JP6823589B2 - 被分析物の検出および定量のためのシステム - Google Patents
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Description
本出願は、2014年9月11日に出願された米国仮出願番号第62/049,313号に基づく米国特許法第119条(e)項の下で優先権を主張しており、この仮出願の内容は、その全体が参考として本明細書によって援用される。
本技術は、概して、分子検出の分野に関する。具体的には、本技術は、収集されたサンプル内の1つまたはそれを上回る特定の被分析物の存在、非存在、および/または量を検出するためのマイクロ流体デバイス、システム、および方法に関する。
サンプル内の核酸、タンパク質、および/または他の目的とする分子の存在、非存在、ならびに/もしくは量を識別するための従来の技術は、多くの場合、高価な研究室機器および高度な訓練を受けた医療専門家の専門知識を必要とする。その結果として、そのような分析は、典型的には、研究室または医療施設内で行われる。そのような分子検出は、例えば、個人または他の動物内、もしくは環境内の病原体、疾患、汚染、過剰摂取、および中毒の存在を検出するために重要であり得る。残念ながら、現在、個人は、適正な試験を行うことができる前に、および結果を生成して分析することができる前に、長い待ち時間に直面し得る。長い待ち時間および研究室または医療施設への移動の不便さにより、疾患および汚染は、多くの場合、拡散し、該疾患または汚染の存在が識別される前でさえ、重大な有害を引き起こし得る。
改良型分子検出および定量化技術の有意な必要性がある。現在使用されている従来のデバイスより少ない時間で、かつ少ない技術的専門知識を用いて、目的とする分子を検出することができるデバイスの必要性がある。非臨床設定で、例えば、学校、勤務先、および家庭内で、消費者によって利用することができる、分子検出技術の必要性がある。また、薬局または医療施設に来院した際に消費者によって使用することができ、消費者が薬剤師または医療関係者と話す時間までに結果が入手可能であるように、迅速に結果を生成することができる、分子検出技術の必要性もある。また、生体有害(バイオハザード)リスクを最小限化するように構成される、消費者を標的にした分子検出デバイスの必要性もある。本明細書で開示される種々の実施形態は、これらの必要性のうちの1つまたはそれを上回るものを満たし得る。
本発明は、例えば、以下を提供する。
(項目1)
1つまたはそれを上回る被分析物の存在、非存在、および量のうちの少なくとも1つを検出する信号を生成するためのシステムであって、前記システムは、
サンプル分析カートリッジであって、
開口から延在する入力トンネルであって、サンプルに暴露されるように適合されるサンプル収集デバイスの遠位部分の挿入を可能にするように構成される、入力トンネルと、
液体を保持するように構成され、前記サンプル収集デバイスの前記遠位部分から前記サンプルを受容するように構成される、貯留部と、
前記貯留部から、その中で混合させられた前記サンプルおよび試薬を有する前記液体を受容するように構成される、分析チャネルと、
前記分析チャネル内の前記混合液体に暴露されるように、ならびに前記サンプル内の1つまたはそれを上回る被分析物の存在、非存在、および量のうちの少なくとも1つを示す信号を生成するように構成される、センサと
を備える、サンプル分析カートリッジと、
前記サンプル分析カートリッジに電気的に連結される、サンプル分析読取機であって、処理するために前記信号を受信するように、ならびに前記サンプル内の前記1つまたはそれを上回る被分析物の前記存在、非存在、および量のうちの少なくとも1つを示す処理された信号をコンピュータに伝送するように構成される、サンプル分析読取機と、
前記コンピュータのプロセッサによって実行されると、グラフィカルユーザインターフェースに前記1つまたはそれを上回る被分析物の前記存在、非存在、および量のうちの少なくとも1つを示す情報を表示させる命令を備えた、コンピュータ可読媒体と
を備える、システム。
(項目2)
前記グラフィカルユーザインターフェースは、前記コンピュータを介してアクセス可能なアプリケーションによって生成される、項目1に記載のシステム。
(項目3)
