JP6884268B2 - 糖原病Ia型治療薬 - Google Patents
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Description
(1)c.648G>T変異を有するG6PC遺伝子のcDNAに相補的なヌクレオチド配列からなる塩基数15〜30のオリゴヌクレオチドであって、c.648G>T変異を有するG6PC遺伝子のエクソン5の5'末端から82番目乃至92番目のいずれかの部位を含む領域に相補的な配列からなる前記オリゴヌクレオチド、その薬理上許容される塩又は溶媒和物。
(2)塩基数15〜21のオリゴヌクレオチドであって、c.648G>T変異を有するG6PC遺伝子のエクソン5の5'末端から86番目乃至92番目のいずれかの部位を含む領域に相補的な配列からなる、(1)に記載のオリゴヌクレオチド、その薬理上許容される塩又は溶媒和物。
(3)塩基数15〜21のオリゴヌクレオチドであって、c.648G>T変異を有するG6PC遺伝子のエクソン5の5'末端から92番目の部位を含む領域に相補的な配列からなる、(1)に記載のオリゴヌクレオチド、その薬理上許容される塩又は溶媒和物。
(4)塩基数15〜18のオリゴヌクレオチドであって、c.648G>T変異を有するG6PC遺伝子のエクソン5の5'末端から92番目の部位を含む領域に相補的な配列からなる、(1)に記載のオリゴヌクレオチド、その薬理上許容される塩又は溶媒和物。
(5)塩基数18のオリゴヌクレオチドであって、c.648G>T変異を有するG6PC遺伝子のエクソン5の5'末端から92番目の部位を含む領域に相補的な配列からなる、(1)に記載のオリゴヌクレオチド、その薬理上許容される塩又は溶媒和物。
(6)塩基数17のオリゴヌクレオチドであって、c.648G>T変異を有するG6PC遺伝子のエクソン5の5'末端から92番目の部位を含む領域に相補的な配列からなる、(1)に記載のオリゴヌクレオチド、その薬理上許容される塩又は溶媒和物。
(7)塩基数16のオリゴヌクレオチドであって、c.648G>T変異を有するG6PC遺伝子のエクソン5の5'末端から92番目の部位を含む領域に相補的な配列からなる、(1)に記載のオリゴヌクレオチド、その薬理上許容される塩又は溶媒和物。
(8)塩基数15のオリゴヌクレオチドであって、c.648G>T変異を有するG6PC遺伝子のエクソン5の5'末端から92番目の部位を含む領域に相補的な配列からなる、(1)に記載のオリゴヌクレオチド、その薬理上許容される塩又は溶媒和物。
(9)配列番号1〜32、40〜42、44〜48のいずれかの配列(但し、配列中のtはuであってもよく、uはtであってもよい)中の連続する少なくとも15個のヌクレオチドの配列を含む、(1)に記載のオリゴヌクレオチド、その薬理上許容される塩又は溶媒和物。
(10)さらに、生体内で切断されうるオリゴヌクレオチドが5'末端及び/又は3'末端に付加された(1)〜(9)のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド、その薬理上許容される塩又は溶媒和物。
(11)オリゴヌクレオチドを構成する糖及び/又はリン酸ジエステル結合の少なくとも1個が修飾されている、(1)〜(10)のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド、その薬理上許容される塩又は溶媒和物。
(12)オリゴヌクレオチドを構成する糖がD-リボフラノースであり、糖の修飾がD-リボフラノースの2'位の水酸基の修飾である、(1)〜(10)のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド、その薬理上許容される塩又は溶媒和物。
(13)オリゴヌクレオチドを構成する糖がD-リボフラノースであり、糖の修飾がD-リボフラノースの2’-O-アルキル化及び/又は2'-,4'-架橋化である、(1)〜(10)のいずれか1項に記載のオリゴヌクレオチド、その薬理上許容される塩又は溶媒和物。
(14)オリゴヌクレオチドを構成する糖がD-リボフラノースであり、糖の修飾がD-リボフラノースの2’-O-アルキル化及び/又は2'-O,4'-C-アルキレン化である、(1)〜(10)のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド、その薬理上許容される塩又は溶媒和物。
(15)リン酸ジエステル結合の修飾がホスホロチオエートである、(1)〜(14)のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド、その薬理上許容される塩又は溶媒和物。
(16)5'末端及び/又は3'末端にGalNAcユニットが結合した(1)〜(15)のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド、その薬理上許容される塩又は溶媒和物。
(17)5'末端にGalNAcユニットが結合した(1)〜(15)のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド、その薬理上許容される塩又は溶媒和物。
(18)GalNAcユニットが、式
(19)GalNAcユニットが、式
(20)GalNAcユニットが、式
(21)GalNAcユニットが、式
(22)GalNAcユニットが、又は、式
(23)GalNAcユニットが、式
(24)式
(26)(1)〜(24)のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド、その薬理上許容される塩又は溶媒和物を含む、糖原病Ia型治療薬。
(27)(1)〜(24)のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド、その薬理上許容される塩又は溶媒和物を医薬的に有効な量で被験者に投与することを含む、糖原病Ia型の治療方法。
(28)糖原病Ia型の治療方法に使用するための、(1)〜(24)のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド、その薬理上許容される塩又は溶媒和物。
(29)(1)〜(24)のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド、その薬理上許容される塩又は溶媒和物を含む、経口又は非経口で投与するための配合物。
(30)医薬として使用するための、(1)〜(24)のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド、その薬理上許容される塩又は溶媒和物。
本明細書は、本願の優先権の基礎である日本国特許出願、特願2018-43524及び特願2018-128015の明細書および/または図面に記載される内容を包含する。
また、「結合手を有するGalNAcユニット」であるXg、及び、RがXX基又はG基からなるRO−Xg−の「GalNAcユニット」としては、次のような基が挙げられる。
本発明のGalNAcユニットが結合したオリゴヌクレオチドは、GalNAcユニットを含有するアミダイトをヌクレオシドのアミダイト試薬と同様に用いることにより、市販の合成機(例えば、パーキンエルマー社のホスホロアミダイド法によるモデル392)などを用いて、文献(Nucleic Acids Research, 12, 4539 (1984))に記載の方法に準じて合成することができる。オリゴヌクレオチドの5'末端に結合する場合は、オリゴヌクレオチドの部分の鎖伸長を終了した後に、GalNAcユニットを含有するアミダイトをカップリングすることで合成することができる。また、オリゴヌクレオチドの3'末端に結合する場合は、修飾されたCPG(特開平7−87982の実施例12bに記載)、3'-amino-Modifier C3 CPG, 3'-amino-Modifier C7 CPG, Glyceryl CPG, (Glen Research), 3'-specer C3 SynBase CPG 1000, 3'-specer C9 SynBase CPG 1000(link technologies)などを使い、GalNAcユニットを含有するアミダイトをカップリングし、その後に、オリゴヌクレオチドの部分の鎖伸長することで、3'末端にヒドロキシアルキルリン酸基、または、アミノアルキルリン酸基を持ち、さらにGalNAcユニットが結合したオリゴヌクレオチドを合成できる。
本発明のGalNAcユニット含有アミダイトは、後述するA法からI法に従って製造することができる。A法からI法において、各反応終了後、各反応の目的化合物は常法に従って、反応混合物から採取される。例えば、反応混合物を適宜中和し、また、不溶物が存在する場合にはろ過により除去した後、水と酢酸エチルのような混和しない有機溶媒を加え、目的物を含む有機層を分離し、水などで洗浄後、無水硫酸ナトリウムなどで乾燥後、溶剤を留去することによって得られる。得られた化合物は、必要ならば、常法、例えばシリカゲルカラムクロマトグラフィーで分離・精製することができる。あるいは、再沈殿、再結晶により精製することができる。
A法は、化合物(8)を製造するための方法である。化合物(2)に逆の立体配置のものを用いると、化合物(8)において、−P(R3)R4が結合した二級水酸基の立体配置も逆になる。
B法は、化合物(14)又は分岐型の化合物(19)を製造するための方法である。化合物(2)に逆の立体配置のものを用いると、化合物(14)又は分岐型の化合物(19)において、−P(R3)R4が結合した二級水酸基の立体配置も逆になる。
C法は、化合物(26)又は分岐型の化合物(30)を合成する製造するための方法である。化合物(23)の二級水酸基で逆の立体配置のものを用いると、化合物(26)あるいは分岐型の化合物(30)において、−P(R3)R4が結合した二級水酸基の立体配置も逆になる。
D法は、化合物(35)を製造するための方法である。2回あるアミド縮合の順序を変えたり、各化合物の保護基の状態によって、適宜工程を選ぶことができる。化合物(23)の二級水酸基で逆の立体配置のものを用いると、化合物(35)において、−P(R3)R4が結合した二級水酸基の立体配置も逆になる。
E法は、D法で使用した化合物(31)や合成した中間体(38)を利用して、分岐型の化合物(44)を製造するための方法である。2回あるアミド縮合の順序を変えたり、各化合物の保護基の状態によって、適宜工程を選ぶことができる。化合物(23)の二級水酸基で逆の立体配置のものを用いると、化合物(44)において、−P(R3)R4が結合した二級水酸基の立体配置も逆になる。
F法は、A法で合成した中間体(3)を利用して、分岐型の化合物(49)を製造するための方法である。化合物(3)の二級水酸基で逆の立体配置のものを用いると、化合物(49)において、GalNAcが結合した二級水酸基の立体配置も逆になる。
G法は、C法で使用した中間体(22)を利用して、分岐型の化合物(55)を製造するための方法である。化合物(52)あるいは化合物(56)の二級水酸基で逆の立体配置のものを用いると、化合物(55)において、GalNAcが結合した二級水酸基の立体配置も逆になる。
式中R3、R4、X、n及びmは、前記と同意義を示し、rは、0又は1を示し、R11はアミノ基の一般的な保護基であり、R12及びR13は水酸基の一般的な保護基である。
H法は、C法で使用した中間体(22)あるいはG法で使用した中間体(51)を利用して、分岐型の化合物(61)を製造するための方法である。化合物(52)あるいは化合物(56)の立体配置は限定しない。
I法は、分岐型の化合物(73)、及び化合物(74)を製造するための方法である。例えば、化合物(70)を用いることで、GalNAc部分の6位水酸基の保護基を適宜選択できる。R14がアセチル基の場合、化合物(70)として、C法で合成できる化合物(22)を使用する。R14が4,4'-ジメトキシトリチル基の場合、化合物(70)として、例えば後述する参考例に従って合成できる化合物を使用する。
HO-Ae2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Am1s-Am1s-Ae2s-Am1s-Um1s-Ce2s-Cm1s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Ge2s-Cm1s-Gm1s-Ae2-sAm1s-Ge2t-H (21e_002)(配列番号1)
核酸自動合成機(「ABI 394 DNA/RNA Synthesizer」Applied Biosystems製)を用い、ホスホロアミダイト法(Nucleic Acids Research, 12, 4539 (1984))を用いて合成を行った。試薬としては、アクチベーター溶液-3(0.25 mol/L 5-ベンジルチオ-1H-テトラゾール・アセトニトリル溶液、和光純薬工業製、product No. 013-20011)、CAP A for AKTA(1-メチルイミダゾール・アセトニトリル溶液、Sigma-Aldrich製、product No. L040050)、Cap B1 for AKTA(無水酢酸・アセトニトリル溶液、Sigma-Aldrich製、product No. L050050)、Cap B2 for AKTA(ピリジン・アセトニトリル溶液、Sigma-Aldrich製、product No. L050150)、DCA Deblock(ジクロロ酢酸・トルエン溶液、Sigma-Aldrich製、product No. L023050)を用いた。ホスホロチオエート結合を形成するためのチオ化試薬として、0.2Mになるようにフェニルアセチルジスルフィド(CARBOSYNTH製、product No. FP07495)を、アセトニトリル(脱水、関東化学製、product No. 01837-05)、ピリジン(脱水、関東化学製、product No. 11339-05)1:1(v/v)溶液を用いて溶解して用いた。アミダイト試薬としては、2'-O-Meヌクレオシドのホスホロアミダイト(アデノシン体product No. ANP-5751, シチジン体product No. ANP-5752,グアノシン体product No. ANP-5753, ウリジン体product No. ANP-5754)はChemGenes製のものを用いた。非天然型のホスホロアミダイトは特開2000−297097の実施例14(5'-O-ジメトキシトリチル-2'-O,4'-C-エチレン-6-N-ベンゾイルアデノシン-3'-O-(2-シアノエチル N,N-ジイソプロピル)ホスホロアミダイト)、実施例27(5'-O-ジメトキシトリチル-2'-O,4'-C-エチレン-2-N-イソブチリルグアノシン-3'-O-(2-シアノエチル N,N-ジイソプロピル)ホスホロアミダイト)、実施例22(5'-O-ジメトキシトリチル-2'-O,4'-C-エチレン-4-N-ベンゾイル-5-メチルシチジン-3'-O-(2-シアノエチル N,N-ジイソプロピル)ホスホロアミダイト)、実施例9(5'-O-ジメトキシトリチル-2'-O,4'-C-エチレン-5-メチルウリジン-3'-O-(2-シアノエチル N,N-ジイソプロピル)ホスホロアミダイト)の化合物を用いた。固相担体としてGlen Unysupport 0.1μmol(GlenResearch製)を用い、表記の化合物を合成した。プログラムは、核酸自動合成機に付属している0.2μmolスケール用を用い、但し、アミダイト体の縮合に要する時間は、600秒とし、チオ化に要する時間は、150秒とした。
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実施例 配列名称 配列 (5'-3') 開始 終了 分子量 配列番号
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1 21e_002 AgaTaaAauCcgAugGcgAaG 112 92 7544.86 1
2 21e_003 TaaAauCcgAugGcgAagCuG 109 89 7512.84 2
3 21e_004 AauCcgAugGcgAagCugAaA 106 86 7520.89 3
4 21e_005 CcgAugGcgAagCugAaaAgG 103 83 7575.87 4
5 21e_006 AugGcgAagCugAaaAggAaG 100 80 7610.88 5
6 21e_007 GcgAagCugAaaAggAagAaG 97 77 7633.90 6
7 21e_008 AagCugAaaAggAagAagGuA 94 74 7618.89 7
8 21e_009 CugAaaAggAagAagGuaAuG 91 71 7595.86 8
9 21e_010 AaaAggAagAagGuaAugAgA 88 68 7628.89 9
10 21e_011 AggAagAagGuaAugAgaAaA 85 65 7628.88 10
11 21e_012 AagAagGuaAugAgaAaaTaT 82 62 7578.93 11
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表中の配列において大文字は2’-O,4’-C-エチレン架橋核酸、小文字は2'-OMe-RNAを示す。2’-O,4’-C-エチレン架橋核酸のCは、5-メチルシトシンである。開始および終了については、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5'末端から番号を示す。化合物は負イオンESI質量分析により同定し、表中に実測値を示す。
HO-Am1s-Gm1s-Am1s-Um1s-Am1s-Am1s-Am1s-Am1s-Um1s-Cm1s-Cm1s-Gm1s-Am1s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Cm1s-Gm1s-Am1s-AGm1t-H (21m_002)(配列番号1)
核酸自動合成機(BioAutomation製MerMade 192X)を用い、実施例1と同様に合成および精製を行い、目的化合物を得た。
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実施例 配列名称 配列 (5'-3') 開始 終了 分子量 配列番号
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12 21m_002 agauaaaauccgauggcgaag 112 92 7416.86 1
13 21m_003 uaaaauccgauggcgaagcug 109 89 7369.80 2
14 21m_004 aauccgauggcgaagcugaaa 106 86 7368.81 3
15 21m_005 ccgauggcgaagcugaaaagg 103 83 7423.81 4
16 21m_006 auggcgaagcugaaaaggaag 100 80 7475.89 5
17 21m_007 gcgaagcugaaaaggaagaag 97 77 7494.86 6
18 21m_008 aagcugaaaaggaagaaggua 94 74 7483.90 7
19 21m_009 cugaaaaggaagaagguaaug 91 71 7456.82 8
20 21m_010 aaaaggaagaagguaaugaga 88 68 7503.86 9
21 21m_011 aggaagaagguaaugagaaaa 85 65 7527.88 10
22 21m_012 aagaagguaaugagaaaauau 82 62 7453.87 11
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表中の配列において小文字は2'-OMe-RNAを示す。開始および終了については、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5'末端から番号を示す。化合物は負イオンESI質量分析により同定し、表中に実測値を示す。
HO-Ge2s-Am1s-Um1s-Ae2s-Am1s-Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H (21e_015)(配列番号12)
実施例12と同様に合成および精製を行い、目的化合物を得た。
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実施例 配列名称 配列 (5'-3') 開始 終了 分子量 配列番号
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23 21e_015 GauAaaAucCgaTggCgaAgC 111 91 7544.88 12
24 21e_016 AuaAaaTccGauGgcGaaGcT 110 90 7477.80 13
25 21e_017 AaaAucCgaTggCgaAgcTgA 108 88 7544.87 14
26 21e_018 AaaTccGauGgcGaaGcuGaA 107 87 7506.86 15
27 21e_019 AucCgaTggCgaAgcTgaAaA 105 85 7544.86 16
28 21e_020 TccGauGgcGaaGcuGaaAaG 104 84 7518.81 17
29 21e_021 CgaTggCgaAgcTgaAaaGgA 102 82 7623.82 18
30 21e_022 GauGgcGaaGcuGaaAagGaA 101 81 7591.85 19
31 21e_002m01 Agauaaaauccgauggcgaag 112 92 7432.84 1
32 21e_002m02 agauaaaauccgauggcgaaG 112 92 7432.84 1
33 21e_002m03 AgauaaaauccgauggcgaaG 112 92 7440.85 1
34 21e_002m04 AgauaaaauccgAuggcgaaG 112 92 7452.86 1
35 21e_002m05 AgauaaaauCcgauggcgaaG 112 92 7466.86 1
36 21e_002m06 AgaTaaaauccgauggcgAaG 112 92 7482.86 1
37 21e_002m07 AgauaaaauCcgAuggcgaaG 112 92 7478.83 1
38 21e_002m08 AgauaaaauCcgaugGcgaaG 112 92 7478.84 1
39 21e_002m09 AgaTaaAauccgAuggcgaaG 112 92 7490.83 1
40 21e_002m10 AgauaaAauccgaugGcgAaG 112 92 7476.81 1
41 21e_002m11 AgauaaAauccgAugGcgaaG 112 92 7481.84 1
42 21e_002m12 AgauaaAauCcgaugGcgaaG 112 92 7490.85 1
43 21e_002m13 AgaTaaAauccgAuggcgAaG 112 92 7502.82 1
44 21e_002m14 AgaTaaaauCcgAuggcgAaG 112 92 7516.85 1
45 21e_002m15 AgauaaAauCcgAugGcgaaG 112 92 7502.82 1
46 21e_002m16 AgaTaaAauCcgAuggcgAaG 112 92 7533.87 1
47 21e_002m17 AgaTaaaauCcgAugGcgAaG 112 92 7528.84 1
48 21e_002m18 AgaTaAaaTcCgaTgGcgAaG 112 92 7584.91 1
49 21e_002m19 AgAuaAaAuCcGaTgGcgAaG 112 92 7564.84 1
50 21e_002m20 AgAuAaAaTcCgAuGgCgAaG 112 92 7594.88 1
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表中の配列において大文字は2’-O,4’-C-エチレン架橋核酸、小文字は2'-OMe-RNAを示す。2’-O,4’-C-エチレン架橋核酸のCは、5-メチルシトシンである。開始および終了については、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5'末端から番号を示す。化合物は負イオンESI質量分析により同定し、表中に実測値を示す。
HO-Um1s-Ae2s-Am1s-Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H (18e_005)(配列番号20)
実施例12と同様に合成を行った。目的配列を有する保護されたオリゴヌクレオチド類縁体を450μLの濃アンモニア水で処理することによってオリゴマーを支持体から切り出すとともに、リン原子上の保護基シアノエチル基と核酸塩基上の保護基をはずした。オリゴマーの混合溶液を、Clarity QSP DNA Loading Buffer(Phenomenex製)300μLを混合し、Clarity SPE 96 well plate(Phenomenex製)上にチャージした。Clarity QSP DNA Loading Buffer:水=1:1溶液1mL、水3mL、3%ジクロロ酢酸(DCA)水溶液3mL、水6mLの順に添加した後、20mM Tris水溶液:アセトニトリル=9:1溶液にて抽出される成分を集めた。溶媒留去後、目的化合物を得た。
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実施例 配列名称 配列 (5'-3') 開始 終了 分子量 配列番号
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51 18e_005 uAaaAucCgaTggCgaAg 109 92 6437.79 20
52 18e_006 aAaaTccGauGgcGaaGc 108 91 6408.78 21
53 18e_007 aAauCcgAugGcgAagCu 107 90 6399.76 22
54 18e_008 aAucCgaTggCgaAgcTg 106 89 6443.80 23
55 18e_009 aTccGauGgcGaaGcuGa 105 88 6401.74 24
56 18e_010 uCcgAugGcgAagCugAa 104 87 6415.75 25
57 18e_011 cCgaTggCgaAgcTgaAa 103 86 6466.81 26
58 18e_012 cGauGgcGaaGcuGaaAa 102 85 6434.76 27
59 18e_013 gAugGcgAagCugAaaAg 101 84 6488.79 28
60 18e_014 aTggCgaAgcTgaAaaGg 100 83 6516.82 29
61 18e_015 uGgcGaaGcuGaaAagGa 99 82 6474.78 30
62 18e_016 gGcgAagCugAaaAggAa 98 81 6511.81 31
63 18e_017 gCgaAgcTgaAaaGgaAg 97 80 6525.84 32
64 18e_022 TaaaauCCgaTggCgaag 109 92 6453.82 20
65 18e_023 aaaauCCgaTggCgaagC 108 91 6452.84 21
66 18e_024 aaauCCgaTggCgaagCT 107 90 6455.83 22
67 18e_025 aauCCgaTggCgaagCTg 106 89 6471.82 23
68 18e_026 auCCgaTggCgaagCTga 105 88 6471.83 24
69 18e_031 TaAaaTccgauGgcGaag 109 92 6411.77 20
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表中の配列において大文字は2’-O,4’-C-エチレン架橋核酸、小文字は2'-OMe-RNAを示す。2’-O,4’-C-エチレン架橋核酸のCは、5-メチルシトシンである。開始および終了については、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5'末端から番号を示す。化合物は負イオンESI質量分析により同定し、表中に実測値を示す。
HO-Um1s-Am1s-Am1s-Am1s-Am1s-Um1s-Cm1s-Cm1s-Gm1s-Am1s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Cm1s-Gm1s-Am1s-Am1s-Gm1t-H (18m_005)(配列番号20)
核酸自動合成機(BioAutomation製MerMade 192X)を用い、実施例12と同様に合成および精製を行い、目的化合物を得た。
