JP6871415B2 - 抗lag3抗体 - Google Patents
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Description
A)(a)配列番号1のアミノ酸配列を含むHVR−H1;(b)配列番号2のアミノ酸配列を含むHVR−H2;(c)配列番号3のアミノ酸配列を含むHVR−H3;(d)配列番号4のアミノ酸配列を含むHVR−L1;(e)配列番号5のアミノ酸配列を含むHVR−L2;及び(f)配列番号6のアミノ酸配列を含むHVR−L3、又は
B)(a)配列番号9のアミノ酸配列を含むHVR−H1;(b)配列番号10のアミノ酸配列を含むHVR−H2;(c)配列番号11のアミノ酸配列を含むHVR−H3;(d)配列番号12のアミノ酸配列を含むHVR−L1;(e)配列番号13のアミノ酸配列を含むHVR−L2;及び(f)配列番号14のアミノ酸配列を含むHVR−L3、又は
C)(a)配列番号17のアミノ酸配列を含むHVR−H1;(b)配列番号18のアミノ酸配列を含むHVR−H2;(c)配列番号19のアミノ酸配列を含むHVR−H3;(d)配列番号20のアミノ酸配列を含むHVR−L1;(e)配列番号21のアミノ酸配列を含むHVR−L2;及び(f)配列番号22のアミノ酸配列を含むHVR−L3、又は
D)(a)配列番号25のアミノ酸配列を含むHVR−H1;(b)配列番号26のアミノ酸配列を含むHVR−H2;(c)配列番号27のアミノ酸配列を含むHVR−H3;(d)配列番号28のアミノ酸配列を含むHVR−L1;(e)配列番号29のアミノ酸配列を含むHVR−L2;及び(f)配列番号30のアミノ酸配列を含むHVR−L3、又は
E)(a)配列番号33のアミノ酸配列を含むHVR−H1;(b)配列番号34のアミノ酸配列を含むHVR−H2;(c)配列番号35のアミノ酸配列を含むHVR−H3;(d)配列番号36のアミノ酸配列を含むHVR−L1;(e)配列番号37のアミノ酸配列を含むHVR−L2;及び(f)配列番号38のアミノ酸配列を含むHVR−L3
を含む抗体を提供する。
A)(a)(i)配列番号1のアミノ酸配列を含むHVR−H1、(ii)配列番号2のアミノ酸配列を含むHVR−H2及び(iii)配列番号3から選択されるアミノ酸配列を含むHVR−H3を含むVHドメインと、(b)(i)配列番号4のアミノ酸配列を含むHVR−L1;(ii)配列番号5のアミノ酸配列を含むHVR−L2及び(iii)配列番号6のアミノ酸配列を含むHVR−L3を含むVLドメイン;又は
B)(a)(i)配列番号9のアミノ酸配列を含むHVR−H1、(ii)配列番号10のアミノ酸配列を含むHVR−H2及び(iii)配列番号11から選択されるアミノ酸配列を含むHVR−H3を含むVHドメインと、(b)(i)配列番号12のアミノ酸配列を含むHVR−L1;(ii)配列番号13のアミノ酸配列を含むHVR−L2及び(iii)配列番号14のアミノ酸配列を含むHVR−L3を含むVLドメイン;又は
C)(a)(i)配列番号17のアミノ酸配列を含むHVR−H1;(ii)配列番号18のアミノ酸配列を含むHVR−H2;及び(iii)配列番号11から選択されるアミノ酸配列を含むHVR−H3を含むVHドメインと、(b)(i)配列番号20のアミノ酸配列を含むHVR−L1;(ii)配列番号21のアミノ酸配列を含むHVR−L2;及び(iii)配列番号22のアミノ酸配列を含むHVR−L3を含むVLドメイン;又は
D)a)(i)配列番号25のアミノ酸配列を含むHVR−H1;(ii)配列番号26のアミノ酸配列を含むHVR−H2;及び(iii)配列番号27から選択されるアミノ酸配列を含むHVR−H3を含むVHドメインと、(b)(i)配列番号28のアミノ酸配列を含むHVR−L1;(ii)配列番号29のアミノ酸配列を含むHVR−L2;及び(iii)配列番号30のアミノ酸配列を含むHVR−L3を含むVLドメイン;又は
E)(a)(i)配列番号33のアミノ酸配列を含むHVR−H1;(ii)配列番号34のアミノ酸配列を含むHVR−H2;及び(iii)配列番号35から選択されるアミノ酸配列を含むHVR−H3を含むVHドメインと、(b)(i)配列番号36のアミノ酸配列を含むHVR−L1;(ii)配列番号37のアミノ酸配列を含むHVR−L2;及び(iii)配列番号38のアミノ酸配列を含むHVR−L3を含むVLドメインと
を含む抗体をさらに提供する。
i)配列番号7のVH配列と配列番号8のVL配列とを含むか、
ii)配列番号15のVH配列と配列番号16のVL配列とを含むか、
iii)配列番号23のVH配列と配列番号24のVL配列とを含むか、
iv)配列番号31のVH配列と配列番号32のVL配列とを含むか、又は
v)配列番号39のVH配列と配列番号40のVL配列とを含む
抗体をさらに提供する。
i)LAG3への結合について、配列番号7のアミノ酸配列を持つVHと配列番号8のアミノ酸配列を持つVLとを含む抗LAG3抗体と競合し、且つ/又は
ii)ヒト及びカニクイザルLAG3に結合し、且つ/又は
iii)ヒトA375腫瘍細胞で発現したMHC−IIの結合を阻害し、且つ/又は
iv)混合リンパ球反応(mMLR)アッセイでグランザイムB又はIL−2の放出を増加させる
抗体をさらに提供する。
(a)アミノ酸残基26〜32(L1)、50〜52(L2)、91〜96(L3)、26〜32(H1)、53〜55(H2)、及び96〜101(H3)に生じる超可変ループ(Chothia and Lesk, J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987));
(b)アミノ酸残基24〜34(L1)、50〜56(L2)、89〜97(L3)、31〜35b(H1)、50〜65(H2)、及び95〜102(H3)に生じるCDR(Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (1991));
(c)アミノ酸残基27c〜36(L1)、46〜55(L2)、89〜96(L3)、30〜35b(H1)、47〜58(H2)、及び93−101(H3)に生じる抗原コンタクト(MacCallum et al. J. Mol. Biol. 262: 732-745 (1996));及び
(d)HVRアミノ酸残基46〜56(L2)、47〜56(L2)、48〜56(L2)、49〜56(L2)、26〜35(H1)、26〜35b(H1)、49〜65(H2)、93〜102(H3)、及び94〜102(H3)を含む、(a)、(b)、及び/又は(c)の組み合わせ
を含む。
一態様において、本発明は、LAG3に結合する単離された抗体を提供する。
特定の実施態様では、以下の抗LAG3抗体が提供される。
i)LAG3への結合について、配列番号7のアミノ酸配列を持つVHと配列番号8のアミノ酸配列を持つVLとを含む抗LAG3抗体(aLAG3(0414)のVH及びVLを含む)と競合する抗体、及び/又は
ii)ヒト及びカニクイザルLAG3に結合する抗体、及び/又は
iii)ヒトA375腫瘍細胞で発現したMHC−IIの結合を阻害する抗体、及び/又は
iv)(実施例3に示すように)混合リンパ球反応(mMLR)アッセイでグランザイムB又はIL−2の放出を増加させる
抗体。
ある実施態様において、本明細書で提供される抗体は、≦1μM、≦100nM、≦10nM、≦1nM、≦0.1nM、≦0.01nM又は≦0.001nM(例えば10−8M以下、例えば10−8M〜10−13M、例えば10−9M〜10−13M)の解離定数(Kd)を有する。
特定の実施態様において、本明細書に提供される抗体は、抗体断片である。「抗体断片」という用語は、抗原に特異的に結合する能力を保持する、インタクトな抗体の一部分を含むインタクトな抗体以外の分子を指す。抗体断片の例には、限定されないが、Fv、Fab、Fab’、Fab’−SH、F(ab’)2、Fv、一本鎖Fab(scFab);一本鎖可変断片(scFv)、及び単一ドメイン抗体(dAb)が含まれる。特定の抗体断片の総説については、Holliger及びHudson,Nature Biotechnology 23:1126−1136(2005)を参照されたい。
特定の実施態様では、本明細書で提供される抗体は、キメラ抗体である。いくつかのキメラ抗体が、例えば米国特許第4816567号及びMorrisonら,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,81:6851−6855(1984)に記載されている。一例として、キメラ抗体は、非ヒト可変領域(例えば、マウス、ラット、ハムスター、ウサギ又は非ヒト霊長類(サルなど)由来の可変領域)とヒト定常領域とを含む。さらなる例として、キメラ抗体は、クラス又はサブクラスが親抗体のものから変更されている「クラススイッチ」抗体である。キメラ抗体には、その抗原結合断片も含まれる。
