arg 1 <210> 425 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> C3 cleavage sequence (6) <400> 425 Leu Pro Ser Arg 1 <210> 426 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> C3 cleavage sequence (7) <400> 426 Ser Leu Leu Arg 1 <210> 427 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> C3 cleavage sequence (8) <400> 427 Leu Gly Leu Ala 1 <210> 428 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> C3 cleavage sequence (9) <400> 428 Leu Ser Val Val 1 <210> 429 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> C4 cleavage sequence (1) <400> 429 His Arg Gly Arg 1 <210> 430 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> C2 cleavage sequence (1) <400> 430 Gly Ala Thr Arg 1 <210> 431 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> C2 cleavage sequence (2) <400> 431 Ser Leu Gly Arg 1 <210> 432 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> C2 cleavage sequence (3) <400> 432 Val Phe Ala Lys 1 <210> 433 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> urokinase plasminogen activator (uPA) preproprotein <400> 433 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Phe Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Leu 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Lys Phe Glu Val Glu Asn Leu Ile 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Leu Lys Met Thr Val Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 434 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> AR73 F173I; F30I (CHYM SYSTEM) <400> 434 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Ile Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Leu 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Lys Phe Glu Val Glu Asn Leu Ile 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Leu Lys Met Thr Val Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 435 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> AR81 L224A, I240V; L73A, I89V (CHYM SYSTEM) <400> 435 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Phe Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Ala 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Lys Phe Glu Val Glu Asn Leu Val 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Leu Lys Met Thr Val Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 436 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> AR1 L224P; L73P (CHYM SYSTEM) <400> 436 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Phe Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Pro 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Lys Phe Glu Val Glu Asn Leu Ile 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Leu Lys Met Thr Val Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 437 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> AR3 R378C; R217C (CHYM SYSTEM) <400> 437 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Phe Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Leu 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Lys Phe Glu Val Glu Asn Leu Ile 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Leu Lys Met Thr Val Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Cys Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 438 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> AR4 L312P; L155P (CHYM SYSTEM) <400> 438 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Phe Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Leu 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Lys Phe Glu Val Glu Asn Leu Ile 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Pro Lys Met Thr Val Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 439 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> AR7 S226P, I240V, I298T; S75P, I89V, I138T (CHYM SYSTEM) <400> 439 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Phe Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Leu 210 215 220 Asn Pro Asn Thr Gln Gly Glu Met Lys Phe Glu Val Glu Asn Leu Val 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Thr Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Leu Lys Met Thr Val Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 440 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> AR32 E294G; E137G (CHYM SYSTEM) <400> 440 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Phe Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Leu 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Lys Phe Glu Val Glu Asn Leu Ile 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Gly Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Leu Lys Met Thr Val Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 441 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> AR36 R223G, L312P; R72G, L155P (CHYM SYSTEM) <400> 441 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Phe Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Gly Leu 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Lys Phe Glu Val Glu Asn Leu Ile 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Pro Lys Met Thr Val Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 442 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> AR37 G290D; G133D (CHYM SYSTEM) <400> 442 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Phe Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Leu 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Lys Phe Glu Val Glu Asn Leu Ile 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Asp Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Leu Lys Met Thr Val Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 443 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> AR66 V317A; V160A (CHYM SYSTEM) <400> 443 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Phe Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Leu 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Lys Phe Glu Val Glu Asn Leu Ile 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Leu Lys Met Thr Val Ala Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 444 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> AR24 V185D; V38D (CHYM SYSTEM) <400> 444 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Phe Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Asp Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Leu 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Lys Phe Glu Val Glu Asn Leu Ile 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Leu Lys Met Thr Val Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 445 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> AR85 F289L, V317A; F132L, V160A (CHYM SYSTEM) <400> 445 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Phe Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Leu 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Lys Phe Glu Val Glu Asn Leu Ile 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Leu Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Leu Lys Met Thr Val Ala Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 446 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> ARF2 F173T, L224A, I240V; F30T, L73A, I189V (CHYM SYSTEM) <400> 446 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Thr Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Ala 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Lys Phe Glu Val Glu Asn Leu Val 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Leu Lys Met Thr Val Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 447 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> ARF6 F173L, L224A, I240V; F30L, L73A, I189V (CHYM SYSTEM) <400> 447 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Leu Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Ala 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Lys Phe Glu Val Glu Asn Leu Val 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Leu Lys Met Thr Val Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 448 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> ARF11 F173V, L224A, I240V; F30V, L73A, I189V (CHYM SYSTEM) <400> 448 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Val Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Ala 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Lys Phe Glu Val Glu Asn Leu Val 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Leu Lys Met Thr Val Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 449 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> ARF17 F173G, L224A, I240V; F30G, L73A, I189V (CHYM SYSTEM) <400> 449 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Gly Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Ala 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Lys Phe Glu Val Glu Asn Leu Val 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Leu Lys Met Thr Val Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 450 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> ARF16 F173L, L224A, I240V; F30L, L73A, I189V (CHYM SYSTEM) <400> 450 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Leu Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Ala 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Lys Phe Glu Val Glu Asn Leu Val 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Leu Lys Met Thr Val Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 451 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> ARF33 L224A, I240V, L312V; L155V, L73A, I189V (CHYM SYSTEM) <400> 451 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Phe Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Ala 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Lys Phe Glu Val Glu Asn Leu Val 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Val Lys Met Thr Val Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 452 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> ARF35 F173M, L224A, I240V; F30M, L73A, I189V (CHYM SYSTEM) <400> 452 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Met Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Ala 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Lys Phe Glu Val Glu Asn Leu Val 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Leu Lys Met Thr Val Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 453 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> ARF36 L224A, L312M; L155M, L73A, I189V (CHYM SYSTEM) <400> 453 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Phe Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Ala 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Lys Phe Glu Val Glu Asn Leu Val 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Met Lys Met Thr Val Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 454 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> ARF37 F173M, L224A, I240V; F30M, L73A, I189V (CHYM SYSTEM) <400> 454 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Met Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Ala 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Lys Phe Glu Val Glu Asn Leu Val 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Leu Lys Met Thr Val Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 455 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> ARF43 F173L, L224A, I240V; F30L, L73A, I189V (CHYM SYSTEM) <400> 455 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Leu Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Ala 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Lys Phe Glu Val Glu Asn Leu Val 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Leu Lys Met Thr Val Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 456 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> ARF47 F173V, L224A, I240V; F30V, L73A, I189V (CHYM SYSTEM) <400> 456 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Val Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Ala 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Lys Phe Glu Val Glu Asn Leu Val 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Leu Lys Met Thr Val Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 457 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> ARF48 F173L, L224A, I240V, L312M; F30L, L155M, L73A, I189V (CHYM SYSTEM) <400> 457 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Leu Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Ala 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Lys Phe Glu Val Glu Asn Leu Val 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Met Lys Met Thr Val Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 458 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> ARF103 F173L, L224A, I240V; F30L, L73A, I189V (CHYM SYSTEM) <400> 458 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Leu Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Ala 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Lys Phe Glu Val Glu Asn Leu Val 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Leu Lys Met Thr Val Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 459 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> ARF115 F173G, L224A, I240V, L312M; F30G, L155M, L73A, I189V (CHYM SYSTEM) <400> 459 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Gly Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Ala 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Lys Phe Glu Val Glu Asn Leu Val 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Met Lys Met Thr Val Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 460 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> uPA/Ia F164V; F21V (CHYM SYSTEM) <400> 460 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Val Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Phe Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Leu 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Lys Phe Glu Val Glu Asn Leu Ile 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Leu Lys Met Thr Val Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 461 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> uPA/Ib I167L; I24L (CHYM SYSTEM) <400> 461 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Leu Glu Asn Gln Pro Trp Phe Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Leu 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Lys Phe Glu Val Glu Asn Leu Ile 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Leu Lys Met Thr Val Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 462 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> uPA/Ic F173V; F30V (CHYM SYSTEM) <400> 462 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Val Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Leu 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Lys Phe Glu Val Glu Asn Leu Ile 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Leu Lys Met Thr Val Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 463 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> uPA/Id F173L; F30L (CHYM SYSTEM) <400> 463 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Leu Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Leu 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Lys Phe Glu Val Glu Asn Leu Ile 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Leu Lys Met Thr Val Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 464 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> uPA/IIa F173V, Y209H; F30V, Y61aH (CHYM SYSTEM) <400> 464 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Val Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 His Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Leu 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Lys Phe Glu Val Glu Asn Leu Ile 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Leu Lys Met Thr Val Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 465 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> uPA/IIb F173V, K233E; F30V, K82E (CHYM SYSTEM) <400> 465 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Val Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Leu 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Glu Phe Glu Val Glu Asn Leu Ile 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Leu Lys Met Thr Val Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 466 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> uPA/IIc F173V, K313T; F30V, K156T (CHYM SYSTEM) <400> 466 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Val Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Leu 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Lys Phe Glu Val Glu Asn Leu Ile 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Leu Thr Met Thr Val Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 467 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> uPA/IIIa F173V, K233E, V316A; F30V, K82E, V159A (CHYM SYSTEM) <400> 467 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Val Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Leu 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Glu Phe Glu Val Glu Asn Leu Ile 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Leu Lys Met Thr Ala Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 468 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> uPA/IIIb F173V, K233E, T186A, V316A; F30V, K82E, 39A, V159A (CHYM SYSTEM) <400> 468 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Val Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Ala Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Leu 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Glu Phe Glu Val Glu Asn Leu Ile 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Leu Lys Met Thr Ala Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 469 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> uPA/IIIc F173V, K233E, T315A, V316A; F30V, K82E, T158A, V159A (CHYM SYSTEM) <400> 469 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Val Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Leu 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Glu Phe Glu Val Glu Asn Leu Ile 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Leu Lys Met Ala Ala Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 470 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> uPA/IIId F173V, Y209H, K243E; F173V, Y61aH, K92E (CHYM SYSTEM) <400> 470 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Val Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 His Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Leu 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Glu Met Lys Phe Glu Val Glu Asn Leu Ile 225 230 235 240 Leu His Glu Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Leu Lys Met Thr Val Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Lys Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 471 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> uPA/IVa F173V, K233E, V316A, G231E, I240V, K348E; F173V, K82E, V159A, E80G, I89V, K187E (CHYM SYSTEM) <400> 471 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Val Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Leu 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Gly Met Glu Phe Glu Val Glu Asn Leu Val 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Leu Lys Met Thr Ala Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Glu Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 472 <211> 411 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> uPA/IVb F173V, K233E, V316A, G231E, E235K, I240V, K348E; F173V, K82E, V159A, E80G, E89K, I89V, K187E (CHYM SYSTEM) <400> 472 Ser Asn Glu Leu His Gln Val Pro Ser Asn Cys Asp Cys Leu Asn Gly 1 5 10 15 Gly Thr Cys Val Ser Asn Lys Tyr Phe Ser Asn Ile His Trp Cys Asn 20 25 30 Cys Pro Lys Lys Phe Gly Gly Gln His Cys Glu Ile Asp Lys Ser Lys 35 40 45 Thr Cys Tyr Glu Gly Asn Gly His Phe Tyr Arg Gly Lys Ala Ser Thr 50 55 60 Asp Thr Met Gly Arg Pro Cys Leu Pro Trp Asn Ser Ala Thr Val Leu 65 70 75 80 Gln Gln Thr Tyr His Ala His Arg Ser Asp Ala Leu Gln Leu Gly Leu 85 90 95 Gly Lys His Asn Tyr Cys Arg Asn Pro Asp Asn Arg Arg Arg Pro Trp 100 105 110 Cys Tyr Val Gln Val Gly Leu Lys Pro Leu Val Gln Glu Cys Met Val 115 120 125 His Asp Cys Ala Asp Gly Lys Lys Pro Ser Ser Pro Pro Glu Glu Leu 130 135 140 Lys Phe Gln Cys Gly Gln Lys Thr Leu Arg Pro Arg Phe Lys Ile Ile 145 150 155 160 Gly Gly Glu Phe Thr Thr Ile Glu Asn Gln Pro Trp Val Ala Ala Ile 165 170 175 Tyr Arg Arg His Arg Gly Gly Ser Val Thr Tyr Val Cys Gly Gly Ser 180 185 190 Leu Ile Ser Pro Cys Trp Val Ile Ser Ala Thr His Cys Phe Ile Asp 195 200 205 Tyr Pro Lys Lys Glu Asp Tyr Ile Val Tyr Leu Gly Arg Ser Arg Leu 210 215 220 Asn Ser Asn Thr Gln Gly Gly Met Glu Phe Lys Val Glu Asn Leu Val 225 230 235 240 Leu His Lys Asp Tyr Ser Ala Asp Thr Leu Ala His His Asn Asp Ile 245 250 255 Ala Leu Leu Lys Ile Arg Ser Lys Glu Gly Arg Cys Ala Gln Pro Ser 260 265 270 Arg Thr Ile Gln Thr Ile Cys Leu Pro Ser Met Tyr Asn Asp Pro Gln 275 280 285 Phe Gly Thr Ser Cys Glu Ile Thr Gly Phe Gly Lys Glu Asn Ser Thr 290 295 300 Asp Tyr Leu Tyr Pro Glu Gln Leu Lys Met Thr Ala Val Lys Leu Ile 305 310 315 320 Ser His Arg Glu Cys Gln Gln Pro His Tyr Tyr Gly Ser Glu Val Thr 325 330 335 Thr Lys Met Leu Cys Ala Ala Asp Pro Gln Trp Glu Thr Asp Ser Cys 340 345 350 Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Val Cys Ser Leu Gln Gly Arg Met 355 360 365 Thr Leu Thr Gly Ile Val Ser Trp Gly Arg Gly Cys Ala Leu Lys Asp 370 375 380 Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Val Ser His Phe Leu Pro Trp Ile Arg 385 390 395 400 Ser His Thr Lys Glu Glu Asn Gly Leu Ala Leu 405 410 <210> 473 <211> 299 <212> PRT <213> Autographa californica nucleopolyhedrovirus <220> <223> P35 peptide <400> 473 Met Cys Val Ile Phe Pro Val Glu Ile Asp Val Ser Gln Thr Ile Ile 1 5 10 15 Arg Asp Cys Gln Val Asp Lys Gln Thr Arg Glu Leu Val Tyr Ile Asn 20 25 30 Lys Ile Met Asn Thr Gln Leu Thr Lys Pro Val Leu Met Met Phe Asn 35 40 45 Ile Ser Gly Pro Ile Arg Ser Val Thr Arg Lys Asn Asn Asn Leu Arg 50 55 60 Asp Arg Ile Lys Ser Lys Val Asp Glu Gln Phe Asp Gln Leu Glu Arg 65 70 75 80 Asp Tyr Ser Asp Gln Met Asp Gly Phe His Asp Ser Ile Lys Tyr Phe 85 90 95 Lys Asp Glu His Tyr Ser Val Ser Cys Gln Asn Gly Ser Val Leu Lys 100 105 110 Ser Lys Phe Ala Lys Ile Leu Lys Ser His Asp Tyr Thr Asp Lys Lys 115 120 125 Ser Ile Glu Ala Tyr Glu Lys Tyr Cys Leu Pro Lys Leu Val Asp Glu 130 135 140 Arg Asn Asp Tyr Tyr Val Ala Val Cys Val Leu Lys Pro Gly Phe Glu 145 150 155 160 Asn Gly Ser Asn Gln Val Leu Ser Phe Glu Tyr Asn Pro Ile Gly Asn 165 170 175 Lys Val Ile Val Pro Phe Ala His Glu Ile Asn Asp Thr Gly Leu Tyr 180 185 190 Glu Tyr Asp Val Val Ala Tyr Val Asp Ser Val Gln Phe Asp Gly Glu 195 200 205 Gln Phe Glu Glu Phe Val Gln Ser Leu Ile Leu Pro Ser Ser Phe Lys 210 215 220 Asn Ser Glu Lys Val Leu Tyr Tyr Asn Glu Ala Ser Lys Asn Lys Ser 225 230 235 240 Met Ile Tyr Lys Ala Leu Glu Phe Thr Thr Glu Ser Ser Trp Gly Lys 245 250 255 Ser Glu Lys Tyr Asn Trp Lys Ile Phe Cys Asn Gly Phe Ile Tyr Asp 260 265 270 Lys Lys Ser Lys Val Leu Tyr Val Lys Leu His Asn Val Thr Ser Ala 275 280 285 Leu Asn Lys Asn Val Ile Leu Asn Thr Ile Lys 290 295 <210> 474 <211> 2105 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> Full length u-PA <400> 474 atgagagccc tgctggcgcg cctgcttctc tgcgtcctgg tcgtgagcga ctccaaaggc 60 agcaatgaac ttcatcaagt tccatcgaac tgtgactgtc taaatggagg aacatgtgtg 120 tccaacaagt acttctccaa cattcactgg tgcaactgcc caaagaaatt cggagggcag 180 cactggtgaa atagataagt caaaaacctg ctatgagggg aatggtcact tttaccgagg 240 aaaggccagc actgacacca gttgccggcc ctgcctgccc tggaactctg ccactgtcct 300 tcagcaaacg taccatgccc acagatctga tgctcttcag ctgggcctgg ggaaacataa 360 ttactgcagg aacccagaca accggaggcg accctggtgc tatgtgcagg tgggcctaaa 420 gccgcttgtc caagagtgca tggtgcatga ctgcgcagat ggaaaaaagc cctcctctcc 480 tccagaagaa ttaaaatttc agtgtggcca aaagactctg aggccccgct ttgagattat 540 tgggggagaa ttcaccacca tcgagaacca gccctggttt gcggccatct acaggaggca 600 ccgggggggc tctgtcacct acgtgtgtgg aggcagcctc atcagccctt gctgggtgat 660 cagcgccaca cactgcttca ttgattaccc aaagaaggag gactacatcg tctacctggg 720 tcgctcaagg cttaactcca acacgcaagg ggagatgaag tttgaggtgg aaaacctcat 780 cctacacaag gactacagcg ctgacacgct tgctcaccac aacgacattg ccttgctgaa 840 gatccgttcc aaggagggca ggtgtgcgca gccatcccgg actatacaga ccatctgcct 900 gccctcgatg tataacgatc cccagtttgg cacaagctgt gagatcactg gctttggaaa 960 agagaattct accgactatc tctatccgga gcagctgaaa atgactgttg tgaagctgat 1020 ttcccaccgg gagtgtcagc agccccacta ctacggctct gaagtcacca ccaaaatgct 1080 atgtgctgct gacccccaat ggaaaacaga ttcctgccag ggagactcag ggggacccct 1140 cgtctgttcc ctccaaggcc gcatgacttt gactggaatt gtgagctggg gccgtggatg 1200 tgccctgaag gacaagccag gcgtctacac gagagtctca cacttcttac cctggatccg 1260 cagtcacacc aaggaagaga atggcctggc cctctgaggg ttttcagtgt ggccaaaaga 1320 ctctgaggcc ccgctttaag attattgggg gagaattcac caccatcgag aaccagccct 1380 ggtttgcggc catctacagg aggcaccggg ggggctctgt cacctacgtg tgtggaggca 1440 gcctcatcag cccttgctgg gtgatcagcg ccacacactg cttcattgat tacccaaaga 1500 aggaggacta catcgtctac ctgggtcgct caaggcttaa ctccaacacg caaggggaga 1560 tgaagtttga ggtggaaaac ctcatcctac acaaggacta cagcgctgac acgcttgctc 1620 accacaacga cattgccttg ctgaagatcc gttccaagga gggcaggtgt gcgcagccat 1680 cccggactat acagaccatc tgcctgccct cgatgtataa cgatccccag tttggcacaa 1740 gctgtgagat cactggcttt ggaaaagaga attctaccga ctatctctat ccggagcagc 1800 tgaaaatgac tgttgtgaag ctgatttccc accgggagtg tcagcagccc cactactacg 1860 gctctgaagt caccaccaaa atgctatgtg ctgctgaccc ccaatggaaa acagattcct 1920 gccagggaga ctcaggggga cccctcgtct gttccctcca aggccgcatg actttgactg 1980 gaattgtgag ctggggccgt ggatgtgccc tgaaggacaa gccaggcgtc tacacgagag 2040 tctcacactt cttaccctgg atccgcagtc acaccaagga agagaatggc ctgccctctg 2100 agggt 2105 <210> 475 <211> 804 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> uPA protease domain <400> 475 tttcagtgtg gccaaaagac tctgaggccc cgctttaaga ttattggggg agaattcacc 60 accatcgaga accagccctg gtttgcggcc atctacagga ggcaccgggg gggctctgtc 120 acctacgtgt gtggaggcag cctcatcagc ccttgctggg tgatcagcgc cacacactgc 180 ttcattgatt acccaaagaa ggaggactac atcgtctacc tgggtcgctc aaggcttaac 240 tccaacacgc aaggggagat gaagtttgag gtggaaaacc tcatcctaca caaggactac 300 agcgctgaca cgcttgctca ccacaacgac attgccttgc tgaagatccg ttccaaggag 360 ggcaggtgtg cgcagccatc ccggactata cagaccatct gcctgccctc gatgtataac 420 gatccccagt ttggcacaag ctgtgagatc actggctttg gaaaagagaa ttctaccgac 480 tatctctatc cggagcagct gaaaatgact gttgtgaagc tgatttccca ccgggagtgt 540 cagcagcccc actactacgg ctctgaagtc accaccaaaa tgctatgtgc tgctgacccc 600 caatggaaaa cagattcctg ccagggagac tcagggggac ccctcgtctg ttccctccaa 660 ggccgcatga ctttgactgg aattgtgagc tggggccgtg gatgtgccct gaaggacaag 720 ccaggcgtct acacgagagt ctcacacttc ttaccctgga tccgcagtca caccaaggaa 780 gagaatggcc tgccctctga gggt 804 <210> 476 <211> 22 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Primer UPAF1 <400> 476 atgagagccc tgctggcgcg cc 22 <210> 477 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Primer UPAF2 <400> 477 ggaaaagaga attctaccg 19 <210> 478 <211> 6 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthesized protease cleavage site <400> 478 Ile Ala Gly Arg Ser Leu 1 5 <210> 479 <211> 6 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthesized protease cleavage site <400> 479 Ser Leu Gly Arg Lys Ile 1 5 <210> 480 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthesized protease cleavage site <400> 480 Val Leu Lys Asp 1 <210> 481 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthesized protease cleavage site <400> 481 Leu Val Glu Asp 1 <210> 482 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthesized protease cleavage site <400> 482 Trp Phe Lys Asp 1 <210> 483 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthesized protease cleavage site <400> 483 Arg Ile Tyr Asp 1 <210> 484 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthesized protease cleavage site <400> 484 Lys Val Gly Arg 1 <210> 485 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthesized protease cleavage site <400> 485 Arg Val Arg Lys 1 <210> 486 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthesized protease cleavage site <400> 486 Arg Lys Thr Lys 1 <210> 487 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthesized protease cleavage site <400> 487 Lys Thr Lys Lys 1 <210> 488 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthesized protease cleavage site <400> 488 Thr Lys Lys Arg 1 <210> 489 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthesized protease cleavage site <400> 489 Arg Arg Val Arg 1 <210> 490 <211> 1474 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Alpha-2-macroglobulin precursor (Alpha-2-M) <400> 490 Met Gly Lys Asn Lys Leu Leu His Pro Ser Leu Val Leu Leu Leu Leu 1 5 10 15 Val Leu Leu Pro Thr Asp Ala Ser Val Ser Gly Lys Pro Gln Tyr Met 20 25 30 Val Leu Val Pro Ser Leu Leu His Thr Glu Thr Thr Glu Lys Gly Cys 35 40 45 Val Leu Leu Ser Tyr Leu Asn Glu Thr Val Thr Val Ser Ala Ser Leu 50 55 60 Glu Ser Val Arg Gly Asn Arg Ser Leu Phe Thr Asp Leu Glu Ala Glu 65 70 75 80 Asn Asp Val Leu His Cys Val Ala Phe Ala Val Pro Lys Ser Ser Ser 85 90 95 Asn Glu Glu Val Met Phe Leu Thr Val Gln Val Lys Gly Pro Thr Gln 100 105 110 Glu Phe Lys Lys Arg Thr Thr Val Met Val Lys Asn Glu Asp Ser Leu 115 120 125 Val Phe Val Gln Thr Asp Lys Ser Ile Tyr Lys Pro Gly Gln Thr Val 130 135 140 Lys Phe Arg Val Val Ser Met Asp Glu Asn Phe His Pro Leu Asn Glu 145 150 155 160 Leu Ile Pro Leu Val Tyr Ile Gln Asp Pro Lys Gly Asn Arg Ile Ala 165 170 175 Gln Trp Gln Ser Phe Gln Leu Glu Gly Gly Leu Lys Gln Phe Ser Phe 180 185 190 Pro Leu Ser Ser Glu Pro Phe Gln Gly Ser Tyr Lys Val Val Val Gln 195 200 205 Lys Lys Ser Gly Gly Arg Thr Glu His Pro Phe Thr Val Glu Glu Phe 210 215 220 Val Leu Pro Lys Phe Glu Val Gln Val Thr Val Pro Lys Ile Ile Thr 225 230 235 240 Ile Leu Glu Glu Glu Met Asn Val Ser Val Cys Gly Leu Tyr Thr Tyr 245 250 255 Gly Lys Pro Val Pro Gly His Val Thr Val Ser Ile Cys Arg Lys Tyr 260 265 270 Ser Asp Ala Ser Asp Cys His Gly Glu Asp Ser Gln Ala Phe Cys Glu 275 280 285 Lys Phe Ser Gly Gln Leu Asn Ser His Gly Cys Phe Tyr Gln Gln Val 290 295 300 Lys Thr Lys Val Phe Gln Leu Lys Arg Lys Glu Tyr Glu Met Lys Leu 305 310 315 320 His Thr Glu Ala Gln Ile Gln Glu Glu Gly Thr Val Val Glu Leu Thr 325 330 335 Gly Arg Gln Ser Ser Glu Ile Thr Arg Thr Ile Thr Lys Leu Ser Phe 340 345 350 Val Lys Val Asp Ser His Phe Arg Gln Gly Ile Pro Phe Phe Gly Gln 355 360 365 Val Arg Leu Val Asp Gly Lys Gly Val Pro Ile Pro Asn Lys Val Ile 370 375 380 Phe Ile Arg Gly Asn Glu Ala Asn Tyr Tyr Ser Asn Ala Thr Thr Asp 385 390 395 400 Glu His Gly Leu Val Gln Phe Ser Ile Asn Thr Thr Asn Val Met Gly 405 410 415 Thr Ser Leu Thr Val Arg Val Asn Tyr Lys Asp Arg Ser Pro Cys Tyr 420 425 430 Gly Tyr Gln Trp Val Ser Glu Glu His Glu Glu Ala His His Thr Ala 435 440 445 Tyr Leu Val Phe Ser Pro Ser Lys Ser Phe Val His Leu Glu Pro Met 450 455 460 Ser His Glu Leu Pro Cys Gly His Thr Gln Thr Val Gln Ala His Tyr 465 470 475 480 Ile Leu Asn Gly Gly Thr Leu Leu Gly Leu Lys Lys Leu Ser Phe Tyr 485 490 495 Tyr Leu Ile Met Ala Lys Gly Gly Ile Val Arg Thr Gly Thr His Gly 500 505 510 Leu Leu Val Lys Gln Glu Asp Met Lys Gly His Phe Ser Ile Ser Ile 515 520 525 Pro Val Lys Ser Asp Ile Ala Pro Val Ala Arg Leu Leu Ile Tyr Ala 530 535 540 Val Leu Pro Thr Gly Asp Val Ile Gly Asp Ser Ala Lys Tyr Asp Val 545 550 555 560 Glu Asn Cys Leu Ala Asn Lys Val Asp Leu Ser Phe Ser Pro Ser Gln 565 570 575 Ser Leu Pro Ala Ser His Ala His Leu Arg Val Thr Ala Ala Pro Gln 580 585 590 Ser Val Cys Ala Leu Arg Ala Val Asp Gln Ser Val Leu Leu Met Lys 595 600 605 Pro Asp Ala Glu Leu Ser Ala Ser Ser Val Tyr Asn Leu Leu Pro Glu 610 615 620 Lys Asp Leu Thr Gly Phe Pro Gly Pro Leu Asn Asp Gln Asp Asp Glu 625 630 635 640 Asp Cys Ile Asn Arg His Asn Val Tyr Ile Asn Gly Ile Thr Tyr Thr 645 650 655 Pro Val Ser Ser Thr Asn Glu Lys Asp Met Tyr Ser Phe Leu Glu Asp 660 665 670 Met Gly Leu Lys Ala Phe Thr Asn Ser Lys Ile Arg Lys Pro Lys Met 675 680 685 Cys Pro Gln Leu Gln Gln Tyr Glu Met His Gly Pro Glu Gly Leu Arg 690 695 700 Val Gly Phe Tyr Glu Ser Asp Val Met Gly Arg Gly His Ala Arg Leu 705 710 715 720 Val His Val Glu Glu Pro His Thr Glu Thr Val Arg Lys Tyr Phe Pro 725 730 735 Glu Thr Trp Ile Trp Asp Leu Val Val Val Asn Ser Ala Gly Val Ala 740 745 750 Glu Val Gly Val Thr Val Pro Asp Thr Ile Thr Glu Trp Lys Ala Gly 755 760 765 Ala Phe Cys Leu Ser Glu Asp Ala Gly Leu Gly Ile Ser Ser Thr Ala 770 775 780 Ser Leu Arg Ala Phe Gln Pro Phe Phe Val Glu Leu Thr Met Pro Tyr 785 790 795 800 Ser Val Ile Arg Gly Glu Ala Phe Thr Leu Lys Ala Thr Val Leu Asn 805 810 815 Tyr Leu Pro Lys Cys Ile Arg Val Ser Val Gln Leu Glu Ala Ser Pro 820 825 830 Ala Phe Leu Ala Val Pro Val Glu Lys Glu Gln Ala Pro His Cys Ile 835 840 845 Cys Ala Asn Gly Arg Gln Thr Val Ser Trp Ala Val Thr Pro Lys Ser 850 855 860 Leu Gly Asn Val Asn Phe Thr Val Ser Ala Glu Ala Leu Glu Ser Gln 865 870 875 880 Glu Leu Cys Gly Thr Glu Val Pro Ser Val Pro Glu His Gly Arg Lys 885 890 895 Asp Thr Val Ile Lys Pro Leu Leu Val Glu Pro Glu Gly Leu Glu Lys 900 905 910 Glu Thr Thr Phe Asn Ser Leu Leu Cys