前記アプリケーションは、インターネットからダウンロード可能である、項目2に記載のシステム。
(項目4)
前記アプリケーションは、使用に先立って安全なログインを必要とする、項目2または3に記載のシステム。
(項目5)
前記コンピュータは、データをサーバに伝送し、かつそこから受信するように構成される、項目1〜4のいずれか1項に記載のシステム。
(項目6)
前記データは、前記1つまたはそれを上回る被分析物の前記存在、非存在、および量のうちの少なくとも1つを示すデータを含む、項目5に記載のシステム。
(項目7)
前記データは、前記サーバに記憶された過去の試験結果を含む、項目5に記載のシステム。
(項目8)
前記グラフィカルユーザインターフェース上に表示される前記情報は、前記1つまたはそれを上回る被分析物の前記存在、非存在、および量のうちの少なくとも1つに基づく、ユーザアクションの推奨を含む、項目1〜4のいずれか1項に記載のシステム。
(項目9)
前記グラフィカルユーザインターフェース上に表示される前記情報は、前記1つまたはそれを上回る被分析物の前記存在、非存在、および量のうちの少なくとも1つに基づく、表またはグラフもしくは両方を含む、項目1〜4のいずれか1項に記載のシステム。
(項目10)
前記コンピュータは、装着型デバイスからデータを受信するように構成され、
前記コンピュータの前記プロセッサは、前記装着型デバイスからの前記データを処理するように、および前記グラフィカルユーザインターフェースに前記装着型デバイスからの前記データに基づく情報を表示させるように構成される、項目1〜4のいずれか1項に記載のシステム。
(項目11)
前記アプリケーションは、カレンダーアプリケーションと同期化するように、および前記カレンダーアプリケーションとの前記同期化に基づいて特定の時間にユーザに通知するように構成される、項目2に記載のシステム。
(項目12)
前記アプリケーションは、ユーザのソーシャルネットワークのうちの1つまたはそれを上回るものにリンクするように構成される、項目2に記載のシステム。
(項目13)
前記アプリケーションは、前記ユーザの1つまたはそれを上回るソーシャルネットワーク内の1つまたはそれを上回る連絡先に、前記サンプル内の前記1つまたはそれを上回る被分析物の前記存在、非存在、および量のうちの少なくとも1つを示す試験結果を通知するように構成される、項目12に記載のシステム。
(項目14)
前記アプリケーションは、生殖能力レベルを示す試験結果について、前記1つまたはそれを上回る連絡先に通知するように構成される、項目13に記載のシステム。
(項目15)
前記アプリケーションは、前記1つまたはそれを上回る連絡先に匿名で通知するように構成される、項目13に記載のシステム。
(項目16)
前記命令は、前記プロセッサによって実行されると、前記1つまたはそれを上回る被分析物の前記存在、非存在、および量のうちの少なくとも1つに基づいて、前記グラフィカルユーザインターフェースに、医師または薬局もしくは両方に連絡するようにユーザを促す、項目1〜4のいずれか1項に記載のシステム。
(項目17)
前記グラフィカルユーザインターフェースは、マップ上の場所における他のユーザによる1つまたはそれを上回る被分析物の陽性試験結果を示すマップを表示するように構成される、項目1〜4のいずれか1項に記載のシステム。
(項目18)
前記コンピュータは、スマートフォン、タブレット、装着型デバイス、またはラップトップを備える、項目1〜4のいずれか1項に記載のシステム。
(項目19)
前記サンプル分析読取機による前記のサンプル分析カートリッジの受容は、前記サンプル分析カートリッジと前記サンプル分析読取機との間の電気的連結を引き起こす、項目1〜4のいずれか1項に記載のシステム。
(項目20)
前記システムはさらに、サンプル収集デバイスを備える、項目1〜4のいずれか1項に記載のシステム。
以下の詳細な説明では、本開示の一部を形成する、添付図面を参照する。図面および説明で説明される実施形態は、限定的ではなく例示的であることを目的としている。本明細書で示されるように、「例示的な」という用語は、「実施例または例証としての機能を果たすこと」を意味し、必ずしも他の実施形態と比べて好ましい、または有利であると解釈されるべきではない。本明細書で提示される主題の精神または範囲から逸脱することなく、他の実施形態が利用されてもよく、修正が行われてもよい。本明細書で説明および例証されるような本開示の側面は、種々の異なる構成で配列し、組み合わせ、および設計することができ、その全ては、明示的に企図され、本開示の一部を形成する。