ある実施態様において、本明細書で提供される抗体は、ヒト抗体である。ヒト抗体は、当技術分野において既知の様々な技術を用いて生産することができる。ヒト抗体は、van Dijk及びvan de Winkel,Curr.Opin.Pharmacol.5:368−74(2001)、並びにLonberg,Curr.Opin.Immunol.20:450−459(2008)に一般的に記載されている。
本発明の抗体は、所望の活性(複数可)を有する抗体についてコンビナトリアルライブラリーをスクリーニングすることによって単離することができる。コンビナトリアルライブラリーをスクリーニングするための方法は、例えばLernerら,Nature Reviews 16:498−508(2016)に総説されている。例えば、ファージディスプレイライブラリーを作成して所望の結合特性を有する抗体の当該ライブラリーをスクリーニングするための様々な方法が、当技術分野で知られている。当該方法は、例えばFrenzelら,mAbs 8:1177−1194(2016);Bazanら,Human Vaccines and Immunotherapeutics 8:1817−1828(2012)及びZhaoら,Critical Reviews in Biotechnology 36:276−289(2016)、及びHoogenboomら,Methods in Molecular Biology 178:1−37(O’Brien et al., ed., Human Press, Totowa, NJ, 2001)、並びにMarks及びBradbury,Methods in Molecular Biology 248:161−175(Lo, ed., Human Press, Totowa, NJ, 2003)に総説されている。
特定の実施態様では、本明細書で提供される抗体は、多重特異性抗体、例えば二重特異性抗体である。多重特異性抗体は、少なくとも2つの異なる部位、すなわち異なる抗原上の異なるエピトープ又は同じ抗原上の異なるエピトープに対する結合特異性を有するモノクローナル抗体である。特定の実施態様では、多重特異性抗体は、3つ以上の結合特異性を有する。特定の実施態様において、結合特異性の1つはLAG3に対してであり、その他(2つ以上)の特異性は他の任意の抗原に対するものである。ある実施態様において、二重特異性抗体は、LAG3の2つ(又はそれ以上)の異なるエピトープに結合することができる。多重特異性(例えば二重特異性)抗体はまた、LAG3を発現する細胞に細胞傷害性剤又は細胞を限局化するために用いることもできる。多重特異性抗体は、完全長抗体又は抗体断片として調製することができる。
特定の実施態様では、本明細書で提供されている抗体のアミノ酸配列バリアントが企図されている。例えば、抗体の結合アフィニティー及び/又は他の生物学的特性を改善することが望まれ得る。抗体のアミノ酸配列バリアントは、抗体をコードするヌクレオチド配列に適切な改変を導入することにより、又はペプチド合成により調製することができる。このような改変には、例えば、抗体のアミノ酸配列内の残基からの欠失、及び/又は該残基への挿入、及び/又は該残基の置換が含まれる。削除、挿入、及び置換の任意の組み合わせを行って、最終コンストラクトに到達することができるが、但し、これは最終コンストラクトが所望の特性、例えば抗原結合を有する場合に限る。
ある実施態様では、1つ以上のアミノ酸置換を有する抗体バリアントが提供される。置換変異誘発の対象部位には、HVR及びFRが含まれる。保存的置換は、表1の「好ましい置換」の見出しの下に示されている。より実質的な変更を、表1の「例示的置換」の見出しの下に示し、アミノ酸側鎖のクラスに従って下記にさらに説明する。アミノ酸置換を目的の抗体に導入することができ、その産物は、所望の活性、例えば抗原結合の保持/増強、免疫原性の低下、又はADCC若しくはCDCの改善についてスクリーニングすることができる。
アミノ酸は以下の共通の側鎖特性に従ってグループ化することができる。
(1)疎水性:ノルロイシン,Met,Ala,Val,Leu,Ile;
(2)中性の親水性:Cys,Ser,Thr,Asn,Gln;
(3)酸性:Asp、Glu
(4)塩基性:His,Lys,Arg;
(5)鎖配向に影響する残基:Gly,Pro;
(6)芳香族:Trp、Tyr、Phe
ある実施態様において、本明細書で提供される抗体は、抗体がグリコシル化される程度を増大又は低下させるように変更される。グリコシル化部位の抗体への付加又は削除は、1つ以上のグリコシル化部位が創出又は除去されるようにアミノ酸配列を変更することにより、簡便に達成することができる。
ある実施態様において、本明細書で提供される抗体のFc領域に1つ以上のアミノ酸修飾を導入し、それによりFc領域バリアントを生成することができる。Fc領域バリアントは、1つ以上のアミノ酸位置でアミノ酸修飾(例えば置換)を含むヒトFc領域配列(例えばヒトIgG1、IgG2、IgG3又はIgG4のFc領域)を含み得る。
抗体は、例えば米国特許第4816567号に記載されているような組換え方法及び組成物を用いて製造することができる。これらの方法のために、抗体をコードする1つ以上の単離された核酸が提供される。
− ジスルフィド結合した2つの同一の軽鎖と2つの同一の重鎖から構成される抗体又はその断面を含むVHとVLの場合、
(1)抗体のVLを含むアミノ酸配列と抗体のVHを含むアミノ酸配列とをコードする核酸を含むベクター、又は
(2)抗体のVLを含むアミノ酸配列をコードする核酸を含む第1のベクターと、抗体のVHを含むアミノ酸配列をコードする核酸を含む第2のベクター;
− ヘテロ二量体重鎖を持つ二重特異性抗体の場合、
(1)一方が抗体の第1のVLを含み他方が第1のVHを含むアミノ酸配列をコードする第1の核酸対を含む第1の核酸対を含む第1のベクターと、一方が抗体の第2のVLを含み他方が第2のVHを含むアミノ酸配列をコードする第2の核酸対とを含む第2のベクター;又は
(2)可変ドメインの1つ(好ましくは軽鎖可変ドメイン)を含むアミノ酸配列をコードする第1の核酸を含む第1のベクター、一方が軽鎖可変ドメインを含み他方が第1の重鎖可変ドメインを含むアミノ酸配列をコードする核酸対を含む第2のベクター、及び一方が、第2のベクターにあるように、対応する他方の軽鎖可変ドメインを含みもう一方は第2の重鎖可変ドメインを含むアミノ酸配列をコードする核酸対を含む第3のベクター、又は
(3)抗体の第1のVLを含むアミノ酸配列をコードする核酸を含む第1のベクター、抗体の第1のVHを含むアミノ酸配列をコードする核酸を含む第2のベクター、抗体の第2のVLを含むアミノ酸配列をコードする核酸を含む第3のベクター、及び抗体の第2のVHを含むアミノ酸配列をコードする核酸を含む第4のベクター。
本明細書で提供される抗LAG3抗体が、同定され、当技術分野で既知の様々なアッセイによってその物理的/化学的性質及び/又は生物学的活性について同定、スクリーニング又は特徴付けされ得る。
一態様において、本発明の抗体は、例えばELISA、ウエスタンブロットなどの周知の方法により、その抗原結合活性について試験される。
一態様では、アッセイは、生物学的活性を有するその抗(LAG3)抗体(anti-LAG3 antibodies thereof)を同定するために提供される。生物学的活性には、混合リンパ球反応(mMLR)assaにおけるヒトCD4 T細胞による細胞傷害性グランザイムB放出及びIL−2分泌に対する抗LAG3抗体(単独又は抗PDL1抗体との組み合わせ)の効果、又はヒトCD4 T細胞によるグランザイムBのTreg抑制及びIFN−γ放出に対する抗LAG3抗体の効果、又は抗LAG3抗体によるヒトA375腫瘍細胞で発現したMHC−IIへのLAG−3結合の阻害が含まれ得る。in vivo及び/又はin vitroでこのような生物学的活性を有する抗体が提供される。
特定の実施態様では、本明細書において提供される抗LAG3抗体のいずれもが、生物学的試料中のLAG3の存在を検出するために有用である。本明細書で使用する「検出」という用語は、定量的又は定性的検出を包含する。特定の実施態様において、生物学的試料は、細胞又は組織を含む。