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実施例 配列名称 配列 (5'-3') 開始 終了 分子量 配列番号
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70 18m_005 uaaaauccgauggcgaag 109 92 6323.74 20
71 18m_006 aaaauccgauggcgaagc 108 91 6322.76 21
72 18m_007 aaauccgauggcgaagcu 107 90 6299.74 22
73 18m_008 aauccgauggcgaagcug 106 89 6315.73 23
74 18m_009 auccgauggcgaagcuga 105 88 6315.73 24
75 18m_010 uccgauggcgaagcugaa 104 87 6315.73 25
76 18m_011 ccgauggcgaagcugaaa 103 86 6338.75 26
77 18m_012 cgauggcgaagcugaaaa 102 85 6362.76 27
78 18m_013 gauggcgaagcugaaaag 101 84 6402.77 28
79 18m_014 auggcgaagcugaaaagg 100 83 6402.77 29
80 18m_015 uggcgaagcugaaaagga 99 82 6402.77 30
81 18m_016 ggcgaagcugaaaaggaa 98 81 6425.79 31
82 18m_017 gcgaagcugaaaaggaag 97 80 6425.80 32
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表中の配列において小文字は2'-OMe-RNAを示す。開始および終了については、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5'末端から番号を示す。化合物は負イオンESI質量分析により同定し、表中に実測値を示す。
HO-Ae2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Am1s-Am1s-Ae2s-Am1s-Um1s-Ce2s-Cm1s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Ge2s-Cm1s-Gm1s-Ae2-sAm1s-Ge2t-H (21e_001)(配列番号33)
実施例1と同様に合成、精製し、目的化合物を得た。
HO-Ge2s-Cm1s-Am1s-Ge2s-Am1s-Um1s-Ae2s-Am1s-Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2t-H (21e_013)(配列番号34)
実施例12と同様に合成および精製を行い、目的化合物を得た。
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参考例 配列名称 配列 (5'-3') 開始 終了 分子量 配列番号
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2 21e_013 GcaGauAaaAucCgaTggCgA 114 94 7530.86 34
3 21e_014 CagAuaAaaTccGauGgcGaA 113 93 7505.88 35
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表中の配列において大文字は2’-O,4’-C-エチレン架橋核酸、小文字は2'-OMe-RNAを示す。2’-O,4’-C-エチレン架橋核酸のCは、5-メチルシトシンである。開始および終了については、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5'末端から番号を示す。化合物は負イオンESI質量分析により同定し、表中に実測値を示す。
HO-Cm1s-Ae2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Am1s-Am1s-Ae2s-Am1s-Um1s-Ce2s-Cm1s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Ge2s-Cm1t-H (18e_001)(配列番号36)
実施例51と同様に合成および精製を行い、目的化合物を得た。
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参考例 配列名称 配列 (5'-3') 開始 終了 分子量 配列番号
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4 18e_001 cAgaTaaAauCcgAugGc 113 96 6383.77 36
5 18e_002 aGauAaaAucCgaTggCg 112 95 6437.79 37
6 18e_003 gAuaAaaTccGauGgcGa 111 94 6409.76 38
7 18e_004 aTaaAauCcgAugGcgAa 110 93 6407.78 39
8 18e_018 CagaTaaaauCCgaTggC 113 96 6439.82 36
9 18e_019 agaTaaaauCCgaTggCg 112 95 6453.82 37
10 18e_020 gaTaaaauCCgaTggCga 111 94 6453.82 38
11 18e_021 aTaaaauCCgaTggCgaa 110 93 6437.83 39
12 18e_027 CaGauAaaaucCgaTggc 113 96 6385.78 36
13 18e_028 AgAuaAaauccGauGgcg 112 95 6383.74 37
14 18e_029 GaTaaAauccgAugGcga 111 94 6397.76 38
15 18e_030 AuAaaAuccgaTggCgaa 110 93 6395.78 39
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表中の配列において大文字は2’-O,4’-C-エチレン架橋核酸、小文字は2'-OMe-RNAを示す。2’-O,4’-C-エチレン架橋核酸のCは、5-メチルシトシンである。開始および終了については、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5'末端から番号を示す。化合物は負イオンESI質量分析により同定し、表中に実測値を示す。
HO-Cm1s-Am1s-Gm1s-Am1s-Um1s-Am1s-Am1s-Am1s-Am1s-Um1s-Cm1s-Cm1s-Gm1s-Am1s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Cm1t-H (18m_001)(配列番号36)
実施例70と同様に合成および精製を行い、目的化合物を得た。
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参考例 配列名称 配列 (5'-3') 開始 終了 分子量 配列番号
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16 18m_001 cagauaaaauccgauggc 113 96 6283.74 36
17 18m_002 agauaaaauccgauggcg 112 95 6323.74 37
18 18m_003 gauaaaauccgauggcga 111 94 6323.75 38
19 18m_004 auaaaauccgauggcgaa 110 93 6307.75 39
20 21m_001 agcagauaaaauccgauggcg 115 95 7396.88 33
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表中の配列において小文字は2'-OMe-RNAを示す。開始および終了については、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5'末端から番号を示す。化合物は負イオンESI質量分析により同定し、表中に実測値を示す。
HO-Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H (15e_001)(配列番号40)
AKTA Oligopilotを用いて、固相担体としてPrimer Support 5G Unylinker 350, 100μmol(GE Healthcare製)を用い、実施例1と同様に合成を行った。目的配列を有する保護されたオリゴヌクレオチド類縁体を25mLの濃アンモニア水で処理することによってオリゴマーを支持体から切り出すとともに、リン原子上の保護基シアノエチル基と核酸塩基上の保護基をはずした。オリゴマーの混合溶液を、phenomenex Clarity QSP 5gを用いて、脱保護、精製を行い、溶媒留去後、目的化合物を得た。
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実施例 配列名称 配列 (5'-3') 開始 終了 分子量 配列番号
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83 15e_001 aAucCgaTggCgaAg 106 92 5371.68 40
84 15e_002 cCgaTggCgaAgcTg 103 89 5377.68 41
85 15ed_001 aAtcCgaTggCgaAg 106 92 5099.59 40
86 15ed_002 cCgaTggCgaAgcTg 103 89 5105.60 41
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表中の配列において大文字は2’-O,4’-C-エチレン架橋核酸、小文字は2'-OMe-RNA、小文字に下線のものはDNAを示す。2’-O,4’-C-エチレン架橋核酸のCは、5-メチルシトシンである。開始および終了については、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5'末端から番号を示す。化合物は負イオンESI質量分析により同定し、表中に実測値を示す。
HO-Am1s-Ae2s-Um1s-Ce2s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H (15e_001.1)(配列番号40)
実施例1と同様に合成を行った。但し、固相担体としてPrimer Support 5G Unylinker 350, 10μmol(GE Healthcare製)を用い、10μmolのプログラムを用いた。実施例83と同様に精製を行い、目的化合物を得た。
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実施例 配列名称 配列 (5'-3') 開始 終了 分子量 配列番号
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87 15e_001.1 aAuCCgATggCgaAg 106 92 5409.71 40
88 15e_001.2 aAucCgATggCgAAg 106 92 5395.69 40
89 15e_001.3 aAuCCgaTggCgAAg 106 92 5409.71 40
90 15e_001.4 aAuCCgATggCgAAg 106 92 5421.70 40
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表中の配列において大文字は2’-O,4’-C-エチレン架橋核酸、小文字は2'-OMe-RNAを示す。2’-O,4’-C-エチレン架橋核酸のCは、5-メチルシトシンである。開始および終了については、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5'末端から番号を示す。化合物は負イオンESI質量分析により同定し、表中に実測値を示す。
HO-X−X−X−Ap−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H(配列番号42)
実施例1と同様に合成を行った。但し、固相担体としてPrimer Support 5G Unylinker 350, 10μmol(GE Healthcare製)を用い、10μmolのプログラムを用いた。X部分は、文献(Bioorg. Med. Chem. (2016) 24, 26-32)記載のGalNAc phosphoramidite unit 1を用いて3回縮合した。実施例83と同様に精製を行い、目的化合物を得た。
HO-X−X−X−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H(配列番号40)
実施例91と同様に合成を行った。
HO-X−X−X−Tp−Cp−Ap−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H(配列番号43)
実施例91と同様に合成を行った。
HO-X−X−X−Ap−Am1s-Ae2s-Um1s-Ce2s-Cm1s-Ge2s-Am1s-Te2s-Gm1s-Ge2s-Cm1s-Ge2s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H(配列番号42)
実施例91と同様に合成を行った。
HO-X−X−X−Ap−Ae2s-Am1s-Te2s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Ge2s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Am1s-Ge2t-H(配列番号42)
実施例91と同様に合成を行った。
(21A)
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[5-(ベンジルオキシカルボニルアミノ)ペントキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物21A)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.37-7.32 (5H, m), 5.69 (1H, d, J = 9.1 Hz), 5.35 (1H, d, J = 2.4 Hz), 5.29 (1H, d, J = 11.5 Hz), 5.10 (2H, s), 4.94 (1H, br), 4.68 (1H, d, J = 7.9 Hz), 4.20-4.09 (2H, m), 3.97-3.86 (3H, m), 3.49-3.44 (1H, m), 3.20-3.17 (2H, m), 2.14 (3H, s), 2.05 (3H, s), 2.01 (3H, s), 1.93 (3H, s), 1.66-1.34 (6H, m).
Calcd for C27H38N2O11: [M+H]+ 567, Found 567.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-(5-アミノペントキシ)テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物21B)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 5.78 (1H, d, J = 8.5 Hz), 5.36-5.32 (2H, m), 4.72 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.21-4.09 (2H, m), 3.96-3.88 (3H, m), 3.52-3.47 (1H, m), 2.70 (2H, t, J = 6.7 Hz), 2.15 (3H, s), 2.05 (3H, s), 2.01 (3H, s), 1.96 (3H, s), 1.75-1.36 (6H, m).
Calcd for C19H32N2O9: [M+H]+ 433, Found 433.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[5-[[(4S)-2,2-ジメチル-1,3-ジオキソラン-4-イル]メトキシカルボニルアミノ]ペントキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物21C)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 5.75 (1H, d, J = 8.5 Hz), 5.36 (1H, d, J = 3.0 Hz), 5.30 (1H, dd, J = 11.2, 3.3 Hz), 4.97 (1H, br), 4.71 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.33-4.29 (1H, m), 4.23-3.88 (8H, m), 3.74-3.72 (1H, m), 3.49-3.46 (1H, m), 3.19-3.14 (2H, m), 2.15 (3H, s), 2.05 (3H, s), 2.01 (3H, s), 1.96 (3H, s), 1.63-1.53 (6H, m), 1.44 (3H, s), 1.37 (3H, s).
Calcd for C26H42N2O13: [M+H]+ 591, Found 591.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[5-[[(2S)-2,3-ジヒドロキシプロポキシ]カルボニルアミノ]ペントキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物21D)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 5.75 (1H, d, J = 7.3 Hz), 5.35 (1H, d, J = 3.0 Hz), 5.22 (1H, dd, J = 11.5, 3.0 Hz), 5.13 (1H, br s), 4.61 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.23-3.87 (7H, m), 3.67-3.60 (3H, m), 3.49-3.46 (1H, m), 3.22-3.16 (2H, m), 2.16 (3H, s), 2.05 (3H, s), 2.01 (3H, s), 1.97 (3H, s), 1.61-1.50 (6H, m).
Calcd for C23H38N2O13: [M+H]+ 551, Found 551.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[5-[[(2S)-3-[ビス(4-メトキシフェニル)-フェニル-メトキシ]-2-ヒドロキシ-プロポキシ]カルボニルアミノ]ペントキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物21E)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.43-7.42 (2H, m), 7.32-7.29 (6H, m), 7.24-7.19 (1H, m), 6.84-6.81 (4H, m), 5.74 (1H, d, J = 8.5 Hz), 5.35 (1H, d, J = 3.0 Hz), 5.26 (1H, dd, J = 11.2, 3.3 Hz), 4.94 (1H, br), 4.65 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.22-4.09 (4H, m), 3.97-3.91 (4H, m), 3.79 (6H, s), 3.47-3.43 (1H, m), 3.18-3.15 (4H, m), 3.00 (1H, d, J = 4.8 Hz), 2.14 (3H, s), 2.04 (3H, s), 1.99 (3H, s), 1.95 (3H, s), 1.65-1.34 (6H, m).
Calcd for C44H56N2O15: [M+Na]+ 875, Found 875.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[5-[[(2S)-3-[ビス(4-メトキシフェニル)-フェニル-メトキシ]-2-[2-シアノエトキシ-(ジイソプロピルアミノ)ホスファニル]オキシプロポキシ]カルボニルアミノ]ペントキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物21F)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.46-7.40 (2H, m), 7.35-7.17 (7H, m), 6.82-6.80 (4H, m), 5.73-5.63 (1H, m), 5.37-5.35 (1H, m), 5.30-5.26 (1H, m), 4.97-4.94 (0.5H, m), 4.72-4.68 (1H, m), 4.42-4.40 (0.5H, m), 4.22-4.10 (4H, m), 3.99-3.43 (14H, m), 3.18-3.12 (4H, m), 2.67-2.62 (1H, m), 2.46-2.44 (1H, m), 2.14 (3H, s), 2.01-1.96 (9H, m), 1.65-0.97 (18H, m).
HO-X1−X1−X1−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H (配列番号40)
Xの部分をX1と置き換えて、実施例91と同様に合成を行った。X1の部分は参考例21で合成した化合物21Fを用い、3回縮合した。
(22A)
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[5-[[(4R)-2,2-ジメチル-1,3-ジオキソラン-4-イル]メトキシカルボニルアミノ]ペントキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物22A)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 5.71 (1H, d, J = 8.5 Hz), 5.36 (1H, d, J = 3.0 Hz), 5.31 (1H, dd, J = 11.2, 3.0 Hz), 4.97 (1H, br), 4.71 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.33-4.30 (1H, m), 4.22-3.99 (5H, m), 3.95-3.89 (3H, m), 3.74-3.71 (1H, m), 3.50-3.46 (1H, m), 3.19-3.14 (2H, m), 2.15 (3H, s), 2.05 (3H, s), 2.01 (3H, s), 1.96 (3H, s), 1.69-1.47 (6H, m), 1.44 (3H, s), 1.37 (3H, s).
Calcd for C26H42N2O13: [M+H]+ 591, Found 591.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[5-[[(2R)-2,3-ジヒドロキシプロポキシ]カルボニルアミノ]ペントキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物22B)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 5.98 (1H, d, J = 8.5 Hz), 5.37-5.20 (3H, m), 4.63 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.21-3.88 (7H, m), 3.69-3.57 (3H, m), 3.51-3.44 (1H, m), 3.21-3.14 (2H, m), 2.16 (3H, s), 2.05 (3H, s), 2.01 (3H, s), 1.97 (3H, s), 1.66-1.34 (6H, m).
Calcd for C23H38N2O13: [M+H]+ 551, Found 551.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[5-[[(2R)-3-[ビス(4-メトキシフェニル)-フェニル-メトキシ]-2-ヒドロキシ-プロポキシ]カルボニルアミノ]ペントキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物22C)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.42 (2H, d, J = 7.9 Hz), 7.32-7.16 (6H, m), 6.83 (4H, d, J = 9.1 Hz), 5.74 (1H, d, J = 8.5 Hz), 5.35 (1H, d, J = 3.0 Hz), 5.27 (1H, dd, J = 11.2, 3.0 Hz), 4.93 (1H, br), 4.66 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.25-4.11 (4H, m), 4.01-3.89 (4H, m), 3.79 (6H, s), 3.50-3.43 (1H, m), 3.21-3.13 (4H, m), 2.98 (1H, br), 2.13 (3H, s), 2.04 (3H, s), 1.99 (3H, s), 1.94 (3H, s), 1.65-1.34 (6H, m).
Calcd for C44H56N2O15: [M+Na]+ 875, Found 875.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[5-[[(2R)-3-[ビス(4-メトキシフェニル)-フェニル-メトキシ]-2-[2-シアノエトキシ-(ジイソプロピルアミノ)ホスファニル]オキシプロポキシ]カルボニルアミノ]ペントキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物22D)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.46-7.40 (2H, m), 7.35-7.17 (7H, m), 6.85-6.78 (4H, m), 5.70-5.57 (1H, m), 5.38-5.34 (1H, m), 5.32-5.24 (1H, m), 4.96-4.91 (0.5H, m), 4.73-4.65 (1H, m), 4.44-4.38 (0.5H, m), 4.23-4.08 (4H, m), 4.00-3.41 (14H, m), 3.27-3.03 (4H, m), 2.68-2.60 (1H, m), 2.49-2.42 (1H, m), 2.14 (3H, s), 2.07-1.91 (9H, m), 1.65-0.97 (18H, m).
HO-X2−X2−X2−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H (配列番号40)
Xの部分をX2と置き換えて、実施例91と同様に合成を行った。X2の部分は参考例22で合成した化合物22Dを用い、3回縮合した。
(23A)
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[8-(ベンジルオキシカルボニルアミノ)オクトキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物23A)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.39-7.29 (5H, m), 5.65 (1H, d, J = 8.5 Hz), 5.35 (1H, d, J = 3.0 Hz), 5.29 (1H, dd, J = 11.5, 3.0 Hz), 5.10 (2H, s), 4.83 (1H, br), 4.68 (1H, d, J = 7.9 Hz), 4.20-4.09 (2H, m), 3.99-3.85 (3H, m), 3.50-3.42 (1H, m), 3.22-3.15 (2H, m), 2.14 (3H, s), 2.05 (3H, s), 2.00 (3H, s), 1.95 (3H, s), 1.62-1.27 (12H, m).