いくつかの実施形態では、標的被分析物110a、110bが、図1Aおよび1Bに示されるように、サンプル調製試薬の溶液に添加される。この標的被分析物は、核酸、タンパク質、小分子、または重金属等の任意の分子であってもよい。サンプル調製試薬は、少なくとも、磁気マイクロビーズまたはナノ粒子120a、120b(本明細書では「磁気粒子」と称される)を含む。いくつかの実施形態では、磁気粒子は、金シェルによってコーティングまたは別様に取り囲まれた鉄心(Fe2O3)もしくは他の強磁性金属から形成される。いくつかの実施形態では、磁気粒子は、約100ナノメートル(nm)、約5000nm、またはその間の任意の値の半径を有する。例えば、いくつかの実施形態では、磁気粒子集団のうちの1つまたはそれを上回るものは、約100〜1000nmの半径を有する。他の実施形態では、磁気粒子集団のうちの1つまたはそれを上回るものは、約1000〜5000nmの半径を有する。いくつかの実施形態では、磁気粒子は、約100、200、300、400、500、600、700、800、900、1000、1100、1200、1300、1400、1500、1600、1700、1800、1900、2000、2100、2200、2300、2400、2500、2600、2700、2800、2900、3000、3100、3200、3300、3400、3500、3600、3700、3800、3900、4000、4100、4200、4300、4400、4500、4600、4700、4800、4900、および/または5000nm、ならびに/もしくは、例えば、100〜1600nmまたは200〜1600nm、もしくは300〜4900nmの間の任意の範囲の半径を有する。いくつかの実施形態では、磁気粒子の複数の集団が提供され、各集団は、溶液中に存在する他の集団に一意的であるサイズを有する。
種々の実施形態のサンプル収集デバイスは、検体からサンプルを収集するように構成される。サンプル収集デバイスは、任意の所望の領域または場所、例えば、頬の内側、口、喉、鼻腔、耳から、尿から、唾液から、血液から、または別の身体部分から、細胞および他の生物学的物質を収集するように構成されてもよい。1つの例示的なサンプル収集デバイスは、血液、唾液、粘液、または尿の小液滴を小型毛管チャネルの中へ吸い上げるユニットを含む。他の実施形態では、サンプル収集デバイスは、例えば、空気または水から、もしくは物理的表面または他の構造から等、環境から生物学的物質、粒子状物質、または他の化学物質を収集するように構成されてもよい。
種々の実施形態では、カートリッジは、筐体から形成され、これは、封入空間を画定し、カートリッジが、サンプル収集デバイスから標的被分析物を伴うサンプルを受容すること、サンプル調製試薬とともにサンプルを貯蔵すること、標的被分析物をサンプル調製試薬と混合してハイブリダイズさせるための空間を提供すること、ハイブリダイズした標的被分析物が検出のためのセンサ上に局在化される、分析ゾーンを提供すること、ハイブリダイズした標的被分析物を分析ゾーンに輸送するための液体媒体を提供すること、ハイブリダイズした標的被分析物に導入されたときに検出可能な反応を受けることができる、基質を貯蔵して提供すること、基質を分析ゾーン内のハイブリダイズした標的被分析物に輸送するための液体媒体を提供すること、および廃棄物が貯蔵される廃棄物収集ゾーンを提供することのうちの1つまたはそれを上回るものを行うことを可能にする、種々の特徴を有する。
種々の実施形態の読取機デバイスまたは読取機は、特殊化コンピュータを備え、もしくは特殊化コンピュータから成る。コンピュータは、サンプル中の標的被分析物の存在、非存在、および/または量を検出するための1つまたはそれを上回る方法を実行するために、その上に記憶された命令を有する、メモリを伴うプロセッサを含む。種々の実施形態では、読取機のコンピュータは、例えば、カートリッジの第1の貯留部中の流体の混合、弁の開放、および/またはセンサ上の磁気粒子の局在化等のシステムの種々の機能が起こるとき、およびどのようにして起こるかを制御する、検出システムの動作を制御する。そのような動作を制御するために、コンピュータ化読取機は、読取機またはカートリッジ内に存在する物理的構成要素から情報を受信し、情報を物理的構成要素に送信するように構成される。