本明細書に記載の抗LAG3抗体の薬学的製剤は、所望の程度の純度を有する当該抗体を1種以上の任意選択的な薬学的に許容される担体と混合することによって(Remington’s Pharmaceutical Sciencesth 16th edition, Osol, A. Ed. (1980) edition, Osol, A. Ed. (1980))、凍結乾燥製剤又は水溶液の形態に調製される。通常、薬学的に許容される担体は、用いられる用量及び濃度でレシピエントに対して非毒性であり、限定されるものではないが、リン酸、クエン酸、及び他の有機酸等のバッファー;アスコルビン酸及びメチオニンを含む酸化防止剤;防腐剤(例えばオクタデシルジメチオルベンジルアンモニウムクロリド;ヘキサメトニウムクロリド;ベンザルコニウムクロリド;ベンゼトニウムクロリド、フェノール、ブチル又はベンジルアルコール;メチル又はプロピルパラベンなどのアルキルパラベン;カテコール;レゾルシノール;シクロヘキサノール;3−ペンタノール;及びm−クレゾール);低分子量(約10残基未満)のポリペプチド;血清アルブミン、ゼラチン又は免疫グロブリン等のタンパク質;ポリビニルピロリドンなどの親水性ポリマー;グリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アルギニン又はリジン等のアミノ酸;グルコース、マンノース又はデキストリンを含む単糖類、二糖類、及びその他の糖質;EDTAなどのキレート剤;スクロース、マンニトール、トレハロース又はソルビトール等の糖;ナトリウムなどの塩形成対イオン;金属錯体(例えばZn−タンパク質錯体);及び/又はポリエチレングリコール(PEG)などの非イオン性界面活性剤が含まれる。本明細書における例示的な薬学的に許容される担体には、可溶性の中性活性ヒアルロニダーゼ糖タンパク質(sHASEGP)などの介在性薬物分散剤、例えばrHuPH20(HYLENEX(登録商標)、Baxter International社)などのヒト可溶性PH−20ヒアルロニダーゼ糖タンパク質がさらに含まれる。rHuPH20を含む特定の例示的なsHASEGP及び使用法については、米国特許出願公開第2005/0260186号及び同第2006/0104968号に記載されている。一態様において、sHASEGPは、コンドロイチナーゼなどの1種以上のさらなるグリコサミノグリカナーゼと組み合わせられる。
本明細書に提供される抗LAG3抗体のいずれも、治療方法において使用され得る。
本発明の別の態様では、上述した障害の治療、予防及び/又は診断に有用な物質を含有する製造品が提供される。製造品は、容器と、容器に貼られているか又は付随しているラベル又は添付文書とを備える。好適な容器には、例えば瓶、バイアル、シリンジ、IV輸液バッグ等が含まれる。容器はガラス又はプラスチックなどの様々な材料から形成され得る。容器は、病状の治療、予防及び/又は診断に効果的である、単独の又は別の組成物と併用の組成物を収容し、滅菌のアクセスポートを有し得る(例えば、容器は皮下注射針で貫通可能なストッパーを有する静脈内溶液バッグ又はバイアルであってもよい)。該組成物中の少なくとも1種の活性剤は、本発明の抗体である。ラベル又は添付文書は、最適な病状の治療のために該組成物が使用されることを示している。さらに、製造品は、(a)本発明の抗体を含む組成物が中に収容されている第1の容器;及び(b)さらなる細胞傷害性又はその他の治療剤を含む組成物が中に収容されている第2の容器を備え得る。本発明の本実施態様における製造品は、組成物が特定の病状を治療するために使用できることを示す添付文書をさらに備えてもよい。代替的に又は追加的に、製造品は、薬学的に許容されるバッファー(例えば注射用静菌水(BWFI)、リン酸緩衝生理食塩水、リンゲル液、及びデキストロース溶液)を収容する第2(又は第3)の容器をさらに備えてもよい。製造品は、他のバッファー、希釈剤、フィルター、針及びシリンジを含む、商業的及びユーザーの観点から望ましい他の材料をさらに備えてもよい。
1)aLAG3(0403)
配列番号15:VH
EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFDDYTMHWVRQAPGKGLEWVSLVSWDGGGTYYTNSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYFCAKAITDTSLYGYDYWGQGILVTVSS
配列番号16:VH
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGNAPKLLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQTYSTPLTFGGGTKVEIK
2)aLAG3(0411)
配列番号23:VH
EVHLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFIVDDYTMNWVRQAPGKGLEWVSVISWDGGATYYADSVKGRFTISRDDFKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKGLTDDTLYGSDYWGQGTLVTVSS
配列番号24:VL
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSIVSYLNWYQQKPGKAPKLLIYASSSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQTYSTPLTFGGGTKVEIK
3)aLAG3(0414)
配列番号7:VH
EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFIFDDYTMNWVRQAPGKGLEWVAVISWDGGGTYYTDSVKGRFTISRDDFKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKGLTDTTLYGSDYWGQGTLVTVSS
配列番号8:VL
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYAASTLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQTYSSPLTFGGGTKVEIK
4)aLAG3(0416)
配列番号39:VH
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLACAASGFTFSDYAMSWVRQAPGKGLEWVSGIDNSGYYTYYTDSVKGRFTISRDDVKNTLYLQMNSLRAEDTAVYLCTKTHSGLIVNDAFDIWGQGTMVTVSS
配列番号40:VL
DIQLTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYDASSLESGVPSRFSGSGSGTDATLTISSLQPEDFATYYCQQSYSTPLTFGGGTKVEIK
5) aLAG3(0417)
配列番号31:VH
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLACAASGFTFSDYAMSWVRQAPGKGLEWVSGIDNSGYYTYYTDSVKGRFTISRDDVKNTLYLQMNSLRAEDTAVYLCTKTHSGLIVNDAFDIWGQGTMVTVSS
配列番号32:VL
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQTYSTPLTFGGGTKVEIK
1.ヒトLAG3に結合する単離された抗体であって、
A)(a)配列番号1のアミノ酸配列を含むHVR−H1;(b)配列番号2のアミノ酸配列を含むHVR−H2;(c)配列番号3のアミノ酸配列を含むHVR−H3;(d)配列番号4のアミノ酸配列を含むHVR−L1;(e)配列番号5のアミノ酸配列を含むHVR−L2;及び(f)配列番号6のアミノ酸配列を含むHVR−L3、又は
B)(a)配列番号9のアミノ酸配列を含むHVR−H1;(b)配列番号10のアミノ酸配列を含むHVR−H2;(c)配列番号11のアミノ酸配列を含むHVR−H3;(d)配列番号12のアミノ酸配列を含むHVR−L1;(e)配列番号13のアミノ酸配列を含むHVR−L2;及び(f)配列番号14のアミノ酸配列を含むHVR−L3、又は
C)(a)配列番号17のアミノ酸配列を含むHVR−H1;(b)配列番号18のアミノ酸配列を含むHVR−H2;(c)配列番号19のアミノ酸配列を含むHVR−H3;(d)配列番号20のアミノ酸配列を含むHVR−L1;(e)配列番号21のアミノ酸配列を含むHVR−L2;及び(f)配列番号22のアミノ酸配列を含むHVR−L3、又は
D)(a)配列番号25のアミノ酸配列を含むHVR−H1;(b)配列番号26のアミノ酸配列を含むHVR−H2;(c)配列番号27のアミノ酸配列を含むHVR−H3;(d)配列番号28のアミノ酸配列を含むHVR−L1;(e)配列番号29のアミノ酸配列を含むHVR−L2;及び(f)配列番号30のアミノ酸配列を含むHVR−L3、又は
E)(a)配列番号33のアミノ酸配列を含むHVR−H1;(b)配列番号34のアミノ酸配列を含むHVR−H2;(c)配列番号35のアミノ酸配列を含むHVR−H3;(d)配列番号36のアミノ酸配列を含むHVR−L1;(e)配列番号37のアミノ酸配列を含むHVR−L2;及び(f)配列番号38のアミノ酸配列を含むHVR−L3