Calcd for C30H44N2O11: [M+H]+ 609, Found 609.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-(8-アミノオクトキシ)テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物23B)の合成
Calcd for C22H38N2O9: [M+H]+ 475, Found 475.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[8-[[(4S)-2,2-ジメチル-1,3-ジオキソラン-4-イル]メトキシカルボニルアミノ]オクトキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物23C)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 5.64 (1H, d, J = 7.9 Hz), 5.36 (1H, d, J = 3.0 Hz), 5.29 (1H, dd, J = 11.2, 3.0 Hz), 4.85 (1H, br), 4.69 (1H, d, J = 7.9 Hz), 4.35-3.86 (9H, m), 3.76-3.70 (1H, m), 3.50-3.43 (1H, m), 3.20-3.12 (2H, m), 2.14 (3H, s), 2.05 (3H, s), 2.01 (3H, s), 1.96 (3H, s), 1.65-1.28 (12H, m), 1.44 (3H, s), 1.37 (3H, s).
Calcd for C29H48N2O13: [M+H]+ 633, Found 633.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[8-[[(2S)-2,3-ジヒドロキシプロポキシ]カルボニルアミノ]オクトキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物23D)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 5.87 (1H, d, J = 7.9 Hz), 5.35 (1H, d, J = 3.0 Hz), 5.27 (1H, dd, J = 11.2, 3.0 Hz), 5.07 (1H, br), 4.66 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.27-3.86 (7H, m), 3.70-3.57 (2H, m), 3.50-3.43 (2H, m), 3.24-3.13 (2H, m), 2.15 (3H, s), 2.05 (3H, s), 2.01 (3H, s), 1.96 (3H, s), 1.67-1.24 (12H, m).
Calcd for C26H44N2O13: [M+H]+ 593, Found 593.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[8-[[(2S)-3-[ビス(4-メトキシフェニル)-フェニル-メトキシ]-2-ヒドロキシ-プロポキシ]カルボニルアミノ]オクトキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物23E)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.44-7.40 (2H, m), 7.33-7.19 (7H, m), 6.85-6.81 (4H, m), 5.61 (1H, d, J = 8.5 Hz), 5.35 (1H, d, J = 3.0 Hz), 5.29 (1H, dd, J = 11.2, 3.3 Hz), 4.79 (1H, br), 4.69 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.24-4.09 (4H, m), 4.00-3.86 (4H, m), 3.79 (6H, s), 3.50-3.43 (1H, m), 3.21-3.12 (4H, m), 2.14 (3H, s), 2.04 (3H, s), 2.00 (3H, s), 1.95 (3H, s), 1.63-1.26 (12H, m).
Calcd for C47H62N2O15: [M+Na]+ 917, Found 917.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[8-[[(2S)-3-[ビス(4-メトキシフェニル)-フェニル-メトキシ]-2-[2-シアノエトキシ-(ジイソプロピルアミノ)ホスファニル]オキシプロポキシ]カルボニルアミノ]オクトキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物23F)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.46-7.40 (2H, m), 7.34-7.17 (7H, m), 6.84-6.78 (4H, m), 5.56-5.48 (1H, m), 5.37-5.34 (1H, m), 5.32-5.28 (1H, m), 4.87-4.80 (0.5H, m), 4.73-4.68 (1H, m), 4.43-4.37 (0.5H, m), 4.23-4.08 (4H, m), 3.97-3.43 (14H, m), 3.26-3.06 (4H, m), 2.66-2.61 (1H, m), 2.47-2.41 (1H, m), 2.14 (3H, s), 2.06-1.93 (9H, m), 1.64-1.23 (12H, m), 1.21-0.98 (12H, m).
HO-X3−X3−X3−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H (配列番号40)
Xの部分をX3と置き換えて、実施例91と同様に合成を行った。X3の部分は参考例23で合成した化合物23Fを用い、3回縮合した。
(24A)
7-[(2S)-3-ベンジルオキシ-2-ヒドロキシプロポキシ]ヘプタン-1-オール(化合物24A)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.39-7.28 (5H, m), 4.57 (2H, s), 4.02-3.96 (1H, m), 3.67-3.61 (2H, m), 3.59-3.43 (6H, m), 2.48 (1H, d, J = 4.2 Hz), 1.61-1.52 (4H, m), 1.37-1.30 (6H, m).
Calcd for C17H28O4: [M+Na]+ 319, Found 319.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[7-[(2S)-3-ベンジルオキシ-2-ヒドロキシ-プロポキシ]ヘプトキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物24B−1)の合成
(化合物24B−1)
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.39-7.28 (5H, m), 5.51 (1H, d, J = 8.5 Hz), 5.37-5.29 (2H, m), 4.71 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.56 (2H, s), 4.20-4.09 (2H, m), 4.03-3.85 (4H, m), 3.58-3.41 (7H, m), 2.58 (1H, d, J = 4.2 Hz), 2.14 (3H, s), 2.05 (3H, s), 2.00 (3H, s), 1.95 (3H, s), 1.63-1.52 (4H, m), 1.36-1.29 (6H, m).
Calcd for C31H47NO12: [M+H]+ 626, Found 626.
(化合物24B−2)
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.41-7.28 (5H, m), 5.65 (1H, d, J = 8.5 Hz), 5.48 (1H, d, J = 8.5 Hz), 5.42-5.23 (4H, m), 4.84 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.72 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.59-4.49 (2H, m), 4.20-3.38 (17H, m), 2.19-1.92 (24H, m), 1.61-1.47 (4H, m), 1.38-1.26 (6H, m).
Calcd for C45H66N2O20: [M+H]+ 955, Found 955.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[7-[(2R)-2,3-ジヒドロキシプロポキシ]ヘプトキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物24C)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 5.55 (1H, d, J = 9.1 Hz), 5.37-5.27 (2H, m), 4.69 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.21-4.09 (2H, m), 3.99-3.42 (11H, m), 2.69 (1H, d, J = 5.4 Hz), 2.15 (3H, s), 2.05 (3H, s), 2.01 (3H, s), 1.96 (3H, s), 1.65-1.52 (4H, m), 1.40-1.29 (6H, m).
Calcd for C24H41NO12: [M+H]+ 536, Found 536.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[7-[(2S)-3-[ビス(4-メトキシフェニル)-フェニル-メトキシ]-2-ヒドロキシ-プロポキシ]ヘプトキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物24D)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.45-7.41 (2H, m), 7.34-7.20 (7H, m), 6.85-6.80 (4H, m), 5.50 (1H, d, J = 8.5 Hz), 5.37-5.29 (2H, m), 4.71 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.20-4.09 (2H, m), 3.98-3.85 (4H, m), 3.79 (6H, s), 3.55-3.40 (5H, m), 3.22-3.13 (2H, m),2.51 (1H, d, J = 4.2 Hz), 2.14 (3H, s), 2.05 (3H, s), 2.00 (3H, s), 1.93 (3H, s), 1.60-1.52 (4H, m), 1.35-1.27 (6H, m).
Calcd for C45H59NO14: [M+Na]+ 860, Found 860.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[7-[(2S)-3-[ビス(4-メトキシフェニル)-フェニル-メトキシ]-2-[2-シアノエチル-(ジイソプロピルアミノ)ホスファニル]オキシプロポキシ]ヘプトキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物24E)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.48-7.41 (2H, m), 7.36-7.15 (7H, m), 6.85-6.77 (4H, m), 5.59-5.41 (1H, m), 5.38-5.26 (2H, m), 4.75-4.68 (1H, m), 4.20-4.07 (2H, m), 3.97-3.06 (21H, m), 2.67-2.40 (2H, m), 2.14 (3H, s), 2.04 (3H, s), 2.00 (3H, s), 1.92 (3H, s), 1.64-1.46 (4H, m), 1.37-1.22 (6H, m), 1.22-0.97 (12H, m).
HO-X4−X4−X4−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H (配列番号40)
Xの部分をX4と置き換えて、実施例91と同様に合成を行った。X4の部分は参考例24で合成した化合物24Eを用い、3回縮合した。
(25A)
7-[(2R)-3-ベンジルオキシ-2-ヒドロキシプロポキシ]ヘプタン-1-オール(化合物25A)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.39-7.27 (5H, m), 4.56 (2H, s), 4.04-3.94 (1H, m), 3.67-3.59 (2H, m), 3.58-3.40 (6H, m), 2.51 (1H, d, J = 4.2 Hz), 1.63-1.49 (4H, m), 1.41-1.30 (6H, m).
Calcd for C17H28O4: [M+Na]+ 319, Found 319.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[7-[(2R)-3-ベンジルオキシ-2-ヒドロキシ-プロポキシ]ヘプトキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物25B−1)の合成
(化合物25B−1)
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.39-7.27 (5H, m), 5.50 (1H, d, J = 9.1 Hz), 5.37-5.28 (2H, m), 4.70 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.57 (2H, s), 4.20-4.08 (2H, m), 4.03-3.85 (4H, m), 3.58-3.42 (7H, m), 2.58 (1H, d, J = 4.2 Hz), 2.14 (3H, s), 2.05 (3H, s), 2.00 (3H, s), 1.95 (3H, s), 1.64-1.50 (4H, m), 1.38-1.29 (6H, m).
Calcd for C31H47NO12: [M+H]+ 626, Found 626.
(化合物25B−2)
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.39-7.28 (5H, m), 5.85-5.21 (6H, m), 4.90-4.73 (2H, m), 4.53 (2H, s), 4.22-3.38 (17H, m), 2.20-1.91 (24H, m), 1.63-1.51 (4H, m), 1.41-1.30 (6H, m).
Calcd for C45H66N2O20: [M+H]+ 955, Found 955.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[7-[(2S)-2,3-ジヒドロキシプロポキシ]ヘプトキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物25C)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 5.62 (1H, d, J = 8.5 Hz), 5.38-5.26 (2H, m), 4.69 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.21-4.09 (2H, m), 4.00-3.43 (11H, m), 2.74 (1H, br s), 2.15 (3H, s), 2.05 (3H, s), 2.01 (3H, s), 1.96 (3H, s), 1.68-1.50 (4H, m), 1.41-1.29 (6H, m).
Calcd for C24H41NO12: [M+H]+ 536, Found 536.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[7-[(2R)-3-[ビス(4-メトキシフェニル)-フェニル-メトキシ]-2-ヒドロキシ-プロポキシ]ヘプトキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物25D)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.46-7.40 (2H, m), 7.34-7.18 (7H, m), 6.86-6.79 (4H, m), 5.50 (1H, d, J = 8.5 Hz), 5.37-5.28 (2H, m), 4.70 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.20-4.08 (2H, m), 3.98-3.84 (4H, m), 3.79 (6H, s), 3.55-3.39 (5H, m), 3.21-3.14 (2H, m),2.51 (1H, d, J = 4.2 Hz), 2.14 (3H, s), 2.04 (3H, s), 2.00 (3H, s), 1.94 (3H, s), 1.65-1.47 (4H, m), 1.36-1.27 (6H, m).
Calcd for C45H59NO14: [M+Na]+ 860, Found 860.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[7-[(2R)-3-[ビス(4-メトキシフェニル)-フェニル-メトキシ]-2-[2-シアノエチル-(ジイソプロピルアミノ)ホスファニル]オキシプロポキシ]ヘプトキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物25E)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.48-7.40 (2H, m), 7.36-7.16 (7H, m), 6.84-6.77 (4H, m), 5.58-5.42 (1H, m), 5.37-5.27 (2H, m), 4.74-4.68 (1H, m), 4.20-4.07 (2H, m), 3.97-3.06 (21H, m), 2.67-2.39 (2H, m), 2.14 (3H, s), 2.05 (3H, s), 2.00 (3H, s), 1.92 (3H, s), 1.63-1.45 (4H, m), 1.36-1.23 (6H, m), 1.21-0.98 (12H, m).
HO-X5−X5−X5−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H (配列番号40)
Xの部分をX5と置き換えて、実施例91と同様に合成を行った。X5の部分は参考例16で合成した化合物25Eを用い、3回縮合した。
(26A)
13-[(2S)-3-ベンジルオキシ-2-ヒドロキシプロポキシ]トリデカン-1-オール(化合物26A)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.38-7.27 (5H, m), 4.56 (2H, s), 4.02-3.94 (1H, m), 3.69-3.39 (8H, m), 2.49 (1H, d, J = 4.2 Hz), 1.61-1.50 (4H, m), 1.39-1.21 (18H, m).
Calcd for C23H40O4: [M+H]+ 381, Found 381.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[13-[(2S)-3-ベンジルオキシ-2-ヒドロキシ-プロポキシ]トリデコキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物26B)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.38-7.27 (5H, m), 5.39-5.30 (3H, m), 4.72 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.57 (2H, s), 4.20-4.09 (2H, m), 4.02-3.85 (4H, m), 3.58-3.40 (7H, m), 2.48 (1H, d, J = 4.2 Hz), 2.14 (3H, s), 2.05 (3H, s), 2.01 (3H, s), 1.96 (3H, s), 1.63-1.51 (4H, m), 1.37-1.21 (18H, m).
Calcd for C37H59NO12: [M+H]+ 710, Found 710.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[13-[(2R)-2,3-ジヒドロキシプロポキシ]トリデコキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物26C)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 5.42-5.29 (3H, m), 4.57 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.21-4.09 (2H, m), 3.95-3.44 (11H, m), 2.60 (1H, d, J = 4.8 Hz), 2.14 (3H, s), 2.05 (3H, s), 2.01 (3H, s), 1.96 (3H, s), 1.64-1.51 (4H, m), 1.37-1.22 (18H, m).
Calcd for C30H53NO12: [M+Na]+ 642, Found 642.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[13-[(2S)-3-[ビス(4-メトキシフェニル)-フェニルメトキシ]-2-ヒドロキシ-プロポキシ]トリデコキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物26D)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.45-7.41 (2H, m), 7.34-7.18 (7H, m), 6.85-6.80 (4H, m), 5.40-5.30 (3H, m), 4.72 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.20-4.09 (2H, m), 3.97-3.84 (4H, m), 3.79 (6H, s), 3.56-3.40 (5H, m), 3.22-3.13 (2H, m),2.43 (1H, d, J = 4.8 Hz), 2.14 (3H, s), 2.05 (3H, s), 2.01 (3H, s), 1.95 (3H, s), 1.63-1.50 (4H, m), 1.35-1.21 (18H, m).
Calcd for C51H71NO14: [M+Na]+ 944, Found 944.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[13-[(2S)-3-[ビス(4-メトキシフェニル)-フェニルメトキシ]-2-[2-シアノエチル-(ジイソプロピルアミノ)ホスファニル]オキシプロポキシ]トリデコキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物26E)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.48-7.41 (2H, m), 7.36-7.16 (7H, m), 6.84-6.78 (4H, m), 5.41-5.30 (3H, m), 4.72 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.20-4.09 (2H, m), 3.95-3.07 (21H, m), 2.66-2.40 (2H, m), 2.14 (3H, s), 2.05 (3H, s), 2.00 (3H, s), 1.95 (3H, s), 1.63-1.45 (4H, m), 1.35-1.21 (18H, m), 1.21-0.99 (12H, m).
HO-X6−X6−X6−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H (配列番号40)
Xの部分をX6と置き換えて、実施例91と同様に合成を行った。X6の部分は参考例26で合成した化合物26Eを用い、3回縮合した。
(27A)
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-6-[7-[(2R)-2-[(2R,3R,4R,5R,6R)-3-アセトアミド-4,5-ジアセトキシ-6-(アセトキシメチル)テトラヒドロピラン-2-イル]オキシ-3-ヒドロキシ-プロポキシ]ヘプトキシ]-3,4-ジアセトキシテトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物27A)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 5.84 (1H, d, J = 8.5 Hz), 5.69 (1H, d, J = 8.5 Hz), 5.41-5.14 (4H, m), 4.85 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.70 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.22-3.40 (17H, m), 2.86-2.81 (1H, m), 2.20-1.93 (24H, m), 1.65-1.49 (4H, m), 1.39-1.23 (6H, m).
Calcd for C38H60N2O20: [M+H]+ 865, Found 865.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-6-[7-[(2S)-2-[(2R,3R,4R,5R,6R)-3-アセトアミド-4,5-ジアセトキシ-6-(アセトキシメチル)テトラヒドロピラン-2-イル]オキシ-3-[2-シアノエトキシ-(ジイソプロピルアミノ)ホスファニル]オキシプロポキシ]ヘプトキシ]-3,4-ジアセトキシテトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物27B)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 6.04-5.69 (2H, m), 5.39-5.06 (4H, m), 4.86-4.69 (2H, m), 4.25-3.40 (21H, m), 2.80-2.67 (2H, m), 2.21-1.92 (24H, m), 1.66-1.48 (4H, m), 1.38-1.15 (18H, m).
HO-X7−X4−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H (配列番号40)
Xの部分をX4とX7と置き換えて、実施例91と同様に合成を行った。X4の部分は参考例15で合成した化合物24Eを用い、1回縮合した。X7の部分は参考例27で合成した化合物27Bを用い、1回縮合した。
(28A)
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-6-[7-[(2S)-2-[(2R,3R,4R,5R,6R)-3-アセトアミド-4,5-ジアセトキシ-6-(アセトキシメチル)テトラヒドロピラン-2-イル]オキシ-3-ヒドロキシ-プロポキシ]ヘプトキシ]-3,4-ジアセトキシテトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物28A)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 5.93 (1H, d, J = 8.5 Hz), 5.71 (1H, d, J = 8.5 Hz), 5.42-5.22 (4H, m), 4.82-4.73 (2H, m), 4.23-3.35 (17H, m), 2.98-2.92 (1H, m), 2.21-1.92 (24H, m), 1.66-1.48 (4H, m), 1.42-1.23 (6H, m).
Calcd for C38H60N2O20: [M+H]+ 865, Found 865.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-6-[7-[(2R)-2-[(2R,3R,4R,5R,6R)-3-アセトアミド-4,5-ジアセトキシ-6-(アセトキシメチル)テトラヒドロピラン-2-イル]オキシ-3-[2-シアノエトキシ-(ジイソプロピルアミノ)ホスファニル]オキシプロポキシ]ヘプトキシ]-3,4-ジアセトキシテトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物28B)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 5.91-5.67 (2H, m), 5.41-5.18 (4H, m), 4.91-4.72 (2H, m), 4.26-3.35 (21H, m), 2.79-2.63 (2H, m), 2.20-1.92 (24H, m), 1.67-1.50 (4H, m), 1.40-1.13 (18H, m).
HO-X8−X5−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H (配列番号40)
Xの部分をX5とX8と置き換えて、実施例91と同様に合成を行った。X5の部分は参考例25で合成した化合物25Eを用い、1回縮合した。X8の部分は参考例28で合成した化合物28Bを用い、1回縮合した。
(29A)
(2R)-1-ベンジルオキシ-3-[2-[2-(2-ヒドロキシエトキシ)エトキシ]エトキシ]プロパン-2-オール(化合物29A)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.37-7.25 (5H, m), 4.55 (2H, s), 4.05-3.97 (1H, m), 3.65-3.56 (16H, m).
Calcd for C16H26O6: [M+H]+ 315, Found 315.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[2-[2-[2-[(2R)-3-ベンジルオキシ-2-ヒドロキシ-プロポキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物29B)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.38-7.27 (5H, m), 6.69 (1H, d, J = 9.1 Hz), 5.28 (1H, d, J = 3.0 Hz), 5.02 (1H, dd, J = 11.2, 3.0 Hz), 4.77 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.56 (2H, s), 4.29-3.47 (21H, m), 2.15 (3H, s), 2.04 (3H, s), 1.97 (3H, s), 1.96 (3H, s).
Calcd for C30H45NO14: [M+H]+ 644, Found 644.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[2-[2-[2-[(2R)-2,3-ジヒドロキシプロポキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物29C)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 6.83-6.76 (1H, m), 5.32 (1H, d, J = 3.0 Hz), 5.11 (1H, dd, J = 11.2, 3.0 Hz), 4.79 (1H, d, J = 9.1 Hz), 4.27-4.08 (3H, m), 3.97-3.53 (18H, m), 2.16 (3H, s), 2.06 (3H, s), 2.00 (3H, s), 1.97 (3H, s).