Pro Ser Gly Gly Glu Val Ser 915 920 925 Glu Glu Leu Ser Leu Lys Leu Pro Pro Asn Val Val Glu Glu Ser Ala 930 935 940 Arg Ala Ser Val Ser Val Leu Gly Asp Ile Leu Gly Ser Ala Met Gln 945 950 955 960 Asn Thr Gln Asn Leu Leu Gln Met Pro Tyr Gly Cys Gly Glu Gln Asn 965 970 975 Met Val Leu Phe Ala Pro Asn Ile Tyr Val Leu Asp Tyr Leu Asn Glu 980 985 990 Thr Gln Gln Leu Thr Pro Glu Val Lys Ser Lys Ala Ile Gly Tyr Leu 995 1000 1005 Asn Thr Gly Tyr Gln Arg Gln Leu Asn Tyr Lys His Tyr Asp Gly Ser 1010 1015 1020 Tyr Ser Thr Phe Gly Glu Arg Tyr Gly Arg Asn Gln Gly Asn Thr Trp 1025 1030 1035 1040 Leu Thr Ala Phe Val Leu Lys Thr Phe Ala Gln Ala Arg Ala Tyr Ile 1045 1050 1055 Phe Ile Asp Glu Ala His Ile Thr Gln Ala Leu Ile Trp Leu Ser Gln 1060 1065 1070 Arg Gln Lys Asp Asn Gly Cys Phe Arg Ser Ser Gly Ser Leu Leu Asn 1075 1080 1085 Asn Ala Ile Lys Gly Gly Val Glu Asp Glu Val Thr Leu Ser Ala Tyr 1090 1095 1100 Ile Thr Ile Ala Leu Leu Glu Ile Pro Leu Thr Val Thr His Pro Val 1105 1110 1115 1120 Val Arg Asn Ala Leu Phe Cys Leu Glu Ser Ala Trp Lys Thr Ala Gln 1125 1130 1135 Glu Gly Asp His Gly Ser His Val Tyr Thr Lys Ala Leu Leu Ala Tyr 1140 1145 1150 Ala Phe Ala Leu Ala Gly Asn Gln Asp Lys Arg Lys Glu Val Leu Lys 1155 1160 1165 Ser Leu Asn Glu Glu Ala Val Lys Lys Asp Asn Ser Val His Trp Glu 1170 1175 1180 Arg Pro Gln Lys Pro Lys Ala Pro Val Gly His Phe Tyr Glu Pro Gln 1185 1190 1195 1200 Ala Pro Ser Ala Glu Val Glu Met Thr Ser Tyr Val Leu Leu Ala Tyr 1205 1210 1215 Leu Thr Ala Gln Pro Ala Pro Thr Ser Glu Asp Leu Thr Ser Ala Thr 1220 1225 1230 Asn Ile Val Lys Trp Ile Thr Lys Gln Gln Asn Ala Gln Gly Gly Phe 1235 1240 1245 Ser Ser Thr Gln Asp Thr Val Val Ala Leu His Ala Leu Ser Lys Tyr 1250 1255 1260 Gly Ala Ala Thr Phe Thr Arg Thr Gly Lys Ala Ala Gln Val Thr Ile 1265 1270 1275 1280 Gln Ser Ser Gly Thr Phe Ser Ser Lys Phe Gln Val Asp Asn Asn Asn 1285 1290 1295 Arg Leu Leu Leu Gln Gln Val Ser Leu Pro Glu Leu Pro Gly Glu Tyr 1300 1305 1310 Ser Met Lys Val Thr Gly Glu Gly Cys Val Tyr Leu Gln Thr Ser Leu 1315 1320 1325 Lys Tyr Asn Ile Leu Pro Glu Lys Glu Glu Phe Pro Phe Ala Leu Gly 1330 1335 1340 Val Gln Thr Leu Pro Gln Thr Cys Asp Glu Pro Lys Ala His Thr Ser 1345 1350 1355 1360 Phe Gln Ile Ser Leu Ser Val Ser Tyr Thr Gly Ser Arg Ser Ala Ser 1365 1370 1375 Asn Met Ala Ile Val Asp Val Lys Met Val Ser Gly Phe Ile Pro Leu 1380 1385 1390 Lys Pro Thr Val Lys Met Leu Glu Arg Ser Asn His Val Ser Arg Thr 1395 1400 1405 Glu Val Ser Ser Asn His Val Leu Ile Tyr Leu Asp Lys Val Ser Asn 1410 1415 1420 Gln Thr Leu Ser Leu Phe Phe Thr Val Leu Gln Asp Val Pro Val Arg 1425 1430 1435 1440 Asp Leu Lys Pro Ala Ile Val Lys Val Tyr Asp Tyr Tyr Glu Thr Asp 1445 1450 1455 Glu Phe Ala Ile Ala Glu Tyr Asn Ala Pro Cys Ser Lys Asp Leu Gly 1460 1465 1470 Asn Ala <210> 491 <211> 439 <212> PRT <213> Spodoptera litura nucleopolyhedrovirus <400> 491 Met Cys Val Leu Ile Pro Thr Phe Asp Ala Ser Ala Thr Thr Ile Val 1 5 10 15 Asp Cys Ala Asn Leu Ser Asp Ser Ser Leu Arg Asp Leu Ile Tyr Val 20 25 30 Asn Asn Val Ala Val Ser Lys Thr Gly Asn Tyr Ile Asn Arg Ser Val 35 40 45 Ile Met Ala Leu Asn Ile Ser Gly Pro Val Val Ser Val Asn Arg Val 50 55 60 Ser Met His Ile Val His Met Tyr Arg Ser His Ile Asp Arg Ile Phe 65 70 75 80 Asp Arg Phe Asn Arg Leu Thr Tyr Ser Ala Thr Val Thr Asp Gly Gly 85 90 95 Asp Ile Asp Arg Val Leu Lys Ser Asp Asp Tyr Thr Val Val Cys Met 100 105 110 Ser Arg Ser Glu Leu Leu Asp Asn Tyr Lys Lys Cys Leu Ile Asn Glu 115 120 125 Met Gly Ala Thr Gln Asp Asp Val Glu Lys Phe Arg Lys Tyr Cys Leu 130 135 140 Lys Pro Leu Val Glu Thr Glu Asn Asp Gly Gly Val Glu Asp Arg Lys 145 150 155 160 Lys Pro Tyr Val Val Ile Cys Ser Leu Lys Pro Lys Leu Leu Asn Lys 165 170 175 Asn Lys Thr Leu Cys Phe Thr Tyr Lys Pro Gln Thr Gly Gln Val Ile 180 185 190 Val Pro Leu Met His Glu Ile Asn Glu Asn Gly Ser Asp Val Tyr Ser 195 200 205 Tyr Glu Val Met Ala Met Ile Lys Asp Val Arg Leu Ser Asn Lys Pro 210 215 220 Leu Ser Met Leu Glu Arg Leu Lys Arg Ser Met Asp Gln Ile Val Leu 225 230 235 240 Asn His Asn Glu Asn Lys Tyr Met Met Thr Asn Gln Leu Glu Ser Leu 245 250 255 Lys Tyr Tyr Leu Lys Ser Ile Asn Ser Asn Glu Asp Asp Asp Leu Asn 260 265 270 Lys Leu Met Asn Val Leu Asn Asn Leu Ile Asp Gln Leu Glu Lys Val 275 280 285 Leu His Lys Lys Ser Ile Cys Asp Phe Ser Asp Asp Asp Glu Asp Asp 290 295 300 Asp Gly Leu Ile Asp Met Lys Tyr Tyr Asn Ser Ile Ile Glu Asp Asn 305 310 315 320 Met Arg Ile Leu Leu Met Lys Ile Gln Gln Tyr Ile Asp Asp Arg His 325 330 335 Met Phe Leu Ser Pro Pro Leu Ser Val Glu Lys Ser Thr Lys Ile Arg 340 345 350 Leu Phe Glu Asn Val Met Ser Phe Met Lys Arg Phe Asn Leu Gly Glu 355 360 365 Leu Tyr Ser Tyr Leu Lys Lys Ile Ile Asp Trp Lys Thr His Glu Asn 370 375 380 Asn Gln Lys Leu Ala Trp Pro Glu Ile Val Asp Asp Lys Tyr Ala Phe 385 390 395 400 Leu Lys Tyr Asp Tyr Phe Gly Thr Pro His Gly Phe Val Tyr Asp Gln 405 410 415 Lys Asp Arg Thr Met Tyr Val Lys Leu His Cys Gly Ile Ala Ala Asn 420 425 430 Arg Asn Ile Tyr Ile Asp Ile 435 <210> 492 <211> 341 <212> PRT <213> Cowpox virus <400> 492 Met Asp Ile Phe Arg Glu Ile Ala Ser Ser Met Lys Gly Glu Asn Val 1 5 10 15 Phe Ile Ser Pro Pro Ser Ile Ser Ser Val Leu Thr Ile Leu Tyr Tyr 20 25 30 Gly Ala Asn Gly Ser Thr Ala Glu Gln Leu Ser Lys Tyr Val Glu Lys 35 40 45 Glu Ala Asp Lys Asn Lys Asp Asp Ile Ser Phe Lys Ser Met Asn Lys 50 55 60 Val Tyr Gly Arg Tyr Ser Ala Val Phe Lys Asp Ser Phe Leu Arg Lys 65 70 75 80 Ile Gly Asp Asn Phe Gln Thr Val Asp Phe Thr Asp Cys Arg Thr Val 85 90 95 Asp Ala Ile Asn Lys Cys Val Asp Ile Phe Thr Glu Gly Lys Ile Asn 100 105 110 Pro Leu Leu Asp Glu Pro Leu Ser Pro Asp Thr Cys Leu Leu Ala Ile 115 120 125 Ser Ala Val Tyr Phe Lys Ala Lys Trp Leu Met Pro Phe Glu Lys Glu 130 135 140 Phe Thr Ser Asp Tyr Pro Phe Tyr Val Ser Pro Thr Glu Met Val Asp 145 150 155 160 Val Ser Met Met Ser Met Tyr Gly Glu Ala Phe Asn His Ala Ser Val 165 170 175 Lys Glu Ser Phe Gly Asn Phe Ser Ile Ile Glu Leu Pro Tyr Val Gly 180 185 190 Asp Thr Ser Met Val Val Ile Leu Pro Asp Asn Ile Asp Gly Leu Glu 195 200 205 Ser Ile Glu Gln Asn Leu Thr Asp Thr Asn Phe Lys Lys Trp Cys Asp 210 215 220 Ser Met Asp Ala Met Phe Ile Asp Val His Ile Pro Lys Phe Lys Val 225 230 235 240 Thr Gly Ser Tyr Asn Leu Val Asp Ala Leu Val Lys Leu Gly Leu Thr 245 250 255 Glu Val Phe Gly Ser Thr Gly Asp Tyr Ser Asn Met Cys Asn Ser Asp 260 265 270 Val Ser Val Asp Ala Met Ile His Lys Thr Tyr Ile Asp Val Asn Glu 275 280 285 Glu Tyr Thr Glu Ala Ala Ala Ala Thr Cys Ala Leu Val Ala Asp Cys 290 295 300 Ala Ser Thr Val Thr Asn Glu Phe Cys Ala Asp His Pro Phe Ile Tyr 305 310 315 320 Val Ile Arg His Val Asp Gly Lys Ile Leu Phe Val Gly Arg Tyr Cys 325 330 335 Ser Pro Thr Thr Asn 340 <210> 493 <211> 432 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> antithrombin III mature <400> 493 His Gly Ser Pro Val Asp Ile Cys Thr Ala Lys Pro Arg Asp Ile Pro 1 5 10 15 Met Asn Pro Met Cys Ile Tyr Arg Ser Pro Glu Lys Lys Ala Thr Glu 20 25 30 Asp Glu Gly Ser Glu Gln Lys Ile Pro Glu Ala Thr Asn Arg Arg Val 35 40 45 Trp Glu Leu Ser Lys Ala Asn Ser Arg Phe Ala Thr Thr Phe Tyr Gln 50 55 60 His Leu Ala Asp Ser Lys Asn Asp Asn Asp Asn Ile Phe Leu Ser Pro 65 70 75 80 Leu Ser Ile Ser Thr Ala Phe Ala Met Thr Lys Leu Gly Ala Cys Asn 85 90 95 Asp Thr Leu Gln Gln Leu Met Glu Val Phe Lys Phe Asp Thr Ile Ser 100 105 110 Glu Lys Thr Ser Asp Gln Ile His Phe Phe Phe Ala Lys Leu Asn Cys 115 120 125 Arg Leu Tyr Arg Lys Ala Asn Lys Ser Ser Lys Leu Val Ser Ala Asn 130 135 140 Arg Leu Phe Gly Asp Lys Ser Leu Thr Phe Asn Glu Thr Tyr Gln Asp 145 150 155 160 Ile Ser Glu Leu Val Tyr Gly Ala Lys Leu Gln Pro Leu Asp Phe Lys 165 170 175 Glu Asn Ala Glu Gln Ser Arg Ala Ala Ile Asn Lys Trp Val Ser Asn 180 185 190 Lys Thr Glu Gly Arg Ile Thr Asp Val Ile Pro Ser Glu Ala Ile Asn 195 200 205 Glu Leu Thr Val Leu Val Leu Val Asn Thr Ile Tyr Phe Lys Gly Leu 210 215 220 Trp Lys Ser Lys Phe Ser Pro Glu Asn Thr Arg Lys Glu Leu Phe Tyr 225 230 235 240 Lys Ala Asp Gly Glu Ser Cys Ser Ala Ser Met Met Tyr Gln Glu Gly 245 250 255 Lys Phe Arg Tyr Arg Arg Val Ala Glu Gly Thr Gln Val Leu Glu Leu 260 265 270 Pro Phe Lys Gly Asp Asp Ile Thr Met Val Leu Ile Leu Pro Lys Pro 275 280 285 Glu Lys Ser Leu Ala Lys Val Glu Lys Glu Leu Thr Pro Glu Val Leu 290 295 300 Gln Glu Trp Leu Asp Glu Leu Glu Glu Met Met Leu Val Val His Met 305 310 315 320 Pro Arg Phe Arg Ile Glu Asp Gly Phe Ser Leu Lys Glu Gln Leu Gln 325 330 335 Asp Met Gly Leu Val Asp Leu Phe Ser Pro Glu Lys Ser Lys Leu Pro 340 345 350 Gly Ile Val Ala Glu Gly Arg Asp Asp Leu Tyr Val Ser Asp Ala Phe 355 360 365 His Lys Ala Phe Leu Glu Val Asn Glu Glu Gly Ser Glu Ala Ala Ala 370 375 380 Ser Thr Ala Val Val Ile Ala Gly Arg Ser Leu Asn Pro Asn Arg Val 385 390 395 400 Thr Phe Lys Ala Asn Arg Pro Phe Leu Val Phe Ile Arg Glu Val Pro 405 410 415 Leu Asn Thr Ile Ile Phe Met Gly Arg Val Ala Asn Pro Cys Val Lys 420 425 430 <210> 494 <211> 9765 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pAcGP67b vector <400> 494 aagctttact cgtaaagcga gttgaaggat catatttagt tgcgtttatg agataagatt 60 gaaagcacgt gtaaaatgtt tcccgcgcgt tggcacaact atttacaatg cggccaagtt 120 ataaaagatt ctaatctgat atgttttaaa acacctttgc ggcccgagtt gtttgcgtac 180 gtgactagcg aagaagatgt gtggaccgca gaacagatag taaaacaaaa ccctagtatt 240 ggagcaataa tcgatttaac caacacgtct aaatattatg atggtgtgca ttttttgcgg 300 gcgggcctgt tatacaaaaa aattcaagta cctggccaga ctttgccgcc tgaaagcata 360 gttcaagaat ttattgacac ggtaaaagaa tttacagaaa agtgtcccgg catgttggtg 420 ggcgtgcact gcacacacgg tattaatcgc accggttaca tggtgtgcag atatttaatg 480 cacaccctgg gtattgcgcc gcaggaagcc atagatagat tcgaaaaagc cagaggtcac 540 aaaattgaaa gacaaaatta cgttcaagat ttattaattt aattaatatt atttgcattc 600 tttaacaaat actttatcct attttcaaat tgttgcgctt cttccagcga accaaaacta 660 tgcttcgctt gctccgttta gcttgtagcc gatcagtggc gttgttccaa tcgacggtag 720 gattaggccg gatattctcc accacaatgt tggcaacgtt gatgttacgt ttatgctttt 780 ggttttccac gtacgtcttt tggccggtaa tagccgtaaa cgtagtgccg tcgcgcgtca 840 cgcacaacac cggatgtttg cgcttgtccg cggggtattg aaccgcgcga tccgacaaat 900 ccaccacttt ggcaactaaa tcggtgacct gcgcgtcttt tttctgcatt atttcgtctt 960 tcttttgcat ggtttcctgg aagccggtgt acatgcggtt tagatcagtc atgacgcgcg 1020 tgacctgcaa atctttggcc tcgatctgct tgtccttgat ggcaacgatg cgttcaataa 1080 actcttgttt tttaacaagt tcctcggttt tttgcgccac caccgcttgc agcgcgtttg 1140 tgtgctcggt gaatgtcgca atcagcttag tcaccaactg tttgctctcc tcctcccgtt 1200 gtttgatcgc gggatcgtac ttgccggtgc agagcacttg aggaattact tcttctaaaa 1260 gccattcttg taattctatg gcgtaaggca atttggactt cataatcagc tgaatcacgc 1320 cggatttagt aatgagcact gtatgcggct gcaaatacag cgggtcgccc cttttcacga 1380 cgctgttaga ggtagggccc ccattttgga tggtctgctc aaataacgat ttgtatttat 1440 tgtctacatg aacacgtata gctttatcac aaactgtata ttttaaactg ttagcgacgt 1500 ccttggccac gaaccggacc tgttggtcgc gctctagcac gtaccgcagg ttgaacgtat 1560 cttctccaaa tttaaattct ccaattttaa cgcgagccat tttgatacac gtgtgtcgat 1620 tttgcaacaa ctattgtttt ttaacgcaaa ctaaacttat tgtggtaagc aataattaaa 1680 tatgggggaa catgcgccgc tacaacactc gtcgttatga acgcagacgg cgccggtctc 1740 ggcgcaagcg gctaaaacgt gttgcgcgtt caacgcggca aacatcgcaa aagccaatag 1800 tacagttttg atttgcatat taacggcgat tttttaaatt atcttattta ataaatagtt 1860 atgacgccta caactccccg cccgcgttga ctcgctgcac ctcgagcagt tcgttgacgc 1920 cttcctccgt gtggccgaac acgtcgagcg ggtggtcgat gaccagcggc gtgccgcacg 1980 cgacgcacaa gtatctgtac accgaatgat cgtcgggcga aggcacgtcg gcctccaagt 2040 ggcaatattg gcaaattcga aaatatatac agttgggttg tttgcgcata tctatcgtgg 2100 cgttgggcat gtacgtccga acgttgattt gcatgcaagc cgaaattaaa tcattgcgat 2160 tagtgcgatt aaaacgttgt acatcctcgc ttttaatcat gccgtcgatt aaatcgcgca 2220 atcgagtcaa gtgatcaaag tgtggaataa tgttttcttt gtattcccga gtcaagcgca 2280 gcgcgtattt taacaaacta gccatcttgt aagttagttt catttaatgc aactttatcc 2340 aataatatat tatgtatcgc acgtcaagaa ttaacaatgc gcccgttgtc gcatctcaac 2400 acgactatga tagagatcaa ataaagcgcg aattaaatag cttgcgacgc aacgtgcacg 2460 atctgtgcac gcgttccggc acgagctttg attgtaataa gtttttacga agcgatgaca 2520 tgacccccgt agtgacaacg atcacgccca aaagaactgc cgactacaaa attaccgagt 2580 atgtcggtga cgttaaaact attaagccat ccaatcgacc gttagtcgaa tcaggaccgc 2640 tggtgcgaga agccgcgaag tatggcgaat gcatcgtata acgtgtggag tccgctcatt 2700 agagcgtcat gtttagacaa gaaagctaca tatttaattg atcccgatga ttttattgat 2760 aaattgaccc taactccata cacggtattc tacaatggcg gggttttggt caaaatttcc 2820 ggactgcgat tgtacatgct gttaacggct ccgcccacta ttaatgaaat taaaaattcc 2880 aattttaaaa aacgcagcaa gagaaacatt tgtatgaaag aatgcgtaga aggaaagaaa 2940 aatgtcgtcg acatgctgaa caacaagatt aatatgcctc cgtgtataaa aaaaatattg 3000 aacgatttga aagaaaacaa tgtaccgcgc ggcggtatgt acaggaagag gtttatacta 3060 aactgttaca ttgcaaacgt ggtttcgtgt gccaagtgtg aaaaccgatg tttaatcaag 3120 gctctgacgc atttctacaa ccacgactcc aagtgtgtgg gtgaagtcat gcatctttta 3180 atcaaatccc aagatgtgta taaaccacca aactgccaaa aaatgaaaac tgtcgacaag 3240 ctctgtccgt ttgctggcaa ctgcaagggt ctcaatccta tttgtaatta ttgaataata 3300 aaacaattat aaatgctaaa tttgtttttt attaacgata caaaccaaac gcaacaagaa 3360 catttgtagt attatctata attgaaaacg cgtagttata atcgctgagg taatatttaa 3420 aatcattttc aaatgattca cagttaattt gcgacaatat aattttattt tcacataaac 3480 tagacgcctt gtcgtcttct tcttcgtatt ccttctcttt ttcatttttc tcctcataaa 3540 aattaacata gttattatcg tatccatata tgtatctatc gtatagagta aattttttgt 3600 tgtcataaat atatatgtct tttttaatgg ggtgtatagt accgctgcgc atagtttttc 3660 tgtaatttac aacagtgcta ttttctggta gttcttcgga gtgtgttgct ttaattatta 3720 aatttatata atcaatgaat ttgggatcgt cggttttgta caatatgttg ccggcatagt 3780 acgcagcttc ttctagttca attacaccat tttttagcag caccggatta acataacttt 3840 ccaaaatgtt gtacgaaccg ttaaacaaaa acagttcacc tcccttttct atactattgt 3900 ctgcgagcag ttgtttgttg ttaaaaataa cagccattgt aatgagacgc acaaactaat 3960 atcacaaact ggaaatgtct atcaatatat agttgctgat atcatggaga taattaaaat 4020 gataaccatc tcgcaaataa ataagtattt tactgttttc gtaacagttt tgtaataaaa 4080 aaacctataa atattccgga ttattcatac cgtcccacca tcgggcgcgg atctatgcta 4140 ctagtaaatc agtcacacca aggcttcaat aaggaacaca caagcaagat ggtaagcgct 4200 attgttttat atgtgctttt ggcggcggcg gcgcattctg cctttgcggc ggatcttgga 4260 tcccgggcca tgggaattcc ggagcggccg ctgcagatct gatcctttcc tgggacccgg 4320 caagaaccaa aaactcactc tcttcaagga aatccgtaat gttaaacccg acacgatgaa 4380 gcttgtcgtt ggatggaaag gaaaagagtt ctacagggaa acttggaccc gcttcatgga 4440 agacagcttc cccattgtta acgaccaaga agtgatggat gttttccttg ttgtcaacat 4500 gcgtcccact agacccaacc gttgttacaa attcctggcc caacacgctc tgcgttgcga 4560 ccccgactat gtacctcatg acgtgattag gatcgtcgag ccttcatggg tgggcagcaa 4620 caacgagtac cgcatcagcc tggctaagaa gggcggcggc tgcccaataa tgaaccttca 4680 ctctgagtac accaactcgt tcgaacagtt catcgatcgt gtcatctggg agaacttcta 4740 caagcccatc gtttacatcg gtaccgactc tgctgaagag gaggaaattc tccttgaagt 4800 ttccctggtg ttcaaagtaa aggagtttgc accagacgca cctctgttca ctggtccggc 4860 gtattaaaac acgatacatt gttattagta catttattaa gcgctagatt ctgtgcgttg 4920 ttgatttaca gacaattgtt gtacgtattt taataattca ttaaatttat aatctttagg 4980 gtggtatgtt agagcgaaaa tcaaatgatt ttcagcgtct ttatatctga atttaaatat 5040 taaatcctca atagatttgt aaaataggtt tcgattagtt tcaaacaagg gttgtttttc 5100 cgaaccgatg gctggactat ctaatggatt ttcgctcaac gccacaaaac ttgccaaatc 5160 ttgtagcagc aatctagctt tgtcgatatt cgtttgtgtt ttgttttgta ataaaggttc 5220 gacgtcgttc aaaatattat gcgcttttgt atttctttca tcactgtcgt tagtgtacaa 5280 ttgactcgac gtaaacacgt taaataaagc ttggacatat ttaacatcgg gcgtgttagc 5340 tttattaggc cgattatcgt cgtcgtccca accctcgtcg ttagaagttg cttccgaaga 5400 cgattttgcc atagccacac gacgcctatt aattgtgtcg gctaacacgt ccgcgatcaa 5460 atttgtagtt gagctttttg gaattatttc tgattgcggg cgtttttggg cgggtttcaa 5520 tctaactgtg cccgatttta attcagacaa cacgttagaa agcgatggtg caggcggtgg 5580 taacatttca gacggcaaat ctactaatgg cggcggtggt ggagctgatg ataaatctac 5640 catcggtgga ggcgcaggcg gggctggcgg cggaggcgga ggcggaggtg gtggcggtga 5700 tgcagacggc ggtttaggct caaatgtctc tttaggcaac acagtcggca cctcaactat 5760 tgtactggtt tcgggcgccg tttttggttt gaccggtctg agacgagtgc gatttttttc 5820 gtttctaata gcttccaaca attgttgtct gtcgtctaaa ggtgcagcgg gttgaggttc 5880 cgtcggcatt ggtggagcgg gcggcaattc agacatcgat ggtggtggtg gtggtggagg 5940 cgctggaatg ttaggcacgg gagaaggtgg tggcggcggt gccgccggta taatttgttc 6000 tggtttagtt tgttcgcgca cgattgtggg caccggcgca ggcgccgctg gctgcacaac 6060 ggaaggtcgt ctgcttcgag gcagcgcttg gggtggtggc aattcaatat tataattgga 6120 atacaaatcg taaaaatctg ctataagcat tgtaatttcg ctatcgttta ccgtgccgat 6180 atttaacaac cgctcaatgt aagcaattgt attgtaaaga gattgtctca agctccgcac 6240 gccgataaca agccttttca tttttactac agcattgtag tggcgagaca cttcgctgtc 6300 gtcgacgtac atgtatgctt tgttgtcaaa aacgtcgttg gcaagcttta aaatatttaa 6360 aagaacatct ctgttcagca ccactgtgtt gtcgtaaatg ttgtttttga taatttgcgc 6420 ttccgcagta tcgacacgtt caaaaaattg atgcgcatca attttgttgt tcctattatt 6480 gaataaataa gattgtacag attcatatct acgattcgtc atggccacca caaatgctac 6540 gctgcaaacg ctggtacaat tttacgaaaa ctgcaaaaac gtcaaaactc ggtataaaat 6600 aatcaacggg cgctttggca aaatatctat tttatcgcac aagcccacta gcaaattgta 6660 tttgcagaaa acaatttcgg cgcacaattt taacgctgac gaaataaaag ttcaccagtt 6720 aatgagcgac cacccaaatt ttataaaaat ctattttaat cacggttcca tcaacaacca 6780 agtgatcgtg atggactaca ttgactgtcc cgatttattt gaaacactac aaattaaagg 6840 cgagctttcg taccaacttg ttagcaatat tattagacag ctgtgtgaag cgctcaacga 6900 tttgcacaag cacaatttca tacacaacga cataaaactc gaaaatgtct tatatttcga 6960 agcacttgat cgcgtgtatg tttgcgatta cggattgtgc aaacacgaaa actcacttag 7020 cgtgcacgac ggcacgttgg agtattttag tccggaaaaa attcgacaca caactatgca 7080 cgtttcgttt gactggtacg cggcgtgtta acatacaagt tgctaaccgg cggttcgtaa 7140 tcatggtcat agctgtttcc tgtgtgaaat tgttatccgc tcacaattcc acacaacata 7200 cgagccggaa gcataaagtg taaagcctgg ggtgcctaat gagtgagcta actcacatta 7260 attgcgttgc gctcactgcc cgctttccag tcgggaaacc tgtcgtgcca gctgcattaa 7320 tgaatcggcc aacgcgcggg gagaggcggt ttgcgtattg ggcgctcttc cgcttcctcg 7380 ctcactgact cgctgcgctc ggtcgttcgg ctgcggcgag cggtatcagc tcactcaaag 7440 gcggtaatac ggttatccac agaatcaggg gataacgcag gaaagaacat gtgagcaaaa 7500 ggccagcaaa aggccaggaa ccgtaaaaag gccgcgttgc tggcgttttt ccataggctc 7560 cgcccccctg acgagcatca caaaaatcga cgctcaagtc agaggtggcg aaacccgaca 7620 ggactataaa gataccaggc gtttccccct ggaagctccc tcgtgcgctc tcctgttccg 7680 accctgccgc ttaccggata cctgtccgcc tttctccctt cgggaagcgt ggcgctttct 7740 catagctcac gctgtaggta tctcagttcg gtgtaggtcg ttcgctccaa gctgggctgt 7800 gtgcacgaac cccccgttca gcccgaccgc tgcgccttat ccggtaacta tcgtcttgag 7860 tccaacccgg taagacacga cttatcgcca ctggcagcag ccactggtaa caggattagc 7920 agagcgaggt atgtaggcgg tgctacagag ttcttgaagt ggtggcctaa ctacggctac 7980 actagaagga cagtatttgg tatctgcgct ctgctgaagc cagttacctt cggaaaaaga 8040 gttggtagct cttgatccgg caaacaaacc accgctggta gcggtggttt ttttgtttgc 8100 aagcagcaga ttacgcgcag aaaaaaagga tctcaagaag atcctttgat cttttctacg 8160 gggtctgacg ctcagtggaa cgaaaactca cgttaaggga ttttggtcat gagattatca 8220 aaaaggatct tcacctagat ccttttaaat taaaaatgaa gttttaaatc aatctaaagt 8280 atatatgagt aaacttggtc tgacagttac caatgcttaa tcagtgaggc acctatctca 8340 gcgatctgtc tatttcgttc atccatagtt gcctgactcc ccgtcgtgta gataactacg 8400 atacgggagg gcttaccatc tggccccagt gctgcaatga taccgcgaga cccacgctca 8460 ccggctccag atttatcagc aataaaccag ccagccggaa gggccgagcg cagaagtggt 8520 cctgcaactt tatccgcctc catccagtct attaattgtt gccgggaagc tagagtaagt 8580 agttcgccag ttaatagttt gcgcaacgtt gttgccattg ctacaggcat cgtggtgtca 8640 cgctcgtcgt ttggtatggc ttcattcagc tccggttccc aacgatcaag gcgagttaca 8700 tgatccccca tgttgtgcaa aaaagcggtt agctccttcg gtcctccgat cgttgtcaga 8760 agtaagttgg ccgcagtgtt atcactcatg gttatggcag cactgcataa ttctcttact 8820 gtcatgccat ccgtaagatg cttttctgtg actggtgagt actcaaccaa gtcattctga 8880 gaatagtgta tgcggcgacc gagttgctct tgcccggcgt caatacggga taataccgcg 8940 ccacatagca gaactttaaa agtgctcatc attggaaaac gttcttcggg gcgaaaactc 9000 tcaaggatct taccgctgtt gagatccagt tcgatgtaac ccactcgtgc acccaactga 9060 tcttcagcat cttttacttt caccagcgtt tctgggtgag caaaaacagg aaggcaaaat 9120 gccgcaaaaa agggaataag ggcgacacgg aaatgttgaa tactcatact cttccttttt 9180 caatattatt gaagcattta tcagggttat tgtctcatga gcggatacat atttgaatgt 9240 atttagaaaa ataaacaaat aggggttccg cgcacatttc cccgaaaagt gccacctgac 9300 gtctaagaaa ccattattat catgacatta acctataaaa ataggcgtat cacgaggccc 9360 tttcgtctcg cgcgtttcgg tgatgacggt gaaaacctct gacacatgca gctcccggag 9420 acggtcacag cttgtctgta agcggatgcc gggagcagac aagcccgtca gggcgcgtca 9480 gcgggtgttg gcgggtgtcg gggctggctt aactatgcgg catcagagca gattgtactg 9540 agagtgcacc atatgcggtg tgaaataccg cacagatgcg taaggagaaa ataccgcatc 9600 aggcgccatt cgccattcag gctgcgcaac tgttgggaag ggcgatcggt gcgggcctct 9660 tcgctattac gccagctggc gaaaggggga tgtgctgcaa ggcgattaag ttgggtaacg 9720 ccagggtttt cccagtcacg acgttgtaaa acgacggcca gtgcc 9765 <210> 495 <211> 8 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> FLAG tag <400> 495 Asp Tyr Lys Asp Asp Asp Asp Lys 1 5 <210> 496 <211> 6 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> 6xHis tag <400> 496 His His His His His His 1 5 <210> 497 <211> 432 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant AT3 sequence <223> AT3/RRVRKE <400> 497 His Gly Ser Pro Val Asp Ile Cys Thr Ala Lys Pro Arg Asp Ile Pro 1 5 10 15 Met Asn Pro Met Cys Ile Tyr Arg Ser Pro Glu Lys Lys Ala Thr Glu 20 25 30 Asp Glu Gly Ser Glu Gln Lys Ile Pro Glu Ala Thr Asn Arg Arg Val 35 40 45 Trp Glu Leu Ser Lys Ala Asn Ser Arg Phe Ala Thr Thr Phe Tyr Gln 50 55 60 His Leu Ala Asp Ser Lys Asn Asp Asn Asp Asn Ile Phe Leu Ser Pro 65 70 75 80 Leu Ser Ile Ser Thr Ala Phe Ala Met Thr Lys Leu Gly Ala Cys Asn 85 90 95 Asp Thr Leu Gln Gln Leu Met Glu Val Phe Lys Phe Asp Thr Ile Ser 100 105 110 Glu Lys Thr Ser Asp Gln Ile His Phe Phe Phe Ala Lys Leu Asn Cys 115 120 125 Arg Leu Tyr Arg Lys Ala Asn Lys Ser Ser Lys Leu Val Ser Ala Asn 130 135 140 Arg Leu Phe Gly Asp Lys Ser Leu Thr Phe Asn Glu Thr Tyr Gln Asp 145 150 155 160 Ile Ser Glu Leu Val Tyr Gly Ala Lys Leu Gln Pro Leu Asp Phe Lys 165 170 175 Glu Asn Ala Glu Gln Ser Arg Ala Ala Ile Asn Lys Trp Val Ser Asn 180 185 190 Lys Thr Glu Gly Arg Ile Thr Asp Val Ile Pro Ser Glu Ala Ile Asn 195 200 205 Glu Leu Thr Val Leu Val Leu Val Asn Thr Ile Tyr Phe Lys Gly Leu 210 215 220 Trp Lys Ser Lys Phe Ser Pro Glu Asn Thr Arg Lys Glu Leu Phe Tyr 225 230 235 240 Lys Ala Asp Gly Glu Ser Cys Ser Ala Ser Met Met Tyr Gln Glu Gly 245 250 255 Lys Phe Arg Tyr Arg Arg Val Ala Glu Gly Thr Gln Val Leu Glu Leu 260 265 270 Pro Phe Lys Gly Asp Asp Ile Thr Met Val Leu Ile Leu Pro Lys Pro 275 280 285 Glu Lys Ser Leu Ala Lys Val Glu Lys Glu Leu Thr Pro Glu Val Leu 290 295 300 Gln Glu Trp Leu Asp Glu Leu Glu Glu Met Met Leu Val Val His Met 305 310 315 320 Pro Arg Phe Arg Ile Glu Asp Gly Phe Ser Leu Lys Glu Gln Leu Gln 325 330 335 Asp Met Gly Leu Val Asp Leu Phe Ser Pro Glu Lys Ser Lys Leu Pro 340 345 350 Gly Ile Val Ala Glu Gly Arg Asp Asp Leu Tyr Val Ser Asp Ala Phe 355 360 365 His Lys Ala Phe Leu Glu Val Asn Glu Glu Gly Ser Glu Ala Ala Ala 370 375 380 Ser Thr Ala Val Val Arg Arg Val Arg Lys Glu Asn Pro Asn Arg Val 385 390 395 400 Thr Phe Lys Ala Asn Arg Pro Phe Leu Val Phe Ile Arg Glu Val Pro 405 410 415 Leu Asn Thr Ile Ile Phe Met Gly Arg Val Ala Asn Pro Cys Val Lys 420 425 430 <210> 498 <211> 6 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> replacement cleavage site RRVRKE <400> 498 Arg Arg Val Arg Lys Glu 1 5 <210> 499 <211> 432 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant AT3 sequence <223> AT3/SLGRKI <400> 499 His Gly Ser Pro Val Asp Ile Cys Thr Ala Lys Pro Arg Asp Ile Pro 1 5 10 15 Met Asn Pro Met Cys Ile Tyr Arg Ser Pro Glu Lys Lys Ala Thr Glu 20 25 30 Asp Glu Gly Ser Glu Gln Lys Ile Pro Glu Ala Thr Asn Arg Arg Val 35 40 45 Trp Glu Leu Ser Lys Ala Asn Ser Arg Phe Ala Thr Thr Phe Tyr Gln 50 55 60 His Leu Ala Asp Ser Lys Asn Asp Asn Asp Asn Ile Phe Leu Ser Pro 65 70 75 80 Leu Ser Ile Ser Thr Ala Phe Ala Met Thr Lys Leu Gly Ala Cys Asn 85 90 95 Asp Thr Leu Gln Gln Leu Met Glu Val Phe Lys Phe Asp Thr Ile Ser 100 105 110 Glu Lys Thr Ser Asp Gln Ile His Phe Phe Phe Ala Lys Leu Asn Cys 115 120 125 Arg Leu Tyr Arg Lys Ala Asn Lys Ser Ser Lys Leu Val Ser Ala Asn 130 135 140 Arg Leu Phe Gly Asp Lys Ser Leu Thr Phe Asn Glu Thr Tyr Gln Asp 145 150 155 160 Ile Ser Glu Leu Val Tyr Gly Ala Lys Leu Gln Pro Leu Asp Phe Lys 165 170 175 Glu Asn Ala Glu Gln Ser Arg Ala Ala Ile Asn Lys Trp Val Ser Asn 180 185 190 Lys Thr Glu Gly Arg Ile Thr Asp Val Ile Pro Ser Glu Ala Ile Asn 195 200 205 Glu Leu Thr Val Leu Val Leu Val Asn Thr Ile Tyr Phe Lys Gly Leu 210 215 220 Trp Lys Ser Lys Phe Ser Pro Glu Asn Thr Arg Lys Glu Leu Phe Tyr 225 230 235 240 Lys Ala Asp Gly Glu Ser Cys Ser Ala Ser Met Met Tyr Gln Glu Gly 245 250 255 Lys Phe Arg Tyr Arg Arg Val Ala Glu Gly Thr Gln Val Leu Glu Leu 260 265 270 Pro Phe Lys Gly Asp Asp Ile Thr Met Val Leu Ile Leu Pro Lys Pro 275 280 285 Glu Lys Ser Leu Ala Lys Val Glu Lys Glu Leu Thr Pro Glu Val Leu 290 295 300 Gln Glu Trp Leu Asp Glu Leu Glu Glu Met Met Leu Val Val His Met 305 310 315 320 Pro Arg Phe Arg Ile Glu Asp Gly Phe Ser Leu Lys Glu Gln Leu Gln 325 330 335 Asp Met Gly Leu Val Asp Leu Phe Ser Pro Glu Lys Ser Lys Leu Pro 340 345 350 Gly Ile Val Ala Glu Gly Arg Asp Asp Leu Tyr Val Ser Asp Ala Phe 355 360 365 His Lys Ala Phe Leu Glu Val Asn Glu Glu Gly Ser Glu Ala Ala Ala 370 375 380 Ser Thr Ala Val Val Ser Leu Gly Arg Lys Ile Asn Pro Asn Arg Val 385 390 395 400 Thr Phe Lys Ala Asn Arg Pro Phe Leu Val Phe Ile Arg Glu Val Pro 405 410 415 Leu Asn Thr Ile Ile Phe Met Gly Arg Val Ala Asn Pro Cys Val Lys 420 425 430 <210> 500 <211> 432 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant AT3 sequence <223> SKGRSL <400> 500 His Gly Ser Pro Val Asp Ile Cys Thr Ala Lys Pro Arg Asp Ile Pro 1 5 10 15 Met Asn Pro Met Cys Ile Tyr Arg Ser Pro Glu Lys Lys Ala Thr Glu 20 25 30 Asp Glu Gly Ser Glu Gln Lys Ile Pro Glu Ala Thr Asn Arg Arg Val 35 40 45 Trp Glu Leu Ser Lys Ala Asn Ser Arg Phe Ala Thr Thr Phe Tyr Gln 50 55 60 His Leu Ala Asp Ser Lys Asn Asp Asn Asp Asn Ile Phe Leu Ser Pro 65 70 75 80 Leu Ser Ile Ser Thr Ala Phe Ala Met Thr Lys Leu Gly Ala Cys Asn 85 90 95 Asp Thr Leu Gln Gln Leu Met Glu Val Phe Lys Phe Asp Thr Ile Ser 100 105 110 Glu Lys Thr Ser Asp Gln Ile His Phe Phe Phe Ala Lys Leu Asn Cys 115 120 125 Arg Leu Tyr Arg Lys Ala Asn Lys Ser Ser Lys Leu Val Ser Ala Asn 130 135 140 Arg Leu Phe Gly Asp Lys Ser Leu Thr Phe Asn Glu Thr Tyr Gln Asp 145 150 155 160 Ile Ser Glu Leu Val Tyr Gly Ala Lys Leu Gln Pro Leu Asp Phe Lys 165 170 175 Glu Asn Ala Glu Gln Ser Arg Ala Ala Ile Asn Lys Trp Val Ser Asn 180 185 190 Lys Thr Glu Gly Arg Ile Thr Asp Val Ile Pro Ser Glu Ala Ile Asn 195 200 205 Glu Leu Thr Val Leu Val Leu Val Asn Thr Ile Tyr Phe Lys Gly Leu 210 215 220 Trp Lys Ser Lys Phe Ser Pro Glu Asn Thr Arg Lys Glu Leu Phe Tyr 225 230 235 240 Lys Ala Asp Gly Glu Ser Cys Ser Ala Ser Met Met Tyr Gln Glu Gly 245 250 255 Lys Phe Arg Tyr Arg Arg Val Ala Glu Gly Thr Gln Val Leu Glu Leu 260 265 270 Pro Phe Lys Gly Asp Asp Ile Thr Met Val Leu Ile Leu Pro Lys Pro 275 280 285 Glu Lys Ser Leu Ala Lys Val Glu Lys Glu Leu Thr Pro Glu Val Leu 290 295 300 Gln Glu Trp Leu Asp Glu Leu Glu Glu Met Met Leu Val Val His Met 305 310 315 320 Pro Arg Phe Arg Ile Glu Asp Gly Phe Ser Leu Lys Glu Gln Leu Gln 325 330 335 Asp Met Gly Leu Val Asp Leu Phe Ser Pro Glu Lys Ser Lys Leu Pro 340 345 350 Gly Ile Val Ala Glu Gly Arg Asp Asp Leu Tyr Val Ser Asp Ala Phe 355 360 365 His Lys Ala Phe Leu Glu Val Asn Glu Glu Gly Ser Glu Ala Ala Ala 370 375 380 Ser Thr Ala Val Val Ser Lys Gly Arg Ser Leu Asn Pro Asn Arg Val 385 390 395 400 Thr Phe Lys Ala Asn Arg Pro Phe Leu Val Phe Ile Arg Glu Val Pro 405 410 415 Leu Asn Thr Ile Ile Phe Met Gly Arg Val Ala Asn Pro Cys Val Lys 420 425 430 <210> 501 <211> 6 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> replacement cleavage site SKGRSL <400> 501 Ser Lys Gly Arg Ser Leu 1 5 <210> 502 <211> 432 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant AT3 sequence <223> AT3/PRFKII <400> 502 His Gly Ser Pro Val Asp Ile Cys Thr Ala Lys Pro Arg Asp Ile Pro 1 5 10 15 Met Asn Pro Met Cys Ile Tyr Arg Ser Pro Glu Lys Lys Ala Thr Glu 20 25 30 Asp Glu Gly Ser Glu Gln Lys Ile Pro Glu Ala Thr Asn Arg Arg Val 35 40 45 Trp Glu Leu Ser Lys Ala Asn Ser Arg Phe Ala Thr Thr Phe Tyr Gln 50 55 60 His Leu Ala Asp Ser Lys Asn Asp Asn Asp Asn Ile Phe Leu Ser Pro 65 70 75 80 Leu Ser Ile Ser Thr Ala Phe Ala Met Thr Lys Leu Gly Ala Cys Asn 85 90 95 Asp Thr Leu Gln Gln Leu Met Glu Val Phe Lys Phe Asp Thr Ile Ser 100 105 110 Glu Lys Thr Ser Asp Gln Ile His Phe Phe Phe Ala Lys Leu Asn Cys 115 120 125 Arg Leu Tyr Arg Lys Ala Asn Lys Ser Ser Lys Leu Val Ser Ala Asn 130 135 140 Arg Leu Phe Gly Asp Lys Ser Leu Thr Phe Asn Glu Thr Tyr Gln Asp 145 150 155 160 Ile Ser Glu Leu Val Tyr Gly Ala Lys Leu Gln Pro Leu Asp Phe Lys 165 170 175 Glu Asn Ala Glu Gln Ser Arg Ala Ala Ile Asn Lys Trp Val Ser Asn 180 185 190 Lys Thr Glu Gly Arg Ile Thr Asp Val Ile Pro Ser Glu Ala Ile Asn 195 200 205 Glu Leu Thr Val Leu Val Leu Val Asn Thr Ile Tyr Phe Lys Gly Leu 210 215 220 Trp Lys Ser Lys Phe Ser Pro Glu Asn Thr Arg Lys Glu Leu Phe Tyr 225 230 235 240 Lys Ala Asp Gly Glu Ser Cys Ser Ala Ser Met Met Tyr Gln Glu Gly 245 250 255 Lys Phe Arg Tyr Arg Arg Val Ala Glu Gly Thr Gln Val Leu Glu Leu 260 265 270 Pro Phe Lys Gly Asp Asp Ile Thr Met Val Leu Ile Leu Pro Lys Pro 275 280 285 Glu Lys Ser Leu Ala Lys Val Glu Lys Glu Leu Thr Pro Glu Val Leu 290 295 300 Gln Glu Trp Leu Asp Glu Leu Glu Glu Met Met Leu Val Val His Met 305 310 315 320 Pro Arg Phe Arg Ile Glu Asp Gly Phe Ser Leu Lys Glu Gln Leu Gln 325 330 335 Asp Met Gly Leu Val Asp Leu Phe Ser Pro Glu Lys Ser Lys Leu Pro 340 345 350 Gly Ile Val Ala Glu Gly Arg Asp Asp Leu Tyr Val Ser Asp Ala Phe 355 360 365 His Lys Ala Phe Leu Glu Val Asn Glu Glu Gly Ser Glu Ala Ala Ala 370 375 380 Ser Thr Ala Val Val Pro Arg Phe Lys Ile Ile Asn Pro Asn Arg Val 385 390 395 400 Thr Phe Lys Ala Asn Arg Pro Phe Leu Val Phe Ile Arg Glu Val Pro 405 410 415 Leu Asn Thr Ile Ile Phe Met Gly Arg Val Ala Asn Pro Cys Val Lys 420 425 430 <210> 503 <211> 6 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> replacement cleavage site PRFKII <400> 503 Pro Arg Phe Lys Ile Ile 1 5 <210> 504 <211> 723 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> MT-SP1 protease domain <400> 504 gttgttgggg gcacggatgc ggatgagggc gagtggccct ggcaggtaag cctgcatgct 60 ctgggccagg gccacatctg cggtgcttcc ctcatctctc ccaactggct ggtctctgcc 120 gcacactgct acatcgatga cagaggattc aggtactcag accccacgca gtggacggcc 180 ttcctgggct tgcacgacca gagccagcgc agcgcccctg gggtgcagga gcgcaggctc 240 aagcgcatca tctcccaccc cttcttcaat gacttcacct tcgactatga catcgcgctg 300 ctggagctgg agaaaccggc agagtacagc tccatggtgc ggcccatctg cctgccggac 360 gcctcccatg tcttccctgc cggcaaggcc atctgggtca cgggctgggg acacacccag 420 tatggaggca ctggcgcgct gatcctgcaa aagggtgaga tccgcgtcat caaccagacc 480 acctgcgaga acctcctgcc gcagcagatc acgccgcgca tgatgtgcgt gggcttcctc 540 agcggcggcg tggactcctg ccagggtgat tccgggggac ccctgtccag cgtggaggcg 600 gatgggcgga tcttccaggc cggtgtggtg agctggggag acggctgcgc tcagaggaac 660 aagccaggcg tgtacacaag gctccctctg tttcgggact ggatcaaaga gaacactggg 720 gta 723 <210> 505 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> MT-SP1 protease domain <400> 505 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 506 <211> 444 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> MT-SP1 protease domain fusion <223> STII/MT-SP1/GeneII <400> 506 Met Lys Lys Asn Ile Ala Phe Leu Leu Ala Ser Met Phe Val Phe Ser 1 5 10 15 Ile Ala Thr Asn Ala Tyr Ala Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu 20 25 30 Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His 35 40 45 Ile Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala 50 55 60 His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln 65 70 75 80 Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro 85 90 95 Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe 100 105 110 Asn Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys 115 120 125 Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala 130 135 140 Ser His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly 145 150 155 160 His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu 165 170 175 Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln 180 185 190 Ile Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp 195 200 205 Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp 210 215 220 Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala 225 230 235 240 Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp 245 250 255 Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val Ser Gly Ser Ser Gly Gly Gly Ser 260 265 270 Glu Gly Gly Gly Ser Glu Gly Gly Gly Ser Glu Gly Gly Gly Ser Gly 275 280 285 Gly Gly Ser Gly Ser Gly Asp Phe Asp Tyr Glu Lys Met Ala Asn Ala 290 295 300 Asn Lys Gly Ala Met Thr Glu Asn Ala Asp Glu Asn Ala Leu Gln Ser 305 310 315 320 Asp Ala Lys Gly Lys Leu Asp Ser Val Ala Thr Asp Tyr Gly Ala Ala 325 330 335 Ile Asp Gly Phe Ile Gly Asp Val Ser Gly Leu Ala Asn Gly Asn Gly 340 345 350 Ala Thr Gly