を含む抗体。
A)(a)(i)配列番号1のアミノ酸配列を含むHVR−H1、(ii)配列番号2のアミノ酸配列を含むHVR−H2及び(iii)配列番号3から選択されるアミノ酸配列を含むHVR−H3を含むVHドメインと、(b)(i)配列番号4のアミノ酸配列を含むHVR−L1;(ii)配列番号5のアミノ酸配列を含むHVR−L2及び(iii)配列番号6のアミノ酸配列を含むHVR−L3を含むVLドメイン;又は
B)(a)(i)配列番号9のアミノ酸配列を含むHVR−H1、(ii)配列番号10のアミノ酸配列を含むHVR−H2及び(iii)配列番号11から選択されるアミノ酸配列を含むHVR−H3を含むVHドメインと、(b)(i)配列番号12のアミノ酸配列を含むHVR−L1;(ii)配列番号13のアミノ酸配列を含むHVR−L2及び(iii)配列番号14のアミノ酸配列を含むHVR−L3を含むVLドメイン;又は
C)(a)(i)配列番号17のアミノ酸配列を含むHVR−H1;(ii)配列番号18のアミノ酸配列を含むHVR−H2;及び(iii)配列番号19から選択されるアミノ酸配列を含むHVR−H3を含むVHドメインと、(b)(i)配列番号20のアミノ酸配列を含むHVR−L1;(ii)配列番号21のアミノ酸配列を含むHVR−L2;及び(iii)配列番号22のアミノ酸配列を含むHVR−L3を含むVLドメイン;又は
D)(a)(i)配列番号25のアミノ酸配列を含むHVR−H1;(ii)配列番号26のアミノ酸配列を含むHVR−H2;及び(iii)配列番号27から選択されるアミノ酸配列を含むHVR−H3を含むVHドメインと、(b)(i)配列番号28のアミノ酸配列を含むHVR−L1;(ii)配列番号29のアミノ酸配列を含むHVR−L2;及び(iii)配列番号30のアミノ酸配列を含むHVR−L3を含むVLドメイン;又は
E)(a)(i)配列番号33のアミノ酸配列を含むHVR−H1;(ii)配列番号34のアミノ酸配列を含むHVR−H2;及び(iii)配列番号35から選択されるアミノ酸配列を含むHVR−H3を含むVHドメインと、(b)(i)配列番号36のアミノ酸配列を含むHVR−L1;(ii)配列番号37のアミノ酸配列を含むHVR−L2;及び(iii)配列番号38のアミノ酸配列を含むHVR−L3を含むVLドメインと
を含む抗体。
i)配列番号7の配列と比較して95%、96%、97%又は98%のアミノ酸配列同一性を有するVHドメインと、配列番号8の配列と比較して95%、96%、97%又は98%のアミノ酸配列同一性を有するVLドメインとを含むか、
ii)配列番号15の配列と比較して95%、96%、97%又は98%のアミノ酸配列同一性を有するVHドメインと、配列番号16の配列と比較して95%、96%、97%又は98%のアミノ酸配列同一性を有するVLドメインとを含むか、
iii)配列番号23の配列と比較して95%、96%、97%又は98%のアミノ酸配列同一性を有するVHドメインと、配列番号24の配列と比較して95%、96%、97%又は98%のアミノ酸配列同一性を有するVLドメインとを含むか、
iv)配列番号31の配列と比較して95%、96%、97%又は98%のアミノ酸配列同一性を有するVHドメインと、配列番号32の配列と比較して95%、96%、97%又は98%のアミノ酸配列同一性を有するVLドメインとを含むか、又は
v)配列番号39の配列と比較して95%、96%、97%又は98%のアミノ酸配列同一性を有するVHドメインと、配列番号40の配列と比較して95%、96%、97%又は98%のアミノ酸配列同一性を有するVLドメインとを含む抗体。
A)(a)配列番号7の配列と比較して95%、96%、97%又は98%のアミノ酸配列同一性を有するVHドメイン及び配列番号8の配列と比較して95%、96%、97%又は98%のアミノ酸配列同一性を有するVLドメインであって、VHドメインが(i)配列番号1のアミノ酸配列を含むHVR−H1、(ii)配列番号2のアミノ酸配列を含むHVR−H2及び(iii)配列番号3から選択されるアミノ酸配列を含むHVR−H3を含み、(b)VLドメインが(i)配列番号4のアミノ酸配列を含むHVR−L1、(ii)配列番号5のアミノ酸配列を含むHVR−L2及び(iii)配列番号6のアミノ酸配列を含むHVR−L3を含む、
VHドメイン及びVLドメインを含むか、
B)(a)配列番号15の配列と比較して95%、96%、97%又は98%のアミノ酸配列同一性を有するVHドメイン及び配列番号16の配列と比較して95%、96%、97%又は98%のアミノ酸配列同一性を有するVLドメインであって、VHドメインが(i)配列番号9のアミノ酸配列を含むHVR−H1、(ii)配列番号10のアミノ酸配列を含むHVR−H2及び(iii)配列番号11から選択されるアミノ酸配列を含むHVR−H3を含み、(b)VHドメインが(i)配列番号12のアミノ酸配列を含むHVR−L1、(ii)配列番号13のアミノ酸配列を含むHVR−L2及び(iii)配列番号14のアミノ酸配列を含むHVR−L3を含む、
VHドメイン及びVLドメインを含むか、
C)(a)配列番号23の配列と比較して95%、96%、97%又は98%のアミノ酸配列同一性を有するVHドメイン及び配列番号24の配列と比較して95%、96%、97%又は98%のアミノ酸配列同一性を有するVLドメインであって、VHドメインが(i)配列番号17のアミノ酸配列を含むHVR−H1、(ii)配列番号18のアミノ酸配列を含むHVR−H2及び(iii)配列番号19から選択されるアミノ酸配列を含むHVR−H3を含み、(b)VLドメインが(i)配列番号20のアミノ酸配列を含むHVR−L1、(ii)配列番号21のアミノ酸配列を含むHVR−L2及び(iii)配列番号22のアミノ酸配列を含むHVR−L3を含む、
VHドメイン及びVLドメインを含むか、
D)(a)配列番号31の配列と比較して95%、96%、97%又は98%のアミノ酸配列同一性を有するVHドメイン及び配列番号32の配列と比較して95%、96%、97%又は98%のアミノ酸配列同一性を有するVLドメインであって、VHドメインが(i)配列番号25のアミノ酸配列を含むHVR−H1、(ii)配列番号26のアミノ酸配列を含むHVR−H2及び(iii)配列番号27から選択されるアミノ酸配列を含むHVR−H3を含み、(b)VLドメインが(i)配列番号28のアミノ酸配列を含むHVR−L1、(ii)配列番号29のアミノ酸配列を含むHVR−L2及び(iii)配列番号30のアミノ酸配列を含むHVR−L3を含む、
VHドメイン及びVLドメインを含むか、
E)(a)配列番号39の配列と比較して95%、96%、97%又は98%のアミノ酸配列同一性を有するVHドメイン及び配列番号40の配列と比較して95%、96%、97%又は98%のアミノ酸配列同一性を有するVLドメインであって、VHドメインが(i)配列番号33のアミノ酸配列を含むHVR−H1、(ii)配列番号34のアミノ酸配列を含むHVR−H2及び(iii)配列番号35から選択されるアミノ酸配列を含むHVR−H3を含み、(b)VLドメインが(i)配列番号36のアミノ酸配列を含むHVR−L1、(ii)配列番号37のアミノ酸配列を含むHVR−L2及び(iii)配列番号38のアミノ酸配列を含むHVR−L3を含む、
VHドメイン及びVLドメインを含む、抗体。
i)配列番号7のVH配列と配列番号8のVL配列とを含むか、
ii)配列番号15のVH配列と配列番号16のVL配列とを含むか、
iii)配列番号23のVH配列と配列番号24のVL配列とを含むか、
iv)配列番号31のVH配列と配列番号32のVL配列とを含むか、又は
v)配列番号39のVH配列と配列番号40のVL配列とを含む、
抗体。
i)LAG3への結合について、配列番号7のアミノ酸配列を持つVHと配列番号8のアミノ酸配列を持つVLとを含む抗LAG3抗体と競合する
ii)ヒト及びカニクイザルLAG3に結合する
iii)ヒトA375腫瘍細胞で発現したMHC−IIの結合を阻害する
iv)(実施例3に示すように)混合リンパ球反応(mMLR)アッセイでグランザイムB又はIL−2の放出を増加させる
のうちの1つ以上によって独立に特徴付けられる抗体。
i)LAG3への結合について、配列番号7のアミノ酸配列を持つVHと配列番号8のアミノ酸配列を持つVLとを含む抗LAG3抗体と競合し、且つ/又は
ii)ヒト及びカニクイザルLAG3に結合し、且つ/又は
iii)ヒトA375腫瘍細胞で発現したMHC−IIの結合を阻害し、且つ/又は
iv)(実施例3に示すように)混合リンパ球反応(mMLR)アッセイでグランザイムB又はIL−2の放出を増加させる
抗体。
以下は、本発明の方法及び組成物の実施例である。上に提供された一般的な説明を前提として、他の様々な実施態様が実施されうることが理解される。
ウサギの免疫化
ヒト化抗体レパートリーを発現するロシュ独自のトランスジェニックウサギを、プラスミドDNAを発現するLAG3で免疫した。