Calcd for C23H39NO14: [M+H]+ 554, Found 554.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[2-[2-[2-[(2S)-3-[ビス (4-メトキシフェニル)-フェニルメトキシ]-2-ヒドロキシ-プロポキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物29D)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.44-7.40 (2H, m), 7.33-7.18 (7H, m), 6.85-6.80 (4H, m), 6.59 (1H, d, J = 9.7 Hz), 5.29 (1H, d, J = 3.0 Hz), 5.00 (1H, dd, J = 11.2, 3.0 Hz), 4.77 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.27-4.07 (3H, m), 4.00-3.82 (4H, m), 3.79 (6H, s), 3.71-3.49 (12H, m), 3.20-3.10 (2H, m), 2.14 (3H, s), 2.01 (3H, s), 1.93 (6H, s).
Calcd for C44H57NO16: [M+Na]+ 878, Found 878.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[2-[2-[2-[(2S)-3-[ビス(4-メトキシフェニル)-フェニルメトキシ]-2-[2-シアノエトキシ-(ジイソプロピルアミノ)ホスファニル]オキシプロポキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物29E)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.47-7.40 (2H, m), 7.35-7.16 (7H, m), 6.85-6.77 (4H, m), 6.40 (1H, d, J = 9.1 Hz), 5.33-5.28 (1H, m), 5.03-4.93 (1H, m), 4.81-4.74 (1H, m), 4.28-4.08 (3H, m), 3.96-3.46 (26H, m), 3.27-3.04 (2H, m), 2.69-2.41 (2H, m), 2.15 (3H, s), 2.04 (3H, s), 1.97-1.90 (6H, m), 1.30-0.98 (12H, m).
HO-X9−X9−X9−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H (配列番号40)
Xの部分をX9と置き換えて、実施例91と同様に合成を行った。X9の部分は参考例29で合成した化合物29Eを用い、3回縮合した。
(30A)
(2R)-1-ベンジルオキシ-3-[2-[2-[2-(2-ヒドロキシエトキシ)エトキシ]エトキシ]エトキシ]プロパン-2-オール(化合物30Aの合成)
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.37-7.23 (5H, m), 4.56 (2H, s), 4.01 (1H, br), 3.75-3.41 (20H, m).
Calcd for C18H30O7: [M+H]+ 359, Found 359.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[2-[2-[2-[2-[(2R)-3-ベンジルオキシ-2-ヒドロキシ-プロポキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物30Bの合成)
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.38-7.24 (5H, m), 6.72 (1H, d, J = 8.5 Hz), 5.29 (1H, d, J = 3.0 Hz), 5.00 (1H, dd, J = 11.2, 3.3 Hz), 4.76 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.56 (2H, s), 4.31-4.21 (1H, m), 4.18-3.46 (24H, m), 2.15 (3H, s), 2.04 (3H, s), 1.97 (6H, s).
Calcd for C32H49NO15: [M+H]+ 688, Found 688.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[2-[2-[2-[2-[(2R)-2,3-ジヒドロキシプロポキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(30Cの合成)
1H-NMR (CDCl3) δ: 6.85 (1H, d, J = 9.7 Hz), 5.32 (1H, d, J = 3.0 Hz), 5.10 (1H, dd, J = 11.2, 3.0 Hz), 4.74 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.32-4.09 (2H, m), 3.99-3.56 (23H, m), 2.16 (3H, s), 2.05 (3H, s), 2.00 (3H, s), 1.99 (3H, s).
Calcd for C25H43NO15: [M+H]+ 598, Found 598.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[2-[2-[2-[2-[(2S)-3-[ビス (4-メトキシフェニル)-フェニル-メトキシ]-2-ヒドロキシ-プロポキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物30Dの合成)
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.44-7.40 (2H, m), 7.33-7.18 (7H, m), 6.85-6.79 (4H, m), 6.63 (1H, d, J = 9.1 Hz), 5.29 (1H, d, J = 3.0 Hz), 4.96 (1H, dd, J = 11.2, 3.3 Hz), 4.75 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.29-4.21 (1H, m), 4.17-4.07 (2H, m), 4.00-3.81 (4H, m), 3.79 (6H, s), 3.71-3.58 (14H, m), 3.53-3.43 (2H, m), 3.21-3.10 (2H, m), 2.14 (3H, s), 2.02 (3H, s), 1.95 (6H, s).
Calcd for C46H61NO17: [M+Na]+ 922, Found 922.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[2-[2-[2-[2-[(2S)-3-[ビス(4-メトキシフェニル)-フェニル-メトキシ]-2-[2-シアノエトキシ-(ジイソプロピルアミノ)ホスファニル]オキシ-プロポキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物30Eの合成)
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.46-7.40 (2H, m), 7.35-7.17 (7H, m), 6.84-6.78 (4H, m), 6.43 (1H, d, J = 9.1 Hz), 5.31 (1H, br), 5.00-4.93 (1H, m), 4.78 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.29-4.08 (3H, m), 3.91-3.48 (30H, m), 3.27-3.04 (2H, m), 2.67-2.62 (1H, m), 2.46-2.41 (1H, m), 2.15 (3H, s), 2.04 (3H, s),1.97-1.94 (6H, m), 1.30-0.99 (12H, m).
HO-X10−X10−X10−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H (配列番号40)
Xの部分をX10と置き換えて、実施例91と同様に合成を行った。X10の部分は参考例30で合成した化合物30Eを用い、3回縮合した。
(31A)
(2R)-1-ベンジルオキシ-3-[2-(2-ヒドロキシエトキシ)エトキシ]プロパン-2-オール(化合物31Aの合成)
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.38-7.27 (5H, m), 4.56 (2H, s), 4.05-3.97 (1H, m), 3.77-3.48 (12H, m), 2.85-2.82 (1H, m), 2.47-2.42 (1H, m).
Calcd for C14H22O5: [M+ Na]+ 293, Found 293.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[2-[2-[(2R)-3-ベンジルオキシ-2-ヒドロキシ-プロポキシ]エトキシ]エトキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物31Bの合成)
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.37-7.28 (5H, m), 6.71 (1H, d, J = 9.7 Hz), 5.30 (1H, d, J = 3.0 Hz), 5.12 (1H, dd, J = 11.2, 3.3 Hz), 4.77 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.57 (2H, s), 4.27-4.05 (1H, m), 3.93-3.45 (16H, m), 2.15 (3H, s), 2.05 (3H, s), 1.98 (3H, s), 1.95 (3H, s).
Calcd for C28H41NO13: [M+ Na]+ 622, Found 622.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[2-[2-[(2R)-2,3-ジヒドロキシプロポキシ]エトキシ]エトキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル (化合物31Cの合成)
1H-NMR (CDCl3) δ: 6.58 (1H, d, J = 9.1 Hz), 5.32-5.30 (1H, m), 5.16 (1H, dd, J = 11.2, 3.3 Hz), 4.78 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.26-4.09 (2H, m), 3.95-3.58 (15H, m), 2.16 (3H, s), 2.06 (3H, s), 2.01 (3H, s), 1.98 (3H, s).
Calcd for C21H35NO13: [M+H]+ 510, Found 510.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[2-[2-[(2S)-3-[ビス(4-メトキシフェニル)-フェニルメトキシ]-2-ヒドロキシ-プロポキシ]エトキシ]エトキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物31D)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.47-7.42 (2H, m), 7.35-7.18 (7H, m), 6.86-6.80 (4H, m), 6.73 (1H, d, J = 9.7 Hz), 5.31 (1H, d, J = 3.0 Hz), 5.14 (1H, dd, J = 11.2, 3.0 Hz), 4.76 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.28-4.09 (3H, m), 4.07-3.83 (4H, m), 3.79 (6H, s), 3.72-3.49 (8H, m), 3.26 (1H, d, J = 3.6 Hz), 3.18-3.13 (2H, m), 2.14 (3H, s), 2.04 (3H, s), 1.94 (3H, s), 1.90 (3H, s).
Calcd for C42H53NO15: [M+Na]+ 834, Found 834.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[2-[2-[(2S)-3-[ビス(4-メトキシフェニル)-フェニルメトキシ]-2-[2-シアノエトキシ-(ジイソプロピルアミノ)ホスファニル]オキシプロポキシ]エトキシ]エトキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物31E)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.47-7.40 (2H, m), 7.37-7.17 (7H, m), 6.86-6.77 (4H, m), 6.08-5.95 (1H, m), 5.34-5.29 (1H, m), 5.16-5.06 (1H, m), 4.76-4.69 (1H, m), 4.20-4.02 (3H, m), 3.95-3.47 (22H, m), 3.31-3.08 (2H, m), 2.69-2.40 (2H, m), 2.14 (3H, s), 2.04-2.02 (3H, m), 1.97-1.94 (3H, m), 1.91-1.88 (3H, m), 1.21-1.01 (12H, m).
HO-X11−X11−X11−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H (配列番号40)
Xの部分をX11と置き換えて、実施例91と同様に合成を行った。X11の部分は参考例31で合成した化合物31Eを用い、3回縮合した。
(32A)
(2S)-1-ベンジルオキシ-3-[2-[2-(2-ヒドロキシエトキシ)エトキシ]エトキシ]プロパン-2-オール(化合物32A)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.38-7.25 (5H, m), 4.56 (2H, s), 4.19-3.45 (17H, m).
Calcd for C16H26O6: [M+H]+ 315, Found 315.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[2-[2-[2-[(2S)-3-ベンジルオキシ-2-ヒドロキシ-プロポキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物32B)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.39-7.25 (5H, m), 6.68 (1H, d, J = 9.1 Hz), 5.33-5.27 (1H, m), 5.07-4.95 (1H, m), 4.78 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.55 (2H, s), 4.25-3.24 (21H, m), 2.15 (3H, s), 2.04 (3H, s), 1.97 (3H, s), 1.96 (3H, s).
Calcd for C30H45NO14: [M+H]+ 644, Found 644.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[2-[2-[2-[(2S)-2,3-ジヒドロキシプロポキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物32C)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 6.80 (1H, d, J = 9.1 Hz), 5.34-5.30 (1H, m), 5.15-5.03 (1H, m), 4.81 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.33-4.08 (3H, m), 3.99-3.48 (18H, m), 2.16 (3H, s), 2.06 (3H, s), 2.00 (3H, s), 1.98 (3H, s).
Calcd for C23H39NO14: [M+H]+ 554, Found 554.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[2-[2-[2-[(2R)-3-[ビス(4-メトキシフェニル)-フェニルメトキシ]-2-ヒドロキシ-プロポキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物32D)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.44-7.40 (2H, m), 7.35-7.18 (7H, m), 6.86-6.79 (4H, m), 6.67 (1H, d, J = 9.1 Hz), 5.29 (1H, d, J = 3.0 Hz), 5.03 (1H, dd, J = 11.2, 3.0 Hz), 4.77 (1H, d, J = 9.1 Hz), 4.26-4.06 (3H, m), 4.00-3.81 (4H, m), 3.79 (6H, s), 3.75-3.50 (12H, m), 3.23-3.11 (2H, m), 2.15 (3H, s), 2.01 (3H, s), 1.94 (6H, s).
Calcd for C44H57NO16: [M+Na]+ 878, Found 878.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[2-[2-[2-[(2R)-3-[ビス(4-メトキシフェニル)-フェニルメトキシ]-2-[2-シアノエトキシ-(ジイソプロピルアミノ)ホスファニル]オキシプロポキシ]エトキシ]エトキシ]エトキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物32E)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.47-7.40 (2H, m), 7.36-7.16 (7H, m), 6.85-6.78 (4H, m), 6.45-6.38 (1H, m), 5.33-5.28 (1H, m), 5.03-4.94 (1H, m), 4.80-4.75 (1H, m), 4.27-4.08 (3H, m), 3.93-3.45 (26H, m), 3.28-3.04 (2H, m), 2.69-2.40 (2H, m), 2.15 (3H, s), 2.04 (3H, s), 1.97-1.92 (6H, m), 1.21-1.01 (12H, m).
HO-X12−X12−X12−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H (配列番号40)
Xの部分をX12と置き換えて、実施例91と同様に合成を行った。X12の部分は参考例32で合成した化合物32Eを用い、3回縮合した。
HO-X9−X9−X9−X9−X9−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H (配列番号40)
Xの部分をX9と置き換えて、実施例91と同様に合成を行った。X9の部分は参考例29で合成した化合物29Eを用い、5回縮合した。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5'末端から92番目から106番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:7817.33)。
HO-X9−X9−X9−X9−X9−X9−X9−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H (配列番号40)
Xの部分をX9と置き換えて、実施例91と同様に合成を行った。X9の部分は参考例29で合成した化合物29Eを用い、7回縮合した。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5'末端から92番目から106番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:8796.73)。
(33A)
9H-フルオレン-9-イルメチル N-[2-[2-[(2R)-3-ベンジルオキシ-2-ヒドロキシ-プロポキシ]エトキシ]エチル]カーバメート(化合物33A)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.76 (2H, d, J = 7.9 Hz), 7.60 (2H, d, J = 7.3 Hz), 7.42-7.37 (2H, m), 7.35-7.27 (7H, m), 5.40 (1H, s), 4.53 (2H, s), 4.39 (2H, d, J = 6.7 Hz), 4.25-4.19 (1H, m), 4.04-3.97 (1H, m), 3.69-3.35 (12H, m).
Calcd for C29H33NO6: [M+H]+ 492, Found 492.
(2R)-1-[2-(2-アミノエトキシ)エトキシ]-3-ベンジルオキシ-プロパン-2-オール、トリフルオロ酢酸塩(化合物33B)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.38-7.27 (5H, m), 4.55 (2H, s), 4.07-3.99 (1H, m), 3.77-3.48 (10H, m), 2.96-2.88 (2H, m).
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[2-[2-[2-[(2R)-3-ベンジルオキシ-2-ヒドロキシ-プロポキシ]エトキシ]エチルアミノ]-2-オキソ-エトキシ]テトレヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物33C)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.39-7.28 (5H, m), 7.00-6.93 (1H, m), 6.50-6.44 (1H, m), 5.33-5.29 (1H, m), 5.16 (1H, dd, J = 11.5, 3.6 Hz), 4.63-4.53 (3H, m), 4.34 (1H, d, J = 15.1 Hz), 4.22-3.83 (5H, m), 3.73-3.26 (13H, m), 2.15 (3H, s), 2.05 (3H, s), 1.99 (6H, s).
Calcd for C30H44N2O14: [M+H]+ 657, Found 657.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[2-[2-[2-[(2R)-2,3-ジヒドロキシプロポキシ]エトキシ]エチルアミノ]-2-オキソ-エトキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル アセテート(化合物33D)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.03-6.98 (1H, m), 6.43 (1H, d, J = 9.1 Hz), 5.35 (1H, d, J = 3.3 Hz), 5.15 (1H, dd, J = 11.2, 3.3 Hz), 4.58 (1H, d, J = 7.9 Hz), 4.35 (1H, d, J = 15.7 Hz), 4.28-3.82 (5H, m), 3.77-3.34 (13H, m), 2.18 (3H, s), 2.06 (3H, s), 2.03 (3H, s), 2.01 (3H, s).
Calcd for C23H38N2O14: [M+H]+ 568, Found 568.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[2-[2-[2-[(2S)-3-[ビス(4-メトキシフェニル)-フェニル-メトキシ]-2-ヒドロキシ-プロポキシ]エトキシ]エチルアミノ]-2-オキソ-エトキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物33E)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.42 (2H, d, J = 7.9 Hz), 7.33-7.19 (7H, m), 7.01-6.94 (1H, m), 6.83 (4H, d, J = 9.1 Hz), 6.37 (1H, d, J = 8.5 Hz), 5.33 (1H, d, J = 3.3 Hz), 5.15 (1H, dd, J = 11.2, 3.3 Hz), 4.58 (1H, d, J = 7.9 Hz), 4.32 (1H, d, J = 15.7 Hz), 4.22-3.86 (5H, m), 3.79 (6H, s), 3.66-3.12 (13H, m), 2.13 (3H, s), 2.03 (3H, s), 1.97 (3H, s), 1.95 (3H, s).
Calcd for C44H56N2O16: [M+Na]+ 893, Found 892.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[2-[2-[2-[(2S)-3-[ビス(4-メトキシフェニル)-フェニル-メトキシ]-2-[2-シアノエトキシ-(ジイソプロピルアミノ)ホスファニル]オキシ-プロポキシ]エトキシ]エチルアミノ]-2-オキソ-エトキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物33F)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.47-7.40 (2H, m), 7.35-7.17 (7H, m), 6.98-6.91 (1H, m), 6.85-6.78 (4H, m), 6.05-5.89 (1H, m), 5.37-5.33 (1H, m), 5.17-5.07 (1H, m), 4.59-4.49 (1H, m), 4.37-4.30 (1H, m), 4.23-3.06 (28H, m), 2.69-2.42 (2H, m), 2.15 (3H, s), 2.05 (3H, s), 2.02-1.98 (3H, m), 1.97-1.94 (3H, m), 1.30-1.00 (12H, m).
HO-X13−X13−X13−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H (配列番号40)
Xの部分をX13と置き換えて、実施例91と同様に合成を行った。X13の部分は参考例33で合成した化合物33Fを用い、3回縮合した。
HO-X13−X13−X13−X13−X13−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H (配列番号40)
Xの部分をX13と置き換えて、実施例91と同様に合成を行った。X13の部分は参考例33で合成した化合物33Fを用い、5回縮合した。
HO-X13−X13−X13−X13−X13−X13−X13−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H (配列番号40)
Xの部分をX13と置き換えて、実施例91と同様に合成を行った。X13の部分は参考例33で合成した化合物33Fを用い、7回縮合した。
(34A)
tert-ブチル N-[(5S)-6-[2-[2-[(2R)-3-ベンジルオキシ-2-ヒドロキシ-プロポキシ]エトキシ]エチルアミノ]-5-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)-6-オキソ-ヘキシル]カーバメート(化合物34A)の合成
Calcd for C30H51N3O9: [M+H]+ 599, Found 599.
(2S)-2,6-ジアミノ-N-[2-[2-[(2R)-3-ベンジルオキシ-2-ヒドロキシ-プロポキシ]エトキシ]エチル]ヘキサンアミド TFA塩(化合物34B)の合成
Calcd for C20H35N3O5: [M+H]+ 399, Found 398.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-6-[2-[[(5S)-5-[[2-[(2R,3R,4R,5R,6R)-3-アセトアミド-4,5-ジアセトキシ-6-(アセトキシメチル)テトラヒドロピラン-2-イル]オキシアセチル]アミノ]-6-[2-[2-[(2R)-3-ベンジルオキシ-2-ヒドロキシ-プロポキシ]エトキシ]エチルアミノ]-6-オキソ-ヘキシル]アミノ]-2-オキソ-エトキシ]-3,4-ジアセトキシ-テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物34C)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.50-7.44 (1H, m), 7.39-7.28 (5H, m), 7.17-7.11 (2H, m), 6.94-6.88 (1H, m), 6.30-6.26 (1H, m), 5.37-5.32 (2H, m), 5.09-4.99 (2H, m), 4.57 (2H, s), 4.56-3.11 (30H, m), 2.18 (3H, s), 2.16 (3H, s), 2.07-1.99 (15H, m), 1.97 (3H, s), 1.96-1.34 (6H, m).
Calcd for C52H77N5O25: [M+H]+ 1172, Found 1173.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-6-[2-[[(5S)-5-[[2-[(2R,3R,4R,5R,6R)-3-アセトアミド-4,5-ジアセトキシ-6-(アセトキシメチル)テトラヒドロピラン-2-イル]オキシアセチル]アミノ]-6-[2-[2-[(2R)-2,3-ジヒドロキシプロポキシ]エトキシ]エチルアミノ]-6-オキソ-ヘキシル]アミノ]-2-オキソ-エトキシ]-3,4-ジアセトキシ-テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物34D)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.72-7.67 (1H, m), 7.16 (2H, d, J = 9.1 Hz), 7.04-6.98 (1H, m), 6.27 (1H, d, J = 9.1 Hz), 5.36 (2H, d, J = 3.0 Hz), 5.10-4.99 (2H, m), 4.67-3.07 (30H, m), 2.18 (3H, s), 2.17 (3H, s), 2.08-2.00 (15H, m), 1.98 (3H, s), 1.93-1.33 (6H, m).