図4Aおよび4Bのサンプル収集デバイス400と、図7Aおよび7Bのカートリッジデバイス700と、図22の読取機デバイス2200とを含む、検出システム2800の一実施形態が、図28Aおよび28Bで提供される。本システムを形成するデバイスは、図28Aでは使用に先立って、および図28Bでは連結構成で、別々に示される。図28Aの実施形態を含む、種々の実施形態のサンプル収集デバイス400は、使い捨てであり、1回限りの使用のために構成される。これは、取り外し可能な滅菌包装内で提供されてもよい。いったんカートリッジ700の入力トンネル712に挿入されると、サンプル収集デバイス400は、永久固定係合で係止され、再度使用することができない。同様に、描写したカートリッジ700は、使い捨てであり、1回限りの使用のために構成される。いったんサンプル収集デバイス400がカートリッジ700の入力トンネル712内で定位置に係止すると、カートリッジ700を再度使用することができない。しかしながら、カートリッジ700を読取機2200から除去することができる。種々の実施形態では、カートリッジ700および読取機2200は、別々に連結されるように構成され、カートリッジ700は、少なくとも検出プロトコルの実施の前および後に、読取機2200のドックに、挿入し、そしてそれから除去することができる。いくつかの実施形態では、読取機2200は、カートリッジ700を一時的に定位置に係止し、検出試験サイクルの持続時間中に除去を制限するための係止機構を含んでもよい。種々の実施形態の読取機2200は、再利用可能である。
上記のように、コンピュータ化読取機は主に、検出システムの動作を制御する。読取機は、プロセッサと、メモリとを含み、メモリは、収集されたサンプル内の標的被分析物の存在、非存在、および/または量の検出に成功するために必要とされる、種々の方法を実装するためのその上に記憶された命令を有する。例えば、自動的にコンピュータ化読取機によって行われる1つの方法の実施形態が、図32で提供される。
第1の実験のセットでは、種々の電気化学センサの性能が試験された。具体的には、上記で説明される実施形態と一致する表面化学特徴を有する、電気化学センサが形成された。電気化学センサは、メルカプトウンデカン酸およびヘキサエチレングリコールジチオール(MUDA+HEG SAM)から形成された自己組織化単層を有した。本電気化学センサによって生成された信号対雑音比は、2つの対照の信号対雑音比と比較された。対照1は、裸センサであり、対照2は、センサの信号対雑音比および安定性を増進させるために業界で広く使用されている表面改質である、メルカプトヘキサノール自己組織化単層(C6 SAM)を伴うセンサであった。各センサは、異なる分析チャネル内に位置付けられ、各センサからの信号および雑音は、センサに電気的に接続されたコンピュータデバイスによって測定された。標的被分析物、すなわち、H3N2核タンパク質は、親和性作用物質に結合された磁気粒子および検出作用物質の両方と組み合わせられ、サンドイッチ複合体を形成し、サンドイッチ複合体は、各分析チャネルに添加された。3つの試験が、一連のH3N2核タンパク質濃度にわたって実行された。具体的には、試験1、2、および3は、それぞれ、4ng/ml、12ng/ml、および60ng/mlのH3N2核タンパク質を使用した。試験の結果が、図38に示されている。示されるように、MUDA+HEG SAM表面化学を有する電気化学センサは、一連の濃度にわたって対照センサより大いに優れていた。
第2の実験のセットでは、被分析物検出システム内に音波発生装置を含むことの効果が試験された。具体的には、試験被分析物検出システムおよび対照被分析物検出システムが提供された。試験被分析物検出システムは、本開示に従って作製され、カートリッジの第1の貯留部の下方に配置された音波発生装置を含んだ。対照システムは、同様に構築されたが、音波発生装置を伴わなかった。試験および対照システムの両方では、サンプルが、第1の貯留部に添加され、サンプル調製試薬と混合してハイブリダイズするように、そこに2分間とどまらされた。第1の貯留部に添加されたサンプルは、60ng/mlのH3N2ウイルスを含んだ。