Asp Phe Ala Gly Ser Asn Ser Gln Met Ala Gln Val Gly 355 360 365 Asp Gly Asp Asn Ser Pro Leu Met Asn Asn Phe Arg Gln Tyr Leu Pro 370 375 380 Ser Leu Pro Gln Ser Val Glu Cys Arg Pro Phe Val Phe Ser Ala Gly 385 390 395 400 Lys Pro Tyr Glu Phe Ser Ile Asp Cys Asp Lys Ile Asn Leu Phe Arg 405 410 415 Gly Val Phe Ala Phe Leu Leu Tyr Val Ala Thr Phe Met Tyr Val Phe 420 425 430 Ser Thr Phe Ala Asn Ile Leu Arg Asn Lys Glu Ser 435 440 <210> 507 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutated MT-SP1 protease domain <223> CB496 <400> 507 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 508 <211> 44 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MT-SP1 forward primer <400> 508 gcgcagatat cgtaccgcat atgaaaaaga atatcgcatt tctt 44 <210> 509 <211> 43 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MT-SP1 reverse primer <400> 509 gtgcatgctg actgactgag ctcccgctta ccccagtgtt ctc 43 <210> 510 <211> 1335 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> MT-SP1 protease domain fusion <223> STII/MT-SP1/GeneIII <400> 510 atgaaaaaga atatcgcatt tcttcttgca tctatgttcg ttttttctat tgctacaaat 60 gcctatgcag ttgttggggg cacggatgcg gatgagggcg agtggccctg gcaggtaagc 120 ctgcatgctc tgggccaggg ccacatctgc ggtgcttccc tcatctctcc caactggctg 180 gtctctgccg cacactgcta catcgatgac agaggattca ggtactcaga ccccacgcag 240 tggacggcct tcctgggctt gcacgaccag agccagcgca gcgcccctgg ggtgcaggag 300 cgcaggctca agcgcatcat ctcccacccc ttcttcaatg acttcacctt cgactatgac 360 atcgcgctgc tggagctgga gaaaccggca gagtacagct ccatggtgcg gcccatctgc 420 ctgccggacg cctcccatgt cttccctgcc ggcaaggcca tctgggtcac gggctgggga 480 cacacccagt atggaggcac tggcgcgctg atcctgcaaa agggtgagat ccgcgtcatc 540 aaccagacca cctgcgagaa cctcctgccg cagcagatca cgccgcgcat gatgtgcgtg 600 ggcttcctca gcggcggcgt ggactcctgc cagggtgatt ccgggggacc cctgtccagc 660 gtggaggcgg atgggcggat cttccaggcc ggtgtggtga gctggggaga cggctgcgct 720 cagaggaaca agccaggcgt gtacacaagg ctccctctgt ttcgggactg gatcaaagag 780 aacactgggg taagcgggag ctccggtggt ggctctgagg gtggcggttc tgagggtggc 840 ggctctgagg gaggcggttc cggtggtggc tctggttccg gtgattttga ttatgaaaag 900 atggcaaacg ctaataaggg ggctatgacc gaaaatgccg atgaaaacgc gctacagtct 960 gacgctaaag gcaaacttga ttctgtcgct actgattacg gtgctgctat cgatggtttc 1020 attggtgacg tttccggcct tgctaatggt aatggtgcta ctggtgattt tgctggctct 1080 aattcccaaa tggctcaagt cggtgacggt gataattcac ctttaatgaa taatttccgt 1140 caatatttac cttccctccc tcaatcggtt gaatgtcgcc cttttgtctt tagcgctggt 1200 aaaccatatg aattttctat tgattgtgac aaaataaact tattccgtgg tgtctttgcg 1260 tttcttttat atgttgccac ctttatgtat gtattttcta cgtttgctaa catactgcgt 1320 aataaggagt cttaa 1335 <210> 511 <211> 23 <212> PRT <213> Escherichia coli <220> <223> STII leader sequence <400> 511 Met Lys Lys Asn Ile Ala Phe Leu Leu Ala Ser Met Phe Val Phe Ser 1 5 10 15 Ile Ala Thr Asn Ala Tyr Ala 20 <210> 512 <211> 180 <212> PRT <213> M13 phage <220> <223> GeneIII <400> 512 Ser Gly Ser Ser Gly Gly Gly Ser Glu Gly Gly Gly Ser Glu Gly Gly 1 5 10 15 Gly Ser Glu Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Ser Gly Asp Phe 20 25 30 Asp Tyr Glu Lys Met Ala Asn Ala Asn Lys Gly Ala Met Thr Glu Asn 35 40 45 Ala Asp Glu Asn Ala Leu Gln Ser Asp Ala Lys Gly Lys Leu Asp Ser 50 55 60 Val Ala Thr Asp Tyr Gly Ala Ala Ile Asp Gly Phe Ile Gly Asp Val 65 70 75 80 Ser Gly Leu Ala Asn Gly Asn Gly Ala Thr Gly Asp Phe Ala Gly Ser 85 90 95 Asn Ser Gln Met Ala Gln Val Gly Asp Gly Asp Asn Ser Pro Leu Met 100 105 110 Asn Asn Phe Arg Gln Tyr Leu Pro Ser Leu Pro Gln Ser Val Glu Cys 115 120 125 Arg Pro Phe Val Phe Ser Ala Gly Lys Pro Tyr Glu Phe Ser Ile Asp 130 135 140 Cys Asp Lys Ile Asn Leu Phe Arg Gly Val Phe Ala Phe Leu Leu Tyr 145 150 155 160 Val Ala Thr Phe Met Tyr Val Phe Ser Thr Phe Ala Asn Ile Leu Arg 165 170 175 Asn Lys Glu Ser 180 <210> 513 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthesized protease cleavage site RQAR <400> 513 Arg Gln Ala Arg 1 <210> 514 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Synthesized protease cleavage site SLGR <400> 514 Ser Leu Gly Arg 1 <210> 515 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 full length <223> CB469 <400> 515 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 516 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP-1 protease domain <223> CPC-0019595 <400> 516 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Thr Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asp Gln Ala 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Leu Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Val Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 517 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 protease domain <223> CPC-0023085 <400> 517 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Phe Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 518 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 protease domain <223> CPC-0024153 <400> 518 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Phe Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Thr Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Gly <210> 519 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 protease domain <223> CPC-0025366 <400> 519 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Glu Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Phe Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Pro Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Ile Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 520 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 protease domain <223> CPC-0025387 <400> 520 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Phe Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 521 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 protease domain <223> CPC-0025582 <400> 521 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Phe Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Phe Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Gly <210> 522 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP-1 protease domain <223> CPC-0025720 <400> 522 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly Arg Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Arg Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 523 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 protease domain <223> CPC-0025876 <400> 523 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Phe Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Phe Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 524 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 protease domain <223> CPC-0025974 <400> 524 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 525 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 protease domain <223> CPC-0026100 <400> 525 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Phe Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Val Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Gly <210> 526 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 protease domain <223> CPC-0026323 <400> 526 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Phe Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Met Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser His Asp Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Leu Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 527 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 protease domain <223> CPC-0027399 <400> 527 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Thr Leu Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 528 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 protease domain <223> CPC-0027706 <400> 528 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Tyr Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Val Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys His Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ile Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 529 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 protease domain <223> CPC-0027797 <400> 529 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 Arg Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Ser Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Val Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 530 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 protease domain <223> CPC-0028017 <400> 530 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Val Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 531 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 protease domain <223> CPC-0028333 <400> 531 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Lys Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Leu Phe Asn Asp Tyr Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Val Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 532 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 protease domain <223> CPC-0028341 <400> 532 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Thr Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Ser Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Leu Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 533 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 protease domain <223> CPC-0033634 <400> 533 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Leu Phe Asn Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Leu Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 534 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 protease domain <223> CPC-0028791 <400> 534 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 535 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 protease domain <223> CPC-0027484 <400> 535 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Lys Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 536 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 protease domain <223> CPC-0028993 <400> 536 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Ser Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Arg Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 537 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 full length <223> CPC-0019595 <400> 537 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Thr Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asp Gln Ala Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Leu Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Val Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 538 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 full length <223> CPC-0023085 <400> 538 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Phe 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 539 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 full length <223> CPC-0024153 <400> 539 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Phe 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Thr Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Gly 850 855 <210> 540 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 full length <223> CPC-0025366 <400> 540 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Glu Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Phe 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Pro Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Ile Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 541 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 full length <223> CPC-0025387 <400> 541 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Phe 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 542 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 full length <223> CPC-0025582 <400> 542 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Phe 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Phe Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Gly 850 855 <210> 543 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 full length <223> CPC-0025720 <400> 543 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly Arg 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Arg Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 544 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 full length <223> CPC-0025876 <400> 544 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Phe 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Phe Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 545 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 full length <223> CPC-0025974 <400> 545 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 546 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 full length <223> CPC-0026100 <400> 546 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Phe 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Val Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Gly 850 855 <210> 547 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 full length <223> CPC-0026323 <400> 547 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Phe 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Met Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Asp Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Leu 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 548 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 full length <223> CPC-002739 <400> 548 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Leu Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 549 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 full length <223> CPC-0027706 <400> 549 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Tyr Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Val Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys His Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ile Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 550 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 full length <223> CPC-0027797 <400> 550 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu Arg Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Ser Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Val Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 551 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 full length <223> CPC-0028017 <400> 551 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Val Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 552 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 full length <223> CPC-0028333 <400> 552 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Lys Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Leu Phe Asn 690 695 700 Asp Tyr Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Val Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 553 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 full length <223> CPC-0028341 <400> 553 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Thr 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Ser Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Leu Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 554 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 full length <223> CPC-0033634 <400> 554 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Leu Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Leu Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 555 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 full length <223> CPC-0028791 <400> 555 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 556 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 full length <223> CPC-0027484 <400> 556 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Lys 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 557 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MT-SP1 full length <223> CPC-0028993 <400> 557 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Ser Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Ser Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Arg Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 558 <211> 26 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> N-terminal sequence of pIVEX 2.3d MTSP <400> 558 Met Glu Lys Thr Arg His His His His His His Ser Gly Ser Asp Cys 1 5 10 15 Gly Leu Arg Ser Phe Thr Arg Gln Ala Arg 20 25 <210> 559 <211> 3560 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pIVEX 2.3d vector <400> 559 tcgcgcgttt cggtgatgac ggtgaaaacc tctgacacat gcagctcccg gagacggtca 60 cagcttgtct gtaagcggat gccgggagca gacaagcccg tcagggcgcg tcagcgggtg 120 ttggcgggtg tcggggctgg cttaactatg cggcatcaga gcagattgta ctgagagtgc 180 accatatatg cggtgtgaaa taccgcacag atgcgtaagg agaaaatacc gcatcaggcg 240 ccattcgcca ttcaggctgc gcaactgttg ggaagggcga tcggtgcggg cctcttcgct 300 attacgccag ctggcgaaag ggggatgtgc tgcaaggcga ttaagttggg taacgccagg 360 gttttcccag tcacgacgtt gtaaaacgac ggccagtgcc aagcttgcat gcaaggagat 420 ggcgcccaac agtcccccgg ccacggggcc tgccaccata cccacgccga aacaagcgct 480 catgagcccg aagtggcgag cccgatcttc cccatcggtg atgtcggcga tataggcgcc 540 agcaaccgca cctgtggcgc cggtgatgcc ggccacgatg cgtccggcgt agaggatcga 600 gatctcgatc ccgcgaaatt aatacgactc actataggga gaccacaacg gtttccctct 660 agaaataatt ttgtttaact ttaagaagga gatataccat ggcacatatg agcggccgcg 720 tcgactcgag cgagctcccg gggggggttc tcatcatcat catcatcatt aataaaaggg 780 cgaattccag cacactggcg gccgttacta gtggatccgg ctgctaacaa agcccgaaag 840 gaagctgagt tggctgctgc caccgctgag caataactag cataacccct tggggcctct 900 aaacgggtct tgaggggttt tttgctgaaa ggaggaacta tatccggata tccacaggac 960 gggtgtggtc gccatgatcg cgtagtcgat agtggctcca agtagcgaag cgagcaggac 1020 tgggcggcgg ccaaagcggt cggacagtgc tccgagaacg ggtgcgcata gaaattgcat 1080 caacgcatat agcgctagca gcacgccata gtgactggcg atgctgtcgg aatggacgat 1140 atcccgcaag aggcccggca gtaccggcat aaccaagcct atgcctacag catccagggt 1200 gacggtgccg aggatgacga tgagcgcatt gttagatttc atacacggtg cctgactgcg 1260 ttagcaattt aactgtgata aactaccgca ttaaagctta tcgatgataa gctgtcaaac 1320 atgagaattc gtaatcatgt catagctgtt tcctgtgtga aattgttatc cgctcacaat 1380 tccacacaac atacgagccg gaagcataaa gtgtaaagcc tggggtgcct aatgagtgag 1440 ctaactcaca ttaattgcgt tgcgctcact gcccgctttc cagtcgggaa acctgtcgtg 1500 ccagctgcat taatgaatcg gccaacgcgc ggggagaggc ggtttgcgta ttgggcgctc 1560 ttccgcttcc tcgctcactg actcgctgcg ctcggtcgtt cggctgcggc gagcggtatc 1620 agctcactca aaggcggtaa tacggttatc cacagaatca ggggataacg caggaaagaa 1680 catgtgagca aaaggccagc aaaaggccag gaaccgtaaa aaggccgcgt tgctggcgtt 1740 tttccatagg ctccgccccc ctgacgagca tcacaaaaat cgacgctcaa gtcagaggtg 1800 gcgaaacccg acaggactat aaagatacca ggcgtttccc cctggaagct ccctcgtgcg 1860 ctctcctgtt ccgaccctgc cgcttaccgg atacctgtcc gcctttctcc cttcgggaag 1920 cgtggcgctt tctcatagct cacgctgtag gtatctcagt tcggtgtagg tcgttcgctc 1980 caagctgggc tgtgtgcacg aaccccccgt tcagcccgac cgctgcgcct tatccggtaa 2040 ctatcgtctt gagtccaacc cggtaagaca cgacttatcg ccactggcag cagccactgg 2100 taacaggatt agcagagcga ggtatgtagg cggtgctaca gagttcttga agtggtggcc 2160 taactacggc tacactagaa ggacagtatt tggtatctgc gctctgctga agccagttac 2220 cttcggaaaa agagttggta gctcttgatc cggcaaacaa accaccgctg gtagcggtgg 2280 tttttttgtt tgcaagcagc agattacgcg cagaaaaaaa ggatctcaag aagatccttt 2340 gatcttttct acggggtctg acgctcagtg gaacgaaaac tcacgttaag ggattttggt 2400 catgagatta tcaaaaagga tcttcaccta gatcctttta aattaaaaat gaagttttaa 2460 atcaatctaa agtatatatg agtaaacttg gtctgacagt taccaatgct taatcagtga 2520 ggcacctatc tcagcgatct gtctatttcg ttcatccata gttgcctgac tccccgtcgt 2580 gtagataact acgatacggg agggcttacc atctggcccc agtgctgcaa tgataccgcg 2640 agacccacgc tcaccggctc cagatttatc agcaataaac cagccagccg gaagggccga 2700 gcgcagaagt ggtcctgcaa ctttatccgc ctccatccag tctattaatt gttgccggga 2760 agctagagta agtagttcgc cagttaatag tttgcgcaac gttgttgcca ttgctacagg 2820 catcgtggtg tcacgctcgt cgtttggtat ggcttcattc agctccggtt cccaacgatc 2880 aaggcgagtt acatgatccc ccatgttgtg caaaaaagcg gttagctcct tcggtcctcc 2940 gatcgttgtc agaagtaagt tggccgcagt gttatcactc atggttatgg cagcactgca 3000 taattctctt actgtcatgc catccgtaag atgcttttct gtgactggtg agtactcaac 3060 caagtcattc tgagaatagt gtatgcggcg accgagttgc tcttgcccgg cgtcaatacg 3120 ggataatacc gcgccacata gcagaacttt aaaagtgctc atcattggaa aacgttcttc 3180 ggggcgaaaa ctctcaagga tcttaccgct gttgagatcc agttcgatgt aacccactcg 3240 tgcacccaac tgatcttcag catcttttac tttcaccagc gtttctgggt gagcaaaaac 3300 aggaaggcaa aatgccgcaa aaaagggaat aagggcgaca cggaaatgtt gaatactcat 3360 actcttcctt tttcaatatt attgaagcat ttatcagggt tattgtctca tgagcggata 3420 catatttgaa tgtatttaga aaaataaaca aataggggtt ccgcgcacat ttccccgaaa 3480 agtgccacct gacgtctaag aaaccattat tatcatgaca ttaacctata aaaataggcg 3540 tatcacgagg ccctttcgtc 3560 <210> 560 <211> 36 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pQE-Insert-F2 forward primer <400> 560 ttcacgagac aggctcgtgt tgttgggggc acggat 36 <210> 561 <211> 37 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pQE-Insert-R3 reverse primer <400> 561 cagctaatta agcttattat accccagtgt tctcttt 37 <210> 562 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pQE-Linear-F2 primer <400> 562 acgagcctgt ctcgtgaatg accgcagccc 30 <210> 563 <211> 31 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pQE-Linear-R1 primer <400> 563 taataagctt aattagctga gcttggactc c 31 <210> 564 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> forward primer: MTSP-5F <400> 564 ggagaaaccg gcagagtac 19 <210> 565 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> reverse primer MTSP-5R <400> 565 ggttctcgca ggtggtctg 19 <210> 566 <211> 5443 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pET21a vector <400> 566 atccggatat agttcctcct ttcagcaaaa aacccctcaa gacccgttta gaggccccaa 60 ggggttatgc tagttattgc tcagcggtgg cagcagccaa ctcagcttcc tttcgggctt 120 tgttagcagc cggatctcag tggtggtggt ggtggtgctc gagtgcggcc gcaagcttgt 180 cgacggagct cgaattcgga tccgcgaccc atttgctgtc caccagtcat gctagccata 240 tgtatatctc cttcttaaag ttaaacaaaa ttatttctag aggggaattg ttatccgctc 300 acaattcccc tatagtgagt cgtattaatt tcgcgggatc gagatctcga tcctctacgc 360 cggacgcatc gtggccggca tcaccggcgc cacaggtgcg gttgctggcg cctatatcgc 420 cgacatcacc gatggggaag atcgggctcg ccacttcggg ctcatgagcg cttgtttcgg 480 cgtgggtatg gtggcaggcc ccgtggccgg gggactgttg ggcgccatct ccttgcatgc 540 accattcctt gcggcggcgg tgctcaacgg cctcaaccta ctactgggct gcttcctaat 600 gcaggagtcg cataagggag agcgtcgaga tcccggacac catcgaatgg cgcaaaacct 660 ttcgcggtat ggcatgatag cgcccggaag agagtcaatt cagggtggtg aatgtgaaac 720 cagtaacgtt atacgatgtc gcagagtatg ccggtgtctc ttatcagacc gtttcccgcg 780 tggtgaacca ggccagccac gtttctgcga aaacgcggga aaaagtggaa gcggcgatgg 840 cggagctgaa ttacattccc aaccgcgtgg cacaacaact ggcgggcaaa cagtcgttgc 900 tgattggcgt tgccacctcc agtctggccc tgcacgcgcc gtcgcaaatt gtcgcggcga 960 ttaaatctcg cgccgatcaa ctgggtgcca gcgtggtggt gtcgatggta gaacgaagcg 1020 gcgtcgaagc ctgtaaagcg gcggtgcaca atcttctcgc gcaacgcgtc agtgggctga 1080 tcattaacta tccgctggat gaccaggatg ccattgctgt ggaagctgcc tgcactaatg 1140 ttccggcgtt atttcttgat gtctctgacc agacacccat caacagtatt attttctccc 1200 atgaagacgg tacgcgactg ggcgtggagc atctggtcgc attgggtcac cagcaaatcg 1260 cgctgttagc gggcccatta agttctgtct cggcgcgtct gcgtctggct ggctggcata 1320 aatatctcac tcgcaatcaa attcagccga tagcggaacg ggaaggcgac tggagtgcca 1380 tgtccggttt tcaacaaacc atgcaaatgc tgaatgaggg catcgttccc actgcgatgc 1440 tggttgccaa cgatcagatg gcgctgggcg caatgcgcgc cattaccgag tccgggctgc 1500 gcgttggtgc ggatatctcg gtagtgggat acgacgatac cgaagacagc tcatgttata 1560 tcccgccgtt aaccaccatc aaacaggatt ttcgcctgct ggggcaaacc agcgtggacc 1620 gcttgctgca actctctcag ggccaggcgg tgaagggcaa tcagctgttg cccgtctcac 1680 tggtgaaaag aaaaaccacc ctggcgccca atacgcaaac cgcctctccc cgcgcgttgg 1740 ccgattcatt aatgcagctg gcacgacagg tttcccgact ggaaagcggg cagtgagcgc 1800 aacgcaatta atgtaagtta gctcactcat taggcaccgg gatctcgacc gatgcccttg 1860 agagccttca acccagtcag ctccttccgg tgggcgcggg gcatgactat cgtcgccgca 1920 cttatgactg tcttctttat catgcaactc gtaggacagg tgccggcagc gctctgggtc 1980 attttcggcg aggaccgctt tcgctggagc gcgacgatga tcggcctgtc gcttgcggta 2040 ttcggaatct tgcacgccct cgctcaagcc ttcgtcactg gtcccgccac caaacgtttc 2100 ggcgagaagc aggccattat cgccggcatg gcggccccac gggtgcgcat gatcgtgctc 2160 ctgtcgttga ggacccggct aggctggcgg ggttgcctta ctggttagca gaatgaatca 2220 ccgatacgcg agcgaacgtg aagcgactgc tgctgcaaaa cgtctgcgac ctgagcaaca 2280 acatgaatgg tcttcggttt ccgtgtttcg taaagtctgg aaacgcggaa gtcagcgccc 2340 tgcaccatta tgttccggat ctgcatcgca ggatgctgct ggctaccctg tggaacacct 2400 acatctgtat taacgaagcg ctggcattga ccctgagtga tttttctctg gtcccgccgc 2460 atccataccg ccagttgttt accctcacaa cgttccagta accgggcatg ttcatcatca 2520 gtaacccgta tcgtgagcat cctctctcgt ttcatcggta tcattacccc catgaacaga 2580 aatccccctt acacggaggc atcagtgacc aaacaggaaa aaaccgccct taacatggcc 2640 cgctttatca gaagccagac attaacgctt ctggagaaac tcaacgagct ggacgcggat 2700 gaacaggcag acatctgtga atcgcttcac gaccacgctg atgagcttta ccgcagctgc 2760 ctcgcgcgtt tcggtgatga cggtgaaaac ctctgacaca tgcagctccc ggagacggtc 2820 acagcttgtc tgtaagcgga tgccgggagc agacaagccc gtcagggcgc gtcagcgggt 2880 gttggcgggt gtcggggcgc agccatgacc cagtcacgta gcgatagcgg agtgtatact 2940 ggcttaacta tgcggcatca gagcagattg tactgagagt gcaccatata tgcggtgtga 3000 aataccgcac agatgcgtaa ggagaaaata ccgcatcagg cgctcttccg cttcctcgct 3060 cactgactcg ctgcgctcgg tcgttcggct gcggcgagcg gtatcagctc actcaaaggc 3120 ggtaatacgg ttatccacag aatcagggga taacgcagga aagaacatgt gagcaaaagg 3180 ccagcaaaag gccaggaacc gtaaaaaggc cgcgttgctg gcgtttttcc ataggctccg 3240 cccccctgac gagcatcaca aaaatcgacg ctcaagtcag aggtggcgaa acccgacagg 3300 actataaaga taccaggcgt ttccccctgg aagctccctc gtgcgctctc ctgttccgac 3360 cctgccgctt accggatacc tgtccgcctt tctcccttcg ggaagcgtgg cgctttctca 3420 tagctcacgc tgtaggtatc tcagttcggt gtaggtcgtt cgctccaagc tgggctgtgt 3480 gcacgaaccc cccgttcagc ccgaccgctg cgccttatcc ggtaactatc gtcttgagtc 3540 caacccggta agacacgact tatcgccact ggcagcagcc actggtaaca ggattagcag 3600 agcgaggtat gtaggcggtg ctacagagtt cttgaagtgg tggcctaact acggctacac 3660 tagaaggaca gtatttggta tctgcgctct gctgaagcca gttaccttcg gaaaaagagt 3720 tggtagctct tgatccggca aacaaaccac cgctggtagc ggtggttttt ttgtttgcaa 3780 gcagcagatt acgcgcagaa aaaaaggatc tcaagaagat cctttgatct tttctacggg 3840 gtctgacgct cagtggaacg aaaactcacg ttaagggatt ttggtcatga gattatcaaa 3900 aaggatcttc acctagatcc ttttaaatta aaaatgaagt tttaaatcaa tctaaagtat 3960 atatgagtaa acttggtctg acagttacca atgcttaatc agtgaggcac ctatctcagc 4020 gatctgtcta tttcgttcat ccatagttgc ctgactcccc gtcgtgtaga taactacgat 4080 acgggagggc ttaccatctg gccccagtgc tgcaatgata ccgcgagacc cacgctcacc 4140 ggctccagat ttatcagcaa taaaccagcc agccggaagg gccgagcgca gaagtggtcc 4200 tgcaacttta tccgcctcca tccagtctat taattgttgc cgggaagcta gagtaagtag 4260 ttcgccagtt aatagtttgc gcaacgttgt tgccattgct gcaggcatcg tggtgtcacg 4320 ctcgtcgttt ggtatggctt cattcagctc cggttcccaa cgatcaaggc gagttacatg 4380 atcccccatg ttgtgcaaaa aagcggttag ctccttcggt cctccgatcg ttgtcagaag 4440 taagttggcc gcagtgttat cactcatggt tatggcagca ctgcataatt ctcttactgt 4500 catgccatcc gtaagatgct tttctgtgac tggtgagtac tcaaccaagt cattctgaga 4560 atagtgtatg cggcgaccga gttgctcttg cccggcgtca atacgggata ataccgcgcc 4620 acatagcaga actttaaaag tgctcatcat tggaaaacgt tcttcggggc gaaaactctc 4680 aaggatctta ccgctgttga gatccagttc gatgtaaccc actcgtgcac ccaactgatc 4740 ttcagcatct tttactttca ccagcgtttc tgggtgagca aaaacaggaa ggcaaaatgc 4800 cgcaaaaaag ggaataaggg cgacacggaa atgttgaata ctcatactct tcctttttca 4860 atattattga agcatttatc agggttattg tctcatgagc ggatacatat ttgaatgtat 4920 ttagaaaaat aaacaaatag gggttccgcg cacatttccc cgaaaagtgc cacctgaaat 4980 tgtaaacgtt aatattttgt taaaattcgc gttaaatttt tgttaaatca gctcattttt 5040 taaccaatag gccgaaatcg gcaaaatccc ttataaatca aaagaataga ccgagatagg 5100 gttgagtgtt gttccagttt ggaacaagag tccactatta aagaacgtgg actccaacgt 5160 caaagggcga aaaaccgtct atcagggcga tggcccacta cgtgaaccat caccctaatc 5220 aagttttttg gggtcgaggt gccgtaaagc actaaatcgg aaccctaaag ggagcccccg 5280 atttagagct tgacggggaa agccggcgaa cgtggcgaga aaggaaggga agaaagcgaa 5340 aggagcgggc gctagggcgc tggcaagtgt agcggtcacg ctgcgcgtaa ccaccacacc 5400 cgccgcgctt aatgcgccgc tacagggcgc gtcccattcg cca 5443 <210> 567 <211> 379 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> PAI-1 stable <400> 567 Val His His Pro Pro Ser Tyr Val Ala His Leu Ala Ser Asp Phe Gly 1 5 10 15 Val Arg Val Phe Gln Gln Val Ala Gln Ala Ser Lys Asp Arg Asn Val 20 25 30 Val Phe Ser Pro Tyr Gly Val Ala Ser Val Leu Ala Met Leu Gln Leu 35 40 45 Thr Thr Gly Gly Glu Thr Gln Gln Gln Ile Gln Ala Ala Met Gly Phe 50 55 60 Lys Ile Asp Asp Lys Gly Met Ala Pro Ala Leu Arg His Leu Tyr Lys 65 70 75 80 Glu Leu Met Gly Pro Trp Asn Lys Asp Glu Ile Ser Thr Thr Asp Ala 85 90 95 Ile Phe Val Gln Arg Asp Leu Lys Leu Val Gln Gly Phe Met Pro His 100 105 110 Phe Phe Arg Leu Phe Arg Ser Thr Val Lys Gln Val Asp Phe Ser Glu 115 120 125 Val Glu Arg Ala Arg Phe Ile Ile Asn Asp Trp Val Lys Thr His Thr 130 135 140 Lys Gly Met Ile Ser His Leu Leu Gly Thr Gly Ala Val Asp Gln Leu 145 150 155 160 Thr Arg Leu Val Leu Val Asn Ala Leu Tyr Phe Asn Gly Gln Trp Lys 165 170 175 Thr Pro Phe Pro Asp Ser Ser Thr His Arg Arg Leu Phe His Lys Ser 180 185 190 Asp Gly Ser Thr Val Ser Val Pro Met Met Ala Gln Thr Asn Lys Phe 195 200 205 Asn Tyr Thr Glu Phe Thr Thr Pro Asp Gly His Tyr Tyr Asp Ile Leu 210 215 220 Glu Leu Pro Tyr His Gly Asp Thr Leu Ser Met Phe Ile Ala Ala Pro 225 230 235 240 Tyr Glu Lys Glu Val Pro Leu Ser Ala Leu Thr Asn Ile Leu Ser Ala 245 250 255 Gln Leu Ile Ser His Trp Lys Gly Asn Met Thr Arg Leu Pro Arg Leu 260 265 270 Leu Val Leu Pro Lys Phe Ser Leu Glu Thr Glu Val Asp Leu Arg Lys 275 280 285 Pro Leu Glu Asn Leu Gly Met Thr Asp Met Phe Arg Gln Phe Gln Ala 290 295 300 Asp Phe Thr Ser Leu Ser Asp Gln Glu Pro Leu His Val Ala Leu Ala 305 310 315 320 Leu Gln Lys Val Lys Ile Glu Val Asn Glu Ser Gly Thr Val Ala Ser 325 330 335 Ser Ser Thr Ala Val Ile Val Ser Ala Arg Met Ala Pro Glu Glu Ile 340 345 350 Ile Ile Asp Arg Pro Phe Leu Phe Val Val Arg His Asn Pro Thr Gly 355 360 365 Thr Val Leu Phe Met Gly Gln Val Met Glu Pro 370 375 <210> 568 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 protease domain <223> I136T/N164D/T166A/F184(A)L/D217V <400> 568 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Thr Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asp Gln Ala 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Leu Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Val Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 569 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 protease domain <223> I41F <400> 569 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Phe Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 570 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 protease domain <223> I41F/A126T/V244G <400> 570 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Phe Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Thr Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Gly <210> 571 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 protease domain <223> D23E/I41F/T98P/T144I <400> 571 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Glu Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Phe Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Pro Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Ile Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 572 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 protease domain <223> I41F <400> 572 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Phe Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 573 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 protease domain <223> I41F/L171F/V244G <400> 573 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Phe Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Phe Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Gly <210> 574 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 protease domain <223> H143R/Q175R <400> 574 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly Arg Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Arg Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 575 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 protease domain <223> I41F/L171F <400> 575 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Phe Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Phe Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 576 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 protease domain <223> R230W <400> 576 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 577 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 protease domain <223> I41F/I154V/V244G <400> 577 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Phe Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Val Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Gly <210> 578 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 protease domain <223> I141F/L52M/V129D/Q221(A)L <400> 578 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Phe Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Met Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser His Asp Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Leu Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 579 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 protease domain <223> F99L <400> 579 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Thr Leu Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 580 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 protease domain <223> F97Y/I136V/Q192H/S201I <400> 580 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Tyr Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Val Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys His Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ile Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 581 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 protease domain <223> H71R/P131S/D217V <400> 581 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 Arg Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Ser Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Val Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 582 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 protease domain <223> D217V <400> 582 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Val Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 583 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 protease domain <223> T65K/F93L/F97Y/D217V <400> 583 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Lys Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Leu Phe Asn Asp Tyr Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Val Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 584 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 protease domain <223> I41T/P173S/Q209L <400> 584 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Thr Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Ser Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Leu Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 585 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 protease domain <223> F97L//F234L <400> 585 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Leu Phe Asn Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Leu Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 586 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 protease domain <223> Q175R <400> 586 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 587 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 protease domain <223> N95K <400> 587 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Lys Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 588 <211> 241 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 protease domain <223> Y60(G)S <400> 588 Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly Glu Trp Pro Trp Gln Val 1 5 10 15 Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile Cys Gly Ala Ser Leu Ile 20 25 30 Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His Cys Tyr Ile Asp Asp Arg 35 40 45 Gly Phe Arg Ser Ser Asp Pro Thr Gln Trp Thr Ala Phe Leu Gly Leu 50 55 60 His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly Val Gln Glu Arg Arg Leu 65 70 75 80 Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn Asp Phe Thr Phe Asp Tyr 85 90 95 Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro Ala Glu Tyr Ser Ser Met 100 105 110 Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser His Val Phe Pro Ala Gly 115 120 125 Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His Thr Gln Tyr Gly Gly Thr 130 135 140 Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile Arg Val Ile Asn Gln Thr 145 150 155 160 Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Arg Ile Thr Pro Arg Met Met Cys 165 170 175 Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser Cys Gln Gly Asp Ser Gly 180 185 190 Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly Arg Ile Phe Gln Ala Gly 195 200 205 Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln Arg Asn Lys Pro Gly Val 210 215 220 Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp Ile Lys Glu Asn Thr Gly 225 230 235 240 Val <210> 589 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 full length <223> I136T/N164D/T166A/F184(A)L/D217V <400> 589 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Thr Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asp Gln Ala Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Leu Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Val Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 590 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 full length <223> I41F <400> 590 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Phe 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 591 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 full length <223> I41F/A126T/V244G <400> 591 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Phe 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Thr Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Gly 850 855 <210> 592 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 full length <223> D23E/I41F/T98P/T144I <400> 592 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Glu Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Phe 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Pro Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Ile Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 593 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 full length <223> I41F <400> 593 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Phe 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 594 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 full length <223> I41F/L171F/V244G <400> 594 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Phe 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Phe Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Gly 850 855 <210> 595 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 full length <223> H143R/Q175R <400> 595 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly Arg 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Arg Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 596 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 full length <223> I41F/L171F <400> 596 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Phe 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Phe Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 597 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 full length <223> R230W <400> 597 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 598 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 full length <223> I41F/I154V/V244G <400> 598 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Phe 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Val Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Gly 850 855 <210> 599 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 full length <223> I141F/L52M/V129D/Q221(A)L <400> 599 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Phe 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Met Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Asp Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Leu 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 600 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 full length <223> F99L <400> 600 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Leu Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 601 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 full length <223> F97Y/I136V/Q192H/S201I <400> 601 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Tyr Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Val Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys His Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ile Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 602 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 full length <223> H71R/P131S/D217V <400> 602 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu Arg Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Ser Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Val Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 603 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 full length <223> D217V <400> 603 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Val Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 604 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 full length <223> T65K/F93L/F97Y/D217V <400> 604 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Lys Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Leu Phe Asn 690 695 700 Asp Tyr Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Val Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 605 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 full length <223> I41T/P173S/Q209L <400> 605 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Thr 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Ser Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Leu Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 606 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 full length <223> F97L//F234L <400> 606 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Leu Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Leu Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 607 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 full length <223> Q175R <400> 607 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 608 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 full length <223> N95K <400> 608 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Lys 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Gln Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 609 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant MTSP1 full length <223> Y60(G)S <400> 609 Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 1 5 10 15 Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30 Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45 Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60 Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gln 65 70 75 80 Tyr Arg Asp Val Arg Val Gln Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95 Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110 Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125 Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140 Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160 Ile Pro Gln His Leu Val Glu Glu Ala Glu Arg Val Met Ala Glu Glu 165 170 175 Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190 Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gln Arg 195 200 205 Thr Gln Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220 Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240 His Ala Arg Cys Gln Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255 Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270 Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285 Ala Leu Val Gln Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300 Phe His Ser Ser Gln Asn Val Leu Leu Ile Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320 Glu Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gln Leu Pro Arg 325 330 335 Met Ser Ser Cys Gly Gly Arg Leu Arg Lys Ala Gln Gly Thr Phe Asn 340 345 350 Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365 Asn Ile Glu Val Pro Asn Asn Gln His Val Lys Val Arg Phe Lys Phe 370 375 380 Phe Tyr Leu Leu Glu Pro Gly Val Pro Ala Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400 Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Lys Tyr Cys Gly Glu Arg Ser Gln Phe 405 410 415 Val Val Thr Ser Asn Ser Asn Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430 Gln Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445 Ser Ser Asp Pro Cys Pro Gly Gln Phe Thr Cys Arg Thr Gly Arg Cys 450 455 460 Ile Arg Lys Glu Leu Arg Cys Asp Gly Trp Ala Asp Cys Thr Asp His 465 470 475 480 Ser Asp Glu Leu Asn Cys Ser Cys Asp Ala Gly His Gln Phe Thr Cys 485 490 495 Lys Asn Lys Phe Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Ser Val Asn 500 505 510 Asp Cys Gly Asp Asn Ser Asp Glu Gln Gly Cys Ser Cys Pro Ala Gln 515 520 525 Thr Phe Arg Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Ser Lys Ser Gln Gln Cys 530 535 540 Asn Gly Lys Asp Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Pro 545 550 555 560 Lys Val Asn Val Val Thr Cys Thr Lys His Thr Tyr Arg Cys Leu Asn 565 570 575 Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Glu Asp 580 585 590 Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asp Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605 Phe Thr Arg Gln Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asp Ala Asp Glu Gly 610 615 620 Glu Trp Pro Trp Gln Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gln Gly His Ile 625 630 635 640 Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655 Cys Tyr Ile Asp Asp Arg Gly Phe Arg Ser Ser Asp Pro Thr Gln Trp 660 665 670 Thr Ala Phe Leu Gly Leu His Asp Gln Ser Gln Arg Ser Ala Pro Gly 675 680 685 Val Gln Glu Arg Arg Leu Lys Arg Ile Ile Ser His Pro Phe Phe Asn 690 695 700 Asp Phe Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720 Ala Glu Tyr Ser Ser Met Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Ala Ser 725 730 735 His Val Phe Pro Ala Gly Lys Ala Ile Trp Val Thr Gly Trp Gly His 740 745 750 Thr Gln Tyr Gly Gly Thr Gly Ala Leu Ile Leu Gln Lys Gly Glu Ile 755 760 765 Arg Val Ile Asn Gln Thr Thr Cys Glu Asn Leu Leu Pro Gln Arg Ile 770 775 780 Thr Pro Arg Met Met Cys Val Gly Phe Leu Ser Gly Gly Val Asp Ser 785 790 795 800 Cys Gln Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Ala Asp Gly 805 810 815 Arg Ile Phe Gln Ala Gly Val Val Ser Trp Gly Asp Gly Cys Ala Gln 820 825 830 Arg Asn Lys Pro Gly Val Tyr Thr Arg Leu Pro Leu Phe Arg Asp Trp 835 840 845 Ile Lys Glu Asn Thr Gly Val 850 855 <210> 610 <211> 380 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant mature PAI-1 <223> PAI-1/RRAR <400> 610 Met Val His His Pro Pro Ser Tyr Val Ala His Leu Ala Ser Asp Phe 1 5 10 15 Gly Val Arg Val Phe Gln Gln Val Ala Gln Ala Ser Lys Asp Arg Asn 20 25 30 Val Val Phe Ser Pro Tyr Gly Val Ala Ser Val Leu Ala Met Leu Gln 35 40 45 Leu Thr Thr Gly Gly Glu Thr Gln Gln Gln Ile Gln Ala Ala Met Gly 50 55 60 Phe Lys Ile Asp Asp Lys Gly Met Ala Pro Ala Leu Arg His Leu Tyr 65 70 75 80 Lys Glu Leu Met Gly Pro Trp Asn Lys Asp Glu Ile Ser Thr Thr Asp 85 90 95 Ala Ile Phe Val Gln Arg Asp Leu Lys Leu Val Gln Gly Phe Met Pro 100 105 110 His Phe Phe Arg Leu Phe Arg Ser Thr Val Lys Gln Val Asp Phe Ser 115 120 125 Glu Val Glu Arg Ala Arg Phe Ile Ile Asn Asp Trp Val Lys Thr His 130 135 140 Thr Lys Gly Met Ile Ser Asn Leu Leu Gly Lys Gly Ala Val Asp Gln 145 150 155 160 Leu Thr Arg Leu Val Leu Val Asn Ala Leu Tyr Phe Asn Gly Gln Trp 165 170 175 Lys Thr Pro Phe Pro Asp Ser Ser Thr His Arg Arg Leu Phe His Lys 180 185 190 Ser Asp Gly Ser Thr Val Ser Val Pro Met Met Ala Gln Thr Asn Lys 195 200 205 Phe Asn Tyr Thr Glu Phe Thr Thr Pro Asp Gly His Tyr Tyr Asp Ile 210 215 220 Leu Glu Leu Pro Tyr His Gly Asp Thr Leu Ser Met Phe Ile Ala Ala 225 230 235 240 Pro Tyr Glu Lys Glu Val Pro Leu Ser Ala Leu Thr Asn Ile Leu Ser 245 250 255 Ala Gln Leu Ile Ser His Trp Lys Gly Asn Met Thr Arg Leu Pro Arg 260 265 270 Leu Leu Val Leu Pro Lys Phe Ser Leu Glu Thr Glu Val Asp Leu Arg 275 280 285 Lys Pro Leu Glu Asn Leu Gly Met Thr Asp Met Phe Arg Gln Phe Gln 290 295 300 Ala Asp Phe Thr Ser Leu Ser Asp Gln Glu Pro Leu His Val Ala Gln 305 310 315 320 Ala Leu Gln Lys Val Lys Ile Glu Val Asn Glu Ser Gly Thr Val Ala 325 330 335 Ser Ser Ser Thr Ala Val Ile Arg Arg Ala Arg Met Ala Pro Glu Glu 340 345 350 Ile Ile Met Asp Arg Pro Phe Leu Phe Val Val Arg His Asn Pro Thr 355 360 365 Gly Thr Val Leu Phe Met Gly Gln Val Met Glu Pro 370 375 380 <210> 611 <211> 380 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant mature PAI-1 <223> PAI-1/69 (containing PFGRS) <400> 611 Met Val His His Pro Pro Ser Tyr Val Ala His Leu Ala Ser Asp Phe 1 5 10 15 Gly Val Arg Val Phe Gln Gln Val Ala Gln Ala Ser Lys Asp Arg Asn 20 25 30 Val Val Phe Ser Pro Tyr Gly Val Ala Ser Val Leu Ala Met Leu Gln 35 40 45 Leu Thr Thr Gly Gly Glu Thr Gln Gln Gln Ile Gln Ala Ala Met Gly 50 55 60 Phe Lys Ile Asp Asp Lys Gly Met Ala Pro Ala Leu Arg His Leu Tyr 65 70 75 80 Lys Glu Leu Met Gly Pro Trp Asn Lys Asp Glu Ile Ser Thr Thr Asp 85 90 95 Ala Ile Phe Val Gln Arg Asp Leu Lys Leu Val Gln Gly Phe Met Pro 100 105 110 His Phe Phe Arg Leu Phe Arg Ser Thr Val Lys Gln Val Asp Phe Ser 115 120 125 Glu Val Glu Arg Ala Arg Phe Ile Ile Asn Asp Trp Val Lys Thr His 130 135 140 Thr Lys Gly Met Ile Ser Asn Leu Leu Gly Lys Gly Ala Val Asp Gln 145 150 155 160 Leu Thr Arg Leu Val Leu Val Asn Ala Leu Tyr Phe Asn Gly Gln Trp 165 170 175 Lys Thr Pro Phe Pro Asp Ser Ser Thr His Arg Arg Leu Phe His Lys 180 185 190 Ser Asp Gly Ser Thr Val Ser Val Pro Met Met Ala Gln Thr Asn Lys 195 200 205 Phe Asn Tyr Thr Glu Phe Thr Thr Pro Asp Gly His Tyr Tyr Asp Ile 210 215 220 Leu Glu Leu Pro Tyr His Gly Asp Thr Leu Ser Met Phe Ile Ala Ala 225 230 235 240 Pro Tyr Glu Lys Glu Val Pro Leu Ser Ala Leu Thr Asn Ile Leu Ser 245 250 255 Ala Gln Leu Ile Ser His Trp Lys Gly Asn Met Thr Arg Leu Pro Arg 260 265 270 Leu Leu Val Leu Pro Lys Phe Ser Leu Glu Thr Glu Val Asp Leu Arg 275 280 285 Lys Pro Leu Glu Asn Leu Gly Met Thr Asp Met Phe Arg Gln Phe Gln 290 295 300 Ala Asp Phe Thr Ser Leu Ser Asp Gln Glu Pro Leu His Val Ala Gln 305 310 315 320 Ala Leu Gln Lys Val Lys Ile Glu Val Asn Glu Ser Gly Thr Val Ala 325 330 335 Ser Ser Ser Thr Ala Val Ile Pro Phe Gly Arg Ser Ala Pro Glu Glu 340 345 350 Ile Ile Met Asp Arg Pro Phe Leu Phe Val Val Arg His Asn Pro Thr 355 360 365 Gly Thr Val Leu Phe Met Gly Gln Val Met Glu Pro 370 375 380 <210> 612 <211> 1395 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <223> ATIII <400> 612 atgtattcca atgtgatagg aactgtaacc tctggaaaaa ggaaggttta tcttttgtcc 60 ttgctgctca ttggcttctg ggactgcgtg acctgtcacg ggagccctgt ggacatctgc 120 acagccaagc cgcgggacat tcccatgaat cccatgtgca tttaccgctc cccggagaag 180 aaggcaactg aggatgaggg ctcagaacag aagatcccgg aggccaccaa ccggcgtgtc 240 tgggaactgt ccaaggccaa ttcccgcttt gctaccactt tctatcagca cctggcagat 300 tccaagaatg acaatgataa cattttcctg tcacccctga gtatctccac ggcttttgct 360 atgaccaagc tgggtgcctg taatgacacc ctccagcaac tgatggaggt atttaagttt 420 gacaccatat ctgagaaaac atctgatcag atccacttct tctttgccaa actgaactgc 480 cgactctatc gaaaagccaa caaatcctcc aagttagtat cagccaatcg cctttttgga 540 gacaaatccc ttaccttcaa tgagacctac caggacatca gtgagttggt atatggagcc 600 aagctccagc ccctggactt caaggaaaat gcagagcaat ccagagcggc catcaacaaa 660 tgggtgtcca ataagaccga aggccgaatc accgatgtca ttccctcgga agccatcaat 720 gagctcactg ttctggtgct ggttaacacc atttacttca agggcctgtg gaagtcaaag 780 ttcagccctg agaacacaag gaaggaactg ttctacaagg ctgatggaga gtcgtgttca 840 gcatctatga tgtaccagga aggcaagttc cgttatcggc gcgtggctga aggcacccag 900 gtgcttgagt tgcccttcaa aggtgatgac atcaccatgg tcctcatctt gcccaagcct 960 gagaagagcc tggccaaggt ggagaaggaa ctcaccccag aggtgctgca ggagtggctg 1020 gatgaattgg aggagatgat gctggtggtc cacatgcccc gcttccgcat tgaggacggc 1080 ttcagtttga aggagcagct gcaagacatg ggccttgtcg atctgttcag ccctgaaaag 1140 tccaaactcc caggtattgt tgcagaaggc cgagatgacc tctatgtctc agatgcattc 1200 cataaggcat ttcttgaggt aaatgaagaa ggcagtgaag cagctgcaag taccgctgtt 1260 gtgattgctg gccgttcgct aaaccccaac agggtgactt tcaaggccaa caggcctttc 1320 ctggttttta taagagaagt tcctctgaac actattatct tcatgggcag agtagccaac 1380 ccttgtgtta agtaa 1395 <210> 613 <211> 1458 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> AT3 His tag fusion protein <400> 613 atgctactag taaatcagtc acaccaaggc ttcaataagg aacacacaag caagatggta 60 agcgctattg ttttatatgt gcttttggcg gcggcggcgc attctgcctt tgcggcggat 120 cttggatccc acgggagccc tgtggacatc tgcacagcca agccgcggga cattcccatg 180 aatcccatgt gcatttaccg ctccccggag aagaaggcaa ctgaggatga gggctcagaa 240 cagaagatcc cggaggccac caaccggcgt gtctgggaac tgtccaaggc caattcccgc 300 tttgctacca ctttctatca gcacctggca gattccaaga atgacaatga taacattttc 360 ctgtcacccc tgagtatctc cacggctttt gctatgacca agctgggtgc ctgtaatgac 420 accctccagc aactgatgga ggtatttaag tttgacacca tatctgagaa aacatctgat 480 cagatccact tcttctttgc caaactgaac tgccgactct atcgaaaagc caacaaatcc 540 tccaagttag tatcagccaa tcgccttttt ggagacaaat cccttacctt caatgagacc 600 taccaggaca tcagtgagtt ggtatatgga gccaagctcc agcccctgga cttcaaggaa 660 aatgcagagc aatccagagc ggccatcaac aaatgggtgt ccaataagac cgaaggccga 720 atcaccgatg tcattccctc ggaagccatc aatgagctca ctgttctggt gctggttaac 780 accatttact tcaagggcct gtggaagtca aagttcagcc ctgagaacac aaggaaggaa 840 ctgttctaca aggctgatgg agagtcgtgt tcagcatcta tgatgtacca ggaaggcaag 900 ttccgttatc ggcgcgtggc tgaaggcacc caggtgcttg agttgccctt caaaggtgat 960 gacatcacca tggtcctcat cttgcccaag cctgagaaga gcctggccaa ggtagagaag 1020 gaactcaccc cagaggtgct gcaagagtgg ctggatgaat tggaggagat gatgctggtg 1080 gtccacatgc cccgcttccg cattgaggac ggcttcagtt tgaaggagca gctgcaagac 1140 atgggccttg tcgatctgtt cagccctgaa aagtccaaac tcccaggtat tgttgcagaa 1200 ggccgagatg acctctatgt ctcagatgca ttccataagg catttcttga ggtaaatgaa 1260 gaaggcagtg aagcagctgc aagtaccgct gttgtgattg ctggccgttc gctaaacccc 1320 aacagggtga ctttcaaggc caacaggcct ttcctggttt ttataagaga agttcctctg 1380 aacactatta tcttcatggg cagagtagcc aacccttgtg ttaagggagg cggaagccat 1440 caccaccatc accactaa 1458 <210> 614 <211> 485 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> AT3 His tag fusion protein <400> 614 Met Leu Leu Val Asn Gln Ser His Gln Gly Phe Asn Lys Glu His Thr 1 5 10 15 Ser Lys Met Val Ser Ala Ile Val Leu Tyr Val Leu Leu Ala Ala Ala 20 25 30 Ala His Ser Ala Phe Ala Ala Asp Leu Gly Ser His Gly Ser Pro Val 35 40 45 Asp Ile Cys Thr Ala Lys Pro Arg Asp Ile Pro Met Asn Pro Met Cys 50 55 60 Ile Tyr Arg Ser Pro Glu Lys Lys Ala Thr Glu Asp Glu Gly Ser Glu 65 70 75 80 Gln Lys Ile Pro Glu Ala Thr Asn Arg Arg Val Trp Glu Leu Ser Lys 85 90 95 Ala Asn Ser Arg Phe Ala Thr Thr Phe Tyr Gln His Leu Ala Asp Ser 100 105 110 Lys Asn Asp Asn Asp Asn Ile Phe Leu Ser Pro Leu Ser Ile Ser Thr 115 120 125 Ala Phe Ala Met Thr Lys Leu Gly Ala Cys Asn Asp Thr Leu Gln Gln 130 135 140 Leu Met Glu Val Phe Lys Phe Asp Thr Ile Ser Glu Lys Thr Ser Asp 145 150 155 160 Gln Ile His Phe Phe Phe Ala Lys Leu Asn Cys Arg Leu Tyr Arg Lys 165 170 175 Ala Asn Lys Ser Ser Lys Leu Val Ser Ala Asn Arg Leu Phe Gly Asp 180 185 190 Lys Ser Leu Thr Phe Asn Glu Thr Tyr Gln Asp Ile Ser Glu Leu Val 195 200 205 Tyr Gly Ala Lys Leu Gln Pro Leu Asp Phe Lys Glu Asn Ala Glu Gln 210 215 220 Ser Arg Ala Ala Ile Asn Lys Trp Val Ser Asn Lys Thr Glu Gly Arg 225 230 235 240 Ile Thr Asp Val Ile Pro Ser Glu Ala Ile Asn Glu Leu Thr Val Leu 245 250 255 Val Leu Val Asn Thr Ile Tyr Phe Lys Gly Leu Trp Lys Ser Lys Phe 260 265 270 Ser Pro Glu Asn Thr Arg Lys Glu Leu Phe Tyr Lys Ala Asp Gly Glu 275 280 285 Ser Cys Ser Ala Ser Met Met Tyr Gln Glu Gly Lys Phe Arg Tyr Arg 290 295 300 Arg Val Ala Glu Gly Thr Gln Val Leu Glu Leu Pro Phe Lys Gly Asp 305 310 315 320 Asp Ile Thr Met Val Leu Ile Leu Pro Lys Pro Glu Lys Ser Leu Ala 325 330 335 Lys Val Glu Lys Glu Leu Thr Pro Glu Val Leu Gln Glu Trp Leu Asp 340 345 350 Glu Leu Glu Glu Met Met Leu Val Val His Met Pro Arg Phe Arg Ile 355 360 365 Glu Asp Gly Phe Ser Leu Lys Glu Gln Leu Gln Asp Met Gly Leu Val 370 375 380 Asp Leu Phe Ser Pro Glu Lys Ser Lys Leu Pro Gly Ile Val Ala Glu 385 390 395 400 Gly Arg Asp Asp Leu Tyr Val Ser Asp Ala Phe His Lys Ala Phe Leu 405 410 415 Glu Val Asn Glu Glu Gly Ser Glu Ala Ala Ala Ser Thr Ala Val Val 420 425 430 Ile Ala Gly Arg Ser Leu Asn Pro Asn Arg Val Thr Phe Lys Ala Asn 435 440 445 Arg Pro Phe Leu Val Phe Ile Arg Glu Val Pro Leu Asn Thr Ile Ile 450 455 460 Phe Met Gly Arg Val Ala Asn Pro Cys Val Lys Gly Gly Gly Ser His 465 470 475 480 His His His His His 485 <210> 615 <211> 6644 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pMal2c vector <400> 615 ccgacaccat cgaatggtgc aaaacctttc gcggtatggc atgatagcgc ccggaagaga 60 gtcaattcag ggtggtgaat gtgaaaccag taacgttata cgatgtcgca gagtatgccg 120 gtgtctctta tcagaccgtt tcccgcgtgg tgaaccaggc cagccacgtt tctgcgaaaa 180 cgcgggaaaa agtggaagcg gcgatggcgg agctgaatta cattcccaac cgcgtggcac 240 aacaactggc gggcaaacag tcgttgctga ttggcgttgc cacctccagt ctggccctgc 300 acgcgccgtc gcaaattgtc gcggcgatta aatctcgcgc cgatcaactg ggtgccagcg 360 tggtggtgtc gatggtagaa cgaagcggcg tcgaagcctg taaagcggcg gtgcacaatc 420 ttctcgcgca acgcgtcagt gggctgatca ttaactatcc gctggatgac caggatgcca 480 ttgctgtgga agctgcctgc actaatgttc cggcgttatt tcttgatgtc tctgaccaga 540 cacccatcaa cagtattatt ttctcccatg aagacggtac gcgactgggc gtggagcatc 600 tggtcgcatt gggtcaccag caaatcgcgc tgttagcggg cccattaagt tctgtctcgg 660 cgcgtctgcg tctggctggc tggcataaat atctcactcg caatcaaatt cagccgatag 720 cggaacggga aggcgactgg agtgccatgt ccggttttca acaaaccatg caaatgctga 780 atgagggcat cgttcccact gcgatgctgg ttgccaacga tcagatggcg ctgggcgcaa 840 tgcgcgccat taccgagtcc gggctgcgcg ttggtgcgga tatctcggta gtgggatacg 900 acgataccga agacagctca tgttatatcc cgccgttaac caccatcaaa caggattttc 960 gcctgctggg gcaaaccagc gtggaccgct tgctgcaact ctctcagggc caggcggtga 1020 agggcaatca gctgttgccc gtctcactgg tgaaaagaaa aaccaccctg gcgcccaata 1080 cgcaaaccgc ctctccccgc gcgttggccg attcattaat gcagctggca cgacaggttt 1140 cccgactgga aagcgggcag tgagcgcaac gcaattaatg taagttagct cactcattag 1200 gcacaattct catgtttgac agcttatcat cgactgcacg gtgcaccaat gcttctggcg 1260 tcaggcagcc atcggaagct gtggtatggc tgtgcaggtc gtaaatcact gcataattcg 1320 tgtcgctcaa ggcgcactcc cgttctggat aatgtttttt gcgccgacat cataacggtt 1380 ctggcaaata ttctgaaatg agctgttgac aattaatcat cggctcgtat aatgtgtgga 1440 attgtgagcg gataacaatt tcacacagga aacagccagt ccgtttaggt gttttcacga 1500 gcacttcacc aacaaggacc atagattatg aaaatcgaag aaggtaaact ggtaatctgg 1560 attaacggcg ataaaggcta taacggtctc gctgaagtcg gtaagaaatt cgagaaagat 1620 accggaatta aagtcaccgt tgagcatccg gataaactgg aagagaaatt cccacaggtt 1680 gcggcaactg gcgatggccc tgacattatc ttctgggcac acgaccgctt tggtggctac 1740 gctcaatctg gcctgttggc tgaaatcacc ccggacaaag cgttccagga caagctgtat 1800 ccgtttacct gggatgccgt acgttacaac ggcaagctga ttgcttaccc gatcgctgtt 1860 gaagcgttat cgctgattta taacaaagat ctgctgccga acccgccaaa aacctgggaa 1920 gagatcccgg cgctggataa agaactgaaa gcgaaaggta agagcgcgct gatgttcaac 1980 ctgcaagaac cgtacttcac ctggccgctg attgctgctg acgggggtta tgcgttcaag 2040 tatgaaaacg gcaagtacga cattaaagac gtgggcgtgg ataacgctgg cgcgaaagcg 2100 ggtctgacct tcctggttga cctgattaaa aacaaacaca tgaatgcaga caccgattac 2160 tccatcgcag aagctgcctt taataaaggc gaaacagcga tgaccatcaa cggcccgtgg 2220 gcatggtcca acatcgacac cagcaaagtg aattatggtg taacggtact gccgaccttc 2280 aagggtcaac catccaaacc gttcgttggc gtgctgagcg caggtattaa cgccgccagt 2340 ccgaacaaag agctggcaaa agagttcctc gaaaactatc tgctgactga tgaaggtctg 2400 gaagcggtta ataaagacaa accgctgggt gccgtagcgc tgaagtctta cgaggaagag 2460 ttggcgaaag atccacgtat tgccgccacc atggaaaacg cccagaaagg tgaaatcatg 2520 ccgaacatcc cgcagatgtc cgctttctgg tatgccgtgc gtactgcggt gatcaacgcc 2580 gccagcggtc gtcagactgt cgatgaagcc ctgaaagacg cgcagactaa ttcgagctcg 2640 aacaacaaca acaataacaa taacaacaac ctcgggatcg agggaaggat ttcagaattc 2700 ggatcctcta gagtcgacct gcaggcaagc ttggcactgg ccgtcgtttt acaacgtcgt 2760 gactgggaaa accctggcgt tacccaactt aatcgccttg cagcacatcc ccctttcgcc 2820 agctggcgta atagcgaaga ggcccgcacc gatcgccctt cccaacagtt gcgcagcctg 2880 aatggcgaat ggcagcttgg ctgttttggc ggatgagata agattttcag cctgatacag 2940 attaaatcag aacgcagaag cggtctgata aaacagaatt tgcctggcgg cagtagcgcg 3000 gtggtcccac ctgaccccat gccgaactca gaagtgaaac gccgtagcgc cgatggtagt 3060 gtggggtctc cccatgcgag agtagggaac tgccaggcat caaataaaac gaaaggctca 3120 gtcgaaagac tgggcctttc gttttatctg ttgtttgtcg gtgaacgctc tcctgagtag 3180 gacaaatccg ccgggagcgg atttgaacgt tgcgaagcaa cggcccggag ggtggcgggc 3240 aggacgcccg ccataaactg ccaggcatca aattaagcag aaggccatcc tgacggatgg 3300 cctttttgcg tttctacaaa ctctttttgt ttatttttct aaatacattc aaatatgtat 3360 ccgctcatga gacaataacc ctgataaatg cttcaataat attgaaaaag gaagagtatg 3420 agtattcaac atttccgtgt cgcccttatt cccttttttg cggcattttg ccttcctgtt 3480 tttgctcacc cagaaacgct ggtgaaagta aaagatgctg aagatcagtt gggtgcacga 3540 gtgggttaca tcgaactgga tctcaacagc ggtaagatcc ttgagagttt tcgccccgaa 3600 gaacgttctc caatgatgag cacttttaaa gttctgctat gtggcgcggt attatcccgt 3660 gttgacgccg ggcaagagca actcggtcgc cgcatacact attctcagaa tgacttggtt 3720 gagtactcac cagtcacaga aaagcatctt acggatggca tgacagtaag agaattatgc 3780 agtgctgcca taaccatgag tgataacact gcggccaact tacttctgac aacgatcgga 3840 ggaccgaagg agctaaccgc ttttttgcac aacatggggg atcatgtaac tcgccttgat 3900 cgttgggaac cggagctgaa tgaagccata ccaaacgacg agcgtgacac cacgatgcct 3960 gtagcaatgg caacaacgtt gcgcaaacta ttaactggcg aactacttac tctagcttcc 4020 cggcaacaat taatagactg gatggaggcg gataaagttg caggaccact tctgcgctcg 4080 gcccttccgg ctggctggtt tattgctgat aaatctggag ccggtgagcg tgggtctcgc 4140 ggtatcattg cagcactggg gccagatggt aagccctccc gtatcgtagt tatctacacg 4200 acggggagtc aggcaactat ggatgaacga aatagacaga tcgctgagat aggtgcctca 4260 ctgattaagc attggtaact gtcagaccaa gtttactcat atatacttta gattgattta 4320 ccccggttga taatcagaaa agccccaaaa acaggaagat tgtataagca aatatttaaa 4380 ttgtaaacgt taatattttg ttaaaattcg cgttaaattt ttgttaaatc agctcatttt 4440 ttaaccaata ggccgaaatc ggcaaaatcc cttataaatc aaaagaatag cccgagatag 4500 ggttgagtgt tgttccagtt tggaacaaga gtccactatt aaagaacgtg gactccaacg 4560 tcaaagggcg aaaaaccgtc tatcagggcg atggcccact acgtgaacca tcacccaaat 4620 caagtttttt ggggtcgagg tgccgtaaag cactaaatcg gaaccctaaa gggagccccc 4680 gatttagagc ttgacgggga aagccggcga acgtggcgag aaaggaaggg aagaaagcga 4740 aaggagcggg cgctagggcg ctggcaagtg tagcggtcac gctgcgcgta accaccacac 4800 ccgccgcgct taatgcgccg ctacagggcg cgtaaaagga tctaggtgaa gatccttttt 4860 gataatctca tgaccaaaat cccttaacgt gagttttcgt tccactgagc gtcagacccc 4920 gtagaaaaga tcaaaggatc ttcttgagat cctttttttc tgcgcgtaat ctgctgcttg 4980 caaacaaaaa aaccaccgct accagcggtg gtttgtttgc cggatcaaga gctaccaact 5040 ctttttccga aggtaactgg cttcagcaga gcgcagatac caaatactgt ccttctagtg 5100 tagccgtagt taggccacca cttcaagaac tctgtagcac cgcctacata cctcgctctg 5160 ctaatcctgt taccagtggc tgctgccagt ggcgataagt cgtgtcttac cgggttggac 5220 tcaagacgat agttaccgga taaggcgcag cggtcgggct gaacgggggg ttcgtgcaca 5280 cagcccagct tggagcgaac gacctacacc gaactgagat acctacagcg tgagctatga 5340 gaaagcgcca cgcttcccga agggagaaag gcggacaggt atccggtaag cggcagggtc 5400 ggaacaggag agcgcacgag ggagcttcca gggggaaacg cctggtatct ttatagtcct 5460 gtcgggtttc gccacctctg acttgagcgt cgatttttgt gatgctcgtc aggggggcgg 5520 agcctatgga aaaacgccag caacgcggcc tttttacggt tcctggcctt ttgctggcct 5580 tttgctcaca tgttctttcc tgcgttatcc cctgattctg tggataaccg tattaccgcc 5640 tttgagtgag ctgataccgc tcgccgcagc cgaacgaccg agcgcagcga gtcagtgagc 5700 gaggaagcgg aagagcgcct gatgcggtat tttctcctta cgcatctgtg cggtatttca 5760 caccgcatat ggtgcactct cagtacaatc tgctctgatg ccgcatagtt aagccagtat 5820 acactccgct atcgctacgt gactgggtca tggctgcgcc ccgacacccg ccaacacccg 5880 ctgacgcgcc ctgacgggct tgtctgctcc cggcatccgc ttacagacaa gctgtgaccg 5940 tctccgggag ctgcatgtgt cagaggtttt caccgtcatc accgaaacgc gcgaggcagc 6000 tgcggtaaag ctcatcagcg tggtcgtgca gcgattcaca gatgtctgcc tgttcatccg 6060 cgtccagctc gttgagtttc tccagaagcg ttaatgtctg gcttctgata aagcgggcca 6120 tgttaagggc ggttttttcc tgtttggtca ctgatgcctc cgtgtaaggg ggatttctgt 6180 tcatgggggt aatgataccg atgaaacgag agaggatgct cacgatacgg gttactgatg 6240 atgaacatgc ccggttactg gaacgttgtg agggtaaaca actggcggta tggatgcggc 6300 gggaccagag aaaaatcact cagggtcaat gccagcgctt cgttaataca gatgtaggtg 6360 ttccacaggg tagccagcag catcctgcga tgcagatccg gaacataatg gtgcagggcg 6420 ctgacttccg cgtttccaga ctttacgaaa cacggaaacc gaagaccatt catgttgttg 6480 ctcaggtcgc agacgttttg cagcagcagt cgcttcacgt tcgctcgcgt atcggtgatt 6540 cattctgcta accagtaagg caaccccgcc agcctagccg ggtcctcaac gacaggagca 6600 cgatcatgcg cacccgtggc caggacccaa cgctgcccga aatt 6644 <210> 616 <211> 543 <212> DNA <213> M13 phage <220> <223> GeneIII <400> 616 agcggctcga gcggtggtgg ctctgagggt ggcggttctg agggtggcgg ctctgaggga 60 ggcggttccg gtggtggctc tggttccggt gattttgatt atgaaaagat ggcaaacgct 120 aataaggggg ctatgaccga aaatgccgat gaaaacgcgc tacagtctga cgctaaaggc 180 aaacttgatt ctgtcgctac tgattacggt gctgctatcg atggtttcat tggtgacgtt 240 tccggccttg ctaatggtaa tggtgctact ggtgattttg ctggctctaa ttcccaaatg 300 gctcaagtcg gtgacggtga taattcacct ttaatgaata atttccgtca atatttacct 360 tccctccctc aatcggttga atgtcgccct tttgtctttg gcgctggtaa accgtatgaa 420 ttttctattg attgtgacaa aataaactta ttccgtggtg tctttgcgtt tcttttatat 480 gttgccacct ttatgtatgt attttctacg tttgctaaca tactgcgtaa taaggagtct 540 taa 543 <210> 617 <211> 3 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> uPA cleavage substrate AGR <400> 617 Ala Gly Arg 1 <210> 618 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> MTSP sequencing primer <400> 618 ggtgttttca cgagcacttc 20 <210> 619 <211> 6601 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pCAT0002 vector <400> 619 gatctcgatc ccgcgaaatt aatacgactc actatagggg