Calcd for C45H71N5O25: [M+H]+ 1082, Found 1083.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-6-[2-[[(5S)-5-[[2-[(2R,3R,4R,5R,6R)-3-アセトアミド-4,5-ジアセトキシ-6-(アセトキシメチル)テトラヒドロピラン-2-イル]オキシアセチル]アミノ]-6-[2-[2-[(2S)-3-[ビス(4-メトキシフェニル)-フェニル-メトキシ]-2-ヒドロキシ-プロポキシ]エトキシ]エチルアミノ]-6-オキソ-ヘキシル]アミノ]-2-オキソ-エトキシ]-3,4-ジアセトキシ-テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物34E)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.60-7.55 (1H, m), 7.43 (2H, d, J = 7.3 Hz), 7.35-7.20 (7H, m), 7.17-7.10 (2H, m), 6.92-6.87 (1H, m), 6.83 (4H, d, J = 9.1 Hz), 6.30 (1H, d, J = 9.1 Hz), 5.36-5.30 (2H, m), 5.09-4.95 (2H, m), 4.60-3.07 (36H, m), 2.19-2.14 (6H, m), 2.06-1.99 (15H, m), 1.97 (3H, s), 1.70-1.34 (6H, m).
Calcd for C66H89N5O27: [M+Na]+ 1407, Found 1407.
酢酸[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-6-[2-[[(5S)-5-[[2-[(2R,3R,4R,5R,6R)-3-アセトアミド-4,5-ジアセトキシ-6-(アセトキシメチル)テトラヒドロピラン-2-イル]オキシアセチル]アミノ]-6-[2-[2-[(2S)-3-[ビス(4-メトキシフェニル)-フェニル-メトキシ]-2-[2-シアノエトキシ-(ジイソプロピルアミノ)ホスファニル]オキシ-プロポキシ]エトキシ]エチルアミノ]-6-オキソ-ヘキシル]アミノ]-2-オキソ-エトキシ]-3,4-ジアセトキシ-テトラヒドロピラン-2-イル]メチル(化合物34F)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.47-7.41 (2H, m), 7.35-7.05 (10H, m), 6.89-6.78 (5H, m), 6.35-6.25 (1H, m), 5.37-5.34 (2H, m), 5.11-4.98 (2H, m), 4.55-3.08 (40H, m), 2.70-2.45 (2H, m), 2.18 (3H, s), 2.17 (3H, s), 2.07-1.99 (15H, m), 1.98-1.94 (3H, m), 1.91-1.31 (6H, m), 1.21-1.02 (12H, m).
HO-X14−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H (配列番号40)
Xの部分をX14と置き換えて、実施例91と同様に合成を行った。X14の部分は参考例34で合成した化合物34Fを用い、1回縮合した。
HO-X14−X14−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H (配列番号40)
Xの部分をX14と置き換えて、実施例91と同様に合成を行った。X14の部分は参考例34で合成した化合物34Fを用い、2回縮合した。
HO-X14−X14−X14−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H (配列番号40)
Xの部分をX14と置き換えて、実施例91と同様に合成を行った。X14の部分は参考例34で合成した化合物34Fを用い、3回縮合した。
ジステアロイルホスファチジルコリン(1,2-Distearoyl-sn-glycero-3-phosphocholine:以下DSPCと表記,NOF CORPORATION)、コレステロール(Cholesterol:以下Cholと表記,Sigma-Aldrich,Inc.)、国際公開第2015/005253に記載されている実施例8の化合物(LPとする)、及びN−[メトキシ ポリ(エチレングリコール)2000]カルバモイル]−1,2−ジミリスチルオキシプロピル−3−アミン(以下PEG-C-DMAと表記,NOF CORPORATION))を、DSPC:Chol:LP:PEG-C-DMA=10:48:40:2のモル比にてエタノール中、総脂質濃度5mMになるように脂質溶液を調製した。
オリゴヌクレオチドの封入率は、Quant-iT RiboGreen RNA Assay kit(Invitrogen)を用い、添付文書に準じて測定した。すなわち、0.015%Triton X-100界面活性剤存在下及び非存在下において、核酸脂質粒子の分散液中のオリゴヌクレオチドを定量し、次式により封入率を算出した。
{[界面活性剤存在下におけるオリゴヌクレオチド量]−[界面活性剤非存在下におけるオリゴヌクレオチド量]}/[界面活性剤存在下におけるオリゴヌクレオチド量]}x100(%)
(2)オリゴヌクレオチドと脂質の比率
核酸脂質粒子の分散液中のリン脂質量をリン脂質C−テストワコー(和光純薬工業株式会社)を用い、添付文書に準じて測定した。すなわち、1%Triton X-100界面活性剤存在下において、試料中のリン脂質を定量した。
核酸脂質粒子の分散液中のコレステロール及びLP量を逆相クロマトグラフィーにて測定した(System:Agilent 1100series,Column:Chromolith Performance RP-18 endcapped 100-3 monolithic HPLC-column(Merck),Buffer A:0.01%トリフルオロ酢酸,Buffer B:0.01%トリフルオロ酢酸,メタノール,Gradient(B%):82−97%(0−17min),Flow Rate:2mL/min,Temperature:50℃,Detection:205nm)。
リン脂質量、コレステロール量、及びLP量とリポソームを構成する脂質成分の組成比から総脂質量を算出し、上述(1)の「界面活性剤存在下におけるオリゴヌクレオチド量」から、次式によりオリゴヌクレオチドと脂質の比率を算出した。
[界面活性剤存在下におけるオリゴヌクレオチド濃度]/[総脂質濃度] (wt/wt)
(3)平均粒子径
リポソームの粒子径は、Zeta Potential/Particle Sizer NICOMPTM 380ZLS(PARTICLE SIZING SYSTEMS)にて測定した。表中の平均粒子径は体積平均粒子径を表し、±以下は、偏差を表す。
−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−
核酸脂質粒子 ASO 封入率 ASO/lipid 粒子径
(%) (wt/wt)* (nm)
−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−
実施例116 21e_002 98 12 60±35
実施例117 18e_005 98 12 69±36
実施例118 21m_002 98 13 67±33
実施例119 18e_005 98 12 61±31
実施例120 18m_022 98 13 59±21
実施例121 15e_001 98 13 57±20
実施例122 15ed_001 99 15 58±19
実施例123 18e_008 97 14 62±36
実施例124 18e_025 98 14 58±25
実施例125 18m_008 98 13 62±28
実施例126 15e_002 98 13 62±33
実施例127 15ed_002 98 14 54±21
−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−
* ASO/lipid(wt/wt):オリゴヌクレオチドと脂質の重量比。
HO-X14−Am1s-Te2s-Cm1s-Cm1s-Ge2s-Am1s-Um1s-Ge2s-Gm1s-Cm1s-Ge2s-Am1s-Am1s-Ge2s-Cm1t-H (配列番号44)
実施例113で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005を用い、実施例113と同様に合成を行った。
HO-X14−Um1s-Ce2s-Cm1s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Ge2s-Cm1s-Gm1s-Ae2s-Am1s-Gm1s-Ce2s-Um1t-H (配列番号45)
実施例113で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_006を用い、実施例113と同様に合成を行った。
HO-X14−Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Cm1s-Te2s-Gm1t-H (配列番号41)
実施例113で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_002を用い、実施例113と同様に合成を行った。
(35A)[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[2-[3-(tert-ブトキシアルボニルアミノ)プロピルアミノ]-2-オキソ-エトキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル アセテート(化合物35A)の合成
Calcd for C19H31N3O10: [M+H]+ 462, Found 462.
(S)-(+)-1,2-イソプロピリデングリセロール(6.53g, 49.4mmol)、クロロぎ酸4-ニトロフェニル(9.96g, 49.4mmol) をジクロロメタン(200ml)に溶解させ、ピリジン(7.95ml,98.8mmol)を加え、室温で30分攪拌した。この反応液に、工程(35B)で合成した粗生成物(15.9g)のジクロロメタン(100ml)溶液、トリエチルアミン(20.5ml,148mmol)を加え、室温で、終夜攪拌した。反応終了後、有機層を0.5N塩酸、飽和食塩水、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液、飽和食塩水で洗浄した後、無水硫酸ナトリウムで乾燥、濾過し、溶媒を減圧留去して粗生成物を得た。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(酢酸エチル:メタノール=100:0‐65:35, v/v)で精製し、目的物35C(9.0g、収率59%(3工程))を固体として得た。
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.09-7.01 (1H, m), 6.16 (1H, d, J = 8.5 Hz), 5.53-5.46 (1H, m), 5.37 (1H, d, J = 3.6 Hz), 5.22-5.14 (1H, m), 4.53 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.41-3.99 (9H, m), 3.96-3.89 (1H, m), 3.79-3.71 (1H, m), 3.44-3.15 (4H, m), 2.17 (3H, s), 2.06 (3H, s), 2.04 (3H, s), 1.98 (3H, s), 1.80-1.58 (2H, m), 1.43 (3H, s), 1.37 (3H, s).
Calcd for C26H41N3O14: [M+Na]+ 642, Found 642.
Calcd for C23H37N3O14: [M+H]+ 580, Found 580, [M+Na]+ 602, Found 602.
工程(35D)で合成した粗生成物(7.36g)にジクロロメタン(150ml)、ピリジン(10ml)を加え、溶媒を減圧留去した。その後、ピリジン(60ml)に溶解させ、4,4'-ジメトキシトリチルクロリド(5.59 g , 16.5 mmol)を加え、室温で30分攪拌した。反応終了後、メタノール(1.03ml,25.4mmol)、N,N-ジイソプロピルエチルアミン(4.42mL, 25.4mmol)溶媒を減圧留去した。これをシリカゲルカラムクロマトグラフィー(酢酸エチル:酢酸エチル/メタノール(5/1)=100:0‐0:100, v/v、1%トリエチルアミン含有)で精製し、目的物35E(4.51 g、収率40%)を固体として得た。
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.45-7.39 (2H, m), 7.34-7.28 (6H, m), 7.24-7.18 (1H, m), 7.07-6.99 (1H, m), 6.86-6.80 (4H, m), 6.21 (1H, d, J = 8.5 Hz), 5.48-5.41 (1H, m), 5.36 (1H, d, J = 3.6 Hz), 5.19-5.13 (1H, m), 4.52 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.39-3.88 (9H, m), 3.79 (6H, s), 3.50-3.12 (6H, m), 2.92 (1H, d, J = 4.8 Hz), 2.16 (3H, s), 2.05 (3H, s), 1.99 (3H, s), 1.95 (3H, s), 1.80-1.54 (2H, m).
Calcd for C44H55N3O16: [M+Na]+ 904, Found 904.
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.47-7.38 (2H, m), 7.35-7.16 (7H, m), 7.12-7.04 (1H, m), 6.86-6.76 (4H, m), 6.25-6.12 (1H, m), 5.58-5.18 (3H, m), 4.61-4.53 (1H, m), 4.46-3.42 (19H, m), 3.39-3.02 (6H, m), 2.68-2.41 (2H, m), 2.19-2.13 (3H, m), 2.08-2.02 (3H, m), 2.01-1.91 (6H, m), 1.78-1.54 (2H, m), 1.31-0.94 (12H, m).
(36A)[(4R)-2,2-ジメチル-1,3-ジオキソラン-4-イル]メチル N-[2-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)エチル]カルバメート(化合物36A)の合成
Calcd for C28H38N4O9: [M+H]+ 575, Found 575.
1H-NMR (DMSO-D6) δ: 8.14-8.08 (1H, m), 8.03-7.91 (2H, m), 7.33-7.22 (2H, m), 7.16-7.10 (1H, m), 5.27-5.23 (2H, m), 5.01-4.93 (2H, m), 4.59-4.52 (2H, m), 4.26-3.55 (17H, m), 3.36-3.30 (2H, m), 3.18-2.86 (7H, m), 2.14-2.06 (6H, m), 2.04-1.98 (6H, m), 1.94-1.89 (6H, m), 1.88-1.79 (6H, m), 1.71-1.48 (2H, m), 1.47-1.35 (2H, m), 1.32-1.15 (2H, m).
Calcd for C44H68N6O25: [M+H]+ 1081, Found 1081.
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.47-7.38 (2H, m), 7.36-6.95 (10H, m), 6.86-6.79 (4H, m), 6.33-6.27 (1H, m), 5.53-4.99 (4H, m), 4.57-3.07 (30H, m), 2.21-2.14 (6H, m), 2.08-1.94 (18H, m), 1.92-1.07 (6H, m).
Calcd for C65H86N6O27: [M+Na]+ 1406, Found 1406.
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.47-7.40 (2H, m), 7.36-7.10 (11H, m), 6.95-6.86 (1H, m), 6.85-6.78 (4H, m), 6.34-6.28 (1H, m), 5.56-5.33 (2H, m), 5.12-4.98 (2H, m), 4.52-3.04 (36H, m), 2.72-2.46 (2H, m), 2.20-2.15 (6H, m), 2.08-1.94 (18H, m), 1.93-1.81 (2H, m), 1.67-1.52 (2H, m), 1.46-1.34 (2H, m), 1.22-0.98 (12H, m).
(37A)[(2R,3R,4R,5R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-[3-(ベンジルオキシカルボニルアミノ)プロポキシ]テトラヒドロピラン-2-イル]メチル アセテート (化合物37A)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.43-7.29 (5H, m), 6.26 (1H, d, J = 8.5 Hz), 5.36-5.29 (1H, m), 5.12 (1H, d, J = 12.1 Hz), 5.08 (1H, d, J = 12.1 Hz), 5.03-4.95 (2H, m), 4.33 (1H, d, J = 9.1 Hz), 4.21-4.06 (3H, m), 4.01-3.93 (1H, m), 3.80-3.73 (1H, m), 3.62-3.49 (1H, m), 3.44-3.35 (1H, m), 3.14-3.04 (1H, m), 2.15 (3H, s), 2.05 (3H, s), 2.01 (3H, s), 1.95 (3H, s), 1.88-1.75 (1H, m), 1.69-1.56 (1H, m).
Calcd for C25H34N2O11: [M+H]+ 539, Found 539.
Calcd for C17H28N2O9: [M+H]+ 405, Found 405.
Calcd for C53H69N5O22: [M+H]+ 1128, Found 1129, [M+Na]+ 1151, Found 1151.
1H-NMR (DMSO-D6) δ: 8.34-8.26 (1H, m), 8.14-8.05 (4H, m), 7.90-7.82 (2H, m), 5.25-5.21 (2H, m), 5.00-4.92 (2H, m), 4.50-4.45 (2H, m), 4.08-3.82 (5H, m), 3.80-3.63 (3H, m), 3.51-3.39 (3H, m), 3.19-3.02 (4H, m), 2.70-2.53 (2H, m), 2.14-2.05 (6H, m), 2.04-1.96 (6H, m), 1.93-1.86 (6H, m), 1.84-1.75 (6H, m), 1.69-1.57 (4H, m).
Calcd for C38H59N5O20: [M+H]+ 905, Found 906.
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.19-7.12 (1H, m), 6.96-6.85 (2H, m), 6.83-6.75 (1H, m), 6.16 (1H, d, J = 9.1 Hz), 5.41-5.34 (2H, m), 5.25-5.08 (2H, m), 4.66 (1H, d, J = 8.5 Hz), 4.51-3.87 (16H, m), 3.79-3.72 (1H, m), 3.64-3.14 (6H, m), 3.01-2.91 (1H, m), 2.68-2.57 (1H, m), 2.22-2.14 (6H, m), 2.10-1.93 (18H, m), 1.90-1.63 (4H, m), 1.42 (3H, s), 1.35 (3H, s).
Calcd for C45H69N5O24: [M+Na]+ 1086, Found 1086.
Calcd for C42H65N5O24: [M+H]+ 1024, Found 1024.
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.44-7.38 (2H, m), 7.33-7.09 (9H, m), 6.86-6.69 (6H, m), 6.22 (1H, d, J = 7.9 Hz), 5.38-5.33 (2H, m), 5.23-5.09 (2H, m), 4.66 (1H, d, J = 7.9 Hz), 4.54-4.42 (2H, m), 4.24-3.87 (16H, m), 3.79 (6H, s), 3.57-3.14 (8H, m), 2.97-2.87 (1H, m), 2.66-2.50 (1H, m), 2.19-2.13 (6H, m), 2.08-1.91 (10H, m), 1.87-1.65 (4H, m).
Calcd for C63H83N5O26: [M+Na]+ 1349, Found 1349.
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.45-7.38 (2H, m), 7.34-6.95 (9H, m), 6.88-6.62 (6H, m), 6.18-6.10 (1H, m), 5.39-5.32 (2H, m), 5.24-5.05 (2H, m), 4.69-4.60 (1H, m), 4.52-4.41 (2H, m), 4.34-2.90 (32H, m), 2.68-2.42 (3H, m), 2.20-2.14 (6H, m), 2.09-1.91 (18H, m), 1.87-1.66 (4H, m), 1.21-0.97 (12H, m).
(38A)ベンジル N-[3-[(2R,3R,4R,5R,6R)-3-アセトアミド-4,5-ジヒドロキシ-6-(ヒドロキシメチル)テトラヒドロピラン-2-イル]オキシプロピル]カルバメート (化合物38A)の合成
1H-NMR (DMSO-D6) δ: 7.60 (1H, d, J = 9.1 Hz), 7.40-7.17 (5H, m), 5.01 (2H, s), 4.62-4.55 (2H, m), 4.49 (1H, d, J = 4.2 Hz), 4.20 (1H, d, J = 8.5 Hz), 3.76-3.27 (6H, m), 3.08-2.99 (2H, m), 1.81 (3H, s), 1.66-1.56 (2H, m).
Calcd for C19H28N2O8: [M+Na]+ 435, Found 435.
1H-NMR (D2O) δ: 4.27 (1H, d, J = 8.5 Hz), 3.90-3.50 (8H, m), 2.93 (2H, t, J = 7.0 Hz), 1.89 (3H, s), 1.82-1.75 (2H, m).
1H-NMR (DMSO-D6) δ: 7.89 (2H, d, J = 7.3 Hz), 7.69 (2H, d, J = 7.3 Hz), 7.61 (1H, d, J = 9.1 Hz), 7.42 (2H, t, J = 7.3 Hz), 7.33 (2H, t, J = 7.3 Hz), 7.24 (1H, t, J = 5.7 Hz), 4.60-4.57 (2H, m), 4.49 (1H, d, J = 4.2 Hz), 4.31-4.18 (4H, m), 3.76-3.28 (8H, m), 3.05-2.97 (2H, m), 1.81 (3H, s), 1.62-1.57 (2H, m).
Calcd for C26H32N2O8: [M+Na]+ 523, Found 523.
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.77 (2H, d, J = 7.3 Hz), 7.62 (2H, d, J = 7.3 Hz), 7.43-7.18 (13H, m), 6.83-6.79 (4H, m), 6.03 (1H, d, J = 9.1 Hz), 5.55 (1H, d, J = 3.0 Hz), 5.14-5.03 (2H, m), 4.46-4.43 (3H, m), 4.24-4.04 (2H, m), 3.97-3.91 (1H, m), 3.85-3.82 (1H, m), 3.77 (6H, s), 3.72-3.71 (1H, m),3.54-3.33 (3H, m), 3.09-3.04 (2H, m), 2.03 (3H, s), 1.89 (6H, s), 1.65-1.56 (2H, m).
Calcd for C52H55NO12: [M+Na]+ 908, Found 909.
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.39-7.18 (9H, m), 6.83-6.80 (4H, m), 5.55 (1H, d, J = 3.0 Hz), 5.51 (1H, d, J = 9.1 Hz), 5.27 (1H, dd, J = 11.2, 3.3 Hz), 4.64 (1H, d, J = 8.5 Hz), 3.98-3.90 (2H, m), 3.84-3.82 (1H, m), 3.79 (6H, s), 3.75-3.74 (1H, m), 3.58-3.56 (1H, m), 3.35 (1H, dd, J = 9.1, 5.4 Hz), 3.07 (1H, t, J = 8.5 Hz), 2.82-2.74 (4H, m), 2.01 (3H, s), 1.96 (3H, s), 1.89 (3H, s), 1.74-1.69 (2H, m).