96ウェルNUNC Maxisorpプレート上に、100μl/ウェルPBSでヒト組換えLAG3タンパク質2μg/mlを固定し、その後に、プレートを2%Crotein Cを含む200μl/ウェルPBS中でブロッキング;抗血清の段階希釈液を、2回繰り返して0.5%Crotein Cを含む100μl/ウェルPBSに塗布;それぞれが0.5%Crotein Cを含む100μl/ウェルPBSで希釈された(1)HRPコンジュゲートロバ抗ウサギIgG抗体(Jackson Immunoresearch/Dianova 711−036−152;1/16 000)、又は(2)HRPコンジュゲートウサギ抗ヒトIgG抗体(Pierce/Thermo Scientific 31423;1/5000)、又は(3)ビオチン化ヤギ抗ヒトカッパ抗体(Southern Biotech/Biozol 2063−08,1/5 000)のいずれか及びストレプトアビジン−HRPで検出する工程が続いた。全工程について、プレートを37℃で1時間インキュベートした。各工程の合間に、0.05%Tween 20を含むPBSでプレートを3回洗浄した。シグナルは、BM Blue POD可溶性基質(ロッシュ)100μl/ウェルの添加により現れ、1M HClを100μl/ウェル添加することによって停止された。690nmを基準として、450nmで吸光度を読み取った。力価は、最大シグナルの半分をもたらす血清の希釈と定義された。
免疫トランスジェニックウサギの血液試料を採取した。全血を含むEDTAを1×PBS(オーストリア、パッシングのPAA社)で2倍希釈した後、製造業者の仕様書に従って、哺乳動物のリンパ球を用いる密度遠心分離を行った。PBMCを1×PBSで2回洗浄した。
10%FCS(米国ユタ州ローガンのHyclone社)、2mMグルタミン、1%ペニシリン/ストレプトマイシン溶液(オーストリア、パッシングのPAA社)、2mM ピルピン酸ナトリウム、10mM HEPES(ドイツ、アイデンバッハのPAN Biotech社)及び0,05mM b−メルカプトエタノール(スコットランド、ペイズリーのGibco社)を補充したRPMI 1640(ドイツ、アイデンバッハのPan Biotech社)を使用した。
滅菌細胞培養6ウェルプレートを、炭酸バッファー(0,1M重炭酸ナトリウム、34mM炭酸水素二ナトリウム(Disodiumhydrogencarbonate)、pH9,55)中、ヒトFc部分(2μg/ml)にコンジュゲートしたヒトLAG3 ECDで、4℃で一晩コーティングした。プレートを使用前に、滅菌PBSで3回洗浄した。
(a)CHO細胞のコンフルエントな単層で覆われた滅菌6ウェルプレート(細胞培養グレード)を使用して、非特異的接着及び非特異的結合リンパ球を介してマクロファージ/単球を枯渇させた。
(b)空の滅菌6ウェルプレート(細胞培養グレード)を使用して、マクロファージ、単球及びその他の細胞を非特異的接着により枯渇させた。
PBMC試料の半分を(a)に、残りの半分を(b)に使用した。
各ウェルに最大で4mlの培地と最大6×106の免疫ウサギからのPBMCを充填し、インキュベーター内で37℃で1時間結合させた。上清中の細胞(末梢血リンパ球(PBL))を抗原パニング工程に使用した。
タンパク質抗原
LAG3−ECD−huFcタンパク質でコーティングされた6ウェル組織培養プレートに、空の6ウェルプレートを使用した枯渇工程からの培地4mlあたり最大6×10e6 PBLを播種し、インキュベーター内で37℃で1時間結合させた。ウェルを慎重に1×PBSで1〜2回洗浄することにより、非接着細胞を除去した。インキュベーター内で37℃で10分間、トリプシンによって残りの粘着細胞を剥離した。トリプシン処理はEL−4 B5培地で停止させた。免疫蛍光染色まで細胞を氷上に保持した。
ヒトLAG3陽性CHO細胞の単層で覆われた6ウェル組織培養プレートに、CHOで覆われた6ウェルプレートを使用した枯渇工程からの培地4mlあたり最大6×106 PBLを播種し、インキュベーター内で37℃で1時間結合させた。ウェルを慎重に1×PBSで1〜2回洗浄することにより、非接着細胞を除去した。インキュベーター内で37℃で10分間、トリプシンによって残りの粘着細胞を剥離した。トリプシン処理はEL−4 B5培地で停止させた。免疫蛍光染色まで細胞を氷上に保持した。
抗IgG FITC(ドイツ、デュッセルドルフのAbD Serotec)及び抗huCk PE(ドイツ、ハンブルグのDianova)抗体を単一細胞ソーティングのために使用した。表面染色のために、枯渇及び濃縮(enrichment)工程からの細胞を、PBS中の抗IgG FITC及び抗huCk PE抗体と共にインキュベートし、4℃の暗所で45分間インキュベートした。染色後、PBMCを氷冷PBSで2回洗浄した。最後に、PBMCを氷冷PBSに再懸濁させ、すぐにFACS解析にかけた。5μg/mlの濃度のヨウ化プロピジウム(米国カリフォルニア州サンディエゴのBD Pharmingen社)をFACS解析の前に添加して、死細胞と生細胞を区別した。
コンピューターとFACSDivaソフトウェア(米国、BD Biosciences社)を装備したBecton Dickinson FACSAriaを単一細胞ソーティングに使用した。
ウサギB細胞の培養は、Seeberら(S Seeber et al. PLoS One 9 (2), e86184. 2014 Feb 04)によって説明されている方法で実施した。簡単に言えば、単一のソートされたウサギB細胞を、96ウェルプレートで、Pansorbin細胞(1:100000)(Calbiochem(ドイツ、ダルムシュタットのメルク社))、5%ウサギ胸腺細胞上清(ドイツ、ベルンリートのMicroCoat社)及びガンマ線照射マウスEL−4 B5胸腺腫細胞(5×10e5細胞/ウェル)を含む200μl/ウェルEL−4 B5培地と共に、インキュベーター内で37℃で7日間インキュベートした。B細胞培養物の上清をスクリーニングのために除去し、残りの細胞をすぐに回収し、RLTバッファー(ドイツ、ヒルデンのQiagen)100μl中、−80℃で凍結させた。
[VドメインのPCR増幅]
NucleoSpin8/96 RNAキット(Macherey&Nagel;740709.4,740698)を使用して、製造業者のプロトコールに従い、B細胞ライセート(RLTバッファー−Qiagen−カタログ番号79216に再懸濁)から全RNAを調製した。60μlのRNaseフリー水でRNAを溶出した。6μのRNAを使用し、Superscript III First−Strand Synthesis SuperMix(Invitrogen 18080−400)と製造業者の指示書に従ってオリゴdTプライマーとを使用した逆転写酵素反応により、cDNAを生成した。全工程がHamilton ML Star Systemで実施された。4μlのcDNAを使用し、プライマーのrbHC.up及びrbHC.doを重鎖に、BcPCR_FHLC_leader.fw及びBcPCR_huCkappa.revを軽鎖に用いる、最終量50μlのAccuPrime Supermix(Invitrogen 12344−040)で、免疫グロブリン重鎖及び軽鎖可変領域(VH及びVL)を増幅した(表1.1)。全てのフォワードプライマーは(それぞれVH及びVLの)シグナルペプチドに特異的であったが、リバースプライマーは(それぞれVH及びVLの)定常領域に特異的であった。RbVHのPCR条件は次のとおり:94℃で5分間のホットスタート;94℃で20秒、70℃で20秒、68℃で45秒の35サイクル、及び68℃で7分間の最終伸展。HuVLのPCR条件は次のとおり:94℃で5分間のホットスタート;94℃で20秒、52℃で20秒、68℃で45秒の40サイクル、及び68℃で7分間の最終伸展。
8μlの50μl PCR溶液を48 E−Gel 2%(Invitrogen G8008−02)に充填した。製造業者のプロトコールに従いNucleoSpin Extract IIキット(Macherey&Nagel;740609250)を使用して陽性PCR反応物を洗浄し、50μlの溶出バッファーで溶出した。全洗浄工程がHamilton ML Star Systemで実施された。
ウサギモノクローナル二価抗体の組換え発現のために、VH又はVLをコードするPCR産物をオーバーハングクローニング法(RS Haun et al., Biotechniques (1992) 13, 515-518; MZ Li et al., Nature Methods (2007) 4, 251-256)によりcDNAとして発現ベクターにクローニングした。発現ベクターは、イントロンAを含む5’CMVプロモーターと、3’BGHポリアデニル化配列とからなる発現カセットを含有していた。発現カセットに加えて、プラスミドは、pUC18由来の複製起点と、大腸菌(E.coli)でのプラスミド増幅のためにアンピシリン耐性を付与するベータラクタマーゼ遺伝子とを含有していた。基本的なプラスミドの3つのバリアントを使用したが、1つは、VL領域を受け入れるヒトカッパLC定常領域を含みながら、VH領域を受け入れるように設計されたウサギIgG定常領域を含むプラスミドであった。