aattgtgagc ggataacaat 60 tcccctctag aaataatttt gtttaacttt aagaaggaga tatacatatg tcgggattaa 120 acgacatttt cgaagcgcag aagattgaat ggcacgaggc gagcgaaaac ttgtactttc 180 agggcgtgca tcatccgccg agctatgtag cgcatctggc ttccgacttt ggcgtgcgtg 240 tgtttcagca ggtcgcccag gcgtcaaaag atcgcaatgt ggtgttcagc ccgtatggtg 300 ttgcgtccgt gttggcgatg cttcaactta ctaccggcgg tgaaacgcag caacagattc 360 aggcggcgat gggcttcaag atagatgaca aaggcatggc acccgccctg cgtcatctgt 420 ataaagaact gatggggccg tggaacaaag atgagattag caccaccgat gcgatatttg 480 tgcagcgcga tctgaagctg gtccagggat tcatgcctca tttcttccgt ctgtttcgta 540 gcaccgtgaa acaggtggat tttagcgagg tggagcgtgc ccgcttcatc ataaacgatt 600 gggtgaagac ccacacgaag ggcatgattt cgcacctgct tgggaccggc gctgtggatc 660 aactgacccg tctggtgctg gtaaatgcgt tgtatttcaa cgggcaatgg aaaaccccgt 720 ttccggattc aagcacccat cgtcgtcttt ttcataaaag cgatggctct accgtcagcg 780 tccccatgat ggcgcagacg aacaaattca attacaccga attcaccacg ccggatggcc 840 actactatga tattctggag ctgccgtacc atggcgatac cctgagcatg ttcattgcgg 900 caccgtatga gaaagaagtg ccgctgtcgg ctctgaccaa cattctgagc gcgcagctta 960 ttagccattg gaaaggcaat atgacccgcc tgccacgtct gctggttctg ccgaaattta 1020 gcctggagac cgaagtggat ctgcgtaaac cgctggagaa tctggggatg acggatatgt 1080 tccggcagtt tcaagctgat ttcaccagcc ttagcgacca ggaacctctg catgtggccc 1140 tggcgttgca gaaggttaag atcgaagtga atgaaagcgg aaccgtggcg tctagtagca 1200 ctgctgtgat tcgtcgtgcg cgtatggcgc ctgaggaaat tatcatcgac cgtccgttcc 1260 tgtttgtggt gcgtcacaat ccgaccggga ctgtgctgtt tatgggccag gtgatggaac 1320 cgtaataagc ttgcggccgc actcgagcac caccaccacc accactgaga tccggctgct 1380 aacaaagccc gaaaggaagc tgagttggct gctgccaccg ctgagcaata actagcataa 1440 ccccttgggg cctctaaacg ggtcttgagg ggttttttgc tgaaaggagg aactatatcc 1500 ggattggcga atgggacgcg ccctgtagcg gcgcattaag cgcggcgggt gtggtggtta 1560 cgcgcagcgt gaccgctaca cttgccagcg ccctagcgcc cgctcctttc gctttcttcc 1620 cttcctttct cgccacgttc gccggctttc cccgtcaagc tctaaatcgg gggctccctt 1680 tagggttccg atttagtgct ttacggcacc tcgaccccaa aaaacttgat tagggtgatg 1740 gttcacgtag tgggccatcg ccctgataga cggtttttcg ccctttgacg ttggagtcca 1800 cgttctttaa tagtggactc ttgttccaaa ctggaacaac actcaaccct atctcggtct 1860 attcttttga tttataaggg attttgccga tttcggccta ttggttaaaa aatgagctga 1920 tttaacaaaa atttaacgcg aattttaaca aaatattaac gtttacaatt tcaggtggca 1980 cttttcgggg aaatgtgcgc ggaaccccta tttgtttatt tttctaaata cattcaaata 2040 tgtatccgct catgagacaa taaccctgat aaatgcttca ataatattga aaaaggaaga 2100 gtatgagtat tcaacatttc cgtgtcgccc ttattccctt ttttgcggca ttttgccttc 2160 ctgtttttgc tcacccagaa acgctggtga aagtaaaaga tgctgaagat cagttgggtg 2220 cacgagtggg ttacatcgaa ctggatctca acagcggtaa gatccttgag agttttcgcc 2280 ccgaagaacg ttttccaatg atgagcactt ttaaagttct gctatgtggc gcggtattat 2340 cccgtattga cgccgggcaa gagcaactcg gtcgccgcat acactattct cagaatgact 2400 tggttgagta ctcaccagtc acagaaaagc atcttacgga tggcatgaca gtaagagaat 2460 tatgcagtgc tgccataacc atgagtgata acactgcggc caacttactt ctgacaacga 2520 tcggaggacc gaaggagcta accgcttttt tgcacaacat gggggatcat gtaactcgcc 2580 ttgatcgttg ggaaccggag ctgaatgaag ccataccaaa cgacgagcgt gacaccacga 2640 tgcctgcagc aatggcaaca acgttgcgca aactattaac tggcgaacta cttactctag 2700 cttcccggca acaattaata gactggatgg aggcggataa agttgcagga ccacttctgc 2760 gctcggccct tccggctggc tggtttattg ctgataaatc tggagccggt gagcgtgggt 2820 ctcgcggtat cattgcagca ctggggccag atggtaagcc ctcccgtatc gtagttatct 2880 acacgacggg gagtcaggca actatggatg aacgaaatag acagatcgct gagataggtg 2940 cctcactgat taagcattgg taactgtcag accaagttta ctcatatata ctttagattg 3000 atttaaaact tcatttttaa tttaaaagga tctaggtgaa gatccttttt gataatctca 3060 tgaccaaaat cccttaacgt gagttttcgt tccactgagc gtcagacccc gtagaaaaga 3120 tcaaaggatc ttcttgagat cctttttttc tgcgcgtaat ctgctgcttg caaacaaaaa 3180 aaccaccgct accagcggtg gtttgtttgc cggatcaaga gctaccaact ctttttccga 3240 aggtaactgg cttcagcaga gcgcagatac caaatactgt ccttctagtg tagccgtagt 3300 taggccacca cttcaagaac tctgtagcac cgcctacata cctcgctctg ctaatcctgt 3360 taccagtggc tgctgccagt ggcgataagt cgtgtcttac cgggttggac tcaagacgat 3420 agttaccgga taaggcgcag cggtcgggct gaacgggggg ttcgtgcaca cagcccagct 3480 tggagcgaac gacctacacc gaactgagat acctacagcg tgagctatga gaaagcgcca 3540 cgcttcccga agggagaaag gcggacaggt atccggtaag cggcagggtc ggaacaggag 3600 agcgcacgag ggagcttcca gggggaaacg cctggtatct ttatagtcct gtcgggtttc 3660 gccacctctg acttgagcgt cgatttttgt gatgctcgtc aggggggcgg agcctatgga 3720 aaaacgccag caacgcggcc tttttacggt tcctggcctt ttgctggcct tttgctcaca 3780 tgttctttcc tgcgttatcc cctgattctg tggataaccg tattaccgcc tttgagtgag 3840 ctgataccgc tcgccgcagc cgaacgaccg agcgcagcga gtcagtgagc gaggaagcgg 3900 aagagcgcct gatgcggtat tttctcctta cgcatctgtg cggtatttca caccgcatat 3960 atggtgcact ctcagtacaa tctgctctga tgccgcatag ttaagccagt atacactccg 4020 ctatcgctac gtgactgggt catggctgcg ccccgacacc cgccaacacc cgctgacgcg 4080 ccctgacggg cttgtctgct cccggcatcc gcttacagac aagctgtgac cgtctccggg 4140 agctgcatgt gtcagaggtt ttcaccgtca tcaccgaaac gcgcgaggca gctgcggtaa 4200 agctcatcag cgtggtcgtg aagcgattca cagatgtctg cctgttcatc cgcgtccagc 4260 tcgttgagtt tctccagaag cgttaatgtc tggcttctga taaagcgggc catgttaagg 4320 gcggtttttt cctgtttggt cactgatgcc tccgtgtaag ggggatttct gttcatgggg 4380 gtaatgatac cgatgaaacg agagaggatg ctcacgatac gggttactga tgatgaacat 4440 gcccggttac tggaacgttg tgagggtaaa caactggcgg tatggatgcg gcgggaccag 4500 agaaaaatca ctcagggtca atgccagcgc ttcgttaata cagatgtagg tgttccacag 4560 ggtagccagc agcatcctgc gatgcagatc cggaacataa tggtgcaggg cgctgacttc 4620 cgcgtttcca gactttacga aacacggaaa ccgaagacca ttcatgttgt tgctcaggtc 4680 gcagacgttt tgcagcagca gtcgcttcac gttcgctcgc gtatcggtga ttcattctgc 4740 taaccagtaa ggcaaccccg ccagcctagc cgggtcctca acgacaggag cacgatcatg 4800 cgcacccgtg gggccgccat gccggcgata atggcctgct tctcgccgaa acgtttggtg 4860 gcgggaccag tgacgaaggc ttgagcgagg gcgtgcaaga ttccgaatac cgcaagcgac 4920 aggccgatca tcgtcgcgct ccagcgaaag cggtcctcgc cgaaaatgac ccagagcgct 4980 gccggcacct gtcctacgag ttgcatgata aagaagacag tcataagtgc ggcgacgata 5040 gtcatgcccc gcgcccaccg gaaggagctg actgggttga aggctctcaa gggcatcggt 5100 cgagatcccg gtgcctaatg agtgagctaa cttacattaa ttgcgttgcg ctcactgccc 5160 gctttccagt cgggaaacct gtcgtgccag ctgcattaat gaatcggcca acgcgcgggg 5220 agaggcggtt tgcgtattgg gcgccagggt ggtttttctt ttcaccagtg agacgggcaa 5280 cagctgattg cccttcaccg cctggccctg agagagttgc agcaagcggt ccacgctggt 5340 ttgccccagc aggcgaaaat cctgtttgat ggtggttaac ggcgggatat aacatgagct 5400 gtcttcggta tcgtcgtatc ccactaccga gatatccgca ccaacgcgca gcccggactc 5460 ggtaatggcg cgcattgcgc ccagcgccat ctgatcgttg gcaaccagca tcgcagtggg 5520 aacgatgccc tcattcagca tttgcatggt ttgttgaaaa ccggacatgg cactccagtc 5580 gccttcccgt tccgctatcg gctgaatttg attgcgagtg agatatttat gccagccagc 5640 cagacgcaga cgcgccgaga cagaacttaa tgggcccgct aacagcgcga tttgctggtg 5700 acccaatgcg accagatgct ccacgcccag tcgcgtaccg tcttcatggg agaaaataat 5760 actgttgatg ggtgtctggt cagagacatc aagaaataac gccggaacat tagtgcaggc 5820 agcttccaca gcaatggcat cctggtcatc cagcggatag ttaatgatca gcccactgac 5880 gcgttgcgcg agaagattgt gcaccgccgc tttacaggct tcgacgccgc ttcgttctac 5940 catcgacacc accacgctgg cacccagttg atcggcgcga gatttaatcg ccgcgacaat 6000 ttgcgacggc gcgtgcaggg ccagactgga ggtggcaacg ccaatcagca acgactgttt 6060 gcccgccagt tgttgtgcca cgcggttggg aatgtaattc agctccgcca tcgccgcttc 6120 cactttttcc cgcgttttcg cagaaacgtg gctggcctgg ttcaccacgc gggaaacggt 6180 ctgataagag acaccggcat actctgcgac atcgtataac gttactggtt tcacattcac 6240 caccctgaat tgactctctt ccgggcgcta tcatgccata ccgcgaaagg ttttgcgcca 6300 ttcgatggtg tccgggatct cgacgctctc ccttatgcga ctcctgcatt aggaagcagc 6360 ccagtagtag gttgaggccg ttgagcaccg ccgccgcaag gaatggtgca tgcaaggaga 6420 tggcgcccaa cagtcccccg gccacggggc ctgccaccat acccacgccg aaacaagcgc 6480 tcatgagccc gaagtggcga gcccgatctt ccccatcggt gatgtcggcg atataggcgc 6540 cagcaaccgc acctgtggcg ccggtgatgc cggccacgat gcgtccggcg tagaggatcg 6600 a 6601 <210> 620 <211> 4 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> GGGS linker <400> 620 Gly Gly Gly Ser 1 <210> 621 <211> 405 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant PAI-1 <223> OptiPAI-1stab <400> 621 Met Ser Gly Leu Asn Asp Ile Phe Glu Ala Gln Lys Ile Glu Trp His 1 5 10 15 Glu Ala Ser Glu Asn Leu Tyr Phe Gln Gly Val His His Pro Pro Ser 20 25 30 Tyr Val Ala His Leu Ala Ser Asp Phe Gly Val Arg Val Phe Gln Gln 35 40 45 Val Ala Gln Ala Ser Lys Asp Arg Asn Val Val Phe Ser Pro Tyr Gly 50 55 60 Val Ala Ser Val Leu Ala Met Leu Gln Leu Thr Thr Gly Gly Glu Thr 65 70 75 80 Gln Gln Gln Ile Gln Ala Ala Met Gly Phe Lys Ile Asp Asp Lys Gly 85 90 95 Met Ala Pro Ala Leu Arg His Leu Tyr Lys Glu Leu Met Gly Pro Trp 100 105 110 Asn Lys Asp Glu Ile Ser Thr Thr Asp Ala Ile Phe Val Gln Arg Asp 115 120 125 Leu Lys Leu Val Gln Gly Phe Met Pro His Phe Phe Arg Leu Phe Arg 130 135 140 Ser Thr Val Lys Gln Val Asp Phe Ser Glu Val Glu Arg Ala Arg Phe 145 150 155 160 Ile Ile Asn Asp Trp Val Lys Thr His Thr Lys Gly Met Ile Ser His 165 170 175 Leu Leu Gly Thr Gly Ala Val Asp Gln Leu Thr Arg Leu Val Leu Val 180 185 190 Asn Ala Leu Tyr Phe Asn Gly Gln Trp Lys Thr Pro Phe Pro Asp Ser 195 200 205 Ser Thr His Arg Arg Leu Phe His Lys Ser Asp Gly Ser Thr Val Ser 210 215 220 Val Pro Met Met Ala Gln Thr Asn Lys Phe Asn Tyr Thr Glu Phe Thr 225 230 235 240 Thr Pro Asp Gly His Tyr Tyr Asp Ile Leu Glu Leu Pro Tyr His Gly 245 250 255 Asp Thr Leu Ser Met Phe Ile Ala Ala Pro Tyr Glu Lys Glu Val Pro 260 265 270 Leu Ser Ala Leu Thr Asn Ile Leu Ser Ala Gln Leu Ile Ser His Trp 275 280 285 Lys Gly Asn Met Thr Arg Leu Pro Arg Leu Leu Val Leu Pro Lys Phe 290 295 300 Ser Leu Glu Thr Glu Val Asp Leu Arg Lys Pro Leu Glu Asn Leu Gly 305 310 315 320 Met Thr Asp Met Phe Arg Gln Phe Gln Ala Asp Phe Thr Ser Leu Ser 325 330 335 Asp Gln Glu Pro Leu His Val Ala Leu Ala Leu Gln Lys Val Lys Ile 340 345 350 Glu Val Asn Glu Ser Gly Thr Val Ala Ser Ser Ser Thr Ala Val Ile 355 360 365 Arg Arg Ala Arg Met Ala Pro Glu Glu Ile Ile Ile Asp Arg Pro Phe 370 375 380 Leu Phe Val Val Arg His Asn Pro Thr Gly Thr Val Leu Phe Met Gly 385 390 395 400 Gln Val Met Glu Pro 405 <210> 622 <211> 381 <212> PRT <213> Homo sapiens <220> <223> Mutant PAI-1 <223> V1C OptiPAI-1stab <400> 622 Met Cys Val His His Pro Pro Ser Tyr Val Ala His Leu Ala Ser Asp 1 5 10 15 Phe Gly Val Arg Val Phe Gln Gln Val Ala Gln Ala Ser Lys Asp Arg 20 25 30 Asn Val Val Phe Ser Pro Tyr Gly Val Ala Ser Val Leu Ala Met Leu 35 40 45 Gln Leu Thr Thr Gly Gly Glu Thr Gln Gln Gln Ile Gln Ala Ala Met 50 55 60 Gly Phe Lys Ile Asp Asp Lys Gly Met Ala Pro Ala Leu Arg His Leu 65 70 75 80 Tyr Lys Glu Leu Met Gly Pro Trp Asn Lys Asp Glu Ile Ser Thr Thr 85 90 95 Asp Ala Ile Phe Val Gln Arg Asp Leu Lys Leu Val Gln Gly Phe Met 100 105 110 Pro His Phe Phe Arg Leu Phe Arg Ser Thr Val Lys Gln Val Asp Phe 115 120 125 Ser Glu Val Glu Arg Ala Arg Phe Ile Ile Asn Asp Trp Val Lys Thr 130 135 140 His Thr Lys Gly Met Ile Ser His Leu Leu Gly Thr Gly Ala Val Asp 145 150 155 160 Gln Leu Thr Arg Leu Val Leu Val Asn Ala Leu Tyr Phe Asn Gly Gln 165 170 175 Trp Lys Thr Pro Phe Pro Asp Ser Ser Thr His Arg Arg Leu Phe His 180 185 190 Lys Ser Asp Gly Ser Thr Val Ser Val Pro Met Met Ala Gln Thr Asn 195 200 205 Lys Phe Asn Tyr Thr Glu Phe Thr Thr Pro Asp Gly His Tyr Tyr Asp 210 215 220 Ile Leu Glu Leu Pro Tyr His Gly Asp Thr Leu Ser Met Phe Ile Ala 225 230 235 240 Ala Pro Tyr Glu Lys Glu Val Pro Leu Ser Ala Leu Thr Asn Ile Leu 245 250 255 Ser Ala Gln Leu Ile Ser His Trp Lys Gly Asn Met Thr Arg Leu Pro 260 265 270 Arg Leu Leu Val Leu Pro Lys Phe Ser Leu Glu Thr Glu Val Asp Leu 275 280 285 Arg Lys Pro Leu Glu Asn Leu Gly Met Thr Asp Met Phe Arg Gln Phe 290 295 300 Gln Ala Asp Phe Thr Ser Leu Ser Asp Gln Glu Pro Leu His Val Ala 305 310 315 320 Leu Ala Leu Gln Lys Val Lys Ile Glu Val Asn Glu Ser Gly Thr Val 325 330 335 Ala Ser Ser Ser Thr Ala Val Ile Arg Arg Ala Arg Met Ala Pro Glu 340 345 350 Glu Ile Ile Ile Asp Arg Pro Phe Leu Phe Val Val Arg His Asn Pro 355 360 365 Thr Gly Thr Val Leu Phe Met Gly Gln Val Met Glu Pro 370 375 380 <210> 623 <211> 6526 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pCAT0051 vector <400> 623 gatctcgatc ccgcgaaatt aatacgactc actatagggg aattgtgagc ggataacaat 60 tcccctctag aaataatttt gtttaacttt aagaaggaga tatacatatg tgccatcatc 120 cgccgagcta tgtagcgcat ctggcttccg actttggcgt gcgtgtgttt cagcaggtcg 180 cccaggcgtc aaaagatcgc aatgtggtgt tcagcccgta tggtgttgcg tccgtgttgg 240 cgatgcttca acttactacc ggcggtgaaa cgcagcaaca gattcaggcg gcgatgggct 300 tcaagataga tgacaaaggc atggcacccg ccctgcgtca tctgtataaa gaactgatgg 360 ggccgtggaa caaagatgag attagcacca ccgatgcgat atttgtgcag cgcgatctga 420 agctggtcca gggattcatg cctcatttct tccgtctgtt tcgtagcacc gtgaaacagg 480 tggattttag cgaggtggag cgtgcccgct tcatcataaa cgattgggtg aagacccaca 540 cgaagggcat gatttcgcac ctgcttggga ccggcgctgt ggatcaactg acccgtctgg 600 tgctggtaaa tgcgttgtat ttcaacgggc aatggaaaac cccgtttccg gattcaagca 660 cccatcgtcg tctttttcat aaaagcgatg gctctaccgt cagcgtcccc atgatggcgc 720 agacgaacaa attcaattac accgaattca ccacgccgga tggccactac tatgatattc 780 tggagctgcc gtaccatggc gataccctga gcatgttcat tgcggcaccg tatgagaaag 840 aagtgccgct gtcggctctg accaacattc tgagcgcgca gcttattagc cattggaaag 900 gcaatatgac ccgcctgcca cgtctgctgg ttctgccgaa atttagcctg gagaccgaag 960 tggatctgcg taaaccgctg gagaatctgg ggatgacgga tatgttccgg cagtttcaag 1020 ctgatttcac cagccttagc gaccaggaac ctctgcatgt ggccctggcg ttgcagaagg 1080 ttaagatcga agtgaatgaa agcggaaccg tggcgtctag tagcactgct gtgattcgtc 1140 gtgcgcgtat ggcgcctgag gaaattatca tcgaccgtcc gttcctgttt gtggtgcgtc 1200 acaatccgac cgggactgtg ctgtttatgg gccaggtgat ggaaccgtaa taagcttgcg 1260 gccgcactcg agcaccacca ccaccaccac tgagatccgg ctgctaacaa agcccgaaag 1320 gaagctgagt tggctgctgc caccgctgag caataactag cataacccct tggggcctct 1380 aaacgggtct tgaggggttt tttgctgaaa ggaggaacta tatccggatt ggcgaatggg 1440 acgcgccctg tagcggcgca ttaagcgcgg cgggtgtggt ggttacgcgc agcgtgaccg 1500 ctacacttgc cagcgcccta gcgcccgctc ctttcgcttt cttcccttcc tttctcgcca 1560 cgttcgccgg ctttccccgt caagctctaa atcgggggct ccctttaggg ttccgattta 1620 gtgctttacg gcacctcgac cccaaaaaac ttgattaggg tgatggttca cgtagtgggc 1680 catcgccctg atagacggtt tttcgccctt tgacgttgga gtccacgttc tttaatagtg 1740 gactcttgtt ccaaactgga acaacactca accctatctc ggtctattct tttgatttat 1800 aagggatttt gccgatttcg gcctattggt taaaaaatga gctgatttaa caaaaattta 1860 acgcgaattt taacaaaata ttaacgttta caatttcagg tggcactttt cggggaaatg 1920 tgcgcggaac ccctatttgt ttatttttct aaatacattc aaatatgtat ccgctcatga 1980 gacaataacc ctgataaatg cttcaataat attgaaaaag gaagagtatg agtattcaac 2040 atttccgtgt cgcccttatt cccttttttg cggcattttg ccttcctgtt tttgctcacc 2100 cagaaacgct ggtgaaagta aaagatgctg aagatcagtt gggtgcacga gtgggttaca 2160 tcgaactgga tctcaacagc ggtaagatcc ttgagagttt tcgccccgaa gaacgttttc 2220 caatgatgag cacttttaaa gttctgctat gtggcgcggt attatcccgt attgacgccg 2280 ggcaagagca actcggtcgc cgcatacact attctcagaa tgacttggtt gagtactcac 2340 cagtcacaga aaagcatctt acggatggca tgacagtaag agaattatgc agtgctgcca 2400 taaccatgag tgataacact gcggccaact tacttctgac aacgatcgga ggaccgaagg 2460 agctaaccgc ttttttgcac aacatggggg atcatgtaac tcgccttgat cgttgggaac 2520 cggagctgaa tgaagccata ccaaacgacg agcgtgacac cacgatgcct gcagcaatgg 2580 caacaacgtt gcgcaaacta ttaactggcg aactacttac tctagcttcc cggcaacaat 2640 taatagactg gatggaggcg gataaagttg caggaccact tctgcgctcg gcccttccgg 2700 ctggctggtt tattgctgat aaatctggag ccggtgagcg tgggtctcgc ggtatcattg 2760 cagcactggg gccagatggt aagccctccc gtatcgtagt tatctacacg acggggagtc 2820 aggcaactat ggatgaacga aatagacaga tcgctgagat aggtgcctca ctgattaagc 2880 attggtaact gtcagaccaa gtttactcat atatacttta gattgattta aaacttcatt 2940 tttaatttaa aaggatctag gtgaagatcc tttttgataa tctcatgacc aaaatccctt 3000 aacgtgagtt ttcgttccac tgagcgtcag accccgtaga aaagatcaaa ggatcttctt 3060 gagatccttt ttttctgcgc gtaatctgct gcttgcaaac aaaaaaacca ccgctaccag 3120 cggtggtttg tttgccggat caagagctac caactctttt tccgaaggta actggcttca 3180 gcagagcgca gataccaaat actgtccttc tagtgtagcc gtagttaggc caccacttca 3240 agaactctgt agcaccgcct acatacctcg ctctgctaat cctgttacca gtggctgctg 3300 ccagtggcga taagtcgtgt cttaccgggt tggactcaag acgatagtta ccggataagg 3360 cgcagcggtc gggctgaacg gggggttcgt gcacacagcc cagcttggag cgaacgacct 3420 acaccgaact gagataccta cagcgtgagc tatgagaaag cgccacgctt cccgaaggga 3480 gaaaggcgga caggtatccg gtaagcggca gggtcggaac aggagagcgc acgagggagc 3540 ttccaggggg aaacgcctgg tatctttata gtcctgtcgg gtttcgccac ctctgacttg 3600 agcgtcgatt tttgtgatgc tcgtcagggg ggcggagcct atggaaaaac gccagcaacg 3660 cggccttttt acggttcctg gccttttgct ggccttttgc tcacatgttc tttcctgcgt 3720 tatcccctga ttctgtggat aaccgtatta ccgcctttga gtgagctgat accgctcgcc 3780 gcagccgaac gaccgagcgc agcgagtcag tgagcgagga agcggaagag cgcctgatgc 3840 ggtattttct ccttacgcat ctgtgcggta tttcacaccg catatatggt gcactctcag 3900 tacaatctgc tctgatgccg catagttaag ccagtataca ctccgctatc gctacgtgac 3960 tgggtcatgg ctgcgccccg acacccgcca acacccgctg acgcgccctg acgggcttgt 4020 ctgctcccgg catccgctta cagacaagct gtgaccgtct ccgggagctg catgtgtcag 4080 aggttttcac cgtcatcacc gaaacgcgcg aggcagctgc ggtaaagctc atcagcgtgg 4140 tcgtgaagcg attcacagat gtctgcctgt tcatccgcgt ccagctcgtt gagtttctcc 4200 agaagcgtta atgtctggct tctgataaag cgggccatgt taagggcggt tttttcctgt 4260 ttggtcactg atgcctccgt gtaaggggga tttctgttca tgggggtaat gataccgatg 4320 aaacgagaga ggatgctcac gatacgggtt actgatgatg aacatgcccg gttactggaa 4380 cgttgtgagg gtaaacaact ggcggtatgg atgcggcggg accagagaaa aatcactcag 4440 ggtcaatgcc agcgcttcgt taatacagat gtaggtgttc cacagggtag ccagcagcat 4500 cctgcgatgc agatccggaa cataatggtg cagggcgctg acttccgcgt ttccagactt 4560 tacgaaacac ggaaaccgaa gaccattcat gttgttgctc aggtcgcaga cgttttgcag 4620 cagcagtcgc ttcacgttcg ctcgcgtatc ggtgattcat tctgctaacc agtaaggcaa 4680 ccccgccagc ctagccgggt cctcaacgac aggagcacga tcatgcgcac ccgtggggcc 4740 gccatgccgg cgataatggc ctgcttctcg ccgaaacgtt tggtggcggg accagtgacg 4800 aaggcttgag cgagggcgtg caagattccg aataccgcaa gcgacaggcc gatcatcgtc 4860 gcgctccagc gaaagcggtc ctcgccgaaa atgacccaga gcgctgccgg cacctgtcct 4920 acgagttgca tgataaagaa gacagtcata agtgcggcga cgatagtcat gccccgcgcc 4980 caccggaagg agctgactgg gttgaaggct ctcaagggca tcggtcgaga tcccggtgcc 5040 taatgagtga gctaacttac attaattgcg ttgcgctcac tgcccgcttt ccagtcggga 5100 aacctgtcgt gccagctgca ttaatgaatc ggccaacgcg cggggagagg cggtttgcgt 5160 attgggcgcc agggtggttt ttcttttcac cagtgagacg ggcaacagct gattgccctt 5220 caccgcctgg ccctgagaga gttgcagcaa gcggtccacg ctggtttgcc ccagcaggcg 5280 aaaatcctgt ttgatggtgg ttaacggcgg gatataacat gagctgtctt cggtatcgtc 5340 gtatcccact accgagatat ccgcaccaac gcgcagcccg gactcggtaa tggcgcgcat 5400 tgcgcccagc gccatctgat cgttggcaac cagcatcgca gtgggaacga tgccctcatt 5460 cagcatttgc atggtttgtt gaaaaccgga catggcactc cagtcgcctt cccgttccgc 5520 tatcggctga atttgattgc gagtgagata tttatgccag ccagccagac gcagacgcgc 5580 cgagacagaa cttaatgggc ccgctaacag cgcgatttgc tggtgaccca atgcgaccag 5640 atgctccacg cccagtcgcg taccgtcttc atgggagaaa ataatactgt tgatgggtgt 5700 ctggtcagag acatcaagaa ataacgccgg aacattagtg caggcagctt ccacagcaat 5760 ggcatcctgg tcatccagcg gatagttaat gatcagccca ctgacgcgtt gcgcgagaag 5820 attgtgcacc gccgctttac aggcttcgac gccgcttcgt tctaccatcg acaccaccac 5880 gctggcaccc agttgatcgg cgcgagattt aatcgccgcg acaatttgcg acggcgcgtg 5940 cagggccaga ctggaggtgg caacgccaat cagcaacgac tgtttgcccg ccagttgttg 6000 tgccacgcgg ttgggaatgt aattcagctc cgccatcgcc gcttccactt tttcccgcgt 6060 tttcgcagaa acgtggctgg cctggttcac cacgcgggaa acggtctgat aagagacacc 6120 ggcatactct gcgacatcgt ataacgttac tggtttcaca ttcaccaccc tgaattgact 6180 ctcttccggg cgctatcatg ccataccgcg aaaggttttg cgccattcga tggtgtccgg 6240 gatctcgacg ctctccctta tgcgactcct gcattaggaa gcagcccagt agtaggttga 6300 ggccgttgag caccgccgcc gcaaggaatg gtgcatgcaa ggagatggcg cccaacagtc 6360 ccccggccac ggggcctgcc accataccca cgccgaaaca agcgctcatg agcccgaagt 6420 ggcgagcccg atcttcccca tcggtgatgt cggcgatata ggcgccagca accgcacctg 6480 tggcgccggt gatgccggcc acgatgcgtc cggcgtagag gatcga 6526 <210> 624 <211> 4202 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pQE30 vector <400> 624 ctcgagaaat cataaaaaat ttatttgctt tgtgagcgga taacaattat aatagattca 60 attgtgagcg gataacaatt tcacacagaa ttcattaaag aggagaaatt aactatgaga 120 ggatcgcatc accatcacca tcacggatcc gatgagaagg actgcgactg tgggctgcgg 180 tcattcacga gacaggctcg tgttgttggg ggcacggatg cggatgaggg cgagtggccc 240 tggcaggtaa gcctgcatgc tctgggccag ggccacatct gcggtgcttc cctcatctct 300 cccaactggc tggtctctgc cgcacactgc tacatcgatg acagaggatt caggtactca 360 gaccccacgc agtggacggc cttcctgggc ttgcacgacc agagccagcg cagcgcccct 420 ggggtgcagg agcgcaggct caagcgcatc atctcccacc ccttcttcaa tgacttcacc 480 ttcgactatg acatcgcgct gctggagctg gagaaaccgg cagagtacag ctccatggtg 540 cggcccatct gcctgccgga cgcctcccat gtcttccctg ccggcaaggc catctgggtc 600 acgggctggg gacacaccca gtatggaggc actggcgcgc tgatcctgca aaagggtgag 660 atccgcgtca tcaaccagac cacctgcgag aacctcctgc cgcagcagat cacgccgcgc 720 atgatgtgcg tgggcttcct cagcggcggc gtggactcct gccagggtga ttccggggga 780 cccctgtcca gcgtggaggc ggatgggcgg atcttccagg ccggtgtggt gagctgggga 840 gacggctgcg ctcagaggaa caagccaggc gtgtacacaa ggctccctct gtttcgggac 900 tggatcaaag agaacactgg ggtatagaag cttaattagc tgagcttgga ctcctgttga 960 tagatccagt aatgacctca gaactccatc tggatttgtt cagaacgctc ggttgccgcc 1020 gggcgttttt tattggtgag aatccaagct agcttggcga gattttcagg agctaaggaa 1080 gctaaaatgg agaaaaaaat cactggatat accaccgttg atatatccca atggcatcgt 1140 aaagaacatt ttgaggcatt tcagtcagtt gctcaatgta cctataacca gaccgttcag 1200 ctggatatta cggccttttt aaagaccgta aagaaaaata agcacaagtt ttatccggcc 1260 tttattcaca ttcttgcccg cctgatgaat gctcatccgg aatttcgtat ggcaatgaaa 1320 gacggtgagc tggtgatatg ggatagtgtt cacccttgtt acaccgtttt ccatgagcaa 1380 actgaaacgt tttcatcgct ctggagtgaa taccacgacg atttccggca gtttctacac 1440 atatattcgc aagatgtggc gtgttacggt gaaaacctgg cctatttccc taaagggttt 1500 attgagaata tgtttttcgt ctcagccaat ccctgggtga gtttcaccag ttttgattta 1560 aacgtggcca atatggacaa cttcttcgcc cccgttttca ccatgggcaa atattatacg 1620 caaggcgaca aggtgctgat gccgctggcg attcaggttc atcatgccgt ttgtgatggc 1680 ttccatgtcg gcagaatgct taatgaatta caacagtact gcgatgagtg gcagggcggg 1740 gcgtaatttt tttaaggcag ttattggtgc ccttaaacgc ctggggtaat gactctctag 1800 cttgaggcat caaataaaac gaaaggctca gtcgaaagac tgggcctttc gttttatctg 1860 ttgtttgtcg gtgaacgctc tcctgagtag gacaaatccg ccctctagag ctgcctcgcg 1920 cgtttcggtg atgacggtga aaacctctga cacatgcagc tcccggagac ggtcacagct 1980 tgtctgtaag cggatgccgg gagcagacaa gcccgtcagg gcgcgtcagc gggtgttggc 2040 gggtgtcggg gcgcagccat gacccagtca cgtagcgata gcggagtgta tactggctta 2100 actatgcggc atcagagcag attgtactga gagtgcacca tatgcggtgt gaaataccgc 2160 acagatgcgt aaggagaaaa taccgcatca ggcgctcttc cgcttcctcg ctcactgact 2220 cgctgcgctc ggtcgttcgg ctgcggcgag cggtatcagc tcactcaaag gcggtaatac 2280 ggttatccac agaatcaggg gataacgcag gaaagaacat gtgagcaaaa ggccagcaaa 2340 aggccaggaa ccgtaaaaag gccgcgttgc tggcgttttt ccataggctc cgcccccctg 2400 acgagcatca caaaaatcga cgctcaagtc agaggtggcg aaacccgaca ggactataaa 2460 gataccaggc gtttccccct ggaagctccc tcgtgcgctc tcctgttccg accctgccgc 2520 ttaccggata cctgtccgcc tttctccctt cgggaagcgt ggcgctttct catagctcac 2580 gctgtaggta tctcagttcg gtgtaggtcg ttcgctccaa gctgggctgt gtgcacgaac 2640 cccccgttca gcccgaccgc tgcgccttat ccggtaacta tcgtcttgag tccaacccgg 2700 taagacacga cttatcgcca ctggcagcag ccactggtaa caggattagc agagcgaggt 2760 atgtaggcgg tgctacagag ttcttgaagt ggtggcctaa ctacggctac actagaagga 2820 cagtatttgg tatctgcgct ctgctgaagc cagttacctt cggaaaaaga gttggtagct 2880 cttgatccgg caaacaaacc accgctggta gcggtggttt ttttgtttgc aagcagcaga 2940 ttacgcgcag aaaaaaagga tctcaagaag atcctttgat cttttctacg gggtctgacg 3000 ctcagtggaa cgaaaactca cgttaaggga ttttggtcat gagattatca aaaaggatct 3060 tcacctagat ccttttaaat taaaaatgaa gttttaaatc aatctaaagt atatatgagt 3120 aaacttggtc tgacagttac caatgcttaa tcagtgaggc acctatctca gcgatctgtc 3180 tatttcgttc atccatagtt gcctgactcc ccgtcgtgta gataactacg atacgggagg 3240 gcttaccatc tggccccagt gctgcaatga taccgcgaga cccacgctca ccggctccag 3300 atttatcagc aataaaccag ccagccggaa gggccgagcg cagaagtggt cctgcaactt 3360 tatccgcctc catccagtct attaattgtt gccgggaagc tagagtaagt agttcgccag 3420 ttaatagttt gcgcaacgtt gttgccattg ctacaggcat cgtggtgtca cgctcgtcgt 3480 ttggtatggc ttcattcagc tccggttccc aacgatcaag gcgagttaca tgatccccca 3540 tgttgtgcaa aaaagcggtt agctccttcg gtcctccgat cgttgtcaga agtaagttgg 3600 ccgcagtgtt atcactcatg gttatggcag cactgcataa ttctcttact gtcatgccat 3660 ccgtaagatg cttttctgtg actggtgagt actcaaccaa gtcattctga gaatagtgta 3720 tgcggcgacc gagttgctct tgcccggcgt caatacggga taataccgcg ccacatagca 3780 gaactttaaa agtgctcatc attggaaaac gttcttcggg gcgaaaactc tcaaggatct 3840 taccgctgtt gagatccagt tcgatgtaac ccactcgtgc acccaactga tcttcagcat 3900 cttttacttt caccagcgtt tctgggtgag caaaaacagg aaggcaaaat gccgcaaaaa 3960 agggaataag ggcgacacgg aaatgttgaa tactcatact cttccttttt caatattatt 4020 gaagcattta tcagggttat tgtctcatga gcggatacat atttgaatgt atttagaaaa 4080 ataaacaaat aggggttccg cgcacatttc cccgaaaagt gccacctgac gtctaagaaa 4140 ccattattat catgacatta acctataaaa ataggcgtat cacgaggccc tttcgtcttc 4200 ac 4202 <210> 625 <211> 4822 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> pPAI-his vector <220> <221> misc_feature <222> (1)...(4822) <223> n = A,T,C or G <400> 625 gatctcgatc ccgcgaaatt aatacgactc actataggga gaccacaacg gtttccctct 60 agaaataatt ttgtttaact ttaagaagga gatatacata tgcaccatca ccatcaccat 120 gctagcgaga atctttattt tcagggcgtg caccatcccc catcctacgt ggcccacctg 180 gcctcagact tcggggtgag ggtgtttcag caggtggcgc aggcctccaa ggaccgcaac 240 gtggttttct caccctatgg ggtggcctcg gtgttggcca tgctccagct gacaacagga 300 ggagaaaccc agcagcagat tcaagcagct atgggattca agattgatga caagggcatg 360 gcccccgccc tccggcatct gtacaaggag ctcatggggc catggaacaa ggatgagatc 420 agcaccacag acgcgatctt cgtccagcgg gatctgaagc tggtccaggg cttcatgccc 480 cacttcttca ggctgttccg gagcacggtc aagcaagtgg acttttcaga ggtggagaga 540 gccagattca tcatcaatga ctgggtgaag acacacacaa aaggtatgat cagcaacttg 600 cttgggaaag gagccgtgga ccagctgaca cggctggtgc tggtgaatgc cctctacttc 660 aacggccagt ggaagactcc cttccccgac tccagcaccc accgccgcct cttccacaaa 720 tcagacggca gcactgtctc tgtgcccatg atggctcaga ccaacaagtt caactatact 780 gagttcacca cgcccgatgg ccattactac gacatcctgg aactgcccta ccacggggac 840 accctcagca tgttcattgc tgccccttat gaaaaagagg tgcctctctc tgccctcacc 900 aacattctga gtgcccagct catcagccac tggaaaggca acatgaccag gctgccccgc 960 ctcctggttc tgcccaagtt ctccctggag actgaagtcg acctcaggaa gcccctagag 1020 aacctgggaa tgaccgacat gttcagacag tttcaggctg acttcacgag tctttcagac 1080 caagagcctc tccacgtcgc gcaggcgctg cagaaagtga agatcgaggt gaacgagagt 1140 ggcacggtgg cctcctcatc cacagctgtc atannnnnnn nnnnnnnnnn ncccgaggag 1200 atcatcatgg acagaccctt cctctttgtg gtccggcaca accccacagg aacagtcctt 1260 ttcatgggcc aagtgatgga accctgaaag cttccgggat ccggctgcta acaaagcccg 1320 aaaggaagct gagttggctg ctgccaccgc tgagcaataa ctagcataac cccttggggc 1380 ctctaaacgg gtcttgaggg gttttttgct gaaaggagga actatatccg gatcgacgcg 1440 aggctggatg gccttcccca ttatgattct tctcgcttcc ggcggcatcg ggatgcccgc 1500 gttgcaggcc atgctgtcca ggcaggtaga tgacgaccat cagggacagc ttcaaggatc 1560 gctcgcggct cttaccagcc taacttcgat cattggaccg ctgatcgtca cggcgattta 1620 tgccgcctcg gcgagcacat ggaacgggtt ggcatggatt gtaggcgccg ccctatacct 1680 tgtctgcctc cccgcgttgc gtcgcggtgc atggagccgg gccacctcga cctgaatgga 1740 agccggcggc acctcgctaa cggattcacc actccaagaa ttggagccaa tcaattcttg 1800 cggagaactg tgaatgcgca aaccaaccct tggcagaaca tatccatcgc gtccgccatc 1860 tccagcagcc gcacgcggcg catctcgggc agcgttgggt cctggccacg ggtgcgcatg 1920 atcgtgctcc tgtcgttgag gacccggcta ggctggcggg gttgccttac tggttagcag 1980 aatgaatcac cgatacgcga gcgaacgtga agcgactgct gctgcaaaac gtctgcgacc 2040 tgagcaacaa catgaatggt cttcggtttc cgtgtttcgt aaagtctgga aacgcggaag 2100 tcagcgccct gcaccattat gttccggatc tgcatcgcag gatgctgctg gctaccctgt 2160 ggaacaccta catctgtatt aacgaagcgc tggcattgac cctgagtgat ttttctctgg 2220 tcccgccgca tccataccgc cagttgttta ccctcacaac gttccagtaa ccgggcatgt 2280 tcatcatcag taacccgtat cgtgagcatc ctctctcgtt tcatcggtat cattaccccc 2340 atgaacagaa atccccctta cacggaggca tcagtgacca aacaggaaaa aaccgccctt 2400 aacatggccc gctttatcag aagccagaca ttaacgcttc tggagaaact caacgagctg 2460 gacgcggatg aacaggcaga catctgtgaa tcgcttcacg accacgctga tgagctttac 2520 cgcagctgcc tcgcgcgttt cggtgatgac ggtgaaaacc tctgacacat gcagctcccg 2580 gagacggtca cagcttgtct gtaagcggat gccgggagca gacaagcccg tcagggcgcg 2640 tcagcgggtg ttggcgggtg tcggggcgca gccatgaccc agtcacgtag cgatagcgga 2700 gtgtatactg gcttaactat gcggcatcag agcagattgt actgagagtg caccatatgc 2760 ggtgtgaaat accgcacaga tgcgtaagga gaaaataccg catcaggcgc tcttccgctt 2820 cctcgctcac tgactcgctg cgctcggtcg ttcggctgcg gcgagcggta tcagctcact 2880 caaaggcggt aatacggtta tccacagaat caggggataa cgcaggaaag aacatgtgag 2940 caaaaggcca gcaaaaggcc aggaaccgta aaaaggccgc gttgctggcg tttttccata 3000 ggctccgccc ccctgacgag catcacaaaa atcgacgctc aagtcagagg tggcgaaacc 3060 cgacaggact ataaagatac caggcgtttc cccctggaag ctccctcgtg cgctctcctg 3120 ttccgaccct gccgcttacc ggatacctgt ccgcctttct cccttcggga agcgtggcgc 3180 tttctcatag ctcacgctgt aggtatctca gttcggtgta ggtcgttcgc tccaagctgg 3240 gctgtgtgca cgaacccccc gttcagcccg accgctgcgc cttatccggt aactatcgtc 3300 ttgagtccaa cccggtaaga cacgacttat cgccactggc agcagccact ggtaacagga 3360 ttagcagagc gaggtatgta ggcggtgcta cagagttctt gaagtggtgg cctaactacg 3420 gctacactag aaggacagta tttggtatct gcgctctgct gaagccagtt accttcggaa 3480 aaagagttgg tagctcttga tccggcaaac aaaccaccgc tggtagcggt ggtttttttg 3540 tttgcaagca gcagattacg cgcagaaaaa aaggatctca agaagatcct ttgatctttt 3600 ctacggggtc tgacgctcag tggaacgaaa actcacgtta agggattttg gtcatgagat 3660 tatcaaaaag gatcttcacc tagatccttt taaattaaaa atgaagtttt aaatcaatct 3720 aaagtatata tgagtaaact tggtctgaca gttaccaatg cttaatcagt gaggcaccta 3780 tctcagcgat ctgtctattt cgttcatcca tagttgcctg actccccgtc gtgtagataa 3840 ctacgatacg ggagggctta ccatctggcc ccagtgctgc aatgataccg cgagacccac 3900 gctcaccggc tccagattta tcagcaataa accagccagc cggaagggcc gagcgcagaa 3960 gtggtcctgc aactttatcc gcctccatcc agtctattaa ttgttgccgg gaagctagag 4020 taagtagttc gccagttaat agtttgcgca acgttgttgc cattgctgca ggcatcgtgg 4080 tgtcacgctc gtcgtttggt atggcttcat tcagctccgg ttcccaacga tcaaggcgag 4140 ttacatgatc ccccatgttg tgcaaaaaag cggttagctc cttcggtcct ccgatcgttg 4200 tcagaagtaa gttggccgca gtgttatcac tcatggttat ggcagcactg cataattctc 4260 ttactgtcat gccatccgta agatgctttt ctgtgactgg tgagtactca accaagtcat 4320 tctgagaata gtgtatgcgg cgaccgagtt gctcttgccc ggcgtcaaca cgggataata 4380 ccgcgccaca tagcagaact ttaaaagtgc tcatcattgg aaaacgttct tcggggcgaa 4440 aactctcaag gatcttaccg ctgttgagat ccagttcgat gtaacccact cgtgcaccca 4500 actgatcttc agcatctttt actttcacca gcgtttctgg gtgagcaaaa acaggaaggc 4560 aaaatgccgc aaaaaaggga ataagggcga cacggaaatg ttgaatactc atactcttcc 4620 tttttcaata ttattgaagc atttatcagg gttattgtct catgagcgga tacatatttg 4680 aatgtattta gaaaaataaa caaatagggg ttccgcgcac atttccccga aaagtgccac 4740 ctgacgtcta agaaaccatt attatcatga cattaaccta taaaaatagg cgtatcacga 4800 ggccctttcg tcttcaagaa tt 4822 <210> 626 <211> 42 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> ATIII cDNA forward primer <400> 626 gtcactgact gacgtggatc ccacgggagc cctgtggaca tc 42 <210> 627 <211> 9 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> ATIII cDNA forward primer - encoded protein <400> 627 Gly Ser His Gly Ser Pro Val Asp Ile 1 5 <210> 628 <211> 60 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> ATIII cDNA reverse primer <400> 628 gtagccaacc cttgtgttaa gggaggcgga agccatcacc accatcacca ctaagaattc 60 <210> 629 <211> 17 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> ATIII cDNA reverse primer - encoded protein <400> 629 Val Ala Asn Pro Cys Val Lys Gly Gly Gly Ser His His His His His 1 5 10 15 His <210> 630 <211> 60 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Wild type AT3 primer <400> 630 gctgcaagta ccgctgttgt gattgctggc cgttcgctaa accccaacag ggtgactttc 60 <210> 631 <211> 20 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Wild type AT3 primer - encoded protein <400> 631 Ala Ala Ser Thr Ala Val Val Ile Ala Gly Arg Ser Leu Asn Pro Asn 1 5 10 15 Arg Val Thr Phe 20 <210> 632 <211> 60 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Complement C2 Target Sequence primer <400> 632 gctgcaagta ccgctgttgt gtcgttaggc cgtaaaatta accccaacag ggtgactttc 60 <210> 633 <211> 20 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> Complement C2 Target Sequence primer - encoded protein <400> 633 Ala Ala Ser Thr Ala Val Val Ser Leu Gly Arg Lys Ile Asn Pro Asn 1 5 10 15 Arg Val Thr Phe 20 <210> 634 <211> 60 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> VEGFR2 Target Sequence primer <400> 634 gctgcaagta ccgctgttgt gcgccgtgtg cgcaaagaaa accccaacag ggtgactttc 60 <210> 635 <211> 20 <212> PRT <213> Artificial Sequence <220> <223> VEGFR2 Target Sequence primer - encoded primer <400> 635 Ala Ala Ser Thr Ala Val Val Arg Arg Val Arg Lys Glu Asn Pro Asn 1 5 10 15 Arg Val Thr Phe 20 <210> 636 <211> 68 <212> DNA <213> Escherichia coli <220> <223> STII leader <400> 636 tgaaaaagaa tatcgcattt cttcttgcat ctatgttcgt tttttctatt gctacaaacg 60 cgtatgca 68