Calcd for C37H45NO10: [M+Na]+ 687, Found 687.
(39A)ベンジル 2-[[2-ベンジルオキシ-3-[(2-ベンジルオキシ-2-オキソ-エチル)カルバモイルオキシ]プロポキシ]カルボニルアミノ]アセテート(化合物39A)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.37-7.33 (15H, m), 5.48 (2H, t, J = 5.4 Hz), 5.18 (4H, s), 4.64 (2H, s), 4.23 (4H, d, J = 5.4 Hz), 3.99 (4H, d, J = 5.4 Hz), 3.84 (1H, t, J = 5.4 Hz).
Calcd for C30H32N2O9: [M+H]+ 565, Found 565, [M+Na]+ 587, Found 587
1H-NMR (D2O) δ: 4.21-4.14 (5H, m), 3.86 (4H, s).
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.39-7.17 (18H, m), 6.83-6.80 (8H, m), 6.70-6.27 (2H, m), 5.56-5.54 (2H, m), 5.10 (2H, d, J = 10.9 Hz), 4.49-3.02 (44H, m), 2.01 (6H, s), 1.96 (6H, s), 1.90 (6H, s), 1.80-1.63 (4H, m).
Calcd for C81H98N6O27: [M+Na]+ 1611, Found 1611
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.39-7.17 (18H, m), 6.87-6.70 (8H, m), 6.29-6.06 (2H, m), 5.55 (2H, d, J = 3.0 Hz), 5.11 (2H, d, J = 10.9 Hz), 4.47-3.02 (47H, m), 2.63 (2H, t, J = 6.3 Hz), 2.02 (6H, s), 1.96 (6H, s), 1.90 (6H, s), 1.80-1.64 (4H, m), 1.17 (12H, d, J = 6.7 Hz).
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.39-7.30 (15H, m), 5.37-5.35 (2H, m), 5.17-5.12 (5H, m), 4.56-4.51 (2H, m), 4.33-4.30 (2H, m), 4.03-3.94 (4H, m), 3.61 (2H, d, J = 5.4 Hz).
Calcd for C30H32N2O9: [M+Na]+ 587, Found 587
1H-NMR (D2O) δ: 4.32-4.19 (3H, m), 3.94-3.87 (4H, m), 3.81-3.71 (2H, m).
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.40-7.18 (18H, m), 6.81 (8H, dd, J = 9.1, 3.0 Hz), 6.70-6.50 (1H, m), 6.16-6.02 (1H, m), 5.56-5.54 (2H, br), 5.11-5.00 (2H, m), 4.53-2.99 (44H, m), 2.01 (6H, s), 1.95 (6H, s), 1.88 (6H, s), 1.77-1.68 (4H, m).
Calcd for C81H98N6O27: [M+Na]+ 1611, Found 1611
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.38-7.18 (18H, m), 7.13-6.97 (1H, m), 6.83-6.81 (8H, m), 6.58-6.36 (1H, m), 5.56-5.52 (2H, m), 5.10-5.04 (2H, m), 4.46-2.97 (47H, m), 2.65-2.63 (2H, m), 2.02 (6H, s), 1.95 (3H, s), 1.94 (3H, s), 1.90 (3H, s), 1.89 (3H, s), 1.77-1.67 (4H, m), 1.20-1.16 (12H, m).
HO-X16−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H)(配列番号40)
Xの部分をX16と置き換えて、実施例91と同様に合成を行った。X16の部分は参考例36で合成した化合物36Gを用い、1回縮合した。
HO-X15−X15−X15−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H(配列番号40)
Xの部分をX15と置き換えて、実施例91と同様に合成を行った。X15の部分は参考例35で合成した化合物35Fを用い、3回縮合した。
X18−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H(配列番号40)
Xの部分をX18と置き換えて、実施例91と同様に合成を行った。X18の部分は参考例39で合成した化合物39Dを用い、1回縮合した。
HO-X15−X15−X15-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号44)
実施例132で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.1を用い、実施例132と同様に合成を行った。
HO-X15−X15−X15-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-Ce2s-Um1t -H(配列番号45)
実施例132で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_006.1を用い、実施例132と同様に合成を行った。
HO-X15−X15−X15−Am1s−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H(配列番号42)
実施例132で使用した配列の代わりに上記の配列である16e_001を用い、実施例132と同様に合成を行った。
HO-X15−X15−X15−Am1s−Am1s−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H(配列番号46)
実施例132で使用した配列の代わりに上記の配列である17e_001を用い、実施例132と同様に合成を行った。
X18−Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号44)
実施例133で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.1を用い、実施例133と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6250.00)
X18-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2s-Um1t-H(配列番号45)
実施例133で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_006.1を用い、実施例133と同様に合成を行った。
X18−Am1s−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H(配列番号42)
実施例133で使用した配列の代わりに上記の配列である16e_001を用い、実施例133と同様に合成を行った。
X18−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号47)
実施例133で使用した配列の代わりに上記の配列である16e_002を用い、実施例133と同様に合成を行った。
X18-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2s-Um1t-H(配列番号48)
実施例133で使用した配列の代わりに上記の配列である16e_003を用い、実施例133と同様に合成を行った。
X18−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H(配列番号40)
実施例133で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_001.5を用い、実施例133と同様に合成を行った。
X18−Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号44)
実施例133で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5を用い、実施例133と同様に合成を行った。
X18-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2s-Um1t-H(配列番号45)
実施例133で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_006.5を用い、実施例133と同様に合成を行った。
X18−Am1s−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H(配列番号42)
実施例133で使用した配列の代わりに上記の配列である16e_001.5を用い、実施例133と同様に合成を行った。
X18−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号47)
実施例133で使用した配列の代わりに上記の配列である16e_002.5を用い、実施例133と同様に合成を行った。
X18-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2s-Um1t-H(配列番号48)
実施例133で使用した配列の代わりに上記の配列である16e_003.5を用い、実施例133と同様に合成を行った。
HO-X16−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H(配列番号40)
実施例131で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_001.5を用い、実施例131と同様に合成を行った。
X19−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H(配列番号40)
Xの部分をX19と置き換えて、実施例91と同様に合成を行った。X19の部分は参考例40で合成した化合物40Dを用い、1回縮合した。
X17−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H(配列番号40)
Xの部分をX17と置き換えて、実施例91と同様に合成を行った。X17の部分は参考例37で合成した化合物37Hを用い、1回縮合した。
(参考例41)
(41A)3-[[2-ベンジルオキシ-3-[(3-ベンジルオキシ-3-オキソ-プロピル)カルバモイルオキシ]プロポキシ]カルボニルアミノ]プロパン酸ベンジルエステル(化合物41A)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.39-7.27 (15H, m), 5.21 (2H, br s), 5.14 (4H, s), 4.63 (2H, s), 4.24-4.10 (4H, m), 3.79-3.74 (1H, m), 3.48-3.44 (4H, m), 2.59 (4H, t, J = 6.0 Hz).Calcd for C32H36N2O9: [M+H]+ 593, Found 593, [M+Na]+ 615, Found 615
(41B)3-[[3-(2-カルボキシエチルカルバモイルオキシ)-2-ヒドロキシ-プロポキシ]カルボニルアミノ]プロパン酸(化合物41B)の合成
1H-NMR (D2O) δ: 4.22-4.04 (5H, m), 3.46-3.32 (4H, m), 2.57 (4H, t, J = 6.7 Hz).
(41C)[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-6-[3-[3-[[3-[[3-[3-[(2R,3R,4R,5R,6R)-3-アセトアミド-4,5-ジアセトキシ-6-[[ビス(4-メトキシフェニル)-フェニル-メトキシ]メチル]テトラヒドロピラン-2-イル]オキシプロピルアミノ]-3-オキソ-プロピル]カルバモイルオキシ]-2-ヒドロキシ-プロポキシ]カルボニルアミノ]プロパノイルアミノ]プロポキシ]-4-アセトキシ-2-[[ビス(4-メトキシフェニル)-フェニル-メトキシ]メチル]テトラヒドロピラン-3-イル]アセテート(化合物41C)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.32-7.24 (18H, m), 6.82-6.80 (8H, m), 6.64-6.61 (1H, br), 6.27-6.24 (1H, br), 5.91-5.88 (1H, br), 5.56 (2H, d, J = 3.0 Hz), 5.10 (2H, d, J = 11.5 Hz), 4.46-3.05 (43H, m), 2.47-2.37 (4H, m), 2.02 (6H, s), 1.98 (6H, s), 1.90 (6H, s), 1.78-1.67 (4H, m).
Calcd for C83H102N6O27: [M+Na]+ 1638, Found 1638
(41D)[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-6-[3-[3-[[3-[[3-[3-[(2R,3R,4R,5R,6R)-3-アセトアミド-4,5-ジアセトキシ-6-[[ビス(4-メトキシフェニル)-フェニル-メトキシ]メチル]テトラヒドロピラン-2-イル]オキシプロピルアミノ]-3-オキソ-プロピル]カルバモイルオキシ]-2-[2-シアノエトキシ-(ジイソプロピルアミノ) ホスファニルl]オキシ-プロポキシ]カルボニルアミノ]プロパノイルアミノ]プロポキシ]-4-アセトキシ-2-[[ビス(4-メトキシフェニル)-フェニル-メトキシ]メチル]テトラヒドロピラン-3-イル] アセテート(化合物41D)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.39-7.18 (18H, m), 6.85-6.78 (8H, m), 6.73-6.64 (1H, m), 6.40-6.23 (1H, m), 5.83-5.72 (1H, m), 5.56 (2H, d, J = 3.0 Hz), 5.13-5.04 (2H, m), 4.45-4.35 (2H, m), 4.22-3.30 (40H, m), 3.22-3.03 (4H, m), 2.64 (2H, t, J = 6.0 Hz), 2.54-2.32 (4H, m), 2.02 (6H, s), 2.00-1.95 (6H, m), 1.90 (6H, s), 1.83-1.59 (4H, m), 1.20-1.10 (12H, m).
(参考例42)
(42A)4-[[2-ベンジルオキシ-3-[(4-ベンジルオキシ-4-オキソ-ブチル)カルバモイルオキシ]プロポキシ]カルボニルアミノ]ブタン酸ベンジルエステル(化合物42A)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.38-7.27 (15H, m), 5.11 (4H, s), 4.80 (2H, br s), 4.63 (2H, s), 4.19-4.15 (4H, m), 3.77-3.75 (1H, m), 3.23-3.18 (4H, m), 2.40 (4H, t, J = 7.3 Hz), 1.88-1.81 (4H, m).
Calcd for C34H40N2O9: [M+H]+ 621, Found 622, [M+Na]+ 643, Found 644
(42B)4-[[3-(3-カルボキシプロピルカルバモイルオキシ)-2-ヒドロキシ-プロポキシ]カルボニルアミノ]ブタン酸(化合物42B)の合成
1H-NMR (D2O) δ: 4.19-4.05 (5H, m), 3.19-3.12 (4H, m), 2.36-2.27 (4H, m), 1.83-1.73 (4H, m).
(42C)[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-6-[3-[4-[[3-[[4-[3-[(2R,3R,4R,5R,6R)-3-アセトアミド-4,5-ジアセトキシ-6-[[ビス(4-メトキシフェニル)-フェニル-メトキシ]メチル] テトラヒドロピラン-2-イル]オキシプロピルアミノ]-4-オキソ-ブチル] カルバモイルオキシ]-2-ヒドロキシ-プロポキシ]カルボニルアミノ]ブタノイルアミノ] プロポキシ]-4-アセトキシ-2-[[ビス(4-メトキシフェニル)-フェニル-メトキシ]メチル]テトラヒドロピラン-3-イル]アセテート(化合物42C)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.31-7.24 (18H, m), 6.82-6.80 (8H, m), 6.68-6.65 (3H, m), 5.91-5.84 (1H, m), 5.56 (2H, d, J = 3.0 Hz), 5.10 (2H, d, J = 10.9 Hz), 4.45 (2H, d, J = 8.5 Hz), 4.23-3.12 (40H, m), 2.31-2.22 (4H, m), 2.01 (6H, s), 1.98 (6H, s), 1.90 (6H, s), 1.81-1.68 (8H, m).
Calcd for C85H106N6O27: [M+Na]+ 1666, Found 1667
(42D)[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-6-[3-[3-[[3-[[3-[3-[(2R,3R,4R,5R,6R)-3-アセトアミド-4,5-ジアセトキシ-6-[[ビス(4-メトキシフェニル)-フェニル-メトキシ]メチル]テトラヒドロピラン-2-イル]オキシプロピルアミノ]-4-オキソ-ブチル]カルバモイルオキシ]-2-[2-シアノエトキシ-(ジイソプロピルアミノ) ホスファニル]オキシ-プロポキシ]カルボニルアミノ]ブタノイルアミノ]プロポキシ]-4-アセトキシ-2-[[ビス(4-メトキシフェニル)-フェニル-メトキシ]メチル]テトラヒドロピラン-3-イル] アセテート(化合物42D)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 7.40-7.17 (18H, m), 6.85-6.77 (8H, m), 6.72-5.65 (5H, m), 5.56 (2H, d, J = 3.0 Hz), 5.11-5.03 (2H, m), 4.46-4.35 (2H, m), 4.25-3.02 (42H, m), 2.65 (2H, t, J = 6.0 Hz), 2.39-2.16 (4H, m), 2.02 (6H, s), 1.99-1.94 (6H, m), 1.90 (6H, s), 1.87-1.59 (8H, m), 1.18 (12H, d, J = 6.7 Hz).
(参考例43)
(43A)[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-3,4-ジアセトキシ-6-(5-アミノペントキシ)テトラヒドロピラン-2-イル]メチルアセテート 塩酸塩(化合物43A)の合成
Calcd for C19H32N2O9: [M+H]+ 433, Found 433.
(43B)[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-6-[5-[[3-[5-[(2R,3R,4R,5R,6R)-3-アセトアミド-4,5-ジアセトキシ-6-(アセトキシメチル)テトラヒドロピラン-2-イル]オキシペンチルカルバモイルオキシ]-2-ベンジルオキシ-プロポキシ]カルバモイルアミノ]ペントキシ]-3,4-ジアセトキシ-テトラヒドロピラン-2-イル]メチル アセテート (化合物43B)の合成
Calcd for C50H74N4O23 : [M+H]+ 1099, Found 1099. [M+Na]+ 1121, Found 1121.
(43C)[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-6-[5-[[3-[5-[(2R,3R,4R,5R,6R)-3-アセトアミド-4,5-ジアセトキシ-6-(アセトキシメチル)テトラヒドロピラン-2-イル]オキシペンチルカルバモイルオキシ]-2-ヒドロキシ-プロポキシ]カルボニルアミノ]ペントキシ]-3,4-ジアセトキシ-テトラヒドロピラン-2-イル]メチル アセテート(化合物43C)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 6.10-5.96 (1H, m), 5.38-4.94 (6H, m), 4.70-4.64 (2H, m), 4.23-3.44 (19H, m), 3.20-3.15 (4H, m), 2.15 (6H, s), 2.05 (6H, s), 2.01 (6H, s), 1.97 (6H, s), 1.67-1.38 (12H, m).
Calcd for C43H68N4O23 : [M+H]+ 1009, Found 1009. [M+Na]+ 1031, Found 1031.
(43D)[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-6-[5-[[3-[5-[(2R,3R,4R,5R,6R)-3-アセトアミド-4,5-ジアセトキシ-6-(アセトキシメチル)テトラヒドロピラン-2-イル]オキシペンチルカルバモイルオキシ]-2-[2-シアノエトキシ-(ジイソプロピルアミノ) ホスファニル]オキシ-プロポキシ]カルバモイルアミノ]ペントキシ]-3,4-ジアセトキシ-テトラヒドロピラン-2-イル]メチル アセテート(化合物43D)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 5.95-5.89 (1H, m), 5.38-5.26 (4H, m), 5.20-5.16 (1H, m), 5.00-4.95 (1H, m), 4.71-4.68 (2H, m), 4.36-3.44 (22H, m), 3.15 (4H, q, J = 6.4 Hz), 2.67 (2H, t, J = 6.3 Hz), 2.15 (6H, s), 2.05 (6H, s), 2.01 (6H, s), 1.96 (6H, s), 1.67-1.33 (12H, m), 1.18 (12H, d, J = 6.7 Hz).
(参考例44)
(44A)[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-6-[3-[3-[[3-[[3-[3-[(2R,3R,4R,5R,6R)-3-アセトアミド-4,5-ジアセトキシ-6-(アセトキシメチル)テトラヒドロピラン-2-イル]オキシプロピルアミノ]-3-オキソ-プロピル]カルバモイルオキシ]-2-ヒドロキシ-プロポキシ]カルボニルアミノ]プロパノイルアミノ]プロポキシ]-3,4-ジアセトキシ-テトラヒドロピラン-2-イル]メチル アセテート(化合物44A)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 6.76 (2H, br), 6.69-6.63 (2H, m), 5.96 (1H, br), 5.36 (2H, d, J = 3.0 Hz), 5.13-5.08 (2H, m), 4.53 (2H, d, J = 8.5 Hz), 4.25-3.07 (27H, m), 2.51-2.44 (4H, m), 2.17 (6H, s), 2.06 (6H, s), 2.02 (6H, s), 2.00 (6H, s), 1.86-1.73 (4H, m).
Calcd for C45H70N6O25: [M+H]+ 1095, Found 1096. [M+Na]+ 1117, Found 1117.
(44B)[(2R,3R,4R,5R,6R)-5-アセトアミド-6-[3-[3-[[3-[[3-[3-[(2R,3R,4R,5R,6R)-3-アセトアミド-4,5-ジアセトキシ-6-(アセトキシメチル)テトラヒドロピラン-2-イル]オキシプロピルアミノ]-3-オキソ-プロピル]カルバモイルオキシ]-2-[2-シアノエトキシ-(ジイソプロピルアミノ)ホスファニル]オキシ-プロポキシ]カルボニルアミノ]プロパノイルアミノ]プロポキシ]-3,4-ジアセトキシ-テトラヒドロピラン-2-イル]メチル アセテート(化合物44B)の合成
1H-NMR (CDCl3) δ: 6.60-6.44 (4H, m), 5.76-5.68 (1H, m), 5.36 (2H, d, J = 3.0 Hz), 5.09-5.05 (2H, m), 4.50-4.45 (2H, m), 4.26-3.37 (28H, m), 3.17 (2H, br), 2.67 (2H, t, J = 6.3 Hz), 2.52-2.42 (4H, m), 2.17 (6H, s), 2.05 (6H, s), 2.02 (6H, s), 1.99 (6H, s), 1.81-1.70 (4H, m), 1.18 (12H, d, J = 6.7 Hz).
