JP6202001B2 - メタクリリル−CoAの製造法 - Google Patents
メタクリリル−CoAの製造法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP6202001B2 JP6202001B2 JP2014537402A JP2014537402A JP6202001B2 JP 6202001 B2 JP6202001 B2 JP 6202001B2 JP 2014537402 A JP2014537402 A JP 2014537402A JP 2014537402 A JP2014537402 A JP 2014537402A JP 6202001 B2 JP6202001 B2 JP 6202001B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- coa
- pseudomonas
- methacrylyl
- dehydratase
- hydroxyisobutyryl
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
- NPALUEYCDZWBOV-NDZSKPAWSA-N methacrylyl-CoA Chemical compound O[C@@H]1[C@H](OP(O)(O)=O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OCC(C)(C)[C@@H](O)C(=O)NCCC(=O)NCCSC(=O)C(=C)C)O[C@H]1N1C2=NC=NC(N)=C2N=C1 NPALUEYCDZWBOV-NDZSKPAWSA-N 0.000 title claims description 63
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 title claims description 31
- 108090001042 Hydro-Lyases Proteins 0.000 claims description 80
- 102000004867 Hydro-Lyases Human genes 0.000 claims description 77
- 241000589516 Pseudomonas Species 0.000 claims description 75
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 61
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 50
- WWEOGFZEFHPUAM-MIZDRFBCSA-N 3-hydroxy-2-methylpropanoyl-CoA Chemical compound O[C@@H]1[C@H](OP(O)(O)=O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OCC(C)(C)[C@@H](O)C(=O)NCCC(=O)NCCSC(=O)C(CO)C)O[C@H]1N1C2=NC=NC(N)=C2N=C1 WWEOGFZEFHPUAM-MIZDRFBCSA-N 0.000 claims description 46
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims description 46
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims description 35
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 30
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 25
- 241000316848 Rhodococcus <scale insect> Species 0.000 claims description 18
- 244000005700 microbiome Species 0.000 claims description 16
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 claims description 13
- 230000003204 osmotic effect Effects 0.000 claims description 10
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 9
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 9
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims description 8
- 239000012736 aqueous medium Substances 0.000 claims description 6
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 claims description 5
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims 4
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 26
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 25
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 23
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 22
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 21
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 21
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 20
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 16
- CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N Acetone Chemical compound CC(C)=O CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 15
- 239000002994 raw material Substances 0.000 description 14
- 102000011426 Enoyl-CoA hydratase Human genes 0.000 description 13
- 108010023922 Enoyl-CoA hydratase Proteins 0.000 description 13
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 13
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 10
- 239000002585 base Substances 0.000 description 10
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 10
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- CERQOIWHTDAKMF-UHFFFAOYSA-N Methacrylic acid Chemical compound CC(=C)C(O)=O CERQOIWHTDAKMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- WCUXLLCKKVVCTQ-UHFFFAOYSA-M Potassium chloride Chemical compound [Cl-].[K+] WCUXLLCKKVVCTQ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 8
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 8
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 8
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 7
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 description 7
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 description 7
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 7
- 239000002028 Biomass Substances 0.000 description 6
- LRHPLDYGYMQRHN-UHFFFAOYSA-N N-Butanol Chemical compound CCCCO LRHPLDYGYMQRHN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- YXFVVABEGXRONW-UHFFFAOYSA-N Toluene Chemical compound CC1=CC=CC=C1 YXFVVABEGXRONW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 238000006297 dehydration reaction Methods 0.000 description 6
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 6
- 125000005397 methacrylic acid ester group Chemical group 0.000 description 6
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 6
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 5
- 241001240958 Pseudomonas aeruginosa PAO1 Species 0.000 description 5
- 239000003054 catalyst Substances 0.000 description 5
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 5
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 5
- 239000000047 product Substances 0.000 description 5
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 5