Claims (170)

  1. 하기의 단계를 포함하는,
    단백질 표적 기질 내 절단 서열을 절단하는 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분을 확인하거나 선별하는 방법:
    a) 돌연변이 프로테아제 또는 돌연변이 프로테아제의 촉매 활성 부분의 수거물을 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 접촉시키는 단계,
    여기서, 상기 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 단백질 표적 기질에 대한 절단 서열을 함유하는 반응성 부위를 포함하고;
    상기 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 서핀, 알파 마크로글로불린 계열의 구성원, p35 계열의 구성원 및 단백질 표적 기질의 절단 서열을 포함할 수 있도록 하나 이상의 아미노산이 대체, 제거, 또는 치환됨으로써 프로테아제 포획 폴리펩티드의 반응성 부위가 변형된 이들의 변형된 형태로부터 선택된 것이며;
    상기 접촉은, 상기 수거물 중의 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분에 의해 상기 프로테아제 포획 폴리펩타이드내 반응성 부위의 절단 서열의 아미노산이 절단을 위한 조건하에 수행되어, 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분과 공유적으로 결합된 상기 프로테아제 포획 폴리펩타이드를 함유하는 안정한 복합체가 형성하고;
    프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분에 의한 프로테아제 포획 폴리펩타이드내의 반응성 부위가 포함된 절단 서열 내의 아미노산의 절단시, 상기 프로테아제 포획 폴리펩타이드가 상기 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분과 공유 결합을 형성하여 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분을 포함하는 안정한 복합체를 형성함;
    b) 상기 수거물의 비복합체화된 구성원들로부터 상기 복합체화된 프로테아제를 분리하는 단계; 및
    c) 상기 프로테아제 포획 폴리펩타이드내 절단 서열을 절단하는 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분을 확인하고 선별하기 위해, 복합체내 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분을 확인하거나 선별함으로써, 상기 단백질 표적 기질을 절단하는 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분을 확인하거나 선별하는 단계.
  2. 삭제
  3. 제1항에 있어서, 프로테아제의 수거물이, 야생형 또는 주형 프로테아제의 1차 아미노산 서열 내 하나 이상의 아미노산 대체, 제거 또는 치환을 포함하는 프로테아제 또는 촉매 활성 부분을 함유하는 방법.
  4. 제3항에 있어서, 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분의 수거물이 비변형된 프로테아제와 비교하여 표적 기질에 대한 변화된 활성, 변화된 특이성, 또는 변화된 활성 및 특이성을 갖도록 변형된 방법.
  5. 제1항에 있어서,
    상기 프로테아제 포획 폴리펩타이드가 검출 또는 분리를 위해 표지화되고;
    분리가, 임의의 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분과 함께 상기 검출가능한 프로테아제 포획 폴리펩타이드를 함유하는 복합체의 포획에 의해 수행되는 방법.
  6. 제5항에 있어서, 포획이 현탁액, 용액 또는 고형 지지체에서 수행되는 방법.
  7. 제5항에 있어서, 상기 프로테아제 포획 폴리펩타이드가 비오틴으로 표지화되는 방법.
  8. 제1항에 있어서, 상기 분리된 복합체 내 상기 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분을 암호화하는 핵산을 증폭시키는 단계를 추가로 포함하며, 여기서 증폭은 숙주 세포에서 상기 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분을 암호화하는 상기 핵산의 성장 및 발현을 포함하는 방법.
  9. 제1항에 있어서,
    다수의 상이한 프로테아제 포획 폴리펩타이드가 상기 수거물과 접촉되고;
    2개 이상의 프로테아제 포획 폴리펩타이드가 확인가능하게 검출되어, 하나 이상의 프로테아제가 확인되는, 다중복합된 방법.
  10. 제1항에 있어서, 상기 복합체내 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분이 디스플레이되어, 수거물 내 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분의 확인 또는 선별 후에, 상기 확인 또는 선별된 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분을 암호화하는 핵산 분자를 숙주 세포 내 핵산 분자의 성장 및 발현에 의해 증폭하여 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분의 제2 수거물을 제조하는 방법.
  11. 제10항에 있어서, 상기 제2 수거물과 제2 프로테아제 포획 폴리펩타이드를 접촉시켜 제2 세트의 안정한 복합체를 제조하는 단계로써,
    여기서, 상기 제2 프로테아제 포획 폴리펩티드는 제2 수거물 유래 프로테아제 또는 이의 촉매 활성부분과 공유결합을 형성하여 제2 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 프로테아제 또는 이의 활성 부분을 포함하는 복합체를 형성하는 단계를 추가로 포함하는 방법.
  12. 제11항에 있어서, 상기 제2 프로테아제 포획 폴리펩타이드가 상기 제1 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 동일하거나 상이한 방법.
  13. 제11항에 있어서, 상기 제2 세트의 안정한 복합체내의 프로테아제를 확인하거나 선별하는 단계를 추가로 포함하는 방법.
  14. 제1항에 있어서, 상기 수거물이 5, 10, 50, 100, 500, 103, 104, 105 또는 106개 이상의 상이한 구성원을 함유하는 방법.
  15. 제1항에 있어서, 상기 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분이 세린 또는 시스테인 프로테아제인 방법.
  16. 제1항에 있어서, 상기 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분이 디스플레이되는 방법.
  17. 제16항에 있어서, 상기 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분이 고형 지지체상에, 세포 표면상에 또는 미생물 표면상에 디스플레이되는 방법.
  18. 제17항에 있어서, 상기 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분이 효모, 세균, 바이러스, 파지, 핵산, mRNA 분자 표면상에 또는 리보솜상에 디스플레이되는 방법.
  19. 제16항에 있어서, 상기 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분이 파지 디스플레이 라이브러리에서 디스플레이되는 방법.
  20. 제1항에 있어서, 상기 프로테아제가 프로테아제의 촉매 활성 부분으로서 제공되는 방법.
  21. 제1항에 있어서,
    2개 이상의 상이한 프로테아제 포획 폴리펩타이드가 상기 수거물과 접촉되고;
    하나 이상의 상기 프로테아제 포획 폴리펩타이드가 검출가능하게 표지화되어, 상기 검출가능한 프로테아제 포획 폴리펩타이드 및 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분을 함유하는 안정한 복합체의 포획이 수행되고;
    나머지 또는 나머지들이 상기 검출가능하게 표지된 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 비교하여 각각 과량으로 존재하는 방법.
  22. 제21항에 있어서, 검출가능한 표지가 비오틴인 방법.
  23. 제1항에 있어서, 상기 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분이 키모트립신, 서브틸리신, 카스파제 및 파파인 계열의 프로테아제로부터 선택되는 방법.
  24. 제23항에 있어서, 프로테아제가 세린 프로테아제, 시스테인 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분이고, 그랜자임 B, 테스티신, 트립스타제 베타 1, 칼리크레인 hk5, 코린, 칼리크레인 12, DESC1 오리테스아제, 트립스타제 감마 1, 칼리크레인 hK14, 하이알루로난-결합 세핀 프로테아제, 트립타제, 칼리크레인 hK15, 트립신, 호중구 엘라스타제, 만난-결합 렉틴-결합 세린 프로테아제-3, 카텝신 G, 미엘로블라스틴, 그랜자임 A, 그랜자임 M, 키마제, 그랜자임 K, 그랜자임 H, 키모트립신 B, 췌장 엘라스타제, 췌장 엔도펩티다제 E, 췌장 엘라스타제 II, 엔테로펩티다제, 키모트립신 C, 프로스타신, 칼리크레인 1, 칼리크레인 hK2, 칼리크레인 3, 사람 칼리크레인 8, 메소트립신, 인자 XII, 혈장 칼리크레인 KLK3, 인자 XI, 인자 IX, 인자 VII, 인자 Xa, 트롬빈, 단백질 C, 아크로신, 헵신, 간세포 성장 인자 활성화인자(uPA), 뇨 플라스미노겐 활성화인자(uPA), 조직 플라스미노겐 활성화인자(tPA), 플라스민, 뉴로신, 뉴로트립신, 뉴로프신, 칼리크레인 hK10, 에피텔리아신, 프로스타제, 키모파신, 칼리크레인 11, 막형 세린 프로테아제 1(MT-SP1), 스피네신, 카텝신 L, 카텝신 V, 카텝신 K, 카텝신 S, 카텝신 F, 카텝신 B, 파파인, 크루자인, 서브틸리신, 써미타제, C5a 펩티다제, 페르비도리신, 락토세핀, 푸린, 켁신, 카스파제-1, 카스파제 3, 카스파제-7, 카스파제-6, 카스파제-2, 카스파제-4, 카스파제-5, 카스파제-8, 카스파제-9, 카스파제-10, 카스파제-11, 카스파제-12, 카스파제-1, 카스파제-13 및 카스파제-14로부터 선택되는 방법.
  25. 제24항에 있어서, 상기 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분이 우로키나제 플라스미노겐 활성화인자(u-PA), 조직 플라스미노겐 활성화인자(t-PA) 및 막형 세린 프로테아제 1(MT-SP1)로부터 선택되는 방법.
  26. 제1항에 있어서, 상기 프로테아제 포획 폴리펩타이드가 표적 기질에 대해 미리 결정된 기질 특이성, 활성, 또는 기질 특이성 및 활성을 갖는 프로테아제에 의해 절단되도록 변형된 방법.
  27. 제1항에 있어서, 상기 프로테아제 포획 폴리펩타이드가 서핀이고, 상기 서핀 또는 이의 변형된 형태는 하기로부터 선택되는 방법:
    a) 플라스미노겐 활성화인자 억제제-1(PAI-1) 또는 단백질 표적 기질의 절단 서열을 포함할 수 있도록 하나 이상의 아미노산이 대체, 제거 또는 치환됨으로써 플라스미노겐 활성화인자 억제제-1(PAI-1)의 반응성 부위가 변형된 이의 변형된 형태; 및
    b) 안티트롬빈 III(AT3) 또는 단백질 표적 기질의 절단 서열을 포함할 수 있도록 하나 이상의 아미노산이 대체, 제거 또는 치환됨으로써 안티트롬빈 III(AT3)의 반응성 부위가 변형된 이의 변형된 형태.
  28. 제1항에 있어서, 상기 프로테아제 포획 폴리펩타이드가 알파-2-마크로글로불린 또는 단백질 표적 기질의 절단 서열을 포함할 수 있도록 하나 이상의 아미노산이 대체, 제거, 또는 치환됨으로써 알파-2-마크로글로불린의 반응성 부위가 변형된 이의 변형된 형태로부터 선택되는 방법.
  29. 삭제
  30. 삭제
  31. 제1항에 있어서, 표적 기질이 질환 또는 장애의 병인에 관여하는 방법.
  32. 제31항에 있어서, 표적 기질이 IL-5, IL-5 수용체, IL-1, IL-1 수용체, IL-13, IL-13 수용체, IL-12, IL-12 수용체, IL-4, IL-4 수용체, TNF, TNF 수용체, CCR5, CXCR4, gp120, gp141, CD4, RSV 융합 단백질, 헤마글루티닌, B7, CD28, IgE, IgE 수용체, CD2, CD3, CD40, IL-2, IL-2 수용체, VEGF, FGF, EGF, TGF, HER2, CCR1, CXCR3, CCR3, Src, Akt, Bcl-2, BCR-Ab1, GSK-3, Cdk-2, Cdk-4, EGFR, VEGFR-1, VEGFR-2 및 보체 단백질로부터 선택되는 방법.
  33. 제1항에 있어서, 표적 기질이 VEGFR, 보체 단백질, 또는 조직 플라스미노겐 활성화인자(tPA)의 기질인 방법.
  34. 제33항에 있어서, VEGFR이 VEGFR2인 방법.
  35. 제33항에 있어서, 보체 단백질이 C2인 방법.
  36. 제1항에 있어서, 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 서열번호 406-432 및 480-489 중 어느 하나로 제시된 아미노산 서열을 갖는 절단 서열에 상응하는 하나 이상의 아미노산 변형에 의해 프로테아제 포획 폴리펩타이드의 반응 부위 내에서 변형된 방법.
  37. 제1항에 있어서, 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 서열번호 389, 479 및 498 중 어느 하나로 제시된 아미노산 서열을 갖는 절단 서열에 상응하는 하나 이상의 아미노산 변형에 의해 프로테아제 포획 폴리펩타이드의 반응 부위 내에서 변형된 방법.
  38. 제1항에 있어서, 상기 프로테아제 포획 폴리펩타이드가 변형된 서핀이고, 상기 서핀의 반응성 부위내 하나 이상의 아미노산 대체가 상기 서핀 폴리펩타이드의 반응성 부위 루프에 존재하는 방법.
  39. 제38항에 있어서, 상기 변형된 서핀이 서열번호 497, 499, 610 및 611 중 어느 하나로 제시된 상기 아미노산 서열을 갖는 방법.
  40. 제1항에 있어서, 상기 프로테아제 포획 폴리펩타이드가 변형된 알파 2 마크로글로불린이고, 상기 알파 2 마크로글로불린의 반응성 부위내 하나 이상의 아미노산 대체가 상기 폴리펩타이드의 베이트(bait) 영역에 존재하는 방법.
  41. 제1항에 있어서, 프로테아제를 확인하는 상기 방법이 수회 수행되어, 상기 방법이 반복적인 방법.
  42. 제41항에 있어서, 비-표적 기질과 비교하여 표적 기질에서 절단 서열에 대해 증가된 기질 특이성, 증가된 활성, 또는 증가된 기질 특이성 및 활성을 나타내는 프로테아제가 확인될 때까지 상기 방법이 수행되는 방법.
  43. 제41항에 있어서, 다수의 상이한 프로테아제가 적어도 상기 방법의 제1 반복과정 내에서 확인되는 방법.
  44. 제43항에 있어서, 상기 확인된 프로테아제의 아미노산 서열을 비교하여 핫 스팟(hot spot)을 확인하는 단계로써,
    여기서, 핫 스팟이 2개, 3개, 4개 또는 5개 이상의 상기 확인된 프로테아제에 존재하는 변형된 위치인 단계를 추가로 포함하는 방법.
  45. 제1항에 있어서, 하기의 단계를 추가로 포함하는 방법:
    제1 프로테아제 또는 프로테아제들을 확인한 후, 프로테아제의 제2 수거물을 제조하는 단계, 여기서, 확인된 제1 프로테아제를 주형으로 사용하여 상기 프로테아제 서열 또는 이의 촉매 활성 부분에 추가의 돌연변이를 생성시킴으로써, 상기 제2 수거물의 구성원이 상기 확인된 제1 프로테아제의 돌연변이 및 추가의 돌연변이를 갖는 폴리펩타이드를 함유하도록 함;
    이어서, 상기 제1 프로테아제 또는 프로테아제들을 분리하기 위해 사용되는 상기 제1 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 동일하거나 상이한 제2 프로테아제 포획 폴리펩타이드를 상기 제2 수거물과 접촉시키는 단계, 여기서, 상기 제1 및 제2 프로테아제 포획 폴리펩타이드는 목적하는 표적 기질 특이성을 갖는 프로테아제에 의해 절단되도록 변형됨; 및
    복합체내 상기 수거물로부터 제2 프로테아제(들) 또는 프로테아제의 촉매 활성 부분(들)을 확인하는 단계, 이에 의해, 상기 제2 확인된 프로테아제(들)는 상기 제1 확인된 프로테아제 보다 상기 표적 기질에 대한 더 큰 활성 또는 특이성을 가짐.
  46. 제1항에 있어서, 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분간의 반응물에 경쟁인자를 첨가하여, 확인된 프로테아제(들) 또는 촉매 활성 부분(들)의 선택성을 증진시키는 단계를 추가로 포함하는 방법.
  47. 제1항에 있어서,
    a) 제1 절단 서열을 함유하는 제1 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 안정한 복합체를 형성하는 제1 프로테아제 또는 프로테아제들 또는 이의 촉매 활성 부분을 확인한 후, 상기 확인된 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분을 제2 절단 서열을 함유하는 제2 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 접촉시키는 단계, 여기서, 상기 접촉은 경쟁인자의 존재하에 수행됨; 및
    b) 상기 제2 프로테아제 포획 폴리펩타이드와 복합체를 형성하는 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분을 확인하거나 선별하는 단계
    를 추가로 포함하며,
    이에 의하여 상기 확인되거나 선별된 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분은 2개 이상의 절단 서열에 대해 기질 특이성, 절단활성, 또는 기질 특이성 및 절단 활성을 가지는 방법.
  48. 제47항에 있어서, 상기 2개 이상의 절단 서열이 하나의 표적 기질에 존재하는 방법.
  49. 제47항에 있어서, 상기 2개 이상의 절단 서열이 2개의 상이한 표적 기질에 존재하는 방법.
  50. 제47항에 있어서, 상기 제1 및 제2 프로테아제 포획 폴리펩타이드가 상이하고, 각각이 상이한 표적 기질에 대해 목적하는 기질 특이성을 갖는 프로테아제에 의해 절단되도록 변형된 방법.
  51. 제47항 내지 제50항 중 어느 한 항에 있어서, 2개 이상의 절단 서열에 대해 목적하거나 미리 결정된 기질 특이성 및 절단 활성을 갖는 확인되거나 선택된 프로테아제가 분리될 때까지 단계 a) 및 b)를 1회 이상 반복함을 추가로 포함하는 방법.
  52. 제1항에 있어서, 상기 확인된 프로테아제를 상기 표적 기질의 절단 서열에 대한 기질 특이성에 대해 스크리닝하는 단계를 추가로 포함하는 방법.
  53. 돌연변이 프로테아제 또는 돌연변이 프로테아제의 촉매 활성 부분의 수거물; 및
    서핀, 알파 마크로글로불린 계열 구성원 또는 p35 계열 구성원 또는 단백질 표적 기질의 절단 서열을 포함할 수 있도록 하나 이상의 아미노산이 대체, 제거, 또는 치환됨으로써 프로테아제 포획 폴리펩티드의 반응성 부위가 변형된 이의 변형된 형태인 하나 이상의 프로테아제 포획 폴리펩타이드를 포함하는; 단백질 표적 기질 내 절단 서열을 절단하는 프로테아제 또는 이의 촉매적 활성 부분을 확인하거나 선별하기 위한 스크리닝용 조합물.
  54. 제53항에 있어서, 프로테아제 또는 이의 촉매 활성 부분의 상기 수거물이 디스플레이 라이브러리에 제공되는 조합물.
  55. 제54항에 있어서, 상기 디스플레이 라이브러리가 파지 디스플레이 라이브러리이고, 구성원들이 적어도 프로테아제의 촉매 활성 부분을 디스플레이하는 조합물.
  56. 각각의 성분이 별도로 패키징되는, 제53항 내지 제55항 중 어느 한 항에 따른 조합물을 포함하는, 단백질 표적 기질 내 절단 서열을 절단하는 프로테아제 또는 이의 촉매적 활성 부분을 확인하거나 선별하기 위한 스크리닝용 키트.
  57. 삭제
  58. 삭제
  59. 삭제
  60. 삭제
  61. 삭제
  62. 삭제
  63. 삭제
  64. 삭제
  65. 삭제
  66. 삭제
  67. 삭제
  68. 삭제
  69. 삭제
  70. 삭제
  71. 삭제
  72. 삭제
  73. 삭제
  74. 삭제
  75. 삭제
  76. 삭제
  77. 삭제
  78. 삭제
  79. 삭제
  80. 삭제
  81. 삭제
  82. 삭제
  83. 삭제
  84. 삭제
  85. 삭제
  86. 삭제
  87. 삭제
  88. 삭제
  89. 삭제
  90. 삭제
  91. 삭제
  92. 삭제
  93. 삭제
  94. 삭제
  95. 삭제
  96. 삭제
  97. 삭제
  98. 삭제
  99. 삭제
  100. 삭제
  101. 삭제
  102. 삭제
  103. 삭제
  104. 삭제
  105. 삭제
  106. 삭제
  107. 삭제
  108. 삭제
  109. 삭제
  110. 삭제
  111. 삭제
  112. 삭제
  113. 삭제
  114. 삭제
  115. 삭제
  116. 삭제
  117. 삭제
  118. 삭제
  119. 삭제
  120. 삭제
  121. 삭제
  122. 삭제
  123. 삭제
  124. 삭제
  125. 삭제
  126. 삭제
  127. 삭제
  128. 삭제
  129. 삭제
  130. 삭제
  131. 삭제
  132. 삭제
  133. 삭제
  134. 삭제
  135. 삭제
  136. 삭제
  137. 삭제
  138. 삭제
  139. 삭제
  140. 삭제
  141. 삭제
  142. 삭제
  143. 삭제
  144. 삭제
  145. 삭제
  146. 삭제
  147. 삭제
  148. 삭제
  149. 삭제
  150. 삭제
  151. 삭제
  152. 삭제
  153. 삭제
  154. 삭제
  155. 삭제
  156. 제1항, 제3항, 제27항, 제28항, 제38항, 제40항 및 제53항 중 어느 항에 있어서, 아미노산 대체는 삽입을 포함하는 방법.
  157. 삭제
  158. 삭제
  159. 삭제
  160. 삭제
  161. 삭제
  162. 삭제
  163. 삭제
  164. 삭제
  165. 삭제
  166. 삭제
  167. 삭제
  168. 삭제
  169. 삭제
  170. 삭제
KR20097002442A 2006-07-05 2007-07-05 프로테아제 스크리닝 방법 및 이에 의해 확인된 프로테아제 KR101476458B1 (ko)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US81880406P 2006-07-05 2006-07-05
US81891006P 2006-07-05 2006-07-05
US60/818,804 2006-07-05
US60/818,910 2006-07-05
PCT/US2007/015571 WO2008045148A2 (en) 2006-07-05 2007-07-05 Protease screening methods and proteases identified thereby