(実施例152)
X20−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H(配列番号40)
X18の部分をX20と置き換えて、実施例143と同様に合成を行った。使用した配列は上記配列15e_001.5である。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から92番目から106番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6261.98)
(実施例153)
X20−Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号44)
X18の部分をX20と置き換えて、実施例144と同様に合成を行った。使用した配列は上記配列15e_005.5である。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6264.00)
(実施例154)
X20−Am1s−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H(配列番号42)
X18の部分をX20と置き換えて、実施例146と同様に合成を行った。使用した配列は上記配列16e_001.5である。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から92番目から107番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6621.04)
(実施例155)
X20−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号47)
X18の部分をX20と置き換えて、実施例147と同様に合成を行った。使用した配列は上記配列16e_002.5である。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から106番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6623.05)
(実施例156)
X21−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H(配列番号40)
X18の部分をX21と置き換えて、実施例143と同様に合成を行った。使用した配列は上記配列15e_001.5である。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から92番目から106番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6290.02)
(実施例157)
X22−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H(配列番号40)
X18の部分をX22と置き換えて、実施例143と同様に合成を行った。使用した配列は上記配列15e_001.5である。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から92番目から106番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6175.96)
(実施例158)
X22−Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号44)
X18の部分をX22と置き換えて、実施例144と同様に合成を行った。使用した配列は上記配列15e_005.5である。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6177.98)
(実施例159)
X22−Am1s−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H(配列番号42)
X18の部分をX22と置き換えて、実施例146と同様に合成を行った。使用した配列は上記配列16e_001.5である。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から92番目から107番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6535.03)
(実施例160)
X22−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号47)
X18の部分をX22と置き換えて、実施例147と同様に合成を行った。使用した配列は上記配列16e_002.5である。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から106番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6537.05)
293A細胞(ヒト胎児腎細胞)の培養
以下のようにして、293A細胞(R705-07 invitrogen)の培養を行った。
293A細胞を維持培地(DMEM、10%FBS)にて維持培養した。実験では6 well plateに2x105 cells/well 12 well plateに1x105 cells/wellの密度で細胞を播種し、翌日、後述のように実施例の化合物、及び、プラスミドベクターを同時に導入し、評価に用いた。
以下のようにして、ヒトG6PC全長プラスミドベクター(pcDNA hG6PC,pcDNA hG6PC (c.648G>T) + Int4)を作製した。
Human Multiple Tissue cDNA Panelを鋳型とし、下記G6PC cDNA Amplified primerを用いてG6PC cDNAを増幅後、さらにG6PC cDNA IF primerで増幅した。増幅した断片をInFusion SystemによりpcDNA3.1のBamHI siteに挿入した(pcDNA hG6PC)。
G6PC cDNA Amplified primer:
フォワードプライマー 5'-ATAGCAGAGCAATCACCACCAAGCC-3' (配列番号49)
リバースプライマー 5'-ATTCCACGACGGCAGAATGGATGGC-3' (配列番号50)
G6PC IF primer:
フォワードプライマー 5'-TACCGAGCTCGGATCCACCACCAAGCCTGGAATAACTGC-3'(配列番号51)、
リバースプライマー 5'-CTGGACTAGTGGATCCTGGCATGGTTGTTGACTTTAAAC-3'(配列番号52)
Human Genome DNAを鋳型とし、下記G6PC Int4 Amplified primerを用いてG6PC Intron4とExon5を一部含む領域を増幅し、さらにG6PC Intron4をG6PC Int4 IF primerで増幅した。また、STEP1-1作成のpcDNA hG6PCを下記hG6PC vector IF primerを用いて増幅した。なお、InFusion primerにはExon5内のc.648G>T変異を導入した。両断片をInFusion Systemにより連結し、pcDNA hG6PC内にG6PC Intron4配列を挿入した (pcDNA hG6PC (c.648G>T) + Int4)。
G6PC Int4 Amplified primer:
フォワードプライマー 5'-TCTGGGCTGTGCAGCTGAATGTCTG-3' (配列番号53)
リバースプライマー 5'-GTAGGGGATGACACTGACGGATGCC-3' (配列番号54)
G6PC Int4 IF primer:
フォワードプライマー 5'-CTGGAGTCCTGTCAGGTATGGGC-3' (配列番号55)
リバースプライマー 5'-AGCTGAAAAGGAAGAAGGTAATGAG-3' (配列番号56)
hG6PC vector IF primer:
フォワードプライマー 5'-TCTTCCTTTTCAGCTTCGCCATCGG-3' (配列番号57)
リバースプライマー 5'-CTGACAGGACTCCAGCAACAAC-3' (配列番号58)
以下のようにして、実施例の化合物、及び、プラスミドベクターをコトランスフェクションした。
下記A液とB液を作製後、混合した。
6 well plateで実施の場合、1 wellあたり、A液として250μL Opti-MEM Medium(gibco)、0.50μLプラスミドベクター(1mg/mL)、4.0μL(final: 20nM)実施例で製造した化合物(12.5μM)を準備し、B液として250 μL Opti-MEM Medium(gibco)、6.0μL Lipofectamine2000 (Invitrogen)を準備し、A液とB液を混合した。12 well plateで実施の場合、1 wellあたり、A液として125 μL Opti-MEM Medium(gibco)、0.25 μLプラスミドベクター(1mg/mL)、2.0μL(final: 20nM)実施例で製造した化合物(12.5μM)B液として125μL Opti-MEM Medium(gibco)、3.0μL Lipofectamine 2000(Invitrogen)を準備し、A液とB液を混合した。
上記の混合液を20分間室温でインキュベーション後、継代翌日の細胞に添加した(コトランスフェクション)。添加6時間後に新鮮な維持培地と交換し、上記混合液添加から24時間CO2インキュベーターでインキュベーションした。
以下のようにしてRNAの抽出を行った。
以下のようにして逆転写反応を行った。
逆転写反応産物20μLに対し精製水80μLで5倍稀釈し-30℃にて保存した。
下記のようにqRT PCR Primer(SYBR Green)を設計した。
Repaired hG6PC primer(SYBR):
フォワードプライマー 5'-TTGTGGTTGGGATTCTGGGC-3' (配列番号59)
リバースプライマー 5'-ATGCTGTGGATGTGGCTGAA-3' (配列番号60)
hActin primer(SYBR):
フォワードプライマー 5'-TGGCACCCAGCACAATGAA-3' (配列番号61)
リバースプライマー 5'-CTAAGTCATAGTCCGCCTAGAAGCA-3' (配列番号62)
またPCR反応液を1 wellあたり, 5μL 2x FAST SYBR Green Master Mix(Applied Biosystems)、2μL 精製水、1μL Primer mix (10μM)、2μLcDNA(5倍稀釈済)を懸濁し、viia7(Applied Biosystems)でPCR反応を行った(プログラム:SYBR Green Regents, FAST, include Melt curve))。
下記のようにRepaired hG6PC primer set、Total hG6PC primer set を設計し、20x primer probe mix(primer濃度: 1000nM probe濃度: 250nM)を調整した。hActin primer set、mActin primer setはは原液のままを使用した。
Repaired hG6PC primer set (Taqman):
フォワードプライマー 5'-GCTGCTCATTTTCCTCATCAAGTT-3' (配列番号63)
リバースプライマー 5'-TGGATGTGGCTGAAAGTTTCTGTA-3' (配列番号64)
プローブ 5'-TCCTGTCAGGCATTGC-3' FAM (配列番号65)
hActin primer set(Taqman):ABI Hs01060665_g1 FAM
mActin primer set(Taqman): ABI Mm02619580_g1 FAM
18s primer set(Taqman): ABI Hs99999901_s1 FAM
また1ウェル辺りに5μL 2x Taqman Fast Advanced Master Mix(Applied Biosystems)、2.5μL精製水、0.5μL 20x Primer probe mix (10μM)、2μL cDNA (5倍稀釈済)を懸濁しPCR反応液を調整(1 tubeあたり)し、viia7またはQuantstadio7(Applied Biosystems社)にてPCR反応を行った(プログラム:Taqman regents, FAST)。
以下のようにしてタンパク質の抽出ならびに正常ヒトG6PC特異的ペプチドのLC-MS/MS定量を行った。
コトランスフェクション後24時間インキュベーションした細胞を、cold PBSにて1回洗浄した。RIPA buffer(ナカライテスク)を1 wellにつき100μLずつ加え、氷上でインキュベーション後回収した。回収液について、氷上で20分間インキュベート後、10000g、10分、4℃で遠心し上清を回収した。上清について総タンパク質量を測定し、0.4mg/mLになるように調整しタンパク質ライセートとした。
DS264_100u: 安定同位体標識ペプチドGLGVD(L*)LWT(L*)EK(Scrum、L*: L-Leucine- 13C6,15N)を50%cn (精製水/acetonitrile)で100μMに調整した。
DS266_100u: 安定同位体標識ペプチドWCEQPEW(V*)HIDTTPFAS(L*)LK(L*: L-Leucine- 13C6,15N, V*:L-Valine-13C5,15N)を50%cn (精製水/acetonitrile)で100μMに調整した。
DS268_100u: 安定同位体標識ペプチドNLGTLFG(L*)GLA(L*)NSSMYR(Scrum、L*: L-Leucine- 13C6,15N)を50%cn (精製水/acetonitrile)で100μMに調整した。
IS solution-1: 50mL acetonitrile、0.5mL Trifuoroacetic acid(ナカライ)、20μL DS264_100u、20μL DS266_100u、20μL DS268_100uを懸濁した。
IS solution-2: 50mL acetonitrile、50mL 精製水、 0.5mL Trifuoroacetic acid(ナカライ)、20μL DS264_100u、20μL DS266_100u、20μL DS268_100uを懸濁した。
0.1M Tris-HCl:5mL 1M Tris-HCl Buffer Solution (pH 8.0)を45mLの精製水に添加懸濁した。
Urea/EDTA solution:2.4g Urea(ナカライ)、100μL 0.5M EDTA(sigma-aldorich)を4.9mL 0.1M Tris-HClに添加、懸濁した。
DTT solution (20mg/mL):20mg DTT (dithiothreitol)(Wako)を1mLの精製水に添加懸濁した。
IAA solution (50mg/mL):50mg IAA (iodoacetamide)(sigma-aldorich)を1mL精製水に添加懸濁した。
Trypsin /LysC Mix solution (200μg/mL):20μg Trypsin/Lys-C Mix (1 vial)(Promega)を100μL Resuspension buffer(Promega)に添加懸濁した。
下記に従い酵素消化反応を実施し、LC-MSインジェクションサンプルを調整した(1 sampleあたり)。
Ultimate 3000(Thermo Fisher), Q Exactive plus(Thermo Fisher)を用いてLC-MSインジェクションサンプルのLC-MS分析を実施した。内部標準法を用いてMass range 820.0632-820.0782 (m/z)より下記ペプチド(DS265)の試料中濃度を算出した
DS265:WCEQPEWVHIDTTPFASLLK(配列番号66)
下記のように抽出した各検体のミクロソーム画分のG6PCの活性測定を実施した。
BufferA: 100mM BIS-TRIS Buffer, pH 6.5 37℃
180mL精製水に4.2g BIS-TRIS (Sigma-Aldrich)を添加.塩酸、精製水を用いてpH 6.5、37℃、200mLに調整。
BufferB: HEPES 20mM, EDTA 1mM, Sucrose 250mM (4℃保存)
180mL精製水に4.0mL 1.0M HEPES (Gibco), 0.4mL 0.5M EDTA (USB), 17g Sucrose (Wako)を添加。精製水を200mLに調整後、0.22μmフィルターの透過処理。
Substarate: 200mM Glucose 6-Phosphate(4℃保存)
88.65 mL 精製水に 5mg D-Glucose 6-Phosphate Sodium Salt (Sigma-Aldrich)を添加。
TCA: 20% Trichloroacetic Acid (室温、遮光保存)
40 mL 精製水に 10 mL Trichloroacetic Acid Solution (Sigma-Aldrich)を添加。
Standard: Phosphorus Standard Solution, 20 μg/ml (Sigma-Aldrich)(4℃保存)
5M Sulfuric Acid Solution(室温、遮光保存)
67mL 精製水に25 mL Sulfuric Acid(Aldrich 258105)を添加。
TSCR: Taussky-Shorr Color Reagent (用時調製)
5M Sulfuric Acid Solution 20mL に2.4mg Ammonium Molybdate Tetrahydrate (Sigma-Aldrich)添加、溶解液を 140mLの精製水に添加。さらに10 g Ferrous Sulfate Heptahydrate (Sigma-Aldrich)を添加し、溶解するまで撹拌後、精製水で200mLまでメスアップ。
下記手順に従いミクロソーム画分を精製、調整した。
実施例化合物、及び、プラスミドベクターのコトランスフェクションを行った293A細胞(in 6 well plate)をice cold PBSでwash後、ice cold BufferBを各wellに添加、セルスクレーパーで回収した。回収した細胞をOn iceにてダウンスホモジナイザーを用いて十分にホモジナイズした後、1000g 10min 4℃にて遠心し上清を回収した。その上清を13000g 60min 4℃で遠心し、上清を除去、ペレットをBufferBで懸濁した。懸濁液の蛋白濃度が一定になるように(0.3〜1.0 mg/mL)になるようにBufferBで調整を行った。
蛋白濃度を調整したミクロソーム画分(sample)のG6PC酵素活性を下記の方法にて測定した。試薬の呼称は(1)に準じた。
各sampleにつきTestとBlankを作製した。Testでは150μL BufferA、50uL substrateを懸濁し、5分間37℃でインキュベートした。そこに5μLのsampleを添加、懸濁し、正確に5分間、37℃でインキュベートした後、45μL TCAを添加した。よく懸濁した後、5分間、25℃でインキュベートした。Blankでは150μL BufferA、50uL substrateを懸濁し、5分間37℃でインキュベートした。そこに5μLのsample、45μL TCAを懸濁し25℃でインキュベートしたものを添加した。各sampleのTestとBlankを4000g、10分間、室温で遠心し、その上清を別チューブに分注した。各上清100μLに対し、100μLのTSCRを添加、室温で5分間インキュベートした後、660nmの吸光度をプレートリーダー(Spectra Max M4 Molecular Devices)で測定した。 Standardの希釈系列を用いて算出した検量線、各sampleのTestとBlankの吸光度、sampleの蛋白濃度からG6PC酵素活性(U/mg:sample中の総タンパク質1mgが1分間に分解するG6P量(μmol))を算出した。
ヒトG6PC全長プラスミドベクター(pcDNA hG6PC (c.648G>T) + Int4)とオリゴヌクレオチド(21e_001〜012、及び、21m_001〜012)のコトランスフェクションを行い、G6PC (c.648G>T)による異常スプライシングが修復されるかをqRT-PCR(SYBR Green)にて評価した。図5A及び5Bに示したように、21e_002〜012、及び、21m_002〜012の化合物でG6PC mRNAの異常スプライシングの正常化が認められた。また、LC-MS/MSによる正常ヒトG6PC特異的ペプチドの産生を調べたところ、図6A及び6Bに示したように、21e_002〜012、及び、21m_002〜012の化合物において、正常ヒトG6PC特異的ペプチドの産生が認められた。さらに、G6PC 酵素活性測定したところ、図7A及び7Bに示したように、21e_002〜012、及び、21m_002〜012の化合物において、G6PC 酵素活性が認められた。
ヒトG6PC全長プラスミドベクター(pcDNA hG6PC (c.648G>T) + Int4)とオリゴヌクレオチド(21e_001〜006、及び、21e_013〜022)のコトランスフェクションを行い、G6PC (c.648G>T)による異常スプライシングが修復されるかをqRT-PCR(SYBR Green)にて評価した。図9に示したように、21e_002〜006、及び、21e_015〜022の化合物でG6PC mRNAの異常スプライシングの正常化が認められた。また、LC-MS/MSによる正常ヒトG6PC特異的ペプチドの産生を調べたところ、図10に示したように、21e_002〜006、及び、21e_015〜022の化合物において、正常ヒトG6PC特異的ペプチドの産生が認められた。
ヒトG6PC全長プラスミドベクター(pcDNA hG6PC (c.648G>T) + Int4)とオリゴヌクレオチド(18e_001〜017、及び、18m_001〜017)のコトランスフェクションを行い、G6PC (c.648G>T)による異常スプライシングが修復されるかをqRT-PCR(SYBR Green)にて評価した。図13A及び13Bに示したように、18e_005〜017、及び、18m_005〜017の化合物でG6PC mRNAの異常スプライシングの正常化が認められた。また、LC-MS/MSによる正常ヒトG6PC特異的ペプチドの産生を調べたところ、図14A及び14Bに示したように、18e_005〜017、及び、18m_005〜017の化合物において、正常ヒトG6PC特異的ペプチドの産生が認められた。
ヒトG6PC全長プラスミドベクター(pcDNA hG6PC (c.648G>T) + Int4)とオリゴヌクレオチド(18e_018〜031)のコトランスフェクションを行い、G6PC (c.648G>T)による異常スプライシングが修復されるかをqRT-PCR(SYBR Green)にて評価した。図16Aに示したように、18e_022〜026、及び、18e_031の化合物でG6PC mRNAの異常スプライシングの正常化が認められた。また、LC-MS/MSによる正常ヒトG6PC特異的ペプチドの産生を調べたところ、図16Bに示したように、18e_022〜026、及び、18e_031の化合物において、正常ヒトG6PC特異的ペプチドの産生が認められた。
ヒトG6PC全長プラスミドベクター(pcDNA hG6PC (c.648G>T) + Int4)とオリゴヌクレオチド(21e_002, 18e_005, 21m_002, 18e_005, 18m_022, 15e_001, 15ed_001, 18e_008, 18e_025, 18m_008, 15e_002, 15ed_002、及び、コントロールとして国際公開第2004/048570の実施例93の化合物)のコトランスフェクションを行い、G6PC (c.648G>T)による異常スプライシングが修復されるかをqRT-PCR(SYBR Green)にて評価した。図18に示したように、21e_002, 18e_005, 21m_002, 18e_005, 18m_022, 15e_001, 15ed_001, 18e_008, 18e_025, 18m_008, 15e_002, 及び、15ed_002の化合物でG6PC mRNAの異常スプライシングの正常化が認められた。
マウスの作出
ベクターの作成
下記手順に従い、G6PC KI vetorを作製した。
Mouse Genome DNAを鋳型に、下記mG6PC 5' arm Amplified primerを用いて、G6PC 5' arm領域を増幅した。さらにmG6PC 5' arm IF primerで増幅後、pBluescriptII(+/-)のXhoI siteに挿入した(G6PC 5' arm vector)。
mG6PC 5' arm Amplified primer:
フォワードプライマー 5'-GGGAAACATGCATGAAGCCCTGGGC-3' (配列番号67)
リバースプライマー 5'-TCCCTTGGTACCTCAGGAAGCTGCC-3' (配列番号68)
mG6PC 5' arm IF primer:
フォワードプライマー 5'-CGGGCCCCCCCTCGAAAACTAGGCCTGAAGAGATGGC-3' (配列番号69)
リバースプライマー 5'-TACCGTCGACCTCGAGGGTTGGCCTTGATCCCTCTGCTA-3' (配列番号70)
次にMouse Genome DNAを鋳型に、下記mG6PC 3' arm Amplified primerを用いて、G6PC 3' arm領域を増幅した。さらにmG6PC 3' arm IF primerで増幅後、G6PC 5' arm vectorのNotI saiteに挿入した(G6PC 5'+3' arm vector)。
mG6PC 3' arm Amplified primer:
フォワードプライマー 5'-GGTTGAGTTGATCTTCTACATCTTG-3' (配列番号71)
リバースプライマー 5'-GCAAGAGAGCCTTCAGGTAGATCCC-3' (配列番号72)
mG6PC 3' arm IF primer:
フォワードプライマー 5'-AGTTCTAGAGCGGCCGCCCATGCAAAGGACTAGGAACAAC-3' (配列番号73)
リバースプライマー 5'-ACCGCGGTGGCGGCCAATGTTGCCTGTCTTCCTCAATC-3' (配列番号74)
先述のpcDNA hG6PC (c.648G>T) + Int4を鋳型とし、下記hG6PC + Int4 IF primerを用いてhG6PC (c.648G>T)+Intron4 を増幅した。また、G6PC 5'+3' arm vectorを鋳型とし、下記Arm vector IF Primerを用いて増幅した。両断片をInFusion Systemを用いて連結しG6PC KI vetorを作成した。
hG6PC + Int4 IF primer:
フォワードプライマー 5'-GGCCAACCCTGGAATAACTGCAAGGGCTCTG-3' (配列番号75)
リバースプライマー 5'-TTGCATGGTTGTTGACTTTAAACACCGAAGA-3' (配列番号76)
Arm vector IF Primer:
フォワードプライマー 5'-TCAACAACCATGCAAAGGACTAGGAACAAC-3' (配列番号77)
リバースプライマー 5'-ATTCCAGGGTTGGCCTTGATCCCTCTGCTA-3' (配列番号78)
pSPgRNA(addgene)のgRNA配列導入領域に、下記KI 5’ gRNA、KI 3' gRNA配列を導入しpSPgRNA(KI 5')、pSPgRNA(KI 3')を作製した。
KI 5' gRNA:5'-GGGATCAAGGCCAACCGGCTGG-3' (配列番号79)
KI 3' gRNA:5'-TAAAGTCAACCGCCATGCAAAGG-3' (配列番号80)
各種ベクターを滅菌蒸留水を用いて、最終濃度がG6PC KI vetor 10ng/μL、pSPgRNA(KI 5') 5ng/μL、pSPgRNA(KI 3') 5ng/μL、pSPCas9(addgene)5ng/μLとなるように調整した後、MILLEX-GVシリンジフィルター(ミリポア)を通したものをC57BL/6Jマウス受精卵の前核十分膨らむ程度まで(約2pL)インジェクションした。その受精卵をレシピエントC57BL/6Jマウスの卵管に移植し、F0マウスを取得した。
以下の手順でGenotypingを実施、F1系統化を行った。
F0マウスの尾組織より核酸自動抽出装置(PI-200 クラボウ)及び専用キットを用いてゲノムDNAを抽出した。抽出DNAをAmplitaq Gold Master mix (Thermo fisher)を用いて及び下記KI screening primerを用いて増幅した(95℃ 10 min、(95℃ 30 sec、60℃ 30 sec、72℃ 30 sec) 35 cycles、72 ℃ 2 min、4℃ Hold)。
KI screening primer:
フォワードプライマー 5'-TACGTCCTCTTCCCCATCTG-3' (配列番号81)、
リバースプライマー 5'-CTGACAGGACTCCAGCAACA-3' (配列番号82)
上記PCR産物についてゲル電気泳動を実施し、433bp付近にバンドを認めた個体のゲノムDNAをテンプレートとし、PrimeSTAR GXL(takara)および下記KI genotyping primerを用いて増幅した(98℃ 2 min、(95℃ 15 sec、68℃ 5 min) 38 cycles、68 ℃ 7 min、15℃ Hold)。
KI genotyping primer (5'):
フォワードプライマー 5'-TTCCTTCCAAAGCAGGGACTCTCTATGT-3' (配列番号83)同じ(1))
リバースプライマー 5'-CTTGCAGAAGGACAAGACGTAGAAGACC-3' (配列番号84同じ(2))
KI genotyping primer (3'):
フォワードプライマー 5'-GAGTCTATATTGAGGGCAGGCTGGAGTC-3' (配列番号85)、
リバースプライマー 5'-TAGTCTGCCTGCTCACTCAACCTCTCCT-3' (配列番号86)
上記PCR産物についてゲル電気泳動を実施した。KI genotyping primer (5')をおよびKI genotyping primer (3')のいずれでも期待された配列長(4705bp、4026bp)に増幅を認めた個体のゲノムDNAのKI genotyping primer (5')を用いたPCR産物をGentetic analyzer(Lifetechnology)および下記KI sequence primerを用いてダイレクトシークエンスを行った。期待した配列のKIが確認できたものをKI陽性F0とした。
KI sequence primer (5'): 5'-GAGTCTATATTGAGGGCAGGCTGGAGTC-3' (配列番号87)
KI陽性F0とC57BL/6Jを交配しF1を取得した。F1の耳介組織よりDNeasy 96 Blood & Tissue Kit(Qiagen)を用いてゲノムDNAを抽出し、PrimeSTAR GXL(takara)および先述KI genotyping primer (5')を用いて増幅した(98℃ 2 min、(95℃ 15 sec、68℃ 5 min) 38 cycles、68 ℃ 7 min、15℃ Hold)。
上記PCR産物についてゲル電気泳動を実施し、期待された配列長(4705b)に増幅を認めた個体をKI陽性F1とした。KI陽性F1の中から選別した1ラインを繁殖しhG6PC (c.648G>T) + Int4 KI系統とした。
耳介組織よりDNeasy 96 Blood & Tissue Kit(Qiagen)を用いてゲノムDNAを抽出し、KOD FX(TOYOBO)および下記KI genotyping primer、mG6PC WT primer を用いてmultiprex増幅した(98℃ 2 min、(95℃ 15 sec、68℃ 5.5 min) 32 cycles、68 ℃ 5 min、4℃ Hold)。
KI genotyping primer (5'):
フォワードプライマー 5'-TTCCTTCCAAAGCAGGGACTCTCTATGT-3' (配列番号83同じ(1))
リバースプライマー 5'-CTTGCAGAAGGACAAGACGTAGAAGACC-3' (配列番号84同じ(2))
mG6PC WT primer :
フォワードプライマー 5'-TAAATTTGACCAATGAGCACTGGAGGTC-3' (配列番号88)
リバースプライマー 5'-AAAATCATGTGTATGCGTGCCTTTCCTA-3' (配列番号89)’
上記PCR産物についてゲル電気泳動を実施し、4705b 近傍の増幅をKI アレル、2536 bp近傍の増幅をmG6PC WT アレルとし、産子のgenotyping(WT、Ht、Homo)を判別した。
以下のようにしてマウスの採材を行った。
採材の前日の夕方に糞食を避けるための床網を設置した上で、絶食を開始した。翌日、麻酔導入下で開腹し、十分に脱血後、肝臓、腎臓を摘出した。各臓器はice cold PBSで洗浄後、適切な大きさにトリミングし、予めホモジナイズビーズ(ニッカトー)を入れたチューブに保存した。各臓器は液体窒素にて瞬間冷却した後-80℃で保管した。
以下のようにしてRNAの抽出を行った。
hG6PC (c.648G>T) + Int4 Ht KIマウスに対して実施例116乃至127の化合物をPBSに溶解し、3mg/kgとなるように尾静脈投与を実施することができる。投与7日後に一晩絶食条件下でマウスの肝臓組織の採取しG6PC (c.648G>T)による異常スプライシングが修復されるかqRT-PCR(Taqman)にて評価することできる。
hG6PC (c.648G>T) + Int4 Ht KIマウスに対して実施例91乃至95の化合物を大塚生食注に溶解し、25mg/kgとなるように皮下投与を実施した。投与7日後に一晩絶食条件下でマウスの肝臓組織の採取しG6PC (c.648G>T)による異常スプライシングが修復されるかqRT-PCR(Taqman)にて評価したところ、図19に示したように、実施例91乃至95の化合物でhG6PC (c.648G>T) + Int4 Ht KIマウスの肝臓においてmRNAの異常スプライシングの正常化が認められた。