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 5
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 5
- -1 sulfur Amino acids Chemical class 0.000 description 5
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 4
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N L-valine Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 4
- KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N Valine Natural products CC(C)C(N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 4
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 4
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 4
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 4
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 4
- 239000001103 potassium chloride Substances 0.000 description 4
- 235000011164 potassium chloride Nutrition 0.000 description 4
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 4
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 4
- 239000004474 valine Substances 0.000 description 4
- DBXBTMSZEOQQDU-UHFFFAOYSA-N 3-hydroxyisobutyric acid Chemical compound OCC(C)C(O)=O DBXBTMSZEOQQDU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- UHOVQNZJYSORNB-UHFFFAOYSA-N Benzene Chemical compound C1=CC=CC=C1 UHOVQNZJYSORNB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N Dichloromethane Chemical compound ClCCl YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N Diethyl ether Chemical compound CCOCC RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N Ethyl acetate Chemical compound CCOC(C)=O XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000012181 QIAquick gel extraction kit Methods 0.000 description 3
- 241000647111 Rhodococcus erythropolis PR4 Species 0.000 description 3
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 3
- 150000005693 branched-chain amino acids Chemical class 0.000 description 3
- 239000006285 cell suspension Substances 0.000 description 3
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 3
- 235000014113 dietary fatty acids Nutrition 0.000 description 3
- 238000006911 enzymatic reaction Methods 0.000 description 3
- 229930195729 fatty acid Natural products 0.000 description 3
- 239000000194 fatty acid Substances 0.000 description 3
- 150000004665 fatty acids Chemical class 0.000 description 3
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 3
- 238000006703 hydration reaction Methods 0.000 description 3
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 description 3
- 238000012269 metabolic engineering Methods 0.000 description 3
- VLKZOEOYAKHREP-UHFFFAOYSA-N n-Hexane Chemical compound CCCCCC VLKZOEOYAKHREP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 3
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 description 3
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- MWFMGBPGAXYFAR-UHFFFAOYSA-N 2-hydroxy-2-methylpropanenitrile Chemical compound CC(C)(O)C#N MWFMGBPGAXYFAR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- BWLBGMIXKSTLSX-UHFFFAOYSA-N 2-hydroxyisobutyric acid Chemical compound CC(C)(O)C(O)=O BWLBGMIXKSTLSX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 2
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000195493 Cryptophyta Species 0.000 description 2
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N Dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 2
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 2
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 description 2
- AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N L-threonine Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N 0.000 description 2
- 241001670047 Malikia spinosa Species 0.000 description 2
- XNXMTEWAOQTIJR-BLPRJPCASA-N OCC(C)C(O)=O.O[C@@H]1[C@H](OP(O)(O)=O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OCC(C)(C)[C@@H](O)C(=O)NCCC(=O)NCCS)O[C@H]1N1C2=NC=NC(N)=C2N=C1 Chemical compound OCC(C)C(O)=O.O[C@@H]1[C@H](OP(O)(O)=O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OCC(C)(C)[C@@H](O)C(=O)NCCC(=O)NCCS)O[C@H]1N1C2=NC=NC(N)=C2N=C1 XNXMTEWAOQTIJR-BLPRJPCASA-N 0.000 description 2
- 241000866634 Paraburkholderia phenazinium Species 0.000 description 2
- 241000589779 Pelomonas saccharophila Species 0.000 description 2
- OFBQJSOFQDEBGM-UHFFFAOYSA-N Pentane Chemical compound CCCCC OFBQJSOFQDEBGM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N Phosphoric acid Chemical compound OP(O)(O)=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241001645955 Pseudomonas chlororaphis subsp. aureofaciens Species 0.000 description 2
- 241000520873 Pseudomonas citronellolis Species 0.000 description 2
- 241000589540 Pseudomonas fluorescens Species 0.000 description 2
- 241000589755 Pseudomonas mendocina Species 0.000 description 2
- 241000589781 Pseudomonas oleovorans Species 0.000 description 2
- 241000589776 Pseudomonas putida Species 0.000 description 2
- 241001518128 Rhodococcus coprophilus Species 0.000 description 2
- 241000187561 Rhodococcus erythropolis Species 0.000 description 2
- 241000187694 Rhodococcus fascians Species 0.000 description 2
- 241000158504 Rhodococcus hoagii Species 0.000 description 2