Related Child Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
KR1020147012678A Division KR20140072201A (ko) 2006-07-05 2007-07-05 프로테아제 스크리닝 방법 및 이에 의해 확인된 프로테아제

Publications (2)

Publication Number Publication Date
KR20090031936A KR20090031936A (ko) 2009-03-30
KR101476458B1 true KR101476458B1 (ko) 2015-01-05

Family

ID=39217879

Family Applications (5)

Application Number Title Priority Date Filing Date
KR1020157003739A KR20150033726A (ko) 2006-07-05 2007-07-05 프로테아제 스크리닝 방법 및 이에 의해 확인된 프로테아제
KR1020157027322A KR101778174B1 (ko) 2006-07-05 2007-07-05 프로테아제 스크리닝 방법 및 이에 의해 확인된 프로테아제
KR1020177002633A KR20170014023A (ko) 2006-07-05 2007-07-05 프로테아제 스크리닝 방법 및 이에 의해 확인된 프로테아제
KR20097002442A KR101476458B1 (ko) 2006-07-05 2007-07-05 프로테아제 스크리닝 방법 및 이에 의해 확인된 프로테아제
KR1020147012678A KR20140072201A (ko) 2006-07-05 2007-07-05 프로테아제 스크리닝 방법 및 이에 의해 확인된 프로테아제

Family Applications Before (3)

Application Number Title Priority Date Filing Date
KR1020157003739A KR20150033726A (ko) 2006-07-05 2007-07-05 프로테아제 스크리닝 방법 및 이에 의해 확인된 프로테아제
KR1020157027322A KR101778174B1 (ko) 2006-07-05 2007-07-05 프로테아제 스크리닝 방법 및 이에 의해 확인된 프로테아제
KR1020177002633A KR20170014023A (ko) 2006-07-05 2007-07-05 프로테아제 스크리닝 방법 및 이에 의해 확인된 프로테아제

Family Applications After (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
KR1020147012678A KR20140072201A (ko) 2006-07-05 2007-07-05 프로테아제 스크리닝 방법 및 이에 의해 확인된 프로테아제

Country Status (18)

Country Link
US (3) US8211428B2 (ko)
EP (4) EP2402437B1 (ko)
JP (5) JP4546578B2 (ko)
KR (5) KR20150033726A (ko)
CN (1) CN103289980A (ko)
AT (1) ATE530644T1 (ko)
AU (1) AU2007307260B2 (ko)
CA (1) CA2656531C (ko)
DK (1) DK2046951T5 (ko)
ES (3) ES2372709T3 (ko)
HK (3) HK1126521A1 (ko)
IL (3) IL196314A0 (ko)
MX (1) MX2008016221A (ko)
NO (1) NO20085408L (ko)
NZ (2) NZ574140A (ko)
SG (2) SG175602A1 (ko)
TW (2) TW201139677A (ko)
WO (1) WO2008045148A2 (ko)

Families Citing this family (100)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US7700341B2 (en) * 2000-02-03 2010-04-20 Dendreon Corporation Nucleic acid molecules encoding transmembrane serine proteases, the encoded proteins and methods based thereon
US9012141B2 (en) 2000-03-27 2015-04-21 Advaxis, Inc. Compositions and methods comprising KLK3 of FOLH1 antigen
MXPA05003493A (es) * 2002-10-02 2005-09-30 Catalyst Biosciences Metodos para generar y seleccionar proteasas con especificidad alterada.
US7939304B2 (en) * 2002-10-02 2011-05-10 Catalyst Biosciences, Inc. Mutant MT-SP1 proteases with altered substrate specificity or activity
AU2005244271B2 (en) 2004-04-12 2010-04-08 Vertex Pharmaceuticals Incorporated Cleavage of VEGF and VEGF receptor by wildtype and mutant MT-SP1
US20070093443A1 (en) 2005-10-21 2007-04-26 Madison Edwin L Modified proteases that inhibit complement activation
EP2423306A1 (en) * 2006-06-19 2012-02-29 Catalyst Biosciences, Inc. Modified coagulation factor IX polypeptides and use thereof for treatment
EP2402437B1 (en) 2006-07-05 2016-06-01 Catalyst Biosciences, Inc. Protease screening methods and proteases identified thereby
CN103451172A (zh) * 2007-04-13 2013-12-18 催化剂生物科学公司 修饰的因子vii多肽及其应用
US8501449B2 (en) * 2007-12-04 2013-08-06 Proteon Therapeutics, Inc. Recombinant elastase proteins and methods of manufacturing and use thereof
TWI465247B (zh) 2008-04-11 2014-12-21 Catalyst Biosciences Inc 經修飾的因子ｖｉｉ多肽和其用途
US9017660B2 (en) 2009-11-11 2015-04-28 Advaxis, Inc. Compositions and methods for prevention of escape mutation in the treatment of Her2/neu over-expressing tumors
US9650639B2 (en) 2008-05-19 2017-05-16 Advaxis, Inc. Dual delivery system for heterologous antigens
WO2009143167A2 (en) 2008-05-19 2009-11-26 Advaxis Dual delivery system for heterologous antigens
MX2011001949A (es) * 2008-08-29 2011-07-20 Oral Health Australia Pty Ltd Prevencion, tratamiento y diagnostico de infeccion por p. gingivalis.
FI121712B (fi) 2009-04-30 2011-03-15 Ab Enzymes Oy Uusi sieniperäinen proteaasi ja sen käyttö
FI121711B (fi) 2009-04-30 2011-03-15 Ab Enzymes Oy Sieniperäinen seriiniproteaasi ja sen käyttö
FI121851B (fi) * 2009-07-08 2011-05-13 Ab Enzymes Oy Sieniperäinen proteaasi ja sen käyttö
US8652476B2 (en) 2009-07-27 2014-02-18 Niigata University Pharmaceutical composition for treating ischemic events
US10016617B2 (en) 2009-11-11 2018-07-10 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Combination immuno therapy and radiotherapy for the treatment of Her-2-positive cancers
WO2011091366A2 (en) * 2010-01-22 2011-07-28 University Of Louisville Research Foundation, Inc. Methods of treating or preventing periodontitis and diseases associated with periodontitis
EP2579040A4 (en) * 2010-05-25 2014-02-12 Nanoentek Inc QUALITATIVE AND QUANTITATIVE ANALYSIS METHOD FOR ANALYZING THE ACTIVITY TYPE OF A PROTEOLYST-ENZYME ACTIVATED
GB2482536B (en) 2010-08-05 2013-07-24 Hera Pharmaceuticals Inc Expression of antibody or a fragment thereof in lactobacillus
CN103282048B (zh) 2010-10-01 2017-05-17 宾夕法尼亚大学理事会 李斯特菌疫苗载体用于在寄生虫感染的个体中扭转免疫无应答的用途
FI123942B (fi) 2010-10-29 2013-12-31 Ab Enzymes Oy Sieniperäisen seriiniproteaasin variantteja
FR2966734B1 (fr) * 2010-10-29 2014-07-18 Max Rombi Composition comprenant au moins une enzyme proteolytique pour son utilisation pour empecher la synthese des triglycerides
TWI557135B (zh) 2010-11-03 2016-11-11 介控生化科技公司 經修飾之第九因子多胜肽及其用途
US8940297B2 (en) * 2010-12-22 2015-01-27 Saint Louis University Expression of thrombin variants
WO2012125551A1 (en) 2011-03-11 2012-09-20 Advaxis Listeria-based adjuvants
FI123425B (fi) 2011-03-31 2013-04-30 Ab Enzymes Oy Proteaasientsyymi ja sen käytöt
EP2827882B1 (en) * 2012-02-21 2020-04-08 Cytonics Corporation Systems, compositions, and methods for transplantation
SG10201700392UA (en) 2012-03-12 2017-03-30 Advaxis Inc Suppressor cell function inhibition following listeria vaccine treatment
EA028865B1 (ru) 2012-07-25 2018-01-31 Каталист Биосайенсиз, Инк. Модифицированные полипептиды фактора х и их применение
WO2014138371A1 (en) * 2013-03-06 2014-09-12 Glaxosmithkline Llc Host cells and methods of use
GB2532156A (en) * 2013-07-03 2016-05-11 Univ City New York Res Found Method for screening catalytic peptides using phage display technology
CA2922806A1 (en) 2013-08-28 2015-03-05 Cytonics Corporation Systems, compositions, and methods for transplantation and treating conditions utilizing a composition comprising a wild-type or a variant a2m polypeptide or portion thereof
GB201322091D0 (en) * 2013-12-13 2014-01-29 Cambridge Entpr Ltd Modified serpins for the treatment of bleeding disorders
EP2886140A1 (en) * 2013-12-17 2015-06-24 University of Limerick An apparatus for the extracorporeal treatment of blood
WO2015155738A2 (en) 2014-04-09 2015-10-15 Christopher Rudd Use of gsk-3 inhibitors or activators which modulate pd-1 or t-bet expression to modulate t cell immunity
GB2536650A (en) 2015-03-24 2016-09-28 Augmedics Ltd Method and system for combining video-based and optic-based augmented reality in a near eye display
BR112017028052A2 (pt) * 2015-06-23 2018-09-11 Epivax Inc peptídeo, método para induzir uma resposta imune em um sujeito e formulação de vacina
EP3121272A1 (en) * 2015-07-24 2017-01-25 Zymetech ehf. Novel fish trypsin isoforms and their use
KR102622462B1 (ko) * 2016-01-18 2024-01-08 주식회사 엘지생활건강 신경세포 투과 촉진 활성의 펩타이드
GB201603568D0 (en) * 2016-03-01 2016-04-13 Immatics Biotechnologies Gmbh Efficient treatment options including peptides and combination of peptide and cell based medicaments for use in immunotherapy against urinary bladder cancer
DE102016204814A1 (de) * 2016-03-23 2017-09-28 Henkel Ag & Co. Kgaa Verbesserte Reinigungsleistung an Protein sensitiven Anschmutzungen
DE102016204815A1 (de) * 2016-03-23 2017-09-28 Henkel Ag & Co. Kgaa Proteasen mit verbesserte Enzymstabilität in Waschmittel
JP7068702B2 (ja) * 2016-06-02 2022-05-17 国立研究開発法人理化学研究所 アジュバント組成物とその利用
AU2017364818A1 (en) 2016-11-28 2019-05-23 Chugai Seiyaku Kabushiki Kaisha Ligand-binding molecule having adjustable ligand binding activity
KR102630923B1 (ko) 2016-11-28 2024-01-30 추가이 세이야쿠 가부시키가이샤 항원 결합 도메인 및 운반 부분을 포함하는 폴리펩티드
US10617756B2 (en) 2017-01-05 2020-04-14 Shimojani, LLC Drug regimen for treatment of cerebral ischemia
CA3177086A1 (en) * 2017-06-22 2018-12-27 Catalyst Biosciences, Inc. Modified membrane type serine protease 1 (mtsp-1) polypeptides and methods of use
US20200174021A1 (en) * 2017-08-08 2020-06-04 Queensland University Of Technology Methods for diagnosis of early stage heart failure
TW202348632A (zh) 2017-11-28 2023-12-16 日商中外製藥股份有限公司 含有抗原結合域及運輸部分之多胜肽
JP7140362B2 (ja) * 2018-04-09 2022-09-21 国立大学法人東海国立大学機構 活性型組換えアクロシン
KR102131300B1 (ko) * 2018-05-02 2020-07-07 한국과학기술연구원 세균에서 단량체 ｃａｒｄ를 생산하는 방법
WO2019211741A1 (en) 2018-05-02 2019-11-07 Augmedics Ltd. Registration of a fiducial marker for an augmented reality system
CN111088242A (zh) * 2018-10-23 2020-05-01 北京谱峰源生物科技有限公司 Ctss蛋白及编码其的基因的用途
US11766296B2 (en) 2018-11-26 2023-09-26 Augmedics Ltd. Tracking system for image-guided surgery
WO2020109343A1 (en) 2018-11-29 2020-06-04 F. Hoffmann-La Roche Ag Combination therapy for treatment of macular degeneration
US11613744B2 (en) 2018-12-28 2023-03-28 Vertex Pharmaceuticals Incorporated Modified urokinase-type plasminogen activator polypeptides and methods of use
AU2019413431A1 (en) * 2018-12-28 2021-07-08 Vertex Pharmaceuticals Incorporated Modified urokinase-type plasminogen activator polypeptides and methods of use
WO2020168061A1 (en) * 2019-02-13 2020-08-20 Biomadison, Inc. Compositions and methods for protease screening
CN110079514A (zh) * 2019-04-12 2019-08-02 江苏大学 一种制备蛋白酶3重组蛋白的方法
JPWO2020246567A1 (ko) * 2019-06-05 2020-12-10
KR102174197B1 (ko) * 2019-06-12 2020-11-04 주식회사 앤씨비아이티 생산성이 향상된 비독성 프로테아제
US11980506B2 (en) 2019-07-29 2024-05-14 Augmedics Ltd. Fiducial marker
WO2021028577A1 (en) 2019-08-14 2021-02-18 Universität Innsbruck Bacterial selection system for target-specific proteases
EP3833381B1 (en) 2019-08-15 2022-08-03 Catalyst Biosciences, Inc. Modified factor vii polypeptides for subcutaneous administration
CN110878313A (zh) * 2019-12-21 2020-03-13 吉林大学 大豆Gm-SEIPIN2家族基因及其在提高植物种子含油量中的应用
US11382712B2 (en) 2019-12-22 2022-07-12 Augmedics Ltd. Mirroring in image guided surgery
CN111004794B (zh) * 2019-12-30 2022-07-22 江南大学 一种热稳定性提高的枯草蛋白酶e突变体及其应用
WO2021199037A1 (en) * 2020-03-29 2021-10-07 Tel Hashomer Medical Research Infrastructure And Services Ltd. Methods of determining activity of activated protein c
CN111534603B (zh) * 2020-04-23 2022-07-26 中国检验检疫科学研究院 一种利用荧光rpa鉴定白纹伊蚊的方法
CN111621511B (zh) * 2020-05-25 2022-04-08 中国科学院深圳先进技术研究院 多蛋白体系的共生产方法、多蛋白体系的循环共生产系统及应用
CN111718923B (zh) * 2020-06-30 2022-09-27 北京联合大学 一种用于治疗白菜软腐病的药物的筛选方法
GB2619610A (en) 2020-07-20 2023-12-13 Enanta Pharm Inc Functionalized Peptides as Antiviral Agents
WO2022031733A2 (en) * 2020-08-03 2022-02-10 Cornell University Keratinolytic polypeptides and methods of use
US11959108B2 (en) 2020-08-28 2024-04-16 Codexis, Inc. Engineered protease variants
MX2023003210A (es) * 2020-09-21 2023-04-13 Bayer Cropscience Lp Nuevas serina proteasas.
IL302990A (en) 2020-11-23 2023-07-01 Enanta Pharm Inc Antivirals that are derivatives of the novel spiropyrrolidine
US11384090B2 (en) 2020-11-23 2022-07-12 Enanta Pharmaceuticals, Inc. Spiropyrrolidine derived antiviral agents
US11352363B1 (en) 2020-11-23 2022-06-07 Enanta Pharmaceuticals, Inc. Spiropyrrolidine derived antiviral agents
CN112662694A (zh) * 2020-12-25 2021-04-16 康九生物科技(长春)有限公司 一种麦芽糖结合蛋白、麦芽糖结合蛋白表达载体、重组工程菌及其应用
US11970502B2 (en) 2021-05-04 2024-04-30 Enanta Pharmaceuticals, Inc. Macrocyclic antiviral agents
US11319325B1 (en) 2021-05-11 2022-05-03 Enanta Pharmaceuticals, Inc. Macrocyclic spiropyrrolidine derived antiviral agents
US11896445B2 (en) 2021-07-07 2024-02-13 Augmedics Ltd. Iliac pin and adapter
US11339170B1 (en) 2021-07-23 2022-05-24 Enanta Pharmaceuticals, Inc. Spiropyrrolidine derived antiviral agents
US11325916B1 (en) 2021-07-29 2022-05-10 Enanta Pharmaceuticals, Inc. Spiropyrrolidine derived antiviral agents
CN113999866B (zh) * 2021-11-04 2023-09-05 南京农业大学 一种高密度展示的噬菌粒载体及其用途
WO2023086400A1 (en) 2021-11-12 2023-05-19 Enanta Pharmaceuticals, Inc. Novel spiropyrrolidine derived antiviral agents
WO2023086350A1 (en) 2021-11-12 2023-05-19 Enanta Pharmaceuticals, Inc. Alkyne-containing antiviral agents
US11912714B2 (en) 2021-11-12 2024-02-27 Enanta Pharmaceuticals, Inc. Spiropyrrolidine derived antiviral agents
US11993600B2 (en) 2021-12-08 2024-05-28 Enanta Pharmaceuticals, Inc. Saturated spirocyclics as antiviral agents
AU2023211165A1 (en) * 2022-01-31 2024-07-25 Aarhus Universitet A biopharmaceutical prodrug platform based on protein conformational change
CN115260314B (zh) * 2022-05-10 2023-10-24 吉林大学 一种重组嗜热中性蛋白酶及其在降解蛋白质中的应用
WO2024057210A1 (en) 2022-09-13 2024-03-21 Augmedics Ltd. Augmented reality eyewear for image-guided medical intervention
CN116218911A (zh) * 2022-11-25 2023-06-06 中国科学院深圳先进技术研究院 一种靶向髓系细胞基因编辑的crispr-cas系统及其构建方法
WO2024129862A2 (en) * 2022-12-13 2024-06-20 Dana-Farber Cancer Institute, Inc. Checkpoint modulators for enhancing immunotherapy
CN116426509B (zh) * 2023-04-27 2024-07-30 湖北佶凯星生物科技有限公司 一种碱性蛋白酶组合突变体及其应用
CN117159748B (zh) * 2023-09-12 2024-05-28 中国农业大学 Tmprss12基因在制备预防或治疗新型冠状病毒感染药物的应用