カッパ又はガンマ定常領域及びVL/VHインサートをコードする直鎖化発現プラスミドを、オーバーラッププライマーを使用するPCRで増幅した。
精製されたPCR産物は、一本鎖オーバーハングを生成するT4 DNAポリメラーゼとインキュベートされた。反応は、dCTP添加により停止された。
次の工程では、プラスミドとインサートを組み合わせて、部位特異的組換えを誘導するrecAとインキュベートした。組換えプラスミドを大腸菌に形質転換した。翌日、増殖したコロニーを採取し、プラスミド調製、制限分析、及びDNA配列シーケンシングにより正しい組み換えプラスミドについて試験した。
抗体発現のために、単離されたHC及びLCプラスミドを一時的にHEK293細胞にコトランスフェクトし、上清を1週間後に収集した。
Nunc maxisorpプレート(Nunc 464718)をタンパク質濃度800ng/mlの25μ/ウェルの組換えヒトLAG−3 Fcキメラタンパク質(R&D Systems、2319−L3)でコーティングし、4℃で一晩又は室温で1時間インキュベートした。洗浄後(PBSTバッファーで3×90μl/ウェル)、各ウェルを90μlのブロッキングバッファー(PBS+2% BSA+0.05% Tween 20)と共に室温で1時間インキュベートした。洗浄後(PBSTバッファーで3×90μl/ウェル)、1〜9μg/mlの濃度(OSEPバッファーで1:3希釈)の抗Lag3試料25μlを加え、室温で1時間インキュベートした。洗浄後(PBSTバッファーで3×90μl/ウェル)、ヤギ抗ヒトIg κ鎖抗体−HRPコンジュゲート(Milipore、AP502P)25μl/ウェルを1:2000希釈で添加し、室温で1時間インキュベートした。洗浄後(PBSTバッファーで3×90μl/ウェル)、TMB基質(ロッシュ、11835033001)25μl/ウェルを添加し、2〜10分間インキュベートした。測定は、370/492nmでTecan Safire 2装置で行われた。
25μl/ウェルのLag3細胞(Lag3を発現する組換えCHO細胞、10000細胞/ウェル)を、組織培養処理した384ウェルプレート(Corning、3701)に播種し、37℃で1日又は2日間インキュベートした。培地を除去した翌日、25μlの抗Lag3試料(OSEPバッファーでの1:3希釈液、6〜40nMの濃度で開始)を添加し、4℃で2時間インキュベートした。洗浄後(PBSTで1×90μl)、細胞を30μl/ウェルのグルタルアルデヒドを、最終濃度0,05%(Sigma カタログ番号G5882)まで、室温で10分間添加することにより、固定した。洗浄後(PBSTバッファーで3×90μl/ウェル)、ヤギ抗ヒトIg κ鎖抗体−HRPコンジュゲート(Milipore、AP502P)25μl/ウェルを1:1000希釈で添加し、室温で1時間インキュベートした。洗浄後(PBSTバッファーで3×90μl/ウェル)、TMB基質(ロッシュ、11835033001)25μl/ウェルを添加し、6〜10分間インキュベートした。測定は、370/492nmでTecan Safire 2装置で行われた。
表面プラズモン共鳴(SPR)ベースのアッセイを使用して、25℃での一価Fab断片である抗Lag3抗体とヒトFcタグ付きヒトLag3細胞外ドメイン(ECD)間の結合のカイネティックパラメーターを決定した。
したがって、「固定化ウィザード」を使用して、酢酸バッファーpH4.5で25μg/mlに希釈したニュートラアビジンを固定化することにより、C1バイオセンサーチップの2つのフローセルをBiacore T200で調製した。これにより、約1900RUの固定化レベルが得られた。その後、CaptureSelectTMビオチン抗IgG−Fc(ヒト)コンジュゲートを、ランニングバッファー(HBS−EP+、GEヘルスケア)での20μg/ml希釈液を用いニュートラアビジンに結合させた。
この方法自体は、サイクルごとに4つのコマンドで構成されていた。第1のコマンド:約46RUのhuLag3−Fcの捕捉(20秒、10μl/分)。第2のコマンド:試料を120秒間注入した後、流速30μll/分で1200秒間の解離。第3及び第4のコマンド:グリシン−HCl(pH1.5)を30秒間注入することによる再生。
次いで、各抗体Fab断片の希釈系列(3.13nM〜200nM、ランニングバッファーでの2倍希釈)及び追加のブランクサイクルを前述の方法を使用して測定した。その後、Biacore T200評価ソフトウェアを利用し、捕捉レベルが完全に再現可能ではなかったため、Rmaxフィットパラメーターを「ローカル」に設定した1:1ラングミュアフィットを適用することによって、カイネティック値を得た。結果を表2に示す。
表面プラズモン共鳴(SPR)ベースのアッセイを使用して、25℃での二価型aLag3バインダーとヒトLag3細胞外ドメイン(ECD)の間の相互作用の見かけの親和性を決定した。
したがって、Biacoreバイオセンサーチップは、標準のアミンカップリング条件を利用して、最小約800RUのP329G点突然変異特異的抗体を固定化することにより、Biacore T200で調製された。
その後、各サイクルで試料抗体を捕捉し、huLag3 ECD濃度系列(合計4つの濃度から成る)の1濃度をこの系に20分間適用し、その後1200秒間の解離を行った。その後、バイオセンサーチップが再生された。
結果として得られた実験データは、Ridgeview Diagnostics TraceDrawerソフトウェアが提供する「相互作用マップ」機能を使用して評価され、各試料の個々の見かけのアフィン結合寄与が計算された。
結果を表2に示す。
エピトープビニングは、表面プラズモン共鳴(SPR)ベースのアッセイを使用して実施された。したがって、aLag3バインダーは、Biacore T200装置でhuLag3に結合された。その後、先に形成されたaLag3バインダーである、huLag3複合体に対する他のバインダーのアクセシビリティーを評価した。
SA CAPキット(GEヘルスケア)を使用してこのアッセイを実施した。特に記載がない場合、SA CAPキットのマニュアルに従ってアッセイを行った。
ランには1つのサイクルタイプのみが含まれていた。ハイブリダイゼーション後、ビオチン化された、huFcタグ付きhuLag3の10nM希釈液を、センサーチップ上のストレプトアビジンに10μl/分の流速で20秒間結合させた。その後、ランニングバッファーで希釈した第1の200nM試料を30μl/分の流速で180秒間注入し、すぐに同じ条件下で第2の試料が続いた。その後、表面が再生された。
その後、試料を類似の競合パターンを持つ様々なエピトープグループに割り当てた。6.1RUの閾値を使用した2回目の注入の相対応答に基づいて、最初の大まかな分類が行われた。全ての値と決定は、センサーグラムの目視検査によって最終的に検証された。
結果を表2に示す。3つの主要なエピトープパターン(E1、E2、E3)が同定された。aLag3−0416とヒト化BAP 050はグループが同じであるが、互いに完全に阻害するわけではないため、サブグループE2bとE2cに割り当てられた。
表面にヒトLag3を組換え的に発現するHEK細胞を使用した結合分析に加えて、カニクイザルLag3陽性HEK細胞への結合も評価された。この実験では、先に一時的にカニクイザル−LAG−3をトランスフェクトした凍結HEK293F細胞を解凍し、遠心分離し、PBS/2%FBSを再補充した。1.5x105細胞/ウェルを96ウェルプレートに播種した。抗Lag3抗体を10μg/mlの最終正規化濃度まで加えた。参照用及びコントロールとして、自家蛍光及び陽性コントロール(Medarex 25F7)、並びにアイソタイプコントロール(シグマ社製huIgG1、カタログ番号#I5154、データは示していない)抗体を実験で調製および測定した。HEK細胞を示されている抗体と氷上で45分間インキュベートし、2%FBSを含む200μlの氷冷PBSバッファーで2回洗浄した後、二次抗体(APC標識ヤギ抗ヒトIgG−κ、Invitrogen、カタログ番号#MH10515)を添加し(FACS−Puffer/wellで1:50希釈)、氷上でさらに30分間インキュベートした。細胞を200μlの氷冷PBS/2%FBSバッファーで2回洗浄した後、最終的に試料を150μlのFACSバッファーに再懸濁させ、FACS CANTO−II HTSモジュールで結合を測定した。
以下の表に、カニクイザルLAG3を発現するHEK293細胞に対する様々な抗Lag3抗体の結合及び交差反応性を示す。結合により、陽性細胞のパーセンテージ又はシグナル強度の幾何平均(GeoMean)が得られる。