- DKGAVHZHDRPRBM-UHFFFAOYSA-N Tert-Butanol Chemical compound CC(C)(C)O DKGAVHZHDRPRBM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 description 2
- 241001670042 [Pseudomonas] boreopolis Species 0.000 description 2
- 238000007792 addition Methods 0.000 description 2
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 description 2
- 229910052783 alkali metal Inorganic materials 0.000 description 2
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 2
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 2
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 2
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 description 2
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 2
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 2
- 230000006652 catabolic pathway Effects 0.000 description 2
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 2
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 2
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 2
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 2
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 2
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 2
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 2
- LELOWRISYMNNSU-UHFFFAOYSA-N hydrogen cyanide Chemical compound N#C LELOWRISYMNNSU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 2
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 2
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 2
- 230000002503 metabolic effect Effects 0.000 description 2
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 description 2
- TZIHFWKZFHZASV-UHFFFAOYSA-N methyl formate Chemical compound COC=O TZIHFWKZFHZASV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 150000002772 monosaccharides Chemical class 0.000 description 2
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 description 2
- 229910052698 phosphorus Inorganic materials 0.000 description 2
- 229910052700 potassium Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 2
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 2
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 2
- 229920006395 saturated elastomer Polymers 0.000 description 2
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 2
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 2
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 2
- 239000008223 sterile water Substances 0.000 description 2
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 description 2
- 238000001308 synthesis method Methods 0.000 description 2
- 229920001791 ((R)-3-Hydroxybutanoyl)(n-2) Polymers 0.000 description 1
- MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N (2S)-2-Amino-3-hydroxypropansäure Chemical compound OC[C@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- JHPBZFOKBAGZBL-UHFFFAOYSA-N (3-hydroxy-2,2,4-trimethylpentyl) 2-methylprop-2-enoate Chemical compound CC(C)C(O)C(C)(C)COC(=O)C(C)=C JHPBZFOKBAGZBL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZGGHKIMDNBDHJB-NRFPMOEYSA-M (3R,5S)-fluvastatin sodium Chemical compound [Na+].C12=CC=CC=C2N(C(C)C)C(\C=C\[C@@H](O)C[C@@H](O)CC([O-])=O)=C1C1=CC=C(F)C=C1 ZGGHKIMDNBDHJB-NRFPMOEYSA-M 0.000 description 1
- DURPTKYDGMDSBL-UHFFFAOYSA-N 1-butoxybutane Chemical compound CCCCOCCCC DURPTKYDGMDSBL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ISPYQTSUDJAMAB-UHFFFAOYSA-N 2-chlorophenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1Cl ISPYQTSUDJAMAB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QHHKKMYHDBRONY-RMNRSTNRSA-N 3-hydroxybutanoyl-CoA Chemical compound O[C@@H]1[C@H](OP(O)(O)=O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OCC(C)(C)[C@@H](O)C(=O)NCCC(=O)NCCSC(=O)CC(O)C)O[C@H]1N1C2=NC=NC(N)=C2N=C1 QHHKKMYHDBRONY-RMNRSTNRSA-N 0.000 description 1
- BERBFZCUSMQABM-IEXPHMLFSA-N 3-hydroxypropanoyl-CoA Chemical compound O[C@@H]1[C@H](OP(O)(O)=O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OCC(C)(C)[C@@H](O)C(=O)NCCC(=O)NCCSC(=O)CCO)O[C@H]1N1C2=NC=NC(N)=C2N=C1 BERBFZCUSMQABM-IEXPHMLFSA-N 0.000 description 1
- 239000004925 Acrylic resin Substances 0.000 description 1
- 229920000178 Acrylic resin Polymers 0.000 description 1
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 1
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000228212 Aspergillus Species 0.000 description 1
- 241000193830 Bacillus <bacterium> Species 0.000 description 1
- 241001135516 Burkholderia gladioli Species 0.000 description 1
- 241000866604 Burkholderia pyrrocinia Species 0.000 description 1
- DKPFZGUDAPQIHT-UHFFFAOYSA-N Butyl acetate Natural products CCCCOC(C)=O DKPFZGUDAPQIHT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000866631 Caballeronia glathei Species 0.000 description 1
- UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L Calcium chloride Chemical compound [Cl-].[Cl-].[Ca+2] UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 241000222120 Candida <Saccharomycetales> Species 0.000 description 1
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004215 Carbon black (E152) Substances 0.000 description 1
- 241000186216 Corynebacterium Species 0.000 description 1