Family Cites Families (143)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US3536809A (en) 1969-02-17 1970-10-27 Alza Corp Medication method
US3598123A (en) 1969-04-01 1971-08-10 Alza Corp Bandage for administering drugs
US3630200A (en) 1969-06-09 1971-12-28 Alza Corp Ocular insert
US3847770A (en) 1972-04-10 1974-11-12 Continental Can Co Photopolymerizable compositions prepared from beta hydroxy esters and polyitaconates
US3845770A (en) 1972-06-05 1974-11-05 Alza Corp Osmatic dispensing device for releasing beneficial agent
US3916899A (en) 1973-04-25 1975-11-04 Alza Corp Osmotic dispensing device with maximum and minimum sizes for the passageway
GB1541435A (en) * 1975-02-04 1979-02-28 Searle & Co Immunological materials
US4046784A (en) 1975-04-04 1977-09-06 Texaco Development Corporation Boride catalyst for epoxidizing olefinic compounds
US4008719A (en) 1976-02-02 1977-02-22 Alza Corporation Osmotic system having laminar arrangement for programming delivery of active agent
US4331647A (en) 1980-03-03 1982-05-25 Goldenberg Milton David Tumor localization and therapy with labeled antibody fragments specific to tumor-associated markers
US4348376A (en) 1980-03-03 1982-09-07 Goldenberg Milton David Tumor localization and therapy with labeled anti-CEA antibody
US4361544A (en) 1980-03-03 1982-11-30 Goldenberg Milton David Tumor localization and therapy with labeled antibodies specific to intracellular tumor-associated markers
US4460561A (en) * 1980-03-03 1984-07-17 Goldenberg M David Tumor localization and therapy with labeled antibodies specific to intracellular tumor-associated markers
US4444744A (en) 1980-03-03 1984-04-24 Goldenberg Milton David Tumor localization and therapy with labeled antibodies to cell surface antigens
US4468457A (en) 1981-06-01 1984-08-28 David M. Goldenberg Method for producing a CSAp tryptic peptide and anti-CSAp antibodies
US4671958A (en) * 1982-03-09 1987-06-09 Cytogen Corporation Antibody conjugates for the delivery of compounds to target sites
IL68366A (en) 1982-04-15 1990-08-31 Genentech Inc Process for expressing a gene encoding a protein comprising the enzymatic portion of human urokinase in a microorganism or cell culture
US4818709A (en) 1983-01-21 1989-04-04 Primus Frederick J CEA-family antigens, Anti-CEA antibodies and CEA immunoassay
US4460459A (en) 1983-02-16 1984-07-17 Anschutz Mining Corporation Sequential flotation of sulfide ores
US4624846A (en) 1983-07-29 1986-11-25 Immunomedics, Inc. Method for enhancing target specificity of antibody localization and clearance of non-target diagnostic and therapeutic principles
US4952496A (en) 1984-03-30 1990-08-28 Associated Universities, Inc. Cloning and expression of the gene for bacteriophage T7 RNA polymerase
US4769027A (en) 1984-08-15 1988-09-06 Burroughs Wellcome Co. Delivery system
EP0238473A3 (en) 1986-03-18 1989-06-07 Monsanto Company Serine protease inhibitors
US4687610A (en) 1986-04-30 1987-08-18 E. I. Du Pont De Neumours And Company Low crystallinity polyester yarn produced at ultra high spinning speeds
EP0266032A1 (en) * 1986-08-29 1988-05-04 Beecham Group Plc Modified fibrinolytic enzyme
FI100106B (fi) 1986-12-05 1997-09-30 Novartis Ag Menetelmä plasminogeenin yksisäikeisen yhdistelmäaktivaattorin valmist amiseksi
US4932412A (en) 1986-12-18 1990-06-12 Immunomedics, Inc. Intraoperative and endoscopic tumor detection and therapy
GB8721023D0 (en) 1987-09-07 1987-10-14 Lepetit Spa Modified plasminogen activators
US4892538A (en) 1987-11-17 1990-01-09 Brown University Research Foundation In vivo delivery of neurotransmitters by implanted, encapsulated cells
US5283187A (en) 1987-11-17 1994-02-01 Brown University Research Foundation Cell culture-containing tubular capsule produced by co-extrusion
US5033252A (en) 1987-12-23 1991-07-23 Entravision, Inc. Method of packaging and sterilizing a pharmaceutical product
US5052558A (en) 1987-12-23 1991-10-01 Entravision, Inc. Packaged pharmaceutical product
US5541297A (en) 1988-04-01 1996-07-30 Immunomedics, Inc. Therapeutic conjugates of toxins and drugs
EP0336508A1 (en) * 1988-04-06 1989-10-11 K.U. Leuven Research & Development Recombinant human single-chain urokinase-type plasminogen activator mutant produced by site-specific mutagenesis of lysine 158 to histidine 158
US5073543A (en) 1988-07-21 1991-12-17 G. D. Searle & Co. Controlled release formulations of trophic factors in ganglioside-lipsome vehicle
US4925648A (en) 1988-07-29 1990-05-15 Immunomedics, Inc. Detection and treatment of infectious and inflammatory lesions
US5223409A (en) 1988-09-02 1993-06-29 Protein Engineering Corp. Directed evolution of novel binding proteins
EP0768377A1 (en) 1988-09-02 1997-04-16 Protein Engineering Corporation Generation and selection of recombinant varied binding proteins
US5218092A (en) 1988-09-29 1993-06-08 Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd. Modified granulocyte-colony stimulating factor polypeptide with added carbohydrate chains
US5304482A (en) 1989-03-06 1994-04-19 The Board Of Regents Of The University Of Texas System Serine protease mutants of the chymotrypsin superfamily resistant to inhibition by their cognate inhibitors
US5550042A (en) * 1989-03-06 1996-08-27 The Board Of Regents Of The University Of Texas System Serine protease mutants of the chymotrypsin superfamily resistant to inhibition by their cognate inhibitors and genes encoding the same and serine protease inhibitor mutants and genes encoding the same
ES2185529T3 (es) 1989-03-06 2003-05-01 Univ Texas T-pa resistente a la serpina; mutante; genes.
US5866413A (en) 1989-03-06 1999-02-02 Board Of Regents Of The University Of Texas System Pai-1 mutants
EP0387380A1 (en) * 1989-03-17 1990-09-19 BEHRINGWERKE Aktiengesellschaft Mutants of urinary plasminogen activator, their production and use
IT1229203B (it) * 1989-03-22 1991-07-25 Bioresearch Spa Impiego di acido 5 metiltetraidrofolico, di acido 5 formiltetraidrofolico e dei loro sali farmaceuticamente accettabili per la preparazione di composizioni farmaceutiche in forma a rilascio controllato attive nella terapia dei disturbi mentali organici e composizioni farmaceutiche relative.
US5332567A (en) 1989-08-24 1994-07-26 Immunomedics Detection and treatment of infections with immunoconjugates
NL8902454A (nl) * 1989-10-03 1991-05-01 Stichting Centraal Lab Mutanten van de humane plasminogeen activator inhibitor 1 (pai-1), hun bereiding en toepassing, en recombinante polynucleotiden die voor deze mutanten coderende genetische informatie omvatten.
US6271012B1 (en) * 1989-10-11 2001-08-07 Genencor International, Inc. Protease muteins and their use in detergents
US5120548A (en) 1989-11-07 1992-06-09 Merck & Co., Inc. Swelling modulated polymeric drug delivery device
KR0162259B1 (ko) 1989-12-05 1998-12-01 아미 펙터 감염성 병변 및 염증성 병변을 검출 및 치료하기 위한 키메라 항체
US5427908A (en) 1990-05-01 1995-06-27 Affymax Technologies N.V. Recombinant library screening methods
US5733566A (en) * 1990-05-15 1998-03-31 Alkermes Controlled Therapeutics Inc. Ii Controlled release of antiparasitic agents in animals
GB9015198D0 (en) 1990-07-10 1990-08-29 Brien Caroline J O Binding substance
DK0585287T3 (da) 1990-07-10 2000-04-17 Cambridge Antibody Tech Fremgangsmåde til fremstilling af specifikke bindingsparelementer
DK0564531T3 (da) 1990-12-03 1998-09-28 Genentech Inc Berigelsesfremgangsmåde for variantproteiner med ændrede bindingsegenskaber
EP1279731B1 (en) 1991-03-01 2007-05-30 Dyax Corporation Process for the development of binding mini-proteins
ATE269401T1 (de) * 1991-04-10 2004-07-15 Scripps Research Inst Bibliotheken heterodimerer rezeptoren mittels phagemiden
DE4122599C2 (de) 1991-07-08 1993-11-11 Deutsches Krebsforsch Phagemid zum Screenen von Antikörpern
US5580578A (en) 1992-01-27 1996-12-03 Euro-Celtique, S.A. Controlled release formulations coated with aqueous dispersions of acrylic polymers
PT644771E (pt) 1992-06-11 2002-12-31 Alkermes Inc Sistema de entrega da droga eritropoietina
US5323907A (en) 1992-06-23 1994-06-28 Multi-Comp, Inc. Child resistant package assembly for dispensing pharmaceutical medications
US5591767A (en) 1993-01-25 1997-01-07 Pharmetrix Corporation Liquid reservoir transdermal patch for the administration of ketorolac
US5354934A (en) 1993-02-04 1994-10-11 Amgen Inc. Pulmonary administration of erythropoietin
CA2163107C (en) 1993-05-17 2001-04-17 David Milton Goldenberg Improved detection and therapy of lesions with biotin/avidin-metal chelating protein conjugates
US5354566A (en) 1993-06-02 1994-10-11 Kraft General Foods, Inc. Preparation of yeast-leavened dough crusts
US5472692A (en) * 1993-07-02 1995-12-05 New England Deaconess Hospital Corporation Pro-urokinase mutants
US5443953A (en) 1993-12-08 1995-08-22 Immunomedics, Inc. Preparation and use of immunoconjugates
WO1995020401A1 (en) 1994-01-31 1995-08-03 Trustees Of Boston University Polyclonal antibody libraries
IT1270594B (it) 1994-07-07 1997-05-07 Recordati Chem Pharm Composizione farmaceutica a rilascio controllato di moguisteina in sospensione liquida
US5686578A (en) 1994-08-05 1997-11-11 Immunomedics, Inc. Polyspecific immunoconjugates and antibody composites for targeting the multidrug resistant phenotype
IL114909A (en) 1994-08-12 1999-10-28 Immunomedics Inc Immunoconjugates and humanized antibodies specific for b-cell lymphoma and leukemia cells
US5766842A (en) 1994-09-16 1998-06-16 Sepracor, Inc. In vitro method for predicting the evolutionary response of a protein to a drug targeted thereagainst
US6168919B1 (en) 1996-07-17 2001-01-02 Diversa Corporation Screening methods for enzymes and enzyme kits
US6077697A (en) 1996-04-10 2000-06-20 Chromos Molecular Systems, Inc. Artificial chromosomes, uses thereof and methods for preparing artificial chromosomes
US6699658B1 (en) 1996-05-31 2004-03-02 Board Of Trustees Of The University Of Illinois Yeast cell surface display of proteins and uses thereof
US20040248201A1 (en) 1996-06-27 2004-12-09 Serge Muyldermans Recognition molecules interacting specifically with the active site or cleft of a target molecule
GB9618960D0 (en) * 1996-09-11 1996-10-23 Medical Science Sys Inc Proteases
US7083786B2 (en) * 1997-04-03 2006-08-01 Jensenius Jens Chr MASP-2, a complement-fixing enzyme, and uses for it
US20030049678A1 (en) 1999-03-05 2003-03-13 Nienaber Vicki L. Ligand screening and design by X-ray crystallography
DE69933369D1 (en) 1998-04-03 2006-11-09 Compound Therapeutics Inc Adressierbare protein arrays
CN1314952A (zh) * 1998-08-19 2001-09-26 诺维信公司 直接通过底物再加载进行的酶活性筛选
US7355015B1 (en) 1999-03-12 2008-04-08 Georgetown University School Of Medicine Matriptase, a serine protease and its applications
JP2002543777A (ja) 1999-05-07 2002-12-24 ヒューマン ジノーム サイエンシーズ， インコーポレイテッド セリンプロテアーゼ
US6472147B1 (en) 1999-05-25 2002-10-29 The Scripps Research Institute Methods for display of heterodimeric proteins on filamentous phage using pVII and pIX, compositions, vectors and combinatorial libraries
JP2001008687A (ja) 1999-06-25 2001-01-16 Yamanouchi Pharmaceut Co Ltd 新規金属プロテアーゼ及び該金属プロテアーゼ遺伝子
IL142025A0 (en) 1999-07-20 2002-03-10 Morphosys Ag Novel methods for displaying (poly) peptides/proteins on bacteriophage particles via disulfide bonds
EP1214427A2 (en) 1999-09-09 2002-06-19 Millennium Pharmaceuticals, Inc. 26176, a novel calpain protease and uses thereof
DE19943177C2 (de) 1999-09-09 2002-10-24 Dieter Jenne Verfahren zur Herstellung von aktiven Serienproteasen und inaktiven Varianten
US7030231B1 (en) * 1999-09-30 2006-04-18 Catalyst Biosciences, Inc. Membrane type serine protease 1 (MT-SP1) and uses thereof
WO2001032711A2 (en) 1999-10-21 2001-05-10 Board Of Trustees Of The University Of Arkansas Adeno-associated virus aav rep78 major regulatory protein, mutants thereof and uses thereof
GB9928787D0 (en) 1999-12-03 2000-02-02 Medical Res Council Direct screening method
US6797504B1 (en) 2000-09-08 2004-09-28 Dendreon San Diego Llc Inhibitors of serine protease activity of matriptase or MTSP1
CA2396774A1 (en) 2000-02-03 2001-08-09 Corvas International, Inc. Nucleic acid molecules encoding transmembrane serine proteases, the encoded proteins and methods based thereon
US7700341B2 (en) * 2000-02-03 2010-04-20 Dendreon Corporation Nucleic acid molecules encoding transmembrane serine proteases, the encoded proteins and methods based thereon
JP4449141B2 (ja) * 2000-02-22 2010-04-14 ソニー株式会社 電源制御装置、電源制御システム
US20020031801A1 (en) * 2000-03-24 2002-03-14 Millennium Pharmaceuticals, Inc. 18806, a novel trypsin serine protease-like molecule and uses thereof
AU2001265092A1 (en) * 2000-06-02 2001-12-17 Regents Of The University Of California Profiling of protease specificity using combinatorial fluorogenic substrate libraries
EP1355637A2 (en) 2000-06-21 2003-10-29 Georgetown University Medical Center Inhibitors of matriptase for the treatment of cancer
WO2002008392A2 (en) 2000-07-25 2002-01-31 Bayer Aktiengesellschaft Regulation of human matriptase-like serine protease
US7157596B2 (en) * 2000-09-08 2007-01-02 Dendreon Corporation Inhibitors of serine protease activity of matriptase or MTSP1
EP1360490B1 (en) 2001-01-23 2011-12-21 President and Fellows of Harvard College Nucleic-acid programmable protein arrays
WO2002072786A2 (en) 2001-03-13 2002-09-19 Corvas International, Inc. Nucleic acid molecules encoding a transmembrane serine protease 7, the encoded polypeptides and methods based thereon
CA2441378A1 (en) 2001-03-22 2002-10-03 Dendreon San Diego Llc Nucleic acid molecules encoding serine protease cvsp14, the encoded polypeptides and methods based thereon
EP1379637A4 (en) 2001-03-27 2005-04-06 Dendreon Corp TRANSMEMBRANE SERINE PROTEASE 9 CODING NUCLEIC ACID MOLECULES, THE POLYPEPTIDE CODED, AND METHODS FORMING THEREOF
CA2447050A1 (en) 2001-05-14 2002-11-21 Dendreon San Diego Llc Nucleic acid molecules encoding a transmembrane serine protease 10, the encoded polypeptides and methods based thereon
CA2447023A1 (en) 2001-05-23 2002-11-28 Dendreon San Diego Llc Conjugates activated by cell surface proteases and therapeutic uses thereof
EP1390384A4 (en) 2001-05-30 2005-08-17 Chromos Molecular Systems Inc PLATFORMS ON CHROMOSOME BASIS
AU2002315525A1 (en) 2001-07-03 2003-01-21 Dendreon San Diego Llc Nucleic acid molecules encoding a transmembrane serine protease 20, the encoded polypeptides and methods based thereon
US20030186374A1 (en) 2001-10-01 2003-10-02 Hufton Simon E. Multi-chain eukaryotic display vectors and uses thereof
US20030143219A1 (en) * 2001-10-09 2003-07-31 Madison Edwin L Nucleic acid molecules encoding a transmembrane serine protease 25, the encoded polypeptides and methods based thereon
WO2003044179A2 (en) 2001-11-20 2003-05-30 Dendreon San Diego Llc Nucleic acid molecules encoding serine protease 17, the encoded polypeptides and methods based thereon
US20030199463A1 (en) 2002-04-23 2003-10-23 Silviu Itescu DNA enzyme to inhibit plasminogen activator inhibitor-1
US20060069035A1 (en) * 2002-05-08 2006-03-30 Higazi Abd Al-Roof Peptide for regulation of urokinase plasminogen activator and method of optimizing therapeutic efficacy
US20040072276A1 (en) * 2002-05-10 2004-04-15 Direvo BioTech AG. Process for generating sequence-specific proteases by directed evolution and use thereof
EP1361284A1 (en) 2002-05-10 2003-11-12 Direvo Biotech AG Process for generating sequence-specific proteases by directed evolution and use thereof
AU2003269880A1 (en) 2002-05-21 2003-12-22 Dendreon Corporation Nucleic acid molecules encoding a transmembrane serine protease 12, the encoded polypeptides and methods based thereon
US20040001801A1 (en) * 2002-05-23 2004-01-01 Corvas International, Inc. Conjugates activated by cell surface proteases and therapeutic uses thereof
WO2004005471A2 (en) 2002-07-02 2004-01-15 Dendreon Corporation Serine protease 16
US7666627B2 (en) 2002-08-08 2010-02-23 Targetex Kft. Folded recombinant catalytic fragments of multidomain serine proteases, preparation and uses thereof
MXPA05003493A (es) 2002-10-02 2005-09-30 Catalyst Biosciences Metodos para generar y seleccionar proteasas con especificidad alterada.
US7939304B2 (en) 2002-10-02 2011-05-10 Catalyst Biosciences, Inc. Mutant MT-SP1 proteases with altered substrate specificity or activity
US20060024289A1 (en) 2002-10-02 2006-02-02 Ruggles Sandra W Cleavage of VEGF and VEGF receptor by wild-type and mutant proteases
US20040235054A1 (en) 2003-03-28 2004-11-25 The Regents Of The University Of California Novel encoding method for "one-bead one-compound" combinatorial libraries
US7070958B2 (en) 2003-04-18 2006-07-04 Thrombolytic Science, Inc. Methods of making pro-urokinase mutants
AU2004249903B2 (en) 2003-06-18 2009-06-04 Bayer Schering Pharma Aktiengesellschaft New biological entities and the use thereof
WO2004113522A1 (en) 2003-06-18 2004-12-29 Direvo Biotech Ag New biological entities and the pharmaceutical or diagnostic use thereof
IL156566A0 (en) 2003-06-19 2004-01-04 Hadasit Med Res Service Urokinase plasminogen activator derived octapeptide in the treatment of multiple sclerosis
US7439226B2 (en) * 2003-09-30 2008-10-21 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Serine protease inhibitors
CN1890262B (zh) 2003-10-09 2015-01-28 协和发酵麒麟株式会社 抗凝血酶ⅲ组合物的制造方法
GB0405330D0 (en) * 2004-03-10 2004-04-21 Astrazeneca Ab Enzyme and preparation method
WO2005100556A2 (en) 2004-04-12 2005-10-27 Catalyst Biosciences Cleavage of vegf and vegf receptor by wild-type and mutant proteases
AU2005244271B2 (en) 2004-04-12 2010-04-08 Vertex Pharmaceuticals Incorporated Cleavage of VEGF and VEGF receptor by wildtype and mutant MT-SP1
US20060029590A1 (en) * 2004-06-10 2006-02-09 Christopher Thanos Administration of neutral endopeptidase to treat inflammatory bowel disease
WO2006067198A2 (en) 2004-12-22 2006-06-29 Direvo Biotech Ag Targeted use of engineered enzymes
EP1726643A1 (en) 2005-05-27 2006-11-29 Direvo Biotech AG Method for the provision, identification and selection of proteases with altered sensitivity to activity-modulating substances
US20070093443A1 (en) 2005-10-21 2007-04-26 Madison Edwin L Modified proteases that inhibit complement activation
CN101374856A (zh) * 2005-11-29 2009-02-25 斯克里普斯研究学院 抑制肿瘤细胞浸润、转移和血管生成
EP2423306A1 (en) * 2006-06-19 2012-02-29 Catalyst Biosciences, Inc. Modified coagulation factor IX polypeptides and use thereof for treatment
EP2402437B1 (en) 2006-07-05 2016-06-01 Catalyst Biosciences, Inc. Protease screening methods and proteases identified thereby
CN103451172A (zh) * 2007-04-13 2013-12-18 催化剂生物科学公司 修饰的因子vii多肽及其应用
TWI465247B (zh) 2008-04-11 2014-12-21 Catalyst Biosciences Inc 經修飾的因子ｖｉｉ多肽和其用途
TWI557135B (zh) 2010-11-03 2016-11-11 介控生化科技公司 經修飾之第九因子多胜肽及其用途
EA028865B1 (ru) 2012-07-25 2018-01-31 Каталист Биосайенсиз, Инк. Модифицированные полипептиды фактора х и их применение

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Comb Chem High Throughput Screen., Vol. 2, No. 2, Pages 73-90 (1999.04.) *

Also Published As

Publication number Publication date
JP2009542218A (ja) 2009-12-03
KR20150115968A (ko) 2015-10-14
NO20085408L (no) 2009-04-06
IL217488A0 (en) 2012-02-29
KR20170014023A (ko) 2017-02-07
EP2046951B1 (en) 2011-10-26
CA2656531C (en) 2012-12-11
JP2017029167A (ja) 2017-02-09
CA2656531A1 (en) 2008-04-17
KR20090031936A (ko) 2009-03-30
EP2402438A3 (en) 2012-03-28
KR101778174B1 (ko) 2017-09-13
US20090123452A1 (en) 2009-05-14
SG175602A1 (en) 2011-11-28
EP2046951A2 (en) 2009-04-15
EP2402437A3 (en) 2012-03-21
TW200817517A (en) 2008-04-16
HK1126521A1 (en) 2009-09-04
US20120308551A1 (en) 2012-12-06
JP2012034701A (ja) 2012-02-23
SG10201503055TA (en) 2015-06-29
EP2402437B1 (en) 2016-06-01
JP2010075209A (ja) 2010-04-08
HK1226098B (zh) 2017-09-22
AU2007307260B2 (en) 2013-02-28
US20120301945A1 (en) 2012-11-29
HK1165828A1 (zh) 2012-10-12
TWI369402B (en) 2012-08-01
WO2008045148A2 (en) 2008-04-17
EP3034607A1 (en) 2016-06-22
US8663633B2 (en) 2014-03-04
CN103289980A (zh) 2013-09-11
EP2402438A2 (en) 2012-01-04
JP4546578B2 (ja) 2010-09-15
WO2008045148A8 (en) 2008-09-04
DK2046951T3 (da) 2011-11-28
JP2015062422A (ja) 2015-04-09
NZ596269A (en) 2012-12-21
IL217489A0 (en) 2012-02-29
US9290757B2 (en) 2016-03-22
MX2008016221A (es) 2009-02-23
EP3034607B1 (en) 2019-03-27
ES2372709T3 (es) 2012-01-25
ES2721266T3 (es) 2019-07-30
WO2008045148A9 (en) 2008-05-29
IL217488A (en) 2014-02-27
AU2007307260A1 (en) 2008-04-17
KR20140072201A (ko) 2014-06-12
ES2579437T3 (es) 2016-08-11
DK2046951T5 (da) 2012-01-23
WO2008045148A3 (en) 2008-10-16
KR20150033726A (ko) 2015-04-01
IL217489A (en) 2014-02-27
EP2402437A2 (en) 2012-01-04
NZ574140A (en) 2012-02-24
TW201139677A (en) 2011-11-16
US20130164820A9 (en) 2013-06-27
ATE530644T1 (de) 2011-11-15
US8211428B2 (en) 2012-07-03
JP4922387B2 (ja) 2012-04-25
IL196314A0 (en) 2009-09-22

Similar Documents

Publication Publication Date Title
KR101476458B1 (ko) 프로테아제 스크리닝 방법 및 이에 의해 확인된 프로테아제
CN101517074B (zh) 蛋白酶筛选方法及由此鉴别的蛋白酶
KR101691692B1 (ko) 보체 활성화를 억제하는 변형된 프로테아제
AU2022200903B2 (en) Engineered Cascade components and Cascade complexes
KR20210149060A (ko) Tn7-유사 트랜스포존을 사용한 rna-유도된 dna 통합
DK2443248T3 (en) IMPROVEMENT OF LONG-CHAIN POLYUM Saturated OMEGA-3 AND OMEGA-6 FATTY ACID BIOS SYNTHESIS BY EXPRESSION OF ACYL-CoA LYSOPHOSPHOLIPID ACYL TRANSFERASES
KR20200126997A (ko) 인간 대상체에서의 비-노화-관련 청각 손상의 치료를 위한 조성물 및 방법
CN101939434A (zh) 用于在大豆中提高种子贮藏油脂的生成和改变脂肪酸谱的来自解脂耶氏酵母的dgat基因
KR20190013627A (ko) 재조합 콜라겐의 수산화를 제어하기 위한 효모 균주 및 방법
KR20220030205A (ko) 면역 세포의 트랜스포존 기반 변형
KR20220157944A (ko) 인간 대상체에서 비-연령-연관 청각 장애를 치료하기 위한 조성물 및 방법
US6365391B1 (en) Isolated human serine protease, nucleic acid molecules encoding human serine protease, and uses thereof
US6818429B2 (en) Isolated human protease proteins, nucleic acid molecules encoding human protease proteins, and uses thereof
US20020137184A1 (en) Isolated human protease proteins, nucleic acid molecules encoding human protease proteins, and use thereof
RU2827658C2 (ru) Сконструированные компоненты cascade и комплексы cascade
RU2774631C1 (ru) Сконструированные компоненты cascade и комплексы cascade
TW202313972A (zh) 新ｎｒｇ１融合物、融合接合處及檢測彼等之方法
US6344353B1 (en) Isolated human protease proteins, nucleic acid molecules encoding human protease proteins, and uses thereof
JP2000050886A (ja) 新規なヒトカテプシンｌ２タンパク質及びそれをコ―ドする遺伝子並びにそれらの利用
EP1481079A2 (en) Isolated human enzyme proteins, nucleic acid molecules encoding human enzyme proteins, and uses thereof

Legal Events

Date Code Title Description
A201 Request for examination
E902 Notification of reason for refusal
A107 Divisional application of patent
E701 Decision to grant or registration of patent right
GRNT Written decision to grant
LAPS Lapse due to unpaid annual fee