H3N2ウイルスとサンドイッチ複合体を形成するためのサンプル調製試薬が、第1の貯留部内に存在した。試験システムでは、音波処理プロトコルが、2分の時間周期中に第1の貯留部の内容物を混合することを支援した。いかなる音波処理プロトコルも、対照システムに適用されなかった。2分後、第1の貯留部の内容物は、サンプル中の標的被分析物の検出および定量化のために分析チャネルの中へ出された。実験の結果は、図43内で提供される。音波発生装置の存在は、電気化学センサにおける信号の増加によって示されるように、サンドイッチ複合体内で結合された捕捉標的の量の実質的増加をもたらした。2分マークにおいて、試験システムは、対照システムと比較して平均信号を8倍増加させた。したがって、音波発生装置は、標的被分析物検出のための必要な反応のうちの少なくとも1つが起こる速度を大いに増加させる。
第3の実験のセットは、サンプル収集デバイスから第1の貯留部にサンプルを移送することにおいてシステムの有効性を試験した。本明細書で提供される実施形態に従って形成された試験システムでは、標的被分析物を伴うサンプルが、サンプル収集デバイスの第1の端部上に提供され、サンプル収集デバイスの第1の端部が、入力トンネルを通して第1の貯留部に挿入された。本明細書で提供される実施形態に従って形成された対照システムでは、標的被分析物を伴うサンプルが、いかなるサンプルを失うことも回避するために、ピペットを使用して第1の貯留部に直接注入された。試験および対照システムの両方では、次いで、サンプルが、音波発生装置の存在下でサンプル調製試薬と混合し、サンドイッチ複合体が、標的被分析物とサンプル調製試薬との間に形成された。指定時間周期後に、第1の貯留部への弁が開放され、サンドイッチ複合体が、分析チャネルに流し込まれ、そこで、電気化学センサ上に局在化され、化学基質に導入された。電気化学センサからの信号が記録された。試験システム内の信号は、対照システム内の信号の96.5%に等しいことが分かった。信号の4%未満が、サンプル収集デバイスから第1の貯留部の中への標的被分析物の移送において失われた。将来、そのような損失は、標的被分析物の定量化において対処され得る。加えて、損失は、ピペットを介してサンプルをカートリッジに注入するのではなく、サンプル収集デバイスをカートリッジに挿入することに起因する、有用性の増加と比較して、比較的重要ではないと見なされる。
第4の実験のセットは、標的被分析物の異なる濃度を再現可能に区別するシステムの能力を実証し、したがって、標的被分析物を再現可能に定量化するシステムの能力を実証した。1つの実験では、標的被分析物、すなわち、インフルエンザが、第1の貯留部に挿入され、そこで、インフルエンザ特異サンプル調製試薬と混合し、サンドイッチ複合体を形成した。サンドイッチ複合体は、分析チャネルに流し込まれ、そこで、電気化学センサ上に局在化され、化学基質に導入された。電気化学センサからの信号が記録された。複数の試験が、5つの異なる標的被分析物濃度において実行された。具体的には、本システムは、120ng/ml、60ng/ml、12ng/ml、4ng/ml、および0ng/mlのインフルエンザを使用して試験された。実験の結果は、図44で提供される。平均値および標準偏差の両方が示されている。描写されるように、各濃度値の信号が異なり、信号は、標的被分析物の濃度の減少とともに減少する。本システムは、標的被分析物の定量化を可能にするであろうデータを生成することが可能であることを実証した。
第5の実験のセットは、システムの時間を、他の公知の被分析物検出システムの結果と比較した。インフルエンザについて検査する際に、カートリッジへのサンプル収集デバイスの挿入から最終結果を受信するまでの実行時間は、3分かかった。対照的に、標準ELISA検定の実行時間は、120分である。本明細書に説明されるシステムの実施形態に含まれる種々の革新は、この大いに向上した実行時間につながり、向上したユーザ体験に寄与する。
Claims (15)
- 1つまたは複数の被分析物の存在、非存在、および量のうちの少なくとも1つを検出する信号を生成するためのシステムであって、前記システムは、サンプル分析カートリッジを備え、前記サンプル分析カートリッジは、
開口から延在する入力トンネルであって、前記入力トンネルは、サンプルに暴露されるように適合されるサンプル収集デバイスの遠位部分の挿入を可能にするように構成される、入力トンネルと、