- XDTMQSROBMDMFD-UHFFFAOYSA-N Cyclohexane Chemical compound C1CCCCC1 XDTMQSROBMDMFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N D-Mannitol Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N 0.000 description 1
- 241001524110 Dietzia maris Species 0.000 description 1
- ZAFNJMIOTHYJRJ-UHFFFAOYSA-N Diisopropyl ether Chemical compound CC(C)OC(C)C ZAFNJMIOTHYJRJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XTHFKEDIFFGKHM-UHFFFAOYSA-N Dimethoxyethane Chemical compound COCCOC XTHFKEDIFFGKHM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 1
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241001509432 Gordonia aichiensis Species 0.000 description 1
- 241001509401 Gordonia rubripertincta Species 0.000 description 1
- 241001509412 Gordonia sputi Species 0.000 description 1
- 241001670062 Halomonas utahensis Species 0.000 description 1
- 241001660422 Herbaspirillum huttiense Species 0.000 description 1
- VQTUBCCKSQIDNK-UHFFFAOYSA-N Isobutene Chemical group CC(C)=C VQTUBCCKSQIDNK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N L-Cysteine Chemical compound SC[C@H](N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N L-Proline Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P L-argininium(2+) Chemical compound NC(=[NH2+])NCCC[C@H]([NH3+])C(O)=O ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P 0.000 description 1
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N L-lysine Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000006142 Luria-Bertani Agar Substances 0.000 description 1
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 1
- 229910021380 Manganese Chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- GLFNIEUTAYBVOC-UHFFFAOYSA-L Manganese chloride Chemical compound Cl[Mn]Cl GLFNIEUTAYBVOC-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 229930195725 Mannitol Natural products 0.000 description 1
- 241000206597 Marinobacter hydrocarbonoclasticus Species 0.000 description 1
- 241000212302 Marinobacterium georgiense Species 0.000 description 1
- 241000227153 Marinobacterium stanieri Species 0.000 description 1
- RJUFJBKOKNCXHH-UHFFFAOYSA-N Methyl propionate Chemical compound CCC(=O)OC RJUFJBKOKNCXHH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BZLVMXJERCGZMT-UHFFFAOYSA-N Methyl tert-butyl ether Chemical compound COC(C)(C)C BZLVMXJERCGZMT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241001524108 Mycobacterium chlorophenolicum Species 0.000 description 1
- CTQNGGLPUBDAKN-UHFFFAOYSA-N O-Xylene Chemical compound CC1=CC=CC=C1C CTQNGGLPUBDAKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 1
- 241001670033 Phaseolibacter flectens Species 0.000 description 1
- ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N Proline Natural products OC(=O)C1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-M Propionate Chemical compound CCC([O-])=O XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 241000589517 Pseudomonas aeruginosa Species 0.000 description 1
- 241000204715 Pseudomonas agarici Species 0.000 description 1
- 241000202216 Pseudomonas avellanae Species 0.000 description 1
- 241000218935 Pseudomonas azotoformans Species 0.000 description 1
- 241001279845 Pseudomonas balearica Species 0.000 description 1
- 241000204712 Pseudomonas caricapapayae Species 0.000 description 1
- 241001508466 Pseudomonas cichorii Species 0.000 description 1
- 241000647960 Pseudomonas coronafaciens pv. coronafaciens Species 0.000 description 1
- 241000520898 Pseudomonas ficuserectae Species 0.000 description 1
- 241001148192 Pseudomonas flavescens Species 0.000 description 1
- 241000589538 Pseudomonas fragi Species 0.000 description 1
- 241000218899 Pseudomonas fulva Species 0.000 description 1
- 241000490004 Pseudomonas fuscovaginae Species 0.000 description 1
- 241001670039 Pseudomonas lundensis Species 0.000 description 1
- 241000394642 Pseudomonas marginalis pv. marginalis Species 0.000 description 1
- 241001670064 Pseudomonas meliae Species 0.000 description 1
- 241001291501 Pseudomonas monteilii Species 0.000 description 1
- 241000204709 Pseudomonas mucidolens Species 0.000 description 1
- 241000218904 Pseudomonas oryzihabitans Species 0.000 description 1
- 241001670066 Pseudomonas pertucinogena Species 0.000 description 1
- 241000589630 Pseudomonas pseudoalcaligenes Species 0.000 description 1
- 241000520900 Pseudomonas resinovorans Species 0.000 description 1
- 241001291486 Pseudomonas rhodesiae Species 0.000 description 1
- 241001148183 Pseudomonas savastanoi Species 0.000 description 1
- 241000589614 Pseudomonas stutzeri Species 0.000 description 1
- 241000218902 Pseudomonas synxantha Species 0.000 description 1
- 241000589615 Pseudomonas syringae Species 0.000 description 1
- 241000218903 Pseudomonas taetrolens Species 0.000 description 1
- 241001148199 Pseudomonas tolaasii Species 0.000 description 1
- 241001291485 Pseudomonas veronii Species 0.000 description 1
- 241001464820 Pseudomonas viridiflava Species 0.000 description 1
- 241000577556 Pseudomonas wisconsinensis Species 0.000 description 1