組換えLag3タンパク質、及び哺乳類細胞上で組換え的に発現されたLag3への結合後、活性化カニクイザルT細胞上で発現されたLag3への結合を評価/確認した。
カニクイザルT細胞又はPBMCの細胞表面に発現されたLag3に対する、新規に生成された抗Lag3抗体(ロシュのトランスジェニックウサギ由来)の結合特性は、FACS解析によって確認された。Lag3はナイーブT細胞では発現していないが、活性化の際に、及び/又は消耗したT細胞上ではアップレギュレートされる。よって、カニクイザル末梢血単核細胞(PBMC)を新鮮なカニクイザルの血液から調製し、その後CD3/CD28前処理(1μg/ml)によって2〜3日間活性化した。続いて、活性化細胞をLag3発現について分析した。簡単に言えば、1〜3×105個の活性化細胞を、示されている抗Lag3抗体及び最終濃度10μg/mlの各コントロール抗体で氷上で30〜60分間染色した。結合した抗Lag3抗体は、蛍光コンジュゲート抗ヒトIgG又は抗ウサギIgG二次抗体により検出された。染色後、細胞をPBS/2%FCSで2回洗浄し、FACS Fortessa(BD)で分析した。
次の表は、活性化カニクイザルPBMC内のLag3陽性細胞の割合をまとめたものである。
活性化されたカニクイザルT細胞では、全てのウサギ抗Lag3抗体がLag3+細胞への有意な結合を示した。これにより、新規に生成された全ての抗体は、ヒト抗Lag3参照抗体(例えばMDX25F7、BMS−986016など)と比較して陽性細胞のパーセンテージが増加したことを示した。
25μl/ウェルのA375細胞(10000細胞/ウェル)を、組織培養処理した384ウェルプレート(Corning、3701)に播種し、37℃で一晩インキュベートした。抗Lag3抗体を、3μg/mlの抗体濃度から開始してビオチン化Lag3(250ng/ml)を含む1:3希釈の細胞培養培地と共に1時間プレインキュベートした。播種した細胞を含むウェルから培地を除去した後、25μlの抗体−Lag3プレインキュベーション混合物をそのウェルに移し、4℃で2時間インキュベートした。洗浄後(PBSTで1×90μl)、細胞を30μl/ウェルのグルタルアルデヒドを、最終濃度0,05%(Sigma カタログ番号G5882)まで、室温で10分間添加することにより、固定した。洗浄後(PBSTバッファーで3×90μl/ウェル)、25μl/ウェルのポリ−HRP40−ストレプトアビジン(Fitzgerald、65R−S104PHRPx)を1:2000又は1:8000希釈で添加し、室温で1時間インキュベートした。洗浄後(PBSTバッファーで3×90μl/ウェル)、TMB基質(ロッシュ、11835033001)25μl/ウェルを添加し、2〜10分間インキュベートした。測定は、370/492nmでTecan Safire 2装置で行われた。
アッセイ原理
抗Lag3抗体のアンタゴニスト機能を研究するため、MHCII:Lag3競合アッセイを実施した。抗Lag3抗体とのプレインキュベーションの有無にかかわらず、社内で生成したビオチン化Lag3:Fc融合タンパク質で、MHCII+ ヒトA375細胞を染色した。この分析は、FACS競合実験で研究された:A375細胞(ATCC、#CRL−1619)を、EBSS(PAN、カタログ番号#P04−00509)、10%FBS、2mM L−グルタミン、1×NEAA及び1×ピルビン酸ナトリウムを補充したEMイーグル培地で2〜3継代培養した。全ての抗体を、FACSバッファーで希釈し、25μlで20μg/mlの最終濃度にした(96ウェルU底プレート)。社内で生成したビオチン化組換えLAG−3:Fc融合タンパク質25μlを最終濃度10μg/mlまで培地又は抗Lag3抗体又はコントロールに添加し、室温で30分間プレインキュベートした。A375細胞をPBSで洗浄し、PBS中3×106細胞/mlに調整した。96ウェルV底プレートに、1ウェルあたり100μlを播種した。プレートを遠心分離し、上清を除去した。次に、プレインキュベートしたLAG−3:Fc融合タンパク質/抗体混合物(50μl/ウェル)を細胞に加え、室温で1時間インキュベートした。この後、細胞を200μlのFACSバッファーで洗浄した。細胞MHCIIに結合したビオチン化Lag3:Fcタンパク質の検出のために、APCコンジュゲートヤギ抗ビオチン抗体を3μl/試料で使用し(Miltenyi Biotec、カタログ番号#130−090−856)、さらに10〜15分間インキュベートした。染色後、細胞を150μlのFACSバッファー(PBS/2%FBS)で再度洗浄し、U底プレートに移し、HTSモジュールを使用してFACS Canto−IIで分析した。
2種の抗Lag3抗体(クローン25F7及び26H10;Medarex)は陽性コントロールとして、ヒトIgG1(Sigma、カタログ番号#I5154)は適切なアイソタイプコントロールとして使用した。全ての抗体は、最終濃度10μg/mlで使用した。
下の表に示すのは、細胞上のMHC−IIへのLag3タンパク質の結合の阻害率を示すFACS解析の結果である(ブロッキング抗体の非存在下での最大値を参照し、減少した結合シグナルとして計算)。
これらのデータは、Lag3との機能的な相互作用と、試験された全ての抗体の細胞間相互作用の遮断をサポートしている。
抑制されたT細胞応答をin vitroで復元する際の新規抗Lag3抗体の中和効力を試験するために、市販のレポーターシステムを使用した。このシステムは、Lag3+ NFAT Jurkatエフェクター細胞(Promega、カタログ番号#CS194801)、MHC−II+ ラージ細胞(ATCC、#CLL−86)、及びスーパー抗原で構成されている。簡単に言えば、このレポーターシステムは、次の3つの工程に基づいている:(1)スーパー抗原誘導NFAT細胞活性化、(2)MHCII(ラージ細胞)とLag3+ NFAT Jurkatエフェクター細胞との間の阻害相互作用により媒介される活性化シグナルの阻害、(3)Lag3アンタゴニスト/中和aVH−Fc融合コンストラクトによるNFAT活性化シグナルの回復。
この実験では、ラージ及びLag−3+ Jurkat/NFAT−luc2エフェクターT細胞を、供給業者の記載に従って培養した。いくつかの抗Lag3及び参照抗体の段階希釈液(40pg/ml〜50μg/ml)を、平らな白底の96ウェル培養プレート(Costar、カタログ番号#3917)において、アッセイ培地(RPMI 1640(PAN Biotech、カタログ番号#P04−18047)、1%FCS)中で調製した。1×105 Lag3+ NFAT−Jurkat細胞/ウェル)を抗体溶液に加えた。この工程の後、2.5x104 Raji細胞/ウェルをJurakt細胞/抗体混合物に加え、50ng/mlの最終濃度のSEDスーパー抗原(Toxin technology、カタログ番号DT303)にも加えた。37℃、5%CO2で6時間インキュベートした後、Bio−Glo基質(Promega、#G7940)を室温まで温め、1ウェルあたり75μlを加え、5〜10分間インキュベートし、キットの製造元の推奨に従って全体の発光をTecan Infiniteリーダーで測定した。
図に示すのは、SED刺激時の様々な抗Lag3抗体によるNFATルシフェラーゼシグナルのMHCII/Lag3を介した抑制の回復である(EC50値として示す)。
本発明者らは、アロジェネイック環境で抗PD−1と組み合わせて抗LAG−3ブロッキング抗体をスクリーニングするために、単球由来のアロジェネイック成熟樹状細胞(mDC)の存在下で、新たに精製したCD4 T細胞を5日間共培養するアッセイを開発した。1週間前に、プラスチック接着によって、新鮮なPBMCから単球を単離し、続いて非接着細胞を除去にした。その後、GM−CSF(50ng/ml)及びIL−4(100ng/ml)を含む培地で5日間培養することにより、単球から未成熟DCを生成した。iDCの成熟を誘導するために、TNFアルファ、IL−1ベータ及びIL−6(各50ng/ml)をさらに2日間培養培地に加えた。その後、フローサイトメトリー(LSRFortessa、BD Biosciencesで主要組織適合制遺伝子複合体クラスII(MHCII)、CD80、CD83及びCD86の表面発現を測定することにより、DCの成熟を評価した。