前記入力トンネルの遠位端に位置付けられる貯留部であって、前記貯留部は、液体を保持するように構成され、かつ、前記サンプル収集デバイスの前記遠位部分から前記サンプルを受容するように構成される、貯留部と、
前記貯留部から、前記サンプルおよび試薬が内部で混合させられた前記液体を受容するように構成される分析チャネルと、
前記分析チャネル内の前記混合させられた液体に暴露されるように、かつ、前記サンプル内の1つまたは複数の被分析物の存在、非存在、および量のうちの少なくとも1つを示す信号を生成するように構成される電気化学センサと
を備え、
前記電気化学センサは、オリゴエチレングリコールジチオールとカルボン酸末端チオールとの混合物を含む、システム。 - 前記サンプル分析カートリッジに電気的に連結されるサンプル分析読取機であって、前記サンプル分析読取機は、処理するために前記信号を受信するように、かつ、前記サンプル内の前記1つまたは複数の被分析物の前記存在、非存在、および量のうちの少なくとも1つを示す前記処理された信号をコンピュータに伝送するように構成される、サンプル分析読取機と、
前記1つまたは複数の被分析物の前記存在、非存在、および量のうちの少なくとも1つを示す情報を表示するためのグラフィカルユーザインターフェースと
をさらに備える、請求項1に記載のシステム。 - 前記電気化学センサの表面は、自己組織化単層を備え、前記自己組織化単層は、少なくとも、前記オリゴエチレングリコールジチオールと前記カルボン酸末端チオールとの前記混合物から成る、請求項1または請求項2に記載のシステム。
- 前記グラフィカルユーザインターフェースは、前記コンピュータを介してアクセス可能なアプリケーションによって生成される、請求項2に記載のシステム。
- 前記コンピュータは、データをサーバに伝送するように、かつ、データを前記サーバから受信するように構成される、請求項2または請求項4に記載のシステム。
- 前記データは、前記1つまたは複数の被分析物の前記存在、非存在、および量のうちの少なくとも1つを示すデータを含む、請求項5に記載のシステム。
- 前記データは、前記サーバに記憶された過去の試験結果を含む、請求項5に記載のシステム。
- 前記グラフィカルユーザインターフェース上に表示される情報は、前記1つまたは複数の被分析物の前記存在、非存在、および量のうちの少なくとも1つに基づくユーザアクションの推奨を含む、請求項2または請求項4に記載のシステム。
- 前記グラフィカルユーザインターフェース上に表示される情報は、前記1つまたは複数の被分析物の前記存在、非存在、および量のうちの少なくとも1つに基づく表またはグラフもしくは両方を含む、請求項2または請求項4に記載のシステム。
- 前記コンピュータは、装着型デバイスから睡眠データまたは運動データを受信するように構成され、
前記コンピュータのプロセッサは、前記装着型デバイスからの前記データを処理するように、かつ、前記グラフィカルユーザインターフェースに前記装着型デバイスからの前記データに基づく情報を表示させるように構成される、請求項2または請求項4に記載のシステム。 - 前記アプリケーションは、カレンダーアプリケーションと同期化するように、かつ、前記カレンダーアプリケーションとの前記同期化に基づいて特定の時間にユーザに通知するように構成される、請求項4に記載のシステム。
- 前記アプリケーションは、ユーザのソーシャルネットワークのうちの1つまたは複数にリンクするように構成される、請求項4に記載のシステム。
- 前記アプリケーションは、前記ユーザの1つまたは複数のソーシャルネットワーク内の1つまたは複数の連絡先に、前記サンプル内の前記1つまたは複数の被分析物の前記存在、非存在、および量のうちの少なくとも1つを示す試験結果を通知するように構成される、請求項12に記載のシステム。
- 前記サンプル分析読取機による前記サンプル分析カートリッジの受容は、前記サンプル分析カートリッジと前記サンプル分析読取機との間の電気的連結を引き起こす、請求項2または請求項4に記載のシステム。
- 前記システムは、前記サンプル収集デバイスをさらに備える、請求項1〜4のいずれか1項に記載のシステム。
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