- 241001464989 Rhodococcus globerulus Species 0.000 description 1
- 241000915491 Rhodococcus jostii Species 0.000 description 1
- 241001524101 Rhodococcus opacus Species 0.000 description 1
- 241001478124 Rhodococcus pyridinivorans Species 0.000 description 1
- 241000187693 Rhodococcus rhodochrous Species 0.000 description 1
- 241000235070 Saccharomyces Species 0.000 description 1
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000122973 Stenotrophomonas maltophilia Species 0.000 description 1
- 241001670040 Stenotrophomonas pictorum Species 0.000 description 1
- 241000194017 Streptococcus Species 0.000 description 1
- 241000187747 Streptomyces Species 0.000 description 1
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 1
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 1
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 1
- 241001670036 [Pseudomonas] cissicola Species 0.000 description 1
- 241001670030 [Pseudomonas] geniculata Species 0.000 description 1
- 241001670027 [Pseudomonas] hibiscicola Species 0.000 description 1
- KXKVLQRXCPHEJC-UHFFFAOYSA-N acetic acid trimethyl ester Natural products COC(C)=O KXKVLQRXCPHEJC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- POODSGUMUCVRTR-IEXPHMLFSA-N acryloyl-CoA Chemical compound O[C@@H]1[C@H](OP(O)(O)=O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OCC(C)(C)[C@@H](O)C(=O)NCCC(=O)NCCSC(=O)C=C)O[C@H]1N1C2=NC=NC(N)=C2N=C1 POODSGUMUCVRTR-IEXPHMLFSA-N 0.000 description 1
- 239000000853 adhesive Substances 0.000 description 1
- 230000001070 adhesive effect Effects 0.000 description 1
- 238000000246 agarose gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 125000001931 aliphatic group Chemical group 0.000 description 1
- 150000001338 aliphatic hydrocarbons Chemical class 0.000 description 1
- 239000003513 alkali Substances 0.000 description 1
- 229910000147 aluminium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 150000001408 amides Chemical class 0.000 description 1
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 1
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 1
- 239000007900 aqueous suspension Substances 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000004945 aromatic hydrocarbons Chemical class 0.000 description 1
- 210000004507 artificial chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 description 1
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 description 1
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 description 1
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 description 1
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 1
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000011942 biocatalyst Substances 0.000 description 1
- 239000001110 calcium chloride Substances 0.000 description 1
- 235000011148 calcium chloride Nutrition 0.000 description 1
- 229910001628 calcium chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- 229940041514 candida albicans extract Drugs 0.000 description 1
- 210000000692 cap cell Anatomy 0.000 description 1
- 150000001732 carboxylic acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 238000012824 chemical production Methods 0.000 description 1
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 1
- 238000001816 cooling Methods 0.000 description 1
- 239000013601 cosmid vector Substances 0.000 description 1
- 125000004122 cyclic group Chemical group 0.000 description 1
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 1
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000003013 cytotoxicity Effects 0.000 description 1
- 231100000135 cytotoxicity Toxicity 0.000 description 1
- 230000018044 dehydration Effects 0.000 description 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 1
- POLCUAVZOMRGSN-UHFFFAOYSA-N dipropyl ether Chemical compound CCCOCCC POLCUAVZOMRGSN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000002016 disaccharides Chemical class 0.000 description 1
- 239000012153 distilled water Substances 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 239000003759 ester based solvent Substances 0.000 description 1
- 150000002148 esters Chemical class 0.000 description 1
- 239000004210 ether based solvent Substances 0.000 description 1
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 229960003765 fluvastatin Drugs 0.000 description 1
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000008282 halocarbons Chemical class 0.000 description 1
- FUZZWVXGSFPDMH-UHFFFAOYSA-N hexanoic acid Chemical compound CCCCCC(O)=O FUZZWVXGSFPDMH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229930195733 hydrocarbon Natural products 0.000 description 1
- 150000002430 hydrocarbons Chemical class 0.000 description 1
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 1
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 description 1
- 238000009776 industrial production Methods 0.000 description 1
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 1
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 description 1
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N isopropyl beta-D-thiogalactopyranoside Chemical compound CC(C)S[C@@H]1O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N 0.000 description 1