最小混合リンパ球反応(mMLR)の日に、無関係のドナーから取得した108個のPBMCから、マイクロビーズキット(Miltenyi Biotec)を介してCD4 T細胞を濃縮した。培養前に、CD4 T細胞を5μMのカルボキシ−フルオレセイン−スクシンイミジルエステル(CFSE)で標識した。その後、ブロッキング抗PD−1抗体aPD1(=PD1−0103−0312、PCT出願PCT/EP2016/073248より)の存在下又は非存在下で、105個のCD4 T細胞を単独で、又はキメラ抗LAG−3抗体(aLAG3(0403)からaLAG(0418)((0403)から(0418))又は参照抗体(ヒト化BAP050(LAG525)及びBMS 986016)と10μg/mlの濃度で.組み合わせて、成熟アロDC(5:1)と共に96ウェルプレートに播種した。DP47は、FcγRによる認識を避けるためにFc部分にLALA突然変異を持つ非結合ヒトIgGであり、陰性コントロールとして使用された。
5日後、細胞培養上清を収集し、後でELISA(R&Dシステム)によってIL−2レベルを測定するために使用し、Golgi Plug(ブレフェルジンA)とGolgi Stop(モネンシン)の存在下で細胞をさらに5時間37℃で放置した。その後、細胞を洗浄し、Fix/Perm Buffer(BD Bioscience)で固定/透過処理する前に、抗ヒトCD4抗体とLive/Dead固定可能色素Aqua(Invitrogen)で表面を染色した。グランザイムB(BD Bioscience)とIFN−γ(eBioscience)の細胞内染色を実施した。結果を図1AとBに示す。
機能的研究では、CD−4 T細胞を腫瘍細胞株ARH77(すなわちmDCよりも低いレベルのPDL−1を発現するB細胞リンパ芽球様細胞株)と共培養し、PD−1遮断に対するLAG−3拮抗作用の寄与をよりよく特徴付けた。この実験のセットアップの残りと読み出しは、mMLRから変更されなかった。抗PD−1抗体と組み合わせた本発明の抗LAG−3抗体(mLRでIL−2とグランザイムBを共分泌する能力に基づいて選択されたaLAG3(0414)及びaLAG3(0416))は、CD4 T細胞によるグランザイムBの分泌について、参照抗LAG−3抗体((ヒト化BAP050(LAG525)及びBMS 986016))よりも(P<0.05)、及び抗PD−1単独より(P<0.01)も有意な増加を示した(図2)。
制御性T細胞(Treg)抑制アッセイを含む機能研究では、同じドナーのPBMCを2つの試料に分けた。1つはCD4 T細胞で、もう1つは、マイクロビーズキット(Miltenyi Biotec)によってCD4+CD25highCD127low T細胞と定義されるTregで濃縮された。2つの集団を精製したら、CD4 T細胞を5μMのカルボキシ−フルオレセイン−スクシンイミジルエステル(CFSE)で標識し、Tregを5μMのCell−Trace−Violet(CTV)で標識して、後でFACSで識別できるようにした。
その後、CD4 T細胞(105)とTreg(105)の両方を、本発明の抗LAG−3抗体(aLAG3(0414)及びaLAG3(0416))又は参照抗LAG−3抗体(ヒト化BAP050(LAG525)及びBMS986016)の存在下又は非存在下で、本発明の抗PD−1抗体と10μg/mlの濃度で組み合わせて、関係のないドナーからの照射PBMC(105)と共に1:1の比率で96ウェルプレートに共培養した。また、TregsによるCD4 T細胞エフェクター機能の抑制の大きさを推定する対照として、CD4 T細胞(105)は、Tregの非存在下で照射されたPBMC(105)とも共培養された。
5日後、細胞培養上清を収集し、後でELISA(R&Dシステム)でIFN−γレベルを測定するために使用し、Golgi Plug(ブレフェルジンA)とGolgi Stop(モネンシン)の存在下で細胞をさらに5時間37℃で放置した。その後、細胞を洗浄し、Fix/Perm Buffer(BD Bioscience)で固定/透過処理する前に、抗ヒトCD4抗体とLive/Dead固定可能色素Aqua(Invitrogen)で表面を染色した。グランザイムB(BD Bioscience)とIFN−γ(eBioscience)の細胞内染色を実施した。結果を図3AとBに示す。
抗LAG−3抗体(aLAG3(0414)及びaLAG3(0416)、抗PD−1抗体aPD1(0376)(=PD1−0103−0312、PCT出願PCT/EP2016/073248より)との組み合わせで、抗PD−1単独の存在下(P<0.05)又はチェックポイント阻害剤の非存在下(P<0.001)でのTconvよりも有意に高い量のグランザイムBの分泌により示されるように、制御性T細胞の厳しい制御からのTconvn回避を誘発した。抗PD−1と組み合わせた参照抗LAG−3抗体(ヒト化BAP050(LAG525)及びBMS 986016)は、Treg抑制からTconvエフェクター機能を有意にレスキューしなかった。IFN−gについても、わずか4名のドナーで差が統計的有意に達しなかったとはいえ、同様の結果が得られた。
黒色腫患者のPBMCには、検出可能な頻度の腫瘍抗原特異的T細胞が含まれていることが以前に記載されている。したがって、POCについて、本発明者らは、免疫原性黒色腫関連抗原ペプチドプールで一晩再刺激した黒色腫患者PBMCで、抗LAG−3抗体(0414)プラス抗PD−1 v.s.抗PD−1、又は抗PD−1単独を試験した。
飽和濃度(10μg/ml)の抗PD−1単独(0376)の存在下又は非存在下で、抗LAG−3(aLAG3(0414)=(0414)、10μg/ml)抗体と組み合わせて、室温でインキュベートした黒色腫患者の105〜106のPBMC。T細胞は、タンパク質輸送阻害剤Golgi Plug(ブレフェルジンA)及びGolgi Stop(モネンシン)の存在下、MAGEA1、MAGEA3、MAGEA4、Melan−A/MART−1、NYESO−1、メラノサイトタンパク質Pmel 17 gp100、チロシナーゼ、チロシナーゼ関連タンパク質2等の免疫原性腫瘍関連抗原のプールで一晩再刺激された。
その後、細胞を洗浄し、Fix/Perm Buffer(BD Bioscience)で固定/透過処理する前に、抗ヒトCD4抗体とLive/Dead固定可能色素Aqua(Invitrogen)で表面を染色した。グランザイムB(BD Bioscience)とIFN−γ(eBioscience)の細胞内染色を実施した。
抗LAG−3抗体と抗PD−1抗体の組み合わせ(P<0.01及びP<0.001)は、腫瘍抗原特異的T細胞エフェクター機能(すなわち、グランザイムB及びIFN−γ分泌)が有意に向上したが、PD−1遮断のみでは全く効果がなかった(データは示していない)。
同様に、当業者は、実施例3の細胞培養/動物研究に基づいて、上記をヒトの治療方法に拡張することができるであろう。
Claims (16)
- ヒトLAG3に結合する単離された抗体であって、
(a)配列番号1のアミノ酸配列を含むHVR−H1;(b)配列番号2のアミノ酸配列を含むHVR−H2;(c)配列番号3のアミノ酸配列を含むHVR−H3;(d)配列番号4のアミノ酸配列を含むHVR−L1;(e)配列番号5のアミノ酸配列を含むHVR−L2;及び(f)配列番号6のアミノ酸配列を含むHVR−L3を含む、
抗体。 - ヒトLAG3に結合する単離された抗体であって、
配列番号7のVH配列と配列番号8のVL配列とを含む、
抗体。 - ヒトLAG3に結合する単離された抗体であって、
i)LAG3への結合について、配列番号7のアミノ酸配列を持つVHと配列番号8のアミノ酸配列を持つVLとを含む抗LAG3抗体と競合し、且つ/又は
ii)ヒト及びカニクイザルLAG3に結合し、且つ/又は
iii)ヒトA375腫瘍細胞で発現したMHC−IIの結合を阻害し、且つ/又は
iv)混合リンパ球反応(mMLR)アッセイでグランザイムB又はIL−2の放出を増加させる
抗体。 - ヒト、ヒト化又はキメラ抗体である、請求項1から3のいずれか一項に記載の抗体。
- 突然変異L234A、L235A及びP329G(KabatのEUインデックスによる番号付け)を有する完全長IgG1抗体である、請求項1から4のいずれか一項に記載の抗体。
- 請求項1から5のいずれか一項に記載の抗体をコードする、単離された核酸。
- 請求項6に記載の核酸を含む宿主細胞。
- 抗体が生成されるように請求項7に記載の宿主細胞を培養することを含む、抗体を生成する方法。
- 宿主細胞から抗体を回収することをさらに含む、請求項8に記載の方法。
- 請求項1から5のいずれか一項に記載の抗体と、薬学的に許容される担体とを含む薬学的製剤。
- がんの治療における使用のための、請求項1から5のいずれか一項に記載の抗体。
- 医薬としての使用のための、請求項1から5のいずれか一項に記載の抗体。
- がんの治療における使用のための、請求項1から5のいずれか一項に記載の抗体。
- 医薬の製造における、請求項1から5のいずれか一項に記載の抗体の使用。
- 医薬ががんの治療のためである、請求項14に記載の使用。
- 請求項1から5のいずれか一項に記載の抗体の有効量を含む、がんを有する個体を治療するための医薬。
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