hG6PC (c.648G>T) + Int4 Ht KIマウスに対して実施例91、92、及び、96乃至103の化合物を大塚生食注に溶解し、25mg/kgとなるように皮下投与を実施した。投与7日後に一晩絶食条件下でマウスの肝臓組織の採取し、G6PC (c.648G>T)による異常スプライシングが修復されるかqRT-PCR(Taqman)にて評価したところ、図20に示したように、実施例91、92、及び、96乃至103の化合物でhG6PC (c.648G>T) + Int4 Ht KIマウスの肝臓においてmRNAの異常スプライシングの正常化が認められた。
hG6PC (c.648G>T) + Int4 Ht KIマウスに対して実施例83乃至91、及び、104乃至107の化合物を大塚生食注に溶解し、30mg/kgとなるように皮下投与を実施した。投与7日後に一晩絶食条件下でマウスの肝臓組織の採取し、G6PC (c.648G>T)による異常スプライシングが修復されるかqRT-PCR(Taqman)にて評価したところ、図21に示したように、実施例83乃至91、及び、104乃至107の化合物でhG6PC (c.648G>T) + Int4 Ht KIマウスの肝臓においてmRNAの異常スプライシングの正常化が認められた。
hG6PC (c.648G>T) + Int4 Ht KIマウスに対して実施例104、及び、108乃至115の化合物を大塚生食注に溶解し、30mg/kgとなるように皮下投与を実施した。投与7日後に一晩絶食条件下でマウスの肝臓組織の採取し、G6PC (c.648G>T)による異常スプライシングが修復されるかqRT-PCR(Taqman)にて評価したところ、図22に示したように、実施例83乃至91、及び、104乃至107の化合物でhG6PC (c.648G>T) + Int4 Ht KIマウスの肝臓においてmRNAの異常スプライシングの正常化が認められた。
hG6PC (c.648G>T) + Int4 Ht KIマウスに対して実施例105、113、及び、131乃至137の化合物を大塚生食注に溶解し、30mg/kgとなるように皮下投与を実施した。投与7日後に一晩絶食条件下でマウスの肝臓組織の採取し、G6PC (c.648G>T)による異常スプライシングが修復されるかqRT-PCR(Taqman)にて評価したところ、図23に示したように、実施例105、113、及び、131乃至137の化合物でhG6PC (c.648G>T) + Int4 Ht KIマウスの肝臓においてmRNAの異常スプライシングの正常化が認められた。
PCR反応とフラグメント配列解析
以下のようにしてPCR反応とフラグメント配列解析を行った。
hG6PC splicing validation primer:
フォワードプライマー 5'-TTGTGGTTGGGATTCTGGGC-3' (配列番号90)
リバースプライマー 5'-TCCAGAGTCCACAGGAGGTC -3' (配列番号91)
以下のようにPCR反応液を調整し、PCR反応を行った。
23μL PlatinumTM PCR SuperMix High Fidelity (thermo fisher)、2μL Primer mix (10μM)、1μLcDNA(5倍稀釈済)を懸濁し、PCR反応を行った(95℃ 5min, (95℃ 30sec, 62℃ 30sec, 68℃ 30sec ) 36 cycles, 68℃ 4min, 4℃ Hold)。
PCR産物はE-Gel(登録商標)アガロースゲル電気泳動システムを用い、E-gel Ex 2% agarose (Invitrogen)にて電気泳動し、解析した。各フラグメントは、NucleoSpin(登録商標) Gel and PCR Clean-up (MACHEREY-NAGEL)にてゲルから抽出し、G6PC sequence primer を添加の上、BigDye v3.1を用いてシークエンス反応を行った。Applied Biosystems 3730xl DNA Analyzer(Life technologies)をもちいて塩基配列を確認した(図24)。
G6PC sequence primer 5'-GCTGTGCAGCTGAATGTCTG-3' (配列番号92)
ヒトG6PC全長プラスミドベクター(pcDNA hG6PC (c.648G>T) + Int4)を用いた実施例化合物によるG6PC mRNAの異常スプライシングの修復評価(1)において作成したヒトG6PC全長プラスミドベクター(pcDNA hG6PC (c.648G>T) + Int4)のみをトランスフェクションした検体、ヒトG6PC全長プラスミドベクター(pcDNA hG6PC (c.648G>T) + Int4)とオリゴヌクレオチド(21e_002)をコトランスフェクションした検体から作成したcDNAをテンプレートとして用いてPCR反応とフラグメント配列解析を行った。図24に示したように実施例1の化合物(21e_002)によって91塩基が欠損する異常スプライシングの正常化が認められた。
(試験例4)モデルマウスを用いた実施例化合物による異常スプライシングの修復評価
試験例2と同様に実施例化合物について、モデルマウスを用いて評価をした。
hG6PC (c.648G>T) + Int4 Ht KIマウスを用いた実施例化合物による異常スプライシングの修復評価(7)
hG6PC (c.648G>T) + Int4 Ht KIマウスに対して実施例133及び、143乃至149の化合物を大塚生食注に溶解し、30mg/kgとなるように皮下投与を実施した。投与7日後に一晩絶食条件下でマウスの肝臓組織の採取し、G6PC (c.648G>T)による異常スプライシングが修復されるかqRT-PCR(Taqman)にて評価したところ、図25に示したように、実施例133及び、143乃至149の化合物でhG6PC (c.648G>T) + Int4 Ht KIマウスの肝臓においてmRNAの異常スプライシングの正常化が認められた。
hG6PC (c.648G>T) + Int4 Ht KIマウスを用いた実施例化合物による異常スプライシングの修復評価(8)
hG6PC (c.648G>T) + Int4 Ht KIマウスに対して実施例149及び、152乃至160の化合物を大塚生食注に溶解し、30mg/kgとなるように皮下投与を実施した。投与7日後に一晩絶食条件下でマウスの肝臓組織の採取し、G6PC (c.648G>T)による異常スプライシングが修復されるかqRT-PCR(Taqman)にて評価したところ、図26に示したように、実施例149及び、152乃至160の化合物でhG6PC (c.648G>T) + Int4 Ht KIマウスの肝臓においてmRNAの異常スプライシングの正常化が認められた。
X20−Am1s-Am1s-Te2s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Am1s-Gm1t-H(配列番号93)
実施例133で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_001.6を用い、X18の部分をX20と置き換えて、実施例133と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から92番目から106番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6278.03)
(実施例162)
X20−Am1s-Te2s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Am1s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号94)
実施例133で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.6を用い、X18の部分をX20と置き換えて、実施例133と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6280.03)
(実施例163)
X20−Am1s-Am1s-Te2s-Ce2s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Am1s-Gm1t-H(配列番号93)
実施例133で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_001.7を用い、X18の部分をX20と置き換えて、実施例133と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から92番目から106番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6304.04)
(実施例164)
X20−Am1s-Te2s-Ce2s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Am1s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号94)
実施例133で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.7を用い、X18の部分をX20と置き換えて、実施例133と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6306.03)
(実施例165)
X20−Am1s-Um1s-Cm1s-Cm1s-Gm1s-Am1s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Cm1s-Gm1s-Am1s-Am1s-Gm1s-Cm1t-H(配列番号95)
実施例133で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.8を用い、X18の部分をX20と置き換えて、実施例133と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6149.93)
(実施例166)
X20−Ae2s-Um1p-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例153で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.01を用い、実施例153と同様に合成を行った。ただし、核酸自動合成機で使用する試薬のうち、表記配列合成に必要な部分の酸化剤として、OXDIZER 0.05M(Sigma-Aldrich製、product No. L560250-04)、あるいは、0.02 Mになるようにヨウ素(関東化学製、product No. 20035-00)を、テトラヒドロフラン (脱水、関東化学製、product No. 40993-05)、ピリジン (脱水、関東化学製、product No. 11339-05)、蒸留水78:20:2(v/v/v)溶液を用いて溶解し、適宜使用した。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6248.00)
(実施例167)
X20−Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1p-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.02を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6248.00)
(実施例168)
X20−Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1p-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.03を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6247.99)
(実施例169)
X20−Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1p-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.04を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6248.00)
(実施例170)
X20−Ae2s-Um1p-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1p-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.05を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6232.02)
(実施例171)
X20−Ae2s-Um1p-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1p-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.06を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6232.02)
(実施例172)
X20−Ae2s-Um1p-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1p-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.07を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6232.02)
(実施例173)
X20−Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1p-Gm1p-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.08を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6232.02)
(実施例174)
X20−Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1p-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1p-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.09を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6232.01)
(実施例175)
X20−Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1p-Gm1s-Ce2s-Gm1p-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.10を用い、実施例166と同様に合成を行った。使用した配列は上記配列15e_005.5.10である。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6232.01)
(実施例176)
X20−Ae2s-Um1p-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1p-Gm1p-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.11を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6216.00)
(実施例177)
X20−Ae2s-Um1p-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1p-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1p-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.12を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6216.03)
(実施例178)
X20−Ae2s-Um1p-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1p-Gm1s-Ce2s-Gm1p-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.13を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6216.02)
(実施例179)
X20−Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1p-Gm1p-Gm1s-Ce2s-Gm1p-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.14を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6216.03)
(実施例180)
X20−Ae2s-Um1p-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1p-Gm1p-Gm1s-Ce2s-Gm1p-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.15を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6200.06)
(実施例181)
X20−Ae2p-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.16を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6247.99)
(実施例182)
X20−Ae2s-Um1s-Cm1p-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.17を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6248.01)
(実施例183)
X20−Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2p-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.18を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6248.00)
(実施例184)
X20−Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1p-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.19を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6248.01)
(実施例185)
X20−Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2p-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.20を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6248.00)
(実施例186)
X20−Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1p-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.21を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6248.01)
(実施例187)
X20−Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2p-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.22を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6248.00)
(実施例188)
X20−Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1p-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.23を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6248.00)
(実施例189)
X20−Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2p-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.24を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6248.00)
(実施例190)
X20−Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1p-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.25を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6248.00)
(実施例191)
X20−Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2p-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2p-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.26を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6232.01)
(実施例192)
X20−Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2p-Gm1s-Ae2p-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2p-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.27を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6216.03)
(実施例193)
X20−Ae2p-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2p-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2p-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.28を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6216.03)
(実施例194)
X20−Ae2p-Um1s-Cm1s-Ce2p-Gm1s-Ae2p-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2p-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.29を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6200.06)
(実施例195)
X20−Ae2p-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2p-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2p-Gm1s-Am1s-Ae2p-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.30を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6200.06)
(実施例196)
X20−Ae2p-Um1s-Cm1s-Ce2p-Gm1s-Ae2p-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2p-Gm1s-Am1s-Ae2p-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.31を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6184.11)
(実施例197)
X20−Ae2p-Um1p-Cm1p-Ce2p-Gm1p-Ae2p-Um1p-Gm1p-Gm1p-Ce2p-Gm1p-Am1p-Ae2p-Gm1p-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.32を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6040.30)
(実施例198)
X20−Ae2p-Um1s-Cm1s-Ce2p-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.33を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6232.02)
(実施例199)
X20−Ae2p-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2p-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.34を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6232.01)
(実施例200)
X20−Ae2p-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2p-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.35を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6232.04)
(実施例201)
X20−Ae2p-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2p-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.36を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6232.03)
(実施例202)
X20−Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2p-Gm1s-Ae2p-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.37を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6232.02)
(実施例203)
X20−Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2p-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2p-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.38を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6232.01)
(実施例204)
X20−Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2p-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2p-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.39を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6232.02)
(実施例205)
X20−Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2p-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2p-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.40を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6232.02)
(実施例206)
X20−Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2p-Gm1s-Am1s-Ae2p-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.41を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6232.02)
(実施例207)
X20−Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2p-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2p-Gm1s-Am1s-Ae2p-Gm1s-Ce2t-H(配列番号95)
実施例166で使用した配列の代わりに上記の配列である15e_005.5.42を用い、実施例166と同様に合成を行った。
本化合物の塩基配列は、Homo sapiens glucose-6-phosphatase catalytic subunit (G6PC), transcript variant 1, mRNA (NCBI-GenBank accession No. NM_000151.3)のヌクレオチド番号728のGからTへ変異している、c.648G>T変異G6PC遺伝子のエクソン5の5’末端から91番目から105番目に相補的な配列である。化合物は負イオンESI質量分析により同定した(実測値:6216.00)
<配列番号49〜65、67〜92>プライマーの配列を示す。
<配列番号66>ペプチドの配列を示す。
Claims (2)
- 以下の実施例133、138〜148及び152〜155の式のいずれか一つで表されるオリゴヌクレオチドとGalNAcユニットのコンジュゲート、
実施例133: X18−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H(配列番号40)
実施例138: X18−Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号44)
実施例139: X18-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2s-Um1t-H(配列番号45)
実施例140: X18−Am1s−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H(配列番号42)
実施例141: X18−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号47)
実施例142: X18-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Te2s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2s-Um1t-H(配列番号48)
実施例143: X18−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H(配列番号40)
実施例144: X18−Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号44)
実施例145:X18-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2s-Um1t-H(配列番号45)
実施例146: X18−Am1s−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H(配列番号42)
実施例147:X18−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号47)
実施例148: X18-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2s-Um1t-H(配列番号48)
実施例152: X20−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H(配列番号40)
実施例153: X20−Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号44)
実施例154: X20−Am1s−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1t-H(配列番号42)
実施例155: X20−Am1s-Ae2s-Um1s-Cm1s-Ce2s-Gm1s-Ae2s-Um1s-Gm1s-Gm1s-Ce2s-Gm1s-Am1s-Ae2s-Gm1s-Ce2t-H(配列番号47)
[上記式において、左側が5'末端、右側が3’末端を表し、Am1t、Gm1t、Cm1t、5meCm1t、Um1t、Am1p、Gm1p、Cm1p、5meCm1p、Um1p、Am1s、Gm1s、Cm1s、5meCm1s、Um1s、A e2t、G e2t、C e2t、T e2t、Ae2p、Ge2p、Ce2p、Te2p、Ae2s、Ge2s、Ce2s、Te2s、X18、X20は、下記に示す構造を有する基である。X18およびX20において、リン酸基に結合した結合手はオリゴヌクレオチドの5'末端の炭素原子に結合して、リン酸ジエステル結合を形成することを表す。]
- G6PC遺伝子にc.648G>T変異を有する糖原病1a型患者に投与されることを特徴とする、請求項1に記載のコンジュゲート、その薬理上許容される塩又は溶媒和物を含有する糖原病1a型治療剤。
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