- 238000004811 liquid chromatography Methods 0.000 description 1
- 239000011565 manganese chloride Substances 0.000 description 1
- 235000002867 manganese chloride Nutrition 0.000 description 1
- 239000000594 mannitol Substances 0.000 description 1
- 235000010355 mannitol Nutrition 0.000 description 1
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 1
- 229910052751 metal Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000002184 metal Substances 0.000 description 1
- 229940017219 methyl propionate Drugs 0.000 description 1
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 1
- 239000003607 modifier Substances 0.000 description 1
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 1
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 1
- 229930014626 natural product Natural products 0.000 description 1
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 229920001542 oligosaccharide Polymers 0.000 description 1
- 150000002482 oligosaccharides Chemical class 0.000 description 1
- 239000003973 paint Substances 0.000 description 1
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 1
- 239000003209 petroleum derivative Substances 0.000 description 1
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 1
- 229920000070 poly-3-hydroxybutyrate Polymers 0.000 description 1
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 1
- 230000002265 prevention Effects 0.000 description 1
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 1
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 1
- 230000035484 reaction time Effects 0.000 description 1
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 1
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 1
- 230000035939 shock Effects 0.000 description 1
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 1
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 description 1
- 150000008163 sugars Chemical class 0.000 description 1
- 239000011593 sulfur Substances 0.000 description 1
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 1
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 1
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K trisodium phosphate Chemical compound [Na+].[Na+].[Na+].[O-]P([O-])([O-])=O RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 238000010792 warming Methods 0.000 description 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 1
- 239000008096 xylene Substances 0.000 description 1
- 239000012138 yeast extract Substances 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P19/00—Preparation of compounds containing saccharide radicals
- C12P19/26—Preparation of nitrogen-containing carbohydrates
- C12P19/28—N-glycosides
- C12P19/30—Nucleotides
- C12P19/32—Nucleotides having a condensed ring system containing a six-membered ring having two N-atoms in the same ring, e.g. purine nucleotides, nicotineamide-adenine dinucleotide
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/88—Lyases (4.)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P7/00—Preparation of oxygen-containing organic compounds
- C12P7/40—Preparation of oxygen-containing organic compounds containing a carboxyl group including Peroxycarboxylic acids
- C12P7/52—Propionic acid; Butyric acids
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
Description
(2)3−ヒドロキシイソブチリル−CoAからメタクリリル−CoAへの変換率が50%以上であるデヒドラターゼを用いる、(1)の製造法。
(3)pH4〜10の反応条件でメタクリリル−CoAへ変換する、(1)又は(2)の製造法。
(4)温度5〜80℃の反応条件でメタクリリル−CoAへ変換する、(1)から(3)のいずれかの製造法。
(5)時間1分〜1週間の反応条件でメタクリリル−CoAへ変換する、(1)から(4)のいずれかの製造法。
(6)3−ヒドロキシイソブチリル−CoAが、1mM以上の浸透圧調整剤を含む水性媒体で調製されたものである、(1)から(5)のいずれかの製造法。
(7)デヒドラターゼをコードする遺伝子を発現する形質転換体の存在下で、3−ヒドロキシイソブチリル−CoAをメタクリリル−CoAへ変換する、(1)から(6)のいずれかの製造法。
(8)デヒドラターゼをコードする遺伝子が微生物由来の遺伝子である、(7)の製造法。
(9)微生物が、シュードモナス属又はロドコッカス属に属する微生物である(8)の製造法。
(10)デヒドラターゼが下記(a)〜(f)からなる群より選択される(7)の製造法。
(a)配列番号1または3で示すアミノ酸配列からなるタンパク質。
(b)配列番号1または3で示すアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換、付加及び/又は挿入したアミノ酸配列からなり、かつデヒドラターゼ活性を有するタンパク質。
(c)配列番号1または3で示すアミノ酸配列からなるタンパク質と90%以上の同一性を示し、かつデヒドラターゼ活性を有するタンパク質。
(d)配列番号2または4で示す塩基配列からなるDNAでコードされるタンパク質。
(e)配列番号2または4で示す塩基配列からなるDNAとストリンジェントな条件でハイブリダイズするDNAでコードされ、かつデヒドラターゼ活性を有するタンパク質。
(f)配列番号2または4で示す塩基配列からなるDNAと90%以上の同一性を示すDNAでコードされ、かつデヒドラターゼ活性を有するタンパク質。
(11)微生物由来のデヒドラターゼをコードする遺伝子を発現する形質転換体の存在下、1mM以上の浸透圧調整剤を含む水性媒体で調製された3−ヒドロキシイソブチリル−CoA水溶液を、pH4〜10、温度5〜80℃、時間1分〜1週間の反応条件で反応させることにより、3−ヒドロキシイソブチリル−CoAをメタクリリル−CoAへ変換率50%以上で変換するメタクリリル−CoAの製造法。
本発明において、メタクリリル−CoAとは、以下の式(1)で示される化合物であり、生体内ではバリンの代謝中間体として知られている。
[メタクリリル−CoA生成量]/[3−ヒドロキシイソブチリル−CoA残存量+メタクリリル−CoA生成量]×100
(a)配列番号1または3で示すアミノ酸配列からなるタンパク質。
(b)配列番号1または3で示すアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換、付加及び/又は挿入したアミノ酸配列からなり、かつデヒドラターゼ活性を有するタンパク質。
(c)配列番号1または3で示すアミノ酸配列からなるタンパク質と90%以上の同一性を示し、かつデヒドラターゼ活性を有するタンパク質。
(d)配列番号2または4で示す塩基配列からなるDNAでコードされるタンパク質。
(e)配列番号2または4で示す塩基配列からなるDNAとストリンジェントな条件でハイブリダイズするDNAでコードされ、かつデヒドラターゼ活性を有するタンパク質。
(f)配列番号2または4で示す塩基配列からなるDNAと90%以上の同一性を示すDNAでコードされ、かつデヒドラターゼ活性を有するタンパク質。
本発明において、デヒドラターゼは、上記配列を有するものに限定されるものではなく、配列番号1または3記載のアミノ酸配列と約50%以上、好ましくは約60%以上、より好ましくは約70%以上、さらに好ましくは約80%以上、特に好ましくは約90%以上、さらに特に好ましくは約95%以上、最も好ましくは約98%以上の相同性あるいは同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつデヒドラターゼ活性を有するタンパク質も本発明のデヒドラターゼに含まれる。
上記の相同性の数値は、配列解析ソフトウェアであるDNASIS(日立ソフトウェアエンジニアリング)を用いて、例えば、マキシマムマッチング法のコマンドを実行することにより求められる。その際のパラメータは、デフォルトの設定(初期設定)とする。また、本発明においてデヒドラターゼには、配列番号1または3記載のアミノ酸配列において、1個または数個のアミノ酸が欠失、置換、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を含み、かつデヒドラターゼ活性を有するタンパク質も含まれる。
本発明において、デヒドラターゼをコードする遺伝子は、上記配列に限定されるものではなく、配列番号2または4記載の塩基配列と約50%以上、好ましくは約60%以上、より好ましくは約70%以上、さらに好ましくは約80%以上、特に好ましくは約90%以上、さらに特に好ましくは約95%以上、最も好ましくは約98%以上の相同性(同一性)を有する塩基配列を有するDNAも、それがデヒドラターゼ活性を有するタンパク質をコードする限り、デヒドラターゼをコードする遺伝子に含まれる。
ハイブリダイゼーションは、公知の方法によって行うことができる。ハイブリダイゼーションの方法は、例えば、「Molecular Cloning, A Laboratory Manual 2nd ed.」(ColdSpring Harbor Laboratory Press(1989))、「Current Protocols in Molecular Biology」(John Wiley & Sons(1987−1997))等を参照することができる。
<RhodococcusからのゲノムDNAの調製>
LB寒天培地培地(1%バクトトリプトン、0.5%バクトイーストエキス、0.5%NaCl、1.5%寒天)上で生育させたRhodococcus erythropolis PR4 (NBRC100887)株を10mlのLB液体培地(1%バクトトリプトン、0.5%バクトイ−ストエキス、0.5%NaCl)に植菌し、30℃にて36時間振盪培養を行った。培養終了後、2mlの培養液より菌体を遠心により回収し、Wizard Genomic DNA Purification Kit(プロメガ株式会社)を用いてゲノムDNA100μlを取得した。
得られたゲノムDNAを鋳型にして、デヒドラターゼをコ−ドすることが推定された遺伝子を含むDNA断片を、発現ベクターに容易に導入可能な制限酵素認識部位が付加された形となるようPCR法により調製した。
MMA−031: 5’−GGTCATGACCGACTTCAACACCATCATCCTC −3’(配列番号5)
MMA−032: 5’−GGCCTGCAGGTTCAGCTGTTCGAAAGTTCAGCGC −3’(配列番号6)
滅菌水 22 μl
2×PrimeSTAR(タカラバイオ社製) 25 μl
MMA−031(配列番号5) 1 μl
MMA−032(配列番号6) 1 μl
ゲノムDNA 1 μl
総量 50 μl
温度サイクル:
98℃ 10秒、55℃ 15秒及び72℃ 150秒の反応を30サイクル
1)デヒドラターゼ活性を有する細胞破砕液の調製
実施例1で得られたデヒドラターゼをコードする遺伝子が導入された大腸菌組換え体JM109/pMMA011を2mlのLBAmp培地に植菌し、37℃にて24時間前培養を行った。培養液を0.1ml取り、1mM IPTGを含む100mlの同培地に加え、37℃にて24時間振盪培養した。得られた培養液から遠心分離(3,700×g、10分間、4℃)により菌体を回収し、10mMリン酸−ナトリウム緩衝液(pH7.0)で2回洗浄した後、同緩衝液にOD630nmが6となるように懸濁した。
1.0Mトリス塩酸緩衝液(pH7.4)を0.05ml、5mM 3−ヒドロキシイソブチリル−CoAを0.2ml及び水0.65mlを混合したものに、上記のようにして得られたエノイルCoAヒドラターゼ活性を有する細胞破砕液0.1mlを加え、反応液1mlに調整した。37℃で3時間反応させ、以下に示すHPLC条件にて分析を行った。その結果、0.6mMのメタクリリル−CoAの生成を確認した。そのとき、3−ヒドロキシイソブチリル−CoA残存量は0.33mMであった。3−ヒドロキシイソブチリル−CoAからメタクリリル−CoAへ変換率は、65%(=0.6/(0.33+0.6)×100)であった。
カラム:Capcell Pak ODS-UG120(shiseido),2.0mm×250mm
移動相:25% MeOH,50mM H3PO4,pH5.7
流量:1.0ml/min
カラム温度:40℃
検出:UV 254nm
注入量10μl(反応溶液を移動相で10倍希釈)
<PseudomonasからのゲノムDNAの調製>
10mlのLB液体培地で培養したPseudomonas aeruginosa PA01株より、実施例1と同様にしてゲノムDNAを取得した。
下記のオリゴヌクレオチドプライマーを用い、上記で得られたPseudomonas aeruginosa PA01(NBRC106052)株ゲノムDNAを鋳型として、実施例1と同様にして、デヒドラターゼをコ−ドすることが推定された遺伝子を含むDNA断片(約0.8kb)を増幅した。
MMA−025:5’−GGTCATGAACACTGCCGTCGAACCCTACAAG−3’(配列番号7)
MMA−026:5’−GGCCTGCAGGCTCAGCAGTTGCGCCACTTGGGATC−3’(配列番号8)
1)デヒドラターゼ活性を有する細胞破砕液の調製
実施例3で得られたデヒドラターゼ遺伝子が導入された大腸菌組換え体JM109/pMMA015を実施例2の1)記載の方法と同様の方法を用いて培養及び菌体の回収を行い、菌体懸濁液を得た。得られた菌体懸濁液から実施例2の1)記載の方法と同様の方法を用いて細胞破砕液を調製した。
1.0Mトリス塩酸緩衝液(pH7.4)を0.05ml、5mM 3−ヒドロキシイソブチリル−CoAを0.2ml及び水0.65mlを混合したものに、上記のようにして得られたエノイルCoAヒドラターゼ活性を有する細胞破砕液0.1mlを加え、反応液1mlに調整した。37℃で3時間反応させ、実施例2の2)に示すHPLC条件にて分析を行った。その結果、0.6mMのメタクリリル−CoAの生成を確認した。そのとき、3−ヒドロキシイソブチリル−CoA残存量は0.37mMであった。3−ヒドロキシイソブチリル−CoAからメタクリリル−CoAへ変換率は、62%(=0.6/(0.37+0.6)×100)であった。
配列番号6:MMA−032
配列番号7:MMA−025
配列番号8:MMA−026
Claims (10)
- 水性媒体中で、デヒドラターゼの存在下、3−ヒドロキシイソブチリル−CoAをメタクリリル−CoAへ、変換率50%以上で変換するメタクリリル−CoAの製造法。
- pH4〜10の反応条件でメタクリリル−CoAへ変換する、請求項1記載の製造法。
- 温度5〜80℃の反応条件でメタクリリル−CoAへ変換する、請求項1又は2記載の製造法。
- 時間1分〜1週間の反応条件でメタクリリル−CoAへ変換する、請求項1から3のいずれか1項に記載の製造法。
- 3−ヒドロキシイソブチリル−CoAが、1mM以上の浸透圧調整剤を含む水性媒体で調製されたものである、請求項1から4のいずれか1項に記載の製造法。
- デヒドラターゼをコードする遺伝子を発現する形質転換体の存在下で、3−ヒドロキシイソブチリル−CoAをメタクリリル−CoAへ変換する、請求項1から5のいずれか1項に記載の製造法。
- デヒドラターゼをコードする遺伝子が微生物由来の遺伝子である、請求項6記載の製造法。
- 微生物が、シュードモナス属又はロドコッカス属に属する微生物である請求項7記載の製造法。
- デヒドラターゼが下記(a)〜(f)からなる群より選択される請求項6記載の製造法。
(a)配列番号1または3で示すアミノ酸配列からなるタンパク質。
(b)配列番号1または3で示すアミノ酸配列において1若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換、付加及び/又は挿入したアミノ酸配列からなり、かつデヒドラターゼ活性を有するタンパク質。
(c)配列番号1または3で示すアミノ酸配列からなるタンパク質と90%以上の同一性を示し、かつデヒドラターゼ活性を有するタンパク質。
(d)配列番号2または4で示す塩基配列からなるDNAでコードされるタンパク質。
(e)配列番号2または4で示す塩基配列からなるDNAとストリンジェントな条件でハイブリダイズするDNAでコードされ、かつデヒドラターゼ活性を有するタンパク質。
(f)配列番号2または4で示す塩基配列からなるDNAと90%以上の同一性を示すDNAでコードされ、かつデヒドラターゼ活性を有するタンパク質。 - 微生物由来のデヒドラターゼをコードする遺伝子を発現する形質転換体の存在下、1mM以上の浸透圧調整剤を含む水性媒体で調製された3−ヒドロキシイソブチリル−CoA水溶液を、pH4〜10、温度5〜80℃、時間1分〜1週間の反応条件で反応させることにより、3−ヒドロキシイソブチリル−CoAをメタクリリル−CoAへ変換率50%以上で変換するメタクリリル−CoAの製造法。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2013160302 | 2013-08-01 | ||
JP2013160302 | 2013-08-01 | ||
PCT/JP2014/003934 WO2015015784A1 (ja) | 2013-08-01 | 2014-07-25 | メタクリリル-CoAの製造法 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JPWO2015015784A1 JPWO2015015784A1 (ja) | 2017-03-02 |
JP6202001B2 true JP6202001B2 (ja) | 2017-09-27 |
Family
ID=52431342
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2014537402A Active JP6202001B2 (ja) | 2013-08-01 | 2014-07-25 | メタクリリル−CoAの製造法 |
Country Status (8)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US10323264B2 (ja) |
EP (1) | EP3029145B1 (ja) |
JP (1) | JP6202001B2 (ja) |
KR (1) | KR101812426B1 (ja) |
CN (1) | CN105378098A (ja) |
AU (1) | AU2014297758B2 (ja) |
BR (1) | BR112016000541B1 (ja) |
WO (1) | WO2015015784A1 (ja) |
Families Citing this family (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
DK2848694T3 (en) | 2012-09-10 | 2018-09-03 | Mitsubishi Chem Corp | METHOD OF PREPARING METHACRYLIC ACID ESTES |
WO2017069267A1 (ja) | 2015-10-23 | 2017-04-27 | ザ リージェンツ オブ ザ ユニバーシティ オブ カリフォルニア | メチルメタクリレートの生物生産 |
Family Cites Families (8)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
DE102006017760A1 (de) | 2006-03-24 | 2007-09-27 | Ufz-Umweltforschungszentrum Leipzig-Halle Gmbh | Verfahren zur enzymatischen Herstellung von 2-Hydroxy-2-methylcarbonsäuren |
EP2048939A4 (en) * | 2006-08-17 | 2010-04-28 | Monsanto Technology Llc | TRANSGENIC PLANTS WITH ADVANCED AGRONOMIC CHARACTERISTICS |
CN101679187B (zh) | 2007-06-01 | 2013-06-05 | 赢创罗姆有限责任公司 | 用于制备甲基丙烯酸或甲基丙烯酸酯的方法 |
EP2285973A4 (en) | 2008-05-01 | 2012-04-25 | Genomatica Inc | PROCESS FOR PREPARING METHACRYLIC ACID |
CN102625845A (zh) | 2009-09-09 | 2012-08-01 | 基因组股份公司 | 协同产生异丙醇与伯醇,二元醇和酸的微生物和方法 |
US9133487B2 (en) | 2011-04-01 | 2015-09-15 | Genomatica, Inc. | Microorganisms for producing methacrylic acid and methacrylate esters and methods related thereto |
DK2848694T3 (en) * | 2012-09-10 | 2018-09-03 | Mitsubishi Chem Corp | METHOD OF PREPARING METHACRYLIC ACID ESTES |
KR101706831B1 (ko) | 2012-09-10 | 2017-02-14 | 미쯔비시 레이온 가부시끼가이샤 | 메타크릴산 및/또는 그의 에스테르의 제조 방법 |
-
2014
- 2014-07-25 JP JP2014537402A patent/JP6202001B2/ja active Active
- 2014-07-25 KR KR1020167002306A patent/KR101812426B1/ko active IP Right Grant
- 2014-07-25 BR BR112016000541-4A patent/BR112016000541B1/pt active IP Right Grant
- 2014-07-25 WO PCT/JP2014/003934 patent/WO2015015784A1/ja active Application Filing
- 2014-07-25 EP EP14832931.1A patent/EP3029145B1/en active Active
- 2014-07-25 AU AU2014297758A patent/AU2014297758B2/en active Active
- 2014-07-25 US US14/905,155 patent/US10323264B2/en active Active
- 2014-07-25 CN CN201480039902.4A patent/CN105378098A/zh active Pending
-
2019
- 2019-04-10 US US16/379,823 patent/US11667939B2/en active Active
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
EP3029145A4 (en) | 2016-11-02 |
JPWO2015015784A1 (ja) | 2017-03-02 |
KR101812426B1 (ko) | 2017-12-26 |
US10323264B2 (en) | 2019-06-18 |
EP3029145B1 (en) | 2020-05-13 |
US11667939B2 (en) | 2023-06-06 |
US20160145665A1 (en) | 2016-05-26 |
EP3029145A1 (en) | 2016-06-08 |
CN105378098A (zh) | 2016-03-02 |
US20190256880A1 (en) | 2019-08-22 |
BR112016000541A2 (pt) | 2017-12-12 |
KR20160025011A (ko) | 2016-03-07 |
BR112016000541B1 (pt) | 2023-01-10 |
AU2014297758B2 (en) | 2016-12-22 |
WO2015015784A1 (ja) | 2015-02-05 |
AU2014297758A1 (en) | 2015-12-17 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN111699194A (zh) | 脂质生产 | |
CN106957850B (zh) | 一株产磷脂酶d的基因工程菌及其构建方法与应用 | |
WO2010023206A1 (en) | Enzymatic production of 2-hydroxy-isobutyrate (2-hiba) | |
JPWO2019107516A1 (ja) | 3−ヒドロキシアジピン酸、α−ヒドロムコン酸および/またはアジピン酸を生産するための遺伝子改変微生物および当該化学品の製造方法 | |
Pan et al. | Synthetic biology toolkit for engineering Cupriviadus necator H16 as a platform for CO 2 valorization | |
AU2012214255A1 (en) | Cells and methods for producing isobutyric acid | |
Zhang et al. | Biosynthesis of γ-aminobutyric acid by a recombinant Bacillus subtilis strain expressing the glutamate decarboxylase gene derived from Streptococcus salivarius ssp. thermophilus Y2 | |
WO2008143150A1 (ja) | 遺伝子破壊株、組換えプラスミド、形質転換体、及び3-カルボキシムコノラクトンの製造方法 | |
JP5142268B2 (ja) | 改良型没食子酸合成酵素および没食子酸の製造法 | |
JP3848047B2 (ja) | ポリヒドロキシアルカノエート合成酵素及び該酵素をコードする遺伝子 | |
US11667939B2 (en) | Method for producing methacrylyl-CoA | |
US10053716B2 (en) | 4-amino cinnamic acid production method using enzyme | |
JP5268064B2 (ja) | プラスミド、形質転換体、及び3−カルボキシムコノラクトンの製造方法 | |
JPH11253168A (ja) | ニトリルヒドラターゼの活性化に関与するタンパク質及びそれをコードする遺伝子 | |
WO2016127469A1 (zh) | 用于生产β-丙氨酸的工程菌及生产β-丙氨酸的方法 | |
KR100447532B1 (ko) | (알)-하이드록시카르복실산 생산 재조합 미생물 및 그를이용한 (알)-하이드록시카르복실산의 제조방법 | |
CN107619832B (zh) | 一种氯代硝基苯酚类化合物氧化还原酶基因簇cnpAB及其应用 | |
JPH06303971A (ja) | ニトリルヒドラターゼ活性を有する新規なタンパク質およびそれをコードする遺伝子ならびに該遺伝子を含有する形質転換体によるニトリル類からアミド類の製造方法 | |
JP6156442B2 (ja) | ニトリルヒドラターゼ遺伝子を置換した微生物 | |
KR20110130614A (ko) | 신규 타입 ⅲ 폴리케타이드 합성효소 및 그 응용 | |
KR20180082079A (ko) | 형질전환 미생물을 이용한 2,3-부탄디올 생산방법 | |
WO2024231217A1 (en) | Glucolipid production | |
JP2003284579A (ja) | 2−ケト酪酸の製造方法 | |
Pan et al. | Synthetic biology toolkit for engineering Cupriviadus necator H16 as a platform for CO | |
JP2024517485A (ja) | フェニルプロパノイド化合物の生合成 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20161205 |
|
RD04 | Notification of resignation of power of attorney |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A7424 Effective date: 20170330 |
|
A02 | Decision of refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02 Effective date: 20170404 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20170704 |
|
A911 | Transfer to examiner for re-examination before appeal (zenchi) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A911 Effective date: 20170711 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20170801 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20170814 |
|
R151 | Written notification of patent or utility model registration |
Ref document number: 6202001 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R151 |